RU2778786C2 - Antisense tyrosinase oligonucleotides - Google Patents
Antisense tyrosinase oligonucleotides Download PDFInfo
- Publication number
- RU2778786C2 RU2778786C2 RU2019142512A RU2019142512A RU2778786C2 RU 2778786 C2 RU2778786 C2 RU 2778786C2 RU 2019142512 A RU2019142512 A RU 2019142512A RU 2019142512 A RU2019142512 A RU 2019142512A RU 2778786 C2 RU2778786 C2 RU 2778786C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- formula
- mrna
- group
- nucleic acid
- peptide nucleic
- Prior art date
Links
- 108060008724 EC 1.14.18.1 Proteins 0.000 title claims abstract description 135
- 102000003425 EC 1.14.18.1 Human genes 0.000 title claims abstract description 135
- 229920000272 Oligonucleotide Polymers 0.000 title description 105
- 230000000692 anti-sense Effects 0.000 title description 12
- 229920002224 Peptide nucleic acid Polymers 0.000 claims abstract description 108
- 230000000295 complement Effects 0.000 claims abstract description 44
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 23
- 208000000069 Hyperpigmentation Diseases 0.000 claims abstract description 15
- 230000003810 hyperpigmentation Effects 0.000 claims abstract description 15
- 231100001006 hyperpigmentation Toxicity 0.000 claims abstract description 15
- 229920002106 messenger RNA Polymers 0.000 claims abstract description 15
- 108020004999 Messenger RNA Proteins 0.000 claims abstract description 12
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims abstract description 10
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 9
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims abstract description 6
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 47
- 125000004435 hydrogen atoms Chemical group [H]* 0.000 claims description 30
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 claims description 27
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N Thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 24
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N Cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N Guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 229940104302 Cytosine Drugs 0.000 claims description 13
- 125000001570 methylene group Chemical group [H]C([H])([*:1])[*:2] 0.000 claims description 13
- 229940113082 Thymine Drugs 0.000 claims description 12
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 claims description 12
- 125000004453 alkoxycarbonyl group Chemical group 0.000 claims description 12
- 229960000643 Adenine Drugs 0.000 claims description 11
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Natural products NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 10
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims description 9
- 125000004430 oxygen atoms Chemical group O* 0.000 claims description 6
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 claims description 4
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 claims description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 17
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 12
- 229940079593 drugs Drugs 0.000 abstract description 5
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract description 4
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 82
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 82
- 210000004027 cells Anatomy 0.000 description 51
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 description 32
- 229920002459 Intron Polymers 0.000 description 26
- BJRNKVDFDLYUGJ-RMPHRYRLSA-N ARBUTIN Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CC=C(O)C=C1 BJRNKVDFDLYUGJ-RMPHRYRLSA-N 0.000 description 24
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- 108020004459 Small Interfering RNA Proteins 0.000 description 20
- 229920001985 Small interfering RNA Polymers 0.000 description 20
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 20
- 229920000160 (ribonucleotides)n+m Polymers 0.000 description 19
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 16
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 16
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 15
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 15
- 206010025650 Malignant melanoma Diseases 0.000 description 14
- QIGBRXMKCJKVMJ-UHFFFAOYSA-N benzohydroquinone Chemical compound OC1=CC=C(O)C=C1 QIGBRXMKCJKVMJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 14
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 14
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 14
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 description 13
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 13
- 239000000047 product Substances 0.000 description 13
- 229920002676 Complementary DNA Polymers 0.000 description 12
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 12
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 12
- 229960000271 Arbutin Drugs 0.000 description 11
- 210000002752 Melanocytes Anatomy 0.000 description 11
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 11
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 11
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 11
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 11
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 10
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 10
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 10
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 9
- BEJNERDRQOWKJM-UHFFFAOYSA-N Kojic acid Chemical compound OCC1=CC(=O)C(O)=CO1 BEJNERDRQOWKJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 210000003491 Skin Anatomy 0.000 description 8
- 125000005257 alkyl acyl group Chemical group 0.000 description 8
- -1 eumelanin Chemical compound 0.000 description 8
- 230000000670 limiting Effects 0.000 description 8
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 8
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 8
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 8
- 230000001225 therapeutic Effects 0.000 description 8
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 229920000665 Exon Polymers 0.000 description 7
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 7
- 230000036564 melanin content Effects 0.000 description 7
- 230000003061 melanogenesis Effects 0.000 description 7
- 230000000699 topical Effects 0.000 description 7
- XUMBMVFBXHLACL-UHFFFAOYSA-N Melanin Chemical compound O=C1C(=O)C(C2=CNC3=C(C(C(=O)C4=C32)=O)C)=C2C4=CNC2=C1C XUMBMVFBXHLACL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 6
- 125000005100 aryl amino carbonyl group Chemical group 0.000 description 6
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 6
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 6
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 6
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 6
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 6
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229940100611 Topical Cream Drugs 0.000 description 5
- 229940035893 Uracil Drugs 0.000 description 5
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 5
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 5
- 238000007857 nested PCR Methods 0.000 description 5
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 5
- 210000000805 Cytoplasm Anatomy 0.000 description 4
- YFTGOBNOJKXZJC-UHFFFAOYSA-N DHICA Chemical compound OC1=C(O)C=C2NC(C(=O)O)=CC2=C1 YFTGOBNOJKXZJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N HCl Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108020004391 Introns Proteins 0.000 description 4
- 210000004940 Nucleus Anatomy 0.000 description 4
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N Stearic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000005251 aryl acyl group Chemical group 0.000 description 4
- 125000005161 aryl oxy carbonyl group Chemical group 0.000 description 4
- 229910052805 deuterium Inorganic materials 0.000 description 4
- 125000004431 deuterium atoms Chemical group 0.000 description 4
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 229960004705 kojic acid Drugs 0.000 description 4
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N methylene dichloride Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 238000006011 modification reaction Methods 0.000 description 4
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 4
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Chemical compound [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 4
- 230000002829 reduced Effects 0.000 description 4
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 4
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 4
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 4
- 230000002194 synthesizing Effects 0.000 description 4
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 4
- GFBCWCDNXDKFRH-UHFFFAOYSA-N 4-(oxan-2-yloxy)phenol Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1OC1OCCCC1 GFBCWCDNXDKFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000000170 Cell Membrane Anatomy 0.000 description 3
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M NaHCO3 Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 206010062080 Pigmentation disease Diseases 0.000 description 3
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 3
- 102000002278 Ribosomal Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010000605 Ribosomal Proteins Proteins 0.000 description 3
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 239000012062 aqueous buffer Substances 0.000 description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 3
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 3
- 239000002537 cosmetic Substances 0.000 description 3
- 230000001419 dependent Effects 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108060003195 glnE Proteins 0.000 description 3
- 230000002440 hepatic Effects 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 3
- 210000004962 mammalian cells Anatomy 0.000 description 3
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 3
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 3
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 3
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000002953 preparative HPLC Methods 0.000 description 3
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 3
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 3
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 3
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 3
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 3
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 3
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N (3β)-Cholest-5-en-3-ol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 1-[(1S,2R,3R,4S,5R,6R)-3-carbamimidamido-6-{[(2R,3R,4R,5S)-3-{[(2S,3S,4S,5R,6S)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-(methylamino)oxan-2-yl]oxy}-4-formyl-4-hydroxy-5-methyloxolan-2-yl]oxy}-2,4,5-trihydroxycyclohexyl]guanidine Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 206010008570 Chloasma Diseases 0.000 description 2
- VJNCICVKUHKIIV-LURJTMIESA-M L-dopachromate Chemical compound O=C1C(=O)C=C2N[C@H](C(=O)[O-])CC2=C1 VJNCICVKUHKIIV-LURJTMIESA-M 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- 102000007330 LDL Lipoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108010007622 LDL Lipoproteins Proteins 0.000 description 2
- 210000004185 Liver Anatomy 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- TZRFSLHOCZEXCC-HIVFKXHNSA-A Mipomersen Chemical compound N1([C@H]2C[C@@H]([C@H](O2)COP([O-])(=O)S[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)COP([O-])(=O)S[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C(NC(=O)C(C)=C2)=O)COP([O-])(=O)S[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C(N=C(N)C(C)=C2)=O)COP([O-])(=O)S[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C(NC(=O)C(C)=C2)=O)COP([O-])(=O)S[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)COP([O-])(=O)S[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=NC=NC(N)=C3N=C2)COP([O-])(=O)S[C@H]2[C@H]([C@@H](O[C@@H]2COP([O-])(=O)S[C@H]2[C@H]([C@@H](O[C@@H]2COP([O-])(=O)S[C@H]2[C@H]([C@@H](O[C@@H]2COP([O-])(=O)S[C@H]2[C@H]([C@@H](O[C@@H]2COP([O-])(=O)S[C@H]2[C@H]([C@@H](O[C@@H]2CO)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OCCOC)N2C(N=C(N)C(C)=C2)=O)OCCOC)N2C(N=C(N)C(C)=C2)=O)OCCOC)N2C(NC(=O)C(C)=C2)=O)OCCOC)N2C(N=C(N)C(C)=C2)=O)OCCOC)SP([O-])(=O)OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2SP([O-])(=O)OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2SP([O-])(=O)OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2SP([O-])(=O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OCCOC)SP([O-])(=O)OC[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)N2C(N=C(N)C(C)=C2)=O)OCCOC)SP([O-])(=O)OC[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)N2C3=NC=NC(N)=C3N=C2)OCCOC)SP([O-])(=O)OC[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)N2C(N=C(N)C(C)=C2)=O)OCCOC)SP([O-])(=O)OC[C@H]2[C@H](O)[C@@H]([C@H](O2)N2C(N=C(N)C(C)=C2)=O)OCCOC)N2C(N=C(N)C(C)=C2)=O)N2C(NC(=O)C(C)=C2)=O)N2C(NC(=O)C(C)=C2)=O)C=C(C)C(N)=NC1=O TZRFSLHOCZEXCC-HIVFKXHNSA-A 0.000 description 2
- 229960004778 Mipomersen Drugs 0.000 description 2
- 101700080605 NUC1 Proteins 0.000 description 2
- 238000010802 RNA extraction kit Methods 0.000 description 2
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 2
- 101700000513 TYRP1 Proteins 0.000 description 2
- 235000018936 Vitellaria paradoxa Nutrition 0.000 description 2
- 241001135917 Vitellaria paradoxa Species 0.000 description 2
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 2
- 230000000240 adjuvant Effects 0.000 description 2
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 2
- 125000004457 alkyl amino carbonyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000004390 alkyl sulfonyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000004682 aminothiocarbonyl group Chemical group NC(=S)* 0.000 description 2
- 102000004965 antibodies Human genes 0.000 description 2
- 108090001123 antibodies Proteins 0.000 description 2
- 125000004391 aryl sulfonyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000004104 aryloxy group Chemical group 0.000 description 2
- 230000037348 biosynthesis Effects 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 125000003917 carbamoyl group Chemical group [H]N([H])C(*)=O 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000001413 cellular Effects 0.000 description 2
- 239000008406 cosmetic ingredient Substances 0.000 description 2
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 2
- 239000006071 cream Substances 0.000 description 2
- 230000001472 cytotoxic Effects 0.000 description 2
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing Effects 0.000 description 2
- 230000004059 degradation Effects 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 2
- 125000002485 formyl group Chemical group [H]C(*)=O 0.000 description 2
- 230000002068 genetic Effects 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000034 method Methods 0.000 description 2
- 230000003278 mimic Effects 0.000 description 2
- 229920002784 mipomersen Polymers 0.000 description 2
- 230000000051 modifying Effects 0.000 description 2
- 101700006494 nucA Proteins 0.000 description 2
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000003642 reactive oxygen metabolite Substances 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 238000007480 sanger sequencing Methods 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000008117 stearic acid Substances 0.000 description 2
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 2
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000004434 sulfur atoms Chemical group 0.000 description 2
- 238000001196 time-of-flight mass spectrum Methods 0.000 description 2
- 230000037317 transdermal delivery Effects 0.000 description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 2
- 150000005208 1,4-dihydroxybenzenes Chemical class 0.000 description 1
- PGNRLPTYNKQQDY-UHFFFAOYSA-N 2,3-dihydroxyindole Chemical compound C1=CC=C2C(O)=C(O)NC2=C1 PGNRLPTYNKQQDY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PIINGYXNCHTJTF-UHFFFAOYSA-N 2-(2-azaniumylethylamino)acetate Chemical compound NCCNCC(O)=O PIINGYXNCHTJTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AAJVDDFSOMFLSO-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxyethyl prop-2-enoate;sodium Chemical compound [Na].OCCOC(=O)C=C AAJVDDFSOMFLSO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RMTFNDVZYPHUEF-XZBKPIIZSA-N 3-O-methyl-D-glucose Chemical compound O=C[C@H](O)[C@@H](OC)[C@H](O)[C@H](O)CO RMTFNDVZYPHUEF-XZBKPIIZSA-N 0.000 description 1
- ANZUDYZHSVGBRF-UHFFFAOYSA-N 3-ethylnonane-1,2,3-triol Chemical compound CCCCCCC(O)(CC)C(O)CO ANZUDYZHSVGBRF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SGNZYJXNUURYCH-UHFFFAOYSA-N 5,6-dihydroxyindole Chemical compound C1=C(O)C(O)=CC2=C1NC=C2 SGNZYJXNUURYCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LJSAJMXWXGSVNA-UHFFFAOYSA-N A805044 Chemical compound OC1=CC=C(O)C=C1.OC1=CC=C(O)C=C1 LJSAJMXWXGSVNA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 206010003210 Arteriosclerosis Diseases 0.000 description 1
- IXIBAKNTJSCKJM-BUBXBXGNSA-N Bovine insulin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H]1CSSC[C@H]2C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3NC=NC=3)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC1=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=O)CSSC[C@@H](C(N2)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)[C@@H](C)CC)C(C)C)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)C1=CN=CN1 IXIBAKNTJSCKJM-BUBXBXGNSA-N 0.000 description 1
- 210000004556 Brain Anatomy 0.000 description 1
- VLFIBROLAXKPQK-UHFFFAOYSA-N Catechin 7-glucoside Chemical compound OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1=CC(O)=C(CC(O)C(O2)C=3C=C(O)C(O)=CC=3)C2=C1 VLFIBROLAXKPQK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940093528 Cetearyl Ethylhexanoate Drugs 0.000 description 1
- 229940107161 Cholesterol Drugs 0.000 description 1
- 206010009802 Coagulopathy Diseases 0.000 description 1
- 108009000280 Complement Activation Proteins 0.000 description 1
- 108020004394 Complementary RNA Proteins 0.000 description 1
- 208000010247 Contact Dermatitis Diseases 0.000 description 1
- 101710004105 DCT Proteins 0.000 description 1
- 101700011961 DPOM Proteins 0.000 description 1
- ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N Deoxyribose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)CC=O ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 0.000 description 1
- 206010012442 Dermatitis contact Diseases 0.000 description 1
- SZXQTJUDPRGNJN-UHFFFAOYSA-N Dipropylene glycol Chemical compound OCCCOCCCO SZXQTJUDPRGNJN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003109 Disodium ethylene diamine tetraacetate Substances 0.000 description 1
- NOPFSRXAKWQILS-UHFFFAOYSA-N Docosanol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCO NOPFSRXAKWQILS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004461 Double-Stranded RNA Proteins 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 206010048653 Enzyme inhibition Diseases 0.000 description 1
- 206010015150 Erythema Diseases 0.000 description 1
- 206010064503 Excessive skin Diseases 0.000 description 1
- 241000272184 Falconiformes Species 0.000 description 1
- IRXSLJNXXZKURP-UHFFFAOYSA-N Fluorenylmethyloxycarbonyl chloride Chemical compound C1=CC=C2C(COC(=O)Cl)C3=CC=CC=C3C2=C1 IRXSLJNXXZKURP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940049294 GLYCERYL STEARATE SE Drugs 0.000 description 1
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N Glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- 229960003180 Glutathione Drugs 0.000 description 1
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- UQEAIHBTYFGYIE-UHFFFAOYSA-N Hexamethyldisiloxane Chemical compound C[Si](C)(C)O[Si](C)(C)C UQEAIHBTYFGYIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010020718 Hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 206010021425 Immune system disease Diseases 0.000 description 1
- 210000003734 Kidney Anatomy 0.000 description 1
- 208000001083 Kidney Disease Diseases 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 206010024217 Lentigo Diseases 0.000 description 1
- 241000408529 Libra Species 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 101710029649 MDV043 Proteins 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-XIXRPRMCSA-N Mesotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-XIXRPRMCSA-N 0.000 description 1
- 208000008466 Metabolic Disease Diseases 0.000 description 1
- 230000036650 Metabolic stability Effects 0.000 description 1
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010029149 Nephropathy Diseases 0.000 description 1
- 206010029151 Nephropathy Diseases 0.000 description 1
- 240000008467 Oryza sativa Japonica Group Species 0.000 description 1
- 235000005043 Oryza sativa Japonica Group Nutrition 0.000 description 1
- 101700061424 POLB Proteins 0.000 description 1
- 239000002033 PVDF binder Substances 0.000 description 1
- 229940049954 Penicillin Drugs 0.000 description 1
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 1
- QCDWFXQBSFUVSP-UHFFFAOYSA-N Phenoxyethanol Chemical compound OCCOC1=CC=CC=C1 QCDWFXQBSFUVSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005323 Phenoxyethanol Drugs 0.000 description 1
- RZKYEQDPDZUERB-UHFFFAOYSA-N Pindone Chemical group C1=CC=C2C(=O)C(C(=O)C(C)(C)C)C(=O)C2=C1 RZKYEQDPDZUERB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 229920001451 Polypropylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 102000002727 Protein Tyrosine Phosphatases Human genes 0.000 description 1
- 108020000494 Protein Tyrosine Phosphatases Proteins 0.000 description 1
- 240000001987 Pyrus communis Species 0.000 description 1
- 235000014443 Pyrus communis Nutrition 0.000 description 1
- 101700054624 RF1 Proteins 0.000 description 1
- 102000000574 RNA-Induced Silencing Complex Human genes 0.000 description 1
- 108010016790 RNA-Induced Silencing Complex Proteins 0.000 description 1
- 210000001525 Retina Anatomy 0.000 description 1
- 206010039580 Scar Diseases 0.000 description 1
- 206010070834 Sensitisation Diseases 0.000 description 1
- 229940057910 Shea butter Drugs 0.000 description 1
- 206010064127 Solar lentigo Diseases 0.000 description 1
- 206010041660 Splenomegaly Diseases 0.000 description 1
- 229960005322 Streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 102100007096 TYRP1 Human genes 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- XOAAWQZATWQOTB-UHFFFAOYSA-N Taurine Chemical compound NCCS(O)(=O)=O XOAAWQZATWQOTB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000036335 Tissue distribution Effects 0.000 description 1
- 229940100617 Topical Lotion Drugs 0.000 description 1
- 240000008529 Triticum aestivum Species 0.000 description 1
- 208000001072 Type 2 Diabetes Mellitus Diseases 0.000 description 1
- 108009000112 Type II diabetes mellitus Proteins 0.000 description 1
- 240000000985 Vaccinium erythrocarpum Species 0.000 description 1
- UQYZFNUUOSSNKT-UHFFFAOYSA-N [benzotriazol-1-yloxy(dimethylamino)methylidene]-dimethylazanium;hexafluorophosphate Chemical compound F[P-](F)(F)(F)(F)F.C1=CC=C2N(OC(N(C)C)=[N+](C)C)N=NC2=C1 UQYZFNUUOSSNKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 125000003282 alkyl amino group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004670 alkyl amino thio carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000003862 amino acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000003466 anti-cipated Effects 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 125000001769 aryl amino group Chemical group 0.000 description 1
- 201000001320 atherosclerosis Diseases 0.000 description 1
- 239000007640 basal medium Substances 0.000 description 1
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 229960000626 benzylpenicillin Drugs 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 230000020411 cell activation Effects 0.000 description 1
- 239000008004 cell lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 229940081733 cetearyl alcohol Drugs 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 1
- 235000015165 citric acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000035602 clotting Effects 0.000 description 1
- 230000015271 coagulation Effects 0.000 description 1
- 230000002860 competitive Effects 0.000 description 1
- 230000024203 complement activation Effects 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 238000010668 complexation reaction Methods 0.000 description 1
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 1
- 229910001431 copper ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000008278 cosmetic cream Substances 0.000 description 1
- 239000008341 cosmetic lotion Substances 0.000 description 1
- 239000006184 cosolvent Substances 0.000 description 1
- 230000001808 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000080 dermatitis contact Toxicity 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 229940008099 dimethicone Drugs 0.000 description 1
- 239000004205 dimethyl polysiloxane Substances 0.000 description 1
- 235000013870 dimethyl polysiloxane Nutrition 0.000 description 1
- 229940042399 direct acting antivirals Protease inhibitors Drugs 0.000 description 1
- 235000019301 disodium ethylene diamine tetraacetate Nutrition 0.000 description 1
- ZGTMUACCHSMWAC-UHFFFAOYSA-L disodium;2-[2-[carboxylatomethyl(carboxymethyl)amino]ethyl-(carboxymethyl)amino]acetate Chemical compound [Na+].[Na+].OC(=O)CN(CC([O-])=O)CCN(CC(O)=O)CC([O-])=O ZGTMUACCHSMWAC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 229960000735 docosanol Drugs 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 231100000371 dose-limiting toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000002500 effect on skin Effects 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 210000000039 epithelial melanocyte Anatomy 0.000 description 1
- 231100000321 erythema Toxicity 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 230000001815 facial Effects 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 230000002538 fungal Effects 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 239000001963 growth media Substances 0.000 description 1
- UBHWBODXJBSFLH-UHFFFAOYSA-N hexadecan-1-ol;octadecan-1-ol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCO.CCCCCCCCCCCCCCCCCCO UBHWBODXJBSFLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010903 husk Substances 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 235000011167 hydrochloric acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000008172 hydrogenated vegetable oil Substances 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 1
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N iso-propanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 239000002609 media Substances 0.000 description 1
- 230000001404 mediated Effects 0.000 description 1
- 229940098779 methanesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- GRVDJDISBSALJP-UHFFFAOYSA-N methyloxidanyl Chemical group [O]C GRVDJDISBSALJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 1
- YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N morpholine Chemical compound C1COCCN1 YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940113083 morpholine Drugs 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000004792 oxidative damage Effects 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-L phosphoramidate Chemical compound NP([O-])([O-])=O PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 239000000049 pigment Substances 0.000 description 1
- 230000019612 pigmentation Effects 0.000 description 1
- 229920000435 poly(dimethylsiloxane) Polymers 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 1
- 231100000175 potential carcinogenicity Toxicity 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 230000002335 preservative Effects 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 230000002035 prolonged Effects 0.000 description 1
- 229910052904 quartz Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010453 quartz Substances 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000001603 reducing Effects 0.000 description 1
- 238000006722 reduction reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000268 renotropic Effects 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 125000000548 ribosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 1
- 230000008313 sensitization Effects 0.000 description 1
- 230000001235 sensitizing Effects 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N silicon dioxide Inorganic materials O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 235000013555 soy sauce Nutrition 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 1
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 1
- 229960001367 tartaric acid Drugs 0.000 description 1
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940104261 taurate Drugs 0.000 description 1
- 238000003419 tautomerization reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001519 tissues Anatomy 0.000 description 1
- ZGYICYBLPGRURT-UHFFFAOYSA-N tri(propan-2-yl)silicon Chemical compound CC(C)[Si](C(C)C)C(C)C ZGYICYBLPGRURT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 238000000870 ultraviolet spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 235000021307 wheat Nutrition 0.000 description 1
- 235000014101 wine Nutrition 0.000 description 1
Images
Abstract
Description
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИFIELD OF TECHNOLOGY
Данное изобретение относится к производным пептидных нуклеиновых кислот, комплементарно целенаправленно воздействующим на пре-мРНК тирозиназы человека, для улучшения опосредованной тирозиназой пигментации кожи.The present invention relates to peptide nucleic acid derivatives that complementarily target human tyrosinase pre-mRNA to improve tyrosinase-mediated skin pigmentation.
