RU2780280C1 - Способ диагностики бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами, у реципиентов сердца или легких - Google Patents
Способ диагностики бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами, у реципиентов сердца или легких Download PDFInfo
- Publication number
- RU2780280C1 RU2780280C1 RU2021133356A RU2021133356A RU2780280C1 RU 2780280 C1 RU2780280 C1 RU 2780280C1 RU 2021133356 A RU2021133356 A RU 2021133356A RU 2021133356 A RU2021133356 A RU 2021133356A RU 2780280 C1 RU2780280 C1 RU 2780280C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- gram
- heart
- crp
- microrna
- bacteremia
- Prior art date
Links
- 206010003997 Bacteraemia Diseases 0.000 title claims abstract description 24
- 210000004072 Lung Anatomy 0.000 title claims abstract description 21
- 244000005700 microbiome Species 0.000 title claims abstract description 18
- 102000025380 C-Reactive Protein Human genes 0.000 claims abstract description 23
- 108010074051 C-Reactive Protein Proteins 0.000 claims abstract description 23
- 210000002381 Plasma Anatomy 0.000 claims abstract description 15
- 210000002966 Serum Anatomy 0.000 claims abstract description 12
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 abstract description 22
- 230000001717 pathogenic Effects 0.000 abstract description 9
- 244000052769 pathogens Species 0.000 abstract description 9
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 abstract description 8
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 7
- 210000000056 organs Anatomy 0.000 abstract description 6
- 238000007374 clinical diagnostic method Methods 0.000 abstract description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 230000002458 infectious Effects 0.000 description 9
- 229920001239 microRNA Polymers 0.000 description 9
- 210000004369 Blood Anatomy 0.000 description 7
- 230000000721 bacterilogical Effects 0.000 description 7
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 7
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 6
- 201000009910 diseases by infectious agent Diseases 0.000 description 6
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 5
- 108020004388 MicroRNAs Proteins 0.000 description 4
- 230000003115 biocidal Effects 0.000 description 4
- 229940079593 drugs Drugs 0.000 description 4
- 238000002650 immunosuppressive therapy Methods 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 230000002906 microbiologic Effects 0.000 description 4
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 4
- 229920000160 (ribonucleotides)n+m Polymers 0.000 description 3
- 206010060945 Bacterial infection Diseases 0.000 description 3
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 3
- 238000009640 blood culture Methods 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 3
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 3
- 241000588626 Acinetobacter baumannii Species 0.000 description 2
- 108010048233 Procalcitonin Proteins 0.000 description 2
- CWCXERYKLSEGEZ-KDKHKZEGSA-N Procalcitonin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(O)=O)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H]1NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CSSC1)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C1=CC=CC=C1 CWCXERYKLSEGEZ-KDKHKZEGSA-N 0.000 description 2
- 206010052779 Transplant rejections Diseases 0.000 description 2
- 230000000845 anti-microbial Effects 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial Effects 0.000 description 2
- 230000002146 bilateral Effects 0.000 description 2
- 238000009534 blood test Methods 0.000 description 2
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 2
- 238000002651 drug therapy Methods 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 2
- 230000002980 postoperative Effects 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 2
- 102000011767 Acute-Phase Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010062271 Acute-Phase Proteins Proteins 0.000 description 1
- 229940064005 Antibiotic throat preparations Drugs 0.000 description 1
- 229940083879 Antibiotics FOR TREATMENT OF HEMORRHOIDS AND ANAL FISSURES FOR TOPICAL USE Drugs 0.000 description 1
- 229940042052 Antibiotics for systemic use Drugs 0.000 description 1
- 229940042786 Antitubercular Antibiotics Drugs 0.000 description 1
- 206010059512 Apoptosis Diseases 0.000 description 1
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 1
- 206010003816 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 102100000546 CX3CL1 Human genes 0.000 description 1
- 101710027818 CX3CL1 Proteins 0.000 description 1
- 241000244203 Caenorhabditis elegans Species 0.000 description 1
- 208000005623 Carcinogenesis Diseases 0.000 description 1
- 229920002676 Complementary DNA Polymers 0.000 description 1
