RU2204603C2 - Hcv antigen polypeptide (variants), set for immune analysis, method of immune analysis, polynucleotide (variants), polynucleotide probe and set containing thereof, method of hcv detection, method for preparing hcv-free blood (variants) - Google Patents

Hcv antigen polypeptide (variants), set for immune analysis, method of immune analysis, polynucleotide (variants), polynucleotide probe and set containing thereof, method of hcv detection, method for preparing hcv-free blood (variants) Download PDF

Info

Publication number
RU2204603C2
RU2204603C2 SU4831952/13A SU4831952A RU2204603C2 RU 2204603 C2 RU2204603 C2 RU 2204603C2 SU 4831952/13 A SU4831952/13 A SU 4831952/13A SU 4831952 A SU4831952 A SU 4831952A RU 2204603 C2 RU2204603 C2 RU 2204603C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
hcv
polypeptide
sample
polynucleotide
hepatitis
Prior art date
Application number
SU4831952/13A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Майкл ХАФТОН (GB)
Майкл Хафтон
Куи-Лим ЧУ (SG)
Куи-Лим ЧУ
Джордж КЬЮО (US)
Джордж КЬЮО
Original Assignee
Чирон Корпорейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Чирон Корпорейшн filed Critical Чирон Корпорейшн
Priority to LV930442A priority Critical patent/LV10306B/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2204603C2 publication Critical patent/RU2204603C2/en

Links

Images

Landscapes

  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

FIELD: molecular biology, medicine, immunology. SUBSTANCE: by screening cDNA-libraries nucleotides sequences encoding hepatitis C virus (HCV) polypeptides eliciting antigenic properties are isolated. Invention proposes to use fragments of isolated nucleic acid sequences containing 8 nucleotides, not less, as probes for detection of HCV polynucleotides in biological material and for preparing virus nucleic acid-free blood samples. By method of recombinant DNA antigenic polypeptides of hepatitis C virus and their fragments corresponding to antigenic determinants are prepared. The use of prepared HCV antigens allows to detect the presence of antibodies raised against hepatitis C virus in biological samples and to take blood samples no containing indicated antibodies. Invention can be used in medicine, in part, in diagnosis of hepatitis C. EFFECT: improved method of detection, preparing and analysis, valuable properties. 24 cl, 49 dwg, 17 ex

Description

Текст описания в факсимильном виде (см. чертежи) Т ТТ Description text in facsimile form (see drawings) T TT

Claims (24)

