RU2680090C1 - 2-(4,4-diftor-1,3,5,7-tetramethyl-2,6-disulfo-4-boro-3a,4a-diaza-s-indacen-8-yl)-benzoic acid and its derivatives, method of their production and their application for fluorescent blinding of protein molecules - Google Patents
2-(4,4-diftor-1,3,5,7-tetramethyl-2,6-disulfo-4-boro-3a,4a-diaza-s-indacen-8-yl)-benzoic acid and its derivatives, method of their production and their application for fluorescent blinding of protein molecules Download PDFInfo
- Publication number
- RU2680090C1 RU2680090C1 RU2017143419A RU2017143419A RU2680090C1 RU 2680090 C1 RU2680090 C1 RU 2680090C1 RU 2017143419 A RU2017143419 A RU 2017143419A RU 2017143419 A RU2017143419 A RU 2017143419A RU 2680090 C1 RU2680090 C1 RU 2680090C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- compound
- fluorescent
- formula
- derivatives
- compounds
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 15
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 15
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract description 15
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title description 7
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract description 47
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims abstract description 9
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims abstract description 8
- 229910052783 alkali metal Inorganic materials 0.000 claims abstract description 7
- 125000000020 sulfo group Chemical group O=S(=O)([*])O[H] 0.000 claims abstract description 7
- 150000001340 alkali metals Chemical class 0.000 claims abstract description 3
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims abstract 2
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 238000006277 sulfonation reaction Methods 0.000 claims description 11
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 10
- KZMGYPLQYOPHEL-UHFFFAOYSA-N Boron trifluoride etherate Chemical compound FB(F)F.CCOCC KZMGYPLQYOPHEL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- -1 benzoyloxytrifluoroborate Chemical compound 0.000 claims description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 4
- MFFMQGGZCLEMCI-UHFFFAOYSA-N 2,4-dimethyl-1h-pyrrole Chemical compound CC1=CNC(C)=C1 MFFMQGGZCLEMCI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- PAPNRQCYSFBWDI-UHFFFAOYSA-N DMP Natural products CC1=CC=C(C)N1 PAPNRQCYSFBWDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 claims description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 13
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 11
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 abstract description 7
- 238000006862 quantum yield reaction Methods 0.000 abstract description 7
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 16
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 239000000047 product Substances 0.000 description 12
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 10
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- ZOXJGFHDIHLPTG-UHFFFAOYSA-N Boron Chemical group [B] ZOXJGFHDIHLPTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229910052796 boron Inorganic materials 0.000 description 6
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N monobenzene Natural products C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- KEQGZUUPPQEDPF-UHFFFAOYSA-N 1,3-dichloro-5,5-dimethylimidazolidine-2,4-dione Chemical compound CC1(C)N(Cl)C(=O)N(Cl)C1=O KEQGZUUPPQEDPF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 5
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 5
- XTHPWXDJESJLNJ-UHFFFAOYSA-N chlorosulfonic acid Substances OS(Cl)(=O)=O XTHPWXDJESJLNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 5
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 4
- QUSNBJAOOMFDIB-UHFFFAOYSA-N Ethylamine Chemical compound CCN QUSNBJAOOMFDIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 4
- WTEOIRVLGSZEPR-UHFFFAOYSA-N boron trifluoride Chemical compound FB(F)F WTEOIRVLGSZEPR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- QYSGYZVSCZSLHT-UHFFFAOYSA-N octafluoropropane Chemical compound FC(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)F QYSGYZVSCZSLHT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 150000003233 pyrroles Chemical class 0.000 description 4
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 4
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N Dimethyl sulfoxide Chemical compound [2H]C([2H])([2H])S(=O)C([2H])([2H])[2H] IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N 0.000 description 3
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 3
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 3
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 3
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 3
- 238000000425 proton nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 3
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 3
- OBTZDIRUQWFRFZ-UHFFFAOYSA-N 2-(5-methylfuran-2-yl)-n-(4-methylphenyl)quinoline-4-carboxamide Chemical compound O1C(C)=CC=C1C1=CC(C(=O)NC=2C=CC(C)=CC=2)=C(C=CC=C2)C2=N1 OBTZDIRUQWFRFZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910015900 BF3 Inorganic materials 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 2
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000001263 acyl chlorides Chemical class 0.000 description 2
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 150000008064 anhydrides Chemical class 0.000 description 2
- 239000012300 argon atmosphere Substances 0.000 description 2
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 2
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 2
- 150000002170 ethers Chemical class 0.000 description 2
- 125000002485 formyl group Chemical class [H]C(*)=O 0.000 description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 2
- 150000008040 ionic compounds Chemical class 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 2
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 2
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 2
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 2
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 2
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 2
- DRSHXJFUUPIBHX-UHFFFAOYSA-N COc1ccc(cc1)N1N=CC2C=NC(Nc3cc(OC)c(OC)c(OCCCN4CCN(C)CC4)c3)=NC12 Chemical compound COc1ccc(cc1)N1N=CC2C=NC(Nc3cc(OC)c(OC)c(OCCCN4CCN(C)CC4)c3)=NC12 DRSHXJFUUPIBHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical class ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FIWILGQIZHDAQG-UHFFFAOYSA-N NC1=C(C(=O)NCC2=CC=C(C=C2)OCC(F)(F)F)C=C(C(=N1)N)N1N=C(N=C1)C1(CC1)C(F)(F)F Chemical compound NC1=C(C(=O)NCC2=CC=C(C=C2)OCC(F)(F)F)C=C(C(=N1)N)N1N=C(N=C1)C1(CC1)C(F)(F)F FIWILGQIZHDAQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LGRFSURHDFAFJT-UHFFFAOYSA-N Phthalic anhydride Natural products C1=CC=C2C(=O)OC(=O)C2=C1 LGRFSURHDFAFJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000002441 X-ray diffraction Methods 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002877 alkyl aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002585 base Substances 0.000 description 1
