WO2004055051A1 - 転写制御因子zhx3 - Google Patents

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WO2004055051A1
WO2004055051A1 PCT/JP2003/009164 JP0309164W WO2004055051A1 WO 2004055051 A1 WO2004055051 A1 WO 2004055051A1 JP 0309164 W JP0309164 W JP 0309164W WO 2004055051 A1 WO2004055051 A1 WO 2004055051A1
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WO
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zhx3
zhx1
protein
amino acid
acid sequence
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PCT/JP2003/009164
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French (fr)
Inventor
Kaoru Miyamoto
Kazuya Yamada
Original Assignee
Japan Science And Technology Agency
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Publication date
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4702Regulators; Modulating activity
    • C07K14/4703Inhibitors; Suppressors
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/16Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for liver or gallbladder disorders, e.g. hepatoprotective agents, cholagogues, litholytics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Definitions

  • the present invention relates to a protein having a transcription repressing activity, and more particularly, to a transcription factor ZHX3 of a liver cancer-specific gene.
  • Conventional technology relates to a protein having a transcription repressing activity, and more particularly, to a transcription factor ZHX3 of a liver cancer-specific gene.
  • the glycolytic enzyme genes pyruvate kinase (PK) M gene and type I hexokinase (HKII) gene, are suppressed in normal liver but are induced by hepatocarcinogenesis.
  • the transcription factor common to both is Nuclear Factor-Y (NF-Y), but there is no difference in the expression of NF-Y in normal hepatocytes and hepatoma cells. Therefore, it is considered that factors interacting with NF-Y are involved in gene expression specific to liver cancer.
  • NF-YA A-subunit that interacts with the A-subunit (NF-YA), which is particularly important in NF-Y, revealed that it consists of 873 amino acids, two zinc finger (Znf) motifs, and five homeodomains ( HD) has been cloned (Yamada,., Osawa, H., and Granner, DK (1999) FEBS Lett. 460, 41-45).
  • ZHX1 belongs to the homeobox protein superfamily Znf class, and the amino acid sequence of 272 to 564, including the HD1 to HD2 regions of human ZHX1, is composed of NF-YA N-terminal glutamine-Lutsch AD and (Yamada, K., Osawa, H., and Granner, DK (1999) FEBS Lett. 460, 41-45). As a result of Northern blot analysis, it was found that ZHX1 transcript was universally expressed (Yamada, K., Printz, RL, Osawa, H., and Granner, DK (1999) Biochem.
  • this ZHX1 functions as a transcription repressor and is localized in the nucleus (Yamada, K., Kawata, H., Matsuura, K., Shou, Z., Hirano, S., Mizutani, T., Yazawa, T., Yoshino, M., Sekiguchi, T., Kajitani, T., and Miyamoto.. (2002) Biochem. Biophys. Res. Comm. 279, 368-374).
  • the inventors investigated whether ZHX1 interacts with proteins other than NF-YA and regulates gene transcription in order to determine the biological role of ZHX1. Therefore, the present inventors searched for a protein that interacts with ZHX1 in a cDNA library of rat liver and ovarian granulosa cells using the yeast 2-hybrid system. Means for solving the problem
  • ZHX family 1 is involved in the regulation of gene expression by forming homodimers and heterodimers with each other.
  • ZHX3 not only forms a dimer with both ZHX1 and ZHX3, but also interacts with the NF-YA AD described above. Further analysis revealed that ZHX3 is a universal transcriptional reblesser localized in the nucleus and functions as a dimer.
  • the present invention relates to an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been deleted, substituted or added in the amino acid sequence, or an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • a protein or peptide having a transcriptional repressing activity comprising a functional part of the above or an amino acid sequence containing an amino acid sequence in which one or several amino acids have been deleted, substituted or added in said functional part.
  • the amino acid sequence of rat ZHX3 is shown in SEQ ID NO: 2. This amino acid sequence is considered to be a region corresponding to amino acid sequence 114 to 642 in human ZHX3. Therefore, a protein having an amino acid sequence that is 85% or more homologous to the amino acid sequence of ZHX3 (SEQ ID NO: 1) is considered to be a protein having the same transcription repressing function as human ZHX3.
  • the present invention also provides an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having at least 85% homology to the amino acid sequence, or an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • the protein comprises a functional part of the amino acid sequence or an amino acid sequence containing an amino acid sequence at least 85% homologous to the functional part, and can be expressed as a protein or a peptide having a transcription repressing activity.
  • the amino acid sequence at positions 303 to 502 of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 can be said to be a part responsible for its transcription repressing function. Therefore, the functional portion of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 is preferably the amino acid sequence of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 at position 303 to 502.
  • ZHX3 suppresses the expression of hepatocellular carcinoma-specific isozam genes in normal liver, and ZHX3 It is considered that the expression of ZHX3 is reduced or the ZHX3 protein is modified and loses its activity. Therefore, by developing a substance that detects the presence of ZHX3 or a drug that regulates the function, it can be applied to the diagnosis and treatment of liver cancer.
  • the present invention is also a drug for inhibiting transcription, comprising the above protein or peptide as an active ingredient.
  • the present invention is any of the above proteins or peptides that suppresses transcription of a gene expressed only in liver cancer cells.
  • the gene may be type I hexose or pyruvate kinase M.
  • the present invention is also a therapeutic agent for liver cancer comprising the protein or peptide as an active ingredient.
  • the present invention is a method for treating a disease caused by a deficiency of a transcriptional repressor, particularly liver cancer, using the protein or peptide.
  • the present invention is an antibody capable of specifically recognizing any of the above peptides or proteins. Further, the present invention is a screening agent for a drug having a transcriptional repressing activity, comprising this antibody as an active ingredient.
  • FIG. 1 shows a comparison of the deduced amino acid sequence of human ZHX3 with human ZHX1. Compare the amino acid sequences of ZHX3 and ZHX1. Two ZnF motifs and five HDs are indicated by a plus sign and underline, respectively. Asterisks indicate amino acid identity. The dashed line indicates that there is no amino acid sequence corresponding to each protein. The gap at the right time is shown. Shown are the deduced amino acid sequences of clones G58 and G23, and KIAA 0395, corresponding to the amino acid sequences of human ZHX3 from 114 to 642, 242 to 615, and 495 to 956, respectively.
  • FIG. 2 shows the tissue distribution of human ZHX3 mRNA. Each lane contains 2 // g of poly A + RNA isolated from the indicated tissue. Size markers are indicated on the left side in kb. Lane 1, heart; lane 2, brain; lane 3, placenta; lane 4, m-, lane 5, IS1; lane 6, skeletal muscle; lane 7, kidney; lane 8, knee Lane 9, spleen; lane 10, thymus; lane 11, prostate; lane 12, testis; lane 13, ovary; lane 14, small intestine; lane 15, colon; lane 16, leukocytes.
  • FIG. 1 shows the tissue distribution of human ZHX3 mRNA.
  • Each lane contains 2 // g of poly A + RNA isolated from the indicated tissue. Size markers are indicated on the left side in kb.
  • Lane 1 heart
  • lane 2, brain lane 3, placenta
  • lane 4 m-, lane 5, IS1; lane 6, skeletal muscle; lane 7, kidney; lane 8, knee Lane
  • FIG. 3 shows the identification of the minimal heterodimerization domain between ZHX1 and ZHX3 using the yeast two-hybrid system or GST push / down analysis.
  • a schematic representation of the human ZH XI and GAL4 AD-ZHX1 fusion constructs is shown on the left.
  • Znf and HD indicate the zinc finger motif and the homeodomain, respectively.
  • the + and one symbols are pDBD-G23, which expresses the 242-488 amino acid sequence of human ZHX3 fused to GAL4 DBD, and compared to yeast containing a combination of uACT2, respectively. Shows increased and unchanged values of galactosidase activity.
  • FIG. 4 shows the identification of the minimal heterodimerization domain between ZHX1 and ZHX3 using the yeast 2-hybrid system or GST pull-down analysis.
  • Panoramic representations of the human ZHX3 and GAL4 AD-ZHX3 fusion constructs are shown on the left.
  • Znf, HD, and E indicate the zinc finger motif, homeodomain, and glutamate mono-rich region, respectively.
  • the + and-symbols represent the pDBD—ZHXl (1—8), which expresses the entire coding region of human ZHX1 fused to the GAL4 DBD.
  • FIG. 5 shows the results obtained using the yeast 2-hybrid system or GST Punoledown analysis.
  • FIG. 6 shows the identification of the minimal homodimerization domain of ⁇ 3 using the yeast 2-hybrid system or GST down analysis.
  • a schematic representation of the human # 3 and GAL4 AD-ZHX3 fusion constructs is shown on the left.
  • Znf, HD, and E indicate a zinc finger motif, a homeodomain, and a glutamate-rich region, respectively.
  • the + and one symbol indicate the same as shown in the description of FIG.
  • FIG. 7 shows the identification of the minimal homodimerization domain of ZHX3 using the yeast two-hybrid system or GST punoredown analysis.
  • FIG. 8 shows the mapping of the interaction domain between NF-YA and ZHX3 using the yeast 2-hybrid system.
  • a schematic representation of the human ZHX3 and GAL4 AD-ZHX3 fusion constructs is shown on the left.
  • Z ⁇ , HD, and E indicate a zinc finger motif, a homeodomain, and a glutamate / l-tamic acid region, respectively.
  • the + symbol is the increase in -galactosidase activity, respectively, as compared to an enzyme containing a combination of ⁇ 1-269 and pACT2 expressing the activation domain of NF-YA fused to GAL4 DBD. Indicates a value that does not change.
  • FIG. 9 shows the mapping of the interaction domain between NF-YA and ZHX3 using the yeast 2-hybrid system.
  • a graphical representation of the deletion mutants fused to NF-YA and GAL4 DBD is shown on the left.
  • Q and ST represent the glutamine-rich region and the serine-threon-rich region, respectively.
  • SID and DBD indicate subunit interaction and DNA binding domain, respectively.
  • DBD and a yeast comprising the combination of pAD-ZHX3 (242-488), which expresses the amino acid sequence of 242 to 488 of human ZHX3 fused to GAL4 AD, respectively.
  • FIG. 10 shows that ⁇ 3 is a transcription repressor.
  • pSG424 and pGAL4-ZHX3 (1-956) express the entire coding sequence of human ZHX3 only fused to GAL4 DBD and GAL4 DBD, respectively. A 100% response was indicated by promoter activity for the reporter plasmid in the presence of 50 ng of pSG424, respectively.
  • ZHX3 is a transcriptional repressor.
  • the total amount of plasmid (202 ng) was adjusted, if necessary, by the addition of: cDNA3.1His-C2. A value of 100% was shown for the promoter activity of the reporter plasmid in the presence of 50 ng of pSG424 and 50 ng of pcDNA3.1 His-C2 1 ".
  • FIG. 12 shows the determination of the minimal repressor domain of ZHX3.
  • SG424 and various pGAL4-ZHX3 constructs express various deletion mutants of human ZHX3 fused to GAL4 DBD alone and GAL4 DBD, respectively. The conditions are the same as those shown in the description of FIG.
  • Each force ram and bar shows the average and standard deviation of at least 5 transfection experiments.
  • FIG. 13 shows the subcellular localization of ZHX3 and the determination of nuclear translocation signal in HEK293 cells.
  • Expression plasmids 300 ng encoding either GFP alone or various truncated ZHX3 proteins fused to the C-terminus of GFP were transfected into HEK293 cells. 48 hours after transfection, the intracellular localization of the GFP fusion protein was observed. The construct is shown at the top of each panel.
  • FIG. 14 shows the functional domains of ZHX3.
  • Znf zinc finger motif
  • HD homeodomain
  • E glutamate-rich region
  • DD dimerization domain
  • ID interaction domain with NF-YA
  • RD replate third domain
  • NLS nucleus Transition signal.
  • This experiment was performed using the yeast 2-noid hybrid system, pDsRedl-C1, X- ⁇ -gal, human testis marathon-ready cDNA, Advantage2 PCR kit, human Multiple Tissue Northern Blot and BlotII, ExpressHyb
  • the hybridization solution and pEGFP-C1 were purchased from Clontec (Palo Alto, CA).
  • pGEX-4T-2, PGEX-5X-1, Hi- 32 PdCTP (llTBq / thigh ol), gnoletathione-cepharose-4 ⁇ ⁇ and ass-methionine (37 TBq / tyrool) are from Amers am Pharmacia Biotech. (Cleveland, ⁇ H) Riki's purchased.
  • HEK293 Itoda wrapping Hitoda 3 ⁇ 4Ken Itoda wrapping system [Ma American Tvpe Culture Collection (Manassas, VA) Purchased from power.
  • TRIOZOL reagent, Superscript, pcDNA3.1His-C plasmid, and LIPOFECTAMINE PLUS were purchased from Invitrogen (Groningen, Netherlands).
  • ExTaqD dish polymerase, pT7Blue-T2 vector, and BcaBest DNA labeling kit were obtained from TaKaRa BIOMEDICALS.
  • pGEM-T Easy vector T7 TNT Quick-binding transcription Z translation system, pGL3-Control, pRL-CMV, and dual luciferase analysis system were purchased from Proiaega (Madison, Wis.).
  • the Big Dye terminator FS cycle sequencing kit was purchased from Applied Biosystems Japan (Tokyo, Japan).
  • OPP3 IfflJJStt Stragene (La Jolla, CA).
  • QIAGEN plasmid kit was purchased from QIAGEN (Hilden, Germany).
  • the PACT2B1 plasmid was prepared as previously described (Yamada, K., Osawa, H., and Granner, D. K. (1999) FEBS Lett. 460, 41-45).
  • the cloned G23 plasmid, pAD-G23 is digested with EcoRiZXhoI or SfiI_Bg1II, and each fragment is ligated to the EcoR I / XhoI site of the pGEX-4T-2 vector.
  • subcloning was performed into the Sfi I / B am HI site of the pGBKT7 vector to obtain pGST-G23 and pDBD-G23, respectively.
  • the 250 bp EcoRI / Hindill fragment of pAD-G23 was subcloned into the EcoRI / Hindill site of pDsRed1—C1 and the pDsR6 (1—reverse Orientation 023 (HD 1) was prepared from the above S—D s Red 1 C 1—Hind III (SEQ ID NO: 3) and the above A sD s Red dCl CSa1 I oligonucleotide (SEQ ID NO: 4). After that, it was analyzed, phosphorylated, and inserted into the HindlllZSa1I site of pDsRed1—C1 to obtain pDsRedl—C1E1.
  • pBSLI-KIAA0395 was provided by Dr. Takahiro Nagase (KAZUSA DNA RESEARCH INSTITUTE Japan).
  • the 1.2 kb Sa1I / AaI fragment of the above plasmid was subcloned into pDsRedl—C1E1 Sa1I / ApaI site and pDsRed— ZHX3 (HD 2-5) was produced.
