TH7610C3 - How to detect macrobraciam virus Rosenbeji Ayanoidavirus (Macrobrachium rosenbergii nodavirus, MrNV) and the aforementioned diagnostic kits. - Google Patents

How to detect macrobraciam virus Rosenbeji Ayanoidavirus (Macrobrachium rosenbergii nodavirus, MrNV) and the aforementioned diagnostic kits.

Info

Publication number
TH7610C3
TH7610C3 TH803000211U TH0803000211U TH7610C3 TH 7610 C3 TH7610 C3 TH 7610C3 TH 803000211 U TH803000211 U TH 803000211U TH 0803000211 U TH0803000211 U TH 0803000211U TH 7610 C3 TH7610 C3 TH 7610C3
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
pcr
virus
mrnv
shrimp
primer
Prior art date
Application number
TH803000211U
Other languages
Thai (th)
Other versions
TH7610A3 (en
Inventor
สืบสิงห์ นางสาวรุ่งกานต์
มณฑาทอง นายสุดเขต
Original Assignee
นางสาวอรุณศรี ศรีธนะอิทธิพล
นายชาญชัย นีรพัฒนกุล
นางสาวอรกนก พรรณรักษา
Filing date
Publication date
Application filed by นางสาวอรุณศรี ศรีธนะอิทธิพล, นายชาญชัย นีรพัฒนกุล, นางสาวอรกนก พรรณรักษา filed Critical นางสาวอรุณศรี ศรีธนะอิทธิพล
Publication of TH7610C3 publication Critical patent/TH7610C3/en
Publication of TH7610A3 publication Critical patent/TH7610A3/en

