RU2057809C1 - Method of preparing factor stimulating granulocyte colony formation - Google Patents

Method of preparing factor stimulating granulocyte colony formation Download PDF

Info

Publication number
RU2057809C1
RU2057809C1 SU864028325A SU4028325A RU2057809C1 RU 2057809 C1 RU2057809 C1 RU 2057809C1 SU 864028325 A SU864028325 A SU 864028325A SU 4028325 A SU4028325 A SU 4028325A RU 2057809 C1 RU2057809 C1 RU 2057809C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
mmol
dna
csf
fragment
cells
Prior art date
Application number
SU864028325A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Ямазаки Тацуми
Нагата Сигеказу
Цутия Масаюки
Хирата Юичи
Ямамото Осами
Секимори Ясуо
Original Assignee
Чугай Сейяку Кабусики Кайся
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from JP60269455A external-priority patent/JPS62129298A/en
Priority claimed from JP60270838A external-priority patent/JPH06102021B2/en
Application filed by Чугай Сейяку Кабусики Кайся filed Critical Чугай Сейяку Кабусики Кайся
Application granted granted Critical
Publication of RU2057809C1 publication Critical patent/RU2057809C1/en

Links

Images

Landscapes

  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

FIELD: biotechnology. SUBSTANCE: method involves the preparing polypeptide or glycoproteide showing activity of human factor that stimulates the formation of granulocyte colonies. Method involves the preparing double-stranded cDNA which is complementary to messenger RNA (mRNA) encoding polypeptide indicated above and human chromosomal gene encoding polypeptide that shows factor activity stimulating granulocyte colony formation, gene insertion into vector, transformation of prepared recombinant DNA of recipient cells, isolation and purification of the end product. EFFECT: improved method of stimulating factor preparing. 40 dwg, 17 tbl

Description

Изобретение относится к способу получения полипептида или гликопротеина, обладающих активностью фактора стимулирования образования колоний гранулоцитов G-CSF с использованием технологии рекомбинантных молекул ДНК. The invention relates to a method for producing a polypeptide or glycoprotein having G-CSF granulocyte colony stimulating factor activity using recombinant DNA molecule technology.

Биологическим действием G-СSF, является их способность вызывать дифференциацию лейкемических клеток костного мозга и усиливать функции зрелых гранулоцитов, вследствие чего их использование в области лечения и предотвращения лейкемии является многообещающим. Предприняты попытки изолировать и очистить G-СSF из надосадочной жидкости клеточной культуры, но гомогенный G-СSF не был получен в больших количествах, поскольку продуцируется в низкой концентрации и после процедуры очистки получается в "следовых" количества из большого объема культуральной жидкости. The biological effect of G-CSF is their ability to differentiate leukemic bone marrow cells and enhance the function of mature granulocytes, which is why their use in the treatment and prevention of leukemia is promising. Attempts have been made to isolate and purify G-CSF from the cell culture supernatant, but homogeneous G-CSF was not obtained in large quantities because it is produced in a low concentration and after the purification procedure it is obtained in "trace" amounts from a large volume of the culture fluid.

На фиг.1 представлены последовательности различных зондов, IWQ, А и LC; на фиг.2 нуклеотидная последовательность вставки pHCS-1; на фиг. 3-5 нуклеотидная последовательность вставки КДНК в pBRG4; на фиг.6 аминокислотная последовательность предшественника человеческого Г-КСФ, выведенная на рBRG4 КДНК; на фиг.7 аминокислотная последовательность человеческого Г-КСФ, выведенная из рBRG4 КДНК; на фиг. 8-10 нуклеотидная последовательность вставки КДНК в рBRV2; на фиг.11 аминокислотная последовательность предшественника человеческого Г-КСФ, выведенная из pBRV2 КДНК, на фиг.12 аминокислотная последовательность человеческого Г-КСФ, выведенная из pBRV2 КДНК; на фиг.13-17 нуклеотидная последовательность человеческого хромосомного гена, кодирующего Г-КСФ; на фиг.18 сайты расщепления растриктазой pBRG4 или PBRV2 КДНК человеческого Г-КСФ; на фиг. 19 сайты расщепления растриктазой человеческого хромосомного гена, кодирующего Г-КСФ; на фиг.20 частично способ получения tac-промотор-содержащего вектора (+ VSЕ линия); на фиг.21-22 способ получения PL-промотор-содержащего вектора (+VSE линия); на фиг.23 cпособ получения trp промотор-содержащего вектора (+VSE линия); на фиг.24 частично способ получения tac-промотор-содержащего вектора (VSE линия); на фиг. 25-26 способ получения PL-промоторсодержащего вектора (-VSЕ линия), на фиг.27 способ получения trp промотор-содержащего вектора (-VSЕ линия); на фиг.28 cхематически структура рНGA410; на фиг.29 способы конструирования рекомбинантных векторов экспрессии рТN-G4, pТN-G4VAα и рТN-G4VA β на фиг.30-31 два способа конструирования рН GG4-dhfr; на фиг.32 способы конструирования pG4DR1 и pGDR2; на фиг.33 схематически структура рН GV2; на фиг.34 способы конструирования рекомбинантных векторов экспрессии рТN-V2, рТN-VAα и рТN-VAβ на фиг. 35-36 два способа конструирования рекомбинантного вектора экспрессии рНGV2-dhfr; на фиг. 37 cпособы конструирования рV2DR1 и pV2DR 2; на фиг.38 схематически структура pML СЕЗ α; на фиг.39 схематически структура pТN CEЗ α; на фиг.40 cхематически по структуры pD26SVCEЗα и pDRCEЗ α.Figure 1 presents the sequence of various probes, IWQ, A and LC; 2, the nucleotide sequence of the pHCS-1 insert; in FIG. 3-5 nucleotide sequence of cDNA insertion into pBRG4; Fig.6 amino acid sequence of the precursor of human G-CSF, displayed on pBRG4 cDNA; 7, the amino acid sequence of human G-CSF derived from pBRG4 cDNA; in FIG. 8-10 nucleotide sequence of the insertion of cDNA into pBRV2; in Fig.11 the amino acid sequence of the precursor of human G-CSF derived from pBRV2 cDNA, Fig.12 amino acid sequence of the human G-CSF derived from pBRV2 cDNA; 13-17, the nucleotide sequence of a human chromosomal gene encoding G-CSF; on Fig sites of cleavage by rastrictase pBRG4 or PBRV2 cDNA of human G-CSF; in FIG. 19 restriction enzyme cleavage sites of the human chromosomal gene encoding G-CSF; on Fig partially a method for producing a tac-promoter-containing vector (+ VSE line); on Fig.21-22 a method of obtaining a P L -promoter-containing vector (+ VSE line); on Fig the method of obtaining t rp promoter-containing vector (+ VSE line); on Fig partially a method for producing a tac-promoter-containing vector (VSE line); in FIG. 25-26 a method for producing a P L promoter-containing vector (-VSE line), FIG. 27 a method for producing a t rp promoter-containing vector (-VSE line); on Fig schematically the structure of the pHGA410; on Fig methods of constructing recombinant expression vectors pTN-G4, pTN-G4VAα and pTN-G4VA β in Fig.30-31 two methods of constructing pH GG4-dhfr; on Fig methods for constructing pG4DR1 and pGDR2; on Fig schematically the pH structure of GV2; on Fig methods of constructing recombinant expression vectors pTN-V2, pTN-VAα and pTN-VAβ in Fig. 35-36 two methods for constructing a recombinant pHGV2-dhfr expression vector; in FIG. 37 methods of constructing pV2DR1 and pV2DR 2; on Fig schematically the structure of the pML CEZ α; on Fig schematically the structure of pTN CEZ α; on Fig schematically in the structure of pD26SVCEЗα and pDRCEЗ α.

Ген, кодирующий полипептид, обладающий активностью человеческого Г-КСФ (G-CSF), представляет собой ДНК (КДНК), которая является комплементарной и информационной РНК (ИРНК), которую получают в виде фракций 15-17S путем ценрифугирования в градиенте плотности сахарозы и которая кодируют полипептид, обладающий активностью человеческого Г-КСФ. A gene encoding a polypeptide having human G-CSF activity (G-CSF) is DNA (cDNA), which is complementary and messenger RNA (mRNA), which is obtained as fractions 15-17S by centrifugation in a sucrose density gradient and which encode a polypeptide having human G-CSF activity.

Получили две линии КДНК. Got two lines of cDNA.

КДНК одной линии содержит полную последовательность или часть гена, кодирующего полипептид I или II (фиг.6 и 7). Более конкретно, эта КДНК имеет нуклеотидную последовательность, идущую от АТГ в нуклеотидных положениях 32-34, отсчитываемых от 5'-конца (фиг.3-5), до ЦЦЦ в положениях нуклеотидов 650-652, либо от АЦЦ в положениях 122-124 до ЦЦЦ в положениях 650-652. Альтернативно КДНК имеет нуклеотидную последовательность или ее часть, КДНК этой линии здесь ниже называют КДНК (+VSЕ). A single line cDNA contains the complete sequence or part of a gene encoding a polypeptide I or II (FIGS. 6 and 7). More specifically, this cDNA has a nucleotide sequence extending from ATG at nucleotide positions 32-34, measured from the 5'-end (Figs. 3-5), to CCC at positions of nucleotides 650-652, or from ACC at positions 122-124 to the CCC in the provisions of 650-652. Alternatively, the cDNA has a nucleotide sequence or part thereof, the cDNA of this line is hereinafter called cDNA (+ VSE).

КДНК другой линии имеет весь или часть гена, кодирующего полипептид I или II, показанный на фиг. 6-7. Более конкретно, эта КДНК имеет нуклеотидную последовательность, идущую от АТГ в нуклеотидных положениях 31-33, отсчитываемых от 5' конца [см.фиг. 8-10] до ЦЦЦ и нуклеотидных положениях 640-642, либо от АЦЦ в положениях 121-123 до ЦЦЦ в положениях 640-642. Альтернативно КДНК может иметь нуклеотидную последовательность, показанную на фиг. 8-10, или ее часть КДНК этой линии здесь ниже называют КДНК (-VSЕ). Another line cDNA has all or part of the gene encoding the polypeptide I or II shown in FIG. 6-7. More specifically, this cDNA has a nucleotide sequence extending from ATG at nucleotide positions 31-33, counted from the 5 'end [see FIG. 8-10] to the CCC and the nucleotide positions 640-642, or from the ACC at positions 121-123 to the CCC at positions 640-642. Alternatively, the cDNA may have the nucleotide sequence shown in FIG. 8-10, or part of the cDNA of this line, hereinafter referred to as cDNA (-VSE).

Описанный выше ген можно получить следующими способами: сначала получают ИРНК, кодирующую Г-КСФ, из клеток млекопитающего животного или из других клеток хозяина, обладающих способностью продуцировать полипептид, имеющий активность Г-КСФ, затем ИРНК превращают в двухнитиевую КДНК любым известным способом; полученную библиотекой КДНК затем подвергают направленному отбору известными способами. The gene described above can be obtained in the following ways: first, mRNA encoding G-CSF is obtained from mammalian animal cells or from other host cells capable of producing a polypeptide having G-CSF activity, then the mRNA is converted into a double-stranded cDNA by any known method; obtained by the cDNA library is then subjected to directional selection by known methods.

Ген по настоящему изобретению также включает человеческий хромосомный ген, кодирующий полипептид, обладающий активностью Г-КСФ. Этот ген содержит всю или часть нуклеотидной последовательности, показанной на фиг. 13-17. The gene of the present invention also includes a human chromosomal gene encoding a polypeptide having G-CSF activity. This gene contains all or part of the nucleotide sequence shown in FIG. 13-17.

Человеческий хромосомный ген можно получить из любого типа человеческих клеток, таких, как клетки, экстрагированные из печени или из почек, либо из малигнизированных клеток. Библиотеку человеческого хромосомного гена можно получить из человеческих клеток любым из известных способов [см. Maniatis et all, Cell, 15, 687(1978); and Manidtis et al. Molecular Cloning, Сold Spring Harbor Laboratory, р. 269, ff. (1982)] который проиллюстрирован ниже:
экстрагируют человеческую хромосомную ДНК из таких источников, как печень эмбриона человека, фенолом или другими подходящими реактивами, частично или полностью переваривают экстрагированную ДНК подходящей рестриктазой, чтобы получить фрагмент ДНК подходящей длины, вставляют фрагмент ДНК в векторный фрагмент ДНК λ -фага с помощью Т4 ДНК-лигазы или других подходящих лигаз, при необязательном присоединении линкера, содержащего ограничительный сайт для подходящего фермента, такого, как ЕсоRI, затем получают частицы λ -фага способом укладки in vitro и трансформируют клетки хозяина, такого, как Е.coli, c помощью полученных частиц λ -фага.
The human chromosomal gene can be obtained from any type of human cells, such as cells extracted from the liver or from the kidneys, or from malignant cells. A library of the human chromosomal gene can be obtained from human cells by any of the known methods [see Maniatis et all, Cell, 15, 687 (1978); and Manidtis et al. Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory, p. 269, ff. (1982)] which is illustrated below:
human chromosomal DNA is extracted from sources such as the liver of a human embryo, phenol or other suitable reagents, the extracted DNA is partially or completely digested with a suitable restriction enzyme to obtain a DNA fragment of suitable length, the DNA fragment is inserted into the vector fragment of the λ-phage DNA using T4 DNA- ligase or other suitable ligase, optionally connecting a linker containing a restriction site for a suitable enzyme, such as EcoRI, then receive particles of λ-phage by laying in vitro and transform host cells, such as E. coli, using the resulting particles of λ-phage.

Примеры λ -фага, который можно использовать в качестве вектора в указанных способах, включают Charon 4А и ЕMBL-3 и ЕMBL-4. Examples of λ phage that can be used as a vector in these methods include Charon 4A and EMBL-3 and EMBL-4.

Клетка млекопитающего, которую можно использовать в качестве источника ИРНК, представляет собой штамм клеток, например выведенный из клеток рака ротовой полости человека, СНU-2 депонированный в Национальной коллекции культур микроорганизмов или C.N.С.M. под инвентарным номером I-483). Получение и РНК можно осуществить одним из способов, которые уже были предложены для клонирования генов ряда других физиологически активных протеинов: например, всю РНК получают сначала путем обработок поверхностно-активным веществом и фенолом в присутствии рибонуклеозного ингибитора такого, как комплекс ванадила рибонуклеозида [см. Berger аnd Birkenmeier, Biochemistry, 18- 5143(1979)] или центрифугированием в градиенте плотности CsCl с последующей обработкой гуанидинтиоцианатом [см. Chirgwin et al. Biochemistry, 18,5294(1979)] затем получают поли(A+) РНК(ИРНК), подвергая всю РНК периодической адсорбционной или аффинной хроматографии на колонке олиго (dТ) целлюлозы или на поли-U-cефарозе, при использовании сефарозы 2В в качестве носителя. Поли(А+) РНК можно далее фракционировать подходящим способом, таким, как центрифугирование в градиенте плотности сахарозы. Способность полученной таким образом иРНК кодировать полипептид, обладающий активностью Г-КСФ, можно подтвердить с помощью ряда способов: например, ИРНК транслируют в протеин и проверяют его физиологические активности, альтернативно, определяют подлинность этого протеина с помощью антитела анти-Г-КСФ. Более конкретно, иРНК вводят в овоциты Хenopus Laevis для осуществления трансляции [см. Gurdon et al. Nature, 233, 177(1972)] либо можно провести трансляционные реакции с ретикулоцитами кролика или с зародышами пшеницы [Schleif and Wensink, "Practical Methods in Molecular Biology". Springer-Verlag, NY (1981)] Активность Г-КСФ можно попытать, применяя, применяя способ культивирования на мягком агаре с использованием клеток костного мозга, и методика проведения этого способа уже описана [Metcalf, "Hemopoietic Colonies", Springer-Verlag, Berlin, Неidelberg, NY 1977)]
Однонитевую КДНК синтезируют с помощью полученной таким образом иРНК, которую используют в качестве матрицы, затем из этой однонитевой КДНК синтезируют двухнитевую КДНК и двухнитевую КДНК вставляют в подходящий вектор ДНК, чтобы получить рекомбинантную плазмиду. Эту рекомбинантную плазмиду можно использовать для трансформации подходящего хозяина, скажем Еscherichia coli, с тем, чтобы получить библиотеку КДНК.
A mammalian cell that can be used as a source of mRNA is a strain of cells, for example, derived from human oral cancer cells, CHU-2 deposited in the National Collection of Microorganism Cultures or CN.M. under inventory number I-483). Obtaining and RNA can be carried out in one of the ways that have already been proposed for cloning the genes of a number of other physiologically active proteins: for example, all RNA is obtained first by treatment with a surfactant and phenol in the presence of a ribonucleoside inhibitor such as a vanadyl ribonucleoside complex [see Berger and Birkenmeier, Biochemistry, 18-5143 (1979)] or by centrifugation in a density gradient of CsCl followed by treatment with guanidine thiocyanate [see Chirgwin et al. Biochemistry, 18.5294 (1979)] then produce poly (A + ) RNA (IRNA) by subjecting all RNA to periodic adsorption or affinity chromatography on an oligo (dT) cellulose column or on poly-U-sepharose using Sepharose 2B as carrier. Poly (A + ) RNA can be further fractionated by a suitable method, such as centrifugation in a sucrose density gradient. The ability of the mRNA thus obtained to encode a polypeptide having G-CSF activity can be confirmed by a number of methods: for example, the mRNA is translated into a protein and its physiological activity is checked, alternatively, the authenticity of this protein is determined using an anti-G-CSF antibody. More specifically, mRNA is introduced into xenopus Laevis oocytes for translation [see Gurdon et al. Nature, 233, 177 (1972)] or it is possible to carry out translational reactions with rabbit reticulocytes or with wheat germ [Schleif and Wensink, "Practical Methods in Molecular Biology". Springer-Verlag, NY (1981)] G-CSF activity can be tried using a soft-agar culture method using bone marrow cells, and the methodology has already been described [Metcalf, "Hemopoietic Colonies", Springer-Verlag, Berlin , Neidelberg, NY 1977)]
Single-stranded cDNA is synthesized using the mRNA thus obtained, which is used as a template, then double-stranded cDNA is synthesized from this single-stranded cDNA and double-stranded cDNA is inserted into a suitable DNA vector to obtain a recombinant plasmid. This recombinant plasmid can be used to transform a suitable host, say Escherichia coli, in order to obtain a cDNA library.

Двухнитевую КДНК получить из иРНК одним из следующих двух способов: иРНК обрабатывают обратной транскриптазой с олиго(dТ), который является комплементарным к поли-(А)-цепи на 3' -конце, используемом в качестве затравки, либо синтезируют олигонуклеотид, который соответствует части аминокислотной последовательности протеина Г-КСФ, и синтезируют КДНК, которая является комплементарной к ИРНК, путем обработки обратной скриптазой, причем используют в качестве затравки синтезированный олигонуклеотид. Двухнитевую КДНК можно также получить следующими способами: иРНК разлагают и удаляют путем обработки щелочью, и полученную однонитевую КДНК обрабатывают сначала реверстранскриптазой или ДНК-полимеразой I (например, фрагментном Кленоу(Klenow), затем S1 нуклеазой, альтернативно ИРНК можно непосредственно обработать РН-азой Н и ДНК-полимеразой (например, Е. сoli полимеразой I). Для более подробной информации см. Maniatis et al. "Molecular Clonig", Сold Spring Harbor Laboramory (1982); и Gubler and Нoffman, Gene, 25, 263 (1983). A double-stranded cDNA can be obtained from mRNA in one of the following two ways: mRNA is processed by reverse transcriptase with oligo (dT), which is complementary to the poly (A) chain at the 3 'end, used as a seed, or an oligonucleotide that corresponds to part the amino acid sequence of the protein G-CSF, and cDNA is synthesized, which is complementary to mRNA, by reverse scripting, and the synthesized oligonucleotide is used as seed. Double-stranded cDNA can also be obtained in the following ways: mRNA is decomposed and removed by treatment with alkali, and the obtained single-stranded cDNA is treated first with reverstranscriptase or DNA polymerase I (for example, fragment Klenow), then S1 nuclease, alternatively, mRNA can be directly treated with RNase H and DNA polymerase (e.g., E. coli polymerase I). For more information see Maniatis et al. "Molecular Clonig", Spring Harbor Laboramory (1982); and Gubler and Hoffman, Gene, 25, 263 (1983) .

Полученную таким образом двухнитевую КДНК вставляют в подходящий вектор, в такой, как например, один из плазмидных векторов ЕК-типа, типичными представителями которого являются pS CIOI, рDF 41, Сol Е1, рMB9, pBR322, pBR327 и рАСYC1, либо один из фаговых векторов, типичными примерами которых являются λgt, λc, λgt 10 и λgtWЕS, а после этого рекомбинантный вектор используют для трансформации штамма Е.coli (например, Х1776, НB101, ДН1 или С600) с тем, чтобы получить библиотеку сДНК (см.например, "Molecular Cloning", выше). The double-stranded cDNA thus obtained is inserted into a suitable vector, such as, for example, one of the EC-type plasmid vectors, typical representatives of which are pS CIOI, pDF 41, Sol E1, pMB9, pBR322, pBR327 and pACYC1, or one of the phage vectors typical examples of which are λgt, λc, λgt 10 and λgtWES, and then a recombinant vector is used to transform the E. coli strain (e.g., X1776, HB101, DN1 or C600) in order to obtain a cDNA library (see, for example, " Molecular Cloning ", above).

Двухнитевую КДНК можно присоединить к вектору следующими способами: конец КДНК снабжают присоединяемым концом путем прикрепления подходящего синтезированного химическим способом фрагмента ДНК, и вектор ДНК, который был отщеплен рестриктазой, присоединяют к указанной КДНК посредством обработки ДНК-лигазы фаза Т4 в присутствии АТФ. Альтернативно прикрепляют звенья dC, dG (или dТ, dА-звенья) соответственно двухнитевой сДНК и к вектору ДНК, который расщепляют рестриктазой, и подвергают ренетурации раствор, содержащий оба вида ДНК (см.выше "Molecular Cloning"). A double-stranded cDNA can be attached to a vector in the following ways: the end of the cDNA is provided with a attachable end by attaching a suitable chemically synthesized DNA fragment, and the DNA vector that has been cleaved with restriction enzyme is attached to the cDNA by treatment of T4 phase DNA ligase in the presence of ATP. Alternatively, the dC, dG units (or dT, dA units) of the double-stranded cDNA, respectively, are attached to the DNA vector that is digested with restrictase and the solution containing both types of DNA is renatured (see above "Molecular Cloning").

Клетку хозяина можно трансформировать полученной таким образом рекомбинантной ДНК любым из известных способов. Если клеткой хозяином является Е.Coli, то можно использовать способ, разработанный Нanahan [J. Mol. Biol. 166, 557(1983)] где рекомбинантную ДНК добавляют к компетентной клетке, полученной в присутствии CaCl2, MgCl2 или RbCl.The host cell can be transformed with the recombinant DNA thus obtained by any of the known methods. If the host cell is E. coli, then the method developed by Hanahan [J. Mol. Biol. 166, 557 (1983)] where recombinant DNA is added to a competent cell obtained in the presence of CaCl 2 , MgCl 2 or RbCl.

Направленный отбор клеток, несущих нужный ген, можно осуществить с помощью ряда способов, которые включают: плюс-минус способ, используемый при клонировании КДНК интерферона [Тaniguchi et al. Proc. Jpn. Асаd. 55, сер. В. 464 (1979)] способ анализа гибридизации трансляции [Nagata et al. Nature, 284, 316(1980)] и способ гибридизации колонии или пятна с использованием олигонуклеотидного зонда, синтезированного химическим образом на основе аминокислотной последовательности белка, обладающего активностью человеческого Г-КСФ [Wallace et al. Nucleic Acids Res. 9, 879(1981); и Benton Davis, Science, 196, 180(1977). Directed selection of cells carrying the desired gene can be carried out using a number of methods, which include: plus or minus the method used for cloning interferon cDNA [Taniguchi et al. Proc. Jpn. Acad. 55, ser. B. 464 (1979)] a method for translational hybridization analysis [Nagata et al. Nature, 284, 316 (1980)] and a method for hybridizing a colony or spot using an oligonucleotide probe chemically synthesized based on the amino acid sequence of a protein having human G-CSF activity [Wallace et al. Nucleic Acids Res. 9, 879 (1981); and Benton Davis, Science, 196, 180 (1977).

Фрагмент, включающий клонируемый таким образом ген, кодирующий полипептид, обладающий активностью человеческого Г-КСФ, встраивали в подходящий вектор ДНК с целью трансформации других прокариотических или эукариотических клеток хозяина (Proc. Natl. Acad. Sei, USA82, July 1985, рр 4360-4364) (прототип). A fragment comprising a gene thus cloned encoding a polypeptide having human G-CSF activity was inserted into a suitable DNA vector to transform other prokaryotic or eukaryotic host cells (Proc. Natl. Acad. Sei, USA82, July 1985, pp 4360-4364 ) (prototype).

Е. сoli можно трансформировать рBR 322, которая представляет собой вектор, способный к репликации в Е. соli [см. Bolivar, Gene, 2, 95 (1975)] Этот вектор содержит гены, резистентные как к ампициллину, так и к тетрациклину, и любое из свойств можно использовать для идентификации трансформированных клеток. Примеры промотора, который нужен для генетической экспрессии в прокариотных хозяевах, включают промотор β -лактамазного гена [Сhang et al. Nature, 275, 615 (1978)] лактозный промотор [см. Goeddel et al. Nature 281, стр. 544(1979)] и триптофанный промотор [см. Goeddel et al. Nucleic Acid Res. 8, 4057 (1980)] и т.д. E. coli can be transformed with pBR 322, which is a vector capable of replication in E. coli [see Bolivar, Gene, 2, 95 (1975)] This vector contains genes that are resistant to both ampicillin and tetracycline, and any of the properties can be used to identify transformed cells. Examples of the promoter that is needed for genetic expression in prokaryotic hosts include the promoter of the β-lactamase gene [Chang et al. Nature, 275, 615 (1978)] lactose promoter [see Goeddel et al. Nature 281, p. 544 (1979)] and tryptophan promoter [see Goeddel et al. Nucleic Acid Res. 8, 4057 (1980)], etc.

Любой из этих промоторов можно использовать при получении полипептида, обладающего активностью человеческого Г-КСФ, по настоящему изобретению. Any of these promoters can be used in the preparation of a polypeptide having human G-CSF activity of the present invention.

Эукариотический микроорганизм, такой как Saccharomусеs сerevisiae, можно трансформировать вектором, таким как плазмида YRp7 [см. Stinchcomb et al. Nature, 282, 39, (1979)] Эта плазмида имеет ген ТКP1 в качестве селекционного маркера для дрожжевых штаммов, лишенных способности продуцировать триптофан, поэтому трансформанты можно отобрать путем выращивания в отсутствии триптофана. Примеры промотора, который можно использовать для экспрессии гена, включают кислый фосфатазный промотор гена [Miyanohara et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 80,1 (1983)] и алкокгольдегидрогеназный промотор гена [Valenzuela et al. Nature, 298, 347 (1982)]
Для трансформации клеток млекопитающих, таких как клетки СOS, клетки яичника китайского хомяка (СНО), клетки С-127 и клетки Hela можно использовать, например pSV2-gpt [см. Milligan and Berg; Proc. Natl. Асаd. Sci. USA, 78, 2072(1981)] Векторы, используемые для трансформации этих клеток, содержат сайт инициации, селективный маркер, промотор, положение которого предшествует положение экспрессуемого гена, сигнал полиаденилирования и т.д. Для экспрессии гена в клетках млекопитающих можно использовать промоторы ретровируса, вируса полиомы, аденовируса, обезьяньего вируса 40 (SV 40) и т.д. Если используют промотор SV 40, то нужную экспрессию гена можно легко осуществить по способу Маллигана с сотр. (Mulligan et al. описанному в Nature, 277,108(1979).
A eukaryotic microorganism, such as Saccharomyces cerevisiae, can be transformed with a vector such as the plasmid YRp7 [see Stinchcomb et al. Nature, 282, 39, (1979)] This plasmid has the TKP1 gene as a selection marker for yeast strains lacking the ability to produce tryptophan, so transformants can be selected by growing in the absence of tryptophan. Examples of a promoter that can be used to express a gene include an acidic phosphatase gene promoter [Miyanohara et al. Proc. Natl. Acad Sci. USA, 80.1 (1983)] and alkkholdehydrogenase gene promoter [Valenzuela et al. Nature, 298, 347 (1982)]
For transformation of mammalian cells, such as COS cells, Chinese hamster ovary cells (CHO), C-127 cells and Hela cells, for example, pSV2-gpt can be used [see Milligan and Berg; Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 78, 2072 (1981)] The vectors used to transform these cells contain an initiation site, a selectable marker, a promoter whose position is preceded by the position of the expressed gene, a polyadenylation signal, etc. For gene expression in mammalian cells, promoters of retrovirus, polyoma virus, adenovirus, monkey virus 40 (SV 40), etc. can be used. If the SV 40 promoter is used, then the desired gene expression can be easily carried out according to the method of Mulligan et al. (Mulligan et al. Described in Nature, 277.108 (1979).

Сайты инициацини, которые можно использовать, получают из SV 40, полиомного вируса, аденовируса, вируса бычьей папилломы (BPV) и т.д. Используемые селективные маркеры включают ген фосфортрансферазы (АРН (3') II или I, ген тимидинкиназы, ген Е.coli хanthine гуанинфосфорибозилтрансферазы (Ecogpt), ген дигидрофолатредуктазы (DHFR) и т.д. The initiation sites that can be used are derived from SV 40, polio virus, adenovirus, bovine papilloma virus (BPV), etc. Selective markers used include the phosphorotransferase (ARN (3 ') II or I gene, thymidine kinase gene, E. coli xanthine guanine phosphoribosyltransferase gene (Ecogpt), dihydrofolate reductase gene (DHFR), etc.

Эукаристические гены обычно проявляют полиморфизм, как это известно для гена человеческого интерферона [см. Nishi et al. J. Biochem. 97,153 (1985)] при этом либо изменение в нуклеотидной последовательности не приводит к какому-либо изменению в аминокислотной последовательности, либо изменения в аминокислотной последовательности не затрагивают функциональную активность белка. Eukaristic genes usually exhibit polymorphism, as is known for the human interferon gene [see Nishi et al. J. Biochem. 97,153 (1985)] wherein either a change in the nucleotide sequence does not lead to any change in the amino acid sequence, or changes in the amino acid sequence do not affect the functional activity of the protein.

Активностью Г-ГКС также может обладать полипептид с делецией, добавлением или замещением одной или более аминокислот в последовательности, показанной на фиг.6, 7 и 11 и 19. The activity of G-GCS may also have a polypeptide with a deletion, addition or substitution of one or more amino acids in the sequence shown in Fig.6, 7 and 11 and 19.

Ниже описан способ получения фактора в соответствии с изобретением. The following describes a method for producing a factor in accordance with the invention.

(I) Получение зонда. (I) Obtaining a probe.

