TH12114C3 - ลำดับนิวคลีโอไทด์สำหรับตรวจอาหารที่ปลอมปนหรือปนเปื้อนด้วยเนื้อปลาปักเป้า - Google Patents
ลำดับนิวคลีโอไทด์สำหรับตรวจอาหารที่ปลอมปนหรือปนเปื้อนด้วยเนื้อปลาปักเป้าInfo
- Publication number
- TH12114C3 TH12114C3 TH1303001601U TH1303001601U TH12114C3 TH 12114 C3 TH12114 C3 TH 12114C3 TH 1303001601 U TH1303001601 U TH 1303001601U TH 1303001601 U TH1303001601 U TH 1303001601U TH 12114 C3 TH12114 C3 TH 12114C3
- Authority
- TH
- Thailand
- Prior art keywords
- primer
- puffers
- probe
- ipc
- puffer fish
- Prior art date
Links
- 239000000872 buffer Substances 0.000 title claims abstract 43
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 title claims abstract 18
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 title claims abstract 10
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 title claims abstract 10
- 235000013305 food Nutrition 0.000 title claims abstract 9
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims abstract 28
- 241001441724 Tetraodontidae Species 0.000 claims abstract 19
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 claims abstract 10
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims abstract 6
- ABZLKHKQJHEPAX-UHFFFAOYSA-N tetramethylrhodamine Chemical compound C=12C=CC(N(C)C)=CC2=[O+]C2=CC(N(C)C)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C([O-])=O ABZLKHKQJHEPAX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 5
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract 4
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 claims 2
- UDGUGZTYGWUUSG-UHFFFAOYSA-N 4-[4-[[2,5-dimethoxy-4-[(4-nitrophenyl)diazenyl]phenyl]diazenyl]-n-methylanilino]butanoic acid Chemical compound COC=1C=C(N=NC=2C=CC(=CC=2)N(C)CCCC(O)=O)C(OC)=CC=1N=NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 UDGUGZTYGWUUSG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 108050009160 DNA polymerase 1 Proteins 0.000 claims 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims 1
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 claims 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 claims 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 claims 1
- UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N triphosphoric acid Chemical compound OP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 235000019688 fish Nutrition 0.000 abstract 15
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 abstract 7
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract 7
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 abstract 4
- 241000238557 Decapoda Species 0.000 abstract 4
- 241000723298 Dicentrarchus labrax Species 0.000 abstract 4
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 abstract 4
- 241000123826 Lutjanus campechanus Species 0.000 abstract 4
- 241000269821 Scombridae Species 0.000 abstract 4
- 235000013330 chicken meat Nutrition 0.000 abstract 4
- 235000020640 mackerel Nutrition 0.000 abstract 4
- 235000015277 pork Nutrition 0.000 abstract 4
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 abstract 4
- 235000015278 beef Nutrition 0.000 abstract 3
- 238000011109 contamination Methods 0.000 abstract 3
- 241000285661 Colomesus asellus Species 0.000 abstract 2
- 239000003086 colorant Substances 0.000 abstract 1
Abstract
