RU2366717C2 - Multiple use device for nucleic acids hybridisation and application thereof - Google Patents
Multiple use device for nucleic acids hybridisation and application thereof Download PDFInfo
- Publication number
- RU2366717C2 RU2366717C2 RU2007106800/13A RU2007106800A RU2366717C2 RU 2366717 C2 RU2366717 C2 RU 2366717C2 RU 2007106800/13 A RU2007106800/13 A RU 2007106800/13A RU 2007106800 A RU2007106800 A RU 2007106800A RU 2366717 C2 RU2366717 C2 RU 2366717C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- compartment
- sample
- carrier
- target
- stranded
- Prior art date
Links
Images
Abstract
Description
Изобретение относится к процессам и аппаратам для сепарации, изоляции или обнаружения нуклеиновых кислот и в особенности имеет отношение к процессам и аппаратам, пригодным для регенерации устройств многоразового использования для гибридизации нуклеиновых кислот, далее биочипов или ДНК-чипов.The invention relates to processes and devices for the separation, isolation or detection of nucleic acids, and in particular relates to processes and devices suitable for the regeneration of reusable devices for hybridization of nucleic acids, hereinafter biochips or DNA chips.
Гибридизационные ДНК-чипы представляют собой твердый носитель, например стекло, полимерный материал, кремний, на поверхности которого упорядоченно расположены зоны, в каждой из которых иммобилизовано множество копий определенных последовательностей ДНК.Hybridization DNA chips are a solid carrier, for example glass, polymeric material, silicon, on the surface of which zones are arranged in an orderly manner, in each of which many copies of certain DNA sequences are immobilized.
Наиболее важной особенностью технологии ДНК-чипов или биочипов с точки зрения практической пользы является возможность анализа большого количества молекул ДНК или РНК в смеси на наличие уникальных последовательностей.The most important feature of the technology of DNA chips or biochips from the point of view of practical use is the ability to analyze a large number of DNA or RNA molecules in a mixture for the presence of unique sequences.
Современное развитие техники биочипов позволяет определять, какие гены работают в данной клетке на какой-либо стадии развития, а какие находятся в неактивном состоянии. Например, с помощью экспрессионных микрочипов установлены гены, принимающие участие в регуляции цикла деления клеток дрожжей, а также процессов метаболизма в бактерии Escherichia coli.The modern development of biochip technology allows us to determine which genes work in a given cell at any stage of development and which are in an inactive state. For example, using expression microchips, genes were established that are involved in the regulation of the yeast cell division cycle, as well as metabolic processes in Escherichia coli bacteria.
В разработанных экспрессионных микрочипах используют иммобилизованную ДНК двух типов: во-первых, относительно короткие ген-специфичные фрагменты ДНК длиной 20-25 нуклеотидов, например, олигонуклеотидные микрочипы фирмы Affymetrix; во-вторых, крупные фрагменты кодирующей ДНК длиной 300-500 нуклеотидов, получаемые в результате клонирования, ПЦР (полимеразная цепная реакция) - амплификации и очистки ДНК.The developed expression microchips use two types of immobilized DNA: first, relatively short gene-specific DNA fragments with a length of 20-25 nucleotides, for example, Affymetrix oligonucleotide microchips; secondly, large fragments of coding DNA with a length of 300-500 nucleotides obtained by cloning, PCR (polymerase chain reaction) - amplification and DNA purification.
При использовании ДНК-чипов можно одновременно следить за изменением десятков тысяч генов в процессе развития клеток и тканей при различных физиологических и патологических ситуациях, при воздействии терапевтических средств и токсинов. Выявление четких маркеров патологии на уровне экспрессии генов и разработка диагностических ДНК-чипов - одна из приоритетнейших задач медико-биологических исследований. Работа над ней может способствовать решению ряда важнейших проблем здравоохранения.When using DNA chips, you can simultaneously monitor the change in tens of thousands of genes during the development of cells and tissues in various physiological and pathological situations, under the influence of therapeutic agents and toxins. The identification of clear pathology markers at the level of gene expression and the development of diagnostic DNA chips is one of the top-priority tasks of biomedical research. Work on it can contribute to solving a number of critical health problems.
К сожалению, дороговизна и сложность затрудняют использование этой техники.Unfortunately, the high cost and complexity make it difficult to use this technique.
Изобретение решает задачу разработки простых, недорогих и более доступных методов работы с ДНК-пробами, характеризующими определенные гены, чем работа с современными ДНК-микрочипами.The invention solves the problem of developing simple, inexpensive and more affordable methods of working with DNA samples characterizing certain genes than working with modern DNA microarrays.
Предложен процесс идентифицикации нуклеиновой кислоты (НК), комплементарной другой НК. Процесс включает гибридизацию НК-пробы с носителем НК-пробы для того, чтобы сформировать единый комплекс НК-пробы с носителем НК-пробы.A process for the identification of nucleic acid (NK) complementary to another NK is proposed. The process involves hybridization of the NK sample with the NK sample carrier in order to form a single complex of the NK sample with the NK sample carrier.
Указанный комплекс помещают в компартмент (отсек, камеру), ограниченный с одной стороны перегородкой, выполненной из материала, проницаемого для НК-пробы и непроницаемого для указанного носителя НК-пробы и указанного комплекса.The specified complex is placed in a compartment (compartment, chamber), bounded on one side by a partition made of a material permeable to the NK sample and impermeable to the specified carrier NK sample and the specified complex.
Затем указанный комплекс денатурируют и НК-пробу транспортируют сквозь перегородку и приводят в контакт с НК-мишенью. В условиях гибридизации НК-проба гибридизуется с комплементарной НК-мишенью, в результате чего получается двунитчатый комплекс НК-проба - НК-мишень. НК-пробы, которые некомплементарны НК-мишени и по этой причине с ней не связаны, возвращают обратно в исходный компартмент, где обеспечивают условия, в которых указанные НК-пробы гибридизуются обратно на носитель НК-пробы.Then this complex is denatured and the NK sample is transported through the septum and brought into contact with the NK target. Under hybridization conditions, an NK sample hybridizes with a complementary NK target, resulting in a double-stranded complex NK sample - NK target. NK samples that are not complementary to the NK target and, for this reason, are not associated with it, are returned back to the original compartment, where they provide the conditions under which these NK samples hybridize back to the carrier of the NK sample.
Обнаружение комплексов НК-пробы как с НК-мишенью, так и с носителем НК-пробы используют для того, чтобы определить комплементарность НК-пробы к НК-мишени.Detection of complexes of an NK sample with both an NK target and a carrier of an NK sample is used to determine the complementarity of an NK sample to an NK target.
