TW201927764A - 細菌雙分子訊息傳遞系統之抑制劑及其用途 - Google Patents

細菌雙分子訊息傳遞系統之抑制劑及其用途 Download PDF

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Abstract

本揭示內容是關於一種式 (I) 化合物作為細菌雙分子訊息傳遞系統之抑制劑的新穎用途, A–L–B–L–A (I) 其中,A 是一具有負電荷的基團;L 是 –(C2 H5 –O)n –CH2 –,或是一由碳環基及雜環基所組成的基團,其中該碳環基及雜環基分別具有 5 至 10 個環上的原子並相互耦接,其中 n 是 0 或 1;以及,B 是一 5 至 10 個原子的碳環基或雜環基。該式 (I) 化合物可用以抑制多重抗藥性細菌等細菌的生長。

Description

細菌雙分子訊息傳遞系統之抑制劑及其用途
本揭示內容整體來說是關於抗細菌的技術領域,以及去治療細菌感染所引起的病症。
雙分子訊息傳遞系統(two component signal transduction systems,TCS)是一種去控制可回應環境變化的基因之表現的系統,並且其是由表現出組胺酸激酶(histidine kinase,HK)活性的感應器(sensor)蛋白及 DNA結合蛋白(DNA-binding protein)的調節器(regulator)蛋白所組成。細菌具有多種不同的感應器及調節器來回應各種環境變化,因此,TCS 在許多不同的微生物之生長、維持及功能(例如調節胞外多醣(exopolysaccharides)及毒力因子(virulence factors)的生產、調節運動性、附著性及形成生物膜,以及生長並維持存活率)上扮演重要角色。這類具有 TCS 的細菌可藉由抑制 TCS 調節器的反應(即 TCS 抑制劑)來殺死之。因此,一種具有可對抗細菌 TCS 系統之抗菌活性(特別是可對抗 TCS 調節器的反應)的抗菌劑是有前景的抗菌劑。
有鑑於此,相關領域急需一種新穎的抗菌劑,其係作為 TCS 抑制劑,據以抑制抗藥性細菌等細菌的生長。
本揭示內容至少部分是基於,發明人意外發現某些化合物可有效破壞細菌反應調節器與 DNA 之間的結合,因此可抑制細菌(特別是多重抗藥性(multi-drug resistant,MDR)細菌)的生長。據此,這類化合物可作為候選前導化合物,據以製備適用於治療細菌感染性疾病(例如肺炎、敗血症、角膜感染、皮膚感染、中樞神經系統感染或毒性休克症候群(toxic shock syndrome))之藥物。
據此,本揭示內容的第一態樣是提供一種用以治療一個體之細菌感染性疾病的方法,包含對該個體投予一有效量之式 (I) 化合物,或其藥學上可接受的鹽類、水合物或溶劑合物, A–L–B–L–A (I) 其中, A 是一具有負電荷的基團; L是–(C2 H5 –O)n –CH2 –,或是一由碳環基(carbocyclyl)及雜環基(heterocyclyl)所組成的基團,其中該碳環基及雜環基分別具有 5 至 10 個環上的原子並相互耦接,其中 n 是 0 或 1;以及, B 是一 5 至 10 員的碳環基或雜環基; 據以緩解(alleviate)或改善(ameliorate)細菌感染性疾病的症狀。
依據本揭示內容的實施方式,該式 (I) 化合物是細菌 PmrA/PmrB系統的抑制劑。
依據本揭示內容的實施方式,A 是 –PO4 、PO3 2– 或 –SO3 。在一較佳的實施例中,A 是 –SO3
依據本揭示內容的一較佳的實施方式,A 是 –SO3 ;L 是;且 B 是 –C6 H4 –。
依據本揭示內容的另一較佳的實施方式,A 是 –SO3 ;L 是 –(C2 H5 –O)n –CH2 –,其中 n 是 1;且 B 是
依據本揭示內容的再另一較佳的實施方式,A 是 –SO3 ;L 是 –(C2 H5 –O)n –CH2 –,其中 n 是 0;且 B 是
依據本揭示內容的實施方式,該細菌是炭疽桿菌(Bacillus anthracis )、枯草桿菌(Bacillus subtilis )、仙人掌桿菌(Bacillus cereus 白喉桿菌(Corynebacterium diptheria e)、破傷風桿菌(Clostridium tetani )、肉毒桿菌(Clostridium botulinum )、產氣莢膜芽胞梭菌(Clostridium perfringes )、困難梭狀芽孢桿菌(Clostridium difficile )、閃爍梭菌(Clostridium scindens )、草綠色鏈球菌(Streptococcus viridians )、糞腸球菌(Enterococcus faecalis )、屎腸球菌(Enterococcus faecium 丹毒桿菌(Erysipelothrix rhusiopathia e)、大腸桿菌(Escherichia coli )、幽門螺旋桿菌(Helicobacter pylori 克雷伯氏肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae 李斯特菌(Listeria monocytogens )、結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis 痤瘡丙酸桿菌(Propionbacterium acnes )、馬玫瑰球菌(Rhodococcus equi )、無乳鏈球菌(Staphylococcus agalactiae )、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus )、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis )、肺炎鏈球菌(Streptococcus pneumoniae )、釀膿葡萄球菌(Staphylococcus pyrogens )或腐生葡萄球菌(Staphylococcus saprophyticus )的任一種。
依據較佳的實施方式,該細菌是多重抗藥性細菌。
依據某些實施方式,該細菌是抗多黏菌素(polymyxin)或抗黏菌素(colistin)的克雷伯氏肺炎桿菌。
依據某些實施方式,該細菌是抗克拉黴素(clarithromycin)的幽門螺旋桿菌。
依據其他實施方式,該細菌是抗雷福黴素(rifamycin)或抗異菸酸酊(isoniazid)的結核分枝桿菌。
依據本揭示內容的某些實施方式,該細菌感染性疾病是肺炎、敗血症、角膜感染、皮膚感染、中樞神經系統感染或毒性休克症候群。
依據其他實施方式,該個體具有皮膚膿瘍(abscess)、癤(furuncle)或皮膚疔(boil)。
依據本揭示內容的某些實施方式,該方法更包含在投予該式 (I) 化合物的同時、之前及/或之後,對該個體投予另一種治療劑(例如抗生素),據以緩解或改善疾病的症狀。
依據某些較佳的實施方式,可用於本揭示內容方法的抗生素之實例包括,但不限於,針黴素(acumycin)、胺苄青黴素(ampicillin)、阿莫西林(amoxycillin)、雙性黴素(amphotericins)、抗黴素(antimycins)、盎格魯黴素(anglomycin)、阿維菌素(avermectins)、阿奇黴素(azithromycin)、硼黴素(boromycin)、嘉寶黴素(carbomycins)、碳青黴烯(carbapenem)、頭孢子菌素(ceftazidime)、塞紅黴素(cethromycin)、氯黴素(chloramphenicol)、卻兒可黴素(chalcomycin)、賽普沙辛(ciprofloxacin)、伴刀球黴素(concanamycins)、卷鬚黴素(cirramycin)、克拉黴素、黏菌素、氯噻青黴素(cycloxacillin)、達托黴素(daptomycin)、去甲阿奇黴素(des甲基 azithromycin)、沙漠黴素(desertomycins)、二氫苦黴素(dihydropikromycin)、地紅黴素(dirithromycin)、多西環素(doxycycline)、安來黴素(enramycin)、紅黴素(erythromycin)、氟紅黴素(flurithromycin)、氟甲喹(flumequin)、慶大黴素(gentamycin)、異菸酸酊、幼黴素(juvenimicins)、久慈黴素(kujimycins)、蘭卡黴素(lankamycins)、林可黴素(lincomycin)、雨濱蛙肽(litorin)、白黴素(leucomycins)、巨黴素(megalomicins)、美羅培南(meropenem)、酒黴素(methymycin)、麥迪黴素(midecamycins)、麥新米星I(mycinamicin I)、麥新米星II(mycinamicin II)、麥新米星III(mycinamicin III)、麥新米星IV(mycinamicin IV)、麥新米星V(mycinamicin V)、麥新米星VI(mycinamicin VI)、麥新米星VII(mycinamicin VII)、麥新米星VIII(mycinamicin