SK5393A3 - Cdnas encoding the gastrin and cck-b receptors - Google Patents

Cdnas encoding the gastrin and cck-b receptors Download PDF

Info

Publication number
SK5393A3
SK5393A3 SK53-93A SK5393A SK5393A3 SK 5393 A3 SK5393 A3 SK 5393A3 SK 5393 A SK5393 A SK 5393A SK 5393 A3 SK5393 A3 SK 5393A3
Authority
SK
Slovakia
Prior art keywords
cells
cck
receptor
gastrin
polypeptide
Prior art date
Application number
SK53-93A
Other languages
English (en)
Inventor
Alan S Kopin
Original Assignee
New England Medical Center Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US07/978,892 external-priority patent/US5541071A/en
Application filed by New England Medical Center Inc filed Critical New England Medical Center Inc
Publication of SK5393A3 publication Critical patent/SK5393A3/sk

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/72Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for hormones
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/04Centrally acting analgesics, e.g. opioids
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/24Antidepressants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/26Psychostimulants, e.g. nicotine, cocaine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/28Drugs for disorders of the nervous system for treating neurodegenerative disorders of the central nervous system, e.g. nootropic agents, cognition enhancers, drugs for treating Alzheimer's disease or other forms of dementia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/06Antianaemics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Psychiatry (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Description

