TW202242142A - 預測炎性腸病患者的響應之血液基因表現生物標誌物 - Google Patents

預測炎性腸病患者的響應之血液基因表現生物標誌物 Download PDF

Info

Publication number
TW202242142A
TW202242142A TW110148231A TW110148231A TW202242142A TW 202242142 A TW202242142 A TW 202242142A TW 110148231 A TW110148231 A TW 110148231A TW 110148231 A TW110148231 A TW 110148231A TW 202242142 A TW202242142 A TW 202242142A
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
sgp130
protein
igkv1
biomarkers
thr
Prior art date
Application number
TW110148231A
Other languages
English (en)
Inventor
史帝芬 薛伯
康拉德 亞丁
喬格 渥特茲格
菲利普 羅森斯蒂爾
Original Assignee
荷蘭商菲林公司
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 荷蘭商菲林公司 filed Critical 荷蘭商菲林公司
Publication of TW202242142A publication Critical patent/TW202242142A/zh

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118—Prognosis of disease development
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本發明關於如由奧蘭基西普示例的sgp130蛋白，用於治療個體之炎性腸病（IBD）。特別地，本發明提供了一組基因表現生物標誌物，其在單一投與sgp130蛋白如奧蘭基西普之後預測炎性腸病患者之響應。

Description

預測炎性腸病患者的響應之血液基因表現生物標誌物
本發明關於如由奧蘭基西普（olamkicept）示例的sgp130蛋白，用於治療個體之炎性腸病（IBD）。特別地，本發明提供了一組基因表現生物標誌物，其在單一投與sgp130蛋白如奧蘭基西普之後預測炎性腸病患者之響應。
炎性腸病（IBD）包含主要形式克隆氏病（CD）和潰瘍性結腸炎（UC），這係胃腸道之慢性的不能治癒的炎性疾病。藉由引入針對單分子靶標的特定療法，用於IBD的療法得到了極大的改善。引入並仍然最廣泛應用於臨床實踐的第一個靶向療法係針對細胞介素腫瘤壞死因子-α（TNF）的單株抗體，即英夫利昔單抗（infliximab）、阿達木單抗（adalimumab）和戈利木單抗（Golimumab），同時補充以非專利藥物（generics）。後來引入IBD的臨床管理中的包括抗黏附分子（維多珠單抗（vedolizumab））、抗白血球介素-12/-23抗體（烏司奴單抗（Ustekinubab））和Janus激酶抑制劑（托法替尼（Tofacitinib））。雖然使用靶向療法大大改善了疾病相關的死亡率且有助於減少嚴重的不受控制疾病之病例，但治療的長期成功率仍然很小。在該等療法的任一者中，只有不到20%的暴露的患者能保持臨床和內視鏡檢查緩解，大量的患者會進展出疾病相關併發症（發展瘺管、狹窄性疾病和結腸炎相關癌變）和長期合併慢性炎症（心血管和代謝疾病）。考慮到相對較少的患者群體（在西方國家占總人口的最高達0.5%），IBD的經濟負擔很大。
大量使用靶向療法失敗的患者產生了對生物標誌物的大量未滿足的需求，該等生物標誌物用以鑒定在治療的早期階段響應靶向療法而進入臨床緩解的患者群體，這不僅是為了儘早適應劑量強化或靶向變化以最小化疾病之進展，也可以減少患者和衛生系統的不必要的和非常昂貴的治療。然而，尋找適當的生物標誌物由於可用的靶向療法越來越多而變得複雜，這使得很難區分藥物特異性和響應特異性的特徵。目前，雖然在先前的研究中已經鑒定了多種標誌物，但在總轉錄本水平（血液或腸黏膜）上沒有既定的生物標誌物被驗證用於早期響應或緩解預測。
生物標誌物可以被分類為例如預後性或預測性的。預後性生物標誌物提供有關患者可能結果之資訊，而不管治療如何。相比之下，預測性生物標誌物指示治療的可能受益。在許多情況下，預測性生物標誌物在治療前（即，在基線）測量，並提供有關治療響應可能性之資訊。另一種類型的預測性生物標誌物係鑒定的那些，其表現隨時間動態變化，並且從基線和治療誘導後的早期時間點之間的基因之差異表現鑒定。
由於引入抗TNF劑作為IBD中的第一個靶向療法，大多數生物標誌物已在抗TNF治療的背景下進行了鑒定，但也有新出現的用於其他生物製劑的血清生物標誌物（Noor等人. 2020, Lancet Gastroenterol. Hepatol.[柳葉刀 胃腸病學和肝臟病學] 5:80; Gisbert & Chaparro 2020, J. Crohns Colitis[克隆氏病和結腸炎雜誌], doi:10.1093/ecco-jcc/jjz195）。
白血球介素-6（IL-6）係一種多效性細胞介素，由生血細胞和非生血細胞響應於感染和組織損傷而產生並且參與IBD之病理生理學（Garbers等人. 2018, Nat. Rev. Drug Discov.[自然評論藥物發現] 17:395）。IL-6藉由兩條主要的傳訊通路發揮多種功能，這兩條通路都需要由跨膜共受體gp130預先形成的二聚物進行訊息傳導（Scheller等人. 2014, Semin. Immunol.[免疫學研討文輯] 26:2）。在經典傳訊中，IL-6利用主要是由肝細胞和白血球表現的膜結合IL-6受體（IL-6R）。在反式傳訊通路中，藉由蛋白酶切割或可變剪接產生的循環可溶性IL-6R（sIL-6R）募集IL-6，形成IL-6/sIL-6R複合物，該複合物可啟動幾乎所有體細胞上普遍表現的gp130（Garbers等人. 2018, Nat. Rev. Drug Discov.[自然評論藥物發現] 17:395）。在生理情況下，這種普遍存在的反式傳訊被血液中存在的充當緩衝劑的過量可溶性gp130亞型（sgp130）所阻止（Jostock等人. 2001, Eur. J. Biochem.[歐洲生物化學雜誌] 268:160）。經典的IL-6傳訊具有許多生理和抗感染功能，而過度的反式傳訊則存在於許多慢性炎性病症中。使用抗IL-6R抗體托珠單抗觀察到了伺機性感染和嚴重感染發生率的上升（Rose-John等人. 2017, Nat. Rev. Rheumatol.[自然評論風濕病學] 13:399）。完全IL-6抑制之另一個潛在缺陷係三酸甘油酯和LDL膽固醇之潛在升高（Garbers等人. 2018, Nat. Rev. Drug Discov.[自然評論藥物發現] 17:395）。因此，有人提出藉由sgp130蛋白利用特異性的反式傳訊抑制而非阻斷IL-6或其受體來治療慢性炎症，避免全身免疫抑制之負面作用及其他副反應（Rose-John等人. 2017, Nat. Rev. Rheumatol.[自然評論風濕病學] 13:399；Garbers等人. 2018, Nat. Rev. Drug Discov.[自然評論藥物發現] 17:395）。
選擇性IL-6/sIL-6R複合物誘捕劑奧蘭基西普由兩個sgp130結構域與人免疫球蛋白G1之可結晶片段融合組成（EP1148065B1；Jostock等人. 2001, Eur. J. Biochem.[歐洲生物化學雜誌] 268:160）。奧蘭基西普（優化的sgp130Fc；WO 2008000516）在大量的動物模型中係有效的（Rose-John等人. 2017, Nat. Rev. Rheumatol.[自然評論風濕病學] 13:399；Garbers等人. 2018, Nat. Rev. Drug Discov.[自然評論藥物發現] 17:395），在IBD中成功通過了I期試驗（無安全問題）和IIa期機理試驗（EudraCT 2016-000205-36），目前正在UC中進行完整的IIb期臨床開發（NCT03235752）。到目前為止，未公佈任何用於預測投與任何sgp130蛋白後的臨床響應或緩解的生物標誌物。出於上述原因，非常希望在周邊血中找到易於獲得的生物標誌物，該等生物標誌物可以預測單次投與奧蘭基西普後已經接受奧蘭基西普治療的患者之緩解。
本揭露提供了以下較佳的實施方式。然而，本發明不限於該等實施方式。
在一個實施方式中，本揭露提供了一或多種生物標誌物，用於預測患有炎性腸病的個體對用sgp130蛋白治療的響應之用途，所述生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC。
在一個實施方式中，本揭露提供了一種鑒定可能會對用sgp130蛋白治療有響應的、患有炎性腸病的個體之方法，該方法包括對投與了sgp130蛋白的個體測量選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平：AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC，其中至少一或多種生物標誌物之血液表現水平之降低鑒定該個體對所述治療可能有響應。
在一個實施方式中，本揭露提供了一種體外鑒定對sgp130的接受性之方法，該方法包括測量血液樣本中選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC的一或多種生物標誌物之表現水平，其中該血液樣本獲得自投與了初始劑量的sgp130蛋白的受試者，較佳地其中選擇該等生物標誌物中的兩種或更多種之表現水平。在一個實施方式中，本揭露提供了一種體外測量血液樣本中一或多種生物標誌物、較佳的是兩種或更多種生物標誌物之表現水平之方法，該等生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC，其中該血液樣本獲得自投與了初始劑量的sgp130蛋白的受試者。在一個實施方式中，本揭露提供了一種體外預測個體對sgp130的響應、較佳地用於預測個體響應於sgp130的臨床緩解之方法，該方法包括測量一或多種生物標誌物、較佳的是兩種或更多種生物標誌物之血液表現水平，該等生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC，其中在投與sgp130蛋白後7-28天測量血液表現水平。
較佳地，一或多種生物標誌物之血液表現水平係在投與該sgp130蛋白後7-28天、較佳的是7-21天、更較佳的是7-14天、並且甚至更較佳的是14天測量的。較佳地，一或多種生物標誌物之血液表現水平係由RNA定序確定的。
較佳地，對治療的響應係臨床緩解。較佳地，對治療的響應係內視鏡檢查緩解。
在一個實施方式中，本揭露提供了一種用於治療個體之炎性腸病的sgp130蛋白，其中使在接受第一劑量的該sgp130蛋白後7-28天、較佳的是7-21天、並且甚至更較佳的是14天具有選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平降低的個體接受至少第二劑量的該sgp130蛋白：AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC。
在一個實施方式中，本揭露提供了一種用於治療個體之炎性腸病之方法，所述方法包括將至少第一劑量的sgp130蛋白投與於有需要的個體，並且如果所述個體的選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平降低，則投與另外劑量的sgp130多肽二聚物：AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC，較佳地其中該方法還包括測量該一或多種生物標誌物之血液表現水平。
在本揭露之較佳的實施方式中，一或多種生物標誌物之血液表現水平係在投與第一劑量的sgp130蛋白後7-28天、較佳的是7-21天、更較佳的是7-14天、並且甚至更較佳的是14天測量的。在本揭露之較佳的實施方式中，將sgp130蛋白每7-28天、較佳的是每7-14天投與於個體。在本揭露之較佳的實施方式中，sgp130蛋白之投與劑量係60 mg至1 g，較佳的是150 mg至600 mg。在本揭露之較佳的實施方式中，炎性腸病係潰瘍性結腸炎。在本揭露之較佳的實施方式中，炎性腸病係克隆氏病。在本揭露之較佳的實施方式中，炎性腸病係輕度至中度的。在本揭露之較佳的實施方式中，炎性腸病係中度至重度的。在本揭露之較佳的實施方式中，sgp130蛋白係多肽二聚物，該多肽二聚物包含兩個單體，每個單體與SEQ ID NO: 1具有至少90%的序列同一性，其中這兩個單體包含gp130 D6結構域、Fc結構域鉸鏈區，該gp130 D6結構域包含SEQ ID NO: 1之第585-595位的胺基酸，該Fc結構域鉸鏈區包含SEQ ID NO: 1之第609-612位的胺基酸，並且這兩個單體不包含位於gp130部分與Fc結構域之間的連接子。
在一些實施方式中，確定了至少兩種生物標誌物、至少三種生物標誌物或至少四種生物標誌物之表現。在本揭露之較佳的實施方式中，生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、S100A12、S100A9、SLC1A3、SOCS3、和TESC。在本揭露之較佳的實施方式中，生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、和TESC。
本揭露提供了用於預測對用sgp130蛋白治療的響應之生物標誌物。用sgp130蛋白進行治療係本領域中已知的並且也包括在本發明之一些方面中。
特別地，生物標誌物可用於預測患有炎性腸病的個體之響應。炎性腸病（IBD）例如克隆氏病（CD）和潰瘍性結腸炎（UC），係發生在易感個體之腸道中的慢性炎症，被認為與特定的病原體無關。上皮黏膜屏障之改變與腸道通透性的增加導致黏膜免疫系統對腔內抗原的暴露增加，從而引起患者腸道免疫系統之不適當啟動。
本文描述的sgp130蛋白藉由選擇性靶向並中和IL-6/sIL-6R複合物來抑制過量的IL-6反式傳訊，因此，該蛋白被認為在理想的治療濃度下僅抑制IL-6反式傳訊，而保留完整的經典傳訊及其多種生理功能和急性炎性防禦機制。目前已發現，sgp130蛋白如奧蘭基西普之功效類似於例如抗IL-6R抗體托珠單抗或抗IL-6抗體西魯庫單抗（sirukumab）所產生的全域IL-6阻斷，但副作用顯著減少，尤其是不會出現通常的免疫抑制。
本文描述的sgp130蛋白較佳地包含gp130-Fc單體，如奧蘭基西普，該單體具有對應於SEQ ID NO:1的序列。在某些實施方式中，該等gp130-Fc單體形成gp130-Fc多肽二聚物。如本文描述的gp130-Fc多肽二聚物包含多肽，該多肽與SEQ ID NO: 1具有至少90%、95%、97%、98%、99%或99.5%的序列同一性。較佳地，該多肽包含gp130 D6結構域（特別是胺基酸殘基TFTTPKFAQGE：SEQ ID NO: 1第585-595位胺基酸）、Fc結構域鉸鏈區內的胺基酸殘基AEGA（SEQ ID NO: 1第609-612位胺基酸），並且不包含位於gp130部分與Fc結構域之間的連接子。在較佳的實施方式中，本揭露提供了一種包含兩個單體的多肽二聚物，這兩個單體具有與SEQ ID NO: 1具有至少90%的序列同一性的胺基酸序列，其中該胺基酸序列包含gp130 D6結構域、Fc結構域鉸鏈區內的AEGA，並且在gp130部分與Fc結構域之間不存在連接子。較佳地，二聚物包含由雙硫鍵連接的、SEQ ID NO: 1之兩個單體。較佳地，二聚物包含由雙硫鍵連接的、SEQ ID NO: 2的兩個單體。在一些實施方式中，本發明提供了包含本文描述的sgp130蛋白（例如，本文描述的多種多肽單體和/或多肽二聚物）之組成物。
