RU2809912C1 - Method of predicting risk of developing hypertension in men based on results of genetic testing - Google Patents

Method of predicting risk of developing hypertension in men based on results of genetic testing Download PDF

Info

Publication number
RU2809912C1
RU2809912C1 RU2023118683A RU2023118683A RU2809912C1 RU 2809912 C1 RU2809912 C1 RU 2809912C1 RU 2023118683 A RU2023118683 A RU 2023118683A RU 2023118683 A RU2023118683 A RU 2023118683A RU 2809912 C1 RU2809912 C1 RU 2809912C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
hypertension
risk
men
obfc1
bag6
Prior art date
Application number
RU2023118683A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Татьяна Анатольевна Иванова
Михаил Иванович Чурносов
Анна Владимировна Елыкова
Мария Юрьевна Абрамова
Ирина Васильевна Пономаренко
Original Assignee
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ")
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ") filed Critical Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ")
Application granted granted Critical
Publication of RU2809912C1 publication Critical patent/RU2809912C1/en

Links

Abstract

FIELD: medicine; cardiology; biotechnology and medical genetics.
SUBSTANCE: invention can be used to predict the risk of developing hypertension in men based on the results of genetic testing. DNA from the peripheral venous blood is isolated. The polymorphic loci BAG6, AC026703.1 and OBFC1 are analyzed. When identifying a combination of genotypes rs805303 GG BAG6 × rs1173771 AA AC026703.1 × rs4387287 AA OBFC1 a high risk of developing hypertension in men is predicted.
EFFECT: method provides new criteria for assessing the risk of developing ×hypertension in men of Russian nationality who are natives of the Central Black Earth Region of the Russian Federation and are not relatives to each other, based on data on the combination of genotypes of the BAG6, AC026703, OBFC1 and RGL3 genes.
1 cl, 1 tbl, 4 ex

Description

Изобретение относится к области медицины, а именно кардиологии, к биотехнологии, медицинской генетике и может быть использовано для прогнозирования риска развития артериальной гипертензии у мужчин.The invention relates to the field of medicine, namely cardiology, biotechnology, medical genetics, and can be used to predict the risk of developing arterial hypertension in men.

Гипертоническая болезнь (ГБ, эссенциальная гипертензия) - это хронически протекающее заболевание, основным проявлением которого является артериальная гипертензия, не ассоциированная с патологическими процессами, при которых повышение артериального давления обусловлено известными причинами [Диагностика и лечение артериальной гипертензии [Текст]: рос. рекомендации (четвертый пересмотр) / Рос. мед. о-во по артериальной гипертонии, Всерос. науч. о-во кардиологов; Е.И. Чазова, Л.Г. Ратова, С.А. Бойцов [и др.]. - Москва, 2010. - 34 с. ]. Диагноз ГБ устанавливается при среднем значении двух и более последовательных измерений систолического АД ≥140 мм.рт.ст. и/или диастолического АД ≥90 мм.рт.ст. [Чазова, И.Е. Рекомендации по диагноcтике и лечению артериальной гипертензии / И.Е. Чазова, Е.В. Ощепкова, Ю.В. Жернакова // Кардиологичеcкий веcтник. - 2015. - № 1. - C. 3-30.]. Этиология и патогенез гипертонической болезни активно изучаются как российскими так и зарубежными исследователями. Известными факторами риска развития ГБ являются возраст, половая принадлежность, высокий уровень потребления соли, дислипидемия, абдоминальное ожирение, вредные привычки, частые стрессовые ситуации, низкая физическая активность, а также генетические факторы [Lee HA, Park H. Diet-Related Risk Factors for Incident Hypertension During an 11-Year Follow-Up: The Korean Genome Epidemiology Study. Nutrients. 2018;10(8):1077. Published 2018 Aug 13. doi:10.3390/nu10081077].Hypertension (EH, essential hypertension) is a chronic disease, the main manifestation of which is arterial hypertension, not associated with pathological processes in which the increase in blood pressure is due to known causes [Diagnostics and treatment of arterial hypertension [Text]: growing. recommendations (fourth revision) / Ross. honey. Institute for Arterial Hypertension, Vseros. scientific Society of Cardiologists; E.I. Chazova, L.G. Ratova, S.A. Boytsov [and others]. - Moscow, 2010. - 34 p. ]. The diagnosis of hypertension is established when the average value of two or more consecutive systolic blood pressure measurements is ≥140 mmHg. and/or diastolic blood pressure ≥90 mmHg. [Chazova, I.E. Recommendations for the diagnosis and treatment of arterial hypertension / I.E. Chazova, E.V. Oshchepkova, Yu.V. Zhernakova // Cardiological Bulletin. - 2015. - No. 1. - P. 3-30.]. The etiology and pathogenesis of hypertension are being actively studied by both Russian and foreign researchers. Known risk factors for the development of hypertension are age, gender, high salt intake, dyslipidemia, abdominal obesity, bad habits, frequent stressful situations, low physical activity, as well as genetic factors [Lee HA, Park H. Diet-Related Risk Factors for Incident Hypertension During an 11-Year Follow-Up: The Korean Genome Epidemiology Study. Nutrients. 2018;10(8):1077. Published 2018 Aug 13. doi:10.3390/nu10081077].

