TWI327166B - Novel neomycin-phosphotransferase genes and methods for the selection of recombinant cells producing high levels of a desired gene product - Google Patents

Description

I I1327166 玖、發明說明,： 【發明所屬之技術領域】 本發明係關於新穎之經改質新黴素磷酸轉移酶基因及其 用於南產量重組細胞選擇方法之用途。因此，本發明也關 於新的表現载體，其含有經改質新黴素磷酸轉移酶基因， 車父佳的是與功能上連接至異源啟動子之所需基因組合。本 發明進一步關於利用相對應的高產量重組細胞製備異源基 因產物的方法。 【先前技術】 哺乳類細胞為製造複雜生物製藥蛋白質的較佳宿主細胞 因為轉譯後進行的修改於功能上及藥物動力學上兩者與人 類可相容。主要適當細胞類型為融合瘤、骨髓癌、中國倉 鼠印巢（CHO，Chinese Hamster Ovary)細胞及幼倉鼠腎 (BHK，Baby Hamster Kidney)細胞。宿主細胞的培養越來越 多實施於無血清及蛋白質製造條件。此原因為附隨成本降 低、純化重組蛋白質中降低的干擾及降低導入病原體（如蛋 白病毒（prions)及病毒）之可能性。利用ch〇細胞作為宿主細 胞變成更廣泛因此等細胞適合懸浮生長於無血清及蛋白質 的培養液中同時也經主管機關視為及接受為安全製造細 胞。 為了產生穩定表現異源所需基因（G〇j，gene interesq 之哺乳類細胞株，一般將異源基因與可選擇標記基因如新 黴素磷酸轉移酶（NPT，neomycin ph〇sph〇transferase)藉轉染 一起插入理想細胞株中。由一個單獨或或分開的共同轉染

〇:\89tf9299.D〇C Ϊ327166 的載體開始，，可砰異源基因及可選擇標記基因表現於宿主 細胞中。轉染二至三天後將轉染的細胞轉移至含有選擇劑 的培養液中，如當利用新黴素磷酸轉移酶基因（Νρτ基因） 時為G418，並於此等選擇條件下培養數週。可將已整合外 來DNA的新興耐受細胞分離及研究（GOI的）理想基因產物 的表現。 在建立具有高表現之理想蛋白質的細胞株中，一個主要 問題發生自隨機及未受指導的整合重組載體進入宿主細胞 基因組的轉錄-有活性或_無活性位置。結果得到一群細胞具 有凡全不同異源基因表現速率，細胞的生產率通常符合常 態分佈。所以為了確認具有非常高表現異源所需基因之細 胞純系，必須檢視及測試大數量純系，其為耗費時間、大 量人力及昂貴。所以藉由適當選擇策略開始改善用於轉染 的載體系統以增加轉染細胞族群中高產量者的比例及因而 降低涉及純系確認之支出及工作。此表現系統之發展為本 發明之主題。 使用於大腸桿菌中為跳躍子（transp〇s〇n) 5_相關之胺基 葡萄糖普-3’-磷酸轉移酶„酵素（新黴素磷酸轉移 酶）（EC27195)的基因作為可選擇標記於許多生物中（如細 菌、酵母菌、植物及哺乳類細胞）。此酵素賦予對許多胺基 葡萄糖苷抗生素之耐受性如新黴素、嘉黴素（kanamycin)及 G418 ’藉由自ATP轉移末端鱗酸根至胺基己糖環〗之3，羥基 而去活化抗生素。除了野生型新黴素磷酸轉移酶，已知有 些突變體具有降低的磷酸轉移酶活性及因而降低對胺基葡

O:\89\89299.DOC 1327166 萄糖苷抗生素的而ί受性於細菌中（Bldzquez等人，1991 ; Kocabiyik等人，1992 ; Yenofsky等人，1990)及於來自终葉 的切片中（Yenofsky等人，1990)。 使用其中一種突變體（Glul82Asp)作為選擇胚胎幹細胞 的標記，將新黴素磷酸轉移酶基因藉由目標的同源重組（基 因標的）整合入c-myc基因（Hanson等人，1995)。作者限制本 身於使用改質的酵素於基因標的。 專利申請案WO 99/53046說明表現改質的新黴素鱗酸轉 移酶基因（Asp261 Asn)於製造相關的哺乳類細胞中。作者說 明種無純糸方法以表現所需基因於哺乳類細胞中。藉由 以編碼啟動子元件、所需基因及與内核醣體進入處（ires， internal ribosomal entry site)元件耦合之可選擇標記之三個 各別DNA片段共同轉染細胞，能夠慎重地生長細胞，於選 擇壓力下，其中將所有三DNA片段結合為有功能的雙基因 (bicistronic)轉錄單元（所需基因啟動子_IRES_新黴素磷酸 轉移酶基因）。元件之排列僅發生於轉染的細胞，所以僅少 數細胞顯示元件之正確排列。再者，&因放大後，利用可 放大可選擇標記可產生高製造純系。在反覆選擇及基 因放大後產生的細胞呈現最高6 pg蛋白質/細胞/天。土 無-文獻揭示具有制適㈣於製備高表現載體系統於 哺乳類細胞之改質的新黴素磷酸轉移酶基因，使其能夠發 展高產量細胞以製備重組生物製藥蛋白質，其對—或多所 需基因及同時對具有降低的抗生素耐受性之改質的新：素 磷酸轉移酶基因兩者皆含有一或多個完整功能的轉錄單

O:\89\89299.DOC 1327166 凡。說明於WQ 99丨53046之DNA構體僅含有無啟動子新黴素 基因功能上連接至二氫葉酸還原酶（DHFR，dihydr〇f〇late reductase)之基因。 所以需要使適當改質的新黴素磷酸轉移酶基因可取得， 特別是為了發展生物製藥製程用之相對應高表現載體系 統。所以本發明的問題為提供相對應新穎改質的新黴素填 酸轉移酶基因’含有改質的新黴素磷酸轉移酶基因及所需 基因功能上連接至異源啟動子之表現載體，選擇高產量重 組細胞（特別是哺乳類細胞）的方法，及製造異源基因產物之 方法。 意外地’於本發明的範圍内，已能製造及確認新穎之經 改質高選擇性新黴素磷酸轉移酶基因，其特徵為其特別適 於選擇高產量細胞β 【發明内容】 本發明提供新穎的經改質新黴素磷酸轉移酶基因。意外 地’已發現藉由利用說明於下文中的經改質新黴素磷酸轉 移酶基因作為可選擇標記，可達成具有共同整合所需基因 之局表現率的轉染哺乳類細胞增加。 與利用野生型新黴素磷酸轉移酶作為可選擇標記比較， 以根據本發明之新穎新黴素磷酸轉移酶基因轉染後，細胞 呈現蛋白質（―種抗體）之生產率增加1.4至14.6倍。 根據本發明改質的新黴素磷酸轉移酶基因較佳為突變 體’其編碼與野生型基因不同的胺基酸於胺基酸位置91、 182、198、227、240或261。於較佳具體實施例中，根據本

O:\89\89299.DOC 1327166 發明的新彳蘇素碑酸轉移酶基因為突變Glul82Gly、 GlU182AsP、TrP91Ala、Vall98Gly、Asp227Ala、Asp227Va卜

AsP227Gly、Asp261ASn、AsP261Gly 或 Phe240Ile。為了選 擇高產量哺乳類細胞’已證實特別適合於使用突變體 TrP91Ala 、Asp227Val 、Asp261Asn、Asp26iGiy 及

Phe240Ile，而突變體Asp227Val及Asp261Gly依次給予細胞 純系最高生產率且因而為特別較佳。 藉由利用含有異源所需基因功能上連接至異源啟動子及 根據本發明之改質的新黴素磷酸轉移酶基因的真核表現載 體得到高產量細胞。表現載體較佳含有其他調控元件，如 一或多個促進子功能上連接至啟動子。另外含有螢光蛋白 質基口功此上連接至所需基因及異源啟動子，較佳經由内 核醣體進入處（IRES，internal rib〇s〇mal entry⑴幻之表現載 體也為較佳，其得以於異源啟動子的控制下雙基因表現編 碼螢光蛋白質之基因及編碼所需蛋白質/產物之基因。特別 較么的疋異源所需基因於泛激素（ubiquitin)/S27a啟動子的 控制下之表現載體。 本發明亦關於表現載體，其取代所需基因含有為併入此 "之多重選殖處，即具有限制核酸内切酶之多重辨識序 列之序列區域。 於另一觀點中，本發明係關於重組哺乳類細胞，其含有 種則述根據本發明之改質的新黴素磷酸轉移酶基因。此 Η外本發明係關於重組哺乳類細胞，其已受一種根據本發 月之表現載體轉染。此等較佳為重組齧齒目動物細胞，其

α 魏 92 效.DOC 1327166 中重組倉鼠绅胞:CHO細胞或BHK細胞為特別較佳。於另 一較佳具體實施例中，將該重組細胞另外以可放大的可選 擇標記之基因轉染，如以二氫葉酸還原酶（DHFR， dihydrofolate reductase)之基因。 本發明亦關於增加表現改質的新黴素磷酸轉移酶基因之 重組哺乳類細胞的方法，其特徵為⑴將一群哺乳類細胞以 改質的新黴素碟酸轉移酶基因轉染，其僅具有1至8〇%，較 佳僅1至60%’更佳僅1.5至30%，最佳僅1.5至26%之活性及 /或一種上述改質；（ii)將哺乳類細胞於允許表現改質的新黴 素磷酸轉移酶基因的條件下培養.；及（iii)將哺乳類細胞於至 少一種選擇劑存在下培養，其選擇性作用於哺乳類細胞的 生長，並給予表現新黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長優勢。 本發明亦關於表現至少一種所需基因於重組哺乳類細胞 中的方法，其特徵為⑴將一群哺乳類細胞以至少一種所需 基因及一種改質的新黴素磷酸轉移酶基因轉染，其僅具有工 至80% ’較佳僅丨至60%，更佳僅丨5至3〇%，最佳僅丨5至％% 之活性及/或一種上述改質；（lf)將細胞於允許表現所需基因 及改質的新黴素磷酸轉移酶基因的條件下培養；（出)將哺乳 類細胞於至少-種選擇劑存在下培養，其選擇性作用於哺 乳類細胞的生長，並給予表現新黴素磷酸轉移酶基因的細 胞生長優勢；及（iv)㈣乳類細胞或自培養上層液得到所需 蛋白質。 本發明更關於得到及選擇表 . _ ..〜一/ 很兴鄉所冩基因. 重組哺乳類細胞的方法，甘4主W .¾ /· ·、< 万法其特徵為（1)重組哺乳類細胞以;

a\89\S9299.DOC 1327166 據本發明之表現勢體轉染，其除了所需基因及改質的新徽 素磷酸轉移酶基因編碼一螢光蛋白質；（ii)將細胞於允許表 現所需基因、編碼螢光蛋白質的基因及改f的新黴素鱗酸 轉移輕基因的條件下培養，（出）將喷乳類細胞於至少一種選 擇劑存在下培養，其選擇性作用於哺乳類細胞的生長，並 給予表現新黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長優勢丨及（iv) 藉流式細胞儀分析（flow cytometric analysis)將哺乳類細胞 篩分。 若已將哺乳類細胞另外以可放大可選擇標記基因如 DHFR基因轉染，能夠於也表現可放大可選擇的標記基因之 條件下培養哺乳類細胞，及加入培養液一種選擇劑造成可 放大可選擇標記基因的放大。 較佳的疋，將根據本發明的方法實施於適應懸浮生長的 哺乳類細胞’即於懸浮培養中培養的哺乳類細胞。其他具 體實施例係關於方法，其中將哺乳類細胞（較佳的是適應懸 浮中生長者）於無血清條件下培養。 【實施方式】 下列胺基酸位置的資訊於各情況中係關於由具有S]Eq ID NO : 1的野生型新黴素磷酸轉移酶基因編碼的胺基酸位 置。「改質的新黴素磷酸轉移酶基因」意指編碼具有新黴素 磷酸轉移酶活性的多肽之核酸，該多肽具有與野生型蛋白 質不同的胺基酸於至少一個胺基酸位置，於本說明書中更 完全地說明，其為與具有SEQ ID NO : 2之野生型蛋白質同 源。於本文中，用詞「同源」意指可將攜帶突變的序列區 0：V89\892W.D0C -12- 1327166 域與參考序列相對照，於此情況中，根據SEQ ID NO : 2之 野生型新黴素磷酸轉移酶之序列，利用所謂標準「調準」 演算法，如例如「BLAST」（Altschul, S.F., Gish，W_, Miller， W.，Myers，E.W.& Lipman，D.J· (1990)「基本局部調準搜尋 工具」J· Mol. Biol. 215:403-410; Gish, W. & States, D.J. (1993)「藉資料庫類似性搜尋鑑定蛋白質編碼區域」Nature Genet. 3:266-272; Madden, T.L., Tatusov, R.L. & Zhang, J. (1996)「網路BLAST伺服器之運用」Meth. Enzymol. 266:131-141; Zhang，J. & Madden, T.L. (1997)「PowerBLAST:—種新的網 路BLAST運用於互動或自動序列分析及註解」Genome Res. 7:649-656; Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller,及 David J. Lipman(1997)「Gapped BLAST 及 PSI-BLAST :新一代蛋白質資料庫搜尋程式」Nucleic Acids Res. 25:3389-3402)。當其符合其序列順序及可利用標準「調 準」演算法確認，序列為一致。 本發明提供新穎之經改質新黴素磷酸轉移酶基因及允許 高表現異源基因產物（較佳的是生物製藥上相關的多肽或 蛋白質）之哺乳類細胞株之製備及選擇方法。根據本發明的 方法主要係基於選擇細胞除了所需基因也表現根據本發明 之新黴素磷酸轉移酶基因，其給予轉染的細胞比未轉染的 細胞有選擇性優勢。意外地，已發現利用說明本文中根據 本發明的改質新黴素磷酸轉移酶基因（mNPT基因）具有大 體上選擇優勢超過野生型新黴素磷酸轉移酶基因（wtNPT基 O:\89\89299.DOC -13- 1327166 因）。此尤有.關於.利用具有比wtNPT低酵素活性的突變體。 根據本發明之改質的新黴素磷酸轉移酶基因 已證實特別適合使用編碼僅具有1至80%，較佳僅1至60% 之wtNPT酵素活性的NPT之改質的NTP基因。較佳的NTP突 變體為僅具有1至30%之wtNPT酵素活性者，而僅具有1.5至 26%之wtNPT酵素活性者為特別較佳。NTP的酵素活性可於 例如點分析中決定，如說明於實例4中及稱為方法5。 用詞野生型新黴素磷酸轉移酶意指編碼胺基葡萄糖苷 -3'-磷酸轉移酶II酵素（EC2.7.1.95)之新黴素磷酸轉移酶基 因，其基因為天然的跳躍子（transposon ) 5-相關於大腸桿 菌中，並含有例如示於SEQ ID NO : 2中的胺基酸序列，或 由示於SEQ ID NO : 1中的核苷酸序列編碼。此酵素賦予對 許多胺基葡萄糖苷抗生素之耐受性如新黴素、嘉黴素 (kanamycin)及G41 8，藉由轉移ATP末端硝:酸根至胺基己糖 環I之3'羥基而去活化抗生素。用詞wtNPT也意指具有與由 SEQ ID NO : 1編碼的NPT可相比較的酵素活性之所有 NPT。此特別包括彼等NPT其中催化自ATP轉移末端磷酸根 至受質的酵素活性中心存在於相同或幾乎相同形態（Shaw 等人，1993 ; Hon等人，1997 ; Burk等人，2001)因此具有 與含有胺基酸序列SEQ ID NO : 2的酵素可比較的酵素活 性。wtNPT具有可比較的酵素活性若其呈現8 1至1 50%，較 佳90至120%之由SEQ ID NO : 2定義的NPT展現的酵素活 性，而活性可於例如點分析中決定，如說明於實例4中及稱 為方法5。 O:\89\89299.DOC -14- 1327166 基本上較隹為寒變體，其中與wtNPT相較降低的酵素活 性係基於胺基酸序列的修改，如於置換、插入或刪除至少 一或多個胺基酸。刪除、插入及置換突變體可由「特定位 置突變」及/或「以PCR為基本的突變技術」產生。適當的 方法係說明於例如由Lottspeich及Zorbas (1998)(第36.1章 與其他參考資料）。 意外地’已發現若使用新黴素磷酸轉移酶突變體作為可 選擇標記，其中與wtNPT比較至少胺基酸色胺酸於胺基酸 位置91、胺基酸麩胺酸於胺基酸位.置丨82、胺基酸頡胺酸於 胺基酸位置198、胺基酸天門冬胺酸於胺基酸位置227、胺 基酸天門冬胺酸於胺基酸位置261或胺基酸苯丙胺酸於胺 基酸位置240已被改變，可能達到特別有效增加具有高表現 率之共同整合的所需基因之轉染的哺乳類細胞。於是，影 響胺基酸於位置91、182、198、227及/或240之突變體為較 佳。特別有利的為置換突變體，即突變體中發生於於野生 型此位置的胺基酸已由另一胺基酸取代。再更佳的為相對 應的置換突變體，其中改變相對應的胺基酸導致相較於 wtNPT降低酵素活性至1至80%，較佳至1至60%，更佳至1,5 至30 /〇，最佳至i _5%至26%。特別較佳的是改質的Νρτ基因 其中胺基酸91、227、261及/或240已被改質，所以造成與 WtNPT比較酵素活性僅為1至80%，較佳的是僅！至60%，更 佳的是僅1.5至30%，最佳的是僅1 5%至26%。最佳的是置 換突變體其中胺基酸於胺基酸位置227已被改質，使得改質 的NPT之酵素活性與wtNPT比較為小於26%，較佳的是於j

O:\89\89299.DOC -15- 1327166 及20%之間，·更倖的是於1及16%之間。 根據本發明另一具體實施例，有利的突變體為與wtNPT 比較，編碼甘胺酸、丙胺酸、頡胺酸、白胺酸、異白胺酸、 苯丙胺酸或酪胺酸於胺基酸位置91、182或227者。再者， 麩胺酸於胺基酸位置182可由天門冬胺酸、天門冬醯胺酸、 麩醯胺酸或任何其他較佳的負電荷胺基酸。也為較佳的是 改質的NPT基因其與wtNPT比較，編碼甘胺酸、丙胺酸、白 胺酸、異白胺酸、苯丙胺酸、酪胺酸或色胺酸於胺基酸位 置198者。也為較佳的是改質的NPT基因其與wtNPT比較， 編碼甘胺酸、丙胺酸、白胺酸、異白胺酸、苯丙胺酸、酪 胺酸、色胺酸、天門冬醯胺酸、麩醯胺酸或天門冬胺酸於 胺基酸位置261者。特別是，已發現以突變體Glul82Gly、 Glul82Asp、Trp91Ala' Vall98Gly、Asp227Ala、Asp227Val、 Asp227Gly、Asp261Gly、Asp261Asn 及 Phe240Ile作為可選 擇標記可能達到增加具有高表現率之共同整合的所需基因 之轉染的哺乳類細胞，結果是此等突變體為特別較佳。再 更佳的為突變體 Asp227Val、Asp227Gly、Asp261Gly、 Asp261 Asn、Phe240Ile及Trp9 1 Ala，因利用此等達到最佳增 加率。突變體Asp227Val為特別較佳。 相反地，已證實Aspl90Gly及Asp208Gly突變體為於無血 清培養條件下選擇轉染的CHO-DG44細胞之不適當標記。此 等突變體（Aspl90Gly、Asp208Gly)可能大幅降低的酵素活 性之結果，在選擇時期後僅得到少數細胞，其更加嚴重地 損害其生長及生命力。 O:\89\89299.DOC -16- 1327166 基於野生型胺棊酸於位置182及227為非保守的胺基酸， 其位於胺基葡萄糖苷-3，-磷酸轉移酶的C端區域之三個保守 的基序之外。胺基酸於位置91也屬於非保守的胺基酸且位 於胺基葡萄糖苷-3'-磷酸轉移酶的N端區域之一個保守的基 序之外。相反地，胺基酸於位置198及240為保守的胺基酸 於NPT的C端區域，但然而於保守的基序之外。相反地，胺 基酸於位置261為保守的胺基酸於C端區域的第三個基序中 (Shaw等人，1993 ; Hon等人，1997 ; Burk等人，2001)。 與利用wtNPT作為可選擇標記比較，在Glul82Gly、

Glu 182Asp及Vail98Gly突變體的情況中細胞顯示生產量增 加倍數為1.4-2.4倍，在Asp227Gly突變體的情況中生產量增 加倍數為1.6-4.1倍，在Asp227Ala或Trp91Ala突變體的情況 中生產量增加倍數為2.2或4倍，在Phe240Ile或Asp261Asn 突變體的情況中生產量增加倍數為5·7或7.3倍及在

Asp261Gly或ASp227Val·突變體的情況中生產量甚至增加至 9‘3或14.6倍。為了表現多鏈蛋白質（抗體），進行共同轉染。 將兩蛋白質鏈各自以其本身載體表現，一個載體另外編碼 NPT基因而另一載體編碼可放大可選擇的二氫葉酸還原酶 基因。 因此本發明係關於增加表現改質的新黴素磷酸轉移酶基 因的重組哺乳類細胞的方法，其特徵為⑴將一群哺乳類細 胞以改質的新黴素磷酸轉移酶基因轉染，其僅具有1至 8〇%，較佳僅16〇%，更佳僅h5至3〇%，最佳社、5至26% 之野生型新黴素磷酸轉移酶活性及/或—種說明於本文中

