WO2002051797A1 - Nouveau monomere d'acide nucleique peptidique fonctionnel et procede de production correspondant - Google Patents

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Hisafumi Ikeda
Isao Saito
Fumihiko Kitagawa
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Applied Biosystems Japan Ltd
Hisafumi Ikeda
Isao Saito
Fumihiko Kitagawa
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Definitions

  • the present invention relates to a functional peptide nucleic acid monomer having a novel structure and a method for producing the same.
  • Nucleic acids are DNA and RNA that control the genetic information of an organism.
  • PNA peptide nucleic acid
  • Figure 1 Nucleic acids are DNA and RNA that control the genetic information of an organism.
  • PNA peptide nucleic acid
  • Figure 1 N- (2-aminoethyl) glycine skeleton
  • the sugar phosphate backbone of DNA / RNA is negatively charged under neutral conditions, and there is electrostatic repulsion between complementary strands.However, since the spinal structure of PNA originally has no charge, electrostatic repulsion occurs. Absent. Therefore, PNA has higher duplex forming ability and higher nucleotide sequence recognition ability than conventional nucleic acids. Further, since PNA is very stable and is not decomposed to nuclease / protease in vivo, application to gene therapy as an antisense molecule is being studied.
  • DNA microarray technology for high-speed and large-scale systematic analysis of genetic information
  • Molecular Beacon recently developed as a probe that can detect specific recognition of a base sequence by fluorescence emission It is possible to apply to. Since these all use DNA, which has poor enzyme resistance, as a medium, strict sampling is required when using these techniques. Satisfying this requirement is the key to advance the above technology.
  • the method for synthesizing Fmoc-type PNA monomer units has already been established, and the synthesis of the oligomer can be performed by a general automatic DNA synthesizer.
  • the PNA has the following tB0c-type PNA monomer unit:
  • the functional molecule to be introduced is not compatible with the conditions of the magnetic force.
  • the tBoc-type PNA spine structure which does not use the Alkyli condition, is highly useful because it is often stable.
  • the present inventors have already filed a patent application for “method for producing t-butoxycarbonylaminoethylamine and an amino acid derivative” as Japanese Patent Application No. 2000-266683.
  • an object of the present invention is to provide a novel functional PNA monomer which has solved the above-mentioned problems and an efficient method for synthesizing the same.
  • an ⁇ -amino acid derivative 8 is used in the PNA spine structure to condense with an active ester 7 containing a penfluorofluorinated group 1 to synthesize a photofunctional PNA monomer 4 almost quantitatively.
  • an active ester 7 containing a penfluorofluorinated group 1 to synthesize a photofunctional PNA monomer 4 almost quantitatively.
  • R represents H, N0 2, NH 2, NHCbz ;, Br, F, is CI or S0 3 Na 2, n is an integer of 1 to 4.
  • the present invention provides a method for producing a functional PNA monomer comprising reacting t-butoxycarbonylaminoethylamine with a derivative of an organic molecule and introducing the functional molecule into a PNA monomer. And a derivative of the functional molecule is an active ester.
  • the active ester is represented by the following general formula (II)
  • R represents H, N0 2, NH 2, NHCbz, Br, F, is CI or S0 3 Na 2, n is an integer from 1 to 4)
  • carbonyl carbon forming an ester bond has a group represented by the formula:
  • the present invention relates to the above-mentioned production method, wherein the active ester has a pentafluorofluorooxy group or a succinimidoxy group on a carbonyl carbon.
  • the present invention relates to a method for producing an active ester, comprising the steps of:
  • the present invention relates to the above method, which comprises a reaction between a boronic acid derivative and a compound having a penfluorofluorophenoxy group or a succinimidoxy group.
  • the present invention relates to a method for producing a carboxylic acid derivative of a functional molecule, comprising a reaction between the derivative of the functional molecule and an aliphatic carboxylic acid.
  • the present invention provides a method for producing a derivative of a functional molecule from a functional molecule, producing a sulfonic acid derivative of a functional molecule from the derivative of the functional molecule,
  • R 1 is a hydrogen atom or a linear or branched alkyl group having 1 to 5 carbon atoms, and m represents an integer of 1 to 11
  • the active ester is represented by the following general formula (II):
  • R represents H, an N_ ⁇ 2, NH 2, NHCbz, Br , F, CI or S0 3 Na 2, n is an integer from 1 to 4)
  • carbonyl group forms an ester bond directly or via an aliphatic chain or a peptide chain.
  • the present invention relates to the above-mentioned production method, wherein the active ester has a penfluorofluorophenoxy group or a succinimidoxy group on the carbonyl carbon.
  • the present invention provides a method for producing a functional PNA monomer from a functional molecule, the method comprising producing an active ester from a functional molecule and producing a functional PNA monomer from the active ester.
  • the production of an active ester from a molecule is performed by reacting m-methyl red with a compound containing a succinimidoxy group, and / or the production of a functional PNA monomer from the active ester is represented by the general formula (III). Reacting a benzyloxycarbonyl ⁇ -amino acid derivative with a derivative of a functional molecule that is an active ester, and introducing the functional molecule into a monomer.
  • R 1 represents a hydrogen atom or a linear or branched alkyl group having 1 to 5 carbon atoms, and m represents an integer of 1 to 11
  • the derivative Since a linker (carboxylamino acid) is previously bonded to the benzyloxycarbonyl- ⁇ -amino acid derivative represented by the formula, the derivative is rich in versatility, and by reacting the active ester form with the derivative, The desired functionality can be obtained in one process.
  • many commercially available benzyloxycarbonyl-1 ⁇ -amino acid derivatives can also be used. Therefore, the route C is particularly effective when targeting relatively expensive photofunctional molecules.
  • the monomerization of photofunctional molecules such as sulfonic acid chlorides and methyl red having a large steric hindrance is more preferably performed by the route.
  • photofunctional monomer units such as Naphthalimide type, Flavin type, Dabcyl type, Biotin type, FAM type, Rhodamine type, TAM type, R0X type, HABA type, Pyrene type, Coumarin type can get. It is also possible to obtain a photofunctional monomer unit other than these and a functional monomer unit other than the photofunctional monomer unit. Both are possible.
  • FIG. 1 is a diagram showing the difference between the structures of DNA and PNA and the state of charge.
  • FIG. 2 is a diagram illustrating the structure of two types of PNA monomer units. BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION
  • the naphthylimide derivative 3b was also obtained in 44% yield from the corresponding lb and 2b, but only 4% of the 4b obtained by the subsequent hydrolysis was used (route A).
  • route B the reaction of 4b proceeded in 75% yield.
  • an aliphatic carboxylic acid preferably a linear aliphatic carboxylic acid, is used.
  • an active ester having a succinimid group is suitably used for the production of a monomer to be introduced into the terminal of the amino group of PNA.
  • ⁇ -amino acid derivative of the general formula (III) used for the route C one having a carbon chain length of 1 to 11 carbon atoms on the carbonyl carbon in the amino acid portion is generally used. Therefore, derivatization that is sterically similar to DN ⁇ is desirable. In consideration of this point, when carboxylamino acid is used as a linker, it is most preferable that the amino acid moiety is Z-glycine.
  • the Fmoc method and the tBoc method are used as a method for synthesizing the photofunctional oligo PNA.
  • the Fmoc method involves a deprotection step using an alkaline reagent, and is unsuitable for the design of photofunctional oligo-PNA.
  • the tBoc method is suitable as a method for synthesizing a photofunctional oligo PNA because it does not use an alkaline condition in the synthesis process. Therefore, if the PNA monomer according to the present invention is applied to the tBoc method, the synthesis of the photofunctional oligo PNA can be performed efficiently.
  • the calculated value is 515.2252, the measured value is 515.2273; UV max (DMF) 390, 460 (nm).
  • Triethylamine (732 ul, 5.25 ol) was added to a DMF solution (10 mL) of methyl red (1.35 g, 5 ol) and t-butylglycine hydrochloride (880 mg, 5.25), and then water-cooled.
  • the lower DCC (1.13 g, 5.5 ol) was added, and the mixture was stirred for 30 minutes and further at room temperature for 15 hours.
  • the reaction mixture was filtered, the filtrate was concentrated under reduced pressure, and the residue was purified by silica gel column chromatography (0-10% acetone / CH 2 C 12 ) to give lc t-butyl ester derivative (1 .05 g, 55%).
  • Flavin-OPfp 100 mg, 208 ⁇ mol
  • B. To a DMF solution (10 mL) of PNA-0H (45.4 mg, 208 juml) was added diisopropylethylamine (36.3 / il, 208 mol), and the mixture was stirred at room temperature for 15 hours. This was concentrated under reduced pressure, and the residue was purified by silica gel column chromatography (10-50% MeOH / CHCL), and then Flavin- B °. PNA-0H (130 mg, 85%) was obtained. ⁇ NMR
  • NI-0Pfp 211 mg, 0.50 ol
  • 8 a clear solution (10 mL) of lightning-OH (120 mg, 0.55 employed ol) was added diisopropylethylamine (87 ⁇ ., 0.50 liter), and the mixture was stirred at room temperature for 15 hours. This was concentrated under reduced pressure, and the residue was purified by silica gel column chromatography (0-20% MeOH / CHCL) to obtain NI- B . e PNA-0H (130 mg, 85%) was obtained. ⁇ NMR (DMSO-de) ⁇
  • NI (NH 2 ) -0H 100 mg, 0.37 benzyl was dissolved in pyridine (3 mL) and Ac 20 (3 mL) and stirred at room temperature for 15 hours. After concentration under reduced pressure, the residue was washed with dichloromethane, filtered and dried to obtain NI (thigh c) -0H (103.2 mg, 89%).
  • NI (Dish Ac)-OPfp 140 mg, 0.29 t ol
  • B To a DMF solution (5 mL) of lightning-OH (67 mg, 0.30 t ol) was added diisopropylethylamine (54 juh, 0.30 t ol), and the solution was added at room temperature.
  • the novel functional PNA monomer according to the present invention can be used for the construction of PNA used for gene therapy and the like. Further, according to the present invention, the functional molecules can be efficiently introduced into PNA by the two synthetic routes B and C, which are complementary to each other, of the functional PNA monomer. Therefore, the present invention can be used in industries such as industrial synthesis of functional PN monomer units using Boc-type monomer units or benzyloxycarbonyl-1 ⁇ -amino acid derivatives.

