SU659573A1 - Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени - Google Patents

Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени

Info

Publication number
SU659573A1
SU659573A1 SU772491239A SU2491239A SU659573A1 SU 659573 A1 SU659573 A1 SU 659573A1 SU 772491239 A SU772491239 A SU 772491239A SU 2491239 A SU2491239 A SU 2491239A SU 659573 A1 SU659573 A1 SU 659573A1
Authority
SU
USSR - Soviet Union
Prior art keywords
spin
labeled
cytidine
oxyl
tetramethyl
Prior art date
Application number
SU772491239A
Other languages
English (en)
Inventor
Софья Мустафинична Женодарова
Валентина Александровна Поротикова
Вера Павловна Клягина
Ренат Ибрагимович Жданов
Original Assignee
Институт биологической физики АН СССР
Научно-Исследовательский Институт По Биологическим Испытаниям Химических Соединений
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Институт биологической физики АН СССР, Научно-Исследовательский Институт По Биологическим Испытаниям Химических Соединений filed Critical Институт биологической физики АН СССР
Priority to SU772491239A priority Critical patent/SU659573A1/ru
Application granted granted Critical
Publication of SU659573A1 publication Critical patent/SU659573A1/ru

Links

Landscapes

  • Saccharide Compounds (AREA)

Description

(54) СПИН-МЕЧЕНЫЕ ПРОИЗВОДНЫЕ ОЛИГОРИБОНУКЛЕОТИДОВ

Claims (2)

