TW200817520A - Detection of microorganisms and devices therefor - Google Patents
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Description
200817520 九、發明說明: C發明所肩之^技術領域1 發明領域 本發明係有關用於偵測諸如水路中的大腸菌等微生物 5 及諸如可能與其出現相關的酵素之敏感且迅速的方法’及 用於進行此等方法之裝置。 【先前技術3 發明背景 現今及既有之計算及識別包括諸如飲水中的糞便型大 10 腸菌等細菌之微生物之方法係包括直接視覺偵測,諸如菌 落叶數,或以與特定基材上的新陳代謝效應、流式細胞/細 胞分類技術、致免疫性偵測、與特定微生物相關聯的特定 酵素之彳貞測、或目標微生物内的特定核苷酸順序之偵測相 關聯的色彩變化為基礎之間接觀察。 15 _ 這些技術大部份係需要放大微生物細胞數,放大目標 偵剛材料(諸如特定核酸順序)量,及/或若一給定樣本中具 有夕數或預期具有少數的目標微生物細胞數時之基材的冗 ,蛑月。譬如,水樣本中的大腸菌偵測係需要培養微生物 扣错以增加細胞數。現今的產業慣例係獲得小的水樣本(〜ι〇〇 m1)」在視覺糞便型污染(亦即糞便敎腸菌)之特定指 〜物種的生長之前,使其穿過一濾'器以困陷細菌且然後 =適#生絲體巾培«器以放大細S數及/或容許充 刀4間以容許媒體中的一可偵測變化。或者,可使用特定 的核苦酸順序來谓測特定微生物的出現。繁於可能出現在 5 200817520 特疋本(諸如水)中之任何特定屬、種或株的有限細菌細胞 數_1較佳技術通常係包含PCR以在譬如由南方墨點作偵測 之刖放大目標核酸量。因為大腸菌為細菌的一互異群組, 技術可月b而要使用大量的PCR放大探針、及债測探針。 此外,放大探針的不良純度或特找”致不正確或誤導 的結果。 因此,現今用來制或計算樣本中的微生物、或微生 物類型之方法係時常耗時及/或需要精細研究室設備及合 理程度的技術專門性。從收集一樣本到記錄結果之通常時 1〇間一般至少為24小時。此外,難以從遠蠕部位獲得代表性 樣本且每次測試的成本一般很高。 此外,此等技術所產生之資料只可用來記載過去事件 (亦即,24小時前)而非能夠立即發展/採用獅性策略。此 外,上述困難排除了水供應的統計嚴密性測試方案之 15 實行方式。 【明内 本發明之一目的係提供一經改良、“ α 於 菌 艮車父快且敏感之用 偵測特定微生物、或微生物類型諸如水 ^、應/源中的大腸 之方法,及此目的之部件/裝置。 20 發明概要 現在已驚人地發現,可利用 化方式敏感且快速地偵測諸如與特定微生 相關聯者等特定酵素活動。 根據第一實施例,本發明提供 不複雜的技術及材料以 電 物或微生物類型 用於偵測一樣本中的 200817520 一相關酵素量之方法,包含·· (a)赙月一包含該樣本及可被該酵素作用於其上的 一基材之反應混合物; I) (b)使一第二酵素接觸於反應混合物,其中該第一 能夠作用在-選自該至少—基材及_導因於相關酵素= 在該至少一基材上之產物的一或多者之物質上且其中,# 二酵素作用在該至少—基材或產物上料致—第 ,,Λ F I極處 的電位之一變化;及 (c)在該接觸之後一或多次觀察該工作電極處的電位及 10從該一或多次電位觀察決定出樣本中的相關酵素量。 根據另一實施例,本發明提供一用於偵測一樣本中、 一相關酵素量之方法,包含: 、 (a)孵育一包含該樣本及可被該酵素作用於其上的至小 一基材之反應混合物; ^ 15 20 (b) 使一苐一酵素接觸於反應混合物,其中該第—酵素 能夠作用在-選自該至少—基材及—導因於相關酵素作用 在该至少一基材上之產物的一或多者之物質上且其中該第 一酵素作用在該至少一基材或產物上係導致一工作電極處 的電位之一變化;及 °处 (c) 在該接觸之後一或多次觀察該工作電極處的電位及 攸°亥或夕個所偵測電位決定出樣本中的相關酵素量。 該第二酵素被固定在該工作電極中或該工作電極上, ^作電極可為一電化感測器的部份。雖然特定實施例 中,第二酵素物理性連結至工作電極,亦可想見第二酵素 7 200817520 未被束缚但仍被固定,譬如,藉由將第_ 布一酵素扣持在一有 限容積内或者該工作電極中或上之一基曾 土貝干使侍第二酵素 充分緊鄰於工作電極表面令其在該至少一基材戈產物上、 作用導致工作電極處的電位之一變化。 用於偵測一樣本 因此,另一實施例中, 中的一相關酵素量之方法,包含: ⑷孵育n«本及可被_素作用於其上的至少 一基材之反應混合物; ⑻使-電化感測器及-第二酵素接觸於反應混合物, 10其中該感測器包含一已在其中固定該第二酵素或使該第二 «與其固定之工作電極’其中該第二酵素能夠個在= 選自該至少一基材及一導因於相關酵素作用在該至少一基 材上之產物的-或多者之物質上;其中該第二酵素作用在 該至少一基材或產物上係導致該工作電極處的電位之一變 15 化;及 (c)在該接觸之後-或多次觀察該工作電極處的電位及 從該一或多次電位觀察決定出樣本中的相關酵素量。 另一實施例中’本發明提供-用於_ — #1中的一 相關酵素量之方法,包含: 20 (a)孵育一包含該樣本及可被該酵素作用於其上的至少 一基材之反應混合物; ⑻使-電化感測器及-第二酵素接觸於反應混合物, 其中該感測器包含一已在其中固定該第二酵素或使該第二 酵素與其固定之工作電極,其中該第二酵素能夠作用在一 8 200817520 選自該至少一基材及一導因於相關酵素作用在兮至I其 材上之產物的-或多者之物質上;其中該第二酵素二用二 該至少-基材或產物上係導致該工作電極處的電位之一變 化;及 < 5 ⑷在該接狀後—❹:欠侧社作電極處的電位及 從該一或多個所偵測電位決定出樣本中的相關酵素 電化感測器譬如可在反應混合物的一選定孵育^寺間之 後接觸於反應混合物,使得與樣本中出現的酵素^成二= 之-基材量將已被轉換成產物且,可在該接觸之後從工作 10電極處所觀察的電位之變化來決定樣本中的相關酵素量。 ,另-進行本發明的-方法之方式中,電化感測器可在 形成反應混合物之同時或其短暫之後接觸於該反應混合 物。然後可頻繁地、或甚至連續地監·作電極處的電位, 且該工作電極處的電位在該接觸之後回到—實質穩態基線 值所需要的時間期間可能被決定且用來決定樣本中的相關 酵素量。譬如,若束缚至工作電極之第二酵素作用在與相 關酵素相同的基材上,樣本中出現的較多相關酵素將導致 使工作^極處的電位回到一穩態基線值之—較短的時間期 間,若第二酵素作用在相關酵素作用在基材上之一產物 2〇上#本中出現的相關酵素愈多將導致工作電極處的電位 回到一穩態基線值之一較長時間。 因此,根據本發明另一實施例,提供—用於偵測一樣 本中的一相關酵素量之方法,包含: (a)畔育-包含該樣本及可被該酵素作用於其上的至少 9 200817520 一基材之反應混合物; (b) 在下列兩者的任一者中使一電化感测器及一第二酵 素接觸於包含樣本之反應混合物: ⑴反應混合物的一選定孵育時間之後或 5 (ii)製備反應混合物之同時或立即之後, 其中該感測器包含一其中固定有該第二酵素或可供★亥 第二酵素與其固定之工作電極,其中該第二酵素能夠作用 在選自該至少一基材及一導因於相關酵素作用在該至少_ 基材上之產物的一或多者之一物質上;其中該第二酵素作 10用在該至少一基材或產物上係導致該工作電極處的電位之 一變化; (c) 下列兩者任一者: ⑴在步驟(b)(i)的該接觸之後偵測該工作電極處的 電位之變化;或 15 (Π)決定該工作電極處的電位在步驟(b)(ii)的該接觸 之後回到一實質穩態基線值所需要的時間期間;及 (d) 從步驟(c)(i)所偵測的電位之變化或步驟(c)(ii)所決 定的時間期間來決定樣本中的相關酵素量。 工作電極可具有固定於其中或固定於其上或與其吸附 20 之第二酵素。 步驟(c)(1)所憤測的電位之變化可與對於下列所偵測的 電位之變化作比較:-不含相關酵素之控制反應混合物; -包含-已知相關酵素量之反應混合物;—用於電位變化 VS.相關酵素量之校準曲、線,或者其任何組合或步驟⑷⑼ 10 200817520 所決定的時間期間可與下列作比較:對於一包含一已知相 關酵素羞之反應混合物之該工作電極處的電位回到一穩態 基線值所費之時間期間;或對於該工作電極處的電位回到 一穩態基線值所費之時間期間VS·反應混合物中的相關酵素 5 量之一校準曲線。 相關酵素可分別為一 β_半乳糖苷酶或一卜葡萄苷酸 酶,且至少一基材可為一 Ρ_半乳糖或卜葡萄普酸化物衍生 物。此等基材可譬如包含一5务4養弓卜朵連結式化合 2 ’諸如5|4_氣_3斗朵0_連結式糖普或葡萄苦酸化物, 10譬如5-“氣-3』引哚β_〇_半乳α比喃糖苷。 第二酵素可與相關酵素相同,或可為一有關酵素。譬 如’第二酵素可為—卜半乳糖㈣或β·葡萄純酶。或者, 第-酵素可為-可作用在相關酵素作用在基材上的一產物 15 ^之酵素。第二酵素可藉由—諸如鏈菌素_生物素束缚對之 5向親和力束缚對被束缚至工作電極,可被直接地束缚至工 作電極,或可經由-_件分子被束缚至卫作電極。 電極的導電材料可包含一聚合性材料,其譬如為聚喵 咯或聚苯胺或者可包含一非聚合性材料諸如石墨、碳膏、 -鉑或其他適當導電材料。聚合性材料可為電傳導聚 2〇合性材料,譬如電傳導聚少各(PPy)或聚苯胺(PANI)。電傳 導聚合性材料的電阻係數可位於9〇 S/cniM,· S/cm或更 大、或400 S/cm至9〇〇 S/cm的範圍中。 樣本可得自—水源且相關酵素可與一諸如大腸菌等能 夠造成哺乳動物腸失調之微生物或微生物類型相關聯。 11 200817520 因此,根據本發明另一實施例,提供—用於偵測一樣 本中的大腸菌之方法,包含: 、 ⑻以-包含-β_半乳糖或β·葡萄㈣化物街生物之基 材在一反應混合物中孵育該樣本; 5 (b)使一酵素接觸於反應混合物,其中該酵素能夠作用 在該基材上,且其中該酵素作用在該基材上係導致一工作 電極處的電位之一變化;及 ⑷該接觸之後-或多次觀察紅作電極處的電位及從 該一或多次電位觀察來決定樣本中的細菌數。 10 根據本發明另一實施例,提供一用於偵蜊一铲本中的 大腸菌之方法,包含: (a)以一包含一 β-半乳糖或卜葡萄苷酸化物衍生物之美 材在一反應混合物中孵育該樣本; 1 ⑻使-酵素接觸於反應混合物’其中_素能夠作用 15在該基材上,且其中該酵素作用在該基材上係導致—工作 電極處的電位之一變化;及 (c)在該接觸之後一或多次偵測該工作電極處的電位及 從一或多個所偵測電位來決定樣本中的細菌數。 根據本發明另一實施例,提供一用於偵測一樣本中的 20 大腸菌之方法,包含: (a) 以一包含一β-半乳糖或0_葡萄苷酸化物衍生物之基 材在一反應混合物中孵育該樣本; (b) 使一感測器及一酵素接觸於反應混合物,其中該感 測器包含一其中固定有該酵素或供該酵素與其固定之工作 12 200817520 電極,其中該酵素能夠作用在該基材上,且其中該酵素作 用在該基材上係導致一工作電極處的電位之一變化;及 - (c)在該接觸之後一或多次觀察該工作電極處的電位及 • 從該一或多次電位觀察來決定樣本中的細菌數。 5 根據本發明另一實施例,提供一用於偵測一樣本中的 大腸菌之方法,包含: ’ (a)以一包含一 β·半乳糠或β_葡萄苷酸化物衍生物之基 材在一反應混合物中孵育該樣本; (b) 使一感測器及一酵素接觸於反應混合物,其中該感 10測器包含一其中固定有該酵素或供該酵素與其固定之工作 電極,其中該酵素能夠作用在該基材上,且其中該酵素作 用在該基材上係導致一工作電極處的電位之一變化;及 (c) 在該接觸之後一或多次偵測該工作電極處的電位及 從該一或多個所偵測電位來決定樣本中的細菌數。 .15 根據本發明一特定實施例,提供一用於偵測一樣本中 的大腸菌之方法,包含: (a) 以一包含一 β-半乳糖或β-葡萄苦酸化物衍生物之基 材在一反應混合物中孵育該樣本; (b) 在下列兩者的任一者中使一電化感謂器接觸於包含 20 樣本之反應混合物: ⑴反應混合物的一選定孵育時間之後或 (ii)製備反應混合物之同時或立即之後, 其中該感測器包含一其中固定有一能夠作用在★亥美材 上的酵素或可供該酵素與其固定之工作電極;其中該感、、則 13 200817520 酵素作用在該基材上係導致該工作電極處的電位之 一變化; (C)下列兩者任一者: ⑴在步驟(b)(i)的該接觸之後偵測該工作電極處的 5 電位之變化;或 (11)決定該工作電極處的電位在步驟(b)(ii)的該接觸 之後回到一實質穩態基線值所需要的時間期間;及 (d)下列兩者任一者: (1)步驟(c)(i)所偵測的電位之變化與下列作比較··對 10 於一不含大腸菌之控制反應混合物所偵測的電位之變 化;對於一已知大腸菌數所偵測的電位之變化;一用於 電位變化vs.