TH18052U - A primer kit for detecting SDDV virus and the method of detection using such primers. - Google Patents

A primer kit for detecting SDDV virus and the method of detection using such primers.

Info

Publication number
TH18052U
TH18052U TH1803001575U TH1803001575U TH18052U TH 18052 U TH18052 U TH 18052U TH 1803001575 U TH1803001575 U TH 1803001575U TH 1803001575 U TH1803001575 U TH 1803001575U TH 18052 U TH18052 U TH 18052U
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
sddv
detecting
atpase
virus
procedure
Prior art date
Application number
TH1803001575U
Other languages
Thai (th)
Other versions
TH18052A3 (en
TH18052C3 (en
TH18052Y (en
Inventor
สนธิ นางสาวมลฤดี
เสนาปิน นางสาวแสงจันทร์
เจริญไวย์ นางสาวอรอนงค์
เนื่องแสง นายบัลลังก์
มีเมตตา นายวัชรชัย
ทังห์ ด่อง นายฮา
Original Assignee
สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
Filing date
Publication date
Application filed by สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ filed Critical สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
Publication of TH18052A3 publication Critical patent/TH18052A3/en
Publication of TH18052U publication Critical patent/TH18052U/en
Publication of TH18052C3 publication Critical patent/TH18052C3/en
Publication of TH18052Y publication Critical patent/TH18052Y/en

Links

Abstract

หน้า 1 ของจำนวน 1 หน้า บทสรุปการประดิษฐ์ การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจหาเชื้อไวรัสเอสดีดีวี และกรรมวิธีการตรวจด้วย ไพรเมอร์ดังกล่าว ซึ่งเป็นระบบการตรวจหาไวรัสเอสดีดีวีซึ่งเน้นดีเอ็นเอไวรัสที่ก่อโรคเกล็ดหลุดในปลากะพง ขาว อาศัยหลักการเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมของไวรัส 2 ครั้ง (Semi-nested PCR) โดยออกแบบให้ไพรเมอร์ จับได้กับยีนเอทีพีเอส (ATPase) ของไวรัส โดยกรรมวิธีการตรวจสอบไวรัสดังกล่าวด้วยไพรเมอร์นี้มีความไวที่ 100 copies/(สัญลักษณ์)l และมีความจำเพาะต่อไวรัสเอสดีดีวี (SDDV) เท่านั้นPage 1 of 1. Summary of the Invention. This invention relates to a primer set for the detection of SDDV virus and a detection method using such primers. This is an SDDV detection system focusing on the viral DNA of the white sea bass leachate disease, based on the principle of double viral amplification (Semi-nested PCR). The primers are designed to bind to the viral ATPase gene. This primer-based detection method has a sensitivity of 100 copies/(symbol)l and is specific only to SDDV.

Claims (7)