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Description

明 細 書 新規な機能性べプチド核酸モノマーとその製法 技術分野
本発明は、 新規な構造を有する機能性べプチド核酸モノマ一およびその製造方 法に関する。 背景技術
核酸は生物の遺伝情報を司る DNAおよび RNAである。 これに対して、 ぺプ チド核酸 (PNA) とは、 核酸の糖リン酸骨格を N— (2-アミノエチル)グリシン 骨格に変換した修飾核酸である (図 1) 。 DNA/RNAの糖リン酸骨格は中性 条件で負電荷を帯びていて相補鎖間の静電的な反発があるが、 PN Aの背骨構造 はもともと電荷を持たないので静電的な反発がない。 そのため PN Aは従来の核 酸と比較して、 高い二重鎖形成能をもち、 高い塩基配列認識能を持つ。 さらに P NAは生体内ヌクレア一ゼ ·プロテア一ゼに対し非常に安定で分解されないので 、 アンチセンス分子として遺伝子治療に応用することが検討されている。
従来の DN Aを媒体にしていた技術を PNA化することにより、 これまで克服 できなかった DNAの欠点を補うことが可能となった。 例えば、 遺伝情報の体系 的な解析を高速に且つ大量に行うための 「DNAマイクロアレイ技術」 および塩 基配列を特異的に認識したことを蛍光発光により検出できるプローブとして最近 開発された 「モレキュラービーコン」 に応用することが可能である。 これらはい ずれも酵素耐性に乏しい DN Aを媒体とするため、 これらの技術を用いるに際し ては厳密なサンプリングが要求される。 この要求を満たすことが、 前記の技術を 高度化する上での鍵となっている。
一方 PN Aは酵素に対し完全な耐性を持つので、 DN Aマイクロアレイ技術お よびモレキュラービーコンにおいて PN Aを DN Aに代用することによって、 前 記技術の欠点が克服され、 さらに長所が引き出されるものと期待されている。
DNAマイクロアレイ技術およびモレキュラービーコン以外にも PN A化する ことにより発展が期待される分野は数多いが、 それらにおいては PNAの効率的 な機能化、 すなわち P N Aモノマーへの機能性分子の効率的な導入による新規な P N Aモノマ一の設計が必要である。
PN Aオリゴマーの合成方法には通常の固相べプチド合成法を用いるので、 P NAモノマ一ュニヅトを PNAの背骨構造によって分類すると、 Fmo c型 PN Aモノマ一ュニヅトと t B 0 c型 PNAモノマーュニッ卜の 2種類が含まれる ( 図 2) 。
Fmo c型 PNAモノマーュニヅトの合成方法は既に確立されており、 しかも そのオリゴマーの合成は一般的な DN A自動合成機によって可能であるため、 下 記のルート
Figure imgf000004_0001
(Xはグァニン、 チミン、 シ卜シンまたはアデニンを表す)
によって、 少量スケ一ルでの合成が可能となっている。
当初 PNAには下記のような t B 0 c型 PNAモノマ一ュニヅト
- 2 - 差替え用紙 (規則 26) Michael Egholm, Ole Buchardt, Peter E.
Nielsen, and Rolf H. Berg
J- Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1895-1897.
Figure imgf000005_0001
が採用され、 その後より効率のよい合成方法
Figure imgf000005_0002
Kim L. Dueholm, Mchael Egholm, et. al,
J. Org. Chem. 1994, 59, 5767-5773.
が確立された。 しかし、 前述したように取り扱いが容易な F m o c型が開発され たため、 t B o c型の使用頻度は減少している。
しかし、 グァニン 'チミン 'シトシン ·アデ二ン 4種類の核酸塩基以外の機能性 分子を導入する際、 例えば光機能性分子を導入する際には、 導入する機能性分子 がアル力リ条件に不安定な場合が多いので、 アル力リ条件を使用しない t B o c 型 P N A背骨構造の有用性は高い。 「t一ブトキシカルボニルアミノエチルアミ ン及びアミノ酸誘導体の製造方法」 に関しては、 本発明者らが特願 2 0 0 0 - 2 6 8 6 3 8として既に特許出願中である。
これ以外にも、 光機能性オリゴ; P N Aのモノマ一ュニヅ卜の合成例は過去に 5 例が知られている。 これら全てが上記ルートを用いているが、 その収率について は記載がないか、 または極めて低いものでしかない (Peter E. Nielsen, Gerald Haa
- 3 - 差替え用紙(規則 26) iman, Anne B. Eldrap PCT Int. Appl. (1998) WO 985295 Al 19981126, T. A. Tran, R.-H. Mattern, B. A. Morgan (1999) J. Pept. Res, 53, 134-145, Jesper Lohse et al. (1
997) Bioconjugate Chem., 8, 503-509, Hans-georg Batz, Henrik Frydenlund Hansen, et al. Pet Int. Appl. (1998) WO 9837232 A2 19980827, Bruce Armitage, Troels Koch, et al. (1998) Nucleic Acid Res" 26, 715-720, Hans-georg Bate, Henrik Frydenlund H ansen, et al.) 。 また、 用いられる化合物の構造がアルカリ性条件に比較的安定で あることが特徴的であるため、 アルカリ性条件に不安定な発色団が付くと、 前記 従来法と類似の方法、 すなわち下記ルート A
ς -
c
Figure imgf000007_0001
0ZT80/T0df/13d .6.IS0/30 OAV
Figure imgf000008_0001
では効率良く合成できないと予想される。
そのため、 例えば光機能性 PNAモノマーのような機能性 PNAモノマーの開 発とともに、 PNAモノマーを効率的に機能化する技術の確立が強く望まれてい る o 発明の開示
したがって、 本発明は、 上記の問題を解消した新規な機能性 P N Aモノマーお よびその効率的な合成方法の提供を目的とする。
本発明者らは上記課題を解決すべく鋭意研究を重ねた結果、 下記ルート B
Figure imgf000009_0001
に示すように、 Ρ Ν Α背骨構造に t一ブトキシカルボニルアミノエチルァミン誘 導体 6を用いて 1のペン夕フルォロフ 二ル基を含む活性エステル体 5と縮合して ほぼ定量的に光機能性 P N Aモノマ一 4を合成することに成功した。
さらに本発明者らは、 下記ルート C
ルート C
Figure imgf000010_0001
8
に示すように、 P N A背骨構造に ω—アミノ酸誘導体 8を用いて 1のペン夕フル ォロフヱ二ル基を含む活性エステル体 7と縮合してほぼ定量的に光機能性 P N A モノマー 4を合成することにも成功した。
上記ルート Bおよび Cにより、 本発明者らは、 上記課題を解決することを見出 し本発明を完成するに至った。
すなわち本発明は、 下記一般式 (I )
Figure imgf000010_0002
(式中、 Aは
Figure imgf000011_0001
であり、 Bは
Figure imgf000011_0002
であり、 Rは H、 N02、 NH2、 NHCbz;、 Br、 F、 CIまたは S03Na2 であり、 nは 1〜4の整数である。 ただし、 Aが
- 9 - 差替え用紙 (規則 26)
Figure imgf000012_0001
である場合、 Bは
Figure imgf000012_0002
である) で表される化合物に関する。
また、 本発明は、 t -ブトキシカルボニルァミノェチルァミンを機會¾性分子の 誘導体と反応させ、 機能性分子を P NAモノマーに導入することよりなる機能性 P N Aモノマ一の製造方法であつて、 該機能性分子の誘導体が活性エステルであ ることを特徴とする、 前記製造方法に関する。
さらに、 本発明は、 活性エステルが、 下記一般式 (I I )
Figure imgf000012_0003
(式中、 Aは
Figure imgf000013_0001
であり、 Rは H、 N02、 NH2、 NHCbz、 Br、 F、 CIまたは S03Na2 であり、 nは 1〜4の整数である)
で表される基を、 エステル結合を形成するカルボニル炭素に有することを特徴と する、 前記製造方法に関する。
また、 本発明は、 活性エステルが、 ペン夕フルオロフヱノキシ基またはスクシ ンイミ ドォキシ基をカルボニル炭素に有することを特徴とする、 前記製造方法に 関する。
さらに、 本発明は、 活性エステルを製造する方法であって、 機能性分子のカル ボン酸誘導体と、 ペン夕フルオロフエノキシ基またはスクシンィミドォキシ基を 有する化合物との反応を含むことを特徴とする、 前記方法に関する。
また、 本発明は、 機能性分子のカルボン酸誘導体を製造する方法であって、 機 能性分子の誘導体と脂肪族カルボン酸との反応を含むことを特徴とする、 前記方 法に関する。
またさらに、 本発明は、 機能性分子から該機能性分子の誘導体を製造し、 該機 能性分子の誘導体から機能性分子の力ルポン酸誘導体を製造し、 該機能性分子の カルボン酸誘導体から活性エステルを製造し、 該活性エステルから機能性 P N A モノマーを製造することを含む、 機能性分子から機能性 P N Aモノマーを製造す る方法において、 下記 a ) 〜c ) :
a ) 前記機能性分子のカルボン酸誘導体の製造において、 機能性分子の誘導体と 脂肪族カルボン酸とを反応させること;
b ) 前記活性エステルの製造において、 機能性分子のカルボン酸誘導体とペン夕 フルオロフエノキシ基またはスクシンィミドォキシ基を有する化合物とを反応さ せること;および、
c ) 前記機能性 P N Aモノマーの製造において、 t —ブトキシカルボニルァミノ ェチルァミンを、 活性エステルである機能性分子の誘導体と反応させること; の 1または 2以上を含むことを特徴とする、 前記方法に関する。
