RU2376381C2 - Способ определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий - Google Patents

Способ определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий Download PDF

Info

Publication number
RU2376381C2
RU2376381C2 RU2008100982/13A RU2008100982A RU2376381C2 RU 2376381 C2 RU2376381 C2 RU 2376381C2 RU 2008100982/13 A RU2008100982/13 A RU 2008100982/13A RU 2008100982 A RU2008100982 A RU 2008100982A RU 2376381 C2 RU2376381 C2 RU 2376381C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
control
antagonistic activity
strain
nutrient medium
microorganisms
Prior art date
Application number
RU2008100982/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2008100982A (ru
Inventor
Олег Валерьевич Бухарин (RU)
Олег Валерьевич Бухарин
Александр Васильевич Семенов (RU)
Александр Васильевич Семенов
Сергей Викторович Черкасов (RU)
Сергей Викторович Черкасов
Андрей Викторович Сгибнев (RU)
Андрей Викторович Сгибнев
Original Assignee
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН filed Critical Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН
Priority to RU2008100982/13A priority Critical patent/RU2376381C2/ru
Publication of RU2008100982A publication Critical patent/RU2008100982A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2376381C2 publication Critical patent/RU2376381C2/ru

Links

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к микробиологии и может быть использовано для изучения механизма межмикробных взаимодействий. Способ предусматривает следующее. Из исследуемой культуры микроорганизмов получают клеточные компоненты, представляющие собой экзометаболиты, клеточный экстракт и клеточные стенки. Полученные клеточные компоненты обеззараживают хлороформом из расчета 0,1 мл хлороформа на 3 мл клеточных компонентов. Затем смешивают каждый из выделенных клеточных компонентов со штаммом-антагонистом в соотношении 1:2 соответственно. Параллельно готовят две контрольные пробы, при этом контроль 1 готовят из жидкой питательной среды и физиологического раствора, а контроль 2 - из жидкой питательной среды и штамма-антагониста. После чего опытные и контрольные пробы инкубируют. После этого разбавляют жидкой питательной средой, инкубируют и отделяют супернатанты центрифугированием. Полученные супернатанты обеззараживают путем обработки их хлороформом из расчета 0,1 мл хлороформа на 3 мл сутпертатанта. Обеззараженные супернатанты смешивают с взвесью индикаторного штамма в соотношении 1:2 соответственно. Инкубируют и разбавляют жидкой питательной средой. После чего высевают индикаторный штамм на плотную питательную среду и культивируют. Затем подсчитывают КОЕ в опытных и контрольных пробах. Рассчитывают антагонистическую активность штамма-антагониста и по изменению антагонистической активности в опытных пробах по сравнению с контролем судят о способности исследуемой культуры микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий. Изобретение позволяет определять способность микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий. 1 табл.

