TW202300643A - 用於增強幹細胞樣記憶t細胞工程改造之材料及方法 - Google Patents

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拉庫馬 加內桑
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Abstract

本揭露提供用於生成幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之方法。本揭露亦提供細胞、醫藥組成物、及其在過繼免疫療法中用於治療疾病(諸如癌症)之用途。

Description

用於增強幹細胞樣記憶T細胞工程改造之材料及方法
本發明係關於生成用於過繼免疫治療之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之方法。本發明亦係關於細胞、醫藥組成物、及其在過繼免疫療法中用於治療疾病之用途。 序列表
本申請案含有序列表,其已經以ASCII格式藉由電子方式提交且其全文以引用方式併入本文中。該ASCII副本(建立於2022年4月6日)被命名為253505_000131_SL.txt且檔案大小為21,082位元組。
免疫療法為治療實性瘤及其他癌症提供一種新途徑 1,2。生物製劑包括單株抗體、T細胞重定向雙特異性抗體、檢查點阻斷、以及最近的嵌合抗原受體T細胞(chimeric antigen receptor-T cells, CAR-T細胞),大幅地改善了腫瘤之治療。有力的證據表明,使用經基因改造之T細胞(諸如T細胞受體(T-cell receptor, TCR)轉導的及經CAR工程改造之T細胞)之過繼轉移之免疫療法可導致一些轉移性癌症患者之完全消退。目前,四種CAR-T療法已獲得美國食品藥物管理局(Food and Drug Administration, FDA)之批准,亦有更多正在臨床開發中 3。然而,最近在基於CAR-T細胞療法上之成功並非沒有缺點 4-7
CAR-T細胞係藉由收集患者之血液、提取T細胞、及表現CAR来生成,通常具有靶向(多個)腫瘤相關抗原(tumor associated antigen(s), TAA)之單鏈片段變量(single-chain fragment variables, scFv)。此過程對患者之T細胞進行重新程式化,使其專門針對腫瘤細胞並摧毀它們,導致細胞死亡 8。目前的臨床試驗已經利用經周邊血單核細胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)衍生之T細胞亞群或未選擇之大量T細胞群體作為經TCR工程改造及CAR-T細胞擴增之起始群體。然而,目前之製造程序已經導致生成投予至患者之最終細胞產品之不一致的、可變之細胞組成物。
幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞係一種罕見的早期記憶T細胞亞群,直接由初始T細胞生成,具有與其他特徵性記憶及效應T細胞亞群不同之表型、轉錄、及表觀遺傳狀態。單個T SCM細胞具有自我更新之能力,從而重建整個T細胞亞群,包括中樞記憶(T CM)、效應記憶、及效應T細胞亞群。T SCM細胞在健康供體及癌症患者中均被檢測到(儘管後者之頻率較低),並且與其他已知之記憶T細胞亞群相比,顯示出具有較少衰竭標記之基因特徵。從大量未分選之PBMC群體中生成優化之T SCM或T SCM樣細胞之努力,特別係應用當今之習知製造方法,已被證明基本上無效。
在此背景下,本申請提供一種產生具有增強效應功能及減少衰竭標記之T SCMCAR-T細胞以增強抗腫瘤免疫力之方法。
在一個態樣中,本文提供一種在T細胞群體中富集幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之方法,其包含下列(多個)步驟: a)  使該T細胞群體與一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素接觸一段足以富集T SCM細胞之時間;及 b)  可選地擴增該T SCM細胞。
在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-21。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15及IL-21。
在一些實施例中,一或多種細胞介素中之各者以約1至15 ng/ml、約2至14 ng/ml、約3至13 ng/ml、約4至12 ng/ml、約5至12 ng/ml、約6至12 ng/ml、約7至11 ng/ml、約8至12 ng/ml、約8至10 ng/ml、或約10 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。在一個實施例中,該一或多種細胞介素中之各者以約10 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。
在一些實施例中,該一或多種細胞介素不包含IL-2。
在一些實施例中,該T細胞群體包含泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合。在一些實施例中,該方法進一步包含在步驟(a)之前,從周邊血單核細胞(PBMC)中分離泛T細胞、初始CD4 +細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +細胞、或其任何組合。在一些實施例中,該T細胞群體不包含抑制性調節性T細胞。
在一些實施例中,該一或多種細胞介素在該擴增步驟(b)期間存在。
在一些實施例中,該方法進一步包含:對該等T細胞進行基因改造,以表現嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR)。在一些實施例中,該基因改造係藉由將編碼該CAR或經工程改造之TCR之多核苷酸引入該等細胞來進行。在一些實施例中,編碼該CAR或經工程改造之TCR之該多核苷酸係藉由病毒轉導、電穿孔、直接注射、磁轉染(magnetofection)、超聲波、衝擊或流體力學方法、或其組合而引入。
在一些實施例中,該CAR或經工程改造之TCR特異性結合一腫瘤抗原、一傳染性抗原、或一自體免疫抗原。在一些實施例中,該腫瘤抗原係選自BCMA、GPRC5D、CD79、KLK2、CD19、CD30、CD33、CD123、hK2、FLT3、CD20、CD22、KRASG12D、p53、BRAC1、及PSMA。
在一些實施例中,該基因改造係在該擴增步驟(b)之前進行。在一些實施例中,該一或多種細胞介素在該基因改造步驟期間存在。
在各種實施例中,該接觸步驟(a)進行約5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一個實施例中,該接觸步驟(a)進行約14天。
在各種實施例中,該接觸步驟(a)及該擴增步驟(b)總共進行5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一些實施例中,該接觸步驟(a)及該擴增步驟(b)總共進行約14天。
在各種實施例中,該接觸步驟(a)在約37℃之溫度下進行。
在各種實施例中,該方法進一步包含:在該接觸步驟(a)開始時活化該T細胞群體。在一個實施例中,該活化步驟用抗CD3藥劑及/或抗CD28藥劑進行約24小時。
在各種實施例中,該方法進一步包含:在該活化步驟(a)之前促發(priming)該T細胞群體。
在各種實施例中,該方法進一步包含:在該擴增步驟(b)之後,判定T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比。在一些實施例中,在該擴增步驟(b)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係至少約40%、50%、60%、或70%。在一個實施例中,在該擴增步驟(b)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係約60%至70%。
在一些實施例中,在T細胞群體中富集T SCM細胞之該方法係在體外或離體進行。
在一些實施例中,本文提供一種生成經基因改造之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之方法,其包含下列步驟: a)  獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體; b)  活化該T細胞群體; c)  對步驟(b)之後存在之該等細胞進行基因改造,以表現一嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR); d)  擴增該等經基因改造之細胞; 其中步驟b)、c)、及d)係在存在一或多種包含介白素-7 (IL-7)之細胞介素之情況下進行。
在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-21。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15及IL-21。
在一些實施例中,一或多種細胞介素中之各者以約1至15 ng/ml、約2至14 ng/ml、約3至13 ng/ml、約4至12 ng/ml、約5至12 ng/ml、約6至12 ng/ml、約7至11 ng/ml、約8至12 ng/ml、約8至10 ng/ml、或約10 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。在一個實施例中,該一或多種細胞介素中之各者以約10 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。
在各種實施例中,該一或多種細胞介素不包含IL-2。
在各種實施例中,從周邊血單核細胞(PBMC)中分離出泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合。在一些實施例中,該等T細胞不包含抑制性調節性T細胞。
在各種實施例中,該基因改造係藉由將編碼該CAR或經工程改造之TCR之多核苷酸引入該等細胞來進行。在一些實施例中,編碼該CAR或經工程改造之TCR之該多核苷酸係藉由病毒轉導、電穿孔、直接注射、磁轉染、超聲波、衝擊或流體力學方法、或其組合而引入。在一些實施例中,該CAR或經工程改造之TCR特異性結合一腫瘤抗原、一傳染性抗原、或一自體免疫抗原。在一些實施例中,該腫瘤抗原係選自BCMA、GPRC5D、CD79、KLK2、CD19、CD30、CD33、CD123、hK2、FLT3、CD20、CD22、KRASG12D、p53、BRAC1、及PSMA。
在一些實施例中,該擴增步驟(d)進行5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一些實施例中,該擴增步驟(d)進行約14天。
在一些實施例中,該等步驟(b)、(c)、及(d)總共進行5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一些實施例中,該等步驟(b)、(c)、及(d)總共進行14天。
在各種實施例中,該等步驟(b)、(c)、及(d)在約37℃之溫度下進行。
在各種實施例中,該活化步驟用抗CD3藥劑及/或抗CD28藥劑進行。在各種實施例中,該活化步驟進行約12至48小時(例如,24小時)。
在各種實施例中,該方法進一步包含:在該活化步驟(b)之前促發該T細胞群體。
在各種實施例中,該方法進一步包含:在該擴增步驟(d)之後,判定T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比。在一些實施例中,在該擴增步驟(d)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係至少約40%、50%、60%、或70%。在一個實施例中,在該擴增步驟(d)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係約60%至70%。
在一些實施例中,用於生成經基因改造之T SCM細胞之方法在體外或離體進行。
在另一態樣中,本文提供一種包含富集的幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之T細胞群體,其藉由包含下列(多個)步驟之方法製備: a)  將泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合與一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素接觸,以達到足以富集T SCM細胞之一段時間;及 b)  可選地擴增該T SCM細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含富集的幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之T細胞群體,其可藉由包含下列(多個)步驟之方法獲得: a)  將泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合與一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素接觸,以達到足以富集T SCM細胞之一段時間;及 b)  可選地擴增該T SCM細胞。
在本文所述之該T細胞群體之一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-21。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15及IL-21。
在本文所述之該T細胞群體之一些實施例中,以約1至15 ng/ml、約2至14 ng/ml、約3至13 ng/ml、約4至12 ng/ml、約5至12 ng/ml、約6至12 ng/ml、約7至11 ng/ml、約8至12 ng/ml、約8至10 ng/ml、或約10 ng/ml之濃度各自添加該一或多種細胞介素。在一個實施例中,以約10 ng/ml之濃度各自添加該一或多種細胞介素。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該一或多種細胞介素不包含IL-2。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,從周邊血單核細胞(PBMC)分離泛T細胞、初始CD4 +細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +細胞、或其任何組合。在一些實施例中,泛T細胞、初始CD4 +細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +細胞、或其任何組合不包含抑制性調節性T細胞。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該一或多種細胞介素在該擴增步驟(b)期間存在。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該製備方法進一步包含:對該等T細胞進行基因改造,以表現嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR)。在一些實施例中,該基因改造係藉由將編碼該CAR或經工程改造之TCR之多核苷酸引入該等細胞來進行。在一些實施例中,編碼該CAR或經工程改造之TCR之該多核苷酸係藉由病毒轉導、電穿孔、直接注射、磁轉染、超聲波、衝擊或流體力學方法、或其組合而引入。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該CAR或經工程改造之TCR特異性結合一腫瘤抗原、一傳染性抗原、或一自體免疫抗原。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該腫瘤抗原係選自BCMA、GPRC5D、CD79、KLK2、CD19、CD30、CD33、CD123、hK2、FLT3、CD20、CD22、KRASG12D、p53、BRAC1、及PSMA。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該基因改造係在該擴增步驟(b)之前進行。在一些實施例中,該一或多種細胞介素在該基因改造步驟期間存在。在一些實施例中,該一或多種細胞介素在該擴增步驟(b)期間存在。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該接觸步驟(a)進行約5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一個實施例中,該接觸步驟(a)進行約14天。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該接觸步驟(a)及該擴增步驟(b)總共進行約5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一個實施例中,該接觸步驟(a)及該擴增步驟(b)總共進行14天。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該接觸步驟(a)在約37℃之溫度下進行。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該製備方法進一步包含:在該接觸步驟(a)開始時活化該T細胞群體。在一個實施例中,該活化步驟用抗CD3藥劑及/或抗CD28藥劑進行約24小時。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該方法進一步包含:在該活化步驟(a)之前促發該T細胞群體。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,該方法進一步包含:在該擴增步驟(b)之後,判定T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比。在一些實施例中,在該擴增步驟(b)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係至少約40%、50%、60%、或70%。在一個實施例中,在該擴增步驟(b)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係約60%至70%。
在另一態樣中,本文提供一種包含富集的幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之T細胞群體,其藉由包含下列步驟之方法製備(或可藉由其獲得): a)  獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體; b)  活化該T細胞群體; c)  對步驟(b)之後存在之該等細胞進行基因改造,以表現一嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR); d)  擴增該等經基因改造之細胞; 其中步驟b)、c)、及d)係在存在一或多種包含介白素-7 (IL-7)之細胞介素之情況下進行。
在本文所述之T細胞群體之一些實施例中,在從對象獲得之樣本上執行獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體之步驟。
在本文所述之該T細胞群體之一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-21。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15及IL-21。
在本文所述之該T細胞群體之一些實施例中,以約1至15 ng/ml、約2至14 ng/ml、約3至13 ng/ml、約4至12 ng/ml、約5至12 ng/ml、約6至12 ng/ml、約7至11 ng/ml、約8至12 ng/ml、約8至10 ng/ml、或約10 ng/ml之濃度各自添加該一或多種細胞介素。在一個實施例中,以約10 ng/ml之濃度各自添加該一或多種細胞介素。
在本文所述之T細胞群體之各種實施例中,該一或多種細胞介素不包含IL-2。
在本文所述之T細胞群體之各種實施例中,從周邊血單核細胞(PBMC)分離泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合。在一些實施例中,該等T細胞不包含抑制性調節性T細胞。
在本文所述之T細胞群體之各種實施例中,該基因改造係藉由將編碼該CAR或經工程改造之TCR之多核苷酸引入該等細胞來進行。在一些實施例中,編碼該CAR或經工程改造之TCR之該多核苷酸係藉由病毒轉導、電穿孔、直接注射、磁轉染、超聲波、衝擊或流體力學方法、或其組合而引入。在一些實施例中,該CAR或經工程改造之TCR特異性結合一腫瘤抗原、一傳染性抗原、或一自體免疫抗原。在一些實施例中,該腫瘤抗原係選自BCMA、GPRC5D、CD79、KLK2、CD19、CD30、CD33、CD123、hK2、FLT3、CD20、CD22、KRASG12D、p53、BRAC1、及PSMA。
在本文所述之T細胞群體之各種實施例中,該擴增步驟(d)進行約5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一些實施例中,該擴增步驟(d)進行約14天。
在本文所述之T細胞群體之各種實施例中,該等步驟(b)、(c)、及(d)總共進行約5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一些實施例中,該等步驟(b)、(c)、及(d)總共進行14天。
在本文所述之T細胞群體之各種實施例中,該等步驟(b)、(c)、及(d)在約37℃之溫度下進行。
在本文所述之T細胞群體之各種實施例中,該活化步驟用抗CD3藥劑及/或抗CD28藥劑進行。在各種實施例中,該活化步驟進行約24小時。
在本文所述之T細胞群體之各種實施例中,該方法進一步包含:在該活化步驟(b)之前促發該T細胞群體。
在本文所述之T細胞群體之各種實施例中,該方法進一步包含:在該擴增步驟(d)之後,判定T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比。在一些實施例中,在該擴增步驟(d)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係至少約40%、50%、60%、或70%。在一些實施例中,在該擴增步驟(d)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係約60%至70%。
在另一態樣中,本文提供一種醫藥組成物,該醫藥組成物包含在本文中所述之該T細胞群體及醫藥上可接受之載劑或賦形劑。
