WO1998042835A1 - Genes humains - Google Patents

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WO1998042835A1
WO1998042835A1 PCT/JP1998/001146 JP9801146W WO9842835A1 WO 1998042835 A1 WO1998042835 A1 WO 1998042835A1 JP 9801146 W JP9801146 W JP 9801146W WO 9842835 A1 WO9842835 A1 WO 9842835A1
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PCT/JP1998/001146
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Takashi Tokino
Yusuke Nakamura
Original Assignee
Otsuka Pharmaceutical Co., Ltd.
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Definitions

  • the present invention relates to a gene useful as a guide for the prevention, diagnosis and treatment of human diseases, and more specifically, to a human gene under specific transcriptional control by the tumor suppressor gene P53, Genes that can be used to develop therapeutic methods.
  • Mutations in the tumor suppressor gene P53 are among the most ubiquitous genetic mutations found in human cancer and are considered to be one of the most important genes involved in human carcinogenesis. , et al., Science (Washington DC), 253: 49-53, 1991).
  • p53 acts as a transcription factor [Vogelstein B., et al., Cell, 70: 523-526, 1992], and by binding to sequence-specific DNA, p21 / WAF1, MDM2, It has been confirmed that it activates various genes such as GADD45, BAX, cyclin G, IGF-BP3, PCNA and GML [EI-Deiry WS, et al., Cell, 75: 817-825, 1993; Wu X., et al., Genes Dev., 7 ⁇ 1126-1132, 1993; Kastan MB, et al., Cell, 71: 587-597, 1992; iyashita T., et al., Cell, 80 : 293-299, 1995; Okamoto K., et al., EMBO.
  • the present inventors have functional p 5 3 binding site of human genome (functional P 53 -binding sites or p 5 3 Tagusai DOO: p53- tagged sites) to close the [rho &'3 of the target gene candidate
  • functional P 53 -binding sites or p 5 3 Tagusai DOO: p53- tagged sites to close the [rho &'3 of the target gene candidate
  • the present invention relates to a novel target gene (p53-target genes) or p53-inducible genes of the tumor suppressor gene p53, ie, a novel gene under specific transcriptional control by p53.
  • the purpose is to find human genes, identify them, and provide desired information desired in the art. Disclosure of the invention
  • the present inventors isolated a novel gene induced by wild-type p53 in the cloning of functional p53 chromosome from human genome, and found that this was a novel human gene meeting the above-mentioned object. And found that the present invention was completed.
  • the present invention relates to a human gene comprising a nucleotide sequence encoding all or a part of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, particularly a gene comprising all or a part of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2.
  • FIG. 9 presents photographs showing the results of RT-PCR analysis of expression of p53-induced mRNA in colon cancer cell line SW480 lacking type p53 allele.
  • FIG. 2 is a photograph showing the results of Northern blot analysis of P 2 XM in human tissue.
  • FIGS. 3 and 4 show the genomic organization of the P2XM gene.
  • FIG. 3 shows the nucleotide sequence of the exon / indone boundary of the 191 gene, and)-'in FIG. The locations of the Son and P53 binding sites are shown, and
  • FIG. 4 (c) shows a comparison between the p53 binding site of the cosmid p53-191 and the p53 consensus binding sequence.
  • FIGS. 5 and 6 are diagrams showing amino acid sequences of various P 2 X receptors.
  • FIG. 7 is a diagram showing another embodiment splicing variant.
  • FIGS. 8 to 10 are photographs showing the results of RT-PCR analysis of splicing variant expression in skeletal muscle and various cancer cell lines.
  • FIG. 11 is a photograph showing the result of fluorescence in situ hybridization. BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION
  • the gene of the present invention is represented by a single-stranded DNA sequence, for example, as shown in SEQ ID NO: 2, but the present invention also includes a DNA sequence complementary to the single-stranded DNA sequence and a component containing both of them. Also encompasses.
  • the sequence of the gene of the present invention shown in SEQ ID NO: 2 is a single combination of codons representing each amino acid residue encoded thereby.
  • the gene of the present invention is not limited to this, and it is of course possible to have a nucleotide sequence in which arbitrary codons are combined and selected for each amino acid residue. The selection of the codon can be performed according to a conventional method, for example, considering the frequency of codon usage of the host to be used (Nucleic Acids Res., 9 43-74, 1981).
  • the gene of the present invention encodes the same amino acid having the same function as that of the amino acid sequence shown above, in which a part of the amino acid sequence or the amino acid sequence is modified by substitution, deletion, addition or the like. DNA sequences are also included. Production, modification (mutation), etc. of these polypeptides may occur naturally, and natural genes (for example, genes of the present invention) may be prepared by post-translational modification or by genetic engineering techniques.
  • the gene shown in SEQ ID NO: 2 according to the present invention is a gene under the specific transcriptional control of p53, and its expression is activated by p53 in a living body, which is considered to contribute to the suppression of cancer. . Therefore, gene therapy aimed at expressing the gene of the present invention or administration of the gene product of the present invention to a living body is considered to be extremely useful for prevention and treatment of cancer.
  • the cancer suppressive function of p53 is lost as in the case of hereditary high carcinogenesis, i-Fraumeni syndrome, LOH of P53 gene, and various cancers with mutations. As a result, it is considered that the use of the present gene or the gene product is suitable for individuals who are considered to become cancerous.
  • the P53-related protein encoded by each of the above genes can be easily and stably obtained. Can be manufactured.
  • a specific antibody can be prepared using each protein obtained by using the gene of the present invention.
  • a protein produced in large quantities according to the above-mentioned genetic engineering technique can be used, and the obtained antibody may be either a polyclonal antibody or a monoclonal antibody. It can be used advantageously for measurement and identification.
  • the gene of the present invention can be easily produced by general genetic engineering techniques based on the sequence information disclosed by the present invention [Molecular Cloning 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989); “See Gene Research Methods III, IIIJ, The Japanese Biochemical Society (1986), etc.].
  • a desired clone is selected from a human cDNA library (prepared from an appropriate source cell in which each gene is expressed) by an appropriate probe specific for the gene of the present invention.
  • examples of the source cell include various cells and tissues expressing the target gene, and cultured cells derived therefrom.Separation of all RNA, isolation and purification of mRNA, conversion to cDNA Both (synthesis) and cloning thereof can be performed according to a conventional method.
  • cDNA libraries are commercially available, and in the present invention, such cDNA libraries, for example, Clontech Co., Ltd. (Clontech Lab. Inc.) or other commercially available cDNA libraries can also be used.
  • the screening method includes, for example, a method of selecting a corresponding cDNA clone from a protein produced by cDNA by immunoscreening using the protein-specific antibody, and selecting a target DNA sequence. Plaque hybridization, colony hybridization using a probe that specifically binds to ', and the like, and combinations thereof.
  • a DNA sequence or the like chemically synthesized based on the information on the DNA sequence of the gene of the present invention is generally used. It can be used as a probe.
  • sense'primer and antisense'primer can also be used as screening probes.
  • a DNA / RNA amplification method by a PCR method can be suitably used.
  • the lace method RACE: Rapid amplification of cDNA ends; Experimental Medicine, J (6): 35-38, 1994
  • 5'-RACE CFrohman MA et al., Pro Natl. Acad. Sci. USA, 8 ⁇ 8998-9002, 1988
  • the primer used for adopting such a PCR method can be appropriately set based on the sequence information of the gene of the present invention which has already been revealed by the present invention, and can be synthesized according to a conventional method.
  • the amplified DNA / RNA fragment can be isolated and purified according to a conventional method as described above, for example, by gel electrophoresis.
  • Determination of the nucleotide sequence of the gene of the present invention or various DNA fragments obtained above can be performed according to a conventional method, for example, the didequine method [Pro Natl. Acad. Sci. USA, 74 5463-5467, 1977] or the Maxam-Gilbert method [Method in Enzymology, 65: 499, 1980].
  • a base sequence can be easily determined using a commercially available sequence kit or the like.
  • the eukaryotic cells include cells such as vertebrates and yeast, and the vertebrate cells include, for example, COS cells which are monkey cells [Cell, 23: 175-182, 1981]. Chansters' hamster ovary cells and their dihydrofolate reductase deficient strain roc. Natl. Acad. Sci. USA, 77: 4216-4220, 1980], etc. Absent.
  • a vertebrate expression vector those having a promoter, an RNA splice site, a polyadenylation site, a transcription termination sequence, etc., which are usually located upstream of the gene to be expressed, can be used. It may have a starting point.
  • An example of the expression vector is p SV 2dMr CMol. Cell. Biol., 854, 1981, which has an early promoter of SV40.
  • yeasts are generally used, and among them, yeast belonging to the genus Saccharomyces can be advantageously used.
  • yeast for example, PAM82CProc. Natl. Acad. Sci.
  • the expression vector of the gene of the present invention include prokaryotic gene fusion vectors.
  • specific examples of the vector include, for example, a GST domain (S. japonicum) (derived from japonicum), pGEX-2TK and pGEX-4T-2.
  • Escherichia coli and Bacillus subtilis are commonly used as prokaryotic hosts.
  • a plasmid vector that can be replicated in the host bacterium is used, and a promoter and an SD (Shine and Dalgarno) are located upstream of the gene so that the gene of the present invention can be expressed in the vector.
  • an expression plasmid having a nucleotide sequence and an initiation codon (eg, ATG) required for initiation of protein synthesis.
  • Escherichia coli K12 strain or the like is often used, and as a vector, pBR322 and its improved vector are commonly used, but are not limited thereto.
  • a vector pBR322 and its improved vector are commonly used, but are not limited thereto.
  • Various known strains and vectors can also be used.
  • the promoter for example, a tryptophan (trp) promoter, an lpp promoter, a lac promoter, a PL / PR promoter, or the like can be used.
  • the obtained transformant can be cultured according to a conventional method, and the culture produces and expresses the target protein encoded by the gene of the present invention.
  • the medium used for the culture various types commonly used depending on the host cell used can be appropriately selected and used, and the culture can be carried out under conditions suitable for the growth of the host cell.