- JHIWVOJDXOSYLW-UHFFFAOYSA-N butyl 2,2-difluorocyclopropane-1-carboxylate Chemical compound CCCCOC(=O)C1CC1(F)F JHIWVOJDXOSYLW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000013480 data collection Methods 0.000 description 1
- 238000010908 decantation Methods 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- WGLUMOCWFMKWIL-UHFFFAOYSA-N dichloromethane;methanol Chemical compound OC.ClCCl WGLUMOCWFMKWIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IITFYNDIDPCBJL-UHFFFAOYSA-N dichloromethane;n,n-diethylethanamine;ethyl acetate Chemical compound ClCCl.CCOC(C)=O.CCN(CC)CC IITFYNDIDPCBJL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 description 1
- NLFBCYMMUAKCPC-KQQUZDAGSA-N ethyl (e)-3-[3-amino-2-cyano-1-[(e)-3-ethoxy-3-oxoprop-1-enyl]sulfanyl-3-oxoprop-1-enyl]sulfanylprop-2-enoate Chemical compound CCOC(=O)\C=C\SC(=C(C#N)C(N)=O)S\C=C\C(=O)OCC NLFBCYMMUAKCPC-KQQUZDAGSA-N 0.000 description 1
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 1
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 238000002189 fluorescence spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000006260 foam Substances 0.000 description 1
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010185 immunofluorescence analysis Methods 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 239000007800 oxidant agent Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 239000012460 protein solution Substances 0.000 description 1
- 230000005588 protonation Effects 0.000 description 1
- 238000001226 reprecipitation Methods 0.000 description 1
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 1
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F5/00—Compounds containing elements of Groups 3 or 13 of the Periodic Table
- C07F5/02—Boron compounds
- C07F5/022—Boron compounds without C-boron linkages
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/6428—Measuring fluorescence of fluorescent products of reactions or of fluorochrome labelled reactive substances, e.g. measuring quenching effects, using measuring "optrodes"
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/531—Production of immunochemical test materials
- G01N33/532—Production of labelled immunochemicals
- G01N33/533—Production of labelled immunochemicals with fluorescent label
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Biotechnology (AREA)
Abstract
Description
Область техники, к которой относится изобретениеFIELD OF THE INVENTION
Изобретение относится к области органической химии, в частности сульфированным производным бордипиррометена, способам их получения, к указанным соединениям для применения в качестве флуоресцентных меток белковых молекул, в том числе при производстве меченых антител, применяемых в иммунофлуоресцентном анализе для диагностики инфекционных заболеваний.The invention relates to the field of organic chemistry, in particular, a sulfonated derivative of bordipyrromethene, methods for their preparation, to said compounds for use as fluorescent labels of protein molecules, including in the production of labeled antibodies used in immunofluorescence analysis for the diagnosis of infectious diseases.
Уровень техникиState of the art
В литературе имеется описание производных бордипиррометена [1] и способов их получения.In the literature there is a description of derivatives of bordipyrometers [1] and methods for their preparation.
Известен способ получения различных производных бордипиррометена формулы (I) реакцией замещенных пирролов с ацилхлоридами или ангидридами. Вначале проводят конденсацию замещенных пирролов с ацилхлоридом или ангидридом в органическом растворителе, затем, не выделяя получившийся продукт, обрабатывают этиламином и комплексом трифторида бора с диэтиловым эфиром [1], после чего выделяют продукт в виде молекулярных кристаллических или аморфных соединений, имеющих в своем составе один атом бора и являющихся цвиттер-ионами (положительно заряженный атом азота и отрицательно заряженный атом бора) (I).A known method of obtaining various derivatives of bordehyrromethene of the formula (I) by the reaction of substituted pyrroles with acyl chlorides or anhydrides. First, substituted pyrroles are condensed with an acyl chloride or anhydride in an organic solvent, then, without isolating the resulting product, it is treated with ethylamine and a complex of boron trifluoride with diethyl ether [1], after which the product is isolated in the form of molecular crystalline or amorphous compounds containing one a boron atom and being zwitterions (a positively charged nitrogen atom and a negatively charged boron atom) (I).
I R1- R8 - H, алкильные, арильные и иные заместителиIR 1 - R 8 - H, alkyl, aryl and other substituents
Известен способ получения производных бордипиррометена формулы (I) реакцией замещенных пирролов с альдегидами. Вначале проводят конденсацию замещенных пирролов с альдегидом в органическом растворителе, затем обрабатывают смесь окислителем, после чего, не выделяя получившийся продукт, обрабатывают этиламином и комплексом трифторида бора с диэтиловым эфиром [1]. Продукт выделяют в виде молекулярных кристаллических или аморфных соединений, имеющих в своем составе один атом бора и являющихся цвиттер-ионами (положительно заряженный атом бора и отрицательно заряженный атом азота) (I).A known method of producing derivatives of bordehyrromethene of the formula (I) by the reaction of substituted pyrroles with aldehydes. First, substituted pyrroles are condensed with an aldehyde in an organic solvent, then the mixture is treated with an oxidizing agent, and then, without isolating the resulting product, it is treated with ethylamine and a complex of boron trifluoride with diethyl ether [1]. The product is isolated in the form of molecular crystalline or amorphous compounds having one boron atom and being zwitterions (a positively charged boron atom and a negatively charged nitrogen atom) (I).
Известен способ получения дисульфопроизводных бордипиррометена (II) сульфированием соединений формулы (I), где R2, R6=H, при том что в состав соединения (I) входит не более 1 атома бора, хлорсульфоновой кислотой и последующей нейтрализацией реакционной смеси основанием [2-9].A known method of producing disulfonated borodipyrometers (II) by sulfonation of compounds of formula (I), where R 2 , R 6 = H, while the composition of compound (I) contains no more than 1 boron atom, chlorosulfonic acid and subsequent neutralization of the reaction mixture with a base [2 -9].