По некоторым оценкам, к 2025 г. число больных ГБ достигло 1,56 млрд [Taljaard, M. et al. Cardiovascular disease population risk tool (CVDPoRT): predictive algorithm for assessing CVD risk in the community setting. BMJ Open. 4, 213-219 (2014).]. Ежегодно во всем мире регистрируется более 9,4 млн случаев смерти в результате осложнений ГБ, таких как инсульт, инфаркт миокарда, почечная недостаточность и др. [Tocci, G. et al. Therapeutic approach to hypertension urgencies and emergencies during acute coronary syndrome. High Blood Press. Cardiovasc. Prev. 25, 253-259.].According to some estimates, by 2025 the number of HD patients will reach 1.56 billion [Taljaard, M. et al. Cardiovascular disease population risk tool (CVDPoRT): predictive algorithm for assessing CVD risk in the community setting. BMJ Open. 4, 213-219 (2014).]. Every year, more than 9.4 million deaths are recorded worldwide as a result of complications of hypertension, such as stroke, myocardial infarction, renal failure, etc. [Tocci, G. et al. Therapeutic approach to hypertension urgencies and emergencies during acute coronary syndrome. High Blood Press. Cardiovasc. Prev. 25, 253-259].

По результатам зарубежных исследований распространенность артериальной гипертензии среди населения составляет 30-45 %, преобладает среди лиц мужского пола [Артериальная гипертензия у взрослых. Клинические гипертензия рекомендации 2020 / Ж. Д. Кобалава, А. О. Конради, С. В. Недогода [и др.] // Российский кардиологический журнал. - 2020. - Т. 25, № 3. - С. 149-218.]. Высокая частота среди лиц мужского пола также прослеживается и в российской популяции (в возрасте 25-65 лет - 47 % среди мужчин и 40 % среди женщин) [Эпидемиология артериальной гипертензии в Российской Федерации - важность выбора критериев диагностики / А. М. Ерина, О. П. Ротарь, В. Н. Солнцев [и др.] // Кардиология. - 2019. - Т. 59, № 6. - С. 5-11.].According to the results of foreign studies, the prevalence of arterial hypertension among the population is 30-45%, prevailing among males [Arterial hypertension in adults. Clinical hypertension recommendations 2020 / Zh. D. Kobalava, A. O. Conradi, S. V. Nedogoda [et al.] // Russian Journal of Cardiology. - 2020. - T. 25, No. 3. - P. 149-218.]. A high frequency among males can also be traced in the Russian population (aged 25-65 years - 47% among men and 40% among women) [Epidemiology of arterial hypertension in the Russian Federation - the importance of choosing diagnostic criteria / A. M. Erina, O P. Rotar, V. N. Solntsev [etc.] // Cardiology. - 2019. - T. 59, No. 6. - P. 5-11.].

Изучению молекулярно-генетических основ гипертонической болезни на основе анализа ассоциаций однонуклеотидного полиморфизма отдельных генов-кандидатов (или групп генов-кандидатов) с развитием заболевания посвящено значительное количество работ как зарубежных, так и отечественных ученых. При этом следует отметить, что полученные данные неоднозначны, нередко противоречивы и имеют низкую воспроизводимость. Это определяет необходимость продолжения исследований молекулярно-генетических основ артериальной гипертензии, с использованием новых подходов активно развивающихся в настоящее время системной генетики и сетевой медицины.A significant number of works by both foreign and domestic scientists are devoted to the study of the molecular genetic basis of hypertension based on the analysis of associations of single nucleotide polymorphism of individual candidate genes (or groups of candidate genes) with the development of the disease. It should be noted that the data obtained are ambiguous, often contradictory and have low reproducibility. This determines the need to continue research into the molecular genetic basis of arterial hypertension, using new approaches of system genetics and network medicine that are currently actively developing.

Нами были специально отобраны полиморфные локусы генов-кандидатов, связанные с развитием артериальной гипертензии по данным полно-геномных исследований (Churnosov M, Abramova M, Reshetnikov E, et al. Polymorphisms of hypertension susceptibility genes as a risk factors of preeclampsia in the Caucasian population of central Russia. Placenta. 2022;129:51-61. doi:10.1016/j.placenta.2022.09.010). В основу отбора полиморфных локусов для данной работы были положены следующие критерии: статистически значимые при уровне p≤5×10-8 связи с АГ (или; встречаемость редкого аллеля 0,05 и более; наличие функциональных эффектов (связь с эпигенетическими характеристиками, транскрипцией генов согласно базы данных HaploReg, версия программы 4.1).We specifically selected polymorphic loci of candidate genes associated with the development of arterial hypertension according to genome-wide studies (Churnosov M, Abramova M, Reshetnikov E, et al. Polymorphisms of hypertension susceptibility genes as a risk factors of preeclampsia in the Caucasian population of central Russia. Placenta. 2022;129:51-61. doi:10.1016/j.placenta.2022.09.010). The selection of polymorphic loci for this work was based on the following criteria: statistically significant connections with hypertension at the p≤5×10 -8 level (or; occurrence of a rare allele of 0.05 or more; presence of functional effects (relationship with epigenetic characteristics, gene transcription according to the HaploReg database, program version 4.1).

В Российской Федерации исследования вовлеченности данных о полиморфных локусах BAG6, AC026703.1 и OBFC1 в формировании предрасположенности к гипертонической болезни у мужчин единичны и фрагментарны, а данные о роли комбинации генотипов генов rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и rs4387287 гена OBFC1 в развитии гипертонической болезни у мужчин отсутствуют.In the Russian Federation, studies of the involvement of data on the polymorphic loci BAG6, AC026703.1 and OBFC1 in the formation of predisposition to hypertension in men are single and fragmentary, and data on the role of the combination of genotypes of the rs805303 gene BAG6, rs1173771 gene AC026703.1 and rs4387287 gene OBFC1 in the development There are no hypertension in men.