  • the resulting Bgl II BamHI fragment was subcloned into the BamHI site of pACT 2B1 to yield PAD-ZHX3 (498-903).
  • RNA from HE 293 cells was prepared using TRIZOL reagent according to the manufacturer's protocol.
  • Reverse transcription-one polymerase chain reaction (RT-PCR s) was performed as described previously with some modifications (Yamada, K., Printz, RL, Osawa, H., and Granner, DK (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun. 261, 614-621).
  • Polymerase chain reaction (PGR) conditions were previously described, except for the use of ExTaq DNA polymerase (Yaiaada, K., Printz, RL, Osawa, H., and Granner, DK (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun. 261, 614-621).
  • S-GBKT 7-Nde I SEQ ID NO: 1
  • As—GBKT 7—Nco I oligonucleotide SEQ ID NO: 22
  • Nde I / p of pGBKT7B1 Insertion into the NcoI site yielded pGBKT7NEN.
  • GEM-T Easy ZHX3 (MetZNcoI) is digested with NcoI and the 960 bp fragment is digested in the NcoI site of GBKT7—ZHX3 (NcoI—STOP). To obtain pDBD—ZHX3 (1-956). The resulting plasmid was digested with BamHI, blunt-ended by a K enow reaction, and then digested with EcoRI. The above 2.9 kb fragment was subcloned into the EcoRl / Smal site of the pGEX-5X-1 vector to obtain pGST-ZHX3 (1-956).
  • pGST—EcoR I / XhoI fragment of ZHX3 (1-956) is subcloned into the EcoRl / XhoI site of pACT2B1 to obtain pAD—ZHX3 (1-956). Obtained.
  • PCR was performed using the combination of S—hZHX3H D 1 (SEQ ID NO: 11) and As—hZHX3—HD 1—Eco (SEQ ID NO: 23) as primers and: DBD—ZHX3 (1 -956) as primers. Made with After digestion with EcoRI, the above fragment was subcloned into the EcoRI site of pACT2B1 to obtain pAD-ZHX3 (303-364).
  • the pSG424, pSG424B1, 5XGAL4-pGL3Control, and pEGFP-C1E1 plasmids have been previously shown (6, 13-15).
  • the 2.9 kb EcoRI ZBamHI fragment of pDBD-ZHX3 (1-956) was transferred to the EcoRI / BamHI site of the pSG424B1 or pEGFP-C1E1 vector.
  • the Bg1 Il / BamHI fragment of pDsRed—ZHX3 (HD2—5) was subcloned into the BamHI site of pSG424B1 to obtain pGAL4-ZHX3 (498-903).
  • G EM-T E asy ZHX 3 (HD 1-2), p GEM ⁇ TE asy ZHX 3 (HD 1-1506), pGEM—TE asy ZHX 3 (1090—HD 2), and pGEM—TE asy ZHX 3 (HD 2)
  • EcoRI / BamHI fragment was subcloned into pSG424B1 or pEGFP—C1E1 vector EcoRI / BamHI site, and pGAL4-ZHX3 (303 -555), PGAL4-ZHX3 (303-502), pGFP—ZHX3 (3 03-555), pGFP-ZHX3 (303-502), pGFP-ZHX3 (364-555), and pGFP-ZHX3 (497-555).
  • pGEM—Eco RI / BamHI fragment of TE asy ZHX3 (HD1) was subcloned into the EcoRI / BamHI site of pSG424B1 vector, and pGAL4-ZHX3 (303-364) was obtained. Obtained.
  • S-hZHX3-436 SEQ ID NO: 27) and As-hZHX3-909 (SEQ ID NO: 25), Sh ZHX3-Met 3 (SEQ ID NO: 24) and As-hZHX3-322 (SEQ ID NO: 28), S-hZHX3-322 (SEQ ID NO: 29) and As-hZHX3-435 (SEQ ID NO: 26), and S-hZHX3-1666 (SEQ ID NO: 30) and As-hZHX3-B Using the combination of s mB I—2 (SEQ ID NO: 31) as a primer, pDBD—ZHX3 (1—956) as type I, and S—hZHX3-1090 (SEQ ID NO: 14) and As—hZHX3— The experiment was performed using the combination of 1506 (SEQ ID NO: 13) as a primer and pGFP-ZHX3 (303-555) as a type III.
  • the amplified DNA is also subcloned into pGEM—TE asy or pT7B1ue_2T—beta and pGEM—TE asy ZHX3 (Met / 909), pGEM-T Easy ZHX3 (Me t / 435) p GEM-T Easy ZHX 3 (436/909), p T 7B lue— 2 T ZHX 3 (Me t / 321), pT 7 Blu e-2 T ZHX 3 (322,435), p GEM-TE asy ZHX 3 (1663/2022) and p GEM—TE asy ZHX 3 (1090/1 506) were obtained.
  • the EcoRI / BamHI fragment of these plasmids was subcloned into the EcoRI / BamHI site of the pSG424B1 or pEGFP-C1E1 vector, and: GAL4-ZHX3 (1-145 ), PGAL4-ZHX3 (146-303), pGFP-ZH3 (1-303), pGFP-ZHX3 (1-107), pGFP-ZHX3 (108-145), and pGFP-ZHX3 (146-303) 303).
  • p G EM—E c oR l / B amti of TE asy ZHX 3 (1090/1 506) The I fragment was subcloned into the EcoRI / BamHI site of pSG424B1 to obtain pGAL4-ZHX3 (364-502).
  • pGEM—T Ea sy Subcloning the EcoRI / BsmBI fragment of ZHX3 (1663/2022) into the EcoRI / BsmBI site of pDsRed—ZHX3 (HD2-STOP) As a result, pDsRed—ZHX3 (1663—STOP) was obtained.
  • the resulting plasmid EcoR IZB amHI fragment was subcloned into the EcoR IZB amHI site of pEGFP-ClEl to obtain pGFP-ZHX3 (555-956).
  • PDBD expresses the entire coding sequence of human ZHX1, fused to the DNA-binding domain (DBD) of yeast transcription factor GAL4, pDBD—ZHX1 (1-873) (pGB T7-ZHX1 (1-873)) , And rat granulosa cell and liver cDNA libraries were constructed as previously described (Hirano, S., Yamada, K., Kawata, ⁇ ., Shou, ⁇ ., Mizutani, ⁇ ., Yazawa, ⁇ ., Ka j itani, T., Sekiguchi, T., Yoshino, M., Sigematsu, Y., Mayumi, M., and Miyamoto, K.
  • AH109 yeast cells were transformed with the pDBD-ZHX1 (1-873) plasmid described above.
  • the above strain was used as a decoy for screening cDNA libraries.
  • a high-efficiency transformation method based on TE / LiAc— was used for library screening (Yamada, K., Wang, J.-C., Osawa, ⁇ ⁇ , Scott, DK, and Granner, DK (1998) BioTechnic ⁇ ies 24, 596-600).
  • the 5,1 RACE method was used using the human testis marathon-ready cDNA and the Advanage 2 PCR kit.
  • Two gene-specific primers, hZHX3-5RACE-As1 (SEQ ID NO: 34) and hZHX3--5RACE-As2 (SEQ ID NO: 35) were used.
  • the above 5'-RACE procedure was performed according to the protocol recommended by the manufacturer.
  • the amplified DNA fragments were subcloned into the pGEM-TE asy vector and their nucleotide sequences were determined.
  • Test Example 4 Polv (A) + RNA blot analysis
  • Test Example 5 Yeast 2-Hybrid System and Liquid ⁇ 3-Galatatosidase Analysis
  • a S FY5 26 yeast strain containing pDBD or PDBD-G23 was used.
  • GAL4 AD fused to various truncated forms of ZHX1, or!) ACT2.
  • To map the heterodimerization domain of ZHX3 with ZHX1 or the homodimerization domain of ZHX, pDBD, pDBD-ZHX1 (1-873) or pDBD—G23 was transformed with various truncated forms of ZHX3 fused to GAL4 AD, or pACT2.
  • the S FY526 yeast strain containing 1) 080 or 1) 1-269 was transformed with various types of ZHX3 fused to GAL4AD. Transformed in cut form.
  • SFAD526 yeast strain containing pAD-ZHX3 (242-488) and various NF-YA fused to GAL4 DBD was transformed in a truncated form.
  • Glutathione-S-transferase (GST) pull-down analysis pGST-ZHXl (l-873) plasmid was prepared according to the previous report (Hirano, S., Yamada, K., Kawata, ⁇ ., Shou, ⁇ ., Mizutani , ⁇ , Yazawa, ⁇ ., Kajitani, ⁇ ., Sekiguchi, ⁇ ., Yoshino, ⁇ ., Shigematsu, ⁇ ., Mayumi, ⁇ ., And Miyamoto, ⁇ . (2002) Gene 290, 107-114).
  • ⁇ 3 cells were transformed with pGEX-5X-1, pGST-ZHX1 (1-873), pGST-G23 or PGST-ZHX3 (1-956) fusion protein expression plasmid.
  • the preparation of a GST fusion protein, 35 S one labeled ⁇ Pi pulldown analysis ZHX1 in vitro translated was shown previously (Yamada, K., Printz, RL , Osawa, H., and Granner, DK (1999 261, 614-621; Hirano, S., Yamada, K., Kawata, H., Shou, Z., Mizutani, T., Yazawa, T., Kajitani, T., Sekiguchi, T., Yoshino, M., Shigematsu, Y., Mayumi, M., and Miyamoto, K.
  • HEK293 cells were cultured in Dulbecco's modified Eagles-medium supplemented with 10% fetal calf serum at 37 ° C. in a 5% CO 2 incubator.
  • DNA transfection uses LI POFECTAMI NE PLUS reagent Made with All plasmids used for transfection were prepared using QIAGEN plasmid kit, followed by CsC1 gradient centrifugation. Cells (5 ⁇ 10 4 per well) were seeded the day before transfection in 24-well plates.
  • the above 5 XGAL4-pGL3 Control was prepared according to the previous report (Tanaka, T., Inazu. T., Yamada, ⁇ ., Myint, ⁇ ., Keng, VW, Inoue, Y., Taniguchi, N., and Noguchi, T. (1999) Biochem. J. 339, 111-117).
  • 5 XGAL4-pGL3 Control 1 or pGL3-Control was used as reporter plasmid.
  • 100 ng of the reporter plasmid, 211 1 L-CMW, and the indicated amount of the GAL4DBD-ZHX3 fusion protein expression plasmid were transfected.
  • the total amount of plasmid (152 ng) was adjusted, if necessary, by adding pSG424.
  • BS 69 co-repressor, nuclear protein, telangiectasia ataxia-like protein, androgen-induced aldose reductase, activating transcription factor (ATF) interacting protein (ATF-IP) , Spinocerebellar ataxia type I, dixin, Elf-1, 11-19 lysine monolithic leukemia gene, and ZHX1 were cloned as known proteins (Hirano, S., Yamada, K., Kawata, H., Shou, Z., Mizutani, T., Yazawa, T., Kajitani, T., Sekiguchi, T., Yoshino, M., Shigematsu, Y., Mayumi, M., and Miyamoto, K.
  • the 5'-RACE method (Test Example 3) was used to isolate the 5'-noncoding sequence and the remaining coding region of human KI AAO 395 cDNA.
  • a cDNA fragment was obtained by PCR using human testis marathon cDNA as type II.
  • the size of the full-length cDNA was determined to be 9,302 bp.
  • the overall length C DNA 965 has an open Lee de I ring frame of amino acid residues, and its estimated Amino acid sequence of the protein two in addition to ZHX 1 C ys 2 -H is 2 - -type Includes Znf motif and 5 HD. This amino acid sequence is shown in SEQ ID NO: 1.
  • ZHX3 was presented to the HUGO Nomenclature Committee from the name of zinc finger and homeobox 3.
  • FIG. 1 shows a comparison of the deduced amino acid sequence of human ZHX3 with human ZHX1.
  • This human ZHX3 protein has a predicted molecular weight of 104.7 kDa and an isoelectric point of 5.68.
  • the KIAA0395 encodes the 498-956 amino acid sequence of human ZHX3, while the pAD-G58 and pAD-G23 encode 114-642 and 242-615 amino acid sequences of ZHX3, respectively.
  • the glutamate monolithic region which can serve as a transcription control domain, is present in the 670-710 amino acid sequence, and there is no putative nuclear translocation signal.
  • the homology in nucleotide sequence and amino acid sequence in the coding region between ZHX3 and ZHX1 was 46.9% and 34.4%, respectively.
  • Example 2 the tissue distribution of human ZHX3 mRNA was determined by Northern blot analysis (Test Example 4). As shown in FIG. 2, human ZHX3 mRNA was detected as multiple bands, lengths 9.4, 7.3, 5.0, and 4.6 kb. The size of our cloned input was 9,302 bp, which is almost the same as the longest transcript. Although the intensities varied between tissues, these transcripts were observed in all tissues examined. This indicates that human ZHX3 mRNA is ubiquitously expressed.
  • Example 2 the tissue distribution of human ZHX3 mRNA was determined by Northern blot analysis. As shown in FIG. 2, human ZHX3 mRNA was detected as multiple bands, lengths 9.4, 7.3, 5.0, and 4.6 kb. The size of our cloned input was 9,302 bp, which is almost the same as the longest transcript. Although the intensities varied between tissues, these transcripts were observed in all tissues examined. This indicates that human ZHX3 mRNA is ubiquitously expressed.
  • mapping of the minimal heterodimerization domain between ZHX1 and ZHX3 was performed to investigate which domain of ZHX1 is required for interaction with ZHX3.
  • Yeast strain SFY526 was transformed with pDBD expressing only GAL4 DBD or pDBD-G23 encoding amino acid residues 242-615 of ZHX3 fused to GAL4 DBD.
  • the above two yeast strains were used as reporter yeast.
  • Several plasmids encoding various truncated forms of ZHX1 fused to pACT2 or GAL4AD expressing only GAL4 AD were used as prey plasmids.
  • reporter yeasts containing pDBD When reporter yeasts containing pDBD were transformed with these prey plasmids, they showed low / 3-galactosidase activity (data not shown).
  • a reporter yeast containing pDBD-1 G23 is transformed with pACT2, pAD-ZHX1 (565-873), pAD-ZHX1 (430-564) or pAD-ZHX1 (345-463). Then, these yeasts also showed low galactosidase activity (Fig. 3).
  • the yeast was transfected with pAD-ZHX1 (142-873), pAD-ZHX1 (272-873), pAD-ZHX1 (272-564) or pAD-ZHXl (272-432). Upon conversion, high] 3-galactosidase activity was observed.
  • the pAD—ZHX1 (272-432) encodes 242 to 432 amino acid residues of ZHX1.
  • Yeast strain SFY526 was transformed with pDBD-ZHX1 (1-873) or pDBD encoding the entire coding sequence of ZHX1 fused to GAL4 DBD.