さらにまた、 本発明は、 下記一般式 (I I I )
(in)
Figure imgf000014_0001
(式中、 R 1は水素原子または炭素数 1〜 5の直鎖若しくは分枝鎖状のアルキル基 、 mは 1〜 1 1の整数を表す)
で表される ω—アミノ酸誘導体を機能性分子の誘導体と反応させ、 機能性分子を P N Αモノマーに導入することよりなる機能性 P N Αモノマーの製造方法であつ て、 該機能性分子の誘導体が活性エステルであることを特徴とする、 前記製造方 法に関する。 そして、 本発明は、 活性エステルが、 下記一般式 (I I )
Figure imgf000015_0001
(式中、 Aは
Figure imgf000015_0002
であり、 Rは H、 N〇2、 NH2、 NHCbz、 Br、 F、 CIまたは S03Na2 であり、 nは 1〜4の整数である)
で表'される基を、 直接または脂肪鎖あるいはペプチド鎖を介して、 エステル結合 を形成するカルボニル基に有することを特徴とする、 前記製造方法に関する。
- 13 - 差替え用紙 (規則 26) そしてまた、 本発明は、 活性エステルが、 ペン夕フルオロフエノキシ基または スクシンイミ ドォキシ基をカルボニル炭素に有することを特徴とする、 前記製造 方法に関する。
そしてさらに本発明は、 機能性分子から活性エステルを製造し、 該活性エステ ルから機能性 P N Aモノマ一を製造すること含む、 機能性分子から機能性 P N A モノマ一を製造する方法において、 前記機能性分子からの活性エステルの製造が 、 m—メチルレツドとスクシンィミ ドォキシ基を含む化合物とを反応させること 、 および/または前記活性エステルから機能性 P NAモノマーの製造が、 一般式 ( I I I ) で表されるベンジルォキシカルボ二ルー ω—アミノ酸誘導体を、 活性 エステルである機能性分子の誘導体と反応させ、 機能性分子を Ρ Ν Αモノマーに 導入すること、 を含むこと特徴とする、 前記方法に関する。
ここで、 本発明による方法と従来の方法とを比較することによって本発明の特 徴を詳細に説明する。
t B o c型 P NAモノマ一ュニヅト 4の合成は通常下記のルート Aが用いられ る o
ル-ト A
Figure imgf000017_0001
=アルカリ条件に不安定な分子
ルート B
Figure imgf000017_0002
即ち、 1と 2を脱水縮合して 3を合成した後、 3をアルカリ加水分解することによ り 4を得る方法である。 グァニン ·チミン ·シトシン ·アデニン 4種類の核酸塩 基を導入する場合もこの方法を用いる。 これ以外の機能性分子 (表 1に挙げる既 知化合物のこと) を導入する際にも、 ルート Aが用いられている。 ところが、 一 般に光機能性分子はアル力リ条件に不安定な場合が多いので、 ル一ト Aを用いる と収率良く 4を得ることができない。 そこで従来の P N A背骨構造 2を用いて縮合 するのではなく、 2を先に加水分解した 6を用いることにした。 6は 1と同様な遊離 カルボン酸基を内包しており分子内脱水縮合反応が引き起こる可能性があるため 、 DCCなどの縮合剤による直接的な脱水縮合反応は利用できない。 そこで 1をぺ ン夕フルオロフエノ一ルにて活性エステル体 5に変換した後、 6と反応させること により 6の遊離カルボン酸基と 2級ァミノ基が分子内縮合しないように工夫した ( ルート B) 。 これにより 4が定量的に得られるようになった。 このように、 光機 能性分子を活性エステル化して 6と反応させ 4を合成する方法は前例がなく、 今後 の多種多様な光機能性 P N Aモノマーの合成に不可欠な手段であるといえる。 また、 ルート Cに用いる、 下記一般式 (I I I )
NH2
( ° o
BocHN 人 (III
丫人 )
OH 、 '
R1
(式中、 R 1は水素原子または炭素数 1〜 5の直鎖若しくは分枝鎖状のアルキル基 、 mは 1〜1 1の整数を表す)
で表されるベンジルォキシカルボニル— ω—アミノ酸誘導体には予めリンカー ( カルボキシルアミノ酸) が結合しているため、 当該誘導体は汎用性に富んでおり 、 活性エステル体を当該誘導体と反応させることによって、 1工程で目的とする 機能性 Ρ Ν Αモノマ一ユニットが得られる。 しかも、 ベンジルォキシカルボニル 一 ω—アミノ酸誘導体も、 多くの市販品を用いることができる。 したがって、 当 該ル一ト Cは、 比較的高価な光機能性分子を対象とする場合に特に有効である。 一方、 スルホン酸クロリ ド系および立体障害が大きいメチルレッド等の光機能 性分子の Ρ Ν Αモノマ一化は、 ルート Βによってより好適に行われる。
したがって、 本発明のルート Bおよびル一ト Cによる合成法を適宜選択するこ とによって、 多種多様な機能性 P N Aモノマーを合成することができる。
本発明によれば、 例えば、 Naphthalimide型、 Flavin型、 Dabcyl型、 Biotin型、 FAM型、 Rhodamine型、 TA M型、 R0X型、 HABA型、 Pyrene型、 Coumarin型のような 光機能性モノマーユニットが得られる。 また、 これら以外の光機能性モノマーュ ニヅトおよび光機能性モノマーュニット以外の機能性モノマーュニヅトを得るこ とも可能である。 図面の簡単な説明
図 1は、 D N Aと P NAの構造および荷電の状況の違いを表す図である。 図 2は、 2種類の P N Aモノマ一ュニヅトの構造を表す図である。 発明を実施するための形態
光機能性モノマーュニヅ卜の合成に関しては、 例えば化合物 4aの合成、
ルート A
Figure imgf000020_0001
において従来は機能性分子のカルボン酸誘導体 laと P N A背骨構造 2aを脱水縮合 して 3aを合成したあとで、 アルカリ加水分解して目的の 4aを得ていた (ルート A ) 。 ところが laのフラビン骨格は酸には安定であるがアルカリ性条件で容易に分 解し 6,7-dimethylquinoxalinedion^lなってしまうので、 例え 3aが合成できても 4a を効率よく得ることは不可能である。 そこで laを活性エステル体 5aに変換して 6a と反応させたところ、 4aは 85%の収率でほぼ定量的に反応が進行するようになった (ルート B) 。
また、 化合物 4 bの合成
ルート A
Figure imgf000022_0001
において、 ナフ夕ルイミド誘導体 3bも該当する lbと 2bから 44%の収率で得られた が、 次のアル力リ加水分解により得られる 4 bはわずか 4%であった (ルート A ) 。 そこで lbを活性エステル体 5bに変換して 6bと反応させたところ、 4 bは 75% の収率で反応が進行するようになった (ルート B) 。 カルボン酸誘導体である 1 aおよび l bの製造には、 脂肪族カルボン酸、 好ま しくは直鎖の脂肪族カルボン酸を用いる。
また、 P NAのァミノ基末端に導入するモノマーの製造には、 スクシンイミ ド 基を有する活性エステルが好適に用いられる。
なお、 ルート Cに用いる一般式 (I I I ) の ω—アミノ酸誘導体として、 その アミノ酸部分におけるカルボニル炭素上の炭素鎖の長さが炭素数 1〜 1 1のもの が用いられるが、 一般に Ρ ΝΑは D N Aとのハイプリヅドを期待しているので、 立体的に D N Αに類似している誘導化が望ましい。 この点を考慮すると、 カルボ キシルァミノ酸をリンカ一として利用する場合、 ァミノ酸部分が Z -グリシンで あるものが最適である。
光機能性オリゴ P N Aの合成方法としては、 F m o c法と tB o c法が用いら れる。 F m o c法はアルカリ性試薬による脱保護過程を含んでおり、 光機能性ォ リゴ P NAの設計には不適切である。 一方、 tB o c法はその合成過程にアル力 リ条件を使用しないので光機能性オリゴ P N Aの合成方法として適している。 し たがって、 本発明による P NAモノマーを t B o c法に適用すれば、 光機能性ォ リゴ P N Aの合成が効率的に行えるようになる。 実施例
以下に実施例を用いて本発明をさらに詳細に説明するが、 本発明の範囲はこれ に限られるものではない。
(実施例 1 )
2,3,4,5,6-ペン夕フルオロフェニル 2-(5,7,8-トリメチル -1,3-ジォキソ -2,5-ジヒドロ -2,4-ジァザフエナジン- 2-ィル)ァセテ一ト (5a)の合成
4a (100 mg, 318 ^mol ) と PfpOH (70.2 mg, 381 ^iol ) の DMF溶液 (10 mL ) に EDC (73.2 mg, 382 mol ) を 0 。 C で加え、 この反応液を 0 ° Cで 1時 間室温で 12 時間撹拌した。 この反応液を減圧濃縮し、 残渣を水■クロ口ホルム系 で分酉 由出した。 有機層を硫酸マグネシウムで乾燥し、 減圧濃縮したあと、 残渣 をシリカゲルカラムクロマト法 (2.5% MeOH/CHCL) により精製し 5a ( 130 mg, 85%) を得た。 ¾ NMR (CDCL) δ 8.07 (s, 1 H), 7.44 (s, 1 H), 5.21 (s, 2 H TRANSLATION IN JP
INTERNATION SEARCH REPORT
SUBSTITUTE SHEET (RULE 26) 差替え用紙 (規則 26)
SUBSTITUTE SHEET (RULE 26 ISA/JP) 差替え用紙 (規則 26 ISA/JP)
AMENDED SHEET (ARTICLE 19) 補正された用紙 (条約第 19条)
STATEMENT UNDER ARTICLE 19 (1) 条約第 19条 (1) に基づく説明書
RECTIFIED SHEET (RULE 91) 訂正された用紙 (規則 91)
RECTIFIED SHEET (RULE 91 ISA/JP) 訂正された用紙 (規則 91 ISA/JP)
RECTIFIED SHEET (RULE 91 RO/JP) 訂正された用紙 (規則 91 RO/JP) ), .14 (s, 3 H), 2.55 (s, 3 H), 2.45 (s, 3 H); H MS (FAB+, NBA/CH2CI C HnO s [(M+H) の計算値は 481.0934, 実測値は 481.0950; UV 入 max (酵) 390, 460 (nm).
