RU2662944C1 - Agent for treating human body conditions associated with a decrease in the level of expression of the prok 1 gene and/or a decrease in the amount of prokineticin 1 protein on the basis of gene-therapeutic substances with prok 1 gene, method for obtaining and using - Google Patents
Agent for treating human body conditions associated with a decrease in the level of expression of the prok 1 gene and/or a decrease in the amount of prokineticin 1 protein on the basis of gene-therapeutic substances with prok 1 gene, method for obtaining and using Download PDFInfo
- Publication number
- RU2662944C1 RU2662944C1 RU2017105285A RU2017105285A RU2662944C1 RU 2662944 C1 RU2662944 C1 RU 2662944C1 RU 2017105285 A RU2017105285 A RU 2017105285A RU 2017105285 A RU2017105285 A RU 2017105285A RU 2662944 C1 RU2662944 C1 RU 2662944C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- gene
- prok
- cdna
- seq
- protein
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/18—Growth factors; Growth regulators
- A61K38/1858—Platelet-derived growth factor [PDGF]
- A61K38/1866—Vascular endothelial growth factor [VEGF]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
- A61K48/0058—Nucleic acids adapted for tissue specific expression, e.g. having tissue specific promoters as part of a contruct
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
Abstract
Description
Область, к которой относится изобретениеFIELD OF THE INVENTION
Изобретение относится к молекулярной биологии, биотехнологии, генной и медицине и может быть использовано для коррекции патологических состояний клеток различных органов и тканей, а также собственно органов и тканей человека, связанных с уменьшением уровня экспрессии гена PROK 1 и/или уменьшением количества белка прокинетицина 1, в частности, в терапевтических целях.The invention relates to molecular biology, biotechnology, gene and medicine, and can be used to correct the pathological conditions of cells of various organs and tissues, as well as human organs and tissues proper, associated with a decrease in the level of expression of the
Предшествующий уровеньPrior level
Ангиогенез подразделяют на два этапа: васкулогенез и собственно ангиогенез. При этом васкулогенез представляет собой процесс образования кровеносных сосудов de novo из мезодермальных клеток-предшественников, тогда как ангиогенез - развитие новых сосудов из сосудов, сформировавшихся во время васкулогенеза. Ангиогенез начинается с секреции растворимого ангиогенного фактора, воздействующего на близрасположенный кровеносный сосуд и приводящего к изменениям в капиллярной стенке в виде деградации базальной мембраны, митотическому делению эндотелиоцитов, их последующей миграцией в строму и протеолитической деградацией экстрацеллюлярного матрикса. На следующем этапе происходит организация сосудистых эндотелиоцитов в трубчатую структуру и инициализация кровотока во вновь сформированном участке.Angiogenesis is divided into two stages: vasculogenesis and actually angiogenesis. At the same time, vasculogenesis is the process of the formation of blood vessels de novo from mesodermal progenitor cells, while angiogenesis is the development of new vessels from the vessels that formed during vasculogenesis. Angiogenesis begins with the secretion of a soluble angiogenic factor acting on a nearby blood vessel and leading to changes in the capillary wall in the form of degradation of the basement membrane, mitotic division of endotheliocytes, their subsequent migration to the stroma and proteolytic degradation of the extracellular matrix. The next stage is the organization of vascular endotheliocytes into a tubular structure and the initialization of blood flow in a newly formed area.
Ангиогенез не характерен для неповрежденных тканей организма взрослого человека в физиологических условиях и активизируется при патологическом росте тканей при опухолях, остром или хроническом воспалительном процессе, диабетической ретинопатии. Эндометрий и ткани яичника являются уникальным исключением из этого правила, так как процессы циклического ангиогенеза в них происходят ежемесячно.Angiogenesis is not characteristic of intact tissues of an adult's body under physiological conditions and is activated by pathological tissue growth in tumors, an acute or chronic inflammatory process, and diabetic retinopathy. The endometrium and ovarian tissue are a unique exception to this rule, since the processes of cyclic angiogenesis in them occur monthly.
Процесс ангиогенеза играет важную роль в развитии и нормальном росте тканей, заживлении ран, репродуктивном цикле у женщин (развитие плаценты и желтого тела, овуляции), и вовлечен в патогенез различных заболеваний. Основными медиаторами ангиогенеза являются: фактор роста фибробластов, тромбоцитарный фактор роста, сосудистый эндотелиальный фактор роста (VEGF), трансформирующий фактор роста бета. Известно индуцирующее действие других факторов: плацентарного фактора роста, интерлейкина-8, фактора роста гепатоцитов, колониестимулирующего фактора роста гранулоцитов. Действие индукторов ангиогенеза направлено на эндотелиальные клетки, а также на сосудистые гладкомышечные клетки и фибробласты. Регуляция неоваскуляризации представляет собой динамический процесс тонкого взаимодействия ингибиторов и активаторов ангиогенеза.The process of angiogenesis plays an important role in the development and normal growth of tissues, wound healing, the reproductive cycle in women (development of the placenta and corpus luteum, ovulation), and is involved in the pathogenesis of various diseases. The main mediators of angiogenesis are: fibroblast growth factor, platelet growth factor, vascular endothelial growth factor (VEGF), transforming growth factor beta. The inducing effect of other factors is known: placental growth factor, interleukin-8, hepatocyte growth factor, colony-stimulating granulocyte growth factor. The action of angiogenesis inducers is directed to endothelial cells, as well as to vascular smooth muscle cells and fibroblasts. The regulation of neovascularization is a dynamic process of the subtle interaction of inhibitors and activators of angiogenesis.
Фактор роста, выделяемый клетками эндокринных желез, который получил название прокинетицин 1 (PROK 1). По своей структуре он близок к семейству VEGF и поэтому первоначально был назван сосудистым эндотелиальным фактором роста, выделенным из эндокринных желез (EG-VEGF). Данная молекула вызывала пролиферацию, миграцию и образование мембранных разрывов в эндотелиальных клетках капилляров, полученных из эндокринных желез. При этом прокинетицин 1 практически не оказывал никакого влияния на другие типы тестируемых эндотелиальных и не эндотелиальных клеток. Подобно VEGF, прокинетицин 1 обладает сайтом связывания HIF-1, и его экспрессия индуцируется гипоксией. Оба фактора приводили к обширному ангиогенезу и формированию кисты при их доставке в яичник. Однако, в отличие VEGF, с помощью прокинетицина 1 удалось стимулировать ангиогенез в роговице или скелетной мышце. Прокинетицин 1 (EG-VEGF) является примером класса узкоспециализированных митогенов, которые действуют, чтобы регулировать тканеспецифичные пролиферацию и дифференцировку эндотелия сосудов.A growth factor secreted by endocrine gland cells called prokineticin 1 (PROK 1). In its structure, it is close to the VEGF family and therefore was originally called the vascular endothelial growth factor isolated from endocrine glands (EG-VEGF). This molecule caused proliferation, migration, and the formation of membrane breaks in the endothelial cells of capillaries derived from endocrine glands. Moreover,
Белок Bv8, который обозначается как прокинетицин 2 (PROK 2) и представляет собой близко связанный секретируемый белок с EG-VEGF (PROK 1). Показано, что Bv8 индуцирует пролиферацию, выживаемость и миграцию клеток эндотелия сосудов коры надпочечников (LeCouter, J. et al, Proc Natl Acad Sci USA 100, 2685-2690 (2003)). Если PROK 1 (EG-VEGF) экспрессируется преимущественно в эндокринных железах и половых органах, то PROK 2 (Bv8) связан преимущественно с нервной системой.Protein Bv8, which is designated as prokineticin 2 (PROK 2) and is a closely related secreted protein with EG-VEGF (PROK 1). Bv8 has been shown to induce proliferation, survival, and migration of adrenal cortical endothelial cells (LeCouter, J. et al, Proc Natl Acad Sci USA 100, 2685-2690 (2003)). If PROK 1 (EG-VEGF) is expressed primarily in the endocrine glands and genitals, then PROK 2 (Bv8) is associated mainly with the nervous system.
Сигнальная система прокинетицинов представлена двумя парами лиганд/рецептор - парой PROK1/PROKR1, область действия которой ограничивается желудочно-кишечным трактом (здесь продукты этих генов участвуют в запуске действия мотилина - полипептидного гормона, регулирующего моторику желудка и кишечника).The prokineticin signaling system is represented by two ligand / receptor pairs - the PROK1 / PROKR1 pair, whose scope is limited to the gastrointestinal tract (here the products of these genes are involved in triggering the action of motilin, a polypeptide hormone that regulates the motility of the stomach and intestines).
Экспрессия PROK1 выявлена в клетках семенников, надпочечников, яичников и плаценты, а его эффекты ограничены эндотелиоцитами этих органов. Также экспрессия выявлена в вагине, шейке, придатках матки, отделах головного мозга, мозжечке, гипофизе, коре головного мозга, спинном мозге, предстательной железе, сердце, молочных железах, селезенке, скелетной мышечной ткани, мочевом пузыре, желчном пузыре, коже ноги, надлобковой коже, роговице, слизистой оболочке канала шейки матки, подкожной жировой клетчатке, висцеральной жировой ткани (http://www.proteinatlas.org/ENSG00000143125-PROK1/tissue).Expression of PROK1 was detected in the cells of the testes, adrenal glands, ovaries and placenta, and its effects are limited to endotheliocytes of these organs. Expression is also found in the vagina, cervix, uterine appendages, brain, cerebellum, pituitary gland, cerebral cortex, spinal cord, prostate gland, heart, mammary glands, spleen, skeletal muscle tissue, bladder, gall bladder, leg skin, suprapubic skin, cornea, mucous membrane of the cervical canal, subcutaneous fat, visceral adipose tissue (http://www.proteinatlas.org/ENSG00000143125-PROK1/tissue).
В патенте RU 2559542 описана кодирующая нуклеиновая кислота; вектор экспрессии на ее основе для получения антитела к Bv8 (PROK 2); клетка-хозяин для экспрессии антитела на основе вектора, а также способ получения антитела с использованием клетки. Раскрыта фармацевтическая композиция, использующая антитело в эффективном количестве, а также применение антитела - для лечения опухоли, рака или нарушения пролиферации клеток. Предложено применение антитела для снижения или ингибирования ангиогенеза у субъекта, а также для ингибирования пролиферации клеток эндотелия. Использование изобретения обеспечивает новые антитела с аффинностью в отношении Bv8 человека или макака (KD) менее 10-11 М, как измерено методом BIACORE 3000, которые могут найти применение в терапии различных раковых заболеваний.Patent RU 2559542 describes a coding nucleic acid; expression vector based on it to obtain antibodies to Bv8 (PROK 2); a host cell for expressing a vector-based antibody; and a method for producing an antibody using a cell. Disclosed is a pharmaceutical composition using an antibody in an effective amount, as well as the use of an antibody to treat a tumor, cancer, or cell proliferation disorder. The use of antibodies is proposed to reduce or inhibit angiogenesis in a subject, as well as to inhibit proliferation of endothelial cells. The use of the invention provides new antibodies with an affinity for human Bv8 or macaque (K D ) less than 10 -11 M, as measured by the BIACORE 3000 method, which can be used in the treatment of various cancers.
В заявке WO 2004081229 описано изобретение, которое содержит способы применения полипептидов Bv8 (PROK 2) и EG-VEGF (PROK 1) и соответствующих нуклеиновых кислот для содействия процессу кроветворения. Кроме того, содержит методы скрининга модуляторов для активности Bv8 и EG-VEGF. Кроме того, в заявке предусмотрены способы лечения с использованием полипептидов Bv8 и EG-VEGF или их антагонистов.WO2004081229 describes an invention that provides methods for using the Bv8 polypeptides (PROK 2) and EG-VEGF (PROK 1) and the corresponding nucleic acids to facilitate the blood formation process. In addition, it contains modulator screening methods for Bv8 and EG-VEGF activity. In addition, the application provides methods of treatment using Bv8 and EG-VEGF polypeptides or their antagonists.
За прототип авторами было принято решение по заявке WO 2003/020892, в котором описаны способы применения полипептида Bv8 (PROK 2), чтобы индуцировать пролиферацию эндотелиальных клеток и повысить выживаемость эндотелиальных клеток. Также содержит методы скрининга модуляторов для активности Bv8. Кроме того, в заявке предусмотрены способы лечения с использованием полипептида Bv8. В одном из вариантов реализации изобретения способ включает в себя контактирование клетки с Bv8 в количестве, эффективном для индукции пролиферации клеток. Способ может дополнительно включать в себя контактирование клеток с VEGF. В другом варианте осуществления настоящего изобретения способ включает введение нуклеиновой кислоты, кодирующей Bv8 в клетки в количестве, эффективном для индукции пролиферации клеток.For the prototype, the authors made a decision on the application WO 2003/020892, which describes methods of using the Bv8 polypeptide (PROK 2) to induce proliferation of endothelial cells and increase the survival of endothelial cells. Also contains screening methods for modulators for Bv8 activity. In addition, the application provides methods of treatment using the Bv8 polypeptide. In one embodiment of the invention, the method comprises contacting the cell with Bv8 in an amount effective to induce cell proliferation. The method may further include contacting the cells with VEGF. In another embodiment of the present invention, the method comprises introducing a nucleic acid encoding Bv8 into cells in an amount effective to induce cell proliferation.
Недостатком данного подхода является высокая стоимость получения чистого белка, более частое его введение при терапии (что увеличивает стоимость терапии и повышает риск побочных явлений) и сложность внутриклеточной доставки препарата, а также то, что при создании генно-терапевтического средства в этом изобретении не учитываются индивидуальные характеристики пациента, в связи с которыми может понадобиться группа вариаций для данного средства.The disadvantage of this approach is the high cost of obtaining pure protein, its more frequent administration during therapy (which increases the cost of therapy and increases the risk of side effects) and the complexity of the intracellular delivery of the drug, as well as the fact that when creating a gene-therapeutic agent in this invention are not taken into account patient characteristics, in connection with which a group of variations for this agent may be needed.
Раскрытие изобретенияDisclosure of invention
Задачей данного изобретения является создание высокоэффективного средства для лечения состояний человеческого организма, связанных с уменьшением уровня экспрессии гена PROK 1 и/или уменьшением количества белка прокинетицина 1, на основе генно-терапевтических субстанций с геном PROK 1.The objective of the invention is to provide a highly effective tool for the treatment of human body conditions associated with a decrease in the level of expression of the
Указанная задача решается за счет того, что создано средство для лечения состояний человеческого организма, связанных с уменьшением экспрессии гена PROK 1 и/или уменьшением количества белка прокинетицина 1, на основе генно-терапевтических субстанций с геном PROK 1, представляющее собой, по крайней мере, одну генно-терапевтическую субстанцию, выбранную из группы генно-терапевтических субстанций, каждая из которых представляет генетическую конструкцию на основе векторной плазмиды, включающей кДНК гена PROK 1, с кодирующей последовательностью белка прокинетицина 1, с делециями 5' и 3'-нетранслируемых областей, а именно, полученной на основе участка нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:1, или модифицированной кДНК гена PROK 1, при этом в качестве модифицированной кДНК гена PROK 1 используют SEQ ID No:2, или SEQ ID No:3, или SEQ ID No:4, или SEQ ID No:5, или SEQ ID No:6, или SEQ ID No:7, или сочетание этих генетических конструкций, каждая из которых содержит также регуляторные элементы, обеспечивающие высокий уровень экспрессии гена PROK 1 в эукариотических клетках, в частности в клетках органов и тканей человека, и способную увеличить количество белка прокинетицина 1, в клетках органов и тканей и/или органах и тканях человека, в частности в фибробластах, в эндотелиоцитах семенников, надпочечников, яичников и плаценты, в вагине, шейке, придатках матки, отделах головного мозга, мозжечке, гипофизе, коре головного мозга, спинном мозге, предстательной железе, сердце, молочных железах, селезенке, скелетной мышечной ткани, мочевом пузыре, желчном пузыре, коже ноги, надлобковой коже, роговице, слизистой оболочке канала шейки матки, подкожной жировой клетчатке, висцеральной жировой ткани в сочетании с транспортной молекулой или без нее при введении этих генно-терапевтических субстанций в органы и ткани человека. При этом каждая генетическая конструкция с модифицированной кДНК гена PROK 1 содержит последовательность нуклеотидов, включающую в себя белок-кодирующую область кДНК гена PROK 1, которая несет модификации, не затрагивающие структуру белка прокинетицина 1, а именно: нуклеотидные замены, не приводящие к аминокислотным заменам или обрыву аминокислотной цепи, или комбинации вышеперечисленных модификаций и, не влияющие на кодируемую этой последовательностью аминокислотную последовательность.This problem is solved due to the fact that a tool has been created for treating the conditions of the human body associated with a decrease in the expression of the
В качестве транспортной молекулы используют липосомы, или дендримеры 5-го и выше поколений, или амфифильные блок-сополимеры.Liposomes, or dendrimers of the 5th and higher generations, or amphiphilic block copolymers are used as a transport molecule.
Способ получения средства для лечения состояний человеческого организма связанного с уменьшением экспрессии гена PROK 1 и/или уменьшением количества белка прокинетицина 1, заключается в получении каждой генно-терапевтической субстанции из группы созданных генно-терапевтических субстанций, при этом получают кДНК гена PROK 1, затем помещают кДНК в векторную плазмиду, способную обеспечить высокий уровень экспрессии этой кДНК в клетках различных органов и тканей человека, наращивают и выделяют необходимое количество генетической конструкции, затем комбинируют генетическую конструкцию с транспортной молекулой для трансфекции полученной генно-терапевтической субстанцией клеток органов и тканей и/или введения полученной генно-терапевтической субстанции в органы и ткани человека, при этом используют кДНК гена PROK 1 с кодирующей последовательностью белка прокинетицина 1, с делециями 5' и 3'-нетранслируемых областей, а именно, полученной на основе участка нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:1, или модифицированной кДНК гена PROK 1, при этом в качестве модифицированной кДНК гена PROK 1 используют, или SEQ ID No:2, или SEQ ID No:3, или SEQ ID No:4, или SEQ ID No:5, или SEQ ID No:6, или SEQ ID No:7, или сочетание этих генетических конструкций.A method of obtaining a means for treating the conditions of the human body associated with a decrease in the expression of the
Способ использования средства для лечения состояний человеческого организма, связанных с уменьшением экспрессии гена PROK 1 и/или уменьшением количества белка прокинетицина 1, заключается в трансфекции генно-терапевтической субстанцией, выбранной из группы созданных генно-терапевтических субстанций клеток органов и тканей пациента и/или во введении в органы и ткани пациента аутологичных клеток пациента, трансфицированных генно-терапевтической субстанцией, выбранной из группы созданных генно-терапевтических субстанций, и/или во введении в органы и ткани пациента генно-терапевтической субстанции или нескольких субстанций, выбранной/ выбранных из группы созданных генно-терапевтических субстанций, или сочетанием обозначенных способов.A method of using an agent for treating conditions of the human body associated with a decrease in the expression of the
Описание фигурDescription of figures
На фиг. 1 представлена нуклеотидная последовательность немодифицированной кДНК гена PROK 1 длиной 318 н.п. SEQ ID No:1, которая имеет высокую гомологию с приводимой в базе данных GenBank под номером NM_032414. и кодирует белок прокинетицина 1 (GenBank NP_115790.1).In FIG. 1 shows the nucleotide sequence of unmodified cDNA of the
На фиг. 2 представлена нуклеотидная последовательность модифицированной кДНК гена PROK 1, SEQ ID No:2, которая содержит 1 нуклеотидную замену G→C в позиции 66 и 1 нуклеотидную замену A→G в позиции 69, не приводящих к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1.In FIG. Figure 2 shows the nucleotide sequence of the modified cDNA of the
На фиг. 3 представлена нуклеотидная последовательность модифицированной кДНК гена PROK 1, SEQ ID No:3, котораяIn FIG. 3 shows the nucleotide sequence of the modified cDNA of the
содержит 1 нуклеотидную замену G→C в позиции 66, две нуклеотидных замены A→G в позиции 69, 90, не приводящих к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1.contains 1 nucleotide substitution G → C at position 66, two nucleotide substitutions A → G at position 69, 90, which do not lead to changes in the amino acid sequence of
На фиг. 4 представлена нуклеотидная последовательность модифицированной кДНК гена PROK 1, SEQ ID No:4, котораяIn FIG. 4 shows the nucleotide sequence of the modified cDNA of the
содержит 1 нуклеотидную замену G→C в позиции 66, 3 нуклеотидных замены A→G в позициях 69, 90, 93, не приводящих к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1.contains 1 nucleotide substitution G → C at
На фиг. 5 представлена нуклеотидная последовательность модифицированной кДНК гена PROK 1, SEQ ID NO:5, котораяIn FIG. 5 shows the nucleotide sequence of the modified cDNA of the
содержит 1 нуклеотидную замену G→C в позиции 66, 4 нуклеотидных замены A→G в позициях 69, 90, 93, 186, не приводящих к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1.contains 1 nucleotide substitution G → C at
На фиг. 6 представлена нуклеотидная последовательность модифицированной кДНК гена PROK 1, SEQ ID NO:6, котораяIn FIG. 6 shows the nucleotide sequence of the modified cDNA of the
содержит 2 нуклеотидных замены G→C в позициях 66, 207; 4 нуклеотидных замены A→G в позициях 69, 90, 93, 186, не приводящих к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1.contains 2 nucleotide substitutions G → C at positions 66, 207; 4 nucleotide substitutions A → G at positions 69, 90, 93, 186, which do not lead to changes in the amino acid sequence of
На фиг. 7 представлена нуклеотидная последовательность модифицированной кДНК гена PROK 1, SEQ ID No:7, котораяIn FIG. 7 shows the nucleotide sequence of the modified cDNA of the
содержит 3 нуклеотидных замены G→C в позициях 66, 207, 321; 4 нуклеотидных замены A→G в позициях 69, 90, 93, 186, не приводящих к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1.contains 3 nucleotide substitutions G → C at positions 66, 207, 321; 4 nucleotide substitutions A → G at positions 69, 90, 93, 186, which do not lead to changes in the amino acid sequence of
Фиг. 8. С целью последующего корректного определения генно-терапевтического эффекта после трансфекции фибробластов генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1 проводили анализ эндогенной экспрессии гена PROK 1 в культуре первичных фибробластов. На фигуре представлены графики накопления продуктов полимеразной цепной реакции (ПЦР), соответствующих:FIG. 8. In order to subsequently correctly determine the gene therapeutic effect after transfection of fibroblasts with the gene therapeutic substance with the cDNA of the
1 - кДНК гена PROK 1, фибробласты со сниженной экспрессией гена PROK 1,1 - cDNA of the
2 - кДНК гена PROK 1, фибробласты с нормальной экспрессией гена PROK 1,2 - cDNA of the
3 - кДНК гена В2М, фибробласты со сниженной экспрессией гена PROK 1,3 - cDNA of the B2M gene, fibroblasts with reduced expression of the
4 - кДНК гена В2М, фибробласты с нормальной экспрессией гена PROK 1.4 - cDNA of the B2M gene, fibroblasts with normal expression of the
В качестве референтного гена использовали ген В2М (Бета-2-микроглобулин) приведенного в базе данных GenBank под номером NM 004048.2.The B2M gene (Beta-2-microglobulin) shown in the GenBank database under the number NM 004048.2 was used as the reference gene.