Для оценки сложившейся патентной ситуации был выполнен поиск по охранным документам за период с 1990 по 2023 гг. Анализ документов производился по направлению: способ прогнозирования риска развития гипертонической болезни у мужчин в зависимости от данных о полиморфных локусах BAG6, AC026703.1 и OBFC1. Источник информации: сайт Федерального института промышленной собственности http://fips.ru.To assess the current patent situation, a search was performed on protection documents for the period from 1990 to 2023. The analysis of documents was carried out in the following direction: a method for predicting the risk of developing hypertension in men depending on data on the polymorphic loci BAG6, AC026703.1 and OBFC1. Source of information: website of the Federal Institute of Industrial Property http://fips.ru.

В изученной научно-медицинской и доступной патентной литературе авторами не было обнаружено способа прогнозирования риска развития гипертонической болезни у мужчин на основе данных о SNP х SNP взаимодействий и на основе данных о комбинации генотипов генов BAG6, AC026703.1 и OBFC1.In the studied scientific, medical and available patent literature, the authors did not find a method for predicting the risk of developing hypertension in men based on data on SNP x SNP interactions and on the basis of data on the combination of genotypes of the BAG6, AC026703.1 and OBFC1 genes.

Из области техники известен патент RU №2257139 (опубл. 27.07.2005) Способ прогнозирования возникновения гипертонической болезни. Изобретение относится к области медицины, а именно к терапии, и может быть использовано при прогнозировании гипертонической болезни (ГБ), в том числе при профосмотрах. У испытуемых оценивают гемодинамический показатель в ответ на нагрузочную пробу. При этом в качестве нагрузочной пробы пациент делает глубокий вдох и задерживает дыхание. Оценивают полноту наполнения пульса до нагрузки и на высоте задержки дыхания и при сохранении или повышении полноты наполнения пульса на высоте задержки дыхания прогнозируют возникновение гипертонической болезни. Способ расширяет арсенал диагностических средств для прогноза гипертонической болезни. Недостаток указанного способа заключается в том, что не рассматриваются сочетания полиморфных маркеров генов-кандидатов с риском развития гипертонической болезни, не учитывается половой диморфизм.Patent RU No. 2257139 (published on July 27, 2005) is known from the field of technology. A method for predicting the occurrence of hypertension. The invention relates to the field of medicine, namely to therapy, and can be used in predicting hypertension (HT), including during medical examinations. The subjects are assessed for hemodynamic parameters in response to a stress test. In this case, as a stress test, the patient takes a deep breath and holds his breath. The completeness of pulse filling is assessed before exercise and at the height of breath-holding, and if the completeness of pulse filling remains or increases at the height of breath-holding, the occurrence of hypertension is predicted. The method expands the arsenal of diagnostic tools for prognosis of hypertension. The disadvantage of this method is that combinations of polymorphic markers of candidate genes with the risk of developing hypertension are not considered, and sexual dimorphism is not taken into account.

В патенте RU №2329503 (опубл. 20.07.2008) описан способ оценки риска прогрессирования артериальной гипертензии у женщин. Изобретение относится к области медицины, в частности к кардиологии, и может быть использовано для прогнозирования течения артериальной гипертензии (АГ). Сущность способа: готовят суспензию эритроцитов в буферном растворе и методом 31Р-ЯМР определяют содержание аденозинтрифосфата (АТФ) и 2,3-дифосфоглицерата (ДФГ) эритроцитов в относительных единицах. В зависимости от возраста женщин по прогностическим таблицам определяют процент риска утяжеления течения эссенциальной АГ в ближайшие 5 лет. Использование способа дает возможность регистрировать биохимические параметры энергетического метаболизма эритроцитов, что приводит к верификации медицинского прогноза. Также способ позволяет определить процент риска утяжеления течения эссенциальной АГ у женщин в ближайшие 5 лет. Недостаток метода заключается в сложности анализа и низкой доступности использованного оборудования, кроме того, данный способ применим только для женщин и не рассматриваются генетические полиморфизмы прогнозирования риска гипертонической болезни у мужчин.Patent RU No. 2329503 (published July 20, 2008) describes a method for assessing the risk of progression of arterial hypertension in women. The invention relates to the field of medicine, in particular to cardiology, and can be used to predict the course of arterial hypertension (AH). The essence of the method: a suspension of erythrocytes is prepared in a buffer solution and the content of adenosine triphosphate (ATP) and 2,3-diphosphoglycerate (DPG) of erythrocytes is determined using the 31 P-NMR method in relative units. Depending on the age of women, the percentage of risk of worsening the course of essential hypertension in the next 5 years is determined using prognostic tables. Using the method makes it possible to record the biochemical parameters of the energy metabolism of erythrocytes, which leads to verification of the medical prognosis. The method also makes it possible to determine the percentage of risk of worsening the course of essential hypertension in women in the next 5 years. The disadvantage of the method is the complexity of the analysis and low availability of the equipment used; in addition, this method is applicable only to women and genetic polymorphisms for predicting the risk of hypertension in men are not considered.