1. Существенно очищенный полипептид, представляющий собой антиген вируса гепатита С (HCV), причем указанный антиген содержит аминокислоты 1-450 последовательности, приведенной на фиг. 17, или фрагмент полипептида, который представляет собой эпитоп HCV, содержащий, по крайней мере, 10 последовательно расположенных аминокислот. 1. A substantially purified polypeptide, which is a hepatitis C virus antigen (HCV), said antigen containing amino acids 1-450 of the sequence shown in FIG. 17, or a fragment of a polypeptide that is an HCV epitope containing at least 10 consecutive amino acids. 2. Полипептид по п. 1, содержащий аминокислоты, выбранные из группы: 1-50, 1-84, 9-177, 1-120, 35-45, 50-100, 40-90, 65-75, 80-90, 99-120, 95-110, 100-150, 150-200, 200-250, 220-240, 245-265, 250-300, 290-330, 290-305, 300-350, 310-330, 350-400 и 400-450. 2. The polypeptide according to claim 1, containing amino acids selected from the group: 1-50, 1-84, 9-177, 1-120, 35-45, 50-100, 40-90, 65-75, 80-90 , 99-120, 95-110, 100-150, 150-200, 200-250, 220-240, 245-265, 250-300, 290-330, 290-305, 300-350, 310-330, 350 -400 and 400-450. 3. Полипептид по п. 2, содержащий аминокислоты, выбранные из группы: 1-50, 1-84, 1-120, 35-45, 50-100, 40-90, 65-75, 80-90, 99-120, 95-110 и 100-150. 3. The polypeptide according to claim 2, containing amino acids selected from the group: 1-50, 1-84, 1-120, 35-45, 50-100, 40-90, 65-75, 80-90, 99-120 , 95-110 and 100-150. 4. Полипептид по п. 1 или 2, отличающийся тем, что он дополнительно связан с твердым субстратом. 4. The polypeptide according to claim 1 or 2, characterized in that it is additionally associated with a solid substrate. 5. Существенно очищенный полипептид, представляющий собой антиген вируса гепатита С (HCV), причем указанный антиген содержит аминокислотную последовательность, приведенную на фиг. 11, или фрагмент полипептида, который представляет собой эпитоп HCV, содержащий, по крайней мере, 10 последовательно расположенных аминокислот. 5. A substantially purified polypeptide, which is a hepatitis C virus (HCV) antigen, said antigen containing the amino acid sequence shown in FIG. 11, or a fragment of a polypeptide that is an HCV epitope containing at least 10 consecutive amino acids. 6. Полипептид по п. 5, отличающийся тем, что он дополнительно связан с твердым субстратом. 6. The polypeptide according to p. 5, characterized in that it is additionally associated with a solid substrate. 7. Существенно очищенный полипептид, представляющий собой антиген вируса гепатита С (HCV), причем указанный антиген содержит аминокислоты 2887-2955 последовательности, приведенной на фиг. 17, или фрагмент полипептида, который представляет собой эпитоп HCV, содержащий, по крайней мере, 10 последовательно расположенных аминокислот. 7. A substantially purified polypeptide, which is a hepatitis C virus antigen (HCV), said antigen containing amino acids 2887-2955 of the sequence shown in FIG. 17, or a fragment of a polypeptide that is an HCV epitope containing at least 10 consecutive amino acids. 8. Фрагмент полипептида по п. 7, содержащий аминокислоты, выбранные из группы: 2900-2950, 2910-2930 и 2925-2950. 8. A fragment of the polypeptide according to claim 7, containing amino acids selected from the group: 2900-2950, 2910-2930 and 2925-2950. 9. Полипептид по п. 7 или 8, отличающийся тем, что он дополнительно связан с твердым субстратом. 9. The polypeptide according to claim 7 or 8, characterized in that it is additionally associated with a solid substrate. 