SA515360489B1 - Targeting bcl11a distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction - Google Patents
Targeting bcl11a distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction Download PDFInfo
- Publication number
- SA515360489B1 SA515360489B1 SA515360489A SA515360489A SA515360489B1 SA 515360489 B1 SA515360489 B1 SA 515360489B1 SA 515360489 A SA515360489 A SA 515360489A SA 515360489 A SA515360489 A SA 515360489A SA 515360489 B1 SA515360489 B1 SA 515360489B1
- Authority
- SA
- Saudi Arabia
- Prior art keywords
- cell
- cells
- dna
- expression
- chromosome
- Prior art date
Links
- 108010044495 Fetal Hemoglobin Proteins 0.000 title claims abstract description 122
- 230000008685 targeting Effects 0.000 title claims description 26
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 title description 34
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 253
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 224
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 79
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims abstract description 74
- 102100022976 B-cell lymphoma/leukemia 11A Human genes 0.000 claims abstract description 23
- 101000903703 Homo sapiens B-cell lymphoma/leukemia 11A Proteins 0.000 claims abstract description 23
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 540
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 198
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 198
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims description 156
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 125
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 claims description 114
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 claims description 114
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims description 110
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 claims description 107
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 claims description 105
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 103
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 claims description 76
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 claims description 74
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 claims description 74
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 69
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 63
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 58
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 58
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 claims description 52
- 238000009472 formulation Methods 0.000 claims description 45
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 44
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 claims description 43
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims description 41
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 claims description 41
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 claims description 40
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 40
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 40
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 40
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 claims description 39
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 38
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 32
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 32
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 claims description 31
- 238000013461 design Methods 0.000 claims description 31
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 claims description 31
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 28
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 claims description 24
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 claims description 24
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 24
- 230000000925 erythroid effect Effects 0.000 claims description 23
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 23
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 20
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 19
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 19
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 18
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 15
- 230000011132 hemopoiesis Effects 0.000 claims description 13
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 13
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 12
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 10
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 claims description 10
- 210000004263 induced pluripotent stem cell Anatomy 0.000 claims description 10
- 108010008532 Deoxyribonuclease I Proteins 0.000 claims description 9
- 102000007260 Deoxyribonuclease I Human genes 0.000 claims description 9
- 210000002593 Y chromosome Anatomy 0.000 claims description 8
- 238000010459 TALEN Methods 0.000 claims description 6
- 108010043645 Transcription Activator-Like Effector Nucleases Proteins 0.000 claims description 6
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 claims description 5
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 claims description 5
- 102100031181 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 claims description 4
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 4
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 claims description 4
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 claims description 3
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 claims description 2
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 claims description 2
- 238000003756 stirring Methods 0.000 claims description 2
- ABYZSYDGJGVCHS-ZETCQYMHSA-N (2s)-2-acetamido-n-(4-nitrophenyl)propanamide Chemical compound CC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 ABYZSYDGJGVCHS-ZETCQYMHSA-N 0.000 claims 2
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N Acetaminophen Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- WKMPTBDYDNUJLF-UHFFFAOYSA-N 2-fluoroadenine Chemical compound NC1=NC(F)=NC2=C1N=CN2 WKMPTBDYDNUJLF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 241000252073 Anguilliformes Species 0.000 claims 1
- 101800000407 Brain natriuretic peptide 32 Proteins 0.000 claims 1
- 101800002247 Brain natriuretic peptide 45 Proteins 0.000 claims 1
- 235000018453 Curcuma amada Nutrition 0.000 claims 1
- 241001512940 Curcuma amada Species 0.000 claims 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims 1
- 244000287680 Garcinia dulcis Species 0.000 claims 1
- 241000989913 Gunnera petaloidea Species 0.000 claims 1
- 101000684181 Homo sapiens Selenoprotein P Proteins 0.000 claims 1
- 102100034184 Macrophage scavenger receptor types I and II Human genes 0.000 claims 1
- 101710134306 Macrophage scavenger receptor types I and II Proteins 0.000 claims 1
- 240000000233 Melia azedarach Species 0.000 claims 1
- 101100380295 Mus musculus Asah1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100011750 Mus musculus Hsp90b1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100127662 Mus musculus Lama1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 241000353355 Oreosoma atlanticum Species 0.000 claims 1
- 101100230499 Oryza sativa subsp. japonica HAK2 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100150299 Penicillium chrysogenum SREP gene Proteins 0.000 claims 1
- 241001674048 Phthiraptera Species 0.000 claims 1
- 239000004236 Ponceau SX Substances 0.000 claims 1
- 244000088401 Pyrus pyrifolia Species 0.000 claims 1
- 235000001630 Pyrus pyrifolia var culta Nutrition 0.000 claims 1
- 101150059681 RNR1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101150033538 Rala gene Proteins 0.000 claims 1
- 235000014548 Rubus moluccanus Nutrition 0.000 claims 1
- 240000005499 Sasa Species 0.000 claims 1
- 102100023843 Selenoprotein P Human genes 0.000 claims 1
- 235000013405 beer Nutrition 0.000 claims 1
- OSOCQWFTTAPWEK-BYPYZUCNSA-N beta-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CCN OSOCQWFTTAPWEK-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims 1
- 239000003245 coal Substances 0.000 claims 1
- MCWXGJITAZMZEV-UHFFFAOYSA-N dimethoate Chemical compound CNC(=O)CSP(=S)(OC)OC MCWXGJITAZMZEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- LNEPOXFFQSENCJ-UHFFFAOYSA-N haloperidol Chemical compound C1CC(O)(C=2C=CC(Cl)=CC=2)CCN1CCCC(=O)C1=CC=C(F)C=C1 LNEPOXFFQSENCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 claims 1
- 230000001926 lymphatic effect Effects 0.000 claims 1
- HYIMSNHJOBLJNT-UHFFFAOYSA-N nifedipine Chemical compound COC(=O)C1=C(C)NC(C)=C(C(=O)OC)C1C1=CC=CC=C1[N+]([O-])=O HYIMSNHJOBLJNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000032696 parturition Effects 0.000 claims 1
- 229940119265 sepp Drugs 0.000 claims 1
- 239000002689 soil Substances 0.000 claims 1
- 101150117196 tra-1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 208000034737 hemoglobinopathy Diseases 0.000 abstract description 71
- 238000011282 treatment Methods 0.000 abstract description 52
- 208000018337 inherited hemoglobinopathy Diseases 0.000 abstract description 21
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 70
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 66
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 55
- 230000004049 epigenetic modification Effects 0.000 description 55
- 108060003196 globin Proteins 0.000 description 55
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 54
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 43
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 43
- 102000018146 globin Human genes 0.000 description 43
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 38
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 38
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 37
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 33
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 30
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 description 30
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 27
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 26
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 description 25
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 description 25
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 25
- 230000008672 reprogramming Effects 0.000 description 25
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 24
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 description 24
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 23
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 23
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 22
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 22
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 22
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 22
- -1 alpha proteins ol Proteins 0.000 description 19
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 18
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 18
- 230000006870 function Effects 0.000 description 18
- 208000007056 sickle cell anemia Diseases 0.000 description 17
- 208000007502 anemia Diseases 0.000 description 16
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 16
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 16
- 101150066555 lacZ gene Proteins 0.000 description 16
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 16
- 238000011161 development Methods 0.000 description 15
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 15
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 15
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 14
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 14
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 14
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 14
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 13
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Substances CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 235000002639 sodium chloride Nutrition 0.000 description 13
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 12
- 238000010362 genome editing Methods 0.000 description 12
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 12
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 12
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 12
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 12
- 230000008569 process Effects 0.000 description 12
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 12
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 12
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 11
- 230000000913 erythropoietic effect Effects 0.000 description 11
- 210000003924 normoblast Anatomy 0.000 description 11
- 239000000047 product Substances 0.000 description 11
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 11
- 241000894007 species Species 0.000 description 11
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 11
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 10
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 10
- 230000001973 epigenetic effect Effects 0.000 description 10
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 10
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 10
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 9
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 9
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 9
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 9
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 9
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 9
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 9
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 9
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 9
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 9
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Natural products CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 8
- 238000002487 chromatin immunoprecipitation Methods 0.000 description 8
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 8
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 8
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 8
- 230000009610 hypersensitivity Effects 0.000 description 8
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 8
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 8
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 7
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108010017070 Zinc Finger Nucleases Proteins 0.000 description 7
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 7
- 230000001364 causal effect Effects 0.000 description 7
- 230000008859 change Effects 0.000 description 7
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 7
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 7
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 7
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 7
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 7
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 7
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 7
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 7
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 7
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 7
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 7
- 210000001325 yolk sac Anatomy 0.000 description 7
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 7
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 7
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 6
- 239000000592 Artificial Cell Substances 0.000 description 6
- 102100021519 Hemoglobin subunit beta Human genes 0.000 description 6
- 108091005904 Hemoglobin subunit beta Proteins 0.000 description 6
- 208000002903 Thalassemia Diseases 0.000 description 6
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 6
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 6
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 6
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 6
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 6
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 6
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 6
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 6
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 6
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 6
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 6
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 6
- 238000003762 quantitative reverse transcription PCR Methods 0.000 description 6
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 6
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 6
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 6
- OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl beta-D-galactoside Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CNC2=CC=C(Br)C(Cl)=C12 OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 0.000 description 5
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 5
- 108010044091 Globulins Proteins 0.000 description 5
- 102000006395 Globulins Human genes 0.000 description 5
- 102100031573 Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Human genes 0.000 description 5
- 102000006947 Histones Human genes 0.000 description 5
- 101000777663 Homo sapiens Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Proteins 0.000 description 5
- 101001012669 Homo sapiens Melanoma inhibitory activity protein 2 Proteins 0.000 description 5
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102100029778 Melanoma inhibitory activity protein 2 Human genes 0.000 description 5
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 101100247004 Rattus norvegicus Qsox1 gene Proteins 0.000 description 5
- 229960002756 azacitidine Drugs 0.000 description 5
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 5
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 5
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 5
- 230000011559 double-strand break repair via nonhomologous end joining Effects 0.000 description 5
- 230000010437 erythropoiesis Effects 0.000 description 5
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 5
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 5
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 5
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 5
- 210000004681 ovum Anatomy 0.000 description 5
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 5
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M Butyrate Chemical compound CCCC([O-])=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 241000070928 Calligonum comosum Species 0.000 description 4
- 208000031637 Erythroblastic Acute Leukemia Diseases 0.000 description 4
- 208000036566 Erythroleukaemia Diseases 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 4
- 206010018910 Haemolysis Diseases 0.000 description 4
- 108091005886 Hemoglobin subunit gamma Proteins 0.000 description 4
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 4
- 108010073062 Transcription Activator-Like Effectors Proteins 0.000 description 4
- 208000021841 acute erythroid leukemia Diseases 0.000 description 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 4
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 4
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 4
- NIJJYAXOARWZEE-UHFFFAOYSA-N di-n-propyl-acetic acid Natural products CCCC(C(O)=O)CCC NIJJYAXOARWZEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 210000000267 erythroid cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 4
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000008588 hemolysis Effects 0.000 description 4
- 235000014304 histidine Nutrition 0.000 description 4
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 4
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 150000002484 inorganic compounds Chemical class 0.000 description 4
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 4
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 4
- 230000009456 molecular mechanism Effects 0.000 description 4
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 4
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 4
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 4
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 4
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 4
- 102210007272 rs1427407 Human genes 0.000 description 4
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 4
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 4
- 230000003393 splenic effect Effects 0.000 description 4
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 4
- GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N trimethylamine Chemical compound CN(C)C GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- MSRILKIQRXUYCT-UHFFFAOYSA-M valproate semisodium Chemical compound [Na+].CCCC(C(O)=O)CCC.CCCC(C([O-])=O)CCC MSRILKIQRXUYCT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 229960000604 valproic acid Drugs 0.000 description 4
- NEAQRZUHTPSBBM-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-3,3-dimethyl-7-nitro-4h-isoquinolin-1-one Chemical compound C1=C([N+]([O-])=O)C=C2C(=O)N(O)C(C)(C)CC2=C1 NEAQRZUHTPSBBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- NMUSYJAQQFHJEW-KVTDHHQDSA-N 5-azacytidine Chemical compound O=C1N=C(N)N=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 NMUSYJAQQFHJEW-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 3
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 3
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 description 3
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 description 3
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 3
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 3
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100024165 G1/S-specific cyclin-D1 Human genes 0.000 description 3
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 3
- 102000003964 Histone deacetylase Human genes 0.000 description 3
- 108090000353 Histone deacetylase Proteins 0.000 description 3
- 101000980898 Homo sapiens Cell division cycle-associated protein 4 Proteins 0.000 description 3
- 101000980756 Homo sapiens G1/S-specific cyclin-D1 Proteins 0.000 description 3
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 3
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 3
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 3
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 3
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical class [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 3
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 3
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 3
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 3
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 3
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 3
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 3
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 3
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 3
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 3
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 3
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 3
- GYKLFBYWXZYSOW-UHFFFAOYSA-N butanoyloxymethyl 2,2-dimethylpropanoate Chemical compound CCCC(=O)OCOC(=O)C(C)(C)C GYKLFBYWXZYSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 3
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 3
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 3
- 230000003750 conditioning effect Effects 0.000 description 3
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 3
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 3
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 3
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 3
- 230000005782 double-strand break Effects 0.000 description 3
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 3
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 3
- 210000001654 germ layer Anatomy 0.000 description 3
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 3
- 208000020451 hereditary persistence of fetal hemoglobin Diseases 0.000 description 3
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000013632 homeostatic process Effects 0.000 description 3
- 102000044493 human CDCA4 Human genes 0.000 description 3
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 3
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 3
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 3
- 230000003426 interchromosomal effect Effects 0.000 description 3
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 3
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 3
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 3
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 3
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 3
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 3
- 210000001778 pluripotent stem cell Anatomy 0.000 description 3
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 3
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 3
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 3
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 3
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 3
- OHRURASPPZQGQM-GCCNXGTGSA-N romidepsin Chemical compound O1C(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(=C/C)/NC(=O)[C@H]2CSSCC\C=C\[C@@H]1CC(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N2 OHRURASPPZQGQM-GCCNXGTGSA-N 0.000 description 3
- 102210059946 rs7606173 Human genes 0.000 description 3
- 238000007480 sanger sequencing Methods 0.000 description 3
- 150000004666 short chain fatty acids Chemical class 0.000 description 3
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 3
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 3
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 3
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 3
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 3
- RTKIYFITIVXBLE-QEQCGCAPSA-N trichostatin A Chemical compound ONC(=O)/C=C/C(/C)=C/[C@@H](C)C(=O)C1=CC=C(N(C)C)C=C1 RTKIYFITIVXBLE-QEQCGCAPSA-N 0.000 description 3
- QRPSQQUYPMFERG-LFYBBSHMSA-N (e)-5-[3-(benzenesulfonamido)phenyl]-n-hydroxypent-2-en-4-ynamide Chemical compound ONC(=O)\C=C\C#CC1=CC=CC(NS(=O)(=O)C=2C=CC=CC=2)=C1 QRPSQQUYPMFERG-LFYBBSHMSA-N 0.000 description 2
- XGIKILRODBEJIL-UHFFFAOYSA-N 1-(ethylamino)ethanol Chemical compound CCNC(C)O XGIKILRODBEJIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150101112 7 gene Proteins 0.000 description 2
- 108010044267 Abnormal Hemoglobins Proteins 0.000 description 2
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 2
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 2
- 206010002383 Angina Pectoris Diseases 0.000 description 2
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- 101100257372 Caenorhabditis elegans sox-3 gene Proteins 0.000 description 2
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000005623 Carcinogenesis Diseases 0.000 description 2
- 206010061764 Chromosomal deletion Diseases 0.000 description 2
- 206010011224 Cough Diseases 0.000 description 2
- UHDGCWIWMRVCDJ-CCXZUQQUSA-N Cytarabine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-CCXZUQQUSA-N 0.000 description 2
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 2
- 101100447432 Danio rerio gapdh-2 gene Proteins 0.000 description 2
- 206010011878 Deafness Diseases 0.000 description 2
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 2
- DLVJMFOLJOOWFS-UHFFFAOYSA-N Depudecin Natural products CC(O)C1OC1C=CC1C(C(O)C=C)O1 DLVJMFOLJOOWFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100234002 Drosophila melanogaster Shal gene Proteins 0.000 description 2
- 208000000059 Dyspnea Diseases 0.000 description 2
- 206010013975 Dyspnoeas Diseases 0.000 description 2
- 108091092584 GDNA Proteins 0.000 description 2
- 101150112014 Gapdh gene Proteins 0.000 description 2
- 102100038617 Hemoglobin subunit gamma-2 Human genes 0.000 description 2
- 206010019842 Hepatomegaly Diseases 0.000 description 2
- 101000984042 Homo sapiens Protein lin-28 homolog A Proteins 0.000 description 2
- VSNHCAURESNICA-UHFFFAOYSA-N Hydroxyurea Chemical compound NC(=O)NO VSNHCAURESNICA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710128836 Large T antigen Proteins 0.000 description 2
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 2
- 101000926167 Lumbricus terrestris Extracellular globin-2 Proteins 0.000 description 2
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 2
- 101100257376 Mus musculus Sox3 gene Proteins 0.000 description 2
- 101100369076 Mus musculus Tdgf1 gene Proteins 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 208000002193 Pain Diseases 0.000 description 2
- 240000002390 Pandanus odoratissimus Species 0.000 description 2
- 235000005311 Pandanus odoratissimus Nutrition 0.000 description 2
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 2
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- 102100025460 Protein lin-28 homolog A Human genes 0.000 description 2
- 108091030071 RNAI Proteins 0.000 description 2
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 description 2
- 244000166071 Shorea robusta Species 0.000 description 2
- 235000015076 Shorea robusta Nutrition 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 2
- 206010041660 Splenomegaly Diseases 0.000 description 2
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 2
- 208000006011 Stroke Diseases 0.000 description 2
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 2
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- RTKIYFITIVXBLE-UHFFFAOYSA-N Trichostatin A Natural products ONC(=O)C=CC(C)=CC(C)C(=O)C1=CC=C(N(C)C)C=C1 RTKIYFITIVXBLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 2
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 2
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 2
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 2
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 2
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 2
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 2
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 239000008365 aqueous carrier Substances 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- 210000004436 artificial bacterial chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 2
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 description 2
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 2
- 210000002798 bone marrow cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 2
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000036952 cancer formation Effects 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 2
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 2
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 2
- 239000002385 cottonseed oil Substances 0.000 description 2
- 235000012343 cottonseed oil Nutrition 0.000 description 2
- 238000005138 cryopreservation Methods 0.000 description 2
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 2
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- DLVJMFOLJOOWFS-INMLLLKOSA-N depudecin Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H]1\C=C\[C@H]1[C@H]([C@H](O)C=C)O1 DLVJMFOLJOOWFS-INMLLLKOSA-N 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 2
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 2
- 210000002308 embryonic cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 2
- 230000002124 endocrine Effects 0.000 description 2
- 210000004700 fetal blood Anatomy 0.000 description 2
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 2
- 230000004992 fission Effects 0.000 description 2
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 2
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 2
- 210000003780 hair follicle Anatomy 0.000 description 2
- 201000001505 hemoglobinuria Diseases 0.000 description 2
- 108010051779 histone H3 trimethyl Lys4 Proteins 0.000 description 2
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 2
- 229960001330 hydroxycarbamide Drugs 0.000 description 2
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 description 2
- 238000007373 indentation Methods 0.000 description 2
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 2
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 2
- 238000009434 installation Methods 0.000 description 2
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 2
- 238000001361 intraarterial administration Methods 0.000 description 2
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 2
- 210000004153 islets of langerhan Anatomy 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N isopropylamine Chemical compound CC(C)N JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 2
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 2
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 2
- 239000011325 microbead Substances 0.000 description 2
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 2
- 210000000663 muscle cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000000066 myeloid cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 2
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 2
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 2
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 2
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 2
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 2
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 2
- 210000002826 placenta Anatomy 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 2
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 2
- 201000011264 priapism Diseases 0.000 description 2
- MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N procaine Chemical compound CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1 MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960004919 procaine Drugs 0.000 description 2
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 2
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 2
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 2
- 210000001995 reticulocyte Anatomy 0.000 description 2
- 108010091666 romidepsin Proteins 0.000 description 2
- 229960003452 romidepsin Drugs 0.000 description 2
- 102210024377 rs766432 Human genes 0.000 description 2
- 235000021391 short chain fatty acids Nutrition 0.000 description 2
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 2
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 2
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 2
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 2
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 2
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 2
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 2
- 229960000237 vorinostat Drugs 0.000 description 2
- WAEXFXRVDQXREF-UHFFFAOYSA-N vorinostat Chemical compound ONC(=O)CCCCCCC(=O)NC1=CC=CC=C1 WAEXFXRVDQXREF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N (2R)-2-hydroxy-2-phenylacetic acid Chemical compound O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1.O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1 QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N 0.000 description 1
- WCAWZARVUUEHRX-FRKDHNBESA-N (2e,4e,6r)-7-[4-(dimethylamino)phenyl]-n-hydroxy-6-methyl-7-oxohepta-2,4-dienamide Chemical compound ONC(=O)/C=C/C=C/[C@@H](C)C(=O)C1=CC=C(N(C)C)C=C1 WCAWZARVUUEHRX-FRKDHNBESA-N 0.000 description 1
- LAQPKDLYOBZWBT-NYLDSJSYSA-N (2s,4s,5r,6r)-5-acetamido-2-{[(2s,3r,4s,5s,6r)-2-{[(2r,3r,4r,5r)-5-acetamido-1,2-dihydroxy-6-oxo-4-{[(2s,3s,4r,5s,6s)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy}hexan-3-yl]oxy}-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-4-hydroxy-6-[(1r,2r)-1,2,3-trihydrox Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]([C@@H](NC(C)=O)C=O)[C@@H]([C@H](O)CO)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@]2(O[C@H]([C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)C2)[C@H](O)[C@H](O)CO)C(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 LAQPKDLYOBZWBT-NYLDSJSYSA-N 0.000 description 1
- GNYCTMYOHGBSBI-SVZOTFJBSA-N (3s,6r,9s,12r)-6,9-dimethyl-3-[6-[(2s)-oxiran-2-yl]-6-oxohexyl]-1,4,7,10-tetrazabicyclo[10.3.0]pentadecane-2,5,8,11-tetrone Chemical compound C([C@H]1C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)N[C@H](C(N[C@H](C)C(=O)N1)=O)C)CCCCC(=O)[C@@H]1CO1 GNYCTMYOHGBSBI-SVZOTFJBSA-N 0.000 description 1
- UEJJHQNACJXSKW-UHFFFAOYSA-N 2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1H-isoindole-1,3(2H)-dione Chemical compound O=C1C2=CC=CC=C2C(=O)N1C1CCC(=O)NC1=O UEJJHQNACJXSKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GBPSCCPAXYTNMB-UHFFFAOYSA-N 4-(1,3-dioxo-2-benzo[de]isoquinolinyl)-N-hydroxybutanamide Chemical compound C1=CC(C(N(CCCC(=O)NO)C2=O)=O)=C3C2=CC=CC3=C1 GBPSCCPAXYTNMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YXHLJMWYDTXDHS-IRFLANFNSA-N 7-aminoactinomycin D Chemical compound C[C@H]1OC(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C(=O)[C@@H]2CCCN2C(=O)[C@@H](C(C)C)NC(=O)[C@H]1NC(=O)C1=C(N)C(=O)C(C)=C2OC(C(C)=C(N)C=C3C(=O)N[C@@H]4C(=O)N[C@@H](C(N5CCC[C@H]5C(=O)N(C)CC(=O)N(C)[C@@H](C(C)C)C(=O)O[C@@H]4C)=O)C(C)C)=C3N=C21 YXHLJMWYDTXDHS-IRFLANFNSA-N 0.000 description 1
- 108700012813 7-aminoactinomycin D Proteins 0.000 description 1
- 101150044182 8 gene Proteins 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 241001136792 Alle Species 0.000 description 1
- 241000272517 Anseriformes Species 0.000 description 1
- 241001550224 Apha Species 0.000 description 1
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000016605 B-Cell Activating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010028006 B-Cell Activating Factor Proteins 0.000 description 1
- 229940122146 Bcl11A inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 210000001266 CD8-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 102000000905 Cadherin Human genes 0.000 description 1
- 108050007957 Cadherin Proteins 0.000 description 1
- 241000282421 Canidae Species 0.000 description 1
- 241000282465 Canis Species 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000700198 Cavia Species 0.000 description 1
- 238000001353 Chip-sequencing Methods 0.000 description 1
- 208000015943 Coeliac disease Diseases 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 244000124209 Crocus sativus Species 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- ZZZCUOFIHGPKAK-UHFFFAOYSA-N D-erythro-ascorbic acid Natural products OCC1OC(=O)C(O)=C1O ZZZCUOFIHGPKAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100024812 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A Human genes 0.000 description 1
- 108050002829 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A Proteins 0.000 description 1
- 102100024810 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B Human genes 0.000 description 1
- 101710123222 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B Proteins 0.000 description 1
- 102000004214 DNA polymerase A Human genes 0.000 description 1
- 108090000725 DNA polymerase A Proteins 0.000 description 1
- 230000007018 DNA scission Effects 0.000 description 1
- 231100001074 DNA strand break Toxicity 0.000 description 1
- 102100031149 Deoxyribonuclease gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010002156 Depsipeptides Proteins 0.000 description 1
- 102100036949 Developmental pluripotency-associated protein 2 Human genes 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 206010013457 Dissociation Diseases 0.000 description 1
- 108700003861 Dominant Genes Proteins 0.000 description 1
- 101100015729 Drosophila melanogaster drk gene Proteins 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 241000283074 Equus asinus Species 0.000 description 1
- 102100031690 Erythroid transcription factor Human genes 0.000 description 1
- 101710100588 Erythroid transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 108010066805 F-Box Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018700 F-Box Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 102000018233 Fibroblast Growth Factor Human genes 0.000 description 1
- 108050007372 Fibroblast Growth Factor Proteins 0.000 description 1
- 102000017707 GABRB3 Human genes 0.000 description 1
- 108010088742 GATA Transcription Factors Proteins 0.000 description 1
- 102000009041 GATA Transcription Factors Human genes 0.000 description 1
- 241000283899 Gazella Species 0.000 description 1
- 230000010558 Gene Alterations Effects 0.000 description 1
- 241000282818 Giraffidae Species 0.000 description 1
- 101710166358 Globin-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010068370 Glutens Proteins 0.000 description 1
- 102100035364 Growth/differentiation factor 3 Human genes 0.000 description 1
- 108010051041 HC toxin Proteins 0.000 description 1
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 1
- 206010018852 Haematoma Diseases 0.000 description 1
- 108010068308 Hemoglobin H Proteins 0.000 description 1
- 102100027685 Hemoglobin subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 108091005902 Hemoglobin subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- MAJYPBAJPNUFPV-BQBZGAKWSA-N His-Cys Chemical compound SC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MAJYPBAJPNUFPV-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 102000011787 Histone Methyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 108010036115 Histone Methyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 241001272567 Hominoidea Species 0.000 description 1
- 101000804948 Homo sapiens Developmental pluripotency-associated protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001073597 Homo sapiens Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3 Proteins 0.000 description 1
- 101001023986 Homo sapiens Growth/differentiation factor 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001028019 Homo sapiens Metastasis-associated protein MTA2 Proteins 0.000 description 1
- 101001109685 Homo sapiens Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000835745 Homo sapiens Teratocarcinoma-derived growth factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000800116 Homo sapiens Thy-1 membrane glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 101000687905 Homo sapiens Transcription factor SOX-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000835093 Homo sapiens Transferrin receptor protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000976622 Homo sapiens Zinc finger protein 42 homolog Proteins 0.000 description 1
- 208000001953 Hypotension Diseases 0.000 description 1
- 206010021143 Hypoxia Diseases 0.000 description 1
- 108010000178 IGF-I-IGFBP-3 complex Proteins 0.000 description 1
- 206010023126 Jaundice Diseases 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 241001103596 Lelia Species 0.000 description 1
- 241000408529 Libra Species 0.000 description 1
- 102100027754 Mast/stem cell growth factor receptor Kit Human genes 0.000 description 1
- 102100037511 Metastasis-associated protein MTA2 Human genes 0.000 description 1
- 108010085220 Multiprotein Complexes Proteins 0.000 description 1
- 102000007474 Multiprotein Complexes Human genes 0.000 description 1
- 101000804949 Mus musculus Developmental pluripotency-associated protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000881849 Mus musculus Developmental pluripotency-associated protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 101100224389 Mus musculus Dppa5a gene Proteins 0.000 description 1
- 101100446513 Mus musculus Fgf4 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100404103 Mus musculus Nanog gene Proteins 0.000 description 1
- 101100310645 Mus musculus Sox15 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100310650 Mus musculus Sox18 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000976618 Mus musculus Zinc finger protein 42 Proteins 0.000 description 1
- 108091057508 Myc family Proteins 0.000 description 1
- BHUZLJOUHMBZQY-YXQOSMAKSA-N N-[4-[(2R,4R,6S)-4-[[(4,5-diphenyl-2-oxazolyl)thio]methyl]-6-[4-(hydroxymethyl)phenyl]-1,3-dioxan-2-yl]phenyl]-N'-hydroxyoctanediamide Chemical compound C1=CC(CO)=CC=C1[C@H]1O[C@@H](C=2C=CC(NC(=O)CCCCCCC(=O)NO)=CC=2)O[C@@H](CSC=2OC(=C(N=2)C=2C=CC=CC=2)C=2C=CC=CC=2)C1 BHUZLJOUHMBZQY-YXQOSMAKSA-N 0.000 description 1
- 206010028813 Nausea Diseases 0.000 description 1
- 206010029350 Neurotoxicity Diseases 0.000 description 1
- 102100022669 Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 Human genes 0.000 description 1
- 206010029825 Nucleated red cells Diseases 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 206010033546 Pallor Diseases 0.000 description 1
- 241000282579 Pan Species 0.000 description 1
- 241000282320 Panthera leo Species 0.000 description 1
- 241000282376 Panthera tigris Species 0.000 description 1
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 1
- 241000286209 Phasianidae Species 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- 102000055027 Protein Methyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 108700040121 Protein Methyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 101001012040 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) Immunomodulating metalloprotease Proteins 0.000 description 1
- IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N R-2-phenyl-2-hydroxyacetic acid Natural products OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150010363 REM2 gene Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 102000007503 Retinoblastoma-Binding Protein 7 Human genes 0.000 description 1
- 108010071000 Retinoblastoma-Binding Protein 7 Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 1
- 101150086694 SLC22A3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150052594 SLC2A3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150064359 SLC6A1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150099493 STAT3 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 108010016797 Sickle Hemoglobin Proteins 0.000 description 1
- 206010040642 Sickle cell anaemia with crisis Diseases 0.000 description 1
- 101150044140 Slc7a5 gene Proteins 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010017842 Telomerase Proteins 0.000 description 1
- 102100026404 Teratocarcinoma-derived growth factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 208000031320 Teratogenesis Diseases 0.000 description 1
- 206010043276 Teratoma Diseases 0.000 description 1
- 208000035199 Tetraploidy Diseases 0.000 description 1
- 206010043391 Thalassaemia beta Diseases 0.000 description 1
- 206010043395 Thalassaemia sickle cell Diseases 0.000 description 1
- 102100033523 Thy-1 membrane glycoprotein Human genes 0.000 description 1
- RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N Titanium Chemical compound [Ti] RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010044221 Toxic encephalopathy Diseases 0.000 description 1
- 102100024270 Transcription factor SOX-2 Human genes 0.000 description 1
- 102100022012 Transcription intermediary factor 1-beta Human genes 0.000 description 1
- 101710177718 Transcription intermediary factor 1-beta Proteins 0.000 description 1
- 102100039362 Transducin-like enhancer protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710101305 Transducin-like enhancer protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 108091032917 Transfer-messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 102100026144 Transferrin receptor protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 1
- 206010052779 Transplant rejections Diseases 0.000 description 1
- 229930189037 Trapoxin Natural products 0.000 description 1
- 102000004243 Tubulin Human genes 0.000 description 1
- 108090000704 Tubulin Proteins 0.000 description 1
- 241001199012 Usta Species 0.000 description 1
- 229930003268 Vitamin C Natural products 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- 108700029631 X-Linked Genes Proteins 0.000 description 1
- 101001029301 Xenopus tropicalis Forkhead box protein D3 Proteins 0.000 description 1
- 102100023550 Zinc finger protein 42 homolog Human genes 0.000 description 1
- 108091007916 Zinc finger transcription factors Proteins 0.000 description 1
- 102000038627 Zinc finger transcription factors Human genes 0.000 description 1
- 238000002679 ablation Methods 0.000 description 1
- 210000002506 abnormal erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 206010000210 abortion Diseases 0.000 description 1
- 231100000176 abortion Toxicity 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 108020002494 acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000005421 acetyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 1
- 206010051895 acute chest syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 210000004504 adult stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000013566 allergen Substances 0.000 description 1
- 208000033571 alveolar capillary dysplasia with misalignment of pulmonary veins Diseases 0.000 description 1
- 230000001668 ameliorated effect Effects 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 238000012197 amplification kit Methods 0.000 description 1
- 230000033115 angiogenesis Effects 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 230000003460 anti-nuclear Effects 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 1
- 229940053200 antiepileptics fatty acid derivative Drugs 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 238000012098 association analyses Methods 0.000 description 1
- 238000012093 association test Methods 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- 230000003416 augmentation Effects 0.000 description 1
- 230000003190 augmentative effect Effects 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003651 basophil Anatomy 0.000 description 1
- 210000004103 basophilic normoblast Anatomy 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 229940054066 benzamide antipsychotics Drugs 0.000 description 1
- 150000003936 benzamides Chemical class 0.000 description 1
- 125000005605 benzo group Chemical group 0.000 description 1
- 230000005266 beta plus decay Effects 0.000 description 1
- 208000005980 beta thalassemia Diseases 0.000 description 1
- 239000012867 bioactive agent Substances 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 239000012267 brine Substances 0.000 description 1
- 239000000337 buffer salt Substances 0.000 description 1
- 150000004652 butanoic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000011116 calcium hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 239000002771 cell marker Substances 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000002458 cell surface marker Substances 0.000 description 1
- 230000033077 cellular process Effects 0.000 description 1
- 239000003610 charcoal Substances 0.000 description 1
- 230000001149 cognitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000005757 colony formation Effects 0.000 description 1
- 229940000425 combination drug Drugs 0.000 description 1
- 230000002301 combined effect Effects 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 210000002808 connective tissue Anatomy 0.000 description 1
- 108091036078 conserved sequence Proteins 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 239000006071 cream Substances 0.000 description 1
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 1
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 1
- 238000009109 curative therapy Methods 0.000 description 1
- WZHCOOQXZCIUNC-UHFFFAOYSA-N cyclandelate Chemical compound C1C(C)(C)CC(C)CC1OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 WZHCOOQXZCIUNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001945 cysteines Chemical class 0.000 description 1
- 229960000684 cytarabine Drugs 0.000 description 1
- 230000021953 cytokinesis Effects 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000006392 deoxygenation reaction Methods 0.000 description 1
- 108010031616 deoxyribonuclease gamma Proteins 0.000 description 1
- 210000004207 dermis Anatomy 0.000 description 1
- 230000009025 developmental regulation Effects 0.000 description 1
- 229960003957 dexamethasone Drugs 0.000 description 1
- UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N dexamethasone Chemical compound C1CC2=CC(=O)C=C[C@]2(C)[C@]2(F)[C@@H]1[C@@H]1C[C@@H](C)[C@@](C(=O)CO)(O)[C@@]1(C)C[C@@H]2O UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N 0.000 description 1
- JXSJBGJIGXNWCI-UHFFFAOYSA-N diethyl 2-[(dimethoxyphosphorothioyl)thio]succinate Chemical compound CCOC(=O)CC(SP(=S)(OC)OC)C(=O)OCC JXSJBGJIGXNWCI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 230000003292 diminished effect Effects 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- LWUICDQVEORCSP-UHFFFAOYSA-L disodium butanoate Chemical compound [Na+].[Na+].CCCC([O-])=O.CCCC([O-])=O LWUICDQVEORCSP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 1
- 208000018459 dissociative disease Diseases 0.000 description 1
- 208000002173 dizziness Diseases 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 230000034431 double-strand break repair via homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 230000002900 effect on cell Effects 0.000 description 1
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 description 1
- 230000013020 embryo development Effects 0.000 description 1
- 230000008011 embryonic death Effects 0.000 description 1
- 210000001671 embryonic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000004945 emulsification Methods 0.000 description 1
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 1
- 230000007515 enzymatic degradation Effects 0.000 description 1
- 210000003979 eosinophil Anatomy 0.000 description 1
- 210000002615 epidermis Anatomy 0.000 description 1
- 230000004076 epigenetic alteration Effects 0.000 description 1
- 230000008995 epigenetic change Effects 0.000 description 1
- 239000003797 essential amino acid Substances 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 238000013401 experimental design Methods 0.000 description 1
- 230000008175 fetal development Effects 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 229940126864 fibroblast growth factor Drugs 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 239000000834 fixative Substances 0.000 description 1
- 231100000221 frame shift mutation induction Toxicity 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 210000000973 gametocyte Anatomy 0.000 description 1
- BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N gamma-aminobutyric acid Chemical compound NCCCC(O)=O BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 102000054767 gene variant Human genes 0.000 description 1
- 230000004077 genetic alteration Effects 0.000 description 1
- 231100000118 genetic alteration Toxicity 0.000 description 1
- 230000009395 genetic defect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 230000007614 genetic variation Effects 0.000 description 1
- 230000037442 genomic alteration Effects 0.000 description 1
- 230000004110 gluconeogenesis Effects 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000021312 gluten Nutrition 0.000 description 1
- 101150098203 grb2 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 201000000079 gynecomastia Diseases 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- GNYCTMYOHGBSBI-UHFFFAOYSA-N helminthsporium carbonum toxin Natural products N1C(=O)C(C)NC(=O)C(C)NC(=O)C2CCCN2C(=O)C1CCCCCC(=O)C1CO1 GNYCTMYOHGBSBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002489 hematologic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003677 hemocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940000351 hemocyte Drugs 0.000 description 1
- 230000002440 hepatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 150000002411 histidines Chemical class 0.000 description 1
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 description 1
- 238000012766 histopathologic analysis Methods 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 238000003165 hybrid screening Methods 0.000 description 1
- 150000004679 hydroxides Chemical class 0.000 description 1
- 208000021822 hypotensive Diseases 0.000 description 1
- 230000001077 hypotensive effect Effects 0.000 description 1
- 230000007954 hypoxia Effects 0.000 description 1
- 230000006303 immediate early viral mRNA transcription Effects 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 238000003365 immunocytochemistry Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000012744 immunostaining Methods 0.000 description 1
- 239000007943 implant Substances 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 1
- 239000012212 insulator Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007913 intrathecal administration Methods 0.000 description 1
- 238000007914 intraventricular administration Methods 0.000 description 1
- 235000014413 iron hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- NCNCGGDMXMBVIA-UHFFFAOYSA-L iron(ii) hydroxide Chemical class [OH-].[OH-].[Fe+2] NCNCGGDMXMBVIA-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000002085 irritant Substances 0.000 description 1
- 231100000021 irritant Toxicity 0.000 description 1
- 235000015110 jellies Nutrition 0.000 description 1
- 239000008274 jelly Substances 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000012177 large-scale sequencing Methods 0.000 description 1
- 230000002045 lasting effect Effects 0.000 description 1
- 231100000225 lethality Toxicity 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 238000012417 linear regression Methods 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 1
- 239000012669 liquid formulation Substances 0.000 description 1
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000005923 long-lasting effect Effects 0.000 description 1
- 230000035168 lymphangiogenesis Effects 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 238000002826 magnetic-activated cell sorting Methods 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000005075 mammary gland Anatomy 0.000 description 1
- 210000004216 mammary stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 229960002510 mandelic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 235000019988 mead Nutrition 0.000 description 1
- 210000003593 megakaryocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000031864 metaphase Effects 0.000 description 1
- 239000003697 methyltransferase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 230000000116 mitigating effect Effects 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 208000030454 monosomy Diseases 0.000 description 1
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 1
- 210000002894 multi-fate stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 208000031225 myocardial ischemia Diseases 0.000 description 1
- 210000000107 myocyte Anatomy 0.000 description 1
- FMURUEPQXKJIPS-UHFFFAOYSA-N n-(1-benzylpiperidin-4-yl)-6,7-dimethoxy-2-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)quinazolin-4-amine;trihydrochloride Chemical compound Cl.Cl.Cl.C=12C=C(OC)C(OC)=CC2=NC(N2CCN(C)CCC2)=NC=1NC(CC1)CCN1CC1=CC=CC=C1 FMURUEPQXKJIPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091008800 n-Myc Proteins 0.000 description 1
- OYKBQNOPCSXWBL-SNAWJCMRSA-N n-hydroxy-3-[(e)-3-(hydroxyamino)-3-oxoprop-1-enyl]benzamide Chemical compound ONC(=O)\C=C\C1=CC=CC(C(=O)NO)=C1 OYKBQNOPCSXWBL-SNAWJCMRSA-N 0.000 description 1
- 230000008693 nausea Effects 0.000 description 1
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 description 1
- 210000003061 neural cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001537 neural effect Effects 0.000 description 1
- 230000007135 neurotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000228 neurotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 210000000287 oocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000004768 organ dysfunction Effects 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 150000002902 organometallic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 1
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000007310 pathophysiology Effects 0.000 description 1
- 229920001277 pectin Polymers 0.000 description 1
- 230000000149 penetrating effect Effects 0.000 description 1
- 210000004303 peritoneum Anatomy 0.000 description 1
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- 208000004594 persistent fetal circulation syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000003094 perturbing effect Effects 0.000 description 1
- 238000011458 pharmacological treatment Methods 0.000 description 1
- NTGBUUXKGAZMSE-UHFFFAOYSA-N phenyl n-[4-[4-(4-methoxyphenyl)piperazin-1-yl]phenyl]carbamate Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1N1CCN(C=2C=CC(NC(=O)OC=3C=CC=CC=3)=CC=2)CC1 NTGBUUXKGAZMSE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003884 phenylalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011007 phosphoric acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000003016 phosphoric acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 231100000683 possible toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 210000002996 primitive erythroblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000007639 printing Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000031877 prophase Effects 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 238000012175 pyrosequencing Methods 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 238000002673 radiosurgery Methods 0.000 description 1
- 235000008001 rakum palm Nutrition 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000009711 regulatory function Effects 0.000 description 1
- 230000002787 reinforcement Effects 0.000 description 1
- 210000005132 reproductive cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002271 resection Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000002207 retinal effect Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000000468 rubriblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 230000009919 sequestration Effects 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 208000013220 shortness of breath Diseases 0.000 description 1
- 238000007390 skin biopsy Methods 0.000 description 1
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 210000001988 somatic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 208000006379 syphilis Diseases 0.000 description 1
- VAZAPHZUAVEOMC-UHFFFAOYSA-N tacedinaline Chemical compound C1=CC(NC(=O)C)=CC=C1C(=O)NC1=CC=CC=C1N VAZAPHZUAVEOMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 1
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- 230000002463 transducing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 108010060597 trapoxin A Proteins 0.000 description 1
- 238000011277 treatment modality Methods 0.000 description 1
- VLCQZHSMCYCDJL-UHFFFAOYSA-N tribenuron methyl Chemical compound COC(=O)C1=CC=CC=C1S(=O)(=O)NC(=O)N(C)C1=NC(C)=NC(OC)=N1 VLCQZHSMCYCDJL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 210000001835 viscera Anatomy 0.000 description 1
- 235000019154 vitamin C Nutrition 0.000 description 1
- 239000011718 vitamin C Substances 0.000 description 1
- 230000036266 weeks of gestation Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/01—Preparation of mutants without inserting foreign genetic material therein; Screening processes therefor
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K35/12—Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/46—Hydrolases (3)
- A61K38/465—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
- A61P7/06—Antianaemics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4702—Regulators; Modulating activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/795—Porphyrin- or corrin-ring-containing peptides
- C07K14/805—Haemoglobins; Myoglobins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
Abstract
Description
"١1
SES التنظيمية البعيدة لإعادة حث هِيمُوجلوبين BCLITA استهداف عناصرSES Distal Regulatory Reinduction of Hemoglobin Induction BCLITA Targeting Elements
Targeting BCL1 1A distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction الوصف الكامل خلفية الاختراع في الكبار على أربع بروتينات جلوبين Normal hemoglobin يشتمل الهيموجلوبين الطبيعي beta منها بروتينات بيتا oily alpha (a) proteins منها بروتينات ألفا ol, globin proteins لاسيما في mammalian fetal development أثناء التطور الجنيني الثديي . (B) proteins والذي يشتمل على اثنين بروتينات fetal hemoglobin البشر, ينتج الجنين الهيموجلوبين الجنيني © 8 - -جلوبين B من اثتين بروتينات Ya: gamma (y)-globin proteins جاما (لا)-جلوبين فترة ما بعد الولادة, يحدث تحول الجلوبين, المشار إليه بالاسم "التحول oi globin proteins الجنيني”, وعند هذه النقطة, تتبدل المواد المنتجة للكريات الحُمر من تصنيع على نحو سائد لا-جلوبين إلى تصنيع على نحو سائد 8 -جلوبين. يبدأ التحول التطوري من إنتاج الهيموجلوبين الجنيني على عند من حوالي (HOA ((X2P2 ((272)ل) إلى إنتاج الهيموجلوبين في الكبار أو HOF نحو سائد أو ٠ سائداً. ينتج هذا HDA أسبوعاً من الحمل ويستمر لفترة وجيزة بعد الولادة حتى يصبح YE إلى YA وزيادة gamma-—globin genes التحول على نحو أولي من انخفاض انتساخ جينات جاما-جلوبين في المتوسط, يحتوي دم الشخص البالغ الطبيعي beta-globin 98085 انتساخ جينات بيت -جلوبين ٠١ المتبقية تكون متباينة بأكثر من HOF على الرغم من أن مستويات (HOF 7١ على أقل من ضعف في الكبار الأصحاء ويتم التحكم فيها وراثياً. V0 يضم اعتلال الهيموجلوبين عدد من أمراض فقر الدم ذات الأصل الجيني والتي فيها يوجد إنتاج .red blood cells (RBCs) منخفض و / أو إتلاف متزايد (انحلال الدم) لخلايا الدم الحمراء تشتمل هذه أيضاً على العيوب الجنينية التي ينتج عنها إنتاج هيموجلوبينات شاذة مع ضعف القدرة تشتمل بعض الاضطرابات المذكورة على فشل oxygen مصاحب في الحفاظ على تركيز الأكسجين بكميات كافية, في حين تشتمل الأخرى على normal 8. —globin awk إنتاج 8 -جلوبين ٠ slam 8 الفشل في إنتاج 8 -جلوبين طبيعي كلياً. يشار إلى هذه الاضطرابات المرتبطة ببروتينTargeting BCL1 1A distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction Full description Background of the invention In adults, four globin proteins Normal hemoglobin Normal hemoglobin includes beta, including oily alpha (a) proteins, including alpha proteins ol, globin proteins, particularly in mammalian fetal development during mammalian embryonic development. (B) proteins Which includes two human fetal hemoglobin proteins, the fetus produces fetal hemoglobin © 8 - - globin B from two proteins Ya: gamma (y)-globin proteins gamma (la)-globin In the postnatal period, the conversion of globin, referred to as the “transformation of fetal oi globin proteins,” occurs, and at this point, the erythropoietic substances change from predominantly no-globin to predominantly synthesized 8 - globin The evolutionary transition from fetal hemoglobin production begins at about HOA ((X2P2 ((272)l) to adult hemoglobin production or HOF towards dominant or 0 dominant. This produces HDA weeks of gestation and continues for a short period after birth until it becomes YE to YA and an increase of gamma---globin genes shifting primarily from decreased transcription of gamma--globin genes On average, the blood of a normal adult contains beta-globin 98085 transcripts of the remaining 01 bet-globin genes are more variant than HOF although levels of HOF 71 are less than twice that of healthy adults and are genetically controlled. Anemias of genetic origin in which there is decreased production of red blood cells (RBCs) and/or increased damage (hemolysis) of red blood cells. These also include fetal defects that result in the production of abnormal hemoglobin with an impaired ability Some of the disorders listed include a concomitant failure of oxygen to maintain oxygen concentration in adequate amounts, while others involve normal 8. —globin awk 8 production - globin 0 slam 8 failure to produce 8 - globin All natural. These are referred to as protein-related disorders
© عموماً بالاسم 8 -اعتلال الهيموجلوبين. على سبيل المثال, تتتج 8 -الثلاسيميا من عيب جزئي أو IS في التعبير عن جين 8 -جلوبين, مما يؤدي إلى نقص HDA أو عدم تواجده. ينتج فقر الدم المنجلي عن طافرة نقطة في الجين البنيوي 8 -جلوبين, مما يؤدي إلى إنتاج هيموجلوبين sickle ais) hemoglobin (HbS) ) شاذ. يكون HBS عرضة للبلمرة, لاسيما في Jb ظروف © نزع الأكسجين. يكون HDS RBCs أكثر هشاشة من RBCS الطبيعي ويخضع لانحلال pall بسرعة أكبر, ممما يؤدي تدريجياً إلى فقر الدم. chase يركز البحث عن علاج يستهدف تقليل اختلال توازن سلسلة الجلوبين في مرضى يعانون من اعتلال الهيموجلوبين ] على المعالجة الدوائية للهيموجلوبين الجنيني hereditary ¢02y2) (persistence fetal HbF يتم اقتراح الإمكانية العلاجية لهذه الطرق بواسطة ملاحظات خاصة ٠ بالنمط الظاهري المعتدل للأفراد الذين لديهم صفات وراثية مشتركة من فقر الدم البحري م المتجانسة والاستدامة الوراثية للهيموجلوبين الجيني hereditary persistence of fetal hemoglobin (HPFH) بالإضافة إلى المرضى الذين لديهم فقر الدم البحري م المتجانسة والتي لا نتتج هيموجلوبين لدى البالغين» ولكن تتم ملاحظة مطلب منخفض لحالات نقل الدم في وجود تركيزات عالية من الهيموجلوبين الجيني. علاوة على ذلك؛ تمت ملاحظة أن مجموعة معينة من المرضى Vo البالغين الذين لديهم تشوهات في سلسلة B يكون لديهم مستويات (Aol من الطبيعية من الهيموجلوبين الجيني hemoglobin (HF) 16181؛ وتمت ملاحظة أن لديهم مسار سريري لمرض أكثر اعندالاً من المرضى الذين لديهم مستويات طبيعية من ال HEF لدى البالغين. على سبيل المثال؛ يكون لمجموعة من المرضى السعوديين الذين يعانون من فقر الدم المنجلي ويعبرون وراثياً على ما يتراوح من 770-7١ من ال HOF مظاهر سريرية معتدلة فقط للمرض «et al. (Pembrey) .ل Br. (Haematol. 40: 415-429 (1978) ٠ . يعتبر مقبولاً الآن أن يتم تحسين اضطرابات الهيموجلوبين؛ Jie فقر الدم المنجلي وفقر pall البحري off بواسطة إنتاج ال HOF المتزايد. كما تم ذكره أعلاه؛ Sale ما يستمر التحويل من هيموجلوبين جنيني إلى هيموجلوبين لدى البالغين (0272؛ (HDA في خلال ستة أشهر بعد الولادة. مع ذلك؛ في غالبية المرضى الذين يعانون من اعتلال الهيموجلوبين ل تعتبر جينات الجلوبين 7 القبلية سليمة وتعمل بشكل كامل؛ بحيث إذا تمت © إعادة تتشيط هذه الجينات؛ يمكن الحفاظ على تخليق الهيموجلوبين الوظيفي أثناء سن البلوخ؛ وبالتالي© Generally by name 8 - Hemoglobinopathy. For example, 8-thalassemia results from a partial defect, or IS, in the expression of the 8-globin gene, which results in a deficiency or absence of HDA. Sickle cell anemia results from a point mutation in the structural 8-globin gene, which results in the production of abnormal sickle ais (HbS) hemoglobin. HBS is susceptible to polymerization, particularly under Jb© deoxygenation conditions. HDS RBCs are more fragile than normal RBCS and undergo pall decay more rapidly, which progressively leads to anemia. chase The search for a treatment aimed at reducing globin chain imbalance in patients with hemoglobinopathy] focuses on pharmacological treatment of hereditary fetal hemoglobin ¢02y2 (persistence fetal HbF). The therapeutic potential of these methods is suggested by observations of type 0 Moderate phenotype for individuals with common genetic traits of heterozygous marine anemia and hereditary persistence of fetal hemoglobin (HPFH) in addition to patients with heterozygous marine anemia who do not produce hemoglobin in adults, but it is noted Low requirement for blood transfusions in the presence of high concentrations of genomic hemoglobin.Furthermore, a certain group of adult Vo patients with B-chain abnormalities have been observed to have normal (Aol) levels of genomic hemoglobin (HF) 16181 has been observed to have a clinical course of milder disease than patients with normal levels of HEF in adults.For example, a group of Saudi patients with Sickle cell anemia and genetically expressing 71-770 of the HOF are only mild clinical manifestations of the disease” et al. (Pembrey). The increased HOF As mentioned above, Sale The conversion from fetal hemoglobin to adult hemoglobin (HDA) continues within six months after birth. However, in the majority of patients with The pre-globin-7 genes are intact and fully functional, so that if these genes are reactivated, functional hemoglobin synthesis can be maintained during puberty, thus
و تحسين خطورة المرض. على نحو غير ملاتم؛ تعتبر الآليات الجزيئية داخل الجسم الحي والتي تعتبر أساس تحويل الجلوبين غير مفهومة بصورة جيدة. يتم الحصول على الدليل الذي يدعم إمكانية sale) تنشيط إنتاج الهيموجلوبين الجيني من التجارب التي تظهر أن الدم المحيطي؛ الذي يحتوي على خلايا مولدة للنسائل؛ عند توفير توليفة مناسبة من عوامل 0 النموء ينتج مستعمرات WAL شبيهة بالكريات الحمراء ودفقات في مزرعة نصف صلبة. يمكن للخلايا الفردية في هذه المستعمرات أن تراكم هيموجلوبين جنيني (HDF) أو هيموجلوبين بالغين adult hemoglobin (HbA) أو توليفة منها. في المزارع من دم البالغين»؛ تراكم الخلايا الحمراء المنواة إما (F-A+) HbA فقط أو توليفة من HbA; HOF (++]). على نحو cage تشتمل المستعمرات المستقلة على الخلايا + (Fog الأمر الذي يدل على أن كلا النوعين عبارة عن نسل من نفس ٠ > الخلايا الجذعية الجائلة. بالتالي؛ أثناء المراحل الأولى للتطور في المزرعة؛ تتفذ الخلايا OLE) عن طريق آليات معروفة الآن؛ سواء أن تعبر وراثياً عن ال HBF أم لا. من الواضح أن نسبة خلايا ال Ft في البالغين غير مبرمجة مسبقاً في الجسم الحي؛ ولكن من الواضح أنها تعتمد على ظروف المزرعة: (Say إجراء تعديل في مسار التعبير الوراثي HBF و15/8ا؛ على سبيل (Jill في المعمل بواسطة تركيزات Alle في المصلء نتيجة لنشاط مركب غير محدد يمكن امتصاصه على فحم منشط. عموماً؛ يكون تحديد الجزيئات التي تلعب دوراً في تحويل الجلويين مهماً في تطوير الاستراتيجيات العلاجية الحديثة التي تتداخل مع هيموجلوبين البالغين وتحث تخليق الهيموجلوبين الجنيني. ستوفر هذه الجزتيات أهداف جديدة لتطوير التداخلات العلاجية للعديد من حالات اعتلال الهيموجلوبين والتي يؤدي Led إعادة تنتشيط تخليق الهيموجلوبين الجنيني إلى تحسين خطورة المرض ومسبباته إلى حدٍ كبير . ٠ الوصف العام للاختراع يتم في الطلب الحالي تقديم طرق وتركييات sa) مستويات 8 -جلوبين fetal 8 -globin cual في خلية بواسطة اضطراب التعبير عن 8061118 على المستوى الجينومي. يتم أيضاً في الطلب الحالي تقديم طرق وتركيبات تتعلق بعلاج اعتلال الهيموجلوبين بواسطة إعادة حث مستويات 8 - جلوبين جنيني. CARand improve disease severity. inappropriately The in vivo molecular mechanisms underlying globin conversion are poorly understood. Evidence supporting the possibility of (sale) activating gene hemoglobin production comes from experiments showing that peripheral blood; which contains reproductive cells; When given an appropriate combination of growth factors 0, WAL produces erythrocyte-like colonies and flows in semisolid culture. Individual cells in these colonies can accumulate fetal hemoglobin (HDF), adult hemoglobin (HbA), or a combination thereof. in cultures from the blood of adults»; accumulation of nucleated red cells with either (F-A+) HbA only or a combination of HbA; HOF (++]). In a cage fashion the independent colonies contain + cells (Fog which indicates that both types are offspring of the same 0 > circulating stem cells. Thus, during early stages of development in culture, OLE cells are permeated) via mechanisms now known; Whether or not you genetically express HBF. It is clear that the proportion of Ft cells in adults is not preprogrammed in vivo; But it is clearly dependent on culture conditions: (Say) modification of the HBF gene expression pathway and 15/8a; for example (Jill) in vitro by Alle concentrations in serum as a result of the activity of a non-specific compound that can be absorbed on charcoal Overall, the identification of molecules that play a role in transducing gluconeogenesis will be important in developing novel therapeutic strategies that interfere with adult hemoglobin and induce fetal hemoglobin synthesis.These molecules will provide new targets for developing therapeutic interventions for many hemoglobinopathies in which Led reactivates synthesis. GENERAL DESCRIPTION OF THE INVENTION In the present application, methods and compositions of (sa) fetal 8-globin cual levels in a cell are presented by perturbing the expression of 8061118 at the genomic level. Also presented in the present application are methods and formulations related to the treatment of hemoglobinopathy by re-induction of fetal 8-globin levels.
—o——o—
تتعلق أحد الجوانب الموصوفة في الطلب الحالي بطريقة لإنتاج خلية أولية تشتمل على تعبير متخفضOne of the aspects described in the present application relates to a method for producing a protocell that has reduced expression
عن 0088 801118 أو البروتين, تشتمل الطريقة على تلامس خلية أولية معزولة مع عامل يربطFor 0088 801118 or protein, the method involves contacting an isolated protocell with a binding agent
حمض genomic «sual DNA للخلية على الكرموسوم chromosome " الموقعThe genomic acid “sual DNA of the cell on the chromosome” site
TY AY لقف الس افد (طبقاً لتجميعة 19 UCSC Genome Browser hg الجينوميةTY AY syphilis (according to UCSC Genome Collection 19 Browser hg)
© البشرية human genome ), وبناءً عليه خفض تعبير MRNA أو البروتين عن BCL11A© human genome), and accordingly reduced mRNA or protein expression of BCL11A
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي بطريقة لإنتاج خلية بشرية مهندسة وراثياً بها تعديلAnother aspect described in the present application relates to a method for producing a genetically engineered human cell with modification
جيني واحد على الأقل تشتمل على تلامس خلية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقلAt least one gene comprises contact of an isolated cell with an effective amount of a combination comprising at least
Deoxyribo Nucleic acid (DNA) يستهدف حمض نوري endonuclease على إندونيوكليازDeoxyribo Nucleic acid (DNA) nucleic acid endonuclease targets the endonuclease
أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يشطر ٠ إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم Y الموقعOr an expression vector carrying the coding sequence for a DNA-targeting endonuclease, by which 0 DNA-targeting endonuclease cleaves the genomic DNA of the cell at the Y chromosome site
10771/62171574 ويتسبب في تعديل جيني genetic modification واحد على10771/62171574 and causes one genetic modification
الأقل فيه.least in it.
يتم أيضاً تقديم في الطلب الحالي في جانب آخر خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديل جينيAlso presented in the present application is another isolated genetically engineered human cell with genetic modification
واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع 10077/0117-7507131061894. في أحد النماذج, تعديل جيني واحد على الأقل يكون حذف في حمض DNA الجينومي في الموقع المحدد. في أحد النماذج,At least one on the chromosome? Website 10077/0117-7507131061894. In one embodiment, at least one genetic modification is a deletion in genomic DNA at the specified location. in one form,
isolated معزولة genetic engineered human cell Lil); يكون ل خلية بشرية مهندسةisolated genetically engineered human cell Lil); An engineered human cell
تعبير منخفض أو أقل ل MRNA أو البروتين عن 801118 مقارنة بخلية مقارنة لا تشتمل علىDecreased or lower expression of mRNA or protein than 801118 compared to a non-comparison cell
تعديل جيني واحد في الكرموسوم ؟ الموقع SOYTACTI Y= VY TO AROne genetic modification in the chromosome? SOYTACTI Y= VY TO AR
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديل ٠ جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع 100776517-75697156184 الموصوف فيAnother aspect described in the present application relates to the use of an isolated genetically engineered human cell with at least one 0 gene modification in the chromosome? Location 100776517-75697156184 described at
الطلب الحالي بغرض زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني5ا678١ fetal hemoglobin .في ثدييThe current application is for the purpose of increasing the levels of fetal hemoglobin 6781a5 in my breasts.
.mammal.mammal
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب Mall باستخدام خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديلAnother aspect described in the Mall application concerns the use of an isolated genetically engineered human cell with a modification
جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع TH YYACH Y=T0 eV TO AS الموصوف في Yo الطلب الحالي لعلاج اعتلال الهيموجلوبين/ا051000810ا1610009 .في ثديي .At least one gene on a chromosome? The site TH YYACH Y=T0 eV TO AS described in Yo The current order for the treatment of hemoglobinopathy/A051000810A1610009 in breasts.
h —_ _ يتعلق جانب AT موصوف في الطلب الحالي باستخدام خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع 007700117-75071106184 الموصوف في الطلب الحالي لتصنيع دواء لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي والتي بواسطتها تتم زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في تديي. © يكون جانب آخر موصوف في الطلب Mall تركيبة تشتمل على خلايا بشرية مهندسة Us معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع 10077/117-55067156184. في أحد النماذج, تشتمل التركيبة علاوة على ذلك على sabe حاملة carrier مقبولة صيدلانياً. يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على WDA بشرية مهندسة Lis معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع VTA 0778217-56 Ye بغرض زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في تديي. يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على WDA بشرية مهندسة Lis معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع VTA 0778217-56 يتعلق جانب AT موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على خلايا بشرية مهندسة Lis ٠ معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع Y= Te VY TOA لتم لتصنيع دوا ءِِ لعلاج f عتلال الهيموجلوبين في تديي والتي بواسطتها تتم زياد IS مستويات الهيموجلوبين يكون جانب آخر موصوف في الطلب الحالي تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي ٠ بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية البشرية في الكرموسوم ؟ الموقع 10077/6117-7507156184 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. في أحد النماذج, تشتمل التركيبة علاوة على ذلك على مادة حاملة مقبولة صيدلانياً. يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير coding sequence لإندونيوكلياز YO يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA CARh —_ _ The aspect of AT described in the present application relates to the use of an isolated genetically engineered human cell with at least one genetic modification in the chromosome? Location 007700117-75071106184 described in the present application for the manufacture of a drug for the treatment of mammary haemoglobinopathy by which fetal hemoglobin levels are increased in breast tissue. © Another aspect described in the application Mall is a composition comprising isolated engineered human cells Us with at least one genetic modification in the chromosome ? Website 10077/117-55067156184. In one embodiment, the composition furthermore includes a pharmaceutically acceptable carrier sabe. Another aspect described in the present application relates to the use of a formulation comprising engineered human WDA Lis isolates having at least one genetic modification in the chromosome ? Website VTA 0778217-56 Yee for the purpose of increasing fetal hemoglobin levels in Tedi. Another aspect described in the present application relates to the use of a formulation comprising engineered human WDA Lis isolates having at least one genetic modification in the chromosome ? Location VTA 0778217-56 The aspect of AT described in the present application relates to the use of a composition comprising isolated Lis 0 engineered human cells having at least one genetic modification in chromosome ? Y = Te VY TOA A drug has been manufactured for the treatment of f hemoglobinopathies in Dede by which IS hemoglobin levels are increased Another aspect described in the present application is a formulation comprising at least a DNA-targeting endonuclease or an expression vector carries the coding sequence for a DNA-targeting endonuclease (0) by which a DNA-targeting endonuclease cleaves the genomic DNA of a human cell in the chromosome? Locus 10077/6117-7507156184 and causing at least one genetic modification at it. In one embodiment, the composition furthermore includes a pharmaceutically acceptable carrier. Another aspect described herein relates to the use of a formulation comprising at least one DNA-targeting endonuclease or an expression vector carrying the coding sequence of a YO-DNA-targeting endonuclease by which a DNA-targeting endonuclease cleaves DNA CAR
لto
الجينومي للخلية البشرية في الكرموسوم 7 الموقع Y=T0 VV TOA 10077771 ويتسبب في تعديلThe genome of a human cell at chromosome 7 at position Y=T0 VV TOA 10077771 and causes modification
جيني واحد على الأقل فيه بغرض زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في تديي.At least one gene in it for the purpose of increasing fetal hemoglobin levels in a child.
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكليازAnother aspect described herein relates to the use of a formulation containing at least an endonuclease
يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNAA DNA target or expression vector carrying the coding sequence for an indonuclease targets DNA
© والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية البشرية في© by which an endonuclease DNA cleavage targets the genomic DNA of a human cell in
الكرموسوم ؟ الموقع 1007776717-76071106184 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيهchromosome? Location 1007776717-76071106184 and causes at least one genetic modification there
لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في تديي.For the treatment of hemoglobinopathy in Tedi.
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكليازAnother aspect described herein relates to the use of a formulation comprising at least an endonuclease
يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA Ve والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية البشرية فيA DNA target or an expression vector carrying the coding sequence for an indonuclease targets DNA Ve, by which an endonuclease targets DNA cleaves the genomic DNA of a human cell in
الكرموسوم ؟ الموقع 1007776717-76071106184 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيهchromosome? Location 1007776717-76071106184 and causes at least one genetic modification there
لتصنيع دواء لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في تثديي والتي بواسطتها تتم زيادة مستويات الهيموجلوبينTo manufacture a drug for the treatment of hemoglobinopathy in gynecomastia by which hemoglobin levels are increased
الجنيني في تديي.Embryo in my hand.
في أحد النماذج, يتم في الطلب Jal) تقديم استخدام عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية في VO الكرموسوم ؟ الموقع 1007780717-75071566184 (طبقاً لتجميعة | UCSC GenomeIn one embodiment, the application (Jal) is presented using an agent that binds the genomic DNA of a cell at the VO chromosome? position 1007780717-75071566184 (according to the UCSC Genome Assembly).
Browser hg 9 البشرية الجينومية) لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلالBrowser hg 9 human genomic) to increase fetal hemoglobin in breasts or to treat celiac disease.
الهيموجلوبين في الثديي أو لخفض التعبير عن التعبير عن MRNA أو 806111/8, حيث ينخفضMammary hemoglobin or to reduce the expression of mRNA expression or 806111/8, where it decreases
تعبير MRNA أو البروتين عن 86111/8.mRNA or protein expression of 86111/8.
في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على ٠ إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدفIn one embodiment, the use of an effective amount of a formulation comprising at least 0 endonuclease targeting DNA or an expression vector carrying the coding sequence for an endonuclease targeting DNA is presented in the present application.
حمض DNA لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي أوDNA to increase fetal hemoglobin in my breast, or to treat hemoglobinopathies in the breast, or
لخفض التعبير عن MRNA أو 80111/8, حيث يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمضTo reduce the expression of mRNA or 80111/8, an endonuclease that cleaves DNA targets
DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ¥ الموقع 100777717-75071501845 ويتسبب في تعديلThe cell's genomic DNA is at chromosome ¥ position 100777717-75071501845 and causes modification
جيني واحد على الأقل فيه.At least one gene in it.
CANCAN
-- في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA لزيادة الهيموجلوبين al) في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلويين في الثديي أو لخفض التعبير عن mRNA أو ,BCL11A حيث ينتج إنزيم يستهدف حمض DNA تعديل لا جيني واحد على الأقل في © حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ,١ وبناءً عليه يؤثتر على التعبير عن MRNA أو 80178 . في أحد النماذج, يكون تعديل لا جيني واحد على الأقل في الموقع =I AS 7 . في نموذج آخر, إحداتث تعديل لا جيني واحد يكون خفض تعبير 0401/8 أو البروتين عن .BCL1IA في أحد النماذج, يؤثر تعديل لا جيني واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ١ على نحو غير مباشر أو مباشرةً على الموقع 70071366184- 10727/8021970٠ للكرموسوم 7. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام أي الخلايا المعزولة الموصوفة في الطلب الحالي لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام تركيبة تشتمل على WA بشرية مهندسة Lys معزولة لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي, حيث يكون ١ بالخلايا تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع Y= Te VY TOA لتمت ١ (طبقاً لتجميعة 19 UCSC Genome Browser hg البشرية الجينومية) تم إجرائه بواسطة lee تلامس الخلايا بكمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض 0118 أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم * الموقع ToYYACTIY=Te VY TYAY - ٠ (طبقاً لتجميعة 19 UCSC Genome Browser hg البشرية الجينومية) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام تركيبة تشتمل على WA بشرية مهندسة Lys معزولة لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي, حيث يكون بالخلايا تعديل لا جيني واحد على الأقل في الكرموسوم 7. في أحد النماذج, تعديل لا جيني واحد على YO الأقل في الكرموسوم 7 يكون في الموقع ToeYYACIY=T0 eV TVA (طبقاً لتجميعة UCSC Genome Browser hg 9 الجينومية البشرية). في نموذج AT , يتم إجراء تعديل لا جيني واحد ١ه-- In one embodiment, the present application submits the use of an effective amount of a formulation comprising at least a DNA-targeting enzyme or an expression vector carrying the sequence coding for a DNA-targeting enzyme to increase hemoglobin (al) in mammals or to treat hemoglobinopathies In mammals, or to reduce the expression of mRNA or BCL11A, where a DNA-targeting enzyme produces at least one epigenetic modification in the cell's genomic DNA on chromosome 1, and accordingly affects the expression of mRNA or 80178. In one embodiment, at least one epigenetic modification is at position =I AS 7 . In another embodiment, a single epigenetic modification reduces the expression of 0401/8 or the protein BCL1IA. In one embodiment, at least one epigenetic modification affects the cell's genomic DNA on chromosome 1 indirectly or directly at 70071366184- 10727/80219700 for chromosome 7. In one embodiment, the use of any of the cell isolates described in the present application to increase fetal hemoglobin in breasts or to treat hemoglobinopathies in breasts is presented in the present application. In one embodiment, in the present application is presented the use of a formulation comprising engineered human WA Lys isolated to increase fetal hemoglobin in the breast or to treat mammary hemoglobinopathy, where 1 of the cells has at least one genetic modification in the chromosome? Site Y=Te VY TOA lTMT 1 (according to UCSC Genome Assembly 19 Human Genomic Browser hg) performed by lee contacting cells with an effective amount of a formulation comprising at least an endonuclease targeting acid 0118 or an expression vector Carries the coding sequence for a DNA-targeting endonuclease by which a DNA-targeting endonuclease cleaves the cell's genomic DNA in the chromosome *location ToYYACTIY=Te VY TYAY - 0 (according to UCSC Genome Browser hg Collection 19) And it causes at least one genetic modification in it. In one embodiment, the use of a formulation comprising engineered human WA Lys isolated to increase fetal hemoglobin in breasts or to treat mammary haemoglobinopathy, where the cells have at least one epigenetic modification in chromosome 7, is presented in the present application. In the models, one epigenetic modification on at least YO on chromosome 7 is at loci ToeYYACIY=T0 eV TVA (according to the UCSC Genome Browser Assembly hg 9 human genome). In the AT model, only one epigenetic modification is made 1e
على الأقل في الكرموسوم 7 بواسطة عملية تلامس الخلايا بكمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها ينتج إنزيم يستهدف حمض DNA تعديل لا جيني واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ¥ المؤثر على الموقع 00774717-7507156184 (طبقاً © لتجميعة 19 UCSC Genome Browser hg البشرية الجينومية) ويحدث فيه. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام أي الخلايا المعزولة الموصوف في الطلب الحالي أو أي من التركيبات الموصوفة في الطلب الحالي لتصنيع دواء لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في dala إليه أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي. يكون جانب آخر موصوف في الطلب الحالي طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية, ٠ تشتمل الطريقة على خطوات: تلامس خلية معزولة بكمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض (Alls DNA بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ١ الموقع TeeV TAC Y=T0 eV TOA ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الخلية المذكورة, أو سليفتها, Vo بالنسبة إلى الخلية قبل التلامس. يكون جانب AT موصوف في الطلب الحالي طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات تلامس خلية أولية معزولة مكونة للدم في الثديي المذكور مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز ٠ - يستهدف حمض DNA (mes DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ؟ الموقع “TI TOA 77 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور. يكون جانب آخر موصوف في الطلب الحالي طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على غرس خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديل جيني واحد YO على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع ET TAC Y= TeV TO AS الثديي.at least on chromosome 7 by the process of contacting cells with an active amount of a combination comprising at least one DNA-targeting enzyme or an expression vector carrying the coding sequence for a DNA-targeting enzyme in which a DNA-targeting enzyme produces at least one epigenetic modification In the genomic DNA of a cell at the ¥ chromosome affecting position 00774717-7507156184 (according to © UCSC Genome Browser hg Assembly 19) and occurring there. In one embodiment, the use of any cell isolates described in the present application or any of the combinations described in the present application for the manufacture of a drug to increase fetal hemoglobin in breast dala or for the treatment of hemoglobinopathies in breasts is presented in the present application. Another aspect described herein is a method for increasing fetal hemoglobin levels in a cell, 0 The method includes steps: contacting an isolated cell with an effective amount of a combination comprising at least a DNA-targeting endonuclease or an expression vector carrying the coding sequence for a DNA-targeting endonuclease (Alls DNA by which the endonuclease cleaves DNA targets the genomic DNA of the cell in chromosome 1 site TeeV TAC Y=T0 eV TOA and causes at least one genetic modification in it, by which the expression of fetal hemoglobin increases in Said cell, or its precursor, Vo in relation to the precontact cell The AT side is described in the present application A method for increasing fetal hemoglobin levels in two mammals in need of it The method comprises the steps of contacting an isolated hematopoietic protocell of said mammal with an amount of An active form of a combination comprising at least one DNA-targeting endonuclease or an expression vector carrying the coding sequence for a DNA-targeting endonuclease by which the endonuclease-0 (mes) cleaves the genomic DNA of the cell in the chromosome? TOA 77 and causes At least one genetic modification therein, by which the expression of fetal hemoglobin in said mammal is increased, relative to said precontact expression. Another aspect described in the present submission is a method for increasing fetal hemoglobin levels in two breasts in need of it. The method involves implanting an isolated genetically engineered human cell with at least one YO gene modification in the chromosome? Mammal site ET TAC Y= TeV TO AS.
CARCAR
I. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير مجموعة معزولة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي في خارج الجسم الحي, وتلامس مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض 0118 أو والتي بواسطتها يستهدف DNA يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض joes ناقل © , ٠١ الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع DNA ويشطر حمض DNA إندونيوكلياز حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والذي بواسطته يزيد TY YYA LTS VAS 3 التعبير عن الهيموجلويين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين WIA إليه, تشتمل الطريقة على خطوات عزل مجموعة من ٠ الدم من الثديي, وتلامس في خارج الجسم الحي مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم أو ناقل تعبير DNA مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز (Alls DNA يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض -١184 ,7176 ,60 الموقع ١ الجينومي للخلية على الكرموسوم DNA ويشطر حمض DNA حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن 117 ,778 ,10 NO الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير عزل مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية ,716 680 الجينومي للخلايا على الكرموسوم الموقع DNA لتكوين الدم من الثديي وحذف حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير 1١7 LYYA 840ا-:ة, YS عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات عزل مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ الموقع DNA حذف حمض all الدم من الثديي وخارج الجسم ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها 117 ,7748 ,1:-184 ITT YO يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس.I. In one embodiment, this disclosure provides a method for increasing fetal hemoglobin levels in two mammals in need of it, the method includes the steps of providing an isolated pool of hematopoietic progenitor cells or hematopoietic stem cells from the mammal in vivo, and contact A group of hematopoietic progenitor cells or stem cells with an effective amount of composition comprising at least an endonuclease targeting acid 0118 or with which it targets DNA carrying the coding sequence of an endonuclease targeting acid joes vector © 01 Genomics cell on the chromosome? The DNA endonuclease cleaves the DNA site and causes at least one genetic modification therein, by which TYYYA LTS VAS 3 increases expression of fetal mammary hemoglobin, relative to precontact expression. in one embodiment. , This disclosure presents a method to increase the levels of fetal hemoglobin in breasts in need of primary hematopoiesis or stem cells to form WIA, the method includes the steps of isolating a group of 0 blood from the mammal, and touching in vivo a group of primary cells or hematopoietic stem cells, or a DNA expression vector with an effective amount of a combination comprising at least an endonuclease targeting an acid by which an endonuclease targets an acid (Alls DNA carrying the coding sequence of an endonuclease targeting an acid 60, 7176, 1184) The genomic locus 1 of the cell on the DNA chromosome cleaves the DNA and causes at least one genetic modification in it, by which the expression of 10,778,117 NO increases in the fetal mammalian hemoglobin, relative to the expression before contact. In one embodiment, this detection offers a way to increase fetal hemoglobin levels in two breasts in need. E, the method includes steps to provide for the isolation of a group of primary hematopoietic cells or stem cells, 716 680 genomic cells on the chromosome site of hematopoietic DNA from the mammal and delete acid and cause at least one genetic modification in it, by which it increases Expression 117 LYYA 840A-:A,YS of fetal mammary hemoglobin, relative to precontact expression. In one embodiment, this disclosure provides a method for increasing fetal hemoglobin levels in breasts in need of it. The method includes Steps to isolate a group of primary blood-forming cells or stem cells to form the genome of the cells on the chromosome? The site DNA deletes the acid of all blood from the mammal and outside the body and causes at least one genetic modification in it, by which 117 ,7748 ,1:-184 ITT YO increases the expression of fetal hemoglobin in the mammal, relative to the expression before contact.