細菌數之校準曲線;或其任何組合;或 (⑴步驟(c)(ii)所決定的時間期間與下列作比較:對 於一包含一已知大腸菌數之反應混合物使該工作電極處 15 的電位回到一穩態基線值所費的時間期間;或對於該工 作電極處的電位回到一穩態基線值所費的時間期間vs.反 應混合物中的細菌數之一校準曲線;及 0)從步驟(c)(i)所觀察的電位之變化或步驟(c)(ii)所觀 察的時間期間來決定樣本中的大腸菌數量。 20 步驟(c)(ii)可包含決定該工作電極處的電位在步驟 (b)(ii)中的該接觸之後回到一恆定基線值所需要的時間期 間。 本發明亦有關使用本發明的方法來偵測微生物之感測器。 因此,根據本發明的另一態樣,提供一包含一工作電 200817520 極之電化感測器,該工作電極中固定有一酵素或可供一酵 素與其固定’該酵素⑴能夠作用在一基材上,該基材身為 能夠被-相關酵素作用在其上者;或⑼能夠作用在一導因 於-相關酵素作用在-基材上之產物上;其中該相關酵素 5與-微生物或微生物類型相關聯;其中該電極固定式酵素 作用在該基材或產物上係導致該工作電極處的電位之一變 化0 笔極U疋式酵素可能能夠作用在一卜半乳糖或卜葡萄 苦酸化物衍生物上,且可能譬如為半乳料酶郭-葡萄 10 苷酸酶。 因此,根據本發明的一特定態樣,提供-包含一工作 電極之電化感測器,該工作電極中固定有—酵素或供一酵 素與其固定,該酵素能夠仙在—β_半乳糖或㈣萄普酸化 15 物衍生物上以導致該工作電極處的電位之_變化,諸如一 β-半乳糖苦酶。 酵素可藉由-高親和力束缚對被束缚至電極,可直接 地束缚至電極,或可經由一間隔件分子被束缚至電極。 20 選定孵育時間可位於i分鐘至24小時或更大的範圍中 且將依據反應混合物的本質及預期位於樣本中的細胞數或 酵素數里而疋。粹育時間譬如可能位於選自由下列各物所 組成的群組之範圍中·· 1至24、2至24、3至24、4至24、5至 24、1 至20、2至20、3至2〇、4至2〇、5至2〇、e 15、2至 15、 15 200817520 列各物所組成的群組:1至60分鐘,諸如5至60 ' 10至60、 15至 60、20至 60、30至 60、5至 50、10至 50、15至50、5至 45、10至45、15至45、5至30、10至30、20至30、5至20、 10至20、40至60或50至60分鐘。若電化感測器在製備反應 5 混合物之後緊接著接觸於反應混合物則其可能在任何適當 的時間被接觸,諸如一將容許被感測器中或上的至少一酵 素所催化之反應抵達穩態反應速率、且可容許所有酵素催 化式反應抵達穩態之充分時間。因此,譬如,電化感測器 可在製備反應混合物之1秒至20分鐘的範圍内接觸於反應 10 混合物’諸如製備反應混合物之10秒至10分鐘、20秒至10 分鐘、30秒至10分鐘、丨分鐘至10分鐘、1分鐘至5分鐘、3〇 秒至5分鐘、20秒至5分鐘、10秒至5分鐘、1〇秒至3分鐘、 20秒至3分鐘、30秒至3分鐘、1分鐘至3分鐘、1分鐘至2分 鐘、30秒至2分鐘、20秒至2分鐘、或10秒至2分鐘、1〇秒至 15 1分鐘、秒至1分鐘、或30秒至1分鐘以内。 本發明亦有關藉由本發明的方法來偵測微生物且包含 如上述的感測器之裝置。 定義 如此處所用的“包含,,用語係指“主要包括,但未必只 20 有。包各(comprising)用语的變異堵如“包含(comprise)’’ 及“包含(comprises)”等係具有對應的類似意義。 如此處所用的“偵測,,用語係包括觀察、測量及量化及 偵測,且這些用語可在全文互換使用。貞測(detecti〇n),,用 語的變異諸如“偵測(detecting)”、“偵測(detect),,及“债測 16 200817520 (detects)料具麵應的類似範圍。 轉換用的“酵素”用語係指能夠便利-或多個基材 薄膜之任何生物摧化性分子,且2夕個基材運运橫越一 5 10 15 20 八子_7錢雜酵素、薄_送蛋白f、催化性舰 勿子(堵如核酸代峰)。 如此處所用的“微生物”係 生命形式,包括細菌、古細菌、^戈人相尺寸的任何 藻。 囷古,田囷'原生動物、真菌、病毒及 “如此處在束缚至此等電極的酵素之上下文中所 導致该工作電極處之電位的一變化_ :上:接地或間接地導致電極處的電位的一變化。擘如, «處之電位的變化可能來自於酵素作用在物質上賴, 或一或多個產物與其環境的一 ,飞夕個化合物、電極表面、 Μ…後績反應所致。電位的變化可能包含工作電極 處的=極電位相對於電極束缚式酵素曝露於基材前之工作 電位之減小或增加。所_變化可能包含曝露於 作電極處的電位之實質連續的測量/债測’或可 :包含曝露於基材後之一或多個離散時間所作之工作電極 之測量,或用於決定此等變化之任何其他的手段。 圖式間早說明 弟1圖提供本發明的一方法中> ,,fflM , 電極束缚式酵素的 =式之示意圖,其中酵素被動地吸附至電極的表面。 將被偵測的相關酵素以虛線顯示於一箱中以顯示酵素在感 17 200817520 測器與反應混合物接觸時可能未實際出現於反應混合物中 之事實; 第2圖提供對於增加濃度的卜半乳糖苷酶(2_1(^g/mL) 浸於2x酵母胰化蛋白生長媒體中之一恆定濃度的5_溴_4_氯 5 各°引哚P-半乳°比喃糖苷(X-Gal-5(^g/mL)之電極的飽和之 本發明的一工作電極與一參考電極之間的電位差隨著時間 之一圖形; 第3圖提供本發明的一工作電極與一參考電極之間的 電位差隨著時間之圖形,其中:第3A圖一1000ng/mL β-半 10乳糖普酶施加至電極且浸於2χ酵母胰化蛋白生長媒體中之 增加漠度的5漠-4-氯_3_ , Π朵β_半乳α比喃糖苦 (X-Gal-1.5-100pg/mL);第 36圖_1〇〇〇叩/1^ β-半乳糖苷嗨 施加至電極且浸於2χ酵母胰化蛋白生長媒體中之2倍稀釋 的5_溴-4-氣-3-吲哚β-D-半乳吡喃糖苷 15 (X-Gal-50-0_625pg/mL);第 3C圖-30U/mL β-半乳糖苷酶施 加至電極且浸於2χ酵母胰化蛋白生長媒體中之減小濃度的 5-溴-4-氣-3_吲哚β-D-半乳吡喃糖苷(x_Gal-5〇-〇|ulg/mL);及 第3D圖-7500ng/mL β-半乳糖苷崎施加至電極且浸於2又酵 母胰化蛋白生長媒體中之減小濃度的5_溴_4_氯_3_σ引哚 2〇 半乳吡喃糖苷(X-GaMO-Opg/mL)。 第4圖顯示本發明的一工作電極與一參考電極之間的 電位差之結果,其中工作電極包含藉由不同部件或以不同 數里施加至電極之生物素化β-半乳糖普酶,如下: 7500ng/mL生物素化卜半乳糖苷晦經由束缚至電極表面 18 200817520 的鏈菌素施加至電極;750〇ng/mL生物素化β-半乳糖苷酶 被動地束缚至電極表面;75〇〇ng/mL生物素化卜半乳糖苷 酶被動地束缚至電極表面;325〇ng/mL生物素化卜半乳糖苷 酶被動地束缚至電極表面;175〇ng/mL生物素化卜半乳糖苷 5酶被動地束缚至電極表面;浸於2x酵母胰化蛋白生長媒體 中之50pg/mL的5-溴-4_氯-3·°引哚β-D-半乳吡喃糖苷中。第 4A圖以柱狀圖形式提供結果而第4B圖提供電位變化隨著 時間之原始資料(經鏈菌素束缚之卜半乳糖苷酶結果係以經 充填三角形代表,而未充填符號代表Ogg/mL· X-Gal控制 10 組); 第5圖提供一柱狀圖,顯示製備工作電極之後或製備工 作電極前β-半乳糖苷酶在乾冰上作三天儲存之後當浸於 50pg/mL X-Gal中時不同濃度的未經生物素化β_半乳糖苷 酶施加(直接地,被動地)至工作電極之結果; 15 第6圖顯示對於塗覆有6U/mL β-半乳糖苷酶且曝露於 一範圍的X-Gal濃度(經界定媒體中介於1〇(^G/mLs OpG/mL)之經絲網列印聚嗞咯感測器的感測器校準圖形。各 柱係代表一式二份的讀數,附有誤差柱。輸出係表示為全 尺度偏向中的%下降;
20 第7圖顯示以30u/lnL β-半乳糖苷酶對於浸入5〇!Ig/mL X-Gal中時之電極所記錄的電位差之增力口時間量(相對於一 參考電極)之孵育工作電極的結果。第7A圖為顯示浸於 5(^g/mL X-Gal中近似3分鐘之後對於各電極之所記錄的電 位差(一式二份的讀數,附有誤差柱)之柱狀圖,而第76圖 19 200817520 提供在自其取得最大讀數之工作電極浸於5〇|Ig/mL x_Gal 中之後隨著時間經過之電位差的第一組讀數之原始資料; 第8圖顯示一對於在2X酵母胰化蛋白生長媒體中浸於 5(^g/mL X-Gal中之根據本發明的11感測器之可重覆性研 5究的結果’已藉由將一包含7.5pg/mL經生物素化β_半乳糖 苷酶的溶液施加至工作電極一小時來製備感測器。第8八圖 顯示浸於Kg/mL X-Gal中之後近似3分鐘對於各電極之經正 常化電位差(相對於〇 pg/mLX-Gal控制)的柱狀圖,而第8B 圖提供工作電極浸於50 pg/mL X-Gal中之後隨著時間經過 10 對於電位差之原始資料; 弟9圖顯示基材的繼續存在(Carry_〇ver)對於根據本發 明的感測器所獲得讀數之精確度之效應。第9A圖為對於六 [減小]濃度的X-Gal (黑柱)所決定的電位差㈦”之柱狀 圖,其後電極固持件被倒置然後以相反次序來測定六x_Gal 15濃度(影線狀柱)。第9B圖顯示對於各對感測器由於基材繼 續存在所導入之誤差; 第10圖顯示對於包含β-葡萄苷酸酶(第10A圖)或包含β_ 葡萄糖苷酶(第10Β圖)之本發明的感測器之所獲得的結果; 第11圖提供根據本發明的細菌偵測測定之示意圖。基 20材顯示為經充填三角形而細菌細胞顯示為具有一管腔之卵 形; 第12圖提供一圖形,其顯示5-溴-4-氯-3-α引哚p_D_半乳 。比喃糖苦的細菌耗盡導致較低的感測器輸出:全程採用 15pg/mL 5_溴冰氣-3-吲哚β-D-半乳吡喃糖苷,其中有 20 200817520 〇-5χ106五·μ/ζ·細胞(ATCC 11775)及一“無基材”控制組; 第13A及13B圖顯示以(及因此藉由下列之混合物中 X-Gal的耗盡)減小初始接種體的五.⑶// ATCC 11775的反應 混合物孵育之後對於X-Gal之反應混合物的測定所獲得的 5 結果,結果被顯示為全尺度偏向的%降低(相對於0細菌細胞 控制)。第13A圖-1·2χ107至1·2χ105細胞/mL歷時三小時。第 13B圖-3·7χ105至3·7χ102細胞/mL歷時五小時。反應混合物 中之X-Gal的初始濃度為2x酵母胰化蛋白生長媒體中之 50pg/mL ; 10 第14A及14B圖顯示包含(且因此藉由下列之混合物中 X-Gal的耗盡)增加初始接種體的五c〇// ATcc 11775之反應 混合物孵育之後(以包含0_半乳糖苷酶之根據本發明的感測 器)對於X-Gal之反應混合物的測定所獲得的結果。在包含 5〇gg/mL X-Gal之2x酵母胰化蛋白生長媒體的初始接種之 15後2小時後直到6小時為止每小時採取樣本。結果提供為所 觀察之%電位差降低(相對於〇細菌細胞控制)。第14B圖的資 料代表對於各初始接種體之一式二份的結果; 第15A至15(:圖顯示對於浸於5(^g/mL X-Gal中4小時 2之後如根據本發明的感測器(包含束缚至工作電極之β_半乳 糖芽轉)所決定從所觀察的%電位差降低(相對於〇細菌細胞 =制)來決定初始樣本細胞濃度(對於五·⑺"ATCC 11775)所 獲得的校準曲線; 一第16圖顯不在包含5〇从§/11^的2}^酵母胰化蛋白生長媒 一中%月4小時之後以一式二份的減小初始接種體的野型 21 200817520 株365之反應混合物孵育之後對KX_Gal之反應混合物的測 定(藉由包含β_半乳糖苷酶之根據本發明的感測器)所獲得 的結果。以所觀察的%電位差降低(相對於〇細菌細胞控制) 來提供結果。 5 第17圖顯示在包含5(^g/mL X-Gal的2χ酵母胰化蛋白 生長媒體中5小時孵育之後以(及因此藉由下列之混合物中 X-Gal的耗盡)一式二份之野型株365的初始接種體的系列 稀釋之反應混合物的孵育之後對於x_Gal2反應混合物的 測定(藉由包含β-半乳糖苷酶之根據本發明的感測器)所獲 10得的結果。結果提供為所觀察的%電位差降低(相對於〇細菌 細胞控制)。第16圖亦顯示五小時孵育之培養中的培養1 (40,000cfu/mL初始接種體)及4 (40cfu/mL初始接種體)中的 細胞數; 第18圖顯示對於進入包含用來作為基材之$μΜ iptg 15 及100或60Kg/niL X_Gal的2χ酵母胰化蛋白生長媒體中之一 給定接種體之經正常化%感測器輸出下降的差異; 第19圖顯示使用包含束缚至工作電極的β_半乳糖苦 酶之根據本發明的感測器之細胞培養期間的pH減小對於 X-Gal測定所獲得讀數的敏感度之效應; 20 第2〇圖顯示使用包含束缚至工作電極的β-半乳糖苷 酶之根據本發明的感測器之1 mM十二烷基硫酸鈉(SDS)對 於X-Gal測定所獲得讀數的敏感度之效應; 第21圖顯示使用包含束缚至工作電極的β-半乳糖苷 酶之根據本發明的感測器之反應混合物中出現的乳糖對 22 200817520 於X_Gal測定所獲得讀數的敏感度之效應; 第22圖顯示使用包含束缚至工作電極的β-半乳糖苷 酶之根據本發明的感測器之反應混合物中出現的異丙基 -β-D-硫代半乳吡喃糖苷(IPTG)對於X_Gal測定所獲得讀數 5 的敏感度之效應; 第23A及23B圖顯示使用兩型的經絲網列印碳膏電極 來測量X-gal濃度,其中β-半乳糖苷酶以6U/mL及OU/mL被 吸附至感測器表面。