RU2771581C1 - Recombinant yeast strain komagataella phaffii - producer of secreted endo-dissociative xyloglucanase of the gh74 family, encoded by a mutated gene, and a method for microbiological synthesis of secreted endo-dissociative xyloglucanase based on this strain - Google Patents
Recombinant yeast strain komagataella phaffii - producer of secreted endo-dissociative xyloglucanase of the gh74 family, encoded by a mutated gene, and a method for microbiological synthesis of secreted endo-dissociative xyloglucanase based on this strain Download PDFInfo
- Publication number
- RU2771581C1 RU2771581C1 RU2021118689A RU2021118689A RU2771581C1 RU 2771581 C1 RU2771581 C1 RU 2771581C1 RU 2021118689 A RU2021118689 A RU 2021118689A RU 2021118689 A RU2021118689 A RU 2021118689A RU 2771581 C1 RU2771581 C1 RU 2771581C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- xyloglucanase
- dissociative
- strain
- endo
- family
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
- C12N15/81—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01151—Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase (3.2.1.151), i.e. endoxyloglucanase
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Mycology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Description
Группа заявляемых изобретений относится к биотехнологии, в частности к биосинтезу ксилоглюканазы, и представляет собой рекомбинантный штамм дрожжей Komagataella phaffii, несущий на хромосоме ген ксилоглюканазы из Myceliophthora thermophila ВКПМ F-244, содержащей замены (W324A/W325A), направленные на изменение способа действия фермента на субстрат с эндо-процессивного на эндо-диссоциативный, и способный синтезировать эндо-диссоциативную ксилоглюканазу, а также способ микробиологического синтеза эндо-диссоциативной ксилоглюканазы на основе заявленного штамма.The group of claimed inventions relates to biotechnology, in particular to the biosynthesis of xyloglucanase, and is a recombinant yeast strain Komagataella phaffii, carrying on the chromosome the xyloglucanase gene from Myceliophthora thermophila VKPM F-244, containing substitutions (W324A/W325A), aimed at changing the mode of action of the enzyme on a substrate from endo-processive to endo-dissociative, and capable of synthesizing endo-dissociative xyloglucanase, as well as a method for microbiological synthesis of endo-dissociative xyloglucanase based on the claimed strain.
Лигноцеллюлозная биомасса является дешевым возобновляемым источником ферментируемых сахаров являющихся субстратами множества биосинтетических процессов. Ферментативный гидролиз - экологически безопасный способ биоконверсии растительной биомассы в сахара. Сложный полисахаридный состав растительных клеточных стенок, содержащих, помимо целлюлозы, множество разнообразных связующих гликанов, обуславливает необходимость использования широкого спектра ферментов для гидролиза.Lignocellulosic biomass is a cheap, renewable source of fermentable sugars that are the substrates of many biosynthetic processes. Enzymatic hydrolysis is an environmentally friendly way to bioconvert plant biomass into sugars. The complex polysaccharide composition of plant cell walls, containing, in addition to cellulose, a variety of binding glycans, necessitates the use of a wide range of enzymes for hydrolysis.
Основным структурным полисахаридом первичной клеточной стенки всех двудольных и многих однодольных растений является разновидность бета-глюкана - ксилоглюкан (КГ). Наряду с другими связующими гликанами, он формирует аморфный матрикс, в который погружены микрофибриллы целлюлозы. Поэтому полный гидролиз целлюлозы невозможен без предварительного гидролиза полисахаридов матрикса, в том числе КГ.The main structural polysaccharide of the primary cell wall of all dicotyledonous and many monocotyledonous plants is a variety of beta-glucan - xyloglucan (XG). Along with other binding glycans, it forms an amorphous matrix in which cellulose microfibrils are immersed. Therefore, complete hydrolysis of cellulose is impossible without preliminary hydrolysis of matrix polysaccharides, including CG.
Основная цепь молекулы КГ состоит из блоков целлотетраозы, соединенных между собой β-(1,4)-связями. В большинстве случаев каждые три из четырех остатков глюкозы в таком блоке связаны α-(1,6)-связями с остатками D-ксилозы. Некоторые из остатков глюкозы, в свою очередь, могут быть связаны β-(1,2)-связями с остатками D-галактозы или, реже, L-арабинозы. В КГ некоторых растений остатки D-галактозы могут быть связаны α-(1,2)-связями с остатками L-фукозы. Видо- и тканеспецифичность модификаций остатков ксилозы определяет разнообразие типов КГ в растениях.The main chain of the CG molecule consists of cellotetraose blocks interconnected by β-(1,4)-bonds. In most cases, every three of the four glucose residues in such a block are linked by α-(1,6)-bonds to D-xylose residues. Some of the glucose residues, in turn, can be linked by β-(1,2)-bonds to D-galactose or, more rarely, L-arabinose residues. In the CG of some plants, D-galactose residues can be linked by α-(1,2)-bonds to L-fucose residues. The species and tissue specificity of modifications of xylose residues determines the diversity of CG types in plants.
Ферменты, специфически расщепляющие β-(1,4)-связи основной цепи молекулы КГ, называются ксилоглюканазами.Enzymes that specifically cleave the β-(1,4)-bonds of the main chain of the CG molecule are called xyloglucanases.
В соответствии с классификацией Хериссата, карбогидразы разделяются на семейства, объединенные общими структурно-функциональными свойствами, на основании сходства аминокислотной последовательностей (Henrissat and Bairoch, 1996). В настоящее время в базе данных CAZy находится более 140 семейств гликозил-гидролаз (http://www.Cazy.org). Ферменты, гидролизующие ксилоглюкан, обнаружены в семействах гликозил-гидролаз: GH5, GH7, GH12, GH16, GH26, GH44 и GH74. В отличие от других семейств, содержащих помимо ксилоглюканаз, ферменты с иной субстратной специфичностью, семейство GH74 содержит только ферменты, обладающие активностью на ксилоглюкане. В состав семейства GH74 входят:According to Herissat's classification, carbohydrases are divided into families, united by common structural and functional properties, based on the similarity of amino acid sequences (Henrissat and Bairoch, 1996). Currently, the CAZy database contains more than 140 families of glycosyl hydrolases (http://www.Cazy.org). Xyloglucan hydrolyzing enzymes are found in the glycosyl hydrolase families: GH5, GH7, GH12, GH16, GH26, GH44, and GH74. Unlike other families that contain, in addition to xyloglucanases, enzymes with different substrate specificities, the GH74 family contains only enzymes that have activity on xyloglucan. The GH74 family includes:
1) целлюлазы (ЕС 3.2.1.4), расщепляющие β-(1,4)-D-глюкозидные связи в целлюлозе, лихенане и β-D-глюканах злаков;1) cellulases (EC 3.2.1.4) that cleave β-(1,4)-D-glucosidic bonds in cellulose, lichenan and β-D-glucans of cereals;
2) целлобиогидролазы, специфичные к редуцирующим концам олигосахаридов (OXG-RCBH, КФ 3.2.1.150), отщепляющие целлобиозу с восстанавливающего конца молекулы КГ или его олигосахаридов;2) cellobiohydrolases specific to the reducing ends of oligosaccharides (OXG-RCBH, EC 3.2.1.150), which cleave cellobiose from the reducing end of the CG molecule or its oligosaccharides;
3) ксилоглюкан-специфические эндо-β-1,4-глюканазы, ксилоглюканазы (ЕС 3.2.1.151), гидролизующие β-1,4-D-глюкозидные связи у незамещенного остатка глюкозы в основной цепи КГ.3) xyloglucan-specific endo-β-1,4-glucanases, xyloglucanases (EC 3.2.1.151), hydrolyzing β-1,4-D-glucosidic bonds at the unsubstituted glucose residue in the CG main chain.
Способ действия ксилоглюканаз на субстрат может быть эндо-процессивным и эндо-диссоциативным. В первом случае ферменты случайным образом прикрепляются к основной цепи молекулы КГ и делают первый разрез, после чего процессивным способом удаляют «строительные блоки» КГ (гептасахариды XXXG, октасахариды XXLG/XLXG и нонасахариды XLLG - классификация Фрая (Fry et al. 1993)) с конца одной из частей молекулы, гидролизуя β-1,4-связи у незамещенного остатка глюкозы. Эндо-диссоциативные ксилоглюканазы открепляются от молекулы КГ после каждого акта гидролиза и затем случайным образом присоединяются к ней снова. В результате действия на КГ эндо-процессивных ксилоглюканаз основными конечными продуктами гидролиза являются «строительные блоки» КГ (XXXG, XXLG, XLXG и XLLG). В процессе гидролиза такими ферментами общая длина полисахаридной цепи, а значит и вязкость растворов КГ, снижаются медленно. Конечными продуктами эндо-диссоциативных ксилоглюканаз являются олигоксилоглюканы различной длины, а вязкость растворов под действием таких ферментов уменьшается очень быстро. Поэтому эндо-диссоциативные ксилоглюканазы могут быть использованы в качестве кормовых добавок для снижения вязкости промышленных субстратов на основе лигноцеллюлозной биомассы, а также кормов для животных.The mode of action of xyloglucanases on the substrate can be endo-processive and endo-dissociative. In the first case, enzymes are randomly attached to the main chain of the CG molecule and make the first cut, after which the “building blocks” of CG (XXXG heptasaccharides, XXLG/XLXG octasaccharides and XLLG nonasaccharides - Fry classification (Fry et al. 1993)) are removed in a processive manner from the end of one of the parts of the molecule, hydrolyzing β-1,4 bonds at the unsubstituted glucose residue. Endo-dissociative xyloglucanases detach from the CG molecule after each hydrolysis event and then randomly reattach to it. As a result of the action of endoprocessive xyloglucanases on CG, the main end products of hydrolysis are the building blocks of CG (XXXG, XXLG, XLXG, and XLLG). In the course of hydrolysis by such enzymes, the total length of the polysaccharide chain, and hence the viscosity of CG solutions, decreases slowly. The end products of endo-dissociative xyloglucanases are oligoxyloglucans of various lengths, and the viscosity of solutions under the action of such enzymes decreases very quickly. Therefore, endo-dissociative xyloglucanases can be used as feed additives to reduce the viscosity of industrial substrates based on lignocellulosic biomass, as well as animal feed.
В источниках информации имеются сведения о микроорганизмах - природных продуцентах ксилоглюканаз: Geotrichum sp. (Yaoi and Mitsuishi, 2004), Aspergillus japonicus, Chrysosporium lucknowense, Trichoderma reesei (Grishutin et al., 2004; Markov et al., 2005; Qi et al., 2013; Lopes et al., 2021), Phanerochaete chrysosporium (Ishida et al., 2007), Cellvibrio japonicus (Attia et al., 2016), Aspergillus clavatus (Damasio et al., 2014), Sporotrichum thermophile, Myceliophthora thermophila и Sporotrichum pruinosum (Krestyanova et al., 2016), Paenibacillus odorifer (Gusakov et al., 2020). Методами селекции и радиационного мутагенеза получены штаммы, синтезирующие повышенные количества ксилоглюканаз: Penicillium verruculosum (RU 2361918), Penicillium funiculosum (RU 2323254), Aspergillus aculeatus (RU 2303057). Подобным образом был получен высокоактивный штамм мицелиального гриба Aspergillus foetidus - продуцента комплекса карбогидраз, содержащего ксилоглюканазу (RU 2323973 C1).Information sources contain information about microorganisms - natural producers of xyloglucanases: Geotrichum sp. (Yaoi and Mitsuishi, 2004), Aspergillus japonicus, Chrysosporium lucknowense, Trichoderma reesei (Grishutin et al., 2004; Markov et al., 2005; Qi et al., 2013; Lopes et al., 2021), Phanerochaete chrysosporium (Ishida et al., 2007), Cellvibrio japonicus (Attia et al., 2016), Aspergillus clavatus (Damasio et al., 2014), Sporotrichum thermophile, Myceliophthora thermophila and Sporotrichum pruinosum (Krestyanova et al., 2016), Paenibacillus odorifer (Gusakov et al., 2020). Selection and radiation mutagenesis methods were used to obtain strains synthesizing increased amounts of xyloglucanases: Penicillium verruculosum (RU 2361918), Penicillium funiculosum (RU 2323254), Aspergillus aculeatus (RU 2303057). In a similar way, a highly active strain of mycelial fungus Aspergillus foetidus, a producer of a carbohydrase complex containing xyloglucanase (RU 2323973 C1), was obtained.
Описаны также полученные методами генной инженерии штаммы Escherichia coli - продуценты рекомбинантных ксилоглюканаз из Geotrichum sp. М128 (US 2004038367; Yaoi and Mitsuishi, 2002), Fusarium graminearum (Habrylo et al., 2012), Rhizomucor miehei (Song et al., 2013), Aspergillus cervinus (RU 2625013 C1), Xanthomonas citri (Feng et al., 2014), Xanthomonas campestris (de Araujo et al., 2013). В качестве реципиентов для гетерологичной экспрессии грибных ксилоглюканаз используют различные штаммы грибов: в Aspergillus oryzae экспрессированы ксилоглюканазы из Malbranchea cinnamomea (US 6500658), в Fusarium venenatum - ксилоглюканаза из Trichoderma reesei (US 2004067569 A1), в Penicillium canescens - ксилоглюканаза из Penicillium canescens (RU 2358756), в Aspergillus niger - ксилоглюканаза из Thielavia australiensis и собственная ксилоглюканаза (WO 2014138983; Hasper et al., 2002), в Aspergillus nidulans - ксилоглюканаза из Aspergillus terreus (Vitcosque et al., 2016).Also described are strains of Escherichia coli obtained by genetic engineering methods - producers of recombinant xyloglucanases from Geotrichum sp. M128 (US 2004038367; Yaoi and Mitsuishi, 2002), Fusarium graminearum (Habrylo et al., 2012), Rhizomucor miehei (Song et al., 2013), Aspergillus cervinus (RU 2625013 C1), Xanthomonas citri (Feng et al., 2014), Xanthomonas campestris (de Araujo et al., 2013). Different strains of fungi are used as recipients for the heterologous expression of fungal xyloglucanases: xyloglucanases from Malbranchea cinnamomea (US 6500658) are expressed in Aspergillus oryzae, xyloglucanase from Trichoderma reesei (US 2004067569 A1) is expressed in Fusarium venenatum, xyloglucanase from Pensillium canescenes (RU 2358756), in Aspergillus niger - xyloglucanase from Thielavia australiensis and its own xyloglucanase (WO 2014138983; Hasper et al., 2002), in Aspergillus nidulans - xyloglucanase from Aspergillus terreus (Vitcosque et al., 2016).