ПРЕДПОСЫЛКИ СОЗДАНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯBACKGROUND OF THE INVENTION
Меланин обобщенно относится к темным природным и полимерным пигментам, вырабатываемым в живых организмах. Существует три типа меланина, т.е. эумеланин, феомеланин и нейромеланин. Эумеланин и феомеланин синтезируются в коже. Одновременно нейромеланин является меланином, найденным в головном мозге, и его физиологические функции до сих пор не выяснены.Melanin generally refers to dark natural and polymeric pigments produced in living organisms. There are three types of melanin i.e. eumelanin, pheomelanin and neuromelanin. Eumelanin and pheomelanin are synthesized in the skin. Simultaneously, neuromelanin is melanin found in the brain, and its physiological functions have not yet been elucidated.
Меланин в коже эффективно поглощает УФ (ультрафиолетовое) излучение и защищает животных от УФ (ультрафиолетового) облучения при естественном солнечном свете. Таким образом, загар является естественным процессом, которым животные защищают себя от УФ облучения на солнце.Melanin in the skin effectively absorbs UV (ultraviolet) radiation and protects animals from UV (ultraviolet) radiation in natural sunlight. Thus, tanning is a natural process by which animals protect themselves from UV exposure in the sun.
Аминокислота тирозин полимеризуется до эумеланина после ряда сложных реакций в присутствии тирозиназы. Эумеланин относится к полимерам 5,6-дигидроксииндола (dihydroxyindole, DHI) и 5,6-дигидроксииндол-2-карбоновой кислоты (5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid, DHICA). Феомеланин образуется при полимеризации тирозина с помощью тирозиназы в присутствии цистеина или глутатиона.The amino acid tyrosine polymerizes to eumelanin after a series of complex reactions in the presence of tyrosinase. Eumelanin refers to polymers of 5,6-dihydroxyindole (dihydroxyindole, DHI) and 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid (5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid, DHICA). Pheomelanin is formed by the polymerization of tyrosine by tyrosinase in the presence of cysteine or glutathione.
В схеме 1 обобщены реакции, включающие TYR (тирозиназа), TYRP-1 (тирозиназа-зависимый белок 1, т.е. DHICA оксидаза) и TYRP-2 (тирозиназа-зависимый белок 2, т.е. DОРАхром (допахром) таутомераза) во время биосинтеза эумеланина и феомеланина. [Int. J. Mol. Sci. vol 10,4066-4087 (2009)].
Схема 1
Принимая во внимание, что тирозиназа (TYR) играет центральные роли в биосинтезе меланина в коже, были использованы или разработаны ингибиторы TYR в качестве косметических ингредиентов для уменьшения чрезмерной пигментации кожи, т.е. гиперпигментации. В нескольких публикациях [Int. J. Cosmetic Sci. vol 33, 210-221 (2011); Int. J. Mol. Sci. vol 10, 2440-2475 (2009)] ингибиторы TYR были проверены на предмет их воздействия на меланогенез.Given that tyrosinase (TYR) plays a central role in melanin biosynthesis in the skin, TYR inhibitors have been used or developed as cosmetic ingredients to reduce excessive skin pigmentation, i.e. hyperpigmentation. Several publications [Int. J. Cosmetic Sci.
Гидрохинон (1,4-дигидроксибензол) был использован для местного лечения гиперпигментации в течение десятилетий. [JAMA vol 194(9), 965-967 (1965)] Гидрохинон, как известно, подавляет активность TYR путем связывания с активным центром тирозиназы. В 2006 году US FDA (Управление по контролю за продуктами и лекарствами США) отозвало предыдущую регистрацию всех безрецептурных (ОТС over-the-counter) продуктов, содержащих гидрохинон, из-за проблем с безопасностью, включая потенциальную канцерогенность. Гидрохинон индуцирует активные формы кислорода (reactive oxygen species, ROS), повреждая мембранные липиды и белки, включая тирозиназу. Окислительное повреждение мембранных липидов необратимо лишает меланоцитов.Hydroquinone (1,4-dihydroxybenzene) has been used for the topical treatment of hyperpigmentation for decades. [JAMA vol 194(9), 965-967 (1965)] Hydroquinone is known to inhibit TYR activity by binding to the active site of tyrosinase. In 2006, the US FDA withdrew previous registrations for all over-the-counter (OTC) products containing hydroquinone due to safety concerns, including potential carcinogenicity. Hydroquinone induces reactive oxygen species (ROS) by damaging membrane lipids and proteins, including tyrosinase. Oxidative damage to membrane lipids irreversibly deprives melanocytes.
Арбутин (гидрохинон-О-β-D-глюкопиранозид) представляет собой гликозилированный гидрохинон, извлеченный из растения толокнянки. Арбутин также содержится в шелухе пшеницы и кожице груши. Как и гидрохинон, арбутин ингибирует меланогенез путем конкурентного связывая с активным центром TYR. [J. Pharmacol. Exp. Ther. vol 276(2), 765-769 (1996)]. Арбутин менее цитотоксичен к меланоцитам, чем гидрохинон.Arbutin (hydroquinone-O-β-D-glucopyranoside) is a glycosylated hydroquinone extracted from the bearberry plant. Arbutin is also found in wheat husks and pear skins. Like hydroquinone, arbutin inhibits melanogenesis by competitive binding to the TYR active site. [J. Pharmacol. Exp. Ther. vol 276(2), 765-769 (1996)]. Arbutin is less cytotoxic to melanocytes than hydroquinone.
Дезоксиарбутин является синтетическим производным арбутина и сравним с гидрохиноном и арбутином по ингибирующей активности TYR. Дезоксиарбутин менее цитотоксичен к меланоцитам, чем арбутин, а также и гидрохинон. [J. Dermatol. Sci. vol 55(3), 179-184 (2009)]. Дезоксиарбутин значительно улучшил светлый цвет кожи человека при наружной обработке в течение 12 недель. [Exp. Dermatol, vol 14(8), 601-608 (2005)].Deoxyarbutin is a synthetic derivative of arbutin and is comparable to hydroquinone and arbutin in terms of TYR inhibitory activity. Deoxyarbutin is less cytotoxic to melanocytes than arbutin, as well as hydroquinone. [J. Dermatol. sci. vol 55(3), 179-184 (2009)]. Deoxyarbutin significantly improved fair human skin color when applied topically for 12 weeks. [Exp. Dermatol, vol 14(8), 601-608 (2005)].
Койевая кислота является хелатирующим агентом, полученным во время грибкового брожения в производстве соевого соуса и саке, т.е. японского рисового вина. Койевая кислота была использована для сохранения или изменения цвета в пищевых и косметических продуктах. Койевая кислота связывается в хелатный комплекс к ионами меди в активном центре TYR для ингибирования меланогенеза. Также подавляется таутомеризация DОРАхрома в 5,6-дигидроксииндол-2-карбоновую кислоту. [J. Pharm. Pharmacol, vol 46(12), 982-985 (1994)]. Койевая кислота была широко использована для лечения мелазмы, хотя она может вызвать контактный дерматит, сенсибилизацию и эритему. [J. Drugs Dermatol, vol 6(1), 32-39 (2007)].Kojic acid is a chelating agent obtained during fungal fermentation in the production of soy sauce and sake, i.e. Japanese rice wine Kojic acid has been used to preserve or change color in food and cosmetic products. Kojic acid chelates to copper ions at the TYR active site to inhibit melanogenesis. The tautomerization of DOPAchrom to 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid is also inhibited. [J. Pharm. Pharmacol, vol 46(12), 982-985 (1994)]. Kojic acid has been widely used to treat melasma, although it can cause contact dermatitis, sensitization, and erythema. [J. Drugs Dermatol, vol 6(1), 32-39 (2007)].
Хотя существуют целый ряд ингибиторов TYR, их величины IC50 по сравнению с TYR в большинстве случаев являются микромолярными (мкМ). [J. Enzyme Inhibition Med. Chem. vol 32(1), 403-425 (2017)]. Считается, что такие величины IC50 являются плохими, принимая во внимание их молекулярные размеры, и повышают вероятность перекрестной реактивности с другой(ими) молекулярной(ыми) мишенью(ями). Поскольку плохая ингибирующая активность транслируется в большую трансдермальную дозу, ингибирующую активность необходимо заметно улучшить, чтобы удовлетворить желаемую трансдермальную активность против пигментации кожи, а также безопасности.Although there are a number of TYR inhibitors, their IC50 values compared to TYR are in most cases micromolar (µM). [J. Enzyme Inhibition Med. Chem. vol 32(1), 403-425 (2017)]. Such IC 50 values are considered to be poor in view of their molecular size and increase the likelihood of cross-reactivity with other molecular target(s). Since a poor inhibitory activity is translated into a large transdermal dose, the inhibitory activity must be markedly improved in order to satisfy the desired transdermal activity against skin pigmentation as well as safety.
Пре-мРНК: Генетическая информация осуществляется на ДНК (2-дезоксирибонуклеиновая кислота). ДНК транскрибируется для продуцирования пре-мРНК (пре-информационная (матричная) рибонуклеиновая кислота) в ядре. Пре-мРНК млекопитающих обычно состоит из экзонов и интронов, а экзон и интрон взаимосвязаны друг с другом, как схематично приведено ниже. Экзоны и интроны пронумерованы, как проиллюстрировано на рисунке ниже.Pre-mRNA: Genetic information is carried on DNA (2-deoxyribonucleic acid). DNA is transcribed to produce pre-mRNA (pre-messenger ribonucleic acid) in the nucleus. Mammalian pre-mRNA usually consists of exons and introns, and the exon and intron are interconnected with each other, as shown schematically below. Exons and introns are numbered as illustrated in the figure below.
Схематическое описание структуры пре-мРНКSchematic description of the structure of pre-mRNA
Сплайсинг пре-мРНК: Пре-мРНК подвергается процессингу в мРНК после удаления интронов серией сложных реакций в совокупности называемых "сплайсингом", который схематически обобщен ниже на диаграмме. [Ann. Rev. Biochem. 72(1), 291-336 (2003); Nature Rev. Mol. Cell Biol. 6(5), 386-398 (2005); Nature Rev. Mol. Cell Biol. 15(2), 108-121 (2014)].Pre-mRNA splicing: Pre-mRNA is processed into mRNA after removal of introns by a series of complex reactions collectively referred to as "splicing", which is summarized schematically in the diagram below. [Ann. Rev. Biochem. 72(1), 291-336 (2003); Nature Rev. Mol. Cell biol. 6(5), 386-398 (2005); Nature Rev. Mol. Cell biol. 15(2), 108-121 (2014)].
Сплайсинг инициируется образованием "сплайсомного Е комплекса" (т.е. ранний сплайсомный комплекс) между пре-мРНК и адапторными факторами сплайсинга. В "сплайсомном Е комплексе", U1 связывается с областью соединения экзона N и интрона N, и U2AF35 связывает область соединения интрона N и экзона (N+1). Таким образом, области соединения экзон/интрон или интрон/экзон являются критическими для образования раннего сплайсомного комплекса. "Сплайсомный Е комплекс" превращается в "сплайсомный А комплекс " при дополнительном комплексообразовании с U2. "Сплайсомный А комплекс" претерпевает серию сложных реакций для удаления или сплайсирования интрона, чтобы присоединить соседние экзоны.Splicing is initiated by the formation of a "splicesome E complex" (ie, an early splice complex) between pre-mRNA and splicing adapter factors. In the "splicesome E complex", U1 binds to the junction of exon N and intron N, and U2AF 35 binds to the junction of intron N and exon (N+1). Thus, the exon/intron or intron/exon junction regions are critical for the formation of the early splicesome complex. The "splicesome E complex" is converted to the "splicesome A complex" by additional complexation with U2. The "splicesome A complex" undergoes a series of complex reactions to remove or splice an intron to add adjacent exons.
Синтез рибосомного белка: Белки кодируются ДНК (2-дезоксирибонуклеиновая кислота). В ответ на клеточную стимуляцию или спонтанно ДНК транскрибируется для продуцирования пре-мРНК (пре-матричная рибонуклеиновая кислота) в ядре. Интроны пре-мРНК ферментативным путем сплайсируются для получения мРНК (матричная рибонуклеиновая кислота), которая затем транслоцируется в цитоплазму. В цитоплазме комплекс трансляционного механизма, вызванный рибосомой, связывается с мРНК и осуществляется синтез белка, поскольку он сканирует генетическую информацию, кодируемую по мРНК. [Biochemistry vol 41, 4503-4510 (2002); Cancer Res. vol 48, 2659-2668 (1988)].Ribosomal protein synthesis: Proteins are encoded by DNA (2-deoxyribonucleic acid). In response to cellular stimulation or spontaneously, DNA is transcribed to produce pre-mRNA (pre-matrix ribonucleic acid) in the nucleus. The pre-mRNA introns are enzymatically spliced to produce mRNA (messenger ribonucleic acid), which is then translocated into the cytoplasm. In the cytoplasm, the translational machinery complex caused by the ribosome binds to the mRNA and protein synthesis occurs as it scans the genetic information encoded by the mRNA. [Biochemistry vol 41, 4503-4510 (2002); Cancer Res. vol 48, 2659-2668 (1988)].
Антисмысловой олигонуклеотид (Antisense Oligonucleotide, ASO): Связывание олигонуклеотида с нуклеиновой кислотой, включая ДНК, мРНК и пре-мРНК, в сиквенс-специфичном методе (т.е. комплементарно) называется антисмысловым олигонуклеотидом (ASO).Antisense Oligonucleotide (ASO): The binding of an oligonucleotide to a nucleic acid, including DNA, mRNA, and pre-mRNA, in a sequence-specific (i.e., complementary) manner, is called an antisense oligonucleotide (ASO).
Если ASO прочно связывается с мРНК в цитоплазме, например, ASO может ингибировать синтез рибосомного белка по мРНК. Необходимо, чтобы ASO присутствовал внутри цитоплазмы для того, чтобы ингибировать синтез рибосомного белка его белка-мишени.If ASO binds tightly to mRNA in the cytoplasm, for example, ASO can inhibit ribosomal protein synthesis from mRNA. It is necessary for ASO to be present within the cytoplasm in order to inhibit ribosomal protein synthesis of its target protein.
Антисмысловое ингибирование сплайсинга: Если ASO прочно связывается с пре-мРНК в ядре, ASO сможет ингибировать или модулировать сплайсинг пре-мРНК в мРНК. Необходимо, чтобы ASO присутствовал внутри ядра для того, чтобы ингибировать или модулировать сплайсинг пре-мРНК в мРНК. Такое антисмысловое ингибирование сплайсинга продуцирует мРНК или мРНКы, не содержащие экзона, нацеленного с помощью ASO. Такая(ие) мРНК(ы) называется(ются) "сплайс-вариантом(ами)", и кодирует(ют) белок(и) меньший(ие), чем белок, кодируемый полноразмерной мРНК.Antisense Splicing Inhibition: If ASO binds tightly to pre-mRNA in the nucleus, ASO will be able to inhibit or modulate pre-mRNA splicing into mRNA. It is necessary for ASO to be present within the nucleus in order to inhibit or modulate pre-mRNA splicing into mRNA. This antisense splicing inhibition produces mRNA or mRNAs that do not contain the ASO-targeted exon. Such mRNA(s) are referred to as "splice variant(s)", and encode(s) for protein(s) smaller(s) than the protein encoded by the full-length mRNA.