Links

Abstract

DC60 (21/09/55) การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับการตรวจหาไวรัสแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส (Macrobrachium rosenbergii nodavirus, MrNV) ซึ่งเป็นโรคที่ทำให้กล้ามเนื้อกุ้งขาวขุ่น ลูกกุ้งระยะ โพสต์ ลาร์วี (post larvae) ไม่คว่ำตัว และตายทั้งในลูกกุ้งและกุ้งโตเต็มวัย โดยการประดิษฐ์นี้ได้จัดให้ มีการสร้างไพร์เมอร์ใหม่จำนวน 2 คู่ โดยคู่หนึ่งที่ตรวจหาไวรัสแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย ดาโนไวรัสร่วมกับไพรเมอร์ที่มีการเปิดเผยอยู่แล้ว ด้วยเทคนิควิธีรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ 2 ขั้นตอน แบบใช้หลอดพีซีอาร์หลอดเดียว (single tube nested PCR technique) ส่วนไพรเมอร์ที่สร้างขึ้น คู่ที่เหลือทำหน้าที่ควบคุมปฏิกิริยาภายในของพีซีอาร์ ซึ่งการตรวจหาไวรัสด้วยวิธีพีซีอาร์ร่วมกับการใช้ ไพรเมอร์ที่กล่าวนี้สามารถเพิ่มความไว ความแม่นยำของการตรวจได้มากขึ้น และลดโอกาสการ ปนเปื้อนเชื้ออื่นให้น้อยลง โดยใช้เวลาน้อยกว่า การใช้วิธีรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ขั้นตอนเดียว (single PCR) หรือ วิธีรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ 2 ขั้นตอน แบบใช้หลอดพีซีอาร์ 2 หลอด (two tube nested PCR technique) นอกจากนี้ยังได้ผลิตชุดตรวจหาไวรัสแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย ดาโน ไวรัส ขึ้นเพื่อความสะดวก รวดเร็วในการตรวจสอบ และราคาถูก ซึ่งการตรวจหาไวรัสแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส มีความสำคัญและจำเป็นต่อระบบการผลิตพ่อแม่พันธุ์กุ้งก้ามกราม การเลี้ยง กุ้งก้ามกราม ตลอดจนการตรวจสอบยืนยันผลิตภัณฑ์กุ้งก้ามกรามที่นำเข้าและส่งออกไปต่างประเทศ การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับการตรวจวินิจฉัยโรคแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส (Macrobrachium rosenbergil nodavirus, MrNV) ซึ่งเป็นโรคที่ทำให้กล้ามเนื้อกุ้งขาวขุ่น ลูกกุ้งระยะ โพสต์ ลาร์วี (post larvae) ไม่คว่ำตัว และตายทั้งในลูกกุ้งและกุ้งโตเต็มวัย โดยจัดให้มีการสร้างไพร์ เมอร์ของแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย ดาโนไวรัส และนำมาใช้กับวิธีรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ 2 ขั้นตอน แบบใช้หลอดพีซีอาร์หลอดเดียว (single tube nested PCR technique) ซึ่งมีความไว ความ แม่นยำมากขึ้น และใช้เวลาน้อยกว่า การใช้วิธีรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ขั้นตอนเดียว (single PCR) หรือ วิธีรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ 2 ขั้นตอน แบบใช้หลอดพีซีอาร์ 2 หลอด (two tube nested PCR technique) นอกจากนี้ยังได้ผลิตชุดตรวจวินิจฉัยแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย ดาโนไวรัส ขึ้นเพื่อ ความสะดวก รวดเร็วในการตรวจสอบ และราคาถูก โดยการตรวจวินิจฉัยโรคแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอ จิอาย โนดาไวรัส มีความสำคัญและจำเป็นต่อระบบการผลิตพ่อแม่พันธุ์กุ้ง การเลี้ยงกุ้ง ตลอดจนการ ตรวจสอบยืนยันผลิตภัณฑ์กุ้งที่นำเข้าและส่งออกไปต่างประเทศ DC60 (21/09/55) This invention is related to the detection of the macrobracium virus. Macrobrachium rosenbergii nodavirus (MrNV), a disease that causes the muscles of post larvae to turbulent white shrimp (post larvae) do not invert and die in shrimp and shrimp. Mature By this invention provided Two pairs of new primers were created, one of which checked for the macrobracic virus. Rosenbeji Eye Danovirus together with an already revealed primer With the reverse technique A 2-step PCR transcript utilizing a single tube nested PCR technique, a primer built. The remaining pairs control the internal reaction of the PCR. Which the virus detection method by PCR in conjunction with the use The primer mentioned here can increase sensitivity. The accuracy of the examination can be improved. And reduce the chance of Less contaminated with other infectious agents In less time Using the reverse method Transcript A single PCR or a two-tube reversible PCR technique uses two PCR tubes (two tube nested PCR technique). Macrobrachium virus Rosenbeji Ayadanovirus was raised for convenience. Fast to detect and cheap to detect Mac Cobra Chiam virus. Rosenbeji Ayanoidavirus is essential and essential to the lobster breeder's production system, lobster farming, and the verification of lobster products imported and exported abroad. The invention relates to the diagnosis of macrophages. Macrobrachium rosenbergil nodavirus (MrNV), a disease that causes the muscles of post larvae to turbid white shrimp (post larvae), do not invert and die in young shrimp and shrimp. Mature By arranging to create a prime McBruchiam's Mercedes Rosenberger Eyedanovirus and it is applied in reverse. A 2-step PCR transcript using a single tube nested PCR technique offers greater sensitivity and accuracy. And takes less time Using the reverse method Transcript One-step PCR or two tube nested PCR technique, 2-step reverse transcript or two-tube PCR technique has also been produced. Macrobraciam The Rosenbeji Eyedanovirus was established for the convenience, speed of detection and low cost, with the diagnosis of Macrobrachiamine Rosenburg Ayanoidavirus is vital and essential to the paternity production system. Shrimp breeder Shrimp farming as well as verification of shrimp products that are imported and exported abroad.

Claims (8)