用於製備sgp130蛋白以及sgp130多肽二聚物之方法在本領域中係眾所周知的並且描述於例如WO 2016/089206中，將其藉由援引併入本文。在示例性實施方式中，編碼SEQ ID NO: 1或SEQ ID NO: 2的胺基酸序列之DNA可以選殖到載體中，使得訊息肽框內連接於抗體鏈胺基酸序列之胺基末端。可以將載體引入（例如轉染入）宿主細胞哺乳動物細胞，例如中國倉鼠卵巢（CHO）細胞中。培養轉染的細胞以表現二聚物。然後可以收集細胞和培養物並純化多肽二聚物，例如藉由層析柱步驟（例如，MAbSelect Sure、SP Sepharose、Capto Q）。還可以用病毒減少/滅活步驟濃縮和/或處理二聚物。
當用作治療時，期望gp130蛋白基本上不含半乳糖-α-1,3-半乳糖部分，因為該等與免疫性響應有關。在較佳的實施方式中，多肽二聚物每莫耳多肽含有不超過6%的半乳糖-α-1,3-半乳糖。較佳地，多肽二聚物含有不超過4莫耳%、3莫耳%、2莫耳%、1莫耳%、0.5莫耳%、0.2莫耳%、0.1莫耳%或甚至不可檢出水平的半乳糖-α-1,3-半乳糖（例如，藉由WAX-HPLC、NP-HPLC或WAX測量的，較佳的是藉由WAX-HPLC測量的）。在其他實施方式中，相對於聚醣之總量（按質量或莫耳基礎計），多肽二聚物含有少於6%、4%、3%、2%、1%、0.5%、0.2%、或甚至0.1%的半乳糖-α-1,3-半乳糖。
還期望gp130蛋白係唾液酸化的。這具有增加本發明多肽的半衰期之優點。多肽二聚物之每條鏈含有10個N-糖基化位點；九個N-糖基化位點位於gp130部分中，一個N-糖基化位點位於Fc部分中。因此，多肽含有總共20個糖基化位點。在某些實施方式中，多肽上平均至少52%或至少54%的聚醣包括唾液酸殘基，例如平均值為52%-65%（例如，藉由WAX-HPLC、NP-HPLC或WAX測量的，較佳的是藉由WAX-HPLC測量的）。較佳地，gp130蛋白之近似分子量為220 kDa；每93 kDa具有另外的、衍生自10 N-糖基化鏈的約20 kDa分子量。
本文描述的sgp130蛋白用於腸胃外投與，例如靜脈內輸注或皮下注射。合適的配製物包括那些包含界面活性劑的製劑，尤其是包含例如聚山梨醇酯界面活性劑（例如，聚山梨醇酯20）等非離子界面活性劑的配製物。配製物還可包含緩衝劑和糖類。一種示例性緩衝劑係組胺酸。一種示例性糖係蔗糖。從而，合適的配製物可以包含聚山梨醇酯20（例如，0.01 mg/mL-1 mg/mL、0.02 mg/mL-0.5 mg/mL、0.05 mg/mL-0.2 mg/mL）、組胺酸（例如，0.5 mM-250 mM、1 mM-100 mM、5 mM-50 mM、10 mM-20 mM）和蔗糖（例如，10 mM-1000 mM、20 mM-500 mM、100 mM-300 mM、150 mM-250 mM）。
本文描述的sgp130蛋白通常以60 mg至1 g、較佳的是150 mg至600 mg的劑量投與。在一些實施方式中，sg130蛋白之投與劑量在500至700 mg之間。給藥頻率通常是每7-28天一次，較佳的是每7-14天一次。在較佳的實施方式中，每週（每7天一次）或每兩週（每14天一次）給藥。給藥係指單次給藥，無論是單位劑型還是多個單位劑型一起（如接受兩次或多次注射，在幾分鐘或幾小時內經靜脈內輸注投與）。在WO2016/087941中描述了合適的給藥方案和頻率，將其藉由援引併入本文。
如實例1中所討論的，鑒定了與gp130蛋白治療相關的基因表現生物標誌物。因此，本揭露提供了至少一種生物標誌物用於預測患有炎性腸病的個體對用如本文揭露的sgp130蛋白治療的響應之用途，所述生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC。
本揭露中使用的、下表1中定義的基因名稱縮寫與美國國家生物技術資訊中心（NCBI；美國馬里蘭州貝塞斯達（Bethesda, MD, USA））的基因子據庫中使用的縮寫一致，並且序列識別字來自NCBI GenBank數據庫。
[表1]：根據NCBI基因子據庫的基因名稱、縮寫和序列
縮寫 基因名稱或序列說明
AC005392.2 智人19號染色體殖株CTC-490G23，完整序列
AL035661.1 來自染色體20p11.21-11.23上的殖株RP4-568C11之人DNA序列，完整序列；現為AL035661.16
ANKRD22 錨蛋白重複結構域（Ankyrin repeat domain） 22
ANXA3 膜聯蛋白A3
CD177 CD177分子
CYSTM1 富含半胱胺酸的跨膜模組1（Cysteine rich transmembrane module containing 1）
FCGR1A IgG受體Ia之Fc片段
FCGR1B IgG受體Ib之Fc片段
FCGR1CP IgG受體Ic之Fc片段，偽基因
GALNT14 多肽 N-乙醯胺基半乳糖轉移酶14
GYG1 肝醣核心蛋白1
HP 血紅素結合素
IGHG2 免疫球蛋白重恒定區γ2（G2m標記物）
IGKV1-12 免疫球蛋白κ可變區1-12
IGKV1-16 免疫球蛋白κ可變區1-16
IGKV2-24 免疫球蛋白κ可變區2-24
IGKV4-1 免疫球蛋白κ可變區4-1
IGLV2-11 免疫球蛋白λ可變區2-11
IGLV5-45 免疫球蛋白λ可變區5-45
IGLV7-43 免疫球蛋白λ可變區7-43
MCEMP1 肥大細胞表現膜蛋白1
MRC2 甘露糖受體C類型2
PDZK1IP1 PDZK1相互作用蛋白1
PLSCR1 磷脂雙向翻轉酶1
S100A12 S100鈣結合蛋白A12
S100A9 S100鈣結合蛋白A9
SFRP2 分泌型捲曲相關蛋白2
SLC1A3 溶質載體家族1成員3
SOCS3 細胞介素傳訊抑制物3
TESC 特斯卡林蛋白（Tescalcin）
本揭露還提供了鑒定可能會對用sgp130蛋白治療有響應的、患有炎性腸病的個體之方法，以及用於預測sgp130蛋白治療響應之方法。該等方法包括測量選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平：AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC。在一些實施方式中，向被鑒定為可能的治療響應者的個體投與一或多個後續劑量的sgp 130蛋白。
特別地，該等方法包括測量投與了sgp130蛋白的個體之一或多種生物標誌物之血液表現水平。在一些實施方式中，本文所述之方法包括在sgp130蛋白投與前以及投與後測量個體之一或多種生物標誌物之血液表現水平。如本文所述，如本文揭露的至少一種生物標誌物之血液表現水平之降低表明該個體可能對sgp130蛋白治療有響應。
在一些實施方式中，確定了至少兩種、至少五種，較佳的是至少10種、至少15種、或全部30種生物標誌物之表現水平。如實例中所證明的，血液表現水平之降低表明有響應。如本領域技術者將清楚的，不需要降低所有生物標誌物之血液表現水平就可將個體分類為可能受益於治療。在一些實施方式中，至少一種所述生物標誌物之血液表現水平降低足以預測治療益處。在一些實施方式中，至少兩種、至少五種、至少10種、至少15種、或全部30種生物標誌物之血液表現水平降低表明治療受益的可能性。
在較佳的實施方式中，生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、S100A12、S100A9、SLC1A3、SOCS3、和TESC。在一些實施方式中，至少兩種、至少五種、至少10種、至少15種、或全部24種所述生物標誌物之血液表現水平降低表明治療受益的可能性。
如本文所用，術語「血液表現水平」和「血液樣本」係指來自全血以及由紅血球（如周邊血單核細胞（PBMC））和/或血漿構成的樣本之生物標誌物表現水平。
藉由測量核酸或蛋白質表現水平，可以確定生物標誌物表現水平。在一些實施方式中，從樣本中純化核酸或蛋白質，並藉由核酸或蛋白質表現分析測量基因表現。蛋白質表現水平可以藉由本領域已知的任何方法確定，包括ELISA、免疫細胞化學、流式細胞分析技術、西方印漬術、蛋白質組學和質譜法。
較佳地，確定核酸表現水平。核酸表現水平可以藉由本領域已知的任何方法確定，包括RT-PCR、定量PCR、北方印漬術、基因定序特別是RNA定序和基因表現譜分析技術。基於定序的基因表現分析之代表性方法包括基因表現系列分析（SAGE），以及藉由大規模平行特徵定序（MPSS）進行的基因表現分析。較佳地，使用RNA定序（RNAseq）評估生物標誌物表現水平。
較佳地，核酸係RNA，例如mRNA。如熟悉該項技術者所理解的，確定的RNA表現水平可以直接檢測，或者可以例如藉由首先產生cDNA和/或藉由擴增RNA/cDNA來間接確定。
表現水平不必係絕對值，而可為標準化的表現值或相對值。例如，表現水平可以相對於管家基因或參考基因表現標準化。
在示例性實施方式中，將在接受至少一個劑量的sgp130蛋白後從個體獲得的一或多種生物標誌物之血液表現水平（本文稱為「治療後/投與後」水平）與在投與sgp130蛋白前（即基線時）從所述個體獲得的血液表現水平進行比較。在一些實施方式中，在個體接受一個劑量的sgp130蛋白後2至60天之間獲得治療後水平。在一些實施方式中，在個體接受一個劑量的sgp130蛋白後7-28天之間獲得治療後水平。在一些實施方式中，在個體接受一個劑量的sgp130蛋白後7至21天之間獲得治療後水平。較佳地，在個體接受一個劑量的sgp130蛋白後13至15天之間獲得治療後水平。更較佳地，在個體接受一個劑量的sgp130蛋白後14天獲得治療後水平。
在一些實施方式中，在個體接受第一劑量的sgp130蛋白後2至60天之間獲得治療後水平。在一些實施方式中，在個體接受第一劑量的sgp130蛋白後7-28天之間獲得治療後水平。在一些實施方式中，在個體接受第一劑量的sgp130蛋白後7至21天之間獲得治療後水平。較佳地，在個體接受第一劑量的sgp130蛋白後13至15天之間獲得治療後水平。更較佳地，在個體接受第一劑量的sgp130蛋白後14天獲得治療後水平。
確定治療後的表現水平是否與基線「顯著」不同或減少「顯著」係在熟悉該項技術者之能力範圍內的。差異表現基因之表現水平與治療響應之間的相關性強度可以藉由顯著性統計檢驗來確定。例如，可以使用卡方檢驗為每個差異表現的標記物分配一個卡方值，表明該標記物之表現與治療益處的相關性強度。在一些實施方式中，使用Anders和Huber 2010中描述之方法來確定來自RNAseq數據的表現之顯著減少（Genome Biology[基因組生物學]11:R106）。
如本文所述，實例證明，在至少一個劑量的sgp 130蛋白投與後，一或多種生物標誌物之血液表現水平降低表明治療益處。特別地，降低的血液表現水平預示臨床緩解和/或內視鏡檢查緩解。如熟練的行醫者所理解的，在治療計畫的早期（例如，僅在第一個治療劑量之後）預測對治療的積極響應（例如，臨床緩解）的能力對於確定進一步的治療選項係有用的。因此，本揭露提供了治療方法和sgp130蛋白在治療方法中之用途，該治療方法基於初始sgp130蛋白治療後本文揭露的生物標誌物之血液表現水平之降低來鑒定待治療的個體。較佳地，待治療的個體係人。
在一方面，本揭露提供了一種用於治療個體之炎性腸病的sgp130蛋白，其中使在接受一個劑量、較佳第一劑量的該sgp130蛋白後7-28天、較佳的是7-21天、並且甚至更較佳的是14天具有選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平降低的個體接受至少第二劑量的該sgp130蛋白：AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC。
在一方面，本揭露提供了一種用於治療個體之炎性腸病之方法，所述方法包括投與至少第一劑量的sgp130蛋白，並且如果所述個體的選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平降低，則投與另外劑量的sgp130多肽二聚物： AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC。
較佳的sgp130蛋白、劑量和頻率方案如本文進一步揭露的。
在一些實施方式中，所述治療方法和用途可包括將接受至少一個劑量的sgp130蛋白後從個體獲得的一或多種生物標誌物之血液表現水平與sgp130蛋白治療前從所述個體獲得的血液表現水平進行比較。
在一些實施方式中，所述治療方法和用途進一步包括測量如本文進一步揭露的一或多種生物標誌物之血液表現水平。例如，本揭露提供了如下方法，該等方法包括 - 將至少第一劑量的sgp130蛋白投與於有需要的個體， - 測量選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平： AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC， - 如果來自一或多種生物標誌物之血液表現水平與基線時的血液表現水平相比降低，則向該個體投與另外劑量的sgp130蛋白。在一些實施方式中，該等方法還包括在基線（即在sgp130治療之前）測量該一或多種生物標誌物之血液表現水平。
如本文所用，術語「治療（treatment、treat、和treating）」係指逆轉、緩解、推遲疾病或障礙或其一或多種症狀之發作，或抑制疾病或障礙或其一或多種症狀之進展，如本文所述之。在一些實施方式中，可以在一或多種症狀發展後投與治療。在其他實施方式中，可以在沒有症狀的情況下投與治療。例如，可以在症狀發作之前向易感個體（例如，鑒於症狀史和/或遺傳或其他易感因素）投與治療。治療也可能在症狀解決後繼續，例如用於預防或延遲其復發。在較佳的實施方式中，本文描述的治療導致臨床緩解或內視鏡檢查緩解。
在一些實施方式中，內視鏡檢查緩解係基於對潰瘍之大小、有潰瘍表面、受影響的表面和五個結腸段（末端回腸、右結腸、橫結腸、左結腸和直腸）中的狹窄之評估。用於CD的示例性得分系統如下。
[表2]
   得分 = 0 得分 = 1 得分 = 2 得分 = 3
潰瘍之大小 無 口瘡性潰瘍（0 0.1-0.5 cm） 大潰瘍 （0 0.5-2.0 cm） 很大 潰瘍 （0 ＞2.0 cm）
有潰瘍 表面 無 ＜10% 10%-30% ＞30%
受影響的 表面 不受影響的節段 ＜50% 50%-75% ＞75%
狹窄 無 單處， 可以通過 多處， 可以通過 不能通過
如本文所用，「包括」及其連接詞在其非限制性意義上係指該詞後面的項目被包括在內，但不排除未具體提及的項目。此外，動詞「由...組成」可以被「基本上由...組成」替換，這意味著本文定義的化合物或輔助化合物可包括比具體確定的組分更多的額外組分，所述額外組分不改變本發明之獨特特徵。
本文使用的冠詞「一個/一種（a與an）」用於指代該冠詞的一個或多於一個（即，至少一個）語法物件。舉例來說，「一個/一種元素」係指一個元素或多於一個元素。
本說明書中引用的所有專利和文獻參考藉由援引以其整體併入本文。
在以下實例中進一步解釋了本發明。該等實例不限制本發明之範圍，而是僅用於闡明本發明。
實例
實例1
在一項為期14週、開放標籤、系統生物學驅動的IIa期試驗（EudraCT 2016-000205-36）中，16名活動性IBD患者接受了奧蘭基西普治療，以評估療效、安全性和IL-6反式傳訊阻斷之分子機制。總得來說，全部患者中有44%（UC，55%，5/9；CD，28%，2/7）實現了臨床響應且有20%（UC，22%，2/9；CD，14%，1/7）實現了臨床緩解。在周邊血細胞中鑒定出由奧蘭基西普誘導的緩解的基因表現生物標誌物。
方法
患者