在另一態樣中,本文提供一種在有需要之對象中治療疾病或病症之方法,該方法包含向該對象投予一治療有效量之包含富集的幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之該T細胞群體,或包含該T細胞群體及醫藥上可接受之載劑或賦形劑之醫藥組成物,該T細胞群體包含富集的T SCM細胞,其中包含富集的T SCM細胞之該T細胞群體係藉由包含下列步驟之方法製備(或可藉由其獲得): a)  獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體; b)  活化該T細胞群體; c)  對步驟(b)之後存在之該等細胞進行基因改造,以表現一嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR); d)  擴增該等經基因改造之細胞; 其中步驟b)、c)、及d)係在存在一或多種包含介白素-7 (IL-7)之細胞介素之情況下進行。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,在從對象獲得之樣本上執行獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體之步驟。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-21。在一些實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15及IL-21。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,以約1至15 ng/ml、約2至14 ng/ml、約3至13 ng/ml、約4至12 ng/ml、約5至12 ng/ml、約6至12 ng/ml、約7至11 ng/ml、約8至12 ng/ml、約8至10 ng/ml、或約10 ng/ml之濃度各自添加該一或多種細胞介素。在一個實施例中,以約10 ng/ml之濃度各自添加該一或多種細胞介素。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該一或多種細胞介素不包含IL-2。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,從周邊血單核細胞(PBMC)分離泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合。在一些實施例中,該等T細胞不包含抑制性調節性T細胞。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該基因改造係藉由將編碼該CAR或經工程改造之TCR之多核苷酸引入該等細胞來進行。在一些實施例中,編碼該CAR或經工程改造之TCR之該多核苷酸係藉由病毒轉導、電穿孔、直接注射、磁轉染、超聲波、衝擊或流體力學方法、或其組合而引入。在一些實施例中,該CAR或經工程改造之TCR特異性結合一腫瘤抗原、一傳染性抗原、或一自體免疫抗原。在一些實施例中,該腫瘤抗原係選自BCMA、GPRC5D、CD79、KLK2、CD19、CD30、CD33、CD123、hK2、FLT3、CD20、CD22、KRASG12D、p53、BRAC1、及PSMA。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該擴增步驟(d)進行約5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一些實施例中,該擴增步驟(d)進行約14天。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該等步驟(b)、(c)、及(d)總共進行約5至20天、約10至20、約5至18天、約8至15天、約10至18天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、或約18天。在一些實施例中,該等步驟(b)、(c)、及(d)總共進行14天。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該等步驟(b)、(c)、及(d)在約37℃之溫度下進行。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該活化步驟用抗CD3藥劑及/或抗CD28藥劑進行約24小時。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該方法進一步包含:在該活化步驟(b)之前促發該T細胞群體。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該方法進一步包含:在該擴增步驟(d)之後,判定T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比。在一些實施例中,在該擴增步驟(d)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係至少約40%、50%、60%、或70%。在一些實施例中,在該擴增步驟(d)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係約60%至70%。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該T細胞群體係對該對象同種異體的。在一些實施例中,該T細胞群體對該對象係自體的。
在本文所述之治療方法之一些實施例中,該疾病或病症係癌症、傳染病、或自體免疫疾病。在一些實施例中,該癌症係血液惡性疾病。在一些實施例中,癌症係實體腫瘤。在一些實施例中,該癌症係鱗狀細胞癌、腺鱗狀癌、肺癌、腹膜癌、肝細胞癌、胃癌(gastric or stomach cancer)、子宮頸癌、卵巢癌、肝癌(liver cancer)、膀胱癌、尿道癌、肝細胞瘤(hepatoma)、乳癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮內膜癌、唾液腺癌、腎癌(kidney or renal cancer)、前列腺癌、外陰癌、甲狀腺癌、肝癌(hepatic carcinoma)、肛門癌、陰莖癌、皮膚癌、多發性骨髓瘤及急性淋巴球性白血病(acute lymphocytic leukemia, ALL)、急性骨髓性白血病(acute myelocytic leukemia, AML)、慢性骨髓性白血病(chronic myelocytic leukemia, CML)、及慢性淋巴球性白血病(chronic lymphocytic leukemia, CLL)、諸如何杰金氏淋巴瘤(Hodgkin lymphoma, HL)及非何杰金氏淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma, NHL)之淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病/小淋巴球性淋巴瘤(chronic lymphocytic leukemia/small lymphocytic lymphoma, CLL/SLL)、外套細胞淋巴瘤(mantle cell lymphoma, MCL)、邊緣區B細胞淋巴瘤、原發性縱隔B細胞淋巴瘤、伯奇氏淋巴瘤(Burkitt lymphoma)、淋巴漿細胞淋巴瘤、免疫母細胞性大細胞淋巴瘤、毛細胞白血病(hairy cell leukemia, HCL)、前驅物B淋巴母細胞性淋巴瘤及原發性中樞神經系統(central nervous system, CNS)淋巴瘤、諸如前驅物T淋巴母細胞性淋巴瘤/白血病之T細胞NHL、周邊T細胞淋巴瘤(peripheral T-cell lymphoma, PTCL)、血管免疫母細胞性T細胞淋巴瘤、結外自然殺手T細胞淋巴瘤、腸病變型T細胞淋巴瘤、皮下脂層炎樣T細胞淋巴瘤、退行性大細胞淋巴瘤、上述一或多種白血病/淋巴瘤之混合物、腦癌、頭頸部癌、膽道癌(biliary cancer)、支氣管癌、脊索瘤、絨毛膜癌、上皮癌(epithelial carcinoma)、內皮細胞肉瘤、食道癌、Ewing氏肉瘤、重鏈病、造血癌(hematopoietic cancer)、免疫細胞類澱粉變性、意義不明單株免疫球蛋白增高症(monoclonal gammopathy of undetermined significance)、骨髓發育不良症候群、骨髓增生性疾病、原因不明性骨髓化生(agnogenic myeloid metaplasia, AMM)或骨髓纖維化(myelofibrosis, MF)、慢性特發性骨髓纖維化、骨髓增生性腫瘤、真性紅血球增多症、直腸腺癌、原發性血小板增多症、慢性嗜中性白血病、嗜酸性白血球增多症、或軟組織肉瘤、或其組合或轉移。
在一些實施例中,該癌症係表現BCMA之癌症。在一些實施例中,該表現BCMA之癌症係急性骨髓性白血病(AML)或多發性骨髓瘤(MM)、或燜燃型多發性骨髓瘤(SMM)。
在另一態樣中,本文提供一種用於在T細胞群體中富集幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之系統,其包含下列元素: a)  一用於使該T細胞群體與一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素接觸一段足以富集T SCM細胞之時間的構件;及 b)  可選地一用於擴增該等T SCM細胞的構件。
在本文所述之系統之一些實施例中,該T細胞群體包含泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合。
在本文所述之系統之一些實施例中,該系統進一步包含用於從周邊血單核細胞(PBMC)中分離出泛T細胞、初始CD4 +細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及CD8 +初始細胞、或其任何組合的構件。在一些實施例中,該系統進一步包含用於對該等T細胞進行基因改造以表現嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR)之構件。在一些實施例中,該系統進一步包含用於在該T細胞群體與包含介白素7 (IL-7)之一或多種細胞介素接觸開始時活化該T細胞群體之構件。在一些實施例中,該系統進一步包含用於在該活化之前促發該T細胞群體之構件。在一些實施例中,該系統進一步包含用於在該擴增步驟之後判定T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比之構件。
在另一態樣中,本文提供一種用於生成經基因改造之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之系統,其包含下列元素: a)  用於獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體之構件; b)  用於活化該T細胞群體之構件; c)  用於在活化後對該等細胞進行基因改造以表現嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR)之構件; d)  用於擴增該等經基因改造之細胞之構件; 其中在存在一或多種包含介白素-7 (IL-7)之細胞介素之情況下,獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體,活化該T細胞群體並對該T細胞群體進行基因改造。
在本文所述之系統之各種實施例中,該一或多種細胞介素進一步包含IL-15及/或IL-21。
在另一態樣中,本文提供一種用於在T細胞群體中富集幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之組成物,其包含: a.  一T細胞群體, b.  一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素,其係用於富集T SCM細胞之一構件,及 c.  可選地一用於擴增該等T SCM細胞的構件。
在另一態樣中,本文提供一種用於在T細胞群體中富集幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之組成物,其包含: a.  一T細胞群體,及 b.  一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素,及 一用於下列之構件: (i) 使該T細胞群體與一有效量之一或多種包含IL-7之細胞介素接觸,從而富集T SCM細胞, (ii) 活化該等富集的T SCM細胞,及 (iii)  可選地一用於擴增該等T SCM細胞的構件。
在另一態樣中,本文提供一種生成經基因改造之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之組成物,其包含: a.  一T細胞群體,及 b.  一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素,及 一用於下列之構件: (i) 使該T細胞群體與一有效量之一或多種包含IL-7之細胞介素接觸,從而富集T SCM細胞, (ii) 活化該等富集的T SCM細胞, (iii)  對該等富集的T SCM細胞進行基因改造,以表現嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR),及 (iv)  可選地一用於擴增該等T SCM細胞的構件。
在各種實施例中,該等T SCM細胞係藉由將該T細胞群體與一有效量之該一或多種包含IL-7之細胞介素接觸一段足以富集T SCM細胞之時間來富集。
相關申請案之交互參照
本申請案主張美國臨時專利申請案第63/172,595號(2021年4月8日申請)、第63/172,601號(2021年4月8日申請)、第63/172,605號(2021年4月8日申請)、及第63/172,610號(2021年4月8日申請)之優先權,各申請案之揭露內容全文以引用方式併入本文中。 定義
用語「T細胞(T cell)」及「T淋巴球(T lymphocyte)」在本文中係可互換的且同義地使用。如本文所使用,T細胞包括胸腺細胞、初始T淋巴球、未成熟T淋巴球、成熟T淋巴球、休止T淋巴球、或活化T淋巴球。T細胞可係T輔助(Th)細胞,例如T輔助1 (Th1)、T輔助2 (Th2)細胞、T輔助17 (Th17)或調節性T (Treg)細胞。T細胞可係T輔助細胞(Th;CD4 +T細胞)CD4 +T細胞、CD8 +T細胞、細胞毒性T細胞(CTL;CD8 +T細胞)、腫瘤浸潤細胞毒性T細胞(TIL;CD8 +T細胞)、CD4 +CD8 +T細胞、幹細胞樣記憶T(T SCM)細胞、中央記憶T細胞(T CM)、效應記憶T細胞(T EM)、末端效應T細胞(T eff)、或任何其他T細胞亞群。適合用於特定實施例之說明性T細胞群體包括幹中央記憶T細胞(T SCM)。
初始T細胞可具有下列細胞表面標記之表現模式:CCR7 +、CD62L +、CD45RA +、CD45RO -、CD95 -。幹細胞樣記憶T細胞(T SCM)可具有下列細胞表面標記之表現模式:CCR7 +、CD62L +、CD45RA +、CD45RO 、CD95 +。中央記憶T細胞(T CM)可具有下列細胞表面標記之表現模式:CCR7 +、CD62L +、CD45RA -、CD45RO +、CD95 +。效應記憶T細胞(T EM)可具有下列細胞表面標記之表現模式:CCR7 -、CD62L -、CD45RA -、CD45RO +、CD95 +。末端效應T細胞(T eff)可具有下列細胞表面標記之表現模式:CCR7 -、CD62L -、CD45RO -、CD95 +。參見,例如,Gattinoni et al. Nat. Med. 17(2011):1290-7;及Flynn et al. Clin. Translat. Immunol. 3(2014):e20,其等出於所有目的以全文引用之方式併入本文。
用語「表現(express)」及「表現(expression)」係指允許或導致基因或DNA序列中之資訊產生,例如藉由活化參與相應基因或DNA序列轉錄及/或翻譯之細胞功能來生成RNA或蛋白質。DNA序列係表現在細胞中或由細胞表現以形成「表現產物」,諸如RNA或蛋白質。亦可將表現產物本身(例如,所得蛋白質)表示為由該細胞「表現」。可將表現產物表徵為胞內、胞外、或跨膜的。
用語「載體(vector)」、「選殖載體(cloning vector)」及「表現載體(expression vector)」係指可將DNA或RNA序列(例如,外來基因)引入宿主細胞以對細胞進行基因改造並促進所引入之序列的表現(例如,轉錄及轉譯)之媒劑。載體包括質體、合成之RNA及DNA分子、噬菌體、病毒等。在某些實施例中,載體係病毒載體,諸如但不限於,病毒載體係腺病毒、腺相關病毒、α病毒、皰疹病毒、慢病毒、反轉錄病毒、或痘苗載體。
如本文所使用,用語「特異性結合(specifically binds)」、「特異性識別(specifically recognizes)」或「特異性用於(specific for)」指的係可測量及可重現之相互作用,諸如靶與抗原結合蛋白(諸如CAR或經工程改造之TCR)之間的結合,其在存在包括生物分子在內的異質分子群體之情況下,對於靶標之存在係決定性的。
用語「多肽(polypeptide)」、「肽(peptide)」或「蛋白質(protein)」可互換使用,並係指胺基酸殘基之聚合物。用語涵蓋所有種類的天然存在及合成蛋白質,包括各種長度之蛋白質片段、融合蛋白質、及經修飾蛋白質,包括但不限於醣蛋白,以及所有其他類型之經修飾蛋白質(例如,由磷酸化、乙醯化、肉豆蔻醯化(myristoylation)、棕櫚醯化(palmitoylation)、醣基化、氧化、甲醯化、醯胺化、聚麩胺醯化(polyglutamylation)、ADP-核糖基化、聚乙二醇化(pegylation)、生物素化(biotinylation)等產生之蛋白質)。
除非另有說明,否則用語「核酸(nucleic acid)」、「核苷酸(nucleotide)」及「多核苷酸(polynucleotide)」包括DNA及RNA。「核酸序列(nucleic acid sequence)」或「核苷酸序列(nucleotide sequence)」係指編碼胺基酸之核酸序列,該用語亦可指包括編碼作為選殖人造物(artifact)添加之任何胺基酸的部分之核酸序列,其包括針對連接子所編碼之任何胺基酸。
用語「治療(treat)」或一種狀態、病症或病況之「治療(treatment)」包括:(1)預防、延遲、或降低在對象中發展之該狀態、病症或病況之至少一種臨床或亞臨床症狀出現之發生率及/或可能性,該對象可能患有或易患該狀態、病症或病況,但尚未經歷或顯示該狀態、病症或病況之臨床或亞臨床症狀;或(2)抑制該狀態、病症或病況,即阻止、減少或延遲疾病之發展或其復發或其至少一種臨床或亞臨床症狀;或(3)緩解疾病,即引起狀態、病症或病況或其臨床或亞臨床症狀中之至少一者之消退。對待治療對象之益處係具有統計學意義,或至少對患者或醫師來說係可察覺的。
應用於劑量或量之用語「有效(effective)」係指化合物或醫藥組成物在投予至有需要之對象時足以產生所欲活性之量。請注意,當投予活性成分之組合時,組合之有效量可能包括或可能不包括若單獨投予時有效之各成分之量。所需之確切量將因對象而異,此取決於對象之物種、年齡、及大致狀況、正在治療之病況之嚴重性、所用的一或多種特定藥物、投予方式、及類似者。
如與本文所述之組成物有關時所使用,片語「醫藥上可接受(pharmaceutically acceptable)」係指此類組成物之分子實體及其他成分,其在向哺乳動物(例如人類)投予時係生理上可耐受且一般不會產生不利反應。較佳地,用語「醫藥上可接受」意指經美國聯邦或州政府之管理機構批准,或列在美國藥典(U.S. Pharmacopeia)或其他公認藥典中以用於哺乳動物、且尤其是人類中。
用語「患者(patient)」、「個體(individual)」、「對象(subject)」及「動物(animal)」在本文中可互換使用,係指哺乳動物,包括但不限於人類、非人類靈長類動物、及獸醫動物(veterinary animal)(例如,貓、狗、牛、馬、羊、豬等)及實驗動物模型。哺乳動物之實例包括齧齒目哺乳動物(諸如小鼠及倉鼠)、兔形目哺乳動物(諸如兔子)、食肉目哺乳動物(包括貓科動物(貓)及犬科動物(狗))、偶蹄目哺乳動物(包括牛科動物(牛)及豬科動物(豬)),奇蹄目哺乳動物(包括馬科動物(馬))、或靈長目哺乳動物、新世界猴類(Ceboid)、或猴類(Simoid)(猴)、或類人猿亞目哺乳動物(人類及猿)。在一較佳實施例中,該對象為人類。
用語「載劑(carrier)」係指與化合物一起投予之稀釋劑、佐劑、賦形劑、或媒劑。此類醫藥載劑可係無菌液體,諸如水及油,包括來自石油、動物、蔬菜、或合成來源者,諸如花生油、大豆油、礦物油、芝麻油、及類似者。較佳地,採用水或水溶液鹽水溶液及右旋糖水溶液及甘油溶液作為載體,尤其是用於可注射溶液。替代地,載劑可係固體劑型載劑,其包括但不限於下列中之一或多者:黏合劑(用於壓製丸劑)、助滑劑、封裝劑(encapsulating agent)、調味劑、及著色劑。合適的醫藥載劑係描述於E.W. Martin之「Remington’s Pharmaceutical Sciences」中。
除非上下文另有明確說明,否則單數形式「一(a)」、「一(an)」及「該(the)」皆包括複數指稱。因此,例如,提及之「方法」包括一或多個方法及/或本文描述之類型之步驟及/或當閱讀本揭露時對所屬技術領域中具有通常知識者而言將變得顯而易見者。
用語「約(about)」或「近似(approximately)」包括在值之統計上有意義之範圍內。此一範圍可在給定值或範圍之一數量級內,較佳地50%內、更佳地20%內、再更佳地10%內、且甚至更佳地5%內。用語「約」或「大約」所涵蓋之可允許變化取決於所研究之具體系統,且可由所屬技術領域中具有通常知識者輕易理解。
本揭露全文中之各個態樣可採範圍之形式呈現。應當理解,範圍形式之描述僅僅係為了方便及簡潔起見,不應理解為對本揭露範圍之僵化限制。因此,範圍之描述應該視為已經具體揭示了所有可能之子範圍以及該範圍內之個別數值。例如,對諸如1到6之範圍之描述應該被認為具有具體揭示之子範圍,例如從1到3、從1到4、從1到5、從2到4、從2到6、從3到6等,以及該範圍內之個別數字,例如1、2、2.7、3、4、5、5.3、及6。作為另一實例,諸如95至99%同一性之範圍包括具有95%、96%、97%、98%或99%同一性之某物,並且包括諸如96至99%、96至98%、96至97%、97至99%、97至98%及98至99%同一性之子範圍。此適用於任何範圍之寬度。
除非上下文另有明確說明,否則本發明任何態樣之所有實施例皆可組合使用。 發明方法
適用於本揭露方法之細胞可來自所有細胞及組織,特別係哺乳動物細胞及組織。適合之細胞可能來自人類、猿、猴、豬或齧齒動物,亦可能係初級細胞或培養細胞。在一些實施例中,使用本揭露之方法修飾之細胞係人類細胞。 供體細胞分離/富集
在一些實施例中,用於本揭露之方法之細胞從供體獲得。在一些實施例中,對於細胞被投予之接受者,細胞可係同種異體的或非自體的(「非自身」)。在替代實施例中,對於細胞被投予之接受者,細胞可係自體的。在一些實施例中,細胞獲自哺乳動物對象。在其他實施例中,細胞獲自靈長類對象。在一些實施例中,細胞獲自人類對象。
在一些實施例中,本揭露之方法中使用之細胞係淋巴球(例如,T細胞)。淋巴球可從下列來源獲得,諸如但不限於周邊血單核細胞、骨髓、淋巴結組織、臍帶血、胸腺組織、來自感染部位之組織、腹水、胸膜積水、脾組織、及腫瘤。淋巴球亦可由幹細胞分化生成。在一些實施例中,可使用技術人員通常已知的技術,諸如沉降,例如FICOLL™分離,從採集自對象之血液中獲得淋巴球。
來自對象循環血液之細胞可藉由血球分離術獲得。血球分離裝置一般含有淋巴球,包括T細胞、單核球、顆粒球、B細胞、其他有核白血球、紅血球、及血小板。可洗滌藉由血球分離術收集之細胞以去除血漿部分,並將細胞置於適當之緩衝液或培養基中以進行後續處理。可用PBS或另一種不含鈣、鎂及大多數(若不係全部)二價陽離子之合適溶液洗滌細胞。洗滌步驟可藉由所屬技術領域中具有通常知識者已知的方法完成,諸如但不限於使用半自動流通式離心機(例如,Cobe 2991細胞處理器、或Baxter CytoMate)。洗滌後,可將細胞重新懸浮在各種生物相容性緩衝液、細胞培養基、或其他有或沒有緩衝液之鹽水溶液中。
T細胞可藉由溶解紅血球及去除單核球從周邊血單核細胞(PBMC)中分離出來。作為一實例,可藉由PERCOLL™梯度離心分選T細胞。在一些實施例中,在分離PBMC之後,細胞毒性T淋巴球及輔助T淋巴球都可在活化、擴增、及/或基因改造之前或之後分選成初始、記憶、及效應T細胞亞群體。
在一些實施例中,本文所述方法中使用之T細胞群體包含泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及CD8 +T細胞、或其任何組合。在一些實施例中,該T細胞群體分離自從對象獲得之樣本。
在一些實施例中,本文所述方法中使用之T細胞群體不包含抑制性調節性T細胞。
在一些實施例中,可富集T淋巴球。例如,特定之T淋巴球亞群體(諸如幹中央記憶T細胞(T SCM),其表現一或多種標記,諸如但不限於CD3、CD4、CD8、CD14、CD15、CD16、CD19、CD27、CD28、CD34、CD36, CD45RA、CD45RO, CD56、CD62、CD62L、CD122、CD123、CD127、CD235a、CCR7、HLA-DR或其組合)可使用陽性或陰性選擇技術進行富集。在一些實施例中,使用本文詳述之方法富集幹細胞樣記憶T細胞(T SCM)。
在一些實施例中,T淋巴球亦可從幹細胞分化而來,如臍血幹細胞、前驅細胞、骨髓幹細胞、造血幹細胞(HSCs)、及誘導性多能幹細胞(iPSCs)。 基因改造
可對T細胞進行基因改造以表現高親和力T細胞受體(經工程改造之TCR)或嵌合抗原受體(CAR)。在一些實施例中,本文所述之方法包括將外源核酸分子引入細胞之步驟,該外源核酸分子包含編碼CAR或經工程改造之TCR之核苷酸序列。在一些實施例中,T細胞經基因改造以表現一或多種經工程改造之TCR或CAR。
在一些實施例中,可在存在包含IL-7、IL-15及/或IL-21之一或多種細胞介素之情況下進行基因改造。在一些實施例中,基因改造可在IL-7存在之情況下進行。在一些實施例中,基因改造可在IL-7及IL-15存在之情況下進行。在一些實施例中,基因改造可在IL-7及IL-21存在之情況下進行。在一些實施例中,基因改造可在IL-7、IL-15及IL-21存在之情況下進行。
在一些實施例中,基因改造可在沒有IL-2之情況下進行。
在一些實施例中,基因改造可在T細胞擴增之前進行。例如,可對從PBMC分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及CD8 +T細胞、或其任何組合進行基因改造。
在一些實施例中,可在T細胞擴增後進行基因改造。在一些實施例中,包含富集的幹細胞樣記憶T細胞(T SCM)之T細胞經基因改造。
如本文所使用,「嵌合抗原受體(chimeric antigen receptor)」或「CAR」係指包含細胞外靶結合域、跨膜域、及胞質域之細胞表面受體,其包含淋巴球活化域及可選地至少一種共刺激信號傳導域,所有該等域之組合不會一起天然存在於單一蛋白質上。此特別包括其中胞外域及胞質域不會一起天然存在於單一受體蛋白上之受體。