  1. КАК СПИНОВЫЕ ЗОНДЫ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ МЕХАНИЗМА ДЕЙСТВИЯ ФЕРМЕНТОВ И СПОСОБ ИХ ПОЛУЧЕНИЯ полученных спин-меченых динуклеозид монофосфатов с нуклеозид-5-дифосфатами при участий полинуклеотидфосфорилазы в трис-буфере при рН 9,0-9,2. Получение исходных веществ. Пример 1. (1-ОКСИЛ-2 ,2 , 5 -тетраметил-З-карбонилпирролин)-аденозин-2 (3 )-фосфат. К суспензии 0,2 г (0,47 М) Ру-сол аденозин-2 (З)-фосфата в 3 мл абсолютного пиридина добавл ют хлорангид рид, полученный из 1,1 г 2,2,5,5-тет раметил-З-карбоксипирролин-1-оксила в 2,5 мл абсолютного пиридина при охлаждении в бане из сухого льда и . ацетона. Образовавшийс  раствор оставл ют рри комнатной температуре на 3,5 ч. Выпавший осадок отфильтровывают и промывают абсолютным пириди ном. К охлажденному фильтрату добавл ют 3,5 мл дистиллированной воды и раствор экстрагируют три раза хлороформом (20, 10, 5 мл). Хлороформный слой сушат безводным .и упарива досуха при комнатной температуре. К осадку добавл ют 8 мл 50%-ного водного пиридина, раствор охлаждают, приливают 7 мл предварительно охла1жденнрго 2 н.. NaOH и оставл ют при комнатной температуре на 15 мин. Затем быстро добавл ют Дауэкс 50x4 (100-200 мевд) в Ру форме до рН 7,5. Смолу отфильтровывают и промывают трем  объемами 2 М водного пиридина . Фильтрат и каждую из промывок пропускают через колонку с 40 мл свеже го Дауэкс 50x4 (100-200 меш) в РуФорме . Объединенные промывки упаривают при добавлении пиридина до выпадени  осадка кислоты. Из этой сме си (рН 6-7) кислоту-раликал экстраг гируют эфиром (л-10О мл) . Водный ра.с вор упарившот на роторе при комнатной температуре досуха. Получают 0,19 г спин-меченого производного, загр зненного исходным нуклеотидом, Далее очистку провод т методом препаративной БХ в системе (А). Выход 60%-, RJ 0,61 (А); ,8б Уфспектр:Л д (.282 нм. 4 Пример 2. N -(1-оксил 2 ,2,5,5-тетраметил-З-карбонилпирролин )-цитидин-2(з)-фосфат получают аналогично описанному в примере 1 . Врем  гидролиза перацильного производного 30 мин. Выход 70%J R 0,69 (А)г Уф-спектр: /.д,д,260, 303 НМ. Пример 3. (1-оксил2 ,2 ,,5-тетраметил-З-карбонилпирролин )-цитидин получают аналогично описанному в примере 1. Очистку про вод т методом препаративной ТСХ на пластинках из силуфола в системе н- бутанрл, насыщенный водой. С адсо бента спин-меченый цитидин элюируют этанолом. Выход 60%; Rj 0,84 (Б); 1,12. Т.пл. 132-134 . УФ-спектр Л7лс кс2бО, 303 нм. Спектр ЭПР (хлоро орм): N 15,6; содержание спинов: , 8- 10 спин/моль. Дл  Н. 25 N40/ ычислено, %: С 52,80; Н б,1б;Ы 13,68. Найдено, %: С 53,19; 52,97; 6,45; 6,35; N 13,93; 13,81. Пример 4. (l-oкcил ,2,5,5-тетраметил-З-карбонилпирроин ) -цитидин-2, 3-циклофосфат .153 о.е . (8 мкМ) спин-меченого цитидин-2 (3)осфата раствор ют в 1 мл воды, дово т рН раствора 0,1 н. НС6 до 6,0 и добавл ют 25 мг п-толуолсульфоната циклогексил- )i- N- (N-метилморфолиний) -этилкарбодиамида . Реакционную смесь оставл ют на 4 ч при комнатной температуре , поддержива  рН равным примерно 6,0. Затем реакционную смесь упаривают досуха на роторе. Остаток промывают несколько раз эфиром, после чего раствор ют в небольшом количестве дистиллированной воды и дел т методом препаративного электрофореза на бумаге. После обессоливани  в системе этанол:вода-7 : 3 получаиот 85 о.е. (56%) хроматографически чистого циклофосфата . R,: 0,91 (А); U 0,62: УФ-спектр: , 303 нм. Пример 5. N -(1-оксил-2,2,5,5-тeтpaмeтил-3-кapбoнилпиppoлин ) -аденозин-2 , 3-циклофосфат получают аналогично описанному в примере 4. Выход 52%; RJ 0,85 (А); О 64 ; УФ-спектр: (ис282 нм. Получение целевбго продукта. П р и М е р 6. (1-оксил-2,2,5,5-тетраметил-3-карбонилпирролин )-цитидилил- ()-цитидин. 136 о.