TW202413409A - 多域結合分子 - Google Patents
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Abstract
本發明係關於多域單鏈結合分子。該等分子包含i)肽-主要組織相容性複合物(pMHC)結合域,其結合SLLQHLIGL(SEQ ID NO: 1)HLA-A*02複合物,該pMHC域包含連接至恆定區之第一可變區(VC1)及連接至恆定區之第二可變區(VC2);ii)T細胞接合免疫效應子域,其包含抗體輕鏈可變區(TCE-VL)及抗體重鏈可變區(TCE-VH);及iii)半衰期延長域,其包含第一IgG Fc區(FC1)及第二IgG Fc區(FC2),其中該FC1區與該FC2區二聚形成Fc域。該等結合分子可用於治療諸如癌症之疾病。
Description
本申請案係關於多域單鏈結合分子及相關核酸、表現載體、宿主細胞、製備方法、醫藥組成物及用途。
序列表
本申請案含有序列表,其以全文引用之方式併入本文中。該XML複本創建於2023年8月2日,命名為P211284WO ST.26.xml序列表且大小為51594位元組。
包括抗體片段及融合蛋白之多種基於蛋白質之治療劑在投予後會迅速從體內清除。其短循環半衰期係通常歸因於其尺寸較小,此允許經由腎過濾而有效清除,以及缺乏針對細胞內降解之保護。在此類情況下,需要頻繁投予或長時間輸注來在較長時段內維持藥物之有效濃度。為改良給藥,已採用若干策略來延長循環半衰期。此等策略包括經由連接可撓性親水性分子,諸如碳水化合物或聚乙二醇(polyethelene glycol;PEG)來增加蛋白質之流體動力學半徑,及經由連接抗體Fc域或血清白蛋白來利用經由新生兒Fc受體(neonatal Fc receptor;FcRn)進行之再循環(Konnteman, Curr Opin Biotechnol. 2011年12月;22(6):868-76)。
利用FcRn介導之再循環的策略由於活體內誘導免疫原性之風險較低及可實現之較長半衰期延長而尤其具有吸引力。舉例而言,據報告,在連接Fc域之後,BiTE®形式之T細胞接合雙特異性抗體之半衰期超過200小時(Lorenczewski等人,Blood 2017. 130(增刊1), 2815)。類似地,據報告,合併有白蛋白結合域之TriTac®形式之雙特異性抗體具有超過四天之半衰期(Wesche等人,Cancer Res 2018;78(13增刊):摘要nr 3814)。
包含融合至抗CD3抗體片段之可溶性T細胞受體(T cell receptor;TCR)之融合蛋白為相對較新類別之T細胞接合雙特異性融合蛋白,其活體內半衰期在6至8小時範圍內(Sato等人,2018 J Clin Onc 2018 36, 第15期, 增刊9521-9521;Middleton等人,J Clin Onc 2016 34, 第15期, 增刊3016-3016)。此遠短於傳統單株抗體,傳統單株抗體通常具有在260至720小時範圍內之半衰期(Ovacik及Lin, 2018 Clin Transl Sci, 11:540)。此外,TCR-抗CD3融合蛋白已展現包括皮莫耳效能之有利治療特性(Lowe等人,2019 Cancer treatment reviews, 第77卷35-43)。因此,需要鑑別適用於延長TCR-抗CD3融合蛋白及其他含TCR蛋白之半衰期的方法,以便降低給藥頻率且在較長時段內維持有效濃度,而不影響其他治療特性。
不同於傳統抗體,TCR經設計以識別源自細胞內抗原且藉由人類白血球抗原(human leukocyte antigen)呈現於細胞表面上之短肽(肽-HLA)。抗原呈現細胞上之肽-HLA複合物與T細胞之間的有效免疫突觸形成依賴於平衡之能量足跡(energetic footprint),包括交互作用幾何結構,其可被膜間距離增加干擾(Choudhuri等人,2005 Nature 7月28日;436(7050):578-82;Holland等人,J Clin Invest. 2020;130(5):2673-2688)。因此,增加含TCR蛋白之半衰期的融合方法,諸如連接抗體Fc域或血清白蛋白,由於干擾TCR結合所需之交互作用幾何結構的風險而具有高度挑戰性。類似挑戰亦適用於含有與肽-HLA複合物結合之抗體的融合蛋白,該等抗體被稱為TCR樣或TCR模擬抗體。
WO 2020/157211描述一種藉由使TCR-抗CD3融合蛋白融合至免疫球蛋白Fc域或白蛋白結合域而延長其半衰期之方法。然而,此類多域結合分子為大型且複雜的蛋白質,因此存在多種可能的形式,亦即各域(及各域中之各區)在一或多個多肽鏈上之位置及位向的可能組合。分子中各域(及其區)之位置及位向以及所存在的多肽鏈之數目可影響結合分子之特徵,諸如活性、半衰期及可製造性。因此,仍需要鑑別此類多域結合分子之有利形式。
本發明大體上係關於多域結合分子。本發明尤其係關於包含以下之多域結合分子:i)肽-主要組織相容性複合物(peptide-major histocompatibility complex;pMHC)結合域,其結合SLLQHLIGL(SEQ ID NO: 1)HLA-A*02複合物,該pMHC結合域包含連接至恆定區之第一可變區(VC1)及連接至恆定區之第二可變區(VC2);ii)T細胞接合(T cell engaging)免疫效應子域,其包含抗體輕鏈可變區(TCE-VL)及抗體重鏈可變區(TCE-VH);及iii)半衰期延長域,其包含第一IgG Fc區(FC1)及第二IgG Fc區(FC2),其中該FC1區與該FC2區二聚形成Fc域。該等結合分子可用於治療諸如癌症之疾病。
本發明人測試了超過35種不同形式(亦即多肽中之各域之位向及位置)之包含pMHC結合域、T細胞接合免疫效應子域及半衰期延長域之多域結合分子。藉此,發現在許多形式中,使TCR-抗CD3融合蛋白與Fc域融合引起試管內效能實質上損失。然而,本發明人意外地鑑別出可表現為單一多肽鏈,具有顯著增強的半衰期,且保持原始分子之高效能的此類分子之形式。
在第一態樣中,提供一種多域單鏈結合分子,其包含:
i)肽-主要組織相容性複合物(pMHC)結合域,其結合SLLQHLIGL(SEQ ID NO: 1)HLA-A*02複合物,該pMHC結合域包含連接至恆定區之第一可變區(VC1)及連接至恆定區之第二可變區(VC2),其中VC1與VC2二聚形成該pMHC結合域;
ii)T細胞接合免疫效應子域,其包含抗體輕鏈可變區(TCE-VL)及抗體重鏈可變區(TCE-VH);及
iii)半衰期延長域,其包含第一IgG Fc區(FC1)及第二IgG Fc區(FC2),其中該FC1區與該FC2區二聚形成Fc域;
其中該T細胞接合免疫效應子域連接至VC1之N端,VC1經由其C端連接至該FC1區之N端,該FC1區經由其C端連接至VC2之N端,且VC2經由其C端連接至該FC2區之N端;及
其中該pMHC結合域及該T細胞接合免疫效應子域分別能夠結合pMHC複合物及T細胞。
在另一態樣中,提供一種多域單鏈結合分子,其包含:
i)可溶性TCR,其包含連接至恆定區之第一可變區(VC1)及連接至恆定區之第二可變區(VC2),其中VC1包含具有SEQ ID NO: 16中所提供之胺基酸序列或與其至少90%、至少95%或至少98%一致之序列的TCRβ可變區及恆定區,且VC2包含具有SEQ ID NO: 14中提供之胺基酸序列或與其至少90%、至少95%或至少98%一致之序列的TCRα可變區及恆定區;
ii)抗CD3 scFv,其包含具有SEQ ID NO: 31中提供之胺基酸序列或與其至少90%、至少95%或至少98%一致之序列的抗體輕鏈可變區(TCE-VL),及具有SEQ ID NO: 32中提供之胺基酸序列或與其至少90%、至少95%或至少98%一致之序列的抗體重鏈可變區(TCE-VH);及
iii)半衰期延長域,其包含具有SEQ ID NO: 42中所提供之胺基酸序列或與其至少90%、至少95%或至少98%一致之序列的第一IgG Fc區(FC1),及具有SEQ ID NO: 43中所提供之胺基酸序列或與其至少90%、至少95%或至少98%一致之序列的第二IgG Fc區(FC2),其中該FC1區與該FC2區二聚形成Fc域;
其中該T細胞接合免疫效應子域連接至VC1之N端,VC1經由其C端連接至該FC1區之N端,該FC1區經由其C端連接至VC2之N端,且VC2經由其C端連接至該FC2區之N端;及
其中該pMHC結合域及該T細胞接合免疫效應子域分別能夠結合pMHC複合物及T細胞。
在另一態樣中,提供一種包含SEQ ID NO: 45中所提供之胺基酸序列之多域單鏈結合分子。
在又一態樣中,提供一種編碼多域結合分子之核酸。亦提供一種表現載體,其包含此態樣之核酸。另外,提供一種宿主細胞,其包含此態樣之核酸或載體。
在另一態樣中,亦提供一種製造多域結合分子之方法,其包含將上述宿主細胞維持於最佳條件下,該等最佳條件係用於表現核酸的最佳條件,且分離該多域結合分子。
在另一態樣中,提供一種包含多域結合分子之醫藥組成物。
以上態樣中之任一者之多域結合分子、核酸、載體、宿主細胞或醫藥組成物可用於治療諸如癌症之疾病。因此,在另一態樣中,亦提供用作藥劑之多域結合分子、核酸、載體、宿主細胞或醫藥組成物。在再另一態樣中,提供一種治療方法,其包含向有需要之患者投予多域結合分子、核酸、載體、宿主細胞或醫藥組成物。
肽-主要組織相容性複合物(pMHC)結合域
如本文所用,「pMHC結合域(pMHC binding domain)」為能夠結合肽-MHC複合物之蛋白質域。本文所描述之多域分子之pMHC結合域結合SLLQHLIGL(SEQ ID NO: 1)HLA-A*02複合物。SLLQHLIGL(SEQ ID NO: 1)為源自PRAME,一種腫瘤相關抗原的肽。連接至恆定區之第一可變區(VC1)及連接至恆定區之第二可變區(VC2)二聚形成pMHC結合域。在此上下文中,「VC1」係指包含連接至恆定區之第一可變區的pMHC結合域序列區,且「VC2」係指包含連接至恆定區之第二可變區的區。pMHC結合位在VC1及VC2之可變區內。適合可變區及恆定區序列包括TCR或抗體可變區及恆定區。如本文所用,術語「MHC」及「HLA」可互換使用。
pMHC結合域可包含TCRα及TCRβ鏈之至少一部分。舉例而言,VC1及VC2之可變區可為TCR可變區。VC1可包含TCRα或TCRβ可變區且VC2可包含TCRα及TCRβ可變區中之另一者。舉例而言:
(i)VC1可包含(a)TCRα可變區及恆定區或(b)TCRβ可變區及恆定區;及
(ii)VC2可包含(a)或(b)中之另一者。較佳地,VC1包含該TCRβ可變區及恆定區且VC2包含該TCRα可變區及恆定區。
pMHC結合域可為包含TCR可變區及恆定區之T細胞受體(TCR),諸如可溶性TCR。本文所定義之TCR序列參考IMGT命名法描述,該命名法廣泛已知且TCR領域工作人員可獲得。舉例而言,參見:LeFranc及LeFranc, (2001). 「T cell Receptor Factsbook」, Academic Press;Lefranc, (2011), Cold Spring Harb Protoc 2011 (6): 595-603;Lefranc, (2001), Curr Protoc Immunol附錄1:附錄100;及Lefranc, (2003), Leukemia 17(1): 260-266。簡言之,TCR由兩個二硫鍵連接之鏈組成。各鏈(α及β)一般被視為具有兩個細胞外區,亦即可變區及恆定區。短接合區連接可變區及恆定區且通常被視為α可變區之一部分。另外,β鏈通常含有緊鄰接合區之短多樣性區,其通常亦被視為β可變區之一部分。典型TCR之各鏈之可變區位於N端,且包含嵌入構架序列中之三個互補決定區(Complementarity Determining Region;CDR)。CDR包含針對肽-MHC結合之識別位。
替代地,pMHC結合域可包含抗體之可變區。VC1及VC2可變區可為抗體重鏈或輕鏈可變區。舉例而言,VC1可包含重鏈或輕鏈抗體可變區且VC2可包含重鏈或輕鏈抗體可變區中之另一者。就此而言,pMHC結合域可為TCR樣抗體,亦稱為「TCR模擬抗體(TCR mimic antibody)」(TCRm-Ab)。舉例而言,pMHC結合域可包含TCR樣抗體之可變區。抗體並不天然識別pMHC複合物。然而,已知可經工程改造得到對pMHC具有特異性之抗體,如Chang等人,Expert Opin Biol Ther. 2016年8月;16(8):979-87及Dahan等人,Expert Rev Mol Med. 2012年2月24日;14:e6中所描述。
pMHC結合域可包含至少一個免疫球蛋白恆定區。舉例而言,VC1及VC2中之恆定區可為免疫球蛋白恆定區。恆定區可對應於來自TCRα鏈或TCRβ鏈之恆定區(分別為TRAC或TRBC)。替代地,pMHC結合域之恆定區可為來自抗體輕鏈或重鏈之恆定區(CL、CH1、CH2、CH3或CH4)。恆定區可為全長的或可經截短。可截短TCR恆定區以移除跨膜域及胞質尾區。在恆定區經截短之情況下,較佳地僅自C端移除膜相關及細胞質部分。在pMHC結合域包含TCRα或TCRβ鏈序列的情況下,VC1及VC2可各自包含TCR可變區及TCR恆定區。較佳地,VC1及VC2不包含跨膜或細胞質域,亦即,較佳地,pMHC結合域為可溶性的。相對於天然恆定區,可將額外突變引入恆定區之胺基酸序列中。恆定區亦可包括允許藉由例如兩個半胱胺酸殘基之間的二硫鍵二聚之天然存在或引入的殘基。
若存在,本發明之分子之TCR部分可為αβ異二聚體。本發明之分子的α-β異二聚TCR部分可包含α鏈TRAC恆定區序列及/或β鏈TRBC1或TRBC2恆定區序列。如上文所描述,恆定區可呈可溶形式(亦即,不具有跨膜域或細胞質域)。恆定區中之一或兩者可含有相對於原生TRAC及/或TRBC1/2序列之突變、取代或缺失。術語TRAC及TRBC1/2亦涵蓋天然多型變異體,例如TRAC之位置4處N變為K(Bragado等人,International immunology. 1994年2月;6(2):223-30)。
α鏈及β鏈恆定區序列可藉由截短或取代修飾,以刪除TRAC之外顯子2之Cys4與TRBC1或TRBC2之外顯子2之Cys2之間的原生二硫鍵。α及/或β鏈恆定區序列在各別恆定域之殘基之間可具有引入之二硫鍵,如例如WO 2003/020763、WO 2004/033685及WO 2006/000830中所描述,及例如美國專利第7,329,731號、第7,569,664號及第8,361,794號中所描述,該等文獻中之各者的內容以引用之方式併入本文中。α及β恆定區可藉由取代在TRAC之位置Thr 48及TRBC1或TRBC2之位置Ser 57處之半胱胺酸殘基來修飾,該等半胱胺酸在TCR之α恆定區與β恆定區之間形成二硫鍵。TRBC1或TRBC2可另外包括在恆定域之位置75處之半胱胺酸至丙胺酸突變及在恆定域之位置89處之天冬醯胺酸至天冬胺酸突變。αβ異二聚體中存在之細胞外恆定區中之一者或兩者可在C端(C terminus/C termini)處截短,例如截短至多15個、或至多10個、或至多8個或更少個胺基酸。α鏈細胞外恆定區之C端可截短8個胺基酸。
VC1及VC2可變區及恆定區之胺基酸序列可對應於自然界中發現之胺基酸序列,或其可相對於天然蛋白質含有一或多個突變。可進行此類突變以增加pMHC結合域對SLLQHLIGL(SEQ ID NO: 1)HLA-A*02複合物之親和力。另外或替代地,可併入突變以提高穩定性及可製造性。VC1及VC2序列可源自人類序列。
VC1及VC2序列可包含在恆定區中之一或多個經工程改造之半胱胺酸殘基,以在VC1與VC2之間形成非原生二硫鍵。用於在各別恆定區之殘基之間引入二硫鍵的適合位置描述於WO 2003/020763及WO 2004/033685中。單鏈TCR進一步描述於WO2004/033685;W098/39482;WO01/62908;Weidanz等人(1998) J Immunol Methods 221 (1 -2): 59-76;Hoo等人(1992) Proc Natl Acad Sci U S A 89(10): 4759-4763;Schodin (1996) Mol Immunol 33(9): 819-829)。
VC1可包含TCRα或TCRβ可變區且VC2可包含TCRα及TCRβ可變區中之另一者。較佳地:
(i) TCRα可變區包含SEQ ID NO: 3、4及5分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR;及
