RU2506595C2 - Method for prediction of risk of paranoid schizophrenia - Google Patents

Method for prediction of risk of paranoid schizophrenia Download PDF

Info

Publication number
RU2506595C2
RU2506595C2 RU2012116999/15A RU2012116999A RU2506595C2 RU 2506595 C2 RU2506595 C2 RU 2506595C2 RU 2012116999/15 A RU2012116999/15 A RU 2012116999/15A RU 2012116999 A RU2012116999 A RU 2012116999A RU 2506595 C2 RU2506595 C2 RU 2506595C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
ntrk3
gene
risk
locus
schizophrenia
Prior art date
Application number
RU2012116999/15A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2012116999A (en
Inventor
Анна Эмировна Гареева
Денис Филарисович Закиров
Эльза Камилевна Хуснутдинова
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра Российской академии наук (ИБГ УНЦ РАН)
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Башкирский государственный университет" (БашГУ)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра Российской академии наук (ИБГ УНЦ РАН), Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Башкирский государственный университет" (БашГУ) filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра Российской академии наук (ИБГ УНЦ РАН)
Priority to RU2012116999/15A priority Critical patent/RU2506595C2/en
Publication of RU2012116999A publication Critical patent/RU2012116999A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2506595C2 publication Critical patent/RU2506595C2/en

Links

Images

Abstract

FIELD: medicine.
SUBSTANCE: present invention refers to medicine, namely to medical genetics and psychiatry, and may be used for the prediction of a risk of paranoid schizophrenia. Substance of the method: DNA is recovered by phenol-chloroform extraction that is followed by genetic typing of polymorphous locus rs 1443445 of NTRK2 gene, locus rs 1946698, locus rs 7170062, locus rs 11631508 of NTRK3 gene, locus rs 1469794 of NRXN1 gene; if observing the genetic type NTRK2*C/*C (rs 1443445), the genetic type NTRK3*G/*G (rs 1946698), the genetic type NTRK3*T7*T (rs 7170062), the genetic type NTRK3*A/*A (rs 11631508) in Russian people; the genetic type NRXN1*A/*A (rs 1469794) in the Tatar people, the risk of paranoid schizophrenia is predicted.
EFFECT: using the invention enables the more accurate, objective prediction of the disease.
1 tbl, 2 ex, 5 dwg

Description

Предлагаемое изобретение относится к медицине, а именно к медицинской генетике и психиатрии, и может быть использовано для прогнозирования риска развития параноидной шизофрении.The present invention relates to medicine, namely to medical genetics and psychiatry, and can be used to predict the risk of paranoid schizophrenia.

Шизофрения - комплексное полигенно-наследуемое расстройство психики и головного мозга, манифестирующее в результате взаимосочетания предрасполагающих факторов наследственности и среды (психогенных, социогенных, экзогенных) и проявляющееся дезорганизацией и диссоциацией психических функций с развитием спектра психотических симптомов в виде бреда и галлюцинаций, специфическими нарушениями мышления и постепенным формированием эмоционально-волевого и когнитивного дефицита (Тиганов, 1999; Мосолов с соавт., 2010; Gottesman et al., 2003; Tamminga et al., 2005). В 2001 году Всемирная организация здравоохранения внесла шизофрению в список десяти ведущих причин инвалидности (Tandon et al., 2008).Schizophrenia is a complex polygenic inherited disorder of the psyche and brain, manifested as a result of a combination of predisposing factors of heredity and the environment (psychogenic, sociogenic, exogenous) and manifested by disorganization and dissociation of mental functions with the development of a spectrum of psychotic symptoms in the form of delusions and hallucinations, specific disorders of thinking and the gradual formation of emotional-volitional and cognitive deficits (Tiganov, 1999; Mosolov et al., 2010; Gottesman et al., 2003; Tamminga et al., 2005). In 2001, the World Health Organization put schizophrenia on the list of ten leading causes of disability (Tandon et al., 2008).

Несмотря на значительные успехи нейробиологии и фармакологии, способствовавших формированию новых концепций патогенеза, диагностики, лечения и профилактики шизофрении, данное заболевание по своим многообразным последствиям является одним из самых тяжелых и по-прежнему представляет серьезную социально-экономическую проблему, связанную с хроническим характером болезни и четко выраженной тенденцией к углублению расстройств психики и инвалидизации больных (Гурович с соавт., 2002; Любов с соавт., 2008). В связи с этим, важной задачей, является необходимость исследования механизмов развития данного заболевания с целью разработки эффективных методов диагностики, профилактики и патогенетической терапии с учетом этнической принадлежности и генетической предрасположенности каждого больного. Изучение структурных особенностей генома, предрасполагающих к развитию различных многофакторных заболеваний, особенно с использованием значительного числа полиморфных локусов, позволяет оценить их вклад в этиопатогенез и выявлять факторы риска развития заболевания, а также разрабатывать профилактические мероприятия. Исследование полиморфных вариантов генов-кандидатов шизофрении дает возможность установить генетические факторы повышенного и пониженного риска развития этой патологии, представляющие собой различные сочетания тех или иных аллелей и генотипов.Despite the significant successes of neurobiology and pharmacology, which contributed to the formation of new concepts of the pathogenesis, diagnosis, treatment and prevention of schizophrenia, this disease is one of the most severe in its diverse consequences and still poses a serious socio-economic problem associated with the chronic nature of the disease and clearly a pronounced tendency to deepen mental disorders and disability of patients (Gurovich et al., 2002; Lyubov et al., 2008). In this regard, an important task is the need to study the mechanisms of development of this disease in order to develop effective methods of diagnosis, prevention and pathogenetic therapy, taking into account the ethnicity and genetic predisposition of each patient. Studying the structural features of the genome predisposing to the development of various multifactorial diseases, especially using a significant number of polymorphic loci, allows us to evaluate their contribution to etiopathogenesis and identify risk factors for the development of the disease, as well as develop preventive measures. The study of polymorphic variants of schizophrenia candidate genes makes it possible to establish genetic factors of an increased and reduced risk of developing this pathology, which are various combinations of certain alleles and genotypes.

Применение разработанного способа обеспечит выявление лиц с повышенным риском развития параноидной шизофрении (ПШ) с целью формирования групп высокого риска и осуществления своевременных, целенаправленных мероприятий по профилактике развития данной патологии.The application of the developed method will ensure the identification of individuals with an increased risk of developing paranoid schizophrenia (PS) in order to form high-risk groups and implement timely, targeted measures to prevent the development of this pathology.

Известен способ прогнозирования риска развития шизофрении (Ш) на основании учета роли наследственного фактора, согласно которому считается, что риск развития Ш у родителей больных составляет 14%, у братьев и сестер - 15-16%, у детей больных родителей - 10-12%, у дядей и теток - 5-6%. (Тиганов, 1999). Недостатком данного способа является недостаточная точность и информативность, а также возможность расчета риска только в том случае, если в семье есть больные шизофренией.A known method for predicting the risk of developing schizophrenia (III) based on the role of the hereditary factor, according to which it is believed that the risk of developing Ш for parents of patients is 14%, for brothers and sisters - 15-16%, for children of sick parents - 10-12% , uncles and aunts - 5-6%. (Tiganov, 1999). The disadvantage of this method is the lack of accuracy and information, as well as the ability to calculate risk only if the family has patients with schizophrenia.

Задачей изобретения стала разработка объективного, высокоинформативного способа прогнозирования риска развития параноидной шизофрении.The objective of the invention was the development of an objective, highly informative method for predicting the risk of developing paranoid schizophrenia.

Технический результат при использовании изобретения повышение точности прогноза.The technical result of using the invention is to increase the accuracy of the forecast.