O:\89V89299.DOC -17- 1327166 的修改；（11).將哺乳類細胞於允許表現改質的新黴素磷酸轉 移酶基因的條件下培養；及（iii)將哺乳類細胞於至少一種選 擇劑存在下培養，其選擇性作用於哺乳類細胞的生長，並 給予表現新黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長優勢。 特別較佳的為相對應的方法，其使用於本申請案中更詳 細説明的改質NPT基因，特別是若使用的改質NPT基因編碼 改質的NPT，其與野生型基因比較，編碼丙胺酸於胺基酸 位置91，編碼甘胺酸或天門冬胺酸於胺基酸位置182，編碼 甘胺酸於胺基酸位置198，編碼丙胺酸、甘胺酸或頡胺酸於 胺基酸位置227，編碼甘胺酸或天門冬醯胺酸於胺基酸位置 261或編碼異白胺酸於胺基酸位置24〇。再更佳的是Νρτ基 因，其與野生型基因比較，編碼頡胺酸於胺基酸位置227 及/或編碼甘胺酸及/或天門冬醯胺酸於胺基酸位置261。特 別較佳的是彼等ΝΡΤ基因，其與野生型基因比較，編碼異 白胺鲅於胺基酸位置240或編碼頡胺酸於胺基酸位置227， 而與野生型基因比較編碼頡胺酸於胺基酸位置227的νρτ 基因為特別較佳。自然地，本發明也包括改質的Νρτ基因 及利用根據本發明的改f Νρτ基因其包含相對應胺基酸交 換的組合。 本發明進一步關於真核表現載體其含有⑴一異源所需基 因功旎上連接至異源啟動子及（ii)根據本發明之改質新黴 素磷酸轉移酶基因其編碼具有比野生型新黴素磷酸轉移酶 較低的酵素活性之新黴素磷酸轉移酶。為本發明目的之 「低」或「較低」酵素活性意指酵素活性其相當於最多

O:\89\89299.DOC •18- 1327166 80%，較佳1至80%，更佳僅1至6〇%之wtNpT酵素活性。根 據本發明的一個具體實施例，「較低酵素活性」代表野生型 新黴素填酸轉移酶之1至30%，較佳1 5至26%之酵素活性。 較佳表現載體含有改質的NPT基因，其編碼具有僅1至 80%，較佳僅1至60%之wtNPT酵素活性之改質Νρτ。也為較 佳的是具有改質NPT基因的表現載體，其編碼具有僅1至 30%之wtNPT酵素活性之突變體。特別較佳的是含有改質 NPT基因之表現載體其編碼具有僅1.5至26%之wtNPT酵素 活性之突變體，活性由說明於實例4中的點分析決定並稱為 方法5。 於本發明之另一具體實施例中，表現載體含有改質Νρτ 之基因’與wtNPT比較，其被修改於胺基酸位置Trp91、

Glul82、Vall98、Asp227、Phe240或於位置 Asp261。於本 文中’ ΝΡΤ突變體較佳修改於位置Trp91、Glul82、Vall98、 Asp227、Phe240或Asp261且具有僅1至80%，較佳僅1至 60%，更佳僅1.5至30%，最佳僅1.5%至26%之wtNPT酵素活 性。較佳的是可將胺基酸Trp91、Glul82或Asp227各以甘胺 酸、丙胺酸、頡胺酸、白胺酸、異白胺酸、苯丙胺酸或酪 胺酸取代於相對應的位置《較佳的是也可將於位置丨82的糙 胺酸以天門冬胺酸、天門冬醯胺酸、麩醯胺酸或另一較佳 負電荷的胺基酸取代。也為較佳的是改質的NPT基因其與 wtNPT比較編碼甘胺酸、丙胺酸、頡胺酸、白胺酸、異白 胺酸、苯丙胺酸、酪胺酸或色胺酸於胺基酸位置198。此外， 改質的NPT基因較佳與wtNPT比較編碼甘胺酸、丙胺酸、頡 O:\89\89299.DOC -19- 1327166 胺酸、異白胺酸、.酪胺酸或色胺酸於胺基酸位置240。也為 較佳的是改質的NPT基因，其與wtNPT比較編碼甘胺酸、丙 胺酸、白胺酸、異白胺酸、苯丙胺酸、酪胺酸、色胺酸、 天門冬醯胺酸、麩醯胺酸或天門冬胺酸於胺基酸261。特別 較佳使用突變體，其中將於位置227的天門冬胺酸以甘胺 酸、丙胺酸、頡胺酸、白胺酸或異白胺酸取代，於位置261 的天門冬胺酸以丙胺酸、頡胺酸、白胺酸、異白胺酸或麩 醯胺酸取代，特別是由甘胺酸或天門冬醯胺酸取代。 特別較佳的是含有改質NPT基因的表現載體，其編碼 Glul82Gly、Glul82Asp、Trp91Ala、Vall98Gly、Asp227Ala、 Asp227Val、Asp227Gly、Asp261Gly、Asp261Asn或 Phe240Ile 突變體，其於Glul82Gly突變體的情況中含有胺基酸序列 SEQ ID NO : 4，於Glu 182Asp突變體的情況中含有胺基酸 序列SEQ ID NO : 20，於Trp91Ala突變體的情況中含有胺基 酸序列SEQ ID NO : 6，於Vall98Gly突變體的情況中含有胺 基酸序列SEQ ID NO : 8，於Asp227Ala突變體的情況中含 有胺基酸序列SEQ ID NO : 10，於Asp227Val突變體的情況 中含有胺基酸序列SEQ ID NO : 12，於Asp227Gly突變體的 情況中含有胺基酸序列SEQ ID NO : 22，於Asp261Gly突變 體的情況中含有胺基酸序列SEQ ID NO : 14，於Asp261Asn 突變體的情況中含有胺基酸序列SEQ ID NO : 16及於 Phe240Ile突變體的情況中含有胺基酸序歹丨j SEQ ID NO ： 18。最佳的是利用 Asp227Val、Asp227Gly、Asp261Gly、 Asp261Asn、Phe240Ile或Trp91Ala突變體之表現載體，特別 O:\89\89299.DOC •20- 1327166

是若其含有示 ID NO : 12、SEQ ID NO : 22、SEQ ID NO : 14、SEQ ID NO : 16、SEQ ID NO : 18 或 SEQ ID N〇： 6之胺基酸序列或若其以示於SEQ ID NO : 11、SEQ ID NO : 21、SEQ ID NO : 13、SEQ ID NO : 15、SEQ ID NO : 17或 SEQ ID NO : 5之核酸序列編碼或含有之。 此外，本發明第一次提供改質的新黴素磷酸轉移酶基因 及其基因產物，其與wtNPT比較編碼不同胺基酸於胺基酸 位置Trp91、Vall98或Phe240。本發明特別第一次提供 Trp91、乂31198或？1^240突變體其具有與〜阶!'比較降低的 酵素活性。說明於此及於本發明範圍内可製作獲得的改質 NPT較佳編碼丙胺酸於胺基酸位置91，編碼甘胺酸於位置 198及編碼異白胺酸於位置240。再者，本發明第一次提供 NPT突變體，其與wtNPT比較，編碼甘胺酸於位置182，編 碼丙胺酸或頡胺酸於位置227及編碼甘胺酸於位置261。基 因及基因產物（酵素）兩者皆第一次提供於本發明範圍内。於 本文中，本發明第一次提供改質的NPT具有胺基酸序列根 據 SEQ ID NO : 4、SEQ ID NO : 6、SEQ ID NO : 8、SEQ ID NO : 10、SEQ ID NO : 12、SEQ ID NO : 14及 SEQ ID NO : 1 8。再者，本發明提供改質的NPT基因具有DNA序列根據 SEQ ID NO ： 3 ' SEQ ID NO ： 5 ' SEQ ID NO ： 7 ' SEQ ID NO ： 9、SEQ ID NO : 11、SEQ ID NO : 13 及 SEQ ID NO : 17。 所需基因 包含於根據本發明之表現載體中的所需基因包含編碼所 需產物之任何長度核苷酸序列。基因產物或「所需產物」 O:\89\89299.DOC -21 - 1327166 -般為蛋白質、多肽、肽或其片段或衍生物。然而，其也 可為RNA或反義RNAe可將所需基因以其全長、以縮短形 式、為融合基因或為標記的基因呈現。其可為基因組舰 或較佳的是eDNA或相對應的融合片段m因可為天然 基因序列，或其可為突變或其他方式改質。此修改包括為 了適應特定宿主細胞及人化之密碼子最佳化。所需基因可 編碼，例如，分泌的、細胞質内、位於細胞核、與膜結合 或細胞表面結合的多肽。 ^用詞「核皆酸序列」或「核酸序列」意指寡核皆酸、核 苷酉文夕核苷酸及其片段以及基因組或合成來源的DNA或 RNA，其出現為單或雙鏈且可代表基因的編碼或非編碼 鏈。可將核酸序列改質利用標準技術如特定位置突變或經 PCR的突變（如說明於Sambr〇〇k等人，1989或Ausubei等人， 1994)。 由「編碼」意指核酸中核苷酸之特定序列之性質或能力， 例如染色體中的基因或mRNA，作用為基質以合成其他聚合 物及巨分子如例如rRNA、tRNA ' mRNA、其他rna分子、 cDNA或夕肽於生物流程中。於是，一基因編碼一蛋白質若 將理想的蛋白質於細胞或另一生物系統中藉轉錄及隨後 mRNA的轉譯而產生。基因的編碼鏈（其核苷酸序列相同於 mRNA序列且通常示於序列資料庫中，如EMBi^GenBank) 及無編碼鏈或cDNA (其作用為轉錄的基質）兩者皆可稱為 編碼一產物或蛋白質。編碼蛋白質的核酸也包括基於簡併 遺傳密碼而具有不同核苷酸序列順序但造成蛋白質之相同

O:\89\89299.DOC -22- 1327166 胺基酸序列的核蜂。編碼蛋白質的核酸序列也可包含内含 子（intron)。 用詞cDNA代表去氧核醣核酸，其由自基因產生的mRNA 或其他RNA反轉錄及合成第二DNA鏈。若cDNA存在為雙鏈 DNA分子’其含有編碼及無編碼鍵兩者。 用柯内含子代表任何長度之無編碼核苷酸序列。其自然 發生於許多真核基因中且由稱為剪接（spHeing)的過程自先 前轉錄的mRNA前驅物去除。此需要準確切除内含子於5, 及3,端及正確結合形成的mRNA末端以便產生具有成功蛋 白質合成所需之正確讀取架構(reading作叫的成熟處理 後mRNA。目前為止許多涉及於此剪接過程令之剪接貢獻端 及剪接接受端（即直接位於外顯子·内含子或内含子·外顯子 介面的序列)已被定義。概要見㈣刪等人，1987。 所需蛋白質/產物 具有生物醫藥重要性的蛋白質 貞/夕肽包括例如抗體、酵 素、細胞激素、淋巴激辛、黏 ,, 京㈣分子、㈣及其衍生物或 片鈥，但不限於此。一般而言 ,^ ^ ^ 乍用為協同劑或抑制劑及/ 或八有心療或診斷運用的所有多肤皆為重要。 使用用詞「多月土，％ t # + 夕肽」於胺基酸序列或蛋 度之胺基酸聚合物。此用qα 、並意扣任仃長 儿Α 1也包括藉由反應如醣化、磷酸 化、乙酿化或蛋白質處理受到轉譯後 =狀 多肽的結構修改，例如，藉由置換、刪^蛋白質。可將 盥直他蛋白、 矛、或插入胺基酸及 …、他蛋白貝妨而保持其生物活性1 也包括，例如，由免疫球蛋 #肽」因此 攻刀如Fc成分，及生長因

O:\89\89299.DOC -23· 1327166 子，如介白素（In.terleukin)組成的融合蛋白質。 治療蛋白質的實例為胰島素、似胰島素生長因子、人類 生長贺爾蒙（hGH，human growth hormone )及其他生長因 子、組織胞漿素原活化劑（tPA，tissue plasminogen activator)、紅血球生長激素（EPO, erythropoietin)、細胞激 素如介白素（IL，Interleukin)如 IL-卜 IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、 IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-13、IL-14、

IL-15、IL-16、IL-17、IL-18干擾素（IFN，interferon)-a、 、-γ、-ω 或-r、腫瘤壞死因子（TNF, tumor necrosis factor)如 TNF- a、或 7、TRAIL、G-CSF、GM-CSF、 M-CSF ' MCP-l及VEGF 〇其他實例為單株、多株、多專一 及單鏈抗體及其片段如例如Fab、Fab·、F(ab')2、Fc及Fc'片 段、輕（L)及重（H)免疫球蛋白鏈及其固定、多變異或高變異 區以及Fv及Fd片段（Chamov等人，1999)。抗體可為人的或 非人的來源。人化或嵌合抗體也為可能。

Fab片段（片段抗原結合（fragment antigen binding) = Fab) 由兩鏈的多變異區域組成，其由附近固定區域固定在一 起。可將其製造例如由習見抗體藉由以蛋白酶如木瓜酵素 (Papain)處理或藉由DNA選殖。其他抗體片段為F(ab’）2片 段，其可由以木瓜酵素之蛋白酵素分解而產生。 藉由基因選殖也可製備縮短抗體片段，其僅由重（VH)及 輕鏈（VL)的多變異區域組成。將此等稱為FV片段（片段多變 異（fragment variable)=多變異部分之片段（fragment of variable part)。因為經由固定鏈的半胱胺酸基團之共價鍵結 O:\89\89299.DOC •24- 1327166 不可能於此等Fv片段中，常將其以一些其他方法穩定。為 此目的’常將重及輕鏈的多變異區域藉由約1〇至3〇個胺基 馱（較佳為15個胺基酸）之短肽片段相連。此產生單一多肽 鏈其中藉肽連結物將VH及VL相連。此抗體片段也稱為單 鏈Fv片段（scFv)eScFv抗體之實例為已知並說明比較於例如

Huston等人，1988。 過去幾年來’已發展許多策略來製造多聚scFv衍生物。 目的為產生重組抗體具有改善的藥物動力學性質及增加結 合親和力。為了達到scFv片段的多聚化，將其產生為具有 多聚化區塊的融合蛋白質。多聚化區塊可為例如IgG的ch3 區域或螺旋結構（「卷曲螺旋結構」）如白胺酸拉鍊區塊。於 其他策略中’使用scFv片段的VH及VL區域之間交互作用作 為多聚化（如二、三-及五聯體）。 於本技藝中使用用詞二聯體來表示雙價類雙聚體scFv衍 生物。縮短scFv分子中的肽連結物至5至1〇個胺基酸造成由 重疊VH/VL鏈的類雙體形成。另外可將二聯體藉插入的雙 硫鍵橋而穩定。二聯體的實例可見於文獻中，如於Perisic 等人，1994。 於本技藝中使用用詞微抗體（minib〇dy)來表示雙價類雙 聚體scFv衍生物。其由含有免疫球蛋白（較佳為IgG，最佳 為IgGl)的CH3區域作為二聚化區域之融合蛋白質組成。此 連接scFv片段藉由樞紐區域，也為IgG，及連結物區域。此 微抗體的實例說明於Hu等人，1996。 於本技藝中使用用詞三聯體來表示三價類三聚體scFv O:\S9\89299.DOC -25- 1327166 衍生物（Kort.t等Λ，1997)。VH VL直接融合而不使用連結 物序列導致三聚體的形成。 於本技藝中已知為微抗體的片段，其具有二、三、或四 價結構，也為scFv片段的衍生物。藉由二、三、或四聚體 卷曲螺旋結構達到多聚化（Pack等人，1993及1995 ; Lovejoy 等人，1993)。 編碼螢光蛋白質之基因 於另一具體實施例中，根據本發明之表現載體含有編碼 螢光蛋白質之基因，較佳的是功能上連接至所需基因。較 佳的是，將二基因皆於單一異源啟動子之控制下轉錄，所 以所需蛋白質/產物及螢光蛋白質由雙基因mRNA編碼《此 使得可以藉由螢光蛋白質的表現率鑑定產生大量所需蛋白 質/產物之細胞。 螢光蛋白質可為，例如，綠色、藍綠色、藍色、黃色或 其他顏色的螢光蛋白質。一個特別的實例為綠色螢光蛋白 質（GFP，green fluorescent protein)，得自水母（Aequorea victoria或Renilla reniformis)及由彼等發展出的突變體；比 較例如 Bennet等人，1998; Chalfie 等人，1994; W0 01/04306 及其中引用的文獻。 其他螢光蛋白質及編碼之的基因係說明於w0 00/34318、 WO 00/34326、WO 00/34526 及 WO 01/27150，將其以參考 資料併於本文中。此等螢光蛋白質為珊瑚綱物種之非生物 發光生物之螢光發光基團（fluorophore)，例如海葵 (Anemonia majano)、羽珊湖（Clavularia sp_)、花群體海蔡 O:\89\89299.DOC -26- 1327166 (Zoanthus sp..I > Zoanthus sp.II) ^ ^ll(Discosoma striata) ' 香菇珊瑚（DiSC0S0ma sp〇 j紅」，香菇珊瑚。「綠」香菇珊 蝴 00紅」’敵擅海葵（Anemonia sulcata)。 根據本發明使用的螢光蛋白質除了野生型蛋白質，也包 含天然或基因工程的.突變體或變種、其片段、衍生物或例 如與其他蛋白質或肽融合之變體。使用的突變體可例如改 變激發或放射光譜、發色團的形成、消光係數或蛋白質的 女疋性。再者，藉由密碣子最佳化可將哺乳類細胞或其他 物種中的表現改善。根據本發明也可將螢光蛋白質用於與 可選擇標記之融合中，較佳一可放大可選擇標記如二氫葉 酸還原酶（DHFR，dihydrofolate reductase)。 由螢光蛋白質發射的螢光使其能夠偵測蛋白質如藉由 穿流具螢光活性細胞分類（FACS，fluorescence_activated cell sorter)的細胞儀或藉由螢光顯微鏡。 其他調控元件 表現载體含有至少一個異源啟動子其允許所需基因及較 佳螢光蛋白質之基因表現。 用詞啟動子代表多核苷酸序列其允許及控制功能上連接 至此的基因或序列的轉錄。啟動子包含有結合RNA聚合酶 用的辨識序列及轉錄的起始位置（轉錄起始位置為了於某 細胞類型或宿主細胞中表現理想序列，必須選擇適合的有 用啟動子。熟悉本技藝者將熟悉許多來自不同來源的啟動 子，包括組成性、可誘導及可抑制啟動子。其係儲存於資 料庫如例如GenBank’且可得到為分開的元件或選殖入由市

O:\89\89299.DOC -27- 1327166 面或個人來源的多核苷酸序列内的元件。於可誘導的啟動 子中，可將啟動子的活性回應一訊號降低或增加。可誘導 的啟動子之一個實例為四環素（tet，tetracycline)啟動子。此 含有四環素操作子序列（tet〇)，其可受四環素調控的反式激 活蛋白質（tTA)誘導。在四環素存在中，抑制tTA結合至 tetO。其他可誘導的啟動子實例為jun、f〇s、金屬硫蛋白及 熱休克啟動子（也見Sambro〇k等人，1989 ; G〇ss⑶等人， 1994)。 特別適合於真核高表現的啟動子之中，有例如倉鼠的泛 激素/S27a啟動子（W〇 97/15664)、SV4Q早期啟動子、腺病 毒主要晚期啟動子、小鼠金屬硫蛋白]啟動子、勞斯肉瘤病 毒（Rous sarcoma virus)的長末端反覆區域、人類巨細胞病 毒之早期啟動子。其他異源哺乳類啟動子之實例為肌動蛋 白、免疫球蛋白或熱休克啟動子。 可將相對應的異源啟動子功能上連接至其他調控序列以 便增加/調控表現組合體㈣⑽_⑽咖）中的轉錄活 性。 例如，可频料功能上連接至促進子序心便增加轉 錄活性。為此’可使用一或多個促進子及/或數個促進 列的複製體，如CMV或SV40促進子。於是，於另一具 施例中’根據本發明的表現載體含有—或多個促進子、 子序列，較佳為CMV或SV40促進子。 進 用詞促進子代表一多核芽酸序列，其於順式位 啟動子的活性並因而刺激功能上連接至此啟動子的基因之

O:\89\89299.DOC -28- 1327166 轉錄。不像啟動子，促進子的作用無關於位置及方位，所 以可將其置於轉錄單元之前或之後，於内含子之内或甚至 於編碼區域之内。你推? ~ 促進子可位於轉錄單元的緊接處及距啟 動子相當距離處皆可。也可與啟動子有實體及功能上的重 疊。熟悉本技#者將知衫來自許多㈣的促料（並儲存 於資料庫如GenBank，如SV4〇促進子、cmv促進子、多瘤 病毒㈣y〇ma)促進子、腺病毒促進子），其可得到為獨立元 件或選瘦於多核普酸序列内之元件（如健存於ATCC或來自 市面及個體來源）°許多啟動子序列也含有促進子序列如常 用的隨啟動子。人類CMV促進子為迄今鑑定最強促進子 之。可誘導的促進子之一個實例為金屬硫蛋白促進子， 可將其以醣皮質素(glucoc〇rtic〇id)或重金屬刺激。 另一可能的修改為，例如，導入多重Spl結合處。也可將 啟動子與允許控制/調控轉錄活性的調控元件結合。因此， K㈣+為可抑制/可誘導。例如’藉由連接至向上-或向 下-調控轉錄因子的結合處的序列可將此完成。例如，上面 所提轉錄因子Spl對轉錄活性具有正面效果。另_實例為對 活化子蛋白質奶之結合處，其可有利及不利地作用於轉錄 上。AP1的活性可由所有種類之因子控制如，例如，生長因 子、細胞激素及血清（Faisst等人，㈣及其中的來考_ 也可由突變（置換、插入或刪除）—、二、三或多個驗基改變 =動子序列，而後於報導基因分析法（rep〇nergenea㈣ 中決定是否此已增加啟動子活性而將轉錄效率增加。 基本上，其他調控元件包括異源啟動子、促進子、終止