Description

Изобретение относится к микробиологии и может быть использовано для изучения механизма межмикробных взаимодействий, в частности роли отдельных клеточных компонентов микроорганизмов в регуляции антагонистических отношений в микробных сообществах.
Антагонизм в мире микробов широко распространен и характеризуется тем, что один вид микроорганизмов так или иначе подавляет развитие или задерживает рост других микроорганизмов [Егоров Н.С. Основы учения об антибиотиках: Учебник. 6-е изд., перераб. и доп.М.: Изд-во МГУ; Наука, 2004. 503 с.]. Антимикробный потенциал реализуется за счет веществ различной природы: органические кислоты, перекись водорода, ферменты, антибиотики.
Известно о различных механизмах регуляции продукции антимикробных факторов. В случае ферментов-антибиотиков синтез последних, как правило, индуцируется субстратом [Уотсон Дж. Молекулярная биология гена/ Под ред.акад. Энгельгардта В.А. М.: Мир, 1978. 720 с.], а активность регулируется физико-химическими факторами среды [Диксон М., Уэбб Э. Ферменты: Пер. с англ. М.: Мир. Т.2. 1982. 515 с.].
Синтез большого количества антимикробных факторов находится в прямой зависимости от условий среды, мало зависит от субстрата, большее значение имеет соотношение углерод/азот, наличие микроэлементов, факторов роста, аэрация и др. [Егоров Н.С. Основы учения об антибиотиках: Учебник. 6-е изд., перераб. и доп. М.: Изд-во МГУ; Наука 2004. 503 с., Биотехнология: Учебн. пособие для вузов. В 8 кн. Под ред. Н.С.Егорова, В.Д.Самуилова. Кн. 6: Микробиологическое производство биологически активных веществ и препаратов. М.: ВШ, 1987. 134 с.].
Известны регуляторы синтеза бактериоцинов - белки у грамположительных и лактоны у грамотрицательных бактерий, методы их выделения и изучения [Brurberg М.В., Nes I.F., Eijsink V.G.H. Pheromone-induced production of antimicrobial peptides in Lactobacillus // Mol. Microbiol. 1997. V.26. P.347-360].
Многие микроорганизмы синтезируют метаболиты, которые являются факторами роста для штаммов-продуцентов антибиотиков. Так, известны способы увеличения продукции антибиотиков на основе добавления в среду культивирования факторов роста биологической природы [Биотехнология: Учебн. пособие для вузов. В 8 кн. Под ред. Н.С.Егорова, В.Д. Самуилова. Кн. 6: Микробиологическое производство биологически активных веществ и препаратов. М.: ВШ, 1987. 134 с.] метаболитов бактерий [Вахитов Т.Я., Яшина О.Ю., Петров Л.Н. и др. Действие препарата аутостимуляторов роста Escherichia coli M-17 (Актофлор) на рост чистых и смешанных культур бактерий // Журн. микробиол. 2000. №3. С.20-24, Хохлов А.С. Низкомолекулярные микробные ауторегуляторы. М.: Наука, 1988. 272 с.], клеточных стенок бактерий [Fermor Т.R., Wood D.A., Lincoln S.P., Fenlon J.S. Bacteriolysis by Agaricus bisporus. // J. of General Microbiology. 1991. V.130. P.761-769, Bronneke V., Fiedler F. Production of bacteriolytic enzymes by exogenous bacterial cell walls. Appl. Environ. Microbiol. 1994. Vol.60. V.3. P.785-791].
Известен способ регуляции выхода антибиотика [Хохлов А.С. Низкомолекулярные микробные ауторегуляторы. М.: Наука, 1988. 272 с., Горбунова Н.А., Яковлева Е.П. Действие собственного антибиотика на продуцент имбирцина при выращивании на агаризованной среде // Антибиотики и химиотерапия. 2000. №5. С.45-48.], основанный на изучении способности фильтрата бульонной культуры продуцента антибиотика регулировать образование изучаемого продукта. Однако способ не позволяет оценить антагонистическую активность бактерий, т.к. выход продукта тестируют не биологическими методами, а физико-химическими, например, по светопоглощению.
Актуальность разработки способа определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий обусловлена возможностью изучения механизма межмикробных взаимодействий, в частности роли отдельных микроорганизмов и их клеточных компонентов в регуляции антагонистических отношений в микробных сообществах, что позволит изучать механизмы формирования и функционирования микробиоценозов и разрабатывать на основе полученных знаний методические подходы к созданию новых способов и препаратов для лечения инфекционных болезней, санации бактерионосителей и коррекции дисбиотических состояний.
Технический результат, на достижение которого направлено изобретение, заключается в создании способа, позволяющего определять способность исследуемых микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий и роль отдельных клеточных компонентов исследуемых культур микроорганизмов (экзометаболита, клеточного экстракта или клеточной стенки) в ее регуляции.
Для достижения указанного технического результата в заявляемом способе определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий из исследуемой культуры микроорганизмов получают клеточные компоненты: экзометаболиты, клеточный экстракт и клеточные стенки, обеззараживают их хлороформом из расчета 0,1 мл на 3 мл клеточных компонентов, смешивают каждый из выделенных клеточных компонентов со штаммом-антагонистом в соотношении 1:2, параллельно готовят две контрольные пробы, при этом контроль 1 готовят из жидкой питательной среды и физиологического водного раствора, а контроль 2 - из жидкой питательной среды и штамма-антагониста, опытные и контрольные пробы инкубируют, разбавляют жидкой питательной средой, инкубируют, отделяют супернатанты центрифугированием, обеззараживают их хлороформом из расчета 0,1 мл на 3 мл супернатанта, затем смешивают с взвесью индикаторного штамма, инкубируют, разбавляют жидкой питательной средой, высевают индикаторный штамм на плотную питательную среду, культивируют, затем подсчитывают КОЕ в опытных и контрольных пробах, рассчитывают антагонистическую активность штамма-антагониста и по изменению антагонистической активности в опытных пробах по сравнению с контролем судят о способности исследуемой культуры микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий.