- 206010056559 Graft infection Diseases 0.000 description 1
- 229940093922 Gynecological Antibiotics Drugs 0.000 description 1
- 210000003734 Kidney Anatomy 0.000 description 1
- 210000004185 Liver Anatomy 0.000 description 1
- 208000008466 Metabolic Disease Diseases 0.000 description 1
- 206010029803 Nosocomial infection Diseases 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 101700014436 RTN4 Proteins 0.000 description 1
- 241000606695 Rickettsia rickettsii Species 0.000 description 1
- 229940075118 Rickettsia rickettsii Drugs 0.000 description 1
- 229940024982 Topical Antifungal Antibiotics Drugs 0.000 description 1
- 230000001154 acute Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000000844 anti-bacterial Effects 0.000 description 1
- 230000002429 anti-coagulation Effects 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- 239000003124 biologic agent Substances 0.000 description 1
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 238000010241 blood sampling Methods 0.000 description 1
- 230000036952 cancer formation Effects 0.000 description 1
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 1
- 210000000748 cardiovascular system Anatomy 0.000 description 1
- 210000004027 cells Anatomy 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 1
- 238000003748 differential diagnosis Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N edta Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003394 haemopoietic Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 239000003018 immunosuppressive agent Substances 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 229940079866 intestinal antibiotics Drugs 0.000 description 1
- 201000009085 invasive aspergillosis Diseases 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 244000005706 microflora Species 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 229940005935 ophthalmologic Antibiotics Drugs 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N phenol group Chemical group C1(=CC=CC=C1)O ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001124 posttranscriptional Effects 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 210000002345 respiratory system Anatomy 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic Effects 0.000 description 1
- 230000000451 tissue damage Effects 0.000 description 1
- 231100000827 tissue damage Toxicity 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Abstract
Изобретение относится к медицине, а именно к трансплантации органов и клинической лабораторной диагностике, и может быть использовано при ведении пациентов после трансплантации сердца или легких для скрининга бактериемии, вызванной грамотрицательными возбудителями. У реципиента в плазме крови определяют уровень экспрессии микроРНК-424 (Э), а в сыворотке крови определяют концентрацию С-реактивного белка (СРБ). При величине Э выше -5,72 и концентрации СРБ выше 7 мг/л диагностируют наличие бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами. Способ обеспечивает эффективную диагностику бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами, у реципиентов сердца или легких путем определения уровня экспрессии микроРНК-424 в плазме крови совместно с измерением уровня СРБ в сыворотке крови. 3 пр.
Description
Изобретение относится к медицине, а именно к трансплантации органов и клинической лабораторной диагностике, может быть использовано при ведении пациентов после трансплантации сердца или легких для скрининга бактериемии, вызванной грамотрицательными возбудителями.
На сегодняшний день уровень развития трансплантации сердца и легких позволяет обеспечить высокое качество жизни и социальной активности пациентам с терминальной стадией заболеваний дыхательной и сердечно-сосудистой систем, однако результат трансплантации во многом определяется своевременностью диагностики осложнений, а также технологией лекарственного и нелекарственного ведения реципиентов.
Несмотря на последние достижения хирургии, проведение подобных высокотехнологичных вмешательств сопряжено с риском развития инфекционных осложнений бактериальной природы, которые продолжают оставаться одной из причин смертности реципиентов в раннем госпитальном периоде [Biderman Р, Bugaevsky Y, Ben-Zvi Н, et al. Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii infections in lung transplant patients in the cardiothoracicintensive care unit. Clin Transplant. 2015;29(9):756-62. doi: 10.1111/ctr.12575].
При этом на фоне иммуносупрессивной терапии инфекционные осложнения после трансплантации часто имеют атипичное течение, что затрудняет своевременную диагностику и начало этиотропной терапии [Barkanova O.N., Perlin D.V., Shepeleva Yu.B., et al. Infectious complications of early postoperative period in patients after kidney transplantation. Journal of VolgSMU. 2016;2(58):32-34. (In Russ.)].