1. ไพร์เมอร์ (primer) จำนวน 2 คู่ ที่ใช้สำหรับตรวจวินิจฉัยแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดา ไวรัส (Macrobrachium rosenbergil nodavirus, MrNV) ได้อย่างจำเพาะ ซึ่งประกอบด้วยลำดับ นิวคลีโอไทด์ ดังนี้ MrNV-F-N 5\'- GAT GTC GAT CAG TTA CTT AGG C-3\' MrNV-R-N 5\'- GTG AAA CTT CCA CTG GTG TAG-3\' MrNV18S-F 5\'- GAG CCA GAG GTA ATG ATA AAG A-3\' MrNV18S-R 5\'- GCT CTT AAT CTG TCA ATC CTT C-3\'1. Primers (2 pairs) used for diagnosing macrobracium Rosenbergiaanoda virus (Macrobrachium rosenbergil nodavirus, MrNV). Which consists of the nucleotide sequence as follows: MrNV-FN 5 \ '- GAT GTC GAT CAG TTA CTT AGG C-3 \' MrNV-RN 5 \ '- GTG AAA CTT CCA CTG GTG TAG-3 \' MrNV18S-F 5 \ '- GAG CCA GAG GTA ATG ATA AAG A-3 \' MrNV18S-R 5 \ '- GCT CTT AAT CTG TCA ATC CTT C-3 \' 2. การตรวจวินิจฉัยไวรัสแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส ด้วยวิธีรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ 2 ขั้นตอน แบบใช้หลอดพีซีอาร์หลอดเดียว (single tube nested PCR technique) โดยใช้ ไพร์เมอร์จากข้อถือสิทธิที่ 1 มีขั้นตอนดั้งนี้ 2.1 เตรียมตัวอย่างกุ้งที่ต้องการตรวจไวรัสแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส มาสกัด อาร์เอ็นเอ 2.2 นำดีเอ็นเอจากข้อ 2.1 มาตรวจหาไวรัสโดยผ่านกระบวนการรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ ขั้นตอนที่หนึ่ง (First step RT-PCR) 2.3 นำผลผลิตที่ได้จากกระบวนการพีซีอาร์ขั้นตอนที่หนึ่งในข้อ 2.2 มาทำปฏิกิริยาต่อใน กระบวนการรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ขั้นตอนที่สอง (Nested step PCR) 2.4 นำผลผลิตพีซีอาร์ที่ได้จากข้อ 2.3 มาตรวจสอบขนาดโดยใช้เทคนิคเจลอิเล็คโทรโฟรีซิส2. Diagnosis of macrophages virus Rosenberger Eainoda virus by reverse method A 2-step PCR transcript using a single tube nested PCR technique using a primer from claim 1 follows these steps: 2.1 Prepare the sample. Shrimp that need to be tested for Macrobrachium virus Rosenberger Eynodavirus is extracted from RNA 2.2 DNA from 2.1 is used to detect the virus through the reverse process. First step RT-PCR 2.3 The product obtained from the PCR process, step one in item 2.2, is used to continue the reaction in Reverse process Transcript Nested step PCR 2.4 The PCR yield obtained from clause 2.3 was examined by using gel electrophoresis technique. 3. การตรวจวินิจฉัยแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส ตามข้อถือสิทธิที่ 2 ที่ซึ่ง การทำ ปฏิกิริยากระบวนการรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ ขั้นตอนที่หนึ่ง มีส่วนประกอบของปฏิกิริยา คือ 2X PCR buffer 10 ไมโครลิตร (มิวL) 1มิวM Mr18S-F 0.2 มิลลิลิตร (mL) 1มิวM Mr18S-R 0.2 มิลลิลิตร (mL) 1มิวM MrNV-F 0.5 มิลลิลิตร (mL) 1มิวM MrNV-R 0.5 มิลลิลิตร (mL) RT/Tag Supercript lll 0.5 ไมโครลิตร (mL) Template 2.0 ไมโครลิตร (มิวL) น้ำกลั่น (DW) 1.1 ไมโครลิตร (มิวL) รวม 15.0 ไมโครลิตร (มิวL) ปฏิกิริยาพีซีอาร์ ที่ใช้คือ 94 ํซ. 2 นาที 94 ํซ. 20 วินาที 55 ํซ. 30 วินาที 15 รอบ (cycles) 72 ํซ. 30 วินาที 72 ํซ. 2 นาที 20 ํซ. oc3. Macrobrachium diagnosis Rosenborg Ainodavirus according to claim 2 where the reaction of the reverse process PCR transcript, step one The reaction component is 2X PCR buffer 10 μl (muL) 1 mu M Mr18S-F 0.2 ml (mL) 1 mu M Mr18S-R 0.2 ml (mL) 1 mu M MrNV-F 0.5 ml (mL) ) 1 mu M MrNV-R 0.5 ml (mL) RT / Tag Supercript lll 0.5 μl (mL) Template 2.0 μl (muL) Distilled water (DW) 1.1 μl (muL) Total 15.0 μl (muL ) The PCR reaction was 94 ° c. 2 min. 94 ° c. 20 sec. 55 °. 30 sec. 15 cycles. 72 ํ. 30 sec. 72 ํ. 