Предложенный НК-гибридизационный чип (устройство) многоразового использования содержит канал. Указанный канал имеет компартмент, в котором находится носитель НК-пробы. Канал обеспечивает контакт жидкостей, которые находятся в отсеке для НК-мишени и в отсеке для носителя НК-пробы. Указанные отсеки отделены от канала перегородками, проницаемыми для НК-пробы и непроницаемыми для НК-мишени и носителя НК-пробы. Носитель НК-пробы не может выйти за пределы компартмента, в котором он находится.The proposed NK-hybridization chip (device) reusable contains a channel. The specified channel has a compartment in which the carrier of the NK-sample is located. The channel provides contact between liquids that are in the compartment for the NK target and in the compartment for the carrier of the NK sample. These compartments are separated from the channel by partitions permeable to the NK sample and impermeable to the NK target and the carrier of the NK sample. The carrier of the NK test cannot go beyond the compartment in which it is located.
Устройство избирательно перемещает однонитчатую НК-пробу между указанными компартментами, содержащими НК-мишень и носитель НК-пробы.The device selectively moves a single-stranded NK sample between the indicated compartments containing the NK target and the NK sample carrier.
Предложен также процесс копирования описанных в данном изобретении гибридизационных НК-чипов многоразового использования. Внутри камеры, заполненной гелем и содержащей, по крайней мере, один электрод для электрофореза, создают множество копий молекулы НК. После этого камеру контактируют с другой подобной камерой, содержащей, как минимум, один электрод. Прикладывая электрическое поле, обеспечивают переход части копий НК из указанной первой камеры в указанную вторую камеру. После разделения камер получают две камеры, содержащие копии НК. Изобретение позволяет таким образом одновременно копировать множество изолированных друг от друга камер.A process has also been proposed for copying the reusable hybridization NK chips described in this invention. Inside the chamber, filled with a gel and containing at least one electrode for electrophoresis, many copies of the NA molecule are created. After that, the chamber is contacted with another similar chamber containing at least one electrode. Applying an electric field, provide the transition of some copies of NK from the specified first camera to the specified second camera. After separation of the chambers, two chambers are obtained containing copies of the NC. The invention thus allows to simultaneously copy multiple isolated from each other cameras.
Сущность изобретения далее детализирована с помощью следующих чертежей, которые иллюстрируют конкретные варианты воплощений настоящего изобретения. Они не предназначены для того, чтобы ограничить изобретение, описанное выше, а скорее обеспечить иллюстрацию по существу заявляемых пунктов формулы изобретения.The invention is further detailed using the following drawings, which illustrate specific embodiments of the present invention. They are not intended to limit the invention described above, but rather to provide an illustration of the merits of the claimed claims.
Краткое описание.Short description.
Фиг.1(a)-(p) - схематически и по шагам показывают последовательность работы предложенных НК-чипов с подвижными НК-пробами;Figure 1 (a) - (p) - schematically and in steps show the sequence of operation of the proposed NK chips with mobile NK samples;
Фиг.2 - схематически изображает многоканальный НК-чип, предложенный в настоящем изобретении;Figure 2 - schematically depicts a multi-channel NK chip proposed in the present invention;
Фиг.3(a)-(d) - схематически показывают в поперечном сечении различные варианты воплощения НК-чипа, содержащего множество электрофоретических камер, предложенные в настоящем изобретении;Figure 3 (a) - (d) - schematically show in cross section various embodiments of an NK chip containing a plurality of electrophoretic cameras, proposed in the present invention;
Фиг.4 - показывает схематически ряд камер с разводкой проводов, обеспечивающих электрический контакт с каждой парой электродов;Figure 4 - shows schematically a series of cameras with wiring, providing electrical contact with each pair of electrodes;
Фиг.5 - представляет собой разнесенный вид комбинации пластин, которые в совокупности формируют НК-чип, содержащий такие электрофоретические камеры, как показанные на Фиг.4;Figure 5 is an exploded view of a combination of plates that together form an NK chip containing electrophoretic cameras such as those shown in Figure 4;
Фиг.6(a)-(d) - схематически показывают последовательные шаги процедуры копирования НК-чипов, в результате которой происходит перемещение молекул нуклеиновой кислоты из исходного НК-чипа в его копию;6 (a) - (d) - schematically show the successive steps of the procedure for copying NK chips, as a result of which the nucleic acid molecules are transferred from the original NK chip to its copy;
Фиг.7(a)-(r) - схематически показывают последовательные шаги диагностики с использованием такого электрофоретического варианта НК-чипа, предложенного в настоящем изобретении, в котором камеры, содержащие как НК-носители НК-пробы, так и камеры, содержащие НК-мишени, частично или полностью заполнены гелем.7 (a) - (r) - schematically show sequential diagnostic steps using such an electrophoretic variant of an NK chip proposed in the present invention, in which cameras containing both NK carriers of an NK sample and cameras containing NK- the target is partially or completely filled with gel.
Детальное описание предпочтительных вариантов изобретения.Detailed Description of Preferred Embodiments
Существующие НК-чипы можно подразделить на следующие два вида. ДНК-чипы, на поверхности которых ДНК-пробы организованы в виде пятен. Внутри каждого такого пятна однонитчатые ДНК молекулы иммобилизованы одним концом на поверхности НК-чипа. Второй тип НК-чипов это олигонуклеотидные чипы, на поверхности которых иммобилизованы относительно короткие олигонуклеотиды.Existing NK chips can be divided into the following two types. DNA chips, on the surface of which DNA samples are organized in the form of spots. Within each such spot, single-stranded DNA molecules are immobilized at one end on the surface of an NK chip. The second type of NK chips are oligonucleotide chips, on the surface of which relatively short oligonucleotides are immobilized.
Оба типа НК-чипов используют так, что НК-мишень гибридизуют с НК-пробой непосредственно на поверхности НК-чипа. С точки зрения функциональной роли молекул НК, вовлеченных в процедуру диагностики, современные методы используют только два типа молекул нуклеиновой кислоты: НК-пробы и НК-мишени.Both types of NK chips are used so that the NK target is hybridized with the NK probe directly on the surface of the NK chip. From the point of view of the functional role of NK molecules involved in the diagnostic procedure, modern methods use only two types of nucleic acid molecules: NK samples and NK targets.
Настоящее изобретение вводит третий тип молекулы нуклеиновой кислоты, а именно такой носитель однонитчатой НК-пробы, что при соответствующих условиях НК-носитель и НК-проба способны образовать полностью комплементарную двунитчатую нуклеиновую кислоту.The present invention introduces a third type of nucleic acid molecule, namely, a single-stranded NK sample carrier such that, under appropriate conditions, the NK carrier and NK sample are capable of forming a fully complementary double-stranded nucleic acid.