Также для гетерологичной экспрессии грибных ксилоглюканаз применяют отличные от Е. coli бактериальные реципиенты, например, Acidothermus cellulolyticus использован для гетерологичной экспрессии ксилоглюканаз из Acremonium sp., Cladorrhinum foecundissimum, Humicola insolens, Thielavia terrestris, Trichoderma reesei, Aspergillus aculeatus, Aspergillus aculeatus, Aspergillus fumigatus, Myceliophthora thermophila (Vlasenko et al., 2010).Also, bacterial recipients other than E. coli are used for heterologous expression of fungal xyloglucanases, for example, Acidothermus cellulolyticus is used for heterologous expression of xyloglucanases from Acremonium sp. Myceliophthora thermophila (Vlasenko et al., 2010).
Описаны также полученные методами генной инженерии штаммы дрожжей Komagataella phaffii - продуценты рекомбинантных ксилоглюканаз из Phanerochaete chrysosporium (Ishida et al., 2007), Aspergillus cervinus ВКПМ F-612 (RU 2639248 C1) и эндоксилоглюканазы Penicillium oxalicum (CN 104388406 A; Xian et al., 2016). Помимо этого, разработан метод микробиологического синтеза в Komagataella phaffii термостабильной рекомбинантной ксилоглюканазы, кодируемой синтетическим геном на основе нуклеотидной последовательности ксилоглюканазы семейства GH74 из Myceliophthora thermophila ВКПМ F-244 (RU 2605629 C1).Yeast strains Komagataella phaffii, obtained by genetic engineering, are also described as producers of recombinant xyloglucanases from Phanerochaete chrysosporium (Ishida et al., 2007), Aspergillus cervinus VKPM F-612 (RU 2639248 C1) and endoxyloglucanase Penicillium oxalicum (CN 104388406 A. Xian et al. , 2016). In addition, a method has been developed for microbiological synthesis in Komagataella phaffii of a thermostable recombinant xyloglucanase encoded by a synthetic gene based on the nucleotide sequence of xyloglucanase of the GH74 family from Myceliophthora thermophila VKPM F-244 (RU 2605629 C1).
Системы гетерологичной экспрессии на основе бактерий и микроскопических грибов имеют свои преимущества и недостатки. К недостаткам штаммов-продуцентов на основе микроскопических грибов родов Aspergillus и Penicillium относят невысокий уровень синтеза рекомбинантных ферментов по сравнению с E. coli и сложности с проведением генетических манипуляций на штаммах вследствие нестандартизированного и недостаточно разработанного генетического инструментария (Demain and Vaishnav, 2009). Метилотрофные дрожжи (Pichia, Komagataella, Hansenula) являются высокоэффективными продуцентами рекомбинантных белков. Преимуществом метилотрофных дрожжей является то, что их культуру можно выращивать в ферментерах до более высокой плотности, по сравнению с традиционно используемыми дрожжами Saccharomyces cerevisiae, что позволяет получить более высокий уровень продукции целевого белка (Gellissen, 2000). Метилотрофные дрожжи обладают одними из самых мощных в природе промоторов. В отличие от Е. coli, метилотрофные дрожжи обладают способностью ко всем характерным для эукариот посттрансляционным модификациям (гликозилирование, фосфорилирование, образование дисульфидных связей между цистеиновыми остатками, секреция рекомбинантных белков в культивационную среду). Низкий уровень секреции собственных белков существенно облегчает выделение и очистку целевого рекомбинантного продукта (Macauley-Patrick and Fazenda, 2005). Рекомбинантные белки в метилотрофных дрожжах, в отличие от Е. coli, не образуют телец включения.Heterologous expression systems based on bacteria and microscopic fungi have their own advantages and disadvantages. The disadvantages of producer strains based on microscopic fungi of the genera Aspergillus and Penicillium include a low level of synthesis of recombinant enzymes compared to E. coli and difficulties in performing genetic manipulations on strains due to non-standardized and insufficiently developed genetic tools (Demain and Vaishnav, 2009). Methylotrophic yeasts (Pichia, Komagataella, Hansenula) are highly efficient producers of recombinant proteins. The advantage of methylotrophic yeasts is that they can be cultured in fermenters to higher densities than the traditionally used Saccharomyces cerevisiae yeasts, allowing for a higher level of target protein production (Gellissen, 2000). Methylotrophic yeasts have some of the most potent promoters in nature. Unlike E. coli, methylotrophic yeasts are capable of all post-translational modifications characteristic of eukaryotes (glycosylation, phosphorylation, formation of disulfide bonds between cysteine residues, secretion of recombinant proteins into the cultivation medium). The low level of secretion of its own proteins greatly facilitates the isolation and purification of the target recombinant product (Macauley-Patrick and Fazenda, 2005). Recombinant proteins in methylotrophic yeast, in contrast to E. coli, do not form inclusion bodies.
Ближайшим аналогом заявляемого штамма является рекомбинантный штамм дрожжей Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933 - продуцент секретируемой термостабильной ксилоглюканазы семейства GH74 из Myceliophthora thermophila ВКПМ F-244, кодируемой геном mt74sin, интегрированным в хромосому P. pastor is под контролем промотора АОХ1 (RU 2605629, Berezina et al. 2017). Рекомбинантный фермент MtXgh74 является ксилоглюкан-специфической эндо-β-1,4-глюканазой с эндо-процессивным способом действия на субстрат. Деградация полимерной молекулы ксилоглюкана происходит в результате последовательного отщепления ферментом MtXgh74 структурных гепта-, окта- и нонасахаридов ксилоглюкана путем гидролиза β-1,4-гликозидной связи у незамещенных остатков основной цепи полисахарида. В результате фермент MtXgh74 эффективно осахаривает субстрат, продуцируя короткие ксилоглюкан-олигосахариды, но недостаточно эффективно снижает вязкость растворов ксилоглюкана. Снижение динамической вязкости 1% раствора КГ в процессе его гидролиза ферментом MtXgh74 при 50°С составляет 1,79 мПа⋅с в пересчете на 0,01 мкмоль образовавшихся редуцирующих концов.The closest analogue of the claimed strain is a recombinant yeast strain Komagataella phaffii VKPM Y-4933 - a producer of secreted thermostable xyloglucanase of the GH74 family from Myceliophthora thermophila VKPM F-244, encoded by the mt74sin gene integrated into the chromosome of P. pastor is under the control of the AOX1 promoter (RU 2605629, Berezina et al. 2017). The recombinant enzyme MtXgh74 is a xyloglucan-specific endo-β-1,4-glucanase with an endo-processive mode of action on the substrate. Degradation of the polymeric xyloglucan molecule occurs as a result of sequential cleavage by the enzyme MtXgh74 of the structural hepta-, octa-, and nonasaccharides of xyloglucan by hydrolysis of the β-1,4-glycosidic bond at the unsubstituted residues of the polysaccharide backbone. As a result, the MtXgh74 enzyme effectively saccharifies the substrate, producing short xyloglucan oligosaccharides, but does not effectively reduce the viscosity of xyloglucan solutions. The decrease in the dynamic viscosity of a 1% KH solution in the course of its hydrolysis with the MtXgh74 enzyme at 50°C is 1.79 mPa⋅s in terms of 0.01 μmol of the resulting reducing ends.
Ближайшим аналогом заявляемого способа микробиологического синтеза ксилоглюканазы является способ синтеза рекомбинантной секретируемой термостабильной ксилоглюканазы MtXgh74 при ферментации штамма дрожжей Komagataella phaffii ВКПМ Y-4269 (RU 2605629, Berezina et al., 2017). Активность ксилоглюканазы MtXgh74 в конце ферментации в культуральной жидкости ВКПМ Y-4269 составляла не менее 60 ед/мл.The closest analogue of the claimed method of microbiological synthesis of xyloglucanase is a method for the synthesis of recombinant secreted thermostable xyloglucanase MtXgh74 during the fermentation of the yeast strain Komagataella phaffii VKPM Y-4269 (RU 2605629, Berezina et al., 2017). The activity of MtXgh74 xyloglucanase at the end of fermentation in the culture liquid VKPM Y-4269 was at least 60 units/ml.
Задача заявляемой группы изобретений состоит в разработке способа микробиологического синтеза ксилоглюканазы на основе рекомбинантного штамма Komagataella phaffii, сочетающего высокий уровень продукции гетерологичного фермента с эндо-диссоциативным способом действия на субстрат, обеспечивающим эффективное снижение вязкости растворов ксилоглюкана и предназначенного для снижения вязкости ксилоглюкан-содержащих субстратов.The task of the claimed group of inventions is to develop a method for the microbiological synthesis of xyloglucanase based on a recombinant strain of Komagataella phaffii, which combines a high level of production of a heterologous enzyme with an endo-dissociative mode of action on the substrate, providing an effective reduction in the viscosity of xyloglucan solutions and designed to reduce the viscosity of xyloglucan-containing substrates.
Задачу решают путем:The problem is solved by:
- конструирования рекомбинантного штамма дрожжей Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933 - продуцента секретируемой термостабильной ксилоглюканазы GH74, кодируемой мутированный геном mt74sin-mut, соответствующим SEQ ID NO 1,- construction of a recombinant yeast strain Komagataella phaffii VKPM Y-4933 - a producer of secreted thermostable xyloglucanase GH74 encoded by a mutated mt74sin-mut gene corresponding to SEQ ID NO 1,
- разработки способа микробиологического синтеза ксилоглюканазы на основе рекомбинантного штамма дрожжей Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933.- development of a method for the microbiological synthesis of xyloglucanase based on the recombinant yeast strain Komagataella phaffii VKPM Y-4933.
Процесс конструирования заявляемого штамма состоит из следующих этапов:The design process of the proposed strain consists of the following steps:
- конструирования мутированного гена mt74sin-mut (SEQ ID NO 1) на основе нуклеотидной последовательности гена mt74sin, кодирующего мутантный вариант ксилоглюканазы семейства GH74 из Myceliophthora thermophila ВКПМ F-244.- construction of a mutated mt74sin-mut gene (SEQ ID NO 1) based on the nucleotide sequence of the mt74sin gene encoding a mutant variant of the GH74 family xyloglucanase from Myceliophthora thermophila VKPM F-244.
- конструирования интегративной плазмидной ДНК (плазмиды) pPIC-mt74sin-mut, содержащей ген mt74sin-mut, являющийся мутантным вариантом гена ксилоглюканазы mt74sin.- constructing an integrative plasmid DNA (plasmid) pPIC-mt74sin-mut containing the mt74sin-mut gene, which is a mutant variant of the mt74sin xyloglucanase gene.
- конструирования рекомбинантного штамма дрожжей Komagataella phaffii/mt74sin-mut, способного синтезировать ксилоглюканазу семейства GH74 с эндо-диссоциативным способом действия на субстрат.- construction of a recombinant yeast strain Komagataella phaffii/mt74sin-mut capable of synthesizing xyloglucanase of the GH74 family with an endo-dissociative mode of action on the substrate.
- разработки способа микробиологического синтеза ксилоглюканазы на основе рекомбинантного штамма дрожжей Komagataella phaffii/mt74sin-mut, сочетающего высокий уровень синтеза гетерологичной ксилоглюканазы семейства GH74 с эндо-диссоциативным способом действия на субстрат.- development of a method for the microbiological synthesis of xyloglucanase based on the recombinant yeast strain Komagataella phaffii/mt74sin-mut, which combines a high level of synthesis of heterologous xyloglucanase of the GH74 family with an endo-dissociative mode of action on the substrate.
Этап 1. Конструирование мутированного гена mt74sin-mut на основе нуклеотидной последовательности гена mt74sin, интегрированного в геном штамма Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933 и кодирующего мутантную форму ксилоглюканазы MtXgh74 с эндо-диссоциативным способом действия на субстрат.Step 1. Construction of the mutated mt74sin-mut gene based on the nucleotide sequence of the mt74sin gene integrated into the genome of the Komagataella phaffii VKPM Y-4933 strain and encoding the mutant form of MtXgh74 xyloglucanase with endo-dissociative mode of action on the substrate.
Ксилоглюканаза MtXgh74 является эндо-процессивным ферментом. Для изменения способа действия фермента на субстрат с эндо-процессивного на эндо-диссоциативный, конструируют мутантную форму MtXgh74-mut (W324A/W325A). Дизайн нуклеотидной последовательности mt74sin-mut разрабатывают на основании гена mt74sin (GenBank: KY549923.1), интегрированного в геном штамма Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933 и кодирующего ксилоглюканазу MtXgh74 из Myceliophthora thermophila ВКПМ F-244 (GenBank: ARR73955.1), (RU 2605629, Berezina et al., 2017). Введение мутаций в ген mt74syn осуществляли методом перекрывающихся ПЦР-продуктов (Overlap PCR) с использованием праймеров и гена mt74syn в качестве матрицы. Для проведения мутагенеза использованы следующие праймеры: F_mtgh74syn_BgIII - AAGAGATCTGGTACCGCTACGGC, R_mtgh74syn_XhoI - GCCCCTCGAGTTATTAATTGGCAGC, SP_II (VATLNSAA) - TAATAGCGCTGCTCCAGATGCCCAGATT, ASP_II (VATLNSAA) - ATCTGGAGCAGCGCTATTAAGGGTAG.Xyloglucanase MtXgh74 is an endo-processive enzyme. To change the way the enzyme acts on the substrate from endo-processive to endo-dissociative, a mutant form of MtXgh74-mut (W324A/W325A) is constructed. The design of the mt74sin-mut nucleotide sequence is developed based on the mt74sin gene (GenBank: KY549923.1) integrated into the genome of the Komagataella phaffii VKPM Y-4933 strain and encoding MtXgh74 xyloglucanase from Myceliophthora thermophila VKPM F-244 (GenBank: ARR73955.1), (RU 2605629, Berezina et al., 2017). The introduction of mutations in the mt74syn gene was carried out by the method of overlapping PCR products (Overlap PCR) using primers and the mt74syn gene as a template. The following primers were used for mutagenesis: F_mtgh74syn_BgIII - AAGAGATCTGGTACCGCTACGGC, R_mtgh74syn_XhoI - GCCCCTCGAGTTATTAATTGGCAGC, SP_II (VATLNSAA) - TAATAGCGCTGCTCCAGATGCCCAGATT, ASP_II (VATLNSAA) - ATCTGGAGCAGCGCTATTAAGGGTAG.