Технический результат от реализации изобретения выражается в создании способа, позволяющего определять новое свойство микроорганизмов - способность регулировать антагонистическую активность бактерий различных таксонов за счет выявления различного влияния (стимулирующего, ингибирующего или индифферентного) клеточных компонентов исследуемых культур микроорганизмов (экзометаболитов, клеточного экстракта и клеточных стенок) на антагонистическую активность бактерий, а также за счет выявления способности микроорганизмов регулировать антагонизм бактерий, имеющих различные требования к питанию.
Аналогов изобретения в патентной и научно-технической литературе не обнаружено.
Известно изучение роли клеточных компонентов микроорганизмов в стимуляции синтеза лактацина Б путем отдельного исследования ее экзометаболитов, вещества, ассоциированного с клеточной стенкой, клеточного экстракта и фрагментов-мономеров клеточной стенки промышленного производства. В способе определяется способность микроорганизмов повышать синтез лактацина Б у штамма-продуцента L.acidophilus. [Barefoot, S.F. et. all. Identification and purification of a protein that induces production of the Lactobacillus acidophilus bacteriocin lactacin В. // Appl. Environ. Microbiol. 1994. Vol.60. V.10. P.3522-3528].
Однако способ не позволяет выявить характер влияния исследуемых культур микроорганизмов на антагонистическую активность бактерий - стимулирующее, ингибирующее или индифферентное, не позволяет оценить способность микроорганизмов регулировать антагонизм бактерий, имеющих различные требования к питанию, определить роль клеточных стенок в регуляции антагонистической активности бактерий.
Авторами экспериментально установлена способность микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий и определена роль отдельных клеточных компонентов исследуемой культуры микроорганизма, а именно экзометаболита, клеточного экстракта и клеточной стенки, в ее регуляции.
Авторами были проведены следующие исследования.
Для штаммов Enterococcus faecalis и Lactobacillus casei методом прямого антагонизма [Murrey R., Loeb L. Antibiotics produced by micrococci and streptococci that show selective inhibition within genus Streptococcus // Canad.J. Res. 1950. №28. P.177-185] определили чувствительные виды микроорганизмов - Staphylococcus aureus и Enterobacter cloacae.
Далее изучали способность Micrococcus luteus и Corynebacterium minutissimum регулировать антагонистическую активность штаммов-антагонистов E.faecalis и L.casei по отношению к S.aureus и E.cloacae. Для этого из исследуемых культур M.luteus и С.minutissimum получали клеточные компоненты: экзометаболиты, клеточный экстракт и клеточные стенки, используя общепринятые в микробиологии и химии методы (Методы химии углеводов. М.: Мир. 1967, Лизоцим. / Составитель У.Я.Каульньи. Рига: Авотс. 1982, Методы общей бактериологии. Т.2. / Под ред. Ф.Герхардта. М.: Мир. 1984).
Для получения экзометаболитов суточные бульонные культуры M.luteus и C.minutissimum центрифугировали при 3000 об/мин 15 минут, отбирали супернатанты, обеззараживали их хлороформом 20 минут (на 3 мл супернатанта - 0,1 мл хлороформа), центрифугировали при 3000 об/мин 15 минут и снова отбирали супернатанты.
Для получения клеточных экстрактов осадок, полученный после центрифугирования суточных бульонных культур M.luteus и C.mmutissimum дважды отмывали физиологическим раствором, доводили МПБ до изначальной мутности (ОД=0,15 для M.luteus и 0,225 для C.minutissimum, при λ=492 нм, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл), подвергали однократной заморозке (-20°С) - отморозке (37°С), обеззараживали хлороформом 20 минут (на 3 мл супернатанта 0,1 мл хлороформа), центрифугировали при 3000 об/мин 15 минут и отбирали супренатанты.
Клеточные стенки получали путем последовательной обработки биомассы исследуемых культур M.luteus и C.minutissimum смесью этилового спирта и хлороформа (3:1), 2М водным раствором гидроксида натрия, кислым раствором трипсина в концентрации 100 мкг/мл (после нейтрализации щелочи 3,5% раствором соляной кислоты), этиловым спиртом, ацетоном. Ацетоновый раствор клеточных стенок M.luteus и C.minutissimum высушивали при комнатной температуре, затем ресуспендировали в МПБ до изначальной мутности (ОД=0,15 для M.luteus и 0,225 для C.minutissimum, при λ=492 нм, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл) и обеззараживали автоклавированием при 0,5 атм 30 минут.