Фиг. 9. С целью подтверждения увеличения экспрессии гена PROK 1 в клеточной культуре фибробластов со сниженной экспрессией гена PROK 1 при трансфекции данных клеток генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1 с генетической конструкцией pCMV6- PROK 1 SEQ ID No:1 представлены графики накопления ПЦР-продуктов, соответствующих:FIG. 9. In order to confirm the increase in the expression of the
1 - кДНК гена PROK 1 в фибробластах с нормальной экспрессией гена PROK 1,1 - cDNA of the
2 - кДНК гена PROK 1 в фибробластах со сниженной экспрессией гена PROK 1 до трансфекции ГТС с кДНК гена PROK 1,2 - cDNA of the
3 - кДНК гена PROK 1 в фибробластах со сниженной экспрессией гена PROK 1 после трансфекции ГТС с кДНК гена PROK 1,3 - cDNA of the
4 - кДНК гена PROK 1 в фибробластах со сниженной экспрессией гена PROK 1 после трансфекции вектором без кДНК гена PROK 1,4 - cDNA of the
5 - кДНК гена В2М в фибробластах с нормальной экспрессией гена PROK 1,5 - cDNA of the B2M gene in fibroblasts with normal expression of the
6 - кДНК гена В2М в фибробластах со сниженной экспрессией гена PROK 1 до трансфекции ГТС с кДНК гена PROK 1,6 - cDNA of the B2M gene in fibroblasts with reduced expression of the
7 - кДНК гена В2М в фибробластах со сниженной экспрессией гена PROK 1 после трансфекции ГТС с кДНК гена PROK 1,7 - cDNA of the B2M gene in fibroblasts with reduced expression of the
8 - кДНК гена В2М в фибробластах со сниженной экспрессией гена PROK 1 после трансфекции вектором без кДНК гена PROK 1.8 - cDNA of the B2M gene in fibroblasts with reduced expression of the
Из графиков следует, что в случае трансфекции вектором без вставки кДНК гена PROK 1 уровень кДНК гена PROK 1 в фибробластах не изменился, а в случае трансфекции вектором с кДНК гена PROK 1 - уровень кДНК фибробластов со сниженной экспрессией гена PROK 1 многократно увеличился (до уровня выше, чем уровень кДНК гена PROK 1 в нормальных фибробластах).From the graphs it follows that in the case of transfection with a vector without inserting the cDNA of the
Фиг. 10. С целью подтверждения увеличения количества белка прокинетицина 1, в клеточной культуре фибробластов с нормальной экспрессией гена PROK 1 при трансфекции данных клеток генно-терапевтической субстанцией содержащей кДНК гена PROK 1 представлен график изменения количества белка прокинетицина 1, нетрансфицированных фибробластов (культура А), трансфицированных вектором pCDNA 3.1 (+) не содержащим кДНК гена PROK 1 (культура В) и трансфицированных генно-терапевтической субстанцией с генетической конструкцией pCDNA 3.1-PROK 1SEQ ID No:1 (культура С). Из графика следует, что при трансфекции фибробластов генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1 происходит увеличение количества белка прокинетицина 1, в клеточном лизате.FIG. 10. In order to confirm the increase in the amount of
Фиг. 11. С целью подтверждения увеличения количества белка прокинетицина 1, в коже человека при введении в кожу клеточной культуры фибробластов, трансфицированной генно-терапевтической субстанцией, представлен анализ изменения количества белка прокинетицина 1, в коже пациентов. При этом пациентам вводили три варианта культуры аутологичных фибробластов - нетрансфицированные (А), трансфицированные вектором pCMV6-XL5 (В) и трансфицированные генно-терапевтической субстанцией с генетической конструкцией pCMV6- PROK 1 SEQ ID No:7 (С) - в кожу голени. Также анализировали количественный уровень белка прокинетицина 1, в интактной коже. Показано повышение количества белка прокинетицина 1, в коже пациента в области введения фибробластов, трансфицированных генно-терапевтической субстанцией кДНК гена PROK 1 (С).FIG. 11. In order to confirm the increase in the amount of
Фиг. 12. С целью подтверждения увеличения количества белка прокинетицина 1 до различного индивидуального уровня в клеточных культурах фибробластов пациентов при трансфекции данных клеток генно-терапевтическими субстанциями с участком нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и модифицированных кДНК гена PROK 1, представлен анализ изменения количественного уровня белка прокинетицина 1, в культурах фибробластов кожи человека в зависимости от наличия и типа модификаций в кДНК гена PROK 1, используемой для трансфекции фибробластов.FIG. 12. In order to confirm the increase in the amount of
Культуры фибробластов 24 пациентов делили на 8 частей каждую с (А) по (Н); первые части (А) клеточных культур пациентов трансфицировали генно-терапевтической субстанцией pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:1, части (В) трансфицировали генно-терапевтической субстанцией pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:2, части (С) трансфицировали генно-терапевтической субстанцией pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:3, части (D) трансфицировали генно-терапевтической субстанцией pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:4, части (E) трансфицировали генно-терапевтической субстанцией pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:5, части (F) трансфицировали генно-терапевтической субстанцией pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:6, части (G) трансфицировали генно-терапевтической субстанцией pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:7, части (H) трансфицировали векторной плазмидой, не содержащей кДНК гена PROK 1.Fibroblast cultures of 24 patients were divided into 8 parts each from (A) to (H); the first parts (A) of the patient’s cell cultures were transfected with the gene therapeutic substance pCMV6-
По итогам анализа количественного уровня белка прокинетицина 1, выбрали показатели, касательно каждой части клеточной культуры от каждого пациента, продемонстрировавшие максимальное количество белка прокинетицина 1, и объединили их в семь групп, исходя из следующего критерия:Based on the results of the analysis of the quantitative level of
В группе 1 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:1,In
в группе 2 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:2,in
в группе 3 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:3,in
в группе 4 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:4,in
в группе 5 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:5,in
в группе 6 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:6,in
в группе 7 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:7.in
Ни в одной из клеточных культур не наблюдалось того, что максимальное количество белка прокинетицина 1, присутствует при трансфекции вектором без вставки кДНК гена PROK 1.None of the cell cultures showed that the maximum amount of
На фигуре 12 для каждой группы клеточных культур приведены диаграммы показателей концентрации белка прокинетицина 1, (усредненных в рамках группы, в случае, если в группу входит более одной клеточной культуры) применительно ко всем, участвующим в эксперименте генно-терапевтическим субстанциям, после трансфекции этих клеточных культур генно-терапевтическими субстанциями, содержащими модифицированные и нативную кДНК гена PROK 1.The figure 12 for each group of cell cultures shows a diagram of indicators of the concentration of
Из фигуры следует, что достижение максимального количества белка прокинетицина 1, в культурах фибробластов кожи различных пациентов при их трансфекции генно-терапевтическими субстанциями, связано с индивидуальными особенностями пациентов и зависит от наличия и типа модификаций в кДНК гена PROK 1, входящих в генно-терапевтические субстанции.It follows from the figure that the achievement of the maximum amount of
Каждая генно-терапевтическая субстанция из группы генно-терапевтических субстанций является эффективной в некоторой значительной группе пациентов. Следовательно, для выбора наиболее эффективной генно-терапевтической субстанции из группы генно-терапевтических субстанций для терапевтических целей необходимо предварительное персонализированное исследование пациента.Each gene-therapeutic substance from the group of gene-therapeutic substances is effective in some significant group of patients. Therefore, in order to select the most effective gene-therapeutic substance from the group of gene-therapeutic substances for therapeutic purposes, a preliminary personalized study of the patient is necessary.
Обозначения:Designations:
части клеточных культур, трансфицированных ГТС PROK 1 SEQ ID No:1 (A) parts of cell cultures transfected with
части клеточных культур, трансфицированных ГТС PROK 1 SEQ ID No:2 (В) parts of cell cultures transfected with
части клеточных культур, трансфицированных ГТС PROK 1 SEQ ID No:3 (С) parts of cell cultures transfected with
части клеточных культур, трансфицированных ГТС PROK 1 SEQ ID No:4 (D) parts of cell cultures transfected with
части клеточных культур, трансфицированных ГТС PROK 1 SEQ ID No:5 (E) parts of cell cultures transfected with
части клеточных культур, трансфицированных ГТС PROK 1 SEQ ID No:6 (F) parts of cell cultures transfected with
части клеточных культур, трансфицированных ГТС PROK 1 SEQ ID No:7 (G) parts of cell cultures transfected with
части клеточных культур, трансфицированных плацебо (Н) parts of cell cultures transfected with placebo (H)
Фиг. 13. С целью подтверждения увеличения экспрессии гена PROK 1 в клеточной культуре эпителия эндометрия матки при трансфекции данных клеток генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1 в генетической конструкции pCMV6-Kan/Neo PROK 1 SEQ ID No:2 приведены графики накопления ПЦР-продуктов, соответствующих:FIG. 13. In order to confirm the increase in the expression of the
1 - кДНК гена PROK 1, эпителий эндометрия до трансфекции1 - cDNA of the
2 - кДНК гена PROK 1, эпителий эндометрия после трансфекции2 - cDNA of the
3 - кДНК гена В2М, эпителий эндометрия до трансфекции3 - cDNA of the B2M gene, endometrial epithelium before transfection
4 - кДНК гена В2М, эпителий эндометрия после трансфекции4 - cDNA of the B2M gene, endometrial epithelium after transfection
Ген В2М использовали в качестве референтного.The B2M gene was used as a reference.
Из фигуры следует, что в результате трансфекции уровень специфической кДНК гена PROK 1 в культуре эпителия эндометрия матки многократно вырос.From the figure it follows that as a result of transfection, the level of specific cDNA of the
Фиг. 14. С целью подтверждения увеличения экспрессии гена PROK 1 в клеточной культуре эпителиальных клеток роговицы глаза человека при трансфекции данных клеток генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1 приведены графики накопления ПЦР-продуктов, соответствующих:FIG. 14. In order to confirm the increase in the expression of the
1 - кДНК гена PROK 1, до трансфекции1 - cDNA of the
2 - кДНК гена PROK 1, после трансфекции2 - cDNA of the
3 - кДНК гена В2М, до трансфекции3 - cDNA of the B2M gene, before transfection
4 - кДНК гена В2М, после трансфекции4 - cDNA of the B2M gene, after transfection
Ген В2М использовали в качестве референтного.The B2M gene was used as a reference.
Из фигуры следует, что в результате трансфекции уровень специфической кДНК гена PROK 1 вырос многократно.From the figure it follows that as a result of transfection, the level of specific cDNA of the
Фиг. 15. С целью подтверждения увеличения количества белка прокинетицина 1, в коже человека при введении в кожу генно-терапевтической субстанции представлен анализ изменения количественного уровня белка прокинетицина 1, в коже. При этом пациенту вводили генно-терапевтическую субстанцию, содержащую векторную плазмиду с кДНК гена PROK 1 pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:4 (В) и параллельно вводили плацебо, представляющее собой комбинацию векторной плазмиды pCMV-XL5 не содержащей кДНК гена PROK 1 с транспортной молекулой (А) - в кожу в зоне голени. Показано увеличение количества белка прокинетицина 1, в биоптате кожи пациента 1В, которому вводились генно-терапевтическая субстанция, содержащая генетическую конструкцию с кДНК гена PROK 1, что говорит об эффективности генно-терапевтической субстанции.FIG. 15. In order to confirm the increase in the amount of
Обозначения:Designations:
пациент 1А patient 1A
пациент 1В patient 1B
пациент 1В до введения ГТС patient 1B before the introduction of the GTS
Фиг. 16. С целью подтверждения увеличения количества белка прокинетицина 1 в хрящевой ткани человека при введении в хрящевую ткань генно-терапевтической субстанции представлен анализ изменения количественного уровня белка прокинетицина 1 хрящевой ткани. При этом пациенту вводили генно-терапевтическую субстанцию, содержащую векторную плазмиду с кДНК гена PROK 1 pCDNA 3.1 PROK 1 SEQ ID No:5 (В) и параллельно вводили плацебо pCDNA 3.1(+), представляющее собой комбинацию векторной плазмиды не содержащей кДНК гена PROK 1 с транспортной молекулой (А) - в хрящевую ткань.FIG. 16. In order to confirm the increase in the amount of
Показано увеличение количественного уровня белка прокинетицина 1, в лизате биоптата хрящевой ткани пациента 1В, которому вводились генно-терапевтическая субстанция, содержащая генетическую конструкцию с кДНК гена PROK 1, что говорит об эффективности генно-терапевтической субстанции.An increase in the quantitative level of
Обозначения:Designations:
пациент 1А patient 1A
пациент 1В patient 1B
пациент 1В до введения ГТС patient 1B before the introduction of the GTS
Фиг. 17. С целью подтверждения увеличения количества белка прокинетицина 1, в мышечной ткани человека при введении в мышечную ткань генно-терапевтической субстанции представлен анализ изменения количества белка прокинетицина 1, в мышечной ткани. При этом пациенту вводили генно-терапевтическую субстанцию, содержащую векторную плазмиду с кДНК гена PROK 1 - pCMV6-Kan/Neo PROK 1 SEQ ID No:6 (В) и параллельно вводили плацебо pCMV6-Kan/Neo, представляющее собой комбинацию векторной плазмиды не содержащей кДНК гена PROK 1 с транспортной молекулой (А) - в мышечную ткань в зоне предплечья. Показано увеличение количества белка прокинетицина 1, в биоптате мышечной ткани пациента 1В, которому вводились генно-терапевтическая субстанция, содержащая генетическую конструкцию с кДНК гена PROK 1, что говорит об эффективности генно-терапевтической субстанции. Обозначения:FIG. 17. In order to confirm the increase in the amount of
пациент 1А patient 1A
пациент 1В patient 1B
пациент 1В до введения ГТС patient 1B before the introduction of the GTS
Фиг. 18. С целью подтверждения увеличения количества белка прокинетицина 1, до различного индивидуального уровня при введении в кожу пациентов генно-терапевтических субстанций с модифицированными кДНК гена PROK 1 и участком нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 анализировали количественный уровень белка прокинетицина 1 в коже человека в зависимости от наличия и типа модификаций в кДНК гена PROK 1.FIG. 18. In order to confirm the increase in the amount of
Каждому из 23-х пациентов, которые были отобраны в случайном порядке, вводили в кожу голени 7 генно-терапевтических субстанций pCMV6-SEQ ID No:1, pCMV6-SEQ ID No:2, pCMV6-SEQ ID No:3, pCMV6-SEQ ID No:4, pCMV6-SEQ ID No:5, pCMV6-SEQ ID No:6, pCMV6-SEQ ID No:7, и плацебо pCMV6- XL5.To each of the 23 patients who were randomly selected, 7 gene-therapeutic substances pCMV6-SEQ ID No: 1, pCMV6-SEQ ID No: 2, pCMV6-SEQ ID No: 3, pCMV6-SEQ were injected into the lower leg skin ID No: 4, pCMV6-SEQ ID No: 5, pCMV6-SEQ ID No: 6, pCMV6-SEQ ID No: 7, and placebo pCMV6-XL5.
По итогам анализа количества белка прокинетицина 1, в биоптатах выбрали показатели, касательно каждого биоптата от каждого пациента, продемонстрировавшие максимальные количественные уровни белка прокинетицина 1, и объединили их в семь групп, исходя из следующего критерия:Based on the results of the analysis of the amount of
В группе 1 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:1,In
в группе 2 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:2,in
в группе 3 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:3,in
в группе 4 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении pCMV6-PPOK 1 SEQ ID No:4,in
в группе 5 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:5,in
в группе 6 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:6,in
в группе 7 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении pCMV6-PROK 7 SEQ ID No:7.in
Ни в одном из биоптатов не наблюдалось того, что максимальное количество белка прокинетицина 1, присутствует в случае введения плацебо.None of the biopsy specimens showed that the maximum amount of
На фигуре 18 для каждой группы биоптатов приведены диаграммы показателей концентрации белка прокинетицина 1, (усредненных в рамках группы, в случае, если в группу входит более одного биоптата) применительно ко всем, участвующим в эксперименте генно-терапевтическим субстанциям, после введения пациентам этих генно-терапевтических субстанций, содержащих модифицированные кДНК гена PROK 1 и участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1.The figure 18 for each group of biopsy samples shows charts of indicators of the concentration of
Из данного примера следует, что достижение максимального количества белка прокинетицина 1, в биоптатах кожи различных пациентов при введении им в кожу генно-терапевтических субстанций, связано с индивидуальными особенностями пациентов и зависит от наличия и типа модификаций в кДНК гена PROK 1, входящих в генно-терапевтические субстанции.From this example, it follows that the achievement of the maximum amount of
Каждая генно-терапевтическая субстанция из группы генно-терапевтических субстанций является эффективной в некоторой значительной группе пациентов. Следовательно, для выбора наиболее эффективной генно-терапевтической субстанции из группы генно-терапевтических субстанций для терапевтических целей, необходимо предварительное персонализированное исследование пациента. Обозначения:Each gene-therapeutic substance from the group of gene-therapeutic substances is effective in some significant group of patients. Therefore, in order to select the most effective gene-therapeutic substance from the group of gene-therapeutic substances for therapeutic purposes, a preliminary personalized study of the patient is necessary. Designations:
биоптаты пациентов после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:1 (A) biopsy specimens of patients after the administration of
биоптаты пациентов после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:2 (В) biopsy specimens of patients after the administration of
биоптаты пациентов после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:3 (С) biopsy specimens of patients after the administration of
биоптаты пациентов после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:4 (D) biopsy specimens of patients after the administration of
биоптаты пациентов после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:5 (E) biopsy specimens of patients after the administration of
биоптаты пациентов после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:6 (F) biopsy specimens of patients after the administration of
биоптаты пациентов после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:7 (G) biopsy specimens of patients after the administration of
биоптаты пациентов после введения плацебо (Н) biopsy samples of patients after placebo (N)
Фиг. 19. С целью определения наиболее эффективной применительно к конкретному пациенту генно-терапевтической субстанции анализировали количественный уровень белка прокинетицина 1, в клеточных лизатах фибробластов этого пациента, трансфицированных разными генетическими конструкциями, содержащими участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 или модифицированные кДНК гена PROK 1.FIG. 19. In order to determine the most effective gene-therapeutic substance for a particular patient, the quantitative level of
По итогам анализа количества белка прокинетицина 1, в культуре фибробластов пациента выделили вариант генно-терапевтической субстанции, при трансфекции которой выявляется максимальная концентрация белка прокинетицина 1, в лизате клеточной культуры. В данном эксперименте максимальная концентрация белка прокинетицина 1, в лизате наблюдается при трансфекции генно-терапевтической субстанцией на базе pCMV6 PROK 1 SEQ ID No:1, содержащей участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1, что показано на фигуре 19.According to the results of the analysis of the amount of
Таким образом, выбрана наиболее эффективная применительно к данному пациенту генно-терапевтическая субстанция для последующей трансфекции клеток пациента в рамках терапевтической процедуры.Thus, the most effective gene-therapeutic substance has been selected for this patient for subsequent transfection of the patient's cells as part of a therapeutic procedure.
Обозначения:Designations:
1 - клеточный лизат после трансфекции ГТС PROK 1 SEQ ID No:1 (A)1 - cell lysate after transfection of
2 - клеточный лизат после трансфекции ГТС PROK 1 SEQ ID No:2 (В)2 - cell lysate after transfection of
3 - клеточный лизат после трансфекции ГТС PROK 1 SEQ ID No:3 (С)3 - cell lysate after transfection of
4 - клеточный лизат после трансфекции ГТС PROK 1 SEQ ID No:4 (D)4 - cell lysate after transfection of the
5 - клеточный лизат после трансфекции ГТС PROK 1 SEQ ID No:5 (E)5 - cell lysate after transfection of
6 - клеточный лизат после трансфекции ГТС PROK 1 SEQ ID No:6 (F)6 - cell lysate after transfection of the
7 - клеточный лизат после трансфекции ГТС PROK 1 SEQ ID No:7 (G)7 - cell lysate after transfection of
8 - клеточный лизат после трансфекции плацебо (Н) 8 - cell lysate after placebo transfection (H)
Фиг. 20. С целью определения наиболее эффективной применительно к конкретному пациенту генно-терапевтической субстанции анализировали количество белка прокинетицина 1, в лизатах биоптатов кожи этого пациента, после введения ему генно-терапевтических субстанций, содержащих участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 или участки модифицированных кДНК гена PROK 1.FIG. 20. In order to determine the most effective gene-therapeutic substance for a particular patient, the amount of
По итогам анализа количества белка прокинетицина 1, в лизате биоптатов кожи пациента выделили вариант генно-терапевтической субстанции, при введении которой выявляется максимальная концентрация белка прокинетицина 1, в лизате биоптата. В данном эксперименте максимальная концентрация белка прокинетицина 1, отмечена при введении генно-терапевтической субстанции на базе pCMV6 PROK 1 SEQ ID No:7, содержащей модифицированную кДНК гена, что показано на фигуре 20.According to the analysis of the amount of
Таким образом, выбрана наиболее эффективная применительно к данному пациенту генно-терапевтическая субстанция для ее последующего введения пациенту в рамках терапевтической процедуры.Thus, the most effective gene-therapeutic substance has been selected for this patient for its subsequent administration to the patient as part of a therapeutic procedure.
Обозначения:Designations:
1 - лизат биоптата после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:1 (A)1 - lysate of the biopsy specimen after administration of the
2 - лизат биоптата после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:2 (В)2 - biopsy specimen lysate after administration of
3 - лизат биоптата после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:3 (С)3 - biopsy specimen lysate after administration of
4 - лизат биоптата после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:4 (D)4 - biopsy specimen lysate after administration of
5 - лизат биоптата после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:5 (E)5 - biopsy specimen lysate after administration of
6 - лизат биоптата после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:6 (F)6 - biopsy specimen lysate after administration of
7 - лизат биоптата после введения ГТС PROK 1 SEQ ID No:7 (G)7 - biopsy specimen lysate after administration of
8 - лизат биоптата после введения плацебо (Н) Реализация изобретения.8 - biopsy specimen lysate after placebo (H). Implementation of the invention.