В результате получают фрагмент ДНК, содержащий мутированный ген mt74sin-mut. Корректность введенной мутации подтверждают при помощи секвенирования методом Сэнгера.The result is a DNA fragment containing the mutated mt74sin-mut gene. The correctness of the introduced mutation is confirmed by Sanger sequencing.
Этап 2. Конструирование интегративной плазмидной конструкции pPIC-mt74sin-mutStep 2. Construction of the pPIC-mt74sin-mut integrative plasmid construct
Плазмиду pPIC-mt74sin-mut конструируют путем клонирования полученного на этапе 1 фрагмента ДНК, содержащего мутированнвый ген mt74sin-mut, в вектор pPIC-101 разработанный для интеграции в штаммы Komagataella phaffii (his 4, mut+). Вектор pPIC-101 размером 7404 пары оснований содержит промотор АОХ1; терминатор АОХ1; кодирующую область гена HIS4; кодирующую область гена bla, обеспечивающего устойчивость штаммов Е. coli к ампициллину; репликон pBR-322; последовательность, кодирующую сигнальный пептид α-фактор дрожжей.Plasmid pPIC-mt74sin-mut was constructed by cloning the DNA fragment obtained in step 1 containing the mutated mt74sin-mut gene into the pPIC-101 vector designed for integration into strains of Komagataella phaffii (his 4, mut+). The 7404 base pair pPIC-101 vector contains the AOX1 promoter; terminator AOX1; the coding region of the HIS4 gene; the coding region of the bla gene, which provides resistance of E. coli strains to ampicillin; replicon pBR-322; the sequence encoding the yeast α-factor signal peptide.
Плазмида pPIC-mt74sin-mut размером 9285 пар оснований, наряду с генами вектора pPIC-101, содержит кодирующую область мутированного гена mt74sin-mut ксилоглюканазы под контролем промотора АОХ1. (Фиг. 2).The pPIC-mt74sin-mut 9285 bp plasmid, along with the pPIC-101 vector genes, contains the coding region of the mutated mt74sin-mut xyloglucanase gene under the control of the AOX1 promoter. (Fig. 2).
Этап 3. Получение рекомбинантного штамма Komagataella phajfii/mt74sin-mutStage 3. Obtaining a recombinant strain of Komagataella phajfii/mt74sin-mut
В качестве штамма-реципиента используют штамм Komagataella phaffii (his 4, mut+), не синтезирующий ксилоглюканазу. Компетентные клетки данного штамма трансформируют плазмидой pPIC-mt74sin-mut. В результате получают рекомбинантный штамм Komagataella phaffii/mt74sin-mut, способный синтезировать ксилоглюканазу семейства GH74 с эндо-диссоциативным способом действия на субстрат.The recipient strain is Komagataella phaffii (his 4, mut+), which does not synthesize xyloglucanase. Competent cells of this strain are transformed with the plasmid pPIC-mt74sin-mut. As a result, a recombinant Komagataella phaffii/mt74sin-mut strain is obtained, capable of synthesizing xyloglucanase of the GH74 family with an endo-dissociative mode of action on the substrate.
Штамм Komagataella phaffii/mt74sin-mut депонирован во Всероссийской коллекции промышленных микроорганизмов как Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933;The Komagataella phaffii/mt74sin-mut strain was deposited in the All-Russian Collection of Industrial Microorganisms as Komagataella phaffii VKPM Y-4933;
Заявляемый штамм Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933 имеет следующие морфологические и физиолого-биохимические характеристики:The claimed strain Komagataella phaffii VKPM Y-4933 has the following morphological and physiological-biochemical characteristics:
Морфологические признакиMorphological features
При культивировании при температуре 28°С в течение 48 часов на агаризованной среде YPD следующего состава (мас.%):When cultivated at a temperature of 28°C for 48 hours on YPD agar medium of the following composition (wt.%):
пептон - 2peptone - 2
дрожжевой экстракт - 1yeast extract - 1
глюкоза - 2glucose - 2
агар - 2agar - 2
вода - остальное.water is the rest.
Клетки имеют овальную форму, 3-4 мкм в диаметре; почкуются; почкование истинное, многостороннее; истинного мицелия не образуют. На агаризованной среде YPD формируются колонии светло-бежевого цвета с ровным краем, матовой поверхностью, линзовидным профилем и пастообразной консистенцией. При росте в жидкой среде YPD при 28°С в течение 24 ч культивирования - жидкость мутная, осадок белый, коагуляции не наблюдается, пристеночных пленок культура не образует.Cells are oval, 3-4 μm in diameter; bud; budding true, many-sided; do not form true mycelium. Light beige colonies with a smooth edge, matte surface, lenticular profile and pasty consistency are formed on YPD agar medium. When growing in a liquid YPD medium at 28°C for 24 hours of cultivation, the liquid is cloudy, the precipitate is white, no coagulation is observed, and the culture does not form parietal films.
Физиолого-биохимические признакиPhysiological and biochemical signs
Штамм является факультативным анаэробом. Температура роста - 20-33°С (оптимум - 28°С). рН среды культивирования - 4,8-7,4 (оптимум - 6,0). В качестве источников углерода штамм может использовать глюкозу, глицерин, метанол, олеат, сорбитол, рамнозу. Не утилизирует галактозу, ксилозу, арабинозу. В качестве источников азота штамм может использовать аминокислоты, сернокислый аммоний, азотнокислый аммоний. Существенными признаками штамма является отсутствие потребности в гистидине. Штамм Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933 синтезирует рекомбинантную секретируемую ксилоглюканазу с эндо-диссоциативным способом действия на субстрат.The strain is a facultative anaerobe. Growth temperature - 20-33°C (optimum - 28°C). pH of the cultivation medium - 4.8-7.4 (optimum - 6.0). The strain can use glucose, glycerol, methanol, oleate, sorbitol, rhamnose as carbon sources. Does not utilize galactose, xylose, arabinose. As nitrogen sources, the strain can use amino acids, ammonium sulphate, ammonium nitrate. The essential features of the strain is the absence of the need for histidine. The Komagataella phaffii VKPM Y-4933 strain synthesizes a recombinant secreted xyloglucanase with an endo-dissociative mode of action on the substrate.
Способ микробиологического синтеза ксилоглюканазы в общем видеThe method of microbiological synthesis of xyloglucanase in general
Посевной материал, представляющий собой клетки рекомбинантного штамма-продуцента, подготавливают путем инкубации в течение 15-24 часов при температуре 29°С на среде YPD при постоянной аэрации на термостатируемой качалке (250 об/мин). Затем выросшую культуру переносят в соотношении 1:200 (по объему) в среду YPgM следующего состава (мас.%):The inoculum, which is the cells of a recombinant producer strain, is prepared by incubation for 15-24 hours at a temperature of 29°C on YPD medium with constant aeration on a thermostatically controlled shaker (250 rpm). Then the grown culture is transferred in a ratio of 1:200 (by volume) to the YPgM medium of the following composition (wt.%):
пептон - 2peptone - 2
дрожжевой экстракт - 1yeast extract - 1
глицерин 0,5glycerin 0.5
метанол - 0,5methanol - 0.5
вода - остальное.water is the rest.
Процесс биосинтеза ведут в колбах Эрленмейера, содержащих 100 мл среды YPgM, в течение 62 часов в ротационном шейкере-термостате (250 об/мин), при температуре 28°С. Каждые 24 часа проводят индукцию метанолом, путем асептического добавления 50% раствора метанола в пробирки, до конечной концентрации 0,5%. По истечении 62 часов биомассу отделяют центрифугированием. Наличие рекомбинантной ксилоглюканазы в культуральной среде определяют при помощи электрофореза в полиакриламидном геле в присутствии додецилсульфата натрия с последующей зимограммой (Маниатис и др., 1984). Количественную оценку специфической активности рекомбинантной ксилоглюканазы осуществляют при помощи ДНС-метода (Miller, 1959).The process of biosynthesis is carried out in Erlenmeyer flasks containing 100 ml of YPgM medium, for 62 hours in a rotary shaker-thermostat (250 rpm), at a temperature of 28°C. Every 24 hours, an induction with methanol is carried out by aseptically adding a 50% methanol solution to the tubes, to a final concentration of 0.5%. After 62 hours, the biomass is separated by centrifugation. The presence of recombinant xyloglucanase in the culture medium is determined by polyacrylamide gel electrophoresis in the presence of sodium dodecyl sulfate followed by a zymogram (Maniatis et al., 1984). Quantification of the specific activity of recombinant xyloglucanase is carried out using the DNS method (Miller, 1959).
Уровень синтеза ксилоглюканазы заявляемым способом составляет не менее 60 ед/мл культуральной жидкости, что сопоставимо с ближайшим аналогом.The level of synthesis of xyloglucanase by the claimed method is not less than 60 U/ml of culture fluid, which is comparable to the closest analogue.
Изобретение проиллюстрировано следующими фигурами графических изображений:The invention is illustrated by the following figures of graphic images:
Фиг. 1 - Схема плазмидной ДНК pPIC-101. Плазмидный вектор pPIC-101: промотор АОХ1; терминатор АОХ1; ген HIS4; ген bla, обеспечивающий устойчивость к ампициллину (ApR).Fig. 1 - Diagram of pPIC-101 plasmid DNA. Plasmid vector pPIC-101: AOX1 promoter; terminator AOX1; HIS4 gene; the bla gene conferring resistance to ampicillin (ApR).
Фиг. 2 - Схема рекомбинантной плазмидной ДНК pPIC-mt74sin-mut. Плазмидный вектор pPIC-mt74sin-mut: промотор АОХ1; терминатор АОХ1; ген HIS4; ген bla, обеспечивающий устойчивость к ампициллину (ApR); mt74syn-mut.Fig. 2 - Scheme of recombinant plasmid DNA pPIC-mt74sin-mut. Plasmid vector pPIC-mt74sin-mut: AOX1 promoter; terminator AOX1; HIS4 gene; the bla gene conferring resistance to ampicillin (ApR); mt74syn-mut.
Пример 1. Конструирование рекомбинантной плазмидной ДНК pPIC-mt74sin-mut, содержащей синтетический ген mt74sin-mut, кодирующий ксилоглюканазу семейства GH74 с эндо-диссоциативным способом действия на субстратExample 1 Construction of pPIC-mt74sin-mut recombinant plasmid DNA containing the synthetic mt74sin-mut gene encoding the GH74 family xyloglucanase with endo-dissociative mode of action on the substrate
Все стандартные генно-инженерные и микробиологические манипуляции проводят по известным методикам (Маниатис с соавт, 1984).All standard genetic engineering and microbiological manipulations are carried out according to known methods (Maniatis et al., 1984).
Синтетический ген mt74sin-mut (SEQ ID NO 1) получают путем введения мутаций в ген mt74syn методом перекрывающихся ПЦР-продуктов.Synthetic gene mt74sin-mut (SEQ ID NO 1) is obtained by introducing mutations in the gene mt74syn method of overlapping PCR products.
Плазмиду pPIC-mt74sin-mut конструируют путем клонирования фрагмента, содержащего ген mt74sin-mut в интегративный вектор pPIC-101 (Фиг. 1).The pPIC-mt74sin-mut plasmid was constructed by cloning a fragment containing the mt74sin-mut gene into the pPIC-101 integrative vector (FIG. 1).
Гидролиз плазмиды pPIC-101 и фрагмента ДНК, содержащего ген mt74sin-mut, проводят рестриктазами BglII и XhoI (Fermentas, Латвия). Реакционную смесь очищают набором для выделения ДНК из реакционных смесей (Биосилика, Россия) согласно инструкции производителя. Лигирование проводят в реакционной смеси объемом 20 мкл, содержащей 20 нг ДНК вектора, 1,5 нг ДНК фрагмента и 5 ед. Т4 ДНК лигазы (Fermentas, Латвия), согласно методике производителя. Полученной лигазной смесью в количестве 5 мкл трансформируют компетентные клетки штамма Е. coli XL1 blue MRF' (Stratagene, США) (генотип - Δ(mcrΔ)183 Δ(mcrCB-hsdSMR-mrr)173 end A1 supE44 thi-1 recA1 gyrA96 relA1 lac [F' proAB lacIqZΔM15 Tn10 (Tetr)]). Плазмидную ДНК полученных трансформантов анализируют путем гидролиза рестриктазами BglII и XhoI. В результате отбирают клоны, содержащие BglII/XhoI фрагменты размером, равным исходному фрагменту вставки. Правильность клонирования подтверждают секвенированием каждой из рекомбинантных вставок методом Сэнгера на генетическом анализаторе ABI 3500 (Life technology, США). В результате получают рекомбинантную плазмиду pPIC-mt74sin-mut размером 9285 пар оснований, содержащую наряду с генами вектора pPIC-101, также мутированный ген mt74sin-mut, кодирующий секретируемую ксилоглюканазу семейства GH74 с эндо-диссоциативным способом действия на субстрат (SEQ ID NO 2) (Фиг. 2).Hydrolysis of plasmid pPIC-101 and a DNA fragment containing the mt74sin-mut gene was carried out with BglII and XhoI restrictases (Fermentas, Latvia). The reaction mixture was purified with a kit for DNA isolation from reaction mixtures (Biosilika, Russia) according to the manufacturer's instructions. Ligation is carried out in a 20 μl reaction mixture containing 20 ng of vector DNA, 1.5 ng of DNA fragment, and 5 units. T4 DNA ligase (Fermentas, Latvia), according to the manufacturer's method. Competent cells of E. coli XL1 blue MRF' strain (Stratagene, USA) (genotype - Δ(mcrΔ)183 Δ(mcrCB-hsdSMR-mrr)173 end A1 supE44 thi-1 recA1 gyrA96 relA1 lac [F'proAB lacIqZΔM15 Tn10 (Tetr)]). Plasmid DNA obtained transformants analyzed by digestion with restrictases BglII and XhoI. As a result, clones containing BglII/XhoI fragments with a size equal to the original fragment of the insert are selected. The correctness of cloning is confirmed by sequencing each of the recombinant inserts by the Sanger method on an ABI 3500 genetic analyzer (Life technology, USA). As a result, a recombinant plasmid pPIC-mt74sin-mut with a size of 9285 base pairs is obtained, which, along with the genes of the pPIC-101 vector, also contains a mutated mt74sin-mut gene encoding a secreted xyloglucanase of the GH74 family with an endo-dissociative mode of action on the substrate (SEQ ID NO 2) (Fig. 2).