O:\89\89299.DOC -29- 1327166 及聚腺苷酸訊號及其他表現控制元件。對許多細胞類型可 誘導及組成性調控序列兩者皆為已知。 轉錄調控元件」一般包含欲表現基因序列上游的啟動 子、轉錄起始及終止處及聚腺苷酸訊號。 用3轉錄起始處」意指於構體中的核酸其相當於併入 初級轉錄產物（即mRNA前驅物）中之第一個核酸。轉錄起始 處可與啟動子序列重疊。 用詞「轉錄終止處」意指一核苷酸序列其通常於所需基 因或欲轉錄的基因段落之3,端，且其引起由RNA聚合酶轉錄 之終止。 「聚腺苷酸訊號」為一訊號序列其造成在真核mRNA的 3端特定處的斷裂及轉錄後加入約100-200個腺嘌呤核苷酸 (聚A尾巴）之序列於切斷的3,端。聚腺苷酸訊號包含有序列 AATAAA於切斷處上游約1 〇·3〇個核脊西复及一序列位於下 游。許多聚腺苷酸元件為已知如tk聚A、SV40晚期及早期 聚A或BGH聚A(例如說明於美國專利5,122,458中）。 於本發明較佳具體實施例中，各轉錄單元具有啟動子或 啟動子/促進子元件、所需基因及/或標記基因以及轉錄終止 元件。於另一較佳具體實施例中，轉錄單元含有兩個另外 的轉譯調控單元。 「轉譯調控單元」包含對每個欲表現的多肽之轉譯起始 處（AUG)、停止密碼子及聚a訊號。為了最佳表現，較佳可 去除、加入或改變欲表現的核酸序列之5’_及/或3’-未轉譯區 域’以便去除任何可能不適當多餘的轉譯起始密碼子或其

O:\89\89299.DOC -30- 1327166 他可成影響轉錄的表現或表現量的序列。為了促進表現， 可將核酿體一致（consensus)結合處交替地插入緊接起始密 碼子的上游。為了產生分泌的多肽，所需基因通常含有編 碼運送合成的多肽至及通過ER膜的訊號前驅物肽之訊號序 列。訊號序列通常但非一定位於分泌的蛋白質之胺基端且 在蛋白質已經通過ER膜後由訊號肽酶切斷。基因序列將通 常但不一定含有其本身訊號序列。若天然訊號序列不存 在’則可以已知方式將異源訊號序列導入。許多此種訊號 序列對熟悉本技藝者為已知且儲存於序列資料庫如 GenBank及 EMBL。 根據本發明一個重要調控元件為内核醣體進入處（IRES， internal ribosomal entry site)。IRES元件包含一序列，其功 月b上獨立地活化轉譯起始5'端甲基§11姐03丨]1丨11111蓋（CAp結 構）及上游基因並於動物細胞内允許由單一轉錄產物轉譯 兩個順反子（cistron)(開啟讀碼框（opeil reading frames ))。 IRES元件提供轉譯位於緊接下游之開啟讀碼框的獨立核醣 體進入處。相反於細菌mRNA可為多順反子（即其可編碼許 ^不同户肽或產物，其係一個接一個由mRNA轉譯），來自 動物細胞的mRNA大部分為單順反子且僅編碼一個蛋白質 或產物。於多順反子轉錄產物的情況中，於真核細胞中轉 譯將由最靠近上游的轉譯起始處開始且將由第一個停止密 碼子終止，之後轉錄產物將由核醣體釋放。因此，僅有由 mRAN編碼的第一個多肽或產物於轉譯期間產生。相反地， 具有IMS元件的多順反子轉錄產物，其於轉錄產物中功能 O:\89\89299.DOC 31- 1327166 上連接至第二或之後的開啟讀碼框，允許位於其下游的開 啟讀瑪框隨後轉譯，所以於真核細胞中產生由相同轉錄產 物編碼的二或多個多肽或產物。 IRES元件可為不同長度及不同來源且可源自例如腦心肌 炎病毒（EMCV, Encephalomyocarditis virus)或其他 口蹄疫 (picorna virus)。不同IRES序列及其於載體建造中的用途 揭示於文獻中，參見例如Pelletier等人，1988 ; Jang等人， 1989 ; Davies等人，1992 ; Adam等人，1991 ; Morgan等人， 1992 ; Sugimoto等人，1994 ; Ramesh等人，1996 ; Mosser 等人，1997。 將位於下游的基因序列功能上連接至IREs元件的3，端， 即選擇間隔以使基因的表現不受影響或僅少量地影響或有 充分表現預計的目的。IRES元件與位於其下游基因的起始 密碼子之間的最佳可允許距離可藉由改變間隔及利用報導 基因分析法決定表現率為間隔的函數而藉簡單的實驗決 定。 藉由δ尤明的方法能得到最佳表現組合體，其有表現異源 基因產物之極大價值。所以藉由一或多種此方法得到的表 現組合體為本發明之主題。 倉鼠·泛激素/S27a啟動子 於另一具體實施例中，根據本發明之表現載體含有倉鼠 的泛激素/S27a啟動子，較佳的是功能上連接至所需基因， 更佳的是功能上連接至所需基因及編碼螢光蛋白質的基 因。

O:\89\89299.DOC -32· 1327166 倉鼠的泛激素/S27a啟動子為有力的同源啟動子，說明於 世界專利W0 97/15664中。此啟動子較佳具有至少下列其中 一項特徵：多GC序列區域、Spl結合處、多嘧啶元件、無 TATA盒。也較佳的是具有Spl結合處但無ΤΑΤΑ盒的啟動 子。也較佳的是組成性活化及特別是在含血清、低血清及 無血清細胞培養條件下同樣有活性的啟動子。於另一具體 實施例中，其為可誘導啟動子，特別是藉由移除血清而活 化的啟動子。 一特別有利的具體實施例為具有如包含於世界專利w〇 97Λ5664的圖5中之核苷酸序列的啟動子。特別較佳的是含 有圖5之位置· 161至_45的序列之啟動子序列。 用於本專利說明書實例中的啟動子各含有隨附序列名冊 的seqidNO:55之位置1923至雇序列之dna分子。此序 列相當於世界專利WO 97/15664的圖5之片段·仍至+⑴且 代表較佳啟動子，即較佳啟動子應併入此序列區域。另一 適合的啟動子片段含有由位置213 4至2 4 0 6之序列（相當於 世界專利W0 97/15664的_ 5之-161至+111)。僅含由位置 2251至2406的序列之啟動子不再有功能（相當於世界專利 W〇 97/15664的圓5中位置七至能夠自位置2134於 5'方向延伸啟動子序列。 也此夠利用70整倉鼠泛激素/S27a啟動子序列的功能性 次級片段以及其次級片段的完整序列受改質（例如由取 代插入或删除）之功能性突變體/變形。相對應的次級片 •k犬交體、變形於下文中也稱為「改質的啟動子

O:\S9\89299.DOC •33· 1327166 貝的啟動子（視情況與其他調控元件結合）較佳具有轉 錄活性相當於示於SEQ ID職55之核普酸序列由位置朗 至2406的啟動子片段（世界專利W0 97/15664圖5的-372至 111)的/舌性。改質的啟動子顯示為有用於 若其於比較報導基因分析法中具有轉錄活性具有至的少 50%、較佳至少80%、更佳至少9〇%及更佳至少之19” 至240M段（-372至+111片段）的活性。特別較佳的改質啟動 子具有最少序列同源性於倉鼠泛激素/S27a啟動子之野生 型序列SEQIDNO:55之至少8G%，較佳至少85%，較佳至少 90/。’更佳至少95%，最佳至少97%且於比較報導基因分析 法中具有相當啟動子活性。 於相對應比較報導基因分析法中’將包含參考序列的測 試啟動子片段選殖於無啟動子報導基因前，其編碼例如發 光酵素（luCiferase)、分泌的鹼性磷酸酶（八似丨⑹ 抑〇__叫或綠螢光蛋白質（GFP，green fluorescent Pr〇tein)。隨後將此構體（啟動子序列+報導基因）藉轉染導入 測試細胞（如CHO-DG44)中及藉由測量報導基因的蛋白質 含量決定由研究的啟動子片段引發之報導基因表現。相對 應的測試見於例如Ausubel等人Current Protocols in Molecular Biology，1994，新版 〇 倉鼠泛激素/S 27a啟動子及改質的啟動子之啟動子序 列，其也可包括例如5,未轉譯區域或其特定片段，及編碼區 域以及泛激素/S27a基因的3'未轉譯區域或其特定片段，可 由熟悉本技藝者以說明於世界專利w〇 97/15664中之序列 O:\89\89299.DOC -34- 1327166 的知識利用許多標準方法如說明於例如Sambr〇〇k等人，

Ausubel等人，1994而得到。例如開始由說明於世 界專利W0 97/15664中之序列，可選擇一適當片段，且可將 含有此部份序列之寡核苷酸探針化學合成。此種探針可用 於例如選殖泛激素/S27a基因或5,未轉譯區域或其其他片 段’例如藉由自倉鼠基因組的資料庫雜交。利用上述報導 基因分析法熟悉本技藝者可確認啟動子活性片段而無須極 大努力並使用之作為本發明的目的。藉由以相對應引子之 PCR放大可自基因組DNA或基因組資料庫將其$，未轉譯區 域或其特殊片段輕易地獲得。5,未轉料域的片段也可由較 大DNA片段之有限制的外切酶„消化而得。此DNA分子也 可為化學合成或藉由接合自化學合成的片段產生。 刪除、插入及置換突變體可由「特定位置突變」及/或「以 PCR為基本的突變技術」產生。相對應的方法係說明於例 如由L〇ttspeich及Zorbas(1998)第36」章與其他參考資料。 藉由自倉鼠泛激素/S27a基因的5，未轉譯區域或自倉穿乏 激素/S27a基因的S27a部分或3,未轉譯區域與探針交2雜 交’也能夠自其他(較佳的是哺乳類種類)相對應同源基因確 認及分離適當啟動子序列。適當技術藉由實例說明於 Lompeich及Zorbas(1998)第23章中。為了本發明之目的基 因為「同源」若其核《序列展現至少鳩，較佳至少帆土， 較佳至少规，更佳至少95%及至少97%—致於與其為_ 的基因之核苷酸序列。 藉由說明的方法能得到最佳表現組合體，其有表現異源

O:\89\89299.DOC -35- 1327166 基因產物之高度價值。所以藉由一或多種此方法得到的表 現組合體為本發明之主題。 製備根據本發明之表現載體 根據本發明之表現載體理論上可由本技藝中已知習見方 法製備，如例如由Sambrook等人（1989)所述。Sambrook也 說明載體的功能成分，如適當的啟動子（除了倉鼠泛激素 /S27a啟動子）、促進子、終止及聚腺苷酸訊號、抗生素耐受 基因、可選擇標記、複製起始點及剪接訊號。可使用習見 轉殖載體來產生之，如質體、噬菌體、噬菌質體、柯斯質 體（cosmid)或病毒載體如桿狀病毒、反轉錄病毒、腺病毒、 腺相關病毒及單純泡殄病毒（Herpes Simplex Virus)，以及 人造染色體/迷你染色體。真核表現載體通常也含有原核序 列如，例如，複製起點及抗生素耐受基因其允許於細菌中 複製及選擇載體。許多含有多重轉殖處以導入多核苷酸序 列之真核表現載體為已知且一些可自許多公司購入如 Stratagene、La Jolla, CA, USA; Invitrogen, CA USA; Promega, Madison, Wi, USA 或 BD Biosciences Clontech， Palo Alto, CA，USA。 將異源啟動子、所需基因及改質的新黴素磷酸轉移酶基 因及視情況編碼螢光蛋白質的基因、其他調控元件如内核 聽體進入處（IRES, internal ribosomal entry site)、促進子、 或聚腺苷酸訊號以對熟悉本技藝者熟知的方式導入表現載 體中。根據本發明的表現載體至少含有異源啟動子、所需 基因及改質的新黴素磷酸轉移酶基因。較佳的是，表現載

O:\89\89299.DOC 1327166 體也含有編碼螢光蛋白質的基因。根據本發明特別較佳使 用泛激素/S2城料作為異源啟料。制較佳的表現载 體為將異源啟動子（較佳為泛激素脱〜啟動子）、所需基因 及編碼螢光蛋白質的基因功能上連在―起或功能上=且 新黴素磷酸轉移酶基因為於相同分開的轉錄單元中。 於本說明的範圍内’用詞「功能上連接」意指將二或多 個核酸序列或部分序列安排以使其可表現其預期功能。例 如將啟動子/促進子功能上連接至編媽基因序列若於順式 位置其能夠控制或調節連接的基因序列之轉錄。一般，但 非必須，功能上連接的DNA序列為#在—起且若將二又編碼 基因序列連接或在分泌訊號序列的情況中，於相同讀碼框 中雖然功月b上連接的啟動子一般位於編碼基因序列的上 靠近它。促進子不一定要靠近，其限制條 件為其幫助基因序列的轉錄。為此㈣，其可為基因序列 的上游及下游兩者’可能與其有些距離。將聚料酸化處 :力能上連接至基因序列若其位於基因序列的3，端以轉錄進 订經由編碼序列至聚腺苷酸訊號的方式。連接可根據習見 重=法進行’如藉由PCR技術、藉由接合於適當限制酶 或藉由剪接。若無適當限制酶切割位置可得，可以 本身已知的方式使用合絲核㈣連接子或接合子。 本發明功能上連接較佳不經内含子序列發生。 個具體實施例中，將異源啟動子(較佳為泛激 一啟動子）、所需基因及編碼營光蛋白質的基因功能上 連在一起。此意指例如將所需基因及編碼螢光蛋白質的"基

O:\89\89299.DOC -37- 1327166 因自相同異源啟動子開始表現。 於特別較佳的具體實施例t，功能連接經ires元件發 生，所以雙基因mRNA由兩個基因合成。根據本發明的表現 载體可另外含有促進子元件，其功能上作用於一或多個啟 動子上。特別較佳的是一表現載體其中將異源啟動子（較佳 為泛激素/S27a啟動子或其改質的形式）連接至促進子元件 如SV40促進子或CMV促進子元件。 基本上，於表現載體㈣基因之表現可由-或多個轉錄 早疋開始進行。將轉錄單元定義為含有一或多個欲轉錄的 基因之區域。將轉錄單元内的基因功能上連接至彼此使得 於此單元内的所有基因於相同啟動子或啟動子/促進子的 =錄控制下。此基因的轉錄連接之結果，可自一轉錄單元 轉錄及因而表現多於一種蛋白質或產物。各轉錄單元含有 轉錄及轉譯包含於其中的基因序列所必須的調控元件。各 轉錄元件可含有相同或不同調控元件。麵元件或内含子 可用於轉錄單元内基因的功能性連接。 表現载體可含有單一鳇- 轉錄早疋以表現所需基因、改質的 T基因及視情況編碼螢光蛋白f的基因。或者，也可將 =等基因安排於二或多個轉錄單元中。於轉錄單元内許多 ^因組合為可能。於本發明的另—具體實施例中，可將由 :或夕個轉錄早兀組成的多於—個表現載體藉由共同 轉^或以任何理想順序連續轉染而插入宿主細胞。可選擇 調控；τ:件及基因之任何組入 载體上，其限制條件為保 €轉錄早兀之適當表規。 視4要’其他調控元件及基因，

0:\89\89299.D〇C •38· 1327166 如其他所需基因或可選擇標記，可置於表現載體上。 於是’根據本發明含有所需基因及編碼改f的新徽 酸轉移酶基因之表現載體可含有此二基因於一或兩個分開 的轉錄早70中。各轉錄單以轉錄及表現—或多個基因產 物。若將二基因包含於一個轉錄單元内，其於相同啟動子 或啟動子/促進子的控制τ，而較佳的是使請即元件來轉 保所有成分之功能性連接。若將編碼改質的新黴素碟酸轉 移酶基因及所需基因包含於兩個分開轉錄單元中，其可於 相同或不同啟動子/促進子的控制下。然而，較佳的是，使 用較弱異源啟動子如SV4〇早期啟動子於改質的Νρτ基因且 較佳不使用促進子。於本發明範圍内具有兩個分開轉錄單 7C之表現載體為較佳。一個（雙基因）轉錄單元含有所需基因 及視情況編碼螢光蛋白質的基因，而另一轉錄單元含有改 質的ΝΡΤ基因。較佳的是，各轉錄單元於31端受編碼聚Α訊 號的序列限制’較佳的是BGH聚A或SV40聚A。 根據本發明也為較佳的表現載體為取代所需基因，僅有 多重轉殖位置經由限制内切酶的辨識序列允許所需基因之 轉殖。各種限制内切酶的許多辨識序列以及相關限制内切 酶為先前技藝已知。較佳的是，使用由至少六個核苦酸作 為辨識序列組成的序列。適合的辨識序列之名單可見於例 如 Sambrook等人，1989。 宿主細胞 為了以根據發明之表現載體轉染，使用真核宿主細胞， 較佳的是哺乳類細胞，更特別是齧齒目動物細胞如小鼠、 O:\89\89299.DOC •39- 1327166 大鼠及倉鼠細胞株。以根據發明之表現載體成功轉染相對 應細胞造成轉化、基因改質的、重組或基因轉殖細胞，其 也為本發明的主題。 為了本發明之目的較佳的宿主細胞為倉鼠細胞如 BKH21 ' BHK TK-CHO' CH0-K1 ' CHO-DUKX' CHO-DUKX B 1及CHO-DG44細胞或此等細胞株之衍生物/後裔。特別較 佳的是 CHO-DG44、CHO-DUKX、CH0-K1 及 BKH21細胞， 特別是CHO-DG44及CHO-DUKX細胞。也為適合的是來自 小鼠的骨髓癌細胞，較佳的是NS0及Sp2/0細胞及此等細胞 株之衍生物/後裔。 根據本發明可使用的倉鼠及小鼠細胞之實例係示於下表 1中。然而，此等細胞株之衍生物/後裔、其他哺乳類細胞（包 括但不限於人類、小鼠、大鼠、猴子、齧齒目動物）、或真 核細胞（包括但不限於酵母菌、昆蟲及植物細胞）也可作為製 造生物製藥蛋白質的宿主細胞。 O:\89\89299.DOC -40- 1327166 表1 :倉鼠及小鼠製造細胞株 細胞株 登錄號碼 NS0 ECASS No. 85 1 10503 Sp2/0-Agl4 ATCC CRL-1581 BHK21 ATCC CCL-10 ΒΗΚ TK' ECACC No. 8501 1423 HaK ATCC CCL-15 2254-62.2 ATCC CRL-8544 (BHK-21衍生物） CHO ECACC No. 8505302 CHO-K1 ATCC CCL-61 CHO-DUKX ATCC CRL-9096 (=CHO duk" CHO/dhfr ) CHO-DUKX B1 ATCC CRL-9010 CHO-DG44 Urlaub et al; Cell 32[21, 405-412, 1983 CHO Pro-5 ATCC CRL-1781 V79 ATCC CCC-93 B14AF28-G3 ATCC CCL-14 GHL ECACC No. 8711 1906 以多核苷酸或一個根據本發明之表現載體轉染真核細胞 係藉由習見方法進行（Sambrook等人，1989 ; Ausubel等人， 1994)。轉染的適當方法包括例如微脂粒介導的轉染、磷酸 O:\89\89299.DOC -41 - 1327166 弼共同沈澱、電穿孔法、多陽離子_(如DEAE-葡萄聚糖）介 導的轉染、原生質體融合、微量注射及病毒感染。根據本 發明較佳進行穩定轉染，其中將構體整合入宿主的基因組 或人造染色體/迷你染色體内，或以安定的方式游離地包含 於信主細胞中。產生最佳轉染頻率及異源基因的表現於研 究的宿主細胞中之轉染方法為較佳。由定義，將插入宿主 細胞中的每個序列或每個基因稱為關於宿主細胞之「異源 序列J或「異源基因」。即使欲導入的序列或欲導入的基因 相同於佰主細胞的内生序列或内生基因，此亦適用。例如， 將導入倉鼠宿主細胞中的倉鼠肌動蛋白基因由定義為異源 基因。 根據本發明，重組哺乳類細胞，較佳的是f齒目動物細 胞，最佳的是倉鼠細胞如CH〇或BHK細胞，以根據本發明 說明於本文中的一種表現載體轉染為較佳。 於雜聚蛋白質如單株抗體（mAb)之重組製造中，理論上可 將適當宿主細胞的轉染由兩種不同方法進行。此種⑽係 由許^次單元（重及輕鏈）組成。編碼此等次單元的基因可容 早-質體上之獨立或多基因轉錄單元中，而後以此轉 卞侣主、’·田胞。&目的為確保整合人宿主細胞的基因組後基 因之化學計量代表。然而，於獨立轉錄單元的情況中，以 此方式必須確保編碼不同蛋白質的mRNA呈現相同安定性 =錄及轉澤效率。於第：種情況中，藉由單—啟動子於 錄單元内發生基因的表現且僅形成-個轉錄產 物猎由利用卿元件，於第二及隨後順反子中得到高度

O:\89\89299.DOC •42- 1327166 =之基因内轉譯起始。然而，此等順反子之表現率低於 f一個順反子的表現率，藉由所謂「蓋」依賴的起始前複 口物’其轉譯起始大體上比IRES依賴的轉料始更有效 率。為了達到順反子的真正等莫爾表現，可導入另外的順 反子間元件，例如，其與刪元件一起確保一致表現率紲 界專利 W〇 94/05785；)。 同時產生許多異源蛋白質的另一可能方式為#同轉染， 根據本發明其為較佳，纟中將基因分別整合於不同表現載 體中。此優點為可調整基因及基因產物與另一者的某些比 例，因而抵銷mRNA安定性及轉錄及轉譯效率中的任何差 異。此外，表現載體更為安定因為其大小較小及於轉殖期 間及於轉染期間較易於操作。 所以，於本發明的一個特別具體實施例中，另外將宿主 細胞以一或多個具有編碼一或多個其他所需基因之載體轉 染，較佳為共同轉染。用於共同轉染的其他載體編碼例如 其他所需蛋白質，於相同啟動子/促進子組合控制下及至少 一種其他可選擇標記，如二氫葉酸還原酶。 根據本發明較佳將宿主細胞建立、適合及培養於無血清 條件下，視情況於無動物蛋白質/肽之培養基中。市售可購 得的培養基實例包括Ham's F12 (Sigma，Deisenhofen， DE)、RPMI-1640 (Sigma)、Dulbecco's 改質的 Eagle’s培養 基（DMEM; Sigma)、最少必須培養基（MEM; Sigma)、Isc〇ve，s 改貝的 Dulbecco s 培養基（IMDM ; Sigma)、CD-CHO (Invitrogen，Carlsbad，CA，USA)、CHO-S-SFMII (Invitrogen)、