В принципе, сплайсинг может быть нарушен при ингибировании образования «сплайсомного Е комплекса». Если ASO прочно связывается с областью соединения (5'→3') экзон-интрон, т.е. "5' сайт сплайсинга», то ASO блокирует образование комплекса между пре-мРНК и фактором U1, и, следовательно, образование «сплайсомного Е комплекса». Аналогичным образом, «сплайсомный Е комплекс» не может образоваться, если ASO прочно связывается с областью соединения (5'→3') интрон-экзон, т.е. «3' сайт сплайсинга».In principle, splicing can be disrupted by inhibiting the formation of the "splicesome E complex". If ASO binds strongly to the exon-intron junction (5'→3'), i.e. "5' splicing site", then ASO blocks the formation of a complex between the pre-mRNA and factor U1, and hence the formation of the "splicesome E complex". Similarly, the "splicesome E complex" cannot be formed if ASO binds tightly to the junction region (5'→3') intron-exon, i.e. "3' splicing site".
3' сайт сплайсинга и 5' сайт сплайсинга схематически проиллюстрированы на рисунке, приведенном ниже.The 3' splicing site and the 5' splicing site are schematically illustrated in the figure below.
Олигонуклеотиды не природного происхождения: ДНК- или РНК-олигонуклеотиды подвержены деградации эндогенными нуклеазами, ограничивая их терапевтическую ценность. В настоящее время были разработаны и интенсивно исследованы многие виды олигонуклеотидов не природного происхождения (не встречающиеся в природе). [Clin. Exp. Pharmacol. Physiol, vol 33, 533-540 (2006)]. Некоторые из них показывают длительную метаболическую стабильность по сравнению с ДНК и РНК. Ниже приведены химические структуры для нескольких типичных олигонуклеотидов не природного происхождения. Такие олигонуклеотиды предсказуемо связываются с комплементарной нуклеиновой кислотой, как это делает ДНК или РНК.Non-natural Oligonucleotides: DNA or RNA oligonucleotides are susceptible to degradation by endogenous nucleases, limiting their therapeutic value. Currently, many types of non-naturally occurring (non-naturally occurring) oligonucleotides have been developed and intensively researched. [clin. Exp. Pharmacol. Physiol,
В: Нуклеиновое основаниеB: Nucleic base
Фосфоротиоатный олигонуклеотид: Фосфоротиоатный олигонуклеотид (ФТО) (Phosphorothioate oligonucleotide, РТО) является аналогом ДНК с одним остовом атомов фосфатного кислорода, замещенных атомом серы в мономере. Такое небольшое структурное изменение сделало ФТО сравнительно устойчивым к деградации нуклеазами. [Ann. Rev. Biochem. vol 54, 367-402 (1985)].Phosphorothioate oligonucleotide: Phosphorothioate oligonucleotide (PTO) (Phosphorothioate oligonucleotide, PTO) is a DNA analog with one backbone of phosphate oxygen atoms replaced by a sulfur atom in the monomer. Such a small structural change made PTO relatively resistant to degradation by nucleases. [Ann. Rev. Biochem. vol 54, 367-402 (1985)].
Отражая структурное сходство в остове ФТО и ДНК, они оба плохо проникают в клеточную мембрану в большинстве типов клеток млекопитающих. При этом, для некоторых типов клеток, чрезмерно экспрессирующих транспортер(ы) ДНК, ДНК и ФТО показывают хорошее проникновение в клетки. Известно, что системно вводимые ФТО(ы) легко распределяются в печени и почках. [Nucleic Acids Res. vol 25, 3290-3296 (1997)].Reflecting the structural similarity in the backbone of PTO and DNA, both of them poorly penetrate the cell membrane in most mammalian cell types. However, for some cell types overexpressing the DNA transporter(s), DNA and PTO show good cell penetration. Systemically administered PTO(s) are known to be readily distributed in the liver and kidneys. [Nucleic Acids Res.
Для того, чтобы облегчить проникновение в клетки ФТО in vitro, обычно на практике применяют липофекцию. Однако, липофекция физически изменяет клеточную мембрану, вызывает цитотоксичность, и поэтому не будет идеальным для долгосрочного терапевтического применения in vivo.In order to facilitate the penetration of PTO into cells in vitro, lipofection is usually used in practice. However, lipofection physically alters the cell membrane, causes cytotoxicity, and therefore would not be ideal for long-term in vivo therapeutic applications.
За прошедшие 30 лет антисмысловые ФТО(ы) и варианты ФТО(ов) были клинически оценены для лечения рака, иммунологических расстройств, метаболических заболеваний и так далее. [Biochemistry vol 41, 4503-4510 (2002); Clin. Exp. Pharmacol. Physiol, vol 33, 533-540 (2006)]. Многие из таких кандидатов антисенс-препаратов не были успешно разработаны отчасти из-за плохого проникновения в клетки ФТО. Для того, чтобы преодолеть плохое проникновение в клетки, ФТО необходимо вводить в высокой дозе для терапевтической активности.Over the past 30 years, antisense PTO(s) and variants of PTO(s) have been clinically evaluated for the treatment of cancer, immunological disorders, metabolic diseases, and so on. [Biochemistry vol 41, 4503-4510 (2002); Clin. Exp. Pharmacol. Physiol,
Однако, известно, что ФТО(ы) связаны с дозолимитирующей токсичностью, включающей увеличенное время свертывания, активацию комплемента, тубулярную нефропатию, активацию купферовых клеток и иммунную стимуляцию, включая спленомегалию, лимфоидную гиперплазию, мононуклеарную клеточную инфильтрацию. [Clin. Exp. Pharmacol. Physiol, vol 33, 533-540 (2006)].However, PTO(s) are known to be associated with dose-limiting toxicity including prolonged clotting time, complement activation, tubular nephropathy, Kupffer cell activation and immune stimulation including splenomegaly, lymphoid hyperplasia, mononuclear cell infiltration. [clin. Exp. Pharmacol. Physiol,
Было найдено, что многие антисмысловые ФТО(ы) показывают надлежащую клиническую активность при заболеваниях со значительной ролью печени или почек. Мипомерсен является аналогом ФТО, который ингибирует синтез ароВ-100, белка, вовлеченного в транспорт холестерина липопротеинов низкой плотности (LDL). Мипомерсен проявлял надлежащую клиническую активность у больных атеросклерозом, скорее всего, из-за его избирательного распределения в печени. [Circulation vol 118(7), 743-753 (2008)]. ISIS-113715 является антисмысловым аналогом ФТО, ингибирующего синтез протеинтирозинфосфатазы IB (РТР1В), и было установлено, что показывает терапевтическую активность у больных сахарным диабетом II типа. [Curr. Opin. Mol. Ther. vol 6, 331-336 (2004)].Many antisense PTO(s) have been found to show adequate clinical activity in diseases with significant hepatic or renal involvement. Mipomersen is a PTO analog that inhibits the synthesis of apoB-100, a protein involved in the transport of low-density lipoprotein (LDL) cholesterol. Mipomersen showed adequate clinical activity in patients with atherosclerosis, most likely due to its selective distribution in the liver. [Circulation vol 118(7), 743-753 (2008)]. ISIS-113715 is an antisense analog of PTO that inhibits the synthesis of protein tyrosine phosphatase IB (PTP1B) and has been found to show therapeutic activity in patients with type II diabetes mellitus. [Curr. Opin. Mol. Ther.
Запертая нуклеиновая кислота: В запертой нуклеиновой кислоте (ЗНК) (locked nucleic acid, LNA) рибозное кольцо остова РНК структурно затрудняет увеличить связывающую способность для РНК или ДНК. Таким образом, ЗНК можно рассматривать как аналог ДНК или РНК высокой аффинности. [Biochemistry vol 45, 7347-7355 (2006)].Locked nucleic acid: In a locked nucleic acid (LNA), the ribose ring of the RNA backbone makes it structurally difficult to increase the binding capacity for RNA or DNA. Thus, LNA can be considered as a high affinity analogue of DNA or RNA. [Biochemistry vol 45, 7347-7355 (2006)].
Фосфородиамидат морфолино олигонуклеотид: В фосфородиамидат морфолино олигонуклеотиде (ФМО) (phosphorodiamidate morpholino oligonucleotide, PMO) фосфатный остов и 2-дезоксирибоза ДНК заменяются фосфорамидатом и морфолином, соответственно. [Appl. Microbiol. Biotechnol. vol 71, 575-586 (2006)]. При этом остов ДНК отрицательно заряжен, ФМО остов не заряжен. Таким образом, связывание между ФМО и мРНК не имеет электростатического отталкивания между остовами и, как правило, сильнее, чем таковое между ДНК и мРНК. Так как ФМО структурно очень сильно отличается от ДНК, ФМО не будет распознаваться печеночным(и) транспортером(ами), распознающим(ими) ДНК или РНК. При этом ФМО не легко проникает в клеточную мембрану.Phosphorodiamidate morpholino oligonucleotide: In the phosphorodiamidate morpholino oligonucleotide (PMO), the phosphate backbone and 2-deoxyribose DNA are replaced by phosphoramidate and morpholine, respectively. [Appl. microbiol. Biotechnol.
Пептидная нуклеиновая кислота: Пептидная нуклеиновая кислота (ПНК) (Peptide nucleic acid, PNA) является полипептидом с N-(2-аминоэтил)глицином в качестве остовного звена и была открыта Dr. Nielsen и коллегами. [Science vol 254, 1497-1500 (1991)]. Химическая структура и сокращенная номенклатура ПНК иллюстрируются на представленном ниже рисунке. Подобно ДНК и РНК, ПНК также селективно связывается с комплементарной нуклеиновой кислотой. [Nature (London) vol 365, 566-568 (1992)]. При связывании с комплементарной нуклеиновой кислотой N-конец ПНК рассматривается как эквивалент «5'-конца» ДНК или РНК и С-конец ПНК как эквивалент «3'-конца» ДНК или РНК.Peptide Nucleic Acid: Peptide nucleic acid (PNA) is a polypeptide with N-(2-aminoethyl)glycine as a backbone and was discovered by Dr. Nielsen and colleagues. [Science vol 254, 1497-1500 (1991)]. The chemical structure and abbreviated nomenclature of PNA are illustrated in the figure below. Like DNA and RNA, PNA also selectively binds to a complementary nucleic acid. [Nature (London) vol 365, 566-568 (1992)]. When bound to a complementary nucleic acid, the N-terminus of the PNA is considered equivalent to the "5' end" of DNA or RNA and the C-terminus of PNA is considered to be the equivalent of the "3' end" of DNA or RNA.
Подобно ФМО, остов ПНК не заряжен. Таким образом, связывание между ПНК и РНК, как правило, сильнее, чем связывание между ДНК и РНК. Так как ПНК заметно отличается от ДНК по химической структуре, ПНК не будет распознаваться печеночным(ми) транспортером(ами), распознающим(ими) ДНК, и будет показывать профиль распределения в тканях, отличный от такого для ДНК или ФТО. Однако, ПНК также плохо проникает в мембрану клеток млекопитающих. (Adv. Drug Delivery Rev. vol 55, 267-280,2003).Like FMO, the PNA backbone is not charged. Thus, the binding between PNA and RNA is generally stronger than the binding between DNA and RNA. Since PNA is markedly different from DNA in chemical structure, PNA will not be recognized by the hepatic DNA-recognizing transporter(s) and will show a tissue distribution profile different from that of DNA or PTO. However, PNA also poorly penetrates the membrane of mammalian cells. (Adv. Drug Delivery Rev. vol 55, 267-280, 2003).
Модифицированные нуклеиновые основания для улучшения мембранной проницаемости ПНК: ПНК была получена высоко проницаемой для мембраны клеток млекопитающих путем введения модифицированных нуклеиновых оснований с катионным липидом или его эквивалентном ковалентно к нему присоединенным. Химические структуры таких модифицированных нуклеиновых оснований приведены ниже. Было найдено, что такие модифицированные нуклеиновые основания цитозина, аденина и гуанина предсказуемо и комплементарно гибридизируются с гуанином, тимином и цитозином, соответственно. [РСТ Appl. No. PCT/KR2009/001256; ЕР2268607; US8680253].Modified Nucleic Bases to Improve PNA Membrane Permeability: PNA has been made highly membrane permeable to mammalian cells by introducing modified nucleobases with a cationic lipid or equivalent covalently attached to it. The chemical structures of such modified nucleic bases are given below. These modified nucleobases of cytosine, adenine, and guanine have been found to hybridize predictably and complementarily to guanine, thymine, and cytosine, respectively. [PCT Appl. no. PCT/KR2009/001256; EP2268607; US8680253].
Включение таких модифицированных нуклеиновых оснований в ПНК имеет сходство с ситуациями липофекции. При липофекции молекулы олигонуклеотида с фосфатным остовом скрыты катионными липидными молекулами, такими как липофектамин, и такие липофектамин/олигонуклеотидные комплексы склонны проникать в мембрану довольно легко по сравнению с оголенными молекулами олигонуклеотида.The incorporation of such modified nucleobases into PNA is similar to situations of lipofection. In lipofection, the phosphate backbone oligonucleotide molecules are obscured by cationic lipid molecules such as lipofectamine, and such lipofectamine/oligonucleotide complexes tend to penetrate the membrane rather easily compared to naked oligonucleotide molecules.
Было найдено, что в дополнение к хорошей мембранной проницаемости, эти производные ПНК обладают ультра-сильным сродством к комплементарной нуклеиновой кислоте. Например, введение от 4 до 5 модифицированных нуклеиновых оснований в 11-13-мерные производные ПНК легко дало прирост Tm в 20°С или выше при дуплексном образовании с комплементарной ДНК. Такие производные ПНК очень чувствительны к ошибочному спариванию пары оснований. Ошибочное спаривание пары оснований привело к потере Tm от 11 до 22°С в зависимости от типа модифицированного основания, а также последовательности ПНК.In addition to good membrane permeability, these PNA derivatives have been found to have an ultra-strong affinity for the complementary nucleic acid. For example, the introduction of 4 to 5 modified nucleic bases into 11-13-mer PNA derivatives easily gave rise to a T m of 20° C. or more when duplexed with complementary DNA. Such PNA derivatives are very sensitive to base pair mismatch. The base pair mismatch resulted in a T m loss of 11 to 22°C, depending on the type of modified base as well as the PNA sequence.
Малая интерферирующая РНК (siPHК) (small Interfering RNA, siRNA): Малая интерферирующая РНК (siPHК) относится к двухцепочечной РНК из 20-25 пар оснований. [Microbiol. Mol. Biol. Rev. vol 67(4), 657-685 (2003)]. Антисмысловая цепь siPHK каким-то образом взаимодействует с белками, образуя «индуцированный РНК комплекс сайленсинга» (RNA-induced Silencing Complex, RISC). Затем RISC связывается с определенной частью мРНК, комплементарной к антисмысловой цепи siPHК. мРНК, образовавшая комплекс с RISC, подвергается расщеплению. Таким образом, siPHК каталитически индуцирует расщепление своей мишени(целевой) мРНК, и, следовательно, подавляет экспрессию белка с помощью мРНК. RISC не всегда связывается с полной комплементарной последовательностью в пределах целевой мРНК, что вызывает опасения, связанные с ненаправленными действиями лекарственного действия siPHК. Как и другие классы олигонуклеотида с остовом ДНК или РНК, siPHК обладает плохой клеточной проницаемостью и, следовательно, имеет тенденцию показывать плохую терапевтическую активность in vitro или in vivo, если должным образом не подготовлена или химически не модифицирована для получения хорошей мембранной проницаемости.Small interfering RNA (siRNA) (small Interfering RNA, siRNA): Small interfering RNA (siRNA) refers to double-stranded RNA of 20-25 base pairs. [Microbiol. Mol. Biol. Rev. vol 67(4), 657-685 (2003)]. The antisense strand of siRNA somehow interacts with proteins, forming an “RNA-induced Silencing Complex” (RISC). The RISC then binds to a specific portion of the mRNA that is complementary to the siRNA antisense strand. mRNA complexed with RISC is cleaved. Thus, siRNA catalytically induces cleavage of its target (target) mRNA, and therefore suppresses protein expression by mRNA. RISC does not always bind to the full complementary sequence within the target mRNA, which raises concerns about non-targeted siRNA drug actions. Like other classes of DNA or RNA backbone oligonucleotide, siRNA has poor cell permeability and therefore tends to show poor in vitro or in vivo therapeutic activity unless properly prepared or chemically modified to obtain good membrane permeability.
siPHК(ы) тирозиназы: Было найдено, что siPHК TYR, направленная на 19-мерную РНК последовательность в мРНК TYR человека, ингибирует экспрессию мРНК TYR и белка в эпидермальных меланоцитах человека (human epidermal melanocytes, HEMs) после липофекции при 20 нМ. siPHК подавляла мРНК TYR и белок, но не влияла на экспрессию тирозиназа-зависимых белков 1 и 2. siPHК ингибировала меланогенез, индуцированный ультрафиолетовым излучением. [ВМВ Reports, vol 42(3), 178-183 (2009)].Tyrosinase siRNA(s): TYR siRNA targeting the 19mer RNA sequence in human TYR mRNA was found to inhibit TYR mRNA and protein expression in human epidermal melanocytes (HEMs) after lipofection at 20 nM. siRNA suppressed TYR mRNA and protein, but did not affect the expression of tyrosinase-
siPHК(ы), направленные на мишень мРНК TYR мыши, подвергли скринингу на их способность подавлять экспрессию мРНК TYR и белка, и меланогенез в клетках В16 меланомы мыши после липофекции при 40 нМ. Наиболее эффективную siPHК вводили в глазное яблоко мыши C57BL/6 и было установлено ингибирование мРНК TYR в сетчатке на примерно 60%. [Mol. Biol. International, vol 2010, Article ID 240472 (2010)].siRNA(s) targeting mouse TYR mRNA were screened for their ability to suppress TYR mRNA and protein expression and melanogenesis in mouse melanoma B16 cells after lipofection at 40 nM. The most effective siRNA was injected into the eyeball of a C57BL/6 mouse and TYR mRNA inhibition in the retina was found to be approximately 60%. [Mol. Biol. International, vol 2010, Article ID 240472 (2010)].
Описание изобретенияDescription of the invention
Решаемая проблемаProblem being solved
Имеются другие общедоступные примеры для siPHК TYR. Например, в известном уровне техники раскрыты siPHК(ы), направленные на мРНК TYR человека для лечения гиперпигментации. [US 7504385]. Тем не менее, применимость таких siPHК(т) сомнительна для использования против гиперпигментации. siPHК(ы) слишком дороги для производства, и их косметическая полезность, как правило, ограничена. Также они должны быть доставлены в кожу с помощью трансдермального введения при надлежащем соблюдении пользователем. Следует предусмотреть, что трансдермальная доставка является огромной технической проблемой в области олигонуклеотида.There are other public examples for siPHK TYR. For example, the prior art discloses siRNA(s) directed to human TYR mRNA for the treatment of hyperpigmentation. [US 7504385]. However, the applicability of such siRNA(t) is questionable for use against hyperpigmentation. siRNA(s) are too expensive to manufacture and their cosmetic utility is generally limited. They must also be delivered to the skin via transdermal administration with proper user compliance. It should be anticipated that transdermal delivery is a huge technical challenge in the field of oligonucleotide.