以一毫伏特計來讀取輸出。 第24A及24B圖顯示使用兩型的經絲網列印碳膏電極 10來測量脲濃度,使用以所顯示三種濃度吸附至感測器表面 之脲酶。以一毫伏特計來讀取輸出。 L資施方式3 較佳實施例之詳細說明 如上述,大部份或許多既有之用以偵測及計算微生物 15體的標準技術係具有身為緩慢及/或技術嚴格要求、需要至 少24小時來得到結果及/或專業化技術、裝備及訣竅之缺 點’特別是在一給定樣本中可能有小數量的微生物體時尤 然。特別是在環境監測等許多應用中,由於常需要頻繁測 試及/或大量樣本,若需要的話(譬如在水路被高位準的大腸 2〇菌驟然3染之案例中),可能快速地需要結果藉以採取行 動,這些缺點很顯著。 酵素的偵測 本發明提供一快逮且敏感之用於偵測一樣本中出現一 相關酵素之方法。根據本發明之一製程係包含:⑷以可被 23 200817520 相關酵素作用在其上的至少一基材在一反應混合物中孵育 樣本;接下來(b)使一電化感測器接觸於包含樣本之反應混 合物,其中電化感測器包含一能夠作用在該至少一基材的 至少一者上或相關酵素作用在該至少一基材上的一或多個 5產物上之第二酵素;(c)該接觸之後決定工作電極處的電位 之變化;及⑷從步驟⑷所觀察的電位之變化來決定樣本中 的相關酵素量。 根據本發明之-替代性製程係包含:在製備反應混合 物同時、或立即之後使電化感測器接觸於反應混合物;監 10測工作電極處的電位且決定工作電極處的電位回到一實質 穩態基線值所需要的時間期間,其可實質地等同於對於一 不含基材的反應混合物之相同電極所先前獲得的一數值; 及從對於該工作電極處的電位回到一穩態基線值所需要的 時間期間來決定樣本中的相關酵素量。 15 實f地穩態基線值或穩態基線值可能為-值定基線 值0
參照第1圖,感測器包含一工作電極1(Π。第二酵素胸 或102b可被固定或吸附至工作電極ι〇ι的表面。 工作電極ΗΠ可為可供—酵素咖或職所束缚、同時 2〇保留其活動之任何適當的工作電極ι〇ι,且其中酵素活動導 致產物相較於基材之一改變的氧還、pH、或離子性狀離, 而具有工作電極表面處之氧還狀態的一所導致變化。:作 電極1〇1可包含得自諸如料"夫喃、《吩等適當單體性 早70之-導電聚合性材料1〇3作為導電表面塗層 24 200817520 101可被絲網列印,如發證予德國澤西的感测器科技有限公 司(Sensor-Tech Limited)之國際專利公開案號WQ 03/019171所描述,且可自英國的通用感測器有限公司 (Universal Sensors Ltd.亦即USL)取得。或者,工作電極ίο! 5可包含一非聚合性導電材料103,其可包含石墨、碳膏、金、 鉑或其他適當的導電材料。適當的經絲網列印碳膏電極係 自英國龐帝浦的葛溫特電子材料有限公司(Gwem Electronic Materials Ltd)取得。 對於一電位計式偵測步驟而言係需要參考電極1〇9,可 10 將譬如一甘汞(calomel)或Ag/AgCl參考電極放置在與工作 電極101相同的支撐件上,或者可採用一外部參考電極 109。並且,參考電極109可被包含在可於其中進行步驟(匕) 及(c)的容槽中或包含該容槽,或者可為一用於數個用於進 行步驟(b)及(c)的容槽之共同參考電極1〇9,如同若使用多 15 井板所可能需要之情形。 可能具有用於進行本發明的一方法之任何佈局,諸如 早反應谷裔或胞至、沾-黏格式(dip-stick format)、或多井 板,且可包含整合式電化感測器。 一第二/感測器束缚式酵素l〇2a能夠作用在至少一義 2〇材1〇4上,其亦為一用於相關酵素1〇〇之基材。或者,第二/ 感測為束缚式酵素102b能夠作用在相關酵素1 〇〇作用在義 材104上的一產物105上。第二酵素1〇2a或i〇2b作用在至少 一基材104或產物1〇5上係分別產生工作電極1〇1處的電位 之一變化。隨後可能在感測器100接觸於反應混合物1〇8之 25 200817520 後由偵測器107在任何適當的一或多個時間決定此電位變 化’且其可與原始樣本中之相關酵素量相關。 5 10 15 根據本發明的一方法中,包含原始樣本或其一部分及 可被相關酵素1G G作用於其上之反應混合物丨G 8係畔育—段 所而要的間。為了避賴測器接觸於反應混合物⑽ 期間來自相關酵素⑽的干擾,可在感測器接觸於反應混合 物8之别自反應混合物1〇8移除相關酵素1〇〇。工作電極 1〇1中係固定或吸附有—能夠作用在基材刚上的第二酵素 102a。销測$束縛式酵素黯作用在該至少—基材⑽上 係‘致工作電極1〇1處的電位之一變化。藉由監測身為對於 一所需要時間之時_函數之電位在接觸步驟之後,相對 於經由電傳導線i06b電性連接至偵測器1〇7之參考電極ι〇9 來决疋紅由電傳導線1063電性連接至侦測器術之工作電 極101處的電位之變化。隨後可從身為時間的函數之電位的 ^化來決定原始樣本巾相_素之存在或不存在及/或數 量。束缚至工作電極101之酵素職可能為能夠作用在與相 關酵素相同的基材上之任何酵素,或可能為能夠作用在相 關酵素作用在-基材上的一產物上之任何酵素咖,盆中 該酵素贿或娜導致-或多個產物相較於—或多個基材 20之^變的氧還、pH、或離子性狀態,及工作電極表面處 之制狀態的-所導致變化。此等酵素可能包括孽如但不 限於分解代謝性酵素,諸如碳水化合物_劣化酵素包 普q諸如β-半乳㈣酶、β_葡萄芽酸朴蛋白質分解或 肽分解性酵素、_、薄膜運送蛋白f及核酸酶。 26 200817520 ,、相關酵素可譬如包括分解代謝性酵素,諸如碳水化合_ 名化酵包括糖苦峰(諸如大腸菌相關聯的p-半乳糖皆酶 及/,葡萄荅酸酶)、或流感病毒相關聯的神經胺酸酶、蛋 白質分解或肽分解性酵素、脲酶(與祕〇心心種及部分藍 5綠澡相關聯)、薄膜運送蛋白質及核_,但亦可包括合成 酵素’或歧化酵素/轉移酶,在該例中一或多個基材上受到 作用以產生至p可供-電極束缚柄素祕侧於其上 之產物105。 關酵素1GG及t極束缚式酵素丨咖可為相同酵素 10 (亦即,來自相同來源之相同酵素),可為來自不同來源之相 關/相同酵素,或可為完全不同的酵素。 相關酵素剛及-電極束料料祕可為完全不同 的酵素。然而,若相關酵素觸及酵素嶋所催化的反應為 可逆式,這些酵素可為相同酵素(亦即,來自相同來源的相 15同酵素)’或為來自不同來源的相關/相同酵素。然而,此情 景中,在感測器接觸於反應混合物1〇8之前將需自反應混合 物卿除實質所有相,素刚(或财相_伽)藉以 獲得有意義的結果。 在相關酵素及電極束缚式酵素繼徘用在相同基材上 2〇之案例中,由於相關酵素將對於藉由電極束缚式酵素咖 的作用使得反應混合物⑽中之可取得基材1〇4量耗盡,受 調查樣本中存在相關酵素將比起樣本中不存在相關=素= 所觀察者而言導致步驟⑷之工作電極⑻處之電位的 小變化。 27 200817520 在電極束収料職仙在相_素仙在至少一 : 上的|物上之賴巾,若受調查樣本包含相關酵 常’步驟(C)所觀察的電位之變化將較大。 Μ至少—基材104可為被相關酵素作用其上且亦可被電 5 酵素搬仙在其上以導虹作電極⑻處相對於 電極1G9之電位的變化之任何-或多個化合物。 盆可破至少一電極束缚式酵素102a或102b水解地作用於 ^藉以導致—氧還、pH或離子性變化(此導致電極束 私=素收緊鄰處之此變化,藉以導致工作電極處的電位 之欠化)之適當基材1〇4係為此技藝所已知,纟可譬如包 括1/臭-4·氯·3-°引°朵-或6_氯冬°引嗓-連結式化合物、螢光黃-連九式化合物、甲基傘形嗣衍生物或螢光素-連結式化合 15 20 言如,-實施例中,至少一基材104可為_被相關酵素 被電極束収酵素黯作用在其上藉以導致工作電極 101處的電位的-變化之糖苦。根據此實施例,兩酵素可皆 為糖料,諸如α•或㈣料麟银果糖料(諸如轉化 酶)及其他,且基材可為一α·或β-吼喃葡糖#,諸如…或 吼喃葡半乳㈣㈣、α•或p_Dtt喃甘露糖苦、 α·或β_葡萄苷酸化物、β_果呋喃糖苷、及其他。 相關酵素亦可為糖苷酶而電極束缚式酵素1〇此 & 酶或氧化_。譬如’相關酵素刚可為卜半乳糖科,基= 104可為β_半乳糖,產物1()5則可為半乳糖且電極束缚^酵 素1〇2b可為卩_半乳糖脫氫酶。或者,相關酵素咖可為二(或 28 200817520 Μ糖料’基材1G4為P伽歸’產物H)5可為葡萄糖 而電極束、縳柄素職可為㈣糖氧化梅。 至工=2:或^可由該技藝熟知的任何適當部件束轉 5 f如,酵素㈣或贿可被動地吸附至電極⑼表面, 或可精由電極101表面、且選用性地包括酵素之官能化被束 縛至電極101藉以能夠使酵素直接束縛至電極。或者,酵素 職或聰係可經由一間隔件分子藉由間接連結被束缚至 電極101,或可藉由-包含一高親和力束缚對之連結系統被 10束缚至電極ιοί,其中此一束縛對的各構件係共輛/束缚至 酵素或電極表面的任一者。一適當高親和對的一範例譬如 包含一鏈菌素生物素束缚對。 若使用一鏈菌素·生物素束缚對來將酵素束缚至電極 ,鏈菌素可被束缚至電極表面,且生物素可譬如藉由酵 15素與-經生物素化炫合終端之重組表示被餘至酵素⑽& 或102b。這可容許酵素職或嶋對於電極ι〇ι之高度特定 性且強固的束缚。特定表面可能不需要官能化藉以能夠束 缚酵素、鏈时,且已發現—聚料表面1()3可容許鍵菌素 的直接束缚或β-半乳糖苦酶的直接束缚而不喪失活動性。 20 I缚至工作電極之酵素量將依據數項因素而定,包括 酵素本身的本質、束缚至電極的模式及電極表面的本質。 一般而t ’酵素量可從每電極約1χ1〇-6單位的酵素活動 (μιηοΐα的所轉換基材每分鐘)改變至每電極約單位, 諸如每電極約lxl〇-5單位,每電極約5χ1〇_5單位,每電極約 29 200817520 1X10單位’或每電極約5χ10·4單位。 亦可包含使不只—型酵素束缚至卫作電極之本發明的 及其感。譬如,—束缚至功電極1G1表面之酵 」〇2係可作用在與一相關酵素相同之基材104上、或相關 5酵素作用在基材上之一產物1〇5上,且一束缚至工作電極表 面之第二酵素係可作用在酵素1〇2作用的一產物上導致工 广电極處的電位之一進一步變化,潛在地導致較大的測定 敏感或者,若一樣本可含有兩或更多種相關酵素,諸 如可此為包含微生物的樣本所發生之情形,兩或多個酵素 10 102可束缚至工作電極應表面,其各者可作用在一亦被一 相關酵素所作用的基材104上,或一相關酵素作用在-基材 上之-產物U)5上。多重相關酵素性活動之偵測的一替代方 式可能係為利用包含可供束缚不同酵素類型之工作電極之 分離的感測器來進行本發明的方法,可容許分離地偵測樣 15 本中的各酵素性活動。 微生物的偵測 20 本發明的方法之另-實施例中,相關酵素1〇〇係與一微 生物或微生物«相關聯,且該转可為—歸制一樣 本中存在該微生物祕生物類型之方法,諸如—用於债測 水樣本中的大㈣、或线樣本巾^毒之方法。 特定的微生物、或微生物類型係在許多案例中於至少 -給定樣本類射與特殊酵素性活動相襲。#如,水樣 本中的β·半乳㈣w葡㈣酸_動係與此等樣本中 的大腸菌數呈強烈交又相關。數種病毒亦在其外部塗層 30 200817520 上具有特定酵素。譬如,流感病毒包含作為外塗層蛋白質 之神經胺酸酶。 5 10 15 20 特別是對於此目的,而非本發明的任何方法之目的, 相關酵素100可為β_半乳糖普酶或β_葡萄芽酸酶,且基材⑽ 可分別為β·半乳糖或β_葡萄㈣化物衍生物。此等方法中, 束、專至電極的酵素可為—能夠分別作用在卜半乳糖或卜葡 萄普酸化物衍生物上之酵素跑,或―能·半乳糖 苷酶或β-葡萄普酸酶作用在Ρ_半乳糖或卜葡萄苦酸化物 衍生物或-水物(諸如耗糖_萄祕酸)上之酵素 102b。若該方法絲制大腸菌,相對酵素刚及電極束缚 式酵素102a皆可為β·耗㈣酶或㈣萄純酶且基材 104可為β-半乳糖或(3_葡萄苷酸化物。 b方法中可使用任何適當的卜半乳糖或卜葡萄苷酸 化物基材104,其限制條件在於:其被電極束缚式酵素102a 或獅作_將導致卫作電極處的電位之—變化且亦身 為用於藉由與大腸g相關聯的—相關酵素剛(諸如卜半乳 ㈣酶或β·葡萄《酶)的酵素性作用之適#基材1〇4。適當 基材可譬如包含6.氯m叫半乳吼喃糖苦 、5_漠_4·氣_3H叫半乳吼喃糖* (Blue-gal)、螢光黃專D_半乳吼喃糖苦)、榮光黃單仰· 半乳吼喃㈣、4_甲基傘_仰,ut⑽苷、蔡紛榮 光黃二|D_半乳Μ㈣)、4_三氟甲基轉酮仰-半乳 °比喃㈣、及3,4_環⑽七㈣β-D·半乳ntt喃㈣(s_gal)。 