RU2343483C1 - Способ оценки активности ядрышкообразующих районов хромосом в клетках - Google Patents

Способ оценки активности ядрышкообразующих районов хромосом в клетках Download PDF

Info

Publication number
RU2343483C1
RU2343483C1 RU2007116084/15A RU2007116084A RU2343483C1 RU 2343483 C1 RU2343483 C1 RU 2343483C1 RU 2007116084/15 A RU2007116084/15 A RU 2007116084/15A RU 2007116084 A RU2007116084 A RU 2007116084A RU 2343483 C1 RU2343483 C1 RU 2343483C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
chromosomes
activity
level
preparations
cells
Prior art date
Application number
RU2007116084/15A
Other languages
English (en)
Inventor
Иль Николаевич Медведев (RU)
Илья Николаевич Медведев
Ирина Валерьевна Амелина (RU)
Ирина Валерьевна Амелина
Борис Дмитриевич Беспарточный (RU)
Борис Дмитриевич Беспарточный
Original Assignee
Илья Николаевич Медведев
Борис Дмитриевич Беспарточный
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Илья Николаевич Медведев, Борис Дмитриевич Беспарточный filed Critical Илья Николаевич Медведев
Priority to RU2007116084/15A priority Critical patent/RU2343483C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2343483C1 publication Critical patent/RU2343483C1/ru

Links

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к медицине и биологии и может быть использовано для точного определения уровня генетической стабильности хромосом. Для осуществления способа из локтевой вены обследуемого берут кровь для культивирования лимфоцитов и приготовления препаратов метафазных хромосом с последующим анализом хромосомных препаратов для изучения активности ЯОР в клетках с последующей обработкой полученных данных системным многофакторным анализом. Рассчитывают значение общего потенциала активности хромосом -