IIII
Известный способ сульфирования соединений формулы (I) не позволяет получать соединения (III) или его солей щелочных металлов по сульфогруппам, если R является гидроксильной группой (IIIa)The known method for sulfonation of compounds of formula (I) does not allow to obtain compounds (III) or its alkali metal salts by sulfo groups if R is a hydroxyl group (IIIa)
IIIIII
IIIa, 2-(4,4-дифтор-1,3,5,7-тетраметил-2,6-дисульфо-4-боро-3a,4a-диаза-s-индацен-8-ил)-бензойная кислотаIIIa, 2- (4,4-difluoro-1,3,5,7-tetramethyl-2,6-disulfo-4-boro-3a, 4a-diaza-s-indacen-8-yl) benzoic acid
Известен патент на химически реакционноспособные соединения формулы I, где R - Н, Hal, алкил, арил, циклоалкил, алкиларил, ацил и сульфогруппа [10]. Патент не упоминает соединение IIIa или IIIa, кроме того формула изобретения патента описывает в качестве заместителя в 8-м положении иные заместители кроме H. Таким образом, патент [10] не описывает соединение IIIa или его предшественник IV, не имеющий в своем составе сульфогрупп.A patent is known for chemically reactive compounds of the formula I, where R is H, Hal, alkyl, aryl, cycloalkyl, alkylaryl, acyl and sulfo group [10]. The patent does not mention compound IIIa or IIIa, moreover, the patent claims describe substituents other than H. as substituents at the 8th position. Thus, the patent [10] does not describe compound IIIa or its precursor IV, which does not have sulfo groups.
Пункт 2 формулы патента [10] упоминает карбоксильную группу, как одну из активных групп, способных формировать химическую связь с лигандом, а пункт 1 формулы патента [10] упоминает, что любая из активных групп по зависимым пунктам формулы должна получаться химической модификацией красителей из п. 1 формулы патента [10], уже имеющих готовое бордипиррометеновое ядро.
Предлагаемый способ получения красителя вводит карбоксильную группу в состав вещества сразу на стадии синтеза бордипиррометенового ядра в положение 8, таким образом патент [10] не описывает способ получения соединения IIIa.The proposed method for producing dye introduces a carboxyl group into the composition of the substance immediately at the stage of synthesis of the bordepyrromethene nucleus at position 8, so the patent [10] does not describe a method for producing compound IIIa.
Известен способ получения соединения формулы IV, где карбоксильная группа вводится в состав вещества на стадии синтеза бордипиррометенового ядра [11]. Сульфирование получаемого известным способом соединения IV не позволяет получать соединение IIIa.A known method of obtaining the compounds of formula IV, where the carboxyl group is introduced into the composition of the substance at the stage of synthesis of bordipyrromethene core [11]. Sulfonation obtained in a known manner, compound IV does not allow to obtain compound IIIa.
IVIV
Реальных веществ, синтезированных с сульфогруппами в положении 2 и 6 невелико [1]; это указывает на тот факт, что далеко не каждый продукт с сульфозаместителями в положении 2 и 6 может быть получен сульфированием бордпиррометенов. Таким образом известное по патенту [10] применение веществ, несущих активированных группы, где R=SO3H, во флуоресцентных приложениях не включает в себя автоматически применение соединения IIIa с активированной группой, о достоверном существовании которого к моменту подачи патента не было известно.The real substances synthesized with sulfo groups in
Раскрытие сущности изобретенияDisclosure of the invention
Задачей изобретения является получение 2-(4,4-дифтор-1,3,5,7-тетраметил-2,6-дисульфо-4-боро-3a,4a-диаза-s-индацен-8-ил)-бензойной кислоты (соединение IIIa), а также ее производных с N-оксисукцимидильными группами, отличающимися возможностью применения для флуоресцентного мечения белков (канал флуоресцеина, 490-520 нм), отличающимися растворимостью в воде, более высоким квантовым выходом, более высоким коэффициентом экстинкции, по сравнению с флуоресцеином и с известными красителями формулы (I), например BODIPY FL, используемых для канала флуоресцеина.The objective of the invention is to obtain 2- (4,4-difluoro-1,3,5,7-tetramethyl-2,6-disulfo-4-boro-3a, 4a-diaza-s-indacen-8-yl) -benzoic acid (compound IIIa), as well as its derivatives with N-oxysuccimidyl groups, characterized by the possibility of using for fluorescent labeling of proteins (fluorescein channel, 490-520 nm), characterized by solubility in water, higher quantum yield, higher extinction coefficient, compared to fluorescein and with known dyes of the formula (I), for example BODIPY FL, used for the fluorescein channel.
Техническим результатом является возможность получения водорастворимого флуоресцентного красителя IIIa с более высоким выходом и чистотой, чем это возможно с использованием приемов, известных из уровня техники, достижение у данного флуоресцентного красителя лучшей растворимости в воде, более высокого квантового выхода, и более высокого коэффициента экстинкции по сравнению с аналогами, а также применение его производных с N-оксисукцимидильными группами как более ярких, чем известно из уровня техники, а стало быть требующих меньшего расхода, флуоресцентых меток белковых молекул.The technical result is the possibility of obtaining a water-soluble fluorescent dye IIIa with a higher yield and purity than is possible using methods known from the prior art, the achievement of this fluorescent dye better solubility in water, higher quantum yield, and higher extinction coefficient compared with analogues, as well as the use of its derivatives with N-oxysuccimidyl groups as brighter than known from the prior art, and therefore require less consumption ode, fluorescent labels of protein molecules.