患者年齡在21至66歲之間，患有中度至重度活動性UC（Mayo得分最高11，內視鏡檢查子得分≥2分）或回結腸CD（克隆氏病活動指數[CDAI] 220-500；CD的簡單內視鏡檢查得分[SES-CD]≥7），免疫活性炎症（C反應蛋白[CRP]≥5 mg/L），常規治療失敗，且之前接受過不超過2種生物製劑（限於抗TNF和/或維多珠單抗）。基線的患者人口統計數據總結在表3中。
[表3]：基線患者人口統計數據
參數 患有 UC 的患者 患有 CD 的患者 所有患者
患者數量 9 7 16
年齡， y，中位數(範圍) 36.0 (21.0-66.0) 25.0 (21.0-48.0) 25.5 (21.0-66.0)
女性，n(%) 7 (77.8) 4 (57.1) 11 (68.8)
身體質量指數， kg/m 2 ，中位數(範圍) 21.8 (18.3-60.6) 21.5 (20.1-27.9) 21.7 (18.3-30.6)
體重， kg，中位數(範圍) 60.0 (49.0-97.0) 67.0 (60.0-76.0) 66.5 (49.0-97.0)
Mayo得分(UC之臨床活動性)，中位數(範圍) 10 (7-11)
CDAI(CD之臨床活動性)，中位數(範圍) 330 (227-396)
診斷後時間， y，中位數(範圍) 5.3 (0.5-10.2) 6.9 (0.2-16.2) 5.3 (0.2-16.2)
吸煙者，n(%) 0 (0.0) 1 (14.3) 1 (6.3)
類固醇療法，n(%) 2 (22.2) 1 (14.3) 3 (18.7)
美沙拉𠯤療法，n(%) 8 (88.9) 1 (14.3) 9 (56.3)
免疫抑制療法，n(%) 1 (11.1) 0 (0.0) 1 (6.2)
任何先前的單株抗體療法，n(%) 2 (22.2) 3 (42.9) 5 (31.3)
先前的抗TNF療法，n(%) 2 (22.2) 2 (28.6) 4 (25.0)
C反應蛋白，中位數(範圍) 29.6 (1.4-197.0) 16.4 (3.3-89.9) 23.0 (1.4-197.0)
糞便鈣防衛蛋白，中位數(範圍) 1795 (74-3000) 2098 (39-3000) 2098 (39-3000)
蒙特利爾（Montreal）A，n(%)    1: 1(14,3) 2: 6 (85,7)   
蒙特利爾L，n(%)    1: 2 (28,6) 2: 3 (42,9) 3: 2 (28,6)   
蒙特利爾B，n(%)    1: 7 (100)   
蒙特利爾E，n(%) 1: 1 (11,1) 2: 7 (77,8) 3: 1 (11,1)      
試驗設計
這項兩中心、探索性、開放標籤、研究人員發起的試驗研究了基因表現變化和奧蘭基西普療效之機理方面以及第14週的臨床響應和緩解（實現了臨床緩解的患者之比例，藉由針對UC[Mayo得分≤ 2，出血0和內視鏡檢查≤1]和CD[CDAI ＜150]的臨床疾病參數測量）。奧蘭基西普以一個劑量水平（600 mg）作為靜脈內（i.v.）輸注投與，每2週一次持續12週（即，總共7次輸注）。除了多次生物採樣外，還在基線和第2、6和14週對臨床疾病活動性（包括內視鏡檢法）進行評估。所有內視鏡檢查均被錄影和獨立評級，並且使用內視鏡檢查Mayo得分（UC）或SES-CD（CD）評估臨床疾病活動性。向患者分發連續的紙質日記，用於報告每日大便頻率和直腸出血（便血）。指導患者使用日記，並在每次臨床訪視時進行日記審查。
RNA 定序
收集了16名患者之全血樣本作為縱向數據集，從中分離出用於高通量RNA定序（RNA-Seq）的RNA。在基線（0 h）、第一次奧蘭基西普輸注後2週、6週和14週收集樣本。使用TruSeq RNA文庫製備技術（依諾米那公司（Illumina））製備全RNA文庫，並分別使用HiSeq 3000和HiSeq 4000（依諾米那公司）對總共104份血液和105份活檢樣本進行定序。兩個數據集配對末端讀數均為75 bp（2x75bp）。系統地獲得了整個治療過程中每位患者之基因表現。使用內部RNA-Seq管線（pipeline）映射並對齊定序數據（https://github.com/nf-core/rnaseq）。管線輸出表明所有的定序樣本都很好地映射到GRCh38智人基因組（基因組參照序列聯盟人類基因組38版（Genome Reference Consortium Human Build 38）和GenBank Assembly ID: GCA_000001405.27），每個樣本之總讀數與血液樣本之參考基因組平均對齊70.87%。數據集包括女性和男性患者，但只有女性實現了臨床緩解。儘管如此，沒有理由認為對奧蘭基西普治療之響應受性別的影響。為了避免差異表現分析中的潛在偏差，我們決定刪除所有映射到Y染色體基因的讀數。
分析
無論是否將患者分組為特定類別（例如，臨床緩解的患者），藉由比較整個治療過程中的表現譜來鑒定差異表現的基因。數據集被測試為意向治療（intention-to-treat）和符合方案（per-protocol）。為了鑒定差異表現的基因，使用了套裝DESeq2 R（Love等人. 2014, Genome Biol.[基因組生物學] 15:550）和套裝ImpulseDE2 R（Fischer等人. 2018, Nucleic Acids Res.[核酸研究] 46:e119）。使用DESeq2來在基線和治療後時間點之間進行成對比較，而使用ImpulseDE2來鑒定縱向數據集中具有暫態差異表現的基因。兩種統計工具都基於具有離散趨勢平滑的負二項分布模型。每個樣本的歸一化讀數係藉由估計尺寸因子來控制庫的大小，然後用DESeq2對原始計數數據進行對數轉換來確定的。
結果和討論
總得來說，全部患者中有44%（UC，55%，5/9；CD，28%，2/7）實現了臨床響應且有20%（UC，22%，2/9；CD，14%，1/7）實現了臨床緩解。鑒定了一組30個基因序列，該等基因序列在響應於奧蘭基西普實現了臨床緩解的IBD患者之周邊血細胞中選擇性且顯著下調（表3中按照倍數變化排序）。對於統計分析，合併進入緩解的3例患者（2例UC患者和1例CD患者）。當比較來自緩解和非緩解患者的數據（合併（IBD）或按疾病分開（CD與UC））時，很明顯，在CD和UC的大多數基因序列中觀察到類似的變化（表4；排序與表3中相同）。毫不奇怪，許多由標記物基因編碼的蛋白由免疫細胞表現或與免疫響應相關。單次投與奧蘭基西普後，在緩解者與非緩解者中受到強烈且明顯差異調節的基因之一個實例係分泌型捲曲相關蛋白2（SFRP2）（圖1）。
[表3]：在響應於奧蘭基西普治療實現了臨床緩解的IBD患者之周邊血細胞中選擇性且顯著下調的基因序列表現之平均倍數變化
基因名稱縮寫或序列識別字 ENSG log2-FC 2 週相比於基線 P adj 2 週相比於基線 log2-Fc 6 週相比於基線 P adj 6 週相比於基線 log2-FC 14 週相比於基線 P adj 14 週相比於基線
IGLV5-45 211650 -3.236782 6.00E-13 -2.124891 0.000153 -2.574352 7.18E-05
IGKV1-16 240864 -2.764639 2.29E-12 -1.891190 0.000134 -2.018882 0.000148
SFRP2 145423 -2.759297 0.017830 -1.806368 0.046288 -1.727087 0.088647
SLC1A3 79215 -2.720338 0.008539 -1.696938 0.048069 -2.462354 0.004305
IGKV1-12 243290 -2.645693 5.71E-05 -1.989437 3.86E-07 -2.053117 1.65E-06
CD177 204936 -2.542351 4.00E-07 -3.410888 2.17E-14 -4.078601 1.04E-18
IGKV4-1 211598 -2.337523 1.24E-05 -1.188514 0.001569 -1.901360 1.50E-05
FCGR1CP 265531 -2.059319 0.037539 -1.773419 0.002283 -2.677676 0.000107
FCGR1A 150337 -2.001666 0.000736 -1.718784 0.001416 -2.337711 0.000180
IGKV2-24 241294 -1.957811 0.002336 -1.670936 0.003144 -2.316736 0.000180
IGLV2-11 211668 -1.939144 0.000696 -0.944367 0.049473 -1.715306 0.000533
MCEMP1 183019 -1.898566 4.59E-06 -2.227255 3.86E-07 -2.475147 3.00E-06
ANKRD22 152766 -1.770990 0.049348 -1.824765 0.005140 -1.731784 0.034369
MRC2 11028 -1.760273 0.007368 -1.894117 0.001416 -1.499728 0.018049
HP 257017 -1.713530 0.001429 -1.643701 0.001517 -2.178085 1.17E-05
ANXA3 138772 -1.682248 5.71E-05 -2.071487 1.60E-05 -2.757338 1.53E-07
IGHG2 211893 -1.677144 0.007368 -1.359514 0.000594 -1.453743 0.000416
S100A12 163221 -1.626302 0.000564 -2.089672 2.05E-06 -2.355126 1.17E-05
IGLV7-43 211652 -1.604567 0.003340 -1.182664 0.012958 -2.212568 4.41E-06
S100A9 163220 -1.496462 0.001087 -1.510054 0.000978 -1.750099 0.001854
GYG1 163754 -1.454035 0.000790 -1.355348 0.005321 -1.603328 0.001922
FCGR1B 198019 -1.395799 0.013606 -1.187520 0.045699 -2.013035 0.000132
GALNT14 158089 -1.322980 0.048348 -2.063607 3.86E-07 -2.800619 3.24E-07
PDZK1IP1 162366 -1.314657 0.003587 -1.682411 0.001416 -1.153758 0.103313
TESC 88992 -1.294152 0.005572 -1.233020 0.045241 -1.064985 0.108925
CYSTM1 120306 -1.243353 0.008237 -1.247122 0.014856 -1.705802 0.000714
SOCS3 184557 -1.240008 0.007947 -1.089967 0.006263 -1.513922 0.003087
PLSCR1 188313 -1.231135 0.030181 -1.193740 0.006434 -1.538290 0.001404
AC005392.2 231412 -1.528121 0.003340 -1.559360 0.001420 -1.292253 0.056157
AL035661.1 274173 -1.585697 0.005091 -2.564716 3.78E-12 -3.300351 2.35E-11
ENSG，ENSEMBL基因標識號；基因名稱縮寫基於美國國家生物技術資訊中心（NCBI）基因子據庫；序列識別字基於NCBI GenBank；log2-FC，log2倍數變化；P adj，與基線基因表現相比，在2、6或14週時經調整的p值倍數變化。
[表4]：在IBD患者之周邊血細胞中，響應於奧蘭基西普治療選擇性且顯著下調的基因序列之歸一化表現水平之平均值和標準差
BL，基線；CD，克隆氏病；基因，基因名稱縮寫基於美國國家生物技術資訊中心（NCBI）基因子據庫或基因序列識別字基於NCBI GenBank；IBD，炎性腸病（克隆氏病合併潰瘍性結腸炎）；NA，不適用；NR，非緩解型患者；R，緩解型患者；Rem.，緩解；SD，標準差；UC，潰瘍性結腸炎；w，週。
基因 時間 Rem. 均值 _IBD SD_IBD 均值 _UC SD_UC 均值 _CD SD_CD  
IGLV5-45 BL NR 6.52668 0.66241 6.75230 0.78931 6.26345 0.38868  
IGLV5-45 BL R 7.89003 1.65128 7.20699 1.62917 9.25611 NA  
IGLV5-45 2 w NR 6.46822 0.67694 6.66485 0.57875 6.23880 0.76194  
IGLV5-45 2 w R 6.49326 0.02926 6.47257 NA 6.51395 NA  
IGLV5-45 6 w NR 6.38266 0.60706 6.65824 0.56041 6.06115 0.52650  
IGLV5-45 6 w R 6.46001 0.68935 6.12326 0.51962 7.13350 NA  
IGLV5-45 14 w NR 5.99630 0.82796 6.19797 1.27258 5.84504 0.46928  
IGLV5-45 14 w R 6.16358 0.32850 6.06569 0.39791 6.35936 NA  
IGKV1-16 BL NR 7.96245 0.41302 8.17473 0.32056 7.71479 0.38654  
IGKV1-16 BL R 8.82483 1.05460 8.71591 1.46737 9.04267 NA  
IGKV1-16 2 w NR 8.10176 0.77845 8.23753 0.97215 7.94337 0.51417  
IGKV1-16 2 w R 7.51154 0.21958 7.66680 NA 7.35627 NA  
IGKV1-16 6 w NR 7.56152 0.46090 7.68475 0.37291 7.41775 0.54488  
IGKV1-16 6 w R 7.55299 0.54629 7.31615 0.51018 8.02669 NA  
IGKV1-16 14 w NR 7.53462 0.51502 7.63787 0.86059 7.45719 0.13452  
IGKV1-16 14 w R 7.47382 0.22650 7.48998 0.31786 7.44150 NA  
SFRP2 BL NR 5.26255 0.77210 5.60030 0.65919 4.86852 0.75051  
SFRP2 BL R 5.59411 0.96491 5.06980 0.46116 6.64274 NA  
SFRP2 2 w NR 5.69044 0.87354 6.13415 0.72639 5.17278 0.77524  
SFRP2 2 w R 4.27584 0.82924 3.68948 NA 4.86221 NA  
SFRP2 6 w NR 5.27518 1.07988 5.76711 0.92726 4.70126 1.01631  
SFRP2 6 w R 4.55103 0.19811 4.45639 0.15735 4.74030 NA  