(ii) TCRβ可變區包含SEQ ID NO: 9、10及11分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR。
替代地,TCRα及TCRβ CDR序列可各自視情況相對於以上列舉之序列具有一個、兩個、三個或四個胺基酸取代。
分別地,TCRα可變區可包含作為CDR1、CDR2及CDR3,與SEQ ID NO: 3、4及5之序列至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致之CDR,及/或TCRβ可變區可包含作為CDR1、CDR2及CDR3,與SEQ ID NO: 9、10及11至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致之CDR。
TCRα可變區可包含對應於SEQ ID NO: 3、4及5之序列之CDR,且包含與SEQ ID NO: 27、6、7及28之序列至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致之FR,及/或TCRβ可變區可包含對應於SEQ ID NO: 9、10及11之序列之CDR,且包含與SEQ ID NO: 29、12、13及30之序列至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致的FR。
TCRα可變區可與SEQ ID NO: 2之序列至少80%一致且TCRβ可變區可與SEQ ID NO: 8之序列至少80%一致。TCRα可變區可與SEQ ID NO: 2之序列至少90%、至少95%或至少98%一致且TCRβ可變區可與SEQ ID NO: 8之序列至少90%、至少95%或至少98%一致。較佳地,TCRα可變區具有提供於SEQ ID NO: 2中之序列且TCRβ可變區具有提供於SEQ ID NO: 8中之序列。
VC1可包含TCRα或TCRβ恆定區且VC2可包含TCRα及TCRβ恆定區中之另一者。TCRα恆定區可與SEQ ID NO: 15之序列至少80%一致且TCRβ恆定區可與SEQ ID NO: 19之序列至少80%一致。TCRα恆定區可與SEQ ID NO: 15之序列至少90%、至少95%或至少98%一致且TCRβ恆定區可與SEQ ID NO: 19之序列至少90%、至少95%或至少98%一致。較佳地,TCRα恆定區具有提供於SEQ ID NO: 15中之序列且TCRβ恆定區具有提供於SEQ ID NO: 19中之序列。
VC1可包含TCRα可變區及恆定區或TCRβ可變區及恆定區,且VC2可包含TCRα及TCRβ可變區及恆定區中之另一者。TCRα可變區及恆定區可包含與SEQ ID NO: 14之序列至少80%一致之胺基酸序列或由其組成,且TCRβ可變區及恆定區可包含與SEQ ID NO: 16之序列至少80%一致之胺基酸序列或由其組成。TCRα可變區及恆定區可包含與SEQ ID NO: 14之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列或由其組成,且TCRβ可變區及恆定區可包含與SEQ ID NO: 16之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列或由其組成。較佳地,TCRα可變區及恆定區包含提供於SEQ ID NO: 14中之胺基酸序列或由其組成,且TCRβ可變區及恆定區包含提供於SEQ ID NO: 16中之胺基酸序列或由其組成。
所屬技術領域中具有通常知識者應瞭解,本發明之多域結合分子之形式可同樣適用除上文所述之TCR序列以外的TCR序列。舉例而言,其他適合之TCR鏈胺基酸序列提供於WO2011001152、WO2017109496、WO2017175006及WO2018234319中,及例如美國專利第8,519,100號、第11,639,374號、第11,505,590號及第11,427,624號中,該等文獻中之各者的內容以引用之方式併入本文中。
如所屬技術領域中熟知,可以對蛋白質分子進行轉譯後修飾。醣基化係一種此類修飾,其包含寡醣部分與TCR或抗體鏈中之確定胺基酸之共價連接。舉例而言,天冬醯胺酸殘基或絲胺酸/蘇胺酸殘基為用於寡醣連接之熟知位置。特定蛋白質之醣基化狀態視多種因素而定,該等因素包括蛋白質序列、蛋白質構形及某些酶之可用性。此外,醣基化狀態(亦即寡醣類型、共價鍵聯及連接總數)可影響蛋白質功能。因此,當產生重組蛋白時,控制醣基化通常為合乎需要的。控制醣基化已用於改良基於抗體之治療劑。(Jefferis等人,(2009) Nat Rev Drug Discov 3月;8(3):226-34.)。醣基化可藉由使用例如特定細胞株(包括但不限於哺乳動物細胞株,諸如中國倉鼠卵巢(Chinese hamster ovary;CHO)細胞或人類胚胎腎(human embryonic kidney;HEK)細胞)或藉由化學修飾來控制。因為醣基化可改良藥物動力學、降低免疫原性且更接近地模擬原生人類蛋白質,此類修飾可為合乎需要的(Sinclair及Elliott, (2005) Pharm Sci.8月; 94(8):1626-35)。替代地,醣基化可導致製造缺乏一致性,其對於治療分子而言不合乎需要。
VC1及/或VC2可包含相比於未經修飾之V1及/或VC2之一或多個胺基酸取代,其中一或多個胺基酸取代移除一或多個醣基化位。在此情形下,取代係相對於原生(例如野生型)序列或未經修飾之序列。舉例而言:
(i) VC1或VC2可包含TCRα可變區及恆定區,該TCRα可變區及恆定區包含如下位置處的一或多個胺基酸取代:選自由根據SEQ ID NO: 14編號之N24、N148、N182及N193組成之群;及/或
(ii) VC1及VC2中之另一者可包含TCRβ可變區及恆定區,該TCRβ可變區及恆定區包含根據SEQ ID NO: 16編號之位置N184處之胺基酸取代。取代可為Asn至Gln(亦即N至Q)取代。較佳地,TCRα可變區及恆定區包含根據SEQ ID NO: 14編號之N24Q、N148Q、N182Q及N193Q取代,且TCRβ可變區及恆定區包含根據SEQ ID NO: 16編號之N184Q取代。
pMHC結合域可不完全去醣基化,亦即pMHC可保留一或多個來自其原生序列之醣基化位。舉例而言,pMHC結合域可在單一醣基化位處醣基化(亦即pMHC結合域可僅含有一個醣基化位)。單一醣基化位可在VC1或VC2之可變區中。單一醣基化位可位於根據SEQ ID NO: 16編號之TCRβ可變區之位置N18。有利地,本發明人已鑑別出,相較於其他醣基化及/或去醣基化變異體,除了保留對肽-MHC結合之親和力及目標細胞殺滅效能之外,具有此單一醣基化位之多域結合蛋白具有更佳之可製造性(例如蛋白質產率、對熱應力及聚集之抗性)。
T細胞接合免疫效應子域
如本文所用,「T細胞接合免疫效應子域(T cell engaging immune effector domain)」為能夠結合T細胞上之目標以促進免疫反應的蛋白質域。T細胞接合免疫效應子域包含抗體輕鏈可變區(TCE-VL)及抗體重鏈可變區(TCE-VH)。如本文所用,「TCE-VL」及「TCE-VH」分別係指T細胞接合免疫效應子域之輕鏈可變區及重鏈可變區。本文中「TCE-VL」及「TCE-VH」亦可稱為「TCEVL」及「TCEVH」。因此,T細胞接合免疫效應子域可包含抗原結合位。舉例而言,T細胞接合免疫效應子域可結合在T細胞之細胞表面上表現之蛋白質以促進T細胞之活化。舉例而言,T細胞接合免疫效應子域可為CD3效應子域。T細胞接合免疫效應子域可結合,例如,特異性結合CD3(亦即,T細胞接合免疫效應子域可為CD3結合蛋白)。T細胞接合免疫效應子可為抗體或其功能片段,例如單鏈可變片段(single-chain variable fragment;scFv)或類似大小的抗體樣骨架,或經由與CD3及/或TCR/CD3複合物交互作用來活化T細胞之任何其他結合蛋白。
T細胞接合免疫效應子域可為單鏈可變片段(scFv)。亦縮寫為「sFv」或「scFv」之「單鏈Fv」為包含連接至單一多肽鏈中之VH及VL抗體域的抗體片段。scFv多肽可進一步包含VH與VL域之間的多肽連接子,其使得scFv能夠形成用於抗原結合之所要結構。關於scFv之綜述,參見Pluckthun, The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, 第113卷, Rosenburg及Moore編, Springer-Verlag, New York, 第269-315頁(1994)。
CD3效應子包括但不限於抗CD3抗體或抗體片段,尤其抗CD3 scFv或抗體樣骨架。T細胞接合免疫效應子域可為抗CD3 scFv。其他免疫效應子包括但不限於結合T細胞上之抗原的抗體,包括其片段、衍生物及變異體。此類抗原包括CD28、4-1bb(CD137)或CD16或在免疫突觸發揮作用之任何分子。尤其較佳的免疫效應子係抗CD3抗體,或該抗CD3抗體的功能片段或變異體。如本文所用,術語「抗體(antibody)」涵蓋此類片段及變異體。抗CD3抗體之實例包括但不限於OKT3、UCHT-1、BMA-031及12F6。適用於本文所描述之組成物及方法的抗體片段及變異體/類似物包括微型抗體、Fab片段、F(ab')
2片段、dsFv及scFv片段。
較佳地,T細胞接合免疫效應子域包含:
(i) VL區,其包含SEQ ID NO: 33、34及35分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR;及
(ii) VH區,其包含SEQ ID NO: 36、37及38分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR。
替代地,T細胞接合免疫效應子域可包含:
(i) VL區,其包含SEQ ID NO: 33、34及35分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR;及
(ii) VH區,其包含SEQ ID NO: 48、37及38分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR。
以上VL及VH CDR序列可相對於以上列舉之序列各自視情況具有一個、兩個、三個或四個胺基酸取代。
分別地,TCE-VL可包含作為CDR1、CDR2及CDR3,與SEQ ID NO: 33、34及35之序列至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致之CDR,及/或TCE-VH可包含作為CDR1、CDR2及CDR3,與SEQ ID NO: 36、37及38至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致之CDR。
替代地,分別地,TCE-VL可包含作為CDR1、CDR2及CDR3,與SEQ ID NO: 33、34及35之序列至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致之CDR,及/或TCE-VH可包含作為CDR1、CDR2及CDR3,與SEQ ID NO: 48、37及38至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致之CDR。
TCE-VL可包含與SEQ ID NO: 31之序列至少80%一致之胺基酸序列或由其組成,且TCE-VH可包含與SEQ ID NO: 32之序列至少80%一致之胺基酸序列或由其組成。TCE-VL可包含與SEQ ID NO: 31之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列或由其組成,且TCE-VH可包含與SEQ ID NO: 32之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列或由其組成。較佳地,TCE-VL包含SEQ ID NO: 31中所提供之胺基酸序列或由其組成,且TCE-VH包含SEQ ID NO: 32中所提供之胺基酸序列或由其組成。
替代地,TCE-VL包含與SEQ ID NO: 31之序列至少80%一致之胺基酸序列或由其組成,且TCE-VH包含與SEQ ID NO: 41之序列至少80%一致之胺基酸序列或由其組成。TCE-VL可包含與SEQ ID NO: 31之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列或由其組成,且TCE-VH可包含與SEQ ID NO: 41之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列或由其組成。舉例而言,TCE-VL可包含SEQ ID NO: 31中所提供之胺基酸序列或由其組成,且TCE-VH可包含SEQ ID NO: 41中所提供之胺基酸序列或由其組成。
如上文所描述,T細胞接合免疫效應子域可為scFv。T細胞接合免疫效應子域可為包含與SEQ ID NO: 17或40之序列至少80%一致之胺基酸序列或由其組成之scFv。scFv可包含與SEQ ID NO: 17或40之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列或由其組成。較佳地,scFv包含SEQ ID NO: 17中所提供之胺基酸序列或由其組成。替代地,scFv可包含SEQ ID NO: 40中提供之胺基酸序列或由其組成。
半衰期延長域
如本文所用,「半衰期延長域(half-life extending domain)」係指用於相對於不具有半衰期延長域之多域結合蛋白,延長多域結合蛋白之半衰期的蛋白域。半衰期延長域包含第一IgG Fc區(FC1)及第二IgG Fc區(FC2),其中FC1區與FC2區二聚形成Fc域。如本文所用,術語「Fc區(Fc region)」用於指包含至少CH2域及CH3域序列之單一多肽鏈的區,而術語「Fc域(Fc domain)」係指兩個Fc區(亦即FC1及FC2)之二聚體。
WO 2020/157211描述一種藉由使TCR-抗CD3融合蛋白融合至IgG Fc域而延長其半衰期之方法。本發明人意外地發現,本發明之多域結合分子保持由WO 2020/157211中所揭示之形式中的Fc域提供之半衰期延長,且另外,具有顯著更高效能。
免疫球蛋白Fc域可為任何抗體Fc域。Fc域為與細胞表面Fc受體及補體系統之一些蛋白質交互作用的抗體之尾區。Fc域包含皆具有兩個或三個重鏈恆定域(稱為CH2、CH3及CH4)之兩個多肽鏈(亦即兩個Fc「區」),及視情況,鉸鏈區。兩個Fc區鏈可藉由鉸鏈區內之一或多個二硫鍵連接。來自免疫球蛋白子類IgG1、IgG2及IgG4之Fc域結合FcRn且經歷FcRn介導之再循環,提供較長循環半衰期(3至4週),由此延長本發明之多域結合分子之半衰期。IgG與FcRn之交互作用位於Fc區中,涵蓋CH2及CH3域之部分。用於本發明之較佳免疫球蛋白Fc域包括但不限於來自IgG1或IgG4之Fc域。舉例而言,Fc域可為IgG1 Fc域,亦即FC1及FC2區可為IgG1 Fc區。Fc域可源自人類序列。
FC1區可包含與SEQ ID NO: 42之序列至少80%一致之胺基酸序列或由其組成,且FC2區可包含與SEQ ID NO: 43之序列至少80%一致之胺基酸序列或由其組成。FC1區可包含與SEQ ID NO: 42之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列或由其組成,且FC2區可包含與SEQ ID NO: 43之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列或由其組成。較佳地,FC1區包含SEQ ID NO: 42中所提供之胺基酸序列或由其組成,且FC2區包含SEQ ID NO: 43中所提供之胺基酸序列或由其組成。如所屬技術領域中具有通常知識者將瞭解,上文針對FC1及FC2提供之序列反之亦適合。舉例而言,FC1區可包含SEQ ID NO: 43中所提供之胺基酸序列或由其組成,且FC2區可包含SEQ ID NO: 42中所提供之胺基酸序列或由其組成。