天然存在之T細胞受體包含兩個次單元:一個α次單元及一個β次單元,各次單元係由各T細胞基因組中之重組事件生成之獨特蛋白質。可針對其對於特定靶抗原之選擇性來篩選TCR庫。以此方式,可選擇、選殖對靶抗原具有高親和力及反應性之天然TCR,並隨後將其引入用於過繼免疫治療之T細胞群體中。
在一個實施例中,T細胞係藉由引入編碼TCR次單元之多核苷酸來修飾,該次單元具有形成TCR之能力,該等TCR針對表現靶抗原之腫瘤細胞賦予T細胞特異性。在特定實施例中,與自然發生之次單元相比,該等次單元具有一或多個胺基酸替換、缺失、插入、或修飾,只要該等次單元保持形成TCR之能力,使轉染之T細胞具有歸巢到靶細胞之能力,並參與免疫相關之細胞介素信號傳導。經工程改造之TCR亦能較佳地以高親和力結合顯示相關腫瘤相關肽之靶細胞,並選擇性地介導對呈現相關肽的靶細胞於體內之有效殺滅。
包含編碼CAR或經工程改造之TCR之核苷酸序列之外源核酸分子可游離地表現(episomally expressed)。替代地,可經由同源定向修復(homology directed repair, HDR)(例如,藉由使用基因組編輯核酸酶,諸如CRISPR/Cas)將包含編碼CAR或經工程改造之TCR之核苷酸序列之外源核酸分子敲入基因座。例如,但不限於,可將包含編碼CAR或經工程改造之TCR之核苷酸序列之外源性核酸分子敲入TCRα、TCRβ、或B2M基因座,以替換內源基因。在敲入之情況下,可將包含編碼CAR或經工程改造之TCR之核苷酸序列之核酸分子作為雙鏈DNA (dsDNA)、單鏈DNA (ssDNA)、或在病毒載體中提供(例如,AAV)。在任一實施例中,該基因與在細胞中具活性之啟動子(promoter)可操作地連接(即,在轉錄控制下)。
CAR或經工程改造之TCR可針對在惡性細胞或感染細胞表面所表現之抗原,諸如腫瘤抗原或感染性抗原。
可由本文所述之經修飾细胞靶向之腫瘤抗原之非限制性實例包括B細胞成熟抗原(BCMA)、人上皮生長因子受體2 (human epidermal growth factor receptor 2, HER2)、激肽釋放素相關肽酶2 (Kallikrein Related Peptidase 2, KLK2)、己糖激酶2 (Hexokinase 2, hK2)、介白素-13受體次單元α-2 (interleukin-13 receptor subunit alpha-2, IL-13Ra2)、肝配蛋白(ephrin) - A型受體2 (ephrin type-A receptor 2, EphA2)、A激酶錨定蛋白4 (A kinase anchor protein 4, AKAP-4)、腎上腺素受體β3 (adrenoceptor beta 3, ADRB3)、退行性淋巴瘤激酶(naplastic lymphoma kinase, ALK)、免疫球蛋白λ樣多肽1 (immunoglobulin lambda- like polypeptide 1, IGLL1)、雄性激素受體、血管生成素結合細胞表面受體2 (Tie 2)、B7H3 (CD276)、骨髓基質細胞抗原2 (bone marrow stromal cell antigen 2, BST2)、碳酸酐酶IX (carbonic anhydrase IX, CAIX)、CCCTC結合因子(鋅指蛋白)樣(BORIS)、CD171、CD179a、CD24、CD300分子樣家族成員f (CD300LF)、CD38、CD44v6、CD72、CD79a、CD79b、CD97、X染色體開放讀框61 (CXORF61)、密連蛋白6 (CLDN6)、CS-1(CD2亞群1、CRACC、SLAMF7、CD319、或19A24)、C型凝集素域家族12成員A (C-type lectin domain family 12 member A, CLEC12A)、C型凝集素樣分子-1 (C-type lectin-like molecule-1, CLL-1)、細胞週期素B1、細胞色素P450 1B 1 (Cytochrome P450 1B 1, CYP1B 1)、含EGF樣模組黏蛋白樣荷爾蒙受體2 (EGF-like module-containing mucin-like hormone receptor-like 2, EMR2)、上皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor, EGFR)、ERG(跨膜蛋白酶絲胺酸2 (transmembrane protease, serine 2, TMPRSS2) ETS融合基因)、位於12p染色體上之ETS易位變異基因6 (ETV6-AML)、IgA受體之Fc片段(Fc fragment of IgA receptor, FCAR)、Fc受體樣5 (Fc receptor-like 5, FCRL5)、Fms樣酪胺酸激酶3 (Fms-like tyrosine kinase 3, FLT3)、葉酸受體β、Fos相關抗原1、岩藻糖GM1、G蛋白偶聯受體20 (G protein-coupled receptor 20, GPR20)、G蛋白偶聯受體C型家族5D (G protein-coupled receptor class C group 5, member D, GPRC5D)、神經節苷脂GD3、神經節苷脂GM3、糖神經醯胺(glycoceramide) (GloboH)、磷脂肌醇聚糖-3 (Glypican-3, GPC3)、A型肝炎病毒細胞受體1 (HAVCR1)、globoH六醣部分、高分子量黑色素瘤相關抗原(high molecular weight-melanoma-associated antigen, HMWMAA)、人端粒酶反轉錄酶(human Telomerase reverse transcriptase, hTERT)、介白素11受體α (interleukin 11 receptor alpha, IL-11Ra)、KIT (CD117)、白血球相關免疫球蛋白樣受體1 (leukocyte-associated immunoglobulin-like receptor 1, LAIR1)、白血球免疫球蛋白樣受體次家族A成員2 (leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 2, LILRA2)、Lewis(Y)抗原、淋巴球抗原6錯合物、基因座K 9 (LY6K)、淋巴球抗原75 (lymphocyte antigen 75, LY75)、淋巴球特異性蛋白酪胺酸激酶(lymphocyte-specific protein tyrosine kinase, LCK)、乳腺分化抗原(NY-BR-1)、黑色素瘤癌睾丸抗原1 (melanoma cancer testis antigen-1, MAD-CT-1)、黑色素瘤癌睾丸抗原-2 (melanoma cancer testis antigen-2, MAD-CT-2)、黑色素瘤凋亡抑制劑(melanoma inhibitor of apoptosis, ML-IAP)、細胞表面相關粘蛋白1 (mucin 1, cell surface associated, MUC1)、N-乙醯胺基葡萄糖胺基轉移酶V (N-acetyl glucosaminyl-transferase V, NA17)、神經細胞粘附分子(neural cell adhesion molecule, NCAM)、o-乙醯基-GD2神經節苷脂(o-acetyl-GD2 ganglioside, OAcGD2)、嗅覺受體51E2 (olfactory receptor 51E2, OR51E2)、p53突變體、配對盒蛋白Pax-3 (PAX3)、配對盒蛋白Pax-5 (PAX5)、泛連接蛋白3 (pannexin 3, PANX3)、胎盤特異性1 (placenta-specific 1, PLAC1)、血小板衍生之生長因子受體β(platelet-derived growth factor receptor beta, PDGFR-β)、聚唾液酸、前頂體素結合蛋白sp32 (OY-TES 1)、前列腺幹細胞抗原(prostate stem cell antigen, PSCA)、蛋白酶絲胺酸21 (Protease Serine 21, PRSS21)、蛋白酶體(Prosome, Macropain)次單元β型9 (LMP2)、Ras同源家族成員C (Ras Homolog Family Member C, RhoC)、肉瘤易位斷點、唾液酸化之路易斯黏著分子(sialyl Lewis adhesion molecule, sLe)、精子蛋白17 (sperm protein 17, SPA17)、T細胞識別之鱗狀細胞癌抗原3 (squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells 3, SART3)、階段特異性胚胎抗原4 (stage-specific embryonic antigen-4, SSEA-4)、滑膜肉瘤、X斷點2 (SSX2)、TCRγ交替讀框蛋白(TCR gamma alternate reading frame protein, TARP)、TGS5、甲狀腺刺激素受體(thyroid stimulating hormone receptor, TSHR)、Tn抗原(Tn Ag)、腫瘤內皮標記1 (tumor endothelial marker 1, TEM1/CD248)、腫瘤內皮標記7相關的(tumor endothelial marker 7-related, TEM7R)、尿溶蛋白2 (uroplakin 2, UPK2)、血管內皮生長因子受體2 (vascular endothelial growth factor receptor 2, VEGFR2)、v-myc禽骨髓細胞瘤病毒癌基因神經母細胞瘤衍生同源物(v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene neuroblastoma derived homolog, MYCN)、威爾姆氏瘤蛋白(Wilms tumor protein, WT1)、以及X抗原家族成員1A (XAGE1)、或其片段或變體。
可由本文所述之經修飾細胞靶向之額外抗原包括但不限於:碳酸酐酶EX、α-胎蛋白、A3、A33抗體特異性抗原、Ba 733、BrE3-抗原、CA125、CD1、CD1a、CD3、CD5、CD15、CD16、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD25、CD30、CD33、CD38、CD45、CD74、CD80、CD123、CD138、Fms樣受體酪胺酸激酶3 (FLT3)或CD135、結腸特異性抗原-p (CSAp)、CEA (CEACAM5)、CEACAM6、CSAp、EGFR、EGP-I、EGP-2、Ep-CAM、EphA1、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7、EphA8、EphA10、EphB1、EphB2、EphB3、EphB4、EphB6、FIt-I、Flt-3、葉酸受體、HLA-DR、人類絨毛膜促性腺激素(human chorionic gonadotropin, HCG)及其次單元、缺氧誘導因子(hypoxia inducible factor, HIF-I)、Ia、IL-2、IL-6、IL-8、胰島素生長因子-1 (insulin growth factor-1, IGF-I)、KC4-抗原、KS-1-抗原、KS1-4、Le-Y、巨噬細胞抑制因子(macrophage inhibition factor, MIF)、MAGE、MUC1、MUC2、MUC3、MUC4、NCA66、NCA95、NCA90、PAM-4抗體特異性抗原、胎盤生長因子、p53、前列腺酸性磷酸酶、PSA、PSMA、RS5、S100、TAC、TAG-72、生腱蛋白(tenascin)、TRAIL受體、Tn抗原、Thomson-Friedenreich抗原、腫瘤壞死抗原、VEGF、ED-B纖連蛋白、17-IA-抗原、血管生成標記、癌基因標記、或癌基因產物。
在特定實施例中,由本文所述之經修飾細胞靶向之腫瘤抗原係BCMA、GPRC5D、CD79、KLK2、CD19、CD30、CD33、CD123、hK2、FLT3、CD20、CD22、KRASG12D、p53、BRAC1、或PSMA。
在一個實施例中,與BCMA特異性結合之CAR包含胞外靶結合域,該域包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 2具有至少70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%之同一性之序列。
在一個實施例中,與BCMA特異性結合之BCMA包含胞外靶結合域,該域包含SEQ ID NO: 3之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 3具有至少70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%之同一性之序列。
在一個實施例中,與BCMA特異性結合之CAR包含SEQ ID NO: 11之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 11具有至少70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%之同一性之序列。
在一個實施例中,與BCMA特異性結合之CAR包含胞外靶結合域,該域包含SEQ ID NO: 12之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 12具有至少70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%之同一性之序列。
感染性抗原可係病毒抗原、細菌抗原、真菌抗原、寄生蟲抗原、或普里昂蛋白(prion)抗原、或類似者。感染性抗原包括完整之微生物(例如,病毒、細菌、真菌)及其天然分離物及片段或衍生物,以及與天然微生物抗原相同或相似並誘導對彼微生物(例如病毒、細菌、真菌)特異性免疫反應之合成或重組化合物。若化合物誘導對天然微生物抗原之免疫反應(體液性及/或細胞性),則其類似於天然微生物抗原。此類抗原例行用於本領域中,並且為所屬技術領域中具有通常知識者所熟知。
感染性抗原可係感染性病毒或源自感染性病毒。已在人類中發現之感染性病毒之非限制性實例包括但不限於:腺病毒科(Adenoviridae)(大多數腺病毒);沙粒病毒科(Arena viridae)(出血熱病毒);鳥病毒科(Birnaviridae);布加病毒科(Bungaviridae)(例如,漢江病毒、布加病毒、靜脈病毒、及內羅病毒(Nairo virus));鈣化病毒科(Calciviridae)(例如,引起腸胃炎之菌株);冠狀病毒科(Coronoviridae)(例如,冠狀病毒);絲狀病毒科(例如,伊波拉病毒);黃病毒科(Flaviridae)(例如,登革熱病毒、腦炎病毒、黃熱病病毒);嗜肝DNA病毒科(Hepadnaviridae)(B型肝炎病毒);皰疹病毒科(Herpesviridae)(單純皰疹病毒(herpes simplex virus, HSV)1及2、水痘帶狀皰疹病毒、鉅細胞病毒(cytomegalovirus, CMV)、皰疹病毒);虹彩病毒科(Iridoviridae)(例如,非洲豬瘟病毒);諾瓦克病毒及相關病毒,以及星狀病毒;正黏病毒科(Orthomyxoviridae)(例如,流感病毒);巴波多病毒科(Papovaviridae)(乳突病毒、多瘤病毒);副黏液病毒科(Paramyxoviridae)(例如,副流感病毒、腮腺炎病毒、麻疹病毒、呼吸道合胞病毒);細小病毒科(Parvovirida)(細小病毒);小核糖核酸病毒科(例如,脊髓灰質炎病毒、A型肝炎病毒;腸病毒、人柯薩奇病毒、鼻病毒、埃可病毒);痘病毒科(Poxviridae)(天花病毒、牛痘病毒、痘病毒);呼腸孤病毒科(Reoviridae)(例如,呼腸孤病毒、環形病毒、及輪狀病毒);逆轉錄病毒科(Retroviridae)(例如,人類免疫缺陷病毒,諸如HIV-1(亦稱為HTLV-III、LAV或HTLV-III/LAV、或HIV-III);及其他分離物,諸如,HIV-LP);彈狀病毒科(Rhabdoviradae)(例如,水皰性口炎病毒、狂犬病病毒);披膜病毒科(Togaviridae)(例如,馬腦炎病毒、風疹病毒);及未分類之病毒(例如,海綿狀腦病之病原體、三角洲肝炎(delta hepatitis)之病原體、非A非B型肝炎(即C型肝炎)之病原體)。
感染性抗原可係感染性細菌或源自感染性細菌。革蘭氏陰性菌及革蘭氏陽性菌都可作為脊椎動物之抗原。這種革蘭氏陽性細菌包括但不限於巴氏桿菌屬、葡萄球菌屬、及鏈球菌屬。穀物陰性細菌包括但不限於大腸桿菌、假單胞菌屬、及沙門氏菌屬。感染性細菌之非限制性實例包括但不限於:以色列放線菌( Actinomyces israelli)、炭疽桿菌( Bacillus antracis)、擬桿菌屬、伯氏疏螺旋體( Borelia burgdorferi)、衣原體、產氣莢膜梭菌( Clostridium perfringers)、破傷風梭菌、白喉棒狀桿菌、棒桿菌、產氣腸桿菌、腸球菌屬、紅斑丹毒絲菌、具核梭桿菌( Fusobacterium nucleatum)、流感嗜血桿菌、幽門螺桿菌、克雷伯氏肺炎桿菌、嗜肺軍團菌( Legionella pneumophilia)、鉤端螺旋體、單核球增多性李氏菌、分枝桿菌屬。(例如,結核分枝桿菌、鳥分枝桿菌、戈登分枝桿菌、胞內分枝桿菌、關西分枝桿菌)、淋病雙球菌、腦膜炎奈瑟菌、多殺巴斯德氏菌、致病性彎曲桿菌屬、立克次氏體、金黃色葡萄球菌、念珠狀鏈桿菌、鏈球菌(厭氧菌)、鏈球菌(草綠色鏈球菌群體)、無乳鏈球菌(B型鏈球菌)、牛鏈球菌、糞鏈球菌、肺炎鏈球菌、化膿性鏈球菌(A群體鏈球菌)、密螺旋體、及細弱密螺旋體。
感染性抗原可係或來源於其他感染性微生物。感染性真菌之非限制性實例包括:新型隱球菌、莢膜組織胞漿菌( Histoplasma capsulatuin)、粗球孢子菌、皮炎芽生菌( Blastomyces dernatitidis)、沙眼衣原體、及白色念珠菌。其他感染性生物(即原生生物)包括:瘧原蟲,諸如惡性瘧原蟲、三日瘧原蟲、卵形瘧原蟲、間日瘧原蟲、弓形蟲及血吸蟲。其他醫學相關微生物已在文獻中廣泛描述,例如,參見C. G. A. Thomas, “Medical Microbiology”, Bailliere Tindall, Great Britain 1983,其以全文引用之方式併入本文中。
傳染性抗原之其他非限制性實例包括病毒抗原,諸如HIV抗原(例如,gp120、gp160、p18、Tat、Gag、Pol、Env、Nef)、來自皰疹病毒之糖蛋白,以及來自B型肝炎病毒之表面抗原及核心抗原;細菌抗原,諸如來自疏螺旋體屬之OspA、OspB及OspC抗原;真菌及寄生蟲抗原,諸如來自白色念珠菌之MP65及來自瘧原蟲之CS蛋白。
在一些實施例中,CAR或經工程改造之TCR可針對自體抗原。此類抗原之實例包括與自體免疫疾病相關的彼等,諸如類風濕性關節炎(Rheumatoid arthritis, RA)、多發性硬化症(multiple sclerosis, MS)、休格倫氏症候群(Sjögren's syndrome)、肉狀瘤病、胰島素依賴型糖尿病(insulin dependent diabetes mellitus, IDDM)、自體免疫甲狀腺炎、反應性關節炎、僵直性脊椎炎、硬皮病、多發性肌炎、皮肌炎、牛皮癬、血管炎、華格納氏肉芽病(Wegener's granulomatosis)、克羅恩氏病(Crohn’s disease)、及潰瘍性結腸炎(ulcerative colitis)。
在額外的實施例中,本揭露之方法亦可涉及減少或抑制一或多種內源性T細胞受體(T cell receptor, TCR)之表現。
上述方法之各種實施例涉及將一或多個多核苷酸/多肽劑(例如,CAR或經工程改造之TCR)引入至細胞中。本發明所述之多核苷酸及/或多肽經由病毒、非病毒基因遞送方法、或物理方法引入細胞。用於本發明方法之多核苷酸及/或多肽遞送之合適方法包括所屬技術領域中具有通常知識者已知的任何方法,藉由該方法可將多核苷酸及/或多肽引入細胞器、細胞、組織、或生物體中。多核苷酸及/或多肽轉移可在體外、離體、或體內進行。
在各種實施例中,使用物理方法將多肽或多核苷酸引入細胞中。合適之物理方法包括但不限於電穿孔、直接注射(例如,顯微注射)、磁轉染、超聲、衝擊或流體力學方法、或其組合。
電穿孔係一種用於多核苷酸及/或多肽遞送之方法。參見例如,Potter et al., (1984) Proc. Nat'l Acad. Sci. USA,81, 7161-7165及Tur-Kaspa et al., (1986) Mol. Cell Biol.,6, 716-718,兩者出於所有目的以全文引用之方式併入本文中。電穿孔涉及將細胞及DNA之懸浮液暴露於高壓放電中。在一些實施例中,細胞壁降解酶,諸如果膠降解酶,可用於使細胞比未處理細胞更容易藉由電穿孔進行基因改造。參見例如,美國專利第5,384,253號,其出於所有目的以全文引用之方式併入本文中。
當使用CRISPR/Cas核酸酶時,可組裝一或多種CRISPR/Cas核酸酶及一或多種gRNA以形成一或多種核糖核蛋白(ribonucleoprotein, RNP)錯合物,接著藉由電穿孔將該等錯合物引入細胞中。
用於本發明之電穿孔方法包括,例如,Sardesai, N. Y., and Weiner, D. B., Current Opinion in Immunotherapy23:421-9 (2011)及Ferraro, B. et al., Human Vaccines7:120-127 (2011),兩者出於所有目的以全文引用之方式併入本文中。
用於多核苷酸及/或多肽轉移之另一種物理方法包括注射。在一些實施例中,多肽、多核苷酸、或載體可經由一或多次注射(例如,針頭注射)遞送至細胞、組織、或生物體。注射之非限制性方法包括組成物(例如,基於鹽水之組成物)之注射。多核苷酸及/或多核苷酸亦可藉由直接顯微注射引入。非限制性注射部位包括皮下、皮內、肌肉內、結內(允許將抗原直接遞送至淋巴組織)、靜脈內、質子內、腫瘤內、淋巴內(允許直接投予樹突細胞)及腹膜內。可理解,適當之注射準備部位係必要的(例如,注射部位需剃毛,以便觀察針頭之正確放置)。
在一些實施例中,本發明中描述之多核苷酸及/或多肽係藉由以高滲透壓或低滲透壓所誘導之胞飲作用而被引入細胞。例如,可將細胞置於鹽濃度高於或低於生理鹽水之緩衝液中。這可能會活化細胞中之主動攝取機制,其等在該機制下會吞噬細胞外環境。可使用各種化學品來增強及修改此過程。可能不需要任何特殊機器。本領域描述胞飲可用於轉導之示例性方式。參見例如WO2017093326A1,其出於所有目的以全文引用之方式併入本文中。
在各種實施例中,本發明中描述之多核苷酸及/或多肽經由載體被引入細胞中。載體可係病毒載體或非病毒載體。
在一些實施例中,載體係病毒載體。可用於本發明之合適病毒載體包括但不限於反轉錄病毒載體、慢病毒載體、腺病毒載體、腺相關病毒(AAV)載體、α病毒載體、痘病毒載體、單純疱疹病毒載體、或桿狀病毒載體。在一個特定實施例中,病毒載體係慢病毒載體。在一個特定實施例中,病毒載體係反轉錄病毒載體。在一些實施例中,細胞經由反轉錄病毒轉導進行轉導。描述基因之反轉錄病毒轉導之參考文獻係Anderson等人,美國專利第5,399,346號;Mann等人,Cell 33:153 (1983);Temin等人,美國專利第4,650,764號;Temin等人,美國專利第4,980,289號;Markowitz等人,J. Virol. 62:1120 (1988);Temin等人,美國專利第5,124,263號;Dougherty等人於1995年3月16日公開之國際專利公開案第WO 95/07358號;及Kuo等人,Blood 82:845 (1993),各篇都以全文引用之方式併入本文。
在一些實施例中,載體係非病毒載體。可用於本發明方法之非病毒載體之非限制性實例包括質體或轉位子。
核酸疫苗亦可用於將多核苷酸轉移到細胞中。此類疫苗包括但不限於非病毒多核苷酸載體、「裸」DNA及RNA、及病毒載體。使用此等疫苗對細胞進行基因改造及用於優化此等疫苗中所包括之基因表現之方法係所屬技術領域中具有通常知識者已知。
在一些實施例中,可使用奈米粒子、聚合物、樹枝狀聚合物、脂質體、及聚乙烯亞胺(PEI)粒子將多核苷酸及/或多肽引入細胞中。在一些實施例中,將多肽(例如,CRISPR/Cas核酸酶)作為可溶性蛋白質或核糖核蛋白引入細胞中。