Решение проблемыSolution
Данное изобретение предлагает производное пептидной нуклеиновой кислоты, представленное формулой I, или ее фармацевтически приемлемую соль:This invention provides a peptide nucleic acid derivative represented by formula I, or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
[Формула I][Formula I]
гдеwhere
n - целое число от 10 до 21;n is an integer from 10 to 21;
соединение формулы I обладает по меньшей мере 10-мерным комплементарным перекрыванием с 14-мерной последовательностью пре-мРНК [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] в пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I has at least a 10-mer complementary overlap with the 14-mer pre-mRNA sequence [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] in human TYR pre-mRNA;
соединение формулы I полностью комплементарно пре-мРНК TYR человека или частично комплементарно пре-мРНК TYR человека с одним или двумя ошибочными спариваниями от всего соединения формулы I;a compound of formula I is fully complementary to human pre-TYR mRNA or partially complementary to human pre-TYR mRNA with one or two mismatches from the total compound of formula I;
S1, S2, , Sn-1, Sn, Т1, T2, , Tn-1 и Tn независимо обозначают атом дейтерия, атом водорода, замещенную или незамещенную алкилгруппу или замещенную или незамещенную арилгруппу; S1 , S2 , , S n-1 , S n , T 1 , T 2 , , T n-1 and T n independently represent a deuterium atom, a hydrogen atom, a substituted or unsubstituted alkyl group, or a substituted or unsubstituted aryl group;
X и Y независимо обозначают атом дейтерия, атом водорода [Н], формилгруппу [Н-С(=O)-], аминокарбонилгруппу [NH2-C(=O)-], аминотиокарбонилгруппу [NH2-C(=S)-], замещенную или незамещенную алкилгруппу, замещенную или незамещенную арилгруппу, замещенную или незамещенную алкилацилгруппу, замещенную или незамещенную арилацилгруппу, замещенную или незамещенную алкилоксикарбонилгруппу, замещенную или незамещенную арилоксикарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкиламинокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную ариламинокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкиламинотиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную ариламинотиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилокситиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную арилокситиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилсульфонилгруппу, замещенную или незамещенную арилсульфонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилфосфонилгруппу или замещенную или незамещенную арилфосфонилгруппу;X and Y independently represent a deuterium atom, a hydrogen atom [H], a formyl group [H-C(=O)-], an aminocarbonyl group [NH 2 -C(=O)-], an aminothiocarbonyl group [NH 2 -C(=S)- ], substituted or unsubstituted alkyl group, substituted or unsubstituted aryl group, substituted or unsubstituted alkyl acyl group, substituted or unsubstituted arylacyl group, substituted or unsubstituted alkyloxycarbonyl group, substituted or unsubstituted aryloxycarbonyl group, substituted or unsubstituted alkylaminocarbonyl group, substituted or unsubstituted arylaminocarbonyl group, substituted or unsubstituted arylaminocarbonyl group, substituted or unsubstituted arylaminocarbonyl group, substituted or unsubstituted arylaminocarbonyl group, substituted or unsubstituted arylaminocarbonyl group, an arylaminothiocarbonyl group, a substituted or unsubstituted alkyloxythiocarbonyl group, a substituted or unsubstituted aryloxythiocarbonyl group, a substituted or unsubstituted alkylsulfonyl group, a substituted or unsubstituted arylsulfonyl group, a substituted or unsubstituted alkylphosphonyl group, or a substituted or unsubstituted arylphosphonyl group;
Z обозначает атом водорода, гидроксигруппу, замещенную или незамещенную алкилоксигруппу, замещенную или незамещенную арилоксигруппу, замещенную или незамещенную аминогруппу, замещенную или незамещенную алкилгруппу или замещенную или незамещенную арилгруппу;Z is a hydrogen atom, a hydroxy group, a substituted or unsubstituted alkyloxy group, a substituted or unsubstituted aryloxy group, a substituted or unsubstituted amino group, a substituted or unsubstituted alkyl group, or a substituted or unsubstituted aryl group;
B1, B2, , Bn-1 и Bn независимо выбраны из природных нуклеиновых оснований, включая аденин, тимин, гуанин, цитозин и урацил, и нуклеиновых оснований не природного происхождения; и B1 , B2 , , B n-1 and B n are independently selected from naturally occurring nucleobases including adenine, thymine, guanine, cytosine, and uracil, and non-naturally occurring nucleobases; and
по меньшей мере четыре из B1, B2, , Bn-1 и Bn независимо выбраны из нуклеиновых оснований не природного происхождения с замещенной или незамещенной аминогруппой, ковалентно связанной с остатком нуклеинового основания.at least four of B 1 , B 2 , , B n-1 and B n are independently selected from non-naturally occurring nucleic bases with a substituted or unsubstituted amino group covalently linked to the rest of the nucleic base.
Соединение формулы I индуцирует пропуск «экзона 2» в пре-мРНК TYR человека, дает сплайс-вариант(ы) мРНК TYR человека, не содержащий(ие) «экзона 2», и, следовательно, пригодно для ингибирования функциональной активности гена, считывающего пре-мРНК TYR человека.The compound of formula I induces "
Условие, что «п представляет собой целое число от 10 до 21» буквально означает, что п является целым числом, выбираемым из группы целых чисел 11, 12, 13, 14,15, 16, 17,18, 19 и 20.The condition that "n is an integer from 10 to 21" literally means that n is an integer selected from the group of
Химические структуры природных нуклеиновых оснований или нуклеиновых оснований не природного происхождения в производном ПНК формулы I подтверждаются примерами на Фиг. 1а-1с. Природные (т.е. встречающиеся в природе) нуклеиновые основания или нуклеиновые основания не природного происхождения (т.е. не встречающиеся в природе), описанные в настоящем изобретении, включают, но не ограничиваются нуклеиновыми основаниями, представленными на Фиг. 1а-1с. Обеспечение таких нуклеиновых оснований не природного происхождения является иллюстрацией разнообразия приемлемых нуклеиновых оснований, и поэтому не должно быть истолковано для ограничения объема настоящего изобретения.The chemical structures of naturally occurring or non-naturally occurring nucleobases in the PNA derivative of formula I are illustrated by the examples in FIG. 1a-1c. Natural (ie, naturally occurring) or non-naturally occurring (ie, not naturally occurring) nucleobases described herein include, but are not limited to, the nucleobases shown in FIG. 1a-1c. The provision of such non-naturally occurring nucleobases is illustrative of the variety of acceptable nucleobases and should therefore not be construed as limiting the scope of the present invention.
Заместители, выбранные для описания производного ПНК формулы I, приведены на фиг. 2а-2е. Фиг. 2а приводит примеры для замещенных или незамещенных алкилгрупп. Замещенные или незамещенные алкилацилгруппы и замещенные или незамещенные арилацилгруппы приведены на фиг. 2b. Фиг. 2с иллюстрирует примеры для замещенной или незамещенной алкиламиногруппы, замещенной или незамещенной ариламиногруппы, замещенной или незамещенной арилгруппы, замещенной или незамещенной алкилсульфонилгруппы или арилсульфонилгруппы. Фиг. 2d приводит примеры для замещенной или незамещенной алкилоксикарбонилгруппы или арилоксикарбонилгруппы, замещенной или незамещенной алкиламинокарбонилгруппы или ариламинокарбонилгруппы. На фиг. 2е приведены примеры для замещенной или незамещенной алкиламинотиокарбонилгруппы, замещенной или незамещенной ариламинотиокарбонилгруппы, замещенной или незамещенной алкилокситиокарбонилгруппы и замещенной или незамещенной арилокситиокарбонилгруппы. Обеспечение таких типичных заместителей является иллюстрацией разнообразия приемлемых заместителей, и поэтому не должно быть истолковано для ограничения объема настоящего изобретения. Специалист в данной области может легко додумать, что олигонуклеотидная последовательность является ключевым фактором для сиквенс-специфичного связывания олигонуклеотида с целевой последовательностью пре-мРНК по сравнению с заместителями в N-конце или С-конце.The substituents chosen to describe the PNA derivative of Formula I are shown in FIG. 2a-2e. Fig. 2a gives examples for substituted or unsubstituted alkyl groups. Substituted or unsubstituted alkyl acyl groups and substituted or unsubstituted arylacyl groups are shown in FIG. 2b. Fig. 2c illustrates examples for a substituted or unsubstituted alkylamino group, a substituted or unsubstituted arylamino group, a substituted or unsubstituted aryl group, a substituted or unsubstituted alkylsulfonyl group, or an arylsulfonyl group. Fig. 2d gives examples of a substituted or unsubstituted alkyloxycarbonyl group or an aryloxycarbonyl group, a substituted or unsubstituted alkylaminocarbonyl group, or an arylaminocarbonyl group. In FIG. 2e are examples of a substituted or unsubstituted alkylaminothiocarbonyl group, a substituted or unsubstituted arylaminothiocarbonyl group, a substituted or unsubstituted alkyloxythiocarbonyl group, and a substituted or unsubstituted aryloxythiocarbonyl group. The provision of such exemplary substituents is illustrative of the variety of acceptable substituents and should therefore not be construed as limiting the scope of the present invention. A person skilled in the art can easily guess that the oligonucleotide sequence is a key factor for the sequence-specific binding of the oligonucleotide to the target pre-mRNA sequence, compared to substituents at the N-terminus or C-terminus.
Соединение формулы 1 прочно связывается с комплементарной ДНК, пример которой приведен в предшествующем уровне техники [PCT/KR2009/001256]. Дуплекс между производным ПНК формулы I и его полноразмерной комплементарной ДНК или РНК обладает значением Tm слишком высоким, чтобы достоверно определить в водном буфере. Соединение ПНК формулы I дает высокие значения Tm с комплементарными ДНКами более короткой длины.The compound of
Соединение формулы I комплементарно связывается с 3' сайтом сплайсинга "экзона 2" пре-мРНК TYR человека. [NCBI Reference Sequence: NG_0008748]. 14-мерная последовательность [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] охватывает область соединения «интрона 1» и "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека, и состоит из 7-мерной от "интрона 1" и 7-мерной от "экзона 2". Таким образом, 14-мерная последовательность пре-мРНК может обычно обозначаться как [(5'→3') uguacag AUUGUCU], где последовательность интрона и экзона определяется соответственно "строчными" и "заглавными" буквами и область соединения интрона-экзона выражается "". Традиционное обозначение для пре-мРНК дополнительно иллюстрируется 30-мерной последовательностью [(5'→3') ggguguuuuguacag AUUGUCUGUAGCCGA], охватывающей область соединения "интрона 1" и "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека. Кроме того, 30-мерная последовательность пре-мРНК однозначно определяет 3' сайт сплайсинга, направленный соединением формулы I в пре-мРНК TYR человека, хотя нумерация экзонов TYR может описываться иным образом.The compound of formula I binds complementarily to the 3' splicing site of "
Соединение формулы I прочно связывается с целевым 3' сайтом сплайсинга пре-мРНК TYR человека, считанного из гена TYR человека, и препятствует образованию «раннего сплайсомного комплекса», включающего целевой экзон соединения. Так как соединение, описанное в настоящем изобретении, стерически тормозит образование «раннего сплайсомного комплекса», "экзон 2" TYR сплайсируется для получения сплайс-варианта(ов) мРНК TYR, не содержащего(их) "экзона 2". Следовательно, соединение настоящего изобретения индуцирует пропуск "экзона 2" TYR.The compound of formula I binds tightly to the target 3' splicing site of the human TYR pre-mRNA read from the human TYR gene and prevents the formation of an "early splicesome complex" including the compound's target exon. Since the compound of the present invention sterically inhibits the formation of the "early splice complex", TYR "
Сильное сродство РНК позволяет соединению формулы I вызвать пропуск "экзона 2" TYR, даже если производное ПНК имеет одно или два ошибочных спаривания с целевым 3' сайтом сплайсинга в пре-мРНК TYR. Подобным образом производное ПНК формулы I все еще может индуцировать пропуск "экзона 2" TYR в мутантной пре-мРНК TYR, обладающей одним или двумя однонуклеотидными полиморфизмами (single nucleotide polymorphism, SNPs) в целевом сайте сплайсинга.The strong affinity of the RNA allows the compound of formula I to cause TYR "
Соединение формулы I обладает хорошей клеточной проницаемостью и может быть легко доставлено в клетку как «оголенный» олигонуклеотид, примером чего является предшествующий уровень техники [PCT/KR2009/001256]. Таким образом, соединение, описанное в настоящем изобретении, индуцирует пропуск "экзона 2" в пре-мРНК TYR и дает сплайс-вариант(ы) мРНК TYR, не содержащий(ие) "экзона 2" TYR в клетках, обработанных соединением формулы I как «оголенным» олигонуклеотидом. Соединение формулы I не требует каких-либо средств или составов для доставки в клетку, чтобы мощно индуцировать пропуск целевого экзона в клетках. Соединение формулы I легко индуцирует пропуск "экзона 2" TYR в клетках, обработанных соединением, описанным в настоящем изобретении, как «оголенным» олигонуклеотидом при субфемтомолярной концентрации.The compound of formula I has good cell permeability and can be easily delivered into the cell as a "naked" oligonucleotide, an example of which is the prior art [PCT/KR2009/001256]. Thus, the compound of the present invention induces "
Вследствие хорошей клеточной или мембранной проницаемости, производное ПНК формулы I может местно вводиться как «оголенный» олигонуклеотид для индуцирования пропуска "экзона 2" TYR в коже. Соединению формулы I не требуется лекарственная форма для увеличения трансдермальной доставки в ткань-мишень с точки зрения надлежащей терапевтической или биологической активности. Обычно соединение формулы I растворяют в воде и сорастворителе и наружно или трансдермально вводят при субпикомолярной концентрации, чтобы вызвать желаемую терапевтическую или биологическую активность в коже-мишени. Соединение, описанное в настоящем изобретении, не обязательно должно быть интенсивно или агрессивно вводиться, чтобы вызвать топическую терапевтическую активность. Тем не менее, производное ПНК формулы I может входить в состав с косметическими ингредиентами или адъювантами в качестве наружного крема или лосьона. Такой наружный косметический крем или лосьон может быть пригоден для лечения гиперпигментации лица.Due to good cellular or membrane permeability, the PNA derivative of formula I can be topically administered as a "naked" oligonucleotide to induce TYR "
Соединение формулы I может использоваться в сочетании с фармацевтически приемлемой кислотой или основанием, включая, но не ограничиваясь, гидроксид натрия, гидроксид калия, соляную кислоту, метансульфоновую кислоту, лимонную кислоту, трифторуксусную кислоту и другие.The compound of Formula I may be used in combination with a pharmaceutically acceptable acid or base, including but not limited to sodium hydroxide, potassium hydroxide, hydrochloric acid, methanesulfonic acid, citric acid, trifluoroacetic acid, and others.
Производное ПНК формулы I или ее фармацевтически приемлемая соль может вводиться субъекту вместе с фармацевтически приемлемым адъювантом, включая, но не ограничиваясь, лимонную кислоту, соляную кислоту, винную кислоту, стеариновую кислоту, полиэтиленгликоль, полипропиленгликоль, этанол, изопропанол, бикарбонат натрия, дистиллированную воду, консервант(ы) и другие.The PNA derivative of formula I, or a pharmaceutically acceptable salt thereof, may be administered to the subject along with a pharmaceutically acceptable adjuvant, including, but not limited to, citric acid, hydrochloric acid, tartaric acid, stearic acid, polyethylene glycol, polypropylene glycol, ethanol, isopropanol, sodium bicarbonate, distilled water, preservative(s) and others.
Соединение, описанное в настоящем изобретении, может вводиться местно субъекту при терапевтически или биологически эффективной концентрации в диапазоне от 1 аМ до более чем 1 нМ, которая будет варьироваться в зависимости от схемы приема препарата, состояний или ситуаций субъекта, и так далее.The compound described in the present invention may be administered topically to a subject at a therapeutically or biologically effective concentration ranging from 1 aM to more than 1 nM, which will vary depending on the dosing regimen, conditions or situations of the subject, and so on.
Предпочтительным является производное ПНК формулы I или ее фармацевтически премлемая соль:Preferred is a PNA derivative of formula I or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
гдеwhere
n - целое число от 10 до 21;n is an integer from 10 to 21;
соединение формулы I обладает по меньшей мере 10-мерным комплементарным перекрыванием с 14-мерной последовательностью пре-мРНК [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] в пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I has at least a 10-mer complementary overlap with the 14-mer pre-mRNA sequence [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] in human TYR pre-mRNA;
соединение формулы I полностью комплементарно пре-мРНК TYR человека или частично комплементарно пре-мРНК TYR человека с одним или двумя ошибочными спариваниями от всего соединения формулы I;a compound of formula I is fully complementary to human pre-TYR mRNA or partially complementary to human pre-TYR mRNA with one or two mismatches from the total compound of formula I;
S1, S2, , Sn-1, Sn, T1, T2, , Tn-1 и Tn независимо обозначают атом дейтерия или атом водорода; S1 , S2 , , S n-1 , S n , T 1 , T 2 , , T n-1 and T n independently represent a deuterium atom or a hydrogen atom;
X и Y независимо обозначают атом дейтерия, атом водорода, формилгруппу, аминокарбонилгруппу, аминотиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилгруппу, замещенную или незамещенную арилгруппу, замещенную или незамещенную алкилацилгруппу, замещенную или незамещенную арилацилгруппу, замещенную или незамещенную алкилоксикарбонилгруппу, замещенную или незамещенную арилоксикарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкиламинокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную ариламинокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкиламинотиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную ариламинотиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилокситиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную арилокситиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилсульфонилгруппу, замещенную или незамещенную арилсульфонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилфосфонилгруппу или замещенную или незамещенную арилфосфонилгруппу;X and Y are independently deuterium atom, hydrogen atom, formyl group, aminocarbonyl group, aminothiocarbonyl group, substituted or unsubstituted alkyl group, substituted or unsubstituted aryl group, substituted or unsubstituted alkylacyl group, substituted or unsubstituted arylacyl group, substituted or unsubstituted alkyloxycarbonyl group, substituted or unsubstituted aryloxycarbonyl group, substituted алкиламинокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную ариламинокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкиламинотиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную ариламинотиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилокситиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную арилокситиокарбонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилсульфонилгруппу, замещенную или незамещенную арилсульфонилгруппу, замещенную или незамещенную алкилфосфонилгруппу или замещенную или незамещенную арилфосфонилгруппу;
Z обозначает атом водорода, гидроксигруппу, замещенную или незамещенную алкилоксигруппу, замещенную или незамещенную арилоксигруппу или замещенную или незамещенную аминогруппу;Z is a hydrogen atom, a hydroxy group, a substituted or unsubstituted alkyloxy group, a substituted or unsubstituted aryloxy group, or a substituted or unsubstituted amino group;
B1, B2, , Bn-1, Bn независимо выбраны из природных нуклеиновых оснований, включая аденин, тимин, гуанин, цитозин и урацил, и нуклеиновых оснований не природного происхождения; B1 , B2 , , B n-1 , B n are independently selected from naturally occurring nucleobases including adenine, thymine, guanine, cytosine, and uracil, and non-naturally occurring nucleobases;
по меньшей мере четыре из B1, B2, , Bn-1, Bn, независимо выбраны из нуклеиновых оснований не природного происхождения, представленных формулой II, формулой III или формулой IV:at least four of B 1 , B 2 , , B n-1 , B n , are independently selected from non-naturally occurring nucleic bases represented by formula II, formula III or formula IV:
гдеwhere
R1, R2, R3, R4, R5 и R6 независимо выбраны из атома водорода и замещенной или незамещенной алкилгруппы;R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are independently selected from a hydrogen atom and a substituted or unsubstituted alkyl group;
L1, L2 и L3 являются ковалентным линкером, представленным формулой V, ковалентно соединяющий основную аминогруппу с остатком нуклеинового основания:L 1 , L 2 and L 3 are a covalent linker represented by formula V, covalently connecting the basic amino group with the remainder of the nucleic base:
гдеwhere
Q1 и Qm представляют собой замещенную или незамещенную метиленгруппу (-СН2-) и Qm непосредственно связывается с основной аминогруппой;Q 1 and Q m represent a substituted or unsubstituted methylene group (-CH 2 -) and Q m directly associated with the basic amino group;
Q2, Q3, , Qm-1, независимо выбраны из замещенной или незамещенной метиленгруппы, атома кислорода (-O-), атома серы (-S-) и замещенной или незамещенной аминогруппы [-N(H)- или -N(заместитель)-]; и Q2 , Q3 , , Q m-1 independently selected from a substituted or unsubstituted methylene group, an oxygen atom (-O-), a sulfur atom (-S-) and a substituted or unsubstituted amino group [-N(H)- or -N(substituent)-]; and
m - целое число от 1 до 15.m is an integer from 1 to 15.