2 min. 20 ํ. Oc. 4. การตรวจวินิจฉัยแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส ตามข้อถือสิทธิที่ 2 ที่ซึ่ง การทำ ปฏิกิริยากระบวนการรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ ขั้นตอนที่สอง มีส่วนประกอบของปฏิกิริยา คือ 10 x PCR buffer 2.5 มิวL 50mM MgCl2 0.75 มิวL 10mM dNTPs 0.5 มิวL 10มิวM Mr18S-F 0.1 มิวL 10มิวM Mr18S-R 0.1 มิวL 10มิวM MrNV-F-N 0.4 มิวL 10มิวM MrNV-R-N 0.4 มิวL 5 Unit Tag DNA Polymerase 0.25 มิวL น้ำกลั่น (DDW) 10.0 มิวL First step PCR 15.0 มิวL รวม 30.0 มิวL ปฏิกิริยาพีซีอาร์ ที่ใช้คือ 94 ํซ. 2 นาที 94 ํซ. 20 วินาที 50 ํซ. 30 วินาที 30 รอบ (cycles) 72 ํซ. 30 วินาที 72 ํซ. 2 นาที 20 ํซ. oc4. Macrobrachium diagnosis Rosenborg Ainodavirus according to claim 2 where the reaction of the reverse process Second-step PCR transcript It has reaction components: 10 x PCR buffer 2.5 mu L 50 m M MgCl2 0.75 m L 10 m M dNTPs 0.5 m L 10 m M Mr18S-F 0.1 mu L 10 mu M Mr18S-R 0.1 mu L 10 mu M MrNV-FN 0.4 mu L 10 mu M MrNV-RN 0.4 mu L 5 Unit Tag DNA Polymerase 0.25 mu L Distilled water (DDW) 10.0 mu L First step PCR 15.0 m L Total 30.0 m L Reaction The PCR used is 94 ํ. 2 min. 94 ํ. 20 sec., 50 ํ. 30 sec., 30 cycles. 72 ํ. 30 sec., 72 ํ. 2 min. 20 ํ. Oc. 5. การตรวจวินิจฉัยแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส ตามข้อถือสิทธิที่ 2 - 4 ข้อใดข้อหนึ่ง ที่ซึ่ง ผลิตผลที่ได้จากกระบวนการรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ กรณีกุ้งติดเชื้อแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส แบบรุนแรง จะพบผลิตผลทั้งในกระบวนการพีซีอาร์ขั้นตอนที่หนึ่ง และ กระบวนการพีซีอาร์ขั้นตอนที่สอง5. Macrobrachium diagnosis Rosenborg Ainodavirus, pursuant to any of the 2nd to 4th claim, where the produce obtained from the reverse process Transcript PCR in case of shrimp infected with macrophages The Rosenberger Ayanoid virus is found to be productive in both the first stage of the PCR process and the second stage of the PCR process. 6. การตรวจวินิจฉัยแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส ตามข้อถือสิทธิที่ 2 - 4 ข้อใดข้อหนึ่ง ที่ซึ่ง ผลิตผลที่ได้จากกระบวนการรีเวอร์ส ทรานสคริปชั่น พีซีอาร์ กรณีกุ้งติดเชื้อแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส แบบรุนแรง จะพบผลิตผลในกระบวนการพีซีอาร์ขั้นตอนที่สอง เท่านั้น6. Macrobrachium diagnosis Rosenborg Ainodavirus under any of the 2nd to 4th claim, where the produce obtained from the reverse process Transcript PCR in case of shrimp infected with macrophages Rosenberger Ainoda virus is severe only to be productive in second-stage PCR process. 7. การตรวจวินิจฉัยแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส ตามข้อถือสิทธิที่ 2 - 6 ข้อใดข้อ หนึ่ง ใช้กับกุ้งก้ามกราม7. Macrobrachium diagnosis Rosenberger Ayanoidavirus according to Claim 2 - 6, any one applies to lobsters. 8. ชุดตรวจวินิจฉัยแมคโคบราเคี่ยม โรเซนเบอจิอาย โนดาไวรัส ด้วยวิธีตามข้อถือสิทธิที่ 2 - 4 ข้อใด ข้อหนึ่ง ที่ประกอบด้วยแต่มิได้จำกัดเฉพาะ ดังนี้ 1 มิวM ของ ไพร์เมอร์ MrNV-F, ไพร์เมอร์ MrNV-R, ไพร์เมอร์ MrNV18S-F, ไพร์เมอร์ MrNV18S-R 10 มิวM ของ ไพร์เมอร์ MrNV-F-N, ไพร์เมอร์ MrNV-R-N, ไพร์เมอร์ MrNV18S-F และไพร์เมอร์ MrNV18S-R 1.5 mM MgCl2, 10mM dNTP และ ตัวควบคุมบวก (positive control)8. Macrobraciam Diagnostic Kit Rosenbeji Ayano Virus by means of claim 2 - 4, any of which includes, but is not limited to: 1 mu M of the MrNV-F primer, MrNV primer. -R, MrNV18S-F primer, MrNV18S-R 10mM primer of MrNV-FN primer, MrNV-RN primer, MrNV18S- primer F and MrNV18S-R primer 1.5 mM MgCl2, 10mM dNTP and a positive control.
TH803000211U 2008-02-19 How to detect macrobraciam virus Rosenbeji Ayanoidavirus (Macrobrachium rosenbergii nodavirus, MrNV) and the aforementioned diagnostic kits. TH7610A3 (en)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
TH7610C3 true TH7610C3 (en) 2012-11-15
TH7610A3 TH7610A3 (en) 2012-11-15