  • the desired recombinant protein is expressed, produced, accumulated or secreted inside, outside, or on the cell membrane of the transformant.
  • Each recombinant protein may be subjected to various separation operations utilizing its physical properties, chemical properties, etc., if desired [Biochemical Data Book II], pp. 175-1259, 1st edition, 1st printing, June 1980 Sep. 23, Tokyo Chemical Co., Ltd .; Biochemistry, 25 (25): 8274 8277, 1986; see Eur. J. Biochem., 163 ⁇ 313-321, 1987, etc.].
  • the method includes, for example, ordinary reconstitution treatment, treatment with a protein precipitant, and the like.
  • Examples thereof include various liquid chromatography such as (HPLC) and the like, a dialysis method, and a combination thereof.
  • a particularly preferable example of the above method is affinity chromatography using a column to which a desired protein is bound.
  • the primers used are not particularly limited as long as they are specific to the gene of the present invention capable of specifically amplifying only the gene of the present invention.
  • the sequence can be set as appropriate. Usually, it can have a partial sequence of about 20 to 30 nucleotides according to a conventional method.
  • the present invention also provides a primer and a probe or probe useful for detection unique to such a novel human gene.
  • the p53 tag site (clone P533-191) was identified according to the method of Tokino et al. [Tokino T., et al., Hum. Mol. Gene, 3 ⁇ 1537-1542, 1994].
  • the cosmid library of human peripheral blood lymphocytes was screened using a [ 32 P] -labeled probe containing p53.
  • the obtained cosmid: p53-cos191 was digested with EcoRI, and the EcoRI fragment and the main fragment were digested with pBluescript llSK (-) (Stratagene). Subcloned. DNA sequencing was performed on an ABI 377 DNA sequencer using a kit (Taq Dye Deoxy Terminator Cycle Sequencing Kit; ABO).
  • the cosmid P53-c0s191 is digested with BamHI and Bg1II, and the restriction enzyme fragment is digested with BamHI of exon trap vector pSPL3 (Gibco-BRL). It was subcloned on site and introduced into COS7 cells using Lipofect ACE (Gibco-BRL). After culturing the cells for 24 hours, total RNA was prepared using TRIZ ⁇ L (Gibco-BRL). First-strand cDNA synthesis and PCR amplification of spliced fragments were performed according to the method of North et al. [North M. 'et al., Mamm. Genome, 4: 466-474, 1993].
  • the cDNA fragment was subcloned into pB1uescrypt IIS K (-) and sequenced using T3 or T7 primers as described above.
  • a cDNA amplification kit (Marathon cDNA amplification kit; Clontech)
  • skeletal muscle poly (A) + RNA was used as the type I 5'1 and 3 ' —Attached to RACE.
  • the amplified cDNA was used for 3% NuSieve GTG (2: l) agarose gel. And separated.
  • the blocks were washed at 50 ° C (0.1XSSCZ 0.1% SDS) and exposed to autoradiography at 80 ° C for 24 hours.
  • FISH was performed according to the method of Inazawa et al. [Inazawa J., et al., Genomics, 17: 153-162, 1993].
  • Metaphase human chromosomes were prepared according to the conventional method (thymidine synchronization I bromodeoxyuridine release technique) .
  • metaphase cells were stained (Hoechst 33258) and irradiated with UV light.
  • p53-c0s191 was labeled with nick-transition-based pyotin-16-d UTP and hybridized with denatured metaphase chromosomes A1u repeat-like scatter Chromosomal in situ suppression hybridization was used to remove the noise signal due to the repeated sequence, which was detected by FITC-avidin. Detailed localization of the replication signal was performed by visualization of the replicated G band.
  • DNA comparison was performed by non-redundant nucleic acid sequence databese or norrredundant protein sequence databese performed by overnight search using the FASTA program; Human Genome Center, Institute of Medical Science, The University of Tokyo) ⁇ ⁇ ;
  • FIG. 1 the expression of P 5 3 induction m RNA RT in colon cancer cell line SW 4 8 0 lacking wild-type P 5 3 allele -
  • SW480 was transiently transformed with p53-wt (W) or p53-273 (M), and the expression of the P2XM gene was confirmed by RT-PCR amplification. did.
  • the RNA sample was subjected to a reverse transcription reaction in the presence (10) or absence (1) of reverse transcriptase (RT). RNAi type was controlled by amplification of the GAP DH transcript, which gave comparable signals in both samples.
  • the cDNA has a 193-bp open reading frame encoding a protein of 431 amino acids.
  • the entire DNA sequence is as shown in SEQ ID NO: 3. That is, the coding region of the P2XMc DNA is represented by nucleotide numbers 46 to 133, and the potential transmembrane domains (M1 and M2) are 33 to The analogous segment (H) of the 49th and 32 4 to 3 4 4 amino acid sequences and the voltage-gated K + channels H5 region existed at amino acid numbers 36 to 319.
  • FIG. 2 is a photograph showing the results of Northern blot analysis of P2XM in human tissues.
  • FIG. 3 shows the results of hybridizing a block of poly (A) + RNA (2 / g / lane) from Small intestine, Colon, Leukocyte) with P-2 XM cDNA.
  • the amino acid sequence according to the present invention was identified as ATP-gated ion channel (P2X) receptor family [Valera S., et al., Nature, 37L 516-519. , 1994; Brake AJ, et al., Nature, 37 ⁇ 519-523, 1994], and in particular, rat P2X6 CCollo G., et al., J. Neurosci., 16 : 2495-2507 1996) and 80% identity (see Figures 5 and 6).
  • P2X ATP-gated ion channel
  • FIGS. 3 and 4 show the genomic organization of the ⁇ 2 ⁇ gene.
  • FIG. 3 (a) shows the nucleotide sequence of the exon Z intron boundary of the 191 gene. The exon and intron sequences are shown in uppercase and lowercase, respectively.
  • (b) shows the location of the exons by numbered boxes according to their size.
  • (c) shows a comparison of the p53 consensus binding sequence with the p53 consensus binding sequence of cosmid p53-191, and the arrow indicates the p53 consensus binding sequence. (Penyu Maichi).
  • Uppercase nucleotides indicate a genomic sequence that matches the consensus
  • lowercase letters indicate a sequence that differs from the consensus sequence.
  • FIGS. 5 and 6 show the amino acid sequences of various P 2 X receptors.
  • the boxed residues indicate the sequence of P 2 XM and the rat P 2 XI—P 2 X 7 receptor. Saved in common.
  • the upper line shows two conserved hydrophobic regions (Ml and M2) and H5.
  • the asterisk indicates the potential N-linked glycosylation site of P2XM.
  • Amino acid sequences encoded by such genes of the invention also have the basic features of the P2X receptor family, similar to that of the human P2X receptor family. It is considered a new member of the United States.
  • p53-cosl91 Comparison of the above cDNA and its corresponding genomic DNA sequence (p53-cosl91) revealed the genomic organization of this gene, including the exon / intron boundary and the DNA sequence near the adjacent intron (see Figure 3). ). This gene spans a genomic region of about 12 kb and consists of 12 exons (see Figure 4b). The p53 tag site is located about 1.6 kb downstream of this gene (see FIG. 4, b and c). Fluorescence in situ hybridization (FISH) using cosmid p53—cosl91 as a probe confirmed that the chromosomal location of this gene was 22q11 (see Figure 11: Specificity). Hybridization signal was found in human chromosome band 22q11, and no signal was found on other chromosomes).
  • FISH Fluorescence in situ hybridization
  • FIG. 7 shows a schematic diagram of this alternative embodiment splicing.
  • Major from normal skeletal muscle RT—PCR amplification products are indicated by N1 and N2.
  • the three types of variants are designated AL1, AL2 and AL3.
  • Each of these alternative splicing transcripts lacked a multiple of three nucleotides, and all maintained their reading frames.
  • exons 1-2 and exons 11 correspond to the transmembrane regions M1 and M2, respectively.
  • the Ml and M2 regions are said to form an ion pore and ion-bindin site together with the proximal hydrophobic segment (H5) encoded by exon 10 [Valera S., et al. , Nature, 371: 516-519, 1994; Brake AJ, et al., Nature, 37h 519-523, 1994). According to structural predictions, these exons appear to encode domains important for biological function.
  • RT-PCR was performed as described above using total RNA (200 ng) prepared from a cell line, and each lane (Cell lines) was composed of a striated muscle (A204: lane 1, A673 : Lane 2, Hs729T: Lane 3, RD: Lane 4), liposarcoma (SW872: Lane 5) and osteosarcoma (NY: Lane 6, Hu03Nl: Lane 7).
  • PCR amplification was carried out using cDNA prepared from skeletal muscle total RNA (200 ng) and diluted (1, 1: 2, 1: 4, 1: 8, 1:16, 1:32). The results are shown together ("Skeletal muscle" lane) ⁇
  • Figures 8 and 9 show the results for N1, AL2, AL2 and AL3, respectively. As shown, their PCR product sizes are 392, 314, 450, 384 and 306 bp, respectively. RNA type II was controlled through amplification of GAPDH, which gave similar signals in all samples (Fig. 10).
  • RD RD
  • Hu03Nl osteosarcoma
  • a novel p53-inducible gene which is considered to be a new member of the P2X family that encodes ATP-gated ion channels has been isolated.
  • a p53 binding sequence was found approximately 1.6 kb downstream of the gene by sequencing of the entire cosmid DNA containing this gene.
  • Functional P53 binding sites for genes controlled by p53 have hitherto been found in the intron or promoter regions of these genes.
  • the functional p53 binding site was located downstream thereof.
  • the amino acid sequence deduced from the cDNA of the present invention has homology to members of the P2X receptor family, particularly rat P2X6 (80% identity).
  • rat P2X6 mRNA was found in a large area of the brain, this gene was specifically expressed in skeletal muscle, and therefore, It is not considered a homolog.
  • the P2X receptor is classified as ATP-gated ion channels, and extracellular ATP such as cell death and synaptic transmission. It has been reported to function as a mediator of inducible biological activity [Zhengshi M., et al., J. Cell Biol., ⁇ 3 ⁇ 279-288 1991; Zotewei j JP, et al., Biochem.