基材104可為5_溴-4-氯如弓卜格連結式糖苦或葡萄苦 31 200817520 酸化物。根據一特定實施例,基材104為5-溴-4-氣-3-吲哚 β-D-半乳吡喃糖苷。 因此,根據本發明的一特定方法,該方法係用於一樣 本中偵測大腸菌,包含: 5 (a)赙育一包含樣本及一含有β-半乳糖或β-葡萄普酸化 物衍生物的基材之反應混合物; (b)在下列兩者任一者中使一電化感測器接觸於包含樣 本之反應混合物: ⑴反應混合物的一選定孵育時間之後或 10 (ii)製備反應混合物之同時或立即之後, 其中該感測器包含一其中固定有一能夠作用在基材上 的酵素或可供該酵素吸附之工作電極;其中該感測器束缚 式酵素作用在基材上係導致該工作電極處的電位之一變 化; 15 (c)下列兩者任一者: ⑴在步驟(b)(i)的該接觸之後偵測該工作電極處的 電位之變化;或 (ii)決定該工作電極處的電位在步驟(b)(ii)的該接觸 之後回到一實質穩態基線值所需要的時間期間;及 20 (d)下列兩者任一者: ⑴步驟(c)所偵測的電位之變化係與下列變化作比 較:對於一不含大腸菌之控制反應混合物所偵測之電位 的變化;對於一已知數量的大腸菌所偵測之電位的變 化;對於電位變化vs.細菌數、或其任何組合之一校準曲 32 200817520 線;或 (11)步驟(C)(ll)所決定的時間期間與下列作比較:對 於一包含一已知大腸菌數的反應混合物使該工作電極的 電位回到一穂態基線值所費的時間期間;或對於該工作 5 電極處的電位回到一穩態基線值所費的時間期間v s ·反應 混合物中的細囷數之一校準曲線;及 (e)使步驟(c)⑴所觀察的電位之變化或步驟⑷⑼所觀 察的時間期間與樣本中的大腸菌之存在或數量產生相關。 步驟(c)(ii)可包含: 10 的該接觸之後該工作電極處的電位回到一 恆定基線值所需要的時間期間。 此悲樣的一實施例中,測定係為一耗盡測定,其中相 較於對於不含細菌或不含酵素的控制樣本所偵測/決定 者’由於細菌相關聯的相關酵素100耗盡藉由一電極束缚式 15酵素102&所催化的反應可取用的基材數量之故,較高大腸 菌數係與所偵測電位的較小變化、或步驟(c)所決定的較短 日守間期間相關聯,且大腸菌被定量或半定量式偵測。 譬如,參照第10圖,本發明的一耗盡測定可包含測定 一已由一未知樣本及基材(諸如X_Gal)作孵育之測試樣本。 2〇 若大腸菌出現在反應混合物中,這些將耗盡反應混合物中 的基材量,且大腸菌的細胞數亦可增加。反應混合物隨後 可利用根據本發明的一感測器作測定,諸如一包含一已吸 附有β -半乳糖苷酶之以聚唤咯為基礎的工作電極之感測 器’其在與感測器接觸之前被選用性地過濾。相對於一參 33 200817520 考電極在工作電極處所觀察的電位隨後係可與對於一正控 制,其包含一不含基材或含有基材及一具有高卜半乳糖苷 酶活動之而接種體的細菌(使得實質全部或全部的基材在 接觸包含反應混合物之本發明的一感測器之前被耗盡)· 一 5負控制反應混合物,其不含細菌(對於給定初始基材濃度之 最大電位差);或其-組合之反應混合物所觀察者作比較。 隨後可利用對於該感測器或感測器批次所先行製備的一適 當校準曲線使得對於測試及—適#控朗觀察的電位差異 等同於將已出現在初始樣本中之大腸菌細胞的—近似數 10 字。 大腸菌將在廣泛情況中構成問題,特別是諸如處理流 出物及集水區域/河流等水源中尤然。因此,根據一特定實 施例本發明的-方法係用於積測一得自水源的樣本中之 大腸菌。 15 目為水樣本巾很低位準的大腸时時仍可能造成消耗 該水的人類及其他動物之病理狀況,樣本可能在以基材膊 育之前譬如藉由過濾/超過濾被濃縮。 測定條件 叙而a ’本發明的方法中,基材可以-提供最大反 2〇應速率的濃度來提供,以具有最好的敏感度,但亦可採用 次佳的基材濃度。譬如,若使用電位變化的初始斜率而非 基材04或產物之實質完全或完全的耗盡之後電位變化 =制則可知用逼近酵素⑽咖㈣的米氏(黯^㈣ 常數(Km)、或略微更高之_基材濃度藉以確保所制電位 34 200817520 變化逮率之 及束縛至電極的酵素=使用的基材濃度將依據相關酵素 基本酵素參數為已知力學而定’且其如果或一旦 決定及/或可容_料f 、模型贿或計算來 或溶解度亦可為決定所==:基材的成本及/ 素。 用的基材》辰度日守之一項決定因 對於細菌糖苷_,% u、 "如,已知具有從微莫耳範圍(諸如 約25μΜ)至毫莫耳範圍 ^ ^ 、、- 1啫如約25mM)之廣泛的米氏常數 (m)。為了達成最大的 10 15 20 反應速率,基材濃度應至少約為該 未氏吊數(Km)的3至5倍, 、 且理想上為更局,諸如約10倍之 特定基材的一給定酵紊沾 , '、、未氏常數或更南。因此,對於端 點電位變化決定,若對a 、 钉於相關酵素100或電極束缚式酵素 102a或102b的一者之最古士 取巧水氏常數為近似ImM,適當基材 濃度可能南達約lGGmM或更高,但基材成本可能需要較低 濃度’諸如約75mM、約5〇福、約4〇碰、約3〇福、約 20mM、約 15mM、約 l〇mM、約 7 5mM、約 5mM、約4mM、 約3mM或甚至更小。若採用接近米氏常數、或較低的基材 濃度,由於基材濃度的小差異可能導致反應速率的大差 異,應小心確保測定之間的基材濃度的一致性。或者,應 在基材批次之間測試適當的標準。 若在感測器接觸於反應混合物之後的設定時間決定工 作電極處的電位之變化(見下文),為了具有最好敏感度,此 等測定中所使用的基材104量應使得電極束缚式酵素102a 可取用的基材104或作用的酵素102b之產物105的數量(及 35 200817520 因此未被相關酵素所轉換之基材量,或相關酵素的作用所 釋放之產物105量)位於對於此基材之電極束缚式酵素的米 氏常數(Km)之約〇至約2至3倍的範圍中。若採用較高的基材 濃度,精確度可能受到妥協,且這亦可能發生於採用很低 5基材濃度(其可能難以精確地複製)及/或對於電極束缚式酵 素之基材飽和曲線在很低基材濃度處非常陡峭(亦即,酵素 為飽和,且因此反應速率為近似最大)之情形。 為了增加偵測一相關酵素性活動之機會,樣本可嬖如 在與基材104孵育之前藉由過濾/超過濾被濃縮。 0 為了在與基材孵育之後消除來自微生物之干擾,反應 混合物108可在步驟⑻之後過濾以從齡物移除微生物以 被施加至感測器。 -般而言,雖然較接近對於相_素刚及電極束縛式 酵素102a或102b活動的最佳溫度之溫度可提供較大測定速 15度或敏就,本發明的-方法中對於步驟⑷或⑻所採用之 溫度並不重要。若作出與其他測定回合之有意義比較,溫 度理想上在不同測定執行之間應為相同,或者應在不同田 度執行適當的標準及/或控制。—旦基本酵素及基材參數= 已知,熟習該技術者可藉由直率程序及模型模擬容易地將 2〇用於進行步驟(a)及(b)之溫度予以最佳化。
對於藉由來自五.⑽的β-半乳㈣*戶斤儐化之反 最佳值溫度被記載為,然而,可採用從約机 至約50°C的溫度諸如約2(TC、22它、24t、26它、28它 3〇t、坑、3(C、机、38t、4吖、机、听、% 36 200817520 °C、48°C、或50°C、甚至位於此區域外之溫度,但已知來 自的卜半乳糖苷酶在高於3Tt之溫度並不穩定。 對於相關酵素100及感測器束缚式酵素102之最佳值溫 度將未必相同,因此可能需以不同溫度進行步驟0)及卬)。 5 反應環境應具有一位於相關酵素100、感測器束缚式酵 素102、或兩者的pH最佳值的約1至2 PH單位内之pH。然 而,若酵素具有一相對較扁平的pH活動輪廓,較寬廣的ρΗ 可能適用。反應pH亦可影響反應物濃度,且這可為一項決 定因素,且酵素的pH最佳值可能未必提供最佳值反應條 10件。一旦基本酵素及反應物參數為已知,熟習該技術者可 藉由直率的程序及模型模擬容易地進行pH最佳化。 相關酵素100及感測器束缚式酵素102之pH最佳值將未 必相同,因此可能需要在步驟(a)之後調整反應混合物的 pH 〇 15 來自五·的β_半乳糖苷酶具有6.6-8.0的pH,依據基 材及所使用緩衝液而定,在pH 6.0為穩定但在pH 5.0則不穩 定’且在大於pH 9.0的pH值並不穩定。為此,若來自五 的β-半乳糖苷酶出現於反應混合物中,且來自五.Co"的β-半乳糖苷酶束缚至工作電極,則反應環境pH可能為從約 20 pH 5.5至約pH 9_0,諸如從約pH 6.0至約pH 8.0,諸如約pH 6.0,約pH 6.2,約pH 6.4,約pH 6·6,約pH 6.8,約pH 7.0, 約pH 7_2,約pH 7·4,約pH 7_6,約pH 7·8或約pH 8.0。 因此,雖然未必需要,反應混合物可包含一適當緩衝 液以使pH維持在所想要範圍内。適當緩衝液及其濃度係為 37 200817520 該技藝所熟知且可僅藉由例行實驗對於任何給定組的所想 要反應條件由熟習該技術者來決定。 若《亥方法包g肖樣本中存在一微生物相關聯之相 關酵素性活動的制,且步驟⑷包含孵育一包含該樣本及 5 -基材之反應混合物,除神|期陳料樣本中存在报 低的微生物量,反應混合物可能預期發生酸化。這可能將 pH降低至一顯著地低於對於酵素的pH最佳值、或可使工作 電極表面不那麼具有回應性之位準,潛在地降低了感測器 的敏感度。可藉由反應混合物的適當緩衝、避免一或多個 10樣本中的過度細胞數、適當的孵育定時、或其一組合來避 免或限制此效應。 依據被催化反應及酵素而定,本發明的方法亦可能需 要對於相關酵素的活動在孵育媒體中包括一或多個共同因 素或共同基材,或對於第二/感測器束缚式酵素的活動將其 15 包括在或測定媒體中。 亦應考量抑制劑對於相關酵素或第二/感測器束縛式 酵素的活動之潛在效應、或可能以其他方式影響本發明之 感測器的敏感度之因素。 譬如,若相關酵素、第二/感測器束缚式酵素、或兩者 20 為β-半乳糖苷酶,由於這些化合物兩者皆與X-Gal競爭來自 万.Co/i的β-半乳糖苷酶的作用,包括乳糖或異丙基令D_硫 代半乳吡喃糖苷(IPTG)之作用係可能降低留存在反應混合 物中的X-Gal之偵測的敏感度。由於乳糖或iptg時常用來誘 發β-半乳糖苷酶的表示,這可能在本發明的方法包含藉 38 200817520 由β_半乳糠苷酶活動的偵測來偵測大腸菌時構成問題。 為了令用於偵測微生物之使用根據本發明的方法具有更好 的測定敏感度,因此可能偏好不使用乳糖或IPTG來誘發β-半乳糖苷酶。或者,可以低、實質非干擾性濃度使用低位 5 準的此等β-半乳糖苷酶誘發劑,且這可能容許具有較可靠 的結果。 並且,在這些研究過程中,已經發現陰離子性清潔劑 SDS(其可用來滲透化微生物細胞以釋放、或增加相關酵素 的細胞外位準)係與使用束缚有β_半乳糖苷酶之來自英國的
10通用感》則菇有限公司(Universal Sensors Ltd· : USL)以聚口必 略為基礎的感測裔之對於X-Gal的測定敏感度產生干擾。因 為SDS亦為製備感測為的工作電極中之摻雜物,其部分原 因可能由於電荷所致,或者SDS所提供的電荷可能為干擾 1因素。可預期其他離子性清潔劑亦可與此等感測器的敏感 度產生干擾,且因此若將使用聚D必咯則對於微生物細胞的 滲透化而言可能偏好使用非離子性清潔劑。 若測定敏感度並非極為重要,可執行適當控制以顧及 往何抑制劑或干擾物質的效應。 酵素或微生物量之決定 直本發明的方法可包含相關酵素1〇〇的半定量決定及定 ^定。前者案例中’可能μ要精確的基材濃度及溫度, 至;=法可能較適合使用小型且可能為可攜式裝置(甚 又工 /、可依需要選用性地在襯衫或夾克口袋 39 200817520 中孵育。 右忒方法為半定量性,亦可能不