При снижении экспрессии генов, кодирующих белки, например, гена PROK 1, происходит снижение количества белка в организме, что приводит к патологическим состояниям.With a decrease in the expression of genes encoding proteins, for example, the
Преимущества использования генетической конструкции с геном PROK1 для коррекции количественного уровня белка прокинетицина 1 в клетках органов и тканей человека, по сравнению с использованием белка прокинетицина 1 человека и нуклеиновой кислоты, кодирующей белок прокинетицин 1 человека, решение по заявке WO 2003/020892 (прототип) следующие:The advantages of using the genetic construct with the PROK1 gene to correct the quantitative level of
1) легче обеспечить более высокий и стабильный уровень белка в клетках,1) it is easier to provide a higher and stable level of protein in the cells,
2) не требуется сложная и дорогостоящая процедура рефолдинга и очистки белкового препарата,2) a complex and expensive procedure for refolding and purification of a protein preparation is not required,
3) обеспечивается транспортировка генно-терапевтической субстанции в больший спектр клеток органов и тканей человека, а также более эффективная внутриклеточная транспортировка генно-терапевтической субстанции.3) transportation of the gene-therapeutic substance is provided to a larger spectrum of cells of human organs and tissues, as well as more efficient intracellular transportation of the gene-therapeutic substance.
4) учтены индивидуальные особенности пациентов.4) individual characteristics of patients are taken into account.
Таким образом, для создания группы генно-терапевтических субстанций по данному изобретению был выбран ген PROK 1, а не белок прокинетицина 1 человека, кодируемый этим геном.Thus, to create a group of gene therapeutic substances according to this invention, the
Для получения группы генно-терапевтических субстанций осуществляют следующие действия:To obtain a group of gene-therapeutic substances carry out the following actions:
1. Получение участка нативной кДНК гена PROK 1, содержащей белок-кодирующую область гена PROK 1, клонирование его в промежуточную плазмиду, переклонирование его в экспрессионные векторные плазмиды под контроль эукариотических регуляторных элементов для экспрессии целевого гена таким образом, что полученные генетические конструкции содержат кодирующую нуклеотидную последовательность кДНК белка прокинетицина 1, которая является участком нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и которая используются для дальнейших модификаций.1. Obtaining a portion of the native cDNA of the
2. Внесение в последовательность нуклеотидов кДНК гена PROK 1 модификаций с целью создания ряда кДНК гена PROK 1, обеспечивающих достаточный для борьбы с патологическими проявлениями уровень трансляции белка прокинетицина 1.2. Introduction of modifications of the
3. Клонирование участка нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и полученных на его основе модифицированных кДНК гена PROK 1 в векторные плазмиды, способные обеспечить эффективную экспрессию этой кДНК в клетках органов и тканей человека.3. Cloning of a portion of the native unmodified cDNA of the
4. Трансформация каждой из полученных генетических конструкций бактериальных клеток E.coli, анализ трансформированных клонов на предмет наличия, ориентации и копийности вставки кДНК и наращивание отобранных клонов для получения необходимого для дальнейшей работы количества вариантов плазмидной ДНК.4. Transformation of each of the obtained genetic constructs of bacterial E. coli cells, analysis of transformed clones for the presence, orientation, and copy number of the cDNA insert and the growth of selected clones to obtain the number of plasmid DNA variants necessary for further work.
5. Выделение ряда генетических конструкций, содержащих модифицированные кДНК гена PROK 1 и участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 для создания на их базе группы генно-терапевтических субстанций.5. Isolation of a number of genetic constructs containing modified cDNA of the
6. Создание группы генно-терапевтических субстанций (ГТС), каждая из которых включает генетическую конструкцию с модифицированными кДНК гена PROK 1 и участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1, или комбинацию такой конструкции с транспортной молекулой для эффективной трансфекции различных типов клеток органов и тканей и/или введения в органы и ткани человека.6. Creation of a group of gene therapeutic substances (GTS), each of which includes a genetic construct with modified cDNA of the
Для доказательства эффективности созданных генно-терапевтических субстанций, приводящих к увеличению экспрессии гена PROK 1, проводят следующие исследования:To prove the effectiveness of the created gene-therapeutic substances leading to an increase in the expression of the
A) Выращивание культур различных типов клеток из биоптатов различных органов и тканей человека, например, фибробластов кожи человека, или клеток эпителия эндометрия матки, или клеток эпителия глаза.A) Cultivation of cultures of various types of cells from biopsies of various human organs and tissues, for example, human skin fibroblasts, or uterine endometrial epithelial cells, or eye epithelial cells.
B) Выделение РНК из культуры клеток, например, фибробластов кожи человека, или клеток эпителия эндометрия матки, или клеток эпителия глаза, и анализ экспрессии гена PROK 1 из генома этих клеток.B) Isolation of RNA from a cell culture, for example, human skin fibroblasts, or uterine endometrial epithelial cells, or eye epithelial cells, and analysis of the expression of the
C) Трансфекция культуры клеток, например, фибробластов кожи человека, или клеток эпителия эндометрия матки, или клеток эпителия глаза генно-терапевтическими субстанциями содержащими участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и/или модифицированные кДНК гена PROK 1 и параллельная трансфекция культуры этих же клеток векторной плазмидой, не содержащей кДНК гена PROK 1 в различных комбинациях.C) Transfection of a cell culture, for example, human skin fibroblasts, or uterine endometrial epithelial cells, or eye epithelial cells with gene therapeutic substances containing a portion of native unmodified cDNA of the
D) Сравнительный анализ изменения уровня мРНК гена PROK 1 и/или изменения количества белка прокинетицина 1, после трансфекции в различных комбинациях клеток, например, фибробластов кожи человека, или клеток эпителия эндометрия матки или клеток эпителия глаза генно-терапевтическими субстанциями содержащими участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и/или модифицированные кДНК гена PROK 1 и параллельной трансфекции культуры этих же клеток векторной плазмидой, не содержащей кДНК гена PROK 1. Данный анализ проводят, в частности, перед предполагаемой терапией с целью определения наиболее эффективной для пациента генно-терапевтической субстанции.D) Comparative analysis of changes in the mRNA level of the
E) Введение пациентам в органы и ткани культуры клеток трансфицированных генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1, например, введение, в кожу человека, аутологичных фибробластов, трансфицированных генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1 и параллельное введение пациентам в органы и ткани, например, в кожу, культур этих же клеток нетрансфицированных и трансфицированных вектором без вставки кДНК гена PROK 1 и/или введение пациентам в органы и ткани генно-терапевтических субстанций, например, введение в кожу человека генно-терапевтических субстанций, содержащих участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и/или модифицированные кДНК PROK 1, а также плацебо в различных комбинация.E) Introduction to patients in the organs and tissues of a cell culture transfected with a gene therapeutic substance with a cDNA of the
F) Сравнительный анализ количества белка прокинетицина 1 в органах и тканях человека, в частности в коже человека, после введения клеток нетрансфицированных и трансфицированных генно-терапевтическими субстанциями, содержащими кДНК гена PROK 1 и векторными плазмидами, не содержащими кДНК гена PROK 1 и/или генно-терапевтических субстанций, содержащих участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 или модифицированные кДНК гена PROK 1, а также плацебо.F) A comparative analysis of the amount of
G) Введение пациентам в органы и ткани, например, в хрящевую или мышечную ткань, генно-терапевтических субстанций, содержащих участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и/или модифицированных кДНК гена PROK 1, а также плацебо.G) Introduction to patients in organs and tissues, for example, in cartilage or muscle tissue, of gene-therapeutic substances containing a portion of native unmodified cDNA of the
H) Сравнительный анализ количества белка прокинетицина 1, в органах и тканях человека, в частности в хрящевой или мышечной ткани человека, после введения генно-терапевтических субстанций, содержащих участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и/или участки модифицированных кДНК гена PROK 1, а также плацебо.H) A comparative analysis of the amount of
I) Введение пациентам в органы и ткани, например, введение в кожу пациента генно-терапевтических субстанций, содержащих участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и участки модифицированных кДНК гена PROK 1.I) The introduction into patients of organs and tissues, for example, the introduction into the patient's skin of gene-therapeutic substances containing a portion of native unmodified cDNA of the
J) Сравнительный анализ количества белка прокинетицина 1, в органах и тканях пациента, в частности в коже, после введения генно-терапевтических субстанций, содержащих участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и участки модифицированных кДНК гена PROK 1. Данный анализ проводят, в частности, перед предполагаемой терапией с целью выбора наиболее эффективной для пациента генно-терапевтической субстанции из группы генно-терапевтических субстанций.J) A comparative analysis of the amount of
Пример 1Example 1
Получение и клонирование нативной немодифицированной кДНКгена PROK 1.Obtaining and cloning of native
Немодифицированная кДНК гена PROK 1 представляет собой последовательность нуклеотидов, которая имеет высокую гомологию с нуклеотидной последовательностью гена и мРНК PROK 1, приведенной в базе данных GenBank под номером NM_032414; нуклеотиды с 52 по 369 транслируются в аминокислотную последовательность белка прокинетицина 1, соответствующую приведенной в GenBank под номером NP_115790.1.Unmodified cDNA of the
Суммарную РНК получают из клеток человеческой крови с помощью набора PAXGeneBlood RNA Kit (Qiagen, Germany) и используют для получения суммарной кДНК путем обратной транскрипции с помощью обратной транскриптазы RevertAid (ThermoScientific, USA) и случайных 9-нуклеотидных праймеров по методике производителя обратной транскриптазы. Затем, используя суммарную кДНК в качестве матрицы и специфичные, предварительно кинированные праймеры, комплементарные нуклеотидам 17-39 5' AAGCAGGCAGTGTTTTGCCTTCA 3' (PROK1-F1) и 817-797 5' CACGTGAAGGGCCTGAGGGTC 3' (PROK1-R1) из последовательности мРНК PROK1 (NM_032414), получают участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1, содержащий кодирующую последовательность белка прокинетицина 1, и частичные делеции 5' и 3'-нетранслируемых областей. Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) проводят с помощью ДНК-полимеразы Phusion (ThermoScientific, USA), дающей продукты с тупыми концами, на амплификаторе Master CyclerGradient (Eppendorf, USA) в 50 мкл реакционной смеси, содержащей 0,5 мкл суммарной кДНК первой цепи, по 0,1 мкМ каждого праймера PROK1F1 и PROK1R1, 250 мкМ каждого дезоксинуклеотидтрифосфата (дАТФ, дЦТФ, дТТФ и дГТФ), 100 мМ трис-HCl (рН 8,85 при 20°С), 50 мМ сульфата аммония, 250 мМ хлористого калия, 0,01% Твин-20 и 5 ед. Pfu ДНК-полимеразы (PhusionThermoScientific, USA) при следующих условиях: первоначальная денатурация при +98°С в течение 30 с, 35 циклов, включающих денатурацию при +98°С в течение 10 с, отжиг праймеров при +64°С в течение 30 с и элонгацию при +68°С течение 2 минут.Total RNA is obtained from human blood cells using the PAXGeneBlood RNA Kit (Qiagen, Germany) and is used to obtain total cDNA by reverse transcription using RevertAid reverse transcriptase (ThermoScientific, USA) and random 9-nucleotide primers according to the method of the manufacturer of reverse transcriptase. Then, using total cDNA as a template and specific pre-primed primers complementary to nucleotides 17-39 5 'AAGCAGGCAGTGTTTTGCCTTCA 3' (PROK1-F1) and 817-797 5 'CACGTGAAGGGCCTGAGGGTC 3' (PROK1-M1 R1) ), a portion of the native unmodified cDNA of the
Продукт амплификации выделяют из агарозного геля с помощью набора QIAquickGelExtractionKit (Qiagen, Germany)The amplification product was isolated from agarose gel using the QIAquickGelExtractionKit kit (Qiagen, Germany)
Амплифицированный фрагмент кДНК длиной 801 н.п., несущий участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1, клонируют в плазмидном векторе pUC19 (NEB, USA, кат номер N3041S). ДНК векторной плазмиды pUC19 (NEB, USA, кат. номер N3041S) гидролизуют рестриктазой, дающей тупые концы, например, Smal (NEB, USA) и обрабатывают щелочной фосфатазой. Амплифицированный фрагмент кДНК и линеаризованную плазмиду pUC19 лигируют с помощью ДНК-лигазы фага Т4 400000 ед./мл (NEB, USA, кат номер M0202S) из расчета 1 мкл фермента на 1 мкг ДНК. Лигирование проводят в объеме 20 мкл в присутствии 2 мМ АТФ, 50 мМ трис -HCl, рН 7,6, 10 мМ MgCl2, 10 мМ DTT в течение 10 ч при +16°.The amplified cDNA fragment of 801 bp in length, carrying the portion of the native unmodified cDNA of the
Полученной смесью трансформируют компетентные клетки Е.coli Top10 (http://molbiol.ru/protocol/03_04.html), которые высевают на чашки Петри с L-агаром, содержащих 100 мкг/мл ампициллина и по 40 мкл на чашку растворов 100 мМ ИПТГ и 2% X-gal. Отдельные колонии анализируют на наличие вставки с помощью ПЦР с праймерами PROK 1 --F1 и PROK 1 --R1 и подтверждают секвенированием по методу Сэнгера.The resulting mixture is transformed with competent E. coli Top10 cells (http://molbiol.ru/protocol/03_04.html), which are seeded on Petri dishes with L-agar containing 100 μg / ml ampicillin and 40 μl per cup of 100 mM solutions IPTG and 2% X-gal. Separate colonies are analyzed for the presence of an insert using PCR with primers PROK 1 - F1 and PROK 1 - R1 and confirmed by sequencing according to the Sanger method.
Пример 2Example 2
Получение генетических конструкций с участком немодифицированной кДНК гена PROK 1Obtaining genetic constructs with a plot of unmodified cDNA of the
Для экспрессии участка немодифицированной кДНК гена PROK 1 в клетках органов и тканей человека вариант кДНК гена PROK 1 по Примеру 1 помещают в векторную плазмиду, при выборе которой используют следующие критерии выбора:To express a portion of the unmodified cDNA of the
1) плазмида должна обязательно реплицироваться в E.coli, желательно с высокой копийностью;1) the plasmid must necessarily be replicated in E. coli, preferably with high copy number;
2) в плазмиде должен быть бактериальный фактор селекции либо другой фактор селекции не содержащий генов резистентности к антибиотикам;2) the plasmid must contain a bacterial selection factor or another selection factor that does not contain antibiotic resistance genes;
3) в плазмиде должно быть наличие эукариотических регуляторных элементов - обязательных промотора и терминатора (сигнала полиаденилирования), например, энхансер и интронный(е) элемент(ы);3) the plasmid must have the presence of eukaryotic regulatory elements - the obligatory promoter and terminator (polyadenylation signal), for example, an enhancer and intron (e) element (s);
4) в плазмиде должно быть наличие удобного полилинкера для клонирования. Примером такой плазмиды может быть pCMV6-XL5, pCMV6-Kan/Neo (OriGene, USA) или pCDNA 3.1 (+) (ThermoFisherScientific, USA), либо плазмидные векторы вирусного происхождения - например, аденовирус человека 5-го серотипа.4) the plasmid must have a convenient polylinker for cloning. An example of such a plasmid can be pCMV6-XL5, pCMV6-Kan / Neo (OriGene, USA) or pCDNA 3.1 (+) (ThermoFisher Scientific, USA), or plasmid vectors of viral origin - for example, human adenovirus of the 5th serotype.
5) Плазмида может содержать нуклеотидные последовательности с регуляторными элементами для репликации в клетках млекопитающих, например, такие как SV40 ori из вируса обезьян SV40 или ori P/EBNA-1 из вируса Эпштейн-Барра человека.5) The plasmid may contain nucleotide sequences with regulatory elements for replication in mammalian cells, for example, such as SV40 ori from the monkey virus SV40 or ori P / EBNA-1 from the human Epstein-Barr virus.
6) Плазмида также может содержать дополнительные регуляторные элементы, усиливающие трансляцию белка, например, участки связывания с транскрипционным фактором NFkB, обеспечивающим активный транспорт плазмидной ДНК в клеточное ядро для более эффективной транскрипции целевого гена.6) The plasmid may also contain additional regulatory elements that enhance the translation of the protein, for example, binding sites with the transcription factor NFkB, which ensures the active transport of plasmid DNA into the cell nucleus for more efficient transcription of the target gene.
При клонировании участка немодифицированной кДНК гена PROK 1 в pCDNA 3.1 (+) кодирующая нуклеотидная последовательность помещается под контроль промотора цитомегаловируса человека CMV, эффективного в эукариотических клетках, и сигнала полиаденилирования гена бычьего гормона роста. Также данная плазмида обладает бактериальным фактором селекции - геном устойчивости к ампициллину, и эукариотическим фактором селекции - геном устойчивости к неомицину.When cloning a portion of the unmodified cDNA of the
При клонировании участка немодифицированной кДНК гена PROK 1 в pCMV6-XL5, pCMV6-Kan/Neo кодирующая нуклеотидная последовательность помещается под контроль промотора цитомегаловируса человека CMV, эффективного в эукариотических клетках, и сигнала полиаденилирования гена гормона роста человека. Также данная плазмида обладает бактериальным фактором селекции - геном устойчивости к ампициллину.When cloning a portion of the unmodified cDNA of the
Векторную плазмиду pUC19-PROK 1 с участком нативной немодифицированной последовательности кДНК гена PROK 1 используют в качестве матрицы для амплификации со следующими парами праймеров:The vector plasmid pUC19-
для ориентации Hind III - PROK 1-Eco RIfor orientation Hind III - PROK 1-Eco RI
PROK1 F2 GGAAGCTTGCCACCATGAGAGGTGCCACGPROK1 F2 GGAAGCTTGCCACCATGAGAGGTGCCACG
PROK1 R2 AAGAATTCCTAAAAATTGATGTTCTTCAAPROK1 R2 AAGAATTCCTAAAAATTGATGTTCTTCAA
для ориентации Eco RI - PROK 1-Hind IIIOrientation Eco RI - PROK 1-Hind III
PROK1 F3 GGGAATTCGCCACCATGAGAGGTGCCACGPROK1 F3 GGGAATTCGCCACCATGAGAGGTGCCACG
PROK1 R3 GGAAGCTTCTAAAAATTGATGTTCTTCAAPROK1 R3 GGAAGCTTCTAAAAATTGATGTTCTTCAA
Амплификацию проводят при условиях, приведенных в Примере 1. Далее продукты амплификации переосаждают этиловым спиртом, осадки промывают 70% этанолом и растворяют в 1× ТЕ буфере, после чего подвергают рестрикции с эндонуклеазами EcoRI и HindIII.Amplification is carried out under the conditions described in Example 1. Next, the amplification products are reprecipitated with ethanol, the precipitates are washed with 70% ethanol and dissolved in 1 × TE buffer, and then subjected to restriction with EcoRI and HindIII endonucleases.
Продукты рестрикции разделяют с помощью электрофореза в геле 1% агарозы, окрашивают раствором бромистого этидия и фрагменты ДНК, соответствующие гену-вставке HindIII-5'NTR- кДНК PROK 1 -3'NTR-EcoRI, либо EcoRI -5'NTR-кДНК PROK 1 -3'NTR- HindIII и линеаризованной плазмиде pCMV6-XL5 и pCMV6-Kan/Neo и pCDNA 3.1(+), вырезают, выделяют из геля с помощью набора для выделения из геля QIAquickGelExtractionKit из примера 1 и смешивают. Полученную смесь рестрикционных фрагментов лигируют с помощью ДНК-лигазы фага Т4. Лигирование проводят в течение 10-15 мин при комнатной температуре, а затем - при 12°С в течение 10 ч. Лигированную ДНК используют для трансформации клеток Е. coli по стандартной методике с использованием хлористого кальция. Трансформированные клетки отбирают на агаризованной среде LB с ампициллином (100 мкг/мл). Плазмидную ДНК из ампициллин-устойчивых колоний выделяют с помощью набора для выделения плазмид QiagenSpinMiniprepKit, анализируют с помощью гидролиза рестриктазами EcoRI и HindIII и отбирают генетическую(ие) конструкцию с помощью секвенирования ДНК генетических конструкций по методу Сэнгера.The restriction products are separated by 1% agarose gel electrophoresis, stained with ethidium bromide solution and DNA fragments corresponding to the HindIII-5'NTR-cDNA insert gene PROK 1 -3'NTR-EcoRI or EcoRI-5'NTR-cDNA PROK 1 -3'NTR-HindIII and the linearized plasmid pCMV6-XL5 and pCMV6-Kan / Neo and pCDNA 3.1 (+), excised, isolated from the gel using the QIAquickGelExtractionKit gel isolation kit from Example 1 and mixed. The resulting mixture of restriction fragments is ligated using T4 phage DNA ligase. Ligation is carried out for 10-15 minutes at room temperature, and then at 12 ° C for 10 hours. Ligation DNA is used to transform E. coli cells according to the standard method using calcium chloride. Transformed cells were selected on agar medium LB with ampicillin (100 μg / ml). Plasmid DNA was isolated from ampicillin-resistant colonies using the QiagenSpinMiniprepKit plasmid isolation kit, digested with restriction enzymes EcoRI and HindIII, and the genetic construct was selected by DNA sequencing of genetic constructs using the Sanger method.
Бактерии, содержащие полученные генетические конструкции на базе векторов pCMV6-XL5, pCMV6-Kan/Neo и pCDNA 3.1(+), выращивают на жидкой среде LB с ампициллином, лизируют и выделяют плазмидную ДНК для трансфекции специальным набором для выделения плазмид QiagenMaxiKit для получения соответствующих генно-терапевтических субстанций.Bacteria containing the obtained genetic constructs based on the vectors pCMV6-XL5, pCMV6-Kan / Neo and pCDNA 3.1 (+) are grown on LB liquid medium with ampicillin, lysed, and plasmid DNA is isolated for transfection with a special QiagenMaxiKit plasmid isolation kit to obtain the corresponding genes -therapeutic substances.
Таким образом, получают экспрессионные генетические конструкции на базе векторов pCMV6-XL5, pCMV6-Kan/Neo и pCDNA 3.1(+), которые содержат нуклеотидную последовательность длиной 318 н.п. с первичной структурой, приведенной на фиг. 1 Seq ID NolThus, expression genetic constructs are obtained based on the vectors pCMV6-XL5, pCMV6-Kan / Neo and pCDNA 3.1 (+), which contain a 318 bp nucleotide sequence. with the primary structure shown in FIG. 1 Seq ID Nol
Пример 3Example 3
Модификации кДНК гена PROK 1 в генетических конструкциях для получения на их основе генно-терапевтических субстанций.Modifications of the cDNA of the
Модификации проводят таким образом, чтобы не затрагивать первичную структуру белка прокинетицина 1, а именно, нуклеотидные замены, не приводящие к аминокислотным заменам или обрыву аминокислотной цепи, и, соответственно, не влияющие на кодируемую этой последовательностью аминокислотную последовательность.Modifications are carried out in such a way as not to affect the primary structure of the
В частности для получения модифицированных кДНК гена PROK 1 с целью повышения эффективности транскрипции и трансляции белка прокинетицина 1, в клетках тканей и органов человека в участок нативной последовательности кДНК гена PROK 1, используя принцип оптимизации кодонов, вносят модификации путем замены минорных кодонов на синонимичные мажорные таким образом, чтобы замены не привели к изменениям в аминокислотной последовательности белка или обрыву аминокислотной цепи при трансляции, не ухудшили процессы транскрипции и трансляции.In particular, to obtain modified cDNAs of the
Все модификации осуществляют в несколько этапов методом ПЦР мутагенеза набором QuikChPROK 1 е II XL kit или QuikChPROK 1 е Multi Site-Directed Mutagenesis Kit (AgilentTechnologies, USA) согласно рекомендациям производителя (http://www.agilent.com/cs/library/usermanuals/Public/200513).All modifications are carried out in several stages by PCR mutagenesis using the QuikChPROK 1 e II XL kit or QuikChPROK 1 e Multi Site-Directed Mutagenesis Kit (Agilent Technology, USA) according to the manufacturer's recommendations (http://www.agilent.com/cs/library/usermanuals / Public / 200513).