Гомогенный протеин человеческого КСФ получали очисткой из поверхностного слоя культуры опухолевых клеток линии CНU-2 и определили ее аминокислотную последовательность от N-типа. Фрагменты получили путем разложения бромоцианом и обработкой трипсином, и аминокислотные последовательности этих фрагментов также были определены [пример 3(I), (II) и (III)]
На основании определенных аминокислотных последовательностей были синтезированы три нуклеотидных зонда (А), (LC) и (IWQ), имеющие последовательности, показанные на фиг.1 (пример 4). Зонд (А) был смешанного типа и состоял из 14 последовательных нуклеотидов. Зонд (IWQ) состоял из 30 последовательных нуклеотидов с деоксиинозином и представлял собой зонд такого типа, который используют при клонировании человеческого холецистокининового гена [Таkahashi et al. Proc. Natl. Асаd. Sci. USA 82, 1931 (1985)] Зонд (LC) представлял собой 24-нулеотидный зонд, который был синтезирован из нуклеотидов в 32-39 положениях от N-конца аминокислотной последовательности, показанной в примере 3(I), на основе нуклеотидной последовательности, показанной на фиг.3-5.
A homogeneous protein of human CSF was obtained by purification from the surface layer of a culture cell of tumor cells of the CHU-2 line and its amino acid sequence was determined from the N-type. Fragments were obtained by decomposition with bromocyanine and trypsin treatment, and the amino acid sequences of these fragments were also determined [example 3 (I), (II) and (III)]
Based on the determined amino acid sequences, three nucleotide probes (A), (LC) and (IWQ) were synthesized having the sequences shown in FIG. 1 (Example 4). The probe (A) was a mixed type and consisted of 14 consecutive nucleotides. The probe (IWQ) consisted of 30 consecutive nucleotides with deoxyinosine and was of the type used for cloning the human cholecystokinin gene [Takahashi et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 1931 (1985)] The probe (LC) was a 24-nullotide probe that was synthesized from nucleotides at 32-39 positions from the N-terminus of the amino acid sequence shown in example 3 (I), based on the nucleotide sequence shown figure 3-5.

Химический синтез нуклеотидов можно осуществить путем применения усовершенствованного фосфотриэфирнго способа к твердофазному методу, и это было рассмотрено Hapaнгом (Narang) [Tetrahedron, 39,3-22(1983)]
Можно также использовать зонды на основе аминокислотных последовательностей, в положениях, которые отличны от используемых в вышеупомянутых зондах.
The chemical synthesis of nucleotides can be carried out by applying the improved phosphotriether method to the solid phase method, and this was reviewed by Hapang (Narang) [Tetrahedron, 39.3-22 (1983)]
Amino acid sequence based probes may also be used at positions that are different from those used in the aforementioned probes.

(2) Построение библиотеки КДНК. (2) Construction of a cDNA library.

Клетки СНU-2 были гомогенизированы после добавления гуанидинтиоцианатного раствора, и всю РНК получили центрифугированием в градиенте плотности, CsCl. CHU-2 cells were homogenized after addition of guanidine thiocyanate solution, and all RNA was obtained by density gradient centrifugation, CsCl.

Поли (А+) РНК выделили из всей РНК с помощью колоночной хроматографии на олиго (dТ)-целлюлозе. После этого, синтезировали однонитевую КДНК с помощью реверстранскриптазы, и добавили рибонуклеазу Н и Е. cоli ДНК-полимеразу I, чтобы получить двухнитевую сДНК. Цепь dC присоединили к полученной двухнитевй сДНК, которую присоединили к вектору рВ R 322, к которой прикрепили цепь dG в сайте отщепления Pst-I; полученную рекомбинантную ДНК использовали для трансформации штампа Е.cоli Х1776, и построили библиотеку кДНК рВ R 322-линии (примеры 5 и 6).Poly (A + ) RNA was isolated from all RNA by column chromatography on oligo (dT) cellulose. After that, single-stranded cDNA was synthesized using reverstranscriptase, and ribonuclease H and E. coli DNA polymerase I were added to obtain double-stranded cDNA. The dC chain was attached to the resulting double-stranded cDNA, which was attached to the pB vector R 322, to which the dG chain was attached at the Pst-I cleavage site; the resulting recombinant DNA was used to transform the E. coli X1776 stamp, and a library of rB R 322 line cDNA was constructed (examples 5 and 6).

Аналогичным способом двухнитевую КДНК присоединили к вектору λgt 10 с помощью линкера Есo RI и построили библиотеку КДНК линии λ -фага (пример 7). In a similar way, a double-stranded cDNA was attached to the λgt 10 vector using the Eco RI linker and a cDNA library of the λ-phage line was constructed (Example 7).

(3) Направленный отбор. (3) Directional selection.

Клоны библиотеки кДНК рВ R322-линии, фиксировали на фильтровальной бумаге Ватман S41, и путем гибридизации колоний с зондом (IWQ) меченным 32, можно было отобрать единственный клон. Последующее исследование методом пятен по Саузерну [Southern. J. Mol. Biol. 98,503(1975)] показало, что этот клон также гибридизуется с зондом (А). Нуклеотидную последовательность этого клона определили дидезоксиметодом [Sanger, Science, 214, 1205 (1981)]
Нуклеотидная последовательность полученной вставки КДНК показана на фиг. 2, где можно видеть, что эта вставка состоит из 308 пар оснований, включая зонды (IWQ) и (А), и имеет открытую рамку считывания, кодирующую 83 аминокислоты, последовательность которых показанав примере 3 (III) pB R 322-производное, содержащее эти 308 пар оснований pHCS-1 (пример 8).
Clones of the rB R322 line cDNA library were fixed on Whatman S41 filter paper, and by hybridizing the colonies with a probe (IWQ) labeled 32, a single clone could be selected. Subsequent Southern Spot Method [Southern. J. Mol. Biol. 98,503 (1975)] showed that this clone also hybridizes with probe (A). The nucleotide sequence of this clone was determined by a dideoxymethod [Sanger, Science, 214, 1205 (1981)]
The nucleotide sequence of the resulting cDNA insert is shown in FIG. 2, where it can be seen that this insert consists of 308 base pairs, including probes (IWQ) and (A), and has an open reading frame encoding 83 amino acids, the sequence of which is shown in Example 3 (III) pB R 322-derivative containing these 308 base pairs pHCS-1 (example 8).

Фрагмент ДНК, содержащий 308 пар оснований полученный из рНСs-I, пометили радиоактивной меткой по способу меченной трансляции (см. там же Molecular Cloning), и, используя этот фрагмент в качестве зонда, осуществили направленный отбор λgt 10 библиотеки КДНК с помощью гибридизации пятен [Benton and Davis, Science, 196, 180(1977)] чтобы получить пять клонов. С помощью того же способа, который описан выше, определяли нуклеотидную последовательность клона, который, как считали, содержит КДНК [фиг. 3-5]
Эта вставка КДНК имела единственную большую открытую рамку считывания.
A DNA fragment containing 308 base pairs obtained from rNCs-I was labeled with a radioactive label according to the method of labeled translation (see ibid. Molecular Cloning), and using this fragment as a probe, directional selection of the λgt 10 cDNA library was performed using spot hybridization [ Benton and Davis, Science, 196, 180 (1977)] to obtain five clones. Using the same method as described above, the nucleotide sequence of the clone, which was believed to contain cDNA, was determined [Fig. 3-5]
This cDNA insert had a single large open reading frame.

Как показано на фиг. 3-5, можно вывести аминокислотную последовательность, кодируемую этой кДНК. As shown in FIG. 3-5, the amino acid sequence encoded by this cDNA can be derived.

Сравнение с N-концевой аминокислотной последовательностью Г-КСФ протеина, приведенной в примере 3(1), обнаружил, что эта кДНК содержала нуклеотидную последовательность, которая соответствовала как сигнальному пептиду, кодируемому 90 пар оснований, начиная с последовательности АТГ в нуклеотидных положениях 32-34 от 5'-конца и кончая последовательностью ГЦЦ в положениях 119-121, так и полному Г-КСФ полипептиду, кодируемому 531 парами оснований, начиная с последовательности АЦЦ в положениях 122-124 и кончая последовательностью ЦЦЦ в положениях 650-652. Поэтому полипептид с аминокислотной последовательностью l, приведенной на фиг. 6-7, cостоял из 207 аминокислот, а рассчитанным молекулярным весом 22292, 67D. Полипептид с аминокислотной последовательностью II состоял из 177 аминокислот, его молекулярная масса была рассчитана в размере 18986, 74 D (пример 9). Comparison with the N-terminal amino acid sequence of the G-CSF protein shown in Example 3 (1) found that this cDNA contained a nucleotide sequence that corresponded as a signal peptide encoded 90 base pairs, starting from the ATG sequence at nucleotide positions 32-34 from the 5'-end and ending with the HCC sequence at positions 119-121, and the full G-CSF polypeptide encoded by 531 base pairs, starting with the ACC sequence at positions 122-124 and ending with the CCC sequence at positions 650-652. Therefore, a polypeptide with the amino acid sequence l shown in FIG. 6-7, consisted of 207 amino acids, and the calculated molecular weight of 22292, 67D. A polypeptide with amino acid sequence II consisted of 177 amino acids, its molecular weight was calculated in the amount of 18986, 74 D (example 9).

Следует отметить, что АТГ в положениях 32-34 или в положениях 68-70 можно также считать сайтом инициации протеина. It should be noted that ATG at positions 32-34 or at positions 68-70 can also be considered a protein initiation site.

Штамм Х1776 Escherichia coli, содержащей pB R 322, который имел эту КДНК (+VSE) в сайте ЕсoRI был отдан на хранение в Институт исследования ферментации бюро промышленных наук и технологии (Fermentation Research Institute, the Agencу оf Industrial Science and Technology (FERM ВР-954). Strain X1776 of Escherichia coli containing pB R 322 that had this cDNA (+ VSE) at the EcoRI site was deposited with the Fermentation Research Institute, the Agenc of Industrial Science and Technology (FERM BP- 954).

На фиг.18 показаны сайты рестрикции данной ДНК. On Fig shows the restriction sites of this DNA.

Эту КДНК лигировали с рB R327 Соберон с сотр. [Soberon et al. Gene, 9,287(1980)] в сайте ЕсоRI и полученную плазмиду называют здесь ниже pBRG4. This cDNA was ligated with pB R327 Soberon et al. [Soberon et al. Gene, 9.287 (1980)] at the EcoRI site and the resulting plasmid is referred to here below as pBRG4.

Полученную таким образом pBRG4 обработали рестриктазой ЕсоRI, чтобы получить фрагмент ДНК, содержащий КДНК, длиной примерно 1500 пар оснований. Этот фрагмент пометили радиактивной меткой способом меченой трансляции (см. там же Molecular Cloning) и, используя в качестве зонда этот фрагмент ДНК, меченный радиоактивной меткой, еще раз провели направленный отбор библиотеки λgt 10 КДНК клонов с помощью гибридизации пятна (см. Benton and Davis). Thus obtained pBRG4 was digested with restriction enzyme EcoRI to obtain a DNA fragment containing cDNA with a length of about 1500 base pairs. This fragment was radiolabeled using the labeled translation method (see ibid. Molecular Cloning) and, using this radiolabeled DNA fragment as a probe, we again targeted the λgt library of 10 cDNA clones using spot hybridization (see Benton and Davis )

В этом способе гибридизации пятна приготавливают два листа нитроцеллюлозной фильтровальной бумаги со связанной ДНК λ -фага, один из этих листов используют для вышеуказанной гибридизации пятна, а другой подвергают гибридизации пятна с уже описанным зондом (LC). Отобрали фаги, которые оказались положительными для обоих зондов. Отобрали клон, который имел "полномерную" кДНК, и нуклеотидная последовательность вставки кДНК, определенная дидезокси-способом, показана на фиг. 8-10. In this spot hybridization method, two sheets of nitrocellulose filter paper with coupled λ-phage DNA are prepared, one of these sheets is used for the above spot hybridization, and the other is subjected to spot hybridization with the probe already described (LC). Phages that were positive for both probes were selected. A clone that had a "full length" cDNA was selected and the nucleotide sequence of the cDNA insert determined by the dideoxy method is shown in FIG. 8-10.

Эта кДНК имели единственную большую открытую рамку считывания, была определена аминокислотная последовательность, которую можно кодировать эта кДНК, показанная на фиг. 8-10. This cDNA had a single large open reading frame, the amino acid sequence that this cDNA shown in FIG. 8-10.

Сравнение с N-концевой аминокислотной последовательностью Г-КСФ протеина, показанной в примере 3(1), открыло, что эта КДНК содержала нуклеотидную последовательность, которая соответствовала как сигнальному пептиду, кодируемому с помощью 90 пар оснований, начиная с последовательности АТГ в положениях нуклеотидов 31-33 от 5'-конца и кончая последовательностью ГЦЦ в положениях 118-120, так и законченному Г-КСФ полипептиду, кодируемому с помощью 522 пар оснований, начиная с последовательности АЦЦ в положениях 121-123 и кончая последовательностью ЦЦЦ в положениях 640-642. Поэтому полипептид с аминокислотной последовательностью l, показанной на фиг. 11 и 12, состоял из 204 аминокислот, и было рассчитано, что его молекулярный вес составлял 21977,35 дальтонов. Полипептид с аминокислотной последовательностью ll состоял из 174 аминокислот, было рассчитано, что его молекулярный вес составлял 18671,42 дальтонов (пример 10). Comparison with the N-terminal amino acid sequence of the G-CSF protein shown in Example 3 (1) revealed that this cDNA contained a nucleotide sequence that corresponded as a signal peptide encoded using 90 base pairs, starting from the ATG sequence at nucleotide positions 31 -33 from the 5'-end and ending with the MCC sequence at positions 118-120, and the completed G-CSF polypeptide encoded using 522 base pairs, starting from the ACC sequence at positions 121-123 and ending with the MCC sequence in dix 640-642. Therefore, a polypeptide with the amino acid sequence l shown in FIG. 11 and 12, consisted of 204 amino acids, and it was calculated that its molecular weight was 21977.35 daltons. A polypeptide with the amino acid sequence ll consisted of 174 amino acids, it was calculated that its molecular weight was 18671.42 daltons (example 10).

Следует отметить, что АТГ в положениях 58-60 или в положениях 67-69 также можно рассматривать как сайт инициации протеина. It should be noted that ATG at positions 58-60 or at positions 67-69 can also be considered as a protein initiation site.

Штамм Х1776 Еsherichia coli, несущий pBR322, которая имела эту КДНК (-VSЕ) в сайте ЕсоRI был отдан на хранение в Институт исследования ферментации бюро промышленных наук и технологии (Fermentation Research Institute, the Agency of Iнdustrial Science and Technology (FERM BP-955). Strain X1776 of Esherichia coli carrying pBR322, which had this cDNA (-VSE) at the EcoRI site, was deposited with the Institute of Fermentation Research of the Bureau of Industrial Sciences and Technology (Fermentation Research Institute, the Agency of Industrial Science and Technology (FERM BP-955) .

На фиг.18 показаны сайты рестрикции данной ДНК. On Fig shows the restriction sites of this DNA.

Эту КДНК лигировали с pBR327 в сайте ЕсoRI, чтобы получить плазмиду, которую здесь ниже называют плазмидой pBRV 2. This cDNA was ligated with pBR327 at the EcoRI site to obtain a plasmid, which is hereinafter referred to as pBRV 2 plasmid.

(4) Направленный отбор библиотеки человеческого хромосомного гена. (4) Directional selection of a human chromosomal gene library.

Библиотеку человеческого хромосомного гена, полученную в соответствии со способами, описанными Манятисом и сорт. (Maniatis et al. Molecular Cloning, там же), подвергали направленному отбору с указанной выше рНСS-I. Зонды, которые можно использовать при направленном отборе, включали: pHCS-I фрагмент ДНК длиной 308 пар оснований, pBRG4 фрагмент ДНК длиной примерно 1500 пар оснований pBRV 2 фрагмент ДНК длиной примерно 1500 пар оснований, фрагмент ДНК подходящей длины, содержащий часть одного или нескольких из этих фрагментов ДНК, а также вышеуказанные олигонуклеотидные зонды [т.е. (IWQ), (А) и (IC). Здесь ниже описан случай использования фрагмента ДНК pHCS-I. The library of the human chromosomal gene, obtained in accordance with the methods described by Manyatis and grade. (Maniatis et al. Molecular Cloning, ibid.) Were subjected to directional selection with the above pCS-I. Probes that can be used in targeted sampling included: a pHCS-I DNA fragment of 308 base pairs long, pBRG4 DNA fragment of approximately 1,500 base pairs pBRV 2 DNA fragment of approximately 1,500 base pairs, a suitable length DNA fragment containing a portion of one or more of of these DNA fragments, as well as the above oligonucleotide probes [i.e. (IWQ), (A) and (IC). The following describes the use of a pHCS-I DNA fragment.

Этот фрагмент ДНК пометили радиоактивной меткой 32P в соответствии с методом меченой трансляции [см. Roop et al. Сеll, 15, 431 (1978)] Используя в качестве зонда полученный 32Р меченый фрагмент, библиотеку человеческого хромосомного гена подвергли направленному отбору с помощью гибридизации пятен (см. там же Benton and Davis) c тем, чтобы получить десять с лишним клонов.This DNA fragment was labeled with a radioactive label 32 P according to the method of labeled translation [see Roop et al. Sell, 15, 431 (1978)] Using the obtained 32 P labeled fragment as a probe, the library of the human chromosome gene was targeted by spot hybridization (see Benton and Davis) to obtain ten-odd clones.

После выделения ДНК из клонов с помощью известных способов получили карту рестрикции [Fritsch et al. Сеll, 19, 959 (1980)]
Используя тот же зонд ДНК, осуществляли гибридизацию по Саузерну (см. там же Southern), было найдено, что фрагмент ДНК длиной примерно 4 тысячи оснований, вырезаемый с помощью ЕсoRI и ХhoI, может потенциально содержать участок, кодирующий человеческий полипептид Г-КСФ. Поэтому, фрагмент ДНК примерно 4 тысячи оснований вставили в рBR327 и сайт ЕcoRI, используя линкер ЕcoRI, с тем, чтобы получить pBRCE3 β. Используя эту плазмиду в качестве ДНК с определенной последовательностью оснований, определяли дидезокси-способом нуклеотидную последовательность участка примерно 3 тысячи оснований этого фрагмента ДНК длиной примерно 4 тысячи оснований. В результате было найдено, что указанный фрагмент ДНК является геном, кодирующим полипептид человеческого Г-КСФ (рис.5).
After isolation of the DNA from the clones using known methods, a restriction map was obtained [Fritsch et al. Sell, 19, 959 (1980)]
Using the same DNA probe, Southern hybridization was performed (see ibid. Southern), it was found that a DNA fragment with a length of about 4 thousand bases cut with EcoRI and XhoI could potentially contain a region encoding the human G-CSF polypeptide. Therefore, a DNA fragment of approximately 4 thousand bases was inserted into pBR327 and the EcoRI site using the EcoRI linker in order to obtain pBRCE3 β. Using this plasmid as DNA with a specific base sequence, the nucleotide sequence of a portion of approximately 3 thousand bases of this DNA fragment of approximately 4 thousand bases in length was determined by the dideoxy method. As a result, it was found that this DNA fragment is a gene encoding the polypeptide of human G-CSF (Fig. 5).

Штамм Х1776 Е.coli, несущий pBRCЕ3β (т.е. плазмида pBR327, имеющую указанный фрагмент ДНК примерно 4 тысячи оснований, вставленный в сайт ЕсoRI) был отдан на хранение в Институт Исследования Ферментации Бюро промышленных наук и технологии (Fermentation Research Institute, the Аgency of Industrial Science and Тесhnolohgy (FE RM ВР-956). The E. coli strain X1776 carrying pBRCЕ3β (i.e., the pBR327 plasmid having the indicated DNA fragment of about 4 thousand bases inserted into the EcoRI site) was deposited with the Fermentation Research Institute, the Emergency of Industrial Science and Thehnolohgy (FE RM BP-956).

Сравнение вставки pBRG4 кДНК, показанной на фиг.3-5, и вставки pB RV2 кДНК, показанной на фиг.8-12, показано, что обсуждаемый фрагмент ДНК содержал пять экзонных частей, и он кодировал аминокислотные последовательности, выведенные из pB RG4 и pB RV 2. A comparison of the pBRG4 cDNA insert shown in FIGS. 3-5 and the pB RV2 cDNA insert shown in FIGS. 8-12 shows that the DNA fragment under discussion contained five exon parts and it encoded the amino acid sequences derived from pB RG4 and pB RV 2.

На фиг.19 показаны сайты рестрикции полученного гена. On Fig shows the restriction sites of the obtained gene.

Этот фрагмент ДНК содержал хромосомный ген человеческого Г-КСФ, либо предшествующий участок, транскрибируемый в иРНК человеческого Г-КСФ, вместе с нуклеотидной последовательностью, принимающей участие в управлении транскрипцией [Benoist and Chambon, Nature, 290, 304 (1981), и Breathnack and Chambon, Ann. Rev. Biochem. 50, 349 (1981)]
(5) Построение рекомбинантного вектора для экспрессии в Е.coli.
This DNA fragment contained the chromosomal gene of human G-CSF, or the preceding site, transcribed in the mRNA of human G-CSF, together with the nucleotide sequence involved in transcription control [Benoist and Chambon, Nature, 290, 304 (1981), and Breathnack and Chambon, Ann. Rev. Biochem. 50, 349 (1981)]
(5) Construction of a recombinant vector for expression in E. coli.

А/ Рекомбинантный вектор линии +VSЕ. A / Recombinant line vector + VSE.

Из плазмиды pB RG4, полученной в (3) (пример 9), вырезали фрагмент кДНК полипептида Г-КСФ с помощью рестриктазы, и построили рекомбинантный вектор с помощью одного из следующих способов: (I) используя ренатурированный синтетический линкер, фрагмент связали с фрагментом, полученным из tac-промотор-содержащей рКК223-3 (Pharmacia Fine Chemicals) (пример 12 и рис.8);
(II) три фрагмента, полученные из PL-промотор-содержащей PL-ламбда (Pharmacia Fine Chemicals), связали с ренатурированным синтетическим линкером, и продукт связывания и фрагмент кДНК подвергли стадиям повторного получения, чтобы построить рекомбинантный вектор (пример 13, фиг. 21-22) или
(III) используя, ренатурированный синтетический линкер, фрагмент связали с фрагментом, полученными из trp-промотор-содержащей плазмиды pOYI (пример 14 и фиг.23),
(В) Рекомбинантный вектор линии-VSЕ.
From the plasmid pB RG4 obtained in (3) (Example 9), a cDNA fragment of the G-CSF polypeptide was cut using a restriction enzyme and a recombinant vector was constructed using one of the following methods: (I) using a renatured synthetic linker, the fragment was linked to the fragment, obtained from tac-promoter-containing pKK223-3 (Pharmacia Fine Chemicals) (example 12 and Fig. 8);
(II) three fragments obtained from a PL-promoter-containing PL-lambda (Pharmacia Fine Chemicals) were coupled to a renatured synthetic linker, and the binding product and cDNA fragment were subjected to re-preparation steps to construct a recombinant vector (Example 13, FIG. 21 -22) or
(III) using a renatured synthetic linker, the fragment was linked to the fragment obtained from the t rp promoter-containing plasmid pOYI (example 14 and FIG. 23),
(B) Recombinant line vector-VSE.

Тем же способом, какой описан выше, построили три рекомбинантных вектора, используя плазмиду pBRV2 (пример 10), показанную в примере 19 и на фиг. 24, 25, 26, 27. In the same manner as described above, three recombinant vectors were constructed using the plasmid pBRV2 (Example 10) shown in Example 19 and in FIG. 24, 25, 26, 27.

(6) Получение трансформантов Е.coli и их выращивание и экспрессия
Используя три рекомбинантных вектора каждой из линий +VSE и -VSЕ, штамм Е. coli DН1, N 4830 или JM 105 трансформировали при обработке хлоридом кальция или хлоридом рубидия, описанной в Molecular Cloning там же (примеры 12,13,14 и 19). Каждый из полученных трансформантов культивировали в среде Луриа (Luria), содержащей ампициллин, причем затем проводили индуцирование, как это нужно, чтобы осуществить экспрессию (примеры 15 и 20).
(6) Obtaining transformants of E. coli and their cultivation and expression
Using three recombinant vectors of each of the + VSE and -VSE lines, the E. coli strain DH1, N 4830 or JM 105 was transformed by treatment with calcium chloride or rubidium chloride described in Molecular Cloning in the same place (examples 12,13,14 and 19). Each of the obtained transformants was cultured in Luria medium containing ampicillin, and then induction was carried out as necessary to effect expression (examples 15 and 20).

(7) Выделение и очистки полипептида Г-КСФ из Е.coli и его аминокислотный анализ. (7) Isolation and purification of the G-CSF polypeptide from E. coli and its amino acid analysis.

Культуральный раствор трансформантов подвергали центрифугированию, чтобы получить клеточный осадок после центрифугирования. Собранные клетки обработали лизоцином и после лизиса посредством циклического замораживания и оттаивания получили поверхностный раствор. Альтернативно клетки обрабатывали хлоридом гуанидия, центрифугировали, и получали поверхностный раствор. The transformants culture solution was centrifuged to obtain a cell pellet after centrifugation. The harvested cells were treated with lysozine and, after lysis, a surface solution was obtained by cyclic freezing and thawing. Alternatively, the cells were treated with guanidium chloride, centrifuged, and a surface solution was obtained.

Поверхностный раствор подвергали гель-фильтрации на колонке Ultrogel АСА54 (LKB), и активные фракции были сконцентрированы с помощью ультрафильтрационного устройства. The surface solution was subjected to gel filtration on an Ultrogel ACA54 (LKB) column, and the active fractions were concentrated using an ultrafiltration device.

Затем водный раствор трифторуксусной кислоты, содержащий н-пропанол, добавляли к концентрату, и после выдерживания во льду, смесь отцентрифугировали и абсорбировали на колонке с обращенной фазой С18. После элюирования проверили фракции на их активность. Активные фракции собрали и подвергали тем же способам очистки, какие описаны выше. Очищенные фракции были высушены вымораживанием, и порошок растворили и подвергли высоко разрешающей жидкостной хроматографии с разделением по размерам. Полученные полипептиды подвергали SDS-полиакриламидному гельэлектрофорезу, и единственная полоса подтверждала наличие нужного полипептида (Г-КСФ) (примеры 16 и 20). Полученный таким образом полипептид проявлял активность человеческого полипептида Г-КСФ (примеры 17 и 20). Полипептид Г-КСФ анализировали методом аминокислотного анализа с помощью автоматического аминокислотного анализатора "Хитачи 835" (Hitachi, Ltd). Для анализа N-концевых аминокислот использовали газофазный определитель последовательности (для разложения по Эдману), хроматограф высокоэффективной жидкостной хрома- тографии и колонку Ultrasphere-ODS (примеры 18 и 21). Then, an aqueous trifluoroacetic acid solution containing n-propanol was added to the concentrate, and after standing in ice, the mixture was centrifuged and absorbed on a C18 reverse phase column. After elution, the fractions were checked for their activity. Active fractions were collected and subjected to the same purification methods as described above. The purified fractions were freeze-dried, and the powder was dissolved and subjected to size resolution liquid chromatography. The resulting polypeptides were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, and a single lane confirmed the presence of the desired polypeptide (G-CSF) (examples 16 and 20). Thus obtained polypeptide showed the activity of the human G-CSF polypeptide (examples 17 and 20). The G-CSF polypeptide was analyzed by amino acid analysis using a Hitachi 835 automatic amino acid analyzer (Hitachi, Ltd). For analysis of N-terminal amino acids, a gas phase sequence determinant (for Edman decomposition), a high performance liquid chromatography chromatograph, and an Ultrasphere-ODS column were used (Examples 18 and 21).

(8) Построение рекомбинантных векторов для клеток животных. (8) Construction of recombinant vectors for animal cells.

Рекомбинантные векторы (производные BPV) для использования в хозяйских клетках С 127 и N IН3ТЗ были построены для каждой КДНК линии +VSE и -VSЕ и для хромосомного гена. Рекомбинантные векторы (с dhar) для использования с клетками СНО также были построены для каждой КДНК линии +VSE и -VSЕ для хромосомного гена. Также были построены рекомбинантные векторы для использования в клетках СoS. Описаны показательные примеры, а для более подробного описания следует ссылаться на соответствующие рабочие примеры. Recombinant vectors (BPV derivatives) for use in host cells With 127 and N IN3T3 were constructed for each cDNA line + VSE and -VSE and for the chromosomal gene. Recombinant vectors (with dhar) for use with CHO cells were also constructed for each cDNA line + VSE and -VSE for the chromosomal gene. Recombinant vectors have also been constructed for use in CoS cells. Illustrative examples are described, and for a more detailed description, reference should be made to the corresponding working examples.

(А) Построение рекомбинантных векторов линии +VSЕ
Фрагмент кДНК (+VSЕ), полученный в (3), вставили в вектор pdKCR, чтобы получить плазмиду pНGA 410, (пример 22, фиг.28), которую частично переваривали с помощью Есо RI, а затем обрабатывали ДНК-полимеразой I (фрагмент Кленова), чтобы получить тупые концы. К ДНК прикрепили линкер Hind III, затем ее обработали Hind III, и Т4 ДНК лигазой, обработанную ДНК использовали для трансформации штамма ДНI Е. coli с применением хлорида рубидия (см. там же Molecular Cloning). Полученную плазмиду назвали рН GA 410 (Н) (фиг.29). рафии и колонку Ultrasphere-ODS (примеры 18 и 21).
(A) Construction of recombinant line vectors + VSЕ
The cDNA fragment (+ VSE) obtained in (3) was inserted into the pdKCR vector to obtain the plasmid pHGA 410, (Example 22, FIG. 28), which was partially digested with Eco RI and then treated with DNA polymerase I (fragment Klenova) to get blunt ends. The Hind III linker was attached to the DNA, then it was treated with Hind III, and T4 DNA with a ligase, the treated DNA was used to transform E. coli DNI strain using rubidium chloride (see also Molecular Cloning). The resulting plasmid was called pH GA 410 (H) (FIG. 29). raffia and column Ultrasphere-ODS (examples 18 and 21).

(8) Построение рекомбинантных векторов для клеток животных. (8) Construction of recombinant vectors for animal cells.

Рекомбинантные векторы (производные BPV) для использования в хозяйских клетках С 127 и N IН3ТЗ были построены для каждой КДНК линии +VSE и -VSЕ и для хромосомного гена. Рекомбинантные векторы (с dhfr) для использования с клетками СНО также были построены для каждой КДНК линии +VSE и -VSЕ для хромосомного гена. Также были построены рекомбинантные векторы для использования в клетках СoS. Описаны показательные примеры, а для более подробного описания следует ссылаться на соответствующие рабочие примеры. Recombinant vectors (BPV derivatives) for use in host cells With 127 and N IN3T3 were constructed for each cDNA line + VSE and -VSE and for the chromosomal gene. Recombinant vectors (with dhfr) for use with CHO cells were also constructed for each cDNA line + VSE and -VSE for the chromosomal gene. Recombinant vectors have also been constructed for use in CoS cells. Illustrative examples are described, and for a more detailed description, reference should be made to the corresponding working examples.