Известен патент RU №2456608 (опубл. 20.07.2012) Способ прогнозирования риска возникновения гипертонической болезни у мужчин. Изобретение относится к медицине, конкретно к диагностике в кардиологии, и касается способа прогнозирования риска возникновения гипертонической болезни у мужчин. Выделяют геномную ДНК из периферической венозной крови пациентов и выявляют генотипы полиморфизмов rs2266782 гена флавиновой монооксигеназы 3 типа, rs1056836 гена цитохрома Р-450 1В1 и rs1799930 гена N-ацетилтрансферазы 2 типа. Оценивают характер употребления алкоголя, факт курения и наличие контакта с вредными химическими веществами. Затем каждому из указанных факторов присваивают соответствующие цифровые значения, после чего по уравнению логистической регрессии с рассчитанными для каждого фактора коэффициентами регрессии рассчитывают натуральный логарифм отношения шансов возникновения гипертонической болезни у пациента. Затем рассчитывают вероятность отнесения пациента к группе с низким - от 1 до 10%, средним - от 11 до 19% или высоким - более 20% риском возникновения гипертонической болезни. Способ обеспечивает существенное повышение точности прогнозирования риска возникновения гипертонической болезни у мужчин посредством совместной оценки комплекса генетических и средовых факторов риска заболевания и использования метода логистического регрессионного анализа. Недостаток метода заключается в том, что он не рассматриваются сочетания полиморфных маркеров генов-кандидатов с риском развития гипертонической болезни у мужчин.Known patent RU No. 2456608 (published on July 20, 2012) A method for predicting the risk of hypertension in men. The invention relates to medicine, specifically to diagnostics in cardiology, and concerns a method for predicting the risk of hypertension in men. Genomic DNA is isolated from the peripheral venous blood of patients and genotypes of polymorphisms rs2266782 of the flavin monooxygenase type 3 gene, rs1056836 of the cytochrome P-450 1B1 gene and rs1799930 of the N-acetyltransferase type 2 gene are identified. The pattern of alcohol consumption, smoking, and exposure to harmful chemicals are assessed. Then, each of these factors is assigned corresponding numerical values, after which the natural logarithm of the odds ratio for the occurrence of hypertension in the patient is calculated using the logistic regression equation with the regression coefficients calculated for each factor. Then the probability of classifying the patient into a group with a low - from 1 to 10%, an average - from 11 to 19%, or a high - more than 20% risk of hypertension is calculated. The method provides a significant increase in the accuracy of predicting the risk of hypertension in men through a joint assessment of a complex of genetic and environmental risk factors for the disease and the use of logistic regression analysis. The disadvantage of the method is that it does not consider combinations of polymorphic markers of candidate genes with the risk of developing hypertension in men.

Задачей настоящего исследования является расширение арсенала методов диагностики, а именно создание способа прогнозирования риска развития гипертонической болезни у мужчин на основе данных о полиморфных локусах BAG6, AC026703.1 и OBFC1.The objective of this study is to expand the arsenal of diagnostic methods, namely to create a method for predicting the risk of developing hypertension in men based on data on the polymorphic loci BAG6, AC026703.1 and OBFC1.

Технический результат использования изобретения - получение критериев оценки риска развития гипертонической болезни у мужчин русской национальности, являющихся уроженцами Центрального Черноземья РФ и не имеющих родства между собой, на основе данных о полиморфных локусах BAG6, AC026703.1 и OBFC1, включающий:The technical result of using the invention is to obtain criteria for assessing the risk of developing hypertension in men of Russian nationality who are natives of the Central Black Earth Region of the Russian Federation and are not related to each other, based on data on the polymorphic loci BAG6, AC026703.1 and OBFC1, including:

- выделение ДНК из периферической венозной крови;- DNA extraction from peripheral venous blood;

- анализ полиморфных локусов rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и rs4387287 гена OBFC1;- analysis of polymorphic loci rs805303 of the BAG6 gene, rs1173771 of the AC026703.1 gene and rs4387287 of the OBFC1 gene;

- прогнозирование высокого риска развития артериальной гипертензии у мужчин при выявлении комбинации генотипов rs805303 GG BAG6 × rs1173771 AA AC026703.1 × rs4387287 AA OBFC1.- prediction of a high risk of developing arterial hypertension in men when identifying the combination of genotypes rs805303 GG BAG6 × rs1173771 AA AC026703.1 × rs4387287 AA OBFC1.

Новизна и изобретательский уровень заключаются в том, что из уровня техники не известна возможность прогноза развития гипертонической болезни у мужчин на основе данных о комбинации генотипов rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и rs4387287 гена OBFC1.The novelty and inventive step lie in the fact that the prior art does not know the possibility of predicting the development of hypertension in men based on data on the combination of genotypes rs805303 of the BAG6 gene, rs1173771 of the AC026703.1 gene and rs4387287 of the OBFC1 gene.

Способ осуществляют следующим образом:The method is carried out as follows:

Выделение геномной ДНК из периферической крови осуществляют методом фенольно-хлороформной экстракции [Miller, S. A. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells / S. A. Miller, D. D. Dykes, H. F. Polesky // Nucleic. Acids. Res. - 1988. - Vol. 16, № 3. - P. 1215] в два этапа. На первом этапе к 4 мл крови с ЭДТА добавляют 25 мл лизирующего буфера, содержащего 320мМ сахарозы, 1% тритон Х-100, 5мМ MgCl2, 10мМ трис-HCl (pH=7,6). Полученную смесь перемешивают и центрифугируют при 4°С, 4000 об./мин. в течение 20 минут. После центрифугирования надосадочную жидкость сливают, к осадку добавляют 4 мл раствора, содержащего 25 мМ ЭДТА (рН=8,0) и 75 мМ NaCl, ресуспензируют. Затем прибавляют 0,4 мл 10% SDS, 35 мкл протеиназы К (10мг/мл) и инкубируют образец при 37°С в течение 16 часов.Isolation of genomic DNA from peripheral blood is carried out using the phenol-chloroform extraction method [Miller, SA A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells / SA Miller, DD Dykes, HF Polesky // Nucleic. Acids. Res. - 1988. - Vol. 16, No. 3. - P. 1215] in two stages. At the first stage, 25 ml of lysis buffer containing 320 mM sucrose, 1% Triton X-100, 5 mM MgCl 2 , 10 mM Tris-HCl (pH = 7.6) is added to 4 ml of EDTA blood. The resulting mixture is stirred and centrifuged at 4°C, 4000 rpm. within 20 minutes. After centrifugation, the supernatant is poured off, 4 ml of a solution containing 25 mM EDTA (pH = 8.0) and 75 mM NaCl is added to the sediment and resuspended. Then add 0.4 ml of 10% SDS, 35 µl of proteinase K (10 mg/ml) and incubate the sample at 37°C for 16 hours.

