WO1995003412A2 - Fragment nucleotidique de l'arn ribosomique 23s de mycobacteries, sondes et amorces derivees, reactif et procede de detection - Google Patents

Fragment nucleotidique de l'arn ribosomique 23s de mycobacteries, sondes et amorces derivees, reactif et procede de detection Download PDF

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WO1995003412A2
WO1995003412A2 PCT/FR1994/000929 FR9400929W WO9503412A2 WO 1995003412 A2 WO1995003412 A2 WO 1995003412A2 FR 9400929 W FR9400929 W FR 9400929W WO 9503412 A2 WO9503412 A2 WO 9503412A2
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Claude Mabilat
Richard Christen
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Bio Merieux
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    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/35—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Mycobacteriaceae (F)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria

Definitions

  • the present invention relates to the field of techniques for detecting and / or identifying bacteria of the genus Mycobacterium and more particularly to those using a genetic marker.
  • the ribosomal RNA of bacteria is used as a target, because firstly it is found in all cells of all living organisms, in quantity, and secondly it has a particular nucleotide sequence made up of a succession of regions characterized by a speed of variable evolution.
  • Patent application WO-88/03957 describes probes specific for detecting mycobacteria, including the sequences nucleotides are capable of hybridizing to the 16S and 23S subunits of the ribosomal RNA of said bacteria.
  • the probes described are 7 probes of species or groups of species and 4 probes of genus, and are collated in Table 1 below which are respectively listed the targeted ribosomal RNA subunit, the targeted nucleotide sequence taking as references the nucleotide sequence of the ribosomal RNA of E. Coli and the specificity of the probes with regard to the species, group of species or genus Mycobacterium.
  • the regions variable from one species to another or from one species to a group of species, used to develop probes are located on the sub- 16S unit of ribosomal RNA, and that on the other hand, the 23S subunit comprises homologous regions within the genus Mycobacterium making it possible to detect groups of species of mycobacteria.
  • certain authors have sought, from the partial determination of the nucleotide sequences of the 23S subunit of the ribosomal RNA of some pathogenic mycobacteria, to develop probes of species which , by specific hybridization, would make it possible to selectively detect a species of mycobacteria.
  • variable areas within the genus Mycobacterium have been determined on the ribosomal RNA of the 23S subunit, which makes it possible to meet the current need to diagnose a pathogenicity in particular in immunocompromised subjects, by providing species-specific detection probes and species groups of mycobacteria.
  • the starting point of the invention is the complete determination of the nucleotide sequences of the 23S subunit of the ribosomal RNA for a sufficient number of species of mycobacteria, which made it possible to highlight several variable regions allowing to discriminate several species of mycobacteria.
  • a nucleotide fragment or an oligonucleotide is a chain of monomers, characterized by the informational sequence of natural nucleic acids, capable of hybridizing to a nucleotide fragment under predetermined conditions, the sequence being able to contain monomers of different structures and to be obtained from a natural nucleic acid molecule and / or by genetic recombination and / or by chemical synthesis ,
  • a monomer can be a natural nucleotide of nucleic acid whose constituent elements are a sugar, a phosphate group and a nitrogenous base; in DNA the sugar is ribose, in RNA the sugar is deoxy-2-ribose; depending on whether it is DNA or RNA, the nitrogen base is selected from adenine, guanine, uracil, cytosine, thymine; or a nucleotide modified in at least one of the three constituent elements; by way of example, the modification may take place at the base level, generating modified bases such as inosine, methyl-5-deoxycytidine, deoxyuridine, dimethylamino-5-deoxyuridine, diamino-2,6-purine , bromo-5-deoxyuridine and any other modified base promoting hybridization, at the sugar level, namely the replacement of at least one deoxyribose by a polyamide [PE Nielsen et al, Science, 254, 1497-1
  • information sequence means any ordered sequence of monomers, the chemical nature and order in a reference direction constitute information of the same quality as that of natural nucleic acids
  • hybridization means the process during which, under appropriate conditions, two nucleotide fragments, having sufficiently complementary sequences, pair to form a double strand
  • a probe is a nucleotide fragment comprising from 5 to 100 monomers, advantageously from 8 to 50 monomers, having a specificity of hybridization under determined conditions to form a hybridization complex with a nucleotide fragment having a nucleotide sequence included in the Ribosomal RNA, DNA obtained by reverse transcription of said ribosomal RNA and DNA of which said ribosomal RNA is the transcription product;
  • a probe can be used for diagnostic purposes such as capture and / or detection probes or for therapy purposes, - the capture probe can be immobilized on a solid support by any suitable means, i.e. -to say directly or indirectly, for example by covalence or passive adsorption,
  • the detection probe is marked by means of a marker chosen from radioactive isotopes, enzymes notably chosen from peroxidase and alkaline phosphatase and those capable of hydrolyzing a chromogenic, fluorigenic or luminescent substrate, chromophoric chemical compounds, chromogenic, fluorigenic or luminescent compounds, analogs of nucleotide bases, and biotin,
  • a marker chosen from radioactive isotopes, enzymes notably chosen from peroxidase and alkaline phosphatase and those capable of hydrolyzing a chromogenic, fluorigenic or luminescent substrate, chromophoric chemical compounds, chromogenic, fluorigenic or luminescent compounds, analogs of nucleotide bases, and biotin,
  • the probes used for diagnostic purposes of the invention can be used in all known hybridization techniques and in particular the so-called “DOT-BLOT” techniques [MANIATIS et al, Molecular Cloning, Cold Spring Harbor, (1982 )], "SOUTHERN BLOT” [SOUTHERN. E.M., J. Mol. Biol., 98, 503 (1975)], "NORTHEN BLOT” which is a technique identical to the "SOUTHERN BLOT” technique but which uses RNA as target, the SANDWICH technique [DUNN A.R.,
  • the SANDWICH technique is used in the present invention comprising a specific capture probe and / or a specific detection probe, it being understood that the capture probe and the detection probe must have an nucleotide sequence at least partially different,
  • a therapy probe for treating infections due to mycobacteria said probe being capable of hybridizing in vivo on the 23S ribosomal RNA of said bacteria and / or on genomic DNA to block the translation and / or transcription phenomena
  • a primer is a probe comprising from 5 to 30 monomers, having a specificity of hybridization under conditions determined for the initiation of an enzymatic polymerization, for example in an amplification technique such as PCR (Polymerase Chain Reaction), in an elongation process, such as sequencing, in a reverse transcription method or the like,
  • the probes and primers are those whose sequences are identified below or those which have at least 70% homology and at least 5 consecutive monomers of identical information sequence with the latter.
  • nucleotide sequence of the 23S ribosomal RNA was determined for 16 species of mycobacteria, sequencing from which single-stranded nucleotide fragments belonging to variable regions have been defined. therefore specific to a species of mycobacteria.
  • the single-stranded nucleotide fragments of the invention have a nucleotide sequence chosen from the following sequences:
  • nucleotide N ° 1409 starting at nucleotide N ° 1409 and ending at nucleotide N ° 1420, excluding the fragments of ribosomal RNA 23S of M. tuberculosis, M. marinum, M. scrofulaceum, M. avium TMC 724, M. leprae, M. kansasii and M. asiaticum, M. ulcerans ATCC 19423, M. malmoense ATCC 29571,
  • nucleotide N ° 1854 starting at nucleotide N ° 1854 and ending at nucleotide N ° 1876, excluding fragments of ribosomal RNA 23S from M. tuberculosis, M. kansasii and M. fortuitum, - starting at nucleotide N ° 2126 and ending at nucleotide
  • nucleotide sequences of the fragments of the invention are chosen from the sequences SEQ ID NO 1 to SEQ ID N028, SEQ ID N030 to SEQ ID N037, SEQ ID N039 to SEQ ID N041, SEQ ID N043 to SEQ ID N049, SEQ ID N051 to SEQ ID N067, SEQ ID N069 to SEQ ID N075, SEQ ID N077 to SEQ ID N093, SEQ ID N095, SEQ ID N097, SEQ ID N098, SEQ ID N0100 to SEQ ID N0136, SEQ ID N0138 to SEQ ID N0144, SEQ ID N0146 to SEQ ID N0148, SEQ ID N0150 to SEQ ID N0152, SEQ ID N0154 to SEQ ID N0158, SEQ ID N0160, SEQ ID N0161, SEQ ID N0163 to SEQ ID N0174 and SEQ ID N0178, and their complementary sequences .
  • E. coli 23S rRNA sequence applied to the sequences identified in the present description does not always reflect the number of nucleotides or monomers constituting these sequences. Indeed, mycobacteria have additional genetic material compared to E. coli, which is particularly highlighted for the sequences SEQ ID NO 29 to SEQ ID NO 41.
  • the fragments of the invention are RNA fragments, but they can also be single-stranded DNA fragments resulting from the reverse transcription of the above-mentioned RNA fragments, or their complementary fragments, as well as single-stranded fragments of genomic DNA whose transcripts are the abovementioned RNA fragments, or their complementary fragments.
  • the preferred probes are those having a sequence chosen from the sequences:
  • a particularly advantageous probe of the invention is that whose nucleotide sequence begins at nucleotide N ° 1 and ending at nucleotide N ° 21 of the variable zone corresponding to SEQ ID N ° 94, whose interest lies in its specificity vis- against the M. tuberculosis species, among other species of mycobacteria, but also within the M. tuberculosis group itself.
  • Another subject of the invention is a primer for the specific reverse transcription of a 23S ribosomal RNA sequence of mycobacteria belonging to a variable region, into a complementary DNA sequence, or a primer in particular for specific amplification, by polymerase chain reaction of the sequence of DNA complementary to a 23S ribosomal RNA sequence of mycobacteria, belonging to a variable region.
  • the therapy probes of the present invention comprise a nucleotide sequence belonging to the sequence of a fragment having at least one of the following nucleotide sequences of the 23S RNA:
  • nucleotide N ° 2126 starting at nucleotide N ° 2126 and ending at nucleotide N ° 2161, and their complementary sequences.
  • the invention also relates to a reagent for detecting and / or identifying at least one species of mycobacteria in a biological sample comprising at least one probe of the invention, and in particular a capture probe and a detection probe one and / or the other corresponding to the definition of a probe according to the invention.
  • the reagent may include a mixture of probes of the invention for the purpose of detecting at least two species of mycobacteria.
  • the invention provides a method for selectively detecting and / or identifying a species of mycobacteria in a biological sample according to which the 23S ribosomal RNA, extracted from mycobacteria and possibly denatured, or DNA is exposed. genomic, extracted and denatured bacteria, or DNA obtained from reverse transcription of ribosomal RNA 23S, to at least one probe of the invention and hybridization of said probe is detected.
  • an amplification of this DNA is carried out in the presence of a suitable enzymatic system and at least one amplification primer of the invention.
  • Figures 7, 8 and 9 are formed by the alignment of Figures 7a and 7b respectively; 8a, 8b and 8c; 9a, 9b and 9c. More specifically, Figures 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10,
  • 1 1, 12 and 13 relate to the variable zones in the order of their appearance on the 23S rRNA of the mycobacteria and correspond to the sequences respectively:
  • the amplification products obtained were cloned into the double-stranded forms of phage M13.
  • the recombinant M13 phages obtained served as a template for the sequencing reaction using the chain termination method (Sanger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1977, 74: 5463-5467).
  • Hybridization of the ribosomal RNA of a target bacterium was carried out according to the non-radioactive and semi-automated detection method described in French patent n ° 90 07249 and modified for the detection of ribosomal RNA by the addition destabilizing.
  • a capture probe 34 nucleotides in M. tuberculosis inserted corresponding to 15
  • a microtiter plate (Nunc 439454) is deposited a solution of 1 ng / ⁇ l of the capture oligonucleotide, the 5 'end of which reacted with the reagent Aminolink 2 (Applied Biosystems, Foster city, California) in PBS 3X (0.45 M NaCI 0.15 M sodium phosphate pH 7.0). The plate is incubated for 2 h at 37 ° C. and then washed 3 times with 300 ⁇ ⁇ of PBST [PBS 1 x, Tween 20: 0.5 ° / 00 (Merck 822184)].
  • the Aminolink 2 reagent makes it possible to add an arm comprising a 6-aminohexyl group to the 5 ′ end of the probe.
  • the probe thus coupled to a ligand having a polar group (primary amine), and passively attached to the support, provides an improved signal; see application FR 91 09057.
  • the target constituted by 10 ⁇ ⁇ of total RNA extract is mixed with 40 ⁇ ⁇ of salmon PBS buffer (PBS-3X + salmon sperm DNA 10 ⁇ g / ml [Sigma D 9156)].
  • the whole is added to the well at 50 ⁇ ⁇ of a solution of the oligonucleotide-peroxidase conjugate, constituting the detection probe, at the concentration of 0.1 ng / ⁇ l of oligonucleotide in a PBS-horse buffer [PBS 3X + 10% horse serum (BioMérieux 55842)].
  • the plate is incubated for 1 h at 37 ° C. and then washed 3 times with 300 ⁇ ⁇ of PBST buffer.