К плазмидной ДНК, полученной по Примеру 2, в количестве 10-50 нг добавляют 50-100 нг праймера, содержащего необходимую замену, инсерцию или делецию длиной 19-45 н.п.и проводят ПЦР в буфере QuikChPROK 1 е Multi reaction buffer (AgilentTechnologies, USA) со смесью ферментов QuikChPROK 1 е Multi mix (AgilentTechnologies, USA) при следующих условиях: 95°С, 1 мин; далее от 30 до 35 циклов: 95°С 1 минута, 55°С 1 минута, 65°С 2 минуты/1000 н.п. После проведения ПЦР к амплификационной смеси добавляют 1-2 мкл рестриктазы Dpn I и инкубируют 1-2 часа при 37°С. Полученной смесью трансформируют компетентные клетки E.coli Тор10 (http://molbiol.ru/protocol/03_04.html), которые высевают на чашки с L-агаром, содержащих 100 мкг/мл ампициллина. Трансформированные колонии анализируют на содержание мутаций секвенированием плазмидной ДНК по методу Сэнгера.To the plasmid DNA obtained in Example 2, 50-100 ng of primer containing the necessary replacement, insertion or deletion of 19-45 bp was added in the amount of 10-50 ng and PCR was carried out in QuikChPROK 1 e Multi reaction buffer (AgilentTechnologies) , USA) with a mixture of QuikChPROK 1 e Multi mix enzymes (Agilent Technologies, USA) under the following conditions: 95 ° С, 1 min; further from 30 to 35 cycles: 95 °
Для получения модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No 2 проводят последовательный ПЦР-мутагенез на плазмидах pCMV6-XL5-PROK 1Seq ID No1, pCMV6-Kan/Neo-PROK 1Seq ID No1 и pCDNA 3.1(+)- PROK 1Seq ID No1 с праймерами, комплементарными участку нативной кДНК гена PROK 1, приведенной в GenBank под номером NM_032414:To obtain the modified cDNA of the
1. PROK 54-81 F:1. PROK 54-81 F:
5' GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',5 'GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',
Комплементарный нуклеотидам 54-81, с заменой G→C в позиции 66 и заменой A→G в позиции 69Complementary to nucleotides 54-81, with the replacement of G → C at position 66 and the replacement of A → G at position 69
Модифицированная таким образом нуклеотидная последовательность кДНК PROK 1 SEQ ID No:2 содержит 1 нуклеотидную замену G→C в позиции 66 и 1 нуклеотидную замену A→G в позиции 69, не приводящую к изменениям в аминокислотной последовательности белка, кодируемого последовательностью гена PROK 1 и имеет первичную структуру, приведенную на фиг. 2.The nucleotide sequence of the
Для получения модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No 3 проводят последовательный ПЦР-мутагенез на плазмидах PCMV6-XL5-PROK 1 SEQ ID No1, pCMV6-Kan/Neo-PROK 1 SEQ ID No1 и pCDNA 3.1(+)- PROK 1 SEQ ID No1 с праймерами, комплементарными участку нативной кДНК гена PROK 1, приведенной в GenBank под номером NM_032414:To obtain a modified cDNA of the
1. PROK 54-81 F:1. PROK 54-81 F:
5' GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',5 'GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',
Комплементарный нуклеотидам 54-81, с заменой G→C в позиции 66 и заменой А→G в позиции 69Complementary to nucleotides 54-81, with the replacement of G → C at position 66 and the replacement of A → G at position 69
2. PROK 1 79-109 F:2.
5' ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',5 'ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',
Комплементарный нуклеотидам 79-109, с заменой A→G в позиции 90;Complementary to nucleotides 79-109, with the replacement of A → G at position 90;
Модифицированная таким образом нуклеотидная последовательность кДНК PROK 1 SEQ ID No:3 содержит 1 нуклеотидную замену G→C в позиции 66, две нуклеотидных замены A→G в позиции 69, 90; не приводящие к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1, и имеет первичную структуру, приведенную на фиг. 3.The nucleotide sequence of the
Для получения модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No 4 проводят последовательный ПЦР-мутагенез на плазмидах pCMV6-XL5-PROK 1 SEQ ID No1, pCMV6-Kan/Neo-PROK 1 SEQ ID No1 и pCDNA 3.1(+)- PROK 1 SEQ ID No1 с праймерами, комплементарными участку нативной кДНК гена PROK 1, приведенной в GenBank под номером NM_032414:To obtain the modified cDNA of the
1. PROK 54-81 F:1. PROK 54-81 F:
5' GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',5 'GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',
Комплементарный нуклеотидам 54-81, с заменой G→C в позиции 66 и заменой A→G в позиции 69Complementary to nucleotides 54-81, with the replacement of G → C at position 66 and the replacement of A → G at position 69
2. PROK 1 79-109 F:2.
5' ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',5 'ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',
Комплементарный нуклеотидам 79-109, с заменой A→G в позиции 90;Complementary to nucleotides 79-109, with the replacement of A → G at position 90;
3. PROK 1 79-106 F:3.
5' ATGCTCCTCCTGGTGACTGTGTCTGACT 3'5 'ATGCTCCTCCTGGTGACTGTGTCTGACT 3'
Комплементарный нуклеотидам 79-106, с заменами A→G в позициях 90 и 93;Complementary to nucleotides 79-106, with A → G substitutions at positions 90 and 93;
Модифицированная таким образом нуклеотидная последовательность кДНК PROK 1 SEQ ID No:4 содержит 1 нуклеотидную замену G→C в позиции 66, 3 нуклеотидных замены A→G в позициях 69, 90, 93; не приводящие к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1, и имеет первичную структуру, приведенную на фиг. 4.The nucleotide sequence of the
Для получения модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No 5 проводят последовательный ПЦР-мутагенез на плазмидах pCMV6-XL5-PROK 1 SEQ ID No1, pCMV6-Kan/Neo-PROK 1 SEQ ID No1 и pCDNA 3.1(+)- PROK 1 SEQ ID No1 с праймерами, комплементарными участку нативной кДНК гена PROK 1, приведенной в GenBank под номером NM_032414:To obtain a modified cDNA of the
1. PROK 54-81 F:1. PROK 54-81 F:
5' GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',5 'GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',
Комплементарный нуклеотидам 54-81, с заменой G→C в позиции 66 и заменой A→G в позиции 69Complementary to nucleotides 54-81, with the replacement of G → C at position 66 and the replacement of A → G at position 69
2. PROK 1 79-109 F:2.
5' ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',5 'ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',
Комплементарный нуклеотидам 79-109, с заменой A→G в позиции 90;Complementary to nucleotides 79-109, with the replacement of A → G at position 90;
3. PROK 1 79-106 F:3.
5' ATGCTCCTCCTGGTGACTGTGTCTGACT 3'5 'ATGCTCCTCCTGGTGACTGTGTCTGACT 3'
Комплементарный нуклеотидам 79-106, с заменами A→G в позициях 90 и 93;Complementary to nucleotides 79-106, with A → G substitutions at positions 90 and 93;
4. PROK 1 172-196 F:4.
5' AGCCTGTGGCTTCGGGGGCTGCGGA 3',5 'AGCCTGTGGCTTCGGGGGCCTGCGGA 3',
Комплементарный нуклеотидам 172-196, с заменой A→G в позиции 186;Complementary to nucleotides 172-196, with the replacement of A → G at position 186;
Модифицированная таким образом нуклеотидная последовательность кДНК PROK 1 SEQ ID No:5 содержит 1 нуклеотидную замену G→C в позиции 66, 4 нуклеотидных замены A→G в позициях 69, 90, 93, 186; не приводящие к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1, и имеет первичную структуру, приведенную на фиг. 5.The nucleotide sequence of the
Для получения модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No 6 проводят последовательный ПЦР-мутагенез на плазмидах pCMV6-XL5-PROK 1 SEQ ID No1, pCMV6-Kan/Neo-PROK 1 SEQ ID No1 и pCDNA 3.1(+)- PROK 1 SEQ ID No1 с праймерами, комплементарными участку нативной кДНК гена PROK 1, приведенной в GenBank под номером NM_032414:To obtain the modified cDNA of the
1. PROK 54-81 F:1. PROK 54-81 F:
5' GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',5 'GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',
Комплементарный нуклеотидам 54-81, с заменой G→C в позиции 66 и заменой A→G в позиции 69Complementary to nucleotides 54-81, with the replacement of G → C at position 66 and the replacement of A → G at position 69
2. PROK 1 79-109 F:2.
5' ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',5 'ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',
Комплементарный нуклеотидам 79-109, с заменой A→G в позиции 90;Complementary to nucleotides 79-109, with the replacement of A → G at position 90;
3. PROK 1 79-106 F:3.
5' ATGCTCCTCCTGGTGACTGTGTCTGACT 3'5 'ATGCTCCTCCTGGTGACTGTGTCTGACT 3'
Комплементарный нуклеотидам 79-106, с заменами A→G в позициях 90 и 93;Complementary to nucleotides 79-106, with A → G substitutions at positions 90 and 93;
4. PROK 1 172-196 F:4.
5' AGCCTGTGGCTTCGGGGGCTGCGGA 3',5 'AGCCTGTGGCTTCGGGGGCCTGCGGA 3',
Комплементарный нуклеотидам 172-196, с заменой A→G в позиции 186;Complementary to nucleotides 172-196, with the replacement of A → G at position 186;
5. PROK 1 194-221 F:5.
5' GGATGTGCACCCCCCTGGGGCGGGAAGG 3',5 'GGATGTGCACCCCCCTGGGGCCGGGAAGG 3',
Комплементарный нуклеотидам 194-221, с заменой G→C в позиции 207;Complementary to nucleotides 194-221, with the replacement of G → C at position 207;
Модифицированная таким образом нуклеотидная последовательность кДНК PROK 1 SEQ ID No:6 содержит 2 нуклеотидных замены G→C в позициях 66, 207; 4 нуклеотидных замены A→G в позициях 69, 90, 93, 186; не приводящие к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1, и имеет первичную структуру, приведенную на фиг. 6.The nucleotide sequence of the
Для получения модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No 7 проводят последовательный ПЦР-мутагенез на плазмидах pCMV6-XL5-PROK 1 SEQ ID No1, pCMV6-Kan/Neo-PROK 1 SEQ ID No1 и pCDNA 3.1(+)- PROK 1 SEQ ID No1 с праймерами, комплементарными участку нативной кДНК гена PROK 1, приведенной в GenBank под номером NM_032414:To obtain the modified cDNA of the
1. PROK 54-81 F:1. PROK 54-81 F:
5' GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',5 'GAGAGGTGCCACCCGGGTCTCAATCATG 3',
Комплементарный нуклеотидам 54-81, с заменой G→C в позиции 66 и заменой A→G в позиции 69Complementary to nucleotides 54-81, with the replacement of G → C at position 66 and the replacement of A → G at position 69
2. PROK 1 79-109 F:2.
5' ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',5 'ATGCTCCTCCTGGTAACTGTGTCTGACTGTG 3',
Комплементарный нуклеотидам 79-109, с заменой A→G в позиции 90;Complementary to nucleotides 79-109, with the replacement of A → G at position 90;
3. PROK 1 79-106 F:3.
5' ATGCTCCTCCTGGTGACTGTGTCTGACT 3'5 'ATGCTCCTCCTGGTGACTGTGTCTGACT 3'
Комплементарный нуклеотидам 79-106, с заменами A→G в позициях 90 и 93;Complementary to nucleotides 79-106, with A → G substitutions at positions 90 and 93;
4. PROK 1 172-196 F:4.
5' AGCCTGTGGCTTCGGGGGCTGCGGA 3',5 'AGCCTGTGGCTTCGGGGGCCTGCGGA 3',
Комплементарный нуклеотидам 172-196, с заменой A→G в позиции 186;Complementary to nucleotides 172-196, with the replacement of A → G at position 186;
5. PROK 1 194-221 F:5.
5' GGATGTGCACCCCCCTGGGGCGGGAAGG 3',5 'GGATGTGCACCCCCCTGGGGCCGGGAAGG 3',
Комплементарный нуклеотидам 194-221, с заменой G→C в позиции 207;Complementary to nucleotides 194-221, with the replacement of G → C at position 207;
6. PROK 1 308-336 F:6.
5' GCTCCAGGTTCCCCGACGGCAGGTACCGC 3',5 'GCTCCAGGTTCCCCGACGGCAGGTACCGC 3',
Комплементарный нуклеотидам 308-336, с заменой G→C в позиции 321;Complementary to nucleotides 308-336, with substitution G → C at position 321;
Модифицированная таким образом нуклеотидная последовательность кДНК PROK 1 SEQ ID No:7 содержит 3 нуклеотидных замены G→C в позициях 66, 207, 321; 4 нуклеотидных замены A→G в позициях 69, 90, 93, 186; не приводящие к изменениям в аминокислотной последовательности белка прокинетицина 1, и имеет первичную структуру, приведенную на фиг. 7.The nucleotide sequence of the
Таким образом, получают экспрессионные векторы на базе плазмид pCMV6-XL5, pCMV6-Kan/Neo и pCDNA 3.1(+), в которых клонированы участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:1) и модифицированные нуклеотидные последовательности кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:2, 3, 4, 5, 6, 7), кодирующие белок прокинетицина 1.Thus, expression vectors based on plasmids pCMV6-XL5, pCMV6-Kan / Neo and pCDNA 3.1 (+) are obtained in which a portion of the native unmodified cDNA of the
Бактерии, содержащие полученные генетические конструкции на базе векторов pCMV6-XL5, pCMV6-Kan/Neo и pCDNA 3.1(+), выращивают на жидкой среде LB с ампициллином, лизируют и выделяют плазмидную ДНК для трансфекции специальным набором для выделения плазмид QiagenMaxiKit для получения соответствующих генно-терапевтических субстанций.Bacteria containing the obtained genetic constructs based on the vectors pCMV6-XL5, pCMV6-Kan / Neo and pCDNA 3.1 (+) are grown on LB liquid medium with ampicillin, lysed, and plasmid DNA is isolated for transfection with a special QiagenMaxiKit plasmid isolation kit to obtain the corresponding genes -therapeutic substances.
Полученные экспрессионные векторы используют для получения на их основе генно-терапевтических субстанций, которые в дальнейшем применяют для трансфекции эукариотических клеток органов и тканей и/или введения в органы и ткани человека. В качестве контрольных плазмид используют исходный вектор pCMV6-XL5, (pCMV6-Kan/Neo) или pCDNA 3.1 (+) без вставки кДНК гена PROK 1.The resulting expression vectors are used to obtain gene-therapeutic substances based on them, which are subsequently used for transfection of eukaryotic cells of organs and tissues and / or introduction into human organs and tissues. As control plasmids, the original vector pCMV6-XL5, (pCMV6-Kan / Neo) or pCDNA 3.1 (+) without the cDNA insert of the
Пример 4Example 4
Наращивание генетической конструкции в бактериальной культуре.Building up the genetic construct in bacterial culture.
Для получения препаративных количеств векторной плазмиды, содержащей один из вариантов кДНК гена PROK 1, полученными конструкциями по примеру 3 трансформируют бактериальные клетки E.coli (Маниатис Т., и др. Молекулярное клонирование. М., Мир, 1984) и выращивают полученные клоны бактерий, содержащие конструкцию, в присутствии бактериального фактора селекции - устойчивости к ампициллину.To obtain preparative amounts of a vector plasmid containing one of the cDNA variants of the
Лигазную смесь по примеру 3 используют для трансформации компетентных клеток E.coli штамма XLblue. Предварительный отбор клонов, содержащих вставку кДНК гена PROK 1 в правильной ориентации и единичной копии, осуществляют путем гидролиза плазмидной ДНК рестриктазами EcoRI и HindIII и анализа продуктов рестрикции путем электрофореза в 1.2% агарозном геле. Отобранные клоны используют для препаративного наращивания плазмидной ДНК с целью дальнейшей трансфекции в культуры фибробластов (клеток эпителия глаза, или клеток эпителия эндометрия матки и др.).The ligase mixture of Example 3 is used to transform competent E. coli cells of strain XLblue. The preliminary selection of clones containing the cDNA insert of the
Для получения препаративных количеств генетических экспрессионных конструкций по Примеру 3 выращивали 20 мл ночной культуры E.coli в LB-среде с 150 мкг/мл ампициллина. Этой культурой инокулировали 500 мл LB-среды с 100 мкг/мл ампициллина, рост осуществляли в шейкере-инкубаторе в течение 16 часов при 37°С и 200 об/мин. Выделение плазмидной ДНК проводили с помощью набора EndoFreePlasmidMaxiKit (Qiagen, Germany). Выход составил 350 мкг ДНК.To obtain preparative amounts of the genetic expression constructs of Example 3, 20 ml of an overnight E.coli culture was grown in LB medium with 150 μg / ml ampicillin. 500 ml of LB medium with 100 μg / ml ampicillin were inoculated with this culture; growth was carried out in a shaker-incubator for 16 hours at 37 ° C and 200 rpm. Isolation of plasmid DNA was performed using the EndoFreePlasmidMaxiKit kit (Qiagen, Germany). The yield was 350 μg of DNA.
Пример 5Example 5
Культивирование эукариотических клеток, например, фибробластов для последующих трансфекции генно-терапевтической субстанцией и анализа экспрессии гена PROK 1.Cultivation of eukaryotic cells, for example, fibroblasts for subsequent transfection with a gene therapeutic substance and analysis of the expression of the
Для последующей трансфекции генно-терапевтической субстанцией содержащей один из вариантов кДНК гена PROK 1 по примеру 3, выращивают первичные культуры фибробластов человека из биоптатов кожи пациентов.For subsequent transfection with a gene-therapeutic substance containing one of the cDNA variants of the
Используя устройство для взятия биопсии кожи Epitheasy 3.5 (MedaxSRL) берут образец биоптата кожи из зоны, защищенной от действия ультрафиолета, например, за ушной раковиной или с боковой внутренней поверхности в зоне голени, размером около 3 мм, массой - до 20 мг. Кожу пациента предварительно промывали стерильным физиологическим раствором и анестезировали раствором лидокаина. Выращивание первичной культуры клеток осуществляют на чашках Петри при 37°С в атмосфере, содержащей 5% CO2 в среде DMEM с 10% фетальной телячьей сывороткой и ампициллином 100 Ед/мл. Трипсинизацию и пересев производят каждые 5 дней, для трипсинизации клетки промывали раствором PBS и инкубировали 30 минут при 37°С в растворе, содержащем 0.05% трипсина и 1 мМ ЭДТА. Для нейтрализации трипсина к клеткам добавляли 5 мл культуральной среды и центрифугировали суспензию при 600 об/мин 5 минут. Рост культуры фибробластов после 4-5 пассажей осуществляли в культуральных флаконах емкостью 75 мл в среде, содержащей 10 г/л DMEM, 3.7 г/л Na2CO3, 2.4 г/л HEPES, 10% фетальной сыворотки и 100 Ед/мл ампициллина. Смену культуральной среды осуществляли каждые 2 дня. Общая продолжительность роста культуры не превышала 25-30 дней. Из культуры клеток отбирали аликвоту, содержащую 106 клеток.Using a skin biopsy device Epitheasy 3.5 (MedaxSRL), a skin biopsy sample is taken from a zone protected from ultraviolet radiation, for example, behind the auricle or from the side inner surface in the lower leg, about 3 mm in size, weighing up to 20 mg. The patient’s skin was pre-washed with sterile saline and anesthetized with lidocaine solution. The primary cell culture was grown on Petri dishes at 37 ° C in an atmosphere containing 5% CO 2 in DMEM medium with 10% fetal calf serum and ampicillin 100 U / ml. Trypsinization and reseeding is performed every 5 days; for trypsinization, the cells were washed with PBS and incubated for 30 minutes at 37 ° C in a solution containing 0.05% trypsin and 1 mM EDTA. To neutralize trypsin, 5 ml of culture medium was added to the cells and the suspension was centrifuged at 600 rpm for 5 minutes. The growth of fibroblast culture after 4-5 passages was carried out in 75 ml culture bottles in a medium containing 10 g / l DMEM, 3.7 g / l Na 2 CO 3 , 2.4 g / l HEPES, 10% fetal serum and 100 U / ml ampicillin . The culture medium was changed every 2 days. The total duration of culture growth did not exceed 25-30 days. An aliquot containing 10 6 cells was selected from the cell culture.
Часть культуры фибробластов, предназначенную для выделения РНК с последующим анализом транскрипции гена PROK 1, центрифугировали при 1000 об/мин 20 минут и дважды отмывали в буферном растворе PBS центрифугированием при 600 об/мин в течение 5 минут. Затем клетки ресуспендировали в 1.5 мл стабилизирующего реагента RNAlater и хранили при 4°С в течение 10 дней для последующего выделения РНК.A portion of the fibroblast culture for RNA isolation followed by transcription analysis of the
Выделение РНК проводили с помощью набора RNeasyMiniKit. (Qiagen, Germany). Выделенную РНК анализировали спектрофотометрически, измеряя соотношение оптической плотности при 260 и 280 нм, а также с помощью капиллярного электрофореза на приборе QIAxcel (Qiagen, Germany), используя картридж RNA Qiality Control. Для дальнейшей работы использовали только те образцы, для которых общее количество выделенной РНК было не менее 50 мкг РНК, соотношение D260:D280 - не менее 1,8, а соотношение полос 28S:18S на капиллярном электрофорезе - не ниже 1:1.RNA isolation was performed using the RNeasyMiniKit kit. (Qiagen, Germany). The isolated RNA was analyzed spectrophotometrically, measuring the ratio of optical density at 260 and 280 nm, as well as by capillary electrophoresis on a QIAxcel instrument (Qiagen, Germany) using an RNA Qiality Control cartridge. For further work, we used only those samples for which the total amount of isolated RNA was not less than 50 μg RNA, the ratio of D260: D280 was not less than 1.8, and the ratio of the 28S: 18S bands on capillary electrophoresis was not less than 1: 1.