Далее в опыте каждый из клеточных компонентов (экзометаболиты, клеточный экстракт и клеточные стенки) исследуемых культур M.luteus и C.minutissimum смешивали по отдельности в соотношении 1:2 со штаммами-антагонистами E.faecalis и L.casei, взвешенными в физиологическом 0,9% водном растворе хлорида натрия, (ОД=0,2, при λ=492 нм, что соответствовало 109 кл/мл, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл).
Параллельно готовили контроль 1 (контроль роста индикаторного штамма) из жидкой питательной среды, используемой для роста исследуемой культуры? и физиологического (0,9%) водного раствора хлорида натрия в соотношении 1:2, и контроль 2 (контроль антагонистической активности) из жидкой питательной среды, используемой для роста исследуемой культуры и взвеси штаммов-антагонистов E.faecalis и L.casei в физиологическом водном растворе хлорида натрия (ОД=0,2, при λ=492 нм, что соответствовало 109 клеток/мл, объем пробы 200 мкл) в соотношении 1:2.
Опытные и контрольные пробы инкубировали 1 час при 37°С, после чего их разбавляли в 4 раза жидкой питательной средой, пригодной для роста штамма-антагониста (МПБ для E.faecalis и МРС для L.casei) и вновь инкубировали сутки при 37°С в условиях, подходящих для каждой культуры антагониста (E.faecalis в обычных условиях, L.casei - в микроаэрофильных), отделяли супернатанты центрифугированием при 3000 об/мин 15 минут, обеззараживали их хлороформом из расчета 0,1 мл на 3 мл супернатанта жидкости 20 минут.
Затем определяли выживаемость индикаторных штаммов S.aureus и E.cloacae в опытных и контрольных пробах. Для этого готовили на физиологическом растворе взвеси S.aureus и E.cloacae из суточных агаровых культур (ОД=0,15, при λ=492 нм, что соответствовало 107 кл/мл, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл). Затем в соотношении 1:2 смешивали взвеси индикаторных штаммов S.aureus и E.cloacae с супернатантами опытных и контрольных проб.
Смеси инкубировали 1 час при 37°С, разбавляли в 4 раза жидкой питательной средой, пригодной для роста индикаторных штаммов S.aureus и E.cloacae (МПБ), и культивировали при 37°С. Производили высев индикаторных штаммов S.aureus и Е. cloacae на плотную среду, используя метод серийных разведении, сразу и через 8 часов роста, подсчитывали КОЕ и вели расчет антагонистической активности (АА) в опытных и контрольных пробах по формулам
Figure 00000001
Figure 00000002
где АА - антагонистическая активность микроорганизмов;
А - контроль роста индикаторного штамма, КОЕ t8/КОЕ t0 (контроль 1);
B1 - контроль антагонистической активности, КОЕ t8/КОЕ t0 (контроль 2);
B2 - степень прироста индикаторного штамма, КОЕ t8/КОЕ t0 (опыт).
Изменение антагонистической активности рассчитывают по формуле
ΔАА=ААопыт-ААконтроль.
О способности исследуемых культур микроорганизмов M.luteus и C.minutissimum регулировать антагонистическую активность бактерий судили по ее изменению в опыте по сравнению с контролем. При ΔАА, равной нулю регуляция, АА отсутствует, при ΔАА меньше нуля происходит снижение АА, а при ΔАА больше нуля происходит повышение АА.
Результаты исследования приведены в таблице.
Как видно из таблицы, обработка E.faecalis экзометаболитами и клеточными экстрактами M.luteus приводила к появлению антагонизма по отношению к Е.cloacae с выраженностью 38 и 35% соответственно, а в отношении S.aureus наблюдали полное ингибирование признака. Действие клеточных стенок микрококка сводилось к повышению АА энтерококка по отношению к S.aureus на 17,4%.
Из описанных результатов следует, что регулирующим эффектом могут обладать различные клеточные компоненты исследуемой культуры микроорганизма, их действие проявляется по-разному, в зависимости от вида индикаторного штамма.
Изучение способности C.minutissimum регулировать АА E.faecalis выявило способность коринебактерии повышать АА энтерококка в отношении S.aureus, причем различные клеточные компоненты увеличивали выраженность антагонизма E.faecalis одинаково, в среднем на 25%. При использовании в качестве индикаторной культуры E.cloacae антагонизма со стороны энтерококка, обработанного компонентами коринебактерии, не наблюдали.
Изучение способности M.luteus и C.minutissimum регулировать АА L.casei выявило индифферентный характер влияния исследуемых культур. Антагонизм лактобациллы был на высоком уровне и его изменение при действии факторов микробной природы не определено.
Таким образом, экспериментально установлена способность различных видов микроорганизмов за счет действия их клеточных компонентов (экзометаболитов, клеточного экстракта и клеточной стенки) регулировать антагонистическую активность различных видов штаммов-антагонистов по отношению к различным видам индикаторных культур бактерий.
Способ осуществляют следующим образом.
Выбирают исследуемую культуру микроорганизмов, у которой будет изучаться способность регулировать антагонистическую активность штамма-антагониста; штамм-антагонист, у которого будет изучаться регуляция антагонистической активности и индикаторный штамм, по отношению к которому будет изучаться регуляция антагонистической активности штамма-антагониста.
Используя общепринятые в микробиологии и химии методы (Методы химии углеводов. М.: Мир. 1967, Лизоцим. / Составитель У.Я.Каульньи. Рига: Авотс. 1982, Методы общей бактериологии. Т.2. / Под ред. Ф.Герхардта. М.: Мир. 1984) получают клеточные компоненты: экзометаболиты, клеточный экстракт и клеточые стенки исследуемой культуры.