Description

Изобретение относится к медицине и биологии в области генетики человека и может быть использовано для точного определения уровня генетической стабильности хромосом.
В качестве ближайшего аналога заявленного способа можно считать (Амелина И.В. Активность ядрышкообразующих районов хромосом в популяции жителей города Курска, автореф. дисс. канд. биол. наук, г.Саранск, 2006).
Отличием заявленного изобретения от известного заключается в том, что дополнительно определяют соотношение показателей ядрышкообразующих районов хромосом (ЯОР) D ЯОР/10 AgЯОР, G ЯОР/10 AgЯОР, D ЯОР/G ЯОР, обрабатывают полученные результаты с помощью системного многофакторного анализа и по значению общего потенциала активности хромосом определяют уровень активности ЯОР: резко повышенный, нормальный, сниженный или резко сниженный.
Техническим результатом является повышение точности определения уровня активности ядрышкообразующих районов хромосом.
Целью изобретения является повышение точности определения уровня активности ЯОР хромосом в клетках.
Сущность заявляемого способа заключается в том, что для исследования активности ЯОР хромосом в клетках из локтевой вены обследуемого берется кровь для культивирования лимфоцитов и приготовления препаратов метафазных хромосом с последующим анализом хромосомных препаратов для изучения активности ЯОР хромосом в клетках с последующей обработкой полученных данных системным многофакторным анализом.
Полученное значение является общим потенциалом активности ЯОР хромосом в клетках обследуемого.
Способ отличается тем, что с применением нескольких технически простых и не требующих дорогостоящих реактивов, оборудования, затрат сил и времени методов возможно определение уровня активности ЯОР хромосом у обследуемых с последующим вычислением общего потенциала активности ЯОР хромосом, по значению которого можно судить об уровне активности белоксинтезирующего аппарата у того или иного индивида.
Постановка культуры лимфоцитов и приготовление препаратов метафазных хромосом.
Используется гепарин фирмы "Riсter" (Венгрия), фитогемагглютинин фирмы "Difko-P" (США), среда 199, сыворотка крупного рогатого скота, колхицин, хлорид калия, метанол, ледяная уксусная кислота, серная кислота концентрированная, дихромат калия, нитрат серебра, раствор желатина, цитрат натрия, хлорид натрия, гидроортофосфат натрия, дигидроортофосфат калия, краситель Гимза фирмы "Merck" (США). Реактивы отечественного производства были марки "ХЧ" и "ОСЧ".
Культивирование крови и приготовление препаратов метафазных хромосом проводили по общепринятой методике [Методические рекомендации / ЦИУВ. - М.: Медицина, 1989. - 113 с. Бочков Н.П. Культура лимфоцитов как тест-объект для изучения генетических последствий у лиц, контактирующих с мутагенами / Н.П.Бочков, B.C.Журков, Н.П.Кулешов // Докл. АН СССР. - 1974. - Т. 218. - №2. - С.463-465]. Кровь забирали из локтевой вены и заполняли ею стерильные пенициллиновые флаконы, в которых находился раствор гепарина (0,1 мл на 1 мл крови). Гепарин использовали в разведении бидистилированной водой 1:20. Кровь культивировали в стерильных пенициллиновых флаконах с питательной средой при 37°С в течение 72 часов. Питательная среда состояла из среды 199 (6,0 мл) и сыворотки крупного рогатого скота (1,5 мл). В качестве стимулятора пролиферативной активности использовали фитогемагглютинин. За 2 часа до начала фиксации в культуру лимфоцитов добавляли колхицин в конечной концентрации 0,5 мкг/мл.
Фиксацию проводили на 72 часу культивирования. После центрифугирования и отсасывания надосадочной жидкости клетки инкубировали с предварительно подогретым до 37°С 0,75 М раствором хлорида калия в течение 20 минут при 37°С. После гипотонизации проводили центрифугирование и отбор надосадочной жидкости. Клетки фиксировали в фиксаторе Карнуа (метанол + уксусная кислота) в соотношении 3:1 в течение трех и более часов. За это время производили три смены фиксатора. После полного обесцвечивания суспензии клеток, ее раскапывали на обезжиренные предметные стекла, смоченные дистиллированной холодной водой. Препараты высушивали на воздухе и шифровали.
Посадку, культивирование лимфоцитов крови и приготовление препаратов проводили строго стандартно во всех случаях. После приготовления препараты выдерживали при комнатной температуре для окраски нитратом серебра 7-14 дней, а для рутинного окрашивания для изучения уровня хромосомных аберраций - 2-3 дня.
Окраска хромосомных препаратов раствором нитрата серебра - Ag-окрашивание.
С целью выявления транскрипционно активных ЯОР хромосом использовали метод, предложенный Howell W.M. [Howell W.M. Chromosome core structure revealed by silver staining // Chromosome. - 1979. - Vol.73. - P.61-66]. На препараты метафазных хромосом наносили по 50 мкл бидистиллированной воды, 150 мкл 50% раствора нитрата серебра и 100 мкл 2% раствора желатина. Тщательно перемешивали и помещали в термостат на 8-10 мин при температуре 56,7 С°. После завершения окраски смывали раствор серебра под проточной водой и высушивали на воздухе. Препараты помещали в нагретый до 56,7 С° раствор 2×SSC (0,03 М раствор Na3C6H5O7·5,5 Н2O и 0,3 М раствор NaCl в соотношении 1:1) и выдерживали при 56,7 С° в течение 10 мин. Обезвоживали в 70% и 96% этиловом спитре. Препараты высушивали на воздухе и окрашивали раствором красителя Романовского-Гимзы (250 мкл красителя растворяли в 5 мл буферного раствора (хлорид натрия + цитрат натрия).
Оценка хромосомных препаратов на количество активных ЯОР проводилась следующим образом.
Количество активных ЯОР хромосом определяли с помощью светового микроскопа "Биолам" (увеличение окуляра 10, увеличение объектива 90). Сумма размеров 10 AgЯОР (ЯОР 10 акроцентрических хромосом) характеризует количество транскрипционно активных ЯОР в клетке и служит основой для сравнения индивидуальных геномов по этому признаку (Ag-полиморфизм).