Указанный технический результат достигается тем, что выделяют ДНК методом фенольно-хлороформной экстракции, проводят генотипирование полиморфных локусов rs 1443445 гена NTRK2, rs 1946698, rs7170062, rs 11631508 гена NTRK3, rs 1469794 гена NRXN1 при выявлении аллеля NTRK2*C (rs 1443445), NTRK3*G (rs 1946698), NTRK3*T (rs 7170062), NTRK3*A (rs 11631508) и генотипа NTRK3*G/*G (rs 1946698), NTRK3*T/*T (rs 7170062) у русских; аллеля NRXN1*А (rs 1469794) у татар, прогнозируют риск развития параноидной шизофрении.The indicated technical result is achieved by isolating DNA by phenol-chloroform extraction, genotyping of polymorphic loci rs 1443445 of the NTRK2 gene, rs 1946698, rs7170062, rs 11631508 of the NTRK3 gene, rs 1469794 of the NRXN1 gene with the detection of the NTRK453 * C allele (r) * G (rs 1946698), NTRK3 * T (rs 7170062), NTRK3 * A (rs 11631508) and the genotype NTRK3 * G / * G (rs 1946698), NTRK3 * T / * T (rs 7170062) in Russians; the NRXN1 * A allele (rs 1469794) in Tatars, they predict the risk of paranoid schizophrenia.

Способ осуществляется следующим образом. ДНК выделяют из лимфоцитов периферической крови фенольно-хлороформной экстракции. Кровь набирают в пробирку с консервантом, содержащим 0,48% лимонной кислоты, 1,32% лимоннокислого натрия, 1,47% глюкозы, в соотношении 6:1, тщательно перемешивают и хранят при температуре 40°С не более одной недели. Для выделения ДНК к 8 мл крови добавляют 32 мл лизирующего буфера, содержащего 320 мМ сахарозы, 1% тритон Х-100, 5 мМ MgCl2, 10 мМ трис-HCl, рН 7,6. Полученную смесь перемешивают и центрифугируют при 4°С, 4000 об./мин. в течение 20 минут. Надосадочную жидкость сливают, к осадку повторно приливают 20 мл лизирующего буфера и центрифугируют при тех же условиях в течение 10 мин. К полученному осадку добавляют 400 мкл буфера Soline ЭДТА (25 мМ ЭДТА, рН 8,0 и 75 мМ NaCl), 40 мкл 10% SDS, 30-40 мкл протеиназы К (10 мг/мл) и инкубируют при 37°С в течение 16 часов. После этого из лизата последовательно в три этапа проводят экстракцию ДНК равными объемами забуференного фенола (200 мкл меркаптоэтанола на 50 мл фенола - Трис-HCI, рН 7,8), смесью фенол-хлороформа (1:1) и хлороформа с центрифугированием при 10000 об./мин. в течение 10 минут и отбором водной фазы после каждого этапа. ДНК осаждают двумя объемами 96% этанола. Осадок промывают 70% этанолом, подсушивают на воздухе, растворяют в дистиллированной воде и хранят при -20°С. Выделенная ДНК используется для проведения полимеразной цепной реакции синтеза ДНК (ПЦР).The method is as follows. DNA is isolated from peripheral blood lymphocytes by phenol-chloroform extraction. Blood is drawn into a test tube with a preservative containing 0.48% citric acid, 1.32% sodium citrate, 1.47% glucose, in a 6: 1 ratio, mixed thoroughly and stored at 40 ° C for no more than one week. To isolate DNA, add 32 ml of lysis buffer to 8 ml of blood containing 320 mM sucrose, 1% Triton X-100, 5 mM MgCl2, 10 mM Tris-HCl, pH 7.6. The resulting mixture was stirred and centrifuged at 4 ° C, 4000 rpm. for 20 minutes. The supernatant is drained, 20 ml of lysis buffer is re-added to the precipitate and centrifuged under the same conditions for 10 minutes. 400 μl of Soline EDTA buffer (25 mM EDTA, pH 8.0 and 75 mM NaCl), 40 μl 10% SDS, 30-40 μl proteinase K (10 mg / ml) are added to the resulting pellet and incubated at 37 ° C for 16 hours. After that, DNA is extracted in succession in three stages from the lysate in equal volumes of buffered phenol (200 μl of mercaptoethanol per 50 ml of phenol - Tris-HCI, pH 7.8), a phenol-chloroform mixture (1: 1) and chloroform with centrifugation at 10000 rpm ./min for 10 minutes and the selection of the aqueous phase after each stage. DNA is precipitated with two volumes of 96% ethanol. The precipitate is washed with 70% ethanol, dried in air, dissolved in distilled water and stored at -20 ° C. Isolated DNA is used for the polymerase chain reaction of DNA synthesis (PCR).

Амплификация изученных ДНК-локусов rs 1443445 гена NTRK2, rs 1946698, rs 7170062, rs 11631508 гена NTRK3, rs 1469794 гена NRXN1 проводят методом ПЦР синтеза ДНК в 25 мкл общего объема смеси, содержащей 2,5 мкл 10×Taq-буфера (67 мМ трис-HCl (рН 8,8), 16,6 мМ (NH4)2SO4,, 1,5 мМ MgCl2, 0,01% Tween-20), 0,1 мкг геномной ДНК, смесь dNTP (dATP, dGTP, dCTP, dTTP no 200 мкМ каждого), 1 ед. ДНК-полимеразы Termus aquaticus (производства фирмы «Силекс», г.Москва) и 5-10 пМ локусспецифичных олигонуклеотидных праймеров. Перечень исследуемых локусов, последовательности праймеров, размеры амплифицируемых фрагментов и температурные режимы ПЦР представлены в таблице 1.Amplification of the studied DNA loci rs 1443445 of the NTRK2 gene, rs 1946698, rs 7170062, rs 11631508 of the NTRK3 gene, rs 1469794 of the NRXN1 gene is carried out by PCR DNA synthesis in 25 μl of the total volume of the mixture containing 2.5 μl of 10 × Taq buffer (67 mm Tris-HCl (pH 8.8), 16.6 mM (NH 4 ) 2 SO 4 ,, 1.5 mM MgCl 2 , 0.01% Tween-20), 0.1 μg of genomic DNA, dNTP mixture (dATP , dGTP, dCTP, dTTP no 200 μM each), 1 unit. Termus aquaticus DNA polymerase (manufactured by Sileks, Moscow) and 5-10 pM locus-specific oligonucleotide primers. The list of the studied loci, the sequence of primers, the sizes of amplified fragments and the temperature regimes of PCR are presented in table 1.

Для определения нуклеотидных замен проводят гидролиз амплифицированных фрагментов соответствующей рестриктазой. Данные о рестрикционных локусах, названия рестриктаз и длины продуктов расщепления представлены в таблице 1. Рестрикцию полиморфного локуса rs 1443445 гена NTRK2 проводили эндонуклеазой рестрикции BstSFI, rs 1946698 гена NTRK3 - KspAI, rs 7170062 гена NTRK3- Cac8I, rs 11631508 гена NTRK3- Hpy188I, rs 1469794 гена NRXN1- Mph1103I, в соответствии с рекомендациями фирм-производителей.To determine the nucleotide substitutions, the amplified fragments are hydrolyzed by the corresponding restriction enzyme. Data on restriction loci, names of restriction enzymes, and lengths of cleavage products are presented in Table 1. Restriction of the polymorphic locus rs 1443445 of the NTRK2 gene was performed by the restriction endonuclease BstSFI, rs 1946698 of the NTRK3 gene - KspAI, rs 7170062 of the NTRK3-Cac8I, rs188508 gene, rs188508 gene, rs188508 1469794 of the NRXN1-Mph1103I gene, in accordance with the recommendations of manufacturers.