(А) Построение рекомбинантных векторов линии +VSЕ
Фрагмент кДНК (+VSЕ), полученный в (3), вставили в вектор pdKCR, чтобы получить плазмиду pНGA 410, (пример 22, фиг.28), которую частично переваривали с помощью Есо RI, а затем обрабатывали ДНК-полимеразой I (фрагмент Кленова), чтобы получить тупые концы. К ДНК прикрепили линкер Hind III, затем ее обработали Hind III, и Т4 ДНК лигазой, обработанную ДНК использовали для трансформации штамма ДНI Е. coli с применением хлорида рубидия (см. там же Molecular Cloning). Полученную плазмиду назвали рН GA 410 (Н) (фиг.29).
(A) Construction of recombinant line vectors + VSЕ
The cDNA fragment (+ VSE) obtained in (3) was inserted into the pdKCR vector to obtain the plasmid pHGA 410, (Example 22, FIG. 28), which was partially digested with Eco RI and then treated with DNA polymerase I (fragment Klenova) to get blunt ends. The Hind III linker was attached to the DNA, then it was treated with Hind III, and T4 DNA with a ligase, the treated DNA was used to transform E. coli DNI strain using rubidium chloride (see also Molecular Cloning). The resulting plasmid was called pH GA 410 (H) (FIG. 29).

pН GA 410(Н) обработали SalI и после получения тупых концов ее обработали еще раз Hind III и выделили фрагмент Hind III Sal I. Плазмиду pdBPV-1, имеющую трансформированный фрагмент вируса бычьей папилломы, обработали Hind III и Pvu II, и выделили большой фрагмент ДНК и присоединили к отдельно приготовленному фрагменту Hind III Sal I. Соединенные фрагменты использовали для трансформации штамма DHI Е. соli, чтобы получить плазмиду pTN-G4, которая имела рН GA 410 выведенную СSF кДНК (фиг.29, пример 23) (CSF-КСФ, Прим. перев.). pН GA 410 (H) was treated with SalI and after blunt ends it was treated again with Hind III and a Hind III Sal I fragment was isolated. The plasmid pdBPV-1 having a transformed fragment of bovine papilloma virus was treated with Hind III and Pvu II and a large fragment was isolated DNA and attached to a separately prepared Hind III Sal I. fragment. The combined fragments were used to transform E. coli DHI strain to obtain the plasmid pTN-G4, which had pH GA 410 derived CSF cDNA (Fig. 29, Example 23) (CSF-CSF , Note transl.).

Любую из плазмид, рН GA 410, или рН GA 410 (Н), в сочетании с плазмидой pAdD26SVpA использовали для построения рН GG4-dhfr, который представлял собой рекомбинантный вектор (+VSЕ для использования с клетками CHO (фиг. 30, 31, пример 26). Any of the plasmids, pH GA 410, or pH GA 410 (H), in combination with plasmid pAdD26SVpA, was used to construct the pH of GG4-dhfr, which was a recombinant vector (+ VSЕ for use with CHO cells (Fig. 30, 31, example 26).

Фрагмент ДНК длиной 2 тыс. оснований, содержащий ген dhfr, выделили из pAdD26SVpA путем обработки с ЕсoRI и BamНI1 выделенный фрагмент вставили в рНGA 410(Н) в сайт Hind III c тем, чтобы построить pG4DR1 и pG4DR2 (фиг.32, пример 25). A 2,000-base DNA fragment containing the dhfr gene was isolated from pAdD26SVpA by treatment with EcoRI and BamHI1, the selected fragment was inserted into pHGA 410 (H) at the Hind III site in order to construct pG4DR1 and pG4DR2 (Fig. 32, example 25) .

(В) Конструирование рекомбинантных векторов линии-VSЕ. (B) Construction of recombinant line vectors-VSE.

Фрагмент КДНК (-VSЕ), полученный в (3), вставили в вектор pdKCR, чтобы получить плазмиду рН GV2 (пример 28), которую частично переваривали с Есо RI с последующей обработкой ДНК-полимеразой I (фрагмент Кленоу), чтобы получить тупые концы. The cDNA fragment (-VSE) obtained in (3) was inserted into the pdKCR vector to obtain the plasmid pH GV2 (Example 28), which was partially digested with Eco RI followed by DNA polymerase I (Klenow fragment) to obtain blunt ends .

Линкер Hind III присоединили к ДНК, которую последовательно обработали Hind III и Т4 ДНК-лигазой. Обработанную ДНК использовали для трансформации штамма DH1 Е. сoli с применением хлорида рубидия (см. там же Melecular Cloning). Полученную плазмиду назвали рН GV2(Н) (фиг.34). The Hind III linker was attached to the DNA, which was sequentially treated with Hind III and T4 DNA ligase. The treated DNA was used to transform E. coli DH1 strain using rubidium chloride (see Melecular Cloning). The resulting plasmid was called pH GV2 (H) (Fig. 34).

Плазмиду рН GV2 (Н) обработали Sal I после получения тупых концов, ее обработали ее раз Hind III и выделили фрагмент Hind III Sal I. Плазмиду pdBPV-1, имеющую трансформированный фрагмент вируса бычьей папилломы, обработали Hind III и Pvu II и отделили больший фрагмент ДНК и присоединили к отдельно приготовленному фрагменту Hind III Sal I. Plasmid pH GV2 (H) was treated with Sal I after blunt ends were obtained, it was treated with Hind III times and a Hind III Sal I fragment was isolated. Plasmid pdBPV-1 having a transformed bovine papilloma virus fragment was treated with Hind III and Pvu II and a larger fragment was separated DNA and attached to a separately prepared fragment of Hind III Sal I.

Присоединенные фрагменты использовали для трансформации штамма DН1 Е.соli, чтобы получить плазмиду рTN V2, которая имела рН GV-2, выведенную КСФ-кДНК (фиг.34, пример 29). The attached fragments were used to transform E. coli strain DH1 to obtain plasmid pTN V2, which had a pH of GV-2 deduced by CSF cDNA (Fig. 34, Example 29).

Аналогичными способами либо плазмиду рН GV2, либо плазмиду рН GV2(Н), в сочетании с плазмидой рАdD 26SV pA использовали для построения рН GV2-dhfr, которая представляла собой рекомбинантный вектор (-VSЕ) для использования с клетками СНО (фиг.35, 36, пример 31). By similar methods, either plasmid pH GV2 or plasmid pH GV2 (H), in combination with plasmid pADD 26SV pA, was used to construct pH GV2-dhfr, which was a recombinant vector (-VSE) for use with CHO cells (Figs. 35, 36 , example 31).

Фрагмент ДНК примерно 2 тыс. оснований, содержащий ген dhfr, выделили из pAdD 26 SV pA обработкой с помощью ЕсoRI и BamН 1, и выделенный фрагмент вставили в рН GV2(Н), в сайт Hind III c тем, чтобы построить pV2DR1 и pV2DR2 (фиг.37, пример 31). A DNA fragment of about 2 thousand bases containing the dhfr gene was isolated from pAdD 26 SV pA by treatment with EcoRI and BamH 1, and the isolated fragment was inserted into pH GV2 (H) at the Hind III site in order to construct pV2DR1 and pV2DR2 ( Fig. 37, example 31).

(С) Построение рекомбинантных векторов, содержащих хромосомный ген. (C) Construction of recombinant vectors containing the chromosomal gene.

Плазмиду pBRCE3 β которую получили в (4) и которая содержала хромосомный ген, показанный на фиг. 13-17, обработали ЕсоRI. Плазмиду pSVН+K+, описанную Baner J1 et al. in Cell, 27, 299(1981), обработали Kpn I, чтобы удалить глобиновый ген. Затем плазмиду подвергали частичному перевариванию с Hind III c тем, чтобы удалить часть позднего гена SV40. Фрагменты повторно соединили, чтобы получить вектор экспрессии pML-Е+.The plasmid pBRCE3 β, which was obtained in (4) and which contained the chromosomal gene shown in FIG. 13-17, treated with EcoRI. Plasmid pSVH + K + described by Baner J1 et al. in Cell, 27, 299 (1981), were treated with Kpn I to remove the globin gene. The plasmid was then partially digested with Hind III so as to remove part of the late SV40 gene. Fragments were re-combined to obtain the expression vector pML-E + .

Этот вектор обработали рестриктазой, Есо RI и подвергали дефосфорилированию щелочной фосфатазой (Takara Shuzo Co. Ltd.), чтобы получить вектор ДНК, который был связан с вышеуказанным фрагментом хромосомной ДНК с помощью Т4 ДНК-лигазы (Takava Shuzo Co. Ltd.), чтобы получить pMLCЕЗ α, которая представляла собой рекомбинантный вектор для клеток СОS (пример 34). Как показано на фиг.31, эта плазмида содержала энхансер гена SV 40, начало репликации SV40, начало репликации pBR322 и β -лактамазный ген (Ampr) pBR322 и человеческий Г-КСФ хромосомный ген, расположенный за энхансером SV 40.This vector was digested with restrictase, Eco RI and dephosphorylated with alkaline phosphatase (Takara Shuzo Co. Ltd.) to obtain a DNA vector that was linked to the above chromosomal DNA fragment using T4 DNA ligase (Takava Shuzo Co. Ltd.) to get pMLCEZ α, which was a recombinant vector for COS cells (example 34). As shown in FIG. 31, this plasmid contained the enhancer of the SV 40 gene, the start of SV40 replication, the start of pBR322 replication, and the β-lactamase gene (Amp r ) pBR322 and the human G-CSF chromosome gene located behind the SV 40 enhancer.

Вектор экспрессии для клеток С127 построили следующими способами. Фрагмент ДНК, содержащий хромосомный ген КСФ, вырезали с помощью подходящей рестриктазы из pML CEЗα которая представляла собой вектор экспрессии для клеток СOS. Этот фрагмент присоединили с помощью Т4 ДНК лигазы к фрагменту присоединили с помощью Т4 ДНК лигазы к фрагменту ДНК, содержащему оrigin вируса бычьей папилломы (BPV) и фрагмент ДНК, содержащий ранний промотор SV40. Полученная рТ NCЕ3 α представляла собой вектор экспрессии, который имел хромосомный ген КСФ, расположенный за ранним промотором SV 40, и который содержал 65% часть BPV. The expression vector for C127 cells was constructed in the following ways. A DNA fragment containing the CSF chromosomal gene was excised using a suitable restriction enzyme from pML CEZα which was an expression vector for COS cells. This fragment was attached using a T4 DNA ligase to the fragment was attached using a T4 DNA ligase to a DNA fragment containing bovine papillomavirus origin (BPV) and a DNA fragment containing the SV40 early promoter. The resulting pT NCE3 α was an expression vector that had the CSF chromosomal gene located behind the early promoter SV 40, and which contained 65% of BPV.

Вектор экспрессии для клеток СНО имел два фрагмента ДНК, соединенные с помощью Т4 ДНК-лигазы, один фрагмент содержал хромосомный ген КСФ и ранний промотор SV 40, как в случае вектора экспрессии для клеток С127, а другой фрагмент содержал ген pAdD 26 SV pА-dhfr. Полученная pD26SVCE3α представляла собой вектор экспрессии, который имел хромосомный ген КСФ, расположенный за промотором SV 40 и ген dhfr за основным поздним промотором аденовируса. The expression vector for CHO cells had two DNA fragments connected using T4 DNA ligase, one fragment contained the CSF chromosome gene and early promoter SV 40, as in the case of the expression vector for C127 cells, and the other fragment contained the pAdD 26 SV pA-dhfr gene . The resulting pD26SVCE3α was an expression vector that had the CSF chromosomal gene located behind the SV 40 promoter and the dhfr gene behind the main late adenovirus promoter.

(9) Экспрессия в клетках животных
(А) Экспрессия в клетках мышей С127
Плазмиду pТN-G4 или рТN-V2 обработали BamHI. Обработанную плазмиду использовали для трансформации клеток С127 (предварительно выращенных путем культивирования) по методике с применением фосфата кальция. Выращивали трансформированные клетки, и отобрали клоны, имеющие высокую скорость продуцирования КСФ. Выделили гликопротеины, содержащие экспрессованный КСФ, и очистили от культурального раствора трансформированных клеток. Найдено, что они обладают активностью человеческого Г-КСФ. Наличие нужного гликопротеина было также подтверждено с помощью аминокислотного анализа и анализа содержания сахара в образце.
(9) Expression in animal cells
(A) Expression in C127 Mouse Cells
Plasmid pTN-G4 or pTN-V2 was treated with BamHI. The treated plasmid was used to transform C127 cells (previously grown by cultivation) according to the method using calcium phosphate. Transformed cells were grown, and clones having a high CSF production rate were selected. Glycoproteins containing expressed CSF were isolated and purified from the transformed cell culture solution. It was found that they possess human G-CSF activity. The presence of the desired glycoprotein was also confirmed by amino acid analysis and analysis of the sugar content in the sample.

Для анализа содержания сахара образец КСФ, использованный в аминокислотном анализе, подвергали процедуре определения аминосахара по методу Элсона-Маргана (Еlson-Margan), определения нейтрального сахара по методу с применением орцинолсульфата, либо определения сиаловой кислоты по методу с применением тиобарбитурата. Методы каждого определения описаны в "Тohshitsu no Kagaku "Сhemistry of Saccharides" (ч. 2 из двух частей), ч. 13, т. 4 курса А в Биохимических экспериментах (Biochemical Ехperiments, published bу Тokyо Kagaku Dojin). Перевод измеренных величин в весовые проценты показал, что содержание сахара в полученном Г-КСФ было распределено в диапазоне 1-20 мас. в зависимости от типа клетки-хозяина, векторов экспрессии и от условий культивирования. To analyze the sugar content, the CSF sample used in the amino acid analysis was subjected to the determination of the amino sugar according to the Elson-Margan method, the determination of neutral sugar by the method using orcinol sulfate, or the determination of sialic acid by the method using thiobarbiturate. The methods for each determination are described in the Tohitsitsu no Kagaku Chemistry of Saccharides (part 2 of two parts), part 13, volume 4 of course A in Biochemical Experiments (published by Tokyo Kagaku Dojin). weight percent showed that the sugar content in the obtained G-CSF was distributed in the range of 1-20 wt. depending on the type of host cell, expression vectors and cultivation conditions.

(В) Экспрессия в клетках СOS. (B) Expression in COS cells.

Клетки СOS, которые были выведены из клеток обезьян СV-I и которые были трансформированы с помощью мутанта, лишенного начала SV40, для выражения крупноразмерного Т-антигена SV 40 [см. Gluzman et al. Сell. 32, 175(1981)] были трансформированы вектором pML CEЗ α, который был получен в (5) (С) и который содержал человеческий хромосомный ген Г-КСФ. Надосадочная жидкость культуры клеток СOS проявляла активность человеческого Г-КСФ (пример 35). COS cells that were removed from the cells of monkeys CV-I and which were transformed using a mutant devoid of the beginning of SV40, to express the large-sized T-antigen SV 40 [see Gluzman et al. Cell. 32, 175 (1981)] were transformed with the pML CEZ α vector, which was obtained in (5) (C) and which contained the human G-CSF chromosomal gene. The supernatant of the cell culture COS showed activity of human G-CSF (example 35).

Клетки СOS были выделены из подвергнуты анализу мРНК, который показал наличие двух мРНК, соответствующих аминокислотным последовательностям, показанным на фиг.3 и фиг.4, соответственно. Следующий пример иллюстрирует определение активности КСФ. COS cells were isolated from mRNA analyzed, which showed the presence of two mRNAs corresponding to the amino acid sequences shown in FIG. 3 and FIG. 4, respectively. The following example illustrates the determination of CSF activity.

Проба активности, стимулирующей образование колоний (а) С клетками костного мозга человека:
Культивирование в монослое мягкого агара проводили в соответствии с методикой Brandley, Т.R. and Metcalf, D. (Аust. J. Ехр. Biol. Med. Sci. 44, 287-300, 1966). Смешали 0,2 мл сыворотки бычьего эмбриона, 0,1 мл образцы, 0,1 мл суспензии несросшихся клеток костного мозга человека (1-2х х105 нуклеарных клеток), 0,2 мл модифицированного культурального раствора Мак-Кой 5А (Mc Coy) и 0,4 мл модифицированного культурального раствора Мак-Кой 5А, содержащего 0,75% агара, вылили в пластиковую чашку для культуры ткани (диаметром 35 мл), подвергли коагуляции и культивировали при 37оС в 5% СО2/95% воздуха при 100% влажности. Через десять дней подсчитали число полученный колоний (одна колония состояла из не менее 50 клеток) и определили колониистимулирующую активность, причем считали, что одна единица представляет собой активность, необходимую для образования одной колонии.
A sample of activity that stimulates the formation of colonies (a) With human bone marrow cells:
Cultivation in a monolayer of soft agar was carried out in accordance with the method of Brandley, T.R. and Metcalf, D. (Aust. J. Exp. Biol. Med. Sci. 44, 287-300, 1966). 0.2 ml of bovine embryo serum were mixed, 0.1 ml of samples, 0.1 ml of a suspension of non-assembled human bone marrow cells (1-2 x 10 5 nuclear cells), 0.2 ml of a modified McCoy 5A culture solution (Mc Coy) and 0.4 ml of the culture solution of the modified McCoy 5A containing 0.75% agar, poured into a plastic dish for tissue culture (35 ml in diameter) was subjected to coagulation, and cultured at 37 ° C in 5% CO 2/95% air at 100% humidity. Ten days later, the number of obtained colonies was calculated (one colony consisted of at least 50 cells) and the colony-stimulating activity was determined, and one unit was considered to be the activity necessary for the formation of one colony.

(в) С клетками костного мозга мыши:
Смешали лошадиную сыворотку (0,4 мл) 0,1 мл образца 0,1 мл суспензии клеток костного мозга (самок) мышей С3Н/Не (0,5-1x x105 нуклеарных клеток) и 0,4 мл модифицированного культурального раствора Мак-Кой 5А, содержащего 0,75% агара, вылили смесь в пластиковую чашку для культуры ткани (диаметром 35 мм), подвергли коагуляции и культивировали в течение 5 дней при 37оС в 5% СО2 95% воздуха и при 100% влажности. Подсчитали число образовавшихся колоний (одна колония состояла из не менее 50 клеток) и определила колониистимулирующую активность, считая, что одна единица соответствует активности, необходимой для образования одной колонии.
(c) With mouse bone marrow cells:
Horse serum (0.4 ml) was mixed 0.1 ml of a sample 0.1 ml of a suspension of bone marrow cells (females) of C3H / He mice (0.5-1x x10 5 nuclear cells) and 0.4 ml of a modified culture solution Coy 5A containing 0.75% of agar, the mixture was poured into a plastic tissue culture dish (35 mm diameter), subjected to coagulation and cultured for 5 days at 37 ° C in 5% CO 2 and 95% air at 100% humidity. The number of colonies formed was calculated (one colony consisted of at least 50 cells) and determined colony-stimulating activity, assuming that one unit corresponds to the activity necessary for the formation of one colony.

П р и м е р 1. Установление СНU-2. PRI me R 1. The establishment of CHU-2.

Опухоль больного, имеющего рак ротовой полости, при котором наблюдалось выраженное увеличение числа нейтрофилов, трансплантировали в мышь nu/nu. Примерно через 10 дней после пересадки отмечали увеличение веса опухоли и числа нейтрофилов. Через двенадцать дней после пересадки опухоль извлекли асептически, нарезали на кубики 1-2 мм3 и выращивали следующим образом.A tumor of a patient having oral cancer, in which a marked increase in the number of neutrophils was observed, was transplanted into a nu / nu mouse. Approximately 10 days after transplantation, an increase in tumor weight and the number of neutrophils was noted. Twelve days after transplantation, the tumor was removed aseptically, diced into 1-2 mm 3 cubes and grown as follows.

От десяти до пятнадцати кубиков опухоли поместили в 50 мл пластиковую центрифужную пробирку. После добавления 5 мл раствора трипсина (содержащего 0,25% трипсина и 0,02% ЭДТА) пробирку трясли в течение 10 мин в теплой бане при 37оС и надосадочную жидкость сливали. Добавили еще 5 мл порцию того же самого раствора трипсина, и трипсиновое переваривание проводили при перемешивании в течение 15 мин при 37оС. Выделили надосадочную клеточную суспензию и хранили ее во льду после того, как трипсин дезактивировали путем добавления 1 мл сыворотки бычьего эмбриона.Ten to fifteen tumor cubes were placed in a 50 ml plastic centrifuge tube. After adding 5 ml trypsin solution (containing 0.25% trypsin and 0.02% EDTA) tube was shaken for 10 minutes in a warm bath at 37 ° C and the supernatant was decanted. Was added an additional 5 ml portion of the same solution of trypsin and trypsin digestion was performed under agitation for 15 min at 37 C. The Have allocated supernatant cell suspension and it was stored on ice after trypsin was deactivated by the addition of 1 ml of fetal bovine serum.

После еще одного повторения этих способов, клеточную суспензию выделили, смешали с ранее полученной суспензией и подвергли центрифугированию при 15000 оборотов в 1 мин в течение 10 мин, чтобы получить клеточный осадок после центрифугирования. Осадок после центрифугирования дважды промыли F-10, содержащим 10% сыворотку бычьего эмбриона, и после этого поместили в пластиковую колбу для культуры (25 см2), чтобы получить клеточную концентрацию 5х106 клеток/колбу. После инкубирования в течение ночи в инкубаторе с СО2 (5% СО2 и 100% влажность) с F-10 культуральным раствором, содержащим 10% сыворотки бычьего эмбриона, надосадочную жидкость удалили вместе с несросшимися клетками, и культивирование продолжали со свежим вливанием культурального раствора. Через шесть дней после начала культивирования колба заполнилась клетками, и культуральный раствор заменили свежим. На другой день культуральный раствор вылили, и в колбу загрузили 2 мл анти-мышинного эритроцитного антитела (Сappel), разбавленного в 5 раз с помощью RPMI-1640 и 2 мл хромосомного набора морской свинки (Kyokuto Seiyaku Co. Ltd.), разбавленного в 2,5 раза с помощью RPMI-1640. После инкубирования в течение 20 мин при 37оС культуру дважды промыли F-10, содержащими 10% сыворотку бычьего эмбриона и удалили мышиные фибробласты. Затем добавили F-1 культуральный раствор, содержащий 10% сыворотку бычьего эмбриона, и культивирование проводили еще в течение 2 дней. После этого часть клеток выделили и подвергли клонированию по способу предельного разбавления.After repeating these methods again, the cell suspension was isolated, mixed with the previously prepared suspension and centrifuged at 15,000 rpm for 1 min for 10 min to obtain a cell pellet after centrifugation. After centrifugation, the pellet was washed twice with F-10 containing 10% bovine embryo serum, and then placed in a plastic culture flask (25 cm 2 ) to obtain a cell concentration of 5x10 6 cells / flask. After overnight incubation in a CO 2 incubator (5% CO 2 and 100% humidity) with an F-10 culture solution containing 10% bovine embryo serum, the supernatant was removed along with non-fused cells, and cultivation was continued with fresh infusion of the culture solution . Six days after the start of cultivation, the flask was filled with cells, and the culture solution was replaced with fresh. The next day, the culture solution was poured, and 2 ml of anti-mouse erythrocyte antibody (Cappel) diluted 5 times with RPMI-1640 and 2 ml of a guinea pig chromosome kit (Kyokuto Seiyaku Co. Ltd.) diluted in 2 , 5 times using RPMI-1640. After incubation for 20 min at 37 ° C the culture was washed twice with F-10 containing 10% fetal bovine serum was removed and mouse fibroblasts. Then an F-1 culture solution containing 10% bovine embryo serum was added, and cultivation was carried out for another 2 days. After that, part of the cells was isolated and subjected to cloning by the method of limiting dilution.

У полученных II клонов проверили их КСФ активность, было найдено, что один клон (СН U-2) проявлял активность примерно в 10 раз более высокую, чем другие клоны. The obtained II clones were checked for their CSF activity, it was found that one clone (CH U-2) showed activity about 10 times higher than other clones.

П р и м е р 2. Выделение КСФ. PRI me R 2. The allocation of CSF.

Клетки, полученные в примере 1, выращивали в совершенно плотной популяции в двух культуральных колбах (150 см3). Клетки выделили, суспендировали в 500 мл культурального раствора F-10, содержащего 10% сыворотку бычьего эмбриона, перенесли в стеклянную вращающуюся бутыль 1580 см3 (Belco) и подвергали вихревому культивированию при вращении со скоростью 0,5 оборотов 1 мин. Когда было найдено, что клетки выросли в совершенно плотной популяции на внутренней стенке вращающейся бутылки, культуральный раствор заменили на R PMI 1640, не содержащий сыворотки. После культивирования в течение 4 дней выделили надосадочную жидкость культуры и культиварование продолжали добавлением с F-10 раствора, содержащего 10% сыворотки бычьего эмбриона. После трехдневного культивирования культуральный раствор снова заменили на RPMI 1640, не содержащий сыворотки, и через 4 дня выделили надосадочную жидкость культуры. Путем повторения этих способов каждую наделю получали 500 мл не содержащую сыворотки надосадочную жидкость в расчете на одну бутыль. Кроме того, этот способ дает возможность выделять надосадочную жидкость культуры при поддержании клеток в течение существенно удлиненного периода.The cells obtained in example 1 were grown in a completely dense population in two culture flasks (150 cm 3 ). Cells were isolated, suspended in 500 ml of an F-10 culture solution containing 10% bovine embryo serum, transferred to a 1580 cm 3 glass rotating bottle (Belco), and subjected to vortex culture at 0.5 rpm rotation for 1 minute. When it was found that the cells had grown in a completely dense population on the inner wall of the rotating bottle, the culture solution was replaced with serum-free PMI 1640. After culturing for 4 days, the culture supernatant was isolated and cultivation was continued by adding with F-10 a solution containing 10% bovine embryo serum. After a three-day cultivation, the culture solution was again replaced with serum-free RPMI 1640, and after 4 days the culture supernatant was isolated. By repeating these methods, each plot received 500 ml of serum-free supernatant per bottle. In addition, this method makes it possible to isolate the supernatant of the culture while maintaining the cells for a substantially extended period.

Порцию, содержащую 5000 мл надосадочной жидкости полученной культуры, смешали с 0,01% Твин 20 и сконцентрировали примерно в 1000 раз путем ультрафильтрации через фильтры Hollow Fiber DC-4 and Amicon PM-10 (Amicon). A portion containing 5000 ml of the supernatant of the obtained culture was mixed with 0.01% Tween 20 and concentrated approximately 1000 times by ultrafiltration through Hollow Fiber DC-4 and Amicon PM-10 (Amicon) filters.

Концентрат очищали следующими способами. The concentrate was purified by the following methods.

(I) Порцию (5 мл) сконцентрированного поверхностного слоя культуры подвергали гель-фильтрации на колонке Ultrogel АСА54 (диаметр 4,6 см, длина 90 см, LKB) при скорости потока примерно 50 мл/ч с 0,01 моль/л Трис-HCl буфером (рН 7,4), содержащим 0,15 моль/л NaCl и 0,01% Твин 20 (Nakai Kagaku Co. Ltd. ). Колонку откалибровали с помощью сыворотки бычьего альбумина (мол.м. 67000), овоальбумина (мол. м. 45000) и цитохрома С (мол.м. 12400). После окончания гель-фильтрации 0,1 мл каждой из фракций разбавили в 10 раз, и провели направленный отбор активных фракций с помощью вышеописанного способа определения активности стимулирующей колонии (КСА) (в). Найдено, что фракции с Ve 400-700 мл проявляют макрофаг-доминантную колониистимулирующую активность, в то время как фракции с Ve 800-1200 мл проявляют гранулоцит-доминантную активность, стимулирующую колонии. Поэтому последние фракции собрали и сконцентрировали до объема примерно 5 мл на ультрафильтрующем устройстве с РМ-10 (Аmico). (I) A portion (5 ml) of the concentrated surface layer of the culture was subjected to gel filtration on an Ultrogel ACA54 column (diameter 4.6 cm, length 90 cm, LKB) at a flow rate of about 50 ml / h with 0.01 mol / L Tris- HCl buffer (pH 7.4) containing 0.15 mol / L NaCl and 0.01% Tween 20 (Nakai Kagaku Co. Ltd.). The column was calibrated using bovine albumin serum (mol. M. 67000), ovoalbumin (mol. M. 45000) and cytochrome C (mol. M. 12400). After gel filtration, 0.1 ml of each of the fractions was diluted 10 times, and a directed selection of active fractions was carried out using the above-described method for determining the activity of a stimulating colony (CSA) (c). It was found that fractions with Ve 400-700 ml exhibit macrophage-dominant colony stimulating activity, while fractions with Ve 800-1200 ml exhibit granulocyte-dominant colony stimulating activity. Therefore, the latter fractions were collected and concentrated to a volume of about 5 ml on an ultrafiltration device with PM-10 (Amico).

(II) К концентрированным фракциям добавляли водный раствор 0,1% трифторуксусной кислоты, содержащий 30% н-пропанола (для определения аминокислотной последовательности, поставляемый фирмой "Тokyo Kasei K.K."). После выдерживания смеси во льду в течение примерно 15 мин осадок удалили путем центрифугирования в течение 10 мин при 15000 оборотах в минуту. Надосадочную жидкость адсорбировали на колонке С18 μ -Бондапак (8 мм х 30 см для полупрепаративного использования, Waters), уравновешенной водным раствором, содержащим н-пропанол и трифторуксусную кислоту, колонку непрерывно элюировали водным раствором 0,1% трифторуксусной кислоты, содержащим н-пропанол, который имел линейный градиент концентрации 30-60% Использовали жидкостный хроматограф высокого давления фирмы "Хитачи", модель 685-50(Hitaсhi. Ltd.) и детектор "Хитачи" модель 638-41 (Hitachi, Ltd.). (II) To the concentrated fractions was added an aqueous solution of 0.1% trifluoroacetic acid containing 30% n-propanol (to determine the amino acid sequence supplied by Tokyo Kasei K.K.). After keeping the mixture in ice for about 15 minutes, the precipitate was removed by centrifugation for 10 minutes at 15,000 rpm. The supernatant was adsorbed on a C18 μ-Bondapak column (8 mm x 30 cm for semi-preparative use, Waters) balanced with an aqueous solution containing n-propanol and trifluoroacetic acid; the column was continuously eluted with an aqueous solution of 0.1% trifluoroacetic acid containing n-propanol which had a linear concentration gradient of 30-60% A Hitachi high pressure liquid chromatograph, model 685-50 (Hitahi. Ltd.) and a Hitachi detector model 638-41 (Hitachi, Ltd.) were used.

Для определения величин поглощения одновременно на 220 нм и на 280 нм. После элюирования, 10 мкл каждой из фракций разбавили в 100 раз, и провели направленный отбор активных фракций с помощью вышеописанного способа определения колонистимулирующей активности (в). Найдено, что пики, элюирование 40% н-пропанолом, обладают активностью стимулирующей колонии, поэтому их собрали, подвергли повторному хроматографированию в тех же самых условиях, и тем же самым способом определили их активность стимулирующую колонию. Снова наблюдали активность в пиках в 40% н-пропаноле. Поэтому эти пики собрали (4 фракции 4 мл) и высушили замораживанием. To determine the absorption values simultaneously at 220 nm and 280 nm. After elution, 10 μl of each of the fractions was diluted 100 times, and a directed selection of the active fractions was carried out using the above method for determining colony stimulating activity (c). It was found that the peaks, eluting with 40% n-propanol, have the activity of a stimulating colony, therefore they were collected, re-chromatographed under the same conditions, and their activity of the stimulating colony was determined in the same way. Again activity was observed at peaks in 40% n-propanol. Therefore, these peaks were collected (4 fractions 4 ml) and dried by freezing.