Пример 2. Получение заявляемого штамма Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933 - продуцента эндо-диссоциативной ксилоглюканазы семейства GH74Example 2. Obtaining the claimed strain Komagataella phaffii VKPM Y-4933 - producer of endo-dissociative xyloglucanase of the GH74 family
С целью получения рекомбинантного штамма Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933 - продуцента ксилоглюканазы, клетки штамма Komagataella phaffii GS115 (his 4, mut+) (Invitrogen) трансформируют плазмидой pPIC-mt74sin-mut. Трансформацию проводят 5 мг линеаризованной плазмидной ДНК, для получения которой исходную плазмиду обрабатывают эндонуклеазой рестрикции MluI.In order to obtain a recombinant strain of Komagataella phaffii VKPM Y-4933, a xyloglucanase producer, cells of the Komagataella phaffii GS115 (his 4, mut+) (Invitrogen) strain were transformed with the plasmid pPIC-mt74sin-mut. Transformation is carried out with 5 mg of linearized plasmid DNA, to obtain which the original plasmid is treated with restriction endonuclease MluI.
Культуру дрожжей штамма Komagataella phaffii GS115 (his 4, mut+) выращивают на среде YPD, в аэробных условиях (250 об/мин) до оптической плотности 1-2 единицы. Клетки биомассы, отделенные центрифугированием при 3000g в течение 5 минут, ресуспендируют в буфере, содержащем 1 мМ дитиотрейтол и 100 мМ HEPES, затем инкубируют на шейкере в течение 30 минут и после двукратного промывания холодной деионизированной водой ресуспендируют в 1 мл 1 М сорбитола. Суспензию разделяют на аликвоты по 40 мкл. Электропорацию проводят на приборе GenePulser Xcell (Biorad) в кюветах с зазором 2 мм при 1500 В, 25 мкФ, 600 Ом. После электропорации быстро добавляют 1 мл холодного раствора 1 М сорбитола, инкубируют 1 час при температуре 30°С и высевают на селективную среду для отбора трансформантов. Отбор трансформантов проводят на минимальной среде М9, содержащей (мас.%):The culture of yeast strain Komagataella phaffii GS115 (his 4, mut+) is grown on YPD medium, under aerobic conditions (250 rpm) to an optical density of 1-2 units. Biomass cells separated by centrifugation at 3000g for 5 minutes are resuspended in a buffer containing 1 mM dithiothreitol and 100 mM HEPES, then incubated on a shaker for 30 minutes and, after washing twice with cold deionized water, resuspended in 1 ml of 1 M sorbitol. The suspension is divided into aliquots of 40 μl. Electroporation is carried out on a GenePulser Xcell (Biorad) in cuvettes with a gap of 2 mm at 1500 V, 25 μF, 600 Ohm. After electroporation, 1 ml of a cold solution of 1 M sorbitol is quickly added, incubated for 1 hour at 30°C, and plated on a selective medium for selection of transformants. The selection of transformants is carried out on the minimum medium M9 containing (wt.%):
КН2РО4 - 0,1KN 2 RO 4 - 0.1
MgSO4 - 0,05MgSO 4 - 0.05
NaCl - 0,01NaCl - 0.01
CaCl2 - 0,01CaCl 2 - 0.01
(NH4)2SO4 - 0,35(NH4) 2 SO4 - 0.35
глюкоза - 2glucose - 2
тиамин - 0,02thiamine - 0.02
рибофлавин - 0,02riboflavin - 0.02
никотиновая кислота - 0,02nicotinic acid - 0.02
п-аминобензойная кислота - 0,02p-aminobenzoic acid - 0.02
пантотенат кальция - 0,02calcium pantothenate - 0.02
биотин - 0,0002biotin - 0.0002
пиридоксин - 0,02pyridoxine - 0.02
инозит - 1inositol - 1
фолиевая кислота - 0,02folic acid - 0.02
вода - остальное.water is the rest.
Клетки инкубируют при 29°С в течение 3 суток. Трансформанты выявляют методом ПЦР-скрининга. В результате получают заявляемый штамм Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933, продуцирующий секретируемую ксилоглюканазу с эндо-диссоциативным способом действия на субстрат.Cells are incubated at 29°C for 3 days. Transformants are detected by PCR screening. The result is the claimed strain Komagataella phaffii VKPM Y-4933, which produces a secreted xyloglucanase with an endo-dissociative mode of action on the substrate.
Пример 3. Микробиологический синтез термостабильной секретируемой ксилоглюканазы заявляемым штаммом Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933Example 3. Microbiological synthesis of thermostable secreted xyloglucanase by the claimed strain Komagataella phaffii VKPM Y-4933
Посевной материал выращивают путем инкубации клеток штамма Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933 в течение 15-24 часов при температуре 29°С на среде YPD при постоянной аэрации (250 об/мин). Среду YPgM засевают подготовленным посевным материалом и ведут процесс биосинтеза в аэробных условиях при температуре 28°С, проводя индукцию метанолом.The inoculum is grown by incubating the cells of the strain Komagataella phaffii VKPM Y-4933 for 15-24 hours at a temperature of 29°C on YPD medium with constant aeration (250 rpm). The YPgM medium is inoculated with the prepared inoculum and the biosynthesis process is carried out under aerobic conditions at a temperature of 28°C, by induction with methanol.
Уровень синтеза ксилоглюканазы заявляемым способом составляет не менее 60 Ед/мл, что сопоставимо с таковым у ближайшего аналога - штамма Komagataella phaffii ВКПМ Y-4269. При инкубации препарата фермента в течение часа при 50°С, рН 5.0 сохраняется 100% ферментативной активности, что не уступает ближайшему аналогу.The level of synthesis of xyloglucanase by the claimed method is not less than 60 U/ml, which is comparable to that of the closest analogue - Komagataella phaffii strain VKPM Y-4269. When the enzyme preparation is incubated for an hour at 50°C, pH 5.0, 100% of enzymatic activity is retained, which is not inferior to the closest analogue.
Конечными продуктами гидролиза КГ ферментом MtXgh74-mut являются олигоксилоглюканы различной длины, в то время как конечными продуктами гидролиза КГ ближайшим аналогом MtXgh74 являются «строительные блоки» КГ (XXXG, XXLG, XLXG и XLLG).The end products of CG hydrolysis by the MtXgh74-mut enzyme are oligoxyloglucans of various lengths, while the end products of CG hydrolysis with the closest analog of MtXgh74 are the building blocks of CG (XXXG, XXLG, XLXG, and XLLG).
Кинетические константы Vmax и kcat для MtXgh74-mut составляют 76 Ед/мг белка и 97 с-1, что превышает данные показатели для ближайшего аналога, ксилоглюканазы MtXgh74 (44 Ед/мг белка и 56 с-1, соответственно). Кинетическая константа Km для MtXgh74-mut и ближайшего аналога MtXgh74 составляет 24 и 0,45 мг КГ в мл, соответственно, что объясняет различие в способе действия ферментов на субстрат: эндо-диссоциатитвный для MtXgh74-mut и эндо-процессивный для MtXgh74.The kinetic constants V max and k cat for MtXgh74-mut are 76 U/mg protein and 97 s -1 , which exceeds the data for the closest analogue, MtXgh74 xyloglucanase (44 U/mg protein and 56 s -1 , respectively). The kinetic constant K m for MtXgh74-mut and the closest analog MtXgh74 is 24 and 0.45 mg Kg/mL, respectively, which explains the difference in the way the enzymes act on the substrate: endo-dissociative for MtXgh74-mut and endo-processive for MtXgh74.
Снижение динамической вязкости 1% раствора КГ в процессе его гидролиза эндо-диссоциативной ксилоглюканазой MtXgh74-mut при 50°С составляет 3,55 мПа⋅с в пересчете на 0,01 мкмоль образовавшихся редуцирующих концов, что в два раза превышает это значение для ближайшего аналога - эндо-процессивной ксилоглюканазы MtXgh74 (1,79 мПа⋅с в пересчете на 0,01 мкмоль образовавшихся редуцирующих концов).The decrease in the dynamic viscosity of a 1% solution of CG during its hydrolysis with endo-dissociative xyloglucanase MtXgh74-mut at 50°C is 3.55 mPa⋅s in terms of 0.01 µmol of the resulting reducing ends, which is two times higher than this value for the closest analogue - endo-processive xyloglucanase MtXgh74 (1.79 mPa⋅s in terms of 0.01 μmol of the formed reducing ends).
Таким образом, получен рекомбинантный штамм дрожжей Komagataella phaffii ВКПМ Y-4933, способный к биосинтезу секретируемой эндо-диссоциативной ксилоглюканазы семейства GH74, кодируемой мутированным геном. При культивировании заявляемым способом уровень синтеза целевого продукта у заявляемого штамма сопоставим с таковым у ближайшего аналога, но в отличие от ближайшего аналога, продуцируемый фермент является является эндо-диссоциативной ксилоглюканазой и эффективно снижает вязкость растворов ксилоглюкана.Thus, a recombinant yeast strain Komagataella phaffii VKPM Y-4933 was obtained, capable of biosynthesis of the secreted endo-dissociative xyloglucanase of the GH74 family encoded by the mutated gene. When cultivated by the claimed method, the level of synthesis of the target product in the claimed strain is comparable to that of the closest analogue, but unlike the closest analogue, the produced enzyme is an endo-dissociative xyloglucanase and effectively reduces the viscosity of xyloglucan solutions.
Источники информацииInformation sources
1. Berezina OV, Herlet J, Rykov SV, Kornberger P, Zavyalov A, Kozlov D, Sakhibgaraeva L, Krestyanova I, Schwarz WH, Zverlov VV, Liebl W, Yarotsky SV. Thermostable multifunctional GH74 xyloglucanase from Myceliophthora thermophila: high-level expression in Komagataella phaffii and characterization of the recombinant protein. Appl Microbiol Biotechnol. 2017 Jul; 101 (14): 5653-5666. doi: 10.1007/s00253-017-8297-2.1. Berezina OV, Herlet J, Rykov SV, Kornberger P, Zavyalov A, Kozlov D, Sakhibgaraeva L, Krestyanova I, Schwarz WH, Zverlov VV, Liebl W, Yarotsky SV. Thermostable multifunctional GH74 xyloglucanase from Myceliophthora thermophila: high-level expression in Komagataella phaffii and characterization of the recombinant protein. Appl Microbiol Biotechnol. 2017 Jun; 101(14): 5653-5666. doi: 10.1007/s00253-017-8297-2.
2. RU 2605629 // Рекомбинантный штамм дрожжей Komagataella phaffii - продуцент секретируемой термостабильной ксилоглюканазы, кодируемой синтетическим геном, и способ микробиологического синтеза секретируемой термостабильной ксилоглюканазы на основе этого штамма // Дата приоритета: 16.12.2015.2. RU 2605629 // Recombinant yeast strain Komagataella phaffii - producer of secreted thermostable xyloglucanase encoded by a synthetic gene, and method for microbiological synthesis of secreted thermostable xyloglucanase based on this strain // Priority date: 12/16/2015.
3. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж., Молекулярное клонирование, М.: Мир, 1984; Клонирование ДНК. Методы. Под ред. Д. Гловера, Пер. с англ., Москва, Мир, 1988.3. Maniatis T., Fritsch E., Sambrook J., Molecular cloning, M.: Mir, 1984; DNA cloning. Methods. Ed. D. Glover, Trans. from English, Moscow, Mir, 1988.
4. Fry SC, York WS, Albersheim P, Darvill A, Hayashi T, Joseleau JP, Kato Y, Lorences EP, Maclachlan GA, McNeil M, Mort AJ, Reid JSG, Seitz HU, Selvendran RR, Voragen AGJ, White AR (1993) An unambiguous nomenclature for xyloglucan-derived oligosaccharides. Physiol Plant, 89 (1): 1-3. doi: 10.1111/j.1399-3054.1993.tb01778.x.4. Fry SC, York WS, Albersheim P, Darvill A, Hayashi T, Joseleau JP, Kato Y, Laurences EP, Maclachlan GA, McNeil M, Mort AJ, Reid JSG, Seitz HU, Selvendran RR, Voragen AGJ, White AR ( 1993) An unambiguous nomenclature for xyloglucan-derived oligosaccharides. Physiol Plant, 89(1): 1-3. doi: 10.1111/j.1399-3054.1993.tb01778.x.
5. Demain AL, Vaishnav P. // Production of recombinant proteins by microbes and higher organisms // Biotechnol Adv., 2009.5. Demain AL, Vaishnav P. // Production of recombinant proteins by microbes and higher organisms // Biotechnol Adv., 2009.
6. Grishutin S.G., Gusakov A.V., Markov A.V., Ustinov B.B., Semenova M.V., Sinitsyn A.P. // Specific xyloglucanases as a new class of polysaccharide-degrading enzymes.// Biochim Biophys Acta, 2004.6. Grishutin S.G., Gusakov A.V., Markov A.V., Ustinov B.B., Semenova M.V., Sinitsyn A.P. // Specific xyloglucanases as a new class of polysaccharide-degrading enzymes.// Biochim Biophys Acta, 2004.
7. Habrylo O., Song X., Forster A., Jeltsch J.M., Phalip V. // Characterization of the four GH12 Endoxylanases from the plant pathogen Fusarium graminearum. // J. Microbiol Biotechnol., 2012.7. Habrylo O., Song X., Forster A., Jeltsch J.M., Phalip V. // Characterization of the four GH12 Endoxylanases from the plant pathogen Fusarium graminearum. // J. Microbiol Biotechnol., 2012.
8. Hasper A.A., Dekkers E., van Mil M., van de Vondervoort P.J., de Graaff L.H. // EglC, a new endoglucanase from Aspergillus niger with major activity towards xyloglucan. // Appl Environ Microbiol., 2002.8. Hasper A.A., Dekkers E., van Mil M., van de Vondervoort P.J., de Graaff L.H. // EglC, a new endoglucanase from Aspergillus niger with major activity towards xyloglucan. // Appl Environ Microbiol., 2002.
9. Ishida Т., Yaoi K., Hiyoshi A., Igarashi K., Samejima M. // Substrate recognition by glycoside hydrolase family 74 xyloglucanase from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium. // FEBS J., 2007.9. Ishida T., Yaoi K., Hiyoshi A., Igarashi K., Samejima M. // Substrate recognition by glycoside hydrolase family 74 xyloglucanase from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium. // FEBS J., 2007.