O:\89\89299.DOC -43· 1327166 無血清CH〇培養基（SiSma)及無蛋白質CHO培養基 (Sigma)。此等培養基各可視情況補充許多成分，如贺爾蒙 及/或其他生長因子（如胰島素、轉鐵蛋白（transferdn)、表 皮生長因子、類姨島素生長因子）、鹽類（如氯化納、約、鎮、 構酸幻、緩衝液（如HEPES)'核芽（如腺普、胸们、麵酿 胺酸、葡萄糖或其他相當營養物、抗生素及/或微量元素。 雖然根據本發明無血清培養基為較佳，也可將宿主細胞利 用曾與適量也清混和的培養基培養及隨之產生蛋白質。為 了選擇基因改貝的細胞，其表現—或多種可選擇標記基 因’將一或多種選擇劑加至培養基。 用5司厂選擇劑」意指影響具有研究的可選擇標記基因之 缺陷的宿主細胞生長或存活之物質。於本發明範圍内，較 仫使用geneticin (G41 8)作為培養基添加劑以選擇攜帶改質 的新黴素磷酸轉移酶基因之異源宿主細胞。較佳的是，使 用100及800.克/毫升之培養基之間的G418濃度，更佳為则 至400:克/毫升之培養基。若要將宿主細胞以許多表現載 體轉染，即若要分開地將幾個所需基因導入宿主細胞中， 其一般具有不同可選擇標記基因。 可選擇標記基因為藉由加入相對應選擇劑至培養基而允 許專一選擇含有此基因的細胞之基因。作為舉例，可使用 抗生素耐受基因作為正可選擇標記。僅有已受此基因轉染 的細胞能夠於相對應抗生素存在中生長及因而被選擇。另 方面未义轉染的細胞於此專選擇條件下無法生長或存 活有正、負及雙功能可選擇標記。正可選擇標記藉由赋 O:\89\89299.DOC -44· 1327166 予對選擇劑的耐受力或藉由補償宿主細胞中的代謝或分解 缺陷而允許選擇及因而增加轉化的細胞。相反地’藉由負 可選擇標記可選擇性消滅已接受可選擇標記基因的細胞。 此之實例為單純泡療病毒的胸苦激酶，於細胞中的表現此 與同時加入阿昔洛韋（Acyclovir)或更昔洛韋（Ganciclovir) 導致其消滅。用於本發明中的可選擇標記（包括可放大可選 擇標記）包括基因改質的突變體及變形、片段、功能相等 物、衍生物、同源物及與其他蛋白質或肽之融合，其限制 條件為可選擇標記保持其選擇的特性。此衍生物呈現相當 的同源性於視為選擇性的區域或區塊中的胺基酸序列。文 獻說明大量可選擇標記基因包括雙功能（正/負）標記（例如 見世界專利W0 92/08796及W094/；28143)。通常用於真核細 胞中的可選擇標記之實例包括胺基糖苷磷酸轉移酶（ΑΡΗ, aminoglycoside phosphotransferase)、效高黴素構酸轉移酶 (HYG，hygromycine phosphotransferase)、二氫葉酸還原酶 (DHFR, dihydrofolate reductase)、胸苷激酶（TK, thymidine kinase)、麵醯胺酸合成酶、天門冬酿胺酸合成酶之基因及 賦予對新黴素（G418)、嘌呤黴素（Puromycin)、組胺醇D、博 菜黴素（belomycin)、腐草黴素（phleomycin)及 zeocin。 藉由螢光活性細胞分類（FACS, fluorescence-activated cell sorter)也能夠選擇轉化的細胞。為此，可使用細菌3-半乳糖苷酶、細胞表面標記或螢光蛋白質（如綠螢光蛋白質 (GFP, green fluorescent protein)及其來自水母（Aequorea victoria及Renillareniformis)或其他物種之變形；紅螢光蛋 O:\89\89299.DOC -45- 丄327166 白質及其他顏色發榮光的蛋白質及其來自非生物發光微生 物的變形如香兹珊蝴（Discosoma sp )、海葵（如灿〇心 sp.)、羽珊瑚（Clavulariasp)、花群體海葵（2〇扣化旧邛））作 為轉化細胞的選擇。 基因表現及選擇高產量宿主細胞 用阑基因表現係關於宿主細胞中異源基因序列的轉錄及 /或轉#。表現率一般可基於存在於宿主細胞中相對應 mRNA量或基於由所需基因編碼的基因產物之產生量而決 定。由特定核苷酸序列轉錄而製造的mRNA量可由例如北方 墨點雜交法、核醣酶_RNA保護法、細胞RNA之原位雜交或 藉由PCR法決定（sambro〇k等人，1989 ; Ausubel等人， 1994)。由特定核苷酸序列編碼的蛋白質也可由許多方法決 定，如例如ELISA、西方墨點法、放射線免疫分析法、免 疫沉澱法、偵測蛋白質的生物活性或藉由免疫染色蛋白質 接著做FACS分析（Sambrook等人，1989 ; Ausubel等人， 1994)。 用詞「高表現量（或率）、高表現、增加的表現或高生產 置」意指導入宿主細胞中的異源序列（即編碼有療效蛋白質 之基因）之持久及充分高表現或合成。若將根據本發明之細 胞、藉根據本發明說明於此的一種方法培養，無基因放大， 且若此細胞、產生至少多於每天大約〇 5 pg理想基因產物（〇 5 Pg/細胞、/天）’則呈現增加的或高表現或高表現量或率或高 生產® °若根據本發明之細胞、無先前基因放大而產生至少 多於每天大約1.0 pg理想基因產物（1 〇 pg/細胞、/天），則也呈

O:\89\89299.DOC -46- 1327166 現增扣'的或高表現或高表現或率或高生產量。特別是若根 據本發明之細胞、無先前基因放大而產生至少多於每天大^ 1·5 ?名理想基因產物(1.5 pg/細胞/天)，呈現增力，或高表現 或高表現量或率或高生產量。特别是若根據本發明之細胞 無先前基因放大而產生至少多於每天大約2〇靡想基因 產物（2.0 Pg/細胞、/天），呈現增扣的或高表現或高表現或率 或尚生產量。若根據本發明之細胞無先前基因放大而產生 至少多於每天大約3.0pg理想基因產物（3〇pg/細胞/天），則 呈現特別增加、的或高表現或特別高表現量或率或特別高生 產里藉由早一基因放大步驟，如利用下文中所述之 DHFR/MTX放大系統，可將生產量增加至少2至1〇倍所以 使用用詞、「高表現」、「增如、的表現」或「高生產量」關聯 匕受到基因放大步驟的細胞、若此細胞產生至少多於每天大 、力5 pg理想基因產物（5 pg/細胞/天），較佳至少多於大約

Pg/細胞、/天，更佳至少多於大約15pg/細胞/天，再更佳至少 多於大約20 Pg/細胞/天或至少多於大約3〇㈣細胞/天。 藉由利用根據本發明之—種表現載體及藉由利用根據本 ㈣之-種方法兩者可達到高或增加的表現、高生產量或 高表現量或率。 例如，藉由共同表現所需基因及改質的Νρτ基因，能夠 選擇及確認表現異源基因至高程度的細胞。與以⑼打比 較改貝的ΝΡΤ允許更有效的選擇具有高表現異源所需基 因之穩定轉染的宿主細胞。 因此本發明亦關於表現至少_種所需基因於重組哺乳類

O:\89\89299.DOC -47- 1327166 細胞中之方法，特徵為⑴將一群哺乳類細胞以至少一種所 需基因及一種改質的新黴素磷酸轉移酶基因轉染，其與野 生型新黴素磷酸轉移酶比較僅具有1至80%之活性，較佳僅 1至60%，更佳僅L5至30%，最佳僅！ 5至26% ; (Η)將細胞 於允許表現所需基因及改質的新黴素磷酸轉移酶基因的條 件下培養；（iii)將哺乳類細胞於至少一種選擇劑（較佳為 G418)存在下培養，其選擇性作用於哺乳類細胞的生長，並 給予表現改質的新黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長優勢； 及（iv)自哺乳類細胞或自培養上層液得到所需蛋白質。較佳 的是使用曾經以根據本發明的表現載體轉染之重組哺乳類 細胞。 本發明亦關於選擇表現至少一種所需基因的重組哺乳類 細胞之方法，其中⑴將一群哺乳類細胞以至少一種所需基 因及一種改質的新黴素磷酸轉移酶基因轉染，其與野生型 新黴素磷酸轉移酶比較僅具有i至8〇%之活性，較佳僅！至 60%，更佳僅1.5至30%，最佳僅丨.5至26% ; (ii)將哺乳類細 胞於允許表現所需基因及改質的新黴素磷酸轉移酶基因的 條件下培養，（iii)將哺乳類細胞於至少一種選擇劑（較佳為 G41 8)存在下培養，其選擇性作用於哺乳類細胞的生長，並 給予表現改質的新黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長優勢。 若使用本申請案中詳述的改質NPT基因，為特別較佳的 方法來表現至少一種所需基因及選擇表現相對應所需基因 之重組細胞，特別是若與野生型基因比較使用編碼甘胺酸 或天門冬胺酸於胺基酸位置182，編碼丙胺酸於胺基酸位置

O:\S9\89299.DOC -48- 1327166 91 ’編碼甘胺酸於胺基酸位置丨98，編碼丙胺酸、甘胺酸或 領胺酸於胺基酸位置227，編碼甘胺酸或天門冬胺酸於胺基 如·位置261或編瑪異白胺酸於胺基酸位置240之改質NPT基 因。特別較佳使用 Asp227Val、Asp227Gly、Asp261Gly、 Asp261Asn、Phe240Ile或 Trp91Ala突變體。一般而言，根據 本發明於本專利說明書中提到的所有改質的新黴素磷酸轉 移酶基因皆適用於此方法中。對於較佳的新黴素磷酸轉移 酶基因’見改質的新黴素磷酸轉移酶基因章節。 表現所需基因及改質的NPT基因之細胞的選擇係由例如 加入G418作為選擇劑而實施。然而，也能夠利用其他胺基 葡萄糖苷抗生素如新黴素或嘉黴素。較佳將根據本發明的 細胞培養及選擇於每毫升培養基有2〇〇至8〇〇:克g418中。 已證實特別較佳每毫升培養基加入3〇〇至7〇〇 :克〇418。每 毫升培養基加入大約400 :克G418為最佳具體實施例。利用 此方法此夠選擇具有特別高表現率的重組細胞。與利用 wtNPT比較，在以每毫升培養基4〇〇微克G4i8選擇作為可選 擇 ‘》己後在 Glul 82Gly、Glul82Asp及 Vall98Gly 突變體的 情況中細胞顯示生產量增加倍數為1 ·4·2·4倍，在Asp227Gly 突變體的情況中倍數為! ]倍，在_22施或_心 突變體的情況中倍數為2.2或4倍，在phe24〇ne或Asp%! Am 突變體的情況中倍數為5.7或7.3倍及甚至在Asp2_y或 _22劑突變體的情況中倍數為9.3或14.6倍。將不同改質 的NPT基因之明確生產量示於圖6中。 可將相對應的方法& c Λ p c ±；e ^ 去與FACS-辅助的選擇重組宿主細胞結

O:\89\89299.DOC -49- 1327166 合，其含有一或多個螢光蛋白質（如GFP)或細胞表面標記作 為另外的可選擇標記。也可使用得到增加的表現之其他方 法，及不同方法之組合，係基於例如利用（人造）轉錄因子、 以天然或合成的藥劑處理細胞以向上調節内生或異源基因 表現、改善mRNA或蛋白質的安定性（半生期）、改善mRNA 轉譯的起始、藉由利用游離質體（基於利用病毒序列作為複 製起點，如SV40、多瘤病毒、腺病毒、EBV或EPV)增加基 因劑量、利用促進放大序列（Hemann等人，1994)或基於DNA 串聯體之試管内放大系統（Monaco等人，1996)。 所需基因及編碼螢光蛋白質的基因之耦合轉錄已證實特 別有效於與利用改質NPT基因作為可選擇標記連結。形成 的雙基因mRNA表現所需蛋白質/產物及螢光蛋白質兩者。 基於表現所需基因及螢光蛋白質之此種耦合，藉由表現的 螢光蛋白質，如藉由利用螢光活性細胞分類設備（FACS， fluorescence-activated cell sorting equipment)篩分，可輕易 地根據本發明確認及分離高生產量的重組宿主細胞。 呈現高生命力及理想基因產物之增加的表現率之重組宿 主細胞的選擇為多重階段的方法。例如，將已以根據本發 明之表現載體轉染的宿主細胞或視情況以其他載體共同轉 染於允許選擇表現改質的NPT之細胞的條件下培養，如藉 由培養於如G418以濃度100、200、400、600、800 : g或以 上之G418/毫升培養基之選擇劑存在下。而後將相對應的細 胞研究至少編碼螢光蛋白質且耦合至所需基因的基因之表 現，以便確認及篩分展現螢光蛋白質最高表現率的細胞/細 O:\89\89299.DOC -50- 1327166 胞知群。較佳的是’將屬於螢光蛋白質最高表現率的10-20%細 胞分出並進一步培養。實際上，此意指將螢光細胞最亮的1〇% 分出並進一步培養。於是’也可將細胞混合物的螢光細胞最亮 的5/。，較佳最亮的3%或甚至最亮的1%分出及複製。特佳具體 貫例中’僅分出最亮0.5%或最亮之0.1%螢光細胞並加以複製。 可將選擇步驟實施於細胞群中或利用預先篩分的細胞群 /、’’田胞單株。可實施一或多次，較佳二或多次及特別是三或 多-人篩分步驟，而於個別篩分步驟之間可將細胞培養及複 製一段特定時間，如在細胞群的情況中大約二週。例如， 圖11及12顯示突變體Asp227Gly有及無基因放大步驟之以 FACS為基本的篩分後之單位生產率。 因此本發明係關於得到及選擇表現至少一種異源所需基 因之重組哺乳類細胞的方法，特徵為⑴將重組喷乳類細胞 以根據本發明之表現載體轉染；（⑴將轉染的細胞於允許表 現所需基因、編碼螢光蛋白質的基因及改質的新黴素磷酸 轉移酶基因的條件下培養；（出）將哺乳類細胞於至少一種選 擇劑存在下培養，其選擇性作用於哺乳類細胞的生長，並 給予表現改質的新黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長優勢； 及㈣將呈現特別高螢光基因表現的哺乳類細胞藉流式細 胞儀分析篩分。視需要，可將步驟㈣中得到的細胞以步驟 (ii)至（iv)重複一次或數次。 -相對應方法為較佳，其特徵為篩分的哺乳類細胞具有 平均單位生產率（無額外基因放大步驟）為大於每細胞每天 〇_5 Pg理想基因產物(0.5 pg/細胞/天），較佳大於i…細胞/

O:\89\89299.DOC -51- 1327166 天，更佳大於2 Pg/細胞/天，再更佳大於3…細胞/天，再 更佳大於4 pg/細胞/天’例如大於5' 6、7、8、9、10等、 :於15、20、25 pg/細胞/天等。如上述，此等細胞之生產 量可由簡單基因放大步驟’如利用系統，而增 加至夕2至1〇倍。例如將此示於圖I〕中以利用突變體 ASp227Gly選擇。單位生產率為2G及25pg/細胞/天之間。 根據本發明也為較佳的是—方法，其中將適當篩分的細 胞複製及用來製備編碼的所需基因產物。為此，較佳將選 疋的南產量細胞培養於無血清培養基中及較佳於於允許所 需基因表現的條件下的懸浮培養中。較佳所需蛋白質/產物 係得自細胞培養基為分泌的基因產物。然而，若將蛋白質 表現而無分泌訊號，則也可將基因產物自細胞溶解物分 離。為了得到大體上無其他重組蛋白質及宿主細胞蛋白質 之純的同質產4勿，實施習見純化程序。首先，將細胞及細 胞殘锻自培養基或溶解物料。而後可將理想基因產物去 除巧染的可溶蛋白質、多肽及核酸，如藉由在免疫親和及 離子父換管柱、乙醇沉澱、反相HpLC或管柱層析法於葡聚 糖凝膠（Sephadex)、矽石或陽離子交換樹脂如deae上分 離。造成純化由重組宿主細胞表現的異源蛋白質之方法為 熟悉本技藝者已知且說明於文獻中，如由Hards等人，Η% 及 Scopesl988。 可放大可選擇的標記基因 此外，視情況也可將根據本發明的細胞經過一或多個基 因放大步驟，其中將其培養於導致可放大可選擇的標記基

O:\89\S9299.DOC -52- 1327166 因放大之選擇劑存在中。可將此步驟實施於表現螢光蛋白 質且較佳曾以FACS預先篩分一次或數次（較佳以說明於此 的一種方式）的細胞及於未曾篩分的細胞兩者。 前提為將宿主細胞另外以編碼可放大可選擇標記的基因 轉染。可以想見，編碼可放大可選擇的標記之基因可存在 於根據本發明的一個表現載體上或藉由其他載體而被導入 宿主細胞。 可放大可選擇的標記基因通常編碼一酵素，其為真核細 胞於某些培養條件下生長必須。例如，可放大可選擇的標 記基因可編碼二氫葉酸還原酶（DHFR，dihydrofolate reductase)。於此情況中，若將以此轉染的宿主細胞在選擇 劑曱氨喋呤（MTX, Methotrexate)存在中培養，將基因放大。 下表2呈現其他可放大可選擇的標記基因之實例及根據 本發明可使用的相關選擇劑，其係概要說明於由Kaufman， Methods in Enzymology, 1 85:537-566(1990) t 0 表2:可放大可選擇的標記基因 可放大可選擇的標記基因 登錄號碼 選擇劑 二氫葉酸還原酶 M19869(倉鼠） E00236(小鼠） 曱氨嗓吟(MTX, Methotrexate) 金屬硫蛋白 D10551(倉鼠） M13003(人） Ml 1794(大鼠） 錢 CAD(胺基甲醯磷酸合成 封·天門冬胺酸轉胺基曱 醯酶：二氫乳酸酶） M23652(倉鼠） D78586(人） N-填酸乙醯-L-天門冬胺酸酯 腺苦去胺酶 K02567(人） M 10319(小鼠） Xyl-A-或腺苷、脫氧柯福黴素 (2f deoxycoformycin) AMP(腺苷酸>脫氨酶 D12775(人） J02811(大鼠） 腺嗓吟、azaserin、柯福黴素 O:\89\S9299.DOC -53- 1327166 UMP-合成酶 103626(A) 6-氣展苦、pyrazofUran IMP 5’-脫氫酶 Γ04209(倉鼠） J04208(A) M22934(小鼠） 黴盼酸(mycophenolic acid) 黃嘌吟鳥嘌吟填酸核糖轉 移酶 X00221(大腸桿菌） 具有限黃嘌呤之黴酚酸 突變HGPRT酶或突變胸 J00060(倉鼠） 次黄嘌呤、胺基蝶呤及胸苷 普激酶 M13542,K02581(人） (HAT, hypoxanthine, J00423, M68489(小鼠） M63983(大鼠） M36160(皰疹病毒） aminopterine and thymidine) 胸皆酸合成酶 D00596(人） M13019(小鼠） L12138(大鼠） 5-敦脫氧展苦 P-醣蛋白 170(MDR1) AF016535(人） 數種藥物如阿黴素 J03398(小鼠） (Adriamycin)、長春新驗 (vincristin)、秋水仙驗 (colchicine) 核糖核苷酸還原酶 M124223，K02927(小 氣） aphidicoline 楚酿胺酸合成酶 AF150961(倉鼠） 曱硫胺酸硫氧胺 U09114，M60803(小鼠） TVISX,Methionine M29579(大鼠） Sulphoximine) 天門冬醯胺酸合成酶 M27838(倉鼠） 天門冬胺酸異羥肟酸 Μ27396(Λ) (aspartylhydroxamate)、合歡胺 U38940(小鼠） U07202(大鼠） 酸(albizziin)、5'氮胞苷 精氨酸代琥珀酸合成酶 X01630(人） M31690(小鼠） M26198(牛） 刀豆胺酸(canavanin) 鳥胺酸(ornithine)-脫觀酶 M34158(人） J03733(小鼠） M16982(大鼠） α-二氟曱基鳥胺酸 HMG-CoA還原酶 L00183，M12705(倉鼠） M11058(人） 密實菌素(Compactin) N-乙醯葡萄糖胺基轉移酶 M55621(人） 膜黴素(tunicamycin) Threonyl-tRNA合成酶 M63180(人） 疏螺旋體素(borrelidin) Na+K+-ATP 酶 105096(A) M14511(大鼠） 烏巴因(Ouabain) O:\89\89299.DOC •54- 1327166 根據本發明，使用的可放大可選擇的標記基因較佳為編 碼具有DHFR功能之多肽的基因，如編碼DHFR或來自螢光 蛋白質與DHFR的融合蛋白質。DHFR必須於嘌呤的生合 成。缺少DHFR基因的細胞無法生長於缺少嘌呤的培養基 中。所以DHFR基因為有用的可選擇標記於無嘌呤培養基中 培養的細胞中選擇及放大基因。與DHFR基因聯結使用的選 擇培養基為甲氨喋呤（MTX，Meth()tiiexate)。 所以本發明包括製備及選擇重組哺乳類細胞的方法，其 3有下列步驟_ (1)以至少編碼一所需蛋白質、改質的新黴 素磷酸轉移酶及DHFR之基因轉染宿主細胞；（ii)將細胞於 允許表現不同基因的條件下培養；及（出）藉由培養細胞於允 卉至少可放大可選擇的標記基因放大之選擇劑如甲氨喋呤 存在下放大共同整合的基因。較佳較，將轉染的細胞培 養於無次黃嘌呤/胸苷培養基中於缺乏血清中及加入增加 濃度的MTX。較佳的是，在第一次放大步驟中Μτχ濃度為 至少5 ηΜ。然而，ΜΤΧ的濃度也可為至少2〇 ηΜ 且可逐步增加至1: Μ。於獨立情況中，可使用大於ι:μ之 濃度，如2 : Μ。 若相對應細胞另外以螢光蛋白質的基因轉化，利用螢光 活性細胞分類裝置（FACS，fluorescence_activated S〇rtingdeVlce)可將此等細胞確認及篩分，而後在存在至少 20,較佳在存在50或1〇〇 nMMTX中，培養於基因放大步驟。 以此方式，能夠大量增加生產量至每細胞及每天多於汕叩 基因產物，較佳至多於21、22、23、24、25等、30、35、