  • OPD substrate ortho-phenylenediamine Cambridge Medical Biotechnology ref / 456
  • citric acid buffer 0.1 M sodium monohydrogen phosphate, pH 4.93
  • 30% hydrogen peroxide diluted 1/1000 is added immediately.
  • the enzymatic activity is blocked with 100 ⁇ l of 1 N sulfuric acid and the reading is carried out on an Axia Microreader device (AXIA: registered trademark) (bioMérieux) at 492 nm.
  • Axia Microreader device AXIA: registered trademark
  • bioMérieux bioMérieux
  • M. bovis including ATCC 19210) and 2 strains of M. bovis BCG
  • M. avium-intracel / ulare including ATCC 35764), M. asiaticum (ATCC 25276), M. chelonae (ATCC 14472), M. flavescens, M. fortuitum, M. gastri, M. gordonae, M. kansasii, M. marinum, M. phlei, scrofulaceum, M. simiae, M. smegmatis, M. terrae, M. vaccae, M. xenopi, Nocardia asteroides (ATCC 3308), N. brasilensis (ATCC 19296).
  • the combination of probes used is, a posteriori, specific for the tuberculosis complex. It does not cross-react with nucleic acids, in particular ribosomal RNA, from other bacterial species. It has been checked that the ribosomal target RNAs of the other species are well released during the lysis step since they react with the combination of capture and detection probes directed against 16S ribosomal RNA and of eubacterial specificity.
  • the adaptation of the specific combination on the VIDAS machine has been carried out.
  • the wall of the microplate well is here replaced by the SPR (trademark) ("Solid Phase Receptacle") which is a conical support made from a material sold under the name K resin (butadiene-styrene copolymer) and marketed by the company bioMérieux- VITEK (USA).
  • the various reagents are placed in a strip with several cuvettes and the different stages take place in the SPR which is capable of sucking and discharging the reagents and which therefore acts as a pipette.
  • the sandwich hybridization reaction described in the protocol below takes place on the internal wall of the cone.
  • the capture oligonucleotide is passively attached comprising at its 5 ′ end the ligand Aminolink 2 (Applied Biosystems-ref. 400808) at a concentration of 1 ng / ⁇ l in a volume of 315 ⁇ ⁇ d ' a 4x PBS solution (200 mM sodium phosphate pH 7.0, 600 mM NaCl). After overnight at room temperature or two hours at 37 ° C., the cones are washed twice with a PBS Tween solution, then dried under vacuum.
  • the strip contains in cuvettes the reagents necessary for detection, that is to say: 200 ⁇ ⁇ of a solution at 0.1 ng / ⁇ l of the oligonucleotide-phosphatase detection conjugate 17
  • the cone After incubating the cone for 30 minutes with the target mixture plus detection probe, the cone is washed twice with a PBS Tween solution. 250 ⁇ l of MUP substrate (4-methyl umbelliferyl phosphate) in solution in a diethanolamine buffer are aspirated into the cone, then released into a reading bowl. The device measures the fluorescent signal expressed in URF (relative fluorescence units) of the cuvette.
  • MUP substrate 4-methyl umbelliferyl phosphate
  • a collection of mycobacterial strains was tested by hybridization on the 23S rRNA and made it possible to observe the specificity of this probe a posteriori.
  • the hybridization of the rRNAs of a target bacterium was carried out according to the method described in example 3 above for the VIDAS robot.
  • a capture probe (30 nucleotides in M. xenopi corresponding to the coordinates 81-1 10 of SEQ ID N0173) and an oligonucleotide-enzyme detection conjugate, corresponding to the coordinates 59-76 of SEQ ID N0173, are used.
  • the target bacteria tested were notably the following: 18
  • mycobacteria various other mycobacteria (56 isolates) including 2 strains of M. bovis (including ATCC 19210), M. asiaticum (ATCC 25276), M. avium- intracellulare (including ATCC 35764), M. chelonae (ATCC 14472), M. flavescens, M. fortuitum, M. gastri, M. gordonae, M. kansasii, M. marinum, M. non chromogenicum, M. phlei, M. scrofulaceum, M. simiae, M. smegmatis, M.szulgai, M. terrae , M. vaccae, Nocardia asteroides (ATCC 3308), M. brasilensis (ATCC 19296).
  • M. bovis including ATCC 19210
  • M. asiaticum ATCC 25276
  • M. avium- intracellulare including ATCC 35764
  • the hybridization of the rRNAs of a target bacterium was carried out according to the method described in example 3 above for the VIDAS robot.
  • a capture probe 24 nucleotides in M. fortuitum corresponding to the coordinates 1468-1493 of E. coli
  • an oligonucleotide-enzyme detection conjugate corresponding to the coordinates 6-22 of SEQ ID NO 1 17, are used.
  • the target bacteria tested were notably the following:
  • mycobacteria various other mycobacteria (45 isolates) including 2 strains of M. bovis (including ATCC 19210), M. asiaticum (ATCC 25276), M. avium-intracel / u / are (including ATCC 35764), M. chelonae (ATCC 14472 ), M. flavescens, M. fortuitum, M. gastri, M. gordonae, M. kansasii, M. marinum, M. non chromogenicum, M. phlei, M. scrofulaceum,
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  • GUGUGGAGCC GUGAUGAUGA AUCACCGGUA CUAACCACCC AAAACCGAUC GAUCGACCUU 60 CCUUCGGGUG UGGAGUUCUG GGGCUGCGUG GAACUUCGCU GGUAGUAGUC AAGCGAA 117 114
  • IViB STRAIN CIP 140 120001 lviC INDIVIDUAL / ISOLATED: lviD STAGE OF DEVELOPMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE OF USSU: lviG TYPE OF CELL: lviH CELLULAR LINE: lvii ORGANAL: lvii IMMEDIATE SOURCE: bioMérieux SA lviII BIB: THE GENOME: lviiiA CHROMOSOME / SEGMENT: lviiiB POSI ⁇ ON RELATIVE
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  • GUGUGGCGUC CCUGAUGAAU CAGCGGUACU AACCACCCAA AACCGGAUCG ACCAUUCCUU 60 CGGGGCGUGG AGUUUCGGGG CUGCGUGGAA CCUUCGCUGG UAGUAGUCAA GCAAU 115 119
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Abstract

L'invention concerne des fragments nucléotidiques monocaténaires appartenant à une région variable de l'ARN ribosomique 23S des espèces du genre Mycobacterium. L'invention concerne en outre les sondes, les amorces dont les séquences appartiennent à celles des fragments de l'invention, un réactif et un procédé pour identifier les espèces de mycobactéries.

Description

Fragment nucléotidique de l'ARN ribosomique 23S de mycobactéries, sondes et amorces dérivées, réactif et procédé de détection
La présente invention relève du domaine des techniques de détection et/ou identification des bactéries du genre Mycobacterium et plus particulièrement de celles utilisant un marqueur génétique.
L'importance d'un diagnostic bactériologique fiable et suffisamment rapide a été remis en lumière avec l'épidémie actuelle du Syndrome d'Immunodéficience Acquise (SIDA) qui occasionne d'une part, une résurgence des cas de tuberculose due à Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis, Mycobacterium africanum et Mycobacterium microti, espèces taxonomiquement très proches et regroupées sous le nom de "complexe M. tuberculosis", et d'autre part, l'apparition d'infections à mycobactéries atypiques plus particulièrement causées par Mycobacterium intracellulare, Mycobacterium avium et Mycobacterium paratuberculosis, rassemblées sous le nom de "complexe aviaire".
Aussi la technique utilisant un marqueur génétique dans un procédé de détection par hybridation d'acides nucléiques, alliant spécificité, sensibilité et rapidité, a déjà fait l'objet de plusieurs applications spécifiques au diagnostic des mycobactéries.
Plus particulièrement, l'ARN ribosomique des bactéries est utilisé comme cible, car premièrement il est retrouvé dans toutes cellules de tous les organismes vivants, en quantité, et deuxièmement il présente une séquence nucléotidique particulière faite d'une succession de régions caractérisées par une vitesse d'évolution variable.
La valeur taxonomique des sous-unités 16S et 23S ribosomiques de diverses espèces bactériennes a été mise en évidence dans des procédés d'hybridation pour quantifier des niveaux d'homologies entre ces espèces. Ainsi, Woese et coll., Microbiological Reviews 47 : 621-669 (1983), et Grayet et coll., Nucleic Acids Research 12: 5837- 5852 (1984) montrent, par des comparaisons de séquences d'ARN 16S, que des régions hautement conservées sont intercalées avec des régions de moyenne et basse homologies, même dans le cas d'espèces proches.
La demande de brevet WO-88/03957 décrit des sondes de détection spécifiques des mycobactéries, dont les séquences nucléotidiques sont susceptibles de s'hybrider aux sous-unités 16S et 23S des ARN ribosomiques desdites bactéries.
Les sondes décrites sont 7 sondes d'espèces ou groupes d'espèces et 4 sondes de genre, et sont rassemblées dans le Tableau 1 suivant où sont respectivement répertoriées la sous-unité d'ARN ribosomique ciblée, la séquence de nucléotides ciblée en prenant comme référence la séquence nucléotidique de l'ARN ribosomique de E. Coli et la spécificité des sondes vis-à-vis de l'espèce, du groupe d'espèces ou du genre Mycobacterium.
TABLEAU 1
SONDE Sous-unité Position dans
Spécificité N° d'ARN ribosomique la séquence
1 16S 185-225 M. avium
2 16S 185-225 M. intracellulare
3 16S 185-225 complexe M. tuberculosis
4 23S 1 155-1 190 complexe M. tuberculosis
5 23S 540-575 complexe M. tuberculosis
6 23S 2195-2235 complexe M. tuberculosis
7 23S 2195-2235 complexe M. tuberculosis
8 16S 1025-1060 genre Mycobacterium
9 23S 1440-1475 genre Mycobacterium
10 23S 1515-1555 genre Mycobacterium
1 1 23S 1570-1610 genre Mycobacterium Il ressort de ce tableau, qu'au niveau de l'espèce, seules deux sondes ont été mises au point, l'une spécifique de l'espèce M. avium, l'autre spécifique de l'espèce M. intracellulare, et elles l'ont été à partir du séquençage des sous-unités ribosomiques 16S. Si deux espèces du "complexe aviaire" très proches du point de vue taxonomique, peuvent être indépendamment identifiées par ces méthodes, les différentes espèces du "complexe tuberculosis" ne le peuvent pas encore.
Il se dégage, en outre, de cet art antérieur que d'une part les régions variables d'une espèce à l'autre ou d'une espèce à un groupe d'espèces, retenues pour élaborer des sondes sont situées sur la sous- unité 16S de l'ARN ribosomique, et que d'autre part, la sous-unité 23S comprend des régions homologues au sein du genre Mycobacterium permettant de détecter des groupes d'espèces de mycobactéries. Conformément à l'enseignement de WO93/04201 , certains auteurs ont recherché, à partir de la détermination partielle des séquences nucléotidiques de la sous-unité 23S de l'ARN ribosomique de quelques mycobactéries pathogènes, à mettre au point des sondes d'espèces qui, par hybridation spécifique, permettraient de détecter sélectivement une espèce de mycobactéries. Les résultats expérimentaux ont cependant mis en évidence que les sondes élaborées étaient des sondes de genre spécifiques des mycobactéries ou des sondes de groupes, tuberculosis ou aviaire, mais qu'elles ne permettaient en tout cas pas la détection sélective d'espèces de mycobactéries. Aujourd'hui, aucune technique de détection n'est à la fois assez spécifique, sensible et rapide pour diagnostiquer la présence d'une espèce déterminée de mycobactéries dans un échantillon biologique.
Selon la présente invention, on a déterminé sur l'ARN ribosomique de la sous-unité 23S, des zones variables au sein du genre Mycobacterium, ce qui permet de subvenir au besoin actuel de diagnostiquer une pathogénicité notamment chez les sujets immunodéprimés, en apportant des sondes de détection spécifiques des espèces et groupes d'espèces des mycobactéries.
Le point de départ de l'invention est la détermination complète des séquences nucléotidiques de la sous-unité 23S de l'ARN ribosomique pour un nombre suffisant d'espèces de mycobactéries, ce qui a permis de mettre en évidence plusieurs régions variables permettant de discriminer plusieurs espèces de mycobactéries.