VIII)、那波黴素(narbomycin)、新抗黴素(neoantimycin)、新酒黴素(neomethymycin)、奈替米星(netilmicin)、乙基西梭黴素(neutromycin)、尼達黴素(niddamycins)、諾氟沙星(norfioxacin)、奧連黴素(oleandomycins)、寡黴素(oligomycins)、奧薩黴素(ossamycin)、苯唑西林(oxacillin)、歐索林酸(oxolinic acid)、青黴素(penicillin)、苦黴素(pikromycin)、哌拉西林(piperacillin)、普拉特黴素(微量盤nomycins)、多黏菌素、雷帕黴素(rapamycins)、雷洛黴素(relomycin)、雷福黴素、羅沙米星(rosaramicin)、羅紅黴素(roxithromycin)、維黴素(virginiamycin)、螺旋黴素(spiramycin)、斯珀里亞黴素(sporeamycin)、葡萄球菌黴素(staphycoccomycin)、鏈黴素(streptomycin)、磺胺甲異㗁唑(sulfamethoxazole)、索爾巴黴素(swalpamycin)、泰樂黴素(telithromycin)、壁黴素(teicoplanin)、特美汀(timentin)、妥布黴素(tobramycin)、替卡西林(ticarcillin)、甲氧苄啶(trimethoprim)、四環黴素(tetracyclin)、洛西林(zlocillin),及/或其組合。在一較佳的實施例中,該抗生素是多黏菌素(例如多黏菌素B)。在另一較佳的實施例中,該抗生素是黏菌素。
據此,本揭示內容的第二態樣是提供一種可抑制具有雙分子訊息傳遞系統(TCS)(例如PmrA/PmrB系統)的細菌生長的組合物。因此該組合物是可用於治療一細菌感染性疾病。該組合物包含一有效量之上述式 (I) 化合物、其藥學上可接受的鹽類、水合物或溶劑合物;以及一藥學上可接受的賦形劑。
該式 (I) 化合物的重量約佔該組合物總重量的 0.1% 至 99%。在某些實施方式中,該式 (I) 化合物的重量約佔該組合物總重量的至少 1%。在其他實施方式中,該式 (I) 化合物的重量約佔該組合物總重量的至少 5%。在進一步的實施方式中,該式 (I) 化合物的重量約佔該組合物總重量的至少 10%。在再進一步的實施方式中,該式 (I) 化合物的重量約佔該組合物總重量的至少 25%。
依據某些較佳的實施方式,該組合物更包含一抗生素。可用於本揭示內容組合物的抗生素之實例包括,但不限於,針黴素、胺苄青黴素、阿莫西林、雙性黴素、抗黴素、盎格魯黴素、阿維菌素、阿奇黴素、硼黴素、嘉寶黴素、碳青黴烯、頭孢子菌素、塞紅黴素、氯黴素、卻兒可黴素、賽普沙辛、伴刀球黴素、卷鬚黴素、克拉黴素、黏菌素、氯噻青黴素、達托黴素、去甲阿奇黴素、沙漠黴素、二氫苦黴素、地紅黴素、多西環素、安來黴素、紅黴素、氟紅黴素、氟甲喹 慶大黴素、異菸酸酊、幼黴素、久慈黴素、蘭卡黴素、林可黴素、雨濱蛙肽、白黴素、巨黴素、美羅培南、酒黴素、麥迪黴素、麥新米星I、麥新米星II、麥新米星III、麥新米星IV、麥新米星V、麥新米星VI、麥新米星VII、麥新米星VIII、那波黴素、新抗黴素、新酒黴素、奈替米星、乙基西梭黴素、尼達黴素、諾氟沙星、奧連黴素、寡黴素、奧薩黴素、苯唑西林、歐索林酸、青黴素、苦黴素、哌拉西林、普拉特黴素、多黏菌素、雷帕黴素、雷洛黴素、雷福黴素、羅沙米星、羅紅黴素、維黴素、螺旋黴素、斯珀里亞黴素、葡萄球菌黴素、鏈黴素、磺胺甲異㗁唑、索爾巴黴素、泰樂黴素、壁黴素、特美汀、妥布黴素、替卡西林、甲氧苄啶、四環黴素、洛西林,及/或其組合。在一較佳的實施方式中,該抗生素是多黏菌素(例如多黏菌素 B)。在另一較佳的實施方式中,該抗生素是黏菌素。
本揭示內容一或多個實施方式的詳細內容及說明闡述如下。在參閱以下的詳細說明及申請專利範圍後,本揭示內容的其餘特徵及優點將顯而易見。
下文提供了詳細說明及附隨圖式係為了使本揭示內容實施例的敘述更加詳盡與完備,而非代表用以理解或運用本揭示內容實施例的唯一形式。本說明書闡述實施例的功能以及用以建構與操作此等實施例的步驟順序。然而,亦可利用其他實施例來達成相同或均等的功能與步驟順序。
1. 定義
為方便起見,此處將本揭示內容中所使用的特定詞彙揭示於此。除非本說明書另有定義,此處所用的科學與技術詞彙的含義與本發明所屬技術領域中具有通常知識者所理解與慣用的意義相同。
除非另有指明,此處所使用之「碳環」(carbocycle)或「碳環基」(carbocyclyl)一詞,是指具有 5 至 10 個碳原子作為單環的飽和、部分不飽和或芳香的環。單環碳環具有 5 至 10 個環上的原子,又更常是具有 5 或 6 個環上的原子。單環碳環的非限制性之實例包括環烷基(例如環戊基、環己基、環庚基、環辛基)或芳基(例如苯基等)。因此,此處所使用之「碳環」涵蓋,但不限於,「芳基」及「苯基」。
此處所使用之「雜環」(heterocycle)或「雜環基」(heterocyclyl)一詞,是指一 5 至 10 個原子的單環,其可以是含有 1、2、3 或 4 個選自氧,氮及硫的雜原子的飽和、部分不飽和或芳香的環,其中該雜原子可以是相同或不同。雜環包括芳香及非芳香的單環。在本發明的某些實施方式中,「雜環」包括此處所定義之「碳環」,其中一或多個(例如 1、2、3 或4 個)碳原子是以一雜原子(例如 O、N 或 S)來取代。除非另有指明,每個雜環基的實例個別是可任選取代的,亦即,無以一或多個取代基來取代(一「無取代的雜環基」(unsubstituted heterocyclyl))或有以一或多個取代基來取代(一「有取代的雜環基」(substituted heterocyclyl))。合適的取代基之實例包括鹵素、烷基、胺基、硝基、羥基、烷氧基、羰基及羧基。較佳的雜環基是飽和的 10 個原子的碳環基,其中 4 個環上的碳原子是以硫來取代。
除非另有指明,「有取代的」(substituted)一詞,當用於描述化學結構或基團時,是指該結構或基團之衍生物的其中一或多個氫原子是以一或多個的:烷氧基、烷基、芳基、鹵基、鹵代烷基或羥基來取代。
「可任選取代的」(optionally substituted)一詞是指有取代或無取代的。「有取代的」(substituted)一詞,當用於描述化學結構或基團時,是指該結構或基團之衍生物的其中一或多個氫原子是以一原子、化學基團或官能基例如,但不限於,–OH、–CHO、烷氧基、鏈烷基(alkanoyloxy)(例如–OAc)、烯基、烷基(例如甲基、乙基、丙基、叔丁基)、芳基、芳氧基、鹵基或鹵代烷基(例如–CCl3 、–CF3 、–C(CF3 )3 )來取代。
除非另有指明,緊接著一系列名詞之前的一或多個形容詞,解釋成適用於每個名詞。舉例來說,用語「可任選取代的烷基、環烷基、雜環烷基、芳基、或雜芳基」(optionally substituted alky, cycloalkyl, heterocycloalkyl, aryl, or heteroaryl)與「可任選取代的烷基、可任選取代的環烷基、可任選取代的雜環烷基、可任選取代的芳基或任選取代的雜芳基」(optionally substituted alky, optionally substituted cycloalkyl, optionally substituted heterocycloalkyl, optionally substituted aryl, or optionally substituted heteroaryl.)的意義相同。
「藥學上可接受的鹽類」(pharmaceutically acceptable salt)一詞是指該些鹽,在合理的醫學判斷範圍內,適用於與人類及較低等動物的組織接觸使用而無過度毒性、刺激性、過敏反應等,且具有合理的效益/風險比例。藥學上可接受的鹽類是本領域所熟知的。本發明化合物的藥學上可接受的鹽類包括該些衍生自合適的無機和有機酸和鹼。藥學上可接受的無毒酸加成鹽的實例是一具有胺基的鹽,其與無機酸(例如鹽酸、氫溴酸、磷酸、硫酸及過氯酸)或與有機酸(例如乙酸、草酸、馬來酸、酒石酸、檸檬酸、琥珀酸或丙二酸)或藉由使用本領域所熟知的其它方法(例如離子交換)形成的鹽。其它藥學上可接受的鹽類包括己二酸鹽、藻酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬氨酸鹽、苯磺酸鹽(benzenesulfonate)、苯甲酸鹽、硫酸氫鹽、硼酸鹽、丁酸鹽、樟腦酸鹽、樟腦磺酸鹽、檸檬酸鹽、環戊烷丙酸鹽、二葡糖酸鹽、十二烷基硫酸鹽、乙磺酸鹽、甲酸鹽、富馬酸鹽、葡庚糖酸鹽、甘油磷酸鹽、葡糖酸鹽、半硫酸鹽、庚酸鹽、己酸鹽、氫碘酸鹽、2-羥基-乙磺酸鹽、乳糖酸鹽、乳酸鹽、月桂酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、丙二酸鹽、甲磺酸鹽、2-萘磺酸鹽、煙酸鹽、硝酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、果膠酸鹽、過硫酸鹽、3-苯基丙酸酯、磷酸鹽、苦味酸鹽、新戊酸鹽、丙酸鹽、硬脂酸鹽、琥珀酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、硫氰酸鹽、對甲苯磺酸鹽、十一烷酸鹽、和戊酸鹽等。衍生自適當的鹼的鹽包括鹼金屬、鹼土金屬、銨及N+ (C1–4 烷基)4 鹽。代表性的鹼金屬或鹼土金屬鹽包括鈉、鋰、鉀、鈣、鎂等。進一步藥學上可接受的鹽類包括,當適當時,使用抗衡離子如鹵化物、氫氧化物、羧酸鹽、硫酸鹽、磷酸鹽、硝酸鹽、低級烷基磺酸鹽及芳基磺酸鹽所形成的無毒銨、季銨和胺陽離子。