В опыте каждый из клеточных компонентов (экзометаболиты, клеточный экстракт и клеточные стенки) исследуемой культуры смешивают по отдельности в соотношении 1:2 со штаммом-антагонистом, взвешенным в физиологическом 0,9% водном растворе хлорида натрия (ОД=0,2, при λ=492 нм, что соответствовало 109 кл/мл, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл).
Параллельно готовят контроль 1 (контроль роста индикаторного штамма) из жидкой питательной среды, используемой для роста исследуемой культуры и физиологического (0,9%) водного раствора хлорида натрия в соотношении 1:2, и контроль 2 (контроль антагонистической активности) из жидкой питательной среды, используемой для роста исследуемой культуры и взвеси штамма-антагониста в физиологическом водном растворе хлорида натрия (ОД=0,2; при λ=492 нм, что соответствовало 109 клеток/мл, объем пробы 200 мкл) в соотношении 1:2.
Опытные и контрольные пробы инкубируют 1 час при 37°С, после чего разбавляют в 4 раза жидкой питательной средой, пригодной для роста штамма-антагониста, вновь инкубируют сутки при 37°С, отделяют супернатант центрифугированием при 3000 об/мин 15 минут, обеззараживают его хлороформом из расчета 0,1 мл на 3 мл культуральной жидкости 20 минут.
Далее в опытных и контрольных пробах определяют выживаемость индикаторного штамма. Для этого готовят на физиологическом растворе взвесь индикаторного штамма из суточной агаровой культуры (ОД=0,15, при λ=492 нм, что соответствовало 107 кл/мл, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл). Затем в соотношении 1:2 смешивают взвеси индикаторного штамма с супернатантами опытных и контрольных проб.
Смеси инкубируют 1 час при 37°С, разбавляют в 4 раза жидкой питательной средой, пригодной для роста индикаторного штамма, и культивируют при 37°С.
Производят высев индикаторного штамма на плотную среду, используя метод серийных разведении, сразу и через 24 часа роста индикаторной культуры (для быстрорастущих видов - 6-8 часов), подсчитывают КОЕ и ведут расчет антагонистической активности (АА) в опытных и контрольных пробах по формулам:
Figure 00000001
Figure 00000002
где АА - антагонистическая активность микроорганизмов;
А - контроль роста индикаторного штамма, КОЕ t8/КОЕ t0 (контроль 1);
B1 - контроль антагонистической активности, КОЕ t8/КОЕ t0 (контроль 2);
B2 - степень прироста индикаторного штамма, КОЕ t8/КОЕ t0 (опыт).
О способности исследуемых культур микроорганизмов регулировать антагонистическую активность штамма-антагониста судят по ее изменению в опыте по сравнению с контролем. Изменение антагонистической активности рассчитывают по формуле
ΔАА=ААопыт-ААконтроль
При ΔАА, равной нулю регуляция, АА отсутствует, при ΔАА меньше нуля считают исследуемую культуру микроорганизмов способной снижать АА у исследуемого штамма-антагониста, а при ΔАА больше нуля повышается АА.
Таким образом судят о способности исследуемой культуры микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий.
Примеры конкретного выполнения.
Пример 1. У исследуемой культуры M.luteus определяли способность регулировать антагонистическую активность E.faecalis по отношению к S.aureus.
Получали клеточные компоненты исследуемой культуры: экзометаболиты, клеточный экстракт и клеточные стенки.
Для получения экзометаболитов суточную бульонную культуру M.luteus центрифугировали при 3000 об/мин 15 минут, отбирали супернатант, обеззараживали его хлороформом 20 минут (на 3 мл супернатанта 0,1 мл), центрифугировали при 3000 об/мин 15 минут и снова отбирали супернатант.
Для получения клеточного экстракта осадок, полученный после центрифугирования суточной бульонной культуры M.luteus, дважды отмывали физ.раствором, доводили МПБ до изначальной мутности (ОД=0,15, при λ=492 нм, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл), подвергали однократной заморозке
(-20°С) - отморозке (37°С), обеззараживали хлороформом 20 минут (на 3 мл супернатанта 0,1 мл), центрифугировали при 3000 об/мин 15 минут и отбирали супернатант.
Клеточную стенку получали путем последовательной обработки биомассы исследуемой культуры M.luteus смесью этилового спирта и хлороформа (3:1), 2М водным раствором гидроксида натрия, кислым раствором трипсина в концентрации 100 мкг/мл (после нейтрализации щелочи 3,5% раствором соляной кислоты), этиловым спиртом, ацетоном. Ацетоновый раствор клеточной стенки M.luteus высушивали при комнатной температуре, затем ресуспендировали в МПБ до изначальной мутности (ОД=0,15, при λ=492 нм, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл) и обеззараживали автоклавированием при 0,5 атм 30 минут.
Затем клеточные компоненты (экзометаболиты, клеточный экстракт и клеточные стенки) M.luteus смешивали в соотношении 1:2 (0,5 мл: 1 мл) с штаммом-антагонистом E.faecalis, взвешенным в физиологическом 0,9% водном растворе хлорида натрия (ОД=0,2, при λ=492 нм, что соответствовало 109 кл/мл, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл). Параллельно готовили контроль 1 (контроль роста индикаторного штамма) из жидкой питательной среды (МПБ), используемой для роста исследуемой культуры M.luteus и физиологического (0,9%) водного раствора хлорида натрия в соотношении 1:2, и контроль 2 (контроль антагонистической активности) из жидкой питательной среды, используемой для роста исследуемой культуры M.luteus и взвеси штамма-антагониста E.faecalis в физиологическом водном растворе хлорида натрия (ОД=0,2, при λ=492 нм, что соответствовало 109 клеток/мл, объем пробы 200 мкл) в соотношении 1:2.