CARCAR
-١١- في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: خارج WA جذعية لتكوين الدم أو 105©5: (ب) تلامس WIA (أ) توفير خلايا أولية لتكوين الدم أو الجسم الحي أو في المعمل مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف والتي DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض الجينومي للخلية على DNA ويشطر حمض DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض © ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل 117 ,778 Tam AL VY الكرموسوم ؟ الموقع فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: من الثديي: (ب) تلامس الخلايا خارج pall خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين Jie )( ٠ الجسم الحي أو في المعمل مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف والتي DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض الجينومي للخلية على DNA ويشطر حمض DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل 117 ,778 Tam AL VY الكرموسوم ؟ الموقع بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل lly فيه, VO التلامس: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: (ب) خارج الجسم الحي SIPSCs جذعية لتكوين الدم أو WA (أ) توفير خلايا أولية لتكوين الدم أو-11- In one embodiment, this disclosure presents a method for treating hemoglobinopathy in mammals comprising steps: outside WA hematopoietic stem cells or 105©5: (b) touching WIA (a) providing hematopoietic progenitor cells or in vivo or in vitro with an effective amount of a combination comprising at least an endonuclease that targets DNA or an expression vector carrying the coding sequence of an endonuclease that targets the genomic acid of a cell on the DNA and cleaves the DNA DNA by which it targets an acid endonuclease © and causes at least one genetic modification 778, 117 Tam AL VY chromosome? The site in which fetal hemoglobin expression is increased in the mammal, relative to precontact expression: and (c) given from step (b) in the mammal. In one embodiment, this disclosure provides a method for treating hemoglobinopathies in Mammalian Including steps: From mammals: (b) cells outside the pall contact hematopoietic progenitor cells or Jie-forming stem cells (0) in vivo or in vitro with an effective amount of a formulation comprising at least an endonuclease targeting Which DNA or expression vector carries the coding sequence of an endonuclease that targets the DNA genomic acid of the cell on the DNA and cleaves the DNA by which the endonuclease targets the acid and causes at least one genetic modification Tam 778, 117 AL VY chromosome ?the location by which expression of fetal hemoglobin increases in the mammal, relative to expression before lly in it, VO contact: and (c) giving from step (b) in the mammal. In one embodiment, This disclosure presents a method for the treatment of hemoglobinopathy in mammals comprising the steps of: (b) ex vivo hematopoietic stem SIPSCs or WA (a) provision of hematopoietic precursor cells or
TY خالا Te AT TT الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ المرقع DNA (mea حذف ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني ٠٠ في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس: و (ج) إعطاء الخلايا من الخطوة (ب)) في الثديي. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: جذعية لتكوين الدم من الثديي: (ب) خارج الجسم الحي LDA خلايا أولية لتكوين الدم أو Je (أ) TY خالا Te AT TT الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ المرقع DNA (mea حذف ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني YO في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي.TY Uncle Te AT TT The genome of the cells on the chromosome? patched DNA (a mea deletion causing at least one genetic modification therein, by which expression of fetal hemoglobin 00 in the mammal is increased, relative to precontact expression: and (c) given cells from step (b)) in In one embodiment, this disclosure presents a method for treating hemoglobinopathy in mammals comprising steps: Mammary hematopoietic stem: (b) ex vivo LDA hematopoietic precursor cells or Je (a) TY Uncle Te AT TT The genome of the cells on the chromosome? patchwork DNA (mea deletion) causing at least one genetic modification in it, by which expression of fetal hemoglobin YO is increased in the mammal, relative to precontact expression: and (c) administration from step (b) in the mammal. ,
CARCAR
_— \ \ _ في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي (على سبيل المثال إنسان) تشتمل على إدخال تركيبة الموصوف في الطلب الحالي تشتمل على خلايا معالجة بالهندسة الوراثية معزلة وراثياً بها تعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟ الموقع IAT NTT ١١" ,74 ٠ والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي. © في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي Ao) سبيل المثال_— \ \ _ In an embodiment, this disclosure provides a method for treating hemoglobinopathies in mammals (eg, human) comprising the introduction of a combination described in the present application comprising isolated transgenic cells with at least one genetic modification on the chromosome? site IAT NTT 11" ,74 0 by which expression of fetal hemoglobin is increased in the mammary gland.
إنسان) تشتمل على زيادة التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي بواسطة الطريقة الموصوفة في الطلب الحالي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية المعزولة أو المجموعة المعزولة من الخلايا تكون الخلية (الخلايا) البشرية.human) involving overexpression of fetal hemoglobin in the mammal by the method described in the present application. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the isolated cell or group of cells is the human cell(s).
٠ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية المعزولة أو المجموعة المعزولة من الخلايا تكون خلية (خلايا) أولية. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية البشرية خلية أولية لتكوين الدم. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية البشرية0 In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the isolated cell or group of cells is a primary cell(s). In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the human cell is a proto-hematopoietic cell. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the human cell
VO خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية الجذعية المستحثة متعددة القدرات تكون خلية أولية لتكوين الدم. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية الأولية لتكوين الدم عبارة عن خلية ADL إريترويد.VO is an induced pluripotent stem cell. In one embodiment of this and all others described in the present submission, an induced pluripotent stem cell is a hematopoietic progenitor cell. In one embodiment of this and all others described in the present submission, the primary hematopoietic cell is an erythroid ADL cell.
٠ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم أو المعزولة خارج الجسم الحي أو في المعمل أو في الكائن الحي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يكون التعديل الجيني الواحد على الأقل حذف.0 In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the original cell is contacted to form blood or is isolated ex vivo, in vitro, or in vivo. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, at least one genetic modification is a deletion.
CARCAR
— \ _ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يزيل الحذف كامل المنطقة بين الكرموسوم ؟ الموقع LYYA Tam VAS ,7/15 Te 117 أو يزيل جزء من المنطقة مما يترتب عليه تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل hypersensitive sites - ١ .(DHS) © في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 laa, oot, 0A+ ,17+ (DHS) DNAse للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة . في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من مرقمات صور بلورية انيكليوتيد واحد مشترك | single nucleotide polymorphism (SNP) | ٠ الموصوفة في الجدول XY في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول 7. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يزيل الحذف كامل المنطقة بين الكرموسوم 7 الموقع LT AG ,715 Te 7748, 117 أو يزيل جزء من المنطقة ٠ مما يترتب عليه تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل 1 DNAse (0115). في أحد النماذج, وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "جزء” في سياق الحذف الجينومي يبلغ على الأقل 2/0٠ _من المنطقة المحددة. في نموذج إضافي من أية طريقة علاج, تشتمل الطريقة على علاج chemotherapy ils و أو علاج radiation eles) لإزالة remove أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية5|ا06 stem ٠ داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أحد النماذج من أية طريقة, الخلايا المتلامسة التي تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل يمكن HL Lela 335 وتخزينها حتى يتم احتياج الخلايا للإعطاء في ثديي. في أحد النماذج على أية طريقة موصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو الخلايا المعزولة يمكن توزيعها باستخدام IPSCs الموصوف في الطلب الحالي. CAR— \ _ In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the deletion removes the entire interchromosomal region ? LYYA Tam VAS 7/15 Te 117 ,7/15 or removes part of the area resulting in rupture of one or more hypersensitive sites - 1 (DHS)© in another embodiment of this side and all Other aspects described in the present application, the deletion includes one or more of the hypersensitive loci for 1,laa, oot, 0A+,17+ (DHS) DNAse described in the present application in the Examples section. In another embodiment of this and all other aspects described in the present application, the deletion comprises one or more crystal image digitizers of one common oligonucleotide | single nucleotide polymorphism (SNP) | 0 Described in Schedule XY In another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present application, the omission includes one or more of the fragments listed in Schedule 7. In another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present application, A deletion removes the entire region between chromosome 7 loci LT AG ,715 Te 7748, 117 or part of region 0 resulting in rupture of one or more loci hypersensitive to DNAse 1 (0115). In one embodiment, as used in the present application, the expression “fraction” in the context of a genomic deletion is at least 2/00 of the specified region. In an additional embodiment of any treatment modality, the modality includes chemotherapy ils and/or treatment radiation eles) to remove or reduce progenitor cells or stem cells endogenous to mammary hematopoiesis. In an embodiment of any method, contact cells with at least one genetic modification can HL Lela 335 and stored until the cells are needed for administration into the breast.In an embodiment of any method described, primary cells, hematopoietic stem cells, or cell isolates may be distributed using the IPSCs described in the present application.
_— ¢ \ _ في أحد النماذج على أية طريقة موصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو iPSCs أو الخلايا المعزولة تكون ذاتية إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا تكون مشتقة من نفس الثديي. في نموذج آخر على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو 105605 أو الخلايا المعزولة تكون غير BE BD إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفس الثديي , ولكن تديي آخر من نفس النوع . على سبيل المثال, الثديي يكون إنسان . في أحد النماذج من أية طريقة علاج, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء تديي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني . في أحد النماذج من أية طريقة علاج, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى علاج اعتلال الهيموجلوبين. ٠ في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -اعتلال الهيموجلوبين B —hemoglobinopathy . في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -ثلاسيميا- 8( .thalassemia في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلويين فقر الدم المنجلي sickle .cell anemia ١٠ شرح مختصر للرسومات الشكل رقم ١أ يعرض توزيع 776+ SNPs المنشور سابقاً ليكون مرتبط بسمات شبيهة بالكريات الحمراء عند 8٠١ X 5 > P بالنسبة إلى المعزز, متعلق بالإكسون0016*© , متعلق بالإنترون intronic 1477 لا, ومتواليات بين الجينات. للمقارنة, يتم عرض التوزيع الجينومي genomic distribution | ٠ لهذه المناطق. الشكل رقم ١ب رسم بياني يخطط التوزيع المتراكم لمسافات من 163706 SNPs مرتبطة بالسمات شبيهة بالكريات الحمراء بالنسبة إلى أقرب محسن شبيه بالكريات الحمراء. تم تمييز المحسنات الشبيهة بالكريات الحمراء بواسطة متواليات أكثر من ؟ كيلو بايت من 1958 لجينات موضحة ب Refseq CAR yoo وعدم وجود ,H3K9ac أو H3K27ac إما ,H3K4mel وجود , DNase | ذات حساسية مفرطة مجموعة من 176 بصورة عشوائية 5٠ ل SD + و13/270163. بدلت مسافة متوسط H3K4me3 وتم ,) GWAS مرتبطة بالسمات شبيهة بالكريات الحمراء (من قاعدة بيانات SNPs أنواع غير العشوائية أيضاً. SNPs للتنتميط الجيني, أو Affy 6.0 من مصفوفة SNPS تخطيط تلاه عمل متواليات متوازي بصورة شاملة منفذ بالمواد المنتجة للكريات ChIP الشكل رقم ؟أ يعرض © (H3K4me3 (H3K27me3 الحُمر المشتقة من 0034+-خلية- مع الأجسام المضادة ل النواة المعزولة من المواد المنتجة للكريات L Poll 5, TALI «GATAL (H3K27ac (H3K4mel بحيث تكون مواضع DNase | الحُمر, مخ الجنين, و8- و1-الخلايا اللمفاوية الخاضعة إلى علاج تلك FIDF المرتبطة ب SNPS الانشطار محددة بواسطة عمل متواليات متوازي بصورة شاملة. تتضمن تلك ذات أعلى SNPs وتحرس 8-٠١ x 0 > © عند F خلية sae أو FIDF المرتبطة بمستوى ٠ متجاورة شبيهة بالكريات DHS معينة. يتم ترميز ثلاث GWAS في F ارتباط ب 05ا أو عدد خلية .86111/8 TSS و+0ه بناءً على المسافة بالكيلو بايت من ,0A+ ,67+ ب DHS الحمراء 8611178 الشكل رقم "ب يعرض 6010-9008 لمواد منتجة للكريات الحُمر بشرية رئيسية عند مظللة. TY من الشكل 00+, 0A+ ,17+ DHS كروماتين مدخلة. 7١ ل Lida إنترون-7, معايرة_— ¢ \ _ In an embodiment of any method described, primary cells, hematopoietic stem cells, iPSCs, or cell isolates are endogenous to the mammal, which means that the cells are derived from the same mammal. In another embodiment of the method described, primary cells, hematopoietic stem cells, 105605, or isolated cells are non-BE BD to mammalian, which means that the cells are not derived from the same mammal, but from another of the same species. For example, a mammal is a human. In one embodiment of any treatment method, the method also includes selection for a patient in need of increased expression of fetal hemoglobin. In one embodiment of any treatment method, the method also includes selection of two breasts in need of treatment for hemoglobinopathies. 0 In any form of any prescribed treatment method, hemoglobinopathy is 8 - hemoglobinopathy B —hemoglobinopathy . In any form of any prescribed treatment method, the hemoglobinopathy is 8-thalassemia. Figure 1a presents the distribution of the 776+ SNPs previously reported to be associated with erythroid-like traits at 801 X > 5 P with respect to the enhancer, related to exon0016*©, related to intronic 1477 no, and intergenic sequences. The genomic distribution | 0 for these regions is shown. Figure 1b Graph plots the cumulative distance distribution of 163,706 SNPs associated with erythroid-like traits relative to the nearest erythroid-like enhancer. Sequences of over ?kb from 1958 genes annotated by Refseq CAR yoo, no H3K9ac, or H3K27ac, either H3K4mel, presence, DNase hypersensitivity | cohort of 176 randomized 50 l SD + 13/270163. Altered H3K4me3 mean distance (GWAS) has been associated with globular-like traits. Selection (from a database of SNPs of non-random species as well. SNPs for genotyping, or Affy 6.0 from a SNPS array plotted followed by comprehensively parallel sequencing performed with ChIP genotypes Fig. no.? a shows © H3K4me3 (H3K27me3) erythroblasts derived from 0034+ cells with anti-nuclear antibodies isolated from globulins L Poll 5, TALI “GATAL (H3K27ac (H3K4mel) so that the DNase loci | Erythroid, fetal brain, and 8- and 1-lymphocytes subjected to FIDF treatment that associated with fission SNPS were identified by comprehensively parallel sequencing work. Those with the highest SNPs include guarding 8-01 x 0 > © at F sae or FIDF cells associated with a level 0 contiguous spherule-like DHS given. Three GWAS are encoded in F correlation with 05a or cell number 86111/8 TSS and 0+e based on distance in kB from 67+, 0A+b DHS red 8611178 Fig. B. 6010-9008 presents major human erythropoietic substances at shaded. TY of Figure 00+, 0A+, 17+, DHS inserted chromatin. 71 for Lida intron-7, assay.
LCR HS3 ومواضع مقارن موجب (0-جلوبين (GAPDH, OCT4) الإثراء عند مقارن سالب Vo معروضة للمقارنة. (HS=40 وألفا-جلوبين الشكل رقم "ج يعرض التقاط توافق الكرموسوم منفذ في المواد المنتجة للكريات الحُمر البشرية الرئيسية باستخدام معزز 8011178 كمثبت. تتم معايرة تكرار التفاعل طبقاً لتفاعل BCLIIA عبر موضع . LCR-HBB يعرض متبرعين أصحاء مجهولي الاسم توفرت منهم خلايا جذعية / خلايا أولية مكونة IV الشكل رقم ٠ للدم تم إجراء التتميط الجيني لها عند 181427407 لتمييز أفراد متغايرة الزيجوت. تم تمييز خمسة متبرعين. تم إخضاع الخلايا الجذعية / الخلايا الأولية مكونة للدم إلى مستعمرة تمايز شبيهة بالكرياتLCR HS3 and positive comparator loci (0-globin (GAPDH, OCT4) enrichment at negative comparator Vo are shown for comparison. HS=40 and alpha-globin Fig. of primary human erythroblasts using promoter 8011178 as fixative Reaction frequency calibrated according to BCLIIA reaction across locus LCR-HBB displays anonymous healthy donors from whom IV-forming stem cells/progenitor cells were available Figure 0 blood Genotyping was performed at 181427407 to distinguish heterozygous individuals Five donors were identified Hematopoietic stem cells/primary cells were subjected to colony spheroid differentiation
TALL الحمراء. تم عزل الكروماتين من الأرومة الحمراء, وتم ترسيبها مناعياً بواسطة 687781 أو المدخلة إلى تفاعل تسلسل بالحرارة لتحديد كمية الوفرة النسبية DNA أو ChIP DNA إخضاع rs 1427407 G ليل YoTALL red. Chromatin was isolated from erythroblasts, immunoprecipitated with 687781 or accessed to a thermal sequencing reaction to quantify relative abundance DNA or ChIP DNA subjecting rs 1427407 G lil Yo
CARCAR
_ أ \ _ الشكل رقم "ب يعرض بيانات من متبرعين أصحاء مجهولي الاسم توفرت منهم خلايا جذعية / خلايا أولية مكونة للدم تم إجراء التتميط الجيني لها عند ,rsT606173 rsl427407 5 57569946 لتمييز أفراد متغايرة الزيجوت Lill القزدانيٌ rs1427407-rsT606173 وكذلك 157569946 تم تمييز ثلاثة متبرعين. كشف (asl bill أن أليل © 57569946”كان على نفس الكرموسوم كما © أليل G 51427407 وأليل © 157606173 في كلٍ. تم إخضاع الخلايا الجذعية / الخلايا الأولية مكونة للدم إلى مستعمرة تمايز شبيهة بالكريات الحمراء. تم عزل حمض RNA وحمض DNA جينومي, وتم إنتاج CDNA بواسطة الانتساخ العكسي. تم إخضاع حمض DNA المتزاوج وعينات cDNA إلى تفاعل تسلسل بالحرارة لتحديد كمية الوفرة النسبية لأليل 1758144847 6-. الشكل “ج يعرض متوسط HDF للأنماط الفردانية 151427407-57606173 في منتخب إحصائي lS._ a \ _ Figure No. "b presents data from anonymous healthy donors who had stem cells / primary hematopoietic cells available, for which genotyping was performed at, rsT606173 rsl427407 5 57569946 to distinguish individuals heterozygous Lill al-Qazdani rs1427407-rsT606173 So 157569946 three donors were identified. (asl bill) revealed that the ©57569946 allele “was on the same chromosome as the ©G allele 51427407 and the ©157606173 allele in each. Hematopoietic stem/progenitor cells were subjected to erythroid-like differentiation colony Genomic DNA and RNA were isolated, and cDNA was produced by reverse transcription. Displays the mean HDF for haplotypes 151427407-57606173 in the lS statistic selection.
CSSCD ٠ متوسط مستوى HbF 74,05 )3.10 50) في YAY فرد rsl427407- 6-6 7606173ي ,11018 )4.50 50) في rs1427407-rs7606173 T-G/G-T Yet متغايرة الزيجوت, و711,71 )4.37 (SD في 60 فرد 7-6 rsl427407-rsT606173 . نتاظر قيم © اختبارات 1 student مفردة النتجة. تكون تكرارات النوع الفرداني في CSSCD هي: TG : TC , صما GC اا 66 ٠١ Vo الأشكال ؛أ-؛ z توضح بيانات من شظية ؛,"١-كيلو بايت من 8011178 إنترون-؟ تضم 01155 +57 +/ه 0045 (تضم +0 £-0Y, ,14 كيلو بايت من (TSS المستتسخ قبل 15068 أدنى معزز وجين مبلغ 862 محاط بعناصر عازل 119 . ولدت الأجنة الفأرية المحورة Lis العابرة بواسطة حقن نووي عند مرحلة الخلية الواحدة. الشكل رقم it يعرض جنين متحور Wis عابر E12.5 مبقع ب X-gal ٠ الشكل رقم ؛ب يعرض معلقات WIA معزولة من الدم المحيطي وكبد جنيني من أجنة محورة Lis ثابتة 12.5 . تم Cytospins adi ب X-gal وتم التبقيع المضاد لها باستخدام Nuclear Red الشكل رقم ؛ ج يعرض بيانات من الأرومات الحمراء لنخاع العظم (19 (+CDT71+/Terl والخلايا اللمفاوية الطحالية (19 000+ ل 8-الخلايا اللمفاوية 5 +CD3 ل1-الخلايا اللمفاوية) التي تم عزلها وفرزها من محورات وراثياً ثابتة من صغار بالغين. تم إخضاع الخلايا إلى تبقيع X-gal أو dye CARCSSCD 0 Mean HbF Level 74.05 (3.10 50) in YAY individual rsl427407-6-6 7606173y,11018 (4.50 50) in rs1427407-rs7606173 T-G/G-T Yet heterozygous, 711, 71 (4.37 (SD) in 60 individuals 7-6 rsl427407-rsT606173. Symmetric values for © 1 single-student tests. Haplotype frequencies in CSSCD are: TG : TC , deaf GC AA 66 01 Vo fig. a- z showing data from the 1-KB fragment of 8011178 intron-? comprising 01155 +57 +/e 0045 (comprising +0 £- 0Y, 14 kb of TSS transcribed prior to 15068 minimal promoter and sum gene 862 surrounded by 119 insulator elements. Transient Lis-modified mouse embryos were born by nuclear injection at the one-cell stage. Figure 1 showing a mutant embryo Wis transient E12.5 stained with X-gal 0 Fig. b shows WIA suspensions isolated from peripheral blood and fetal liver from fixed Lis 12.5 transgenic embryos. Figure C shows data from bone marrow erythroblasts (CDT71+/Terl 19+) and splenic lymphocytes (19 000+ L8-cells). Lymphocyte 5+CD3L1-lymphocytes) that were isolated and sorted from fixed transgenic transgenics from young adults. Cells were subjected to X-gal staining or CAR dye
ل \ — RNA تلاه .RT-qPCR تمت معايرة التعبير الجيني طبقاً ل 5/0011 , وتم إظهاره بالنسبة إلى 1-الخلايا اللمفاوية, التي لا تعبر عن أي من BCL11A ولا 862ا1. الأشكال zo-lo توضح خلايا ابيضاض الدّم الاحْمِرَاريٌ mouse erythroleukemia Lally (MEL) والخلايا اللمفاوية المؤازرة ل B= المنقول إليها العدوى بزوجين من TALENS كل منها © مصمم لتوليد 058 على إما نهاية متشابهة عند الموضع أورثو ٠١ كيلو بايت 801117 محسن إنترون-7 شبيهة بالكريات الحمراء من +10,44-55,4 كيلو بايت. تم عزل النسائل (التي يُطلق عليها (AS50.4-60.4 باستخدام حذف al الأليل لقسم ٠١ كيلو بايت. الشكل رقم fo يعرض 1-0068 منفذ من Bell la مع أزواج بادئة تتعرف على متواليات قبل, تمتد, وبعد ARTS Ve الشكل رقم دب يعرض لطخة مناعية من 850.4-60.4 مع مضاد ل BCL 11 A الشكل رقم ٠ج يعرض جلوبين التعبير الجيني في نسائل AS50.4-60.4 MEL . يتعرف زوج بادئ مشترك على جلوبينات oP بالغين P2 وأم, في حين تتعرف بادئات مستقلة على جلوبينات oP PHI sy الجنينية. الشكل رقم 7 يعرض dalla ثّواة الزيجوت من الفأر المحقونة ببنية مبلغ 1862 . تم عزل أجنة محورة Lily, ١5 عند 512.5. تم تتميط ظاهري للأجنة بواسطة PCR 1862. تم إظهار جزء من أجنة محورة وراتياً fraction of transgenic embryos بالتبقيع ب X-gal لكبد fetal liver aus . الشكل رقم ١ يعرض من واحدة إلى شظيتي متوالية كيلو بايت مستنسخة في بنية محسن TKS لأدنى معزز .GFP تم نقل بنيات مبلغ محسن بواسطة ناقلات تعبير فيروسة عدسية إلى المواد المنتجة للكريات الحُمر البشرية الرئيسية. تم انتقاء الخلايا المصابة بالعدوى بواسطة مقاومة بوروميسين. تم ٠ قياس متوسط شدة التألق الفلوري GFP الشكل رقم A يعرض البيانات التي Blan بتحديد خواص الكروماتين للفأر لخلايا شبيهة بالكريات الحمراء تكشف بصمة محسن متشابهة عند الموضع أورثو عند 18 Bell إنترون-". مسحات الفأر التي تم الحصول عليها من تحديد خواص كروماتين كلي تم نشره من قبل من HU شبيه بالكريات الحمراء , بتعديلات هستون وانشطار DNase-| من و GATAL ومن 0010-5680 TALI .l \ — RNA followed by RT-qPCR. Gene expression was assayed according to 5/0011, and shown for 1-lymphocytes, which express neither BCL11A nor 862a1. Figures zo-lo showing mouse erythroleukemia Lally (MEL) cells and B= allergen lymphocytes transfected with two pairs of TALENS each designed to generate 058 on either end at the ortho site 01 kb 801117 enhancer intron-7 erythroid-like from +10.44-55.4 kb. Clones (termed AS50.4-60.4) were isolated using a deletion of the β allele of a 01 kb section. Fig. fo shows 1-0068 ports of Bell la with primer pairs recognizing pre-sequences , stretching, and after ARTS Ve Fig. No. Bear displays an immunoblot of 850.4-60.4 with anti-BCL 11 A. Fig. No. 0c shows globin gene expression in AS50.4-60.4 MEL clones. The oP globulins of adults P2 and mother are shared, while independent primers recognize fetal PHI sy oP globulins. , 15 at 512.5.The embryos were phenotypically smeared by PCR 1862. A fraction of transgenic embryos was shown by X-gal staining of fetal liver aus. One to two kb sequence fragments cloned into a TKS enhancer construct of a minimal .GFP enhancer The enhancer sum constructs were transfected with lentiviral expression vectors into primary human erythropoietic subjects Selection of infected cells with puromycin resistance. s YAS Mean Intensity GFP Fluorescence Intensity Figure A presents Blan data by characterizing mouse chromatin properties of erythrocyte-like cells revealing a similar enhancer signature at the locus ortho-18 at Bell-intron. Mouse smears obtained from a previously published total chromatin characterization of HU-like erythrocytes, with histone modifications and DNase-γ cleavage from GATAL and from TALI 0010-5680.
م \ — المستطيل المنقط يربط بصمة محسن متشابهة عند الموضع أورثو تحدد عنصر 50.4-60.4م مستهدف لحذف يتوسط فيه لاطا 1. الشكل رقم 19 Jag مخطط من استراتيجية هندسة جينوم يتوسط فيها 1/81-1مستخدمة في الطلب الحالي. تمثل 181115 إنزيمات نيوكلياز محددة بالمتوالية. تمت معالجة زوجين من TALENS © بالهندسة الوراثية لتوليد فواصل جديلة مزدوجة, إحداها على 50.4+ Bell la والأخرى عند Set تم عزل النسائل التي قومت اثنين من DSBS بواسطة NFFEJ باستتصال القسم المتداخل ٠١ كيلو بايت. تم فحص النسائل بواسطة PCR بالبادئات ©', "', وحذف 46-٠١ الداخلي والممتد. الشكل رقم 8 يعرض لطخة سوذرن لحمض DNA جينومي مهتضم ب 1110011١ من نسائل -50.4م 4 مما أكد أن هذه النسائل قد توقعت أليل الاستئصال وافتقرت إلى الأليل غير المستأصل. ٠ الشكل رقم ٠١ يعرض عمل متواليات Sanger لنواتج PCR من نسائل 50.4-60.4. يتم توضيح متواليات "V5 (00,64) To (+10,4) يسرى ويمنى للتعرف على TALEN مع مباعدات تدخل. أظهرت بعض الآلائل دليل على الارتباط عند الطرف مباشرةً من كل متوالية مباعدة مهتضمة بينما أظهرت الآلائل الأخرى فقد مئات من النيوكليوتيدات الإضافية. تم عزل أليل واحد فقط لكل من نسيلة ١# MEL وطليعة نسيلة #2 P V0 الشكل ١١ يعرض بيانات النمط الجيني التي تم الحصول عليها في ١78 ,١ فرد من 055600 ل YA صورة مغايرة داخل 861118 +17, +8/ه أو +5 .DHSs تتسق معظم الارتباطات ذات الدلالة بدرجة أعلى مستوى 0]7ا7 بين (1 > SNPs (MAF (ع = (V+ قبل (rs1427407) أو بعد (rs7606173) التحليل الشرطي SNP .00551427407 للكرموسوم ؟, buildingl9 الشكل ١١أ يعرض بيانات النمط الجيني التي تم الحصول lee في ١78 ,١ فرد من 05500 ل YA Yo صورة مغايرة داخل 861118 +17, oA+ أو +5 .DHSs تتسق معظم الارتباطات ذات الدلالة بدرجة أعلى مستوى 0]7ا7 بين (1 > SNPs (MAF (ع = (V+ قبل (rs1427407) أوm \ — dotted rectangle connecting a similar enhancer fingerprint at the ortho locus identifies a 50.4-60.4 m element targeted for a Lat1-mediated deletion. Fig. 19 Jag. Schematic of the 1/81-1-mediated genome engineering strategy used in the present submission. They represent 181,115 sequence-specific nuclease enzymes. Two pairs of TALENS© were genetically engineered to generate double strand breaks, one at 50.4+ Bell la and the other at Set. Progeny with two DSBSs were isolated by NFFEJ calling cross section 01. kilobytes. The clones were examined by PCR with the prefixes '©', '', and the 46-01 internal and extended deletions. Figure 8 shows a Southern blot of genomic DNA digested with 11100111 from clones -50.4m4, which confirmed that these clones had predicted the excision allele and lacked the non-extracting allele. 0 Figure 01 presents Sanger sequencing work of PCR products from clones 50.4–60.4. The sequences “V5 (00,64) To (+10) are shown , 4) left and right to identify TALEN with interfering spacers. Some alleles showed evidence of binding directly at the tip of each digested divergent sequence, while other alleles showed the loss of hundreds of additional nucleotides. Only one allele was isolated for each of clone #1 MEL and proclone #2 P V0 Figure 11 presents genotype data obtained in 1,178 individuals from 055600 for YA as a contrast Within 861118 +17, +8/e or +5 .DHSs the most significant associations are consistent with a higher degree of [0]7a7 level between SNPs (MAF) > 1 (p = (V+) before (rs1427407) or After (rs7606173) conditional analysis of SNP .00551427407 for chromosome ?, buildingl9 Fig. 11a presents genotype data obtained for lee in 1,178 individuals from 05500 for YA Yo as an intravariant. 861118 +17, oA+ or +5 DHSs. Most significant associations are consistent with the highest degree of [0]7 [0] between SNPs (MAF) (p = (V+) > 1) before (rs1427407) or
بعد (rs7606173) التحليل الشرطي SNP .00551427407 للكرموسوم ؟, buildingl9 الشكل ١١ب يحلل ارتباط 107 عند /806111. يعرض بيانات النمط الجيني التي تم الحصول عليها ١78 ,١ فرد من 65560 ل YA صورة مغايرة داخل 861118 +17, of oA+ +00After (rs7606173) conditional analysis of SNP .00551427407 for chromosome ?, buildingl9 Fig. 11b analyzes linkage of 107 at /806111. Genotype data obtained on 1,178 individuals from 65560 YA displays a variant within 861118 +17, of oA+ +00
.DHSs vo.DHSs vo
ه١E1
q —_ \ _ تكون SNPs الحارسة هي تلك التي لها أعلى ارتباط بمستوى HOF أو عدد خلية GWAS iF القبلي L(V Y-V) يتم توضيح SNPS هذه بالنسبة إلى BCLIIA إنترون-؟ مع بيان ¥ 01155 +17, +/ه 4 +00 . الوصف التفصيلى: © تتعلق الطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي, جزثياً, باكتشاف منطقة تنظيمية بعيدة قبل جين 118 ا80 يمكن أن ينظم التعبير عن بروتين 8011178 . يؤتر بروتين 8011178 في صورة منظم محدد بالمرحلة للتعبير عن الهيموجلوبين الجنيني بواسطة إخماد حث جلوبين-لا. وعلى هذا النتحو, تكون الطرق والتركيبات المقدمة في الطلب الحالي طرق جديدة لتتظيم التعيير عن جلوبين-لا في خلايا شبيهة بالكريات الحمر. بمزيد من التحديد, يمكن اقتران هذه الأنشطة في طرق لعلاج م - ٠ اعتلال الهيموجلوبين بواسطة حث جلوبين-لا عن طريق تثبيط منتج جين BCLIIA في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم طريقة لإنتاج خلية أولية معزولة تتسم بتعبير منخفض عن BCL1IIA mRNA أو البروتين, تشتمل الطريقة على تلامس خلية أولية معزولة بعامل يربط DNA (mea الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع IY ,7748 Tem A TT (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري), وبناءً عليه خفض التعبير عن BCL1 1A ١ 5 أو بروتين MRNA . في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم طريقة لإنتاج خلية أولية معزولة تتسم بتعبير منخفض عن mRNA 801118 أو البروتين, تشتمل الطريقة على توفير خلية أولية معزولة وتلامس الخلية الأولية المعزولة مع عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع IVT, كص ات رغلا TYY (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري), Yo وبناءً عليه خفض التعبير عن BCL1 1A أو بروتين MRNA . في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم طريقة لإنتاج خلية أولية معزولة تتسم بتعبير منخفض عن mRNA 801118 أو البروتين, تشتمل الطريقة على تلامس خلية أولية معزولة بعامل يرتبط ليحدث تعديل لا جيني في حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ وبناءً عليه خفض التعبير عن /80111 أو بروتين MRNA . في أحد النماذج, يكون التعديل اللا جيني في حمض CARq —_ \_ The sentinel SNPs are those with the highest association with the HOF level or pre-GWAS iF cell number L(V Y-V) These SNPS are illustrated for BCLIIA intron- ? With the statement 01155 yen +17, + / e 4 +00 . Detailed Description: © The methods and constructs described in the present submission relate, in part, to the discovery of a distal regulatory region prior to the 118a80 gene that could regulate the expression of the 8011178 protein. The 8011178 protein acts as a stage-specific regulator of fetal hemoglobin expression by suppressing La-globin induction. In this way, the methods and structures presented in the present application are novel methods for regulating expression of globin-LA in erythroid-like cells. More specifically, these activities could be combined into methods for treating M-0 hemoglobinopathy by inducing no-globin by inhibiting the BCLIIA gene product. In one embodiment, a method for producing an isolated progenitor cell with low expression of BCL1IIA mRNA or protein, the method involves contacting an isolated primary cell with a DNA-binding agent (the cell's genomic mea on chromosome ?Location IY, 7748 Tem A TT (according to 19 UCSC Genome Browser hg Human Genome Collection), and accordingly reduced expression of BCL1 1A 1 5 or a protein mRNA In one embodiment, in the present application, a method for producing isolated progenitor cell with low expression of mRNA 801118 or protein is presented, the method includes provision of isolated progenitor cell and contact The primary cell isolated with a factor that binds the cell's genomic DNA to the chromosome ?IVT site, as tyy (according to 19 UCSC Genome Browser hg Human Genome Collection), Yo and accordingly reduced the expression of BCL1 1A or mRNA protein In one embodiment, in the present submission a method for producing primary cell isolates with low expression of mRNA 80 is presented. 1118 or protein, the method involves contacting an isolated primary cell with a binding agent to cause an epigenetic modification of the cell's genomic DNA on the chromosome? Accordingly, reduced expression of /80111 or mRNA protein. In one embodiment, the epigenetic modification is in the CAR
١١11
UCSC (طبقاً ل 1١7 ,778 Tem A IT Te الجينومي عند الكرموسوم ؟ الموقع DNA .(human genome بشري asin مجموعة Genome Browser hg 19 في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم طريقة لإنتاج خلية أولية معزولة تتسم بتعبير منخفض أو البروتين, تشتمل الطريقة على توفير خلية أولية معزولة وتلامس الخلية 801118 mRNA عن الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ DNA الأولية المعزولة مع عامل ينتج تعديل لا جيني في حمض © في أحد النماذج, يكون التعديل . MRNA أو بروتين BCLIIA وبناءً عليه خفض التعبير عنUCSC (according to 117,778 Tem A IT Te genomic at chromosome? loci DNA human genome asin Genome Browser set hg 19 In one embodiment, a method for producing a progenitor cell is presented in the present application isolates characterized by low expression or protein, the method includes provision of an isolated primary cell and cell contacts of 801118 mRNA from the genomic cell of the cell on chromosome? The isolated primary DNA with an agent that produces an epigenetic modification in the © acid in one embodiment, The modification is .mRNA or BCLIIA protein and accordingly reduced expression of .mRNA
TAY خالا Tem A YT Te للكرمروسوم ١ الجينومي عند موقع DNA اللاجيني في حمض مجموعة جينوم بشري). UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل الكشف الموصوف في الطلب الحالي, في نموذج مفضل, لا يتعلق بعملية لاستتساخ كائنات بشرية, عمليات لتعديل الهوية الجينية للسلالة الجرثومية للكائنات البشرية, واستخدامات الأجنة البشرية ٠ لأغراض صناحية أو تجارية أو عمليات لتعديل الهوية الوراثية للحيوانات التي يحتمل أن تجعلها تعاني دون أي فائدة أساسية طبية للإنسان أو الحيوان, وأيضاً الكائنات الناتجة من مثل هذه العمليات. أحد جوانب الموصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لإنتاج خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل تشتمل على تلامس الخلية مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز DNA على إندونيوكلياز يستهدف حمض ٠TAY Tem A YT Te cell of chromosome 1 genomics at the epigenetic DNA site in the DNA of a human genome assembly). UCSC Genome Browser hg 19 (according to the disclosure described in the present application, in a preferred embodiment , is not related to the cloning of human beings, operations to modify the genetic identity of the germline of human beings, uses of human embryos 0 for industrial or commercial purposes or operations to modify the genetic identity of animals that are likely to make them suffer without any essential medical benefit to humans or animals , as well as the organisms resulting from such processes. One aspect described in the present application relates to a method for producing an isolated genetically engineered human cell characterized by at least one genetic modification involving cell contact with an effective amount of at least one combination or expression vector It carries the coding sequence of a DNA endonuclease on an endonuclease targeting acid 0
DNA ويشطر حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA يستهدف حمضDNA and cleaves DNA, by means of which the endonuclease targets DNA.
UCSC (طبقاً ل 11 ,778 ,10-184 ,7136 Te الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. Genome Browser hg 9 يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية أو التعبير عن البروتين في الخلية. في 801118 MRNA معزولة, تشتمل الطريقة على تخفيض Yo أو البروتين بواسطة ويتسبب في 801118 MRNA أحد الجوانب, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن , ٠١ الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع DNA تعديل جيني واحد على الأقل عند حمض مجموعة جينوم UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل TYY لماص اتمبغالا, LY أو البروتين بواسطة 801118 MRNA بشري). في جانب آخر, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن ١ الجينومي للخلية على الكرموسوم DNA ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل عند حمض YO yy يترتب عليه تعديل لا جيني للوظيفة الجينية عند 117 ,778 ,10-184 VT ,10 الموقع في هذا الجانب, يتم تخفيض نشاط محسن .117 ,774 Tem A YY الكرموسوم ؟ الموقع بواسطة IY LYYA 1-184 VY Te 7 الموجود داخل موقع هذا الكرموسوم 861118 أو التعبير عن 801118 MRNA التخفيض في هذا الجانب, تكون فعالية المحسن في تحسين أقل, على الأقل 770 أقل, 77١0 أقل, على الأقل 7٠١ البروتين في الخلية أقل بنسبة 75 على الأقل أقل, على الأقل .75 أقل, على الأقل 7760 أقل, على الأقل 79760 أقل, على الأقل Zee على الأقل أقل, على الأقل 790 أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ٠ فعض-٠٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠١ أقل, على الأقل فعض-٠ أقل, أو أكثر مقارنة بخلية مقارنة لم تتم معالجتها في أية طريقة تم الكشف عنها في الطلب الحالي. أو التعبير عن البروتين في الخلية أن التعبير عن البروتين 801118 MRNA المقصود بتخفيض ٠ أقل, على الأقل 7780 أقل, 77١8 أقل, على الأقل 7٠١ على الأقل على الأقل Te يكون أقل بنسبة أقل, على الأقل .75 أقل, على الأقل 7760 أقل, على الأقل 79760 أقل, على الأقل 74٠0 على الأقل أقل, على الأقل 790 أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ٠ فعض-٠٠٠١ JY) ضعف أقل, على ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠١ أقل, على الأقل ano في الطلب الحالي. lee أقل, أو أكثر مقارنة بخلية مقارنة لم تتم معالجتها في أية طريقة تم الكشف ١٠ يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية 8061118 MRNA معزولة, تشتمل الطريقة على توفير خلية بشرية أو خلية أولية معزولة وتخفيض عن البروتين في الخلية. uel) أو يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية, تشتمل الطريقة على خطوات: _تلامس خلية بشرية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على Yo أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز DNA الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمضUCSC (according to Te 7136, 10-184, 10,778 11 The genome of the cell on the chromosome? locus human genome set) and causes at least one genetic modification in it. Genome Browser hg 9 Another aspect presented in The current demand is for a way to increase fetal hemoglobin levels in a cell or protein expression in a cell. In 801118 mRNA isolates, the method involves reduction of Yo or protein by and induced by 801118 mRNA. At least one DNA locus at UCSC Genome Browser hg 19 DNA loci (according to TYY of Atamegala, LY or protein by 801118 human mRNA). On the other hand, the reduction of the expression of the genomic 1 of the cell is achieved on the DNA chromosome and causes at least one genetic modification at the YO yy acid resulting in an epigenetic modification of the genetic function at 10-184, 10-184, 778, 117 VT , 10 site In this aspect, enhancer activity is reduced. 117,774 Tem A YY chromosome? Location by IY LYYA 1-184 VY Te 7 located within the location of this chromosome 861118 or expression of 801118 mRNA reduction in this aspect, the effectiveness of the enhancer in improving less, at least 770 less, 7710 Less, at least 701 Protein in the cell is at least 75 less Less, at least .75 Less, at least 7760 Less, at least 79760 Less, at least Zee Less, at least 790 less, at least 1-fold less, at least 1-fold less, at least 0 some-0001 times less, at least 001 times less, at least 01 less, at least some-0 Less, or more, compared to a comparison cell that was not processed in any way disclosed in the present application. Or protein expression in the cell Protein expression 801118 mRNA mean reduction 0 Less, at least 7780 Less, 7718 Less, at least 701 at least Te is less than, at least .75 less, at least 7760 less, at least 79760 less, at least 7400 less, at least least 790 less, at least 1-fold less, at least 1-fold less, at least 0 some-0001 JY) twice less, at 001 z Less, at least 01 less, at least ano in the current application. lee less, or more compared to a comparison cell not processed in any way disclosed 10 Another aspect introduced in the current application relates to a way to increase Fetal Hemoglobin Levels in an Isolated 8061118 mRNA Cell The method includes provision of a human cell or primary cell isolate and reduction of the protein in the cell. cell, The method includes steps: _Contact an isolated human cell with an effective amount of a formulation comprising Yo or an expression vector carrying the coding sequence of a DNA-less endonuclease on an acid-targeted endonuclease
DNA يشطر حمض DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض (Ally DNA يستهدف حمض 0656 (طبقاً ل 11 ,778 ,10-184 VT ,60 جينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, Genome Browser hg 9 والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الخلية, أو سليفتها, بالنسبة إلى الخلية قبل YO التلامس. CARDNA cleaves DNA by means of which the Ally DNA targets acid endonuclease 0656 (according to 11,778,10-184,VT 60,11 genomes of a cell on chromosome ?location is a human genome set) and causes At least one genetic modification in it, Genome Browser hg 9, by which the expression of fetal hemoglobin in the cell, or its progenitor, is increased relative to the pre-contact YO cell.
و يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية, تشتمل الطريقة على خطوات توفير خلية بشرية أو خلية أولية معزولة, تلامس خلية بشرية أو خلية أولية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض 0108 أو ناقل تعبير Jang متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف © إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع ٠١ , LY لماص اتمبغالا, TYY (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الخلية, أو سليفتها, بالنسبة إلى الخلية قبل التلامس. جانب آخر موصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي ٠ في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على تخفيض mRNA 8011/8 أو التعبير عن البروتين في خلية أولية لتكوين الدم في الثتديي. في أحد الجوانب, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن MRNA 861118 أو البروتين بواسطة ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع 66 VTA, T= AG VAT 117 (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 9 مجموعة جينوم بشري). في جانب آخر, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن BCLIIA mRNA ١ أو البروتين بواسطة ويتسبب في تعديل لا جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟. في جانب آخر, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن mRNA 861118 أو البروتين بواسطة ويتسبب في تعديل لا جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم > الموقع TAS YY TT خالا 117 جانب آخر موصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي ٠ في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على توفير خلية بشرية أو خلية أولية معزولة من ثديي وتخفيض mRNA 801118 أو التعبير عن البروتين في الخلية. في أحد الجوانب, تشتمل الطريقة Lad على انتقاء ثديي في حاجة إلى زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني فيه. جانب آخر موصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات تلامس خلية أولية لتكوين الدم في (til) مع كمية فعالة YO من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA CARAnother aspect presented in the present application relates to a method for increasing fetal hemoglobin levels in a cell. The method includes the steps of providing a human cell or progenitor cell isolate, contacting a human cell or progenitor cell isolate with an effective amount of a formulation comprising at least an endonuclease targeting acid 0108 or A vector expressing Jang the coding sequence of a DNA-targeting endonuclease by which the endonuclease © targets DNA and cleave the cell's genomic DNA on the chromosome? Locus 01, LY of the Ampegala receptacle, TYY (according to 19 UCSC Genome Browser hg human genome set) and causes at least one genetic modification therein, by which it increases the expression of fetal hemoglobin in the cell, or its progenitor, relative to the cell before contact. Another aspect described in the present submission relates to a method for increasing fetal hemoglobin levels in mammals 0 in need of it, the method involving reduction of mRNA 8011/8 or protein expression in a mammalian hematopoietic progenitor cell. In one aspect, reduction of expression of mRNA 861118 or protein is achieved by and causes at least one genetic modification at the cell's genomic DNA on the chromosome? Locus 66 VTA, T= AG VAT 117 (according to UCSC Genome Browser hg 9 human genome set). On the other hand, reduction of expression of BCLIIA mRNA 1 or protein is achieved by and causes at least one epigenetic modification at the cell's genomic DNA on chromosome ?. In another aspect, the reduction of expression of mRNA 861118 or protein is achieved by and causes at least one epigenetic modification at the cell's genomic DNA on chromosome > TAS YY TT site XLA 117. Another aspect described in the present application relates to the method To increase levels of fetal hemoglobin in mammals 0 in need of it, the method involves feeding a human cell or a mammalian progenitor cell and reducing mRNA 801118 or protein expression in the cell. In one aspect, the Lad method involves selecting two mammals in need of increased fetal hemoglobin levels. Another aspect described in the present submission relates to a method for increasing fetal hemoglobin levels in two mammals in need of it, the method includes hematopoietic proto-cell contact steps in (til) with an effective amount YO of a formulation comprising at least one DNA-targeting endonuclease Or an expression vector carrying the coding sequence of a DNA-targeting endonuclease with which the endonuclease targets a DNA-targeting CAR
Ad — \ — ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ المروقع 0, YA TIAL YT 17 (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. © جانب AT موصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلويين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير خلية بشرية معزولة أو خلية أولية أو مجموعة معزولة LDA أولية لتكوين pall من ثديي تلامس the الخلية البشرية أو خلية أولية أو خلية أولية لتكوين pal مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف ٠ إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع ٠١ , LY لماص اتمبغالا, TYY (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في ail) المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي Vo في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على زرع خلية بشرية مهندسة وراثياً وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في التديي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تشتمل الطريقة أيضاً على توفير خلية معزولة أو خلية أولية معزولة أو مجموعة معزولة من الخلايا التي يمكن أن تكون خلية أولية أو خلية أولية لتكوين الدم .hematopoietic progenitor cell ٠ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تكون الخلية المعزولة خلية أولية معزولة .isolated progenitor cell في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تكون الخلية الأولية المعزولة خلية بشرية معزولة .isolated human cell في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية البشرية YO المعزولة تكون خلية أولية لتكوين الدم.Ad — \ — and cleaves the cell's genomic DNA on the chromosome? locus 0, YA TIAL YT 17 (according to 19 UCSC Genome Browser hg human genome set) and causes at least one genetic modification in it, by which expression of fetal hemoglobin in mammals is increased, relative to precontact expression. © Aspect AT described in the present application relates to a method for increasing fetal hemoglobin levels in mammals in need of it, the method includes the steps of providing an isolated human cell, progenitor cell, or primary LDA isolate group to form a pall of the cell-contact mammals human, progenitor cell or pal-forming progenitor cell with an effective amount of combination comprising at least a DNA-targeting endonuclease or an expression vector carrying the coding sequence of a DNA-targeting endonuclease with which 0 endonuclease targets DNA The genomic DNA of the cell is bisected on the chromosome. Locus 01, LY of the Atambagala sucker, TYY (according to 19 UCSC Genome Browser hg human genome set) and causes at least one genetic modification therein, by which expression of fetal hemoglobin is increased in ail) mentioned , with respect to the expression before contact. Another aspect presented in the present application relates to a method for increasing fetal hemoglobin levels in two breasts of Vo in need of it, the method involving transplantation of a genetically engineered human cell as described in the present application in the submission. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the method also includes provision of an isolated cell, an isolated progenitor cell, or an isolated group of cells which may be a progenitor cell or a hematopoietic progenitor cell. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, an isolated progenitor cell is an isolated progenitor cell .isolated progenitor cell In an embodiment of this and all other aspects described in the present application, an isolated progenitor cell is an isolated human cell .isolated human cell In one embodiment of this and all others described in the present application, the isolated human YO cell is a progenitor hematopoietic cell.
_ \ ¢ —_ في نموذج AT من هذا الجانب وجميع الجوانب (AY) الموصوف في الطلب الحالي, تكون الخلية المكونة للدم عبارة عن خلية لسلالة إريثرويد. تعرف طرق Je خلية أولية لتكوين الدم جيداً في المجال, على سبيل المثال, بواسطة تتقية قياس التدفق الخلوي لخلايا +CD34 أو 00133+ , الخرزات الدقيقة المترافقة مع الأجسام المضادة ضد CD34 أو 133 ,CD مرقمات خلية أولية لتكوين © الدم. تتوفر كذلك الأطقم التجارية, على سبيل المثال, MACS® Technology CD34_ \ ¢ —_ In the AT model of this and all sides (AY) described in the present application, the hematopoietic cell is a cell of the erythroid race. Je primary cell hematopoiesis methods are well known in the art, eg, by flow cytometry purification of CD34+ or 00133+ cells, microbeads conjugated with antibodies against CD34 or CD133, primary cell markers. Composition © blood. Commercial kits are also available, for example, MACS® Technology CD34
STEMCELL™ Technology البشرية, و , 21034 MultiSort Kit البشرية, و ,MicroBead Kit . 501100009801 Kit خلية أولية لتكوين الدم EasySep™ Mouse في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, الخلية البشرية تكون خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات .induced pluripotent stem cell (IPSC) ٠ في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يمكن أن يكون تلامس أية خلية موصوف في الطلب الحالي خارج الجسم الحي أو في المعمل أو في الكائن الحي. أية خلية موصوف في الطلب الحالي يشتمل على تلامس بعامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم Yo ويحدث تعديل لا جيني في الجينوم للخلية على الكرموسوم , وبناءً عليه خفض Vo التعبير عن 806111 أو بروتين MRNA . في أحد النماذج, يكون التعديل اللا جيني على الكرموسوم 7 الموقع ,خالا TYY LVYALT— YA (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 9 مجموعة جينوم بشري). في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ١ على نحو غير مباشر أو .١ للكرموسوم 1١7 ,748 STA YT Te مباشرةٌ يؤثر على الموقع Ye ,1 0-1894 YT Te وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, 'يؤثر على نحو غير مباشر على الموقعSTEMCELL™ Technology Human, 21034 Human MultiSort Kit, and MicroBead Kit . 501100009801 Kit Hematopoietic Progenitor Cell EasySep™ Mouse In another embodiment of this and all other aspects described in the present application, the human cell is an induced pluripotent stem cell (IPSC) 0 in another embodiment of This and all other aspects described in the present application, any cell contact described in the present application can be ex vivo, in vitro, or in vivo. Any cell described herein has contact with a factor that binds the cell's genomic DNA on the Y chromosome and an epigenetic modification occurs in the genome of the cell on the Y chromosome, accordingly Vo reduced the expression of 806111 or the mRNA protein. In one embodiment, the epigenetic modification on chromosome 7 locus TYY LVYALT- YA (according to UCSC Genome Browser hg 9 Human Genome Collection). In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, at least one epigenetic modification in the genomic DNA of a cell on chromosome 1 indirectly or .1 of chromosome 117,748 STA YT Te Directly Affects Location Ye ,1 0-1894 YT Te According to its use in the current application, 'Indirectly Affects Location'
DNA للكرموسوم 7" يشير إلى تأثيرات المسافة الطويلة على تعديل لا جيني في حمض 117 ,774 للكرموسوم ا TYY الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع دا خالا تغناص ا بكار في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تلامس أية Yo خلية موصوف في الطلب الحالي يشتمل على تلامس بعامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية CAR"DNA of chromosome 7" refers to the effects of long distance on an epigenetic modification of 117,774 TYY DNA of a cell's genomic TYY on the chromosome of this locus during virginal chromatosis in a further embodiment of this aspect and all other aspects described in the application. The current, any Yo cell contact described in the present application includes contact with an agent that binds the cell's genomic DNA CAR
اج \ _ على الكرموسوم ؟ الموقع VAT, 0-184 1, 72748, 117 (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 9 مجموعة جينوم بشري), ويحدث تعديل لا جيني على الكرموسوم ,١ وبناءً عليه في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تلامس أية © خلية موصوف في الطلب الحالي يشتمل على تلامس مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو BU تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA All بواسطتها the إنزيم يستهدف حمض DNA يحدث تعديل لا جيني على الكرموسوم ,١ وبناءً في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تلامس أية ٠ خلية موصوف في الطلب الحالي يشتمل على تلامس مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو BU تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها the إنزيم يستهدف حمض DNA يحدث تعديل لا جيني على الكرموسوم ؟ الموقع مال تاللا كخناص اتمبغالا, TYY (طبقاً UCSC Genome Browser hg 19 J مجموعة جينوم بشري) وبناءً عليه خفض التعبير عن BCLIIA أو بروتين MRNA . في أحد الجوانب, يزيد VO التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم, الخلية البشرية المعزولة, أو خلية معزولة خارج الجسم الحي أو في المعمل في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون التعديل Yo الجيني الواحد على الأقل حذف. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني واحد على الأقل. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 ,0A+ ,17+ (DHS) DNAse ,+00 وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب YO الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو أكثر من المواقع مفرطة CARA / _ on the chromosome? Location VAT, 0-184 1, 72748, 117 (according to UCSC Genome Browser hg 9 human genome set), epigenetic modification occurs on chromosome 1, and accordingly in another model of this and all aspects Other than that described in the present application, the contact of any © cell described herein includes contact with an effective amount of a composition comprising at least a DNA-targeting enzyme or a BU expression carrying the coding sequence for an enzyme that targets DNA-All by which the enzyme that targets DNA causing an epigenetic modification on chromosome 1, and accordingly in another embodiment of this and all other aspects described in the present application, contact with any 0 cell described in the present application involves contact with an effective quantity Which combination includes at least one DNA-targeting enzyme or a BU expression carrying the coding sequence for a DNA-targeting enzyme by which the DNA-targeting enzyme occurs epigenetic modification on a chromosome? The Maltalla locus of Impegalla, TYY (according to UCSC Genome Browser hg 19 J human genome set) and accordingly reduced expression of BCLIIA or mRNA protein. In one aspect, VO increases expression of fetal hemoglobin in the mammal, relative to precontact expression. In another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present application, the original cell is brought into contact to form blood, the isolated human cell, or a cell isolated ex vivo or in vitro In another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present application, the modification is Yo has at least one gene deleted. In another embodiment of this and all other aspects described in the present submission, at least one epigenetic modification is present. In further embodiment of this and all other aspects described in the present application, the deletion includes one or more sites hypersensitive to 1,0A+,17+ (DHS) DNAse ,+00 as described in the present application in the Examples section. In another embodiment of this and all other YO aspects described in the present application, the deletion consists primarily of one or more CAR hyperlocal sites
Cyne وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم 0045 ,0A+ ,17+ (DHS) DNAse 1 الحساسية لCyne as described in the present order in section 17+, 0A+, 0045 (DHS) DNAse 1 sensitivity to
DNAse 1 الأمثلة. في نموذج آخر, يتكون الحذف من واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة. 00+, 0A+ ,17+ (DHS) في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا hypersensitive sites جيني يشتمل على أو يؤثر على واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية © وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة. وفقاً 0045 ,0A+ ,17+ (DHS) DNAse 1 ل لاستخدامه في الطلب الحالي, العبارة 'يؤثر على واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية لDNAse 1 examples. In another embodiment, the deletion consists of one or more sites hypersensitive to, as described in the present application in the Examples section. The present, hypersensitive sites genetic modification includes or affects one or more © hypersensitive sites as described in the present application in the Examples section. In accordance with 0045 0A+ ,17+ (DHS) DNAse 1 for use in the present application, the phrase 'affects one or more sites hypersensitive to
DNAse 1 يعني أنه يتم تخفيض الوظيفة الطبيعية لهذه المواقع مفرطة الحساسية ل "DNAse 1 على سبيل المثال, الوصول إلى عوامل الانتساخ أو إنزيمات انحلال , 00+ 5 ,0A+ ,17+ (DHS) هي (DHSs) DNase | بصفة عامة؛ تكون مواضع مفرطة الحساسية ل .001856 | Ji ملالا في هذه . DNase | التي تكون حساسة لانشطار بواسطة إنزيم chromatin مناطق الكروماتين مما يجعل من (DNA المناطق المحددة من الجينوم, فقد الكروماتين بنيته المكثفة؛ كاشفاً حمضDNAse 1 means that the normal function of these DNAse 1 hypersensitive sites is reduced eg, access to transcription factors or degradation enzymes, 00+, 0A+, 17+ (DHS) are (DHSs) DNase In general, loci are hypersensitive to .001856 | Ji malala in these .DNase DNases that are sensitive to cleavage by the chromatin enzyme regions of chromatin making DNA specific regions of the genome. chromatin lost its condensed structure, revealing acid
Jie للانحلال بواسطة الإنزيمات؛ DNA الممكن الوصول إليه. الأمر الذي يثير إتاحة حمض تكون مناطق الكروماتين هذه القابلة للوصول إليها مرتبطة وظيفياً بنشاط انتساخي؛ ونظراً . DNase ا لأن هذه الحالة المعاد نمذجتها تكو ضرورية لارتباط البروتينات مثل عوامل الانتساخ. وعلى هذا النحو, يترتب على التعديل اللا جيني المتوقع في الطلب الحالي إمكانية وصول منخفض لإنزيمات أقل, 77١0 أقل, على الأقل 7٠١ تكون يكون أقل بنسبة 75 على الأقل على الأقل DNA انحلال أقل, على الأقل 7460 أقل, على الأقل .75 أقل, على الأقل 7760 أقل, على الأقل 77٠0 على الأقل -١ أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل Za أقل, على الأقل TA أقل, على الأقل 7٠ ضعف أقل, ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠-ضعف أقل, على الأقل Ye على الأقل ١٠٠٠-ضعف أقل, أو أكثر مقارنة بخلية مقارنة لم تتم معالجتها في أية طريقة تم الكشف عنها في الطلب الحالي. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف الموصوفة في الجدول 7. في نموذج آخر من هذا SNP markers على واحد أو أكثر من مرقمات الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو Yo من هذا الجانب وجميع الجوانب HAT الموصوفة في الجدول 7. في نموذج SNP أكثر من مرقماتJie for degradation by enzymes; accessible DNA. These accessible regions of chromatin are functionally associated with transcriptional activity; Given. DNase because this remodeled state is required for the binding of proteins such as transcription factors. As such, the expected epigenetic modification in the current demand entails reduced access to fewer enzymes, 7710 fewer, at least 701 being at least 75% less DNA degradation, at least 7460 less, at least .75 less, at least 7760 less, at least 7700 at least -1 less, at least 1-fold less, at least Za less, at least TA less, At least 70-fold less, 100-fold less, At least 10-fold less, At least 0-fold less, At least Ye At least 1,000-fold less, or more, than an unprocessed comparison cell in Any variant disclosed in the present request. In another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present request, the deletion described in Table 7. In another embodiment of this SNP markers includes one or more of Aspect Markers and all other facets described in the present application, the deletion consists primarily of one or Yo of this aspect and all HAT facets described in Table 7. In a sample SNP more than one Markers
CAR yy الموصوفة SNP الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف من واحد أو أكثر من مرقمات .7 في الجدول في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا الموصوفة في الجدول 7. وفقاً SNP جيني يشتمل على أو يؤثر على واحد أو أكثر من مرقمات تعني أنه تم " SNP ا لاستخدامه في الطلب الحالي, العبارة 'يؤثر على واحد أو أكثر من من مرقمات على سبيل المثال, الوصول إلى عوامل الانتساخ. , SNPS تخفيض الوظيفة (الوظائف) الطبيعية لهذه إلى تخفيض ارتباط SNPs لهذه methylation على سبيل المثال, يمكن أن تؤدي المعالجة بالميثيل . MRNA عوامل الانتساخ, مما يؤدي إلى التعبير المنخفض عن /80111 أو بروتين في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع .١7 على واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول ٠ الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحدة أو أكثر من في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة .١7 الشظايا المدرجة في الجدول في نموذج .١7 في الطلب الحالي, يتكون الحذف من واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول ,٠١ آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون الحذف منCAR yy Described Other SNP Described in the present application, the deletion consists of one or more digits of 7. In the table In another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present application, the modification is not Described in the table 7. According to a genetic SNP that includes or affects one or more markers, the phrase 'affects one or more markers' for use in the current application means that the SNP 'affects one or more of the markers'. SNPS transcription factors Reduction of the normal function(s) of these SNPs leads to reduced binding of these SNPs to methylation For example, methylation can induce .mRNA transcription factors, leading to reduced expression of /80111 or a protein in another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present application, the deletion in another embodiment of this aspect and all of .17 includes one or more of the fragments listed in Table 0 other aspects described in the application present, the deletion consists essentially of one or more of in another form this aspect and all other aspects described. Model 17. In the present application, the deletion consists of one or more of the fragments listed in Table 01, other than this aspect and all other aspects described in the present application, the deletion is from
YY Te gma, AY الا Te VAT VT Te ,من ,778 Te الاق إلى Ye من 10, 5,777 » إلى , +1 1/14 Te اأالا, 11 إلى Te من YY YA LT إلى 7 إلى م 7132 111,٠١ آلا ,من ٠ إلى AVY خالا Te من , 6 VYY ,٠YY Te gma, AY except Te VAT VT Te from 778 Te to Ye from 10, 5,777 » to +1 1/14 Te from 11 to Te from YY YA LT to 7 to PM 7132 111.01 Ala, from 0 to AVY except Te from 0, 6 VYY
IVA فده إلى نت TY Te oe, AAR TYE Te 1ه إلى 177 ST ",من TVA من SAA LYYY Te إلى ١١ YY) ,10 ceo TLV ,10 إلى 779 VY Te من YY ,٠ا١ ge, Yo VE ٠ ذلا إلى VY ,1٠ ee, EY) VY ٠ الا يألا إلى Th YoIVA FHD to Net TY Te oe, AAR TYE Te 1 H to 177 ST “from TVA from SAA LYYY Te to 11 YY), 10 ceo TLV, 10 to 779 VY Te From YY 1,0a ge, Yo VE 0 th to VY 10,ee, EY) VY 0 yala to Th Yo
AYN ١ أو من ,اد١ SAY ,0 ,من نا تام 8 إلى VER Te ا إلى EAAYN 1 or from ED1, SAY 0, from Na Tam 8 to VER Te A to EA
LOOT ام Te إلى 4 في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديلLOOT em Te to 4 in another form of this aspect and all other aspects described in the present application, Amendment
Lay .7 اللاجيني يشتمل على أو يؤثر على واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول "7 الاستخدامه في الطلب الحالي, العبارة 'يؤثر على واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول 5 تعني أنه يتم تخفيض الوظيفة (الوظائف) الطبيعية لهذه الشظايا, على سبيل المثال, الوصول إلى7. Epigenetic Lay includes or affects one or more of the fragments listed in Schedule 7 'Used in the present application, the phrase 'affects one or more of the fragments listed in Schedule 5' means that the function(s) is reduced Natural for these fragments, for example, access to
CAR yA عوامل الانتساخ. على سبيل المثال, المعالجة بالميثيل لهذه الشظايا يمكن أن تخفض ارتباط عوامل . MRNA أو بروتين BCL11A الانتساخ, مما يؤدي إلى التعبير المنخفض عن في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون التعديلCAR yA transcription factors. For example, methylation of these fragments can reduce binding factors. mRNA or BCL11A protein transcription, leading to reduced expression of In another model of this and all other aspects described in the present submission, the modification is
IIE Te إلى VAT YT Te من ,117 ,78 LT اللا جيني من 184,716,360 إلىIIE Te to VAT YT Te from 78, 117 LT Non-genetic from 184,716,360 to
See TYNE Te إلى 7756 VY Te رخالا, 117 , من ١ من 10, 77ل, 347 إلى AY. 8See TYNE Te to 7756 VY Te Rachela, 117 , from 1 of 10, 77L, 347 to AY. 8
Cle ,من YAY ,777 160 إلى 9 VY 4,10 من , 84/77 Te ذ, "الات إلى ,171 01١ ,من 1483 TY ET إلى OFT 177 ,٠١ ae, «YY TYAS إلى 12 , إلى 7١١ VY) 10 من , oT Te إلى 1 ,الا١/ Te من YY ,174 LT 5ه إلى , a إلى YO VY Te نمر,كا١ ,2771 ٠ إلى YA« آلا 4,٠١ من ,90A ,/77 ,٠Cle, from YAY, 777 160 to 9 VY 4,10 from 84/77 Te y, "ATS to 171, 011, from 1483 TY ET to OFT 177, 01 ae , “YY TYAS to 12 , to 711 VY) 10 from , oT Te to 1, 1/Te from 174 LT, YY 5 to , a to YO VY Te Nimr, Ka 1, 2771, 0 to YA” except 4.01 from 0, 77/77, 90A
AYY Te من 875,10 8 إلى , 7/44 Te .لا ,من 60ل 2 إلى YsAYY Te From 875,10 8 to 7/44 Te .No, From 60 to 2 to Ys
LOOT م Te لام فده إلى JT أو من ,10١ في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يزيل الحذف أو يزيل جزء من المنطقة 117 ,7748 LT AG ,715 Te كامل المنطقة بين الكرموسوم 7 الموقعLOOT M Te lam Faddh to JT or from 101 , in another form of this and all other aspects described in the present application, removes the omission or removes part of the area 7748 , 117 LT AG , 715 Te The entire region between chromosome 7 loci
La, (DHS) DNAse 1 مما يترتب عليه تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل الاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير 'تمزيق” يشير إلى تخفيض في انتساخ 861118 شبيه ٠5La, (DHS) DNAse 1 resulting in rupture of one or more hypersensitive sites for For use in the present application, the expression 'tearing' indicates a reduction in transcript 861118 similar 05
DNAse - بالكريات الحمراء في خلية تشتمل على تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية لDNAse - by erythrocytes in a cell that has ruptured one or more hypersensitive sites
Ste على الأقل ve على الأقل ZY على الأقل (على سبيل المثال, على الأقل 7٠ بنسبة 1 على الأقل Za على الأقل ZA على الأقل Tye الأقل eT على الأقل ,75 ٠. على الأقل (أي, لا يوجد انتساخ قابل للكشف لشبيهة بالكريات الحمراء)) 7٠٠0 على الأقل 794 أو حتى 700 مقارنة بخلية لا تتسم بمثل هذا التمزق. في أحد النماذج, يشتمل التمزق على عدم قدرة موضع معدل YoSte at least ve at least ZY at least (eg, at least 70 by at least 1 Za at least ZA at least Tye at least eT at least 0.75 (ie, no detectable erythrocyte-like transcription) 7000 at least 794 or even 700 compared to a cell without such rupture. In one embodiment, the rupture involves the inability of the Yo-modifier position
GATAL للارتباط بعوامل انتساخه الأصلية (على سبيل المثال, DNAse -1 مفرط الحساسية ل (TALI في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن علىGATAL to bind to its native transcription factors (eg, DNAse-1 hypersensitive to TALI) in another model of this and all other aspects described in the present submission, epigenetic modification that interferes with formation and/or maintenance On the epigenetic footprint at the Mohsen Ali area
UCSC Genome Browser (طبقاً ل TYY LVYALT— YA الكرموسوم 7 الموقع ,خالا YoUCSC Genome Browser (According to TYY LVYALT— YA Chromosome 7 Location, Uncle Yo
CARCAR
hg 9 مجموعة جينوم بشري) وبناءً عليه مما يؤدي إلى التعبير المنخفض عن عن 80111 أو بروتين MRNA , وزيادة التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن على fo الكرموسوم 7 الموقع ,خالا TYY LVYALT— YA (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 19 مجموعة جينوم بشري) تتضمن ولكن ليس على سبيل الحصر تعديلات لاجينية تؤثر على حساسية | DNase , تعديلات لاجينية تؤثر على تعديلات الهستونات, تعديلات لاجينية تؤثر على ارتباط GATAL/TALL , وتعديلات لاجينية تؤثر على تفاعل المعزز على المدى البعيد للمعزز من .BCL11A على سبيل المثال, التعديل اللاجيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن على الكرموسوم ؟ الموقع Tem VA YT Te 774, 117 يتضمن ولكن ليس على سبيل الحصر واحد على الأقل من حذف داخل الكرموسوم ؟ الموقع 60, 715, -١84 LTS 1, 117 بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أو 801118 . على سبيل المثال, يكون الحذف عند مناطق حساسية DNasel ٠ الكرموسوم Yo الموقع Tam VAS VY Te 774, 117, على سبيل المثال, +17, L005 0A يمكن أن يكون الحذف عند +67 أو +88 أو cod أو توليفة منه. على سبيل الأمتلة, عند +17 وج ره +00 +17 +00 أو عند جميع الثلاثة من +17, OM 5 +00 كمثال آخر, التعديل اللاجيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن على الكرموسوم ؟ الموقع Tm YA YT Te 7748, 117 يتضمن ولكن ليس ٠ على سبيل الحصر تغييرات في تعديلات الهستونات على الكرموسوم ؟ الذي لا يكون في الموقع ,٠١ LYALL TSA, 7 117, أو تغييرات في تعديلات الهستونات على الكرموسوم ؟ عند الموقع د الا, LYALL TAG 117, أو كل من تعديلات الهستونات على الكرموسوم ؟ ليست عند الموقع 10, YT 184-:1, 774, 117 وكذلك عند عند الموقع LT SIAL TT خالا ٠١ بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن MRNA Yo أو .BCL1IA CARhg 9 human genome assembly) and accordingly lead to decreased expression of 80111 or mRNA protein, and increased expression of fetal hemoglobin in mammals. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, an epigenetic modification that interferes with the formation and/or maintenance of an epigenetic imprint at the enhancer region on chromosome 7 fo locus, except for TYY LVYALT- YA (according to UCSC Genome Browser hg 19 human genome assembly) including but not limited to epigenetic modifications that affect the sensitivity of | DNase, epigenetic modifications affecting histone modifications, epigenetic modifications affecting GATAL/TALL binding, and epigenetic modifications affecting long-term enhancer interaction of the BCL11A promoter. For example, epigenetic modification that interferes with formation and/or Or preserving the epigenetic imprint at the enhancer region on the chromosome? The site Tem VA YT Te 774, 117 includes but is not limited to at least one intrachromosomal deletion? Site 60, 715, -184 LTS 1, 117 so that the overall function of this region is affected by which the expression of mRNA or 801118 is reduced or reduced. For example, the deletion is at DNAsel sensitivity regions 0 The yo chromosome Location Tam VAS VY Te 774, 117, for example, +17, L005 0A The deletion can be at +67 or + 88, cod, or a combination thereof. For example, at +17 and at +00 +17 +00 or at all three of +17, OM 5 +00 as another example, an epigenetic modification that interferes with the formation and/or maintenance of an epigenetic imprint at the enhancer region on the chromosome ? The site Tm YA YT Te 7748, 117 includes, but is not limited to, 0 changes in modifications of histones on the chromosome? Which is not at position 01 LYALL TSA 7 117 or changes in modifications of histones on the chromosome? At locus D only, LYALL TAG 117, or each of the histone modifications on the chromosome? Not at site 10, YT 184-:1, 774, 117 and also at site LT SIAL TT Khala 01 so that the overall function of this region is affected by which the expression of mRNA Yo or .BCL1IA CAR
=« اذ في نموذج آخر, التعديل اللاجيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن على الكرموسوم ؟ الموقع Tem VA YT Te 774, 117 يتضمن ولكن ليس على سبيل الحصر إدخال واحد على الأقل من متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية تغير السمات اللاجينية للعناصر غير المشفرة عند الكرموسوم ؟ الموقع YA LTA TT © 117 وبالتالي يترتب على ذلك إخماد التعبير الجيني المستهدف. يتم التركيز من الأول على any التحديد على محسنات فردية للإخماد على نحو لا جيني. بعبارة أخرى؛ يمكن أن يؤدي إدخال متواليات محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية في الكروموسوم 7 إلى تداخل على متوقع مع التعديل جين 80111/8. Vo يمكن استخدام أي طرق معروفة في المجال لإنتاج التعديل اللا جيني المتوقع. على سبيل المثال, وفقاً للموصوف في 2013 ,Mendenhall E.=« So in another model, the epigenetic modification that interferes with the formation and/or maintenance of the epigenetic imprint at the enhancer region on the chromosome? Tem VA YT Te 774, 117 includes, but is not limited to, an insertion of at least one repressor-specific genetically engineered sequence that alters the epigenetic features of non-coding elements at the chromosome? YA LTA TT site © 117 and consequently suppression of target gene expression. The focus of the first is on any specificity on individual enhancers of suppression in a non-genetic manner. In other words; The introduction of genetically engineered repressor-specific sequences into chromosome 7 could result in predictable interference with the modification of the 80111/8 gene. Vo Any methods known in the art can be used to produce the expected epigenetic modification. For example, as described in 2013, Mendenhall E.