O:\89\89299.DOC -55· 丄 327166 40等。可將宿主細胞經過一或多次基因放大步驟以便增加 至少所需基因及可放大可選擇的標記基因之複製數目。根 據本發明’藉由新黴素磷酸轉移酶調節的對胺基葡萄糖苷 抗生素如新黴素、嘉黴素及G4i8的耐受性，將可達到的高 生產置連接至有效的預先選擇。所以能夠降低基因放大步 驟所需數目及例如僅實行單一基因放大。 因此於另一具體實施例中，本發明亦關於得到及選擇表 現至少一種異源所需基因的重組哺乳類細胞的方法，其特 徵為：⑴將重組哺乳類細胞以根據本發明之表現載體及可 放大可選擇的標記基因之基因轉染；（ii)將哺乳類細胞於允 許表現所需基因、改質的新黴素磷酸轉移酶基因及編碼螢 光蛋白質的基因的條件下培養；（iii)將哺乳類細胞於至少一 種選擇劑存在下培養，其選擇性作用於哺乳類細胞的生 長’並給予表現改質的新黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長 優勢，（iv)將呈現特別高螢光基因表現的哺乳類細胞藉流式 細胞儀分析篩分；（v)將篩分的細胞於表現可放大可選擇的 標3己基因的條件下培養；及（vi)將選擇劑加至培養基中其造 成可放大可選擇的標記基因的放大。 特別較佳的為一相對應的方法’其中使用說明於本發明 中的改質的新黴素磷酸轉移酶基因。也為較佳的為一方 法，其中僅實施-次放大步驟。也為較佳的為一相對應方 法其導致重㈣乳類細胞呈現平均單位生產率大於每細胞 每天 2〇Pg，較佳大於 21、22、23、24、25等、3〇、35、4〇 等之理想基因產物。

ΟΛ8卿299DOC -56- 1327166 哺乳類細胞，較佳為小鼠骨髓癌及倉鼠細胞，為較佳的 宿主細胞於利用DHFR作為可放大可選擇的標記。細胞株 CHO-DUKX (ATCC CRL-9096)及 CHO-GD44 (Urlaub 等人， 1983)為特別較佳因其突變的結果不具本身的DHFR活性。 為了也能夠使用DHFR引發的放大於其他具有其本身内生 DHFR活性之細胞類型，於轉染過程中能夠使用突變的 DHFR基因其編碼具有對甲氨喋呤降低的敏感度之蛋白質 (Simonson等人，1983; Wigler等人，1980; Haber等人，1982)。 當利用無DHFR基本細胞如CHO-GD44或CHO-DUKX 時，DHFR標記特別適用於選擇及隨後放大，因此等細胞不 表現内生DHFR且所以不生長於無嘌呤培養基中。因此，可 將DHFR基因於此使用為顯性可放大可選擇的標記並將轉 化的細胞於無次黄嘌吟/胸苷培養基中選擇。 參照一些非限制性實例將本發明更完全地說明於下文 中0 實例 缩寫 Ala(=A) 丙胺酸 AP: 鹼性磷酸酶 Asn(=N) 天門冬醯胺酸 Asp(=D) 天門冬胺酸 bp: 驗基對 BSA: 牛血清白蛋白 CHO: 中國倉鼠卵巢 O:\89\89299.DOC -57- 1327166 dhfr: 二氫葉酸還原酶 DMSO: 二甲基亞砜. ELISA: 酵素聯免疫吸附分析 FACS: 螢光活性細胞分類裝置 FITC: 異硫氰酸營光素 GFP: 綠螢光蛋白質 Glu(=E): 麩胺酸 Gly(=G): 甘胺酸 HBSS: 漢克斯平衡鹽溶液 HT: 次黄嘌呤/胸苷 Ile(=I): 異白胺酸 IRES: 内核醣體進入處 kb: 4千驗基 mAb: 單株抗體 MCP-1: 單核球趨化蛋白-1 MTX: 曱氨喋呤 MW: 中值 NPT: 新黴素磷酸轉移酶 PCR: 聚合酶鏈反應 PBS: 磷酸鹽緩衝液 Phe(=F): 苯丙胺酸 Trp(=W): 色胺酸 Val(=V): 頡胺酸 WT: 野生型 O:\89\89299.DOC •58- 1327166 方法 1.細胞培養及轉染

將細胞CHO-DG44/dhfr-’-(Urlaub等人，1983)固定培養為 懸浮細胞於無血清CHO-S-SFMII培養基補充次黄嘌呤及胸 苦（Invitrogen GmbH, Karlsruhe, DE)於細胞培養瓶及 37°C 潮濕大氣及5%C02中。以CASY1細胞計數器（Schaerfe System，DE)或藉錐藍（tryptan blue)染色決定細胞總數及存 活率，而後將細胞以濃度1-3x105/毫升播種及每2-3天實施。

使用脂質體轉染劑（Lipofectamine Plus Reagent) (Invitrogen GmbH)於CHO-DG44之轉染。對各轉染混合物’ 將總計1微克質體DNA、4微升脂質體及6微升轉染劑根據製 造商的說明書混合在一起並以200微升之體積加至於〇·8毫 升HT補充的CHO-S-SFMII培養基中的6xl〇5指數生長的 CHO-DG44細胞。於細胞培養箱中37〇C培養3小時後加入2 毫升HT補充的CHO-S_SFMII培養基。對於以NPT為基本的 選擇中，轉染後2天將細胞轉移至具有G41 8的HT補充的 CHO-S-SFMII培養基，每3至4天更換培養基。通常’將400 微克/毫升G418加入作為選擇，於一些實驗序列中也將濃度 降低至200微克/毫升或提高至500、600或800微克/毫升。在 共同轉轉情況於DHFR-及NPT-為基本的選擇中’其中一個 表現載體含有DHFR而另一表現載體含有新黴素磷酸轉移 酶可選擇標記，轉染後2天將細胞轉移至未加黄嘌呤及胸苦 的 CHO-S-SFMII 培養基同時將 G418 (Invitrogen)以 400 微克 / 毫升之濃度加入培養基。 O:\89\89299.DOC -59- 1327166 整合的異源基因之以DHFR為基本的基因放大可由以濃 度 5-2000nM選擇劑 MTX (Sigma，Deisenhofen，DE)加入至 無HTCHO-S-SFMII培養基而得到。 2.表現載體

為了分析表現，使用基於pAD-CMV載體（Werner等人， 1998)及藉CMV促進子/倉鼠泛激素/S27a啟動子之組合調節 異源基因之組成性表現（W0 97/15 664)之真核載體。雖然基 本載體pBID含有作用為可放大可選擇標記之dhfr迷你基因 (比較如EP-0-393-438)，於載體pBIN中dhfr迷你基因已由新 黴素磷酸轉移酶耐受基因取代（圖1)。為此目的，將可選擇 標記新黴素磷酸轉移酶（包括SV40早期啟動子及TK-聚腺苷 酸訊號）自市售質體pBK-CMV (Stratagene，La Jolla, CA， USA)分離為1640 bp Bsu361片段。在以克列諾夫 (klenow)-DNA聚合酶填上片段末段的反應後，將片段與同 樣以克列諾夫-DNA聚合酶處理之載體pBID的3750 bp Bsu361/Stul片段接合。 在雙基因基本載體pBIDG (圖1)中，自載體pIRES2-EGFP (Clontech，Palo Alto, CA，USA)分離 IRES-GFP 區域並使其 於載體pBID中CMV促進子/啟動子的控制下以保留啟動子 區域及IRES-元件之間的多重選殖位置》使用下列程序。於 PCR突變法中，其中質體pIRES2-EGFP作用為模板，一方面 藉由利用突變的引子將IRES序列内的Hindlll切割處 AAGCTT轉變成序列ATGCTT而因而消除。另一方面，藉由 具有對IRES序列之5'端互補的引子將Xbal切割處插入或藉 O:\89\89299.DOC -60- 1327166 由具有對GFP序列之3·端互補的引子將Spel切割處導入。將 形成的PCR片段（其含有完整IRES及GFP序列）以Xbal及 Spel消化並選殖入載體pBID的多重選殖處之3'端的單獨 Xbal切割處。以相同方式，使來自載體pIRES2-EGFP的 IRES-GFP基因區域於載體pBIN中CMV促進子/倉鼠泛激素 /S27a啟動子的控制下。此產生雙基因基本載體pBIDG (圖1)。 將人類MCP-1 cDNA (Yoshimura等人，1989)選殖入載體 pBID的相對應切割處為0.3 kb Hindlll/EcoRI片段，造成載 體 pBIN-MCPl (圖 2A)。 為了表現單株人化IgG2抗體，將重鏈選殖為1.5 kb BamHI/Hindlll片段進入以BamHI及Hindlll消化的載體 pBID 或 pBIDG，以得到載體 pBID-HC 或 pBIDG-HC(圖 2B)。 另一方面，將輕鏈選殖為0.7 kb BamHI/Hindlll片段進入以 載體pBIN或pBING的相對應切割處，產生載體pBIN-LC或 pBING-LC (圖 2B)。

3.FACS 以庫爾特（Coulter Epics Altra)裝置進行流式細胞儀分析 及篩分。將FACS安裝具有激發波長488 nm的氦-氬雷射。於 適合螢光蛋白質的波長將螢光強度吸收及藉由連接的軟體 Coulter Expo32處理。通常以速率8000-10000次/秒實施篩 分。可將懸浮的細胞離心（於180xg 5分鐘）並於HBSS中調整 細胞濃度至1 -1 ·5χ 107/毫升。而後可將細胞根據其螢光蛋白 質訊號筛分。將細胞收集於已含埼養基的試管中，而後離 心及視筛分的細胞數目而定，植入適當培養皿或直接置於 O:\89\89299.DOC -61 - 1327166 微量滴定盤中。

4. ELISA 利用OptEIA人類MCP-1套裝組根據製造商的說明書（BD Biosciences Pharmingen，Heidelberg, DE)藉 ELISA定量穩定 轉染的CHO-DG44上層液中MCP-1效價。 一方面利用羊抗人IgG Fc片段（Dianova, Hamburg, DE)另 一方面利用AP-結合的羊抗人κ輕鏈抗體（Sigma)藉ELIS A根 據標準程序（Current Protocols in Molecular Biology, Ausubel等人，1994,更新版）定量來自穩定轉染的CHO-DG44 上層液中的IgG2 mAb。使用純化的IgG2抗體作為標準。由 公式pg/((Ct-Co)t/ln(Ct-Co))計算生產量（pg/細胞/天），其中 Co及Ct分別為植入及收成時的細胞總數，而t為培養時間。 5. 點分析以決定NPT酵素活性 為了製備細胞萃取，根據Duch等人，1990之方法，將6x 106個細胞以PBS清洗二次，而後重新懸浮於600微升萃取緩 衝液（0.135]\11'1^-11(：1?116.8,20%甘油，4 111]^雙硫蘇醣醇 (dithiothreitol))。於乾冰或水浴中四次冷束及解象循環後， 藉離心將細胞殘骸移除，使用上層液於隨後酵素分析。利 用 BIO-RAD 蛋白質分析（Bio-Rad Laboratories GmbH, Munich, DE)，以BSA作為標準蛋白質，藉蛋白質定量分析 法（Bradford assay)決定細胞萃取中的蛋白質濃度（Current Protocols in Molecular Biology，Ausubel等人，1994，更新 版）。為了決定NPT酵素活性，實施點分析法（Dot Assay)(基 於Platt等人，1987的方法）。為此，將5微克、2.5微克及1·25 O:\89\89299.DOC -62· 1327166 微克蛋白質以萃取緩衝液調整至最終體積20微升，以來自 非轉染的CHO-DG44細胞的細胞萃取增加總蛋白質量至5微 克。在加入200微升分析缓衝液（67mM Tris-HCl pH7.1，42 mM MgCl2, 400 mM NH4C1)加/減 40微克/毫升 G418及加/減 5 微居里[l33P]-ATP/ml(NEN)後，將萃取培養於27°C135分 鐘。而後將萃取於96孔真空歧管（Schleicher & Schull, Dassel，DE)通過一層沃特曼（whatman)3MM滤紙，P8 1填酸 纖維素膜（Whatman Laboratory Division，Maidstone, Great Britain)及硝化纖維素膜（Schleicher & Schull)之夾層過 濾。由蛋白質激酶磷酸化的蛋白質及無磷酸化的蛋白質結 合至硝化纖維素，而磷酸化的G41 8通過硝化纖維素並結合 至磷酸纖維素。以去離子水清洗三次後將膜自裝置移出， 再以水清洗而後風乾。利用填光影像分析儀（Phospho imager) (Molecular Dynamics, Krefeld，DE)定量放射線訊號。 6.北方墨點分析 以TRIZOL試劑根據製造商說明書（Invitrogen GmbH, Karlsruhe，DE)自細胞分離全部RNA並根據乙二醛 (Glyoxal)/DMSO-變性 RNA 的標準程序（Current Protocols in Molecular Biology, Ausubel等人，1994，更新版）實施由凝 膠電泳分離30微克RNA及轉移至Hybond N+尼龍膜 (Amersham Biosciences, Freiburg，DE)。用於隨後與 Gnenlmages CDP-Star偵測組之無放射性雜交之探針為包含 NPT基因的編碼區域之PCR產物，根據製造商的說明書以 Genelmages 隨機啟動標記組（Amersham Biosciences， O:\89\89299.DOC -63- 1327166

Freiburg，DE) FITC-dUTP-標記。 7.點墨點分析 利用DNA分離組根製造商的說明書（細胞及組織的DNA 分離組；Roche Diagnostics GmbH, Mannheim，DE)自細胞分 離基因組DNA。利用96孔真空歧管（Schleicher & Schull, Dassel, DE)藉標準方法（Ausubel等人，1994)於鹼緩衝液中 將不同量DNA(10微克、5微克、2.5微克、1.25微克、0.63 微克及0.32微克）過遽至Hybond N+尼龍膜（Amersham Biosciences，Freiburg, DE)上。使用未轉染的 CHO-DG44 細 胞作為負控制組。使用使用質體pBIN-LC作為標準（320 pg、 160 pg ' 80 pg ' 40 pg ' 20 pg ' 10 pg、5 pg、2.5 pg) ° 用 於隨後與Gnenlmages CDP-Star彳貞測組之無放射性雜交之 探針為包含NPT基因的編碼區域之PCR產物，根據製造商的 說明書以Genelmages隨機啟動標記組（Amersham Biosciences，Freiburg, DE)FITC-dUTP-標記。利用 ImageMaster VDS-CL (Amersham Biosciences)定量化學發光訊號。而後 研究的細胞中npt基因的複製數利用標定過的質體DNA所 得的訊號強度之標準系列決定。利用亞佛加厥常數及將 CHO細胞的DNA含量設定為約5 pg，計算質體分子數。 實例1 :新黴素磷酸轉移酶的突變 藉由PCR利用突變引子（圖3)進行製備NPT突變體 Glul82Gly (SEQ ID NO:3) ' Trp91Ala (SEQ ID NO:5) ' Vall98Gly (SEQ ID NO:7)、Asp227Ala (SEQ ID NO:9)、 Asp227Val (SEQ ID NO:ll)、Asp261Gly (SEQ ID NO:13)、 O:\89\89299.DOC -64- 1327166

Asp261Asn (SEQ ID N0:15)、Phe240Ile (SEQ ID N〇:l7)、 Glul82Asp (SEQ ID NO:19)、Asp227Gly (SEQ ID N〇:2U、

Aspl90Gly (SEQ ID NO:23)及 Asp208Gly (SEQ ID N〇:25) 所需的野生型NPT基因之鹼基置換。使用載體pBlN(圖U或 pBK-CMV (Stratagene，La Jolla，USA)作為PCR突變的模 板。首先，將突變體的51或3'段落於不同PCR操作中製備° 為 了製備突變體 Glul82Gly、Glul82Asp、Trp91Ala、 Aspl90Gly、Vall98Gly、Asp208Gly 及 Asp227Gly，使用引 子組合來放大，其包含Neofor5 (SEQ ID NO:27)及相關突變 反置（rev)引子或Neorev5 (SEQ ID NO:28)及相關突變前置 (for)引子： -在NPT突變體Glul82Gly (SEQ ID NO:3)的情況中之 Neofor5 (SEQ ID NO:27)及 E182Grev (SEQ ID NO:32)或 Neorev5 (SEQ ID NO:28)及 E182Gfor (SEQ ID NO:31); -在NPT突變體Glul82Asp (SEQ ID NO:19)的情況中之 Neofor5 (SEQ ID NO:27)及 E182Drev (SEQ ID NO:48)或 Neorev5 (SEQ ID NO:28)及 E182Dfor (SEQ ID NO:47); -在NPT突變體TΓp91Ala(SEQIDNO:5)的情況中之Neofor5 (SEQ ID NO:27)及 W91Arev (SEQ ID NO:34)或 Neorev5 (SEQ ID NO:28)及 W91Afor (SEQ ID NO:33); -在NPT突變體Vall98Gly (SEQ ID N0:7)的情況中之 Neofor5 (SEQ ID NO:27)及 V198Grev (SEQ ID NO:36)或 Neorev5 (SEQ ID NO:28)及 V198Gfor (SEQ ID NO:35); -在NPT突變體Aspl90Gly (SEQ ID NO:23)的情況中之 O:\89\89299.DOC -65- 1327166

Neofor5 (SEQ ID NO:27)及 D190Grev (SEQ ID NO:50)或 Neorev5 (SEQ ID NO:28)及 D190Gfor (SEQ ID NO:49); -在NPT突變體Asp208Gly (SEQ ID NO:25)的情況中之 Neofor5 (SEQ ID NO:27)及 D208Grev (SEQ ID NO:52)或 Neorev5 (SEQ ID NO:28)及 D208Gfor (SEQ ID NO:51); -在NPT突變體Asp227Gly (SEQ ID NO:21)的情況中之 Neofor5 (SEQ ID NO:27)及 D227Grev (SEQ ID NO:54)或 Neorev5 (SEQ ID NO:28)及 D227Gfor (SEQ ID NO:52)。 為 了製備突變體 Asp227Aal、Asp227Val、Asp261Gly、 Asp261Asn及Phe240Ile，使用引子組合來放大，其包含 Neofor2 (SEQ ID NO:29)及相關突變反置（rev)引子或IC49 (SEQ ID NO:30)及相關突變前置（for)引子：

-在NPT突變體Asp227Ala (SEQ ID N0:9)的情況中之 Neofor2 (SEQ ID NO:29)及 D227Arev (SEQ ID NO:38)或 IC49 (SEQ ID NO:30)及 D227Afor (SEQ ID NO:37); -在NPT突變體Asp227Val(SEQIDNO:ll)的情況中之 Neofor2 (SEQ ID NO:29)及 D227Vrev (SEQ ID NO.40)或 IC49 (SEQ ID NO:30)及 D227Vfor (SEQ ID NO:39); -在NPT突變體Asp261Gly (SEQ ID NO:13)的情況中之 Neofor2 (SEQ ID NO:29)及 D261Grev (SEQ ID NO:42)或 IC49 (SEQ ID NO:30)及 D261Gfor (SEQ ID NO:41); -在NPT突變體Asp261Asn (SEQ ID NO:15)的情況中之 Neofor2 (SEQ ID NO:29)及 D261Nrev (SEQ ID NO:44)或 IC49 (SEQ ID NO:30)及 D261Nfor (SEQ ID NO:43); O:\89\89299.DOC •66- 1327166 -在NPT突變體Phe240Ile (SEQ ID NO: 1 7)的情況中之 Neofor2 (SEQ ID NO:29)及 F240Irev (SEQ ID NO:46)或 IC49 (SEQ ID NO:30)及 F240Ifor (SEQ ID NO:45)。 而後將研究的突變體之V段落的编碼股與3'段落的互補 股由雜交結合於由突變引子序列形成的重疊區域，將單股 區域填滿並於以引子Neofor5 (SEQ ID NO:27)及Neorev5 (SEQ ID NO:28)或 Neofor2 (SEQ ID NO:29)及 IC49 (SEQ ID NO:30)之PCR中再度將整個產物放大。將PCR產物以 StuI/RsrII (突變體 Glul82Gly、Trp91Ala 及 Vall98Gly 之 Neofor5/Neorev5 PCR 產物）、StuI/BstBI (突變體 Glul82Asp、Aspl90Gly、Asp208Gly 及 Asp227Gly 之 Neofor5/Neorev5 PCR 產物）或 Dralll/RsrII (突變體 Asp227Aal、Asp227Val、Asp261Gly、Asp261Asn及 Phe240Ile 之Neofor2/IC49 PCR產物）消化。而後於載體pBIN-LC (圖 2B)或 pBK-CMV (Stratagene，La Jolla, USA)中，由 StuI/RsrII 消化、Dralll/RsrII消化或StuI/BstBI消化將部分野生型NPT 序列去除並以PCR產物的相對應片段取代。藉由序列分析 互補及編碼股二者，核對不同突變體中理想鹼基置換以確 保剩餘DNA序列相對應於野生型NPT序列。以此方式，產 生 pBINl-LC、pBIN2-LC 、pBIN3-LC 、pBIN4-LC 、 pBIN5-LC、pBIN6-LC、pBIN7-LC及 pBIN8-LC，其含有 NPT 突變體 Glul82Gly、Trp91Ala、Vall98Gly、Asp227Aal、 Asp227Val、Asp261Gly、Asp261Asn或 Phe240Ile (圖 2B) ° 將剩餘NPT突變體自改質的pBK-CMV分離為1640 bp O:\89\89299.DOC -67- 1327166