  • the above two yeast strains were used as reporter yeast.
  • Several plasmids encoding various truncated forms of ZHX3 fused to pACT2 or GAL4AD were used as prey plasmids ( Figure 4). When reporter-yeasts containing pDBD were transformed with these prey plasmids, they exhibited low / 3-galactosidase activity (data not shown).
  • yeasts have high j3— only when a reporter yeast containing pDBD—ZHX1 (1-873) is transformed with pAD—G23 or pAD—ZHX3 (242-488). It showed galactosidase activity.
  • the pAD-ZHX3 (242-488) encodes amino acids 242 to 488 of ZHX3.
  • reporter yeasts containing pDBD were transformed with the above plasmids, they exhibited low 13-galactosidase activity (data not shown).
  • reporter yeast containing £) 080-023 was transformed with 1) ⁇ 2, pAD-ZHX3 (303-364), and pAD-ZHX3 (498-903), very low mono-galactosidase was obtained. Activity was detected.
  • yeast transformed with pAD_G23 or pAD-ZHX3 (242-488) showed high] 3-galatatosidase activity.
  • ZHX3 also interacts with NF-YA AD.
  • Human ZHX1 was initially cloned as a protein that interacts with NF-YA (Yamada, K., Printz, RL, Osawa, H., and Granner, DK (1999) Biochem. Biophys. Res. Co. 261, 614-621).
  • the interaction of ZHX3 with NF-YA was examined using a yeast two-one hybrid system (Test Example 5). We used two reporter yeast strains transformed with pDBD or pYAl-269, respectively. The above pYA1-269 expresses NF-YA AD fused to GA L4 DBD.
  • AD of NF-II is composed of glutamine-rich and serine / threonine-rich domains, respectively.
  • S FY 526 yeast strain containing PAD—ZHX3 (242-488) was used as the reporter yeast.
  • a variety of plasmids expressing truncated forms of NF-YA fused to GAL4 DBD were transformed into the yeasts and their galactosidase activity determined.
  • This region does not contain the repressor domain of 1S ZHX1, which is consistent with the dimerization domain of ZHX1 with ZHX3 (Yamada, K., Kawata, H., Matsuura, K., Shou, ⁇ ., Hirano, S., Mizutani, ⁇ ., Yazawa, ⁇ ., Yoshino, ⁇ ., Sekiguchi, ⁇ ., Kajitani,, and Miyamoto. ⁇ . (2002) Biochem. Biophys. Res. Comm. 279, 368-374).
  • overexpression of this protein functions as a dominant negative form of ZHX1.
  • the subcellular localization of ZHX3 was determined and the nuclear translocation signal (NLS) was determined using the GFP-ZHX3 fusion protein expression system. Mapping was done. For this, various truncated forms of ZHX3 fused to GFP were prepared. These plasmids were transfected into HEK293 cells and the subcellular localization of the GFP fusion protein was observed. PEGFP-C1E1, encoding only the GFP protein, was observed throughout the cells (FIG. 13). In contrast, GFP-ZHX3 (1-956), where full-length ZHX3 was fused to the C-terminus of GFP, was localized in the nucleus.
  • ZHX1 contains two Zn motifs and five HDs, forming a homodimer, interacting with NF-YA AD, and is localized in the nucleus.
  • ZH X3 mRNA is ubiquitously expressed. From this finding, the inventors concluded that both ZHX1 and ZHX3 are members of the same family, namely the ZHX family.
  • the homology of all amino acid sequences of ZHX1 and ZHX3 was 34.4%, but the two Znf motifs and the five HDs were highly conserved.
  • the homology in the amino acid sequence of Znf1, Znf2, HD1, HD2, HD3, HD4, and HD5 between ZHX1 and ZHX3 is 50.0, 45.5, respectively.
  • a unique glutamate monolithic region is located in the amino acid sequence of residues 670 to 710 of ZHX3 (FIGS. 1 and 9).
  • the Zn motif, HD, and acidic region are responsible for the functional properties of the transcription factor.
  • the glutamate monolithic region is involved in transcriptional activity, and the basic region is DBD or NLS (Gehring, WJ, Affolter, M., and Burglin, T. (1994) Annu. Rev. Biochem. 63, 487-526, etc.).
  • ZHX 3 not only forms a heterodimer with ZHX1, but also forms a homodimer.
  • the amino acid sequence of 242 to 488 of ZHX3 is necessary for their dimerization. (Figs. 3 to 7).
  • the minimal domain of homo- and heterodimerization of ZHX1 with ZHX3 was mapped to the amino acid sequence of 272-432 of ZHX1 (FIGS. 3-5). In these regions, the force S including HD1 and HD1 alone cannot be dimerized (Figs. 3 to 9). A larger area, including HD1, is required for dimorphism.
  • both ZHX3 and ZHX1 interact with NF-YA AD; the former interacts with the NF-YA serine-threonine monolith AD, and the latter interacts with daltamine-litsch AD (Fig. 8, (Fig. 9).
  • the interaction domain of ZHX3 with NF-YA AD was mapped to the same region as the dimerization domain of ZHX3 (Figs. 8 and 9).
  • the 272-5564 amino acid sequence containing the HD1-HD2 region of human ZHX1 is required for its interaction (Yamada,., Osawa, H., and Granner, DK (1999) FEBS Lett. 460 , 41-45). The question of whether the heterodimeric complex of ZHX1 with ZHX3 interacts with different ADs of NF-YA remains to be determined.
  • ZHX3 is a transcriptional repressor (Figs. 10-12).
  • the minimal repressor domain of ZHX3 is mapped to a region that overlaps both the dimerization and interaction domains.
  • overexpression of the heterodimerization domain of ZHX1 caused a decrease in repressor activity of ZHX3, although it was not responsible for repressor activity (Figure 11).
  • ZHX3 has essentially no repressor activity and that the activity observed above is a dimerization partner, where the repressor domain is located at the C-terminus of the acidic region (Yamada, K., Kawata, H., Matsuura, K., Shou, ⁇ ., Hirano, S., Mizutani, T., Yazawa, ⁇ ., Yoshino, ⁇ .,, Sekiguchi, ⁇ ⁇ , Ka itani, ⁇ ., And Miyamoto. ⁇ . (2002) Biochem. Biophys. Res. Comm. 279, 368-374) Repressor activity of ZHX 1 suggests that it is due to production.
  • ZHX 3 is a DNA-binding protein, so that the region of Z HX 3, including the HD 1 region, is a pleiotropic domain A heterodimerization domain with homo and ZHX1, an interaction domain of NF-YA with AD, and a repressed domain. Looks like it's in.
  • the transcriptional regulatory region interacts with cofactors to function as a transcriptional liberator ⁇ "(Hu, X., and Lazar, MA (2000) Trends Endocrinol. Metab. 11, 6-10, etc.).
  • BS69 is a protein that directly interacts with AD of the 289 R adenovirus type 5 El A protein.
  • BS69 mediates repression, at least in part, through its interaction with the co-repressor N—COR of the MYND domain of BS69 (Masselink, H., and Bernards, R. (2000) Oncogene 19, 1538-1546.)
  • ATF-IP is a basic transcription machinery that contains RNA polymerase II holoenzyme ( TF IIE and TF IIH) (DeGraeve, F., Bahr, A., Chatton, ⁇ ., And Kedinger, C. (2000) Oncogene 10, 1807-1819) ZHX1 and ZHX3. Can act as a transcriptional repressor and can interact with these co-repressors and thus repress gene transcription.
  • both ZHX1 and ZHX3 are NF-YA interacting proteins.
  • NF-? Y co Akuchibeta one, p 300 and p 300Z cyclic AMP response elementary toe binding protein one binding protein A Correlation factor (P / CAF) is associated that force s reported Ru (Mantovani, R. (1999) Gene 239, 15-27).
  • PZCAF with histone acetyltransferase activity interacts with NF-YA to form a transcriptionally active NF-Y complex (Mantovani, R. (1999) Gene 239, 15-27). Therefore, a combination of interactions between ZHX1, ZHX3, and NF-YA appears to affect the transcriptional activity of NF-Y.
  • ZHX1 or ZHX3 can enhance or prevent the association of PZCAF with the NF-Y, and thus regulate NF-Y activity.
  • members of the ZHX family, transcriptional repressors with co-rebulators, Can be directly involved and therefore inhibit NF-Y activity.
  • ZHX proteins may participate in the regulation of some NF-Y-regulatable genes.