  • RP-2 has been isolated by subtractive hybridization from mRNAs induced in rat thymocytes undergoing apoptosis by gamma irradiation [0wens GP, et al., Mol. Cell. Biol., ⁇ : 4177-4188 1991].
  • ATP induces cell death in thymocytes, hepatocytes and various lymphocyte cell lines by increasing intracellular calcium concentration. According to these facts, it is considered that the gene of the present invention is closely involved in P53-dependent apoptosis (probably mediated by extracellular ATP) in skeletal muscle.
  • This peptide has key features of members of the P2X family (ATP- gated ion channels) and is activated in thymocytes that have been induced to progra hidden cell death. Similar to the gene, RP-2. This gene is mainly expressed in skeletal muscle and was named P2XM (P2X specifically expressed in skeltal muscle). The P2XM gene appears to be involved in the suppression of cell proliferation and / or apoptosis in skeletal muscle.
  • This gene was significantly suppressed in one of the four striated muscle cell lines tested. Minor splice variants lacking a portion of exon 1 encoding the transmembrane region M1 were relatively prevalent in two of the seven cancer cell lines tested. This suggests that the proportion of mutant products resulting from this splicing is significantly increased in these cancer cell lines.
  • This gene was located on chromosome band 22q11, a known deletion in rhabdoid tumors.
  • a novel human gene under specific transcriptional control by the tumor suppressor gene p53 is provided, and by using the gene, detection of expression of the gene in various tissues, The structure and function of the encoded product can be analyzed, and the gene product can be produced by genetic engineering, which is useful for elucidation of the occurrence, progression, metastasis, etc. of cancer and its diagnosis, prevention, and treatment Technology is provided. Sequence listing
  • Sequence type nucleic acid
  • ATGGGCTCCC CAGGGGCTAC GACAGGCTGG GGGCTTCTGG ATTATAAGAC GGAGAAGTAT 60 GTGATGACCA GGAACTGGCG GGTGGGCGCC CTGCAGAGGC TGCTGCAGTT TGGGATCGTG 120 GTCTATGTGG TAGGGTGGGC GCTCCTCGCC AAAAAAGGCT ACCAGGAGGGGGCGGA
  • CCGTCCGTCC CACTGGCTAA CTGCTGGGTC GACGAGGACT GCCCCGAAGG GGAGGGAGGC 420
  • ACACACAGCC ACGGTGTAAA AACAGGCCAG TGTGTGGTGT TCAATGGGAC CCACAGGACC 480
  • GCCCAGGCCC AGAACTTCAC ACTGTTCATC AAAAACACAG TCACCTTCAG CAAGTTCAAC 600 TTCTCTAAGT CCAATGCCTT GGAGACCTGG GACCCCACCT ATTTTAAGCA CTGCCGCTAT 660
  • Sequence type nucleic acid
  • Trp Trp Glu Gin Pro Gly Val Glu Ala Arg Thr Leu Leu Lys Leu Tyr

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Description

明 細 書 ヒ ト遺伝子 技術分野
本発明は、 ヒトの疾患の予防、 診断及び治療の指針として有用な遺伝子、 より 詳しくは、 癌抑制遺伝子 P 5 3による特異的な転写制御下にあるヒ ト遺伝子に関 し、 遺伝子診断並びに新しい治療法の開発に利用可能な遺伝子に関する。 背景技術
癌抑制遺伝子 P 5 3の変異は、 ヒ ト癌に見出される遺伝的変異において最も普 遍的なものであり、 ヒ トの発癌に関与する最も重要な遺伝子のひとつとされてい る 〔Hollstein M. , et al., Science (Washington DC), 253: 49-53, 1991) 。 p 5 3は転写因子として作用し 〔Vogelstein B. , et al. , Cell, 70: 523-526, 1992) 、 配列特異的な DN Aへの結合により、 p 2 1 /WAF 1、 MDM 2、 GADD 4 5、 BAX、 cyclin G、 I GF— BP 3、 PCNA及びGML等の 各種遺伝子を活性化することが確認されている 〔EI- Deiry W. S. , et al., Cell, 75: 817-825, 1993 ; Wu X. , et al. , Genes Dev. , 7^ 1126- 1132, 1993 ; Kastan M. B. , et al. , Cell, 71: 587-597, 1992 ; iyashita T. , et al. , Cell, 80: 293-299, 1995 ; Okamoto K., et al. , EMBO. J. , 13: 4816-4822, 1994 ; Buckbinder し, et al. , Nature, 377^ 646-649, 1995 ; Morris G. E., et al., Pro Natl. Acad. Sci. USA, 93: 895-899, 1996 ; Furuhata T. , et al., Oncogene, 13: 1965-1970, 1996 〕 。 このう ち、 p 2 1 / WA F l 、 BAX及び GMLは、 p 5 3により仲介される細胞周期停止及びアポトーシスの 主要因子と思われる。 また、 GADD 4 5は、 DNA修復に重要な役割を果たし ている。 しかして、 p 5 3によって制御されている遺伝子の確認は、 p 5 3の生物生理 学的機能の解明に必須である。 すなわち、 かかる p 5 3標的遺伝子の同定、 解明 は、 癌研究の分野はもとより、 その標的遺伝子を利用する新しい癌の診断乃至治 療法の開発の面からも斯界で望まれているところである。
尚、 本発明者等は、 ヒ トゲノムの機能的 p 5 3結合部位 (functional P53 -binding sites或は p 5 3タグサイ ト : p53- tagged sites) の近隣に ρ &'3標的 遺伝子の候補を見出すようにデザィンされた方法を確立しており、 この方法に関 して、 本発明者はその発現が抗癌剤の感受性に相関すると考えられている GML の単離に既に成功している 〔Furuhata,T. , et al., Oncogene, 13: 1965-1970, 1996〕 。
本発明は、 癌抑制遺伝子 p 5 3の標的遺伝子 (p53-target genes) 或は p 5 3 誘導型遺伝子 (p53- inducible genes) 、 すなわち p 5 3による特異的な転写制 御下にある新規なヒト遺伝子を見出し、 これを同定して斯界で要望される所望の 情報を提供することを目的とする。 発明の開示
本発明者等は、 ヒトゲノ厶からの機能的 p 5 3夕グサイトのクローニングにお いて、 野生型 p 5 3によって誘導される新規な遺伝子を単離し、 これが上記目的 に合致する新規なヒト遺伝子であることを見出し、 ここに本発明を完成するに至 つた o
すなわち、 本発明は、 配列番号: 1で示されるアミノ酸配列の全部又は一部を コードする塩基配列を含むヒト遺伝子、 特に、 配列番号: 2で示される塩基配列 の全部又は一部を含む遺伝子を提供するものである。 図面の簡単な説明
図 1は、 野生型 p 5 3による P 2 XM遺伝子発現の誘導を調べるために、 野生 型 p 5 3アレルを欠く大腸癌細胞株 SW 4 8 0における p 5 3誘導 mRNAの発 現を RT— P CRにより解析した結果を示す写真である。
図 2は、 ヒ ト組織における P 2 XMのノーザンブロッ ト解析結果を示す写真で める。
図 3及び 4は、 P 2 XM遺伝子のゲノム構成を示す図であり、 図 3は 1 9 1遺 伝子のェクソン/ィント口ン境界のヌクレオチド配列を示し、 図 4の )-'はェク ソ ン及び P 5 3結合部位の存在位置を示し、 図 4の(c) はコス ミ ド p 5 3— 1 9 1の p 5 3結合部位と p 5 3コンセンサス結合配列の比較を示す。
図 5及び 6は、 各種 P 2 Xレセプターのァミ ノ酸配列を示す図である。
図 7は、 別態様スプライシングバリアントを示す図である。
図 8〜 1 0は、 骨格筋及び各種癌細胞株におけるスプライシングバリアン トの 発現を R T - PCRにより解析した結果を示す写真である。
図 1 1は、 蛍光 in situ ハイブリダィゼーシヨンの結果を示す写真である。 発明を実施するための最良の形態