Bsu361片段，將片段末端以克列諾夫（klenow)-DNA聚合酶 填滿並與同樣以克列諾夫-DNA聚合酶處理之載體pBID的 3750 bp Bsu361/Stul片段接合。以此方式，產生pKS-N5、 pKS-N6、pKS-N7及pKS-N8，其分別含有NPT突變體 Glul82Asp、Aspl90Gly、Asp208Gly 及 Asp227Gly。而後將 人類MCP-1 cDNA選殖入此等表現載體成為0.3 kb Hindlll/EocRI片段（圖2A)或將人化IgG2抗體之輕鏈選殖入 此等表現載體成為0.7 kb Hindlll/BamHI片段（圖2B)。 插入新黴素碗酸轉移酶的突變一方面為較多 (Vall98Gly、Phe240Ile)或較少（Trp91Ala、Glul82Gly、 Glul82Asp、Asp227Aa卜 Asp227Va卜 Asp227Gly)保守的胺 基酸其兩側包圍保守的區塊，如基序（motif) 1、2及3 (Shaw 等人，1993)(圖4)。另一方面，突變位於保守的基序1 (Aspl90Gly)、2 (Asp208Gly)或 3 (Asp261Gly、Asp261Asn) 内並關於保守的胺基酸。 實例2 : NPT突變對穩定轉染的MCP-1表現細胞選擇之影響 使用MCP作為CHO細胞中單鏈蛋白質表現之實例。為 此，將 CHO-DG44細胞以 pKS-N5-MCPl、pKS-N6-MCPl、 pKS-N7-MCPl、pKS-N8-MCPl 或 pBIN-MCPl (圖 2A)轉染。 進行二雙重製備。轉染後兩天，將細胞植入96孔盤（2000個 細胞/孔）並以400微克/毫升G418於HT-補充的CHO-S-SFMII 培養基選擇。在以pBIN-MCPl轉染的細胞之情況中，同時 以800微克/毫升G41 8進行選擇。將得到的細胞族群連續經 24孔盤轉移至6孔盤中。即使於選擇階段期間不同轉染混合 O:\89\89299.DOC -68- 1327166 物之間可偵測到差異。相反於已以NPT野生型基因（SEQ ID N0:1)進行選擇之細胞族群，已以突變的NPT轉染的細胞族 群中，較少細胞存活以G418的起始選擇。所以直到約四天 後才可將此等細胞族群轉移入24孔盤内。在已以 PKS-N6-MCP1及pKS-N7-MCPl轉染的混合中，無穩定轉染 的細胞於400微克/毫升G418之濃度被選出。推測，具有突 變Aspl90Gly及Asp208Gly的NPT突變體中酵素功能嚴重受 損以致於無足夠G418分子可被去活性以使穩定的轉染細胞 生長。無可否認地，當將G418濃度降低至200微克/毫升， 一些細胞存活於第一選擇階段，但其皆嚴重地不良於其生 長及存活率而無法擴張，除了突變體Asp2 08 Gly的情況中之 少數例外》 由以突變體Glul 82Asp及Asp227Gly或以NPT野生型轉染 的細胞’培養1 8群（9群各有1及2的混合物）經過四代於6孔盤 中，藉ELISA測量細胞培養上層液中產生的MCP-1濃度。已 使用NPT突變體作為可選擇標記的細胞群顯示比以npt野 生型於400或甚至800微克/毫升G41 8之濃度實施選擇的細 胞群平均 50-57% (Glul 82Asp突變體）或 57-65% (Asp227Gly 突變體）之更高生產量（圖5)。因此，藉由利用NPT突變體作 為可選擇標記，可將轉染的細胞族群中高產量者的比例確 實地增加。 實例3 : NPT突變對穩定轉染的表現細胞選擇之影響

於共同轉染中，將CHO-DG44細胞首先以質體組合 pBIDG-HC/pBIN-LC (NTP野生型）、pBIDG-HC/pKS-N5-LC O:\S9\89299.DOC -69· 1327166 (Glul82Asp NPT 突變體）或 pBIDG-HC/pKS-N8-LC (Asp227Gly NPT突變體）（圖2B)轉染。於使用的載體組態 中，將人化IgG2抗體之兩蛋白質鏈各以其本身載體表現， 其另外編碼DHFR或新黴素可選擇標記於不同轉錄單元 中。產物基因之表現係由CMV-促進子/倉鼠泛激素/S27a啟 動子組合調節。然而，例如，利用CMV促進子/啟動子、SV40 促進子/倉鼠泛激素/S27a啟動子或其他啟動子組合也可得 到可比較的資料。 總計，實施四個轉染系列，於各情況中每質體組合使用6 群細胞。相反於以NPT野生型基因進行選擇的細胞族群， 已以突變NPT轉染的細胞族群中，較少細胞存活以G41 8的 起始選擇。二至三週選擇轉染的細胞群於加入400微克/毫 升G418之無-HT CHO-S-SFMII培養基後，進行數次（6-8次） 由ELISA決定細胞培養上層液中抗體效價。與利用NTP野生 型基因作為可選擇標記比較，以Glu 182Asp突變體選擇的細 胞顯示分別平均生產量及效價86%及77%增加，以Asp227Gly 突變體選擇的細胞顯示分別平均生產量及效價126%及 107%增加。因此，藉由利用具有降低的酵素活性之NPT突 變體，能夠選擇性增加具有基本生產量高達兩倍之細胞。 於另一轉染系列，測試不同濃度G41 8於選擇的影響。使 用400、500及600微克/毫升G418來選擇轉染的細胞群，各 情況3群。在較高濃度，顯著較少細胞存活於選擇以NPT野 生型基因進行的選擇之細胞族群，以Asp227Gly突變體效果 最大。然而，得到的穩定轉染的細胞族群顯示無不良於生 O:\89\89299.DOC -70- 1327166 長及生命力。然而，於用於轉染之質體組合内達到的生產 量及效價之間偵測不到顯著差異。但是，即使於此，由NPT 突變體選擇的細胞再次平均具有最高生產量，由Asp227Gly 突變體領先，其生產量比NPT野生型高四倍，之後為 Glul82Asp突變體，高2.4倍（圖6A)。 而後於共同轉染中，將CHO-DG44細胞以質體組合 pBIDG-HC/pBIN-LC (NTP野生型）、pBIDG-HC/pBINl-LC (Glul82Asp NPT突變體）、pBIDG-HC/pBIN2-LC (Trp91Ala NPT突變體）、pBIDG-HC/pBIN3-LC (Vall98GlyNPT 突變體）、pBIDG-HC/pBIN4-LC (Asp227Ala) > pBIDG-HC/pBIN5-LC (Asp227Val NPT 突變體）、 pBIDG-HC/pBIN6-LC (Asp261Gly NPT 突變體）、 pBIDG-HC/pBIN7-LC (Asp261Asn NPT 突變體）或 pBIDG-HC/pBIN8-LC (Phe240Ile NPT突變體）（圖 2B)轉染。 於使用的載體組態中，再度將單株人化IgG2抗體之兩蛋白 質鏈各以其本身載體表現，其也另外編碼DHFR或新黴素可 選擇標記於不同轉錄單元中。 對各質體組合，轉染5群。相反於以NPT野生型基因進行 選擇的細胞族群，已以突變NPT轉染的細胞族群中，較少 細胞存活以G418的起始選擇。二至三週選擇轉染的細胞群 於加入400微克/毫升G418之無-HT CHO-S-SFMII培養基 後，進行六次由ELISA決定細胞培養上層液中抗體效價。 圖6B顯示由測試中的群中決定的平均效價及生產量。與利 用NPT野生型基因作為可選擇標記比較，所有已以NPT突變 O:\89\89299.DOC -71 - 1327166 體選擇的細胞群顯示平均增加生產量及效價分別為 1.4-14.6倍及1.4-10.8倍（圖6B)。因此以NPT突變體 Asp227Val及Asp261Gly得到具有較高基本生產量細胞之最 佳選擇性增加’其增加平均生產量分別為14.6及9.3倍。 載體pBIDG-HC含有另一可選擇標記_GFP。GFP係轉錄上 經IRES元件連接至重鏈。目標蛋白質及可選擇標記GFP之 表現之間形成的關連也使得能夠快速地基於FACS分析中 決定的GFP螢光評估轉染細胞族群中表現程度之量及分 佈。二至三週選擇轉染的細胞群於G418之無-HT CHO-S-SFMII培養基後，於FACS分析中測量GFP螢光（圖 7)。事實上GFP螢光訊號關聯於單株抗體IgG2抗體所得到的 效價資料。以 NPT突變體 Asp227Va卜 Asp261Gly、Aspl61Asn 及Phe240Ile選擇的群也具有較高比例之具有高GFP螢光的 細胞，之後為以NPT突變體Trp91Ala、Asp227Ala、 Asp227Gly、Glul82Asp、Glul82Gly及Vall98Gly選擇的細胞。 藉由加入選擇劑甲氨嗓吟（MTX，Methotrexate)至培養液 中能夠藉由引發經dhfr調節的基因放大更進一步增加細胞 的生產量。因此，例如，以100 nM MTX之單一基因放大步 驟後，由以質體組合pBIDG-HC/pBIN5-LC (NPT突變體 Asp227Val) 、 pBIDG-HC/pBIN6-LC(NPT 突變體 Asp261Gly)、pBIDG-HC/pBIN7-LC (NPT突變體 Asp261Asn) 及 pBIDG-HC/pBIN8-LC (NPT突變體 Phe240Ile)共同轉染所 得的細胞群中單位生產量可增加2至4倍，視群而定，可達 到4及I4 pg/細胞/天之間的生產量。圖8顯示，經由實例， O:\89\89299.DOC -72· 1327166 由共同轉染 pBIDG-HC/pBIN5-LC (NPT 突變體 Asp227Val) 所得的細胞群，藉由加入MTX (100 nM MTX接著500 nM MTX)達到生產量增加至27pg/細胞/天。 實例4 :決定及比較NPT酵素活性

為了比較NPT突變體的酵素活性與NPT野生型之酵素活 性，實施點分析法以決定細胞萃取中的NPT活性，基於Platt 等人1987的程序並於圖9A中藉由實例顯示NPT突變體 01\1182入8卩及入5卩22701丫。由兩群不同111八1)-表現細胞製備細 胞萃取，其已以NPT野生型基因（SEQ ID ΝΟ:1)或以NPT突 變體 Glul82Gly (SEQ ID NO:3)、Glul82Asp (SEQ ID NO:19)' Trp91Ala (SEQ ID NO:5) ' Aspl90Gly (SEQ ID NO:23) ' Vall98Gly (SEQ ID NO:7) ' Asp208Gly (SEQ ID NO:25) ' Asp227Ala (SEQ ID NO:9) > Asp227Val (SEQ ID NO:ll) > Asp227Gly (SEQ ID NO:21) > Asp261Gly (SEQ ID NO:13)、Asp261Asn (SEQ ID NO:15)或 Phe240Ile (SEQ ID 1^0:17)轉染及選擇。使用來自未轉染的0：110-0044細胞之 細胞萃取作為負控制組。 與NPT野生型比較，NPT突變體的酵素活性顯著降低。平 均NPT突變體僅具野生型酵素活性的1.5%及62%之間，而 NPT突變體Asp261Gly及Asp261Asn為3.1%及1.5%有最低殘 餘活性而NPT突變體Vall98Gly及TΓp91Ala為61·9%及53.2% 有最高殘餘活性（圖9B)。於鱗酸纖維素上得到的訊號係針 對由NPT酵素活性造成的G418磷酸化。未加入NPT受質 G41 8至分析緩衝液中，於磷酸纖維素上無活性可偵測《於 O:\89tf9299.DOC -73- 1327166 硝化纖維素膜上得到的訊號，其由細胞萃取内的蛋白質激 酶磷酸化的蛋白質形成，作為運用的樣品等量之内部控制。 無法將NPT突變體與NPT野生型比較降低的酵素活性歸 因於降低的基因表現。相反地，北方墨點分析整體RNA顯 示以NPT野生型轉染及呈現高NPT酵素活性的細胞群比以 NPT突變體轉染的細胞群表現較少RNA (圖1 0)。唯一的例 外為以NPT突變體Glul82Gly轉染並表現可比較量之 NPT-mRNA的細胞。於實施於來自此等轉染細胞族群的基 因組DNA上的點墨點分析中，顯示NPT突變體的較高表現 係由基因劑量效果及/或由整合外生DNA進入更轉錄活躍 的基因區域而得（圖10)。例如，於以NPT突變體Trp91Ala選 擇的細胞中，基因劑量效果顯著於第1群中而第2群中整合 效果顯著。以此方式，具有降低酵素活性的標記之轉染細 胞用於選擇於相同選擇壓力下能夠合成足夠標記蛋白質以 補償對選擇劑降低的财受性。 實例5 :藉由以GFP為基本的FACS篩分，分離具有mAb 高表現之細胞 於共同轉染中，將CHO-DG44細胞以質體組合pBID-HC 及pBING-LC轉染，編碼單株人化IgG2抗體（圖2B)。於使用 的載體組態中，將抗體之兩蛋白質鏈各以其本身載體表 現，其也另外編碼DHFR或改質的新黴素磷酸轉移酶可選擇 標記（Asp227Gly突變體；SEQ ID NO:21)於不同轉錄單元 中。此外，載體pBING-LC含有另一可選擇標記-GFP。藉由 IRES元件轉錄連接GFP及輕鏈的表現之結果，以載體 O:\89\89299.DOC -74- 1327166

pBID-HC/pBING-LC共同轉染CHO-DG44，能夠於短時間分 離具有單株抗體高表現之細胞，僅以藉由連續FACS篩分選 擇具有高GFP含量的細胞。總計，將8個不同細胞群轉染， 由此在前二至三週選擇於加入400微克/毫升G41 8之無-HT CHO-S-SFMII培養基後，得到穩定轉染的細胞族群。，進 行數次（7-8次）由ELISA決定所有8群細胞的效價及生產 量。平均效價約為1.4毫克/升，生產量約為1.3 pg/細胞/天。 為了隨後連續以FACS為基本的篩分，選擇第5群及第8群， 第5群具有最高生產量而第8群具有相當於所有群的平均生 產量。各步驟中，藉FACS將具有最高GFP螢光的5%細胞篩 出並於群中進一步培養。將此篩分實施高達總計六次，每 次篩分之間約二週培養期。令人驚訝地，發現mAb生產量 與GFP螢光之間良好關聯性（圖13)，雖然兩蛋白質鏈各自由 其本身載體表現及於以GFP為基本的FACS篩分期間，僅能 夠選擇輕鏈之表現，因其轉錄耦合至GFP。由以FACS為基 本的篩分單獨能夠將生產量增加至9.5 pg/細胞/天（圖11)。 當將倉鼠啟動子功能上連接至SV40促進子代替CMV促進 子，也可得到可比較的資料。藉由單一隨後MTX放大步驟， 始自第一個篩分步驟之第5群及第8群，藉由加入100 nM MTX至選擇培養基，能夠增加群的生產量至平均多於20pg/ 細胞/天（圖12)。螢光蛋白質的高表現量在細胞生長及生命 力皆無負面影響。於基因放大期間，細胞生長性質也嚴重 地受MTX加入之負面影響，特別是當將其以更高濃度加 入。然而，預先篩分的細胞群顯示對平靜高起始劑量之100 nM O:\89\89299.DOC -75- 1327166 MTX反應出更加強健的特性。其更加禁得起選擇階段，即 僅2週後得到具有高生命力及良好生長速率之細胞族群。 此外，選擇高生產量細胞的發展時間降低至約6週，與習 見逐步基因放大策略比較，其通常包含4個放大階段及增加 ΜΤΧ加入。藉由組合使用增加具有增加表現所需基因之轉 染細胞，由利用具有降低酵素活性之改質的ΝΡΤ可選擇標 記達到，之後以GFP為基本的FACS篩分與隨後基因放大步 驟可將此達成。 文獻：

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Werner, R.G. et al., Arzneim.-Forsch./Drug.Res. 1998, 48, 870 - 880 Wigler, M. et ai., Proc Natl Acad Sci USA 1980, 77, 3567 - 3570 Zhang, J. & Madden, T.L. Genome Res. 1997, 7, 649 - 656; O:\89\89299.DOC -77- 1327166 【圖式簡單說明】 圖1顯示於CHO-DG44細胞中用來表現重組蛋白質的基礎 載體之概略代表。「P/E」為CMV促進子及倉鼠-泛激素/S27a 啟動子之組合，「P」本身代表啟動子元件及「T」為轉錄之 終止訊號，其對轉錄的mRNA之聚腺苷酸化為必須。於各轉 錄單元内轉錄起始的位置及方向以箭頭指明。為了轉殖異 源基因，將具有限制核酸内切酶的多重切割處之序列區域 (多重轉殖處（MCS，multiple cloning sites))插入於啟動子元 件之後。將可放大的可選擇標記二氫葉酸還原酶縮寫為 「dhfr」及可選擇標記新黴素磷酸轉移酶縮寫為「npt」（npt 野生型或npt突變體）。來自腦心肌炎（Encephalomyocarditic) 病毒的「IRES」元件於雙基因轉錄單元内作為内核醣體進 入處並使隨後綠螢光蛋白質（GFP，green fluorescent protein)得以轉譯。 圖2顯示編碼單鏈蛋白質（圖2A)或單株抗體的次單元（圖 2B)並用來轉染CHO-DG44細胞之真核表現載體之概略圖。 「P/E」為CMV促進子及倉鼠-泛激素/S27a啟動子之組合， 「P」本身代表啟動子元件及「T」為轉錄之終止訊號，其 對轉錄的mRNA之聚腺苷酸化為必須。於各轉錄單元内轉錄 起始的位置及方向以箭頭指明。將可放大的可選擇標記二 氫葉酸還原酶縮寫為「dhfr」及可選擇標記新黴素磷酸轉移 酶縮寫為「npt」。NPT突變體 E182G (SEQ ID NO : 3) ' E182D(SEQ ID NO: 19)、W91A(SEQ ID NO: 5)、D190G(SEQ ID NO : 23)、V198G (SEQ ID NO : 7)、D208G (SEQ ID NO : O:\89\89299.DOC -78- 1327166 25)、D227A (SEQ ID NO : 9)、D227V (SEQ ID NO : 11)、 D227G (SEQ ID NO : 21)、D261G (SEQ ID NO : 13)、D261N (SEQ ID NO : 15)及 F240I (SEQ ID NO : 17)含有點突變， 造成在指示的位置一改質的胺基酸（以1字母密碼表示）。來 自腦心肌炎（Encephalomyocarditis)病毒的「IRES」元件於 雙基因轉錄單元内作為内核醣體進入處並使隨後綠螢光蛋 白質（GFP，green fluorescent protein)得以轉譯。「MCP-1」 編碼單核球趨化蛋白-1 (monocyte chemoattractant protein-1) ’而「HC」及「LC」分別編碼人化單株IgG2抗 體之重及輕鏈。 圖3顯示新黴素磷酸轉移酶（npt)基因之部分序列，其中已 藉突變引子之PCR插入點突變。大寫字母代表ntp編碼區域 的核苷酸序列而小寫字母代表兩側無編碼核苷酸序列。由 核苷酸序列（3-字母密碼）預測的胺基酸序列示於編碼核苷 酸序列之上。箭頭代表使用的引子之方向、長度及位置， 箭頭具有實線代表突變正向引子，虛線代表突變反置引 子，點線代表分別位於npt基因或突變位置的上游之引子 Neofor5 (SEQ ID NO:27)或 Neofor2 (SEQ ID NO:29)，而點 劃線代表分別位於npt基因或突變位置的下游之引子 Neorev5 (SEQ ID NO:28)或 IC49 (SEQ ID NO:3 0)。將相對 於野生型序列交換的核苷酸強調於箭頭上方及下方。 圖4顯示NPT胺基酸序列内保守的區塊及插入NPT突變的 位置。基於不同胺基葡萄糖苷改質的酵素之間序列同源 性，於NPT蛋白質序列内鑑定不同保守的區塊（以灰色表 O:\89\89299.DOC •79- 1327166 示）。酵素C端區域的三個基序（motif)明顯具有特殊功用。 基序1及2可能牽涉ATP催化中末端磷酸根的催化轉移或核 苷酸結合，而基序3被視為具有ATP水解的功能及/或改變酵 素-胺基葡萄糖苷複合物的型態。發生於至少70%胺基葡萄 糖苷改質的酵素之胺基酸以粗體強調。基於其類似性及發 生於至少70%胺基葡萄糖苷改質的酵素將單下標線的胺基 酸指明為相同族群。以星號標註的胺基酸代表突變處的位 置。 圖5顯示NPT突變影響穩定轉染的MCP-1表現細胞的選 擇。為此，將CHO-DG44細胞以載體pBIN-MCPl、 PKS-N5-MCP1 及 pKS-N8-MCPl (圖 2A)轉染，其含有 NTP 野 生型（WT)或NPT突變體Glul82Asp及Asp227Gly作為可選擇 標記。為了選擇穩定轉染的細胞，將400微克/毫升或800微 克/毫升G418加至培養液作為選擇劑。細胞培養上層液中產 生的重組蛋白質MCP-1之濃度藉ELISA決定並計算每細胞 及每天的單位生產率。長條代表平均單位生產率或來自6 孔盤中的6個培養之18群之濃度。 於圖6中研究NTP突變影響穩定轉染的mAb表現細胞的選 擇。為此，將CHO-DG44細胞以質體組合pBIDG-HC/pBIN-LC (NPT野生型）、pBIDG-HC/pKS-N5-LC (NPT突變體Glul82Asp) 或 pBIDG-HC/pKS-N8-LC (NPT突變體 Asp227Gly)(圖 6A)或 以組合pBIDG-HC/pBIN-LC (NPT野生型）、pBIDG-HC/pBINl-LC (NPT突變體 Glul82Asp)、pBIDG-HC/pBIN2-LC(NPT突變體 Trp91Ala)、pBIDG-HC/pBIN3-LC (NPT突變體 Vall98G)、 O:\89\89299.DOC -80- 1327166 pBIDG-HC/pBIN4-LC (NPT 突變體 Asp227Aia)、 pBIDG-HC/pBIN5-LC (NPT 突變體 Asp227Val)、 pBIDG-HC/pBIN6-LC (NPT 突變體 Asp261Gly)、 pBIDG-HC/pBIN7-LC (NPT 突變體 Asp261Asn)或 pBIDG-HC/pBIN8-LC (NPT突變體 phe240Ile)(圖 6B)轉染， 其僅不同於NTP基因（野生型或突變體）作為可選擇標記。細 胞培養上層液中產生的重組單株IgG2抗體之濃度藉ELISA 決定並計算每細胞及每天的單位生產率。總共，將5-9群對 各載體組合建立。長條代表平均單位生產率或來自75平方 公分瓶中進行的6個培養之測試中所有孔之濃度。為了計算 相對濃度或相對單位生產率，將以NPT野生型基因選擇的 群之平均值視為1。 圖7顯示藉由根據本發明之NPT突變體作為可選擇標記