  • ZHX3 mRNA was found to be more highly expressed in ubiquitously expressed skeletal muscle, kidney, and testis (FIG. 2).
  • the size of ZHX3 mRNA was multiple as determined by Northern blot analysis.
  • the cloned insert contains 9,302 bp, and the size is the same as the largest transcript of ZHX3.
  • a search for the human ZHX3 gene was performed using a database compiled by the Human Genome Project, it was found to be located on chromosome 20q. This indicates that the ZHX3 gene exists as a single copy per haploid human genome.
  • the nucleotide sequence of the ZHX3 cDNA revealed that multiple polyadenylation signals were present in the 3,1 non-coding region. It is therefore likely that smaller sized mRNAs can be produced by the use of different polyadenylation signals from a single gene rather than the presence of other ZHX3-related mRNAs.
  • This region is associated with nuclear import proteins, such as importin a, and is then translocated from the cytoplasm to the nucleus (Kaffman, A., and 0 * Shea, EK (1999) Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 15, 291-339).
  • nuclear import proteins such as importin a
  • ZHX3 may be associated with other molecules to be translocated to the nucleus.

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Abstract

発明者らが既に見出していた転写リプレッサーとして機能するZHX1の生物学的役割を決定するために、酵母2−ハイブリッドシステムを用いて、ZHX1と相互作用するタンパク質の探索を行った。 その結果、新規なタンパク質をコードする全長cDNAの分子クローニング及びヌクレオチド配列を決定したところ、配列番号1から成る新規なタンパク質が見出された。このタンパク質(ZHX3)は、ZHX1と同様に、2つのジンクフィンガー(Znf)モチーフ及び5つのホメオドメイン(HDs)を含み、、転写抑制活性を有することが明らかになった。

Description

明 細 書 転写制御因子 ZHX 3 技術分野
この発明は、 転写抑制活性を有するタンパク質に関し、 より詳細には、 肝癌に 特異的な遺伝子の転写制御因子 Z HX 3に関する。 従来技術
解糖系酵素遺伝子であるピルピン酸キナーゼ (PK) M遺伝子や I I型へキソ キナ ゼ (HK I I) 遺伝子は、 正常肝では発現が抑制されているが、 肝発癌 により誘導される。 両者に共通の転写因子は、 Nuclear Factor-Y (NF— Y) であるが、 正常肝細胞と肝癌細胞における N F— Yの発現には差異が認められな い。 従って、 NF—Yと相互作用する因子が肝癌に特異的な遺伝子発現に関与し ていると考えられる。
そこで、 NF—Yで特に重要である Aサブユエット (NF—YA) と相互作用 する蛋白質の検索を行ったところ、 873個のアミノ酸から成り、 2つのジンク フィンガー (Zn f) モチーフと 5つのホメォドメイン (HD) を有する ZHX 1をクローユングしてきた (Yamada, . , Osawa, H. , and Granner, D. K. (1999) FEBS Lett. 460, 41-45)。 ZHX1は、 ホメォボックスタンノ ク質 スーパーフアミリ の Z n f クラスに属し、 ヒト ZHX 1の HD 1から HD 2領 域を含む 272〜564のアミノ酸配列は、 NF— YAの N末端グルタミンーリ ツチ ADとの相互作用に必要である(Yamada, K. , Osawa, H., and Granner, D. K. (1999) FEBS Lett. 460, 41 - 45)。 このノザンプロット分析を行つ た結果、 ZHX 1転写産物が普遍的に発現していることがわかった(Yamada, K., Printz, R. L. , Osawa, H. , and Granner, D. K. (1999) Bioc em. Biophys . Res . Commun . 261, 614-621; Hirano, S., Yamada, . , Kawata, H. , S ou, Z. , Mizutani, T. , Yazawa, T. , Kajitani, T. , Sekiguchi, T., Yoshino, M. , Shigematsu, Y., Mayumi , M. , and Miyamoto, K. (2002) Gene 290, 107-114)。 このヒ 卜 Z HX 1遺伝子は染 色体 8 q上、 マーカー CHLC. GATA5 OB 06及び CHLC. GATA7 GO 7の間に局在する (Yamada, K. , Printz, R. L., Osawa, H., and Granner, D. K. (1999) Biochem. Biop ys . Res . Commun . 261, 614-621)。 発明者らは、 この ZHX 1が転写リブレッサーとして機能し、 そし て核内に局在することを報告した(Yamada, K., Kawata, H., Matsuura, K., Shou, Z . , Hirano, S . , Mizutani, T . , Yazawa, T. , Yoshino, M. , Sekiguchi, T. , Kajitani, T. , and Miyamoto. . (2002) Biochem. Biophys . Res. Comm. 279, 368 - 374)。
なお、 後述する本発明者らが発見した新規な転写制御因子 (ZHX3) をコー ドすると思われる塩基配列を含む配列 (GenBank/XM 029734) 及ぴその一部 (DDBJ/ AB007855) は既にデータベースに登録されているが、 前者はデータべ ース上で散在していた部分配列をつなげて、 推定上の蛋白質として報告されたも のであり、 蛋白質をコードしている可能 I1生を示唆したに過ぎない。 また後者は部 分的にクローユングされていた配列である力 機能解析は行われていなかった。 即ち、 これら公開された塩基配列のコードするタンパク質が転写抑制活性を有す ることは全く知られておらず、 またこれらの開示情報から推測することも不可能 であった。 発明が解決しょうとする課題
発明者らは、 ZHX1の生物学的役割を決定することを目的として、 ZHX1 が N F— Y A以外のタンパク質と相互作用し、 そして遺伝子転写を制御するかど うかを調べた。そのため、発明者らは、酵母 2—ハイプリッドシステムを用いて、 ラット肝臓及び卵巣顆粒膜細胞の cDNAライブラリ一において ZHX 1と相互 作用するタンパク質の探索を行った。 課題を解決するための手段
その結果、 ZHX1、 転写共因子、 DNA結合タンパク質、 Zyx i n、 アン ドロゲン誘発性アルドース還元酵素のような核タンパク質、 11一 19リジン一 リッチ白血病遺伝子、 及ぴその他の未知のタンパク質がクローユングされ、 新規 なタンパク質が見出された。 この新規タンパク質をコードする全長 c DNAの分 子クローニング及びヌクレオチド配列を決定したところ、 その新規なタンパク質 は 956アミノ酸残基 (配列番号 1) から成り、 ZHX1と同様に、 2つのジン クフィンガー (Zn f) モチーフ及び 5つのホメォドメイン (HDs) を含むこ とが明らかになった。
発明者らはこの新規なタンパク質が ZHX1と共に ZHXファミリーを形成す ることと結論し、 そしてそれを ZHX 3と名付けた。 ZHXファミリ一は、 互い にホモダイマーやへテロダイマーを形成することにより、 遺伝子発現の調節に関 与していると推察される。
ZHX3は、 ZHX1及び ZHX3の両方と二量体を形成するのみでなく、 上 記 NF— YAの ADとも相互作用する。 さらに分析したところ、 この ZHX3は 核内に局在する普遍的な転写リブレッサーであり、 そして二量体として機能する ことが明らかになった。
即ち、 本発明は、 配列番号 1で表されるアミノ酸配列若しくは該アミノ酸配列 において 1若しくは数個のアミノ酸が欠失、 置換若しくは付加されたアミノ酸配 列、 又は配列番号 1で表されるァミノ酸配列の機能部分若しくは該機能部分にお いて 1若しくは数個のァミノ酸が欠失、 置換若しくは付加されたァミノ酸配列を 含むァミノ酸配列から成り、 転写抑制活性を有するタンパク質又はぺプチドであ る。
ヒトとマウスの ZHX3のアミノ酸配列を比べると、 その相同性は 85. 3% であり、ヒトとラット型 ZHX3のァミノ酸配列の相同性は 87.3 %であった。 ラット型 ZHX 3のアミノ酸配列を配列番号 2に示す。 このアミノ酸配列はヒト ZHX 3でいうところのアミノ酸配列 1 14番から 642番目までに相当する領 域と考えられる。 従って、 ZHX3のアミノ酸配列 (配列番号 1) と 85%以上 相同のアミノ酸配列を有するタンパク質はヒトの ZHX 3と同一の転写抑制機能 を有するタンパク質であると考えられる。
従って、 本発明はまた、 配列番号 1で表されるアミノ酸配列若しくは該ァミノ 酸配列に少なくとも 85 %相同のァミノ酸配列、 又は配列番号 1で表されるアミ ノ酸配列の機能部分若しくは該機能部分に少なくとも 8 5 %相同のァミノ酸配列 を含むァミノ酸配列から成り、 転写抑制活性を有するタンパク質又はぺプチドと 表すことができる。
後述の実施例でも明らかにされるが、 配列番号 1のァミノ酸配列の 3 0 3〜 5 0 2番目のアミノ酸配列はその転写抑制機能を担う部分であるといえる。従って、 上記配列番号 1で表されるアミノ酸配列の機能部分は、 配列番号 1で表されるァ ミノ酸配列の 3 0 3〜 5 0 2番目のァミノ酸配列であることが好ましい。
肝癌細胞では専ら亢進した解糖系に依存してエネルギー代謝を行っていること 、 Z HX 3が正常肝では肝癌特異的アイソザム遺伝子群の発現を抑制してお り、 癌化に伴い Z HX 3の発現が低下する力 \ 又は、 Z HX 3蛋白質が修飾され て活性を失うものと考えられる。 従って、 Z HX 3の存在を検出する物質や機能 を調節する薬剤を開発することにより、 肝癌の診断と治療へ応用することができ る。
即ち、 本発明は、 また、 上記のタンパク質又はペプチドを有効成分とする、 転 写抑制を目的とする薬剤である。 更に、 本発明は、 肝癌細胞でのみ発現する遺伝 子の転写を抑制する上記いずれかのタンパク質又はべプチドである。 この遺伝子 は I I型へキソース又はピルビン酸キナーゼ Mであってもよい。また、本発明は、 このタンパク質又はペプチドを有効成分とする肝癌の治療薬である。 更に、 本発 明は、このタンパク質又はペプチドを用いて転写抑制因子の欠如に起因する疾患、 特に肝癌を治療する方法である。
また、 本発明は、 上記いずれかのペプチド又はタンパク質を特異的に認識する ことができる抗体である。 更に、 本発明は、 この抗体を有効成分とする、 転写抑 制活性を有する薬剤のスクリーニング剤である。 図面の簡単な説明
第 1図は、 ヒト Z HX 3の推測されるアミノ酸配列のヒト Z HX 1との比較を 示す。 Z H X 3及び Z HX 1のアミノ酸配列を比較する。 2つの Z n fモチーフ 及ぴ 5つの HDをそれぞれプラスの印及ぴ下線で示す。 アステリスクはアミノ酸 同一性を示す。 破線はそれぞれのタンパク質に対応するアミノ酸配列が存在しな いときのギャップを示す。 それぞれ、 114〜642、 242〜615、 及び 4 95〜 956のヒト ZHX 3のアミノ酸配列に対応する、 クローン G 58及ぴ G 23、 並びに K I A A 0395の推測されるァミノ酸配列を示す。
第 2図は、 ヒト ZHX3 mRNAの組織分布を示す。 それぞれのレーンは、 示された組織から単離された 2 // gのポリ A+— RNAを含む。 サイズマーカー は k bで左側に示す。 レーン 1、 心臓; レーン 2、 脳; レーン 3、 胎盤; レーン 4、 m-,レ―ン 5、 I S1; レ―ン 6、骨格筋;レ―ン 7、 腎臓;レ―ン 8、膝臓; レーン 9、 脾臓; レーン 10、 胸腺;レーン 11、 前立腺; レーン 12、 精巣; レーン 13、卵巣;レーン 14、小腸;レーン 15、結腸;レーン 16、 白血球。 第 3図は、酵母 2—ハイブリッドシステム又は GSTプ^/ダウン分析を用いた、 ZHX1及び ZHX 3間の最小へテロ二量体化ドメインの同定を示す。 ヒ ト ZH XI及び GAL4 AD-ZHX1融合構築物の図解表示は左側に示す。 Z n f 及ぴ HDはそれぞれ、 ジンクフィンガーモチーフ及びホメォドメインを示す。 + 及び一のシンボルは、 GAL4 DBDに融合したヒ ト ZHX3の 242〜48 8のアミノ酸配列を発現する、 pDBD— G 23、 及び u ACT 2の組み合わせ を含む酵母と比較した、 それぞれ、 ]3—ガラクトシダーゼ活性の増加した及び変 化のない値を示す。
第 4図は、酵母 2—ハイプリッドシステム又は GSTプルダウン分析を用いた、 ZHX 1及び Z H X 3間の最小へテ口二量体化ドメインの同定を示す。 ヒ ト Z H X 3及び G A L 4 AD-ZHX3融合構築物の図角表示は左側に示す。 Z n f、 HD、 及び Eは、 それぞれ、 ジンクフィンガーモチーフ、 ホメォドメイン、 及び グルタミン酸一リッチ領域を示す。 +及ぴーのシンボルは、 GAL4 DBDに 融合したヒ ト ZHX1の全コード領域を発現する、 pDBD— ZHXl (1— 8
73 )、及び p A C T 2の組み合わせを含む酵母と比較した、それぞれ、 ーガラ クトシダーゼ活性の増加した及び変化のない値を示す。
第 5図は、酵母 2—ハイプリッドシステム又は G S Tプノレダウン分析を用いた、
ZHX 1及ぴ Z HX 3間の最小へテロ二量体化ドメィンの同定を示す。 G S Tプ ルダウン分析を用いた、 Z HX 1及ぴ Z HX 3間の in vitroのへテロ二量体化。 in vitro で翻訳された35 S—標識された、 全長ヒト Z HX 1又は Z HX 3を、 結合した GSTのみ (レーン 1、 5、 及び 8) 及ぴ GSTに融合した ZHX 3の 242〜615のアミノ酸配列(レーン 3)、 ヒ ト ZHX3 (レーン 6)又はヒ ト ZHX1 (レーン 9) タンパク質の全コード配列を含むセファロースビーズとィ ンキュベートした。 上記ビーズを激しく洗浄し、 そして結合したタンパク質を溶 出し、 そして: L O%SDS— PAGEにより分析した。 相互作用シグナルはォー トラジオグラフィーにより検出された。 レーン 2、 4、 及ぴ 7、 他のレーンで示 される上記反応に添加されたタンパク質の 10%がのせられた。
第 6図は、酵母 2—ハイプリッドシステム又は GSTプ ダウン分析を用いた、 ΖΗΧ 3の最小ホモ二量体化ドメインの同定を示す。 ヒ ト ΖΗΧ3及ぴ GAL4 AD-ZHX3融合構築物の図解表示は左側に示す。 Z n f 、 HD、 及び Eは、 それぞれ、 ジンクフィンガーモチーフ、 ホメォドメイン、 及びグルタミン酸ーリ ツチ領域を示す。 +及び一のシンボルは第 3図についての説明において示すもの と同じものを示す。
第 7図は、酵母 2—ハイブリッドシステム又は G S Tプノレダウン分析を用いた、 ZHX 3の最小ホモ二量体化ドメインの同定を示す。 GSTプルダウン分析を用 いた、 ZHX3の in vitro のホモ二量体化。 in vitro で翻訳された、 35 S —標識された、 全長ヒ ト ZHX3を、 結合した GSTのみ (レーン 2) 又は GS Tに融合したヒ ト ZHX 3タンパク質の全コード配列 (レーン 3) を含むセファ ロースビーズとインキュベートした。 続く手順は第 5図についての説明において 示されたともの同じである。 レーン 1、 他のレーンで示される上記反応に添加さ れたタンパク質の 10%がのせられた。