Изобретение использует НК-носитель НК-пробы и тем самым позволяет НК-пробам в определенных условиях существовать в виде свободных молекул в растворе. Одновременно с этим использование НК-носителя НК-пробы позволяет использовать НК-мишени не только в виде свободных молекул в растворе, как это необходимо в существующих методах, но и в виде молекул, иммобилизованных на поверхности или находящихся внутри пористой среды, например в геле, в которую свободные молекулы НК-проб могут легко проникнуть.The invention uses an NK carrier of NK samples and thereby allows NK samples to exist under certain conditions in the form of free molecules in solution. At the same time, the use of an NK carrier of an NK sample allows the use of NK targets not only in the form of free molecules in solution, as is necessary in existing methods, but also in the form of molecules immobilized on the surface or inside a porous medium, for example, in a gel, into which free molecules of NK samples can easily penetrate.
В результате настоящее изобретение позволяет упростить методы использования и изготовления таких НК-чипов, разработать разнообразные простые варианты управления ими и разработать как одноразовые устройства, так и НК-чипы для многоразового использования.As a result, the present invention allows to simplify the methods of use and manufacture of such NK chips, to develop a variety of simple options for managing them and to develop both disposable devices and NK chips for reusable use.
В соответствии с изобретением можно приготовить комплекс НК-носитель с НК-пробой следующим образом. Вначале изготовить длинную двунитчатую молекулу НК, которая имеет повторенную первичную структуру. В этой структуре повторяющейся единицей в одной из нитей является структура НК-пробы, ограниченная последовательностями-сигналами, которые опознает какая-либо однонитчатая рестриктаза таким образом, что после обработки этой рестриктазой в этих местах появятся однонитчатые разрезы. В результате указанная двунитчатая молекула НК превратится в одну длинную однонитчатую НК, к которой последовательно присоединено множество НК-проб.In accordance with the invention, it is possible to prepare a complex of an NK carrier with an NK sample as follows. First, make a long double-stranded NA molecule, which has a repeated primary structure. In this structure, the repeating unit in one of the strands is the structure of the NK sample, limited by sequences of signals that any single-stranded restrictase is recognized in such a way that after processing with this restrictase, single-stranded cuts will appear in these places. As a result, this double-stranded NK molecule will turn into one long single-stranded NK, to which many NK samples are sequentially attached.
Предлагаемые НК-носители обладают способностью специфически и обратимо связывать НК-пробы. В составе НК-чипов (устройств) такие НК-носители НК-проб могут быть локализованы на поверхности или в ограниченном объеме.The proposed NK carriers have the ability to specifically and reversibly bind NK samples. As part of NK chips (devices), such NK carriers of NK samples can be localized on the surface or in a limited volume.
Структура предлагаемых НК-носителей НК-проб позволяет использовать следующий метод получения НК-проб. Однонитчатая НК-проба способна присоединять к себе с образованием двунитчатой структуры только комплементарные последовательности НК. Поэтому в случае обработки такого НК-носителя раствором смеси статистически приготовленных олигонуклеотидов (например, имеющих длину от 5 до 50 оснований), только комплементарные последовательности гибридизуются с НК-носителем и образуют комплекс НК-носителя с НК-пробой.The structure of the proposed NK-carriers of NK-samples allows you to use the following method of obtaining NK-samples. A single-stranded NK sample is able to attach only complementary NK sequences to itself with the formation of a double-stranded structure. Therefore, in the case of processing such an NK carrier with a solution of a mixture of statistically prepared oligonucleotides (for example, having a length of 5 to 50 bases), only complementary sequences hybridize with the NK carrier and form a complex of the NK carrier with an NK probe.
Использованный в изобретении термин "носитель НК-пробы" определен как некое вещество, которое способно специфически и обратимо связываться с НК-пробой и, в частности, включает в себя комплементарные НК-пробе однонитчатые нуклеиновые кислоты, другие органические молекулы и пористые структуры. В настоящем изобретении такой носитель рассматривается как комплексный носитель, который может быть использован как свободные молекулы в растворе, иммобилизованные молекулы и пористые структуры.As used herein, the term “NK probe carrier” is defined as a substance that can specifically and reversibly bind to an NK probe and, in particular, includes single-stranded nucleic acids, other organic molecules and porous structures complementary to the NK probe. In the present invention, such a carrier is considered as a complex carrier, which can be used as free molecules in solution, immobilized molecules and porous structures.
Разнообразие молекул другой природы, нежели нуклеиновая кислота, способных присодиняться к НК-носителю НК-проб в соответствии с настоящим изобретением, практически неограничено. Эти молекулы могут нести в своем составе такие группы, которые обеспечивают такие функции, как специфическое опознавание и связывание с различными субстратами и НК-пробами, спектроскопически активные метки и их комбинации.The variety of molecules of a different nature than nucleic acid, capable of attaching to the NK carrier of NK samples in accordance with the present invention, is practically unlimited. These molecules can carry groups that provide functions such as specific recognition and binding to various substrates and NK samples, spectroscopically active labels, and combinations thereof.
Расположение носителей НК-пробы не только на плоскости, но и в пространстве предоставляет новые возможности как изготовления, так и функционирования предлагаемых ПК-чипов (устройств).The location of the NK-sample carriers not only on the plane, but also in space provides new opportunities for both manufacturing and functioning of the proposed PC chips (devices).
Например, НК-носители могут быть последовательно соединены конец в конец, образуя длинную нитевидную структуру, в которой многократно повторены одинаковые НК-носители или заранее определенная комбинация разных НК-носителей. Эта структура может включать в себя специальные разграничительные участки, которые, например, устраняют возможные стерические припятствия в работе соседних НК-носителей и позволяют, при необходимости, заменять одни НК-носители на другие без повреждения этих НК-носителей.For example, NK carriers can be connected end-to-end in series, forming a long filamentary structure in which identical NK carriers or a predetermined combination of different NK carriers are repeatedly repeated. This structure may include special demarcation sites, which, for example, eliminate possible steric hindrances in the operation of neighboring NK carriers and, if necessary, replace one NK carrier with another without damaging these NK carriers.
Изобретение учитывает, что для НК-носителей НК-проб такими разграничителями могут быть сайты опознавания рестриктаз.The invention takes into account that for NK carriers of NK samples, restriction sites can be such delimiters.
Использование НК-носителей НК-проб, представляющих собой длинные однонитчатые молекулы НК, позволяет исключить проблемы, возникающие при попытках гибридизовать однонитчатые молекулы НК в непосредственной близости к той поверхности, к которой одна из этих молекул иммобилизована. В результате предлагаемые НК-носители НК-проб должны быть полезны при использовании особенно длинных НК-проб, например, при длинах НК-проб более чем 60 оснований.The use of NK carriers of NK samples, which are long single-stranded NK molecules, eliminates the problems that arise when trying to hybridize single-stranded NK molecules in close proximity to the surface to which one of these molecules is immobilized. As a result, the proposed NK carriers of NK samples should be useful when using particularly long NK samples, for example, when the length of NK samples is more than 60 bases.