「水合物」(hydrate)一詞是指與水結合的化合物。一般來說,包含在化合物的水合物中的水分子的數目與水合物中化合物分子的數目的比率是明確的。因此,化合物的水合物可以例如由通式 R・XH2 O 來代表,其中 R 是化合物,且 X 是大於 0 的數。給定的化合物可以形成多於一種類型的化合物,包括,例如單水合物(X 為 1)、低水合物(X 為大於 0 且小於 1 的數,例如半水合物(R・0.5H2 O)),以及多水合物(X 為大於1的數,例如二水合物(R・2H2 O)及六水合物(R・6H2 O))。
「溶劑合物」(solvate)一詞是指與溶劑結合的化合物的形式,通常是藉由溶劑分解反應來結合。此物理結合(physical association)可以包括氫鍵結合。常規的溶劑包括水、甲醇、乙醇、乙酸、二甲基亞碸(dimethyl sulfoxide,DMSO)、四氫呋喃(tetrahydrofuran,THF)、乙醚等。本揭示內容化合物可以例如以結晶形式來製備,並可被溶合(solvated)。合適的溶劑合物包括藥學上可接受的溶劑合物,並更包括化學計量的溶劑合物和非化學計量的溶劑合物二者。在某些實例中,例如當一種或更多種溶劑分子被併入結晶固體的晶格時,溶劑合物將能夠分離。「溶劑合物」包含溶液相和可分離的溶劑合物二者。代表性的溶劑合物包括水合物、乙醇化物和甲醇化物。
「個體」(subject)或「病患」(patient)一詞是指一種可用本發明化合物來治療的動物,包括人類。除非有具體指出其中一種性別,否則「個體」或「病患」一詞意指男性及女性二者。據此,「個體」或「病患」一詞包含任一種可自本揭示內容治療方法獲益的哺乳動物。
「投予」(administered、administering或administration)一詞在本文中可交替使用,是指一種遞送方式包括,但不限於,靜脈內、肌肉內、腹腔內、動脈內、皮下或經皮吸收方式來投予本發明藥物(例如一化合物或一組合物)。
此處所使用之「一有效量」(an effective amount)是指一種在劑量上及必要的期間內能有效地達到期望之疾病治療結果的量。舉例來說,在治療感染性疾病中,一種可減少、預防、延緩、抑制或阻滯感染性疾病的任何症狀的藥物(亦即一化合物或一組合物)應當是有效的。一有效量的藥物不需要治癒疾病或病症,但將為疾病或病症提供治療,使得疾病或病症的發作得以延緩、阻止或預防,或是疾病或病症的症狀得以改善。該有效量可分成一、二或多個合適的形式之劑量,在一段指定的期間內來投予一、二或多次。
此處所使用之「一足夠量」(a sufficient amount)一詞是指一種在劑量上及必要的期間內能有效地達到期望之抑制革蘭氏陽性細菌的生長結果的量,以至於其可持續存在一段足夠的期間來協助抑制細菌生長。在較佳的實施例中,一足夠量之式(I)化合物是使其與一細菌接觸一段期間,使得相較於未經處理的細菌而言,該細菌的生長受到抑制至少 80%,例如 80、85、90、95或99%。
此處所使用之「治療」(treatment)一詞是旨在表示獲得一期望的藥理及/或生理功效,例如抑制細菌的生長,特別是指具有PmrA/PmrB系統之細菌的生長。該功效可以是預防性的,即完全或部分預防一疾病或其症狀;及/或是治療性的,即部分或完全治癒一疾病及/或其所造成的不適。此處所使用之「治療」包括預防(例如預防用藥)、治療或減緩一哺乳類動物(特別是人類)的疾病;該治療包括:(1) 預防、治療或減緩一個體罹患一疾病或病狀(例如感染性疾病),其中該個體為罹患該疾病的高風險族群,或是已罹患該疾病而尚未確診;(2) 抑制一疾病(例如阻止其發展);或 (3) 減輕一疾病(例如減輕與該疾病相關的症狀)。依據本揭示內容特定的實施方式,是對一罹患由細菌所引起的感染之個體投予一有效量之式 (I) 化合物,使得該細菌(例如克雷伯氏肺炎桿菌)對某些抗生素(例如多黏菌素 B 及黏菌素)的感受性增加,因此相較於未經治療的個體而言,該細菌在該個體中的數目減少至少 80%,例如 80、85、90、95 或 99%,且因此緩解或改善與疾病相關的一或多種症狀、與疾病相關的一或多種症狀的嚴重度及/或疾病的病程進展。在較佳的實施方式中,是對一罹患與感染相關的疾病(例如肺炎、敗血症、角膜感染、皮膚感染、中樞神經系統感染或毒性休克症候群)之個體投予一有效量之本揭示內容式 (I) 化合物,據以緩解或改善與疾病相關的一或多種症狀,從而達到治療疾病的目的。
應當留意的是,若結構或結構的一部分的立體化學未用例如粗體或虛線表示,則該結構或該結構的一部分視為涵蓋其所有的立體異構物。同樣地,具有一個或多個掌性中心的化合物的名稱沒有具明該些中心的立體化學的話,則涵蓋純的立體異構物及其混合物。再者,圖中顯示具有不飽和價數的任一原子,均推定為連接至足夠的氫原子以滿足其價數。此外,在價數允許的情形下,以一實線平行一虛線來表示的化學鍵是涵蓋單鍵或雙鍵(例如芳香族)二者。
除非上下文另有明確說明,單數形式「一」(a 或 an)及「該」(the)在本文中包括複數對象。
2. 細菌的雙分子訊息傳遞系統( TCS )的抑制劑
本揭示內容至少部分是基於發明人意外地發現由細菌反應調節器(例如 PmrA)及 DNA 複合物的藥效基團模型中找出的式 (I) 化合物,可破壞細菌反應調節器及 DNA 複合物的形成,進而抑制細菌生長。更令人意外的是,該式(I)化合物可恢復多重抗藥性(MDR)細菌對先前無法有效殺死該 MDR 細菌之抗生素的感受性。因此,本揭示內容化合物可作為前導化合物,以發展用以治療細菌感染性疾病(特別是由 MDR 細菌所引起的感染性疾病)的藥物。
本揭示內容的第一態樣因此是經由細菌反應調節器–DNA 複合物的藥效基團模型來篩選出潛力候選化合物,據以確認新穎的 TCS 抑制劑。
依據本揭示內容較佳的實施方式,利用細菌的轉錄因子 PmrA 來建立 PmrA–DNA 複合物藥效基團模型(即,實施例 1.1 的Ch2pharN4 ),以篩選出候選抑制劑,其中該細菌的轉錄因子 PmrA 可活化該編碼可改變脂多醣(lipopolysaccharides,LPSs)組成之酵素的基因,最終導致可增加細菌對多黏菌素 B 的抵抗性。共計有 103,000 種候選化合物可符合(fit to)實施例 1.1 的Ch2pharN4 模型,篩選該些可精確對準或最符合細菌 PmrA–DNA 複合物熱點殘基的化合物作為候選抑制劑,進一步藉由微生物抑制分析來確認其生物活性。
依據本揭示內容的實施方式,所找出的 TCS 抑制劑具有式 (I) 的結構, A–L–B–L–A (I) 其中, A 是一具有負電荷的基團; L 是–(C2 H5 –O)n –CH2 –,或是一由碳環基及雜環基所組成的基團,其中該碳環基及雜環基分別具有 5 至 10 個環上的原子並相互耦接,其中 n 是 0 或 1;以及, B 是一 5 至10 個原子的碳環基或雜環基; 據以緩解或改善細菌感染性疾病的症狀。
依據本揭示內容的實施方式,在式 (I) 中,A 是 –PO4 、PO3 2– 或 –SO3 。在某些實施方式中,A 是 –SO3 。在其他實施方式中,A 是 –PO4
依據本揭示內容的一較佳的實施方式,在式 (I) 中,A 是 –SO3 ;L 是;且 B 是 –C6 H4 –。
依據本揭示內容的另一較佳的實施方式,在式 (I) 中,A 是 –SO3 ;L 是–(C2 H5 –O)n –CH2 –,其中 n 是 1;且 B 是
依據本揭示內容的再另一較佳的實施方式,在式 (I) 中,A 是–SO3 ;L 是 –(C2 H5 –O)n –CH2 –,其中 n 是 0;且 B 是
依據本揭示內容的實施方式,該式 (I) 化合物是細菌 PmrA/PmrB系統的抑制劑。
可向廠商(例如 InterBioScreen Ltd(Moscow, Russia))購買;或可依據相關領域所熟知的方法來合成各式 (I) 化合物。
以下為本揭示內容式 (I) 較佳的化合物:;以及 E1 E2。 E3
3. TCS 抑制劑的用途
本揭示內容亦涵蓋一種利用經確認之 TCS 抑制劑來治療一罹患一細菌感染性疾病之個體的方法。該方法包括對該個體投予一有效量之該式 (I)化合物或其藥學上可接受的鹽類、水合物或溶劑合物,據以緩解或改善一或多種與該感染性疾病相關的症狀。
依據本揭示內容較佳的實施方式,該式 (I) 化合物可以是下列任一種,;以及 E1 E2。 E3
依據本揭示內容其他特定的實施方式,該式 (I) 化合物不是下列任一種,。 E4 E5
