RU2095413C1 - Method of preparing plasmid from streptomycetes - Google Patents
Method of preparing plasmid from streptomycetes Download PDFInfo
- Publication number
- RU2095413C1 RU2095413C1 RU93007528A RU93007528A RU2095413C1 RU 2095413 C1 RU2095413 C1 RU 2095413C1 RU 93007528 A RU93007528 A RU 93007528A RU 93007528 A RU93007528 A RU 93007528A RU 2095413 C1 RU2095413 C1 RU 2095413C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- plasmids
- plasmid
- streptomycetes
- mycelium
- streptomyces
- Prior art date
Links
Images
Landscapes
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Description
Изобретение относится к биотехнологии, и может быть использовано в генно-инженерных, молекулярно-биологических и микробиологических исследованиях. The invention relates to biotechnology, and can be used in genetic engineering, molecular biological and microbiological studies.
Известны способы выделения плазмид из различных видов стрептомицетов /EP, заявка 0006692 C 12 N 15/00, 1980; EP заявка 0038156, C 12 N 15/00, 1981/. Задача изобретения заключается в том, чтобы выделить новые плазмиды стрептомицетов с новыми свойствами, определить их размер, обнаружить уникальные сайты рестрикции и построить рестрикционную карту. Known methods for the isolation of plasmids from various types of streptomycetes / EP, application 0006692 C 12 N 15/00, 1980; EP application 0038156, C 12 N 15/00, 1981 /. The objective of the invention is to isolate new streptomycete plasmids with new properties, determine their size, detect unique restriction sites and construct a restriction map.
В качестве ближайшего аналога изобретение рассматривает способ получения плазмид из Streptomyces coelicolor, S. lividans и S. Parvulus/ EP, заявка 0006692, C 12 N 15/00, 1980/. Изобретение отличается от ближайшего аналога тем, что для выделения плазмид используют штамм Streptomyces chpysomallus ВКМ Ас-1355 и его белый вариант. As a closest analogue, the invention contemplates a method for producing plasmids from Streptomyces coelicolor, S. lividans and S. Parvulus / EP, application 0006692, C 12 N 15/00, 1980 /. The invention differs from the closest analogue in that a strain of Streptomyces chpysomallus VKM Ac-1355 and its white variant are used to isolate plasmids.
Сущность изобретения заключается в том, что культуры штаммов выращиваются в питательной среде, затем лизируют клетки мицелия с помощью додецилсульфата натрия (SDS) и путем центрифугирования выделяют новые плазмиды pSCH2 и pSCH3 соответственно. The essence of the invention lies in the fact that the cultures of the strains are grown in a nutrient medium, then mycelium cells are lysed with sodium dodecyl sulfate (SDS) and new plasmids pSCH2 and pSCH3 are isolated by centrifugation, respectively.
На фиг. 1 приведена рестрикционная карта плазмиды pSCH2, а на фиг. 2 - рестрикционная карта плазмиды pSCH3. In FIG. 1 shows a restriction map of the plasmid pSCH2, and FIG. 2 is a restriction map of the plasmid pSCH3.
Изобретение иллюстрируется следующим примером. The invention is illustrated by the following example.
Пример. Example.
Культуры штамма Streptomyces chrysomallus BKM
АС-1355 и его белого варианта засевают по отдельности в 100 мл стерильной среды YEME /1/ следующего состава:
дрожжевой экстракт 3 г/л
бакто-пептон 5
солодовый экстракт 3
глюкоза 10
содержащую также 34% сахарозы, 0,005 M MgCl2 и 0,5% глицина. Культивируют на качалке при интенсивном перемешивании 48 ч при 28oC.Cultures of the Streptomyces chrysomallus BKM strain
AC-1355 and its white variant are inoculated individually in 100 ml of sterile medium YEME / 1 / of the following composition:
yeast extract 3 g / l
bacto peptone 5
glucose 10
also containing 34% sucrose, 0.005 M MgCl 2 and 0.5% glycine. Cultivate on a rocking chair with vigorous stirring for 48 hours at 28 o C.
Мицелий осаждают центрифугированием при 2.000 об/мин/ затем промывают 0,3 M сахарозой. Мицелий непосредственно используют для выделения плазмид или хранят при -20oC. В основу процедуры выделения плазмид положен метод щелочного лизиса /2/. Выделение плазмид осуществляют следующим образом.The mycelium is precipitated by centrifugation at 2,000 rpm / then washed with 0.3 M sucrose. Mycelium is directly used to isolate plasmids or stored at -20 o C. The basis for the procedure for isolation of plasmids is the alkaline lysis method / 2 /. Isolation of plasmids is as follows.