Oblasť techniky
Tento vynález sa uskutočnil s vládnou podporou poskytnutou pod č. DK01934, č. p30DK39428 a č. DK32878 Národnými ústavmi zdravia. Vláda má zakotvené isté práva v tomto vynáleze.
Vynález ša týka rodiny receptorov gastrínu/cholecystokinínu (CCK-B).
Doterajší stav techniky
Gastrín je peptidový hormón so 17timi aminokyselinami produkovaný žalúdočnými antrálnymi G bunkami. Hlavným fyziologickým účinkom tohoto hormónu je stimulácia parientálnych buniek žalúdka tak, .aby vylučovali kyselinu chlorovodíkovú. Gastrín je tiež trofický hormón, ktorý moduluj e rast a diferenciáciu žalúdočnej sliznice ako aj sliznice tenkého a tlstého čreva počas normálneho vývinu (Johnson, L. R., 1987,
Physiology of the Gastrointestinal Tract, Raven Press, N.Y.) a pri istých patologických stavoch (napr. Zollinger-Ellisonovom syndróme, karcinóme žalúdka, zhubnej anémii). Fyziologické účinky tohoto peptidu sa spúšťajú naviazaním na jeho plazmalémový receptor, ktorý bol pokusne identifikovaný afinitným značením ako bielkovina so zdanlivou molekulovou hmotnosťou 74 000 daltonov (Baldwin, G. S., 1986, J. Biol. Chem. 261: 12252-7, Matsumoto, M. et al. 1987, J. Am. Physiol. 252: G143-G147). Agonistická gastrínu má za následok hydrolýzu zvýšenie koncentrácie intracelulárneho stimulácia receptorov fosfatidylinozitolu a vápnika (Muallem, S. a Sachs, G 805: 181-185, Chew, C. S., a
Biophys. Acta 888: 116-125) viažúcimi guanínnukleotid (G-proteínmi) (Roche, S. et al., 1990, Biochem. Biophys. Acta 1055: 287-294). Gastrín, cholecystokinín . 1984, Biochem. Biophys. Acta
Brown, M. R., 1986, Biochem. sprostredkované bielkovinám!
Receptory na bunkách a peptidy príbuzné CCK tvoria rodinu hormónov, ktorá je charakterizovaná rovnakou štruktúrou C-koncového pentapeptidamidu, čo je doména s kritickým významom pre väzbu na receptor.
Cielové receptory príslušné k tejto rodine hormónov sa dajú zaradiť: do dvoch hlavných tried, a to receptory typu CCK-A a receptory typu CCK-B, podlá ich agonistickej alebo antagonistickej špecifity (Miller, L. J., 1991, v CCK Antagonists in Gastroenterology, Springer-Verlag, Berlín, str. 27-34 ). Periférny alebo zažívací receptor (CCK-A), ktorý je pankrease, žlčníku a niektorých modzgových jadrách, má tisíc raž vyššiu afinitu k sulfátovanému CCK-8 ako ku gastrínu.
CCK-B/gastrínu sa nachádzajú v modzgu (CCK-B), hladkého svalstva a na parientálnych bunkách (gastrínové receptory. Väzobné štúdie s modzgovými membránami a s parientálnymi bunkami v ktorých sa porovnávali relatívne afinity k agonistom ukazujú na 6-10krát resp. l-2krát vyššiu afinitu pre CCK ako pre gastrín (Jensen, R. T. et al. v Gastrointestinal Endocrinology: Receptors and Post-Receptor Mechanisíns, Harcourt Brače Jovanovich, San Diego, str. 95). Centrálne miesta receptorov CCK (CCK-B) vykazujú vysokú aktivitu pre sulfátovaný oktapeptidový fragment (CCK-3s), desulfátovaný oktapeptidový fragment (CCK-3d), gastrín, CCK-4 (C-koncový tetrapeptid CCK) a pentagastrín (CCK-5) a podobajú sa receptorom gastrínu svojou agonistickou selektivitou. Receptory CCK-B môžu mat svoju úlohu pri stavoch stiesnenosti, pri modulácii bolesti, pamäti, pocitu sýtosti a v panikových poruchách. CCK je najčastejší neuropeptid a CCK-B je najčastejší podtyp receptora vyskytujúceho sa v modzgu (CCK-B >>> CCK-A).
Podstata vynálezu
Podstaou vynálezu obecne je prečistená nukleová kyselina kódujúca jeden z rodiny cicavčích receptorov gastrínu/ cholecystokininínu (CCK-B) lebo jeho fragment lebo analóg. Pod pojmom rodina cicavčích receptorov gastrínu/ cholecystokininínu B sa rozumejú polypeptidy cicavčieho pôvodu, ktoré obecne vykazujú 60%nú, lebo lepšie 80%nú, ešte lepšie 90%nú lebo najlepšie 95%nú či dokonca 99%nú sekvenčnú homolóogiu s prírodným cicavčím receptorom gastrínu/CCK-B (ako je znázornené v obr.l: sekvenčné identifikačné číslo SEKV ID Č:2). S výhodou nukleová kyselina kóduje receptor gastrínu, nukleová kyselina kóduje receptor CCK-8, člen rodiny receptorov gastrínu/CCK-8 je na povrchu parietálnych buniek, modzgových buniek, imunologických buniek, enterochromovým bunkám podobných buniek (ECL), nádorových buniek, napr. buniek rakoviny tlstého čreva, malých buniek karcinómu plúc lebo leiomyomu, lebo buniek hladkého svalstva, najlepšie keď sú tieto bunky z psích tkání alebo ešte lepšie kečf sú to ludské bunky.
Vynález sa tyká aj homogénnej populácie buniek v ktorej každá z buniek obsahuje naklónovanú nukleoví! kyselinu kódujúcu jeden z členov rodiny receptorov gastrinu/CCK-B. Bakteriálne bunky transfekované prečistenou nukleovou kyselinou kódujúcou receptor gastrínu sú uložené v ATCC a označené čís. 75195. Dva klóny bakteriálnych buniek transfekovaných prečistenou nukleovou kyselinou kódujúcou časť (HBR-1) lebo cely (hCCKB, FBCR-4) receptor CCK-B sú uložené v ATCC a označené čís. 75196, resp. 75303. Bunky podlá tohoto vynálezu obsahujúce nukleovú kyselinu môžu najlepšie exprimovat biologicky aktívny polypeptid z rodiny receptorov gastrínu/CCK-8. Bunky môžu byť aj eukaryotické bunky, napr. COS-7 lebo bunky vaječníku čínskeho škrečka (CHO).
Súčastou vynálezu podlá tejto prihôášky je naviac v podstate čistý polypeptid, receptor gastrínu, produkovaný nukleovou kyselinou kódujúcou jeden z členov rodiny receptorov gastrínu/ CCK-B lebo jeho fragment či analog. V preferovaných príkladoch je receptor gastrínu polypeptid obsahujúci sled aminokyselín v podstate identický s aminokyselinami vo slede SEKV ID Č:l:
130
GTWCXAVSYL«GVSVSVSTLSI,7A:A£.íRYSAÍCaPlQARW<2?RSHAARVirATWH
131
LjGLLMVRYPVYTÄVQRAGGARALQCVriRWPSARVRCTWSVLl
240 'VRGWKAVAYG
300 llSRELYlGlREOEaSOSESRVRSQGGLRGGAGPGPAPRNGSCRRSGGlAG&OGOGCYVQ
301
LPRSRQtLELSAiXÄPTPGPGCGPRRYQÄXLLÄXXRVVRMLLVITVL
260 ’LCWLPLYSANT
361
WRAEOSSGAHRALSGAP1S
420
S'íA5AC’/N?lVÍC“HHRRERQACLEtG.ARCC?R??R
A?.?R?£?C£D??T?sr.ASGSRLSY:S~lG?G.
V iných preferovaných príkladoch je zdánlivá molekulová hmotnosť glykozylovaného polypeptidu zhruba 76 000 daltonov, polypeptid je glykozylovaný lebo neglykozylovaný a polypeptid je exprimovaný ludskými bunkami, napr. ludskými parietálnymi bunkami, modzgovými bunkami, bunkami hladkého svalstva, imunologickými bunkami, ECL bunkami či nádorovými bunkami.
Tento vynález takisto zahrnuje v podstate čistý pclypeptidový receptor CCK-3 produkovaný nukleovou kyselinou kódujúcou jeden z členov rodiny cicavčích receptorov gastrínu/ CCK-B lebo jeho fragment či analóg. Polypetidový receptor CCK-B môže obsahovať sled aminokyselín v podstate identický s aminokyselinami 1 až 447 v slede uvedenom pod SEKV ID Č: 4
YAVI
120
M.SVGGNMLriWI.GCSRRraarrrjrÄELLSZAVSDLLLA.VXCMPmiSiniiSGTF rao
- 5 L31 240
L5GL-.HV?Y?\l'Y7'.VQPVG?RV7QCVH?.W?SA?'.'?.Q7rtS'.rLLLLLL773?GWXAVAYGL
ZSRíLYZ.GLRíGGCSCSDSQSRVRNQGGZ.RGÄVHQNGnCR?
R ? A L ϊ í. 7 AT. 7 A ? G ? G S G S R ? 7 Q A37. L A XXR V.’RHT - '·' 3 '.V7.
PGAHRATSGA? 33 HTT3YASÄG'.’N?T7YG7“K?.?.?RQAG:
300 ‘GAVGSCSOGCYVQLPRS
360 'L GWLRVY S ANTWRAF 7G
420
G .A?. C G ? R ? ? ?_AR ? R.AT ?7ľT??7?S3AS7SRT5Y773577G?G.
Polypeptid CCK-8 môže byť glykozylovaný lebo neglykozylovaný a exprimovaný iudskými bunkami, napr. ludskými parietálnymi bunkami, iudskými modzgovými bunkami lebo iudskými bunkami hladkého svalstva.
V inom ohiade postup podlá tohoto vynálezu obsahuje knižnicu cDNA expresie parietálnych buniek. Segmenty cDNA tejto knižnice sú najlepšie odvodené od psích parietálnych buniek, ludských parietálnych buniek lebo hlavných ludských buniek. Vektor expresie používaný v tejto knižnici cDNA môže obsahovať-jednu lebo viacero z týchto zložiek: počiatok replikácie SV40 lebo cytomegalovírusový (CMV) promótor. Ešte lepšie je konštruovať knižnicu cDNA s vektorom expresie obsahujúcim pcDNA-1 lebo lambda gtll.
Postupom pódia tohoto vynálezu je aj metóda na izoláciu nukleových kyselín kódujúcich polypeptidy prítomné v parietálnych bunkách vyznačujúca sa vyhodnocovaním knižnice cDNA expresie s cielom nájsť izolovanú nukleovú kyselinu kódujúcu receptor prostaglandínu E2 (PGE2).
DNA kódujúca jeden receptor z rodiny cicavčích receptorov gastrínu/CCK-B pódia tohoto vynálezu je použitelná pre metódu na identifikáciu antagonisty tohoto člena rodiny. Metóda zahrnuje pridanie agonisty špecifického pre rodinu receptorov gastrínu/CCK-B ku kultivovaným bunkám, ktoré boli transfekované napr. cDNA GR-1 alebo cDNA CCK-B podlá tohoto vynálezu a stanovenie schopnosti tohoto potenciálneho antagonistu bud
a) brániť väzbe agonistu na gastrínový receptor alebo b) blokovať agonistom indukovaný vzrast volného vápnika [Ca2_r] v cytozóle
- 6 alebo c) blokovať agonistom idukovanú aktiváciu fosfolipázy C alebo ď) blokovať agonistom idukovanú aktiváciu adenylát cyklázy a tak preukázať jeho antagonistickú aktivitu. Agonistom môže byť gastrín, napr. gastrín-17 lebo gastrín-34 (sulfátovaný lebo desulfátovaný) alebo agonistom môže byť cholecystokinín (CCK), lepšie CCK-8s, CCK-8d, CCK-4 alebo pentagastrín (CCK-5). Agonistu je tu treba chápať ako chemickú zlúčeninu schopnú spojiť sa s receptorom a iniciovať jeho aktivitu. Preferovaným príkladom podlá tohoto vynálezu je antagonist receptoru z rodiny cicavčích receptorov gastrínu/CCK-B identifikovaný podlá tejto metódy. Pod pojmom antagonista ako je tu používaný treba chápať chemickú zlúčeninu, ktorá inhibuje aktivitu receptoru, akou je jeho schopnosť viazať agonistu.
Pod pojmom glykozylovaný ako je tu používaný treba rozumieť bielkovinu s kovalentne naviazanou jednou cukornou zložkou lebo viacerými cukornými zložkami. Pod pojmom neglykozylovaný treba rozumieť neobsahujúci kovalentne naviazané cukorné zložky. Pod pojmom zdanlivá molekulová hmotnosť sa myslí molekulová molekulová hmotnosť stanovená v denaturačnom géle porovnaním so štandartami, napr.
s bielkovinovými štantartami so známou molekulovou hmotnosťou. Pod pojmom receptor sa tu myslí molekula na povrchu delovej bunky, ktorá viaže hormón, napr. gastrín alebo CCK.
V podstate čistý tu znamená preparát, napr. bielkovinový, ktorý je v podstate zbavený bielkovín, lipidov a ďalších prímesí s ktorými sa vyskytuje v prírode. Typicky je látka v podstate čistá ak najmenej 10%, lepšie najmenej 20%, ešte lepšie najmenej 50%, ešte lepšie najmenej 60%, ešte lepšie najmenej 75%, ešte lepšie najmenej 90%, a vôbec najlepšie najmenej 99% (počítané na hmotnosť, na suchú lebo vlhkú hmotnosť alebo na molárne percentá lebo molárny zlomok) je bielkovina o ktorú sa jedná. Čistota sa dá stanovovať vhodnou metódou, napr. stĺpcovou chromatografiou, elektroforézou v polyakrylamidovom géle alebo pomocou HPLC. Bielkovina je v podstate prečistená ak je zbavená svojich prirodzených prímesí, alebo ak je oddelená od natívnych hmotnosť sa myslí polyakrylamidovom znečistenín, ktoré ju doprevádzajú v prírode.
Pod pojmom v podstate identický sled aminokyselín sa tu myslí sled aminokyselín, ktorý sa odlišuje len konzervatívnymi zámenami aminokyselín, napr. zámenou jednej aminokyseliny aminokyselinou tej istej triedy (napr. aminokyselinou, ktorá má rovnaký hydrofóbny charakter, náboj, pKa alebo dalšie rovnaké konformačné lebo chemické vlastnosti, ako je napr. zámena valínu za leucín, arginínu za lyzín atd.) alebo sled, ktorý sa odlišuje jednou lebo viac nekonzervatívnymi zámenami aminokyselín, deléciami alebo inzerciami v polohách sledu aminokyselín tak, že nezrušia biologickú aktivitu polypeptidu ako je popísané vyššie. Sled aminokyselín je zaradený do tohoto vynálezu ak sa odlišuje modifikáciou, ktorá zníži lebo pozmení jednu receptorovú aktivitu, ale nie daíšie. Tak napr. zmena, ktorá vedie k zmene aktivity vo väzbe ligandu ale nie k zmene v signálnej aktivite recptoru alebo naopak je zahrnutá do tohoto vynálezu.
Pod pojmom prečistená nukleová kyselina ako sa tu používa sa má chápať sled nuklovej kyseliny alebo jej fragmentov prečistený od sledov, ktoré ju obklopujú v prirodzenom stave, napr. fragment DNA, ktorý bol izolovaný od sekvencíi, ktoré k nemu priliehajú, napr. od sekvencií, ktoré ho obklopujú na jeho normálnom mieste v genóme. Termín sa vzťahuje aj na nukleové kyseliny, ktoré boli v podstate prečistené od iných zložiek, ktoré ich doprevádzajú v bunke.
Pod pojmom homologický ako sa používa tu sa má rozumieť podobnosť dvoch polypeptidových molekúl alebo dvoch molekúl nukleových kyselín. Ak je poloha v obidvoch porovnávaných sledoch obsadená tou istou monomérnou jednotkou, napr. ak je jedna poloha v obidvoch molekulách DNA obsadená adenínom, potom sú molekuly homologické v tejto polohe. Homológia dvoch sledov je funkciou počtov porovnatelných alebo homologických polôh spoločných obidvom sledom. Tak napr. ak 6 z 10 polôh v dvoch sledoch je zodpovedajúcich lebo homologických, potom sú sledy homologické zo 60 %. Napr. homológia dvoch sledov DNA, a to 3'ATTGCC 5'a 3' TATGGC 5' je 50 %.
- 8 Popis preferovaných príkladov podía vynálezu
Najprv sa podáva stručný popis obrázkov Obrázky
Obr. 1 znázorňuje sled aminokyselín receptoru gastrínu z psích parietálnych buniek (SEKV ID Č:l). Predpokládané transmembránové domény receptoru gastrínu sú podčiarknuté a označené rímskymi číslicami. Súhlasné miesta N-glykozylácie sú označené #. Potencálne miesta proteín kinázy C lebo kazeín kinázy II, ako boli predpovedané podía schém nájdených v Prosíte Database (Bairock, A., 1991, Nucleic Acids Res. 19: 2241) sú označené *.
Obr. 2 znázorňuje primárnu štruktúru receptoru gastrínu z psích parietálnych buniek a priradenie známych receptorov naviazaných na G-proteín. Aminokyseliny označené tieňovaním sú identické v 2 z 3 receptorov. Vodorovné čiary nad sledmi znázorňujú transmembránové segmenty predpovedané podlá KKD algoritmu. Skratky: FC5, receptor neuropeptidu Y-Yl; hB2AR, íudský beta2 adrenergický receptor.