可引起個體感染的細菌之實例包括,但不限於,炭疽桿菌、枯草桿菌、仙人掌桿菌 白喉桿菌、破傷風桿菌、肉毒桿菌、產氣莢膜芽胞梭菌、困難梭狀芽孢桿菌、閃爍梭菌、草綠色鏈球菌、糞腸球菌、屎腸球菌 丹毒桿菌、大腸桿菌、幽門螺旋桿菌 克雷伯氏肺炎桿菌 李斯特菌、結核分枝桿菌 痤瘡丙酸桿菌、馬玫瑰球菌、無乳鏈球菌、金黃色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肺炎鏈球菌、釀膿葡萄球菌或腐生葡萄球菌。
依據某些實施方式,個體具有皮膚膿瘍、癤或皮膚疔,因而使得該個體易有細菌感染。細菌感染性疾病之實例包括,但不限於,肺炎、敗血症、角膜感染、皮膚感染、中樞神經系統感染及毒性休克症候群。
以肺炎為例作說明,最常見可引起肺炎的細菌是克雷伯氏肺炎桿菌或肺炎鏈球菌。據此,本揭示內容的某些實施方式是關於一種用以治療一具有由克雷伯氏肺炎桿菌或肺炎鏈球菌感染所引起的肺炎之個體的方法。依據某些實施例,該克雷伯氏肺炎桿菌是一具有抗藥性的克雷伯氏肺炎桿菌,例如抗多黏菌素或抗黏菌素的克雷伯氏肺炎桿菌。在對該個體投予該式 (I) 化合物之後,該抗多黏菌素或抗黏菌素的克雷伯氏肺炎桿菌會變得對多黏菌素或黏菌素敏感。
依據進一步的實施方式,本發明是關於一種用以治療一罹患由結核分枝桿菌所引起的細菌感染性疾病之個體的方法。在某些實施例中,該結核分枝桿菌是抗利福平(rifampicin,有效成分為雷福黴素)或抗異菸酸酊的結核分枝桿菌。在對該個體投予該式 (I) 化合物之後,該抗雷福黴素或抗異菸酸酊的結核分枝桿菌會變得對雷福黴素或異菸酸酊敏感。
依據再進一步的實施方式,本發明是關於一種用以治療一罹患由幽門螺旋桿菌所引起的細菌感染性疾病之個體的方法。在某些實施例中,該幽門螺旋桿菌是抗克拉黴素的幽門螺旋桿菌。在對該個體投予該式 (I) 化合物之後,該抗克拉黴素的幽門螺旋桿菌會變得對克拉黴素敏感。
整體來說,對該有需要之個體投予的該式 (I) 化合物的量,約為每公斤體重1至100毫克,例如每公斤體重1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100毫克;較佳地,約為每公斤體重 20 至 80 毫克,例如每公斤體重 20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79或80毫克;更佳地,約為每公斤體重 40 至 60 毫克,例如每公斤體重 40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59 或 60 毫克。可以單一劑量或以一天多個劑量(例如每天 2、3 或 4 個劑量)來投予上述量。該式 (I) 化合物實際的量會取決於該個體特定症狀,以及該個體的生理條件(例如年齡、性別、病史等)而定;且可方便地由主治醫師依他或她的經驗來決定。
在某些實施方式中,該方法更包括在投予該式 (I) 化合物之前、同時或之後,投予另一抗生素及/或抗菌劑。可用於本揭示內容式 (I) 化合物的抗生素之實例包括,但不限於,針黴素、胺苄青黴素、阿莫西林、雙性黴素、抗黴素、盎格魯黴素、阿維菌素、阿奇黴素、硼黴素、嘉寶黴素、碳青黴烯、頭孢子菌素、塞紅黴素、氯黴素、卻兒可黴素、賽普沙辛、伴刀球黴素、卷鬚黴素、克拉黴素、黏菌素、氯噻青黴素、達托黴素、去甲阿奇黴素、沙漠黴素、二氫苦黴素、地紅黴素、多西環素、安來黴素、紅黴素、氟紅黴素、氟甲喹 慶大黴素、異菸酸酊、幼黴素、久慈黴素、蘭卡黴素、林可黴素、雨濱蛙肽、白黴素、巨黴素、美羅培南、酒黴素、麥迪黴素、麥新米星 I、麥新米星 II、麥新米星 III、麥新米星 IV、麥新米星 V、麥新米星 VI、麥新米星 VII、麥新米星 VIII、那波黴素、新抗黴素、新酒黴素、奈替米星、乙基西梭黴素、尼達黴素、諾氟沙星、奧連黴素、寡黴素、奧薩黴素、苯唑西林、歐索林酸、青黴素、苦黴素、哌拉西林、普拉特黴素、多黏菌素s、雷帕黴素、雷洛黴素、雷福黴素s、羅沙米星、羅紅黴素、維黴素、螺旋黴素、斯珀里亞黴素、葡萄球菌黴素、鏈黴素、磺胺甲異㗁唑、索爾巴黴素、泰樂黴素、壁黴素、特美汀、妥布黴素、替卡西林、甲氧苄啶、四環黴素、洛西林,及/或其組合。
4. 藥學組合物
本揭示內容亦涵蓋一用以治療細菌感染性疾病或用以抑制細菌生長的藥學組合物。該藥學組合物包含一有效量之該式 (I) 化合物,其藥學上可接受的鹽類、水合物或溶劑合物;以及一藥學上可接受的賦形劑。
本發明式 (I) 化合物的重量約佔該藥學組合物總重量的 0.1% 至 99%。在某些實施方式中,本發明式 (I) 化合物的重量佔該藥學組合物總重量的至少 1%。在某些實施方式中,本發明式 (I) 化合物的重量佔該藥學組合物總重量的至少 5%。在再其他實施方式中,本發明式 (I) 化合物的重量佔該藥學組合物總重量的至少 10%。在再又其他實施方式中,本發明式 (I) 化合物的重量佔該藥學組合物總重量的至少 25%。
可依據合適的藥學製程(例如Remington’s Pharmaceutical Sciences, 17th edition, ed. Alfonoso R. Gennaro, Mack Publishing Company, Easton, Pa (1985)中所述者)來製備該藥學組合物。藥學上可接受的賦形劑是該些可與該劑型中的其他成分相容,並為生物學上可接受的賦形劑。
依據某些非必要的實施方式,該藥學組合物更包括一抗生素。合適的可用於本揭示內容藥學組合物的抗生素之實例包括,但不限於,針黴素、胺苄青黴素、阿莫西林、雙性黴素、抗黴素、盎格魯黴素、阿維菌素、阿奇黴素、硼黴素、嘉寶黴素、碳青黴烯、頭孢子菌素、塞紅黴素、氯黴素、卻兒可黴素、賽普沙辛、伴刀球黴素、卷鬚黴素、克拉黴素、黏菌素、氯噻青黴素、達托黴素、去甲阿奇黴素、沙漠黴素、二氫苦黴素、地紅黴素、多西環素、安來黴素、紅黴素、氟紅黴素、氟甲喹 慶大黴素、異菸酸酊、幼黴素、久慈黴素、蘭卡黴素、林可黴素、雨濱蛙肽、白黴素、巨黴素、美羅培南、酒黴素、麥迪黴素、麥新米星I、麥新米星 II、麥新米星 III、麥新米星 IV、麥新米星 V、麥新米星 VI、麥新米星 VII、麥新米星 VIII、那波黴素、新抗黴素、新酒黴素、奈替米星、乙基西梭黴素、尼達黴素、諾氟沙星、奧連黴素、寡黴素、奧薩黴素、苯唑西林、歐索林酸、青黴素、苦黴素、哌拉西林、普拉特黴素、多黏菌素s、雷帕黴素、雷洛黴素、雷福黴素s、羅沙米星、羅紅黴素、維黴素、螺旋黴素、斯珀里亞黴素、葡萄球菌黴素、鏈黴素、磺胺甲異㗁唑、索爾巴黴素、泰樂黴素、壁黴素、特美汀、妥布黴素、替卡西林、甲氧苄啶、四環黴素、洛西林,及/或其組合。
可將本發明式 (I) 化合物配製成一適用於經由口服、穿膜(例如經鼻、舌下、陰道、經頰及/或直腸),及/或腸胃外(即皮下、靜脈內、肌肉內、腹腔內或大劑量注射(bolus injection))投予的單一劑型。所述劑型實例包括,但不限於,錠劑(tablets)、剝半錠劑(caplets)、膠囊(capsules)(例如軟式彈性明膠膠囊(soft elastic gelatin capsules))、藥包(cachets)、口含片(troches)、喉片(lozenges)、分散劑(dispersions)、栓劑(suppositories)、軟膏(ointments)、粥狀敷劑(cataplasms)(又稱糊劑(poultices))、乳霜(creams)、膏劑(plasters)、溶液(solutions)、貼片(patches)、氣霧劑(aerosols)或凝膠(gels)。本發明式(I)化合物可配製成一液態的藥學組合物,其可以是適用於例如口服或靜脈內、肌肉內、皮下或腹腔內注射來投予的無菌溶液、懸浮液(例如水溶性或非水溶性液體懸浮液、水包油乳劑或油包水乳劑)或酏劑(elixirs)。
可依據預定的投予途徑來配製本發明化合物。舉例來說,若本發明化合物是預定以口服方式來投予,則需於本發明化合物外塗覆一腸衣膜,以保護本發明化合物避免在酸性環境中或在到達個體的腸道時受到降解。該劑型可更包括額外的成分,來協助遞送本發明化合物至其預定的作用位置。在某些實施例中,本發明化合物是包覆於脂質體中,以避免其受到酵素降解,並有助於個體的循環系統來傳送本揭示內容化合物,及/或通過細胞膜傳送至其預定的胞內位置。
進一步地,可添加溶解劑、乳化劑及/或界面活性劑來將難溶的本發明化合物配製成液體劑型。所述添加劑之實例包括,但不限於,環糊精(cyclodextrin)(例如 α-環糊精或 β-環糊精)及非水性的溶劑,其包括,但不限於,乙醇、異丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸苄酯、丙二醇、1,3–丁二醇、二甲基甲醯胺、二甲基亞碸(dimethyl sulfoxide,DMSO)、生物相容性油(biocompatible oils)(例如棉籽油、花生油、玉米油、小麥胚芽油(wheat germ oil)、蓖麻油(castor oil)、橄欖油、芝麻油、甘油、四氫呋喃、聚乙二醇、山梨糖醇酐的脂肪酸酯(fatty acid esters of sorbitan)及以上化合物的混合物。
本揭示內容化合物在該劑型中的量,會依投予途徑而異。舉例來說,相較於用於慢性治療的劑型而言,用於急性治療的劑型會含有較多量的一或多種活性成分。同樣地,相較於口服劑型,不經腸胃道的劑型會包含較少量的一或多種活性成分。本揭示內容亦涵蓋適用於其他投予途徑的劑型。