(実施例 2 )
2 - (N- (2-((t-ブトキシ)カルボニルァミノ)ェチル))-2-(5,7,8-トリメチル - 1,3 - ジォキソ(2,5-ジヒドロ- 2,4-ジァザフエナジン- 2-ィノレ)ァセチルァミノ)酢酸 (4 a)の合成
5a (100 mg, 208 /zmol) と 6a (45.4 mg, 208 〃mol) の DMF溶液 (10 mL)に ジイソプロビルェチルァミン (36.3 ul, 208 umol) を加え、 室温で 1 5時間 撹拌した。 これを減圧濃縮し残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (10-50% MeOH/ CHCL) により精製し 4a (130 mg, 85%) を得た。 Ή腿 (C請)6 7.94 (s) 及 び 7.86 (s) (1 H), 7.80 (s) 及び 7.75 (s) (1 H), 5.03 (s) 及び 4.88 (s) (2 H), 4.17 (s) 及び 4.13 (s) (3 H), 3.64及び 3.52 (2 H), 3.38及び 3.2 6 (2 H), 2.58 (s) 及び 2.56 (s) (3 H), 2.46 (s) 及び 2.44 (s) (3 H), 1.4 6 (s) 及び 1.41 (s) (9 H); HRMS (FAB NBA/CH2C12) C24H3
Figure imgf000025_0001
算値は 515.2252, 実測値は 515.2273; UV 人 max (DMF) 390, 460 (nm).
(実施例 3 )
N- (4-ジメチルアミノアゾベンゼン- 2, -カルボニル)グリシン(lc)の合成
メチルレツド(1.35 g, 5 腿 ol)と t-ブチルグリシン塩酸塩(880 mg, 5.25顧 0 1)の DMF溶液(10 mL)にトリエチルァミン(732 ul, 5.25 匪 ol)を加えたあと、 水冷下 DCC(1.13g, 5.5醒 ol)を加え 30分、 さらに室温で 15時間攪袢した。 反応液 を濾過し濾液を減圧濃縮して、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-10% ァセ トン/ CH2C12) により精製し、 橙色針状晶として lcの t-ブチルエステル誘導体 (1. 05 g, 55%)を得た。 これ (765 mg, 2腿 ol) に蟻酸 (50 mL)を加え室温で 2日攪拌 し、 減圧濃縮し蟻酸を除いたあと、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-5% A cetone/CH2Cl2) により精製し、 赤色針状晶として lc(549 mg, 84%) を得た.。 Ή 腿 (CDCL) δ 9.99 (brt, 1H)3 8.40 (d, J = 8 Hz, 1 H), 7.89 (d, J = 9 Hz, 2 H), 7.84 (d, J = 8 Hz, 1H)3 7.56 (t, J = 8 Hz, 1 H), 7.49 (t, J = 8 Hz, 1 H), 6.75 (d, J = 9 Hz, 2H), 4.42 (d, J = 5 Hz, 2 H), 3.10 (s, 6 H); 13
-22- 訂正された用紙 (規則 91) C NMR (CDCla) d 167.61, 153.39, 150.86, 143.30, 132.49, 131.47, 129.38, 127.69, 126.28, 116.24,111.63, 43.20, 40.24.
(実施例 4)
2, 3, 4,5, 6-ペン夕フルォロフェニル N-(4-ジメチルァミノァゾベンゼン- 2' -カル ボニル)グリシネート (5c)の合成
lc(326 mg, 1 画 ol)と PfpOH(276 mg, 1.5 腿 ol)の DMF溶液(10 mL)に DCC(308 m g, 1.5纖01)を氷冷下加ぇ、 この反応液を室温で: 15時間撹拌した。 反応液を濾過し 濾液を減圧濃縮し、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-5% アセトン/ CH2C12 ) により精製し橙色粉末として 5c(449 mg, 91%) を得た。 Ή NMR (CDCL) d 10. 14 (brt, 1 H),8.37 (d, J = 8 Hz, 1 H), 7.78 (d, J = 9 Hz, 2 H), 7.76 (d,
J = 8 Hz, 1 H),7.57 (t, J = 8 Hz, 1 H)5 7.50 (t, J = 8 Hz, 1 H), 6.74 ( d, J = 9 Hz, 2 H),4.68 (d, J = 5 Hz, 2 H), 3.06 (s, 6 H).
(実施例 5 )
2- (N- (2- ((t-ブトキシ)カルボニルァミノ)ェチル)-2-(4-ジメチルアミノアゾベン ゼン -25 -カルボニルァミノ)ァセチルァミノ)酢酸 (4c)の合成
5c (246 mg, 0.5 腿 ol)と 6(109 mg, 0.5 蘭 ol)の DMF溶液(5 mL)にジイソプロピ ルェチルァミン (85 μΐ, 0.5 腿 ol) を加え、 室温で 1 5時間撹拌した。 これを 減圧濃縮し残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-30% MeOH/ CH2CI2) により精 製し 4c(225 mg, 72%)を得た。 Ή NMR (CDCL) δ 9.99 (s) 及び 9.85 (s) (1 H) ,8.3-7.6 (m,4 H), 7.4-7.2 (m,2 H), 6.67 (s) 及び 6.59 (s) (2 H), 5.62 (s )及び 5.27 (s) (1 H), 4.35 (s) 及び 4.20 (s) (2 H), 3.99 及び 3.90 (2 H) , 3.5(brs) 及び 3.3 (brs) (2 H), 3.2 (brs) 及び 3.0 (brs) (2 H), 2.99 (s ) 及び 2.87(s) (6 H), 1.25 (brs, 9 H).
1 cから 4 cに至るルートは下記の通りであった。
- 23
Figure imgf000027_0001
Figure imgf000027_0002
0ZT80/I0df/X3d .6.TS0/Z0 OAV (実施例 6 )
N-(4-ヒドロキシァゾベンゼン- 2, -カルボニル)グリシン (Id)の合成
HABA(1.21 g, 5删 ol)と t-ブチルグリシン塩酸塩 (880 mg, 5.25画 ol)の DMF溶 液(lOmL)に卜リエチルァミン(732 jul, 5.25 蘭 ol)を加えたあと、 氷冷下 DCC(1. 13 g, 5.5顧 ol)を加え 30分、 さらに室温で 15時間攪拌した。 反応液を濾過し濾液 を減圧濃縮して、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-5% アセトン/ CH2C12) により'精製し、 橙色粉末として Idの t-プチルエステル誘導体 (1.73 g5 97%)を得 た。 これ(1.07 g, 3雇 ol)に蟻酸 (50 mL)を加え室温で 2日攪拌し、 減圧濃縮し蟻 酸を除いたあと、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-5% アセトン/ CH2C1 により精製し、 橙色粉末として ld(0.89 g, 99%)を得た。 Ή ΝΜΙί (CDCL) δ 10.4 5 (brt, 1 H), 8.88 (brt, J =5 Hz, 1 H), 7.91 (d, J = 9 Hz, 2 H), 7.85 (d, J = 8 Hz, 1 H), 7.70 (d, J = 8Hz, 1 H), 7.60 (t, J = 8 Hz, 1 H), 7.5 7 (t, J = 8 Hz, 1 H), 6.94 (d, J = 9Hz, 2 H), 4.05 (d, J = 5 Hz, 2 H); 13 C N R (CDCL) ό1 171.18, 166.44, 161.54,149.13, 145.34, 133.20, 131.09, 130.18, 129.61, 125.86, 116.00, 115.88,41.60.
(実施例 7 )
2,3,4,5,6-ぺン夕フルォロフェニル N- (4-ヒドロキシァゾベンゼン _2? -カルボ ニル)グリシネート(5d)の合成
ld(299 mg, 1 腿 ol)と PfpOH(276 mg, 1.5顧 ol)の MF溶液(10 mL)に DCC(308 m S, 1.5匪 ol)を氷冷下加え、 この反応液を室温で 15時間撹拌した。 反応液を濾過 し濾液を減圧濃縮し、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-5% アセトン/ CH2C 1 により精製し橙色粉末として 5d(46 mg, 10%)を得た。 Ή NMR (CDC13) δ 9.6 7 (brs, 1 H),9.02 (brt, 1 H), 7.8-7.7 (m, 3 H), 7.6-7.5 (m, 2 H), 7.23 (d, J = 9 Hz, 1H), 6.86 (d, J = 9 Hz, 2 H), 4.67 (d, J = 5 Hz, 2 H).
(実施例 8 )
2- (N- (2-((t-ブトキシ)カルボニルァミノ)ェチル)- 2-(4-ヒドロキシァゾベンゼ ン -2, -カルボニルァミノ)ァセチルァミノ)酢酸 (4d)の合成
5d(37 mg, 80 〃inol)と 6(18 mg, 80 〃mol)の DMF溶液(5 mL)にジイソプロピル ェチルァミン(14 l, 80 jLL ol) を加え、 室温で 15時間撹拌した。 これを減圧
-25- 訂正された用紙 (規則 91) 濃縮し残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-30% MeOH/ CH2C12) により精製し
4d(13 mg, 33%)を得た。 Ή NMR (CDCL)^ 9.77 (s) 及び 9.59 (s) (1 H), 8.26 (s) 及び 8.14 (s) (2H), 7.9-7.6 (m, 2 H), 7.6-7.3 (m, 2 H), 7.0-6.6 (m, 2 H), 5.35 (s) 及び 5.05(s) (1 H), 4.40 (s) 及び 4.24 (s) (2 H), 3.98 ( s, 2 H), 3.6-3.3 (m, 2 H),3.21 (s) 及び 3.02 (s) (2 H), 1.28 (s) 及び 1.
18 (s) (9 H).
1 dから 4 dに至るルートは下記の通りであった。
26 LZ一
Figure imgf000030_0001
0ZT80/I0df/X3d .6.TS0/Z0 OAV (実施例 9 )
FAM-Gly-B。。PNA-OHの合成
Gly-BocPNA-OH (30.3 mg, 0. 10 雇 ol) の dimethylformamide溶液 (5 mL) に 5, 6-FAM -hydroxysucc inimide ester (50 mg, 0. 11 腿 ol) と triethylamine (250 L, 2.0 雇 ol) を順番に加え、 室温で 1 5時間撹拌した。 反応終了後減圧濃縮し 、 残渣をシリ力ゲル力ラムクロマトグラフィー (0-25% MeOH/dichloromethane) に付し、 黄色粉末として FAM-Gly -, NA- 0H (69.8 mg, 100%) を得た。 FABMS m/z
634 [ (M+H)+j ; 丽 (FAB calcd for C 0"Ν3 [ ( +Η)+] 634. 1959, observed 634.2034.