1. Мицелий суспендируют в среде выделения при pH 7,4/10 мл среды на 1 г сырого мицелия/ следующего состава: 0,3 М сахароза, 25 мМ трис -HCl, 25 мМ ЭДТА, лизоцим (1 мг/мл среды)
2. Инкубируют 5-15 мин при 37oC.1. Mycelium is suspended in isolation medium at pH 7.4 / 10 ml of medium per 1 g of raw mycelium / of the following composition: 0.3 M sucrose, 25 mM Tris-HCl, 25 mM EDTA, lysozyme (1 mg / ml medium)
2. Incubate for 5-15 minutes at 37 o C.
3. Добавляют два объема щелочного раствора SDS/1% SDS, 0,2 М NaOH/ и выдерживают 10 мин при 0oC.3. Add two volumes of an alkaline solution of SDS / 1% SDS, 0.2 M NaOH / and incubated for 10 min at 0 o C.
4. Добавляют уксуснокислый натрий в количестве 1,5 первоначального объема /3М, pH, 4.8/, выдерживают 1 ч при 0oC, центрифугируют при 18000 об/мин в течение 20 мин.4. Add sodium acetate in an amount of 1.5 of the original volume / 3M, pH, 4.8 /, incubated for 1 h at 0 o C, centrifuged at 18000 rpm for 20 minutes
5. К супернатанту добавляют изопропанол в количестве 0,6 первоначального объема, выдерживают 15 мин при комнатной температуре, центрифугируют при 2500 об0/мин, в течение 20 мин, осадок высушивают и растворяют в 10 мл ТЕ-буфера /10 мМ тис-HCl, pH 7,4; 1мМ ЭДТА, pH 8,0/. 5. To the supernatant add isopropanol in an amount of 0.6 of the initial volume, stand for 15 min at room temperature, centrifuged at 2500 rpm / min, for 20 min, the precipitate is dried and dissolved in 10 ml of TE-buffer / 10 mm tis-HCl, pH 7.4; 1 mm EDTA, pH 8.0 /.
6. К раствору ДНК добавляют равный объем 4 М LiCl, выдерживают 1 ч при 0oC и центрифугируют в течение 20 мин при 2000 об/мин.6. An equal volume of 4 M LiCl is added to the DNA solution, incubated for 1 h at 0 ° C and centrifuged for 20 minutes at 2000 rpm.
7. К супернатанту добавляют 2 объема этанола, выдерживают 1 ч при 0oC, центрифугируют в течение 20 мин при 2500 об/мин, осадок высушивают и растворяют в 0,5 мл ТЕ-буфера.7. 2 volumes of ethanol are added to the supernatant, incubated for 1 h at 0 ° C, centrifuged for 20 minutes at 2500 rpm, the precipitate is dried and dissolved in 0.5 ml of TE buffer.
8. К раствору ДНК добавляют раствор РНКазы /предварительно прогретый/ до конечной концентрации 100 мкг/мл, инкубируют в течение 10 мин при 37oC.8. To the DNA solution add a solution of RNase (preheated) to a final concentration of 100 μg / ml, incubated for 10 min at 37 o C.
9. Добавляют 0,1 объема ацетата натрия и экстрагируют раствор ДНК одним объемом хлороформа /хлороформ: изоамиловый спирт, 24:1/. 9. Add 0.1 volume of sodium acetate and extract the DNA solution with one volume of chloroform / chloroform: isoamyl alcohol, 24: 1 /.
10. К раствору ДНК добавляют 2 объема этанола, выдерживают 1 ч при 0oC, центрифугируют в течение 20 мин при 2500 об/мин, осадок промывают 70-ным этанолом, высушивают и растворяют в 0,1 мл бидистиллята.10. Two volumes of ethanol are added to the DNA solution, kept for 1 h at 0 ° C, centrifuged for 20 minutes at 2500 rpm, the precipitate is washed with 70% ethanol, dried and dissolved in 0.1 ml of double distillate.
Таким образом из лизата культур Streptomyces chrysomallus BKM Ас-1355 и его белого варианта выделяют две плазмиды pSCH2 и pSCH3, имеющие соответственно размеры 13,4 и 15,1 килобаз. Thus, two plasmids pSCH2 and pSCH3, with sizes of 13.4 and 15.1 kilobases respectively, are isolated from the lysate of cultures of Streptomyces chrysomallus BKM Ac-1355 and its white variant.
