TH18684Y - Primers for detecting the response regulator VraR (vraR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR. - Google Patents

Primers for detecting the response regulator VraR (vraR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.

Info

Publication number
TH18684Y
TH18684Y TH2003001775U TH2003001775U TH18684Y TH 18684 Y TH18684 Y TH 18684Y TH 2003001775 U TH2003001775 U TH 2003001775U TH 2003001775 U TH2003001775 U TH 2003001775U TH 18684 Y TH18684 Y TH 18684Y
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
vrar
temperature
degrees celsius
seconds
gene
Prior art date
Application number
TH2003001775U
Other languages
Thai (th)
Other versions
TH18684C3 (en
TH18684U (en
TH18684A3 (en
Inventor
ศิริโชติ นายอรรถวิทย์
ลุลิตานนท์ รองศาสตราจารย์อรุณลักษณ์
ลุลิตานนท์ ศาสตราจารย์วีระพงศ์
Original Assignee
มหาวิทยาลัยขอนแก่น
Filing date
Publication date
Application filed by มหาวิทยาลัยขอนแก่น filed Critical มหาวิทยาลัยขอนแก่น
Publication of TH18684Y publication Critical patent/TH18684Y/en
Publication of TH18684C3 publication Critical patent/TH18684C3/en
Publication of TH18684U publication Critical patent/TH18684U/en
Publication of TH18684A3 publication Critical patent/TH18684A3/en

Links

Abstract

การประดิษฐ์นี้เป็นการประดิษฐ์ไพรเมอร์สำหรับตรวจยีนเรสสปอนแรคคูเรเตอร์วีอาร์เอ อาร์ (Response regulator VraR (vroR) gene) สำหรับเชื้อสแตฟิโลคอคคัส ออเรียส ที่ดื้อต่อยาเมธิซิลลิน (methicillin-resistant Staphylococcus aureus) ด้วยเทคนิคเรียลไทม์พีซีอาร์ (real-time PCR) ประกอบด้วยไพรเมอร์ (primer) จำนวน 2 เส้น ซึ่งสามารถจับลำดับเบสของยีน vraR บนดีเอ็นเอเป้าหมายได้ อย่างจำเพาะ โดยคู่ผสมไพรเมอร์กับบํ้ายาทดสอบและตัวอย่างสารพันธุกรรม หรือดีเอ็นเอสายคู่สม (complementary DNA) จากสารพันธุกรรมอาร์เอ็นเอ (RNA) ที่แยกสกัดจากตัวอย่างเชื้อ แล้วทำการเพิ่ม ขยายปริมาณสารพันธุกรรมด้วยเทคนิคเรียลไทม์พีซีอาร์ (real-time PCR) สำหรับการประดิษฐ์นี้สามารถ นำมาใช้ในการตรวจวิเคราะห์เชิงคุณภาพและเชิงปริมาณสำหรับในการศึกษาการแสดงออกของยีนที่ให้ผล การศึกษาที่ถูกต้องแม่นยำ น่าเชื่อถือ มีความไว และความจำเพาะสูง และสามารถรายงานผลได้ในเวลา อันรวดเร็วThis invention is a primer for detecting the response regulator VraR (vroR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR. It consists of two primers capable of specifically binding to the vraR gene sequence on the target DNA. The primers are combined with the test reagent and a sample of genetic material, or complementary DNA, from RNA extracted from the bacteria. The genetic material is then amplified using real-time PCR. This invention can be used for both qualitative and quantitative analysis of gene expression, providing accurate, reliable, highly sensitive, and specific results that can be reported rapidly.