以下、 本明細書におけるアミノ酸、 ペプチド、 塩基配列、 核酸等の略号による 表示は、 I UPAC、 I UBの規定、 「塩基配列又はアミノ酸配列を含む明細書 等の作成のためのガイ ドライン」 (特許庁編) 及び当該分野における慣用記号に 従うものとする。
本発明遺伝子の一具体例としては、 後述する実施例に示される 「P 2 XM」 と 名付けられたクローンの有する DN A配列から演繹されるものを挙げることがで き、 その塩基配列は、 配列表に示される通りである。
本発明遺伝子は、 例えば配列番号: 2で示されるように、 一本鎖 DNA配列で 表されるが、 本発明はかかる一本鎖 D N A配列に相補的な D N A配列やこれらの 両者を含むコンポーネントもまた包含する。 尚、 配列番号: 2に示す本発明遺伝 子の配列は、 これによりコードされる各ァミノ酸残基を示すコ ドンの一つの組合 せ例であり、 本発明遺伝子はこれに限らず、 各アミノ酸残基に対して任意のコド ンを組合せ選択した塩基配列を有することも勿論可能である。 該コドンの選択は 常法に従うことができ、 例えば利用する宿主のコドン使用頻度を考慮することが できる (Nucleic Acids Res. , 9ι 43-74, 1981 〕 。
更に本発明遺伝子には、 上記で示されるァミノ酸配列の一部のァミノ酸乃至ァ ミノ酸配列を置換、 欠失、 付加等により改変してなり、 同様の機能を有する同効 物をコードする DNA配列もまた包含される。 これらポリペプチドの製造、 改変 (変異) 等は天然に生じることもあり、 また翻訳後の修飾により或は遺伝子工学 的手法により、 天然の遺伝子 (例えば本発明の具体例遺伝子) を、 例えばサイ ト スぺシフィ ック ' ミ ュー夕ゲネシス (Methods in Enzymology, 154^ p.350, 367 -382, 1987 ; 同 p.468, 1983 ; Nucleic Acids Res. , 12: p.9441, 1984 ; 続生化学実験講座 1 「遺伝子研究法 II」 、 日本生化学会編, P.105, 1986〕 等 の方法により改変したり、 リ ン酸トリエステル法やリ ン酸ァミダイ ト法等の 化学合成手段 〔 Am. Chem. So , 89: p.4801, 1967 ;同 p.3350, 1969; Science, 150: p.178, 1968 ; Tetrahedron Lett., 22: p.1859, 1981 :同 24: p.245, 1983) により変異させた D N Aを合成したり、 或はそれらの組合せによ り収得することができる。
本発明にかかる配列番号: 2に示す遺伝子は、 p 5 3による特異的な転写制御 下にある遺伝子であり、 生体において p 5 3によりその発現が活性化され、 癌の 抑制に寄与すると考えられる。 従って、 本発明遺伝子の発現を目的とする遺伝子 治療或は本発明遺伝子産物の生体への投与は、 癌の予防及び治療に極めて有用で あると考えられる。 殊に、 遺伝性の高発癌体質であるし i- Fraumeni症候群や、 P 5 3遺伝子の LOHや、 変異が認められる各種の癌等の場合のように p 5 3に よる癌抑制機能が失われた結果として癌化に向かうとされる個体において、 本発 明遺伝子乃至同遺伝子産物の利用が好適と考えられる。
尚、 上記した本発明遺伝子を利用する遺伝子治療或は同遺伝子産物を利用する 癌処置においては、 必ずしも本発明遺伝子又はそのコードする産物の全て、 すな わち全配列からなる遺伝子或は産物が必要とされることはなく、 本発明にかかる 配列番号: 2に示す遺伝子における所望の機能と実質的に同質な機能を保持する 限りにおいて、 前記したそれらの改変体或はそれらの一部配列からなる遺伝子或 は産物が良好に使用できる。
本発明遺伝子を利用して、 すなわち例えば、 これを微生物のベクターに組込み、 形質転換された微生物を培養することによって、 上記各遺伝子でコー ドされる P 5 3関連蛋白を容易にかつ安定して製造することができる。
また本発明の遺伝子を利用して得られる各蛋白を用いて、 特異抗体を作成する こともできる。 ここで抗原として用いられるコンポーネントとしては、 上記遺伝 子工学的手法に従って大量に産生される蛋白を用いることができ、 得られる抗体 はポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体のいずれでもよく、 それぞれの蛋 白の精製、 測定、 識別等に有利に利用できる。
本発明遺伝子は、 本発明によって開示された配列情報に基づいて、 一般的遺伝 子工学的手法により容易に製造できる 〔Molecular Cloning 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989) ;続生化学実験講座 「遺伝子研究法し Π、 IIIJ 、 日本生化学会編 (1986) 等参照〕 。
例えば、 ヒ ト c DNAライブラリー (各遺伝子の発現される適当な起源細胞よ り常法に従い調製されたもの) から、 本発明遺伝子に特有の適当なプローブゃ抗 体を用いて所望クローンを選択することができる 〔Pro Natl. Acad. Sci. USA., 78: 6613, 1981 ; Science, 222: 778, 1983 等〕 。
上記において、 起源細胞としては、 目的の遺伝子を発現する各種の細胞、 組織 やこれらに由来する培養細胞等が例示され、 これらからの全 RN Aの分離、 mRNAの分離や精製、 cDNAへの変換 (合成) とそのクローニング等はいず れも常法に従い実施できる。 また、 c DNAライブラリ一は市販されてもおり、 本発明においてはそれら c D N Aライブラ リー、 例えばクローンテッ ク社 (Clontech Lab. Inc. ) 等より市販の各種 c DNAライブラリ一等を用いること もできる。
c DNAライブラリ一からの本発明遺伝子のスクリ一二ングは、 前記通常の方 法に従い実施できる。 該スクリーニング方法としては、 例えば c DNAの産生す る蛋白質に対して、 該蛋白質特異抗体を使用した免疫的スクリ一二ングにより、 対応する c DNAクローンを選択する方法、 目的の DN A配列に選択的に-'結合す るプローブを用いたプラークハイブリダイゼ一ション、 コロニ一ハイブリダイゼ ーション等ゃこれらの組合せを例示できる。 ここで用いられるプローブとしては、 本発明遺伝子の DN A配列に関する情報をもとにして化学合成された DN A配列 等を用いるのが一般的であり、 勿論既に取得された本発明遺伝子やその断片もか かるプローブとして利用できる。
更に各細胞、 組織より抽出、 単離精製された天然抽出物の部分アミノ酸配列情 報に基づき、 センス ' プライマー、 アンチセンス 'プライマーをスクリーニング 用プローブとして用いることもできる。
また、 本発明遺伝子の取得に際しては、 PCR法 (Science, 23( 1350-1354, 1985) による DNA/RNA増幅法が好適に利用できる。 殊に、 ライブラリーか ら全長の c D N Aが得られ難いような場合には、 レース法 ( R A C E : Rapid amplification of cDNA ends;実験医学、 J (6): 35-38, 1994)、 殊に 5 ' -RACE CFrohman M. A., et al., Pro Natl. Acad. Sci. USA, 8^ 8998- 9002, 1988) の採用が好適である。 かかる PCR法の採用に際して使用されるプ ライマーは、 既に本発明によって明らかにされた本発明遺伝子の配列情報に基づ いて適宜設定でき、 これは常法に従い合成できる。
尚、 増幅させた DNA/RNA断片の単離精製は、 前記の通り常法に従うこと ができ、 例えばゲル電気泳動法等によればよい。
上記で得られる本発明遺伝子或は各種 DN A断片等の塩基配列の決定も、 常法 に従うことができ、 例えばジデォキン法 〔Pro Natl. Acad. Sci. USA, 74 : 5463-5467, 1977〕 やマキサム一ギルバート法 〔Method in Enzymology, 65: 499, 1980〕 等により行なうことができる。 かかる塩基配列の決定は、 市販のシ ークエンスキッ ト等を用いても容易に行ない得る。
本発明遺伝子の利用によれば、 通常の遺伝子組換え技術 〔例えば、 Science, 224: p.1431, 1984 ; Biochem. Biophys. Res. Comm. , 13(h p.692, 1985; Pro Natl. Acad. Sci. USA, 80: p.5990, 1983及び前記引用文献等参照-'〕 に従 うことにより、 各組換え体蛋白を得ることができる。 該蛋白の製造は、 より詳細 には、 本発明遺伝子が宿主細胞中で発現できる組換え DNAを作成し、 これを宿 主細胞に導入して形質転換し、 該形質転換体を培養することにより行なわれる。
ここで宿主細胞としては、 真核生物及び原核生物のいずれも用いることができ る。 該真核生物の細胞には、 脊椎動物、 酵母等の細胞が含まれ、 脊椎動物細胞と しては、 例えばサルの細胞である C 0 S細胞 〔Cell, 23: 175-182, 1981〕 ゃチ ャィニ一ズ ' ハムスター卵巣細胞及びそのジヒ ドロ葉酸レダクターゼ欠損株 roc. Natl. Acad. Sci. USA, 77: 4216-4220, 1980〕 等がよく用いられてい るが、 これらに限定される訳ではない。
脊椎動物の発現べクタ一としては、 通常発現しょうとする遺伝子の上流に位置 するプロモーター、 RNAのスプライス部位、 ポリアデニル化部位及び転写終了 配列等を保有するものを使用でき、 これは更に必要により複製起点を有していて もよい。 該発現べクタ一の例としては、 例えば、 SV 4 0の初期プロモーターを 保有する p SV 2dMr CMol. Cell. Biol., 854, 1981〕 等を例示できる。 ま た、 真核微生物としては、 酵母が一般によく用いられ、 中でもサッカロミセス属 酵母を有利に利用できる。 該酵母等の真核微生物の発現ベクターとしては、 例え ば酸性ホスファターゼ遺伝子に対するプロモータ一を有する P AM 8 2 CProc. Natl. Acad. Sci. USA, 80: 1-5, 1983) 等を利用できる。 また、 本発明遺伝子 の発現べクタ一としては、 原核生物遺伝子融合ベクターを好ましく例示でき、 該 べク夕一の具体例としては、 例えば分子量 2 6 0 0 0の G ST ドメイ ン (S. japonicum 由来) を有する p G EX— 2 TKや p GEX— 4 T - 2等を例示でき る。
原核生物の宿主としては、 大腸菌や枯草菌が一般によく用いられる。 これらを 宿主とする場合、 例えば該宿主菌中で複製可能なプラスミ ドベクターを用い、 こ のベクター中に本発明遺伝子が発現できるように該遺伝子の上流にプロモーター 及び SD (シャイン ·アンド · ダルガーノ) 塩基配列、 更に蛋白合成開始に必要 な開始コ ドン (例えば ATG) を付与した発現プラスミ ドを利用するのが好まし い。 上記宿主としての大腸菌としては、 ェシエリ ヒア ' コリ (Escherichia coli) K 1 2株等がよく用いられ、 ベクタ一としては一般に p BR 3 2 2及びその改良 ベクターがよく用いられるが、 これらに限定されず公知の各種の菌株及びべクタ —をも利用できる。 プロモー夕一としては、 例えばトリブトファン(trp) プロモ —ター、 lpp プロモーター、 lac プロモータ一、 PL/PRプロモーター等を使用で きる。