SFRP2 14 w NR 4.72359 0.61160 5.00056 0.80126 4.51586 0.43110  
SFRP2 14 w R 4.58444 0.50669 4.61314 0.71310 4.52704 NA  
SLC1A3 BL NR 5.12705 0.95407 5.47341 1.14015 4.72298 0.51067  
SLC1A3 BL R 5.46293 1.31815 4.72430 0.44908 6.94017 NA  
SLC1A3 2 w NR 4.87315 0.88731 4.96493 1.23370 4.76607 0.19387  
SLC1A3 2 w R 4.32907 0.45767 4.00544 NA 4.65269 NA  
SLC1A3 6 w NR 4.87746 0.81265 5.12801 0.99913 4.58515 0.44341  
SLC1A3 6 w R 4.53247 0.91871 4.01203 0.25076 5.57336 NA  
SLC1A3 14 w NR 5.05580 0.84257 4.90339 0.89485 5.17011 0.91943  
SLC1A3 14 w R 4.14439 0.48929 3.92219 0.42728 4.58879 NA  
IGKV1-12 BL NR 7.48713 0.67975 7.82852 0.65347 7.08885 0.49296  
IGKV1-12 BL R 8.50835 0.86348 8.02149 0.26275 9.48205 NA  
IGKV1-12 2 w NR 7.32976 0.51545 7.47730 0.48084 7.15763 0.54237  
IGKV1-12 2 w R 7.02022 0.27550 7.21503 NA 6.82541 NA  
IGKV1-12 6 w NR 7.09535 0.29439 7.16671 0.28097 7.01210 0.31275  
IGKV1-12 6 w R 7.16553 0.46412 6.89978 0.08405 7.69703 NA  
IGKV1-12 14 w NR 7.00812 0.37107 7.09331 0.58726 6.94423 0.18104  
IGKV1-12 14 w R 7.13008 0.55874 6.81921 0.21108 7.75181 NA  
CD177 BL NR 12.92046 2.02099 13.75019 2.12316 11.95244 1.51817  
CD177 BL R 11.66428 1.42770 11.42705 1.93364 12.13874 NA  
CD177 2 w NR 12.50252 1.43238 12.83892 1.61751 12.11005 1.20052  
CD177 2 w R 11.00215 1.00762 11.71465 NA 10.28965 NA  
CD177 6 w NR 12.38202 1.59566 12.61835 1.60257 12.10631 1.69099  
CD177 6 w R 10.06066 0.36635 9.92930 0.40607 10.32338 NA  
CD177 14 w NR 11.54676 1.60378 10.45657 0.86187 12.36441 1.60285  
CD177 14 w R 9.88497 0.25329 9.80409 0.29844 10.04672 NA  
IGKV4-1 BL NR 10.79433 0.81167 10.92151 0.43181 10.64595 1.14381  
IGKV4-1 BL R 11.20225 0.86791 10.81400 0.77595 11.97876 NA  
IGKV4-1 2 w NR 10.75468 0.70124 11.13196 0.72083 10.31451 0.35337  
IGKV4-1 2 w R 10.09874 0.45430 10.41998 NA 9.77750 NA  
IGKV4-1 6 w NR 10.32475 0.54219 10.72485 0.36066 9.85797 0.25269  
IGKV4-1 6 w R 10.41322 0.82416 9.99999 0.57784 11.23968 NA  
IGKV4-1 14 w NR 10.15168 0.86482 10.56036 1.27081 9.84518 0.35627  
IGKV4-1 14 w R 9.95627 0.34452 9.76069 0.08882 10.34742 NA  
FCGR1CP BL NR 7.30324 0.77298 6.88657 0.40344 7.78936 0.84382  
FCGR1CP BL R 7.23877 0.95764 6.68955 0.15582 8.33722 NA  
FCGR1CP 2 w NR 7.39892 0.81637 7.25363 0.60381 7.56843 1.04784  
FCGR1CP 2 w R 6.28025 0.05211 6.24341 NA 6.31710 NA  
FCGR1CP 6 w NR 7.35811 0.83494 7.35780 0.80910 7.35846 0.94208  
FCGR1CP 6 w R 6.20410 0.34401 6.00805 0.07790 6.59620 NA  
FCGR1CP 14 w NR 7.34981 1.17428 6.28305 0.61935 8.14988 0.71460  
FCGR1CP 14 w R 5.75774 0.14458 5.79739 0.17993 5.67844 NA  
FCGR1A BL NR 10.47917 0.69663 10.10467 0.48301 10.91610 0.67773  
FCGR1A BL R 10.20238 1.28907 9.54517 0.85551 11.51678 NA  
FCGR1A 2 w NR 10.54963 0.74437 10.36865 0.63584 10.76077 0.86331  
FCGR1A 2 w R 9.52468 0.05473 9.48598 NA 9.56338 NA  
FCGR1A 6 w NR 10.48233 0.76754 10.38929 0.83893 10.59088 0.73694  
FCGR1A 6 w R 9.14561 0.47704 8.93504 0.43486 9.56675 NA  
FCGR1A 14 w NR 10.45661 1.14970 9.33365 0.63081 11.29882 0.41415  
FCGR1A 14 w R 8.81686 0.15074 8.76477 0.17078 8.92103 NA  
IGKV2-24 BL NR 7.53646 0.76568 7.84683 0.64325 7.17435 0.78632  
IGKV2-24 BL R 8.07188 1.08560 7.47941 0.50091 9.25683 NA  
IGKV2-24 2 w NR 7.40204 0.62720 7.85945 0.40802 6.86840 0.33122  
IGKV2-24 2 w R 7.19738 0.19450 7.05985 NA 7.33491 NA  
IGKV2-24 6 w NR 7.56668 0.74736 7.90859 0.80216 7.16780 0.46235  
IGKV2-24 6 w R 6.98869 0.46464 6.72880 0.16290 7.50847 NA  
IGKV2-24 14 w NR 7.21152 0.84128 7.43050 1.24679 7.04729 0.54339  
IGKV2-24 14 w R 6.62926 0.34401 6.51868 0.40412 6.85042 NA  
IGLV2-11 BL NR 8.91263 0.52751 9.20683 0.46414 8.56939 0.38313  
IGLV2-11 BL R 9.55595 0.84826 9.29065 1.00836 10.08655 NA  
IGLV2-11 2 w NR 8.92561 0.48956 9.13854 0.51868 8.67719 0.33887  
IGLV2-11 2 w R 8.71469 0.64174 9.16847 NA 8.26091 NA  
IGLV2-11 6 w NR 8.82970 0.57934 9.15665 0.59983 8.44827 0.22254  
IGLV2-11 6 w R 8.92682 0.91458 8.60516 1.02574 9.57014 NA  
IGLV2-11 14 w NR 8.41140 0.74180 8.63532 1.17450 8.24347 0.30519  
IGLV2-11 14 w R 8.41469 0.20679 8.31311 0.15368 8.61784 NA  
MCEMP1 BL NR 12.14860 1.01288 12.59491 0.94605 11.62789 0.88543  
MCEMP1 BL R 11.37549 0.91006 11.00846 0.92094 12.10957 NA  
MCEMP1 2 w NR 11.97966 0.83920 12.21772 0.83231 11.70192 0.82887  
MCEMP1 2 w R 10.70080 0.05177 10.73741 NA 10.66420 NA  
MCEMP1 6 w NR 11.87438 0.78525 12.02266 0.74370 11.70139 0.86572  
MCEMP1 6 w R 10.14329 0.47102 9.87331 0.07983 10.68326 NA  
MCEMP1 14 w NR 11.43635 1.19014 10.85837 0.91072 11.86984 1.30204  
MCEMP1 14 w R 10.01953 0.11270 9.95449 0.00433 10.14962 NA  
ANKRD22 BL NR 7.93514 0.63163 7.88278 0.80460 7.99623 0.41509  
ANKRD22 BL R 7.21661 1.53920 6.36598 0.62993 8.91787 NA  
ANKRD22 2 w NR 7.83015 0.70844 7.94993 0.74883 7.69040 0.69865  
ANKRD22 2 w R 6.74868 0.57709 6.34062 NA 7.15674 NA  
ANKRD22 6 w NR 7.73649 0.83921 7.81677 1.02441 7.64282 0.64142  
ANKRD22 6 w R 6.28816 0.71446 5.91955 0.45351 7.02539 NA  
ANKRD22 14 w NR 7.77347 1.08907 6.98572 1.15495 8.36428 0.63001  
ANKRD22 14 w R 6.24327 0.50590 6.03906 0.51153 6.65170 NA  
MRC2 BL NR 7.55784 0.46947 7.64053 0.40494 7.46136 0.55808  
MRC2 BL R 8.01957 0.69323 7.62187 0.11026 8.81497 NA  
MRC2 2 w NR 7.80989 0.54383 7.93715 0.58233 7.66142 0.50372  
MRC2 2 w R 7.02495 0.33457 6.78837 NA 7.26153 NA  
MRC2 6 w NR 7.64391 0.69816 7.93169 0.63960 7.30815 0.65399  
MRC2 6 w R 6.84312 0.46875 6.83780 0.66278 6.85377 NA  
MRC2 14 w NR 7.36819 0.56950 7.56189 0.44784 7.22291 0.67030  
MRC2 14 w R 7.07558 0.57640 6.99513 0.79097 7.23647 NA  
HP BL NR 9.77593 1.18396 10.36635 1.23291 9.08711 0.69480  
HP BL R 8.94784 1.46011 8.15686 0.71412 10.52980 NA  
HP 2 w NR 9.59201 0.86923 10.00088 0.86808 9.11500 0.63402  
HP 2 w R 8.50209 0.70071 8.00662 NA 8.99757 NA  
HP 6 w NR 9.38512 0.71767 9.61199 0.63856 9.12045 0.76856  
HP 6 w R 8.07669 1.14443 7.41598 0.01591 9.39811 NA  
HP 14 w NR 9.07592 1.04160 8.65522 0.81770 9.39145 1.18928  
HP 14 w R 7.83706 0.97441 7.27453 0.01864 8.96211 NA  
ANXA3 BL NR 11.42492 0.84186 11.79557 0.82497 10.99251 0.68378  
ANXA3 BL R 11.14977 1.04815 10.81746 1.23882 11.81438 NA  
ANXA3 2 w NR 11.49143 0.76761 11.74555 0.77053 11.19496 0.71118  
ANXA3 2 w R 10.64295 0.18651 10.77484 NA 10.51106 NA  
ANXA3 6 w NR 11.37090 0.68069 11.57389 0.55286 11.13408 0.78755  
ANXA3 6 w R 9.93366 0.72848 9.52752 0.26776 10.74593 NA  
ANXA3 14 w NR 10.92567 1.09970 10.43382 0.96054 11.29457 1.17483  
ANXA3 14 w R 9.58435 0.17960 9.48817 0.09490 9.77671 NA  
IGHG2 BL NR 11.38454 0.95762 11.79983 0.84149 10.90004 0.90995  
IGHG2 BL R 11.37380 0.49759 11.20504 0.56949 11.71131 NA  
IGHG2 2 w NR 11.06996 0.77884 11.53801 0.76591 10.52390 0.29557  
IGHG2 2 w R 10.57068 0.69647 11.06316 NA 10.07821 NA  
IGHG2 6 w NR 10.84556 0.84600 11.35601 0.74759 10.25004 0.50666  
IGHG2 6 w R 10.51271 0.62607 10.21651 0.50748 11.10510 NA  
