RU2325647C1 - Method of syringomyelia development forecast for ethnic russians - Google Patents
Method of syringomyelia development forecast for ethnic russians Download PDFInfo
- Publication number
- RU2325647C1 RU2325647C1 RU2007104736/15A RU2007104736A RU2325647C1 RU 2325647 C1 RU2325647 C1 RU 2325647C1 RU 2007104736/15 A RU2007104736/15 A RU 2007104736/15A RU 2007104736 A RU2007104736 A RU 2007104736A RU 2325647 C1 RU2325647 C1 RU 2325647C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- syringomyelia
- col1a1
- development
- dna
- risk
- Prior art date
Links
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Предлагаемое изобретение относится к медицине, а именно, к неврологии, и может быть использовано для прогнозирования развития сирингомиелии у лиц русской этнической принадлежности.The present invention relates to medicine, namely to neurology, and can be used to predict the development of syringomyelia in individuals of Russian ethnicity.
Сирингомиелия - хроническое прогрессирующее заболевание нервной системы, характеризующееся разрастанием глии (спинальный глиоз, глиоматоз) и образованием полости в спинном мозге. Основными клиническими признаками сирингомиелии являются развитие диссоциированных расстройств чувствительности, периферических парезов, преимущественно в руках, и трофических изменений кожи, костей и суставов. Врожденная форма заболевания часто имеет семейный характер и поражает чаще мужчин в возрасте 25-40 лет. Данное заболевание является краевой патологией в Башкортостане с неравномерной частотой распространения по районам и представляет собой серьезную медико-социальную проблему, так как приводит к ранней инвалидизации молодого трудоспособного населения.Syringomyelia is a chronic progressive disease of the nervous system characterized by the growth of glia (spinal gliosis, gliomatosis) and the formation of a cavity in the spinal cord. The main clinical signs of syringomyelia are the development of dissociated sensitivity disorders, peripheral paresis, mainly in the hands, and trophic changes in the skin, bones and joints. The congenital form of the disease often has a family character and affects more often men aged 25-40 years. This disease is a regional pathology in Bashkortostan with an uneven frequency of distribution in districts and represents a serious medical and social problem, as it leads to early disability of the young working population.
Самым эффективным и экономичным направлением в медицине является профилактика заболевания. Первичная профилактика предполагает формирование групп риска сирингомиелии с использованием молекулярно-генетических маркеров заболевания и меры предупреждения развития болезни.The most effective and economical direction in medicine is disease prevention. Primary prevention involves the formation of risk groups for syringomyelia using molecular genetic markers of the disease and measures to prevent the development of the disease.
Применение разработанного способа обеспечивает выявление лиц с повышенным риском развития сирингомиелии с целью формирования групп высокого риска и осуществления своевременных целенаправленных мероприятий по профилактике развития данной патологии.The application of the developed method provides the identification of individuals with an increased risk of developing syringomyelia in order to form high-risk groups and implement timely targeted measures to prevent the development of this pathology.
Известен способ прогнозирования течения нервно-психических заболеваний и степени риска их развития, заключающийся в заборе крови, получении сыворотки, иммуноферментном анализе с использованием тест-системы ELI-N-1, определении в динамике уровня сывороточных антител к антигенам нервной ткани (ATI), уровня соответствующих антиидиотипических антител (АТ2), коэффициента I, представляющего собой отношение АТ2/АТ1.A known method for predicting the course of neuropsychiatric diseases and the degree of risk of their development, which consists in taking blood, obtaining serum, enzyme-linked immunosorbent assay using the ELI-N-1 test system, determining the dynamics of serum antibodies to neural tissue antigens (ATI), level corresponding anti-idiotypic antibodies (AT2), coefficient I, which is the ratio of AT2 / AT1.