之數值決定及/或與標準或控制的電位變化電位的 低限值變化、或依需要足 M 5 10 15 20 的斜率之比較。 ^、或負結果的電位之變化 〜二者纟:亥方法包含一樣本中之相關酵素的定量决 :不所觀察的電位之變化可能與下列作比較:對: ㈣已:目關酵素之控制反應混合物ι〇8所觀察 =對於一包含一已知相關酵素-量之反應混合物二 相察的電位之變化…對於電位的變化VM目_素10 置之校準曲線,或其任何組合。 工作電極處的電位之變化可能在任何適當的一或多個 時間決定。可分別供電極束缚式酵素咖或娜作用於其 上之基材104或產物105的各個分子之偵測係可能需要—_ 伸的時間量(隨著電極束缚式酵素的基材量被耗盡,反應迷 率減慢,提供一漸近性耗盡曲線)。為此,工作電極101處 ㈣位可在-或多個設定時間決定,且可使用電位的變^ 之實際值或斜率來回溯與樣本中相關酵素1〇〇量產生相 =。此製程由於只需妓-初始反應速率而非容許反應^ 質地繼續進行至均衡或繼續進行至均衡故可顯著地加^ 定時間。 Μ 或者,可在本發明的一電化感測器接觸於一反應現合 物(製備反應混合物之同時或立即之後)及決定工作電極、: 當接觸於一不含基材的反應混合物時之類似的電極處所^ 40 200817520 察的電位回到一穩態基線值(其可能為實質等同於或等同 於對其所先行觀察數值之數值)所需要的時間期間之後連 4丨生或週期性地監測工作電極處的電位。工作電極處的電 位所需要之時間期間隨後可能與一適當控制或標準作比較 5藉以決定一樣本中出現之相關酵素或微生物量。譬如,所 觀察的時間期間可與該工作電極處的電位回到對於一包含 一已知大腸菌數量的反應混合物之一穩態基線值所費的時 間期間作比較。或者,所觀察的時間期間可與一對於一工 作電極處的電位回到—穩態基線值所費時間期間vs·反應混 10合物中的細菌數之校準曲線作比較。由於可容易取得用於 偵測漸近性端點之軟體,此等方法亦可被自動化。 對於一樣本所獲得結果與一適當控制作比較之本發明 的方法中可利用分離的電極來測試一正控制(一不具有基 材、或具有一已知微生物量之控制組)及/或一負控制(一具 15有基材但無微生物之控制組)。然而,為了容許電極之間可 忐的不一致,可使用相同電極來測定樣本及一正控制、一 負控制或兩者。此-方法中,為了降低由於攜載基材或產 物所致之不精確,電極可在讀取之間以一適當媒體作清 洗,或者可以下列次序進行讀取:正控制;樣本;負控制。 2 〇 本發明的方法之特定優點 本發明的方法係由於該等方法的簡單性及相關材料的 堅固性而可叉到自動化。因此,根據一實施例,本發明的 -方法之至;步驟⑼及⑷受到自動化。根據另—實施例, 本發明的-方法之所有步驟皆受到自動化。 41 200817520 本發明可因此提供一自動地獲得諸如一水樣本等樣本 且將將提供至一利用生物感測器來偵測及量化相關酵素性 活動及/或微生物的數量之測定之系統。因此,本發明的方 法可依需要容許新測定及生物感測器之自動佈署,故容兮午 5可在無人照料下執行一自我圍堵式環境監測系統。 並且,由於使用在本發明的方法中之感測器可被絲網 列印,且因此能夠被使用在小測定容器/胞室中,可在諸如 96井板等多井板中進行至少步驟(b)及(c)。 經絲網列印的感測器亦可使用在感測器陣列中以備測 10多重酵素性活動。這可容許偵測藉由微生物之酵素表示的 圖案,而可能容許偵測已經據以培養一微生物之條件,或 容許偵測具有特定酵素表示圖案之微生物。 因此,本發明可容許自動的迅速(〜4至6小時)之少數微 生物的計算,諸如水中的細菌。此短的測定時間係區分出 15本發明的方法與需要一隔夜孵育步驟之現今、產業標準、 以培養為基礎的偵測方法。自動地處理樣本之能力係區分 出本發明與需要操作人員在製程中不同階段操縱測定之其 他以生物感測器為基礎的系統。此外,所採用的中央測定 係為電化式’其利用適應現場條件及無人操作之堅固、便 20宜且可棄的電極,主要係用於環境監測之領域中。此測定 亦為一般性本質且適可用來偵測大量相關酵素性活動、微 生物病原體或指示器微生物,在環境監測及諸如水產業的 領域或臨床診斷等其他的領域中皆然。 本發明的方法之較大速度且特別是關於微生物的谓測 42 200817520 (諸如五及其他大腸菌之環境中的病原體)時係可容許更 迅速地獲得結果’且可使以這些結果為基礎的決策更為有 效。此外’低的測定成本、及取樣程序的自動化將可容許 在一給定時間期間中取得許多樣本。在水監測領域中這將 5旎夠建造出環境事件對於水源污染的效應之一較好的預測 性模型’或例如在水產業領域中早期指示出存在致病生物 藉以能夠作預防性干預。亦可利用本發明的方法來達成 水、廢水、水產業、生物固體等中之其他病原體的監測。 譬如,可監測身為水工業中的主要問題之心及身 10為散佈在水冷卻系統中的重要病原體之狀//α。 本發明亦想見包含本發明的一或多個電化感測器之用 於偵測微生物或微生物類型之裝置。此等裝置中,一或多 個感測可能接觸於、或可接觸於一電位計。電位計可直 接地或經由遠端導通部件與至少一資料收集模組呈導通。 15此外,該裝置可包含、或可接觸於一資料處理模組以使一 或夕個感測器所偵測的電位之一變化定量地或半定量地與 一樣本中的微生物類型或微生物量產生相關。對於微生物 頟型或微生物量之定量決定,處理模組亦可包含用於下列 之資料·有關一樣本中缺乏微生物之電位的變化;有關一 20樣本中存在一已知微生物數量之電位的變化;一有關對於 微生物細胞數量之電位的變化之校準曲線;或其任何組 合,且此模組能夠比較感測器所偵測的電位之一變化與該 貧料以定量或半定量地決定該樣本中之該微生物類型或微 生物量。 43 200817520 5 件 本發明所想見之裝置係包括用於遠端監測一環 如水路)之自動式裝置,或研究室用之部分自動式或完全手 動式裝置’及用於環境監測之囊袋尺寸#置其可包含 至少一或多個感測器、—電位計及資料獲取或資料傳^ 現在將參照下列範例只藉由範例來描述本發明的較佳 形式,且其不被視為以任何方式限制本發明的範圍或精神。 範例 範例1-製備感測器 10 具有經聚嗞咯塗覆工作電極之經絲網列印的電化感測 器係付自通用感測器有限公司(Universal Sensores Ltd.: USL)(Unit 2 Suite,Abbey Barns, Duxford Road,Ickleton,
Cambridge CB 10 1SX United Kingdom)。 感測器自其保護包覆物移除且加熱至150°C兩分鐘。 15 所有後續步驟係在一96井聚丙烯微板之井中進行。 酵素對於工作電極之直接、被動式吸附
感測器浸於一包含一所想要酵素濃度之適當容積的溶 液中一段充分時間期間以容許所想要酵素量束缚至工作電 極。鐾如,為了製備適合偵測一反應混合物中的X-Gal之感 20 測器,感測器可浸於16〇 Μ之〇·1Μ石粦酸鹽緩衝液(PH7.3)中 的6U/ml β_半乳糠苷酶中一段位於1分鐘至1小時或更大的 範圍之時間(譬如,Κ25、Κ5、1/75、2、2·25、2·5、2·75、 3、3 5、4、4.5、5小時或更大)。感測器可浸於160 W之〇·1Μ 磷酸鹽缓衝液(ρΗ7.3)中的6U/ml Ρ-半乳糠苷酶中譬如約 44 200817520 2^3^4^5^7.8^9M0^11^12M3>14M5>16^17^ 18、19、20、21'22、23、24、25、26、27、28、29、3〇、 3卜 32、33、34、35、40、45、50、55或58分鐘。 感測器隨後被清洗以移除未束縛的酵素。上述特定範例 5中,清洗可能包含使感測器浸於三份的叫喊酸鹽緩衝液。 感測1§此時可易於立即使用、或覆蓋有一保護塗層(諸 如ArraygUardTM,或後塗覆(Postdating)緩衝液,得自^洲 昆士蘭湯斯維爾的輟普拜爾(Tr〇pBi〇))以供儲存。 酵素經由一鏈菌素生物素連結被束缚至工作電極 10 感測器浸於一包含在蔗糖緩衝液中處於80 pg/ml的鏈 菌素(Sigma ; Cat No· S0677)之適當容積的溶液中。對於各 1 mm2的工作電極需要7μ1的鏈菌素溶液。 鏈菌素溶液隨後乾燥於電極(37°C/3小時最小值)上且 感測器隨後被清洗以移除未束缚的鏈菌素。 15 經生物素共軛的P-半乳糖苷酶(Sigma; Cat No. G5025) 溶解於一處於1 mg/ml的專屬酵素穩定化溶液中 (Stabilzym,瑟蒙地公司(Surm〇dics心))。此物料在pBs_ 7·〇)中進-步稀釋以提供所想要的酵素濃度,且其7μΐ以移 液官移至經清洗之塗覆有鏈菌素的電極上。經生物素化卜 2〇半乳糖苦酶被特定地定向且藉由生物素分子與對於此分子 的特定受體之交互作用被束缚在聚料電極上的鏈菌素 上感測杰卩通後被清洗以移除未束缚的酵素。經擷取的酵 素(β-半礼糖芽酶,或任何診斷性細菌酵素)隨後乾燥於感測 ⑽小時37〇上’且可制性地施加及乾燥—保護層的微 45 200817520 陣列塗層(諸如Array guard™,或後塗覆(Postcoating)緩衝 液,得自TropBio,澳洲昆士蘭湯斯維爾)。感測器然後儲存 在4°C直到使用為止。 酵素經由抗體附接被束缚至工作電極 5 抗體亦可藉由在一適當緩衝液(諸如填酸鹽緩衝的鹽 水pH 7.4)中將充分容積的抗體溶液(濃度被實證式決定)以 移液管移動而被施加至感測器表面(譬如,對於碳電極為3〇 uL且對於聚哒咯電極為3μί)。 感測器隨後在3 7 °C被乾燥直到幾乎乾燥為止(諸如約 10 15分鐘),然後可選用性地施加30μί或3uL的保護溶液(嬖 如,TropBio後塗覆緩衝液),且感測器被完全地乾燥及儲存 於4°C、脫水。 緊接在使用之前,若已施加一保護層,感測器則可被 緩衝液清洗以移除保護層。 15 酵素溶液隨後可以移液管被移至工作電極上,或電極 浸於酵素溶液中。一孵育期間容許藉由抗體來擷取酵素之 後,感測器可被沖洗以移除未束缚的抗體。 感測器可立即用於如上述般地測定一基材,或藉由浸 於基材溶液中,其中譬如在USL聚哆咯感測器之案例中藉 2〇由一USL讀取、或在諸如碳電極等其他電極之案例中利用 一宅伏特計來收集資料。 右抗體將藉由諸如鏈菌素/生物素等特定連結被附接 至感測器,鏈菌素可由該技藝已知的任何適當方法施加至 包極。譬如,為了使鏈菌素連結至USL聚吆咯感測器,可 46 200817520 如USL技術手冊所描述來進行此作用。 鏈菌素的一溶液(譬如,0.005M磷酸鹽緩衝液pH8〇中 的一 10%嚴糖溶液中之8(WmL)可放置在工作電極表面上 (譬如,對於碳電極為3〇μί,對於USL聚嗞咯電極為^l) 5且在37 C乾燥4小時。感測器隨後可儲存於4它。 經製備的感測器隨後可在PBS中清洗,且一經生物素 化抗體的/谷液係共扼至被施加至工作電極的相關酵素(譬 如,對於碳電極為3(^L或對於USL聚哒咯電極為3μί如前 述)’或感測器浸於經生物素化抗體酵素溶液中,且孵育一 10期間以容許鏈菌素與抗體上的生物素終端之交互作用。 作一沖洗以移除未束缚抗體之後,感測器將使用於測 定中如上述。 可利用該技藝所知的任何專屬套組或方法使抗體被生 物素化。 15範例2 —用於偵測基材且因此包括酵素性活動之感測器及方 法的發展 感測器範例1如所描述般地製備,其中瓦⑺"p_半乳糖 苷酶直接地(被動地吸附)或經由一鏈菌素_生物素連結而被 束缚至工作電極。施加至感测器之β_半乳糖苷酶的濃度依 20 需要而變動。 感測為、被固持在用於測置個別感測器的電位之裝置 (英國 Unit 2 Suite 2, Abbey Bams,Duxford R0ad,Ickleton, Cambridge CB 10 1SX之USL所製造)的個別通路中。總共 12個感測器可被固持在此裝置中,故能夠具有6組的控制及 47 200817520 測試讀數。各感測器係設置於一96井聚丙烯板的一井中。 來自各感測器之電性輸出係利用U s L提供的專屬軟體被測 量及顯示。 基於評估範例1所描述方法製備的感測器效能之目 5的’各者係浸於所想要濃度的2x酵母生長媒體中之X-Gal (5-演-4-氯-叫卜朵半乳糖)中(依需要稀釋於2\酵母胰化 蛋白中之50mg/mL X-Gal物流溶液)。生長媒體中之X-Gal 的濃度依需要而變動。 第一系列的實驗中,利用從2pg/mL至10μ§/ηιΙ^β_半乳 10糖苷酶濃度來調查在製備期間施加至感測器之不同濃度的 β-半乳糖苷酶之效應。在感測器浸於5(^g/mL X-Gal之後監 測各pg/mL處理之工作電極處所觀察的電位之變化。結果顯 示於第3圖中。 另一系列的實驗中,相較於β-半乳糖苷酶經由一鏈菌 15素·生物素連結被束缚至感測器之情形,調查β-半乳糖苷酶 藉由直接/被動吸附被束缚至感測器之效應。結果顯示於第 4Α及4Β圖中··第4Α圖提供浸於包含5(^g/mL X-Gal的2χ酵 母胰化蛋白生長媒體中三分鐘之後位於各電極處的電位之 柱狀圖(對於各β-半乳糖苷酶束缚方法/處理一式二份)。第 20 4Β圖顯示對於第4Α圖所代表資料所獲得之原始電位線 跡;第4B圖中的經充填三角形代表唯一的鏈菌素_生物素樣 本’而中空符號代表〇pg/mL X-Gal控制;其餘(經充填)符號 代表經直接束缚/被動吸附的樣本。結果顯示β_半乳糖苦酶 可藉由被動吸附被直接地束缚至經聚吆咯塗覆的感測器, 48 200817520 相較於β半乳糖♦酶藉由一鏈菌素_生物素連結被束缚至感 測為之情形並無顯著的活動損失。
第4Α及4Β圖所提供的結果亦顯示當一包含丨75^g/mL β-半乳糖普酶之溶液在其製備期間施加至感測器時,電極 5幾乎被β_半乳糖苷酶所飽和。 一後續系列的實驗中,進一步調查藉由β_半乳糖苷酶 的感測為飽和,施加至感測器之溶液中的β_半乳糖苷酶在 其製備期間係變動於〇至100單位/mL。第5圖顯示,藉由一 新批次的β-半乳糖苷酶(未經生物素化),塗覆緩衝液中只 10需要6U/mL來提供最大值輸出。此數字亦顯示,β—半乳糖苷 酶實質地未受到儲存於乾冰上三天所影響。 利用6U/mL β-半乳糖苷酶製備的電極係具有近似 8χ10_5單位/電極的活動(每分鐘/電極所轉換的gmoles基 材,工作電極表面積=〜1.3mm)。 15 下一系列的實驗中,對於經界定媒體(EZRich媒體-F.C.