Представляет интерес олигомер ПНК формулы I или его фармацевтически приемлемая соль:Of interest is the PNA oligomer of formula I or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
гдеwhere
n - целое число от 11 до 18;n is an integer from 11 to 18;
соединение формулы I обладает по меньшей мере 10-мерным комплементарным перекрыванием с 14-мерной последовательностью пре-мРНК [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] в пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I has at least a 10-mer complementary overlap with the 14-mer pre-mRNA sequence [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] in human TYR pre-mRNA;
соединение формулы I полностью комплементарно пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I is fully complementary to human pre-mRNA TYR;
S1, S2, , Sn-1, Sn, T1, T2, , Tn-1 и Tn представляют собой атом водорода; S1 , S2 , , S n-1 , S n , T 1 , T 2 , , T n-1 and T n represent a hydrogen atom;
X и Y независимо обозначают атом водорода, замещенную или незамещенную алкилгруппу, замещенную или незамещенную арилруппу, замещенную или незамещенную алкилацилгруппу, замещенную или незамещенную арилацилгруппу,замещенную или незамещенную алкилоксикарбонилгруппу или замещенную или незамещенную арилоксикарбонилгруппу;X and Y independently represent a hydrogen atom, a substituted or unsubstituted alkyl group, a substituted or unsubstituted aryl group, a substituted or unsubstituted alkyl acyl group, a substituted or unsubstituted arylacyl group, a substituted or unsubstituted alkyloxycarbonyl group, or a substituted or unsubstituted aryloxycarbonyl group;
Z обозначает замещенную или незамещенную аминогруппу;Z is a substituted or unsubstituted amino group;
B1, B2, , Bn-1, Bn независимо выбраны из природных нуклеиновых оснований, включая аденин, тимин, гуанин, цитозин и урацил, и нуклеиновых оснований не природного происхождения; B1 , B2 , , B n-1 , B n are independently selected from naturally occurring nucleobases including adenine, thymine, guanine, cytosine, and uracil, and non-naturally occurring nucleobases;
по меньшей мере четыре из B1, B2, , Bn-1, Bn независимо выбраны из нуклеиновых оснований не природного происхождения, представленных формулой II, формулой III или формулой IV;at least four of B 1 , B 2 , , B n-1 , B n are independently selected from non-naturally occurring nucleic bases represented by formula II, formula III, or formula IV;
R1, R2, R3, R4, R5 и R6 независимо выбраны из атома водорода и замещенной или незамещенной алкилгруппы;R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are independently selected from a hydrogen atom and a substituted or unsubstituted alkyl group;
Q1 и Qm представляют собой замещенную или незамещенную метиленгруппу и Qm непосредственно связывается с основной аминогруппой;Q 1 and Q m represent a substituted or unsubstituted methylene group and Q m directly associated with the basic amino group;
Q2, Q3, и Qm-1 независимо выбраны из замещенной или незамещенной метиленгруппы, атома кислорода и аминогруппы; и Q2 , Q3 , and Q m-1 are independently selected from a substituted or unsubstituted methylene group, an oxygen atom, and an amino group; and
m - целое число от 1 до 11.m is an integer from 1 to 11.
Представляет интерес производное ПНК формулы I или ее фармацевтически приемлемая соль:Of interest is a PNA derivative of formula I or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
гдеwhere
n - целое число от 11 до 16;n is an integer from 11 to 16;
соединение формулы I обладает по меньшей мере 10-мерным комплементарным перекрыванием с 14-мерной последовательностью пре-мРНК [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] в пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I has at least a 10-mer complementary overlap with the 14-mer pre-mRNA sequence [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] in human TYR pre-mRNA;
соединение формулы I полностью комплементарно пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I is fully complementary to human pre-mRNA TYR;
S1, S2, , Sn-1, Sn, T1, T2, , , Tn-1 и Tn представляют собой атом водорода; S1 , S2 , , S n-1 , S n , T 1 , T 2 , , , T n-1 and T n represent a hydrogen atom;
X и Y независимо выбраны из атома водорода, замещенной или незамещенной алкилацилгруппы или замещенной или незамещенной алкилоксикарбонилгруппы;X and Y are independently selected from a hydrogen atom, a substituted or unsubstituted alkylacyl group, or a substituted or unsubstituted alkyloxycarbonyl group;
Z обозначает замещенную или незамещенную аминогруппу;Z is a substituted or unsubstituted amino group;
B1, B2, , Bn-1, Bn, независимо выбраны из природных нуклеиновых оснований, включая аденин, тимин, гуанин, цитозин и урацил, и нуклеиновых оснований не природного происхождения; B1 , B2 , , B n-1 , B n , are independently selected from naturally occurring nucleobases including adenine, thymine, guanine, cytosine, and uracil, and non-naturally occurring nucleobases;
по меньшей мере четыре из B1, B2, , Bn-1, Bn, независимо выбраны из нуклеиновых оснований не природного происхождения, представленных формулой II, формулой III или формулой IV;at least four of B 1 , B 2 , , B n-1 , B n , independently selected from non-naturally occurring nucleic bases represented by formula II, formula III or formula IV;
R1, R2, R3, R4, R5 и R6 независимо выбраны из атома водорода и замещенной или незамещенной алкилгруппы;R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are independently selected from a hydrogen atom and a substituted or unsubstituted alkyl group;
Q1 и Qm представляет собой метиленгруппу и Qm непосредственно связана с основной аминогруппой;Q 1 and Q m is a methylene group and Q m is directly linked to a basic amino group;
Q2, Q3, и Qm-1 независимо выбраны из метиленгруппы, атома кислорода и аминогруппы; и Q2 , Q3 , and Q m-1 are independently selected from a methylene group, an oxygen atom and an amino group; and
m - целое число от 1 до 9.m is an integer from 1 to 9.
Представляет интерес олигомер ПНК формулы I или его фармацевтически приемлемая соль:Of interest is the PNA oligomer of formula I or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
гдеwhere
n - целое число от 11 до 16;n is an integer from 11 to 16;
соединение формулы I обладает по меньшей мере 10-мерным комплементарным перекрыванием с 14-мерной последовательностью пре-мРНК [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] в пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I has at least a 10-mer complementary overlap with the 14-mer pre-mRNA sequence [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] in human TYR pre-mRNA;
соединение формулы I полностью комплементарно TYR пре-мРНК человека;the compound of formula I is fully complementary to human pre-mRNA TYR;
S1, S2, , Sn-1, Sn, T1, T2, , Tn-1 и Tn представляют собой атом водорода; S1 , S2 , , S n-1 , S n , T 1 , T 2 , , T n-1 and T n represent a hydrogen atom;
X и Y независимо выбраны из атома водорода, замещенной или незамещенной алкилацилгруппы или замещенной или незамещенной алкилоксикарбонилгруппы;X and Y are independently selected from a hydrogen atom, a substituted or unsubstituted alkylacyl group, or a substituted or unsubstituted alkyloxycarbonyl group;
Z обозначает замещенную или незамещенную аминогруппу;Z is a substituted or unsubstituted amino group;
B1, В2, , Bn-1 и Bn независимо выбраны из природных нуклеиновых оснований, включая аденин, тимин, гуанин, цитозин и урацил, и нуклеиновых оснований не природного происхождения;B 1 , B 2 , , B n-1 and B n are independently selected from naturally occurring nucleobases including adenine, thymine, guanine, cytosine, and uracil, and non-naturally occurring nucleobases;
по меньшей мере четыре из B1, В2, , Bn-1 и Bn независимо выбраны из нуклеиновых оснований не природного происхождения, представленных формулой II, формулой III или формулой IV;at least four of B 1 , B 2 , , B n-1 and B n are independently selected from non-naturally occurring nucleic bases represented by formula II, formula III or formula IV;
R1, R3 и R5 представляют собой атом водорода и R2, R4 и R6 независимо обозначают атом водорода или замещенную или незамещенную алкилгруппу;R 1 , R 3 and R 5 represent a hydrogen atom and R 2 , R 4 and R 6 independently represent a hydrogen atom or a substituted or unsubstituted alkyl group;
Q1 and Qm представляют собой метиленгруппу и Qm непосредственно связана с основной аминогруппой;Q 1 and Q m are a methylene group and Q m is directly linked to a basic amino group;
Q2, Q3, и Qm-1 независимо выбраны из метиленгруппы, атома кислорода; и Q2 , Q3 , and Q m-1 are independently selected from a methylene group, an oxygen atom; and
m - целое число от 1 до 9.m is an integer from 1 to 9.
Представляет интерес производное ПНК формулы I или ее фармацевтически приемлемая соль:Of interest is a PNA derivative of formula I or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
гдеwhere
n - целое число от 11 до 16;n is an integer from 11 to 16;
соединение формулы I обладает по меньшей мере 10-мерным комплементарным перекрыванием с 14-мерной последовательностью пре-мРНК [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] в пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I has at least a 10-mer complementary overlap with the 14-mer pre-mRNA sequence [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] in human TYR pre-mRNA;
соединение формулы I полностью комплементарно пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I is fully complementary to human pre-mRNA TYR;
S1, S2, , Sn-1, Sn, T1, T2, , Tn-1 и Tn представляют собой атом водорода; S1 , S2 , , S n-1 , S n , T 1 , T 2 , , T n-1 and T n represent a hydrogen atom;
X и Y независимо выбраны из атома водорода, замещенной или незамещенной алкилацилгруппы или замещенной или незамещенной алкилоксикарбонилгруппы;X and Y are independently selected from a hydrogen atom, a substituted or unsubstituted alkylacyl group, or a substituted or unsubstituted alkyloxycarbonyl group;
Z обозначает замещенную или незамещенную аминогруппу;Z is a substituted or unsubstituted amino group;
B1, В2, , Bn-1 и Bn независимо выбраны из аденина, тимина, гуанина, цитозина и нуклеиновых оснований не природного происхождения;B 1 , B 2 , , B n-1 and B n are independently selected from adenine, thymine, guanine, cytosine and non-naturally occurring nucleic bases;
по меньшей мере пять из B1, В2, , Bn-1 и Bn независимо выбраны из нуклеиновых оснований не природного происхождения, представленных формулой II, формулой III или формулой IV;at least five of B 1 , B 2 , , B n-1 and B n are independently selected from non-naturally occurring nucleic bases represented by formula II, formula III or formula IV;
R1, R2, R3, R4, R5 и R6 являются атомами водорода;R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are hydrogen atoms;
Q1 and Qm представляют собой метиленгруппу и Qm непосредственно связана с основной аминогруппой;Q 1 and Q m are a methylene group and Q m is directly linked to a basic amino group;
Q2, Q3, и Qm-1 независимо выбраны из метиленгруппы, атома кислорода; и Q2 , Q3 , and Q m-1 are independently selected from a methylene group, an oxygen atom; and
m - целое число от 1 до 9.m is an integer from 1 to 9.
Представляет интерес производное ПНК формулы I или ее фармацевтически приемлемая соль:Of interest is a PNA derivative of formula I or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
гдеwhere
n - целое число от 11 до 16;n is an integer from 11 to 16;
соединение формулы I обладает по меньшей мере 10-мерным комплементарным перекрыванием с 14-мерной последовательностью пре-мРНК [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] в пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I has at least a 10-mer complementary overlap with the 14-mer pre-mRNA sequence [(5'→3') UGUACAGAUUGUCU] in human TYR pre-mRNA;
соединение формулы I полностью комплементарно пре-мРНК TYR человека;the compound of formula I is fully complementary to human pre-mRNA TYR;
S1, S2, , Sn-1, Sn, T1, T2, , Tn-1 и Tn представляют собой атом водорода; S1 , S2 , , S n-1 , S n , T 1 , T 2 , , T n-1 and T n represent a hydrogen atom;
X является атомом водорода;X is a hydrogen atom;
Y обозначает замещенную или незамещенную алкилацилгруппу или замещенную или незамещенную алкилоксикарбонилгруппу;Y is a substituted or unsubstituted alkylacyl group or a substituted or unsubstituted alkyloxycarbonyl group;
Z обозначает замещенную или незамещенную аминогруппу;Z is a substituted or unsubstituted amino group;
B1, B2, , Bn-1 и Bn независимо выбраны из аденина, тимина, гуанина, цитозина и нуклеиновых оснований не природного происхождения; B1 , B2 , , B n-1 and B n are independently selected from adenine, thymine, guanine, cytosine and non-naturally occurring nucleic bases;
по меньшей мере пять из B1, B2, , Bn-1 и Bn независимо выбраны из нуклеиновых оснований не природного происхождения, представленных формулой II, формулой III или формулой IV;at least five of B 1 , B 2 , , B n-1 and B n are independently selected from non-naturally occurring nucleic bases represented by formula II, formula III or formula IV;
R1, R2, R3, R4, R5 и R6 являются атомами водорода;R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are hydrogen atoms;
L1 обозначает -(СН2)2-O-(СН2)2-группу, -СН2-O-(СН2)2-группу, -СН2-O-(СН2)3-группу, -СН2-O-(СН2)4-группу или -СН2-O-(СН2)5-группу с правым концом, непосредственно связанным с основной аминогруппой; иL 1 denotes -(CH 2 ) 2 -O-(CH 2 ) 2 group, -CH 2 -O-(CH 2 ) 2 group, -CH 2 -O-(CH 2 ) 3 group, -CH 2 -O-(CH 2 ) 4 -group or -CH 2 -O-(CH 2 ) 5 -group with the right end directly connected to the main amino group; and
L2 и L3 независимо выбраны из -(СН2)2-O-(СН2)2-группы, -(СН2)3-O-(СН2)2-группы, -(СН2)2-O-(СН2)3-группы, -(СН2)2-группы, -(СН2)3-группы, -(СН2)4-группы, -(СН2)5-группы, -(СН2)6-группы, -(СН2)7-группы и -(СН2)8-группы с правым концом, непосредственно связанным с основной аминогруппой.L 2 and L 3 are independently selected from -(CH 2 ) 2 -O-(CH 2 ) 2 group, -(CH 2 ) 3 -O-(CH 2 ) 2 group, -(CH 2 ) 2 -O -(CH 2 ) 3 groups, -(CH 2 ) 2 groups, -(CH 2 ) 3 groups, -(CH 2 ) 4 groups, -(CH 2 ) 5 groups, -(CH 2 ) 6 groups, -(CH 2 ) 7 groups and -(CH 2 ) 8 groups with the right end directly attached to the basic amino group.