Разделение фрагментов ДНК после амплификации и рестрикции проводят при помощи электрофореза в 7% полиакриламидном геле (ПААГ), приготовленном из 30% раствора ПААГ (соотношение акриламид:N,N'-метиленбисакриламид - 29:1). Электрофорез проводят в 1×ТБЕ буфере (0,089 М трис-HCl; 0,089 М борная кислота; 0,002 М ЭДТА, рН=8,0). Перед нанесением на гель пробы смешивают в соотношении 5:1 с краской, содержащей 0,25% бромфенолового синего, 0,25% ксиленцианола и 15% фикола. После окончания электрофореза гель окрашивают раствором бромистого этидия и визуализируют при УФ-освещении на трансиллюминаторе.The separation of DNA fragments after amplification and restriction is carried out by electrophoresis in 7% polyacrylamide gel (PAGE) prepared from a 30% solution of PAGE (ratio of acrylamide: N, N'-methylene bisacrylamide - 29: 1). Electrophoresis is carried out in 1 × TBE buffer (0.089 M Tris-HCl; 0.089 M boric acid; 0.002 M EDTA, pH = 8.0). Before applying to the gel, the samples are mixed in a 5: 1 ratio with paint containing 0.25% bromophenol blue, 0.25% xylencyanol and 15% ficol. After electrophoresis, the gel is stained with a solution of ethidium bromide and visualized under UV light on a transilluminator.

Частоты аллелей определяются по формуле (Животовский, 1991).Allele frequencies are determined by the formula (Zhivotovsky, 1991).

pi=Ni/N,p i = N i / N,

где Ni - число i-ых аллелей, N - объем выборки.where N i is the number of i-th alleles, N is the sample size.

Стандартная ошибка частоты аллелей рассчитывается по формуле:The standard error of the allele frequency is calculated by the formula:

S=√pi(1-pi)/2NS = √p i (1-p i ) / 2N

При попарном сравнении частот генотипов и аллелей в группах больных и здоровых лиц используется критерий χ2 (Р) для таблиц сопряженности 2×2 с поправкой Иэйтса на непрерывность, вычисляемый по формуле:When pairwise comparing the frequencies of genotypes and alleles in groups of patients and healthy individuals, the χ 2 (P) criterion is used for 2 × 2 contingency tables with Iates correction for continuity, calculated by the formula:

Figure 00000001
,
Figure 00000001
,

где n1 и n2 - объемы сравниваемых распределений; p1 и р2 - частоты соответствующих классов. При числе наблюдаемых случаев <5 используется точный двусторонний критерий Фишера р(F2).where n 1 and n 2 are the volumes of the compared distributions; p 1 and p 2 are the frequencies of the corresponding classes. When the number of observed cases <5, the exact two-sided Fisher test p (F 2 ) is used.

Для выявления факторов повышенного и пониженного риска развития параноидной шизофрении, проводится, для статистически значимо различающихся вариаций вышеуказанных полиморфных ДНК-локусов, оценка статистики связи - показателя отношения шансов (OR-odds ratio), а также границ его 95% доверительного интервала (CI95%). OR является мерой ассоциации, количественно определяющей взаимосвязь между фактором риска и развитием определенного признака. Степень ассоциаций оценивается в значениях показателя соотношения шансов по формуле:To identify factors with an increased and reduced risk of developing paranoid schizophrenia, for statistically significantly different variations of the above polymorphic DNA loci, the connection statistics are evaluated - the odds ratio indicator (OR-odds ratio), as well as the boundaries of its 95% confidence interval (CI95%) . OR is an association measure that quantifies the relationship between a risk factor and the development of a particular trait. The degree of associations is estimated in the values of the odds ratio indicator according to the formula:

OR=(a×d)/(b×c),OR = (a × d) / (b × c),

где а - число лиц с наличием, b - с отсутствием маркера среди больных; с и d - число лиц соответственно с наличием и отсутствием маркера среди здоровых. При OR=1 нет ассоциации, OR>1 рассматривается как положительная ассоциация с аллелем или генотипом («фактор повышенного риска») и OR<1 - как отрицательная ассоциация («фактор пониженного риска»). Доверительный интервал для показателя отношения шансов рассчитывается по следующей формуле:where a is the number of individuals with presence, b is the absence of a marker among patients; c and d are the number of individuals, respectively, with the presence and absence of a marker among healthy people. When OR = 1 there is no association, OR> 1 is considered as a positive association with an allele or genotype (“high risk factor”) and OR <1 - as a negative association (“low risk factor”). The confidence interval for the odds ratio indicator is calculated using the following formula:

Figure 00000002
Figure 00000002

Figure 00000003
Figure 00000003

Проведено клинико-генетическое изучение группы больных русских и татар с параноидной шизофренией (N=436), проживающих в Республике Башкортостан. Нозологический диагноз параноидной шизофрении F20.хх (с непрерывным или эпизодическим типом течения, с неполной или отсутствием ремиссии) основывался на данных комплексного клинико-параклинического обследования больных с учетом диагностических критериев, представленных в МКБ-10. Диагноз верифицировался на основании клинико-анамнестического обследования, лабораторного обследования, данных ЭКГ, УЗИ, РЭГ, ЭЭГ, МРТ.A clinical genetic study of a group of sick Russians and Tatars with paranoid schizophrenia (N = 436) living in the Republic of Bashkortostan was carried out. The nosological diagnosis of paranoid schizophrenia F20.xx (with a continuous or episodic type of course, with incomplete or lack of remission) was based on data from a comprehensive clinical and paraclinical examination of patients taking into account the diagnostic criteria presented in ICD-10. The diagnosis was verified on the basis of clinical and anamnestic examination, laboratory examination, ECG, ultrasound, REG, EEG, MRI.

В контрольную группу вошли здоровые доноры (N=307) соответствующего возраста и этнической принадлежности.The control group included healthy donors (N = 307) of the appropriate age and ethnicity.

Нейротрофины - семейство структурно родственных пептидов, играющих важную роль в регуляции и развитии как центральной, так и периферической нервной системы, вовлечены в процессы выживания и дифференцировки нейронов в течение эмбрионального развития, а также синаптической пластичности в различных регионах мозга (Hunnerkopf et al., 2007).Neurotrophins, a family of structurally related peptides that play an important role in the regulation and development of both the central and peripheral nervous systems, are involved in the survival and differentiation of neurons during embryonic development, as well as synaptic plasticity in various regions of the brain (Hunnerkopf et al., 2007 )

Исследования на животных моделях по гену-нокауту NTRK1 (рецептор BDNF) обнаружили повреждения процессов выживания и дифференцировки неокортикальных нейронов (Gates et al., 2000), а также нарушения в их обучении и поведении при стрессовых ситуациях (Minichiello et al., 1999). Согласно литературным данным ряд локусов гена тирозинкиназного рецептора NTRK2 (9q22.1) ассоциированы с шизофренией (Pilla et al., 2008) с униполярной депрессией (Dong et al. 2009), суицидальным поведением (Kohli et al., 2010), биполярным расстройством (Smith et al., 2009), также было показано снижение экспрессии генов BDNF и TrkB в некоторых структурах головного мозга (Thompson et al., 2011).Studies on animal models of the NTRK1 knockout gene (BDNF receptor) have revealed damage to the processes of survival and differentiation of neocortical neurons (Gates et al., 2000), as well as impaired learning and behavior in stressful situations (Minichiello et al., 1999). According to published data, a number of loci of the NTRK2 tyrosine kinase receptor gene (9q22.1) are associated with schizophrenia (Pilla et al., 2008) with unipolar depression (Dong et al. 2009), suicidal behavior (Kohli et al., 2010), bipolar disorder ( Smith et al., 2009), a decrease in the expression of BDNF and TrkB genes in some brain structures has also been shown (Thompson et al., 2011).