Avant d'exposer l'invention, différents termes utilisés dans la description et les revendications sont à présent définis : - selon l'invention, un fragment nucléotidique ou un oligonucleotide est un enchaînement de monomères, caractérisé par la séquence informationnelle des acides nucléiques naturels, susceptibles de s'hybrider à un fragment nucléotidique dans des conditions prédéterminées, l'enchaînement pouvant contenir des monomères de structures différentes et être obtenu à partir d'une molécule d'acide nucléique naturelle et/ou par recombinaison génétique et/ou par synthèse chimique,
- ainsi un monomère peut être un nucléotide naturel d'acide nucléique dont les éléments constitutifs sont un sucre, un groupement phosphate et une base azotée; dans l'ADN le sucre est le ribose, dans l'ARN le sucre est le désoxy-2-ribose; selon qu'il s'agisse de l'ADN ou l'ARN, la base azotée est choisie parmi l'adénine, la guanine, l'uracile, la cytosine, la thymine; ou un nucléotide modifié dans l'un au moins des trois éléments constitutifs; à titre d'exemple, la modification peut intervenir au niveau des bases, générant des bases modifiées telles que l'inosine, la méthyl-5-désoxycytidine, la désoxyuridine, la diméthylamino-5-désoxyuridine, la diamino-2,6-purine, la bromo-5- désoxyuridine et toute autre base modifiée favorisant l'hybridation, au niveau du sucre à savoir le remplacement d'au moins un désoxyribose par un polyamide [P.E. Nielsen et al, Science, 254, 1497-1500 (1991 )], au niveau du groupement phosphate par exemple son remplacement par des esters notamment choisis parmi les esters de diphosphate, d'alkyl et arylphosphonate et de phosphorothioate,
- par "séquence informationnelle", on entend toute suite ordonnée de monomères, dont la nature chimique et l'ordre dans un sens de référence constituent une information de même qualité que celle des acides nucléiques naturels,
- par "hybridation", on entend le processus au cours duquel, dans des conditions appropriées, deux fragments nucléotidiques, ayant des séquences suffisamment complémentaires, s'apparient pour former un double brin, - une sonde est un fragment nucléotidique comprenant de 5 à 100 monomères, avantageusement de 8 à 50 monomères, possédant une spécificité d'hybridation dans des conditions déterminées pour former un complexe d'hybridation avec un fragment nucléotidique ayant une séquence nucléotidique comprise dans l'ARN ribosomique, l'ADN obtenu par transcription inverse dudit ARN ribosomique et l'ADN dont ledit ARN ribosomique est le produit de transcription; une sonde peut être utilisée à des fins de diagnostic telles que les sondes de capture et/ou de détection ou à des fins de thérapie, - la sonde de capture peut être immobilisée sur un support solide par tout moyen approprié, c'est-à-dire directement ou indirectement, par exemple par covalence ou adsorption passive,
- la sonde de détection est marquée au moyen d'un marqueur choisi parmi les isotopes radioactifs, des enzymes notamment choisis parmi la péroxydase et la phosphatase alcaline et ceux susceptibles d'hydrolyser un substrat chromogène, fluorigène ou luminescent, des composés chimiques chromophores, des composés chromogènes, fluorigènes ou luminescents, des analogues de bases nucléotidiques, et la biotine,
- les sondes utilisées à des fins de diagnostic de l'invention peuvent être mises en oeuvre dans toutes les techniques d'hybridation connues et notamment les techniques dites "DOT-BLOT" [MANIATIS et al, Molecular Cloning, Cold Spring Harbor, (1982)], "SOUTHERN BLOT" [SOUTHERN. E.M., J. Mol. Biol., 98, 503 (1975)], "NORTHEN BLOT" qui est une technique identique à la technique "SOUTHERN BLOT" mais qui utilise de l'ARN comme cible, la technique SANDWICH [DUNN A.R.,
HASSEL J.A., Cell, V2, 23 (1977)]; avantageusement, on utilise la technique SANDWICH dans la présente invention comprenant une sonde de capture spécifique et/ou une sonde de détection spécifique, étant entendu que la sonde de capture et la sonde de détection doivent présenter une séquence nucléotidique au moins partiellement différente,
- une autre application de l'invention est une sonde de thérapie pour traiter les infections dues aux mycobactéries, ladite sonde étant susceptible de s'hybrider in vivo sur l'ARN ribosomique 23S desdites bactéries et/ou sur l'ADN génomique pour bloquer les phénomènes de traduction et/ou de transcription, - une amorce est une sonde comprenant de 5 à 30 monomères, possédant une spécificité d'hybridation dans des conditions déterminées pour l'initiation d'une polymérisation enzymatique par exemple dans une technique d'amplification telle que la PCR (Polymerase Chain Reaction), dans un procédé d'élongation, tel que le séquençage, dans une méthode de transcription inverse ou analogue,
- l'homologie caractérise le degré de similitude de deux fragments nucléotidiques comparés.
En particulier, les sondes et amorces sont celles dont les séquences sont identifiées ci-après ou celles qui présentent au moins 70% d'homologie et au moins 5 monomères consécutifs de séquence informationnelle identique avec ces dernières.
Selon l'invention et dans des conditions qui seront détaillées plus loin dans le texte, on a déterminé la séquence nucléotidique des ARN ribosomiques 23S pour 16 espèces de mycobactéries, séquençage à partir duquel on a défini des fragments nucléotidiques monocaténaires appartenant à des régions variables et donc spécifiques d'une espèce de mycobactéries.
Pour définir ces fragments et pour les aligner, on a utilisé comme référence la numérotation de la séquence nucléotidique de l'ARN ribosomique 23S de Escherichia Coli, complètement identifiée par Brosius et al. (1980; Proc. Natl. Acad. Sci. USA; 77 :201 -204).
Les fragments nucléotidiques monocaténaires de l'invention présentent une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences suivantes :
- commençant au nucléotide N° 137 et finissant au nucléotide N° 179,
- commençant au nucléotide N° 206 et finissant au nucléotide N° 248,
- commençant au nucléotide N° 269 et finissant au nucléotide N° 289, à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de M. tuberculosis et de M. fortuitum,
- commençant au nucléotide N° 289 et finissant au nucléotide N° 290, à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de M. tuberculosis et de M. fortuitum,
- commençant au nucléotide N °341 et finissant au nucléotide N° 372, - commençant au nucléotide N° 645 et finissant au nucléotide N° 661 , à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de M. tuberculosis et de M. fortuitum,
- commençant au nucléotide N° 1201 et finissant au nucléotide N° 1242,
- commençant au nucléotide N° 1409 et finissant au nucléotide N° 1420, à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de M. tuberculosis, de M. marinum, de M. scrofulaceum, de M. avium TMC 724, de M. leprae, de M. kansasii et de M. asiaticum, de M. ulcerans ATCC 19423, M. malmoense ATCC 29571 ,
M. gordonae, M. lactae ATCC 25854, M. aurum ATCC 23366, M. vaccae ATCC 15483 et M. neoaurum ATCC 25795,
- commençant au nucléotide N° 1493 et finissant au nucléotide N° 1515, - commençant au nucléotide N° 1703 et finissant au nucléotide
N° 1761 ,
- commençant au nucléotide N° 1854 et finissant au nucléotide N° 1876, à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de M. tuberculosis, de M. kansasii et de M. fortuitum, - commençant au nucléotide N° 2126 et finissant au nucléotide
N° 2161 , à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de
M. tuberculosis, de M. kansasii et de M. fortuitum, et leurs séquences complémentaires, les numéros des nucléotides correspondant à leur position par rapport à la séquence nucléotidique de l'ARN ribosomique 23S d'Escherichia coli, utilisée comme référence.
Plus particulièrement, les séquences nucléotidiques des fragments de l'invention sont choisies parmi les séquences SEQ ID NO 1 à SEQ ID N028, SEQ ID N030 à SEQ ID N037, SEQ ID N039 à SEQ ID N041 , SEQ ID N043 à SEQ ID N049, SEQ ID N051 à SEQ ID N067, SEQ ID N069 à SEQ ID N075, SEQ ID N077 à SEQ ID N093, SEQ ID N095, SEQ ID N097, SEQ ID N098, SEQ ID N0100 à SEQ ID N0136, SEQ ID N0138 à SEQ ID N0144, SEQ ID N0146 à SEQ ID N0148,SEQ ID N0150 à SEQ ID N0152, SEQ ID N0154 à SEQ ID N0158, SEQ ID N0160, SEQ ID N0161 , SEQ ID N0163 à SEQ ID N0174 et SEQ ID N0178, et leurs séquences complémentaires. La numérotation de la séquence de l'ARNr 23S de E. coli appliquée aux séquences identifiées dans la présente description, ne reflète pas toujours le nombre de nucléotides ou monomères constituant ces séquences. En effet, les mycobactéries possèdent un matériel génétique supplémentaire par rapport à E. coli, ce qui est particulièrement mis en évidence pour les séquences SEQ ID NO 29 à SEQ ID NO 41 .
Conformément à la définition ci-dessus les fragments de l'invention sont des fragments d'ARN, mais ils peuvent aussi être des fragments monocaténaires d'ADN résultant de la transcription inverse des fragments d'ARN précités, ou leurs fragments complémentaires, ainsi que des fragments monocaténaires d'ADN génomique dont les produits de transcription sont les fragments d'ARN précités, ou leurs fragments complémentaires.
Les sondes préférentielles sont celles présentant une séquence choisie parmi les séquences :
- commençant au nucléotide N° 10 et finissant au nucléotide N° 24 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 1 à 14,
- commençant au nucléotide N° 26 et finissant au nucléotide N° 45 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 1 à 14, - commençant au nucléotide N° 1 et finissant au nucléotide N° 20 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 15 à 28,
- commençant au nucléotide N° 26 et finissant au nucléotide N° 43 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 15 à 28,
- commençant au nucléotide N° 4 et finissant au nucléotide N° 22 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 29 à 41 ,
- commençant au nucléotide N° 12 et finissant au nucléotide N° 29 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 42 à 53,
- commençant au nucléotide N° 36 et finissant au nucléotide N° 56 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 42 à 53, - commençant au nucléotide N° 13 et finissant au nucléotide N° 32 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 54 à 67,
- commençant au nucléotide N° 5 et finissant au nucléotide N° 23 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 68 à 79,
- commençant au nucléotide N° 15 et finissant au nucléotide N° 33 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 80 à 93, - commençant au nucléotide N° 1 et finissant au nucléotide N° 21 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID N094 à 106 et SEQ ID N0166 à 178,
- commençant au nucléotide N° 44 et finissant au nucléotide N° 76 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 94 à 106 et
SEQ ID NO 166 à 178,
- commençant au nucléotide N° 67 et finissant au nucléotide N° 85 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 94 à 106, et SEQ ID NO 166 à 178, - commençant au nucléotide N° 6 et finissant au nucléotide N° 26 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 107 à 120,
- commençant au nucléotide N° 1 et finissant au nucléotide N° 18 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 121 à 136,
- commençant au nucléotide N° 39 et finissant au nucléotide N° 55 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 121 à 136,
- commençant au nucléotide N° 1 1 et finissant au nucléotide N° 26 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 137 à 152,
- commençant au nucléotide N° 5 et finissant au nucléotide N° 22 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 153 à 165, et leurs séquences complémentaires, étant entendu que la numérotation des monomères constitutifs de chaque sonde prend son origine au début de la séquence dont est issue la sonde.
Une sonde particulièrement avantageuse de l'invention est celle dont la séquence nucléotidique commence au nucléotide N° 1 et finissant au nucléotide N° 21 de la zone variable correspondant à la SEQ ID N° 94, dont l'intérêt réside dans sa spécificité vis-à-vis de l'espèce M. tuberculosis, parmi d'autres espèces de mycobactéries, mais également au sein même du groupe M. tuberculosis.
D'autres sondes particulières, décrites et testées dans les exemples qui suivront, sont celles spécifiques de l'espèce M. fortuitum et M. xenopi, respectivement.
Un autre objet de l'invention est une amorce pour la transcription inverse spécifique d'une séquence d'ARN ribosomique 23S des mycobactéries appartenant à une région variable, en une séquence d'ADN complémentaire, ou une amorce notamment pour l'amplification spécifique, par réaction de polymérisation en chaîne, de la séquence d'ADN complémentaire à une séquence d'ARN ribosomique 23S des mycobactéries, appartenant à une région variable.
Les sondes de thérapie de la présente invention comprennent une séquence nucléotidique appartenant à la séquence d'un fragment présentant au moins une des séquences nucléotidiques suivantes de l'ARN 23S :
- commençant au nucléotide N° 137 et finissant au nucléotide N° 179,
- commençant au nucléotide N° 206 et finissant au nucléotide N° 248,
- commençant au nucléotide N° 269 et finissant au nucléotide N° 289, - commençant au nucléotide N° 289 et finissant au nucléotide N° 290,
- commençant au nucléotide N° 341 et finissant au nucléotide N° 372,
- commençant au nucléotide N° 645 et finissant au nucléotide N° 661 ,
- commençant au nucléotide N° 1201 et finissant au nucléotide N° 1242, - commençant au nucléotide N° 1409 et finissant au nucléotide
N° 1420,
- commençant au nucléotide N° 1493 et finissant au nucléotide N° 1515,
- commençant au nucléotide N° 1703 et finissant au nucléotide N° 1761 ,
- commençant au nucléotide N° 1854 et finissant au nucléotide N° 1876,
- commençant au nucléotide N° 2126 et finissant au nucléotide N° 2161 , et leurs séquences complémentaires.