M. et al., Nat.M. et al., Nat.
Biotechnol. 06 September و2013 2013 .Maeder ML et al., Nat Biotechnol. 09 October في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, إدخال متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل على أي موقع كرموسوم ؟ يترتب عليه Vo ولكن لا يقتصر على ذلك مناطق منخفضة الحساسية DNasel عند الكرموسوم ” للموقع ٠١ , , كاحء1, 1١7 YYA , على سبيل المثال, +17, 0A+ ,+00 تعديلات هستونات متزايدة على الكرموسوم ؟ للموقع LVYA ,1 184 VAT Te 117: وعوامل انتساخ منخفض ترتبط ب 1 لمنطقة المحسن على الكرموسوم ؟ للموقع TT كاحت POY LYYA وتفاعل منخفض أو مضعف بين الكرموسوم 7 للموقع Tam YA YT, 274, 117 مع معزز BCL11A ٠٠ . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون التأثيرات الكلية لإدخال متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل على أي موقع كرموسوم Y تعبير منخفض أو أقل عن mRNA و BCL 1 1A . في بعض النماذج , وفقاً لما هو مستخدم في سياق MRNA والتعبير عن /80111, التفاعل بين YO الكرموسوم ؟ للموقع VYA ,1:-144 WT, 117 أو محسن 8061118 مع معزز CARBiotechnol. 06 September and 2013 2013. Maeder ML et al., Nat Biotechnol. 09 October In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, insertion of at least one engineered suppressor-defined sequence at any chromosome site? Vo leads to, but is not limited to, DNAsel desensitized regions on the chromosome “for position 01, , C1, 117 YYA, eg, +17, 0A+, +00 increased histone modifications on the chromosome ? For LVYA locus 1, 184 VAT Te 117: And low transcription factors bind to 1 to the enhancer region on the chromosome? The TT locus has suppressed POY LYYA and reduced or impaired interaction between chromosome 7 of the Tam YA YT locus 274, 117 with the BCL11A 00 promoter. In an embodiment of this and all other aspects described in the present submission, the overall effects of insertion of a genetically engineered suppressor-specific sequence at least one on any Y chromosome site would be low or lower expression of mRNA and BCL 1 1A . In some models, according to what is used in the context of mRNA and expression of /80111, the interaction between the YO chromosome? For Site VYA ,1:-144 WT, 117 or Enhanced 8061118 with CAR Booster
١ لمنطقة المحسن, التعبير 'منخفض” أو GATAL/TALL, وعوامل الانتساخ التي ترتبط , 86118 أقل, على الأقل 770 أقل, على الأقل 7٠١ يشير إلى أقل بنسبة 75 على الأقل على الأقل mead أقل, ye أقل, على الأقل 700 أقل, على الأقل Tee أقل, على الأقل Zee أقل, على الأقل أقل, على الأقل 7960 أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل 7"-ضعف أقل, TA على الأقل ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠١ على الأقل 5٠-ضعف أقل, على الأقل 5 أقل, أو أكثر مقارنة بالموقف المقارن الذي يكون في عدم وجود التعديل اللاجيني أو فعض-٠ 861118 | إدخال المتواليات المعالجة بالهندسة الوراثية في الطلب الحالي. المقصود بتخفيض أو التعبير عن البروتين في الخلية يعني أن التعبير عن البروتين يكون أقل بنسبة 75 على MRNA أقل, على Zee أقل, على الأقل 770 أقل, على الأقل 77١0 أقل, على الأقل 7٠١ الأقل على الأقل1 for enhancer region, expression 'low' or GATAL/TALL, transcription factors that are associated with , 86118 less, at least 770 less, at least 701 indicates at least 75 less mead less, ye less, at least 700 less, at least Tee less, at least Zee less, at least less, at least 7960 less, at least 1-times less, at least 7"-times less, TA is at least two-fold lower, at least 100-fold lower, at least 01-at least 50-fold lower, at least 5-fold lower, or more compared to the comparative situation which would be in the absence of epigenetic modification or Vd-0 861118 | Entering the genetically engineered sequences in the current request. What is meant by a reduction or protein expression in the cell means that protein expression is 75% lower on less mRNA, on Zee less, at least 770 less, at least 7710 less, at least 701 less than at least
Za أقل, على الأقل TA الأقل 750 أقل, على الأقل 700 أقل, على الأقل 770 أقل, على الأقل Ys أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل -- ضعف أقل, على الأقل ضعف أقل, على الأقل ١٠٠٠-ضعف أقل, أو أكثر مقارنة بخلية ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠ مقارنة لا تتسم بالتعديل اللا جيني أو إدخال المتواليات المعالجة بالهندسة الوراثية في الطلب الحالي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يحدث إدخالZa less, at least TA at least 750 less, at least 700 less, at least 770 less, at least Ys less, at least 1-twice less, at least 1-twice less, at least -- twice less , at least 0-fold less, at least 1,000-fold less, or more compared to a cell 001-fold less, at least 0 in a comparison that does not feature epigenetic modification or insertion of genetically engineered sequences in the present application. Forms from this aspect and all other aspects described in the present application, entry occurs
DNasel متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل داخل مناطق الحساسية ل ١ 00+ 5 OA ,17+ على سبيل المثال, ,117 VTA Tem VAS VY TT للكرموسوم ؟ الموقع أو +58 أو 1+ YY أو عند الطرف oot أو oA+ يمكن أن يكون الإدخال عند #'الطرف +67 أو و+250, أو بين +00 و+17. OAF بين OAs 7+ أو بين 00+ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يغير إدخالDNasel suppressor-specific sequence engineered at least one within the susceptibility regions of 1 00+ 5 OA, 17+ eg, 117, VTA Tem VAS VY TT of the chromosome? Location or +58 or +1 YY or at the oot or +oA terminal The entry can be at the #' terminal +67 or +250, or between +00 and +17. OAF Between OAs 7+ or between 00+ in one of the forms from this aspect and all other aspects described in the present application, alter an entry
DNasel متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراقية واحدة على الأقل مناطق الحساسية ل YoDNasel quencher-defined sequence treated with leaf geometry and at least one of the regions sensitive to Yo
SY كاحت خالا VT Te للكرموسوم > الموقع في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تغير التعديلاتSY scraped off the cell VT Te of the chromosome > location in one embodiment of this aspect and all other aspects described in the present application, alterations change
SOY كاحت خالا YY Te الموقع ١ للكرموسوم DNasel اللاجينية مناطق الحساسية ل في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تغير التعديلات 117 خالا LT AG YT Te اللاجينية تعديلات الهستونات على الكرموسوم > للمرقع YOSOY suppressed cells YY Te chromosome position 1 DNAsel epigenetic regions of susceptibility to In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, alterations alter 117 cells LT AG YT Te epigenetic alterations histones on the chromosome > for the patchwork YO
CARCAR
_— \ اذ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يغير إدخال متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل تعديلات الهستونات على الكرموسوم Y للمرقع LTA VT LT خالا CY في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تغير التعديلات © اللاجينية GATAL/TALL Lis) _لمنطقة المحسن على الكرموسوم ؟ للموقع -١84 ,7156 Te IY ,»1 LTS بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أو 861118 . على سبيل المثال, ارتباط عوامل الانتساخ ب 687781/1/811. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يحدث إدخال متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل داخل GATAL/TALL وفقاً Yo للموصوف في الطلب الحالي. يمكن أن يكون الإدخال عند #' الطرف أو الطرف 'Y 67/81 أو 1/1 . يمكن أن يكون الإدخال بين 687/81 TALL; يغير الإدخال ارتباط 6/81781/1/811 لمنطقة المحسن على الكرموسوم ¥ للموقع 1١7 ,72748 LTA TT بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أو 80611178 . على سبيل المثال, ارتباط عوامل الانتساخ ب 7/81/1/11م/6. Vo في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يغير التعديل اللاجيني التفاعل بين محسن 861118 ومعزز 801118 . في أحد النماذج, يتم تخفيض التفاعل أو إضعافه بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أر BCL11A . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تغير التعديلات ٠ اللاجينية التفاعل بين الكرموسوم ؟ للموقع 60, 715, Tem AG 7748, 117 مع معزز 861118 . في أحد النماذج, يتم تخفيض التفاعل أو إضعافه بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أو 801118 . أيضاً يتم في الطلب الحالي تقديم في جانب AT خلية بشرية مهندسة Uy معزولة تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟ للموقع Tem) A TT 7748, 117 (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 19 Yo مجموعة جينوم بشري) تم بواسطة lee تلامس الخلية مع كمية CAR_— \ If in one embodiment of this and all other aspects described in the present application, insertion of an engineered suppressor-defined sequence alters at least one modification of histones on the Y chromosome of the LTA VT LT patch during the CY genus in one of the embodiments In this and all other aspects described in the present application, the epigenetic modifications (GATAL/TALL Lis) alter the _enhancer region on the chromosome? For site -184, 7156 Te IY, 1 LTS so that the overall function of this region is affected by which the expression of mRNA or 861118 is reduced or reduced. For example, transcription factors bind to 687781/1/811. In an embodiment of this and all other aspects described in the present submission, insertion of at least one engineered suppressor-defined sequence occurs within GATAL/TALL according to the Yo described in the present submission. The entry can be at the #' terminal or the Y terminal '67/81 or 1/1 . The entry could be between 687/81 TALL; the entry alters the binding of 6/81781/1/811 to the enhancer region on chromosome ¥ to locus 72748, 117 LTA TT so that the overall function of this region is affected by which the expression of mRNA is reduced or decreased or 80611178. For example, transcription factors bind to 7/81/1/11m/6. Vo In one embodiment of this and all other aspects described in the present submission, epigenetic modification alters the interaction between enhancer 861118 and enhancer 801118 . In one embodiment, the interaction is reduced or impaired so that the overall function of this region is affected by which the expression of the BCL11A mRNA is reduced or reduced. In one embodiment of this and all other aspects described in the present submission, epigenetic modifications alter the interaction between the chromosome? For position 60, 715, Tem AG 7748, 117 with reinforcement 861118 . In one embodiment, the interaction is reduced or impaired so that the overall function of this region is affected by which the expression of mRNA or 801118 is reduced. Also, in the present application, an isolated Uy engineered human cell characterized by at least one genetic modification on the chromosome ? Locator Tem) A TT 7748, 117 (according to UCSC Genome Browser hg 19 Yo Human Genome Collection) made by lee cell contact with the amount of CAR
اخ فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع CIAL YT Te 1١7 ,74 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, الخلية البشريةAn effective combination of at least one DNA-targeting endonuclease or an expression vector carrying the coding sequence of a DNA-targeting endonuclease by which the DNA-targeting endonuclease cleave the cell's genomic DNA on a chromosome? It has a locus CIAL YT Te 74,117 and causes at least one genetic modification there. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the human cell
المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة تتسم بتعديل لا جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم 7. في جانب من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, الخلية البشرية المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة تتسم بتعديل لا جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع VY تنص ا بلكلا JUYYThe genetically engineered isolate characterized by at least one epigenetic modification at the genomic DNA of the cell on chromosome 7. In one aspect of this and all other aspects described in the present application, the genetically engineered human cell is isolated characterized by at least one epigenetic modification at the genomic DNA of the cell on chromosome 7. The cell's genomic DNA on the chromosome at the site VY states a plural JUYY
٠ في بعض جوانب من أي لهذه خلايا بشرية مهندسة وراثياً معزولة تتسم بتعديل لا جيني واحد على الأقل, يتم زرع الخلايا في ثديي للاستخدام في زيادة الهيموجلوبين الجنيني في الثديي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتم زرع الخلية البشرية المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع دا خالا تماص ا بكار TYY في ثديي للاستخدام0 In some aspect of any of these isolated genetically engineered human cells characterized by at least one epigenetic modification, the cells are transplanted into my breast for use in increasing fetal mammary hemoglobin. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, a genetically engineered human cell isolate characterized by at least one genetic modification at the cell's genomic DNA on the chromosome of the in situ during virgin abortion TYY is transplanted into a mammal for use
Ve في زيادة الهيموجلوبين الجنيني في الثديي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتم تخزين الخلية البشرية المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع ا خللا, تباصا مب مكار TYY للاستخدام اللاحق بواسطة الحفظ بالتبريد.Ve in increasing fetal hemoglobin in the mammal. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, a genetically engineered human cell isolate characterized by at least one genetic modification at the cell's genomic DNA on the chromosome of the defective locus, spliced by TYY, is stored for subsequent use by Cryopreservation.
٠ في بعض جوانب من أي من تلك يتم تخزين خلايا بشرية مهندسة وراثياً معزولة تتسم بتعديل لا جيني واحد على الأقل, الخلايا للاستخدام اللاحق بواسطة الحفظ بالتبريد. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي,يتم حفظ الخلية البشرية المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة التي تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع دا خالا تغناص ا بكار TYY بالتبريد , واذابتها0 In some aspect of any of these isolated genetically engineered human cells characterized by at least one epigenetic modification, the cells are stored for later use by cryopreservation. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, a genetically engineered human cell isolate that is characterized by at least one genetic modification at the cell's genomic DNA on the chromosome of the in situ within TYY virginity is cryopreserved, And melt it
YO وزرعها في ثديي للاستخدام في زيادة الهيموجلوبين الجنيني في الثديي.YO and implanted in my breast for use in increasing fetal hemoglobin in the breast.
OY AYOYAY
دومalways
في بعض جوانب من أي من تلك الخلايا البشرية المهندسة وراثياً المعزولة تتسم بتعديل لا جيني واحدIn some aspect of any of these isolated genetically engineered human cells, a single epigenetic modification is noted
على الأقل, يتم حفظها بالتبريد, وتتم إذابتها ويتم زرعها في ثديي للاستخدام في زيادة الهيموجلوبينAt least, it's cryopreserved, thawed, and implanted in my breasts for use in increasing hemoglobin.
الجنيني في الثديي.embryonic in the mammary.
يتعلق جانب آخر مقدم في الطلب الحالي بتركيبة تشتمل على خلايا بشرية مهندسة وراثياً معزولة,Another aspect presented in the present application relates to a composition comprising isolated genetically engineered human cells,
© حيث تتسم الخلايا بتعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم Y للموقع CYA TT© Where cells have at least one genetic modification on the Y chromosome of the CYA TT site
TYY LVYA (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري) تم بواسطةTYY LVYA (according to 19 UCSC Genome Browser hg Human Genome Collection)
عملية تلامس الخلايا مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمضThe process of contacting cells with an effective amount of a formulation comprising at least an acid-targeting endonuclease
DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتهاDNA or an expression vector carrying the coding sequence of a DNA-targeting endonuclease by which
يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ Ye للموقع TYY LVYALT—YA9 VY, (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hgThe endonuclease targets DNA and cleave the genomic DNA of the cell on the chromosome. Ye for site TYY LVYALT—YA9 VY, (according to 19 UCSC Genome Browser hg)
مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه.human genome) and causes at least one genetic modification in it.
يتعلق جانب آخر مقدم في الطلب الحالي بتركيبة تشتمل على خلايا بشرية مهندسة وراثياً معزولة,Another aspect presented in the present application relates to a composition comprising isolated genetically engineered human cells,
حيث تتسم الخلايا بتعديل لا جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟. في أحد النماذج, يكونWhere cells have at least one non-genetic modification on a chromosome? In one embodiment, it is
التعديل اللاجيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟ عند الموقع LYALL TA YT Te 7ل yo (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري). في نموذج آخر, يتم تعديلEpigenetic modification of at least one chromosome? At site LYALL TA YT Te7l yo (according to 19 UCSC Genome Browser hg Human Genome Collection). In another embodiment, it is modified
لا جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ¥ بواسطة عملية تلامس الخلايا مع كمية فعالة من تركيبةAt least one gene on the ¥ chromosome is removed by the process of cell contact with an effective amount of combination
تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيمInclude at least one DNA-targeting enzyme or an expression vector carrying the coding sequence for an enzyme
يستهدف حمض DNA والذي بواسطته يحدث الإنزيم الذي يستهدف حمض DNA تعديل لا جينيIt targets DNA, by means of which the enzyme that targets DNA makes an epigenetic modification
واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ١ مما يؤثر على الموقع ,٠١ ٠ الا كتخمناصات بالا TYY (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينومat least one in the cell's genomic DNA on chromosome 1 affecting locus 0.01 except as TYY imperfections (according to 19 UCSC Genome Browser hg
بشري) ويتسبب في ذلك.human) and cause it.
في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تحدث التركيبةIn one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the combination takes place
زيادة في الهيموجلوبين الجنيني MRNA أو التعبير عن البروتين في خلية التلامس.Increased fetal hemoglobin mRNA or protein expression in cell contacts.
oY AYoYAY
اج اذ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة ذاتية المنشاً, إلى الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع, أي, تكون LS DA مشتقة أو تم حصدها من الثديي قبل أي تعديل موصوف . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي © من التركيبات الموصوفة غير BE Ld إلى الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع, أي, لا تكون خلايا التركيبة مشتقة أو تم حصدها من الثديي قبل أي تعديل موصوف. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة بحد أدنى من نوع HLA المطابق مع الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع. ٠ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة خلايا أولية معزولة قبل أي تعديل موصوف. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة خلايا أولية معزولة مكونة للدم قبل أي تعديل موصوف. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي ge 5 التركيبات الموصوفة WDA جذعية معزولة مستحثة متعددة القدرة قبل أي تعديل موصوف. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 ,0A+ ,17+ (DHS) DNAse و+ده وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة . في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو أكثر من المواقع مفرطة ٠ الحساسية ل 1 0A+ ,17+ (DHS) DNAse و+هه وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة . في نموذج آخر, يتكون الحذف من واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل DNAse 0A+ ,17+ (DHS) 1 0045 وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم AB) . في أحد النماذج, وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "جزء' في سياق الحذف الجينومي على الأقل 7٠١ إلى حوالي ل من المنطقة المحددة. في نماذج أخرى, يكون الجزء المحذوف على f لأقل YAR , على CARWhereas in an embodiment of this and all other aspects described in the present application, the cells of any of the combinations described are endogenous, to the mammal that is the recipient of the cells in a transplant procedure, that is, the LS DA is derived from or harvested from the mammal prior to any Described modification. In an embodiment of this and all other aspects described in the present application, the cells of any of the constructs described are not BE Ld to a mammal that is the recipient of the cells in a transplant procedure, that is, the cells of the construct are not derived from or harvested from the mammal prior to any Described modification. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the cells of any of the combinations described are minimally HLA-type-matched with the mammalian being the recipient of the cells in a transplant procedure. 0 In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the cells of any of the combinations described are primary cells isolated prior to any modification described. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the cells of any of the combinations described are isolated primary hematopoietic cells prior to any modification described. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the cells of any 5 ge constructs described are WDA isolated induced pluripotent stem cells prior to any modification described. In another embodiment of this and all other aspects described in the present application, the deletion includes one or more sites hypersensitive to 1, 0A+, 17+ (DHS) DNAse and +D as described in the present application in the Examples section. In further embodiment of this and all other aspects described in the present application, the deletion consists primarily of one or more sites hypersensitive to 1, 0A+, 17+ (DHS) DNAse and +e as described in the present application in Examples section. In another embodiment, the deletion consisted of one or more hypersensitive loci of DNAse 0A+,17+ (DHS) 1 0045 as described in the present application in section AB). In one embodiment, as used in the present application, the expression 'fragment' in the context of a genomic deletion is at least 701 to about l of the specified region. In other embodiments, the deleted fragment is on f of less than YAR, on CAR
Cyr على الأقل Ave على الأقل Ze الأقل edo على الأقل Ze الأقل 770, على الأقل من المنطقة المحددة. 72٠٠١ الأقل 72955, على الأقل 799 أو حتى ea على الأقل TA في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف الموصوفة في الجدول 7. في نموذج آخر من هذا الجانب SNP على واحد أو أكثر من مرقمات وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو أكثر من © الموصوفة في الجدول ". في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى SNP مرقمات الموصوفة في SNP الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف من واحد أو أكثر من مرقماتCyr at least Ave at least Ze at least edo at least Ze at least 770, at least from the specified area. 72001 at least 72955, at least 799 or even ea at least TA In another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present application, the deletion described in Table 7 is included. In another embodiment of this aspect the SNP includes one or more markers and all other aspects described in the present application, consisting The deletion is essentially from one or more of the ©s described in table ”. In another embodiment of this and all other aspects the SNPs are described in the SNPs described in the present application, the deletion consists of one or more of the SNPs
NX الجدول في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول 7. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع ٠ الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو أكثر من في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة .١ الشظايا المدرجة في الجدول في الطلب الحالي, يتكون الحذف من واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول 7. في نموذج ,٠١ آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون الحذف منNX Schedule In another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present application, the omission includes one or more of the fragments listed in Table 7. In another embodiment of this aspect and all 0 other aspects described in the present application , the omission consists essentially of one or more of In another embodiment of this aspect and all other aspects described 1. The fragments included in the table In the present application, the omission consists of one or more of the fragments listed in Table 7. In OTHER FORM 01 of this aspect and all other aspects described in the present application, omission from
YY Te من AY !آل Te إلى YAR VT Te لالاكذا إلى نتبخالا, ,من YeYY Te from AY!Al Te to YAR VT Te Lalaka to Netbakhala, from Ye
COTLYYY Te eo TLV 0 اأالا, 1 إلى LT رخالا, ,من ١ إلى 7 إلى FATTY LT من YAY VY Te إلى ق٠ YY E Te إلى 0, “الاب , منCOTLYYY Te eo TLV 0 Aala, 1 to LT Rakhala, 1 to 7 to FATTY LT from YAY VY Te to 0 s YY E Te to 0, “Father, from ,
Cle إلى 815 IY Te من AAS TYE Te برخلا ",من نا 177 1 إلىCle to 815 IY Te from AAS TYE Te Barkhla, from Na 1 to 177
YY Te إلى 7٠١ YY 16 من , TTL, Te الا 735 إلى LT الا من ,1YY Te to 701 YY 16 from , TTL, Te to 735 to LT from 1,
NOE VE Te قلا إلى 74 Te الاك من VY Te إلى VAL YY E Te دقر من ٠ أو من ,101 SAYY Te إلى ERA LAY Te لاك من Te أ“ إلى YEA LT من LOOT كم Te اك قف إلى TL في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يزيل الحذف 0656 (طبقاً ل 1١7 ,778 Tem A ITT كامل المنطقة بين الكرموسوم ؟ للموقع مجموعة جينوم بشري) أو يزيل جزء من المنطقة مما يترتب عليه Genome Browser hg 19 Yeo .)0115( DNAse 1 تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية لNOE VE Te decrease to 74 Te Lak from VY Te to VAL YY E Te 0 digits or from 101 SAYY Te to ERA LAY Te Lak from Te A” to YEA LT from LOOT km Te ak stand to TL in another embodiment of this aspect and all other aspects described in the present order, remove the omission 0656 (according to 117,778 Tem A ITT full The interchromosomal region of a human genome assembly) or removes part of the region resulting in a rupture of one or more loci hypersensitive to DNAse 1 Genome Browser hg 19 Yeo (0115)
CARCAR
_ 7 اذ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى زيادة الهيموجلوبين الجنيني. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تم تشخيص الثديي على أنه مصاب باعتلال الهيموجلوبين. © في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون الثديي_7 For in one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the method also includes the selection of two mammals in need of increased fetal hemoglobin. In one embodiment of this and all others described in the present application, the mammary was diagnosed as having hemoglobinopathy. © In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, it is the mammalian
الذي في dala إلى زيادة الهيموجلوبين الجنيني قد تم تشخيصه أنه مصاب باعتلال الهيموجلوبين. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -اعتلال الهيموجلوبين —hemoglobinopathy 8 . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون اعتلالwho in dala increased fetal hemoglobin has been diagnosed as having hemoglobinopathy. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, hemoglobinopathy 8 —hemoglobinopathy 8 . In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, it is morbidity
٠ - الهيموجلويين مرض الخلية المنجلية. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون اعتلال الهيموجلويين م8 -ثلاسيميا —thalassemia 8 . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتم إعطاء الخلية المتلامسة, الخلية البشرية, خلية أولية لتكوين الدم أو سليفتها إلى الثديي.0 - Hemoglobin sickle cell disease. In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, hemoglobinopathy is M8 - thalassemia 8 . In one embodiment of this and all other aspects described in the present application, the contact cell, the human cell, a hematopoietic progenitor cell or its precursor, is given to the mammal.
VO في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير مجموعة معزولة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي في خارج الجسم الحي, وتلامس مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين pall مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدفVO In one embodiment, this disclosure provides a method for increasing fetal hemoglobin levels in two mammals in need of it, the method includes the steps of providing an isolated pool of hematopoietic progenitor cells or hematopoietic stem cells from the mammal in ex vivo, and contacting a pool of progenitor cells or stem cells to form a pall with an effective amount of a combination comprising at least a DNA-targeting endonuclease or an expression vector carrying the coding sequence of a DNA-targeting endonuclease with which to target
,٠١ الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع DNA ويشطر حمض DNA إندونيوكلياز حمض ٠ ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد 117 LYYA LTS YAR 7 التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, يتم حفظ المجموعة التي تم تلامسها من الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم إدخالها في الثديي. sale] التي تتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني بالتبريد ويتم تخزينها أو,,01 the genome of the cell on the chromosome? The DNA endonuclease cleaves DNA site 0 and causes at least one genetic modification therein, by which 117 LYYA LTS YAR 7 increases expression of fetal mammalian hemoglobin, relative to precontact expression. In a further embodiment of this method, the contacted group of primary cells or hematopoietic stem cells introduced into the mammary. sale] that have increased expression of fetal hemoglobin is cryopreserved and stored or
CARCAR
A —_ اذ في نموذج آخر, تتم إذابة المجموعة التي تم حفظها بالتبريد من الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم التي تتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني وبعد ذلك تتم sale) إدخالها في الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أي من النماذج © على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم يمكن توزيعها باستخدام الموصوف في الطلب الحالي. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات عزل مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي, وتلامس في خارج الجسم الحي مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم ٠ مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض (Alls DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع -١84 ,7156 Te 1١7 YYA 7٠4 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والذي بواسطته يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في نموذج إضافي من هذه VO الطريقة, يتم حفظ بالتبريد للمجموعة المتلامسة خارج الجسم all من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم التي نتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني ويتم تخزينها أو إعادة إدخالها في الثديي. في نموذج آخر, تتم إذابة المجموعة التي تم حفظها بالتبريد من خلايا أولية أو WA جذعية لتكوين الدم والتي تتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني وبعد ذلك تتم إعادة إدخالها في التديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة ٠ أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أي من النماذج على الطريقة الموصوفة, يمكن توزيع الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم باستخدام IPSCs المشتقة من الثديي. في أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة Yo إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير Jie مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي وحذف حمض DNA الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ للموقع ITT CARA —_ in another embodiment, a cryopreserved population of primary or hematopoietic stem cells with increased expression of fetal hemoglobin is thawed and then (sale) introduced into the mammal. In a further embodiment of this method, the method includes chemotherapy and/or radiotherapy to remove or reduce mammary hematopoietic progenitor cells or endogenous stem cells. In any of the models© in the manner described, primary cells or hematopoietic stem cells can be distributed using that described in the present application. In one embodiment, this discovery provides a method for increasing fetal hemoglobin levels in two mammals in need of it, the method includes the steps of isolating a group of primary hematopoietic cells or hematopoietic stem cells from the mammal, and contacting in vivo a group of primary cells or stem cells to form blood 0 with an effective amount of a combination comprising at least an endonuclease targeting DNA or an expression vector carrying the coding sequence of an endonuclease targeting DNA (Alls DNA) by which the endonuclease targets DNA and cleave the cell's genomic DNA on the chromosome ?-184,7156 Te 117 YYA 704 site and causes at least one genetic modification therein, by which the expression of fetal hemoglobin in the mammal is increased, relative to precontact expression. Cryopreserved extracorporeal contact ALL of progenitor cells or hematopoietic stem cells that have increased expression of fetal hemoglobin stored or reintroduced into the mammal. hematopoietic stem and which are characterized by increased expression of fetal hemoglobin and subsequently re-introduced into the embryo. In a further embodiment of this method, the method includes chemotherapy and/or radiotherapy to remove 0 or reduce progenitor cells or endogenous stem cells of mammary hematopoiesis. In any of the models in the manner described, progenitor cells or hematopoietic stem cells can be distributed using mammalian-derived iPSCs. In any embodiment of the method, the method also includes selection of mammals in need of increased expression of fetal hemoglobin. In one embodiment, this disclosure provides a method for increasing fetal hemoglobin levels in two breasts that Yo needs, the method involves the steps of providing Jie with a pool of mammary hematopoietic progenitor or hematopoietic stem cells and deleting the cells' genomic DNA at chromosome? For the ITT CAR website
LVYA TYAS 117 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلويين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, يتم حفظ بالتبريد لمجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم بحمض DNA جينومي تم حذفه وتتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني ويتم تخزينها أو إعادة © إدخالها في الثديي. في نموذج DAT تتم إذابة مجموعة من WDA أولية أو خلايا جذعية لتكوين pall بحمض DNA جينومي تم حذفه وتتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني وبعد ذلك تتم sale) إدخالها في الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة أو تخفيض WIA أولية أو WIA جذعية داخلية المنشأً لتكوين الدم في الثديي. في أي نموذج من الطريقة الموصوفة, يمكن توزيع الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم ٠ باستخدام 1050658 الموصوف في الطلب الحالي. في أي من النماذج على الطريقة الموصوفة, تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو IPSCs مناظرة للثديي, الأمر الذي يعني أن Wall تكون مشتقة من نفس الثديي. في نموذج آخر على الطريقة الموصوفة, لا تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو IPSCs مناظرة للثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفس الثديي, ولكن من ثديي آخر من نفس النوع. على سبيل JB الثديي يكون إنسان. في أي ٠ نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى تعبير متزايد عنLVYA TYAS 117 and causes at least one genetic modification in it, by which expression of fetal hemoglobin is increased in said mammal, relative to said precontact expression. In a further embodiment of this method, a group of progenitor cells or hematopoietic stem cells with deleted genomic DNA and characterized by increased expression of fetal hemoglobin is cryopreserved and stored or reintroduced into the mammal. In the DAT model a pool of primary WDA or stem cells to form a pall is thawed with deleted genomic DNA and characterized by increased expression of fetal hemoglobin (sale) and then inserted into the mammal. In a further embodiment of this method, the method includes chemotherapy and/or radiotherapy to remove or reduce a primary WIA or an endogenous stem WIA of mammary hematopoiesis. In any embodiment of the method described, primary cells or hematopoietic stem cells 0 can be distributed using the 1050658 described in the present order. In either embodiment of the method described, primary cells, hematopoietic stem cells, or IPSCs are mammalian counterparts, which means that Wall is derived from the same mammal. In another embodiment of the method described, the progenitor cells, hematopoietic stem cells, or IPSCs are not mammalian counterparts, which means that the cells are not derived from the same mammal, but from another mammal of the same species. For example JB the mammal is a human. In any embodiment of the method, the method also includes the selection of mammals in need of increased expression
الهيموجلوبين الجنيني. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات عزل مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي وخارج الجسم all حذف حمض DNA الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ للموقع TY خالا قا ة, LYYA 117 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعيير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, يتم حفظ مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم بحمض DNA جينومي تم حذفه وتتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلويين الجنيني بالتبريد ويتم تخزينها أو إعادة إدخالها في الثديي. في نموذج آخر, تتم إذابة المجموعة التي تم حفظها بالتبريد من خلايا YO أولية أو خلايا جذعية لتكوين pall تتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني وبعد ذلك تتم sale) إدخالها في الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أوFetal hemoglobin. In one embodiment, this discovery provides a method for increasing fetal hemoglobin levels in two mammals in need of it, the method involves the steps of isolating a group of hematopoietic progenitor cells or hematopoietic stem cells from the mammal and outside the body all deletion of the genomic DNA of the cells on the chromosome ? Locus TY has a cleavage cleft, LYYA 117 and causes at least one genetic modification therein, by which titration exceeds fetal hemoglobin in said mammal, relative to said precontact expression. In a further embodiment of this method, a group of hematopoietic progenitor or stem cells with deleted genomic DNA and characterized by increased expression of fetal hemoglobin is cryopreserved and stored or reintroduced into the mammal. In another embodiment, the cryopreserved pool of primary YO cells or stem cells is thawed to form a pall with increased expression of fetal hemoglobin and then (sale) introduced into the mammal. In a further embodiment of this method, the method includes chemotherapy and/or chemotherapy
CARCAR
=« _ علاج إشعاعي AY أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أي من النماذج على الطريقة الموصوفة, يمكن توزيع الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم باستخدام IPSCs المشتقة من الثديي. في أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة Lad على انتقاء ثديي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني. © في أحد النماذج من أية طريقة تم وصفها, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني. يكون الثديي التمثيلي الذي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني هو الذي تم تشخيص حالته على أنه مصاب باعتلال الهيموجلوبين. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: (أ) توفير خلايا أولية لتكوين الدم أو WDA جذعية لتكوين الدم أو 10505: (ب) تلامس الخلايا خارج ٠ - الجسم الحي أو في المعمل مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم " للموقع TY ,7748 ,1:-1484 TT ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس NO المذكور: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي. في أحد النماذج من أية طريقة, الخلايا بعد الخطوة (ب) يمكن Leta 333500 حتى تكون مطلوبة للإعطاء في الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي chemotherapy و / أو علاج إشعاعي AY radiation أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين pal) في الثديي. في أي من النماذج على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو ٠ -_ الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو 10565 تكون ذاتية إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا تكون مشتقة من نفس الثديي. في نموذج آخر على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين aall أو 10565 تكون غير ذائية CE إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفس التديي , ولكن تديي آخر من نفس النوع . على سبيل المثال, الثديي يكون إنسان . في أحد النماذج من أية طريقة تم وصفها, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى Yo علاج اعتلال الهيموجلوبين . CAR gy في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: (أ) عزل خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي: (ب) تلامس الخلايا خارج الجسم الحي أو في المعمل مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف والتي DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض الجينومي للخلية على DNA ويشطر حمض DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض © ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل 117 ,778 Tam AL VY الكرموسوم ؟ للموقع فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي. البُزوْدَة حتى تكون مطلوبة للإعطاء في Lelia في أحد النماذج, الخلايا بعد الخطوة (ب) يمكن على انتقاء ثديي في حاجة إلى علاج Lad التديي. في أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة ٠ اعتلال الهيموجلوبين. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: (ب) خارج الجسم الحي SIPSCs جذعية لتكوين الدم أو WA (أ) توفير خلايا أولية لتكوين الدم أو 17 حال TYAS WATT الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ للمروقع DNA حذف حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني VO في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور: و (ج) إعطاء الخلايا من الخطوة (ب)) في الثديي. البُزوْدَة حتى تكون مطلوبة للإعطاء في Lelia في أحد النماذج, الخلايا بعد الخطوة (ب) يمكن الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أي ٠=” _ AY radiotherapy or reduction of progenitor cells or endogenous stem cells of mammary hematopoiesis. In any of the models in the manner described, progenitor cells or hematopoietic stem cells can be distributed using mammalian-derived iPSCs. In either embodiment of the method, the Lad method involves selection of mammals in need of increased expression of fetal hemoglobin. © In an embodiment of any method described, the method also includes selection of mammals in need of increased expression of fetal hemoglobin. A representative mammal in need of increased expression of fetal hemoglobin would be the one diagnosed as having haemoglobinopathy. In one embodiment, this disclosure provides a method for treating mammalian haemoglobinopathies comprising the steps of: (a) providing hematopoietic progenitor cells or WDA hematopoietic stem cells or 10505: (b) contacting cells ex vivo or in vitro With an effective amount of a combination comprising at least a DNA-targeting endonuclease or an expression vector carrying the coding sequence of a DNA-targeting endonuclease by means of which the endonuclease targets DNA and cleave the cell's genomic DNA on the chromosome "for locus TY , 1,7748:-1484 TT and causes at least one genetic modification therein, by which the expression of fetal hemoglobin is increased in said mammal, relative to the precontact expression of said NO: and (c) administration of step (b) in the mammal In one embodiment of any method, cells after step (b) Leta 333500 may be required for administration into the breast.In an additional embodiment of this method, the method includes chemotherapy and/or AY radiation or reduction of progenitor cells or endogenous stem cells to form pal) in the breast in any of the embodiments by the method described. Pfh, primary cells or 0 -_ hematopoietic stem cells or 10565 are autologous to the mammal, which means that the cells are derived from the same mammal. In another embodiment of the method described, the progenitor cells or stem cells of aall formation or 10565 are non-cetogenic to mammalian, which means that the cells do not derive from the same branch, but from another branch of the same species. For example, a mammal is a human. In one embodiment of any method described, the method also includes selection of breasts in need of treatment for hemoglobinopathies. CAR gy In one embodiment, this disclosure presents a method for treating hemoglobinopathy in mammals comprising the steps of: (a) isolating primary hematopoietic cells or hematopoietic stem cells from the mammal: (b) cell contact ex vivo or in vitro with an effective amount of a combination comprising at least an endonuclease targeting DNA or an expression vector carrying the coding sequence of an endonuclease targeting the cell's genomic acid on DNA and cleaving the DNA with it targeting the endonuclease acid © and causes at least one genetic modification 117 ,778 Tam AL VY chromosome? of the site in it, by which expression of fetal hemoglobin increases in the mammal, relative to said pre-contact expression: and (c) administration from step (b) in the mammal. In models, cells after step (b) can be selected for breast implants in need of Lad breast reduction treatment. In any embodiment of the method, method 0 includes haemoglobinopathies. In one embodiment, this disclosure presents a method for the treatment of mammary haemoglobinopathies comprising the steps of: (b) ex vivo hematopoietic stem SIPSCs or WA (a) providing hematopoietic progenitor cells or 17 genome TYAS WATT status of cells on the chromosome? The locus has a DNA deletion and causes at least one genetic modification therein, by which the expression of fetal hemoglobin VO in said mammal increases, relative to said precontact expression: and (c) administration of cells from step (b )) in the mammal. The bozodella until it is required for administration into Lelia in one embodiment, the cells after step (b) can be the mammalian. In a further embodiment of this method, the method includes chemotherapy and/or radiation therapy to remove or reduce endogenous hematopoietic progenitor cells or stem cells in the breast. at any 0
IPSCs من النماذج على الطريقة الموصوفة, تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو مناظرة إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا تكون مشتقة من نفس الثديي. في نموذج آخر على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو 10565 لا تكون مناظرة إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفس الثديي, ولكن ثديي آخر من نفس النوع. يكون إنسان. في أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء oi, JB على سبيل YO ثديي في حاجة إلى علاج اعتلال الهيموجلوبين.IPSCs are models of the method described, which are progenitor or hematopoietic stem cells or are mammalian analogues, which means that the cells are derived from the same mammal. In another embodiment of the method described, primary cells or hematopoietic stem cells or 10565 are not mammalian counterparts, which means that the cells are not derived from the same mammal, but from another mammal of the same species. That is, a human. In any model of the method, the method also includes the selection of oi, JB for example YO breasts in need of treatment for hemoglobinopathy.
CARCAR
_ \ —__ \ —_
في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات:In one embodiment, this disclosure presents a method for treating hemoglobinopathy in breasts that includes steps:
(أ) Je خلايا أولية لتكوين الدم أو LDA جذعية لتكوين الدم من الثديي: (ب) خارج الجسم الحي(a) Je hematopoietic progenitor cells or LDA hematopoietic stem cells from mammals: (b) ex vivo
حذف حمض DNA الجينومي للخلايا على الكرموسوم للموقع دا خالا تغناص ا بكار TYYDeletion of the genomic DNA of cells on the chromosome of this locus during TYY
ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنينيIt causes at least one genetic modification in it, by which the expression of fetal hemoglobin is increased
© في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي.© in the mammalian, with respect to the said pre-contact expression: and (c) given from step (b) in the mammalian.
في أحد النماذج, الخلايا بعد الخطوة (ب) يمكن HL Leki 335 حتى تكون مطلوبة للإعطاء فيIn one embodiment, cells after step (b) can HL Leki 335 be required for administration in
الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاجmammary. In a further embodiment of this method, the method includes chemotherapy and/or therapy
إشعاعي لإزالة أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا Leda داخلية Land) لتكوين الدم في الثديي. فيRadiosurgery to remove or reduce progenitor cells (or endogenous Leda cells) of mammary hematopoiesis. in
أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى علاج اعتلال ٠ - الهيموجلوبين.Any model of the method, the method also includes the selection of breasts in need of treatment for hemoglobin-0 disease.
في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي (على سبيل المثالIn one embodiment, this disclosure provides a method for treating hemoglobinopathies in breasts (eg
إنسان) تشتمل على إدخال تركيبة الموصوف في الطلب الحالي تشتمل على خلايا معالجة بالهندسةhuman) comprising the insertion of the composition described in the present application comprising engineered treated cells
الوراثية معزلة وراثياً بها تعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟ للموقع 60, 715, 184-Is it genetically isolated with at least one genetic modification on the chromosome? For site 60, 715, 184-
TY y YYA y Te والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي . في نموذج ١ إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة أو تخفيضTY y YYA y Te, by which the expression of fetal hemoglobin in the mammal increases. In an additional 1 embodiment of this method, the method includes chemotherapy and/or radiotherapy for removal or reduction
خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية Land) لتكوين الدم .في الثديي. في أي نموذج من الطريقة,Primary cells or endogenous stem cells (Land) for hematopoiesis in the mammal. in any form of manner,
تشتمل الطريقة Lad على انتقاء تديي في حاجة إلى علاج اعتلال الهيموجلوبين.The Lad method involves the selection of patients in need of hemoglobinopathy treatment.
في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي (على سبيل المثالIn one embodiment, this disclosure provides a method for treating hemoglobinopathies in breasts (eg
إنسان) تشتمل على زيادة التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي بواسطة الطريقة الموصوفة في ٠ -_ الطلب الحالي.human) involving overexpression of fetal hemoglobin in the mammal by the method described in 0 -_ the present application.
في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -اعتلال الهيموجلوبين.In any form of any treatment method described, hemoglobin-8 is impaired - hemoglobinuria.
في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -ثلاسيميا.In any form of any treatment method prescribed, the disorder is hemoglobin 8 - thalassemia.
في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين فقر الدم المنجلي.In any form of any treatment method described, hemoglobinopathy is sickle cell anemia.
CARCAR
_ Ad —__ Ad —_
في أحد النماذج على أي من الطرق الموصوفة, تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدمIn one embodiment of any of the methods described, they are progenitor cells or hematopoietic stem cells
أو iPSCs ذاتية المنشاً إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا تكون مشتقة من نفس الثديي. فيor iPSCs are autologous to mammary, which means that the cells are derived from the same mammal. in
نموذج آخر على أي طريقة موصوفة, تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أوAnother example of any of the methods described are primary hematopoietic stem cells or hematopoietic stem cells
IPSCs تكون غير LE As إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفسIPSCs are not LE As to mammalian, which means that the cells are not derived from the same
5 الثديي , ولكن تديي آخر من نفس النوع . على سبيل المثال ٠, يكون الثديي إنسان .5 mammals, but another mammal of the same species. For example 0, a mammal is a human.
في أحد النماذج على أي من الطرق الموصوفة, يمكن أن يكون تلامس أية خلية موصوفة في الطلبIn an embodiment on any of the methods described, the contact can be any cell described in the application
الحالي خارج الجسم الحي أو في المعمل أو في الكائن الحي.The current outside the living body, in the laboratory, or in the living organism.
في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يشتمل تلامس أية خلية موصوفة في الطلب الحالي علىIn another embodiment of any method described, the contact of any cell described in the present application includes
تلامس بعامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ ويحدث تعديل لا جيني فيContact with a factor that binds the genomic DNA of the cell on the chromosome? No genetic modification occurs
في أحد النماذج, يكون التعديل اللاجيني على الكرموسوم ؟ للموقع YA LTA YT,In one embodiment, is the epigenetic modification on the chromosome? For the site YA LTA YT,
17 (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري).17 (according to UCSC Genome Browser hg 19 Human Genome Collection).
في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يشتمل تلامس أية خلية موصوف في الطلب الحالي علىIn another embodiment of any method described, the contact of any cell described in the present application includes
تلامس بعامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع CIAL YT Te ا WY LYYA (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري), ويحدث تعديلContact with a factor that binds the genomic DNA of the cell on the chromosome? Location CIAL YT Te A WY LYYA (according to 19 UCSC Genome Browser hg human genome set), and modification occurs
لا جيني على الكرموسوم ؟, وبناءً عليه خفض التعبير عن /80111 أو 4555( MRNA .No gene on the chromosome?, and therefore reduced expression of /80111 or (4555) mRNA.
في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يشتمل تلامس أية خلية موصوف في الطلب الحالي علىIn another embodiment of any method described, the contact of any cell described in the present application includes
تلامس مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبيرContact with an effective amount of a formulation comprising at least a DNA-targeting enzyme or expression vector
يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA والذي بواسطته ١ لإنزيم الذي يستهدف حمضcarries the coding sequence for a DNA-targeting enzyme with which 1 for an enzyme that targets DNA
. MRNA بروتين,. mRNA is a protein
في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يشتمل تلامس أية خلية موصوف في الطلب الحالي علىIn another embodiment of any method described, the contact of any cell described in the present application includes
تلامس مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبيرContact with an effective amount of a formulation comprising at least a DNA-targeting enzyme or expression vector
يحمل متوالية wall لتشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA والذي بوا سطته ١ لإنزيم الذي يستهدف حمض DNA Yo يحدث تعديل لا جيني على الكرموسوم ؟ للموقع VYA Tem AL TT 117 (طبقاً لIt carries a wall sequence coding for an enzyme that targets DNA, and through which 1 of an enzyme that targets DNA Yo, an epigenetic modification occurs on the chromosome? For the website VYA Tem AL TT 117 (according to
CARCAR
_ _ UCSC Genome Browser hg 9 مجموعة جينوم بشري) وبناءً عليه خفض التعبير عن BCL11A أو بروتين MRNA . في أحد الجوانب, يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في نموذج آخر من A طريقة موصوفة, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم, الخلية البشرية المعزولة, أو خلية معزولة خارج الجسم الحي أو في المعمل. في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يكون التعديل الجيني الواحد على الأقل حذف. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني واحد على الأقل. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على UCSC Genome Browser (طبقاً ل TYY LVYALT— YA الكرموسوم 7 للموقع ,خالا Ye مجموعة جينوم بشري) لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين hg 9_ _ UCSC Genome Browser hg 9 human genome assembly) and accordingly reduced the expression of BCL11A or the mRNA protein. In one aspect, expression of fetal hemoglobin increases in mammals, relative to precontact expression. In another embodiment of A method described, the original cell is contacted to form blood, the isolated human cell, or a cell isolated ex vivo or in vitro. In another embodiment of any method described, at least one genetic modification is a deletion. In another embodiment of this and all other aspects described in the present submission, at least one epigenetic modification is present. In one embodiment, in the present application the use of an agent that binds the cell's genomic DNA on the UCSC Genome Browser (according to the TYY LVYALT—YA chromosome 7 locus, Xala Ye human genome set) to increase fetal hemoglobin in breasts or for the treatment of hemoglobinopathy hg 9
BCL11A في الثديي أو لخفض التعبير عن 00818 أو 56111/8, حيث يتم تخفيض التعبير عن . mRNA أو بروتين في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على V0 إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي أو لخفض التعبير عن MRNA أو 80111/8, حيث يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشقطر حمض NA 9 الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع ١ 0 77 A 0 1 += ١ AQ 0 7 ١ 1 0 1 ٠ 1 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. ٠ في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي أو لخفض التعبير عن mRNA أو 801118, حيث يحدث الإنزيم الذي يستهدف حمض DNA تعديل لا جيني واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ,١ وبناءً عليه يؤثر على التعبير عن ,٠١ في أحد النماذج, يكون التعديل اللا جيني واحد على الأقل عند الموقع BCLIIA أو mRNA Yo CAR gon نموذج آخر, يكون تأثير التعديل اللاجيني الواحد خفض التعبير BL 117 LVYA ,1:- 144 , 7 . MRNA عن 8061118 أو بروتين في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام أي الخلايا المعزولة الموصوف في الطلب الحالي لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في تديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي.BCL11A in mammals or to reduce the expression of 00818 or 56111/8, where the expression is reduced. mRNA or protein In one embodiment, in the present application the use of an effective amount of a combination comprising at least V0 DNA-targeting endonuclease or an expression vector carrying the coding sequence of a DNA-targeting endonuclease to increase fetal hemoglobin In mammals or for the treatment of mammary haemoglobinopathy or to reduce the expression of mRNA or 80111/8, wherein the endonuclease targets DNA and cleaves the genomic NA9 of the cell on the chromosome for position 1 0 77 A 0 1 += 1 AQ 0 7 1 1 0 1 0 1 and cause at least one genetic modification in it. 0 In one embodiment, the present application submits the use of an effective amount of a formulation comprising at least a DNA-targeting enzyme or an expression vector carrying the coding sequence for a DNA-targeting enzyme to increase fetal hemoglobin in breasts or to treat hemoglobinopathies in breasts or to reduce the expression of mRNA or 801118, whereby an enzyme that targets DNA causes at least one epigenetic modification of the cell's genomic DNA on chromosome 1 and accordingly affects the expression of 01 in one of In the models, at least one epigenetic modification is at the site BCLIIA or mRNA Yo CAR gon. Another model, the effect of one epigenetic modification is to reduce the expression of BL 117 LVYA,1:- 144, 7. mRNA for 8061118 or a protein. In one embodiment, the use of any isolated cells described in the present application to increase fetal hemoglobin in a patient or to treat mammary haemoglobinopathy is presented in the present application.
Lys بشرية مهندسة WA في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام تركيبة تشتمل على © معزولة لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي, حيث تتسمLys Engineered Human WA In one embodiment, in the present application, the use of a formulation comprising an isolated © is presented to increase fetal hemoglobin in the breast or to treat hemoglobinopathy in the breast, wherein it is characterized by
TAY خالا Tem AG YT Te الخلايا بتعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم للموقع مجموعة جينوم بشري) تم بواسطة عملية تلامس UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل أو ناقل DNA الخلايا مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض والتي بواسطتها يستهدف DNA تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض ٠ ,60 الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع DNA ويشطر حمض DNA حمض زايلكوينودنإ مجموعة جينوم UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل TYY لماص اتمبغالا, LY بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه.TAY cells Tem AG YT Te cells with at least one genetic modification on the chromosome of the locus human genome group) done by contact process UCSC Genome Browser hg 19 (according to or vector DNA cells with an effective amount of A combination comprising at least one acid-targeting endonuclease by which DNA targets expression carrying the coding sequence of an endonuclease that targets 0,60 genomic acid of the cell on the chromosome? UCSC Genome Browser hg 19 (according to TYY Atamegala sucker, LY human) and causes at least one genetic modification in it.
Lys بشرية مهندسة WA في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام تركيبة تشتمل على معزولة لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي, حيث تتسم VO الخلايا بتعديل لا جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ". في أحد النماذج, يكون التعديل اللاجيني (طبقاً ل 117 VTA, TA TT الواحد على الأقل على الكرموسوم 7 عند الموقع مجموعة جينوم بشري). في نموذج آخر, يتم تعديل لاجيني UCSC Genome Browser hg 9 واحد على الأقل على الكرموسوم ¥ بواسطة عملية تلامس الخلايا مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف DNA على الأقل على إنزيم يستهدف حمض Yo تعديل لا جيني واحد على DNA والتي بواسطتها يحدث الإنزيم الذي يستهدف حمض DNA حمض VT 60 الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ مما يؤثر على الموقع DNA الأقل في حمض مجموعة جينوم بشري) UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل TYY صخ اغالا 4 ويتسبب في ذلك.Engineered human Lys WA In one embodiment, the use of a formulation comprising an isolate to increase fetal hemoglobin in the breast or to treat mammary haemoglobinopathy, wherein the VO cells have at least one epigenetic modification on the chromosome is presented in the present application. In one embodiment, the epigenetic modification (according to 117 VTA, TA TT at least one on chromosome 7 at locus human genome set).In another embodiment, one UCSC Genome Browser hg 9 epigenetic at least on the ¥ chromosome by the process of cell contact with an active amount of a combination comprising or an expression vector carrying the coding sequence for a DNA-targeting enzyme at least one yo-acid-targeting enzyme a single epigenetic modification to the DNA by which the enzyme that DNA targets the VT 60 genomic acid of the cell on the chromosome?, affecting the lowest DNA location in the DNA of a human genome set (UCSC Genome Browser hg 19 (according to TYY Sakh Agla 4) And it causes.
CARCAR
h —_ _ في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام أي الخلايا المعزولة الموصوف في الطلب الحالي أو أي واحدة من التركيبات الموصوفة في الطلب الحالي لتصنيع دواء لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في تديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي. في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تحدث التركيبة زيادة في الهيموجلوبين الجنيني MRNA أو التعبير عن البروتين في خلية التلامس. في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة ذاتية Lael) , إلى الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع, أي, تكون خلايا التركيبة مشتقة أو تم حصدها من الثديي قبل أي تعديل موصوف . في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات ٠ الموصوفة غير ذاتية TE إلى الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في shal زرع, أي, لا تكون خلايا التركيبة مشتقة أو تم حصدها من الثديي قبل أي تعديل موصوف . في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, خلايا أي من التركيبات الموصوفة بحد أدنى من نوع HLA المطابق مع الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع. في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات ١ 25 الموصوفة خلايا أولية معزولة قبل أي تعديل موصوف . في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, خلايا أي من التركيبات الموصوفة تكون خلايا جذعية معزولة مستحثة متعددة القدرة قبل أي تعديل موصوف. ٠ في أحد النماذج على استخدام التركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة محفوظة بالتبريد قبل الاستخدام. من المعروفة أن هناك صور متغايرة مرتبطة ب HBF في /80111. تم إجراء ست GWAS من مستوى HOF (أو سمة مرتبطة Lay بدرجة عالية عدد خلية ]) في أفراد من ينحدرون من سلالة CARh —_ _ In an embodiment, the use of any of the cell isolates described in the present application or any one of the combinations described in the present application for the manufacture of a drug to increase fetal hemoglobin in Teddy or for the treatment of mammary haemoglobinopathy is presented in the present application. In one embodiment of use of the formulation described herein, the formulation induces an increase in fetal hemoglobin mRNA or protein expression in cell contacts. In one example of using the combination described in the present application, the cells of any of the combinations described are autologous (Lael), to the mammal that is the recipient of the cells in a transplant procedure, ie, the cells of the combination are derived from or harvested from the mammal prior to any modification described. In one embodiment of the use of the combination described in the present application, the cells of any of the combination 0 described are non-autologous TE to a mammal that is a recipient of cells in a transplanted shal, i.e., the cells of the combination are not derived from or harvested from the mammal prior to No modification described. In one embodiment of the use of the combination described in the present application, cells of any of the combinations described are minimally HLA-type-matched from the mammalian recipient of the cells in a transplant procedure. In one embodiment of the use of the combination described in the present application, the cells of any of the 1 25 combinations described are primary cells isolated prior to any modification described. In an embodiment using the combination described in the present application, the cells of any of the combinations In an embodiment using the combination described in the present application, the cells of any of the combinations described are isolated induced pluripotent stem cells prior to any modification described. 0 In one embodiment of the use of the composition described in the present application, the cells of any of the compositions described are cryopreserved prior to use. There are known variants associated with HBF in /80111. Six GWAS of the HOF level (or Lay-associated trait with high cell count []) were performed in individuals of the CAR offspring.
PVPV
.)١"-7( BCL11A أوروبية, أفريقية وأسيوية, كل منهم يميزصورة مغايرة مرتبطة بالسمة في نطاقEuropean, African and Asian BCL11A (1"-7). Each of them distinguishes a variant associated with the trait in its range.
HOF ونتسق مع ,)20 ,٠١ ,9( و5 -ثلاسيميا SCD ترتبط نفس الصور المغايرة بالحدة الإكلينيكية ل كمحدد رئيسي لهذه الاضطرابات. وتم تقدير التباين في 80611178 ليشرح -715 من التباين في بوصفهم الأكثر ارتباطا SNPs وتم تمييز أربع مختلفة (67,07 ,7( HDF السمة في مستوى 5766432 5 (1) 54671393 (A) rsl 18868658 ,)1( rsl427407) بدرجة عالية السمة © إنترون-؟ BCLITA من بعضها البعض في kb ¥ الحارسة داخل SNPS تتجمع :))١-٠١(HOF and consistent with (9,01,20) and 5-thalassemia SCD The same variants are associated with clinical severity of L as a major determinant of these disorders. Variance in 80611178 was estimated to explain -715 of the variance in as the most closely related Four different SNPs (67,07,7) HDF were characterized for the trait at the 5766432 5 (1) 54671393 (A) rsl 18868658 (1( rsl427407), (1) 5766432, with a high trait score © Intron-? BCLITA from each other in kb ¥ the guard inside SNPS congregate :)(1-01)
HOF الحارسة تشرح ارتباط SNPs (الأشكال "أ و١١ب). يبدو أن الأنماط الفردانية التي تتضمن 861118 عند موضع SNPS تم ربط خمسين .)47 ,١١( فردي SNP بصورة أفضل من أي -٠١ x © > P) بدلالة جينوم واسعة HBF داخل إنترون-؟ ربط بمستوى SNPS وسبعة وعشرين على الرغم من جهود إعادة عمل المتواليات على المقياس الكبير, ولم يتم وصف تشفير الصورة (A ٠ (£7) BCL11A المغايرة ل 50111 عند موضع HOF لتعيين إشارة الارتباط مع CSSCD فيما سبق؛ استخدم المخترعون وأفادوا بارتباط قوي مع 14671393 )£7( في تلك الدراسة؛ تم إدخال 51427407. وتم تمييز أيضاً في الدراسات السابقة باعتبار rsl 1886868 هما 18766432 و SNPs اثنين إضافيين من في مجموعة فرعية من .)51 ,1١ ٠١ ,8( الحارسة الأكثر ارتباطا بالسمة بدرجة عالية SNPs ١ الحارسة متوفرة؛ ولم تكن نتيجة SNPS التي كانت الأنماط الجينية لها عند جميع (VYA الأفراد (ع- الارتباط ذات دلالة عند 54671393 8766432 أو 1886868 ل بعد التكييف على الأنماط 51427407 وبالعكس؛ ظل الارتباط ذي دلالة بدرجة عالية بالنسبة ل ¢r81427407 الجينية عند (الجدول 4). بناءً عليه, م rs 18868681 8766432 54671393 عند التكييف على في نطاق 01155 الشبيهة بالكريات HBF الأكثر ارتباطاً بقوة بمستوى SNP تمثل 1427407 ٠ الحارسة الموصوفة فيما سبق. SNPs الحمراء وتفسر ارتباط السمة بصورة أفضل من أظهر التحليل الشرطي ارتباطات ظلت ذات دلالة بعد التكيف على 181427407 وكان الارتباط في 157599488 ;(1\ =) + x 4,11 = P) DHS +55 المتبقي الأكثر دلالة ل 157606173 في -٠١ * 3,47 = P) أقل دلالة بصورة طفيفة فقط GIS, (£F) سبق Led أوردناه 3, DHS +62 النادرة لصورة مغايرة داخل ثلاث 01155 إشارات DNA ولم يعطي تحليل متوالية .)١ (الجدول )٠١ YO .)# (الجدول HBF إضافية مستقلة مرتبطة بإشاراتThe sentinel HOF explains the association of SNPs (Figs. A and 11b). It appears that haplotypes including 861118 at the SNPS locus linked fifty SNP haplotypes (11, 47) better than any - 01 x © > P) genome-wide marker HBF within an intron- ?association level of SNPS-twenty-seven Despite large-scale sequencing efforts, image coding has not been described (A 0 (£7) BCL11A variant 50111 at the HOF locus to map association signal with CSSCD previously; the authors used and reported strong association with 14671393 (£7) in that study; 51427407 was entered. The above are 18766432 and two additional SNPs from in a subset of (8, 01, 11, 51). The most highly associated guard SNPs for the trait were (8, 01, 11, 51). The most highly associated sentinel 1 sentinel SNPs were available; no SNPS result was available. whose genotypes were in all VYA individuals (p-significant correlation at 54671393 8766432 or 1886868 for after conditioning on the 51427407 genotypes and vice versa; the correlation remained highly significant for the genotype ¢r81427407 at (Table 4). Accordingly, m rs 18868681 8766432 54671393 when conditioning on the 01155 globule-like range HBF most strongly associated with the SNP level represented the 0 1427407 guard described above. The red SNPs better explain the association of the trait than shown. Conditional analysis Correlations remained significant after adjustment for 181427407 and the correlation was in 157599488 ;(1\=) + x 4,11 = P) DHS +55 most significant residual for 157,606173 in -01 * 3.47 = P ) is only slightly less significant GIS, (£F) previously reported by Led 3, DHS +62 rare variant image within three 01155 DNA signals and did not give sequence analysis 1. (Table 1) 01 YO .)# (Table HBF Additional Independent Linked Signals
CAR eA تبين للمخترعين أن ارتباط عامل الانتساخ المحدد بالأليل transcription factor (TF) متعلق بالتعبير عن /80111. وتم إجراء دراسات كيميائية حيوية محددة بالأليل باستخدام زيجوت متغايرة الآلائل إخباري للتحكم في الفروق تبادلية التأثير بين العينات لضمان وفرة متساوية لكل من الآلائل؛ وتم إثباتها بالتمثيل المتساوي للآلائل في gDNA المتزاوج (الأشكال "ب (zs تبين asa ا © 1427407 مباشرة عند مركز قمة ارتباط GATAL و TALI عند 62+ DHS (الشكل رقم (RY في تجارب ChIP المجراة؛ تم تعريض الكروماتين للموجات الصوتية إلى 50٠0 زوج قاعدة تقريباً من الشظايا. وتم عمل متواليات Sanger من خمس عينات بشرية رئيسية من مادة منتجة شبيهة بالكريات الحمراء لزيجوت متغايرة الآلائتل ل 1427407 rs مستخدمة ل 6010-0068 عند 01155 شبيهة بالكريات الحمراء. كان SNP الآخر لزيجوت متغايرة الآلاثل فقط في نطاق Ove زوج قاعدة من 5 ٠ 1427407 في أي من هذه العينات هو 157599488 (4 ١ 7-زوج قاعدة 'V من (S1427407 والتي كانت متغايرة الزيجوت في اثنتين فقط من العينات الخمس. لم يقع SNP هذا داخل محفزات Lis) 67/1 أو TALL . بل بناءً عليه بدا من غير المحتمل أن SNP آخر داخل 62+ DHS يمكن أن يفسر ارتباط TF الملاحظ المحدد بالأليل. إضافة لذلك, اكتشف المخترعون أن هناك ارتباط بين التعبير عن BCLIIA ومستوى HPF توفر Vo دراسات المخترعين تقدير للتغيير في التعبير عن 8011178 يمكن أن يترتب عليه زيادة ذات دلالة إكلينيكياً في مستوى HDF - من بين مجموعة محدودة من سلالات خلية شبيهة بأرومة لمفاوية بشرية أوردت Lad سبق Ale بينية لأليل A مرتبط ب HDF عالي ل 54671393 بتعبير منخفض عن .)١١( 861118 أخفق تمديد هذه التجارب على مجموعة أكبر من سلالات ذات نمط جيني في التأكيد على هذه الملاحظة. ومن ثم؛ تبين للمخترعين أن التعبير عن 801117 لتأثير النوع الفرداني ٠٠ ل 1s1427407-rs7606173 المرتبط HDF في سياق محدد بشبيه بالكريات الحمراء» ومن الممكن أن يتسق مع نتائج حساسية | DNase اختلف التعبير عن MRNA /806111 في المواد المنتجة الرئيسية الشبيهة بالكريات الحمراء بمقدار ٠١" ضعفاً بين -1 rs1427407-1s7606173 HOF 6 المرتفع والأنماط الفردانية ©-6 المنخفضة في Jal) HBF رقم (FF على نحو مناظر؛ كانت مستويات HBF المتوسطة 796 و 77,1 في متغايرات الزيجوت homozygotes de G-C 4 T-G remains Yo الترتيب (الشكل رقم (ZV من الجدير بالملاحظة؛ تمت ملاحظة النتائج التي تبين التعبير المحدد بالأليل عن /806111 في الخلايا البشرية الرئيسية الشبيهة بالكرياتCAR eA The authors show that allele-specific transcription factor (TF) binding is related to the expression of /80111. Allele-specific biochemical studies were performed using informative heterozygotes to control for cross-reactivity differences between samples to ensure equal abundance of both alleles; It was demonstrated by equal representation of alleles in paired gDNA (Figs. b (zs) showing asa © 1427407 directly at the center of the binding peak of GATAL and TALI at 62+ DHS (Fig. RY In in vivo ChIP experiments, chromatin was sonogrammed to approximately 5,000 base pairs of fragments.Sanger sequences were made from five primary human samples of erythrocyte-like producers of heterozygotes heterozygotes for 1,427,407 rs used for 6010-0068 at erythroid-like 01155. The other SNP of heterozygote was only in the Ove range 0 5 base pair of 1427407 in any of these samples is 157599488 (4 1 7-base pair 'V' (S1427407) which was heterozygous in only two of the five samples. This SNP did not fall within promoters of Lis 67/1 or TALL. Rather, it seemed unlikely that another SNP Within 62+ DHS could explain the observed allele-specific association of TF.In addition, the inventors discovered that there was an association between BCLIIA expression and HPF level Vo the inventors' studies provide an estimate of the change in expression of 8011178 that could be associated on him CLINICALLY SIGNIFICANT INCREASE IN HDF LEVEL Among a limited group of human lymphoblastoid-like cell lineages, Lad reported an Ale precursor between a high HDF-associated A allele of 54671393 with low expression of . (11). 861118 Extending these trials to a larger group of genotyped strains failed to confirm this observation. and then; The authors show that expression of 801117 of haplotype 0.0 of 1s1427407-rs7606173 associated with HDF in a specific erythrocyte-like context” is likely to be consistent with the results of susceptibility. DNase expression of mRNA /806111 in primary erythrocyte-like producers differed by 01"-fold between rs1427407-1s7606173 HOF6 high and low©-6 haplotypes in HBF (Jal) no. correspondingly; median HBF levels were 796 and 77.1 in homozygotes de G-C 4 T-G remains Yo order (Fig. ZV). Noteworthy; results showing Allele-specific expression of /806111 in human primary spheroid cells
CARCAR
الحمراء في الخلايا متغايرة الزيجوت للنمط الفرداني rs1427407-rs7606173 وبالتالي تعكس الآثار المتواضعة على التعبير عن /80111 التأثيرات المشتركة لجميع SNPs الوظيفية في نطاق النمط الفرداني. في حين يكون إرث النمط الفرداني 8611178 الواقي مفيد إكلينيكياً على أساس المجموعة (5, ,٠١ 90), ظل متوسط مستوى HBF في متغايرات الزيجوت 1-6 أدنى من ذلك © المطلوب لمنع الوفاة جراء .SCD ومع ذلك؛ تتوقع حساسية مستوى HBF للتعبير عن (BCL1IA أن تخفيف حدة المرض يمكن أن يتطلب تخفيض متواضع إضافي فقط في التعبير عن 86111/8. درس المخترعون أيضاً التتظيم التطويري لجينات جلوبين و86111/5 . أثناء التطوير البشري؛ تم استبدال جلوبين- 0 مشتق من كيس الصفار في الأشهر الثلاثة الأولى بجلوبين-ا] مشتق من كبد جنين. وبعد الميلاد؛ Ui خروج الكريات الحمر من الكبد إلى نخاع العظم؛ يتم إخماد جلوبين- لا ٠ تدريجياً ويسود جلوبين-لا. ويحدث تحويل مفرد فقط في التعبير عن جين جلوبين في تطور الجنين. وأثناء هذا التحول؛ الذي يحدث عند منتتصف الحمل؛ تعبر الكريات الحمراء الأولية المشتقة من كيس الصفار الدائرة عن الجلوبينات في المرحلة الجنينية Oy و IHD في حين تعبر الكريات الحمراء المحددة بكبد الجنين عن الجلوبينات في مرحلة البلوخ 1لا و 02( طبقاً لهذا التحول التطوري؛ يتم التعبير عن 806111/8 في السلالة المحددة ولكن ليس في السلالة الشبيهة بالكريات الحمراء في ١ المرحلة الأولية والمطلوبة للتغيير في التعبير عن جين الجلوبين (OF V1) في سلالات مبلغ 52.0-64.4+ 80111 محورة وراثياً ثابتة عند ٠١,5 000, تمت ملاحظة التعبير عن lacZ فقط في منشم الكبد الجنيني وليس في الدم الدائر داخل الجنين, المشيمة أو كيس الصفار (الشكل رقم +أ). هذه النتائج, مجتمعة مع نتيجة التعبير عن 1802 في الأرومات الحمراء المحددة بالكبد الجنيني dpc ١7,5 ولكن ليس في الخلايا الحمراء الأولية الدائرة المشتقة من كيس ٠٠ الصفار (الشكل رقم ؛ب), توضح أن متواليات محسن مركب BCLITA تثير التعبير في نمط محدد على نحو تطويري متسق مع تحويل جين الجلوبين داخلي المنشاً. تم توليد سلسلة من طافرات الحذف لتتقيح أدنى العناصر المطلوبة لنشاط محسن شبيه بالكريات الحمراء. كانت المتواليات التي تحتوي على المركز +58 0115 كافية لنشاط محسن شبيه بالكريات الحمراء. كانت تلك المتواليات التي لا تحتوي سوى على عناصر +67 أو oot المحيطة غير قادرة YO على توجيه التعبير عن جين شبيه بالكريات الحمراء (الشكل رقم 1( لاختبار قدرة DHSs على تحسين التعبير الجيني في المواد المنتجة للكريات الحُمر البشرية الرئيسية, استخدمنا توصيل فيروسة CARerythropoiesis in cells heterozygous for the rs1427407-rs7606173 haplotype and thus the modest effects on expression of /80111 reflect combined effects of all functional SNPs within the haplotype range. While the protective legacy of haplotype 8611178 was clinically useful on a group basis (5, 01,90), the mean HBF level in heterozygotes 1–6 remained below that required to prevent death from SCD. However; The sensitivity of the HBF level of BCL1IA expression predicts that disease alleviation could require only a modest additional reduction in the expression of 86111/8. The inventors also studied the developmental regulation of the globin and 86111/5 genes. During human development, globin- was replaced 0 is derived from the yolk sac in the first trimester with globin-a] derived from fetal liver.After birth;Ui erythrocytes exit from the liver into the bone marrow;globin-la 0 is gradually suppressed and globin-la predominates.Single conversion occurs During this transition, which occurs at mid-gestation, primary erythrocytes derived from the circulating yolk sac express globins in the embryonic stage Oy and IHD, while erythrocytes specific to the fetal liver express globins in baloch stage 1la and 02) According to this evolutionary transition, 806111/8 is expressed in the selected progeny but not in the erythroid-like progeny in prophase 1 and is required for the change in expression of the globin gene (OF V1) in progenitors Amount of 52.0-64.4+ transgenic 80111 fixed at 01.5 000, expression observed lacZ was detected only in the fetal hepatocyte and not in the circulating blood within the fetus, placenta or yolk sac (Fig. A). These results, combined with the result of expression of 1802 in 17.5 dpc fetal liver-specific erythroblasts but not in 00 yolk sac-derived primary erythroblasts (Fig. b), indicate that BCLITA enhancer sequences Elicit expression in a developmentally defined pattern consistent with endogenous globin gene transfer. A series of deletion mutants were generated to purify the minimum elements required for enhanced erythrocyte-like activity. Sequences containing the +58 0115 center were sufficient for enhanced erythrocyte-like activity. Those sequences containing only the flanking +67 or oot elements were unable YO to direct expression of an erythroid-like gene (Fig. 1) to test the ability of DHSs to improve gene expression in primary human erythropoietic subjects , we used CAR virus delivery
مه عدسية لنظام مبلغ lida GFP لما تم وصفه من قبل (39). على نحو مماثل, التعبير الجيني عن +/ه DHS المحسن في تجربة المبلغ المذكورة (الشكل رقم .)١ قرر المخترعون توليد سلالات خلايا مع حذف محسن 18 Bell لبحث متطلبات المحسن المحسن yell عن 806111/8. تم توليد خلايا تابتة شبيهة بالكريات الحمراء مع تمزيق المحسن. نظراً لأنه لم © يكن هناك سلالات خلايا بشرية مناسبة في مرحلة البلوخ شبيهة بالكريات الحمراء, وكدليل على المبدأ, تحول المخترعون إلى النظام الفأري. تعتمد خلايا ابضاض p30 الاحْمِرَارِيٌ بالفأر (MEL) على 801118 لجلوبين التعبير الجيني للنمط في مرحلة البلوغ (VE) وحدد المخترعون محسن مركب ages بالكريات الحمراء متشابه عند الموضع أورثو عند Bell ١18. من Ll لإنترون-7. وعلى غرار إنترون-؟" محسن 801118 المرقم ب GWAS بشري, اتسمت هذه المتواليات بسلسلة من خلايا ٠ شبيهة بالكريات الحمراء محددة ب DHSS إضافة لذلك, تمت زخرفة هذه المتواليات بواسطة ,H3K27ac 3 H3K4mel وافتقر ,H3K2Tme3 5 H3K4me3 وتم شغلها بكل من 68181 TALI في كروماتين من الفأر شبيه بالكريات الحمراء (الشكل رقم (A تبين أن العناصر التتظيمية المركبة التي تتضمن سلسلة من DHSS المتجاورة تعد هامة للتعبير عن الجين عند مواقع متعددة؛ بما في ذلك من بين أخريات منطقة التحكم في موضع جلوبين-بيتا؛ والمتواليات المحافظة للأنواع المتعددة ١ لجلوبين-ألفاء والمنطقة التتظيمية ل IgH )00-07( ولاحظنا السمات الفريدة المحددة بالنوع للمحسن المركب. على سبيل المثال, حدد المخترعون متواليات الفأر المحافظة لكل واحد من 014158 +17, oot 5 oA+ البشرية الثلاث, وتبين لهم أن الحساسية المفرطة ل DNase ١ للخلايا شبيهة بالكريات الحمراء عند +7 5 +00 aay, ذلك افتقرت المتواليات المحافظة oA إلى الحساسية المفرطة ل DNase | . ٠ | تحقق PCR وتلطيخ Southern من استئصال القسم 64 Kb Te fo المتعلق بالإنترون من 98 في ثلاث نسائل MEL فريدة واثنتين من نسائل الخلية اللمفاوية طليعة 8 الفريدة (الشكل رقم ٠ (4 كانت نقاط الفصل ذات المتوالية طبقاً ل Sanger مميزة لانشطار يتوسط فيه TALEN بإصلاح NHEJ لاحق (الشكل رقم .)٠١ عند حذف القسم المتعلق بالإنترون؛ لاحظنا انخفاض كبير في منتسخ /806111 في نسائل خلية MEL بواسطة 41-0068 باستخدام أزواج بادئ تكشف YO وصلات إكسون «JE وبامتداد أو بعد الحذف (الشكل رقم (To التعريفات CARA lenticular effect of the lida GFP sum system has been described before (39). Similarly, gene expression of +/e DHS enhanced in the reported amount experiment (Fig. 1). The inventors decided to generate cell lines with the deletion of the 18 Bell enhancer to investigate the requirements for the yell enhancer for 806111/8. . Erythrocyte-like penetrating cells with enhanced disruption were generated. Since there were no suitable human erythrocyte-like cell lines available at the Baluch stage, as a proof of principle, the inventors turned to the mouse system. Mouse p30 erythroid leukemia (MEL) cells are based on 801118 globin gene expression of the adulthood phenotype (VE) and the authors identify an erythrocyte ages complex enhancer homologous at the ortho locus at Bell 118. From Ll. for intron-7. Similar to intron-?” enhancer 801118 numbered in a human GWAS, these sequences were characterized by a series of erythrocyte-like 0 cells specific for DHSS. In addition, these sequences were transcribed by H3K27ac3, H3K4mel, and lacked H3K2Tme3. 5 H3K4me3 and were occupied by each of 68181 TALI in mouse erythrocyte-like chromatin (Fig. A). Complex regulatory elements that include a series of adjacent DHSSs have been shown to be important for gene expression at multiple sites, including Among others are the control region of the beta-globin locus; the conservative sequences of multiple 1-alpha-globin species and the IgH regulatory region (00-07) and we observed unique species-specific features of the combined enhancer. For example, the authors identified conservative mouse sequences for each One of 014158 +17, oot 5 oA+ human subjects, found to have DNase 1 hypersensitivity to erythroid cells at +7 5 +00 aay, that conservative oA sequences lacked hypersensitivity to erythrocytes DNase|.0|PCR and Southern staining verified the excision of the 64 KbTe fo section related to intron 98 in Tl. Three unique MEL clones and two unique pro-8 lymphocyte clones (Fig. 01 when the section relating to the intron is omitted; We observed a significant decrease in the /806111 transcript in MEL cell clones by 41-0068 using primer pairs that detect YO connections of the exon “JE” and with an extension or after a deletion (Fig.