第 8図は、 酵母 2—ハイブリッドシステムを用いた NF— YA及び ZHX3間 の相互作用ドメインのマッピングを示す。 ヒト ZHX3及ぴ GAL4 AD— Z HX 3融合構築物の図解表示は左側に示す。 Z η ί、 HD、及ぴ Eは、それぞれ、 ジンクフィンガーモチーフ、 ホメォドメイン、 及びグ^/タミン酸一リツチ領域を 示す。 +及ぴ一のシンボルは、 GAL4 DBDに融合した NF— YAの活性化 ドメインを発現する、 ρΥΑ1— 269、 及び p ACT 2の組み合わせを含む酵 母と比較した、 それぞれ、 ーガラクトシダーゼ活性の増加した及ぴ変化のない 値を示す。 第 9図は、 酵母 2—ハイプリッドシステムを用いた NF— YA及び ZHX3間 の相互作用ドメィンのマッビングを示す。 N F一 Y A及ぴ G A L 4 D B Dに融 合したその欠失変異体の図解表示は左側に示す。 Q及び S Tは、 それぞれ、 グ ルタミン一リツチ及ぴセリン スレオ ン一リツチ領域を示す。 S I D及び D B Dは、 それぞれ、 サブユニット相互作用及び DN A結合ドメインを示す。 +及び 一のシンポルは、 ; DBD及び、 GAL4 ADに融合したヒト Z HX 3の 24 2〜488のアミノ酸配列を発現する、 pAD— ZHX3 (242— 488) の 組み合わせを含む酵母と比較した、 それぞれ、 β—ガラク トシダーゼ活性の増加 した及ぴ変化のない値を示す。
第 10図は、 ΖΗΧ 3は転写リプレッサーであることを示す。 ΗΕΚ293細 胞を 2 n gの pRL— CMV、 50 n gの (カラム上に示す) SV40プロモー ターダイレクティッド発現ベクター、 及び 100 n gの 5 XGAL4— ; GL 3 Co n t r o 1又は pGL3— Co n t r o 1レポータープラスミドで共トラン スフエタトした。 p SG424及び pGAL4— ZHX3 (1— 956) は、 そ れぞれ、 GAL4 DBDのみ及ぴ GAL4 D BDに融合したヒト Z HX 3の 全コード配列を発現する。 100 %のィ直は、 それぞれ、 50 n gの p SG424 の存在下におけるレポータープラスミドについてのプロモーター活性に示された。 第 11図は、 ZHX 3は転写リプレッサーであることを示す。 HEK293細 胞を 2 n gの pRL— CMV、 50 n gの (カラム上に示す) SV40プロモー ターダイレクティッド発現ベクター、 100 n gの 5 XGAL4— : GL 3 C o n t r o 1レポータープラスミド、 示された量の p CIVIV— ZHX 1 (242 一 432)発現プラスミドで共トランスフエクトした。 プラスミド(202 n g) の総量は、 必要であれば、 : cDNA3. lHi s— C2の添加により調節され た。 100%の値は、 50 n gの p SG424及ぴ 50 n gの p c DNA3. 1 H i s— C 2の存在下におけるレポータープラスミドのプロモーター活 1"生に示さ れた。 トランスフエクシヨン 48時間後、 上記細胞を回収し、 そしてホタノレ及ぴ ゥミシィタケルシフェラーゼ活性を決定した。 ホタルルシフェラーゼ活性は全て の実験にぉ ヽてゥミシィタケノレシフェラーゼ活†生により正規化された。 それぞれ のカラム及び棒は少なくとも 5のトランスフエクション実験の平均及び標準偏差 を示す。
第 12図は、 ZHX 3の最小リプレッサードメインの決定を示す。 SG42 4及びさまざまな pGAL4— ZHX3構築物は、 それぞれ、 GAL4 DBD のみ及び GAL4 DBDに融合したヒ ト ZHX 3のさまざまな欠失変異体を発 現する。 条件は第 10図についての説明において示されたものと同じである。 そ れぞれの力ラム及び棒は少なくとも 5のトランスフエクション実験の平均及び標 準偏差を示す。
第 13図は、 HEK293細胞における Z HX 3の細胞内局在及び核移行シグ ナルの決定を示す。 GFPのみ又は GFPの C末端に融合されたさまざまな切断 された ZHX3タンパク質をコードする、 発現プラスミド (300n g) を HE K293細胞にトランスフエタ トした。 トランスフエクシヨン 48時間後、 GF P融合タンパク質の細胞内局在を観察した。 構築物はそれぞれのパネルの上部に 示す。
第 14図は、 ZHX 3の機能ドメインを示す。 Zn f、 ジンクフィンガーモチ ーフ; HD、 ホメォドメイン; E、 グルタミン酸一リッチ領域; DD、 二量体化 ドメイン; ID、 NF—YAとの相互作用ドメイン; RD、 リプレツサードメイ ン; N L S、 核移行シグナル。 以下、 実施例により本発明を例証するが、 これらは本発明を制限することを意 図したものではない。
実施例
本実施 ί列こおレヽて、 酵母 2—ノヽイブリツドシステム、 pDsRedl— C1、X— α— gal、 ヒ ト精巣マラソン一レディ c DNA、Advantage2PCR キット、 ヒ ト Multiple Tissue Northern Blot及び BlotII、ExpressHybノヽイブリダィゼーシヨン 溶液、及び pEGFP- C1は Clontec (Palo Alto、CA)力 ら購入した。 pGEX - 4T - 2、 PGEX-5X— 1、 ひ—32 PdCTP(lllTBq/腿 ol)、 グノレタチオンーセファロ—ス 4 Βヽ 及び a s s— メ チォニ ン (37TBq/諷 ol) は Amers am Pharmacia Biotech (Cleveland,〇H)力 ら '購入した。 HEK293 糸田包、 ヒ ト台¾賢糸田包系【ま American Tvpe Culture Collection (Manassas、 VA) 力 ら購入 し 。 TRIOZOL 試薬、 Superscriptェェ、 pcDNA3.1His— C プラス ミ ド、、 及び LIPOFECTAMINE PLUSは Invitrogen (Groningen、Netherlands)力 ら購入 した。 ExTaqD皿ポリメラーゼ、 pT7Blue-T2ベクター、及ぴ BcaBestDNAラベ リングキットは TaKaRa BIOMEDICALS力、ら入手した。 pGEM— T Easyべクター、 T7 TNT Quick-結合転写 Z翻訳系、 pGL3- Control、pRL- CMV、及び二重ルシフ ェラーゼ分析系は Proiaega (Madison、 WI )力 ら購入した。 Big Dye terminator FS cycle シークェンシングキットは Applied Biosystems Japan (Tokyo、 Japan)力 ら購人した。 OPP3 IfflJJStt Stragene (La Jolla、CA)力 ら人手した。 QIAGENプラスミドキ トは QIAGEN (Hilden、 Germany)から購入した。
本実施例において行った試験の手順を以下に示す。 試験例 1 プラスミ ドの構築
PACT2B 1プラスミドを既報に従って作製した(Yamada, K., Osawa, H., and Granner, D. K. (1999) FEBS Lett. 460, 41 - 45)。
クローンィ匕された G 23プラスミド、 pAD— G23を E c oR iZXh o I 又は S f i I_ Bg 1 IIで消化し、それぞれの断片を pGEX— 4T— 2ベクタ 一の E c oR I/Xh o Iサイト又は pGBKT 7ベクターの S f i I/B am HIサイト中へサブクローユングし、 それぞれ pGST— G23及び pDBD— G 23を得た。
p AD-G 23の 250 b pの Ec oR I /H i n dill断片を pD s R e d 1— C 1の E c o R I/H i n dillサイト中へサブクローユングし、 pD s R 6 (1—逆向き023 (HD 1) を作製した。 上記 S—D s R e d 1 C 1— H i n d III (配列番号 3) 及ぴ上記 A s-D s Re d lC l-S a 1 Iオリゴヌタレ ォチド (配列番号 4) をその後、 ァユーリングし、 リン酸化し、 そして pD s R e d 1— C 1の H i n dlllZS a 1 Iサイト中へ挿入し、 pDs Re d l—C 1 E 1を得た。 pD s R e d—逆向き G23 (HD 1) の E c o R I "B g 1 II 断片を pD sRe d l— C 1E 1の E c oR I /B amH I中へサブクローニン グし、 pD s Re d— r ZHX3 (HD 1) を作製した。 生ずるプラスミ ドの E c oR I/Xh o I断片を pACT 2の E c o R I/Xh o Iサイト中へサブク ローニングし、 PAD_ZHX3 (242-488) を得た。
p B S lI- K I AA O 3 9 5は Dr.Takahiro Nagase (KAZUSA DNA RESEARCH INSTITUTE Japan)から賦与された。 上記プラスミドの 1. 2 k b の S a 1 I /A a I断片を pD s R e d l— C 1 E 1の S a 1 I /A p a Iサ イト中へサブクローユングし、 pD s Re d— ZHX3 (HD 2-5) を作製し た。生ずるものの B g l II B amH I断片をpACT 2B 1の B amH Iサイ ト中へサブクローユングし、 PAD— ZHX 3 (498-903) を得た。 p AD-ZHX 1 (142— 873)、 pAD-ZHXl (272— 8 73)、 p AD-ZHX 1 (565— 873)、 p AD-ZHX 1 (272— 564)、 p AD-ZHX 1 (272— 432)、 p AD-ZHX 1 (430— 564)、 p A D-ZHX 1 (345— 463)、 pDBD、 pYAl— 26 9、 p YA 1- 14 0、 pYA 1— 1 1 2、 pYA141— 26 9、 p YA 1 72— 269、 及び p YA 205-269を既報に従って作製した (Yamada, K. , Osawa, Η. , and Granner, D. Κ. (1999) FEBS Lett. 460, 41-45; Yamada, K. , Printz, R. L. , Osawa, H. , and Granner, D. K. (1999) Bioc em. Biophys . Res. Commun . 261, 614-621)
HE 293細胞からのトータル RNAを製造業者のプロトコルに従って TR I ZOL試薬を用いて調製した。逆転写一ポリメラーゼ鎖反応 (RT-PCR s) を若干の改変を伴って以前に示したように行った (Yamada, K., Printz, R. L. , Osawa, H. , and Granner, D. K. (1999) Biochem. Biophys . Res . Commun. 261, 614-621)。 ポリメラーゼ鎖反応 (PGR) 条件は ExT a qD NAポリメラーゼの使用を除いては、 以前に示した (Yaiaada, K., Printz, R. L. , Osawa, H., and Granner, D. K. (1999) Biochem. Biophys . Res . Commun. 261, 614-621)。 S— hZHX3— Ap a I 2 (配列番号 5) 及ぴ A s— hZHX3— STOP4 (配列番号 6)、 S_hZHX3— Nc o l (配列番 号 7)及ぴ A s—hZHX3— B smB I 2 (配列番号 8)、 S— hZHX3— M e t (配列番号 9 )及び A s -hZHX 3-Nc o I (配列番号 10)、 S _ h Z HX 3-HD 1 (配列番号 1 1 )及ぴ A s—hZHX3— HD 2 (配列番号 1 2)、 S-hZHX3-HD 1 (配列番号 1 1 ) 及ぴ A s— h Z HX 3— 1 506 (配 列番号 13)、 S-hZHX3-l 090 (配列番号 14)及ぴ As— hZHX3 -HD 2 (配列番号 12)、 S-hZHX3-HD2 (配列番号 15 )及ぴ A s— hZHX3-HD 2 (配列番号 12)、 S— hZHX3— HD 1 (配列番号 11) 及び A s -hZHX3 -HD 1 (配列番号 16 )、及び S -hZHX3N (配列番 号 17) 及ぴ As— hZHX3N (配列番号 18) の組み合わせをプライマーと して用いた。
これらの生成物を p GEM— T E a s yベクター中へサブクローユングし、 それぞれ、 pGEM—T Ea s y ZHX 3 (A p a I/STOP)N p GEM -T E a s y ZHX 3 (N c o I /B srtiB I), pGEM-T E a s y Z HX 3 (Me t /N c o I )、 p GEM— T Ea s y ZHX 3 (HD 1— 2)、 pGEM-T E a s y ZHX3 (HD 1-1506), pGEM-T E a s y ZHX3 (1090— HD2)、 pGEM-T Ea s y ZHX 3 (HD 2)、 pGEM-T E a s y ZHX 3 (HD 1 )、 及び p G EM— T Ea s y Z HX3Nを得た。
GBKT 7MC S 1 (配列番号 19) 及び GB KT 7MC S 2オリゴヌクレオ チド (配列番号 20) をアニーリングし、 リン酸化し、 そして p GBKT 7の E c o R lZB amH Iサイト中へサブクローユングし、 p G B KT 7 B 1を得た。 上記 pGEM— T Ea s y Z HX 3 (A p a I ZS T O P) の A p a I /B amH I断片を pD s R e d— ZHX 3 (HD2— 5) の Ap a lZB amHI サイト中へサブクローユングし、 pD s Re d— ZHX3 (HD 2— STOP) を得た。 pGEM— T E a s y ZHX 3 (N c o I /B s mB I ) の E c o R IZB smB I断片を pD s Re d— ZHX3 (HD2— STOP) の E c o R lZB s mB Iサイト中へサブクローユングし、 pD s Re d— ZHX3 (N c o I -STOP) を得た。
S-GBKT 7-Nd e I (配列番号 έ 1 ) 及ぴ A s— G B KT 7— N c o I オリゴヌクレオチド (配列番号 22 ) をァニーリングし、 リン酸化し、 そして p GBKT7B 1の Nd e I /N c o Iサイト中へ挿入し、 pGBKT7NENを 得た。 pD s Re d— ZHX3 (N c o l— STOP) の 2 k bの Nc o lZB amHI断片をpGBKT7NENのNc o I/BamHIサイト中へサブクロ 一ユングし、 : p GBKT 7— ZHX3 (Nc o l— STOP) を得た。 上記!) G EM-T E a s y Z HX 3 (M e t ZN c o I ) を N c o Iで消化し、 96 0 b pの断片を: GBKT 7— ZHX3 (Nc o I—STOP) の N c o Iサイ ト中へサブクローユングし、 pDBD— ZHX3 (1-956) を得た。 生ずる プラスミドを B a mH Iで消化し、 K 1 e n o w反応により平滑末端処理し、 そ してその後 E c oR Iで消化した。 上記 2. 9 k bの断片を pGEX— 5X— 1 ベクターの E c oR l/Sma lサイト中へサブクローユングし、 pGST— Z HX 3 (1-9 56) を得た。 pGST— ZHX 3 (1— 9 56) の E c oR I /Xh o I断片を pACT 2B 1の E c oR l/Xh o Iサイト中へサブクロー ニングし、 pAD— ZHX3 (1 -9 56) を得た。 PCRは S— hZHX3H D 1 (配列番号 1 1) 及ぴ As—hZHX3— HD 1— E c o (配列番号 23) の組み合わせをプライマーとして、 : DBD— ZHX3 (1 -956) を鑤 ½と して用いて行われた。 E c oR Iでの消化後、 上記断片を p ACT2B 1の E c oR Iサイト中へサブクローユングし、 pAD— ZHX3 (303-364) を 得た。