На втором этапе из полученного лизата последовательно проводят экстракцию ДНК равными объемами фенола, фенол-хлороформа (1:1) и хлороформа с центрифугированием при 4000 об./мин. в течение 10 минут. После каждого центрифугирования производят отбор водной фазы. ДНК осаждают из раствора двумя объемами охлажденного 96% этанола. После лиофилизации полученную ДНК растворяют в бидистиллированной, деионизованной воде и хранят при -200С.At the second stage, DNA is sequentially extracted from the resulting lysate with equal volumes of phenol, phenol-chloroform (1:1) and chloroform with centrifugation at 4000 rpm. within 10 minutes. After each centrifugation, the aqueous phase is collected. DNA is precipitated from solution with two volumes of chilled 96% ethanol. After lyophilization, the resulting DNA is dissolved in bidistilled, deionized water and stored at -20 0 C.

Анализ полиморфных локусов rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и rs4387287 гена OBFC1 осуществлялся методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) на термоциклере CFX-96 Real-Time System (Bio-Rad) c использованием стандартных олигонуклеотидных праймеров и зондов.Analysis of the polymorphic loci rs805303 of the BAG6 gene, rs1173771 of the AC026703.1 gene and rs4387287 of the OBFC1 gene was carried out by polymerase chain reaction (PCR) on a CFX-96 Real-Time System thermal cycler (Bio-Rad) using standard oligonucleotide primers and probes.

Генотипирование исследуемых образцов осуществлялось с использованием программного обеспечения «CFX-Manager™» методом дискриминации аллелей по величинам относительных единиц флуоресценции (ОЕФ).Genotyping of the studied samples was carried out using the CFX-Manager™ software using the method of allele discrimination based on the values of relative fluorescence units (RFU).

Метод MDR в его модификации MB-MDR [Mbmdr: an R package for exploring gene-gene interactions associated with binary or quantitative traits / M. L. Calle, V. Urrea, N. Malats, K. Van Steen // Bioinformatics. - 2010. - Vol. 26, № 17. - P. 2198-2199] применялся для изучения интерлокусных взаимодействий, ассоциированных с артериальной гипертензии ом. Рассматривались двух-, трех-, четырех-, пяти- и шестилокусные модели. Расчеты проводили с ковариатами в программе MB-MDR (версия 2.6) в программной среде R. Наиболее значимые модели интерлокусных взаимодействий, связанных с артериальной гипертензии ом, отбирались на основе поправки Бонферрони (при этом рассматривалось число возможных комбинаций изучаемых SNPs генов BAG6, AC026703.1 и OBFC1 при 2-, 3-, 4-, 5- и 6-локусных моделях). В дальнейший анализ (валидация моделей с помощью пермутационного теста) включались модели межлокусных взаимодействий, соответствующие следующим критериям: 2-х локусные модели - p<1,78*10-3 (<0,05/28), 3-х локусные модели - p<8,92*10-4 (<0,05/56), 4-х локусные модели - p<7,14*10-4 (<0,05/70), 5-ти локусные модели - p<8,92*10-4 (<0,05/56), 6-ти локусные модели - p<1,78*10-3 (<0,05/28). Для отобранных в соответствии с вышеуказанными критериями наиболее значимых моделей SNP×SNP взаимодействий, ассоциированных с гипертонической болезнью, выполнялся пермутационный тест (проводилось 1000 пермутаций). Статистически значимым считали рperm≤0,001. Отдельные комбинации генотипов, связанные с риском развития гипертонической болезни у мужчин определялись методом MB-MDR при p<0,05.The MDR method in its modification MB-MDR [Mbmdr: an R package for exploring gene-gene interactions associated with binary or quantitative traits / ML Calle, V. Urrea, N. Malats, K. Van Steen // Bioinformatics. - 2010. - Vol. 26, No. 17. - P. 2198-2199] was used to study interlocus interactions associated with arterial hypertension. Two-, three-, four-, five- and six-locus models were considered. Calculations were performed with covariates in the MB-MDR program (version 2.6) in the R software environment. The most significant models of interlocus interactions associated with arterial hypertension were selected based on the Bonferroni correction (the number of possible combinations of the studied SNPs of the BAG6, AC026703.1 genes was considered and OBFC1 in 2-, 3-, 4-, 5- and 6-locus models). Further analysis (validation of models using a permutation test) included models of interlocus interactions that met the following criteria: 2-locus models - p<1.78*10 -3 (<0.05/28), 3-locus models - p<8.92*10 -4 (<0.05/56), 4-locus models - p<7.14*10 -4 (<0.05/70), 5-locus models - p< 8.92*10 -4 (<0.05/56), 6-locus models - p<1.78*10 -3 (<0.05/28). For the most significant models of SNP×SNP interactions associated with hypertension, selected in accordance with the above criteria, a permutation test was performed (1000 permutations were performed). P perm ≤0.001 was considered statistically significant. Certain combinations of genotypes associated with the risk of developing hypertension in men were determined by the MB-MDR method at p<0.05.

Возможность использования предложенного способа для оценки прогнозирования риска развития гипертонической болезни у мужчин подтверждает анализ результатов наблюдений 821 пациента (таблица 1).The possibility of using the proposed method to assess the prediction of the risk of developing hypertension in men is confirmed by the analysis of the results of observations of 821 patients (Table 1).