多核苷酸及/或多肽轉移之其他方法包括脂質體介導之轉染(例如,截留在懸浮於過量水溶液中之脂質錯合物中之多核苷酸。參見例如,Ghosh and Bachhawat, (1991) In: Liver Diseases, Targeted Diagnosis and Therapy Using Specific Receptors and Ligands. pp. 87-104)。亦考慮與脂染胺(Lipofectamine)或Superfect錯合之多核苷酸及/或多肽;DEAE-葡聚糖(例如,使用DEAE-葡聚糖,然後係聚乙二醇,將多核苷酸遞送到細胞中。參見例如Gopal, T. V., Mol Cell Biol.1985 May; 5(5):1188-90);磷酸鈣(例如,使用磷酸鈣沉澱將多核苷酸引入細胞。參見例如,Graham and van der Eb, (1973) Virology, 52, 456-467;Chen and Okayama, Mol. Cell Biol.,7(8):2745-2752, 1987)、及Rippeet al., Mol. Cell Biol., 10:689-695, 1990);音振載入(sonication loading)(藉由直接音振載入將多核苷酸引入。參見例如,Fechheimer et al., (1987) Proc. Nat'l Acad. Sci.USA 84: 8463-8467);微粒投射轟擊(microprojectile bombardment)(例如,一或多種粒子可用至少一種多核苷酸及/或多肽包覆,並藉由推進力遞送到細胞中。參見例如,美國專利第5,550,318號;美國專利第5,538,880號;美國專利第5,610,042號;及PCT申請案WO 94/09699;Klein et al., (1987) Nature, 327, 70-73, Yang et al., (1990) Proc. Nat'l Acad. Sci. USA, 87, 9568-9572);及受體介導之轉染(例如,藉由受體介導之胞吞作用對巨分子之選擇性攝取,其將使用各種受體之細胞類型特異性分佈在靶細胞中發生。參見例如,Wu and Wu, (1987) J. Biol. Chem.,262, 4429-4432;Huston et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87(9):3410-3414, 1990;Perales et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91:4086-4090, 1994;Myers, EPO 0273085;Wu and Wu, Adv. Drug Delivery Rev., 12:159-167, 1993;Nicolau et al., (1987) Methods Enzymol., 149, 157-176),此處引用之各參考文獻出於所有目的以全文引用之方式併入本文。
應該認識到,在CRISPR/Cas核酸酶之情況下,Cas蛋白(例如,Cas9、Cas12a)及gRNA不需要使用相同之方法遞送。在一些實施例中,Cas蛋白(例如,Cas9、Cas12a)及gRNA係使用相同方法遞送。例如,Cas蛋白(例如,Cas9、Cas12a)及gRNA都可經由電穿孔或在同一載體中引入細胞。在一些實施例中,Cas蛋白(例如,Cas9、Cas12a)及gRNA使用不同方法遞送。例如,經由電穿孔將Cas蛋白(例如,Cas9、Cas12a)引入細胞中,並將gRNA遞送到病毒載體中。作為另一實例,Cas蛋白(例如,Cas9、Cas12a)及gRNA在不同載體中遞送。 T細胞之刺激/活化
為了達到足夠治療劑量之細胞組成物,可對T細胞進行一或多輪的刺激/活化。可在基因改造步驟之前、之後、及/或期間,對細胞進行離體活化及/或擴增。
在一些實施例中,T細胞之刺激/活化可在存在一或多種包含IL-7、IL-15、及/或IL-21之細胞介素之情況下進行。在一些實施例中,T細胞之刺激/活化可在IL-7存在之情況下進行。在一些實施例中,T細胞之刺激/活化可在IL-7、及IL-15存在之情況下進行。在一些實施例中,T細胞之刺激/活化可在IL-7、及IL-21存在之情況下進行。在一些實施例中,T細胞之刺激/活化可在IL-7、IL-15、及IL-21存在之情況下進行。
在一些實施例中,T細胞之刺激/活化可在不存在IL-2之情況下進行。
在一些實施例中,本文描述之方法包含刺激T細胞,以使其於存在一或多個刺激信號或藥劑(例如,化合物、小分子、例如,小有機分子、核酸、多肽、或其片段、異構體、變體、類似物、或衍生物)之情況下被活化。在一些實施例中,本文所述之方法包含在存在一或多種刺激信號或藥劑之情況下刺激T細胞,以使其被活化並增殖。
T細胞可藉由誘導其生物學狀態之變化來活化,藉由這種變化,細胞表現活化標記、產生細胞介素、增殖及/或對靶細胞具有細胞毒性。所有此等變化都可由初級刺激信號產生。共刺激信號放大主要信號之幅度並抑制初始刺激後之細胞死亡,從而導致更持久之活化狀態並因此具有更高之細胞毒性能力。
T細胞通常可使用下列專利中描述之方法來活化,例如美國專利6,352,694;6,534,055;6,905,680;6,692,964;5,858,358;6,887,466;6,905,681;7,144,575;7,067,318;7,172,869;7,232,566;7,175,843;5,883,223;6,905,874;6,797,514;6,867,041,各篇出於所有目的以全文引用之方式併入本文中。
在一些實施例中,可使用CD3/CD28刺激活化α-β T細胞。作為一實例,可使用抗CD3及抗CD28抗體刺激α-β T細胞。
在一些實施例中,γ-δ T細胞可被唑來磷酸及/或結合γ-δ TCR之藥劑(例如,抗體)活化。IL-2及IL-15亦可用於擴增γ-δ T細胞。
在一些實施例中,T細胞可藉由與活化CD3ζ之藥劑結合來活化。
在其他實施例中,CD2結合劑可用於向T細胞提供初級刺激信號。例如,但不限於,CD2藥劑包括但不限於CD2配體及抗CD2抗體,例如Tl 1.3抗體與Tl 1.1或Tl 1.2抗體之組合(Meuer, S. C. et al. (1984) Cell 36:897-906,其以全文引用之方式併入本文中)及9.6抗體(其識別與TI 1.1相同的表位)與9-1抗體之組合(Yang, S. Y. et al. (1986) J. Immunol. 137:1097-1100,其以全文引用之方式併入本文中)。亦可使用結合至與任何上述抗體相同表位之其他抗體。
在一些實施例中,藉由投予佛波酯(phorbol myristate acetate, PMA)及離子黴素(ionomycine)活化T細胞。在一些實施例中,藉由投予適當之抗原來活化T細胞,該抗原誘導活化並接著擴增。在一些實施例中,PMA、離子黴素(ionomycin)、及/或合適之抗原與CD3一起投予,誘導活化及/或擴增。
一般而言,用於本發明之活化劑包括但不限於抗體、其片段及具有抗體樣功能之蛋白質結合分子。(重組)抗體片段之實例係Fab片段、Fv片段、單鏈Fv片段(scFv)、二價抗體片段諸如(Fab)2′-片段、雙抗體、三抗體(Iliades, P., et al., FEBS Lett (1997) 409, 437-441,其以全文引用之方式併入本文中)、十聚肽體(Stone, E., et al., Journal of Immunological Methods (2007) 318, 88-94,其以全文引用之方式併入本文中)及其他域抗體(Holt, L. J., et al., Trends Biotechnol. (2003), 21, 11, 484-490,其以全文引用之方式併入本文中)。二價抗體片段可係(Fab)2'-片段或二價單鏈Fv片段,而單價抗體片段可選自由Fab片段、Fv片段、及單鏈Fv片段(scFv)所組成之群組。
在一些實施例中,CD3ζ藥劑之一或多個結合位點可係二價蛋白質人工結合分子,諸如二聚脂質運載蛋白突變蛋白(即duocalin)。在一些實施例中,受體結合試劑可具有單個第二結合位點,(即,單價的)。單價藥劑之實例包括但不限於單價抗體片段、具有抗體樣結合特性之蛋白質結合分子或MHC分子。單價抗體片段之實例包括但不限於Fab片段、Fv片段、及單鏈Fv片段(scFv),其包括二價單鏈Fv片段。
特異性結合CD3之藥劑包括但不限於抗CD3抗體、抗CD3抗體之二價抗體片段、抗CD3抗體之單價抗體片段、及具有抗體樣結合特性之蛋白質CD3結合分子。具有抗體樣結合特性之蛋白質CD3結合分子可係適體、基於脂質運載蛋白家族多肽之突變蛋白、重組蛋白(glubody)、基於錨蛋白支架之蛋白、基於晶體支架之蛋白、纖連蛋白(adnectin)、及高親合性多聚體(avimer)。亦可耦接至珠粒。
在一些實施例中,活化劑(例如,CD3結合劑))可以以約0.1至約10 µg/ml之濃度存在。在一些實施例中,活化劑(例如,CD3結合劑)可以以約0.2 µg/ml至約9 µg/ml、約0.3 µg/ml至約8 µg/ml、約0.4 µg/ml至約7 µg/ml、約0.5 µg/ml至約6 µg/ml、約0.6 µg/ml至約5 µg/ml、約0.7 µg/ml至約4 µg/ml、約0.8 µg/ml至約3 µg/ml、或約0.9 µg/ml至約2 µg/ml之濃度存在。在一些實施例中,活化劑(例如,CD3結合劑)以約0.1 µg/ml、約0.2 µg/ml、約0.3 µg/ml、約0.4 µg/ml、約0.5 µg/ml、約0.6 µg/ml、約0.7 µg/ml、約0.8 µg/ml、約0.9 µg/ml、約1 µg/ml、約2 µg/ml、約3 µg/ml、約4 µg/ml、約5 µg/ml、約6 µg/ml、約7 µg/ml、約8 µg/ml、約9 µg/ml、或約10 µg/ml之濃度投予。在一些實施例中,CD3結合劑可以以1 µg/ml之濃度存在。
在一些實施例中,活化劑附著於固體支撐物,諸如但不限於珠粒、存在於培養板或孔中之吸收性聚合物、或其他基質,諸如但不限於瓊脂糖(Sepharose)或玻璃;可藉由所屬技術領域中具有通常知識者已知的方式在天然或重組細胞系之細胞表面上表現(例如,以天然或重組形式)。 T細胞之擴增/增殖
T細胞被活化及轉導後,可培養細胞以使其增殖。可將T細胞培養至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20天,至少1週或2週,至少1、2、3、4、5、或6個月或更長時間,其中進行1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10或更多輪的擴增。在一些實施例中,將T細胞培養1至20天、1至18天、1至14天、3至20天、3至18天、3至14天、5至20天、5至18天、5至14天、7至20天、7至18天、7至16天、7至15天、7至14天、8至20天、8至18天、8至16天、8至15天、8至14天、8至13天、8至12天、9至20天、9至18天、9至16天、9至15天、9至14天、9至13天、9至12天、10至20天、10至18天、10至16天、10至15天、或10至14天。在一些實施例中,將T細胞培養8至14天。在一個實施例中,將T細胞培養14天。
根據本揭露,幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞可藉由用(多個)介白素(諸如IL-7、IL-15、及/或IL-21)培養T細胞來富集。
在一些實施例中,幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞可藉由在IL-7存在情況下培養T細胞來富集。在一些實施例中,幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞可藉由在IL-7、及IL-15存在情況下培養T細胞來富集。在一些實施例中,幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞可藉由在IL-7、及IL-21存在情況下培養T細胞來富集。在一些實施例中,幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞可藉由在IL-7、IL-15、及IL-21存在情況下培養T細胞來富集。在一些實施例中,幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞可藉由在IL-7、IL-15、及IL-21存在情況下培養T細胞來富集。
在一些實施例中,用於富集幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之(多個)介白素不包括IL-2。
在一些實施例中,將用於擴增之(多個)藥劑(例如,IL-7、IL-15、IL-21)以約1 ng/ml至約20 ng/ml投予。在一些實施例中,將用於擴增之(多個)藥劑(例如,IL-7、IL-15、IL-21)以約2 ng/ml至約20 ng/ml、5 ng/ml至約20 ng /ml、5 ng/ml至約18 ng/ml、5 ng/ml至約15 ng/ml、5 ng/ml至約12 ng/ml、7 ng/ml至約20 ng/ml、7 ng/ ml至約18 ng/ml、7 ng/ml至約15 ng/ml、5.5 ng/ml至約9.5 ng/ml、約6 ng/ml至約9 ng/ml、約6.5 ng/ml至約12 ng/ml、或約9 ng/ml至約12 ng/ml投予。在一些實施例中,將用於擴增之(多個)藥劑(例如,IL-7、IL-15、IL-21)以約5 ng/ml、約6 ng/ml、約7 ng/ml、約8 ng/ml、約9 ng/ml、約10 ng/ml、約11 ng/ml、約12 ng/ml、約13 ng/ml、約14 ng/ml、或約15 ng/ml投予。
可用於擴增T細胞之藥劑之其他說明性實例係結合CD8、CD45或CD90之藥劑,諸如αCD8、αCD45或αCD90抗體。T細胞群體之說明性實例包括抗原特異性T細胞、T輔助細胞、細胞毒性T細胞、記憶T細胞(記憶T細胞之說明性實例係CD62L +CD8 +特異性中央記憶T細胞)或調節性T細胞(Treg之說明性實例係CD4 +CD25 +CD45RA +Treg細胞)。
可用於擴增T淋巴球之額外藥劑包括如下所述之方法,例如,美國專利6,352,694;6,534,055;6,905,680;6,692,964;5,858,358;6,887,466;6,905,681;7,144,575;7,067,318;7,172,869;7,232,566;7,175,843;5,883,223;6,905,874;6,797,514;6,867,041,各篇出於所有目的以全文引用之方式併入本文中。
適合T細胞培養之條件包括適當之培養基(例如,最低必需培養基(Minimal Essential Media, MEM)、RPMI培養基1640、龍沙(Lonza) RPMI 1640、高級RPMI、Clicks、AIM-V、DMEM、a-MEM、F-12、TexMACS、X-Vivo 15及X-Vivo 20、Optimizer,添加胺基酸、丙酮酸鈉及維生素,無血清或補充適量之血清(或血漿)或一組確定之荷爾蒙,及/或足夠生長及擴張之(多個)細胞介素數量)。
用於T細胞擴增之其他添加劑之實例包括但不限於表面活性劑、二氧化錳酸鹽(piasmanate)、pH緩沖劑(諸如,HEPES)、及還原劑(諸如,N-乙醯半胱胺酸及2-巰基乙醇)、抗生素(例如,青黴素及鏈黴素),僅包含在實驗培養物中,而不包含在將被注入對象之細胞培養物中。將靶細胞維持在支持生長所需之條件下,例如適當之溫度(例如,37℃)及氣氛(例如,空氣加5% CO 2)。
在一些實施例中,其中細胞係iPSC衍生之細胞,選擇經修飾之細胞用於單個殖株以製備主細胞庫。
在一些實施例中,在细胞擴增后,在T细胞群體中判定T SCM细胞之百分比。在一些實施例中,在細胞擴增後,T SCM細胞在T細胞群體中之百分比係至少約30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、或95%。在一個實施例中,在細胞擴增後,T SCM細胞在T細胞群體中之百分比係約30%至90%、40%至80%、50%至60%、50%至70%、50%至80%、60%至70%、或60%至80%。 本發明之組成物
在一個態樣中,本揭露提供一種T細胞群體,其包含根據本文所述方法所製備之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞。細胞可能已經過基因改造以表現一或多種CAR或經工程改造之TCR。
在另一態樣中,本揭露亦提供一種醫藥組成物,該醫藥組成物包含:T細胞群體,其包含幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞;及可選之醫藥上可接受之載劑及/或賦形劑。醫藥載體之實例包括但不限於無菌液體(諸如水及油),包括來自石油、動物、植物或合成來源者(諸如花生油、大豆油、礦物油、芝麻油、及類似者)。較佳地,採用水或水溶液鹽水溶液及右旋糖水溶液及甘油溶液作為載劑,尤其是用於可注射溶液。
包含本文所述之經修飾細胞之組成物可包含緩衝液,諸如中性緩衝鹽水、磷酸鹽緩衝鹽水、及類似者;碳水化合物,諸如葡萄糖、甘露糖、蔗糖、或葡聚糖、甘露醇;蛋白質;多肽或胺基酸,諸如甘胺酸;抗氧化劑;螯合劑,諸如EDTA或麩胱甘肽;佐劑(例如,氫氧化鋁);及防腐劑。
包含本文所述之經修飾細胞之組成物可包含下列一或多種:無菌稀釋劑諸如注射用水、鹽水溶液,較佳地生理鹽水、林格溶液、等滲氯化鈉、不揮發油諸如合成單甘油酯或雙甘油酯,其可用作溶劑或懸浮介質、聚乙二醇、甘油、丙二醇、或其他溶劑;抗細菌劑,諸如苯甲醇或對羥苯甲酸甲酯;抗氧化劑,諸如抗壞血酸或亞硫酸氫鈉;螯合劑,諸如乙二胺四乙酸;緩沖劑,諸如乙酸鹽、檸檬酸鹽或磷酸鹽,以及用於調節張力之藥劑,諸如氯化鈉或右旋糖。腸胃外製劑可封裝在安瓿、一次性注射器、或由玻璃或塑料製成之多劑量小瓶中。可注射之醫藥組成物較佳係無菌的。
在一些實施例中,組成物被配製用於腸胃外投予,例如血管內(靜脈內或動脈內)、腹膜內、腫瘤內、心室內、胸膜內或肌肉內投予。在一些實施例中,組成物在投予前由凍乾製劑重構。
在一些實施例中,經修飾之細胞可與在其投予之前黏附或滲透之物質混合,例如但不限於奈米粒子。 處理方法
在另一態樣中,本揭露提供一種在有需要之對象中移植之方法,該方法包括向對象投予有效量之T細胞群體,該T細胞群體包含如本文所述之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞或本文所述之醫藥組成物。
在另一態樣中,本揭露提供一種治療有需要之對象之疾病或病症之方法,該方法包括向對象投予有效量之細胞群體,該細胞群體包含本文所述之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞或本文所述之醫藥組成物。
在另一態樣中,本揭露提供本文所述之T細胞群體,或用於醫學之醫藥組成物。在一些實施例中,本揭露提供如本文所述之T細胞群體或用於治療疾病或病症之醫藥組成物,例如但不限於癌症、自體免疫疾病、或感染。
在一些實施例中,用於製造T細胞群體或醫藥組成物之方法在體外或離體進行。
在一些實施例中,對於待投予細胞群體或醫藥組成物之對象,醫藥組成物中之細胞群體或細胞係同種異體的。在一些實施例中,對於待投予細胞群體或醫藥組成物之對象,醫藥組成物中之細胞群體或細胞係自體的。
可使用本揭露之方法及/或組成物治療之疾病或病症包括但不限於癌症、自體免疫疾病、或感染。
在一些實施例中,可用本文所述之方法治療之疾病或病症係癌症。用語「癌症(cancer)」及「癌性的(cancerous)」係指或描述哺乳動物之生理狀況,其通常係由不受調節之細胞生長來表徵。用語「癌症(cancer)」包括例如軟組織腫瘤(例如,淋巴瘤)、血液及造血器官之腫瘤(例如,白血病)、以及實性瘤,其係在血流外之解剖部位生長之腫瘤(例如,癌)。癌症之實例包括但不限於癌、淋巴瘤、母細胞瘤、肉瘤(例如,骨肉瘤或橫紋肌肉瘤)、及白血病或淋巴惡性腫瘤。這類癌症之更具體實例包括鱗狀細胞癌(例如,上皮鱗狀細胞癌)、腺鱗狀癌、肺癌(例如,包括小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺鱗狀細胞癌、支氣管癌、Lewis氏肺癌、肺神經內分泌腫瘤、典型類癌、非典型類癌、及大細胞神經內分泌癌)、腹膜癌、肝細胞癌、胃癌(gastric or stomach cancer)(例如,包括胃腸癌、胃腸道基質瘤胰臟癌、胰腺癌、胰管內乳突狀黏液性腫瘤(intraductal papillary mucinous neoplasm, IPMN)、胰島細胞腫瘤)、子宮頸癌(包括但不限於子宮頸腺癌)、卵巢癌(包括但不限於囊腺癌、卵巢胚胎癌、卵巢腺癌、卵巢透明細胞癌、卵巢漿液性囊腺瘤)、肝癌(liver cancer)、膀胱癌、尿道癌、肝細胞瘤(hepatoma)、乳癌(包括但不限於乳腺癌(adenocarcinoma of the breast)、乳突狀乳癌、乳腺癌(mammary cancer)、乳房髓質癌(medullary carcinoma of the breast))、結腸癌(包括但不限於結腸腺癌)、結腸直腸癌(包括但不限於直腸癌、結直腸腺癌)、子宮內膜癌(包括但不限於子宮癌、子宮肉瘤)、唾液腺癌、腎癌(kidney or renal cancer)(包括但不限於腎胚細胞瘤或威爾姆氏瘤、腎細胞癌)、前列腺癌(prostate cancer)(包括但不限於前列腺腺癌(prostate adenocarcinoma))、外陰癌、甲狀腺癌、肝癌(hepatic carcinoma)、肛門癌、陰莖癌、皮膚癌(包括但不限於原發性或轉移性黑色素瘤、鱗狀細胞癌、角質棘皮瘤、基底細胞癌)、多發性骨髓瘤(包括但不限於燜燃型多發性骨髓瘤)及急性淋巴球性白血病(acute lymphocytic leukemia, ALL)(包括但不限於B細胞ALL、T細胞ALL)、急性骨髓性白血病(acute myelocytic leukemia, AML)(例如,B細胞AML、T細胞AML)、慢性骨髓性白血病(chronic myelocytic leukemia, CML)(例如,B細胞CML、T細胞CML)、及慢性淋巴球性白血病(chronic lymphocytic leukemia, CLL)(例如,B細胞CLL、T細胞CLL)、淋巴瘤諸如何杰金氏淋巴瘤(Hodgkin lymphoma, HL)(包括但不限於,B細胞HL、T細胞HL)及非何杰金氏淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma, NHL)(例如,B細胞NHL,諸如彌漫性大細胞淋巴瘤(diffuse large cell lymphoma, DLCL)(例如,瀰漫性大B細胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL))、濾泡性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病/小淋巴球性淋巴瘤(chronic lymphocytic leukemia/small lymphocytic lymphoma,CLL/SLL)、外套細胞淋巴瘤(mantle cell lymphoma, MCL)、邊緣區B細胞淋巴瘤(包括但不限於黏膜相關淋巴組織(mucosa-associated lymphoid tissue, MALT)淋巴瘤、淋巴結邊緣區B細胞淋巴瘤、脾邊緣區B細胞淋巴瘤)、原發性縱隔B細胞淋巴瘤、伯奇氏淋巴瘤(Burkitt lymphoma)、淋巴漿細胞性淋巴瘤(包括但不限於華氏巨球蛋白血症(Waldenstrom's macro globulinemia))、免疫母細胞性大細胞淋巴瘤、毛細胞白血病(hairy cell leukemia, HCL)、前驅物B淋巴母細胞性淋巴瘤及原發性中樞神經系統(central nervous system, CNS)淋巴瘤、諸如前驅物T淋巴母細胞性淋巴瘤/白血病之T細胞NHL、周邊T細胞淋巴瘤(peripheral T-cell lymphoma, PTCL)(例如,皮膚T細胞淋巴瘤(cutaneous T-cell lymphoma, CTCL),包括但不限於蕈狀肉芽腫(mycosis fungiodes)、Sezary症候群)、血管免疫母細胞性T細胞淋巴瘤、結外自然殺手T細胞淋巴瘤、腸病變型T細胞淋巴瘤、皮下脂層炎樣T細胞淋巴瘤、退行性大細胞淋巴瘤,如上所述之一或多種白血病/淋巴瘤之混合物、腦(例如,高級神經膠質瘤(high grade glioma)、瀰漫性腦橋膠質瘤(diffuse pontine glioma)、室管膜瘤、神經母細胞瘤(neuroblastoma)、腦膜瘤(meningioma)、星形細胞瘤(astrocytoma)、寡樹突細胞瘤(oligodendroglioma);成神經管細胞瘤或膠質母細胞瘤),以及頭部及頸部癌症(包括但不限於頭頸部鱗狀細胞癌)、膽道癌(包括但不限於膽管癌)、支氣管癌、脊索瘤、絨毛膜癌、上皮癌、血管內皮細胞肉瘤(包括但不限於卡波西氏肉瘤、多發性特發性出血性肉瘤)、食管癌(包括但不限於食管腺癌、巴瑞特氏腺癌(Barrett's adenocarcinoma))、Ewing氏肉瘤、重鏈病(包括但不限於α鏈病、γ鏈病、µ鏈病)、造血細胞癌、免疫細胞類澱粉變性、意義不明單株免疫球蛋白增高症(monoclonal gammopathy of undetermined significance)、骨髓發育不良症候群、骨髓增生性疾病、原因不明性骨髓化生(agnogenic myeloid metaplasia, AMM)或骨髓纖維化(myelofibrosis, MF)、慢性特發性骨髓纖維化、骨髓增生性腫瘤、真性紅血球增多症、直腸腺癌、原發性血小板增多症、慢性嗜中性球白血病、嗜酸性粒細胞增多症、軟組織肉瘤(例如,惡性纖維組織細胞瘤(malignant fibrous histiocytoma, MFH)、脂肪肉瘤、惡性周圍神經鞘瘤(malignant peripheral nerve sheath tumor, MPNST)、軟骨肉瘤、纖維肉瘤、黏液肉瘤)、及相關轉移。癌症之其他實例可在下列者中找到:Merck Sharp & Dohme Corp.於2011年出版之關於血液學及腫瘤學之第19版The Merck Manual of Diagnostics and Therapy (ISBN 978-0-911910-19-3);關於血液學及腫瘤學之第20版The Merck Manual of Diagnostics and Therapy,由Merck Sharp & Dohme Corp.於2018年出版(ISBN 978-0-911-91042-1)(2018年Merck Manuals網站上之數位線上版);及SEER程式編碼及分級手冊2016 (SEER Program Coding and Staging Manual 2016),各者出於所有目的以全文引用之方式併入本文中。