Obr. 3 je graf znázorňujúci účinok koncentrácie konkurenta na väzbu 125I-CCK-3. Každý bod znázorňuje priemer z troch pokusov. Maximálna väzba v neprítomnosti konkurenta (100%) bola
5,2 ± 2,0 pM. Bunky, ktoré neboli transfekované nevykazovali vysýtitelnú väzbu.
Obr. 4 je autorádiograf ukazujúci afinitné značenie receptoru gastrínu z psích parietálnych buniek na transfekovaných bunkách COS-7 s použitím bifunkčnej chemickej krížovej väzby. Výsledky sú typické pre 4 podobné pokusy.
Obr. 5 je autorádiograf znázorňujúci analýzu Northern prenosu transkriptov receptoru gastrínu v mRNA izolovanej z psích tkáni. Poly(A)+ RNA bola nanesená takto:: pečeň 1,1 μg, parietálne bunky 0,3 μg, pankreas 0,5 μg, a kôra modzgová 1,0 μg. Transkript zodpovedajúci GR-1 je označený šípkou.
Obr. 6 je graf ukazujúci signál druhého messengeru v transfekovaných bunkách COS-7 po stimulácii gastrínom (1 μΜ).
A. Šípka znázorňuje pridanie gastrínu I. Údaje predstavujú 3 pokusy. B. Ins-1, 4, 5-P3 merania (priemer ± štandartná chyba merania pre n = 1) v bunkách divokého typu a v bunkách transfekovaných.
Obr. 7 ukazuje sled nukleotidov cDNA receptoru gastrínu GR-1 (SEKV ID Č: 1).
Obr. 8 je znázornenie: A. 66 nukleotidov cDNA CCK-B (SEKV ID Č: 2); B. 22 aminokyselín predpovedaných z nukleotidového sledu na obr. 8A v porovnaniu so zodpopvedajúcim sledom aminokyselín odvodeným z cDNA GR-1 (aminokyseliny 281-302 v obr I., SEKV ID Č: 2, SEKV ID Č: 3).
Obr. 9 je znázornenie sledu nukleotidov cDNA hCCKB ludského receptoru CCK-B (SEKV ID Č: 4).
Obr. 10 ukazuje sled aminokyselín ludského receptoru CCK-B (SEKV ID Č: 4).
Obr. 11 ukazuje sled aminokyselín receptoru CCK-B z ludského modzgu a priradenie receptorov psieho gastrínu a potkanieho CCK-A. Aminokyseliny označené tieňovaním sú identické v najmenej 2 z 3 receptorov. Vodorovné čiarky nad sledmi znázorňujú transmembránové segmenty predpovedané podlá KKD algoritmu (Klein et al., 1985, Biochim. Biophys. Acta 815: 468-76). Číslovanie zodpovedá aminokyselinám v receptore CCK-B. Skratky: hCCK-B, ludský receptor CCK-B, dGASTRIN, psí receptor gastrínu, rCCK-A, potkaní receptor CCK-A.
Obr. 12 je autorádiograf znázorňujúci Northern prenos transkriptov receptoru CCK-B v mRNA izolovanej z ludských tkáni. Poly(A)+ RNA bola nanesená do každej dráhy ako je vyznačené. Transkript zodpovedajúci receptoru CCK-B je označený šípkou.
Obr. 6 je graf ukazujúci signál druhého messengeru v transfekovaných bunkách COS-7 exprimujúcich receptor ludského modzgového CCK-B. A. V bunkách COS-7 s prídavkom Fura-2 bola stanovená koncentrácia volného vápnika v cytozóle z pomerov emisií fluorescencie pri 340 a 380 nm (340/380 nm). Šipka znázorňuje pridanie CCK-8 (0,1 μΜ) lebo EGTA (2,5 mM) . Údaje predstavujú výsledky 3 pokusov. B. CCK-8 (0,1 μΜ) zvýšil hladiny
- 10 Ins-1, 4, 5-P3 (priemer ± štandartná chyba merania pre n = 3) v bunkách COS-7 transfekovaných cDNA receptoru CCK-B od 1 8334 ± 119 do 8 302 ± 275 DPM / 106 buniek (p < 0,001).
Obr. 14 je graf znázorňujúci účinok koncentrácie konkurenta na väzbu l^i-ccK-S na receptor CCK-B. Väzba ^25I-CCK-8 na bunky COS-7 prechodne transfekované hCCK-B-pcDNAI je ukázaná v prítomnosti rastúcich koncentrácií: (A) CCK-8, gastrínu, CCK-4 a (B) L364,718 a L365,260. Každá z 3 - 5 pokusov. Netransfekované vysýtitelnú väzbu.
krivka znázorňuje priemer bunky nevykazovali žiadnu
Odvodenie uložených materiálov
Klóny plasmidov GR-1, HBR-1 a hCCK-B boli uložené v American Type Culture Collection (A. T. C. C.) v Rockville, MD, a sú prístupné pod týmito číslami: ATCC No. 75195, No. 75196 a No. 75303. Tieto uložené klóny dávajú tým, ktorí sú školení v obore [možnost] získať: materiály podlá tohoto vynálezu. Odvodenie uložených materiálov je popísané nižšie. Receptor gastrínu a receptor CCK-B produkované týmito uloženými materiálmi predstavujú príklady nie však obmedzenie tohoto vynálezu. Tí, ktorí majú bežnú zručnost v. obore môžu si lahko izolovat príslušné receptory a nukleové kyseliny, ktoré ich kódujú s použitím nižšie popísaných metód. Osoby určené prihlasovatelom, t. j. prezident a pracovníci New England Medical Center Hospital zodpovedajú za to, že nahradia tieto kultúry pokial by zhynuly pred uplynutím termínu vydania patentu a ďalej za to, že dajú ATCC zprávu o udelení takéhoto patentu s tým, že k tomuto dátumu budú uložené kultúry sprístupnené verejnosti. Do toho času budú uložené kultúry prístupné Komisárovi pre patenty za podmienok uvedených v 37 CFR s 1.14 a 35 USC s
112.
Podrobný popis
Nižšie uvedený postup sa použil na konštrukci knižnice expresie cDNA psích parietálnych buniek, na izoláciu génu gastrínového receptoru z psích parietálnych buniek a na overenie identity a biologickej aktivity výsledného rekombinantného klónu. Rekombinantný receptor bol izolovaný z knižnice vyprodukovanej z vysoko nabohateného preparátu parietálnych buniek. Analýza mRNA z izolovaných parietálnych buniek pomocou Northern prenosu ukazuje, že transkrip gastrínového receptoru (GR-1) je vysoko exprimovaný v týchto bunkách. Použili sa väzobné štúdie s agonistami a antagonistami, afinitné značenie a testovanie transdukcie signálu, aby sa dalo zistif, či biologická aktivita rekombinantného receptoru súhlasí s aktivitou nájdenou v natívnych parietálnych bunkách.
Naklónovaná cDNA gastrínového receptoru sa naopak použila na izoláciu cDNA íudského CCK-B a génu.
Konštrukcia knižnice expresie cDNA psích parietálnych buniek
Na izoláciu psích parietálnych buniek sa bunky enzymaticky dispergovali ako je popísané (Soli et al. , 1984, J. Clin. Invest. 73: 1434-47). Izolované bunky boli nabohatené vo vytrepávacom systéme Beckman XJ-10 a izolované pri 900 ot./min v rozmedzí rýchlosti toku 50 až 80 ml/min. Ďalšie nabohatenie na 95%nú čistotu stanovenú farbením podlá Papanicolaoua sa dosiahlo izopyknickou centrifugáciou v diskontinuálnom gradiente hustoty Percollu^.
RNA bola pripravená zo zhruba 1,5 x 108 parietálnych buniek kyselou fenolovou extrakciou (Chromczynski, et al., 1987, Anál Biochem. 162: 156-9) po ktorej následovala chromátografia na oligo(dT) celulóze. Šest μg poly(A)+ RNA bolo prevedených na dvojvláknovú cDNA (Arufo, A. et al. , 1987, PNAS 84: 8573-7). Po pridaní adaptorov BstXI (InVitrogen, San Diego) sa cDNA frakcionaval podlá velkosti v gradiente 5 - 20 % octanu draselného a frakcie väčšie ako 1,5 kb sa zaligovali do vektoru expresie pcDNA-1 (InVitrogen, San Diego).
Izolácia cDNA psieho receptoru qastrinu
Na izolácu klónu receptoru gastrínu z kižnice expresie cDNA psích parietálnych buniek bolo vyprodukovaných 2 x 106 primárnych transformantov v zliatych porciách po 3 000 až 10 000 buniek transformáciou buniek Escherichia coli MC1061.-p3 elektroporáciou (Lin, H. Y. et al. , 1991, PNAB 88:3185-9). Minipreparáty DNA pedstavujúce jednotlivé porcie sa pripravili alkalickou lýzou a potom sa transfekovali do buniek COS-7 prichytených na sklenených bankách (Nunc) s použitím DEAE-dextránu (Pacholczyk, T. et al. , 1991, Náture 350: 350-354). Zásobné suspenzie baktérií predstavujúce jednotlivé porcie sa skladovali v glyceróle. Štyridsaťosem hodín po transfekcii boli bunky inkubované 60 min pri 37°C v Hankovom pufre doplnenom 25 mM HEPESom (pH 7,4), 0,1 % hovädzieho sérového albumínu (roztok A), 50 pM 125I-CCK-8 (New England Nuclear, 2 200 Ci/mmol) a 50 pM 125I-D-Tyr-Gly[(Nie28' 31)-CCK-26-33], čo je analóg CCK s voínou amínovou skupinou dostupnou pre fixáciu (Pearson, R. K. et al., 1987, Biochem. Biopys. Bes. Comm. 147: 346-53 ). Po štyroch prmývaniach v ladovom roztoku A boli bunky fixované vo zmesi fosfátová solanka (pH 7,4) / 2,5 % glutáraldehyd, ponorené do
0,5 %nej želatíny a vysušené pri 37°C. Sklíčká boli exponované 3 dni na fotoemulzii Kodak NTB2 (Gearing, D. P. et al. , 1989, EMBO J. 8: 3667-76) a potom skúmané mikroskoicky v zatemnelom poli. Pozitívna porcia bola postupne delená kým sa získal pozitívny klón (GR-1).
Sled nukleotidov klónu psieho receptoru gastrínu GR-1 cDNA receptoru gastrínu bola subklónovaná do M13mpl8/19 a jednovláknové templáty z obidvoch vlákien boli sekvenované metódou termihácie reťazca (Tábor, S. a Richardson, C., 1987,
- 13 PRAS 84: 4767-71) s použitím modifikovanej polymerázy T7 (United States Biochemical Corp.) (Obr. 7 a SEKV ID Č: 1). Sled bol analyzovaný pomocou UWGCG programu GAP (Devereux, J. et al. , 1984, Rucleic Acids Res. 12; 387-395) a KKD analýzou hydropátie (Klein, P. et al. 1985, Biochim. Biophys. Acta 815: 468-76). cDNA má otvorený čítací rámec kódujúci bielkovinu s 453 aminokyselinami s predpovedanou molekulovou hmotnosťou 48 518 (obr. l, SEKV ID Č: 1). Analýza hydropátie ukazuje na sedem hydrofóbnych segmentov zodpovedajúcich transmembránovým doménam, ktoré sú charakteristické pre rodinu receptorov naviazaných na G-proteín. Preskúmanie ostatných oblastí odvodeného sledu aminokyselín ukazuje veíký počet aminokyselinových podpisov prítomných vo velkej väčšine receptorov naviazaných na G-proteín, Amínový koniec naklónovaného receptoru nemá signálnu sekvenciu aj ked obshuje tri potenciálne možné miesta väzby cukornej zložky na asparagín (N-X-S/T) v polohách 7, 30 a 36.
Gastrinový receptor je signifikantne identický čo do aminokyselín s rodinou β-adrenergických receptorov naviazaných na G-proteín (obr.2). Tak napr. tretia cytoplazmatická slučka a C-koniec sú bohaté na zvyšky treonínu a serínu ako potenciálne regulačné miesta analogické s tými, čo sa našli v rodopsíne a v β2-adrenergickom receptore (Dohlman, H. G. et al. , 1991, Ann. Rev. Biochem. 60: 653-88). Dva cysteínové zvyšky (C127 a C206) sa môžu podielať na disulfidovej väzbe vnútri reťazca podobnej tej, čo sa našla v rodopsíne (Karnik, S. S. et al. , 1989, JWAS’85: 8459-63). Translát GR-1 vykazuje vysoký stupeň (35 %) aminokyselinovej zhody s receptorom neuropeptidu Y-Yl, FC-5. Ďalšie receptory, ktoré vykazujú vysoký stupeň zhody v aminokyselinách s receptorom gastrínu sú receptor ludského dopamínu D4 (28 %), receptor (27 %) a ludský β2 adrenergický analýza ukazuje, že GR-1
5HT z Drosophila melanogaster receptor (26 %). Fylogenetická definuje novú vetvu triedy neuropeptidových ligandov receptorov viazaných na G-proteín.
Hybridizačné skúšky GR-1 pomocou Northern prenosu
Výskyt GR v tkáni (obr. 5) bol odhadovaný vysokostringentným Northern prenosom. Poly(A)+ RNA z dospelých psích tkáni sa separovala na 1,2 %nom agarózovom gele v 0,66 M , TM formaldehyde. RNA bola prenesená na membrány Nytran kapilárnym presávaním. Filtry boli hybridizovné s vysokou stringenciou v pufre obsahujúcom 50 %ný formamid (obj./obj.) s Pstl-Xbal fragmentom cDNA gastrínového receptoru s veíkosťou 1 400 báz, označeným naviazaním náhodných hexamérov (Feinberg, A. P. a Vogelstein, B., 1983, Anál. Biochem. 132: 6-13). Autorádiogram bol exponovaný 45 hodín s dvomi kontrastnými filtrami.
Receptorová mRNA bola nájdená v žalúdočných parietálnych bunkách a v bunkách modzgovej kôry (obr. 5). Vysoká stringencia s ktorou sa vykonávala hybridizácia Northern prenosom poskytuje dobrý dôkaz, že receptor gastrínu a receptor CCK-B sú vysoko homologické. Bolo popísané, že všetky tieto tkáne majú receptory typu receptoru gastrínu/CCK-B (Jensen, R. T. e t al. v Gastrointestinal Endocrinology: Receptors and Post-Receptor Mechanisms, Harcourt Brače Jovanovich, San Diego, str. 95-113; Fourmy, D, et al. , 1987, Eur. J. Biochem. 165: 683-92). 0 psom pankrease sa vie, že v porovnaní s ostatnými druhmi sa vyznačuje značným obsahom receptorov CCK-B/gastrínu.
Afinitné zosieťovanie GR-1
Rekombinantný receptor v membránach buniek COS-7 transfekovaných GR-1 bol afinitne označený, aby sa zistilo, či je identický čo do velkosti s receptorom popísaným skôr na psích natívnych parietálnych bunkách.
Na afinitné značenie sa rekombinantné receptory na membránach buniek COS-7 transfekovaných GR-1 ponechali viazat 125I-D-Tyr-Gly[(Nie28' 31)-CCK-26-33] po 60 min pri 22°C. Následne bol naviazaný rádioligand oddelený od volného centrifugáciou (Pearson, R. K. et al. , 1987, Biochem. Biopys. Res. Comm. 147: 346-53).
Odcentrifugované membrány boli zosieťované s použitím 100 μΜ disukcínimidylsuberátu pri 4°C po dobu 5 min a prebytok sietovacieho činidla bol zrušený Tris pufrora. Označené mebrány boli oddilené elektroforézou v 10 %nom polyakrylamidovom géle v prítomnosti SDS a potom boli vizualizované autorádiografiou. Výsledky ukázali prítomnosť, bielkoviny v páse s Mr zodpovedajúcou približne 76 000 (obr. 4). Široký tvar pásu zodpovedá tomu, že predstavuje glykoproteín. Skutočne tiež cukorná zložka zodpovedá za významný rozdiel v molekulovej hmotnosti medzi predpokládanou bielkovinou a afinitne označeným pásom. Táto veľkosť súhlasí so skoršími údajmi získanými pomocou afinitného značenia, ktoré sa získali s psími parientálnymi bunkami (Matsumoto, M. et al. 1987, J. Am. Physiol. 252: G143-G147).
Väzba na receptor GR-1
Boli charakterizované väzobné vlastnosti rekombinantného receptoru GR-1 aby sa určilo, či sú typické pre receptory CCK-B/ gastrínu. Bunky COS-7 (1,5 x 106) boli naočkované do. kultivačných misiek s priemerom 10 cm (Nunc) a kultivované v DNEM/10 %nom fetálnom teľacom sére v 5 %nom C02 pri 37°C. Po inkubácii cez noc boli bunky transfekované 5 μg GR-1 (Pacholczy'k, T. et al. , 1991, Náture 350: 350-354). Dvadsaťštyri hodín po transfekcii boli bunky rozdelené do misiek s 24 jamkami tak, aby v jednej jamke bolo 5 000 buniek. Po daľších 24 h sa vykonali pokusy s kompetitívnou väzbou v roztoku A, ktorý bol doplnený o 0,15 mM PMSF a o 40 pM aRo o rádioligand. Rovnovážna väzba sa ustálila po 80 min inkubácie pri 37°C. Monovrstvy buniek sa potom tri razy premývali a rádioaktivita sa kvantitatívne stanovila po hydrolýze buniek v IN NaOH. Pokusy s vysýtením rádioligandom