Claims (2)

1. ไพรเมอร์สำหรับตรวจยีนเรสสปอนแรคคูเรเตอร์วีอาร์เอ อาร์ (Response regulator VraR (vraR) gene) สำหรับเชื้อสแตฟิโลคอคคัส ออเรียส ที่ดื้อต่อยาเมธิซิลลิน (methicillin-resistant Staphylococcus aureus) ด้วยเทคนิคเรียลไทม์พีซีอาร์ (real-time PCR) ซึ่งประกอบด้วย ไพรเมอร์ (primers) ที่ใช้เพิ่มสาร พันธุกรรม สำหรับยีนเรสสปอนแรคคูเรเตอร์วีอาร์เอ อาร์ (Response regulator VraR (vraR) gene) จำนวน 2 เส้น ที่มีลำดับเบสดังนี้ ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (forward primer) เป็น 5’-TTA TCT ATC AAC GCA AAG TG -3’ รีเวิร์สไพรเมอร์ (reverse primer) เป็น 5’-AAT CTG GCT TCA ACT CAT -3’1. Primers for detecting the response regulator VraR (vraR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR. These primers consist of two strands of the VraR (vraR) gene with the following base sequences: Forward primer: 5’-TTA TCT ATC AAC GCA AAG TG -3’; Reverse primer: 5’-AAT CTG GCT TCA ACT CAT -3’. 2. ไพรเมอร์สำหรับตรวจยีนเรสสปอนแรคคูเรเตอร์วีอาร์เอ อาร์ (Response regulator VraR (vraR) gene) สำหรับเชื้อสแตฟิโลคอคดัส ออเรียส ที่ดื้อต่อยาเมธิซิลลิน (methicillin-resistant Staphylococcus aureus) ด้วยเทคนิคเรียลไทม์พีซีอาร์ (real-time PCR) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง มีเงื่อนไขของโปรแกรม อุณหภูมิเพื่อเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมที่มีความเหมาะสมที่สุดสำหรับคู่ไพรเมอร์ โดยตั้งโปรแกรมอุณหภูมิ ดังนี้ ขั้นที่ 1 โปรแกรมพรีดีเนเจอร์ (pre-denature) ใช้อุณหภูมิ 95 องศาเซลเซียส นาน 10 นาที ขั้นที่ 2โปรแกรมแอมพลิฟิเคชั่น (amplification) ประกอบด้วย 3 ขั้นตอน คือ ขั้นตอนดีแนทเจอ เรชั่น (denaturation) ใช้อุณหภูมิ 95 องศาเซลเซียส นาน 20 วินาที ขั้นตอนแอนเนียลลิง (annealing) ใช้ อุณหภูมิ 53 องศาเซลเซียส นาน 20 วินาที และขั้นตอนเอ็กเท็นชั่น (extension) ใช้อุณหภูมิ 72 องศา เซลเซียส นาน 30 วินาที ตรวจวัดสัญญาณการเรืองแสง (fluorescence signal) หนึ่งครั้ง ทำซํ้าทั้งหมด 45 รอบ (cycles) โดยกำหนดอัตราการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ (temperature transition rate) เป็น 20 องศา เซลเซียสต่อวินาที ขั้นที่ 3 โปรแกรมเมลติ้งเคิฟ (melting curve) ประกอบด้วย 3 ขั้นตอน คือ การเพิ่มอุณหภูมิถึง 95 องศาเซลเซียส นาน 15 วินาที แล้วลดอุณหภูมิถึง 60 องศาเซลเซียส นาน 60 วินาที โดยใช้อัตราการ เปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ 20 องศาเซลเซียสต่อวินาที จากนั้นเพิ่มอุณหภูมิขึ้นจนถึง 95 องศาเซลเซียส นาน 15 วินาที โดยใช้อัตราการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ 0.1 องศาเซลเซียสต่อวินาที และตรวจวัดสัญญาณการเรืองแสง อย่างต่อเนื่อง ขั้นที่ 4 โปรแกรมคูลลิ่ง (cooling) ลดอุณหภูมิลงถึง 40 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 30 วินาที โดยใช้ อัตราการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ 20 องศาเซลเซียสต่อวินาที2. Primers for detecting the response regulator VraR (vraR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR, as per Patent 1, with program conditions and temperature for optimal genetic material amplification for the primer pair. The temperature program is set as follows: Step 1: Pre-denature program at 95°C for 10 minutes. Step 2: Amplification program consisting of three steps: denaturation at 95°C for 20 seconds, annealing at 53°C for 20 seconds, and extension at 72°C for 30 seconds. Fluorescence signal is measured. (fluorescence signal) once, repeated for a total of 45 cycles, with a temperature transition rate of 20 degrees Celsius per second. Step 3: Melting curve program, consisting of 3 steps: increasing the temperature to 95 degrees Celsius for 15 seconds, then decreasing the temperature to 60 degrees Celsius for 60 seconds using a temperature transition rate of 20 degrees Celsius per second, and then increasing the temperature back to 95 degrees Celsius for 15 seconds using a temperature transition rate of 0.1 degrees Celsius per second, while continuously monitoring the fluorescence signal. Step 4: Cooling program, reducing the temperature to 40 degrees Celsius for 30 seconds using a temperature transition rate of 20 degrees Celsius per second.
TH2003001775U 2020-07-30 A primer for the ResponseregulatorVraR(vraR)gene for staphylococcus aureus resistant to methicillin. Lalin (methicillin-resistant Staphylococusaureus) by real-time PCR technique. TH18684A3 (en)