L'invention concerne aussi un réactif pour détecter et/ou identifier au moins une espèce de mycobactéries dans un échantillon biologique comprenant au moins une sonde de l'invention, et en particulier une sonde de capture et une sonde de détection l'une et/ou l'autre répondant à la définition d'une sonde selon l'invention. Le réactif peut comprendre un mélange de sondes de l'invention dans le but de détecter au moins deux espèces de mycobactéries.
Enfin, l'invention apporte un procédé pour détecter sélectivement et/ou identifier une espèce de mycobactéries dans un échantillon biologique selon lequel on expose l'ARN ribosomique 23S, extrait des mycobactéries et éventuellement dénaturé ou l'ADN génomique, extrait et dénaturé des bactéries, ou l'ADN obtenu à partir de la transcription inverse de l'ARN ribosomique 23S, à au moins une sonde de l'invention et on détecte l'hybridation de ladite sonde.
De manière préférentielle, avant d'exposer l'ADN à la sonde de l'invention, on réalise une amplification de cet ADN en présence d'un système enzymatique adapté et au moins une amorce d'amplification de l'invention.
La genèse de l'invention et certaines de ces applications sont exposées ci-après avec les Exemples 1 à 5 suivants en référence aux Figures 1 à 13 représentant les alignements des séquences appartenant aux zones variables de l'ARN 23S pour différentes souches de 20 espèces de mycobactéries. Parmi ces figures, les figures 7, 8 et 9 sont constituées par l'alignement des figures respectivement 7a et 7b ; 8a, 8b et 8c ; 9a, 9b et 9c. Plus particulièrement, les figures 1 , 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10,
1 1 , 12 et 13 se rapportent aux zones variables dans l'ordre de leur apparition sur l'ARNr 23S des mycobactéries et correspondent aux séquences respectivement :
SEQ ID NO 1 à 14 SEQ ID NO 15 à 28
SEQ ID NO 29 à 41 SEQ ID NO 42 à 53 SEQ ID NO 54 à 67 SEQ ID NO 68 à 79 SEQ ID NO 80 à 93
SEQID NO 94 à 106 SEQID NO 166 à 178 SEQ ID NO 107 à 120 SEQID NO 121 à 136 SEQID NO 137 à 152
SEQID NO 153 à 165
Les numéros inscrits aux extrémités des séquences, sur les figures, font référence chacun à une espèce de mycobactéries conformément aux correspondances présentées dans le Tableau 2 suivant: TABLEAU 2
NUMEROS ESPECES
1 M. tuberculosis
2 M. BCG
3 M. africanum
4 M. marinum
5 M. vaccae
6 M. intracellulare
7 M. scrofulaceum
8 M. szulgai
9 M. kansasii
10 M. leprae
1 1 M. terrae
12 M. chelonae
13 M. flavescens
14 M. fortuitum
15 M. phlei
16 M. chitae
17 M. smegmatis
18 E. coli
19 M. bovis
20 M. avium
21 M. avium θ
22 M. intracellulare
23 M. intracellulare
24 M. intracellulare
25 M. gastri
26 M. simiae
27 M. terrae
28 M. xenopi
29 M. bovis BCG
EXEMPLE 1
Détermination de la séquence nucléotidique des ARN ribosomique 23S de mycobactéries
La séquence nucléotidique de l'ARN ribosomique 23S des 16 souches suivantes a été déterminée: 13
M. tuberculosis A 203 bioMérieux M. bovis BCG hôpital Pasteur-Nice M. africanυm CIP 140030001 M. intracellulare CIP 140310001 M. chelonae A 232 bioMérieux M. chitae ATCC 19627 M. flavesceπs CIP 140230001 M. fortuitum CIP 140410001 M. kansasii CIP 140110001 M. marinum CIP 140120001 M. phlei A 247 bioMérieux
M. scrofulaceum CIP 140220001 M. smegmatis A 251 bioMérieux M. szulgai A 253 bioMérieux M. terrae A 255 bioMérieux M. vaccae bioMérieux
L'ADN total de ces souches a été isolé par la méthode de Sjôbring et al. [1990. P.olymerase chain reaction for détection of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol. 28(10):2200-2204]. Des produits d'amplification PCR qui couvrent 90% de la séquence ont été générés à partir de l'ADN ribosomique à l'aide d'amorces d'amplification de spécificité eubactérienne.
Les produits d'amplification obtenus ont été clones dans les formes double-brin du phage M13. Les phages M13 recombinants obtenus ont servis de matrice à la réaction de séquençage utilisant la méthode de terminaison de chaîne (Sanger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1977, 74: 5463-5467).
EXEMPLE 2
Détermination de la séquence nucléotidique de la zone commençant au nucléotide N° 1409 et finissant au nucléotide N° 1420 des ARN ribosomiques 23S des souches de mycobactéries suivantes 14
ESPECES SOUCHES ORIGINE IN IUMERO N° (
M. bovis ATCC 19210 19
M. bovis BCG C 080 bioMérieux 29
M. avium DSM 43216 21
M. intracellulare ATCC 35764 22
M. intracellulare ATCC 35767 23
M. intracellulare ATCC 35847 24
M. gastri C 097 bioMérieux 25
M. terrae C 104 bioMérieux 27
M. simiae ATCC 25275 26
M. xenopi C 1 12 bioMérieux 28
(*) Les numéros font référence à la figure 9.
EXEMPLE 3
Utilisation d'une sonde spécifique dirigée contre l'ARN ribosomique 23S pour l'identification de M. tuberculosis
La sonde commençant au nucléotide N° 67 et finissant au nucléotide N° 85 de la SEQ ID NO 94, ou son complémentaire, a priori spécifique pour les souches du complexe M. tuberculosis, a été déduite d'après les alignements des séquences nucléotidiques d'ARN ribosomique 23S des figures 8 et 9. Elle est présente dans l'insertion de matériel génétique propre aux mycobactéries par rapport à la position 1419 de la séquence de référence de l'ARN ribosomique 23S d' Escherichia coli déterminée par Brosius et al. (1980; Proc. Natl. Acad. Sci. USA;77:201-204). Une collection de souches de mycobactéries a été testée par hybridation sur l'ARN ribosomique 23S et a permis de constater a posteriori la spécificité de cette sonde.
L'hybridation des ARN ribosomiques d'une bactérie-cible a été conduite selon le procédé de détection non-radioactif et semi-automatisé décrit dans le brevet français n° 90 07249 et modifié pour la détection de l'ARN ribosomique par l'addition d'un déstabilisant. Une sonde de capture (34 nucléotides chez M. tuberculosis insérés correspondant aux 15
coordonnées 1419-1424 d'£. coli) et un conjugué de détection oligonucleotide (correspondant à la sonde définie au début de l'exemple 3) -enzyme sont utilisés. La manipulation a été conduite dans une plaque de microtitration selon le protocole suivant. L'ARN ribosomique des souches a été extrait selon le protocole de base pour l'extraction de l'ARN des bactéries à Gram positif décrit dans "Current Protocols in Molecular Biology" 1987, Ausubel FM et al., Wiley interscience, New York. Dans une plaque de microtitration (Nunc 439454) est déposée une solution de 1 ng/μl de l'oligonucléotide de capture dont l'extrémité 5' a réagi avec le réactif Aminolink 2 (Applied Biosystems, Foster city , Californie) dans du PBS 3X (0.45 M NaCI 0.15 M phosphate de sodium pH 7.0). La plaque est incubée 2 h à 37° C puis lavée 3 fois avec 300 μ\ de PBST [PBS 1 x, Tween 20: 0,5 °/00 (Merck 822184)]. Le réactif Aminolink 2 permet d'ajouter à l'extrémité 5' de la sonde un bras comportant un groupement 6-aminohexyle. La sonde ainsi couplée à un ligand possédant un groupement polaire (aminé primaire), et fixée de façon passive sur le support, procure un signal amélioré; voir la demande FR 91 09057.
La cible constituée par 10 μ\ d'extrait d'ARN totaux est mélangée avec 40 μ\ de tampon PBS saumon (PBS-3X + ADN de sperme de saumon 10 yg/ml [Sigma D 9156)]. L'ensemble est ajouté dans le puits à 50 μ\ d'une solution du conjugué oligonucléotide-peroxydase, constituant la sonde de détection, à la concentration de 0.1 ng/μl en oligonucleotide dans un tampon PBS-cheval [PBS 3X + 10 % sérum de cheval (BioMérieux 55842)]. La plaque est incubée 1 h à 37° C puis lavée par 3 fois avec 300 μ\ de tampon PBST. Dans chaque puits, on rajoute 100 μl de substrat OPD (ortho-phénylènediamine Cambridge Médical Biotechnology ref/456) dans un tampon 0,055 M acide citrique, 0, 1 M monohydrogénophosphate de sodium, pH 4,93) à la concentration de 4 mg/ml, auquel on ajoute extemporanément du peroxyde d'hydrogène à 30% dilué au 1 /1000. Après 20 min de réaction l'activité enzymatique est bloquée par 100 /I d'acide sulfurique 1 N et la lecture est effectuée sur un appareil Axia Microreader (AXIA : marque enregistrée) (bioMérieux) à 492 nm. Les bactéries-cibles étaient notamment les suivantes :
- 50 isolats de M. tuberculosis 16
- 4 souches de M. bovis (dont ATCC 19210) et 2 souches de M. bovis BCG
- divers autres mycobactéries (61 isolats) : M. avium-intracel/ulare (dont ATCC 35764), M. asiaticum (ATCC 25276), M. chelonae (ATCC 14472), M. flavescens, M. fortuitum, M. gastri, M. gordonae, M. kansasii, M. marinum, M. phlei, scrofulaceum, M. simiae, M. smegmatis, M. terrae, M. vaccae, M. xenopi, Nocardia asteroides (ATCC 3308), N. brasilensis (ATCC 19296).
Les résultats obtenus indiquent que la combinaison de sondes utilisée est, a posteriori, spécifique du complexe tuberculosis. Elle ne présente pas de réactions croisées avec les acides nucléiques, en particulier l'ARN ribosomique, des autres espèces bactériennes. On a contrôlé que les ARN ribosomiques-cibles des autres espèces sont bien libérés lors de l'étape de lyse puisqu'ils réagissent avec la combinaison de sondes de capture et de détection dirigées contre l'ARN ribosomique 16S et de spécificité eubactérienne.
L'adaptation de la combinaison spécifique sur l'automate VIDAS (marque déposée-commercialisée par la société bioMérieux-VITEK) a été effectuée. La paroi du puits de microplaque est ici remplacée par le SPR (marque de commerce) ("Solid Phase Réceptacle") qui est un support conique réalisé à partir d'un matériau vendu sous la dénomination K résine (copolymère butadiène-styrène) et commercialisé par la société bioMérieux- VITEK (USA). Les divers réactifs sont disposés dans une barrette à plusieurs cuvettes et les différentes étapes se déroulent dans le SPR qui est capable d'aspirer et de refouler les réactifs et qui fait donc office de pipette. La réaction d'hybridation sandwich décrite dans le protocole ci-dessous se produit sur la paroi interne du cône.
Sur la surface interne du SPR, est fixé passivement l'oligonucléotide de capture comportant à son extrémité 5' le ligand Aminolink 2 (Applied Biosystems-réf.400808) à une concentration de 1 ng/μl dans un volume de 315 μ\ d'une solution de PBS 4x (phosphate de sodium 200 mM pH 7,0, NaCI 600 mM). Après une nuit à température ambiante ou deux heures à 37°C, les cônes sont lavés 2 fois par une solution PBS Tween, puis séchés sous vide. La barrette contient dans des cuvettes les réactifs nécessaires à la détection, c'est à dire: 200 μ\ d'une solution à 0, 1 ng/μl du conjugué de détection oligonucléotide-phosphatase 17
alcaline, deux fois 600 μl de solution de lavage PBS Tween et une cuvette de substrat.
Dans le premier puits de la barrette, sont déposés 10 μl de l'ARN extrait dans le même tampon que pour le protocole microplaque ci- dessus.
Après incubation 30 minutes du cône par le mélange cible plus sonde de détection, le cône est lavé deux fois par une solution de PBS Tween. 250 μl de substrat MUP (méthyl-4 umbelliféryl phosphate) en solution dans un tampon diéthanolamine sont aspirés dans le cône, puis relâchés dans une cuvette de lecture. L'appareil mesure le signal fluorescent exprimé en URF (unités relatives de fluorescence) de la cuvette.
Les résultats obtenus avec ce système sont les mêmes que ceux obtenus en microplaque.
EXEMPLE 4
Utilisation d'une sonde spécifique dirigée contre l'ARNr 23S pour l'identification de M. xenopi. La sonde commençant au nucléotide 59 et finissant au nucléotide 76 de la SEQ ID NO 173, ou son complémentaire, a priori spécifique pour les souches de l'espèce M. xenopi, a été déduite d'après les alignements des séquences nucléotidiques d'ARNr 23S des figures 8 et 9. Elle est présente dans l'insertion de matériel génétique propre aux mycobactéries par rapport à la position 1419 de la séquence de référence de l'ARNr 23S d'Escherichia coli déterminée par Brosius et al. Une collection de souches de mycobactéries a été testée par hybridation sur l'ARNr 23S et a permis de constater a posteriori la spécificité de cette sonde. L'hybridation des ARNr d'une bactérie-cible a été conduite selon le procédé décrit dans l'exemple 3 précédent pour l'automate VIDAS. Une sonde de capture (30 nucléotides chez M. xenopi correspondant aux coordonnées 81 -1 10 de la SEQ ID N0173) et un conjugué de détection oligonucléotide-enzyme, correspondant aux coordonnées 59-76 de la SEQ ID N0173, sont utilisés.