- 16 boli vykonané analogickým spôsobom v rozsahu 2,5 až 1 000 pM 125i_cck pričom nevytesniteiná väzba bola stanovovaná v prítomnosti neznačeného konkurenta v paralelných jamkách.
Väzobné parametre boli taktiež merané v izolovaných plazmatických membránach buniek COS-7, ktoré boli transfekované GR-1. Väzba sa prevádzala 60 min pri 22°C. Oddelenia viazaného a volného rádioligandu sa dosiahlo pomocou filtrácie cez vrstvu viažucu receptor ako bolo popísané skôr (Klueppelberg, U. G. et al. , 1989, Biochemistry 28: 3463-8).
Analýzy kompetetívnej a saturačnej väzby boli vyhodnocované pomocou počítačovej nelineárnej aproximácie kriviek (McPearson,
G. A., 1985, J. Pharmacol. Methods 14: 213-28).
Farmakologická charakterizácia receptorov exprimovaných na bunkách COS-7 transfekovaných GR-1 ukázala väzobnú špecifitu, ktorá je charakteristická pre receptory CCK-B/gastrínu (Matsumoto, M. et al. 1987, J. Am. Physiol. 252: G143-G147). Väzba 125I-CCK preukázala jednu homogénnu triedu receptorov, ako sa potvrdilo hodnotou Hillovej smernice blízkou jednej (0,93 ± 0,07) pre homologickú kompetíciu s použitím CCK. Iní štruktúrne príbuzní členovia tejto rodiny súťažili o väzbu 125I-CCK spôsobom, ktorý bol koncentračné závislý. Vypočítané hodnoty IC50 pre CCK-8, gastrín a desulfátovaný CCK-8 boli 0,09 nM, 0,26 nM resp. 1,4 nM. To je v súlade s afinitou rádioligandu tak, ako bola odvodená zo saturačných väzobných pokusov v parientálnych bunkách COS-7 (Kd = 0,08 nM) transfekovaných GR-1 a v natívnych parietálnych bunkách (Kd = 0,027 nM). Porovnateiné výsledky sa dosiahli s použitím izolovaných membrán pripravených z prechodne transfekovaných buniek COS-7 (IC5Q pre CCK-8, gastrín a desulfátovaný CCK-8 boli 0,0,8 nM, 0,4 nM resp. 1,5 nM). Afinita toho istého rádu pre všetkých testovaných agonistov bola overená s použitím 125I-gastrínu (Amersham) ako rádioligandu.
Antagonisti receptorov gastrínu/CCK nepeptidovej povahy t.j. L364,718 (IC50 = 19 nM) a L365,260 (IC50 = 130 nM) viazali rekombinantný receptor (obr. 3) s afinitámi podobnými tým, ktoré boli popísané pre natívne parietálne bunky. Opäť boli získané porovnateľné výsledky pri použití 125I-CCK lebo 125I-gastrínu ako rádioligandov v intaktných bunkách COS-7 transfekovaných GR-1 alebo v pokusoch s izolovanými membránami týchto buniek. V modzgu morčiat, membránach žalúdočnej žlazy a v králičích parietálnych bunkách, čo všetko sú tkáne bohaté na receptory CCK-B/gastrínu je poradie účinku týchto antagonistov obrátené (Chang, R. S. a Lotti, V. J., 1986, PNAS 83: 4923-6; Roche, S. et al. , 1991, Am. J. Physiol. 260: G182-8).
Aktivácia rekombinantného receptoru GR-1
Väzba gastrínu na rekombinantný receptor vyvoláva typický vzostup koncentrácie intracelulárneho vápnika a hydrolýzy fosfatidylinozitolu. Táto biologická odpoveď v bunkách COS-7 transfekovaných GR-1 sa použila na ďalšie overenie toho, že GR-1 kóduje funkčnú bielkovinu.
Meranie fCa2+1 spustenej receptorom GR-1
Štyridsaťosem hodín po transfekcii bol k bunkám COS-7 pridaný Ca2+ s flurofórom fura-2 v modifikovanom pufre KRB. Zmeny fluorescencie po stimulácii buniek pomocou 10-6 M gastrínu boli merané z pomeru A34o/A38O nm ako ie P°písané prvšie (Rajan, A. S. et al., 1989, Diabetes 38: 874-80).
Gastrín (10 M) spustil výrazný vzostup volného cytozólového vápnika [Ca2+] zo 46,59 ± 6,9 nM na 142,4 ±16,2 nM (n = 3, P < 0,05), zatial čo bunky netransfekované nevykazovali žiadnu odpoveď (obr. 6A). Po chelatácii extracelulárneho vápnika
Oj pomocou EGTA 92,5 nM gastrín postupne zvyšoval [Ca4 ] zo 17,6 ± 1,0 nM na 88,5 ± 11,6 . nM (n = 3, P < 0,05) čé naznačuje, že gastrínom indukovaný vzostup [Ca2+] pochádzal pôvodne z intracelulárnych hotovosti [Ca ].
- 18 Meranie' fosfoinozitolov spustených receptorom GR-1
Charakter odpovede [Ca2+] naznačuje, že rekombinantný receptor spúšťa intracelulárnu signalizáciu cestou aktivácie fosfolipázy C; toto bolo overené meraním metabolitov fosfoinozitolov.
Bunky COS-7 transfekované GR-1 boli kultivované 24 hodín v médiu DNEM (GIBCO) bez inozitolu, doplnenom o 10 pCi/ml [3H](myo)-inozitolu (ARC) pred analýzou. Po 1 h ekvilibrácie v modifikovanom pufre KRB (vid vyššie) boli bunky stimulované 10-6 M gastrínom po dobu 10 sa potom izolované do metanolu:HCl. Vodná fáza bola extrahovaná chloroformom, lyofilizovaná do sucha a analyzovaná pomocou HPLC na silnom anexe (Auger, K. R. et al. , 1989, Celí 57: 167-75).
Meranie metabolitov fosfoinozitolov v bunkách COS-7 transfekovaných GR-1 bolo vykonané 10 s po stimulácii gastrínom (obr. 6b). Bol zvolený čas, ktorý predchádzal vrchol indukovanej [Ca2+]. Gastrín (10-6 M) zvýšil hladinu Ins-1,4,5-P3 o 741 ± 115 % oproti kontrole (bunky COS-7 transfekované GR-1 bez stimulácie). Ins-1,3,4,5-P4, ktoré môžu spolu s Ins-1,4,5-P3 modulovať intracelulárne hladiny vápnika, vzrástli taktiež o 272 ± 15 % (n = 3, P < 0,01). Tieto výsledky sú v súlade s predchádzajúcim sdeleniami o tom, že dráhy druhého messengeru sú prepojené s gastrínovým receptorom natívnych parietálnych buniek (Muallem, S. a Sachs, G., 1984, Biochem. Biophys. Acta 805: 181-185, Chew, C. S., a Brown, M. R., 1986, Biochem. Biophys. Acta 888: 116-125, Roche, S. et al. , 1991, FEBS Lett. 282: 147-51). Predbežné dôkazy nasvedčujú, že receptor gastrínu exprimovaný v bunkách COS-7 je navyše prepojený so stimuláciou adenylát cyklázy.
Väzba agonistov a antagonistov, afinitné značenie a transdukcia signálu sú neodlišitelné od predchádzajúcich výsledkov získaných s natívnymi psími parietálnymi bunkami, o ktorých sa preukázalo, že obsahujú jednu homogénnu triedu receptorov. Hojný výskyt transkriptu GR-1 v bunkách psej modzgovej kôry ako aj v parietálnych bunkách (obr. 5) podporuje názor, že receptory CCK-B a gastrínu sú vysoko homologické.
Konštrukcia knižnice expresie cDNA ľudských parietálnych buniek a izolácia cDNA íudského receptoru gastrínu
Ľudské parietálne bunky lebo hlavné bunky,' o ktorých je známe, že sú obohatené receptormi CCK-B, sa dajú použit na konštrukciu knižnice exprexie ľudskej cDNA. Na prípravu knižnice expresie cDNA íudských parietálnych buniek alebo hlavných buniek sa použijú tie isté metódy ako na konštrukciu knižnice expresie cDNA psích parietálnych buniek s tou výnimkou, že segmenty cDNA sú zaligované do vektorov lambda gtlO lebo lambda gtll ako je poísané inde (Sambrook, et al. , 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. vyd., Cold Spring Harbor Lab. Press, 2: 8.36-38). Prečistená nukleová kyselina z klónu GR-1 podlá tohoto vynálezu sa použije ako sonda na izoláciu cDNA íudského receptrou gastrínu.
Izolácia a sekvenčná analýza cDNA íudského receptoru CCK-B (hCCDB)
Reštrikčný fragment Pstl-Xbal, s 1 400 bázami, kódujúci 3'-koniec receptoru gastrínu z psích parietálnych buniek označený rádioaktívne [alfa- P] dCTP pomocou naviazania náchodných hexamérov (Feinberg, A. P. a Vogelstein, B., 1983, Anál. Biochem. 132: 6-13) bol použitý ako hybridizačná sonda na vyhodnotenie ľudskej knižnice lambda DR2 cDNA ľudských modzgových buniek (Clontech) (Benton, W. D. et al. , 1977, Science 196: 180-182). Filtre boli hybridizované cez noc pri 55°C v 5 % SSC (1 x SSC je
- 20 0,15 M NaCl / 0,015 Μ citrát sodný, pH 7,0) a premyté 2 x SSC /
0,1 %ným SDS pri rovnakej teplote. Jeden pozitívny klón sa našiel medzi 4 x 106 primárnymi rekombinantmi, čo boli vyhodnocované. Po prečistení plaku bol zodpovedajúci inzert cDNA (* 1 kb) subklónovaný do vektoru expresie pcDNA I (Invitrogen, San Diego, CA) a sekvenovaný metódou terminácie reťazca (Tábor, S. a Richardson, C., 1987, PNAS 84: 4767-71) s použitím modifikovanej T7 DNA polymerázy (United States Biochemical Corp.). Porovnanie sledu so sledom cDNA psieho receptoru gastrínu s použitím UWGCG Software programov (Devereux, J. et al. , 1984, Nucleic Acids Pes. 12: 387-395) naznačilo, že pôvodný klón bol fragment zodpovedajúci 3'-koncu predpokladanej cDNA receptoru CCK-B. DNA z plaku bola prečistená a sekvenovaná ako je popísané pre klón GR-1. Sled 66 párov báz vnútri otvoreného čítacieho rámca je ukázaný v obr. 8A (SEKV ID Č: 2). SEKV ID Č: 2 taktiež ukazuje sled aminokyselín CCK-B predpovedaný z cDNA. Týchto 22 aminokyselín je vysoko homológnych s 22 aminokyselinami predpovedaného sledu aminokyselín GR-1 (#281-302 v SEKV ID Č: 1; SEKV ID Č: 3) ako je ukázané v obr 8B.
Inzert cDNA s 1 kb bol potom použitý ako hybridizačná sonda na izoláciu zodpovedajúcej celej cDNA ludského receptoru CCK-B z fetálnej (23, týždeň) íudskej knižnice modzgových buniek v lambda LAS, čo je modifikovaný lambda vektor (Swaroop, et al., 1988, Nucleic Acids. Res. 16: 8739). Vykonalo sa vyhodnotenie x 105 primárnych rekombinantov za podmienok popísaných vyššie. Nukleotidový sled bol analyzovaný pomocou UWGCG Software programov popísaných vyššie (Devereux, J. et al. , 1984, Nucleic Acids Res. 12: 387-395).
cDNA receptoru CCK-B z íudského modzgu kóduje bielkovinu s 447 aminokyselinami (obr. 10, SEKV hmotnosťou 48 419 daltonov. Analýza s inými známymi receptormi svedčí o tom, že receptor CCK-B je členom rodiny receptorov so siedmimi transmembránovými doménami naviazanými na G-proteín. Amínový koniec receptoru obsahuje tri
ID č: 4) s predpovedanou hydropátie a porovnanie
- 21 — možné asparagínové glykozylačné miesta (N-X-S/T), a to v polohách 7, 30, 36. Odvodený sled aminokyselín ukazuje rad štruktúrnych charakteristík, ktoré nachádzame vo väčšine známych receptorov naviazaných na G-proteín. Cysteínové zvyšky, jeden v prvej extracelulárnej slučke (C127) a jeden v druhej extracelulárnej slučke (C205) môžu vytvoriť disulfidovú väzbu vnútri reťazca podobnú tej, čo sa našla v rodopsíne (Karnik,
S. S. et al., 1989, PNAS 85: 8459-63). Zvyšky treonínu a serínu sú nahromadené v tretej cytoplazmatickej slučke ako aj na karboxylovom konci; to môžu byť fosforylačné miesta analogické s tými, čo sa našli v v β2-3<ΐΓθηθ^ίο^ιη receptore a v rodopsíne (Dohlman, H. G. et al. , 1991, Ann. Rev. Biochem. 60: 653-88).
Porovnanie sledov ostatných známych receptorov naviazaných na G-protein ukazuje, že odvodený sled aminokyselín receptoru CCK-B vykazuje najvyšší stupeň identity aminokyselín s psím receptorom gastrínu (91 %), potom následuje potkaní receptor CCKA (49 %). Priradenie sledov aminikyselín troch predpokladaných podtypov receptorov CCK/gastrínu (obr. 11) ukazuje vysoký stupeň sekvenčnej identity týchto troch receptorov a to nielen v transmembránových doménach, ale aj pokial ide o extracelulárne a intracelulárne slučky. Ďalšie receptory, ktoré vykazujú vysoký stupeň identity aminokyselín s receptorom CCK-B sú receptory peptidových hormónov, potkanieho neuropeptidu Y (30 %), ludského vasopressínu V2 (30 %), ludského oxytocínu (28 %), a receptory biogénnych amínov, ludského β-adrenergického (26 %) a potkanieho serotonínu (23 %).
Hybridizačná skúška CCK-B pomocou Northern prenosu
Dva mikrogramy poly(A)+ RNA, izolovanej z deviatich rôznych ludských tkáni boli oddelené v denaturačnom agarózovom géle vo formaldehyde a prenesená na nylonovú membrány (Human MTN Blot, Clontech). Pstl-Xbal fragment hCCKB s velkosťou 1 400 báz,
- 22 označený rádioaktívne [alfa-32P] dCTP naviazaním náhodných hexamérov (Feinberg, A. P. a Vogelstein, B., 1983, Anál. Biochem. 132: 6-13) bol hybridizovaný na membránu cez noc pri 42°C %ný formamid (obj./obj.), 5 x SSC/ 6,6, 1 x Denhardtov roztok, 0,5 %ný SDS, (hmot./obj.) a potrhanú (sheared) DNA μg/ml). Membrána bola premývaná 40 min Prenos bol znova sondovaný bola premytá 0,2 x SSC autorádiografický signál
Eur. J. Bioche. s 2,2 kb najskôr v roztoku obsahujúcom 20 mM fosfát sodný, pH 10 %ný dextránsulfát z lososej spermy (100 v 0,2 x SSC s 0,1 %ným SDS pri 69°C. cDNA ludského β-aktínu a mebrána v 0,15 %nom SDS pri 55°C. Silný β-aktínu bol pozorovaný vo všetkých dráhach po trojhodinovej expozícii (výsledky neuvádzme).
Výskyt transkriptu hCCKB v tkáňach bol posudzovaný pomocou Northern prenosu za stringentných podmienok, obr. 12. Transkript RNA so zhruba 2,2 kb bol nájdený v ludskom modzgu, žalúdku a pankrease, o ktorých je známe, že podlá funkčných údajov lebo údajov o väzbe receptrov obsahujú podtypy receptorov CCK/gastrínu. Hybridizačný signál mRNA izolovanej zo žalúdka ukazuje na identitu lebo krížovú reaktivitu s transkriptom receptoru gastrínu íudských parietálnych buniek. Je však takisto možné, že sonda hybridizuje s iným príbuzným podtypom receptoru CCK/gastrínu. Dva pankreatické signály naznačujú expresiu receptorov CCK/gastrínu taktiež v pankrease. I ked to doteraz nebolo popísané pre ludský materiál, fotoafinitným značením bolo dokázané, že psí pankreas obsahuje významné množstvo receptorov gastrínu navyše k receptorom CCK-A (Fourmy, D. et al., 1987, 165: 683-92). Tak teda hybridizačný signál predsavuje transkript receptoru gastrínu lebo CCK-B. Väčší, menej intenzívny signál môže byť odrazom mRNA receptoru CCKA, alternatívne procesovanej varianty transkriptu s 2,2 kb alebo mRNA pankreatického receptoru.
kódujúcou doteraz neznámy subtyp
Meranie [Ca2+1 spustenej receptorom GR-1