Синтез суммарной кДНК первой цепи проводили, используя обратную транскриптазу RevertAid (Thermo Scientific, USA), согласно рекомендациям изготовителя. 1-2 мкг суммарной РНК использовали в качестве матрицы для синтеза первой цепи кДНК. В реакционную смесь для проведения обратной транскрипции вносили 100-200 ед. обратной транскриптазы и 10 пМ случайного 9-нуклеотидного праймера.The synthesis of total cDNA of the first strand was carried out using RevertAid reverse transcriptase (Thermo Scientific, USA), according to the manufacturer's recommendations. 1-2 μg of total RNA was used as a template for the synthesis of the first cDNA strand. 100-200 units were added to the reaction mixture for reverse transcription. reverse transcriptase and 10 pM random 9-nucleotide primer.
Пример 6Example 6
Анализ эндогенной экспрессии гена PROK 1 в культуре первичных фибробластов.Analysis of endogenous expression of the
Анализ экспрессии гена PROK 1 из генома фибробластов проводят с целью последующего корректного определения генно-терапевтического эффекта после трансфекции этих клеток генетическими конструкциями с кДНК гена PROK 1.Analysis of the expression of the
Для анализа используют клеточные линии фибробластов кожи, фибробласты с низкой экспрессией гена PROK 1 и фибробласты с нормальной экспрессией гена PROK 1, из которых выделяют РНК по стандартной методике (Маниатис Т. и др. Молекулярное клонирование. М., Мир, 1984).For analysis, skin fibroblast cell lines, fibroblasts with low expression of the
Выделенную РНК анализируют методом ПЦР в режиме реального времени (SYBR GreenRealTimePCR). Для амплификации кДНК (251-332 н.п.), специфичной для гена PROK 1, используют прямой праймерIsolated RNA is analyzed by real-time PCR (SYBR GreenRealTimePCR). For amplification of cDNA (251-332 n.p.) specific for the
PROK 1FA1 5' CCACGCGAGTCTCAATCA 3'PROK 1FA1 5 'CCACGCGAGTCTCAATCA 3'
и обратный праймерand reverse primer
PROK 1-RA1 5' ACTGGACATCCCGCTCAC 3'PROK 1-RA1 5 'ACTGGACATCCCGCTCAC 3'
Длина продукта амплификации - 84 нуклеотида. В качестве референтного гена используют ген бета-2-микроглобулина В2М, уровень экспрессии которого в фибробластах сопоставим с таковым в норме для гена PROK 1.The length of the amplification product is 84 nucleotides. As a reference gene, the beta-2-microglobulin B2M gene is used, the expression level of which in fibroblasts is comparable to that normal for the
ПЦР-амплификацию проводят с помощью набора реагентов SYBR GreenQuantitect RT-PCR Kit (Qiagen, USA) или другого набора для ПЦР в режиме реального времени в 20 мкл амплификационной смеси, содержащей: 25 мкл QuantiTect SYBR Green RT-PCR MasterMix, 2,5 mM хлорида магния, по 0,5 мкМ каждого праймера, 5 мкл суммарной РНК. Реакцию осуществляют на амплификаторе CFX96 (Bio-Rad, USA) при следующих условиях: 1 цикл обратной транскрипции при 50°С 30 минут, денатурация 98°С - 15 мин., затем 40 циклов, включающих денатурацию 94°С - 15 с, отжиг праймеров 62°С - 30 с и элонгацию 72°С - 30 сPCR amplification is performed using the SYBR GreenQuantitect RT-PCR Kit (Qiagen, USA) or another real-time PCR kit in 20 μl amplification mixture containing: 25 μl QuantiTect SYBR Green RT-PCR MasterMix, 2.5 mM magnesium chloride, 0.5 μm of each primer, 5 μl of total RNA. The reaction is carried out on a CFX96 thermocycler (Bio-Rad, USA) under the following conditions: 1 reverse transcription cycle at 50 ° C for 30 minutes, denaturation 98 ° C for 15 minutes, then 40 cycles including denaturation 94 ° C for 15 s, annealing primers 62 ° C for 30 s and elongation 72 ° C for 30 s
В качестве положительного контроля используют концентрацию ампликонов, получаемых при ПЦР на матрицах, представляющих собой плазмиды в известных концентрациях, содержащие последовательности кДНК генов PROK 1 и В2М. В качестве отрицательного контроля используют деионизированную воду (кривые накопления ПЦР продуктов отрицательного и положительных контролей для упрощения визуализации на фигуре 8 не показаны). Количество ПЦР продуктов - кДНК генов PROK 1 и В2М, полученных в результате амплификации, оценивают в режиме реального времени с помощью программного обеспечения амплификатора Bio-RadCFXManager 2.1.As a positive control, the concentration of amplicons obtained by PCR on matrices representing plasmids at known concentrations containing cDNA sequences of the
По итогам анализа экспрессии гена PROK 1 в разных культурах фибробластов (с низкой экспрессией гена PROK 1 и с нормальной экспрессией гена PROK 1) были отобраны клоны от пациентов одного возраста и одного типа старения, в которых количество ПЦР-продукта, соответствующего кДНК гена PROK 1, была в 10-20 раз ниже таковой кДНК гена В2М. Кривые накопления специфических ПЦР-продуктов приведены на фигуре 8.Based on the analysis of the expression of the
Пример 7Example 7
Трансфекция клеточной культуры фибробластов со сниженной экспрессией гена PROK 1 генно-терапевтической субстанцией с целью подтверждения увеличения экспрессии гена PROK 1 в культуре данных клеток.Transfection of a fibroblast cell culture with reduced expression of the
Для оценки эффективности генно-терапевтической субстанции, содержащей немодифицированную кДНК гена PROK 1 по примеру 2, этой генно-терапевтической субстанцией трансфицируют первичную культуру фибробластов человека со сниженной экспрессией гена PROK 1, отобранную по примеру 6.To evaluate the effectiveness of the gene therapeutic substance containing the unmodified cDNA of the
Данную культуру фибробластов выращивают в культуральных флаконах (25 см2) до момента, когда клетки покрывают 50-70% поверхности флакона. Полученные клетки трансфицируют генно-терапевтической субстанцией на основе pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:1 в присутствии транспортной молекулы (например, дендримера) и вектором pCMV6-XL5 в качестве контроля.This fibroblast culture is grown in culture bottles (25 cm 2 ) until the cells cover 50-70% of the surface of the bottle. The resulting cells are transfected with the gene therapeutic substance based on pCMV6-
6-луночный планшет с DMEM-средой с 10% фетальной телячьей сывороткой (1.6 мл в лунке) засевали фибробластами из расчета 1-4×105 клеток на лунку. Инкубировали клетки в течение 18 часов при 37°С и в атмосфере, содержащей 5% CO2. Затем 2 мкг плазмидной ДНК растворяли в среде DMEM без сыворотки с буфером Трис-HCl 20 мМ с 1 мМ ЭДТА, рН 7-8 (минимальная концентрация ДНК - 0.1 мкг/мкл). Конечный объем смеси составлял 100 мкл.A 6-well plate with DMEM medium with 10% fetal calf serum (1.6 ml per well) was seeded with fibroblasts at a rate of 1-4 × 10 5 cells per well. Cells were incubated for 18 hours at 37 ° C and in an atmosphere containing 5% CO 2 . Then, 2 μg of plasmid DNA was dissolved in serum-free DMEM with Tris-
В качестве транспортной молекулы использовали раствор дендримера SuperFect Transfection Reagent 6-го поколения (Qiagen, Германия).The 6th generation SuperFect Transfection Reagent dendrimer solution (Qiagen, Germany) was used as a transport molecule.
Приготовление комплекса ДНК-дендример проводили по методике производителя (QIAGEN, SuperFect Transfection Reagent Handbook, 2002) с некоторыми изменениями: к 15 мкл раствора дендримера (с концентрацией 3 мкг/мкл) добавляли 5 мкл (с концентрацией 0,5 мкг/мкл) раствора плазмидной ДНК и тщательно перемешивали. Затем инкубировали смесь ДНК с дендримером в течение 5-10 минут при температуре 15-25°С.Preparation of the DNA dendrimer complex was carried out according to the manufacturer's method (QIAGEN, SuperFect Transfection Reagent Handbook, 2002) with some changes: 5 μl (with a concentration of 0.5 μg / μl) was added to 15 μl of the dendrimer (with a concentration of 3 μg / μl) plasmid DNA and mixed thoroughly. Then the DNA mixture with the dendrimer was incubated for 5-10 minutes at a temperature of 15-25 ° C.
Из лунок планшета с клеточной культурой осторожно отбирали среду (не нарушая клеточного слоя) и промывали клетки 3 мл буфера PBS. К раствору, содержащему комплексы ДНК-дендример, добавляли 600 мкл среды DMEM с фетальной сывороткой и переносили эту смесь в лунки планшета с клетками. Клетки инкубировали с комплексами 2-3 часа при 37°С и в атмосфере, содержащей 5% CO2. Затем осторожно удаляли среду и промывали клеточный слой 3 мл буфера PBS. Затем добавляли культуральную среду и инкубировали 24-48 часов при 37°С и в атмосфере, содержащей 5% CO2, после чего оценивали уровень кДНК гена PROK 1 и контрольной кДНК гена В2М с помощью амплификации в режиме реального времени как описано в примере 6. Результаты анализа приведены на фигуре 9.Medium was carefully selected from the wells of the cell culture plate (without disturbing the cell layer) and the cells were washed with 3 ml PBS buffer. To a solution containing DNA dendrimer complexes, 600 μl of fetal serum DMEM medium was added and the mixture was transferred to the wells of a cell plate. Cells were incubated with complexes for 2-3 hours at 37 ° C and in an atmosphere containing 5% CO 2 . Then the medium was carefully removed and the cell layer was washed with 3 ml of PBS buffer. Culture medium was then added and incubated 24-48 hours at 37 ° C and in an atmosphere containing 5% CO 2, after which the cDNA was evaluated the level of
Из графиков следует, что в случае трансфекции вектором без вставки кДНК гена PROK 1 уровень кДНК гена PROK 1 в фибробластах не изменился, а в случае трансфекции вектором с кДНК гена PROK 1 - уровень кДНК фибробластов со сниженной экспрессией гена PROK 1 многократно увеличился (до уровня выше, чем уровень кДНК гена PROK 1 в нормальных фибробластах).From the graphs it follows that in the case of transfection with a vector without inserting the cDNA of the
Показано, что в клетках трансфицированных генно-терапевтической субстанцией на основе pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:1 наблюдается усиление экспрессии целевого гена PROK 1.It was shown that in cells transfected with a gene-therapeutic substance based on pCMV6-
Пример 8Example 8
Трансфекция клеточной культуры фибробластов с нормальной экспрессией гена PROK 1 генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1 с целью подтверждения увеличения количества белка прокинетицина 1, в культуре данных клеток.Transfection of a fibroblast cell culture with normal expression of the
Для оценки изменения количества белка прокинетицина 1, использовали культуру фибробластов кожи человека по Примеру 5, в качестве транспортной молекулы - дендримеры SuperFect Transfection Reagent 6-го поколения (Qiagen, Германия), в качестве контроля - водный раствор дендримеров без плазмидной ДНК (А), векторную плазмиду pCDNA 3.1(+), не содержащую кДНК гена PROK 1 (В), в качестве трансфицируемых агентов - генно-терапевтическую субстанцию на основе векторной плазмиды pCDNA 3.1(+), содержащую кДНК гена PROK 1-pCDNA 3.1 PROK 1 SEQ ID No: 1(C), Приготовление комплекса ДНК-дендример и трансфекцию фибробластов проводили согласно Примеру 7.To assess the change in the amount of
После трансфекции к 0,5 мл культуральной жидкости приливали 0,1 мл 1N HCl, тщательно перемешивали и инкубировали 10 минут при комнатной температуре. Затем нейтрализовывали смесь, добавляя 0,1 мл 1.2N NaOH/0.5M HEPES (рН 7-7,6) и тщательно перемешивали.After transfection, 0.1 ml of 1N HCl was poured into 0.5 ml of culture liquid, mixed thoroughly and incubated for 10 minutes at room temperature. The mixture was then neutralized by adding 0.1 ml of 1.2N NaOH / 0.5M HEPES (pH 7-7.6) and mixed thoroughly.
Данную смесь использовали для количественного определения целевого белка. Количественное определение продукта кДНК гена PROK 1 проводили методом твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA), используя набор Human Prokineticin 1, PROK1 ELISA Kit (CD creative diagnostics, США) чувствительностью 16-2,000 pg/ml согласно методике производителя http://img.creative-diagnostics.com/pdf/DEIA096%20Human%20PROK1%20ELISA%20Kit.pdf.This mixture was used to quantify the target protein. The quantitative determination of the cDNA product of the
Метод детекции результатов - колориметрический. Оптическая плотность образцов измерялась при длине волны 450 нм при помощи автоматического биохимического и иммуноферментного анализатора ChemWell (Awareness TechNology Inc., США) и пропорциональна концентрации белка PROK 1 в пробе. Численное значение концентрации определяется с помощью калибровочной кривой, построенной по калибраторам с известной концентрацией белка PROK 1, входящим в состав набора. Разница между значениями оптической плотности (ОП) калибраторов поставленных в трех повторностях не превышала 10%.The method of detecting results is colorimetric. The optical density of the samples was measured at a wavelength of 450 nm using a ChemWell automatic biochemical and enzyme immunoassay analyzer (Awareness TechNology Inc., USA) and is proportional to the concentration of
Статистическую обработку полученных результатов, осуществляли с помощью программного обеспечения для статистической обработки и визуализации данных R, версия 3.0.2 (https://www.r-project.org/).Statistical processing of the results was carried out using software for statistical processing and visualization of data R, version 3.0.2 (https://www.r-project.org/).
Таким образом, показано, что транфекция фибробластов полученной генно-терапевтической субстанцией, несущей кДНК гена PROK 1, приводит к увеличению количества белка прокинетицина 1, в клетках фибробластов. Результаты показаны на фигуре 10.Thus, it was shown that the transfection of fibroblasts with the obtained gene therapeutic substance carrying the cDNA of the
Пример 9Example 9
Введение в кожу человека клеточной культуры фибробластов, трансфицированной генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1 с целью подтверждения увеличения после этого количества белка прокинетицина 1, в биоптате кожи человека.The introduction into the human skin of a cell culture of fibroblasts transfected with a gene therapeutic substance with cDNA of the
С целью анализа изменения количества белка прокинетицина 1, в тканях человека пациентам в кожу голени вводили три варианта культуры аутологичных фибробластов - нетрансфицированных (А), трансфицированных вектором без вставки, например, pCMV6-XL5 (В) и трансфицированных генно-терапевтической субстанцией на основе pCMV6- PROK 1 SEQ ID No:7(C) в комбинации с транспортными молекулами - липосомами TRANSFAST ТМ Transfection Reagent (PROMEGA, USA),In order to analyze changes in the amount of
Приготовление суспензии липосом проводили по методике производителя (Promega, TransFast Transfection Reagent, Instruction for Use of Product, E2431) с некоторыми изменениями: к 0,4 мг порошка липосом добавляли 0,4 мл стерильной воды степени очистки Nuclease-Free. Суспензию хорошо перемешивали взбалтыванием. Полученный полупродукт суспензии липосом выдерживали в течение 18 часов при температуре - 20°С, затем оттаивали при комнатной температуре, ресуспендировали встряхиванием или на настольном миксере типа «ВОРТЕКС».The suspension of liposomes was prepared according to the manufacturer's method (Promega, TransFast Transfection Reagent, Instruction for Use of Product, E2431) with some changes: 0.4 ml of Nuclease-Free sterile water was added to 0.4 mg of liposome powder. The suspension was mixed well by shaking. The resulting intermediate product of the suspension of liposomes was kept for 18 hours at a temperature of -20 ° C, then thawed at room temperature, resuspended by shaking or on a table mixer type "VORTEX".
Для приготовления комплекса ДНК-липосомы к 400 мкл раствора липосом (с концентрацией 1 мг/мл) добавляли 400 мкл раствора плазмидной ДНК (с концентрацией 150 мкг/мл) и тщательно перемешивали. Затем инкубировали смесь ДНК с липосомами в течение 5-10 минут при температуре 15-25°С и использовали далее в качестве генно-терапевтической субстанции.To prepare the DNA liposome complex, 400 μl of plasmid DNA solution (with a concentration of 150 μg / ml) was added to 400 μl of liposome solution (with a concentration of 1 mg / ml) and mixed thoroughly. Then the mixture of DNA with liposomes was incubated for 5-10 minutes at a temperature of 15-25 ° C and was further used as a gene-therapeutic substance.
Для последующей трансфекции клеток генно-терапевтической субстанцией выращивали первичные культуры фибробластов человека из биоптатов кожи пациентов по примеру 5.For subsequent transfection of cells with a gene therapeutic substance, primary cultures of human fibroblasts were grown from biopsy samples of the skin of patients according to Example 5.
Для трансфекции из лунок планшета с клеточной культурой осторожно отбирали среду (не нарушая клеточного слоя) и промывали клетки 3 мл буфера PBS. К раствору, содержащему комплексы ДНК-липосимы, добавляли 600 мкл среды DMEM с фетальной сывороткой и переносили эту смесь в лунки планшета с клетками. Клетки инкубировали с комплексами 2-3 часа при 37°С и в атмосфере, содержащей 5% CO2. Затем осторожно удаляли среду и промывали клеточный слой 3 мл буфера PBS. Затем добавляли культуральную среду и инкубировали 24-48 часов при 37°С в атмосфере, содержащей 5% CO2.For transfection, the medium was carefully selected from the wells of a cell culture plate (without disturbing the cell layer) and the cells were washed with 3 ml of PBS buffer. To a solution containing DNA liposime complexes, 600 μl of fetal serum DMEM medium was added and this mixture was transferred to the wells of a cell plate. Cells were incubated with complexes for 2-3 hours at 37 ° C and in an atmosphere containing 5% CO 2 . Then the medium was carefully removed and the cell layer was washed with 3 ml of PBS buffer. Then, the culture medium was added and incubated for 24-48 hours at 37 ° C in an atmosphere containing 5% CO 2 .
Часть клеточной культуры центрифугировали при 700 об/мин, дважды отмывали клетки физиологическим раствором, ресуспендировали в физиологическом растворе из расчета 1 млн клеток в 200 мкл и использовали для введения пациенту. Введение осуществляли тоннельным методом иглой 30G на глубину 3 мм. Очаги введения культур фибробластов располагались на расстоянии 3-5 см друг от друга.Part of the cell culture was centrifuged at 700 rpm, the cells were washed twice with physiological saline, resuspended in physiological saline at the rate of 1 million cells in 200 μl and used for administration to the patient. The introduction was carried out by the tunnel method with a 30G needle to a depth of 3 mm. Foci of introducing fibroblast cultures were located at a distance of 3-5 cm from each other.
Определение количества белка прокинетицина 1, оценивали в лизатах биоптатов кожи пациента методом твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА ELISA), используя набор Human Prokineticin 1, PROK1 ELISA Kit (CD creative diagnostics, США), как описано в Примере 8.The determination of the amount of
Биопсийные образцы брали на 3 сутки после введения суспензии фибробластов. Взятие биопсии осуществляли из участков введения суспензии фибробластов, а также из интактной кожи, используя устройство для взятия биопсии кожи Epitheasy 3.5 (MedaxSRL). Кожу пациента предварительно промывали стерильным физиологическим раствором и анестезировали раствором лидокаина. Размер биопсийного образца был около 3 мм, масса - до 20 мг. Образец помещали в буферный раствор, содержащий 50 мМ Трис-HCl рН 7.6, 100 мМ NaCl, 1 мМ ЭДТА и 1 мМ фенилметилсульфонилфторид, и гомогенизировали до получения однородной суспензии. Полученную суспензию центрифугировали в течение 10 минут при 14000 об/мин. Отбирали супернатант и использовали его для количественного определения целевого белка.Biopsy samples were taken 3 days after the introduction of a suspension of fibroblasts. A biopsy was performed from the injection sites of the fibroblast suspension, as well as from the intact skin, using an Epitheasy 3.5 skin biopsy device (MedaxSRL). The patient’s skin was pre-washed with sterile saline and anesthetized with lidocaine solution. The size of the biopsy sample was about 3 mm, and the mass was up to 20 mg. The sample was placed in a buffer solution containing 50 mM Tris-HCl pH 7.6, 100 mM NaCl, 1 mM EDTA and 1 mM phenylmethylsulfonyl fluoride, and homogenized to obtain a uniform suspension. The resulting suspension was centrifuged for 10 minutes at 14,000 rpm. The supernatant was taken and used to quantify the target protein.