10. Выделенный полипептид, содержащий эпитоп полипротеина вируса гепатита С (HCV), характеризующийся тем, что он содержит, по крайней мере, 10 последовательно расположенных аминокислот из области от аминокислоты 450 до аминокислоты 2850 последовательности, приведенной на фиг. 17, и выбран из группы: 450-500, 475-495, 500-550, 511-690, 515-550, 550-600, 550-625, 575-605, 600-650, 600-625, 635-665, 650-700, 645-680, 700-750, 700-725, 725-775, 770-790, 750-800, 800-815, 850-875, 800-850, 920-990, 850-900, 920-945, 940-965, 950-1000, 1000-1060, 1000-1050, 1025-1040, 1075-1175, 1050-1200, 1070-1100, 1100-1130, 1195-1250, 1200-1225, 1225-1250, 1250-1300, 1260-1310, 1260-1280, 1300-1350, 1310-1340, 1345-1405, 1350-1400, 1365-1380, 1380-1405, 1400-1450, 1450-1500, 1475-1515, 1475-1500, 1500-1550, 1515-1550, 1550-1600, 1570-1590, 1595-1610, 1590-1650, 1610-1645, 1650-1690, 1685-1770, 1690-1720, 1720-1745, 1745-1770, 1750-1800, 1775-1810, 1795-1850, 1850-1900, 1900-1950, 1900-1920, 1920-1940, 1949-2124, 1950-2000, 1950-1985, 2000-2050, 2020-2045, 2045-2100, 2045-2070, 2070-2100, 2100-2150, 2150-2200, 2200-2325, 2250-2330, 2265-2280, 2280-2290, 2300-2350, 2350-2400, 2345-2415, 2345-2375, 2348-2464, 2370-2410, 2400-2450, 2400-2425, 2415-2450, 2445-2500, 2371-2502, 2500-2550, 2505-2540, 2550-2600, 2560-2580, 2600-2650, 2620-2650, 2650-2700, 2655-2670, 2670-2700, 2700-2750, 2750-2800, 2755-2780, 2780-2830, 2785-2810, 2810-2825 и 2800-2850, причем указанный полипептид не является 1266-2124, 1472-1930, 1192-1457, 1569-1805, 1950-2124, 1266-1428, 2054-2223, 1472-1630, 1678-1805, 1569-1703, 1689-1805, 1022-1136, 1916-2020, 1793-1930, 1122-1214, 1403-1483, 1688-1735, 451-2886, 626-2886, 717-2486, 451-904, 1560-1934, 819-987, 2691-2841, 2506-2658, 946-1079, 2622-2754, 626-766, 717-847, 2371-2486, 2211-2307, 2348-2464, 2796-2886 или 2287-2384. 10. An isolated polypeptide comprising an hepatitis C virus (HCV) polyprotein epitope, characterized in that it contains at least 10 consecutive amino acids from amino acid 450 to amino acid 2850 of the sequence shown in FIG. 17, and is selected from the group: 450-500, 475-495, 500-550, 511-690, 515-550, 550-600, 550-625, 575-605, 600-650, 600-625, 635-665 , 650-700, 645-680, 700-750, 700-725, 725-775, 770-790, 750-800, 800-815, 850-875, 800-850, 920-990, 850-900, 920 -945, 940-965, 950-1000, 1000-1060, 1000-1050, 1025-1040, 1075-1175, 1050-1200, 1070-1100, 1100-1130, 1195-1250, 1200-1225, 1225-1250 , 1250-1300, 1260-1310, 1260-1280, 1300-1350, 1310-1340, 1345-1405, 1350-1400, 1365-1380, 1380-1405, 1400-1450, 1450-1500, 1475-1515, 1475 -1500, 1500-1550, 1515-1550, 1550-1600, 1570-1590, 1595-1610, 1590-1650, 1610-1645, 1650-1690, 1685-1770, 1690-1720, 1720-1745, 1745-1770 , 1750-1800, 1775-1810, 1795-1850, 1850-1900, 1900-1950, 1900-1920, 1920-1940, 1949-2124, 1950-2000, 1950-1985, 2000-2050, 2020-2045, 2045 -2100, 2045-2070, 2070-2100, 2100-2150, 2150-2200, 2200-2325, 2250-2330, 2265-2280, 2280-2290, 2300-2350, 2350-2400, 2345-2415, 2345-2375 , 2348-2464, 2370-2410, 2400-2450, 2400-2425, 2415-2450, 2445-2500, 2371-2502, 2500-2550, 2505-2540, 2550-2600, 2560-2580, 2600-2650, 2620-2650, 2650-2700, 2655-2670, 2670-2700, 2700-2750, 2750-2800, 2755- 2780, 2780-2830, 2785-2810, 2810-2825 and 2800-2850, wherein said polypeptide is not 1266-2124, 1472-1930, 1192-1457, 1569-1805, 1950-2124, 1266-1428, 2054-2223 , 1472-1630, 1678-1805, 1569-1703, 1689-1805, 1022-1136, 1916-2020, 1793-1930, 1122-1214, 1403-1483, 1688-1735, 451-2886, 626-2886, 717 -2486, 451-904, 1560-1934, 819-987, 2691-2841, 2506-2658, 946-1079, 2622-2754, 626-766, 717-847, 2371-2486, 2211-2307, 2348-2464 , 2796-2886 or 2287-2384. 11. Полипептид по п. 10, отличающийся тем, что дополнительно связан с твердым субстратом. 11. The polypeptide according to p. 10, characterized in that it is additionally associated with a solid substrate. 12. Набор для иммуноанализа для обнаружения антител против HCV, содержащий полипептид или фрагмент полипептида, охарактеризованные в любом из пп. 1-11, в подходящем контейнере. 12. An immunoassay kit for detecting anti-HCV antibodies, comprising a polypeptide or polypeptide fragment, as described in any one of claims. 1-11, in a suitable container. 