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Wu et al. Establishment of a fluorescent polymerase chain reaction method for the detection of the SARS-associated coronavirus and its clinical application
CN103409555B (en) RT-LAMP-LFD detection method and detection kit for Macrobrachium rosenbergii Nodamura virus
CN105624303A (en) Bovine, goat, porcine and canine brucella typing fluorescent PCR (polymerase chain reaction) detection reagent kit and preparation and application thereof
CN102925548B (en) Actinobacillus pleuropneumoniae LAMP kit and application method thereof
CN101880709B (en) Salmonella enteritidis detection reagent kit and method based on loop-mediated isothermal amplification technology
CN102952896A (en) Universal loop-mediated isothermal amplification kit for detecting influenza A virus and application of universal loop-mediated isothermal amplification kit
CN105349702A (en) PPV (porcine parvovirus) LAMP (loop-mediated isothermal amplification) kit and application thereof
TH7610C3 (en) How to detect macrobraciam virus Rosenbeji Ayanoidavirus (Macrobrachium rosenbergii nodavirus, MrNV) and the aforementioned diagnostic kits.
TH7610A3 (en) How to detect macrobraciam virus Rosenbeji Ayanoidavirus (Macrobrachium rosenbergii nodavirus, MrNV) and the aforementioned diagnostic kits.
Ek-Huchim et al. Non-lethal detection of DNA from Cichlidogyrus spp.(Monogenea, Ancyrocephalinae) in gill mucus of the Nile tilapia Oreochromis niloticus
Rim et al. Molecular typing of Vibrio alginolyticus strains isolated from Tunisian marine biotopes by two PCR-based methods (ERIC and REP)
CN101144771B (en) kit for detecting human immunodeficiency virus
CN103333946A (en) Rapid detection method for vibrio vulnificus and vibrio harveyi
CN107287352A (en) The probe primer group and its method of duck enteritis virus and duck hepatitis virus quick detection
Liu et al. Non-linear relationships between children age and pneumococcal vaccine coverage: important implications for vaccine prevention strategies
CN104450951B (en) The primer of plant soil-borne diseases Fusarium oxysporum Rapid identification and method
CN105132572B (en) A kind of patau syndrome kit of noninvasive Prenatal Screening 21
CN104313163B (en) Method and kit for triple PCR detection of porcine infectious actinobacillus pleuropneumonia serum types 2, 3 and 6 and application of porcine infectious actinobacillus pleuropneumonia serum types 2, 3 and 6
Abdul Rahman et al. Loop-mediated isothermal amplification of the toxR gene coupled with lateral flow dipstick (LAMP-LFD) for the novel, rapid and specific visual detection of Vibrio harveyi.
CN101082063A (en) One-tube half-nest type PCR detection reagent case for injury vibrio and detection method
CN104178584A (en) Kit for detecting nervous necrosis viruses of pacific codfish
TH7609A3 (en) Methods for detecting Hepatopancreatic Parvo-like Virus (HPV) and such virus detection kits.
CN219551980U (en) Sampling device for biological agent detection
TH7608A3 (en) Monodon baculovirus (MBV) detection methods and such virus detection kits.
CN102559914A (en) Primers for quickly detecting Edwardsiella tarda by using gene amplification method