-ه- للملائمة؛ يتم في هذه الوثيقة تجميع تعبيرات محددة مستخدمة في الطلب بالكامل (بما في ذلك المواصفة؛ (AB وعناصر الحماية المرفقة). ما لم يتم ذكر ما يخالف ذلك؛ يكون لجميع التعبيرات التقنية والعلمية المستخدمة في هذه الوثيقة نفس المعنى وفقاً لما يتم إدراكها بوجه عام بواسطة ذوي المهارة العادية في المجال الذي ينتمي إليه الاختراع. © وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, العبارة "عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم Y للموقع TOY ,7748 TIAL YT Te يشير إلى جزيئات صغيرة؛ أو أحماض نووية؛ بروتينات, ببتيدات؛ أو قليل النيوكليوتيدات التي يمكن of ترتبط بالموقع داخل حمض DNA الجينومي (على سبيل المثال, الكرموسوم ؟ للموقع LYALL TAG TT 117) ويخمد التعبير عن 8061118 أو بروتين mRNA في خلية بنسبة على الأقل 770 مقارنة بحمض MRNA ٠ أو مستوى بروتين 80611178 في خلية غير معالجة بمثل هذا العامل. في أحد النماذج, يتداخل العامل " مع تفاعلات 8011178 مع شركاء ربط 8011178 , " وفقاً لاستخدام تلك العبارة في الطلب الحالي. كما هو مستخدم هناء يشير التعبير sin’ صغير" إلى عامل كيميائي بما في ذلك؛ على سبيل المثال وليس الحصرء ببتيدات؛ أو شبيهات الببتيد؛ أو أحماض أمينية؛ أو نظائر حمض أميني؛ أو عديد Vo النيوكليوتيدات» أو نظائر عديد النيوكليوتيدات؛ أو أبتامرات؛ أو نيوكليوتيدات» أو نظائر نيوكليوتيدات أو مركبات عضوية أو غير عضوية (أي؛ بما في ذلك مركبات عضوية غير متجانسة أو عضوية فلزية) لها وزن جزيئي أقل من حوالي ٠٠٠٠١ جم لكل مول؛ مركبات عضوية أو غير عضوية لها وزن جزيئي أقل من حوالي 5080850 جم لكل مول؛ مركبات عضوية أو غير عضوية لها وزن جزيئي أقل من حوالي ٠٠٠١ جم لكل مول؛ مركبات عضوية أو غير عضوية لها وزن جزيئي أقل من حوالي PRS ٠ جم لكل مول» وأملاح» واسترات وأشكال أخرى مقبولة صيدلانياً لهذه المركبات. يمكن أن يكون "الحمض gyal كما تم وصفه هناء عبارة عن RNA أو (DNA ويمكن أن يكون مفرد أو مزدوج الجديلة؛ ويمكن اختياره. على سبيل (JB من مجموعة تشتمل على: حمض نووي يشفر بروتيد ذو فائدة؛ أوليجو نيوكليوتيدات؛ نظائر حمض نووي؛ على سبيل المثال ببتيد--“حمض نووي PNA (peptide— nucleic acid (PNA) متمم -كاذب pseudo-complementary (PNA (pc-PNA) Yo حمض نووي ثابت locked nucleic acid (LNA) إلخ. تشتمل متواليات الحمض الأميني المذكورة؛ على سبيل المثال وليس (oan) متوالية حمض أميني تشفر CAR-e- for convenience; Specific expressions used in this document are compiled in their entirety (including Specification; (AB) and the accompanying claims). Unless otherwise stated, all technical and scientific expressions used in this document have the same meaning as they are specifically perceived. Generalized by those of ordinary skill in the field to which the invention belongs © As used in the present application, the phrase “a factor that binds the genomic DNA of a cell on the Y chromosome of locus TOY ,7748 TIAL YT Te refers to small molecules; or acids Nuclear; proteins, peptides, or oligonucleotides that can bind to a site within genomic DNA (eg, chromosome ? of locus LYALL TAG TT 117) and suppress expression of 8061118 or protein mRNA in a cell by At least 770 compared to a mRNA of 0 or a protein level of 80611178 in a cell not treated with such an agent.In one embodiment, the agent interferes with “8011178 interacts with 8011178 binding partners,” as that phrase is used in the present application. As used herein indicates The expression 'sin' is lowercase" to a chemical agent including; for example and not exclusive peptides; or peptide analogues; or amino acids; or amino acid analogues; or “Vo polynucleotides” or polynucleotide analogues; or aptamers; or nucleotides” or analogues of nucleotides or organic or inorganic compounds (that is, including heterocyclic organic or organometallic compounds) having a molecular weight less than about 00001 g per mole; organic or inorganic compounds having a molecular weight less than about 5080850 g per mole; organic or inorganic compounds having a molecular weight less than about 10001 g per mole; Organic or inorganic compounds having a molecular weight less than about PRS 0 g per mole and salts, esters and other pharmaceutically acceptable forms of these compounds. The 'gyal acid' as described here can be either RNA or DNA and can be single or double-stranded; eg JB can be selected from a group comprising: a nucleic acid that encodes a protein of interest oligonucleotides; analogues of a nucleic acid; for example, peptide— “PNA (peptide— nucleic acid (PNA) pseudo-complementary (PNA (pc-PNA) Yo) fixed nucleic acid locked nucleic acid (LNA) etc. include amino acid sequences listed, for example but not (oan) an amino acid sequence that encodes CAR
اج بروتينات؛ على سبيل المثال التي تعمل ككوابت للاستنساخ؛ وجزيئات مضادة لاتجاه النسخ؛ وجزيئات مضادة لاتجاه النسخ» والريبوسومات 805855005 ؛ ومتواليات حمض نووي صغيرة antisense molecules مثبطة؛ على سبيل المثال وليس الحصر RNAi siRNA shRNAi (RNAI دقيقة «(MRNAI) أوليجو نيوكليوتيدات oligonucleotides مضادة لاتجاه النسخ إلخ. © المقصود بعبارة 'يتداخل مع تفاعلات BCLITA مع شركاء ربط BCL11A " أن كمية من التفاعل لبروتين 861117 مع شريك رابط BCL11A على الأقل 75 أقل في المجموعات المعالجة بمثبط 861118 , وبعد ذلك المجموعة المقارنة, ومجموعة المقارنة, حيث لا يكون هناك أي مثبط 806178 موجود. من المفضل أن كمية من التفاعل من البروتين 861118 مع شريك رابط 806118 في مجموعة معالجة بمثبط IA 8611 على الأقل 7٠١ أقل, على الأقل 770 أقل, على Ys الأقل 770 أقل, على الأقل 746 أقل, على الأقل 75٠ أقل, على الأقل 700 أقل, على الأقل 1776 أقل, على الأقل ZA أقل, على الأقل Za أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠-ضعف أقل, أو أكثر من مجموعة معالجة بمجموعة مقارنة لم تتم فيها إضافة أي مثبط BCL11A . عند أدتى حد, يمكن اختبار تفاعل 8011178 بواسطة تحديد كمية من 8611178 Yo ترتبط بشريك رابط 801117 باستخدام التقنيات القياسية في المجال, بما في ذلك, ولكن ليس على سبيل الحصر, قياس الطيف الكتلي, الترسيب المناعي, أو اختبارات الترشيح بالجل. بصورة بديلة, أو إضافة لذلك, يمكن اختبار فعالية 861118 بواسطة قياس التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني عند MRNA أو مستوى بروتين بعد العلاج باستخدام مثبط 8611178 المرشح. في أحد النماذج, تمثل فعالية 11/8 801 تفاعل 11/8 861 مع شركاء الربط الخاصة به: (GATA-1 ٠ 06-1 مكونات معقد .RBBP7; MTA2 0210-3 « NURD وعلى هذا النحو, يمكن اعتبار أي جسم مضاد أو شظية منه, جزيء صغير, أو عامل كيميائي أو مركب يمكن أن يعوق هذا التفاعل Lie لنشاط 8011178 . وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "خلية معالجة بالهندسة الوراثية" يشير إلى خلية تشتمل على تعديل جيني واحد على الأقل, وفقاً لاستخدام هذا التعبير في الطلب الحالي. CARh proteins; For example, which act as cloning qubits; anti-transcriptional molecules; anti-transcriptional molecules and ribosomes 805855005; small nucleic acid sequences antisense inhibitory molecules; For example, but not limited to RNAi siRNA shRNAi (RNAi min) antisense oligonucleotides (MRNAI) antisense oligonucleotides etc. © 'interferes with BCLITA interactions with BCL11A-binding partners' means that the amount of interaction 861117 protein with BCL11A binding partner had at least 75% lower in the 861118 inhibitor-treated groups, and then the control group, and the comparison group, where no 806178 inhibitor was present. Treatment with an IA inhibitor 8611 at least 701 lower, at least 770 lower, at least 770 lower than Ys, at least 746 lower, at least 750 lower, at least 700 lower, at least 1776 lower, at least ZA is less, at least Za is less, at least 1-times less, at least 1-times less, at least 1-times less, at least 10-times less, at least 001-fold less, at least 0-fold less, or more than a control group treated with a control group in which no BCL11A inhibitor was added At two extremes, the interaction of 8011178 can be tested by quantifying the amount of 8611178 Yo bound to the binding partner 801117 using Industry standard techniques, including, but not limited to, mass spectrometry, immunoprecipitation, or gel filtration assays. Alternatively, or in addition, the efficacy of 861118 can be tested by measuring the expression of fetal hemoglobin at an mRNA or protein level after treatment with the candidate 8611178 inhibitor. In one embodiment, the activity of 11/8 801 represents the interaction of 11/8 861 with its binding partners: (GATA-1 0 06-1 components of the RBBP7 complex; MTA2 0210-3 “NURD”). As such, it can be considered Any antibody or fragment thereof, small molecule, chemical agent or compound that can inhibit this reaction Lie of activity 8011178. As used in the present application, the term "engineered cell" refers to a cell that includes at least one genetic modification, According to the use of this expression in the current request. CAR
سجن وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير 'تعديل جيني" يشير إلى تمزيق على المستوى الجينومي يترتب عليه تخفيض في التعبير عن 806111/8 أو نشاط في خلية. يمكن أن تتضمن التعديلات الجينية التمثيلية عمليات حذف, تطفيرات بإزاحة الإطار , طافرات نقطة, إزالة الإكسون, إزالة واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل 1 (DHS) DNAse (على سبيل المثال, LY “, ؛ أو المزيد من © مناطق (DHS إلخ. المقصود من التعبير 'يثبط التعبير عن 'BCLIIA أن كمية من التعبير عن 86111/8 تكون على الأقل 75 أقل في خلية أو مجموعة خلايا معالجة بإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA عن خلية قابلة للمقارنة, خلية مقارنة أو مجموعة خلايا, حيث لا يوجد أي إندونيوكلياز يستهدف حمض 8/لا0 . ومن المفضل أن تبلغ النسبة المئوية من التعبير عن 8611178 في مجموعة معالجة على الأقل 2٠0 Ye أقل, على الأقل 77١0 أقل, على الأقل 770 أقل, على الأقل 7460 أقل, على الأقل 75٠ أقل, على الأقل 7650 أقل, على الأقل Tye أقل, على الأقل 780 أقل, على الأقل 790 أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١"-ضعف أقل, على الأقل ٠--ضعف أقل, على الأقل ٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ١٠٠٠-ضعف أقل, أو أكثر من مجموعة معالجة مقارنة قابلة للمقارنة لا تتم Led إضافة أي إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA . Vo المقصود من التعبير 'يثبط نشاط /80111 " أن كمية من النشاط الوظيفي ل 861117 على الأقل 2 أقل في خلية أو مجموعة WIA معالجة بالطرق الموصوفة في الطلب الحالي, من الخلية القابلة للمقارنة, الخلية أو المجموعة المقارنة, حيث لا يوجد أي إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA . ومن المفضل أن تكون النسبة المئوية من نشاط 801117 في مجموعة معالجة بمتبط IA 8061-1 على الأقل 7٠١ أقل, على الأقل 77١0 أقل, على الأقل 7760 أقل, على الأقل 740 أقل, على الأقل 756 ٠ أقل, على الأقل 760 أقل, على الأقل 7970 أقل, على الأقل 780 أقل, على الأقل 7960 أقل, على الأقل -١ ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل 5- ضعف أقل, على الأقل ٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ١٠٠٠-ضعف أقل, أو أكثر من مجموعة معالحة بمقارن قابل للمقارنة لا تتم Led إضافة أي إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA . على أدنى تقدير, يمكن اختبار نشاط 8011178 بواسطة تحديد كمية التعبير عن 118 BCL على مستويات Yo البروتين أو MRNA , باستخدام التقنيات القياسية في المجال. بصورة بديلة, أو إضافة لذلك, يمكن تحديد نشاط ,861117 باستخدام بنية مبلغ, حيث تكون بنية المبلغ حساسة لنشاط 861118 . CARImprisoned according to its use in the present application, the term 'genetic modification' refers to disruption at the genomic level that results in a reduction in the expression of 806111/8 or activity in a cell. Representative genetic alterations could include deletions, frameshift mutations, point mutations, exon removal , removal of one or more sites hypersensitive to 1 (DHS) DNAse (eg, LY “), or more © (DHS) regions etc. The expression ‘inhibits expression of BCLIIA’ is meant The amount of expression of 86111/8 is at least 75% lower in a cell or group of cells treated with an endonuclease that targets DNA than in a comparable cell, control cell or group of cells, in which there is no endonuclease that targets DNA 8/No0. The percentage of expression of 8611178 in the treatment group is at least 200 Ye less, at least 7710 less, at least 770 less, at least 7460 less, at least 750 less, at least 7650 less, at least Tye less, at least 780 less, at least 790 less, at least 1-times less, at least 1"-times less, at least 0--times less, at least 01-times less, at least , 100-fold less, at least 1,000-fold less, or more than a comparable control treatment group Led No DNA-targeting endonuclease added. Vo The expression 'inactivates /80111' means that the amount of functional activity of 861117 is at least 2 less in a WIA cell or group treated with the methods described in the present application, than in the comparable cell, comparison cell or group, where there is no Any endonuclease that targets DNA Preferably, the percentage of 801117 activity in the IA 8061-1 co-treated group should be at least 701 lower, at least 7710 lower, at least 7760 lower, at least 740 lower. , at least 756 0 less, at least 760 less, at least 7970 less, at least 780 less, at least 7960 less, at least -1 times less, at least 1-times less, at least-5 At least 100-fold lower, at least 100-fold lower, at least 1000-fold lower, at least 1000-fold lower, or more than a comparable treatment group Led No DNA-targeting endonuclease is added. At a minimum, the activity of 8011178 can be tested by quantifying the expression of 118 BCL at the levels of the Yo protein or mRNA, using standard techniques in the art. Alternatively, or in addition, the activity of 861117 can be determined using a sum structure, Where the sum structure is sensitive to the activity of 861118. CAR
دوهDuh
تكون متوالية موقع جلويين-7 قابلة للتعرف عليها بواسطة محفز ارتباط الحمض النووي 01061666The Gluin-7 site sequence is recognizable by DNA binding promoter 01061666.
.BCL11A لبنية acid-binding motif.BCL11A lactic acid-binding motif
في أحد النماذج, وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير DNA يستهدف إندونيوكليازIn one embodiment, as used in the present application, DNA expression targets an endonuclease
endonuclease يشير إلى إنزيم إندونيوكلياز يولد فاصل مزدوج الجديلة عند موضع مطلوب في © الجينوم (على سبيل المثال, الكرموسوم ؟ للموقع 60, (VY ,774 ,1 0-184 NT دون إنتاجendonuclease refers to an endonuclease enzyme that generates a double-stranded spacer at a desired locus in the genome (eg, chromosome ? of position 60, (VY 1,774, 0-184 NT) without producing
فواصل مزدوجة الجديلة غير مستهدفة غير مرغوب فيها. يمكن أن يكون حمض DNA الذي يستهدفUnwanted double-strand breaks. It could be the target DNA
إندونيوكلياز إنزيم إندونيوكلياز حادث بصورة طبيعية (على سبيل المثال, ميجا نيوكلياز بكتيريA naturally occurring endonuclease enzyme (eg, bacterial meganuclease
(bacterial meganuclease أو يمكن توليده بصورة اصطناعية (على سبيل المثال, إنزيمات ميجاbacterial meganuclease or can be generated synthetically (eg, megaenzymes
نيوكلياز meganuclease معالجة بالهندسة الوراثية, 18105 , أو ,ZFNs من بين أخريات).genetically engineered meganuclease nucleases, 18105, or ZFNs, among others).
٠ في نموذج آخر, وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير DNA" يستهدف إندونيوكلياز endonuclease " يشير إلى إنزيم إندونيوكلياز يولد فاصل مفرد الجديلة أو "شق" أو فاصل على إحدى جدائل الجزء الأساسي لسكر فوسفات phosphate sugar حمض DNA عند موضع مطلوب في الجينوم genome (على سبيل المثال, الكرموسوم 7 للموقع ٠ خالا كتناصن ات مب الا (TOY دون إنتاج فواصل بجديلة حمض DNA غير مستهدفة غير مرغوب فيها.0 In another embodiment, according to its use in the present application, the expression “DNA targets endonuclease” refers to an endonuclease enzyme that generates a single-stranded spacer or "cleft" or spacer on one of the strands of the acid phosphate sugar base DNA at a desired locus in the genome (for example, chromosome 7 for locus 0) can be used as a TOY homozygotes without producing unwanted off-target DNA strand breaks.
Vo وقفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير 'ناقل تعبير” يشير إلى جزيء الحمض النووي القادر على نقل حمض نووي HAT يرتبط به. ويكون أحد أنواع الناقل عبارة عن Fuad مما يشير إلى حلقة DNA مجدولة مزدوجة دائرية يمكن ربط قطاعات الحمض النووي الإضافية بها. يكون نوع آخر من الناقل عبارة عن ناقل فيروسي؛ حيث يمكن ربط قطاعات الحمض النووي الإضافية في الجينوم الفيروسي. وتكون نواقل محددة قادرة على التكاثر التلقائي في الخلية العائلة التي يتم إدخاله led (متلVo and according to its use in the present application, the term 'expression vector' refers to a nucleic acid molecule capable of transporting a HAT nucleic acid to which it binds. One type of vector is a Fuad, which indicates a circular double-stranded DNA loop to which additional DNA segments can be attached. Another type of vector is a viral vector; where additional DNA segments in the viral genome can be attached. Certain vectors are able to spontaneously replicate in the host cell into which the led is introduced (eg
٠٠ النواقل البكتيرية bacterial vectors التي يكون لها أصل تكاثر بكتيري ونواقل ثديية لجسيمات ملحقة بالكروموسومات). يتم دمج النواقل الأخرى (النواقل الثديية من غير الجسيمات الملحقة بالجسيمات) في مجموعة العوامل الوراثية للخلية العائلة عند الإدخال في الخلية العائلة؛ وبذلك يتم تكائره مع مجموعة العوامل الوراثية للخلية العائلة. علاوة على ذلك» تكون نواقل محددة قادرة على توجيه التعبير الوراثي للجينات التي ترتبط بها بصورة فعالة. يتم الإشارة إلى تلك النواقل في هذه الوثيقة00 Bacterial vectors that have a bacterial reproductive origin, and mammalian vectors for particles attached to chromosomes). Other vectors (non-sosome-associated mammalian vectors) are incorporated into the host cell's gene pool upon introduction into the host cell; Thus, it is replicated with a group of genetic factors of the family cell. Furthermore, specific vectors are able to effectively direct the expression of genes to which they bind. These vectors are referenced throughout this document
YO بتعبير 'ثواقل التعبير الوراثي الناتجة عن عودة الارتباط الجيني"؛ أو بصورة بسيطة أنواقل التعبير الوراثي". بوجه cole تكون نواقل التعبير الوراثي النافعة في تقنيات DNA الناتجة عن عودة الارتباطYO is referred to as 'recombinant gene expression haulers'; or simply expression vectors. In terms of cole expression vectors, they are useful in recombinant DNA technologies
OY AYOYAY
هه الجيني في صورة بلازميدات. في المواصفة الحالية؛ يتم استخدام تعبيرات 'بلازميد " وناقل" بصورة متبادلة حيث يكون البلازميد مستخدم بصورة متكررة من الناقل. مع هذاء يتضمن الاختراع صور أخرى من نواقل التعبير الوراثي؛ مثل النواقل الفيروسية J) فيروسات النسخ العكسي المعيبة للتكاثر, والفيروس البطيء lentiviruses ¢ والفيروس الغدي «adenoviruses والفيروسات المرتبطة © بالغدد adeno-associated viruses .)؛ التي تقوم بوظائف مكافئة. في نطاق ناقل التعبير الوراتي» يعني تعبير "مرتبط بصورة فعالة” أن متوالية النيوكليوتيد nucleotide 8008 محل الأهمية ترتبط بالمتواليات المنتظمة بطريقة تسمح بالتعبير الوراثي عن متوالية النيوكليوتيد (على سبيل المثال, في نظام الانتساخ / الترجمة في المعمل أو في الخلية المستهدفة عند إدخال الناقل في الخلية المستهدفةاا6©© ]18096 ). يتضمن تعبير 'متوالية منتظمة regulatory Yo 56006068 ' المعززات؛ والمعززات؛ وعناصر التحكم في التعبير sl الأخرى (على سبيل المثال, إشارات المعالجة ببولي signals Juul 007 ). ويتم وصف المتواليات التتظيمية المذكورة» على سبيل المثال؛ في Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990) تتضمن المتواليات التتظيمية تلك التي تتعلق بالتعبير الوراثي التكويني المباشر لمتوالية النيوكليوتيد في العديد من أنواع ١ الخلية العائلة وتلك التي ترتبط بالتعبير الوراثي المباشر لمتوالية النيوكليوتيد فقط في خلايا عائلة محددة (مثل المتواليات التتظيمية المحددة بالنسيج 115506). علاوة على ذلك؛ يمكن توصيل إنزيم إندونيوكلياز الذي يستهدف DNA بواسطة الناقل الذي يشتمل على متوالية نتظيمية لإجراء عملية تخليق مباشرة لإنزيم إندونيوكلياز الذي يستهدف DNA عند فترات زمنية محددة؛ أو على فترة زمنية محددة. ويدرك الماهرون في المجال أن تصميم ناقل التعبير الوراثي يمكن أن يعتمد على تلك العوامل ٠ | كاختيار للخلايا المستهدفة؛ ومستوى التعبير الوراثي المطلوب؛ وما شابه ذلك. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي التعبير 'يشطر” عموماً يشير إلى توليد فاصل مزدوج الجديلة في جينوم ye DNA موضع مطلوب. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض "DNA يشير إلى كمية من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA ينتج نشاط Yo إندونيوكلياز كافي لتوليد فاصل مزدوج الجديلة في موقع الجينوم المطلوب. في أحد النماذج, تولد كمية فعالة من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA فاصل مزدوج الجديلة عند الموقع الجيني المطلوب فيThe gene is in the form of plasmids. In the current specification; The expressions 'plasmid' and 'vector' are used interchangeably where the plasmid is frequently used from the vector. However, the invention includes other forms of genetic expression vectors; such as viral vectors J) replication-defective retroviruses, lentiviruses ¢, adenoviruses and adeno-associated viruses .); that perform equivalent functions. Within the gene expression vector’, “effectively associated” means that the nucleotide sequence 8008 of interest binds to upregulated sequences in such a way as to allow genetic expression of the nucleotide sequence (for example, in a laboratory transcription/translation system or in a target cell at Introducing the vector into the target cell. Said regulatory sequences are described” eg in Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990). Many of the 1 host cell types and those that are directly genotyped express a nucleotide sequence only in specific host cells (eg Tissue-specific regulatory sequences 115506). DNA by a vector containing a regulatory sequence to directly synthesize the DNA-targeting endonuclease enzyme at specific time intervals; or over a specified period of time. Those skilled in the art know that design of an expression vector can depend on these 0 | factors as a choice of target cells; the level of gene expression required; and the like. As used in the present application, the term 'cleavage' generally refers to the generation of a double-stranded spacer in the ye DNA genome at a desired locus. As used in the present application, the term “effective amount of a combination comprising at least a DNA-targeting endonuclease” refers to an amount of a DNA-targeting endonuclease producing sufficient Yo endonuclease activity to generate a double-stranded spacer at the desired genomic location. In one embodiment, an effective amount of endonuclease was generated that targets a double-stranded DNA breaker at the desired genomic location in
على الأقل 770 من الخلايا في مجموعة متلامسة مع تركيبة (على سبيل المثال, على الأقل JX على الأقل Tee على الأقل Tee على الأقل Te على الأقل 770, على الأقل TA على الأقل ,٠ على الأقل 790 على الأقل 799, أو حتى 7٠٠١ للخلايا في المجموعة التي تشتمل على تعديل جيني منتج بواسطة تركيبة إندونيوكلياز تستهدف حمض (DNA © وققاً لاستخدامه في الطلب الحالي التعبير 'زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني” في خلية يشير إلى أن الهيموجلوبين الجنيني يكون على الأقل 75 أعلى في المجموعات المعالجة بعامل يمزق BCLIIA mRNA أو التعبير عن البروتين (على سبيل المثال, إندونيوكلياز يستهدف حمض (DNA بواسطة الارتباط بحمض DNA جينومي عند الكرموسوم ١ للموقع 60, SYA LVN LVYA 117 , عنه في مجموعة ALE للمقارنة, مقارنة, حيث لا يوجد عامل. ويفضل أن تكون النسبة ٠ المئوية للتعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في مجموعة معالجة بمثل هذا العامل الذي يربط حمض DNA الجينومي عند الكرموسوم ؟ للموقع LT VAS YT LT 7748, 117 على الأقل 12٠ أعلى, على الأقل 77١0 أعلى, على الأقل 770 أعلى, على الأقل 7460 أعلى, على الأقل Tow أعلى, على الأقل 72700 أعلى, على الأقل 770 أعلى, على الأقل 7860 أعلى, على الأقل 1790 أعلى, على الأقل ١-ضعف أعلى, على الأقل ١-ضعف أعلى, على الأقل cameo أعلى, على No الأقل ٠١ ضعف أعلى, على الأقل ٠٠١ ضعف أعلى, على الأقل -٠٠٠١ ضعف أعلى, أو أكثر من المجموعة المعالجة بمقارن من حجم LB للمقارنة وظروف المزرعة. يُستخدم التعبير 'مجموعة معالجة بمقارن” في الطلب الحالي ليصف مجموعة من الخلايا تمت معالجتها باستخدام أوساط مطابقة, حث فيروسي, متواليات الحمض الأميني, درجة الحرارة؛ نسبة تشابك النسيج الخلوي؛ حجم الدورق» الرقم الهيدروجيني؛ إلخ؛ مع استثناء أنه تتم إضافة عامل يربط حمض DNA جينومي عند ٠ الكرموسوم ؟ للموقع TAG VT Te 774, 117. في أحد النماذج, يمكن استخدام أية طريقة معروفة في المجال لقياس زيادة في التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني, على سبيل المثال؛ تحليل لطخة وسترن Western Blot لبروتين جلوبين- y جنيني fetal y —globin protein وتحديد كمية MRNA لبروتين جلوبين- 7 جنيني. التعبير "خلية معزولة isolated cell " وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يشير إلى خلية تمت إزالتها YO من كائن توجد فيه أصلاً, أو تتحدر من Jie هذه الخلية. اختيارياً تم اسنتبات الخلية cell has been cultured في المعمل, على سبيل المتال, في وجود Wal الأخرى. اختيارياً يتم إدخال الخلية CARAt least 770 cells in a group in contact with a combination (eg, at least JX at least Tee at least Tee at least Te at least 770, at least TA at least ,0 At least 790 at least 799, or even 7001 for cells in the group containing genetic modification produced by an endonuclease formulation targeting DNA (© depending on its use in the present application). The expression 'increased levels of fetal hemoglobin' in a cell indicates that Fetal hemoglobin was at least 75% higher in groups treated with an agent that cleaves BCLIIA mRNA or protein expression (eg, endonuclease targeting DNA) by binding to genomic DNA at chromosome 1 at position 60, SYA LVN LVYA 117, than in the ALE group for comparison, comparison, where there is no factor. It is preferable to have 0 percent of fetal hemoglobin expression in a group treated with such an agent that binds genomic DNA at the chromosome? LT VAS YT LT 7748, at least 117 120 up, at least 7710 up, at least 770 up, at least 7460 up, at least Tow Higher, at least 72700 higher, at least 770 higher, at least 7860 higher, at least 1790 higher, at least 1-times higher, at least 1-times higher, at least cameo higher, on No Least 100-fold higher, at least 100-fold higher, at least -0001-fold higher, or more than the group treated with a comparator of comparable LB size and culture conditions. The term 'comparator treatment group' is used in the present application to describe a group of cells treated with matched media, viral induction, amino acid sequences, temperature; cell crosslinking ratio; beaker volume » pH; etc; With the exception that a factor that binds genomic DNA is added at chromosome 0? for TAG VT Te 774, 117. In an embodiment, any method known in the art can be used to measure an increase in the expression of fetal hemoglobin, eg; Western Blot analysis of fetal y —globin protein and quantification of mRNA for fetal 7 globin protein. The term “isolated cell” as used in the present application refers to a cell that has been removed YO from an organism in which it originally resides, or is a descendant of such cell Jie. Optionally the cell has been been cultured in the laboratory, for example, in the presence of the other Wal. Optionally enter the cell CAR
7ه لاحقاً في كائن ثاني أو تتم إعادة إدخالها في الكائن الذي تم عزل الخلية منه (أو الذي تتحدر منه الخلية). التعبير 'مجموعة معزولة” بالنسبة إلى مجموعة معزولة من WA وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يشير إلى مجموعة من الخلايا تمت إزالتها وتم فصلها من مجموعة مختلطة أو غير متجانسة heterogeneous © من الخلايا. في بعض النماذج, تكون المجموعة المعزولة هي مجموعة نقية من الخلايا إلى حد بعيد مقارنة بالمجموعة غير المتجانسة التي تم عزل الخلايا منها أو إثراؤها بها. في بعض النماذج, تكون المجموعة المعزولة مجموعة معزولة من خلايا أولية بشرية لتكوين الدم, على سبيل المثال, مجموعة نقية إلى حد بعيد من LDA أولية بشرية لتكوين pall مقارنة بمجموعة غير متجانسة من الخلايا التي تشتمل على خلايا أولية بشرية لتكوين الدم والخلايا التي تم منها اشتقاق Vy الخلايا الأولية البشرية لتكوين الدم. التعبير 'نقي إلى حد بعيد, " بالنسبة إلى مجموعة خلايا معينة, يشير إلى مجموعة من WAN تبلغ على الأقل حوالي Ve ويفضل على الأقل حوالي ZA ويفضل أكثر على الأقل حوالي Jae والأفضل على الأقل حوالي 795 نقي, بالنسبة إلى الخلايا التي تشكل إجمالي مجموعة الخلايا. أي, التعبيرات 'نقي إلى حد بعيد" أو 'متقى بصورة أساسية, ' فيما يتعلق بمجموعة من الخلايا الأولية ١ _لتكوين الدم, يشير إلى مجموعة من الخلايا التي تحتوي على أقل من حوالي TY ويفضل أكثر أقل من حوالي 715, ,71١ 78, 71, والأفضل أقل من حوالي 75, BVA SIVA S/S 21, أو أقل من ,7١ ومن الخلايا التي لا تكون خلايا أولية لتكوين الدم طبقاً لما تم تعريفه بواسطة التعبيرات في الطلب الحالي. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير pe يتضمن خفض أو تخفيف واحد على الأقل من Yo تأثير غير ملائم أو عرض حالة, مرض أو اضطراب. على سبيل المثال, التعبير Tallady Ee يشير إلى إعطاء إلى خاضع كمية فعالة من تركيبة, على سبيل المثال, كمية فعالة من تركيبة تشتمل على مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم بحيث يكون لدى الخاضع تخفيض في عرض واحد على الأقل من المرض أو تحسين في المرض, على سبيل المثال, نتائج مفيدة أو إكلنيكية مطلوبة. لأغراض هذا الكشف, تتضمن النتائج المفيدة أو الإكلينيكية المطلوبة, ولكن ليس على سبيل الحصر, تخفيف © واحد أو أكثر من الأعراض, وتقليل مدى المرض, ثبات المرض (على سبيل المثال, عدم ازدياد الحالة سوءا), تأخير أو إبطاء تطور المرض, تخفيف أو تسكين Alla المرض, وهجوع (سواء جزئي أو كلي), CAN7e later in a second organism or reintroduced into the organism from which the cell was isolated (or from which the cell is a descendant). The expression 'isolated group' in relation to an isolated group of WA as used in the present application denotes a group of cells removed and separated from a mixed or heterogeneous© group of cells. In some embodiments, the isolated population is a much more pure group of cells than the heterogeneous group from which the cells were isolated or enriched. In some embodiments, an isolated population is an isolated population of human hematopoietic progenitor cells, eg, a significantly pure population of pallor-forming human primary LDA compared to a heterogeneous population of cells that includes human hematopoietic and hematopoietic progenitor cells from which Vy human hematopoietic progenitor cells were derived. The expression 'extremely pure,' with respect to a given group of cells, denotes a group of WAN of at least about Ve, preferably at least about ZA, more preferably at least about Jae, and preferably at least about 795 pure , with respect to cells that make up the total cell population. That is, the expressions 'extremely pure' or 'essentially pious,' in relation to a group of primary cells 1 _of hematopoiesis, refer to a group of cells containing less than about TY and preferably less than about 715, 711 78, 71, and preferably less than about 75, BVA SIVA S/S 21, or less than 0.71 and from cells that are not primary hematopoietic cells according to for what is defined by the expressions in the current request. According to its use in the present application, the expression pe includes the reduction or mitigation of at least one Yo of an adverse effect or symptom of a condition, disease or disorder. For example, the expression Tallady Ee refers to administration to a subject of an effective amount of a formulation, eg, an effective amount of a formulation comprising a group of hematopoietic progenitor cells such that the subject has a reduction in at least one symptom of the disease or an improvement in Disease, for example, is a desired instrumental or clinical outcome. For the purposes of this disclosure, desired clinical or beneficial outcomes include, but are not limited to, alleviation of one or more symptoms, reduction of the extent of disease, stabilization of disease (eg, no worsening of the condition), delay or slow disease progression, amelioration or Alleviation of disease, remission (whether partial or complete), CAN
-مه- سواء قابل للكشف أو غير قابل للكشف. في بعض النماذج, يمكن أن يشير العلاج إلى إطالة البقاء مقارنة بالبقاء المتوقع في حالة عدم تلقي العلاج. بالتالي, يدرك ذو المهارة في المجال أن العلاج يمكن أن يحسن حالة المرض, ولكن يمكن ألا يكون شفاء كامل من المرض. في بعض النماذج, يمكن أن يتضمن العلاج الوقاية. ومع ذلك, في نماذج بديلة, لا يتضمن العلاج الوقاية. © تستخدم العبارة "مقبول صيدلانياً”؛ في الطلب الحالي لتشير إلى تلك المركبات, المواد, والتركيبات, و / أو صور الجرعات التي تكون, في نطاق مجال الحكم الطبي الصائب, ومناسبة للاستخدام في تلامس مع أنسجة الكائنات البشرية والكائنات دون سمية مفرطة؛ وتهيج؛ واستجابة تحساسية؛ أو مشكلة أو تعقيد آخر بما يتتاسب مع نسبة الفائدة/ الخطر المعقولة. La, لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "'مقبول صيدلانياً”؛ LF للتحمل فسيولوجيا” والصور ٠ النحوية المتتوعة منهاء إلى تركيبات» ومواد ناقلة carriers ؛ ومواد مخففة diluents ومواد (Jeli يتم استخدامها بشكل متبادل وتوضح أن المواد قابلة للإعطاء لكائن ثديي بدون إنتاج تأثيرات فسيولوجية مثل الغثيان nausea ¢ والدوار0122107655© واضطراب المعدة gastric upset وما شابه. لن تؤدي المادة الناقلة المقبولة صيدلانياً إلى تعزيز ارتفاع الاستجابة المناعية تجاه عامل يتم خلطها معه؛ إلا عند الحاجة. يعتبر تحضير تركيبة دوائية تحتوي على مكونات فعالة مذابة أو مشتته Vo فيها معروفة في المجال ولا تحتاج إلى تقييد sly على الصيغة. تشتمل الصيغة الصيدلانئية على مركب الاختراع في توليفة مع واحد أو أكثر من المكونات المقبولة صيدلانياً. يمكن أن تكون المادة الناقلة في صورة صلبة؛ أو نصف صلبة أو مادة مخففة سائلة؛ أو كريم أو كبسولة. نمطياً؛ يتم تحضير هذه التركيبات بحيث تكون ALE للحقن Le) في صورة محاليل سائلة أو معلقات؛ مع ذلك يمكن أيضاً تحضير الصور الصلبة للمحلول أو المعلقات في سائل قبل الاستخدام. يمكن أيضاً أن Yo يكون المستحضر في صورة مستحلب أو موجود في تركيبة دهنية. يمكن خلط المكون الفعال مع سواغات مقبولة صيدلانياً ومتوافقة مع المكون الفعال وبكميات مناسبة للاستخدام في الطرق العلاجية التي تم وصفها هنا. Jian السواغات excipients المناسبة؛ على سبيل المثال؛ في الماء؛ أو محلول ملحي saline ؛ أو ديكستروز dextrose ؛ أو جليسرول glycerol أو إيثانول ethanol أو ما شابه وتوليفات منها. بالإضافة إلى ذلك؛ عند الحاجة؛ يمكن أن تشتمل التركيبة على كميات ثانوية من مواد YO مساعدة مثل عوامل الترطيب wetting أو الاستحلاب emulsifying agents « وعوامل منظمة buffering agents للرقم الهيدروجيني PH وما شابه Ally يمكنها تعزيز فاعلية المكون الفعال. CAR-meh- whether detectable or non-detectable. In some embodiments, treatment may indicate a prolongation of survival compared to the expected survival without treatment. Thus, those skilled in the art realize that treatment may improve the condition of the disease, but it may not be a complete cure for the disease. In some cases, treatment may include prevention. However, in alternative embodiments, treatment does not include prevention. © The term “pharmaceutically acceptable” is used in the present application to refer to those compounds, substances, compositions, and/or dosage forms which are, within the scope of good medical judgment, suitable for use in contact with human tissues and organisms without excessive toxicity; irritant; an allergic response; or other problem or complication commensurate with a reasonable benefit/risk ratio. La, for use in the present application, the term 'pharmaceutically acceptable'; LF for physiological endurance” and the various grammatical forms ending in “combinations” and carriers; Diluents and Jeli are used interchangeably and show that the substances can be administered to a mammal without producing physiological effects such as nausea, dizziness, gastric upset, etc. A pharmaceutically acceptable carrier will not cause Enhancing the elevation of the immune response to an agent with which it is mixed with it, except when needed The preparation of a pharmaceutical formulation containing dissolved or dispersed Vo active ingredients known in the art and not requiring strict restriction of the formulation The pharmaceutical formulation includes the compound of the invention in combination With one or more pharmaceutically acceptable ingredients The carrier may be a solid; semisolid or liquid diluent; cream or capsule Typically; such compositions are prepared as ALE for injection (Le) as solutions liquid or suspensions; However, solid forms of solutions or suspensions in liquid may also be prepared prior to use. Yo may also be in the form of an emulsion or in an oily formulation. The active ingredient may be mixed with pharmaceutically acceptable excipients compatible with the active ingredient in amounts suitable for use in the therapeutic methods described herein. Jian Appropriate excipients; For example; In the water; or saline solution; or dextrose; glycerol, ethanol, or the like, and combinations thereof. in addition to; If necessary; The formulation may include minor amounts of YO adjuvants such as wetting or emulsifying agents, pH buffering agents, etc. Ally can enhance the potency of the active ingredient. CAR
-4ه8--4H8-
يمكن أن تشتمل التركيبة العلاجية الخاصة بالاختراع الحالي على أملاح مقبولة صيدلانياً للمكونات الواردة هنا. تشتمل الأملاح المقبولة صيدلانياً على أملاح إضافة الحمض (التي يتم تشكيلها بواسطة مجموعات الأمين الحرة free amino للبولي ببتيد (polypeptide التي يتم تشكيلها بواسطة أحماض غير عضوية inorganic acids ؛ على سبيل المثال» أحماض الهيدروكلوريك hydrochloric © والفسفوريك phosphoric acids « وتتمتل الأحماض العضوية المذكورة في حمض الأسيتيك acetic » والترتريك tartaric « والمندليك mandelic وما شابه. يمكن أيضاً اشتقاق الملاح المتكونة باستخدام مجموعات الكربوكسيل الحرة free carboxyl من قواعد غير عضوية؛ مثل هيدروكسيدات hydroxides من الصوديوم sodium » أو البوتاسيوم potassium ¢ أو الأمونيوم ammonium » أو الكالسيوم calcium أو الحديديك ferric ؛ وتتمثل القواعد العضوية المذكورة في الأيزو ٠ بروبيلامين isopropylamine » وتراي ميثيلامين trimethylamine ¢ و؟-ايقيل أمينو Jeli ethylamino ethanol ؛ وهيستدين histidine ¢ وبروكاين procaine وما شابه. تعتبر المواد الناقلة المقبولة فسيولوجياً معروفة في المجال. تكون المواد الناقلة التمثيلية ALLY عبارة عن محاليل مائية معقمة والتي لا تحتوي على مواد بالإضافة إلى المكونات الفعالة والماء؛ أو تحتوي على محلول منظم Jie فوسفات الصوديوم sodium phosphate عند ded رقم هيدروجيني فسيولوجية؛ أو Vo محلول ملحي فسيولوجي أو Jie (Lads محلول ملحي منظم بالفوسفات phosphate-buffered saline بالإضافة إلى ذلك؛ يمكن للمواد الناقلة المائية أو تشتمل على أكثر من ملح منظم واحد؛ بالإضافة إلى أملاح مثل كلوريدات الصوديوم والبوتاسيوم sodium and potassium chlorides « وديكستروز dextrose ؛ وبولي إيتيلين جليكول polyethylene glycol ومواد مذابة أخرى. يمكن أيضاً أن تشتمل التركيبات السائلة على أطوار سائلة بإضافة الماء أو استبعاده. Ab ian الأطوار ٠ السائلة liquid phases الإضافية المذكورة في الجليسرين» أو الزيوت النباتية Jie زيت بذر القطنء ومستحلبات الماء والزيت. ستعتمد كمية العامل الفعال المستخدم في الاختراع والذي سيكون فعالاً في علاج اضطراب أو Ala محددة على طبيعة الاضطراب أو الحالة؛ ويمكن تحديده بواسطة تقنياتThe therapeutic composition of the present invention may include pharmaceutically acceptable salts of the ingredients herein. Pharmaceutically acceptable salts include acid addition salts (formed by free amino groups of a polypeptide) formed by inorganic acids; for example, hydrochloric© and phosphoric Phosphoric acids The mentioned organic acids are included in acetic acid, tartaric acid, mandelic acid, etc. Salts formed using free carboxyl groups can also be derived from inorganic bases, such as hydroxides hydroxides of sodium, potassium, ammonium, calcium, or ferric; the mentioned organic bases are isopropylamine and trimethylamine. ¢ and ?-ethylamino jelly ethylamino ethanol ;histidine ¢ , procaine and the like Physiologically acceptable carriers are known in the art. Representative ALLY carriers are sterile aqueous solutions which do not does not contain substances in addition to the active ingredients and water; or contain a buffer solution Jie sodium phosphate at a physiological pH ded; or Vo Physiological Saline or Jie (Lads) phosphate-buffered saline additionally; aqueous carriers may or may include more than one buffer salt; as well as salts such as sodium and potassium chlorides sodium and potassium chlorides, dextrose, polyethylene glycol and other solutes. mentioned in glycerin” or vegetable oils, Jie cottonseed oil, water and oil emulsions. The amount of active agent used in the invention that will be effective in treating a specific disorder or Ala will depend on the nature of the disorder or condition; it can be determined by techniques
سريرية قياسية. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, 'وقاية" أو "للوقاية, " عند استخدامها في الإشارة إلى مرض, أو Yo اضطراب أو أعراض منها, يشير إلى تخفيض في احتمالية أن يتكون لدى الفرد مرض أو اضطراب, على سبيل المثال, اعتلال الهيموجلوبين. يتم تقليل احتمالية تكوين مرض أو اضطراب, على سبيل qa يعاني فرد ما من واحد أو أكثر من عوامل الخطر لمرض ما أو اضطراب إما يخفق في Lovie, JE هذا المرض أو الاضطراب في وقت لاحق أو بحدة أقل, من الناحية Jie تكوين الاضطراب أو تكوين الإحصائية, بالنسبة إلى مجموعة تعاني من نفس عوامل الخطر ولا تتلقى علاج وفقاً للموصوف في الطلب الحالي. يتم اعتبار الإخفاق في تقليل تطور أعراض مرض ما, أو تطور أعراض مخفضة على الأقل على مقياس مقبول إكلينيكياً لذلك المرض أو الاضطراب) 7٠١ (على سبيل المثال, بنسبة © أو تم تأخيرها (على سبيل المثال, بأيام, أسابيع, أو شهور أو أعوام) وقاية فعالة. ,50111/ لتخفيض التعبير عن DNA يتعلق بتلامس الخلية مع إندونيوكلياز يستهدف حمض Lod العبارة 'زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية” تشير إلى أن الهيموجلويين الجنيني في خلية أو مجموعة من الخلايا يكون على الأقل 75 أعلى في الخلية أو مجموعة من الخلايا المعالجة بحمض من مجموعة قابلة للمقارنة, مقارنة, حيث لا يوجد إنزيم DNA يستهدف إندونيوكلياز حمض ٠ ويفضل أن يكون التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في خلية . DNA إندونيوكلياز يستهدف حمض أعلى, على 77١ أعلى, على الأقل 7٠١ على الأقل DNA بإندونيوكلياز يستهدف حمض dallas الأقل 730 أعلى, على الأقل 7460 أعلى, على الأقل 756 أعلى, على الأقل 71650 أعلى, على الأقلstandard clinical. According to its use in the present application, 'prevent' or 'to prevent,' when used in reference to a disease, or a disorder or symptoms thereof, indicates a reduction in the likelihood that an individual will develop a disease or disorder, for example, hemoglobinopathy. The likelihood of developing a disease or disorder is reduced, eg qa an individual has one or more risk factors for a disease or disorder that either fails Lovie, JE That disease or disorder later or with less severity, in terms of Jie The composition of the disorder or the composition of the statistic, in relation to a group with the same risk factors and not receiving treatment as described in the present application.Failure to reduce the development of symptoms of a disease, or the development of symptoms is considered reduced at least on a clinically acceptable scale for that disease or disorder) 701 (eg, by © or delayed (eg, by days, weeks, months, or years) effective prevention. With endonuclease targeting acid Lod the phrase 'increased levels of fetal hemoglobin in a cell' indicates that fetal hemoglobin in a cell or group of cells is n at least 75 higher in the acid-treated cell or group of cells than in a comparable group, comparatively, in which no DNA enzyme targets acid endonuclease 0 preferably expressing fetal hemoglobin in a cell. DNA endonuclease targets acid above, at least 771 up, at least 701 up, DNA endonuclease targets acid dallas low 730 up, at least 7460 up, at least 756 up, at least 71650 up, At least
JN أعلى, على الأقل 780 أعلى, على الأقل 7960 أعلى, على الأقل ١-ضعف أعلى, على ٠ ٠٠١ ضعف أعلى, على الأقل ٠١ أعلى, على الأقل Geese 7-ضعف أعلى, على الأقل | 5 ضعف أعلى, على الأقل ١٠٠٠-ضعف أعلى, أو أكثر من مجموعة معالحة بمقارن قابل للمقارنة. يُستخدم التعبير 'مجموعة معالجة بمقارن" في الطلب الحالي ليصف مجموعة من الخلايا تمت معالجتها باستخدام أوساط مطابقة, حث فيروسي, متواليات الحمض الأميني, درجة الحرارة؛ نسبةJN higher, at least 780 higher, at least 7960 higher, at least 1-x higher, at least 0 001 times higher, at least 01 higher, at least Geese 7-x higher, at least | 5-fold higher, at least 1000-fold higher, or more than a comparable comparator-treatment group. amine, temp; ratio
BCL1IA تشابك النسيج الخلوي؛ حجم الدورق» الرقم الهيدروجيني؛ إلخ؛ مع استثناء إضافة متبط ثديي" واحد أو مجموعة من "الثدييات”؛ ويشتمل على AS ثديي" أن يضم GIS يقصد بمصطلح ٠ سبيل المثال وليس الحصرء؛ على البشر؛ والحيوانات الرئيسة مثل القرود؛ والنسانيس والسعلات الهرة والأسود والنمور؛ وفصيلة Jie والشمبانزي؛ وفصيلة الكلبيات متل الكلاب والذئاب ؛فصيلة القطط الخيول مثل الحصان؛ والحمار والحمار الوحشي؛ والحيوانات التي تؤكل مثل البقر؛ والخنازير والخراف؛ والحافريات مثل الغزال والزرافات؛ والقوارض مثل الفئران؛ والجرذان والهمستر والخنازير الغينية؛ والدببة. في بعض النماذج المفضلة؛ يتمثل الكائن الثديي في البشر. YoBCL1IA cytokine tangle; beaker volume » pH; etc; With the exception of the addition of a single "mammal" or group of "mammals"; And it includes “AS mammals” that the GIS means by the term 0, for example, but not limited to; humans; primates such as monkeys; monkeys, kittens, lions and tigers; the Jie family and chimpanzees; the canine family such as dogs and wolves; Cats Horses such as the horse; Donkeys and zebras; Animals that eat such as cows; Pigs and sheep; Fossils such as gazelles and giraffes; Rodents such as mice; Rats, hamsters and guinea pigs; and Bears.In some favored embodiments, the mammal is the human beings
CARCAR
في أحد النماذج؛ تم تشخيص أن الكائن البشري يعاني من اعتلال الهيموجلوبين. في نموذج colin وفقاً آخرء يكون اعتلال الهيموجلوبين عبارة عن اعتلال الهيموجلوبين ]. في أحد النماذج المفضلة؛ يكون اعتلال الهيموجلوبين عبارة عن مرض الخلية المنجلية. كما هو مستخدم هناء يمكن أن يكون 'مرض sickle-hemoglobin الخلية المنجلية" عبارة عن فقر الدم المنجلي؛ ومرض الهيموجلوبين المنجلي وثلاسيمية الخلية المنجلية (HDS B+) ©؛ وتلاسيمية الخلية المنجلية بيتا بلس disease )155©( ©in one of the models; It was diagnosed that the human being suffers from hemoglobinopathy. In colin's model, according to another, hemoglobinopathy is a hemoglobinopathy]. in one of my favorite forms; Hemoglobinopathy is sickle cell disease. As used here 'sickle-hemoglobin disease' can be sickle cell anemia; sickle cell hemoglobin disease and sickle cell thalassemia (HDS B+)©; sickle cell beta plus disease (155©) ©
PB مفضل؛ يكون اعتلال الهيموجلوبين عبارة عن ثلاسيمية AT بيتا صفر (105/]0). في نموذج وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, يشير المصطلح "اعتلال الهيموجلوبين" إلى أي خلل في هيكل أو وظيفة أي هيموجلويين خاص بفرد؛ ويتضمن حالات الخلل في الهيكل الأولي؛ أو الثانوي؛ أو الثلاثي فرات الحذف أو طفرات الاستبدال في مناطق Jie والرباعي للهيموجلوبين الذي يحدث بسبب أي طفرة؛ أو طفرات أو حالات حذف في محفزات أو معززات هذه الجينات التي تتسبب I تثشفير جين الجلوبين Ipreferred PB; The hemoglobinopathies are AT thalassemia beta zero (105/]0). In a form as used in the present application, the term "hemoglobin impairment" refers to any abnormality of the structure or function of any individual's hemoglobin; It includes defects in the initial structure; or secondary; triple deletions or substitution mutations in the Jie and quadruple regions of hemoglobin caused by any mutation; or mutations or deletions in the promoters or enhancers of such genes that encode the I globin gene
Lad في تقليل كمية الهيموجلوبين الذي يتم إنتاجه مقارنة بحالة عادية أو قياسية. يشتمل المصطلح على أي انخفاض في كمية أو فاعلية الهيموجلوبين» سواء طبيعي أو غير طبيعي؛ والذي يحدث شابه. Los 107005 المرض؛ أو العلاج الكيميائي؛ والسموم Jie بواسطة عوامل خارجية كما هو مستخدم هناء إلى كمية من تركيبة الخلية Clad في أحد النماذج, يشير المصطلح "كمية تكون آمنة وفعالة لعلاج؛ أو تقليل احتمالية أو تأخير تطور اعتلال الهيموجلوبين. بالتالي يمكن للكمية Vo أن تعالج أو تؤدي إلى تحسين أعراض اعتلال الهيموجلوبين؛ أو إبطاء تقدم مرض اعتلال أو تثبيط عرض اعتلال الهيموجلوبين؛ أو إبطاء أو تثبيط ظهور أعراض clad الهيموجلوبين؛ أو ثانوية لاعتلال الهيموجلوبين أو تثبيط تطور العرض الثانوي لاعتلال الهيموجلوبين. تعتمد الكمية الفعالة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين على نوع اعتلال الهيموجلوبين المراد علاجه؛ وخطورة الأعراض؛ ونمط الإعطاء وهكذا. بالتالي؛ ليس cad عمر الخاضع والحالة العامة candle والخاضع الذي تتم ٠ بالضرورة تحديد "كمية فعالة' دقيقة. مع ذلك؛ بالنسبة لأي حالة معينة؛ يمكن تحديد "كمية فعالة" مناسبة بواسطة صاحب المهارة العادية في المجال باستخدام التجارب الروتينية فقط. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يتم استخدام المصطلح 'يشتمل" أو 'يشتمل على" بالإشارة إلى تركيبات, طرق, ومكون مناظر منه, والتي تكون أساسية للاختراع, ولا تزال مفتوحة لإدراج عناصر غير محددة؛ سواءً أساسية أو لا. YOLad results in less hemoglobin being produced compared to a normal or standard condition. The term includes any decrease in the amount or activity of hemoglobin, whether normal or abnormal; What happens is similar. Los 107005 disease; or chemotherapy; Jie and toxins by external agents As used herein to refer to an amount of Clad cell composition In one embodiment, the term refers to "an amount that is safe and effective for treating; treat or improve symptoms of hemoglobinopathy; slow progression of disease or inhibit presentation of hemoglobinopathy; slow or inhibit the onset of symptoms of hemoglobinopathy clad; secondary to hemoglobinopathy or inhibit development of secondary symptom of hemoglobinopathy. The effective amount for treating hemoglobinopathy depends on the type of hemoglobinopathy to be treated, the severity of the symptoms, the mode of administration, etc. Therefore, the cad is not the age of the subject, the general condition, candle, and the subject who is given 0 necessarily to determine an exact 'effective amount'. however; for any particular case; An appropriate 'effective quantity' may be determined by one of ordinary skill in the art using routine experiments only. As used in the present application the term 'comprising' or 'comprising' is used with reference to a composition, method, and a corresponding component thereof, which are essential to the invention, and are still open to the inclusion of unspecified elements; Essential or not. YO
CARCAR
h \ —_ _ وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يشير المصطلح Gall) بشكل أساسي من" إلى تلك العناصر المطلوبة لنموذج محدد. يسمح المصطلح بوجود عناصر إضافية لا تؤثر مادياً على السمة الأساسية والمبتكرة أو الوظيفية لذلك النموذج من الاختراع. يشير المصطلح "التي تتكون من" إلى تركيبات, طرق, ومكونات مناظرة منه وفقاً للموصوف في الطلب 0 الحالي, والتي تستثني أي عنصر غير مستشهد به في وصف النموذج. كما هو مستخدم في هذه المواصفة وعناصر الحماية المرفقة؛ تتضمن أدوات النكرة والمعرفة الإشارة إلى الجمع ما لم يتم الإشارة إلى ما يخالف ذلك بوضوح في السياق. بالتالي؛ وعلى سبيل المثال؛ تتضمن الإشارة إلى "الطرق" واحد أو أكثر من الطرق»؛ و/ أو الخطوات من النوع المذكور في هذه الوثيقة و/أو الذي يتضح للماهرين في المجال عند الإطلاع على الكشف وما إلى ذلك. يتم إدراك أن ٠٠ الوصف التفصيلي السابق والأمثلة التالية تكون لغرض التوضيح فقط ولا تكون مقيدة لمجال الاختراع. يمكن إجراء العديد من التغيرات والتعديلات على النماذج التي تم الكشف عنهاء والتي تتضح للماهرين في المجال؛ دون الابتعاد عن مجال الاختراع الحالي. علاوة على ذلك؛ يتم تضمين جميع البراءات؛ وطلبات البراءة؛ والنشرات المحددة بوضوح في هذه الوثيقة بواسطة الإشارة إلى أغراض الوصف والكشف؛ على سبيل المثال؛ المنهجيات المذكورة في النشرات المذكورة والتي يمكن استخدامها ١٠ بالاشتراك مع الاختراع الحالي. ويتم توفير تلك النشرات فقط للكشف عنها قبل تاريخ الإيداع للطلب الحالي. ويجب عدم تقبيد أي شيء في هذا المنطلق باعتباره نص على أن المخترع يكون له الحق في التسجيل بتاريخ سابق للكشف المذكور بموجب الاختراع السابق أو لأي سبب آخر. تعتمد جميع البيانات حتى تاريخ أو تقديم محتويات تلك الوثائق على المعلومات المتوفرة لمقدمي الطلب ولا تشكل أي قبول بتصحيح تواريخ أو محتويات تلك الوتائق. Yo اعتلال الهيموجلوبين يكون الهيموجلوبين الجنيني Fetal hemoglobin (HF) عبارة عن تترامير fy من بولي ببتيدات الجلويين © لدى البالغين واثنين من بولي ببتيدات الجلوبين globin polypeptides .8 الشبيهة ببولي ببتيدات الجلوبين 7. أثناء الحملء تُنشاً جينات الجلوبين98065 globin 7 المزدوجة الجينات السائدة التي تم نسخها من موضع الجلوبين B بعد الولادة؛ يتم استبدال الجلوبين y بشكل تدريجي YO بالجلوبين | للبالغين» وهي عملية يشار إليها ب"التحويل الجنيني” (7). ظلت الآليات الجزيئية التي CARh \ —_ _ as used in the present application The term 'Gall' refers primarily to those elements which are required for a specific embodiment. The term allows for additional elements that do not materially affect the essential, innovative or functional feature of that embodiment of the invention. The term denotes "which consists of" to combinations, methods, and corresponding components thereof as described in the present Application 0, which excludes any element not cited in the form description. As used in this specification and the accompanying claims; the indefinite and definite articles include reference to the plural unless The contrary is clearly indicated in the context. Thus, for example, references to 'methods' include one or more 'methods' and/or steps of the kind mentioned herein and/or which would become apparent to those skilled in the art upon perusal of Disclosure etc. It is understood that the foregoing detailed description and following examples are for illustrative purposes only and are not restrictive to the scope of the invention Numerous variations and modifications may be made to the disclosed embodiments which are evident to those skilled in the art; without departing from the scope of the present invention .Furthermore; is included n all patents; patent applications; releases clearly identified herein by reference to description and disclosure purposes; For example; The methodologies described in the cited publications 10 can be used in conjunction with the present invention. These prospectuses are provided only for disclosure prior to the filing date of the current application. Nothing in this sense shall be construed as a provision that the inventor shall have the right to register with a date prior to the said disclosure under the previous invention or for any other reason. All statements as to the date or presentation of the contents of such documents are based on the information available to the applicants and do not constitute any acceptance of a correction of the dates or contents of those documents. Yoo hemoglobinopathy Fetal hemoglobin (HF) is a tetramer fy of adult globin© polypeptides and two globin polypeptides 8. globin-7-like. During pregnancy, globin genes are generated98065 globin 7 duplex dominant genes transcribed from the globin B locus after birth; The y globin is gradually replaced by YO by globin | to adults,” a process referred to as “embryonic conversion” (7). The molecular mechanisms by which CAR is involved have remained
ا يعتبر أساسها هذا التحويل غير محدد على نحو كبير وتخضع لأبحاث مكثفة, يبدا التحويل التطويري من إنتاج هيموجلوبين جنيني سائد أو HDF (0272) إلى إنتاج هيموجلوبين لدى البالغين أو HDA (0202) عند حوالي 78 إلى TE أسبوع من الحمل ويستمر لفترة قصيرة بعد الولادة عند النقطة التي يصبح Led ال HDA سائداً. ينتج هذا التحويل بشكل أساسي من الاستتساخ المنخفض لجينات 0 الجلوبين جاما والاستتساخ المتزايد لجينات الجلوبين بيتا. في المتوسط؛ يحتوي دم البالغ الطبيعي على حوالي 77 HOF فقط» على الرغم من أن مستويات وحدة ال HBF البنائية يكون بها اختلاف أكثر من ٠٠ مرة في البالغين الأصحاء .(Semin.The basis for this conversion is highly ill-defined and subject to extensive research. Developmental conversion from dominant fetal hemoglobin production or HDF (0272) to adult hemoglobin production or HDA (0202) begins at about 78 to TE weeks of pregnancy and continues for a short time after birth at which point the Led HDA becomes dominant. This conversion mainly results from decreased transcription of the gamma globin 0 genes and increased transcription of the beta globin genes. in the middle; Normal adult blood contains only about 77 HOF” although levels of the HBF residue are more than 100-fold different in healthy adults (Semin.
Hematol. 38(4):367-73 (2001) «Atweh) تتضمن حالات اعتلال الهيموجلوبين عدد من حالا الأنيميا من أصل وراثي والتي يكون فيها إنتاج منخفض و/أو هدم متزايد (انحلال الدم) لخلايا الدم الحمراء .red blood cells (RBCs) وتشتمل ٠ أيضاً هذه الاضطرابات على عيوب جينية والتي تؤدي إلى إنتاج هيموجلوبينات غير عادية مع قدرة ضعيفة مصاحبة على الحفاظ على تركيز الأكسجين. تتضمن بعض هذه الاضطرابات الفشل في إنتاج جلوبين ] طبيعي بكميات كافية؛ بينما تتضمن أخرى الفشل في إنتاج جلوبين ] طبيعي بشكل كلي. يتم بصفة عامة الإشارة إلى الاضطرابات المصاحبة لبروتين جلوبين B بحالات اعتلال الهيموجلوبين . على سبيل JB تنتج فقر الدم البحري | من الخلل الجزئي أو الكلي في التعبير الوراثي لجين ١ الجلوبين «ff مما يؤدي إلى HDA ناقص أو غير موجود. ينتج فقر الدم المنجلي من طفرة نيوكليوتيد واحد في جين الجلوبين 3] الهيكلي؛ مما يؤدي إلى إنتاج هيموجلوبين غير طبيعي منجلي (HBS) تكون HBS RBCs أكثر هشاشة من ال RBCs الطبيعية وتخضع لانحلال الدم بسهولة؛ مما يؤدي في النهاية إلى الأنيميا (Semin.Hematol. 38(4):367-73 (2001) “Atweh” ) These disorders also include genetic defects that result in the production of abnormal hemoglobin with an associated impaired ability to maintain oxygen concentration. Some of these disorders include failure to produce normal globin in sufficient amounts; Others involve failure to produce completely normal globin. Disorders associated with the B-globin protein are generally referred to as hemoglobinopathies. For example JB produces marine anemia | From a partial or total defect in the genetic expression of the globin 1 gene “ff” resulting in a deficient or non-existent HDA. Sickle cell anemia results from a single nucleotide mutation in the structural globin [3] gene; resulting in the production of abnormal sickle cell hemoglobin (HBS) HBS RBCs are more fragile than normal RBCs and undergo hemolysis easily; Which ultimately leads to anemia (Semin.
Hematol. 38(4):367-73 (2001) Atweh) علاوة على ذلك» يؤدي وجود البديل الجيني ل BCLITA والصور المنتوعة ل HBSIL-MYB إلى تحسين ٠ الخطورة السريرية في فقر الدم البحري بيتا. وجد أن هذا البديل يكون مصاحب لمستويات ال HOF هنا توضيح أنه يوجد نسبة فرق تبلغ © لصورة ثلاسيمية بيتا أقل خطورة مع بديل HEF عالي .(in press «Blood 2009 «Galanello 5. et al.) يركز البحث عن علاج يستهدف تقليل اختلال توازن سلسلة الجلوبين في مرضى يعانون من اعتلال الههموجلوبين ] على المعالجة الدوائية للهيموجلوبين الجنيني (0272؛ (HOF يتم اقتراح الإمكانية Yo العلاجية لهذه الطرق بواسطة ملاحظات خاصة بالنمط الظاهري المعتدل للأفراد الذين لديهم صفات وراثية مشتركة من فقر الدم البحري B المتجانسة والاستدامة الوراثية للهيموجلوبين الجيني hereditary CARHematol. 38(4):367-73 (2001) Atweh) Furthermore, “the presence of the BCLITA gene variant and HBSIL-MYB variants improve clinical risk in beta marine anemia. This variant was found to be associated with HOF levels. Here it is shown that there is a difference ratio of ∼ for a less severe beta thalassemia profile with a high HEF variant (in press “Blood 2009” Galanello 5. et al.) The research focuses The therapeutic potential of these approaches is suggested by observations of the mild phenotype of individuals with common genetic traits of anemia. Marine blood B homogenate and genetic sustainability of hereditary hemoglobin CAR
— أ — persistence fetal hemoglobin (HPFH) بالإضافة إلى المرضى الذين لديهم فقر pall البحري 3 المتجانسة والتي لا تتتج هيموجلوبين لدى البالغين؛ ولكن تتم ملاحظة مطلب منخفض لحالات نقل الدم في وجود تركيزات عالية من الهيموجلوبين الجيني. علاوة على ذلك؛ تمت ملاحظة أن مجموعة معينة من المرضى البالغين الذين لديهم تشوهات في سلسلة م يكون لديهم مستويات أعلى من 5 الطبيعية من الهيموجلوبين الجيني H bF) ( » وتمت ملاحظة أن لديهم مسار سريري لمرض أكثر Vise! من المرضى الذين لديهم مستويات طبيعية من ال HPF لدى البالغين. على سبيل JED يكون لمجموعة من المرضى السعوديين الذين يعانون من فقر الدم المنجلي ويعبرون وراثياً على ما يتراوح من 770-7١ من ال HBF مظاهر سريرية معتدلة فقط للمرض Br. «et al. (Pembrey) Haematol. 40: 415-429 )1978( .ل). يعتبر مقبولاً الآن أن يتم تحسين اضطرابات ٠ الهيموجلوبين» مثل فقر الدم المنجلي وفقر الدم البحري off بواسطة إنتاج ال 107 المتزايد. Reviewed in Jane and Cunningham Br. J. Haematol. 102: 415-422 (1998)) .(N. Engl. J. Med. 328: 129-131 (1993) Bunn على الرغم من أن الآليات الجزيئية التي تتحكم في التحويل التطويري في الجسم الحي من التعبير الوراثي عن جين جلوبين 7 إلى م تعتبر معروفة حالياً؛ يوجد دليل تراكمي على أن العوامل الخارجية .يمكنها أن تؤثر على التعبير الوراثي عن جين جلوبين 7.كانت مجموعة المركبات الأولى التي تم ١ كانت عبارة عن عقاقير مسممة للخلايا. القدرة على إحداث HBF تتشيط sale) اكتشاف أن بها نشاط -٠ التي تم إظهارها أولاً باستخدام Algal) بواسطة المعالجة HEF عملية تخليق من البداية لل— a — persistent fetal hemoglobin (HPFH) plus patients with homozygous pall3 marine anemia who do not produce hemoglobin in adults; However, a low requirement for blood transfusions is observed in the presence of high concentrations of genetic hemoglobin. Furthermore it; A certain group of adult patients with M series abnormalities has been observed to have levels above normal 5 of the gene hemoglobin H bF ( » and have been observed to have a clinical course of disease more Vise! than patients with normal levels of HPF in adults.For example, JED, a group of Saudi patients with sickle cell anemia and genetically expressing 71-770 HBF have only mild clinical manifestations of Br disease. et al. (Pembrey) Haematol 40: 415-429 (1978) L. It is now accepted that hemoglobin 0 disorders such as sickle cell anemia and marine anemia are ameliorated by increased L-107 production. Reviewed in Jane and Cunningham Br. J. Haematol. 102: 415-422 (1998)) (N. Engl. J. Med. 328: 129-131 (1993) Bunn. Although the molecular mechanisms that control developmental transfer in vivo are genetic expression The globin 7 gene to M is currently known; there is accumulating evidence that external factors can influence the genotyped expression of the globin 7 gene. HBF activation (sale) detected to have activity -0 that was first shown using Algal) by HEF processing is an initiating synthesis of
Proc Natl Acad Sci لا 5 A. (DeSimone) آزاسيتيدين في حيوانات التجارب )1982( 79)14(:4428-31). بشكل لاحق للدراسات التي تأكد على قدرة ال © -آزاسيتيدين azacytidine | ٠ على زيادة ال HDF في المرضى الذين يعانون من فقر الدم Bad) ومرض الخلية المنجلية et Ley, 307: 1469-1475 (1982) «N. Engl. J. Medicine cet al. (Ley) (Blood 62: 370-380 (1983) «al. توضح تجارب إضافية أن حيوانات السعدان التي تم علاجها باستخدام جرعات مسممة للخلايا من أرابينو سيل سيتوزسين (Ch) استجابت للارتفاعات الكبيرة في الخلايا الشبكية Science. 224(4649):617-9 Papayannopoulou et al.) F Yo (1984))؛ وأدى العلاج باستخدام الهيدروكسي hydroxyurealy sy إلى حث الجلوبين 7 في القرود أو حيوانات السعدان et. al.) صأساعاء )1984( 310(14):869-73 Engl J Med. ل١).Proc Natl Acad Sci No 5 A. (DeSimone) Azacitidine in Experimental Animals (1982) 79(14):4428-31). Subsequently, studies confirming the ability of © -azacytidine | 0 on an increase in HDF in patients with anemia (Bad) and sickle cell disease et Ley, 307: 1469-1475 (1982) «N. Engl. J. Medicine cet al. (Ley) (Blood 62: 370-380 (1983)” al. Additional experiments show that monkeys treated with cytotoxic doses of arabinocytosine (Ch) responded to significant elevations in retinal cells, Science. 224(4649):617-9 Papayannopoulou et al.) F Yo (1984)); Treatment with hydroxyurealy sy induced globin 7 in monkeys or monkeys et al. al.) p. (1984) 310(14):869-73 Engl J Med. l1).
—vo- تم التحقق من قدرة مجموعة المركبات الثانية على إحداث نشاط HBF Lisi sale) مع أحماض دهنية قصيرة السلسلة05 86 short chain fatty . أدت الملاحظة الأولية في الخلايا الأصلية لدم الحبل السري الجنيني fetal cord blood progenitor cells إلى اكتشاف أن حمض الأمينو بيوتريك y aminobutyric يمكن أن يعمل كمحدث للهيموجلوبين الجنيني Biochem (Perrine et al.) yell. (Biophys Res Commun. 148)2(:694-700 )1987( © الدراسات اللاحقة أن البوتيرات تحث إنتاج الجلوبين في حيوانات السعدان البالغة Blood. 000518010018165 et al.) ¢Dec )1988( 72)6(:1961-7) كما أنها تحث الجلوبين 7 في الخلايا الأصلية الشبيهة بالكريات الحمراء في الحيوانات البالغة أو المرضى الذين يعانون فقر الدم المنجلي Blood. (Perrine et al.) (1989) 74)1(:454-9). أظهرت أيضاً مشتقات الأحماض الدهنية قصيرة السلسة Jie الفينيل (Br J Haematol. 83(3):555-61 (1994) Dover et al.) بوتيرات1/816ا5الا080م ٠ 1: Blood. 186(8):3227-35 «Liakopoulou et al.) valproic acid وحمض الفالبرويك في الجسم الحي. بمعرفة العدد الكبير لنظائر أو مشتقات الأحماض HBF أنها تحث ال ((1995) الدهنية قصيرة السلسة الخاصة بهذه العائلة؛ فإنه يوجد عدد من المركبات المحتملة الخاصة بهذه العائلة والتي تكون أكثر فاعلية من البوتيرات 50173816 . تم إعتبار أن أحماض الفينيل أسيتيك—vo- The ability of group II compounds to induce HBF (Lisi sale) activity was validated with 05 86 short chain fatty acids. Initial observation in fetal cord blood progenitor cells led to the discovery that y-aminobutyric acid can act as an inducer of fetal hemoglobin Biochem (Perrine et al.) yell. (Biophys Res Commun. 148(2):694-700 (1987) © Subsequent studies show that butyrate stimulates globin production in adult monkeys Blood. 000518010018165 et al.) ¢Dec (1988) 72(6): 1961-7) and also induce globin 7 in progenitor erythrocyte-like cells in adult animals or patients with sickle cell blood. (Perrine et al.) (1989) 74(1):454-9). Short-chain fatty acid derivatives, Jie phenyl (Br J Haematol. 83(3):555-61 (1994) Dover et al.) butyrate 1/816a5ala080m 0 1: Blood. 186(8):3227-35 “Liakopoulou et al.) valproic acid and valproic acid in vivo. Given the large number of isotopes or derivatives of HBF acids that induce the short-chain fatty acids (1995) of this family, there are a number of potential compounds of this family that are more effective than butyrate50173816. It was considered that phenyl acids acetic
Blood Cells Mol Dis. 101461500 et al.) phenylalkyl والفينيل ألكيل Phenylacetic Yo محتملة HBF الدراسات اللاحقة؛ أنها محدثات Ui والتي تم اكتشافها ¢(22(2):150-8. (1996) يظل استخدام البوتيرات أو Jal حيث أنها تتتمي لهذه العائلة من المركبات. مع ذلك؛ في الوقت الخاصة به في فقر الدم المنجلي أو فقر الدم البحري م قيد التجربة ولا يمكن تزكيته في sual العلاج خارجة التجارب السريرية. ٠ تتضمن التجارب السريرية التي تهدف إلى إعادة تنشيط تخليق الهيموجلويين الجنيني في فقر الدم المنجلي وفقر الدم Bad) الإعطاء قصير المدى وطويل المدى لهذه المركبات Jie © -آزاسيتيدين azacytidine « والهيدروكسي hydroxyurealyys ومكون كرات الدم الحمراء البشري الناتج عن عودة الارتباط الجيني ونظائر حمض البيوتيريك؛ بالإضافة إلى توليفات منها. بعد هذه الدراسات؛ تم استخدام الهيدروكسي يوريا لحث ال HDF في البشر وأصبح الأخير العقار الأول والوحيد الموافق علية Yo بواسطة (FDA) Food and Drug Administration لعلاج حالات اعتلال الهيموجلوبين. مع cell يدل التفاوت في العيوب على وجود خطأً في الاستخدام طويل الأجل لهذه العوامل أو العلاجات؛Blood Cells Mall Dis. 101461500 et al.) phenylalkyl and phenylalkyl phenylacetic Yo potential HBF Subsequent studies; They are Ui-modifiers which were discovered ¢(22(2):150-8. (1996) The use of butyrate or Jal remains as they belong to this family of compounds. However, at its time it is in poverty Sickle cell or marine anemia is under trial and cannot be recommended for sual therapy outside of clinical trials. The range of these compounds is Jie©-azacytidine, hydroxyurealys, recombinant human erythrocyte recombination, and butyric acid analogues; In addition to combinations thereof. After these studies; Hydroxyurea has been used to induce HDF in humans and the latter became the first and only Yo-ho drug approved by the (FDA) Food and Drug Administration for the treatment of hemoglobinopathies. With cell variability in defects indicates that there is something wrong with the long-term use of these agents or treatments;
-؟--?-
بما في ذلك التأثيرات الجانبية غير المرغوب فيها والتغير يف استجابات المريض. على سبيل (JO على الرغم من أن الهيدروكسي يوريا يحث إنتاج ال HBF وأنه أظهر أنه يقلل أزمة تكون الخلايا المنجلية في الدم سريرياً؛ ويتم الحد منه بشكل ممكن بواسطة السمية النقيية وخطر التسرطن. يمكن أيضاً أن يتواجد التسرطن المحتمل طويل الأجل في العلاجات التي أساسها ©-آزاسيتيدين. لم تثبت 0 العلاجات التي أساسها مكون كرات الدم الحمراء أنها ثابتة ضمن نطاق من مجموعات مرضى. أظهرت أنصاف الأعمار القصيرة لحمض البيوتيريك butyric acid في الجسم all عائق محتمل في ملائمة هذه المركبات للاستخدام في التداخلات العلاجية. علاوة على ذلك؛ تكون الجرعات المرتفعة جداً من حمض البيوتريك لازمة لحث التعبير الوراثي عن جين الجلوبين oy الأمر الذي يتطلب قسطرة للانتشار المتواصل للمركب. علاوة على cells يمكن أن تكون الجرعات المرتفعة من ٠ حمض البيوتريك مصحوبة بسمية عصبية وتلف أكثر من عضو Blood 81: «et al.Including unwanted side effects and change in patient responses. For example (JO) Although hydroxyurea induces HBF production and has been shown to reduce sickle cell crisis in the blood clinically; it is possibly limited by myelotoxicity and the risk of carcinogenesis. Potential long-term carcinogenesis may also exist. In azacitidine-based therapies 0 Erythrocyte component-based therapies have not been shown to be stable in a range of patient populations Short half-lives of butyric acid in the body all showed a potential drawback in the suitability of these compounds for use in interventions Furthermore, very high doses of butyric acid are required to induce genetic expression of the oy globin gene, which requires catheterization for sustained diffusion of the compound. Moreover, high doses of 0-butyric acid can be associated with neurotoxicity. More than one Blood 81 member was damaged: «et al.