Осведомленность о спектре ведущей микрофлоры и об уровне ее антибиотикочувствительности ориентирует врачей на назначение адекватной лекарственной терапии тяжелым больным и является базой для разработки алгоритмов рационального антибактериального лечения [Zemko V.Ju., Okulich V.K., Dzjadz'ko A.M. Monitoring antibiotikorezistentnosti mikroorganizmov v otdelenii reanimacii i intensivnoj terapii mnogoprofil'nogo stacionara. Transplantologija. 2018; 10(4):284-297. (In Russ.). doi: 10.23873/2074-0506-2018-10-4284-297].
Среди наиболее тяжелых форм выделяют бактериальную инфекцию кровотока (бактериемию), вызванную карбапенем-резистентными грамотрицательными бактериями [Lee JS, Lee SH, Kim KS, et al. Bacterial infection monitoring in the early period after liver transplantation. Ann Surg Treat Res. 2018;94(3):154-158. doi: 10.4174/astr.2018.94.3.154].
Основным методом определения бактериемии на сегодняшний день является микробиологическое обследование (бактериологический анализ посевов крови [Opota О., Croxatto A., Prod'hom G., Greub G., Blood culture-based diagnosis of bacteraemia: state of the art. Clin Microbiol Infect. 2015; 21(4):313-22. doi: 10.1016/j.cmi.2015.01.003].
Однако применение методов микробиологического обследования имеет ряд недостатков: во-первых, в зависимости от особенностей возбудителей бактериемии, потенциально присутствующих в образце крови, длительность выявления роста микроорганизма может занимать до нескольких суток; во-вторых размещение в клинике лабораторного подразделения, занимающегося микробиологической диагностикой, требует существенных экономических затрат и выполнения жестких организационно-технических требований, что не всегда доступно многим стационарам, и влечет перевод микробиологических исследований на аутсорсинг, не позволяя проводить регулярный стабильный мониторинг вспышек инфекции и еще более оттягивая сроки выявления опасного инфекционного осложнения [Friedrich AW. Control of hospital acquired infections and antimicrobial resistance in Europe: the way to go. Wien Med Wochenschr. 2019;169 [suppl. 1]:25-30. doi: 10.1007/s10354-018-0676-5].
В связи с этим особую актуальность приобретает поиск ранних предикторов бактериемии. Особенно остро стоит данный вопрос в условиях трансплантологических отделений, пациенты которых наиболее подвержены развитию инфекционных осложнений ввиду необходимости применения иммуносупрессивных препаратов.
Отдельную группу эффективных биологических агентов, способных выступать индикаторами осложнений после трансплантации солидных органов, составляют сигнальные молекулы микроРНК, семейство малых эндогенных некодирующих одноцепочечных РНК длиной от 18 до 25 нуклеотидов, выступающих в качестве посттранскрипционных регуляторов, играющих ключевую роль во множестве биологических процессов. Исследования последних лет позволили выявить участие микроРНК в развитии и дифференцировке кроветворных клеток, пролиферации и апоптозе, нарушении обмена веществ, аутоиммунных заболеваниях, канцерогенезе и отторжении трансплантированных органов.
Показан диагностический потенциал оценки уровня экспрессии ряда микроРНК в образцах крови реципиентов солидных органов в отношении развития и течения различных посттрансплантационных осложнений [MicroRNAs: potential biomarker in organ transplantation / J. Shan, L. Feng, L. Luo [et al.]. - Текст: непосредственный // Transplant Immunology. - 2011. - Vol. 24. - №4. - P. 210-215.].
В работе Abha Sahni отмечается участие микроРНК-424 в механизмах иммунного ответа и индуцировании экспрессии CX3CL1 при инфекции, вызванной грамотрицательным возбудителем Rickettsia rickettsii [MicroRNA-424 regulates the expression of CX3CL1 (fractalkine) in human microvascular endothelial cells during Rickettsia rickettsii infection/ Abha Sahni, Hema P. Narra, Sanjeev K. Sahni. // Biochemistry and Biophysics Reports. - 2021. - Vol. 25. - 100897].
