SU659573A1 - Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени - Google Patents
Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получениInfo
- Publication number
- SU659573A1 SU659573A1 SU772491239A SU2491239A SU659573A1 SU 659573 A1 SU659573 A1 SU 659573A1 SU 772491239 A SU772491239 A SU 772491239A SU 2491239 A SU2491239 A SU 2491239A SU 659573 A1 SU659573 A1 SU 659573A1
- Authority
- SU
- USSR - Soviet Union
- Prior art keywords
- spin
- labeled
- cytidine
- oxyl
- tetramethyl
- Prior art date
Links
Landscapes
- Saccharide Compounds (AREA)
Description
(54) СПИН-МЕЧЕНЫЕ ПРОИЗВОДНЫЕ ОЛИГОРИБОНУКЛЕОТИДОВ
Claims (2)
- КАК СПИНОВЫЕ ЗОНДЫ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ МЕХАНИЗМА ДЕЙСТВИЯ ФЕРМЕНТОВ И СПОСОБ ИХ ПОЛУЧЕНИЯ полученных спин-меченых динуклеозид монофосфатов с нуклеозид-5-дифосфатами при участий полинуклеотидфосфорилазы в трис-буфере при рН 9,0-9,2. Получение исходных веществ. Пример 1. (1-ОКСИЛ-2 ,2 , 5 -тетраметил-З-карбонилпирролин)-аденозин-2 (3 )-фосфат. К суспензии 0,2 г (0,47 М) Ру-сол аденозин-2 (З)-фосфата в 3 мл абсолютного пиридина добавл ют хлорангид рид, полученный из 1,1 г 2,2,5,5-тет раметил-З-карбоксипирролин-1-оксила в 2,5 мл абсолютного пиридина при охлаждении в бане из сухого льда и . ацетона. Образовавшийс раствор оставл ют рри комнатной температуре на 3,5 ч. Выпавший осадок отфильтровывают и промывают абсолютным пириди ном. К охлажденному фильтрату добавл ют 3,5 мл дистиллированной воды и раствор экстрагируют три раза хлороформом (20, 10, 5 мл). Хлороформный слой сушат безводным .и упарива досуха при комнатной температуре. К осадку добавл ют 8 мл 50%-ного водного пиридина, раствор охлаждают, приливают 7 мл предварительно охла1жденнрго 2 н.. NaOH и оставл ют при комнатной температуре на 15 мин. Затем быстро добавл ют Дауэкс 50x4 (100-200 мевд) в Ру форме до рН 7,5. Смолу отфильтровывают и промывают трем объемами 2 М водного пиридина . Фильтрат и каждую из промывок пропускают через колонку с 40 мл свеже го Дауэкс 50x4 (100-200 меш) в РуФорме . Объединенные промывки упаривают при добавлении пиридина до выпадени осадка кислоты. Из этой сме си (рН 6-7) кислоту-раликал экстраг гируют эфиром (л-10О мл) . Водный ра.с вор упарившот на роторе при комнатной температуре досуха. Получают 0,19 г спин-меченого производного, загр зненного исходным нуклеотидом, Далее очистку провод т методом препаративной БХ в системе (А). Выход 60%-, RJ 0,61 (А); ,8б Уфспектр:Л д (.282 нм. 4 Пример 2. N -(1-оксил 2 ,2,5,5-тетраметил-З-карбонилпирролин )-цитидин-2(з)-фосфат получают аналогично описанному в примере 1 . Врем гидролиза перацильного производного 30 мин. Выход 70%J R 0,69 (А)г Уф-спектр: /.д,д,260, 303 НМ. Пример 3. (1-оксил2 ,2 ,,5-тетраметил-З-карбонилпирролин )-цитидин получают аналогично описанному в примере 1. Очистку про вод т методом препаративной ТСХ на пластинках из силуфола в системе н- бутанрл, насыщенный водой. С адсо бента спин-меченый цитидин элюируют этанолом. Выход 60%; Rj 0,84 (Б); 1,12. Т.пл. 132-134 . УФ-спектр Л7лс кс2бО, 303 нм. Спектр ЭПР (хлоро орм): N 15,6; содержание спинов: , 8- 10 спин/моль. Дл Н. 25 N40/ ычислено, %: С 52,80; Н б,1б;Ы 13,68. Найдено, %: С 53,19; 52,97; 6,45; 6,35; N 13,93; 13,81. Пример 4. (l-oкcил ,2,5,5-тетраметил-З-карбонилпирроин ) -цитидин-2, 3-циклофосфат .153 о.