於轉染的細胞群中具有較高GFP表現的細胞之增加。為 此，將 CHO-DG44細胞以質體組合 pBIDG-HC/pBIN-LC(NTP 野生型）、pBIDG-HC/pKS-N5-LC (NPT突變體 Glul82Asp) pBIDG-HC/pKS-N8-LC (NPT 突變體 Asp227Gly)、 pBIDG-HC/pBINl-LC (NPT 突變體 Glul82Gly)、

pBIDG-HC/pBINl-LC pBIDG-HC/pBIN2-LC pBIDG-HC/pBIN3-LC pBIDG-HC/pBIN4-LC pBIDG-HC/pBIN5-LC pBIDG-HC/pBIN6-LC (NPT 突變體 Glul82Gly) (NPT 突變體 Trp91Ala) (NPT 突變體 Vall98G) (NPT 突變體 Asp227Ala) (NPT 突變體 Asp227Val) (NPT 突變體 Asp261Gly) O:\89\89299.DOC -81 - 1327166 pBIDG-HC/pBIN7-LC (NPT 突變體 ASp26lAsn)或 pBIDG-HC/pBIN8-LC (NPT 突變體 Phe240Ile)(於各情況中 有5至9群），其僅不同於NTP基因（野生型或突變體）作為可 選擇標記。再者，pBIDG載體也含有GFP作為標記基因。在 2至3週選擇轉染的細胞群於加入G418的無HT培養液中，藉 FACS分析測量GFP螢光。每個圖，除了以無轉染的 CHO-DG44細胞作為負控制組，代表來自以相同質體組合轉 染的每群之平均GFP螢光。 圖8顯示由經dhfr調節的基因放大達成之mAb生產率增 加，以由載體組合pBIDG-HC/pBIN-LC (NPT野生型）或 pBIDG-HC/pBIN5-LC (NPT 突變體 D227V)轉染的 CHO-DG44所得到的細胞群作為實例。在G418存在中於無 次黃嘌吟（hypoxanthine)/胸腺痛咬CHO-S-SFMII培養液中 的第一次選擇後，藉由加入100 nM及而後500 nM MTX至培 養液中進行經dhfr調節的基因放大。於細胞培養上層液中的 mAb濃度藉ELISA決定並計算每細胞及每天的單位生產率 (pg/細胞*天）。各數據點代表於75平方公分瓶中進行的6個 培養之平均。

圖9顯示根據本發明之NPT突變體與NPT野生型於點分析 中比較之酵素活性。為此，將已以NPT野生型基因（SEQ ID NO: 1)或以 NPT突變體 E182G (SEQ ID NO: 3)、E182D (SEQ ID NO : 19)、W91A (SEQ ID NO : 5)、V198G (SEQ ID NO : 7)、D227A (SEQ ID NO : 9)、D227V (SEQ ID NO : 11)、 D227G (SEQ ID NO : 21) ' D261G (SEQ ID NO : 13)、D261G O:\89\89299.DOC -82- 1327166

(SEQ ID NO: 13)、D261N (SEQ ID NO: 15)及 F240I (SEQ ID NO : 17) Glul82Asp或Asp227Gly轉染及選擇的兩種不同表 現mAb之細胞群（細胞群1及2)之細胞萃取製備。使用未轉染 的CHO-DG44細胞作為負控制組。使用G418於磷酸化分析 中作為受質。將萃取物經P81磷酸纖維素及硝化纖維膜的夾 層過渡於96孔真空歧管中。由蛋白激酶填酸化的蛋白質及 未鱗酸化的蛋白體同時結合至硕化纖維素，而填酸化及未 磷酸化的G41 8通過硝化纖維素並結合至磷酸纖維素（圖 9A)。偵測放射線訊號及利用磷光影像分析儀 (Phosphoimager)定量。使用以5微克萃取物得到的訊號來計 算酵素活性百分比。酵素活性百分比表示來自2細胞群表現 mAb的NTP突變體的平均值，將野生型NPT的酵素活性視為 100%(圖 9B)。

圖10顯示NPT表現之北方墨點分析及於轉染的細胞群中 NPT基因複製數。為此，將已以NPT野生型基因（SEQ ID NO: 1)或以 NPT突變體 E182G (SEQ ID NO: 3)、E182D (SEQ ID NO : 19)、W91A (SEQ ID NO : 5)、V198G (SEQ ID NO : 7)、D227A (SEQ ID NO : 9)、D227V (SEQ ID NO : 11)、 D227G (SEQ ID NO : 21)、D261G (SEQ ID NO : 13)、D261N (SEQ ID NO : 15)及 F240I (SEQ ID NO : 17) Glul82Asp或 Asp227Gly轉染及選擇的兩種不同表現mAb之細胞群之全 部RNA製備。使用未轉染的CHO-DG44細胞作為負控制組。 將30 : gRNA與FITC-dUTP標記的PCR產物雜交，其包含有 NPT基因的編碼區域。於所有轉染的細胞中，偵測到約1.3 kb Ο:細 9299.DOC -83- 1327166 之專一單獨NPT轉錄體。為了決定npt基因的複製數’於點 墨點分析中，將基因組DNA自前述表現mAb的細胞群分 離。將10微克、5微克、2.5微克、1.25微克、0.63微克、0.32 微克基因組DNA與FITC-dUTP標記的PCR產物雜交，其包含 有NPT基因的編碼區域。使用未轉染的CHO-DG44細胞作為 負控制組。使用質體pBIN-LC作為標準（320 pg、160 pg、 80 pg、40 pg、20 pg ' 10 pg、5 pg、2.5 pg)。利用對標定 過的質體DNA測量的訊號強度決定的標準系列計算npt基 因於細胞群中的複製數。 圖11顯示以二細胞群為例（細胞群5及8)利用FACS藉GFP 為基本的選擇分離高表現mAb細胞群。將此等得自以 pBID-HC及pBING-LC共同轉染的細胞群經過連續以GFP為 基本的FACS篩分。在每次篩分步驟後以ELISA決定細胞培 養上層液中的IgG2抗體之濃度並計算每細胞及每天的單位 生產率（pg/細胞*天）。在所有6個篩分完成中，及於各情況 中，將具有最高GFP螢光的5%細胞選出。各數據點代表於 75平方公分瓶中進行的至少6個培養之平均值。 圖12顯示以細胞群5及8為例（比較圖11)藉由合併以GFP 為基本的選擇與MTX放大步驟達到mAb生產率的增加。在 以載體pBID-HC及pBING-LC共同轉染CHO-DG44兩週後’ 自細胞群5及8選出具有最高GFP螢光的5%細胞。而後藉由 加入100 nM曱氨嗓吟（MTX，Methotrexate)至培養液中進行 經dhfr調節的基因放大。於細胞培養上層液中的mAb濃度藉 ELISA決定並計算每細胞及每天的單位生產率（pg/細胞* O:\89\89299.DOC -84- 1327166 天）。各數據點代表於75平方公分瓶中進行的6個培養之平 均0 圖13顯示以細胞群5及8為例（比較圖11)抗體生產率及 GFP螢光之間的關聯性。此等細胞群係由以載體組合 pBID-HC及pBING-LC轉染CHO-DG44得到。將其經過連續 以GFP為基本的FACS篩分，選出具有最高GFP螢光的5%細 胞。在每次篩分步驟後以ELIS A決定細胞培養上層液中的 IgG2抗體之濃度並計算每細胞及每天的單位生產率（pg/細 胞*天）。各數據點代表於75平方公分瓶中進行的6個培養之 平均。 O:\89\89299.DOC -85- 1327166 序列表 <11〇>德商百靈佳殷格翰製藥公司 <12 0>新賴新黴素填酸轉移酶基因及選擇大量製造所需基因產物之重組 細胞之方法 <130> Case 1-1411 <140〉092133573 <141〉2003-11-28 <150> 10256081.1; 10330686.2 <151> 2002-11-29; 2003-07-08 <160> 55 <170> Patentln Ver. 3.1

<210> 1 <211> 795 <212> DNA <213>大腸桿菌 <400> 1 atgattgaac 60 ggctatgact 120 gcgcaggggc '180 caagacgagg 240 ctcgacgttg 300 gatctcctgt 360 cggcggctgc 420 atcgagcgag 480 gagcatcagg 540 ggcgaggatc 600 ggccgctttt 660 atagcgttgg 720 ctcgtgcttt 780 aagatggatt gggcacaaca gcccggttct cagcgcggct tcactgaagc catctcacct atacgcttga cacgtactcg ggctcgcgcc tcgtcgtgac ctggattcat ctacccgtga acggtatcgc gcacgcaggt gacaatcggc ttttgtcaag atcgtggctg gggaagggac tgctcctgcc tccggctacc gatggaagcc agccgaactg ccatggcgat cgactgtggc tattgctgaa cgctcccgat tctccggccg tgctctgatg accgacctgt gccacgacgg tggctgctat gagaaagtat tgcccattcg ggtcttgtcg ttcgccaggc gcctgcttgc cggctgggtg gagcttggcg tcgcagcgca cttgggtgga ccgccgtgtt ccggtgccct gcgttccttg tgggcgaagt ccatcatggc accaccaagc atcaggatga tcaaggcgag cgaatatcat tggcggaccg gcgaatgggc tcgccttcta gaggctattc ccggctgtca gaatgaactg cgcagctgtg gccggggcag tgatgcaatg gaaacatcgc tctggacgaa catgcccgac g^tggaaaat ctatcaggac tgaccgcttc tcgccttctt

O:\89\89299.DOC 1327166

gacgagttct tctga 795 <210> 2 <211> 264 <212> PRT <213>大腸桿菌 <400> 2

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 15 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser 20 25' 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 160

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp 工le Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Asp lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe 225 230 235 240 O:\89\89299.DOC -1· 1327166

Leu Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260 <210> 3 <211> 795 <212> DNA <213>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明：新黴素突變體E182G <400> 3 atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120 gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatg'aactg 180 caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240 ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa t480 gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac 540 ggcggggatc tcgtcgtgac ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat 600 ggccgctttt ctggattcat cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac 660 atagcgttgg ctacccgtga tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc 720 ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt 780 gacgagttct tctga 795 <210> 4 <211> 264 <212> PRT <213> 人造序列 <220>

<223>人造序列之說明·_新黴素突變體E182G

O:\89\89299.DOC 1327166 <400> 4

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 15 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser 20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 HO 、

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 160 ,Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala

165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Gly Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Asp 工le Al3 Glu Glu Leu Gly Gly Glu Tirp Ala Asp Arg Phe 225 230 235 ' 240

Leu Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260 <210> 5 O:\89\89299.DOC -4- 1327166 <211> 795 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：新徽素突變體W91A <400> 5 atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120 gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg 180

caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240 ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac gcgctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 ' atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa 480 gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac 540 ggcgaggatc tcgtcgtgac ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat 600 ggccgctttt ctggattcat cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac 660 atagcgttgg ctacccgtga tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc Π20

ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt 780 gacgagttct tctga 795 <210> 6 <211> 264

<212> PRT <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：新徽素突變體W91A <400> 6

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 15 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr 工le Gly Cys Ser 20 25 30

O:\89\89299.DOC 1327166

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala "Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Ala Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Glra Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp^Glu 145 150 155 ^160

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Asp lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe 225 230 235 240

Leu Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260

<210> Ί <211> 795 <212> DNA <213>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明··新黴素突變體V198G 55 O:\89\89299.DOC -6- 1327166 <400> 7 atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120 gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg 180 caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240 ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa 480 gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac 540 ggcgaggatc tcgtcgtgac ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat gggggaaaat 600 ggccgctttt ctggattcat cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatqaggac 660 atagcgttgg ctacccgtga tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc 720 ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt 780 gacgagttct tctga 795

<210> 8 t<211> 264 <212> PRT <213>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明：新黴素突變體V198G <400> 8

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 1 5 l〇 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser 20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 5〇 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

O:\89\S9299.DOC 1327166

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 160

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Gly Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala ‘ 210 215 220

Thr Arg Asp lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe 225 230 235 240

Leu Val Leu Tyi: Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Axg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260

<210> 9 <211> 795 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：新黴素突變體D227A <400> 9 atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120 gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg 180

O:\89\89299.DOC 1327166 caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240 ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa 480

gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac 540 ggcgaggatc tcgtcgtgac ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat 600 ggccgctttt ctggattcat cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac 660 atagcgttgg ctacccgtgc tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc 7.20 ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt 780

gacgagttct tctga 795 <210> 10 <211> 264 <212> PRT <213>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明：新黴素突變體D227A

<400> 10

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 1 5 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser 20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110 O:\89\89299.DOC -9- 1327166

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg He Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 160

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 l9〇

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Ala lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg、Phe 225 230 235 240

Leu Val Leu Tyr Gly He Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255 iyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260 <210> 11 K211> 795

<212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：新黴素突變體D227V <400> 11 atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120 gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg 180 caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240 ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 O:\89\89299.DOC -10- 1327166 atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa 480 gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac 540 ggcgaggatc tcgtcgtgac ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat 600 ggccgctttt ctggattcat cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac 660 atagcgttgg ctacccgtgt tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc 720 ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt 780

gacgagttct tctga 795 <210> 12 <211> 264 <212> PRT <213>人造序列 <220> 乂

<223>人造序列之說明：新黴素突變體D227V <400> 12

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 1 5 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser 20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 i6〇 O:\89\89299.DOC -11- 1327166

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Val lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe 225 230 235 240

Leu Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260

<210> 13 <211> 795 <212> DNA <2乜> 人造序列

<220> <223>人造序列之說明：新黴素突變體D261G »<400> 13

atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120 gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg 180 caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240 ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa 480 gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac 540 ggcgaggatc tcgtcgtgac ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat 600 ggccgctttt ctggattcat cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac 660 O:\89V89299.DOC -12- 1327166 atagcgttgg ctacccgtga tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc 720 ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt 780

ggcgagttct tctga 795 <210> 14 <211> 264 <212> PRT <2=L3>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明：新黴素突變體D261G <400> 14

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 1 5 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys <jSer 20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg He Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 160

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190 55 Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp O:\89\89299.DOC -13- 1327166 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Asp lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe 225 230 235 240

Leu Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Gly Glu Phe Phe 260

15 795 DNA

人造序列 <210> <211> <212> <213> <220>

<223>人造序列之說明：新黴素突變體D261N <400> 15 atgattgaac 60' ggctatgact 120 gcgcaggggc 180 caagacgagg ^240 ctcgacgttg 300 gatctcctgt 360 cggcggctgc 420 atcgagcgag 480 gagcatcagg 540 ggcgaggatc 600 ggccgctttt 660 atagcgttgg 720 ctcgtgcttt 780 aacgagttct 795 aagatggatt gggcacaaca gcccggttct cagcgcggct tcactgaagc catctcacct atacgcttga cacgtactcg ggctcgcgcc tcgtcgtgac ctggattcat ctacccgtga acggtatcgc tctga gcacgcaggt gacaatcggc ttttgtcaag atcgtggctg gggaagggac tgctcctgcc tccggctacc gatggaagcc agccgaactg ccatggcgat cgactgtggc tattgctgaa cgctcccgat tctccggccg tgctctgatg accgacctgt gccacgacgg tggctgctat gagaaagtat tgcccattcg ggtcttgtcg ttcgccaggc gcctgcttgc cggctgggtg gagcttggcg tcgcagcgca cttgggtgga ccgccgtgtt ccggtgccct gcgttccttg tgggcgaagt ccatcatggc accaccaagc atcaggatga tcaaggcgag cgaatatcat tggcggaccg gcgaatgggc tcgccttcta gaggctattc ccggctgtca gaatgaactg cgcagctgtg gccggggcag tgatgcaatg gaaacatcgc tctggacgaa catgcccgac ggtggaaaat ctatcaggac tgaccgcttc tcgccttctt

O:\89\89299.DOC 14· 1327166 <210> 16 <211> 264 <212> PRT <213>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明：新黴素突變體D261N <400> 16

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 1 5 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser

20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 5〇 55 60 义.

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 1 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg He Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 160

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205 *

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Asp lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asid Arg Phe 225 230 235 * 240 O:\89\89299-DOC -15- 1327166

Leu Val Leu Tyr Gly He Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asn Glu Phe Phe 260

<210> 17 <211> 795 <212> DNA <213>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明：新黴素突變體F240I <400> 17 atgattgaac aagatggatt 60 ggctatgact gggcacaaca 120 gcgcaggggc gcccggttct 180 caagacgagg cagcgcggct 240 ctcgacgttg tcactgaagc 300 gatctcctgt catctcacct 360 cggcggctgc atacgcttga 420 atcgagcgag cacgtactcg ^480 gagcatcagg ggctcgcgcc 540 ggcgaggatc tcgtcgtgac 600 ggccgctttt ctggattcat 660 atagcgttgg ctacccgtga 720 ctcgtgcttt acggtatcgc 780 gacgagttct tctga 795 gcacgcaggt tctccggccg gacaatcggc tgctctgatg ttttgtcaag accgacctgt atcgtggctg gccacgacgg gggaagggac tggctgctat tgctcctgcc gagaaagtat tccggctacc tgcccattcg gatggaagcc ggtcttgtcg agccgaactg ttcgccaggc ccatggcgat gcctgcttgc cgactgtggc cggctgggtg tattgctgaa gagcttggcg cgctcccgat tcgcagcgca cttgggtgga gaggctattc ccgccgtgtt ccggctgtca ccggtgccct gaatgaactg gcgttccttg cgcagctgtg tgggcgaagt gccggggcag ccatcatggc tgatgcaatg accaccaagc gaaacatcgc atcaggatga tctggacgaa tcaaggcgag catgcccgac cgaatatcat ggtggaaaat tggcggaccg ctatcaggac gcgaatgggc tgaccgcatc tcgccttcta tcgccttctt

<210> 18 <211> 264 <212> PRT <2is>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明··新黴素突變體F24〇I O:\89\89299.DOC -16- 1327166 <400> 18

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 15 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser 20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110 、

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 160 ^Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala

165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Asp lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg lie 225 230 235 240

Leu Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260 O:\89\89299.DOC 17· 1327166

<210> 19 <211> 795 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：新黴素突變體E182D <400> 19 atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120

gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg 180 caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240 ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 、 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 480 gagcatcagg ggctcgcgcc 540 atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa

ggcgatgatc 600 ggccgctttt 660 latagcgttgg 720 ctcgtgcttt 780 gacgagttct 795 tcgtcgtgac ctggattcat ctacccgtga acggtatcgc tctga agccgaactg ccatggcgat cgactgtggc tattgctgaa cgctcccgat ttcgccaggc gcctgcttgc cggctgggtg gagcttggcg tcgcagcgca tcaaggcgag cgaatatcat tggcggaccg gcgaatgggc tcgc.cttcta catgcccgac g^tggaaaat ctatcaggac tgaccgcttc tcgccttctt

<210> 20 <211> 264 <212> PRT <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：新黴素突變體E182D <400> 20

Met 工le Glu Gin Asp Gly Lea His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 1 5 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser 20 * 25 30 O:\89\i9299.DOC -18- 1327166

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 160

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Asp Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 1 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Asp lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe 225 230 235 240

Leu Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg 工le Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260

<210> 21 <211> 795 <212> DNA <213>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明：新徽素突變體D227G 0:噴 9299.DOC -19- 1327166 <400> 21 atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120 gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg 180 caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240

ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa 480 gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac 540 ggcgaggatc tcgtcgtgac ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat 600 ggccgctttt ctggattcat cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac 660 atagcgttgg ctacccgtgg tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc 720 ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt 780 gacgagttct tctga 795

k210> 22 <211> 264 <212> PRT <213> 人造序列 <220>

<223>人造序列之說明··新黴素突變體D227G <400> 22

Met 工le Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 1,5 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser 20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val O:\89\89299.DOC -20- 1327166 65 7 0 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 ' 155 160

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190 ^

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp 工le Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Gly lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe 225 230 235 240 iLeia Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe

245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260

<210> 23 <211> 795 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：新黴素突變體D190G <400> 23 atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120 gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg 180 O:\89\89299.DOC •21 - 1327166 caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240 ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa 480 gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac 540 ggcgaggatc tcgtcgtgac ccatggcggt gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat 600

ggccgctttt ctggattcat cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac 660 atagcgttgg ctacccgtga tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc 720 ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt 780 gacgagttct tctga 795 .、

<210> 24 <211> 264 <212> PRT <2l3>人造序列 <220>

<223>人造序列之說明：新黴素突變體D190G

<400> 24

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 1 5 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr He Gly Cys Ser 20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110 O:\89\89299.DOC 22- 1327166

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 160

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Gly Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Asp 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 210 215 220

Thr Arg Asp lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg^Phe 225 230 235 240

Leu Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260

<210> 25 t<211> 795 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：新黴素突變體D208G <400> 25 atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc 60 ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca 120 gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg 180 caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg 240 ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag 300 gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg 360 cggcggctgc atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc 420 O:\89\89299.DOC -23- 1327166 atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa 480 gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac 540 ggcgaggatc tcgtcgtgac ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat 600 ggccgctttt ctggattcat cggctgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac 660 atagcgttgg ctacccgtga tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc 720 ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt 780

gacgagttct tctga 795 <210> 26 <211> 264 <212> PRT <213>人造序列 <2 2 0 > s.