4.1 口服劑型
可將本揭示內容化合物配製成適用於口服的組合物。這類劑型之實例包括,但不限於,咀嚼片(chewable tablets)、錠劑、膠囊及糖漿,其可依據Remington’s Pharmaceutical Sciences(18th ed., Mack Publishing, Easton, PA (1990))中所述的製程來製備。所述口服劑型可依據相關領域所熟知的製程,將一預設的活性成分的量與一或多種藥學上可接受的賦形劑混和來製備。
錠劑及膠囊是二種最常見的口服劑型形式,其可為液態或固態組合物的形式。整體來說,錠劑及膠囊是將活性成分與液體或碾磨的固體賦形劑混和,接著定型成預設的形式來製備。固體劑型可更包括崩解劑,以增加溶解率;以及潤滑劑。
4.2 不經腸胃道的劑型
不經腸胃道劑型是該些適用於皮下、靜脈內(包括大劑量注射)、肌肉內及腹腔內注射的劑型。為達此目的,需要做成無菌的注射劑或懸浮液以避免接受者受到微生物感染。合適的用以製備無菌注射劑溶液或懸浮液的稀釋劑或溶劑包括,但不限於,1,3–丁二醇、甘露醇、水、林格氏液及等張氯化鈉溶液。脂肪酸(例如油酸及其甘油酯衍生物)亦可用於製備注射劑,如天然的藥學上可接受的油,例如橄欖油或篦蔴油。這類油性溶液或懸浮液亦可含有醇類稀釋劑或羧甲纖維素或類似的分散劑。其他常用的界面活性劑例如聚山梨醇酯(Tweens)或山梨醇酯(Spans)或其他類似的常用於製備藥學上可接受的劑型的乳化劑或生物相容性增進劑亦可用於此處劑型的目的。
4.3 穿膜吸收的劑型
穿膜吸收的劑型是該些適用於局部及經黏膜用途的劑型,其包括,但不限於,眼藥水溶液(ophthalmic solutions)、噴霧劑、氣霧劑、乳霜、乳液、軟膏、凝膠、溶液、懸浮液、皮膚貼片等。所述貼片包含「儲液型(reservoir type)」和「基質型(matrix type)」的皮膚貼片,其可黏附於皮膚且經一段期間後,可使活性成分被個體體內吸收。
就局部投予方面,有眾多的本領域所熟知的皮膚病學上可接受的惰性賦形劑可使用。典型的惰性賦形劑可以是,舉例來說,水、乙醇、聚乙烯吡咯烷酮(polyvinylpyrrolidone)、丙二醇、礦物油、硬脂醇及凝膠產生物質(gel–producing substances)。所有上述之劑型及賦形劑均為藥學領域所熟知。劑型的選擇對本揭示內容組合物的功效來說並非關鍵。
就經黏膜投予方面,本發明藥學組合物亦可配製成多種不同的劑型以利經黏膜方式投予,例如經頰及/或舌下的劑型,以利經由口腔黏膜來遞送藥物。可利用眾多的生物可降解的聚合型賦形劑(biodegradable polymeric excipients),由於其具有合適的黏附度及欲求的藥物釋放規格,並可與待投藥的活性成分及存在於該經頰及/或舌下劑型的其他成分相容的緣故,其可為藥學上可接受的賦形劑。一般來說,所述聚合型賦形劑包含可黏附於口腔黏膜的濕面(wet surface)的親水性聚合物。聚合型賦形劑之實例包括,但不限於,聚丙烯酸及共聚物(acrylic acid polymers and copolymers);水解的聚乙烯醇(hydrolyzed polyvinylalcohol);聚乙二醇(polyethylene oxides);聚丙烯酸酯(polyacrylates);乙烯基聚合物及共聚物(vinyl polymers and copolymers);聚乙烯吡咯烷酮;聚葡萄醣(dextran);瓜爾膠(guar gum);果膠(pectins);澱粉(starches);以及纖維素聚合物(cellulosic polymers)。
本揭示內容將參照下列實施方式更具體地說明,其是作為示範性的目的而非限制性的目的。
實施例
材料及方法
製備重組 PmrA/PmrAC 及寡核苷酸
將編碼 PmrA 全長及 PmrAC (PmrA 殘基 N121 至 E223)的 DNA 片段(並分別在其 N 端及 C 端各帶有一額外的甲硫胺酸殘基及一標籤(LEHHHHHH,序列編號:1))選殖進一載體 pET–29b(+)(Novagen)中,並以E. coli 品系 BL21(DE3) 來表現。就 PmrA 全長的部分,將二個殘基進行突變(W181 變成 G,以及 I220 變成 D)來改善溶解度。依據 QuickChange 定點突變步驟(Stratagene)來進行突變,並經 DNA 定序確認。就15 N 標示的蛋白樣品的部分,在 37°C 下,將細胞培養於含有 M9 基本培養液的 H2 O 中,其中該 M9 基本培養液另有補充15 NH4 Cl 及葡萄糖,並利用微射流均質機(M–110S microfluidizer)(Microfluidics)來破壞之。將該蛋白進一步地以鎳–氮基三醋酸親和性樹脂(Qiagen, Hilden, Germany)來純化。以考馬斯亮藍染色的十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)來確認該蛋白的純度 > 95%。全長的 PmrA 可藉由 BeF3 (5.3 毫體積莫耳濃度之 BeCl2 、35毫體積莫耳濃度之 NaF,以及 7 毫體積莫耳濃度之 MgCl2 )來活化。用於螢光偏振(FP)實驗的寡核苷酸(5’–ATTTCTTAATATTATCCTAAGCAAG–3’,序列編號:2 )得自 MDBio Inc.(臺灣)。雙股 DNA 的製備、純化及濃度確認與先前所述之方法(Lou, Y.C. et al., Nature Communications, 2015, 6, 8838)相同。
測量螢光偏振( FP
化合物E1–E5 購自 InterBioScreen(Moscow, Russia)(E1 :貨號1S–95047;E2 :貨號 1N–13224;E3 :貨號 1N–16691;E4 :貨號 1S–43938;E5 :貨號 1S–55283),並經 NMR 確認其純度超過 90%。將以 6–羧基螢光素(6-carboxyfluorescein,6–FAM)標示在 5’ 端的寡核苷酸(5’–ATTTCTTAATATTATCCTAAGCAAG–3’,序列編號:2)溶解於 10 毫體積莫耳濃度之磷酸鈉,以及 15 毫體積莫耳濃度之 NaCl(pH 7.0)中來進行螢光偏振實驗。首先將約 10 微升之活化的 PmrA(配製於 10 毫體積莫耳濃度之磷酸鈉,以及 15 毫體積莫耳濃度之 NaCl 中,pH7.0)加入 ELISA 微量盤的孔中。接著,將1 微升之系列稀釋的抑制劑E1–E5 (配製於活化的 PmrA 之樣品緩衝液中)與PmrA(終濃度為 30 微體積莫耳濃度)混和並配成特定濃度,並在 25°C 下作用 10分鐘。隨後,將 9 微升之以 6–FAM 標示的 DNA(終濃度為 10 奈體積莫耳濃度)加入該反應物中,在 25°C 下另外作用 10 分鐘。利用微量盤分光光譜儀(SpectraMax Paradigm plate reader)(Molecular Devices, CA, USA),並以激發波長 485 奈米,以及發射波長 535 奈米,來測量 3 次反應結果。依據下列公式衍生抑制百分比(抑制 %,Inhibition%):, 其中 (D)、(P+D) 及 (P+I+D) 分別是 DNA 單獨、 PmrA 及 DNA,以及 PmrA 與抑制劑混和後再接著與 DNA 作用,三者的偏振強度。
NMR 光譜學 及化合物滴定
依據先前所述之方法(Mscielag and Goldschmidt,Expert opinion on investigational drugs 2000, 9, 2351-2369)來製備 NMR 樣品。簡言之,利用含或不含 BeF3 活化的 pH8.0 緩衝液(20 毫體積莫耳濃度之 Tris,以及 100 毫體積莫耳濃度之 NaCl)來製備活化的及未活化的 PmrA(0.3 毫升,0.25 毫體積莫耳濃度)。將 PmrAC (0.3 毫升,0.25 毫體積莫耳濃度)配製於 pH8.0 緩衝液(20 毫體積莫耳濃度之 Tris,以及 100 毫體積莫耳濃度之 NaCl)中。將所有的蛋白溶液進一步充填至 NMR 管(Shigemi NMR tubes)(Shigemi Inc.)中。以設置有三度共振(triple–resonance)冷凍探針(包括屏蔽的z–梯度)的 NMR 光譜儀(型號為 Brucker AVANCE 600或800)(Bruker, Karlsruhe, Germany),並在 310 及298K 下,來進行檢測活化的/未 PmrA 及 PmrAC 的 NMR 實驗。依先前於回顧性文獻所述之方法(Garcia-Calderon et al.,Journal of Bacteriology 2007, 189, 6635-6644)來進行骨架指定的異核 NMR 實驗。利用 NMRPipe(Chen and Groisman,Annual review of microbiology 2013, 67, 83-112)來處理,並以NMRViewJ8.0a.22(Wosten et al.,Molecular microbiology 2006, 60, 39-50)來分析所有獲得的 NMR 光譜。在 pH8.0 下,藉由加入漸增的化合物的量至 0.25 毫體積莫耳濃度之15 N 標示的蛋白中並配成特定的蛋白/化合物莫耳比率來進行化合物滴定實驗,並獲得一系列之 2D–1 H–15 N TROSY–HSQC 光譜。利用化合物滴定未活化的及活化的 PmrA 來探測結合位點。利用化合物對 PmrAC 的滴定數據來確認解離常數(KD )。經由公式 Δδ = [(ΔδNH )2 +(0.17×ΔδN )2 ]0.5 來計算化學位移變化,其中 ΔδNH 及 ΔδN 分別是1 HN15 N 的化學位移差額。為確認解離常數(KD ),將 PmrAC 的 NMR 滴定曲線代入下列適用於快速交換(fast exchange)之1:1複合物的公式中:Δν(x) = 0.5×Δνmax ×{(x+1+K−[(x+1+K)2 −4x]0.5 ,其中 x 是[化合物]/[PmrAC ],Δν(x)是在莫耳比率x的[(ΔνH )2 +(ΔνN )2 ]0.5 ,且K 對應於KD /[PmrAC ](Jo et al.,Antimicrobial agents and chemotherapy 2011, 55, 2818-2823)。以 NMRViewJ 8.0.a22 的「滴定分析」(Titration Analysis)函數來代入及分析滴定曲線。