е . (8 мкМ) спин-меченого цитидин-2 (3)осфата раствор ют в 1 мл воды, дово т рН раствора 0,1 н. НС6 до 6,0 и добавл ют 25 мг п-толуолсульфоната циклогексил- )i- N- (N-метилморфолиний) -этилкарбодиамида . Реакционную смесь оставл ют на 4 ч при комнатной температуре , поддержива рН равным примерно 6,0. Затем реакционную смесь упаривают досуха на роторе. Остаток промывают несколько раз эфиром, после чего раствор ют в небольшом количестве дистиллированной воды и дел т методом препаративного электрофореза на бумаге. После обессоливани в системе этанол:вода-7 : 3 получаиот 85 о.е. (56%) хроматографически чистого циклофосфата . R,: 0,91 (А); U 0,62: УФ-спектр: , 303 нм. Пример 5. N -(1-оксил-2,2,5,5-тeтpaмeтил-3-кapбoнилпиppoлин ) -аденозин-2 , 3-циклофосфат получают аналогично описанному в примере 4. Выход 52%; RJ 0,85 (А); О 64 ; УФ-спектр: (ис282 нм. Получение целевбго продукта. П р и М е р 6. (1-оксил-2,2,5,5-тетраметил-3-карбонилпирролин )-цитидилил- ()-цитидин. 136 о.е. (8 мкМ) спин-меченого цитидин-2,3-цйклофосфата и 80 мкМ цитидина в ОД6 мл ОР5 М трис-НСе-буфера (рН 7,6), содержащего панкреатическую рибонуклеазу в концентрации 0,16 , инкубируют при 0-4°С около двух недель . Спин-меченый цитидилил-( )-цитидин выдел ют методом препаративного электрофореза на бумаге. Дополнительную очистку провод т, хроматографиру в системе (Б). Получают 23 о.е. (30%). Rf 0,84 (А); ,58; УФ-спектр :Лдлакс262Г, 303 нм. П р и М е р 7. Гуанилил-( ) (1-ОКСИЛ-2,2,5, 5-тетраметил-З-карбонилпирролин )-цитидин. 60 мкМ гуанозин-2,3-циклофосфата (гуанидиниева соль) и 180 мкМ спин-меченого цитидина в б мл 0,01 М фосфатного буфера рН 7,0), содержащего рибонуклеазу Т в концентрации 50 ед.акт/мл, инкубируют в течение 5-6 ч при . Затем реакционную смесь дел т методом препаративного электрофореза на бумаге. Полосы, ,со- держащие спин-меченый гуанилил-().-цитидин , прищивают к новым листам бумаги и хроматографируют в системе .В. Получают 153 о.е. ( 5 мкМ). Выход 20%; R 0,7 (Б); UOTH 1/5;. УФ-спектр :Л,щ. 259, 302 нм. 5 Примере. Гуанилил-()-N- {1-ОКСИЛ-2 ,2,5, 5-тетрс1метил-3карбонилпирролин , -цитидил-( з-гЗ)-уридин . 145 о.е. (5 мкМ) GpC , 2,5 мкМ уридин-Б-дифосфата (динатриева соль) и 3 мг ПНФ-азы М. lysodeiticus раствор ют в 0,5 мл 0,05 М трис-НС8-буфера {рН 9,0-9,2) содержащего 0,01 М МдСВг и 0,05 мМ ЭДТА, и инкубируют при 36-37°С. Через 2 ч всю реакционную смесь нанос т на бумагу и хроматографируют в системе Б. Полосы, соответствующие различным компонентам реакционной смеси, элюируют. водой и дополнитель но очищают с помощью электрофореза и хроматографии в системе.А. Получают 10 о.е. (15%) (Rp(Up) 1,55 (А); иот.„0,б5; УФ-спектр: Л |,дс(кс 259, 307 нм) и 5 о.е. GpCp ™upU (WUp) 1,02 (А); иотнО68; УФ-спектр Vc,Kc259, 307 нм) . Хрсииатографию и электрофорез пров д т на бумаге марки ленинградска М И FN-3. При хроматографии ис-. пользуют следующие системы растворителей: этанол - 1 М ацетат аммони (рН 7,5), 7:3 (А); этанол - концентрированный аммиак - вода-65:10:25 (Б); изопропанол-концентрированный аммиак - вода-7:2:1 (В). Электрофорез на бумаге провод т в приборе Дл вертикального электрофореза фир1ии Labor (Венгри ) в течение 2 ч с градиентом напр жени 20 В/см в 0,0 триэтилс1ммонийбикар6онате, рЛ 7,5. Формула изобретени . - , I. Спин-меченые производные олиго рибонуклеотидов общей формулы NpN , 3 NpN и NpNpN, где Np ч N - нуклеотиды и нуклеозиды пиримидинового и пуринового р да; Np и производные аденозин-3-фосфата или иитидин-З-фосфата и соответственно цитидина, содержащие спиновую, метку в виде остатка 1-оксил-2,2,5,5-тетраметил-3-карбонилпирролина в качестве заместител по амино-группе адеиина или цитозина, спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов . 2. Способ получени соединений ПОП.1, отличающийс тем, что спин-меченые нуклеозид-2, 3-циклофосфаты или нуклеозиды пиримидинового и пуринового р да подвергают взаимодействию соответственно с нуклеозидами или нуклеотидами при температуре 0-4°С в присутствии специфических рибонуклеаз в соответствующем буферном растворе с последующим взаимодействием при температуре 36-37 с полученных спин-меченых динуклеозидмонофосфатов с нуклеозид-5-дифосфатами при участии полинуклеотидфосфорилазн в трис-буфере при рН 9,0-9,2. Источники информации, прин тые во внимание при экспертизе 1.Сухоруков Б.И., Петров А.И, Спин-меченые нуклеозиды, нуклеозид-5-моно- ,ди- и -трифосфаты.- Биофизика , 1975, Ifl, с.965.
- 2.Табак М., Рууге Э.К., Смирнова И.Н., Петров А.И., Сухоруков Б.И., Твердислов В.А. Взаимодействие мембранного препарата Na, К-АТФ-азы со , -Ь d 14 «л |1 Л С А О. ЗОЛ j спин-меченым аналогом АТФ.-Биохими , 1977, 42, 3, с. 476.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU772491239A SU659573A1 (ru) | 1977-05-31 | 1977-05-31 | Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU772491239A SU659573A1 (ru) | 1977-05-31 | 1977-05-31 | Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SU659573A1 true SU659573A1 (ru) | 1979-04-30 |
Family
ID=20711196
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SU772491239A SU659573A1 (ru) | 1977-05-31 | 1977-05-31 | Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
SU (1) | SU659573A1 (ru) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS57182650A (en) * | 1981-05-06 | 1982-11-10 | Mitsubishi Chem Ind Ltd | Detection method for gene by oligoliponucleotide |
EP0286898A2 (en) * | 1982-06-23 | 1988-10-19 | Enzo Biochem, Inc. | Modified labeled nucleotides and polynucleotides and methods of preparing, utilizing and detecting same |
US7220854B1 (en) | 1982-06-23 | 2007-05-22 | Enzo Life Sciences, Inc. C/O Enzo Biochem, Inc. | Sugar moiety labeled nucleotide, and an oligo- or polynucleotide, and other compositions comprising such sugar moiety labeled nucleotides |
-
1977
- 1977-05-31 SU SU772491239A patent/SU659573A1/ru active
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS57182650A (en) * | 1981-05-06 | 1982-11-10 | Mitsubishi Chem Ind Ltd | Detection method for gene by oligoliponucleotide |
EP0286898A2 (en) * | 1982-06-23 | 1988-10-19 | Enzo Biochem, Inc. | Modified labeled nucleotides and polynucleotides and methods of preparing, utilizing and detecting same |
US7220854B1 (en) | 1982-06-23 | 2007-05-22 | Enzo Life Sciences, Inc. C/O Enzo Biochem, Inc. | Sugar moiety labeled nucleotide, and an oligo- or polynucleotide, and other compositions comprising such sugar moiety labeled nucleotides |
US8097405B1 (en) | 1982-06-23 | 2012-01-17 | Enzo Biochem, Inc. | Nucleic acid sequencing processes using non-radioactive detectable modified or labeled nucleotides or nucleotide analogs, and other processes for nucleic acid detection and chromosomal characterization using such non-radioactive detectable modified or labeled nucleotides or nucleotide analogs |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Khorana et al. | Cyclic phosphates. III. Some general observations on the formation and properties of five-, six-and seven-membered cyclic phosphate esters | |