Однако авторами не установлено наличие конкретных диагностически значимых уровней экспрессии микроРНК-424, свидетельствующих о развитии инфекции и неясна динамика экспрессии при бактериемии, вызванной другими грамотрицательными возбудителями.
Также показано изменение экспрессии микроРНК-424, специфичное для пациентов с инвазивным аспергиллезом после трансплантации легких [Identifying host microRNAs in bronchoalveolar lavage samples from lung transplant recipients infected with Aspergillus / Wajiha Gohir, William Klement, Lianne G Singer et al. // J Heart Lung Transplant - 2020. - doi: 10.1016/j.healun.2020.07.014.], при этом оценка экспрессии микроРНК-424 проводилась в образцах бронхо-альвеолярного лаважа.
У реципиентов сердца и/или легких описана роль прокальцитонина в диагностике инфекционных осложнений после трансплантации [Procalcitonin for differential diagnosis of graft rejection and infection in patients with heart and/or lung grafts / S. Hammer, F. Meisner, P. Dirschedl et al. // Intensive Care Med. - 2000. - Vol. 26. - P. S182-S186], при этом не описаны различия в выделении грамотрицательных и грамположительных возбудителей.
Еще одним широко известным маркером воспаления и инфекции является С-реактивный белок (СРБ) - классический белок острой фазы, который рассматривается как наиболее чувствительный лабораторный маркер инфекции, воспаления и тканевого повреждения и широко применяется в клинической практике. Установлена его высокая чувствительность при бактериальных инфекциях у реципиентов сердца [Serial study of С reactive protein concentrations in cardiac allograft recipients / Gd Harkiss // J Clin Pathol. - 1985. - Vol. 38. - P. 193-197].
Данные о концентрации сывороточного СРБ могут использоваться в качестве прогностического маркера, который отражает уровни системного воспаления, в том числе для мониторинга эффективности терапии и возможности ее коррекции [Effect of C-Reactive Protein-Guided Antibiotic Treatment Duration, 7-Day Treatment, or 14-Day Treatment on 30-Day Clinical Failure Rate in Patients With Uncomplicated Gram-Negative Bacteremia / E. von Dach, W. Albrich, A.-S. Brunei et al. // JAMA. - 2020. - Vol. 323. - Iss. 21. - P. 2160-2169. doi: 10.1001/jama.2020.6348].
Однако СРБ не обладает высокой специфичностью у реципиентов трансплантированного сердца [Serial measurement of presepsin, procalcitonin, and C-reactive protein in the early postoperative period and the response to antithymocyte globulin administration after heart transplantation / J. Franekova, P. Sečník Jr., P. Lavríková, Z et al. // Clin Transplant. - 2017. - Vol. 31. - Iss.1. doi: 10.1111/ctr.12870].
Нами поставлена задача диагностики бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами, у пациентов после трансплантации сердца или легких путем определения уровня микроРНК-424 в плазме крови и концентрации СРБ в сыворотке крови реципиентов.
Технический результат, достигаемый при осуществлении изобретения, заключается в обеспечении диагностики бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами, у реципиентов сердца или легких путем определения уровня экспрессии микроРНК-424 в плазме крови совместно с измерением уровня СРБ в сыворотке крови.
Использование данного сочетания маркеров позволяет:
• осуществлять раннюю диагностику инфекционных осложнений независимо от наступления клинических проявлений, многие из которых также характерны и для картины острого отторжения трансплантата;
• выявлять бактериемию, ассоциированную с грамотрицательными микроорганизмами, отличающимися высокой резистентностью к антимикробным агентам, и тем самым прогнозировать у пациентов тяжелое течение инфекционных осложнений;
• своевременно назначить бактериологическое обследование для уточнения возбудителя и его антибиотикочувствительности;
• снизить медикаментозную нагрузку на пациента путем отказа от назначения препаратов, предусмотренных стандартным протоколом лечения, но неэффективных в отношении выделенных микроорганизмов, и сформировать индивидуальную терапевтическую тактику;
• применять предложенный способ диагностики как у реципиентов сердца, так и реципиентов легких, что отражает универсальность маркера;
• снизить экономическую нагрузку клиники за счет улучшения результатов реабилитации и сокращения сроков пребывания пациентов в стационаре ввиду нестабильного состояния.