Особенностью получения сульфированных производных бордипиррометена из хлорсульфоновой кислоты и исходного бордипиррометена является то, что, по сравнению с большим объемом литературы по производным бордипиррометена, таких реакций немного. В [1] отмечается, что число подобных реакций невелико. То есть, способ получения сульфированных производных бордипиррометена известен из уровня техники, однако имеются лишь немногочисленные данные о производных бордипиррометена, которые действительно успешно поддаются сульфированию, поэтому изобретательскую задачу представляет собой как подбор последовательностей реакций, приводящих к продукту реакции, так и подбор исходного соединения, которое в принципе успешно поддается сульфированию. Для каждого конкретного производного бордипиррометена нет возможности предсказать, какие условия будут оптимальными для сульфирования, и приведет ли оно к целевому продукту.A specific feature of the preparation of sulfonated derivatives of bordipyrromethene from chlorosulfonic acid and the original bordipyrromethene is that, in comparison with the large volume of literature on derivatives of bordipyrromethene, there are few such reactions. In [1], it is noted that the number of such reactions is small. That is, the method for producing sulfonated derivatives of boripyrromethene is known from the prior art, however, there is only a few data on derivatives of bordepyrromethene that are really succesful to sulfonation, therefore, the inventive task is both the selection of the reaction sequences leading to the reaction product and the selection of the starting compound, which in principle, succesfully sulfonated. For each specific derivative of bordipyrromethene, it is not possible to predict which conditions will be optimal for sulfonation and whether it will lead to the target product.
Предлагаются новые соединения формулы III, предпочтительно R означает гидроксил (соединение IIIa) или N-оксисуцинмидил или .New compounds of formula III are provided, preferably R is hydroxyl (compound IIIa) or N-oxisucinmidyl or .
Предлагаются соли щелочных металлов соединения формулы III по сульфогруппам, щелочные металлы предпочтительно Na и K.Alkali metal salts of the compounds of formula III are proposed for sulfo groups, alkali metals preferably Na and K.
Предлагается способ получения соединения формулы IIIa и его солей щелочных металлов, отличающийся тем, что в качестве исходного соединения для сульфирования применяется 2-(4,4-дифтор-1,3,5,7-тетраметил-4-боро-3a,4a-диаза-s-индацен-8-ил)-бензоилокситрифторборат, триэтиламмониевая соль - соединение формулы (V).A method for producing a compound of formula IIIa and its alkali metal salts is proposed, characterized in that 2- (4,4-difluoro-1,3,5,7-tetramethyl-4-boro-3a, 4a- diaz-s-indacen-8-yl) -benzoyloxytrifluoroborate; triethylammonium salt is a compound of formula (V).
VV
Предлагается применение соединений формулы III как флуоресцентных красителей с растворимостью в воде, квантовым выходом, и коэффициентом экстинкции более высокими, чем это известно из уровня техники, - для использования в качестве флуоресцентных меток белковых молекул.It is proposed the use of compounds of formula III as fluorescent dyes with water solubility, quantum yield, and extinction coefficient higher than is known from the prior art, for use as protein fluorescence labels.
Сущность способа получения соединения формулы IIIa в том, что на первой стадии из о-фталевого ангидрида, 2,4-диметилпиррола, триэтиламина и эфирата трифторида бора получают ионное соединение формулы V.The essence of the method for producing the compound of formula IIIa is that in the first step, an ionic compound of formula V is obtained from o-phthalic anhydride, 2,4-dimethylpyrrole, triethylamine and boron trifluoride etherate.
В известном способе синтеза сульфированных бордипиррметенов [2-9] в реакцию сульфирования вводят хлорсульфоновую кислоту и соединения, которые являются молекулярными кристаллическими или аморфными веществами, имеющими в своем составе один атом бора и являющихся цвиттер-ионами. В предлагаемом способе в реакцию сульфирования вводят ионное соединение формулы V (соль с триэтиламином), содержащее в своем составе два атома бора.In the known method for the synthesis of sulfonated borodipyrrmethenes [2-9], chlorosulfonic acid and compounds, which are molecular crystalline or amorphous substances having one boron atom and are zwitterions, are introduced into the sulfonation reaction. In the proposed method, an ionic compound of formula V (salt with triethylamine) containing two boron atoms is introduced into the sulfonation reaction.
Преимуществом описанного способа является то, что сульфирование хлорсульфоновой кислотой, по аналогии с описанными в литературе способами сульфирования, приводит к осмолению продукта.An advantage of the described method is that sulfonation with chlorosulfonic acid, by analogy with sulfonation methods described in the literature, leads to the resinification of the product.
Осуществление изобретенияThe implementation of the invention
Соединение VCompound V
Ацетонитрил продували аргоном в течение 10 минут в круглодонной колбе, затем в атмосфере аргона добавляли 2,4-диметилпиррол (3,8 г; 40 ммоль), фталевый ангидрид (2,96 г; 20 ммоль) и эфират трифторида бора (6,3 г; 44 ммоль). Смесь перемешивали в атмосфере аргона в течение 6 часов, затем охлаждали до 0оС и добавляли эфират трифторида бора (22,7 г; 160 ммоль). Смесь перемешивали в течение 10 минут при данной температуре, затем добавляли триэтиламин (22 г; 220 ммоль) и смесь при постоянном перемешивании оставляли при комнатной температуре на ночь. Затем смесь выливали в воду (400 мл), перемешивали в течение 2 часов и разбавляли дихлорметаном (200 мл). Органическую фазу отделяли и воду экстрагировали дихлорметаном (3×50 мл). Органическую фазу высушивали над сульфатом натрия, растворители выпаривали в вакууме. Продукт очищали колоночной хроматографией (элюент дихлорметан-этилацетат-триэтиламин 300:100:1), получая на выходе темное масло, которое кристаллизовалось при перемешивании в смеси этилацетата (3 мл) и метил-трет-бутилового эфира (5 мл). Выход продукта в виде оранжевого порошка составил 1,6 г (15%). Структура продукта (рисунок 1) подтверждена методом ЯМР-спектроскопии, рентгеноструктурного анализа.Acetonitrile was purged with argon for 10 minutes in a round bottom flask, then 2,4-dimethylpyrrole (3.8 g; 40 mmol), phthalic anhydride (2.96 g; 20 mmol) and boron trifluoride etherate (6.3) were added under argon atmosphere. g; 44 mmol). The mixture was stirred under an argon atmosphere for 6 hours, then cooled to 0 ° C and boron trifluoride etherate (22.7 g; 160 mmol). The mixture was stirred for 10 minutes at this temperature, then triethylamine (22 g; 220 mmol) was added and the mixture was allowed to stir at room temperature overnight. The mixture was then poured into water (400 ml), stirred for 2 hours and diluted with dichloromethane (200 ml). The organic phase was separated and water was extracted with dichloromethane (3 × 50 ml). The organic phase was dried over sodium sulfate, the solvents were evaporated in vacuo. The product was purified by column chromatography (eluent dichloromethane-ethyl acetate-triethylamine 300: 100: 1) to obtain a dark oil, which crystallized upon stirring in a mixture of ethyl acetate (3 ml) and methyl tert-butyl ether (5 ml). The product yield in the form of an orange powder was 1.6 g (15%). Product structure (Figure 1) was confirmed by NMR spectroscopy, X-ray diffraction analysis.