在一些實施例中,癌症係表現BCMA之癌症或病症。在一些實施例中,表現BCMA之癌症或病症包括血液性癌症,諸如急性髓性白血病(AML)或淋巴瘤(例如,多發性骨髓瘤(MM)、燜燃型多發性骨髓瘤(SMM))。
本揭露中描述之組成物及方法可用於治療傳染病。傳染病為所屬技術領域中具有通常知識者所熟知,並且非限制性實例包括但不限於病毒病因之感染,諸如人類免疫缺乏病毒(HIV)、流感、皰疹、病毒性肝炎、艾司坦-巴爾(Epstein Bar)、脊髓灰質炎、病毒性腦炎、麻疹、水痘(chicken pox)、乳突病毒、鉅細胞病毒、狂犬病、水痘(Varicella)、黃熱病、西尼羅病毒、伊波拉病毒;細菌性病因感染,諸如肺炎、肺結核、梅毒、萊姆病、巴貝氏蟲病(babesiosis);或寄生蟲病因感染,諸如瘧疾、錐蟲病、利甚曼病(leishmaniasis)、滴蟲病、阿米巴病(amoebiasis)。
本揭露中所述之組成物及方法可用於治療自體免疫疾病。此類自體免疫疾病之實例包括但不限於類風濕性關節炎(RA)、多發性硬化症(MS)、休格倫氏症候群、肉狀瘤病、胰島素依賴型糖尿病(IDDM)、自體免疫甲狀腺炎、反應性關節炎、僵直性脊椎炎、硬皮病、多發性肌炎、皮肌炎、牛皮癬、血管炎、華格納氏肉芽病、克羅恩氏病、及潰瘍性結腸炎。
在一些實施例中,組成物係以治療有效量投予。在本發明之方法中投予之組成物之劑量將廣泛變化,其取決於對象之物理參數、投予頻率、投予方式、清除率、及類似者。初始劑量可能較大,隨後可能會使用較小之維持劑量。該劑量可不頻繁地投予(如每週或每兩週投予一次),或分成更小之劑量並每天、每半週等投予,以維持有效劑量水平。預期多種劑量將有效實現經修飾細胞之體內持久性。還預期多種劑量將有效改善經修飾細胞之體內效應功能。
在一些實施例中,包含由本文所述方法生成之細胞之組成物可以以10 2至10 10細胞/kg體重、10 5至10 9細胞/kg體重、10 5至10 8細胞/kg體重、10 5至10 7細胞/kg體重、10 7至10 9細胞/kg體重、或10 7至10 8細胞/kg體重之劑量(包括在該等範圍內之全部整數值)投予。細胞之數量將取決於組成物之所欲治療用途。治療性細胞可按上面列出之劑量多次投予。
本揭露中描述之組成物及方法可與其他類型之癌症療法結合使用,諸如化療法、手術、放射、基因療法等。亦預期當用於治療各種疾病/病症時,本揭露之組成物及方法可與適用於相同或相似疾病/病症之其他治療方法/藥劑一起使用。此類其他治療方法/藥劑可共同投予(同時或依次),以產生相加或協同作用。由於相加作用或協同作用的緣故,故可降低每種藥劑之合適治療有效劑量。
在任何上述治療方法之一些實施例中,該方法進一步包含向對象投予一或多種選自由免疫抑製劑、生物製品、益生菌、益生元、及細胞介素(例如,IFN或IL-2)所組成之群組。
作為非限制性實例,本發明可與阻斷發炎之其他療法組合(例如,經由阻斷IL1、INFα/β、IL6、TNF、IL23等)。
本揭露之方法及組成物可與其他免疫調節治療組合,諸如例如治療性疫苗(包括但不限於GVAX、基於DC之疫苗等)、檢查點抑製劑(包括但不限於阻斷CTLA4、PD1、LAG3、TIM3等之藥劑)或活化劑(包括但不限於增強4-1BB、OX40等之藥劑)。本揭露之方法亦可與具有調節NKT功能或穩定性之能力之其他治療組合,包括但不限於CD1d、CD1d-融合蛋白、CD1d二聚體或CD1d之更大聚合物(未負載或負載抗原)、CD1d-嵌合抗原受體(CD1d-CAR)、或人類中存在之五種已知CD1異構體(CD1a、CD1b、CD1c、CD1e)中之任何其他者。本發明之方法亦可與其他治療方法諸如米哚妥林(midostaurin)、恩西地平(enasidenib)、或其組合相結合。
本揭露之治療方法可與另外之細胞療法、免疫療法、及療法組合。例如,當用於治療癌症時,本發明之組成物可與習知癌症療法組合使用,諸如例如手術、放射療法、化療法、或其組合,其取決於腫瘤之類型、患者病況、其他健康問題,及各種因素。在某些態樣中,用於與本發明之抑制劑結合之組合癌症療法之其他治療劑包括抗血管生成劑。許多抗血管生成劑已被鑑定並且係本領域已知的,包括例如TNP-470、血小板因子4、血小板反應蛋白-1、金屬蛋白酶組織抑製劑(TIMP1及TIMP2)、催乳素(16-Kd片段)、血管抑制素(纖溶酶原之38-Kd片段)、內皮抑素、bFGF可溶性受體、轉化生長因子β、干擾素α、可溶性KDR及FLT-1受體、胎盤增殖素相關蛋白,以及Carmeliet及Jain(2000)列出之彼等者。在一個實施例中,本發明之T細胞可與VEGF拮抗劑或VEGF受體拮抗劑組合使用,諸如抗VEGF抗體、VEGF變體、可溶性VEGF受體片段、能夠阻斷VEGF或VEGFR之適配體、中和抗VEGFR抗體、VEGFR酪胺酸激酶抑制劑及其任何組合(例如,抗hVEGF抗體A4.6.1,貝伐珠單抗(bevacizumab)或蘭尼單抗(ranibizumab))。
可用於本發明組合治療之化療化合物之非限制性實例包括,例如,胺魯米特(aminoglutethimide)、安吖啶(amsacrine)、安美達錠(anastrozole)、天門冬醯胺酶、阿扎胞苷(azacitidine)、卡介苗、比卡魯胺(bicalutamide)、博來黴素、布舍瑞林(buserelin)、白消安(busulfan)、喜樹堿(camfcladribinepothecin)、卡培他濱(capecitabine)、卡鉑、雙氯乙基亞硝脲、氯芥苯丁酸、順鉑、克拉屈濱(cladribine)、氯膦酸鹽(clodronate)、秋水仙鹼、環磷酸醯胺、環妊酮、阿糖胞苷(cytarabine)、達卡巴嗪(dacarbazine)、放線菌素、道諾黴素、地西他濱、己二烯雌酚、己烯雌酚、多西他賽(docetaxel)、多柔比星(doxorubicin)、表柔比星(epirubicin)、雌二醇、雌莫司汀(estramnustine)、依託泊苷(etoposide)、伊析美斯坦、非格司亭(filgrastim)、氟達拉濱(fludarabine)、氟可體松、氟尿嘧啶、氟羥甲基睪酮、氟他胺(flutamide)、吉西他濱(gemcitabine)、金雀異黃酮、戈舍瑞林(goserelin)、羥基脲、去甲柔紅黴素(idarubicin)、依弗醯胺、伊馬替尼(imatinib)、干擾素、伊立替康、鐵替替康(ironotecan)、利妥唑、菊白葉酸、亮丙瑞林(leuprolide)、左旋咪唑(levamisole)、洛莫司汀(lomustine)、甲基二(氯乙基)胺、甲羥助孕酮、甲孕酮(megestrol)、黴法蘭、巰嘌呤、美司鈉(mesna)、胺甲喋呤、絲裂黴素、米托坦(mitotane)、米托蒽醌(mitoxantrone)、尼魯米特(nilutamide)、諾考達唑、奧曲肽(octreotide)、奧沙利鉑、紫杉醇、裴米卓耐特(pamidronate)、噴司他丁(pentostatin)、普卡黴素(plicamycin)、卟菲爾鈉(porfimer)、丙卡巴肼(procarbazine)、雷替曲塞(raltitrexed)、利妥昔單抗(rituximab)、鏈黴素(streptozocin)、蘇拉明、他莫西芬(tamoxifen)、替莫唑胺(temozolomide)、替尼泊苷(teniposide)、睪固酮、硫鳥嘌呤、硫泰帕(thiotepa)、二氯化鈦莘、拓撲替康(topotecan)、曲妥珠單抗(trastuzumab)、視網酸、長春鹼、長春新鹼、長春地辛(vindesine)、及長春瑞濱(vinorelbine)。
此等化學治療化合物可按其作用機制分類為例如下列組:抗代謝物/抗癌劑,諸如嘧啶類似物(5-氟尿嘧啶、氟尿苷(floxuridine)、卡培他濱、吉西他濱、及阿糖胞苷)及嘌呤類似物、葉酸拮抗劑及相關抑製劑(巰嘌呤、硫鳥嘌呤、噴司他丁及2-氯脫氧腺苷(克拉屈濱));抗增殖/抗有絲分裂劑,包括天然產物,諸如長春花屬生物鹼(長春鹼(vinblastine)、長春新鹼、及長春瑞濱)、微管破壞劑,諸如紫杉烷(紫杉醇、多西他賽)、長春新鹼(vincristin)、長春花素、諾考達唑、埃坡黴素(epothilone)及萘維濱(navelbine)、表鬼臼毒素(epidipodophyllotoxin)(依托泊苷、替尼泊苷)、DNA損傷藥劑(放線菌素、安吖啶、蒽環類、博來黴素、白消安、喜樹鹼、卡鉑、氯芥苯丁酸、順鉑、環磷酸醯胺、環磷醯胺、放線菌素、道諾黴素、多柔比星、表柔比星(epirubicin)、六甲基苯胺(hexamethyhnelamine)奧沙利鉑、異磷醯胺(iphosphamide)、黴法蘭、甲基氯卡他明(merchlorehtamine)、絲裂黴素、米托蒽醌、硝基脲、普卡黴素、丙卡巴肼、紫杉醇、泰索帝(taxotere)、替尼泊苷、三亞乙基硫代磷醯胺(triethylenethiophosphoramide)及依托泊苷(VP16));抗生素如放線菌素(放線菌素D)、道諾黴素、多柔比星(阿黴素)、去甲柔紅黴素、蒽環類、米托蒽醌、博來黴素、普卡黴素(光神黴素)及絲裂黴素;酶(L-天冬醯胺酶,其系統地代謝L-天冬醯胺酸,並剝奪沒有能力自行合成天冬醯胺酸之細胞);抗血小板劑;抗增生/抗有絲分裂烷化劑,例如氮芥(nitrogen mustards)(雙氯乙基甲胺(mechlorethamine)、環磷酸醯胺(cyclophosphamide)及類似物、黴法蘭(melphalan)、氯芥苯丁酸(chlorambucil))、乙烯亞胺(ethylenimines)及甲基三聚氰胺(methylmelamines)(六甲三聚氫胺(hexamethylmelamine)及噻替派(thiotepa))、烷基磺酸鹽-白消安(alkyl sulfonates-busulfan)、亞硝基脲(nitrosoureas)(卡莫司汀(carmustine (BCNU))及類似物、鏈佐黴素(streptozotocin))、達卡巴𠯤(trazenes-dacarbazine (DTIC));抗增殖/抗有絲分裂抗代謝物,諸如葉酸類似物(胺甲喋呤);鉑配位作用錯合物(順鉑(cisplatin)、卡鉑(carboplatin))、丙卡巴肼(procarbazine)、羥基脲(hydroxyurea)、米托坦(mitotane)、胺魯米特(aminoglutethimide);荷爾蒙、荷爾蒙類似物(雌激素、他莫昔芬、戈舍瑞林、比卡魯胺、尼魯米特)及芳香酶抑製劑(利妥唑、阿那曲唑);抗凝劑(肝素(heparin)、合成肝素鹽(synthetic heparin salts)及其他凝血酶抑製劑);纖維蛋白溶解劑(例如組織纖維蛋白溶酶原活化劑(tissue plasminogen activator)、鏈球菌激酶(streptokinase)及尿激酶(urokinase))、阿司匹靈、雙嘧達莫(dipyridamole)、噻氯匹啶(ticlopidine)、氯吡格雷(clopidogrel)、阿伯西瑪(abciximab);抗遷移劑(antimigratory agent);抗分泌劑(布雷菲德菌素(breveldin));免抑抑制:(環孢黴素(cyclosporine)、塔克羅林(tacrolimus (FK-506))、西羅林莫斯(sirolimus(雷帕黴素(rapamycin)))、硫唑嘌呤(azathioprine)、黴酚酸莫飛替(mycophenolate mofetil);抗血管生成化合物(例如,TNP-470、金雀異黃酮、貝伐珠單抗)及生長因子抑製劑(例如,成纖維細胞生長因子(FGF)抑製劑);血管收縮素受體阻斷劑;一氧化氮供體;反義寡核苷酸;抗體(曲妥珠單抗);細胞週期抑製劑及分化誘導劑(視網酸);mTOR抑制劑、拓撲異構酶抑制劑(多柔比星(阿黴素)、安吖啶、喜樹堿、道諾黴素、放線菌素、替尼泊苷、表柔比星、依託泊苷、去甲柔紅黴素(idarubicin)及米托蒽醌、拓撲替康、伊立替康)、皮質類固醇(可體松、地塞米松、氫化可體松、甲潑尼龍(methylpednisolone)、強體松、及潑尼松龍(prenisolone));生長因子信號轉導激酶抑製劑;粒線體功能障礙誘導劑及凋亡蛋白酶活化劑;及染色質破壞物。
在本文所述之治療方法之各種實施例中,對象係人。對象可係任何年齡或性別之青少年或成年人。 實例
提供下列實例以進一步描述一些本文所揭示之實施例。實例意欲說明而非限制所揭示之實施例。 實例 1. CAR-T 設計及工程改造
本實例之第二代CAR-T包含單鏈可變片段(scFv),其靶向所關注之(多個)腫瘤相關抗原(TAA),例如B細胞成熟抗原(BCMA),與源自人CD8A及細胞內域(例如4-1BB及CD3ζ)之鉸鏈及跨膜序列融合,如 1A所示。CAR-T構建體之scFvs經特別設計以包括5’及3’重疊,對應於病毒載體例如慢病毒載體中之EcoRI及SpeI限制性位點。將所設計之DNA插入片段針對智人進行密碼子優化,隨後進行合成。使用In-Fusion®選殖方法進行構建體之選殖。在轉染之前對所有構建體進行序列確認。在此呈現之實驗中使用之BCMA CAR-T構建體之序列顯示在 1B中。
下列係可用於本文揭示之任何CAR-T細胞測定方法之試劑列表。
試劑: -      TransAct™ -      初始泛T細胞 -      Costar® 24孔透明TC處理多孔板 -      小鼠抗人CD4抗體 -      小鼠抗人CD8抗體 -      小鼠抗人CD62L抗體 -      小鼠抗人CCR7抗體 -      小鼠抗人CD27抗體 -      抗人CD45RO抗體 -      抗人CD45RA抗體 -      抗人CD279 (PD-1) -      抗人CD233 (LAG-3) -      抗人CD366 (Tim-3) -      抗人TIGIT 實例 2. 人類 T 細胞培養及電穿孔
從健康供體之周邊血單核細胞(PBMC)中分離出人類泛T細胞,並在補充有10%胎牛血清(Fetal Calf Serum, FCS)、2 mM麩醯胺酸(GlutaMax)、1 mM丙酮酸鈉、55 µM β-巰基乙醇及100U青黴素/鏈黴素之完全T細胞培養基/RPMI培養基中培養。
按照製造商規程,使用抗CD3/CD28之磁性磁珠(magnetic Dynabead)來體外擴增泛T細胞約12至14天。接著將細胞以1 x 10 6個細胞/小瓶之密度冷凍,並儲存在液氮中。 實例 3. T 細胞活化及嵌合抗原受體 (CAR) 轉導
在第0天,將來自三個供體之初始泛T細胞解凍並在完全T細胞培養基/RPMI培養基(例如,參見實例2)中稀釋至1 x 10 6T細胞/ml之密度。在T細胞活化之前,對解凍之初始T細胞進行免疫表型分析。免疫表型組包括例如CD4 +及CD8 +T細胞亞群。對於T細胞活化,將10 µl TransAct™/ml添加到24孔板之各孔中,其中密度係1 x 10 6T細胞/孔。將細胞在37℃/5% CO 2下培養整夜。在第1天,用B細胞成熟抗原(BCMA)-HL CAR慢病毒顆粒以等於5之感染複數(MOI)來轉導細胞。 實例 4. BCMA-HL CAR 轉導 T 細胞之表型表徵
使用細胞介素調節將經CAR轉導之T細胞擴增14天,以增強CD4 +及CD8 +T細胞亞群中之幹細胞樣記憶T細胞(T SCM)表型。具體而言,使用細胞介素生成下一代T SCM樣細胞,例如,在單獨存在IL-7之情況下,或在存在IL-7與IL-15組合(IL-7+IL-15)或與IL-15及IL-21組合(IL-7+IL-15及IL-21)之情況下。
對於表型表徵,在轉導後第14天使用螢光活化細胞分選(FACS)流式細胞術分析評估CAR T細胞之記憶及效應T細胞標記。對於FACS染色,將來自BCMA-HL CAR轉導細胞之100 µl細胞/孔用磷酸鹽緩衝鹽水(phosphate buffered saline, PBS)洗滌兩次,然後使用經螢光偶聯物標示之細胞標記特異性抗體。本實驗中使用之抗體各自以1:200稀釋,包括例如CD4、CD8、FVD(活死)、CD27、CD62L、CD45RA、CD45RO、CCR7、CD69及CAR+(1 µg/ml),以及Alexa Fluor™ 647 (AF647)二抗。所有樣品均使用Fortessa細胞分選系統進行評估。
在轉導後第14天,CD4 +CAR-T細胞亞群及CD8 +CAR-T細胞亞群中T SCM細胞表型之代表性細胞介素增強分別顯示在 2A 至圖 2C 3A 至圖 3C中。對於CD4 +CAR-T細胞之表型表徵( 2A 至圖 2C),根據上述細胞介素調節範本,在細胞介素存在或不存在之情況下活化泛T細胞。對於FACS分析,在CD4 +CAR +T細胞上圈選細胞,並判定CD4 +BCMA-HL CAR轉導細胞內CD62L( 2A)、CCR7( 2B 及CD27( 2C)表現水平之頻率(親本頻率,%)。對於CD8 +CAR-T細胞之表型表徵( 3A 至圖 3C),根據上述細胞介素調節範本,在細胞介素存在或不存在之情況下類似地活化泛T細胞。對於FACS分析,在CD8 +CAR +T細胞上圈選細胞,並判定CD8 +BCMA-HL CAR轉導細胞內CD62L( 3A)、CCR7( 3B)及CD27( 3C)表現水平之頻率(親本頻率,%)。如 4A 至圖 4B所示,亦根據與上述彼等方法相同之方法進行了表型表徵,以用於量化CD4 +CAR-T細胞( 4A)及CD8 +CAR-T細胞( 4B)亞群中CD45RO -/CD45RA +表現水平之頻率(親本頻率,%)。細胞介素調節增強了CD4 +及CD8 +CAR-T細胞亞群中之CD45RO -/CD45RA +T SCM細胞表型。
基於上述結果,單一細胞介素(IL-7)有效地富集了CD4 +及CD8 +亞群中之T SCM樣細胞。進一步觀察到,當將IL-15及IL-21加入IL-7細胞介素調節中時,CD4 +及CD8 +T細胞中之T SCM表型皆受到增強。當IL-7+IL-15+IL-21細胞因子條件下之CAR T細胞與腫瘤靶細胞共培養時,IL-7+IL-15+IL-21之CAR T細胞已增強細胞介素之生成。儘管不希望受理論束縛,但據信添加IL-15及IL-21分別活化STAT5及STAT3信號傳導,這與單一細胞介素調節相比可能係有利的。
上述生成細胞介素調節之CAR-T細胞之方法增強了效應功能並減少了衰竭標記,其展現出生成CD4 +及CD8 +CAR-T SCM細胞以增強抗腫瘤免疫之概念性驗證(proof-of-concept)。 參考文獻:1.     June CH, O'Connor RS, Kawalekar OU, Ghassemi S, Milone MC. CAR T cell immunotherapy for human cancer. Science (New York, NY) 2018; 359(6382):1361-5 doi 10.1126/science.aar6711. 2.     Mirzaei HR, Rodriguez A, Shepphird J, Brown CE, Badie B. Chimeric Antigen Receptors T Cell Therapy in Solid Tumor: Challenges and Clinical Applications. Front Immunol 2017; 8:1850 doi 10.3389/fimmu.2017.01850. 3.     Anderson JK, Mehta A. A review of chimeric antigen receptor T-cells in lymphoma. Expert Rev Hematol 2019; 12(7):551-61 doi 10.1080/17474086.2019.1629901. 4.     Minutolo NG, Hollander EE, Powell DJ, Jr. The Emergence of Universal Immune Receptor T Cell Therapy for Cancer. Front Oncol 2019; 9:176 doi 10.3389/fonc.2019.00176. 5.     Kloss CC, Condomines M, Cartellieri M, Bachmann M, Sadelain M. Combinatorial antigen recognition with balanced signaling promotes selective tumor eradication by engineered T cells. Nat Biotechnol 2013; 31(1):71-5 doi 10.1038/nbt.2459. 6.     Brudno JN, Kochenderfer JN. Toxicities of chimeric antigen receptor T cells: recognition and management. Blood 2016; 127(26):3321-30 doi 10.1182/blood-2016-04-703751. 7.     Porter DL, Hwang WT, Frey NV, Lacey SF, Shaw PA, Loren AW, et al. Chimeric antigen receptor T cells persist and induce sustained remissions in relapsed refractory chronic lymphocytic leukemia. Sci Transl Med 2015; 7(303):303ra139 doi 10.1126/scitranslmed.aac5415. 8.     Eshhar Z, Waks T, Gross G, Schindler DG. Specific activation and targeting of cytotoxic lymphocytes through chimeric single chains consisting of antibody-binding domains and the gamma or zeta subunits of the immunoglobulin and T-cell receptors. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 1993; 90(2):720-4 doi 10.1073/pnas.90.2.720. * * *
本發明之範圍不受本文所述之具體實施例之限制。實際上,除了本文所述之外,本發明之各種修改對於所屬技術領域中具有通常知識者將從前述描述中變得顯而易見。此類修改意欲落入隨附申請專利範圍之範疇內。