IGHG2 14 w NR 10.52685 1.00058 10.82188 1.38269 10.30557 0.75857  
IGHG2 14 w R 10.43909 0.39699 10.21335 0.09721 10.89057 NA  
S100A12 BL NR 13.09941 1.02027 13.46045 1.12470 12.67821 0.76482  
S100A12 BL R 12.44412 1.50002 11.62335 0.67680 14.08568 NA  
S100A12 2 w NR 13.11192 0.81030 13.32584 0.92388 12.86234 0.64244  
S100A12 2 w R 12.03012 0.78964 11.47176 NA 12.58848 NA  
S100A12 6 w NR 12.86783 0.66775 12.97333 0.60726 12.74474 0.77063  
S100A12 6 w R 11.31558 1.02966 10.72113 0.01366 12.50448 NA  
S100A12 14 w NR 12.38900 1.13420 11.79267 0.96373 12.83624 1.15384  
S100A12 14 w R 11.15692 0.69311 10.76023 0.12900 11.95029 NA  
IGLV7-43 BL NR 7.70647 0.93221 7.64008 0.68052 7.78393 1.23148  
IGLV7-43 BL R 8.17555 0.90096 8.00817 1.20638 8.51032 NA  
IGLV7-43 2 w NR 7.23625 0.56340 7.35356 0.45754 7.09938 0.68472  
IGLV7-43 2 w R 7.56846 0.31108 7.78843 NA 7.34850 NA  
IGLV7-43 6 w NR 7.31696 0.70758 7.71877 0.69455 6.84818 0.36465  
IGLV7-43 6 w R 7.38873 0.67641 7.32378 0.94326 7.51863 NA  
IGLV7-43 14 w NR 7.00433 0.52336 7.09701 0.79898 6.93483 0.32742  
IGLV7-43 14 w R 6.76834 0.35959 6.60195 0.30412 7.10112 NA  
S100A9 BL NR 17.89001 0.68401 18.10128 0.80953 17.64353 0.44843  
S100A9 BL R 17.55154 0.95373 17.01299 0.28111 18.62863 NA  
S100A9 2 w NR 17.88489 0.58076 18.03698 0.65217 17.70745 0.47845  
S100A9 2 w R 16.94363 0.51123 16.58214 NA 17.30512 NA  
S100A9 6 w NR 17.72120 0.58446 17.86233 0.54968 17.55654 0.62995  
S100A9 6 w R 16.62811 0.53741 16.33026 0.21291 17.22380 NA  
S100A9 14 w NR 17.38374 0.79285 16.93135 0.71694 17.72302 0.74593  
S100A9 14 w R 16.49181 0.33039 16.37112 0.36181 16.73320 NA  
GYG1 BL NR 12.20327 0.88457 12.64718 0.83862 11.68539 0.66049
GYG1 BL R 11.49718 0.77516 11.15803 0.71525 12.17550 NA
GYG1 2 w NR 11.93975 0.70130 12.16455 0.78606 11.67748 0.53442
GYG1 2 w R 10.99151 0.13514 10.89595 NA 11.08707 NA
GYG1 6 w NR 11.90999 0.67371 12.09243 0.64516 11.69715 0.69921
GYG1 6 w R 10.67166 0.27081 10.53311 0.17750 10.94876 NA
GYG1 14 w NR 11.59917 0.76410 11.17847 0.63397 11.91470 0.76813
GYG1 14 w R 10.53723 0.11813 10.47799 0.08278 10.65571 NA
FCGR1B BL NR 9.65689 0.56340 9.43360 0.40504 9.91739 0.64320
FCGR1B BL R 9.37435 0.85837 8.97378 0.71475 10.17548 NA
FCGR1B 2 w NR 9.62850 0.60089 9.56742 0.45350 9.69976 0.78003
FCGR1B 2 w R 8.91520 0.11065 8.83696 NA 8.99344 NA
FCGR1B 6 w NR 9.63650 0.56123 9.64513 0.59795 9.62644 0.57156
FCGR1B 6 w R 8.63415 0.34235 8.44247 0.11815 9.01751 NA
FCGR1B 14 w NR 9.55368 0.85003 8.74288 0.59677 10.16178 0.23928
FCGR1B 14 w R 8.19481 0.13540 8.11771 0.03165 8.34901 NA
GALNT14 BL NR 9.24390 0.86230 9.55693 0.68180 8.87870 0.96410
GALNT14 BL R 8.72636 0.64813 8.41247 0.49900 9.35414 NA
GALNT14 2 w NR 9.06040 0.75411 9.24821 0.61848 8.84129 0.89377
GALNT14 2 w R 8.21177 0.14907 8.10636 NA 8.31718 NA
GALNT14 6 w NR 9.09657 0.77669 9.33835 0.61531 8.81449 0.90341
GALNT14 6 w R 7.54800 0.24629 7.43647 0.21608 7.77105 NA
GALNT14 14 w NR 8.55026 1.00166 8.15795 0.45822 8.84449 1.26386
GALNT14 14 w R 7.22062 0.15580 7.24088 0.21467 7.18010 NA
PDZK1IP1 BL NR 10.09752 0.44853 10.21394 0.47120 9.96171 0.41868
PDZK1IP1 BL R 10.37576 1.21755 9.68410 0.30740 11.75908 NA
PDZK1IP1 2 w NR 10.36069 0.70098 10.51500 0.72049 10.18065 0.69580
PDZK1IP1 2 w R 9.75455 1.40529 8.76087 NA 10.74824 NA
PDZK1IP1 6 w NR 10.06876 0.91801 10.37359 1.02398 9.71313 0.69462
PDZK1IP1 6 w R 9.29850 0.64865 9.04297 0.67061 9.80956 NA
PDZK1IP1 14 w NR 9.74326 0.35413 9.58983 0.35654 9.85832 0.35338
PDZK1IP1 14 w R 9.62232 0.77937 9.35543 0.88740 10.15609 NA
TESC BL NR 10.88367 0.48840 11.06502 0.54914 10.67209 0.33294  
TESC BL R 10.97724 0.68712 10.59187 0.23074 11.74797 NA  
TESC 2 w NR 11.11130 0.60730 11.28311 0.60905 10.91085 0.59201  
TESC 2 w R 10.24490 0.67412 9.76823 NA 10.72158 NA  
TESC 6 w NR 10.77599 0.67593 11.00889 0.68913 10.50428 0.60175  
TESC 6 w R 10.16543 0.24737 10.17604 0.34887 10.14423 NA  
TESC 14 w NR 10.61590 0.48675 10.63513 0.49179 10.60147 0.55855  
TESC 14 w R 10.29363 0.54578 10.23019 0.75605 10.42051 NA  
CYSTM1 BL NR 11.63470 0.79458 11.98809 0.75077 11.22242 0.67828  
CYSTM1 BL R 11.06130 0.46480 10.80052 0.15506 11.58286 NA  
CYSTM1 2 w NR 11.54419 0.64646 11.72236 0.52478 11.33632 0.75909  
CYSTM1 2 w R 10.46846 0.35443 10.21784 NA 10.71908 NA  
CYSTM1 6 w NR 11.35237 0.68997 11.57541 0.56307 11.09215 0.78179  
CYSTM1 6 w R 10.30533 0.23072 10.24890 0.29558 10.41817 NA  
CYSTM1 14 w NR 11.03892 0.88768 10.66667 0.55837 11.31810 1.06095  
CYSTM1 14 w R 10.05767 0.21557 10.10419 0.28276 9.96462 NA  
SOCS3 BL NR 11.77991 0.71814 11.89900 0.51840 11.64098 0.93394  
SOCS3 BL R 11.38506 0.27936 11.22639 0.07082 11.70242 NA  
SOCS3 2 w NR 11.58653 0.76289 11.70122 0.56519 11.45273 0.98669  
SOCS3 2 w R 10.71023 0.18429 10.57992 NA 10.84054 NA  
SOCS3 6 w NR 11.64429 0.81590 11.73938 0.75821 11.53334 0.93828  
SOCS3 6 w R 10.70570 0.13590 10.62767 0.02020 10.86176 NA  
SOCS3 14 w NR 11.33798 0.70813 10.96605 0.56780 11.61692 0.73885  
SOCS3 14 w R 10.46759 0.28458 10.62266 0.13300 10.15745 NA  
PLSCR1 BL NR 11.26636 0.41039 11.45364 0.32256 11.04787 0.41588  
PLSCR1 BL R 10.91685 0.59725 10.65134 0.53892 11.44788 NA  
PLSCR1 2 w NR 11.16207 0.45012 11.25527 0.39560 11.05333 0.52166  
PLSCR1 2 w R 10.43968 0.07939 10.49581 NA 10.38354 NA  
PLSCR1 6 w NR 11.24007 0.55868 11.37807 0.59525 11.07908 0.51589  
PLSCR1 6 w R 10.17844 0.40487 9.94825 0.09951 10.63883 NA  
PLSCR1 14 w NR 11.11072 0.70058 10.66344 0.68423 11.44619 0.56515  
PLSCR1 14 w R 9.97526 0.22159 10.01255 0.29976 9.90067 NA  
AC005392.2 BL NR 9.54051 0.99657 10.05205 0.68973 8.94372 1.00943  
AC005392.2 BL R 8.82498 0.96845 8.40623 0.90755 9.66249 NA  
AC005392.2 2 w NR 9.27117 0.68731 9.52025 0.53697 8.98059 0.77432  
AC005392.2 2 w R 8.38562 0.41086 8.09510 NA 8.67614 NA  
AC005392.2 6 w NR 9.12051 1.07063 9.43602 0.82863 8.75241 1.27478  
AC005392.2 6 w R 7.91490 0.42964 7.75768 0.46998 8.22934 NA  
AC005392.2 14 w NR 8.82475 0.65824 8.68106 0.27831 8.93252 0.88250  
AC005392.2 14 w R 8.02859 0.28344 7.97220 0.37629 8.14139 NA  
AL035661.1 BL NR 9.48328 0.76199 9.73399 0.64689 9.19079 0.83708  
AL035661.1 BL R 8.82505 0.88360 8.48755 0.93707 9.50003 NA  
AL035661.1 2 w NR 9.36822 0.69519 9.45744 0.70119 9.26413 0.73875  
AL035661.1 2 w R 8.31663 0.07897 8.37247 NA 8.26079 NA  
AL035661.1 6 w NR 9.32899 0.76017 9.35671 0.54148 9.29665 1.01622  
AL035661.1 6 w R 7.48995 0.52572 7.22813 0.37613 8.01358 NA  
AL035661.1 14 w NR 8.74039 1.16537 8.17621 0.78589 9.16352 1.32189  
AL035661.1 14 w R 7.17321 0.18598 7.06584 0.00121 7.38796 NA  
序列表 SEQ ID NO: 1
Figure 02_image001
Figure 02_image003
Figure 02_image005
Figure 02_image007
Figure 02_image009
Figure 02_image011
Figure 02_image013
(無)
[圖1]：患有炎性腸病（IBD）的患者之周邊血中分泌型捲曲相關蛋白-2（SFRP2）基因表現之示例性差異調控，取決於患者是否響應於奧蘭基西普的治療而實現臨床緩解。
 