13. Способ иммуноанализа для обнаружения антител против вируса гепатита С (HCV), предусматривающий стадии инкубирования биологического образца, предположительно содержащего антитела против HCV, с полипептидом или фрагментом полипептида, охарактеризованными в любом из пп. 1-11, в условиях, позволяющих образовываться комплексу полипептид-антитело, с последующим обнаружением комплекса, присутствие которого свидетельствует о присутствии антител против HCV в данном образце. 13. An immunoassay method for detecting antibodies against hepatitis C virus (HCV), comprising the steps of incubating a biological sample, presumably containing antibodies against HCV, with the polypeptide or fragment of the polypeptide described in any one of paragraphs. 1-11, under conditions allowing the formation of a polypeptide-antibody complex, followed by detection of a complex, the presence of which indicates the presence of anti-HCV antibodies in this sample. 14. Иммуноанализ по п. 13, отличающийся тем, что биологический образец является кровью, сывороткой или плазмой человека. 14. The immunoassay according to claim 13, characterized in that the biological sample is human blood, serum or plasma. 15. Полинуклеотид, кодирующий антиген вируса гепатита С (HCV), имеющий нуклеотидную последовательность, соответствующую геномной последовательности HCV или последовательности кДНК, и содержащий нуклеотиды от -319 до 1348 последовательности, приведенной на фиг. 17, или фрагмент полинуклеотида, содержащий, по крайней мере, 8 последовательно расположенных нуклеотидов. 15. A polynucleotide encoding a hepatitis C virus antigen (HCV), having a nucleotide sequence corresponding to the HCV genomic sequence or cDNA sequence, and containing nucleotides from -319 to 1348 of the sequence shown in FIG. 17, or a fragment of a polynucleotide containing at least 8 consecutive nucleotides. 16. Полинуклеотид по п. 15, который представляет собой ДНК. 16. The polynucleotide of claim 15, which is DNA. 17. Полинуклеотид, кодирующий антиген вируса гепатита С (HCV), имеющий нуклеотидную последовательность, соответствующую геномной последовательности HCV или последовательности кДНК, содержащий нуклеотиды от 8659 до 8866 последовательности, приведенной на фиг. 17, или фрагмент полинуклеотида, содержащий, по крайней мере, 8 последовательно расположенных нуклеотидов. 17. A polynucleotide encoding a hepatitis C virus antigen (HCV) having a nucleotide sequence corresponding to the HCV genomic sequence or cDNA sequence containing nucleotides from 8659 to 8866 of the sequence shown in FIG. 17, or a fragment of a polynucleotide containing at least 8 consecutive nucleotides. 18. Полинуклеотид по п. 17, который представляет собой ДНК. 18. The polynucleotide of claim 17, which is DNA. 19. Полинуклеотидный зонд для обнаружения нуклеиновой кислоты HCV в образце, включающий 8 или более последовательно расположенных нуклеотидов последовательности, которая происходит из кДНК HCV и состоит из нуклеотидов от -319 до 1348 или от 8659 до 8866 последовательности, приведенной на фиг. 17. 19. A polynucleotide probe for detecting HCV nucleic acid in a sample comprising 8 or more consecutive nucleotides of a sequence that originates from HCV cDNA and consists of nucleotides from -319 to 1348 or from 8659 to 8866 of the sequence shown in FIG. 17. 20. Полинуклеотидный зонд по п. 19, являющийся меченым. 20. The polynucleotide probe according to claim 19, which is labeled. 21. Набор для анализа образцов на предмет присутствия полинуклеотидов HCV, содержащий полинуклеотидный зонд по п. 19 или 20 и подходящий носитель. 21. A kit for analyzing samples for the presence of HCV polynucleotides containing a polynucleotide probe according to claim 19 or 20 and a suitable carrier. 