10. Markov A.V., Gusakov A.V., Kondratyeva E.G., Okunev O.N., Bekkarevich A.O., Sinitsyn A.P. // New effective method for analysis of the component composition of enzyme complexes from Trichoderma reesei. // Biochemistry (Mosc), 2005.10. Markov A.V., Gusakov A.V., Kondratyeva E.G., Okunev O.N., Bekkarevich A.O., Sinitsyn A.P. // New effective method for analysis of the component composition of enzyme complexes from Trichoderma reesei. // Biochemistry (Mosc), 2005.
11. Miller, G.L. // Use of dinitrosalicylic acid reagent for determination of reducing sugar // Analytical Chemistry. 1959.11. Miller, G.L. // Use of dinitrosalicylic acid reagent for determination of reducing sugar // Analytical Chemistry. 1959.
12. Qi H., Bai F., Liu A.// Purification and characteristics of xyloglucanase and five other cellulolytic enzymes from Trichoderma reesei QM9414. // Biochemistry (Mosc), 2013.12. Qi H., Bai F., Liu A.// Purification and characteristics of xyloglucanase and five other cellulolytic enzymes from Trichoderma reesei QM9414. // Biochemistry (Mosc), 2013.
13. Yaoi K., Mitsuishi Y.// Purification, characterization, cloning, and expression of a novel xyloglucan-specific glycosidase, oligoxyloglucan reducing end-specific cellobiohydrolase.// J Biol Chem., 2002.13. Yaoi K., Mitsuishi Y.// Purification, characterization, cloning, and expression of a novel xyloglucan-specific glycosidase, oligoxyloglucan reducing end-specific cellobiohydrolase.// J Biol Chem., 2002.
14. Yaoi K., Mitsuishi Y. // Purification, characterization, cDNA cloning, and expression of a xyloglucan endoglucanase from Geotrichum sp. M128. // FEBS Lett., 2004.14. Yaoi K., Mitsuishi Y. // Purification, characterization, cDNA cloning, and expression of a xyloglucan endoglucanase from Geotrichum sp. M128. // FEBS Lett., 2004.
15. Song S., Tang Y., Yang S., Yan Q., Zhou P., Jiang Z. // Characterization of two novel family 12 xyloglucanases from the thermophilic Rhizomucor miehei. // Appl Microbiol Biotechnol., 2013.15. Song S., Tang Y., Yang S., Yan Q., Zhou P., Jiang Z. // Characterization of two novel family 12 xyloglucanases from the thermophilic Rhizomucor miehei. // Appl Microbiol Biotechnol., 2013.
16. Vlasenko E., M., Cherry J., Xu F. // Substrate specificity of family 5, 6, 7, 9, 12, and 45 endoglucanases. // Bioresour Technol., 2010.16. Vlasenko E., M., Cherry J., Xu F. // Substrate specificity of family 5, 6, 7, 9, 12, and 45 endoglucanases. // Bioresour Technol., 2010.
17. Macauley-Patrick S, Fazenda ML (2005) Heterologous protein production using the Komagataella phaffii expression system. Yeast 22: 249-270.17. Macauley-Patrick S, Fazenda ML (2005) Heterologous protein production using the Komagataella phaffii expression system. Yeast 22: 249-270.
18. Gellissen G (2000) Heterologous protein production in methylotrophic yeasts. Appl. Microbiol. Biotechnol. 54(6): 741-750.18. Gellissen G (2000) Heterologous protein production in methylotrophic yeasts. Appl. microbiol. Biotechnol. 54(6): 741-750.
19. RU 2358756 // Способ получения ферментного препарата для расщепления гемицеллюлозных гетерополисахаридов клеточной стенки растений и ферментный препарат (варианты) // Дата приоритета: 26.11.2007.19. RU 2358756 // Method for obtaining an enzyme preparation for the cleavage of hemicellulose heteropolysaccharides of the plant cell wall and an enzyme preparation (options) // Priority date: 26.11.2007.
20. RU 2303057 // Штамм мицелиального гриба Aspergillus aculeatus - продуцент комплекса карбогидраз, содержащего ксиланазы, бета-глюканазы, пектиназы и ксилоглюканазы // Дата приоритета: 14.11.2005.20. RU 2303057 // Strain of mycelial fungus Aspergillus aculeatus - producer of carbohydrase complex containing xylanases, beta-glucanases, pectinases and xyloglucanases // Priority date: 11/14/2005.
21. RU 2323254 // Штамм мицелиального гриба Penicillium funiculosum - продуцент комплекса карбогидраз, содержащего целлюлазы, глюканазы, глюкозидазы, ксиланазы и ксилоглюканазы, и способ получения ферментного препарата комплекса карбогидраз для осахаривания лигноцеллюлозных материалов // Дата приоритета: 04.04.2006.21. RU 2323254 // Strain of the filamentous fungus Penicillium funiculosum - producer of a complex of carbohydrases containing cellulases, glucanases, glucosidases, xylanases and xyloglucanases, and a method for obtaining an enzyme preparation of the carbohydrase complex for saccharification of lignocellulosic materials // Priority date: 04.04.2006.
22. RU 2361918 // Штамм мицелиального гриба Penicillium verruculosum - продуцент комплекса целлюлаз, ксиланазы и ксилоглюканазы и способ получения ферментного препарата комплекса целлюлаз, ксиланазы и ксилоглюканазы для гидролиза целлюлозы и гемицеллюлозы // Дата приоритета: 26.02.2008.22. RU 2361918 // A strain of mycelial fungus Penicillium verruculosum - a producer of a complex of cellulases, xylanase and xyloglucanase and a method for obtaining an enzyme preparation of a complex of cellulases, xylanase and xyloglucanase for the hydrolysis of cellulose and hemicellulose // Priority date: 26.02.2008.
23. US 6500658 // Xyloglucanase from Malbranchea // Priority date: US 20000653778 20000901; WO 2000DK00450 20000811; US 19990149397 P 19990817.23. US 6500658 // Xyloglucanase from Malbranchea // Priority date: US 20000653778 20000901; WO 2000DK00450 20000811; US 19990149397 P 19990817.
24. US 2004038367 // Novel xyloglucan oligosaccharide-degrading enzyme, polynucleotide encoding the enzyme, and method of preparing the enzyme // Priority date: JP 20020083433 20020325.24. US 2004038367 // Novel xyloglucan oligosaccharide-degrading enzyme, polynucleotide encoding the enzyme, and method of preparing the enzyme // Priority date: JP 20020083433 20020325.
25. US 2004067569 A1 // Polypeptides having xyloglucanase activity and nucleic acids encoding same // Priority date: US 20030420191 20030418; US 20020373987 P 20020419.25. US 2004067569 A1 // Polypeptides having xyloglucanase activity and nucleic acids encoding same // Priority date: US 20030420191 20030418; US20020373987 P20020419.
26. WO 2014138983 A1 // Novel cell wall deconstruction enzymes of Malbranchea cinnamomea, Thielavia australiensis, and Paecilomyces byssochlamydoides, and uses thereof // Priority date: US 201361783222 P 20130314; US 201361783313 P 20130314; US 201361783485 P 20130314.26. WO 2014138983 A1 // Novel cell wall deconstruction enzymes of Malbranchea cinnamomea, Thielavia australiensis, and Paecilomyces byssochlamydoides, and uses thereof // Priority date: US 201361783222 P 20130314; US201361783313 P20130314; US201361783485 P20130314.
--->--->
Перечень последовательностейSequence listing
<110> Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный<110> Federal State Budgetary Institution "State
научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных Research Institute of Genetics and Selection of Industrial
микроорганизмов Национального Исследовательского Центра microorganisms of the National Research Center
«Курчатовский Институт» "Kurchatov Institute"
<120> Рекомбинантный штамм дрожжей Komagataella phaffii – продуцент<120> Recombinant yeast strain Komagataella phaffii - producer
секретируемой эндо-диссоциативной ксилоглюканазы семейства GH74, secreted endo-dissociative xyloglucanase of the GH74 family,
кодируемой мутированным геном, и способ микробиологического синтеза encoded by a mutated gene, and a method for microbiological synthesis
секретируемой эндо-диссоциативной ксилоглюканазы на основе этого штамма secreted endo-dissociative xyloglucanase based on this strain
<160> 2<160> 2
<170> PatentIn version 3.1<170> PatentIn version 3.1
<210> 1<210> 1
<211> 2336<211> 2336
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial sequence: mt74syn-mut <213> Artificial sequence: mt74syn-mut
<220><220>
<221> gene<221> gene
<222> (37)..(2242)<222> (37)..(2242)
<223> mt74syn-mut<223> mt74syn-mut
<400> 1<400> 1
agtgcaccaa ttggtcgacc tcgagttaat taacgtaaga tctggtaccg ctacggcttg 60 agtgcaccaa ttggtcgacc tcgagttaat taacgtaaga tctggtaccg ctacggcttg 60
gaagaatgtc aacattggag gcggtggtgg ttttgtccca ggtataatct ttcaccctaa 120gaagaatgtc aacattggag gcggtggtgg ttttgtccca ggtataatct ttcaccctaa 120
agagaagggt gttgcctatg ctagaactga cataggaggc ttgtacagac tgaacccaga 180agagaagggt gttgcctatg ctagaactga cataggaggc ttgtacagac tgaacccaga 180
tgatgactct tggacaccat tgacggataa tttgggcact aatgagaagt ggggaagatg 240tgatgactct tggacaccat tgacggataa tttgggcact aatgagaagt ggggaagatg 240
gggtattgac gcagttgcag ttgatccgca agatgctgac agagtctacg ctgctgtagg 300gggtattgac gcagttgcag ttgatccgca agatgctgac agagtctacg ctgctgtagg 300
catgtataca aacgattggg accccaatcc aggctctatt atccgtagtt ctgatcgagg 360 catgtataca aacgattggg accccaatcc aggctctatt atccgtagtt ctgatcgagg 360
agctacatgg gaggttaccg aattaccctt caaagtggga ggtaatatgc ctggaagagg 420agctacatgg gaggttaccg aattaccctt caaagtggga ggtaatatgc ctggaagagg 420
tatgggtgag agattggctg tagatcctgc caacagtgac atcttgttct ttggtgctag 480 tatgggtgag agattggctg tagatcctgc caacagtgac atcttgttct ttggtgctag 480
gtctggtaat ggtctgtgga agtctgcaga cggaggtgtt acttgggcaa gagtagaatc 540gtctggtaat ggtctgtgga agtctgcaga cggaggtgtt acttgggcaa gagtagaatc 540
cttcaccaat gtcggaactt atgctcctga cccatctgat gctaccggtt tgaactctga 600cttcaccaat gtcggaactt atgctcctga cccatctgat gctaccggtt tgaactctga 600
cttgataggt ctgacttttg ttaccttcga ttcgacttca aacgttgttg gtggagcaac 660660
ttcccgtata tttgtcggta ctgcagacaa caagactgca tcggtttacg tttccgagga 720ttcccgtata tttgtcggta ctgcagacaa caagactgca tcggtttacg tttccgagga 720
tgctggagcc acatggaaac cagtagaagg acaaccaggt gcattctttc ctcacaaatg 780tgctggagcc acatggaaac cagtagaagg acaaccaggt gcattctttc ctcacaaatg 780
cgtgttgcaa ccagaggaaa aggccctata tctatcctat tctaatggag ctggccctta 840cgtgttgcaa ccagaggaaa aggccctata tctatcctat tctaatggag ctggccctta 840
tgacggaacg ttgggagctg tctaccgata cgatttggct gcacgaacct ggacggacat 900 tgacggaacg ttgggagctg tctaccgata cgatttggct gcacgaacct ggacggacat 900
cacaccagct tcaggagggg acctttactt tgggttcggt ggactatcag ttgacttgag 960cacaccagct tcaggagggg acctttactt tgggttcggt ggactatcag ttgacttgag 960
gaaacccggt actcttatgg tagctaccct taatagctgg tggccagatg cccagattta 1020gaaacccggt actcttatgg tagctaccct taatagctgg tggccagatg cccagattta 1020
cagaagtacg gattcgggcg ccacatggag taagatttgg gagtgggctg cttacccgga 10801080
tatgaactgg tactacggtt tgtacacaga caaagcccct tggataaacg ccggtttcat 1140 tgtacacaga caaagcccct tggataaacg ccggtttcat 1140
ctctcaggac accaaaagac tgggttggat gattgaggca ttagagattg acccacatga 1200ctctcaggac acccacatga tgggttggat gattgaggca ttagagattg acccacatga 1200
ttccgatcac tggctatatg gcaccggtct aactttgtat ggtggtcatg accttaccaa 1260ttccgatcac tggctatatg gcaccggtct aactttgtat ggtggtcatg accttaccaa 1260