Прогнозирование осуществляют по степени выраженности отклонений исследуемых параметров от уровня нормальных значений (патент РФ 2002108749, 2003 г.). Недостатком представленного способа является его низкая прогностическая значимость вследствие недифференцированного подхода. Данный способ не позволяет оценить риск развития сирингомиелии в частности, а определяет только общий риск развития нервно-психических заболеваний, к которым относятся как моногенные расстройства с установленным этиопатогенезом (атрофическую миотонию, болезнь Гентингтона, Х-сцепленную бульбоспинальную амиотрофию, синдром Ретта, и др.), так и обширная группа генетически и клинически гетерогенных состояний (Болезнь Альцгеймера, эпилепсия, шизофрения и др.), где оценить вклад наследственных и внешнесредовых факторов не представляется возможным. Кроме того, иммуноферментный анализ - достаточно дорогостоящий и сложный метод, который не столь чувствителен как полимеразная цепная реакция синтеза (ПЦР) ДНК и допускает как ложно положительные, так и ложно отрицательные результаты.Prediction is carried out according to the severity of deviations of the studied parameters from the level of normal values (RF patent 2002108749, 2003). The disadvantage of the presented method is its low prognostic value due to the undifferentiated approach. This method does not allow to assess the risk of developing syringomyelia in particular, but only determines the overall risk of developing neuropsychiatric diseases, which include monogenic disorders with established etiopathogenesis (atrophic myotonia, Huntington's disease, X-linked bulbospinal amyotrophy, Rett syndrome, etc. ), as well as an extensive group of genetically and clinically heterogeneous states (Alzheimer's disease, epilepsy, schizophrenia, etc.), where it does not seem to assess the contribution of hereditary and environmental factors possible. In addition, enzyme immunoassay is a rather expensive and complex method that is not as sensitive as the polymerase chain reaction of synthesis (PCR) of DNA and allows for both false positive and false negative results.
Авторами в доступной научно-медицинской и патентной литературе не обнаружен способ прогнозирования риска развития сирингомиелии.The authors in the available scientific and medical and patent literature have not found a way to predict the risk of syringomyelia.
Задачей изобретения стала разработка объективного, высокоинформативного способа прогнозирования риска развития сирингомиелии у лиц русской этнической принадлежности, позволяющего в количественном отношении оценить риск возникновения данного заболевания.The objective of the invention was the development of an objective, highly informative method for predicting the risk of developing syringomyelia in people of Russian ethnicity, which allows a quantitative assessment of the risk of this disease.
Технический результат при использовании изобретения - получение критериев прогнозирования развития сирингомиелии у лиц русской этнической принадлежности.The technical result when using the invention is to obtain criteria for predicting the development of syringomyelia in individuals of Russian ethnicity.
Указанный технический результат достигается тем, что выделяют ДНК методом фенольно-хлороформной экстракции, проводят генотипирование SpI (1546G>T) полиморфизма гена α1-цепи коллагена 1 типа (Col1A1), и при выявлении аллеля Col1A1*s прогнозируют риск развития сирингомиелии у обследуемого русской этнической принадлежности.The indicated technical result is achieved by isolating DNA by phenol-chloroform extraction, genotyping SpI (1546G> T) of type 1 collagen α1 chain polymorphism (Col1A1) polymorphism is performed, and when the Col1A1 * s allele is detected, the risk of syringomyelia in the examined Russian ethnic is predicted accessories.
Способ осуществляется следующим образом.The method is as follows.