Число окрашенных ЯОР подсчитывали в каждой анализируемой метафазной пластинке. Если данная акроцентрическая хромосома содержала в коротком плече зерна серебра, то такой ЯОР оценивался как транскрипционно активный, если он был неокрашен, то расценивался как неактивный.
Для исключения возможности недоокраски ЯОР серебром для анализа отбирали метафазные пластинки с полной (завершенной) окраской. На хромосомах, окрашенных серебром не полностью, в ЯОР появляется гомогенное, слабо окрашенное пятно вместо хорошо контурированных спутничных нитей, в то время как проксимальная часть короткого плеча и длинные плечи хромосом оставались неизменными. В полностью окрашенных серебром ЯОР таких слабо окрашенных пятен нет.
Для оценки окрашенных серебром хромосом всех просматриваемых метафазных пластинок использовали следующие показатели: D ЯОР (ЯОР D-акроцентрических хромосом), G ЯОР (ЯОР G-акроцентрических хромосом), 10AgЯОР, D ЯОР/10 AgЯОР, G ЯОР/10 AgЯОР, D ЯОР/G ЯОР характеризуют транскрипционную активность 10 AgЯОР данного индивида.
Оценка транскрипционной активности ЯОР акроцентрических хромосом проводится у каждого индивида по приведенным выше показателям в 200 метафазных пластинках с расчетом среднего арифметического каждого показателя. Нормативные показатели получали на группе здоровых лиц численностью не менее 20 человек с расчетом по каждому показателю среднего арифметического значения.
Для определения весомости всех полученных параметров и вычисления общего потенциала активности ядрышкообразующих районов хромосом (ОПАЯОР) обследованных применяется системный многофакторный анализ, позволяющий перевести исследуемые многомерные количественные характеристики 10 AgЯОР в сопоставимые относительные величины (Углова М.В., Углов Б.А., Архипов В.В., Горшкова Т.В., Петунина Н.А., Оль Т.Д., Прохуровская М.А., Шубин С.И. Применение методов морфометрии и статистического анализа в морфологических исследованиях. Куйбышев, 1982. - 47 с.). Метод дает возможность выразить все параметры 10 AgЯОР хромосом единым интегральным показателем. Расчет производился по формулам:
Figure 00000001
Figure 00000002
- исследуемый параметр,
Figure 00000003
- нормативный параметр,
Figure 00000004
- относительная разность.
Figure 00000005
Pi - весовой коэффициент (коэффициент влияния), а - постоянный множитель (в наших исследованиях а=0,1), σj - среднеквадратическое отклонение значения
Figure 00000004
в относительных единицах.
Figure 00000006
Si2 - дисперсия исследуемого параметра Xi, ni - количество наблюдений при определении Xi, S02 - дисперсия нормативного параметра Х0, n0 - количество наблюдений при определении Х0.
Figure 00000007
Figure 00000008
- величина, интегрально характеризующая исследуемый процесс в заданный срок (в относительных единицах).
Обработкой полученных результатов системным многофакторным анализом с определением общего потенциала активности ЯОР хромосом
Figure 00000009
позволяет адекватно оценивать уровень образования белковой основы для рибосом у обследуемых. Так, при значении
Figure 00000008
от 0,051 до 0,070 уровень активности ЯОР хромосом можно оценить как нормальный и не требующий никаких корректирующих вмешательств, при значении
Figure 00000008
от 0,040 до 0,050 активность ЯОР хромосом несколько снижена, а при
Figure 00000008
от 0,071 до 0,080 - повышена и требует динамического наблюдения и коррекции образа жизни; при уровне
Figure 00000008
от 0,039 и ниже активность ЯОР резко снижена, а при 0,081 и выше - резко повышена, что угрожает по развитию различных заболеваний и требует безотлагательного назначения корректирующего лечения.
Внедрение данного способа оценки потенциала активности ЯОР хромосом у людей в практику лечебных учреждений, центров планирования семьи и медикогенетических консультаций позволит решить ряд насущных социально-экономических проблем современности. Своевременное и адекватное назначение корректирующего подхода для нормализации
Figure 00000008
в каждом конкретном случае способно оптимизировать генетические процессы и обеспечить получение более здорового потомства от женщин, собирающихся забеременеть.
Пример 1. Жительница г. Курска, 34 года, практически здорова, ведущая здоровый образ жизни, обследована во время профилактического осмотра по месту жительства. У больной была взята кровь и исследована по изложенной выше схеме с оценкой уровня D ЯОР=10,2 у.е., G ЯОР=8,3 у.е., 10AgЯОР=18,5 у.е., D ЯОР/10 AgЯОР=0,55, G ЯОР/10 AgOP=0,44, D ЯОР/G ЯОР=1,23 и расчетом общего потенциала активности ЯОР хромосом.
У больной было найдено нормативное значение
Figure 00000010
и даны рекомендации и дальше вести здоровый образ жизни.
Пример 2. Житель Курской области, 43 года, страдающий язвенной болезнью двенадцатиперстной кишки в течение 8 лет, обследован во время профилактического осмотра по месту жительства. У больного была взята кровь и исследована по изложенной выше схеме с оценкой уровня D ЯОР=9,9 у.е., G ЯОР=5,4 у.е., 10AgЯOP=15,3 y.e., D ЯОР/10AgЯОР=0,65, G ЯОР/10AgЯОР=0,35, D ЯОР/G ЯОР=1,83 и расчетом общего потенциала активности ЯОР хромосом
Figure 00000011
Больному была рекомендована диета, богатая витамином В5, морепродуктами и прием антиоксиданта - токоферола ацетата 0,2 г по 1 капсуле 12 раз в день на 2 месяца, что позволило нормализовать
Figure 00000008
=0,061 через 4 месяца.
Пример 3. Жительница г. Курска, 68 лет, прооперирована 1/2 года назад по поводу рака желудка II ст., обследована во время профилактического осмотра по месту жительства. У больной была взята кровь и исследована по изложенной выше схеме с оценкой уровня D ЯОР=15,8 у.е., G ЯОР=9,6 у.е., 10AgЯОР=25,4 у.е., D ЯОР/10 AgЯОР=0,62, G ЯОР/10 AgЯОР=0,37, D ЯОР/G ЯОР=1,64 и расчетом общего потенциала активности ЯОР хромосом, составившего
Figure 00000008
=0,086.
Больной была рекомендована диета, богатая молочными продуктами. Через 2 мес. у больной нормализовались оцениваемые показатели с нормализацией
Figure 00000008
=0,063. Больной было предложено соблюдать в дальнейшем данные ей рекомендации.