p SG424、 p SG424B l、 5 XGAL4-pGL 3 Co n t r o l , 及び p EGFP— C 1 E 1プラスミドは以前に示された(6、 1 3〜1 5)。 pD BD-ZHX 3 (1— 956) の 2. 9 k bの E c o R I ZB a mH I断片を p SG424B 1又は p EGF P— C 1 E 1ベクターの E c o R I /B a mH Iサ イト中へサブクローユングし、 それぞれ、 pGAL4— ZHX3 (1— 956) 及び pGFP— ZHX3 (1-956) を得た。 pD s R e d— ZHX 3 (HD 2— 5) の B g 1 Il/B amHI断片をp SG424B 1の B amHIサイト中 へサブクローユングし、 pGAL4— ZHX3 (498〜903) を得た。 : G EM-T E a s y ZHX 3 (HD 1-2), p GEM~T E a s y ZHX 3 (HD 1- 1 506)、 pGEM—T E a s y ZHX 3 (1090—HD 2)、 及び pGEM— T E a s y ZHX 3 (HD 2) の E c o R I /B a mH I断 片を p SG424B 1又は pEGFP— C 1 E 1ベクターの E c oR I/B am H Iサイト中へサブクローニングし、 それぞれ、 pGAL4-ZHX3 (303 -555), PGAL4-ZHX3 (303— 502)、 pGFP— ZHX3 (3 03— 555)、 p GF P-ZHX 3 (303— 502)、 p GF P-ZHX 3 (3 64— 555)、 p GF P-ZHX 3 (497— 5 55) を得た。 pGEM— T E a s y ZHX 3 (HD 1) の E c o R I /B a mH I断片を p S G 424 B 1 ベクターの E c o R I/B amHIサイト中へサブクローニングし、 pGAL4 一 ZHX 3 (303- 364) を得た。
PCRは S— hZHX3— Me t 3 (配列番号 24) 及ぴ As— hZHX3— 909 (配列番号 25)、 S-hZHX3-Me t 3 (配列番号 24 )及び A s _ hZHX3-435 (配列番号 26)、 S— hZHX3— 436 (配列番号 27) 及び A s -hZHX3-909 (配列番号 25)、 S-h ZHX 3—M e t 3 (配 列番号 24)及ぴ A s— hZHX3— 3 21 (配列番号 28)、 S— h ZHX 3— 322 (配列番号 29 )及び A s-hZHX3-435 (配列番号 26)、及び S -hZHX3- 1663 (配列番号 30) 及ぴ A s— h Z HX 3— B s mB I— 2 (配列番号 3 1) の組み合わせをプライマーとして、 pDBD— ZHX3 (1 — 956) を鎊型として用いて、 そして S— hZHX3— 1 090 (配列番号 1 4) 及び As— hZHX3— 1 506 (配列番号 1 3) の組み合わせをプライマ 一として、 pGFP— ZHX3 (303-555)を鎊型として用いて行われた。 増幅された DNAも pGEM— T E a s y又は p T 7 B 1 u e _ 2 T—ベタ ター中へサブクローユングし、 pGEM— T E a s y ZHX3 (Me t/9 09)、 p GEM-T E a s y ZHX 3 (Me t/435) p GEM-T E a s y ZHX 3 (436/909)、 p T 7B l u e— 2 T ZHX 3 (Me t/321)、 pT 7 B l u e-2 T ZHX 3 (322,435)、 p GEM -T E a s y ZHX 3 ( 1 663/2022)、 及ぴ p GEM— T E a s y ZHX 3 (1090/1 506) をそれぞれ得た。 これらのプラスミドの E c o R I /B amH I断片を p SG424 B 1又は p EGFP— C 1 E 1ベクターの E c o R I/B amH Iサイト中へサブクローユングし、 : GAL4— ZHX3 (1— 145)、 pGAL4-ZHX3 (146— 303)、 pGFP-ZH 3 (1— 303)、 pGFP-ZHX3 (1— 107)、 pGFP-ZHX3 (1 0 8— 145)、及ぴ p GFP-ZHX3 (146-303) をそれぞれ得た。 p G EM— T E a s y ZHX 3 (1090/1 506) の E c oR l/B amti I断片を p SG424B 1の Ec oR l/B a mH Iサイト中へサブクローニン グし、 pGAL4— ZHX3 (364— 502) を得た。 pGEM— T Ea s y ZHX 3 (1663/2022) の E c o R I /B s mB I断片を p D s R e d— ZHX3 (HD 2-STOP) の E c o R Iノ B s mB Iサイト中へサブ クローユングし、 pD s Re d— ZHX3 (1663— STOP) を得た。 生ず るプラスミドの Ec oR IZB amHI断片をpEGFP— C l E lのEc oR IZB amH Iサイト中へサブクローユングし、 pGFP— ZHX3 (555- 956) を得た。
H i s CMC S 1 (配列番号 32) 及び H i s CMC S 2オリゴヌクレオチド (配列番号 33) をアニーリングし、 リン酸化し、 そして p cDNA3. 1H i s— Cの Kpn I /E c oR Iサイト中へサブクローユングし、 : cDNA3. 1H i s— C 2を得た。 上記 p GST— ZHX 1 (272— 432) は以前に示 された (12)。 p GS T-ZHX 1 (272— 432) の 480b pの B amH I断片を p cDNA3. lH i s_C2の B amH Iサイト中へサブクローニン グし、 pCMV— ZHX 1 (272-432) を得た。
以上全てのプラスミドのヌクレオチド配列を DN Aシークェンサ一 3100 (Applied Biosystems}を用いて確認した。 試験例 2 ライブラリしスクリーユング
酵母転写因子 GAL 4の DN A結合ドメイン (DBD) に融合した、 ヒト ZH X 1の全コード配列を発現する、 pDBD— ZHX 1 (1— 873) (pGB T 7-ZHX1 (1— 873))、 及びラット顆粒膜細胞及び肝 c DNAライブラリ 一の構築は既報に従って行った (Hirano, S., Yamada, K. , Kawata, Η., Shou, Ζ., Mizutani, Τ., Yazawa, Τ., Ka j itani , T., Sekiguchi, T. , Yoshino, M., S igematsu, Y., Mayumi , M. , and Miyamoto, K. (2002) Gene 290, 107- 114等)。 AH 109酵母細胞を上記 p D B D— Z HX 1 (1 -873) プラスミドで形質転換した。 上記株は cDNAライブラリーをスクリ 一二ングするためのおとりとして使用された。 TE/L i Ac—に基づいた高効 率形質転換法がライブラリースクリ一エングに使用された (Yamada, K. , Wang, J.-C. , Osawa, Η·, Scott, D. K. , and Granner, D. K. (1998) BioTechnic^ies 24, 596 - 600)。 肝及び顆粒膜細胞 c DN Aライブラリーの 1 500万及ぴ 1 100万の独立のクローンがそれぞれ、 4mM 3—ァミノトリ ァゾール及び X— a— g a 1で補充された、 ヒスチジン一、 トリプトファン一、 ロイシン一、 及ぴアデニン一なしの合成デキストロースプレート上にプレートさ れた。 33及ぴ 109の陽性クローンがそれぞれ第一形質転換体から得られた。 量ィ'匕可能な 1 a c Zレポーターを含む、 上記酵母株 S FY 526、 及び p GBK T 7又は pDBD— ZHX 1 (1— 873) プラスミドのいずれかを、 第一スク リーユング又は親ベクター、 p ACT 2における陽性クローンから単離されたプ ラスミドで形質転換した。 第ニスクリ一二ングでは、 肝及び顆粒膜細胞 c D N A ライブラリーの、 それぞれ、 16及び 25のクローンが再現可能な高 —ガラク トシダーゼ活性を特に示した。 ο—二ト口フエ-ルー β _D—ガラクドシドを用 いる、計量可能な )3—ガラクトシダーゼ分析を、既報に示されたように(Yamada, K. , Osawa, H., and Granner, D. K. (1999) FEBS Lett. 460, 41-45; Yamada, K. , Printz, R. L. , Osawa, H. , and Granner, D. K. (1999) Biochem. Biophys . Res. Commun. 261, 614— 621等)、 、浸透された糸田 J3包こ ついて行つた。 それぞれの陽性クローンからのヌクレオチド配列を B L A S T配 列探索及ぴ比較プログラムを用いて G e nB a n kデータベース内に入っている ものと比較した。 試験例 3 cDNA末端の高速増幅 (RACE)
ヒト ZHX3 cDNAの 5, 末端を得るために、 ヒト精巣マラソン一レディ c DNA及ぴ Ad v a n a g e 2 PCRキットを用いて 5, 一RACE法を使用 した。 2つの遺伝子特異的プライマー、 hZHX3— 5RACE— As 1 (配列 番号 34)、 及ぴ hZHX3— 5RACE— As 2 (配列番号 35 ) を使用した。 上記 5' —RACE手順は製造業者が推奨するプロトコルに従って行われた。 増 幅された DNA断片を p GEM— T E a s yベクター中にサブクローングし、 そしてそれらのヌクレオチド配列を決定した。 試験例 4 P o l v (A) +RNAブロット分析
ヒト Mu 1 t i ρ 1 e T i s s u e No r t h e r n B l o t及び B l o t llを、 p GEM— T E a s y h Z HX 3 N プラスミドから単離された、 ヒ ト ZHX 3 c DNAの0. 6 1)の ー32 d C T P—標識 E c o R I断 片とハイブリダィゼーシヨンし、 そして B c a B e s t DNA標識キットで標 識した。 E X J) r e s s H y bハイプリダイゼーション溶液を前ハイブリダイゼ ーション及ぴハイブリダイゼーションに使用した。 前ハイブリダイゼーション、 ハイブリダイゼーション及ぴ洗浄の手順は供給者により提供されるプロトコルに 従って行われた。 試験例 5 酵母 2—ハイブリッドシステム及ぴ液体 ί3—ガラタトシダーゼ分析 ZHX 3との ZHX 1のへテロ二量体化ドメインを分析するために、 pDBD 又は PDBD— G 2 3を含む S FY5 26酵母株を、 GAL 4 ADを融合した ZHX 1のさまざまな切り取られた形態、 又は!) ACT 2で形質転換した。 ZH X 1との ZHX 3のへテロ二量体化ドメイン又は ZHXのホモ二量体化ドメイン をマッピングするために、 pDBD、 pDBD-ZHX 1 (1 -8 7 3) 又は p DBD— G 2 3を含む S FY5 26酵母株を、 GAL4 ADを融合した ZHX 3のさまざまな切り取られた形態、 又は pACT 2で形質転換した。 ZHX 3の NF—YAとの相互作用ドメインを調べるために、 1)080又は1) 1— 2 6 9を含む S FY 5 26酵母株を、 GAL 4 ADに融合された ZHX 3のさまざ まな切り取られた形態で形質転換した。 N F— Y Aの Z HX 3との相互作用ドメ インをマッピングするために、 pAD— ZHX 3 (242-488) を含む S F Y5 2 6酵母株を、 GAL 4 DBDに融合された NF— YAのさまざまな切り 取られた形態で形質転換した。
これらの 13—ガラクトシダーゼ活性は既報 (Yamada, K., Osawa, Η· , and Granner, D. K. (1999) FEBS Lett. 460, 41-45; Yamada, K. , Printz, R. L. , Osawa, H. , and Granner, D. K. (1999) Biochem. Biop ys . Res. Commun. 261, 614-621; Hirano, S. , Yamada, K. , Kawata, H., Shou, Z. , Mizutani, T. , Yazawa, T. , ajitani, T. , Sekiguchi, T. , Yoshino, M. , Shigematsu, Y. , Mayumi, M. , and Miyamoto, K. (2002) Gene 290, 107-114) 【こ示されたよう^:、 決定された。 試験例 6 グルタチオン一 S—トランスフェラーゼ (GST) プルダウン分析 pGST— ZHXl (l— 873)プラスミ ドを既報に従って作製した(Hirano, S . , Yamada, K. , Kawata, Η. , Shou, Ζ . , Mizutani, Τ,, Yazawa, Τ. , Kajitani, Τ., Sekiguchi, Τ., Yoshino, Μ. , Shigematsu, Υ. , Mayumi, Μ. , and Miyamoto, Κ. (2002) Gene 290, 107-114)。 ΤΟΡΡ 3細胞を pGEX— 5X—1、 pGST-ZHX 1 (1— 873)、 pGST— G23又は PGST-ZHX3 (1-956) 融合タンパク質発現プラスミドで形質転換し た。 上記 GST融合タンパク質の調製、 in vitroで翻訳された ZHX1の35 S 一標識及ぴプルダウン分析は以前に示された (Yamada, K., Printz, R. L., Osawa, H. , and Granner, D. K. (1999) Biochem. Biophys . Res . Commun. 261, 614-621; Hirano, S. , Yamada, K. , Kawata, H., Shou, Z., Mizutani, T. , Yazawa, T. , Kajitani, T., Sekiguchi, T. , Yoshino, M. , Shigematsu, Y. , Mayumi , M. , and Miyamoto, K. (2002) Gene 290, 107 - 114)。 上記 p D B D— Z HX 3 ( 1— 956 ) プラスミドを in vitroで翻訳された、 35 S—標識された、 Z HX 3の調製のために使用した。 最後に、 ビーズを等体積の 2 XSDSサンプル緩衝液に再懸濁し、 そしてそれぞ れの上清を前染色分子量マーカーと共に、 10°/oSDS— PAGEゲノレにのせた。 上記ゲルを乾燥させ、そして FU J I X画像化プレート(Kanagawa、 Japan)に露 出した。 相互作用シグナルを FUJ I X BAS- 2000画像分析システムを 用いて検出した。 それぞれの融合タンパク質の比較の純度及ぴ量はクマシーブリ リアントプル一 R— 250でのゲル染色により決定された。 試験例 7 細胞培養及ぴ D NAトランスフエクシヨン
HEK293細胞を 10%ゥシ胎児血清で補充した Dulbecco, s modified Eagles- medium中で 37°Cで 5 % C O 2インキュベータ一中で培養した。
DNAトランスフエクシヨンは L I POFECTAMI NE PLUS試薬を 用いて行われた。 トランスフエクシヨンに使用された全てのプラスミドは Q IA GENプラスミ ドキットを用いて調製され、 続いて C s C 1勾 ^遠心分離を行 つた。 細胞 (ゥエル当たり 5 X 104) をトランスフエクシヨンの前日に 24ゥ エルプレート中で接種した。 上記 5 XGAL4-pGL 3 Con t r o lは既 報に従って作製した (Tanaka, T., Inazu. T. , Yamada, Κ., Myint, Ζ. , Keng, V. W., Inoue, Y., Taniguchi, N. , and Noguchi, T. (1999) Biochem. J. 339, 111-117 )。 5 XGAL4— pGL 3 C o n t r o 1又は pGL3— Co n t r o lはレポータープラスミ ドとして使用された。 ZHX3 の転写活性の決定のために、 100 n gのレポータープラスミド、 211 の 1 L-CMW, 及び示された量の GAL 4 D B D— Z HX 3融合タンパク質発現 プラスミドをトランスフエタトした。 プラスミドの総量 (152 n g) を、 必要 であれば、 p SG424の添加により調節した。 ZHX 3の ZHX 1とのへテロ 二量体化の、 Z HX 3の転写活性への効果の分析のために、 100 n gのレポ一 タープラスミド、 2 n gの; RL— CMW、 50ngの GAL4 DBD融合タ ンパク質発現プラスミド、 及び示された量のヒト ZHX1のェ量体化ドメインの 発現プラスミド、 pCMV— ZHX1 (272-432) をトランスフエタトし た。 プラスミドの総量 (202n g) を、 必要であれば、 p cDNA3. 1H i s— C 2の添加により調節した。 緑色蛍光タンパク質 (GFP) —融合タンパク 質の観察のために、 300 n gの示された GFPプラスミドをトランスフエクト した。 トランスフエクシヨン 3時間後、 培地を変えた。 48時間後、 上記細胞を ノレシフェラーゼ分析にカ け又は Laser microscope (Olympus)で観察した ( 1 5 )。ホタノレ及びゥミシィタケルシフェラーゼ分析を製造業者の推奨するプロトコ ノレ(Promega) こ従って行った。 ノレシフェラーゼ活†生を Berthold Lumat model LB 9501 (Wildbadヽ Germany)により決定した。 ホタノレノレシフェラーゼ活†生 (比 較光単位) をゥミシイタケルシフェラーゼ活性により正規化した。 実施例 1