Fc區可包含相對於野生型或未經修飾之Fc序列的突變。突變包括取代、插入及缺失。此類突變可出於引入所需治療特性之目的進行。舉例而言,為了促進異二聚化,可將杵臼(knobs into holes;KiH)突變工程改造至CH3域中。因此,半衰期延長域可包含促進FC1區與FC2區之二聚之一或多個胺基酸取代。此類取代包括「杵臼」取代。在此情況下,一條鏈(亦即FC1或FC2區中之一者)經工程改造以含有大型突出殘基(亦即杵(knob)),諸如Y,且另一條鏈(亦即FC1及FC2區中之另一者)經工程改造以含有互補凹穴(亦即臼(hole))。舉例而言,杵可藉由用較大側鏈置換小胺基酸側鏈來構築。臼可藉由用較小側鏈置換大胺基酸側鏈來構築。不希望受理論束縛,認為此藉由相較於其他物種,例如FC1與FC2之均多聚體,優先形成異二聚體,而使FC1與FC2區之異二聚體穩定化,由此增強本發明之多域結合分子之穩定性及可製造性。
KiH突變之適合位置及取代,及促進Fc區之二聚的其他突變為所屬技術領域中已知的且包括以下中所描述者:Merchant等人,Nat Biotechnol 16:677 (1998)及Ridgway等人,Prot Engineering 9:617 (1996)及Atwell等人,J Mol Biol 270,1 (1997): 26-35。舉例而言,在兩個Fc區中形成對應杵及臼之取代可對應於下表中提供之一或多個對:
FC1 及 FC2 區中之一者之 CH3 | FC1 及 FC2 區中之另一者之 CH3 |
T366Y | Y407T |
T366W | Y407A |
T366W | T366S:L368A:Y407V |
F405A | T394W |
Y407T | T366Y |
T366Y:F405A | T394W:Y407T |
T366W:F405W | T394S:Y407A |
F405W:Y407A | T366W:T394S |
F405W | T394S |
上表中之取代如下表示:原始殘基,接著係使用EU編號系統之位置,且接著係導入之殘基(所有殘基以單字母胺基酸代碼給出)。多個取代由冒號隔開。
FC1及FC2區可包含上表中之一或多個取代。舉例而言:
(i) 該FC1區及該FC2區中之一者可包含一或多個根據EU編號方案之胺基酸取代,該一或多個胺基酸取代選自由T366S、L368A、T394S、F405A、Y407A、Y407T及Y407V組成之群;及
(ii) 該FC1區及該FC2區中之另一者可包含一或多個根據EU編號方案之胺基酸取代,該一或多個胺基酸取代選自由T366W、T366Y、T366W、T394W及F405W組成之群。(i)及(ii)中之取代分別為形成臼及形成杵之取代。FC1區可包含(i)中之取代中之一或多者且FC2區可包含(ii)中之取代中之一或多者。
舉例而言:
(i) 該FC1區及該FC2區中之一者可包含一或多個根據EU編號方案之胺基酸取代,該一或多個胺基酸取代選自由T366S、L368A及Y407V組成之群;及
(ii) 該FC1區及該FC2區中之另一者可包含根據EU編號方案之T366W胺基酸取代。FC1區可包含(i)中之取代中之一或多者且FC2區可包含(ii)中之取代。
較佳地,(i)FC1區及FC2區中之一者包含根據EU編號方案之T366S、L368A及Y407V胺基酸取代;且(ii)FC1區及FC2區中之另一者包含根據EU編號方案之T366W胺基酸取代。舉例而言,FC1區可包含根據EU編號方案之T366S、L368A及Y407V胺基酸取代;且FC2區可包含根據EU編號方案之T366W胺基酸取代。
Fc域亦可包含一或多個減弱Fc域之效應功能的突變。例示性效應功能包括但不限於補體依賴性細胞毒性(complement-dependent cytotoxicity;CDC)及/或抗體依賴性細胞毒性(antibody-dependent cellular cytotoxicity;ADCC)。減弱效應功能之修飾可為改變Fc域之醣基化模式的修飾,例如產生去醣基化Fc域之修飾。替代地,減弱效應功能之修飾可為不改變Fc域之醣基化模式的修飾。減弱效應功能之修飾可減少或消除與人類效應細胞之結合、與一或多種Fc受體之結合及/或與表現Fc受體之細胞的結合。舉例而言,該半衰期延長域可包含一或多個根據EU編號方案之胺基酸取代,該一或多個胺基酸取代選自由S228P、E233P、L234A、L235A、L235E、L235P、G236R、G237A、P238S、F241A、V264A D265A、H268A、D270A、N297A、N297G、N297Q、E318A、K322A、L328R、P329G、P329A、A330S、A330L、P331A及P331S組成之群。特定修飾包括位於人類IgG1之Fc區中的N297G或N297A取代(EU編號)。其他適合修飾包括人類IgG1之Fc區中使得效應功能減弱的L234A、L235A及P329G取代(EU編號)。本發明之多域結合分子中之Fc區可包含根據EU索引編號之殘基N297處之取代。舉例而言,取代可為N297G或N297A取代。其他適合突變(例如在殘基N297處)為所屬技術領域中具有通常知識者已知。
具有降低的效應功能的Fc變異體係指相比於野生型Fc區(例如,不具有降低效應功能之突變的Fc區,但其可具有其他突變)所達成的效應功能,效應功能(例如CDC、ADCC及/或與FcR之結合等活性)降低至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、97%、98%、99%或更多的Fc變異體。具有降低之效應功能的Fc變異體可為相比於野生型Fc區消除所有可偵測效應功能的Fc變異體。量測效應功能之分析為所屬技術領域中已知的且在下文描述。
可進行試管內及/或活體內細胞毒性分析以確認CDC及/或ADCC活性之降低/耗盡。舉例而言,可進行Fc受體(FcR)結合分析以確保Fc區或融合蛋白缺乏FcγR結合(因此可能缺乏ADCC活性),但保留FcRn結合能力。用於介導ADCC之初級細胞NK細胞僅表現FcγRIII,而單核球表現FcγRI、FcγRII及FcγRIII。FcR在造血細胞上之表現概述於Ravetch及Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9:457-492 (1991)之第464頁之表3中。評估相關分子之ADCC活性之試管內分析的非限制性實例描述於以下中:美國專利第5,500,362號(參見例如Hellstrom, I.等人,Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 83:7059-7063 (1986))及Hellstrom, I等人,Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 82:1499-1502 (1985);第5,821,337號(參見Bruggemann, M.等人,J. Exp. Med. 166:1351-1361 (1987))。
可將消除或減少與Fcy受體之結合及/或增加與FcRn之結合及/或防止Fab臂交換及/或移除蛋白酶位之取代引入至FC1及FC2區中。就此而言,半衰期延長域亦可包含一或多個防止或減少與活化受體之結合的胺基酸取代。半衰期延長域可包含一或多個防止或減少與FcγR之結合之胺基酸取代。舉例而言,FC1區及/或FC2區可包含根據EU編號方案之N297G胺基酸取代。FC1區及FC2區兩者均可包含N297G胺基酸取代。
與未經修飾之半衰期延長域相比,半衰期延長域可包含一或多個胺基酸取代,其中一或多個胺基酸取代促進與FcRn之結合。量測與FcRn之結合的方法為已知的(參見例如Ghetie及Ward, Immunol. Today 18: (12): 592-8 (1997);Ghetie等人,Nature Biotechnology 15 (7): 637-40 (1997);Hinton等人,J. Biol. Chem. 279 (8): 6213-6 (2004);WO 2004/92219(Hinton等人)。可例如在表現人類FcRn之轉殖基因小鼠或經轉染人類細胞株中或在投予具有變異Fc區之多肽的靈長類動物中分析人類FcRn高親和力結合多肽與FcRn的活體內結合及血清半衰期。WO 2004/42072(Presta)描述提高或降低與FcR之結合的抗體取代。亦參見例如Shields等人,J. Biol. Chem. 9(2): 6591-6604 (2001)。特定言之,Mackness等人,MAbs. 11:1276-1288 (2019)描述用於增強與FcRn之結合的抗體Fc區中適合之胺基酸取代。
另外或替代地,可出於製造原因進行突變,例如以移除或置換可經歷如本文所描述之轉譯後修飾,諸如醣基化的胺基酸。免疫球蛋白Fc可經由如本文所描述之連接子及/或鉸鏈序列與本發明分子中之其他域(亦即VC1或VC2)融合。替代地,可不使用連接子。
本發明之分子中之兩個Fc區可包含CH2及CH3恆定域及鉸鏈序列之全部或一部分。鉸鏈序列可實質上或部分對應於來自IgG1、IgG2、IgG3或IgG4之鉸鏈區。鉸鏈序列可為IgG1鉸鏈序列,諸如SEQ ID NO: 44中提供之胺基酸序列。鉸鏈可包含核心鉸鏈域之全部或一部分及下鉸鏈區之全部或一部分。
本發明之多域結合分子之適合半衰期延長形式亦描述於與此一起申請之申請案中,其名稱為「多域結合分子(Multi-Domain Binding Molecules)」,主張2022年8月18日申請之美國臨時申請案第63/371,861號之優先權,其內容以引用的方式併入本文中。
形式及連接子
如本文所用,術語「形式(format)」係指本發明之多域結合分子中之各域(及各域中之各區)之位置及位向,及多肽鏈數目。例示性多域結合分子之形式的示意圖提供於圖1A至圖1B中。此類分子之pMHC結合域及T細胞接合免疫效應子域能夠分別地結合pMHC複合物及T細胞。就此而言,pMHC結合域及T細胞接合免疫效應子域可能夠分別同時結合pMHC複合物及T細胞。
在本發明之多域結合分子之形式中,該T細胞接合免疫效應子域連接至VC1之N端,VC1經由其C端連接至該FC1區之N端,該FC1區經由其C端連接至VC2之N端,且VC2經由其C端連接至FC2之N端。各區在單一多肽鏈中共價連接。形式可表示為:
N-(TCEVL-TCEVH或TCEVH-TCEVL)-VC1-FC1-VC2-FC2-
C。本發明人已鑑別出,所測試之超過35種不同形式當中,此形式之分子具有最高活性(亦即效能及選擇性)及產率。
本發明之多域結合分子呈單鏈形式。在此上下文中,「單鏈(single-chain)」用以描述表現為單一多肽鏈之多域結合分子,其含有pMHC結合域、T細胞接合免疫效應子域及半衰期延長域。
較佳地,VC1包含TCRβ可變區及恆定區,VC2包含TCRα可變區及恆定區,T細胞接合免疫效應子域為抗CD3 scFv,且Fc域為IgG1 Fc域。
TCE-VH、TCE-VL、VC1、VC2、FC1及FC2區中之兩者或更多者可經由連接子及/或IgG鉸鏈序列彼此連接。連接子序列可為可撓性的,此在於其主要由諸如甘胺酸、丙胺酸及絲胺酸之胺基酸構成,該等胺基酸不具有可能限制可撓性之大型側鏈。此類連接子包括「甘胺酸-絲胺酸(glycine-serine)」連接子,其係指僅包含或主要包含甘胺酸及絲胺酸殘基之連接子,例如(GGGGS)n。替代地,具有較大剛性之連接子可為合乎需要的。更剛性連接子之實例包括具有(EAAAK)n之序列的形成α螺旋之連接子。可容易地確定連接子序列之可使用或最佳長度。通常,連接子序列之長度將小於約15個,諸如小於10個,或2至10個胺基酸。連接子之長度可為1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30個胺基酸。可用於多域結合分子中之適合連接子之實例為所屬技術領域中已知且包括WO2010/133828及Chen等人,Adv Drug Deliv Rev. 2013;65(10):1357-1369中所描述者。舉例而言,存在於本發明之多域結合蛋白中之一或多個連接子可具有選自以下之群的序列:GGGGS(SEQ ID NO: 18)、GGGSG(SEQ ID NO: 20)、GGSGG(SEQ ID NO: 21)、GSGGG(SEQ ID NO: 22)、GSGGGP(SEQ ID NO: 23)、GGEPS(SEQ ID NO: 24)、GGEGGGP(SEQ ID NO: 25)、GGEGGGSEGGGS(SEQ ID NO: 26)、GGGSGGGG(SEQ ID NO: 47)、GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGS(SEQ ID NO: 39)、GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO: 49)、EAAAK(SEQ ID NO: 50)及EAAAKEAAAKEAAAK(SEQ ID NO: 51)。
適合IgG鉸鏈序列為所屬技術領域中已知且包括SEQ ID NO: 44中提供之例示性IgG1鉸鏈序列。其他適合IgG鉸鏈序列包括SEQ ID NO: 52中所提供之截短IgG1鉸鏈序列及SEQ ID NO: 53中所提供之IgG4鉸鏈。
TCE-VL區可經由其C端連接至TCE-VH區之N端且TCE-VH區可經由其C端連接至VC1之N端。就此而言,本發明之多域結合分子可具有以下形式:
N-TCEVL-TCEVH-VC1-FC1-VC2-FC2-
C。
VC1可包含TCRβ可變區及恆定區且VC2可包含TCRα可變區及恆定區。因此,VC1與VC2可二聚形成可溶性TCR。就此而言,較佳地,本發明之多域結合分子具有以下形式:
N-TCEVL-TCEVH-TCRβ-FC1-TCRα-FC2-
C(其中「TCRβ」係指TCRβ可變區及恆定區且「TCRα」係指TCRα可變區及恆定區)。
TCE-VL區可經由包含甘胺酸-絲胺酸連接子之序列連接至TCE-VH區。較佳地,使TCE-VL區與TCE-VH區連接之序列為SEQ ID NO: 39中提供之胺基酸序列。
TCE-VH區可經由包含甘胺酸-絲胺酸連接子或由其組成之序列連接至VC1。較佳地,使TCE-VH區與VC1連接之序列為SEQ ID NO: 18中提供之胺基酸序列。
VC1可經由包含IgG鉸鏈序列之序列連接至FC1區且/或VC2可經由包含IgG鉸鏈序列之序列連接至FC2區。IgG鉸鏈序列可與SEQ ID NO: 44至少80%一致。較佳地,IgG鉸鏈序列與SEQ ID NO: 44至少90%、至少95%、至少98%或100%一致。
將VC1連接至FC1區之序列可進一步包含甘胺酸-絲胺酸連接子及/或將VC2連接至FC2區之序列可進一步包含甘胺酸-絲胺酸連接子。較佳地,甘胺酸-絲胺酸連接子具有SEQ ID NO: 47中提供之序列。較佳地,此等序列呈以下形式,N端至C端:VC1-GS連接子-IgG鉸鏈-FC1及VC2-GS連接子-IgG鉸鏈-FC2。
FC1區可經由包含甘胺酸-絲胺酸連接子之序列連接至VC2。較佳地,連接FC1區VC2區之甘胺酸-絲胺酸連接子具有SEQ ID NO: 47中提供之序列。
本發明之多域結合分子為單一多肽鏈(參見圖1A)。多域結合分子可為可溶及/或重組及/或分離的。兩個例示性多域結合分子之全胺基酸序列提供於SEQ ID NO: 45及SEQ ID NO: 46中。
多域結合分子可具有與SEQ ID NO: 45之序列至少80%一致的胺基酸序列。多域結合分子可具有與SEQ ID NO: 45之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列。較佳地,多域結合分子包含SEQ ID NO: 45中提供之胺基酸序列或由其組成。
多域結合分子可具有與SEQ ID NO: 46之序列至少80%一致的胺基酸序列。多域結合分子可具有與SEQ ID NO: 46之序列至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列。多域結合分子可包含SEQ ID NO: 46中所提供之胺基酸序列或由其組成。
視情況,以上多域結合分子序列可進一步與一或多個其他多肽序列融合。
以上序列係關於包含結合SLLQHLIGL(SEQ ID NO: 1)HLA-A*02複合物之TCR鏈的多域結合分子。所屬技術領域中具有通常知識者可藉由用不同相關TCR之序列置換SEQ ID NO: 45及SEQ ID NO: 46中之TCR鏈,而調整此等序列以使其針對另一目標。類似地,所屬技術領域中具有通常知識者可用另一T細胞接合免疫效應子域,例如,不同抗CD3 scFv序列置換SEQ ID NO: 45或SEQ ID NO: 46中之抗CD3 scFv序列(亦即,T細胞接合免疫效應子域)。
較佳地:
a) VC1包含TCRβ可變區及恆定區,
b) VC2包含TCRα可變區及恆定區,
c) 該T細胞接合免疫效應子域為抗CD3 scFv,