Сущность изобретения состоит в следующем.
Для диагностики бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами, у пациентов после трансплантации сердца или легких в плазме крови определяют уровень экспрессии микроРНК-424 по формуле:
Э=log2(2-(Ct1-Ct2)),
где
Э - уровень экспрессии микроРНК-424,
Ct1 - значение порогового цикла ПЦР для образца микроРНК-424,
Ct2 - значение порогового цикла ГТЦР для внутреннего контроля, представленного Cel-miR-39.
Посредством биохимического анализа крови в сыворотке крови определяют концентрацию СРБ (мг/л).
При величине Э более -5,72 и СРБ более 7 мг/л диагностируют наличие бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами.
Способ осуществляется следующим образом.
В качестве материала для исследования величины экспрессии микроРНК используется плазма крови. Взятие крови для исследования производят, как правило, одновременно с плановым обследованием пациентов.
Кровь собирают в одноразовые пробирки с антикоагулянтом ЭДТА (BD Vacutainer, Becton Dickinson, США) и центрифугируют в течение 10 минут при 3500/1500 g оборотах при комнатной температуре. Полученную плазму замораживают и хранят при температуре -20°С.
Уровень экспрессии микроРНК-424 определяют методом полимеразной цепной реакции (ПНР), например, с помощью наборов реагентов SerumPlasma (Qiagen, США).
Определение проводится в соответствии с инструкцией к наборам.
РНК выделяют из 100 мкл плазмы крови с использованием наборов SerumPlasma (Qiagen, США). После инкубации плазмы с фенольной смесью Qiazol добавляется 1,6 х 108 копий синтетической микроРНК Caenorhabditis elegans (Cel-miR-39) (Qiagen) в качестве внутреннего контроля экстракции РНК.
Выделенные образцы с тотальной РНК конвертируются путем проведения реакции обратной транскрипции в кДНК: при t°=37°C в течение 60 минут с последующей инкубацией при 95°С в течение 5 минут, охлаждением на льду и доведением объема образца деионизированной водой до 200 мкл. Далее для выявления исследуемых микроРНК выполняется ПЦР с детекцией в режиме реального времени. Условия реакции ПЦР: 15 минут при to=95°C с последующим проведением 40 циклов по 15 секунд при t°=94°C, 30 секунд при to=55°C и 30 секунд при t°=70°C в амплификаторе.
Значение уровня экспрессии микроРНК исследуемых образцов плазмы крови выражают в относительных единицах (отн.ед.) и рассчитывают по формуле:
Э=log2(2-(Ct1-Ct2)),
где
Э - уровень экспрессии микроРНК-424, отн. ед.
Ct1 - значение порогового цикла ПЦР для образца микроРНК-424
(то есть значение порогового цикла микроРНК-424 на анализаторе нуклеиновых кислот или амплификаторе),
Ct2 - значение порогового цикла ПЦР для внутреннего контроля, представленного Cel-miR-39 (то есть значение порогового цикла внутреннего контроля, представленного Cel-miR-39, на анализаторе нуклеиновых кислот или амплификаторе).
Концентрация СРБ определяется в сыворотке крови при биохимическом анализе крови.
У реципиентов сердца или легких с величиной экспрессии микроРНК-424 Э выше -5,72 отн. ед. в плазме крови и концентрацией СРБ в сыворотке выше 7 мг/л определяют наличие бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами.
После этого образцы крови пациента направляют на бактериологический посев для выделения возможного возбудителя, с последующим определением его чувствительности к спектру антибиотиков и формированием адекватной тактики лекарственной терапии.
Для доказательств возможности реализации заявленного назначения и достижения указанного технического результата приводим следующие данные.
Клинический пример 1.
