TH26206U - Primer kits for the detection of Listeria monocytogenes using the LAMP and LAMP-LFD techniques. - Google Patents

Primer kits for the detection of Listeria monocytogenes using the LAMP and LAMP-LFD techniques.

Info

Publication number
TH26206U
TH26206U TH2003002812U TH2003002812U TH26206U TH 26206 U TH26206 U TH 26206U TH 2003002812 U TH2003002812 U TH 2003002812U TH 2003002812 U TH2003002812 U TH 2003002812U TH 26206 U TH26206 U TH 26206U
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
lis
lamp
biotin
lfd
listeria monocytogenes
Prior art date
Application number
TH2003002812U
Other languages
Thai (th)
Other versions
TH26206Y (en
Inventor
นุชนารถ นางสาววิราวรรณ
Original Assignee
นุชนารถ นางสาววิราวรรณ
Filing date
Publication date
Application filed by นุชนารถ นางสาววิราวรรณ filed Critical นุชนารถ นางสาววิราวรรณ
Publication of TH26206U publication Critical patent/TH26206U/en
Publication of TH26206Y publication Critical patent/TH26206Y/en

Links

Abstract

OCR 10KL (07/11/2567) ชุดไพรเมอร์ (primers) สำหรับการตรวจสอบเชื้อลิสทีเรีย โมโนไซโตจีเนส (Listeria monocytogenes) ด้วย เทคนิคแลมป์ (LAMP) และแลมป์-แอลเอฟดี (LAMP-LFD) ชุดไพรเมอร์ (primers) สำหรับการตรวจสอบเชื้อลิสทีเรีย โมโนไซโตจีเนส (Listeria monocytogenes) ด้วย เทคนิคแลมป์ (LAMP) และแลมป์-แอลเอฟดี (LAMP-LFD) ประกอบด้วยไพรเมอร์และโพรบ ที่ซึ่งไพรเมอร์ที่ ใช้มีลำดับเบส ดังนี้ ชื่อไพรเมอร์ (primers) ลำดับเบส (5'-3') ความยาว (bp) ลิส_โฟร์-เอฟสาม (Lis_4-F3) TTITCGCAGGTTCGGTTA 18 ลิส_โฟร์-บีสาม (Lis_4-B3) GAAACGACTACTTCTTTTGCT 21 ลิส_โฟร์-ฟิฟ (Lis_4-FIP) TAAGAAACTTTCGCCCATTGGTAC-CATTTGGTTGCTAAACTACGC 45 ลิส_โฟร์-บิบ (Lis_4-BIP) CACTACTCGTTCCGCTTGGT-AGAAAACCAGGTATAAGGGT 21 ดิ๊ก-ลิส_โฟร์-ฟิฟ (DIG-Lis_4-FIP) DIG-TAAGAAACTTTCGCCCATTGGTAC-CATTTGGTTGCTAAACTACGC 45 ไบโอติน-ลิส_โฟร์-โพรบ (Biotin-Lis_4-probe) Biotin-GCAATTATCGGTGGCATGCT 20 มีความเข้มข้นของสารในปฏิกิริยาและสภาวะที่เหมาะสมของปฏิกิริยา โดยพรีเอนริชเมนเชื้อลิสทีเรีย โมโนไซ โตจีเนส (Listeria monocytogenes) ที่ 37 องศาเซลเซียส 12 ชั่วโมงและสกัดดีเอ็นเอด้วยวิธีต้มและปั่น เหวี่ยง โดยอุณหภูมิที่เหมาะสมในการทำปฏิกิริยาคือ 60 องศาเซลเซียส นาน 60 นาที นำผลิตภัณฑ์แลมป์ จำนวน 8 ไมโครลิตร ใส่ในสารละลายเอสเสบัฟเฟอร์ 100 ไมโครลิตรที่อุณหภูมิห้อง ผสมให้เข้ากัน แล้วจุ่ม แผ่นแอลเอฟดีลงในส่วนผสม รอประมาน 5 นาที แล้วอ่านผลOCR 10KL (07/11/2024) Primer kit for the detection of Listeria monocytogenes using the LAMP and LAMP-LFD techniques. The primer kit for the detection of Listeria monocytogenes using the LAMP and LAMP-LFD techniques consists of primers and probes, where the primers... Use the following base sequences: Primer Name (primers) Base Sequence (5'-3') Length (bp) Lis_4-F3 (Lis_4-F3) TTITCGCAGGTTCGGTTA 18 Lis_4-B3 (Lis_4-B3) GAAACGACTACTTCTTTTGCT 21 Lis_4-FIP (Lis_4-FIP) TAAGAAACTTTCGCCCATTGGTAC-CATTTGGTTGCTAAACTACGC 45 Lis_4-BIP (Lis_4-BIP) CACTACTCGTTCCGCTTGGT-AGAAAACCAGGTATAAGGGT 21 DIG-Lis_4-FIP (DIG-Lis_4-FIP) DIG-TAAGAAACTTTCGCCCATTGGTAC-CATTTGGTTGCTAAACTACGC 45 Biotin-Lis_4-Probe The Biotin-Lis_4-probe (Biotin-GCAATTATCGGTGGCATGCT 20) was developed using optimal reaction concentrations and conditions. Listeria monocytogenes was pre-enriched at 37°C for 12 hours, and DNA was extracted via boiling and centrifugation. The optimal reaction temperature was 60°C for 60 minutes. 8 µL of the LAMP product was added to 100 µL of room temperature essence buffer solution, mixed thoroughly, and the LFD plate was immersed in the mixture. After approximately 5 minutes, the results were read.