                         序列表
          <![CDATA[<110>  荷蘭商菲林公司（Ferring B.V.）]]>
          <![CDATA[<120>  預測炎性腸病患者的響應之血液基因表現生物標誌物]]>
          <![CDATA[<140>  TW 110148231]]>
          <![CDATA[<141>  2021-12-22]]>
          <![CDATA[<150>  EP 20216433.1]]>
          <![CDATA[<151>  2020-12-22]]>
          <![CDATA[<160>  3     ]]>
          <![CDATA[<170>  PatentIn 3.5版]]>
          <![CDATA[<210>  1]]>
          <![CDATA[<211>  822]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  sgp130部分]]>
          <![CDATA[<400>  1]]>
          Glu Leu Leu Asp Pro Cys Gly Tyr Ile Ser Pro Glu Ser Pro Val Val 
          1               5                   10                  15      
          Gln Leu His Ser Asn Phe Thr Ala Val Cys Val Leu Lys Glu Lys Cys 
                      20                  25                  30          
          Met Asp Tyr Phe His Val Asn Ala Asn Tyr Ile Val Trp Lys Thr Asn 
                  35                  40                  45              
          His Phe Thr Ile Pro Lys Glu Gln Tyr Thr Ile Ile Asn Arg Thr Ala 
              50                  55                  60                  
          Ser Ser Val Thr Phe Thr Asp Ile Ala Ser Leu Asn Ile Gln Leu Thr 
          65                  70                  75                  80  
          Cys Asn Ile Leu Thr Phe Gly Gln Leu Glu Gln Asn Val Tyr Gly Ile 
                          85                  90                  95      
          Thr Ile Ile Ser Gly Leu Pro Pro Glu Lys Pro Lys Asn Leu Ser Cys 
                      100                 105                 110         
          Ile Val Asn Glu Gly Lys Lys Met Arg Cys Glu Trp Asp Gly Gly Arg 
                  115                 120                 125             
          Glu Thr His Leu Glu Thr Asn Phe Thr Leu Lys Ser Glu Trp Ala Thr 
              130                 135                 140                 
          His Lys Phe Ala Asp Cys Lys Ala Lys Arg Asp Thr Pro Thr Ser Cys 
          145                 150                 155                 160 
          Thr Val Asp Tyr Ser Thr Val Tyr Phe Val Asn Ile Glu Val Trp Val 
                          165                 170                 175     
          Glu Ala Glu Asn Ala Leu Gly Lys Val Thr Ser Asp His Ile Asn Phe 
                      180                 185                 190         
          Asp Pro Val Tyr Lys Val Lys Pro Asn Pro Pro His Asn Leu Ser Val 
                  195                 200                 205             
          Ile Asn Ser Glu Glu Leu Ser Ser Ile Leu Lys Leu Thr Trp Thr Asn 
              210                 215                 220                 
          Pro Ser Ile Lys Ser Val Ile Ile Leu Lys Tyr Asn Ile Gln Tyr Arg 
          225                 230                 235                 240 
          Thr Lys Asp Ala Ser Thr Trp Ser Gln Ile Pro Pro Glu Asp Thr Ala 
                          245                 250                 255     
          Ser Thr Arg Ser Ser Phe Thr Val Gln Asp Leu Lys Pro Phe Thr Glu 
                      260                 265                 270         
          Tyr Val Phe Arg Ile Arg Cys Met Lys Glu Asp Gly Lys Gly Tyr Trp 
                  275                 280                 285             
          Ser Asp Trp Ser Glu Glu Ala Ser Gly Ile Thr Tyr Glu Asp Arg Pro 
              290                 295                 300                 
          Ser Lys Ala Pro Ser Phe Trp Tyr Lys Ile Asp Pro Ser His Thr Gln 
          305                 310                 315                 320 
          Gly Tyr Arg Thr Val Gln Leu Val Trp Lys Thr Leu Pro Pro Phe Glu 
                          325                 330                 335     
          Ala Asn Gly Lys Ile Leu Asp Tyr Glu Val Thr Leu Thr Arg Trp Lys 
                      340                 345                 350         
          Ser His Leu Gln Asn Tyr Thr Val Asn Ala Thr Lys Leu Thr Val Asn 
                  355                 360                 365             
          Leu Thr Asn Asp Arg Tyr Leu Ala Thr Leu Thr Val Arg Asn Leu Val 
              370                 375                 380                 
          Gly Lys Ser Asp Ala Ala Val Leu Thr Ile Pro Ala Cys Asp Phe Gln 
          385                 390                 395                 400 
          Ala Thr His Pro Val Met Asp Leu Lys Ala Phe Pro Lys Asp Asn Met 
                          405                 410                 415     
          Leu Trp Val Glu Trp Thr Thr Pro Arg Glu Ser Val Lys Lys Tyr Ile 
                      420                 425                 430         
          Leu Glu Trp Cys Val Leu Ser Asp Lys Ala Pro Cys Ile Thr Asp Trp 
                  435                 440                 445             
          Gln Gln Glu Asp Gly Thr Val His Arg Thr Tyr Leu Arg Gly Asn Leu 
              450                 455                 460                 
          Ala Glu Ser Lys Cys Tyr Leu Ile Thr Val Thr Pro Val Tyr Ala Asp 
          465                 470                 475                 480 
          Gly Pro Gly Ser Pro Glu Ser Ile Lys Ala Tyr Leu Lys Gln Ala Pro 
                          485                 490                 495     
          Pro Ser Lys Gly Pro Thr Val Arg Thr Lys Lys Val Gly Lys Asn Glu 
                      500                 505                 510         
          Ala Val Leu Glu Trp Asp Gln Leu Pro Val Asp Val Gln Asn Gly Phe 
                  515                 520                 525             
          Ile Arg Asn Tyr Thr Ile Phe Tyr Arg Thr Ile Ile Gly Asn Glu Thr 
              530                 535                 540                 
          Ala Val Asn Val Asp Ser Ser His Thr Glu Tyr Thr Leu Ser Ser Leu 
          545                 550                 555                 560 
          Thr Ser Asp Thr Leu Tyr Met Val Arg Met Ala Ala Tyr Thr Asp Glu 
                          565                 570                 575     
          Gly Gly Lys Asp Gly Pro Glu Phe Thr Phe Thr Thr Pro Lys Phe Ala 
                      580                 585                 590         
          Gln Gly Glu Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu 
                  595                 600                 605             
          Ala Glu Gly Ala Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp 
              610                 615                 620                 
          Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp 
          625                 630                 635                 640 
          Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly 
                          645                 650                 655     
          Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn 
                      660                 665                 670         
          Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp 
                  675                 680                 685             
          Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro 
              690                 695                 700                 
          Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu 
          705                 710                 715                 720 
          Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn 
                          725                 730                 735     
          Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile 
                      740                 745                 750         
          Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr 
                  755                 760                 765             
          Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys 
              770                 775                 780                 
          Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys 
          785                 790                 795                 800 
          Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu 
                          805                 810                 815     
          Ser Leu Ser Pro Gly Lys 
                      820         
          <![CDATA[<210>  2]]>
          <![CDATA[<211>  844]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  sgp130部分]]>
          <![CDATA[<400>  2]]>
          Met Leu Thr Leu Gln Thr Trp Leu Val Gln Ala Leu Phe Ile Phe Leu 
          1               5                   10                  15      
          Thr Thr Glu Ser Thr Gly Glu Leu Leu Asp Pro Cys Gly Tyr Ile Ser 
                      20                  25                  30          
          Pro Glu Ser Pro Val Val Gln Leu His Ser Asn Phe Thr Ala Val Cys 
                  35                  40                  45              
          Val Leu Lys Glu Lys Cys Met Asp Tyr Phe His Val Asn Ala Asn Tyr 
              50                  55                  60                  
          Ile Val Trp Lys Thr Asn His Phe Thr Ile Pro Lys Glu Gln Tyr Thr 
          65                  70                  75                  80  
          Ile Ile Asn Arg Thr Ala Ser Ser Val Thr Phe Thr Asp Ile Ala Ser 
                          85                  90                  95      
          Leu Asn Ile Gln Leu Thr Cys Asn Ile Leu Thr Phe Gly Gln Leu Glu 
                      100                 105                 110         
          Gln Asn Val Tyr Gly Ile Thr Ile Ile Ser Gly Leu Pro Pro Glu Lys 
                  115                 120                 125             
          Pro Lys Asn Leu Ser Cys Ile Val Asn Glu Gly Lys Lys Met Arg Cys 
              130                 135                 140                 
          Glu Trp Asp Gly Gly Arg Glu Thr His Leu Glu Thr Asn Phe Thr Leu 
          145                 150                 155                 160 
          Lys Ser Glu Trp Ala Thr His Lys Phe Ala Asp Cys Lys Ala Lys Arg 
                          165                 170                 175     
          Asp Thr Pro Thr Ser Cys Thr Val Asp Tyr Ser Thr Val Tyr Phe Val 
                      180                 185                 190         
          Asn Ile Glu Val Trp Val Glu Ala Glu Asn Ala Leu Gly Lys Val Thr 
                  195                 200                 205             
          Ser Asp His Ile Asn Phe Asp Pro Val Tyr Lys Val Lys Pro Asn Pro 
              210                 215                 220                 
          Pro His Asn Leu Ser Val Ile Asn Ser Glu Glu Leu Ser Ser Ile Leu 
          225                 230                 235                 240 
          Lys Leu Thr Trp Thr Asn Pro Ser Ile Lys Ser Val Ile Ile Leu Lys 
                          245                 250                 255     
          Tyr Asn Ile Gln Tyr Arg Thr Lys Asp Ala Ser Thr Trp Ser Gln Ile 
                      260                 265                 270         
          Pro Pro Glu Asp Thr Ala Ser Thr Arg Ser Ser Phe Thr Val Gln Asp 
                  275                 280                 285             
          Leu Lys Pro Phe Thr Glu Tyr Val Phe Arg Ile Arg Cys Met Lys Glu 
              290                 295                 300                 
          Asp Gly Lys Gly Tyr Trp Ser Asp Trp Ser Glu Glu Ala Ser Gly Ile 
          305                 310                 315                 320 
          Thr Tyr Glu Asp Arg Pro Ser Lys Ala Pro Ser Phe Trp Tyr Lys Ile 
                          325                 330                 335     
          Asp Pro Ser His Thr Gln Gly Tyr Arg Thr Val Gln Leu Val Trp Lys 
                      340                 345                 350         
          Thr Leu Pro Pro Phe Glu Ala Asn Gly Lys Ile Leu Asp Tyr Glu Val 
                  355                 360                 365             
          Thr Leu Thr Arg Trp Lys Ser His Leu Gln Asn Tyr Thr Val Asn Ala 
              370                 375                 380                 
          Thr Lys Leu Thr Val Asn Leu Thr Asn Asp Arg Tyr Leu Ala Thr Leu 
          385                 390                 395                 400 
          Thr Val Arg Asn Leu Val Gly Lys Ser Asp Ala Ala Val Leu Thr Ile 
                          405                 410                 415     
          Pro Ala Cys Asp Phe Gln Ala Thr His Pro Val Met Asp Leu Lys Ala 
                      420                 425                 430         
          Phe Pro Lys Asp Asn Met Leu Trp Val Glu Trp Thr Thr Pro Arg Glu 
                  435                 440                 445             
          Ser Val Lys Lys Tyr Ile Leu Glu Trp Cys Val Leu Ser Asp Lys Ala 
              450                 455                 460                 
          Pro Cys Ile Thr Asp Trp Gln Gln Glu Asp Gly Thr Val His Arg Thr 
          465                 470                 475                 480 
          Tyr Leu Arg Gly Asn Leu Ala Glu Ser Lys Cys Tyr Leu Ile Thr Val 
                          485                 490                 495     
          Thr Pro Val Tyr Ala Asp Gly Pro Gly Ser Pro Glu Ser Ile Lys Ala 
                      500                 505                 510         
          Tyr Leu Lys Gln Ala Pro Pro Ser Lys Gly Pro Thr Val Arg Thr Lys 
                  515                 520                 525             
          Lys Val Gly Lys Asn Glu Ala Val Leu Glu Trp Asp Gln Leu Pro Val 
              530                 535                 540                 
          Asp Val Gln Asn Gly Phe Ile Arg Asn Tyr Thr Ile Phe Tyr Arg Thr 
          545                 550                 555                 560 
          Ile Ile Gly Asn Glu Thr Ala Val Asn Val Asp Ser Ser His Thr Glu 
                          565                 570                 575     
          Tyr Thr Leu Ser Ser Leu Thr Ser Asp Thr Leu Tyr Met Val Arg Met 
                      580                 585                 590         
          Ala Ala Tyr Thr Asp Glu Gly Gly Lys Asp Gly Pro Glu Phe Thr Phe 
                  595                 600                 605             
          Thr Thr Pro Lys Phe Ala Gln Gly Glu Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 
              610                 615                 620                 
          Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala Pro Ser Val Phe Leu Phe 
          625                 630                 635                 640 
          Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val 
                          645                 650                 655     
          Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe 
                      660                 665                 670         
          Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro 
                  675                 680                 685             
          Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr 
              690                 695                 700                 
          Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val 
          705                 710                 715                 720 
          Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala 
                          725                 730                 735     
          Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg 
                      740                 745                 750         
          Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly 
                  755                 760                 765             
          Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro 
              770                 775                 780                 
          Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser 
          785                 790                 795                 800 
          Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln 
                          805                 810                 815     
          Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His 
                      820                 825                 830         
          Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 
                  835                 840                 
          <![CDATA[<210>  3]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  gp130 D6結構域]]>
          <![CDATA[<400>  3]]>
          Thr Phe Thr Thr Pro Lys Phe Ala Gln Gly Glu 
          1               5                   10
Figure 12_A0101_SEQ_0001
Figure 12_A0101_SEQ_0002
Figure 12_A0101_SEQ_0003
Figure 12_A0101_SEQ_0004
Figure 12_A0101_SEQ_0005
Figure 12_A0101_SEQ_0006
Figure 12_A0101_SEQ_0007
Figure 12_A0101_SEQ_0008
Figure 12_A0101_SEQ_0009
Figure 12_A0101_SEQ_0010
Figure 12_A0101_SEQ_0011