Štyridsaťosem hodín po transfekcii hCCKB-pcDNA I bol k bunkám COS-7 pridaný Ca2+ flurofór fura-2 v modifikovanom Krebs-Ringerovom hydrouhličitanovom pufre. Zmeny v pomere emisie fluorescencie (A34q/a3S0 nm’ P° stimulácii buniek 10-7 M CCK-8 boli merané ako je popísané prvšie (Rajan, A. S. et al., 1989, Diabetes 38: 874-80).
Meranie metabolitov fosfoinozitolov spustených receptorom CCK-B
Bunky COS-7 transfekované hCCKB-pcDNA boli kultivované v médiu DNEM (GIBCO) bez inozitolu, doplnenom o 10 μθί/ιη1 [3H](myo)-inozitolu (ARC) 24 h pred analýzou. Po 1 h ekvilibrácie v modifikovanom pufre Krebs-Ringerovm hydrouhličitane (vid vyššie) boli bunky stimulované 10 do metanolu:HCl, lyofilizovaná a (Ins-1,4,5-P3) (Ins-1,3,4,5-P4)
M CCK-8 po 10 s a izolované
Vodná fáza bola extrahovaná chloroformom, analyzovaná na inozitol-1, 4, 5-trifosfát a inozitol-1, 3, 4, 5-tetrakisfosfát pomocou HPLC na silnom anexe (Auger, K. R. et al. , 1989, Celí 57: 167-75).
Aby sa overilo, že hCCKB kóduje funkčný receptor bola meraná signalizácia druhého messenger ako odpoved na stimuláciu buniek
COS-7, exprimujúcich rekombinantný receptor, pomocou CCK-8.
CCK-8 (10-7 M) spúšťal výrazný vzostup volného cytozólového vápnika [Ca2_r]i (obr. 13A, lavý panel), zatial čo netransfekované bunky nevykazovali žiadnu odpoved (obr. 6A). Po chelatácii 2 + extracelulárneho vápnika pomocou 2,5 mM EGTA (1,5 mM Ca v pufre) prídavok CCK-8 (10-7 M) dočasne zvyšoval [Ca2+]i (obr. 13A, lavý panel), čo svedčí o tom, že pôvodný vrchol vzostupu [Ca2+]i indukovaný CCK-8 pochádzal primárne z intracelulárnych hotovostí CCK-8 k
Ca2+. Charakter odpovede [Ca rekombinantnému receptoru 2+]i naznačuje, že väzba spúšťa intracelulárnu
- 24 signalizáciu cestou aktivácie lipázy C. To bolo overené meraním metabolitov fosfatidyl inozitolov v bunkách COS-7 transfekovaných hCCKB-pcDNA 10 sekúnd po stimulácii pomocou CCK-8 (obr. 13B). Tento čas bol zvolený tak, aby práve predchádzal vrchol [Ca2+]i indukovaný CCK-8. CCK-8 (10-7 M) zvyšoval hladinu Ins-1,4,5-P3 o 453 % oproti kontrole (n = 3, P <0,01). Ins-1,3,4,5-P4, bezprostredný metabolit Ins-1,4,5-P3, takisto vzrástol o 186 % oproti kontrole (n = 3, P < 0,01). Tieto výsledky takisto potvrdzujú, že izolovaný klón kóduje funkčný receptor.
Väzba na receptor CCK-B
106) boli rozprestreté na kultivačné (Nunc) a kultivované v DNEM/10 %nom % vzduchu boli bunky
Bunky COS-7 (1,5 x misky s priemerom 10 cm fetálnom teíacom sére v atmosfére 5 % CO2 / v inkubátore pri 37°C. Po inkubácii cez noc transfekované (Pacholczyk, T. et al. , 1991, Náture 350: 350-354) pomocou 5-7 μg pcDNA I vektoru expresie, ktorý obsahová hCCKB (hCCKB-pcDNA I). Dvadsaťštyri hodín po transfekcii boli bunky rozdelené do misiek s 24 jamkami (Costar, 2 x 104 buniek Po áaíších 24 h sa vykonali pokusy s kompetitívnou Hankovom pufri, ktorý bol doplnený o 25 mM HEPES 0,1 %ný hovädzí sérový albumín a 0,15 mM PMSF.
Dvadsať pM 125I-CCK-3 (New Englan Nuclear) bol použitý, ako rádioligand. Rovnovážna väzba sa ustálila po 80 min inkubácie pri 37°C. Monovrstvy buniek sa potom tri razy premývali, na jamku). väzbou v (PH7, 4), hydrolyžovali kvantitatívne. (Penisula) a
N NaOH a Neoznačení antagonisti, naviazaná rádioaktivita sa stanovila agonisti, CCK-8, gastrín I, CCK-4
L364,718 a L365,260 (Glaxo) boli nestovaní v koncentračnom rozsahu 0,1 pM až 10 μΜ. Všetky väzobné pokusy sa opakovali 3 až 5 razy. Údaje o kompetícii boli analyzované pomocou počítačovej nelineárnej aproximácie kriviek (Inplot 4.0 GraphPad, San Diego, CA)
Farmakologická charakterizácia ľudského modzgového receptoru CCK-8 exprimovaného na bunkách COS-7 ukázala agonistické aktivity, ktoré zodpovedali receptoru typu CCK-B (Innis, R. B. et al. , 1980, PNAS 77: 6917-6921; Saito, A. et al., 1980, Science 208: 1155-1156; Lotti, V. J. et al. , 1989, Eur. J. Pharmacol. 162: 273-280; Hays, S. et al., 1980, Neuropeptides, 1: 53-62). Štruktúrne príbuzní agonisti CCK-8, gastrín I a CCK-4 súťažili všetci o väzbu 125I-CCK-8 na bunky COS-7 exprimujúce rekombinantný receptor spôsobom, ktorý prejavoval koncentračnú závislosť. Vypočítané hodnoty IC50 pre CCK-8, gastrín I a CCK-4 boli 0,14 nM, 0,94 nM resp. 32 nM (obr. 14A). Ako sa dalo očakávať pri prototype receptoru CCK-B, rekombinantný receptor má vysokú afinitu ako pre CCK-8 tak aj pre gastrín I, pričom afinita pre CCK-8 je 7násobná. Tento rozdiel v relatívnych afinitách (CCK-8 versus gastrín I) je v dobrom súhlase s lOnásobným rozdielom, ktorý je poísaný v štyroch prácach, čo čtudovali izolované modzgové membrány morčaťa a potkana (Innis, R. B. et al. , viď vyššie; Saito, A. et al. , viď vyššie; Lotti, V. J. et al. , viď vyššie; Hays, S. et al. , viď vyššie). Drobné odchýlky v pomeroch afinity, ktoré sa objavujú pri porovnaní so skoršími prácami sa dajú prisúdiť variabilite v experimentálnych podmienkach vrátane podmienok prípravy tkáni, vo zdroji peptidu a použitých radioligandov.
Afinita k CCK-4 poskytuje ďalší dôkaz, že rekombinantný ľudský modzgový receptor je skôr receptor CCK-B ako receptor CCKA. V prácach s izolovanými modzgovými membránami morčiat (Innis, R. B. et al. , viď vyššie), myší (Hughes, J. et al. , 1990, PNAS 87: 6728-6732) a potkanov (Saito, A. et al. , viď vyššie) bol pomer hodnôt IC^q receptoru CCK-B pre CCK-4 (versus CCK-8) v rozmedzí 10 až 110. V tejto štúdii ľudského rekombinantného receptoru bol nájdený pomer hodnôt IC50 (CCK-4 versus CCK-8) ako rovný 230, čo súhlasí s vyššie citovanými hodnotámi. Naproti tomu receptor CCK-A charakterizovaný na potkaních pankreatických
- 26 membránach viaže CCK-4 (oproti CCK-8) s hodnou pomeru IC5Q rovnou 30 000 až 40 000 (Jensen, R. T. et al. , 1989, Trends Pharmacol. Sci. 10: 418-423, Hughes, J. et al., viď vyššie) .
Väzba nepetidových antagonistov L364,718 a L365,260 na rekombinantný receptor ďalej potvrdzuje správnosť jeho klasifikácie ako receptoru CCK-8 (Hughes, J. et al., viď vyššie, Chang, R. S. a Lotti, V. J., 1986, PNAS 83: 4923-6). Hodnoty IC5Q pre L364,718 a L365,260 sú 145 nM resp. 3,8 nM (obr. 14B) , čo je hodnota, ktorá dobre zapadá do rozmedzia 6 až 125násobnej afinity popísaného v literatúre (Hughes, J. et al., viď vyššie; Lotti, V. J. et al. , viď vyššie). Hodnota IC50' ktorú rekombinantný receptor vykazuje pre L365,260 je rovnako v dobrom súhlase s referenčnou hodnotou stanovenou s izolovanými modzgovými membránami (2,4 nM) (Lotti, V. J. et al. , viď vyššie) .
Čistenie polypeptidovych receptorov gastrínu a CCK-B
Polypeptidový receptor gastrínu a polypepticový receptor CCK-B môžu byť prečistené pomocou konvenčných metód, ktoré sú známe tým, kto sú zaškolení v obore, ako sú napr. ale nie výlučne metódy zrážacie, chromatografické, imunoadsorbčné lebo afinitné techniky. Polypeptid môže byť prečistený z východzieho materiálu pričom sa použije cDNA GR-1 v bunkách COS-7, cDNA CCK-B v bunkách COS-7 alebo rekombinantná forma týchto cDNA zabudovaná do buniek superprodukčnej línie.
Vyber kandidátov na antagonistov
Aktivácia receptoru gastrínu indukovaná gastrínom lebo CCK poskytuje test na vyhodnotenie kandidátov na antagonistov blokujúcich vzostup cytozóloveho [Ca2+], vzostup hydrolýzy fosfatidylinozitolov lebo vzostup adenylát cyklázy. Tak napr. kandidáti na antagonistov sa pridajú ku kultivovaným bunkám, napr. bunkám COS-7, ktoré exprimujú cDNA receptorov GR-l lebo CCK-B. Agonisti sú, pričom výčet sa neobmedzuje len na nich, gastrín, CCK, CCK-8s, CCK-8d, CCK-4, lebo CCK-5 (Penisula Co.). Vápnik [Ca2+] lebo fosfatidylinozitoly sa zmerajú ako je popísané vyššie (obr. 6A a 6B). Na stanovenie hladín cAMP sa použije komerčná súprava (Amersham). Za kandidáta na antagonistu sa považujú látky, ktoré blokujú aktiváciu receptoru, ako je ukázané v obr. 6A a 6B lebo v obr. 13A a 13B. Kanditáti na antagonistov zahrnujú aj peptidové aj nepeptidové látky.
Ináč sa dajú pokusy s kompeptitívnou väzbou vykonať: na bunkách COS-7 transfekovaných c DNA receptoru GR-l lebo CCK-B ako je popísané v obr. 3 a 14. Zmeria sa väzba agonistu na receptor. Tieto merania sa porovnajú s kontrolnou vzorkou buniek inkubovaných za rovnakých podmienok avšak bez prítomnosti potenciálneho antagonistu. Ako použitelní antagonisti sa dajú definovať tie molekuly, ktoré inhibujú väzbu agonistu na receptor, ako je ukázané Hillovým výnosom podobným tomu, čo je na obr. 3.
Terapia
Títo antagonisti, akonáhle boli identifikovaní, sa dajú použiť na inhibíciu aktivity receptoru gastrínu lebo CCK-B in vivo. Antagonisti receptoru gastrínu môžu byť užitoční napr. na liečenie Zollinger-Ellisonovho syndrómu, rakoviny žalúdka, zhubnej anémie, refluxnej ezofágitídy, vredovej žalúdočnej choroby alebo rakovinných nádorov tým, že znižujú aktiváciu receptoru gastrínu a hladinu kyseliny v žalúdku. Tak napr. OmeprazoleR (Merck), o ktorom je známe, že znižuje hladinu kyseliny v žalúdku, zvyšuje pri dlhodobej aplikácii hladinu gastrínu, čo u potkanov spôsobuje vznik rakovinných nádorov. Proti tomuto účinku by bolo možné aplikovať antagonistu receptoru gastrínu, čím by sa dosiahlo toho, že OmeprazoleR by sa mohol používať na liečenie po dlhší čas. Pretože gasstrín sa môže
- 28 uplatňovať taktiež pri raste a diferenciácii, antagonisti receptorov gastrínu by sa dali použiť k liečbe niektorých druhov rakoviny vrátane, nievšak len, rakoviny malých buniek plúc lebo rakoviny hladkého svalstva.
Antagonisti receptorov CCK-B sa dajú použiť na inhibíciu aktivity receptoru CCK-B in vivo. Antagonisti receptoru CCK-B môžu priniesť úžitok pri liečení bolesti, depresií a stiesnenosti, porúch pamäti, porúch pocitu sýtosti a porúch v jedle a panikových stavov. Tak napr. analógy CCK, napr. CCK-4, spôsobujú záchvaty paniky u ludí. Keď je receptor CCK-B blokovaný napr. antagonistom receptoru CCK-B, potom sa nával paniky nedostaví.
Účinné množstvá antagonistov by v obidvoch prípadoch bolo možné podať pacientovi intravenózne s použitím zariadenia pre pomalé dávkovanie alebo per os konvenčným spôsobom.
Iné príklady
Iné príklady sú zahrnuté do následujúcich návrhov.
Tak napr. sa môžu izolovať iné ekvivalentné klóny pomocou hybridizčných vyhodnocovacích techník dobre známych tým, čo bežne ovládajú obor a to s použitím cDNA podlá tohoto vynálezu na vyhodnocovanie knižníc expresie cDNA psích lebo ludských parietálnych buniek. Podobne je možné získať prečistenú nukleovú kyselinu kódujúcu receptor E2 s použitím týchto knižníc cDNA.
Knižnica cDNA expresie môže byť pripravená ligáciou cDNA do iných vektorov, t.j. vektorov iných ako pcDNA-1, lambda gtlO lebo lambda gtll, ktoré sú schopné exprimovat produkty biologicky aktívnych bielkovín v eukarytických bunkách.
Vynález zahrnuje akúkolvek bielkovinu, ktorá je v podstate homologická s psím receptorom gastrínu (obr. 1, SEKV ID Č: 1), s ludským receptorom gastrínu a s ludským receptorom CCK-B (obr. 2, SEKV ID Č: 4), práve tak ako iné, v prírode
- 29 sa vyskytujúce člený rodiny receptorov gastrínu/CCK-B. Takisto sú zahrnuté alelové varianty, prirodzené mutanty, indukované mutanty, bielkoviny kódované DNA, ktorá hybridizuje za podmienok vysokej lebo nízkej stringencie (t.j. premývaní 2 x SSC pri 40°C s dĺžkou sondy prinajmenej 40 nukleotidov) na nukleovú kyselinu. Patria sem aj chimérické polypeptidy, ktoré obsahujú jeden člen rodiny receptorov gastrínu/CCK-B.
Vynález zahrnuje aj hociktorý biologicky aktívny fragment lebo analóg receptoru z rodiny receptorov gastrínu/CCK-B. Pod pojmom biologicky aktívny sa rozumie, že má akúkolvek aktivitu in vi vo lebo in vitro, ktorá je charakteristická pre rodinu receptorov gastrínu/CCK-B. Vzhíadom na to, že rodina cicavčích receptorov gastrínu/CCK-B má velký rad fyziologických vlastností a vzhíadom k tomu, že tieto vlastnosti sa dajú vztiahnuť k rôznym častiam molekuly receptoru gastrinu/CCK-B, je užitočný fragment receptoru gastrínu/CCK-8 ten, ktorý vykazuje biologickú aktivitu v ktoromkoívek teste na receptory gastrínu/CCK-8 alebo ktorý má jednu z následujúcich aktivít: a) schopnosť receptoru viazať agonistu lebo b) schopnosť zvýšiť cytozólový vápnik [Caz j po indukcii agonistom lebo c) schopnosť indukovať fosfolipázu C po indukcii agonistom lebo d) schopnosť aktivovať po indukcii agonistom adenylát cyklázu, aby vzrástla hladina cAMP. Fragment lebo analóg receptoru z rodiny cicavčích receptorov gastrínu/CCK-8, ktorý vykazuje 10 %, lepšie 40 % alebo najmenej 90 % aktivity polypeptidového cicavčieho receptoru gastrínu/CCK-8 (napr. toho, čo je ukázaný v obr. 1, SEKV ID Č: 2) v ktoromkoívek teste in vivo lebo in vitro na cicavčie receptory gastrínu/CCK-B (napr. v tých, čo sú popísané vyššie) sa považuje za biologicky aktívny a užitočný podía tohoto vynálezu.
Pedpokíadané biologicky aktívne fragmenty receptrov gastrínu/CCK-8 je možné vytvoriť metódami, ktoré sú známe tým, čo sú zbehlí v obore. Schopnosť fragmentu vyhovieť testom, ktoré sú popísané vyššie, je možné odhadnúť pomocou metód, ktoré sú známe tým, čo sú zbehlí v obore, napr. metódami popísanými nižšie.
- 30 Preferované analógy zahrnujú členov rodiny receptorov gastrín'u/CCK-8 (alebo ich biologicky aktívne fragmenty) ktorých sledy aminkyselín sa líšia od sledov aminokyselín divokých typov len konzervatívnymi zámenami aminokyselín napr. zámenou jednej aminokyseliny aminokyselinou s podobnými vlastnosťmi (napr. zámena valínu za glycín, arginínu za lyzín atd.) alebo jednou či viac nekonzervatívnymi zámenami aminokyselín, deléciami alebo inzerciami, ktoré neodstraňujú biologickú aktivitu polypeptidu. Iné užitočné modifikácie sú tie, ktoré zvyšujú stabilitu peptidu: takéto analógy môžu obsahovať napr. jednu či viac nepeptidových väzieb (ktoré nahrádzajú peptidovú väzbu) alebo D-aminokyseliny v slede aminokyselín peptidu.