Как видно из фигуры 11, в коже пациента в области введения фибробластов, трансфицированных генно-терапевтической субстанцией на основе pCMV6-PROK 1 SEQ ID No:7, произошло увеличение количества белка прокинетицина 1, что может свидетельствовать об усилении экспрессии гена PROK 1. Тогда как при введении контрольных культур фибробластов (нетрансфицированных и трансфицированных вектором без вставки кДНК гена PROK 1pCMV6-XL5) количество белка прокинетицина 1, в коже не изменялась.As can be seen from figure 11, in the skin of the patient in the area of administration of fibroblasts transfected with the gene therapeutic substance based on pCMV6-
Таким образом, показана эффективность генно-терапевтической субстанции при введении в кожу человека клеточной культуры фибробластов, трансфицированных полученной генно-терапевтической субстанцией, несущей модифицированную кДНК гена PROK 1, что приводит к повышению количества белка прокинетицина 1, в коже в зоне введения.Thus, the efficacy of a gene therapeutic substance was shown when a cell culture of fibroblasts transfected with the obtained gene therapeutic substance carrying a modified cDNA of the
Пример 10Example 10
Трансфекция культур фибробластов из биоптатов группы различных пациентов генно-терапевтическими субстанциями, содержащими модифицированные кДНК гена PROK 1 и участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1.Transfection of fibroblast cultures from biopsies of a group of different patients with gene-therapeutic substances containing modified
С целью подтверждения индивидуального характера увеличения количества белка прокинетицина 1, до различного уровня при трансфекции клеточных культур фибробластов пациентов генно-терапевтическими субстанциями с модифицированными кДНК гена PROK 1 и участком нативной кДНК гена PROK 1 анализировали количественный уровень белка прокинетицина 1, в клеточных лизатах фибробластов, трансфицированных разными генно-терапевтическими субстанциями по примеру 3, содержащими модифицированные кДНК гена PROK 1 и участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 в группе пациентов в зависимости от наличия и типа модификаций в кДНК гена PROK 1.In order to confirm the individual nature of the increase in the amount of
Последовательности участка нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 приведена на фигуре 1, SEQ ID No:1, последовательности модифицированных кДНК гена PROK 1 приведены на фигурах 2-7 (SEQ ID No:2, SEQ ID No:3, SEQ ID No:4, SEQ ID No:5, SEQ ID No:6, SEQ ID No:7).The sequence of the site of the native unmodified cDNA of the
Вырастили культуры фибробластов из однотипных биоптатов кожи, отобранных из зоны внутренней боковой поверхности в зоне голени 24 пациентов, выбранных случайным образом по примеру 5, отобрали аликвоты и оценили уровень белка прокинетицина 1, в клеточных лизатах. Клеточный осадок, соответствующий 2×106 клеток, промывали фосфатным буфером и ресуспендировали во льду в лизирующем буфере, содержащем 25 мМ ХЕПЕС рН 7.9, 100 мM NaCl, 1 мМ ЭДТА, 1% Тритон Х-100, 10% глицерин и 1 мМ фенилметилсульфонилфторид. Лизат центрифугировали 5 минут при 14000 об/мин, концентрацию белка в супернатанте определяли методом Брэдфорда ([Bradford М.М. (1976) Anal. Biochem. 72: 248- 254]).Fibroblast cultures were grown from the same skin biopsy samples taken from the inner lateral surface in the lower leg area of 24 patients randomly selected as in Example 5, aliquots were selected and the level of
Затем каждую из 24-х культур фибробластов разделили на 8 частей. Одну часть, обозначенную (А), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:1, содержащей немодифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:1) по примеру 2 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.Then, each of the 24 cultures of fibroblasts was divided into 8 parts. One part, designated (A), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 1 vector containing unmodified cDNA of the
Вторую часть, обозначенную (В), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:2, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:2) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The second part, designated (B), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 2 vector containing the modified
3-ю часть, обозначенную (С), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:3, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:3) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The 3rd part, labeled (C), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on pCMV6-SEQ ID No: 3 vector containing the modified cDNA of the
4-ю часть, обозначенную (D), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:4, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:4) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The 4th part, designated (D), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 4 vector containing the modified cDNA of the
5-ю часть, обозначенную (Е), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:5, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:5) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The 5th part, designated (E), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 5 vector containing the modified cDNA of the
6-ю часть, обозначенную (F), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID NO:6, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID NO:6) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The 6th part, designated (F), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID NO: 6 vector containing the modified cDNA of the
7-ю часть, обозначенную (G), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:7, содержащей вариант модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:7) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The 7th part, labeled (G), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 7 vector containing the modified variant cDNA of the
8-ю часть, обозначенную (Н), трансфицировали по примеру 7 векторной плазмидой pCMV6-XL5, не содержащей кДНК гена PROK 1 по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The 8th part, designated (H), was transfected according to Example 7 with the vector plasmid pCMV6-XL5 that did not contain the
Определение количества белка прокинетицина 1, оценивали в лизатах биоптатов кожи пациента методом твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА ELISA), используя набор Human Prokineticin 1, PROK1 ELISA Kit (CD creative diagnostics, США), как описано в Примере 8.The determination of the amount of
По итогам определения количества белка прокинетицина 1 выбрали показатели, касательно каждой части клеточной культуры от каждого пациента, продемонстрировавшие максимальные уровни количества белка прокинетицина 1 и объединили их в семь групп, исходя из следующего критерия:Based on the results of determining the amount of
В группе 1 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции немодифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:1. В эту группу вошло 4 культуры из 24.In
В группе 2 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:2. В эту группу вошло 2 культуры из 24.In
В группе 3 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:3. В эту группу вошло 3 культуры из 24.In
В группе 4 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:4. В эту группу вошли 5 культуры из 24.In
В группе 5 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:5. В эту группу вошло 2 культуры из 24.In
В группе 6 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:6. В эту группу вошли 4 культуры из 24.In
В группе 7 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при трансфекции модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:7. В эту группу вошло 4 культуры из 24.In
Ни в одной из клеточных культур, трансфицированных генно-терапевтической субстанцией с векторной плазмидой, не содержащей кДНК гена PROK 1, не было обнаружено максимальное количество белка прокинетицина 1, в отличие от клеточных культур, трансфицированных генно-терапевтическими субстанциями с генетическими конструкциями, содержащими кДНК гена PROK 1.None of the cell cultures transfected with a gene therapeutic substance with a vector plasmid lacking the
На фигуре 12 для каждой группы клеточных культур приведены диаграммы показателей концентраций белка прокинетицина 1, (усредненных в рамках группы, в случае, если в группу входит более одной клеточной культуры) применительно ко всем, участвующим в эксперименте генно-терапевтическим субстанциям, после трансфекции этих клеточных культур генно-терапевтическими субстанциями, содержащими модифицированные и участок нативной кДНК гена PROK 1.The figure 12 for each group of cell cultures shows a diagram of indicators of protein concentrations of
Из данного примера следует, что достижение максимального количества белка прокинетицина 1, в культурах фибробластов кожи различных пациентов при их трансфекции генно-терапевтическими субстанциями, связано с индивидуальными особенностями пациентов и зависит от наличия и типа модификаций в кДНК гена PROK 1, входящих в генно-терапевтические субстанции.From this example, it follows that the achievement of the maximum amount of
Каждая генно-терапевтическая субстанция из группы генно-терапевтических субстанций является эффективной в некоторой значительной группе пациентов. Следовательно, для выбора наиболее эффективной генно-терапевтической субстанции из группы генно-терапевтических субстанций для терапевтических целей необходимо предварительное персонализированное исследование биоптатов пациента, либо клеток, выращенных из этих биоптатов на предмет максимальной эффективности терапевтического воздействия, созданных генно-терапевтических субстанций в рамках группы генно-терапевтических субстанций.Each gene-therapeutic substance from the group of gene-therapeutic substances is effective in some significant group of patients. Therefore, in order to select the most effective gene-therapeutic substance from the group of gene-therapeutic substances for therapeutic purposes, a preliminary personalized study of the patient’s biopsy samples, or cells grown from these biopsy samples for the maximum effectiveness of the therapeutic effect created by the gene-therapeutic substances within the group of gene-therapeutic substances is necessary. therapeutic substances.
Пример 11Example 11
Введение в первичную клеточную культуру эпителия эндометрия матки человека генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1 с целью подтверждения при этом увеличения количества белка прокинетицина 1.Introduction into the primary cell culture of the uterine endometrial epithelium of a gene-therapeutic substance with the cDNA of the
Клеточную культуру эпителия эндометрия матки человека получали путем взятия материала аспирационной биопсии. Трансфекцию этой клеточной культуры проводили генно-терапевтической субстанцией на основе плазмиды pCMV6-Kan/Neo PROK 1 SEQ ID No:2, используя в качестве транспортной молекулы РАМАМ-дендримеры (Weihai CY Dendrimer Technology). В качестве контроля использовали плазмиду pCMV6- Kan/Neo без кДНК гена PROK 1.A cell culture of human uterine endometrial epithelium was obtained by taking aspiration biopsy material. Transfection of this cell culture was carried out with a gene therapeutic substance based on the plasmid pCMV6-Kan /
Перед проведением трансфекции была приготовлена смесь плазмидной ДНК из расчета, что на 25000 клеток необходимо 0,1 мкл раствора плазмидной ДНК (1 мкг/мл) и 0,3 мкл раствора РАМАМ дендример (1 мкг/мл) с доведением до 4 мкл буферным раствором Хенкса. Полученная смесь аккуратно пикетировалась и инкубировалась при комнатной температуре в течение 15 мин.Before transfection, a mixture of plasmid DNA was prepared on the basis that 0.1 μl of a plasmid DNA solution (1 μg / ml) and 0.3 μl of a RAMAM dendrimer solution (1 μg / ml) with 25 μl were added to 4 μl of buffer solution Hanks. The resulting mixture was carefully picketed and incubated at room temperature for 15 minutes.
Непосредственно перед экспериментом первичная клеточная культура эпителия эндометрия матки человека промывалась средой DMEM. Затем клеточная культура инкубировалась в течение 1 ч с приготовленной трансфекционной смесью при плюс 37°С и 5% CO2. В качестве контроля добавляли 4 мкл буферного раствора Хенкса. После инкубирования клеточная культура промывалась средой DMEM, а затем добавлялась полная ростовая среда. Клеточная культура наблюдалась под микроскопом Zeiss Axio Observer А1 в течение 24 ч.Immediately before the experiment, the primary cell culture of the human uterine endometrial epithelium was washed with DMEM. Then the cell culture was incubated for 1 h with the prepared transfection mixture at plus 37 ° C and 5% CO 2 . As a control, 4 μl of Hanks buffer solution was added. After incubation, the cell culture was washed with DMEM, and then complete growth medium was added. Cell culture was observed under a Zeiss Axio Observer A1 microscope for 24 hours.
Сбор клеточной культуры эпителия эндометрия матки человека проводили через 24, 48, 72 и 96 ч после проведения трансфекции. Отбирали ростовую среду, 2 раза промывали буферным раствором Хенкса, 1 раз раствором ЭДТА, затем культуру клеток инкубировали в растворе трипсин-ЭДТА при 37°С в присутствии 5% CO2 в течение 4 минут. Реакцию трипсинизации ингибировали путем добавления ростовой среды. Чтобы избавиться от ростовой среды, суспензию клеток 2 раза промывали буферным раствором Хенкса с последующим центрифугированием.The cell culture of the human uterine endometrial epithelium was harvested 24, 48, 72, and 96 hours after transfection. The growth medium was selected, washed 2 times with Hanks buffer solution, 1 time with EDTA solution, then the cell culture was incubated in trypsin-EDTA solution at 37 ° C in the presence of 5% CO 2 for 4 minutes. The trypsinization reaction was inhibited by the addition of growth medium. To get rid of the growth medium, the cell suspension was washed 2 times with Hanks buffer solution, followed by centrifugation.
Полученный осадок ресуспендировали в консерванте RNAlater (Qiagen, Германия).The resulting precipitate was resuspended in the preservative RNAlater (Qiagen, Germany).
Выделение РНК производили с помощью набора RNeasy Mini Kit (Qiagen, Германия) согласно методике производителя. Для элиминации ДНК в ходе процедуры выделения РНК использовали набор RNAse-Free DNAse Set (Qiagen, Германия).RNA was isolated using the RNeasy Mini Kit (Qiagen, Germany) according to the manufacturer's procedure. To eliminate DNA during the RNA isolation procedure, the RNAse-Free DNAse Set (Qiagen, Germany) was used.
Концентрацию выделенной РНК измеряли спектрофотометрически с помощью NanoDrop 2000 (ThermoFisher Scientific Inc.). Оптическую плотность раствора РНК измеряли в диапазоне 220-320 нм. Для работы использовали образцы, для которых общее количество выделенной РНК было не менее 10 нг/мкл РНК, соотношение А260/А280 - не менее 1,8.The concentration of isolated RNA was measured spectrophotometrically using NanoDrop 2000 (ThermoFisher Scientific Inc.). The optical density of the RNA solution was measured in the range of 220-320 nm. For work, we used samples for which the total amount of isolated RNA was not less than 10 ng / μl of RNA, the ratio A 260 / A 280 - not less than 1.8.
Качество выделенной РНК проверяли методом капиллярного электрофореза на приборе QIAxcel (Qiagen, Германия), используя картридж RNA Quality Control Kit с помощью программы BioGel Software (Qiagen, Германия). Выделенная РНК хранилась на -80°С и использовалась для синтеза первой цепи кДНК методом ОТ-ПЦР.The quality of the isolated RNA was checked by capillary electrophoresis on a QIAxcel instrument (Qiagen, Germany) using an RNA Quality Control Kit cartridge using the BioGel Software program (Qiagen, Germany). The isolated RNA was stored at -80 ° C and was used for the synthesis of the first cDNA strand by RT-PCR.
Синтез суммарной кДНК первой цепи проводили, с помощью обратной транскриптазы RevertAid (Thermo Scientific, США) по методике производителя. В реакционную смесь объемом 20 мкл, состоящую из деионизованной воды, 5Х Reaction Buffer (250 мМ Tris-HCl (рН 8.3 at 25°С), 250 мМ KCl, 20 мМ MgCl2, 50 мМ DTT), dNTP (25 mM), вносили 200 Ед обратной транскриптазы и 5 пмоль случайного 9-нуклеотидного праймера, в качестве матрицы использовали 120 нг суммарной РНК. Обратную транскрипцию проводили при следующих условиях: 1 цикл предварительной инкубации при 25°С 10 минут, 1 цикл инкубации 52°С - 30 мин., 1 цикл инкубации 85°С - 5 мин.The synthesis of total cDNA of the first strand was carried out using RevertAid reverse transcriptase (Thermo Scientific, USA) according to the manufacturer's procedure. In a 20 μl reaction mixture consisting of deionized water, 5X Reaction Buffer (250 mM Tris-HCl (pH 8.3 at 25 ° С), 250 mM KCl, 20 mM MgCl2, 50 mM DTT), dNTP (25 mM) was added 200 Units of reverse transcriptase and 5 pmol of a random 9-nucleotide primer, 120 ng of total RNA was used as a template. Reverse transcription was carried out under the following conditions: 1 pre-incubation cycle at 25 ° C for 10 minutes, 1 incubation cycle of 52 ° C for 30 minutes, 1 incubation cycle of 85 ° C for 5 minutes.
Суммарную кДНК использовали для проведения ПЦР в реальном времени, которую проводили на амплификаторе CFX96 (Bio-Rad, США), с использованием реакционной смеси iTaq Universal SYBR Green Supermix (Bio-Rad, США), в состав которой входит интеркалирующий краситель SYBR Green I. Постановку реакции осуществляли в объеме 20 мкл согласно инструкции производителя с помощью высокоспецифичных праймеров QuantiTect Primer Assay (Qiagen, Германия) к гену PROK 1 и к референтному гену В2М. В качестве матрицы использовали: каждую пробу после стадии синтеза суммарной кДНК. Результаты амплификации оценивали в режиме реального времени с помощью программного обеспечения Bio-Rad CFX Manager 2.1 (Bio-Rad США) и qBase plus (Biogazelle, Бельгия). ПЦР проводили при следующих условиях: первоначальная денатурация при +95°С в течение 30 с, 45 циклов, включающих денатурацию при +95°С в течение 5 с, отжиг праймеров и элонгация при +60°С в течение 30 с.Total cDNA was used for real-time PCR, which was performed on a CFX96 thermocycler (Bio-Rad, USA) using the iTaq Universal SYBR Green Supermix reaction mixture (Bio-Rad, USA), which contains the intercalating dye SYBR Green I. The reaction was carried out in a volume of 20 μl according to the manufacturer's instructions using highly specific QuantiTect Primer Assay primers (Qiagen, Germany) to the
Идентификацию, полученных ПЦР-продуктов проводили путем капиллярного электрофореза в картридже QX DNA High Resolution (Qiagen, Германия) с помощью прибора для капиллярного электрофореза QIAxcel (Qiagen, Германия). В качестве выравнивающего маркера использовали QX Alignment Marker 15-3000 п., в качестве маркера длины - QX DNA Size Marker 50-800 п.н. После сравнения полученных данных с теоретически рассчитанной длиной обоих генов, учитывая погрешность прибора (±10 п.н.), было доказано, что детектируемый продукт соответствует гену PROK 1, и референтному гену В2М. В пробах с отрицательным контролем продукт не детектируется.Identification of the obtained PCR products was carried out by capillary electrophoresis in a QX DNA High Resolution cartridge (Qiagen, Germany) using a QIAxcel capillary electrophoresis device (Qiagen, Germany). A QX Alignment Marker of 15-3000 bp was used as a leveling marker, and a QX DNA Size Marker of 50-800 bp was used as a length marker. After comparing the obtained data with the theoretically calculated length of both genes, taking into account the error of the instrument (± 10 bp), it was proved that the detected product corresponds to the
Показано, что, в клеточной культуре эпителия эндометрия матки человека, трансфицированной генно-терапевтической субстанцией с кДНК гена PROK 1, произошло увеличение количества белка прокинетицина 1, что подтверждает усиление экспрессии гена PROK 1 при использовании генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1. Результаты отражены на фигуре 13.It was shown that, in a cell culture of the human uterine endometrium epithelium transfected with a gene therapeutic substance with
Пример 12Example 12
Трансфекция клеточной культуры эпителия роговицы глаза генно-терапевтической субстанцией с целью подтверждения при этом увеличения экспрессии гена PROK 1 в данной культуре клеток.Transfection of a cell culture of the corneal epithelium of the eye with a gene therapeutic substance in order to confirm an increase in the expression of the
С целью выяснения эффективности генно-терапевтической субстанции, содержащей кДНК гена PROK 1, в различных типах клеток, а также с целью оценки влияния транспортной молекулы на успешность трансфекции этой субстанцией - трансфицировали эпителий роговицы глаза человека, используя в качестве транспортной молекулы амфифильные блок-сополимеры.In order to determine the effectiveness of the gene therapeutic substance containing the cDNA of the
Биопсийный материал из области лимба в виде круга диаметром 1-1.5 мм помещали в чашку Петри в сбалансированный солевой раствор Хэнкса, добавляли диспазу (20 мкл 25 ед./мл) и гентамицин и инкубировали 24 часа при +4. Затем отделяли эпителиальный слой от стромы и нарезали обе ткани кусочками 1-2 мм3.Biopsy material from the limb region in the form of a circle with a diameter of 1-1.5 mm was placed in a Petri dish in a balanced Hanks saline solution, dispase (20 μl 25 units / ml) and gentamicin were added and incubated for 24 hours at +4. Then the epithelial layer was separated from the stroma and both tissues were cut into pieces of 1-2 mm 3 .
Суспензию эпителиальных клеток получали путем инкубирования кусочков тканей в растворе Трипсин-ЭДТА в течение 15 минут при +37°С. Трипсинизацию останавливали добавлением соевого ингибитора трипсина в PBS. Клеточные суспензии отмывали центрифугированием при 700 об/мин и ресуспендировали в бессывороточной среде DMEM с гентамицином. Клетки растили в 25 см2 флаконах с 5 мл среды при 37°С и в атмосфере, содержащей 5% СO2. Через 24 часа среду с не прикрепившимися клетками удаляли и добавляли 5 мл свежей среды. Пересев производили каждые 7 дней в соотношении 1:2-1:3.A suspension of epithelial cells was obtained by incubating pieces of tissue in a solution of Trypsin-EDTA for 15 minutes at + 37 ° C. Trypsinization was stopped by the addition of a soybean trypsin inhibitor in PBS. Cell suspensions were washed by centrifugation at 700 rpm and resuspended in serum-free DMEM with gentamicin. Cells were grown in 25 cm 2 vials with 5 ml of medium at 37 ° C and in an atmosphere containing 5% CO2. After 24 hours, non-adherent cells were removed and 5 ml of fresh medium was added. Reseeding was performed every 7 days in a ratio of 1: 2-1: 3.
Для трансфекции клеток генно-терапевтической субстанцией содержащей кДНК гена PROK 1 использовали амфифильные блок-сополимеры. Применяли методику по (IntJPharm, 2012, 427, 80-87) или в (Macromol. Biosci.2011, 11, 652-661), с некоторыми изменениями. Блок-сополимер синтезировали из смеси линейного полиэтиленимина (ПЭИ) (Polyscience Inc., США) и бифункционального полиэтиленгликоля (ПЭГ) N-гидроксисукцинимидил-75-N(3-малеимидопропионил)-амидо-4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25, 28, 31, 34, 37, 40, 43, 46, 49, 52, 55, 58, 61, 64, 67, 70, 73 - тетракосаоксапента-гептаконтаноата (MAL-dPEG™-NHS ester, Quanta BioDesign, Ltd., США) в боратном буфере. Полиплекс готовили за 1 час до введения в клетки, смешивая раствор блок-сополимера с ДНК генетической конструкции pCMV6-Kan/Neo PROK 1 SEQ ID No:3 с модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:3. Смесь для трансфекции добавляли к суспензии клеток в 1 мл культуральной среды DMEM с 10% фетальной сывороткой и ампициллином.Amphiphilic block copolymers were used to transfect cells with a gene therapeutic substance containing the cDNA of the
Так как для трансфекции использовали конструкцию, содержащую фактор селекции (устойчивость к генетицину), то клетки после трансфекции выращивали в 25 см3 флаконах с 5 мл среды с генетицином в течение 12 дней, меняя среду каждые 4 дня. Каждые 24 часа из каждой культуры отбирали аликвоту по 500 мкл суспензии с целью выделения РНК и анализа уровня специфической кДНК. Выделение РНК производили с помощью набора RNeasyMiniKit (Qiagen, Germany). Образцы РНК были сгруппированы в 3 группы по 8 образцов с близкой концентрацией и объединены. Анализ уровня специфической кДНК гена PROK 1 проводили с помощью амплификации в режиме реального времени по методике и с праймерами по примеру 6, используя набор реагентов iTaqUniversalSYBRGreenSupermix (Bio-Rad, USA), амплификатор CFX96 (Bio-Rad, USA) и программное обеспечение Bio-RadCFXManager 2.1. Максимальное увеличение транскрипции PROK 1 наблюдали на 4 сутки. На фигуре 14 приведены кривые накопления специфического продукта амплификации, соответствующего кДНК гена PROK 1.Since a construct containing a selection factor (resistance to geneticin) was used for transfection, the cells after transfection were grown in 25 cm 3 bottles with 5 ml of medium with geneticin for 12 days, changing the medium every 4 days. An aliquot of 500 μl of suspension was taken from each culture every 24 hours to isolate RNA and analyze the level of specific cDNA. RNA isolation was performed using the RNeasyMiniKit kit (Qiagen, Germany). RNA samples were grouped into 3 groups of 8 samples with a similar concentration and combined. The analysis of the level of the specific cDNA of the
Показано, что в клетках эпителия роговицы глаза трансфицированных генно-терапевтической субстанцией на основе pCMV6-Kan/Neo PROK 1 SEQ ID No:3, используя в качестве транспортной молекулы амфифильные блок-сополимеры, наблюдается усиление экспрессии целевого гена PROK 1.It was shown that in corneal epithelial cells of the eye transfected with a gene therapeutic substance based on pCMV6-Kan /
Пример 13Example 13
Введение в кожу человека генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1 с целью подтверждения при этом увеличения количества белка прокинетицина 1, в коже человека.The introduction into the human skin of a gene-therapeutic substance with a cDNA of the
С целью анализа изменения количества белка прокинетицина 1, пациентам вводили генно-терапевтическую субстанцию, содержащую генетическую конструкцию с кДНК гена PROK 1 (В) и параллельно вводили плацебо, представляющее собой комбинацию векторной плазмиды не содержащей кДНК гена PROK 1 с транспортной молекулой (А) - в кожу голени.In order to analyze the changes in the amount of
В качестве транспортной молекулы использовали порошок липосом TRANSFAST ТМ Transfection Reagent (PROMEGA, USA) по примеру 9. Далее генетическую конструкцию pCMV6 PROK 1 SEQ ID No:4, которая содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:4) и плазмиду pCMV6-XL5, используемую в качестве плацебо - которая не содержит кДНК гена PROK 1, каждую из которых растворяли в стерильной воде степени очистки Nuclease-Free. Для получения генно-терапевтических субстанций готовили комплексы ДНК-липосомы по примеру 9.As a transport molecule, TRANSFAST ™ Transfection Reagent liposome powder (PROMEGA, USA) was used as in Example 9. Next, the genetic
Полученные генно-терапевтическую субстанцию и плацебо использовали для введения пациенту. Введение осуществляли тоннельным методом иглой 30G на глубину 3 мм. Объем вводимого раствора генно-терапевтической субстанции и плацебо - около 0,3 мл для каждого. Очаги введения генно-терапевтической субстанции и плацебо располагались на расстоянии 3-5 см друг от друга.The resulting gene therapeutic substance and placebo were used for administration to a patient. The introduction was carried out by the tunnel method with a 30G needle to a depth of 3 mm. The volume of the injected solution of the gene-therapeutic substance and placebo is about 0.3 ml for each. The foci of the introduction of the gene-therapeutic substance and placebo were located at a distance of 3-5 cm from each other.