本文引用之所有專利、申請案、出版物、試驗方法、文獻及其他材料均以全文引用之方式併入本文中,如同於本說明書中實際存在一樣。 序列表 SEQ ID NO: 1 前導MAWVWTLLFLMAAAQSIQA SEQ ID NO: 2     BCMA scFv-HLQLQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSGSYFWGWIRQPPGKGLEWIGSIYYSGITYYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARHDGAVAGLFDYWGQGTLVTVSSGTEGKSSGSGSESKSTSYVLTQPPSVSVAPGQTARITCGGNNIGSKSVHWYQQPPGQAPVVVVYDDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAGDEAVYYCQVWDSSSDHVVFGGGTKLTVL SEQ ID NO: 3     BCMA scFv-LHSYVLTQPPSVSVAPGQTARITCGGNNIGSKSVHWYQQPPGQAPVVVVYDDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAGDEAVYYCQVWDSSSDHVVFGGGTKLTVLGTEGKSSGSGSESKSTQLQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSGSYFWGWIRQPPGKGLEWIGSIYYSGITYYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARHDGAVAGLFDYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO: 4 連接子GTEGKSSGSGSESKST SEQ ID NO: 5 CD8a- 鉸鏈TSTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD SEQ ID NO: 6     CD8a-TMIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC SEQ ID NO: 7 CD137 共刺激KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL SEQ ID NO: 8ζ RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR SEQ ID NO: 9 胞外域MAWVWTLLFLMAAAQSIQAQLQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSGSYFWGWIRQPPGKGLEWIGSIYYSGITYYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARHDGAVAGLFDYWGQGTLVTVSSGTEGKSSGSGSESKSTSYVLTQPPSVSVAPGQTARITCGGNNIGSKSVHWYQQPPGQAPVVVVYDDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAGDEAVYYCQVWDSSSDHVVFGGGTKLTVLTSTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD SEQ ID NO: 10 細胞質域KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR SEQ ID NO: 11 BCMA CAR-HLMAWVWTLLFLMAAAQSIQAQLQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSGSYFWGWIRQPPGKGLEWIGSIYYSGITYYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARHDGAVAGLFDYWGQGTLVTVSSGTEGKSSGSGSESKSTSYVLTQPPSVSVAPGQTARITCGGNNIGSKSVHWYQQPPGQAPVVVVYDDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAGDEAVYYCQVWDSSSDHVVFGGGTKLTVLTSTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR SEQ ID NO: 12   BCMA CAR-LHMAWVWTLLFLMAAAQSIQASYVLTQPPSVSVAPGQTARITCGGNNIGSKSVHWYQQPPGQAPVVVVYDDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAGDEAVYYCQVWDSSSDHVVFGGGTKLTVLGTEGKSSGSGSESKSTQLQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSGSYFWGWIRQPPGKGLEWIGSIYYSGITYYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARHDGAVAGLFDYWGQGTLVTVSSTSTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
1A 1B]顯示例示性第二代CAR-T細胞設計。 1A係第二代CAR-T之示意圖,其包含靶向所關注之TAA之scFv,例如B細胞成熟抗原(B-cell maturation antigen, BCMA),與源自人CD8A之鉸鏈及跨膜序列以及4-1BB (CD137)及CD3ζ胞內域融合。 1B顯示本文所述之例示性抗BCMA CAR構建體之胺基酸序列。 [ 2A 2C]顯示細胞介素調節增強CD4 +T細胞亞群中之T SCM細胞表型。泛T細胞在指定之細胞介素存在或不存在之情況下被活化。對於螢光活化細胞分選(fluorescence-activated cell sorting, FACS)分析,細胞在CD4 +CAR +T細胞上進行圈選。判定CD4 +BCMA-HL CAR轉導細胞內CD62L( 2A)、CCR7( 2B)及CD27( 2C)之表現水平之頻率。此處顯示CAR-T細胞轉導後第14天之表型特徵。 [ 3A 3B]顯示細胞介素調節增強CD8 +T細胞亞群中之T SCM細胞表型。泛T細胞在指定之細胞介素存在或不存在之情況下被活化。對於FACS分析,細胞在CD8 +CAR +T細胞上進行圈選。判定CD8 +BCMA-HL CAR轉導細胞內CD62L( 3A)、CCR7( 3B)及CD27( 3C)水平之表現水平之頻率。此處顯示CAR-T細胞轉導後第14天之表型特徵。 [ 4A 4B]顯示細胞介素調節增強CD4 +及CD8 +T細胞亞群中之CD45RO -/CD45RA +T SCM細胞表型。泛T細胞在指定之細胞介素存在或不存在之情況下被活化。對於FACS分析,細胞在CAR +T細胞上進行圈選。CD4 +CAR +T細胞亞群中CD45RO -/CD45RA +表現水平之頻率( 4A)。CD8 +CAR +T細胞亞群中CD45RO -/CD45RA +表現水平之頻率( 4B)。此處顯示CAR-T細胞轉導後第14天之表型特徵。
<![CDATA[<110> 美商健生生物科技公司(JANSSEN BIOTECH, INC.)]]>
          <![CDATA[<120> 用於增強幹細胞樣記憶T細胞工程改造之材料及方法]]>
          <![CDATA[<130> 253505.000131]]>
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          Met Ala Trp Val Trp Thr Leu Leu Phe Leu Met Ala Ala Ala Gln Ser 
          1               5                   10                  15      
          Ile Gln Ala 
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          Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu 
          1               5                   10                  15      
          Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly 
                      20                  25                  30          
          Ser Tyr Phe Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 
                  35                  40                  45              
          Trp Ile Gly Ser Ile Tyr Tyr Ser Gly Ile Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser 
              50                  55                  60                  
          Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe 
          65                  70                  75                  80  
          Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr 
                          85                  90                  95      
          Cys Ala Arg His Asp Gly Ala Val Ala Gly Leu Phe Asp Tyr Trp Gly 
                      100                 105                 110         
          Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Glu Gly Lys Ser Ser 
                  115                 120                 125             
          Gly Ser Gly Ser Glu Ser Lys Ser Thr Ser Tyr Val Leu Thr Gln Pro 
              130                 135                 140                 
          Pro Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Gln Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly 
          145                 150                 155                 160 
          Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Ser Val His Trp Tyr Gln Gln Pro Pro 
                          165                 170                 175     
          Gly Gln Ala Pro Val Val Val Val Tyr Asp Asp Ser Asp Arg Pro Ser 
                      180                 185                 190         
          Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr 
                  195                 200                 205             
          Leu Thr Ile Ser Arg Val Glu Ala Gly Asp Glu Ala Val Tyr Tyr Cys 
              210                 215                 220                 
          Gln Val Trp Asp Ser Ser Ser Asp His Val Val Phe Gly Gly Gly Thr 
          225                 230                 235                 240 
          Lys Leu Thr Val Leu 
                          245 
          <![CDATA[<210> 3]]>
          <![CDATA[<211> 245]]>
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          Ser Tyr Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Gln 
          1               5                   10                  15      
          Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Ser Val 
                      20                  25                  30          
          His Trp Tyr Gln Gln Pro Pro Gly Gln Ala Pro Val Val Val Val Tyr 
                  35                  40                  45              
          Asp Asp Ser Asp Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser 
              50                  55                  60                  
          Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Arg Val Glu Ala Gly 
          65                  70                  75                  80  
          Asp Glu Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Ser Ser Ser Asp His 
                          85                  90                  95      
          Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly Thr Glu Gly 
                      100                 105                 110         
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          Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu 
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          Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly Ser Tyr Phe Trp 
          145                 150                 155                 160 
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          Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg His 
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          Asp Gly Ala Val Ala Gly Leu Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu 
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          <![CDATA[<223>/註=「人工序列說明:合成多肽」]]>
          <![CDATA[<400> 5]]>
          Thr Ser Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly 
                      20                  25                  30          
          Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp 
                  35                  40                  45  
          <![CDATA[<210> 6]]>
          <![CDATA[<211> 24]]>
          <![CDATA[<212> PRT]]>
          <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221> 來源]]>
          <![CDATA[<223>/註=「人工序列說明:合成肽」]]>
          <![CDATA[<400> 6]]>
          Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu 
          1               5                   10                  15      
          Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys 
                      20                  
          <![CDATA[<210> 7]]>
          <![CDATA[<211> 42]]>
          <![CDATA[<212> PRT]]>
          <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221> 來源]]>
          <![CDATA[<223>/註=「人工序列說明:合成多肽」]]>
          <![CDATA[<400> 7]]>
          Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met 
          1               5                   10                  15      
          Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe 
                      20                  25                  30          
          Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu 
                  35                  40          
          <![CDATA[<210> 8]]>
          <![CDATA[<211> 112]]>
          <![CDATA[<212> PRT]]>
          <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221> 來源]]>
          <![CDATA[<223>/註=「人工序列說明:合成多肽」]]>
          <![CDATA[<400> 8]]>
          Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly 
          1               5                   10                  15      
          Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr 
                      20                  25                  30          
          Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys 
                  35                  40                  45              
          Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys 
              50                  55                  60                  
          Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg 
          65                  70                  75                  80  
          Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala 
                          85                  90                  95      
          Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg 
                      100                 105                 110         
          <![CDATA[<210> 9]]>
          <![CDATA[<211> 309]]>
          <![CDATA[<212> PRT]]>
          <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221> 來源]]>
          <![CDATA[<223>/註=「人工序列說明:合成多肽」]]>
          <![CDATA[<400> 9]]>
          Met Ala Trp Val Trp Thr Leu Leu Phe Leu Met Ala Ala Ala Gln Ser 
          1               5                   10                  15      
          Ile Gln Ala Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys 
                      20                  25                  30          
          Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile 
                  35                  40                  45              
          Ser Ser Gly Ser Tyr Phe Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys 
              50                  55                  60                  
          Gly Leu Glu Trp Ile Gly Ser Ile Tyr Tyr Ser Gly Ile Thr Tyr Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Asn Pro Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys 