(実施例 1 0 )
TAMRA-Gly-BeePNA- 0Ηの合成
Gly -, NA - OH (5.8 mg, 21 1) の dimethylformamide溶液 (5 mL) に 5,6- TAMRA -hydroxysucc inimide ester (5 mg, 9.5 jumol ) と triethylamine (20 ju I, 140 jumol) を順番に加え、 室温で 1 5時間撹拌した。 反応終了後減圧濃縮し 、 残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (0-30% MeOH/dichloromethane) に付し、 赤紫色粉末として TAMRA- Gly -, NA-0H (6mg, 100%) を得た。 FABMS m/z
688 [ (M+H)つ; 匪 S (FAB+) calcd for C36Hu09Ns [ (M+H)+] 688.2904, observed 6 88.2993.
(実施例 1 1 )
R0X- Gly- B。TNA- OHの合成
Gly-BocPNA-OH (4.9 mg, 18 〃mol) の dimethylformamide溶液 (5 mL) に 5, 6 - 腿■/Hiydroxysucc inimide ester (5 mg, 8 mol) と triethylamine (20 μ.1, 1 40 mol) を順番に加え、 室温で 1 5時間撹拌した。 反応終了後減圧濃縮し、 残 澄をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (0-30% MeOH/dichloromethane) に付 し、 紫色粉末として R0X- Gly-B。。PNA- OH (6mg, 100%) を得た。 FABMS M/Z 792 [ (M +H) ; 画 S (FAB+) calcd for C"i 5 [(M+H)+] 792.3530, observed 792.3615.
(実施例 1 2 )
2, 3, 4, 5 , 6-Pentaf luoropheny 1 N- ( -D imethy 1 aminoazobenzene-25 -carbonyl )gl ycinate o~MR-Gly-0Pfpの合成
- 28 - α-MR-Gly-OH (326 mg, 1 匪 ol)と PfpOH (276 mg, 1.5腿 ol)の DMF溶液(10 mL) に DCC (308 mg, 1.5 顏 ol)を氷冷下加え、 この反応液を室温で 15時間撹拌した。 反応液を濾過し濾液を減圧濃縮し、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-5% A cetone/CHzC ) により精製し橙色粉末として o~MR- Gly- OPfp (449 mg, 91%) を 得た。 Ή腿 (CDC ) d 10.14 (brt, 1 H), 8.37 (d, J= 8 Hz, 1 H), 7.78 (d, J= 9 Hz, 2 H), 7.76 (d, J: 8 Hz, 1 H), 7.57 (t, J= 8 Hz, 1 H), 7. 50 (t, J= 8 Hz, 1 H), 6.74 (d, J= 9 Hz, 2 H), 4.68 (d, «/= 5 Hz, 2 H), 3.06 (s, 6 H).
(実施例 13 )
2-(N-(2-{, { tert- utoxy ) carbonylamino ) ethyl ) -2- ( -dimethyIaminoazobenzene-2' -carbonylamino ) acetylamino ) acetic acid o-MR-Gly-BocPNA-OHの合成
i>- R-Gly-0Pfp (246 mg, 0.5腿 ol)と8" PNA- OH (109 mg, 0.5 麵 ol)の DMF溶液 (5 mL)に diisopropylethylamine (85 jul, 0.5翻 ol) を加え、 室温で 1 5時間 撹拌した。 これを減圧濃縮し残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0- 30% MeOH/ CHzCh) により精製し 观- Gly -8。 TNA-0H (225 mg, 72%)を得た。 Ή薩 (CDCh) δ 9.99 (s) and 9.85 (s) (1 H), 8.3-7.6 (m) (4 H), 7.4-7.2 (m) (2 H),6. 67 (s) and 6.59 (s) (2 H), 5.62 (s) and 5.27 (s) (I E), 4.35 <s) and 4.2 0 (s) (2 H), 3.99 and 3.90 (2 H), 3.5 (brs) and 3.3 (brs) (2 H), 3.2 (br s) and 3.0 (brs) (2 H), 2.99 (s) and 2.87 (s) (6 H), 1.25 (brs, 9 H).
(実施例 14)
2-(N-(2-( ( ieri-Butox ) carbonylamino ) ethyl) -2-( 4-dimethylaminoazobenzene-4' -carbonylamino) acethylamino) acetic acid Dabcyl-Gly-BooPNA-OH (p-MR-Gly-B∞PNA-OH) の合成
Gly-B。。PNA- OH (100 mg, 0.39讓 ol) の dimethyl formamide溶液 (10 mL) に da bcyl THiyd皿 ysuccinimide ester (145 mg, 0.40藤 1) と triethylamine (600 M , 4.5腿 ol) を順番に加え、 室温で 15時間撹拌した。 反応終了後減圧濃縮 し、残渣をシリ力ゲルカラムクロマトグラフィ一(0-4% MeOH/dichloromethane) に付し、 赤褐色粉末として Dabcyl- Gly-B PNA- 0H (184 mg, 90%) を得た。 ¾腿 (DMSO- め δ 8.18 (d, J = 7 Hz, 2 H), 7.91 (d, J = 7 Hz, 2 H), 7.88 (d,
-29- 訂正された用紙 (規則 91) J = 7 Hz, 2 H), 6.77 (d3 J = 7 Hz, 2 H), 5.76 (s) and 5.30 (s) (2 H), 4. 22 (brs) and 4.05 (brs) (2 H), 3.73 (brs) and 3.49 (brs) (2 H), 3.47 (br s) and 3.29 (brs) (2 H), 1.26 (s, 9 H); FABMS m/z 527 [(M+H) +].
(実施例 15 )
N-(4-Hydroxyazobenzene-2' -carbonyl)glycine HABA-Gly -OHの合成
HABA (1.21 , 5腿 ol)と i-ブチルグリシン塩酸塩 (880 mg, 5.25腿 ol)の DMF 溶液(10 mL)にトリエチルァミン(732 JLLL, 5.25醒 ol)を加えたあと、 氷冷下 DCC
(1.13 g, 5.5腿 ol)を加え 30分、 さらに室温で 15時間攪拌した。 反応液を濾過し 濾液を減圧濃縮して、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-5% Acetone/CH2Cl 2) により精製し、 橙色粉末として HABA-Gfly- 0Hの ί -プチルエステル誘導体 (1.73 g, 97%)を得た。 これ(1.07 g, 3腿 ol)に蟻酸 (50 mL)を加え室温で 2日攪拌し、 減 圧濃縮し蟻酸を除いたあと、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-5% Acetone /CILCI により精製し、 橙色粉末として HABA-Gly- 0H (0.89 g, 99%)を得た。 Ή
NMR (CDCb) δ 10.45 (brt, 1 H), 8.88 (brt, = 5 Hz, 1 H), 7.91 (d, J = 9 Hz, 2 H), 7.85 (d, J= 8 Hz, 1 H), 7.70 (d, J= 8 Hz, 1 H), 7.60 (t,
J= 8 Hz, 1 H), 7.57 (t, J= 8 Hz, 1 H), 6.94 (d, J= 9 Hz, 2 H)5 4.05 (d, J= 5 Hz, 2 H); 13C NMR (CDCL) δ 171.18, 166.44, 161.54, 149.13, 14 5.34, 133.20, 131.09, 130.18, 129.61, 125.86, 116.00, 115.88, 41.60.
(実施例 16 )
2,3,4,5,6-Pentafluorophenyl N-(4-Hydroxyazobenzene-2' -carbonyl)glycinate HA
BA-Gly-OPfpの合成
HABA-Gly- OH (299 mg3 1 腿 ol)と PfpOH (276 mg, 1.5顧 ol)の DMF溶液(10 mL) に DCC (308 mg, 1.5 腿 ol)を氷冷下加え、 この反応液を室温で 15時間撹拌した。 反応液を濾過し濾液を減圧濃縮し、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-5% A cetone/CH2Cl2) により精製し橙色粉末として HABA-Gly- OPfp (46 mg, 10%)を得た 。 'Η NMR (CDCls) ό" 9.67 (brs, 1 Η), 9.02 (brt, 1 Η), 7.8-7.7 (m, 3 Η), 7.6-7.5 (m, 2 Η)5 7.23 (d, J= 9 Hz, 1 H), 6.86 (d, J: 9 Hz, 2 H), 4.67
(d, J= 5 Hz, 2 H).
(実施例 17 )
- 30 - 2-(N-(2-((ieri-Butoxy)carbonylamino)ethyI)-2-(4-hydroxyazobenzene-2' -carbonyla mino)acethylamino)acetic acid HABA-Gly-BcPNA-OHの合成
HABA-Gly-OPfp (37 mg, 80 〃mol)と, M-OH (18 mg, 80 〃mol)の DMF溶液(5 mL)に diisopropylethylamine (14 mL, 80 〃mol) を加え、 室温で 15時間撹拌 した。 これを減圧濃縮し残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-30% MeOH/ CH2C 12) により精製し HABA- Gly- B。TM- OH (13 mg, 33 )を得た。 ¾腿 (CDCl3)d 9. 77 (s) and 9.59 (s) (1 H), 8.26 (s) and 8.14 (s) (2 H), 7.9-7.6 (m, 2 H) , 7.6-7.3 (m, 2 H), 7.0-6.6 (m, 2 H), 5.35 (s) and 5.05 (s) (1 H)5 4.40 (s) and 4.24 (s) (2 H), 3.98 (s, 2 H), 3.6-3.3 (m, 2 H), 3.21 (s) and 3. 02 (s) (2 H), 1.28 (s) and 1.18 (s) (9 H).
(実施例 18 )
2,3,4,5,6-Pentafluorophenyl 2-(5,7,8-trimethyl-l,3-dioxo-2,5-dihydro-2,4-diazaphe nazin-2-yl)acetate Flavin-OPfp©合成
Flavin (100 mg, 318 zmol) と PfpOH (70.2 mg, 381 ol) の DMF溶液 (1 0 mL) に EDC (73.2 mg, 382 mol) を 0 ° C で加え、 この反応液を 0 ° C で 1時間室温で 12 時間撹拌した。 この反応液を減圧濃縮し、 残渣を水 'クロ口ホル ム系で分配抽出した。 有機層を硫酸マグネシウムで乾燥し、 減圧濃縮したあと、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (2.5% MeOH/CHCL) により精製し Flavin- 0 Pfp (130 mg, 85%) を得た。 ¾腿 (CDCb) δ 8.07 (s, 1 H), 7.44 (s, 1 H) , 5.21 (s, 2 H), 4.14 (s, 3 H), 2.55 (s, 3 H), 2.45 (s, 3 H); HRMS (FAB+ , ΝΒΑ/CftCL·) calcd for C21H14O4M5 [(M+H)+] 481.0934, observed 481.0950; U V Amax (DMF) 390, 460 (nm).