Les bactéries-cibles testées étaient notamment les suivantes : 18
- 10 isolats cliniques de M. xenopi
- diverses autres mycobactéries (56 isolats) dont 2 souches de M. bovis (dont ATCC 19210), M. asiaticum (ATCC 25276), M. avium- intracellulare (dont ATCC 35764), M. chelonae (ATCC 14472), M. flavescens, M. fortuitum, M. gastri, M. gordonae, M. kansasii, M. marinum, M. non chromogenicum, M. phlei, M. scrofulaceum, M. simiae, M. smegmatis, M.szulgai, M. terrae, M. vaccae, Nocardia asteroides (ATCC 3308), M. brasilensis (ATCC 19296).
Les résultats obtenus indiquent que la combinaison de sondes est spécifique de l'espèce M. xenopi. Elle ne présente pas de réactions croisées avec les acides nucléiques, en particulier l'ARNr, des autres espèces bactériennes testées. On a contrôlé que les ARNr-cibles des autres espèces sont bien libérés lors de l'étape de lyse puisqu'ils réagissent avec la combinaison de sondes dirigées contre l'ARNr 16S et de spécificité eubactérienne.
EXEMPLE 5
Utilisation d'une sonde spécifique dirigée contre l'ARNr pour l'identification de M. fortuitum.
La sonde commençant au nucléotide 6 et finissant au nucléotide 22 de la SEQ ID N0 1 17, ou son complémentaire, a priori spécifique pour les souches de l'espèce de M. fortuitum a été déduite d'après les alignements des séquences nucléotidiques d'ARNr 23S de la figure 10. Une collection de souches de mycobactéries a été testée par hybridation sur l'ARNr 23S et a permis de constater a posteriori la spécificité de cette sonde.
L'hybridation des ARNr d'une bactérie-cible a été conduite selon le procédé décrit dans l'exemple 3 précédent pour l'automate VIDAS. Une sonde de capture (24 nucléotides chez M. fortuitum correspondant aux coordonnées 1468-1493 d'E. coli) et un conjugué de détection oligonucléotide-enzyme, correspondant aux coordonnées 6-22 de la SEQ ID N0 1 17, sont utilisés. Les bactéries-cibles testées étaient notamment les suivantes :
- 8 isolats cliniques de M. fortuitum 19
- diverses autres mycobactéries (45 isolats) dont 2 souches de M. bovis (dont ATCC 19210), M. asiaticum (ATCC 25276), M. avium-intracel/u/are (dont ATCC 35764), M. chelonae (ATCC 14472), M. flavescens, M. fortuitum, M. gastri, M. gordonae, M. kansasii, M. marinum, M. non chromogenicum, M. phlei, M. scrofulaceum,
M. simiae, M. smegmatis, M. szulgai, M. terrae, M. triviale, M. vaccae, M. xenopi, Nocardia astéroïdes (ATCC 3308), M. brasilensis (ATCC 19296).
Les résultats obtenus indiquent que la combinaison de sondes utilisée est spécifique de l'espèce M. fortuitum. Elle ne présente pas de réactions croisées avec les acides nucléiques, en particulier l'ARNr, des autres espèces bactériennes testées. On a contrôlé que les ARNr-cibles des autres espèces sont bien libérés lors de l'étape de lyse puisqu'ils réagissent avec la combinaison de sondes dirigées contre l'ARNr 16S et de spécificité eubactérienne.
20
NOMBRE DE SEQUENCES: -1?6
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 1 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 45 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS lviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lv G TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvil ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A.
IviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179
IviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 1
AGUGAUGUCG UGCUACCCGC AUCUGAAUAU AUAGGGUGCG GGAGG 45 21
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 2 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 45 nucléotides liB TYPE: acide nucléique l C NOMBRE DE BRINS: simple l D CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M BOVIS BCG lviB SOUCHE: HÔP. PASTEUR lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvil ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 2
AGUGAUGUCG UGCUACCCGC AUCUGAAUAU AUAGGGUGCG GGAGG 45 22
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 3 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 45 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire l i TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE:
Ivil ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE:
Iviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 3
AGUGAUGUCG UGUUACCCGU AUCUGAAUAU AUAGGGUGCG GGAGG 45 23
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 4 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 44 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lvi A BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 4
AGUGAUGUCG UGUUACCCGC ACCUGAAUAU AUAGGGUGCG GGGG 44 24
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 5 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 45 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M VACCAE
IviB SOUCHE: lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 5
AGUGAUGUCG UGUCACCCGG CACUGAAUCU CUCGGGUGCG GGAGGC 45 25
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 6 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 30 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140 310001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 174..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 174..179 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 6
CCGCAUCUGA AUAUAUAGGG UGCGGGAGG 30 26
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 7 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 45 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140220001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 7
AGUGAUGUCG UGUUACCCGC AUCUGAAUAU AUAGGGUUCG GGAGG 45 27
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 8 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 45 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SZULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 8
AGUGAUGUCG UGUCACCCGG CACUGAAUAC AUAGGUGUCG GGGGG 45 28
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 9 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 46 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 9
AGUGAUGUCG UGUCACCCGG CACNGAAUAC AUAGGGUGUC GGGAGG 46 29
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 10 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 46 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE : bioMérieux S .A . lviiA BIBLIOTHEQUE : lviiB CLONE : lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 10
AGUGAUGUCG UGUCACCAGG CGCUGAAUAU AUAGGCGUCU GGGAGG 46 30
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 11 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 44 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 11
AGUGAUGUCG UGUCACCCUG CACUGAAUAC AUAGGUGUAG GAGG 44 31
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 12 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 45 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioM* lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 12
AGUGAUGUCG UGUCACCCAA CGCUGAAUAU AUAGGCGUUG GGGGG 45 32
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 13 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 44 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 13
AGUGAUGUCG UGUCACCCGU AUCUGAAUUC AUAGUGGCGG GAGG 44 33
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 14 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 46 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 137..179 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 137..179 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 14
AGUGAUGUCG UGUCACCAGG CGCUGAAUAU AUAGGCGUCU GGGGGG 46 34
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 15 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206..248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par'similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 15
UACCCGUAGG AGGAGAAAAC AAUUGUGAUU CCGCAAGUAG UGG A3 35
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 16 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M BOVIS BCG
IviB SOUCHE: HÔP. PASTEUR lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206..248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 16
UACCCGUAGG AGGAGAAAAC AAUUGUGAUU CCGCAAGUAG UGG 43 36
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 17 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206.-248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 17
UACCCGUAGA GAAAGAAAAC AAUUCUGAUU CCGUCAGUAG UGG 43 37
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 18 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140 120 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE : bioMérieux S .A. lviiA BIBLIOTHEQUE : lviiB CLONE : lviii POSITION DANS LE GENOME : lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D' ESCHERICHIA COLI : 206. - 248 lviiiC UNITES : lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206..248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 18
UACCCGUAGG AAAAGAAAAC AAUUGUGAUU CCGUAAGUAG UGG 43 38
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 19 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 10 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M VACCAE
IviB SOUCHE: lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..215 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206..215 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 19
UCCCCGNCGG 10 39
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 20 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140 310 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206.-248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 20
UACCCGUAGG AGAAGAAAAC AAUUGUGAUU CCGUAAGUAG UGG 43 40
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 21 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140 220 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206.-248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206.-248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 21
UACCCGUAGG AGAAGAAAAC AAUUGUGAUU CCGUUAGUAG UGG 43 41
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 22 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 42 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M S2ULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206.-248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206.-248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 22
UACCCGUAGA AGAGAAAACA AAAGUGAUUC CGUGAGUAGU GG 42 42
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 23 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206.-248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 23
UACCCGUAGG AGGAGAAAAC ANANGUGAUU CCGUGAGUAG UGG 43 43
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 24 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206..248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 24
UACCCGUAGA AGAGAAAACA AAAUGUGAUU CCGUGAGUAG UGG 43 44
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 25 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 44 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206.-248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 25
UACCCGUAGG AAGAGAAAAC AAAAUGUGAU UCCGUGAGUA GUGG 44 45
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 26 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 42 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE:
Figure imgf000048_0001
lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206.-248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par 'similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 26
UACCCGUAGA AGAGAAAACA AUUGUGAUUC CGUGAGUAGU GG 42 46
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 27 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206..248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 27
UACCCGUAGG AAGAGAAAAC AAUUGUGAUU CCGUGAGUAG UGG 43 47
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 28 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 44 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr / lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 206..248 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 206.-248 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 28
UACCCGUAGA AAGAGAAAAN CAAAUGUGAU UCCGUGAGUA GUGG 44 48
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 29 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269.-289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 29
UAAACCGCAC GCAUGGGUAA CCGGGUAGGG GUUGU 35 49
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 30 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M BOVIS BCG
IviB SOUCHE: HÔP. PASTEUR lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 269.-289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par Similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 30
UAAACCGCAC GCAUGGGUAA CCGGGUAGGG GUUGU 35 50
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 31 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269..289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 31
UAAACCGCAU GCAUGGACAA CCGGGUAGGG GUUGU 35 51
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 32 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269.-289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 32
UAAACCGCAC GCAUGUUUAA CCGGGUAGGG GUUGU 35 52
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 33 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140 310001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269..289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 33
UAAACCGCAC GCAUGUGAUA CCGGGUAGGG GUUGU 35 53
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 34 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140 220 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE : bioMérieux S .A . lviiA BIBLIOTHEQUE : lviiB CLONE : lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269.-289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 34
UAAACCGCAU GCAUGGAUAA CCGGGUAGGG GUUGU 35 54
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 35 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SZULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269.-289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 35
UAAACCGUGC ACAUGUGAUA CCCGGCAGGG GUUGU 35 55
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 36 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269..289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 36
UAAACCGUGC ACAUGUGAUA CCCGGCAGGG GUUGU 35 56
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 37 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 24 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269..289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.. 89 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 37
UAAACCGAUG CAUGUGAUAC CGGG 24 57
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 38 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 34 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269.-289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 38
UAAACCGUAU GCAUGUGAUC CGGGUAGGGG UUGU 34 58
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 39 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269.-289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 39
UAAACCGCGU GCAUGUGAUA CCCGGCGGGG GUUGU 35 59
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 40 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269..289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269.-289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 40
UAAACCGUGU GCAUGUGAUA CCCGGCGGGG GUUGU 35 60
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 41 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 269..289 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 269..289 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 41
GAAACCGUAU GCAUGUGAUA CCGGNUAGGG GUUGU 35 61
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 42 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289.-290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289.-290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 42
GUUGUGGGAN GAUAUGUCUC AGCGCUACCC GGCUGAGAGG CAGUCAGAAA GUGUCGUG 58 62
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 43 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M BOVIS BCG
IviB SOUCHE: HÔP. PASTEUR lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289.-290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289..290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 43
GUUGUGGGAG GAUAUGUCUC AGCGCUACCC GGCUGAGAGG CAGUCAGAAA GUGUCGUG 58 63
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 44 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 59 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 289..290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289..290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 44
GUUGUGGGAU UGAUAUGUCU CAGCUCUACC UGGCUGAGGG GUAGUCAGAA AGUGUCGUG 59 64
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 45 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 59 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289..290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289.-290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 45
GUUGUGGGAA UGAUAUGUCU CAGCUCUACC UGGCUGAGAG GCAGUCAGAA AGUGUCGCA 59 65
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 46 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140310001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289.-290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289.-290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 46
GUUGUGGGAG GAUACAUCUC AGCUCUACCU GGCUGAGGGG UAGUCAGAAA GUGUCGUG 58 66
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 47 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 59 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE
Figure imgf000069_0001
lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140220001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289..290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289..290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 47
GUUGUGGGAU UGAUAUGUCU CAGCUCUACC UGGCUGAGGG GUAGUCAGAA AGUGUCGUG 59 67
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 48 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M S2ULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioM< lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289..290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289..290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 48
GUUGUGGGUG CAUCAGUCCU GGAUCUGCCG GUCUGGGCUG CAGUGAGAAA AGCUCGUG 58 68
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 49 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 59 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289.-290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289.-290 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 49
GUUGUGGGGU GCAUCAGUCC UGGAUCUGCC GGUCUGGGCU CGAGUGAGAA AAGCUCGUG 59 69
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAπONS POUR LA SEQ ID NO: 50 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289.-290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289.-290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 50
GUUGUGGGAC CUGUUUUUCC AGUUCUACCU GGCUGGAGGG UAGUGAGAAA AUGUCGUG 58 70
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 51 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289.-290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289.-290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 51
GUUGUGGGGC CUGUGUUCCA UCGUCCGCCG GCGAUGGCAG UAGUGAUAAA AGCAGUGU 58 71
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 52 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 57 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289.-290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289..290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par Similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 52
GUUGUGGGCG UUUCUUCUCA GGUCCUGCGG CCUGGGCGAC AGUCAGAAAG UGUGUGU 57 72
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 53 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 57 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 289..290 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 289..290 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 53
GUUGUGGGNC CUAUCUUUCC GGCUCUACCU GGCUGGAGGG UAGUGAGAAA UGUUGUG 57 73
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 54 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 39 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 54