Представляет интерес производное ПНК формулы I, которое выбрано из группы соединений, представленных ниже, или ее фармацевтически приемлемая соль:Of interest is a PNA derivative of formula I, which is selected from the group of compounds below, or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
(N→C) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-AC(1/2)A(5)-GA(5)C-AA(5)T-CTG(6)-C(1/2)C-NH2;(N→C) Fethoc-AC(1/2)A(5)-GA(5)C-AA(5)T-CTG(6)-C(1/2)C-NH 2 ;
(N→C) Ac-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Ac-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Benzoyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Benzoyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Piv-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Piv-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Methyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Methyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) n-Propyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) n-Propyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Fmoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Fmoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) p-Toluenesulfonyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) p-Toluenesulfonyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) H-Lys-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) H-Lys-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-Lys-Gly-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Fethoc-Lys-Gly-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-Lys-NH2;(N→C) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-Lys-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-Val-Gly-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Fethoc-Val-Gly-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Ac-Arg-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Ac-Arg-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Benzyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Benzyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Phenyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Phenyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) [N-(2-Phenylethyl)amino]carbonyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) [N-(2-Phenylethyl)amino]carbonyl-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Benzoyl-Leu-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Benzoyl-Leu-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Piv-Lys-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-Val-NH2;(N→C) Piv-Lys-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-Val-NH 2 ;
(N→C) Fethoc -CA(7)G-AC(2O2)A-A(4)TC(1O2)-TG(6)T-A-NH2;(N→C) Fethoc -CA(7)G-AC(2O2)AA(4)TC(1O2)-TG(6)TA-NH 2 ;
(N→C) Fethoc -CTG(6)-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Fethoc -CTG(6)-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Fethoc -CA(5)G-ATA(5)-ATC(1O2)-TG(5)T-A(5)-NH2;(N→C) Fethoc -CA(5)G-ATA(5)-ATC(1O2)-TG(5)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Fethoc -TA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2;(N→C) Fethoc -TA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Fethoc -TCA(3)-GAC(1O5)-A(5)AT-C(1O2)TG(5)-TA(5)-NH2;(N→C) Fethoc -TCA(3)-GAC(1O5)-A(5)AT-C(1O2)TG(5)-TA(5)-NH 2 ;
(N→C) Fethoc -CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)C-NH2;(N→C) Fethoc -CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)C-NH 2 ;
(N→C) Fethoc -AG(6)A-CA(5)A-TC(1O2)T-G(6)TA(5)-C-NH2;(N→C) Fethoc -AG(6)A-CA(5)A-TC(1O2)TG(6)TA(5)-C-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-AG(6)A-CA(5)A-TC(lO2)T-G(6)TA(5)-CA(2O2)A-NH2;(N→C) Fethoc-AG(6)A-CA(5)A-TC(lO2)TG(6)TA(5)-CA(2O2)A-NH 2 ;
(N→C) Fethoc -AC(1O2)A-GA(6)C-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)C(1O2)-AA(6)-NH2;(N→C) Fethoc -AC(1O2)A-GA(6)C-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)C(1O2)-AA(6)-NH 2 ;
(N→C) Fethoc -AC(1O3)T-GA(6)C-TA(6)T-CTG(6)-TAC(1O5)-A(4)A-NH2;(N→C) Fethoc -AC(1O3)T-GA(6)C-TA(6)T-CTG(6)-TAC(1O5)-A(4)A-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-GA(6)C-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)C(1O2)-AA(6)-NH2;(N→C) Fethoc-GA(6)C-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)C(1O2)-AA(6)-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-AC(1O2)A-GA(6)C-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)C-A(5)AA(2O2)-A-NH2;(N→C) Fethoc-AC(1O2)A-GA(6)C-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)CA(5)AA(2O2)-A-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)C-A(5)AA(2O2)-A-NH2;(N→C) Fethoc-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)CA(5)AA(2O2)-A-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-AC(1O2)A-GA(6)C-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)C-A(5)AA(2O3)-A-NH2;(N→C) Fethoc-AC(1O2)A-GA(6)C-AA(6)T-CTG(6)-TA(6)CA(5)AA(2O3)-A-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-GC(1O4)T-AC(1O2)A-GA(4)C-AAT-CTG(6)-TA(6)C-NH2;(N→C) Fethoc-GC(1O4)T-AC(1O2)A-GA(4)C-AAT-CTG(6)-TA(6)C-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-GC(1O2)T-A(3)CA-GA(4)C-AAT-C(1O2)TG-NH2;(N→C) Fethoc-GC(1O2)TA(3)CA-GA(4)C-AAT-C(1O2)TG-NH 2 ;
(N→C) Fethoc-GC(1O2)T-A(3)CA-G(2O2)AC-A(5)AT-C(1O2)TG-NH2; и(N→C) Fethoc-GC(1O2)TA(3)CA-G(2O2)AC-A(5)AT-C(1O2)TG-NH 2 ; and
(N→C)Fethoc-GC(1O2)T-A(3)CA-GA(4)C-A(2O2)AT-C(1O2)TG-NH2:(N→C)Fethoc-GC(1O2)TA(3)CA-GA(4)CA(2O2)AT-C(1O2)TG-NH 2 :
гдеwhere
A, G, T и С представляют собой мономеры ПНК с природным нуклеиновым основанием аденином, гуанином, тимином и цитозином, соответственно;A, G, T and C are PNA monomers with natural nucleobase adenine, guanine, thymine and cytosine, respectively;
C(pOq), А(р), A(pOq), G(p) и G(pOq) представляют собой мономеры ПНК с нуклеиновым основанием не природного происхождения, представленным формулой VI, формулой VII, формулой VIII, формулой IX и формулой X, соответственно;C(pOq), A(p), A(pOq), G(p) and G(pOq) are non-naturally occurring nucleobase PNA monomers represented by formula VI, formula VII, formula VIII, formula IX and formula X , respectively;
гдеwhere
р и q - целые числа; иp and q are integers; and
сокращения N- и С-концевых заместителей конкретно описаны как указано далее: "Fmoc-" представляет собой сокращение для "[(9-фторенил)метилокси]карбонилгруппы"; "Fethoc-" для "[2-(9-фторенил)этил-1-окси]карбонилгруппы"; "Ас-" для "ацетилгруппы"; "Benzoyl-" для "бензолкарбонилгруппы"; "Piv-" для "пивалилгруппы"; "Methyl-" для "метилгруппы"; "n-Propyl-" для "1-(н-пропил)группы"; "Н-" для " атома водорода"; "p-Toluenesulfonyl" для "(4-метилбензол)-1-сульфонилгруппы"; "-Lys-" для аминокислотного остатка "лизин"; "-Val-" для аминокислотного остатка "валин"; "-Leu-" для аминокислотного остатка "лейцин"; "-Arg-" для аминокислотного остатка "аргинин"; "-Gly-" для аминокислотного остатка "глицин"; "[N-(2-Phenylethyl)amino]carbonyl-" для "[N-1-(2-фенилэтил)амино]карбонилгруппы"; "Benzyl-" для "1-(фенил)метилгруппы"; "Phenyl-" для "фенилгруппы"; "Ме-"для "метилгруппы"; и "-NH2" для незамещенной "аминогруппы".abbreviations of N- and C-terminal substituents are specifically described as follows: "Fmoc-" is an abbreviation for "[(9-fluorenyl)methyloxy]carbonyl group";"Fethoc-" for the "[2-(9-fluorenyl)ethyl-1-hydroxy]carbonyl group";"Ac-" for "acetyl group";"Benzoyl-" for "benzenecarbonyl group";"Piv-" for "pivalyl group";"Methyl-" for "methyl group";"n-Propyl-" for "1-(n-propyl) group";"H-" for "hydrogen atom";"p-Toluenesulfonyl" for "(4-methylbenzene)-1-sulfonyl group";"-Lys-" for the amino acid residue "lysine";"-Val-" for the amino acid residue "valine";"-Leu-" for the amino acid residue "leucine";"-Arg-" for the amino acid residue "arginine";"-Gly-" for the amino acid residue "glycine";"[N-(2-Phenylethyl)amino]carbonyl-" for the "[N-1-(2-phenylethyl)amino]carbonyl group";"Benzyl-" for "1-(phenyl)methyl group";"Phenyl-" for "phenyl group";"Me-" for "methyl group"; and "-NH 2 " for an unsubstituted "amino group".
Фиг. 3 в совокупности и недвусмысленно представляет химические структуры для мономеров ПНК, сокращенных как A, G, Т, С, C(pOq), А(р), A(pOq), G(p) и G(pOq). Как обсуждалось в предшествующем уровне техники [PCT/KR2009/001256], C(pOq) рассматривается как мономер ПНК с "модифицированным цитозином" вследствие его гибридизации в "гуанин". А(р) и A(pOq) принимаются за мономеры ПНК с "модифицированным аденином" при их гибридизации в "тимин". Таким же образом G(p) и G(pOq) рассматриваются как мономеры ПНК с "модифицированным гуанином" при спаривания оснований их с "цитозином".Fig. 3 collectively and unambiguously represents the chemical structures for PNA monomers, abbreviated as A, G, T, C, C(pOq), A(p), A(pOq), G(p), and G(pOq). As discussed in the prior art [PCT/KR2009/001256], C(pOq) is regarded as a PNA monomer with "modified cytosine" due to its hybridization to "guanine". A(p) and A(pOq) are taken as PNA monomers with "modified adenine" when hybridized to "thymine". In the same way, G(p) and G(pOq) are considered as PNA monomers with "modified guanine" by base-pairing them with "cytosine".
Фиг. 4 однозначно иллюстрирует химические структуры для различных сокращений для заместителей, используемых для разнообразия N-конца или С-конца производного ПНК формулы I в данном изобретении.Fig. 4 unambiguously illustrates the chemical structures for the various substituent abbreviations used to diversify the N-terminus or C-terminus of the PNA derivative of formula I in this invention.
Для того, чтобы проиллюстрировать сокращения, применяемые для таких производных ПНК, химическая структура для 13-мерного производного ПНК, сокращенного как "(N→C) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2", приведена на фиг.5 а. В качестве еще одной иллюстрации, химическая структура для 15-мерного производного ПНК, сокращенного как "(N→С)To illustrate the abbreviations used for such PNA derivatives, the chemical structure for the 13-mer PNA derivative, abbreviated as "(N→C) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG( 6)TA(5)-NH 2 ", is shown in Fig.5 a. As another illustration, the chemical structure for the 15-mer PNA derivative, abbreviated "(N→C)
Fethoc-AG(6)A-CA(5)A-TC(1O2)T-G(3O2)TA(5)-CA(2O2)A-NH2", приведена на фиг. 5b.Fethoc-AG(6)A-CA(5)A-TC(1O2)TG(3O2)TA(5)-CA(2O2)A-NH 2 " is shown in Fig. 5b.
13-мерная последовательность ПНК "(N→С) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2", указанная на фиг. 5а, эквивалентна последовательности ДНК "(5'→3') CAG-ACA-ATC-TGT-A" для комплементарного связывания с пре-мРНК. 13-мерная ПНК имеет 13-мерное комплементарное перекрывание с 13-мерной последовательностью, обозначенной "жирным шрифтом" и "подчеркнутой" в 30-мерной последовательности РНК [(5'→3') ggguguuuuguacag AUUGUCUGUAGCCGA1. охватывающей область соединения "интрона 1" и "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека.The 13mer PNA sequence "(N→C) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 " shown in FIG. 5a is equivalent to the DNA sequence "(5'→3') CAG-ACA-ATC-TGT-A" for complementary binding to pre-mRNA. The 13mer PNA has a 13mer complementary overlap with the 13mer sequence indicated "bold" and "underlined" in the 30mer RNA sequence [(5'→3') ggguguuuuguacag AUUGUCUGUAGCCGA1. spanning the junction region of "
15-мерная последовательность ПНК "(N→С) Fethoc-AG(6)A-CA(5)A-TC(1O2)T-G(3O2)TA(5)-CA(2O2)A-NH2", указанная на фиг. 5b, эквивалентна последовательности ДНК "(5'→3') AGA-CAA-TCT-GTA-CAA" для комплементарного связывания с пре-мРНК. 15-мерная ПНК имеет 15-мерное комплементарное перекрывание с 15-мерной последовательностью, обозначенной "жирным шрифтом" и "подчеркнутой" в 30-мерной последовательности РНК [(5'→3') ggguguuuuguacag AUUGUCUGUAGCCGA], охватывающей область соединения "интрона 1" и "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека.The 15-mer PNA sequence "(N→C) Fethoc-AG(6)A-CA(5)A-TC(1O2)TG(3O2)TA(5)-CA(2O2)A-NH 2 ", indicated on fig. 5b is equivalent to the DNA sequence "(5'→3') AGA-CAA-TCT-GTA-CAA" for complementary pre-mRNA binding. The 15mer PNA has a 15mer complementary overlap with the 15mer sequence indicated "bold" and "underlined" in the 30mer RNA sequence [(5'→3') ggguguuuuguacag AUUGUCUGUAGCCGA], encompassing the "
17-мерная последовательность ПНК "(N→С) Fethoc-AC(1O3)T-GA(6)C-TA(6)T-CTG(6)-TAC(1O5)-A(4)A-NH2" эквивалентна последовательности ДНК "(5'→3') ACT-GAC-TAT-CTG-TAC-AA" для комплементарного связывания с пре-мРНК. 17-мерная ПНК имеет 15-мерное комплементарное перекрывание с 15-мерной последовательностью, обозначенной "жирным шрифтом" и "подчеркнутой" в 30-мерной последовательности РНК [(5'→3') ggguguuuuguacag AU"U"GUC"U"GUAGCCGA], охватывающей область соединения "интрона 1" и "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека. Два ошибочных спаривания отмечены символом, заключенным в кавычки, т.е."".17-mer PNA sequence "(N→С) Fethoc-AC(1O3)T-GA(6)C-TA(6)T-CTG(6)-TAC(1O5)-A(4)A-NH 2 " equivalent to the DNA sequence "(5'→3') ACT-GAC-TAT-CTG-TAC-AA" for complementary binding to pre-mRNA. The 17-mer PNA has a 15-mer complementary overlap with the 15-mer sequence indicated "bold" and "underlined" in the 30-mer RNA sequence [(5'→3') ggguguuuuguacag AU"U"GUC"U"GUAGCCGA], encompassing the "
Одним из аспектов настоящего изобретения является фармацевтическая композиция для лечения заболеваний или состояний, связанных с экспрессией гена тирозиназы человека, включающая производное пептидной нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением.One aspect of the present invention is a pharmaceutical composition for the treatment of diseases or conditions associated with the expression of a human tyrosinase gene, comprising a peptide nucleic acid derivative in accordance with the present invention.
Одним из аспектов настоящего изобретения является фармацевтическая композиция для лечения гиперпигментации, включающая производное пептидной нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением. Примеры гиперпигментации, вызванной сверхсинтезом меланина, включают меланодермию, послеугревые рубцы, печеночные пятна, лентиго, возрастные пятна и актиническое повреждение.One aspect of the present invention is a pharmaceutical composition for the treatment of hyperpigmentation comprising a peptide nucleic acid derivative according to the present invention. Examples of hyperpigmentation caused by melanin oversynthesis include melasma, acne scars, liver spots, lentigo, age spots, and actinic damage.
Одним из аспектов настоящего изобретения является способ лечения заболеваний или состояний, связанных с экспрессией гена тирозиназы человека, включающий введение производного пептидной нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением. Путь введения может быть, например, местным применением.One aspect of the present invention is a method of treating diseases or conditions associated with human tyrosinase gene expression, comprising administering a peptide nucleic acid derivative according to the present invention. The route of administration may be, for example, topical application.
Одним из аспектов настоящего изобретения является способ лечения гиперпигментации, включающий введение производного пептидной нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением. Путь введения может быть, например, местным применением.One aspect of the present invention is a method for treating hyperpigmentation comprising administering a peptide nucleic acid derivative according to the present invention. The route of administration may be, for example, topical application.
Одним из аспектов настоящего изобретения является применение производного пептидной нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением при получении медикамента для лечения заболеваний или состояний, связанных с экспрессией гена тирозиназы человека.One aspect of the present invention is the use of a peptide nucleic acid derivative according to the present invention in the preparation of a medicament for the treatment of diseases or conditions associated with the expression of a human tyrosinase gene.
Одним из аспектов настоящего изобретения является применение производного пептидной нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением при получении медикамента для лечения гиперпигментации. Краткая расшифровка фигурOne aspect of the present invention is the use of a peptide nucleic acid derivative according to the present invention in the preparation of a medicament for the treatment of hyperpigmentation. Brief decoding of figures
Фиг. 1а-1с. Примеры природных нуклеиновых оснований или нуклеиновых оснований не природного происхождения (модифицированных), выбираемых для производного пептидной нуклеиновой кислоты формулы I.Fig. 1a-1c. Examples of naturally occurring or non-naturally occurring (modified) nucleic bases selected for the peptide nucleic acid derivative of Formula I.
Фиг. 2а-2е. Примеры заместителей, выбираемых для производного пептидной нуклеиновой кислоты формулы I.Fig. 2a-2e. Examples of substituents selected for the peptide nucleic acid derivative of Formula I.
Фиг. 3. Химические структуры мономеров ПНК с природным или модифицированным нуклеиновым основанием.Fig. 3. Chemical structures of PNA monomers with a natural or modified nucleic base.
Фиг. 4. Химические структуры для сокращений N- или С-концевых заместителей.Fig. 4. Chemical structures for abbreviations of N- or C-terminal substituents.
Фиг. 5а. Химическая структура 13-мерного производного ПНК "(N→С) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2".Fig. 5a. Chemical structure of the 13-mer PNA derivative "(N→С) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)TA(5)-NH 2 ".
Фиг. 5b. Химические структуры 15-мерного производного ПНК "(N→С) Fethoc-AG(6)A-CA(5)A-TC(1O2)T-G(3O2)TA(5)-CA(2O2)A-NH2".Fig. 5b. Chemical structures of the 15-mer PNA derivative "(N→С) Fethoc-AG(6)A-CA(5)A-TC(1O2)TG(3O2)TA(5)-CA(2O2)A-NH 2 ".
Фиг. 6. Химические структуры мономеров Fmoc-ПНК, применяемых для синтеза производных ПНК данного изобретения.Fig. 6. Chemical structures of the Fmoc-PNA monomers used to synthesize the PNA derivatives of the present invention.
Фиг. 7а-7b. С18-обращенно-фазовые ВЭЖХ хроматограммы"ASO 1" до и после ВЭЖХ очистки, соответственно.Fig. 7a-7b. C 18 reverse phase HPLC chromatograms of "
Фиг. 8. ESI-TOF масс-спектр "ASO 1", очищенного C18-RP препаративной ВЭЖХ.Fig. 8. ESI-TOF mass spectrum of "
Фиг. 9а. Электрофоретический анализ продуктов вложенной ПЦР в клетках B16F10 меланомы мыши, обработанных 0 (негативный контроль), 1,10 или 1000 аМ "ASO 1М".Fig. 9a. Electrophoretic analysis of nested PCR products in B16F10 mouse melanoma cells treated with 0 (negative control), 1.10 or 1000 aM "
Фиг. 9b. Данные секвенирования по Сенгеру для продукта ПЦР, приписанного пропуску экзонов (2-3).Fig. 9b. Sanger sequencing data for the PCR product attributed to exon skipping (2-3).
Фиг. 10а. Изменения в полноразмерном уровне мРНК TYR с помощью кПЦР в клетках B16F10 меланомы мыши, обработанных "ASO 1М" при 0 (негативный контроль), 1, 10, 100 или 1000 аМ (величина ошибки по стандартной погрешности).Fig. 10a. Changes in full-length TYR mRNA level by qPCR in B16F10 mouse melanoma cells treated with "
Фиг. 10b. Данные вестерн-блота TYR в клетках B16F10 меланомы мыши, обработанных в течение 24 часов "ASO 1М" при 0 zM (негативный контроль), 10 zM, 100 zM, 1 аМ или 10 аМ (т.е. 10000 zM).Fig. 10b. Western blot data on TYR in B16F10 mouse melanoma cells treated for 24 hours with "
Фиг. 11. Изменения содержания меланина в клетках B16F10 меланомы мыши, обработанных или "ASO 1М" при 1, 10, 100 или 1000 аМ, или 10 мкг/мл, или 100 мкг/мл арбутина (величина ошибки по стандартной погрешности).Fig. 11. Changes in melanin content in B16F10 mouse melanoma cells treated with either "
Фиг. 12. Изменения в полноразмерном уровне мРНК TYR с помощью кПЦР в первичных эпителиальных меланоцитах человека, обработанных "ASO 1" при 0 zM (негативный контроль), 1 zM, 100 zM или 10 аМ. (величина ошибки по стандартной погрешности).Fig. 12. Changes in full length TYR mRNA level by qPCR in human primary epithelial melanocytes treated with "
Лучший вариант осуществления изобретенияThe best embodiment of the invention
Общие методики приготовления олигомеров ПНКGeneral procedures for the preparation of PNA oligomers
Олигомеры ПНК синтезировали с помощью твердофазного пептидного синтеза (solid phase peptide synthesis, SPPS), основанного на Fmoc-химии в соответствии со способом, раскрытым в предшествующем уровне техники [US6,133,444; WO96/40685] с незначительными, но требуемыми изменениями. Твердая подложка, применяемая в данном исследовании, представляла собой амидную смолу H-Rink Amide-ChemMatrix, закупленную в PCAS BioMatrix Inc. (Квебек, Канада). Мономеры Fmoc-ПНК с модифицированным нуклеиновым основанием синтезировали, как описано в предшествующем уровне техники [PCT/KR 2009/001256] или с незначительными изменениями. Для синтеза производных ПНК настоящего изобретения использовались такие мономеры Fmoc-ПНК с модифицированным нуклеиновым основанием и мономеры Fmoc-ПНК с нуклеиновым основанием природного происхождения. Олигомеры ПНК очищали с помощью С^-обращенно-фазовой ВЭЖХ (вода/ацетонитрил или вода/метанол с 0,1% TFA) и характеризовали масс-спектрометрией, включая ESI/TOF/MS.PNA oligomers were synthesized using solid phase peptide synthesis (SPPS) based on Fmoc chemistry in accordance with the method disclosed in the prior art [US6,133,444; WO96/40685] with minor but required modifications. The solid support used in this study was H-Rink Amide-ChemMatrix amide resin purchased from PCAS BioMatrix Inc. (Quebec, Canada). Nucleic base-modified Fmoc-PNA monomers were synthesized as described in the prior art [PCT/KR 2009/001256] or with minor modifications. For the synthesis of PNA derivatives of the present invention, such Fmoc-PNA monomers with a modified nucleic base and Fmoc-PNA monomers with a nucleic base of natural origin were used. PNA oligomers were purified by C^-reverse phase HPLC (water/acetonitrile or water/methanol with 0.1% TFA) and characterized by mass spectrometry including ESI/TOF/MS.
Схема 2 иллюстрирует типичный цикл удлинения мономеров, принятый в SPPS данного исследования, и синтетические детали (тонкости) приведены ниже. Однако, для специалиста в данной области имеется много незначительных изменений, очевидно, возможных при эффективном проведении таких реакций SPPS на автоматическом пептидном синтезаторе или неавтоматическом пептидном синтезаторе. Каждая стадия реакции в схеме 2 кратко представлена, как изложено ниже.