(III) Полученный сублимационной сушкой порошок растворили в 200 мкл водного раствора, 0,1% трифторуксусной кислоты содержащей 40% н-пропанола, и раствор подвергали жидкостной хроматографии высокого давления на колонке ТSK-G3000SW (Тoуо Soda Manufacturing Co. Ltd. 7,5 ммх 60 см). Элюирование проводили с тем же самым водным раствором при скорости потока 0,4 мл/мин и фракции собирали порциями по 0,4 мл с помощью собирателя фракций FRAC-100 (Pharmacia Fine Chemical). Каждую из взятых фракций проверяли для определения ее колониистимулирующей активностью с помощью такого же способа, какой описан выше, и активность наблюдали во фракциях с временами удерживания 37-38 мин (соответствующей молекулярной массе примерно 2 х104). Активные фракции выделяли и очищали на аналитической колонке μ -Bondapak C18 (4,6 мм х 30 см). Основные пики выделили и высушили вымораживанием. Полученный образец проанализировали с помощью способа определения колониистимулирующей активности (а). Найдено, что он обладал активностью человеческого Г-КСФ.(III) The freeze-dried powder was dissolved in 200 μl of an aqueous solution, 0.1% trifluoroacetic acid containing 40% n-propanol, and the solution was subjected to high pressure liquid chromatography on a TSK-G3000SW column (Touo Soda Manufacturing Co. Ltd. 7.5 mmx 60 cm). Elution was performed with the same aqueous solution at a flow rate of 0.4 ml / min and fractions were collected in 0.4 ml portions using a fraction collector FRAC-100 (Pharmacia Fine Chemical). Each of the fractions taken was checked to determine its colony-stimulating activity using the same method as described above, and activity was observed in fractions with retention times of 37-38 min (corresponding to a molecular weight of about 2 x 10 4 ). Active fractions were isolated and purified on a μ-Bondapak C18 analytical column (4.6 mm x 30 cm). The main peaks were isolated and freeze dried. The resulting sample was analyzed using the method for determining colony-stimulating activity (a). It was found that he possessed the activity of human G-CSF.

П р и м е р 3. Определение аминокислотной последовательности
(I) Определение N-концевой аминокислотной последовательности.
PRI me R 3. Determination of amino acid sequence
(I) Determination of the N-terminal amino acid sequence.

Образец подвергали разложению Эдмана с помощью газофазного определителя последовательности (Applied Biosystems), и полученную РТН-аминокислоту анализировали обычными способами с помощью жидкостного хроматографа высокого давления (Beckman Instruments) и колонки Ultrasphere ODS (Beckman Instruments). Колонку (5 мкм, 4,6 мм диаметром и длиной 250 мм) уравновесили исходным буфером водный раствор, содержащий 15 миллимоль/л натрийацетатного буфера (рН 4,5) и 40% ацетонитрила, и ввели образец (растворенный в 20 мкл исходного буфера). Разделение осуществляли при изократическом элюировании исходным буфером. Скорость потока составляла 1,4 мл/мин, а температуру колонки поддерживали при 40оС. Детектирование РТН-аминокислоты осуществляли, используя поглощения в ультрафиолетовом диапазоне на длинах волн 269 и 320 нм. Стандартные образцы РТН-аминокислоты (Sigma) в 2-наномолярных порциях разделяли на той же самой линии, чтобы определить их времена удерживания, которые сравнивали с временами испытываемых образцов. В результате найдено, что образец имел следующую аминокислотную последовательность из 40 остатков от N-конца. Н2N-Тhr-Про-Лей-Глу-Про-Ала-Сер-Сер-
(10) Лей-Про-Глн-Сер -Phе-Лей-Лей-Лиз-Цис-
(20) Лей-Глу-Глн-Вал-Арг-Лиз-Иле-Глн-Глу-
(30) Асп-Глу- Ала-Лей-Глн-Глу-Лиз-Лей-
(40) Цис-Ала-Тhr-Туr-Лиз- (II) Разложение бромцианом.
The sample was digested with Edman using a gas phase sequencer (Applied Biosystems), and the resulting PTH amino acid was analyzed by conventional methods using a Beckman Instruments HPLC and an Ultrasphere ODS column (Beckman Instruments). A column (5 μm, 4.6 mm diameter and 250 mm long) was equilibrated with an initial buffer in an aqueous solution containing 15 mmol / L sodium acetate buffer (pH 4.5) and 40% acetonitrile, and a sample was introduced (dissolved in 20 μl of the original buffer) . Separation was carried out with isocratic elution with the original buffer. The flow rate was 1.4 ml / min and the column temperature was maintained at 40 C. Detection of PTH-amino acids was performed using the absorption in the UV range at wavelengths between 269 and 320 nm. Standard samples of PTH amino acids (Sigma) in 2-nanomolar portions were separated on the same line to determine their retention times, which were compared with the times of the tested samples. As a result, it was found that the sample had the following amino acid sequence of 40 residues from the N-terminus. H 2 N-Thr-Pro-Lei-Glu-Pro-Ala-Ser-Ser-
(10) Lei-Pro-Gln-Ser -Phe-Lei-Lei-Liz-Cis-
(20) Ley-Glu-Gln-Val-Arg-Liz-Ile-Gln-Glu-
(30) Asp-Glu-Ala-Ley-Gln-Glu-Liz-Ley-
(40) Cis-Ala-Thr-Tur-Liz- (II) Decomposition by bromine cyan.

Образец растворили в 70%-ной муравьиной кислоте. К раствору добавили 200 эквивалентных количеств бромциана, который очищали сублимацией. Смесь оставили на ночь при 37оС для реакции. Продукт реакции высушили вымораживанием и фракционировали с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии и на колонке ТSKG3000SW (Тoyo Soda Manufacturins CO. Ltd.), получив четыре пика. Пики назвали CN-1, CN-2, СN-3, СN-4 в порядке убывания молекуляpной массы. Первые два пика (СN-1 и CN-2) имели лучшие выходы, и их аминокислотные последовательности проанализировали с помощью автоматического газофазного определителя последовательности (Applied Biosystems) при тех же самых условиях, какие использовали в (I).The sample was dissolved in 70% formic acid. 200 equivalent amounts of cyanogen bromide were added to the solution, which was purified by sublimation. The mixture was left overnight at 37 ° C for reaction. The reaction product was freeze dried and fractionated by high performance liquid chromatography and on a TSKG3000SW column (Toyo Soda Manufacturins CO. Ltd.) to obtain four peaks. The peaks were named CN-1, CN-2, CN-3, CN-4 in decreasing molecular weight. The first two peaks (CN-1 and CN-2) had better yields, and their amino acid sequences were analyzed using an automatic gas phase sequence determiner (Applied Biosystems) under the same conditions as those used in (I).

В результате найдено, что СN-1 представляет собой пептид от N-конца протеина Г-КСФ, а СN-2 имел следующую аминокислотную последовательность: Про-Ала-Фен-Ала-Сер-Ала-Фен- Глн-Aрг-Арг-Ала-Гли-Гли-Вал- Лей-Вал-Ала-Сер-Гис-Лей-Глн- (III) Разложение трипсином. As a result, it was found that CN-1 is a peptide from the N-terminus of the G-CSF protein, and CN-2 had the following amino acid sequence: Pro-Ala-Fen-Ala-Ser-Ala-Fen-Gln-Arg-Arg-Ala -Gly-Gli-Val- Lei-Val-Ala-Ser-Gis-Lei-Gln- (III) Trypsin decomposition.

Образец растворили в 0,1 моль/л трис-HCl буфере (рН 7,4), содержащем 8 моль/л мочевины и раствор смешали с 0,1 моль/л трис-НСl буфером (рН 7,4), содержащим 0,1,2-меркаптоэтанола, чтобы получить конечную концентрацию мочевины 2 моль/л. Добавляли ТРСК-обработанный трипсин (Sigma) с тем, чтобы отношение образца к ферменту составляло 50:1. Смесь выдерживали в течение 4 ч при 25оС и после добавления равного количества ТРСК-обработанного трипсином, смесь выдерживали в течение еще 16 ч при 25оС. После этого реакционный продукт подвергали высокоскоростной обращеннофазной колоночной хроматографии на колонке С8 (Yamamura Kagaku K.K.) при элюировании 0,1% трифторуксусной кислотой, содержащей н-пропанол, который имел линейный градиент плотности 5-60% Несмотря на то, что наблюдали несколько пиков при измерении поглощения на 280 нм, анализировали основной пик для определения его аминокислотной последовательности с помощью автоматического газофазного определителя последовательности (Applied Biosystems) при тех же самых условиях, какие и использовали в (I). В результате найдено, что основной пик представлял собой пептид, имеющий следующую последовательность, которая содержала часть CN-2 фрагмента, показанного в (II): Глн-Лей-Асп-Вал-Ала-Асп-Фен-Ала-Тре- Тре-Иле-Трп-Глн-Глн-Мет-Глу-Глу-Лей- Гли-Meт-Ала-Про-Ала-Лей-Глн-Про-Тре- Глн-Гли-Ала-Meт-Про-Ала-Фен-Ала-Cер-
П р и м е р 4. Получение ДНК зонда (I) Синтез зонда (IWQ)
Тридцать последовательных нуклеотидов (см.фиг.1) получили на основании последовательности 10 аминокислот (Иле-Трп-Глн-Глн-Meт-Глу-Глу-Лей-Гли-Мет), включенной в аминокислотную последовательность, полученную в примере 3(II). Нужно сделать одно замечание относительно обозначения нуклеотидов, показанных на фиг. 1, например, нуклеотид в положении 9, от 5'-конца представляет собой эквимолярную смесь dА и dG. Исходные нуклеотиды представляют собой по большей части димеры, но если необходимо, используют также и монокулеотиды. В колонку, снабженную стеклянным фильтром, загрузили 20 мг исходной нуклеотидной смолы Ap-d(G) (Yamasa Snoyu Co. Ltd.). После повторной промывки хлористым метиленом 4,4'-диметокситритиловую группу исключили путем обработки раствором метиленхлорида, содержещего 3% трихлоруксусную кислоту. Затем колону промыли несколько раз 1 мл метиленхлорида. После того, как колонку промыли безводным пиридином, чтобы заместитель растворитель, туда добавили 20 мг нуклеотидного димера (DMTr) ApТр (NHR3), (Nippon Zeon; NHR3-триэтиламмоний; DMТr-диметокситритил) и 0,2 мл пиридина и внутреннюю часть колонки высушили вакуумом с помощью вакуумного насоса. Затем добавили 20 мг 2,4,6-триметилбензолсульфонил-3-нитротриазолида (MSNТ of Wako Pure Chemical Inductries, Ltd.) и 0,2 мл безводного пиридина, и внутреннюю часть колонки вытеснили газообразным азотом. Нуклеотидную смолу сконцентрировали с димером путем реакции в течение 45 мин при комнатной температуре при перемешивании время от времени. После окончания реакции колонку промыли пиридином, и непрореагировавшие ОН группы ацетилировали пиридиновым раствором, содержащим избыток уксусного ангидрида и 4-диметиламинопиридина. После промывания колонки пиридином сконденсировали следующие димеры или мономеры, написанные по порядку, путем повторения вышеописанных способов (DMТr)Ip(NHR3), (DMTr)GpGp(NНR3), (DMTr)Ip(NHR3), эквимолярная смесь (DMTr) CрТр(ТНR3) и (DMTr) ТрТр(NHR3), эквимолярная смесь (DMTr) ApAp(NHR3) и (DMTr)ApGp(NHR3), эквимолярная смесь (DMTr)ApGp(NHR3) и (DMTr)GpGp(NHR3), (DMTr)GpAp(NHR3), (DMTr) TpGp(NHR3), эквимолярная смесь (DMTr)ApAp(NHR3) и (DMTr)GpAp(NHR3), (DMTr)СрАр(NHR3), эквимолярная смесь (DMTr)ApAp(NHR3) и (DMTr)ApGp (NHR3), (DMТr)GpCp(NHR3), (DMTr)ТpGp(NHR3), (DMTr)Ip(NHR3) и (DMTr)ApТp(NHR3), причем все эти нуклеотиды поставляются фирмой "Nippon Zeon" за исключением (DMТr) Ip (NHR3), который поставляется фирмой "Yamasa Shoyu Co. Ltd.". После окончания реакции на конечной стадии смолу последовательно промывали пиридином, метиленхлоридом и эфиром без ацилирования и после этого сушили. Высушенную смолу суспендировали в 1,7 мл cмеси пиридина (0,5 мл), воды (0,2 мл) и диоксана (1 мл), содержащей 1 моль/л тетраметилгуанидина и 1 моль/л α-пиколиналдоксима. Суспензию оставили стоять в течение ночи при комнатной температуре и сконцентрировали до объема 100-200 мкл под вакуумом. Концентрат смешали с небольшим количеством (2-3 капли) пиридина и 2-3 мл концентрированного водного аммиака, смесь нагревали при 55оС в течение 6 ч. После экстрагирования этилацетатом водный слой отделили и сконцентрировали под вакуумом. Концентрат растворили в растворе 50 ммоль/л ацетата триэтиламмония (рН 7,0) и раствор подвергали хроматографии на колонке С-18, (1,0 15 см; Waters), причем элюирование осуществляли ацетонитрилом (линейный градиент плотности 10-30%) в растворе 50 миллимоль/л ацетата триэтиламмония (рН 7,0). Пик фракции, элюируемой при концентрации ацетонитрила примерно 25% сконцентрировали под вакуумом.
The sample was dissolved in 0.1 mol / L Tris-HCl buffer (pH 7.4) containing 8 mol / L urea and the solution was mixed with 0.1 mol / L Tris-HCl buffer (pH 7.4) containing 0, 1,2-mercaptoethanol to obtain a final urea concentration of 2 mol / L. TRPC-treated trypsin (Sigma) was added so that the ratio of sample to enzyme was 50: 1. The mixture was kept for 4 hours at 25 ° C and after adding an equal amount of TPCK-treated trypsin, and the mixture was heated for another 16 hours at 25 C. Thereafter, the reaction product was subjected to reversed phase high column chromatography on C8 column (Yamamura Kagaku KK) at eluting with 0.1% trifluoroacetic acid containing n-propanol, which had a linear density gradient of 5-60% Although several peaks were observed when measuring absorbance at 280 nm, the main peak was analyzed to determine its amino acid last consistency using an automatic gas phase sequencer (Applied Biosystems) under the same conditions as used in (I). As a result, it was found that the main peak was a peptide having the following sequence, which contained part of the CN-2 fragment shown in (II): Gln-Lei-Asp-Val-Ala-Asp-Fen-Ala-Tre-Tre-Ile -Trp-Gln-Gln-Met-Glu-Glu-Lei-Gli-Met-Ala-Pro-Ala-Lei-Gln-Pro-Tre-Gln-Gli-Ala-Met-Pro-Ala-Fen-Ala-Ser -
PRI me R 4. Obtaining DNA probe (I) Synthesis of the probe (IWQ)
Thirty consecutive nucleotides (see FIG. 1) were obtained on the basis of the sequence of 10 amino acids (Ile-Trp-Gln-Gln-Met-Glu-Glu-Lei-Gli-Met) included in the amino acid sequence obtained in example 3 (II) . One point to be made regarding the designation of the nucleotides shown in FIG. 1, for example, the nucleotide at position 9, from the 5 ′ end, is an equimolar mixture of dA and dG. The starting nucleotides are for the most part dimers, but if necessary, monoculeotides are also used. A column equipped with a glass filter was charged with 20 mg of the starting nucleotide resin Ap-d (G) (Yamasa Snoyu Co. Ltd.). After repeated washing with methylene chloride, the 4,4'-dimethoxytrityl group was excluded by treatment with a methylene chloride solution containing 3% trichloroacetic acid. Then the column was washed several times with 1 ml of methylene chloride. After the column was washed with anhydrous pyridine to replace the solvent, 20 mg of the nucleotide dimer (DMTr) ApTp (NHR 3 ), (Nippon Zeon; NHR 3 -triethylammonium; DMT-dimethoxytrityl) and 0.2 ml of pyridine and the inside were added the columns were vacuum dried using a vacuum pump. Then 20 mg of 2,4,6-trimethylbenzenesulfonyl-3-nitrotriazolid (MSNT of Wako Pure Chemical Inductries, Ltd.) and 0.2 ml of anhydrous pyridine were added, and the inside of the column was displaced with nitrogen gas. The nucleotide resin was concentrated with the dimer by reaction for 45 minutes at room temperature with stirring from time to time. After completion of the reaction, the column was washed with pyridine, and unreacted OH groups were acetylated with a pyridine solution containing an excess of acetic anhydride and 4-dimethylaminopyridine. After washing the column with pyridine, the following dimers or monomers, written in order, were condensed by repeating the above methods (DMTr) Ip (NHR 3 ), (DMTr) GpGp (NHR 3 ), (DMTr) Ip (NHR 3 ), equimolar mixture (DMTr) СрТр (ТНR 3 ) and (DMTr) ТТр (NHR 3 ), equimolar mixture (DMTr) ApAp (NHR 3 ) and (DMTr) ApGp (NHR 3 ), equimolar mixture (DMTr) ApGp (NHR 3 ) and (DMTr) GpGp (NHR 3 ), (DMTr) GpAp (NHR 3 ), (DMTr) TpGp (NHR 3 ), an equimolar mixture (DMTr) ApAp (NHR 3 ) and (DMTr) GpAp (NHR 3 ), (DMTr) СрАр (NHR 3 ), an equimolar mixture of (DMTr) ApAp (NHR 3 ) and (DMTr) ApGp (NHR 3 ), (DMTr) GpCp (NHR 3 ), (DMTr) TPp (NHR 3 ), (DMTr) Ip (NHR 3 ) and ( DMTr) ApTp (NHR 3 ), all of these nucleotides being supplied by Nippon Zeon, except (DMTr) Ip (NHR 3 ), which is supplied by Yamasa Shoyu Co. Ltd. After the reaction at the final stage, the resin was washed successively with pyridine, methylene chloride and ether without acylation and then dried. The dried resin was suspended in 1.7 ml of a mixture of pyridine (0.5 ml), water (0.2 ml) and dioxane (1 ml) containing 1 mol / L tetramethylguanidine and 1 mol / L α-picoline aldoxime. The suspension was left to stand overnight at room temperature and concentrated to a volume of 100-200 μl under vacuum. The concentrate was mixed with a small amount (2-3 drops) of pyridine and 3.2 ml of concentrated aqueous ammonia, the mixture was heated at 55 ° C for 6 hours. After extraction with ethyl acetate, the aqueous layer was separated and concentrated in vacuo. The concentrate was dissolved in a solution of 50 mmol / L triethylammonium acetate (pH 7.0) and the solution was chromatographed on a C-18 column, (1.0-15 cm; Waters), eluting with acetonitrile (linear density gradient 10-30%) in a solution of 50 mmol / L triethylammonium acetate (pH 7.0). The peak of the fraction eluted with an acetonitrile concentration of approximately 25% was concentrated in vacuo.

К концентрату добавили 80% уксусную кислоту и смесь оставили стоять в течение 30 мин при комнатной температуре. После экстрагирования этилацетатом отделили водный слой и сконцентрировали его под вакуумом. Полученный концентрат затем очищали жидкостной хроматографией высокого давления на колонке С-18 (поставляемой Senshu Kagaku K.K. SSC-ODS- 272, диаметр 6х 200 мм). Элюирование проводили ацетонитрилом (линейный градиент плотности 10-20%) в растворе 50 ммоль/л ацетата триэтиламмония (рН 7,0). Синтетическую ДНК получили с выходом не ниже, чем 10А260 единиц.80% acetic acid was added to the concentrate, and the mixture was allowed to stand for 30 minutes at room temperature. After extraction with ethyl acetate, the aqueous layer was separated and concentrated in vacuo. The resulting concentrate was then purified by high pressure liquid chromatography on a C-18 column (supplied by Senshu Kagaku KK SSC-ODS-272, diameter 6x200 mm). Elution was performed with acetonitrile (linear gradient of density 10-20%) in a solution of 50 mmol / L triethylammonium acetate (pH 7.0). Synthetic DNA was obtained with a yield of no lower than 10A 260 units.

Анализ с помощью метода определения последовательности по Максаму-Джилберту [Maxam-Gilbert, Meth. Еnzym. 65,499(1980)] показал, что полученный олигонуклеотид имел нуклеотидную последовательность, показанную на рис.1. Analysis using the method of determining the sequence of Maxam-Gilbert [Maxam-Gilbert, Meth. Enzym. 65,499 (1980)] showed that the obtained oligonucleotide had the nucleotide sequence shown in Fig. 1.

(II) Cинтез зонда (А). (II) Synthesis of the probe (A).

Четырнадцать последовательностей нуклеотидов (см.фиг.1) получили на основе последовательности 5 аминокислот (Мет-Про-Ала-Фен-Ала), включенных в аминокислотную последовательность, полученную в примере 3. Fourteen nucleotide sequences (see FIG. 1) were obtained based on the sequence of 5 amino acids (Met-Pro-Ala-Fen-Ala) included in the amino acid sequence obtained in example 3.

Способы синтеза были аналогичны тем, которые использовали при получении зонда (IWQ) и следующие нуклеотиды сконденсировали в нуклеотидную смолу Ар-d (Т) (Yamasa Shoyu Cо. Ltd.) в порядке написания: (DMTr)CpAp(NHR3), (DMTr)GpGp(NHR3), эквимолярная смесь (DMTr)CpAp(NHR3), (DMTr)CрTр(NHR3), (DMTr)CpGp(NНR3) и (DMTr)CpCp(NHR3), эквимолярная смесь (DMTr)ApGp(NНR3), (DMTr)TpGp(NHR3), (DMTr)GpGp(NHR3) и (DMTr)CрGp(NHR3), (DMTr)ApAp(NHR3), эквимолярная смесь (DMTr)CpAp(NНR3) и (DMTr)CpGp(NHR3), и (DMТr)Gp(NНR3), причем все нуклеотиды поставляются фирмой Nippon Zeon. Cинтетическую ДНК получили с выходом примерно 10А260 единиц. Анализ с помощью метода определения последовательности по Максаму-Джилберту показал, что полученный олигонуклеотид имел нуклеотидную последовательность, показанную на фиг.1.The synthesis methods were similar to those used in the preparation of the probe (IWQ) and the following nucleotides were condensed into the nucleotide resin Ap-d (T) (Yamasa Shoyu Co. Ltd.) in the order of writing: (DMTr) CpAp (NHR 3 ), (DMTr ) GpGp (NHR 3 ), equimolar mixture (DMTr) CpAp (NHR 3 ), (DMTr) CpTp (NHR 3 ), (DMTr) CpGp (NHR 3 ) and (DMTr) CpCp (NHR 3 ), equimolar mixture (DMTr) ApGp (NHR 3 ), (DMTr) TpGp (NHR 3 ), (DMTr) GpGp (NHR 3 ) and (DMTr) CpGp (NHR 3 ), (DMTr) ApAp (NHR 3 ), equimolar mixture (DMTr) CpAp (NHR 3 ) and (DMTr) CpGp (NHR 3 ), and (DMTr) Gp (NHR 3 ), all nucleotides being supplied by Nippon Zeon. Synthetic DNA was obtained with a yield of approximately 10A 260 units. Analysis using the Maxam-Gilbert sequence determination method showed that the obtained oligonucleotide had the nucleotide sequence shown in FIG.

(III) Cинтез зонда (LC). (III) Synthesis of the probe (LC).

Автоматический синтез ДНК осуществляли с помощью синтезатора ДНК, модель 380А "Аpplied Biosystems". Эту методику, основанную на принципах, описанных Саruthers et al. [J. Am. Сhem. Soc. 103,3185 (1981)] обычно называют фосфорамидитной методикой. Automatic DNA synthesis was performed using a DNA synthesizer, model 380A "Applied Biosystems". This technique is based on the principles described by Suthers et al. [J. Am. Chem. Soc. 103.3185 (1981)] is commonly referred to as the phosphoramidite technique.

Фосфорамидитную форму (DMTr)-dT, предварительно активированную тетразолом, конденсируют к dG-S (Si подложка), где деблокируют 5'-диметокситритильную группу (DMTr). После этого непрореагировавшие группы ацетилируют и окисляют йодом в присутствии воды, чтобы получить группы фосфорила. После деблокирования группы DMTr повторяют конденсацию таким же образом до тех пор, пока не синтезируют 24 нуклеотида, имеющих последовательность, показанную на фиг.1. Эти нуклеотиды отщепляют от подложки, деблокируют и очищают с помощью обращеннофазной жидкостной хроматографии высокого давления на колонке С-18 (Senshu Kagaku Co. Ltd. SSC-ODS-272). The phosphoramidite form (DMTr) -dT preactivated with tetrazole is condensed to dG-S (Si substrate), where the 5'-dimethoxytrityl group (DMTr) is released. After this, the unreacted groups are acetylated and oxidized with iodine in the presence of water to obtain phosphoryl groups. After the release of the DMTr group, the condensation is repeated in the same way until 24 nucleotides having the sequence shown in FIG. 1 are synthesized. These nucleotides are cleaved from the support, released and purified by high pressure reverse phase liquid chromatography on a C-18 column (Senshu Kagaku Co. Ltd. SSC-ODS-272).

П р и м е р 5. Культивирование клеток CHU-2 и получение иРНК
1/Культивирование и выделение клеток СНU-2.
PRI me R 5. Cultivation of CHU-2 cells and obtaining mRNA
1 / Cultivation and isolation of CHU-2 cells.

Адаптированные клетки СНU-2 выращивали в совершенно плотной популяции в двух колбах для культивирования (150 см2), выделили, суспендировали в 500 мл культурального раствора RРMI 1640, содержащего 10% сыворотки бычьего эмбриона, перенесли в стеклянную вращающуюся бутыль 1580 см2 (Belco) и культивировали при вращении в течение 4 дней со скоростью 0,5 оборота в 1 мин. Когда было найдено, что клетки выросли в совершенно плотной популяции на внутренней стенке вращающейся бутыли, культуральный раствор удалили на вращающейся бутыли, и в нее загрузили 100 мл предварительно нагретого (37оС) физиологического солевого раствора, содержащего 0,02% ЭДТА. После нагревания при 37оС в течение 2 мин клетки отделили с внутренней стенки колбы путем отсасывания пипеткой. Полученную клеточную суспензию центрифугирования при 1500 оборотах в минуту в течение 10 мин, чтобы получить клеточный осадок после центрифугирования. Клетки повторно суспендировали в 5 мл физиологического солевого раствора, не содержащего ЭДТА. Суспензию центрифугировали при 1500 оборотах в 1 мин в течение 10 мин, чтобы получить клеточный осадок после центрифугирования (влажный вес примерно 0,8 г). Полученные таким образом клетки хранили замороженными при -80оС до тех пор, пока их не подвергли процедуре экстракции РНК.Adapted CHU-2 cells were grown in a completely dense population in two culture flasks (150 cm 2 ), isolated, suspended in 500 ml of a culture solution of RPMI 1640 containing 10% bovine embryo serum, transferred to a 1580 cm 2 glass rotating bottle (Belco) and cultured under rotation for 4 days at a speed of 0.5 revolution in 1 min. When it was found that the cells grew in a completely dense population on the inner wall of the rotating bottle, the culture solution was removed on the rotating bottle and 100 ml of pre-heated (37 ° C) physiological saline solution containing 0.02% EDTA was loaded into it. After heating at 37 ° C for 2 minutes, the cells were separated from the inside wall of the flask by suction pipette. The resulting cell suspension was centrifuged at 1,500 rpm for 10 minutes to obtain a cell pellet after centrifugation. Cells were resuspended in 5 ml of physiological saline without EDTA. The suspension was centrifuged at 1500 rpm for 1 min for 10 min to obtain a cell pellet after centrifugation (wet weight of about 0.8 g). The thus-obtained cells were stored frozen at -80 ° C until the moment they are subjected to RNA extraction procedure.

2) Очистки иРНК. 2) Purification of mRNA.

Выделение иРНК из клеток СНU-2, полученных в 1) осуществляли с помощью способов, которые были по существу такими же как способы, описанные в "Molесular Cloning", Maniatis et al. Сold Spring Harbor, р. 196, 1982. Замороженные клетки СНU-2 (влажный вес 3,8 г) суспендировали в 20 мл раствора 6 моль/л гуанидина [6 моль/л изотиодианата гуанидиния, 5 ммоль/л цитрата натрия (рН 7,0) 0,1 моль/л β -меркаптоэтанола и 0,5% саркозилсульфата натрия] и cуспензию хорошо перемешали вихревым вращением в течение 2-3 мин. Смесь подвергали 10 циклам всасывания и выпрыскивания шприцем (емкостью 20 мл), снабженного иглой 18G. Примерно 6 мл вязкого гуанидиниевого раствора, содержащего разорванные клетки, наслоили на 6-мл подушку из 5,7 моль/л CsCl в 0,1 моль/л ЭДТА (рН 7,5) в центрифужной пробирке Вeckman SW40Тi polyallomer таким образом, чтобы пробирка была полностью заполнена. Четыре центрифужные пробирки приготовили описанными выше способами и их центрифугировали при скорости 30000 оборотов в 1 мин в течение 15 ч при 20оС. Полученные осадки после центрифугирования промыли три раза небольшим количеством 70% этанола.Isolation of mRNA from CHU-2 cells obtained in 1) was carried out using methods that were essentially the same as the methods described in "Molesular Cloning", Maniatis et al. Сold Spring Harbor, r. 196, 1982. Frozen CHU-2 cells (wet weight 3.8 g) were suspended in 20 ml of a solution of 6 mol / L guanidine [6 mol / L guanidinium isothiodianate, 5 mmol / L sodium citrate (pH 7.0) 0.1 mol / L β-mercaptoethanol and 0.5% sodium sarcosyl sulfate] and the suspension were mixed well by vortex rotation for 2-3 minutes. The mixture was subjected to 10 suction and injection cycles with a syringe (20 ml capacity) equipped with an 18G needle. About 6 ml of viscous guanidinium solution containing torn cells was layered on a 6 ml pad of 5.7 mol / L CsCl in 0.1 mol / L EDTA (pH 7.5) in a Beckman SW40Ti polyallomer centrifuge tube so that the tube was completely filled. Four centrifuge tubes were prepared by methods described above and centrifuged at 30,000 rpm for 1 minute for 15 hours at 20 C. The resulting precipitates after centrifugation, washed three times with a small amount of 70% ethanol.

Осадки от центрифугирования, полученные из соответствующих пробирок, смешали, растворили в 550 мкл воды и обработали, чтобы получить концентрацию NaCl 0,2 моль/л. После обработки смесью 1:1 фенола и хлороформа, а затем одним хлороформом, добавили 2,5 объема этанола, чтобы осадить всю РНК (примерно 10,1 мг всей РНК получили из 3,8 г влажных клеток). Поли (А+) РНК очищали из всей РНК с помощью следующих способов аффинной хроматографии, используя преимущество прикрепления поли(А)цепи к 3'-концу иРНК. Адсорбцию на олиго (dТ)-целлюлозе (тип 7 Р-L Biochemicals) осуществляли путем пропускания через олиго (dТ)-целлюлозную колонку всей РНК в загрузочном буфере [содержащем 10 миллимоль/л трис-НСl (рН 7,5) 0,5 моль/л NaCl, 1 ммоль/л ЭДТА, и 0,1% раствора SDS] после того, как раствор нагревали при 65оС в течение 5 минут. Колонку уравновешивали тем же самым нагрузочным буфером. Элюирование поли(А+) РНК осуществляли с помощью раствора ТЕ [содержащего 10 миллимоль/л трис-НСl (рН 7,5) и 1 миллимоль/л ЭДТА] Неадсорбированный выходящий поток повторно пропустили через колонку еще раз и элюат, полученный при повторении тех же самих способов, смешали с первым погоном элюата. В результате получили 400 микрограммов поли(А+) РНК.The centrifugation pellets obtained from the respective tubes were mixed, dissolved in 550 μl of water and treated to obtain a NaCl concentration of 0.2 mol / L. After treatment with a 1: 1 mixture of phenol and chloroform, and then with one chloroform, 2.5 volumes of ethanol were added to precipitate all RNA (approximately 10.1 mg of all RNA was obtained from 3.8 g of wet cells). Poly (A + ) RNA was purified from all RNA using the following affinity chromatography methods, taking advantage of the attachment of a poly (A) chain to the 3 ′ end of the mRNA. Adsorption on oligo (dT) -cellulose (type 7 Р-L Biochemicals) was carried out by passing through the oligo (dT) -cellulose column all RNA in loading buffer [containing 10 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.5) 0.5 mol / l NaCl, 1 mmol / l EDTA and 0,1% SDS solution] after the solution was heated at 65 ° C for 5 minutes. The column was balanced with the same load buffer. Poly (A + ) RNA was eluted with a TE solution [containing 10 millimol / L Tris-Hcl (pH 7.5) and 1 millimol / L EDTA]. The non-adsorbed effluent was re-passed through the column again and the eluate obtained by repeating those the methods themselves, mixed with the first epaulet shoulder strap. The result was 400 micrograms of poly (A +) RNA.