(実施例 1 9 )
2-(N-(2-((ieri-Butoxy)carbonyIamino)ethyl)-2-(5,7,8-trimethyl-l,3-dioxo(2,5-dihydro -2,4-di- azaphenazin-2-yl)acethylamino)acetic acid Flavin-B∞PNA-OHの合成
Flavin-OPfp (100 mg, 208 〃mol) と B。。PNA-0H (45.4 mg, 208 juml) の DM F溶液 (10 mL)に diisopropylethylamine (36.3 /il, 208 〃mol) を加え、 室温で 15時間撹拌した。 これを減圧濃縮し残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (10-5 0% MeOH/CHCL) により精製し Flavin- B°。PNA-0H (130 mg, 85%) を得た。 Ή NMR
- 31 - (CD30D)d 7.94 (s) and 7.86 (s) (1 H), 7.80 (s) and 7.75 (s) (1 H), 5.03 (s) and 4.88 (s) (2 H), 4.17 (s) and 4.13 (s) (3 H), 3.64 and 3.52 (2 H ), 3.38 and 3.26 (2 H), 2.58 (s) and 2.56 (s) (3 H), 2.46 (s) and 2.44 ( s) (3 H), 1.46 (s) and 1.41 (s) (9 H); HRMS (FAB÷3 NBA/CH2CL) calcd for C24H31O7N6 [(M+H) +] 515.2252, observed 515.2273; UV A ax (DMF) 390, 460 ( nm).
(実施例 2 0 )
2, ,3, ,4, ,5, ,6, -Pentafluorophenyl l,3-Dioxo-lH-benz[de]isoquinoline-2(3H)-a cetate NI-OPfpの合成
NI-0H (192 mg, 0.75 藤 ol)と PfpOH (152 mg, 0.83 腿 ol)の DMF溶液(5 mL)に D CC (155 mg, 0.75 腿 ol)を氷冷下加え、 この反応液を室温で 15時間撹拌した。 反 応液を濾過し濾液を減圧濃縮し、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (CH2C12) により精製し赤色粉末として NI- OPfp (277 mg, 87%)を得た。 Ή NMR (CDCla) δ 8.64 (d3 J = 8 Hz, 2 H), 8.25 (d, J = 8 Hz, 2 H), 7.78 (t5 J = 8 Hz, 2 H ), 5.29 (s, 2 H).
(実施例 2 1 )
2-(N-(2-((ieri-Butoxy)carbonylamino)ethyl)-2-(l,3-dioxo-lH-benz[de]isoquinoIine-2( 3HD)acethyIamino)acetic acid NI-B°。PNA-OHの合成
NI-0Pfp (211 mg, 0.50 画 ol) と 8。雷- OH (120 mg, 0.55 雇 ol) の 匿溶液 (10 mL)に diisopropylethylamine (87 μ. , 0.50 腿 ol) を加え、 室温で 1 5時 間撹拌した。 これを減圧濃縮し残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (0-20% MeOH /CHCL) により精製し NI-BePNA- 0H (130 mg, 85%) を得た。 Ή NMR (DMSO-de) δ
8.47 (m, 4 H), 7.86 (dd, J= 8.3, 7.3 Hz, 2 H), 4.73 (s, 2 H); 13C NMR ( CDCL) d 167.84, 163.59, 134.20, 131.44, 131.39, 128.11, 126.78, 122.00,
61.59, 41.44, 14.29; HRMS (FAB+, ΝΒΑ/CmCL·) calculated for (Cl6H13NO ff 2 84.2933, observed 456.1767; UV Amax (DMF) 333 nm.
(実施例 2 2 )
2' ,3, ,4, ,5, ,o -Pentafluorophenyl l,3-Dioxo-5-nitro-lH-benz[de]isoquinoline- 2(3H)-acetate NI(N02)-OPfpの合成
- 32 - NI(N02)-0H (100 rag, 318 zmol) と PfpOH (70.2 mg, 381 〃mol) の DMF溶液 (10 mL) に EDC (73.2 mg, 382 j ml) を 0 ° C で加え、 この反応液を 0 ° C で 1時間室温で 12 時間撹拌した。 この反応液を減圧濃縮し、 残渣を水 ·クロ口 ホルム系で分配抽出した。 有機層を硫酸マグネシウムで乾燥し、 減圧濃縮したあ と、 残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (2.5% MeOH/CHCL) により精製し NI(N 02) - OPfp (130 mg, 85%) を得た。 Ή NMR (CDCh) δ 8.07 (s, 1 H), 7.44 (s, 1 H), 5.21 (s, 2 H), 4.14 (s, 3 H), 2.55 (s, 3 H)3 2.45 (s, 3 H); HRMS ( FAB+, NBA/CHzCL) calcd for C21H14O4N4F5 [(M+H) +] 481.0934, observed 481.0950; U V Xmax (DMF) 390, 460 (nm).
(実施例 23)
2-(N-(2-((ieri-Butoxy)carbonylamino)ethyl)-2-(l,3-dioxo-5-nitro-lH-benz[de]isoquin oline-2(3H))acethyIamino)acetic acid NI(N〇2)-BcPNA-OHの合成
NI(N02)-0Pfp (100 mg, 208 mol) と ,NA-0H (45.4 mg, 208 輝 1) の DM F溶液 (10 mL)に diisopropylethylamine (36.3 j l, 208 〃mol) を加え、 室温で 15時間撹拌した。 これを減圧濃縮し残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (10-5 0¾ MeOH/CHCls) により精製し ΝΙ(Ν02)-Β'ΤΝΑ-0Η (130 mg, 85%) を得た。 Ή NMR (C謹) (5 7.94 (s) and 7.86 (s) (1 H), 7.80 (s) and 7.75 (s) (1 H), 5.03
(s) and 4.88 (s) (2 H), 4.17 (s) and 4.13 (s) (3 H), 3.64 and 3.52 (2 H ), 3.38 and 3.26 (2 H), 2.58 (s) and 2.56 (s) (3 H), 2.46 (s) and 2.44 ( s) (3 H)3 1.46 (s) and 1.41 (s) (9 H); HRMS (FAB+, ΝΒΑ/CftCL·) calcd for C24H31O7N6 [(M+H)+3515.2252, observed 515.2273; UV え max (DMF) 390, 460 ( nm).
(実施例 24)
5-Acetylamino-l,3-dioxo-lH-benz[de]isoquinoline-2(3H)-acetic Acid NI(NHAc)-0
Hの合成
NI(NH2)-0H (100 mg, 0.37讓 ol)を pyridine (3 mL)と Ac20 (3 mL)に溶かし、 室 温で 1 5時間撹拌した。 減圧濃縮したあと dichloromethaneで洗い、 ろ過 ·乾燥さ せ NI (腿 c)-0H (103.2 mg, 89%)を得た。 Ή賺 (DMS0-d6) δ 8.79 (s, 1 H), 8 .61 (s, 1 H), 8.40 (d, J = 8 Hz, 1 H), 8.37 (d, J = 8 Hz, 1 H), 7.82 (t,
- 33 - J = 8 Hz, 1 H), 4.71 (s, 2 H)3 2.16 (s, 3 H).
(実施例 2 5 )
2, ,3, ,4, ,5, ,6, -Pentafluorophenyl 5-Acetylamino-l,3-dioxo-lH-benz[de]isoqui noline-2(3H)-acetate NI(NHAc)-OPfpの合成
NI(NHAc)-0H (97 mg, 0.31 腿 ol)と PfpOH (63 mg, 0.3 腿 ol) の匿溶液 ( 5 mL) に DCC (71 mg, 0.34腿 ol) を 0 ° C で加え、 この反応液を 0 。 C で 1 時間室温で 15 時間撹拌した。 この反応液をろ過後減圧濃縮し、 残渣をシリカゲル カラムクロマト法 (0-20% acetone/CHCls) により精製し NI(NHAc)-0Pfp (140 m g, 95%) を得た。 Ή NMR (CDCL) δ 8.96 (s, 1 H), 8.53 (d, J = 7.7 Hz, 1 H ), 8.32 (d, J二 1.6 Hz, 1 H), 8.20 (d, J = 7.7 Hz, 1 H), (t, J = 7.5 Hz , 2 H), 7.82 (brs, 1 H), 7.74 (d, J = 7.7 Hz, 1 H), 5.27 (s, 2 H), 2.28 (s, 3 H).
(実施例 26 )
2-(N-(2-((ieri-Butoxy)carbonylamino)ethyI)-2-(5-acetylamino-l,3-dioxo-lH-benz[de] isoquinoline-2(3H))acethylamino)acetic acid M(NHAc)-B。。PNA-OHの合成
NI (皿 Ac) - OPfp (140 mg, 0.29腿 ol) と B。雷- OH (67 mg, 0.30腿 ol) の DM F溶液 (5 mL)に diisopropylethylamine (54 juh, 0.30腿 ol) を加え、 室温で 1
5時間撹拌した。 これを減圧濃縮し残渣をシリカゲルカラムクロマト法 (2-20% MeOH/CHCL) により精製し NI (脆 c) -, NA-0H (117 mg, 85¾) を得た。 匿 ( DMSO-de) δ 8.4 - 7.3 (m, 5 H)3 5.05 (brs) and 4.90 (brs) (2 H), 3.76 (b rs) and 3.54 (brs) (2 H), 3.64 (s) and 3.49 (s) (2 H), 3.54 (brs) and 3. 41 (brs) (2 H), 2.15 (s) and 2.04 (s) (3 H), 1.48 (s) and 1.45 (s) (9 H)
(実施例 2 7 )
Succinimidyl i^4-Dimethylaminoazobenzene- 3' -carbonate JB~MR- OSuの合成 m-Methyl Red (iff-MR-0H; 110 mg, 0.41 励 1)と ^Hiydroxysuccinimide (60 mg , 0.52蘭 ol)の DMF溶液 (7 mL) に DCC (100 mg, 0.50腿 ol)を 0°Cで加え、 この反 応液を 30分したあと室温で 15時間撹拌した。 この反応液をろ過し、 減圧蒸留して 、 残渣をカラムクロマトグラフィー (CH2C12) に付して、 橙色粉末として
- 34 - su (124 mg; 82%) を得た。 Ή腿 (CDCb) δ 8.59 (s, 1 Η), 8.13 (t, J =9.1 Hz, 2 H), 7.90 (d, J = 9.1 Hz, 2 H), 7.61 (t, J = 7.9 Hz, 1 H), 6.77 (d
, J = 9.1 Hz, 2 H), 3.11 (s, 6 H), 2.93 (brs, 4 H).