Количество белка прокинетицина 1, оценивали в лизатах биоптатов кожи пациента методом твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА ELISA), используя набор Human Prokineticin 1, PROK1 ELISA Kit (CD creative diagnostics, США), как описано в Примере 8.The amount of
Биопсийные образцы брали на 3 сутки после введения генно-терапевтической субстанции. Взятие биопсии осуществляли из участков кожи в зоне введения генно-терапевтической субстанции и плацебо, а также из интактной кожи, используя устройство для взятия биопсии Epitheasy 3.5 (Medax SRL) далее, как описано в примере 9.Biopsy samples were taken 3 days after the introduction of the gene-therapeutic substance. The biopsy was performed from skin areas in the area of the introduction of the gene-therapeutic substance and placebo, as well as from intact skin, using the Epitheasy 3.5 biopsy device (Medax SRL) below, as described in Example 9.
Показано, что в коже пациента в области введения генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1, произошло увеличение количества белка прокинетицина 1, тогда как при введении плацебо, количество белка прокинетицина 1 в коже не изменялась, что говорит об усилении экспрессии гена PROK 1 при использовании генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1. Результаты отражены на фигуре 15.It was shown that in the patient’s skin in the area of the introduction of the gene therapeutic substance with the cDNA of the
Пример 14Example 14
Введение в хрящевую ткань человека генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1 с целью подтверждения при этом увеличения количества белка прокинетицина 1 в хрящевой ткани человека.The introduction into the human cartilage of a gene-therapeutic substance with the cDNA of the
С целью анализа изменения количества белка прокинетицина 1 пациентам вводили генно-терапевтическую субстанцию, содержащую генетическую конструкцию с кДНК гена PROK 1 (В) и параллельно вводили плацебо, представляющее собой комбинацию векторной плазмиды не содержащей кДНК гена PROK 1 с транспортной молекулой (А) - в хрящевую ткань ушных раковин с тыльной стороны.In order to analyze the changes in the amount of
В качестве транспортной молекулы использовали порошок липосом TRANSFAST ТМ Transfection Reagent (PROMEGA, USA) по примеру 9. Далее генетическую конструкцию pCDNA 3.1 PROK 1 SEQ ID No:5, которая содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:5), и плазмиду pCDNA 3.1(+), используемую в качестве плацебо, которая не содержит кДНК гена PROK 1, каждую из которых растворяли в стерильной воде степени очистки Nuclease-Free. Для получения генно-терапевтических субстанций готовили комплексы ДНК-липосомы по примеру 9.Liposome powder TRANSFAST ™ Transfection Reagent (PROMEGA, USA) according to Example 9 was used as a transport molecule. Next, the genetic construct pCDNA 3.1 PROK 1 SEQ ID No: 5, which contains a modified cDNA of the
Полученные генно-терапевтическую субстанцию и плацебо использовали для введения пациенту. Введение осуществляли тоннельным методом иглой 30G на глубину 1 - 2 мм в хрящевую ткань ушных раковин с тыльной стороны. Объем вводимого раствора генно-терапевтической субстанции и плацебо - около 0,3 мл для каждого. Очаги введения генно-терапевтической субстанции и плацебо располагались на расстоянии 2-4 см друг от друга.The resulting gene therapeutic substance and placebo were used for administration to a patient. The introduction was carried out by the tunneling method with a 30G needle to a depth of 1 - 2 mm in the cartilaginous tissue of the auricles from the back side. The volume of the injected solution of the gene-therapeutic substance and placebo is about 0.3 ml for each. The foci of the introduction of the gene-therapeutic substance and placebo were located at a distance of 2-4 cm from each other.
Количество белка прокинетицина 1 оценивали в лизатах биоптатов хрящевой ткани пациента методом твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА ELISA), используя набор Human Prokineticin 1, PROK1 ELISA Kit (CD creative diagnostics, США), как описано в Примере 8.The amount of
Биопсийные образцы брали на 3 сутки после введения генно-терапевтической субстанции. Взятие биопсии осуществляли из участков хрящевой ткани в зоне введения генно-терапевтической субстанции, а также из интактных участков и в зоне введения плацебо, используя устройство для взятия биопсии Epitheasy 3.5 (Medax SRL), далее по примеру 9.Biopsy samples were taken 3 days after the introduction of the gene-therapeutic substance. The biopsy was performed from cartilage tissue sites in the area of the introduction of the gene-therapeutic substance, as well as from the intact areas and in the placebo area, using the Epitheasy 3.5 biopsy device (Medax SRL), further according to Example 9.
Показано, что в хрящевой ткани пациента в области введения генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1, произошло увеличение количества белка прокинетицина 1, тогда как при введении плацебо количество белка прокинетицина 1, в хрящевой ткани не изменялось, что подтверждает усиление экспрессии гена PROK 1 при использовании генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1. Результаты отражены на фигуре 16.It was shown that in the patient’s cartilage tissue in the area of the introduction of the gene therapeutic substance with the cDNA of the
Пример 15Example 15
Введение в мышечную ткань человека генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1 с целью подтверждения при этом увеличения количества белка прокинетицина 1 в мышечной ткани человека.The introduction into the muscle tissue of a human gene of a therapeutic substance with a cDNA of the
С целью анализа изменения количества белка прокинетицина 1 пациентам вводили генно-терапевтическую субстанцию, содержащую векторную плазмиду с кДНК гена PROK 1 (В) и параллельно вводили плацебо, представляющее собой комбинацию векторной плазмиды не содержащей кДНК гена PROK 1 с транспортной молекулой (А) - в мышечную ткань в зоне предплечья.To analyze the change in the amount of
В качестве транспортной молекулы использовали порошок липосом TRANSFAST ТМ Transfection Reagent (PROMEGA, USA) по примеру 9. Далее генетическую конструкцию pCMV6-Kan/Neo PROK 1 SEQ ID No:6, которая содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:6), и плазмиду pCMV6-Kan/Neo, используемую в качестве плацебо, которая не содержит кДНК гена PROK 1, каждую из которых растворяли в стерильной воде степени очистки Nuclease-Free.As a transport molecule, TRANSFAST ™ Transfection Reagent liposome powder (PROMEGA, USA) was used as in Example 9. Next, the pCMV6-Kan /
Для получения генно-терапевтических субстанций готовили комплексы ДНК-липосомы по примеру 9.To obtain gene therapeutic substances, DNA liposome complexes were prepared according to Example 9.
Полученные генно-терапевтическую субстанцию и плацебо использовали для введения пациенту. Введение осуществляли тоннельным методом иглой 30G на глубину 15-20 мм. Объем вводимого раствора генно-терапевтической субстанции и плацебо - около 0,5 мл для каждого. Очаги введения генно-терапевтической субстанции и плацебо располагались на расстоянии 5-7 см друг от другаThe resulting gene therapeutic substance and placebo were used for administration to a patient. The introduction was carried out by the tunnel method with a 30G needle to a depth of 15-20 mm. The volume of the injected solution of the gene-therapeutic substance and placebo is about 0.5 ml for each. The foci of the introduction of the gene-therapeutic substance and placebo were located at a distance of 5-7 cm from each other
Количество белка прокинетицина 1 оценивали в лизатах биоптатов мышечной ткани пациента методом твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА ELISA), используя набор Human Prokineticin 1, PROK1 ELISA Kit (CD creative diagnostics, США), как описано в Примере 8.The amount of
Биопсийные образцы брали на 3 сутки после введения генно-терапевтической субстанции. Взятие биопсии осуществляли из участков мышечной ткани в зоне введения генно-терапевтической субстанции, а также из интактных участков мышцы и в зоне введения плацебо, используя автоматическое устройство для взятия биопсии MAGNUM (компания BARD, USA), далее по примеру 9.Biopsy samples were taken 3 days after the introduction of the gene-therapeutic substance. A biopsy was performed from muscle tissue in the area of the introduction of the gene-therapeutic substance, as well as from intact areas of the muscle and in the placebo, using the MAGNUM automatic biopsy device (company BARD, USA), hereinafter in Example 9.
Показано, что, в мышечной ткани пациента в области введения генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1, произошло увеличение количества белка прокинетицина 1, тогда как при введении плацебо количество белка прокинетицина 1 в мышечной ткани не изменялась, что подтверждает усиление экспрессии гена PROK 1 при использовании генно-терапевтической субстанции с кДНК гена PROK 1. Результаты отражены на фигуре 17.It was shown that in the patient’s muscle tissue in the area of the introduction of the gene therapeutic substance with the cDNA of the
Пример 16Example 16
Введение группе различных пациентов генно-терапевтических субстанций содержащих модифицированные кДНК гена PROK 1 и участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1.The introduction to a group of different patients of gene-therapeutic substances containing modified cDNA of the
С целью подтверждения индивидуального характера увеличения количества белка прокинетицина 1 до различного уровня при введении в кожу пациентов генно-терапевтических субстанций с модифицированными и немодифицированной кДНК гена PROK 1 анализировали количественный уровень белка прокинетицина 1 в лизате биоптатов кожи группы пациентов в зависимости от наличия и типа модификаций в кДНК гена PROK 1.In order to confirm the individual character of the increase in the amount of
Последовательность участка нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 приведена на фигуре 1, PROK 1 SEQ ID No:1, последовательности модифицированных кДНК гена PROK 1 приведены на фигурах 2-7 (PROK 1 SEQ ID No:2, PROK 1 SEQ ID No:3, PROK 1 SEQ ID No:4, PROK 1 SEQ ID No:5, PROK 1 SEQ ID No:6, PROK 1 SEQ ID No:7).The sequence of the portion of the native unmodified cDNA of the
При этом генетические конструкции, одна из которых содержит участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:1), вторая генетическая конструкция содержит участок модифицированной кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:2), третья генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:3), четвертая генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:4), пятая генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:5), шестая генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:6), седьмая генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:7), восьмая генетическая конструкция (плацебо), представляет собой вектор pCMV6 XL5, растворяли в стерильной воде степени очистки Nuclease-Free. Для получения генно-терапевтических субстанций готовили комплексы ДНК в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.Moreover, genetic constructs, one of which contains a portion of the native unmodified cDNA of the
Полученные семь вариантов генно-терапевтических субстанций и плацебо использовали для введения в кожу пациентам. Введение осуществляли тоннельным методом иглой 30G на глубину 3 мм. Объем вводимого раствора каждой генно-терапевтической субстанции составлял около 0,3 мл. Очаги введения генно-терапевтических субстанций и плацебо располагались на расстоянии 3-5 см друг от друга.The resulting seven variants of gene therapeutic substances and a placebo were used for administration to the skin of patients. The introduction was carried out by the tunnel method with a 30G needle to a depth of 3 mm. The volume of the injected solution of each gene therapeutic substance was about 0.3 ml. The foci of the introduction of gene-therapeutic substances and placebo were located at a distance of 3-5 cm from each other.
Каждому из 23-х пациентов, которые были отобраны в случайном порядке, вводили 7 генно-терапевтических субстанций и плацебо в кожу голени.Each of the 23 patients who were randomly selected was injected with 7 gene-therapeutic substances and a placebo into the skin of the lower leg.
Биопсийные образцы брали через 72 часа после введения генно-терапевтических субстанций. Взятие биопсии осуществляли из участков введения генно-терапевтических субстанций, плацебо, а также из интактной кожи, используя устройство для взятия биопсии кожи Epitheasy 3.5 (Medax SRL). Кожу пациента предварительно промывали стерильным физиологическим раствором и анестезировали раствором лидокаина. Размер каждого биопсийного образца был около 3 мм, масса - до 20 мг. Образец помещали в буферный раствор, содержащий 50 мМ Трис-HCl рН 7.6, 100 мМ NaCl, 1 мМ ЭДТА и 1 мМ фенилметилсульфонилфторид и гомогенизировали до получения однородной суспензии. Полученную суспензию центрифугировали в течение 10 минут при 14000 об/мин. Отбирали супернатант и использовали его для количественного определения целевого белка.Biopsy samples were taken 72 hours after the introduction of gene-therapeutic substances. The biopsy was performed from the sites of the introduction of gene-therapeutic substances, placebo, as well as from intact skin, using the device for taking a skin biopsy Epitheasy 3.5 (Medax SRL). The patient’s skin was pre-washed with sterile saline and anesthetized with lidocaine solution. The size of each biopsy sample was about 3 mm, and the weight was up to 20 mg. The sample was placed in a buffer solution containing 50 mM Tris-HCl pH 7.6, 100 mM NaCl, 1 mM EDTA and 1 mM phenylmethyl sulfonyl fluoride and homogenized to obtain a uniform suspension. The resulting suspension was centrifuged for 10 minutes at 14,000 rpm. The supernatant was taken and used to quantify the target protein.
А - биоптат, полученный после введения генно-терапевтической субстанции на базе pCMV6-SEQ ID No:1, содержащий немодифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:1) по примеру 2 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.A - biopsy obtained after the introduction of a gene-therapeutic substance based on pCMV6-SEQ ID No: 1, containing unmodified cDNA of the
В - биоптат, полученный после введения генно-терапевтической субстанции на базе pCMV6-SEQ ID No:2, содержащий модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:2) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.B - a biopsy obtained after the introduction of a gene-therapeutic substance based on pCMV6-SEQ ID No: 2, containing a modified cDNA of the
С - биоптат, полученный после введения генно-терапевтической субстанции на базе pCMV6-SEQ ID No:3, содержащий модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:3) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.C is a biopsy obtained after the introduction of a gene therapeutic substance based on pCMV6-SEQ ID No: 3, containing the modified cDNA of the
D - биоптат, полученный после введения генно-терапевтической субстанции на базе pCMV6-SEQ ID No:4, содержащий модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:4) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.D is a biopsy obtained after the introduction of a gene-therapeutic substance based on pCMV6-SEQ ID No: 4, containing a modified cDNA of the
Е - биоптат, полученный после введения генно-терапевтической субстанции на базе pCMV6-SEQ ID No:5, содержащий модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:5) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.E is a biopsy obtained after the introduction of a gene-therapeutic substance based on pCMV6-SEQ ID No: 5, containing a modified cDNA of the
F - биоптат, полученный после введения генно-терапевтической субстанции на базе pCMV6-SEQ ID No:6, содержащий модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:6) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.F - biopsy obtained after the introduction of a gene-therapeutic substance based on pCMV6-SEQ ID No: 6, containing a modified cDNA of the
G - биоптат, полученный после введения генно-терапевтической субстанции на базе pCMV6-SEQ ID No:7, содержащий модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:7) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.G is a biopsy obtained after the introduction of a gene therapeutic substance based on pCMV6-SEQ ID No: 7, containing a modified cDNA of the
Н - биоптат, полученный после введения векторной плазмиды pCMV6-XL5, не содержащей кДНК гена PROK 1 по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.H is the biopsy obtained after the introduction of the vector plasmid pCMV6-XL5 that does not contain the cDNA of the
Количество белка прокинетицина 1 оценивали в девяти биоптатах кожи от каждого пациента (от А до Н и в биоптате интактной кожи) через 72 часа после введения генно-терапевтических субстанций методом твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА ELISA), используя набор Human Prokineticin 1, PROK1 ELISA Kit (CD creative diagnostics, США), как описано в Примере 8.The amount of
По итогам анализа количественного уровня белка прокинетицина 1 выбрали показатели, касательно каждого биоптата от каждого пациента, продемонстрировавшие максимальные уровни количества белка прокинетицина 1 и объединили их в семь групп, исходя из следующего критерия:Based on the results of the analysis of the quantitative level of
В группе 1 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении немодифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:1. В эту группу вошел 3 биоптат из 23.In
В группе 2 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:2. В эту группу вошли 3 биоптата из 23.In
В группе 3 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:3. В эту группу вошли 3 биоптата из 23.In
В группе 4 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:4. В эту группу вошли 4 биоптата из 23.In
В группе 5 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:5. В эту группу вошли 3 биоптата из 23.In
В группе 6 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:6. В эту группу вошли 5 биоптата из 23.In
В группе 7 максимальное количество белка прокинетицина 1, наблюдалось при введении модифицированной кДНК гена PROK 1 SEQ ID No:7. В эту группу вошли 2 биоптата из 23.In
Ни в одном из биоптатов, в которые были введены генно-терапевтические субстанции плацебо - векторной плазмидой, не содержащей кДНК гена PROK 1, не было обнаружено максимальное количество белка прокинетицина 1, в отличие от биоптатов, в которые были введены генно-терапевтические субстанции с генетическими конструкциями, содержащими кДНК гена PROK 1.None of the biopsy specimens into which the placebo gene therapeutic substances were introduced - a vector plasmid containing the cDNA of the
На фигуре 18 для каждой группы биоптатов приведены диаграммы показателей концентрации белка (усредненных в рамках группы, в случае, если в группу входит более одного биоптата) применительно ко всем, участвующим в эксперименте генно-терапевтическим субстанциям, после введения пациентам этих генно-терапевтических субстанций, содержащих модифицированные и участок нативной кДНК гена PROK 1.The figure 18 for each group of biopsy samples shows diagrams of indicators of protein concentration (averaged within the group, if more than one biopsy is included in the group) for all genetically therapeutic substances participating in the experiment, after the patients have been given these gene therapeutic substances, containing modified and a portion of the native cDNA of the
Из данного примера следует, что достижение максимального количества белка прокинетицина 1, в биоптатах кожи различных пациентов при введении им в кожу генно-терапевтических субстанций, связано с индивидуальными особенностями пациентов и зависит от наличия и типа модификаций в кДНК гена PROK 1, входящих в генно-терапевтические субстанции.From this example, it follows that the achievement of the maximum amount of
Каждая генно-терапевтическая субстанция из группы генно-терапевтических субстанций является эффективной в некоторой значительной группе пациентов. Следовательно, для выбора наиболее эффективной генно-терапевтической субстанции из группы генно-терапевтических субстанций для терапевтических целей необходимо предварительное персонализированное исследование биоптатов пациента, либо клеток, выращенных из этих биоптатов на предмет максимальной эффективности терапевтического воздействия, созданных генно-терапевтических субстанций в рамках группы генно-терапевтических субстанций.Each gene-therapeutic substance from the group of gene-therapeutic substances is effective in some significant group of patients. Therefore, in order to select the most effective gene-therapeutic substance from the group of gene-therapeutic substances for therapeutic purposes, a preliminary personalized study of the patient’s biopsy samples, or cells grown from these biopsy samples for the maximum effectiveness of the therapeutic effect created by the gene-therapeutic substances within the group of gene-therapeutic substances is necessary. therapeutic substances.
Пример 17Example 17
Трансфекция клеточной линии фибробластов пациента разными генно-терапевтическими субстанциями, содержащими модифицированные кДНК гена PROK 1 и участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 с целью персонализированного выбора из группы генно-терапевтических субстанций наиболее эффективной генно-терапевтической субстанции применительно к данному пациенту для последующей трансфекции этой субстанцией клеток пациента в рамках терапевтической процедуры.Transfection of a patient’s fibroblast cell line with different therapeutic genes containing modified
С целью определения наиболее эффективной применительно к конкретному пациенту генно-терапевтической субстанции анализировали количество белка прокинетицина 1, в клеточных лизатах фибробластов этого пациента, трансфицированных разными генно-терапевтическими субстанциями, содержащими участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 и/или модифицированные кДНК гена PROK 1.In order to determine the most effective gene-therapeutic substance for a particular patient, the amount of
Последовательность участка нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 приведена на фигуре 1, PROK 1 SEQ ID No:1, последовательности модифицированных кДНК гена PROK 1 приведены на фигурах 2-7 (PROK 1 SEQ ID No:2, PROK 1 SEQ ID No:3, PROK 1 SEQ ID No:4, PROK 1 SEQ ID No:5, PROK 1 SEQ ID No:6, PROK 1 SEQ ID No:7).The sequence of the portion of the native unmodified cDNA of the
Культуры фибробластов из биоптата пациента вырастили по примеру 5, отобрали аликвоты и провели клеточный лизис: клеточный осадок, соответствующий 2×106 клеток, промывали фосфатным буфером и ресуспендировали во льду в лизирующем буфере, содержащем 25 мМ ХЕПЕС рН 7.9, 100 мМ NaCl, 1 мМ ЭДТА, 1% Тритон Х-100, 10% глицерин и 1 мМ фенилметилсульфонилфторид. Лизат центрифугировали 5 минут при 14000 об/мин.Fibroblast cultures from the patient’s biopsy were grown according to Example 5, aliquots were taken and cell lysis was performed: the cell pellet corresponding to 2 × 10 6 cells was washed with phosphate buffer and resuspended in ice in a lysis buffer containing 25 mM HEPES pH 7.9, 100 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1% Triton X-100, 10% glycerol and 1 mM phenylmethyl sulfonyl fluoride. The lysate was centrifuged for 5 minutes at 14,000 rpm.
Затем культуру фибробластов пациента разделили на 8 частей. Первую часть, обозначенную (А), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:1, содержащей участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:1) по примеру 2 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.Then the patient’s fibroblast culture was divided into 8 parts. The first part, designated (A), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 1 vector containing a portion of the native unmodified cDNA of the
Вторую часть, обозначенную (В), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:2, содержащей участок модифицированной кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:2) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.The second part, designated (B), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 2 vector containing a portion of the modified
Третью часть, обозначенную (С), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:3, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:3) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.The third part, designated (C), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 3 vector containing the modified
Четвертую часть, обозначенную (D), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:4, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:4) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.The fourth part, labeled (D), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 4 vector containing the modified cDNA of the
Пятую часть, обозначенную (Е), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:5, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:5) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.The fifth part, designated (E), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID No: 5 vector containing the modified
Шестую часть, обозначенную (F), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID NO:6, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID NO:6) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.The sixth part, designated (F), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the pCMV6-SEQ ID NO: 6 vector containing the modified cDNA of the
Седьмую часть, обозначенную (G), трансфицировали по примеру 7 генно-терапевтической субстанцией на базе вектора pCMV6-SEQ ID No:7, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:7) по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.The seventh part, designated (G), was transfected according to Example 7 with a gene therapeutic substance based on the vector pCMV6-SEQ ID No: 7 containing the modified cDNA of the
Восьмую часть, обозначенную (Н), трансфицировали по примеру 7 векторной плазмидой pCMV6-XL5, не содержащей кДНК гена PROK 1 по примеру 3 в сочетании с транспортными молекулами - липосомами по примеру 9.The eighth part, designated (H), was transfected according to Example 7 with the vector plasmid pCMV6-XL5 that did not contain the
Определение количества белка прокинетицина 1 в клеточных лизатах фибробластов пациента проводили через 72 часа после трансфекции методом твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА ELISA), используя набор Human Prokineticin 1, PROK1 ELISA Kit (CD creative diagnostics, США), как описано в Примере 8.The amount of
По итогам определения количества белка прокинетицина 1, в культуре фибробластов пациента выделили вариант генно-терапевтической субстанции, при трансфекции которой наблюдается максимальное количество белка прокинетицина 1, в лизате клеточной культуры и соответственно наблюдается максимальная экспрессия гена PROK 1. В данном эксперименте максимальное количество белка прокинетицина 1, в лизате отмечено при трансфекции генно-терапевтической субстанцией на базе pCMV6 PROK 1 SEQ ID No:5, содержащей немодифицированную кДНК гена PROK 1, что показано на фигуре 19.According to the results of determining the amount of
Таким образом, выбрана наиболее эффективная применительно к данному пациенту генно-терапевтическая субстанция для последующей трансфекции клеток пациента в рамках терапевтической процедуры.Thus, the most effective gene-therapeutic substance has been selected for this patient for subsequent transfection of the patient's cells as part of a therapeutic procedure.