Полученную таким образом иРНК фракционировали по размеру путем центрифугирования в градиенте плотности сахарозы в соответствии с методиками, описанными в Лабораторном руководстве Schleif and Wensink, "Practical Methods in Molecular Biology", Springer-Verlag, New York, Неidelberg, Berlin (1981). The mRNA thus obtained was size fractionated by sucrose density gradient centrifugation according to the procedures described in the Schleif and Wensink Laboratory Manual, Practical Methods in Molecular Biology, Springer-Verlag, New York, Heidelberg, Berlin (1981).

Градиент плотности сахарозы 5-25% создавали в центрифужной пробирке Backman SW40Тi. Два сахарозных раствора приготовили путем растворения 5 и 25% сахарозы, не содержащей рН-азы (Schwarz/Mann), в растворе, содержащем 0,1 моль/л NaCl, 10 миллимоль/л Трис-HCl (рН 7,5), 1 миллимоль/л ЭДТА и 0,5 SDS. 7,5) и 1 миллимоль/л ЭДТА] Неадсорбированный выходящий поток повторно пропустили через колонку еще раз и элюат, полученный при повторении тех же самих способов, смешали с первым погоном элюата. В результате получили 400 микрограммов поли(А+) РНК.A sucrose density gradient of 5-25% was created in a Backman SW40Ti centrifuge tube. Two sucrose solutions were prepared by dissolving 5 and 25% sucrose, not containing pHase (Schwarz / Mann), in a solution containing 0.1 mol / L NaCl, 10 mmol / L Tris-HCl (pH 7.5), 1 millimol / l EDTA and 0.5 SDS. 7.5) and 1 millimol / L EDTA] The non-adsorbed effluent was re-passed through the column again and the eluate obtained by repeating the same methods was mixed with the first eluate stream. The result was 400 micrograms of poly (A + ) RNA.

Полученную таким образом иРНК фракционировали по размеру путем центрифугирования в градиенте плотности сахарозы в соответствии с методиками, описанными в Лабораторном руководстве Schleif and Wensink, "Practical Methods in Molecular Biology", Springer-Verlag, New York, Неidelberg, Berlin (1981). The mRNA thus obtained was size fractionated by sucrose density gradient centrifugation according to the procedures described in the Schleif and Wensink Laboratory Manual, Practical Methods in Molecular Biology, Springer-Verlag, New York, Heidelberg, Berlin (1981).

Градиент плотности сахарозы 5-25% создавали в центрифужной пробирке Backman SW40Тi. Два сахарозных раствора приготовили путем растворения 5 и 25% сахарозы, не содержащей рН-азы (Schwarz/Mann), в растворе, содержащем 0,1 моль/л NaCl, 10 миллимоль/л Трис-HCl (рН 7,5), 1 миллимоль/л ЭДТА и 0,5 SDS. A sucrose density gradient of 5-25% was created in a Backman SW40Ti centrifuge tube. Two sucrose solutions were prepared by dissolving 5 and 25% pH-free sucrose (Schwarz / Mann) in a solution containing 0.1 mol / L NaCl, 10 mmol / L Tris-HCl (pH 7.5), 1 millimol / l EDTA and 0.5 SDS.

Восемьсот микрограммов иРНК [поли (A+)-РНК] полученной уже описанным способом, растворили в 200-500 микролитрах ТЕ раствора. Раствор нагревали при 65оС в течение 5 мин, и после резкого охлаждения, его поместили на растворы с градиентом плотности сахарозы, которые подвергали центрифугированию при 30000 оборотах в минуту в течение 20 ч. Собрали фракции массой 0,5 мл каждая, и измерили их поглощение при 260 нм. Размеры фракционированных РНК определяли на основе положений стандартных РНК (рибосомальные РНК, 28S, 18S, и 5S). В это же время определяли активность Г-КСФ каждой фракции, используя овоциты Хenopus laevis по следующими методикам. Сначала, иРНК каждой фракции перевели в водный раствор с концентрацией 1 мкг/1 мкл, овоциты были взяты от Хenopus (в возрасте примерно одного года) и раствор иРНК инжектировали таким образом, что 50-нанограммов иРНК ввели в один овоцит, десять таких овоцитов поместили в каждое из 96 углублений в микротитровальной чашке, овоциты культивировали в течение 48 ч при комнатной температуре в 10 мкл среды Берта (Barth) [88 ммоль/л NaCl; 1 ммоль/л KCl; 2,4 ммоль/л NaHCO3; 0,82 ммоль/л MgSO4; 0,33 ммоль/л Cа(NO3)2; 0,41 ммоль/л CaCl2; 7,5 ммоль/л трис-HCl (рН 7,6); пенициллин 10 мг/л и стрептомицинсульфат 10 мг/л] надосадочную жидкость культуры выделили, сконцентрировали и очистили до чистоты достаточной для определения активности Г-КСФ.Eight hundred micrograms of mRNA [poly (A + ) -RNA] obtained by the method already described, was dissolved in 200-500 microliters of a TE solution. The solution was heated at 65 ° C for 5 min, and after quenching, it was placed in solution with sucrose density gradient which was centrifuged at 30,000 rpm for 20 hours. The mass of collected fractions of 0.5 ml each, and measured their absorption at 260 nm. The sizes of fractionated RNAs were determined based on the positions of standard RNAs (ribosomal RNAs, 28S, 18S, and 5S). At the same time, the activity of G-CSF of each fraction was determined using oocytes of Henopus laevis according to the following methods. First, the mRNA of each fraction was transferred to an aqueous solution with a concentration of 1 μg / 1 μl, oocytes were taken from Henopus (about one year old) and the mRNA solution was injected so that 50 nanograms of mRNA were introduced into one oocyte, ten of these oocytes were placed in each of 96 recesses in a microtiter dish, oocytes were cultured for 48 hours at room temperature in 10 μl of Barth medium [88 mmol / L NaCl; 1 mmol / L KCl; 2.4 mmol / L NaHCO 3 ; 0.82 mmol / L MgSO 4 ; 0.33 mmol / L Ca (NO 3 ) 2 ; 0.41 mmol / L CaCl 2 ; 7.5 mmol / L Tris-HCl (pH 7.6); penicillin 10 mg / l and streptomycin sulfate 10 mg / l] culture supernatant was isolated, concentrated and purified to a purity sufficient to determine G-CSF activity.

Найдено, что активность Г-КСФ присутствовала во фракциях 15-17S. It was found that the activity of G-CSF was present in fractions 15-17S.

П р и м е р 6. Синтез КДНК (построение библиотеки КДНК pBR-линии). PRI me R 6. Synthesis of cDNA (building a library of cDNA pBR-line).

На поли (А+), полученной в примере 5, синтезировали кДНК по методу Лэнда с сотр. (Land et al. [Nucleic Acids Res. 9, 2251 (1981)] модифицированного по способу Gubler and Hoffman [Gene, 25,263 (1983)]
(I) Синтез однонитевой кДНК.
On poly (A + ) obtained in example 5, cDNA was synthesized according to the Land method with al. (Land et al. [Nucleic Acids Res. 9, 2251 (1981)] modified by the method of Gubler and Hoffman [Gene, 25,263 (1983)]
(I) Synthesis of single-stranded cDNA.

В пробирку Эппендорфа (вместимостью 1,5 мл) поместили реагенты в следующем порядке: 80 мкл реакционного буфера (500 ммоль/л KCl, 50 ммоль/л MgCl2, 250 ммоль/л трис-НСl, рН 8,3), 20 мкл 200 ммоль/л дитиотрептола, 32 мкл, 12,5 ммоль/л дезоксинуклеотидтрифосфата (содержащего по 12,5 ммоль/л каждого из дезоксиаденозинтрифосфата, дезоксигуанозинтрифосфата, дезоксицитозинтрифосфата и дезокситимидентрифосфата), 10 мкг α -32Р дезоксицитозинтрифосфата (dЦТФ) (РВ 10205 Amerscham), 32 микролитра олиго (dТ)12-18 (из фирмы P-L Biochemicals, 500 мкг/мл), 20 микрограммов поли(А+) РНК (2,1 мкг/мл) и 206 мкл дистиллированной воды. Всего 400 мкл реакционного раствора нагревали при 65оС в течение 5 мин, а после этого нагревали при 42оС в течение 5 мин. К нагретому раствору добавляли 120 единиц реверстранскриптазы (Тakara Shuzo Co. Ltd.). После проведения реакции в течение более 2 ч при 43оС добавили 2 мкл ингибитора РНК-азы (Bethesda Research Laboranories), 20 мкл ТЕ раствора, 16 мкл 100 ммоль/л пирофосфата натрия и 48 единиц (4 мкл) реверстранскриптазы, и реакцию проводили при 46оС в течение 2 ч. Реакцию гасили путем добавления 0,5 моль/л ЭДТА (8 микролитров) и 10% SDS (8 микролитров). Путем последующей обработки фенолом/хлороформом и осаждение этанолом (дважды) получили однонитевую КДНК.The reagents were placed in an Eppendorf tube (with a capacity of 1.5 ml) in the following order: 80 μl of reaction buffer (500 mmol / L KCl, 50 mmol / L MgCl 2 , 250 mmol / L Tris-Hcl, pH 8.3), 20 μl 200 mmol / L of dithiotreptol, 32 μl, 12.5 mmol / L of deoxynucleotide triphosphate (containing 12.5 mmol / L of each of deoxyadenosine triphosphate, deoxyguanosine triphosphate, deoxycytosine triphosphate and deoxytimidentrifosphate), 10 μg of α- 32 P-5-D-5-R-5-R-5-D-5-R-5-R-5-R-5 ), 32 microliters of oligo (dT) 12-18 (from the firm PL Biochemicals, 500 ug / ml), 20 micrograms of poly (A) + RNA (2.1 ug / ml) and 206 .mu.l dis illirovannoy water. Total 400 l of the reaction solution was heated at 65 ° C for 5 min and then heated at 42 ° C for 5 min. 120 units of reverstranscriptase (Takara Shuzo Co. Ltd.) were added to the heated solution. After reacting for 2 hours at 43 ° C was added 2 .mu.l of an inhibitor of RNA-ase (Bethesda Research Laboranories), 20 l of TE solution, 16 l of 100 mmol / l of sodium pyrophosphate and 48 units (4 l) reverstranskriptazy and reacted at 46 ° C for 2 hours. The reaction was quenched by adding 0.5 mol / l EDTA (8 microliters) and 10% SDS (8 microliters). Subsequent treatment with phenol / chloroform and ethanol precipitation (twice) produced single-stranded cDNA.

2) Прикрепление dC-цепи к однонитевой КДНК. 2) Attachment of the dC chain to single-stranded cDNA.

Однонитевую кДНК, полученную в 1), растворили в дистиллированной воде. К раствору добавили 60 мкл dC-цепьсодержащего буфера [400 ммоль/л какодилата калия, 50 ммоль/л трис-НСl (рН 6,9), 4 ммоль/л дитиотреитола, 1 ммоль/л CoCl2 и 1 ммоль/л дезоксицитозинтрифосфата (dЦТФ)] и смесь нагревали при 37оС в течение 5 мин. К реакционному раствору добавили 3 мкл концевой трансферазы (27 единиц/мкл, Р-L Biochemicals) и смесь нагревали при 37оС в течение 2,5 мин. После обработки фенолом/хлороформом (один раз) и осаждения этанолом (дважды), dC-привязанную КДНК растворили в 40 мкл ТЕ раствора, содержащего 100 миллимоль/л NaCl.Single-stranded cDNA obtained in 1) was dissolved in distilled water. To the solution was added 60 μl of dC-chain-containing buffer [400 mmol / L potassium cacodylate, 50 mmol / L Tris-Hcl (pH 6.9), 4 mmol / L dithiothreitol, 1 mmol / L CoCl 2 and 1 mmol / L deoxycytosine triphosphate ( dTsTF)] and the mixture was heated at 37 ° C for 5 min. To the reaction solution was added 3 l of terminal transferase (27 units / ml, P-L Biochemicals) and the mixture was heated at 37 C for 2.5 min. After treatment with phenol / chloroform (once) and precipitation with ethanol (twice), the dC-bound cDNA was dissolved in 40 μl of a TE solution containing 100 mmol / L NaCl.

3) Cинтез двухнитевой КДНК. 3) Synthesis of double-stranded cDNA.

К 40 мкл раствора ДНК, полученного в 2) добавили 4 мкл олиго (dG)12-18 (200 мкг/мл, Р-L Biochemicals) и смесь нагревали сначала при 65оС в течение 5 мин, а затем при 43оС в течение 30 мин. В то время, как реакционный раствор поддерживали при 0оС, в него добавили 80 мкл буфера [100 ммоль/л трис-HCl (рН 7,5), 20 ммоль/л MgCl2, 50 ммоль/л (NH4)2SO4, и 500 ммоль/л KCl] 4 мкл 4 ммоль/л дезоксинуклеотидтрифосфата (содержащего по 4 ммоль/л каждого dAТФ, dЦТФ, dГТФ и dТТФ), 60 микролитров 1 ммоль/л, β -NAD, 210 мкл дистиллированной воды, 20 мкл Е.coli ДНК-полимеразы I (Тakara Shuzo Co. Ltd. ), 15 мкл Е.coli ДНК-лигазы (Тakara Shuzo Co. Ltd.) и 15 микролитров Е.coli РН-азы Н (Тakara Shuzo Cо. Ltd.) и смесь подвергали реакции при 12оС в течение 1 ч. После добавления 4 миллимоль/л дезоксинуклеотидтрифосфата (4 мкл), реакцию проводили при 25оС в течение 1 ч. Путем последующей обработки фенолом/хлороформом и осаждением этанолом(один раз) получили примерно 8 микрограммов двунитевой КДНК. Эту двунитевую КДНК растворили в ТЕ растворе и подвергли 1,2% агарозному гель-электрофорезу. Фрагменты, соответствующие размеру примерно от 560 пар оснований до 2 тыс. пар оснований, адсорбировали на Ватман DE 81, и выделили посредством элюирования примерно 0,2 мкг двунитевой КДНК.To 40 microliters of DNA solution obtained in 2) was added 4 ul of oligo (dG) 12-18 (200 micrograms / ml, P-L Biochemicals) and the mixture was heated first at 65 ° C for 5 min and then at 43 ° C within 30 minutes While the reaction solution was maintained at 0 ° C, to it was added 80 .mu.l of buffer [100 mmol / l Tris-HCl (pH 7.5), 20 mmol / l MgCl 2, 50 mmol / l (NH 4) 2 SO 4 , and 500 mmol / L KCl] 4 μl 4 mmol / L deoxynucleotide triphosphate (containing 4 mmol / L each dATP, dCTP, dGTP and dTTP), 60 microliters 1 mmol / L, β-NAD, 210 μl distilled water, 20 μl of E. coli DNA polymerase I (Takara Shuzo Co. Ltd.), 15 μl of E. coli DNA polymerase I (Takara Shuzo Co. Ltd.) and 15 microliters of E. coli PHase AS (Takara Shuzo Co. Ltd. .) and the mixture was subjected to reaction at 12 ° C for 1 hour. After adding 4 mmol / l deoxynucleotide triphosphate (4 l), p action was carried out at 25 ° C for 1 hour. By subsequent treatment with phenol / chloroform and precipitation with ethanol (once) received approximately 8 micrograms of double-stranded cDNA. This double-stranded cDNA was dissolved in a TE solution and subjected to 1.2% agarose gel electrophoresis. Fragments corresponding to a size of from about 560 base pairs to 2 thousand base pairs were adsorbed onto Whatman DE 81, and about 0.2 μg double-stranded cDNA was isolated by elution.

4) Соединение dC-цепи с двунитевой кДНК. 4) Connection of the dC chain with double-stranded cDNA.

Двунитевую КДНК, полученную в 3), растворили в 40 мкл ТЕ раствора. После того, как добавили 8 мкл несущего dC-хвост буфера такого типа, какой описан в 2), cмесь нагревали при 37о в течение 2 мин. После добавления 1 мкл концевой трансферазы (27 единиц/микролитр) смесь подвергали реакции при 37оС в течение 3 мин. После этого реакционный раствор немедленно охладили до 0оС, и реакцию погасили путем добавления 1 мкл 0,5 моль/л ЭДТА. После обработки фенолом/хлороформом и осаждения этанолом, полученный осадок суспендировали в 10 мкл ТЕ раствора.The double-stranded cDNA obtained in 3) was dissolved in 40 μl of TE solution. Once added 8 l of dC-tail rotor of this type of buffer as that described in 2) The mixture was heated at 37 for 2 min. After adding 1 ul terminal transferase (27 units / microliter), the mixture was reacted at 37 ° C for 3 min. Thereafter, the reaction solution was immediately cooled to 0 ° C, and the reaction was quenched by adding 1 .mu.l of 0.5 mol / l EDTA. After treatment with phenol / chloroform and ethanol precipitation, the resulting precipitate was suspended in 10 μl of a TE solution.

5) Построение библиотеки КДНК рB R-линии
Четыре микролитра коммерческого олиго (dГ)-сшитого рBR 322 вектора (Bethesda Research Laboratories; 10 нано-граммов/микролитр) и 2 мкл dC-сшитой двунитевой кДНК, полученной в 4), ренатурировали в ТЕ растворе, содержащем 5 мкл 0,1 моль/л раствора NaCl. Ренатурация состояла из трех стадий: нагревание при 65оС в течение 5 мин, последующий нагрев при 40оС в течение 2 ч с последующим охлаждением до комнатой температуры.
5) Construction of a cDNA library of pB R-line
Four microliters of a commercial oligo (dG) cross-linked pBR 322 vector (Bethesda Research Laboratories; 10 nanograms / microliter) and 2 μl of the dC cross-linked double-stranded cDNA obtained in 4) were renatured in a TE solution containing 5 μl of 0.1 mol / l NaCl solution. Renaturation consisted of three stages: heating at 65 ° C for 5 min, then heating at 40 ° C for 2 h followed by cooling to room temperature.

В соответствии со способом, описанным в лабораторном руководстве Манятиса с сотр. [Maniatis et al. Molecular Cloning, Сold Spring Harbor, р. 249 и далее (1982)] (здесь можно также использовать другие известные методы), компетентные клетки получали из штамма Х 1776 Е.сoli и трансформировали с помощью ренатурированной плазмиды, чтобы получить трансформанты. In accordance with the method described in the laboratory manual Manyatis et al. [Maniatis et al. Molecular Cloning, Spring Spring Harbor, b. 249 et seq. (1982)] (other known methods can also be used here), competent cells were obtained from E. coli strain X 1776 and transformed using a renatured plasmid to obtain transformants.

П р и м е р 7. Синтез КДНК (построение библиотеки λ -фага)
1/Синтез однонитевой КДНК.
PRI me R 7. Synthesis of cDNA (construction of a library of λ-phage)
1 / Synthesis of single-stranded cDNA.

В соответствии со способами, описанными в примере 5, 3,8 г замороженных СНU-2 клеток дважды очищали на колонке олиго (dТ)-целлюлозы, а затем подвергли обработке, чтобы получить 400 мкг поли(A+)-РНК.In accordance with the methods described in Example 5, 3.8 g of frozen CHU-2 cells were purified twice on an oligo (dT) -cellulose column and then processed to obtain 400 μg of poly (A + ) -RNA.

ТЕ раствор (10 мкл), в котором растворено 12 мкг поли(А+)-РНК, поместили в реакционную пробирку, содержащую 10 мкг антиномицина D (Cигма). После этого в пробирку загрузили реагенты в следующем порядке: 20 мкл буфера для обратной транскриптазы [250 ммоль/л трис-НСl (рН 8,3); 40 ммоль/л MgCl2; 250 ммоль/л KCl] 20 мкл 5 ммоль/л дезоксинуклеотидтрифосфата (содержащего по 5 ммоль/л каждого из dAТФ, dГТФ, dЦТФ и dТТФ), 20 мкл олиго (dТ)12-18 (0,2 мкг/мл, Р-L Biochemicals); 1 мкл 1 моль/л дитиотреитола, 2 мкл РН-азина (30 единиц) мкл, Promeda Biotech); 10 мкл реверстранскриптазы (10 единиц/мкл, Seikagаku Kogyo Co. Ltd.); 1 мкл α-32Р- dАТФ(10 μСi; Аmerscham) и 16 мкл воды. Реакционный раствор, объем которого составлял 100 мкл, выдерживали при 42оС в течение 2 ч, а затем реакцию погасили путем добавления 0,5 моль/л ЭДТА (5 мкл) и 20% SDS (1 мкл). Последующей обработкой фенолом/хлороформом (100 мкл) и осаждением этанолом (дважды) получили примерно 4 мкг однонитевой КДНК.A TE solution (10 μl) in which 12 μg of poly (A + ) RNA was dissolved was placed in a reaction tube containing 10 μg of antinomycin D (Sigma). After that, the reagents were loaded into the tube in the following order: 20 μl reverse transcriptase buffer [250 mmol / L Tris-Hcl (pH 8.3); 40 mmol / L MgCl 2 ; 250 mmol / L KCl] 20 μl 5 mmol / L deoxynucleotide triphosphate (containing 5 mmol / L each of dATP, dGTP, dTCP and dTTP), 20 μl oligo (dT) 12-18 (0.2 μg / ml, P- L Biochemicals); 1 μl 1 mol / L dithiothreitol, 2 μl RN-azine (30 units) μl, Promeda Biotech); 10 μl of reverstranscriptase (10 units / μl, Seikagaku Kogyo Co. Ltd.); 1 μl of α- 32 P-dATP (10 μCi; Amerscham) and 16 μl of water. The reaction solution whose volume was 100 ul, heated at 42 ° C for 2 hours and then the reaction was quenched by adding 0.5 mol / L EDTA (5 L) and 20% SDS (1 l). Subsequent treatment with phenol / chloroform (100 μl) and ethanol precipitation (twice) gave approximately 4 μg single-stranded cDNA.

2) Синтез двунитевой КДНК
кДНК, полученную в 1), растворили в 29 мкл ТЕ раствора, и реакционный раствор приготовили путем добавления следующих реагентов в написанном порядке: 25 мкл полимеразного буфера [400 миллимоль/л Hepes (рН 7,6); 16 ммоль/л MgCl2, 63 ммоль/л β -меркаптоэтанол и 270 ммоль/л KCl] 10 мкл 5 ммоль/л дезоксинуклеотидтрифосфата; 1,0 мкл 15 ммоль/л β -NAD; 1,0 мкл α -32-Р-dAТР (10 мки/мкл); 0,2 мкл Е.coli ДНК-лигазы (60 единиц/мкл, Тakara Shuzo Co. Ltd.); 5,0 мкл Е.coli ДНК-полимеразы I (New Еngland Biolabs; 10 единиц/мкл); 0,1 мкл рН-азы Н (60 единиц/мкл; Тakara Shuzo Co. Ltd.); и 28,7 мкл дистиллированной воды.
2) Synthesis of double-stranded cDNA
The cDNA obtained in 1) was dissolved in 29 μl of TE solution, and the reaction solution was prepared by adding the following reagents in the written order: 25 μl of polymerase buffer [400 mmol / L Hepes (pH 7.6); 16 mmol / L MgCl 2 , 63 mmol / L β-mercaptoethanol and 270 mmol / L KCl] 10 μl 5 mmol / L deoxynucleotide triphosphate; 1.0 μl 15 mmol / L β-NAD; 1.0 μl α - 32 -P-dATP (10 μi / μl); 0.2 μl of E. coli DNA ligase (60 units / μl, Takara Shuzo Co. Ltd.); 5.0 μl of E. coli DNA polymerase I (New England Biolabs; 10 units / μl); 0.1 μl pH-H (60 units / μl; Takara Shuzo Co. Ltd.); and 28.7 μl of distilled water.

Реакционный раствор инкубировали при 14оС в течение 1 ч, позволили ему остыть до комнатной температуры, и затем инкубировали его еще в течение часа. Затем реакцию погасили путем добавления 0,5 моль/л ЭДТА (5 мкл) и 20% SDS (1 мкл) и обработали реакционную смесь фенолом/хлороформом и провели осаждение этанолом. Полученную ДНК растворили и 20 мкл, 0,5 ммоль/л ЭДТА и получили реакционный раствор путем добавления 3 мкл буфера Кленоу [500 миллимоль/л Трис-НСl (рН 8,0) и 50 ммоль/л MgCl2] 3 мкл 5 ммоль/л дезоксинуклеотидтрифосфата и 4 мкл воды. После добавления 1 мкл ДНК-полимеразы (фрагмент Кленоу, Тakara Shuzo Co. Ltd.) реакционный раствор инкубировали при 30оС в течение 15 мин.The reaction solution was incubated at 14 ° C for 1 h, allowed to cool to room temperature, and then it was incubated for an additional hour. The reaction was then quenched by adding 0.5 mol / L EDTA (5 μl) and 20% SDS (1 μl) and the reaction mixture was treated with phenol / chloroform and ethanol precipitated. The resulting DNA was dissolved and 20 μl, 0.5 mmol / L EDTA and the reaction solution was obtained by adding 3 μl Klenow buffer [500 mmol / L Tris-Hcl (pH 8.0) and 50 mmol / L MgCl 2 ] 3 μl 5 mmol / l deoxynucleotide triphosphate and 4 μl of water. After addition of 1 l of DNA polymerase (Klenow fragment Takara Shuzo Co. Ltd.), the reaction solution was incubated at 30 ° C for 15 min.

Инкубированный реакционный раствор разбавили 70 мкл ТЕ раствора, и реакцию погасили путем добавления 0,5 моль/л ЭДТА (5 мкл) и 20% SDS (1 мкл). Путем последующей обработки фенолом/хлороформом и осаждением этанолом получили примерно 8 микрограммов двунитевой КДНК. The incubated reaction solution was diluted with 70 μl of TE solution, and the reaction was quenched by adding 0.5 mol / L EDTA (5 μl) and 20% SDS (1 μl). Subsequent treatment with phenol / chloroform and ethanol precipitation gave approximately 8 micrograms of double-stranded cDNA.

3) Метилирование двунитевой кДНК
Водный раствор (30 мкл) двунитевой кДНК, синтезированной в 2), смешали с 40 мкл буфера метилирования [500 ммоль/л трис-HCl (рН 8,0), 50 ммоль/л ЭДТА] 20 мкл раствора SAM [800 мкмоль/л S-аденозил-L-метилметионин (SAM), 50 миллимоль/л β -меркаптоэтанола] и 100 микролитрами воды. К смеси добавили 15 мл ЕсoRI метилазы (New Еngland Biolabs; 20 единиц/мкл), чтобы получить реакционный раствор, объем которого составлял 200 мкл. После инкубирования при 37оС в течение 2 часов, провели обработки фенолом и эфиром, и осаждение этанолом, чтобы выделить ДНК.
3) Methylation of double-stranded cDNA
An aqueous solution (30 μl) of the double-stranded cDNA synthesized in 2) was mixed with 40 μl of methylation buffer [500 mmol / L Tris-HCl (pH 8.0), 50 mmol / L EDTA] 20 μl SAM solution [800 μmol / L S-adenosyl-L-methylmethionine (SAM), 50 mmol / L β-mercaptoethanol] and 100 microliters of water. 15 ml of EcoRI methylase (New England Biolabs; 20 units / μl) was added to the mixture to obtain a reaction solution with a volume of 200 μl. After incubation at 37 ° C for 2 hours and had a treatment with phenol and ether, and ethanol precipitation to isolate DNA.

4) Добавление линкера ЕсoRI. 4) Adding an EcoRI linker.

Примерно к 1,2 мкг метилированной двунитевой ДНК добавили 1,5 мкл лигазного буфера [250 ммоль/л трис-НСl (рН 7,5) и 100 ммоль/л MgCl2] 0,5 мкл предварительно фосфорилированного ЕсoRI линкера (10-мер; Тakara Shuzo Co. Ltd. ), 1,5 мкл 10 ммоль/л AТФ, 1,5 мкл 100 ммоль/л, дитиотреитола и 2 мкл H2О, чтобы получить реакционный раствор, объем которого составлял 15 мкл. После добавления 0,7 мкл Т4 ДНК-лигазы (3,4 единицы/микролитр, Тakara Shuzo Co. Ltd. ) реакцию проводили в течение ночи при 4оС. После этого лигазу дезактивировали посредством нагревания при 65оС в течение 10 мин. Реакционный раствор разбавили до полного объема 50 мкл путем добавления 100 ммоль/л трис-HCl (рН 7,5), 5 ммоль/л MgСl2, 50 ммоль/л NaCl и 100 мкг/мл желатина. После добавления ЕсoRI (3,5 мкл, 10 единиц/мкл) реакцию проводили при 37оС в течение 2 ч. Затем добавили 2,5 мкл 0,5 моль/л ЭДТА, и 0,5 мкл 20% SDS, после чего провели обработку фенолом/хлороформом и осаждение этанолом с тем, чтобы выделить ДНК. После этого, непрореагировавший ЕсoRI линкер удалили гельфильтрацией на UltrogelАсА34 (LKB) или агарозным гельэлектрофорезом с тем, чтобы выделить примерно 0,5-0,7 мкг двунитевой кДНК с добавленным линкером.1.5 μl of ligase buffer [250 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.5) and 100 mmol / L MgCl 2 ] 0.5 μl of a pre-phosphorylated EcoRI linker (10 mer) were added to approximately 1.2 μg of methylated double-stranded DNA. ; Takara Shuzo Co. Ltd.), 1.5 μl of 10 mmol / L ATP, 1.5 μl of 100 mmol / L, dithiothreitol and 2 μl of H 2 O to obtain a reaction solution of 15 μl. After addition of 0.7 l of T reaction was performed overnight at 4 April DNA ligase (3.4 units / microliter, Takara Shuzo Co. Ltd.) C. Thereafter ligase inactivated by heating at 65 ° C for 10 min . The reaction solution was diluted to a total volume of 50 μl by adding 100 mmol / L Tris-HCl (pH 7.5), 5 mmol / L MgCl 2 , 50 mmol / L NaCl and 100 μg / ml gelatin. After the addition of EcoRI (3.5 L, 10 units / ml), the reaction was carried out at 37 ° C for 2 hours. Then 2.5 L of 0.5 mol / l EDTA, and 0.5 .mu.l 20% SDS, and then conducted phenol / chloroform treatment and ethanol precipitation in order to isolate DNA. After that, the unreacted EcoRRI linker was removed by gel filtration on UltrogelAcA34 (LKB) or agarose gel electrophoresis so as to isolate approximately 0.5-0.7 μg double stranded cDNA with an added linker.