Изучаемые группы включали мужчин русской национальности, являющихся уроженцами Центрального Черноземья РФ и не имеющих родства между собой. Выборки формировались в соответствии с критериями включения и исключения. Критерии включения в группу больных ГБ: 1. Наличие артериальной гипертензии; 2. Русская национальность; 3. Уроженцы Центрально-Черноземного региона РФ. Критерии исключения: 1. Наличие симптоматических или вторичных гипертензий, печеночная недостаточность, почечная недостаточность; 2. Родство с лицами, включенными в исследование; 3. Отказ от участия в исследовании. Критерии включения в контрольную группу: 1. Русская национальность; 2. Уроженцы Центрально-Черноземного региона РФ; 3. Уровень систолического артериального давления <140 мм.рт.ст. и диастолического АД <90 мм.рт.ст. Критерии исключения: 1. Наличие у индивидуума метаболического синдрома, сердечно-сосудистых, аутоиммунных, онкологических заболеваний; 2. Родство с лицами, включенными в исследование; 3. Отказ от участия в исследовании.The groups studied included men of Russian nationality who were natives of the Central Black Earth Region of the Russian Federation and had no relationship with each other. The samples were formed in accordance with inclusion and exclusion criteria. Criteria for inclusion in the group of patients with hypertension: 1. Presence of arterial hypertension; 2. Russian nationality; 3. Natives of the Central Black Earth region of the Russian Federation. Exclusion criteria: 1. Presence of symptomatic or secondary hypertension, liver failure, renal failure; 2. Relationship with persons included in the study; 3. Refusal to participate in the study. Criteria for inclusion in the control group: 1. Russian nationality; 2. Natives of the Central Black Earth region of the Russian Federation; 3. Systolic blood pressure level <140 mmHg. and diastolic blood pressure <90 mmHg. Exclusion criteria: 1. The individual has metabolic syndrome, cardiovascular, autoimmune, and oncological diseases; 2. Relationship with persons included in the study; 3. Refusal to participate in the study.

Диагноз ГБ устанавливался в соответствии с рекомендациями Всероссийского научного общества кардиологов, на основании результатов клинического и лабораторно-инструментального обследования [Диагностика и лечение артериальной гипертензии: рос. рекомендации (четвертый пересмотр) / Рос. мед. о-во по артериальной гипертонии, Всерос. науч. о-во кардиологов; Е.И. Чазова, Л.Г. Ратова, С.А. Бойцов [и др.]. - Москва, 2010. - 34 с. ]. Общеклиническое, лабораторное, клинико-инструментальное обследование пациентов проводилось в неврологическом и кардиологическом отделениях областной клинической больницы Святителя Иоасафа г. Белгорода. В контрольную группу включались лица, проходившие профилактический осмотр в поликлинике областной клинической больницы Святителя Иоасафа г. Белгорода. Все пациенты включались в исследование после подписания информированного согласия на использование полученных данных для научно-исследовательских целей. Протокол исследования одобрен этическим комитетом медицинского факультета Белгородского государственного национального исследовательского университета.The diagnosis of hypertension was established in accordance with the recommendations of the All-Russian Scientific Society of Cardiologists, based on the results of clinical and laboratory-instrumental examination [Diagnostics and treatment of arterial hypertension: growth. recommendations (fourth revision) / Ross. honey. Institute for Arterial Hypertension, Vseros. scientific Society of Cardiologists; E.I. Chazova, L.G. Ratova, S.A. Boytsov [and others]. - Moscow, 2010. - 34 p. ]. General clinical, laboratory, clinical and instrumental examination of patients was carried out in the neurological and cardiological departments of the regional clinical hospital of St. Joasaph in Belgorod. The control group included persons who underwent a preventive examination at the clinic of the regional clinical hospital of St. Joasaph in Belgorod. All patients were included in the study after signing informed consent for the use of the obtained data for research purposes. The study protocol was approved by the ethics committee of the Faculty of Medicine of Belgorod State National Research University.

В группу больных включались индивидуумы с уровнем систолического артериального давления ≥140 мм.рт.ст. и/или диастолического АД ≥90 мм.рт.ст. Измерение показателей АД проводилось аускультативным методом по Короткову, результатом считали среднее значение трех последовательных измерений. При нахождении на стационарном лечении измерение уровня артериального давления осуществлялось ежедневно.The group of patients included individuals with a systolic blood pressure level ≥140 mmHg. and/or diastolic blood pressure ≥90 mmHg. Blood pressure measurements were carried out using the Korotkov auscultation method; the result was considered the average value of three consecutive measurements. During hospitalization, blood pressure levels were measured daily.

Для всех пациентов, включенных в исследование, заполнялась специальная анкета-опросник, разработанная профессором Полониковым А.В. (Курский государственный медицинский университет). Анкета включала анамнестические, лабораторные и инструментальные данные, сведения об образе жизни пациента, наличии у него профессиональных вредностей. Кроме того, в анкетах регистрировались данные о наличии у пациентов таких средовых факторов риска артериальной гипертензии, как ожирение, высокий уровень употребления алкоголя, курение, особенности питания (в том числе, употребление жирной пищи, «солевой аппетит», регулярность употребления овощей и фруктов), подверженность стрессам и уровень физических нагрузок.For all patients included in the study, a special questionnaire developed by Professor A.V. Polonikov was filled out. (Kursk State Medical University). The questionnaire included anamnestic, laboratory and instrumental data, information about the patient’s lifestyle, and the presence of occupational hazards. In addition, the questionnaires recorded data on the presence of such environmental risk factors for arterial hypertension in patients as obesity, high levels of alcohol consumption, smoking, dietary habits (including consumption of fatty foods, “salt appetite”, regularity of consumption of vegetables and fruits) , exposure to stress and level of physical activity.