Blau) (1993) 529-537). على الرغم من أن حتى أدنى زيادة في مستويات ال HBF تكون مفيدة في مرض الخلية المنجلية؛ تتطلب فقر pal البحري م زيادة أعلى بكثير وهو ما لا يمكن تحقيقه على نحو موثوق به أو آمن بواسطة أي من العوامل المستخدمة حالياً Seminars 0 Olivier)Blau (1993) 529-537. Although even a slight increase in HBF levels is beneficial in sickle cell disease; Marine pal anemia requires a much higher augmentation which cannot be reliably or safely achieved by any of the agents currently in use (Seminars 0 Olivier)
.(Hematology 33: 24-42 (1996) ٠ يمكن of يوفر تحديد المنظمات الطبيعية لحث وإنتاج ال HPF وسائل لاستتباط تداخلات علاجية lam على العيوب المتعددة للمركبات التي تم وصفها أعلاه. نتج عن الدراسات الحالية المكثخف لارتباط الجينوم رؤى تتعلق بالأساس الجيني لأمراض معقدة متعددة وأثارها (McCarthy et al.) Manolio et. al.(Hematology 33: 24-42 (1996) 0.) Identification of natural regulators of HPF induction and production may provide a means to elicit therapeutic interactions lam on the multiple defects of the compounds described above. Genome-wide association insights into the genetic basis of multiple complex diseases and their implications (McCarthy et al.) Manolio et. al.
J Clin Invest 118356 (2008) «Nat Rev Genet 9 « 1590 xe. ((2008) ذلك؛ في غالبية الحالات؛ لم يتم الكتشف عن الوصلة بين الارتباط الجيني وفسيولوجيا ٠ الأمراض التي تشكل الأساس. يكون مستوى الهيموجلوبين الجنيني (HEF) متأصل في صورة أثر كمي ويعتبر مهم من الناحية السريرية؛ بمعرفة دوره المذكور أعلاه والمميز جيداً في تحسين خطورة حالات اعتلال الهيموجلوبين الرئيسية رء؛ ومرض الخلية المنجلية sickle cell disease وفقر الدم البحري -thalassemia لم Nathan and 0505 hematology of (Nathan et. al.) (XI 0. «1864 «xiv) pp. 2 v. «infancy and childhood ed. 6th 2003)). قامت دراسات YO مكثفة لاثنين من الجينوم بتحديد ثلاث مواقع رئيسية تشتمل على مجموعة من خمس صور بلورية لنيكليوتيد واحد مشترك single nucleotide polymorphisms (SNPs) والتي تبلغ قيمتها حواليJ Clin Invest 118356 (2008) Nat Rev Genet 9 1590 xe. (2008) that, in the majority of cases, the link between genetic association and pathophysiology has not been detected. Nathan and 0505 hematology of (Nathan et. al.) (XI 0. «1864] xiv) pp. 2 v. “infancy and childhood ed. 6th 2003)). Extensive YO studies of two genomes identified three major loci comprising a set of five single nucleotide polymorphisms (SNPs) of about
٠ من الصور المتتوعة في مستويات ال 167 Proc Natl Acad Sci U 5 «Lettre et al.) Menzel ¢1620 (2008) «Proc Natl Acad Sci U 5 A 105 Uda et al. «A (2008) «Nat Genet 39 cet al. )2007( 1197( علاوة على ذلك؛ يظهر أن العديد من هذه الصور المتتوعة تتوقع الخطورة السريرية لمرض الخلية المنجلية Proc Natl Acad Sci «Lettre et al.) A )2008( © 5 لا) ويمكن لواحد على الأقل من هذه ال SNPs أن تؤثر على الحصيلة السريرية في فقر الدم البحري م «Proc Natl Acad Sci U 5 A 105 Uda et al.) )2008( 1620). يتم وضع ال SNP التي لها أكبر تأثير؛ والتي تفسر أكثر من 7٠١0 من الصور المنتوعة في ال HOF في الانترون الثاني للجين على الكروموسوم ¢F 80111/8. حيث تم التحقق من دور 80111/8؛ عامل استتنساخ إصبع زنك من نوع «C2H2 في تطور الخلايا اللمفية «Nat Immunol 4 «Liu et al.) «Mol Cancer 5 Liu et 81. 525 )2003( ٠ )2006( 18)»؛ ولم يتم تحديد دورها في إنتاج خلايا الدم الحمراء أو تتظيم جين الجلوبين. في بداية عهد DNA الناتج عن عودة الارتباط الجيني؛ قدمت الدراسات الخاصة بهيكل جين الجلوبين أساس جزيئي قوي لفحص تحويل الجلوبين الجنيني. تم تركيز مجهود كبير على تحديد عناصر عند الموضع سيس في موضع الجلويين B ضرورية للتتظيم المناسب للجينات في مجموعة الجلوبين ١ المشابهة BJ تعتمد هذه الدراسات على الطفرات الموجودة في الطبيعة وحالات الحذف التي تؤثر على نحو مفاجئ على مستويات ال HOF لدى البالغين» والتي تم إلحاقها بواسطة توليد ly متحورة ورائياً تشتمل على جزء من المجمرعة Nathan and Oski's hematology «Nathan et. al.) (Xli p. 1864 xiv) pp. 2 v. «of infancy and childhood ed. 6th 2003) و( G. «Exp Hematol 33 «Stamatoyannopoulos )2005( 259( على الرغم من عناصر سيس ٠ الدقيقة المطلوبة لتحويل الجلوبين تظل غير محددة؛ تشير النتائج في الفئران المتحورة وراثياً إلى أن جينات الجلوبين 7 تعتبر ساكنة تلقائياً في مرحلة البالغين؛ وهي نتيجة تعتبر متوافقة جداً مع غياب المنشطات المعينة للمرحلة الجنينية أو وجود جين كبت معين لمرحلة. توفر النتائج الخاصة بالارتباط الجيني جينات مرشحة لفحص تدخلها في التحكم في جينات الجلوبين oy متل 80111/8. خلايا أولية لتكوين الدم Yo في أحد النماذج؛ يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم خارج الجسم الحي أو في المعمل. في نموذج محدد؛ تكون الخلية التي يتم تلامسها عبارة عن خلية لسلالة خلوية شبيهة بالكريات الحمراء cell of0 of the assorted images at the 167 levels. Proc Natl Acad Sci U 5 “Lettre et al.) Menzel ¢1620 (2008) “Proc Natl Acad Sci U 5 A 105 Uda et al. “A (2008) Nat Genet 39 cet al. (2007) 1197 Furthermore, many of these metamorphoses appear to predict clinical severity of sickle cell disease (Proc Natl Acad Sci” Lettre et al.) A (2008) © 5 no) and at least one of these SNPs could influence clinical outcome in marine anemia (Proc Natl Acad Sci U 5 A 105 Uda et al.) (2008) 1620 . The SNPs with the greatest effect are placed; Which explains more than 7,010 variant motifs in the HOF in the second intron of the gene on chromosome ¢F 80111/8. Where the role of 80111/8 has been verified; C2H2 zinc finger transcription factor in lymphocyte development Nat Immunol 4 Liu et al. Mol Cancer 5 Liu et al. Its role in red blood cell production or regulation of the globin gene has not been determined. At the beginning of the era of DNA resulting from genetic recombination; Studies of the structure of the globin gene provided a strong molecular basis for examining the conversion of embryonic globin. Much effort has been focused on identifying elements at the cis locus of the B gluten locus that are necessary for the proper regulation of genes in the BJ-like globin group 1. These studies rely on in-natural mutations and deletions that surprisingly affect HOF levels. in adults” that were attached by generating a transgenic ly mutant that comprises part of the pool Nathan and Oski's hematology “Nathan et. al.) (Xli p. 1864 xiv) pp. 2v. «of infancy and childhood ed. 6th 2003) and G. “Exp Hematol 33” Stamatoyannopoulos (2005) 259 Although the exact cis0 elements required for globin conversion remain undefined; findings in transgenic mice indicate that the globin 7 genes They are spontaneously dormant in the adult stage, a finding that is very consistent with the absence of embryonic-stage-specific activators or the presence of a stage-specific repressor gene.The results for gene association provide candidate genes to examine for their involvement in the control of oy globin genes such as 80111/8. Blood Yo In one embodiment, the original cell is contacted to form blood ex vivo or in vitro. In a specific embodiment, the cell that is contacted is a cell of an erythrocyte lineage
م+- -the erythroid lineage في أحد النماذج, تركيبة الخلية تشتمل على الخلايا التي لها تعبير منخفض عن .BCL1IA يشير المصطلح "خلية أصلية لتكون all كما هو مستخدم هناء إلى خلايا سلالة خلوية لخلية جذعية والتي تؤدي إلى ارتفاع جميع أنواع WA الدم Ly في ذلك الخلايا النخاعية myeloid (كريات بيضاء © وحيدة النواة monocytes ؛ الخلايا الملتهمة الكبيرة macrophages ؛ خلايا متعادلة بيضاء neutrophils ؛ خلايا تتلون بالملونات القاعدية WIA « basophils يوزينية eosinophils ¢ كريات دموية حمراء erythrocytes ؛ الكريات الكبيرة غير المنواة megakaryocytes /الصفائح الدموية platelets « خلايا متعلقة بالزوائد العصبية (dendritic cells وسلالات خلوية ليمفاوية lymphoid (NK BT WDA) lineages يشير مصطلح "خلية لسلالة خلوية شبيهة بالكريات الحمراء"” إلى ٠ خلية تتلامس مع خلية تخضع لتكون كرات الدم الحمراء والتي بعد التمايز النهائي تشكل كرية حمراء أو خلية دم حمراء ax .80 blood cell (RBC) تلك الخلايا إلى واحدة من ثلاث سلالات خلوية؛ وخلايا شبيهة بالكريات الحمراء؛ وخلايا ليمفاوية وخلايا نخاعية؛ Law من الخلايا الأصلية لتكون الدم لنخاع العظم. بمجرد التعرض لعوامل نمو محددة ومكونات أخرى لبيئة تكون الدم بحجم الميكرو» يمكن أن تتضج الخلايا الأصلية لتكون pall من خلال مجموعة من الأنواع الخلوية الوسيطة ٠ للتتمايزء والمركبات الوسيطة لسلالة خلوية لخلايا شبيهة بالكريات الحمراء في 4805. بالتالي؛ يشتمل المصطلح ADL خلوية لخلايا شبيهة بالكريات الحمراء» كما هو مستخدم هناء على خلايا أصلية لتكون الدم» وأرومات المُضرجة rubriblasts » وسليفة المُضرجة prorubricytes » والأرومات الحمراء erythroblasts ؛ والخليفة المُضرجة ٠ metarubricytes والخلايا الشبكية reticulocytes والكريات الحمراء erythrocytes . ٠ في بعض نموذج, تشتمل الخلية الأصلية لتكون الدم على واحد على الأقل من توصيف مرقم سطح الخلية لخلايا أولية لتكوين الدم: ,+Thyl/CD90 ,+00059 ,+CD34 -/ 003810 , و C-kit/CDI +17. على نحو مفضل, تشتمل الخلايا الأصلية لتكون الدم على العديد من هذه المرقمات. في بعض النماذج, تشتمل الخلايا الأصلية لتكون الدم لسلالة الخلايا شبيهة الكريات الحُمر على توصيف مرقم سطح الخلية لسلالة الخلايا شبيهة الكريات الحُمر: 1071© و19 160.M+- -the erythroid lineage In one embodiment, the cell composition includes cells that have low expression of BCL1IA. Elevation of all types of WA blood Ly including myeloid cells (monocytes; macrophages; neutrophils; WIA “basophils”). eosinophils ¢ red blood cells erythrocytes; megakaryocytes / platelets ¢ dendritic cells and lymphoid cell lineages (NK BT WDA) lineages The term “cell of an erythrocyte-like progeny” refers to a cell in contact with a cell that undergoes erythropoiesis and which after final differentiation forms a erythrocyte or a red blood cell (RBC) ax .80 those cells into one of three cell lineage; erythrocyte-like cells; lymphocytes and myeloid cells; Law From the original blood cells to the bone marrow. Once exposed to specific growth factors and other components of the hematopoietic microenvironment, progenitor cells can mature to form a pall through a combination of differentiation intermediate 0 cell types and intermediate compounds of the erythrocyte lineage P4805. Hence; The term cellular ADL includes erythrocyte-like cells » as used herein on hematopoietic progenitor cells », rubriblasts » prorubricytes » and erythroblasts ; Metarubricytes, reticulocytes, and erythrocytes. 0 In some embodiment, the hematopoietic progenitor cell includes at least one of the hematopoietic progenitor cell surface marker profiles: +Thyl/CD90, +CD34, +00059, +/ -/ 003810 , and C-kit/CDI +17. Preferably, the progenitor cells of hematopoiesis contain many of these markers. In some embodiments, hematopoietic progenitor cells of the erythroid lineage include a characterization of the erythroid lineage cell surface index: 1071© and 19 160.
veve
تكون الخلايا الجذعية Stem cells ؛ مثل الخلايا الأصلية لتكون الدم hematopoietic progenitor cells ¢ قادرة على التكاثر وتؤدي إلى زيادة الخلايا الأصلية التي يكون لديها القدرة علىStem cells are; Like the original cells to form hematopoietic blood Progenitor cells ¢ are able to multiply and lead to an increase in the original cells that have the ability to
توليد عدد كبير من الخلايا الأم والتي بدورها تؤدي إلى زيادة خلايا بنت متمايزة أو قابلة للتمايز. يمكنThe generation of a large number of mother cells, which in turn leads to an increase in differentiated or differentiated daughter cells. maybe
حث خلايا البنت نفسها لتكاثر lly نسل الذي Lad بعد يتمايز إلى واحدة أو أكثر من أنواع خليةInduce the same daughter cells to reproduce lly the offspring of which Lad after differentiates into one or more cell types
© ناضجة mature cell ؛ Law يتم Lad احتجاز واحدة أو أكثر من الخلايا مع إمكانية تطوير الأم. بالتالي» يشير المصطلح "خلية جذعية؛ إلى خلية لها القدرة أو الإمكانية؛ في ظل ظروف محددة؛ على© mature cell; Law Lad One or more cells are retained with the possibility of maternal development. Thus, the term "stem cell" refers to a cell that has the ability or potential, under specified conditions, to
التمايز إلى نمط ظاهري أكثر تخصصاً أو dia والتي تحتجز القدرة» في ظل ظروف محددة؛ علىdifferentiation into a more specialized phenotype or dia that sequesters the ability” under specific conditions; on
التكاثر بدون التمايز إلى حدٍ كبير. في أحد النماذج» يشير التعبير خلية أصلية أو جذعية إلى خلية أمReproduction without differentiation to a large extent. In one embodiment, the term progenitor or stem cell refers to a mother cell
عامة والتي يتخصص السليل (النسل) الخاص بهاء Sale اتجاهات مختلفة؛ بواسطة «pall علىIn general, which specializes the descendant (offspring) of Baha Sale in different directions; by «pal on
Vs سبيل المثال بواسطة اكتساب صفات فردية بالكامل؛ مما يؤدي إلى تعدد متقدم للخلايا والأنسجة الجنينية. يعتبر التمايز الخلوي عبارة عن عملية معقدة تحدث بشكل نمطي من خلال العديد من اتقسامات الخلية. يمكن اشتقاق خلية متمايزة من خلية متعددة القدرات والتي يتم اشتقاقها من خلية متعددة القدرات» وهكذا. بينما يمكن اعتبار كل خلية من الخلايا متعددة القدرات المذكورة عبارة عنVs for example by fully acquiring individual traits; Which leads to an advanced multiplicity of embryonic cells and tissues. Cell differentiation is a complex process that typically occurs through many cell divisions. A differentiated cell can be derived from a pluripotent cell which is derived from a pluripotent cell, and so on. While each of the aforementioned multipotent cells can be considered as a
خلايا جذعية؛ يمكن أن يتفاوت مدى كل نوع من أنواع الخلايا الذي يؤدي إلى زيادة الخلايا المتمايزة.stem cells The extent to which each cell type leads to an increase in differentiated cells can vary.
٠ يكون لبعض الخلايا المتمايزة أيضاً القدرة على زيادة خلايا لها إمكانية أكبر على التطور. يمكن أن تكون هذه القدرة طبيعية أو يمكن Lia طبيعياً عند العلاج بواسطة عوامل متعددة. في العديد من الحالات البيولوجية؛ تكون الخلايا الجذعية أيضاً 'متعددة القدرات" لأنه يمكنها أن تنتج نسل له أكثر0 Some differentiated cells also have the ability to multiply cells that have a greater potential for development. This ability can be natural or Lia can be naturally regenerated when treated by various factors. in many biological situations; Stem cells are also 'pluripotent' because they can produce more offspring
من نوع خلية مميزء ولكن لا يعتبر ذلك مطلوباً "للجذوعية”. يعتبر التجديد الذاتي جزء تقليدي آخر لتعريف الخلية الجذعية؛ وتعتبر أساسية كما هي مستخدمة في هذه الوتيقة. نظرياً؛ يمكن أن يحدثof a distinct cell type but not considered required for "stem". Self-renewal is another traditional part of the definition of a stem cell; it is considered essential as used in this document. Theoretically, it could happen.
٠ . التجديد الذاتي بأي من آليتين أساسيتين. يمكن أن تتقسم الخلايا الجذعية لا Bla مع وجود خلية بنت تحتجز الحالة الجذعية والأخرى تعبر وراثياً عن بعض الوظائف المحددة الأخرى المميزة والنمط الظاهري. على نحو بديل؛ يمكن أن تتقسم بعض الخلايا الجذعية في مجموعة بشكل متماثل إلى0 . Self-renewal by either of two primary mechanisms. Bla' stem cells can divide with one daughter cell retaining the stem state and the other genetically expressing some other specific characteristic function and phenotype. alternatively Some stem cells in a group can divide identically into
خليتين جذعيتين؛ وبالتالي الحفاظ على بعض WAN الجذعية في المجموعة (JSS بينما تؤدي الخلايا الأخرى الموجودة في المجموعة إلى زيادة النسل المتمايز فقط. بصفة عامة؛ يكون DAL الأصلية"two stem cells Thus preserving some WAN stem cells in the JSS while other cells in the cluster only increase the differentiated offspring. In general, the original DAL is
YO نمط ظاهري خلوي يكون أكثر بدائية (أي؛ أنها خطوة أقدم بامتداد مسار تطوري أو تقدمي أكثر من خلية متمايزة بالكامل). dale يكون للخلايا الأصلية إمكانية تكاتر كبيرة أو عالية جداً. يمكن أن ترتفعYO is a cellular phenotype that is more primitive (ie, it is an older step along an evolutionary or progressive pathway than a fully differentiated cell). dale The original cells have a high or very high reproductive potential. can go up
CARCAR
١ «= الخلايا الأصلية إلى أنواع خلايا متمايزة مميزة متعددة أو إلى نوع خلية واحد متمايز؛ بناءً على المسار التطوري والبيئة التي تتطور وتتمايز فيها الخلايا. في سياق نشأة الخلية؛ تعتبر الصفة 'متمايز” أو "lal مصطلح نسبي. تعتبر "خلية متمايزة "differentiated cell عبارة عن خلية تقدمت في مسار التطور أبعد من الخلية التي تتم مقارنتها © بها. بالتالي؛ يمكن أن تتمايز الخلايا الجذعية إلى خلايا منتجة لغيرها مقيدة بسلاسة خلوية Jia) خلايا أصلية مكونة opal والتي بدورها يكن أن تتمايز إلى أنواع أخرى من الخلايا المنتجة لغيرها أبعد من المسار (متل مادة منتجة لكرية حمرا Arig ¢ ( s ذلك مرحلة dale لخلية متمايزة؛ مثل كرية حمرا و والتي تلعب دوراً ase في نوع معين من الأنسجة ويمكنها أن تحتجز أو لا تحتجز القدرة على التكاثر. الخلايا الجذعية متعدد الإمكانات المحفزة ٠ في بعض النماذج, تكون الخلايا البشرية المهندسة Las الموصوفة في الطلب الحالي المشتقة من الخلايا الجذعية متعدد الإمكانات المعزولة. تتمتل ميزة استخدام 105605 في إمكانية أن تكون الخلايا مشتقة من نفس الخاضع الذي يتم إعطاء الخلايا الأولية له. بمعنى أنه, يمكن الحصول على الخلية الجسمية من خاضع, تمت إعادة برمجته إلى خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات, وبعد ذلك تمت sale) تمايزه في خلية أولية لتكوين الدم سيتم إعطائها إلى خاضع (على سبيل المثال, الخلايا ذاتية ١ المنشاً). نظراً oF الخلايا السليفة تكون على نحو أساسي مشتقة من مصدر ذاتي المنشاً, يقل خطر رفض الطعم أو الاستجابات التحساسية مقارنة باستخدام الخلايا من خاضع آخر أو مجموعة من الخاضعين. في بعض النماذج, تكون الخلايا السليفة المكونة للدم مشتقة من مصادر غير ذاتية المنشاً. إضافة لذلك, استخدام iPSCs ينفي الحاجة إلى الخلايا التي تم الحصول عليها من مصدر جنيني. بالتالي, في أحد النماذج, لا تكون الخلايا الجذعية المستخدمة في الطرق التي تم الكشف عنها Yo الخلايا الجذعية الجنينية .embryonic stem cells على الرغم من أن التمايز يكون عموماً غير قابل للعكس في ظل السياقات الفسيولوجية,تم تطوير عدة طرق مؤخراً لإعادة برمجة الخلايا الجسمية إلى الخلايا الجذعية متعدد الإمكانات المحفزة. الطرق التمثيلية تكون معروفة لأولئك المهرة في المجال وتكون موصوفة بإيجاز في الطلب الحالي ما يلي. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, يشير المصطلح "إعادة البرمجة' إلى عملية Jad أو تعكس حالة Yo تتمايز خلية متمايزة Jo) سبيل المثال, الخلية الجسمية (somatic cell . بطريقة أخرى, تشير إعادة CAR yy البرمجة إلى عملية توجيه تمايز الخلية إلى الخلف إلى خلية من نوع أولي غير متمايزة أو أكثر. ينبغي ملاحظة أن وضع الكثير من الخلايا الأولية في مستتبت قد يؤدي إلى بعض الفقد في السمات المتمايزة بالكامل. بالتالي, وببساطة لا يجعل استتبات الخلايا المذكورة المتضمنة في مصطلح الخلايا سبيل المثال, الخلايا غير المتمايزة (Ho) المتمايزة من هذه الخلايا خلايا غير متمايزة أو الخلايا متعددة الإمكانات. يتطلب انتقال خلية متمايزة إلى تعدد (undifferentiated cells © الإمكانات مثير إعادة برمجة أبعد من المثير الذي يؤدي إلى فقد جزئي في صفة التمايز في مستتبت. تتمتع خلايا تمت إعادة برمجتها أيضاً بمواصفات القدرة على التمرير الموسع دون فقد إمكانيات النمو, بالنسبة إلى آباء الخلية الأولية, والتي تتمتع عموماً بالقدرة على عدد من الانقسامات المحدودة فقط في culture مسنتبت أو طرفياً قبل إعادة البرمجة. في بعض Lia برمجتها إما متمايزة sale] قد تكون الخلية التي سنتم ٠ النماذج, تضم إعادة البرمجة قلب كامل لحالة تمايز خلية متمايزة (على سبيل المثال, الخلية الجسمية) إلى حالة متعددة الإمكانات أو حالة متعدد الفعاليات. في بعض النماذج, تضم إعادة البرمجة قلب تام أو جزئي لحالة تمايز خلية متمايزة (على سبيل المثال, الخلية الجسمية) إلى خلية غير متمايزة (على يمكن أن ينتج عن إعادة البرمجة ٠. (embryonic-like cell سبيل المثال, خلية شبيهة بالجنين sale) التعبير عن جينات محددة بواسطة الخلايا, والتي يساهم التعبير عنها علاوة على ذلك في VO البرمجة. في نماذج محددة موصوفة في الطلب الحالي, تتسبب إعادة برمجة خلية متمايزة (على سبيل الجسمية) في أن تتخذ الخلية المتمايزة حالة غير متمايزة (على سبيل المثال, تكون خلية Ada), JA برمجتها, " أو "الخلايا الجذعية sale) غير متمايزة). الخلايا الناتجة يشار إليها بالاسم "خلايا تمت "(iPS أو IPSCs متعدد الإمكانات المحفزة (خلايا قد تشتمل إعادة البرمجة على تبديل, على سبيل المثال, قلب, بعض على الأقل من الأنماط الموروثة Yo ais, (methylation (على سبيل المثال, المعالجة بالميثيل nucleic acid لتعديل حمض نووي التغيرات اللاجينية, الطباعة الجينومية, إلخ, التي تحدث أنثناء التمايز chromatin الكروماتين الخلوي. تكون إعادة البرمجة مميزة عن الحفاظ المبسط على الحالة القائمة غير المتمايزة للخلية تكون متعددة الإمكانات فعلياً أو المحافظة على أقل من الحالة المتمايزة القائمة لخلية تكون بالفعل خلية تكون إعادة البرمجة مميزة أيضاً عن (pall متعددة الفعاليات (على سبيل المتال, خلية جذعية مكونة YO تعزيز التجديد الذاتي ل أو تكاثر الخلايا التي تكون بالفعل متعددة الإمكانات أو متعددة الفعاليات, على1 “= progenitor cells into multiple distinct differentiated cell types or into a single differentiated cell type; Based on the developmental pathway and the environment in which cells develop and differentiate. in the context of cell genesis; The adjective 'differentiated' or 'lal' is a relative term. A 'differentiated cell' is a cell that has advanced further in development than the cell with which it is compared. Thus, stem cells can differentiate into progenitor cells with restricted cellular smoothness Jia) progenitor opal-forming cells which in turn can differentiate into other types of progenitor cells further down the pathway (eg erythrocyte-producing substance Arig ¢ (s) that dale stage of a differentiated cell; such as corpuscle erythrocytes, which play an ase role in a particular type of tissue and may or may not retain the ability to proliferate iPS cells 0 In some embodiments, the engineered human cells Las described in the present submission are derived from stem cells Isolated pluripotency.The advantage of using 105605 is that the cells can be derived from the same subject as the progenitor cells are given.That is, a somatic cell can be obtained from a subject, reprogrammed into an iPS cell, and then sold ) differentiated into a hematopoietic progenitor cell that will be given to subject (eg, autologous 1 cells). Because oF progenitor cells are primarily derived from an autologous source, the risk of graft rejection or allergic responses is reduced compared to using cells from another subject or group of subjects. In some embodiments, hematopoietic progenitor cells are derived from non-autologous sources. In addition, the use of iPSCs eliminates the need for cells obtained from an embryonic source. Thus, in one embodiment, the stem cells used in the methods disclosed are not embryonic stem cells. Although differentiation is generally not reversible under physiological contexts, several methods have recently been developed to recreate Programming of somatic cells into induced pluripotent stem cells. Representative methods are known to those skilled in the art and are briefly described in the present application below. As used in the present application, the term 'reprogramming' refers to a Jad process or reflects the state of Yo in a differentiated Jo cell (eg, a somatic cell). In another way, CAR reprogramming refers to yy Programming to the process of directing cell differentiation backwards into one or more undifferentiated progenitor cells. It should be noted that placing too many progenitor cells in homeostasis may result in some loss of fully differentiated traits. Therefore, it simply does not make the cells stable mentioned contained in the term cells e.g., undifferentiated cells (Ho) differentiated from these cells are undifferentiated cells or pluripotent cells. The transition of a differentiated cell to pluripotent potential requires a further reprogramming The stimulus that leads to a partial loss of differentiation in the homeostasis. Reprogrammed cells also have the characteristics of the ability to pass extensively without loss of growth potential, relative to the primary cell parents, which generally have the capacity for a limited number of divisions only in culture on an installation or peripheral before reprogramming z Lia reprogrammed either differentiated sale] The cell to be studied may be 0 models, reprogramming involves an entire inversion of a differentiated cell state (eg, a somatic cell) into a pluripotent state or a multiactivity state. In some embodiments, reprogramming involves complete or partial reversal of the differentiation state of a differentiated cell (eg, a somatic cell) into an undifferentiated cell (eg an embryonic-like cell). , embryonic cell sale) the expression of specific genes by cells, the expression of which furthermore contributes to VO programming. In specific models described herein, reprogramming of a differentiated cell (eg somatic) causes The differentiated cell assumes an undifferentiated state (for example, an Ada cell, a reprogrammed JA, or a stem cell (sale) is undifferentiated). The resulting cells are referred to as “mutated cells” (iPS) or induced pluripotentiation (IPSCs) cells. Reprogramming may involve switching, for example, inverting, at least some of the Yo ais, (methylation) phenotypes (eg, methylation of nucleic acid to modify nucleic acid) Epigenetic changes, genomic printing, etc., that occur during cellular chromatin differentiation. Reprogramming is distinct from the simplistic preservation of the existing undifferentiated state of the cell. Truly pluripotent or maintaining less than the existing differentiated state of a cell that is already a cell Reprogramming is also distinct from pall Multiactivity (eg, a yo-forming stem cell) Promote self-renewal or proliferation of cells that Be truly all-in-one or multi-functional, on the
CARCAR
7ل الرغم من أن التركيبات والطرق الموصوفة في الطلب الحالي يمكن استخدامها أيضاً للغرض المذكور, في بعض النماذج. لا تكون المنهج أو الطريقة الخاصة المستخدمة لتوليد الخلايا الجذعية متعددة الإمكانات من الخلايا الجسمية (مشار led] على نطاق واسع بالاسم "إعادة (aad ذات أهمية حرجة للاختراع المطلوب © حمايته. بالتالي, ستكون آية طريقة تعيد برمجة الخلية الجسمية إلى النوع النظير متعدد الإمكانات مناسبة للاستخدام في الطرق الموصوفة في الطلب الحالي. تم وصف مناهج إعادة البرمجة لتوليد الخلايا متعددة الإمكانات باستخدام توليفات محددة من عوامل انتساخ الخلايا الجذعية متعددة الإمكانات المحفزة. حول Yamanaka و Takahashi الخلايا الجسمية في الفتران إلى الخلايا شبيهة الخلية ES مع احتمال التطور الموسع بواسطة التحويل المباشر ٠ ل .(Takahashi and Yamanaka, 2006) c-Myc ,KIf4 ,Sox2 ,Oct4 5 تشبه الخلايا ES لأنها تستعيد مجموعة دوائر الانتساخ المرتبطة بتعدد الإمكانات 5 MUC للسطح اللاجيني. إضافة لذلك, تفي 10505 بجميع التجارب القياسية لتعدد الإمكانات: تحديداً, التمايز في المعمل في أنواع الخلية لثلاث طبقات جرثومية, تكوين teratoma المساهمة في الخلايا الخيمرية ,chimeras نقل السلالة الجرثومية ,(Maherali and Hochedlinger, 2008) germline transmission diss; Vo رباعي الصيغة الصبغية )2009 .(Woltjen et al., أوضحت الدراسات التالية أن خلايا IPS البشرية يمكن الحصول عليها باستخدام طرق تحويل مشابهة Lowry et al., 2008; Park et al., 2008; Takahashi et al., 2007; Yu et al., ( Jules ,(2007b الانتساخ ,SOX2 ,0CT4 trio و ,]NANOG المحدد كالمجموعة القلب لعوامل الانتساخ التي تحكم تعدد الإمكانات )2008 (Jaenisch and Young, يمكن إنتاج الخلايا IPS daly Yo تقديم متواليات الحمض الأميني التي تشفر جينات مرتبطة بخلية جذعية في شخص بالغ, الخلية الجسمية, تاريخياً باستخدام نواقل التعبير الفيروسية. يمكن توليد الخلايا IPS أو تكون مشتقة من الخلايا الجسمية المتمايزة طرفياً, وكذلك من الخلايا الجذعية البالغة, أو الخلايا الجذعية الجسمية. بمعنى أن, يمكن جعل خلية أولية غير متعددة الإمكانات متعددة الإمكانات أو متعددة الفعاليات بواسطة إعادة البرمجة. في الحالات المذكورة, قد لا YO يكون من الضروري تضمين الكثير من عوامل إعادة البرمجة المطلوبة لإعادة برمجة خلية متمايزة7For although the compositions and methods described in the present application may also be used for the said purpose, in some embodiments. The particular method or method used to generate pluripotent stem cells from somatic cells ([led] broadly referred to as 're-(aad') is not critical to the claimed patent. Hence, any method that reprograms the somatic cell into the species The pluripotent analogues are suitable for use in the methods described in the present submission Reprogramming approaches to generate pluripotent cells using specific combinations of iPS cell transcription factors Yamanaka and Takahashi converted somatic cells in the period into cell-like cells ES with potential for expanded development by direct conversion 0 to (Takahashi and Yamanaka, 2006) c-Myc, KIf4, Sox2, Oct4 5 cells resemble ES because they restore the pluripotency-associated 5 MUC transcriptional circuitry. In addition, the 10505 fulfills all standard experiments for pluripotency: namely, in vitro differentiation into cell types of three germ layers, teratoma formation, contribution to chimeras, germline transfer, (Maherali and Hochedli). Nger, 2008) germline transmission diss; Vo tetraploid (Woltjen et al., 2009). The following studies indicated that human iPS cells can be obtained using similar transduction methods Lowry et al., 2008; Park et al., 2008; Takahashi et al. ., 2007; Yu et al., (Jules, 2007b) transcription (0CT4, SOX2 trio, and NANOG), identified as the core group of transcription factors governing pluripotency (2008) (Jaenisch and Young, 2008). Producing iPS cells daly Yo Delivering amino acid sequences that encode genes associated with a stem cell in an adult, the somatic cell, historically using viral expression vectors iPS cells can be generated or derived from terminally differentiated somatic cells, as well as from adult stem, or somatic stem cells.In other words, a non-pluripotent progenitor cell can be made pluripotent or multifunctional by reprogramming.In the cases mentioned, it may not be necessary to include as many reprogramming factors as are required to reprogram a differentiated cell
السلاSala
طرفياً. على نحو إضافي, يمكن تحفيز إعادة البرمجة بواسطة تقديم عوامل إعادة البرمجة غير الفيروسية, على سبيل المثال, بواسطة إدخال البروتينات ذاتها, أو بواسطة إدخال أحماض نووية تشفر عوامل إعادة البرمجة, أو بواسطة إدخال RNAS مرسل والذي بمجرد ترجمته وراثياً ينتج عوامل sale) البرمجة (انظر على سبيل المثال, Warren et al.,, Cell Stem Cell, 2010 Nov o(5;7(5):618-30 © يمكن أن تتحقق إعادة البرمجة بواسطة إدخال توليفة من أحماض نووية تشفر جينات مرتبطة خلية جذعية بما في ذلك, على سبيل Jia) 00-4 (أيضاً معروفة بالاسم Oct=3/4 أو ,Sox 18 ,Sox 15 ,Sox3 ,Sox2 ,Soxl ,(Pouf51 و ااحظلا, , KIfl 12لا 4آلها, -LIN28 , , 161 ,Rem2 ,n-Myc ,Myc-) ,c-Myc ,NR5A2 5 في أحد النماذج, تشتمل sale) البرمجة باستخدام الطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي علاوة على ذلك على إدخال ٠ واحد أو أكثر من 001-3/4, عضو من عائلة ,SOX عضو من عائلة KIf وعضو من عائلة Myc في الخلية الجسمية. في أحد النماذج, تشتمل الطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي علاوة على ذلك على إدخال واحد أو أكثر من كل من 4 c-MYC ,Nanog ,Sox2 ,0ct و 14لا لإعادة البرمجة. وفقاً للملاحظ سابقاً, الطريقة المحددة المستخدمة لإعادة البرمجة لا تكون حرجة بالضرورة للطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي. مع ذلك, حيث يكون من المطلوب استخدام الخلايا ١ المتمايزة من خلايا تمت sale) برمجتها في, على سبيل المثال, علاج البشر, في أحد النماذج لا يتم sale) das البرمجة بواسطة طريقة تبدل الجينوم. بالتالي, في النماذج المذكورة, تتحقق إعادة البرمجة,peripherally. Additionally, reprogramming can be induced by the introduction of non-viral reprogramming factors, for example, by the introduction of the proteins themselves, or by the introduction of nucleic acids encoding the reprogramming factors, or by the introduction of messenger RNAs which, once genetically translated, produce sale factors Reprogramming (see, for example, Warren et al., Cell Stem Cell, 2010 Nov © o(5;7(5):618-30) Reprogramming can be accomplished by introducing combinations of nucleic acids They encode stem cell related genes including, for example, Jia 00-4 (also known as Oct=3/4, Sox 15, Sox3, Sox2, Sox3, Sox2, Pouf51, and Sox18). , , KIfl 12 no 4, LIN28, LIN28, 161, Rem2, n-Myc, Myc-) , c-Myc, NR5A2 5 (in one embodiment, sale) includes programming using the methods and constructs described in the present order plus In addition, one or more 001-3/4, a member of the SOX family, a member of the KIf family, and a member of the Myc family of the somatic cell were introduced into the somatic cell.In one embodiment, the methods and constructs described in The current order furthermore contains one or more entries from each of the 4 c-MYC, Nanog, Sox2 ,0ct and 14 are not reprogrammable. As noted above, the specific method used for reprogramming is not necessarily critical to the methods and combinations described in the present application. However, where it is desired to use das1 cells differentiated from cells that have been reprogrammed to, for example, treat humans, in an embodiment the reprogramming of das is not done by the genome-altering method. Thus, in the said models, reprogramming is achieved,
على سبيل المثال, دون استخدام بلازميد ناقل تعبير أو بلازميد فيروسي plasmid vectors يمكن تحسين كفاءة إعادة البرمجة (أي, عدد خلايا تمت إعادة برمجتها) المشتقة من مجموعة من الخلايا البادئة بواسطة إضافة العديد من جزيئات صغيرة وفقاً للموضح بواسطة Shi, Y., et al Cell-Stem Cell 2:525-528, Huangfu, D., et al (2008) Nature ٠ )2008( Biotechnology 26(7): 195-7191, and Marson, A., et al (2008) Cell-Stem Cell 3:132-5. بالتالي, يمكن استخدام عامل أو توليفة من العوامل التي تحسن كفاءة أو معدل إنتاج خلية جذعية متعددة الإمكانات محفزة في إنتاج IPSCs خاصة بالمريض أو بالمرض. تشتمل بعض أمثلة العوامل غير الحصرية التي تحسن كفاءة sale] البرمجة على Wit قابل للذوبان, وسط مهيا بت BIX-01294 (G9a Wnt Yo هيستون ميثيل ترانسفيراز 1805781856 الإ 00810 ,(histone 1 (متبط (MEK مثبطات ميثيل ترانسفيراز DNA methyltransferase , متبطاتFor example, without the use of an expression vector plasmid or viral plasmid vectors the reprogramming efficiency (ie, the number of reprogrammed cells) derived from a group of initiating cells can be improved by adding several small molecules as shown by Shi, Y. , et al Cell-Stem Cell 2:525-528, Huangfu, D., et al (2008) Nature 0 (2008) Biotechnology 26(7): 195-7191, and Marson, A., et al. (2008) Cell-Stem Cell 3:132-5.Therefore, an agent or combination of factors that improve the efficiency or rate of iPSC production can be used to produce patient or disease-specific IPSCs.Some examples of non-exclusive agents include that improve the efficiency of [sale] Programming on Wit soluble, bit-formatted medium BIX-01294 (G9a Wnt Yo) histone methyltransferase 1805781856 No 00810 (histone 1 (MEK) bound) methyltransferase inhibitors DNA methyltransferase, repressors
ل هيستون دي أسيليتاز histone deacetylase (HDAC) حمض فالبوريك —'s , valproic acid أزاسيتيدين azacytidine , دكساميثازون dexamethasone , سوبرويل أنيليد 50061080118 , حمض هيدروكساميك hydroxamic acid (/1ا/5), فيتامين ,C وتراي كوستاتين 110051817 (TSA) , من بين غيرها أخرى. © تشتمل الأمثلة الأخرى غير الحصرية لعوامل تحسين إعادة البرمجة على: حمض سوبرويل أنيليد هيدروكساميك 610 Ae) (SAHA) Suberoylanilide Hydroxamic سبيل المثال, 3, فورينوستات vorinostat ) وأحماض هيدروكساميك hydroxamic acids الأخرى), Depudecin ,BML-210 (على سبيل المثال, Depudecin), HC Toxin, Nullscript (4-(1,3-Dioxo-IH,3H—(-) J a4, (benzo[de]isoquinolin-2-yl)-N-hydroxybutanamide | ٠ بوترات Ae) Phenylbutyrate سبيل المثال, فينيل بوتيرات الصوديوم (sodium phenylbutyrate وحمض فالبوريك (VPA) Valproic Acid والأحماض الدهنية fatty acids الأخرى قصيرة السلسلة ,Scriptaid (short chain سورامين الصوديوم Sodium 207 , تريكوستاتين A (TSA) 10000518110, المركب م Apicidin , APHA بوتيرات الصوديوم Sodium Vo 817/1816 , بيفالويل أوكسي ميثيل بوتيرات ,(Pivanex, AN-9) pivaloyloxymethyl butyrate Trapoxin 8 , 001800700610 , ببتيد ديبسي Depsipeptide (أيضاً معروف بالاسم FR901228 أو (FK228 , بنز أميدات (على سبيل المثال, 1-994 (He) سبيل المثال, ل١- أسيتيل دينالين NVP-LAQ-824, ,MGCDO0103 ,(MS-27-275 (N-acetyl dinaline CBHA (حمض ١٠-كربوكسي سيناميك بيس carboxycinnaminic acid حمض هيدروكساميك —A ,Tubacin ,JNJ16241199 ,(bishydroxamic acid VY. 17 1, بروكساميد ,proxamide أوكسامفلاتين 3-C1-UCHA ,oxamflatin (على سبيل المقال, -3)-6 CHAP31 , (chlorophenylureido)caproic hydroxamic 0 و50 .CHAP تشتمل عوامل تحسين إعادة البرمجة الأخرى, على سبيل المتال, على الصور السالبة السائدة من HDACS (على سبيل المثال, الصور غير النشطة حفزياً), ممقبطات siRNA ل ,HDACs والأجسام المضادة © التي ترتبط تحديداً ب 10/05. تكون المثبطات المذكورة متوفرة, على سبيل المثال, من BIOMOL International, Fukasawa, Merck Biosciences, Novartis, Gloucester oY AYHistone deacetylase (HDAC) valproic acid —'s , valproic acid azacytidine , dexamethasone , superyl anylide 50061080118 , hydroxamic acid (/1a/5), vitamin C, and Tri Costatin 110051817 (TSA), among others. © Other, non-exclusive examples of reprogramming enhancing agents include: Suberoylanilide Hydroxamic Acid 610 Ae (SAHA) eg, 3, vorinostat (and other hydroxamic acids), Depudecin, BML- 210 (eg, Depudecin), HC Toxin, Nullscript (4-(1,3-Dioxo-IH,3H—(-) J a4, (benzo[de]isoquinolin-2-yl)-N -hydroxybutanamide | Sodium 207 , Trichostatin A (TSA) 10000518110, Compound M Apcidin , APHA Sodium Butyrate Sodium Vo 817/1816 , Bivaloyloxymethyl butyrate (Pivanex, AN-9) pivaloyloxymethyl butyrate Trapoxin 8 , 001800700610 , Depsipeptide (also known as FR901228 or FK228), benzamides (eg, 1-994 (He) eg, L1-Acetyldynaline NVP- LAQ-824, MGC DO0103 (MS-27-275 (N-acetyl dinaline) CBHA (10-carboxycinnaminic acid) hydroxamic acid—A , Tubacin , JNJ16241199 (bishydroxamic acid VY.17 1, proxamide) proxamide, oxamflatin, 3-C1-UCHA, oxamflatin (eg, -3)-6, CHAP31, (chlorophenylureido)caproic hydroxamic 0 and 50, CHAP. Other reprogramming enhancing agents include, for example, Predominant negatives from HDACS (eg, catalytically inactive images), siRNA anticoagulants for HDACs, and © antibodies that bind specifically to 5/10. Said inhibitors are available, for example, from BIOMOL International, Fukasawa, Merck Biosciences, Novartis, Gloucester oY AY
١717
Pharmaceuticals, Aton Pharma, Titan Pharmaceuticals, Schering AG, .Sigma Aldrich 4 ,Pharmion, MethylGene لتأكيد حث الخلايا الجذعية متعددة الإمكانات للاستخدام في الطرق الموصوفة في الطلب الحالي, يمكن اختبار نسائل معزولة للتعبير عن مرقم خلية جذعية. يعرف التعبير المذكور في خلية مشتقة من كخلايا جذعية متعددة الإمكانات محفزة. يمكن انتقاء مرقمات الخلية الجذعية DAY الخلية الجسمية © ,Ecatl ذلسط, ,Nanog ,CD9 ,SSEA4 ,SSEA3 من المجموعة غير الحصرية بما في ذلك في أحد ٠ Natl 5 ,Utfl ,Rex| ,Slc2a3 ,Zpf296 ,Daxl ,Cripto ,Fgf4 , 5013 ,Eras ,Esgl النماذج, يتم تعريف الخلية التي تعبر عن 0014 أو 8009 بالاسم متعددة الإمكانات. قد تشتمل وطرق مناعية ترصد RT-PCR طرق كشف التعبير عن المرقمات المذكورة, على سبيل المثال, على أو تحليلات تدفق Westen مثل لطخ , encoded polypeptides: sic وجود بولي ببتيدات ٠ رصد مرقمات البروتين. Lad فقط, بل RT-PCR الخلايا. في بعض النماذج, لا يشتمل الرصد على عن طريق 81-068 , في حين يتم تعريف did) يمكن تعريف المرقمات بين الخلايا على النحو مرقمات سطح الخلية سريعاً, على سبيل المثال, بواسطة كيمياء الخلايا المناعية .Immunocytochemistry تأكيد صفات خلية جذعية متعددة الإمكانات للخلايا المعزولة بواسطة الاختبارات التي تقيم قدرة (Kg ١ على التمايز إلى خلايا كل من الطبقات الجرثومية الثلاث. كأحد الأمثلة, يمكن استخدام 5 تكوين الورم المسخي في الفثران العارية من الشعر لتقييم الصفة متعددة الإمكانات لنسائل معزولة. يتم تقديم الخلايا إلى الفئران العارية من الشعر ويتم إجراء تحليل النسيج و / أو كيمياء النسيج المناعي على الورم الناشئ من الخلايا. يشتمل نمو الورم على الخلايا من جميع الطبقات الجرثومية الثلاث, على سبيل المثال, ويشير علاوة على ذلك إلى أن الخلايا تكون الخلايا الجذعية متعددة الإمكانات. Yo الخلايا الجسمية لإعادة البرمجة الخلايا الجسمية, وفقاً لاستخدام المصطلح في الطلب الحالي, غلى أي الخلايا التي تكون جسم الكائن — mammalian body ill الحي, باستثناء خلايا السلالة الجرثومية. كل نوع خلية في جسم والخلايا التي يتم تكوينها منها (الخلايا المشجية , sperm بعيداً عن البويضات والحيوانات المنوية والخلايا الجذعية غير المتمايزة --تكون الخلية الجسمية المتمايزة. على سبيل (gametocytes YoPharmaceuticals, Aton Pharma, Titan Pharmaceuticals, Schering AG, Sigma Aldrich 4 , Pharmion, MethylGene To confirm the induction of pluripotent stem cells for use in the methods described herein, isolated clones can be tested for expression of a stem cell marker. This expression in a cell derived from is known as an induced pluripotent stem cell. Stem cell markers DAY somatic cell © Ecatl, ZL, Nanog, CD9, SSEA4, SSEA3 can be selected from the non-exclusive set including in one of 0 Natl 5 Utfl , Rex| In Slc2a3, Zpf296, Daxl, Cripto, Fgf4, 5013, Eras, Esgl models, a cell that expresses 0014 or 8009 is identified by the name all-in. Methods for detecting expression of said markers may include, for example, or Westen flow analyses such as Westen blot, encoded polypeptides: sic presence of polypeptides 0 detection of protein markers Lad only, but RT-PCR the cells. In some embodiments, detection is not included via 068-81, while (did) intercellular markers can be quickly identified as cell surface markers, for example, by immunocytochemistry. Confirmation of the pluripotent stem cell characteristics of the isolated cells by assays assessing the ability of 1 Kg to differentiate into cells of each of the three germ layers. As an example, 5 teratogenesis in the hairless protuberances can be used to assess the pluripotency of isolated clones Cells are introduced into hairless mice and histopathologic analysis and/or immunohistochemistry is performed on the tumor arising from the cells Tumor growth includes cells from all three germ layers, for example, and furthermore indicates Somatic cells, as the term is used in the present application, mean any cells that make up the body of an organism — mammalian body ill, with the exception of germline cells. cell in a body, etc The cells from which they are formed (gametophytes, sperm apart from eggs, sperm, and undifferentiated stem cells) form the differentiated somatic cell. For example (gametocytes Yo
SRVSRV
المتال, الأعضاء الداخلية والجلد والعظام والدم والنسج الضام المصنوعة جميعها من الخلايا الجسمية . differentiated somatic cells المتمايزة تشتمل أنواع الخلية الجسمية الإضافية للاستخدام مع التركيبات والطرق الموصوفة في الطلب الحالي خلية العضلات (primary fibroblast على: الخلية الليفية (على سبيل المثال, الخلية الليفية الأولية خلية عصبية «cumulus )؛ خلية ركاميةاا8© myocyte سبيل المثال, خلية عضلية lo) © وخلية جزيرة البنكرياس hepatocyte خلية كبدية « mammary cell ius خلية ¢ neural cell بعض النماذج, تكون الخلية الجسمية سلالة الخلية الأولية أو تكون 4. pancreatic islet cell سليفة سلالة خلية أولية أو ثانوية. في بعض النماذج, الخلية الجسمية يتم الحصول عليها من عينة ؛ خزعة blood sample من الدم due ؛ hair follicle بشرية, على سبيل المتال, بصيلات الشعر «(adipose biopsy أو خزعة دهنية skin biopsy سبيل المثال, خزعة الجلد le) biopsy ~~ ٠ وتكون بالتالي الخلية (oral swab sample وعينة مسحة (على سبيل المثال, عينة مسحة الفم الجسمية البشرية. تشتمل بعض الأمثلة غير الحصرية للخلايا المتمايزة الجسمية, على سبيل المثال لا الحصر, على ء adipose ؛ الشحمية neuronal ؛ العصبية endothelial ؛ البطانية epithelial Adal الخلية immune cells ؛ الخلايا المناعية skeletal muscle عضلات الهيكل العظمي ¢ cardiac القلبية Yo circulating blood ؛ خلايا الدم lung الرئة WA « splenic الطحال « hepatic خلايا الكبد « ؛ خلايا نخاع العظام renal ؛ خلايا الكلى gastrointestinal الجهاز الهضمي LDA ؛ cells في بعض النماذج, قد تكون الخلية الجسمية الخلية pancreatic وخلايا البنكرياس bone marrow , brain الأولية المعزولة من أي نسيج جسمي بما في ذلك, على سبيل المثال وليس الحصر المخ العضلات ¢ fat الدهون » intestine والأمعاء stomach القناة الهضمية, المعدة , liver الكبد Yo endocrine ؛ الغدد الصماء الجهازية spleen الطحال ¢ skin ؛ الجلد uterus الرحم « muscle إلخ. على نحو إضافي, قد تكون الخلية الجسمية من أي أنواع تدبية, مع bone والعظام 7 القرود؛ الخنازير؛ الخيول؛ الأغنام أو الخلية «JEN yall اشتمال الأمثلة غير الحصرية على خلايا البشرية. في بعض النماذج, الخلية الجسمية تكون الخلية الجسمية البشرية. عند استخدام الخلايا المعاد برمجتها المستخدمة لتوليد خلايا أولية لتكوين الدم تستخدم في العلاج YO العلاجي للمرض, يكون من المرغوب فيه, وليس ضروري, استخدام الخلايا الجسمية المعزولة منMetal, internal organs, skin, bones, blood, and connective tissue, all made of somatic cells. differentiated somatic cells Additional somatic cell types for use with the structures and methods described in the present application include muscle cell (primary fibroblast) myocyte (for example, a muscle cell (lo) © and pancreatic islet cell hepatocyte hepatic cell “mammary cell ius cell” s neural cell) in some embodiments, the somatic cell is a progenitor cell or is 4 pancreatic islet cell A precursor of a primary or secondary cell lineage. In some embodiments, the somatic cell is obtained from a sample; blood sample due human hair follicle, for example, hair follicle “(adipose biopsy or skin biopsy le) biopsy ~~ 0 and is Hence the cell (oral swab sample) and a swab sample (eg, human somatic oral swab sample). Some non-exhaustive examples of somatically differentiated cells include, but are not limited to, adipose; neuronal; endothelial nerve; epithelial Adal cell; immune cells; skeletal muscle; skeletal muscle; cardiac; Yo circulating blood; blood cells; lung; lung; WA «splenic spleen hepatic liver cells renal bone marrow cells kidney cells gastrointestinal tract LDA cells in some embodiments the somatic cell may be the pancreatic cell and bone marrow cells of the pancreas , brain, isolated from any bodily tissue including, but not limited to, the brain, the muscle, the fat, the intestine, the stomach, the alimentary canal, the stomach , liver yo endocrine ; systemic endocrine spleen ¢ skin; The skin, the uterus, the uterus, the muscle, etc. In addition, the somatic cell may be of any skeletal species, with bone and bone 7 apes; pigs; horses; The sheep or the cell JEN yall includes non-exhaustive examples of human cells. In some embodiments, the somatic cell is the human somatic cell. When using reprogrammed cells used to generate primary hematopoietic cells for use in the therapeutic YO treatment of disease, it is desirable, but not necessary, to use somatic cells isolated from
—yy— المريض الخاضع للعلاج. على سبيل المثال, يمكن استخدام الخلايا الجسمية المشاركة في الأمراض, والخلايا الجسمية المشاركة في العلاج العلاجي للأمراض وما شابه. في بعض النماذج, يمكن إجراء برمجتها من مجموعة غير متجانسة تشتمل على خلايا تمت إعادة Sale] طريقة لانتقاء خلايا تمت برمجتها وخلايا جسمية مشتقة أو متولدة بواسطة أي الوسائل المعروفة. على سبيل المثال, يمكن تمت إعادة برمجتها LDA استخدام جين مقاوم للعقار أو ما شابه, مثل جين مرقم قابل للانتقاء لعزل © باستخدام المرقم القابل للانتقاء كمؤشر. برمجتها وفقاً لما تم الكشف عنه في الطلب الحالي عن أي sale) يمكن أن تعبر خلايا جسمية تمت alkaline phosphatase عدد من مرقمات الخلية متعددة الإمكانات, بما في ذلك: فوسفاتيز قلوي ٠- stage specific embryonic antigen مولد ضد جنيني محدد المرحلة JABCG2 (AP) ;Tra—2-49/6E ;TRA-1-81 ;1.-TRA-1 ;SSEA-4 ;SSEA-3 ;(SSEA-1) ٠ smooth 2-أكتين العضلة الملساء tubulin 0)-م-تيوبولين ;E—cadherin , ERas/ECATS ,Cripto, (Fof4) ¢ fibroblast growth factor عامل النمو الليفي : (a-SMA) muscle actin ترانسفيراز ليتيسأ-١١ :)210296( 77 206 finger protein بروتين إصبع الزنك ; Dax ;(ECATI) ES 1) منتسخ مرتبط بالخلية j(Natl) ١٠- acetyltransferase ,ECAT10 ام : والم: 4 ;ECATT : امنا 6 ;ECAT3 ;ESG1/DPPAS/ECAT2 ٠ عامل انتساخ الخلية الجنينية غير المتمايزة (ا17لا): ;Sall4 : 1017 ;ECAT15-2 ;ECAT15-1 بما في ذلك 141 : جينات الكرموسوم الصامت telomerase 53م: 53011 : تيلوميراز Rex يحتوي على F-box ;TRIM28 ;Dnmt3b ;Dnmt3a ;silent X chromosome genes ;TDGF1 ;Esrb ;c-Myc ;KIf4 ;Sox2 ;Oct3/4 ;Nanog/ECAT4 ;(FbxI5) ١١ بروتين تعدد الإمكانات المتطروة المرتبط ب ؟ ;CYP25A1 ;GDF3 ;FoxD3 ,Zfp42 ;GABRB3 ٠ 000 8 :) للخلية 11 (ال18 lymphoma نقطة انفصال الورم اللمفي ;(DPPA2) المرقمات العامة الأخرى لتعدد الإمكانات, إلخ. قد تشتمل المرقمات الأخرى على : 0004 المذكورة أيضاً WAY يمكن توصيف .Bmil 5 ,p—catenin ;Grb2 ;Stat3 ;Sox|5 ;Dnmt3L بواسطة التنظيم التنازلي للمرقمات المميزة للخلية الجسمية التي يتم اشتقاق الخلية الجذعية المستحثة—yy— The patient being treated. For example, somatic cells involved in diseases, somatic cells involved in the curative treatment of diseases and the like can be used. In some embodiments, reprogramming can be performed from a heterogeneous population comprising recombinant cells [Sale] method of selecting reprogrammed cells and somatic cells derived or regenerated by any known means. For example, the LDA could be reprogrammed using a drug resistance gene or similar, such as a selectable marker gene to isolate © using the selectable marker as an indicator. Program it as disclosed in the present application for any sale) somatic cells that have alkaline phosphatase can express a number of pluripotent cell markers, including: alkaline phosphatase 0-stage specific embryonic antigen JABCG2 (AP) ;Tra—2-49 /6E ;TRA-1-81 ;1.-TRA-1 ;SSEA-4 ;SSEA-3 ;(SSEA-1) 0 smooth 2-smooth muscle actin tubulin 0)-m-tubulin ;E— cadherin , Eras/ECATS ,Cripto, (Fof4) ¢ fibroblast growth factor (a-SMA) muscle actin transferase Letesa-11:210296( 77 206 finger protein ; Dax (ECATI) ES 1) cell-associated transcriptase j(Natl) 10- acetyltransferase ECAT10, M: M: 4; ECATT: Mn: 6; ECAT3; ESG1/DPPAS/ECAT2 0 Non-fetal cell transcription factor differentiated (A17 no): All4: 1017; ECAT15-2; ECAT15-1 including 141: silent chromosome telomera genes se 53m: 53011: Rex telomerase containing F-box; TRIM28; Dnmt3b; Dnmt3a; silent X chromosome genes; TDGF1; Esrb; c-Myc; KIf4; Sox2; Oct3/4; Nanog/ECAT4; (FbxI5) 11) pluripotency protein associated with ?CYP25A1;GDF3;FoxD3;Zfp42;GABRB3 0 000 8:) of cell 11 (18th) lymphoma cleavage point lymphoma (DPPA2) Other general markers of pluripotency potential, etc. Other markers may include : 0004 also mentioned WAY. Bmil 5 ,p—catenin ;Grb2 ;Stat3 ;Sox|5 ;Dnmt3L can be characterized by the down-regulation of markers characteristic of the somatic cell from which the iPS cell is derived
Jee متعددة القدرات YOJee is versatile YO
DNAS mes التعديل الجينومي واندونيوكلياز يستهدفDNAS mes genomic modification and indonuclease targets
VAVA
وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, يشير المصطلح "التعديل الجينومي" إلى طريقة علم الوراثة العكسي المستخدمة لنيوكلياز المهندس وراثياً صناعياً لقطع وتكوين انفصالات مزدوجة الجديلة محددة في الموقع (المواقع) المطلوبة في الجينوم, والتي يتم إصلاحها بعد ذلك بواسطة عمليات خلوية ذاتية الإصلاح الموجه بالتتاظر homologous recombination (FR) المتجانس seal), Jie المنشاً non-homologous والتوصيل الطرفي غير المتجانس homology directed repair )104( 2 في فصل مزدوج الجديلة, في حين DNA مباشرةً أطراف NHEJ يوصل .end—joining (NFfEJ) المفقودة عند نقطة الانفصال. DNA توليد متوالية soley المتوالية المتجانسة كقالب HDR يستخدم يتعذر إجراء التعديل الجينومي باستخدام إندونيوكلياز التقييد التقليدي نظراً لتعرف معظم إنزيمات التقييد كهدف لها وترتفع الاحتمالية للغاية بحيث يتم العثور على توليفة DNA على أزواج قاعدية قليلة في زوج القاعدة التي تم التعرف عليها في الكثير من المواقع عبر الجينوم مما ينتج عنه قطعات عديدة Vo (أي, لا تقتصر على الموقع المطلوب). للتغلب على هذا التحدي وتكوين انفصالات مزدوجة الجديلة محددة الموقع, تم اكتشاف العديد من الفئات المميزة من نيوكلياز والمهندسة حيوياً ووراثياً حتى اليوم. ola, Zinc finger nucleases (ZFNs) هذه هي ميجا نيوكلياز, نيوكلياز إصبع الزنك شبيه بمنشط الانتساخ effector nucleases ومستجيب نيوكلياز , 0859/0415 .(TALENSs)transcription-activator yo على نحو شائع في أربع مجموعات: مجموعة Meganucleases يتم تصنيف ميجا نيوكلياز تمتاز هذه .18[١[ ومجموعة His—Cys box مجموعة ,GIY-YIG مجموعة ,LAGLIDADG المجموعات بعناصر بنيوية, تؤثر على النشاط الحفزي ومتوالية الإدراك. على سبيل المثال, يمتاز بالاشضتمال على إما نسخة أو نسختين من عنصر LAGLIDADG أعضاء المجموعةAs used in the present application, the term "genomic modification" refers to a reverse genetics method that uses synthetically engineered nucleases to cut and form specific double-strand breaks at the desired site(s) in the genome, which are then repaired by cellular processes homologous recombination (FR) seal), non-homologous Jie and homology directed repair (104) 2 in a double-stranded separation, whereas DNA Directly NHEJ ends join the missing .end—joining (NFfEJ) at the point of separation. DNA Generate a soley sequence Homologous sequence as template HDR Uses Genomic modification cannot be performed using conventional restriction endonucleases because most restriction enzymes are not known As its target and the probability is very high that the DNA combination is found on a few base pairs in a base pair that has been identified in many locations throughout the genome resulting in many Vo segments (ie, not limited to the desired location To overcome this challenge, the composition of the double breakaways Due to the site-specific strand, many distinct classes of bioengineered and bioengineered nucleases have been discovered to date. First, Zinc finger nucleases (ZFNs) These are meganucleases, zinc finger nucleases, effector nucleases and effector nucleases. , 0859/0415. (TALENSs) transcription-activator yo are commonly grouped into four groups: the group of meganucleases. GIY-YIG group, LAGLIDADG groups with structural elements, affect catalytic activity and cognitive continuum. For example, it is characterized by having either one or two copies of the LAGLIDADG element Members of the collection
Chevalier et al. (2001), Nucleic Acids Res. 29( 18): المحافظ (انظر LAGLIDADG ٠ مع نسخة واحدة من صورة عنصر LAGLIDADG تم العثور على ميجانيوكلياز .)3757-4 كدايمرات متجانسة, بينما تم العثور على أعضاء من مع نسختين من LAGLIDADG في صورة مونمرات. على نحو مماثل, يشتمل أعضاء مجموعة 617-716 على LAGLIDADG وحدة بنائية في الطول وتشتمل على أربع أو خمس ٠٠١-7١ والتي نتراوح من GIY-YIG وحدة Van Roey عناصر متواليات محافظة مع أربع وحدات بنائية ثابتة, اثنين منها مطلوبة للنشاط (انظر YO يتميز ميجانيوكلياز .)©] al. (2002), Nature Struct. Biol. 9: 806-811 oY AYChevalier et al. (2001), Nucleic Acids Res. 29 (18): conserved (see LAGLIDADG 0 with one copy of the LAGLIDADG element form). Meganuclease 3757-4 was found as homodimers, while members of with two copies of the LAGLIDADG element were found as Monomers. Similarly, members of the 617-716 group have LAGLIDADG residues in length and comprise four or five 001-71 which range from GIY-YIG Van Roey units of conserved sequence elements with four invariant residues. , two of which are required for activity (see YO characterizing meganucleases.)©] al. (2002), Nature Structure. Biol. 9: 806-811 oY AY
١4 histidines بتسلسلات محافظة للغاية من مركبات هيستيدين His—Cys box Meganucleases فوق منطقة تضم عدة مئات من الوحدات البنائية للحمض الأميني (انظر CYStEINeS وسيستين في حالة (Chevalier et al. (2001), Nucleic Acids Res. 29(18): 3757-4 يتم تعريف الأعضاء بواسطة عناصر تحتوي على زوجين من مركبات هيستيدين NHN مجموعة Chevalier et al. (2001), (انظر asparagine المحافظة المحاطة بالوحدات البنائية أسبراجين © المجموعات الأربع من ميجانيوكلياز تكون (Nucleic Acids Res. 29(18): 3757-3774 مستقلة على نطاق واسع عن بعضها البعض فيما يتعلق بالعخاصر البنيوة المحافظة و, بالتالي, . catalytic activity gall والتشاط DNA خصوصية متوالية إدراك يتم العثور على ميجانيوكلياز على نحو شائع في الأنواع الميكروبية ويشتمل على الخاصية الفريدة مم يجعلها بالتالي شديدة الخصوصية (bp VE<) الاشتماله على متواليات الإدراك الطويلة للغاية ٠ طبيعياً للقطع عند الموقع المطلوب. يمكن استغلالها هذا لصنع انفصالات مزدوجة الجديلة محددة الموقع في التعديل الجينومي. يمكن لذا المهارة في المجال استخدام ميجانيوكلياز هذا الذي يحدث طبيعياً, ومع ذلك يكون عدد من ميجانيوكلياز يحدث طبيعياً المذكور محدود. للتغلب على هذا التحدي, تم استخدام طرق التطفير وفحص الإنتاجية العالية لتكوين صور مغايرة من ميجانيوكلياز تتعرف على المتواليات الفريدة. على سبيل المثال, تم دمج العديد من ميجانيوكلياز لتكوين إنزيمات ٠ هجينة تتعرف على متوالية جديدة. على نحو بديل, يمكن تبديل الأحماض الأمينية المتفاعلة14 histidines contain highly conserved histidine sequences His—Cys box meganucleases over a region of several hundred amino acid residues (see CYStEINeS and cysteine in the case of Chevalier et al. (2001), Nucleic Acids Res. 29(18): 3757-4 Members are defined by elements containing two histidine pairs NHN Chevalier et al. (2001) group (see asparagine © The four groups of meganucleases (Nucleic Acids Res. 29(18): 3757-3774) are largely independent of each other in terms of conservative structural properties and, thus, catalytic activity gall and DNA activity. Sequence specificity is recognized. Meganucleases are commonly found in microbial species and have the unique property which makes them therefore highly specific (bp VE<) of having extremely long 0 grasping sequences naturally cut at the desired location.This can be exploited to make specific double-stranded dissociations Location in genomic modification So skilled in the field can use this MN It occurs naturally, however the number of naturally occurring meganucleases mentioned is limited. To overcome this challenge, high-throughput mutagenesis and screening methods were used to generate variants of meganucleases that recognize unique sequences. For example, several meganucleases combine to form hybrid 0 enzymes that recognize a new sequence. Alternatively, the RAAs can be swapped
A لميجانيوكلياز لتصميم ميجانيوكلياز خاص بالمتوالية (انظر على سبيل المثال, البراءة الأمريكية رقمA for a meganuclease to design a sequence-specific meganuclease (see, for example, US Patent No.
Certo, يمكن تصميم ميجانيوكلياز باستخدام الطرق الموصوفة في على سبيل المثال, (ATY ,07١ :777 ,70 4 A البراءات الأمريكية أرقام MT et al. Nature Method (2012) 9: 073-975Certo, meganucleases can be engineered using the methods described in, for example, (ATY 071:707,777 4 A US Patent Nos. MT et al. Nature Method (2012) 9:073-975
VEY OA كر ITY كد ع IY AYIA NYE JA GYAY NYA LA GATY زلف JAY والتي تم إدراج محتوياتها كمرجع في , 24,117 A تا زه 18 ار 8 »: أو VEY A Ye الطلب الحالي في مجملها. على نحو بديل, يمكن الحصول على ميجانيوكلياز بخصائص القطع محددVEY OA Cr ITY KD A IY AYIA NYE JA GYAY NYA LA GATY Zulf JAY whose contents are listed for reference in , 24,117 A TAZH 18 R8 »: or VEY A Ye the current order in its entirety. Alternatively, meganucleases with specific cutting properties can be obtained
Precision Biosciences’ Directed الموقع باستخدام التقنيات المتوفرة تجارياً على سبيل المتثال, .Neoclease Editor™ Gemnomeic Editing technology يكون مرتبط DNA من إنزيم قطع غير محدد TALENS 5 2215 تستفيد تقنية تقييد إندونيوكلياز YO zinc fingerselsyll أصابع Jie peptide محددة تتعرف على الببتيدات DNA بمتواليةPrecision Biosciences' Directed Site Using Commercially Available Technologies For compliance, Neoclease Editor™ Gemnomeic Editing technology is bound to DNA from an unspecified cutting enzyme TALENS 5 2215 endonuclease restriction technology utilizes YO zinc fingerselsyll fingers Jie A specific peptide that recognizes DNA peptides by sequence
“Aa . transcription activator-like effectors (TALEs) ومستجيبات شبيهة منشط الانتساخ وموقع الانشطار له منفصلين DNA نمطياً يتم اختيار الإندونيوكلياز الذي يكون موقع التعرف على عن بعضهم البعض ويتم فصل جزء الانشطار له وبعد ذلك ربطه بببتيد يتعرف على المتوالية, وبناءً عليه نحصل على إندونيوكلياز بخصوصية مرتفعة للغاية للمتوالية المطلوبة. إنزيم التقييد التمثيلي على نحو إضافي بمزية الحاجة إلى الدايمرة ليكون له Fokl بالخواص المذكورة يكون 4ا0. يتمتع © نشاط نيوكلياز وهذا يعني زيادة الخصوصية بدرجة كبيرة مع تعرف كل شريك نيوكلياز على متوالية وراثياً والذي يمكن أن يقوم فقط بوظيفة Fokl فريدة. لتعزيز هذا التأثير, تمت هندسة نيوكلياز DNA وله نشاط حفزي متزايد. يتجنب نيوكلياز يقوم بوظيفة homodimer الدايرمات غير المتجانسة الدايمر غير المتجانس إمكانية نشاط الدايمر المتجانس غير المطلوب وبالتالي زيادة خصوصية فصل مزدوج الجديلة. ٠ تتمتع بخواص متشابهة إلا أن الفرق TALENS و ZFNs على الرغم من أن أجزاء نيوكلياز لكل من على أصابع الزنك ZFNs يعتمد DNA يكمن في ببتيد التعرف على Lys بين نيوكلياز هذا المهندس هذه بأنه DNA في 18155 . تمتاز كل من مجالات ببتيد يتعرف على TALENSs ; Cys2-His2“Aa. transcription activator-like effectors (TALEs) and transcription activator-like effectors (TALEs) and its cleavage site are separated Typically, the endonuclease that is the recognition site is selected from each other, its cleavage part is separated, and then linked to a peptide that recognizes the sequence. Therefore, we get an endononuclease with very high specificity for the desired sequence. A representative restriction enzyme additionally with the advantage of needing a dimer to have Fokl with the said properties is 0,4. © has nuclease activity, which means significantly increased privacy with each nuclease partner identifying a genetic sequence that can only perform a unique Fokl function. To enhance this effect, DNA nucleases have been engineered and have increased catalytic activity. A nuclease that performs the homodimer function avoids the possibility of unwanted homodimer activity and thus increases the specificity of double-stranded separation. 0 has similar properties, but the difference is TALENS and ZFNs, although Nuclease parts for each of the ZFNs on zinc fingers depend on DNA lies in the Lys recognition peptide between these engineered nucleases as DNA in 18155. Both domains of a peptide that recognizes TALENSs are characterized; Cys2-His2
Cys2-His2 يتم العثور عليها على نحو طبيعي في توليفات في بروتيناتها. تحدث أصابع الزنك في توليفات متتوعة في Lede نمطياً في التكرارات التي تكون متباعدة على مسافة 3 50 ويتم العثور ١ على stall مجموعة منتوعة من البروتينات المتفاعلة مع حمض نووي مثل عوامل الانتساخ. يتم من جهة أخرى في التكرارات مع نسبة تعرف واحد إلى واحد بين الأحماض الأمينية وأزواج TALES في أنماط متكررة, TALES 5 النيوكليوتيد التي تم التعرف عليها. نظراً لحدوث كل من أصابع الزنك يمكن تجربة التوليفات المختلفة لتكوين مجموعة واسعة النطاق من خصوصيات المتوالية. تشتمل طرق تصنيع إصبع زنك إندونيوكلياز المحدد بالموقع, على سبيل المثال, على تجميعة نموذجية (حيث ترتبط ٠ منخفض lial) OPEN أصابع الزنك بمتوالية ثلاثية متصلة في صف لتغطية المتوالية المطلوبة), الصرامة لمجالات الببتيد مقابل النيوكليوتيدات الثلاثية يليها الاختيارات مرتفعة الصرامة لتوليفة الببتيد مقابل الهدف النهائي في النظم البكتيرية), والمسح الهجين الواحد البكتيري لمجموعات إصبع الزنك, للاستخدام مع الطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب ZFNs من بين أخرى. يمكن الحصول على .(Richmond, CA)Sangamo Biosciences™ الحالي تجارياً من على سبيل المثال, YoCys2-His2 is found naturally in combinations in its proteins. Zinc fingers occur in various combinations in Lede typically in repeats that are spaced 3 50 ft apart, and 1 stall is found in a variety of nucleic acid-interacting proteins such as transcription factors. Repeats, on the other hand, with a one-to-one recognition ratio between amino acid and TALES pairs in repeat patterns, TALES 5 nucleotides are identified. Due to the occurrence of both zinc fingers, various combinations can be experimented with to create a wide range of sequence specificities. Methods for manufacturing site-specific zinc finger endonucleases include, for example, a modular assembly (where 0 low lial OPEN zinc fingers bind to a triplet sequence connected in a row to cover the desired sequence), stringency of peptide domains against triple nucleotides followed by highly stringent selections of peptide combinations against the final target in bacterial systems), and single-bacterial hybrid screening of zinc finger populations, for use with the methods and formulations described in the application (ZFNs, among others). The current Sangamo Biosciences™ (Richmond, CA) can be obtained commercially. For example, Yo
CANCAN
للتعديل الجينومي مع الطرق Cas9/CRISPR من المتوقع في الطلب الحالي استخدام نظام والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي. نظم التكرارات التي تتجمع بشكل منتظم والمتباعدة بينياً تكون مفيدة في التعديل (Cas) ddaiyal-CRISPR)/CRISPR) المتتاوبة القصيرة التكراراتFor genome editing with the Cas9/CRISPR methods it is expected in the present submission to use the system and constructs described in the present submission. Systems of repeats that aggregate regularly and are spaced between are useful in modifying (Cas ddaiyal-CRISPR)/CRISPR) short palindromic repeats.