ДНК выделяют из периферической крови методом фенольно-хлороформной экстракции (Mathew С.С.The isolation of high molecular weight eukaryotic DNA // Methods in Molecular Biology / Ed. Walker J.M., N.Y., L.: Human Press. - 1984. - V.2. - P.31-34). Кровь набирают в пробирку с консервантом, содержащим 0,48% лимонной кислоты, 1,32% лимоннокислого натрия, 1,47% глюкозы, в соотношении 6:1, тщательно перемешивают и хранят при температуре 4°С не более одной недели. Для выделения ДНК к 8 мл крови добавляют 32 мл лизирующего буфера, содержащего 320 мМ сахарозы, 1% тритон Х-100, 5 мМ MgCl2, 10 мМ трис-HCl, рН 7,6. Полученную смесь перемешивают и центрифугируют при 4°С, 4000 об/мин в течение 20 минут. Надосадочную жидкость сливают, к осадку добавляют 400 мкл раствора, содержащего 25 мМ ЭДТА, рН 8,0 и 75 мМ NaCl, ресуспензируют, прибавляют 40 мкл 10% SDS, 20 мкл протеиназы К (10 мг/мл), затем образец инкубируют в термостате при 37°С в течение 18 часов. После этого из лизата последовательно проводят экстракцию ДНК равными объемами фенола, фенол-хлороформа (1:1) и хлороформа с центрифугированием при 10000 об/мин в течение 10 минут и отбором водной фазы после каждого этапа. ДНК осаждается из раствора двумя объемами охлажденного 96% этанола. Сформированную ДНК растворяют в деионизированной бидистиллированной воде и хранят при -20°С.DNA is isolated from peripheral blood by phenol-chloroform extraction (Mathew C. C. The isolation of high molecular weight eukaryotic DNA // Methods in Molecular Biology / Ed. Walker JM, NY, L .: Human Press. - 1984. - V. 2. - P.31-34). Blood is drawn into a test tube with a preservative containing 0.48% citric acid, 1.32% sodium citrate, 1.47% glucose, in a 6: 1 ratio, mixed thoroughly and stored at 4 ° C for no more than one week. To isolate DNA, 32 ml of lysis buffer containing 320 mM sucrose, 1% Triton X-100, 5 mM MgCl 2 , 10 mM Tris-HCl, pH 7.6 are added to 8 ml of blood. The resulting mixture was stirred and centrifuged at 4 ° C, 4000 rpm for 20 minutes. The supernatant is drained, 400 μl of a solution containing 25 mM EDTA, pH 8.0 and 75 mM NaCl is added to the precipitate, resuspended, 40 μl 10% SDS, 20 μl proteinase K (10 mg / ml) are added, then the sample is incubated in an incubator at 37 ° C for 18 hours. After that, DNA is sequentially extracted from the lysate in equal volumes of phenol, phenol-chloroform (1: 1) and chloroform with centrifugation at 10,000 rpm for 10 minutes and the selection of the aqueous phase after each stage. DNA is precipitated from solution in two volumes of chilled 96% ethanol. The formed DNA is dissolved in deionized bidistilled water and stored at -20 ° C.
Выделенная ДНК используется для проведения полимеразной цепной реакции синтеза ДНК (ПЦР).Isolated DNA is used for the polymerase chain reaction of DNA synthesis (PCR).
Генотипирование SpI (1546G>T) полиморфизма гена α1-цепи коллагена 1 типа (Col1Al) проводиться при помощи полимеразной цепной реакции синтеза ДНК (ПЦР) в реакционной смеси объемом 25 мкл, которая содержит 2,5 мкл 10×Taq-буфера (67 мМ трис-HCl (рН 8,8), 16,6 мМ (NH4)2 SO4,, 1,5 мМ MgCl2, 0,01% Tween-20), 0,1 мкг геномной ДНК, смесь dNTP (dATP, dGTP, dCTP, dTTP no 200 мкМ каждого), 1 ед. ДНК-полимеразы Termus aquaticus и 5-10 пМ локусспецифичных олигонуклеотидных праймеров. Последовательности праймеров, размеры амплифицируемых фрагментов и температурные режимы амплификации представлены в таблице 1 и 2.Genotyping of SpI (1546G> T) type 1 collagen α1 chain gene polymorphism (Col1Al) was carried out using a DNA polymerase chain reaction (PCR) in a 25 μl reaction mixture that contains 2.5 μl of 10 × Taq buffer (67 mm Tris-HCl (pH 8.8), 16.6 mM (NH 4 ) 2 SO 4 ,, 1.5 mM MgCl 2 , 0.01% Tween-20), 0.1 μg of genomic DNA, dNTP mixture (dATP , dGTP, dCTP, dTTP no 200 μM each), 1 unit. Termus aquaticus DNA polymerase and 5-10 pM locus-specific oligonucleotide primers. The sequence of the primers, the size of the amplified fragments and the temperature modes of amplification are presented in table 1 and 2.
Амплификат, наработанный при ПЦР полиморфного локуса гена Col1A1, подвергают ферментативному гидролизу с использованием рестриктазы MlsI (к 20 мкл амплификата добавляют 5 Ед. активности рестриктазы и инкубируют в термостате при температуре 37°С в течение 12 часов).The amplification obtained by PCR of the polymorphic locus of the Col1A1 gene is subjected to enzymatic hydrolysis using the restriction enzyme MlsI (5 Units of restriction activity are added to 20 μl of the amplification and incubated in an incubator at 37 ° C for 12 hours).
Продукты, образованные при амплификации и гидролизе, оцениваются путем разделения при помощи электрофореза в 7% полиакриламидном геле.Products formed by amplification and hydrolysis are evaluated by separation by electrophoresis in a 7% polyacrylamide gel.