Analógy sa môžu odlišovať od prirodzených receptorov gastrínu/CCK-B v slede aminokyselín alebo v modifikáciách, ktoré neovplyvňujú sled aminokyselín alebo v obidvom. Analógy podía tohoto vynálezu budú obecne vykazovať najmenej 70 %nú, lepšie 80 %nú, ešte lepšie 90 %nú a vôbec najlepšie 95 %nú či dokonca 99 %nú homológiu so segmentom s 20 zvyškami aminokyselín, ale radšej so 40 zvyškami aminokyselín alebo ešte lepšie s celým sledom aminokyselín prirodzeného receptoru gastrínu či CCK-B.
Zmeny v primárnej sekvencii zahrnujú genetické varianty, aj prirodzené aj indukované. Sú zahrnuté aj analógy, ktoré majú aj iné zvyšky ako prirodzené L-aminokyseliny, napr. D-aminokyseliny lebo aminokyseliny nevyskytujúce sa v prírode či syntetické, napr. β lebo gama aminokyseliny. Ináč je možné zvýšiť štabilitu cyklizáciou peptidovej molekuly. Vystavením polypeptidu účinkom enzýmov, ktoré menia fosforyláciu, napr. kinázam lebo fosfatázam; modifikácie zahrnujú chemickú derivatizáciu in vivo lebo in vitro, ako napr. acetyláciu, metyláciu, fosforyláciu, karboxyláciu lebo glykozyláciu; glykozyláciu je možné pozmeniť napr. zmenou miesta glykozylácie búd počas syntézy a opracovania (processingu) polypeptidu alebo až v dalších stupňoch opracovania, napr vystavením polypeptidu účinkom enzýmov, ktoré ovplyvňujú glykozyláciu, čo sú enzýmy z buniek, ktoré normálne takéto opracovanie vykonávajú, ako sú napr. cicavčie glykozylačné
- 31 enzýmy. Fosforylácia sa dá modifikovať vystavením polypeptidu účinkom enzýmov, ktoré ovplyvňujú fosforyláciu, ako sú napr. kinázy či fosfatázy.
Okrem polypeptidov, ktoré majú v podstate celú dĺžku reťazca vynález navyše zahrnuje aj biologicky aktívne fragmenty polypeptidov. Termín fragment ako sa tu používa je vztiahnutý na polypeptid s najmenej ... zvyškami aminokyselín, ale skôr typicky s najmenej 40 zvyškami, najlepšie ale s najmenej 60 zvyškami aminokyselín. Fragmenty receptorov gastrínu lebo CCK-B sa dajú pripraviť metódami, ktoré sú známe tým, čo sú zbehlí v obore. Schopnosť kandidáta na fragment vykazovať biologickú gastrínu lebo CCK-B sa dá odhadnúť tu známymi tým, čo sú školení v obore. Takisto
I sú zahrnuté polypeptidové receptory gastrínu/CCK-B obsahujúce aminokyseliny, ktoré sú normálne odstraňované počas opracovania (processingu.) , vrátane dalších aminokyselín, ktoré nie sú vyžadované pre biologickú aktivitu polypeptidu alebo vrátane ďalších aminokyselín, ktoré sú dôsledkom zostrihu mRNA či iných javov, ku ktorým dochádza pri opracovaní (processingu) bielkovín.
aktivitu receptoru popísanými metódami
- 32 Zoznam sekvencií (1) Obecná informácia (i) Žiadate!: Alan S. Kopin (ii) Názov vynálezu: cDNA kódujúce receptory gastrínu a CCK-B (iii) Počet sekvencií: 4 (iv) Adresa pre korešpondenciu:
(A) Adresát: Fish & Richardson
(B) Ulica: 225 Franklin Street
(C) Mesto: Boston
(D) Štát: Massachusettts
(E) Krajina: U.S.A.
(F) PSČ 02110-2804
(v) Forma čitatelná počítačom:
(A) Typ prostredia: 3,5 disketa
1,44 Mb (B) Počítač: IBM PS/2 Model 50Z lebo 55SX (C) Operačný systém: MS-DOS (verzia 5,0) (D) Software: WordPerfect (verzia 5,1) (vi) Údaje o žiadosti (A) Číslo žiadosti:
(B) Podaná dňa:
(C) Klasifikácia:
(vii)
Údaje o predchádajúcich žiadostiach
(A) Číslo žiadosti: 07/832,841
(B) Podaná dňa: 7. februára 1992
(A) Číslo žiadosti: 07/941,373
(B) Podaná dňa: 3. septembra 1992
(viii) Informácie o právnom zástupcovi a agentúre:
(A) Meno: Paul C. Clark (B) Číslo registrácie: 30,162 (C) Referencia/číslo záznamu: 00398/065003 (ix) Telekomunikačné informácie:
(A) Telefón: (B) Telefax: (C) Telex: (617) 542-5070
(617) 542 200154 -8906
Informácia o sekvencii s iden tifikačným číslom:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 1440
(B) Typ: nukleová kyselina
(C) Vlákno: dvojité
(D) Topológia: lineárna
(xi) Popis sekvencie pod SEKV ID Č: 1
ATG Met GAG Glu CTG Le’- CTA Leu AAG Lvs 5* CTG Leu AAC Aan CGG Arg AGC Ser Ala 10 CAG Gin GGG Gly TCC Ser GGA Gly GCC Ala 15 GGG Gly 7
20 CCG GGG GCT TCC CTG TGC CGC GCG GGC GCC CTC CTC AAC AGC AGC 105
Gly ALä. Ser Leu Cys Arg Ala G Ly Gly Ala Leu Leu Asn Ser Ser
20 2Ξ* 30
GGT <?^.G GGC AAT CTC AGC T·*- — i. GAG CCG CCT CGC CTC CGC GGA GCC GGG 1Ξ Ξ
Gly Ala — 1 , - Asn Leu Ser Cys G iU ?rc ?ro Arg Leu Arg Gly Ala Gly
2 5 2 5 40 45
ACA CGA GAA TTG GAG; CTG GCC ATT AGG GTC ACC CTT TAT GCA GTG ATC 201
T5 - Arg Glu Leu Glu Leu Ala Zle Arg Val Thr Leu Ty* Ala Val Zle
50 c ΐ ó0
30 --- CTG ATG AGT GTT GGA GGA AAT GTG CTC ATC ATC GTG GTC CTG GGA 24?
Phe Leu Met Ser Val GIv Gly Asn Val Leu Zle Zle Val Val Leu Gly
5 5 70* 75 80
CTG AGT CGC CGG CTG AGG ACT GTC ACC AAC GCC TTC CTG CTC TCA CTG 297
Leu Ser Arg Arg Leu Arg Thr Val Thr Asn Ala Phe Leu Leu Ser Leu
35 as 90 95
GCA GTC AGC GAC CTC CTG CTG GCT. GTG GCT TGC ATG ccc TTC ACC CTC 34 5
Ala Val Ser Asp Leu Leu Leu Ala Val Ala Cys Met Pro Phe Thr Leu
100 105 110
CCG CCC Leu Pro AAT Asn 115 CTC Leu ATG Met GGC Glv ACG Chr CTC Phe 120 ACC Íle Phe GGC Gly ACA Thr GCC Val 125 GTC Val CGT Cys AAG Lys 393
GCA GTT TCC CAC CTC ATG GGG GTG CGC GTG AGC GTG TCC ACA CTA AGC
A _ a. V a i Ser Ty r Leu Met Glv Val Ser val Ser Val Ser Thr Leu Ser
130 135 140
CTT GTG GCC ACC GCC CCG GAG CGA CAC AGC GCC ATC TGC CGG CCG CCA 429
Leu Val Au a TLe Ale Leu Glu A. r z Tvr Ser Ala 1 ie Cys Are Pro Leu
_ «n 2 250 155 150
CAA GCA CGC GTG CGG CAG ACG CGT ÄC CAC GCG GCT CG l a . GTG ATC ACC - - -
Gi λ i £ A. r c Val Trp Gin u Arg Ser HlS Ala Ala Arg Val íle íle
U 3 3 - f \J 175
GCC ACC TGG A. - G CCC CCC uGA. CCG CTC A i G GCG CCC TAC r* ľf— U'wSj GTG CAC 535
i ’ Ä “’·»·· —r Met Leu Ser Glv Leu Leu Mg- Val Pro Tvr Pro val Tvr
130 135 190
ACC GCC GCA CAG CCC GCA GGA GGG GCC CGG r* vw CTG CAG TGC GTG CAC 52 3
. r. r A. _ a Val \J 7. ?rc λ- a Glv Glv Ala Arg Ala Leu Gin Cys Val Hl s
20Ó 205
u G - . GG CCC AGC GCG CGC GCC CGC CAA ACC CGG TCG GCA CTG CTG CTC 551
i ·— *** —» ?rc Ser A· a A. r z val Aro Gin — u, — T ro Ser val Leu Leu Leu
U U U 215 220
u _ G C . -' TTG -?r TTC GCC CCA GGC GCG GCC ATG GCT GTG GCC TAC GGG 729
Leu Leu Leu Phe Phe Val Aro Glv Val Val Met Ala Val Ala T' »» Glv
2 2 5 230 225 240
C7C ACC CCC CGC GAG CCC CAC TTA /“ <· * v. · . CGC CTC GAC GAG .AAC AGC ---
” 5 U 2 2 € Ser A. r c Glu Leu '•y — Leu G 1 y Leu Arp Phe Asn Glu A. s o Ser
245 2 50 255
GAC AGC GAA AGC CGA GCC CGA. AGC GGA. Gw CTG Uvj'.j GGT (AGG GCG 225
Asp Ser G u u Ser A r r v a i Are Ser G - Ω Glv Glv Leu Arg Glv Gly Ala
260 255 270
GGA CCA GGC CCC GCC CCC CCC ΛΖ*. - A.GT _ J'— <·<*<· CCG GAG GGC GGG 22
Glv Pro G . y ?Γ3 Ala ?rc ?rc A s r. G - v Ser C'.’S > m Λ- 5 Pro Glu Glv Glv
275 220 225
CCG GCC GGC GAG G Au GGC GAC GGC CAC GCG CAG CTT CCG CGC 521
Leu ALa Gly Glu Α.3Ό Glv Aso Glv CVS Tvr Val Gin Leu ?ro Arg Ser
290 295 300
CGC CAG C i G GAG CTG CCC GCG CTG ACC G v- CCC ACT CCT GGG CCC 955
Are Gin Leu ·— 1 .. nj · Leu Ser A. a Leu ·* U ·“ Ala ?rc Τ' p ·» ?rc Gly ?rz
7 Z 210 215 2 2 0
GGC CCC CGG CCC CAC CAG GCC AAG U . nj CCG GCC AAG PAG CGC 1012
Glv Gly G 2y Pro Arg Pro Tvr ο-Ω **.—a Lvs Leu Leu Ala Lys Lvs Arg
325 230 235
GTG GTG CGG ATG CTG CCG GCG ACC GTC GTG CCC TTT TTC CTG TGT TGG 1065
v a . v a í Αζς Met Leu Leu Val ľ le Val Val Leu Phe Phe Leu Cvs Tro
240 245 350
TTG CCA CCG CAC hv . GCC AAC ACG CGC GCC CCC GAC AGC CCC GGT 2 i * -
Leu Pro Leu Tvr Ser Ala Asn 2h_r ľrc A. r c Ala Phe Aso Ser Ser Gly
25 5 3óC 3 65
GCA CAC CCC TC A yur. GCG CCA A.TC CCC CCC ATC CAC CCG CTG 1151
Ala H i s Aro Ala Leu Ser Glv Ala 2xr Zle Ser Phe ľ le H i s Leu Leu
270 375 330
'> ·' Ο . I im <) . 1 Ο .c ο Ο (J , 1 t.) r»: r-l Q (J
AG<. GAC GGG 7GA G s- G 1GC GTC AAC r* r·'“· <w w w GGG ZZZ TAC TGC ZZZ ATG CAC
5er t· — Ala Ser AL a Cvs Val Asn Leu Val ** ·» w C-.-3 ?ňe “e; His
2 5 5 2?0 2 9 5 400
«. wf - GGC CAG Nj*- U ?GC <jAo ACG zzz GCC u«jG GGC TGC GGG
Λ- -5 A ?he G - “ Ala Cys Leu G L u «U w Cvs Ala Ar? Cvs G v 3 3 w-
«n C .« · Λ -» U‘J A ’ ± w w
f r*» U *J ·“· zzz zzz zzz CGA GAC <jaG GAC zzz zzz
Ar z ? Γ3 ? rc A r r A. a Ar r ? rc Arg ? zz Leu Asp G * u A S c ?ro a--
422 -» 2 2 430
ACG CCľ TCG 177 TCA CTG 7CG AGA zzz AGC TAC ACC ACC ATC AGC
“·- — ? rc Ser ľ L e Alä Ser leu Ser Arg Leu Ser 7y g G ľ; r Cľir Íle Ser
t J 2 440 445
SGG 7GAGGGG7A GCGGGAGAG7 GGAGnjCTGA GACGn^GACA
5' si w . Λ w»w .
7r.r Leu Gly ?r: 4 SO — .λx—«-x-A. .G u.-ACAoGs^A kzws^rtCGGAC AGnC.tC • t tk.
(2) Informácia o sekvencii s identifikačným číslom: 2 (i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka:
(B) Typ:· (C) Vlákno:
(D) Topológia:
nukleová kyselina dvojité lineárna (xi) Popis sekvencie s identifikačným číslom: 2
- 36 GGG CG GC CGG CCT GAG AC GGC GCG G77 GGC GAA GAC AGC GAT GGC 2 0 Gív Arg Cys Arg ?ro GLu br Gív Ala '-'a L. GLy GLu Asg 5 a r Aaa GLy
GGC GAC - G GAA CGG CCA Cvs Tvr Vai Gin Ce·- ?rc
Informácia o sekvencii s identifikačným číslom: 3 (i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 22
(B) Typ: (C) Vlákno: aminokyselinová
(D) Topológia: lineárna
(xi) Popis sekvencie v: SEKV ID Č: 3
5er Cys Arg ?-a. Glu- GLy GLy Leu 5 Alí G-Τ’ G.lu Aso G—y Asc G L v »· 5
vr Val Gin Leu ?rr 20
Informácia o sekvencii s identifikačným číslom:
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 1356
(B) Typ: nukleová kyselina
(C) Vlákno: dvojité
(D) Topológia: lineárna
(xi) Popis sekvencie pod
SEKV ID Č: 4
GAG CTG CTA AAG CTG AAC CGG AGC GTG CAG GGA ACC GGA CCC GGG
Giu Leu Leu Lvs Leu Asn Are Ser Val· Gin Glv Thr Giy Pro Glv
5' ' 10 ' 15'
CCG GGG GCT TCC CTG TGC CGC CCG GGc GCG CCT CTC CTC AAC AGC AGC 9 ó
15 ?rc Gly A la Ser Leu CVS Arg Pro Gly Ala Pro Leu Leu Asn Ser Ser
20 2 5 30
AGT GTG GGC AAC CTC AGC TGC GAG CCC CCT CGC ATT CGC GGA GCC GGG 144
Ser Val Gly Asn Leu Ser Cys G r u ?rc Pro Arg Íle Arg Gly Ara Giy
3 3 ’ 40 45
2 0 ACA CGA GAA TTG GAG CTG GCC Λ i i .“.y. ATC ACT CTT TAC GCA GTG ATG 192
T h r Arg Giu Leu Giu Leu Aia Σ L e Are Íle Thr Leu Tvr Ala Val I ie
50 3 3 50
TTC CTG ATG AGC GTT GGA GGA AAT « Λ · 'J CTC ATC ATC r· *r>f^ M .M GTC CTG GGA 240
?he Leu Met Ser Val Glv Giy Asr. H e r Leu Íle íle Val Val Leu Glv
25' 6 5 70* 73 30
CTG AGC CGC CGC CTG AGG ACT GTC ACC AAT GCC TTC CTC CTC CCA CTG 2 35
Lee Ser Arg Arg Leu Arg T hr v a r ~*hr A s n Aia ?he Leu Leu Ser Leu
a 3 90 95
GCA GTC AGC G AC CTC CTG CTG GCT GTG GCT TGC ATG CCC ‘P**’/·· ACC CTG 235
30 Ala Val Ser Asa Leu Leu Leu Ala Val ,-._a Cys Met Pro ?h.e Thr Leu
100 .05 110
CTG CCC AAT CTC ATG GGC ACA TTC ATC TTT Gs/i. ACC GTC ATC TGC AAG 354
Lee ?ro Asn Leu Met Giy “hr ?'ne Íle ?he Gly Thr Val T 2 λ Cys Ly s
113 120 125
3 5 GCG GTT TCC TAC CTC ATG GGG u i G TCT GTG AGT GTG TCC ACG CTA AGC 432
A i. a. Val Ser Ty »· Leu Met Glv Val Ser Val Ser Val Ser Thr Leu Ser
130 133 140
40 GTG Leu 145 GTG Val GCG Ala ATC Íle GCA Aia CTG Leu 150 kjAG Gl'j t** r· ~ Are TAC AGC Ser GCC Ala ATC íle TGC Cys CGA Arg CCA Pro CTG Leu 160 430
CAG GCA CGA GTG TGG CAG ACG CGC TCC CAC GCG GCT CGC GTG ATT GTA 5 23
o - n Aia Arg Val Tra G!r. Thr Arg Ser Mis A 4. a Ala Arg Val 1 le Val
135 170 175
GGC ACG TGG CTG CTG TCC GGA CTA CTC ATG GTG CCC TAC CCC GTG TAC 5 ” 6
4 5 Aia Thr Tra Leu Leu Ser Gly Leu Leu Met Val Pro Tvr Pro Val Ty r
130 135 190
ACT GTC Val GTG val ' 195 CAA Gin CCA Pro GTG Val GGG Gly CCT Pro 200 CGT Arg GT^j Val CTG Leu CAG Gin TGC Cvs 205 GTG Val CAT Kis CGC Arg 524
TGG CCC AGT GCG CGG GTC CGC CAG ACC TGG TCC GTA CTG CTG CTT CTG 572
5 Trp ?ro Ser Ala Arg Val Arg Gin Thr Trp Ser Val Leu Leu Leu Leu
210 215 220
CTC TTG TTC - CC ATC CCG GGT GTG GTT ATG GCC GTG GCC TAC GGG CTT 720
Leu Leu Phe ? h© 1 le Pre Gly Val Val Ker A L a val Ala Tyr Gly Leu
2 2 5 230 235 240
10 A7C TCT CGC GAG CTC TAC TTA GGG CTT CGC GAC GGC GAC AGT GAC 7 53
2 le Ser Arg Glu Leu Tyr Leu Gly Leu Arg Phe Asp Gly Asp Ser Asp
243 250 255
AGC GAC AGC CAA AGC AGG GTC CGA AAC CAA GGC GGG CTG CCA GGG GCT 315
Ser Asp Ser Gin Ser Arg Val Arg Asn Gin Giv Gly Leu Pro Gly Ala
15 250 255 270
GTT CAC CAG AAC GGG CGT TGC CGG CCT GAG ACT GGC GCG GTT GGC GAA 364
val Hl S G L r. A. s n Gly Arg Cys Arg Pro Glu Thr Gly Ala Val Gly Glu
275 2S0 235
GAC AGC GAT GGC TGC TAC GTG CAA CTT CCA CGT TCC CGG CCT GCC CTG 512
20 Asp Ser Asp Gly Cys T vr Val G i r. Leu Pro Arg Ser Arg Pro Aia Leu
290 295 300
GAG CTG ACG CG CTG ACG GCT CCT GGG CCG GGA TCC GGC TCC CGG CCC 950
Glu Leu Thr Ala Leu Thr Ala Pro Gly Pro Gly Ser Gly Ser Arg Pro
205 210 315 320
25 ACC CAG GCC AAG CTG CTG GCT AAG AAG CGC G. G GTG CGA ATG ‘•''n/·' i i O CTG 1003
Gln Aia 1 y s Leu Leu A i a Lys Lys Val Val Arg Ker Leu Leu
2 z 5 2 30 335
30 GTG V a r ATC i. e G . i Val· GTG Val 340 CTT Leu Phe Phe CTG Leu —«<·«·» . J . Cys T Λ C TGG Trp TTG Leu CCA Pro Val TAT vi 350 AGT Ser GCC Aia 1056
AAC ACG TGG CGC GCC TTT G AT GGC CCG GGT GCA CAC CGA GCA CTC TCG 1104
Asn Thr Trp Arg Aia Phe Asp Glv Pro Gly Ala Kis Arg Ala Leu Ser
355 360 365
GGT GCT CCT ATC TCC TTC ATT CAC TTG CTG AGC TAC GCC TCG GCC TGT 1152
3 5 Gly Ala Pro íle Ser Phe íle His Leu Leu Ser Tvr Ala Ser Aia Cys
370 375 33C
GTC AAC CCC CTG GTC TAC TGC ATG CAC CGT CGC TrpT CGC CAG GCC 1200
Val Asn Pro Leu val Cys Phe Ker Kis Arg Arg Phe Arg Gin Aia
335 390 395 400
40 TGC CTG GAA ACT TGC GCT CGC TGC TGC CCC CGG CCT CCA CGA GCT CGC 1248
Cys Leu Glu Thr Cys Aia Arg Cys Cys ?ro Arg Pro Pro Arg Ala Arg
405 410 415
CCC AGG GCT CTT CCC G AT GAG GAC CCT CCC ACT CCC TCC ATT GCT TCG 1296
Pro Arg Ala Leu Pro Asp Glu Asp Pro Pro Thr ?ro Ser íle Ala Ser
45 420 £ —i — 430
- 39 C7G
Leu
TCC AGG CTT AGC TAC ACG ACC A7C AGC ACA C7G GGC CCT GGC TGA Ser Arg Leu Ser Tvr Thr Thr íle Ser Thr Leu Gly ?ro Gly
435 ’ 440 445
134^
GAG GGG
- 40 £3 — 73