かく して得られる所望の組換え DN Aの宿主細胞への導入方法及びこれによる 形質転換方法としては、 一般的な各種方法を採用できる。 また得られる形質転換 体は、 常法に従い培養でき、 該培養により本発明遺伝子によりコードされる目的 の蛋白が生産、 発現される。 該培養に用いられる培地としては、 採用した宿主細 胞に応じて慣用される各種のものを適宜選択利用でき、 その培養も宿主細胞の生 育に適した条件下で実施できる。
上記により、 形質転換体の細胞内、 細胞外乃至細胞膜上に目的とする組換え蛋 白が発現、 生産、 蓄積乃至分泌される。
各組換え蛋白は、 所望により、 その物理的性質、 化学的性質等を利用した各種 の分離操作 〔 「生化学データーブック Π」 、 1175 - 1259 頁、 第 1版第 1刷、 1980 年 6月 23日株式会社東京化学同人発行 ; Biochemistry, 25(25): 8274 8277, 1986 ; Eur. J. Biochem. , 163^ 313-321, 1987等参照〕 により分離、 精製でき る。 該方法としては、 具体的には例えば通常の再構成処理、 蛋白沈澱剤による処 理 (塩析法) 、 遠心分離、 浸透圧ショ ック法、 超音波破砕、 限外濾過、 分子篩ク 口マトグラフィー (ゲル濾過) 、 吸着クロマトグラフィー、 イオン交換クロマト グラフィ一、 ァフィ二ティ クロマトグラフィ一、 高速液体ク口マ トグラフィ一
(HPLC) 等の各種液体クロマトグラフィー、 透析法、 及びこれらの組合せ等 を例示でき、 特に好ましい上記方法としては所望の蛋白を結合させたカラムを利 用したァフィ二ティクロマトグラフィーを例示できる。 ' - また、 本発明によって明らかにされた本発明遺伝子の配列情報を基にすれば、 例えば該遺伝子の一部又は全部の塩基配列を利用することにより、 各種ヒ 卜組織 における本発明遺伝子の発現の検出を行なうことができる。 これは常法に従って、 例えは RT— P C R [Reverse transcribed - Polymerase chain reaction: Kawasaki E. S.. et al., Amplification of RNA. In PCR Protocol, A Guide to methods and applications, Academic Press, Inc. , SanDiego, 21-27, 1991〕 による RNA増幅により、 またノーザンブロ ッテイ ング解析 (Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory, 1989) 等により、 いずれも良好に実 施し得る。
尚、 前記 P CR法を採用する場合において、 用いられるプライマーは、 本発明 遺伝子のみを特異的に増幅できる本発明遺伝子に特有のものである限り何等限定 はなく、 本発明遺伝情報に基いてその配列を適宜設定することができる。 通常こ れは常法に従って 20〜3 0ヌクレオチド程度の部分配列を有するものとするこ とができる。
しかして、 本発明はかかる新規なヒ ト遺伝子に特有の検出に有用なプライマ一 及びノ又はプローブをも提供するものである。 実施例
以下、 本発明を更に詳しく説明するため、 実施例を挙げる。
実施例 1 ( 1 ) コスミ ドライブラリーのスクリーニング
p 5 3タグサイ ト (クローン P 5 3— 1 9 1 ) は、 時野等の方法に従い特定し た 〔Tokino T., etal. , Hum. Mol. Gene, 3^ 1537-1542, 1994〕 。 p 5 3夕グサ ィ トを含む 〔32P〕 標識プローブを使用して、 ヒ ト末梢血リ ンパ球のコスミ ドラ イ ブラ リ をス ク リ ーニ ン グ した。 得 られた コ ス ミ ド : p 5 3 - c o s 1 9 1 を E c 0 R I で消化 し、 該 E c o R I フ ラ ク、、メ-'ン ト を p B l u e s c r i p t llSK (-) (Stratagene) にサブクローン化した。 DN A配列決定は、 キッ ト (Taq DyeDeoxy Terminator Cycle Sequencing Kit; ABO を使用して AB I 3 7 7 DNAシークェンサ一にて行った。
( 2) c DNAクロ一ニング
コスミ ド p 5 3— c o s l 9 1に存在する遺伝子の単離に、 ェクソン増幅と R AC Eの両者を行った。
コスミ ド P 5 3— c 0 s 1 9 1を B amH I及び B g 1 IIにて消化し、 該制限 酵素フラグメ ン トを、 ェクソン トラップベクタ一 p S P L 3 (Gibco-BRL) の B amH Iサイ 卜にサブクローン化し、 L i p o f e c t A C E (Gibco-BRL) を用いて C 0 S 7細胞に導入した。 該紬胞を 2 4時間培養後、 TR I Z〇 L (Gibco-BRL) により全 R N Aを調製した。 ファーストストランド c D N A合成 及びスプライスしたフラグメントの PCR増幅は、 North 等の方法に従い実施し た 〔North M. ' et al., Mamm. Genome, 4: 466 - 474, 1993) 。 c DNAフラ グメントは、 p B 1 u e s c r i p t IIS K (—) にサブクローン化され、 上記 のとおり T 3又は T 7プライマーを使用して配列決定された。 候補のひとつとし ての配列 1 9 1 E 1を、 c DNA増幅キッ ト (Marathon cDNA amplification kit; Clontech) を用い、 骨格筋ポリ (A) + R N Aを铸型として使用する 5 ' 一及び 3' —RACEに付した。
( 3) RT— P CR解析
p 5 3発現ベクター、 p 5 3— w t又は p 5 3— 2 7 3 CKern S. E.. et al., Science (Washington DC), 256i 827-830, 1992) 、 に よ る大腸癌細胞株 SW 4 8 0の一過的 DNA導入及び c DNAの調製は、 Furuhata 等の報告に従 い行った 〔Furuhata T., et al., Oncogene, 13: 1965- 1970, 1996 〕 。 全 RNAは、 S u p e r s c r i p t s (Gibco-BRL) を使用して逆転写した。 RT— PC Rの指数的成長相は、 2 0— 3 0サイクルにおいて決定され、 同一反 応により得られた c DNA間の半定量的比較を可能とした。 各 P C'R反応は、 2 0 0 n gの全 RNAからの c DNAを使用して実施した。 P C R溶液は文献
CHan H-J. , etal. , Hum. Mol. Genet., 4^ 237-242, 1995〕 記載のものを使用 し、 反応は、 9 4 °C 2分の初期変性ステップに次ぐ 3 0サイクル ( 1 9 1 E 1の 場合) 又は 2 5サイクル (P 2 1 /WAF 1及び GAPDHの場合) のサイク リ ングステップ ( 9 4 °C 3 0秒、 5 5— 6 0 °C 3 0秒、 7 2 °C 1分) にて行つた
(GeneAmp PCR system 9600; Perkin Elmer) 。 プライマ一配列は、 次表 1のと おりである :
表 1
Figure imgf000013_0001
増幅された c DNAは、 3 %Nu S i e v e GTG ( 2 : l ) ァガロースゲル にて分離した。
( 4 ) ノ一ザンブロッ ト解析
正常ヒ ト組織由来のポリ (A) +RNAを含むノーザンプロッ ト (Clontech) を本発明 c DNAのヌクレオチド 9 0 9— 1 5 8 3に相当するランダ厶プライム 〔32P〕 標識 DNAプローブによりハイブリダィズした。 ブロッ トを 5 0°Cにて 洗浄し (0.1XSSCZ0.1% SDS) — 8 0 °Cにて 2 4時間オートラジオグラブィ一の 感光に付した。
( 5) F I SH
F I SHは、 Inazawa 等の方法に従い実施した 〔Inazawa J. , et al., Genomics, 17: 153-162, 1993〕 。 ヒ 卜分裂中期染色体は、 常法 (thymidine synchronization I bromodeoxyuridine release technique; に従し、調製した。 ハイブリダィゼーシヨンに先立ち、 分裂中期の細胞は染色 (Hoechst 33258) 及 び U V照射した。 コスミ ドクローン p 5 3— c 0 s 1 9 1は、 ニック トランスレ —シヨンによりピオチン— 1 6— d UTPにより標識し、 変性した分裂中期染色 体とハイプリダイズした。 A 1 uリ ピ一トのような散在する繰返し配列によるノ ィ ズシグナルを除去する為に、 染色体 in situ 抑制 (chromosomal in situ suppression) ハイブリダィゼ一シヨンを使用した。 ハイブリダィズシグナ ルは、 F I TC—アビジンにて検出した。 ハイブリダィズシグナルの詳細な位置 決定は、 複製一 Gバンドの可視化によって行った。
( 6) 相同性検索
DNA比較は、 F A S T Aプログラムによるデ一夕べ一ス検索により行った non-redundant nucleic acid sequence databese 又は norrredundant protein sequence databese ; ヒトゲノム解析センター、 東京大学医科学研究所) 口^;
p 5 3誘導遺伝子のクロ一ニング
p 5 3タグサイ トのひとつ、 クローン P 5 3— 1 9 1をプローブとして、 ヒ ト ゲノムコスミ ドライブラリーをスクリーニングし、 コスミ ドク□一ン : p 5 3— c 0 s 1 9 1を得た。 このコスミ ドに由来する配列が p 5 3による転写制御を受 けているかどうかを調べる為に、 RT— P CR解析を行った。 RT— P C Rでは、 野生型又は変異型 P 5 3 c DN Aを含む発現ベクターで一過的に DN A導入した SW 4 8 0細胞 (SW 4 8 0— wt 5 3又は SW 4 8 0— m t 5 3) より調製し た RNAを铸型として使用した。 候補配列のひとつである 1 9 1 E Γを試-'験した 結果、 SW 4 8 0 — m t 5 3 (変異型) における場合に比べて、 SW 4 8 0 - w t 5 3 (野生型) における発現が著しく増加しており (図 1 参照) 、 1 9 1 E 1の発現は野生型 p 5 3によって誘導されていると考えられた。
尚、 図 1 は、 野生型 P 5 3アレルを欠く大腸癌細胞株 SW 4 8 0における P 5 3誘導 m RNAの発現を RT - P CRにより解析した結果を示す写真である c これによれば、 SW 4 8 0を、 p 5 3— w t (W) 又は p 5 3 - 2 7 3 (M) で一過的に形質転換して、 RT— P CR増幅により P 2 XM遺伝子の発現を確認 した。 RNAサンプルは、 逆転写酵素 (RT) 存在下 (十) 又は非存在下 (一) に逆転写反応に供した。 RN A铸型は GAP DH転写物の増幅によりコント口一 ルし、 これは両サンプルにおいて同程度のシグナルを与えた。