d) FC1具有SEQ ID NO: 42中所提供之胺基酸序列,或與其至少90%、或至少95%、或至少98%一致之胺基酸序列,及
e) FC2具有SEQ ID NO: 43中所提供之胺基酸序列,或與其至少90%、至少95%或至少98%一致之胺基酸序列。
多域結合分子較佳包含以下胺基酸序列,自N端至C端按以下次序:
a) 抗CD3 scFv(TCE-VL及TCE-VH)之胺基酸序列,視情況接著係提供於SEQ ID NO: 18中之連接子序列;
b) TCRβ可變區及恆定區(VC1)之胺基酸序列;
c) 提供於SEQ ID NO: 47中之連接子序列,接著係提供於SEQ ID NO: 44中之IgG鉸鏈序列;
d) 具有提供於SEQ ID NO: 42中之序列的Fc區(FC1);
e) 提供於SEQ ID NO: 47中之連接子序列;
f) TCRα可變區及恆定區(VC2)之胺基酸序列;
g) 提供於SEQ ID NO: 47中之連接子序列,接著係提供於SEQ ID NO: 44中之IgG鉸鏈序列;及
h) 具有提供於SEQ ID NO: 43中之序列的Fc區(FC2)。
TCRβ恆定區可具有提供於SEQ ID NO: 19中之胺基酸序列及/或TCRα恆定區可具有提供於SEQ ID NO: 15中之胺基酸序列。多域結合分子可不包含除以上a)至h)中之序列以外的胺基酸序列。
抗CD3 scFv可以包含SEQ ID NO: 17中所提供之胺基酸序列或SEQ ID NO: 40中所提供之胺基酸序列或由其組成。
胺基酸序列
在本發明之範圍內的有本文所揭示之任何分子的表型靜默變異體。如本文所用,術語「表型靜默變異體(phenotypically silent variant)」應理解為指除上文所述者之外併入一或多種包括取代、插入及缺失的其他胺基酸變化的變異體,且該變異體具有與不具有該(等)變化之對應分子類似的表型。出於本申請案之目的,表型包含結合親和力(K
D及/或結合半衰期)及特異性。可溶性多域結合分子之表型可包括免疫活化之效能及純化產率,以及結合親和力及特異性。
表型靜默變異體可含有一或多個保守取代及/或一或多個容許取代(tolerated substitution)。容許取代意謂不屬於如下文所提供之保守定義但仍然為表型靜默的彼等取代。所屬技術領域中具有通常知識者意識到,各種胺基酸具有類似特性且因此為『保守性(conservative)』的。蛋白質、多肽或肽之一或多個此類胺基酸通常可經一或多個其他此類胺基酸取代,而不消除該蛋白質、多肽或肽之所要活性。
因此,胺基酸甘胺酸、丙胺酸、纈胺酸、白胺酸及異白胺酸通常可彼此取代(具有脂族側鏈之胺基酸)。在此等可能取代中,較佳地,甘胺酸及丙胺酸用於彼此取代(因為其具有相對較短的側鏈),且纈胺酸、白胺酸及異白胺酸用於彼此取代(因為其具有疏水性的較大脂族側鏈)。通常可彼此取代之其他胺基酸包括:苯丙胺酸、酪胺酸及色胺酸(具有芳族側鏈之胺基酸);離胺酸、精胺酸及組胺酸(具有鹼性側鏈之胺基酸);天冬胺酸及麩胺酸(具有酸性側鏈之胺基酸);天冬醯胺酸及麩醯胺酸(具有醯胺側鏈之胺基酸);以及半胱胺酸及甲硫胺酸(具有含硫側鏈之胺基酸)。應瞭解,本發明之範圍內的胺基酸取代可使用天然存在或非天然存在之胺基酸來進行。舉例而言,本文考慮丙胺酸上之甲基可經乙基置換,及/或可對肽主鏈進行輕微改變。無論是否使用天然胺基酸抑或使用合成胺基酸,較佳僅存在L-胺基酸。
此性質之取代通常稱為「保守性」或「半保守性(semi-conservative)」胺基酸取代。本發明因此擴展至使用包含上文所描述之胺基酸序列中之任一者,但在序列中具有一或多個保守取代及/或一或多個容許取代,使得分子或其任何域或區之胺基酸序列與本文所揭示之序列具有至少90%一致性,諸如90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性之分子。
所屬技術領域中已知之「一致性(identity)」為兩個或更多個多肽序列或兩個或更多個聚核苷酸序列之間的關係,其係藉由將該等序列進行比較而確定。在所屬技術領域中,一致性亦意謂多肽或聚核苷酸序列之間的序列相關性程度,視具體情況可藉由此類序列串之間的匹配所確定。雖然存在多種用於量測兩個多肽或兩個聚核苷酸序列之間的一致性之方法,但常用於確定一致性之方法編碼於電腦程式中。確定兩個序列之間的一致性的較佳電腦程式包括但不限於GCG套裝程式(Devereux,等人,Nucleic Acids Research, 12, 387 (1984)、BLASTP、BLASTN及FASTA(Atschul等人,J. Molec. Biol. 215, 403 (1990))。
可使用諸如CLUSTAL程式之程式來比較胺基酸序列。此程式比較胺基酸序列且藉由視需要在任一序列中插入空隙來找到最佳比對。有可能計算最佳比對之胺基酸一致性或類似性(一致性加胺基酸類型之保守性)。如BLASTx之程式將比對類似序列之最長片段且為該配合指派一個值。因此有可能獲得其中找到若干類似區,各自具有不同評分之比較。本發明中考慮兩種類型之一致性分析。
兩個胺基酸序列或兩個核酸序列之一致性百分比係藉由排比序列以達到最佳比較目的(例如,可將間隙引入第一序列中以實現最佳序列比對),且將對應位置處之胺基酸殘基或核苷酸進行比較來確定。「最佳比對(best alignment)」為產生最高一致性百分比的兩個序列之比對。一致性百分比係藉由所比較的序列中之一致胺基酸殘基或核苷酸之數目來確定(亦即,一致性%=一致位置數/總位置數×100)。
確定兩個序列之間的一致性百分比可使用所屬技術領域中具有通常知識者已知的數學演算法來實現。用於比較兩個序列之數學演算法的一實例為Karlin及Altschul (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:2264-2268之演算法,如Karlin及Altschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5877中所修改。Altschul等人(1990) J. Mol. Biol. 215:403-410之BLASTn及BLASTp程式併入了此類演算法。可使用BLASTn程式進行兩個核苷酸序列之間的一致性百分比的確定。可使用BLASTp程式進行兩個蛋白質序列之間的一致性百分比的確定。為了獲得出於比較目的之間隙比對,可如Altschul等人(1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-3402中所描述使用間隙BLAST。替代地,PSI-Blast可用於執行偵測分子(相同)間的遠緣關係之迭代檢索。當利用BLAST、間隙BLAST及PSI-Blast程式時,可使用各別程式(例如,BLASTp及BLASTp)之預設參數。參見http://www.ncbi.nlm.nih.gov。預設通用參數可包括例如字長=3,預期臨限值=10。可選擇參數以針對短輸入序列而自動調整。用於比較序列之數學演算法的另一實例為Myers及Miller,CABIOS (1989)之演算法。作為CGC序列比對套裝軟體之一部分的ALIGN程式(2.0版)已併有此類演算法。所屬技術領域中已知的用於序列分析之其他演算法包括如Torellis及Robotti (1994) Comput. Appl. Biosci., 10 :3-5中所描述之ADVANCE及ADAM;以及Pearson及Lipman (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. 85:2444-8中描述之FASTA。在FASTA內,ktup為設定檢索之靈敏度及速度的控制選項。出於評價本發明中之一致性百分比的目的,使用利用預設參數之BLASTp作為比較方法。此外,所述之一致性百分比對於胺基酸提供非整數值時(亦即,具有90%序列一致性之25個胺基酸之序列提供值「22.5」,將所得值向下捨入至下一整數,因此係「22」)。因此,在所提供之實例中,25個胺基酸中具有22個匹配之序列屬於90%序列一致性內。
如所屬技術領域中具有通常知識者將顯而易見,可將提供於其C端及/或N端處之序列截短或延長1、2、3、4、5或更多個殘基,而不實質上影響分子,例如TCR部分之功能特徵。提供於其C端及/或N端處之序列可截短或延長1、2、3、4或5個殘基。本發明涵蓋所有此類變異體。
突變,包括保守及容許取代、插入及缺失,可使用任何適當方法引入所提供之序列中,該方法包括但不限於基於聚合酶連鎖反應(polymerase chain reaction;PCR)、基於限制酶之選殖或非接合依賴性選殖(ligation independent cloning;LIC)程序的方法。此等方法在許多標準分子生物學教科書中詳述。關於聚合酶連鎖反應(PCR)及基於限制酶之選殖的其他細節,參見Sambrook及Russell, (2001) Molecular Cloning - A Laboratory Manual (第3版) CSHL Press。關於非接合依賴性選殖(LIC)程序之其他資訊可見於Rashtchian, (1995)
Curr Opin Biotechnol 6(1): 30-6中。本文提供之蛋白質序列可獲自重組表現、固態合成或所屬技術領域中已知之任何其他適當方法。
評估多域結合分子之結合特徵及活性
確定結合親和力(與平衡常數K
D成反比)及結合半衰期(表示為T½)之方法為所屬技術領域中具有通常知識者已知。結合親和力及結合半衰期可分別使用表面電漿子共振(Surface Plasmon Resonance;SPR)或生物層干涉術(Bio-Layer Interferometry;BLI),例如使用BIAcore儀器或Octet儀器確定。應瞭解,使親和力加倍使K
D減半。T½經計算為ln2除以解離速率(k
off)。因此,使T½加倍使k
off減半。通常量測TCR之可溶性形式,亦即經截短以移除細胞質域及跨膜域殘基之彼等形式的TCR的K
D及k
off值。為考慮獨立量測之間的變化,且尤其對於解離時間超過20小時的交互作用,可使用相同分析方案量測給定蛋白質之結合親和力及/或結合半衰期若干次,例如3次或更多次,且取結果之平均值。為比較兩個樣品(亦即兩種不同蛋白質及/或相同蛋白質之兩種製劑)之間的結合數據,較佳使用相同分析條件(例如溫度)進行量測。關於TCR所述之量測方法亦可應用於本文所述之多域結合分子。
本發明之某些多域結合分子能夠在試管內針對抗原陽性細胞,尤其呈現低水平的癌細胞之典型抗原(亦即,約5至100個,例如50個抗原/細胞(Bossi等人,(2013) Oncoimmunol. 1;2 (11) :e26840;Purbhoo等人,(2006). J Immunol 176(12): 7308-7316.)的細胞產生高效T細胞反應。此類TCR可以適合於併入本文所述之多域結合分子中。所量測之T細胞反應可為諸如干擾素γ或顆粒酶B之T細胞活化標記之釋放,或目標細胞殺滅,或諸如T細胞增殖之T細胞活化之其他度量。高效反應可為EC
50值在nM-pM範圍內,例如500 nM或更低,較佳1 nM或更低或500 pM或更低之反應。
本發明涵蓋之分子可具有改良之半衰期。用於判定蛋白質是否具有改良之半衰期的方法將為所屬技術領域中具有通常知識者顯而易見。舉例而言,評估蛋白質結合新生兒Fc受體(FcRn)之能力。就此而言,對於FcRn之結合親和力提高增加蛋白質之血清半衰期(參見例如Kim等人,Eur J Immunol., 24:2429, 1994)。
本發明之蛋白質之半衰期亦可藉由藥物動力學研究,例如根據Kim等人,Eur J of Immunol 24: 542, 1994所述之方法量測。根據此方法,放射性標記之蛋白質經靜脈內注射至小鼠中且其血漿濃度隨時間推移,例如在注射之後3分鐘至72小時週期性地量測。替代地,可注射未標記之本發明蛋白質且使用ELISA週期性量測其血漿濃度。由此獲得之清除曲線應為雙相的,亦即α相及β相。為了確定蛋白質之活體內半衰期,計算β相之清除率且與野生型或未經修飾之蛋白質之清除率相比。
核酸、載體及宿主細胞
本發明提供一種編碼本發明之多域結合分子之核酸。核酸可為cDNA。核酸可為mRNA。核酸可為非天然存在及/或純化及/或工程改造的。核酸序列可根據利用之表現系統經密碼子最佳化。如所屬技術領域中具有通常知識者所知,表現系統可包括細菌細胞,諸如大腸桿菌(E. coli),或酵母細胞,或哺乳動物細胞,或昆蟲細胞,或其可為無細胞表現系統。
本發明亦提供呈包含至少一種如上文所述之核酸的質體、載體、轉錄或表現卡匣形式之構築體。本發明亦提供重組宿主細胞,其包含一或多種上述構築體。如所提及,編碼本發明之特異性結合分子之核酸形成本發明之一態樣,包含自編碼本發明之特異性結合分子之核酸表現的產生特異性結合分子之方法亦如此。表現可能適宜藉由在適當條件下培養含有核酸之重組宿主細胞來達成。在藉由表現產生之後,可使用任何適合之技術分離及/或純化特異性結合分子,隨後視需要使用。
用於在多種不同宿主細胞中選殖及表現多肽之系統為熟知的。適合宿主細胞包括細菌、哺乳動物細胞、酵母及桿狀病毒系統。所屬技術領域中可用於表現異源多肽之哺乳動物細胞株包括中國倉鼠卵巢細胞、希拉細胞(HeLa cell)、幼倉鼠腎細胞、NSO小鼠黑色素瘤細胞及許多其他細胞。常見的較佳細菌宿主為大腸桿菌。抗體及抗體片段在諸如大腸桿菌之原核細胞中之表現在所屬技術領域中沿用已久。關於綜述,參見例如Plückthun, Bio/Technology 9:545-551 (1991)。所屬技術領域中具有通常知識者亦可用培養中之真核細胞中之表現作為產生特異性結合分子的選項,參見近期評述,例如Reff, Curr. Opinion Biotech. 4:573-576 (1993);Trill等人,Curr. Opinion Biotech. 6:553-560 (1995)。
可選擇或構築含有適當調節序列,包括啟動子序列、終止子序列、聚腺苷酸化序列、強化子序列、標記基因及視需要之其他序列之適合的載體。載體可為所屬技術領域中已知之任何適合載體,包括視需要之質體或病毒載體(例如『噬菌體(phage)或噬菌粒(phagemid))。關於其他細節,參見例如Sambrook等人,Molecular Cloning: A Laboratory Manual: 第2版, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)。用於操縱核酸,例如在核酸構築體製備、突變誘發、定序、將DNA引入細胞及基因表現,及蛋白質分析之許多已知技術及方案,詳細描述於Ausubel等人編,Short Protocols in Molecular Biology, 第2版, John Wiley & Sons (1992)中。
本發明亦提供一種含有如本文所揭示之核酸的宿主細胞。此外,本發明提供一種包含將此類核酸引入宿主細胞中之方法。引入可採用任何可用技術。對於真核細胞,適合技術可包括磷酸鈣轉染、DEAE-聚葡萄糖、電穿孔、脂質體介導之轉染及使用反轉錄病毒或其他病毒,例如牛痘或對於昆蟲細胞使用桿狀病毒進行之轉導。對於細菌細胞,適合技術可包括氯化鈣轉形、電穿孔及使用噬菌體轉染。引入之後可接著引起或允許自核酸表現,例如藉由在用於基因表現之條件下培養宿主細胞。
適用於本發明之聚核苷酸及/或載體之選殖或表現的宿主細胞為所屬技術領域中已知的。適用於表現(醣基化)蛋白質之宿主細胞亦源自多細胞生物(無脊椎動物及脊椎動物)。無脊椎動物細胞之實例包括植物及昆蟲細胞。已鑑別出眾多可與昆蟲細胞聯合使用,尤其用於轉染草地黏蟲(Spodoptera frugiperda)細胞之桿狀病毒株系。植物細胞培養物亦可用作宿主。參見例如US 5,959,177、US 6,040,498、US 6,420,548、US 7,125,978及US 6,417,429(描述用於在轉殖基因植物中產生抗體之PLANTIBODIES