Опытные и контрольные пробы инкубировали 1 час при 37°С, после чего разбавляли в 4 раза МПБ (6 мл) и вновь инкубировали сутки при 37°С, отделяли супернатант центрифугированием при 3000 об/мин 15 минут, обеззараживали его хлороформом из расчета 0,1 мл на 3 мл культуральной жидкости.
Далее в опытных и контрольных пробах определяли выживаемость индикаторного штамма S.aureus. Для этого готовили на физиологическом растворе взвесь индикаторного штамма S.aureus из суточных агаровых культур (ОД=0,15, при λ=492 нм, что соответствовало 107 кл/мл, в 96-луночном планшете, объем пробы 200 мкл).
Затем смешивали 0,5 мл взвеси индикаторного штамма S.aureus с 1 мл супернатантов опытных и контрольных проб.
Расчет антагонистической активности (АА) в опытных и контрольных пробах вели по формулам
Figure 00000003
Figure 00000004
где АА - антагонистическая активность микроорганизмов;
А - контроль роста индикаторного штамма S.aureus, КОЕ t8/КОЕ t0 (контроль 1);
B1 - контроль антагонистической ативности, КОЕ t8/КОЕ t0, (контроль 2) при действии культуральной жидкости исследуемого штамма-антагониста E.faecalis, обработанного МПБ;
В2 - степень прироста индикаторного штамма S.aureus, КОЕ t8/КОЕ t0 (опыт) при действии культуральной жидкости исследуемого штамма-антагониста E.faecalis, обработанного одним из компонентов исследуемой культуры M.luteus.
О способности исследуемой культуры M.luteus регулировать антагонистическую активность E.faecalis судили по ее изменению в опыте по сравнению с контролем антагонистической активности. Изменение антагонистической активности рассчитывают по формуле
ΔАА-ААопыт-ААконтроль
Результаты выполнения и расчеты антагонистической активности E.faecalis по отношению к S.aureus под действием клеточных компонентов М. luteus следующие.
КОЕ t0 (S.aureus) в контроле роста индикаторного штамма (контроль 1) равно 244·104.
КОЕ t8 (S.aureus) в контроле роста индикаторного штамма (контроль 1) равно 480·106.
Контроль роста индикаторного штамма S.aureus (контроль 1):
А=КОЕ t8/КОЕ t0=(480·106)/(244·104)=197·102.
КОЕ t0 (S.aureus) в контроле антагонистической активности E.faecalis (контроль 2) равно 272·104.
КОЕ t8 (S.aureus) в контроле антагонистической активности E.faecalis (контроль 2) равно 490·106.
Контроль антагонистической активности E.faecalis (контроль 2):
B1=КОЕ t8/КОЕ t0=(490·106)/(272·104)=180·102;
Figure 00000005
КОЕ t0 (S.aureus) степени прироста индикаторного штамма (опыт) (рост E.faecalis с экзометаболитами M.luteus) равно 256·104.
КОЕ t8 (S.aureus) степени прироста индикаторного штамма (опыт) (рост E.faecalis с экзометаболитами M.luteus) равно 520·106.
Степень прироста индикаторного штамма S.aureus (опыт) (рост E.faecalis с экзометаболитами M.luteus)
В2=КОЕ t8/КОЕ t0=(520·106)/(256·104)=203·102;
Figure 00000006
При отрицательном значении ААопыт судят об отсутствии антагонистической активности, что говорит о полном ингибировании антагонистической активности, наблюдаемой в контроле.
КОЕ t0 (S.aureus) степени прироста индикаторного штамма (опыт) (рост E.faecalis с клеточным экстрактом M.luteus) равно 252·104.
КОЕ t8 (S.aureus) степени прироста индикаторного штамма (опыт) (рост E.faecalis с клеточным экстрактом M.luteus) равно 500·106.
Степень прироста индикаторного штамма S.aureus (опыт) (рост E.faecalis с клеточным экстрактом M.luteus)
B2=КОЕ t8/КОЕ t0=(500·106)/(252·104)=198·102;
Figure 00000007
При отрицательном значении ААопыт судят об отсутствии антагонистической активности, что говорит о полном ингибировании антагонистической активности, наблюдаемой в контроле.
КОЕ t0 (S.aureus) степени прироста индикаторного штамма (опыт) (рост E.faecalis с фрагментами клеточной стенки M.luteus) равно 240·104. КОЕ t8 (S.aureus) степени прироста индикаторного штамма (опыт) (рост E.faecalis с фрагментами клеточной стенки M.luteus) равно 350·106.
Степень прироста индикаторного штамма S.aureus (опыт) (рост E.faecalis с фрагментами клеточной стенки M.luteus)
В2=КОЕ t8/КОЕ t0=(350·106)/(240·104)=146·102;
Figure 00000008
ΔАА=ААопыт-ААконтроль=26-8,6=17,4;
ΔАА равно 17,4, что больше нуля и означает повышение АА на 17,4%.
Установлено регулирующее действие M.luteus на антагонистическую активность E.faecalis по отношению к S.aureus. Влияние фрагментов клеточной стенки M.luteus на антагонистическую активность E.faecalis сводилось к ее увеличению по отношению к S.aureus, в то время как под действием экзометаболитов и клеточного экстракта M.luteus наблюдали снижение АА E.faecalis, вплоть до ее полного ингибирования.
Предлагаемый способ позволяет определять способность исследуемых культур микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий, в частности роль отдельных клеточных компонентов исследуемых культур микроорганизмов (экзометаболитов, клеточного экстракта и клеточной стенки) в ее регуляции, что дает возможность подбирать потенциальные препараты или их источник для стимулирования колонизационной резистентности организма и подбирать биологические условия для увеличения выхода антимикробных факторов.
Figure 00000009