5) Присоединение двунитевой кДНК к вектору λ gt 10
Двунитевую кДНК с добавленным линкером смешивали с 2,4 мкг предварительно ЕсoRI-обработанного вектора λgt 10 (cистема клонирования вектора), с добавлением 1,4 мкл лигазного буфера (250 ммоль/л трис-HCl и 100 ммоль/л MgCl2) и 6,5 мкл дистиллированной воды, и смесь нагревали при 42оС в течение 15 мин. После этого добавили 1 мкл 10 ммоль/л AТФ, 1 мкл 0,1 моль/л дитиотреитола и 0,5 мкл Т4 ДНК лигазы, чтобы получить полный объем 15 мкл, и реакцию проводили в течение ночи при 12оС.
5) Attachment of double-stranded cDNA to the λ gt 10 vector
Double-stranded cDNA with an added linker was mixed with 2.4 μg of a pre-Eco-treated λgt 10 vector (vector cloning system), with the addition of 1.4 μl of ligase buffer (250 mmol / L Tris-HCl and 100 mmol / L MgCl 2 ) and 6 , 5 l of distilled water, and the mixture was heated at 42 ° C for 15 min. Then 1 l of 10 mmol / l ATF, 1 l 0.1 mol / l DTT and 0.5 l of T4 DNA ligase to obtain a total volume of 15 uL, and the reaction was carried out overnight at 12 ° C.

6) Упаковка in vitro
Примерно третью часть рекомбинантных ДНК, полученных в 5), упаковали с помощью набора для упаковки in vitro (Promeda Biotech), чтобы получить фаговые пятна.
6) In vitro packaging
About a third of the recombinant DNA obtained in 5) was packaged using an in vitro packaging kit (Promeda Biotech) to obtain phage spots.

П р и м е р 8. Направленный отбор библиотеки рB R-линии с помощью зонда (IWQ). PRI me R 8. Directional selection of library pB R-line using a probe (IWQ).

Бумагу Ватман 541 поместили на агаровую среду с растущими колониями и оставили при 37оС в течение 2 ч. Фильтровальную бумагу затем обработали по следующему методу Тауба и Томпсона [Тaub and Thompson, Anal. Biochem. 126, 222 (1982)]
Колонии, перенесенные на бумагу 541, затем выращивали на агаровой среде, содержащей хлоранфеникол (250 мкг/мкл), в течение ночи при 37оС.
Whatman 541 paper placed on agar medium with growing colonies and left at 37 ° C for 2 h. The filter paper was then treated by the following method Taub and Thompson [Taub and Thompson, Anal. Biochem. 126, 222 (1982)]
Colonies were transferred onto paper 541, and then grown on agar medium containing hloranfenikol (250 ug / ml) overnight at 37 ° C.

Бумагу 541 извлекли и оставили при комнатной температуре на 3 мин на другом листе фильтровальной бумаге, которая была пропитана 0,5 н. раствором NaOН. Эту процедуру повторяли дважды. Два аналогичных опыта проводили в течение 3 мин, используя раствор 0,5 моль/л трис-НСl (рН 8). При 4оС проводили обработки раствором 0,05 моль/л трис-НСl (рН 8) в течение 3 мин и раствором лизоцима 1,5 мг/мл [содержащим 0,05 моль/л трис-НСl (рН 8) и 25% сахарозы] в течение 10 минут, затем при 37оС проводили обработки раствором 1 SSC (0,15 моль/л NaCl и 0,015 моль/л цитрата натрия) в течение 2 мин и раствором 1 SSC, cодержащим 200 мкг/мл протеиназы К, в течение 30 мин, наконец, при комнатной температуре проводили обработки раствором 1 х SSC в течение 2 мин и раствором 95% этанола в течение 2 минут. Конечную стадию повторяли дважды. После этого бумагу 541 высушили. Высушенную бумагу 541 погружали в смесь 25: 24: 1 фенола/хлороформа/изоамилового спирта [уравновешенную 100 миллимоль/л трис-НСl (рН 8,5), 100 ммоль/л NaCl и 10 ммоль/л ЭДТА] на 30 мин при комнатной температуре. Затем аналогичные процедуры повторяли три раза с раствором 5 х SSC в течение 3 мин, затем дважды с 95% этанольным раствором в течение 3 минут. После этого высушили фильтровальную бумагу.Paper 541 was removed and left at room temperature for 3 minutes on another sheet of filter paper, which was impregnated with 0.5 N. NaOH solution. This procedure was repeated twice. Two similar experiments were carried out for 3 min using a solution of 0.5 mol / L Tris-Hcl (pH 8). At 4 ° C, the treatment was carried out with a solution of 0.05 mol / L Tris-Hcl (pH 8) for 3 min and a solution of lysozyme 1.5 mg / ml [containing 0.05 mol / L Tris-Hcl (pH 8) and 25 % sucrose] for 10 minutes, then at 37 ° C was performed with 1 processing SSC (0,15 mol / l NaCl and 0.015 mol / l sodium citrate) for 2 minutes and a solution of 1 SSC, coderzhaschim 200 ug / ml proteinase K , for 30 minutes, finally, at room temperature, treatments with a 1 x SSC solution for 2 minutes and a solution of 95% ethanol for 2 minutes were performed. The final stage was repeated twice. After that, paper 541 was dried. The dried paper 541 was immersed in a mixture of 25: 24: 1 phenol / chloroform / isoamyl alcohol [balanced 100 mmol / L Tris-Hcl (pH 8.5), 100 mmol / L NaCl and 10 mmol / L EDTA] for 30 min at room temperature. Then, similar procedures were repeated three times with a solution of 5 x SSC for 3 minutes, then twice with 95% ethanol solution for 3 minutes. After that, the filter paper was dried.

Зонд (IWQ) пометили меченным атомом 32Р в соответствии с известными способами (см. Molecular Cloning), и гибридизацию колоний осуществляли по методу Wallace et al. [Nucleic Acids Res. 9, 879 (1981)] Предгибридизацию проводили при 65оС в течение 4 ч в гибридизационном буфере, содержащем 6 х NET [0,9 моль/л NaCl; 0,09 моль/л трис-HCl (рН 7,5) и 6 миллимоль/л ЭДТА] 5 х раствор Денгардта (Denhardt), 0,1% SDS и 0,1 мг/мл денатурированной ДНК (тимуса теленка). После этого гибридизацию проводили в течение ночи при 56оС в гибридизационном буфере (его рецепт см. выше), содержащем 1x106 счетов в минуту/мл радиоактивного меченного зонда (IWQ). После окончания реакции бумагу 541 дважды промыли раствором 6 х SSC (содержащим 0,1% SDS) в течение 30 мин при комнатной температуре, затем промыли при 56оС в течение 1,5 мин. Промытую бумагу 541 затем подвергали авторадиографии.The probe (IWQ) was labeled with a 32P-labeled atom according to known methods (see Molecular Cloning), and colony hybridization was carried out according to the method of Wallace et al. [Nucleic Acids Res. 9, 879 (1981)] Prehybridization was carried out at 65 ° C for 4 hours in a hybridization buffer containing 6 x NET [0.9 mol / L NaCl; 0.09 mol / L Tris-HCl (pH 7.5) and 6 mmol / L EDTA] 5 x Dengardt solution (Denhardt), 0.1% SDS and 0.1 mg / ml denatured DNA (calf thymus). Thereafter, hybridization was carried out overnight at 56 ° C in hybridization buffer (see recipe it. Above), containing 1x10 6 counts per minute / ml radiolabelled probe (IWQ). After completion of the reaction 541 paper washed twice with 6 x SSC solution (containing 0,1% SDS) for 30 min at room temperature, then washed at 56 ° C for 1.5 min. The washed paper 541 was then subjected to autoradiography.

Плазмиду отделили от положительных клонов и подвергали пятнообразованию по Саузерну (Southern) c зондом (IWQ). Гибридизацию и авторадиографию проводили при тех же самых условиях, какие описаны выше. The plasmid was separated from the positive clones and spotted by Southern (Southern) probe (IWQ). Hybridization and autoradiography were performed under the same conditions as described above.

Аналогично пятнообразование по Саузерну проводили с зондом (А). Используя гибридизационный буфер, имеющий указанный выше состав, гибридизацию проводили сначала при 49оС в течение 1 ч. После остывания до 39оС продолжали затем гибридизацию при этой температуре в течение 1 ч. После окончания реакции нитроцеллюлозный фильтр дважды промыли 6 SSC, содержащим 0,1% SDS, в течение 30 мин при комнатной температуре, а затем промыли при 39оС в течение 3 мин. Промытую бумагу затем подвергали авторадиографии. моль/л трис-НСl (рН 8) в течение 3 мин и раствором лизоцима 1,5 мг/мл [содержащим 0,05 моль/л трис-НСl (рН 8) и 25% сахарозы] в течение 10 минут, затем при 37оС проводили обработки раствором 1 х SSC (0,15 моль/л NaCl и 0,015 моль/л цитрата натрия) в течение 2 мин и раствором 1х SSC, cодержащим 200 мкг/мл протеиназы К, в течение 30 мин, наконец, при комнатной температуре проводили обработки раствором 1 х SSC в течение 2 мин и раствором 95% этанола в течение 2 минут. Конечную стадию повторяли дважды. После этого бумагу 541 высушили. Высушенную бумагу 541 погружали в смесь 25:24:1 фенола/хлороформа/изоамилового спирта [уравновешенную 100 миллимоль/л трис-НСl (рН 8,5), 100 ммоль/л NaCl и 10 ммоль/л ЭДТА] на 30 мин при комнатной температуре. Затем аналогичные процедуры повторяли три раза с раствором 5 х SSC в течение 3 мин, затем дважды с 95% этанольным раствором в течение 3 минут. После этого высушили фильтровальную бумагу.Similarly, Southern spotting was performed with a probe (A). Using a hybridization buffer having the aforementioned composition, hybridization was performed first at 49 ° C for 1 hour. After cooling to 39 ° C was continued and then hybridizing at this temperature for 1 hour. After the reaction, the nitrocellulose filter was washed twice with 6 SSC, containing 0 , 1% SDS, for 30 min at room temperature and then washed at 39 ° C for 3 min. The washed paper was then subjected to autoradiography. mol / L Tris-Hcl (pH 8) for 3 min and a solution of lysozyme 1.5 mg / ml [containing 0.05 mol / L Tris-Hcl (pH 8) and 25% sucrose] for 10 minutes, then at 37 ° C was treated with a solution of 1 x SSC (0.15 mol / L NaCl and 0.015 mol / L sodium citrate) for 2 min and a solution 1x SSC containing 200 μg / ml proteinase K, for 30 min, finally, at room temperature was treated with a solution of 1 x SSC for 2 minutes and a solution of 95% ethanol for 2 minutes. The final stage was repeated twice. After that, paper 541 was dried. The dried paper 541 was immersed in a mixture of 25: 24: 1 phenol / chloroform / isoamyl alcohol [balanced 100 mmol / L Tris-Hcl (pH 8.5), 100 mmol / L NaCl and 10 mmol / L EDTA] for 30 min at room temperature. Then, similar procedures were repeated three times with a solution of 5 x SSC for 3 minutes, then twice with 95% ethanol solution for 3 minutes. After that, the filter paper was dried.

Зонд (IWQ) пометили меченным атомом 32Р в соответствии с известными способами (см. Molecular Cloning), и гибридизацию колоний осуществляли по методу Wallace et al. [Nucleic Acids Res. 9, 879 (1981)] Предгибридизацию проводили при 65оС в течение 4 ч в гибридизационном буфере, содержащем 6 х NET [0,9 моль/л NaCl; 0,09 моль/л трис-HCl (рН 7,5) и 6 миллимоль/л ЭДТА] 5 х раствор Денгардта (Denhardt), 0,1% SDS и 0,1 мг/мл денатурированной ДНК (тимуса теленка). После этого гибридизацию проводили в течение ночи при 56оС в гибридизационном буфере (его рецепт см. выше), содержащем 1x106 счетов в минуту/мл радиоактивного меченного зонда (IWQ). После окончания реакции бумагу 541 дважды промыли раствором 6 х SSC (содержащим 0,1% SDS) в течение 30 мин при комнатной температуре, затем промыли при 56оС в течение 1,5 мин. Промытую бумагу 541 затем подвергали авторадиографии.A probe (IWQ) was labeled with a 32 P labeled atom according to known methods (see Molecular Cloning), and colony hybridization was carried out according to the method of Wallace et al. [Nucleic Acids Res. 9, 879 (1981)] Prehybridization was performed at 65 ° C for 4 hours in a hybridization buffer containing 6 x NET [0,9 mol / l NaCl; 0.09 mol / L Tris-HCl (pH 7.5) and 6 mmol / L EDTA] 5 x Dengardt solution (Denhardt), 0.1% SDS and 0.1 mg / ml denatured DNA (calf thymus). Thereafter, hybridization was carried out overnight at 56 ° C in hybridization buffer (see recipe it. Above), containing 1x10 6 counts per minute / ml radiolabelled probe (IWQ). After completion of the reaction 541 paper washed twice with 6 x SSC solution (containing 0,1% SDS) for 30 min at room temperature, then washed at 56 ° C for 1.5 min. The washed paper 541 was then subjected to autoradiography.

Плазмиду отделили от положительных клонов и подвергали пятнообразованию по Саузерну (Southern) c зондом (IWQ). Гибридизацию и авторадиографию проводили при тех же самых условиях, какие описаны выше. The plasmid was separated from the positive clones and spotted by Southern (Southern) probe (IWQ). Hybridization and autoradiography were performed under the same conditions as described above.

Аналогично пятнообразование по Саузерну проводили с зондом (А). Используя гибридизационный буфер, имеющий указанный выше состав, гибридизацию проводили сначала при 49оС в течение 1 ч. После остывания до 39оС продолжали затем гибридизацию при этой температуре в течение 1 ч. После окончания реакции нитроцеллюлозный фильтр дважды промыли 6 х SSC, содержащим 0,1% SDS, в течение 30 мин при комнатной температуре, а затем промыли при 39оС в течение 3 мин. Промытую бумагу затем подвергали авторадиографии.Similarly, Southern spotting was performed with a probe (A). Using a hybridization buffer having the aforementioned composition, hybridization was performed first at 49 ° C for 1 hour. After cooling to 39 ° C was continued and then hybridizing at this temperature for 1 hour. After the reaction, the nitrocellulose filter was washed twice with 6 x SSC, containing 0,1% SDS, for 30 min at room temperature and then washed at 39 ° C for 3 min. The washed paper was then subjected to autoradiography.

В результате было найдено, что единственный клон является положительным. Определение последовательности нуклеотидов с помощью дидезокси-способа показало, что этот клон имел ДНК, состоящую из 308 пар оснований, содержащую части как зонда (IWQ), так и зонда (А), рB R 322-производную плазмиду, содержащую эту вставку, назвали рНСS-1. As a result, it was found that a single clone is positive. Sequencing of the nucleotides using the dideoxy method showed that this clone had 308 base pairs DNA containing parts of both the probe (IWQ) and probe (A), the pB R 322-derived plasmid containing this insert was called pCS -1.

П р и м е р 9. Направленный отбор библиотеки линии λ -фага с помощью зонда рНСS-1 ДНК. PRI me R 9. Directional selection of the library of the λ-phage line using the probe rNS-1 DNA.

Гибридизацию пятен проводили по способу Бентона и Дэвиса (Benton and Davis [Science, 196,180(1977)] рНСS-1, полученную в примере 8, обработали Sau3A и ЕСORI, чтобы получить фрагмент ДНК примерно 600 пар оснований. Этот фрагмент ДНК пометили радиоактивной меткой с помощью меченой трансляции по обычным методикам. Нитроцеллюлозный фильтр (S&S) пометили на фаговое пятно, растущее на агаровой среде, чтобы перевести фаги на фильтр. После денатурации ДНК фага с помощью 0,5 моль/л NaOH, фильтровальную бумагу обработали следующими способами: обработка 0,1 моль/л NaOН и 1,5 моль/л NaCl в течение 20 с, две обработки 0,5 моль/л трис-НСl (рН 7,5) и 1,5 моль/л NaCl в течение 20 с, наконец, обработка 120 ммоль/л NaCl, 15 ммоль/л цитрата натрия, 13 ммоль/л KH2PO2 и 1 ммоль/л ЭДТА (рН 7,2) в течение 20 с.Hybridization of the spots was carried out according to the method of Benton and Davis (Benton and Davis [Science, 196,180 (1977)] pNS-1 obtained in example 8, was treated with Sau3A and ECORI to obtain a DNA fragment of approximately 600 base pairs. This DNA fragment was labeled with a radioactive label with using labeled translation according to conventional methods. A nitrocellulose filter (S&S) was marked on a phage spot growing on an agar medium to transfer the phages to the filter. After denaturing phage DNA using 0.5 mol / L NaOH, the filter paper was processed in the following ways: processing 0 , 1 mol / L NaOH and 1.5 mol / L NaCl in t 20 s, two treatments with 0.5 mol / L Tris-Hcl (pH 7.5) and 1.5 mol / L NaCl for 20 s, finally, treatment with 120 mmol / L NaCl, 15 mmol / L sodium citrate, 13 mmol / L KH 2 PO 2 and 1 mmol / L EDTA (pH 7.2) for 20 s.

Фильтр затем высушили и нагревали при 80оС в течение 2 ч, чтобы иммобилизовать ДНК. Предгибридизацию проводили в течение ночи при 42оС в предгибридизационном буфере, содержащем 5 х SSC, 5 х раствор Денгардта, 50 ммоль/л фосфатного буфера, 50% формамида, 0,25 мг/мл денатурированной ДНК (ДНК из спермы лосося) и 0,1% SDS. После этого гибридизацию проводили при 42оС в течение 20 ч в гибридизационном буфере, содержащем 4 х105 счетов в минуту/мл зонда pНСS-1, который был помечен радиоактивной меткой с помощью меченной трансляции. Этот гибридизационный буфер представлял собой смесь 5 х SSC, 5 х раствора Денгардта, 20 ммоль/л фосфатного буфера (рН 6,0), 50% формамида, 0,1% SDS, 10% декстрансульфата и 0,1 мг/мл денатурированной ДНК (ДНК из спермы лосося).The filter was then dried and heated at 80 ° C for 2 hours to immobilize DNA. Prehybridization was carried out overnight at 42 ° C in prehybridization buffer containing 5 x SSC, 5 x Denhardt's solution, 50 mmol / l phosphate buffer, 50% formamide, 0.25 mg / ml denatured DNA (salmon sperm DNA) and 0 , 1% SDS. Thereafter, hybridization was carried out at 42 ° C for 20 hours in hybridization buffer containing 4 x 10 5 CPMs / ml pNSS-1 probe which was labeled using radiolabelled labeled translation. This hybridization buffer was a mixture of 5 x SSC, 5 x Dengardt solution, 20 mmol / L phosphate buffer (pH 6.0), 50% formamide, 0.1% SDS, 10% dextransulfate and 0.1 mg / ml denatured DNA (DNA from salmon sperm).

Гибридизованный нитроцеллюлозный фильтр промывали в течение 20 мин 2 х SSC, содержащим 0,1% SDS, при комнатной температуре, затем в течение 30 мин с помощью 0,1 х SSC, содержащего 0,1% SDS при 44оС, и наконец, в течение 10 мин с помощью 0,1 х SSC при комнатной температуре. Затем проводили детектирование с помощью авторадиографии.The hybridized nitrocellulose filter was washed for 20 min in 2 x SSC, containing 0,1% SDS, at room temperature, then for 30 minutes using 0.1 x SSC, containing 0,1% SDS at 44 ° C, and finally for 10 min using 0.1 x SSC at room temperature. Then, detection was performed using autoradiography.

В результате получили пять положительных клонов (G1-G5) Клон, содержащий "полномерную" кДНК, подвергали проверке для определения нуклеотидной последовательности его ДНК посредством дидезокси-способа, и была идентифицирована нуклеотидная последовательность, показанная на фиг. 3-5. Эту кДНК вырезали из вектора λ gt и присоединили к pBR 327 (Soberon et al. Gene, 9, 287 (1980)] в сайте ЕсoRI, чтобы получить плазмиду, которую можно получать в больших масштабах. Эту плазмиду назвали pBRG4. Five positive clones (G1-G5) were obtained. A clone containing the "full" cDNA was checked to determine the nucleotide sequence of its DNA using the dideoxy method, and the nucleotide sequence shown in FIG. 3-5. This cDNA was excised from the λ gt vector and attached to pBR 327 (Soberon et al. Gene, 9, 287 (1980)] at the EcoRI site to obtain a plasmid that can be obtained on a large scale. This plasmid was named pBRG4.

П р и м е р 10. Направленный отбор библиотеки линии λ -фаза с помощью зонда pBRG4 и зонда (LC)
Гибридизацию пятна проводили по способу Бентона и Дэвиса (см. там же Science), использованному в примере 9. Нитроцеллюлозный фильтр (S&S) поместили на пятно растущего фага на анаровой среде, чтобы перевести фаги на фильтр. После денатурации фаговой ДНК с помощью 0,5 моль/л NaOН фильтр обработали следующими способами: обработка с помощью 0,1 моль/л NaOН и 1,5 моль/л NaСl в течение 20 с, затем две обработки с помощью 0,5 моль/л трис-НСl (рН 7,5) и 1,5 моль/л NaCl в течение 20 с, ноконец обработка с помощью 120 ммоль/л NaCl, 15 ммоль/л цитрата натрия, 13 ммоль/л КН2PO4 и 1 ммоль/л ЭДТА (рН 7,2) в течение 20 с. Фильтр затем высушили и нагревали при 80оС в течение 2 ч, чтобы иммобилизовать ДНК. Два листа одного и того же фильтра приготовили описанным выше способом и подвергли их направленному отбору с помощью зонда рBRG4 выведенной ДНК и зонда (LC).
PRI me R 10. Directional selection of the library of the λ-phase line using the probe pBRG4 and the probe (LC)
Hybridization of the spot was carried out according to the method of Benton and Davis (see Science there), used in Example 9. A nitrocellulose filter (S&S) was placed on the spot of the growing phage on an anaric medium to transfer the phages to the filter. After denaturing phage DNA using 0.5 mol / L NaOH, the filter was treated in the following ways: processing with 0.1 mol / L NaOH and 1.5 mol / L NaCl for 20 s, then two treatments with 0.5 mol / l Tris-Hcl (pH 7.5) and 1.5 mol / L NaCl for 20 s, but treatment with 120 mmol / L NaCl, 15 mmol / L sodium citrate, 13 mmol / L KH 2 PO 4 and 1 mmol / L EDTA (pH 7.2) for 20 s. The filter was then dried and heated at 80 ° C for 2 hours to immobilize DNA. Two sheets of the same filter were prepared as described above and subjected to directional selection using the pBRG4 probe of the extracted DNA and probe (LC).

Направленный отбор с помощью зонда pBRG4-выведенной ДНК проводили следующим способом. рBRG4-обработали ЕсoRI, чтобы получить фрагмент ДНК примерно 1500 пар оснований. Этот фрагмент ДНК пометили радиоактивной меткой с помощью меченной трансляции в соответствии с обычными методами. Один из двух нитроцеллюлозных фильтров подвергали предгибридизации в течение ночи при 42оС в предгибридизационном буфере, содержащем 5 х SSC, 5 х раствора Денгардта, 50 ммоль/л фосфатного буфера, 50% формамида, 0,25 мг/мл денатурированной ДНК (ДНК из спермы лосося) 0,1% SDS. После этого фильтр подвергали гибридизации при 42оС в течение 20 ч в гибридизационном буфере, содержащем меченный радиоактивной меткой зонд ДНК (примерно 1 х 106 счетов в минуту/мл) примерно 1500 пар оснований. Этот гибридизационный буфер представлял собою смесь 5 х SSC, 5 х раствор Денгардта, 20 ммоль/л фосфатного буфера (рН 6,0), 50% формамида, 0,1% SDS, 10% декстрансульфата и 0,1 мг/мл денатурированной ДНК (ДНК из спермы лосося). Гибридизованный нитроцеллюлозный фильтр промыли в течение 20 мин 2 х SSC cодержащим 0,1% SDS, при комнатной температуре, затем в течение 30 минут, 0,1 х SSC, содержащим 0,1% SDS, при 44оС, и наконец, в течение 10 мин с помощью 0,1 SSC при комнатной температуре. Затем проводили детектирование с помощью авторадиографии.Directed selection using the probe pBRG4-derived DNA was carried out as follows. pBRG4-treated with EcoRI to obtain a DNA fragment of approximately 1,500 base pairs. This DNA fragment was radiolabeled using labeled translation in accordance with conventional methods. One of the two nitrocellulose filters were subjected to prehybridization overnight at 42 ° C in prehybridization buffer containing 5 x SSC, 5 x Denhardt's solution, 50 mmol / l phosphate buffer, 50% formamide, 0.25 mg / ml denatured DNA (DNA from salmon sperm) 0.1% SDS. Thereafter, the filter was subjected to hybridization at 42 ° C for 20 hours in hybridization buffer containing radiolabeled DNA probe (about 1 × 10 6 counts per minute / ml) was approximately 1,500 base pairs. This hybridization buffer was a mixture of 5 x SSC, 5 x Dengardt solution, 20 mmol / L phosphate buffer (pH 6.0), 50% formamide, 0.1% SDS, 10% dextransulfate and 0.1 mg / ml denatured DNA (DNA from salmon sperm). The hybridized nitrocellulose filter was washed for 20 minutes in 2 x SSC coderzhaschim 0,1% SDS, at room temperature, then for 30 minutes, 0.1 x SSC, containing 0,1% SDS, at 44 ° C, and finally, for 10 min using 0.1 SSC at room temperature. Then, detection was performed using autoradiography.

Направленный отбор с помощью зонда (LC) осуществляли следующим образом. Другой фильтр предварительно обработали 3хSSC, cодержащим 0,1% SDS, при 65оС в течение 2 ч. Затем проводили предгибридизацию при 65оС в течение 2 ч в растворе, содержащем 6 х NEТ, 1 х раствор Денгардта и 100 мкг/мл денатурированной ДНК (ДНК из спермы лосося). Затем проводили гибридизацию в течение ночи при 63оС в гибридизационном буфере, содержащем меченный радиоактивной меткой зонд (LC) (2 х 106 счетов в мин/мл). Этот гибридизационный буфер также представлял собой смесь 6 х NEТ, 1 х раствор Денгардта и 100 мкг/мл денатурированной ДНК (ДНК из спермы лосося). Гибридизованный нитроцеллюлозный фильтр промыли три раза (каждый раз по 20 мин) 6 х SSC, содержащим 0,1% SDS, при комнатной температуре, затем промыли 6 х SSС, содержащим 0,1% SDS, при 63оС в течение 2 мин.Directional sampling using a probe (LC) was carried out as follows. Another filter was pretreated 3hSSC that records the 0,1% SDS, at 65 ° C for 2 hours. Then, prehybridization was performed at 65 ° C for 2 hours in a solution containing 6 x NET, 1 x Denhardt's solution and 100 ug / ml denatured DNA (salmon sperm DNA). Then, hybridization was performed overnight at 63 ° C in hybridization buffer containing radiolabeled probe (LC) (2 x 10 6 cpm / ml). This hybridization buffer was also a mixture of 6 x NET, 1 x Dengardt solution and 100 μg / ml denatured DNA (salmon sperm DNA). The hybridized nitrocellulose filter was washed three times (each time for 20 minutes) 6 x SSC, containing 0,1% SDS, at room temperature, then washed with 6 x SSC containing 0,1% SDS, at 63 ° C for 2 min.

Фильтр высушили, и дезактивирование осуществляли с помощью авторадиографии. The filter was dried and deactivation was performed using autoradiography.

В описанном выше направленном отборе отбирали клоны, которые были положительны к обоим зондам, и клон, содержащий "полномерную" кДНК, подвергали проверке для определения ее нуклеотидной последовательности с помощью дидезокси-способа. Было найдено, что она имела нуклеотидную последовательность, показанную на фиг. 8-10. Эту кДНК вырезали из вектора λgt 10 и присоединили к pBR 327 в сайте ЕсоRI чтобы получить плазмиду pBКU 2. In the directed selection described above, clones that were positive for both probes were selected, and the clone containing the “full” cDNA was checked to determine its nucleotide sequence using the dideoxy method. It was found that it had the nucleotide sequence shown in FIG. 8-10. This cDNA was excised from the λgt 10 vector and attached to pBR 327 at the EcoRI site to obtain the plasmid pBKU 2.

П р и м е р 11. Направленный отбор библиотеки человеческого хромосомного гена. PRI me R 11. The directed selection of the library of the human chromosomal gene.

1/Построение библиотеки человеческого хромосомного гена
Библиотеку человеческого хромосомного гена, полученную благодаря любезности доктора Манятиса из Гарвардского университета, приготовили следующим образом: всю хромосомную ДНК экстрагировали из печени эмбриона человека с помощью фенола или других подходящих химических реагентов и подвергли частичному перевариванию с рестриктазами Hae III и AluI, полученные фрагменты ДНК обработали центрифугированием в градиенте плотности сахарозы, чтобы сконцентрировать фрагменты, имеющие длины цепей примерно 18-25 тысяч оснований, сконцентрированные фрагменты присоединили к плечу ДНК Е.coli фага λ Сharon 4А, причем вставили короткоцепные синтетические нуклеотиды, имеющие сайты расщепления рестриктазой ЕсoRI с тем, чтобы получить инфекционные фаговые ДНК-рекомбинанты, с целью получения повышенной инфекционности, при упаковке получили больше очищенных частиц λ -фага. Теоретически считается, что полученная таким образом библиотека человеческого гена представляет собой набор рекомбинантов, содержащих человеческие ДНК с длинами цепей 18-25 тысяч оснований, которые содержат практически все человеческие гены.
1 / Building a library of the human chromosomal gene
The library of the human chromosomal gene, obtained thanks to the courtesy of Dr. Maniatis from Harvard University, was prepared as follows: all chromosomal DNA was extracted from the liver of a human embryo using phenol or other suitable chemicals and partially digested with Hae III and AluI restrictase, the obtained DNA fragments were centrifuged in sucrose density gradient to concentrate fragments having chain lengths of about 18-25 thousand bases, concentrated fra cops attached E. coli phage λ Charon 4A phage to the shoulder, and inserted short-chain synthetic nucleotides having EcoRI restriction enzyme cleavage sites in order to obtain infectious phage DNA recombinants, in order to obtain increased infectivity, when packaging received more purified particles of λ-phage . It is theoretically believed that the human gene library thus obtained is a set of recombinants containing human DNA with chain lengths of 18-25 thousand bases, which contain almost all human genes.

2) Направленный отбор библиотеки человеческого хромосомного гена с помощью зонда рНСS-1 ДНК. 2) Directional selection of a human chromosomal gene library using a pNS-1 DNA probe.