本実施例では、 Z HX 1による転写抑制の分子メ力二ズムを分析し、 ヒ ト Z H X 1が既知の又は新規の転写因子と相互作用するかという問題を調べるために、 ZHX 1相互作用タンパク質のスクリーニングを行った。 ヒト ZHX1の全コー ド配^ Jを GAL4 DBDに融合し、 そしてこのキメラタンパク質を酵母 2—ハ イブリツドシステム (試験例 5 ) を用いてラット肝及び顆粒膜細胞 c D N Aライ ブラリーをスクリーユングするためのおとりとして使用した(試験例 2)。それぞ れのライブラリーの約 1. 5 107及ぴ1. 1 X 107の独立のクローンをスク リーユングし、 そして 16及び 25クローンが再現可能な H i s+、 Ad e+、 及 び a— g a 1陽性特性をそれぞれ示した。 これらのクローンから G A L 4 AD 融合タンパク質をコードするプラスミ ドを単離した。 それらのヌクレオチド配列 の決定後、 それらを BLAST探索プログラムを用いて Ge nB a n kデータべ ースと比較した。 その結果を表 1に示す。
The ZHXl-interacttng proteins
Protein Number of clone
BS69 corepressor 9
Nuclear protein, ataxia-telangiectasia-like protein 5
Androgen-induced alsose reductase 3
ATF-IP 2
Spinocerebellar ataxia type I 2
Z xin 2
Elf-1 1
£leven-nineteen lysine-rich leukemia gene 1
ZHX1 8
unknown 8 表 1に示すように、 BS 69共リブレッサー、 核タンパク質、 毛細血管拡張性 運動失調様タンパク質、 アンドロゲンで誘発されるアルドース還元酵素、 活性化 転写因子(ATF)相互作用タンパク質(ATF— I P)、脊髄小脳性運動失調 I 型、 ジキシン、 E l f — 1、 11— 19リジン一リツチ白血病遺伝子、 及び ZH X 1が既知のタンパク質としてクローユングされた(Hirano, S., Yamada, K., Kawata, H. , Shou, Z., Mizutani, T. , Yazawa, T. , Kajitani, T. , Sekiguchi, T., Yoshino, M., Shigematsu, Y. , Mayumi, M. , and Miyamoto, K. (2002) Gene 290, 107 - 114等)。 8クローンは未知のタン パク質をコードした。 興味深いことに、 3クローン、 G23、 G58、 及ぴ L 2 6は Z n f及ぴ HDモチーフの両方をコードした。 詳細なヌクレオチド配列分析 は、 G 23のヌクレオチド配列が G 58のそれに含まれており、 そして上記ヌク レオチド配列ははじめにクローユングされたヒト KI AA0395 cDNAの それと相似性を示したことを示した。 発明者らはこの研究においてこれらのクロ ーンの分析に焦点をおいた。 K I AA0395とは異なる上記 L 26クローンは ZHX2として他の報告において現れるであろう。 次に、 ヒト K I AAO 395 cDNAの 5' —非コード配列及び残りのコード 領域を単離するために、 5' —RACE法 (試験例 3) を用いた。 遺伝子特異的 プライマー及びアダプタープライマーの組み合わせを用いて、 c DNA断片をヒ ト精巣マラソン cDNAを錶型として PC Rにより得た。 最後に、 全長 cDNA の大きさが 9, 302 b pであることが決定された。
非常に興味深いことに、 全長CDNAは965アミノ酸残基のオープンリーデ ィングフレームを有し、 そしてそのタンパク質の推定されたァミノ酸配列は Z H X 1に加えて 2つの C y s 2-H i s 2—型 Z n fモチーフ及び 5つの HDを含 む。 このアミノ酸配列を配列番号 1に示す。 発明者らはこのタンパク質を ZHX 3と呼ぶ。記号 ZHX 3は、ジンクフィンガー及びホメォボックス 3の名前から、 HUGO Nomenclature Committeeに提示された。 第 1図にこのヒト ZHX3の 推測されるァミノ酸配列のヒト Z H X 1との比較を示す。
このヒト ZHX3タンパク質は予測された分子量 104. 7キロダルトン及び 等電点 5. 68を有する。 上記 pAD— G58及び pAD— G23がそれぞれ Z HX3の 114〜642の及び 242〜615のアミノ酸配列をコードする一方 で、 上記 KI AA0395はヒト ZHX 3の 498〜 956のアミノ酸配列をコ 一ドする。 転写制御ドメインとして働きうるグルタミン酸一リツチ領域は 670 〜 710のァミノ酸配列中に存在し、 そして推定される核移行シグナルは存在し ない。 ZHX 3及ぴ ZHX 1の間のコード領域におけるヌクレオチド配列及びァ ミノ酸配列における相同性は、 それぞれ 46. 9%及ぴ 34. 4%であった。 次に、 ヒト Z HX 3 mRNAの組織分布をノザンブロット分析 (試験例 4) により決定した。 第 2図に示すように、 ヒト ZHX 3 mRNAは複数のバンド、 長さ 9. 4、 7. 3、 5. 0、 及ぴ 4. 6 kbとして検出された。 発明者らのク ローニングされた揷入物の大きさは 9, 302 b pであったので、 それは最長の 転写物とほぼ同じである。 強さは組織間でさまざまであつたが、 これらの転写物 は調べた全ての組織において観察された。 このことはヒト ZHX3 mRNAは 普遍的に発現されることを示している。 実施例 2
本実施例では、 Z H X 1のどのドメインが Z H X 3との相互作用に必要とされ るかという問題を調べるために、 ZHX 1及ぴ ZHX3の間の最小へテロ二量体 化ドメインのマッピングを行った。 酵母株 SFY526を、 GAL4 DBDの みを発現する pDBD又は GAL4 D BDに融合された Z HX 3のアミノ酸残 基 242〜6 1 5をコードする pDBD— G23で形質転換した。 上記 2つの酵 母株はレポーター酵母として使用された。 GAL4 ADのみを発現する p AC T 2又は GAL 4 ADに融合された ZHX 1のさまざまな切断された形態をコ ードするいくつかのプラスミドは獲物プラスミドとして使用された。 pDBDを 含むレポーター酵母をこれらの獲物プラスミドで形質転換したとき、 それらは低 /3_ガラクトシダーゼ活个生を示した(データは示していない)。 さらに、 pDBD 一 G23を含むレポーター酵母を pACT2、 p AD-ZHX 1 (56 5— 87 3)、 p AD-ZHX 1 (430— 564)又は p AD— ZHX 1 (345— 46 3) で形質転換したとき、 これらの酵母も低 —ガラクトシダーゼ活性を示した (第 3図)。 対照的に、 上記酵母を pAD— ZHX 1 (142— 873)、 p AD -ZHX 1 (272— 873)、 p AD-ZHX 1 (272-564) 又は pAD -ZHXl (272— 43 2) で形質転換したとき、 高 ]3—ガラクトシダーゼ活 性が観察された。 上記 pAD— ZHX l (272-432) は ZHXlの 242 〜43 2のアミノ酸残基をコードする。
次に、 ZHX 3のどのドメインが ZHX 1との相互作用に必要とされるかの問 題を決定した。 酵母株 SFY526を、 GAL4 D B Dに融合された Z HX 1 の全コード配列をコードする pDBD— ZHX 1 (1-873) 又は pDBDで 形質転換した。 上記 2つの酵母株はレポーター酵母として使用された。 上記 pA CT 2又は GAL 4 ADに融合された ZHX 3のさまざまな切断された形態を コードするいくつかのプラスミドは獲物プラスミドとして使用された (第 4図)。 pDBDを含むレポータ一酵母をこれらの獲物プラスミドで形質転換したとき、 それらは低 /3—ガラクトシダーゼ活性を示した(データは示していない)。これら の酵母は pDBD— ZHX 1 (1-873) を含むレポーター酵母を p AD— G 23又はpAD— ZHX3 (242-488) で形質転換したときのみ、 高 j3— ガラクトシダーゼ活性を示した。 上記 pAD— ZHX3 (242— 488) は Z HX3の 242〜488のアミノ酸残基をコードする。
これらの結果は ZHX 1及ぴ ZHX 3は HD 1を含むそれぞれの領域を通して へテ口二量体化することを示す。
次に、 ZHX1及び ZHX 3の間の特異的相互作用を実証するために in vitro GSTプノレダウン分析 (試験例 6) を行った。 発明者らは 4つのプラスミド、 G 3丁のみを発現する 0£ ー5 ー1、 GSTに融合されたヒト ZHX3の 2 42〜6 1 5のアミノ酸配列をコードする pGST— G23、 GSTに融合され たヒト ZHX3タンパク質の全コード領域を発現する pGST— ZHX 3 (1— 956)、及び GSTに融合されたヒト ZHX1タンパク質の全コード領域を発現 する pGST— ZHX 1 (1 -873) をそれぞれ使用した。 これらのタンパク 質を大腸菌で発現させ、 そしてグルタチオンーセファロースビーズに固定した。 上記 in vitroで翻訳した、 35 S—標識した、 全長ヒ ト ZHX 1は、 GST— G. 23及ぴ03丁一∑^[ 3 (1-956) に結合するが、 GSTのみには結合し ないことがわかった (第 5図、 レーン 3及び 6)。 さらに、 上記 in vitroで翻 訳した、 35S—標識した、 全長ヒ ト ZHX3は GST— ZHX 1 (1— 873) に結合するが、 GSTのみには結合しないことがわかった (第 5図、 レーン 9)。 対照的に、 プログラム化されていない網状赤血球溶解物は上記タンパク質のいず れにも結合しなかった (データは示していない)。
これらの結果は、 ZHX 1は in vivo及び in vitroの両方で、 ZHX 3と へテ口二量体を形成することができることを示す。 実施例 3
本実施例では、 Z HX 1はホモ二量体を形成するので、 酵母 2—ハイブリッド システム (試験例 5) を用いて ZHX 3のホモ二量体の形成を調べるために、 Z HX3の最小ホモ二量体化ドメィンのマッビングを行った。 p D B D又は p D B D-G23を含む 2つの SFY526酵母株をレポーター酵母として使用した。 発明者らはさまざまな獲物プラスミド、 pACT 2、 pAD— G23、 及ぴ pA D-ZHX3 (242— 488)、 p AD-ZHX 3 ( 303— 364 )、 及び p AD-ZHX 3 (498-903) をそれぞれ調製した。 これらのプラスミドを レポーター酵母に形質転換し、 そして ーガラタトシダーゼ活性をそれぞれの場 合において決定した(第 6図)。 pDBDを含むレポーター酵母を上記プラスミド で形質転換したとき、 それらは低 13—ガラクトシダーゼ活性を示した (データは 示していない)。 さらに、 £)080— 023を含むレポーター酵母を1) 〇丁2、 p AD-ZHX 3 (303— 364)、 及び pAD— ZHX3 (498— 903) で形質転換したときも、 非常に低い 一ガラクトシダーゼ活性が検出された。 対 照的に、 pAD_G23又は pAD— ZHX3 (242— 488) で形質転換し た酵母は高 ]3—ガラタトシダーゼ活性を示した。 これらの結果は、 Z HX 3は 2 42〜 488の領域を介してホモ二量体を形成することができることを示す。 次に、 ZHX 3のホモ二量体化を実証するために in vitro GSTプルダウ ン分析を行った。 発明者らは 2つのプラスミド、 pGEX— 5X—1及ぴ pGS T-ZHX3 (1-956) をそれぞれ使用した。 これらのタンパク質を大腸菌 で発現させ、 そしてダルタチオン一セファロースビーズに固定した。 上記 in vitroで翻訳された、 35 S—標識された、全長ヒト ZHX3は GST— ZHX3 (1 -956)に結合するが GSTのみには結合しないことがわかった(第 7図)。 対照的に、 プログラム化されていない網状赤血球溶解物は上記タンパク質のいず れにも結合しなかった (データは示していない)。 これらの結果は、 ZHX3は in vivo及び iv vitroでホモ二量体を形成することができることを示す。 実施例 4
本実施例では、 Z HX 3が NF— YAの ADとも相互作用することを調べた。 ヒト ZHX 1ははじめに NF— YAと相互作用するタンパク質としてクローェ ングされた (Yamada, K. , Printz, R. L. , Osawa, H., and Granner, D. K. (1999) Biochem. Biophys . Res. Co扁 un. 261, 614 - 621)。 本実施 例では、 ZHX3の NF—YAとの相互作用を酵母 2一ハイブリッドシステム(試 験例 5) を用いて調べた。 発明者らはそれぞれ pDBD又は pYAl— 269で 形質転換した 2つのレポーター酵母株を使用した。 上記 p Y A 1— 269は GA L4 DBDと融合した NF— YAの ADを発現する。 上記 pACT2、 p AD 一 G23、 p AD-ZHX 3 (498— 903)、 p AD-ZHX 3 (242— 4 88)、 p AD-ZHX3 ( 303— 364)、 及ぴ p AD— Z HX 3 (1— 95 6) をレポーター酵母株に形質転換し、 そしてそれらの /3—ガラクトシダーゼ活 性を決定した。 pDBDを含むレポーター酵母をこれらのプラスミドで形質転換 したとき、 それらの |3—ガラクトシダーゼ活性はかなり低いことがわかった (デ ータは示していない)。第 8図中に示すように、 p YA1— 269を含むレポータ 一酵母を pACT2、 p AD-ZHX 3 (498— 903) 又は pAD— ZHX 3 (303-364) で形質転換したときも、 それらの —ガラクトシダーゼ活 性低かった。 しかしながら、 上記酵母を pAD— G23、 pAD-ZHX3 (1 — 956) 又は pAD_ZHX3 (242-488) で形質転換したとき、 高い 値の β—ガラクトシダーゼ活性が検出された。 これらの結果は、 Ζ ΗΧ 3は N F — ΥΑの ADと相互作用し、 そして残基 242〜488のアミノ酸配列がこの相 互作用に重要であることを示す。
次に、 酵母 2—ハイブリッドシステム (試験例 5) を用いて NF— ΥΑの ΖΗ X 3との最小相互作用ドメインを同定した。 第 9図に示すように、 NF— ΥΑの A Dはそれぞれグルタミンーリツチ及びセリン/スレオニン一リッチドメインか ら成る。 PAD— ZHX3 (242-488) を含む S FY 526酵母株がレポ 一ター酵母として使用された。 GAL4 DBDに融合された NF— YAの切断 された形態を発現する、 さまざまなプラスミドを上記酵母に形質転換し、 そして それらの ガラクトシダーゼ活性を決定した。 その結果、 どちらも NF— YA の 141〜269のアミノ酸配列を含む、 : YAl— 269又は pYAl 41- 269を含む酵母のみが高レ、値の 一ガラタトシダーゼ活性を示した。 これらの 結果は、 NF— YAのセリン /スレオニン一リツチ ADは ZHX3との最小相互 作用ドメインを表すことを示す。 実施例 5
本実施例では、 ZHX 3が転写リプレッサーであることを確認するために、 哺 乳類のヮンハイブリッドシステム (試験例 7 ) を用いて Z HX 3の転写の役割を 決定した。 GAL4—結合部位の 5つのコピーが pGL 3— C o n t r o 1の S V40プロモーターの上流に揷入された、 上記 5 XGAL4-pGL 3 C o n t r o 1プラスミドを、 レポータープラスミドとして使用された(14)。 2つのェ フエクタ一プラスミド、 GAL4 DBDのみを発現する p SG424、 及び G AL4 DBDの C末端に融合されたヒト ZHX 3の全コード領域を発現する p GAL4-ZHX3 (1 -956) を調製した。 第 10図及び第 1 1図に示すよ うに、 5 XGAL4— pGL 3C o n t r o 1及びさまざまな量の p G A L 4— ZHX 3 (1- 956) を HEK293細胞中に共トラスフエタトしたとき、 上 記ルシフェラーゼ活性は用量依存的な様式で減少された。 上記最高阻害は 50 n gの PGAL4— ZHX 1 (1— 956) で得られた。 対照的に、 GAL4—結 合部位の 5つのコピーを欠く上記 p GL 3— C o n t r o 1を p SG424又は PGAL4-ZHX3 (1— 956) でトラスフエタトしたとき、 上記ルシフエ ラーゼ活性は変化しなかった(第 10図)。 これらの結果は、上記 GAL4— ZH X 3融合タンパク質は GA L 4結合部位依存的な様式でルシフェラーゼ活性を減 少させることを示し、 ZHX3は転写リブレッサーとしてはたらくことを示す。 発明者らはその後 ZHX3の ZHX 1とのへテロ二量体化はその転写リプレツ サー活性に必要であるかどうかの問題を調べた。 発明者らは、 ZHX1の 272 〜423のアミノ酸配列が発現される、 pCMV— ZHX3 (272— 432) を調製した。この領域は ZHX 1の ZHX3との二量体化ドメインと一致する 1S ZHX 1のリプレッサードメインは含まない (Yamada, K., Kawata, H., Matsuura, K. , Shou, Ζ . , Hirano, S . , Mizutani, Τ. , Yazawa, Τ., Yoshino, Μ. , Sekiguchi, Τ . , Kajitani, . , and Miyamoto . Κ. (2002) Biochem. Biophys . Res. Comm. 279, 368-374 )。 従って、 このタンノ ク 質の過剰発現は ZHX 1のドミナントネガティブ形として機能する。 上記プラス ミドを上記分析システムにおいて共トラスフエクトしたとき、 上記ルシフェラー ゼ活性は用量依存的な様式で増加された (第 1 1図)。 対照的に、 p cDNA3. 1H i s C— 2の共トランスフエクトはルシフェラーゼ活性に全く影響しなかつ た。 これらの結果は、 ZHX3の ZHX 1とのへテロ二量体化はリプレッサー活 4の必要条件であることを示す。