22. Способ обнаружения нуклеиновой кислоты HCV в образце, предусматривающий взаимодействие полинуклеотидного зонда, охарактеризованного в п. 19 или 20, с образцом, в котором предположительно содержится нуклеиновая кислота HCV, с последующим обнаружением образованного таким образом полинуклеотидного дуплекса, присутствие которого свидетельствует о присутствии нуклеиновой кислоты HCV в данном образце. 22. A method for detecting HCV nucleic acid in a sample, comprising contacting a polynucleotide probe described in 19 or 20 with a sample that is believed to contain HCV nucleic acid, followed by detection of a polynucleotide duplex thus formed, the presence of which indicates the presence of a nucleic acid HCV in this sample. 23. Способ получения крови, не содержащей антитела против HCV, предусматривающий следующие стадии: получение образца крови, в которой предполагается присутствие антител против HCV; инкубирование указанного образца с полипептидами или фрагментами полипептидов, охарактеризованными в любом из пп. 1-11, в условиях, позволяющих образовываться комплексу полипептид/фрагмент полипептида-антитело против HCV; обнаружение образованных таким образом комплексов, присутствие которых свидетельствует о содержании антител против HCV в указанном образце; консервирование крови, в образце которой не был обнаружен комплекс полипептид/фрагмент полипептида-антитело против HCV. 23. A method of obtaining blood that does not contain anti-HCV antibodies, comprising the following steps: obtaining a blood sample in which the presence of anti-HCV antibodies is suspected; incubation of the specified sample with polypeptides or fragments of polypeptides described in any one of paragraphs. 1-11, under conditions that allow the formation of a complex polypeptide / fragment of the polypeptide-antibody against HCV; detection of complexes thus formed, the presence of which indicates the content of anti-HCV antibodies in said sample; preservation of blood, in the sample of which the polypeptide / fragment of the polypeptide-antibody against HCV complex was not detected. 24. Способ получения крови, не содержащей полинуклеотиды HCV, предусматривающий следующие стадии: получение образца крови, в которой предполагается присутствие полинуклеотидов HCV; инкубирование указанного образца с полинуклеотидным зондом, охарактеризованным в п. 19 или 20, в условиях, позволяющих образовываться полинуклеотидному дуплексу между указанным зондом и любыми полинуклеотидами HCV, присутствие которых предполагается в образце; обнаружение любого образованного таким образом полинуклеотидного дуплекса, присутствие которого свидетельствует о присутствии в указанном образце полинуклеотидов HCV; и консервирование крови, в образце которой не был обнаружен полинуклеотидный дуплекс между зондом и полинуклеотидами HCV, присутствие которых предполагалось в указанном образце. 24. A method of obtaining blood that does not contain HCV polynucleotides, comprising the following steps: obtaining a blood sample in which the presence of HCV polynucleotides is expected; incubation of the specified sample with a polynucleotide probe, described in paragraph 19 or 20, under conditions that allow the formation of a polynucleotide duplex between the specified probe and any HCV polynucleotides, the presence of which is expected in the sample; detection of any polynucleotide duplex thus formed, the presence of which indicates the presence of HCV polynucleotides in said sample; and preserving blood in a sample of which a polynucleotide duplex was not detected between the probe and HCV polynucleotides, the presence of which was expected in the specified sample.
SU4831952/13A 1989-03-17 1990-03-15 Hcv antigen polypeptide (variants), set for immune analysis, method of immune analysis, polynucleotide (variants), polynucleotide probe and set containing thereof, method of hcv detection, method for preparing hcv-free blood (variants) RU2204603C2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
LV930442A LV10306B (en) 1990-03-15 1993-05-31 Nanbv diagnostics and vaccines