Гибридизацию пятен проводили по способу Бентона и Дэвиса [Science, 196,180(1977)] pНСS-1, полученную в примере 8, обработали Sau3A и ЕсoRI, чтобы получить фрагмент ДНК примерно 600 пар оснований. Этот фрагмент ДНК пометили радиоактивной меткой с помощью меченной трансляции по известным методикам. Нитроцеллюлозный фильтр (S&S) поместили на фаговое пятно, растущее на агаровой среде, чтобы перенести фаги на фильтр. После денатурации фаговой ДНК с помощью 0,5 моль/л NaOH, фильтровальную бумагу обработали следующими способами: обработка 0,1 моль/л NaOН и 1,5 моль/л NaCl в течение 20 с, две обработки 0,5 моль/л трис-НСl (рН 7,5) и 1,5 моль/л NaCl в течение 20 с, наконец, обработка 120 ммоль/л NaCl, 15 ммоль/л цитратом натрия, 13 ммоль/л КН2PO4 и 1 ммоль/л ЭДТА (рН 7,2) в течение 20 с.Hybridization of the spots was carried out according to the method of Benton and Davis [Science, 196,180 (1977)] pHS-1 obtained in Example 8 was treated with Sau3A and EcoRI to obtain a DNA fragment of approximately 600 base pairs. This DNA fragment was tagged with radioactive labeling using known techniques. A nitrocellulose filter (S&S) was placed on a phage spot growing on an agar medium to transfer phages to the filter. After denaturing phage DNA using 0.5 mol / L NaOH, the filter paper was treated in the following ways: processing 0.1 mol / L NaOH and 1.5 mol / L NaCl for 20 s, two treatments 0.5 mol / L Tris -HCl (pH 7.5) and 1.5 mol / L NaCl for 20 s; finally, treatment with 120 mmol / L NaCl, 15 mmol / L sodium citrate, 13 mmol / L KH 2 PO 4 and 1 mmol / L EDTA (pH 7.2) for 20 s.

Фильтр затем высушили и нагревали при 80оС в течение 2 ч, чтобы иммобилизировать ДНК. Предгибридизацию проводили в течение ночи при 42оС в предгибридизационном буфере, содержащем 5 х SSC, 5 х раствор Денгардта, 50 ммоль/л фосфатного буфера, 50% формамида, 0,25 мг/мл денатурированной ДНК (ДНК из спермы лосося) и 0,1% SDS. После этого гибридизацию проводили при 42оС в течение 20 ч в гибридизационном буфере, содержащем 4 х 105 счетов в минуту/мл зонда рНСS-1, который был радиоактивно помечен с помощью меченной трансляции. Этот гибридизационный буфер представляет собой смесь 5 х SSC, 5 х раствор Денгардта, 20 ммоль/л фосфатного буфера (рН 6,0), 50% формамида, 0,1% SDS, 10% декстрансульфата и 0,1 мг/мл денатурированной ДНК (ДНК из спермы лосося).The filter was then dried and heated at 80 ° C for 2 hours to immobilize DNA. Prehybridization was carried out overnight at 42 ° C in prehybridization buffer containing 5 x SSC, 5 x Denhardt's solution, 50 mmol / l phosphate buffer, 50% formamide, 0.25 mg / ml denatured DNA (salmon sperm DNA) and 0 , 1% SDS. Thereafter, hybridization was carried out at 42 ° C for 20 hours in hybridization buffer containing 4 × 10 5 scores cpm / ml probe rNSS-1, which was radioactively labeled using the labeled translation. This hybridization buffer is a mixture of 5 x SSC, 5 x Dengardt solution, 20 mmol / L phosphate buffer (pH 6.0), 50% formamide, 0.1% SDS, 10% dextransulfate and 0.1 mg / ml denatured DNA (DNA from salmon sperm).

Гибридизованный нитроцеллюлозный фильтр промывали в течение 20 мин 2 х SSC, содержащим 0,1% SDS, при комнатной температуре, затем в течение 30 мин, 0,1 х SSC, cодержащим 0,1% SDS при 44оС, и, наконец, в течение 10 мин 0,1 х SSC при комнатной температуре. Затем проводили детектирование с помощью авторадиографии.The hybridized nitrocellulose filter was washed for 20 min in 2 x SSC, containing 0,1% SDS, at room temperature, then for 30 min, 0.1 x SSC, coderzhaschim 0,1% SDS at 44 ° C, and finally for 10 min 0.1 x SSC at room temperature. Then, detection was performed using autoradiography.

В результате получили десять случайных положительных клонов. Рекомбинантные ДНК получили из этих клонов по методу Манятиса [Maniatic, Cell, 15, 687 (1978)] Полученные ДНК обработали рестриктазами, такими как ЕсoRI, BamHI и Bgl II, проанализировали с помощью агарозного гель-электрофореза, и получили их рестриктазную карту по способу Фриша с сотр. [Fritsh et al. Сell, там же)]
Гибридизацию по Саутерну проводили с помощью зонда, представляющего собой меченный радиоактивной меткой рНСS-1 выведенный фрагмент ДНК, который был таким же, какой использовали в вышеописанных способах направленного отбора. Фрагмент ДНК примерно 8 тысяч пар оснований, вырезанный с помощью ЕсoRI, отобрали из клонов, которые гибридизовались с зондом. Этот фрагмент субклонировали к сайту ЕсоRI pНR327. Субклонированную ДНК подвергали другой обработке рестриктазами, и повторно проводили гибридизацию по Саутерну. Найдено, что фрагмент ДНК примерно 4 тыс. пар оснований, вырезанный с помощью ЕсoRI и ХhoI, содержал ген, кодирующий полипептид человеческого Г-КСФ. Этот фрагмент подвергали проверке для определения последовательности его части длиной примерно 3 тыс. пар оснований с помощью дидезокси-способа, была определена нуклеотидная последовательность, показанная на фиг. 13-17. Этот фрагмент ДНК имел сайты расщепления рестриктазой, показанные на фиг.19.
As a result, ten random positive clones were obtained. Recombinant DNAs were obtained from these clones by the Maniatis method [Maniatic, Cell, 15, 687 (1978)]. The obtained DNAs were treated with restriction enzymes such as EcoRI, BamHI and Bgl II, analyzed by agarose gel electrophoresis, and their restriction enzyme map obtained by the method Frisha et al. [Fritsh et al. Cell, in the same place)]
Southern hybridization was carried out using a probe, which was a radiolabeled DNA fragment labeled with a radioactive label pns-1, which was the same as that used in the above methods of directional selection. A DNA fragment of approximately 8 thousand base pairs cut using EcoRI was selected from clones that hybridized with the probe. This fragment was subcloned to the EcoRI pHR327 site. The subcloned DNA was subjected to another restriction enzyme treatment, and Southern hybridization was repeated. It was found that a DNA fragment of approximately 4 thousand base pairs, cut with EcoRI and XhoI, contained a gene encoding a human G-CSF polypeptide. This fragment was checked to determine the sequence of its part with a length of approximately 3 thousand base pairs using the dideoxy method; the nucleotide sequence shown in FIG. 13-17. This DNA fragment had restriction enzyme cleavage sites shown in FIG.

Направленный отбор человеческих хромосомных генов проводили, используя также pBRG4 выведенную ДНК и pBRV-2-выведенную ДНК в качестве зондов. В каждом случае фрагмент ДНК в 1500 пар оснований, уже обработанный ЕсoRI был непосредственно радиоактивно помечен с помощью меченной трансляции вышеописанным способом, либо альтернативно фрагмент ДНК примерно 700 пар оснований, полученный последовательными обработками ЕсoRI и DraI, пометили радиоактивной меткой с помощью меченной трансляции. Полученный таким образом зонд использовали в способе гибридизации пятен, который проводили при тех же самых условиях, какие описаны выше. Отобранные клоны анализировали посредством гибридизации по Саузерну с тем, чтобы получить фрагмент ДНК, имеющий нуклеотидную последовательность, показанную на фиг.13-17. Полученную таким образом плазмиду назвали pBRCE3 β. Directed selection of human chromosomal genes was carried out using pBRG4-derived DNA and pBRV-2-derived DNA as probes. In each case, a 1500 bp DNA fragment already processed by EcoRRI was directly radioactively labeled using the labeled translation as described above, or alternatively a DNA fragment of approximately 700 base pairs obtained by sequential ECORI and DraI treatments was radiolabeled using labeled translation. The probe thus obtained was used in a spot hybridization method which was carried out under the same conditions as described above. Selected clones were analyzed by Southern hybridization so as to obtain a DNA fragment having the nucleotide sequence shown in Fig.13-17. The plasmid thus obtained was called pBRCE3 β.

П р и м е р 12. Построение Е.сoli рекомбинантного вектора и трансформация (с использованием tac-промоторсодержащего вектора)
1) Построение рекомбинантного вектора
1) Получение вектора
5 мкг tac-промотор-содержащего вектора рКК223-3 (Pharmacia) обработали 8 единицами ЕсoRI (Тakara Shuzo Co. Ltd.) в течение 2 ч при 37оС в 30 мкл реакционного раствора (40 ммоль/л трис-HCl, 7 ммоль/л MgCl2, 100 ммоль/л NaCl и 7 ммоль/л 2-меркаптоэтанола). Затем добавили 3 мкл щелочной фосфатазы (Takara Shuzo Co. Ltd.), и обработку проводили при 60оС в течение 30 мин. Фрагмент ДНК выделили путем трех обработок фенолом, одной обработкой эфиром и осаждением этанолом, причем все обработки проводили обычным образом.
PRI me R 12. Construction of E. coli recombinant vector and transformation (using tac-promoter vector)
1) Construction of a recombinant vector
1) Getting the vector
5 ug tac-promoter-containing vector pKK223-3 (Pharmacia) was treated with 8 units of EcoRI (Takara Shuzo Co. Ltd.) for 2 hours at 37 ° C in a 30 ul reaction solution (40 mmol / l Tris-HCl, 7 mM / l MgCl 2 , 100 mmol / l NaCl and 7 mmol / l 2-mercaptoethanol). Then add 3 ul of alkaline phosphatase (Takara Shuzo Co. Ltd.), and treatment was carried out at 60 ° C for 30 min. The DNA fragment was isolated by three treatments with phenol, one treatment with ether and ethanol precipitation, all treatments being carried out in the usual manner.

Выделенный фрагмент ДНК растворили в 50 мкл смеси, состоящей из 50 ммоль/л трис-НСl, 5 ммоль/л 10 ммоль/л DТТ и по 1 ммоль/л каждого из d АТФ, dЦТФ, dГТФ и dТТФ. После добавления 3 мкл Е.coli-ДНК-полимеразы 1-фрагмента Кленоу (Takara Shuzo Co. Ltd.), реакцию проводили при 14оС в течение 2 ч, чтобы создать тупые концы.The isolated DNA fragment was dissolved in 50 μl of a mixture consisting of 50 mmol / L Tris-Hcl, 5 mmol / L 10 mmol / L DTT and 1 mmol / L each of d ATP, d-PTF, d-GTF and dTTP. After addition of 3 .mu.l E. coli DNA polymerase 1 Klenow fragment (Takara Shuzo Co. Ltd.), reaction was conducted at 14 ° C for 2 hours to create blunt ends.

(II) Получение синтетического линкера. (II) Obtaining a synthetic linker.

3 мкг олигонуклеотидов, имеющих последовательности синтетических линкеров ЦГААТГАЦЦЦЦЦЦТГГГЦЦ и ЦАГГГГГГТЦАТТЦГ, фосфорилировали путем проведения реакции в 40 мкл реакционного раствора (состоящего из 50 ммоль/л трис-НСl, 10 ммоль/л MgCl2, 10 ммоль/л 2-меркаптоэтанола и 1 ммоль/л AТФ) при 37оС в течение 60 мин в присутствии 4 единиц Т4 полинуклеотид-киназы.3 μg of oligonucleotides having sequences of synthetic linkers TSGAATGAZTSTSTSTSTSTTGHHTSTs and TSAGHYYYYTTATTSTsG were phosphorylated by reaction in 40 µl of a reaction solution (consisting of 50 mmol / L Tris-Hcl, 10 mmol / L MgCl 2 , 10 mmol / L 2-mer l ATF) at 37 ° C for 60 min in the presence of 4 units of T4 polynucleotide kinase.

Каждый фосфорилированных олигонуклеотидов (0,2 мкг) растворили в 20 мкл 100 ммоль/л NaCl содержащего раствора ТЕ [10 ммоль/л трис-НСl (рН 8,0) и 1 ммоль/л ЭДТА] После обработки при 65оС в течение 10 мин олигонуклеотиды ренатурировали путем медленного охлаждения до комнатной температуры.Each phosphorylated oligonucleotide (0.2 ug) were dissolved in 20 l 100 mmol / l NaCl containing TE solution [10 mmol / l Tris-HCl (pH 8.0), 1 mmol / l EDTA] After treatment at 65 ° C for 10 min, the oligonucleotides were renatured by slow cooling to room temperature.

(III) Получение КДНК фрагмента Г-КСФ
Шестьдесят микрограммов рB RG4, полученной в примере 9, которая содержала КДНК, показанную на фиг.3-5, обработали 100 единицами рестриктазы АpaI (New Еngland Biolabs) и 50 единицами Dra I (Takara Shuzo Cо. Ltd.) при 37оС в течение 3 ч в 200 мкл реакционного раствора, состоящего из 6 ммоль/л трис-НСl, 6 ммоль/л MgCl2 и 6 ммоль/л 2-меркаптоэтанола. Примерно 2 мкг фрагмента АраI-DraI (примерно 590 пар оснований) выделили с помощью 1,2% агарозного гель-электрофореза.
(III) Obtaining cDNA fragment G-CSF
Sixty micrograms Pb RG4, obtained in Example 9 which contained the cDNA, illustrated in Figures 3-5, treated with 100 units of restriction enzyme ApaI (New England Biolabs) and 50 units of Dra I (Takara Shuzo Co. Ltd.) at 37 ° C. for 3 hours in 200 μl of a reaction solution consisting of 6 mmol / L Tris-Hcl, 6 mmol / L MgCl 2 and 6 mmol / L 2-mercaptoethanol. Approximately 2 μg of the AraI-DraI fragment (approximately 590 base pairs) was isolated using 1.2% agarose gel electrophoresis.

(IV) Cвязывание фрагментов. (IV) Binding of fragments.

Примерно 0,1 мкг каждого из фрагментов, полученных в стадиях (I)-(III), растворили в 20 мкл связывающего раствора (66 ммоль/л трис-НСl, 6,6 ммоль/л MgCl2, 10 ммоль/л DТТ и 1 ммоль/л ATФ). После добавления 175 единиц Т4 ДНК-лигазы раствор выдерживали в течение ночи при 4оС, чтобы получить рекомбинантный вектор (фиг.20).About 0.1 μg of each of the fragments obtained in stages (I) to (III) was dissolved in 20 μl of binding solution (66 mmol / L Tris-Hcl, 6.6 mmol / L MgCl 2 , 10 mmol / L DTT and 1 mmol / L ATP). After addition of 175 units of T4 DNA ligase solution was incubated overnight at 4 ° C to obtain a recombinant vector (Figure 20).

2) Трансформация. 2) Transformation.

Используя 20 мкл реакционного раствора, содержащего рекомбинантный вектор, полученный в (IV), трансформировали штамм Е.coli JM105 путем обработки хлоридом рубидия (см. Т. Maniatis et al. Molecular Cloning, р. 252 (1982)] Плазмиду выделили из культуры устойчивости к ампициллину колонии трансформантов и обработали рестриктазами BamHI, АссII и ApaI, чтобы подтвердить получение нужных трансформантов. Using 20 μl of the reaction solution containing the recombinant vector obtained in (IV), E. coli strain JM105 was transformed by treatment with rubidium chloride (see T. Maniatis et al. Molecular Cloning, p. 252 (1982)] The plasmid was isolated from a culture of resistance to ampicillin colony of transformants and was treated with restriction enzymes BamHI, AssII and ApaI to confirm receipt of the desired transformants.

П р и м е р 13. Построение рекомбинантного вектора Е.Coli (+VSE) и трансформации (с использованием PL-промотор-содержащего вектора). PRI me R 13. Construction of a recombinant vector E. Coli (+ VSE) and transformation (using PL-promoter-containing vector).

1) Построение рекомбинантного вектора. 1) Construction of a recombinant vector.

1) Получение вектора. 1) Getting the vector.

Cто микрограммов PL-промотор-содержащего вектора PL-ламбда (Pharmacia) обрабатывали в течение ночи при 37оС с помощью 50 единиц рестриктазы BamHI и 100 мкл реакционного раствора [10 ммоль/л трис-НСl (рН 7,6), 7 ммоль/л MgCl2, 100 ммоль/л NaCl и 10 ммоль/л DТТ] Подвергая реакционный раствор 1% агарозному гель-электрофорезу, выделили примерно 49 мкг фрагмента длиной 4 тысячи оснований и примерно 11 мкг фрагмента примерно 1,2 тыс. оснований.One-hundred micrograms PL-promoter-containing vector PL-lambda (Pharmacia) was treated overnight at 37 ° C with 50 units of restriction enzyme BamHI, and 100 .mu.l of a reaction solution [10 mmol / l Tris-HCl (pH 7.6), 7 mM / l MgCl 2 , 100 mmol / l NaCl and 10 mmol / l DTT] By subjecting the reaction solution to 1% agarose gel electrophoresis, approximately 49 μg of a fragment of 4 thousand bases and approximately 11 μg of a fragment of approximately 1.2 thousand bases were isolated.

Фрагмент 4 тыс.оснований растворили в 100 мкл ТЕ буфера (см. выше состав) и подвергли ее дефосфорилированию путем реакции с щелочной фосфатазой (Тakara Shuzo Co. Ltd.) при 60оС в течение 60 мин.Fragment 4 tys.osnovany dissolved in 100 l of TE buffer (see. The above composition) and subjected to dephosphorylation by its reaction with an alkaline phosphatase (Takara Shuzo Co. Ltd.) at 60 ° C for 60 min.

Другой фрагмент длиной примерно 1,2 тыс. оснований, растворили в 20 мкл буфера (10 ммоль/л трис-НСl, 10 ммоль/л MgCl2, 6 ммоль/л KCl и 1 ммоль/л DТТ) и обрабатывали в течение ночи с 20 единицами рестриктазы и Mbo II (New Еngland Biolabs) при 37оС.Another fragment with a length of approximately 1.2 thousand bases was dissolved in 20 μl of buffer (10 mmol / L Tris-Hcl, 10 mmol / L MgCl 2 , 6 mmol / L KCl and 1 mmol / L DTT) and treated overnight with 20 units of restrictase and Mbo II (New England Biolabs) at 37 about C.

Путем гель-электрофореза 4% полиакриламидного геля выделяли примерно 0,9 мкг Bam HI-Mbo II фрагмента (примерно 200 пар оснований) и примерно 1,9 мкг MboII-BamHI фрагмента (примерно 310 пар оснований). Approximately 0.9 μg Bam HI-Mbo II fragment (approximately 200 base pairs) and approximately 1.9 μg MboII-BamHI fragment (approximately 310 base pairs) were isolated by gel electrophoresis of a 4% polyacrylamide gel.

(II) Получение синтетического линкера. (II) Obtaining a synthetic linker.

Олигонуклеотиды, имеющие последовательности синтетических линкеров ТААГГАГАТТЦАТЦГАТ и ТЦГАТГААТТЦТЦЦТТАГ, подвергали фосфорилированию и ренатурации, как в (II) в примере 12, с тем, чтобы приготовить синтетический S/D линкер. Oligonucleotides having sequences of synthetic linkers TAAGGAGATTZATTSGAT and TTsGATGAATTTSTSTSTTAG were subjected to phosphorylation and renaturation, as in (II) in example 12, in order to prepare a synthetic S / D linker.

(III) Получение вектора экспрессии. (III) Obtaining an expression vector.

Одну десятую микрограмма фрагмента длиной примерно 4 тыс. оснований, 0,05 мкг каждого BamHI-MboII фрагмента, имеющего участок OLPL и Mbо II BamHI фрагмента, имеющего участок tL1 [три фрагмента получили в (1)] и 0,1 мкг ренетурированного синтетического S/D линкера, полученного в (II), подвергали реакции в течение ночи при 12оС в 40 мкл реакционного раствора (66 ммоль/л трис-НСl, 6,6 ммоль/л MgCl2, 10 ммоль/л ДТТ и 1 ммоль/л AТФ) в присутствии 175 единиц Т4 ДНК-лигазы (Тakara Shuzo Co. Ltd.). Двадцать микролитров реакционного раствора использовали для трансформации штамма N99Cl+ Е.сoli (Pharmacia) по методу с использованием хлорида кальция (см. там же Molecular Cloning).One tenth microgram of a fragment with a length of about 4 thousand bases, 0.05 μg of each BamHI-MboII fragment having an O L P L and Mbо II BamHI fragment having a tL1 region [three fragments were obtained in (1)] and 0.1 μg reneturirovannogo synthetic S / D linker prepared in (II), was reacted overnight at 12 ° C in 40 ul reaction solution (66 mmol / l tris-HCl, 6.6 mmol / l MgCl 2, 10 mmol / l DTT and 1 mmol / L ATP) in the presence of 175 units of T 4 DNA ligase (Takara Shuzo Co. Ltd.). Twenty microliters of the reaction solution was used to transform strain N99Cl + E. coli (Pharmacia) according to the method using calcium chloride (see also Molecular Cloning).

Культивировали трансформанты и выделяли плазмиду из культуры их колоний, которые были устойчивы к ампициллину. Обработка плазмиды рестриктазами ЕсoRI BamHI и SмaI показала, что это была целевая плазмида. The transformants were cultured and a plasmid was isolated from the culture of their colonies, which were resistant to ampicillin. Processing of the plasmid with restriction enzymes EsoRI BamHI and SmaI showed that it was the target plasmid.

Два микрограмма этой плазмиды контактировали с рестриктазой СlaI (New Еngland Biolabs) при 37оС в течение 2 ч в 20 мкл буфера (10 ммоль/л трис-НСl, 6 ммоль/л MgCl2 и 50 ммоль/л (NaCl). После этого фермент инактивировали путем нагревания при 65оС в течение 10 мин.Two micrograms of this plasmid is contacted with the restriction enzyme SlaI (New England Biolabs) at 37 ° C for 2 h in 20 l of buffer (10 mmol / l Tris-HCl 6 mmol / l MgCl 2 and 50 mmol / liter (NaCl). After this enzyme was inactivated by heating at 65 about C for 10 minutes

Один микролитр реакционного раствора контактировали в течение ночи при 12оС с 175 единицами Т4 ДНК-лигазы [Тakara Shuzo Co. Ltd.) в связывающем растворе, имеющем вышеописанный состав. Затем реакционный раствор использовали для трансформации штамма N 99 Cl+ Е. сoli (Pharmacia). Плазмиду выделили из культуры устойчивых к ампициллину колоний трансформаторов и обработки ЕсоRI и BamНI, чтобы подтвердить что указанная плазмида является нужной плазмидой.One microliter of the reaction solution were contacted overnight at 12 ° C with 175 units T4 DNA ligase [Takara Shuzo Co. Ltd.) in a binder solution having the above composition. Then the reaction solution was used to transform strain N 99 Cl + E. coli (Pharmacia). The plasmid was isolated from the culture of ampicillin-resistant transformer colonies and the treatment with EcoRI and BamHI to confirm that the plasmid was the desired plasmid.

(IV) Получение рекомбинантного вектора и трансформаторов, экспрессующих Г-КСФ. (IV) Obtaining a recombinant vector and transformers expressing G-CSF.

Плазмиду экспрессии, полученную в (III), обработали рестриктазой СlaI. После создания тупых концов плазмиду затем обработали как в примере 12, чтобы получить рекомбинантный вектор с вставкой КДНК фрагмента Г-КСФ. Этот вектор использовали для трансформации штамма N 4830 Е.сoli (Pharmacia Fine Chemicals) по способу с использованием хлорида кальция, описанному в Molecular Cloning (cм.выше) Отождествление нужных трансформантов производили, как в примере 12 (фиг.21-22). The expression plasmid obtained in (III) was digested with restriction enzyme ClaI. After creating blunt ends, the plasmid was then processed as in example 12 to obtain a recombinant vector with the insertion of a cDNA fragment of G-CSF. This vector was used to transform E. coli strain N 4830 (Pharmacia Fine Chemicals) according to the method using calcium chloride described in Molecular Cloning (see above). Identification of the desired transformants was carried out as in example 12 (Fig.21-22).

П р и м е р 14. Построение Е.coli-рекомбинантного вектора (+VSЕ) и тронсформация (с использованием trp-промотор-содержащего вектора). PRI me R 14. Construction of E. coli-recombinant vector (+ VSE) and throne formation (using trp-promoter-containing vector).

1) Построение рекомбинантного вектора. 1) Construction of a recombinant vector.

1) Получение вектора. 1) Getting the vector.

Плазмиду pOY1 получили путем вставки триптофанного промотора, содержащего фрагмент HpaII-ТagI (примерно 330 пар оснований) в pBR322 в сайт СlAl. Десять микрограммов этой плазмиды обработали 7 единицами рестриктазы СlAl и 8 единицами Pvu II при 37оС в течение 3 ч в 30 мкл реакционного раствора, состоящего из 10 ммоль/л трис-НСl, 6 ммоль/л MgCl2 и 50 ммоль/л NaCl.Plasmid pOY1 was obtained by inserting a tryptophan promoter containing the HpaII-TagI fragment (approximately 330 base pairs) in pBR322 into the ClAl site. Ten micrograms of this plasmid was treated with 7 units of the restriction enzyme SlAl and 8 units of Pvu II at 37 ° C for 3 h in 30 l of a reaction solution consisting of 10 mmol / l Tris-HCl 6 mmol / l MgCl 2 and 50 mmol / l NaCl .

Затем добавили 2 мкл щелочной фосфатазы (Тakara Shuzo Co.0, Ltd.) и реакцию проводили при 60оС в течение 1 ч.Then we added 2 .mu.l of alkaline phosphatase (Takara Shuzo Co.0, Ltd.) and reacted at 60 ° C for 1 hour.

Фрагмент ДНК (примерно 2,5 мкг) примерно 2,6 тыс. оснований длиной выделили из реакционного раствора путем гельэлектрофореза 1% агарозного геля. A DNA fragment (approximately 2.5 μg) of approximately 2.6 thousand base lengths was isolated from the reaction solution by gel electrophoresis of a 1% agarose gel.

(II) Получение синтетического линкера. (II) Obtaining a synthetic linker.

Олигонуклеотиды, имеющие последовательности синтетических линкеров ЦГЦГААТГАЦЦЦЦЦЦТГГГЦЦ и ЦАГГГГГГТЦАТТЦГ, фосфорилировании и ренатурировали, как в (II) в примере 12, с тем, чтобы получить синтетический линкер. Oligonucleotides having sequences of synthetic linkers TSHGCAATGATSTSTSTSTSTSTGHGTSTS and TSAGGYYYYTTSTATTsG, phosphorylation and renatured, as in (II) in example 12, in order to obtain a synthetic linker.

(III) Получение рекомбинантного вектора. (III) Preparation of a recombinant vector.

Примерно 1 мкг векторного фрагмента, полученного в (I), примерно 1 мкг синтетического линкера, полученного в (II), и примерно 1 мкг фрагмента ДНК Г-КСФ, полученного в (III) в примере 12, контактировали с 175 единицами Т4 ДНК-лигазы в течение ночи при 12оС в 20 мкл связывающего раствора, имеющего состав, описанный в примере 12,1) (IV), с тем, чтобы получить рекомбинантный вектор (фиг.23).About 1 μg of the vector fragment obtained in (I), about 1 μg of the synthetic linker obtained in (II), and about 1 μg of the G-CSF DNA fragment obtained in (III) in Example 12 were contacted with 175 units of T 4 DNA -ligazy overnight at 12 C. 20 l of the binding solution having the composition described in example 12,1) (IV), in order to obtain a recombinant vector (23).

2) Трансформация. 2) Transformation.

Двадцать микролитров реакционного раствора, полученного в (III), использовали для трансформации Е.сoli DНI по методу с использованием хлорида рубидия, описанного выше в Molecular Cloning. Twenty microliters of the reaction solution obtained in (III) were used to transform E. coli DHI according to the method using rubidium chloride described above in Molecular Cloning.

Как и в примере 12, плазмиду выделили из устойчивых к ампициллину колоний трансформантов, и обработали эту плазмиду рестриктазами АpaI, Dra I, NruI и Pst I, что показало, что получены нужные трансформанты. As in example 12, the plasmid was isolated from ampicillin-resistant colonies of transformants, and the plasmid was treated with restriction enzymes ApaI, Dra I, NruI and Pst I, which showed that the desired transformants were obtained.

П р и м е р 15. Культивирование трансформантов. PRI me R 15. The cultivation of transformants.

1) Культивирование трансформантов (с tac), полученных в примере 12. 1) Cultivation of transformants (with tac) obtained in example 12.

Трансформанты культивировали в течение ночи при 37оС и 1 мл культуры добавили к 100 мл среды Луриа (Luria), содержащей 25 мкг/мл или 50 мкг/мл ампициллина. Культивирование проводили в течение 2-3 ч при 37оС.Transformants were grown overnight at 37 ° C and 1 ml of culture was added to 100 ml of LB (Luria), containing 25 ug / ml or 50 .mu.g / ml ampicillin. Cultivation was carried out for 2-3 hours at 37 about C.

Культивирование проводили при 37оС в течение 2-4 ч после добавления изопропил- -D-тиогалактозиды, чтобы получить конечную концентрацию 2 ммоль/л.Cultivation was performed at 37 ° C for 2-4 hours after addition of isopropyl -D-thiogalactoside to a final concentration of 2 mmol / l.

2) Культивирование трансформантов (с PL), полученных в примере 13.2) Cultivation of transformants (with P L ) obtained in example 13.

Трансформанты культивировали в течение ночи при 28оС и 1 мл культуры добавили к 100 мл среды Луриа (Luria), содержащей 25 или 50 мкг/мл ампициллина. Культивирование осуществляли примерно в течение 4 ч при 28оС.Transformants were grown overnight at 28 ° C and 1 ml of culture was added to 100 ml of LB (Luria), containing 25 or 50 micrograms / ml ampicillin. Cultivation was carried out for approximately 4 hours at 28 about C.

Культивирование продолжали в течение 2-4 ч при 42оС.Cultivation was continued for 2-4 hours at 42 about C.

3) Культивирование трансформантов (с trp), полученных в примере 14. 3) Cultivation of transformants (with trp) obtained in example 14.

Трансформанты культивировали в течение ночи при 37оС, и 1 мл культуры добавили к 100 мл среды М9, содержащей 0,5% глюкозы, 0,5% казаминокислот (Сasamino acids (Difco)) и 25 или 50 мкг/мл ампициллина. Культивирование проводили в течение 4-6 ч при 37оС. После добавления 50 мкг/мл 3-β -индолакриловой кислоты (IAA), культивирование продолжали в течение 4-9 ч при 37оС.Transformants were grown overnight at 37 ° C, and 1 ml of culture was added to 100 mL of M9 medium containing 0.5% glucose, 0.5% casamino acids (Sasamino acids (Difco)) and the 25 or 50 .mu.g / ml ampicillin. Cultivation was carried out for 4-6 hours at 37 C. After addition of 50 ug / ml 3-β -indolakrilovoy acid (IAA), cultivation was continued for 4-9 hours at 37 ° C.

П р и м е р 16. Выделение и очистка полипептида Г-КСФ из Е.coli
1) Выделение.
PRI me R 16. Isolation and purification of the G-CSF polypeptide from E. coli
1) Isolation.

Три вида трансформантов, культивированных в примере 15, подвергали следующим способам выделения. Three types of transformants cultured in Example 15 were subjected to the following isolation methods.

Культуру (100 мл) подвергали центрифугированию, чтобы получить клеточный осадок после центрифугирования, который суспендировали в 5 мл смеси 20 миллимоль/л трис-НСl (рН 7,5) и 30 миллимоль/л NaCl. The culture (100 ml) was centrifuged to obtain a cell pellet after centrifugation, which was suspended in 5 ml of a mixture of 20 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.5) and 30 mmol / L NaCl.