Рисунок 1
Таблица 1Table 1
Таблица 2table 2
Таблица 3Table 3
Таблица 4Table 4
Таблица 5Table 5
Данные о кристаллическом строении и детализация структуры соединения V:Data on the crystal structure and structural detail of compound V:
Кристаллические данные для соединения V, C26H34B2F5N3O2, (M=537,18): моноклинная, пространственная группа P21/n. Размеры элементарной ячейки: a=10,8302(8) Å, b=38,269(3) Å, c=13,8846(11) Å, β=108,844(2), V (Объем)=5446,1(7) Å3, Z=8, T (температура)=120 K, μ(MoKα) (коэффициент поглощения)=0,105 мм-1, Dcalc (вычисленная плотность)=1,310 г/см3, Собранные/единственные отражения: 53766/11398, диапазон угла тэта для сбора данных: 2,128 ≤ 2Θ ≤ 52,744.. Конечные показатели R: R1=0,0541 (I>2σ(I)), wR2=0,1053.Crystal data for compound V, C 26 H 34 B 2 F 5 N 3 O 2 , (M = 537.18): monoclinic, space group P2 1 / n. Unit cell sizes: a = 10.8302 (8) Å, b = 38.269 (3) Å, c = 13.8846 (11) Å, β = 108.844 (2), V (Volume) = 5446.1 (7) Å 3 , Z = 8, T (temperature) = 120 K, μ (MoKα) (absorption coefficient) = 0.105 mm -1 , Dcalc (calculated density) = 1.310 g / cm 3 , Collected / single reflections: 53766/11398, Theta angle range for data collection: 2.128 ≤ 2Θ ≤ 52.744 .. Final indicators R: R 1 = 0.0541 (I> 2σ (I)), wR 2 = 0.1053.
Спектр ЯМР 1H соединения V (d6-DMSO, δ, м.д., J, Гц): 1,24 (9H, т, CH3CH2); 1,45 (6H, с, 1,7-CH3); 2,48 (6H, с, 3,5-CH3); 3,05 (6H, CH3CH2NH+); 6,11 (2H, 2,6-CH=), 7,44-8,02 (4H, м, -CH- бензольного кольца) 1 H NMR spectrum of compound V (d6-DMSO, δ, ppm, J, Hz): 1.24 (9H, t, CH3CH2); 1.45 (6H, s, 1.7-CH3); 2.48 (6H, s, 3,5-CH3); 3.05 (6H, CH3CH2NH +); 6.11 (2H, 2.6-CH =), 7.44-8.02 (4H, m, -CH- benzene ring)
Синтез соединения IIIa, натриевая сольSynthesis of compound IIIa, sodium salt
Раствор соединения V (0,2 г; 0,426 ммоль) в дихлорметане (3 мл) охлаждали до -50°C. Затем в течение 1 минуты добавляли раствор хлорсульфокислоты в дихлорметане, смесь перемешивали при данной температуре в течение 20 минут и давали смеси нагреться до комнатной температуры в течение 2 часов. При этом образовывался осадок. Жидкость с осадка удаляли декантацией, осадок промывали дихлорметаном (2×3 мл), затем добавляли гидрокарбонат натрия (1 г; 11,3 ммоль), с последующим добавлением воды (5 мл). Смесь перемешивали в течение 20 минут и выпаривали досуха; перед выпариванием добавляли этанол и толуол, чтобы избежать образования пены. При этом получался оранжевый остаток, который хроматографировали на колонке с силикагелем, используя в качестве элюента смесь дихлорметан - метанол (1:1); остаток растворяли в элюенте и органические соли отфильтровывали. Целевой продукт высушивали, получая в результате оранжевый порошок. Вещество перемешивали со смесью тетрагидрофурана и этилацетата в соотношении 1:1 объемом 3 мл. Выход составил 115 мг (47%). Структура продукта подтверждена методом ЯМР-спектроскопии.A solution of compound V (0.2 g; 0.426 mmol) in dichloromethane (3 ml) was cooled to -50 ° C. Then, a solution of chlorosulfonic acid in dichloromethane was added over 1 minute, the mixture was stirred at this temperature for 20 minutes and the mixture was allowed to warm to room temperature for 2 hours. In this case, a precipitate formed. The liquid from the precipitate was removed by decantation, the precipitate was washed with dichloromethane (2 × 3 ml), then sodium bicarbonate (1 g; 11.3 mmol) was added, followed by water (5 ml). The mixture was stirred for 20 minutes and evaporated to dryness; ethanol and toluene were added before evaporation to avoid foam formation. An orange residue was obtained, which was chromatographed on a silica gel column using a dichloromethane-methanol mixture (1: 1) as an eluent; the residue was dissolved in eluent and the organic salts were filtered. The target product was dried, resulting in an orange powder. The substance was mixed with a mixture of tetrahydrofuran and ethyl acetate in a 1: 1 ratio of 3 ml. The yield was 115 mg (47%). The structure of the product is confirmed by NMR spectroscopy.