Claims (19)

  1. 生物標誌物用於預測患有炎性腸病的個體對用sgp130蛋白治療的響應之用途，所述生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC。
  2. 一種鑒定可能會對用sgp130蛋白治療有響應的、患有炎性腸病的個體之方法，該方法包括測量投與了sgp130蛋白的個體之選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平： AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC， 其中該至少一或多種生物標誌物之血液表現水平之降低將該個體鑒定為對所述治療可能有響應。
  3. 一種體外鑒定對sgp130的接受性之方法，該方法包括測量血液樣本中選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC的一或多種生物標誌物之表現水平， 其中該血液樣本獲得自投與了初始劑量的sgp130蛋白的受試者，較佳地其中選擇該等生物標誌物中的兩種或更多種的表現水平。
  4. 一種體外測量血液樣本中一或多種生物標誌物、較佳的是兩種或更多種生物標誌物之表現水平之方法，該等生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC， 其中該血液樣本獲得自投與了初始劑量的sgp130蛋白的受試者。
  5. 一種體外預測個體對sgp130的響應、較佳地用於預測個體響應於sgp130的臨床緩解之方法，該方法包括測量一或多種生物標誌物、較佳的是兩種或更多種生物標誌物之血液表現水平，該等生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC，其中在投與sgp130蛋白後7-28天測量血液表現水平。
  6. 如前述請求項中任一項所述之方法或用途，其中表現水平係由RNA定序確定的。
  7. 如前述請求項中任一項所述之方法或用途，其中該一或多種生物標誌物之血液表現水平係在投與該sgp130蛋白後7-28天、較佳的是7-21天、更較佳的是7-14天、並且甚至更較佳的是14天測量的。
  8. 如前述請求項中任一項所述之方法或用途，其中對治療的響應係臨床緩解或其中對治療的響應係內視鏡檢查緩解。
  9. 一種用於治療個體之炎性腸病的sgp130蛋白，其中使在接受第一劑量的該sgp130蛋白後7-28天、較佳的是7-21天、並且甚至更較佳的是14天具有選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平降低的個體接受至少第二劑量的該sgp130蛋白： AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC。
  10. 用於如請求項9所述使用的sgp130蛋白，其中該一或多種生物標誌物之血液表現水平係在投與第一劑量的該sgp130蛋白後7-28天、較佳的是7-21天、更較佳的是7-14天、並且甚至更較佳的是14天測量的。
  11. 用於如請求項9或10所述使用的sgp130蛋白，其中將該sgp130蛋白每7-28天、較佳的是每7-14天投與於該個體。
  12. 如請求項2-11中任一項所述之方法或用於使用的sgp130蛋白，其中sgp130蛋白之投與劑量係60 mg至1 g，較佳的是150 mg至600 mg。
  13. 如前述請求項中任一項所述之用途、方法或用於使用的sgp130蛋白，其中該炎性腸病係潰瘍性結腸炎。
  14. 如前述請求項中任一項所述之用途、方法或用於使用的sgp130蛋白，其中該炎性腸病係克隆氏病。
  15. 如前述請求項中任一項所述之用途、方法或用於使用的sgp130蛋白，其中該炎性腸病係輕度至中度的或其中該炎性腸病係中度至重度的。
  16. 如前述請求項中任一項所述之用途、方法或用於使用的sgp130蛋白，其中該sgp130蛋白係多肽二聚物，該多肽二聚物包含兩個單體，每個單體與SEQ ID NO: 1具有至少90%的序列同一性，其中這兩個單體包含gp130 D6結構域、Fc結構域鉸鏈區，該gp130 D6結構域包含SEQ ID NO: 1之第585-595位的胺基酸，該Fc結構域鉸鏈區包含SEQ ID NO: 1之第609-612位的胺基酸，並且這兩個單體不包含位於gp130部分與Fc結構域之間的連接子。
  17. 如前述請求項中任一項所述之用途、方法或用於使用的sgp130蛋白，其中至少兩種生物標誌物、至少三種生物標誌物或至少四種生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC。
  18. 如前述請求項中任一項所述之用途、方法或用於使用的sgp130蛋白，其中該生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、S100A12、S100A9、SLC1A3、SOCS3、和TESC，或其中該生物標誌物選自AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、和TESC。
  19. 一種用於治療個體之炎性腸病之方法，所述方法包括將至少第一劑量的sgp130蛋白投與於有需要的個體，並且如果所述個體的選自以下的一或多種生物標誌物之血液表現水平降低，則投與另外劑量的該sgp130蛋白： AC005392.2、AL035661.1、ANKRD22、ANXA3、CD177、CYSTM1、FCGR1A、FCGR1B、FCGR1CP、GALNT14、GYG1、HP、IGHG2、IGKV1-12、IGKV1-16、IGKV2-24、IGKV4-1、IGLV2-11、IGLV5-45、IGLV7-43、MCEMP1、MRC2、PDZK1IP1、PLSCR1、S100A12、S100A9、SFRP2、SLC1A3、SOCS3、和TESC，較佳地其中該方法還包括測量該一或多種生物標誌物之血液表現水平。
TW110148231A 2020-12-22 2021-12-22 預測炎性腸病患者的響應之血液基因表現生物標誌物 TW202242142A (zh)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP20216433 2020-12-22
EP20216433.1 2020-12-22