Jinek, M. et al. Science على سبيل المثال, hil) RNA الجينومي القابل للبرمجة لجمض .)2012( 337 (6096): 816-821 © على نحو بديل, يمكن إجراء التعديل الجينومي باستخدام الهندسة الوراثية لجينوم بناءًٌ على فيروس والذي يكون منصة التعديل الجينومي حول نواقل ,(FAAV) غدي لناتج معاودة الارتباط الجيني في DNA المستخدمة والتي تساعد على إدراج, حذف أو استبدال متواليات حمض AAV تعبير جينومات الخلايا الثديية الحية. يكون جزيء جينوم حمض نووي ديوكسي ريبو أحادي الجديلة موجب الشعور أو سالب الشعور, We, single-stranded deoxyribonucleic acid (ssDNA) ٠ مفردة الجديلة DNA طوله حوالي 4,7 كيلو قاعدة. تشتمل نواقل التعبير الفيروسية لحمض aly والذي الاندماج ذاتي المنشأً sole) هذه على معدلات تحويل مرتفعة وتتمتع بخاصية فريدة تتمثل في تحفيز مزدوج الجديلة في الجينوم. يمكن لذي المهارة في المجال DNA المتجانس في عدم وجود انفصالاتJinek, M. et al. Science (eg, hil) (2012) 337 (6096): 816-821. Alternatively, genome editing can be done by genetically engineering a genome based on a virus that serves as a platform. Genomic modification around adenoviral vectors (FAAV) of DNA recombinant product used that help insert, delete or replace AAV expressing acid sequences into the genomes of living mammalian cells. Single-stranded Sense or Sense, We, single-stranded deoxyribonucleic acid (ssDNA) 0 Single-stranded DNA of about 4.7 kb long. sole) have high conversion rates and have the unique property of double-stranded induction in the genome. Those who are skilled in the field can homogeneous DNA in the absence of separations
Lindl لاستهداف الموقع الجينومي وإجراء كل من تبديلات الجين ذاتي TAAV تصميم ناقل تعبير بميزة استهداف أليل FAAV حذف. يتمتع التعديل الجينومي ل Jie, dda الكلية و / أو المطلقة في Vo تكون TAA فردي ولا ينتج عنه أي تبديلات جينومية بعيدة عن الهدف. تقنية التعديل الجينوميLindl to target the genomic location and make each of the autologous TAAV gene alterations design an expression vector with a feature targeting the FAAV deletion allele. The total and/or absolute genomic modification of Jie, dda in Vo is a single TAA and does not result in any off-target genomic alterations. Genome editing technology
Cambridge, ) Horizon™ rAAV Genes IS™ system متوفرة تجارياً, على سبيل المثال, (UK مواد حاملة مقبولة صيدلانياً تشتمل طرق إعطاء الخلايا السليفة المكونة للدم البشرية إلى خاضع وفقاً للموصوف في الطلب الحالي ٠ على استخدام تركيبات علاجية تشتمل على خلايا أولية لتكوين الدم. تحتوي التركيبات العلاجية على مادة حاملة يمكن تحملها فسيولوجياً إضافة إلى تركيبة الخلية واختيارياً عامل فعال حيوياً إضافي واحد على الأقل وفقاً للموصوف في الطلب الحالي, مذاب أو مشنتت فيه كمكون فعال. في نموذج مفضل, لا تكون التركيبة العلاجية مولدة للمناعة بدرجة كبيرة عند الإعطاء إلى ثديي أو مريض إنسان لأغراض علاجية, ما لم يكن ذلك مطلوباً. YoCambridge, ) Horizon™ rAAV Genes IS™ system Commercially available, e.g., UK Pharmaceutical acceptable carriers Methods for administering human hematopoietic progenitor cells to a subject as described in this Order 0 include the use of therapeutic combinations Include hematopoietic progenitor cells Therapeutic formulations contain a physiologically tolerable carrier in addition to the cell composition and optionally at least one additional bioactive agent as described in the present order, dissolved or dispersed therein as an active ingredient.In a preferred embodiment, The therapeutic composition is not highly immunogenic when administered to a breast or human patient for therapeutic purposes, unless indicated. Yo
CARCAR
-7م- عموماً, يتم إعطاء الخلايا الأصلية لتكون الدم الموصوفة في الطلب الحالي كمعلق مع مادة حاملة مقبولة صيدلانياً. سيدرك ذا المهارة في المجال أن المادة الحاملة المقبولة صيدلانياً التي سيتم استخدمها في تركيية خلية لن تشتمل على محاليل منظم, مركبات, عوامل الحفظ بالتبريد, مواد حافظة, أو عوامل أخرى بكميات تتداخل على نحو أساسي مع حيوية الخلايا المطلوب توصيلها إلى الخاضع. © قد تشتمل صيغة تشتمل على الخلايا على سبيل المثال, على محاليل منظمة أوزموسية تسمح بالحفاظ على تكامل غشاء الخلية, واختيارياً, للمغذيات بالحفاظ على حيوية الخلية أو تعزيز الطعم عند الإعطاء. الصيغ المذكورة والمعلقات تكون معروفة لأولئك المهرة في المجال و / أو يمكن تهيأتها للاستخدام مع الخلايا الأصلية لتكون الدم وفقاً للموصوف في الطلب الحالي باستخدام التجارب الروتينية. Vs يمكن أن تكون تركيبة خلية أيضاً مستحلب أو يتم تقديمها كتركيبة دهنية ما, بشرط ألا يؤثر إجراء الاستحلاب عكسياً على حيوية الخلية. الخلايا ويمكن خلط أي مكون فعال آخر مع السواغات التي تكون مقبولة صيدلانياً وتتوافق مع المكون الفعال وبكميات مناسبة للاستخدام في الطرق العلاجية الموصوفة في الطلب الحالي. قد تشتمل العوامل الإضافية المتضمنة في تركيبة خلية وفقاً للموصوف في الطلب الحالي على أملاح VO مقبولة صيدلانياً من مكونات فيها. تشتمل أملاح مقبولة صيدلانياً على أملاح إضافة الحمض (المتكونة باستخدام مجموعات الأمينو الحرة free amino للبولي ببتيد 0017060106 ) والتي تتكون باستخدام الأحماض غير العضوية مثل, على سبيل (mea, JU الهيدروكلوريك hydrochloric أو الفوسفوريك | «phosphoric أو تلك الأحماض العضوية متل حمض aceticeldall « الطرطريك tartaric « المندليك mandelic وما Yo شابه. يمكن أن تكون الأملاح التي تتكون مع مجموعات الكربوكسيلي الحرة free carboxyl أيضاً مشتقة من قواعد غير عضوية مثل, على سبيل المتال, الصوديوم sodium البوتاسيوم potassium ؛ الأمونيوم ammonium ء الكالسيوم calcium أو هيدروكسيدات الحديد ferric hydroxides « والقواعد العضوية هذه مثل أيزوبروبيل أمين isOpropylamine » ثلاشي Siva أمين trimethylamine » “-إيقيل أمينو ايشانول ethylamino ethanol « هيستيدين histidine , YO بروكايين procaine وما شابه. تكون مواد حاملة يمكن تحملها فسيولوجياً معروفة جيداً في المجال. تكون المواد الحاملة السائلة النموذجية محاليل مائية معقمة لا تحتوي على مواد إضافة إلى مكونات OY AY-7m- Generally, the blood-forming progenitor cells described in the present application are administered as a suspension with a pharmaceutically acceptable carrier. Those skilled in the art will understand that a pharmaceutically acceptable carrier to be used in a cell preparation will not include buffer solutions, compounds, cryopreserving agents, preservatives, or other agents in amounts that materially interfere with the viability of cells to be delivered to the subject. © A cell-based formulation may include, for example, osmotic buffer solutions that allow maintenance of cell membrane integrity and, optionally, nutrients to maintain cell viability or enhance taste upon administration. Said formulas and suspensions shall be known to those skilled in the art and/or may be adapted for use with original hematopoietic cells as described in the present order using routine experiments. Vs A cell formulation may also be emulsified or presented as a lipid formulation, provided that the emulsification procedure does not adversely affect cell viability. Cells and any other active ingredient may be mixed with excipients that are pharmaceutically acceptable and compatible with the active ingredient and in quantities suitable for use in the therapeutic methods described in the present application. Additional agents included in a cell formulation as described herein may include pharmaceutically acceptable VO salts from constituents therein. Pharmaceutically acceptable salts include acid addition salts (formed using free amino groups of polypeptide 0017060106 ) formed using inorganic acids such as, for example (mea, JU hydrochloric or phosphoric or Those organic acids such as acetic acid, tartaric, mandelic, Yo, etc. The salts formed with free carboxyl groups can also be derived from inorganic bases such as, for example, sodium, potassium, potassium; ammonium, ammonium, calcium, or iron hydroxides, ferric hydroxides, and these organic bases such as isopropylamine, siva amine, trimethylamine. ethylamino ethanol « histidine , YO , procaine , etc. Physiologically tolerable carriers are well known in the art. Typical liquid carriers are sterile aqueous solutions that do not contain substances in addition to the OY AY components
ام فعالة وماء, أو تحتوي على محلول منظم مثل فوسفات الصوديوم sodium phosphate عند قيم رقم هيدروجيني فسيولوجي, محلول ملحي فسيولوجي أو كلاهما, مثتل محلول ملحي منظم بالفوسفات 00016 . لا يزال على نحو إضافي, يمكن أن تشتمل المواد الحاملة المائية على أكثر من محلول منظم ملحي واحد, وكذلك أملاح مثل الصوديوم وكلوريدات البوتاسيوم potassium chlorides « © وسكر العنب» بولي إيثيلين جليكول polyethylene glycol والذوابات الأخرى. يمكن أن تحتوي التركيبات السائلة أيضاً على أطوار سائلة إضافة إلى وباستثناء الماء. أمثلة الأطوار السائلة الإضافية المذكورة الجلسرين والزيوت النباتية Jie زيت بذرة القطن, ومستحلبات تحتوي على الماء. ستعتمد كمية المركب الفعال المستخدم في تركيبات الخلية وفقاً للموصوف في الطلب الحالي والفعالة في علاج اضطراب أو حالة محددة على طبيعة الاضطراب أو الحالة, ويمكن تحديدها بواسطة ٠ التقنيات الإكلينيكية القياسية. الإعطاء والفعالية وفقاً لاستخدامها في الطلب الحالي, يتم استخدام المصطلحات "إعطاء, " "إدخال" و"غرس" بالتبادل في سياق وضع الخلايا, على سبيل JE) خلايا أولية لتكوين الدم, وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في خاضع, بواسطة طريقة أو مسار ينتج عنه تحديد موضع Sia على الأقل للخلايا المقدمة في الموقع ١ المطلوب, مثل موضع الإصابة أو الإصلاح, بحيث ينتج التأثيرات المطلوب. يمكن إعطاء الخلايا على سبيل المثال خلايا أولية لتكوين الدم, أو الخلايا السليفة المتمايزة منها بواسطة أي مسار مناسب ينتج عنه التوصيل إلى الموقع المطلوب في خاضع حيث يظل جزء على الأقل من الخلايا المنغرسة أو مكونات الخلايا حياً. مدة حيوية الخلايا بعد الإعطاء إلى خاضع يمكن أن تكون قصيرة قدر بضع ساعات, على سبيل المثال, أربع وعشرين ساعة؛ بضعة (ald أو تدوم لعدة سنوات, أي, طعم طويل ٠ الأمد. على سبيل المثال, في بعض نماذج الجوانب الموصوفة في الطلب الحالي, يتم إعطاء كمية فعالة من خلايا أولية لتكوين الدم عن طريق المسار الجهازي للإعطاء, مثل في الغشاء البريتوني أو في الوريد . عند التقديم وقائياً, يمكن إعطاء خلايا أولية لتكوين الدم الموصوفة في الطلب الحالي إلى خاضع قبل أي عرض لاعتلال usta sal) على سبيل المثال, قبل التحول من 7 -جلوبين جنيني إلى على CARor containing a buffer such as sodium phosphate at physiological pH values, physiological saline, or both, as phosphate buffered saline 00016. Still additionally, the aqueous carriers may include more than one brine buffer, as well as salts such as sodium, potassium chlorides, dextrose, polyethylene glycol, and other solutes. Liquid formulations may also contain liquid phases in addition to and with the exception of water. Examples of the additional liquid phases mentioned are glycerin, vegetable oils, jie, cottonseed oil, and water-containing emulsifiers. The amount of active compound used in cell formulations as described in the present order that is effective in treating a specific disorder or condition will depend on the nature of the disorder or condition, and may be determined by standard clinical techniques. Administration and efficacy According to their use in the present application, the terms “give,” “introduce” and “inculcate” are used interchangeably in the context of placing cells, eg JE) hematopoietic progenitor cells, as described in the present application in Submitted, by method or A pathway that results in at least Sia positioning of cells presented at the desired location 1, such as a locus of injury or repair, so as to produce the desired effects. Cells may be administered for example as hematopoietic progenitor cells, or progenitor cells differentiated from them by any suitable pathway resulting in delivery to the desired site in a subject where at least a portion of the implanted cells or components of the cells remain alive. The duration of cell viability after administration to a subject can be as short as a few hours, eg, twenty-four hours; A few (ald) or lasting for several years, ie, a long-lasting 0 graft. For example, in some embodiments of aspects described in the present application, an effective amount of hematopoietic progenitor cells is administered via the systemic route of administration, such as in the membrane Peritoneal or intravenous When presented prophylactically, hematopoietic progenitor cells described in the present application may be administered to a subject prior to any presentation of usta salopathy (eg, prior to switching from 7-fetal globin to a CAR
CAECAE
نحو سائد 8 -جلوبين. وعلى هذا النحو, يعمل الإعطاء الوقائي لمجموعة خلية أولية لتكوين الدم على منع اعتلال الهيموجلوبين, وفقاً لما تم الكشف عنه في الطلب الحالي. عند التقديم علاجياً, يتم توفير خلايا أولية لتكوين الدم عند (أو بعد) بداية العرض أو مؤشر اعتلال الهيموجلوبين, على سبيل المتال, عند بداية مرض الخلية المنجلية. في بعض النماذج للجوانب الموصوفة في الطلب الحالي, يتم إعطاء مجموعة الخلية الأصلية لتكون © الدم طبقاً للطرق الموصوفة في الطلب الحالي وتشتمل على خلايا أولية لتكوين الدم خيقية تم الحصول عليها من واحد أو أكثر من المتبرعين. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, "خيفي" يشير إلى خلية أولية لتكوين الدم أو عينات حيوية تشتمل على خلايا أولية لتكوين الدم تم الحصول عليها من واحد أو أكثر من المتبرعين المختلفين من نفس الأنواع, حيث لا تتطابق الجينات في واحد أو أكثر من المواضع. على سبيل المثال, يمكن إعطاء مجموعة خلية أولية لتكوين الدم إلى الخاضع وتكون مشتقة ٠ من دم الحبل السري الذي تم الحصول عليه من واحد أو أكثر من المتبرعين الخاضعين غير ذي الصلة, أو من واحد أو أكثر من الأخوة والأخوات غير المتماثلين. في بعض النماذج, يمكن استخدام مجموعات خلية أولية لتكوين الدم تآزرية, مثل تلك التي تم الحصول عليها من الحيوانات المتماثلة وراثياً, أو من توائم متماتلة. في نماذج أخرى من هذا الجانب, تكون الخلايا الأصلية لتكون الدم خلايا يتم الحصول عليها أو عزلها من خاضع وإعطائها pall ذاتية المنشاً: بمعنى أن, الخلايا الأصلية لتكون Vo إلى نفس الخاضع, أي, المتبرع والمتلقي متشابهين. , للاستخدام في الجوانب المتتوعة الموصوفة في الطلب الحالي, كمية فعالة من خلايا أولية لتكوين الدم خلايا أولية لتكوين الدم, ٠١١ x 5 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١١ على الأقل على Jas خلايا أولية مكونة للدم, على الأقل ٠١ x 0 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١7 على الأقل خلايا Veo خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل Veg xo خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١4 ٠Mostly 8-globin. As such, prophylactic administration of a hematopoietic progenitor cell kit prevents hemoglobinopathies, as disclosed in the present order. When administered therapeutically, provide hematopoietic progenitor cells at (or after) onset of symptom or indication of impairment Hemoglobin, for example, at the onset of sickle cell disease. In some embodiments of the aspects described in the present application, the original cell population is given to form the blood according to the methods described in the present application and includes allogeneic hematopoietic progenitor cells obtained from one or more donors. As used in the present application, “allogeneic” refers to a hematopoietic progenitor cell or biological samples comprising hematopoietic progenitor cells obtained from one or more different donors of the same species, where the genes in one or more do not match from the positions. For example, a hematopoietic progenitor cell line may be given to a subject and be derived 0 from umbilical cord blood obtained from one or more unrelated subject donors, or from one or more non-identical brothers and sisters. In some embodiments, synergistic hematopoietic progenitor cell populations can be used, such as those obtained from genetically identical animals, or from identical twins. In other embodiments of this aspect, the progenitor cells of hematopoiesis are cells obtained or isolated from a subject and given an autologous pall: that is, the progenitor cells to be Vo to the same subject, that is, the donor and the recipient are similar., , For use in the various aspects described in the present order, an effective quantity of hematopoietic progenitor cells Hematopoietic precursor cells, 011 x 5 hematopoietic progenitor cells, at least 011 on Jas hematopoietic primary cells, At least 0 x 01 hematopoietic precursor cells, at least at least 017 Veo hematopoietic precursor cells, at least Veg xo hematopoietic precursor cells, at least 014 014 hematopoietic precursor cells
Adsl خلايا ٠١5 x خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ؟ Yeo x Y أولية لتكوين الدم, على الأقل خلايا أولية لتكوين ٠١5 xo خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١5 x لتكوين الدم, على الأقل ؛ خلايا أولية لتكوين الدم, Yeo xv خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١5 xT الدم, على الأقل خلايا أولية لتكوين الدم, على Yeo x 9 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل Yeo x A على الأقل خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١6 * Y خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١١ xy الأقل Ye x 5 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١6 x خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ؛ ٠١ 7 ؟ CARAdsl 015 x Hematopoietic Precursor Cells, at least ? Yeo x Y Hematopoietic Precursor, at least xo 015 Hematopoietic Precursor Cells, at least 015 x Hematopoietic Precursor Cells, on Hematopoietic precursor cells, Yeo xv Hematopoietic precursor cells, at least 015 xT Blood, at least Hematopoietic precursor cells, on Yeo x 9 Hematopoietic precursor cells, at least Yeo x A at least hematopoietic progenitor cells, at least 016 * Y hematopoietic precursor cells, at least xy 1011 at least Ye x 5 hematopoietic progenitor cells, at least x 016 hematopoietic precursor cells blood, at least; 7 01 ? CAR
—Ao——Ao—
Vel x 7 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١6 xT خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠ خلايا Tx 9 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١١ x A خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل أولية لتكوين الدم, أو مضاعفاتها. قد تكون الخلايا الأصلية لتكون الدم مشتقة من واحد أو أكثر من المانحين, أو يمكن الحصول عليها من مصدر ذاتي المنشاً. في بعض النماذج للجوانب الموصوفة في الطلب الحالي, يتم توسيع نطاق الخلايا الأصلية لتكون الدم في مستتبت قبل الإعطاء إلى خاضع في 5 حاجة إليها. في أحد النماذج, المصطلح 'كمية فعالة' وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يشير إلى كمية مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم بشرية أو الخلايا السليفة لها المطلوبة للتخلص من عرض واحد على الأقل أو أكثر من أعراض اعتلال الهيموجلوبين, وتتعلق بكمية كافية من تركيبة لتوفير التأثير المطلوب, فعالة علاجياً” Le على سبيل المثال, علاج خاضع مصاب باعتلال الهيموجلوبين. يشير المصطلح ٠ تكون كافية pall عليه إلى كمية خلايا أولية لتكوين الدم أو تركيبة تشتمل على خلايا أولية لتكوين SL لتعزيز تأثير محدد عند الإعطاء إلى خاضع نمطي, مثل ذلك المصاب ب أو المعرض لخطر اعتلال الهيموجلوبين. يضم المصطلح كمية فعالة وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي أيضاً كمية كافية لمنع أو تأخير تطور عرض المرض, تبديل مسار عرض المرض (على سبيل المثال وليس الحصر, إبطاء تطور عرض المرض), أو قلب عرض المرض. ينبغي إدراك أنه في أية حالة محدد, يمكن تحديد Ve صحيحة بواسطة ذا المهارة العادية في المجال باستخدام التجارب الروتينية. "dled "كمية كما هو مستخدم هناء يشير المصطلح "إعطاء” إلى وضع تركيبة خلية جذعية لتكوين الدم وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في خاضع بواسطة طريقة أو مسلك يترتب عليه تحديد موضع تركيبة على الأقل في الموقع المطلوب. يمكن إعطاء تركيبة الخلية بواسطة أي مسار مناسب Lipa الخلية علاج فعال في الخاضع, أي إعطاء ينتج عنه التوصيل إلى الموقع المطلوب في الخاضع aie ينتج Yo خلايا إلى Ex) حيث يتم توصيل جزء على الأقل من التركيبة التي تم توصيلها, أي على الأقل الموقع المطلوب لفترة من الزمن. تشتمل أوضاع الإعطاء على الحقن؛ التسريب»؛ التقطير» أو الابتلاع. intramuscular أو في العضلات intravenous ويتضمن "الحقن"؛ دون حصر؛ الحقن في الوريد ¢ intraventricular البطين Jala ¢ intrathecal القراب Jala ¢ intra-arterial داخل الشرايين » ؛ عبر intracardiac القلب Jala « intraorbital ؛ داخل الحجاج intracapsular داخل المحفظة Yo « transtracheal عبر الرغامى « intraperitoneal في الغشاء البريتوني ¢ intradermal الأدمةVel x 7 hematopoietic progenitor cells, at least 016 xT hematopoietic precursor cells, at least 0 cells Tx 9 hematopoietic progenitor cells, at least 011 x A hematopoietic progenitor cells, at least primary hematopoiesis, or its complications. The progenitor hematopoietic cells may be derived from one or more donors, or may be obtained from an autologous source. In some embodiments of the aspects described in the present application, the original cells are expanded to form blood in a homeostasis prior to administration to a 5-needed subject. In one embodiment, the term 'effective amount' as used in the present application denotes an amount A group of human primary hematopoietic cells or their precursor cells required to eliminate at least one or more of the symptoms of hemoglobinopathies, and related to a sufficient amount of a combination to provide the desired effect, therapeutically effective. Treating a subject with impaired hemoglobinuria. The term 0 is sufficient pall on it denotes an amount of hematopoietic progenitor cells or a formulation comprising SL hematopoietic progenitor cells to enhance a specified effect when administered to a typical subject, such as one with or at risk of hemoglobinopathies. The term effective quantity as used in the present application also includes a quantity sufficient to prevent or delay the progression of the disease symptom, alter the course of the disease symptom (including, but not limited to, slowing the progression of the disease symptom), or reverse the disease symptom. It should be recognized that in any given case, the correct Ve may be determined by one of ordinary skill in the art using routine experiments. Amount “dled” as used herein The term “give” refers to the setting of a hematopoietic stem cell composition according to Described in the present application in a subject by a method or course that entails locating a composition, at least, in the desired location. The cell composition can be administered by any suitable route Lipa the cell An effective treatment in the subject, that is, an administration that results in delivery to the site required in the subject aie Yo produce cells to Ex) where at least part of the composition has been delivered, i.e. at least the desired site for a period of time. Modes of administration include injection; infusion; instillation; Intramuscular or intravenous “injection” includes, but is not limited to, intravenous ¢ intraventricular Jala ¢ intrathecal Jala ¢ intra-arterial intra-arterial » ; via intracardiac Heart Jala « intraorbital ; J peritoneum ¢ intradermal dermis
“At ¢ intraarticular المفصل Jala ¢ subcuticular تحت البشرة ¢ subcutaneous تحت الجلد intraspinal النخاع Jala « subarachnoid ؛ تحت العنكبوتية sub capsular المحفظة الفرعية intrasternal القص والتسريب Jala والحقن ¢ intracerebro spinal الدماغي الشوكي Jada » لتوصيل الخلايا, يكون الإعطاء بواسطة الحقن أو التسريب مفصل injection and infusion عموماً. © في أحد النماذج, يتم إعطاء الخلايا وفقاً للموصوف في الطلب الحالي جهازياً. تشير العبارات"إعطاء "إعطاء محيطي"” وايتم إعطائه محيطياً” وفقاً لاستخدامه في الطلب "les جهازي, " 'يتم إعطائه الحالي إلى إعطاء مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم على نحو غير مباشر في الموقع المستهدف, في النسيج, أو العضو, بحيث يدخل, بدلاً من ذلك, في الجهاز الدوري للخاضع و, بالتالي, يكون عرضة للأيض والعمليات الأخرى. ٠ يمكن تحديد فعالية علاج يشتمل على تركيبة وفقاً للموصوف في الطلب الحالي لعلاج اعتلال الهيموجلوبين بواسطة الطبيب الإكلينيكي الماهر. مع ذلك, يعد العلاج "علاج فعال, " وفقاً لاستخدام المصطلح في الطلب الحالي, إذا تغيرت أي المؤشرات أو جميعها أو أعراض, كمثال واحد, مستويات 0-جلوبين جنيني بطريقة مفيدة, وتحسنت أعراض أو مرقمات المرض المقبولة إكلينيكياً أو تم التخفيف عقب العلاج بالمثبط. يمكن قياس الفعالية أيضاً 7٠١ على سبيل المثال, بواسطة على الأقل Lie YO بواسطة فشل الفرد في التفاقم وفقاً للتقييم بواسطة العلاج في المستشفيات أو الحاجة إلى التدخلات الطبية (على سبيل المثال, توقف تطور المرض أو إبطائه على الأقل). طرق قياس هذه المؤشرات تكون معروفة لأولئك المهرة في المجال و / أو موصوفة في الطلب الحالي. يشتمل العلاج على أي علاج لمرض في فرد أو حيوان (تشتمل بعض الأمثلة غير الحصرية على إنسان, أو ثديي) وتشتمل التخفيف من (Y) تثبيط المرض, على سبيل المثال, إيقاف, أو إبطاء تطور الإنتان: أو )١( على: Yo المرض, على سبيل المثال, مما ينتج عنه تراجع الأعرض: و (7) منع أو خفض احتمال تطور العدوى أو الإنتان. يعمل العلاج وفقاً للاختراع الحالي على تحسين عرض واحد أو أكثر من الأعراض المصاحبة للاضطراب جلوبين-بيتا عن طريق زيادة كمية الهيموجلوبين الجنيني في الفرد. نمطياً تكون الأعراض الأنيمياء ونقص الأكسجين في (JU مصحوبة باعتلال الهيموجلوبين؛ بما في ذلك على سبيل YO الأنسجة؛ وقصور وظائف الأعضاءء» وقيم الراسب الدموي غير الطبيعية؛ وتكون كريات الحمراء غيرAt ¢ intraarticular joint Jala ¢ subcuticular under the epidermis ¢ subcutaneous under the skin intraspinal medulla Jala subarachnoid; subcapsular intrasternal cut and infusion Jala and injection ¢ intracerebro spinal cerebral-spinal Jada » For cell delivery, administration by injection or infusion is generally joint. Forms, cells as described in the present order are given systemically. The phrases “give a peripheral administration” “and it is given peripherally” according to its use in the request “les systemic,” “the current administration is given to give a group of primary blood-forming cells indirectly at the target site,” in a tissue, or an organ, so that it enters, instead, into the circulatory system of the subject and, consequently, is subject to metabolism and other processes. However, treatment is considered to be “effective treatment,” according to the use of the term in the present application, if any or all indications or symptoms, for example, fetal 0-globin levels, change in a beneficial way, and symptoms or disease markers improve clinically acceptable or attenuated following inhibitor therapy.Efficacy may also be measured 701 eg, by at least Lie YO by the individual's failure to exacerbate as assessed by hospitalization or need for medical interventions (eg For example, halting or at least slowing down the progression of the disease.) Methods for measuring these indicators are known to those skilled in the field The and/or described in the current application. Treatment includes any treatment of disease in an individual or animal (some non-exhaustive examples include human, mammal) and includes alleviation of (Y) inhibition of disease, eg stopping or slowing the progression of sepsis: or (1) on: Yo disease, for example, resulting in regression of symptoms: and (7) to prevent or reduce the possibility of development of infection or sepsis. A treatment of the present invention improves one or more of the symptoms: Symptoms associated with a beta-globin disorder by an increase in the amount of fetal hemoglobin in the individual. Typically, the symptoms of anemia and hypoxia of the JU are associated with hemoglobinopathies, including for example tissue YO; organ dysfunction and regression values. Abnormal hematoma; abnormal erythrocytes
— A 7 —— A 7 —
الفعال» وعدد الكريات الشبكية (الكريات الحمراء) غير الطبيعي؛ وحمل حديد غير طبيعي abnormalactive » abnormal reticulocyte (erythrocyte) count; Abnormal iron load
iron load » ووجود أرومات جانبية حلقية sideroblasts 9 ؛ وتضخم الطحالiron load » and the presence of sideroblasts 9; and enlarged spleen
impaired ؛ وتدفق الدم الطرفي الضعيف hepatomegaly وتضخم الكبد « splenomegaly@impaired; Weak peripheral blood flow, hepatomegaly, and hepatomegaly «splenomegaly».
increased وانحلال الدم المتزايد « dyspnea ؛ وضيق التنفس peripheral blood flowincreased and increased hemolysis « dyspnea ; and shortness of breath peripheral blood flow
hemolysis © ؛ واليرقان jaundice ؛ وأزمات الألم المتعلقة بالأنيميا pain crises 306016hemolysis©; jaundice; Pain crises related to anemia 306016
متلازمة الصدر الحادة chest syndrome 80016 ؛ والاحتجاز الطحالي splenicacute chest syndrome 80016; and splenic detention
hand-foot ؛ وداء اليد والقدم stroke ؛ والسكتة الدماغية priapism والقساح « sequestrationhand-foot; hand and foot stroke; Stroke, priapism and priapism « sequestration
.angina pectoris والألم 7 متثل الذبحة الصدرية syndrome.angina pectoris and the pain 7 represents the angina pectoris syndrome
في أحد النماذج, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم خارج الجسم الحي أو في المعمل مع حمض DNA Vy يستهدف إندونيوكلياز, ويتم إعطاء الخلية أو سليفتها إلى الثديي (على سبيل المثال, إنسان).In one embodiment, the progenitor hematopoietic cell is contacted ex vivo or in vitro with a Vy-DNA targeting endonuclease, and the cell or its progenitor is administered to a mammal (eg, human).
في نموذج إضافي, الخلية الأصلية لتكون الدم عبارة عن خلية لسلالة إريترويد. في أحد النماذج, يتمIn an additional embodiment, the original hematopoietic cell is a cell of the erythroid progeny. In one of the models, it is
إعطاء تركيبة تشتمل على خلية أولية لتكوين الدم تم تلامسها مسبقاً مع إندونيوكلياز يستهدف حمضAdministration of a formulation comprising a hematopoietic progenitor cell previously contacted with an acid-targeting endonuclease
DNA ومادة حاملة مقبولة صيدلانياً إلى تديي.DNA and a pharmaceutically acceptable carrier.
في أحد النماذج, يمكن استخدام أية طريقة معروفة في المجال لقياس الزيادة في التعبير عن Vo الهيموجلوبين الجنيني, على سبيل المثال, تحليل لطخة Westen لبروتين الهيموجلويين الجنينيIn an embodiment, any method known in the art can be used to measure the increase in Vo expression of fetal hemoglobin, eg, Westen blot analysis for fetal hemoglobin
وتحديد كمية TMRNA لا-جلوبين جنيني.And quantification of TMRNA no-fetal globin.
في أحد النماذج, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون pall مع إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA فيIn one embodiment, the original cell contacts to form a pall with an endonuclease that targets the DNA in
المعمل, أو خارج الجسم الحي. في أحد النماذج, تكون الخلية من أصل بشري (على سبيل المثال,laboratory, or ex vivo. In one embodiment, the cell is of human origin (eg,
خلية ذاتية المنشاً أو غيروية المنشاً). في أحد النماذج, تتسبب التركيبة في زيادة في التعبير عن ٠ الهيموجلوبين الجنيني.autologous or heterogeneous cell). In one embodiment, the combination causes an increase in the expression of 0 fetal hemoglobin.
يمكن تعريف الاختراع الحالي في أي من الفقرات المرقمة أبجدياً التالية:The present invention may be defined in any of the following alphabetically numbered paragraphs:
]1[ طريقة لإنتاج خلية أولية تشتمل على تعبير منخفض عن MRNA .118 801 أو البروتين,[1] Method for Producing a Progenitor Cell Involving Low Expression of .118 801 MRNA or Protein,
تشتمل الطريقة على تلامس خلية أولية معزولة مع عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية علىThe method involves contacting an isolated primary cell with an agent that binds the cell's genomic DNA at
UCSC Genome (طبقاً لتجميعة 117 ,778 Tom A WITT الكرموسوم 7 الموقعUCSC Genome (according to assembly 117,778 Tom A WITT chromosome 7 locus)
_ A A —__A A —_
Browser hg 19 البشرية الجينومية), وبناءً عليه خفض تعبير MRNA أو البروتين عن 11 BCLBrowser hg 19 human genome), and accordingly reduced mRNA or protein expression of 11 BCL
AA
[ب] طريقة لإنتاج خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة تشتمل على تعديل جيني واحد على الأقل تشتمل[B] A method for producing an isolated genetically engineered human cell that includes at least one genetic modification that includes
على تلامس خلية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف © حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتيon contact of an isolated cell with an effective amount of a formulation comprising at least a DNA-targeting endonuclease© or an expression vector carrying the coding sequence of a DNA-targeting endonuclease that
بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسومThrough it, the endonuclease targets DNA and cleave the genomic DNA of the cell on the chromosome.
" الموقع 60, Tem AS YT 748ل7, 117 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه.Locus 60, Tem AS YT 748l7, 117 and causing at least one genetic modification there.
[ج] الطريقة وفقاً للفقرة )| أو [ب], حيث خلية أولية معزولة أو خلية معزولة تكون خلية أولية لتكوين[C] The method according to para or [b], where an isolated protocell or an isolated cell is a protocell of formation
الدم.blood.
٠ [د] الطريقة وفقاً للفقرة [ج], حيث الخلية الأولية لتكوين pal تكون عبارة عن خلية لسلالة إريثرويد. [a] الطريقة وفقاً للفقرة [آ] أو [ب], حيث خلية أولية معزولة أو خلية معزولة تكون خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات.0 [d] the method according to [c], wherein the primary cell of the formation of the pal is a cell of the erythroid race. [a] The method according to [a] or [b], wherein an isolated progenitor cell or an isolated cell is an iPS cell.
[و] الطريقة وفقاً للفقرة [ج], حيث يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم خارج الكائن الحي أو في المعمل.[F] The method according to paragraph [C], where the original cell is touched to form blood outside the living organism or in the laboratory.
Ve ([ز] الطريقة وفقاً GY الفقرات [آ]-[و], حيث تعديل جيني واحد على الأقل يكون حذف.Ve ([g] method according to GY paras [a]-[f]), where at least one genetic modification is a deletion.
[ح] الطريقة وفقاً للفقرة [ز], حيث يتخلص الحذف من المنطقة بالكامل بين الكرموسوم ؟ الموقع 60, 7 , 0-184 1, 774, 117 أو يتخلص من جزء من المنطقة مما ينتج عنه مقاطعة واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 .(DHS) DNAse[h] The method according to [g], where the deletion eliminates the entire interchromosomal region? site 60, 7, 0-184 1, 774, 117 or gets rid of part of the region resulting in interruption of one or more sites hypersensitive to 1 (DHS) DNAse.
[ط] خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة تشتمل على تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟[i] An isolated genetically engineered human cell that has at least one genetic modification in a chromosome?
٠ الموقع YA Tem A TT 117 وفقاً للفقرات [ب]-[ح]. [ي] تركيية تشتمل على WA بشرية مهندسة وراثياً معزولة من الفقرة [ط].0 Location YA Tem A TT 117 pursuant to [b]-[h]. [j] turkeys containing genetically engineered human WA isolated from [i].
[ك] طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية, تشتمل الطريقة على خطوات: تلامس خلية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل CAR[k] A method for increasing fetal hemoglobin levels in a cell, the method includes steps: contact of an isolated cell with an effective amount of a formulation comprising at least a DNA-targeting endonuclease or a CAR transporter
A q —_ _ تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع Cie LYYA LTS YAR 7 117 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الخلية المذكورة, أو سليفتها, بالنسبة إلى الخلية المذكورة قبل oo التلامس المذكور. [ل] الطريقة وفقاً للفقرة [ك], حيث الخلية المعزولة تكون خلية أولية لتكوين الدم. [م] الطريقة وفقاً للفقرة [ك] أو [ل], حيث الخلية الأصلية لتكون الدم تكون خلية لسلالة إريثرويد. أن] الطريقة وفقاً للفقرة [ك], حيث الخلية المعزولة تكون خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات. [س] الطريقة وفقاً للفقرة [ل] أو [a] حيث يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم خارج الجسم الحي أو Yo في المعمل. [ع] The طريقة وفقاً لأي الفقرات [ك]-[س], حيث يكون التعديل الجيني الواحد على الأقل حذف. [ف] الطريقة وفقاً للفقرة [ع], حيث يتخلص الحذف من المنطقة بالكامل بين الكرموسوم ؟ الموقع ٠١ , 7 , 0-144 1, 774, 117 أو يتخلص من جزء من المنطقة مما ينتج عنه مقاطعة واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 .(DHS) DNAse VO [ص] طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات تلامس خلية أولية معزولة مكونة للدم في الثديي المذكور مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض lly DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع 10, WT كاحت LYYA 17 ٠ ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. يتم توضيح الاختراع علاوة على ذلك بواسطة الأمثلة التالية التي ينبغي عدم اعتبارها مقيدة. يتم إدراج محتويات جميع المراجع المستشهد بها على مدار هذا التطبيق, وكذلك الأشكال والجدول في الطلب الحالي كمرجع. CARA q —_ _ an expression carrying the coding sequence for a DNA-targeting indonuclease by which the endonuclease targets DNA and cleave the cell's genomic DNA on the chromosome? locus Cie LYYA LTS YAR 7 117 and causes at least one genetic modification therein, by which expression of fetal hemoglobin is increased in said cell, or its progenitor, relative to said cell before said contact. [L] The method according to paragraph [C], wherein the isolated cell is a primary hematopoietic cell. [M] The method according to [C] or [L], wherein the original hematopoietic cell is a cell of the erythroid lineage. That] the method according to paragraph [C], where the isolated cell is an induced pluripotent stem cell. [Q] The method according to paragraph [l] or [a] where the original cell is touched to form blood outside the living body or Yo in the laboratory. [p] The method according to any paragraphs [k]-[o], where at least one genetic modification is a deletion. [P] The method according to paragraph [p], where the deletion gets rid of the entire region between the chromosomes? Site 01 , 7 , 0-144 1, 774, 117 or strips off part of the region resulting in interruption of one or more sites hypersensitive to 1 (DHS) DNAse VO [R]. fetal hemoglobin in a mammal in need of it, the method comprises the steps of contacting an isolated hematopoietic progenitor cell in said mammal with an effective amount of a formulation comprising at least a DNA-targeting endonuclease or an expression vector carrying the coding sequence of a lly-DNA-targeting endonuclease By which endonuclease targets DNA and cleaves the genomic DNA of the cell on the chromosome? Locus 10, WT LYYA cough 17 0 and causes at least one genetic modification therein, by which expression of fetal hemoglobin is increased in said mammal, relative to precontact expression. The invention is further illustrated by the following examples which should not be taken as limiting. The contents of all references cited throughout this application, as well as the figures and table in the present application are included for reference. CAR
q «= — المتال اكتشف المخترعون وقاموا بوصف العناصر التظيمية للجين 80111 والتي تعتبر حاسمة في التعيير عنه في سلالة خلايا الكريات الحمراء. ترتبط البدائل الجينية الشائعة ضمن هذه المتواليات بمستوى الهيموجلوبين الجنيني وشدة اضطراب بيتا - جلوبين. تشتمل هذه المتواليات على عناصر © تنظيمية بعيدة ببصمة كروماتين معزّزة؛ حيث تضم كروماتين يمكن الوصول إليه؛ علامات هيستون نشطة؛ والإشغال بواسطة عوامل نسخ الكريات الحمراء. تتفاعل هذه العناصر مع معزّز 80611178 وتعزز التعبير الجيني في خلايا الكريات الحمراء لكن ليس السلالات الأخرى التي تعبر عن BCL11A مثل الخلايا اللمفية 8. ويمكن استهداف هذه العناصر النتظيمية لأغراض Ladle BCLITA layin واعادة حث الهيموجلوبين الجنيني . يمكن أن يتم هذا بأليات لا تقتصر على التعديل ٠ الجينومي»؛ ربط الأحماض النووية أو البروتينات» والتعديل بالتخلق المتوالي. تضم مزايا هذه الطريقة : قطع عامل تنظيم فسيولوجي لمستوى الهيموجلوبين الجنيني مما يؤدي إلى زيادة إنتاج جاما-جلوبين وخفض إنتاج بيتا - جلويين؛ أدنى أثر على إجمالي خرج الجلويين أو على إنتاج خلايا الدم الحمراء أو وظيفتها؛ الحد من الأثر الذي يقع على الخلايا خارج سلالة الكريات الحمراء ومن ثم تقليل السمية المحتملة. Vo المواد والطرق مزارع الخلايا تم الحصول على خلايا +6034 بشرية من دم طرفي مسال لمانحين أصحاء من Centers of Excellence in Molecular Hematology at Yale University, New Haven, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Connecticut تم إخضاع الخلايا لإنضاج الكريات الحمراء خارج جسم الكائن الحي باستخدام Washington ٠ بروتوكول مزارع سائلة خالية من المصل ثثائية الطور على النحو المبين فيما سبق (79). تم الحصولq “= — METAL The inventors have discovered and described regulatory elements of the 80111 gene that are critical for its expression in the erythroid cell line. Common genetic variants within these sequences are associated with fetal hemoglobin level and severity of the beta-globin disorder. These sequences include distal regulatory elements with enhanced chromatin imprinting; It contains accessible chromatin; active histone marks; and occupancy by erythrocyte transcription factors. These elements interact with the 80611178 promoter and enhance gene expression in erythrocytes but not other BCL11A-expressing strains such as lymphocytes8. These regulatory elements can be targeted for the purposes of ladle BCLITA layin and re-induction of fetal hemoglobin. This can be done by mechanisms that are not limited to 0 genomic modification.” splicing of nucleic acids or proteins” and epigenetic modification. Advantages of this method include: blocking a physiological regulator of fetal hemoglobin level, which leads to increased production of gamma-globin and decreased production of beta-gluin; minimal effect on total glucose output or on red blood cell production or function; Limiting the effect on cells outside the erythrocyte lineage and thus reducing potential toxicity. MATERIALS AND METHODS Cell cultures 6034+ human cells were obtained from the peripheral blood liquified from healthy donors from the Centers of Excellence in Molecular Hematology at Yale University, New Haven, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Connecticut. Subject the cells to ex vivo maturation of erythrocytes using the Washington 0 two-phase serum-free liquid cultures protocol as described above (79). obtained
Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) على خلايا أحادية النواة من الدم الطرفي من مانحين أصحاء من Children’s Hospital 805100. تم إجراء تمايز الكريات الحمراء من PBMCs النحو المبين في السابق (40). تمت زراعة WIA ابيضاض الدم الاحمراري في Yo الفثران Mouse erythroleukemia (MEL) و7957 خلية T على النحو المبين في السابق (V9)Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were cultured on peripheral blood mononuclear cells from healthy donors from Children's Hospital 805100. Differentiation of erythrocytes from PBMCs was performed as described previously (40). WIA erythroleukemia of Yo mouse erythroleukemia (MEL) and 7957 T cells were cultured as previously described (V9).
(المشتقة v-Abl تمت زراعة خلايا لمفاوية جرذية سابقة على الخلايا 8 محوّلة بشكل ثابت بواسطة « penicillin—streptomycin زائد 707 بنسيلين -استريبتومايسين RPMI كما هو مبين ))£(( في sodium بيريوقات الصوديوم 7١ أحماض أمينية غير أساسية؛ 72١ (HEPES 77 (FCS 5 ميكرومولار 8 -ميركابتو إيثتانول ٠٠١١و 9ا01800176نيماتولج- انن١ » pyruvate .mercaptoethanol ©(derivative v-Abl) 8-cell precancerous rat lymphocytes stably transformed with “penicillin-streptomycin plus 707 penicillin-streptomycin RPMI as indicated (£) were cultured in sodium perioate 71 Non-Essential Amino Acids; 721 HEPES 77 (FCS 5 μM) 8-mercaptoethanol 0011, 9A01800176NEM 01800176N1 » pyruvate mercaptoethanol.
DNase ١و ChIP حساسية .)39( تم إجراء الترسيب المناعي للكروماتين وتحديد المتواليات الموازي بشكل هائل على النحو المبينDNase 1 and ChIP sensitivity (39). Chromatin immunoprecipitation and massively parallel sequencing were performed as indicated.
H3K4me3 «(£¢4 - «Vv Millipore) 13/270083 : تم استخدام الأجسام المضادة التالية «Abcam) 132786 (ab8895 Abcam) H3K4mel (vie - .¢ Millipore) «(sc-899 (Santa Cruz «Polll) Polymerase ١١ إنزيم بوليميراز RNA ((ab4729 | ٠ تم تحديد كثافة .)50-12984 «Santa Cruz) TALL, ) abl1852:Abcam)GATA1 تم «ChIP-gPCR وتم تحليلها على النحو المبين في السابق (47). بالنسبة ل DNase | انقسام تم ACH من كروماتين مُدخل بطريقة 7 ١ مع CHIP تحديد الإثراء النسبي بمقارنة تكبير مادة و GATAL استخدام المواضع المسجلة في السابق باعتبارها مشغولة وغير مشغولة بواسطة (79) 11ظاكمواد مقارنة موجبة وسالبة على الترتيب ٠ (3C) Chromosome توافق الكروموسومات Jalil على النحو المبين في السابق )¥9( باستثثناء ما هو موضح أدناه. تم اهتضام 3C تم إجراء اختبار formaldehyde الأنوية من مواد منتجة للكريات الحمراء بشرية أولية مرتبطة تشابكياً بالفورمالديهايد كمي في الزمن الفعلي PCR قبل الربط وعكس الروابط التشابكية. وتم إجراء Hind باستخدام تم استخدام شظية محتوية .)0 ١7. (Bio-Rad) iQ SYBR Green Supermix باستخدام ٠ يتعلق بكفاءة التكبير للبادئات المختلفة؛ تم Lad على معزّز 801117 كمنطقة تثبيت. للتصحيح تحضير قالب مقارنة باهتضام وربط خليط مولاري متكافئ من اثنين من الكروموسومات الصناعية 501118 المشتملة على موضع bacterial artificial chromosomes (BACs) البكتيرية CTD-) -جلوبين بشري J وواحد من (RP11-139C22 5 RP11-606L8) البشري الكامل -١١ وكان التفاعل بين الشظايا في 1151/1152 و 1153 من منطقة مقارنة موضع .)3055511 © qvH3K4me3 «(£¢4 - «Vv Millipore) 13/270083 : The following antibodies were used «Abcam] 132786 (ab8895 Abcam) H3K4mel (vie - .¢ Millipore) «(sc-899 (Santa Cruz «Polll) Polymerase 11 RNA polymerase ((ab4729|0) was determined by ChIP-gPCR and analyzed as described previously (47). ). For DNase | ACH cleavage of inserted chromatin 7 1 with CHIP Determination of relative enrichment by comparison of amplification of material and GATAL Using loci previously recorded as occupied and unoccupied by (79) 11% as positive comparators and negative, respectively, 0 (3C) Chromosome Jalil as previously described (¥9) except as described below. Nuclei from primary human erythrocyte-linked 3C formaldehyde test were digested. Quantitative real-time PCR before crosslinking and reverse crosslinking.Hind was performed using a fragment containing 0.17. (Bio-Rad) iQ SYBR Green Supermix using 0 relates to the amplification efficiency of different primers; Lad on booster 801117 as installation area. To correct: Comparative template preparation by digestion and ligation of an equivalent molar mixture of two of the 501118 synthetic chromosomes comprising one bacterial artificial chromosomes (BACs) locus (CTD-) - human globin J and one (RP11-139C22) 5 RP11-606L8 (complete human RP11-606L8) 11- The interaction between the fragments was at 1151/1152 and 1153 from a position comparison area (3055511 © qv).
LCR كعينة مقارنة. تم التعبير عن تكرار التفاعل كتكبير بالنسبة لتفاعل (LCR) جلوبين البشريLCR as a comparison sample. Reaction frequency was expressed as magnification relative to human globin reaction (LCR).
BAC المعروف» مقرباً إلى قالب مقارنة موضع /806111 للتخطيط المنفّح 861118 الثلاثة من إنترون ؟ ل DHSS كافة الإحداثيات) من بين hg19) تم اختيار العلامات - Te له (عع كت ل (AT خالا Te كح YY من النوع +17 (2نو: عت ©Known BAC" approximated to comparison template position /806111 of the afferent layout 861118 The three of an intron? For DHSS all coordinates (among hg19) the labels were selected - Te for him (AK) for (AT) Te KH YY of type +17 (No: AT ©
YY تم التعرف على (AE VY Te — AY YY EL :chr2) 5ه + (ve RARE AR (CEU) علامة من قاعدة بيانات مشروع الألف جينوم باستخدام مجموعات مرجعية من شمال أوروبا 055110135 بديل إضافي في YA (جدول 51). جد (ASW) والأفارقة الأمريكان (YRI) نيجيريا من DNA في DHS لثلاثة فواصل Sanger قام المخترعون بتحديد المتواليات بكيمياء L(Y (جدول نتسم CSSCD من مجموعة (SCD) و1؟ من مرضى مصابين بمرض الخلايا المنجلية OY Yo على الترتيب. من جهد تحديد (HBF ومنخفضة (أقل من 77) من (ZA بمستويات عالية (أكبر من المتواليات هذاء تم تحديد سبع بدائل متواليات جديدة (جدول 7). ولأن معظم العلامات تتكتل في 676 فواصل جينومية صغيرة؛ لم يكن ممكناً تصميم اختبارات لتحديد الأنماط الجينية لبعضها. من بين تم إجراء اختبارات تحديد النمط الجيني ل (DHSS غير تكراري يتم التعرف عليها في ثلاثة من Jay علامة في 1,717 مشارك من 655©60؛ يمتلون مجموعة 5060 من الأفارقة الأمريكان 46 5 تم تحديد .)7١( لديهم معروفة HOF الخاص بهم ومستويات (DNA) المتاح /1ا0الجينومي تم استبعاد الأفراد وبدائل متواليات . 569080007 IPLEX الأنماط الجينية للعلامات باستخدام منصة نجاح في تحديد النمط الجيني أقل من 90 7. بلغت النسبة الإجمالية لتوافق الأنماط Jaze DNA في جدولي (YA =n ¢QC) SNPs يتم بيان التحكم في جودة مرور .7٠٠0 الجينية من نسخ ثلاثية أ و١١ ب أسفل 00155 الثلاثة. ويعتبر جزء كبير ١١ و" ويتم توضيح ذلك تخطيطياً في شكلي * Yo محددة الأنماط الجينية نادراً في المجموعات المرجعية ومن ثم تكون بشكل غير مثير SNPs من SNPS بقي 178 فرد و١7 من «QC بعد .)١8- 0( CSSCD للدهشة أحادية الشكل فيYY (AE VY Te — AY YY EL :chr2) 5e + (ve RARE AR (CEU) marker identified from the Thousand Genomes Project database using Northern European reference sets 055110135 additional substitution in YA (Table 51). Find (ASW) and African-American (YRI) Nigeria from DNA at DHS for three Sanger spacers. The inventors identified the sequences with L(Y) chemistry (NTSM table CSSCD from a group (SCD) and 1? from patients with sickle cell disease OY Yo, respectively. From HBF determination effort, low (<77) of ZA with high levels (greater than Seven new variant sequences were identified (Table 7).Because most of the markers are clustered at 676 small genomic intervals, it was not possible to design tests to determine the genotypes of some of them.Among the DHSS genotype determination tests were performed Non-repetitive identified in three Jay markers in 1,717 participants from 655©60; comprising a cohort of 5060 African-Americans 46 5 were identified to have known HOF and DNA levels (71). Available/1a0 genomic individuals and alternate sequences were excluded. 569080007 IPLEX Marker genotypes using the genotyping success <90 7 platform. The total concordance ratio of Jaze DNA in the two tabulated (YA = n ¢QC) SNPs showing the quality of passage is .7000. From copies Triple A and 11B below 00155 Three. It is considered a large part 11 and "and this is illustrated schematically in my figure * Yo Genotypes are rarely defined in the reference groups and then they are unexciting SNPs from SNPS 178 individuals and 17 from QC remained after" (18-0) CSSCD is surprisingly monomorphic in
AEF 04) على النحو المبين في السابق HPF متعددة الأشكال للتحليل. تمت نمذجة مستويات أكبر من )1( باستخدام >ال510(؟؛) من خلال MAF) إجراء الربط وتحليلات التهيئة لبدائل أحادية من ST MAF) الارتداد الخطي تحت نموذج جيني يتميز بالإضافة. كشفت تحليلات البدائل الشائعة YoAEF 04) as previously described HPF polymorphisms for analysis. Levels greater than (1) were modeled using the >510(?;) through the MAF (linkage procedure and conditioning analyzes for monosubstituted variants of ST MAF) linear regression under an addition-characteristic genetic model. Analyzes of popular alternatives revealed Yo
X 1,79 =P ( HbF تمتع بأقوى مستوى ارتباط ب DHS +62 عن أن 51427407 في (7)X = 1.79 P ( HbF has the strongest binding level with DHS +62 for 51427407 in (7)
CARCAR
او 0-0 شكلي ١١ أ و ب). أظهرت تحليلات التهيئة أنه بعد التهيئة على 251427407 و57606173 لم تكن أية SNPs أخرى ذات بال (شكل ؟ ب). أدى تعديل المكونات الأساسية (PCs) على Aco فرداً متاح بيانات تحديد النمط الجيني على مستوى الجينوم لديهم لتعويض الاختلاط وغير ذلك من حالات الاندماج إلى نتائج متماثلة. © بالنسبة للبدائل النادرة ومنخفضة التكرار MAF) أقل من 0 7( قام المخترعون تحليلات على أساس المجموعات باستخدام كل من 62+ (DHSS 58+ و55+ الثلاثة كوحدة اختبار. لهذه التحليلات؛ استخدمنا برنامج )45( اختبار ربط أنوية المتواليات (SKAT-0) بالمتغيرات الافتراضية. اختار المخترعون قيمة 0 7 الحدية ل MAF من أجل تعظيم القدرة الإحصائية في ضوء حجم عيننتا المحدود؛ لكن لاحظ أنه تم أيضاً تحليل العلامات التي لها MAF بين 71 و75 في تحليلات البدائل ٠ الأحادية المبينة أعلاه.يتم تبرير هذا التراكب في البدائل باستخدام تحليلات التهيئة بالبدائل الشائعة المرتبطة على حدة بمستويات (HBF وجد أن هناك مجموعتان هامتين (fleas) تحديداً 62+ DHS و55+ (DHS لكن بعد التهيئة على 151427407 و57606173؛ لم تعد النتائج هامة laa بشكل يوحي بضعف LD بين البدائل نادرة/ منخفضة التكرار و5005 الشائعة (جدول ©( لم يجد المخترعون دليلاً على أن بدائل المتواليات النادرة ومنخفضة التكرار في 01155 BCL11A تؤثر على V0 مستويات HBF في من يعانون من (SCD على الرغم من إعادة تحديد المتواليات بواسطة Sanger ل 01155 هذه في AA خاضع للعلاج يعانون من النمط الظاهري الشديد ل HOF نسب تكرار النمط الفردي من 51427407-57606173) في CSSCD هي: 1-6 4.5 1-717 .777,١ 6-6 147,2 6-06 6 متوسط مستوى HOF عبارة عن 74.8 ).٠050( في 7١١ من أفراد 6-6 r81427407-rs7606173 املا ( 5050 ) في Yo£ ٠ من اللواقح المخالفة من rS1427407-rs7606173 T-G/G-T و١211,7 ( 7750) في 60 من أفراد 1-6 rS1427407-rs7606173 (شكل 7 ج). لمقارنات مستويات HOF بين الأنماط الجينية؛ تم تحديد قيم © بواسطة اختبارات ستيودينت تي أحادية التذييل. تحديد النمط الفردي الجزيئي لاثنين من SNPS متغايرة اللاقحة على نفس الكروموسوم؛ هناك طوران محتملان: Blab حم Yo (النموذج )١ و5/8-8-م (النموذج (Y ل SNPs في شظية ١١ كيلو قاعدة من إنترون IY CAROr 0-0 form 11 a and b). The initialization analyzes showed that after initialization on 251427407 and 57606173 no other SNPs were significant (Fig. ?b). Modifying the principal components (PCs) on an Aco in individuals with genome-wide genotyping data to compensate for admixture and other fusion conditions produced similar results. © For rare, low-frequency substitutions (MAF < 0 7) the authors performed cluster-based analyzes using each of the three 62+ (DHSS 58+ and 55+) as a unit test. For these analyses, we used the (45) Sequences Nuclear Ligation Test program (SKAT-0) with the default variables The inventors chose a cut-off value of 0 7 for the MAF in order to maximize statistical power given our limited sample size; however, note that markers with a MAF between 71 and 75 were also analyzed in the 0 substitution analyses. This overlap in the alternatives is justified using adjustment analyzes with common alternatives associated separately with HBF levels. 151427407 and 57606173; results no longer significant laa to suggest poor LD between rare/low-frequency and common 5005 variants (© table) The inventors found no evidence that the rare, low-frequency sequence substitutions in 01155 BCL11A affect V0 HBF levels in subjects with SCD despite resequencing by Sanger of this 01155 in AA Subjects with a severe HOF phenotype (haplotype frequency ratios of 51427407-57606173) in CSSCD are: 1-6 4.5 1-717 .777,1 6-6 147,2 6-06 6 Mean HOF level of 74.8 (.0050) in 711 individuals of 6-6 r81427407-rs7606173 filler (5050) in Yo£0 offending suffixes of rS1427407-rs7606173 T-G/G-T and 1211.7 (7750) in 60 individuals 1-6 rS1427407-rs7606173 (Fig. 7c). for comparisons of HOF levels between genotypes; © values were determined by one-tailed Student t-tests. determining the molecular haplotype of two heterozygous SNPS on the same chromosome; There are two possible instars: Blab-H-Yo (form 1) and 5/8-8-M (T-form (Y) for SNPs in the 11-kb fragment of the IY CAR intron
18 ا80من + oY, - 144 كيلو قاعدة؛ تم تحديد الطور باستتساخ منتجات PCR وتحديد determine phase 57569946 ولتحديد طور الأليلين (SNP التوزيع المشترك ل dav دمج PCR كيلو قاعدة على الكروموسوم ؟)» تم إجراء Vo) ا(االمفصولين بواسطة 7 الدمج منطقتين PCR المستحلب على النحو المبين في السابق (74؛ 75) مع تعديل بسيط. يجلب معنيتين» من أجزاء منفصلة من نفس الكروموسوم؛ معاً في منتج واحد. بإحراء التفاعل في المستحلب © بقطيرات دقيقة مائية محاطة بالزيت؛ يتم اشتقاق تفوق منتجات التكبير من جزيء أحادي القالب. كان غير متجانسي اللواقح بشكل مزدوج بالنسبة ل 57569946 و aed من أفراد معروف esa lIDNA التالي (بالتركيزات النهائية المبين): . إنزيم 100 18١ تالعافتلا مث قالباً في 718 e80 of + oY, - 144 kb; The phase was determined by cloning the PCR products and determining the determine phase 57569946. To determine the phase of the two alleles (SNP co-distribution of dav incorporating PCR kilobase on the chromosome?)” Vo (a) separated by 7 was performed. Fusion of two emulsion PCR regions as described above (74; 75) with a slight modification. Brings “two senses” from separate parts of the same chromosome together into a single product. By heating the reaction in the emulsion © with aqueous micro-droplets surrounded by oil; Superiority amplification products are derived from a monomeric molecule It was heterozygous for 57569946 and aed from the following known esa lIDNA individuals (at final concentrations shown): 7
KOD ,لا 14)؛ المحلول المنظّم Novagen, 71086) KOD Hot Start بوليميراز 8لا0 ل MgSO4 (1X) Ve. (١5,_مللي مولار)ء A oY) dNTPs مولار لكل منها)؛ بادئات SFr) 187569946-R لكل منهما)؛ بادئات i&M Y) rS1427407-R 457569946-F مولار)؛ $Y) rs7569946-R-reveomp-rS1427407-F مولار)؛ بادئة التجسير الداخلية نانوجم). تمت إضافة التفاعل المائي |8 100 بالتتقيط مع التقليب إلى طور Yeo) gDNA الزيت ا8أ 200 لتكوين مستحلب. تم تكبير جزئين 0&1 125 من المستحلب تحت الظروف التالية : Vo ثانية؛ Ve درجة Ve ثواني؛ ٠١ درجة Te ثانية؛ Ye درجة دقيقتين؛ £0 دورة من 15 درجة 40 VO متداخل في25 PCR ل Hexane اندماج مستخلص بالهكسان PCR درجة دقيقتين . تم إخضاع منتج محلول ¢(0.5 U) KOD Hot Start ل Polymerase DNA اا كما يلي : إنزيم بوليميراز مللي مولار لكل منها)؛ +,Y) dNTPs مولار)؛ Ak ,5( 109504 (©17)؛ KOD من alii (Logie نانو مولار لكل Yoo) 1S1427407-nested-R ; rs7569946-nested-F البادئتين ثانية؛ ٠١ دورة من 90 درجة YO نانولتر)؛ 40 درجة دقيقتين؛ VO) اندماج مستخلص PCR منتج ٠ المنتج المتداخل با لاستشراد ash درجة دقيقتين. تم Ve ثانية؛ Fe درجة Ve ثواني» ٠١ درجة ٠ _لتكوين نطاق أحادي بالحجم المتوقع. تم agarose في جل أجاروزا©9 electrophoresis es!KOD, no 14); Buffer (Novagen, 71086) KOD Hot Start polymerase 8NO0 for MgSO4 (1X) Ve. (15,_mM - A oY (M) dNTPs each); SFr prefixes) 187569946-R each); i&M prefixes Y) rS1427407-R 457569946-F molar); $Y) rs7569946-R-reveomp-rS1427407-F molar); internal bridging indentation (nm). The aqueous reaction |8a 100 was added dropwise with stirring to the Yeo-gDNA phase of oil (e8a 200) to form an emulsion. Two parts 0 & 1 125 of the emulsion were amplified under the following conditions: Vo sec; Ve 125 sec; Te 10 sec; Ye 2 min; £0 cycle of 15 degrees 40 VO nested in 25 L PCR Hexane fusion extracted with hexane PCR 2 minutes. The solution product ¢(0.5 U) KOD Hot Start was subjected to DNA Polymerase A as follows: polymerase enzyme (mM each); dNTPs (mM, Y) +; (Ak, 5). 109504 (©17); KOD from alii (Logie nanomolar per Yoo) 1S1427407-nested-R ; rs7569946-nested-F prefix sec;01 turn of 90° YO nl ); 40° 2 min; VO) Fusion of PCR extract, product, 0 interfering product by ash electrophoresis, 0° min. Ve seconds; Fe degrees Ve seconds” 01 degrees 0 _Creates a mono-band of the expected size. The agarose in agarosa gel©9 electrophoresis es!
Life Technologies, ) Zero Blunt PCR Cloning استنساخ المنتج المنقٌّى بمجموعة أدوات لنواتج التكبير بالاندماج إلى تحديد نسائل ؛ Sanger أدى تحديد المتواليات بطريقة L(K2700-20 ؛ © و8-8. تم حساب احتمال كل طور على أساس افتراض توزيع a-bA-B: متواليات ممكنة YO متعدد الحدود (جدول 1). تم حساب نسبة احتمال التصميمين كمقياس للأهمية الإحصائية لنموذجLife Technologies, Zero Blunt PCR Cloning Cloning the purified product with a fusion amplification kit resulted in the identification of Sanger clones; Sequencing was determined by the L method (K2700-20; ©, 8-8). The probability of each phase was calculated based on Assuming a-bA-B distribution: possible sequences YO polynomial (Table 1).The probability ratio of the two designs was calculated as a measure of the statistical significance of the model.
اج q _ النمط الفردي بمطابقة البيانات ١ (مقارنة بالنموذج. ؟). توحي النسبة التي تقترب من ما لا نهاية بالنموذج ١ء وتوحي نسبة عبارة عن ١ بالتوازن وتوحي نسبة تقترب من الصفر بالنموذج 7. تحديد المتواليات الحراري تم فحص مانحي خلايا +0034 أصحاء للتعرف على خمسة مانحين متغايري اللواقح بالنسبة ل © 51427407. تم إخضاع خلايا +0034 هذه لتمايز الكريات الحمراء خارج جسم BEY الحي. وتم عزل الكروماتين واجراء ChIP بالأجسام المضادة GATAL و1811 . تم إخضاع كروماتين JA مقارنة sales 67/1 أو TALL المترسبة لتحديد المتواليات الحراري من أجل تحديد التوازن الأليلي ل 14277407 .rS ثم فحص مانحي CD34+ أصحاء للتعرف على ثلاثة مانحين متغايري اللواقح بالنسبة للنمط الفردي من0/1-6-© 57606173--51427407. تم إخضاع خلايا +0034 ٠ هذه لتمايز الكريات الحمراء خارج جسم الكائن الحي. تم (CDNA) Zaidi DNA glad) و هلا 0 ولتحديد المتواليات الحراري من أجل تحديد التوازن الأليلي ل 157569946 كانت ظروف PCR كما يلي : خليط 2X ١11015181180 الرئيسي (Qiagen) 47 ١٠):012واا (تركيز نهائي “ مللي مولار)» DNA القالب (ans 1-0,١( وبادئات أمامية وعكسية معالجة ببيوثين خاصة = Yeo ) SNP نانو مولار لكل منها ( . وكانت ظروف دورات PCR كما يلي : ١5 40/941 ١٠ دقيقة؛ fo دورة من ؛ م ٠ ثانية؛ ٠ م ٠ ثانية؛ "لام ٠ ثانية؛ a VY ° دقائق. تمت معالجة بادئة واحدة من كل زوج من ببيوتين (biotinylated وتم ربط جديلة منتج PCR المحتوية على البادئة المعالجة ببيوتين بخرزات استريبتاقيدين streptavidin beads ودمجها مع بادئة تحديد متواليات معينة. تم تحديد متواليات DNA أحادي الجديلة المحضّر وتم تحليل نمطه الجيني باستخدام (Qiagen Pyrosequencing) PSQ96 HS System وفقاً لتعليمات الجهة ٠ المصتئعة. الفئران المحورة وراثياً تم الحصول على التركيبة المبلغة المعزّزة pWHERE-Dest من دكتور William Pu. معدّلة من (Invitrogen, pwhere)pWHERE على النحو المبين في السابق )£7( حيث تحتوي التركيية على بديل 1119 جرذي يحيط lacZ Jus 6086-1468 مشتق بالحد الأدنى من 15068 الأدنى YO معزّز باستخدام شريط وجهة Gateway عند MCS القبلي. تم تكبير الشظايا المعززة من IDNA OY AYC q _ haplotype with data match 1 (compared to model.?). A ratio approaching infinity suggests Model 1a, a ratio of 1 suggests equilibrium, and a ratio close to zero suggests Model 7. Thermal sequence determination Healthy 0034+ cell donors were screened for five donors heterozygous for ©51427407. These 0034+ cells are for ex vivo differentiation of erythrocytes by BEY. Chromatin was isolated and ChIP was performed with GATAL and 1811 antibodies. JA chromatin compared to sales 67/1 or precipitated TALL was subjected to thermal sequencing in order to determine the allelic balance of 14,277,407 rS .then healthy CD34+ donors were screened for identification of three heterozygous for haplotype 0 /1-6-© 57606173--51427407. These 0034+ cells were subjected to ex vivo erythroid differentiation. (CDNA) Zaidi DNA glad) and Hala 0 were done. To determine the thermal sequences in order to determine the allelic balance of 157569946, the PCR conditions were as follows: 2X 111015181180 master mixture (Qiagen) 47 10:012waa (concentration Final “mM” template DNA (ans 1-0,1) and biotin-specific forward and reverse primers = Yeo SNP (nM each). The conditions for the PCR cycles were as follows: 15 40 /941 10 min; fo cycle of m 0 sec; 0 m 0 sec; “lam 0 sec; a VY ° min. One prefix processed from each pair of biotin (biotinylated) and the strand of the PCR product containing the biotin-treated primer was attached to streptavidin beads and combined with a specific sequence-specific primer. The prepared single-stranded DNA was sequenced and its genotype was analyzed using (Qiagen Pyrosequencing) PSQ96 HS System as per manufacturer's instructions 0. Transgenic mice The reported fortified formulation pWHERE-Dest was obtained from Dr. William Pu. modified from (Invitrogen, pwhere)pWHERE as previously described (£7 (where it contains Turkish on a rat 1119 substitution flanking lacZ Jus 6086-1468 derived minimally from 15068 lower YO augmented using the Gateway destination bar at premolar MCS. Enhanced fragments of IDNA OY AY have been enlarged
— أ q — فأري؛ وتمت إعادة دمجه في ناقل (Invitrogen, 12536-017) pDONR221 بواسطة إنزيم BP كلوناز (Invitrogen, 11789020) clonase وتمت إعادة دمجها في ناقل PWHERE-Dest مع إنزيم LR كلوناز )11791020 (Invitrogen, .25 اهتضام البلازميدات باستخدام Pacl لإزالة السلسلة الرئيسية للناقل. تمت تتقية شظايا lacZ المبلّغة المعزّزة بالاستشراد الكهربي خلال الجل ثم تم © تركيزها (Promega, A7280) Wizard DNA Clean-Up System تم توليد الفئران المحورة وراثياً بالحقن بطليعة النواة في بويضات 1/8 مخصبة. تم استخدام حوالي ٠١ نانوجم/ ميكرولتر من محلول DNA لسلسلة من الحقن. تم استخدام aly 60-1 كأفراد متلقية للأجنة المحقونة. تم إخراج أجنة أعمارها بين 14,0 16,05 يوماً منذ تاريخ الحقن من الأمهات البديلة مع إجراء التبقيع الكامل والنسيجي ب X-gal على النحو المبين في السابق (17). تم بشكل مضاد ads عناصر التدويم ٠ الخلوي المبقعة ب X-gal باستخدام .(Vector Laboratories, H-3403) Nuclear Fast Red تم استخدام التذييلات لتحديد النمط الجيني ل PCR تمت إجازة إجراءات الحيوانات بواسطة .Children’s Hospital Instititutional Animal Care and Use Committee اختبار تعزيز المواد المنتجة للكريات الحمراء البشرية تم استتساخ شظايا DNA الجينومية المحتوية على عناصر معزَّزة مفترضة إلى pLVX-Puro J# (Clontech, 632164) ٠ أدنى TK 332s وجين am GFP على النحو المبين (79). تمت إصابة 97 خلية T باستخدام عامل التفاعل (Promega, E2691) FuGene6 وفقاً لبروتوكول الجهة المصنّعة. تم تغيير الأوساط بعد 4 7 ساعة وسط SFEM مزوّد ب 77 بنسيلين-استريبتومايسين penicillin-streptomycin « وبعد ١ ساعة؛ تم تجميع المادة الطافية وتم ترشيحها. تم حث مزارع الكريات الحمراء المشتقة من خلايا +6034 باستخدام القيروس البطيء في يومي التوسع ؛ وه ٠ بالعدوى الدورية على النحو المبين في (FA) Glad) تمت إعادة تعليق الخلايا في أوساط تمايز الكريات الحمراء بعد YE ساعة من العدوى الثانية. بدأ الانتقاء باستخدام بيرومايسين ١ PUrOMYCIN ميكرو جم/ مل بعد 8؛ ساعة من العدوى. تم تحليل الخلايا المستحثة بعد خمسة ald في أوساط التمايز بقياس التدفق الخلوي لمتوسط شدة التألق الفلوري ل GFP قياس التدفق التدفق الخلوي oY AY— a q — mouse; It was recombined into the pDONR221 vector (Invitrogen, 12536-017) with BP clonase (Invitrogen, 11789020) and recombined into the PWHERE-Dest vector with LR clonase (11791020). Plasmids were digested (Invitrogen, .25 using Pacl to remove the main chain of the vector. Reported lacZ fragments were purified by intra-gel electrophoresis and then concentrated (Promega, A7280) Wizard DNA Clean-Up System. Transgenic mice were generated Transgenic prokaryotic injections into fertilized 1/8 oocytes Approximately 01 ng/μL of DNA solution was used for a series of injections Aly 60-1 were used as recipients for the injected embryos Embryos aged 0.14 were extruded 16.05 days since the date of injection from surrogate mothers with complete and histological X-gal staining as described previously (17). (Vector Laboratories, H-3403) Nuclear Fast Red. Appendices were used for PCR genotype determination. Animal procedures have been approved by Children's Hospital Instititution. al Animal Care and Use Committee Human Erythropoietic Substance Enhancement Test Genomic DNA fragments containing putative enhancers were cloned into pLVX-Puro J# (Clontech, 632164) 0 down TK 332s and the amGFP gene As indicated (79). 97 T cells were infected with FuGene6 (Promega, E2691) reacting agent according to the manufacturer's protocol. Media were changed after 4 7 h with SFEM medium supplemented with penicillin-streptomycin 77 and after 1 h; The supernatant was collected and filtered. Erythrocyte cultures derived from +6034 cells were induced using slow titration on both days of expansion; E 0 By cyclic infection as indicated in (FA)Glad) Cells were resuspended in erythrocyte differentiation media YE 1 h after the second infection. Selection started with PUrOMYCIN 1 μg/mL after 8; hour of infection. Transduced cells after five ald in differentiation media were analyzed by flow cytometry for the mean fluorescence intensity of GFP oY AY flow cytometry.
_qy_ 7-AAD, BD Pharmingen, ) aminoactinomycin نا -١ تم فتح الخلايا الحية باستبعاد تم عزل معلقات نخاع العظم (للأرومة الحمراء) والطحال (للخلية اللمفية) من صغار ..)5 البالغة. بعد الانحلال منخفض الضغط لخلايا الدم الحمراء الناضجة؛ تم فرز Uy الفئران المحورة «(BD, 550992( biotin-CD71 على أساس التبقيع باستخدام (7-AAD-) الخلايا الحية_qy_ 7-AAD, BD Pharmingen, ) aminoactinomycin Na-1 Live cells were opened by exclusion Bone marrow suspensions (for erythroblasts) and spleen (for lymphocytes) were isolated from young (5 ..) adults. after hypotensive lysis of mature red blood cells; Uy mice transgenic (BD, 550992) biotin-CD71 were sorted based on staining using (7-AAD-) live cells.
CD19-APC (BD, 553673) Ter-119-PE (BD, 554067) APC - streptavidin © و CD19+ «CD71+Ter119+ تم فرز .(BD, 100308) CD3-PE أو (BD, 550992)CD19-APC (BD, 553673) Ter-119-PE (BD, 554067) APC © streptavidin and CD19+ “CD71+Ter119+” sorted CD3-PE (BD, 100308) or (BD, 550992). )
RNA +003من المجموعات المستخدمة باستخدامها في التدويم الخلوي وعزلRNA +003 from the groups used for cytokinesis and isolation
TALEN الحذف الكروموسومي بفعل لإحداث انقسامات في (TALENS) تم تصميم إنزيمات نيوكلياز المؤثّرة الشبيهة بمنشط النسخ الوراثي الإنترون ؟ من 801118 الفأري في موضعي 64 00 كيلو قاعدة (يطلق عليه الموضع 5( و ٠ : على المتواليات التالية TALENS (الموضع 37( بالنسبة ل 155. تتعرف sacl كيلو 0,4+ أيمن)؛ 5°) CCATGCCTTTCCCCCCCT( ه66 ههه 5011/0866 يسار 61 أيسر). تم 3:( CTGACTAATTGATCAT أيسر)ء 3°)GAGTTAAAATCAGAAATCT !8لا للتعرف على 6. تم RVD باستخدام (£4) Golden Gate تخليق 181115 باستتساخ بنطاق إنزيم (Invitrogen, V790-20)pcDNA3.1 المخلّقة في DNA استتساخ نطاقات ربط Vo ؛ نطاق 8152 في الطرف لا ونطاق 63+ في الطرف © المبين في السابق Fokl nuclease 0.5 89 0012*670 الأربعة مع TALEN تم توصيل 89 2.5 من كل من البلازميدات .(£9) سابقة على 8 بالاستشراد الكهربي وفقاً لبروتوكول الجهة WDA أو MEL Voix إلى ؟ (Lonza)TALEN induced chromosomal deletion to cause cleavage (TALENS) Transcriptase activator-like effector nuclease enzymes engineered the intron? of mouse 801118 at positions 64 00 kb (termed locus 5) and 0: on the following sequences TALENS (position 37 (for 155. sacl recognizes 0.4+kk right); 5 °) CCATGCCTTTCCCCCCCT (E66 AH 5011/0866 left 61 left). Done 3: (CTGACTAATTGATCAT left) 3°)GAGTTAAAATCAGAAATCT 8! Done to identify 6. Done RVD using Golden (£4) Gate 181115 synthesis by cloning the enzyme domain (Invitrogen, V790-20)pcDNA3.1 synthesized in DNA cloning of Vo-binding domains; 8152 domain at the no end and 63+ domain at the end © previously shown Fokl nuclease 0.5 89 0012*670 four with TALEN 89 2.5 each of plasmids (£9) preceding 8 were delivered by electrophoresis according to WDA protocol or MEL Voix to ? (Lonza)
EA بقياس التدفق الخلوي بعد GFP تم فرز الخلايا الموجبة ل .)10028, VCA-1005) المصنّعة ساعة. تم اسنتبات الخلايا بالحد من التخفيف في أطباق مكونة من 96 عيناً لعزل النسائل الفردية. Yo ل 9011/8 لاكتشاف تكبير منتج قصير من موضع سابق PCR بينت النسائل التي تم فحصها بواسطة على الموضع ”5 وموضع تال على الموضع ”3 حذف القطاع المقحّم. تم إخضاع النسائل أحادية للحصول على نسائل محذوفة ثنائية الأليل. تم TALEN الأليل المحذوفة لدورة ثانية من الحذف بفعل من الشظية المحذوفة. بلغ ual التعرف على النسائل التي بها حذف ثنائي الأليل باكتشاف غيابEA by flow cytometry after GFP positive cells were sorted (10028, VCA-1005). Cells were cultured by limiting dilution in dishes of 96 samples to isolate individual clones. Yo for 9011/8 to detect amplification of a short product from a previous locus PCR showed the clones examined by at position 5 and a subsequent locus at position 3 Delete the interpolated sector. Monoclonal clones were subjected to obtain bi-allelic deleted clones. The deleted allele was TALEN to a second round of deletion by the action of the deleted fragment. The ual report on the identification of clones that have a bi-allelic deletion by detecting its absence
DNA اهتضام 235. Southem أليل. تم التحقق من الحذف بتبقيع ٠٠ تكرار الحذف تقريباً واحداً في Yo قبل الموضع gDNA من Ss) 561-50 probe jl ويتم تهجين ¢Bmtl الجينومي باستخدامDNA digestion 235. Southem allele. The deletion was verified by spotting approximately one 00 deletion repeats in the Yo before the gDNA locus of the Ss 561-50 probe jl and hybridizing with the ¢Bmtl genome using
CARCAR
CapCap
5°( إلى شظية 3,76 كيلو قاعدة من الأليل غير المعالج وشظية AQ كيلو قاعدة من أليل-50.4م5°) to a 3.76 kbp fragment of the untreated allele and an AQ fragment of the −50.4 kbp allele
4 المحذوف.4 deleted.