Все исследования проводились под контролем этического комитета медицинского факультета Белгородского государственного университета с информированного согласия пациенток на использование материалов лечебно-диагностических мероприятий, связанных с заболеванием, для научно-исследовательских целей и протоколировались по стандартам этического комитета Российской Федерации.All studies were carried out under the control of the ethics committee of the Faculty of Medicine of Belgorod State University with the informed consent of patients for the use of materials from treatment and diagnostic measures related to the disease for research purposes and were protocoled according to the standards of the ethics committee of the Russian Federation.

При изучении SNP х SNP взаимодействий наиболее значимой четырехлокусной моделью, вовлеченную в формирование гипертонической болезни у мужчин, является rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и rs4387287 гена OBFC1 (рperm≤0,001). С развитием заболевания наиболее значимая ассоциация выявлена для комбинации генотипов rs805303 GG BAG6 × rs1173771 AA AC026703.1 × rs4387287 AA OBFC1 (beta =2,29, p=0,029), имеющей рисковую направленность.When studying SNP x SNP interactions, the most significant four-locus pattern involved in the development of hypertension in men is rs805303 of the BAG6 gene, rs1173771 of the AC026703.1 gene and rs4387287 of the OBFC1 gene (p perm ≤0.001). With the development of the disease, the most significant association was found for the combination of genotypes rs805303 GG BAG6 × rs1173771 AA AC026703.1 × rs4387287 AA OBFC1 (beta = 2.29, p = 0.029), which has a risk orientation.

В качестве примеров конкретного применения разработанного способа проведено генетическое обследование мужчин русской национальности, являющихся уроженцами Центрального Черноземья РФ и не имеющих родства между собой: проведено генетическое исследование по локусам rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и гена rs4387287 гена OBFC1.As examples of the specific application of the developed method, a genetic examination of men of Russian nationality who are natives of the Central Black Earth Region of the Russian Federation and are not related to each other was carried out: a genetic study was carried out on the rs805303 loci of the BAG6 gene, rs1173771 of the AC026703.1 gene and the rs4387287 gene of the OBFC1 gene.

У пациента С. была взята венозная кровь, проведено генотипирование ДНК-маркеров, при анализе вовлеченности полиморфных локусов rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и rs4387287 гена OBFC1, была выявлена комбинации генотипов rs805303 GG BAG6 × rs1173771 AA AC026703.1 × rs4387287 AA OBFC1, что позволило отнести пациента в группу больных с повышенным риском развития артериальной гипертензии. Дальнейшее наблюдение подтвердило диагноз артериальной гипертензии у пациента.Venous blood was taken from patient S., genotyping of DNA markers was performed, when analyzing the involvement of the polymorphic loci rs805303 of the BAG6 gene, rs1173771 of the AC026703.1 gene and rs4387287 of the OBFC1 gene, a combination of genotypes rs805303 GG BAG6 × rs1173771 AA AC026703 was identified .1×rs4387287AA OBFC1, which allowed the patient to be included in the group of patients with an increased risk of developing arterial hypertension. Further observation confirmed the diagnosis of arterial hypertension in the patient.

У пациента Ф. была взята венозная кровь, проведено генотипирование ДНК-маркеров, при анализе вовлеченности полиморфных локусов rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и rs4387287 гена OBFC1, была выявлена комбинации генотипов rs805303 АА BAG6 × rs1173771 GG AC026703.1 × rs4387287 CC OBFC1, что позволило отнести пациента в группу пациентов с низким риском развития артериальной гипертензии. Дальнейшее наблюдение не подтвердило диагноз у пациента.Venous blood was taken from patient F., genotyping of DNA markers was carried out, when analyzing the involvement of the polymorphic loci rs805303 of the BAG6 gene, rs1173771 of the AC026703.1 gene and rs4387287 of the OBFC1 gene, a combination of genotypes rs805303 AA BAG6 × rs1173771 GG AC026703 was identified .1 × rs4387287 CC OBFC1, which allowed the patient to be included in the group of patients with a low risk of developing arterial hypertension. Further observation did not confirm the patient's diagnosis.

У пациента И. была взята венозная кровь, проведено генотипирование ДНК-маркеров, при анализе вовлеченности полиморфных локусов rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и rs4387287 гена OBFC1 была выявлена комбинации генотипов rs805303 GA BAG6 × rs1173771 GA AC026703.1 × rs4387287 CA OBFC1, что позволило отнести пациента в группу больных с низким риском развития артериальной гипертензии. Дальнейшее наблюдение не подтвердило диагноз артериальной гипертензии у пациента.Venous blood was taken from patient I., genotyping of DNA markers was performed, and when analyzing the involvement of the polymorphic loci rs805303 of the BAG6 gene, rs1173771 of the AC026703.1 gene and rs4387287 of the OBFC1 gene, a combination of genotypes rs805303 GA BAG6 × rs1173771 GA AC026703 was identified. 1 × rs4387287 CA OBFC1 , which made it possible to classify the patient into the group of patients with a low risk of developing arterial hypertension. Further observation did not confirm the diagnosis of arterial hypertension in the patient.

У пациента Я. была взята венозная кровь, проведено генотипирование ДНК-маркеров, при анализе вовлеченности полиморфных локусов rs805303 гена BAG6, rs1173771 гена AC026703.1 и rs4387287 гена OBFC1 была выявлена комбинации генотипов rs805303 AA BAG6 × rs1173771 AA AC026703.1 × rs4387287 CC OBFC1, что позволило отнести пациента в группу индувидуумов с низким риском развития артериальной гипертензии. При дальнейшем наблюдении диагноз артериальной гипертензии у пациента Я. не подтвердился.Venous blood was taken from patient Y., genotyping of DNA markers was performed, and when analyzing the involvement of the polymorphic loci rs805303 of the BAG6 gene, rs1173771 of the AC026703.1 gene and rs4387287 of the OBFC1 gene, a combination of genotypes rs805303 AA BAG6 × rs1173771 AA AC026703 was identified. 1 × rs4387287 CC OBFC1 , which made it possible to classify the patient into the group of individuals with a low risk of developing arterial hypertension. Upon further observation, the diagnosis of arterial hypertension in patient Ya. was not confirmed.