Плазмиды характеризуются следующими признаками:
1. Имеют три уникальных сайта рестрикции для эндонуклеаз Pvu 11, Kpn 1, Eco 147 1 (Stu 1).Plasmids are characterized by the following features:
1. Have three unique restriction sites for the
2. Имеют по три сайта рестрикции для эндонуклеазы Bam H1. 2. Have three restriction sites for the endonuclease Bam H1.
3. Отличаются делецией в 1,7 килобаз, расположенной между сайтами рестрикации для эндонуклеаз Kpn1 и Eco 147 1. 3. They are distinguished by a deletion of 1.7 kilobases located between restriction sites for Kpn1 and Eco 147 1 endonucleases.
Источники информации:
1. Hopvood D.A. Bibb M.J. Chater K.F. et al. 1985. Genetic manipulations of Streptomyces. A laboratory manual.Information sources:
1. Hopvood DA Bibb MJ Chater KF et al. 1985. Genetic manipulations of Streptomyces. A laboratory manual.
2. Birnboim H.C. Doly 1979. A rapid al Kaline extraction procedure for screening recombination plasmid DNA. Nucleic Acid. Rec. v. 7, p. 1513.4 2. Birnboim H.C. Doly 1979. A rapid al Kaline extraction procedure for screening recombination plasmid DNA. Nucleic Acid. Rec. v. 7, p. 1513.4
Claims (1)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU93007528A RU2095413C1 (en) | 1993-02-08 | 1993-02-08 | Method of preparing plasmid from streptomycetes |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU93007528A RU2095413C1 (en) | 1993-02-08 | 1993-02-08 | Method of preparing plasmid from streptomycetes |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU93007528A RU93007528A (en) | 1996-01-27 |
RU2095413C1 true RU2095413C1 (en) | 1997-11-10 |
Family
ID=20136961
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU93007528A RU2095413C1 (en) | 1993-02-08 | 1993-02-08 | Method of preparing plasmid from streptomycetes |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2095413C1 (en) |
-
1993
- 1993-02-08 RU RU93007528A patent/RU2095413C1/en active
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Заявка ЕПВ N 0006692, кл. C 12 N 15/00, 1980. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US4273875A (en) | Plasmid and process of isolating same | |
JPH0239889A (en) | Macloride biosynthetic gene for use in streptomyces and other organisms | |
US4332900A (en) | Construction of co-integrate plasmids from plasmids of Streptomyces and Escherichia | |
US4338400A (en) | Co-integrate plasmids and their construction from plasmids of Escherichia and Streptomyces | |
US4340674A (en) | Cointegrate plasmids and their construction from plasmids of Escherichia and Streptomyces | |
EP0118367B1 (en) | Recombinant dna cloning vector pve1, deletion and hybrid mutants, and recombinant derivatives thereof, products and processes | |
CA1150169A (en) | Broad host range small plasmid rings as cloning vehicles | |
US4806480A (en) | Novel E. coli hybrid plasmid vector conferring sucrose fermenting capacity | |
Kataoka et al. | Five genes involved in self-transmission of pSN22, a Streptomyces plasmid | |
Schupp et al. | Protoplast preparation and regeneration in Nocardia mediterranei | |
Lin et al. | Transposon Tn916 mutagenesis in Clostridium botulinum | |
US4703009A (en) | RDNA cloning vector pVE1, deletion and hybrid mutants and recombinant derivatives thereof products and processes | |
EP0213898B1 (en) | A host-vector system | |
HU197354B (en) | Process for selecting streptomyces containing recombinant dna | |
RU2095413C1 (en) | Method of preparing plasmid from streptomycetes | |
US5665564A (en) | Isolation and characterisation of genes resistant to anthracycline antibiotics | |
EP0035914A2 (en) | Plasmid vectors, plasmids and their preparation, and cloning processes using them | |
US4401761A (en) | Process for stabilizing plasmids by deletion of DNA | |
EP0038156A2 (en) | A plasmid and its microbiological preparation | |
US4478937A (en) | Plasmid and production thereof | |
GB2045253A (en) | A plasmid and its microbiological preparation | |
AU610411B2 (en) | Isolation and characterisation of genes resistant to anthracycline antibiotics | |
EP0138337A1 (en) | Plasmids and their preparation and use, and protoplast-regenerated microorganisms containing such plasmids | |
GB2046272A (en) | A novel plasmid and its microbiological preparation | |
JPS5921389A (en) | Clonned streptomyces bacteria gene |