Пациенту Г., 30 лет, выполнена двусторонняя трансплантация легких. Иммуносупрессивная терапия назначена по стандартной схеме. Измеренный на 19 сутки после трансплантации уровень экспрессии микроРНК-424 в плазме крови (в соответствии с методикой, представленной на страницах на страницах 6-8 описания) составил -3,80 отн. ед., а концентрация СРБ в сыворотке крови составила 305 мг/л. В соответствии с предлагаемым способом у пациента диагностирована бактериемия, ассоциированная с грамотрицательными микроорганизмами. Методом бактериологического обследования диагноз подтвержден: из образца посева крови выделен штамм грамотрицательной бактерии Acinetobacter baumannii, проведена развернутая антибиотикограмма, по результатам которой скорректирована схема антимикробной терапии.
Клинический пример 2.
Пациенту Г., 53 лет, выполнена ортотопическая трансплантация сердца. Послеоперационный период протекал гладко. Иммуносупрессивная терапия назначена по стандартной схеме лечения. Измеренный на 41 сутки после операции уровень экспрессии микроРНК-424 в плазме крови (в соответствии с методикой, представленной на страницах на страницах 6-8 описания) составил -10,71 отн. ед., а концентрация СРБ в сыворотке крови составила 5 мг/л. В соответствии с предлагаемым способом у пациента диагностировано отсутствие бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами. Методом бактериологического обследования посева крови диагноз подтвержден: в посеве крови роста микроорганизмов не выявлено.
Клинический пример 3.
Пациенту Р., 40 лет, выполнена двусторонняя трансплантация легких. Иммуносупрессивная терапия назначена по стандартной схеме. Измеренный на 109 сутки после трансплантации уровень экспрессии микроРНК-424 в плазме крови (в соответствии с методикой, представленной на страницах на страницах 6-8 описания) составил -5,72 относительных единиц; концентрация СРБ в сыворотке крови составила 4 мг/л. В соответствии с предлагаемым способом у пациента диагностировано отсутствие бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами. По данным бактериологического обследования диагноз подтвержден, роста микроорганизмов в посеве крови не выявлено.
Предложенный способ апробирован в клинической практике на реципиентах сердца и легких в раннем госпитальном периоде (с первых и до 110 суток после трансплантации). Уровень экспрессии микроРНК-424 и концентрации СРБ после трансплантации выше установленных нами пороговых значений наблюдались у 6 реципиентов, из них в 5 (83,3%) случаях результатами бактериологического обследования была верифицирована бактериемия, ассоциированная с грамотрицательными возбудителями.
Чувствительность и специфичность предложенного способа диагностики составляет 83,3% и 90,1% соответственно.
Использование в клинической практике патентуемого способа дает возможность в госпитальном периоде у реципиентов сердца или легких диагностировать развитие инфекционных осложнений бактериальной природы.
Claims (7)
- Способ диагностики бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами, у реципиента сердца или легких, отличающийся тем, что у реципиента в плазме крови определяют уровень экспрессии микроРНК-424 по формуле:
- Э=log2(2-(Ct1-Ct2),
- где
- Э - уровень экспрессии микроРНК-424,
- Ct1 - значение порогового цикла ПЦР для образца микроРНК-424,
- Ct2 - значение порогового цикла ПЦР для внутреннего контроля, представленного Cel-miR-39;
- а в сыворотке крови определяют концентрацию С-реактивного белка (СРБ) и при величине Э выше -5,72 и концентрации СРБ выше 7 мг/л диагностируют наличие бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами.
