TH18684Y -
Primers for detecting the response regulator VraR (vraR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
- Google Patents
Primers for detecting the response regulator VraR (vraR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
การประดิษฐ์นี้เป็นการประดิษฐ์ไพรเมอร์สำหรับตรวจยีนเรสสปอนแรคคูเรเตอร์วีอาร์เอ อาร์ (Response regulator VraR (vroR) gene) สำหรับเชื้อสแตฟิโลคอคคัส ออเรียส ที่ดื้อต่อยาเมธิซิลลิน (methicillin-resistant Staphylococcus aureus) ด้วยเทคนิคเรียลไทม์พีซีอาร์ (real-time PCR) ประกอบด้วยไพรเมอร์ (primer) จำนวน 2 เส้น ซึ่งสามารถจับลำดับเบสของยีน vraR บนดีเอ็นเอเป้าหมายได้ อย่างจำเพาะ โดยคู่ผสมไพรเมอร์กับบํ้ายาทดสอบและตัวอย่างสารพันธุกรรม หรือดีเอ็นเอสายคู่สม (complementary DNA) จากสารพันธุกรรมอาร์เอ็นเอ (RNA) ที่แยกสกัดจากตัวอย่างเชื้อ แล้วทำการเพิ่ม ขยายปริมาณสารพันธุกรรมด้วยเทคนิคเรียลไทม์พีซีอาร์ (real-time PCR) สำหรับการประดิษฐ์นี้สามารถ นำมาใช้ในการตรวจวิเคราะห์เชิงคุณภาพและเชิงปริมาณสำหรับในการศึกษาการแสดงออกของยีนที่ให้ผล การศึกษาที่ถูกต้องแม่นยำ น่าเชื่อถือ มีความไว และความจำเพาะสูง และสามารถรายงานผลได้ในเวลา อันรวดเร็วThis invention is a primer for detecting the response regulator VraR (vroR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR. It consists of two primers capable of specifically binding to the vraR gene sequence on the target DNA. The primers are combined with the test reagent and a sample of genetic material, or complementary DNA, from RNA extracted from the bacteria. The genetic material is then amplified using real-time PCR. This invention can be used for both qualitative and quantitative analysis of gene expression, providing accurate, reliable, highly sensitive, and specific results that can be reported rapidly.
Claims (2)
1. ไพรเมอร์สำหรับตรวจยีนเรสสปอนแรคคูเรเตอร์วีอาร์เอ อาร์ (Response regulator VraR (vraR) gene) สำหรับเชื้อสแตฟิโลคอคคัส ออเรียส ที่ดื้อต่อยาเมธิซิลลิน (methicillin-resistant Staphylococcus aureus) ด้วยเทคนิคเรียลไทม์พีซีอาร์ (real-time PCR) ซึ่งประกอบด้วย ไพรเมอร์ (primers) ที่ใช้เพิ่มสาร พันธุกรรม สำหรับยีนเรสสปอนแรคคูเรเตอร์วีอาร์เอ อาร์ (Response regulator VraR (vraR) gene) จำนวน 2 เส้น ที่มีลำดับเบสดังนี้ ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (forward primer) เป็น 5’-TTA TCT ATC AAC GCA AAG TG -3’ รีเวิร์สไพรเมอร์ (reverse primer) เป็น 5’-AAT CTG GCT TCA ACT CAT -3’1. Primers for detecting the response regulator VraR (vraR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR. These primers consist of two strands of the VraR (vraR) gene with the following base sequences: Forward primer: 5’-TTA TCT ATC AAC GCA AAG TG -3’; Reverse primer: 5’-AAT CTG GCT TCA ACT CAT -3’.2. ไพรเมอร์สำหรับตรวจยีนเรสสปอนแรคคูเรเตอร์วีอาร์เอ อาร์ (Response regulator VraR (vraR) gene) สำหรับเชื้อสแตฟิโลคอคดัส ออเรียส ที่ดื้อต่อยาเมธิซิลลิน (methicillin-resistant Staphylococcus aureus) ด้วยเทคนิคเรียลไทม์พีซีอาร์ (real-time PCR) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง มีเงื่อนไขของโปรแกรม