1-005 والتبقيع المناعي1-005 and immunoblotting
تم RNA (ie بأعمدة (Qiagen, 74106) RNeasy النسخ العكسي باستخدام مجموعة أدوات iQ SYBR Green باستخدام qPCR (Bio-Rad, 170-8890) cDNA لتخليق iScript ©RNA (ie) with RNeasy columns (Qiagen, 74106) was reverse transcribed using the iQ SYBR Green kit using qPCR (Bio-Rad, 170-8890) cDNA for iScript synthesis ©
(Bio-Rad, 170-8890)Supermix والتبقيع المناعي على النحو المبين L(Y) بالنسبة لجينات(Bio-Rad, 170-8890) Supermix and immunoblotting as indicated by L(Y) for genes
التكتل ١١-جلوبين الفأري يتعرف زوج بادئات مشترك على جلوبينات ١“ البالغة من النوعين VYMouse Cluster 11-globin A shared primer pair recognizes adult 1” globins of both types VY
و١١ بينما تتعرف بادئات مستقلة على جلوبينات ١١“ من النوعين 13H 5 ey تم استخدام الأجسامand 11, while independent primers recognize 11” globins of the two types 13H 5 ey antibodies were used
Santa Cruz, ) GAPDH (Abcam, ab19487) 58011178 : المضادة التالية للتبقيع المناعي .)50-25778 ٠Santa Cruz, ) GAPDH (Abcam, ab19487) 58011178: antibody following immunostaining (0-25778-50).
النتائجresults
أدت دراسات الربط الشاملة للجينوم (GWAS) إلى التأكد من البدائل الجينية المتتوعة المرتبطةGenome-wide association studies (GWAS) confirmed associated variant genetic variants
بالسمات؛ والتي كثيراً ما يكون موقعها في DNA التتظيمي. ولقد خضعت النظرية القائلة بأن التباينby attributes; Which is often located in the regulatory DNA. I have undergone the theory that variance
التتظيمي يمكن أن يفسر القابلية للوراثة بدرجة كبيرة لتقييم تجريبي ضئيل. هنا يظهر المخترعون أن Ls Vo جينياً شائعاً في BCLITA مرتبط بمستوى الهيموجلوبين الجنيني (HPF) يبين متواليات غيرRegulatory could explain the heritability to a large extent for a sparse empirical evaluation. Here the authors show that Ls Vo, a common gene in BCLITA, is associated with fetal hemoglobin level (HPF) showing sequences that are not
تشفيرية مزينة بصمة كروماتين 335m للكريات الحمراء. يكشف التخطيط المنفّح في DNA التتظيميA cryptogram decorated with a 335m chromatin imprint of erythrocytes. Reveals the refractory layout in regulatory DNA
المفترض عن بديل مشترك قاطع للموتيفة مرتبط بانخفاض ربط عامل النسخ الوراثي؛ تضاؤل التعبيرA hypothesized co-mutant variant associated with decreased transcription factor binding; diminished expression
عن 80111/8,؛ وارتفاع HBF تعمل المتواليات المحيطة في جسم الكائن jas all تطوري نوعيAbout 80111/8,; The high HBF surrounding sequences in the body of the jas all are evolutionary and specific
المرحلة محدد السلالة. وباهندسة الوراثية للجينوم؛ اتضح أن هذا المعزّز مطلوب للتعبير عن BCLITA ٠ الكريات الحمراء إلا أنه لا فائدة له خارج سلالة الكريات الحمراء. توضح هذه النتائج كيفيةStrain-determinant stage. by genetic engineering of the genome; It turns out that this enhancer is required for the expression of BCLITA 0 erythroblasts, but has no benefit outside the erythroid lineage. These results show how
يمكن أن تبرز GWAS البدائل الوظيفية ذات الأثر المتواضع في العناصر السببية الأساسية للتعبيرGWAS can highlight functional alterations that have a modest effect in the underlying causal elements of expression
الجيني السليم. Jay معزّز 801118 المعلّم بواسطة Ladle as GWAS محبِّذاً في اضطراباتproper genetic. Jay Enhanced 801118 Teacher by Ladle as GWAS favored in Disorders
| -جلوبين.| -Globin.
asl كان | 0/85ا6 ناجحاً بشكل هائل في التعرف على آلاف مؤلّفة من الأشكال المتعددة Yo النيوكليوتيدية الأحادية (SNPs) الشائعة المرتبطة بسمات وأمراض البشر. ومع ذلك كان التقدم منasl was | 0/8516 has been tremendously successful in identifying thousands of common Yo single-nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with human traits and diseases. However, progress has been made
CARCAR
الربط الجيني إلى العملية الحيوية السببية في الغالب صعباً. تضم التحديات العدد الضخم من البدائل المتطابقة التي يمكن ربطها بالسمات الفردية (نظراً Baad اتزان الارتباط (LD) الأثر المتواضع لكثير من عمليات ربط البديل بالسمة؛ وموقع الكثير من البدائل المرتبطة في الجينوم غير التشفيري. ولقد أبرزت الدراسات الحديثة لتخطيط الكروماتين على مستوى الجينوم ثراء بدائل GWAS في DNA ile © التتظيمية؛ بشكل يوحي بأن كثيراً من البدائل السببية يمكن أن يؤثر على تتظيم الجينات. ومع ذلك؛ لم تظهر التجارب إلا بضعة أمثلة تؤكد أهمية البدائل أو العناصر السببية. ail كان GWAS لمستوى HOF مدهشاً بشكل خاص. يبرر التباين الجيني عند ثلاثة مواضع فقط (BCL11A 5 (HBS1L-MYB (HBB) نسبة 5٠ 7 من التباين الموروث في مستوى HDF كذلك يتم ربط نفس البدائل بالشدة السريرية في مرض الخلايا المنجلية باعتلالات ]-جلوبين الرئيسية ٠ والتثلاسيمية 8؛ ربما بشكل غير مثير للدهشة لأن Jane HBF رئيسي لهذه الاضطرابات. أكد العمل من معمل المخترع والآخرين أن 801118 عبارة عن منظّم مباشر لمستويات .HbF 8011178 عبارة عن عامل كبت نسخ وراثي يكمن في المعقدات متعددة البروتينات التي تشغل تكتل Gusta الجيني. وبينما يؤدي نقص /80111 التكويني إلى موت الأجنة وضعف تطور الخلايا اللمفية؛ يؤدي العجز الخاص بالكريات الحمراء في /80111 إلى معادلة الكبت التطوري لجينات جلوبين الأجنة ٠ ويكون كافياً لعلاج السمات المتعلقة بالدم والمرضية في مرض الخلايا المنجلية في النماذج الفأرية. لذا ظهر 801116 كهدف علاجي جديد في اضطرابات ]-جلوبين. ويعتبر فهم تبعات ضعف 801118 ضرورياً. لم يتم وصف بدائل التشفير البشرية من 8011178 على الرغم من جهود إعادة تحديد المتواليات واسعة النطاق. وتكمن بدائل 801118 المرتبطة بمستويات HDF في المناطق غير التشفيرية من 806111/8. لمزيد من فهم كيفية تأثير التباين الجيني الشائع على 86111/8؛ ٠ على مستوى (HBF وشدة اضطراب ]|-جلوبين؛ تم اختبار دور البدائل المرتبطة ب HEF بالتفصيل. البدائل المرتبطة بالسمات بالقرب من ely fre الكريات الحمراء تم إجراء العديد من دراسات GWAS بالإضافة إلى التخطيط المنفّح للمتابعة على سمات الكريات الحمراء La) في ذلك الأنماط الظاهرية مثل عدد وحجم الكريات الحمراء؛ تركيز الهيموجلوبين» ومستوى ((HDF للتعرف على SNPs مرتبطة ب 1776 سمة بأهمية تشمل الجينوم P) أقل من-58 Yo 8). يتم الإثراء ب SNPs في المعزّزات ومناطق التشفير مقارنة ب SNPs عشوائية (شكل .)١ كذلك تكمن غالبية SNPs في مكان آخر في الجينوم. تم وصف سمات الكروماتين العامة للخلايا CAR eam المنتتجة للكريات الحمراء البشرية الأولية؛ وأدى ذلك إلى التعرف على مجموعة كبيرة من معزّزاتLinking genetics to a causal biological process is often difficult. Challenges include the large number of identical substitutions that can be associated with individual traits (due to Baad linkage balance (LD) the modest effect of many variant associations with the trait; and the location of many associated substitutions in the non-coding genome. Recent studies of chromatin mapping have highlighted Genome-wide richness of GWAS substitutions in regulatory DNA ile © suggesting that many causal substitutions can affect gene regulation However, experiments showed only a few examples confirming the importance of substitutions or causal elements. The GWAS for the HOF level is particularly striking. Genetic variance at only three loci (5 BCL11A (HBS1L-MYB) (HBB) accounts for 50 7 of the heritable variance in HDF). The same variants are also associated with clinical severity in Sickle cell disease with major [0]-globinopathies and thalassemia 8; perhaps unsurprisingly because Jane HBF is central to these disorders.Work from the lab of the inventor and others has confirmed that 801118 is a direct regulator of HbF levels. 8011178 is a suppressing agent Genetic transcription resides in the multiprotein complexes that operate the cluster Gusta c Yeni. Whereas a synthetic /80111 deficiency leads to embryonic death and impaired lymphocyte development; The erythrocyte-specific deficit in /80111 offsets developmental repression of fetal globin 0 genes and is sufficient to treat the haematological and pathological features of sickle cell disease in mouse models. Therefore, 801116 has emerged as a new therapeutic target in [-]-globin disorders. Understanding the implications of the 801118 vulnerability is essential. Human coding variants of 8011178 have not been described despite extensive re-sequencing efforts. The variants of 801118 associated with HDF levels lie in the non-coding regions of 806111/8. To further understand how common genetic variation affects 86111/8; 0 (HBF level and severity of [|-globin disorder]; the role of HEF-associated substitutions was tested in detail. Trait-associated substitutions near ely fre erythrocytes Several GWAS studies have been performed in addition to flair planning To continue on the characteristics of erythrocytes (La) including phenotypes such as the number and size of erythrocytes; Hemoglobin concentration” and level ((HDF to identify SNPs associated with 1776 traits of interest including the genome P) less than -58 Yo 8). SNPs are enriched in enhancers and coding regions compared to random SNPs (Fig. 1). The majority of SNPs also reside elsewhere in the genome. General chromatin features of CAR eam cells that produce primary human erythrocytes are described; This led to the identification of a wide range of enhancers
DNase الكريات الحمراء البعيدة التي يتم التعرف عليها بتعديلات هيستون المميّزة وفرط الحساسية ل غير SNPs الكريات الحمراء بالمعزّزات مقارنة ب GWAS SNPS لوحظ تكون قوي لمستعمرات مرتبطة بسمات الكريات الحمراء» 581058 الموجودة على مصفوفة تحديد أنماط جينية شائعة» أو المرتبطة بسمات الكريات الحمراء بشكل SNPS المبدّلة عشوائياً. سقطت نسبة 71,5 من SNPs © مباشر في معزّزات الكريات الحمراء؛ بإثراء يبلغ lanza VY, مقارنة بالمعززات المبدّلة عشوائياً P) J من ))4-٠١ * ١ مقارنة بنسبة 71,4 من SNPS غير المرتبطة بسمات الكريات الحمراء؛ والتي Jia إثراء بنسبة 1,4 ضعفاً =P) 017 0,0( ولقد وجد أن الكثير من SNPs في تقارب وثيق مع معززات الكريات الحمراء (شكل ١ ب). كانت المسافة المتوسطة إلى معزّز الكريات الحمراء عبارة عن 47,1 7786 المرتبطة بسمات الكريات الحمراء» مقارنة ب SNPs ل (kb) كيلو قاعدة ١,6 0٠ غير المرتبطة بسمات الكريات الحمراء؛ الخاصة SNPs و87,4؛ كيلو قاعدة على الترتيب ل بمصفوفة تحديد النمط الجيني؛ والمبدّلة عشوائياً.تبين هذه النتائج أن جزءاً كبيراً من البدائل الشائعة المرتبطة بسمات الكريات الحمراء يكمن في أو بالقرب من معززات الكريات الحمراء» وتتفق مع النظرية القائلة بأن البدائل السببية تؤثر غالباً في التنتظيم الجيني المعتمد على السياق. Vo علامة 610/85 HBF على Laas معزّز الكريات الحمراء تم إجراء ستة GWAS على مستوى HOF (أو عدد FADIA متوافقة السمات بدرجة كبيرة)؛ بما في ذلك مجموعات من أصل أوروبي» أفريقي» وآسيوي. تعرف كل منها على البدائل المرتبطة بالسمات في 8061-118. يتم تقييم التباين في 8011178 لتفسير -715 من تباين السمات. تم التعرف على أربعة SNPs مختلفة باعتبارها مرتبطة بأعلى درجة ممكنة بالسمة (51427407؛ ٠ التي يطلق عليها "الخافرة” في SNPs تتكتل ¢rs766432 5 54671393 511886868 ٠ أ). يبدو أن الأنماط الفردية Y كيلو قاعدة من بعضها البعض في الإنترون ¥ من 8061118 (شكل فردي. ولقد تم ربط خمسين SNP مقارنة بأي HBF خافرة تفسر بشكل أفضل ربط SNPs التي تضمDNase Distant Erythrocytes Recognized by Characteristic Histone Modifications and Hypersensitivity to Non-SNPs Erythrocytes with Enhancers Compared to GWAS SNPS Strong Colony Formation Associated with Erythrocyte Traits was observed. or associated with erythrocyte traits in the form of randomly altered SNPS. 71.5 of the direct SNPs fell into the erythrocyte enhancers; with an enrichment of lanza VY, compared to randomly shifted reinforcers (P)J of 4-01*1 compared to 71.4 SNPS unrelated to erythroid traits; which Jia had a 1.4-fold enrichment (P = 0.017 017) and many of the SNPs were found to be in close affinity to the erythrocyte enhancer (Fig. 1b). The mean distance to the erythrocyte enhancer was There are 47.1 7786 erythroid-associated traits” compared to the SNPs of (kb) 1.6 00 unassociated erythrocyte trait-specific SNPs and 87.4 kb, respectively. These results show that a large part of the common variants associated with erythrocyte traits lie in or near erythrocyte enhancers, and are consistent with the theory that causal variants often influence gene-dependent regulation. Context. Vo sign 610/85 HBF on Laas Erythrocyte Enhancer Six GWAS were performed at the HOF level (or FADIA number of highly compatible traits); including groups of European ancestry “African” and Asian Each identified variants associated with the trait in 8061-118 Variation in 8011178 is assessed to explain -715 of the trait variance Four different SNPs were identified as being associated with the highest degree of AD character machine (51427407; 0 so-called 'sentinel' SNPs cluster ¢rs766432 5 54671393 511886868 0a. The Y haplotypes appear to be 1 k base from each other in the ¥ intron of 8061118 (a haplotype). The binding of fifty SNPs compared to any sentinel HBF better explains the binding of SNPs comprising
HOF ضمن إنترون ؟ بمستوى SNPS من 50005 في الموضع 801118 وسبعة وعشرين من (AY Xo من JETP) بأهمية تضم الجينوم بالكامل على الأقل YO تمت مقارنة توزيع SNPs المرتبطة ب HPF في 8011178 مع الحساسية ل | «DNase وهي مؤشر على حالة الكروماتين التي توحي بقدرة تتظيمية. في الخلايا المنتجة للكريات الحمراء البشرية؛ لوحظت CARHOF within an intron? With a level of 50005 SNPS at position 801118 and twenty-seven (AY Xo from JETP) of significance encompassing at least the whole genome YO the distribution of HPF-associated SNPs in 8011178 was compared with the sensitivity to | DNase is an indicator of the state of chromatin that suggests regulatory capacity. in human erythrocyte-producing cells; CAR observed
“yer بجوار وبشكل متراكب مع البدائل المرتبطة oF في الإنترون DNase | ثلاث قمم من فرط الحساسية ل 62+؛ (DHSs) DNase | والتي يطلق عليها مواضع فرط الحساسية ل (AY (شكل HOF ب يظهر المخ والخلايا اللمفية .BCL1IA 12155 و55+ على أساس المسافة بالكيلو قاعدة من +58 ولا يعبران عن oT /80111؛ والخلايا اللمفية le وهما نسيجان يعبران عن مستويات 8 بندرة (BCL11A في الموضع DNase | بدرجة كبيرة» عن أنماط فريدة من الحساسية ل 801118 ٠ المرتبطة بالسمات (شكل ؟ أ). SNPs المتراكبة مع DNase ١ في الحساسية ل تم تحليل بصمة الكروماتين حول موقع /80111 بشكل أكبر بواسطة الترسيب المناعي للكروماتين من المواد المنتجة للكريات ChIP-seq مع تحديد متواليات مواز بشكل هائل (0510-560). كشف المرتبطة بالسمة في SNPS الحمراء البشرية الأولية عن تعديلات هيستون ببصمة معزّز متراكبة مع العلامتين les H3K27ac و H3KAmel الإنترون ؟ من 80111/8؛ بما في ذلك وجود Vo 6787781 أ). وتشغل عوامل نسخ الكريات الحمراء الرئيسية ١ 63و 13/627003 (شكل أظهرت تجارب 6010-9068 ثلاث قمم متمايزة لربط (TY منطقة المعزز هذه (شكل TALL“yer is adjacent to and overlapping with oF-linked substituents in the DNase intron | Three Peaks of Hypersensitivity to 62+ (DHSs) DNase | which are termed loci of hypersensitivity to AY (HOF fig. b). Brain and lymphocytes are shown. BCL1IA 12155 and 55+ based on a kbase distance of 58+ do not express oT/80111; cells le lymphocytes, two tissues expressing levels of 8 ligands (BCL11A in situ DNase | significantly) showed unique patterns of susceptibility to 8011180-associated traits (Fig. ?a). SNPs overlapping with DNase 1 sensitivity to chromatin imprinting around the /80111 site was further analyzed by chromatin immunoprecipitation of hemocyte ChIP-seq with massively parallel sequence identification (0510-560). in primary human erythroid SNPS report histone modifications with an enhancer imprint overlaid with the les H3K27ac and H3KAmel tags in intron ?of 80111/8; including the presence of Vo 6787781a). 1 63 and 627003/13 (Fig. 6010-9068) Experiments showed three distinct peaks of TY binding of this enhancer region (Fig. TALL).
DHS في الإنترون ¥ من 861118 حيث يسقط كل منها في كرية حمراء TALL 1 (شكل ؟ ب). السمات المشتركة للعناصر التتظيمية البعيدة في التفاعل طويل المدى مع المعزّزات التي gaa) تتمتل Vo كيلو قاعدة من You تنظم التعبير عنها. تم تقييم التفاعلات بين المعزّز 8011178 والشظايا عبر بما في ذلك المتواليات قبل؛ بعدء وداخل الجينات. لوحظ أكبر تفاعل معزّز في BCL1IA موضع المرتبطة بالسمات (شكل ¥ ج). SNPs منطقة الإنترون ؟ المحتوية على 0115 الكريات الحمراء و تبين هذه النتائج أن لهذه المتواليات قدرة تتظيمية. البدائل التتظيمية ٠ السببية المرتبطة بالسمات يمكن أن تعمل بتعديل عناصر سيس 5005 of كان من المقترض 01155 في SNPs التتظيمية الحاسمة. لذا تم إجراء تحديد الأنماط الجينية على نطاق واسع ل في الدراسة التعاونية DNA من عينات ١767 و55+ في «+58 +62 LDU الكريات الحمراء بمجموعة من الأفارقة الأمريكان المصابين بمرض الخلايا ((CSSCD) لمرض الخلايا المنجلية لديهم. تم التعرف على 17 من بدائل HOF الجينومي لهم ومعروف مستويات DNA المنجلية متاح YoDHS in intron ¥ of 861118 where each falls into erythrocyte TALL 1 (Fig. You regulate its expression. Interactions between Enhancer 8011178 and fragments were evaluated via, including sequences, before; beyond and within genes. The largest enhanced interaction was observed at the BCL1IA locus associated with traits (Fig. ¥c). SNPs intron region ? Containing 0115 erythrocytes, these results show that these sequences have regulatory potential. Regulatory substitutions 0 causal associated with the trait can act by modifying cis 5005 elements of Borrower 01155 in the critical regulatory SNPs. Therefore, large-scale genotyping was performed in the Collaborative DNA Study of 1767 samples of 1767 and 55+ in 58+62 LDU erythrocytes from a cohort of African Americans with squamous cell disease (CSSCD). have sickle cell disease 17 genomic HOF variants have been identified and their sickle cell DNA levels are known Available Yo
CAR yay ¢ YRICCEU الثلاثة من 005110 من المجموعات المرجعية DHSS الموجودة في DNA متواليات CSSCD فرداً من AA ل Sanger في مشروع الألف جينوم؛ وبتحديد المتواليات بطريقة ASWCAR yay ¢ YRICCEU The three of the 005110 DHSS reference groups found in the DNA sequences of the CSSCD individual from Sanger's AA at the Thousand Genomes Project; And by specifying the sequences using the ASW method
VA علامة في تصميم اختبار النمط الجيني وكان YT أخفقت (HBF يعانون من نمط ظاهري شديد ل متعددة SNPS فرداً و١7 من VIVA و7). بعد التحكم في الجودة؛ بقي ١ أحاديي الشكل (جدولي أكبر minor allele frequency (MAF) ( الأشكال لاختبار الربط. كشف تحليل البدائل الشائعة © *» 1,13 =P) HOF كان له أقوى ارتباط بمستوى DHS +62 عن أن 51427407 في )7١ من .)١ جدول ؛0-٠ في الموضع HDF للتخطيط المنفّح لإشارة الارتباط مع CSSCD في السابق؛ استخدم المخترعون في الدراسة» كان 51427407 مقدّراً. تم أيضاً ersd671393 80118وسجلوا أقوى ارتباط ب الدراسات المسبقة 3 rS11886868 5 5766432 الإضافية» SNPs التعرف على اثنين من ٠ وفي (FDA (أو عدد HDF الخافرة التي ترتبط بأعلى درجة ممكنة بمستوى SNPs باعتبارهما من الخافرة الأربعة لهم SNPs مجموعة فرعية من الأفراد ( اا 778) كانت الأنماط الجينية عند كل الارتباط ذات بال عند dam معروفة؛ عند التهيئة على الأنماط الجينية عند 51427407 لم تكن بقي الارتباط عالياً بدرجة كبيرة «Sally; أو 1511886868؛ crs766432 «rsd671393 ل 51427407 عند التهيئة على 54671393 5766432 أو 511886868 (جدول 9). لذا Vo في 0115 الكريات الحمراء ويفسر بشكل HBF الأكثر ارتباطاً SNP فإن 151427407 يمثل الخافرة الأخرى المبينة في السابق. SNPs أفضل الارتباط بالسمات مقارنة ب ضمن 01155 الثلاثة HBF وجدت الارتباطات الأخرى بمستوى «rs1427407 عند تهيئتها على كان الارتباط الباقي الأكثر دلالة إحصائية 176061733 في .)١ التي لم يتم فقدها بالكامل (جدول التي تم الابلاغ عنها coA+ DHS كان 57599486 في ؛)٠١-٠١ x 0,3) =P) 58+ 0015 | ٠ في هذا التحليل الشرطي. بعد تهيئة كل )1-٠١ XV, YY) = P) مسبقًاء دلالة إحصائية أقل قليلاً فقط ضبط .)١ دلالة إحصائية (جدول SNPs من 151427407 و 157606173 لم يعد لأي من hs بعدد 8505 فرد المتوفر بيانات النمط principal components (PCs) المكونات الأساسية ذو جينومات واسعة النطاق لهم للأخذ في الاعتبار المزيج الدوائي والمواد المدمجة الأخرى التي أدت rs1427407-rs7606173 يتم توضيح البيانات). تم تحديد النمط الأحادي ل ol) إلى نتائج مشابهة YOVA was a marker in genotype test design and YT was a failure (HBF severely phenotyped for multiple SNPS individuals, 17 of VIVA and 7). after quality control; Remaining 1 monomorphic (larger tabular minor allele frequency (MAF) (forms for association test. Common Substitution Analysis revealed © *” = 1,13) HOF had the strongest association with DHS level +62 reports that 51427407 is in (71 of .1) table 0-0; in position HDF of the Recombinant Signal Layout with CSSCD previously; The inventors used in the study” was an estimated 51,427,407. ersd671393 80118 also reported the strongest association with prior studies 3 rS11886868 5 5766432 Additional SNPs were identified from 0 in the FDA (or sentinel HDF number) that correlate most highly with a level. SNPs as two of their four sentinel SNPs subset of individuals (AA 778) genotypes at each linkage of significance at dam were known; when initialized on genotypes at 51427407 the association was not still high significantly “Sally; or 1511886868; crs766432” rsd671393 for 51427407 when initialized to 54671393 5766432 or 511886868 (Table 9). So Vo in 0115 erythrocytes is interpreted as the most closely related HBF SNP, so 157142740 represents The other sentinel SNPs shown above were the best associated with traits compared to within 01155 of the three HBFs found. Other associations were found at the level of “rs1427407 when configured to. The most significant remaining association was 176061733 in 1.” that were not completely lost (coA+ DHS reported table was 57599486 in 01-01 x 0,3) =P) 58+ 0015 | 0 in this conditional analysis. After initializing all (1-01 XV, YY) = P) beforehand, statistical significance was only slightly lower (setting 1). Individual available pattern data Principal components (PCs) with extensive genomes for them to account for combination drug and other combined substances triggering rs1427407-rs7606173 (data shown). The monotype of ol) yielded similar results to YO
HBF على أنه ذاك المرتبط بشدة بمستوى 1-6HBF is defined as that strongly associated with a level of 1-6
CARCAR
س١ تم أيضنًا تحليل الصور المتغايرة النادرة ومنخفضة التردد MAF) > 75) للكشف عن ارتباطها بمستوى HbFs باستخدام كل من 00155 الثلاثة +217 (OA+ و +00 كمجموعة اختبار. وجدت اثثنتين من المجموعات أنهما ذات دلالة إحصائية»؛ أي DHS +67 و0115 +55,؛ لكن بعد تهيئة (rs7606173 5 rs1427407 لم تعد النتائج ذات دلالة إحصائية؛ مما يشير إلى LD ضعيف بين © الصور المتغايرة النادرة/ منخفضة التردد 5 SNPs المشتركة (جدول 4 ). بالتالي؛ لا يوجد دليل على وجود الصور المتغايرة المتسلسلة النادرة ومنخفضة التردد ضمن 01155 /80111 التي sisi على مستوى HbFs في المرضى بلا50 ؛ على الرغم من إعادة ترتيب Sanger لعدد AA فرد من CSSCD مصابين بالنوع الظاهري HOF المفرط. يقع 51427407 SNP ضمن ذروة ارتباط 67/81 و1811 كما هو محدد بواسطة -0510 ٠ 580 0010-0065 (الأشكال (Ys IY يمزق T-allele الثانوي G-nucleotide لعنصر متسلسل يشابه بشدة تتابع نتظيمي مركب لنصف 5-50«/6/81/8 aay .[CTG(N9)GATA] هذا التتابع التتظيمي أنه غني للغاية بمعقدات 687781 و1811 في LDA الكريات الحمراء بواسطة تجارب .ChlP-seq تم تحديد عينات الكريات الحمراء الأولية من فرد متباين الزيجوت allele Gl الرئيسي 5 T-allele الثانوي عند 151427407 وتم تعريض هذه العينات ChIP يتبع ذلك إحداث V0 تسلسل حسب التخليق. حدد المخترعون توازن متساوي من مركبات الأليل allele في DNA المُدخل. على الرغم من ذلك تمت ملاحظة الارتباط الأكثر تكرارًا ب allele=G مقارنة ب1-أليل الذي يساوي yy 40:75 في كل من عينات الكروماتين المرسبة مناعيًا GATAL J و1811 (الشكل (Iv تم من قبل الابلاغ عن أن allele-A المرتبط HOF, المرتفع ل54671393/ كان مرتبطَا بالتعبير عن 8061118 في سلالات خلايا الأرومات الليمفية البشرية. لم يتمكن المخترعون من sale) إنتاج Yo ارتباط ذي دلالة إحصائية بين النمط الوراثي 861118 ومستوى التعبير الذي يحلل مجموعة أكبر من سلالات خلايا الأرومات الليمفية (لم يتم توضيح البيانات). تم التكهن بأن النمط الأحادي 1s1427407-rs7606173 المرتبط HOF المرتفع يؤثتر على التعبير عن 8611178 في السياق الخاص بالكريات الحمراء. يقع المرادف الشائع ل 57569946 SNP ضمن exon—4 ل/80111 ويمكن أن يعمل كمرقم للتعبير عن الأليل. تم تحديد أن ثلاث عينات أولية من الكريات الحمراء Yo البشرية كانت مزدوجة تباين الزيجوت للنمط الأحادي rs1427407-rsT606173 و157569946. تم تعريض العينات لعملية تحويل إلى نمط أحادي جزيئي بواسطة الدمج في مستحلب PCR CAR yee رئيسي ل 157569946 في allele-G أوضحت عملية التحويل إلى نمط أحادي أنه كان لكل عينة المنخفض. تم تقييم HBF المرتبط /51427407-+57606173 G-C الطور مع النمط الأحادي الجينومي بواسطة إحداث تسلسل حسب التخليق 187569946 لتحديد توازن CDNA 3 DNA الجينومي؛ تمت ملاحظة انعدام التوازن ذي DNA في allele بينما تمت موازنة مركبات .6 المنخفض HOF, الذي يفضل التعبير المتزايد عن 8166-6 المرتبط cDNA الدلالة الإحصائية في ©Q1 Rare variants with low frequency (MAF > 75) were also analyzed for association with HbFs using each of the three 00155 +217 (OA+ and +00) as test groups. Two of the groups were found to be statistically significant.” ie DHS +67 and 0115 +55, but after initialization (rs7606173 5 rs1427407) the results were no longer statistically significant, indicating weak LD among the rare/low frequency 5 shared SNPs (Table 4).Therefore, there is no evidence of rare, low-frequency sequential heterozygotes within 01155/80111 sisi at the level of HbFs in patients sans50, despite Sanger rearrangement of a single AA number of CSSCD 51427407 SNPs fall within peak linkage 67/81 and 1811 as defined by -0510 0 580 0010-0065 (Figs. A nucleotide of a sequence element strongly resembling a 5-50"/6/81/8 aay half-complex regulatory sequence [CTG(N9)GATA]. This regulatory sequence was shown to be highly rich in complexes 687781 and 1811 in LDA erythrocytes by erythrocyte LDA experiments. ChlP-seq eye selected Primary erythrocytes from an individual heterozygous for the Gl major allele 5 T-allele secondary at 151,427,407 were exposed to ChIP followed by V0 sequencing as per synthesis. The inventors specified an equal balance of allele compounds in the inserted DNA. However, a more frequent association with allele=G compared with 1-allele of yy equals 40:75 was observed in both GATAL J and 1811 immunoprecipitated chromatin samples (Fig. (Iv) reported reported that the HOF-associated allele-A, elevated l54671393/ was associated with the expression of 8061118 in human lymphoblastoid cell lineages.The inventors (sale) could not produce a statistically significant association between the 861118 genotype and the level of expression that analyzes of a larger group of lymphoblastoid cell lineages (data not shown).It was speculated that the 1s1427407-rs7606173 monotype associated with elevated HOF affects the expression of 8611178 in an erythroid context.The common synonym of the 57569946 SNP falls within exon—4 l/80111 and can act as a marker for allele expression.Three primary samples of human Yo erythrocytes were determined to be double heterozygous for monotype rs1427407-rsT606173 and 157569946.The samples were subjected to conversion to monotype Molecular by incorporation into emulsion PCR CAR yee master for 157569946 in allele-G explained p The process of converting to mono mode was that for each sample it was subscripted. HBF-associated HBF/51427407-+57606173 G-C metaphase with genomic monotype was evaluated by synthetic-sequencing 187569946 to determine the balance of CDNA 3 genomic DNA; A DNA imbalance was observed in the allele while the 6 compounds were counterbalanced by the low HOF, which favors increased expression of the cDNA-bound 8166-6 Statistical significance in ©
HOF 51427407ب المرتبط T-allele تشير هذه النتائج إلى أن (oF (الشكل r$7569946. المرتفع» الذي يمزق نصف التتابع التتظيمي 5-50«*/6/8778؛ يكون مرتبضًا بالارتباط المخفض والتعبير المخفض عن 8061118 في المواد المنتجة للكريات الحمراء. مستوى TALL; GATALL 457 1s1427407- الأساسي في 60 من الأفراد متجانسو الزيجوت ذوي النمط الأحادي HBF من الأفراد متجانسو الزيجوت 7١“ في 74,٠» مقارنة ب# 211,7١ المرتفع كان 87606173 1-6 ٠ )١-١ X Y,0 = P) المنخفض HBF 1s1427407-rs7606173 1-6 ذوي النمط الأحادي اعتيادي لمستوى SNP (الشكل *ج). في المجمل؛ يشير الدليل التالي إلى أن 151427407 يكون له أعلى ارتباط بالنمط الظاهري لأي صورة متغيرة معروفة»؛ يأخذ في الاعتبار الارتباطات التي :HOF تؤثر على التتابع التتظيمي اللازم لارتباط (Blu الخافرة الموصوفة SNPS تمت ملاحظتها مع وتكون متصلة بارتباط 681/1 و1811 بالإضافة إلى مع التعبير عن «TALL; GATAL ١٠ على الرغم من ذلك؛ تكون الصورة المتغايرة عند هذا الموضع في ضبط الأنماط الأحادية .861118 .86111/8 المشتركة مرتبطة بأقل اضطراب فقط في التعبير عن فعالية المحسن للتعبير عن الخلايا الشبيهة بالكريات الحمر الظاهرة المنظمة المرتبطة بالسمات هذه دورهاء تم اكتشاف SNPs لفهم السياق الذي ضمنه تلعب كيلو TE £207, 4) نوظيفة إيواء العناصر المنظمة لسيس. استتتسخ المخترعون -"١-كيلو قاعدة ٠ وقيموا جهد المعزز في (DHSS التي احتوت على ثلاث من الكريات الحمراء (TSS قاعدة من اختبار مرسل التحول الجيني. في هذا الاختبار يتم وضع متواليات المعزز المفترضة قبل محفز ثانوي مرتبط بمتواليات عازلة. تم إدخال البْنىَ إلى الزيجوت الفأري بحيث (18CZ) وجين مرسل (HSP6S) تتم مراقبة التعبير عن الجين المرسل على مدار التطور. أظهر 8011/8 الفأري داخلي المنشاً تعبير فائض على مدار تكوين الجهاز العصبي المركزي مع ملاحظة تعبير أقل بكثير في الكبد الجنيني. Yo على أنه Gia على العكس من ذلك؛ تمت ملاحظة التعبير عن الجين المرسل في الأجنة المتحولةHOF 51427407b associated T-allele These results indicate that the elevated oF (Fig. r$7569946.) that disrupts half of the 5-50 regulatory sequence*/6/8778 is associated with reduced binding and reduced expression. baseline TALL; GATALL 457 1s1427407- 8061118 in erythropoietic subjects reported in 60 homozygous individuals with HBF monosomy 71" in 74.0" compared to #211 The high was 87,606,173 1-6 0 (1-1 X Y,0 = P) and the low was HBF 1s1427407-rs7606173 1-6 with a normal SNP level (Fig. *c). in general; The following evidence indicates that 151427407 has the highest association with the phenotype of any known variant”; Considers associations that: HOF affect the regulatory sequence required for Blu association (the sentinel described SNPS observed with and is related to association with 681/1 and 1811 as well as with the expression of “TALL; GATAL 10” though In addition, the heterochromia at this locus is in control of the common monotypes.861118.86111/8.linked to the least perturbation only in the expression of the enhancer's effectiveness for the expression of erythroid-like cells. SNPs to understand the context within which Kelo TE £207, 4) plays a function harboring cis-regulatory elements. The inventors cloned -"1-k-base 0" and evaluated the enhancer potential in DHSS containing three erythrocytes (TSS base) from a transgenic transmitter test. In this test putative enhancer sequences are placed before a secondary promoter Linked to isolating sequences Constructs were introduced into mouse zygotes with (18CZ) and transmitter gene (HSP6S) Expression of transmitter gene monitored throughout development Endogenous mouse 8011/8 showed excess expression over the course of organ formation central nervous system with much lower expression observed in the fetal liver.
CARCAR
ف -١ مقتصر بشكل كبير على الكبد الجنيني؛ موقع تكوّن الكريات الحمراء المحدد؛ مع ملاحظة تعبير أقل في الجهاز العصبي المركزي (الشكل ؛أ). السمة المميزة لجينات الجلوبين هي التتظيم المتتامي لهم. أثناء النمو البشري؛ بيتا Gusta المشتق من كيس الصفار يتم تعليق في أول ثلاثة أشهر بواسطة Lala جلوبين y —globin المشتق من الكبد © الجنيني liver ا1618. قرب حلول موعد الولادة؛ يتم إغلاق جاما جلوبين Gayot ويصبح بيتا جلوبين globin منشطًا. يوجد فقد تحول مفرد في التعبير عن الجين أثناء نمو الفأر. أثناء هذا التحول؛ الذي يحدث عند منتصف فترة الحمل؛ يعبر تدوير خلايا الكريات الحمراء البدائية المشتقة من كيس الصفار عن جلوبينات المرحلة الجنينية #* و Lan BEE تعبر الأرومات الحمراء المحددة بالكبد الجنيني عن جلوبينات مرحلة البلوغ BL و82. بالتوافق مع هذا التحول المتنامي؛ يتم التعبير عن ٠ 8611180 في سلالة الكريات الحمراء محددة المرحلة وليست بدائية المرحلة. تم اشتقاق السلالات ذات التحول الجيني المستقر من 861118 14,4-207,٠+ الفأرية المرسلة. في هذه الفئران عند تدوير LDA الكريات الحمراء لا يلطخ X-gal بينما تلطخ أرومات الكريات الحمراء بالكبد بشدة بشكل موجب (الشكل ؛ب). عند (E10.5 تمت ملاحظة uel) عن lacZ فقط في بداية الكبد الجنيني وليس في الدورة الدموية للجنين؛ المشيمة؛ أو كيس الصفار (الشكل ١أ). تشير هذه النتائج Vo إلى أن المتواليات المنظمة 8061118 إنترون-؟ المرقمة ب85//ا6 كافية لتحديد التعبير المتتامي المناسب عن الجين. Jala الحجيرة المكونة للدم, يوجد التعبير عن 11/8 BCL في المواد المنتجة للكريات الحُمر والخلايا اللمفاوية-8. تم عزل المواد المنتجة للكريات الحُمر والخلايا اللمفاوية-8 من حيوانات بالغة صغيرة محورة وراثياً وتم تقبيم التعبير عن جين مبلغ 1862 . تم التعبير عن 8011178 داخلي المنشأ عند ٠ - مستويات lef Cae) o,f في الخلايا اللمفاوية-8 الطحالية splenic B-lymphocytes مقارنة بالمواد المنتجة للكريات الحُمر بنخاع العظم. مع ذلك, تم تقييد التعبيير عن 1802 على المواد المنتجة للكريات الحُمر aly تتم ملاحظته في الخلايا اللمفاوية-8 ( الشكل ؛ ج). تشير هذه النتائج إلى تحديد بخلايا شبيهة بالكريات الحمراء لهذه المتواليات التتظيمية. تم توليد سلسلة من طافرات الحذف لتتقيح أدنى العناصر المطلوبة لنشاط محسن شبيه بالكريات © الحمراء. كانت المتواليات التي تحتوي على المركز +58 DHS كافية لنشاط محسن شبيه بالكريات الحمراء. كانت تلك المتواليات التي لا تحتوي سوى على عناصر +67 أو oot المحيطة غير قادرة CARP-1 is highly restricted to the fetal liver; the specific site of erythropoiesis; with less expression observed in the central nervous system (Fig. ;a). The distinguishing feature of globin genes is their complementary organization. during human development; Gusta beta derived from the yolk sac is suspensed in the first trimester by Lala globin y —globin derived from the liver © embryonic liver A1618. near the birth date; Gayot gamma is closed and beta globin becomes activated. There is a single loss of transgene expression during mouse development. during this shift; which occurs in the middle of pregnancy; Circulating yolk sac-derived primitive erythrocytes express embryonic-stage globulins #* and Lan BEE. Fetal liver-specific erythroblasts express adult-stage globins BL and 82. In line with this growing shift; 0 8611180 is expressed in the definite-stage, not prokaryotic, erythroid lineage. Strains with stable genetic transformation were derived from 861 118 14.4-207.0+ transmissible mice. In these mice, when LDA circulated, erythrocytes did not stain with X-gal, while liver erythroblasts stained strongly positively (Fig.;b). At (E10.5 uel) lacZ was observed only in the beginning of the fetal liver and not in the fetal circulation; placenta; or the yolk sac (Figure 1a). These Vo results indicate that the regulatory sequences 8061118 intron-? numbered B85//A6 is sufficient to determine the appropriate complementary expression of the gene. Jala hematopoietic compartment, expression of 11/8 BCL is found in erythropoietic substances and lymphocytes-8. Erythropoietic substances and lymphocytes-8 were isolated from transgenic young adult animals and the expression of the 1862 gene was measured. 8011178 endogenous (0-lef Cae) o,f levels were expressed in splenic B-lymphocytes compared to bone marrow erythropoietic subjects. However, expression of 1802 was restricted to the erythropoietic material (aly) observed in T-8 lymphocytes (Figure;c). These results indicate identification by erythrocyte-like cells of these regulatory sequences. A series of deletion mutants were generated to phosphorylate the minimum elements required for enhanced erythrocyte-like activity. Sequences containing the +58 DHS center were sufficient for enhanced erythrocyte-like activity. Those sequences containing only the surrounding +67 or oot elements were not CAR capable
Nate على توجيه التعبير عن جين شبيه بالكريات الحمراء (الشكل رقم 7ب). تم اختبار 01155 هذه للتأكد من قدرتها على تحسين التعبير الجيني في المواد المنتجة للكريات الحُمر البشرية الرئيسية. استخدم طبقاً لما تم وصفه من قبل. TK بأدنى معزز GFP المخترعون توصيل فيروسة عدسية لنظام مبلغ ولكن ليس +00 أو +67 هي القادرة على تحسين التعبير oA+ DHSs على نحو مماثل, فقط (VY الجيني في تجربة المبلغ المذكورة (الشكل رقم © متطلبات المحسن للتعبير عن الخلايا شبيهة الكريات الحمر 861118 بعد ذلك اختار المخترعون تحديد متطلبات هذه المتواليات التنتظيمية للتعبير المناسب عن في تحديد خواص الكروماتين الكلي المنشور مسبقاً Bell la وجينات الجلوبين. كشف فحص موقع لخلايا شبيهة بالكريات الحمراء أن هذه المنطقة من إنترون-؟ تتسم ببصمة محسن متشابهة عند lalNate directed the expression of an erythrocyte-like gene (Fig. 7b). This 01155 has been tested for its ability to improve gene expression in key human erythropoietic subjects. Use as described previously. TK with minimal GFP enhancer The Inventors Lentivirus delivery to a reported system but not +00 or +67 is able to similarly enhance expression of oA+ DHSs, only (VY Genetic profile in the reported amount experiment (Fig. © Enhancer Requirements for Expression of Erythroid Cells 861118 The inventors then chose to specify the requirements for these regulatory sequences for appropriate expression of the previously published total chromatin properties of the Bell la globin genes An in situ examination of erythrocyte-like cells revealed that this region of the ?intron has an enhancer imprint similar to that of LAL.
H3K27me3 و H3K4me3 وعدم وجود ,H3K2Tac ; H3KAMel الموضع أورثو مع وجود ٠ (الشكل رقم 8). علاوة على ما سبق, تمت ملاحظة شبيهة بالكريات TALL; 67/81 وشغل بواسطة عند هذه المتواليات. عند كل واحدة من الخلايا DNase ١ الحمراء-المحددة بالحساسية المفرطة ل ملاحظة دليل على حفظ cai, 00+ 5 DHSS +62, +58 البشرية الشبيهة بالكريات الحمراء المتوالية التطورية, لاسيما داخل +17 5 +00 لتحديد متطلبات لهذه المتواليات التتظيمية المتشابهة عند الموضع أورثو للتعبير عن 86111/8, تم استخدام سلالة خلية ابيضاض الدم الاحمراري من Vo تعتمد هذه الخلايا على التعبير عن . (mouse erythroleukemia cell line (MEL الفأر لنمط جلوبين التعبير الجيني المناسب في مرحلة البلوغخ. يمكن أن يترتب على إنزيمات 8601118H3K27me3 and H3K4me3 and no H3K2Tac; H3KAMel at the ortho position with a 0 (Fig. 8). In addition to the above, TALL-like globules have been observed; 67/81 and occupied by at these sequences. At each of the DNase 1 erythroid-specified cells with hypersensitivity to note evidence of conservation of cai, 00+ 5 DHSS +62, +58 human erythrocyte-like evolutionary sequences, particularly within +17 5 +00 To determine the requirement for these co-regulatory sequences at the ortho locus for 86111/8 expression, a erythroid leukemia cell line of Vo dependent on expression of . mouse erythroleukemia cell line (MEL) mouse globin pattern of appropriate gene expression in adulthood. It can be induced by enzymes 8601118
TALENS نيوكلياز محددة بالمتوالية إنتاج عمليات حذف صغيرة الكروموزومات. تمت معالجة متشابهة عند 10-kb 801118 بالهندسة الوراثية لإدخال فواصل مزدوجة الجديلة لإحاطة متواليات الموضع أورثو إنترون-؟ تحمل بصمة كروماتين محسن خلايا شبيهة بالكريات الحمراء. تم فحص ٠ ثلاث نسائل فريدة خضعت لاستئصال ثنائي الأليل. تم Jie وتم NHEJ النسائل لإصلاح يتوسط فيه من الاستئصال لقسم متعلق بالإنترون داخل النسائل Southem ولطخة PCR التحقق من خلال مميزة لانشطار يتوسط فيه Sanger (الشكل رقم 3( كانت نقاط الفصل ذات المتوالية طبقاً ل .)٠١ لاحق (الشكل رقم NHEJ بإصلاح TALEN متعلق بالإنترون | 10-45 ثنائي Gada ذات MEL "تم تحليل التعبير عن 8611178 .في خلايا 5 الأليل. تمت ملاحظة تخفيض هائل للتعبير عن 8011178 إلى مستويات -77 من مستويات القيمةTALENS are sequence-specific nucleases that produce small chromosomal deletions. Homologous at 10-kb 801118 was genetically engineered to insert double-stranded spacers to enclose sequences at the locus ortho intron-? The imprint of enhancer chromatin bears erythrocyte-like cells. 0 three unique clones that underwent bi-allelic excision were examined. Jie and NHEJ clones for repair mediated by resection of an intron-related section within the clone Southem and blot PCR verification by Sanger-mediated fission characteristic (Fig. 3) were separating points with the sequence According to NHEJ 01 (Fig. NHEJ repair of intron-related TALEN | 10-45 binary Gada with MEL” expression of .8611178 was analyzed in allele 5 cells. A dramatic reduction was observed. Expresses 8011178 to -77 levels of the value
CARCAR
-١ ل-1 l
الأولية (الشكل رقم #أ). تمت ملاحظة تخفيضات مماثلة مع أزواج بادئة تكشف وصلات الإكسون قبل, بامتداد, أو بعد الحذف. بتلطيخ Western , لم يكن التعبير عن 8011178 قابل للكشف في النسائل ذات 05-٠١ محسن ملغى (الشكل رقم (wo تعبر MEL LDA نمطياً عن مستويات مرتفعة من جينات الجلويين 01 و52 البالغة ومستويات منخفضة من جينات الجلوبين الجنينية sy .PHI, © في عدم وجود محسن »©-٠١ لبروتين 50111/8, تم تخفيض التعبير عن جينات الجلوبين في البالغين بنسبة -09-7-ضعف, بينما تم تخفيض جينات الجلويين الجنينية بدرجة كبيرة. تمت زيادة نسبة sy الجنينية إلى 1/2 من الكبار بواسطة متوسط Canam VRE في ثلاث نسائل تفتقر إلىprimary (Fig. #a). Similar reductions have been observed with indentation pairs that reveal exon splices before, with, or after a deletion. By Western staining, expression of 8011178 was not detectable in clones with 05-01 abolished enhancer (Fig. sy .PHI, © In the absence of the “©-01” enhancer of 50111/8 protein, expression of adult globin genes was reduced by -09-7-fold, while fetal globin genes were significantly reduced. Increase of the fetal sy ratio to 1/2 of the adult by mean Canam VRE in three clones lacking
خلايا متشابهة لمحسن عند الموضع أورثو BCLIIA شبيهة بالكريات الحمراء (الشكل رقم #٠ج). لتحديد ما إذا كانت متواليات +؛ ,60,45 Kb المتعلقة بالإنترون مطلوبة بصورة كلية للتعبير عن ٠ 8611180 , تم تقييم فقدها في سياق من غير خلايا شبيهة بالكريات الحمراء. تم استخدام نفس الاستراتيجية لتقديم زوجين من TALENS للحصول على النسائل ذات حذف يتوسط فيه NHEJ AS50.4-60.4 في سلالة خلية طليعة لخلية لمفاوية-8. تم عزل اثنتين من النسائل الفريدة -850.4/ 60.4 وتم التحقق منها بواسطة PCR , التلطيخ بلطخة 5001078177 , وعمل متواليات Sanger (الأشكال 9 و١٠). على النتقيض من LOA شبيهة بالكريات الحمراء, تم الاحتفاظ بالتعبير عن ١ 861118 في نسائل خلية طليعة 8 ملغاة محسن A50.4-60.4KD عند كل من مستويات RNA والبروتين (الشكلان ا ودب). تشير هذه النتائج إلى أن متواليات المحسن للخلية المتشابهة عند الموضع أورثو الشبيهة بالكريات الحمراء لا تكون مطلوبة لتكامل انتساخ من موضع 801118 ولكنEnhancer-like cells at the ortho-situ BCLIIA erythrocyte-like (Fig. #0c). To determine whether the + sequences; 0,60.45 Kb pertaining to the intron is required entirely for the expression of 0 8611180 , its loss was assessed in a context other than erythrocyte-like cells. The same strategy was used to introduce two pairs of TALENS to obtain clones with an NHEJ-mediated deletion of AS50.4-60.4 in the lymphocyte-8 progenitor cell lineage. Two unique clones -850.4/60.4 were isolated and verified by PCR, staining with blot 5001078177, and Sanger sequencing (Figs. 9 and 10). In contrast to erythrocyte-like LOA, expression of LOA was retained. 1 861118 in clones of pro-8 cells deactivated enhancer A50.4-60.4KD at both RNA and protein levels (Figures A and D). These results indicate that the erythrocyte-like enhancer sequences of the cell-like at the erythrocyte-like ortho locus are not required for transcriptional integration from the 801118 locus, but
تكون ضرورية فقط للتعبير عن جين خلية شبيهة بالكريات الحمر. تم العثور على بصمة كروماتين محسن عند إنترون-؟ ل 80111/8, يغطي مباشرةً SNPs مرتبطة ب ٠ | 405 . تضم المنطقة العديد من السمات الحيوية الكيميائية للمحسنء بما في ذلك الشغل بواسطة الهستون الذي يميز H3K27ac H3KAmMel في عدم وجود 1314407163 لو (H3K2Tme3 وربط TALI TFs GATAL الشبيهة بالكريات الحمرء ومواضع مفرطة الحساسية ل 011856-١ المحددة بالخلايا الشبيهة بالكريات الحمرء وتفاعل المعزز على المدى البعيد بواسطة “ج. علاوة على ما سبق؛ تمكن المخترعون من تعيين خريطة لهذا الموقع؛ باستخدام 01155 كدليل. لتمييز SNP rs Yo 1424707 باعتباره الأعلى ارتباطاً بالسمة؛ ويسفر تماما ارتباط السمة ب SNPS الحارس الموصوف فيما سبق والمرتبطة بدرجة عالية. بالإضافة إلى ما سبق؛ تبين في الطلب الحالي أن 1427407 rs CAR yA و1811 .في المواد المنتجة GATAL بعوامل الانتساخ GATA يعطل محفز نصف-5- مربع/ عديدة SNPs للكريات الحُمر. مع ذلك, حتى بعد التكيف على 51427407 يظل الارتباط مع أخرى في 01155 متجاورة مما يشير إلى تأثير نمط فرداني. وتبين أن الأنماط الفردانية التي تتسم في العناصر المتجاورة أن كل وظيفة تتظيمية معدلة تتعاون لتعطي SNP بتوليفة من أنماط جينية النمط الظاهري الكلي للتعبير عن 86111/8. باستخدام متبرعين متغايري الزيجوت؛ تبين وجود تأثير © .86111/8 والتعبير عن TF عالي على كل من ارتباط HBF متواضع للنمط الفرداني المرتبط ب تساعد هذه الدراسات في تقييم التغيير في التعبير عن /80111 المطلوب ليترتب عليه زيادة ذات الفرق في التعبير عن pm uss في مرضى ذوي اضطرابات HDF دلالة إكلينيكياً في مستوىThey are only necessary for the expression of an erythroid-like cell gene. An enhancer chromatin imprint is found at an intron-? For 80111/8, it directly covers SNPs associated with 0 | 405. The region harbors several biochemical features of the enhancer including occupancy by histones that characterize H3K27ac H3KAmMel in the absence of 1314407163 lo (H3K2Tme3), binding of erythroid-like GATAL TFs, and loci hypersensitive to 011856-1 specific to cell-like cells. with erythropoiesis and long-term enhancer interaction by J. In addition to the above, the inventors were able to map this locus, using 01155 as a guide, to identify SNP rs Yo 1424707 as having the highest association with the trait; fully yielding association for the trait with SNPS The above-described and highly associated guard In addition to the above, it was found in the present application that 1427407 rs CAR yA and 1811 in GATAL progenitors with GATA transcription factors inactivate the half-5-square/stimulus However, even after adaptation to 51427407, association remains with other erythroid SNPs in contiguous 01155 points to a haplotype effect. Haplotypes characterized in contiguous elements show that each modified regulatory function cooperates to give SNP with a combination of genotypes the overall phenotype of expression of 86111/8. using heterozygous donors; An effect of ©.86111/8 and high TF expression were shown to be associated with both modest HBF-associated haplotype These studies help evaluate the change in expression of /80111 that is required to result in a similarly differential increase in Expression of pm uss in patients with HDF disorders is clinically significant in level
HbF و6-6 57606173 T-G illal-HbF rsl427407- بين الأنماط الفردانية BCL11A ) و6©-6 كان 711,7 و74,1 T-G من متغاير الزيجوت HBF المنخفضة 7,١-ضعف ومستوى ٠ النتائج العكسية ل 500. من 770> HBF تم توقع أن تمنع مستويات (2 V5 oF الشكلان هذا. HBF أضعاف هدف sae المحتمل أن يقترب التخفيض في التعبير عن 8011178 من تحدد هذه الدراسة التباين التتظيمي عند 801117 الذي يؤثر على محسن خلايا شبيهة بالكريات المرتبطة بالسمة مشفرة وتتسم بحجم تأثير صغير نسبيا. ونتيجة SNPS الحمر. ولا يكون الكثير من هذه ذات أهمية إكلينيكية طفيفة. وتوضح هذه الدراسة أن SNPs ا لهذه السمات؛ أحيانا يتم اعتبار حجم تأثير صغير تم توليده بواسطة فرد غير مشفر لصورة مغايرة لا يحول دون حجم تأثير كبيرHbF and 6-6 57606173 T-G illal-HbF rsl427407- among haplotypes (BCL11A) and 6©-6 were 711.7 and 74.1 T-G heterozygotes of 7.1-fold low HBF and level 0. Reverse results for 500. Of the >770 HBF levels (2 V5 oF) were predicted to prevent this. HBF fold sae target likely approximates reduction in expression of 8011178 from this study identifies Regulatory variation at 801117 that affects the enhancer of globulin cells associated with a coded trait and has a relatively small effect size. As a result of erythrocyte SNPS. Many of these are of slight clinical significance. This study demonstrates that SNPs for these traits are Sometimes a small effect size generated by a non-coding individual is considered to be a variant that does not preclude a large effect size.
SNPs للعنصر التتظيمي الضمني. على سبيل المثال؛ على الرغم من التأثير الضعيف نسيياً ل وظيفي على التعبير عن 8011178 المستهدف للجين الضمني؛ تكون العناصر التتظيمية السببية أساسية للتعبي عن جينات 801117 والجلوبين في مواد منتجة للخلايا الشبيهة بالكريات الحمر في مرحلة البلوخ. ولا يمكن الاستغناء عن نفس العنصر التتظيمي للتعبير عن 8011178 في سلالات Yo غير شبيهة بالكريات الحمر. يتمتل الهدف من دراسة الألائل الواقية في فهم الآليات الجزيئية الضمنية في مجهود لانتساخ هذا التأثير الحيوي في الأفراد المعرضين للخطر. وبالتالي؛ تبقى الكثير من الصور المتعددة الشكل البلوري المرتبطة بالسمة في العناصر التنتظيمية الهامة المحددة بالسياق والتي يمكن أن تكمن وظيفتها في توضيح البيولوجيا الضمنية بصورة إضافية للسمة التي تتجاوز مجرد تمييز الجين المنتظم. على سبيل المثال, في حين يترتب على فقد 801117 تحويل ضعيف للهيموجلوبين Yo تكوين ضعيف للأوعية وتكوين للأوعية اللمفاوية ويترتب إهلاك جنيني. في النهاية يمكن أن يميزSNPs of the implicit regulatory element. For example; Despite the relatively weak effect of functional on the expression of the 8011178 target of the underlying gene; The causal regulators are essential for the expression of the 801117 genes and globin in erythropoiesis-producing substances in the baloch stage. The same regulatory element is indispensable for the expression of 8011178 in non-erythroid Yo strains. The goal of studying protective alleles is to understand the molecular mechanisms underlying the effort to replicate this biological effect in susceptible individuals. And therefore; Many of the polymorphic forms associated with the trait remain in important, context-specific regulatory elements whose function may lie in further elucidating the underlying biology of the trait beyond simply identifying an upregulated gene. For example, while loss of 801117 poor conversion of hemoglobin Yo results in poor angiogenesis, lymphangiogenesis, and fetal lethality. Finally, he can distinguish
CARCAR
_ \ ٠ q —_ الفهم الأفضل للعناصر التتظيمية المسببة والشبكات التتظيمية المرتبطة سمات ضمنية للأهداف العلاجية الجديدة. يمكن أن يشكل محسن شبيه بالكريات الحمر ل 801118 ذاته هدف محبذ للجينوم العلاجي المحرر في أن الاجتثاث يمكن أن يعوق التعبير عن 8611178 في المواد المنتجة لخلايا ناتج بينما تتم المحافظة على التعبير عن 801118 في HDF شبيهة بالكريات الحمر مع تخفيض سلالات من غير الخلايا الشبيهة بالكريات الحمر. © المراجع 1. .ا Fugger, 6. McVean, J. I. Bell, N. Engl. J. Med. 367, 2370-2371 (2012). 2. J. Emst et al., Nature. 473, 43-49 (2011). 3. D. 5. Paul et al., PLoS Genet. 7, el002139 (2011). Yo 4. M. T. Maurano et al., Science. 337, 1190-1195 (2012). 5. P. van der Harst et al., Nature. 492, 369-375 (2012). 6. ENCODE Project Consortium et al., Nature. 489, 57-74 (2012). 7. S. Menzel et al., Nat. Genet. 39, 1197-1199 (2007). 8. M. Uda et al., Proc. Natl. Acad. Sci. .ل 5. A. 105, 1620-1625 (2008). ٠ 9. 6. Lettre et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. 5. A. 105, 11869-11874 (2008). 10. M. Nuinoon et al., Hum. Genet. 127, 303-314 (2010). 11. N. Solovieffetal., Blood. 115, 1815-1822 (2010). 12. ©. Bhatnagar et al., J. Hum. Genet. 56, 316-323 (2011). ٠ 13. V. G. Sankaran et al., Science. 322, 1839-1842 (2008)._ \ 0 q —_ A better understanding of causative regulatory elements and associated regulatory networks are implicit features of novel therapeutic targets. The erythroid-like enhancer of 801118 itself could constitute a favored target for therapeutic genome editing in that ablation could suppress the expression of 8611178 in outcome cell progenitors, while the expression of 801118 in erythroid-like HDF was maintained with reduced Strains other than erythroid cells. © References 1. A. Fugger, 6. McVean, J.I. Bell, N. Engl. J.Med. 367, 2370-2371 (2012). 2. J. Emst et al., Nature. 473, 43-49 (2011). 3. D. 5. Paul et al., PLoS Genet. 7, el002139 (2011). Yo 4. M.T. Maurano et al., Science. 337, 1190-1195 (2012). 5. P. van der Harst et al., Nature. 492, 369-375 (2012). 6. ENCODE Project Consortium et al., Nature. 489, 57-74 (2012). 7. S. Menzel et al., Nat. Genet. 39, 1197-1199 (2007). 8. M. Uda et al., Proc. Natl. Acad. Sci. L 5. A. 105, 1620-1625 (2008). 09. 6. Lettre et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. 5. A. 105, 11869-11874 (2008). 10. M. Nuinoon et al., Hum. Genet. 127, 303-314 (2010). 11. N. Solovieffetal., Blood. 115, 1815-1822 (2010). 12. ©. Bhatnagar et al., J. Hum. Genet. 56, 316-323 (2011). 0 13. V. G. Sankaran et al., Science. 322, 1839-1842 (2008).
OY AYOY AY
Ny 14. J. Xu et al., Genes Dev. 24, 783-798 (2010). 15. J. Xu et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 110, 6518-6523 (2013). 16. V. 6. Sankaran et al., Nature. 460, 1093-1097 (2009). 17. J. Xu et al., Science. 334, 993-996 (2011). 18. F. Esteghamat et al., Blood. 121, 2553-2562 (2013). © 19. ©. Liu et al., Nat. Immunol. 4, 525-532 (2003). 20. Y. Yu et al., J. Exp. Med. 209, 2467-2483 (2012). 21. M. D. Farber, M. Koshy, T. R. Kinney, J. Chronic Dis. 38, 495-505 (1985). 22. E. Soler et al., Genes Dev. 24, 277-289 (2010). ٠ 23. M. T. Kassouf et al., Genome Res. 20, 1064-1083 (2010). 24. D. J. Tumer, M. E. Hurles, Nat. Protoc. 4, 1771-1783 (2009). 25. J. Tyson, J. A. Armour, BMC Genomics. 13, 693-2164-13-693 (2012). 26. M. Leid et al., Gene Expr. Patterns. 4, 733-739 (2004). yo 27. M. S. Kowalczyk et al., Mol. Cell. 45, 447-458 (2012). 28. H. J. Lee, E. Kim, J. 5. Kim, Genome Res. 20, 81-89 (2010). 29. D. E. Bauer, S. C. Kamran, S. H. Orkin, Blood. 120, 2945-2953 (2012). 30. A. John et al., Development. 139, 1831-1841 (2012). ٠Ny 14. J. Xu et al., Genes Dev. 24, 783-798 (2010). 15. J. Xu et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110, 6518-6523 (2013). 16. V. 6. Sankaran et al., Nature. 460, 1093-1097 (2009). 17. J. Xu et al., Science. 334, 993-996 (2011). 18. F. Esteghamat et al., Blood. 121, 2553-2562 (2013). © 19. ©. Liu et al., Nat. Immunol. 4, 525-532 (2003). 20. Y.Yu et al., J. Exp. Med. 209, 2467-2483 (2012). 21. M. D. Farber, M. Koshy, T. R. Kinney, J. Chronic Dis. 38, 495-505 (1985). 22. E. Soler et al., Genes Dev. 24, 277-289 (2010). 023. M. T. Kassouf et al., Genome Res. 20, 1064-1083 (2010). 24. D.J. Tumer, M.E. Hurles, Nat. Protoc. 4, 1771-1783 (2009). 25. J. Tyson, J. A. Armour, BMC Genomics. 13, 693-2164-13-693 (2012). 26. M. Leid et al., Gene Expr. Patterns. 4, 733-739 (2004). yo 27. M.S. Kowalczyk et al., Mol. Cell. 45, 447-458 (2012). 28. H. J. Lee, E. Kim, J. 5. Kim, Genome Res. 20, 81-89 (2010). 29. D.E. Bauer, S.C. Kamran, S.H. Orkin, Blood. 120, 2945-2953 (2012). 30. A. John et al., Development. 139, 1831-1841 (2012). 0
SY AYSY AY
-١١١- 31. R. 0. Patwardhan et al., Nat. Biotechnol. 30, 265-270 (2012). 32. A. Melnikov et al., Nat. Biotechnol. 30, 271-277 (2012). 33. K. A. Frazer, S. S. Murray, N. J. Schork, E. J. Topol, Nat. Rev. Genet. 10, 241-251 (2009). 34. A. N. Koehler, Curr. Opin. Chem. Biol. 14, 331-340 (2010). 2 35. F. 0. Umov, E. J. Rebar, M. C. Holmes, H. 5. Zhang, P. D. Gregory,-111- 31. R.0. Patwardhan et al., Nat. Biotechnol. 30, 265-270 (2012). 32. A. Melnikov et al., Nat. Biotechnol. 30, 271-277 (2012). 33. K. A. Frazer, S. S. Murray, N. J. Schork, E. J. Topol, Nat. Rev. Genet. 10, 241-251 (2009). 34. A.N. Koehler, Curr. Open. Chem. Biol. 14, 331-340 (2010). 2 35. F. 0. Umov, E. J. Rebar, M. C. Holmes, H. 5. Zhang, P. D. Gregory,
Nat. Rev. Genet. 11, 636-646 (2010). 36. J. K. Joung, J. D. Sander, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 14, 49-55 (2013). 37. J. van der Oost, Science. 339, 768-770 (2013). 38. Thanks to A. Woo, A. Cantor, M. Kowalczyk, S. Bums, J. Wright, J. YeNat. Rev. Genet. 11, 636-646 (2010). 36. J.K. Joung, J.D. Sander, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 14, 49-55 (2013). 37. J. van der Oost, Science. 339, 768-770 (2013). 38. Thanks to A. Woo, A. Cantor, M. Kowalczyk, S. Bums, J. Wright, J. Ye
Snow, J. Trowbridge and members of the Orkin laboratory, particularly C. Peng, P. Das, G. Guo, M.Snow, J. Trowbridge and members of the Orkin laboratory, particularly C. Peng, P. Das, G. Guo, M.
E. Baena, for Kerenyi,E. Baena, for Kerenyi,
W. Pu the SF. Alt provided the pre-B cell line, A. He discussions. C. Guo pWHERE lacZ reporter Yo 1. Kutyavin sM. Nguyen technical assistance, D. Bates sconstruct, C. Currie expertise with sequence analysis, R. 39. J. Xu et al., Dev. Cell. 23, 796-811 (2012). 40. E. van den Akker, T. J. Satchwell, S. Pellegrin, G. Daniels, A. M. Toye, YoW.Pu the SF. Alt provided the pre-B cell line, A. He discussions. C. Guo pWHERE lacZ reporter Yo 1. Kutyavin sM. Nguyen technical assistance, D. Bates sconstruct, C. Currie expertise with sequence analysis, R. 39. J. Xu et al., Dev. Cell. 23, 796-811 (2012). 40. E. van den Akker, T. J. Satchwell, S. Pellegrin, G. Daniels, A. M. Toye, Yo
Haematologica. 95, 1594-1598 (2010). 04 AYHaematologica. 95, 1594-1598 (2010). 04 AY
-١١- 41. A. .ا Bredemeyer et al., Nature. 442, 466-470 (2006). 42. R. E. Thurman et al., Nature. 489, 75-82 (2012). 43. G. Galameau et al., Nat. Genet. 42, 1049-1051 (2010). 44. 5. Purcell et al., Am. J. Hum. Genet. 81, 559-575 (2007). 45. M. ©. Wu et al., Am. J. Hum. Genet. 89, 82-93 (2011). ٠ 46. A. He, S. W. Kong, Q. Ma, W. T. Pu, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 108, 5632-5637 (2011). 47. M. A. McDevitt, Y. Fujiwara, R. A. Shivdasani, S. H. Orkin, Proc. Natl.-11- 41. A. Bredemeyer et al., Nature. 442, 466-470 (2006). 42. R.E. Thurman et al., Nature. 489, 75-82 (2012). 43. G. Galameau et al., Nat. Genet. 42, 1049-1051 (2010). 44. 5. Purcell et al., Am. J. Hum. Genet. 81, 559-575 (2007). 45. M.©. Wu et al., Am. J. Hum. Genet. 89, 82-93 (2011). 0 46. A. He, S. W. Kong, Q. Ma, W. T. Pu, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108, 5632-5637 (2011). 47. M. A. McDevitt, Y. Fujiwara, R. A. Shivdasani, S. H. Orkin, Proc. Natl.