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US32533889A 1989-03-17 1989-03-17
US325338 2002-12-20

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2204603C2 true RU2204603C2 (en) 2003-05-20

Family

ID=23267470

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SU4831952/13A RU2204603C2 (en) 1989-03-17 1990-03-15 Hcv antigen polypeptide (variants), set for immune analysis, method of immune analysis, polynucleotide (variants), polynucleotide probe and set containing thereof, method of hcv detection, method for preparing hcv-free blood (variants)

Country Status (3)

Country Link
DD (1) DD297446A5 (en)
FI (1) FI105046B (en)
RU (1) RU2204603C2 (en)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4542016A (en) * 1981-03-27 1985-09-17 Institut Merieux Non-a non-b hepatitis surface antigen useful for the preparation of vaccines and methods of use
US4702909A (en) * 1982-05-05 1987-10-27 Louisiana State University A & M Non-A, non-B hepatitis antigen, antigen compositions, vaccine and diagnostic reagent

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4542016A (en) * 1981-03-27 1985-09-17 Institut Merieux Non-a non-b hepatitis surface antigen useful for the preparation of vaccines and methods of use
US4702909A (en) * 1982-05-05 1987-10-27 Louisiana State University A & M Non-A, non-B hepatitis antigen, antigen compositions, vaccine and diagnostic reagent

Also Published As

Publication number Publication date
DD297446A5 (en) 1992-01-09
FI981381A0 (en) 1990-03-15
FI981381A (en) 1998-06-15
FI105046B (en) 2000-05-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
McOmish et al. Geographical distribution of hepatitis C virus genotypes in blood donors: an international collaborative survey
US5847101A (en) Non-A, non-B hepatitis virus genomic cDNA and antigen polypeptide
FI83662B (en) ANTIKROPP DIAGNOSTIC OR FOERFARANDE FOER DESS FRAMSTAELLNING.
BG60348B2 (en) Nanb diagnostics - polynucleotides applicable for screening the hepatite c virus
EP0698216B2 (en) Methods of typing hepatitis c virus and reagents for use therein
Binns et al. Comparison of the spike precursor sequences of coronavirus IBV strains M41 and 6/82 with that of IBV Beaudette
JPH06508026A (en) HCV genome sequence for diagnosis and treatment
NL9002779A (en) VIRAL AGENT.
IE83867B1 (en) HCV genomic sequences for diagnostics and therapeutics
AU695259B2 (en) Hepatitis-C virus type 4, 5 and 6
Mueller-Lantzsch et al. Monospecific immunoprecipitation of murine leukemia virus polyribosomes: Identification of p30 protein-specific menssenger RNA
CA2045323C (en) Non-a, non-b hepatitis virus genomic cdna and antigen polypeptide
Apichartpiyakul et al. Analysis of hepatitis C virus isolates among healthy blood donors and drug addicts in Chiang Mai, Thailand
KR970703425A (en) Hepatitis G virus and its molecular cloning method (HEPATITIS G VIRUS AND MO-LECULAR CLONING THEREOF)
BG97435A (en) Nanbv diagnostics: polynucleotides useful for screening hepatitis c virus
CA2251260A1 (en) Escape mutant of the surface antigen of hepatitis b virus
Oroszlan et al. Amino acid sequence homology of mammalian type C RNA virus major internal proteins
KR910005888A (en) Non A, Non Hepatitis B Virus Antigen Peptides
JPH10210991A (en) Gene on diagnosis for toxoplasmosis
UA73475C2 (en) Hepatitis b virus strain, induced by vaccine, nucleic acid isolated molecule coding mutant main surface antiigen of hepatitis b virus, vector and vector system for the preparation of polypeptide, a method for the preparation of polypeptide (variants), purified polypeptide (variants), oligonucleotide, a method for the preparation of antibodies (variants), antibody (variants), a method for the determination of chemical compound for treating the infection of hepatitis b strain infection, a composition, a method for the preparation of composition, a method of organism liquids screening for hepatitis b virus, a method of antibody use, vaccine against hepatitis
RU2204603C2 (en) Hcv antigen polypeptide (variants), set for immune analysis, method of immune analysis, polynucleotide (variants), polynucleotide probe and set containing thereof, method of hcv detection, method for preparing hcv-free blood (variants)
WO1992009634A1 (en) Non-a non-b hepatitis virus antigen protein
CN113444154A (en) Polypeptide and application thereof in novel coronavirus detection and antibody or vaccine screening
Oroszlan et al. Amino acid sequences of plant and animal viral proteins
Dazza et al. Polymerase chain reaction for detection of hepatitis B virus DNA in HBsAg seronegative patients with hepatocellular carcinoma from Mozambique

Legal Events

Date Code Title Description
PD4A Correction of name of patent owner