Предлагаемые НК-носители НК-проб могут быть иммобилизованы на поверхности НК- чипа таким же образом, как на обычных ДНК-чипах (в виде пятен). Использование предлагаемых НК-носителей позволяет осуществить переход от двумерного расположения молекул НК-проб к расположению в пространстве. В настоящее время такой переход происходит при изготовлении гелевых чипов, существенным ограничением для которых является то, что молекулы ДНК-мишеней должны диффундировать внутрь геля, для того чтобы гибридизоваться с ДНК-пробами, иммобилизованными внутри этого геля. Настоящее изобретение учитывает возможность иммобилизации носителей не только на какой-либо поверхности, но и в объеме геля или пористого материала.The proposed NK carriers of NK samples can be immobilized on the surface of an NK chip in the same way as on ordinary DNA chips (in the form of spots). The use of the proposed NK carriers allows the transition from a two-dimensional arrangement of molecules of NK samples to an arrangement in space. Currently, such a transition occurs in the manufacture of gel chips, a significant limitation of which is that the target DNA molecules must diffuse inside the gel in order to hybridize with DNA samples immobilized inside this gel. The present invention takes into account the possibility of immobilization of carriers not only on any surface, but also in the volume of the gel or porous material.
Для идентификации предлагаемых НК-носителей НК-проб можно использовать не только их пространственное позиционирование. Например, эти НК-носители НК-проб могут упорядоченно двигаться сквозь детектор, который их опознает. Опознавание может осуществляться по различным признакам, например, размеры и конформация молекул, различные метки и разные комбинации этих признаков. Детектор может также определять время или последовательность прохода носителей сквозь детектор.To identify the proposed NK carriers of NK samples, one can use not only their spatial positioning. For example, these NK carriers of NK samples can orderly move through a detector that recognizes them. Identification can be carried out by various signs, for example, the size and conformation of molecules, various labels and different combinations of these signs. The detector may also determine the time or sequence of media passing through the detector.
Благодаря тому что однонитчатые НК-мишени согласно предлагаемому изобретению взаимодействуют не с иммобилизованными комплементарными им НК, но со свободными НК-пробами, появляется возможность упростить процедуру подготовки НК-мишени к процедуре гибридизации. Например, можно использовать для гибридизации НК-мишени, которые находятся внутри геля или иммобилизованы на поверхности частиц. Например, это могут быть парамагнитные, металлические, полупроводниковые и полимерные частицы. В частности, это могут быть парамагнитные частицы, которые общепринято использовать в процедурах очистки и амплификации НК.Due to the fact that single-stranded NK targets according to the invention interact not with immobilized NK targets complementary to them, but with free NK samples, it becomes possible to simplify the procedure for preparing a NK target for the hybridization procedure. For example, can be used to hybridize NK targets that are located inside the gel or immobilized on the surface of the particles. For example, it can be paramagnetic, metal, semiconductor and polymer particles. In particular, these can be paramagnetic particles, which are commonly used in purification and amplification of nanocrystals.
В одном из режимов использования предлагаемых НК-чипов предложено гибридизовать однонитчатые НК-пробы с однонитчатой НК-мишенью в растворе и после этого отделить двунитчатые комплексы мишень-проба от однонитчатых НК-проб. Эти свободные однонитчатые НК-пробы предложено гибридизовать в другом месте с НК-носителями для получения двунитчатых комплексов носитель-проба.In one of the modes of using the proposed NK chips, it was proposed to hybridize single-stranded NK samples with a single-stranded NK target in solution and after that to separate the double-stranded target-sample complexes from single-stranded NK samples. It was proposed to hybridize these free single-stranded NK samples at a different location with NK carriers to obtain double-stranded carrier-sample complexes.
Изобретение учитывает, что в таком режиме работы НК-мишени могут быть иммобилизованы на поверхности другого НК-чипа, например, изготовленного для работы с другими НК-пробами; на поверхности парамагнитных частиц, которые широко используют при сепарации и амплификации НК; а также внутри геля, как это бывает при электрофорезе нуклеиновых кислот.The invention takes into account that in this mode of operation, NK targets can be immobilized on the surface of another NK chip, for example, made to work with other NK samples; on the surface of paramagnetic particles, which are widely used in the separation and amplification of nanocrystals; and also inside the gel, as is the case with nucleic acid electrophoresis.
Результаты гибридизации можно определять, анализируя появление или отсутствие комплексов как НК-мишень с НК-пробой, так и комплексов НК-носитель с НК-пробой. Возможно также обнаружение свободных НК-проб, которые находятся или движутся между НК-мишенью и НК-носителем.Hybridization results can be determined by analyzing the appearance or absence of complexes of both the NK target with the NK probe and the complexes of the NK carrier with the NK probe. It is also possible to detect free NK samples that are located or move between the NK target and the NK carrier.
Еще одним режимом работы может быть такой, при котором НК-носитель иммобилизован на открытой поверхности или внутри пор пористого тела и гибридизован с НК-пробой, образуя двунитчатую НК. Предложено денатурировать такой комплекс НК-носитель с НК-пробой и высвобождать НК-пробу для того, чтобы она в свободном состоянии обнаруживала НК-мишень и гибридизовалась с ней. Способами денатурации, например, могут быть нагрев, изменение pH среды и приложение электрического поля.Another mode of operation may be one in which the NK carrier is immobilized on the open surface or inside the pores of the porous body and hybridized with the NK sample, forming a double-stranded NK. It was proposed to denature such a NK carrier complex with an NK probe and to release the NK probe so that it could detect the NK target and hybridize with it in a free state. Denaturation methods, for example, can be heating, changing the pH of the medium, and applying an electric field.
На Фиг.1 показана последовательность шагов работы одиночного канала НК-чипа (устройства), предложенного в настоящем изобретении.Figure 1 shows the sequence of steps of a single channel NK chip (device), proposed in the present invention.
Изобретение учитывает, что хотя на Фиг.1 показано, что весь раствор перемещается из одного компартмента в другой, существует возможность, приложив к компартментам, заполненным электролитом, электрическое поле, перемещать между компартментами только заряженные молекулы. Аналогично этому возможно использовать электрическое поле для случая, показанного на Фиг.2.The invention takes into account that although Fig. 1 shows that the entire solution moves from one compartment to another, it is possible, by applying an electric field to the compartments filled with an electrolyte, to move only charged molecules between the compartments. Similarly, it is possible to use an electric field for the case shown in FIG. 2.