                          85                  90                  95      
          Asn Gln Phe Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala 
                      100                 105                 110         
          Val Tyr Tyr Cys Ala Arg His Asp Gly Ala Val Ala Gly Leu Phe Asp 
                  115                 120                 125             
          Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Glu Gly 
              130                 135                 140                 
          Lys Ser Ser Gly Ser Gly Ser Glu Ser Lys Ser Thr Ser Tyr Val Leu 
          145                 150                 155                 160 
          Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Gln Thr Ala Arg Ile 
                          165                 170                 175     
          Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Ser Val His Trp Tyr Gln 
                      180                 185                 190         
          Gln Pro Pro Gly Gln Ala Pro Val Val Val Val Tyr Asp Asp Ser Asp 
                  195                 200                 205             
          Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser Asn Ser Gly Asn 
              210                 215                 220                 
          Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Arg Val Glu Ala Gly Asp Glu Ala Val 
          225                 230                 235                 240 
          Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Ser Ser Ser Asp His Val Val Phe Gly 
                          245                 250                 255     
          Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Thr Ser Thr Pro Ala Pro Arg Pro 
                      260                 265                 270         
          Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro 
                  275                 280                 285             
          Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu 
              290                 295                 300                 
          Asp Phe Ala Cys Asp 
          305                 
          <![CDATA[<210> 10]]>
          <![CDATA[<211> 154]]>
          <![CDATA[<212> PRT]]>
          <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221> 來源]]>
          <![CDATA[<223>/註=「人工序列說明:合成多肽」]]>
          <![CDATA[<400> 10]]>
          Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met 
          1               5                   10                  15      
          Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe 
                      20                  25                  30          
          Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg 
                  35                  40                  45              
          Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn 
              50                  55                  60                  
          Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg 
          65                  70                  75                  80  
          Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro 
                          85                  90                  95      
          Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala 
                      100                 105                 110         
          Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His 
                  115                 120                 125             
          Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp 
              130                 135                 140                 
          Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg 
          145                 150                 
          <![CDATA[<210> 11]]>
          <![CDATA[<211> 487]]>
          <![CDATA[<212> PRT]]>
          <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221> 來源]]>
          <![CDATA[<223>/註=「人工序列說明:合成多肽」]]>
          <![CDATA[<400> 11]]>
          Met Ala Trp Val Trp Thr Leu Leu Phe Leu Met Ala Ala Ala Gln Ser 
          1               5                   10                  15      
          Ile Gln Ala Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys 
                      20                  25                  30          
          Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile 
                  35                  40                  45              
          Ser Ser Gly Ser Tyr Phe Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys 
              50                  55                  60                  
          Gly Leu Glu Trp Ile Gly Ser Ile Tyr Tyr Ser Gly Ile Thr Tyr Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Asn Pro Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys 
                          85                  90                  95      
          Asn Gln Phe Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala 
                      100                 105                 110         
          Val Tyr Tyr Cys Ala Arg His Asp Gly Ala Val Ala Gly Leu Phe Asp 
                  115                 120                 125             
          Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Glu Gly 
              130                 135                 140                 
          Lys Ser Ser Gly Ser Gly Ser Glu Ser Lys Ser Thr Ser Tyr Val Leu 
          145                 150                 155                 160 
          Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Gln Thr Ala Arg Ile 
                          165                 170                 175     
          Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Ser Val His Trp Tyr Gln 
                      180                 185                 190         
          Gln Pro Pro Gly Gln Ala Pro Val Val Val Val Tyr Asp Asp Ser Asp 
                  195                 200                 205             
          Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser Asn Ser Gly Asn 
              210                 215                 220                 
          Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Arg Val Glu Ala Gly Asp Glu Ala Val 
          225                 230                 235                 240 
          Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Ser Ser Ser Asp His Val Val Phe Gly 
                          245                 250                 255     
          Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Thr Ser Thr Pro Ala Pro Arg Pro 
                      260                 265                 270         
          Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro 
                  275                 280                 285             
          Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu 
              290                 295                 300                 
          Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys 
          305                 310                 315                 320 
          Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly 
                          325                 330                 335     
          Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val 
                      340                 345                 350         
          Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu 
                  355                 360                 365             
          Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp 
              370                 375                 380                 
          Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn 
          385                 390                 395                 400 
          Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg 
                          405                 410                 415     
          Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly 
                      420                 425                 430         
          Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu 
                  435                 440                 445             
          Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu 
              450                 455                 460                 
          Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His 
          465                 470                 475                 480 
          Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg 
                          485         
          <![CDATA[<210> 12]]>
          <![CDATA[<211> 487]]>
          <![CDATA[<212> PRT]]>
          <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221> 來源]]>
          <![CDATA[<223>/註=「人工序列說明:合成多肽」]]>
          <![CDATA[<400> 12]]>
          Met Ala Trp Val Trp Thr Leu Leu Phe Leu Met Ala Ala Ala Gln Ser 
          1               5                   10                  15      
          Ile Gln Ala Ser Tyr Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ala 
                      20                  25                  30          
          Pro Gly Gln Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser 
                  35                  40                  45              
          Lys Ser Val His Trp Tyr Gln Gln Pro Pro Gly Gln Ala Pro Val Val 
              50                  55                  60                  
          Val Val Tyr Asp Asp Ser Asp Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe 
          65                  70                  75                  80  
          Ser Gly Ser Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Arg Val 
                          85                  90                  95      
          Glu Ala Gly Asp Glu Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Ser Ser 
                      100                 105                 110         
          Ser Asp His Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly 
                  115                 120                 125             
          Thr Glu Gly Lys Ser Ser Gly Ser Gly Ser Glu Ser Lys Ser Thr Gln 
              130                 135                 140                 
          Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr 
          145                 150                 155                 160 
          Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly Ser 
                          165                 170                 175     
          Tyr Phe Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp 
                      180                 185                 190         
          Ile Gly Ser Ile Tyr Tyr Ser Gly Ile Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu 
                  195                 200                 205             
          Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser 
              210                 215                 220                 
          Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
          225                 230                 235                 240 
          Ala Arg His Asp Gly Ala Val Ala Gly Leu Phe Asp Tyr Trp Gly Gln 
                          245                 250                 255     
          Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Ser Thr Pro Ala Pro Arg Pro 
                      260                 265                 270         
          Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro 
                  275                 280                 285             
          Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu 
              290                 295                 300                 
          Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys 
          305                 310                 315                 320 
          Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly 
                          325                 330                 335     
          Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val 
                      340                 345                 350         
          Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu 
                  355                 360                 365             
          Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp 
              370                 375                 380                 
          Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn 
          385                 390                 395                 400 
          Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg 
                          405                 410                 415     
          Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly 
                      420                 425                 430         
          Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu 
                  435                 440                 445             
          Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu 
              450                 455                 460                 
          Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His 
          465                 470                 475                 480 
          Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg 
                          485         
          
Figure 12_A0101_SEQ_0001
Figure 12_A0101_SEQ_0002
Figure 12_A0101_SEQ_0003
Figure 12_A0101_SEQ_0004
Figure 12_A0101_SEQ_0005
Figure 12_A0101_SEQ_0006
Figure 12_A0101_SEQ_0007
Figure 12_A0101_SEQ_0008
Figure 12_A0101_SEQ_0009
Figure 12_A0101_SEQ_0010
Figure 12_A0101_SEQ_0011
Figure 12_A0101_SEQ_0012
Figure 12_A0101_SEQ_0013
Figure 12_A0101_SEQ_0014
Figure 12_A0101_SEQ_0015

Claims (78)

  1. 一種在一T細胞群體中富集幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之方法,其包含下列(多個)步驟: a) 使該T細胞群體與一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素接觸一段足以富集T SCM細胞之時間;及 b) 可選地擴增該T SCM細胞。
  2. 如請求項1之方法,其中該一或多種細胞介素進一步包含IL-15。
  3. 如請求項1或2之方法,其中該一或多種細胞介素進一步包含IL-21。
  4. 如請求項1之方法,其中該一或多種細胞介素進一步包含IL-15及IL-21。
  5. 如請求項1至4中任一項之方法,其中將該一或多種細胞介素中之各者以約1至約15 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。
  6. 如請求項1至5中任一項之方法,其中將該一或多種細胞介素中之各者以約5至12 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。
  7. 如請求項1至6中任一項之方法,其中將該一或多種細胞介素中之各者以約10 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。
  8. 如請求項1至7中任一項之方法,其中該一或多種細胞介素不包含IL-2。
  9. 如請求項1至8中任一項之方法,其中該T細胞群體包含泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合。
  10. 如請求項9之方法,其中該方法進一步包含在步驟(a)之前,從周邊血單核細胞(peripheral blood monocyte cells, PBMC)中分離泛T細胞、初始CD4 +細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +細胞。
  11. 如請求項1至10中任一項之方法,其中該T細胞群體不包含抑制性調節性T細胞。
  12. 如請求項1至11中任一項之方法,其中該一或多種細胞介素在該擴增步驟(b)期間存在。
  13. 如請求項1至12中任一項之方法,其中該方法進一步包含: 對該等T細胞進行基因改造,以表現嵌合抗原受體(chimeric antigen receptor, CAR)或經工程改造之T細胞受體(T cell receptor, TCR)。
  14. 如請求項13之方法,其中該基因改造係藉由將編碼該CAR或經工程改造之TCR之多核苷酸引入該等細胞來進行。
  15. 如請求項14之方法,其中編碼該CAR或經工程改造之TCR之該多核苷酸係藉由病毒轉導、電穿孔、直接注射、磁轉染、超聲波、衝擊或流體力學方法、或其組合而引入。
  16. 如請求項13至15中任一項之方法,其中該CAR或經工程改造之TCR特異性結合一腫瘤抗原、一傳染性抗原、或一自體免疫抗原。
  17. 如請求項16之方法,其中該腫瘤抗原係選自BCMA、GPRC5D、CD79、KLK2、CD19、CD30、CD33、CD123、hK2、FLT3、CD20、CD22、KRASG12D、p53、BRAC1、及PSMA。
  18. 如請求項13至17中任一項之方法,其中該基因改造係在該擴增步驟(b)之前進行。
  19. 如請求項18之方法,其中該一或多種細胞介素在該基因改造步驟期間存在。
  20. 如請求項1至19中任一項之方法,其中該接觸步驟(a)進行10至20天。
  21. 如請求項1至20中任一項之方法,其中該接觸步驟(a)進行約14天。
  22. 如請求項1至21中任一項之方法,其中該接觸步驟(a)及該擴增步驟(b)總共進行10至20天。
  23. 如請求項1至21中任一項之方法,其中該接觸步驟(a)及該擴增步驟(b)總共進行14天。
  24. 如請求項1至23中任一項之方法,其中該接觸步驟(a)在約37℃之溫度下進行。
  25. 如請求項1至24中任一項之方法,其中該方法進一步包含: 在該接觸步驟(a)開始時活化該T細胞群體。
  26. 如請求項1至24中任一項之方法,其中該活化步驟用抗CD3藥劑及/或抗CD28藥劑進行約24小時。
  27. 如請求項25或26之方法,其中該方法進一步包含: 在該活化步驟(a)之前促發(priming)該T細胞群體。
  28. 如請求項1至27中任一項之方法,其中該方法進一步包含: 在該擴增步驟(b)之後,判定T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比。
  29. 如請求項28之方法,其中在該擴增步驟(b)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係至少約40%、50%、60%、或70%。
  30. 如請求項29之方法,其中在該擴增步驟(b)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係約60%至70%。
  31. 一種生成經基因改造之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之方法,其包含下列步驟: a) 獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體; b) 活化該T細胞群體; c) 對步驟(b)之後存在之該等細胞進行基因改造,以表現一嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR); d) 擴增該等經基因改造之細胞; 其中步驟b)、c)、及d)係在存在一或多種包含介白素-7 (IL-7)之細胞介素之情況下進行。
  32. 如請求項31之方法,其中該一或多種細胞介素進一步包含IL-15。
  33. 如請求項31或32之方法,其中該一或多種細胞介素進一步包含IL-21。
  34. 如請求項31之方法,其中該一或多種細胞介素進一步包含IL-15及IL-21。
  35. 如請求項31至34中任一項之方法,其中將該一或多種細胞介素中之各者以約1至約15 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。
  36. 如請求項31至35中任一項之方法,其中將該一或多種細胞介素中之各者以約5至12 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。
  37. 如請求項31至36中任一項之方法,其中將該一或多種細胞介素中之各者以約10 ng/ml之濃度與該T細胞群體接觸。
  38. 如請求項31至37中任一項之方法,其中該一或多種細胞介素不包含IL-2。
  39. 如請求項31至38中任一項之方法,其中從周邊血單核細胞(PBMC)中分離出泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合。
  40. 如請求項39之方法,其中該等T細胞不包含抑制性調節性T細胞。
  41. 如請求項31至40中任一項之方法,其中該基因改造係藉由將編碼該CAR或經工程改造之TCR之多核苷酸引入該等細胞來進行。
  42. 如請求項41之方法,其中編碼該CAR或經工程改造之TCR之該多核苷酸係藉由病毒轉導、電穿孔、直接注射、磁轉染、超聲波、衝擊或流體力學方法、或其組合而引入。
  43. 如請求項31至42中任一項之方法,其中該CAR或經工程改造之TCR特異性結合一腫瘤抗原、一傳染性抗原、或一自體免疫抗原。
  44. 如請求項43之方法,其中該腫瘤抗原係選自BCMA、GPRC5D、CD79、KLK2、CD19、CD30、CD33、CD123、hK2、FLT3、CD20、CD22、KRASG12D、p53、BRAC1、及PSMA。
  45. 如請求項31至44中任一項之方法,其中該擴增步驟(d)進行10至20天。
  46. 如請求項31至45中任一項之方法,其中該擴增步驟(d)進行約14天。
  47. 如請求項31至46中任一項之方法,其中該等步驟(b)、(c)、及(d)總共進行10至20天。
  48. 如請求項31至47中任一項之方法,其中該等步驟(b)、(c)、及(d)總共進行14天。
  49. 如請求項31至48中任一項之方法,其中該等步驟(b)、(c)、及(d)在約37℃之溫度下進行。
  50. 如請求項31至49中任一項之方法,其中該活化步驟用抗CD3藥劑及/或抗CD28藥劑進行約24小時。
  51. 如請求項31至50中任一項之方法,其中該方法進一步包含: 在該活化步驟(b)之前促發該T細胞群體。
  52. 如請求項31至51中任一項之方法,其中該方法進一步包含: 在該擴增步驟(d)之後,判定T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比。
  53. 如請求項52之方法,其中在該擴增步驟(d)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係至少約40%、50%、60%、或70%。
  54. 如請求項53之方法,其中在該擴增步驟(d)之後,T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比係約60%至70%。
  55. 一種包含富集的幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之T細胞群體,其根據請求項1至54中任一項之方法製備。
  56. 一種醫藥組成物,其包含如請求項55之T細胞群體及醫藥上可接受之載劑或賦形劑。
  57. 一種在有需要之對象中治療疾病或病症之方法,其包含向該對象投予一治療有效量之如請求項55之T細胞群體或如請求項56之醫藥組成物。
  58. 如請求項57之方法,其中該T細胞群體對該對象係同種異體的(allogeneic)。
  59. 如請求項57之方法,其中該T細胞群體對該對象係自體的(autologous)。
  60. 如請求項57至59中任一項之方法,其中該疾病或病症係癌症、傳染病、或自體免疫疾病。
  61. 如請求項60之方法,其中該癌症係血液惡性疾病。
  62. 如請求項60之方法,其中該癌症係實性瘤。
  63. 如請求項60之方法,其中該癌症係鱗狀細胞癌、腺鱗狀癌、肺癌、腹膜癌、肝細胞癌、胃癌(gastric or stomach cancer)、子宮頸癌、卵巢癌、肝癌(liver cancer)、膀胱癌、尿道癌、肝細胞瘤(hepatoma)、乳癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮內膜癌、唾液腺癌、腎癌(kidney or renal cancer)、前列腺癌、外陰癌、甲狀腺癌、肝癌(hepatic carcinoma)、肛門癌、陰莖癌、皮膚癌、多發性骨髓瘤及急性淋巴球性白血病(acute lymphocytic leukemia, ALL)、急性骨髓性白血病(acute myelocytic leukemia, AML)、慢性骨髓性白血病(chronic myelocytic leukemia, CML)、及慢性淋巴球性白血病(chronic lymphocytic leukemia, CLL)、諸如何杰金氏淋巴瘤(Hodgkin lymphoma, HL)及非何杰金氏淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma, NHL)之淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病/小淋巴球性淋巴瘤(chronic lymphocytic leukemia/small lymphocytic lymphoma, CLL/SLL)、外套細胞淋巴瘤(mantle cell lymphoma, MCL)、邊緣區B細胞淋巴瘤、原發性縱隔B細胞淋巴瘤、伯奇氏淋巴瘤(Burkitt lymphoma)、淋巴漿細胞淋巴瘤、免疫母細胞性大細胞淋巴瘤、毛細胞白血病(hairy cell leukemia, HCL)、前驅物B淋巴母細胞性淋巴瘤及原發性中樞神經系統(central nervous system, CNS)淋巴瘤、諸如前驅物T淋巴母細胞性淋巴瘤/白血病之T細胞NHL、周邊T細胞淋巴瘤(peripheral T-cell lymphoma, PTCL)、血管免疫母細胞性T細胞淋巴瘤、結外自然殺手T細胞淋巴瘤、腸病變型T細胞淋巴瘤、皮下脂層炎樣T細胞淋巴瘤、退行性大細胞淋巴瘤、腦癌、頭頸部癌、膽道癌(biliary cancer)、支氣管癌、脊索瘤、絨毛膜癌、上皮癌(epithelial carcinoma)、內皮細胞肉瘤、食道癌、Ewing氏肉瘤、重鏈病、造血癌(hematopoietic cancer)、免疫細胞類澱粉變性、意義不明單株免疫球蛋白增高症(monoclonal gammopathy of undetermined significance)、骨髓發育不良症候群、骨髓增生性疾病、原因不明性骨髓化生(agnogenic myeloid metaplasia, AMM)或骨髓纖維化(myelofibrosis, MF)、慢性特發性骨髓纖維化、骨髓增生性腫瘤、真性紅血球增多症、直腸腺癌、原發性血小板增多症、慢性嗜中性白血病、嗜酸性白血球增多症、或軟組織肉瘤、或其組合或轉移。
  64. 如請求項60之方法,其中該癌症係BCMA表現性癌症。
  65. 如請求項64之方法,其中該BCMA表現性癌症係急性骨髓性白血病(acute myeloid leukemia, AML)、多發性骨髓瘤(multiple myeloma, MM)、或燜燃型多發性骨髓瘤(smoldering multiple myeloma, SMM)。
  66. 一種用於在一T細胞群體中富集幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之系統,其包含下列元素: a) 一用於使該T細胞群體與一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素接觸一段足以富集T SCM細胞之時間的構件;及 b) 可選地一用於擴增該等T SCM細胞的構件。
  67. 如請求項66之系統,其中該T細胞群體包含泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合。
  68. 如請求項67之系統,其中該系統進一步包含用於從周邊血單核細胞(PBMC)中分離出泛T細胞、初始CD4 +細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +細胞、或其任何組合的構件。
  69. 如請求項66至68中任一項之系統,其中該系統進一步包含用於對該等T細胞進行基因改造以表現嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR)之構件。
  70. 如請求項66至69中任一項之系統,其中該系統進一步包含用於在該T細胞群體與包含介白素7 (IL-7)之該一或多種細胞介素接觸開始時活化該T細胞群體之構件。
  71. 如請求項70之系統,其中該系統進一步包含用於在該活化之前促發該T細胞群體之構件。
  72. 如請求項66至71中任一項之系統,其中該系統進一步包含用於在該擴增後,判定T SCM細胞在該T細胞群體中之百分比的構件。
  73. 一種用於生成經基因改造之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之系統,其包含下列元素: a) 用於獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體之構件; b) 用於活化該T細胞群體之構件; c) 用於在活化後對該等細胞進行基因改造以表現嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR)之構件; d) 用於擴增該等經基因改造之細胞之構件; 其中在存在一或多種包含介白素-7 (IL-7)之細胞介素之情況下,獲得分離的泛T細胞、初始CD4 +T細胞、初始CD8 +T細胞、或初始CD4 +及初始CD8 +T細胞、或其任何組合之群體,活化該T細胞群體並對該T細胞群體進行基因改造。
  74. 如請求項66至73中任一項之系統,其中該一或多種細胞介素進一步包含IL-15及/或IL-21。
  75. 一種用於在T細胞群體中富集幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之組成物,其包含: a.  一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素,其用於富集T SCM細胞, b. 一T細胞群體,其係一用於富集TSCM細胞之構件,及 c.  可選地一用於擴增該等T SCM細胞的構件。
  76. 一種用於在T細胞群體中富集幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之組成物,其包含: a.  一T細胞群體,及 b. 一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素,及 一用於下列之構件: (i)     使該T細胞群體與一有效量之一或多種包含IL-7之細胞介素接觸,從而富集T SCM細胞, (ii)    活化該等富集的T SCM細胞,及 (iii)   可選地一用於擴增該等T SCM細胞的構件。
  77. 一種用於生成經基因改造之幹細胞樣記憶T (T SCM)細胞之組成物,其包含: a.  一T細胞群體,及 b. 一有效量之一或多種包含介白素7 (IL-7)之細胞介素,及 一用於下列之構件: (i)     使該T細胞群體與一有效量之一或多種包含IL-7之細胞介素接觸,從而富集T SCM細胞, (ii)    活化該等富集的T SCM細胞, (iii)   對該等富集的T SCM細胞進行基因改造,以表現嵌合抗原受體(CAR)或經工程改造之T細胞受體(TCR),及 (iv)   可選地一用於擴增該等T SCM細胞的構件。
  78. 如請求項75至77中任一項之組成物,其中該等T SCM細胞係藉由使該T細胞群體與一有效量之該一或多種包含IL-7之細胞介素接觸一段足以富集T SCM細胞之時間來富集。
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