Электрофорез проводится в 1×TBE буфере (0,089 М трис; 0,089 М борная кислота; 0,002 М ЭДТА, рН 8,0). Пробы перед нанесением на гель, смешиваются в соотношении 5:1 с краской, содержащей 0,25% бромфеноловый синий, 0,25% ксиленцианол и 15% фикол. Детекцию результатов проводят путем окрашивания полиакриламидного геля бромидом этидия (0,1 мкг/мл) в течение 10 минут с последующей визуализацией в ультрафиолетовом свете (при длине волны 312 нм) на трансиллюминаторе.Electrophoresis is carried out in 1 × TBE buffer (0.089 M Tris; 0.089 M boric acid; 0.002 M EDTA, pH 8.0). Samples before application to the gel are mixed in a 5: 1 ratio with paint containing 0.25% bromphenol blue, 0.25% xylencyanol and 15% ficol. The results are detected by staining the polyacrylamide gel with ethidium bromide (0.1 μg / ml) for 10 minutes, followed by visualization in ultraviolet light (at a wavelength of 312 nm) on a transilluminator.
В качестве конкретного примера проведено клинико-генетическое изучение группы неродственных больных (N=121) из 116 семей с установленным клиническим диагнозом «сирингомиелия» [G95.0]. Выборка больных состояла из пациентов различной этнической принадлежности: 48 татар, 31 русских, 31 башкир и 11 метисов, сирингомиелией.As a specific example, a clinical genetic study of a group of unrelated patients (N = 121) from 116 families with a clinical diagnosis of syringomyelia [G95.0] was carried out. The patient sample consisted of patients of different ethnicities: 48 Tatars, 31 Russians, 31 Bashkirs and 11 Métis, and syringomyelia.
Набор больных осуществлялся на базе Республиканской клинической больницы им. Г.Г.Куватова, кафедры неврологии с курсами нейрохирургии и медицинской генетики Башкирского государственного медицинского университета, а также в ходе экспедиционных выездов с 2000 по 2003 гг. Клинический осмотр, оценка характера, степени психических и двигательных нарушений проводились в соответствии с Международной классификацией болезней 10-го пересмотра.The selection of patients was carried out on the basis of the Republican Clinical Hospital. G.G. Kuvatova, Department of Neurology with courses in Neurosurgery and Medical Genetics, Bashkir State Medical University, as well as during expedition trips from 2000 to 2003. Clinical examination, assessment of the nature, degree of mental and motor disorders were carried out in accordance with the International Classification of Diseases of the 10th revision.
Контрольная группа состояла из 185 человек, не имеющих клинических признаков сирингомиелии и мальформации Арнольда-Киари, а также по возрастному, половому и этническому составу соответствующих группе больных с сирингомиелией.The control group consisted of 185 people with no clinical signs of syringomyelia and Arnold-Chiari malformation, as well as age, gender and ethnic composition of the corresponding group of patients with syringomyelia.
В работе использованы образцы ДНК обследованных больных с клиническим диагнозом сирингомиелия, состоящих на учете в медико-генетическом регистре Республики Башкортостан, а также здоровых доноров, проживающих в Башкортостане.The DNA samples of the examined patients with a clinical diagnosis of syringomyelia, registered in the medical genetic registry of the Republic of Bashkortostan, as well as healthy donors living in Bashkortostan, were used in the work.
Рядом авторов предложена гипотеза генетической основы сирингомиелии, основанная на семейном сцеплении сирингомиелии с редкими заболеваниями, косегрегации с известными генетическими синдромами, а также результатах исследований с использованием близнецового метода (Speer M., et al. A genetic hypotesis for Chiari I malformation with or without syringomyelia // Neurosurg Focus. - 2000. - Vol.8, №3. - Р.1-4.)A number of authors have proposed a hypothesis for the genetic basis of syringomyelia, based on the family linkage of syringomyelia with rare diseases, cosegregation with known genetic syndromes, and the results of studies using the twin method (Speer M., et al. A genetic hypotesis for Chiari I malformation with or without syringomyelia // Neurosurg Focus. - 2000. - Vol.8, No. 3. - P.1-4.)
Учитывая возможность нарушения остеогенеза как сопутствующего или предрасполагающего фактора при сирингомиелии, проведено исследование гена, участвующего в процессах формирования и резорбции костной ткани.Considering the possibility of violation of osteogenesis as a concomitant or predisposing factor in syringomyelia, a study of the gene involved in the processes of formation and resorption of bone tissue was carried out.