Claims (1)

  1. Способ определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий, заключающийся в том, что из исследуемой культуры микроорганизмов получают экзометаболиты, клеточный экстракт и клеточные стенки, обеззараживают их хлороформом из расчета 0,1 мл на 3 мл клеточных компонентов, смешивают каждый из выделенных клеточных компонентов со штаммом-антагонистом в соотношении 1:2, параллельно готовят две контрольные пробы, при этом контроль 1 готовят из жидкой питательной среды и физиологического раствора, а в контроль 2 - из жидкой питательной среды и штамма -антагониста, опытные и контрольные пробы инкубируют, разбавляют жидкой питательной средой, инкубируют, отделяют супернатанты центрифугированием, обеззараживают их хлороформом из расчета 0,1 мл на 3 мл супернатанта, затем смешивают с взвесью индикаторного штамма, инкубируют, разбавляют жидкой питательной средой, высевают индикаторный штамм на плотную питательную среду, культивируют, затем подсчитывают КОЕ в опытных и контрольных пробах, рассчитывают антагонистическую активность штамма-антагониста и по изменению антагонистической активности в опытных пробах по сравнению с контролем судят о способности исследуемой культуры микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий.
RU2008100982/13A 2008-01-09 2008-01-09 Способ определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий RU2376381C2 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2008100982/13A RU2376381C2 (ru) 2008-01-09 2008-01-09 Способ определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2008100982/13A RU2376381C2 (ru) 2008-01-09 2008-01-09 Способ определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2008100982A RU2008100982A (ru) 2008-04-27
RU2376381C2 true RU2376381C2 (ru) 2009-12-20