Claims (1)

  1. Способ оценки активности ядрышкообразующих районов хромосом в клетках путем взятия крови, постановки культуры лимфоцитов, приготовления препаратов метафазных хромосом, окраски хромосомных препаратов с нитратом серебра и проведения анализа хромосомных препаратов в метафазных пластинках на предмет уровня активности ЯОР по показателям D ЯОР, G ЯОР, 10 AgЯОР, отличающийся тем, что анализ хромосомных препаратов проводят в 200 метафазных пластинках и дополнительно определяют соотношение показателей D ЯОР/10 AgЯОР, G ЯОР/10 AgЯОР, D ЯОР/G ЯОР, при этом проводят расчет среднего арифметического каждого показателя обработкой результатов исследования с помощью системного многофакторного анализа, переводящего каждый из определяемых показателей в сопоставимые относительные величины, на основании которых с учетом весового коэффициента, определяемого для каждого показателя на основании среднеквадратического отклонения для данного показателя и постоянного множителя, равного 0,1, рассчитывают значение общего потенциала активности ЯОР хромосом -
    Figure 00000012
    по значению которого определяют уровень образования белковой основы для рибосом у обследуемых: при значении
    Figure 00000013
    0,051 до 0,070 уровень активности ЯОР хромосом можно оценить как нормальный и не требующий никаких корректирующих вмешательств, при значении
    Figure 00000013
    0,040 до 0,50 активность ЯОР хромосом несколько снижена, а при
    Figure 00000013
    от 0,071 до 0,080 повышена и требует динамического наблюдения и коррекции образа жизни; при уровне
    Figure 00000013
    от 0,039 и ниже - активность ЯОР хромосом резко снижена, а при 0,081 и выше - резко повышена, что угрожает по развитию различных заболеваний и требует безотлагательного назначения корректирующего лечения.
RU2007116084/15A 2007-04-27 2007-04-27 Способ оценки активности ядрышкообразующих районов хромосом в клетках RU2343483C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2007116084/15A RU2343483C1 (ru) 2007-04-27 2007-04-27 Способ оценки активности ядрышкообразующих районов хромосом в клетках

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2007116084/15A RU2343483C1 (ru) 2007-04-27 2007-04-27 Способ оценки активности ядрышкообразующих районов хромосом в клетках