atgggataca gttacaagga acgttactat ttccagcctt gctgctggaa ttgaagaaat 1320atgggataca gttacaagga acgttactat ttccagcctt gctgctggaa ttgaagaaat 1320
ggctgtctta ggcttagcat ctccacctaa tggaagtgaa ctgctggctg ctgttggtga 1380ggctgtctta ggcttagcat ctccacctaa tggaagtgaa ctgctggctg ctgttggtga 1380
tgactgtgga ttcacttttc gtgaatctca ggatttaggt acgtcaccgc aaaccccttg 1440tgactgtgga ttcacttttc gtgaatctca ggatttaggt acgtcaccgc aaaccccttg 1440
gatgaatcct atttggactt caactactga tgtggattat gccggaaacg aacccgacca 1500gatgaatcct atttggactt caactactga tgtggattat gccggaaacg aacccgacca 1500
tgttgtgaga gtcggtaatt ctcaaggtgc acctcaagta gctgtttcgg aagatggtgg 1560tgttgtgaga gtcggtaatt ctcaaggtgc acctcaagta gctgtttcgg aagatggtgg 1560
agtaacttgg tcagcacatc caggggcaga cgggaccacc aacagtggaa ctttagcata 1620 agtaacttgg tcagcacatc caggggcaga cgggaccacc aacagtggaa ctttagcata 1620
ttcagccgat gccgatacta tcgtctggag ttcaggttcc gcaggggtgc tgaggtccca 1680ttcagccgat gccgatacta tcgtctggag ttcaggttcc gcaggggtgc tgaggtccca 1680
aaaccaggga gcttttgctg ctgtcgggtc tttgccaagc ggcgccacag tggctgccga 1740 aaaccaggga gcttttgctg ctgtcgggtc tttgccaagc ggcgccacag tggctgccga 1740
tagaagaaat aacacagtct tttacgctgc aagtggagct tccttttaca gatccactga 1800tagaagaaat aacacagtct tttacgctgc aagtggagct tccttttaca gatccactga 1800
cactggcgcc acatttgcca aagttgccag cgcctttgga tcgaaggttg ccgctgtcaa 1860cactggcgcc acatttgcca aagttgccag cgcctttgga tcgaaggttg ccgctgtcaa 1860
ggctattgct gcacatcccg tggttgctgg agaagtatgg gttgccactg acgctggatt 1920ggctattgct gcacatcccg tggttgctgg agaagtatgg gttgccactg acgctggatt 1920
gttccgttcc atcgattatg gggccacttt ctctgctgct tctggttcca ttaccgatgc 1980gttccgttcc atcgattatg gggccacttt ctctgctgct tctggttcca ttaccgatgc 1980
aattcaggtg tctttaggaa aaggagatgg ttcagcttgg aacgtgtacg tatttgggac 2040 aattcaggtg tctttaggaa aaggagatgg ttcagcttgg aacgtgtacg tatttgggac 2040
cggtcctgaa gggaccaagt tgtatgcaag cgctgatgaa ggtgccacat gggtggatat 2100cggtcctgaa gggaccaagt tgtatgcaag cgctgatgaa ggtgccacat gggtggatat 2100
ccaaggagag cagggcttcg gttctttgtc agctaacaga cttgttggtt caggaaatgt 2160ccaaggagag cagggcttcg gttctttgtc agctaacaga cttgttggtt caggaaatgt 2160
ggctggtcaa gtctacgttg gcacaaatgg tagaggtgtt ttctatgcaa aggttagtct 2220ggctggtcaa gtctacgttg gcacaaatgg tagaggtgtt ttctatgcaa aggttagtct 2220
ttctgctgct gccaattaat aactcgaggt gggcgatcgc tctagagcta gcgaattcct 2280ttctgctgct gccaattaat aactcgaggt gggcgatcgc tctagagcta gcgaattcct 2280
gtgtgaaatt gttatccgct cacaattcca cacaacatac gagccggaag cataaa 2336gtgtgaaatt gttatccgct cacaattcca cacaacatac gagccggaag cataaa 2336
////
<210> 2<210> 2
<211> 9285<211> 9285
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial sequence: pPIC-mt74sin-mut <213> Artificial sequence: pPIC-mt74sin-mut
<220><220>
<221> promoter <221> promoter
<222> (6100)..( 6834)<222> (6100)..( 6834)
<223> AOX1<223> AOX1
<224> gene<224> gene
<225> (585)..(3119)<225> (585)..(3119)
<226> HIS4, complement<226> HIS4, complement
<227> terminator<227> terminator
<228> (6)..( 356)<228> (6)..( 356)
<229> AOX1ter<229>AOX1ter
<230> gene<230> gene
<231> (4627)..( 5487)<231> (4627)..( 5487)
<232> ApR, complement<232> ApR, complement
<233> gene<233> gene
<234> (7071)..( 9284)<234> (7071)..( 9284)
<235> mt74sin-mut, complement<235> mt74sin-mut, complement
<400> 1<400> 1
tcgaggggcc gcgaattaat tcgccttaga catgactgtt cctcagttca agttgggcac 60tcgaggggcc gcgaattaat tcgccttaga catgactgtt cctcagttca agttgggcac 60
ttacgagaag accggtcttg ctagattcta atcaagagga tgtcagaatg ccatttgcct 120ttacgagaag accggtcttg ctagattcta atcaagagga tgtcagaatg ccatttgcct 120
gagagatgca ggcttcattt ttgatacttt tttatttgta acctatatag tataggattt 180gagagatgca ggcttcattt ttgatacttt tttatttgta acctatatag tataggattt 180
tttttgtcat tttgtttctt ctcgtacgag cttgctcctg atcagcctat ctcgcagctg 240tttttgtcat tttgtttctt ctcgtacgag cttgctcctg atcagcctat ctcgcagctg 240
atgaatatct tgtggtaggg gtttgggaaa atcattcgag tttgatgttt ttcttggtat 300atgaatatct tgtggtaggg gtttgggaaa atcattcgag tttgatgttt ttcttggtat 300
ttcccactcc tcttcagagt acagaagatt aagtgagaag ttcgtttgtg caagctatcg 360ttcccactcc tcttcagagt acagaagatt aagtgagaag ttcgtttgtg caagctatcg 360
tccattccga cagcatcgcc agtcactatg gcgtgctgct agcgctatat gcgttgatgc 420tccattccga cagcatcgcc agtcactatg gcgtgctgct agcgctatat gcgttgatgc 420
aatttctatg cgcacccgtt ctcggagcac tgtccgaccg ctttggccgc cgcccagtcc 480aatttctatg cgcacccgtt ctcggagcac tgtccgaccg ctttggccgc cgcccagtcc 480
tgctcgcttc gctacttgga gccactatcg actacgcgat catggcgacc acacccgtcc 540tgctcgcttc gctacttgga gccactatcg actacgcgat catggcgacc acacccgtcc 540
tgtggatcta tcgaatctaa atgtaagtta aaatctctaa ataattaaat aagtcccagt 600tgtggatcta tcgaatctaa atgtaagtta aaatctctaa ataattaaat aagtcccagt 600
ttctccatac gaaccttaac agcattgcgg tgagcatcta gaccttcaac agcagccaga 660ttctccatac gaaccttaac agcattgcgg tgagcatcta gaccttcaac agcagccaga 660
tccatcactg cttggccaat atgtttcagt ccctcaggag ttacgtcttg tgaagtgatg 720tccatcactg cttggccaat atgtttcagt ccctcaggag ttacgtcttg tgaagtgatg 720
aacttctgga aggttgcagt gttaactccg ctgtattgac gggcatatcc gtacgttggc 780aacttctgga aggttgcagt gttaactccg ctgtattgac gggcatatcc gtacgttggc 780
aaagtgtggt tggtaccgga ggagtaatct ccacaactct ctggagagta ggcaccaaca 840aaagtgtggt tggtaccgga ggagtaatct ccacaactct ctggagagta ggcaccaaca 840
aacacagatc cagcgtgttg tacttgatca acataagaag aagcattctc gatttgcagg 900aacacagatc cagcgtgttg tacttgatca acataagaag aagcattctc gatttgcagg 900
atcaagtgtt caggagcgta ctgattggac atttccaaag cctgctcgta ggttgcaacc 960atcaagtgtt caggagcgta ctgattggac atttccaaag cctgctcgta ggttgcaacc 960
gatagggttg tagagtgtgc aatacacttg cgtacaattt caacccttgg caactgcaca 1020gatagggttg tagagtgtgc aatacacttg cgtacaattt caacccttgg caactgcaca 1020
gcttggttgt gaacagcatc ttcaattctg gcaagctcct tgtctgtcat atcgacagcc 1080gcttggttgt gaacagcatc ttcaattctg gcaagctcct tgtctgtcat atcgacagcc 1080
aacagaatca cctgggaatc aataccatgt tcagcttgag acagaaggtc tgaggcaacg 1140aacagaatca cctgggaatc aataccatgt tcagcttgag acagaaggtc tgaggcaacg 1140
aaatctggat cagcgtattt atcagcaata actagaactt cagaaggccc agcaggcatg 1200aaatctggat cagcgtattt atcagcaata actagaactt cagaaggccc agcaggcatg 1200
tcaatactac acagggctga tgtgtcattt tgaaccatca tcttggcagc agtaacgaac 1260tcaatactac acagggctga tgtgtcattt tgaaccatca tcttggcagc agtaacgaac 1260
tggtttcctg gaccaaatat tttgtcacac ttaggaacag tttctgttcc gtaagccata 1320tggtttcctg gaccaaatat tttgtcacac ttaggaacag tttctgttcc gtaagccata 1320
gcagctactg cctgggcgcc tcctgctagc acgatacact tagcaccaac cttgtgggca 1380gcagctactg cctgggcgcc tcctgctagc acgatacact tagcaccaac cttgtgggca 1380
acgtagatga cttctggggt aagggtacca tccttcttag gtggagatgc aaaaacaatt 1440acgtagatga cttctggggt aagggtacca tccttcttag gtggagatgc aaaaacaatt 1440
tctttgcaac cagcaacttt ggcaggaaca cccagcatca gggaagtgga aggcagaatt 1500tctttgcaac cagcaacttt ggcaggaaca cccagcatca gggaagtgga aggcagaatt 1500
gcggttccac caggaatata gaggccaact ttctcaatag gtcttgcaaa acgagagcag 1560gcggttccac caggaatata gaggccaact ttctcaatag gtcttgcaaa acgagagcag 1560
actacaccag ggcaagtctc aacttgcaac gtctccgtta gttgagcttc atggaatttc 1620actacaccag ggcaagtctc aacttgcaac gtctccgtta gttgagcttc atggaatttc 1620
ctgacgttat ctatagagag atcaatggct ctcttaacgt tatctggcaa ttgcataagt 1680ctgacgttat ctatagagag atcaatggct ctcttaacgt tatctggcaa ttgcataagt 1680
tcctctggga aaggagcttc taacacaggt gtcttcaaag cgactccatc aaacttggca 1740tcctctggga aaggagcttc taacacaggt gtcttcaaag cgactccatc aaacttggca 1740
gttagttcta aaagggcttt gtcaccattt tgacgaacat tgtcgacaat tggtttgact 18001800
aattccataa tctgttccgt tttctggata ggacgacgaa gggcatcttc aatttcttgt 1860aattccataa tctgttccgt ttttctggata ggacgacgaa gggcatcttc aatttcttgt 1860
gaggaggcct tagaaacgtc aattttgcac aattcaatac gaccttcaga agggacttct 1920gaggaggcct tagaaacgtc aattttgcac aattcaatac gaccttcaga agggacttct 1920
ttaggtttgg attcttcttt aggttgttcc ttggtgtatc ctggcttggc atctcctttc 1980ttaggtttgg attcttcttt aggttgttcc ttggtgtatc ctggcttggc atctcctttc 1980
cttctagtga cctttaggga cttcatatcc aggtttctct ccacctcgtc caacgtcaca 2040cttctagtga cctttaggga cttcatatcc aggtttctct ccacctcgtc caacgtcaca 2040
ccgtacttgg cacatctaac taatgcaaaa taaaataagt cagcacattc ccaggctata 2100ccgtacttgg cacatctaac taatgcaaaa taaaataagt cagcacattc ccaggctata 2100
tcttccttgg atttagcttc tgcaagttca tcagcttcct ccctaatttt agcgttcaac 2160tcttccttgg atttagcttc tgcaagttca tcagcttcct ccctaatttt agcgttcaac 2160
aaaacttcgt cgtcaaataa ccgtttggta taagaacctt ctggagcatt gctcttacga 2220aaaacttcgt cgtcaaataa ccgtttggta taagaacctt ctggagcatt gctcttacga 2220
tcccacaagg tggcttccat ggctctaaga ccctttgatt ggccaaaaca ggaagtgcgt 2280tcccacaagg tggcttccat ggctctaaga ccctttgatt ggccaaaaca ggaagtgcgt 2280
tccaagtgac agaaaccaac acctgtttgt tcaaccacaa atttcaagca gtctccatca 2340tccaagtgac agaaaccaac acctgtttgt tcaaccacaa atttcaagca gtctccatca 2340
caatccaatt cgatacccag caacttttga gttcgtccag atgtagcacc tttataccac 2400caatccaatt cgatacccag caacttttga gttcgtccag atgtagcacc tttataccac 2400
aaaccgtgac gacgagattg gtagactcca gtttgtgtcc ttatagcctc cggaatagac 2460aaaccgtgac gacgagattg gtagactcca gtttgtgtcc ttatagcctc cggaatagac 2460
tttttggacg agtacaccag gcccaacgag taattagaag agtcagccac caaagtagtg 2520tttttggacg agtacaccag gcccaacgag taattagaag agtcagccac caaagtagtg 2520
aatagaccat cggggcggtc agtagtcaaa gacgccaaca aaatttcact gacagggaac 2580aatagaccat cggggcggtc agtagtcaaa gacgccaaca aaatttcact gacagggaac 2580
tttttgacat cttcagaaag ttcgtattca gtagtcaatt gccgagcatc aataatgggg 2640tttttgacat cttcagaaag ttcgtattca gtagtcaatt gccgagcatc aataatgggg 2640
attataccag aagcaacagt ggaagtcaca tctaccaact ttgcggtctc agaaaaagca 2700attataccag aagcaacagt ggaagtcaca tctaccaact ttgcggtctc agaaaaagca 2700
taaacagttc tactaccgcc attagtgaaa cttttcaaat cgcccagtgg agaagaaaaa 2760taaacagttc tactaccgcc attagtgaaa cttttcaaat cgcccagtgg agaagaaaaa 2760
ggcacagcga tactagcatt agcgggcaag gatgcaactt tatcaaccag ggtcctatag 2820ggcacagcga tactagcatt agcgggcaag gatgcaactt tatcaaccag ggtcctatag 2820
ataaccctag cgcctgggat catcctttgg acaactcttt ctgccaaatc taggtccaaa 2880ataaccctag cgcctgggat catcctttgg acaactcttt ctgccaaatc taggtccaaa 2880
atcacttcat tgataccatt attgtacaac ttgagcaagt tgtcgatcag ctcctcaaat 2940atcacttcat tgataccatt attgtacaac ttgagcaagt tgtcgatcag ctcctcaaat 2940
tggtcctctg taacggatga ctcaacttgc acattaactt gaagctcagt cgattgagtg 3000tggtcctctg taacggatga ctcaacttgc acattaactt gaagctcagt cgattgagtg 3000
aacttgatca ggttgtgcag ctggtcagca gcatagggaa acacggcttt tcctaccaaa 3060aacttgatca ggttgtgcag ctggtcagca gcatagggaa acacggcttt tcctaccaaa 3060
ctcaaggaat tatcaaactc tgcaacactt gcgtatgcag gtagcaaggg aaatgtcata 3120ctcaaggaat tatcaaactc tgcaacactt gcgtatgcag gtagcaaggg aaatgtcata 3120
cttgaagtcg gacagtgagt gtagtcttga gaaattctga agccgtattt ttattatcag 3180gtagtcttga gaaattctga agccgtattt ttattatcag 3180