CGCGAAAACN CCGGCACCUG CCUAGUAUCA AUUCCCGAG 39 74
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 55 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M BOVIS BCG
IviB SOUCHE: HÔP. PASTEUR lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par Similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 55
CGCGAAAACC CGGCACCUGC CUAGUAUCAA UUCCCGAG 38 75
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 56 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 37 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 56
CGCGAAAACC CGGCACCUGC UUAUAUCAAC ACCCGAG 37 76
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 57 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140 120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 57
CGUGAAAACC CGGCACCUGC CUAGUAUCAA CUCCCGAG 38 77
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 58 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 17 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M VACCAE
IviB SOUCHE: lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 361..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 361..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 58 UAUGUGUANN UCCCGAG 17 78
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAπONS POUR LA SEQ ID NO: 59 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140310001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par Similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 59
CGCGAAAACC CGUCACCUAC CUUGUAUCAN UUCCCGAG 38 79
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 60 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140220001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 60
CGCGAAAACC CGGCACCUAC CUUGUAUCAA CACCCGAG 38 80
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 61 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SZULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 61
GGUGAAAACA CAGUGCUCUG UAGUGAUGUG UCCCCGAG 38 81
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 62 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 62
GGUGAAAACA CCGUGCUCUG UAGUGAUGUG UCCCCGAG 38 82
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 63 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 63
CGUGAAAACC CGACGUCUGU CUUGAUGGUG UUCCCGAG 38 83
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 64 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 39 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID* NO: 64
CGUGAAAACC UGACAUCUAC CAAGAACGGU GUUCCCGAG 39 84
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 65 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 37 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 65
ACCGAAAACA UGCUGCCUGC UGUCACAGGU UCCCGAG 37 85
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 66 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 37 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 66
GGCGAAAACA UGCACUCUGU UGUGGAAUGU UCCCGAG 37 86
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 67 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 341..372 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 341..372 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 67
CGUGAAAACC CGACGUCUGU CUUGAUGGUG UUCCCGAG 38 87
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 68 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 68
UAGGGCGAUC CCAUACGCGC GUGUGAAUAG UGGCG 35 88
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 69 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 30 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 69
UAGGGCGAUC CCUUUGGGGG UGUAGUGGCG 30 89
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 70 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 31 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 70
UAGGGCGUAU CCCGUAAGGG GUGUAGUGGC G 31 90
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 71 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 28 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140 310 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 71
UAGGGCGAUC CCUUUGGGUG UAGUGGCG 28 91
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 72 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 28 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE
Figure imgf000094_0001
lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140220001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATI N D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 72
UAGGGCGCAU CCCUUUGGUG UAGUGGCG 28 92
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 73 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SZULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE:
•lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 73
UAGGGCGUAU CCACACAACA GUGUGUGGNG UAGUGGCG 38 93
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 74 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 74
UAGGGCGUAU CCACACAACA GUGUGUGGUG UAGUGGCG 38 94
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 75 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645. .661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 75
UAGGGCGUAU CCACACAAGA GUGUGUGGUG UAGUGGCG 38 95
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 76 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 76
UAGGGCGUAU CCGCACAGUA GUGUGUGGUG UAGUGGCG 38 96
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 77 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 41 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION- D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 77
UAGGGCGUAU CCAUACGCUA GUUGGUGUUG GUGUAGUGGC -G 41 97
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 78 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 31 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 78
UAGGGCGUAU CCAGUGAGGC GUGUAGUGGC G 31 98
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 79 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 38 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 645..661 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 645..661 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 79
UAGGGCGUAU CCACACAAGA GUGUGUGGUG UAGUGGCG 38 99
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 80 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 42 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 80
CCUCAUUCAG CGAAGCCACC GGGUGACCGG UGGUGGAGGG UG 42 100
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 81 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 41 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M BOVIS BCG
IviB SOUCHE: HÔP. PASTEUR lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 81
CCUCAUUCAG CGAAGCACCG AGUGACCGGU GGUGGAGGGU G 41 101
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 82 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 42 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 82
CCCCAUUCAG CGAAGCCUCC GGGUGACCGG UGGUGGAGGG UG 42 102
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 83 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 41 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1262 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201-.1262 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 83
CCUCAUUCAG CGAAGCUGCC GGGUAACCGU GGUGGAGGAU G 41 103
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 84 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M VACCAE
IviB SOUCHE: lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1262 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1262 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 84
CUGCAUCCGG UGAAGCAGCA GAGUGAUCUA GCUGUGGAGG GUC 43 104
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 85 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 42 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140 310 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 85
CCUCAUUCAG CGAAGCCUCC GGGUGACCGG UGGUGGAGGG UG 42 105
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 86 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 42 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140 220 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201.:1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 86
CCCCAUGCAG CGAAGCUACC GGGUAACCGG UGGUGGAGUU UG 42 106
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 87 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 44 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SZULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 87
CUGCAUCCGG UGAAGCAGCA GAGUGAUCUA GCUGUGGGAG GGUG 44 107
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 88 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 88
CUGCAUCCGG UGAAGCAGCA GAGUGAUCUA GCUGUGGAGG GUG 43 108
NOMBRE DE SEQUE CES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 89 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 89
CUGCAUCCGG UGAAGCCGCC GAGUGAUCGA GUGGUGGAGG GUG 43 109
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 90 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION- D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 90
CAGCAUCCGG UGAAGCAGCA GAGUGAUCUA GCUGUGGAGG GUG 43 110
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 91 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 91
CAGCAUCCGG UGAAGCAGCA GAGUGAUCUA GCUGUGGAGG GUG 43 111
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 92 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 92
CUGCAUCCAG UGAAGCAGCC GGGUGACCGU GUUGUGGAGG GUG 43 112
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 93 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 43 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE
Figure imgf000115_0001
lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE:
Figure imgf000115_0002
lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1201..1242 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1201..1242 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 93
CUGCAUCCGG UGAAGCCGCC GAGUGAUCGA GUGGUGGAGG GUG 43 113
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 94 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 117 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 94
GUGUGGAGCC GUGAUGAUGA AUCACCGGUA CUAACCACCC AAAACCGAUC GAUCGACCUU 60 CCUUCGGGUG UGGAGUUCUG GGGCUGCGUG GAACUUCGCU GGUAGUAGUC AAGCGAA 117 114
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 95 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 115 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE:
Figure imgf000117_0001
lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 95
GUAUGGCGUC CCUGAUGAAU CAGCGGUACU AACCACCCAA AACCGGAUCG ACCAUUCCUU 60 CGGGGCGUUG CCAUUCGGGG CUGCGUGGGA CCUUCGCUGG UAGUAGUCAA GCAAU 115 115
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 96 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 120 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140 120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 96
GUGUGCGCGC CCGUGAUGAA UGAGCGGUAC UAACCACCCA AAACCGGAUC GAUCCAUAUC 60 CCUUCGGGGG CGUGGAGUUC CGGGGCUGCG UGGAACCUUC GUUGGUAGUA GUCAAGCCAC 120 116
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 97 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 115 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M VACCAE
IviB SOUCHE: lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 97
GUGUGAGCGU CCCUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCGCCCC AAACCACAGU CACCGAUCCU 60
UCAGGGUGAG GGAUUGUGGG CUGCGCGGGA CCUUCGUUGG UAGUAGUCAA GCGAU 115 117
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 98 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 117 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140310001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE:
Figure imgf000120_0001
lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 98
GUAUGGGCGU CCCUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCACCCA AAACCGGAUC GACCAUUCCU 60 UCGGGGGCAU GGAGUUUCGG GGCUGCGUGG GACCUUCGCU GGUAGUAGUC AAGCAAU 117 118
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 99 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 115 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140 220001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 99
GUGUGGCGUC CCUGAUGAAU CAGCGGUACU AACCACCCAA AACCGGAUCG ACCAUUCCUU 60 CGGGGCGUGG AGUUUCGGGG CUGCGUGGAA CCUUCGCUGG UAGUAGUCAA GCAAU 115 119
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 100 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 114 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M S2ULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA CÔLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 100
GUGUGAGCGU CCCUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCGCCCA AAACCACGGU CACCGAUCUU 60
CGGGGUNAGG CCUCGUGGGC UGCGUGGGAC CUUCGUUCGU UGUAGUCAAG CGAU 114 120
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 101 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 115 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 101
GUGUGAGCGU CCCUGAUGAA UCACGGUACU AACCGCCCAA AACCACGGUC ACCGAUCCUU 60
CGGGGUGAGG CAUUGUGGGG CUGCGCGGGA CCUUCGUUGG UAGUAGUCAA GCGAU 115 121
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 102 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 118 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 102
GUAUGUGCGU CCAUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCAUCCA AAACCACCGU GAUCACACCU 60
UUCGGGGUGU GGCGUUGGUG GGGCUGCAUG GGACCUUCGU UGGUAGUAGU CAAGCGAU 118 122
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 103 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 116 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 103
GUAUGUGCGU CCCUGAUGAA UCCAUUGUGC UAACCAUCCA AAACCGUCGU GACUGAUCUU 60 CGGGGUGAGG CGUUGACGGG GCUGCGUGGG ACCCCGGUGG GUAGUAGUCA AGCGAU 116 123
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 104 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 79 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1419..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1419..1420 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 104
CCACCCAAAA CCUGGCCGAU CAUCUUCGGG GUGACGGUUG GGGGCUGNGU GGGACNNGGG UGGGUAGUAG UCAAGCGAU 79 124
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 105 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 117 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui .HYPOTHEπQUE iiv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 105
GUNUGAGCGU CCCUGAUGAA UCACCGGUAC UAACCGCCCA AAAGGUGAGC AGAUCUAGAA 60 UCUUCGGGAA AGGACUGUUG CCGCUGCGCG GGACUUCGGU GGUAGUAGUC AAGCGAU 117 125
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 106 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 118 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMAπS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 106
GUAUGUGCGU CCAUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCAUCCA AAACCACCGU GACCGCACCU 60
UUCGGGGUGU GGCGUUGGUG GGGCUGCAUG GGACCUUCGU UGGUAGUAGU CAAGCGAU 118 126
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 107 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 28 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 107
CAAAUCCGUG CGCGUCUACU AAUCCUGA 28 127
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 108 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 22 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M BOVIS BCG
IviB SOUCHE: HÔP. PASTEUR lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 108
CAAAUCCGGG CACUAACUCU UA 22 128
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 109 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 109
CAAAUCCGUC GCUCACUAAU CCUGA 25 129
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 110 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 24 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140 120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 110
CAAAUCCGUC GUCAUUAAUC CUGA 24 130
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 111 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M VACCAE
IviB SOUCHE: lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 111
NAAAUCCGGA UGUCACAUAU CCUGA 25 131
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 112 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140310001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 112
CAAAUCCGUC GCUCAUUAAU CCUGA 25 132
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 113 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140220001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE:
Figure imgf000135_0001
lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 113
CAAAUCCGUC GCUCACCAAU CCUGA 25 133
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 114 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SZULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENTIFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 114
CACAUCCGGA UGGNNCACAU CCUGA 25 134
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 115 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEUQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 115
CAAAUCCGGA UGUCACAUAU CCUGA 25 135
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 116 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEUQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par Similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 116
UAAAUCCGUC UGGCGUAUAU CCUGA 25 136
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 117 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEUQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 117
CAAAUCCGCG UUUCACAUAU CCUGA 25 137
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 118 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEπQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENπFICAπON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 118
CAAAUCCGUC AACAAUGAUG CCUGA 25 138
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 119 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 24 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEUQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 119
CAAAUCCGUC ACUCAUAUGU CUGA 24 139
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 120 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMAUS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1493..1515 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1493..1515 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par Similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 120
UAAAUCCGUC UGGCAUAUAU CCUGA 25 140
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 121 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703-.1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 121
GGGGACCGGA AUAUCGUGAA CACCCUUGCG GUGGGAGCGG GAUCCGGUCG CAGAAACC 58 141
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 122 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M BOVIS BCG
IviB SOUCHE: HÔP. PASTEUR lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 122
GGGGACCGAC AUAUCGUGAA CACCCUUGCG GUGGGAGCGG GAUCCGGUCG CAGAAACC 58 142
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 123 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 123
GGGGGCCGGA AUACCGUGAA CACCCUUGCG GUGGGAGCGG GAUUCGGCCG CAGAAACC 58 143
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 124 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par"similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 124
GGGGACCGGA AUACCGUGAA CACCCUUGCG GUGGGAGCGG GAUUCGGUCG CAGAAACC 58 144
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 125 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 41 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M VACCAE
IviB SOUCHE: lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioM< lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 125
AAGUGUAUUU UACUCAUGGA GCUGAAAUCA GUCGAAGAAC C 41 145
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 126 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140310001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 126
GGGGACCGGA AUACCGUGAA CACCCUUGCG GUGGGAGCGG GAUCCGGCCG CAGAAACC 58 146
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 127 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 57 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140 220001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 127
GGGGGCCGAA AUACCGUGAA CACCUUGCGG UGGGAGCGGG AUUCGGCCGC AGAAACC 57 147