次いで、 1 9 1 E 1をプローブとして使用した c D N Aスクリーニング並びに 5 ' —及び 3' — RAC Eを行ない、 3 5 5 2 b pからなる c DNAを単離した c 「P 2 XM」 と名付けられた該 c DNAは、 4 3 1アミノ酸の蛋白をコードする 1 9 3 b pのオープンリーディングフレームを有している。 その全 DN A配列 は、 配列番号: 3に示すとおりである。 即ち、 P 2 XMc DNAのコード領域は、 塩基番号 4 6から 1 3 3 8に示され、 潜在的な トランスメ ンブラン ドメイ ン (M 1及び M 2 ) は、 それぞれァミ ノ酸番号で 3 3〜 4 9番目及び 3 2 4〜 3 4 4番目のアミノ酸配列にあり、 また voltage - gated K+ channelsH 5領域の 類似セグメント (H) は、 アミノ酸番号 3 0 6〜3 1 9に存在していた。
該 c DN Aをプロ一ブとするノーザンブロッ ト解析によれば、 骨格筋において 3. 6 k bの転写物が検出されており (図 2参照) 、 従って、 該 c DNAは、 ほ ぼ完全な転写物を含んでいるものと考えられる。
尚、 図 2はヒ ト組織における P 2 XMのノーザンブロッ ト解析結果を示す写真 であり、 各種組織 (Heart, Brain, Placenta, Lung, Skeletal muscle, Kidney, Spleen, Thymus, Prostate, Testis, Ovary, Small intestine, Colon, Leukocyte ) からのポリ(A)+ RNA (2 / g /レーン) のブロッ トを P-2 XM c DNAとハイプリダイズさせた結果を示すものである。
(口) 相同性検索
蛋白データベースの相同性検索によれば、 本発明にかかるァミ ノ酸配列は、 ATP - gated ion channel(P2X)レセプ夕一ファ ミ リー 〔Valera S., et al., Nature, 37L 516-519, 1994 ; Brake A. J. , et al., Nature, 37^ 519-523, 1994〕 と類似性を有し、 特に、 ラ ッ ト P 2 X 6 CCollo G., et al., J. Neurosci. , 16: 2495-2507 1996) と 8 0 %の同一性を示した (図 5及び 6参 照) 。
図 3及び 4は、 Ρ 2 ΧΜ遺伝子のゲノム構成を示す図であり、 図 3 (a)は、 1 9 1遺伝子のェクソン Zイントロン境界のヌクレオチド配列を示している。 ェ クソン及びイントロンの配列は、 順次、 大文字及び小文字で示されている。 図 4 中、 (b)は、 ェクソンの存在位置を、 そのサイズに応じた、 番号付き箱により示 したものである。 また、 図 4中(c)は、 コスミ ド p 5 3— 1 9 1の p 5 3結合部 位と p 5 3コンセンサス結合配列を比較したものであり、 矢印は、 p 5 3コンセ ンサス結合配列 (ペン夕マ一) を示す。 大文字のヌクレオチドは、 コンセンサス に一致するゲノム配列を示し、 小文字はコンセンサス配列と相違する配列を示し ている。 P 2 Xレセプ夕一 (P2X1- X6) ファ ミ リ一の全てのメンバ一は、 2つの トランスメンブラン領域 (M 1及び M 2) 、 voltage-gated K+ channel の H 5 領域に類似しているセグメント (H 5) 、 N—グリコシレーシヨンサイ ト及び進 化上保存されている 1 1 システィン残基を有している (図 5及び 6参照) 。 図 5及び 6は、 各種 P 2 Xレセプターのアミノ酸配列を示すものであり、 図中、 箱囲みした残基は、 P 2 XMの配列及びラッ ト P 2 X I— P 2 X 7レセプ夕一に 共通して保存されている。 上線は、 保存されている 2つの疎水性領域 (M l及び M2 ) 及び H 5を示す。 星印は、 P 2 XMの潜在的 N—結合グリコシレ一シヨン サイ トを示す。
本発明のかかる遺伝子によってコードされているァミノ酸配列は、 ·同様:にこれ ら P 2 Xレセプタ一ファ ミ リ一の基本的特徴を有しており、 これはヒ ト P 2 Xレ セプターファ ミ リ一の新規なメンバーであると考えられる。
(ハ) 構造解析
上記 c DNAとその対応するゲノム DNA配列 (p53- cosl91) の比較により、 ェクソン /ィントロン境界及び近接ィントロンの近傍 DN A配列を含む、 この遺 伝子のゲノム構成が明らかとなった (図 3参照) 。 この遺伝子は、 約 1 2 kbの ゲノム領域におよんでおり、 1 2のェクソンからなる (図 4の b参照) 。 p 5 3 タグサイ トは、 この遺伝子の約 1. 6 kb下流に存在している (図 4の b及び c 参照) 。 コスミ ド p 53— c o s l 9 1をプローブとする蛍光 in situ ハイブ リ ダイゼーシヨ ン法 ( F I S H法) により、 この遺伝子の染色体位置は、 22 q 1 1と確認された (図 1 1参照:特異的なハイブリダイゼ一シヨ ンシグナ ルがヒ ト染色体バンド 22 q 1 1に認められ、 他の染色体上にはシグナルは認め られなかった) 。
(二) 骨格筋 (Skeletal muscle) における別態様スプライシング (alternative splicing)
骨格筋より調製した RNAの RT - P CR後の直接 DNA配列決定では、 ェク ソン 1 0、 ェクソン 1 0— 1 1又はェクソン 1の一部 (ェクソン 1のドナーサイ 卜から下流 1 8 bp) を欠く、 別態様スプライシングの 3種のインフレ一厶転写 物 (AL 1、 L 2及び AL 3) が確認された (図 7参照) 。
この別態様スプライシングの模式図を図 7に示す。 正常骨格筋からの主要な RT— PCR増幅産物は、 N 1 と N 2で示されている。 3つのタイプのバリアン トは、 AL 1、 AL 2及び AL 3で示されている。 - これら別態様スプライシング転写物のそれぞれは、 3の倍数のヌクレオチドを 欠失しており、 いずれもそのリ一ディ ングフレームは維持されていた。
図 3及び 4に示すように、 ェクソン 1— 2及びェクソン 1 1は、 順次、 トラン スメ ンブラン領域 M 1及び M 2に相当する。 該 M l及び M 2領域ば、 ェ 'クソン 1 0によってコードされる近接疎水性セグメン ト (H 5) とともに、 ion pore and ion-bindin サイ トを形成するとされている 〔Valera S. , et al. , Nature, 371: 516-519, 1994 ; Brake A. J. , et al. , Nature, 37h 519-523, 1994) 。 構造的推定によれば、 これらのェクソンは、 生物学的機能に重要なドメインをコ 一ドしているものと思われる。
(ホ) ヒ ト癌細胞株における発現と別態様スプライシング
近年、 異常な別態様スプライシングがヒ ト癌の発生、 進展及び又は転移に何等 かの関与をなしていることが報告されている 〔Gunthert U. , et al., Cell, 65: 13 - 24, 1991 ; Arch R. , et al. , Science (Washington DC), 257^ 682- 685, 1992〕 。 そこで、 4種の横紋筋肉種、 2種の骨肉腫及び 1種の脂肪肉腫に 由来する細胞株で、 本発明遺伝子の mRNAレベル及び別態様スプライシングを RT - P CR解析により評価した。 結果を図 8〜 1 0に示す。 同図において、 RT - PCRは、 細胞株から調製した全 RNA (200ng) を用いて前記に従い実 施したものであり、 各レーン (Cell lines) は、 横紋筋肉種 (A204: レーン 1, A673: レーン 2 , Hs729T: レーン 3, RD: レーン 4) , 脂肪肉腫 (SW872: レ一 ン 5) 及び骨肉腫 (NY : レーン 6, Hu03Nl : レーン 7) におけるものである。 ま た、 骨格筋の全 RNA (200ng) から調製し希釈 ( 1 , 1 : 2, 1 : 4, 1 : 8, 1 : 1 6, 1 : 3 2) した c DNAを用いて P CR増幅した結果を併せて示して レヽる ( "Skeletal muscle" レーン) σ
図 8及び 9は、 前記の Nし AL 1、 N 2、 AL 2及び AL 3における結果を 示すものであり、 それらの P CR産物サイズは、 順次、 3 9 2、 3 1 4、 4 5 0、 3 8 4及び 3 0 6 bpである。 尚、 RNA铸型は、 G A P D Hの増幅をとおしてコ ン トロールし、 これは全てのサンプルにおいて同様のシグナルを与えた (図 1 0)
その結果、 この遺伝子の発現は、 試験した 7種の細胞株中、 ひとつの横紋筋肉 種細胞株 (A673) において顕著に減少していた。 また、 これら細胞株における別 態様スプライシングは、 次のとおりであった。 ェクソン 1 0及びェクソン 1 0— 1 1を欠くスプライスバリアントは、 癌細胞におけるその転写パターンが、 正常 骨格筋でのそれに類似していた。 一方、 ェクソン 1の一部を欠失しているバリア ントの割合は、 正常骨格筋では少なかったのに対し、 ひとつの横紋筋肉種細胞株
(RD) 及びひとつの骨肉腫 (Hu03Nl) では相対的により多く認められた。 本発明により、 ATP- gated ion channels をコ一ドする P 2 Xフア ミ リーの新 規なメンバ一であると考えられる新規な p 5 3誘導型遺伝子が単離された。 p 5 3結合性配列は、 この遺伝子を含む全コスミ ド DNAの配列決定により、 該 遺伝子の下流約 1. 6 k bに見出された。 p 5 3により制御されている遺伝子の 機能的 P 5 3結合部位は、 今まで、 これら遺伝子のイントロン又はプロモーター 領域中に見出されてきている。 本発明の新規遺伝子においては、 該機能的 p 5 3 結合部位は、 その下流に位置していた。 これらの結果は、 p 5 3結合部位がェン ハンサー配列として働く可能性を示唆している。