Схема 2
[Активация смолы H-Rink-ChemMatrix] 0,01 ммоль (примерно 20 мг смолы) смолы ChemMatrix в 1,5 мл 20% пиперидина/DMF встряхивали в «libra» пробирке в течение 20 мин, и DeFmoc раствор отфильтровывали. Смолу промывали в течение 30 сек последовательно каждый раз 1,5 мл хлористого метилена (methylene chloride, МС), 1,5 мл диметилформамида (dimethylformamide, DMF), 1,5 мл МС, 1,5 мл DMF и 1,5 мл МС. Полученные свободные амины на твердой подложке подвергали взаимодействию или с мономером Fmoc-ПНК, или с производным Fmoc-защищенной аминокислоты.[Activation of H-Rink-ChemMatrix Resin] 0.01 mmol (about 20 mg resin) of ChemMatrix resin in 1.5 ml of 20% piperidine/DMF was shaken in a "libra" tube for 20 minutes and the DeFmoc solution was filtered. The resin was washed for 30 seconds successively each time with 1.5 ml of methylene chloride (methylene chloride, MS), 1.5 ml of dimethylformamide (dimethylformamide, DMF), 1.5 ml of MS, 1.5 ml of DMF and 1.5 ml of MS . The resulting free amines on a solid support were reacted with either the Fmoc-PNA monomer or an Fmoc-protected amino acid derivative.
[DeFmoc] Смолу встряхивали в 1,5 мл 20% пиперидина/DMF в течение 7 мин, и DeFmoc раствор отфильтровывали. Смолу промывали в течение 30 сек последовательно каждый раз 1,5 мл МС, 1,5 мл DMF, 1,5 мл МС, 1,5 мл DMF и 1,5 мл МС. Полученные свободные амины на твердой подложке тотчас подвергали взаимодействию с мономером Fmoc-ПНК.[DeFmoc] The resin was shaken in 1.5 ml of 20% piperidine/DMF for 7 minutes and the DeFmoc solution was filtered. The resin was washed for 30 seconds successively each time with 1.5 ml MS, 1.5 ml DMF, 1.5 ml MS, 1.5 ml DMF and 1.5 ml MS. The resulting free amines on a solid support were immediately reacted with the Fmoc-PNA monomer.
[Взаимодействие с мономером Fmoc-ПНК] Свободные амины на твердой подложке взаимодействовали с мономером Fmoc-ПНК следующим образом. 0,04 ммолей мономера ПНК, 0,05 ммолей HBTU и 10 ммолей DIEA инкубировали в течение 2 мин в 1 мл безводного DMF и прибавляли к смоле со свободными аминами. Раствор смолы встряхивали в течение 1 часа и реакционную смесь фильтровали. Затем смолу промывали 30 сек последовательно каждый раз 1,5 мл МС, 1,5 мл DMF и 1,5 мл МС. Химические структуры мономеров Fmoc-ПНК с модифицированным нуклеиновым основанием, используемом в данном изобретении, представлены на фиг. 6. Мономеры Fmoc-ПНК с модифицированным нуклеиновым основанием, представленные на фиг. 6, должны быть приняты в качестве примеров и, следовательно, не должны рассматриваться для ограничения объема данного изобретения. Специалист в данной области может легко догадаться о целом ряде изменений в мономерах Fmoc-ПНК для синтеза производного ПНК формулы I.[Reaction with Fmoc-PNA Monomer] Free amines on a solid support were reacted with Fmoc-PNA monomer as follows. 0.04 mmol of PNA monomer, 0.05 mmol of HBTU and 10 mmol of DIEA were incubated for 2 min in 1 ml of anhydrous DMF and added to the resin with free amines. The resin solution was shaken for 1 hour and the reaction mixture was filtered. The resin was then washed for 30 seconds successively each time with 1.5 ml MS, 1.5 ml DMF and 1.5 ml MS. The chemical structures of the nucleobase-modified Fmoc-PNA monomers used in the present invention are shown in FIG. 6. The nucleobase-modified Fmoc-PNA monomers shown in FIG. 6 are to be taken as examples and therefore should not be construed as limiting the scope of the present invention. A person skilled in the art can easily guess a number of changes in the Fmoc-PNA monomers for the synthesis of the PNA derivative of formula I.
[Кэпирование] После реакции связывания непрореагированные свободные амины кэпированы при встряхивании в течение 5 минут в 1,5 мл кэпированного раствора (5% уксусный ангидрид и 6% 2,6-лейтидин в DMF). Затем кэпированный раствор отфильтровывали и промывали в течение 30 сек последовательно каждый раз 1,5 мл МС, 1,5 мл DMF и 1,5 мл МС.[Capping] After the coupling reaction, the unreacted free amines were capped with shaking for 5 minutes in 1.5 ml of a capped solution (5% acetic anhydride and 6% 2,6-leutidine in DMF). The capped solution was then filtered and washed for 30 sec each time successively with 1.5 ml MC, 1.5 ml DMF and 1.5 ml MC.
[Введение группы "Fethoc-" в N-конец] Группу "Fethoc-" вводили в N-конец при взаимодействии свободного амина на смоле с "Fethoc-OSu" при основных условиях связывания. Химическая структура "Fethoc-OSu" [CAS No. 179337-69-0, C20H17NO5, М.В.351,36] приведена, как указано ниже.[Introduction of "Fethoc-" Group at N-Terminus] The "Fethoc-" group was introduced at the N-terminus by reacting the free amine on the resin with "Fethoc-OSu" under basic coupling conditions. Chemical structure of Fethoc-OSu [CAS No. 179337-69-0, C 20 H 17 NO 5 , M.B. 351.36] is listed as below.
[Отщепление смолы] Олигомеры ПНК, связанные со смолой, отщепляли от смолы встряхиванием в течение 3 часов в 1,5 мл отщепляющего раствора (2,5% три-изопропилсилана и 2,5% воды в трифторуксусной кислоте). Смолу отфильтровывали и фильтрат концентрировали при пониженном давлении. Полученный остаток растирали в порошок с помощью диэтилового эфира и полученный осадок собирали с помощью фильтрации для очистки обращенно-фазовой ВЭЖХ.[Resin Removal] The resin-bound PNA oligomers were cleaved from the resin by shaking for 3 hours in 1.5 ml of a cleavage solution (2.5% tri-isopropylsilane and 2.5% water in trifluoroacetic acid). The resin was filtered off and the filtrate was concentrated under reduced pressure. The resulting residue was triturated with diethyl ether, and the resulting precipitate was collected by filtration to purify by reverse phase HPLC.
[Анализ ВЭЖХ и очистка] После отщепления смолы технический продукт производного ПНК очищали с помощью C18-обращенно-фазовой ВЭЖХ, элюируя водой/ацетонитрилом или водой/метанолом (градиентный метод), содержащих 0,1% TFA. Фиг. 7а и 7b представляют типичные хроматограммы ВЭЖХ для "ASO 1" до и после очистки ВЭЖХ, соответственно. Последовательность олигомера "ASO 1" является такой, как представлено в таблице 1.[HPLC Analysis and Purification] After resin cleavage, the technical product of the PNA derivative was purified by C 18 reverse phase HPLC eluting with water/acetonitrile or water/methanol (gradient method) containing 0.1% TFA. Fig. 7a and 7b are representative HPLC chromatograms for "
Синтетические примеры для производного ПНК формулы ISynthetic Examples for a PNA Derivative of Formula I
Для того, чтобы комплементарно целенаправленно воздействовать на 3' сайт сплайсинга "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека, производное ПНК данного изобретения получали согласно методам синтеза, приведенным выше, или с незначительными изменениями. Предоставление таких производных ПНК, целенаправленно воздействующих на пре-мРНК TYR человека, является примером производных ПНК формулы I, и не должно быть истолковано для ограничения объема данного изобретения.In order to complementarily target the 3' splicing site of "
Таблица 1 приводит производные ПНК, комплементарно целенаправленно воздействующие на 3' сайт сплайсинга "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека, считанной с гена TYR человека [Стандартная/эталонная последовательность NCBI (Национального центра биотехнологической информации): NG_0008748], а также данные по структурному исследованию с помощью масс-спектрометрии. Предоставление ASOs TYR в таблице 1 является примером производных ПНК формулы I, и не должно быть истолковано для ограничения объема данного изобретения.Table 1 lists PNA derivatives that complementarily target the 3' splicing site of "
"ASO 1" имеет 13-мерное комплементарное перекрывание с 13-мерной последовательностью, обозначенной "жирным шрифтом" и "подчеркнутой" в пределах 30-мерной последовательности РНК [(5'→3') ggguguuuuguacag AUUGU-CUGUAGCCGA], охватывающей область соединения "интрона 1" и "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека. Таким образом, "ASO 1" имеет 5-мерное перекрывание с "интроном 1" и 8-мерное перекрывание с "экзоном 2" в пределах пре-мРНК TYR человека."
Таблица 2 приводит "ASO 1М", комплементарно целенаправленно воздействующий на 3' сайт сплайсинга "экзона 2" в пре-мРНК TYR мыши, считанной с геномной ДНК мыши [обеспеченный доступ к Стандартной/эталонной последовательности NCBI: NC_000073], а также данные по структурному исследованию с помощью масс-спектрометрии. Предоставление "ASO 1М" состоит в том, чтобы оценить антисмысловую активность в клетках мышиного происхождения.Table 2 lists "
30-мерную последовательность РНК [(5'→3') aauuguuuuucacag AUCAUUUGUAGCAGA], охватывающую область соединения интрона 1 и экзона 2 в пре-мРНК TYR мыши, считывали с гена TYR мыши. [Номер доступа гена NCBI: NC_000073].30-mer RNA sequence [(5'→3') aauuguuuuucacag AUCAUUUGUAGCAGA], spanning the junction of
"ASO 1М" эквивалентна последовательности ДНК "(5'→3') CAA-ATG-ATC-TGT-G" для комплементарного связывания с пре-мРНК. "ASO 1М" имеет 13-мерное комплементарное перекрывание с 13-мерной последовательностью, обозначенной "жирным шрифтом" и "подчеркнутой" в пределах 30-мерной последовательности РНК [(5'→3') aauuguuuuucacag AUCAUUUGUAGCAGA], охватывающей область соединения "интрона 1" и "экзона 2" в пре-мРНК TYR мыши."
Подобно "ASO 1" против пре-мРНК TYR человека, "ASO 1М" обладает 5-мерным перекрыванием с "интроном 1" и 8-мерным перекрыванием с "экзоном 2" в пределах пре-мРНК TYR мыши. "ASO 1М" может служить в качестве хорошего заместительного (имитирующего) соединения для антисмысловой активности "ASO 1" в клетках человеческого происхождения.Like "
Фиг. 7а представляет собой ВЭЖХ хроматограмму, полученную для технического (неочищенного) продукта "ASO 1". Неочищенный продукт очищали C18-RP препаративной ВЭЖХ. Фиг. 7b представляет собой хроматограмму ВЭЖХ для очищенного продукта "ASO 1". Чистота "ASO 1" заметно улучшилась после очистки препаративной ВЭЖХ. Фиг. 8 приводит масс-спектр ESI-TOF, полученный для очищенного продукта "ASO 1". Предоставление аналитических данных для "ASO 1" состоит в том, чтобы проиллюстрировать как производные ПНК формулы I были очищены и идентифицированы в настоящем изобретении, и не должно быть истолковано для ограничения объема данного изобретения.Fig. 7a is the HPLC chromatogram obtained for the technical (crude) product "
Связывающая аффинность типичных производных ПНК для комплементарной ДНКBinding affinity of typical PNA derivatives for complementary DNA
Производные ПНК в таблицах 1 и 2 оценивали по их связывающей аффинности для 10-мерных ДНК(т), комплементарно целенаправленно воздействующих или на N-конец или С-конец. Связывающую аффинность оценивали с помощью величины Tm для дуплекса между ПНК и 10-мерной комплементарной ДНК. Дуплекс между производными ПНК и полностью комплементарными ДНК(тами) показывают величины Tm слишком высокими, чтобы можно было надежно определить в водном буферном растворе, так как буферный раствор склонен кипеть во время измерения Tm.The PNA derivatives in Tables 1 and 2 were evaluated by their binding affinity for 10-mer DNA(s) targeting either the N-terminus or the C-terminus complementarily. Binding affinity was assessed using the T m value for the duplex between PNA and 10-mer complementary DNA. The duplex between PNA derivatives and fully complementary DNA(s) show T m values too high to be reliably determined in an aqueous buffer solution, since the buffer solution tends to boil during T m measurement.
Величины Tm определяли на спектрометре с УФ и видимой областями спектра следующим образом. Смешанный раствор 4 мкмоль олигомера ПНК и 4 мкмоль комплементарной 10-мерной ДНК в 4 мл водного буфера (рН 7, 16, 10 ммоль фосфата натрия, 100 ммоль NaCl) в 15 мл полипропиленовой пробирке фирмы Falcon инкубировали при 90°С в течение минуты и медленно охлаждали до обычной температуры. Затем раствор переносили в 3 мл кварцевую UV кювету, снабженную герметичной крышкой, и подвергали измерению Tm при 260 нм на спектрофотометре с УФ и видимой областями спектра, как описано в предшествующем уровне техники [PCT/KR2009/001256] или с незначительными изменениями. 10-мерные комплементарные ДНК(ы) для измерения Tm приобретали от Bioneer (www.bioneer.com, Dajeon, Республика Корея) и использовали без дополнительной очистки.The values of T m were determined on a spectrometer with UV and visible regions of the spectrum as follows. A mixed solution of 4 µmol PNA oligomer and 4 µmol complementary 10-mer DNA in 4 ml aqueous buffer (
Наблюдаемые величины Tm производных ПНК формулы I очень высоки для комплементарного связывания с 10-мерной ДНК и приведены в таблице 3. Например, "ASO 1" показал значение Tm, равную 78,0°С, для дуплекса с 10-мерной комплементарной ДНК, целенаправленно воздействующей на 10-мерный N-конец в ПНК, обозначенный "жирным шрифтом" и "подчеркнутый" в [(N→С) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2]. Одновременно, "ASO 1" показал Tm, равную 73,0°C, для дуплекса с 10-мерной комплементарной ДНК, целенаправленно воздействующей на 10-мерный С-конец в ПНК, обозначенный "жирным шрифтом" и "подчеркнутый" в [(N→С) Fethoc-CA(5)G-ACA(5)-ATC(1O2)-TG(6)T-A(5)-NH2].The observed T m values of PNA derivatives of formula I are very high for complementary binding to 10-mer DNA and are shown in Table 3. For example, "
Примеры биологических активностей производных ПНК формулы IExamples of biological activities of PNA derivatives of formula I
Производные ПНК в данном изобретении оценивали in vitro на антисмысловые активности TYR в клетках B16F10 меланомы мыши и меланоцитах человека. Биологические примеры предусмотрены в качестве примеров для иллюстрации биологических профилей производных ПНК формулы I, и поэтому не должны быть истолкованы для ограничения объема нынешнего изобретения.The PNA derivatives of the present invention were evaluated in vitro for TYR antisense activities in B16F10 mouse melanoma cells and human melanocytes. The biological examples are provided as examples to illustrate the biological profiles of the PNA derivatives of Formula I and should therefore not be construed as limiting the scope of the present invention.
Пример 1. Пропуск экзона, индуцируемый "ASO 1М".Example 1 Exon skipping induced by "
"ASO 1М", точно определенный в таблице 2, имеет 13-мерное комплементарное перекрывание с 13-мерной последовательностью, обозначенной "жирным шрифтом" и "подчеркнутой" в пределах 30-мерной последовательности РНК [(5'→3') aauuguuuuucacag AUCAUUUGUAGCAGA], охватывающей область соединения "интрона 1" и "экзона 2" в пре-мРНК TYR мыши. Одновременно, "ASO 1М" обладает 9-мерной комплементарностью наряду с 4 ошибочными спариваниями, обозначенными "жирным шрифтом" и "подчеркнутых" в пределах 30-мерной последовательности РНК [(5'→3') ggguguuuug"u"acag AU"UG"U"C"UGUAGCCGA1. охватывающей область соединения "интрона 1" и "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека. 4 ошибочные спаривания отмечены кавычками (" ")."
"ASO 1М" оценивали на его способность индуцировать пропуск "экзона 2" TYR в клетках B16F10 меланомы мыши, несмотря на то, что "ASO 1М" обладает 4 ошибочными спариваниями с 3' сайтом сплайсинга "экзона 2" в пре-мРНК TYR человека. "ASO 1М", который полностью комплементарен пре-мРНК TYR мыши, может служить в качестве хорошего заместительного (имитирующего) соединения для "ASO 1", который полностью комплементарен пре-мРНК TYR человека. [Культура клеток и обработка ASO] Клетки B16F10 меланомы мыши (Cat. Number CRL-6475, АТСС) поддерживали в DMEM (модифицированная по способу Дульбекко минимальная эссенциальная среда Игла), подкрепленная 10% FBS, 1% стрептомицина/пенициллина и 0,01 мг/мл бычьего инсулина. Клетки B16F10, выращенные в 60 мм чашке для культивирования, содержащей 5 мл DMEM, инкубировали в течение 5 часов с "ASO 1М" при 0 (негативный контроль), 1, 10, 100 или 1000 аМ."
[Экстракция РНК и синтез кДНК с помощью одностадийной ПЦР] После инкубирования в течение 5 часов, суммарную РНК экстрагировали с помощью "Универсального набора для экстракции РНК" (Cat. Number 9767, Takara) согласно инструкциям производителя. 200 нг матричной РНК использовали для 25 мкл реакции обратной транскрипции с помощью Super Script® Набор одностадийной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией с Platinum® ДНК-полимеразы Taq (Cat. No. 10928-042, Invitrogen) против набора экзон-специфичных праймеров [экзон 1_прямой: (5'→3') GTAAGTTTGGATTTGGGG; и экзон 4_обратный: (5'→3') AGAGC-GGTATGAAAGGAA] согласно следующим условиям цикла: 50°С в течение 30 мин и 94°С в течение 2 мин с последующими 15 циклами по 30 сек при 94°С, 30 сек при 52°С и 40 сек при 72°С.[RNA Extraction and cDNA Synthesis by One Step PCR] After incubation for 5 hours, total RNA was extracted with a "Universal RNA Extraction Kit" (Cat. Number 9767, Takara) according to the manufacturer's instructions. 200 ng messenger RNA was used for a 25 µl reverse transcription reaction using the Super Script® Platinum® Taq DNA Polymerase One-Step Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction Kit (Cat. No. 10928-042, Invitrogen) against the exon-specific primer set [exon 1_straight: (5'→3') GTAAGTTTGGATTTGGGG; and exon 4_reverse: (5'→3') AGAGC-GGTATGAAAGGAA] according to the following cycle conditions: 50°C for 30 min and 94°C for 2 min followed by 15 cycles of 30 sec at 94°C, 30 sec at 52°C and 40 sec at 72°C.
[Вложенная ПЦР-амплификация] 1 мкл кДНК дополнительно амплифицировали в 20 мкл вложенной ПЦР (Cat. No. K2612, Bioneer) против набора праймеров [экзон 1n_прямой: (5'→3') GAGAACTAACTGGGGATGA; и экзон 4n_обратный: (5'→3') CGATAGGTGCATTGGCTT] согласно условиям цикла, точно определенного, как указано ниже: 95°С в течение 5 мин с последующими 30 циклами по 30 сек при 95°С, 30 сек при 52°С и 40 сек при 72°С.[Nested PCR amplification] 1 µl cDNA was further amplified in 20 µl nested PCR (Cat. No. K2612, Bioneer) against the primer set [exon 1n_forward: (5'→3') GAGAACTAACTGGGGATGA; and exon 4n_reverse: (5'→3') CGATAGGTGCATTGGCTT] according to cycle conditions precisely defined as follows: 95°C for 5 min followed by 30 cycles of 30 sec at 95°C, 30 sec at 52°C and 40 sec at 72°C.