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 128 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANπ-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M S2ULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 128
GGGGACCUCC AUACCGUCAA CCGGUUUACC CUGGGCAGCG GGAGGGGUGG CACAAACC 58 148
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 129 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 18 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M KANSASII
IviB SOUCHE: CIP 140110001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 129 AAUUCGGUCG CACAAACC 1S 149
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 130 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 59 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 130
GGGGACCUCC AUACCGUCAA CCGGUUUACU CGGGGCAGCG GGAGGGGGUG GCACAAACC 59 150
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 131 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par. similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 131
GGGGACCCAC AUGGCGUGUA AGCCUUUACG GCCCAAGCGU GAGUGGGUGG CACAAACC 58 151
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 132 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 59 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FLAVESCENS
IviB SOUCHE: CIP 140 230001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 132
GGGGACCCCC ACACCGUCAA GGCCCUUGCG GCCGGCAGCG GGAGGGGGUG GCACAAACC 59 152
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 133 li CARACTERISTIQUES DE LA- SEQUENCE: liA LONGUEUR: 59 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 133
GGGGACCCCC ACACCGUCAA GGCUCUUGCG GCCGGCAGCG GGAGGGGGUG GCACAAACC 59 153
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 134 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 59 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 134
GGGGACCCCA CUACCGUCAU GGCUCUUGCG GCCGGCAGCG GGGGUGGGUG GCACAAACC 59 154
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 135 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 60 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 135
GGGGACCCAC AUGGCGUGAU CCAUCUUCGC GGUGGUGAGC CUGAGUCGGU UGCUCGAACC 60 155
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 136 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 58 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1703..1761 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1703..1761 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 136
GGGGACCCAC AUGGCGUGUA AGCCUUUACG GCCCAAGCGU GAGUGGGUGG CACAAACC 58 156
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 137 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 27 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 137
AGAGGACCCG UUAACCCGCA AGGGUGA 27 157
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 138 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 27 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M BOVIS BCG
IviB SOUCHE: HÔP. PASTEUR lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 138
AGAGGACCCG UUAACCCGCA AGGGUGA 27 158
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 139 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 27 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 139
AGAGGACCCG UUAACCCGUA AGGGUGA 27 159
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 140 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 27 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 140
AGAGGACCCG UUAACUCGUA AGGGUGA 27 160
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 141 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 26 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M VACCAE
IviB SOUCHE: lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 141
AGAGGACCGG UUAGCCUUCG GGGUGA 26 161
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 142 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140 310001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: pa> similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 142
AGAGGACCCG UUAACCGUAA GGUGA 25 162
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 143 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140220001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 143
AGAGGACCCG UUAACCGUAA GGUGA 25 163
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 144 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 26 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M S2ULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 144
AGAGGACCGG UUAACCUUCG GGGUGA 26 164
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 145 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 27 nucléotides liB 1YPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M KANSASII
IviB SOUCHE: CIP 140 110 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 145
AGAGGACCCG UUAACCCGCA AGGGUGA 27 165
NOMBRE DE SCQUE.MŒS:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 146 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 25 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioM* lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 146
AGAGGACCGG UUAACUUCGG GGUGA 25 166
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 147 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 30 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 147
AGAGGACCCG UUAAGUCCCU UUGGGGGUGA 30 167
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 148 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 27 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FLAVESCENS
IviB SOUCHE: CIP 140 230 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISπQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 148
AGAGGACCCG UUAACCCGCA AGGGUGA 27 168
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 149 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 26 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENπFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 149
AGAGGACCUG UUAACCUUCG GGGUGA 26 169
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 150 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 30 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 150
AGAGGACCCG UUAACCCUUU GCGGGGGUGA 30 170
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 151 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 28 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 151
AGAGGACCUG UUAACCUUUC GGGGGUGA 28 171
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 152 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 30 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioM< lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 1854..1876 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1854..1876 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 152
AGAGGACCCG UUAACUCCCU UUGGGGGUGA 30 172
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 153 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TUBERCULOSIS
IviB SOUCHE: A 203 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAπON D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 153
AGACUGUGAA ACCUCGACGC CAGUUGGGGC GGAGUC 36 173
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 154 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M AFRICANUM
IviB SOUCHE: CIP 140030 001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE : lixA NOM/CLE : ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126. .2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION : par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS :
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE :
SEQ ID NO: 154
AGACUUUGAA GCACAGACGC CAGUUUGUGU GGAGUC 36 174
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 155 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M MARINUM
IviB SOUCHE: CIP 140 120001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 155
AGACUGUGAA ACUCCAACGC CAGUUGGGGC GGAGUC 36 175
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 156 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: CIP 140310001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 156
AGACUGUGAA AUACAGACGC CAGUUUGUAU GGAGUC 36 176
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 157 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SCROFULACEUM
IviB SOUCHE: CIP 140220001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 157
AGACUGUGAA ACCCUAACGC CAGUUGGGGC GGAGUC 36 177
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 158 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M S2ULGAI
IviB SOUCHE: A 253 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE : bioMérieux S .A. lviiA BIBLIOTHEQUE : lviiB CLONE : lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 158
AGACUGUGAA GCGGCCACGC CAGUGGUUGU GGAGUC 36 178
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 159 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 35 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M KANSASII
IviB SOUCHE: CIP 140110001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSiπON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 159
UGACUGUGAA CCUCUAACGC CAGUUGGGUG GAGUC 35 179
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 160 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M TERRAE
IviB SOUCHE: A 255 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 160
AGACUGUGAA GCGGCCACGC CAGUGGUUGU GGAGUC 36 180
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 161 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHELONAE
IviB * SOUCHE: A 232 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 161
AGACUGUGAA GCUCACACGC CAGUGUGGGU GGAGUC 36 181
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 162 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M FORTUITUM
IviB SOUCHE: CIP 140410001 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 162
AGACUGUGAA GCAGCCACGC CAGUUGUUGU GGAGUC 36 182
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 163 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M PHLEI
IviB SOUCHE: A 247 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME : lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D' ESCHERICHIA COLI: 2126. .2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE : lixA NOM/CLE : ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126. .2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS :
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE :
SEQ ID NO: 163
AGACUGUGAA GCUUCGACGC CAGUUCGGGU GGAGUC 36 183
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 164 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M CHITAE
IviB SOUCHE: ATCC 19627 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 164
AGACUGUGAA GCAGUAACGC CAGUUAUUGU GGAGUC 36 184
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 165 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 36 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M SMEGMATIS
IviB SOUCHE: A 251 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE TISSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSITION DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSITION PAR RAPPORT
A LA NUMEROTATION D'ESCHERICHIA COLI: 2126..2161 lviiiC UNITES: lix CARACTERISTIQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 2126..2161 lixC METHODE D'IDENTIFICATION: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 165
AGACUGUGAA GCUCACACGC CAGUGUGGGU GGAGUC 36 185
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 166 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 88 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr lui HYPOTHEUQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. BOVIS
IviB SOUCHE: ATCC 19210
BMX A 221 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 166
GGCGACCGTG ACGAATCAGC GGTACTAACC ACCCAAAACC GGATCGATCA CTCCCCUCG GGGGTGTGGA GUCTGGGGC TGCGTGGG 88 186
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 167 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 119 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHEUQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. AVIUM
IviB SOUCHE: DSM 43216
BMX C 172 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 167
GUAUAGGCGU CCCUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCACCCA AAACCGGAUC GACCAUUCCC CUUCGGGGGC AUGGAGUUUC GGGGCUGCGU GGGACCUUCG CUGGUAGUAG UCAAGCGAU 119 187
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 168 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 120 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHEUQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: ATCC 35764
BMX C 184 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSiπON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 168
GUAUGGGCGU CCCUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCACCCA AAACCGGAUC GACCAUUCCC CUUCGGGGGC AUGGAGUUUC GGGGCUGCGU GGGACCUUCG CUGGUAGUAG GUCAAGCGAU 120 188
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 169 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 120 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHEUQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: ATCC 35767
BMX C 183 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 169
GUAUGGGCGU CCCUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCACCCA AAACCGGAUC GACCAUUCCC CUUCGGGGGC AUGGCGAUUC GGGGCUGCGU GGGACCUUCG CUGGUAGUAG GUCAAGCAAU 120 189
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 170 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 118 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHETIQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. INTRACELLULARE
IviB SOUCHE: ATCC 35847
BMX C 186 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 170
GUAUAGGCGU CCCUGAUGAA UCAGUGGUAC UAACCACCCA AAUGGUGGUC UAUCAAUNCC
CUUCNGGGUG CGAGGAUCAC CGGCUGCGUG GGACCUUCGC UGGUAGUAGU CAAGCGAU 118 190
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 171 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 87 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHEUQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. GASTRI
IviB SOUCHE: C 097 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 171
CCGUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCACCAA AACCGGAUCG AUCACUCCCC UUCGGGGGCG UGGCGGUCUG GCGCUGCGUG GAGCCUU 87 191
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 172 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 98 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHEUQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. SIMIAE
IviB SOUCHE: ATCC 25275
BMX D 005 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 172
UCCAUUCUGC UAACCACCCA AAUGGCGGUC UAUCAAUCCC UUCGGGGUGC GAAGCAUCGC CGGCUGCGUG GGACCCGGGU GGGUAGUAGU CAAGCAAU 98 192
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 173 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 109 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHETIQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. XENOPI
IviB SOUCHE: C 112 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPπON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 173
CCAUACCGAA UCGGAUCUGC UAACCACCCA AACGGUGGGU GAUCACGCCC UUUCGGGGGU GUGGGGCCCG CCCGCUGCGU GGGGCCCGGU CCGCUAGUAG GUAAGCGAG 109 193
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 174 li CARACTERISπQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 114 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHEUQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. TERRAE
IviB SOUCHE: C 104 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 174
UGUCCGGCGA CCGUGAUGAA UCAGCGGUAC UAACCACCCA AAACCGGAUC GAUCACUCCC CUUCGGGGGC GUGGAGGUCU GGGGCUGCGU GGAGCCUCCG CUGG 114 194
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAπONS POUR LA SEQ ID NO: 175 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 83 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAπON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHETIQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. ASIATICUM
IviB SOUCHE: ATCC 25276 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE πSSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 175
CCCGTGATGA ATCATCTGTG CTAACCACCC AAATGGTCGC TGATCAATCC OTCGGGGTG CGACGGTGAC CGGCTGCGTG GGA 83 195
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 176 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 100 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHEUQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. GORDONAE
IviB SOUCHE: TMC 1324 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTYPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 176
GUGCGCGCCC GUGAUGAAUC AAUUGUGCUA ACCACCCAAA UGGUACGCUG AUCAAUCCCU UCGGGGUGCG ACGGUGACCG GCUGCGUGGG ACCCCGGUUG 100 196
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMAUONS POUR LA SEQ ID NO: 177 li CARACTERISUQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 90 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURAUON: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHETIQUE liv ANU-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. KANSASII
IviB SOUCHE: TMC 1204 lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPTION DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 177
UGGGCUUCGG AUGAAUCAGC GGUUCUAACC ACCCAAAACC GGAUCGAUCA CUCCCCUUCG GGGGCGUGGA GGUCUGGGGC UGCGUGGAGG 90 197
NOMBRE DE SEQUENCES:
1 INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 178 li CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: liA LONGUEUR: 93 nucléotides liB TYPE: acide nucléique liC NOMBRE DE BRINS: simple liD CONFIGURATION: linéaire lii TYPE DE MOLECULE: ARNr liii HYPOTHEUQUE liv ANTI-SENS lv TYPE DE FRAGMENT: lvi ORIGINE: lviA ORGANISME: M. BOVIS BCG
IviB SOUCHE: C 080biomérieux lviC INDIVIDU/ISOLE: lviD STADE DE DEVELOPPEMENT lviE HAPLOTΥPE: lviF TYPE DE USSU: lviG TYPE DE CELLULE: lviH LIGNEE CELLULAIRE: lvii ORGANELLE: lvii SOURCE IMMEDIATE: bioMérieux S.A. lviiA BIBLIOTHEQUE: lviiB CLONE: lviii POSIUON DANS LE GENOME: lviiiA CHROMOSOME/SEGMENT: lviiiB POSIUON PAR RAPPORT
A LA NUMEROTAUON D'ESCHERICHIA COLI: 1409..1420 lviiiC UNITES: lix CARACTERISUQUE: lixA NOM/CLE: ARNr lixB EMPLACEMENT: 1409..1420 lixC METHODE D'IDENUFICAUON: par similitude lixD AUTRES RENSEIGNEMENTS:
lxi DESCRIPUON DE LA SEQUENCE:
SEQ ID NO: 178
GGCGACCGTG ACGAATCAGC GGTACTAACC ACCCAAAACC GGATCGATCA CTCCCCUCG GGGGTGTGGA GUCTGGGGC TGCGTGGGAA CTT

Claims

198
REVENDICATIONS
1 ) Fragment nucléotidique monocaténaire appartenant à une région variable de l'ARN ribosomique 23S des espèces du genre
Mycobacterium, caractérisé en ce que ledit fragment est choisi parmi les fragments présentant les séquences nucléotidiques suivantes de l'ARN
23S :
- commençant au nucléotide N° 137 et finissant au nucléotide N° 179,
- commençant au nucléotide N° 206 et finissant au nucléotide N° 248,
- commençant au nucléotide IM° 269 et finissant au nucléotide N° 289, à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de
M. tuberculosis et de M. fortuitum,
- commençant au nucléotide N° 289 et finissant au nucléotide N° 290, à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de M. tuberculosis et de M. fortuitum, - commençant au nucléotide N °341 et finissant au nucléotide N° 372,
- commençant au nucléotide N° 645 et finissant au nucléotide N° 661 , à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de M. tuberculosis et de M. fortuitum,
- commençant au nucléotide N° 1201 et finissant au nucléotide N° 1242,
- commençant au nucléotide N° 1409 et finissant au nucléotide N° 1420, à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de M. tuberculosis, de M. marinum, de M. scrofulaceum, de M. avium TMC 724, de M. leprae, de M. kansasii et de M. asiaticum, de M. ulcerans ATCC 19423, M. malmoense ATCC 29571 ,
M. gordonae, M. lactae ATCC 25854, M. aurum ATCC 23366, M. vaccae ATCC 15483 et M. neoaurum ATCC 25795,
- commençant au nucléotide N° 1493 et finissant au nucléotide N° 1515, - commençant au nucléotide N° 1703 et finissant au nucléotide
N° 1761 ,
- commençant au nucléotide N° 1854 et finissant au nucléotide N° 1876, à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de M. tuberculosis, de M. kansasii et de M. fortuitum, 199
- commençant au nucléotide N° 21 26 et finissant au nucléotide
N° 2161 , à l'exclusion des fragments de l'ARN ribosomique 23S de
M. tuberculosis, de M. kansasii et de M. fortuitum, et leurs séquences complémentaires, les numéros des nucléotides correspondant à leur position par rapport à la séquence nucléotidique de l'ARN ribosomique 23S d'Escherichia coli, utilisée comme référence.