Проведенное исследование полиморфного локуса rs 1443445 гена NTRK2 выявило выраженные отличия в распределении частот аллелей (χ2=4,02, Р=0,05) и генотипов (χ2=7,78; Р=0,02) между больными ПШ и здоровыми донорами русской этнической принадлежности. Для оценки риска развития заболевания использовалась таблица сопряженности 2×2 с вычислением статистик связи (с поправкой Иэйтса). У больных ПШ частота аллеля NTRK2*С была выше, чем в соответствующей контрольной группе русских (χ2=4,02, Р=0,05; OR=1,69, 95%CI 1,04-2,77) (фиг.1). Таким образом, анализ полиморфного локуса rs 1443445 гена NTRK2 выявил ассоциацию аллеля NTRK2*С с ПШ у больных русской этнической принадлежности.A study of the polymorphic locus rs 1443445 of the NTRK2 gene revealed pronounced differences in the distribution of allele frequencies (χ2 = 4.02, P = 0.05) and genotypes (χ 2 = 7.78; P = 0.02) between patients with PN and healthy donors Russian ethnicity. To assess the risk of developing the disease, a 2 × 2 contingency table was used with calculation of connection statistics (with Iates correction). In patients with PN, the frequency of the NTRK2 * C allele was higher than in the corresponding control group of Russians (χ2 = 4.02, P = 0.05; OR = 1.69, 95% CI 1.04-2.77) (Fig. one). Thus, the analysis of the polymorphic locus rs 1443445 of the NTRK2 gene revealed the association of the NTRK2 * C allele with PS in patients of Russian ethnicity.

Один из нейротрофических факторов - нейротрофин 3 - участвует в процессах, контролирующих выживание взрослых нейронов, и в регуляции нервной системы; кроме того, действие нейротрофина 3 опосредовано его взаимодействием с тирозинкиназным рецептором TrkC, кодируемого геном NTRK3 (Conner et al., 2008).One of the neurotrophic factors - neurotrophin 3 - is involved in the processes that control the survival of adult neurons, and in the regulation of the nervous system; in addition, the effect of neurotrophin 3 is mediated by its interaction with the tyrosine kinase receptor TrkC encoded by the NTRK3 gene (Conner et al., 2008).

Вариации в гене NTRK3 (15q25) могут обуславливать развитие психических расстройств. Ассоциативные исследования показали вовлеченность некоторых полиморфных вариантов в гене NTRK3 в развитие шизофрении и аффективных расстройств (Weickert et al., 2005; Feng et al., 2008; Dwivedi et al., 2009; Otaess, 2009).Variations in the NTRK3 gene (15q25) can lead to the development of mental disorders. Associative studies have shown the involvement of certain polymorphic variants in the NTRK3 gene in the development of schizophrenia and affective disorders (Weickert et al., 2005; Feng et al., 2008; Dwivedi et al., 2009; Otaess, 2009).

В результате изучения полиморфного локуса rs 1946698 гена NTRK3 были показаны достоверные различия в распределении частот генотипов (χ2=19,24, Р<0,000) и аллелей (χ2=16,37, Р=0,0001) между больными ПШ и здоровыми индивидами русской этнической принадлежности, за счет достоверно более высокой частоты генотипа NTRK3*G/*G (χ2=16,37, Р=0,0001; OR=5,69, 95%CI 2,38-13,61) и аллеля NTRK3*G у русских больных ПШ по сравнению с контрольной группой (χ2=16,23, Р=0,0001; OR=2,36, 95%CI 1,564-3,55) (фиг.2).As a result of studying the polymorphic locus rs 1946698 of the NTRK3 gene, significant differences were shown in the distribution of the frequencies of genotypes (χ2 = 19.24, P <0.000) and alleles (χ2 = 16.37, P = 0.0001) between patients with PN and healthy individuals of the Russian ethnicity, due to the significantly higher frequency of the NTRK3 * G / * G genotype (χ2 = 16.37, P = 0.0001; OR = 5.69, 95% CI 2.38-13.61) and the NTRK3 * allele G in Russian patients with PS compared with the control group (χ2 = 16.23, P = 0.0001; OR = 2.36, 95% CI 1.564-3.55) (Fig. 2).

Исследование полиморфного локуса rs 7170062 гена NTRK3 продемонстрировало нам достоверно значимые различия в распределении частот генотипов (χ2=18,39, Р<0,000) и аллелей (χ2=17,46, Р=0,00003) между больными ПШ и здоровыми индивидами русской этнической принадлежности. За счет достоверно более высокой частоты генотипа NTRK3*T/*T у больных (χ2=6,85, Р=0,01; OR=2,99, 95%CI 1,37-6,54) Показатель соотношения шансов для носителей аллеля NTRK3*Т составил 2,65 (С195% 1,69-4,16) (фиг.3).The study of the polymorphic locus rs 7170062 of the NTRK3 gene showed us significantly significant differences in the distribution of the frequencies of genotypes (χ2 = 18.39, P <0.000) and alleles (χ2 = 17.46, P = 0.00003) between patients with PN and healthy individuals of the Russian ethnic accessories. Due to the significantly higher frequency of the NTRK3 * T / * T genotype in patients (χ2 = 6.85, P = 0.01; OR = 2.99, 95% CI 1.37-6.54) Odds ratio ratio the NTRK3 * T allele was 2.65 (C195% 1.69-4.16) (FIG. 3).

Был проведен анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного локуса rs 11631508 гена NTRK3 между группами больных ПШ и здоровых в результате которого нами была обнаружена ассоциация аллеля NTRK3*A с риском развития ПШ у русских (χ2=7,74, Р=0,01; OR=2,18, 95%CI 1,28-3,69) (фиг.4).We analyzed the frequency distribution of genotypes and alleles of the polymorphic locus rs 11631508 of the NTRK3 gene between groups of patients with PN and healthy patients, as a result of which we found an association of the NTRK3 * A allele with the risk of developing PN in Russians (χ2 = 7.74, P = 0.01; OR = 2.18, 95% CI 1.28-3.69) (FIG. 4).

Нейрексины - полиморфные мембранные белки, экспрессирующиеся в нейронах, и необходимые для нормального высвобождения нейромедиаторов и обеспечивающие функционирование синапсов (Kirov et al., 2009). Нарушения во взаимодействии нейрексинов с нейролигинами (белков, участвующих в образовании синаптических контактов между нейронами) может играть роль в патогенезе расстройств аутистического спектра и когнитивных отклонений (Sudhof et al., 2008). Поскольку нейрексины (в частности, NRXN1) имеют большое число изоформ и сайтов сплайсинга, то полиморфные локусы, находящиеся в этих сайтах, могут приводить к формированию функционально различных белков. Было показано, что делеции размером до нескольких сот тысяч пар оснований (т.п.о.) в гене нейрексина 1 NRXN1(2p16.3) приводят к развитию таких психических заболеваний, как шизофрения (Rujescu et al., 2009).Neurexins are polymorphic membrane proteins expressed in neurons that are necessary for the normal release of neurotransmitters and ensure the functioning of synapses (Kirov et al., 2009). Disorders in the interaction of neurexins with neurolegins (proteins involved in the formation of synaptic contacts between neurons) may play a role in the pathogenesis of autism spectrum disorders and cognitive impairment (Sudhof et al., 2008). Since neurexins (in particular, NRXN1) have a large number of isoforms and splicing sites, the polymorphic loci located at these sites can lead to the formation of functionally different proteins. It has been shown that deletions of up to several hundred thousand base pairs (kbp) in the neurexin 1 gene NRXN1 (2p16.3) lead to the development of mental illnesses such as schizophrenia (Rujescu et al., 2009).

Изучение полиморфного локуса rs 1469794 гена NRXN1 показало статически значимые различия в распределении частот генотипов (χ2=9,47, Р=0,01) и аллелей (χ2=9,35, Р=0,002) между группами больных ПШ и здоровых татарской этнической принадлежности. Показатель соотношения шансов для носителей аллеля NRXN1*А составил 2,75 (CI95% 1,47-5,15) (фиг.5).The study of the polymorphic locus rs 1469794 of the NRXN1 gene showed statistically significant differences in the distribution of the frequencies of genotypes (χ 2 = 9.47, P = 0.01) and alleles (χ 2 = 9.35, P = 0.002) between groups of patients with PN and healthy Tatar ethnic background. The odds ratio for carriers of the NRXN1 * A allele was 2.75 (CI95% 1.47-5.15) (Figure 5).