等溫滴定熱量測定法( ITC
藉由 ITC 並利用微熱量計(MicroCal iTC200 microcalorimeter)來估算 PmrAC 與化合物E1 的結合親和力。將 PmrAC 樣品配製於反應緩衝液(20毫體積莫耳濃度之磷酸鈉,100 毫體積莫耳濃度之 NaCl,pH6.0)中。將化合物亦配製於反應緩衝液(E1 = 0.4毫體積莫耳濃度)中,並在 25°C 下,將其滴定至PmrAC (45 微體積莫耳濃度)中。將化合物對緩衝液滴定所產生的背景熱量減去,並將 PmrACE1 的結合反應之校正熱量用於推導在 298K 下的結合常數 Ka 、結合焓(ΔH)、吉布斯能(Gibbs free energy,ΔG)變化及熵變化(ΔS=ΔH–ΔG)。利用 ITC 分析工具(Origin ITC Analysis)(MicroCal Software, Northampton, MA, USA)來分析所有的實驗數據。
生物膜干涉技術( Bio–layer interferometry BLI
利用儀器(ForteBio Octet RED96)(ForteBio, Pall Life Sciences)來測量 BLI 動力學。將 C 端帶有 6× 組胺酸標籤的重組 PmrAC 固定於 HIS1K 生物感應器中,並溶於含有 20 毫體積莫耳濃度之磷酸鈉、100 毫體積莫耳濃度之NaCl,pH 6.0 的反應緩衝液中,在 25°C 下,在進行動力學實驗前作用 180 秒。為測量結合度,將預充填的生物感應器暴露於不同濃度的E1 (0 至 37.5微體積莫耳濃度)下作用 300 秒。在解離步驟之後,將感應器置入反應緩衝液中作用 300秒。藉由套入 1:1 動力學對減去參考值的數據之反應模型來獲得動力學常數(包括Kon (結合常數,M–1 s–1 )及Koff (解離常數,s–1 ))。以解離平衡(KD )來計算Koff Kon 的比率。利用數據分析軟體 (Data Analysis 7 software)(ForteBio, Pall Life Sciences)來確認所有的計算。
微生物的存活率試驗分析
依先前所述之方法(Cheng and Peng,J. Biomedical Science , 2010, 17, 60)(並進行部分修改)來確認在抗生素處理下的克雷伯氏肺炎桿菌 CG43S3相對存活率。簡言之,將過夜生長的細菌繼代培養在 LB 中,直到 OD600 達到 0.7。以蒸餾過的 PBS 來清洗細菌培養物二次,接著以 LB 配成每毫升 6.7×104 CFU的濃度。在 37°C 下,將 100 微升之懸浮液單獨或補充E1 (0、0.25、2.5 及 25微體積莫耳濃度),並置於每個 96 孔微量盤的孔中,其中含有 100 微升之 PBS 或以 PBS 稀釋之各終濃度的抗生素:多黏菌素 B (每毫升 0、0.002、0.01 及 0.1 微克)、黏菌素(每毫升 0.1 微克)、亞胺培南(imipenem)(每毫升 80 微克),以及康納黴素(kanamycin)(每毫升 64 微克)。將微量盤在 37°C 下震盪培養 10、30及 60 分鐘。隨後,將 100 微升之懸浮液直接塗佈於 LB 瓊脂平皿上,並在 37°C 下過夜培養,以確認活菌數。以菌落數除以該些以 PBS 處理的相同培養物的數目,再乘以 100 來表示相對存活率。實驗共進行三次,且實驗結果以三重複樣品所得之平均值±標準差來表示。
實施例 1 產生受體 配體之藥效基團及配體 藥效基團疊合
1.1 產生 Ch2pharN4 的藥效基團模型
在本實施例中,利用受體–配體之藥效基團產生模組(Discovery Studio 3.5)來建立一藥效基團模型,以篩選 PmrA 的候選抑制劑。利用 PmrA–DNA 的複合物結構(PDB 之 ID:4S04)來產生一受體–配體之藥效基團模型。依據預先確認的 PmrA–DNA 複合物結晶結構,二個 N 端接受域(receiver domains,RECs)形成二次對稱二聚體(twofold symmetrical dimer),且該二個DBD 以頭尾定向的方式結合至 half–1 及 half–2 的 DNA 序列(第 1 圖,圖 A)。可藉由產生受體–配體之藥效基團來全面性探測 DNA 的生物活性特徵,並找出功能上可標的至 PmrA 的必要元素,其中 PmrA 結構是作為「輸入受體」(Input Receptor),而 DNA 結構則作為「輸入配體」(Input Ligand)。「最小限度特徵」(Minimum Features)及「最大限度特徵」(Maximum Features)分別設為10及30,且「最大限度藥效基團」(Maximum Pharmacophores)設為 10。將「快速方法」(fast method)應用於以「嚴格符合方法」(rigid fitting method)來產生的構型。其餘的參數在產生受體–配體之藥效基團的過程中均設為預設值。隨後,基於 DBD–half–1 及 DBD–half–2 複合物的結構,來分別合理地產生藥效基團之特徵團簇Ch1pharCh2pharCh1phar 含有 1 個氫鍵供給者、 9 個氫鍵接受者,以及 2 個負電荷的特徵。Ch2phar 由 1 個氫鍵供給者、7 個氫鍵接受者、1 個正電荷及 5 個負電荷的特徵所組成(第 1 圖,圖 B)。值得注意的是,藥效基團模型Ch2pharN4 ,由 4 個負電荷的基團(N1–N4;N2 及 N3 任一可以是氫鍵接受者)所構成,代表 DNA 生物活性支架與 PmrA 殘基 R171、H195、R198、K203 及 Y214 有交互作用(第 1 圖,圖 C)。
1.2 利用實施例 1.1 Ch2pharN4 來篩選 PmrA 候選抑制劑
將已建立的藥效基團模型Ch2pharN4 進行配體–藥效基團疊合。共計自天然物資料庫擷取 103,000 個分子,包括自 Specs(Specs, The Netherlands)擷取 1,496 個化合物、自 ACD(AnalytiCon Discovery, Postdam, Germany)擷取 11,247 個化合物、自 ICC(INDOFINE Chemical Company, Inc., Hillsborouhg, NJ)擷取 144 個化合物、自 PNP(Princeton Bio分子Research Inc., Princeton, NJ, USA)擷取 14,084 個化合物、自 TCM(臺灣中醫藥資料庫,Taiwan Chinese medicine)(衛生福利部國家中醫藥研究所,臺北,臺灣)擷取 1,089個化合物,以及自 IBS(the InterBioScreen, Moscow, Russia)多樣性組合擷取 74,940個化合物。以執行 Discovery Studio 3.5(Accelrys Software, Inc., San Diego, CA, USA)所產生的分子草圖及配體模組來建立所有化合物的分子結構,且氫原子出現在所有已建構的配體中。所有的天然物(103,000個化合物)均符合已建立的藥效基團模型Ch2pharN4 ,並將符合方法設為「可變動的」(flexible),而其他所有的參數維持在預設值。利用 PyMOL 軟體(http://www.pymol.org)來完成分子模型的視覺化動作。
觀察到共計有 5 個命中化合物E1–E5 可較佳地對準疊合Ch2pharN4 (第 1 圖,圖 D)(符合階層為E1E2E3E4E5 )。化合物E1 可匹配至所有的Ch2pharN4 特徵;E2E3 可符合 N1 至 N3,而E4E5 則只匹配至 N1 及 N4。E1E5 是含有末端磺基的芳族磺酸衍生物,其可能模擬 DNA 的功能磷酸基來與 PmrA 在靜電上有交互作用。