tgagtcagtc atcaggagat cctctacgcc ggacgcatcg tggccggcat caccggcgat 3240tgagtcagtc atcaggagat cctctacgcc ggacgcatcg tggccggcat caccggcgat 3240
ctaacatcca aagacgaaag gttgaatgaa acctttttgc catccgacat ccacaggtcc 3300ctaacatcca aagacgaaag gttgaatgaa acctttttgc catccgacat ccacaggtcc 3300
attctcacac ataagtgcca aacgcaacag gaggggatac actagcagca gaccgttgca 3360attctcacac ataagtgcca aacgcaacag gaggggatac actagcagca gaccgttgca 3360
aacgcaggac ctccactcct cttctcctca acacccactt ttgccatcga aaaaccagcc 3420aacgcaggac ctccactcct cttctcctca acacccactt ttgccatcga aaaaccagcc 3420
cagttattgg gcttgattgg cacgcgtgag cttggcgtaa tcatggtcat agctgtttcc 3480cagttattgg gcttgattgg cacgcgtgag cttggcgtaa tcatggtcat agctgtttcc 3480
tgtgtgaaat tgttatccgc tcacaattcc acacaacata cgagccggaa gcataaagtg 35403540
taaagcctgg ggtgcctaat gagtgagcta actcacatta attgcgttgc gctcactgcc 3600taaagcctgg ggtgcctaat gagtgagcta actcacatta attgcgttgc gctcactgcc 3600
cgctttccag tcgggaaacc tgtcgtgcca gctgcattaa tgaatcggcc aacgcgcggg 3660cgctttccag tcgggaaacc tgtcgtgcca gctgcattaa tgaatcggcc aacgcgcggg 3660
gagaggcggt ttgcgtattg ggcgctcttc cgcttcctcg ctcactgact cgctgcgctc 3720gagaggcggt ttgcgtattg ggcgctcttc cgcttcctcg ctcactgact cgctgcgctc 3720
ggtcgttcgg ctgcggcgag cggtatcagc tcactcaaag gcggtaatac ggttatccac 3780ggtcgttcgg ctgcggcgag cggtatcagc tcactcaaag gcggtaatac ggttatccac 3780
agaatcaggg gataacgcag gaaagaacat gtgagcaaaa ggccagcaaa aggccaggaa 3840agaatcaggg gtaacgcag gaaagaacat gtgagcaaaa ggccagcaaa aggccaggaa 3840
ccgtaaaaag gccgcgttgc tggcgttttt ccataggctc cgcccccctg acgagcatca 3900ccgtaaaaag gccgcgttgc tggcgttttt ccataggctc cgcccccctg acgagcatca 3900
caaaaatcga cgctcaagtc agaggtggcg aaacccgaca ggactataaa gataccaggc 3960caaaaatcga cgctcaagtc agaggtggcg aaacccgaca ggactataaa gataccaggc 3960
gtttccccct ggaagctccc tcgtgcgctc tcctgttccg accctgccgc ttaccggata 4020gtttccccct ggaagctccc tcgtgcgctc tcctgttccg accctgccgc ttaccggata 4020
cctgtccgcc tttctccctt cgggaagcgt ggcgctttct catagctcac gctgtaggta 4080cctgtccgcc tttctccctt cgggaagcgt ggcgctttct catagctcac gctgtaggta 4080
tctcagttcg gtgtaggtcg ttcgctccaa gctgggctgt gtgcacgaac cccccgttca 4140tctcagttcg gtgtaggtcg ttcgctccaa gctgggctgt gtgcacgaac cccccgttca 4140
gcccgaccgc tgcgccttat ccggtaacta tcgtcttgag tccaacccgg taagacacga 4200gcccgaccgc tgcgccttat ccggtaacta tcgtcttgag tccaacccgg taagacacga 4200
cttatcgcca ctggcagcag ccactggtaa caggattagc agagcgaggt atgtaggcgg 4260cttatcgcca ctggcagcag ccactggtaa caggattagc agagcgaggt atgtaggcgg 4260
tgctacagag ttcttgaagt ggtggcctaa ctacggctac actagaagga cagtatttgg 4320tgctacagag ttcttgaagt ggtggcctaa ctacggctac actagaagga cagtatttgg 4320
tatctgcgct ctgctgaagc cagttacctt cggaaaaaga gttggtagct cttgatccgg 4380tatctgcgct ctgctgaagc cagttacctt cggaaaaaga gttggtagct cttgatccgg 4380
caaacaaacc accgctggta gcggtggttt ttttgtttgc aagcagcaga ttacgcgcag 4440caaacaaacc accgctggta gcggtggttt ttttgtttgc aagcagcaga ttacgcgcag 4440
aaaaaaagga tctcaagaag atcctttgat cttttctacg gggtctgacg ctcagtggaa 4500aaaaaaagga tctcaagaag atcctttgat cttttctacg gggtctgacg ctcagtggaa 4500
cgaaaactca cgttaaggga ttttggtcat gagattatca aaaaggatct tcacctagat 4560cgaaaactca cgttaaggga ttttggtcat gagattatca aaaaggatct tcacctagat 4560
ccttttaaat taaaaatgaa gttttaaatc aatctaaagt atatatgagt aaacttggtc 4620ccttttaaat taaaaatgaa gttttaaatc aatctaaagt atatatgagt aaacttggtc 4620
tgacagttac caatgcttaa tcagtgaggc acctatctca gcgatctgtc tatttcgttc 4680tgacagttac caatgcttaa tcagtgaggc acctatctca gcgatctgtc tatttcgttc 4680
atccatagtt gcctgactcc ccgtcgtgta gataactacg atacgggagg gcttaccatc 4740atccatagtt gcctgactcc ccgtcgtgta gataactacg atacgggagg gcttaccatc 4740
tggccccagt gctgcaatga taccgcgaga cccacgctca ccggctccag atttatcagc 4800tggccccagt gctgcaatga taccgcgaga cccacgctca ccggctccag atttatcagc 4800
aataaaccag ccagccggaa gggccgagcg cagaagtggt cctgcaactt tatccgcctc 4860aataaaccag ccagccggaa gggccgagcg cagaagtggt cctgcaactt tatccgcctc 4860
catccagtct attaattgtt gccgggaagc tagagtaagt agttcgccag ttaatagttt 4920catccagtct attaattgtt gccgggaagc tagagtaagt agttcgccag ttaatagttt 4920
gcgcaacgtt gttgccattg ctacaggcat cgtggtgtca cgctcgtcgt ttggtatggc 4980gcgcaacgtt gttgccattg ctacaggcat cgtggtgtca cgctcgtcgt ttggtatggc 4980
ttcattcagc tccggttccc aacgatcaag gcgagttaca tgatccccca tgttgtgcaa 5040ttcattcagc tccggttccc aacgatcaag gcgagttaca tgatccccca tgttgtgcaa 5040
aaaagcggtt agctccttcg gtcctccgat cgttgtcaga agtaagttgg ccgcagtgtt 5100aaaagcggtt agctccttcg gtcctccgat cgttgtcaga agtaagttgg ccgcagtgtt 5100
atcactcatg gttatggcag cactgcataa ttctcttact gtcatgccat ccgtaagatg 5160atcactcatg gttatggcag cactgcataa ttctcttact gtcatgccat ccgtaagatg 5160
cttttctgtg actggtgagt actcaaccaa gtcattctga gaatagtgta tgcggcgacc 5220cttttctgtg actggtgagt actcaaccaa gtcattctga gaatagtgta tgcggcgacc 5220
gagttgctct tgcccggcgt caatacggga taataccgcg ccacatagca gaactttaaa 5280gagttgctct tgcccggcgt caatacggga taataccgcg ccacatagca gaactttaaa 5280
agtgctcatc attggaaaac gttcttcggg gcgaaaactc tcaaggatct taccgctgtt 5340agtgctcatc attggaaaac gttcttcggg gcgaaaactc tcaaggatct taccgctgtt 5340
gagatccagt tcgatgtaac ccactcgtgc acccaactga tcttcagcat cttttacttt 5400gagatccagt tcgatgtaac ccactcgtgc acccaactga tcttcagcat cttttacttt 5400
caccagcgtt tctgggtgag caaaaacagg aaggcaaaat gccgcaaaaa agggaataag 5460caccagcgtt tctgggtgag caaaaacagg aaggcaaaat gccgcaaaaa agggaataag 5460
ggcgacacgg aaatgttgaa tactcatact cttccttttt caatattatt gaagcattta 5520ggcgacacgg aaatgttgaa tactcatact cttcctttttt caatattatt gaagcattta 5520
tcagggttat tgtctcatga gcggatacat atttgaatgt atttagaaaa ataaacaaat 5580tcagggttat tgtctcatga gcggatacat atttgaatgt atttagaaaa ataaacaaat 5580
aggggttccg cgcacatttc cccgaaaagt gccacctgac gtctaagaaa ccattattat 5640aggggttccg cgcacatttc cccgaaaagt gccacctgac gtctaagaaa ccattattat 5640
catgacatta acctataaaa ataggcgtat cacgaggccc tttcgtctcg cgcgtttcgg 5700catgacatta acctataaaa ataggcgtat cacgaggccc tttcgtctcg cgcgtttcgg 5700
tgatgacggt gaaaacctct gacacatgca gctcccggag acggtcacag cttgtctgta 5760tgatgacggt gaaaacctct gacacatgca gctcccggag acggtcacag cttgtctgta 5760
agcggatgcc gggagcagac aagcccgtca gggcgcgtca gcgggtgttg gcgggtgtcg 5820agcggatgcc gggagcagac aagcccgtca gggcgcgtca gcgggtgttg gcgggtgtcg 5820
gggctggctt aactatgcgg catcagagca gattgtactg agagtgcacc atatgcggtg 5880gggctggctt aactatgcgg catcagagca gattgtactg agagtgcacc atatgcggtg 5880
tgaaataccg cacagatgcg taaggagaaa ataccgcatc aggcgccatt cgccattcag 5940tgaaataccg cacagatgcg taaggagaaa ataccgcatc aggcgccatt cgccattcag 5940
gctgcgcaac tgttgggaag ggcgatcggt gcgggcctct tcgctattac gccagctggc 6000gctgcgcaac tgttgggaag ggcgatcggt gcgggcctct tcgctattac gccagctggc 6000
gaaaggggga tgtgctgcaa ggcgattaag ttgggtaacg ccagggtttt cccagtcacg 60606060
acgttgtaaa acgacggcca gtgaattaat tcacgcgtgc gctcattcca attccttcta 6120acgttgtaaa acgacggcca gtgaattaat tcacgcgtgc gctcattcca attccttcta 6120
ttaggctact aacaccatga ctttattagc ctgtctatcc tggcccccct ggcgaggttc 6180ttaggctact aacaccatga ctttattagc ctgtctatcc tggcccccct ggcgaggttc 6180
atgtttgttt atttccgaat gcaacaagct ccgcattaca cccgaacatc actccagatg 6240atgtttgttt atttccgaat gcaacaagct ccgcattaca cccgaacatc actccagatg 6240
agggctttct gagtgtgggg tcaaatagtt tcatgttccc caaatggccc aaaactgaca 6300agggctttct gagtgtgggg tcaaatagtt tcatgttccc caaatggccc aaaactgaca 6300
gtttaaacgc tgtcttggaa cctaatatga caaaagcgtg atctcatcca agatgaacta 63606360
agtttggttc gttgaaatgc taacggccag ttggtcaaaa agaaacttcc aaaagtcgcc 6420agtttggttc gttgaaatgc taacggccag ttggtcaaaa agaaacttcc aaaagtcgcc 6420
ataccgtttg tcttgtttgg tattgattga cgaatgctca aaaataatct cattaatgct 6480ataccgtttg tcttgtttgg tattgattga cgaatgctca aaaataatct cattaatgct 6480
tagcgcagtc tctctatcgc ttctgaaccc cggtgcacct gtgccgaaac gcaaatgggg 6540tagcgcagtc tctctatcgc ttctgaaccc cggtgcacct gtgccgaaac gcaaatgggg 6540
aaacacccgc tttttggatg attatgcatt gtctccacat tgtatgcttc caagattctg 6600aaacacccgc ttttggatg attatgcatt gtctccacat tgtatgcttc caagattctg 6600
gtgggaatac tgctgatagc ctaacgttca tgatcaaaat ttaactgttc taacccctac 6660gtgggaatac tgctgatagc ctaacgttca tgatcaaaat ttaactgttc taacccctac 6660
ttgacagcaa tatataaaca gaaggaagct gccctgtctt aaaccttttt ttttatcatc 6720ttgacagcaa tatataaaca gaaggaagct gccctgtctt aaaccttttt ttttatcatc 6720
attattagct tactttcata attgcgactg gttccaattg acaagctttt gattttaacg 6780attattagct tactttcata attgcgactg gttccaattg acaagctttt gattttaacg 6780
acttttaacg acaacttgag aagatcaaaa aacaactaat tattcgaagg atcaaaatga 6840acttttaacg acaacttgag aagatcaaaa aacaactaat tattcgaagg atcaaaatga 6840
gattgttact gttgctgtta ttgctgttgc ctgcagcatt aggtgctcca gtcaacacta 6900gattgttact gttgctgtta ttgctgttgc ctgcagcatt aggtgctcca gtcaacacta 6900
caacagaaga tgaaacggca caaattccgg ctgaagctgt catcggttac tcagatttag 6960caacagaaga tgaaacggca caaattccgg ctgaagctgt catcggttac tcagatttag 6960
aaggggattt cgatgttgct gttttgccat tttccaacag cacaaataac gggttattgt 7020aaggggattt cgatgttgct gttttgccat tttccaacag cacaaataac gggtttattgt 7020
ttataaatac tactattgcc agcattgctg ctaaagaaga aggggtatcc atggaaaaga 7080ttataaatac tactattgcc agcattgctg ctaaagaaga aggggtatcc atggaaaaga 7080
gatctggtac cgctacggct tggaagaatg tcaacattgg aggcggtggt ggttttgtcc 7140gatctggtac cgctacggct tggaagaatg tcaacattgg aggcggtggt ggttttgtcc 7140
caggtataat ctttcaccct aaagagaagg gtgttgccta tgctagaact gacataggag 7200caggtataat ctttcaccct aaagagaagg gtgttgccta tgctagaact gacataggag 7200
gcttgtacag actgaaccca gatgatgact cttggacacc attgacggat aatttgggca 7260gcttgtacag actgaaccca gatgatgact cttggacacc attgacggat aatttgggca 7260
ctaatgagaa gtggggaaga tggggtattg acgcagttgc agttgatccg caagatgctg 7320ctaatgagaa gtggggaaga tggggtattg acgcagttgc agttgatccg caagatgctg 7320
acagagtcta cgctgctgta ggcatgtata caaacgattg ggaccccaat ccaggctcta 7380acagagtcta cgctgctgta ggcatgtata caaacgattg ggaccccaat ccaggctcta 7380
ttatccgtag ttctgatcga ggagctacat gggaggttac cgaattaccc ttcaaagtgg 7440ttatccgtag ttctgatcga ggagctacat gggaggttac cgaattaccc ttcaaagtgg 7440
gaggtaatat gcctggaaga ggtatgggtg agagattggc tgtagatcct gccaacagtg 7500gaggtaatat gcctggaaga ggtatgggtg agagattggc tgtagatcct gccaacagtg 7500
acatcttgtt ctttggtgct aggtctggta atggtctgtg gaagtctgca gacggaggtg 7560acatcttgtt ctttggtgct aggtctggta atggtctgtg gaagtctgca gacggaggtg 7560
ttacttgggc aagagtagaa tccttcacca atgtcggaac ttatgctcct gacccatctg 7620ttacttgggc aagagtagaa tccttcacca atgtcggaac ttatgctcct gacccatctg 7620
atgctaccgg tttgaactct gacttgatag gtctgacttt tgttaccttc gattcgactt 7680atgctaccgg tttgaactct gacttgatag gtctgacttt tgttaccttc gattcgactt 7680
caaacgttgt tggtggagca acttcccgta tatttgtcgg tactgcagac aacaagactg 7740caaacgttgt tggtggagca acttcccgta tatttgtcgg tactgcagac aacaagactg 7740
catcggttta cgtttccgag gatgctggag ccacatggaa accagtagaa ggacaaccag 7800catcggttta cgtttccgag gatgctggag ccacatggaa accagtagaa ggacaaccag 7800