Пример 18Example 18
Введение в кожу пациента различных генно-терапевтических субстанций, содержащих модифицированные кДНК гена PROK 1 и участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 с целью выбора из группы генно-терапевтических субстанций наиболее эффективной генно-терапевтической субстанции применительно к данному пациенту для последующего введения этой субстанции пациенту в рамках терапевтической процедуры.The introduction into the patient’s skin of various gene-therapeutic substances containing modified
С целью определения наиболее эффективной применительно к конкретному пациенту генно-терапевтической субстанции анализировали количество белка прокинетицина 1, в лизатах биоптатов кожи этого пациента, после введения ему в кожу генно-терапевтических субстанций, содержащих модифицированные кДНК гена PROK 1 и/или участок нативной кДНК гена PROK 1.In order to determine the most effective gene-therapeutic substance for a particular patient, the amount of
Последовательность участка нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 приведена на фигуре 1, PROK 1 SEQ ID No:1, последовательности модифицированных кДНК гена PROK 1 приведены на фигурах 2-7 (PROK 1 SEQ ID No:2, PROK 1 SEQ ID No:3, PROK 1 SEQ ID No:4, PROK 1 SEQ ID No:5, PROK 1 SEQ ID No:6, PROK 1 SEQ ID No:7).The sequence of the portion of the native unmodified cDNA of the
Пациенту вводили 7 генно-терапевтических субстанций и плацебо в кожу голени.The patient was administered 7 gene-therapeutic substances and a placebo into the skin of the lower leg.
Первая генно-терапевтическая субстанция (А) на базе pCMV6-SEQ ID No:1, содержащая участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:1) по примеру 2 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The first gene therapeutic substance (A) based on pCMV6-SEQ ID No: 1, containing a portion of the native unmodified cDNA of the
Вторая генно-терапевтическая субстанция (В) на базе pCMV6-SEQ ID No:2, содержащая модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:2) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The second gene therapeutic substance (B) based on pCMV6-SEQ ID No: 2, containing the modified cDNA of the
Третья генно-терапевтическая субстанция (С) на базе pCMV6-SEQ ID No:3, содержащая модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:3) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The third gene therapeutic substance (C) based on pCMV6-SEQ ID No: 3, containing the modified cDNA of the
Четвертая генно-терапевтическая субстанция (D) на базе pCMV6-SEQ ID No:4, содержащая модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:4) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The fourth gene therapeutic substance (D) based on pCMV6-SEQ ID No: 4, containing the modified
Пятая генно-терапевтическая субстанция (Е) на базе pCMV6-SEQ ID No:5, содержащая модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:5) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The fifth gene therapeutic substance (E) based on pCMV6-SEQ ID No: 5, containing the modified
Шестая генно-терапевтическая субстанция (F) на базе pCMV6-SEQ ID No:6, содержащая модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:6) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The sixth gene therapeutic substance (F) based on pCMV6-SEQ ID No: 6, containing the modified cDNA of the
Седьмая генно-терапевтическая субстанция (G) на базе pCMV6-SEQ ID No:7, содержащая модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:7) по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The seventh gene therapeutic substance (G) based on pCMV6-SEQ ID No: 7, containing the modified cDNA of the
Восьмая векторная плазмида pCMV6-XL5, не содержащая кДНК гена PROK 1 по примеру 3 в сочетании с транспортной молекулой - дендримером по примеру 7.The eighth vector plasmid pCMV6-XL5 not containing the cDNA of the
При этом генетические конструкции, одна из которых содержит участок нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:1), вторая генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:2), третья генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:3), четвертая генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:4), пятая генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:5), шестая генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:6), седьмая генетическая конструкция содержит модифицированную кДНК гена PROK 1 (SEQ ID No:7), восьмая плазмида (плацебо), представляет собой вектор pCMV6 XL5, растворяли в стерильной воде степени очистки Nuclease-Free. Для получения генно-терапевтических субстанций готовили комплексы ДНК-дендример по примеру 7.Moreover, the genetic constructs, one of which contains a portion of the native unmodified cDNA of the
Полученные семь вариантов генно-терапевтических субстанций и плацебо использовали для введения пациенту. Введение осуществляли тоннельным методом иглой 30G на глубину 3 мм. Объем вводимого раствора каждой генно-терапевтической субстанции составлял около 0,3 мл. Очаги введения генно-терапевтических субстанций и плацебо располагались на расстоянии 3-5 см друг от друга.The resulting seven variants of gene-therapeutic substances and placebo were used for administration to the patient. The introduction was carried out by the tunnel method with a 30G needle to a depth of 3 mm. The volume of the injected solution of each gene therapeutic substance was about 0.3 ml. The foci of the introduction of gene-therapeutic substances and placebo were located at a distance of 3-5 cm from each other.
Биопсийные образцы брали через 72 часа после введения генно-терапевтических субстанций. Взятие биопсии осуществляли из участков введения генно-терапевтических субстанций, плацебо, а также из интактной кожи используя устройство для взятия биопсии кожи Epitheasy 3.5 (Medax SRL). Кожу пациента предварительно промывали стерильным физиологическим раствором и анестезировали раствором лидокаина. Размер каждого биопсийного образца был около 3 мм, масса - до 20 мг. Образец помещали в буферный раствор, содержащий 50 мМ Трис-HCl рН 7.6, 100 мМ NaCl, 1 мМ ЭДТА и 1 мМ фенилметилсульфонилфторид и гомогенизировали до получения однородной суспензии. Полученную суспензию центрифугировали в течение 10 минут при 14000 об/мин. Отбирали супернатант и использовали его для количественного определения целевого белка.Biopsy samples were taken 72 hours after the introduction of gene-therapeutic substances. The biopsy was performed from the sites of the introduction of gene-therapeutic substances, placebo, as well as from intact skin using the device for taking a skin biopsy Epitheasy 3.5 (Medax SRL). The patient’s skin was pre-washed with sterile saline and anesthetized with lidocaine solution. The size of each biopsy sample was about 3 mm, and the weight was up to 20 mg. The sample was placed in a buffer solution containing 50 mM Tris-HCl pH 7.6, 100 mM NaCl, 1 mM EDTA and 1 mM phenylmethyl sulfonyl fluoride and homogenized to obtain a uniform suspension. The resulting suspension was centrifuged for 10 minutes at 14,000 rpm. The supernatant was taken and used to quantify the target protein.
Определение количества белка прокинетицина 1 определяли в девяти биоптатах кожи пациента через 72 часа после введения генно-терапевтических субстанций методом твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА ELISA), используя набор Human Prokineticin 1, PROK1 ELISA Kit (CD creative diagnostics, США), как описано в Примере 8.The determination of the amount of
По итогам определения количества белка прокинетицина 1, в лизате биоптатов кожи пациента выделили вариант генно-терапевтической субстанции, при введении которой в кожу наблюдается максимальное количество белка прокинетицина 1, в лизате биоптата кожи и соответственно наблюдается максимальная экспрессия гена PROK 1. В данном эксперименте максимальное количество целевого белка в лизате биоптата кожи отмечено при введении генно-терапевтической субстанции на базе pCMV6 PROK 1 SEQ ID No:6, содержащей модифицированную кДНК гена PROK 1, что показано на фигуре 20.According to the results of determining the amount of
Таким образом, выбрана наиболее эффективная применительно к данному пациенту генно-терапевтическая субстанция для ее последующего введения пациенту в рамках терапевтической процедуры.Thus, the most effective gene-therapeutic substance has been selected for this patient for its subsequent administration to the patient as part of a therapeutic procedure.
Создано средство для лечения состояний человеческого организма, связанных с уменьшением экспрессии гена PROK 1 и/или уменьшением количества белка прокинетицина 1, состоящее из одной или нескольких генно-терапевтических субстанций из группы генно-терапевтических субстанций для коррекции патологических состояний клеток органов и тканей и/или органов и тканей человека, возникших вследствие недостаточной экспрессии гена PROK 1, способ его получения и использования.An agent has been developed for treating conditions of the human body associated with a decrease in the expression of the
Созданное средство для лечения состояний человеческого организма, связанных с уменьшением экспрессии гена PROK 1 и/или уменьшением количества белка прокинетицина 1, состоящее из одной или нескольких генно-терапевтических субстанций из группы генно-терапевтических субстанций с использованием одной из модифицированных кДНК гена PROK 1 или участка нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 позволяет на практике использовать входящие в группу генно-терапевтические субстанции для повышения до необходимого уровня количества белка прокинетицина 1, в различных клетках органов и тканей и/или органах и тканях человека путем увеличения экспрессии гена PROK 1.An invented tool for treating conditions of the human body associated with a decrease in the expression of the
В результате проведения предварительных исследований биоптата пациента, либо клеток, выращенных из этих биоптатов, определяют, какой вариант генно-терапевтической субстанции из созданной группы генно-терапевтических субстанций необходимо выбрать для данного пациента для того, чтобы повысить количество белка прокинетицина 1, в клетках этих органов и тканей и/или органах и тканях до необходимого уровня применительно к конкретному пациенту. В тех случаях, когда использование генно-терапевтической субстанции с участком нативной немодифицированной кДНК гена PROK 1 не приводит к желаемому изменению уровня количества белка прокинетицина 1, в клетках органов и тканей и/или органах и тканях, необходимо применять субстанцию на основе модифицированной кДНК гена PROK 1, приводящей к более эффективной экспрессии гена PROK 1.As a result of preliminary studies of the biopsy of the patient, or cells grown from these biopsies, determine which version of the gene therapeutic substance from the created group of gene therapeutic substances must be selected for this patient in order to increase the amount of
При использовании заявленной генно-терапевтической субстанции не происходит встраивания экзогенного генетического материала в геном клетки.When using the claimed gene therapeutic substance, there is no embedding of exogenous genetic material in the genome of the cell.
Группа генно-терапевтических субстанций обеспечивает высокий уровень экспрессии гена PROK 1, повышая количество белка прокинетицина 1, в клетках органов и тканей и/или органах и тканях человека в частности, фибробластах, в эндотелиоцитах семенников, надпочечников, яичников и плаценты, в вагине, шейке, придатках матки, отделах головного мозга, мозжечке, гипофизе, коре головного мозга, спинном мозге, предстательной железе, сердце, молочных железах, селезенке, скелетной мышечной ткани, мочевом пузыре, желчном пузыре, коже ноги, надлобковой коже, роговице, слизистой оболочке канала шейки матки, подкожной жировой клетчатке, висцеральной жировой ткани, в сочетании с транспортной молекулой или без нее при трансфекции этими генно-терапевтическими субстанциями клеток органов и тканей человека и/или в органах и тканях человека в частности, фибробластах, в эндотелиоцитах семенников, надпочечников, яичников и плаценты, в вагине, шейке, придатках матки, отделах головного мозга, мозжечке, гипофизе, коре головного мозга, спинном мозге, предстательной железе, сердце, молочных железах, селезенке, скелетной мышечной ткани, мочевом пузыре, желчном пузыре, коже ноги, надлобковой коже, роговице, слизистой оболочке канала шейки матки, подкожной жировой клетчатке, висцеральной жировой ткани в сочетании с транспортной молекулой или без нее при введении этих генно-терапевтических субстанций в органы и ткани человека.The group of gene-therapeutic substances provides a high level of expression of the PROK 1 gene by increasing the amount of prokineticin 1 protein in the cells of organs and tissues and / or organs and tissues of a person, in particular fibroblasts, in the endotheliocytes of the testes, adrenal glands, ovaries and placenta, in the vagina, neck , uterine appendages, parts of the brain, cerebellum, pituitary gland, cerebral cortex, spinal cord, prostate gland, heart, mammary glands, spleen, skeletal muscle tissue, bladder, gall bladder, foot skin, suprapubic skin, the osseum, the mucous membrane of the cervical canal, subcutaneous fatty tissue, visceral fatty tissue, in combination with or without a transport molecule during transfection of these organs with therapeutic substances of human organs and tissues and / or in human organs and tissues, in particular, fibroblasts, endothelial cells of the testes, adrenal glands, ovaries and placenta, in the vagina, cervix, appendages of the uterus, parts of the brain, cerebellum, pituitary gland, cerebral cortex, spinal cord, prostate gland, heart, mammary glands, spleen e, skeletal muscle tissue, bladder, gall bladder, leg skin, suprapubic skin, cornea, cervical canal mucosa, subcutaneous fat, visceral adipose tissue in combination with or without a transport molecule with the introduction of these gene therapeutic substances into organs and human tissue.
Таким образом, приведенные примеры подтверждают выполнение поставленной задачи, а именно, создание высокоэффективного средства для лечения состояний человеческого организма, связанных с уменьшением уровня экспрессии гена PROK 1 и/или уменьшением количества белка прокинетицина 1, на основе генно-терапевтических субстанций с геном PROK 1, представляющего собой группу генно-терапевтических субстанций, при использовании которых с учетом индивидуальных особенностей пациента, происходит повышение уровня экспрессии гена PROK 1 и/или повышение количества белка прокинетицина 1, в клетках органов и тканей и/или органах и тканях организма.Thus, the above examples confirm the fulfillment of the task, namely, the creation of a highly effective agent for treating the conditions of the human body associated with a decrease in the level of expression of the
Кроме этого при введении генетических конструкций в отличие от введения непосредственно белка, снижается требуемая частота их введения в связи с пролонгированным действием, а также облегчается внутриклеточная доставка.In addition, with the introduction of genetic constructs, in contrast to the introduction of the protein itself, the required frequency of their introduction is reduced due to the prolonged action, and intracellular delivery is also facilitated.
Повышение эффективности коррекции количественного уровня белка прокинетицина 1, в клетках органов и тканей человека достигают за счет того, что при недостаточном количестве этого белка вследствие дефекта гена PROK 1 используют не белок, а генетическую конструкцию с кДНК гена PROK 1, кодирующую этот белок.An increase in the efficiency of correction of the quantitative level of
Промышленная применимостьIndustrial applicability
Все приведенные примеры по созданию и использованию созданной группы генно-терапевтических субстанций подтверждают ее промышленную применимость.All the above examples on the creation and use of the created group of gene therapeutic substances confirm its industrial applicability.
Перечень сокращенийList of abbreviations
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислотаDNA - deoxyribonucleic acid
кДНК - комплементарная дезоксирибонуклеиновая кислотаcDNA - complementary deoxyribonucleic acid
РНК - рибонуклеиновая кислотаRNA - ribonucleic acid
мРНК - матричная рибонуклеиновая кислотаmRNA - template ribonucleic acid
ПЦР - полимеразная цепная реакцияPCR - polymerase chain reaction
мл - миллилитр, мкл - микролитрml - milliliter, μl - microliter
л - литрl - liter
мкг - микрограммmcg - micrograms
мг - миллиграммmg - milligram
г - граммg - gram
мкМ - микромольμM - micromol
мМ - миллимольmm - millimole
об/мин - обороты в минутуrpm - revolutions per minute
нм - нанометрnm - nanometer
см - сантиметрcm - centimeter
мВт - милливаттMW - milliwatts
о.е.ф. - относительная единица флуоресценцииo.e.f. - relative unit of fluorescence
ГТС - генно-терапевтическая субстанция GTS - a gene-therapeutic substance
Claims (5)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2017105285A RU2662944C1 (en) | 2017-02-17 | 2017-02-17 | Agent for treating human body conditions associated with a decrease in the level of expression of the prok 1 gene and/or a decrease in the amount of prokineticin 1 protein on the basis of gene-therapeutic substances with prok 1 gene, method for obtaining and using |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2017105285A RU2662944C1 (en) | 2017-02-17 | 2017-02-17 | Agent for treating human body conditions associated with a decrease in the level of expression of the prok 1 gene and/or a decrease in the amount of prokineticin 1 protein on the basis of gene-therapeutic substances with prok 1 gene, method for obtaining and using |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2662944C1 true RU2662944C1 (en) | 2018-07-31 |
Family
ID=63142378
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2017105285A RU2662944C1 (en) | 2017-02-17 | 2017-02-17 | Agent for treating human body conditions associated with a decrease in the level of expression of the prok 1 gene and/or a decrease in the amount of prokineticin 1 protein on the basis of gene-therapeutic substances with prok 1 gene, method for obtaining and using |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2662944C1 (en) |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2004081229A2 (en) * | 2003-03-12 | 2004-09-23 | Genentech, Inc. | Use of bv8 and/or eg-vegf to promote hematopoiesis |
US7419956B2 (en) * | 2000-07-18 | 2008-09-02 | Takeda Pharmaceutical Company Limited | Isolated physiologically active peptide and use thereof |
EP2075334A1 (en) * | 2000-06-23 | 2009-07-01 | Genentech, Inc. | EG-VEGF nucleic acids and polypeptides and methods of use |
RU2559542C2 (en) * | 2009-12-23 | 2015-08-10 | Дженентек, Инк. | Anti-bv8 antibodies and using them |
-
2017
- 2017-02-17 RU RU2017105285A patent/RU2662944C1/en not_active IP Right Cessation
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2075334A1 (en) * | 2000-06-23 | 2009-07-01 | Genentech, Inc. | EG-VEGF nucleic acids and polypeptides and methods of use |
US7419956B2 (en) * | 2000-07-18 | 2008-09-02 | Takeda Pharmaceutical Company Limited | Isolated physiologically active peptide and use thereof |
WO2004081229A2 (en) * | 2003-03-12 | 2004-09-23 | Genentech, Inc. | Use of bv8 and/or eg-vegf to promote hematopoiesis |
RU2559542C2 (en) * | 2009-12-23 | 2015-08-10 | Дженентек, Инк. | Anti-bv8 antibodies and using them |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7077404B2 (en) | Exosomes containing RNA therapeutics | |
CN113151215B (en) | Engineered Cas12i nuclease, effector protein thereof and application thereof | |
Makki et al. | MicroRNA‐9 promotion of interleukin‐6 expression by inhibiting monocyte chemoattractant protein–induced protein 1 expression in interleukin‐1β–stimulated human chondrocytes | |
US20200016297A1 (en) | Matrix scaffold with antimicrobial activity | |
CN109295053B (en) | Method for regulating RNA splicing by inducing splice site base mutation or base substitution of polypyrimidine region | |
US20170035851A1 (en) | Compositions And Methods For Treating Glioma | |
CN110747211A (en) | CRISPR-based method for changing expression of gene product and application thereof | |
CN114591986A (en) | Cyclic RNA molecules and their use in targeted degradation of target proteins | |
RU2658428C1 (en) | Agent for treatment of human body states related to p4ha1 gene reduced expression and/or reduced quantity of prolyl 4-hydroxylase alpha 1 protein on basis of gene-therapeutic substances with p4ha1 gene, method of manufacture and operation | |
RU2662944C1 (en) | Agent for treating human body conditions associated with a decrease in the level of expression of the prok 1 gene and/or a decrease in the amount of prokineticin 1 protein on the basis of gene-therapeutic substances with prok 1 gene, method for obtaining and using | |
RU2665771C1 (en) | Agent for treatment of human body conditions associated with a decrease in the level of ang gene expression and/or a reduction in the amount and/or activity of an angiogenin protein based on gene therapy, a method of production and use | |
RU2651048C1 (en) | Agent for treatment of human organism states related to decrease in il-11 gene expression and/or decrease in the amount of interleukin-11 protein on the basis of gene-therapeutic substances with il-11 gene, the method of obtaining and using | |
RU2649814C1 (en) | Means for treatment of human body states related to decrease of the cat gene expression level and/or reduction of the catalysis protein activity based on gene-therapeutic substances with the cat gene, method for production and use | |
RU2677695C2 (en) | Agent for treating human body conditions associated with a decrease in the level of expression of the prok 2 gene and/or a decrease in the amount of prokineticin 2 protein on the basis of gene-therapeutic substances with prok 2 gene, method for obtaining and using | |
RU2649820C2 (en) | Agent for correction of pathological states of cells and tissues and/or organs and human tissue based on col1a2 gene, related to quantitative decrease of protein of collagen type i alpha 2 chain | |
RU2652350C2 (en) | Line of biologically active gene therapy substances based on col1a1 gene for correction of pathological states of cells of organs and tissues and human organs and tissues, method of obtaining and using | |
RU2652351C2 (en) | Line of biologically active gene-therapy substances based on tgfbr2 gene for correction of pathological states of cells of organs and tissues and human organs and tissues, method of obtaining and using | |
RU2652318C2 (en) | Line of biologically active gene-therapy substances based on clca2 gene for correction of pathological states of cells of organs and tissues and human organs and tissues, method of obtaining and using | |
RU2652312C2 (en) | Line of biologically active gene-therapy substances based on tgfb1 gene for correction of pathological states of cells of organs and tissues and human organs and tissues, method of obtaining and using | |
RU2653487C1 (en) | Agent for treatment of human organism states related to decrease in the lif gene expression and/or decrease in the amount of protein of the factor inhibiting leucemia based on gene-therapeutic substances with lif gene, method of obtaining and using | |
RU2700649C2 (en) | Genetic construct based on non-viral vector plasmid including p4na2 gene cdna for reducing manifestations of human body conditions associated with reduced expression of p4na2 gene and/or reducing amount of prolyl 4-hydroxy acid alpha 2 protein, method of producing and use | |
RU2651757C2 (en) | Line of biologically active gene-therapeutic substances based on sod2 gene for correction of pathological conditions of cells of organs and tissues and human organs and tissues related to oxidative stress, method of obtaining and using | |
RU2652353C2 (en) | Line of biologically active gene-therapy substances based on sod1 gene for correction of pathological states of cells of organs and tissues and human organs and tissues related to oxidative stress, method of obtaining and using | |
JP2009532326A (en) | Method for treating peripheral arterial disease with zinc finger protein | |
WO2020139151A1 (en) | Gene therapy dna vector based on gene therapy dna vector vtvaf17 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20210218 |