Применение данного способа позволит на доклиническом этапе формировать среди мужчин группы риска и своевременно реализовывать в этих группах необходимые лечебно-профилактические мероприятия по предупреждению развития гипертонической болезни.The use of this method will make it possible at the preclinical stage to form risk groups among men and timely implement in these groups the necessary treatment and preventive measures to prevent the development of hypertension.

Claims (1)

Способ прогнозирования риска развития гипертонической болезни у мужчин по результатам генетического тестирования, включающий выделение ДНК из периферической венозной крови, анализ полиморфных локусов BAG6, AC026703.1 и OBFC1, при этом высокий риск развития гипертонической болезни у мужчин прогнозируют при выявлении комбинации генотипов rs805303 GG BAG6 × rs1173771 AA AC026703.1 × rs4387287 AA OBFC1.A method for predicting the risk of developing hypertension in men based on the results of genetic testing, including DNA extraction from peripheral venous blood, analysis of polymorphic loci BAG6, AC026703.1 and OBFC1, while a high risk of developing hypertension in men is predicted by identifying the combination of genotypes rs805303 GG BAG6 × rs1173771 AA AC026703.1 × rs4387287 AA OBFC1.
RU2023118683A 2023-07-14 Method of predicting risk of developing hypertension in men based on results of genetic testing RU2809912C1 (en)

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2809912C1 true RU2809912C1 (en) 2023-12-19

Family

ID=

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2456608C1 (en) * 2011-03-15 2012-07-20 Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Курский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации" Method for prediction of risk of hypertension in males
RU2693469C1 (en) * 2018-12-04 2019-07-03 Федеральное бюджетное учреждение науки "Федеральный научный центр медико-профилактических технологий управления рисками здоровью населения" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН "ФНЦ медико-профилактических технологий управления рисками здоровью Method for prediction of men's risk of essential hypertension associated with obesity

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2456608C1 (en) * 2011-03-15 2012-07-20 Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Курский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации" Method for prediction of risk of hypertension in males
RU2693469C1 (en) * 2018-12-04 2019-07-03 Федеральное бюджетное учреждение науки "Федеральный научный центр медико-профилактических технологий управления рисками здоровью населения" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН "ФНЦ медико-профилактических технологий управления рисками здоровью Method for prediction of men's risk of essential hypertension associated with obesity

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
АБРАМОВА М.Ю. Эпигенетические эффекты полиморфизма генов-кандидатов, ассоциированных с развитием артериальной гипертензии, по данным полногеномных исследований. Медицинская генетика. 2020; 19(5): 62-63. CHURNOSOV M. et al. Polymorphisms of hypertension susceptibility genes as a risk factors of preeclampsia in the Caucasian population of central Russia. Placenta. 2022 Nov; 129: 51-61. Epub 2022 Sep 20. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20220365067A1 (en) Analysis of cell-free dna in urine and other samples
Melk et al. Transcriptional analysis of the molecular basis of human kidney aging using cDNA microarray profiling
JP7000658B2 (en) How to assess liver lesions
CN107254531B (en) Genetic biomarker for auxiliary diagnosis of early colorectal cancer and application thereof
JP6997709B2 (en) How to assess the risk of complications in patients with systemic inflammatory response syndrome (SIRS)
WO2013125691A1 (en) Method for classifying test body fluid sample
RU2578425C2 (en) Method for prediction of risk of preeclampsia
AlDehaini et al. The influence of TERC, TERT and ACYP2 genes polymorphisms on plasma telomerase concentration, telomeres length and T2DM
RU2809912C1 (en) Method of predicting risk of developing hypertension in men based on results of genetic testing
Goharrizi et al. Non-invasive STEMI-related biomarkers based on meta-analysis and gene prioritization
RU2642939C1 (en) Method for prediction of risk of preeclampsia
RU2809911C1 (en) Method of predicting risk of developing hypertension based on data on intergenic interactions
RU2809798C1 (en) Method of predicting risk of developing breast cancer in women using molecular genetic data
ES2340459A1 (en) Method to diagnose or determine the genetic predisposition to develop hypertrophic myocardiathy (Machine-translation by Google Translate, not legally binding)
Rafiei et al. The correlation of long non-coding RNAs IFNG-AS1 and ZEB2-AS1 with IFN-γ and ZEB-2 expression in PBMCs and clinical features of patients with coronary artery disease
JP2021175381A (en) Method for detecting infant atopic dermatitis
RU2798666C1 (en) Method of predicting a low risk of developing breast cancer in women with highly penetrating mutations in the brca1 and chek2 genes
RU2816514C1 (en) Method for prediction of risk of gastric and duodenal ulcer development based on molecular genetic testing
RU2819776C1 (en) Method for prediction of risk of helicobacter pylori-positive gastric ulcer and duodenal ulcer on basis of molecular-genetic testing
RU2819282C1 (en) Method for prediction of risk of developing gastric and duodenal ulcer in males based on molecular genetic testing
RU2796897C1 (en) Method of predicting the risk of osteoarthritis of the knee joint in women based on molecular genetic testing
RU2510508C1 (en) Method for risk prediction of bronchial asthma
Butters et al. A rare splice-site variant in cardiac troponin-T (TNNT2): The need for ancestral diversity in genomic reference datasets
RU2786314C1 (en) A method for predicting the risk of developing peptic ulcer disease in women based on genetic data
RU2811577C1 (en) Method for predicting risk of developing gastric and duodenal ulcers in women based on molecular genetic testing