Коллаген 1 типа является основным белком матрикса соединительной (до 25-30%) и костной (90%) тканей. Он придает механическую прочность и выполняет морфогенетическую функцию, влияя на рост, миграцию и дифференцировку клеток, определяя их секреторную и синтетическую активность. Структурно он образован из α1- и α2- полипептидных цепей, синтез которых у человека детерминируется двумя соответствующими генами - Col1A1 и Соl1А2. В настоящее время известны мутации в этих генах, приводящие к развитию переломов, остеопений, а также полиморфизмы, ассоциированные со снижением минеральной плотности костной ткани (Баранов B.C., с соавт. Геном человека и гены «предрасположенности» (Введение в предиктивную медицину). СПб. Интермедика. - 2000. - С.160-170).Type 1 collagen is the main protein of the matrix of connective (up to 25-30%) and bone (90%) tissues. It gives mechanical strength and performs a morphogenetic function, affecting the growth, migration and differentiation of cells, determining their secretory and synthetic activity. Structurally, it is formed from α1 and α2 polypeptide chains, the synthesis of which in humans is determined by two corresponding genes - Col1A1 and Col1A2. Currently, mutations in these genes are known, leading to the development of fractures, osteopenia, as well as polymorphisms associated with a decrease in bone mineral density (Baranov BC, et al. Human genome and “predisposition” genes (Introduction to predictive medicine). St. Petersburg. Intermedica. - 2000. - S.160-170).
Ген α1-цепи коллагена 1 типа (Col1A1) расположен на 17 хромосоме в области q21.3-22. В первом интроне гена Col1A1 существует сайт узнавания для транскрипционного фактора SpI, в котором обнаружена замена гуанина на тимин (1546G>T; af017178), приводящего к возникновению Col1A1*s аллеля, функциональная активность которого составляет не более 16% по сравнению с Col1A1*S аллелем (Berg J.P., Lehmann E.H., Stakkestad J.A., Haug E. and Halse J. The Spl binding site polymorphism in the collagen type I alpha 1 (COL1A1) gene is not associated with bone mineral density in healthy children, adolescents, and young adults // Eur J Endocrinol. - 2000. V.143. P.261-265).The α1 gene of type 1 collagen (Col1A1) is located on chromosome 17 in the q21.3-22 region. In the first intron of the Col1A1 gene, there is a recognition site for the transcription factor SpI, in which the substitution of guanine for thymine (1546G> T; af017178) is detected, which leads to the appearance of the Col1A1 * s allele, whose functional activity is no more than 16% compared to Col1A1 * S allele (Berg JP, Lehmann EH, Stakkestad JA, Haug E. and Halse J. The Spl binding site polymorphism in the collagen type I alpha 1 (COL1A1) gene is not associated with bone mineral density in healthy children, adolescents, and young adults // Eur J Endocrinol. - 2000. V.143. P.261-265).
С целью выявления генетических маркеров, ассоциированных с повышенным риском развития сирингомиелии, проведен анализ полиморфного ДНК-локуса af017178 гена, кодирующего α1 полипептидные цепи коллагена I типа.In order to identify genetic markers associated with an increased risk of syringomyelia, a polymorphic DNA locus af017178 of a gene encoding type I collagen α1 polypeptide chains was analyzed.
Молекулярно-генетический анализ полиморфизма SpI (1546G>T) гена α1 цепи коллагена I типа (Col1A1) выполнен методом полиморфизма длины рестрикционных фрагментов (ПДРФ).The molecular genetic analysis of the SpI polymorphism (1546G> T) of the α1 gene of the type I collagen chain (Col1A1) was performed by the restriction fragment length polymorphism (RFLP).
Доверительные интервалы частот аллелей и генотипов рассчитывали на основе точной формулы с использованием F-распределения (Животовский Л.А. Популяционная биометрия. - М.: Наука, 1991).Confidence frequency ranges of alleles and genotypes were calculated on the basis of an exact formula using the F-distribution (L. Zhivotovsky. Population biometry. - M .: Nauka, 1991).