Acad. Sci. U. 5. A. 94, 7976-7981 (1997). 48. T. Cermak et al., Nucleic Acids Res. 39, e82 (2011). ٠ 49. J. C. Miller et al., Nat. Biotechnol. 29, 143-148 (2011). 50. R. Galanello et al., Blood. 114, 3935-3937 (2009). 51. H. T. Bae et al., Blood. 120, 1961-1962 (2012). 52. K. E. McGrath et al., Blood. 117, 4600-4608 (2011). 53. 0. Noordermeer, W. de Laat, IUBMB Life. 60, 824-833 (2008). ٠ 54. D. R. Higgs, D. Vemimmen, B. Wood, Adv. Genet. 61, 143-173 (2008). 55. E. Pinaud et al., Adv. Immunol. 110, 27-70 (2011). لAcad. Sci. U. 5. A. 94, 7976-7981 (1997). 48. T. Cermak et al., Nucleic Acids Res. 39, e82 (2011). 0 49. J. C. Miller et al., Nat. Biotechnol. 29, 143-148 (2011). 50. R. Galanello et al., Blood. 114, 3935-3937 (2009). 51. H.T. Bae et al., Blood. 120, 1961-1962 (2012). 52. K. E. McGrath et al., Blood. 117, 4600-4608 (2011). 53. 0. Noordermeer, W. de Laat, IUBMB Life. 60, 824-833 (2008). 0 54. D. R. Higgs, D. Vemimmen, B. Wood, Adv. Genet. 61, 143-173 (2008). 55. E. Pinaud et al., Adv. Immunol. 110, 27-70 (2011). for
١1 - و ١48 /// rs rs شرطى على لأا ارمق علا /خالك .حلا11 - and 148 /// rs rs conditional on I don't sleep on Ola / your uncle. Hala
DHDH
MAF مرقم 5 rs YY vag +, 00A oA ve dy A oo ال١ +MAF numbered 5 rs YY vag +, 00A oA ve dy A oo the 1 +
A AT 3 oY Ty Y¢ oy oive Ty rs ٠ 257 1٠ ا ا لال او ا أ + 7 2549 7 vv هه Ao Yo 1 rs +, Yo) vA ve Ye SYA XY, v4 +, 71 محقلا 1م +A AT 3 oY Ty Y¢ oy oive Ty rs 0 257 10 a a lal or a a a + 7 2549 7 vv eh Ao Yo 1 rs +, Yo) vA ve Ye SYA XY, v4 +, 71 fields 1m +
A vy £) YA -١٠ V¢ 1 فاخا 1 rsA vy £) YA -10 V¢ 1 Vakha 1 rs
XY, Y¥ | ott تكد videa| + .رةه Ye 1 VY TyXY, Y¥ | ott videa| + .rah Ye 1 VY Ty
OY ANOY AN
-١؟- rs-1?- rs
Yot ال ا م +4) vou 7) vodag + 7 ادا اء-٠ YY 1 Ly A AA TY rs +, 140 oY A) ١ ال الت ره ٠ 71317 +Yot lam +4) vou 7) vodag + 7 ada-0 YY 1 Ly A AA TY rs +, 140 oY A) 1 Ly A TY 0 71317 +
Y £) aA A 5-٠ yy Ad 4 TY rs +, TAA oY Xo, 1¢ +34 XY, Yo +, YA YY 174 7 yy 1-٠ Yo YAY Y ve to | OAT rs ٠ ا 0 دا +, Yo 0 vY + ¥1 oo ١٠7941 ١ دلا to A q¢ 24 +ده | لأك نظ rs +, 40. بي م Ye EE «Yo oo ١٠ عل ١ aA A yy ve AR 3 +ده | 7ه rsY £) aA A 5-0 yy Ad 4 TY rs +, TAA oY Xo, 1¢ +34 XY, Yo +, YA YY 174 7 yy 1-0 Yo YAY Y ve to | OAT rs 0 a 0 da +, Yo 0 vY + ¥1 oo 107941 1 dla to A q¢ 24 +d | Lak Naz rs +, 40. Bm Ye EE «Yo oo 10 on 1 aA A yy ve AR 3 +deh | 7 e rs
Xq,11 A XY, AT 1 A Yi.) مواحاا 77١ (٠ a) YA YY | oo+Xq,11 A XY, AT 1 A Yi.) Mowa'ah 771 (0 a) YA YY | oo+
OY AYOY AY
-١ \ اج أو +50 من ,oA+ ,17+ SNPsmBCLIIA DHSs شائع (7) < MAF) تحليل ارتباط ,MAF .DNase | موقع مفرط الحساسية ل ,DHS متاح للتحليل. CSSCD فرد من ١١7 ترددد أليل ثاتوي. أو +ده oA+ 7+ 8601118 DHSs Jala SNPs :¥ الجدول ألليل 0-1/Ag or +50 of oA+,17+ SNPsmBCLIIA DHSs common (7) < MAF) association analysis, MAF .DNase | DHS hypersensitivity locus available for analysis. CSSCD individual out of 117 secondary allele frequency. O+DHS oA+ 7+ 8601118 DHSs Jala SNPs: ¥ Table 0 allele
DHDH
MAF رئيس ألليل 5 نمط جيني H أحادي الشكل | + 5 م C| 7/7844 " البلوري | 7 ١قلدجكتم 0" + a ’ نعم T C TeViVood | ١ ان wy YYYovosy + 9 م تصميم تجربة معيب C TeVIVIEY | ١ wy YEAYYY YY أحادي الشكل | + 5 6 Al كلأكاخفاضح | ١ البلوري | 7 YAYYYYYo أحادي الشكل ١ * 5MAF prime allele 5 genotype H monomorphic | + 5 m C| 7/7844 " crystal | 7 1qdgctm 0" + a ’ yes T C TeViVood | 1 n wy YYYovosy + 9 m defective experiment design C TeVIVIEY | 1 wy YEAYYY YY Monomorphic | + 5 6 Al Kala Kafafadh | 1 crystal | 7 YAYYYYYo monomorphic 1 * 5
Ty T Cl w.vivvia| ١ البلووري VAAY ف + rs ٠, أ" ٍ ,ب أنعم 6 Al حلأاكاحفاخح | ١ $0 YE90AYYTy T Cl w.vivvia| 1 Crystalline VAAY F + rs 0, A " , B softer 6 Al Halakafahh | 1 $0 YE90AYY
OV AYOV AY
-١١١--111-
Ye + نعم T G Te YYA LY Y ١ ١3 » ا 7 TY + rs ؟ لحخاصعي فد لم 3 تجربة ب تصميم تجربةه معيب ٠721772 + rs تجربة 3 T Al TovyAvY | Y ب تصميم تجربةه معيبYe + Yes T G Te YYA LY Y 1 13 » A 7 TY + rs ? For my case, I did 3 experiments with defective design 0721772 + rs Experience 3 T Al TovyAvY | Y b His experiment design is flawed
YAVYA) OA أحادي الشكل ١ i. A G| لمعا Y ل البلوري EYAOY + rs 11 ١ 3 A G| اماف ¥ nl جو ‘0 YAY) Lov) + rs aa 3 T C| لعي ¥ f= ay £9 ع + rs re ; T C| صما | ¥ nl جو 7 تكح + Y rs تحرية 2 T C T+ YYAcoo تصميم تجربةه معيب + ٠-4 9. + Y rsYAVYA) OA monomorphic 1 i. A G| The Y of the crystal is EYAOY + rs 11 1 3 A G| amav ¥ nl jo '0 YAY) Lov) + rs aa 3 T C| ay ¥ f= ay £9 p + rs re ; T C| deaf | ¥ nl jo 7 cough + Y rs edit 2 T C T+ YYAcoo His experiment design is flawed + 0-4 9. + Y rs
Aaya 2 6 A T«YYAOT14 تصميم تجربةه معيب + 1١1١1110Aaya 2 6 A T«YYAOT14 The design of his experiment is flawed + 11111110
SV AYSV AY
-١١- ل | أحادي الشكل م 6 ٠١4-11- for | Monomorphic M 6 014
SRR ay جوري 0/77 + rs ب تصميم تجربة معيب 1 C ادي فد )ار /الا 0/6 + rs د لأارفاخ ا 6 م + تصميم تجربة معيب ١1178 + rs لقص فدح 6 م ب تصميم تجربة معيب 01711٠٠ + rs ب تصميم تجربة معيب 1 C Te VYAVAY ١64 + rs ال اغا 6 م ب تصميم تجربة معيب 11171458 ل | أحادي الشكل ب C Al TYYAAWY اف البلوري + rs الغ اما 6 م ب تصميم تجربة معيب 1١1779361 + rs وي م م 6 ب تصميم تجربة معيب مسي اSRR ay Juri 0/77 + rs b defective experiment design 1 C lead (r / no) 0/6 + rs d for roofs a 6 m + defective experiment design 11178 + rs for fatal cutting 6 MB Defective experiment design 0171100 + rs B Defective experiment design 1 C Te VYAVAY 164 + rs Al Aga 6 MB Defective experiment design 11171458 L | Monomorphic B C Al TYYAAWY F Al-Baluri + rs Alg Ama 6 M B defective experiment design 111779361 + rs WY M M 6 B defective experiment design MSI A
-١١- + rs م ب تصميم تجربة معيب T+ VYAAYT-11- + rs m b defective experiment design T+ VYAAYT
YATAYYYATAYY
0 + Y rs ; 71 G| متا AA fy ,م7 4 "0 re تصميم تجربة معيب C T Te YYYOAY oA مال أحادي الشكل ١ 7 ل 9 0 C G اده قفد لبلوري f YAoYo Nov + Y rs مه أنعم C 71 750 + Y rs ; 71 G| Mta AA fy m7 4 "0 re defective experiment design C T Te YYYOAY oA monomorphic money 1 7 l 9 0 C G EDAH QVD crystalline f YAoYo Nov + Y rs meh softer C 71 75
Yo TYY AYA + Y rs نعم oA A G لاني vt Wag + Y rs نمط جيني معيب oA C T اا 17 + rs د انعم C 71 777Yo TYY AYA + Y rs yes oA A G because I vt Wag + Y rs defective genotype oA C T aa 17 + rs d softer C 71 777
A 7 أحادي الشكل ١ 7 Y rs oA T| اا البلوري 6477841 e] | | © ' } 1A 7 monomorphic 1 7 Y rs oA T| Al-Baluri 6477841 e] | | © ' } 1
OV AYOV AY
-١١- + v re تصميم تجربة معيب oA A G امفففح 176 xy + v re ; G| Al 77776١-11- + v re Defective experiment design oA A G emfffh 176 xy + v re ; G| Al 777761
YY هم ا 7 ل | أحادي الشكل الى Al 6 بص 4م البلوري + v re م 0 نعم 6 77721 "" ١819771 ل | أحادي الشكل ل اق ال evry 78م البلوري ل | أحادي الشكل ل Toc صصح البلوري ١175601YY they are a 7 l | Monomorphic to Al 6 ps 4 m crystalline + v re m 0 yes 6 77721 "" 1819771 l | Monomorphic L QL evry 78 m crystalline L | Monomorphic toc-crystalline 1175601
A 1 0 rd نعم 0 +71 7 vy 58 7 LAS أحادي الشكل | TF ل 0 71 ل6م )اي بم البلوري ,' + v re انعم |G A 77447 ¢ ١6م7 ار ادA 1 0 rd Yes 0 +71 7 vy 58 7 LAS monomorphic | TF for 0 71 6m (crystalline ipm), '+ v re softer | G A 77447 ¢ 16m7 rad
-١ \ «= + ¥ I's تصميم تجربة معيب oo G T اسك فح-1 \ "= + ¥ I's defective experiment design oo G T Ask Fah
YAAEY Tey + ¥ I's تصميم تجربة معيب oo G A ١646 117/784 أحادي الشكل ١ 7 ل 9 oo C G عفد LY البلوري 1174 + I's تصميم تجربة معيب co C T IXRAL-ERAY 2594469١ + I's تصميم تجربة معيب oo G م ماي لصف كين + I's تصميم تجربة معيب oo A G قد عفدYAAEY Tey + ¥ I's defective experiment design oo G A 1646 117/784 monomorphic 1 7 l 9 oo C G crystalline LY 1174 + I's defective experiment design co C T IXRAL-ERAY 25944691 + I's a defective experiment design oo G M May for Kane class + I's a defective experiment design oo A G has returned
YAAYo VO + ¥ I's تصميم تجربة معيب oo A C ره اعفد اما 84 أحادي الشكل ١ 7 ل 9 oo A C العف البلوري 17 أحادي الشكل ١ 7 Y rs oo G C ارح فد سبي البلوري YSYAAYo VO + ¥ I's Defective Experimental Design oo A C rah Afad Ama 84 Monomorphic 1 7 L 9 oo A C Crystalline 17 Monomorphic 1 7 Y rs oo G C Rest in peace, the captivity of the crystal YS
CARCAR
-١؟١- + Y re 1 نعم oo C G TaYYo ام vo YI Y + Y re تصميم تجربة معيب oo T C ٠١04 ٠ ل | أحادي الشكل os Tl G| ٠ 4 البلوري 15118751 أحادي الشكل | TF ل os C 7 .vvevyy البلوري ١١74831 + Y re نمط جيني معيب oo A G ١4 18119971 ٠٠٠١ أو ADSNP Ly أو +00 وتوجد في oA+ 17+ 801118 DHSS ضمن aii SNPS-1?1- + Y re 1 Yes oo C G TaYYo M vo YI Y + Y re Defective experiment design oo T C 0104 0 l | Monomorphic os Tl G| 0 4 crystalline 15118751 monomorphic | TF of os C 7 .vvevyy crystalline 1174831 + Y re defective genotype oo A G 14 18119971 0001 or ADSNP Ly or +00 located in oA+ 17+ 801118 DHSS within aii SNPS
Lis المنمط SNPS و//ا85. تم تعريف CEU YRI ليانات جينومية للمجموعات المرجعية الإحداثيات الجينومية 9او. .CSSCD ضمن MAF [تسجيل Sanger متوالية shal الجدول 17 المرقمات الإضافية التي تم العثور عليها بواسطة إعادة ألليمل | أليمل CHLis patterned SNPS and // A85. CEU YRI genomic data for reference populations identified genomic coordinates 9 or .CSSCD within MAF [Sanger sequence registration shal Table 17 Additional digits found by Allemel Ret | Alimel CH
MAF نمط جينى | DHS ' أتانوي | POS| R قم ٠ 0 * هه *٠ أ" ٠ 7 ١ ما Y 5 م + 17 نعم TMAF genotype | DHS 'Atanoi | POS| R 0 0 * ee * 0 a" 0 7 1 ma Y 5 m + 17 yes T
AS ١ اد oN AYAS 1 ed oN AY
—\YY-—\YY-
Af S$ ار تصميم اختبار فاشل AAf S$ R Failed Test Design A
Af S$Af S$
T+V¥YYY 0T+V¥YYY 0
Cont م +56 انعم G . VY) oACont m +56 softer G . VY) oA
Yi بره 7 55 مقف Cea نعم T c د VY) oAYi Scale 7 55 Stand Cea Yes T c D VY) oA
Ao « بره 7 55 مقف تصميم ل" T 0 7 اختبار فاشل A \Ao « Libra 7 55 design stop for " T 0 7 failed test A \
Af S$ 7671ل" Co انعم 55+ T G VY) oA 0 ١Af S$ 7671" Co 55+ T G VY) oA 0 1
S$ اف Ce انعم 00% A 0 : 7 7 ١S$ F Ce Soft 00% A 0 : 7 7 1
Banger الأقصى إلى إعادة إجراء متوالية HOF مع النوع النظير CSSCD فرداً من AA [Maximum Banger to re-do an HOF sequence with counterpart type CSSCD by one of AA [
ARAR
١ 73- اث 01155 داخل .BCL11A المرقمات المبتكرة المحددة المدرجة. تم تعريف SNPs المنمطة MAF, Lud ضمن CSSCD المسجل. الإحداثيات الجينومية hgl9 الجدول 4 . التحليلات الشرطية لأربع سنتينيل SNPs rs rs rs rs Ae LAVIYAY[ YYAATATA 71177 ١٠7/١ M| Mar1 73-Ath 01155 inside .BCL11A Specific novelty numbers listed. SNPs phenotyped MAF, Lud were identified within the registered CSSCD. The hgl9 genomic coordinates are in Table 4. Conditional analyzes of four sentinel SNPs rs rs rs rs Ae LAVIYAY[ YYAATATA 71177 107/1 M| Mar
AF | ker rs ٠ ٠ اام 2 Y, YA ٠ ,. الاب ٠ تيا Y¢ VEY “> ا -١ “> ا -١ 41 -١ >“ -١ Ye ١ 1 1 Ya a 0] 6 1 1 rs ty ty Y, EA *, *, و و ٠, -١ ov Yv 71 7 34 م -١ a] ory ve| af of gry 1 اه NA | حلا rs لا ٠ ٠ الح ٠ ٠ ,. Yo ATA .25 ا -١ م YY \Y +, YA ١١ 951١ AR a Af TA اح . Y Al 3 3AF | ker rs 0 0 um 2 Y, YA 0 ,. Father 0 ty Y¢ VEY “> a -1 “> a -1 41 -1 >” -1 Ye 1 1 1 Ya a 0] 6 1 1 rs ty ty Y, EA *, *, f and 0, -1 ov Yv 71 7 34 m -1 a] ory ve| af of gray 1 AH NA | Hala rs no 0 0 h 0 0 ,. Yo ATA .25 A -1 M YY \Y +, YA 11 9511 AR a Af TA Ah . Y Al 3 3
-4؟١- rs ٠ -| ev] | + | fv 0 ٠, -١ ov Yv 73 5 1 لبا o—\. 1 NA NA ١ +o Y¢ 1 3 7 التحليلات الشرطية لأربع سنتينيل SNPs شائعة المرتبطة سابقاً بمستويات HPF (44: 17170 37 210)). تمت تحديد النمط الجيني لجميع الأربعة في YYA فرداً من 05500. تعذر حساب © ل 18766432 عند الشرط على 184671393 (والعكس) لأن هذاين المرقمين مرتبطين بقوة (2 - AEA - 2 .) ٠,157 بين 151427407 و15766432: Ved - ١2 ,+ بين © 51427407 5 1886868 ا5: AS - ١2 ,+ بين 51427407 و54671393: 2 - الخلا بين +,YoA - 2 ;rsl 1886868 5 rs766432 بين 1886868 |5 5 Jsaall.rsd671393 © تحليل الصورة المتغيرة نادرة ومنخفضة التردد rs le ays شرطي rs le rsYEYVeayY YEYYEWY 17 حل SY AY-4?1- rs 0 -| ev] | + | fv 0 0, -1 ov Yv 73 5 1 for ba o—\. 1 NA NA 1 +o Y¢ 1 3 7 Conditional analyzes of four common Sentinel SNPs previously associated with HPF levels (44: 17170 37 210)). The genotype of all four in YYA was determined from 05500 individuals. © for 18766432 could not be calculated when conditional on 184671393 (and vice versa) because these two digits are strongly correlated (2 - AEA - 2 .) 0.157 between 151427407 and 15766432: Ved - 12 , + between © 51427407 5 1886868 a5: AS - 12 , + between 51427407 and 54671393: 2 - between +,YoA - 2 ;rsl 1886868 5 rs766432 between 1886868 |5 5 © Jsaall.rsd671393 Variable image analysis rare and low frequency rs le ays conditional rs le rsYEYVeayY YEYYEWY 17 SY AY solution
اج \ \ — ينتج عن تحليل الصورة المتغيرة نادرة ومنخفضة التردد (MAF > 75). تم إجراء التحليل باستخدام خوارزم SKAT-O بناءً على المجموعة باستخدام ,١7+ DHSs 0A ,+00 الفردي كثلاث مجموعات مختلفة. الصف الأدنى "الكل" يعرض نتائج الاختبارات عند طي ثلاث مناطق معاً. الجدول :١ متوالية PCR للتتميط الفردي لدمج المستحلب تحليل PCR النوع الفردي 157569946-51427407 لدمج المستحلب. تم الزيجوت المتغاير ل 187569946 و51427407, وتوليد أمبليكون دمج يضم كل من a3. SNPs استتساخ أمبليكون الدمج, وتم إجراء متوالية Sanger للتسائل الفردية . تم إدراج عدد من النسائل لكل نوع جيني. تم حساب نسبة الاحتمالية ل G-G/A-T مقارنة بالطور 6-1/8-6. الجدول 7: إحداثيات شظايا تجارب المرسل Distance from BCL11A TSS (kb) 9019, 2C \ \ — Variable image analysis results in rare and low frequency (MAF > 75). Group-based analysis was performed using the SKAT-O algorithm using 0,17+ DHSs 0A, +00 singles as three different groups. The bottom row "All" displays test results when three regions are folded together. Table 1: PCR sequence for individual emulsion incorporation PCR analysis Single type 157569946-51427407 for emulsion incorporation. Heterozygoted for 187569946 and 51427407, generating a fusion amplicon comprising both a3. The SNPs cloned the fusion amplicon, and Sanger sequencing of the individual questions was performed. A number of clones are listed for each genotype. The odds ratio for G-G/A-T compared to the 6-1/8-6 phase was calculated. Table 7: Coordinates of the Distance from BCL11A TSS (kb) 9019, 2 transmitter experiments
الطول (bp) انهاية a مرسل | الاسم بداية نهاية ١١ ARERR 16064 Ta dYYACHY ١ بضصت - ٠ 7 q 1¢,¢| LacZThe length (bp) is the end of a sender | Name Beginning End 11 ARERR 16064 Ta dYYACHY 1 Bassat - 0 7 q 1¢,¢| LacZ
YTAD 1 16064 ٠١ YYYAY ١ بضصت -2 7 ٠ a 1¢,¢ 21٠ SAFRAN 57241 Te VYACTH ٠ 4 - 6YTAD 1 16064 01 YYYAY 1 BSAT 2 -7 0 a 1¢,¢ 210 SAFRAN 57241 Te VYACTH 0 4 - 6
Y Y oY,1 اأقف لي ييل Tvvay ITA ARTA BR YTA ARTA) 67+ 1 1Y Y oY,1 Stand for me Yale Tvvay ITA ARTA BR YTA ARTA) 67+ 1 1
Yee OY oYovo SAIYY بره فى كاكلا أي مب اYee OY oYovo SAIYY Outside in Kakla IMPa
A 1 ١٠ 575١ 77 TeeVYTYA[ TeeYY ad 5354 7 ا ٠٠ ١ أ١تالاغعت | Teethers ١٠١6+ ١ v Y 1 GFP ٠م Yoo 64 ١٠١74 TaeAV EAA] ٠١كم ١٠51+ 3 7 a 1 ١ ٠١١م ١١ ٠١ غات ١ حف ا اكت YoY+ 1 A 7 2 اأقف لي ييل Tvvay ITA ARTA BR YTA ARTA) 67+ 1 1A 1 10 5751 77 TeeVYTYA[ TeeYY ad 5354 7 A 100 1 A1TAGT | Teethers 1016+ 1 v Y 1 GFP 0m Yoo 64 10174 TaeAV EAA] 01km 1051+ 3 7 a 1 1 011m 11 01 gat 1 Haf Akt YoY+ 1 A 7 2 Stand for me Tvvay ITA ARTA BR YTA ARTA) 67+1 1
—\YV-—\YV-
Yer ovivoe 545471 TecYYYd0 بره اكد مل اYer ovivoe 545471 TecYYYd0
A YA Y
Yea) 17 oo(AoY TeeVYTtV TeYY EVA 5354 ١ ٠ ٠١4 74 ٠مم و لا او لي 3 2 6١+Yea) 17 oo(AoY TeeVYTtV TeYY EVA 5354 1 0 014 74 0mm and no or 3 2 61 +
Yer بئات ني مح عات أي 771 رض q Y 7+ أخن ك٠ لس ”نت الى |= - ا 1 مي متق ١ A 1- yay - - ١ الى ١ دم ١ دض الى 5,577 | 57 1 35 oy-— المعزز المفترضة المستتسخة في تجارب ناقل المعزز. إحداثيات الكرموسوم ؟ Was إحداثيات .80111/8 TSS وكذلك بالإشارة إلى hgl9 المردجة في متواليات قليل النيوكليوتيد A الجدول الاسم المتوالية التجربة 1 نحنف لاعام AAAGAGCTGTCCGAAGTCCA 0082118-53 -+ 1 نحنف لاعام GGGCACTTCCTAGTCCCTCT 0082118-35 -4 1 طحنفى لاعام 04 TTTGAGCAGGAGGGAATTTG mBcllla—dell-F © 1 وام 04 طحنف لاعام 61661 00016١6611 mBcellla—-dell-RYer categories of units of any 771 rad q Y 7 + akhn k 0 ls “net to |= - a 1 mi mtq 1 A 1- yay - - 1 to 1 dm 1 d to 5,577 | 57 1 35 oy-— The putative reinforcer replicated in the reinforcer vector experiments. Chromosome coordinates? Was coordinates .80111/8 TSS as well as with reference to hgl9 included in the oligonucleotide sequences Table A Name Sequence Experiment 1 We are public AAAGAGCTGTCCGAAGTCCA 0082118-53 - + 1 General Nahf GGGCACTTCCTAGTCCCTCT 0082118-35 -4 1 General Tahnaf 04 TTTGAGCAGGAGGGAATTTG mBcllla—dell-F © 1 WAM 04 General Tahnaf 61661 0001616611 mBcellla—-dell-R
ARAR
—\YA-—\YA-
TALENGWPCR GCAAGGCAGGTACCAAACAT mBcllla-del2-FTALENGWPCR GCAAGGCAGGTACCAAACAT mBcllla-del2-F
TALENGWPCR TAGAGATTCCAGGCCCCTTT mBcllla—-del2-RTALENGWPCR TAGAGATCCAGGCCCCTTT mBcllla—-del2-R
TALENGWPCR AGCAAGGAAAGGTGAAGCAG mBcll1a-3'-FTALENGWPCR AGCAAGGAAAGGTGAAGCAG mBcll1a-3'-F
TALENGWPCR CCCAATGTCTTCCGAACTGT mBcllla-3'-RTALENGWPCR CCCAATGTCTTCCGAACTGT mBcllla-3'-R
TALENGWPCR AGGCTGGTCTTGGGATTTTT mBcllla- © upstreamTALEN-FTALENGWPCR AGGCTGGTCTTGGGATTTTT mBcllla- © upstreamTALEN-F
TALENGAWPCR GCCTTTAACAAGGGTGTCCA mBcllla- downstreamTALEN-R CATAGACCTGGGTCCTGGAA mBcl11a-5'probe-F مسبار '٠ للطغخة ٠ ويسترن TTGCAGAGTGACTCCTGTGG mBcl11a-5'probe-R مسبار '٠ للطغخة ويسترن lacZ Ju ye استتساخ CCAGCCATACCCAAAACAAA hBCL11A-52.0-F lacZ Ju ye استتساخ CTTTCCCTCTTGCCACTCAG hBCL11A-64.4-R lacZ Ju ye استتساخ GGCAGAGAAGGCACAGTGA hBCL11A-56.8-F ١٠ lacZ Ju ye استتساخ GGCTGTCCTGGCATGTAAGT hBCL11A-57.6-R GFP ااستتساخ مرسل 202 AACAGACCCATGTGCTAGGC hBCL11A-63.4-F GFP Ju je /02ااستتساخ TGTGTGGACTGCCTTTTCTG hBCL11A-61.6-R lacZ Ju je اسنتساخ GGGAAAAGGGAGAGGAAAAA hBCL11A-58.6-F lacZ Ju ye استتساخ CTCAGAAAAATGACAGCACCA hBCL11A-57.6-R 0 ٠ oY AYTALENGAWPCR GCCTTTAACAAGGGTGTCCA mBcllla- downstreamTALEN-R CATAGACCTGGGTCCTGGAA mBcl11a-5'probe-F '0 smear probe Western 0 TTGCAGAGTGACTCCTGTGG mBcl11a-5'probe-R '0 smear probe Western lacZ Ju ye CCAGCCATACCCAAAACAAA hBCL11A-52.0-F lacZ Ju ye cloning CTTTCCCTCTTGCCACTCAG hBCL11A-64.4-R lacZ Ju ye cloning GGCAGAGAAGGCACAGTGA hBCL11A-56.8-F 10 lacZ Ju ye cloning GGCTGTCCTGGCATGTAAGR-5 GGCATGTAAGTFP-A hBCL161. Transmitter cloning 202 AACAGACCCATGTGCTAGGC hBCL11A-63.4-F GFP Ju je /02 cloning TGTGTGGACTGCCTTTTCTG hBCL11A-61.6-R lacZ Ju je cloning GGGAAAAGGGAGAGGAAAAA hBCL11A-58.6-F lacZ h ye ye-ATB1GCCAGAA5GAA-ATB1GCAACA5. 0 oYAY
-١؟4- lacZ Jui ye استتساخ GGACTCAGTGGCCTCTTTTG hBCL11A-55.7-F lacZ Ju ye استتساخ GAAGATAATGGCAGCCCAGA hBCL11A-54.4-R-1?4- lacZ Jui ye clone GGACTCAGTGGCCTCTTTTG hBCL11A-55.7-F lacZ Ju ye clone GAAGATAATGGCAGCCCAGA hBCL11A-54.4-R
GFP Jue استتساخ TGTGTGGCCAACCTGTAAAA hBCL11A-164.2-FGFP Jue clone TGTGTGGCCAACCTGTAAAA hBCL11A-164.2-F
GFPJuy اسنتساخ CTCGCTCTGTTTCCCAGTTC hBCL11A-162.6-RGFPJuy Clone CTCGCTCTGTTTCCCAGTTC hBCL11A-162.6-R
GFPJuje استتساخ CTCTCCGACGACCTCTTTTG hBCL11A-157.1-F ه GFP Ju # Lil GTAGGGAAGGGGCTACTTGG hBCL11A-155.6-RGFPJuje clone CTCTCCGACGACCTCTTTTG hBCL11A-157.1-F e GFP Ju #Lil GTAGGGAAGGGGCTACTTGG hBCL11A-155.6-R
GFP اسمتتساخ مرسل AGAGCCAAACTCCGTCTCAA hBCL11A-154.1-FGFP Transmitter Assay AGAGCCAAACTCCGTCTCAA hBCL11A-154.1-F
GFP Ju اسنتساخ AAATACCACAGCCCAACAGC hBCL11A-152.5-R 61 اسنتساخ مرسل GAACAGAGACCACTACTGGCAAT hBCL11A-59.4-FGFP Ju clone AAATACCACAGCCCAACAGC hBCL11A-152.5-R 61 clone transponder GAACAGAGACCACTACTGGCAAT hBCL11A-59.4-F
GFP Jue استتساخ 66666/86666111 68116 0680111-57. 7-4 ٠ استتساخ مرسل61© CTTCCACTGGATGGCACTTT hBCL11A-55.9-FGFP Jue Clone 66666/86666111 68116 0680111-57. 4-7 0 Transcription of a Transponder©61 CTTCCACTGGATGGCACTTT hBCL11A-55.9-F
GFP Jue lus) ACTTCAGCCTCCAGCACTGT hBCL11A-54.2-RGFP Jue lus) ACTTCAGCCTCCAGCACTGT hBCL11A-54.2-R
GFP Jue استتساخ CCTCCCAGCAATGTAGGTGT hBCL11A-41.6-FGFP Jue clone CCTCCCAGCAATGTAGGTGT hBCL11A-41.6-F
GFP Jue استتساخ TGGTGTGGTCCACTGTGACT hBCL11A-40.5-R ©] اسمتتساخ مرسل GCAAGCTTAGCCCCTTCTTT hBCL11A-32.6-F ١٠GFP Jue Translator TGGTGTGGTCCACTGTGACT hBCL11A-40.5-R ©] Translator Translator GCAAGCTTAGCCCCTTCTTT hBCL11A-32.6-F 10
GFP استتساخ مرسل TGAGGCAGAGTCAGATGTGG hBCL11A-31.6-RGFP transcription of the TGAGGCAGAGTCAGATGTGG hBCL11A-31.6-R transmitter
GFP Jui استتساخ CCCCGCTCAGAGTAAGTGAG hBCL11A-n45.8-FGFP Jui clone CCCCGCTCAGAGTAAGTGAG hBCL11A-n45.8-F
GFP Ju اسنتساخ GGAAACTGCCTATCCCATGA hBCL11A-n47.0-RGFP Ju clone GGAAACTGCCTATCCCATGA hBCL11A-n47.0-R
GFP Jue استتساخ CAACACCCCGATTTCAGACT hBCL11A-n51.0-FGFP Jue clone CAACACCCCGATTTCAGACT hBCL11A-n51.0-F
OVAOVA
يدا GAATGGTCCCGATCTCTTGA hBCL11A-n52.9-R استتساخ مرسل ]© RT-gPCR (Gapdh) TGGTGAAGGTCGGTGTGAAC mGapdh-RT-F RT-gPCR CCATGTAGTTGAGGTCAATGAAGG mGapdh-RT-R (Gapdh) ه RT-gPCR AACCCCAGCACTTAAGCAAA mBcl11a-RT-ele2-F (Bcllla exon-1/2)YDA GAATGGTCCCGATCTCTTGA hBCL11A-n52.9-R Transponder Cloning [© RT-gPCR (Gapdh) TGGTGAAGGTCGGTGTGAAC mGapdh-RT-F RT-gPCR CCATGTAGTTGAGGTCAATGAAGG mGapdh-RT-R (Gapdh) e RT- gPCR AACCCCAGCACTTAAGCAAA mBcl11a-RT-ele2-F (Bcllla exon-1/2)
RT-gPCR ACAGGTGAGAAGGTCGTGGT mBcl11a-RT-ele2-R (Bcllla exon-1/2)RT-gPCR ACAGGTGAGAAGGTCGTGGT mBcl11a-RT-ele2-R (Bcllla exon-1/2)
RT-gPCR GCCCCAAACAGGAACACATA mBcll11a-RT-e2e3-F (Bcl 11a exon-2/3) YoRT-gPCR GCCCCAAACAGGAACACATA mBcll11a-RT-e2e3-F (Bcl 11a exon-2/3) Yo
RT-gPCR GGGGCATATTCTGCACTCAT mBcl11a-RT-e2e3-R (Bcllla exon-2/3)RT-gPCR GGGGCATATTCTGCACTCAT mBcl11a-RT-e2e3-R (Bcllla exon-2/3)
RT-gPCR ATGCGAGCTGTGCAACTATG mBcll11a-RT-ed4e4-F (Bcl 11a exon-4/4, xLisoform)RT-gPCR ATGCGAGCTGTGCAACTATG mBcll11a-RT-ed4e4-F (Bcl 11a exon-4/4, xLisoform)
RT-gPCR GTAAACGTCCTTCCCCACCT mBcll11a-RT-e4e4-R ١٠٠ (Bcl 11a exon-4/4, xLisoform)RT-gPCR GTAAACGTCCTTCCCACCACCT mBcll11a-RT-e4e4-R 100 (Bcl 11a exon-4/4, xLisoform)
RT-gPCR CAGCTCAAAAGAGGGCAGAC mBcll11a-RT-e4e5-F (Bcl 11a exon-4/5, Lisoform)RT-gPCR CAGCTCAAAAGAGGGCAGAC mBcll11a-RT-e4e5-F (Bcl 11a exon-4/5, Lisoform)
RT-gPCR GAGCTTCCATCCGAAAACTG mBcll11a-RT-e4e5-R Y. (Bcl 11a exon-4/5, Lisoform)RT-gPCR GAGCTTCCATCCGAAAACTG mBcll11a-RT-e4e5-R Y. (Bcl 11a exon-4/5, Lisoform)
RT-gPCR (eY)TGGCCTGTGGAGTAAGGTCAA mHbby-RT-F 04 AYRT-gPCR (eY)TGGCCTGTGGAGTAAGGTCAA mHbby-RT-F 04 AY
—V ry -—Vry-
RT-qPCR (eY) GAAGCAGAGGACAAGTTCCCA mHbby-RT-RRT-qPCR (eY)GAAGCAAGAGGACAAGTTCCCA mHbby-RT-R
RT-qPCR (bH1) TGGACAACCTCAAGGAGACC mHbb-bh1-RT-FRT-qPCR (bH1) TGGACAACCTCAAGGAGACC mHbb-bh1-RT-F
RT-qPCR (bH1) ACCTCTGGGGTGAATTCCTT mHbb-bh1-RT-RRT-qPCR(bH1)ACCTCTGGGGTGAATTCCTT mHbb-bh1-RT-R
RT-qPCR (b1/b2) TTTAACGATGGCCTGAATCACTT mHbb-b1-RT-FRT-qPCR (b1/b2) TTTAACGATGGCCTGAATCACTT mHbb-b1-RT-F
RT-qPCR (b1/b2) CAGCACAATCACGATCATATTGC mHbb-b1-RT-R ©RT-qPCR(b1/b2) CAGCACAATCACGATCATATTGC mHbb-b1-RT-R©
RT-gqPCR (lacZ) GCCAACATTGAGACACATGG lacZ-RT-FRT-gqPCR (lacZ) GCCAACATTGAGACACATGG lacZ-RT-F
RT-gPCR (lacZ) TGTCTCTCTGCACCATCCTG lacZ-RT-RRT-gPCR(lacZ)TGTCTCTCTGCACCATCCTG lacZ-RT-R
PCR genotyping (lacZ) TTCAATGCTGTCAGGTGCTC lacZ-FPCR genotyping (lacZ) TTCAATGCTGTCAGGTGCTC lacZ-F
PCR genotyping (lacZ) GCCATGTGTCTCAATGTTGG lacZ-R دمج النمط الفردي 04+ GTCTGCCCTCTTTTGAGCTG rs7569946-F ٠ الفردي ball PCR GACTCCAGACAATCGCCTTT rs7569946-R الرابطة , , AAAGGCGATTGTCTGGAGTCAACCTT rs7569946-R-rc— , haplotyping fusion y.allPCR genotyping (lacZ) GCCATGTGTCTCAATGTTGG lacZ-R haplotype fusion 04+ GTCTGCCCTCTTTTGAGCTG rs7569946-F 0 haplotyping ball PCR GACTCCAGACAATCGCCTTT rs7569946-R haplotyping , , AAAGGCGATTGTCTGGAGTCAACCTT rs7569946-R-haplotyping all.
PCR CTTAGCACCCACAAAC rs1427407-F النمط «PCR CATGTTACTGCAACTTGCTTTTT rs1427407-R ١٠ الفردي bail) "دمج AGATCCCTCCGTCCAGCTC rs7569946-nested-F الفردي z=sTGAAAGTTCAAGTAGATATCAGAAGG PCR rs1427407-nested-R النمط الفردي - ٠٠PCR CTTAGCACCCACAAAC rs1427407-F haplotype “PCR CATGTTACTGCAACTTGCTTTTT rs1427407-R 10 haplotype bail) “AGATCCCTCCGTCCAGCTC rs7569946-nested-F haplotype merge z=sTGAAAGTTCAAGTAGATATCAGAAGG haplotype PCR 001427407 -nested-R
AGCAAACCACACAGACTGAAGA 3C-hBCL11A-150.6-F oY AYAGCAAACCACACAGACTGAAGA 3C-hBCL11A-150.6-F oY AY
-١»7--1»7-
CCAGAGCCATTTACGTCACA 3C-hBCL11A-140.9-F 3C CAGAAGGGAATAAGGTACTCTGGA 3C-hBCL11A-114.1-F 30 GTTTGGGCCTCAAGGTCTTT 3C-hBCL11A-111.5-F 30 GAGGTTGGGAGTAAGCATTCTG 3C-hBCL11A-109.1-F 3C ACGCATCAGAATGCCCATAG 3C-hBCL11A-100.7-F ه٠ 3C TTTTGAAAGAAAACGCTGACA 3C-hBCL11A-92.3-F 30 TTCCAGCTGGTTAAATTTAGGG 3C-hBCL11A-80.2-F 3CAGAAGGGGCCAGAAGAACAG 3C-hBCL11A-T717.2-F 30 CCTTCTTTTTICTTTCTTGGTTGC 3C-hBCL11A-72.5-F 3C CCCTGCGTGCCATTAAAATA 3C-hBCL11A-66.8-F ٠ 3C AAAGGCCTTGGGAAGAAAGA 3C-hBCL11A-61.2-F 3C GCAAGTCAGTTGGGAACACA 3C-hBCL11A-59.1-F 3C GGACTCAGTGGCCTCTTTTG 3C-hBCL11A-57.1-F 3C CTGTCTCTGTCTCCCCCAAG 3C-hBCL11A-52.2-F 3CCCAATGCTCCTGTAACAAAGG 3C-hBCL11A-47-F ١ 3CAATGCAGTAGGCAAAGAAGCA 3C-hBCL11A-43.5-F 3C GAAATTTGGAAGGCCACAGA 3C-hBCL11A-38.6-F 30 GCTTGCAACAATTAAAAGATGG 3C-hBCL11A-29.3-F 3C GGTGACAAGGGAGAACCACT 3C-hBCL11A-27.1-FCCAGAGCCATTTACGTCACA 3C-hBCL11A-140.9-F 3C CAGAAGGGAATAAGGTACTCTGGA 3C-hBCL11A-114.1-F 30 GTTTGGGCCTCAAGGTCTTT 3C-hBCL11A-111.5-F 30 GAGGTTGGGAGTAAGCATTCTG 3C-hBCL11A-109.1-F 3C ACGCATCAGAATGCCCATAG 3C-hBCL11A-100.7-F ه٠ 3C TTTTGAAAGAAAACGCTGACA 3C- hBCL11A-92.3-F 30 TTCCAGCTGGTTAAATTTAGGG 3C-hBCL11A-80.2-F 3CAGAAGGGGCCAGAAGAACAG 3C-hBCL11A-T717.2-F 30 CCTTCTTTTTICTTTCTTGGTTGC 3C-hBCL11A-72.5-F 3C CCCTGCGTGCCATTAAAATA 3C-hBCL11A-66.8-F ٠ 3C AAAGGCCTTGGGAAGAAAGA 3C-hBCL11A-61.2 -F 3C GCAAGTCAGTTGGGAACACA 3C-hBCL11A-59.1-F 3C GGACTCAGTGGCCTCTTTTG 3C-hBCL11A-57.1-F 3C CTGTCTCTGTCTCCCCCAAG 3C-hBCL11A-52.2-F 3CCCAATGCTCCTGTAACAAAGG 3C-hBCL11A-47-F ١ 3CAATGCAGTAGGCAAAGAAGCA 3C-hBCL11A-43.5-F 3C GAAATTTGGAAGGCCACAGA 3C- hBCL11A-38.6-F 30 GCTTGCAACAATTAAAAGATGG 3C-hBCL11A-29.3-F 3C GGTGACAAGGGAGAACCACT 3C-hBCL11A-27.1-F
OVAOVA
-١؟--1?-
TGATTTCCTTGCAGCCTTTT 3C-hBCL11A-20.9-F 3C CACACCCACAGCAACAAATG 3C-hBCL11A-8.6-F 3C TGCAGAGATCCCCCAAAGTA 3C-hBCL11Apromoter-R 3C CTCAGGGAGCAAGGGAAATA 3C-hBCL11A-n8.3-F 3C CCCTCCCAACAGGGATTTAT 3C-hBCL11A-n12.6-F ه 3C CAAAATTGAACACCTATGGTCTGA 3C-hBCL11A-n19.5-F 3C AGGAAGACTTTGGCCTCCAT 3C-hBCL11A-n29.8-F 3C-hBCL11A-n34.6-F TTCCAAACAATTATACACCAACAAA 3C 3C TTTCATGGGGAATAGCCAAC 3C-hBCL11A-n54-F 3C CCCTACTTGTTATTTGCTTCTGC 3C-hBCL11A-n78.2-F ٠ 30 3C-hBCL11A-n104.4-F AGCTGAAGTTTCAGGGACCA 3C CCACACCTGCCTTCCTTAGA 3C-LCR-HS1-F 3C TGCATATGATGGGGTAGCAG 3C-LCR-HS3-FTGATTTCCTTGCAGCCTTTT 3C-hBCL11A-20.9-F 3C CACACCCACAGCAACAAATG 3C-hBCL11A-8.6-F 3C TGCAGAGATCCCCCAAAGTA 3C-hBCL11Apromoter-R 3C CTCAGGGAGCAAGGGAAATA 3C-hBCL11A-n8.3-F 3C CCCTCCCAACAGGGATTTAT 3C-hBCL11A-n12.6-F ه 3C CAAAATTGAACACCTATGGTCTGA 3C-hBCL11A-n19.5-F 3C AGGAAGACTTTGGCCTCCAT 3C-hBCL11A-n29.8-F 3C-hBCL11A-n34.6-F TTCCAAACAATTATACACCAACAAA 3C 3C TTTCATGGGGAATAGCCAAC 3C-hBCL11A-n54-F 3C CCCTACTTGTTATTTGCTTCTGC 3C-hBCL11A-n78. 2-F 0 30 3C-hBCL11A-n104.4-F AGCTGAAGTTTCAGGGACCA 3C CCACACCTGCCTTCCTTAGA 3C-LCR-HS1-F 3C TGCATATGATGGGGTAGCAG 3C-LCR-HS3-F
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-68.7-F AAGAGAAGGGGGAATTTGGAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-68.7-F AAGAGAAGGGGGAATTTGGA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-68.7-R TGGTGATAAGGGCAGGAAAC ٠١ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-68.7-R TGGTGATAAGGGCAGGAAAC01
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-65.5-F AGGAAGCTGCAGAAAGGTGAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-65.5-F AGGAAGCTGCAGAAAGGTGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-65.5-R TGCTTCCCCAGGTTTAGATGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-65.5-R TGCTTCCCCAGGTTTAGATG
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-64.7-F CCACTGCTACCCAAAACGATChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-64.7-F CCACTGCTACCCAAAACGAT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-64.7-R CAAGAGCGAAACTCCACCTC ه١ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-64.7-R CAAGAGCGAAACTCCACCTC H1
-١»6- 010-004 ChIP-hBCL11A-63.9-F ACTGTGTGCCAAGTGACCAG-1»6- 010-004 ChIP-hBCL11A-63.9-F ACTGTGTCCAAGTGACCAG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.9-R CAGCTTCCTTCAGGTGCTTCChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.9-R CAGCTTCCTTCAGGTGCTTC
ChIP-gPCR CATGCTGCCTTTGTCTTCTG ChIP-hBCL11A-63.1-FChIP-gPCR CATGTGCCTTTGTCTTCTG ChIP-hBCL11A-63.1-F
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.1-R TGTGGAGCTCTGGAATGATGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.1-R TGTGGAGCTCTGGAATGATG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.0-F GAGCTCCACAATCCAACTCC ©ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.0-F ©GAGCTCCACAATCCAACTCC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.0-R CCAGGAAGGAAATGAGAACGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.0-R CCAGGAAGGAAATGAGAACG
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.5-F ACCCACAAACATTTCCCTTCTChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.5-F ACCACAAACATTTCCCTTCT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.5-R TTTGCTCTTCTCCAGGGTGTChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.5-R TTTGCTCTTCTCCAGGGTGT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.4-F TTTAAACAGCCACCCCACACChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.4-F TTTAAACAGCCACCCCACAC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.4-R ACCACGTAGTTGGGCTTCAC ٠٠ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.4-R ACCACGTAGTTGGGCTTCAC00
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.2-F TTTCAACCATGGTCATCTGCChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.2-F TTTCAACCATGGTCATCTGC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.2-R CCCTCTGGCATCAAAATGAGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.2-R CCCCTGGCATCAAAATGAG
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.8-F GAACCTGGGAGGCAGAAGATChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.8-F GAACCTGGGAGGCAGAAGAT
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.8-R TTTTTGGTGAGACGGAGATTTChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.8-R TTTTTGGTGAGACGGAGATTT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.7-F CCGGGCAACAAGAGTAAATC ١ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.7-F CCGGGCAACAAGAGTAAATC 1
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.7-R ATGCCTAGGGTGTTTTGACGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.7-R ATGCTAGGGTGTTTTGACG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.5-F CTCCGTGTTGAGAGCCAAGTChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.5-F CTCCGTGTTGAGAGCCAAGT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.5-R TGTGTGGACTGCCTTTTCTGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.5-R TGTGTGGACTGCCTTTTCTG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.3-F CAGAAAAGGCAGTCCACACAChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.3-F CAGAAAAGGCAGTCCACACA
OVAOVA
—\yo-—\yo-
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.3-R CCTCTCCAGATTCCCTCTCAChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.3-R CCTCTCCAGATTCCCTCTCA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.0-F AGCGAGACCCTGTCTCAAAAChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.0-F AGCGAGACCCTGTCTCAAAA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.0-R TCCAGCAGGCTTCAAAAAGTChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.0-R TCCAGCAGGCTTCAAAAAGT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.8-F GGTGGATAACCCCATCTCAGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.8-F GGTGGATAACCCCATCTCAG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.8-R GGAAATGAGAATGCCCTITG ©ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.8-R GGAAATGAGAATGCCCTITG ©
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.5-F CAGTCTAGAAAGCCCCCTCAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.5-F CAGTCTAGAAAAGCCCCCTCA
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.5-R GTGGGGGTTCAGTGGTTAGAChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.5-R GTGGGGGTTCAGTGGTTAGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.3-F TCCATGGTGTGGAGTGTGTTChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.3-F TCCATGGTGTGGAGTGTGTT
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.3-R ACCCACATGGCAACCAATAGChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.3-R ACCCCATGGCAACCAATAG
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.0-F CCATTCCCTGGAGAGTTCAA ٠ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.0-F CCATTCCCTGGAGAGTTCAA 0
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.0-R GGGGTCTCTTCCCATCATTTChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.0-R GGGGTCTCTTCCCATCATTT
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.9-F ATGGGAAGAGACCCCAAAACChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.9-F ATGGGAAGAGACCCCAAAAC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.9-R GGACTCCGAACACCACACTTChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.9-R GGACTCCGAACACCACACTT
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.5-F GGGATCAGAGGTGAACAGGAChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.5-F GGGATCAGAGGTGAACAGGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.5-R TTTAATCAGCTTCCGCCACT ٠٠ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.5-R TTTAATCAGCTTCCGCCACT 00
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.0-F TGGGGAGAGAAGAGTGGAAAChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.0-F TGGGGAGAGAAGAGTGGAAA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.0-R TTGCCAATTGGAGATTAGGGChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.0-R TTGCCAATTGGAGATTAGGG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.7-F TGCTCCGAGCTTGTGAACTAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.7-F TGCTCCGAGCTTGTGAACTA
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.7-R GGGAAAGGGCCTGATAACTTChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.7-R GGGAAAGGGCCTGATAACTT
OVAOVA
-؟١--? 1-
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.3-F GAGAGTGCAGACAGGGGAAGChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.3-F GAGAGTGCAGACAGGGGAAG
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.3-R CCTCTTTCGGAAGGCTCTCTChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.3-R CCTCTTTCGGAAGGCTCTCT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.0-F TGGACTTTGCACTGGAATCAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.0-F TGGACTTTGCACTGGAATCA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.0-R GATGGCTGAAAAGCGATACAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.0-R GATGGCTGAAAAGCGATACA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.3-F GGGGAGATGATTGAAAGCAA ه ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.3-R AGAACTTTCCCGGTTCTGGTChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.3-F GGGGAGATGATTGAAAGCAA e ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.3-R AGAACTTTCCCGGTTCTGGT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.0-F GCTCTGGACACACAGCAAAAChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.0-F GCCTTGGACACACAGCAAAA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.0-R TCAAATCCTTGCCTTGAACCChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.0-R TCAAATCCTTGCCTTGAACC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.6-F CCTCAAATCTCCCTCACTGGChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.6-F CCTCAAAATCTCCCTCACTGG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.6-R GGGAAATGGGTCCTGCTTTA ٠ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.6-R GGGAAATGGGTCCTGCTTTA 0
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.3-F AGGGAGTACACCGCAGACACChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.3-F AGGGAGTACACCGCAGACAC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.3-R AAGGAAGGCTGCAAGGAAATChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.3-R AAGGAAGGCTGCAAGGAAAT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.9-F GACTTAAACTGCCGCTCCTGChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.9-F GACTTAAACTGCCGCTCCTG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.9-R TGACTGGTAAGAGCCGATTGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.9-R TGACTGGTAAGAGCCGATTG
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.3-F GCTGGGGTGAGTCAAAAGTC ١٠ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.3-F GCTGGGGTGAGTCAAAAGTC 10
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.3-R GGTCACCTTAAGGAGCCACAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.3-R GGTCACCTTAAGGAGCCACA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.8-F GCACCTGCATTTGTTTTTCAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.8-F GCACCTGCATTTGTTTTTCA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.8-R GGGTCAGATCACCTCTGCTCChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.8-R GGGTCAGATCACCTCCTGCTC
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.4-F AGGCATCCAAAGGGAAGAAT ه١ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.4-F AGGCATCCAAAGGGAAGAAT H1
١ لا 010-004 ChIP-hBCL11A-54.4-R GAAGATAATGGCAGCCCAGA1 No. 010-004 ChIP-hBCL11A-54.4-R GAAGATAATGGCAGCCCAGA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.0-F TGGGAAAGGTTGCACATTCTChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.0-F TGGGAAAGGTTGCACATTCT
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.0-R GGGCCTCAGGCTCTTTATCTChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.0-R GGGCCTCAGGCTCTTTATCT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.4-F CCACTGCCAGGCTGTTTACTChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.4-F CCACTGCCAGGCTGTTTTACT
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.4-R GACCGAAAGGAGGAGAGGAG ©ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.4-R GACCGAAAGGAGGAGAGGAG ©
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.1-F CAGTTCCCCCATTATGCACTChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.1-F CAGTTCCCCCATTATGCACT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.1-R CCCTTCTCTGAAGGCACATCChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.1-R CCCTCTCTGAAGGCACATC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.7-F TTCAAGCCTTGGTGGATAGGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.7-F TTCAAGCCTTGGTGGATAGG
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.7-R GCCAGGAAATTGGTGGTAGAChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.7-R GCCAGGAAAATTGGTGGTAGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.3-F TGCCCACATGAGACATCTTT ٠ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.3-F TGCCCACATGAGACATCTTT 0
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.3-R AAATTGGCTGCCATTGAATCChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.3-R AAATTGGCTGCCATTGAATC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-51.3-F CCACCAGAAGTCCTGGAAAAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-51.3-F CCACCAGAAGTCCTGGAAAA
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-51.3-R TTGGAGGGACCTGATCTCTGChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-51.3-R TTGGAGGGACCTGATCTCTG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-50.2-F CCAAGATGGAGAAGCCACATChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-50.2-F CCAAGATGGAGAAGCCACAT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-50.2-R TCTGTCTTGGGTCTCCTGGT ٠ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-50.2-R TCTGTCTTGGGTCTCCTGGT 0
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.8-F GAGAAGCCCTCAGCAAACACChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.8-F GAGAAGCCCTCAGCAAACAC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.8-R GGTTGCATCTTGGCTCCTAAChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.8-R GGTTGCATCTTGGCTCCTAA
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.5-F GAAATGCAGGAAAGGAACGAChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.5-F GAAATGCAGGAAAGGAACGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.5-R TCTAGCAGATGGGGTTTTGGChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.5-R TCTAGCAGATGGGGTTTTGG
OVAOVA
—\YA-—\YA-
ChIP-gPCRAGTCTGGGCAACAAAGTGAGA ChIP-hOct4-prom-FChIP-gPCRAGTCTGGGCAACAAAGTGAGA ChIP-hOct4-prom-F
ChIP-qPCR AGAAACTGAGGAGAAGGATG ChIP-hOct4-prom-RChIP-qPCR AGAAACTGAGGAGAAGGATG ChIP-hOct4-prom-R
ChIP-gPCRATAGACCATGAGTAGAGGGCAGAC ChIP-hHS3-FChIP-gPCRATAGACCATGAGTAGAGGGCAGAC ChIP-hHS3-F
ChIP-gPCR TGATCCTGAAAACATAGGAGTCAA ChIP-hHS3-RChIP-gPCR TGATCCTGAAAACATAGGAGTCAA ChIP-hHS3-R
ChIP-gPCR CAGATAACTGGGCCAACCAT ChIP-hHS-40-F ه ChIP-gPCR ATTCACCCCTTTCCCTTGTC ChIP-hHS-40-RChIP-gPCR CAGATAACTGGGCCAACCAT ChIP-hHS-40-F e ChIP-gPCR ATTCACCCCTTTCCCTTGTC ChIP-hHS-40-R
ChIP-gPCR CGTAGCTCAGGCCTCAAGAC ChIP-hGAPDH-FChIP-gPCR CGTAGCTCAGGCCTCAAGAC ChIP-hGAPDH-F
ChIP- CGAACAGGAGGAGCAGAGAG ChIP-hGAPDH-R qPCR aad) قليل النيوكليوتيد المستخدم في التجارب ٠ChIP- CGAACAGGAGGAGCAGAGAG ChIP-hGAPDH-R qPCR aad) oligonucleotide used in experiments 0
OY AYOY AY
Claims (1)
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201261730369P | 2012-11-27 | 2012-11-27 | |
US201261730323P | 2012-11-27 | 2012-11-27 | |
US201361776144P | 2013-03-11 | 2013-03-11 | |
US201361889174P | 2013-10-10 | 2013-10-10 | |
PCT/US2013/072236 WO2014085593A1 (en) | 2012-11-27 | 2013-11-27 | Targeting bcl11a distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SA515360489B1 true SA515360489B1 (en) | 2016-12-25 |
Family
ID=50828461
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SA515360489A SA515360489B1 (en) | 2012-11-27 | 2015-05-27 | Targeting bcl11a distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction |
Country Status (18)
Country | Link |
---|---|
US (4) | US9822355B2 (en) |
EP (2) | EP2925864B1 (en) |
JP (2) | JP6542124B2 (en) |
KR (1) | KR102240555B1 (en) |
CN (2) | CN109554350B (en) |
AU (3) | AU2013352156B2 (en) |
BR (1) | BR112015011995B1 (en) |
CA (1) | CA2892860C (en) |
DK (2) | DK2925864T3 (en) |
ES (2) | ES2884925T3 (en) |
HK (1) | HK1215720A1 (en) |
IL (1) | IL238949B (en) |
MX (1) | MX361412B (en) |
PT (2) | PT2925864T (en) |
SA (1) | SA515360489B1 (en) |
SG (3) | SG11201504038XA (en) |
WO (1) | WO2014085593A1 (en) |
ZA (1) | ZA201504004B (en) |
Families Citing this family (95)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP6261500B2 (en) | 2011-07-22 | 2018-01-17 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity |
ES2884925T3 (en) | 2012-11-27 | 2021-12-13 | Childrens Medical Ct Corp | Distal regulatory elements of BCL11A as targets for fetal hemoglobin reinduction |
US9163284B2 (en) | 2013-08-09 | 2015-10-20 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for identifying a target site of a Cas9 nuclease |
WO2015033343A1 (en) | 2013-09-03 | 2015-03-12 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Ltd. | Compositions and methods for expressing recombinant polypeptides |
AU2014316676B2 (en) * | 2013-09-04 | 2020-07-23 | Csir | Site-specific nuclease single-cell assay targeting gene regulatory elements to silence gene expression |
US9322037B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-04-26 | President And Fellows Of Harvard College | Cas9-FokI fusion proteins and uses thereof |
US9340800B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-05-17 | President And Fellows Of Harvard College | Extended DNA-sensing GRNAS |
US9737604B2 (en) | 2013-09-06 | 2017-08-22 | President And Fellows Of Harvard College | Use of cationic lipids to deliver CAS9 |
US10767156B2 (en) | 2013-10-24 | 2020-09-08 | Yeda Research And Development Co., Ltd. | Polynucleotides encoding BREX system polypeptides and methods of using same |
AU2014346559B2 (en) | 2013-11-07 | 2020-07-09 | Editas Medicine,Inc. | CRISPR-related methods and compositions with governing gRNAs |
RS62559B1 (en) | 2013-11-13 | 2021-12-31 | Childrens Medical Center | Nuclease-mediated regulation of gene expression |
US11053481B2 (en) | 2013-12-12 | 2021-07-06 | President And Fellows Of Harvard College | Fusions of Cas9 domains and nucleic acid-editing domains |
SG10201809290SA (en) | 2014-04-25 | 2019-01-30 | Childrens Medical Ct Corp | Compositions and Methods to Treating Hemoglobinopathies |
WO2016005985A2 (en) | 2014-07-09 | 2016-01-14 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Ltd. | Method for reprogramming cells |
US10077453B2 (en) | 2014-07-30 | 2018-09-18 | President And Fellows Of Harvard College | CAS9 proteins including ligand-dependent inteins |
IL234638A0 (en) | 2014-09-14 | 2014-12-02 | Yeda Res & Dev | Nmda receptor antagonists for treating gaucher disease |
US20180200387A1 (en) | 2015-02-23 | 2018-07-19 | Crispr Therapeutics Ag | Materials and methods for treatment of human genetic diseases including hemoglobinopathies |
US20180030438A1 (en) | 2015-02-23 | 2018-02-01 | Crispr Therapeutics Ag | Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies |
US20180064748A1 (en) | 2015-03-27 | 2018-03-08 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Methods of treating motor neuron diseases |
US11572543B2 (en) * | 2015-05-08 | 2023-02-07 | The Children's Medical Center. Corporation | Targeting BCL11A enhancer functional regions for fetal hemoglobin reinduction |
JP7030522B2 (en) | 2015-05-11 | 2022-03-07 | エディタス・メディシン、インコーポレイテッド | Optimized CRISPR / CAS9 system and method for gene editing in stem cells |
BR112017024115A2 (en) * | 2015-05-12 | 2018-08-07 | Sangamo Therapeutics Inc | nuclease-mediated gene expression regulation |
TWI762444B (en) * | 2015-05-13 | 2022-05-01 | 美商西建公司 | Treatment of beta-thalassemia using actrii ligand traps |
AU2016276702B2 (en) | 2015-06-09 | 2022-07-28 | Editas Medicine, Inc. | CRISPR/CAS-related methods and compositions for improving transplantation |
BR112018000903A2 (en) | 2015-07-16 | 2018-09-11 | Biokine Therapeutics Ltd. | compositions and methods for cancer treatment |
WO2017070632A2 (en) | 2015-10-23 | 2017-04-27 | President And Fellows Of Harvard College | Nucleobase editors and uses thereof |
US20180273609A1 (en) | 2015-11-04 | 2018-09-27 | Crispr Therapeutics Ag | Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies |
CA3009727A1 (en) * | 2015-12-28 | 2017-07-06 | Novartis Ag | Compositions and methods for the treatment of hemoglobinopathies |
US10828318B2 (en) | 2016-01-06 | 2020-11-10 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Compositions and methods for treating malignant, autoimmune and inflammatory diseases |
EP3405024B1 (en) | 2016-01-21 | 2022-12-28 | The State of Israel - Ministry of Agriculture & Rural Development, Agricultural Research Organization (ARO) (Volcani Center) | Parthenocarpic plants and methods of producing same |
WO2017130205A1 (en) | 2016-01-31 | 2017-08-03 | Hadasit Medical Research Services And Development Ltd. | Autosomal-identical pluripotent stem cell populations having non-identical sex chromosomal composition and uses thereof |
CN108883136A (en) | 2016-02-12 | 2018-11-23 | 蓝鸟生物公司 | VCN enhancer combination object and its application method |
RU2021103425A (en) | 2016-02-12 | 2021-02-25 | Блубёрд Био, Инк. | COMPOSITIONS INCREASING THE NUMBER OF VECTOR COPIES (VECTOR COPIES) AND METHODS OF THEIR APPLICATION |
US20190046497A1 (en) | 2016-02-14 | 2019-02-14 | Yeda Research And Development Co., Ltd. | Methods of modulating protein exocytosis and uses of same in therapy |
US20190216891A1 (en) | 2016-03-06 | 2019-07-18 | Yeda Research And Development Co., Ltd. | Method for modulating myelination |
CN117821458A (en) * | 2016-03-14 | 2024-04-05 | 爱迪塔斯医药公司 | CRISPR/CAS related methods and compositions for treating beta-hemoglobinopathies |
BR112018071321A2 (en) * | 2016-04-18 | 2019-02-26 | Crispr Therapeutics Ag | Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies |
WO2018027078A1 (en) | 2016-08-03 | 2018-02-08 | President And Fellows Of Harard College | Adenosine nucleobase editors and uses thereof |
CA3033327A1 (en) | 2016-08-09 | 2018-02-15 | President And Fellows Of Harvard College | Programmable cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof |
IL247368A0 (en) | 2016-08-18 | 2016-11-30 | Yeda Res & Dev | Diagnostic and therapeutic uses of exosomes |
WO2018039438A1 (en) | 2016-08-24 | 2018-03-01 | President And Fellows Of Harvard College | Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing |
GB2573062A (en) | 2016-10-14 | 2019-10-23 | Harvard College | AAV delivery of nucleobase editors |
US11542508B2 (en) | 2016-11-28 | 2023-01-03 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides and methods of using same for expressing an expression product of interest |
WO2018119359A1 (en) | 2016-12-23 | 2018-06-28 | President And Fellows Of Harvard College | Editing of ccr5 receptor gene to protect against hiv infection |
EP3563159A1 (en) | 2016-12-29 | 2019-11-06 | Ukko Inc. | Methods for identifying and de-epitoping allergenic polypeptides |
IL250479A0 (en) | 2017-02-06 | 2017-03-30 | Sorek Rotem | Isolated cells genetically modified to express a disarm system having an anti-phage activity and methods of producing same |
TW201839136A (en) | 2017-02-06 | 2018-11-01 | 瑞士商諾華公司 | Compositions and methods for the treatment of hemoglobinopathies |
US11898179B2 (en) | 2017-03-09 | 2024-02-13 | President And Fellows Of Harvard College | Suppression of pain by gene editing |
WO2018165629A1 (en) | 2017-03-10 | 2018-09-13 | President And Fellows Of Harvard College | Cytosine to guanine base editor |
EP3596217A1 (en) | 2017-03-14 | 2020-01-22 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for the treatment of hemoglobinopathies |
KR20190130613A (en) | 2017-03-23 | 2019-11-22 | 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 | Nucleobase edits comprising nucleic acid programmable DNA binding proteins |
US11261441B2 (en) | 2017-03-29 | 2022-03-01 | Bluebird Bio, Inc. | Vectors and compositions for treating hemoglobinopathies |
IL252151A0 (en) | 2017-05-07 | 2017-07-31 | Fainzilber Michael | Methods of treating psychiatric stress disorders |
EP3622070A2 (en) * | 2017-05-10 | 2020-03-18 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/rna-guided nuclease systems and methods |
US11560566B2 (en) | 2017-05-12 | 2023-01-24 | President And Fellows Of Harvard College | Aptazyme-embedded guide RNAs for use with CRISPR-Cas9 in genome editing and transcriptional activation |
WO2018218135A1 (en) | 2017-05-25 | 2018-11-29 | The Children's Medical Center Corporation | Bcl11a guide delivery |
US11866726B2 (en) | 2017-07-14 | 2024-01-09 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for targeted integration and genome editing and detection thereof using integrated priming sites |
IL253642A0 (en) | 2017-07-24 | 2017-09-28 | Seger Rony | Combination therapy for the treatment of cancer |
CN111801345A (en) | 2017-07-28 | 2020-10-20 | 哈佛大学的校长及成员们 | Methods and compositions using an evolved base editor for Phage Assisted Continuous Evolution (PACE) |
US11692166B2 (en) | 2017-08-23 | 2023-07-04 | Technion Research & Development Foundation Limited | Compositions and methods for improving alcohol tolerance in yeast |
WO2019139645A2 (en) | 2017-08-30 | 2019-07-18 | President And Fellows Of Harvard College | High efficiency base editors comprising gam |
WO2019079347A1 (en) | 2017-10-16 | 2019-04-25 | The Broad Institute, Inc. | Uses of adenosine base editors |
CN109722415B (en) * | 2017-10-27 | 2021-01-26 | 博雅辑因(北京)生物科技有限公司 | Hematopoietic stem cell culture composition, culture medium and hematopoietic stem cell culture method |
IL255664A0 (en) | 2017-11-14 | 2017-12-31 | Shachar Idit | Hematopoietic stem cells with improved properties |
WO2019147302A1 (en) * | 2018-01-26 | 2019-08-01 | Bauer Daniel E | Targeting bcl11a distal regulatory elements with a cas9-cas9 fusion for fetal hemoglobin reinduction |
IL257225A (en) | 2018-01-29 | 2018-04-09 | Yeda Res & Dev | Treatment of sarcoma |
EP3749767A1 (en) | 2018-02-05 | 2020-12-16 | Vertex Pharmaceuticals Incorporated | Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies |
WO2019150203A1 (en) | 2018-02-05 | 2019-08-08 | Crispr Therapeutics Ag | Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies |
AU2019297677A1 (en) | 2018-07-04 | 2021-02-25 | Ukko Inc. | Methods of de-epitoping wheat proteins and use of same for the treatment of celiac disease |
IL262658A (en) | 2018-10-28 | 2020-04-30 | Memorial Sloan Kettering Cancer Center | Prevention of age related clonal hematopoiesis and diseases associated therewith |
WO2020112979A2 (en) * | 2018-11-30 | 2020-06-04 | Bauer Daniel E | Therapeutic gene editing for elane-associated disease |
CN109486850B (en) * | 2018-12-04 | 2021-05-25 | 厦门大学 | Optogenetic tool for UV-B light-down regulation of chromatin long-distance interaction |
WO2020178822A1 (en) | 2019-03-05 | 2020-09-10 | The State Of Israel, Ministry Of Agriculture & Rural Development, Agricultural Research Organization (Aro) (Volcani Center) | Genome-edited birds |
KR20210143230A (en) | 2019-03-19 | 2021-11-26 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | Methods and compositions for editing nucleotide sequences |
CN111939271A (en) * | 2019-04-30 | 2020-11-17 | 博雅辑因(北京)生物科技有限公司 | Method for predicting treatment effectiveness of hemoglobinopathy |
EA202192931A1 (en) * | 2019-04-30 | 2022-02-22 | Эдиджен Инк. | METHOD FOR PREDICTION OF THE EFFICIENCY OF HEMOGLOBINOPATHY TREATMENT |
US20220251148A1 (en) | 2019-07-04 | 2022-08-11 | Ukko Inc. | De-epitoped alpha gliadin and use of same for the management of celiac disease and gluten sensitivity |
IL268111A (en) | 2019-07-16 | 2021-01-31 | Fainzilber Michael | Methods of treating pain |
IL270306A (en) | 2019-10-30 | 2021-05-31 | Yeda Res & Dev | Prevention and treatment of pre-myeloid and myeloid malignancies |
IL271656A (en) | 2019-12-22 | 2021-06-30 | Yeda Res & Dev | Systems and methods for identifying cells that have undergone genome editing |
WO2021152587A1 (en) | 2020-01-30 | 2021-08-05 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Treating acute liver disease with tlr-mik inhibitors |
CN116096873A (en) | 2020-05-08 | 2023-05-09 | 布罗德研究所股份有限公司 | Methods and compositions for editing two strands of a target double-stranded nucleotide sequence simultaneously |
CN111705044B (en) * | 2020-05-23 | 2022-12-27 | 南京大学 | Construction of novel controllable high-activity G quadruplex DNA enzyme |
EP4225902A1 (en) | 2020-10-05 | 2023-08-16 | Protalix Ltd. | Dicer-like knock-out plant cells |
EP4228637A1 (en) | 2020-10-15 | 2023-08-23 | Yeda Research and Development Co. Ltd | Method of treating myeloid malignancies |
IL302707A (en) | 2020-11-26 | 2023-07-01 | Ukko Inc | Modified high molecular weight glutenin subunit and uses thereof |
IL279559A (en) | 2020-12-17 | 2022-07-01 | Yeda Res & Dev | Controlling ubiquitination of mlkl for treatment of disease |
CN116829715A (en) | 2020-12-18 | 2023-09-29 | 耶达研究及发展有限公司 | Compositions for treating CHD2 haploinsufficiency and methods of identifying same |
IL308282A (en) | 2021-05-10 | 2024-01-01 | Yissum Res Dev Co Of Hebrew Univ Jerusalem Ltd | Pharmaceutical compositions for treating neurological conditions |
WO2022240787A1 (en) * | 2021-05-13 | 2022-11-17 | The Children's Medical Center Corporation | Methods for stratifying subjects for fetal hemoglobin reinduction |
EP4355857A1 (en) | 2021-06-13 | 2024-04-24 | Yissum Research Development Company of the Hebrew University of Jerusalem Ltd. | Method for reprogramming human cells |
EP4130028A1 (en) | 2021-08-03 | 2023-02-08 | Rhazes Therapeutics Ltd | Engineered tcr complex and methods of using same |
KR20240040770A (en) | 2021-08-03 | 2024-03-28 | 제니시티 리미티드 | Engineered TCR complexes and methods of using the same |
WO2023062636A1 (en) | 2021-10-14 | 2023-04-20 | Weedout Ltd. | Methods of weed control |
WO2023240282A1 (en) | 2022-06-10 | 2023-12-14 | Umoja Biopharma, Inc. | Engineered stem cells and uses thereof |
Family Cites Families (47)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5061620A (en) | 1990-03-30 | 1991-10-29 | Systemix, Inc. | Human hematopoietic stem cell |
US5635387A (en) | 1990-04-23 | 1997-06-03 | Cellpro, Inc. | Methods and device for culturing human hematopoietic cells and their precursors |
US5460964A (en) | 1992-04-03 | 1995-10-24 | Regents Of The University Of Minnesota | Method for culturing hematopoietic cells |
US5409813A (en) | 1993-09-30 | 1995-04-25 | Systemix, Inc. | Method for mammalian cell separation from a mixture of cell populations |
US5677136A (en) | 1994-11-14 | 1997-10-14 | Systemix, Inc. | Methods of obtaining compositions enriched for hematopoietic stem cells, compositions derived therefrom and methods of use thereof |
US5928638A (en) | 1996-06-17 | 1999-07-27 | Systemix, Inc. | Methods for gene transfer |
US5731156A (en) * | 1996-10-21 | 1998-03-24 | Applied Imaging, Inc. | Use of anti-embryonic hemoglobin antibodies to identify fetal cells |
US8101349B2 (en) | 1997-12-23 | 2012-01-24 | Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. | Gene products differentially expressed in cancerous cells and their methods of use II |
FR2777909B1 (en) | 1998-04-24 | 2002-08-02 | Pasteur Institut | USE OF TRIPLEX-STRUCTURED DNA SEQUENCES FOR THE TRANSFER OF NUCLEOTID SEQUENCES IN CELLS, RECOMBINANT VECTORS CONTAINING THESE TRIPLEX SEQUENCES |
CZ308053B6 (en) | 2000-12-01 | 2019-11-27 | Max Planck Gesellschaft | Isolated double-stranded RNA molecule, process for producing it and its use |
JP2006507841A (en) | 2002-11-14 | 2006-03-09 | ダーマコン, インコーポレイテッド | Functional and ultrafunctional siRNA |
ATE474460T1 (en) | 2002-12-13 | 2010-08-15 | Genetix Pharmaceuticals Inc | THERAPEUTIC RETROVIRUS VECTORS FOR GENE THERAPY |
CA2566286A1 (en) | 2004-05-11 | 2005-12-08 | Rnai Co., Ltd. | Polynucleotide causing rna interfere and method of regulating gene expression with the use of the same |
DK2650365T3 (en) | 2005-10-18 | 2016-12-05 | Prec Biosciences | RATIONAL MEGANUCLEASES constructed with altered sequence specificity and DNA binding affinity |
US20080051431A1 (en) | 2006-05-26 | 2008-02-28 | Dominique Verhelle | Methods and compositions using immunomodulatory compounds in combination therapy |
US9051391B2 (en) | 2007-06-11 | 2015-06-09 | Takara Bio Inc. | Method for expression of specific gene |
GB0713183D0 (en) | 2007-07-06 | 2007-08-15 | King S College London | Method |
PT2334794T (en) * | 2008-09-15 | 2017-02-15 | Harvard College | Modulation of bcl11a for treatment of hemoglobinopathies |
US20110294114A1 (en) | 2009-12-04 | 2011-12-01 | Cincinnati Children's Hospital Medical Center | Optimization of determinants for successful genetic correction of diseases, mediated by hematopoietic stem cells |
CN102802412A (en) | 2009-12-08 | 2012-11-28 | 海玛奎斯特医药公司 | Methods and low dose regimens for treating red blood cell disorders |
JP2011135864A (en) * | 2009-12-30 | 2011-07-14 | Korea Univ Research & Business Foundation | Composition for retrodifferentiating somatic cell to embryonic stem cell-like cell, by using oct4 in combination with bmi1 or upstream regulator thereof, and method for generating embryonic stem cell-like cell using the same |
ES2699630T3 (en) | 2010-04-23 | 2019-02-12 | Cold Spring Harbor Laboratory | Innovative structurally designed ARNhc |
WO2012073047A2 (en) | 2010-12-03 | 2012-06-07 | Genome Research Limited | Compositions and methods |
EP2648763A4 (en) | 2010-12-10 | 2014-05-14 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Compositions and methods for inhibiting expression of klf-1 and bcl11a genes |
RU2014100160A (en) | 2011-06-10 | 2015-07-20 | Блуберд Байо, Инк. | VECTORS OF GENE THERAPY OF ADRENOLEUIC DYSTROPHY AND ADRENOMYELONEUROPATHY |
UA114796C2 (en) | 2011-09-30 | 2017-08-10 | Блубьод Байо, Інк. | Compounds for improved viral transduction |
DK2836226T3 (en) | 2012-02-24 | 2017-09-18 | Hutchinson Fred Cancer Res | COMPOSITIONS AND PROCEDURES FOR TREATING HEMOGLOBINOPATHY |
AP2014008100A0 (en) | 2012-05-16 | 2014-12-31 | Gen Hospital Corp | Compositions and methods for modulating hemoglobingene family expression |
JP6343605B2 (en) | 2012-05-25 | 2018-06-13 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | Methods and compositions for RNA-dependent target DNA modification and RNA-dependent transcriptional regulation |
ES2884925T3 (en) | 2012-11-27 | 2021-12-13 | Childrens Medical Ct Corp | Distal regulatory elements of BCL11A as targets for fetal hemoglobin reinduction |
RU2701850C2 (en) | 2012-12-12 | 2019-10-01 | Те Брод Инститьют, Инк. | Designing systems, methods and optimized guide compositions for manipulating sequences |
US10106816B2 (en) | 2012-12-14 | 2018-10-23 | Case Western Reserve University | Genomic RNA packaging enhancer element |
CA2910489A1 (en) | 2013-05-15 | 2014-11-20 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for treatment of a genetic condition |
WO2015065964A1 (en) | 2013-10-28 | 2015-05-07 | The Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, screens and applications thereof |
RS62559B1 (en) | 2013-11-13 | 2021-12-31 | Childrens Medical Center | Nuclease-mediated regulation of gene expression |
CN104955119B (en) | 2014-03-26 | 2019-11-26 | 南京中兴新软件有限责任公司 | A kind of method for switching network based on flow, device and terminal |
US20170049819A1 (en) | 2014-04-25 | 2017-02-23 | Bluebird Bio, Inc. | Kappa/lambda chimeric antigen receptors |
SG10201809290SA (en) | 2014-04-25 | 2019-01-30 | Childrens Medical Ct Corp | Compositions and Methods to Treating Hemoglobinopathies |
SI3134432T1 (en) | 2014-04-25 | 2021-01-29 | Bluebird Bio, Inc. | Mnd promoter chimeric antigen receptors |
JP7026440B2 (en) | 2014-05-28 | 2022-02-28 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | Hybrid tRNA / premiRNA molecules and usage |
HRP20211648T1 (en) | 2014-12-12 | 2022-02-04 | 2Seventy Bio, Inc. | Bcma chimeric antigen receptors |
WO2016182893A1 (en) | 2015-05-08 | 2016-11-17 | Teh Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems for saturating mutagenesis of non-coding elements, compositions, methods, libraries and applications thereof |
CN107614680A (en) | 2015-05-14 | 2018-01-19 | 南加利福尼亚大学 | Utilize the optimization gene editing of recombinant nucleic acid inscribe enzyme system |
AU2016315704B2 (en) | 2015-08-31 | 2022-08-11 | Helixmith Co., Ltd | Anti-sialyl Tn chimeric antigen receptors |
GB201522243D0 (en) | 2015-12-16 | 2016-01-27 | Ucl Business Plc | Treatment |
RU2021103425A (en) | 2016-02-12 | 2021-02-25 | Блубёрд Био, Инк. | COMPOSITIONS INCREASING THE NUMBER OF VECTOR COPIES (VECTOR COPIES) AND METHODS OF THEIR APPLICATION |
WO2018218135A1 (en) | 2017-05-25 | 2018-11-29 | The Children's Medical Center Corporation | Bcl11a guide delivery |
-
2013
- 2013-11-27 ES ES18203436T patent/ES2884925T3/en active Active
- 2013-11-27 BR BR112015011995-6A patent/BR112015011995B1/en active IP Right Grant
- 2013-11-27 DK DK13858006.3T patent/DK2925864T3/en active
- 2013-11-27 US US14/647,547 patent/US9822355B2/en active Active
- 2013-11-27 EP EP13858006.3A patent/EP2925864B1/en active Active
- 2013-11-27 PT PT13858006T patent/PT2925864T/en unknown
- 2013-11-27 PT PT182034363T patent/PT3502240T/en unknown
- 2013-11-27 SG SG11201504038XA patent/SG11201504038XA/en unknown
- 2013-11-27 WO PCT/US2013/072236 patent/WO2014085593A1/en active Application Filing
- 2013-11-27 EP EP18203436.3A patent/EP3502240B1/en active Active
- 2013-11-27 DK DK18203436.3T patent/DK3502240T3/en active
- 2013-11-27 JP JP2015544205A patent/JP6542124B2/en active Active
- 2013-11-27 AU AU2013352156A patent/AU2013352156B2/en active Active
- 2013-11-27 ES ES13858006T patent/ES2708948T3/en active Active
- 2013-11-27 MX MX2015006528A patent/MX361412B/en active IP Right Grant
- 2013-11-27 CA CA2892860A patent/CA2892860C/en active Active
- 2013-11-27 SG SG10202110062SA patent/SG10202110062SA/en unknown
- 2013-11-27 CN CN201810979764.8A patent/CN109554350B/en active Active
- 2013-11-27 KR KR1020157016749A patent/KR102240555B1/en active IP Right Grant
- 2013-11-27 SG SG10201704008RA patent/SG10201704008RA/en unknown
- 2013-11-27 CN CN201380071452.2A patent/CN104955943B/en active Active
-
2015
- 2015-05-21 IL IL238949A patent/IL238949B/en active IP Right Grant
- 2015-05-27 SA SA515360489A patent/SA515360489B1/en unknown
- 2015-06-04 ZA ZA2015/04004A patent/ZA201504004B/en unknown
-
2016
- 2016-03-30 HK HK16103646.4A patent/HK1215720A1/en unknown
-
2017
- 2017-11-17 US US15/816,083 patent/US10472619B2/en active Active
- 2017-12-18 JP JP2017241379A patent/JP6633602B2/en active Active
-
2018
- 2018-12-11 AU AU2018278850A patent/AU2018278850B2/en active Active
-
2019
- 2019-09-17 US US16/573,389 patent/US11542493B2/en active Active
-
2021
- 2021-08-16 AU AU2021218012A patent/AU2021218012B2/en active Active
-
2022
- 2022-12-02 US US18/074,107 patent/US20230348887A1/en active Pending
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
SA515360489B1 (en) | Targeting bcl11a distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction | |
US20230235285A1 (en) | Targeting bcl11a enhancer functional regions for fetal hemoglobin reinduction | |
US20210047632A1 (en) | Targeting bcl11a distal regulatory elements with a cas9-cas9 fusion for fetal hemoglobin reinduction | |
WO2022240787A1 (en) | Methods for stratifying subjects for fetal hemoglobin reinduction | |
Shannon | The Molecular Biology of Sickle Cell Anaemia |