е. (8 мкМ) спин-меченого цитидин-2,3-цйклофосфата и 80 мкМ цитидина в ОД6 мл ОР5 М трис-НСе-буфера (рН 7,6), содержащего панкреатическую рибонуклеазу в концентрации 0,16 , инкубируют при 0-4°С около двух недель . Спин-меченый цитидилил-( )-цитидин выдел ют методом препаративного электрофореза на бумаге. Дополнительную очистку провод т, хроматографиру  в системе (Б). Получают 23 о.е. (30%). Rf 0,84 (А); ,58; УФ-спектр :Лдлакс262Г, 303 нм. П р и М е р 7. Гуанилил-( ) (1-ОКСИЛ-2,2,5, 5-тетраметил-З-карбонилпирролин )-цитидин. 60 мкМ гуанозин-2,3-циклофосфата (гуанидиниева  соль) и 180 мкМ спин-меченого цитидина в б мл 0,01 М фосфатного буфера рН 7,0), содержащего рибонуклеазу Т в концентрации 50 ед.акт/мл, инкубируют в течение 5-6 ч при . Затем реакционную смесь дел т методом препаративного электрофореза на бумаге. Полосы, ,со- держащие спин-меченый гуанилил-().-цитидин , прищивают к новым листам бумаги и хроматографируют в системе .В. Получают 153 о.е. ( 5 мкМ). Выход 20%; R 0,7 (Б); UOTH 1/5;. УФ-спектр :Л,щ. 259, 302 нм. 5 Примере. Гуанилил-()-N- {1-ОКСИЛ-2 ,2,5, 5-тетрс1метил-3карбонилпирролин , -цитидил-( з-гЗ)-уридин . 145 о.е. (5 мкМ) GpC , 2,5 мкМ уридин-Б-дифосфата (динатриева  соль) и 3 мг ПНФ-азы М. lysodeiticus раствор ют в 0,5 мл 0,05 М трис-НС8-буфера {рН 9,0-9,2) содержащего 0,01 М МдСВг и 0,05 мМ ЭДТА, и инкубируют при 36-37°С. Через 2 ч всю реакционную смесь нанос т на бумагу и хроматографируют в системе Б. Полосы, соответствующие различным компонентам реакционной смеси, элюируют. водой и дополнитель но очищают с помощью электрофореза и хроматографии в системе.А. Получают 10 о.е. (15%) (Rp(Up) 1,55 (А); иот.„0,б5; УФ-спектр: Л |,дс(кс 259, 307 нм) и 5 о.е. GpCp ™upU (WUp) 1,02 (А); иотнО68; УФ-спектр Vc,Kc259, 307 нм) . Хрсииатографию и электрофорез пров д т на бумаге марки ленинградска  М И FN-3. При хроматографии ис-. пользуют следующие системы растворителей: этанол - 1 М ацетат аммони  (рН 7,5), 7:3 (А); этанол - концентрированный аммиак - вода-65:10:25 (Б); изопропанол-концентрированный аммиак - вода-7:2:1 (В). Электрофорез на бумаге провод т в приборе Дл  вертикального электрофореза фир1ии Labor (Венгри ) в течение 2 ч с градиентом напр жени  20 В/см в 0,0 триэтилс1ммонийбикар6онате, рЛ 7,5. Формула изобретени  . - , I. Спин-меченые производные олиго рибонуклеотидов общей формулы NpN , 3 NpN и NpNpN, где Np ч N - нуклеотиды и нуклеозиды пиримидинового и пуринового р да; Np и производные аденозин-3-фосфата или иитидин-З-фосфата и соответственно цитидина, содержащие спиновую, метку в виде остатка 1-оксил-2,2,5,5-тетраметил-3-карбонилпирролина в качестве заместител  по амино-группе адеиина или цитозина, спиновые зонды дл  исследовани  механизма действи  ферментов . 2. Способ получени  соединений ПОП.1, отличающийс  тем, что спин-меченые нуклеозид-2, 3-циклофосфаты или нуклеозиды пиримидинового и пуринового р да подвергают взаимодействию соответственно с нуклеозидами или нуклеотидами при температуре 0-4°С в присутствии специфических рибонуклеаз в соответствующем буферном растворе с последующим взаимодействием при температуре 36-37 с полученных спин-меченых динуклеозидмонофосфатов с нуклеозид-5-дифосфатами при участии полинуклеотидфосфорилазн в трис-буфере при рН 9,0-9,2. Источники информации, прин тые во внимание при экспертизе 1.Сухоруков Б.И., Петров А.И, Спин-меченые нуклеозиды, нуклеозид-5-моно- ,ди- и -трифосфаты.- Биофизика , 1975, Ifl, с.965.
  2. 2.Табак М., Рууге Э.К., Смирнова И.Н., Петров А.И., Сухоруков Б.И., Твердислов В.А. Взаимодействие мембранного препарата Na, К-АТФ-азы со , -Ь d 14 «л |1 Л С А О. ЗОЛ j спин-меченым аналогом АТФ.-Биохими , 1977, 42, 3, с. 476.
SU772491239A 1977-05-31 1977-05-31 Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени SU659573A1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
SU772491239A SU659573A1 (ru) 1977-05-31 1977-05-31 Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
SU772491239A SU659573A1 (ru) 1977-05-31 1977-05-31 Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени

Publications (1)

Publication Number Publication Date
SU659573A1 true SU659573A1 (ru) 1979-04-30

Family

ID=20711196

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SU772491239A SU659573A1 (ru) 1977-05-31 1977-05-31 Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени

Country Status (1)

Country Link
SU (1) SU659573A1 (ru)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS57182650A (en) * 1981-05-06 1982-11-10 Mitsubishi Chem Ind Ltd Detection method for gene by oligoliponucleotide
EP0286898A2 (en) * 1982-06-23 1988-10-19 Enzo Biochem, Inc. Modified labeled nucleotides and polynucleotides and methods of preparing, utilizing and detecting same
US7220854B1 (en) 1982-06-23 2007-05-22 Enzo Life Sciences, Inc. C/O Enzo Biochem, Inc. Sugar moiety labeled nucleotide, and an oligo- or polynucleotide, and other compositions comprising such sugar moiety labeled nucleotides

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS57182650A (en) * 1981-05-06 1982-11-10 Mitsubishi Chem Ind Ltd Detection method for gene by oligoliponucleotide
EP0286898A2 (en) * 1982-06-23 1988-10-19 Enzo Biochem, Inc. Modified labeled nucleotides and polynucleotides and methods of preparing, utilizing and detecting same
US7220854B1 (en) 1982-06-23 2007-05-22 Enzo Life Sciences, Inc. C/O Enzo Biochem, Inc. Sugar moiety labeled nucleotide, and an oligo- or polynucleotide, and other compositions comprising such sugar moiety labeled nucleotides
US8097405B1 (en) 1982-06-23 2012-01-17 Enzo Biochem, Inc. Nucleic acid sequencing processes using non-radioactive detectable modified or labeled nucleotides or nucleotide analogs, and other processes for nucleic acid detection and chromosomal characterization using such non-radioactive detectable modified or labeled nucleotides or nucleotide analogs

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Khorana et al. Cyclic phosphates. III. Some general observations on the formation and properties of five-, six-and seven-membered cyclic phosphate esters
Ralph et al. Studies on Polynucleotides. XI. 1 Chemical Polymerization of Mononucleotides. The Synthesis and Characterization of Deoxyadenosine Polynucleotides2
WO1990008155A1 (en) Biologically reversible phosphate and phosphonate protective groups
CA2089668A1 (en) Oligo (alpha-arabinofuranosyl nucleotides) and alpha-arabinofuranosyl precursors thereof
DE2628202A1 (de) Verfahren zur herstellung von 2'-substituierten-d-ribofuranosylpurinderivaten
Holý et al. Synthesis of isomeric and enantiomeric O-phosphonylmethyl derivatives of 9-(2, 3-dihydroxypropyl) adenine
Adamiak et al. Nucleoside 3′ phosphotriesters as key intermediates for the oligoribonucleotide synthesis. III. An improved preparation of nucleoside 3′-phosphotriesters, their 1H NMR characterization and new conditions for removal of 2-cyanoethyl group
Brown et al. 12. Nucleotides. Part IX. The synthesis of adenylic acids a and b from 5′-trityl adenosine
Michelson et al. Nucleotides. Part XXIII. Mononucleotides derived from deoxycytidine. Note on the structure of cytidylic acids a and b
Drummond et al. Deoxyribonucleoside-3′, 5′ Cyclic Phosphates. Synthesis and Acid-Catalyzed and Enzymic Hydrolysis
Rammler et al. Nucleoside phosphonic acids. II. The synthesis of 5'-deoxythymidine 5'-phosphonic acid and its pyrophosphate derivatives
SU659573A1 (ru) Спин-меченые производные олигорибонуклеотидов как спиновые зонды дл исследовани механизма действи ферментов и способ их получени
Kenner The Chemistry of Nucleotides.
US3787392A (en) Process for the preparation of nucleoside diphosphate esters
GB2100721A (en) Neplanocin a derivatives with antitumor activity
Séquin et al. Nucleosides and Nucleotides. Part 2: Synthesis of both anomers of 1‐(5′‐O‐phosphoryl‐2′‐deoxy‐d‐ribofuranosyl)‐2 (1H)‐pyridone [1]
Ikehara et al. Studies on Nucleosides and Nucleotides. LXXXIX. Purine Cyclonucleosides.(43). Synthesis and Properties of 2'-Halogeno-2'-deoxyguanosines
Bennett et al. 2'-0-(α-Methoxyethyl) nucleoside 5'-diphosphates as single-addition substrates in the synthesis of specific oligoribonucleotides with polynucleotide phosphorylase
Ohtsuka et al. Transfer ribonucleic acids and related compounds. II. A method for synthesis of protected ribooligonucleotides using a ribonuclease
Nagyváry Studies on the Specific Synthesis of the Natural Internucleotide Linkage by the Use of Cyclonucleosides. I. The Utilization of Unprotected Nucleotides
Točík et al. Electrophile-promoted addition of hydroxymethylphosphonate to 4′, 5′-didehydronucleosides: A way to novel isosteric analogues of 5′-nucleotides
Nishino et al. Partial protection of carbohydrate derivatives. part 18. simple, preparative procedure for 5'-o-acylribonucleosides; highly regioselective o-deacylation at 2'and 3'positions of fully acylated purine and pyrimidine ribonucleoside through sodium methoxide-thf system
Ohtsuka et al. Stereoselective synthesis of dinucleoside phosphate aryl esters by using new condensing reagents, arenesulfonyl 5-(pyridin-2-yl)-tetrazole
SANEYOSHI et al. Synthetic Nucleosides and Nucleotides. VI. On the Several Routes for the Syntheses of 4-Thiouridylic Acid Homologues
Van Boom et al. The preparation of diribonucleoside monophosphates containing 4‐thiouridine via the phosphotriester approach