В тех случаях, когда для перемещения молекул используют электрическое поле, возможно обойтись без использования оптических и других методов визуализации молекул, которые требуют специфически модифицировать нуклеиновые кислоты. Вместо этого можно измерять такие параметры, как ионный ток и другие неспецифические характеристики движущихся электрически заряженных полимерных молекул нуклеиновых кислот.In cases where an electric field is used to move the molecules, it is possible to do without the use of optical and other methods of visualizing molecules that require specific modification of nucleic acids. Instead, parameters such as ion current and other non-specific characteristics of moving electrically charged polymer nucleic acid molecules can be measured.
Канал, показанный на Фиг.1, это одноканальное устройство, которое в общем виде обозначено как 10. Устройство 10 имеет канал 2, заполненный жидкостью и имеющий пористую перегородку 14, которая проницаема для НК-проб 28 и непроницаема для НК-носителей 30 и НК-мишеней 32. Одна сторона пористой перегородки 14 обозначена как 16, а вторая 18. Пористая перегородка 14 отделяет содержащий НК-носители компартмент 20 от содержащего НК-мишени компартмента 22. Если необходимо, содержащий НК-носители компартмент 20 отгорожен проницаемой для жидкости пористой перегородкой 24, которая непроницаема для НК-носителей 30, НК-проб 28 и НК-мишеней 32. Подобным образом, если необходимо, содержащий НК-мишени компартмент 22 отгорожен проницаемой для жидкости пористой перегородкой 24', которая непроницаема для НК-носителей, НК-проб и НК-мишеней. Аппарат 26, индуцирующий движение нуклеиновых кислот, необходим для того, чтобы обеспечивать перемещение НК-проб 28 из компартмента 20 в 22 и обратно. Природа аппарата 26 может быть различной в зависимости от того, какова природа сил, выбранных для перемещения нуклеиновых кислот между компартментами. Например, в тех случаях, когда НК-пробы 28 перемещаются между компартментами 20 и 22 вместе с потоком жидкости, аппарат 26 представляет собой насос.The channel shown in FIG. 1 is a single-channel device, which is generally designated as 10. The device 10 has a
Альтернативно, в тех случаях, когда НК-пробы 28 перемещаются между компартментами 20 и 22 под влиянием электростатического потенциала, аппарат 26 представляет собой источник питания с электродами, которые индуцируют электрическое поле между перегородками 24 и 24'. Для иллюстративных целей аппарат 26 показан, как насос, перемещающий НК-пробы 28 вместе с потоком жидкости.Alternatively, in cases where
На Фиг.1(a) показано множество копий НК-пробы 28, которые гибридизованы с НК-носителем 30 и находятся в компартменте 20. Изобретение учитывает, что НК-носитель 30 может находиться в компартменте 20 в виде молекул, свободных в растворе, молекул, иммобилизованных на перегородке 24 или/и перегородке 14 со стороны 16, или находится внутри пористых перегородок 24 или/и 14.Figure 1 (a) shows many copies of the NK-
Как показано на Фиг.1(b), комплекс НК-пробы 28 с НК-носителем 30 денатурирован, чтобы освободить НК-пробу 28 в объем раствора компартмента 20. Денатурацию комплексов НК-проб 28 с НК-носителем 30 можно осуществить разными методами, например нагреванием, изменением pH, электрическим полем.As shown in FIG. 1 (b), the complex of the NK-
На Фиг.(1c) показано, что НК-пробы 28 перемещены в компартмент 22. Как изображено на этом чертеже, такое перемещение может быть обеспечено за счет накачивания жидкости в компартмент 22 с помощью насоса через канал 2 или за счет отсасывания жидкости из компартмента 22.In Fig. (1c) it is shown that
Как показано на Фиг.1(d), молекулы НК-мишени 32 вносят в компартмент 22 с помощью диспенсера 34, который, например, может быть микропипеткой, микродиспенсером или другим подобным устройством. Изобретение учитывает, что однонитчатые молекулы НК-мишени 32 могут быть помещены в компартмент 22 до того, как туда помещают НК-пробы 28. В варианте, показанном на Фиг.1, молекулы однонитчатых НК-проб 32 иммобилизованы на парамагнитных частицах 36.As shown in FIG. 1 (d), the
На Фиг.1(e) показано, что молекулы НК-пробы 32, иммобилизованные на парамагнитных частицах 36, взаимодействуют с множеством копий НК-пробы 28. Как это видно на Фиг.1(f), взаимодействие происходит в условиях гибридизации, которые позволяют образование двунитчатых комплексов между комплементарными НК-мишенями и НК-пробами. Методы и условия гибридизации хорошо известны и, например, могут быть обеспечены за счет специальных режимов изменения температуры, pH, ионной силы.Figure 1 (e) shows that the molecules of the NK-
Изобретение учитывает, что на этой стадии содержимое компартмента 22 можно извлечь и исследовать вне описываемого устройства различными хорошо известными методами для того, чтобы определить результаты гибридизации НК-мишени и НК-пробы.The invention takes into account that at this stage the contents of
Однако в предпочтительном варианте, как изображено на Фиг.1(g), раствор переводят из компартмента 22 обратно в компартмент 20, ожидая следующий результат. Если НК-проба 28 комплементарна хотя бы части НК-мишени 30, то НК-пробы 28 останутся в компартменте 22 в составе комплекса НК-мишени с НК-пробой, для которого перегородка 14 непроницаема.However, in a preferred embodiment, as shown in FIG. 1 (g), the solution is transferred from
Непосредственное обнаружение НК-носителя 30 в условиях гибридизации обычными методами, например, с использованием флуоресцентных красителей, может позволить определить, вернулись ли НК-пробы 28 в компартмент 20. Если окажется, что НК-проба 28 вернулась в компартмент 20 и образовала двунитчатые комплексы с НК-носителем 30, то это будет означать, что НК-пробы 28 некомплементарны НК-мишени 32. В том случае, если НК-пробы 28 некомплементарны НК-мишени 32, удаление этой мишени и в случае необходимости дополнительная промывка компартмента 22 вернут канал 10 к исходному состоянию, показанному на Фиг.1(а). В случае, если НК-проба оказалась комплементарна тестируемой НК-мишени, то перед удалением НК-мишени из компартмента 20 понадобится денатурация комплекса НК-мишени с НК-пробой и перемещение освобожденной НК-пробы в компартмент 22.Direct detection of an
Таким образом, в случае, если НК-пробы 28 комплементарны НК-мишени 30, компартмент 22 необходимо вновь заполнить жидкостью, как это показано на Фиг.1(h). Денатурацию двунитчатых комплексов НК-пробы с НК-мишенью, показанную на Фиг.1(i), можно осуществить в тех же условиях, что описаны для Фиг.1(b).Thus, in the event that the