При попарном сравнении частот генотипов и аллелей ДНК-локуса SpI (1546G>T) в группах больных и здоровых лиц использовался критерий хи-квадрат (χ2) для таблиц сопряженности 2×2 с поправкой Иэйтса на непрерывность, вычисляемый по формуле:When pairwise comparing the frequencies of genotypes and alleles of the SpI DNA locus (1546G> T) in groups of patients and healthy individuals, the chi-square criterion (χ 2 ) was used for contingency tables 2 × 2 with Iates correction for continuity, calculated by the formula:
где n1 и n2 - объемы сравниваемых распределений; p1 и р2 - частоты соответствующих классов.where n 1 and n 2 are the volumes of the compared distributions; p 1 and p 2 are the frequencies of the corresponding classes.
Для подтверждения гипотезы о влиянии какого-то аллельного варианта или генотипа как протективного феномена или фактора риска развития сирингомиелии нами проведена для статистически значимо различающихся вариаций проанализированных вышеуказанных полиморфных ДНК-локусов оценка статистики связи - показателя отношения шансов (OR - odds ratio), a также границ его 95% доверительного интервала (CI95%). OR является мерой ассоциации, количественно определяющей взаимосвязь между фактором риска и развитием расстройства в ретроспективном исследовании. Силу ассоциаций оценивали в значениях показателя OR по формуле, предложенной Бландом (Bland, J.M. The odds ratio / J.M.Bland, D.G.Altman // Br. Med. J. - 2000. - Vol.320. - P.1468):To confirm the hypothesis about the influence of some allelic variant or genotype as a protective phenomenon or risk factor for the development of syringomyelia, we have carried out for the statistically significantly different variations of the analyzed polymorphic DNA loci the connection statistics - the odds ratio indicator (OR - odds ratio), as well as the boundaries its 95% confidence interval (CI95%). OR is an association measure that quantifies the relationship between a risk factor and the development of a disorder in a retrospective study. The strength of the associations was evaluated in the values of the OR indicator according to the formula proposed by Bland (Bland, J.M. The odds ratio / J.M. Bland, D.G. Altman // Br. Med. J. - 2000. - Vol. 320. - P.1468):
OR=(a×d)/(b×c),OR = (a × d) / (b × c),
где a - число лиц с наличием, b - с отсутствием маркера среди больных; c и d - число лиц соответственно с наличием и отсутствием маркера среди здоровых доноров.where a is the number of individuals with presence, b is the absence of a marker among patients; c and d are the number of individuals, respectively, with the presence and absence of a marker among healthy donors.
При OR=1 - нет ассоциации, OR>1 рассматривается как положительная ассоциация заболевания с аллелем или генотипом («фактор риска») и OR<1 - как отрицательная ассоциация («фактор устойчивости»).When OR = 1, there is no association, OR> 1 is considered as a positive association of the disease with an allele or genotype ("risk factor") and OR <1 - as a negative association ("resistance factor").
Доверительный интервал для показателя отношения шансов рассчитывался по формуле:The confidence interval for the odds ratio indicator was calculated by the formula:
Статистическая обработка полученных данных проводилась с использованием пакета программ Statistica ver. 6.0 (StatSoft, Inc., 2001), программы «R×C» (Rows × Columns).Statistical processing of the data was carried out using the software package Statistica ver. 6.0 (StatSoft, Inc., 2001), the R × C program (Rows × Columns).
У больных сирингомиелией аллель Col1A1*s встречался в среднем с частотой 0.157, варьируя от 0.097 у башкир до 0.258 у русских, достигая достоверных различий между больными башкирского и русского происхождения (χ2=4.476, df=1, p=0.035). Между больными и контрольной группой в целом обнаружены статистически значимые различия в распределении частот аллелей SpI (1546G>Т) полиморфизма гена Col1A1 (χ2=4.77, df=1, р=0.029). Относительный риск составил 1.60 (95% CI=1.047-2.436). При разделении по этнической принадлежности выявлены достоверные различия по частоте аллеля Col1A1*s между больными сирингомиелией и контрольной группой здоровых доноров русской этнической принадлежности (χ2=5.77, df=1, p=0.017). Относительный риск для данной группы больных по сравнению с контролем составил 2.38 (95% CI=1.226-4.630), что позволяет рассматривать аллель Col1A1*s в качестве аллеля повышенного риска сирингомиелии у русских.In patients with syringomyelia, the Col1A1 * s allele was found on average with a frequency of 0.157, varying from 0.097 in Bashkirs to 0.258 in Russians, reaching significant differences between patients of Bashkir and Russian origin (χ 2 = 4.476, df = 1, p = 0.035). Between the patients and the control group as a whole, statistically significant differences were found in the frequency distribution of SpI alleles (1546G> T) of the Col1A1 gene polymorphism (χ 2 = 4.77, df = 1, p = 0.029). The relative risk was 1.60 (95% CI = 1.047-2.436). Ethnic separation revealed significant differences in the frequency of the Col1A1 * allele between syringomyelia patients and the control group of healthy donors of Russian ethnicity (χ 2 = 5.77, df = 1, p = 0.017). The relative risk for this group of patients compared with the control was 2.38 (95% CI = 1.226-4.630), which allows us to consider the Col1A1 * s allele as an allele of an increased risk of syringomyelia in Russians.