Таким образом, исследование полиморфных вариантов генов NTRK2 NTRK3 и NRXN1 показало наличие ассоциации аллелей NTRK2*С, NTRK3*G, NTRK3*T, NTRK3*A и генотипов NTRK3*G/*G, NTRK3*T/*T с ПШ у русских и аллеля NRXN1*А (rs 1469794) у татар.Thus, the study of polymorphic variants of the NTRK2 NTRK3 and NRXN1 genes showed the presence of the association of the NTRK2 * C, NTRK3 * G, NTRK3 * T, NTRK3 * A alleles and the NTRK3 * G / * G, NTRK3 * T / * T genotypes with PS in Russian and allele NRXN1 * A (rs 1469794) in the Tatars.

На фигуре 1 изображено распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs 1443445 гена NTRK2 в группе больных ПШ русской этнической принадлежности и в контрольной группеThe figure 1 shows the frequency distribution of alleles and genotypes of the polymorphic locus rs 1443445 of the NTRK2 gene in the group of patients with PN of Russian ethnicity and in the control group

На фигуре 2 изображено распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs 1946698 гена NTRK3 в группе больных ПШ русской этнической принадлежности и в контрольной группеThe figure 2 shows the frequency distribution of alleles and genotypes of the polymorphic locus rs 1946698 of the NTRK3 gene in the group of patients with PN of Russian ethnicity and in the control group

На фигуре 3 изображено распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs 7170062 гена NTRK3 в группе больных ПШ русской этнической принадлежности и в контрольной группеThe figure 3 shows the frequency distribution of alleles and genotypes of the polymorphic locus rs 7170062 of the NTRK3 gene in the group of patients with PN of Russian ethnicity and in the control group

На фигуре 4 изображено распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs 11631508 гена NTRK3 в группе больных ПШ русской этнической принадлежности и в контрольной группеThe figure 4 shows the frequency distribution of alleles and genotypes of the polymorphic locus rs 11631508 of the NTRK3 gene in the group of patients with PN of Russian ethnicity and in the control group

На фигуре 5 изображено распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs 1469794 гена NRXN1 в группе больных ПШ татарской этнической принадлежности и в контрольной группеThe figure 5 shows the frequency distribution of alleles and genotypes of the polymorphic locus rs 1469794 of the NRXN1 gene in the group of patients with PN of Tatar ethnicity and in the control group

Пример 1. Больная В., 1965 г.р., русская.Example 1. Patient V., born in 1965, Russian.

Клинический диагноз: параноидная шизофрения, непрерывный тип течения, отсутствие ремиссии.Clinical diagnosis: paranoid schizophrenia, continuous type of course, lack of remission.

С целью проведения анализа полиморфных локусов rs 1443445 гена NTRK2, rs 1946698, rs 7170062, rs 11631508 гена NTRK3, у больной было взято 8 мл венозной крови, из которой выделена ДНК методом фенольно-хлороформной экстракции. Амплификация полиморфных ДНК-локусов проводилась в 25 мкл общего объема смеси, содержащей 67 мМ трис-HCl (рН 8,8), 16,6 мМ (NH4)2SO4, 2,5 мМ MgCl2, 0,1 мкг геномной ДНК, по 10 пМ каждого праймера (табл.1), по 200 мкМ dATP, dGTP, dCTP, dTTP и 1 единицу ДНК-полимеразы. Температурные режимы ПЦР представлены в таблице 1. Затем был проведен электрофорез ПЦР-продуктов в 7% полиакриламидном геле при постоянном напряжении 280-300 вольт в течение 1 часа. После окончания электрофореза гель был окрашен раствором бромистого этидия в течение 10 минут и проанализирован при ультрафиолетовом освещении. Далее, после определения наличия продукта амплификации, проводился анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ) путем гидролиза амплификационного фрагмента эндонуклеазой рестрикции: ПДРФ анализ полиморфного локуса rs 1443445 гена NTRK2 проводили эндонуклеазой рестрикции BstSFI в течение 16 часов при 60°С, rs 1946698 гена NTRK3 - KspAI в течение 16 часов при 37°С, rs 7170062 гена NTRK3- Cac8I в течение 16 часов при 37°С, rs 11631508 гена NTRK3-Hpy188I в течение 16 часов при 37°С. После этого для разделения продуктов ПДРФ-анализа проводился электрофорез в 7% полиакриламидном геле с последующим окрашиванием раствором бромистого этидия и визуализацией при ультрафиолетовом освещении. В результате проведенного исследования выявлено, что больная Б. является носительницей генотипов, гомозиготных по аллелям повышенного риска развития ПШ у русских: NTRK2*С/*С, NTRK3*G/*G, NTRK3*T/*T и NTRK3*A/*A. Время исследования составило 4 дня.In order to analyze polymorphic loci rs 1443445 of the NTRK2 gene, rs 1946698, rs 7170062, rs 11631508 of the NTRK3 gene, 8 ml of venous blood was taken from the patient, from which DNA was extracted by phenol-chloroform extraction. Amplification of polymorphic DNA loci was carried out in 25 μl of the total volume of the mixture containing 67 mm Tris-HCl (pH 8.8), 16.6 mm (NH4) 2SO 4 , 2.5 mm MgCl 2 , 0.1 μg of genomic DNA, 10 pM of each primer (Table 1), 200 μM dATP, dGTP, dCTP, dTTP and 1 unit of DNA polymerase. The temperature regimes of PCR are presented in table 1. Then, electrophoresis of PCR products was carried out in 7% polyacrylamide gel with a constant voltage of 280-300 volts for 1 hour. After electrophoresis, the gel was stained with ethidium bromide solution for 10 minutes and analyzed under ultraviolet light. Further, after determining the presence of the amplification product, a restriction fragment length polymorphism (RFLP) was analyzed by hydrolysis of the amplification fragment with a restriction endonuclease: RFLP analysis of the polymorphic locus rs 1443445 of the NTRK2 gene was carried out with a BstSFI restriction endonuclease for 16 hours at 60 ° C, rs 19TR6698 KspAI for 16 hours at 37 ° C, rs 7170062 of the NTRK3-Cac8I gene for 16 hours at 37 ° C, rs 11631508 of the NTRK3-Hpy188I gene for 16 hours at 37 ° C. After that, to separate the products of RFLP analysis, electrophoresis was carried out in a 7% polyacrylamide gel, followed by staining with ethidium bromide solution and visualization under ultraviolet light. As a result of the study, it was revealed that patient B. is a carrier of genotypes homozygous for alleles of an increased risk of developing PN in Russians: NTRK2 * C / * C, NTRK3 * G / * G, NTRK3 * T / * T and NTRK3 * A / * A. The study time was 4 days.

Пример 2. Больной Т., 1968 г.р., татарин.Example 2. Patient T., born in 1968, Tatar.

Клинический диагноз: параноидная шизофрения, непрерывный тип течения, отсутствие ремиссииClinical diagnosis: paranoid schizophrenia, continuous type of course, lack of remission