Последующие шаги обеспечивают разделение НК-мишени 32, которая была помещена в компартмент 22 так, как это показано на Фиг.1(d), и НК-проб 28, которые в результате денатурации были освобождены из комплекса с НК-мишенью. Изобретение учитывает, что такое разделение может быть обеспечено вне канала 10 хорошо известными методами, например, такими, как электрофорез и хроматография, а также за счет использования парамагнитных частиц, на которых НК-мишень иммобилизована. Однако в предпочтительном варианте, показанном на Фиг.1(j), освобожденные НК-пробы 28 перемещают из компартмента 22 в компартмент 20. После этого в компартменте 20 обеспечивают гибридизацию НК-пробы 28 с НК-носителем 30, как это показано на Фиг.1(k). После этого компартмент 22 заполняют жидкостью так, чтобы молекулы НК-мишеней 32, иммобилизованные на парамагнитных частицах 36, оказались плавающими в растворе, как это показано на Фиг.1(l).The following steps ensure the separation of the
На Фиг.1(m) показано, что в компартмент 22 введен магнит 40, к поверхности которого прилипли все парамагнитные частицы 36. На следующей Фиг.1(n) показано, что магнит 40, удаленный из компартмента 22, унес на своей поверхности все парамагнитные частицы 36 и иммобилизованные на них НК-мишени 32. Как показано на Фиг.1(o), удаление раствора из компартмента 22 возвращает канал 10 к исходному состоянию, показанному на Фиг.1(a).Figure 1 (m) shows that a
Последующая денатурация комплекса НК-носитель 30 с НК-пробой 28 и заполнение компартмента 22 раствором, содержащим НК-пробу 22, подготавливает канал 10 к работе со следующей НК-мишенью 32'. Как показано на Фиг.1(p), следующая НК-мишень 32' может быть, например, иммобилизована на парамагнитных частицах.Subsequent denaturation of the NK-
На Фиг.2 показан схематически многоканальный НК чип (устройство), в котором отдельные каналы функционируют так, как это было описано для Фиг.1. Номера на Фиг.2. имеют те же объяснения, что и на Фиг.1.Figure 2 shows schematically a multi-channel NK chip (device), in which individual channels operate as described for Figure 1. The numbers in FIG. 2. have the same explanations as in figure 1.
Множество пар компартментов НК-носителей 20 и НК-мишеней 22 образуют двумерный или трехмерный НК-чип (устройство). Преимуществом многоканального НК-чипа (устройства) 50, схематически показанного на Фиг.2, является то, что наличие множества пар компартментов 20 и 22 позволяет автоматизировать устройство и повысить производительность его работы.Many pairs of compartments of
Существенной особенностью изобретения является то, что НК-пробы курсируют между компартментами 20 и 22 и не расходуются. Предложенный НК-чип является простым устройством для многоразового использования, пригодным для разработки множественных вариантов недорогой и надежной массовой диагностики.An essential feature of the invention is that NK samples run between
Множество вариантов многоканального использующего электрофорез НК-чипа (устройства) показано на Фиг.3(a)-3(d). Указанный многоканальный НК-чип (устройство) имеет компартмент для НК-носителя 60, ограниченный торцевым электродом 62. Компартмент 60 предназначен для НК-носителей или НК-мишеней. Пористый материал 64 практически непроницаем для НК-носителей и НК-мишеней, но проницаем для НК-проб. Компартмент 60 может быть полностью или частично заполнен гелем 66, в котором могут быть заключены длинные и по этой причине практически не сдвигаемые в электрическом поле молекулы НК-носителей или НК-мишеней. При неполном заполнении компартмента 60 гелем 66 и при использовании пористого материала 64 компартмент 60 содержит также раствор 63. Компартмент 60 содержит также два (или больше) расположенных по бокам компартмента электрода 68 и 70.Many variants of a multichannel electrophoresis-based NK chip (device) are shown in FIG. 3 (a) -3 (d). The specified multi-channel NK chip (device) has a compartment for the
Как показано на Фиг.4, первая пластина, подобная 72, которая представлена на Фиг.3d, содержит набор компартментов, к которым подведены электропроводящие провода 74, обеспечивающие контакт жидкости в компартментах с электродами 68 и 70, которые были показаны также на Фиг.3.As shown in FIG. 4, the first plate, similar to 72, which is shown in FIG. 3d, contains a set of compartments to which conductive wires 74 are connected, providing fluid contact in the compartments with
На Фиг.5 представлен разнесенный вид комбинации пластин 72 и 78, которые совместно образуют электрофоретические камеры, описанные на Фиг.3.Figure 5 presents an exploded view of a combination of
На Фиг.6(a)-6(d) схематически показана процедура копирования НК-чипа (устройства), каждый компартмент которого содержит множество копий какого-либо НК-носителя НК-пробы или НК-мишени. Цифровые обозначения совпадают с описанными для Фиг.3-5.6 (a) -6 (d) schematically shows the procedure for copying an NK chip (device), each compartment of which contains many copies of any NK carrier of an NK sample or NK target. Digital designations are the same as described for Fig.3-5.
НК 80 амплифицирована с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР) внутри компартмента 60 таким образом, что он содержит множество копий этой нуклеиновой кислоты. После этого НК-чип (устройство) 72, который содержит в компартментах 60 множество копий НК, погруженных в гель 66, приводят в соприкосновение с таким же НК-чипом 72' и 78', который имеет концевые электроды 62'. Как показано на Фиг.6(b), в электрическом поле, сформированном между электродами 62 и 62', часть НК 80 будет перемещаться из компартмента 60 в компартмент 60'. После перемещения части НК 80 в компартмент 60' пластины 70 и 72 разъединяют, как это показано на Фиг.6(c). После этого с помощью ПЦР небольшое количество ПК 80, которое было перемещено в компартменты 60', размножают до количеств, соответствующих количеству этих НК 80 в НК-чипе (устройстве), образованном пластинами 72 и 78. Таким образом получают полную копию исходного НК-чипа (устройства).
На Фиг.7(a)-(r) показаны последовательные этапы диагностики для случая, когда НК-носитель НК-проб и НК-мишени погружены каждый в своем компартменте внутрь геля так, что под действием электрического поля НК-пробы могут входить в и выходить из соответствующего компартмента, в то время как НК-носители и НК-мишени практически не будут сдвигаться с места.Figures 7 (a) - (r) show successive diagnostic steps for the case when the NK carrier of NK samples and NK targets are each immersed in their compartment inside the gel so that, under the influence of the electric field, NK samples can enter and exit the corresponding compartment, while NK carriers and NK targets will practically not budge.