Claims (3)

OCR 10KL (07/11/2567)OCR 10KL (07/11/2567) 1. ชุดไพรเมอร์ (primers) สำหรับการตรวจสอบเชื้อลิสทีเรีย โมโนไซโตจีเนส (Listeria monocytogenes) ด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP) และ แลมป์-แอลเอฟดี (LAMP-LFD) ประกอบด้วย ไพรเมอร์ (primers) และโพรบ (probe) ที่ซึ่งไพรเมอร์ (primers) ที่ใช้มีลำดับเบส ดังนี้ ชื่อไพรเมอร์ (primers) ลำดับเบส (5'-3') ความยาว (bp) ลิส_โฟร์-เอฟสาม (Lis_4-F3) TTTTCGCAGGTTCGGTTA 18 ลิส_โฟร์-บีสาม (Lis_4-B3) GAAACGACTACTTCTTTTGCT 21 ลิส_โฟร์-ฟิฟ (Lis_4-FIP) TAAGAAACTTTCGCCCATTGGTAC-CATTTGTTGCTAAACTACGC 45 ลิส_โฟร์-บิบ (Lis_4-BIP) CACTACTCGTTCCGCTTGT-AGAAAACCAGGTATAAGGGT 21 ดิ๊ก-ลิส_โฟร์-ฟิฟ (DIG-Lis_4-FIP) DIG-TAAGAAACTTTCGCCCATTGGTAC-CATTTGGTTGCTAAACTACGC 45 ไบโอติน-ลิส_โฟร์-โพรบ (Biotin-Lis_4-probe) Biotin-GCAATTATCGGTGGCATGCT 201. Primer kit for Listeria detection. Listeria monocytogenes was detected using the LAMP and LAMP-LFD techniques, employing primers and probes. The primers used had the following base sequences: Primer Name, Base Sequence (5'-3'), Length (bp): Lis_4-F3, TTTTCGCAGGTTCGGTTA, 18; Lis_4-B3, GAAACGACTACTTCTTTTGCT, 21; Lis_4-FIP, TAAGAAACTTTCGCCCATTGGTAC-CATTTGTTGCTAAACTACGC, 45; Lis_4-BIP, CACTACTCGTTCCGCTTGT-AGAAAACCAGGTATAAGGGT, 21; Dick-Lis_4-FIP. (DIG-Lis_4-FIP) DIG-TAAGAAACTTTCGCCCATTGGTAC-CATTTGGTTGCTAAACTACGC 45 Biotin-Lis_4-probe (Biotin-Lis_4-probe) Biotin-GCAATTATCGGTGGCATGCT 20 2. ชุดไพรเมอร์ (primers) สำหรับการตรวจสอบเชื้อลิสทีเรีย โมโนไซโตจีเนส (Listeria monocytogenes) ด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP) และ แลมป์-แอลเอฟดี (LAMP-LFD) ตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งโพรบ (probe) ที่ใช้มีลำดับเบส ดังนี้ ไบโอติน (Biotin-GCAATTATCGGTGGCATGCT)2. A set of primers for the detection of Listeria monocytogenes using the LAMP and LAMP-LFD techniques under Patent 1, where the probe used has the following base sequence: Biotin (Biotin-GCAATTATCGGTGGCATGCT). 3. ชุดไพรเมอร์ (primers) สำหรับการตรวจสอบเชื้อลิสทีเรีย โมโนไซโตจีเนส (Listeria monocytogenes) ด้วยเทคนิค แลมป์ (LAMP) และ แลมป์-แอลเอฟดี (LAMP-LFD) ตามข้อถือสิทธิ 1 หรือ 2 มีความเข้มข้นของสารในปฏิกิริยาและสภาวะที่เหมาะสมของปฏิกิริยา ดังนี้ ในปฏิกิริยา ประกอบด้วย ไพรเมอร์ ลิส_โฟร์-ฟิฟ (primers Lis_4-FIP) ที่ติดฉลากด้วยดิ๊ก (DIG) และ ไพรเมอร์ ลิส_โฟร์-บิบ (primers Lis_4-BIP) อย่างละ 0.4 ไมโครโมลาร์ ไพรเมอร์ ลิส_โฟร์-เอฟสาม (Lis_4- F3), ไพรเมอร์ลิส_โฟร์-บีสาม (Lis_4-33) และ โพรบ (probe) ที่ติดฉลากด้วยไบโอติน (Biotin) อย่าง ละ 0.8 ไมโครโมลาร์ สารดีเอ็นทีพี (dNTPs) ความเข้มข้น 1.4 มิลลิโมลาร์ สารแมกนีเซียมซัลเฟส (MgSO4) ความเข้มข้น 4 มิลลิโมลาร์ เอนไซม์บีเอสที ดีเอ็นเอ โพลีเมอร์เรส (Bst DNA polymerase) ความเข้มข้น 8 หน่วย