<223>人造序列之說明：新黴素突變體D208G <400> 26

Met lie Glu Gin Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val 15 10 15

Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp Ala Gin Gin Thr lie Gly Cys Ser 20 25 30

Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser Ala Gin Gly Arg Pro Val Leu Phe 35 40 45

Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gin Asp Glu Ala 50 55 60

Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val 65 70 75 80

Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu 85 90 95

Val Pro Gly Gin Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys 100 105 110

Val Ser lie Met Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro 115 120 125

Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gin Ala Lys His Arg lie Glu Arg Ala 130 135 140

Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu Val Asp Gin Asp Asp Leu Asp Glu 145 150 155 * 160 O:\89W9299.DOC -24- 1327166

Glu His Gin Gly Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala 165 170 175

Ser Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys 180 185 190

Leu Pro Asn lie Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe lie Gly 195 200 205

Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gin Asp lie Ala Leu Ala 21〇 215 220

Thr Axg Asp lie Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe 225 230 235 240

Leu Val Leu Tyr Gly lie Ala Ala Pro Asp Ser Gin Arg lie Ala Phe 245 250 255

Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 260

<210> 27 <211> 21 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸Neofor5 ,<400> 27 ttccagaagt agtgaggagg c 21

<210> 28 <2il> 19 <212> DNA <213>人造序列 <220> :寡核苷酸Neorev5 <223>人造序列之說明 <400> 28 atggcaggtt gggcgtcgc 人造序列 <210> 29 <211> 21 <2I2> DNA <213> O:\S9\89299.DOC -25· 19 1327166 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸Neofor2 <400> 29 gaactgttcg ccaggctcaa g 21

<210> 30 <211> 22 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明··寡核苷酸IC49 <400> 30 cggcaaaatc ccttataaat ca 22

<210> 31 <211> 20 <212> DNA <2工3>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸E182Gfor <400> 31 gacggcgggg atctcgtcgt <210> 32 <211> 20 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸E182Grev <400> 32 acgacgagat ccccgccgtc 20 <210> 33

<211> 23 <212> DNA <213>人造序列 〇:\89\S9299.tX)C -26- 1327166 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸W91Afor <400> 33 gggsagggac gcgctgctat tgg 23

<210> 34 <211> 23 <212> DNA <2工3>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸W91Arev <400> 34 ccaatagcag cgcgtccctt ccc 23

<210> 35 <211> 24 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸V198Gfor <400> 35 ccgaatatca tgggggaaaa tggc 24

<210> 36 <211> 24 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸V198Grev <400> 36 gccattttcc cccatgatat tcgg

<210> 37 <211> 21 <212> DNA O:\89V89299.DOC -27- 24 1327166 <213>人造序列 <220> <223>&造序列之說明：寡核苷酸D227Afor <400> 37 ctacccgtgc tattgctgaa g 21

<210> 38 <211> 21 <212> DNA <213>人造序列 寡核苷酸D227Arev <220> <223>人造序列之說明： <400> 38 cttcagcaat agcacgggta g 21

<210> 39 <211> 21 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸D227Vfor <400> 39 ctacccgtgt tattgctgaa g 21

<210> 40 <211> 21 <212> DNA 人造序列 <220> <223>人造序列之說明··寡核苷酸D227rev <400> 40 cttcagcaat aacacgggta g <210> 41 <211> 24 O:\89\89299.DOC 28- 21 1327166

<212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸D261Gfor <400> 41 gccttcttgg cgagttcttc tgag 24

<210> 42 <211> 24 <212> DNA <2工3>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸D261Grev <400> 42 ctcagaagaa ctcgccaaga aggc 24

<210> 43 <211> 24 <212> DNA <213>人造序列 <220> t<223>人造序列之說明：寡核苷酸D261Nfor <400> 43 gccttcttaa cgagttcttc tgag 24 <210> 44 <211> 24 <212> DNA < 213 >人造序列 <220> <223>人造序列之說明··寡核苷酸D261Nrev <400> 44 ctcagaagaa ctcgttaaga aggc <210> 45 O:\89\89299.DOC •29- 24 1327166

<211> 22 <212> DNA <2U>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸F240Ifor <400> 45 ggctgaccgc atcctcgtgc tt 22

<210> 46 <211> 22 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸F240Irev <400> 46 aagcacgagg atgcggtcag cc 22

<210> 47 <211> 20 <212> DNA <213>人造序列 <220> ‘<223>人造序列之說明：寡核苷酸E182Dfor <400> 47 gacggcgatg atctcgtcgt 20

<210> 48 <211> 20 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸E182Drev <400> 48 acgacgagat catcgccgtc 20 O:\E9\89299.DOC -30- 1327166

<210> 49 <211> 19 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸D190Gfor <400> 49 catggcggtg cctgcttgc 19 <210> 50 <211> 19 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸D19〇Grev <400> 50 gcaagcaggc accgccatg 19

<210> 51 <211> 19 <212> DNA <213>人造序列 '<220> <223>人造序列之說明··寡核苷酸D2〇8Gfor <400> 51

gattcatcgg ctgtggccg 19 <210> 52 <211> 19 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸D2〇8Grev <400> 52 cggccacagc cgatgaatc 19 O:\89\S9299.DOC •31 - 1327166

<210> 53 <211> 21 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸D227Gf〇r <400> 53 ctacccgtgg tattgctgaa g 21

<210> 54 <211> 21 <212> DNA <213>人造序列 <220> <223>人造序列之說明：寡核苷酸D227Grev <400> 54 cttcagcaat accacgggta g 21,

<210> 55 <211> 2406 <212> DNA <213>中國倉鼠 <300> <310> PCT/EP/96/04631 <311> 1996-10-24 <312> 1997-05-01 <400> 55 gatctccagg acagccatgg ctattacaca gagaaaccct gtctggaaaa acaaaaaatt 60 agtgtccatg tgtaaatgtg tggagtatgc ttgtcatgcc acatacagag gtagagggca 120 gtttatggga gtcagttcct attcttcctt tatgggggac ctggggactg aactcaggtc 180 atcaggcttg gcagaaagtg cattagctca cggagcctta tcattggcga aagctctctc 240 aagtagaaaa tcaatgtgtt tgctcatagt gcaatcatta tgtttcgaga ggggaagggt 300 acaatcgttg gggcatgtgt ggtcacatct gaatagcagt agctccctag gagaattcca 360 agttctttgg tggtgtatca atgcccttaa aggggtcaac aacttttttt ccctctgaca 420 O:\89\89299.DOC 32- 1327166 aaactatctt cttatgtcct 480 aatatcaatt ctagcacctc 540 tttaatttaa ctaatttaac 600 gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt 660 gcgcgcgcgc gcgctcggat 720 ggtgcactgt gaaagtctga 780 aactccaggt gtcaactctt 840 tttttattta tttatttttt 900 cctggaacta gctcttgtag 960 ctcctgagtg ctgggattaa 1020 agagattgtg tgtcacaagg 1080 aaaaaaaaaa acttcactga 1140 agctctaggg agtctcctgt 1200 ggggttacaa cacaggtttt 1260 aatgtgtatt ttggaggcag 1320 ttattaggaa gataagcatc 1380 tgtccctcat atttgaagta agacatgtta ggtaagtacc cccaacactt tttctttgtt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt cattctacct tttgtttaaa gggtaacttg ctggggtcag tactgacaga accatccaaa gtttttcgag acagggtttc accaggctgg tctcgaactc aggcatgcgc caccaacgct gtgtcatgtc gccctgcaac agctgaagca cgatgatttg caaacagaat ctcaacaggc tgcatatcag gcattttatc c agagc t aat aga 11aaaa t ttctttatat aaaacaaaac ttttattctt tgcagtgttg ctacaactca ggttaactaa tatccacatt tgtggagtgt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgc aaatgttagt ccaggggtgg ttctttccac tataggacag tagccctatc taattttagt tctgtggctt tggaggctgt agagatccac ctgcctctgc tggctctacc taattttaaa cacccccccc ccaaaaaaaa gttactctgg ctggccaatg gcagcagtct tttttaaagt taagctattt cccagccaaa cccacacagg caaaccaaac tggaggaggt

ctacctttag ggatggaaga aaagacattt 1440 gtgaggtgga ggactgggag agggcgcaac* 1500 tggggacagc acatgttcct atttttccca 1560 gtcgaggact acagtcattt tgcaggtttc 1620 gtgaccatta accgtttcac gctgggaggg 1680 agggccagga gggggctaca cggaagaggc 1740 gcttcagctg gctgagacgc cccagcaggc 1800 ttccggccca taacccttcc cttctaggca 1860 cattcggccc catcccccgg tcctcacctg 1920 actataacca gatagcccgg atgtgtggaa 1980 aagaaagcga cgaaaaacta caattcccag 2040 agagggtgca atagaaaggg cactgagttt cgctttaact gtcctgtttt gcctattttt ggatgggcaa tctccacgtc caaacttgcg cttactgtat ggcttttaaa acgtgcaaag cacgtgcggc tcagatgctt cctctgactg cacacccgca cttgggaaga ctcgatttgg tcctcggcta caccttcagc cccgaatgcc tttccggcga ggacccaccc tcgcgccaaa aatctctaac tctgactcca gagtttagag ctgcatcttg ggacgagtag ttttagcaaa acagacttgt gttacctctc ttctcatgct

O:\89\89299.DOC -33- 1327166 aaacaagccc cctttaaagg aaagcccctc ttagtcgcat' cgactgtgta agaaaggcgt 2100 ttgaaacatt ttaatgttgg gcacaccgtt tcgaggaccg aaatgagaaa gagcataggg 2160 aaacggagcg cccgagctag tctggcactg cgttagacag ccgcggtcgt tgcagcgggc 2220 aggcacttgc gtggacgcct aaggggcggg tctttcggcc gggaagcccc gttggtccgc 2280 gcggctcttc ctttccgatc cgccatccgt ggtgagtgtg tgctgcgggc tgccgctccg 2340 gcttggggct tcccgcgtcg ctctcaccct ggtcggcggc tctaatccgt ctcttttcga 2400 atgtag 2406

O:\S9\89299.DOC 34·

Claims (1)

1. ij)92133573號專利申請案 I32716< ??年午月本: & 申請專利範圍替換本(99年4月） 口 ‘ 4申請專利範圍： 一種經改質新黴素磷酸轉移酶基因，其特徵為該經改質 新黴素磷酸轉移酶基因在關聯於野生型基因之胺基酸位 置91、198及/或240處編碼與野生型新黴素磷酸轉移酶基 因不同的胺基酸。 2.根據申請專利範圍第i項之經改質新黴素磷酸轉移酶基 因，其特徵為由該新黴素磷酸轉移酶基因編碼的經改質 新黴素鱗酸轉移酶具有比野生型新黴素磷酸轉移酶低的 酵素活性。 3 _根據申請專利範圍第丨或2項之經改質的新黴素磷酸轉移 基因，其特徵為與野生型基因比較，該經改質新黴素 鱗酸轉移酶基因在關聯於野生型基因之胺基酸位置91處 編碼丙胺酸’在胺基酸位置19 8處編碼甘胺酸，及/或在胺 基酸位置240處編碼異白胺酸。 4. 根據申請專利範圍第丨或2項之經改質新黴素磷酸轉移酶 基因’其特徵為該經改質新黴素填酸轉移酶基因編碼具 有根據 SEQ ID NO : 6、SEQ ID NO : 8或 SEQ ID NO : 18 之胺基酸序列之多肽。 5. 根據申請專利範圍第1或2項之經改質新黴素磷酸轉移酶 基因’其包含或由根據SEQIDNO: 5、SEQID NO : 7或 SEQ ID NO : 17之序列組成。 6_ 一種經改質新黴素磷酸轉移酶基因，其特徵為與野生型 基因比較’該經改質的新黴素磷酸轉移酶基因在關聯於 野生型基因之胺基酸位置182處編碼丙胺酸，在胺基酸位 89299-990415.doc 置227處編碼丙胺酸或頡胺酸及/或在胺基酸位置mi處甘 胺酸。 7·根據申請專利範圍第6項之經改質新黴素磷酸轉移酶基 因，其特徵為該經改質新黴素磷酸轉移酶基因編碼具有 根據 SEQ ID NO : 4、SEQ ID NO : 10、SEQ ID NO : 12 或SEQ ID NO: 14之胺基酸序列之多肽。 8.根據申請專利範圍第6或7項之經改質新黴素磷酸轉移酶 基因，其包含或由根據SEQ ID N〇 : 3、SEQ ID N〇 : 9、 SEQ ID NO : 11或 SEq ID N〇 : 13之序列組成。 9_ 一種經改質新黴素磷酸轉移酶，其係由根據申請專利範 圍第1至8項中任一項之經改質新黴素磷酸轉移酶基因所 編碼。 —種真核表現載體，其包含根據申請專利範圍第丨至8項 中任項之經改質新黴素峨酸轉移酶基因。 11. 一種真核表現載體，其包含功能上連接至異源啟動子之 異源所需基因及編碼與野生型新黴素磷酸轉移酶比較具 有較低酵素活性之新黴素磷酸轉移酶之根據申請專利範 圍第1至8項中任一項之經改質新黴素磷酸轉移酶基因。 12·根據申請專利範圍第11項之表現載體，其特徵為該經改 質新黴素磷酸轉移酶基因編碼具有根據SEQ ID NO : 4、 SEQ ID NO : 6、SEQ ID NO : 8、SEQ ID NO : 1〇 ' SEQ ID N0 . 12、SEQ ID NO : 14 或 SEQ ID NO : 18 之胺基酸序 列之蛋白質。 13·根據申請專利範圍第11或12項之表現載體，其特徵為包 89299-990415.doc 1327166 3功自b上連接至啟動子之一或多個促進子。 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 根據申請專利範圍第13項之表現載體，其特徵為該促進 子為CMV或SV40促進子。 根據申請專利範圍第11或12項之表現載體’其特徵為包 3层取泛激素/S27a啟動子。 根據申請專利範圍第15項之表現載體，其特徵為該異源 所需基因係於泛激素/S27a啟動子的控制下。 根據申請專利範圍第U或12項之表現載體，其特徵為另 外包含螢光蛋自質的基目’其係、視情況功能上連接至所 需基因及異源啟動子。 根據申請專利範圍第17項之表現載體’其特徵為另外包 3内核醣體進入處（IRES，internal rib〇s〇mal， 其使得編碼螢光蛋白質的基因及編碼所需蛋白質/產物的 基因於異源啟動子的控制下可雙基因表現。 根據申請專利範圍第17項之表現載體，其特徵為編碼螢 光蛋白質的基因及經改質新黴素磷酸轉移酶基因位於一 個或兩個分開的轉錄單元中。 種哺乳類細胞，其包含根據申請專利範圍第丨至8項中 任一項之經改質新黴素磷酸轉移酶基因。 一種哺乳類細胞，其係經根據申請專利範圍第1〇至16項 中任一項之表現載體轉染。 一種哺乳類細胞，其係經根據申請專利範圍第17至19項 中任一項之表現載體轉染。 根據申請專利範圍第20至22項中任一項之哺乳類細胞， 89299-990415.doc 1327166 ' 其特徵為另外以可放大可選擇標記之基因轉染。 ,24.根據申請專利範圍第23項之哺乳類細胞，其特徵為該可 放大"T選擇標記之基因為二氫葉酸還原酶（Djjfr dihydrofolate reductase)。 25. 根據申請專利範圍第2〇至22項中任一項之哺乳類細胞， 其特徵為該哺乳類細胞為齧齒目動物細胞。 26. 根據申請專利範圍第25項之哺乳類細胞，其特徵為該齧 齒目動物細胞為CHO或BHK細胞。 # 27· —種增加哺乳類細胞的方法，其特徵為 (i)將哺乳類細胞群以根據申請專利範圍第丨至8項中任 一項之經改質新黴素磷酸轉移酶基因轉染； (H)將喷乳類細胞於允許表現該經改質新黴素碟酸轉 移酶基因的條件下培養；及 (出）將哺乳類細胞於至少一種選擇劑存在下培養，其選 擇性作用於哺乳類細胞的生長，並給予該表現經改質新 黴素鱗酸轉移酶基因的細胞生長優勢。 • 28· —種得到及選擇表現至少一種異源所需基因之哺乳類細 胞的方法，其特徵為 ⑴將哺乳類細胞群以至少一種所需基因及根據申請專 利範圍第1至8項中任一項之經改質新黴素磷酸轉移^基 因轉染； (Π)將哺乳類細胞於允許表現所需基因及該經改質新 黴素磷酸轉移酶基因的條件下培養；及 (iii)將哺乳類細胞於至少一種選擇劑存在下讲養，其驾 89299-990415.doc 1327166 擇性作用於哺乳類細胞的生長，並給予表現該經改質新 黴素碟酸轉移酶基因的細胞生長優勢。 29. 根據申請專利範圍第28項之方法，其特徵為將喷乳類細 胞另外以可放大可選擇標記之基因轉染，將選擇的哺乳 類細胞經過至少一次基因放大步驟。 30. 根據申請專利範圍第29項之方法，其特徵為該可放大可 選擇標記之基因為DHFR及該基因放大步驟藉加入甲氣 D業呤而實施。 31 · —種得到及選擇表現至少一種異源所需基因之哺乳類細 胞的方法’其特徵為 ⑴將重組哺乳類細胞以根據申請專利範圍第以至^項 中任一項之表現載體轉化； (ii) 將細胞於允許表現所需基因、編碼螢光蛋白質的基 因、及經改質新黴素磷酸轉移酶基因的條件下培養丨土 (iii) 將哺乳類細胞於至少一種選擇劑存在下培養，其選 擇性作用於哺乳類細胞的生長，並給予表現經該改質新 Μ素麟酸轉移酶基因的細胞生長優勢；及 (iv) 藉流式細胞儀分析（fl〇w cyt〇metric anaiysis)將哺 乳類細胞篩分。 32. 根據申請專利範圍第31項之方法，其特徵為將哺乳類細 胞另外以可放大可選擇標記之基因轉染並將由流式細胞 儀分析篩分的細胞經過至少一次基因放大步驟。 33. 根據申請專利範圍第32項之方法，其特徵為該可放大可 選擇標記之基因為DHFR及該基因放大步驟藉加入甲氨 89299-990415.doc 嗓吟而實施。 3 4. —種於重組哺乳類細胞中產生至少一種所需蛋白質的方 法’其特徵為 、 ⑴將-群哺乳類細胞以至少一種所需基因及根據申請 專利範圍第1至8項中任-項之經改質新徵素碟酸轉移酶 基因轉染； (ϋ)將細胞於允許表現所需基因及該經改質新黴素磷 酸轉移酶基因的條件下培養； (iii) 將哺乳類細胞於至少一種選擇劑存在下培養，其選 擇性作用於哺乳類細胞的生長，並給予表現該經改質的 新黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長優勢；及 (iv) 自哺乳類細胞或自培養上層液得到所需蛋白質。 3 5. —種於重組哺乳類細胞中產生至少一種所需蛋白質的方· 法，其特徵為 (1)將重組哺乳類細胞以根據申請專利範圍第丨7至i 9 項中任一項之表現載體轉化； (Π)將細胞於允許表現所需基因、編碼螢光蛋白質的基 因及經改質新黴素磷酸轉移酶基因的條件下培養； (iii) 將哺乳類細胞於至少一種選擇劑存在下培養，其選 擇性作用於哺乳類細胞的生長，並給予表現該經改質新 黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長優勢；及 (iv) lt 流式細胞儀分析（flow cytometric analysis)將 0薄 乳類細胞筛分 (v) 自哺乳類細胞或自培養上層液得到所需蛋白質。 89299-990415.doc 1327166 36. —種產生至少一種所需蛋白質的方法，其特徵為 ⑴將根據申請專利範圍第23或24項中任—項之哺乳類 細胞於允許表現所需基因、經改質新黴素磷酸 因及可放大可選擇標記之基因的條件下培養； 土 (ii)將哺乳類細胞於至少一種選擇劑存在下培養，其選 擇性作用於哺乳類細胞的生長，並給予表現該經改質新 黴素磷酸轉移酶基因的細胞生長優勢； (111)將選擇的哺乳類細胞經過至少一次基因放大步 驟；及 (iv)隨後自哺乳類細胞或自培養上層液得到所需蛋白 質。 而 37.根據申請專利範圍第34至36 項Y仕項之方法，其特徵 為將哺乳類細胞以編碼雜聚蛋白質/產物之至少兩種所需 基因轉染，及 ⑴將細胞於允許表現雜聚蛋白質/產物之次單元的條 件下培養；及 ~ (^)自培養物或培養液分離雜聚蛋白質/產物。 ，其特徵 Pg理想 38. 根據申請專利範圍第34至36項中任一項之方法 為篩選的哺乳類細胞呈現平均單位生產量多於 基因產物/天/細胞。 39. 根據申請專利範圍第36項之方法，其特徵為篩選的宿主 細胞呈現平均單位生產量多於2〇 pg理想基因產物/天/細 胞。 4〇·根據申請專利範圍第27至36項中任一項之方法其特徵 89299-990415.doc 1327166 為該哺乳類細胞為齧齒目動物細胞。 41 ·根據申請專利範圍第40項之方法，其特徵為該齧齒目動 物細胞為CHO或BHK細胞。 其特徵

   42·根據申請專利範圍第27至36項中任一項之方法 為將哺乳類細胞於懸浮培養_培養。 43.根據申請專利範圍第27至36項中任一項之方法 為將哺乳類細胞無血清培養。

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