DC60 (18/09/58) แต่ละชุดของไพรเมอร์และโพรบนี้ ประกอบไปด้วย ลำดับนิวคลีโอไทด์ของไพรเมอร์ซึ่งมีทั้ง ฟอร์เวิร์ด (forward) และ รีเวิร์ส ไพรเมอร์ (reverse primer) และลำดับนิวคลีโอไทด์ของโพรบซึ่งติด ฉลากด้วยสีฟลูออเรสเซนส์ ที่แตกต่างกันในโพรบของบัฟเฟอร์ เซ็ต (puffers set) และ ไอพีซี เซ็ต (IPC set) โดยที่ฟลูออเรสเซนส์นี้จะถูกกระตุ้นได้ด้วยความยาวคลื่นที่แตกต่างกัน ซึ่งในที่นี้จะติด ฉลากด้วย TAMRA และ FAM ตามลำดับ โดยชุดไพรเมอร์และโพรบของบัฟเฟอร์ เซ็ต (puffers set) จะตรวจหาปลาปักเป้าที่ปลอมปนอยู่ในอาหารได้ถึงระดับต่ำสุด 175 พิโคกรัมของปริมาณจีโนมิกดี เอ็นเอปลาปักเป้าหรือประมาณ 100 เซลล์ของเนื้อปลาปักเป้า และชุดไพรเมอร์ บัฟเฟอร์ (puffers) สามารถเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมได้เฉพาะปลาปักเป้าเท่านั้น ส่วนชุดไพรเมอร์ไอพีซี (IPC) จะ สามารถเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมได้สำหรับดีเอ็นเอของปลาอื่นๆด้วย เช่น ปลาแซลมอน ปลากะพง ขาว ปลากะพงแดง ปลาทูน่า ปลาอินทรี รวมทั้งเนื้อสัตว์อื่นๆ เช่น กุ้ง เนื้อหมู เนื้อไก่และเนื้อวัว แก้ไข 18/09/2558 แต่ละชุดของไพรเมอร์และโพรบนี้ ประกอบไปด้วย ลำดับนิวคลีโอไทด์ของไพรเมอร์ซึ่งมีทั้ง ฟอร์เวิร์ด (forward) และ รีเวิร์ส ไพรเมอร์ (reverse primer) และลำดับนิวคลีโอไทด์ของโพรบซึ่งติด ฉลากด้วยสีฟลูออเรสเซนส์ ที่แตกต่างกันในโพรบของบัฟเฟอร์ เซ็ต (puffers set) และ ไอพีซี เซ็ต (IPC set) โดยที่ฟลูออเรสเซนส์นี้จะถูกกระตุ้นได้ด้วยความยาวคลื่นที่แตกต่างกัน ซึ่งในที่นี้จะติด ฉลากด้วย TAMRA และ FAM ตามลำดับ โดยชุดไพรเมอร์และโพรบของบัฟเฟอร์ เซ็ต (puffers set) จะตรวจหาปลาปักเป้าที่ปลอมปนอยู่ในอาหารได้ถึงระดับต่ำสุด 175 พิโคกรัมของปริมาณจีโนมิกดี เอ็นเอปลาปักเป้าหรือปริมาณ 100 เซลล์ของเนื้อปลาปักเป้า และชุดไพรเมอร์ บัฟเฟอร์ (puffers) สามารถเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมได้เฉพาะปลาปักเป้าเท่านั้น ส่วนชุดไพรเมอร์ไอพีซี (IPC) จะ สามารถเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมได้สำหรับดีเอ็นเอของปลาอื่น ๆ ด้วย เช่น ปลาแซลมอน ปลากะพง ขาว ปลากะพงแดง ปลาทูน่า ปลาอินทรี รวมถึงเนื้อสัตว์อื่นๆ เช่น กุ้ง เนื้อหมู เนื้อไก่และเนื้อวัว ---------------------------------------------- แก้ไข 18/9/2558 แต่ละชุดของไพรเมอร์และโพรบนี้ ประกอบไปด้วย ลำดับนิวคลีโอไทด์ของไพรเมอร์ซึ่งมีทั้ง ฟอร์เวิร์ด (forward) และ รีเวิร์ส ไพรเมอร์ (reverse primer) และลำดับนิวคลีโอไทด์ของโพรบซึ่งติด ฉลากด้วยสีฟลูออเรสเซนส์ ที่แตกต่างกันในโพรบของบัฟเฟอร์ เซ็ต (puffers set) และ ไอพีซี เซ็ต (IPC set) โดยที่ฟลูออเรสเซนส์นี้จะถูกกระตุ้นได้ด้วยความยาวคลื่นที่แตกต่างกัน ซึ่งในที่นี้จะติด ฉลากด้วย TAMRA และ FAM ตามลำดับ โดยชุดไพรเมอร์และโพรบของบัฟเฟอร์ เซ็ต (puffers set) จะตรวจหาปลาปักเป้าที่ปลอมปนอยู่ในอาหารได้ถึงระดับต่ำสุด 175 พิโคกรัมของปริมาณจีโนมิกดี เอ็นเอปลาปักเป้าหรือปริมาณ 100 เซลล์ของเนื้อปลาปักเป้า และชุดไพรเมอร์ บัฟเฟอร์ (puffers) สามารถเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมได้เฉพาะปลาปักเป้าเท่านั้น ส่วนชุดไพรเมอร์ไอพีซี (IPC) จะ สามารถเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมได้สำหรับดีเอ็นเอของปลาอื่น ๆ ด้วย เช่น ปลาแซลมอน ปลากะพง ขาว ปลากะพงแดง ปลาทูน่า ปลาอินทรี รวมถึงเนื้อสัตว์อื่นๆ เช่น กุ้น เนื้อหมู เนื้อไก่และเนื้อวัว ------------------------------------------------------------------------------------------- แต่ละชุดของไพรเมอร์และโพรบนี้ ประกอบไปด้วย ลำดับนิวคลีโอไทด์ของไพรเมอร์ซึ่งมี ทั้ง forward และ reverse primer และลำดับนิวคลีโอไทด์ของโพรบซึ่งติดฉลากด้วยสีฟลูออเรส เซนส์ ที่แตกต่างกันในโพรบของ puffers setและ IPC set โดยที่ฟลูออเรสเซนส์นี้จะถูกกระตุ้นได้ ด้วยความยาวคลื่นที่แตกต่างกัน ซึ่งในที่นี้จะติดฉลาก TAMRA และ FAM ตามลำดับ โดยชุด ไพรเมอร์และโพรบของ puffers set จะตรวจหาปลาปักเป้าที่ปลอมปนอยู่ในอาหารได้ถึงระดับ ต่ำสุด 175 พิโคกรัมของปริมาณจีโสมิกดีเอ็นเอปลาปักเป้าหรือปริมาณ 100 เซลล์ของเนื้อปลา ปักเป้า และชุดไพรเมอร์ puffers สามารถเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมได้เฉพาะปลาปักเป้าเท่านั้น ส่วนชุดไพรเมอร์ IPC จะสามารถเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมได้สำหรับดีเอ็นเอของปลาอื่น ๆ เวย เช่น ปลาแซลมอน ปลากะพงขาว ปลากะพงแดง ปลาทูน่า ปลาอินทรี รวมถึงเนื้อสัตว์อื่นๆ เช่น กุ้น เนื้อหมู เนื้อไก่และเนื้อวัว
Claims (1)
1. ลำดับนิวคลีโอไทด์สำหรับตรวจอาหารที่ปลอมปนหรือปนเปื้อนด้วยเนื้อปลาปักเป้า ตามการประดิษฐ์นี้มี ชุดไพรเมอร์และโพรบทั้งสองชุด ดังต่อไปนี้ คือ a.puffers_forward 5\'AAAAAGCAGAGATTAAACCTCGTACCTTTT 3\' b.puffers_Reverse 5\'AGTTCTCGGGCAACCAGCTAT 3\' c.puffers_probe 5\'TAMRA TCCCCGAAACTGGACGAGCTACTCCAAGACAGCCT BHQ2 3\' d.IPC_forward 5\'AAGCTCCATAGGGTCTTCTCGTCTTATG 3\' e.IPC_Reverse 5\'CCTGTTTACCAAAAACATCGCYTCTT 3\' f.IPC1_probe 5\'FAM-ACGGTCAAAATACCGCGGCCGTT-BHQ1 3\' g.IPC2_probe 5\'FAM-ACGGTTAAAATACCGCGGCCGTT-BHQ1 3\'