หน้า 1 ของจำนวน 2 หน้า ข้อถือสิทธิPage 1 of 2: Claims 1. ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจหาเชื้อไวรัสเอสดีดีวี ที่ประกอบด้วย ดังนี้ ไพรเมอร์สำหรับขั้นตอนการทำพีซีอาร์ RB ATPase-Fl = 5’-ATG TCT GTT CCT GTG AAG GAA-3’ RB ATPase-Rl = 5’-TTA TTC AAC AAC AGC AAT TGC G-3’ ไพรเมอร์สำหรับขั้นตอนการทำเซมิ-เนสเตด พีซีอาร์ RB ATPase-Fl = 5’-ATG TCT GTT CCT GTG AAG GAA-3’ RB ATPase-R2 = 5’-ACA AGT TCC AAT GTC TAC CGT-3’1. A primer kit for detecting SDDV virus, consisting of the following: Primers for the PCR procedure: RB ATPase-Fl = 5’-ATG TCT GTT CCT GTG AAG GAA-3’; RB ATPase-Rl = 5’-TTA TTC AAC AAC AGC AAT TGC G-3’. Primers for the semi-nested PCR procedure: RB ATPase-Fl = 5’-ATG TCT GTT CCT GTG AAG GAA-3’; RB ATPase-R2 = 5’-ACA AGT TCC AAT GTC TAC CGT-3’. 2. กรรมวิธีการตรวจหาเชื้อไวรัสเอสดีดีวีด้วยชุดไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่ง กรรมวิธีดังกล่าว ประกอบด้วยขั้นตอนดังนี้ ก) นำตัวอย่างเนื้อเยื่อปลามาสกัดดีเอ็นเอ ข) นำดีเอ็นเอที่ได้มาทำปฏิกิริยาพีซีอาร์ โดยใช้ไพรเมอร์จำเพาะ ค) นำผลิตผลพีซีอาร์ที่ได้มาทำปฏิกิริยาเซมิ-เนสเตด พีซีอาร์ โดยใช้ไพรเมอร์จำเพาะ ง) วิเคราะห์ผลที่ได้ด้วยวิธีอะกาโรสเจลอิเล็กโตรโฟรีซีส2. The procedure for detecting SDDV virus using a primer kit, as per claim 1, consists of the following steps: a) DNA extraction from fish tissue samples; b) PCR reaction of the extracted DNA using specific primers; c) Semi-nested PCR reaction of the resulting PCR product using specific primers; d) Analysis of the results using agarose gel electrophoresis. 3. กรรมวิธีการตรวจหาเชื้อไวรัสเอสดีดีวี ตามข้อถือสิทธิ 2 ที่ซึ่ง ตัวอย่างเนื้อเยื่อปลาที่ใช้ เลือกได้จาก กล้ามเนื้อ เหงือก หัวใจ ม้าม ไส้ กระเพาะ ตับ ไต อย่างใดอย่างหนึ่งหรือหลายอย่างรวมกัน3. The procedure for detecting the SDDV virus under claim 2, whereby the fish tissue samples used can be selected from muscle, gills, heart, spleen, intestine, stomach, liver, kidney, either individually or in combination. 4. กรรมวิธีการตรวจหาเชื้อไวรัสเอสดีดีวี ตามข้อถือสิทธิ 2 ที่ซึ่ง สารละลายที่ใช้ในการทำปฏิกิริยาพีซีอาร์ มี ดังนี้ RB ATPase-Fl 0.5 ไมโครลิตร RB ATPase-Rl 0.5 ไมโครลิตร สารละลายบัฟเฟอร์สำหรับทำปฏิกิริยา 2.5 ไมโครลิตร ดีเอ็นทีพีเอส 0.5 ไมโครลิตร แทคดีเอ็นเอโพลิเมอเรส 0.25 ไมโครลิตร ดีเอ็นเอแม่แบบ 2.0 ไมโครลิตร น้ำกลั่น 18.75 ไมโครลิตร4. Procedure for detecting the SDDV virus according to Patent 2, where the PCR reaction solution consists of the following: RB ATPase-Fl 0.5 µl, RB ATPase-Rl 0.5 µl, reaction buffer solution 2.5 µl, DNTPS 0.5 µl, TAC DNA polymerase 0.25 µl, template DNA 2.0 µl, distilled water 18.75 µl. 5. กรรมวิธีการตรวจหาเชื้อไวรัสเอสดีดีวี ตามข้อถือสิทธิ 2 ที่ซึ่ง สภาวะที่ใช้ในการทำปฏิกิริยาพีซีอาร์ มีดังนี้ 94 องศา C, 5 นาทํ 94 องศา C, 30 วินาที, 60 ?C, 30 วินาที, 72 ?C, 30 วินาที 30 รอบ หน้า 2 ของจำนวน 2 หน้า และ 72 องศา C, 5 นาที5. The method for detecting the SDDV virus, as per claim 2, where the PCR reaction conditions are as follows: 94 °C, 5 min; 94 °C, 30 sec; 60 °C, 30 sec; 72 °C, 30 sec; 30 cycles; and 72 °C, 5 min. (Page 2 of 2) 6. กรรมวิธีการตรวจหาเชื้อไวรัสเอสดีดีวี ตามข้อถือสิทธิ 2 ที่ซึ่ง สารละลายที่ใช้ในการทำปฏิกิริยาเซมิ- เนสเตด พีซีอาร์ มีดังนี้ RB ATPase-Fl 0.4 ไมโครลิตร RB ATPase-R2 0.4 ไมโครลิตร สารละลายบัฟเฟอร์สำหรับทำปฏิกิริยา 2.0 ไมโครลิตร ดีเอ็นทีพีเอส 0.4 ไมโครลิตร แทคดีเอ็นเอโพลิเมอเรส 0.2 ไมโครลิตร ผลิตภัณฑ์พีซีอาร์ 5.0 ไมโครลิตร น้ำกลั่น 11.6 ไมโครลิตร6. Procedure for detecting the SDDV virus according to Patent 2, where the solutions used in the semi-nested PCR reaction are as follows: RB ATPase-Fl 0.4 µl, RB ATPase-R2 0.4 µl, reaction buffer solution 2.0 µl, DNTPS 0.4 µl, TAC DNA polymerase 0.2 µl, PCR product 5.0 µl, distilled water 11.6 µl. 7. กรรมวิธีการตรวจหาเชื้อไวรัสเอสดีดีวิ ตามข้อถือสิทธิ 2 ที่ซึ่ง สภาวะที่ใช้ในการทำปฏิกิริยาเซมิ-เนสเตด พีซีอาร์ มีดังนี้ 94 องศา C, 5 นาที 94 องศา C, 30 วินาที , 67 องศา C, 30 วินาที, 72 องศา c, 30 วินาที 30 รอบ และ 72 องศา C, 5นาที7. The method for detecting the SDG virus under claim 2, where the conditions used for the semi-nested PCR reaction are as follows: 94°C, 5 minutes; 94°C, 30 seconds; 67°C, 30 seconds; 72°C, 30 seconds (30 cycles); and 72°C, 5 minutes.
TH1803001575U 2018-07-13 A primer kit for detecting SDDV virus and the method of detection using such primers. TH18052Y (en)