Для проведения анализа полиморфного локуса rs 1469794 гена NRXN1 у татар, у больного было взято 8 мл венозной крови, из которой выделена ДНК методом фенольно-хлороформной экстракции. Амплификация полиморфного ДНК-локуса проводилась в 25 мкл общего объема смеси, содержащей 67 мМ трис-HCl (рН 8,8), 16,6 мМ (NH4)2SO4, 2,5 мМ MgCl2, 0,1 мкг геномной ДНК, по 10 пМ каждого праймера (табл.1), по 200 мкМ dATP, dGTP, dCTP, dTTP и 1 единицу ДНК-полимеразы. Температурные режимы ПЦР представлены в таблице 1. После определения наличия продукта амплификации путем электрофореза в 7% полиакриламилном геле, проводился анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ) с использованием эндонуклеазы рестрикции Mph1103I в течение 16 часов при 37°С. Затем проводился электрофорез продуктов ПДРФ-анализа в 7% полиакриламидном геле с последующим окрашиванием раствором бромистого этидия и визуализацией при ультрафиолетовом освещении. В результате проведенного исследования выявлено, что больной Т. является носителем гомозиготного генотипа по аллелю повышенного риска развития ПШ у татар NRXN1*А/*А. Время исследования составило 4 дня.To analyze the polymorphic locus rs 1469794 of the NRXN1 gene from Tatars, 8 ml of venous blood was taken from the patient, from which DNA was isolated by phenol-chloroform extraction. The polymorphic DNA locus was amplified in 25 μl of the total volume of the mixture containing 67 mM Tris-HCl (pH 8.8), 16.6 mM (NH4) 2SO 4 , 2.5 mM MgCl 2 , 0.1 μg of genomic DNA, 10 pM of each primer (Table 1), 200 μM dATP, dGTP, dCTP, dTTP and 1 unit of DNA polymerase. The PCR temperature conditions are presented in Table 1. After determining the presence of the amplification product by electrophoresis in a 7% polyacrylamyl gel, restriction fragment length polymorphism (RFLP) was analyzed using the restriction endonuclease Mph1103I for 16 hours at 37 ° C. Then, electrophoresis of the RFLP analysis products was carried out in a 7% polyacrylamide gel, followed by staining with ethidium bromide solution and visualization under ultraviolet light. As a result of the study, it was revealed that patient T. is a carrier of a homozygous genotype for the allele of an increased risk of developing PN in Tatars NRXN1 * A / * A. The study time was 4 days.

Использование данного способа выявления аллелей повышенного риска развития параноидной шизофрении может быть полезно в качестве дополнительного критерия при постановке диагноза, в прогностических целях при оценке течения и исхода заболевания, а также на доклинической стадии заболевания, поскольку эти показатели позволяют получить информацию на продромальном уровне или при инициальных проявлениях заболевания, превышая возможности таких традиционно используемых в клинической практике признаков как тип преморбида, возраст пациента ко времени начала заболевания, что в свою очередь, делает реальным применение ранней терапии, которая является более эффективной с точки зрения последующей социальной адаптации больных. Определение генетических факторов риска возникновения заболевания дает возможность определить риск развития патологии на любой стадии развития организма, учитывая его индивидуальные особенности и этническую принадлежность, что обеспечивает своевременность проведения превентивных мероприятий.The use of this method for identifying alleles of an increased risk of developing paranoid schizophrenia can be useful as an additional criterion for making a diagnosis, for prognostic purposes in assessing the course and outcome of a disease, as well as at the preclinical stage of a disease, since these indicators provide information at the prodromal level or at initial manifestations of the disease, exceeding the capabilities of such signs traditionally used in clinical practice as premorbid type, patient age by the time of the onset of the disease, which, in turn, makes real the use of early therapy, which is more effective in terms of subsequent social adaptation of patients. Determination of the genetic risk factors for the occurrence of the disease makes it possible to determine the risk of pathology at any stage of the development of the organism, taking into account its individual characteristics and ethnicity, which ensures the timeliness of preventive measures.

Список литературыBibliography

1. Гурович, И.Я., Любов Е.Б. Фармакоэпидемиология и фармакоэкономика в психиатрии // М.: Медпрактика-М, 2003. - 264 с.1. Gurovich, I.Ya., Lyubov EB Pharmacoepidemiology and pharmacoeconomics in psychiatry // M .: Medpraktika-M, 2003. - 264 p.

2. Животовский, Л.А. Популяционная биометрия // М.: Наука, 1991. - 272 с.2. Zhivotovsky, L.A. Population biometry // Moscow: Nauka, 1991 .-- 272 p.

3. Любов Е.Б., Бессонова А.А. Первый эпизод шизофрении: клинико-эпидемиологический и социально-экономический аспекты // Российский психиатрический журнал. - 2008. - №2. - С.46-50.3. Lyubov EB, Bessonova A.A. The first episode of schizophrenia: clinical, epidemiological and socio-economic aspects // Russian Psychiatric Journal. - 2008. - No. 2. - S. 46-50.

4. Мосолов, С.Н. Некоторые актуальные теоретические проблемы диагностики, классификации, нейробиологии и терапии шизофрении: сравнение зарубежного и отечественного подходов // Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. - 2010. - №6. - С.4-11.4. Mosolov, S.N. Some relevant theoretical problems of diagnosis, classification, neurobiology and therapy of schizophrenia: a comparison of foreign and domestic approaches // Journal of Neurology and Psychiatry. S.S. Korsakova. - 2010. - No. 6. - S. 4-11.

5. Тиганов, А.С. Снежневский А.В., Орловская Д.Д. Руководство по психиатрии // М.: Медицина, 1999. - Т.1. - 712 с.5. Tiganov, A.S. Snezhnevsky A.V., Orlovskaya D.D. A Guide to Psychiatry // M .: Medicine, 1999. - T.1. - 712 s.

6. Conner А.С., Kissling С., Hodges E. Neurotrophic factor-related gene polymorphisms and adult attention deficit hyperactivity disorder (ADHD) score in a high-risk male population // Am. J. Med. Genet. В Neuropsychiatr Genet. - 2008. - V.147B(8). - P.1476-80.6. Conner A.S., Kissling S., Hodges E. Neurotrophic factor-related gene polymorphisms and adult attention deficit hyperactivity disorder (ADHD) score in a high-risk male population // Am. J. Med. Genet. At the Neuropsychiatr Genet. - 2008 .-- V.147B (8). - P.1476-80.

7. Dong С., Wong M.L., Licinio J. Sequence variations of ABCB1, SLC6A2, SLC6A3, SLC6A4, CREB1, CRHR1 and NTRK2: association with major depression and antidepressant response in Mexican-Americans // Mol.Psychiatry. - 2009. - V.14(12). - P.1105-18.7. Dong C., Wong M.L., Licinio J. Sequence variations of ABCB1, SLC6A2, SLC6A3, SLC6A4, CREB1, CRHR1 and NTRK2: association with major depression and antidepressant response in Mexican-Americans // Mol. Psychiatry. - 2009 .-- V.14 (12). - P.1105-18.

8. Dwivedi Y., Rizavi H.S., Zhang H. Neurotrophin receptor activation and expression in human postmortem brain: effect of suicide // Biol Psychiatry. - 2009. - V.65(4). - P.319-28.8. Dwivedi Y., Rizavi H.S., Zhang H. Neurotrophin receptor activation and expression in human postmortem brain: effect of suicide // Biol Psychiatry. - 2009 .-- V.65 (4). - P.319-28.

9. Feng Y., Vetro A., Kiss E. et al. Association of the neurotrophic tyrosine kinase receptor 3 (NTRK3) gene and childhood-onset mood disorders. // AmJPsychiatry. - 2008. - V.165(5). - P.610-16.9. Feng Y., Vetro A., Kiss E. et al. Association of the neurotrophic tyrosine kinase receptor 3 (NTRK3) gene and childhood-onset mood disorders. // AmJPsychiatry. - 2008 .-- V.165 (5). - P.610-16.

10. Gates M.A., Tai C.C., Macklis J.D. Neocortical neurons lacking the protein-tyrosine kinase В receptor display abnormal differentiation and process elongation in vitro and in vivo. // Neuroscience. - 2000. - V.98(3). - P.437-4710. Gates M.A., Tai C.C., Macklis J.D. Neocortical neurons lacking the protein-tyrosine kinase B receptor display abnormal differentiation and process elongation in vitro and in vivo. // Neuroscience. - 2000. - V.98 (3). - P.437-47

11. Gottesman, H., Gould T.D. The endophenotype concept in psychiatry: etymology and strategic intentions // Am. J. Psychiatry. - 2003. - Vol.160, №4. - P.636-45.11. Gottesman, H., Gould T.D. The endophenotype concept in psychiatry: etymology and strategic intentions // Am. J. Psychiatry. - 2003. - Vol. 160, No. 4. - P.636-45.

12. Kirov G., Rujescu D., Ingason A. Neurexin 1 (NRXN1) deletions in schizophrenia. // Schizophr. Bull. - 2009. - №35. - P.851-54.12. Kirov G., Rujescu D., Ingason A. Neurexin 1 (NRXN1) deletions in schizophrenia. // Schizophr. Bull. - 2009. - No. 35. - P.851-54.