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| TH12114C3 true TH12114C3 (th) | 2016-11-11 |
| TH12114A3 TH12114A3 (th) | 2016-11-11 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Haye et al. | Authentication of commercialized crab-meat in Chile using DNA Barcoding | |
| Sun et al. | Sensitive and rapid detection of infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus (IHHNV) in shrimps by loop-mediated isothermal amplification | |
| Trotta et al. | Multiplex PCR method for use in real-time PCR for identification of fish fillets from grouper (Epinephelus and Mycteroperca species) and common substitute species | |
| Pepe et al. | Fish species identification in surimi-based products | |
| Jaroenram et al. | Rapid and sensitive detection of white spot syndrome virus by loop-mediated isothermal amplification combined with a lateral flow dipstick | |
| Khunthong et al. | Rapid and sensitive detection of shrimp yellow head virus by loop-mediated isothermal amplification combined with a lateral flow dipstick | |
| Tang et al. | Postlarvae and juveniles of a selected line of Penaeus stylirostris are resistant to infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus infection | |
| Comi et al. | Molecular methods for the differentiation of species used in production of cod-fish can detect commercial frauds | |
| Andrade et al. | Real-time reverse transcription polymerase chain reaction assay using TaqMan probe for detection and quantification of infectious myonecrosis virus (IMNV) | |
| Munir et al. | Detection of infectious salmon anaemia virus by real-time RT–PCR | |
| Yang et al. | An improved recombinase polymerase amplification assay for visual detection of Vibrio parahaemolyticus with lateral flow strips | |
| CN104404145B (zh) | 一种基于lamp方法快速检测肉类掺假的试剂盒 | |
| Zagon et al. | A novel screening approach based on six real-time PCR systems for the detection of crustacean species in food | |
| Bak et al. | Occurrence of anisakid nematode larvae in chub mackerel (Scomber japonicus) caught off Korea | |
| Schmidt et al. | PCR–RFLP analysis to identify four ray species of the genus Dasyatis (Elasmobranchii, Dasyatidae) fished along the southeastern and southern coast of Brazil | |
| Chen et al. | Differentiation of fish species in Taiwan Strait by PCR-RFLP and lab-on-a-chip system | |
| Dalama et al. | Detection of the causal agents of Keriorrhea (Lepidocybium flavobrunneum and Ruvettus pretiosus) by means of real time PCR | |
| Liu et al. | Development of cross-priming amplification coupled with vertical flow visualization for rapid detection of infectious spleen and kidney necrosis virus (ISKNV) in mandarin fish, Siniperca chuatsi | |
| You et al. | Species-specific multiplex real-time PCR assay for identification of deer and common domestic animals | |
| CN102899394A (zh) | 特定肉制品的lamp法检测试剂盒及检测方法 | |
| Schiefenhövel et al. | Differentiation of Sparidae species by DNA sequence analysis, PCR-SSCP and IEF of sarcoplasmic proteins | |
| Chen et al. | Rapid visual detection of anisakid nematodes using recombinase polymerase amplification and SYBR Green I | |
| Lakemeyer et al. | Anisakid nematode species identification in harbour porpoises (Phocoena phocoena) from the North Sea, Baltic Sea and North Atlantic using RFLP analysis | |
| Cong et al. | Development of a real-time reverse transcription recombinase polymerase amplification assay for rapid detection of spring viremia of carp virus | |
| Chiu et al. | Genetic diversity of ivory shell (Babylonia areolata) in Taiwan and identification of species using DNA-based assays |