(実施例 28 )
2-(iV-(2-( ( ί er ί-Butox ) carbon l amino ) ethyl )-2- (4-dimethylaminoazobenzene- 3, -carbonylamino)acethylamino)acetic acid MR-Gly- BePNA-0Hの合成
Gly-B。。PNA- OH (50 mg, 0.18臓 ol) の DMF溶液 (10 mL) に MR-OSu (73 mg, 0.20腿 ol) と triethylamine (350〃L, 2.7顧 ol) を順番に加え、 室温で 1 5時 間撹抨した。 反応終了後減圧濃縮し、 残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィ ― (0-10% MeOH/dichloromethane) に付し、 橙色粉末として MR-Gly-B°。PNA- 0H ( 95 mg, 100%) を得た。 ¾ NMR (難 0-ίめ δ 8.26 (s, 1 H), 7.92 (d, J = 7.6
Hz, 2 H)5 7.83 (d, J = 9.1 Hz, 2 H), 7.62 (t, J = 7.6 Hz, 1 H)5 6.88 (b rt) and 6.74 (brt) (1 H), 6.85 (d, J = 9.1 Hz, 2 H), 4.22 (d, J = 2.7 Hz , 2 H), 3.99 (s) and 3.89 (s) (2 H), 3.44 (t, J = 6.4 Hz, 1 H), 3.4-3.25
(brs, 4 H), 3.07 (s, 6 H), 1.39 (s) and i.37 (s) (9 H).
(実施例 29 )
2-(JV-(2-( ( ί er ί-Butoxy ) c arbonyl amino ) ethyl )-N, -( ( 1-pyrenyl-n-butyl )glycy l))'acetic acid Pyrene-Gly- B。TNA- OHの合成
Gly-B«PNA-0H (25 mg, 0.09腿 ol) の DMF溶液 (5 mL) に Pyrene - OSu (39 mg, 0.10腿 ol) と triethylamine (138 μΐ, 1.0雇 ol) を順番に加え、 室温で 15 時間撹拌した。 反応終了後減圧濃縮し、 残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフ ィ一 (0-10% MeOH/dichloromethane) に付し、 淡黄色粉末として Pyrene- Gly -, NA-0H (30 mg, 61%) を得た。 HRMS (FAB+) calcd for C31H35(M3Na [(M+Na)+] 568. 2526, observed 568.2429.
(実施例 30 )
Z-(N-(Z-( ( ieri-Butoxy ) carbony lamino )ethy 1 )-2-(7-diethylaminocoumarin-3-c arbonyl )glycyl )acetic acid Coumarin- Gly- B。。PNA-0Hの合成
Gly-B0CPNA-0H (12.7 mg, 0.046翻 ol) の MF溶液 (5 mL) に coumarin- OSu (1 5 mg, 0.042腿 ol) と triethylamine (55.5 jul, 0.4腿 ol) を順番に加え、 室温
- 35 - で 1 5時間撹拌した。 反応終了後減圧濃縮し、 残渣をシリカゲルカラムクロマト グラフィ一 (0- 20% MeOH/dichloromethane) に付し、 黄色粉末として Coumarin- G ly - B。'PNA- OH (23 mg, 100%) を得た。 Ή NMR (顏- め 5 8.68 (s) and 8.66 (s ) (1 H), 7.70 and 7.69 (each d, J = 9.1 Hz) ( 1 H), 6.89 (brt) and 6.75 ( brt) ( 1 H), 6.80 (d, J = 9.1 Hz, 1 H), 6.62 (s, 1 H), 4.25 (brd) and 4.0 7 (brd) (2 H), 4.13 (m, 1 H), 3.98 (s) and 3.89 (s) (2 H), 3.48 (q, J = 6.8 Hz, 4 H) , 3.35 (m, 2 H), 3.13 (brq) and 3.07 (brq) (2 H) , 1.37 (s) a nd 1.36 (s) (9 H), 1.14 (t, J = 6.8 Hz, 6 H) . 産業上の利用可能性
本発明による新規な機能性 P N Aモノマ一は、 遺伝子治療などに用いられる P NAの構築に用いることができる。 また、 本発明によれば、 機能性 P N Aモノマ —の、 互いに相補的な 2つの合成ルート B及び Cによって、 機能性分子の P N A への効率的な導入が可能になる。 したがって、 本発明は、 B o c型モノマ一ュニ ヅトあるいはベンジルォキシカルボニル一 ω—アミノ酸誘導体を用いた、 機能性 P N Αモノマーュニットの工業的合成等の産業において利用することができる。
- 36

Claims

請求の範囲
1 . 下記一般式 ( I )
Figure imgf000040_0001
(式中、 Aは
Figure imgf000040_0002
であり、 Bは
- 37 - 差替え用紙 (規則 26)
Figure imgf000041_0001
であり、 Rは H、 N02、 NH2、 NHCbz、 Br、 F、 CIまたは S03Na2 であり、 nは 1〜4の整数である。 ただし、 Aが
Figure imgf000041_0002
である場合、 Bは
Figure imgf000041_0003
である) で表される化合物。
2. t—ブトキシカルボニルアミノエチルァミンを機能性分子の誘導体と反応さ せ、 機能性分子を PN Aモノマーに導入することよりなる機能性 PNAモノマー の製造方法であって、 該機能性分子の誘導体が活性エステルであることを特徴と する、 前記製造方法。 .
3. 活性エステルが、 下記一般式 (I I) (II)
(式中、 Aは
38 -
Figure imgf000042_0001
であり、 Rは Η、 NO ΝΗ2、 NHCbz、 Br、 F、 CIまたは S03Na2 であり、 nは 1〜4の整数である)
で表される基を、 エステル結合を形成するカルボニル炭素に有することを特徴と する、 請求項 2に記載の製造方法。
4. 活性エステルが、 ペン夕フルオロフエノキシ基またはスクシンイミ ドォキシ 基をカルボニル炭素に有することを特徴とする、 請求項 2または 3に記載の製造 方法。
5. 請求項 3に記載の活性エステルを製造する方法であって、 機能性分子のカル
- 39 - 差替え用紙 (規則 26) ボン酸誘導体と、 ペン夕フルオロフエノキシ基またはスクシンイミドォキシ基を 有する化合物との反応を含むことを特徴とする、 前記方法。
6 . 請求項 5に記載の機能性分子のカルボン酸誘導体を製造する方法であって、 機能性分子の誘導体と脂肪族カルボン酸との反応を含むことを特徴とする、 前記 方法。
7 . 機能性分子から該機能性分子の誘導体を製造し、 該機能性分子の誘導体から 機能性分子の力ルボン酸誘導体を製造し、 該機能性分子の力ルポン酸誘導体から 活性エステルを製造し、 該活性エステルから機能性 P N Aモノマ一を製造するこ とを含む、 機能性分子から機能性 P NAモノマーを製造する方法において、 下記 a) ~ c ) :
a ) 前記機能性分子のカルボン酸誘導体の製造において、 機能性分子の誘導体と 脂肪族カルボン酸とを反応させること;
b ) 前記活性エステルの製造において、 機能性分子のカルボン酸誘導体とペン夕 フルオロフエノキシ基またはスクシンィミドォキシ基を有する化合物とを反応さ せること;および、
c ) 前記機能性 P N Aモノマーの製造において、 t —ブトキシカルボニルァミノ ェチルァミンを、 活性エステルである機能性分子の誘導体と反応させること; の 1または 2以上を含むことを特徴とする、 前記方法。
8 . 一般式 (I I I )
(III)
Figure imgf000043_0001
(式中、 R 1は水素原子または炭素数 1〜 5の直鎖若しくは分枝鎖状のアルキル基 、 mは 1〜1 1の整数を表す)
で表される ω _アミノ酸誘導体を機能性分子の誘導体と反応させ、 機能性分子を P N Αモノマーに導入することよりなる機能性 P N Αモノマーの製造方法であつ て、 該機能性分子の誘導体が活性エステルであることを特徴とする、 前記製造方 沄。
40
9. 活性エステルが、 下記一般式 (I I)
A^X (ID
(式中、 Αは
Figure imgf000044_0001
であり、 Rは H、 NO 2, NH2、 NHCbz、 Br、 F、 CIまたは S03Na2 であり、 nは 1~4の整数である)
で表される基を、 直接または脂肪鎖あるいはペプチド鎖を介して、 エステル結合 を形成するカルボニル基に有することを特徴とする、 請求項 8に記載の製造方法
- 41 - 差替え用紙 (規則 26)
10. 活性エステルが、 ペン夕フルオロフエノキシ基またはスクシンイミドォキ シ基をカルボニル炭素に有することを特徴とする、 請求項 8または 9に記載の製 造方法。
11. 機能性分子から活性エステルを製造し、 該活性エステルから機能性 PNA モノマ一を製造すること含む、 機能性分子から機能性 P N Aモノマ一を製造する 方法において、 前記機能性分子からの活性エステルの製造が、 m—メチルレヅド とスクシンイミドォキシ基を含む化合物とを反応させること、 および/または前 記活性エステルから機能性 PN Aモノマーの製造が、 一般式 (I I I)
(、in)ノ
Figure imgf000045_0001
(式中、 R 1は水素原子または炭素数 1〜 5の直鎖若しくは分枝鎖状のアルキル基
、 mは 1〜11の整数を表す)
で表される ω—アミノ酸誘導体を、 活性エステルである機能性分子の誘導体と反 応させ、 機能性分子を PN Αモノマ一に導入すること、 を含むこと特徴とする、 刖記方 。
42 補正書の請求の範囲
[2002年 4月 26日 (26. 04. 02) 国際事務局受理:出願当初の請求の範囲 1-11は取り下げられた;新しい請求の範囲 12- 48が加えられた。 (13頁) ]
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12 (追加)下記一般式 (I)
Figure imgf000046_0001
(式中、 Αは
-45- 補正された用紙 (条約第 19条)
Figure imgf000047_0001