Ralph et al. | Studies on Polynucleotides. XI. 1 Chemical Polymerization of Mononucleotides. The Synthesis and Characterization of Deoxyadenosine Polynucleotides2 | |
WO1990008155A1 (en) | Biologically reversible phosphate and phosphonate protective groups | |
CA2089668A1 (en) | Oligo (alpha-arabinofuranosyl nucleotides) and alpha-arabinofuranosyl precursors thereof | |
DE2628202A1 (de) | Verfahren zur herstellung von 2'-substituierten-d-ribofuranosylpurinderivaten | |
Holý et al. | Synthesis of isomeric and enantiomeric O-phosphonylmethyl derivatives of 9-(2, 3-dihydroxypropyl) adenine | |
Adamiak et al. | Nucleoside 3′ phosphotriesters as key intermediates for the oligoribonucleotide synthesis. III. An improved preparation of nucleoside 3′-phosphotriesters, their 1H NMR characterization and new conditions for removal of 2-cyanoethyl group | |
Brown et al. | 12. Nucleotides. Part IX. The synthesis of adenylic acids a and b from 5′-trityl adenosine | |
Michelson et al. | Nucleotides. Part XXIII. Mononucleotides derived from deoxycytidine. Note on the structure of cytidylic acids a and b | |
Drummond et al. | Deoxyribonucleoside-3′, 5′ Cyclic Phosphates. Synthesis and Acid-Catalyzed and Enzymic Hydrolysis | |
Rammler et al. | Nucleoside phosphonic acids. II. The synthesis of 5'-deoxythymidine 5'-phosphonic acid and its pyrophosphate derivatives | |
SU659573A1 (ru) | Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени | |
Kenner | The Chemistry of Nucleotides. | |
US3787392A (en) | Process for the preparation of nucleoside diphosphate esters | |
GB2100721A (en) | Neplanocin a derivatives with antitumor activity | |
Séquin et al. | Nucleosides and Nucleotides. Part 2: Synthesis of both anomers of 1‐(5′‐O‐phosphoryl‐2′‐deoxy‐d‐ribofuranosyl)‐2 (1H)‐pyridone [1] | |
Ikehara et al. | Studies on Nucleosides and Nucleotides. LXXXIX. Purine Cyclonucleosides.(43). Synthesis and Properties of 2'-Halogeno-2'-deoxyguanosines | |
Bennett et al. | 2'-0-(α-Methoxyethyl) nucleoside 5'-diphosphates as single-addition substrates in the synthesis of specific oligoribonucleotides with polynucleotide phosphorylase | |
Ohtsuka et al. | Transfer ribonucleic acids and related compounds. II. A method for synthesis of protected ribooligonucleotides using a ribonuclease | |
Nagyváry | Studies on the Specific Synthesis of the Natural Internucleotide Linkage by the Use of Cyclonucleosides. I. The Utilization of Unprotected Nucleotides | |
Točík et al. | Electrophile-promoted addition of hydroxymethylphosphonate to 4′, 5′-didehydronucleosides: A way to novel isosteric analogues of 5′-nucleotides | |
Nishino et al. | Partial protection of carbohydrate derivatives. part 18. simple, preparative procedure for 5'-o-acylribonucleosides; highly regioselective o-deacylation at 2'and 3'positions of fully acylated purine and pyrimidine ribonucleoside through sodium methoxide-thf system | |
Ohtsuka et al. | Stereoselective synthesis of dinucleoside phosphate aryl esters by using new condensing reagents, arenesulfonyl 5-(pyridin-2-yl)-tetrazole | |
SANEYOSHI et al. | Synthetic Nucleosides and Nucleotides. VI. On the Several Routes for the Syntheses of 4-Thiouridylic Acid Homologues | |
Van Boom et al. | The preparation of diribonucleoside monophosphates containing 4‐thiouridine via the phosphotriester approach |