1.3 確認所找出的實施例 1.2 之候選化合物 E1 E5 的功能
依「材料及方法」章節所述之步驟,首先利用螢光偏振(FP)來評估E1E5 對抗 PmrA–DNA 複合物形成的抑制能力。實驗結果繪示於第 1圖,圖 E 及 F,以及表 1。
發現到在 50 微體積莫耳濃度下,E1E2E3 分別展現出 70.2 ± 3.2、55.9 ± 2.7 及 27.41 ± 1.8% 的抑制力,而E4E5 則具有極少影響或不影響 PmrA 結合至 DNA(第 1 圖,圖 E)。進一步地,E1E3 展現出明顯的劑量依賴性的抑制力,其 IC50 分別為 10.2 ± 2.6、42.5 ± 2.9 及 100 ± 2.5 微體積莫耳濃度(第 1 圖,圖 F;以及表 1)。上述觀察證實實施例 1.2 的配體–藥效基團疊合結果,說明Ch2pharN4 在找出對抗 PmrA–DNA 複合物形成的功能模擬抑制劑上,具有可靠性及精確性。
表 1E1E3 的 IC50
實施例 2 確認 E1
2.1 找出 E1 的結合位點
為進一步找出E1 的結合位點,以核磁共振–最佳化橫向鬆弛光譜學(nuclear magnetic resonance-transverse relaxation optimized spectroscopy,NMR–TROSY)並依「材料及方法」章節所述之步驟,來確認E1 對應 PmrA 的分子交互作用。在滴定E1 時(莫耳比率 PmrA:E1 = 1:3),未活化的及活化的 PmrA二者之 TROSY 光譜展現出明顯的化學位移微擾(第 2 圖,圖 A 及 B),且受擾動的殘基位於 C端之DBD 的環圈(loop)(S167、V169、H170)、a7–螺旋(R171 至 Y175),以及b–髮夾結構(R207、V209 及 F212 至 A217)上(第2 圖 C)。上述結果顯示,E1 藉由專一性地結合至 C端的DBD來破壞 PmrA 結合至 DNA。進一步地,在 Tris 緩衝液 pH8.0 下(在磷酸緩衝液 pH6至 8下,滴定反應會導致嚴重的非晶質聚集作用),直接以15 N 標示的 PmrAC ( PmrA 的 C 端域)來滴定漸增的E1 量而獲得一系列之 2D–1 H–15 N–TROSY–HSQC 光譜。實驗結果指出,殘基 S167、V169、R207、V209、R210、Y214、L216 及 A217 有受擾動,且其骨架醯胺共振位置有持續變化(第 2 圖,圖 D 及E)。上述結果說明,E1 結合是發生在相對於在自由態及束縛態之間的共振頻率差異的快速交換之時間標度(time scale)上。此外,利用顯示出相當位移變化的共振之滴定曲線來決定解離常數(KD )(第 2 圖,圖 F)。E1 的平均KD 值確認為 126 ± 34.6 微體積莫耳濃度。
藉由等溫滴定熱量測定法(ITC)及生物膜干涉技術(BLI),並依先前所述之條件(Lou et al.,Nature communication 2015,6,8838)(磷酸鈉緩衝液 pH6.0)來進一步評估E1 對應 PmrAC (PmrA 的 C 端域)的結合親和力。依據ITC實驗結果,E1 與 PmrAC 的交互作用是一種放熱反應,其焓(ΔH)的變化為每莫耳 –21.4 千卡,熵(ΔS)的變化為每 K 每莫耳 –45.6千卡,以及 N 值為 1.09(第 2 圖,圖 G)。套入一組位點結合模型時,Ka 計算為 5.8 × 105 M–1 ,且對應的KD 為 1.7 微體積莫耳濃度。另外,BLI 實驗確認E1 對應 PmrAC 的結合且KD = 2.6 ± 0.1 微體積莫耳濃度,此與 ITC 的實驗結果相當(第 2 圖,圖 H)。並且,Kon Koff 速率確認分別為(9.494 ± 0.2)×104 (1/Ms)及(2.505 ± 0.1)×10–1 (1/s),顯示在E1 及 PmrAC 之間的交互作用為一種快上快下(fast–on–fast–off)的結合機制,此與 NMR 滴定實驗所觀察到的現象一致。
2.2 建立 PmrA–E1 複合物
為更深入探討在E1 與 PmrA 之間的原子交互作用,發明人進行了分子建模來建構複合物的結構。在滴定E1 時有受擾動的(依據 NMR 實驗結果)活化的 PmrA 之殘基,定義為構成蛋白–配體可變動性對接中的結合位點。結合位點殘基的側鏈設為可變動的,以至於其可在對接分析時用來評估特定的旋轉異構體。最後,將E1 滿足Ch2pharN4 之所有特徵的較低能量模型,選為PmrA–E1 的複合物結構。已建立的結構顯示E1 結合在 C端之DBD 的 α8–螺旋與 b–髮夾結構之間(第 3 圖,圖 A 及 B)。E1 與 PmrA 的細部的分子交互作用繪示於第 3 圖,圖 C。在此結合模型中,E1 的末端磺基可符合Ch2pharN4 之 N1 及 N4,經由電荷–電荷交互作用來與殘基 R171 及 K203 交互作用。二個匹配至Ch2pharN4 之 N2 及 N3 的㗁唑環的三級胺,與 R198 及 Y214 的側鏈形成氫鍵。此外,R210 的 ɛNH 基及 K203 的側鏈醯胺,分別與左端的㗁唑環及右端的苯環形成陽離子–pi 交互作用(cation–pi interactions)。另外,E191 的羧基與左端的㗁唑環形成陰離子–pi 交互作用(anion–pi interaction)。T208 的甲基及H195 的咪唑環,經由疏水力及 pi–pi 交互作用來分別與中間的苯及右端的㗁唑環接觸。另一方面,在 TROSY 光譜中未顯示與E1 有直接接觸的環圈殘基 S167至 H170、α7–螺旋殘基 E172 至 Y175,以及 C 端殘基 M215 至 A217 仍有擾動,推測是由於E1 的結合可能引發這些區域的輕微構形變化的緣故。
2.3 E1 強化微生物對多黏菌素 B 的感受性
為評估E1 在克雷伯氏肺炎桿菌(KP )對多黏菌素 B 之感受性上的功效,而進行微生物的存活率試驗分析實驗。實驗結果顯示,在E1 (2.5微體積莫耳濃度)存在時,多黏菌素 B(在特定的濃度下)對KP 的殺菌能力有增加(第 3圖,圖 D)。此實驗結果說明,E1 可恢復KP 對多黏菌素 B 的感受性。此外,亦觀察到E1 對黏菌素(多黏菌素E)在殺死KP 上的輔助活性(實驗數據未顯示)。另外,利用 BLAST 搜尋 pdbaa 資料庫,顯示出 KP 之 PmrA 的 C 端之 DBD 與其他病原菌的反應調節器(RR)享有相似的結構及序列。值得注意的是,保守區域有涵蓋與E1 交互作用的殘基,特別是在 PmrA 的 R171、R198、K203及 Y214 位置上(實驗數據未顯示)。此觀察顯示E1 可標的至病原菌的 RR(例如結核分枝桿菌(MtrA)及幽門螺旋桿菌(ArsR 及 hp1043)),從而發揮廣效性的殺菌活性。
雖然上文實施方式中揭露本揭示內容的具體實施例,本發明所屬技術領域中具有通常知識者當可對其進行各種更動與修飾。上文的說明書、實施例及實驗數據對本揭示內容作為例示性實施方式中的結構及使用方式做出完整的描述。儘管上文已描述本揭示內容中各種實施方式有一定程度的特性,或參照一或多個各別實施方式,本發明所屬領域技術具有通常知識者仍能在不悖離本揭示內容精神及範圍情形下,對已揭示的實施方式進行眾多修改。
在參閱以下的詳細說明及附隨圖式後,本揭示內容將更明顯易懂,其中:
1 篩選基於藥效基團 pharmacophore 的抑制劑及功能檢驗。 (A ) 基於 PmrA–DNA 複合物的結構(PDB 之 ID:4S04)來產生受體–配體之藥效基團,並產生藥效基團的特徵團簇,Ch1pharCh2phar 。(B )Ch2phar 的放大視圖。(C )Ch2pharN4 的藥效基團支架含有四個負電荷基團(N1–N4)。已標示出 PmrA 對應Ch2pharN4 的互補性交互作用的殘基。(D )E1–E5 的配體藥效基團疊合(mapping)結果。(E) 加入E1–E5 (50 微體積莫耳濃度(μM))的螢光偏振(fluorescence polarization,FP)分析結果。(F ) 以 FP 來確認E1–E3 對抗 PmrA–DNA 複合物的形成,並呈現出劑量依賴性抑制的結果。(圖 A–D,各網狀圓球分別代表正電荷、負電荷、氫鍵供給者、氫鍵接受者及空間障礙球體特徵。PmrA 為摺疊蛋白;DNA 為雙股螺旋)。
2 確認 E1 對應 PmrA 的結合位點及解離常數。 重疊的 2D1 H–15 N HSQC–TROSY 光譜,其中(A ) 是以E1 (灰色)滴定的未活化的 PmrA(黑色),以及 (B ) 加入E1 (灰色)的活化的 PmrA(黑色)。(莫耳比率 PmrA:E1 = 1:3;受擾動的(perturbed)殘基以黑色標示)。(C ) 在E1 結合時,活化的 PmrA 中受擾動的殘基疊合到結構(灰色)上。(D ) 以E1 滴定的 PmrAC 之重疊的 2D1 H–15 N HSQC–TROSY 光譜。受擾動的殘基以黑色標示。(E ) 圖D 的放大視圖。(F ) 將 S167、V169、R207、V209、R210、G213 及 Y214 的醯胺骨架共振之滴定曲線代入適用於 1:1 複合物的公式,且KD = 126 ± 34.6 微體積莫耳濃度。(G )E1 對 PmrAC 交互作用的等溫滴定熱量測定法(Isothermal Titration Calorimetr,ITC)結合等溫線。(H ) BLI 數據顯示出,在特定的E1 濃度下與 PmrAC 交互作用的結合(association)及解離的感應圖譜(sensorgrams)。