Publications (4)

Publication Number Publication Date
TH18684Y true TH18684Y (en) 2021-11-11
TH18684C3 TH18684C3 (en) 2021-11-11
TH18684U TH18684U (en) 2021-11-11
TH18684A3 TH18684A3 (en) 2021-11-11

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA2692633A1 (en) Method for the simultaneous detection of multiple nucleic acid sequences in a sample
WO2001083817A1 (en) Method for detecting product of nucleic acid synthesizing reaction
TH18684U (en) Primers for detecting the response regulator VraR (vraR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH18685Y (en) Primers for detecting the sensor protein VraS (vraS) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH18685U (en) Primers for detecting the sensor protein VraS (vraS) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH13924Y (en) Primers for detecting the Staphylococcal major autolysin (atl) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH13924U (en) Primers for detecting the Staphylococcal major autolysin (atl) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH13925U (en) Primers for detecting the 50S ribosomal protein L14 (rplN) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH13925Y (en) Primers for detecting the 50S ribosomal protein L14 (rplN) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH14527Y (en) Primers for detecting the transcriptional regulatory protein WalR (walR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH14527U (en) Primers for detecting the transcriptional regulatory protein WalR (walR) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH14471U (en) Primers for detecting the penicillin-binding protein 4 (pbp4) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH14471Y (en) Primers for detecting the penicillin-binding protein 4 (pbp4) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH14470Y (en) Primers for detecting the sensor protein kinase Walk (walk) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH14470U (en) Primers for detecting the sensor protein kinase Walk (walk) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
CN103740822B (en) Fluorescence quantitative PCR (polymerase chain reaction) combined rapid detection kit and method for SPF (specific pathogen free) mice pathogenic bacteria nucleic acid
CN102367485B (en) Primer for carrying out PCR (Polymerase Chain Reaction) detection on reference gene of plant disease and application of primer
TH17821Y (en) Primers for detecting the immunodominant staphylococcal antigen A (isaA) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
TH17821U (en) Primers for detecting the immunodominant staphylococcal antigen A (isaA) gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus using real-time PCR.
NOVIA et al. OPTIMIZATION OF ANNEALING TEMPERATURE AND PRIMER CONCENTRATION OF CYTOCHROME B (CYT B) GENE FOR PIG DNA DETECTION WITH REAL-TIME PCR METHOD
KR20260058960A (en) Primer set for detection of Verticillium longisporum and method for detecting Verticillium longisporum using the same
TH14469U (en) Primers for genetic testing of A2 (beta)-casein type in dairy cows using the high-resolution melting method.
TH14469Y (en) Primers for genetic testing of A2 (beta)-casein type in dairy cows using the high-resolution melting method.
Kochanová et al. Laboratory diagnostics of common bunt and dwarf bunt
CN110603328A (en) Quantitative PCR amplification primer pair and application thereof