Claims (38)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    1. Prečistená nukleová kyselina kódujúca člena rodiny cicavčích receptorov, gastrínu/cholecystokinínu B (CCK-B) ^lebo jeho fragment či analóg.
  2. 2. Nukleová kyselina podlá nároku 1, vyznačujúca sa tým, že zmienený člen je receptor gastrínu
  3. 3. Nukleová kyselina podlá nároku 1, vyznačujúca sa tým, že zmienený člen je receptor CCK-B
  4. 4. Prečistená nukleová kyselina podlá nároku 1, vyznačujúca sa tým, že zmienený člen leží na povrchu parietálnych buniek, buniek, modzgových buniek lebo buniek hladkého svalstva.
  5. 5. Prečistená nukleová kyselina podlá nároku 4, vyznačujúca sa tým, že zmienené bunky sú psie bunky.
  6. 6. Prečistená nukleová kyselina podlá nároku 4, vyznačujúca sa tým, že zmienené bunky sú ludské bunky.
  7. 7. Homogénna populácia buniek, vyznačujúca sa tým, že každá zo zmienených buniek obsahuje klónovanú nukleovú kyselinu kódujúcu člena rodiny cicavčích receptorov gastrínu/CCK-8.
  8. 8. Homogénna populácia buniek podlá nároku 7, vyznačujúca sa tým, že zmienené bunky exprimujú biologicky aktívny peptid z rodiny receptorov gastrínu/CCK-8.
  9. 9. Homogénna populácia buniek podlá nároku 7, vyznačujúca sa tým, že zmienené bunky sú eukaryotické bunky.
  10. 10. Homogénna populácia, buniek podlá nároku 7, vyznačujúca sa tým, že zmienené bunky sú bunky COS-7.
    41
  11. 11. V podstate čistý polypeptidový receptor gastrínu pripravený pomocou nukleovej kyseliny podlá nároku 1.
  12. 12. Polypeptid podlá nároku 11, vyznačujúci sa tým, že zmienený polypeptidový receptor gastrínu má sled aminokyselín v podstate zhodný so sledom aminokyselín 1 až 453 sekvencie uvedenej v SEKV ID Č: 1:
    1 60 .u.ELI,XLílRSA<2GSGAG?GASLCSAGGALLMSSGAGNI,SCS?PRLRGAG7RELELAIRVTL
    10 61 120
    YAV1FLMSVGGNVL1 ZWLGLSRRLRTV7NA?LLSLAVSDLLLAVÄCJíPFTLL?NLilGT?
    121 130 lEGTWCXAVSYL.'tGVSVSVSTLSLVAIALERYSAICRPZ.QARVWQTRSEÄARVIIÄTWM
    131 240
    15 Z.SGZ.LMV?Y?VY7AVQPAGGARALQC/KRMPSAR’/R0TWSVLLLtLL??VPGWMAVAYG
    241 300
    EZSRELYiGLSECE050SESRVRSQGGZ.RGGAG?G?APPNGSCRPEGGLAGEDGOGCYVQ
    301 360
    LPRSRQTLELSALTAPTPGPGGGPRPYQAXLĽAXXRVVRMI.I.VIVVLEEI.CWI.PI.Y'SANT
    20361 420 «RA?0SSGAHSAtSGA?:S?IHLtSYASAe/N?Í.VYC?MKRR?aQACi2tCÄRCC?RPPR
    421 453
    ARPR?LPDEDPPT?SIÄSLSar.SYTriSTXG?G
  13. 13. Polypeptid podlá nároku 11, vyznačujúci sa tým, že zdanlivá molekulová hmotnosť zmieneného polypeptidu (ak je glykozylovaný) je asi 76 000 daltonov.
  14. 14. Polypeptid podlá nároku 11, vyznačujúci sa tým, že polypeptid nie je glykozylovaný.
  15. 15. Polypeptid podlá nároku 11, vyznačujúci sa tým, že polypeptid je glykozylovaný.
  16. 16. Polypeptid podlá nároku 11, vyznačujúci sa tým, že zmienený polypeptid je exprimovaný ludskými bunkami.
  17. 17. Polypeptid podlá nároku 11, vyznačujúci sa tým, že zmienený polypeptid je exprimovaný ludskými parietálnymi bunkami, modzgovými bunkami lebo bunkami hladkého svalstva.
  18. 18. V podstate čistý polypeptidový receptor CCK-B pripravený pomocou nukleovej kyseliny podlá nároku 1.
  19. 19. Polypeptid podlá nároku 18, vyznačujúci sa tým, že zmienený polypeptidový receptor CCK-B má sled aminokyselín v podstate zhodný so sledom aminokyselín 1 až ^447 sekvencie uvedenej v SEKV ID Č: 4:
    10 1 ÓO
    MEl.LXl.írRSVQGTG?G?GA51.CRPGAPLLMSSSVGNLSCEPPRIRGAGTaSLSLAIilTL
    5 L 120
    ÍAVIFLHSVGGNMĽirľVÚGLSRRLRCV’ľNAŤLLSLÄVSaLLĹ.AVÄCMPľ'rLLPírLHGTľ
    L21 130
    L 5 I PGTVICXAVS'ÍLXGVSVSSTtStVÄZAL£?.YSArcPP£.QAAVWQTRSKAAaVIVATWL
    131 240
    LSGLilMV? r P’mWQPVG? RVLQCVKPW? S AtlVPQTWSVLLLLl.I.FF IPGWMA.VSYGL
    241 300
    ISPEI.rLGE.PFDGOSOSOSQSPVRNQGGI.?GAVKQNGSCBPETGÄVGEDSDGC£VQLPSS
  20. 20 301 3S0
    PPALELTAl.TAPGPGSGSRPTQAKI.jlAXXKVVPHLLVlWLFFl.CWLPVYSAírrWRAFDG
    361 420
    PGAHRALSGAPISF IHLlSYASACVN?l.'ríCFMHPRFRQACl.FTCAPCC?RPPHARP5AL
    421 447
    2 5 POEDPPTPSIASCSRLSY’ľTISTl.GPG
    20. Polypeptid podlá nároku 18, vyznačujúci sa tým, že zmienený polypeptid je glykozylovaný.
  21. 21. Polypeptid podlá nároku 18, vyznačujúci sa tým, že zmienený polypeptid nie je glykozylovaný.
  22. 22. Polypeptid podlá nároku 18, vyznačujúci sa tým, že zmienený polypeptid je exprimovaný ludskými bunkami.
  23. 23. Polypeptid podlá nároku 18, vyznačujúci sa tým, že zmienený polypeptid je exprimovaný ludskými parietálnymi bunkami, modzgovými bunkami lebo bunkami hladkého svalstva.
  24. 24. Knižnica cDNA expresie parietálnych buniek.
  25. 25. Knižnica podlá nároku 24, vyznačujúca sa tým, že segmenty cDNA zmienenej knižnice sú odvodené z psích parietálnych buniek.
  26. 26. Knižnica podlá nároku 24, vyznačujúca sa tým, že segmenty cDNA zmienenej knižnice sú odvodené z buniek obsahujúcich ludské parietálne bunky lebo ludské hlavné bunky.
  27. 27. Knižnica podlá nároku 24, vyznačujúca sa tým, že vektor expresie používaný vo zmienej knižnici cDNA má začiatok replikácie SV40.
  28. 28. Knižnica podlá nároku 24, vyznačujúca sa tým, že vektor expresie používaný vo zmienej knižnici cDNA má cytomegalovírusový (CMV) promótor.
  29. 29. Knižnica podlá nároku 24, vyznačujúca sa tým, že zmienená knižnica sa konštruuje s vektorom expresie, ktorý zahrnuje pcDNA-l, lambda gtlO lebo lambda gtll.
  30. 30. Metóda na izoláciu nukleových kyselín kódujúcich polypeptidy, ktoré sú v parientálnych bunkách vrátane hodnotenia knižnice expresie cDNA podlá nároku 24.
  31. 31. Metóda podía nároku 30, vyznačujúca se tým, že zmienené nukleové kyseliny kódujú receptor prostaglandínu E2 (PGE2).
  32. 32. Metóda na identifikáciu antagonistu člena rodiny cicavčích receptorov gastrímu/CCK-B, vyznačujúca sa tým, že zahrnuje dodanie agonistu člena rodiny receptorov gastrínu/CCK-B do kultivovaných buniek, transfektovaných prečistenou nukleovou kyselinou podía nároku 1, v prítomnosti kandidáta na antagonistu a stanovenie schopnosti zmieneného kandidáta na antagonistu búd a) brániť väzbe zmieneného antagonistu na zmieneného člena lebo b) blokovať vzrast voíného cytozólového vápnika indikovaný agonistom lebo c) blokovať aktiváciu fosfolipázy C indukovanú agonistom lebo
    d) blokovať aktiváciu adenylát cyklázy indukovanú agonistom, čo je indikáciou antagonistickej aktivity.
  33. 33. Metóda podía nároku 32, vyznačujúca se tým, že zmienený agonista je gastrín.
  34. 34. Metóda podía nároku 32, vyznačujúca se tým, že zmienený agonista je cholecystokinin (CCK).
  35. 35. Metóda podľa nároku 32, vyznačujúca se tým, že zmienený agonista obsahuje CCK-8s, CCK-8d, CCK-4 lebo pentagastrín (CCK-5).
  36. 36. Bakteriálna bunka transfekovaná prečistenou nukleovou kyselinou podía nároku 2, uložená v ATCC a označená č. 75195.
  37. 37. Bakteriálna bunka transfekovaná prečistenou nukleovou kyselinou podía nároku 3, uložená v ATCC a označená č. 75196.
  38. 38. Bakteriálna bunka transfekovaná prečistenou kyselinou podlá nároku 3, uložená v ATCC a č. 75303.
    nukleovou označená
    Antagonista člena rodiny cicavčích receptorov gastrínu/CCK-B identifikovaný metódou podlá nároku 32.
SK53-93A 1992-02-07 1993-02-02 Cdnas encoding the gastrin and cck-b receptors SK5393A3 (en)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US83284192A 1992-02-07 1992-02-07
US94137392A 1992-09-03 1992-09-03
US07/978,892 US5541071A (en) 1992-02-07 1992-11-12 Assay for identifying antagonists of gastrin and CCK-B receptors
CA002088878A CA2088878A1 (en) 1992-02-07 1993-02-05 Cdnas encoding the gastrin and cck-b receptors