Спектр ЯМР 1H соединения II (d6-DMSO, δ, м.д., J, Гц): 1,52 (6H, с, 1,7-CH3); 2,65 (6H, с, 3,5-CH3); 7,2-8,1 (4H, м, -CH- бензольного кольца) 1 H NMR spectrum of compound II (d6-DMSO, δ, ppm, J, Hz): 1.52 (6H, s, 1.7-CH3); 2.65 (6H, s, 3.5-CH3); 7.2-8.1 (4H, m, -CH- benzene ring)
Полученное соединение IIIa, натриевая соль обладает следующими свойствами:The resulting compound IIIa, the sodium salt has the following properties:
- соединение является флуоресцентным красителем.- the compound is a fluorescent dye.
- соединение характеризуется водорастворимостью 27 мг/мл. Данная характеристика имеет высокое значение для применения, учитывая, что соединение I как флуоресцентный краситель предназначается для мечения белковых объектов в водной среде.- the compound is characterized by a water solubility of 27 mg / ml. This characteristic is of high importance for use, given that compound I, as a fluorescent dye, is intended for the labeling of protein objects in an aqueous medium.
- спектр флуоресценции соединения находится в том же диапазоне, что и спектр широко используемого в лабораторной практике флуоресцеина, благодаря чему с веществом можно работать на приборах, имеющих фиксированные длины волн возбуждения/излучения, рассчитанные на флуоресцеиновые красители (рисунки 2 и 3).- the fluorescence spectrum of the compound is in the same range as the spectrum of fluorescein widely used in laboratory practice, due to which the substance can be operated on devices having fixed excitation / radiation wavelengths calculated for fluorescein dyes (Figures 2 and 3).
- соединение имеет высокий квантовый выход в воде (0,96), что позволяет надежно отсекать фоновый сигнал возбуждающего излучения. Данное значение выше, чем квантовые выходы для известных соединений наиболее близких по составу и функциональности, максимальное значение квантового выхода в любом растворителе для которых составляет, 0,73 для соединения IV [11], 0,49 для соединения VI [9].- the compound has a high quantum yield in water (0.96), which allows you to reliably cut off the background signal of the exciting radiation. This value is higher than the quantum yields for known compounds that are closest in composition and functionality, the maximum quantum yield in any solvent for which is 0.73 for compound IV [11], 0.49 for compound VI [9].
Рисунок 2Figure 2
Рисунок 3Figure 3
VIVI
- коэффициент экстинкции вещества в воде составил 8,6×104 л×моль-1×см-1, что примерно на 7% выше коэффициента экстинкции соединений IV и VI, известных из уровня техники [9, 11]. Таким образом, характеристики соединения IIIa исключительно точно соответствуют потребностям исследований в области биохимии и молекулярной биологии.- the extinction coefficient of a substance in water was 8.6 × 10 4 l × mol -1 × cm -1 , which is approximately 7% higher than the extinction coefficient of compounds IV and VI, known from the prior art [9, 11]. Thus, the characteristics of compound IIIa are extremely precisely aligned with the needs of research in biochemistry and molecular biology.
ПримерExample
Применение соединения IIIThe use of compound III
в качестве флуоресцентной метки белковых молекулas a fluorescent label of protein molecules
Вещество IIIa превращали посредством реакции с O-(N-сукцинимидил)-1,1,3,3-тетраметилуроний тетрафторборатом в N-гидроксисукцинимидное производное VII и это производное вводили в реакцию с бычьим альбумином.Substance IIIa was converted by reaction with O- (N-succinimidyl) -1,1,3,3-tetramethyluronium tetrafluoroborate into the N-hydroxysuccinimide derivative VII, and this derivative was reacted with bovine albumin.
VIIVII
Спектр ЯМР 1H соединения VII (d6-DMSO, δ, м.д., J, Гц): 1,42 (6H, с, 1,7-CH3); 2,51 (6H, с, 3,5-CH3); 2,83 (4H, т, -CH2-CH2-), 7,62-8,41 (4H, м, -CH- бензольного кольца) 1 H NMR spectrum of compound VII (d6-DMSO, δ, ppm, J, Hz): 1.42 (6H, s, 1.7-CH3); 2.51 (6H, s, 3.5-CH3); 2.83 (4H, t, -CH2-CH2-), 7.62-8.41 (4H, m, -CH- benzene rings)
Белки содержат аминогруппы, соответственно их модификация часто проводится посредством активированных эфиров. Скорость и полнота протекания реакции активированных эфиров с аминогруппами существенно зависит от pH среды. При низких значениях pH происходит протонирование аминогрупп, в результате чего и термодинамика, и кинетика реакции неудовлетворительны. При высоких значениях на реакцию влияет уже процесс гидролиза активированного эфира. Поэтому оптимальное значение pH в данном случае 8.3-8.5.Proteins contain amino groups, respectively, their modification is often carried out through activated esters. The speed and completeness of the reaction of activated esters with amino groups substantially depends on the pH of the medium. At low pH values, protonation of amino groups occurs, as a result of which both thermodynamics and reaction kinetics are unsatisfactory. At high values, the reaction is already affected by the hydrolysis of the activated ester. Therefore, the optimal pH in this case is 8.3–8.5.
В качестве растворителя для модификации бычьего альбумина использовали воду в смеси с диметилсульфоксидом (ДМСО).As a solvent for the modification of bovine albumin, water was used in a mixture with dimethyl sulfoxide (DMSO).
Активированный эфир для модификации брали в 8-кратном избытке по отношению к модифицируемым аминогруппам. Это экспериментально подобранное число для достижения мечения в среднем по одной группе на макромолекулу.The activated ester for modification was taken in an 8-fold excess relative to the modified amino groups. This is an experimentally selected number to achieve labeling on average for one group per macromolecule.
Концентрация белка при мечении составляла 1 мг на мл. Активированный эфир растворяли в чистом ДМСО (1/10 объема реакционной смеси).The protein concentration during labeling was 1 mg per ml. Activated ether was dissolved in pure DMSO (1/10 volume of the reaction mixture).