であり、 Bは
-OH
Figure imgf000047_0002
46
補正された用紙 (条約第 19条) であり、 Rは H、 NO2, NH2、 NHCbz、 B r、 F、 CIまたは S03Na であり、 nは 1〜4の整数である。 ただし、 Aが
Figure imgf000048_0001
である場合、 Bは
Figure imgf000048_0002
である) で表される化合物。
13. (追加) t一ブトキシカルボニルァミノェチルァミン誘導体を機能性分子の 誘導体と反応させ、 機能性分子を P N Aモノマ一に導入することよりなる機能性 P N Aモノマーの製造方法であって、 該機能性分子の誘導体が活性エステルであ ることを特徴とする、 前記製造方法。
14. (追加)活性エステルが、 下記一般式 (I)
Figure imgf000048_0003
(式中、 Aは FAM rhodamin^ dansyl psoralen dabcyl chromane pyren naphthalimide. flavin HABA、 coumarinおよび biotirfi^ら選択され、 Bはペン 夕フルオロフェニルまたは N—ヒドロキシスクシンィミ ドであり、 そして nは 1
〜4の整数である) で表される光機能性分子の誘導体であり、 t—ブトキシカル ポニルァミノェチルァミン誘導体が、 下記式
Figure imgf000048_0004
で表され、 機能性 PN Aモノマーが、 下記一般式 (IV)
-47- 補正された用紙 (条約第 19条)
Figure imgf000049_0001
(式中、 Aおよび nは前記の意味を表す) で表される、 請求項 13に記載の製造 方法。
15. (追加)活性エステルが、 下記一般式 (I I)
Figure imgf000049_0002
(式中、 Aは
48
補正された用紙 (条約第 19条)
Figure imgf000050_0001
であり、 Rは H、 N02、 NH2s NHCbz、 B r、 F、 CIまたは S03Na であり、 nは 1〜4の整数である)
で表される基を、 エステル結合を形成するカルボニル炭素に有することを特徴と する、 請求項 13に記載の製造方法。
16. (追加)活性エステルが、 ペン夕フルオロフエノキシ基またはスクシンイミ ドォキシ基をカルボニル炭素に有することを特徴とする、 請求項 15に記載の製 造方法。
49
補正された用紙 (条約第 19条)
17. (追加) n= 1であることを特徴とする、 請求項 14または 15に記載の製 造方法。
18. (追加) Aが flavinであることを特徴とする、 請求項 14に記載の製造方法 o
19. (追加) Aが FAMであることを特徴とする、 請求項 14に記載の製造方法
20. (追加) Aが rhodamineであることを特徴とする、 請求項 14に記載の製造 方法。
2 1. (追加) Aが dabcylであり、 Bが N—ヒドロキシスクシンイミ ドであるこ とを特徴とする、 請求項 14に記載の製造方法。
22. (追加)光機能性分子の誘導体が、 下記式
Figure imgf000051_0001
で表される構造を有する、 請求項 14に記載の方法。
23. (追加)光機能性分子の誘導体が、 下記式で表される構造
Figure imgf000051_0002
で表される構造を有する、 請求項 14に記載の製造方法 c
24. (追加)光機能性分子の誘導体が、 下記式
Figure imgf000051_0003
50
補正された用紙 (条約第 19条) で表される構造を有する、 請求項 1 4に記載の製造方法 c
2 5 . (追加)光機能性分子の誘導体が、 下記式
Figure imgf000052_0001
で表される構造を有する、 請求項 1 4に記載の製造方法。
2 6 . (追加)光機能性分子の誘導体が、 下記式
Figure imgf000052_0002
で表される構造を有する、 請求項 1 4に記載の製造方法。
2 7 . (追加)光機能性分子の誘導体が、 下記式
Figure imgf000052_0003
で表される構造を有する、 請求項 1 4に記載の製造方法。
51
補正された用紙 (条約第 19条)
2 8 . (追加)光機能性分子の誘導体が、 下記式
Figure imgf000053_0001
で表される構造を有する、 請求項 1 4に記載の製造方法。
2 9 . (追加)請求項 1 3に記載の活性エステルを製造する方法であって、 機能性 分子のカルボン酸誘導体と、 ベン夕フルオロフエノキシ基またはスクシンイミド ォキシ基を有する化合物との反応を含むことを特徴とする、 前記方法。
3 0 . (追加)請求項 2 9に記載の機能性分子のカルボン酸誘導体を製造する方法 であって、 機能性分子の誘導体と脂肪族カルボン酸との反応を含むことを特徴と する、 前記方法。
3 1 . (追加)機能性分子から該機能性分子の誘導体を製造し、 該機能性分子の誘 導体から機能性分子のカルボン酸誘導体を製造し、 該機能性分子のカルボン酸誘 導体から活性エステルを製造し、 該活性エステルから機能性 P N Aモノマーを製 造することを含む、 機能性分子から機能性 P N Aモノマーを製造する方法におい て、 下記 a ) 〜c ) :
a ) 前記機能性分子のカルボン酸誘導体の製造において、 機能性分子の誘導体と 脂肪族カルボン酸とを反応させること;
b ) 前記活性エステルの製造において、 機能性分子のカルボン酸誘導体とペン夕 フルオロフヱノキシ基またはスクシンィミドォキシ基を有する化合物とを反応さ せること;および、
c ) 前記機能性 P N Aモノマ一の製造において、 t—ブトキシカルボニルァミノ ェチルァミンを、 活性エステルである機能性分子の誘導体と反応させること;
- 52 - 補正された用紙 (条約第 19条) の 1または 2以上を含むことを特徴とする、 前記方法 c
32. (追加)一般式 (I I I)
Figure imgf000054_0001
(式中、 : R 1は水素原子または炭素数 1〜 5の直鎖若しくは分枝鎖状のアルキル 基、 mは 1〜1 1の整数を表す)
で表される ω—アミノ酸誘導体を機能性分子の誘導体と反応させ、 機能性分子を ΡΝ Αモノマーに導入することよりなる機能性 ΡΝ Αモノマーの製造方法であつ て、 該機能性分子の誘導体が活性エステルであることを特徴とする、 前記製造方 法。
33. (追加)活性エステルが、 下記一般式 (V)
0
II
A-C- B (V)
、式中、 Aは FAM、 rhodamine^ dansvi, psoralen, dabcyl chromane pvrene naphthalimide, flavin HABA、 coumarinおよび biotin¾ ら選択され、 Bはペン 夕フルオロフェニルまたは N—ヒドロキシスクシンィミ ドであり、 そして nは 1 〜4の整数である) で表される光機能性分子誘導体であり、 機能性 PNAモノマ 一が、 下記一般式 (VI)
Figure imgf000054_0002
(式中、 A、 R1および mは、 前記にの意味を表す)
で表される、 請求項 32に記載の製造方法。
53
補正された用紙 (条約第 19条)
34. (追加)活性エステルが、 下記一般式 (I I)
Figure imgf000055_0001
(式中、 Aは
Figure imgf000055_0002
であり、 Rは H、 N02、 NH2、 NHCbz、 B r、 F、 CIまたは S03Na であり、 nは 1〜4の整数である)
で表される基を、 直接または脂肪鎖あるいはペプチド鎖を介して、 エステル結合 を形成するカルボニル基に有することを特徴とする、 請求項 32に記載の製造方
54
埔正された用紙 (条約第 19条) 法。
35. (追加)活性エステルが、 ペン夕フルオロフエノキシ基またはスクシンイミ ドォキシ基をカルボニル炭素に有することを特徴とする、 請求項 34に記載の製 造方法。
36. (追加)機能性分子から活性エステルを製造し、 該活性エステルから機能性 PN Aモノマ一を製造すること含む、 機能性分子から機能性 PN Aモノマーを製 造する方法において、 前記機能性分子からの活性エステルの製造が、 m—メチル レッドとスクシンイミ ドォキシ基を含む化合物とを反応させること、 および/ま たは前記活性エステルから機能性 PNAモノマーの製造が、 一般式 (I I I) ")
Figure imgf000056_0001
(式中、 R 1は水素原子または炭素数 1〜 5の直鎖若しくは分枝鎖状のアルキル 基、 mは 1〜11の整数を表す)
で表される ω—アミノ酸誘導体を、 活性エステルである機能性分子の誘導体と反 応させ、 機能性分子を PN Αモノマーに導入すること、 を含むこと特徵とする、 刖記方法。
37. (追加) m= 1であることを特徴とする、 請求項 33または 34に記載の製 造方法。
38. (追加) Aが flavinであることを特徴とする、 請求項 33に記載の製造方法
39. (追加) Aが F AMであることを特徴とする、 請求項 33に記載の製造方法 ο
40. (追加) Aが rhodamineであることを特徴とする、 請求項 33に記載の製造 方法。
41. (追加) Aが dabcylであり、 Bが N—ヒドロキシスクシンイミ ドであるこ とを特徴とする、 請求項 33に記載の製造方法。
-55- 補正された用紙 (条約第 19条)
42. (追加)光機能性分子が、 下記式
Figure imgf000057_0001
で表される構造を有する、 請求項 33に記載の製造方法 (
43. (追加)光機能性分子が、 下記式
Figure imgf000057_0002
で表される構造を有する、 請求項 33に記載の製造方法 <
44. (追加)光機能性分子が、 下記式
Figure imgf000057_0003
で表される構造を有する、 請求項 33に記載の製造方法。
45. (追加)光機能性分子が、 下記式
Figure imgf000057_0004
で表される構造を有する、 請求項 33に記載の製造方法 c
-56- 補正された用紙 (条約第 19条)
46. (追加)光機能性分子が、 下記式
Figure imgf000058_0001
で表される構造を有する、 請求項 33に記載の製造方法。
47. (追力 α)光機能性分子が、 下記式
Figure imgf000058_0002
を有する、 請求項 33に記載の製造方法 c
48. (追加)光機能性分子が、 下記式
Figure imgf000058_0003
で表される搆造を有する、 請求項 33に記載の製造方法 c
■57·
補正された用紙 (条約第 19条)
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