13. Kohli M.A., Salyakina D., Pfennig A. Association of Genetic Variants in the Neurotrophic Receptor-Encoding Gene NTRK2 and a Lifetime History of Suicide Attempts in Depressed Patients // Arch. Gen. Psychiatry. - 2010. - V 67(4). - P.348-5913. Kohli M.A., Salyakina D., Pfennig A. Association of Genetic Variants in the Neurotrophic Receptor-Encoding Gene NTRK2 and a Lifetime History of Suicide Attempts in Depressed Patients // Arch. Gen. Psychiatry. - 2010 .-- V 67 (4). - P.348-59

14. Mathew C.C. The isolation of high molecular weight eucariotic DNA // Methods in Molecular Biology / Ed. Walker J.M. - N -Y.: Human Press. - 1984. - V.2. - P.31-34.14. Mathew C.C. The isolation of high molecular weight eucariotic DNA // Methods in Molecular Biology / Ed. Walker J.M. - N-Y .: Human Press. - 1984. - V.2. - P.31-34.

15. Minichiello L., Korte M., Wolfer D. Essential role for TrkB receptors in hippocampus-mediated learning // Neuron. - 1999. - V.24(2). - P.401-14.15. Minichiello L., Korte M., Wolfer D. Essential role for TrkB receptors in hippocampus-mediated learning // Neuron. - 1999 .-- V.24 (2). - P.401-14.

16. Otnaess M.K., Djurovic S., Rimol L.M., Kulle В., Kahler A.K., Jonsson E.G.,…, Andreassen O.A. Evidence for a possible association of neurotrophin receptor (NTRK-3) gene polymorphisms with hippocampal function and schizophrenia. // Neurobiol. Dis. 2009; 34(3):518-24.16. Otnaess M.K., Djurovic S., Rimol L.M., Kulle B., Kahler A.K., Jonsson E.G., ..., Andreassen O.A. Evidence for a possible association of neurotrophin receptor (NTRK-3) gene polymorphisms with hippocampal function and schizophrenia. // Neurobiol. Dis. 2009; 34 (3): 518-24.

17. Pillai A. Brain-derived neurotropic factor/TrkB signaling in the pathogenesis and novel pharmacotherapy of schizophrenia. // Neurosignals.. - 2008; 16(2-3):183-93.17. Pillai A. Brain-derived neurotropic factor / TrkB signaling in the pathogenesis and novel pharmacotherapy of schizophrenia. // Neurosignals .. - 2008; 16 (2-3): 183-93.

18. Rujescu D., Inganson A. Disruption of the neurexin 1 gene is associated with schizophrenia. // J. Hum. Mol. Genet. - 2009. - Vol.18, №.5 - P.988-96.18. Rujescu D., Inganson A. Disruption of the neurexin 1 gene is associated with schizophrenia. // J. Hum. Mol. Genet. - 2009. - Vol. 18, No. 5 - P.988-96.

19. Smith E.N., Bloss C.S., Badner J.A. Genome-wide association study of bipolar disorder in European American and African American individuals // Mol. Psychiatry. - 2009. - V. 14(8). - P.755-63.19. Smith E.N., Bloss C.S., Badner J.A. Genome-wide association study of bipolar disorder in European American and African American individuals // Mol. Psychiatry. - 2009 .-- V. 14 (8). - P.755-63.

20. Sudhof T.C. Neuroligins and neurexins link synaptic function to cognitive disease // Nature. - 2008. - V. 455(7215). - P.903-1120. Sudhof T.C. Neuroligins and neurexins link synaptic function to cognitive disease // Nature. - 2008 .-- V. 455 (7215). - P.903-11

21. Tamminga C.A, Holcomb H.H.. Phenotype of schizophrenia: a review and formulation // Mol. Psychiatry. - 2005. - Vol.10, №1. - P.27-39.21. Tamminga C. A., Holcomb H. H. Phenotype of schizophrenia: a review and formulation // Mol. Psychiatry. - 2005. - Vol.10, No. 1. - P.27-39.

22. Tandon R, Keshavan M.S., Nasrallah H.A. Schizophrenia "Just the Facts": what we know in 2008 part 1: overview // Schizophr. Res. - 2008. - Vol.100, №1-3. - P.4-19.22. Tandon R, Keshavan M.S., Nasrallah H.A. Schizophrenia "Just the Facts": what we know in 2008 part 1: overview // Schizophr. Res. - 2008. - Vol. 100, No. 1-3. - P.4-19.

23. Thompson Ray M., Weickert C.S., Wyatt E., Webster M.J. Decreased BDNF, trkB-TK+and GAD67 mRNA expression in the hippocampus of individuals with schizophrenia and mood disorders. //]. Psychiatry Neurosci. - 2011; 36(3):195-203.23. Thompson Ray M., Weickert C.S., Wyatt E., Webster M.J. Decreased BDNF, trkB-TK + and GAD67 mRNA expression in the hippocampus of individuals with schizophrenia and mood disorders. //]. Psychiatry Neurosci. - 2011; 36 (3): 195-203.

24. Weickert C.S., Ligons D.L., Romanczyk T. Reductions in neurotrophin receptor mRNAs in the prefrontal cortex of patients with schizophrenia // Mol Psychiatry. - 2005. - V.10(7). - P.637-50.24. Weickert C.S., Ligons D.L., Romanczyk T. Reductions in neurotrophin receptor mRNAs in the prefrontal cortex of patients with schizophrenia // Mol Psychiatry. - 2005 .-- V.10 (7). - P.637-50.

Таблица 1Table 1 ГенGene Полиморфный локусPolymorphic locus Последовательность праймеровPrimer sequence Метод детекции температура отжига, 0СDetection method annealing temperature, 0С Аллели (размер фрагментов, п.о.)Alleles (fragment size, bp) СсылкаLink 1one 22 33 4four 55 66 NTRK2NTRK2 rs 1443445rs 1443445 5'-gaaacttacatgccaccacctt-3' 5'-gactaaaaacagtgccaagcatt-3'5'-gaaacttacatgccaccacctt-3 '5'-gactaaaaacagtgccaagcatt-3' ПЦР/ПДРФ
(BstSF I), 60
PCR / RFLP
(BstSF I), 60
*С(264)
*T(190+78)
* C (264)
* T (190 + 78)
Primer31 Primer3 1 NTRK3NTRK3 rs 1946698rs 1946698 5'-ggtaaaggtctgcttcctcattt-3' 5'-atcctggcaatacactgaatgtt-3'5'-ggtaaaggtctgcttcctcattt-3 '5'-atcctggcaatacactgaatgtt-3' ПЦР/ПДРФ
(KspAI), 60
PCR / RFLP
(KspAI), 60
*G (222)
*С (71+151)
* G (222)
* C (71 + 151)
Primer31 Primer3 1 rs 7170062rs 7170062 5'-ggggagcaagtttattcttgtaa-3' 5'-aagtggttacccagtcctcctta-3'5'-ggggagcaagtttattcttgtaa-3 '5'-aagtggttacccagtcctcctta-3' ПЦР/ПДРФ
(Cac8I), 59
PCR / RFLP
(Cac8I), 59
*С(210)
*T(180+30)
* C (210)
* T (180 + 30)
Primer31 Primer3 1 rs 11631508rs 11631508 5'-ccaaatctcctgaccctctgt-3' 5'-tggagtgcatgctaaaaataaga-3'5'-ccaaatctcctgaccctctgt-3 '5'-tggagtgcatgctaaaaataaga-3' ПЦР/ПДРФ
(Пру 188I), 59
PCR / RFLP
(Pru 188I), 59
*А (98+205)
*G (98+102+104)
* A (98 + 205)
* G (98 + 102 + 104)
Primer31 Primer3 1 NRXN1NRXN1 rs 1469794rs 1469794 5'-ctttttaagtaagccagaatgca-3' 5'-gaaatgaaaaagcaaaattaacca-3'5'-ctttttaagtaagccagaatgca-3 '5'-gaaatgaaaaagcaaaattaacca-3' ПЦР/ПДРФ
(Mph1103I),58
PCR / RFLP
(Mph1103I), 58
*4 (276)
*T (23+257)
* 4 (276)
* T (23 + 257)
Primer31 Primer3 1 Примечание: 1 - праймеры, подобранные с помощью программы Primer3 (http://fokker.wi.mit.edu/primer3/input.htm)Note: 1 - primers selected using the Primer3 program (http://fokker.wi.mit.edu/primer3/input.htm)