อุณหภูมิเพื่อเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมที่มีความเหมาะสมที่สุดสำหรับคู่ไพรเมอร์ โดยตั้งโปรแกรมอุณหภูมิ ดังนี้ ขั้นที่ 1 โปรแกรมพรีดีเนเจอร์ (pre-denature) ใช้อุณหภูมิ 95 องศาเซลเซียส นาน 10 นาที ขั้นที่ 2โปรแกรมแอมพลิฟิเคชั่น (amplification) ประกอบด้วย 3 ขั้นตอน คือ ขั้นตอนดีแนทเจอ เรชั่น (denaturation) ใช้อุณหภูมิ 95 องศาเซลเซียส นาน 20 วินาที ขั้นตอนแอนเนียลลิง (annealing) ใช้ อุณหภูมิ 53 องศาเซลเซียส นาน 20 วินาที และขั้นตอนเอ็กเท็นชั่น (extension) ใช้อุณหภูมิ 72 องศา เซลเซียส นาน 30 วินาที ตรวจวัดสัญญาณการเรืองแสง (fluorescence signal) หนึ่งครั้ง ทำซํ้าทั้งหมด 45 รอบ (cycles) โดยกำหนดอัตราการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ (temperature transition rate) เป็น 20 องศา เซลเซียสต่อวินาที ขั้นที่ 3 โปรแกรมเมลติ้งเคิฟ (melting curve) ประกอบด้วย 3 ขั้นตอน คือ การเพิ่มอุณหภูมิถึง 95 องศาเซลเซียส นาน 15 วินาที แล้วลดอุณหภูมิถึง 60 องศาเซลเซียส นาน 60 วินาที โดยใช้อัตราการ เปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ 20 องศาเซลเซียสต่อวินาที จากนั้นเพิ่มอุณหภูมิขึ้นจนถึง 95 องศาเซลเซียส นาน 15 วินาที โดยใช้อัตราการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ 0.1 องศาเซลเซียสต่อวินาที และตรวจวัดสัญญาณการเรืองแสง อย่างต่อเนื่อง ขั้นที่ 4 โปรแกรมคูลลิ่ง (cooling) ลดอุณหภูมิลงถึง 40 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 30 วินาที โดยใช้ อัตราการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ 20 องศาเซลเซียสต่อวินาที2. Primers for detecting the response regulator VraR (vraR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR, as per Patent 1, with program conditions and temperature for optimal genetic material amplification for the primer pair. The temperature program is set as follows: Step 1: Pre-denature program at 95°C for 10 minutes. Step 2: Amplification program consisting of three steps: denaturation at 95°C for 20 seconds, annealing at 53°C for 20 seconds, and extension at 72°C for 30 seconds. Fluorescence signal is measured. (fluorescence signal) once, repeated for a total of 45 cycles, with a temperature transition rate of 20 degrees Celsius per second. Step 3: Melting curve program, consisting of 3 steps: increasing the temperature to 95 degrees Celsius for 15 seconds, then decreasing the temperature to 60 degrees Celsius for 60 seconds using a temperature transition rate of 20 degrees Celsius per second, and then increasing the temperature back to 95 degrees Celsius for 15 seconds using a temperature transition rate of 0.1 degrees Celsius per second, while continuously monitoring the fluorescence signal. Step 4: Cooling program, reducing the temperature to 40 degrees Celsius for 30 seconds using a temperature transition rate of 20 degrees Celsius per second.
TH2003001775U2020-07-30
A primer for the ResponseregulatorVraR(vraR)gene for staphylococcus aureus resistant to methicillin. Lalin (methicillin-resistant Staphylococusaureus) by real-time PCR technique.
TH18684A3
(en)