2) Fragment selon la revendication 1 , caractérisé en ce qu'il présente une séquence informationnelle choisie parmi les séquences SEQ N01 à SEQ ID N028, SEQ ID N030 à SEQ ID N037, SEQ ID N039 à SEQ ID N041 , SEQ ID N043 à SEQ ID N049, SEQ ID N051 à SEQ ID N067, SEQ ID N069 à SEQ ID N075, SEQ ID N077 à SEQ ID N093, SEQ ID N095, SEQ ID N097, SEQ ID N098, SEQ ID N0100 à SEQ ID N0136, SEQ ID N0138 à SEQ ID N0144, SEQ ID N0146 à SEQ ID N0148,SEQ ID N0150 à SEQ ID N0152, SEQ ID N0154 à SEQ ID N0158, SEQ ID N0160, SEQ ID N01 61 , SEQ ID N01 63 à SEQ ID N0174 et SEQ ID N0178, et leurs séquences complémentaires.
3) Fragment nucléotidique monocaténaire d'ADN, caractérisé en ce qu'il est obtenu par transcription inverse d'un fragment nucléotidique selon la revendication 1 ou 2, ou son fragment complémentaire.
4) Fragment nucléotidique monocaténaire d'ADN génomique caractérisé en ce que son produit de transcription est un fragment nucléotidique selon la revendication 1 ou 2, ou son fragment complémentaire. 5) Sonde pour l'identification d'espèces de bactéries du genre
Mycobacterium, caractérisée en ce qu'elle comprend une séquence de cinq à cent monomères appartenant à la séquence du fragment, selon l'une quelconque des revendications 1 à 4, ou à toute séquence homologue. 6) Sonde selon la revendication 5, caractérisée en ce qu'elle comprend une séquence de huit à cinquante monomères appartenant à la séquence du fragment selon l'une quelconque des revendications 1 à 4.
7) Sonde pour l'identification d'espèces de bactéries du genre Mycobacterium, caractérisée en ce qu'elle présente une séquence choisie parmi les séquences suivantes : 200
- commençant au nucléotide N° 10 et finissant au nucléotide N° 24 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 1 à 14,
- commençant au nucléotide N° 26 et finissant au nucléotide N° 45 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 1 à 14, - commençant au nucléotide N° 1 et finissant au nucléotide N° 20 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 15 à 28,
- commençant au nucléotide N° 26 et finissant au nucléotide N° 43 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 15 à 28,
- commençant au nucléotide N° 4 et finissant au nucléotide N° 22 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 29 à 41 ,
- commençant au nucléotide N° 12 et finissant au nucléotide N° 29 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 42 à 53,
- commençant au nucléotide N° 36 et finissant au nucléotide N° 56 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 42 à 53, - commençant au nucléotide N° 13 et finissant au nucléotide N° 32 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 54 à 67,
- commençant au nucléotide N° 5 et finissant au nucléotide N° 23 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 68 à 79,
- commençant au nucléotide N° 15 et finissant au nucléotide N° 33 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 80 à 93,
- commençant au nucléotide N° 1 et finissant au nucléotide N° 21 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID N094 à 106 et SEQ ID N0166 à 178,
- commençant au nucléotide N° 44 et finissant au nucléotide N° 76 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 94 à 106 et
SEQ ID NO 166 à 178,
- commençant au nucléotide N° 67 et finissant au nucléotide N° 85 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 94 à 106, et SEQ ID NO 166 à 178, - commençant au nucléotide N° 6 et finissant au nucléotide N° 26 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 107 à 120,
- commençant au nucléotide N° 1 et finissant au nucléotide N° 18 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 121 à 136,
- commençant au nucléotide N° 39 et finissant au nucléotide N° 55 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 121 à 136, 201
- commençant au nucléotide N° 11 et finissant au nucléotide N° 26 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 137 à 152,
- commençant au nucléotide N° 5 et finissant au nucléotide N° 22 de la zone variable correspondant aux séquences SEQ ID NO 153 à 165. 8) Sonde selon la revendication 7, pour l'identification de l'espèce M. xenopi, caractérisée en ce qu'elle présente une séquence commençant au nucléotide N° 59 et finissant au nucléotide N° 76 de la séquence SEQ ID NO 173, ou une séquence complémentaire.
9) Sonde selon la revendication 7, pour l'identification de l'espèce M. fortuitum, caractérisée en ce qu'elle présente une séquence commençant au nucléotide N° 6 et finissant au nucléotide N° 22 de la séquence SEQ ID NO 117, ou une séquence complémentaire.
10) Sonde selon la revendication 7, pour l'identification de l'espèce M. tuberculosis, caractérisée en ce qu'elle présente une séquence commençant au nucléotide N° 1 et finissant au nucléotide N° 21 de la SEQ ID N° 94, ou une séquence complémentaire.
11 ) Sonde de thérapie pour le traitement des infections dues à une espèce déterminée de mycobactéries, caractérisée en ce qu'elle comprend une séquence nucléotidique appartenant à la séquence d'un fragment présentant au moins une des séquences nucléotidiques suivantes de l'ARN 23S :
- commençant au nucléotide N° 137 et finissant au nucléotide N° 179,
- commençant au nucléotide N° 206 et finissant au nucléotide N° 248,
- commençant au nucléotide N° 269 et finissant au nucléotide N° 289, - commençant au nucléotide N° 289 et finissant au nucléotide N° 290,
- commençant au nucléotide N° 341 et finissant au nucléotide N° 372,
- commençant au nucléotide N° 645 et finissant au nucléotide N° 661 ,
- commençant au nucléotide N° 1201 et finissant au nucléotide N° 1242, - commençant au nucléotide N° 1409 et finissant au nucléotide N° 1420,
- commençant au nucléotide N° 1493 et finissant au nucléotide N° 1515,
- commençant au nucléotide N° 1703 et finissant au nucléotide N° 1761 , 202
- commençant au nucléotide N° 1854 et finissant au nucléotide N° 1876,
- commençant au nucléotide N° 2126 et finissant au nucléotide N° 2161 , et leurs séquences complémentaires.
12) Amorce pour la transcription inverse spécifique d'une séquence d'ARN ribosomique 23S des mycobactéries appartenant à une région variable, en une séquence d'ADN complémentaire, caractérisée en ce qu'elle comprend une séquence nucléotidique d'au moins cinq nucléotides appartenant à au moins une des séquences nucléotidiques suivantes de l'ARN 23S :
- commençant au nucléotide N° 137 et finissant au nucléotide N° 179,
- commençant au nucléotide N° 206 et finissant au nucléotide N° 248,
- commençant au nucléotide N° 269 et finissant au nucléotide N° 289, - commençant au nucléotide N° 289 et finissant au nucléotide N° 290,
- commençant au nucléotide N° 341 et finissant au nucléotide N° 372,
- commençant au nucléotide N° 645 et finissant au nucléotide N° 661 ,
- commençant au nucléotide N° 1201 et finissant au nucléotide N° 1242, - commençant au nucléotide N° 1409 et finissant au nucléotide
N° 1420,
- commençant au nucléotide N° 1493 et finissant au nucléotide N° 1515,
- commençant au nucléotide N° 1703 et finissant au nucléotide N° 1761 ,
- commençant au nucléotide N° 1854 et finissant au nucléotide N° 1876,
- commençant au nucléotide N° 2126 et finissant au nucléotide N° 2161 , et leurs séquences complémentaires.
13) Amorce notamment pour l'amplification enzymatique spécifique, telle que par réaction de polymérisation en chaîne, de la séquence d'ADN selon les revendications 3 et 4, caractérisée en ce qu'elle comprend une séquence d'au moins cinq monomères. 14) Réactif pour détecter et/ou identifier au moins une espèce de mycobactéries dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il 203
comprend au moins une sonde d'identification selon l'une des revendications 5 à 10.
15) Réactif selon la revendication 13, caractérisé en ce qu'il comprend une sonde dite de capture et/ou une sonde dite de détection selon l'une des revendications 5 à 10, ladite sonde de capture et ladite sonde de détection présentant une séquence nucléotidique au moins partiellement différente.
16) Réactif selon la revendication 15, caractérisé en ce que la sonde de capture est fixée sur un support solide directement ou indirectement.
17) Réactif selon la revendication 14, caractérisé en ce que la sonde de détection est marquée au moyen d'un marqueur choisi parmi les isotopes radioactifs, des enzymes notamment choisis parmi la péroxydase et la phosphatase alcaline et ceux susceptibles d'hydrolyser un substrat chromogène, fluorigène ou luminescent, des composés chimiques chromophores, des composés chromogènes, fluorigènes ou luminescents, des analogues de bases nucléotidiques, et la biotine.
18) Réactif pour détecter et/ou identifier au moins deux espèces différentes de mycobactéries dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il comprend un mélange de sondes selon l'une quelconque des revendications 5 à 10.
19) Réactif selon la revendication 14, caractérisé en ce qu'il comprend au moins une amorce selon la revendication 12 et/ou au moins une amorce selon la revendication 13. 20) Procédé de détection sélective et/ou d'identification d'une espèce de mycobactéries dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'on expose l'ARN ribosomique 23S, extrait des bactéries contenues dans ledit échantillon à au moins une sonde selon l'une des revendications 5 à 10, et on détecte l'hybridation de ladite sonde. 21 ) Procédé de détection sélective et/ou d'identification d'une espèce de mycobactéries dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'on expose l'ADN génomique, extrait et dénaturé des bactéries contenues dans ledit échantillon à au moins une sonde selon l'une des revendications 5 à 10, puis on détecte l'hybridation de ladite sonde. 22) Procédé de détection sélective et/ou d'identification d'une espèce de mycobactéries dans un échantillon biologique, caractérisé en ce 204
qu'on expose l'ADN obtenu par transcription inverse de l'ARN ribosomique 23S des bactéries contenues dans ledit échantillon à au moins une sonde selon l'une des revendications 5 à 10, puis on détecte l'hybridation de ladite sonde.
23) Procédé selon la revendication 21 ou 22, caractérisé en ce qu'avant d'exposer l'ADN à ladite sonde, on réalise une amplification dudit ADN génomique en présence d'un système enzymatique adapté et au moins une amorce selon la revendication 13.
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