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2343483C1 true RU2343483C1 (ru) 2009-01-10

Family

ID=40374310

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2007116084/15A RU2343483C1 (ru) 2007-04-27 2007-04-27 Способ оценки активности ядрышкообразующих районов хромосом в клетках

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2343483C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2447438C2 (ru) * 2010-06-07 2012-04-10 Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Алтайский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации Способ окраски ядрышковых организаторов на гистологических препаратах и цитологических мазках

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
АМЕЛИНА И.В. Активность ядрышкообразующих районов хромосом в популяции жителей города Курска, автореф. дисс. к.б.н., г.Саранск, 2006. ЗАЛЕТАЕВА Т.А. и др. Современные методы хромосомного анализа в клинико-цитогенетических исследованиях, Российская мед. акад. последипл. образ., Москва, Медицина, 1994, 8 с. ЛЯПУНОВА Н.А. и др. Ядрышкообразующие районы (ЯОР) хромосом человека: опыт количественного цитологического и молекулярного анализа, Биологические мембраны, 2001, т.18, №3, с.189-199. ROUSSEL P et al. Identification of Ag-NOR proteins, markers of proliferation related to ribosomal gene activity., Exp Cell Res., 1994 Oct; 214(2): 465-72. PMID: 7523152 [PubMed - indexed for MEDLINE], реферат. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2447438C2 (ru) * 2010-06-07 2012-04-10 Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Алтайский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации Способ окраски ядрышковых организаторов на гистологических препаратах и цитологических мазках

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Zarzar et al. Formocresol mutagenicity following primary tooth pulp therapy: an in vivo study
Huizing et al. Disorders of vesicles of lysosomal lineage: the Hermansky-Pudlak syndromes
US10197578B2 (en) Predictive method of characterizing the radiosensitivity and tissular reaction of a patient to therapeutic ionizing radiation
Mayall et al. Quantification by DNA-based cytophotometry of the 9q+/22q-chromosomal translocation associated with chronic myelogenous leukemia
Viana et al. Altered cellular homeostasis in murine MPS I fibroblasts: evidence of cell-specific physiopathology
Slesinski et al. Mutagenicity evaluation of glutaraldehyde in a battery of in vitro bacterial and mammalian test systems
RU2343483C1 (ru) Способ оценки активности ядрышкообразующих районов хромосом в клетках
Hao et al. Mitochondrial DNA copy number, but not haplogroup is associated with keratoconus in Han Chinese population
CN105349641A (zh) 急性心肌梗死相关基因serpinb13及其应用
Labelle et al. Effects of ophthalmic disease on concentrations of plasma fibrinogen and serum amyloid A in the horse
CN104878010B (zh) 长链非编码rna afap1-as1在制备乳腺癌辅助诊断及预后判断制剂上的应用
RU2390021C1 (ru) Способ упрощенной оценки активности ядрышкообразующих районов хромосом
RU2391662C1 (ru) Способ оценки адаптивных возможностей генома человека
Bissbort et al. Linkage between the variegate porphyria (VP) and the alpha-1-antitrypsin (PI) genes on human chromosome 14
RU2405152C1 (ru) Способ определения устойчивости генома
Hemphill Tooth size apportionment among contemporary Indians: An analysis of caste, language, and geography.
RU2343478C1 (ru) Способ определения генетической стабильности хромосом человека
CN107779503A (zh) 阿尔茨海默相关的差异表达基因及其应用
Friedlande et al. The role of XbaI polymorphism of the apolipoprotein B gene in determining levels and covariability of lipid and lipoprotein variables in a sample of Israeli offspring with family history of myocardial infarction
RU2395809C1 (ru) Способ определения уровня ломкости хромосом человека
JPH07503323A (ja) 選択的なマーカーとしてアルストニンを用いる細胞診断方法及び前記のマーカーを含有する診断キット
US20190192698A1 (en) A method for obtaining indicator signals from a cell
CN102732614A (zh) 检测PJVK基因c.437G>A突变的试剂盒
RU2790782C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития грыжи передней брюшной стенки
CN101586165A (zh) 检测OTOF基因2975-2978delAG突变的试剂盒

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20090428