Бычий альбумин растворяли в буфере pH 8.3 (объем - 9/10 реакционной смеси). Для изготовления буфера использовали 0.1 М раствор бикарбоната натрия (NaHCO3).Bovine albumin was dissolved in pH 8.3 buffer (volume - 9/10 of the reaction mixture). To prepare the buffer, a 0.1 M solution of sodium bicarbonate (NaHCO 3 ) was used.
Раствор активированного эфира в ДМСО прибавляли к раствору белка в буфере и тщательно перемешивали, после чего держали реакционную смесь при 0°С в течение 4 часов. Конъюгаты очищали с помощью переосаждения ацетоном.A solution of activated ether in DMSO was added to a protein solution in buffer and thoroughly mixed, after which the reaction mixture was kept at 0 ° C for 4 hours. The conjugates were purified by reprecipitation with acetone.
Эффективность конъюгации красителей с бычьим альбумином оценивалась следующим образом. Поскольку в белке присутствует большое количество аминогрупп, то конъюгация протекает случайным образом, и выделить индивидуальное вещество после конъюгации не представляется возможным. Поэтому эффективность конъюгации оценивают, сравнивая поглощение красителя при 500 нм (длина волны поглощения сдвинулась по сравнению с красителем до конъюгации) и белка при 280 нм, учитывая, что коэффициенты экстинкции белка и красителя на данной длине волны известны (около 8,6×104 л × моль-1×см-1 и 4,3×104 л × моль-1×см-1 соответственно). Пример такого спектра приведен на рисунке 4. Анализ спектров для красителей показал, что эффективность модификации составила 1-1,2 молекулы красителя в среднем на молекулу белка.The efficiency of the conjugation of dyes with bovine albumin was evaluated as follows. Since a large number of amino groups is present in the protein, conjugation proceeds randomly, and it is not possible to isolate an individual substance after conjugation. Therefore, the conjugation efficiency is evaluated by comparing the absorption of the dye at 500 nm (the absorption wavelength has shifted compared to the dye before conjugation) and protein at 280 nm, given that the extinction coefficients of the protein and dye at this wavelength are known (about 8.6 × 10 4 l × mol -1 × cm -1 and 4.3 × 10 4 l × mol -1 × cm -1, respectively). An example of such a spectrum is shown in Figure 4. Analysis of the spectra for dyes showed that the modification efficiency was 1-1.2 dye molecules on average per protein molecule.
Список литературыBibliography
1. Loudet A., Burgess K. Chem. Rev. 2007, 107, 4891-49321. Loudet A., Burgess K. Chem. Rev. 2007, 107, 4891-4932
2. Shah, M.; Thangaraj, K.; Soong, M.-L.; Wolford, L. T.; Boyer, J. H.; Politzer, I. R.; Pavlopoulos, T. G. Heteroat. Chem. 1990, 1, 389.2. Shah, M .; Thangaraj, K .; Soong, M.-L .; Wolford, L. T .; Boyer, J. H .; Politzer, I. R .; Pavlopoulos, T. G. Heteroat. Chem. 1990, 1, 389.
3. Wories, H. J.; Koek, J. H.; Lodder, G.; Lugtenburg, J.; Fokkens, R.; Driessen, O.; Mohn, G. R. Recl. TraV. Chim. Pays-Bas 1985, 104, 288.3. Wories, H. J .; Koek, J. H .; Lodder, G .; Lugtenburg, J .; Fokkens, R .; Driessen, O .; Mohn, G. R. Recl. TraV. Chim. Pays-Bas 1985, 104, 288.
4. Morgan, L. R.; Boyer, J. H. Boron difluoride compounds useful in photodynamic therapy and production of laser light. U.S. Patent 5446157, 1995.4. Morgan, L. R .; Boyer, J. H. Boron difluoride compounds useful in photodynamic therapy and production of laser light. U.S. Patent 5446157, 1995.
5. Morgan, L. R.; Boyer, J. H. Heterocyclic compounds and their use in photodynamic therapy. WO Patent 9419355, February 18, 1994.5. Morgan, L. R .; Boyer, J. H. Heterocyclic compounds and their use in photodynamic therapy. WO Patent 9419355, February 18, 1994.
6. Urano, T.; Nagasaka, H.; Tsuchiyama, M.; Ide, H. Photopolymerizable composition. U.S. Patent 5498641, April 7, 1994.6. Urano, T .; Nagasaka, H .; Tsuchiyama, M .; Ide, H. Photopolymerizable composition. U.S. Patent 5498641, April 7, 1994.
7. Boyer, J. H.; Morgan, L. R. Preparation of difluoroboradiaza-s-indacene compounds and methods for using them. U.S. Patent 5189029, 1993.7. Boyer, J. H .; Morgan, L. R. Preparation of difluoroboradiaza-s-indacene compounds and methods for using them. U.S. Patent 5189029, 1993.