Таким образом, в ходе проведенного исследования установлено, что выявление аллеля Col1A1*s у лиц русской этнической принадлежности позволяет прогнозировать риск развития сирингомиелии у обследуемого.Thus, in the course of the study, it was found that the detection of the Col1A1 * s allele in persons of Russian ethnicity allows us to predict the risk of syringomyelia in the subject.
Пример 1.Example 1
Обследуемый Ф., 1975 г.р., русской этнической принадлежности, сын больного А., 1945 г.р. с установленным диагнозом сирингомиелии, смешанной формы, медленно прогрессирующего течения с поражением сегментов спинного мозга CII - DVII, умеренным верхним парапарезом по периферическому типу, пирамидной недостаточностью в ногах, гипэстезией, трофическими нарушениями в руках. Диагноз больному А. установлен клинически в 1985 году, подтвержден магниторезонансной томографией в 2005 году. На момент обследования испытуемый Ф. клинически здоров.Surveyed F., born in 1975, of Russian ethnicity, son of a patient A., born in 1945 with a diagnosis of syringomyelia, a mixed form, a slowly progressive course with damage to segments of the spinal cord CII - DVII, moderate peripheral paraparesis, pyramidal insufficiency in the legs, hypesthesia, trophic disorders in the hands. The diagnosis of patient A. was clinically established in 1985, confirmed by magnetic resonance imaging in 2005. At the time of the examination, subject F. is clinically healthy.
Учитывая отягощенный семейный анамнез, определен риск развития сирингомиелии у наблюдаемого Ф. С этой целью у него была взята из вены кровь, выделена ДНК методом фенольно-хлороформной экстракции и проведен генетический анализ полиморфизма SpI (1546G>Т) гена α1 цепи коллагена I типа (Col1A1) методом полиморфизма длины рестрикционных фрагметов.Given the burdened family history, the risk of developing syringomyelia in the observed F. was determined. For this purpose, blood was taken from a vein, DNA was extracted by phenol-chloroform extraction, and a genetic analysis of SpI (1546G> T) polymorphism of the type I collagen α1 chain gene (Col1A1 ) by the method of polymorphism of the length of restriction fragments.
Анализ показал, что обследуемый Ф. является носителем аллеля Col1A1*s. В отношении него был определен риск развития сирингомиелии, были предприняты необходимые меры профилактического характера, он был взят на диспансерный учет, даны рекомендации по наиболее подходящему образу жизни, рациональному трудоустройству.The analysis showed that the examined F. is a carrier of the Col1A1 * s allele. In relation to him, the risk of developing syringomyelia was determined, the necessary preventive measures were taken, he was taken to the dispensary, recommendations were made on the most suitable way of life, rational employment.