[Идентификация продуктов пропуска экзона] Продукты ПЦР подвергали электрофоретическому разделению на 2% агарозном геле. Полосы необходимого размера собирали и анализировали секвенированием по Сенгеру.[Identification of exon skipping products] PCR products were subjected to electrophoretic separation on a 2% agarose gel. Bands of the required size were collected and analyzed by Sanger sequencing.
Фиг. 9а приводит электрофоретические данные продуктов ПЦР. Клетки без обработки "ASO 1М" давали две интенсивные ПЦР полосы, одна для полноразмерной мРНК TYR и другая для сплайс-варианта мРНК TYR, не содержащей экзоны 2 и 3. Таким образом, полагают, что пропуск экзонов 2-3 происходит спонтанно. Клетки, обработанные "ASO 1М" при 1 до 1000 аМ, однако, давали только вариант сплайсинга мРНК TYR, не содержащей экзоны 2 и 3. Таким образом, "ASO 1М" повышает склонность к пропуску экзонов 2-3 в клетках B16F10 меланомы. Продукт ПЦР пропуска экзонов секвенировали для пропуска экзонов 2-3, как показано на фиг. 9b.Fig. 9a shows the electrophoretic data of the PCR products. Cells without "
Пример 2. кПЦР для мРНК TYR в клетках B16F10 меланомы мыши, обработанных "ASO 1М".Example 2 qPCR for TYR mRNA in B16F10 mouse melanoma cells treated with "
"ASO 1М" оценивали с помощью вложенной кПЦР TYR на его способность индуцировать изменения в уровне мРНК TYR мыши в клетках B16F10, как описано ниже."
[Культура клеток и обработка ASO] Клетки B16F10, выращенные в 60 мм чашке для культивирования, содержащей 5 мл DMEM, обрабатывали "ASO 1М" при 0 (негативный контроль), 1, 10,100 или 1000 аМ (2 чашки для культивирования на дозу).[Cell Culture and ASO Treatment] B16F10 cells grown in a 60 mm culture dish containing 5 ml of DMEM were treated with "
[Экстракция РНК и синтез кДНК с помощью одностадийной ПЦР] После инкубирования с "ASO 1М" в течение 5 часов, суммарную РНК экстрагировали из клеток, используя "Универсальный набор для экстракции РНК " (Cat. No. 9767, Takara) согласно инструкциям производителя. 200 нг матричной РНК использовали для 25 мкл реакции обратной транскрипции с помощью Набора одностадийной RT-PCR (Invitrogen, США) против Набора экзон-специфичных праймеров [экзон 1 прямой: (5'→3') GTAAGTTTGGATTTGGGG; и экзон 4_обратный: (5'→3')[RNA Extraction and cDNA Synthesis by One Step PCR] After incubation with "
AGAGCGGTATGAAAGGAA] согласно следующим условиям цикла: 50°С в течение 30 мин и 94°С в течение 2 мин с последующими 15 циклами по 30 сек при 94°С, 30 сек при 52°С и 40 сек при 72°С.AGAGCGGTATGAAAGGAA] according to the following cycle conditions: 50°C for 30 min and 94°C for 2 min followed by 15 cycles of 30 sec at 94°C, 30 sec at 52°C and 40 sec at 72°C.
[Вложенная кПЦР-амплификация] Растворы кДНК разбавляли в 100 раз и 1 мкл каждого разбавленного продукта ПЦР подвергали реакции 20 мкл ПЦР в режиме реального времени с набором зондов Taqman, охватывающих область соединения экзона 2 и экзона 3 (Cat. No. Mm00495818_m1, Thermo Fisher Scientific) согласно следующим условиям цикла: 95°С в течение 3 мин с последующими 30 циклами по 10 сек при 95°С и 30 сек при 60°С.[Nested qPCR amplification] The cDNA solutions were diluted 100-fold and 1 µl of each diluted PCR product was reacted with 20 µl real-time PCR with a set of Taqman probes spanning the junction of
[Статистический анализ] Эксперимент вложенной кПЦР независимо повторяли 4 раза и индивидуальные уровни мДНК от каждого эксперимента нормализовали против уровня мДНК без обработки "ASO 1М". Уровни мДНК, полученные из всех 4 отдельных экспериментов объединяли для статистического анализа с помощью параметрического t-критерия Стьюдента. Таким образом, количество образцов РНК составляет 8 для каждой концентрации.[Statistical Analysis] The nested qPCR experiment was independently repeated 4 times and the individual mDNA levels from each experiment were normalized against the mDNA level without "
Фиг. 10а приводит объединенные данные кПЦР, в которых уровень полноразмерный мДНК существенно снизился на 40% в клетках, обработанных "ASO 1М" при от 1 до 1000 аМ.Fig. 10a shows pooled qPCR data in which the level of full-length mDNA was significantly reduced by 40% in cells treated with "
Пример 3. Ингибирование экспрессии белка TYR в клетках B16F10 меланомы с помощью "ASO 1М".Example 3 Inhibition of TYR protein expression in B16F10 melanoma cells with "
"ASO 1М" оценивали по его способности подавлять экспрессию белка TYR в клетках B16F10 меланомы мыши, как описано ниже."
Клетки B16F10, выращенные в 60 мм чашке для культивирования, содержащей 5 мл DMEM, обрабатывали "ASO 1М" при 0 zM (негативный контроль), 10 zM, 100 zM, 1 аМ или 10 аМ. Через 24 часа клетки промывали 2 раза холодным фосфатно-солевым буферным раствором (phosphate buffered saline, PBS) и затем подвергали лизису с 200 мкл 1X буфера для лизиса клеток (Cat. No. 9803, Cell Signaling Tech), дополненного смесью ингибиторов 1X протеаз (Cat. No. Р8340, Sigma). 200 мкл каждого лизата в 1,5 мл е-трубке смешивали с 100 мкл 5Х буфера для образца и кипятили при 100°С в течение 5 минут. 20 мкл лизата подвергали электрофоретическому разделению на 4-15% градиентном геле TGX (Cat No. 456-1086, Bio-Rad) и белок переносили на 0,45 мкм PVDF мембрану. Мембрану испытывали анти-TYR антителом (Cat. No. 9319, Cell Signaling Tech) и анти-β-актиновым антителом (Cat. No. a3845, Sigma).B16F10 cells grown in a 60 mm culture dish containing 5 ml DMEM were treated with "
Фиг. 10b приводит данные вестерн-блота для экспрессии белка TYR в клетках B16F10. Интенсивность полосы экспрессии TYR была существенно слабее в лизатах с обработкой "ASO 1М", чем в лизатах без обработки "ASO 1М", т.е. негативный контроль. Белок TYR и уровень мРНК уменьшались соизмеримо при обработке ASO. (срав. "Пример 2").Fig. 10b shows Western blot data for TYR protein expression in B16F10 cells. The intensity of the TYR expression band was significantly weaker in lysates treated with "
Пример 4. Ингибирование меланогенеза в клетках B16F10 меланомы с помощью "ASO 1М"Example 4 Inhibition of Melanogenesis in B16F10 Melanoma Cells with "
"ASO 1М" оценивали на его способность ингибировать меланогенез в клетках B16F10 меланомы мыши, как описано ниже."
Клетки B16F10, субкультивированные в 60 мм чашке для культивирования, содержащей 5 мл DMEM, ничем не обработали (негативный контроль), и обработали "ASO 1М" при 1 до 1000 аМ или с 10 или 100 мкг/мл арбутина в качестве положительного контроля (2 чашки для культивирования на дозу). Через 24 часа клетки промывали 2 раза холодным фосфатно-солевым буферным раствором и подвергали лизису с 200 мкл 1N NaOH. Каждый лизат собирали в 1,5 мл е-трубку и выдерживали в течение ночи при комнатной температуре. Содержание меланина в каждом лизате определяли абсорбцией при 475 нм на ELISA ридере. Такой же эксперимент повторили четыре раза, используя клетки при различном пассировании. Четыре набора данных содержания меланина объединили для статистического анализа с помощью параметрического t-критерия Стьюдента против содержания меланина без обработки (негативный контроль).B16F10 cells subcultured in a 60 mm culture dish containing 5 ml DMEM were treated untreated (negative control) and treated with "
Фиг. 11 обобщает изменения содержания меланина в клетках B16F10 после 24 часов инкубирования или с "ASO 1М", или с арбутином. Содержание меланина существенно уменьшилось на около 15% и 25%в клетках, обработанных 10 мкг/мл и 100 мкг/мл арбутина, соответственно. В случае клеток, обработанных "ASO 1М", содержание меланина значительно снизилось на около 15% без заметной зависимости от дозировки. Ингибирующая активность "ASO 1М" была сравнима с таковой для 10 мкг/мл арбутина.Fig. 11 summarizes changes in melanin content in B16F10 cells after 24 hours of incubation with either "
Пример 5. Получение крема для топического применения, содержащего соединение формулы IExample 5 Preparation of a topical cream containing a compound of formula I
Соединение формулы I, например "ASO 2", входил в состав крема для топического применения субъектами. Крем для топического применения получали как описано ниже. Принимая во внимание то, что имеется немереное количество возможных вариантов кремов для топического применения, данный препарат должен быть принят в качестве примера и не должен быть истолкован для ограничения объема нынешнего изобретения.A compound of formula I, eg "
[Получение раствора А] В химическом стакане смешивали дистиллированную воду (196 г), динатриевую EDTA (0,06 г), глицерин (15 г), дипропиленгликоль (30 г), феноксиэтанол (0,9 г), этилгексилглицерин (0,9 г), сополимер[Preparation of Solution A] Distilled water (196 g), disodium EDTA (0.06 g), glycerin (15 g), dipropylene glycol (30 g), phenoxyethanol (0.9 g), ethylhexylglycerol (0.9 d) copolymer
гидроксиэтилакрилата/акрилоилдиметилтаурата натрия (2,4 г) и 1 нМ водный раствор "ASO 2" (0,3 мл). Смесь подвергают гомогенизации при 70 ~ 75°С, используя смеситель-гомогенизатор.sodium hydroxyethyl acrylate/acryloyldimethyl taurate (2.4 g) and 1 nM "
[Получение раствора В] В другом химическом стакане смешивали при 70 ~ 75°С цетеарил этилгексаноат (12 г), диметикон (6 г), стеариновую кислоту/ гидрогенизированное растительное масло/бегениловый спирт/цетеариловый спирт (15 г), масло каритэ (Shea) (9 г) и полиглицерил-3-метилглюкозы дистеарат/глицерил стеарат SE/сесквистеарат метилглюкозы (6 г).[Preparation of Solution B] In another beaker, cetearyl ethylhexanoate (12g), dimethicone (6g), stearic acid/hydrogenated vegetable oil/behenyl alcohol/cetearyl alcohol (15g), shea butter (Shea ) (9 g) and polyglyceryl-3-methylglucose distearate/glyceryl stearate SE/methylglucose sesquistearate (6 g).
[Получение крема для топического применения] "Раствор А" и "Раствор В" смешивали, подвергая гомогенизации при 7200 об/мин и 70 ~ 75°С в течение 3 мин с помощью смесителя-гомогенизатора. Смесь медленно охлаждали до комнатной температуры с получением крема для топического применения, содержащего 1 пМ "ASO 2".[Preparation of Topical Cream] "Solution A" and "Solution B" were mixed by subjecting to homogenization at 7200 rpm and 70 ~ 75°C for 3 minutes with a homogenizer mixer. The mixture was slowly cooled to room temperature to give a topical cream containing 1 pM "
Пример 6. кПЦР для мРНК TYR в меланоцитах человека, обработанных "ASO 1".Example 6 qPCR for TYR mRNA in human melanocytes treated with "
"ASO 1", указанный в таблице 1, представляет 13-мерный ASO TYR полностью комплементарный 3' сайту сплайсинга, охватывающего область соединения интрона 1 и экзона 2 в TYR человека, обозначенный "жирным шрифтом" и "подчеркнутый" в 30-мерной последовательности пре-мРНК TYR человека [(5'→3') ggguguuuuguacag AUUGUCUGUAGCCGA]."
"ASO 1" оценивали с помощью вложенной кПЦР TYR на его способность индуцировать изменения в уровне мРНК TYR в первичных эпидермальных меланоцитах человека, как указано далее."
[Культура клеток и обработка ASO] Первичные клетки эпидермальных меланоцитов (Cat. Number PCS-200-013, АТСС) выдерживали в базальной среде для дермальных клеток (Cat Number PCS-200-030, АТСС), дополненной частью комплекта для роста зрелых меланоцитов (Cat. Number PCS-200-042, АТСС). Меланоциты, выращенные в 60 мм чашке для культивирования, содержащей 5 мл среды для культивирования, обрабатывали "ASO 1" при 0 zM (негативный контроль), 1 zM, 100 zM или 10 аМ. (3 чашки для культивирования для каждой концентрации).[Cell Culture and ASO Treatment] Primary epidermal melanocyte cells (Cat. Number PCS-200-013, ATCC) were maintained in dermal cell basal medium (Cat Number PCS-200-030, ATCC) supplemented with part of the Mature Melanocyte Growth Kit ( Cat. Number PCS-200-042, ATCC). Melanocytes grown in a 60 mm culture dish containing 5 ml culture medium were treated with "
[Экстракция РНК и синтез кДНК с помощью одностадийной ПЦР] После инкубирования с "ASO 1М" в течение 5 часов, суммарную РНК экстрагировали, используя "Мини-набор RNeasy " (Cat. Number 74106, Qiagen) согласно инструкциям производителя. 200 нг матричной РНК подвергали 25 мкл реакции обратной транскрипции с помощью Super Script® Набора одностадийной RT-PCR с Platinum® ДНК-полимеразы Taq (Cat. No. 10928-042, Invitrogen) против набора экзон-специфичных праймеров [экзон 1_прямой(2): (5'→3') CTCTTTGTCTGGATGCATT; и экзон 5_обратный: (5'→3') CTGTGGTAATCCTCTTTCT] согласно следующим указанным условиям цикла: 50°С в течение 30 мин и 94°С в течение 2 мин с последующими 15 циклами по 30 сек при 94°С, 30 сек при 50°С и 1 мин при 72°С.[RNA Extraction and cDNA Synthesis by One Step PCR] After incubation with "
[Вложенная ПЦР-амплификация] 1 мкл кДНК дополнительно амплифицировали в 20 мкл вложенной ПЦР-реакции (Cat. No. K2612, Bioneer) против набора экзон-специфичных праймеров [экзон 2n_прямой(2): (5'→3') GATAAAGCTGCCAATTTC; и экзон 3n_обратный: (5'→3') TTGTGCATGCTGCTTTGA] против зонда Taqman [(5'→3') 5,6-FAM-CACTGG-ZEN-AAGGATTTGCTAGTCCAC-3IABkFQ]. Условия цикла: 95°С в течение 3 мин с последующими 40 циклами по 10 сек при 95°С и 30 сек при 60°С.[Nested PCR amplification] 1 µl cDNA was further amplified in 20 µl nested PCR reaction (Cat. No. K2612, Bioneer) against the exon-specific primer set [exon 2n_forward(2): (5'→3') GATAAAGCTGCCAATTTC; and exon 3n_reverse: (5'→3') TTGTGCATGCTGCTTTGA] versus the Taqman probe [(5'→3') 5,6-FAM-CACTGG-ZEN-AAGGATTTGCTAGTCCAC-3IABkFQ]. Cycle conditions: 95°C for 3 minutes followed by 40 cycles of 10 seconds at 95°C and 30 seconds at 60°C.
Фиг. 12 приводит данные кПЦР, в которых уровень полноразмерной мДНК TYR снизился на около 30% в меланоцитах человека, обработанных "ASO 1" от 1 zM до 10 аМ. Наблюдаемые снижения были значительными (параметрический t-критерий Стьюдента) в клетках, обработанных "ASO 1" при 1 zM и 10 аМ.Fig. 12 shows qPCR data in which the level of full-length TYR mDNA decreased by about 30% in human melanocytes treated with "
Claims (52)
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR20170093605 | 2017-07-24 | ||
KR10-2017-0093605 | 2017-07-24 | ||
KR1020170167558A KR20190011181A (en) | 2017-07-24 | 2017-12-07 | Tyrosinase antisense oligonucleotides |
KR10-2017-0167558 | 2017-12-07 | ||
PCT/KR2018/008143 WO2019022434A1 (en) | 2017-07-24 | 2018-07-19 | Tyrosinase antisense oligonucleotides |
Publications (4)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2019142512A RU2019142512A (en) | 2021-08-24 |
RU2019142512A3 RU2019142512A3 (en) | 2021-11-08 |
RU2778786C2 true RU2778786C2 (en) | 2022-08-24 |
RU2778786C9 RU2778786C9 (en) | 2022-10-14 |
Family
ID=
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20040215006A1 (en) * | 2003-04-25 | 2004-10-28 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Modulation of tyrosinase expression |
WO2009113828A2 (en) * | 2008-03-14 | 2009-09-17 | Cti Bio | Peptide nucleic acid derivatives with good cell penetration and strong affinity for nucleic acid |
RU2011125776A (en) * | 2008-12-31 | 2013-02-10 | Реванс Терапьютикс, Инк. | COMPOSITIONS AND METHODS OF TREATING HYPERPIGMENTATION |
WO2013112548A1 (en) * | 2012-01-23 | 2013-08-01 | University Of South Florida | Gamma-aapeptides with potent and broad-spectrum antimicrobial activity |
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20040215006A1 (en) * | 2003-04-25 | 2004-10-28 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Modulation of tyrosinase expression |
WO2009113828A2 (en) * | 2008-03-14 | 2009-09-17 | Cti Bio | Peptide nucleic acid derivatives with good cell penetration and strong affinity for nucleic acid |
RU2011125776A (en) * | 2008-12-31 | 2013-02-10 | Реванс Терапьютикс, Инк. | COMPOSITIONS AND METHODS OF TREATING HYPERPIGMENTATION |
WO2013112548A1 (en) * | 2012-01-23 | 2013-08-01 | University Of South Florida | Gamma-aapeptides with potent and broad-spectrum antimicrobial activity |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Seemal R. Desai. Hyperpigmentation Therapy: A Review. J Clin Aesthet Dermatol., 2014, 7(8), p. 13-17. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR102236495B1 (en) | Tyrosinase antisense oligonucleotides | |
US20220363720A1 (en) | Melanophilin antisense oligonucleotides | |
RU2753517C2 (en) | Antisense oligonucleotides to hif-1-alpha | |
JP2024038106A (en) | Acetyl-coa carboxylase 2 antisense oligonucleotides | |
RU2778786C2 (en) | Antisense tyrosinase oligonucleotides | |
RU2778786C9 (en) | Tyrosinase antisense oligonucleotides | |
AU2018308224B9 (en) | Tyrosinase antisense oligonucleotides | |
TWI832851B (en) | Matrix metalloproteinase-1 antisense oligonucleotides | |
RU2766701C2 (en) | Antisense oligonucleotides for snap25 | |
RU2802418C2 (en) | Antisense oligonucleotides of matrix metalloproteinase-1 | |
RU2807629C9 (en) | Antisense oligonucleotides of acetyl-coa-carboxylase-2 | |
RU2807629C2 (en) | Antisense oligonucleotides of acetyl-coa-carboxylase-2 | |
RU2786637C2 (en) | Exon skip with peptidonucleic acid derivatives |