最後に、 ZHX 3の最小リプレッサードメインを決定するために、 上記 5 XG AL4-pGL 3 Co n t r o 1をさまざまなプラスミド、 pGAL4— ZHX 3 (1— 145)、 pGAL4-ZHX3 (146— 303)、 p GAL 4-ZH X 3 (303— 555) 又は pGAL4— ZHX3 (498— 903) でトラン スフエタトした(第 1 2図)。残基 303〜555のアミノ酸配列を発現する pG AL4-ZHX 3 (303— 555) のみが、 ルシフェラーゼ活性における減少 を引き起こした。
より詳細な分析のために、 発明者らはエフェクタープラスミド、 : pGAL4— ZHX3 (303— 502)、 pGAL4-ZHX 3 (303- 364) 又は pG AL 4-ZHX 3 (364-502) を調製した。 : GAL4— ZHX 3 (30 3-502) を上記レポータープラスミドでトランスフエタトしたときのみ、 上 記ノレシフェラーゼ活性は減少された(第 1 2図)。 これらの結果は、 Z H X 3の残 基 303〜 502のァミノ酸配列はリプレッサー活性に重要であることを示す。 実施例 6
本実施例では、 ZHX 3タンパク質の細胞内局在を調べるために、 GFP— Z HX3融合タンパク質発現系を使用して、 Z HX 3の細胞内局在の決定及び核移 行シグナル (NLS) のマッピングを行った。 このため、 GFPに融合したZH X 3のさまざまな切断された形態を調製した。 これらのプラスミドを HEK29 3細胞中にトランスフエクトし、 そして GFP融合タンパク質の細胞内局在を観 察した。 GFPタンパク質のみをコードする pEGFP— C 1 E 1は細胞全体に おいて観察された(第 1 3図)。対照的に、全長 ZHX3が GFPの C末端に融合 された GFP— ZHX3 (1-956) は核内に局在した。 2«[ 3の:^1^3を 決定するために、 さまざまなプラスミドをトランスフエタトした。 pGFP— Z HX 3 (1— 303)、 pGFP-ZHX 3 ( 303— 555 )、 及び p G F P— ZHX3 (555-956) をトランスフエタトしたとき、 pGFP— ZHX3 (1— 303) 及び pGFP— ZHX 3 (303— 555) の両方が核内に局在 した。 対照的に、 pGFP— ZHX3 (555-956) をトランスフエタ トし たとき、 上記タンパク質は核外に局在した。 これらの結果は、 ZHX3は 2つの NL S及び核輸出シグナル (NES) を含むことを示す。 最小の N L S sをマツ ビングするために、 さまざまなプラスミドを構築した。 3のプラスミド、 pGF P-ZHX3 (1— 107)、 pGFP-ZHX3 ( 364— 555 )、 及び p G FP-ZHX3 (497- 555) をトランスフエタトしたときのみ、 ZHX3 の核局在が観察された。 これらの結果は、 ZHX3は GFP融合タンパク質とし て核内に局在することができ、 そして ZHX3の 2つの NL Sはそれぞれ 1~1 07、 及ぴ 49 7〜 555のァミノ酸配列に位置することを示す。 上記実施例にて、 ZHX—1相互作用タンパク質の探索を行い、 主にそれらの うち新規転写リブレッサー ZHX3を分析し、 そしてその機能ドメインをマツピ ングした。 ZHX 3の最小機能ドメインは第 14図に要約される。 ZHX1はも ちろん、 ZHX 3は 2つの Z n fモチーフ及び 5つの HDを含み、 ホモ二量体を 形成し、 NF— YAの ADと相互作用し、 そして核内に局在する。 さらに、 ZH X3 mRNAは普遍的に発現される。 この発見から、 発明者らは、 ZHX 1及 び ZHX 3の両方が同じファミリー、 すなわち、 ZHXファミリーの構成員であ ることを結論づけた。 ZHX 1及ぴ ZHX3の全アミノ酸配列の相同性は 34. 4%であったが、 上記 2つの Zn fモチーフ及ぴ 5つの HDは高く保存されてい た。 ZHX 1及ぴ ZHX 3の間の Z n f 1、 Zn f 2、 HD 1、 HD 2、 HD 3、 HD 4、及び HD 5のァミノ酸配列における相同性は、それぞれ 50. 0、 45. 5、 6 1. 7、 50. 0、 53. 3、 43. 3、 及び 33. 3%であった。 上記 HD4は他のドメインよりも非常に低い相同性示した。 独特のグルタミン酸一リ ツチ酸性領域が ZHX 3の残基 670〜71 0のアミノ酸配列中に局在する (第 1図及ぴ第 9図)。 一般的に、上記 Z n fモチーフ、 HD、及び酸性領域は転写因 子の機能特性に責任がある。 例えば、 60アミノ酸から成る、 上記 Zn fモチー フ及び HDの両方は同族の DNA配列に結合するのに必要とされ、 上記グルタミ ン酸一リツチ領域は転写活性に関係し、 そして塩基性領域は上記 D B D又は N L Sでめる (Gehring, W. J., Affolter, M., and Burglin, T. (1994) Annu. Rev. Biochem. 63 , 487-526 等)。
ZHX 3は ZHX 1とへテロ二量体を形成するのみでなく、 ホモ二量体をも形 成する。 ZHX 3の242〜488のアミノ酸配列はこれらの二量体化に必要及 び十分である (第 3図〜第 7図)。 ZHX 1の ZHX3とのホモ及びへテロ二量体 化の最小ドメインは ZHX 1の 272〜432のアミノ酸配列にマッピングされ た(第 3図〜第 5図)。 これらの領域は HD 1を含む力 S、 HD1のみは二量体化で きない(第 3図〜第 9図)。 HD1を含むより広範な領域が二暈体化に必要とされ る。 さらに、 ZHX3及ぴ ZHX 1の両方が NF—YAの ADと相互作用する; 前者は上記 N F— Y Aのセリン スレオニン一リツチ ADと、 そして後者はダル タミンーリツチ ADとそれぞれ相互作用する (第 8図、第 9図)。. ZHX3のNF 一 Y Aの ADとの相互作用ドメインは ZHX 3の二量体化ドメインと同じ領域に マッピングされた (第 8図、第 9図)。 対照的に、 ヒト ZHX1の HD1〜HD2 領域を含む 272〜5 64のアミノ酸配列はその相互作用に必要とされる (Yamada, . , Osawa, H. , and Granner, D. K. (1999) FEBS Lett. 460, 41-45)。 ZHX 1の ZHX 3とのへテロ二量体複合体が NF—YAの異な る A Dと相互作用するかどうかの問題は決定されないままである。
ZHX 3は転写リプレッサーである (第 10図〜第 12図)。 ZHX3の最小リ プレッサードメインは二量体化及び相互作用ドメインの両方と重なる領域にマツ ビングされる。 興味深いことに、 ZHX1のへテロ二量体化ドメインの過剰発現 は、 リプレッサー活性には責任はないが、 ZHX 3のリプレッサー活^における 減少を引き起こした(第 11図)。 このことは、 ZHX 3は本質的にリプレッサー 活性をもたず、 そして上記観察された活性は二量体化のパートナーである、 リプ レッサードメインが酸性領域の C末端に局在する (Yamada, K., Kawata, H., Matsuura, K. , Shou, Ζ . , Hirano, S., Mizutani, T. , Yazawa, Τ . , Yoshino, Μ. , Sekiguchi, Τ·, Ka itani, Τ., and Miyamoto . Κ. (2002) Biochem. Biophys . Res. Comm. 279, 368-374) ZHX 1のリプレッサー 活 1 "生に因るものであることを示唆する。 しかしながら、 ZHX3の二量体化ドメ インは真実にリブレッサー活性を有することを証明することはできない。 ZHX 3が DNA結合タンパク質であるかどうかは明らかでない。 その結果として、 H D 1領域を含む Z HX 3の領域は多面発現性のドメイン;ホモ及び Z HX 1との ヘテロ二量体化ドメイン、 NF— YAの ADとの相互作用ドメイン、 及ぴリプレ ッサードメインであるように見える。 転写制御領域は転写リブレッサ^"として機能するために共因子と相互作用する (Hu, X., and Lazar, M. A. (2000) Trends Endocrinol . Metab. 11, 6- 10等)。 これらの共因子は mS i n 3 A/B, ヒストンデァセチレース、 及び 受容体転写の核共リプレッサー(N— C o R)/サイレンシング仲介物質を含む。 ZHX1相互作用タンパク質として、 発明者らは 2つの共リプレッサー、 BS 6 9及び ATF— I P (表 1)をクローニングした(Hateboer, G., Gennissen, A. , Ramos, Υ. F. Μ. , Kerkhoven, R. Μ. , Sonntag-Buck, V., Stunnenberg, Η. G. , and Bernards . R. (1995) EMBO J. 14, 3159-3169 等)。 B S 69ははじめに 289 Rアデノウイルスタイプ 5 E l Aタンパク質の ADと直接相互作用するタンパク質として同定された。 BS 69は、 少なくとも 部分的には、 B S 69の MYNDドメインの共リプレッサー N— C o Rとの相互 作用を通して、 抑制を仲介することも報告されている (Masselink, H., and Bernards, R. (2000) Oncogene 19, 1538-1546)。 対照的に、 ATF— I Pは、 RN Aポリメラーゼ I Iホロェンザィムを含む、 基本の転写機構 (TF I I E及び TF I I H)のいくつかの成分と相互作用する(DeGraeve, F., Bahr, A. , Chatton, Β., and Kedinger, C. (2000) Oncogene 10, 1807 - 1819)。 ZHX1及び ZHX3が転写リプレッサーとしてはたらくとき、 これらの共リプ レッサーと相互作用することができ、 それゆえ遺伝子転写を抑制する。
さらに、 ZHX 1及ぴ ZHX3の両方は NF— YA相互作用タンパク質である。 NF— Yは共ァクチベータ一、 p 300及び p 300Z環状 AMP応答エレメン トー結合タンパク質一結合タンパク質一関連因子 (P/CAF) と関連すること 力 s報告されて ヽる (Mantovani, R. (1999) Gene 239, 15—27)。 特に、 ヒ ストンァセチルトランスフェラーゼ活性を伴う PZCAFは NF— YAと相互作 用し、転写的に活性な NF—Y複合体を形成する(Mantovani, R. (1999) Gene 239, 15-27)。 それゆえ、 ZHX1、 ZHX 3、 及び NF— YA間の相互作用の 組み合わせは N F一 Yの転写活性に影響するようである。 例えば、 Z H X 1又は ZHX3のどちら力、 又は両方は、 PZCAFの上記 NF— Yとの関連を高め又 は妨害することができ、 それゆえ NF— Y活性を制御する。 さらに、 共リブレツ サーを伴う転写リプレッサー、 ZHXファミリーの構成員は、 上記 NF— YAと 直接関連することができ、 それゆえ、 NF— Y活性を阻害する。 どちらの場合に おいても、 Z H Xタンパク質カ^、くつかの N F— Y制御可能な遺伝子の制御に参 加する可能性がある。
ZHX3 mRNAは普遍的に発現される力 骨格筋、 腎臓、 及び精巣におい てより高く発現されることがわかった (第 2図)。 ZHX3 mRNAの大きさは ノザンブロット分析により決定されるように複数であった。 クロー-ングされた 挿入物は 9, 302 b pを含み、 そして上記大きさは ZHX 3の最も大きな転写 物と同じである。 ヒト ZHX 3遺伝子の探索がヒトゲノムプロジェクトにより編 集されたデータベースを用いて行われたとき、 それは染色体 20 qに局在するこ とがわかった。 このことは、 ZHX 3遺伝子はハプロイドヒ トゲノム当たり単一 のコピーとして存在することを;^す。 ZHX3 c DNAのヌクレオチド配列は、 複数のポリアデニル化シグナルが 3, 一非コ一ド領域内に存在することを明らか にした。 それゆえ、 より小さな大きさの mRNAは、 他の ZHX3関連の mRN Aの存在よりもむしろ単一の遺伝子からの異なるポリアデニル化シグナルの使用 により産生されうるようである。
ZHX3の全コード領域が上記 GF Pの C末端に融合されたとき、 それは核内 に局在した (第 13図)。 ZHX3の2っのNLS、 それぞれ 1〜107、及ぴ 4 97〜555のアミノ酸配列があった。 その一方で、 上記 GFPに融合された Z ΗΧ· 3の 498〜 956のァミノ酸配列は細胞全体ではなく、 核外に排他的に局 在する。 GFPのみ又は NLSを欠く GFP— ZHX 1融合タンパク質は細胞全 体に局在する (第 13図)。 このことは、 ∑«[ 3の領域は £3を含むことを示 す。それゆえ、 ΖΗΧ 3は 1つの分子内に 2つの NLS及び 1つの NE Sを含む、 より複雑なタンパク質である。 ZHX 1を含む多くの他のタンパク質においては、 上記 N L Sは塩基ァミノ酸残基のクラスターにマッピングされたことが報告され て ヽる Yamada, K. , Kawata, H. , Matsuura, Κ. , Shou, Ζ., Hirano, S., Mizutani, T., Yazawa, T. , Yoshino, Μ. , Sekiguchi, Τ. , Kajitani, Τ. , and Miyamoto . Κ. (2002) Biochem. Biophys . Res. Co腿. 279, 368 - 374等)。 この領域はインポルチン aの如き、 核輸入タンパク質と関 連し、そしてそれから細胞質から核へ移行される (Kaffman, A., and 0* Shea, E. K. (1999) Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 15, 291 - 339)。 し力、しな がら、 2^1 3の2っの]^1^は塩基性領域には局在せず、 そして以前に報告さ れた NE Sとは相同 1"生を示さないので、 ZHX 3は核へ移行されるための他の分 子と関連しうる。

Claims

請 求 の 範 囲
1 . 配列番号 1で表されるァミノ酸配列若しくは該ァミノ酸配列にぉ 、て 1若 しくは数個のアミノ酸が欠失、 置換若しくは付加されたアミノ酸配列、 又は配列 番号 1で表されるァミノ酸配列の機能部分若しくは該機能部分において 1若しく は数個のァミノ酸が欠失、 置換若しくは付加されたァミノ酸配列を含むァミノ酸 配列から成り、 転写抑制活性を有するタンパク質又はぺプチド。
2 . 前記機能部分が、 配列番号 1で表されるァミノ酸配列の 3 0 3〜 5 0 2番 目のアミノ酸配列である請求項 1に記載のタンパク質又はぺプチド。
3 . 請求項 1又は 2に記載のタンパク質又はペプチドを有効成分とする、 転写 抑制を目的とする薬剤。
4 . 肝癌細胞でのみ発現する遺伝子の転写を抑制する請求項 1又は 2に記載の タンパク質又はべプチド。
5 . 前記遺伝子が I I型へキソース又はピルビン酸キナーゼ Mである請求項 4 に記載のタンパク質又はぺプチド。
6 . 請求項 4又は 5に記載のタンパク質又はべプチドを有効成分とする肝癌の 治療薬。
7 . 請求項 1又は 2に記載のぺプチド又はタンパク質を特異的に認識すること ができる抗体。
8 . 請求項 7に記載の抗体を有効成分とする、 転写抑制 性を有する薬剤のス クリーニング剤。
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