Claims (1)
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2007104736/15A RU2325647C1 (en) | 2007-02-08 | 2007-02-08 | Method of syringomyelia development forecast for ethnic russians |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2007104736/15A RU2325647C1 (en) | 2007-02-08 | 2007-02-08 | Method of syringomyelia development forecast for ethnic russians |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2325647C1 true RU2325647C1 (en) | 2008-05-27 |
Family
ID=39586674
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2007104736/15A RU2325647C1 (en) | 2007-02-08 | 2007-02-08 | Method of syringomyelia development forecast for ethnic russians |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2325647C1 (en) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2526189C2 (en) * | 2012-09-24 | 2014-08-20 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Башкирский государственный университет" | Method for prediction of risk of fractures |
-
2007
- 2007-02-08 RU RU2007104736/15A patent/RU2325647C1/en not_active IP Right Cessation
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| CHANG HS et al. Theoretical analysis of the pathophysiology of syringomyelia associated with adhesive arachnoiditis. J Neurol Neurosurg Psychiatry. 2004, 75(5), p.754-7, [он-лайн], [найдено 05.11.2007], найдено из Интернет: http://jnnp.bmj.com/cgi/reprint/75/5/754. BENUSLENE E et al. Strategy for prenatal diagnosis of osteogenesis imperfecta by linkage analysis to the type I collagen loci COL1A1 and COL1A2. Med Sci Monit, 2000, 6(2), p.217-226, PMID: 11208313, реф., [он-лайн], [найдено 16.11.2007], найдено из базы данных PubMed. SCHON F et al. Syringomyelia and syringobulbia following tuberculous meningitis. J Neurol., 1990, 237(2), p.122-123, PMID: 2192017, реф., [он-лайн], [найдено 16.11.2007], найдено из базы данных PubMed. HANIEH A et al. Syringomyelia in children with primary scoliosis. Childs Nerv Syst., 2000, 16(4), p.200-202, PMID: 10855515, реф., [он-лайн], [найдено 16.11.2007], найдено из базы данных PubMed. * |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2526189C2 (en) * | 2012-09-24 | 2014-08-20 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Башкирский государственный университет" | Method for prediction of risk of fractures |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US6162604A (en) | Methods for determining genetic predisposition to autoimmune diseases by genotyping apoptotic genes | |
| Weidinger et al. | Loss-of-function variations within the filaggrin gene predispose for atopic dermatitis with allergic sensitizations | |
| Kuokkanen et al. | A putative vulnerability locus to multiple sclerosis maps to 5p14–p12 in a region syntenic to the murine locus Eae2 | |
| US10450610B2 (en) | Single nucleotide polymorphisms (SNP) and association with resistance to immune tolerance induction | |
| JP5899527B2 (en) | Method for examining drug eruption risk with antiepileptic drugs based on single nucleotide polymorphism of chromosome 13 short arm 21.33 region | |
| Alharbi et al. | Screening for genetic mutations in LDLR gene with familial hypercholesterolemia patients in the Saudi population | |
| KR20130043107A (en) | Genetic marker for the diagnosis of dementia with lewy bodies | |
| RU2324937C1 (en) | Method of risk prediction of bronchial asthma | |
| US20030175755A1 (en) | Method of collecting data for estimation of susceptibility to periodontal disease | |
| RU2325647C1 (en) | Method of syringomyelia development forecast for ethnic russians | |
| Vitale et al. | DRD3 Ser9Gly variant is not associated with essential tremor in a series of Italian patients | |
| Dickerson et al. | Polymorphisms in human endogenous retrovirus K-18 and risk of type 2 diabetes in individuals with schizophrenia | |
| ES2350851T3 (en) | HUMAN GENE OF SUSCEPTIBILITY TO AUTISM CODIFYING A TRANSMEMBRANE PROTEIN AND ITS USES. | |
| DK2247752T3 (en) | FORECAST AND DIAGNOSIS OF CANINE degeneration of myelopathy | |
| Ali et al. | Association study of Klotho gene polymorphism with calcium oxalate stones in the Uyghur population of Xinjiang, China | |
| JP2008525000A (en) | Compositions and methods for treating schizophrenia and related disorders | |
| CN105969863B (en) | MMP-8 gene pleiomorphism relevant to premature labor generation and its detection method | |
| RU2304774C1 (en) | Method for predicting the development of syringomyelia | |
| Chen et al. | The gene responsible for autoimmune polyglandular syndrome type 1 maps to chromosome 21q22. 3 in US patients | |
| WO2003102227A1 (en) | Gene expression and multiple sclerosis | |
| RU2753274C1 (en) | Method for predicting risk of developing chronic true eczema in women, taking into account genetic factors | |
| RU2760786C1 (en) | Method for predicting congenital cleft lip and palate in a child when planning pregnancy in a region with ecotoxicants using genetic markers | |
| JP7570087B2 (en) | Pathogenic variant-based prostate cancer testing methods | |
| RU2786313C1 (en) | Method for predicting the weight of a newborn taking into account the polymorphic locus of hexokinase 2, differentially expressed in the placenta | |
| RU2368325C1 (en) | Method of prognosing development of type 1 sugar diabetes in populations of bashkortostan peoples |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20090209 |