ซัพพลายด์บัฟเฟอร์ (ทริส ไฮโดรคลอไรด์) (Tris-HCl) 20 มิลลิโมลาร์, (แอมโมเนียมซัลเฟต) ((NH4)2SO4) 10 มิลลิโมลาร์, (โพแทสเซียมคลอไรด์) (KCl) 10 มิลลิโมลาร์, (แมกนีเซียมซัลเฟต) MgSO4 2 มิลลิโมลาร์, (ไตรตรอนเอ็กซ์) (Triton X)-100 0.1 เปอร์เซนต์, pH 8.8) ความเข้มข้น 1 เท่า สารเบตาอีน (Betaine) ความเข้มข้น 0.8 โมลาร์ ดีเอ็นเอตัวอย่าง (DNA) ของเชื้อลิสทีเรีย โมโนไซโตจีเนส (Listeria monocytogenes) ที่ผ่านการพรีเอนริชเมนต์ (pre- enrichment) ในทริปติกซอยบรอท (Tryptic Soy Broth, TSB) ที่ 37 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 12 ชั่วโมง และสกัดดีเอ็นเอ (DNA) ด้วยวิธีการต้มและปั่นเหวี่ยง ปริมาณ 2 ไมโครลิตร น้ำกลั่นที่ ปราศจากดีเอ็นเอส (DNase) และอาร์เอ็นเอส (RNase) เพื่อปรับปริมาตรรวมให้ได้ 25 ไมโครลิตร ทำ การทดสอบหาอุณหภูมิที่เหมาะสม โดยทำปฏิกิริยาที่อุณหภูมิ 60 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 60 นาที นำผลิตภัณฑ์แลมป์ (LAMP product)จำนวน 8 ไมโครลิตร ไปใส่ในหลอดที่มีสารละลายเอสเส บัฟเฟอร์ (assay buffer) ปริมาตร 100 ไมโครลิตรที่อุณหภูมิห้อง ผสมให้เข้ากัน แล้วทำการจุ่มแผ่น แอลเอฟดี (LFD) ลงในส่วนผสมทิ้งไว้ 5 นาที แล้วอ่านผล3. Primer kit for Listeria detection. Listeria monocytogenes (Listeria monocytogenes) using the LAMP and LAMP-LFD techniques according to patent 1 or 2, with the following reaction concentrations and optimal reaction conditions: The reaction consists of 0.4 µmolar each of DIG-labeled Lis-4-BIP primers, 0.8 µmolar each of Lis-4-F3, Lis-4-B3, and biotin-labeled probe, 1.4 millimolar of dNTPs, 4 millimolar of magnesium sulfate (MgSO4), and the enzyme BST DNA polymerase. (Bst DNA polymerase) 8 units, supplied buffer (Tris hydrochloride) (Tris-HCl) 20 millimolar, (ammonium sulfate) ((NH4)2SO4) 10 millimolar, (potassium chloride) (KCl) 10 millimolar, (magnesium sulfate) MgSO4 2 millimolar, (Triton X)-100 0.1 percent, pH 8.8) 1x concentration, Betaine 0.8 molar, Listeria DNA sample. Listeria monocytogenes, pre-enriched in tryptic soy broth (TSB) at 37°C for 12 hours, was used to extract DNA via boiling and centrifugation. 2 µL of DNase- and RNase-free distilled water was added to adjust the total volume to 25 µL. The optimal temperature was determined by performing the reaction at 60°C for 60 minutes. 8 µL of the LAMP product was added to a tube containing 100 µL of assay buffer at room temperature, mixed thoroughly, and an LFD plate was immersed in the mixture for 5 minutes. The results were then read.
TH2003002812U 2020-10-20 Primer kits for the detection of Listeria monocytogenes using the LAMP and LAMP-LFD techniques. TH26206Y (en)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
TH26206U true TH26206U (en) 2025-08-20
TH26206Y TH26206Y (en) 2025-08-20