本発明 c DN Aから推定されるァミノ酸配列は、 P 2 Xレセプ夕一ファ ミ リ一 のメンバー、 特にラッ ト P 2 X 6 ( 8 0 %同一性) 、 に相同性を有する。 しかし ながら、 ラッ ト P 2 X 6 mRN Aが脳の広い範囲において見出されるのに対し、 この遺伝子は骨格筋において特異的に発現されており、 従って、 これがラ ッ ト P 2 X 6のヒ ト相同物であるとは考えられない。 P 2 Xレセプ夕一は、 ATP - gated ion channels に分類され、 細胞死やシナプス伝達のような細胞外 A T P 誘導型生物活性のメデイエ一夕一として機能するとされてきている 〔Zheng し M., et al., J. Cell Biol., Π3^ 279-288 1991 ; Zo tewei j J. P. , et al. , Biochem. J. , 288^ 207-213, 1992 ; Kennedy , et al. , Nature, 377: 385-386, 1995) 。 また、 アミノ酸レベルでの配列類似性は、 RP— 2と呼ばれ る部分配列 c DNAとの間でも認められる。 RP— 2は、 ガンマ照射によりアポ ト一シスを起こしているラッ ト胸腺細胞において誘導される m R N Aからの subtractive ハイブリダィゼ一シヨンによって単離されている 〔0wens G. P. , et al. , Mol. Cell. Biol. , Π: 4177-4188 1991 〕 。 ATPは、 細胞内カルシ ゥ厶濃度を増加することにより、 胸腺細胞、 肝細胞及び各種のリ ンパ球細胞株に おいて細胞死を誘導する。 これらの事実によれば、 本発明遺伝子は、 骨格筋にお ける P 5 3依存性アポトーシス (おそらく細胞外 ATPにより仲介される) に密 接に関与しているものと考えられる。
ノーザンプロッ ト解析により、 骨格筋において 3. 6 k b転写物が検出された c この遺伝子の発現は、 4種の横紋筋肉種細胞株のひとつにおいて著しく減少して いた。 加えて、 トランスメンブラン ドメイン M 1の一部をコー ドするェクソン 1 の一部を欠失するマイナーなスプライスバリアントが、 残り 6種の癌細胞株の内 2つにおいて相対的により多く認められた。 試験した癌細胞株で別態様スプラィ シングで生じる異常産物の割合が高かったことは注目され、 ァミノ末端での不均 質性の生物学的意義を明らかにする事が重要となる。 更に、 横紋筋肉種を含む種 々の組織の癌では、 この遺伝子を含む染色体領域 (22qll) に欠失があることが 報告されており CNewsham I. , et al. , Genomics, 19: 433-440, 1994 ; Schofield D. E., et al., Genes Chromosom. Cancer, 15: 10 - 17, 1996 ; Biegel J. A., et al. , Genes Chromosom. Cancer, 16: 94-105, 1996) , この 遺伝子がこの領域に存在する癌抑制遺伝子である可能性を示唆している。 産業上の利用可能性 ヒ トゲノ厶からの機能的 p 5 3タグサイ トのクローニングにおいて、 野 生型 P 5 3によって誘導される新規な遺伝子を単離した。 この c DNA配列は、 P 2 Xレセプターファ ミ リーに相同性を示す 4 3 1ァミノ酸べプチドをコ― ドす るオープンリーディ ングフレームを含んでいる。 このペプチドは、 P 2 Xフア ミ リーのメンバーの主要な特徴を有し (ATP- gated ion channels) 、 また、 プログ ラム細胞死 (progra隱 ed cell death) を誘導された胸腺細胞において活性化さ れる遺伝子、 R P— 2、 と類似する。 この遺伝子は、 主に骨格筋に発現され、 P 2 XM (P2X specifically expressed in skeltal muscle) と名付けられた。 該 P 2 XM遺伝子は、 細胞増殖の抑制及び/又は骨格筋におけるアポトーシスに 関与すると思われる。
この遺伝子の発現は、 試験した 4種の横紋筋肉種細胞株のひとつにおいて著し く抑制されていた。 トランスメンブラン領域 M 1をコードするェクソン 1の一部 を欠くマイナーなスプライスバリアントが、 試験した 7種の癌細胞株の 2つにお いて相対的に多かった。 このことは、 このスプライシングによって生じる変異産 物の比率が、 これらの癌細胞株において著しく増加することを示唆する。 この遺 伝子は、 杆状癌 (rhabdoid tumor) において欠失が知られている染色体バン ド 2 2 q 1 1に位置していた。
本発明によれば、 癌抑制遺伝子 p 5 3による特異的な転写制御下にある新規な ヒ ト遺伝子が提供され、 該遺伝子を用いれば、 該遺伝子の各種組織での発現の検 出や、 そのコードする産物の構造及び機能等を解析でき、 また、 該遺伝子産物の 遺伝子工学的製造が可能となり、 これらにより、 癌の発生、 進展、 転移等の解明 やその診断、 予防、 治療等に有用な技術が提供される。 配列表
配列番号: 1
配列の長さ : 4 3 1
配列の型:アミノ酸
トポロジー :直線状
配列の種類:蛋白 ' - 配列:
Met Gly Ser Pro Gly Ala Thr Thr Gly Trp Gly Leu Leu Asp Tyr Lys
1 5 10 15
Thr Glu Lys Tyr Val Met Thr Arg Asn Trp Arg Val Gly Ala Leu Gin
20 25 30
Arg Leu Leu Gin Phe Gly He Val Val Tyr Val Val Gly Trp Ala Leu
35 40 45
Leu Ala Lys Lys Gly Tyr Gin Glu Arg Asp Leu Glu Pro Gin Phe Ser
50 55 60
lie He Thr Lys Leu Lys Gly Val Ser Val Thr Gin He Lys Glu Leu 65 70 75 80
Gly Asn Arg Leu Trp Asp Val Ala Asp Phe Val Lys Pro Pro Gin Gly
85 90 95
Glu Asn Val Phe Phe Leu Val Thr Asn Phe Leu Val Thr Pro Ala Gin
100 105 110
Val Gin Gly Arg Cys Pro Glu His Pro Ser Val Pro Leu Ala Asn Cys
115 120 125
Trp Val Asp Glu Asp Cys Pro Glu Gly Glu Gly Gly Thr His Ser His
130 135 140
Gly Val Lys Thr Gly Gin Cys Val Val Phe Asn Gly Thr His Arg Thr 145 150 155 160
Cys Gl u l ie Trp Ser Trp Cys Pro Val Glu Ser Gly— Val Val Pro Ser
165 170 175
Arg Pro Leu Leu Ala Gin Ala Gin Asn Phe Thr Leu Phe l i e Lys Asn
180 185 190
Thr Val Thr Phe Ser Lys Phe Asn Phe Ser Lys Ser Asn Ala Leu Gl u --
195 200 205
Thr Trp Asp Pro Thr Tyr Phe Lys Hi s Cys Arg Tyr Gl u Pro Gin Phe
210 215 220
Ser Pro Tyr Cys Pro Val Phe Arg H e Gly Asp Leu Val Ala Lys Ala 225 230 235 240
Gly Gly Thr Phe Glu Asp Leu Ala Leu Leu Gly Gly Ser Val Gly l ie
245 250 255
Arg Val Hi s Trp Asp Cys Asp Leu Asp Thr Gl y Asp Ser Gl y Cys Trp
260 265 270
Pro Hi s Tyr Ser Phe Gin Leu Gin Glu Lys Ser Tyr Asn Phe Arg Thr
275 280 285
Ala Thr Hi s Trp Trp Glu Gin Pro Gly Val Gl u Ala Arg Thr Leu Leu
290 295 300
Lys Leu Tyr Gly l ie Arg Phe Asp l ie Leu Val Thr Gly Gin Ala Gly 305 310 315 320
Lys Phe Gly Leu l ie Pro Thr Ala Val Thr Leu Gly Thr Gly Ala Ala
325 330 335
Trp Leu Gly Val Val Thr Phe Phe Cys Asp Leu Leu Leu Leu Tyr Val
340 345 350
Asp Arg Glu Ala His Phe Tyr Trp Arg Thr Lys Tyr Glu Glu Ala Lys 355 360 365
Ala Pro Lys Ala Thr Ala Asn Ser Val Trp Arg Glu Leu Ala Leu Ala
370 375 380
Ser Gin Ala Arg Leu Ala Glu Cys Leu Arg Arg Ser Ser Ala Pro Ala
385 390 395 400
Pro Thr Ala Thr Ala Ala Gly Ser Gin Thr Gin Thr Pro Gly Trp Pro :
405 410 415
Cys Pro Ser Ser Asp Thr Hi s Leu Pro Thr Hi s Ser Gly Ser Leu
420 425 430
配列番号: 2
配列の長さ : 1 2 9 3
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー :直線状
配列の種類: DNA (cDNA)
配列:
ATGGGCTCCC CAGGGGCTAC GACAGGCTGG GGGCTTCTGG ATTATAAGAC GGAGAAGTAT 60 GTGATGACCA GGAACTGGCG GGTGGGCGCC CTGCAGAGGC TGCTGCAGTT TGGGATCGTG 120 GTCTATGTGG TAGGGTGGGC GCTCCTCGCC AAAAAAGGCT ACCAGGAGCG GGACCTGGAA 180
CCCCAGTTTT CCATCATCAC CAAACTCAAA GGGGTTTCCG TCACTCAGAT CAAGGAGCTT 240
GGAAACCGGC TGTGGGATGT GGCCGACTTC GTGAAGCCAC CTCAGGGAGA GAACGTGTTC 300
TTCTTGGTGA CCAACTTCCT TGTGACGCCA GCCCAAGTTC AGGGCAGATG CCCAGAGCAC 360
CCGTCCGTCC CACTGGCTAA CTGCTGGGTC GACGAGGACT GCCCCGAAGG GGAGGGAGGC 420
ACACACAGCC ACGGTGTAAA AACAGGCCAG TGTGTGGTGT TCAATGGGAC CCACAGGACC 480
TGTGAGATCT GGAGTTGGTG CCCCGTGGAG AGTGGCGTTG TGCCCTCGAG GCCCCTGCTG 540
GCCCAGGCCC AGAACTTCAC ACTGTTCATC AAAAACACAG TCACCTTCAG CAAGTTCAAC 600 TTCTCTAAGT CCAATGCCTT GGAGACCTGG GACCCCACCT ATTTTAAGCA CTGCCGCTAT 660
GAACCACAAT TCAGCCCCTA CTGTCCCGTG TTCCGCATTG GGGACCTCGT GGCCAAGGCT 720
GGAGGGACCT TCGAGGACCT GGCGTTGCTG GGTGGCTCTG TAGGCATCAG AGTTCACTGG 780