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2780280C1 true RU2780280C1 (ru) | 2022-09-21 |
Family
ID=
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2088923C1 (ru) * | 1994-02-08 | 1997-08-27 | Ростовский научно-исследовательский институт акушерства и педиатрии | Способ диагностики бактериемии у новорожденных |
| RU2098486C1 (ru) * | 1995-06-23 | 1997-12-10 | Наталья Михайловна Каргальцева | Способ диагностики бактериемии |
| RU2732222C1 (ru) * | 2019-06-19 | 2020-09-14 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н.Блохина" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "НМИЦ онкологии им.Н.Н.Блохина" Минздрава России) | Способ диагностики бактериемии |
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2088923C1 (ru) * | 1994-02-08 | 1997-08-27 | Ростовский научно-исследовательский институт акушерства и педиатрии | Способ диагностики бактериемии у новорожденных |
| RU2098486C1 (ru) * | 1995-06-23 | 1997-12-10 | Наталья Михайловна Каргальцева | Способ диагностики бактериемии |
| RU2732222C1 (ru) * | 2019-06-19 | 2020-09-14 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н.Блохина" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "НМИЦ онкологии им.Н.Н.Блохина" Минздрава России) | Способ диагностики бактериемии |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| ВЕЛИКИЙ Д.А. и др. МикроРНК у реципиентов сердечного трансплантата. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2017; 19(2): 126-132. HUSAIN S. et al. Bacteremia in Lung Transplant Recipients in the Current Era. American Journal of Transplantation. 2006; 6: 3000-3007. SHEVCHENKO O.P. et al. Profiling microRNA in the potential lung recipients. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2019; 21(3): 33-38. * |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Degoricija et al. | Survival analysis of 314 episodes of sepsis in medical intensive care unit in university hospital: impact of intensive care unit performance and antimicrobial therapy | |
| Dobbin et al. | The impact of pan-resistant bacterial pathogens on survival after lung transplantation in cystic fibrosis: results from a single large referral centre | |
| Caméléna et al. | Performance of a multiplex polymerase chain reaction panel for identifying bacterial pathogens causing pneumonia in critically ill patients with COVID-19 | |
| Feizabadi et al. | Direct detection of Pseudomonas aeruginosa from patients with healthcare associated pneumonia by real time PCR | |
| Paugam-Burtz et al. | Daily organ-system failure for diagnosis of persistent intra-abdominal sepsis after postoperative peritonitis | |
| CN106574295A (zh) | 检测多重抗药性生物体的方法 | |
| Bloos | Clinical diagnosis of sepsis and the combined use of biomarkers and culture-and non-culture-based assays | |
| Yang et al. | Inhibition of the PI3K/AKT signaling pathway or overexpression of beclin1 blocks reinfection of Streptococcus pneumoniae after infection of influenza A virus in severe community-acquired pneumonia | |
| Genné et al. | Enhancing the etiologic diagnosis of community-acquired pneumonia in adults using the urinary antigen assay (Binax NOW) | |
| Mu et al. | Prospective evaluation of a rapid clinical metagenomics test for bacterial pneumonia | |
| Zalunardo et al. | Higher serum C-reactive protein predicts short and long-term outcomes in peritoneal dialysis-associated peritonitis | |
| Ay et al. | Serum intestinal fatty acid-binding protein and calprotectin concentrations to assess clinical severity and prognosis of canine parvovirus enteritis | |
| Friend et al. | Procalcitonin elevation suggests a septic source | |
| Fortún et al. | Roles of the multiplex real-time PCR assay and β-D-glucan in a high-risk population for intra-abdominal candidiasis (IAC) | |
| RU2780280C1 (ru) | Способ диагностики бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами, у реципиентов сердца или легких | |
| Gad et al. | Diagnostic role of FilmArray Pneumonia Panel compared to routine microbiological methods to identify pneumonia pathogens | |
| RU2780662C1 (ru) | Способ диагностики бактериемии, ассоциированной с грамотрицательными микроорганизмами, у пациентов после трансплантации сердца и легких | |
| O'donohue et al. | Urinary tract infections in primary biliary cirrhosis and other chronic liver diseases | |
| Muscedere et al. | Determinants of outcome in patients with a clinical suspicion of ventilator-associated pneumonia | |
| Langer et al. | Diagnosis of bacterial infection in the ICU: General principles | |
| Long et al. | Emergency medicine updates: Spontaneous bacterial peritonitis | |
| Stark et al. | Repeated Dientamoeba fragilis infections: a case report of two families from Sydney, Australia | |
| Niu et al. | Clinical features and diagnostic value of metagenomic next-generation sequencing in five cases of non-HIV related Pneumocystis jirovecii pneumonia in children | |
| Saeedinejad et al. | Survey of relationship between changes in serum levels of procalcitonin with response to treatment in patients with SIRS positive Acute pyelonephritis | |
| RU2599479C1 (ru) | Способ оценки микробного спектра эндометрия для этиологической диагностики хронического эндометрита |