Publications (1)

Publication Number Publication Date
TW202242142A true TW202242142A (zh) 2022-11-01

Family

ID=73856778

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW110148231A TW202242142A (zh) 2020-12-22 2021-12-22 預測炎性腸病患者的響應之血液基因表現生物標誌物

Country Status (2)

Country Link
TW (1) TW202242142A (zh)
WO (1) WO2022139580A1 (zh)

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SI1148065T1 (sl) 2000-04-21 2008-06-30 Conaris Res Inst Ag FUZIJSKI PROTEINI, KI VSEBUJEJO DVE TOPNI MOLEKULI gp130.
JP2004182638A (ja) * 2002-12-03 2004-07-02 Yakult Honsha Co Ltd 炎症性疾患又は悪性腫瘍の予防治療剤
SI1873166T1 (sl) 2006-06-30 2011-01-31 Conaris Res Inst Ag IZBOLJĹ ANI sgp 130Fc DIMERJI
MA41116A (fr) 2014-12-01 2017-10-10 Ferring Bv Compositions d'inhibiteur de trans-signalisation par l'il-6 sélectif
MD3226888T2 (ro) 2014-12-01 2021-08-31 Ferring Bv Administrarea unui inhibitor de trans-semnalizare a IL-6 selectiv

Also Published As

Publication number Publication date
WO2022139580A1 (en) 2022-06-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2016333903B2 (en) Biomarkers related to interleukin-33 (IL-33)-mediated diseases and uses thereof
US20110150982A1 (en) Anti-chemokine and associated receptors antibodies for inhibition of growth of neoplasms
EP3548513A1 (en) Methods of treating inflammatory conditions
JP2009526756A (ja) Ｉｌ−３１ｒａアンタゴニストおよびｏｓｍｒｂアンタゴニストを用いて神経組織における疼痛および炎症を治療する方法
JP5814851B2 (ja) 関節炎の全身処置のための組成物および方法
CN113286604B (zh) 治疗炎症性疾病的蛋白质
WO2015191783A2 (en) Biomarkers for inflammatory disease and methods of using same
CN114732899A (zh) MAdCAM拮抗剂的剂量方案
JP2021047186A (ja) 免疫媒介性疾患を有する対象を処置するための組成物および方法
JP2024038034A (ja) 膀胱癌の抗ｐｄ－ｌ１抗体治療
TW202242142A (zh) 預測炎性腸病患者的響應之血液基因表現生物標誌物
US20200405851A1 (en) Method of diagnosis and treatment of rheumatoid arthritis
CN115867577A (zh) 用于预测covid-19肺炎中对il-6拮抗剂反应的生物标志物
BR112020016400A2 (pt) Anticorpos para o ligante do receptor de tirosina cinase 3 similar ao sarcoma felino de mcdonough (fms) (flt3l) e suas utilizações para o tratamento de doenças autoimunes e inflamatórias
JP2024505175A (ja) 関節リウマチを治療する方法
US20210318334A1 (en) Materials and Methods for Improved Prediction of IGG Therapeutic Protein Exposure
US20220340974A1 (en) Method of Predicting Requirement for Biologic Therapy
Lotti Immunity and Inflammation: from complement system activation in Rheumatoid Arthritis to dysregulated immunometabolism in Systemic Lupus Erythematosus
Nyirenda et al. THU0039 DECIPHERING DISEASE-RELEVANT T CELL SUBSETS IN RHEUMATOID ARTHRITIS IDENTIFIES A NOVEL CELLULAR SUBSET OF PATHOGENETIC IMPORTANCE IN THERAPEUTIC RESISTANCE.
Narayan et al. THU0088 Monocyte downregulation of mitochondrial translocator protein may be a contributory mechanism to inflammation in ra
DK2527371T3 (en) A method for the treatment of glomerulonephritis
KR20200101660A (ko) 알레르기성 호흡기 질환의 예방 또는 치료용 약학 조성물