GATTGTGACC TGGACACCGG GGACTCTGGC TGCTGGCCTC ACTACTCCTT CCAGCTGCAG 840
GAGAAGAGCT ACAACTTCAG GACAGCCACT CACTGGTGGG AGCAACCGGG TGTGGAGGCC 900
CGCACCCTGC TCAAGCTCTA TGGAATCCGC TTCGACATCC TCGTCACCGG GCAGGCAGGG - 960
AAGTTCGGGC TCATCCCCAC GGCCGTCACA CTGGGCACCG GGGCAGCTTG GCTGGGCGTG 1020
GTCACCTTTT TCTGTGACCT GCTACTGCTG TATGTGGATA GAGAAGCCCA TTTCTACTGG 1080
AGGACAAAGT ATGAGGAGGC CAAGGCCCCG AAAGCAACCG CCAACTCTGT GTGGAGGGAG 1140
CTGGCCCTTG CATCCCAAGC CCGACTGGCC GAGTGCCTCA GACGGAGCTC AGCACCTGCA 1200
CCCACGGCCA CTGCTGCTGG GAGTCAGACA CAGACACCAG GATGGCCCTG TCCAAGTTCT 1260
GACACCCACT TGCCAACCCA TTCCGGGAGC CTG 1293 配列番号: 3
配列の長さ : 1 6 9 7
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー :直線状
配列の種類: DNA (cDNA)
配列の特徴:
特徴を表わす記号: CDS
存在位置: 4 6 , . 1 3 3 8
特徴を決定した方法: E
配列:
CTGCCATGCT GACTCATGTG CCCGCAGCTA GCAGGAGCTG GCAGC ATG GGC TCC 54
Met Gly Ser CCA GGG GCT ACG ACA GGC TGG GGG CTT CTG GAT TAT AAG ACG GAG AAG 102 Pro Gly Ala Thr Thr Gly Trp Gly Leu Leu Asp Tyr Lys Thr Glu Lys
5 10 15
TAT GTG ATG ACC AGG AAC TGG CGG GTG GGC GCC CTG CAG AGG CTG CTG 150 Tyr Val Met Thr Arg Asn Trp Arg Val Gly Ala Leu Gin Arg Leu Leu
20 25 30 3'5 -:
CAG TTT GGG ATC GTG GTC TAT GTG GTA GGG TGG GCG CTC CTC GCC AAA 198 Gin Phe Gly l ie Val Val Tyr Val Val Gly Trp Ala Leu Leu Ala Lys
40 45 50
AAA GGC TAC CAG GAG CGG GAC CTG GAA CCC CAG TTT TCC ATC ATC ACC 246 Lys Gly Tyr Gin Glu Arg Asp Leu Glu Pro Gin Phe Ser l ie l ie Thr
55 60 65
AAA CTC AAA GGG GTT TCC GTC ACT CAG ATC AAG GAG CTT GGA AAC CGG 294 Lys Leu Lys Gly Val Ser Val Thr Gin He Lys Glu Leu Gly Asn Arg
70 75 80
CTG TGG GAT GTG GCC GAC TTC GTG AAG CCA CCT CAG GGA GAG AAC GTG 342 Leu Trp Asp Val Ala Asp Phe Val Lys Pro Pro Gin Gly Glu Asn Val
85 90 95
TTC TTC TTG GTG ACC AAC TTC CTT GTG ACG CCA GCC CAA GTT CAG GGC 390 Phe Phe Leu Val Thr Asn Phe Leu Val Thr Pro Ala Gin Val Gin Gly
100 105 110 115
AGA TGC CCA GAG CAC CCG TCC GTC CCA CTG GCT AAC TGC TGG GTC GAC 438 Arg Cys Pro Glu Hi s Pro Ser Val Pro Leu Ala Asn Cys Trp Val Asp
120 125 130
GAG GAC TGC CCC GAA GGG GAG GGA GGC ACA CAC AGC CAC GGT GTA AAA 486 Glu Asp Cys Pro Glu Gly Glu Gly Gly Thr Hi s Ser Hi s Gly Val Lys 135 140 145
ACA GGC CAG TGT GTG GTG TTC AAT GGG ACC CAC AGG ACC TGT GAG ATC 534 Thr Gly Gin Cys Val Val Phe Asn Gly Thr Hi s Arg Thr Cys Gl u He
150 155 160
TGG AGT TGG TGC CCC GTG GAG AGT GGC GTT GTG CCC TCG AGG CCC CTG 582 Trp Ser Trp Cys Pro Val Gl u Ser Gly Val Val Pro Ser Arg Pro Leu - '
165 170 175
CTG GCC CAG GCC CAG AAC TTC ACA CTG TTC ATC AAA AAC ACA GTC ACC 630 Leu Ala Gin Ala Gin Asn Phe Thr Leu Phe l i e Lys Asn Thr Val Thr
180 185 190 195
TTC AGC AAG TTC AAC TTC TCT AAG TCC AAT GCC TTG GAG ACC TGG GAC 678 Phe Ser Lys Phe Asn Phe Ser Lys Ser Asn Ala Leu Gl u Thr Trp Asp
200 205 210
CCC ACC TAT TTT AAG CAC TGC CGC TAT GAA CCA CAA TTC AGC CCC TAC 726 Pro Thr Tyr Phe Lys Hi s Cys Arg Tyr Glu Pro Gin Phe Ser Pro Tyr
215 220 225
TGT CCC GTG TTC CGC ATT GGG GAC CTC GTG GCC AAG GCT GGA GGG ACC 774 Cys Pro Val Phe Arg He Gly Asp Leu Val Ala Lys Ala Gl y Gly Thr
230 235 240
TTC GAG GAC CTG GCG TTG CTG GGT GGC TCT GTA GGC ATC AGA GTT CAC 822 Phe Glu Asp Leu Ala Leu Leu Gly Gly Ser Val Gly l ie Arg Val Hi s
245 250 255
TGG GAT TGT GAC CTG GAC ACC GGG GAC TCT GGC TGC TGG CCT CAC TAC 870 Trp Asp Cys Asp Leu Asp Thr Gly Asp Ser Gly Cys Trp Pro Hi s Tyr
260 265 270 275
TCC TTC CAG CTG CAG GAG AAG AGC TAC AAC TTC AGG ACA GCC ACT CAC 918 Ser Phe Gin Leu Gin Glu Lys Ser Tyr Asn Phe Arg Thr Ala Thr Hi s
280 285 290
TGG TGG GAG CAA CCG GGT GTG GAG GCC CGC ACC CTG CTC AAG CTC TAT 966
Trp Trp Glu Gin Pro Gly Val Glu Ala Arg Thr Leu Leu Lys Leu Tyr
295 300 305
GGA ATC CGC TTC GAC ATC CTC GTC ACC GGG CAG GCA GGG AAG TTC GGG --- 1014
Gly H e Arg Phe Asp l ie Leu Val Thr Gly Gin Ala Gly Lys Phe Gly
310 315 320
CTC ATC CCC ACG GCC GTC ACA CTG GGC ACC GGG GCA GCT TGG CTG GGC 1062
Leu l i e Pro Thr Ala Val Thr Leu Gly Thr Gl y Ala Ala Trp Leu Gly
325 330 335
GTG GTC ACC TTT TTC TGT GAC CTG CTA CTG CTG TAT GTG GAT AGA GAA 1110
Val Val Thr Phe Phe Cys Asp Leu Leu Leu Leu Tyr Val Asp Arg Glu
340 345 350 355
GCC CAT TTC TAC TGG AGG ACA AAG TAT GAG GAG GCC AAG GCC CCG AAA 1158
Ala Hi s Phe Tyr Trp Arg Thr Lys Tyr Glu Glu Ala Lys Ala Pro Lys
360 365 370
GCA ACC GCC AAC TCT GTG TGG AGG GAG CTG GCC CTT GCA TCC CAA GCC 1206
Ala Thr Ala Asn Ser Val Trp Arg Glu Leu Ala Leu Ala Ser Gin Ala
375 380 385
CGA CTG GCC GAG TGC CTC AGA CGG AGC TCA GCA CCT GCA CCC ACG GCC 1254
Arg Leu Ala Glu Cys Leu Arg Arg Ser Ser Ala Pro Ala Pro Thr Ala
390 395 400
ACT GCT GCT GGG AGT CAG ACA CAG ACA CCA GGA TGG CCC TGT CCA ACT 1302
Thr Ala Ala Gly Ser Gin Thr Gin Thr Pro Gly Trp Pro Cys Pro Ser
405 410 415 —3
[>
CD
Figure imgf000029_0001
—3
C
n cn
—0
GC AG TAT
GCCCC CTG TCTTT
CGTT TAGGGGCGTGTT CTGTT ATAGATT GGG¾AGC CCCAA TTTT
TGG AA¾GGGCGGGGGGTTTG GTAAG GC GCCT
GCC CCA ACA TTG ACC C C CG GCCGTCCAT TCCTT 13

Claims

請 求 の 範 囲
1 . 配列番号: 1で示されるアミノ酸配列の全部又は一部をコードする塩基配 列を含むヒト遺伝子。
2 . 配列番号: 2で示される塩基配列の全部又は一部を含む請求項 1記載の遺 伝子。 ' --
3 . 請求項 1又は 2記載の遺伝子の一部の塩基配列を有することを特徴とする 請求項 1又は 2記載の遺伝子検出用プローブ又はプライマ一。
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