3 PmrA–E1 的複合物結構及微生物存活率試驗分析結果。 (A )E1 結合在 DNA 結合域(DNA binding domain,DBD)之 a8–螺旋與 C 端 b–髮夾結構之間,並對準藥效基團支架Ch2pharN4 。(B ) PmrA 中與E1 交互作用的殘基以棒條標示並以黑色標示。(C )E1 與PmrA 的細部交互作用之 2D 示意圖。(D )E1 在多黏菌素 B 抑制克雷伯氏肺炎桿菌(KP )上的功效,其中呈現出劑量依賴性的抑制









































Claims (13)

  1. 一種式 (I) 化合物,或其藥學上可接受的鹽類、水合物或溶劑合物於製備一藥物的用途,其中該藥物係用以治療細菌感染性疾病, A–L–B–L–A (I) 其中, A 是一具有負電荷的基團; L 是–(C2 H5 –O)n –CH2 –,或是一由碳環基 (carbocyclyl)及雜環基(heterocyclyl)所組成的基團,其中該碳環基及雜環基分別具有5至10個環上的原子並相互耦接,其中 n 是 0 或 1;以及, B 是一 5 至 10 個原子的碳環基或雜環基; 據以緩解(alleviate)或改善(ameliorate)細菌感染性疾病的症狀。
  2. 如請求項 1 所述之用途,其中 A 是 –PO4 、PO3 2– 或 –SO3
  3. 如請求項 2 所述之用途,其中 A 是 –SO3 ; L是;且 B 是 –C6 H4 –。
  4. 如請求項 2 所述之用途,其中 A 是 –SO3 ;L 是 –(C2 H5 –O)n –CH2 –,其中 n 是 1;且 B 是
  5. 如請求項 2 所述之用途,其中 A 是 –SO3 ;L 是 –(C2 H5 –O)n –CH2 –,其中 n 是 0;且 B 是
  6. 如請求項 1 所述之用途,其中該式 (I) 化合物是細菌 PmrA/PmrB系統的抑制劑。
  7. 如請求項 6 所述之用途,其中該細菌是炭疽桿菌(Bacillus anthracis )、枯草桿菌(Bacillus subtilis )、仙人掌桿菌(Bacillus cereus 白喉桿菌(Corynebacterium diptheria e)、破傷風桿菌(Clostridium tetani )、肉毒桿菌(Clostridium botulinum )、產氣莢膜芽胞梭菌(Clostridium perfringes )、困難梭狀芽孢桿菌(Clostridium difficile )、閃爍梭菌(Clostridium scindens )、草綠色鏈球菌(Streptococcus viridians )、糞腸球菌(Enterococcus faecalis )、屎腸球菌(Enterococcus faecium 丹毒桿菌(Erysipelothrix rhusiopathia e)、大腸桿菌(Escherichia coli )、幽門螺旋桿菌(Helicobacter pylori 克雷伯氏肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae 李斯特菌(Listeria monocytogens )、結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis 痤瘡丙酸桿菌(Propionbacterium acnes )、馬玫瑰球菌(Rhodococcus equi )、無乳鏈球菌(Staphylococcus agalactiae )、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus )、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis )、肺炎鏈球菌(Streptococcus pneumoniae )、釀膿葡萄球菌(Staphylococcus pyrogens )或腐生葡萄球菌(Staphylococcus saprophyticus )的任一種。
  8. 如請求項 7 所述之用途,其中該細菌是多重抗藥性(multi-drug resistant,MDR)細菌。
  9. 如請求項 8 所述之用途,其中該細菌是抗多黏菌素(polymyxin)或抗黏菌素(colistin)的克雷伯氏肺炎桿菌。
  10. 如請求項 8 所述之用途,其中該細菌是抗克拉黴素(clarithromycin)的幽門螺旋桿菌。
  11. 如請求項 8 所述之用途,其中該細菌是抗雷福黴素(rifamycin)或抗異菸酸酊(isoniazid)的結核分枝桿菌。
  12. 如請求項 1 所述之用途,其中該細菌感染性疾病是肺炎、敗血症、角膜感染、皮膚感染、中樞神經系統感染或毒性休克症候群(toxic shock syndrome)。
  13. 如請求項 1 所述之用途,其中該藥物更包含一抗生素,其係選自由針黴素(acumycin)、胺苄青黴素(ampicillin)、阿莫西林(amoxycillin)、雙性黴素(amphotericins)、抗黴素(antimycins)、盎格魯黴素(anglomycin)、阿維菌素(avermectins)、阿奇黴素(azithromycin)、硼黴素(boromycin)、嘉寶黴素(carbomycins)、碳青黴烯(carbapenem)、頭孢子菌素(ceftazidime)、塞紅黴素(cethromycin)、氯黴素(chloramphenicol)、卻兒可黴素(chalcomycin)、賽普沙辛(ciprofloxacin)、伴刀球黴素(concanamycins)、卷鬚黴素(cirramycin)、克拉黴素、黏菌素、氯噻青黴素(cycloxacillin)、達托黴素(daptomycin)、去甲阿奇黴素(des甲基 azithromycin)、沙漠黴素(desertomycins)、二氫苦黴素(dihydropikromycin)、地紅黴素(dirithromycin)、多西環素(doxycycline)、安來黴素(enramycin)、紅黴素(erythromycin)、氟紅黴素(flurithromycin)、氟甲喹(flumequin)、慶大黴素(gentamycin)、異菸酸酊、幼黴素(juvenimicins)、久慈黴素(kujimycins)、蘭卡黴素(lankamycins)、林可黴素(lincomycin)、雨濱蛙肽(litorin)、白黴素(leucomycins)、巨黴素(megalomicins)、美羅培南(meropenem)、酒黴素(methymycin)、麥迪黴素(midecamycins)、麥新米星I(mycinamicin I)、麥新米星II(mycinamicin II)、麥新米星III(mycinamicin III)、麥新米星IV(mycinamicin IV)、麥新米星V(mycinamicin V)、麥新米星VI(mycinamicin VI)、麥新米星VII(mycinamicin VII)、麥新米星VIII(mycinamicin VIII)、那波黴素(narbomycin)、新抗黴素(neoantimycin)、新酒黴素(neomethymycin)、奈替米星(netilmicin)、乙基西梭黴素(neutromycin)、尼達黴素(niddamycins)、諾氟沙星(norfioxacin)、奧連黴素(oleandomycins)、寡黴素(oligomycins)、奧薩黴素(ossamycin)、苯唑西林(oxacillin)、歐索林酸(oxolinic acid)、青黴素(penicillin)、苦黴素(pikromycin)、哌拉西林(piperacillin)、普拉特黴素(微量盤nomycins)、多黏菌素、雷帕黴素(rapamycins)、雷洛黴素(relomycin)、雷福黴素、羅沙米星(rosaramicin)、羅紅黴素(roxithromycin)、維黴素(virginiamycin)、螺旋黴素(spiramycin)、斯珀里亞黴素(sporeamycin)、葡萄球菌黴素(staphycoccomycin)、鏈黴素(streptomycin)、磺胺甲異㗁唑(sulfamethoxazole)、索爾巴黴素(swalpamycin)、泰樂黴素(telithromycin)、壁黴素(teicoplanin)、特美汀(timentin)、妥布黴素(tobramycin)、替卡西林(ticarcillin)、甲氧苄啶(trimethoprim)、四環黴素(tetracyclin)、洛西林(zlocillin),及/或其組合所組成的群組。
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