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US10544452B2 (en) Method and use of nucleic acid isothermal amplification via a polymerase spiral reaction
Moser et al. Thermostable DNA polymerase from a viral metagenome is a potent RT-PCR enzyme
CN104726549B (en) Novel nicking enzyme-based double-stranded nucleic acid isothermal amplification detection method
US10683540B2 (en) Oligonucleotide inhibitor of DNA polymerases
RU2013148806A (en) METHODS AND KITS FOR DETECTION OF CELL-FREE CELLS SPECIFIC FOR PATHOGENES OF NUCLEIC ACIDS
US10465232B1 (en) Methods for quantifying efficiency of nucleic acid extraction and detection
CN115976227B (en) A kit and detection method for blood source identification and personal identification based on CpG-SNP linkage markers
Polz et al. A simple method for quantification of uncultured microorganisms in the environment based on in vitro transcription of 16S rRNA
JP2024032995A (en) Compositions and methods for amplifying or detecting varicella zoster virus
JPH09511133A (en) Method for removal of DNA sequencing artifacts
US6270962B1 (en) Methods for the elimination of DNA sequencing artifacts
US20210002718A1 (en) Quantitative microbial community profiling using molecular inversion probes with unique molecular identifiers
JP5200302B2 (en) Identification of RNA targets using helicases
TH26206Y (en) Primer kits for the detection of Listeria monocytogenes using the LAMP and LAMP-LFD techniques.
TH24592Y (en) A set of primers for the detection of Salmonella spp. using the LAMP and LAMP-LFD techniques.
TH24592U (en) A set of primers for the detection of Salmonella spp. using the LAMP and LAMP-LFD techniques.
CN114836575A (en) A primer pair for rapid detection of H9 subtype avian influenza virus and its application
CN109897856B (en) A set of oligonucleotide aptamers that specifically recognize spermine
CN103173442B (en) Leptobotia elongate four-base repetitive unit simple sequence repeat molecular marker establishing method and application thereof
CN113278736B (en) Reagents and methods for qualitative detection of bovine herpesvirus type I
US20090311677A1 (en) Identification of contaminating bacteria in industrial ethanol fermentations
CN107058517A (en) A kind of kit and detection method that detection is infected for mycobacterium tuberculosis
BR0108928A (en) Methods of analysis of genomic DNA in a sample and determination of an individual's lineage by analysis of genomic DNA in a biological sample of the individual, and parts kit for analysis of genomic DNA in a sample
RU2842887C2 (en) Method for assessing sensitivity of infusoria euplotes aediculatus to mineralized water and/or toxicant potassium bichromate
CN101871015A (en) Goose parvovirus detection kit and method based on loop-mediated isothermal amplification technology