Family

ID=39452867

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008100982/13A RU2376381C2 (ru) 2008-01-09 2008-01-09 Способ определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2376381C2 (ru)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2458135C2 (ru) * 2010-11-01 2012-08-10 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук (ИКВС УрО РАН) Способ определения влияния вагинальных эпителиоцитов на биологические свойства бактерий (варианты)
RU2704115C1 (ru) * 2018-10-22 2019-10-24 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Сибирский федеральный научный центр агробиотехнологий Российской академии наук (СФНЦА РАН) Способ определения антагонистической активности штаммов бактерий в отношении Pseudomonas aeruginosa
RU2813754C1 (ru) * 2023-03-20 2024-02-16 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" Способ стимуляции антагонистической активности лактобактерий

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ГОРБУНОВА Н.А., ЯКОВЛЕВА Е.П. Действие собственного антибиотика на продуцент имбирцина при выращивании на агаризованной среде, Антибиотики и химио терапия. 2000, N5, с.45-48. ПЕТРОВ Л.Н., и др. Действие препарата аутостимуляторов роста Escherichia coli M-17 (Актофлор) на рост читсых и смешанных культур бактерий. Микробиология, 2000, N3, с.20-24. BRURBERG M.B. NES I.F. et al., Pheromone - induced production of antimicrobial peptides in Lactobacillus, Mol. MicrobioL, 1997., V.26, p.347-360. *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2458135C2 (ru) * 2010-11-01 2012-08-10 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук (ИКВС УрО РАН) Способ определения влияния вагинальных эпителиоцитов на биологические свойства бактерий (варианты)
RU2704115C1 (ru) * 2018-10-22 2019-10-24 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Сибирский федеральный научный центр агробиотехнологий Российской академии наук (СФНЦА РАН) Способ определения антагонистической активности штаммов бактерий в отношении Pseudomonas aeruginosa
RU2813754C1 (ru) * 2023-03-20 2024-02-16 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" Способ стимуляции антагонистической активности лактобактерий

Also Published As

Publication number Publication date
RU2008100982A (ru) 2008-04-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Ross et al. Biosynthesis of antifungal and antibacterial polyketides by Burkholderia gladioli in coculture with Rhizopus microsporus
Karbalaei-Heidari et al. Evaluation of the bioactive potential of secondary metabolites produced by a new marine micrococcus species isolated from the Persian Gulf
Dadawala et al. Assessment of Escherichia coli isolates for in vitro biofilm production
Munna et al. Influence of aeration speed on bacterial colony forming unit (CFU) formation capacity
RU2376381C2 (ru) Способ определения способности микроорганизмов регулировать антагонистическую активность бактерий
Benattouche et al. Antioxidant and antibacterial activities of exopolysaccharides produced by lactic acid bacteria isolated from yogurt
Al-Humam Heat-shock technique for isolation of soil Bacillus species with potential of antibiotics secretion in Saudi Arabia
Zilelidou et al. Differential modulation of Listeria monocytogenes fitness, in vitro virulence, and transcription of virulence-associated genes in response to the presence of different microorganisms
Harikrishnan et al. Characterization of active lead molecules from Lissocarinus orbicularis with potential antimicrobial resistance inhibition properties
Darabpour et al. Isolation of an antibiotic producer Pseudomonas sp. from the Persian Gulf
CN111088181A (zh) 短双歧杆菌菌株bk55及在抑制艰难梭菌中的应用
Lakhman et al. Antagonistic effect of Bacillus subtilis isolated and identified from different honey species against Klebsiella pneumoniae bee pathogens
Nisha et al. Isolation and characterization of exopolysaccharide from biofilm producing marine bacteria
El-Sherbiny et al. Enhancement of Streptomyces sp. Mh-133 activity against some antibiotic resistant bacteria using biotic elicitation
Rezapour et al. Analysis of antibiotic resistance and antimicrobial effects of Enterococcus faecium and Lactococcus lactis isolated from Khorramabad traditional cheeses
RU2279079C2 (ru) Способ выявления у микроорганизмов протективного действия в эффекте фентона
Bashir et al. Factors affecting bioactivity of secondary metabolites produced by Streptomyces sp. PT1 using Plackett-Burman design
MONALISA GORGONIAN ELLISELLA SP.-ASSOCIATED BACTERIA AS A PROMISING ANTIPATHOGENIC AGENT AGAINST SKIN DISEASES IN HUMANS
RU2806579C2 (ru) Способ отбора индигенных штаммов бифидобактерий кишечника человека для их включения в состав пробиотических препаратов
Alwan et al. The effects of UV light on mrkA, mrkD genes in local isolates of Klebsiella pneumoniae
RU2772351C1 (ru) Способ выявления из естественных сред перспективных пробиотических штаммов
Lomovatskaya et al. Transmembrane adenylate cyclase controls the virulence factors of plant pathogenic Pseudomonas siringae and mutualistic Rhizobium leguminosarum
Lertcanawanichakul et al. In-vitro Anti-food poisoning bacteria and cytotoxic activities of bioactive compounds produced by Streptomyces sp. A10 isolated from fermented food
Sakai-Kawada et al. Characterization of Prodiginine Pathway in Marine Sponge-Associated Pseudoalteromonas sp. PPB1 in Hilo, Hawai ‘i
Filippova et al. Growth induction and stabilization of population composition in Saccharopolyspora erythraea by catecholamine compounds

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20140110