Publications (1)

Publication Number Publication Date
SK5393A3 true SK5393A3 (en) 1994-01-12

Family

ID=27427008

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SK53-93A SK5393A3 (en) 1992-02-07 1993-02-02 Cdnas encoding the gastrin and cck-b receptors

Country Status (8)

Country Link
EP (1) EP0561496A2 (sk)
JP (1) JPH06339380A (sk)
AU (1) AU665601B2 (sk)
CA (1) CA2088878A1 (sk)
CZ (1) CZ11393A3 (sk)
HU (1) HUT69777A (sk)
NZ (1) NZ245771A (sk)
SK (1) SK5393A3 (sk)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU3459497A (en) * 1996-07-12 1998-02-09 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Cancer cell proliferation inhibitors

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ATE104348T1 (de) * 1990-07-10 1994-04-15 Boehringer Ingelheim Int O-glycosyliertes ifn-alpha.
AU1707892A (en) * 1991-05-22 1993-03-11 Ludwig Institute For Cancer Research Gastrin-binding protein
WO1992020814A1 (en) * 1991-05-22 1992-11-26 Ludwig Institute For Cancer Research Gastrin-binding protein
US5424413A (en) * 1992-01-22 1995-06-13 Gen-Probe Incorporated Branched nucleic acid probes

Also Published As

Publication number Publication date
AU3212393A (en) 1993-08-12
CA2088878A1 (en) 1994-08-06
EP0561496A2 (en) 1993-09-22
EP0561496A3 (sk) 1994-01-05
CZ11393A3 (en) 1994-01-19
HU9300302D0 (en) 1993-04-28
HUT69777A (en) 1995-09-28
NZ245771A (en) 1994-08-26
AU665601B2 (en) 1996-01-11
JPH06339380A (ja) 1994-12-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Feng et al. Functional characterization of a neuropeptide F‐like receptor from Drosophila melanogaster
Michel et al. XVI. International Union of Pharmacology recommendations for the nomenclature of neuropeptide Y, peptide YY, and pancreatic polypeptide receptors
EP0765391B1 (en) Cloning and expression of an acetylcholine-gated ion channel receptor subunit
JP2002514055A (ja) ガラニンgalr3受容体をコードするdnaおよびその使用
EP0579758A1 (en) Parathyroid hormone receptor and dna encoding same
US5892004A (en) Method for preparing PACAP receptor protein
CA2239293A1 (en) Assay for and uses of peptide hormone receptor ligands
US7132248B2 (en) Uses of galanin GALR2 receptors
EP0769024B1 (en) High-affinity melatonin receptors and uses thereof
Goldin Voltage-Gated Sodium
DE69535590T2 (de) Für den bradykinin-b1-rezeptor kodierende dna
US5541071A (en) Assay for identifying antagonists of gastrin and CCK-B receptors
CA2047683C (en) Neuronal nicotinic acetylcholine receptor compositions containing the beta 4 subunit
EP1032423A1 (en) Dna encoding mammalian neuropeptide ff (npff) receptors and uses thereof
AU782848B2 (en) DNA encoding SNORF62 and SNORF72 receptors
Saito et al. Isolation of mouse vomeronasal receptor genes and their co-localization with specific G-protein messenger RNAs
Schmitz et al. Identification of cholecystokinin-B/gastrin receptor domains that confer high gastrin affinity: utilization of a novel Xenopus laevis cholecystokinin receptor.
SK5393A3 (en) Cdnas encoding the gastrin and cck-b receptors
US20020086359A1 (en) Novel guanosine triphosphate (GTP) binding protein-coupled receptor proteins
Civelli et al. The next frontier in the molecular biology of the opioid system: The opioid receptors
US7252945B2 (en) DNA encoding mammalian neuropeptide FF (NPFF) receptors and uses thereof
Darlison Molecular characterization of GABA-gated chloride ion channels from complex and simple nervous systems
Hershey The rat substance P receptor: cDNA and genomic cloning, functional expression, mRNA distribution, and mutational analysis of desensitization responses
Civelli et al. The Next Frontier in the Molecular Biology of the Opioid System: The Opioid Receptor
Hackam Molecular characterization of GABA rho receptors