Neidhardt,P.L.Bloch,及D.F.Smith (1974)“腸桿菌之培養媒 體”,J Bacteriol. 119(3) : 736-747 ; http : //www. genome.wisc.edu/resources/protocols/TekNova.htm) 中之一範圍的X-Gal濃度(0-100pg/mL)之6 U/mLp-半乳糖芽 2〇 酶感測器獲得一校準曲線。結果顯示於第6圖中(資料顯示 為以lOOpg/mL X-Gal所達成的全尺度偏向之%),其顯示這 些條件下從約2.5pg/mL至約85pg/mL X-Gal範圍中之這些 電極的良好敏感度。 另一系列的實驗中,調查β-半乳糖苷酶塗覆/束缚時間 49 200817520 對於所產生感測器的所產生敏感度之效應。使用非生物素 化卜半乳糖苷酶、及直接/被動吸附來將β_半乳糖苷酶束缚 至感測器。如第7Α及7圖所示,1〇分鐘的塗覆時間足以可靠 地以β-半乳糖苷酶來飽和電極表面。 5 另一實驗中,調查用以將β-半乳糖苷酶塗覆在感測器 上之方法的可重覆性(β_半乳糖苷酶藉由鏈菌素-生物素連 結被束缚至感測器)。將7.5pg/mL經生物素化β-半乳糖苷酶 如範例1所述施加至11感測器且隨後浸於包含5(^g/mL X-Gal之2x酵母胰化蛋白生長媒體中。第8A及8B圖所示的 10 結果顯示β -半乳糖苷酶塗覆程序(鏈菌素-生物素連結方法) 之很好的可重覆性,特別如所有η感測器的均值/平均數之 小標準差柱、及對於各感測器的電位變化之原始資料線跡 所示(第8Β圖)。 另一系列的實驗中,調查當感測器用來順序性讀取樣本 15 時之基材攜載的效應。如第9Α及9Β圖結果所示,基材攜載可 在所獲得讀數中導入顯著的誤差,特別是當一感測器從一具 有高基材濃度之樣本移至具有低基材濃度者時尤然。 這些研究的過程中:
-決定感測器上之β-半乳糖苷酶的飽和濃度一施加至工作 20 電極的溶液中之β-半乳糖苷酶的濃度可被削減至6U/mL 同時仍留有全尺度之電位的變化; -決定出無基材控制上之X_Gal的最小可偵測濃度,使用經 β-半乳糖苷酶飽和的感測器,可偵測低於〇e5pg/mL之 X_Gal濃度; 50 200817520 將β七1糖__在電極上之π方法,經由-键囷素-生物素束缚對之連結及被動吸附來提供經聚咕 洛塗覆的讀魏之㈣難的縣; 、 亦孑估%疋化酵素之方法,酵素可乾燥於感測器表面且 5儲存於一保4層(諸如後塗覆(Postcoating)緩衝液,得自 澳州比士蘭湯斯維爾的丁哪此)底下處於代至少數 日β·半祕芽酶亦顯示為可抵抗儲存於乾冰上三天; -以遇來自個別感測器的偏差輸出之部分問題,可能由於 感測器表面的不-致塗覆或聚料的電化沉積,其導致 1〇 Μ器輸ώ的變異性增高,降低了敏感度及可重覆性。 範例3-可供束缚β_葡萄㈣酶或卜糖㈣之感測器 感測器如範例1所述製備,其中來自杏仁之Ε —·的β· 葡萄普酸酶或β·糖苦酶直接地束缚/吸附至工作電極。施加 至感測器之酵素的濃度依需要而變動。 15 感測器被固持在一用以測量個別感測器電位之裝置 (英國 Unit 2 Suite 2, Abbey Barns,Duxford R0ad,Ickleton,
CambridgeCB 10 1SX的USL所製造)的個別通路中。此裝置 中可固持總共12個感測器,其能夠有6組的控制及測試讀 數。各感測器設置於一96井聚丙烯板的一井中。利用uSL 20提供的專屬軟體來測量及顯示來自各感測器的電性輸出。 對於评估如範例1所述方法製備之感測器的效能之目 的,β-葡萄苷酸酶感測器浸於以所想要濃度溶解於2义酵母 胰化蛋白生長媒體中的X-GlcA(5_溴-4-氯_3-⑸哚_p-D_葡萄 苷酸化物)中,且β-葡萄糖苷感測器浸在以所想要濃度溶解 51 200817520 於2χ酵母胰化蛋白生長媒體中的x_Glc(5-溴-4-氯朵 -β-D-糖苷)中。 弟10A圖所示的結果顯示來自又_(^八被β_葡萄苦酸 酶的耗盡之初步結果。隨著束缚至感測器的酵素濃度降低 5而觀察到信號減小,但輸出/敏感度不如β-半乳糖苷酶一 樣咼。藉由一特定交互作用之酵素在感測器上的定向應可 將其改良。 由於可以β-糖苷酶濃度減小來看出信號的差異,第1〇Β 圖所示的結果係指示出感測器亦可藉由使β_糖苷酶與其束 10缚來運作。這些初步實驗的結果並不理想,但對於酵素濃 度、定向及測定條件之進一步運作應可改良結果。 範例4 -樣本中之酵素活動的電化偵測 第11圖中提供根據本發明之用於偵測酵素性活動之方 法背後原理的示意圖(以經分泌或細胞表面細菌性酵素來 15 示範)。 對於一控制測量,一感測器浸於400μί之不含基材(控 制)的溶液中,且三分鐘之後,感測器的輸出讀取90s,其中 具有一初始l〇s OmV電位自調器鉗(potentiostat clamp)。位 於90s的讀數為“基線”讀數。 20 如下獲得一“測試”讀數: 一包含初始基材濃度H]”及含有相關酵素的樣本之 反應混合物(但其他則與“基線”讀數者為相同之組成物)係 孵育一設定時間量。一感測器隨後浸於40μί的反應混合 物,其已被選用性地過慮或作其他處理以移除或去活化酵 52 200817520 素,且三分鐘之後,感測器的輸出讀取90s,其中具有一$ 始lOsOmV電位自調器钳。位於9〇s的讀數為“測試”讀數仞 . 輸出表示如下: “測試基線差異” 5 為了量化“測試”樣本中被酵素所耗盡且以此差異作代 , 表之基材量,該差異可與利用如下述的一或多個標準判別 • 式所製備之一標準曲線作比較,其中自各“標準”讀數減☆ 基線讀數。 " : 適當“標準”可藉由將已知量的基材溶解於與“基線,,判 1〇別式所使用者為相同組成物之一溶液中或藉由孵育一或多 個包含已知酵素活動量及一初始基材濃度[Si]之溶液歷時 與對於“測試’’樣本所用者相同的設定時間期間來製備。一 感測器隨後浸於“標準,,反應混合物中,其已被選用性地過 濾、或作其他處理以移除或去活化酵素且,三分鐘之後,感 15測器的輸出讀取90s,其中有一初始l〇s 〇mv電位自調器 ' 鉗。位於90s的讀數為“標準,,讀數。 、· 若使用單一已知酵素活動作為一“標準”,測試樣本中 的酵素活動可被計算為: ” '、貝,1古六、"一”美錄” ^?票_"-"1:線"χ標準樣本中的酵素性活動量 2〇 若已使用單一已知濃度的基材作為一“標準,,,留在樣 本中的基材量可被計算為: «穌㈣錄量或濃度 53 200817520 藉由將所耗盡基材莫耳數除以原始反應混合物孵育時 間的長度,該量/濃度及原始出現於反應混合物中的量/濃度 之間的差異可能隨後等於所耗費基材的莫耳數,且隨後等 於酵素性活動量(譬如,莫耳/分鐘,或更一般來說微莫耳/ 5分鐘)。施加一其中製備基材濃度相對於“標準,,-“基線,,值的 一校準曲線、且留在測試樣本中的基材量相對於此曲線被 讀取之類似程序。 範例5-樣本中之諸如大腸菌等細菌的電化偵測 感測器如範例1所述製備,其中尺卜半乳糖苷酶 10直接地(被動地吸附)或經由一鏈菌素-生物素連結被束缚至 工作電極。施加至感測器之β-半乳糖苷酶濃度係依需要 而變動。 感測器被固持在一用以測量個別感測器的電位之裝置 (由英國的 Unit 2 Suite 2, Abbey Bams,Duxford R0ad, 15 Ickleton,Cambridge CB 10 1SX的USL所製造)的個別通路 中。此裝置中可固持總共12個感測器,其能夠具有6組的控 制及測試讀數。各感測器設置於一96井聚丙烯板的_井 中。利用USL提供的專屬軟體來測量及顯示來自各感測器 的電性輸出。 20 為了偵測測試樣本中細菌的存在,樣本在37°C於包含 50pg/mLX-Gal(5•溴-4-氣-3-吲哚-β-半乳糖)之2χ酵母胰化 蛋白生長媒體中孵育2至7小時之間。這在5mL聚丙烯小瓶 中以225 rpm搖晃進行以曝氣。一份隨後在— l 微量離 心管中被離心以移除細菌細胞(12,〇〇〇g,2分鐘)且如下利用 54 200817520 本發明的一感測器對於殘留物或未耗盡χ—Gal的存在作浮 表測試: -將感測器浸於400μί的2x酵母胰化蛋白細菌生長媒體中 (正控制,代表X-Gal的總耗盡) 5 --等待3分鐘。 -讀取90s,其中具有一初始l〇s OmV電位自調器钳。 -90s的讀數為“基線”讀數。 -將感測器移至400μί的經過濾耗盡基材(2YT+5〇pg/mL開 始濃度的X-Gal) 10 -等待3分鐘。 -讀取90s ’其中具有初始l〇s OmV鉗。 -90s的讀數為“耗盡”讀數。 -將感測器移至負控制(現今使用2YT+50(Ig/mL,較低的濃 度應可改良敏感度) 15 -等待3分鐘。 -讀取段3及7。 -最後讀數為“最大值”。 輸出表示為· (最大值-基材K經耗盡-基線> “差異,, 20 差異《最大值-基線)xl00=身為全尺度偏向(FSD)的%之 輸出的下降 結果亦可以電位代表·原始或經調整(與一適當控制組 作比較)。 亦可在相同測定條件下相對於對於已知濃度的細菌所 55 200817520 獲付結果來讀取結果藉以在生長媒體中醉育之前估計存在 於樣本中之細菌細胞的初始接種體。 第12至17圖所示的結果係顯示利用五C0/z·株ATCC 11775或野型株365的孵育時間之如上述對於不同初始接種 5體所進行的實驗之結果,且亦顯示初始接種體尺寸及細胞 增殖對於感測器之細菌偵測的敏感度之效應。 利用一其上可經由一鏈菌素_生物素連結供β_半乳糖苷 酶束缚之感測器來獲得第12圖所示的資料,利用可供β-半 乳糖苷酶被動吸附之感測器來獲得其餘資料。 10 部分實驗中觀察到高負控制讀數,突顯出若想要定量 測定則需要進行適當控制。 達成的最高敏感度係位於500μί的湯液中之500及1000 對數期五.co//之間,但在反應混合物孵育5小時之後已經達 成低達約100細胞的偵測。 15 進一步工作顯示出,至少對於已供一 β-半乳糖苷酶 (6U/mL)溶液施加之USL聚嗞咯電極,敏感度在約2.5pg/mL 至約60-85pg/mL的範圍中為最大(譬如請見第6圖)。為此, 若目標細菌具有高的預期濃度,可使用高於50(Ig/mL的 X-Gal濃度,諸如100吨/11^的又-〇&卜若目標細菌具有低的 20預期遭度,5〇gg/mL的X-Gal可為更適當的開始濃度。 進一步工作亦已顯示,若包含此等細菌的樣本以用於 誘發β-半乳糖苷酶表示之IPTG作預處理則對於大腸菌的伯 測將達成較均勻結果。因此,5μΜΙΡΤΘ可被包括在樣本媒 體及負控制媒體中,以誘發β-半乳糖苷酶活動而不顯著壓 56 200817520 抑來自感測器的信號(請見範例6,如下)。 第18圖顯示對於進入包含5μΜ IPTG及1〇〇或6(^g/mL 的2x酵母胰化蛋白生長媒體中之細菌的一給定接種體之經 正常化%下降的差異。與第6圖一致,非線性線在60|Ig/mL 5 X-Gal所接種細菌之較低初始接種體比起lOOpg/mL X-Gal 中提供更大的%下降,但隨著初始細菌接種體增加,配合 線將對於lOOpg/mLX-Gal線變得較陡峭。 範例6-干擾因素 此處所描述的實驗中,如範例1所描述地製備包含束縛 /及附至工作電極的β-半乳糖普酶之感測器,且如範例2所描 述取得測量。所有反應混合物係由包含 酵母胰化蛋白生長媒體、及如下述的額外物質所構成。 第19圖顯示pH變化對於感測器的敏感度之效應。若讓 培養留待生長大於4小時左右,媒體的pH可下降最高達到 lpH單位或更多,這對於感測器輸出具有小效應,如同從培 養後往後尖凸最高達到5 〇 pg/mL X-Gal的一總耗盡樣本所 獲得之降低信號所見(相較於對於其中沒有細菌細胞的尖 凸狀樣本所達成之回應)。 