gtgcattctt tcctcacaaa tgcgtgttgc aaccagagga aaaggcccta tatctatcct 7860gtgcattctt tcctcacaaa tgcgtgttgc aaccagagga aaaggcccta tatctatcct 7860
attctaatgg agctggccct tatgacggaa cgttgggagc tgtctaccga tacgatttgg 7920attctaatgg agctggccct tatgacggaa cgttgggagc tgtctaccga tacgatttgg 7920
ctgcacgaac ctggacggac atcacaccag cttcaggagg ggacctttac tttgggttcg 7980ctgcacgaac ctggacggac atcacaccag cttcaggagg ggacctttac tttgggttcg 7980
gtggactatc agttgacttg aggaaacccg gtactcttat ggtagctacc cttaatagct 8040gtggactatc agttgacttg aggaaacccg gtactcttat ggtagctacc cttaatagct 8040
ggtggccaga tgcccagatt tacagaagta cggattcggg cgccacatgg agtaagattt 8100ggtggccaga tgcccagatt tacagaagta cggattcggg cgccacatgg agtaagattt 8100
gggagtgggc tgcttacccg gatatgaact ggtactacgg tttgtacaca gacaaagccc 8160gggagtgggc tgcttacccg gatatgaact ggtactacgg tttgtacaca gacaaagccc 8160
cttggataaa cgccggtttc atctctcagg acaccaaaag actgggttgg atgattgagg 8220cttggataaa cgccggtttc atctctcagg acaccaaaag actgggttgg atgattgagg 8220
cattagagat tgacccacat gattccgatc actggctata tggcaccggt ctaactttgt 8280cattagagat tgacccacat gattccgatc actggctata tggcaccggt ctaactttgt 8280
atggtggtca tgaccttacc aaatgggata cagttacaag gaacgttact atttccagcc 8340atggtggtca tgaccttacc aaatgggata cagttacaag gaacgttact atttccagcc 8340
ttgctgctgg aattgaagaa atggctgtct taggcttagc atctccacct aatggaagtg 8400ttgctgctgg aattgaagaa atggctgtct taggcttagc atctccacct aatggaagtg 8400
aactgctggc tgctgttggt gatgactgtg gattcacttt tcgtgaatct caggatttag 8460aactgctggc tgctgttggt gatgactgtg gattcacttt tcgtgaatct caggatttag 8460
gtacgtcacc gcaaacccct tggatgaatc ctatttggac ttcaactact gatgtggatt 8520gtacgtcacc gcaaacccct tggatgaatc ctatttggac ttcaactact gatgtggatt 8520
atgccggaaa cgaacccgac catgttgtga gagtcggtaa ttctcaaggt gcacctcaag 8580atgccggaaa cgaacccgac catgttgtga gagtcggtaa ttctcaaggt gcacctcaag 8580
tagctgtttc ggaagatggt ggagtaactt ggtcagcaca tccaggggca gacgggacca 8640tagctgtttc ggaagatggt ggagtaactt ggtcagcaca tccaggggca gacgggacca 8640
ccaacagtgg aactttagca tattcagccg atgccgatac tatcgtctgg agttcaggtt 8700ccaacagtgg aactttagca tattcagccg atgccgatac tatcgtctgg agttcaggtt 8700
ccgcaggggt gctgaggtcc caaaaccagg gagcttttgc tgctgtcggg tctttgccaa 8760ccgcaggggt gctgaggtcc caaaaccagg gagcttttgc tgctgtcggg tctttgccaa 8760
gcggcgccac agtggctgcc gatagaagaa ataacacagt cttttacgct gcaagtggag 8820gcggcgccac agtggctgcc gatagaagaa ataacacagt cttttacgct gcaagtggag 8820
cttcctttta cagatccact gacactggcg ccacatttgc caaagttgcc agcgcctttg 8880cttcctttta cagatccact gacactggcg ccacatttgc caaagttgcc agcgcctttg 8880
gatcgaaggt tgccgctgtc aaggctattg ctgcacatcc cgtggttgct ggagaagtat 8940gatcgaaggt tgccgctgtc aaggctattg ctgcacatcc cgtggttgct ggagaagtat 8940
gggttgccac tgacgctgga ttgttccgtt ccatcgatta tggggccact ttctctgctg 9000gggttgccac tgacgctgga ttgttccgtt ccatcgatta tggggccact ttctctgctg 9000
cttctggttc cattaccgat gcaattcagg tgtctttagg aaaaggagat ggttcagctt 9060cttctggttc cattaccgat gcaattcagg tgtctttagg aaaaggagat ggttcagctt 9060
ggaacgtgta cgtatttggg accggtcctg aagggaccaa gttgtatgca agcgctgatg 9120ggaacgtgta cgtatttggg accggtcctg aagggaccaa gttgtatgca agcgctgatg 9120
aaggtgccac atgggtggat atccaaggag agcagggctt cggttctttg tcagctaaca 9180aaggtgccac atgggtggat atccaaggag agcagggctt cggttctttg tcagctaaca 9180
gacttgttgg ttcaggaaat gtggctggtc aagtctacgt tggcacaaat ggtagaggtg 9240gacttgttgg ttcaggaaat gtggctggtc aagtctacgt tggcacaaat ggtagaggtg 9240
ttttctatgc aaaggttagt ctttctgctg ctgccaatta ataac 9285ttttctatgc aaaggttagt ctttctgctg ctgccaatta ataac 9285
////
<---<---
Claims (2)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2021118689A RU2771581C1 (en) | 2021-06-28 | 2021-06-28 | Recombinant yeast strain komagataella phaffii - producer of secreted endo-dissociative xyloglucanase of the gh74 family, encoded by a mutated gene, and a method for microbiological synthesis of secreted endo-dissociative xyloglucanase based on this strain |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2021118689A RU2771581C1 (en) | 2021-06-28 | 2021-06-28 | Recombinant yeast strain komagataella phaffii - producer of secreted endo-dissociative xyloglucanase of the gh74 family, encoded by a mutated gene, and a method for microbiological synthesis of secreted endo-dissociative xyloglucanase based on this strain |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2771581C1 true RU2771581C1 (en) | 2022-05-06 |
Family
ID=81458862
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2021118689A RU2771581C1 (en) | 2021-06-28 | 2021-06-28 | Recombinant yeast strain komagataella phaffii - producer of secreted endo-dissociative xyloglucanase of the gh74 family, encoded by a mutated gene, and a method for microbiological synthesis of secreted endo-dissociative xyloglucanase based on this strain |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2771581C1 (en) |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2605629C1 (en) * | 2015-12-16 | 2016-12-27 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов" (ФГБУ "ГосНИИгенетика") | RECOMBINANT STRAIN OF YEAST Pichia pastoris - PRODUCER OF THE SECRETED THERMOSTABLE XYLOGLUCANASE CODED BY SYNTHETIC GENE, AND METHOD FOR MICROBIOLOGICAL SYNTHESIS OF SECRETED THERMOSTABLE XYLOGLUCANASE BASED ON THIS STRAIN |
-
2021
- 2021-06-28 RU RU2021118689A patent/RU2771581C1/en active
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2605629C1 (en) * | 2015-12-16 | 2016-12-27 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов" (ФГБУ "ГосНИИгенетика") | RECOMBINANT STRAIN OF YEAST Pichia pastoris - PRODUCER OF THE SECRETED THERMOSTABLE XYLOGLUCANASE CODED BY SYNTHETIC GENE, AND METHOD FOR MICROBIOLOGICAL SYNTHESIS OF SECRETED THERMOSTABLE XYLOGLUCANASE BASED ON THIS STRAIN |
Non-Patent Citations (5)
Title |
---|
MATSUZAWA T. ET AL. GH74 Xyloglucanases: Structures and Modes of Activity. Trends in Glycoscience and Glycotechnology, Vol. 28, No. 162 (July 2016), pp. E63-E70. doi: 10.4052/tigg.1510.1E Найдено онлайн: https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg/28/162/28_1510.1E/_pdf/-char/ja Дата обращения 10.02.2022. * |
Synthetic construct MtXgh74 (mt74syn) gene, complete cds. Найдено онлайн: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/KY549923.1?report=genbank&log$=nuclalign&blast_rank=1&RID=09TEX1F4013 Дата обращения 10.02.2022. XIAN L. ET AL. Identification and characterization of an acidic and acid-stable endoxyloglucanase from Penicillium oxalicum. Int J Biol Macromol. 2016 May;86:512-8. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2016.01.105. Найдено онлайн: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813016301064?via%3Dihub Дата обращения 10.02.2022. MATSUZAWA T. ET AL. GH74 Xyloglucanases: Structures and Modes of Activity. Trends in Glycoscience and Glycotechnology, Vol. 28, No. 162 (July 2016), pp. E63-E70. doi: 10.4052/tigg.1510.1E Найдено онлайн: https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg/28/162/28_1510.1E/_pdf/-char/ja Дата обращения 10.02.2022. * |
XIAN L. ET AL. Identification and characterization of an acidic and acid-stable endoxyloglucanase from Penicillium oxalicum. Int J Biol Macromol. 2016 May;86:512-8. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2016.01.105. Найдено онлайн: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813016301064?via%3Dihub Дата обращения 10.02.2022. * |
База данных GenBank: * |
База данных GenBank: KY549923.1, 21.05.2017. Synthetic construct MtXgh74 (mt74syn) gene, complete cds. Найдено онлайн: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/KY549923.1?report=genbank&log$=nuclalign&blast_rank=1&RID=09TEX1F4013 Дата обращения 10.02.2022. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN101223271B (en) | Modified microorganisms with inactivated lactate dehydrogenase gene | |
CN110088275A (en) | The ethyl alcohol of improved no glycerol produces | |
KR20080012934A (en) | Thermophilic microorganisms with inactivated lactate dehydrogenase gene(ldh) for ethanol production | |
CN109749976B (en) | Recombinant bacillus subtilis for efficiently synthesizing guanosine diphosphate fucose and construction method and application thereof | |
CN108424870B (en) | Corynebacterium glutamicum for producing N-acetylglucosamine and application thereof | |
CN106544361B (en) | Mammalian cell expression vector, expression system, preparation method and application | |
CN107699535B (en) | Recombinant bacillus subtilis for induced synthesis of guanosine diphosphate fucose and construction method and application thereof | |
CN108913718A (en) | A kind of preparation method and application of the CAR-T cell of targeting EGFR v III | |
CN112481271B (en) | Transcription factor C/EBPZ for regulating and controlling formation of adipocytes and application thereof | |
CN107805622B (en) | Recombinant bacillus subtilis for synthesizing guanosine diphosphate rock sugar and construction method and application thereof | |
CN109652381A (en) | The CAR-T cell preparation method and application of CD133 is targeted based on base editor | |
CN113943737A (en) | Application of chicken CTGF gene in inhibiting differentiation of chicken preadipocytes | |
CN113025752B (en) | Internal reference gene, kit and detection method for PCR detection of 2019-nCoV and SARS virus | |
RU2771581C1 (en) | Recombinant yeast strain komagataella phaffii - producer of secreted endo-dissociative xyloglucanase of the gh74 family, encoded by a mutated gene, and a method for microbiological synthesis of secreted endo-dissociative xyloglucanase based on this strain | |
CN101250548B (en) | Shuttle plasmid and derivative plasmid thereof | |
CN107474131A (en) | One kind restructuring bovine serum albumin mature peptide and its preparation method and application | |
CN112608940B (en) | Construction method and application of animal model of congenital cataract disease | |
CN106978432B (en) | Knock out carrier construction method and the application of chlamydomonas endogenous gene and expression alien gene | |
CN114395020B (en) | Application of GmRALF1 protein in promoting phosphorus element absorption of plants | |
KR101639424B1 (en) | Method for Detecting and Quantitating Cellulase Using Artificial Genetic Circuit | |
CN115052477A (en) | Mutants of filamentous fungal cells with increased productivity in polypeptide production | |
CN109022363A (en) | A kind of CD-133-CAR-T system constituting method based on PiggyBac carrier | |
CN111909957B (en) | Genetic transformation method of haematococcus pluvialis | |
CN110168095A (en) | For using engineered yeast bacterial strain from the ameliorative way of the cellulose matrix production ethyl alcohol containing xylose | |
CN114134170A (en) | Preparation method and application of HA tag fusion expression vector |