TM技術)。脊椎動物細胞亦可用作宿主。舉例而言,適於在懸浮液中生長之哺乳動物細胞株可為有用的。有用的哺乳動物宿主細胞株之其他實例為由SV40轉形之猴腎CV1細胞株(COS-7);人類胚腎細胞株(如例如在Graham, F.L.等人,J. Gen Virol. 36 (1977) 59-74中所述之293或293T細胞);幼倉鼠腎細胞(baby hamster kidney;BHK);小鼠塞特利氏細胞(mouse sertoli cell)(如例如在Mather, J.P., Biol. Reprod. 23 (1980) 243-252中所述之TM4細胞);猴腎細胞(CV1);非洲綠猴腎細胞(VERO-76);人類子宮頸癌細胞(希拉);犬腎細胞(MDCK;水牛鼠肝細胞(buffalo rat liver;BRL 3A);人類肺細胞(W138);人類肝細胞(Hep G2);小鼠乳房腫瘤(mouse mammary tumor;MMT 060562);TRI細胞(如例如在Mather, J.P.等人,Annals N.Y. Acad. Sci. 383 (1982) 44-68中所述);MRC 5細胞;及FS4細胞。其他有用的哺乳動物宿主細胞株包括中國倉鼠卵巢(CHO)細胞,包括DHFR-CHO細胞(Urlaub, G.等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77 (1980) 4216-4220);及骨髓瘤細胞株,諸如Y0、NS0及Sp2/0。關於適合於蛋白質生產之某些哺乳動物宿主細胞株之綜述,參見例如Yazaki, P.及Wu, A.M., Methods in Molecular Biology, 第248卷, Lo, B.K.C. (編), Humana Press, Totowa, NJ (2004), 第255-268頁。宿主細胞可為真核細胞,例如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞或淋巴細胞(例如Y0、NS0、Sp20細胞)。
本發明之核酸可整合至宿主細胞之基因體(例如染色體)中。根據標準技術,整合可藉由包括促進與基因體重組之序列來促進。
製造多域結合分子之方法
本文進一步提供製造本文所述之多域結合分子的方法。該等方法包含將本發明之宿主細胞維持於最佳條件下,該等最佳條件係用於表現本發明之核酸或表現載體之最佳條件,且分離該多域結合分子。
產生重組蛋白之方法為所屬技術領域中所熟知。編碼蛋白質之核酸可選殖至表現構築體或載體中,接著轉染至在其他情況下不會產生該蛋白質的宿主細胞,諸如大腸桿菌細胞、酵母細胞、昆蟲細胞或哺乳動物細胞,諸如猴COS細胞、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞、人類胚胎腎(HEK)細胞或骨髓瘤細胞中。用於表現蛋白質之例示性哺乳動物細胞為CHO細胞、骨髓瘤細胞或HEK細胞。達成此等目的之分子選殖技術為所屬技術領域中已知的且描述於例如Ausubel等人(編者), Current Protocols in Molecular Biology, Greene Pub. Associates and Wiley-Interscience(1988,包括迄今為止的所有更新)或Sambrook等人,Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)。廣泛多種選殖及試管內擴增方法適用於構築重組核酸。產生重組抗體之方法在所屬技術領域中亦已知,參見例如US4816567或US5530101。
核酸可被插入而可操作地連接於表現構築體或表現載體中之啟動子,以用於進一步選殖(DNA擴增)或用於在無細胞株統中或在細胞中表現。如本文所用,術語「啟動子(promoter)」應以最廣泛的情形解讀,且包括準確轉錄起始所需之基因體基因之轉錄調節序列,包括TATA盒或起始元件,具有或不具有例如回應於發育及/或外部刺激,或以組織特異性方式改變核酸表現之額外調節元件(例如上游活化序列、轉錄因子結合位、強化子及靜默子)。在本上下文中,術語「啟動子」亦用於描述賦予、活化或增強其可操作地連接之核酸之表現的重組、合成或融合核酸或衍生物。例示性啟動子可以含有一或多種特定調節元件的額外複本,以進一步增強該核酸的表現及/或改變其空間表現及/或時間表現。如本文所用,術語「可操作地連接於(operably linked to)」意謂啟動子相對於核酸定位,使得核酸之表現受啟動子控制。
用於在細胞中表現之多種載體為可商購的。載體組件一般包括但不限於以下中之一或多者:信號序列、編碼蛋白質之序列(例如,源自本文所提供之資訊)、強化子元件、啟動子及轉錄終止序列。所屬技術領域中具有通常知識者將瞭解用於表現蛋白質之適合序列。例示性信號序列包括原核分泌信號(例如pe1B、鹼性磷酸酶、青黴素酶、Ipp或熱穩定腸毒素II)、酵母分泌信號(例如轉化酶前導序列、因子前導序列或酸性磷酸酶前導序列)或哺乳動物分泌信號(例如單純疱疹病毒gD信號)。
哺乳動物細胞中具有活性之例示性啟動子包括巨細胞病毒即刻早期(cytomegalovirus immediate early)啟動子(CMV-IE)、人類延長因子(elongation factor)1-a啟動子(EF1)、小核RNA啟動子(Ula及Ulb)、α-肌凝蛋白重鏈啟動子、猴病毒40啟動子(Simian virus 40;SV40)、勞氏肉瘤病毒啟動子(Rous sarcoma virus;RSV)、腺病毒主要晚期啟動子、β-肌動蛋白啟動子;包含CMV強化子/β-肌動蛋白啟動子或免疫球蛋白啟動子之雜交調節元件或其活性片段。有用哺乳動物宿主細胞株之實例為由SV40轉形之猴腎CV1細胞株(COS-7,ATCC CRL 1651);人類胚腎細胞株(次選殖以在懸浮液培養物中生長之293或293細胞);幼倉鼠腎細胞(BHK,ATCC CCL 10);或中國倉鼠卵巢細胞(CHO)。
適合於在酵母細胞,諸如選自包含畢赤酵母(Pichia pastoris)、釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及粟酒裂殖酵母(S. pombe)之群的酵母細胞中表現之典型啟動子包括但不限於ADH1啟動子、GAL1啟動子、GALA啟動子、CUP1啟動子、PH05啟動子、nmt啟動子、RPR1啟動子或TEF1啟動子。
用於產生蛋白質之宿主細胞可視所用細胞類型而定,在多種培養基中培養。市售培養基,諸如Ham's F10(Sigma)、最低必需培養基(Minimal Essential Medium;MEM)(Sigma)、RPM1-1640(Sigma)及杜爾貝科氏改良伊格爾氏培養基(Dulbecco's Modified Eagle's Medium;DMEM)(Sigma),適用於培養哺乳動物細胞。用於培養本文所論述之其他細胞類型之培養基為所屬技術領域中已知的。
分離蛋白質之方法為所屬技術領域中已知的。在蛋白質分泌於培養基中之情況下,可首先使用市售蛋白質濃縮過濾器,例如Amicon或Millipore Pellicon超過濾單元濃縮來自此類表現系統之上清液。在任何先前步驟中可包括諸如PMSF之蛋白酶抑制劑以抑制蛋白分解,且可包括抗生素以防止外來污染物之生長。替代地或另外,可例如使用連續離心自表現蛋白質之細胞過濾及/或分離上清液。
由細胞製備之蛋白質可使用例如離子交換、羥基磷灰石層析、疏水性交互作用層析、凝膠電泳、透析、親和層析(例如,蛋白質A親和層析或蛋白質G層析)或前述之任何組合純化。
此等方法為所屬技術領域中已知的且描述於例如WO99/57134或Ed Harlow及David Lane (編者) Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, (1988)。
所屬技術領域中具有通常知識者亦將意識到,蛋白質可經修飾以包括促進純化或偵測之標籤,例如聚組胺酸標籤、六組胺酸標籤、流感病毒血球凝集素(hemagglutinin;HA)標籤、猴病毒5(V5)標籤、LLAG標籤或麩胱甘肽S-轉移酶(glutathione S-transferase;GST)標籤。所得蛋白質隨後使用所屬技術領域中已知之方法,諸如親和純化來純化。舉例而言,包含六his標籤之蛋白質藉由以下來純化:使包含蛋白質之樣品與固定於固體或半固體支撐物上之特異性結合六his標籤的鎳-氮基三乙酸(nickel-nitrilotriacetic acid;Ni-NTA)接觸,洗滌樣品以移除未結合之蛋白質,且隨後洗提結合之蛋白質。替代地或另外,在親和純化方法中使用結合標籤之配位體或抗體。
本發明之分子可適於高產率純化。產率可係基於在純化過程期間保留的材料之量(亦即相對於在再摺疊之前獲得的溶解材料之量,在純化過程結束時獲得的正確摺疊材料之量)來確定,及/或產率可係基於相對於原始培養物體積,在純化過程結束時獲得的正確摺疊材料之量。高產率意謂大於1%或大於5%或更高產率。高產率意謂大於1 mg/ml,或大於3 mg/ml,或大於5 mg/ml,或更高產率。
醫藥組成物及醫學方法
對於向患者投予,本發明之分子、本發明之核酸、表現載體或細胞可作為醫藥組成物之一部分與一或多種醫藥學上可接受之載劑或賦形劑一起提供。此醫藥組成物可呈任何適合形式(例如,取決於向患者投予其所需之方法)。其可以單位劑型提供,且一般將提供於密封容器中且可作為套組之一部分提供。此類套組通常(儘管不一定)包括使用說明書。其可包括複數個該等單位劑型。
醫藥組成物可經調適用於藉由任何適當途徑,諸如非經腸(包括皮下、肌肉內、鞘內或靜脈內)、經腸(包括經口或經直腸)、吸入或鼻內途徑投予。此類組成物可藉由藥學技術中已知之任何方法製備,例如藉由在無菌條件下混合活性成分與載劑或賦形劑來製備。用於將蛋白質製備成適合形式(例如醫藥組成物)用於向個體投予之方法為所屬技術領域中已知的,且包括例如如以下中所述之方法:Remington's Pharmaceutical Sciences (第18版, Mack Publishing Co., Easton, Pa., 1990)及U.S. Pharmacopeia: National Formulary (Mack Publishing Company, Easton, Pa., 1984)。
醫藥組成物將通常包含溶解於醫藥學上可接受之載劑,例如水性載劑中的本發明之多域結合分子(或本發明之核酸、細胞或載體)之溶液。可使用多種水性載劑,例如緩衝生理食鹽水及其類似物。組成物可含有接近生理條件所需的醫藥學上可接受之輔助物質,諸如pH調節劑及緩衝劑、毒性調節劑及其類似物,例如乙酸鈉、氯化鈉、氯化鉀、氯化鈣、乳酸鈉及其類似物。在此等調配物中,本發明之分子之濃度可廣泛變化,且將主要基於流體體積、黏度、體重及其類似者,根據所選擇之特定投予模式及患者需求來選擇。例示性載劑包括水、生理食鹽水、林格氏溶液(Ringer's solution)、右旋糖溶液及5%人類血清白蛋白。亦可使用非水性媒劑,諸如混合油及油酸乙酯。脂質體亦可用作載劑。媒劑可含有少量增強等張性及化學穩定性之添加劑,例如緩衝劑及防腐劑。
本發明之分子可具有用作治療劑之理想安全輪廓。理想安全輪廓意謂除了展現良好特異性之外,本發明之分子可通過了進一步臨床前安全性測試。此類測試之實例包括:全血分析,其確認在全血存在下之極少細胞介素釋放,且因此在活體內引起可能的細胞介素釋放症候群之風險較低;及同種異體反應性測試,其確認識別替代HLA類型之潛能較低。
本發明之分子之劑量可視待治療之疾病或病症、待治療之個體之年齡及狀況等而定,在寬廣限度之間變化。醫師將最終確定待使用之適當劑量。
本發明之多域結合分子、醫藥組成物、載體、核酸及細胞可以實質上純形式,例如至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%純提供。
本發明之多域結合分子可進一步與治療劑結合。可與本發明之分子結合之治療劑包括免疫調節劑及效應子、放射性化合物、酶(例如穿孔蛋白)或化學治療劑(例如順鉑)。為確保在所要位置發揮毒性功效,毒素可在連接至本文所述之多域結合分子之脂質體內部,使得化合物被緩慢釋放。此將防止在體內輸送期間之損害性作用,且確保毒素在本文所述之多域結合分子結合相關抗原呈現細胞之後具有最大功效。
適合之治療劑之實例包括但不限於:
● 小分子細胞毒性劑,亦即分子量低於700道爾頓之能夠殺滅哺乳動物細胞之化合物。此類化合物亦可含有能夠具有細胞毒性功效之毒性金屬。此外,應瞭解此等小分子細胞毒性劑亦包括前藥,亦即在生理學條件下衰變或轉化以釋放細胞毒性劑之化合物。此類藥劑之實例包括順鉑、美登素(maytansine)衍生物、雷查黴素(rachelmycin)、卡奇黴素(calicheamicin)、多西他賽(docetaxel)、依託泊苷(etoposide)、吉西他濱(gemcitabine)、異環磷醯胺、伊立替康(irinotecan)、黴法蘭(melphalan)、米托蒽醌(mitoxantrone)、卟吩姆鈉光卟啉II(sorfimer sodiumphotofrin II)、替莫唑胺(temozolomide)、拓朴替康(topotecan)、葡萄糖醛酸曲美沙特(trimetreate glucuronate)、奧瑞斯他汀E(auristatin E)、長春新鹼及小紅莓;
● 肽細胞毒素,亦即能夠殺滅哺乳動物細胞之蛋白質或其片段。舉例而言,蓖麻毒素、白喉毒素、假單胞菌屬(pseudomonas)細菌外毒素A、DNA酶及RNA酶;
● 放射性核素,亦即衰變且同時發射α或β粒子或γ射線中之一或多者之元素之不穩定同位素。舉例而言,碘131、錸186、銦111、釔90、鉍210及213、錒225及砈213;螯合劑可用於促進此等放射性核素與多域結合分子之結合;
● 免疫刺激劑,亦即刺激免疫反應之免疫效應分子。舉例而言,細胞介素,諸如IL-2及IFN-γ,
● 超抗原及其突變體;
● TCR-HLA融合物,例如與肽-HLA複合物之融合物,其中該肽源自常見人類病原體,諸如埃-巴二氏病毒(Epstein Barr Virus;EBV);
● 趨化因子,諸如IL-8、血小板因子4、黑色素瘤生長刺激性蛋白質等;
● 抗體或其片段,包括抗T細胞或NK細胞決定子抗體(例如抗CD3、抗CD28或抗CD16);
● 抗體或其片段,其結合定位於免疫突觸之分子;
● 具有抗體樣結合特徵之替代蛋白質骨架;
● 補體活化劑;
● 異源蛋白質域、同種異體蛋白質域、病毒/細菌蛋白質域、病毒/細菌肽。
本發明之多域結合分子、核酸、載體、醫藥組成物及細胞可用於治療諸如癌症,尤其與腫瘤相關抗原之表現相關的癌症之疾病。舉例而言,癌症可與如WO2011001152、WO2017109496、WO2017175006及WO2018234319中,及例如對應美國專利第8,519,100號、第11,639,374號、第11,505,590號及第11,427,624號中所描述之GP100、NYESO、MAGEA4或PRAME之表現相關,該等文獻中之各者的內容以引用之方式併入本文中。
待治療之癌症可為與PRAME表現相關之癌症。「與PRAME表現相關(associated with PRAME expression)」意謂該癌症包含表現PRAME之癌細胞。就此而言,癌症可為PRAME陽性癌症。癌症可已知與PRAME表現相關,且因此可不評估PRAME表現。替代地,可使用所屬技術領域中已知之任何方法,包括例如組織學方法評估PRAME表現。然而,本發明不意欲限於治療可藉由組織學方法偵測到PRAME表現之癌症。與PRAME表現相關之癌症包括但不限於黑色素瘤、肺癌、乳癌、卵巢癌、子宮內膜癌、食道癌、膀胱癌、頭頸癌、子宮癌、急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病及霍奇金氏淋巴瘤(Hodgkin's lymphoma)。舉例而言,與PRAME表現相關之癌症可為黑色素瘤。黑色素瘤可為葡萄膜黑色素瘤或皮膚黑色素瘤。肺癌可為非小細胞肺癌(non-small cell lung carcinoma;NSCLC)或小細胞肺癌(small cell lung cancer;SCLC)。乳癌可為三陰性乳癌(triple-negative breast cancer;TNBC)。膀胱癌可為尿道上皮癌。食道癌可為胃食道接合部(gastroesophageal junction;GEJ)腺癌。卵巢癌可為上皮卵巢癌,諸如高惡性度漿液性卵巢癌。
本發明亦提供:
● 本發明之多域結合分子、核酸、載體、醫藥組成物或細胞,其用於醫藥中,較佳用於治療癌症或腫瘤之方法中;
● 本發明之多域結合分子、核酸、載體、醫藥組成物或細胞在製造用於治療癌症或腫瘤之藥劑中的用途;
● 治療患者之癌症或腫瘤的方法,其包含向該患者投予本發明之多域結合分子、核酸、載體、醫藥組成物或細胞;
● 用於向人類個體投予的,包含本發明之多域結合分子、核酸、載體、醫藥組成物或細胞的可注射調配物。
治療方法可進一步包括分開地、以組合形式或依序投予額外抗贅生劑。此類藥劑之實例為所屬技術領域中已知且可包括免疫活化劑及/或T細胞調節劑。
套組及製品
在另一態樣中,提供一種套組或製品,其含有可用於治療及/或預防上文所描述之疾病的材料。
套組可包含(a)容器,其包含視情況於醫藥學上可接受之載劑或稀釋劑中之本發明之分子、核酸、載體或細胞;及(b)藥品說明書,其具有用於治療個體之疾病(例如癌症)的說明書。套組可進一步包含(c)至少一種其他治療學上之活性化合物或藥物。