Диагностический НК-чип, который состоит из пластин 72 и 78, содержащих концевой электрод 62 и боковые электроды 68 и 70, в соответсвии с описаниями, приведенными для предыдущих чертежей, имеет компартмент 60, содержащий множество копий коротких НК-проб 28, гибридизованных с длинными однонитчатыми НК-носителями 30. Компартмент 60, заполненный гелем 66, обозначен на чертеже как 86.The diagnostic NK chip, which consists of
Компартмент, содержащий НК-мишень 30, помещенную в гель 66, обозначен как 88. Как показано на Фиг.7(b), комплекс НК-пробы 28 и НК-носителя 30 помещен в условия, при которых он денатурирует с образованием однонитчатых НК-пробы 28 и НК-носителя 30.The compartment containing the
На Фиг.7(d) показано, что пластину 90 вместе с присоединенной к ней пластиной 78' приводят в контакт с пластиной 72 и прикладывают электрические потенциалы к электродам 62 и 62', в результате чего НК-пробы 28 начинают перемещаться из компартмента 86 в компартмент 88, который содержит НК-мишени. На Фиг.7(e) показано, что в результате электрофореза все НК-пробы 28 покидают компартмент 86 и скапливаются в компартменте 88. После этого, как это показано на Фиг.7(f), пластину 90 отделяют от пластины 72.Fig. 7 (d) shows that
Далее пластину с компартментами 88 помещают в условия гибридизации, при которых могут образоваться комплексы НК-проб 28 с НК-мишенями 34. Комплементарные НК-пробы 28 и НК-мишени 34 в результате гибридизации образуют двунитчатые комплексы, как это показано на Фиг.7(g). После этого пластину 90 вновь контактируют с пластиной 72, как показано на Фиг.7(h), и проводят электрофорез в направлении, обратном тому, что показано на Фиг.7(d), с целью вернуть все свободные НК-пробы 28 из компартмента 88 обратно в компартмент 86 с НК-носителями.Next, the plate with
Как показано на Фиг.7(i), пластина 90 вновь отделена от пластины 72 и в компартментах 86 организовано горизонтальное электрическое поле, для того чтобы двигать свободные НК-пробы 28. После этого направление горизонтального электрофореза меняют на обратное, как это показано на Фиг.7(k). В обоих случаях электрофорез организован так, что позволяет измерять электрические характеристики движущихся НК-проб 28, например, величину ионного тока. После этого как показано на Фиг.7(l) в компартментах 86 обеспечивают условия гибридизации для образования комплексов между НК-пробами 28 и НК-носителями 30.As shown in FIG. 7 (i), the
После этого компартменты 88, содержащие двунитчатые комплексы НК-мишеней 34 с НК-пробами 28, помещают в условия денатурации. Пластины 90 и 72 вновь контактируют и организуют электрическое поле между электродами 62 и 62' в том же направлении, как на Фиг.7(h), для того чтобы обеспечить перемещение НК-проб 28, комплементарных НК-мишени 34, обратно в компартмент 86. На Фиг.7(o) показано, что после того как все НК-пробы 28 вернутся в компартмент 86, электрическое поле выключают.After that, compartments 88 containing double-stranded complexes of NK targets 34 with
Пластины 90 и 72 после этого разъединяют. Содержимое компартментов 88 в пластине 90 становится таким же, как оно было в начале процедуры на Фиг.7(a).
На Фиг.7(q) показано, что в компартментах 86 обеспечены условия гибридизации, в результате чего все НК-пробы 28, которые комплементарны НК-мишени 34, образовали двунитчатые НК комплексы с НК-носителями 30. Таким образом на Фиг.7(r) показано, что НК-чип (устройство), содержащее компартменты 86, полностью готово к диагностике другой НК-мишени; аналогично компартменты 88 готовы для тестирования других НК-проб.Figure 7 (q) shows that
Claims (21)
компартмент для однонитчатой НК, состоящей из повторяющейся последовательности нуклеотидов, которая способна присоединять к себе однонитчатую НК-пробу с образованием двунитчатой структуры - НК-носитель;
компартмент для НК-мишени;
НК-носитель, заключенный в компартмент для НК-носителей, при этом указанный компартмент содержит жидкость, которая контактирует с жидкостью, находящейся в компартменте для НК-мишеней;
перегородку, проницаемую для однонитчатых НК-проб и непроницаемую для НК-носителей и НК-мишеней, при этом указанная перегородка отделяет компартмент для НК-носителей от компартмента для НК-мишеней;
устройство, пригодное для перемещения указанных НК-проб из указанного компартмента для НК-носителей в указанный компартмент для НК-мишеней и обратно.1. The device is reusable, designed for the reaction of hybridization of nucleic acids (NK), characterized in that it contains:
a compartment for a single-stranded NK, consisting of a repeating sequence of nucleotides, which is able to attach to itself a single-stranded NK-sample with the formation of a double-stranded structure - NK-carrier;
compartment for the NK target;
NK-carrier enclosed in a compartment for NK-carriers, wherein said compartment contains a liquid that is in contact with a liquid located in the compartment for NK-targets;
a partition that is permeable to single-stranded NK samples and impermeable to NK carriers and NK targets, while this partition separates the compartment for NK carriers from the compartment for NK targets;
a device suitable for moving said NK samples from said compartment for NK carriers to said compartment for NK targets and vice versa.