8. Boyer, J. H.; Morgan, L. R. Fluorescent chemical compositions useful as laser dyes and photodynamic therapy agents, and methods for their use. U.S. Patent 361936, 19908. Boyer, J. H .; Morgan, L. R. Fluorescent chemical compositions useful as laser dyes and photodynamic therapy agents, and methods for their use. U.S. Patent 361936, 1990
9. Li L., Han J., Nguyen B., and Burgess K. J. Org. Chem. 2008, 73, 1963-19709. Li L., Han J., Nguyen B., and Burgess K. J. Org. Chem. 2008, 73, 1963-1970
10. Haugland R.P., Kang H.C., Chemically reactive dipyrrometheneboron difluoride dyes, US Patent 4774339 A, 198810. Haugland R.P., Kang H.C., Chemically reactive dipyrrometheneboron difluoride dyes, US Patent 4,774,339 A, 1988
11. Wang D., Fan J., Gao X., Wang B., Sun S., Peng X., J. Org. Chem. 2009, 74, 7675–768311. Wang D., Fan J., Gao X., Wang B., Sun S., Peng X., J. Org. Chem. 2009, 74, 7675–7683
Claims (6)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2017143419A RU2680090C1 (en) | 2017-12-12 | 2017-12-12 | 2-(4,4-diftor-1,3,5,7-tetramethyl-2,6-disulfo-4-boro-3a,4a-diaza-s-indacen-8-yl)-benzoic acid and its derivatives, method of their production and their application for fluorescent blinding of protein molecules |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2017143419A RU2680090C1 (en) | 2017-12-12 | 2017-12-12 | 2-(4,4-diftor-1,3,5,7-tetramethyl-2,6-disulfo-4-boro-3a,4a-diaza-s-indacen-8-yl)-benzoic acid and its derivatives, method of their production and their application for fluorescent blinding of protein molecules |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2680090C1 true RU2680090C1 (en) | 2019-02-15 |
Family
ID=65442434
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2017143419A RU2680090C1 (en) | 2017-12-12 | 2017-12-12 | 2-(4,4-diftor-1,3,5,7-tetramethyl-2,6-disulfo-4-boro-3a,4a-diaza-s-indacen-8-yl)-benzoic acid and its derivatives, method of their production and their application for fluorescent blinding of protein molecules |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2680090C1 (en) |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5189029A (en) * | 1990-04-23 | 1993-02-23 | Bo-Dekk Ventures, Ltd. | Indacene compounds and methods for using the same |
RU2296333C2 (en) * | 2001-07-02 | 2007-03-27 | Арктик Диагностикс Ой | Dyes based on dipyrromethene boron difluoride with biphotonic absorption and their use |
WO2012083509A1 (en) * | 2010-12-20 | 2012-06-28 | 大连理工大学 | Boron fluoride-dipyrromethene dye, preparation method and application thereof |
-
2017
- 2017-12-12 RU RU2017143419A patent/RU2680090C1/en active IP Right Revival
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5189029A (en) * | 1990-04-23 | 1993-02-23 | Bo-Dekk Ventures, Ltd. | Indacene compounds and methods for using the same |
RU2296333C2 (en) * | 2001-07-02 | 2007-03-27 | Арктик Диагностикс Ой | Dyes based on dipyrromethene boron difluoride with biphotonic absorption and their use |
WO2012083509A1 (en) * | 2010-12-20 | 2012-06-28 | 大连理工大学 | Boron fluoride-dipyrromethene dye, preparation method and application thereof |
Non-Patent Citations (4)
Title |
---|
CHAUHAN P. et al, Novel bodipy - Cellulose nanohybrids for the production of singlet oxygen, RSC Advances, 2016, v. 6, no. 38, p. 32070-32073. * |
LI L. et al, Syntheses and Spectral Properties of Functionalized, Water-Soluble BODIPY Derivatives, J. Org. Chem., 2008, v. 73, p. 1963-1970. * |
LI L. et al, Syntheses and Spectral Properties of Functionalized, Water-Soluble BODIPY Derivatives, J. Org. Chem., 2008, v. 73, p. 1963-1970. WANG D. et al, Carboxyl BODIPY Dyes from Bicarboxylic Anhydrides: One-Pot Preparation, Spectral Properties, Photostability, and Biolabeling, J. Org. Chem., 2009, v. 74, p. 7675-7683. * |
WANG D. et al, Carboxyl BODIPY Dyes from Bicarboxylic Anhydrides: One-Pot Preparation, Spectral Properties, Photostability, and Biolabeling, J. Org. Chem., 2009, v. 74, p. 7675-7683. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5228190B2 (en) | Peroxynitrite fluorescent probe | |
JP5090731B2 (en) | Fluorescent probe | |
Xu et al. | A novel “Turn-On” fluorescent probe for F− detection in aqueous solution and its application in live-cell imaging | |
JP6349091B2 (en) | Probe for super-resolution fluorescence imaging | |
JP5070057B2 (en) | Novel fluorescent labeling compounds | |
JP5292570B2 (en) | New maleimide derivatives | |
JP7344982B2 (en) | Compounds and fluorescently labeled biological substances using them | |
CN104745177A (en) | Light activated fluorescent probe having protein label positioning function as well as preparation method and application thereof | |
CN105670609B (en) | A kind of novel Rhodamine fluorescent probe and preparation method thereof of detection mercury ion | |
WO2014136781A1 (en) | Fluorescent probe | |
CN110092773B (en) | Xanthene derivative and preparation method and application thereof | |
RU2680090C1 (en) | 2-(4,4-diftor-1,3,5,7-tetramethyl-2,6-disulfo-4-boro-3a,4a-diaza-s-indacen-8-yl)-benzoic acid and its derivatives, method of their production and their application for fluorescent blinding of protein molecules | |
CN108314636A (en) | A kind of polyaryl sulphur oscillation luminescent material and its preparation method and application | |
US20040054195A1 (en) | Xanthene derivatives | |
EP3212733A1 (en) | New chromophoric structures for macrocyclic lanthanide chelates | |
EP2758391B1 (en) | Luminescent probes for biological marking and imagery, and preparation method thereof | |
CN111533761B (en) | Ratio type pH probe with organelle or protein targeting function and application thereof | |
KR101125058B1 (en) | Compound for labeling material, intermediate therefor and process for producing the same | |
KR101092332B1 (en) | Fluorescent Anion Receptor of Tweezer-type : Using Pyrene Amide Unit with Cationic Pyridinium Skeleton | |
CN113121566B (en) | Pyrene derivative fluorescent molecule and preparation method and application thereof | |
JP7479667B2 (en) | Compound having a sulfonylaniline skeleton or a salt thereof, or organic fluorescent material having the same | |
CN118126032A (en) | Fluorescent probe and preparation method and application thereof | |
JP2014152243A (en) | Fluorescent ion sensor dye | |
RU2688744C1 (en) | Photostable and bright fluorescent bordipyrrmitone dye | |
Li et al. | Highly specific probe for dual-emissive mitochondrial imaging based on a photostable and aqueous-soluble phosphonium fluorophore |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20191213 |
|
NF4A | Reinstatement of patent |
Effective date: 20201103 |