藥品說明書可在容器上或與容器相關。適合的容器包括例如瓶子、小瓶、注射器等。容器可由各種材料,諸如玻璃或塑膠形成。容器保存或容納包含本發明之分子、核酸、載體或細胞之組成物,且可具有無菌接取口(例如,容器可為靜脈內溶液袋或具有可由皮下注射針刺穿之塞子的小瓶)。組成物中之至少一種活性劑為本發明之分子、核酸、載體或細胞。標籤或藥品說明書指示組成物用於治療符合治療條件之個體,例如患有或易患本文所述疾病之個體,其中關於所提供之組成物及任何其他藥劑之給藥量及時間間隔具有特定指導。套組可進一步包含額外容器,其包含醫藥學上可接受之稀釋劑緩衝液,諸如抑細菌注射用水(bacteriostatic water for injection;BWFI)、磷酸鹽緩衝生理食鹽水、林格氏溶液及/或右旋糖溶液。套組可進一步包括就商業及使用者角度而言所需之其他材料,包括其他緩衝劑、稀釋劑、過濾器、針及注射器。
套組視情況進一步包含容器,該容器包含第二藥劑,其中本發明之分子、核酸、載體或細胞為第一藥劑,且該套組進一步包含藥品說明書上關於以有效量用第二藥劑治療個體之說明書。
本發明之除本文中所展示及描述之修改以外的各種修改將自前述說明而變得對所屬技術領域中具有通常知識者顯而易見,且屬於隨附申請專利範圍之範圍內。本發明之各態樣之較佳特徵如針對其他態樣中之各者,細節上作必要修改。本文所提及之文獻以引用之方式在法律所允許之最大範圍內併入。
序列之描述
SEQ ID NO: 1HLA-A*02限制性肽:SLLQHLIGL
SEQ ID NO: 2例示性TCR之α鏈可變域之胺基酸序列。CDR(CDR1、CDR2及CDR3)加底線且分別指定為SEQ ID NO: 3、4及5,構架區(FR1、FR2、FR3及FR4)呈斜體且分別指定為SEQ ID NO: 27、6、7及28。此序列含有N24Q突變(加雙底線),其移除N連接型醣基化位。
GDAKTTQPNSMESNEEEPVHLPC
Q HS
TISGTDY IHWYRQLPSQGPEYVIH GLTSN VNNRMASLAIAEDRKSSTLILHRATLRDAAVYY CILILGHSRLGNYIATF GKGTKLSVIP
SEQ ID NO: 8例示性TCR之TCRβ鏈可變域之胺基酸序列。CDR(CDR1、CDR2及CDR3)加底線且分別指定為SEQ ID NO: 9、10及11,構架區(FR1、FR2、FR3及FR4)呈斜體且分別指定為SEQ ID NO: 29、12、13及30。
DGGITQSPKYLFRKEGQNVTLSCEQN LNHDA MYWYRQDPGQGLRLIYY SQIMGDE QKGDIAEGYSVSREKKESFPLTVTSAQKNPTAFYL CASSWWTGGASPIRF GPGTRLTVT
SEQ ID NO: 14例示性TCR之TCRα鏈之胺基酸序列。CDR(CDR1、CDR2及CDR3)加底線且分別指定為SEQ ID NO: 3、4及5,構架區(FR1、FR2、FR3及FR4)呈斜體且分別指定為SEQ ID NO: 27、6、7及28。恆定區以粗體展示且指定為SEQ ID NO: 15。在恆定區內,非原生半胱胺酸殘基加雙底線(在恆定區之位置48處),其經引入以產生鏈間二硫鍵。該序列亦含有N24Q、N148Q、N182Q及N193Q取代(加雙底線),其各自移除N連接型醣基化位。
GDAKTTQPNSMESNEEEPVHLPC
Q HS
TISGTDY IHWYRQLPSQGPEYVIH GLTSN VNNRMASLAIAEDRKSSTLILHRATLRDAAVYY CILILGHSRLGNYIATF GKGTKLSVIP NIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQT
QVSQSKDSDVYITDK
CVLDMRSMDFKSNSAVAWS
QKSDFACANAF
QNSIIPEDT
SEQ ID NO: 16例示性TCR之TCRβ鏈之胺基酸序列。CDR(CDR1、CDR2及CDR3)加底線且分別指定為SEQ ID NO: 9、10及11,構架區(FR1、FR2、FR3及FR4)呈斜體且分別指定為SEQ ID NO: 29、12、13及30。恆定區以粗體(無底線)展示且指定為SEQ ID NO: 19。在恆定區內,非原生半胱胺酸殘基加陰影(在恆定區之位置57處),其經引入以產生鏈間二硫鍵。該序列亦含有N184Q取代(加雙底線),其移除N連接型醣基化位。
DGGITQSPKYLFRKEGQNVTLSCEQN LNHDA MYWYRQDPGQGLRLIYY SQIMGDE QKGDIAEGYSVSREKKESFPLTVTSAQKNPTAFYL CASSWWTGGASPIRF GPGTRLTVT EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGV
CTDPQPLKEQPAL
QDSRYALSSRLRVSATFWQDPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRAD
SEQ ID NO: 17例示性抗CD3 scFv(T細胞接合免疫效應子域),在本文中稱為「U0」。輕鏈可變域(VL)呈斜體且指定為SEQ ID NO: 31。輕鏈CDR(CDR1、CDR2及CDR3)加底線且指定為SEQ ID NO: 33、34及35。重鏈可變域(VH)以粗體展示且指定為SEQ ID NO: 32。重鏈CDR(CDR1、CDR2及CDR3)加底線且指定為SEQ ID NO: 36、37及38。連接VL及VH之甘胺酸-絲胺酸連接子以純文字展示且指定為SEQ ID NO: 39。
AIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS
QDIRNYLNWYQQKPGKAPKLLIY
YTSRLESGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYC
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GYSFTGYTMNWVRQAPGKGLEWVAL
INPYKGVSTYNQKFKDRFTISVDKSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYC
ARSGYYGDSDWYFDVWGQGTLVTVSS
SEQ ID NO: 40另一例示性抗CD3 scFv(T細胞接合免疫效應子域),在本文中稱為「U28」。此序列與以上SEQ ID NO: 17相同,除了其中加雙底線之兩個取代(T164A及I201F)。輕鏈可變域(VL)呈斜體且指定為SEQ ID NO: 31。輕鏈CDR(CDR1、CDR2及CDR3)加底線且指定為SEQ ID NO: 33、34及35。重鏈可變域(VH)以粗體展示且指定為SEQ ID NO: 41。重鏈CDR(CDR1、CDR2及CDR3)加底線且指定為SEQ ID NO: 48、37及38。連接VL及VH之甘胺酸-絲胺酸連接子以純文字展示且指定為SEQ ID NO: 39。
AIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS
QDIRNYLNWYQQKPGKAPKLLIY
YTSRLESGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYC
QQGNTLPWTFGQGTKVEIK
GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGS
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS
GYSFTGY AMNWVRQAPGKGLEWVAL
INPYKGVSTYNQKFKDRFT
FSVDKSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYC
ARSGYYGDSDWYFDVWGQGTLVTVSS
SEQ ID NO: 54未經修飾之人類IgG1 Fc區(CH2及CH3域)
APELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 42例示性IgG1 Fc區序列。此序列相對於上述未經修飾之IgG1 Fc序列(SEQ ID NO: 54)具有四個取代,該等取代加雙底線。此等取代為:用於抑制與FcγR之結合之N297G取代,以及用於增強與含有T366W取代(形成杵之取代)之另一Fc區(例如SEQ ID NO: 43)之二聚的T366S、L368A及Y407V取代(形成臼之取代)。此序列中之取代之編號係根據EU編號方案。
APELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQY
G STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSL
S C
A VKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFL
V SKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 43另一例示性IgG1 Fc區序列。此序列相對於上述未經修飾之IgG1 Fc序列(SEQ ID NO: 54)具有兩個取代,該等取代加雙底線。此等取代為:用於抑制與FcγR之結合之N297G取代,以及用於增強與含有T366S、L368A及Y407V取代(形成臼之取代)之另一Fc區(例如SEQ ID NO: 42)之二聚的T366W取代(形成杵之取代)。此序列中之取代之編號係根據EU編號方案。
APELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQY
G STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSL
W CLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 44例示性IgG1鉸鏈序列(相對於原生人類IgG1序列,含有位置5處之C至S取代,根據SEQ ID NO: 44編號):
EPKSSDKTHTCPPCP
SEQ ID NO: 52截短IgG1鉸鏈序列:
DKTHTCPPCP
SEQ ID NO: 53IgG4鉸鏈序列:
ESKYGPPCPSCP
SEQ ID NO: 45命名為「mol093v11」之例示性多域單鏈結合分子之完整胺基酸序列。T細胞接合免疫效應子域(加底線)為SEQ ID NO: 17中所提供之抗CD3 scFv序列(「U0」)。pMHC結合域加雙底線且包含提供於SEQ ID NO: 16中之TCRβ鏈序列(在此情況下為「VC1」)(加雙底線,純文字),及提供於SEQ ID NO: 14中之TCRα鏈序列(在此情況下為「VC2」)(加雙底線,粗體文字)。半衰期延長域為Fc域,其係形成於SEQ ID NO: 42中提供的Fc區序列(斜體)(在此情況下為FC1區)與SEQ ID NO: 43中提供的Fc區序列(斜體及粗體)(在此情況下為FC2區)之間的二聚體。
AIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDIRNYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSRLESGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYCQQGNTLPWTFGQGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYSFTGYTMNWVRQAPGKGLEWVALINPYKGVSTYNQKFKDRFTISVDKSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSGYYGDSDWYFDVWGQGTLVTVSSGGGGS
DGGITQSPKYLFRKEGQNVTLSCEQNLNHDAMYWYRQDPGQGLRLIYYSQIMGDEQKGDIAEGYSVSREKKESFPLTVTSAQKNPTAFYLCASSWWTGGASPIRFGPGTRLTVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVCTDPQPLKEQPALQDSRYALSSRLRVSATFWQDPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADGGGSGGGGEPKSSDKTHTCPPCP
APELLGGP SVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYGSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKGGGSGGGG
GDAKTTQPNSMESNEEEPVHLPCQHSTISGTDYIHWYRQLPSQGPEYVIHGLTSNVNNRMASLAIAEDRKSSTLILHRATLRDAAVYYCILILGHSRLGNYIATFGKGTKLSVIPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTQVSQSKDSDVYITDKCVLDMRSMDFKSNSAVAWSQKSDFACANAFQNSIIPEDT GGGSGGGGEPKSSDKTHTCPPCP
APELLGGP SVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYGSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 46命名為「mol093v9」之例示性多域單鏈結合分子之完整胺基酸序列。T細胞接合免疫效應子域(加底線)為SEQ ID NO: 40中所提供之抗CD3 scFv序列(「U28」)。pMHC結合域加雙底線且包含提供於SEQ ID NO: 16中之TCRβ鏈序列(在此情況下為「VC1」)(加雙底線,純文字),及提供於SEQ ID NO: 14中之TCRα鏈序列(在此情況下為「VC2」)(加雙底線,粗體文字)。半衰期延長域為Fc域,其係形成於SEQ ID NO: 42中提供的Fc區序列(斜體)(在此情況下為FC1區)與SEQ ID NO: 43中提供的Fc區序列(斜體及粗體)(在此情況下為FC2區)之間的二聚體。
AIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDIRNYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSRLESGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYCQQGNTLPWTFGQGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYSFTGYAMNWVRQAPGKGLEWVALINPYKGVSTYNQKFKDRFTFSVDKSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSGYYGDSDWYFDVWGQGTLVTVSSGGGGS
DGGITQSPKYLFRKEGQNVTLSCEQNLNHDAMYWYRQDPGQGLRLIYYSQIMGDEQKGDIAEGYSVSREKKESFPLTVTSAQKNPTAFYLCASSWWTGGASPIRFGPGTRLTVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVCTDPQPLKEQPALQDSRYALSSRLRVSATFWQDPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADGGGSGGGGEPKSSDKTHTCPPCP
APELLGGP SVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYGSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKGGGSGGGG
GDAKTTQPNSMESNEEEPVHLPCQHSTISGTDYIHWYRQLPSQGPEYVIHGLTSNVNNRMASLAIAEDRKSSTLILHRATLRDAAVYYCILILGHSRLGNYIATFGKGTKLSVIPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTQVSQSKDSDVYITDKCVLDMRSMDFKSNSAVAWSQKSDFACANAFQNSIIPEDT GGGSGGGGEPKSSDKTHTCPPCP
APELLGGP SVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYGSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
額外連接子序列:
GGGGS(SEQ ID NO: 18)、GGGSG(SEQ ID NO: 20)、GGSGG(SEQ ID NO: 21)、GSGGG(SEQ ID NO: 22)、GSGGGP(SEQ ID NO: 23)、GGEPS(SEQ ID NO: 24)、GGEGGGP(SEQ ID NO: 25)、GGEGGGSEGGGS(SEQ ID NO: 26)、GGGSGGGG(SEQ ID NO: 47)、GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGS(SEQ ID NO: 39)、GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO: 49)、EAAAK(SEQ ID NO: 50)及EAAAKEAAAKEAAAK(SEQ ID NO: 51)。
實施例
將參考以下實施例更充分地理解本發明。然而,其不應視為限制本發明之範圍。應理解,本文中所描述之實施例及具體實例僅為達成說明之目的,且所屬技術領域中具有通常知識者將想到之根據其之各種修改或變化應包括在本申請案之領域及隨附申請專利範圍之範圍內。
實施例1-具有提高之效能的多域分子
包含TCR-抗CD3融合蛋白且合併有半衰期延長Fc域的多域分子先前已由WO 2020/157211描述且證實具有功能性。然而,隨後發現此類分子相對於分子之非Fc融合形式具有實質上降低之試管內活化T細胞之能力,且因此認為對於治療用途而言並非最佳的。進行進一步工程改造以鑑別具有改良之治療特性的新穎分子形式。
構築多域分子,其中各功能域配置在單一多肽鏈上。圖1A展示域配置之示意性圖示,且圖1B展示分子摺疊結構之假設圖示。
在第一實施例中,如先前所述(WO 2018/234319),多域單鏈分子之TCR域經設計以識別源自PRAME之HLA-A*02限制性肽SLLQHLIGL(SEQ ID NO: 1)。使用ELISpot分析,用IFNγ作為T細胞活化之讀取結果,研究此分子在抗原陽性癌細胞存在下驅動T細胞活化之能力。作為比較,使用WO 2020/157211中先前揭示之形式,用相同的TCR來構築多域分子,且與圖1A至圖1B中呈現之單鏈形式並行測試。
圖2中所示之數據表明,與先前揭示之形式相比,單鏈分子能夠驅動實質上改良的針對抗原陽性癌細胞之T細胞反應。
製造具有替代域配置之其他37種分子形式,且測試試管內效能。此等形式中無一者比圖1A至圖1B中所描繪之分子表現更佳。在17種形式下觀測到很少或未觀測到反應;在15種形式下觀測到低水平反應且在2種形式下觀測到中等水平反應。其餘三種形式除針對抗原陽性細胞之低效能以外,亦展現增加的針對抗原陰性細胞株之交叉反應性。
實施例2-製備靶向PRAME之單鏈多域分子
使用圖1A至圖1B中所示之形式製備兩種多域分子(稱為mol093v9及mol093v11)。兩種分子之TCR區經設計以識別源自PRAME之HLA-A*02限制性肽SLLQHLIGL。兩種分子的不同之處在於抗CD3 scFv片段之胺基酸序列。mol093v9及mol093v11之完整胺基酸序列分別提供於SEQ ID NO: 46及45中。
表現
使用Thermo ExpiCHOTM短暫表現方案,將mol093v9及mol093v11於Cho細胞中表現。簡言之,在轉染之前將培養細胞稀釋至6×10
6之濃度。轉染後第14天收集細胞,其中在轉染後第1天溫度變為32℃。在轉染後第1天及第5天進行進料添加。藉由以300×g及17,500×g進行的兩個連續離心步驟來進行澄清。所得上清液通過0.45 μm及0.2 μm膜過濾器。
純化
藉由蛋白質A繼之以尺寸排阻層析步驟來純化經澄清上清液。準備15 cm床高MabSelect Extra蛋白質A樹脂管柱。向管柱中裝載50倍管柱體積之上清液且使用pH 3.0之檸檬酸鈉緩衝液洗提。在已收集三倍管柱體積之後,藉由添加2 M Tris將經洗提之產物中和,且經由0.2 µm膜過濾器過濾。使用切向流式過濾(利用Ultracel® 30 kDa膜之Pellicon® XL50)將蛋白質A洗提液濃縮至至少2 mg/mL,隨後裝載至HiLoad 26/600 Superdex SEC樹脂上。管柱以5%管柱體積裝載。將產物洗提至磷酸鹽檸檬酸鹽緩衝液中,且經由0.22 μm膜過濾器過濾相關洗提份。
產率
使用Nanodrop分光光度計藉由280 nm下之吸光度量測純化材料之濃度。
每公升上清液之所計算產率為mol093v9:9.6 mg/L,及mol093v11:17 mg/L。
穩定性
在冷凍/解凍循環及/或在i)熱應力及ii)攪拌之條件下14天之後,藉由SEC UPLC評估分子穩定性。結果提供於緊接在下面的表中,其展示在指定條件下之mol093v11單體純度。在各情況下,認為單體純度係可接受的。
實施例3-靶向PRAME之多域分子的結合親和力及動力學
樣品條件 | Mol093 v11 ( U0 ) | Mol093 v9 ( U28 ) | ||||
總 HMW | 總單體 | 總 LMW | 總 HMW | 總單體 | 總 LMW | |
對照(5℃) | 3.3 | 96.7 | <0.1 | - | - | - |
冷凍/解凍 | 3.5 | 96.5 | <0.1 | - | - | - |
對照(5℃) | 4.6 | 95.3 | 0.1 | 3.0 | 97.0 | <0.1 |
攪拌 | 5.6 | 94.3 | 0.1 | 3.1 | 96.8 | <0.1 |
30℃ | 8.2 | 91.6 | 0.2 | 5.5 | 94.4 | 0.1 |
為驗證分子之TCR及抗CD3部分結合對應的目標分子,藉由用T200 BIAcore上進行表面電漿子共振(SPR),隨後單次注射CD3(γƐ),來進行單循環動力學分析。
方法
所使用之晶片來自Serie-S生物素捕捉套組(Cytiva)。操作緩衝液為含有0.005% P20的pH 7.2之磷酸鹽緩衝生理食鹽水(phosphate buffer saline;PBS)。藉由三次連續注射比率為3+1之8 M鹽酸胍(GuHCl)及1 M氫氧化鈉(NaOH)之溶液使晶片再生。流動速率為20 μL/分鐘,接觸時間為120秒。用經PBS+P20以16:1稀釋的生物素捕捉試劑(CAPture reagent)活化晶片。流動速率為2 μL/分鐘持續300秒。所捕捉之量為1600反應單位(Response Unit;RU)。以10 μg/mL、以10 μL/分鐘之流動速率注射經生物素標記之pHLA持續120秒。
對於單循環動力學分析,以60 μL/分鐘之流動速率注射mol093v9及mol093v11之連續稀釋液(最高濃度=15 nM),其中在各注射之間解離200秒,且對於第5次注射解離7200秒。
隨後以300 nM的濃度及10 μL/分鐘的流動速率注射CD3(γƐ)持續60秒。
對於FcRn捕捉,最初向流量槽中添加PBS+P20 0.005% pH6.0。經生物素標記之FcRn之注射以5 μg/mL、以2 μL/分鐘之流動速率進行120秒。FcRn之注射後,在所有流量槽上以10 μL/分鐘注射5 μM生物素持續120秒。FcRn之量為450 RU。
mol093v9或mol093v11以15 nM、以10 μL/分鐘之流動速率注射300秒,且解離600秒。對於mol093v9及mol093v11,反應分別為152 RU及163 RU。
使用製造商軟體計算動力學參數。將解離相擬合至單一指數衰變方程式,使得能夠計算半衰期。由k
off/k
on計算平衡常數K
D。
結果
mol093v9及mol093v11展現對pHLA複合物的皮莫耳親和力以及高水平之CD3活性及與FcRn之結合。數據展示於圖3中且結合參數概述於緊接在下面之表中。
實施例4-藥物動力學
ka ( 1/Ms ) | kd ( 1/s ) | KD ( M ) | KD ( pM ) | t1/2 ( hr ) | CD3 活性 ( % ) | FcRn 結合 | |
mol93v9 | 3.55E+05 | 2.56E-05 | 7.20E-11 | 72.02 | 7.54 | 83.5% | 是 |
mol93v11 | 2.86E+05 | 1.82E-05 | 6.38E-11 | 63.77 | 10.57 | 84.1% | 是 |
在Tg32 SCID小鼠中評估藥物動力學特性。測試物品藉由IV推注以1 mg/Kg、每化合物4隻小鼠來給藥,且在21天時段內連續採集血液樣品。藉由電化學發光免疫分析以及用經生物素標記之PRAME肽-HLA進行捕捉且用經磺基標記(sulfo-tagged)之抗scFv抗體進行偵測,在血清中偵測樣品。圖4展示4隻個別小鼠之隨時間推移的血清濃度。藉由非隔室分析來提取PK參數。
結果
Mol93v9之終末t
1/2經計算為9天。非隔室分析之結果展示於緊接在下面之表中。
分子 | C max ( ng/ml ) | T max ( min ) | T ½ ( h ) | T 1/2 之 SEM ( h ) | AUC inf ( h*ng/ml ) | 清除率 ( ml/h/kg ) |
Mol093v9 | 21814 | 5 | 171 | 13.0 | 1515240 | 0.66 |
使用NONMEM之2隔室模型化之結果展示於緊接在下面之表中。
實施例5-試管內T細胞活化
參數 | 小鼠 ( 25 g ) |
CL(mL/h) | 0.0211 |
V c(mL) | 1.24 |
Q(mL/h) | 0.0358 |
V p(mL/kg) | 3.60 |
比例誤差(%) | 25.8 |
t 1/2 α(hr) | 13.2 |
t 1/2 β(hr) | 216 |
評估Mol093v9及Mol093v11針對呈現SLLQHLIGL-HLA-A*02複合物之細胞,介導CD3+ T細胞的強力及特異性活化的能力。干擾素-γ(IFN-γ)釋放用作T細胞活化讀取結果。
方法
根據製造商說明書使用人類IFN-γ ELISPOT套組(BD Biosciences)進行分析。簡言之,以1×10
6/ml之密度在分析培養基(含有10%熱不活化FBS及1%青黴素-鏈黴素-L-麩醯胺酸之RPMI 1640)中製備目標細胞,且以50 μl之體積每孔50,000個細胞塗鋪。自新鮮供體血液分離之周邊血液單核細胞(peripheral blood mononuclear cell;PBMC)用作效應細胞,且以50 μl之體積以與目標細胞大致1:1之比率塗鋪(用於各實驗之PBMC的確切數目係供體依賴性的,且可調整以產生在適合分析範圍內的反應)。將融合分子自10 nM向下調定,以得到表示之最終濃度(跨越預期臨床上相關範圍)且以50 μl之體積添加至孔中。
根據製造商說明書準備盤。將目標細胞、效應細胞及融合分子添加至相關孔中且用分析培養基補足至200 μl之最終體積。所有反應一式三份地進行。亦藉由省略融合分子製備對照孔。隨後培育盤隔夜(37℃/5% CO2)。次日,用洗滌緩衝液(1×PBS小袋,含有0.05% Tween-20,在去離子水中製得)洗滌盤三次。隨後,以50 μl之體積向各孔中添加初級偵測抗體。盤在室溫下培育2小時,隨後再次洗滌三次。藉由將50 μl經稀釋之鏈球菌親生物素蛋白-HRP添加至各孔中,且在室溫下培育1小時,且重複洗滌步驟來進行二級偵測。在使用之前不超過15分鐘,將一滴(20 μl)AEC色素原添加至各1 ml AEC受質中且混合,且將50 μl添加至各孔中。定期監測點之顯影,且在自來水中洗滌盤以終止顯影反應。使盤在室溫下乾燥至少2小時,隨後使用CTL分析儀與Immunospot軟體(Cellular Technology Limited)對點進行計數。
在此實施例中,以下細胞株用作目標細胞:
抗原陽性:
Mel624 - 人類黑色素瘤細胞株
NCI-H1755 - 非小細胞肺癌(NSCLC)細胞株
OV56 - 卵巢漿液癌細胞株
THP-1 - 急性單核球性白血病細胞株
NCI-H1703 - 肺鱗狀細胞癌細胞株
COV318 - 卵巢漿液癌細胞株
抗原陰性:
TY-KNU - 卵巢漿液性腺癌(HLA-A*02-ve;PRAME-ve)
NCI-H1693 - 非小細胞肺癌(NSCLC)細胞株(HLA-A*02+ve;PRAME-ve)
結果
mol093v9及mol093v11在各種抗原陽性癌細胞存在下展現T細胞之強力活化。自數據計算且使用來自兩個個別供體之PBMC獲得EC
50值。兩個供體之T細胞活化EC
50值展示於緊接在下面之表中。圖5展示獲自供體1之數據。在抗原陰性細胞株中觀測到有限反應。
比較數據
細胞株 | Mol093v11 EC 50 | Mol093v9 EC 50 | ||
供體1 | 供體2 | 供體1 | 供體2 | |
NCI-H1755 | 147.6 | 64.1 | 69.1 | 62.9 |
NCI-H1703 | 126.6 | 231.8 | 120.0 | 117.0 |
OV56 | 9.2 | 10.8 | 4.0 | 5.1 |
COV318 | 47.7 | 37.1 | 36.3 | 29.8 |
THP-1 | 27.0 | 19.7 | 18.0 | 14.7 |
將由mol093v9驅動之T細胞活化與靶向相同PRAME肽但不包括半衰期延長Fc域之替代分子直接比較。此類分子描述於WO 2018/234319及美國專利第11,427,624號中,該等文獻中之各者的內容以引用之方式併入本文中。如上文所描述進行ELISPot分析。圖6展示兩種分子驅動類似強力的T細胞反應。
實施例6-T細胞殺滅
評估Mol093v9及Mol093v11介導抗原陽性癌細胞的強力及特異性殺滅之能力。
方法
分析使用以下進行:利用適用於阻抗讀取之96孔盤(xCELLigence E-盤96 PET部件號300600900)之xCELLigence平台,或利用CellPlayer 96孔凋亡蛋白酶-3/7細胞凋亡分析套組(Essen BioScience,目錄號4440)之Incucyte活細胞成像平台,且根據製造商說明書進行。目標細胞以各別最佳密度塗鋪(每孔添加之目標數目對於各細胞株不同,且先前已調定以確定最佳條件)且培育隔夜以允許其貼附。製備各種濃度之測試分子且將50 μl之各者添加至相關孔中以使得最終濃度在100 fM與10 nM之間。效應細胞以10:1之效應:目標細胞比率使用且以50 μl塗鋪。亦製備無融合物之對照樣品以及單獨含有效應細胞或單獨含有目標細胞之樣品。對於xCELLigence平台,使用分析培養基將盤中之最終體積調整至200 μl。使用標準化細胞指數(阻抗量測)確定細胞溶解百分比。對於Incucyte平台,以30 μM製得NucView分析試劑且將25 μl添加至每孔中,且使最終體積達到150 μl(得到5 μM最終濃度)。確定各影像中凋亡細胞之數目且以凋亡細胞數/mm2記錄。在所有情況下,分析一式三份地進行,在96小時內每2小時進行量測。
結果
圖7中呈現之數據展示經使用xCELLigence平台所測定,在mol093v9及mol093v11存在下抗原陽性細胞之即時殺滅。EC
50值展示於緊接在下面之表中且在低pM範圍內。偵測到之抗原陰性細胞株殺滅有限。
比較數據
細胞株 | Mol093v11 EC 50 ( pM ) | Mol093v9 EC 50 ( pM ) |
NCI-H1755 | 6.2 | 4.1 |
NCI-H1703 | 16.7 | 12.0 |
OV56 | 22.3 | 14.2 |
COV318 | 460.2 | 111.8 |
將由mol093v9驅動之T細胞活化與靶向相同PRAME肽但不包括半衰期延長Fc域之替代分子直接比較。此類分子描述於WO 2018/234319中。使用如上文所描述之Incucyte平台進行殺滅分析。圖8展示兩種分子驅動類似強力的殺滅反應。