гибридизацию НК-пробы комплементарной НК-мишени с таким НК-носителем, которому НК-проба комплементарна, и получение таким образом двунитчатого комплекса НК-пробы с НК-носителем;
помещение двунитчатого комплекса НК-пробы с НК-носителем в компартмент № 1, ограниченный стороной 1 перегородки, которая имеет сторону 1 и сторону 2, ограничивающую компартмент № 2, и является проницаемой для указанной НК-пробы и непроницаемой для указанного НК-носителя и указанного комплекса НК-пробы с НК-носителем;
помещение однонитчатой НК-мишени в компартмент № 2, ограниченный стороной 2 перегородки, имеющей сторону 1 и сторону 2, и проницаемой для указанной НК-пробы и непроницаемой для указанной НК-мишени;
денатурацию указанного комплекса НК-пробы с НК-носителем и возвращение всех копий указанной НК-пробы в компартмент № 1;
обеспечение возможности прохождения указанной НК-пробы сквозь указанную перегородку со стороны 1 на сторону 2 указанной перегородки;
обеспечение контакта комплементарной НК-мишени с указанной НК-пробой в компартменте № 2;
обеспечение таких условий гибридизации, при которых указанная НК-проба будет иметь возможность гибридизоваться с комплементарной НК-мишенью с образованием комплекса НК-пробы с НК-мишенью;
обеспечение возможности перемещения НК-проб, негибридизованных с НК-мишенью на сторону 1 перегородки в компартмент №1 после обеспечения условий для гибридизации указанных проб с комплементарной НК-мишенью;
обеспечение возможности гибридизации указанной НК-пробы с указанным НК-носителем в компартменте № 1 после возвращения указанной пробы из компартмента № 2 сквозь указанную перегородку;
определение комплементарности указанной НК-пробы и указанной НК-мишени путем определения, является ли указанная НК-проба частью комплекса НК-пробы с НК-мишенью в компартменте №2 или НК-пробы с НК-носителем в компартменте №1.9. A method for comparing two sequences of nucleic acids (NK), defined as an NK probe, a NK target and a single-stranded NK, which consists of a repeating nucleotide sequence and which is capable of attaching a single-stranded NK sample to form a double-stranded structure - an NK carrier, hybridization method, characterized in that it is carried out in the presence of two compartments No. 1 and No. 2, which are separated by a partition and contain a liquid that allows you to move the NK sample through the partition, and includes the following steps:
hybridization of the NK sample of a complementary NK target with such an NK carrier to which the NK sample is complementary, and thus obtaining a double-stranded complex of the NK sample with an NK carrier;
placing the double-stranded complex of an NK-sample with an NK-carrier in compartment No. 1, limited by side 1 of the partition, which has side 1 and side 2, bounding compartment No. 2, and is permeable to the specified NK-sample and impermeable to the specified NK carrier and the specified NK-sample complex with NK-carrier;
placing a single-stranded NK target in compartment No. 2, limited by side 2 of the partition having side 1 and side 2, and permeable to the indicated NK sample and impermeable to the specified NK target;
denaturation of the indicated complex of the NK sample with the NK carrier and the return of all copies of the indicated NK sample to compartment No. 1;
providing the possibility of passing the specified NK-test through the specified partition from side 1 to side 2 of the specified partitions;
providing contact of a complementary NK target with the indicated NK sample in compartment No. 2;
providing such hybridization conditions under which the specified NK-sample will be able to hybridize with a complementary NK-target with the formation of a complex of NK-samples with an NK-target;
providing the ability to move NK samples that are not hybridized with the NK target to side 1 of the partition to compartment No. 1 after providing conditions for hybridization of these samples with a complementary NK target;
enabling hybridization of the indicated NK sample with the indicated NK carrier in compartment No. 1 after the return of the indicated sample from compartment No. 2 through the specified partition;
determining the complementarity of the indicated NK sample and the indicated NK target by determining whether the indicated NK sample is part of the complex of the NK sample with the NK target in compartment No. 2 or the NK sample with the NK carrier in compartment No. 1.
копирование нуклеиновой кислоты с образованием множества копий в компартменте, содержащем гель и электрод;
контактирование указанного компартмента с другим компартментом, содержащим гель и электрод;
обеспечение электрофоретического перемещения части копий указанной НК из одного указанного компартмента в другой указанный компартмент;
разъединение указанных компартментов.18. A method of copying multiple isolated from each other chambers containing an electrophoresis electrode, a gel and a copy of a single-stranded nucleic acid consisting of a repeating nucleotide sequence that is capable of attaching a single-stranded NK sample to itself with the formation of a double-stranded structure, including:
copying a nucleic acid to form multiple copies in a compartment containing a gel and an electrode;
contacting said compartment with another compartment containing a gel and an electrode;
providing electrophoretic movement of part of the copies of the specified NK from one specified compartment to another specified compartment;
separation of these compartments.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2007106800/13A RU2366717C2 (en) | 2007-02-22 | 2007-02-22 | Multiple use device for nucleic acids hybridisation and application thereof |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2007106800/13A RU2366717C2 (en) | 2007-02-22 | 2007-02-22 | Multiple use device for nucleic acids hybridisation and application thereof |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2007106800A RU2007106800A (en) | 2008-09-10 |
RU2366717C2 true RU2366717C2 (en) | 2009-09-10 |
Family
ID=39866272
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2007106800/13A RU2366717C2 (en) | 2007-02-22 | 2007-02-22 | Multiple use device for nucleic acids hybridisation and application thereof |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2366717C2 (en) |
-
2007
- 2007-02-22 RU RU2007106800/13A patent/RU2366717C2/en not_active IP Right Cessation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
RU2007106800A (en) | 2008-09-10 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Liu et al. | SlipChip for immunoassays in nanoliter volumes | |
US9149806B2 (en) | Microfluidic devices and methods for cell sorting, cell culture and cells based diagnostics and therapeutics | |
EP2016091B1 (en) | Droplet-based biochemistry | |
KR20110008174A (en) | Microfluidic chip devices and their use | |
JP2010533840A (en) | Methods and apparatus using electric fields for improved biological assays | |
WO2012047889A2 (en) | Systems and methods for automated reusable parallel biological reactions | |
JP2017079766A (en) | Microfluidic device for nucleic acid extraction and fractionation | |
US20120160689A1 (en) | On-chip hybridization coupled with ITP based purification for fast sequence specific identification | |
US9862987B2 (en) | Label free molecular detection methods, systems and devices | |
Jayamohan et al. | Advances in microfluidics and lab-on-a-chip technologies | |
MXPA02001437A (en) | Microfluidic devices for the controlled manipulation of small volumes. | |
US20090286694A1 (en) | Nucleic acid array with releaseable nucleic acid probes | |
JP6665090B2 (en) | Microfluidic devices and arrangements for supplying reagents and biological samples to such devices | |
WO2020243077A1 (en) | Flow cell with one or more barrier features | |
Lien et al. | Miniaturization of molecular biological techniques for gene assay | |
O’Keefe et al. | Highly efficient real-time droplet analysis platform for high-throughput interrogation of DNA sequences by melt | |
US20070148678A1 (en) | Device and method for carrying out a nucleic acid test, and method for producing such a device | |
US20190071722A1 (en) | Modular Flow Cells And Methods Of Sequencing | |
US20070051626A1 (en) | Cataphoresis apparatus cataphoresis method, and detection method for organism-related material using the apparatus and the method | |
US20030087290A1 (en) | Bio-affinity porous matrix in microfluidic channels | |
RU2366717C2 (en) | Multiple use device for nucleic acids hybridisation and application thereof | |
CN108291251A (en) | System and method for foranalysis of nucleic acids | |
US20080044821A1 (en) | Nucleic acid array having fixed nucleic acid anti-probes and complementary free nucleic acid probes | |
US20020179439A1 (en) | Microelectronic system and method of use and fabrication | |
US20100056388A1 (en) | Nucleic acid array having fixed nucleic acid anti-probes and complementary free nucleic acid probes |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20120223 |
|
RH4A | Copy of patent granted that was duplicated for the russian federation |
Effective date: 20141021 |