生長/測定媒體的較好緩衝、或一經界定媒體、或小於 4小時的培養時間可移除此問題。 第20圖顯示一檢查SDS的效應、一細菌的電位滲透器 (^曰加視F半乳糖苷酶活動/細胞)及聚σ必洛中之一用以更 改包極電位的摻雜物且減小來自感測器的整體信號之實驗 的結果。雖然生長/測定媒體中的ImM SDS確實降低了敏感 57 200817520 度,所觀察的電位之變化(相較於1 mM SDS正控制)仍與初 始接種體尺寸成正比。 第21及22圖顯示反應混合物中存在乳糖及IPTG(分別) 對於X-Gal偵測之效應。資料顯示,乳糖及IPTG以一濃度因 5 變性方式影響感測器輸出。由於乳糖及IPTG係為用於β-半 乳糖苷酶的基材且因此預期與X-Gal競爭酵素的活性部位 故其為預期外的情形。由於這些化合物可用來誘發大腸菌 中β-半乳糖苷酶的表示以增強稀釋樣本中之其偵測,乳糖 及IPTG的存在可能是偵測大腸菌之一項議題。 10 第22圖顯示對於兩分離的實驗之結果,一者測試 10mM、5mM、2.5mM、1.25mM及0.625mM濃度的IPTG對 於X-Gal (50pg/mL)的偵測之效應,另一者測試ImM、 0.5mM、0.25mM、0.125mM及0.062mM濃度的 IPTG對於 X_Gal(50pg/mL)的偵測之效應。 15 範例7-對於大腸菌存在之水樣本的測試 獲得一代表性水樣本’其被選用性地次分取樣 (sub-sampled)、及濃縮,如果且依需要,然後混合於包含 所想要濃度的基材之一等容積的雙重強度(2x濃度)細菌生 長媒體以形成一反應混合物。這可為一原始媒體、一選擇 20 性媒體或一經界定媒體,以產生基材(現今為X-Gal {5-溴-4-氯-3-吲哚β-半乳吼喃糖苷}但可使用藉由β_半乳外b喃糖苷 酶的新陳代謝提供一電化信號之任何基材)的迅速生長及 新陳代謝。 反應混合物在37°C孵育一可依據使用需求(亦即,測定 58 200817520 的敏感度將隨著培養時程增加而增高)作調整之時間期間 (諸如〜L5小時)。一不含細菌之負控制(或一含有已知細菌 數之控制)或兩者係在相同條件下孵育。 可能隨後域例4或範例5所描述之一方法來決定測試 5及控制培養皆被過濾以移除細菌且反應混合物中之大腸菌 數(孵育開始時)。 其他相關酵素或微生物之偵測 β_半乳糖苷酶/X-Gal:可對於一給定濃度產生一較大信 號之β-半乳糖苷酶利用不同基材來改用用以在對於水中大 1〇腸菌的所提出測定中從電化感測器產生信號之酵素/基材 系統。酵素本身可由其他種特定酵素所取代,亦即葡萄 4酉文酶特別疋對於五· C0/z·及一病原體的任何其他酵素診斷 或在曝露於其基材時產生一電性信號之指示器種,其可在 一重組系統中被表示以將其生物素化而容許經鏈菌素塗覆 15 的感測器上之特定固定作用。 範例8-束缚至以碳為基礎的電極/感測器之酵素 碳膏電極(型C10903P1及C2000802P2)係購自葛溫特電 子材料有限公司(Gwent Electronic Materials Ltd,Monmouth House,Mamhilad Park,Pontypool,NP4 〇HZ,United 20 Kingdom)。 β-半乳糖苷酶 感測器係塗覆0·1Μ磷酸鹽緩衝液pH 7.3中之6U/mL β-半乳糖苷酶、或單獨的磷酸鹽緩衝液pH 7.3(控制組)。將 30pL的任一溶液直接地施加至工作電極,且在室溫孵育一 59 200817520 小時。藉由移液管來移動緩衝液且隨後立即將其移除,隨 後以200μΙ^|酸鹽緩衝液清洗感測器。 感測器隨後藉由將2〇〇μί的各測試溶液以移液管移至 電極上來測試包含順序性施加至電極之增加濃度的X-Gal 5 之2x酵母胰化蛋白(2YT)湯液之回應,而確保參考電極之覆 蓋。在施加樣本之後60秒以一毫伏特計來取得讀數。 感測器以包含下個[較高]X-Gal濃度的2YT湯液沖 洗’然後將200pL的該2YT X-Gal樣本施加至感測器且如前 測量。 10 第23A及23B圖顯示對於給定X-Gal濃度(〇· 1 〇(^g/mL) 之對於各碳膏電極類型所達成之回應。 脲酶 感測器藉由將30μί之0.2M磷酸鹽緩衝液pH 71中的 295U/mL脲酶、0.2M磷酸鹽緩衝液pH 7.1中的29.5U/mL腺 15酶、或單獨的磷酸鹽緩衝液PH7.1 (控制)直接施加至工作 電極而被塗覆,且在RT孵育1小時。感測器藉由移液管將 200μί的構酸鹽緩衝液移動於其上然後立即予以移除而被 該緩衝液清洗。 感測裔隨後藉由將200μΙ^的各測試溶液以移液管移至 電極上來測試包含順序性施加至電極之增加濃度的腺 (O-lOmg/mL脲)之緩衝液的樣本之回應,而確保參考電極之 覆蓋。在施加樣本之後60秒以一毫伏特計來取得讀數。 感測器隨後以下個[較高脲濃度]樣本沖洗,然後將 20C^L的該樣本施加至感測器且如前作測量。 200817520 第24A及24B圖顯示對於給定脲濃度0mg/mL)之對 於各碳貧電極類型所達成之回應,其中包含三個不同脲_ 濃度。 將"T瞭解雖然此處已以示範性質描述本發明的一特定 5實施例,可作出不同修改而不脫離由申請專利範圍所界定 之本發明的精神與範圍。 【圖式4簡罕^软^明】 第1圖提供本發明的一方法中之一電極束缚式酵素的 作用模式之示意圖,其中酵素被動地吸附至電極的表面。 10將被偵測的相關酵素以虛線顯示於一箱中以顯示酵素在感 測器與反應混合物接觸時可能未實際出現於反應混合物中 之事實; 第2圖提供對於增加濃度的β-半乳糖苷酶G-iOpg/mL) 浸於2x酵母胰化蛋白生長媒體中之一恆定濃度的5_溴_4_氯 15 _3_吲哚β·半乳吡喃糖苷(X-Gal-50pg/mL)之電極的飽和之 本發明的一工作電極與一參考電極之間的電位差隨著時間 之一圖形; 第3圖提供本發明的一工作電極與一參考電極之間的 電位差隨著時間之圖形,其中:第3A圖一 1000ng/mL β-半 20 乳糖苷酶施加至電極且浸於2χ酵母胰化蛋白生長媒體中之 增加濃度的5-漠-4-氣-3-吲哚β-半乳吡喃糖苷 (X-Gal-1.5-100pg/mL);第 3Β 圖-i〇〇〇ng/mL β-半乳糖苷酶 施加至電極且浸於2χ酵母胰化蛋白生長媒體中之2倍稀釋 的5-溴-4-氣-3_吲哚p_D_半乳吡喃糖苷 61 200817520 (X-Gal_5(M).625^/mL);第冗圖·則就p半乳糖普酶施 加至電極且浸於2x酵母胰化蛋白生長媒體中之減小濃度的 5-漢-4-氯-3-十朵β-D-半乳听喃糖普(x_GaM㈣吨就);及 第3D圖-7500ng/mL β-半乳糖苦酶施加至電極且浸於2講 5母胰化蛋白生長媒體中之減小濃度的5务心氯_3令朵卜D_ 半乳吡喃糖苷(X-Gal-10_0pg/mL)。 第4圖顯示本發明的一工作電極與一參考電極之間的 電位差之結果,其中工作電極包含藉由不同部件或以不同 數里加加至電極之生物素化β_半乳糖苷酶,如下·· 10 7500ng/mL生物素化β·半乳糖苷酶經由束缚至電極表面的 鏈菌素施加至電極;7500ng/mL生物素化β-半乳糖苷酶被動 地束縛至電極表面;7500ng/mL生物素化β-半乳糖苷酶被動 地束缚至電極表面;3250ng/mL生物素化β-半乳糖苷酶被動 地束缚至電極表面;175〇ng/mL生物素化β-半乳糖苷酶被動 15地束缚至電極表面;浸於2χ酵母胰化蛋白生長媒體中之 5(^g/mL的5-溴-4-氯-3-吲哚β-D·半乳吡喃糖苷中。第4Α圖 以柱狀圖形式提供結果而第4B圖提供電位變化隨著時間之 原始資料(經鏈菌素束缚之β_半乳糖苷酶結果係以經充填三 角形代表,而未充填符號代表〇pg/mLX-Gal控制組); 20 第5圖提供一柱狀圖,顯示製備工作電極之後或製備工 作電極前β-半乳糖苷酶在乾冰上作三天儲存之後當浸於 5(^g/mL X_Gal中時不同濃度的未經生物素化β-半乳糖苷 酶施加(直接地,被動地)至工作電極之結果; 第6圖顯示對於塗覆有6U/mL β-半乳糖苷酶且曝露於 62 200817520 一範圍的X-Gal濃度(經界定媒體中介於l〇〇(^G/mL至 OpG/mL)之經絲網列印聚嗞哈感測器的感測器校準圖形。各 柱係代表一式三份的讀數,附有誤差柱。輸出係表示為全 尺度偏向中的%下降;
5 第7圖顯示以30U/mL β-半乳糖苷酶對於浸入50pg/mL X-Gal中時之電極所記錄的電位差之增加時間量(相對於一 參考電極)之孵育工作電極的結果。第7A圖為顯示浸於 5(^g/mL X-Gal中近似3分鐘之後對於各電極之所記錄的電 位差(一式二份的讀數,附有誤差柱)之柱狀圖,而第7B圖 10提供在自其取得最大讀數之工作電極浸於5(^g/mL X-Gal 中之後隨著時間經過之電位差的第一組讀數之原始資料; 第8圖顯示一對於在2χ酵母胰化蛋白生長媒體中浸於 5(^g/mL X-Gal中之根據本發明的1丨感測器之可重覆性研 究的結果,已藉由將一包含7.5pg/mL經生物素化β_半乳糖 I5苷酶的溶液施加至工作電極一小時來製備感測器。第8Α 圖顯示浸於gg/mL X-Gal中之後近似3分鐘對於各電極之經 正常化電位差(相對於〇 pg/mL X_Gal控制)的柱狀圖,而第 8B圖提供工作電極浸於5〇 pg/mL x_Gal中之後隨著時間經 過對於電位差之原始資料; 20 冑9圖顯示基材的繼續存在(㈣y叫對於根據本發 明的感測n賴得賴之精確度之效應。圖為對於六 [減小]濃度的X-Gal (黑柱)所決定的電位差(mv)之柱狀 圖,其後電極固持件被倒置然後以相反次序來測定六 濃度(影線狀柱)。第犯圖顯示對於各對感測器由於基材繼 63 200817520 續存在所導入之誤差; 第ίο圖顯示對於包含β_葡萄苷酸酶(第10A圖)或包含卜 葡萄糖苷酶(苐10B圖)之本發明的感測器之所獲得的結果; 第11圖提供根據本發明的細菌偵測測定之示意圖。基 5材顯示為經充填二角形而細菌細胞顯示為具有一管腔之卵 形; 第12圖提供一圖形,其顯示5-溴-4_氣-3-0引哚β-D-半乳 吼喃糖苷的細菌耗盡導致較低的感測器輸出:全程採用 15pg/mL 5-溴-4-氣_3•吲哚β-D-半乳吡喃糖苦,其中有 10 0-5xl06五.cW細胞(ATCC 11775)及一“無基材,,控制組; 第13A及13B圖顯示以(及因此藉由下列之混合物中 X-Gal的耗盡)減小初始接種體的五·μ// ATCC 11775的反應 混合物孵育之後對於X-Gal之反應混合物的測定所獲得的 結果,結果被顯示為全尺度偏向的%降低(相對於〇細菌細胞 15 控制)。第13A圖-1·2χ107至1·2χ105細胞/mL歷時三小時。第 13B圖-3·7χ105至3·7χ102細胞/mL歷時五小時。反應混合物 中之X_Gal的初始濃度為2x酵母胰化蛋白生長媒體中之 50pg/mL ; 第14A及14B圖顯示包含(且因此藉由下列之混合物中 20 X_Gal的耗盡)增加初始接種體的尺ATCC 11775之反應 混合物孵育之後(以包含β-半乳糖苷酶之根據本發明的感測 器)對於X-Gal之反應混合物的測定所獲得的結果。在包含 50pg/mL X-Gal之2x酵母胰化蛋白生長媒體的初始接種之 後2小時後直到6小時為土每小時採取樣本。結果提供為所 64 200817520 觀察之%電位差降低(相對於〇細菌細胞控制)。