實施例7-針對高風險正常組織之極小反應性
為了證明mol093v9及mol093v11之特異性,使用如上所述之相同ELISPOT方法及一組源自健康人類組織之正常細胞作為目標,進行進一步測試。正常組織包括心、肺、腎及皮膚。
針對與來自健康供體之PBMC共培養的目標正常細胞批次,以介於50 pM至10 nM範圍內之六種不同濃度測試TCR-抗CD3融合分子。對照量測使用無融合分子之樣品及其中正常細胞換成NCI-H1755(抗原陽性)細胞之樣品進行。
結果
圖9展示針對一個PBMC效應子供體用兩個正常細胞批次(心臟細胞(HCM27)及肺上皮細胞(HSAEpiC9))獲得之數據。對於至多並包括1.1 nM融合分子之mol093v9及mol093v11濃度,觀測到針對正常細胞之極小T細胞活化。
比較數據
將mol093v9之正常細胞反應性與靶向相同PRAME肽但不包括半衰期延長Fc域之替代分子直接比較。此類分子描述於WO 2018/234319中。圖10展示兩種分子展示針對來自皮膚(黑色素細胞)及腎臟(腎近端小管)之正常細胞的類似反應性缺乏。
無
[圖1A]至[圖1B]為本發明之例示性多域單鏈結合分子之示意圖。圖1A展示自N端至C端的域配置之圖示,且圖1B展示分子摺疊結構之假設圖示。
[圖2]展示使用IFNγ作為T細胞活化之讀取結果的ELISpot分析之結果。作為比較,使用WO 2020/157211中先前揭示之形式,用相同的TCR來構築多域分子,且與圖1A至圖1B中呈現之單鏈形式並行測試。各形式之示意性圖示置於圖2中以指示對應數據點。
[圖3]展示表面電漿子共振實驗之圖式,該等實驗評估mol093v9及mol093v11與pHLA、CD3及FcRn中之各者的結合。
圖4]展示在Tg32 SCID小鼠中評估之藥物動力學特性。小鼠藉由IV推注以1 mg/Kg給藥,且在21天時段內連續取樣血液。樣品在血清中藉由電化學發光免疫分析進行偵測。圖式展示4隻個別小鼠之隨時間推移的血清濃度。
[圖5]呈現展示ELISPot分析之結果的圖式,該等分析中試管內評估mol093v9及mol093v11之T細胞活化。
[圖6]呈現展示ELISPot分析之結果的圖式,該等分析中將mol093v9之T細胞活化與靶向相同PRAME肽但不包括半衰期延長Fc域之替代分子(WO 2018/234319)直接比較。圖6展示兩種分子驅動類似強力的T細胞反應。
[圖7]展示展現經使用xCELLigence平台所測定,在mol093v9及mol093v11存在下抗原陽性細胞之即時殺滅的圖式。
[圖8]呈現展示T細胞殺滅分析之結果的圖式,該等分析中將mol093v9與靶向相同PRAME肽但不包括半衰期延長Fc域之替代分子(WO 2018/234319)直接比較。圖8展示mol093v9展現與非HLE形式之分子(「Mol001」)類似的殺滅數據。
[圖9]展示針對一個PBMC效應子供體用兩個正常細胞批次(心臟細胞(HCM27)及肺上皮細胞(HSAEpiC9))獲得之ELISPOT T細胞活化分析之數據。對於至多並包括1.1 nM融合分子之mol093v9及mol093v11濃度,觀測到針對正常細胞之極小T細胞活化。
[圖10]呈現展示ELISPOT T細胞活化分析之結果的圖式,該等分析中將mol093v9之正常細胞反應性與靶向相同PRAME肽但不包括半衰期延長Fc域之替代分子(WO 2018/234319)直接比較。圖10展示兩種分子展示針對來自皮膚(黑色素細胞)及腎臟(腎近端小管)之正常細胞的類似反應性缺乏。
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Claims (45)
- 一種多域單鏈結合分子,其包含: i)肽-主要組織相容性複合物(peptide-major histocompatibility complex;pMHC)結合域,其結合SLLQHLIGL(SEQ ID NO: 1)HLA-A*02複合物,該pMHC域包含連接至恆定區之第一可變區(VC1)及連接至恆定區之第二可變區(VC2),其中VC1與VC2二聚形成該pMHC結合域; ii)T細胞接合(T cell engaging)免疫效應子域,其包含抗體輕鏈可變區(TCE-VL)及抗體重鏈可變區(TCE-VH);及 iii)半衰期延長域,其包含第一IgG Fc區(FC1)及第二IgG Fc區(FC2),其中該FC1區與該FC2區二聚形成Fc域; 其中該T細胞接合免疫效應子域連接至VC1之N端,VC1經由其C端連接至該FC1區之N端,該FC1區經由其C端連接至VC2之N端,且VC2經由其C端連接至該FC2區之N端;及 其中該pMHC結合域及該T細胞接合免疫效應子域分別能夠結合pMHC複合物及T細胞。
- 如請求項1之多域結合分子,其中該T細胞接合免疫效應子為ScFv。
- 如請求項1或2之多域結合分子,其中 (i)VC1包含(a)TCRα可變區及恆定區或(b)TCRβ可變區及恆定區,及 (ii)VC2包含(a)及(b)中之另一者。
- 如請求項3之多域結合分子,其中VC1包含該TCRβ可變區及恆定區且VC2包含該TCRα可變區及恆定區。
- 如請求項1或2之多域結合分子,其中 (i)VC1包含(a)重鏈抗體可變區或(b)輕鏈抗體可變區,及 (ii)VC2包含(a)及(b)中之另一者。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該TCE-VL區經由其C端連接至該TCE-VH區之N端且該TCE-VH區經由其C端連接至VC1之N端。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該T細胞接合免疫效應子域為CD3效應子域,其經由與CD3及/或TCR/CD3複合物之交互作用來活化T細胞。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該T細胞接合免疫效應子域為抗CD3 scFv。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該TCE-VH、該TCE-VL、該VC1、該VC2、該FC1及該FC2區中之兩者或更多者經由連接子及/或IgG鉸鏈序列彼此連接。
- 如請求項9之多域結合分子,其中該連接子或該等連接子具有選自以下之群之序列:GGGGS(SEQ ID NO: 18)、GGGSG(SEQ ID NO: 20)、GGSGG(SEQ ID NO: 21)、GSGGG(SEQ ID NO: 22)、GSGGGP(SEQ ID NO: 23)、GGEPS(SEQ ID NO: 24)、GGEGGGP(SEQ ID NO: 25)、GGEGGGSEGGGS(SEQ ID NO: 26)、GGGSGGGG(SEQ ID NO: 47)、GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGS(SEQ ID NO: 39)、GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO: 49)、EAAAK(SEQ ID NO: 50)及EAAAKEAAAKEAAAK(SEQ ID NO: 51)。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中VC1經由包含IgG鉸鏈序列之序列連接至該FC1區及/或VC2經由包含IgG鉸鏈序列之序列連接至該FC2區。
- 如請求項11之多域結合分子,其中該IgG鉸鏈序列與SEQ ID NO: 44至少80%一致。
- 如請求項11或請求項12之多域結合分子,其中將VC1連接至該FC1區之序列進一步包含甘胺酸-絲胺酸連接子及/或將VC2連接至該FC2區之序列進一步包含甘胺酸-絲胺酸連接子。
- 如請求項13之多域結合分子,其中該甘胺酸-絲胺酸連接子具有SEQ ID NO: 47中提供之序列。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該TCE-VL區經由包含甘胺酸-絲胺酸連接子之序列連接至該TCE-VH區,視情況其中該序列提供於SEQ ID NO: 39中。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該TCE-VH區經由包含甘胺酸-絲胺酸連接子之序列連接至VC1,視情況其中該序列提供於SEQ ID NO: 18中。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該FC1區經由包含甘胺酸-絲胺酸連接子之序列連接至VC2,視情況其中該序列提供於SEQ ID NO: 47中。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該半衰期延長域包含促進該FC1區與該FC2區之二聚之一或多個胺基酸取代。
- 如請求項18之多域結合分子,其中: (i)該FC1區及該FC2區中之一者包含一或多個根據EU編號方案之胺基酸取代,該一或多個胺基酸取代選自由T366S、L368A、T394S、F405A、Y407A、Y407T及Y407V組成之群;及 (ii)該FC1區及該FC2區中之另一者包含一或多個根據EU編號方案之胺基酸取代,該一或多個胺基酸取代選自由T366W、T366Y、T366W、T394W及F405W組成之群。
- 如請求項18之多域結合分子,其中: (i)該FC1區及該FC2區中之一者包含一或多個根據EU編號方案之胺基酸取代,該一或多個胺基酸取代選自由T366S、L368A及Y407V組成之群;及 (i)該FC1區及該FC2區中之另一者包含根據EU編號方案之T366W胺基酸取代。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該半衰期延長域包含減弱該Fc域之效應功能的一或多個胺基酸取代。
- 如請求項21之多域結合分子,其中該半衰期延長域包含一或多個根據EU編號方案之胺基酸取代,該一或多個胺基酸取代選自由S228P、E233P、L234A、L235A、L235E、L235P、G236R、G237A、P238S、F241A、V264A D265A、H268A、D270A、N297A、N297G、N297Q、E318A、K322A、L328R、P329G、P329A、A330S、A330L、P331A及P331S組成之群。
- 如請求項21或請求項22之多域結合分子,其中該半衰期延長域包含阻止或減少與FcγR之結合之一或多個胺基酸取代。
- 如請求項23之多域結合分子,其中該FC1區及/或該FC2區包含根據EU編號方案之N297G胺基酸取代。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該半衰期延長域包含促進與FcRn之結合之一或多個胺基酸取代。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中VC1及/或VC2包含移除一或多個醣基化位之一或多個胺基酸取代。
- 如請求項26之多域結合分子,其中 (i) 該TCRα可變區及恆定區包含如下位置處的一或多個胺基酸取代:選自由根據SEQ ID NO: 14編號之N24、N148、N182及N193組成之群;及/或 (ii) 該TCRβ可變區及恆定區包含根據SEQ ID NO: 16編號之位置N184處之胺基酸取代。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該T細胞接合免疫效應子域包含: (i) VL區,其包含SEQ ID NO: 33、34及35分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR;及 (ii) VH區,其包含SEQ ID NO: 36、37及38分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該T細胞接合免疫效應子域包含與SEQ ID NO: 31之序列至少80%一致之VL區及與SEQ ID NO: 32之序列至少80%一致之VH區。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中: a) VC1或VC2包含TCRα可變區,該TCRα可變區包含SEQ ID NO: 3、4及5分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR;及 b) VC1及VC2中之另一者包含TCRβ可變區,該TCRβ可變區包含SEQ ID NO: 9、10及11分別作為CDR1、CDR2及CDR3之CDR。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該TCRα可變區包含與SEQ ID NO: 2之序列至少80%、至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列,且該TCRβ可變區包含與SEQ ID NO: 8之序列至少80%、至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該TCRα恆定區包含與SEQ ID NO: 15之序列至少80%一致之胺基酸序列,且該TCRβ恆定區包含與SEQ ID NO: 19之序列至少80%一致之胺基酸序列。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該FC1區及該FC2區為IgG1 Fc區。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該FC1區包含與SEQ ID NO: 42之序列至少80%一致之胺基酸序列,且該FC2區包含與SEQ ID NO: 43之序列至少80%一致之胺基酸序列。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中TCRα區包含與SEQ ID NO: 14之序列至少80%、至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列,且該TCRβ區包含與SEQ ID NO: 16之序列至少80%、至少90%、至少95%或至少98%一致的胺基酸序列。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其自N端至C端按以下次序包含以下胺基酸序列: a) 抗CD3 scFv之胺基酸序列,視情況接著係提供於SEQ ID NO: 18中之連接子序列; b) TCRβ可變區及恆定區之胺基酸序列; c) 提供於SEQ ID NO: 47中之連接子序列,接著係提供於SEQ ID NO: 44中之IgG鉸鏈序列; d) 具有提供於SEQ ID NO: 42中之序列的Fc區; e) 提供於SEQ ID NO: 47中之連接子序列; f) TCRα可變區及恆定區之胺基酸序列; g) 提供於SEQ ID NO: 47中之連接子序列,接著係提供於SEQ ID NO: 44中之IgG鉸鏈序列;及 h) 具有提供於SEQ ID NO: 43中之序列的Fc區。
- 如前述請求項中任一項之多域結合分子,其中該分子具有與SEQ ID NO: 45之序列至少80%一致的胺基酸序列。
- 一種核酸,其編碼如前述請求項中任一項之多域結合分子。
- 一種表現載體,其包含如請求項38之核酸。
- 一種宿主細胞,其包含如請求項38之核酸或如請求項39之表現載體。
- 一種製造如請求項1至37中任一項之多域結合分子的方法,其包含將如請求項40之宿主細胞維持於最佳條件下,該等最佳條件係用於表現如請求項38之核酸或如請求項39之表現載體的最佳條件,且分離該多域結合分子。
- 一種醫藥組成物,其包含如請求項1至37中任一項之多域結合分子、如請求項38之核酸、如請求項39之表現載體或如請求項40之宿主細胞。
- 一種如請求項1至37中任一項之多域結合分子、如請求項38之核酸、如請求項39之表現載體、如請求項40之宿主細胞或如請求項42之醫藥組成物,其用作藥劑。
- 一種如請求項1至37中任一項之多域結合分子、如請求項38之核酸、如請求項39之表現載體、如請求項40之宿主細胞或如請求項42之醫藥組成物,其用於治療癌症。
- 如請求項44之多域結合分子、核酸、表現載體、宿主細胞或醫藥組成物,其中該癌症與PRAME表現相關。
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