Publications (4)

Publication Number Publication Date
TH18052A3 TH18052A3 (en) 2021-07-15
TH18052U true TH18052U (en) 2021-07-15
TH18052C3 TH18052C3 (en) 2021-07-15
TH18052Y TH18052Y (en) 2021-07-15

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2018117645A5 (en)
EP0359789A1 (en) Amplification and detection of nucleic acid sequences.
JP2009268404A (en) Method for extracting dna of bursaphelenchus xylophilus from wood chip, lamp primer set of bursaphelenchus xylophilus, and method for detecting bursaphelenchus xylophilus from wood chip
JP2013055956A5 (en)
CN101522919A (en) Sequences diagnostic for shrimp pathogens
JP2018516594A5 (en)
Aifat et al. Optimization of partial Cyt b gene sequence from selected ancient Presbytis museum skin specimens
CN113881757A (en) Method for detecting mutton-derived gene based on CRISPR system
JP2009183228A (en) Detection method and detection reagent kit for crustacean pathogenic virus by LAMP method
Kojima et al. Genomic analysis of a recently identified virus (SEN virus) and genotypes D and H by polymerase chain reaction
EP4219770A3 (en) Compositions and methods for detection of rsv b in samples
CN105543415A (en) Nest type PCR detection method for different variants of ostreid herpes virus
CN105986044B (en) Avian influenza virus nucleic acid General rapid detection method
TH18052Y (en) A primer kit for detecting SDDV virus and the method of detection using such primers.
CN102399776A (en) Quadruple PCR Primers and Identification Method of Microsatellite Markers in Chinese Shrimp Families
CN111876498B (en) Molecular identification method for Spanish mackerel and Spanish mackerel
CN105296669A (en) RT-LAMP detection primer set, kit and detection method for infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV)
NO20130468A1 (en) COMPAS-PCR Method and Methods for Detection, Identification or Monitoring of Salmon Species and / or Gender
DE602004030036D1 (en) Multiplex analysis of nucleic acids for the determination of human papillomavirus genotypes
Mubemba et al. Evaluation of positive Rift Valley fever virus formalin-fixed paraffin embedded samples as a source of sequence data for retrospective phylogenetic analysis
WO2017209599A1 (en) Method and kit for simultaneous and rapid detection of prawn viruses
CN101942507A (en) Method for rapidly detecting chain alexandrum by adopting LAMP (Loop-Mediated Isothermal Amplification) technology
CN100594240C (en) Multiple PCR determination technology for antibiotic resistance gene of animal derived bacterium chloromycetin drug
CN117551791B (en) Primer combinations, applications, identification methods and kits for identification of common Chinese oyster genus by specific multiplex PCR
RU2722137C1 (en) Method for diagnosis of cattle leukaemia using pcr in real time