第14B圖的資 料代表對於各初始接種體之一式二份的結果; 、 第15A至15C圖顯示對於浸於5〇|Llg/mL x_Gal中4小時 之後如根據本發明的感測器(包含束缚至工作電極之卜半乳 5糖苦酶)所決定從所觀察的%電位差降低(相對於〇細菌細胞 控制)來決定初始樣本細胞濃度(對於五·⑺"ATCC 11775)所 獲得的校準曲線; 第16圖顯示在包含5(^g/mL的2χ酵母胰化蛋白生長媒 體中孵育4小時之後以一式二份的減小初始接種體的野型 1〇株365之反應混合物孵育之後對於X-Gal之反應混合物的測 定(藉由包含β-半乳糖苷酶之根據本發明的感測器)所獲得 的結果。以所觀察的%電位差降低(相對於〇細菌細胞控制) 來提供結果。 第17圖顯示在包含50pg/mL X-Gal的2χ酵母胰化蛋白 15生長媒體中5小日守解月之後以(及因此藉由下列之混合物中 X-Gal的耗盡)一式二份之野型株365的初始接種體的系列 稀釋之反應混合物的孵育之後對於X_Gali反應混合物的 測定(藉由包含β-半乳糖苷酶之根據本發明的感測器)所獲 得的結果。結果提供為所觀察的%電位差降低(相對於〇細菌 20細胞控制)。第16圖亦顯示五小時孵育之培養中的培養i (40,000cfu/mL初始接種體)及4 (40cfu/mL初始接種體)中的 細胞數; 第18圖顯示對於進入包含用來作為基材之5μΜ IpT(J 及100或60pg/mL X-Gal的2x酵母胰化蛋白生長媒體中之一 65 200817520 給定接種體之經正常化%感測器輸出下降的差異; 第19圖顯示使用包含束缚至工作電極的β_半乳糠苷 酶之根據本發明的感測器之細胞培養期間的pH減小對於 X-Gal測定所獲得讀數的敏感度之效應; 5 第20圖顯示使用包含束縛至工作電極的β-半乳糖苷 酶之根據本發明的感測器之1 mM十二烷基硫酸鈉(SDS)對 於X-Gal測定所獲得讀數的敏感度之效應; 第21圖顯示使用包含束缚至工作電極的β_半乳糖苷 酶之根據本發明的感測器之反應混合物中出現的乳糖對於 10 X-Gal測定所獲得讀數的敏感度之效應; 第22圖顯示使用包含束縛至工作電極的β_半乳糖苷 酶之根據本發明的感測器之反應混合物中出現的異丙基 -β-D-硫代半乳吡喃糖苷(IPTg)對於X-Gal測定所獲得讀數 的敏感度之效應; 15 第23A及23B圖顯示使用兩型的經絲網列印碳膏電極 來測量X-gal濃度,其中β_半乳糖苷酶以6U/mL及〇u/mL被 吸附至感測器表面。以一毫伏特計來讀取輸出。 第24A及24B圖顯示使用兩型的經絲網列印碳膏電極 來測量脲濃度,使用以所顯示三種濃度吸附至感測器表面 20 之脲酶。以一毫伏特計來讀取輸出。 【主要元件符號說明】 101···工作電極 103…導電聚合性材料 102a,102b…第二/感測器束缚 104…基材 式酵素 105…產物 66 200817520 106a,106b…電傳導線 1〇8· 107···偵測器 1〇9· •反應混合物 •參考電極 67
Claims (1)
- 200817520 十、申請專利範圍: 1. 一種用於偵測一樣本中的一相關酵素量之方法,包含: (a) 孵育一包含該樣本及可被該酵素作用於其上的 至少一基材之反應混合物; (b) 在下列任一者中使一電化感測器接觸於該包含 該樣本之反應混合物: (i) 該反應混合物的一選定孵育時間之後或 (ii) 與製備該反應混合物同時或立即之後, 其中該感測器包含一其中已固定一第二酵素或可 供其固定之工作電極,其中該第二酵素能夠作用在一選 自該至少一基材及一導因於該相關酵素作用在該至少 一基材上之產物的一或多者之物質上;其中該第二酵素 作用在該至少一基材或產物上係導致該工作電極處的 電位之一變化; (c) 下列任一者: ⑴偵測在步驟(b)(i)中的該接觸後之該工作電極 處的電位之變化;或 (ii)決定在步驟(b)(ii)中的該接觸之後該工作電極 處的電位回到一實質穩態基線值所需要的時間期 間;及 (d) 從在步驟(c)(i)所偵測的電位之變化或在步驟 (c)(ii)所決定之時間期間來決定該樣本中之相關酵素 量。 2. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該相關酵素及該第 68 200817520 二酵素皆能夠作用在該相同基材上,且其中該相關酵素 存在於該反應混合物中係導致比起缺乏該酵素所觀察 者而言在步驟(C)中所觀察之電位的一較小變化或較小 時間期間。 3. 如申請專利範圍第1或2項之方法,其中該相關酵素係與 一微生物或微生物類型相關聯。 4. 如申請專利範圍第3項之方法,其中該微生物或微生物 類型包含大腸菌。 5. 如申請專利範圍第1至4項中任一項之方法,其中該相關 酵素為一β-半乳糖普酶或一β-葡萄普酸酶,且該基材 分別為一β-半乳糖或β-葡萄苷酸化物衍生物。 6. 如申請專利範圍第5項之方法,其中該相關酵素為一β-半乳糖苷酶。 7. 如申請專利範圍第5或6項之方法,其中該第二酵素為一 β-半乳糖苷酶。 8. 如申請專利範圍第1至7項中任一項之方法,其中該至少 一基材為一 5-溴-4-氯-3-,哚或一 5-溴_6-氯-3-叫|哚連結 式化合物。 9. 如申請專利範圍第8項之方法,其中該基材為一 5-溴-4-氣-3-叫丨哚β-連結式糖苷或葡萄苷酸化物。 10. 如申請專利範圍第8項之方法,其中該基材為5-溴_4-氯 -3-吲哚β-D-半乳吡喃糖苷。 11. 如申請專利範圍第1至10項中任一項之方法,其中該樣 本衍生自一水源且該相關酵素與一微生物或微生物類 69 200817520 型相關聯。 12. 如申請專利範圍第1至11項中任一項之方法,其中該反 應混合物在步驟⑻之後被過濾以自該混合物移除相關 酵素或細菌或相關酵素及細菌以被施加至該感測器。 13. —種用於偵測一樣本中的大腸菌之方法,包含: (a) 將育一包含該樣本及一包含一 β-半乳糖或β-葡 萄苷酸化物衍生物的基材之反應混合物; (b) 下列任一者中使一電化感測器接觸於該包含該 樣本之反應混合物: (i) 該反應混合物的一選定孵育時間之後或 (ii) 與製備該反應混合物同時或立即之後,其中 該感測器包含一其中已固定一酵素或可供其固定之 工作電極,其中該酵素能夠作用在該基材上;其中該 感測器束縛式酵素作用在該基材上係導致該工作電 極處的電位之一變化; (c) 下列任一者: ⑴偵測在步驟(b)(i)中的該接觸後之該工作電極 處的電位之變化;或 (ii)決定在步驟(b)(ii)中的該接觸之後該工作電極 處的電位回到一實質穩態基線值所需要的時間期間; (d) 下列任一者: (i)在步驟(c)(i)所彳貞測的電位之變化與下列作比 較:對於一不含大腸菌之控制反應混合物所偵測的電 位之變化;對於一已知大腸菌數所偵測的電位之變 70 200817520 化;一對於電位的變化vs.細菌數之校準曲線;或其任 何組合;或 (ii)將步驟(c)(ii)所決定的時間期間與下歹ij作比 較:對於一包含一已知大腸菌數的反應混合物使該工 作電極處的電位回到一穩態基線值所費的時間期 間;或一對於該工作電極處的電位回到一穩態基線值 所費的時間期間VS.反應混合物中的細菌數之校準曲 線;及 (e)從步驟(c)(i)所觀察之電位的變化或步驟(c)(ii)所 觀察之時間期間來決定該樣本中的大腸菌量。 14. 如申請專利範圍第13項之方法,其中該酵素為一β-半乳 糖苦酶或一 β-葡萄苦酸酶。 15. 如申請專利範圍第13項之方法,其中該基材為一5_溴-4-氯-3-巧哚β-連結式糖苷或葡萄苷酸化物。 16. 如申請專利範圍第13項之方法,其中該基材為5-溴-4-氯-3-吲哚β-D-半乳吼喃糖苷。 17. —種電化感測器,其包令—其中已固定一酵素或已供該 酵素固定之工作電極,其中該酵素: ⑴能夠作用在一基材上,該基材係為其能夠被一相 關酵素作用在其上;或 (ii)其能夠作用在一導因於一相關酵素作用在一基 材上的產物上之一者;其中該相關酵素與一微生物或微 生物類型相關聯;其中該電極固定式酵素作用在該基材 或產物上係導致該工作電極處的電位之一變化。 71 200817520 18. 如申請專利範圍第17項之感測器,其中該相關酵素及該 電極固定式酵素皆能夠作用在該基材上。 19. 如申請專利範圍第18項之感測器,其中該電極固定式酵 素能夠作用在一β-半乳糖或β-葡萄苷酸化物衍生物上。 20. 如申請專利範圍第19項之感測器,其中該電極固定式酵 素係為一 β-半乳糖香酶或一 β-葡萄皆酸酶。 21. —種電化感測器,其包含一其中已固定一酵素或已供該 酵素固定之工作電極,其中該酵素能夠作用在一β_半乳 糖或β-匍詞誓酸化物衍生物上以產生該工作電極處的 電位之一變化。 22. 如申請專利範圍第21項之感測器,其中該酵素為一 β-半 乳糖苦酶或一 β-葡萄苦酸酶。 23. 如申請專利範圍第22項之感測器,其包含聚吆咯或一聚 吆咯塗層作為一導電材料。 24. 如申請專利範圍第23項之感測器,其包含一直接地吸附 至該聚嗞咯之β-半乳糖苷酶。 25. —種用於偵測一樣本中的一微生物或一微生物類型的 數量之裝置,該裝置包含接觸於或可接觸於一電位計之 至少一根據申請專利範圍第17至22項中任一項之電化 感測器。 26. —種用於债測一樣本中的一相關酵素量之方法,包含: (a) 孵育一包含該樣本及可被該酵素作用於其上的 至少一基材之反應混合物; (b) 使一第二酵素接觸於該反應混合物,其中該第二 72 200817520 酵素能夠作用在一選自該至少一基材及一導因於該相 關酵素作用在該至少一基材上之產物的一或多者之物 質上且其中該第二酵素作用在該至少一基材或產物上 係導致一工作電極處的電位之一變化;及 (C)該接觸之後一或多次债測該工作電極處的電位 及從所偵測的一或多個電位來決定該樣本中的相關酵 素量。 27· —種用於偵測一樣本中的一相關酵素的數量之方法,包 含: /匕 (幻衅育一包含該樣本及可被該酵素作用於其上的 至少一基材之反應混合物; (b)使一電化感測器及一第二酵素接觸於反應混合 物,其中該感測器包含-已在其中固㈣第二酵素^ 該第二酵素與其固定之工作電極,其中該第二酵素能夠 作用在-選自該至少-基材及一導因於該相關酵素作 用在該至少一基材上之產物的一或多者之物質上;其中 該第二酵素作用在該至少一基材或產物上係導致該工 作電極處的電位之一變化;及 ⑷在該接觸t後-或多次偵測該工作電極處的電 位及從該-或多個所價測電位決定出該樣本中的相關 酵素數量。 28· —種用於偵測一樣本中的大腸菌之方法,包含·· ⑻以-包含-β-半乳糖或_卜葡萄㈣化物衍生 物的基材在一反應混合物中孵育該樣本; 73 200817520 (b) 使一酵素接觸於該反應混合物,其中該酵素能夠 作用在該基材上,且其中該酵素作用在該基材上係導致 一工作電極處的電位之一變化;及 (c) 在該接觸之後一或多次偵測該工作電極處的電 位及從該一或多個所债測電位來決定該樣本中的細菌 數。 29. —種用於偵測一樣本中的大腸菌之方法,包含: (a) 以一包含一 β-半乳糖或β-葡萄苦酸化物衍生物 的基材在一反應混合物中孵育該樣本; (b) 使一感測器及一酵素接觸於該反應混合物,其中 該感測器包含一已在其中固定該酵素或已供該酵素固 定之工作電極,其中該酵素能夠作用在該基材上,且其 中該酵素作用在該基材上係導致該工作電極處的電位 之一變化;及 (c) 在該接觸之後一或多次彳貞測該工作電極處的電 位及從該一或多個所偵測電位來決定該樣本中的細菌 數0 74
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