Claims (1)

Способ прогнозирования риска развития параноидной шизофрении, отличающийся тем, что выделяют ДНК методом фенольно-хлороформной экстракции, проводят генотипирование по полиморфным локусам rs 1443445 гена NTRK2, rs 1946698, rs 7170062, rs 11631508 гена NTRK3, rs 1469794 гена NRXN1, при выявлении генотипа NTRK2*C/*C (rs 1443445), генотипа NTRK3*G/*G (rs 1946698), генотипа NTRK3*T/*T (rs 7170062), генотипа NTRK3 *A/*A (rs 11631508) у русских; генотипа NRXN1 *А/*А (rs 1469794) у татар прогнозируют риск развития параноидной шизофрении. A method for predicting the risk of developing paranoid schizophrenia, characterized in that DNA is isolated by phenol-chloroform extraction, genotyping is carried out by the polymorphic loci rs 1443445 of the NTRK2 gene, rs 1946698, rs 7170062, rs 11631508 of the NTRK3 gene, rs 1469794 of the NTRX2 gene NRX2 * C / * C (rs 1443445), genotype NTRK3 * G / * G (rs 1946698), genotype NTRK3 * T / * T (rs 7170062), genotype NTRK3 * A / * A (rs 11631508) in Russians; genotype NRXN1 * A / * A (rs 1469794) in Tatars predict the risk of paranoid schizophrenia.
RU2012116999/15A 2012-04-26 2012-04-26 Method for prediction of risk of paranoid schizophrenia RU2506595C2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2012116999/15A RU2506595C2 (en) 2012-04-26 2012-04-26 Method for prediction of risk of paranoid schizophrenia

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2012116999/15A RU2506595C2 (en) 2012-04-26 2012-04-26 Method for prediction of risk of paranoid schizophrenia

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2012116999A RU2012116999A (en) 2013-11-10
RU2506595C2 true RU2506595C2 (en) 2014-02-10

Family

ID=49516477

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012116999/15A RU2506595C2 (en) 2012-04-26 2012-04-26 Method for prediction of risk of paranoid schizophrenia

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2506595C2 (en)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2621266C1 (en) * 2016-04-07 2017-06-01 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научный центр психического здоровья" (ФГБНУ НЦПЗ) Prediction method of therapy effectiveness in patients with paroxysmal schizophrenia

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2001087231A2 (en) * 2000-04-21 2001-11-22 Rutgers, The State University Of New Jersey Methods and compositions for the diagnosis of schizophrenia
RU2338788C2 (en) * 2002-03-25 2008-11-20 Каунсил Оф Сайентифик Энд Индастриал Рисерч New primers for screening of schizophrenia and method of its screening
WO2009143622A1 (en) * 2008-05-29 2009-12-03 Chum Methods of stratifying, prognosing and diagnosing schizophrenia, mutant nucleic acid molecules and polypeptides

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2001087231A2 (en) * 2000-04-21 2001-11-22 Rutgers, The State University Of New Jersey Methods and compositions for the diagnosis of schizophrenia
RU2338788C2 (en) * 2002-03-25 2008-11-20 Каунсил Оф Сайентифик Энд Индастриал Рисерч New primers for screening of schizophrenia and method of its screening
WO2009143622A1 (en) * 2008-05-29 2009-12-03 Chum Methods of stratifying, prognosing and diagnosing schizophrenia, mutant nucleic acid molecules and polypeptides

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
АХМЕРОВА И. Ю. Клинико-эпидемиологическое и молекулярно-генетическое исследование шизофрении в Республике Башкортостан. Автореф. дисс. к.м.н. - М., 2012, с.131. *
ЛАВРУШИНА О.М. и др. Влияние полиморфизма гена рецептора серотонина типа 2а на прогноз шизофрении с ранним началом, медицинская генетика. - М.: Гениус Медиа, 2005, т. 4, No.5, с.217. *
ЛАВРУШИНА О.М. и др. Влияние полиморфизма гена рецептора серотонина типа 2а на прогноз шизофрении с ранним началом, медицинская генетика. - М.: Гениус Медиа, 2005, т. 4, №5, с.217. АХМЕРОВА И. Ю. Клинико-эпидемиологическое и молекулярно-генетическое исследование шизофрении в Республике Башкортостан. Автореф. дисс. к.м.н. - М., 2012, с.131. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2621266C1 (en) * 2016-04-07 2017-06-01 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научный центр психического здоровья" (ФГБНУ НЦПЗ) Prediction method of therapy effectiveness in patients with paroxysmal schizophrenia

Also Published As

Publication number Publication date
RU2012116999A (en) 2013-11-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Ogino et al. Spinal muscular atrophy: molecular genetics and diagnostics
Heinzen et al. Rare deletions at 16p13. 11 predispose to a diverse spectrum of sporadic epilepsy syndromes
Mackay et al. Exome sequencing identifies a missense variant in EFEMP1 co-segregating in a family with autosomal dominant primary open-angle glaucoma
US20220033903A1 (en) Genetic markers associated with asd and other childhood developmental delay disorders
Vladutiu et al. Genetic risk for malignant hyperthermia in non-anesthesia-induced myopathies
MX2014005683A (en) Methods for treating, diagnosing and monitoring alzheimer&#39;s disease.
Todarello et al. Incomplete penetrance of NRXN1 deletions in families with schizophrenia
Kolarova et al. Array-based DNA methylation analysis in individuals with developmental delay/intellectual disability and normal molecular karyotype
US20210212960A1 (en) Identification of seizure susceptibility region in wolf-hirschhorn syndrome and treatment thereof
AlAyadhi et al. High-resolution SNP genotyping platform identified recurrent and novel CNVs in autism multiplex families
JP4515524B2 (en) Normal-tension glaucoma disease susceptibility gene and use thereof
Mohandas et al. Evidence for type-specific DNA methylation patterns in epilepsy: a discordant monozygotic twin approach
CN102869786A (en) Genetic marker for the diagnosis of dementia with lewy bodies
US20200102610A1 (en) Method for cerebral palsy prediction
WO2012017867A1 (en) Method for testing for psychiatric disorder, test kit for psychiatric disorder, and method for evaluating therapeutic agent and/or prevention agent for psychiatric disorder
Paisán‐Ruiz et al. Homozygosity mapping through whole genome analysis identifies a COL18A1 mutation in an Indian family presenting with an autosomal recessive neurological disorder
RU2506595C2 (en) Method for prediction of risk of paranoid schizophrenia
RU2458131C1 (en) Test system for mutation detection in human fumarylacetoacetate hydrolase and alpha-1-antitrypsin genes
JPWO2011148715A1 (en) Normal-tension glaucoma disease susceptibility gene and use thereof
JP6378529B2 (en) Methods for detecting genetic diseases
JP5043985B2 (en) Normal-tension glaucoma disease susceptibility gene and use thereof
US20140171371A1 (en) Compositions And Methods For The Diagnosis of Schizophrenia
Milanovska et al. Association of rs211037 GABRG2 gene polymorphism with susceptibility to idiopathic generalized epilepsy
WO2006126706A1 (en) Prophylactic/therapeutic agent for psychotic disorder such as bipolar mood disorder and schizophrenia, screening method for the same, and method for determination of risk for the development of the disease
da Silva Carvalho et al. DNA methylation epi-signature and biological age in attention deficit hyperactivity disorder patients

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20170427