Затем добавили 0,2 моль/л фенилметилсульфонилфторида 0,2 моль/л ЭДТА, чтобы получить концентрации, соответственно 1 ммоль/л, 10 ммоль/л и 0,2 мг/мл, и суспензию ставили на 30 мин при 0оС.Then was added 0.2 mol / L phenylmethylsulfonyl fluoride 0.2 mol / l EDTA, to obtain a concentration, respectively, 1 mmol / l, 10 mmol / l and 0.2 mg / ml, and the suspension was set at 30 minutes at 0 ° C.

Клетки лизировали с помощью трех циклов замораживания/оттаивания, после чего желательно обработать ультразвуком. Лизат центрифугировали, чтобы получить надосадочную жидкость. Альтернативно, лизат обработали 8 моль/л гуанидинхлоргидрата так, что конечная его концентрация стала 6 моль/л гуанидинхлоргидрата, после чего провели центрифугирование при 30000 оборотов в минуту в течение 5 ч и выделили надосадочную жидкость. Cells were lysed using three freeze / thaw cycles, after which it was desirable to sonicate. The lysate was centrifuged to obtain a supernatant. Alternatively, the lysate was treated with 8 mol / L guanidine hydrochloride so that its final concentration became 6 mol / L guanidine hydrochloride, after which it was centrifuged at 30,000 rpm for 5 hours and the supernatant was isolated.

2) Очистка
(I) Надосадочную жидкость, полученную в 1), подвергали гель-фильтрации на колонке Ultrogel AcA54 (диаметром 4,6 мм, длиной 90 см, LKB) при скорости потока примерно 50 мл/ч с использованием 0,01 моль/л трис-НСl буфера (рН 7,4), содержащего 0,15 моль/л NaCl и 0,01% Твин 20 (Nakai Kagaku Co. Ltd.).
2) Cleaning
(I) The supernatant obtained in 1) was subjected to gel filtration on an Ultrogel AcA54 column (4.6 mm in diameter, 90 cm long, LKB) at a flow rate of about 50 ml / h using 0.01 mol / L Tris- HCl buffer (pH 7.4) containing 0.15 mol / L NaCl and 0.01% Tween 20 (Nakai Kagaku Co. Ltd.).

Отобрали фракции, которые проявляли активность при анализе способом определения колониистимулирующей активности (b) (описанным ранее в этом описании), и их сконцентрировали до объема примерно 5 мл с помощью устройства для ультрафильтрации рМ-10 (Аmicon). The fractions that were active in the analysis by the method for determining colony-stimulating activity (b) (described earlier in this description) were selected and concentrated to a volume of about 5 ml using a pM-10 ultrafiltration device (Amicon).

(II) К cконцентрированным фракциям добавили н-пропанол (чистоты, пригодной для определения аминокислотной последовательности, Тokyo Kasei Co. Ltd. ) и трифторуксусную кислоту, и смесь обработали так, чтобы конечные концентрации н-пропанола и трифторуксусной кислоты составляли 30 и 0,1% соответственно. Обработанную смесь оставили во льду примерно на 15 мин и подвергали центрифугированию при 15000 оборотах в минуту в течение 10 мин, чтобы удалить осадок. Надосадочную жидкость адсорбировали на колонке μ -Bondapak C18 (полупрепаративного сорта; Waters; 8 ммх х30 см), которую уравновешивали водным раствором, содержащим н-пропанол (см. выше) и трифторуксусную кислоту. Колонку непрерывно элюировали водным раствором 0,1% трифторуксусной кислоты, содержащей н-пропанол с линейным градиентом плотности 30-60% Используя "Хитачи" модель 685-50 (жидкостный хроматограф высокого давления фирмы "Хитачи"), "Хитачи" модель 638-41 (детектор фирмы "Хитачи"), одновременно измеряли величины поглощения на длинах волн 220 и 280 нм. После элюирования 10 микролитровую оликвоту каждой фракции разбавляли в 100 раз, и разбавленные растворы подвергали отбору для поиска активных фракций по способу определения колониистимулирующей активности (b). Активность наблюдали в пиках, которые элюировали при 40% н-пропанола. Эти пики смешали и повторно хроматографировали при тех же самых условиях, какие использовали выше, и фракции подвергали проверке для определения их активности по способу (b). Опять активность была найдена в пиках при 40% н-пропанола. Эти активные пики собрали (четыре фракции 4 мл) и высушили вымораживанием. (II) n-propanol (purity suitable for determining the amino acid sequence, Tokyo Kasei Co. Ltd.) and trifluoroacetic acid were added to the concentrated fractions, and the mixture was treated so that the final concentrations of n-propanol and trifluoroacetic acid were 30 and 0.1 % respectively. The treated mixture was left on ice for about 15 minutes and centrifuged at 15,000 rpm for 10 minutes to remove the precipitate. The supernatant was adsorbed on a μ-Bondapak C18 column (semi-preparative grade; Waters; 8 mmx x30 cm), which was equilibrated with an aqueous solution containing n-propanol (see above) and trifluoroacetic acid. The column was continuously eluted with an aqueous solution of 0.1% trifluoroacetic acid containing n-propanol with a linear density gradient of 30-60% Using a Hitachi model 685-50 (Hitachi high-pressure liquid chromatograph), a Hitachi model 638-41 (Hitachi detector), the absorption values at wavelengths of 220 and 280 nm were simultaneously measured. After elution, a 10-liter oliquot of each fraction was diluted 100 times, and the diluted solutions were selected to search for active fractions by the method for determining colony-stimulating activity (b). Activity was observed at peaks that were eluted at 40% n-propanol. These peaks were mixed and rechromatographed under the same conditions as used above, and the fractions were checked to determine their activity by method (b). Again activity was found at peaks at 40% n-propanol. These active peaks were collected (four fractions of 4 ml) and freeze dried.

(III) Высушенный вымораживанием порошок растворили в 200 мкл водного раствора 0,1% трифторуксусной кислоты, содержащего 40% н-пропанола, и раствор подвергали жидкостной хроматографии высокого давления на колонке ТSK-G300 SW (7,5 мм х 60 см, Тoyo Soda Manufacturins Co. Ltd.). Элюирование осуществляли при скорости потока 0,4 мл/мин водным раствором 0,1% трифторуксусной кислоты, содержащим 40% н-пропанол, и фракции по 0,4 мл собрали с помощью коллектора фракций FRAC-100 (Pharmacia Fine Chemicals). Эти фракции проверили описанным выше способом анализа колониистимулирующей активности, и выделили активные фракции. Затем их очищали на аналитической колонке μ -Bondapak C18 (4,6 мм х 30 см), и выделили основной пик и высушили вымораживанием. (III) Freeze-dried powder was dissolved in 200 μl of an aqueous solution of 0.1% trifluoroacetic acid containing 40% n-propanol, and the solution was subjected to high pressure liquid chromatography on a TSK-G300 SW column (7.5 mm x 60 cm, Toyo Soda Manufacturins Co. Ltd.). Elution was carried out at a flow rate of 0.4 ml / min with an aqueous solution of 0.1% trifluoroacetic acid containing 40% n-propanol, and 0.4 ml fractions were collected using a FRAC-100 fraction collector (Pharmacia Fine Chemicals). These fractions were checked as described above for the analysis of colony stimulating activity, and the active fractions were isolated. They were then purified on a μ-Bondapak C18 analytical column (4.6 mm x 30 cm), and the main peak was isolated and freeze dried.

Полученный таким образом протеин обработали 2-меркаптоэтанолом и подвергали гель-электрофорезу с SDS-полиакриламидным гелем (15,0%) (15 мВ, 6 ч). При окрашивании красителем Сoomassie Blue нужный полипептид Г-КСФ можно было идентифицироват в виде единственной полосы. The protein thus obtained was treated with 2-mercaptoethanol and subjected to gel electrophoresis with SDS-polyacrylamide gel (15.0%) (15 mV, 6 h). When staining with Сomassie Blue dye, the desired G-CSF polypeptide could be identified as a single band.

П р и м е р 17. Определение активности Г-КСФ (+VSE). PRI me R 17. Determination of the activity of G-CSF (+ VSE).

Образец КСФ, полученный в примере 16, анализировали способом анализа КСФ(а), описанным ранее в этом описании. Результаты приведены в табл.1. The CSF sample obtained in Example 16 was analyzed by the CSF analysis method (a) described earlier in this description. The results are shown in table 1.

П р и м е р 18. Аминокислотный анализ (+VSЕ)
1) Анализ аминокислотного состава
Образец КСФ, очищенный в примере 16, гидролизовали обычными способами, и аминокислотный состав протеиновой части гидролизата анализировали способом аминокислотного анализа с помощью автоматического аминокислотного анализатора "Хитачи 835" (фирмы "Хитачи"). Результаты приведены в табл.2. Гидролиз проводили при следующих условиях: (I) 6 н. раствор НСl 110оС, 24 часа в вакууме, (II) 4 н. раствор метансульфокислоты + 0,2% 3-(2-аминоэтил) индола, 110оС, 24 ч, 48 ч, 72 ч в вакууме.
PRI me R 18. Amino acid analysis (+ VSE)
1) Analysis of amino acid composition
A CSF sample purified in Example 16 was hydrolyzed by conventional methods, and the amino acid composition of the protein portion of the hydrolyzate was analyzed by amino acid analysis using a Hitachi 835 automatic amino acid analyzer (Hitachi). The results are shown in table.2. Hydrolysis was carried out under the following conditions: (I) 6 N. a solution of Hcl 110 about With, 24 hours in vacuum, (II) 4 N. a solution of methanesulfonic acid + 0.2% 3- (2-aminoethyl) indole, 110 ° C, 24 hours, 48 hours, 72 hours in vacuum.

Образец растворили в растворе (1,5 мл), содержащем 40% н-пропанола и 0,1% трифторуксусной кислоты. Аликвоты массой по 0,1 мл высушили с помощью сухого газообразного азота и после добавления реагентов, перечисленных в (I) или в (II), емкости герметически закрыли в вакууме, после чего проводили гидролиз содержимого. The sample was dissolved in a solution (1.5 ml) containing 40% n-propanol and 0.1% trifluoroacetic acid. Aliquots of 0.1 ml each were dried with dry gaseous nitrogen and, after the addition of the reagents listed in (I) or (II), the containers were sealed in vacuum, after which the contents were hydrolyzed.

Каждая из величин, приведенных в табл.2, представляла собой среднее значение из четырех измерений, величины для 24 ч для (I) и величины для 24,48 и 72 ч для (II), за исключением того, что содержания Тpe, Ceр, 1/2 Цис, Meт, Вал, Иле и Трп рассчитывали с помощью следующих способов (см. "Тampaku Kagaku (Protein Chemistry) II", A Course in Biochemical Ехperiments, Тokyo Kagaku Dohjin):
Для Тре, Сер, 1/2 Цис и Мет кривую зависимости от времени величин для 24, 48 и 72 ч для (I) экстрагировали к нулю часов.
Each of the values given in Table 2 was an average of four measurements, values for 24 h for (I) and values for 24.48 and 72 h for (II), except that the contents of Tpe, Ce, 1/2 Cis, Met, Val, Ile and Trp were calculated using the following methods (see "Tampaku Kagaku (Protein Chemistry) II", A Course in Biochemical Expert, Tokyo Kagaku Dohjin):
For Tre, Ser, 1/2 Cis and Met, the time-dependent curve for 24, 48, and 72 h for (I) was extracted to zero hours.

Для Вал и Иле использовали величину для 72 ч для (II). For Val and Ile, the value for 72 h for (II) was used.

Для Трп использование: среднее значение величин для 24,48 и 72 ч для (II). For Trp use: average values for 24.48 and 72 hours for (II).

2/ Анализ N концевых аминокислот
Образец подвергали разложению по Эдману с помощью газофазного определителя последовательности (фирмы "Aпплайд" Биосистемз"), и полученную РТН-аминокислоту анализировали обычными способами с помощью жидкостного хроматографа высокого давления (фирмы Бекмен инструментс") и колонки Ultrasphere-ODS (фирмы "Бекмен инструментс"). После того, как колонку (5 микрон, диаметр 4,6 мм х длина 250 мм) уравновесили исходным буфером [водный раствор, содержащий 15 ммоль/л натрий-ацетатного буфера (рН 4,5) и 40% ацетонитрила] инжектировали образец (растворенный в 20 мкл исходного буфера) и осуществляли разделение при изократическом элюировании исходным буфером. Во время этих стадий поддерживали скорость потока 1,4 мл/мин и температуру колонки 40оС. Детектирование РТН-аминокислоты осуществляли, измеряя величины поглощения в ультрафиолетовой области спектра на длинах волн 269 нм и 320 нм. Стандартные образцы (весом по 2 нмоль) РТН-аминокислоты ("Сигма") разделяли на той же самой линии, чтобы определить их времена удерживания, которые сравнивали с временем удерживания образца с целью идентификации N-концевых аминокислот. В результате были обнаружены РТН-метионин и РТН-треонин.
2 / Analysis of N terminal amino acids
The sample was digested according to Edman using a gas phase sequence determiner (Apple Biosystems), and the resulting PTH amino acid was analyzed by conventional methods using a high pressure liquid chromatograph (Beckman instruments) and an Ultrasphere-ODS column (Beckman instruments) ) After the column (5 microns, diameter 4.6 mm x length 250 mm) was equilibrated with the original buffer [aqueous solution containing 15 mmol / L sodium acetate buffer (pH 4.5) and 40% acetonitrile], a sample was injected (dissolved in 20 μl of the original buffer) and separation was carried out by isocratic elution with the original buffer. During these stages was maintained flow rate 1.4 ml / min and the column temperature was 40 C. The detection of PTH-amino acids was carried out by measuring the absorption values in the ultraviolet region at wavelengths of 269 nm and 320 nm. Standard samples (weighing 2 nmol) of PTH amino acids (Sigma) were separated on the same line to determine their retention times, which were compared with the retention time of the sample to identify N-terminal amino acids. As a result, PTH methionine and PTH threonine were detected.

П р и м е р 19. Построение Е.coli рекомбинантного вектора (-VSЕ) и трансформация
1) Использование tac-промотор-содержащего вектора.
PRI me R 19. Construction of E. coli recombinant vector (-VSE) and transformation
1) Use of a tac-promoter-containing vector.

Повторили способы примера 12, за исключением того, что "pBRG 4, полученную в примере 9, который содержала КДНК, показанную на фиг.3-5 [cм.(III) в примере 12] заменили на "pBRV2, полученную в примере 10, которая содержала КДНК, показанную на фиг. 8-10". Как и в примере 12, было подтверждено, что полученные трансформанты представляют собой нужные трансформанты фиг.24. Repeated the methods of example 12, except that "pBRG 4 obtained in example 9, which contained the cDNA shown in Fig.3-5 [see (III) in example 12] was replaced by" pBRV2 obtained in example 10, which contained the cDNA shown in FIG. 8-10 ". As in example 12, it was confirmed that the obtained transformants are the desired transformants of Fig.24.

2) Использование PL-промотор-содержащего вектора
Повторили способы примера 13, используя КДНК (-VSЕ), и было подтверждено, что полученные трансформанты представляют собой нужные трансформанты (фиг.25-26).
2) Use of a PL-promoter-containing vector
Repeated the methods of example 13 using cDNA (-VSE), and it was confirmed that the obtained transformants are the desired transformants (Fig.25-26).

3) Использование trp-промотор-содержащего вектора. 3) Use of trp-promoter-containing vector.

Повторили способы примера 14, используя КДНК (-VSЕ), и было подтверждено, что трансформанты представляли собой нужные трансформанты (фиг.27). The methods of Example 14 were repeated using cDNA (-VSE), and it was confirmed that the transformants were the desired transformants (FIG. 27).

П р и м е р 20. Анализ активности Г-КСФ (-VSЕ). PRI me R 20. Analysis of the activity of G-CSF (-VSE).

Три вида трансформантов, полученных в примере 19, культивировали по способу, описанному в примере 15. Из культивированных клеток Е.coli выделили полипептиды Г-КСФ и очищали их способом, описанным в примере 16, в результате чего полипептид человеческого Г-КСФ получили в виде единственной полосы. Three types of transformants obtained in example 19 were cultured according to the method described in example 15. G-CSF polypeptides were isolated from cultured E. coli cells and purified by the method described in example 16, whereby the human G-CSF polypeptide was obtained as single strip.

Полученный таким образом образец КСФ анализировали способом анализа активности КСФ(а), описанным ранее в этом описании. The CSF sample thus obtained was analyzed by the method for analyzing CSF activity (a) described earlier in this description.

Результаты приведены в табл.3. The results are shown in table.3.

П р и м е р 21. Аминокислотный анализ (-VSЕ)
1) Анализ аминокислотного состава.
PRI me R 21. Amino acid analysis (-VSE)
1) Analysis of amino acid composition.

Аминокислотный состав образца КСФ, очищенного в примере 20, анализировали по способу, описанному в 1) в примере 18. Результаты приведены в табл. 4. The amino acid composition of the CSF sample purified in Example 20 was analyzed by the method described in 1) in Example 18. The results are shown in table. 4.

2) Анализ N-концевых аминокислот,
Образец подвергали анализу N-концевых аминокислот по способу, описанному в 2) в примере 18. В результате были обнаружены РТН-метионин и РТН-треонин.
2) Analysis of N-terminal amino acids,
The sample was subjected to N-terminal amino acid analysis according to the method described in 2) in Example 18. As a result, PTH methionine and PTH threonine were detected.

П р и м е р 22. Получение вектора рН GA410 (для использования с клетками животных, +VSЕ линия)
Фрагмент ЕсoRI, полученный в примере 9, который имел КДНК, показанную на фиг. 3-5, обрабатывали рестриктазой Dra I при 37оС в течение 2 ч, после чего обработали с фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы I (Тakara Shuzo Co. Ltd), чтобы создать тупые концы. Один микрограмм линкера (8 mer, Takara Shuzo Co. Ltd. ) фосфорилировали с АТФ и присоединили к отдельно полученной смеси фрагментов ДНК. Присоединенные фрагменты обработали рестриктазой Bgl II и подвергли гель-электрофорезу с агарозным гелем. Затем выделили только самый большой фрагмент ДНК.
PRI me R 22. Obtaining a pH vector GA410 (for use with animal cells, + any line)
The EcoRI fragment obtained in Example 9, which had the cDNA shown in FIG. 3-5 was treated with restriction enzyme Dra I at 37 ° C for 2 hours, then treated with the Klenow fragment of DNA polymerase I (Takara Shuzo Co. Ltd), to create blunt ends. One microgram of the linker (8 mer, Takara Shuzo Co. Ltd.) was phosphorylated with ATP and attached to a separately prepared mixture of DNA fragments. The attached fragments were digested with Bgl II restriction enzyme and subjected to agarose gel electrophoresis. Then only the largest DNA fragment was isolated.

Этот фрагмент ДНК был эквивалентен кодирующей части полипептида человеческого Г-КСФ, содержащей примерно 710 пар оснований (см.фиг.18) Вектор pdKCR [Fukunaga et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81,5086(1984)] обработали рестриктазой BamНI, а затем дефосфорилировали щелочной фосфатазой (Тakara Shuzo Co. Ltd. ). Полученный вектор ДНК присоединили к фрагменту КДНК длиной 710 пар оснований в присутствии Т4 ДНК-лигазы (Takara Shuzo Co. Ltd.) с тем, чтобы получить рНGА410 (фиг.28). Как показано на фиг.28, эта плазмида содержала ранний ген промотора SV40, начало репликации SV40, часть гена кроличьего β -глобина, участок инициации репликации pBR322 и pBR322-выведенного β-лактамазного гена Аmpr), причем ген человеческого Г-КСФ присоединен ниже по потоку от промотора раннего гена SV40.This DNA fragment was equivalent to the coding portion of the human G-CSF polypeptide containing approximately 710 base pairs (see FIG. 18) pdKCR vector [Fukunaga et al. Proc. Natl. Acad Sci. USA, 81.5086 (1984)] was treated with BamHI restrictase and then dephosphorylated with alkaline phosphatase (Takara Shuzo Co. Ltd.). The resulting DNA vector was attached to a 710 bp cDNA fragment in the presence of T 4 DNA ligase (Takara Shuzo Co. Ltd.) in order to obtain pHGA410 (FIG. 28). As shown in FIG. 28, this plasmid contained the early SV40 promoter gene, the start of SV40 replication, part of the rabbit β-globin gene, the replication initiation site of pBR322 and pBR322-derived β-lactamase gene Amp r ), the human G-CSF gene being attached below upstream of the promoter of the early gene SV40.

П р и м е р 23. Построение рекомбинантного вектора (+VSЕ), используемого для трансформации клеток С127
1) Построение рНGA410(Н)
Двадцать микрограммов плазмиды pHGA410 (фиг.28), полученной в примере 22, растворили в реакционном растворе, состоящем из 50 ммоль/л трис-НСl (pH 7,5), 7 ммоль/л MgCl2, 100 ммоль NaCl, 7 ммоль/л 2-меркаптоэтанола и 0,01% сыворотки бычьего альбумина (БСА). Добавили рестриктазу EcoRl (10-15 единиц; Takara Shuzo Co. Ltd.), и реакционный раствор выдерживали при 37оС в течение примерно 30 мин, чтобы вызвать частичное переваривание Есо RI. Затем фрагмент ДНК подвергали двум обработкам с помощью 1:1 cмеси фенола/хлороформа, затем обработали эфиром и провели осаждение этанолом.
PRI me R 23. The construction of the recombinant vector (+ VSE) used for the transformation of C127 cells
1) Construction of pHGA410 (N)
Twenty micrograms of the plasmid pHGA410 (FIG. 28) obtained in Example 22 was dissolved in a reaction solution consisting of 50 mmol / L Tris-HCl (pH 7.5), 7 mmol / L MgCl 2 , 100 mmol NaCl, 7 mmol / l of 2-mercaptoethanol and 0.01% bovine albumin serum (BSA). Was added the restriction enzyme EcoRl (10-15 units; Takara Shuzo Co. Ltd.), and the reaction solution was heated at 37 ° C for about 30 minutes to cause partial digestion with Eco RI. The DNA fragment was then subjected to two treatments with a 1: 1 phenol / chloroform mixture, then treated with ether and ethanol precipitated.

Полученный фрагмент ДНК растворили в 50 мкл раствора, состоящего из 50 ммоль/л трис-НСl, 5 ммоль/л MgCl2, 10 ммоль/л DТТ и по 1 ммоль/л каждого из dАТФ, dЦТФ, dГТФ и dТТФ. После добавления 5 мкл фрагмента Кленоу Е.сoli ДНК-полимеразы (Тakara Shuzo Co. Ltd.) раствор инкубировали при 14оС в течение 2 ч, чтобы создать тупые концы.The obtained DNA fragment was dissolved in 50 μl of a solution consisting of 50 mmol / L Tris-Hcl, 5 mmol / L MgCl 2 , 10 mmol / L DTT and 1 mmol / L each of dATP, d-PTF, d-HTP and dTTP. After addition of 5 .mu.l of Klenow fragment E.soli DNA polymerase (Takara Shuzo Co. Ltd.) solution was incubated at 14 ° C for 2 hours to create blunt ends.

Путем последующего гель-электрофореза 0,5% агарозного геля выделили 6 мкг фрагмента ДНК длиной примерно 5,8 тыс.пар оснований. Subsequent gel electrophoresis of 0.5% agarose gel yielded 6 μg of the DNA fragment with a length of approximately 5.8 thousand base pairs.

Пять микрограммов выделенного фрагмента ДНК повторно растворили в 50 мкг реакционного раствора, состоящего из 50 ммоль трис-НСl (рН 7,6), 10 ммоль/л MgCl2, 10 ммоль/л DТТ и 1 ммоль/л АТФ. После добавления 2 мкг линкера Hind III (Takara Shuzo Co. Ltd.) и 100 единиц Т4 ДНК-лигазы (Тakaro Shuzo Co. Ltd.) реакцию проводили в течение ночи при 4оС.Five micrograms of the isolated DNA fragment was redissolved in 50 μg of a reaction solution consisting of 50 mmol Tris-Hcl (pH 7.6), 10 mmol / L MgCl 2 , 10 mmol / L DTT and 1 mmol / L ATP. After addition of 2 ug linker Hind III (Takara Shuzo Co. Ltd.) and 100 units of T4 DNA ligase (Takaro Shuzo Co. Ltd.) reaction was performed overnight at 4 ° C.

Затем провели обработки фенолом и эфиром и осаждение этанолом. Осадок растворили в 30 мкл раствора, состоящего из 10 ммоль/л трис-НСl (рН 7,5), 7 ммоль/л MgCl2 и 60 ммоль/л NaCl и раствор инкубировали при 37оС в течение 3 ч в присутствии 10 единиц Hind III. После повторной обработки Т4 ДНК-лигазой, полученную ДНК использовали для трансформации штамма DHI Е.сoli посредством обработки с использованием хлорида рубидия (см.выше Molecular Cloning). Из устойчивых к ампициллину (Ampv) колоний трансформантов отобрали клетки, несущие плазмиду, которая была идентична рНGAA 410 за исключением того, что Hind III был вставлен в сайт ЕсoRI. Полученную таким образом плазмиду назвали pНGA410(Н) (фиг.29).Then, phenol and ether treatments and ethanol precipitation were carried out. The precipitate was dissolved in 30 l of a solution consisting of 10 mmol / l Tris-HCl (pH 7.5), 7 mmol / l MgCl 2 and 60 mmol / l NaCl and the solution was incubated at 37 ° C for 3 hours in the presence of 10 units Hind iii. After re-treatment of T 4 with DNA ligase, the obtained DNA was used to transform E. coli DHI strain by treatment using rubidium chloride (see Molecular Cloning above). Cells bearing a plasmid that was identical to pHGAA 410 were selected from ampicillin (Amp v ) resistant transformant colonies, except that Hind III was inserted into the EcoRI site. The plasmid thus obtained was called pHGA410 (H) (Fig. 29).

2) Построение рекомбинантного вектора экспрессии рТN-G4
Двадцать микрограммов полученной таким образом рН GA410 (Н) растворили в 50 мкл реакционного раствора, состоящего из 10 ммоль/л трис-НСl (рН 7,5), 7 ммоль/л MgCl2, 175 ммоль/л NaCl, 0,2 ммоль/л ЭДТА, 7 ммоль/л 2-меркаптоэтанола и 0,01% сыворотки бычьего альбумина. После добавления 20 единиц SalI (Тakara Shuzo Co. Ltd.), реакционный раствор инкубировали при 37оС в течение 5 ч. После обработки фенолом и осаждения этанолом проводили инкубирование, как в 1), в течение примерно 2 ч при 14оС в присутствии фрагмента Кленсу ДНК-полимеразы (Тakara Shuzo Co. Ltd.) с тем, чтобы создать тупые концы. Не проводя выделения ДНК с помощью гель-электрофореза агарозного геля, реакционный раствор сразу же подвергли осаждению этанолом. Полученный фрагмент ДНК обработали Hind III и выделили 5 г фрагмента Нind III Sal I (примерно 2,7 тыс. пар оснований) с помощью гель-электрофореза 1% агарозного геля. В отдельной стадии плазмиду pd BPV-I, имеющую вирус бычьев папилломы [эту плазмиду получили благодаря доктору Хоули, и она описана в Sarver, N, Sbyrne, J.С. Нowley, P.M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 79, 7147-7151 (1982)] обработали с помощью Hind III и Pvu II, как описано Нагата с сотр. [Nagata et al.) [Fukunaga, Sokawa and Nagata, Proc. Natl. Асаd. Sci. USA, 81, 5086-5090(1984)] чтобы получить фрагмент ДНК длиной 8,4 тыс. оснований. Этот фрагмент ДНК 8,4 тыс. оснований и отдельно полученный Hind III-Sal I фрагмент ДНК (примерно 2,7 тыс. оснований) связывали с помощью Т4 ДНК-лигазы. Продукт связывания использовали для трансформации штамма DHI Е.coli по способу с применением хлорида рубидия, описанному в Molecular Cloning, см.выше. Отобрали колонии Е.coli, несущие плазмиду, имеющую рНGA 410-выведенную КДНК Г-КСФ. Эту плазмиду назвали рТN-G4 (фиг.29).
2) Construction of a recombinant expression vector pTN-G4
Twenty micrograms of the thus obtained pH GA410 (H) was dissolved in 50 μl of a reaction solution consisting of 10 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.5), 7 mmol / L MgCl 2 , 175 mmol / L NaCl, 0.2 mmol / l EDTA, 7 mmol / l 2-mercaptoethanol and 0.01% bovine albumin serum. After adding 20 units of SalI (Takara Shuzo Co. Ltd.), the reaction solution was incubated at 37 ° C for 5 hours. After phenol treatment and ethanol precipitation were carried out incubating as in 1), for about 2 hours at about 14 C. the presence of a Klensu fragment of DNA polymerase (Takara Shuzo Co. Ltd.) in order to create blunt ends. Without DNA isolation by agarose gel electrophoresis, the reaction solution was immediately precipitated with ethanol. The resulting DNA fragment was treated with Hind III and 5 g of the Hind III Sal I fragment (approximately 2.7 thousand base pairs) was isolated by gel electrophoresis of 1% agarose gel. In a separate step, plasmid pd BPV-I having a bovine papilloma virus [this plasmid was obtained by Dr. Hawley and is described in Sarver, N, Sbyrne, J.C. Howley, PM Proc. Natl. Acad Sci. USA, 79, 7147-7151 (1982)] processed with Hind III and Pvu II as described by Nagata et al. [Nagata et al.) [Fukunaga, Sokawa and Nagata, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 5086-5090 (1984)] to obtain a DNA fragment with a length of 8.4 thousand bases. This DNA fragment of 8.4 thousand bases and the separately obtained Hind III-Sal I DNA fragment (approximately 2.7 thousand bases) were linked using T 4 DNA ligase. The binding product was used to transform E. coli DHI strain according to the method using rubidium chloride described in Molecular Cloning, see above. E. coli colonies carrying the plasmid having a pHGA 410-derived G-CSF cDNA were selected. This plasmid was named pTN-G4 (FIG. 29).

Аналогично обработали аденовирус типа II [Tanpakushitsu, Kakusan, Koso (протеины, нуклеотидные кислоты и ферменты), 27 декабря 1982, Kyoritsu Shuppan] чтобы получить плазмиду ΔpVA, которая содержала SalI-Hind III фрагмент длиной примерно 1700 пар оснований, несущий VAI и VAII и фрагмент, содержащий VAI и VAII, выделили из этой плазмиды. Этот фрагмент вставили в рТNGA в сайт Hind III с тем, чтобы получить рТNG4VAα и pTNG4VAβ (фиг.29). Из-за наличия VA гена аденовируса эти плазмиды были способны увеличивать экспрессию продукта транскрипции от раннего промотора SV40. Similarly, type II adenovirus was processed [Tanpakushitsu, Kakusan, Koso (proteins, nucleotide acids and enzymes), December 27, 1982, Kyoritsu Shuppan] to obtain the ΔpVA plasmid, which contained a SalI-Hind III fragment of approximately 1,700 base pairs carrying VAI and VAII and a fragment containing VAI and VAII was isolated from this plasmid. This fragment was inserted into pTNGA at the Hind III site in order to obtain pTNG4VAα and pTNG4VAβ (Fig. 29). Due to the presence of the adenovirus VA gene, these plasmids were able to increase the expression of the transcription product from the early SV40 promoter.

П р и м е р 24. Трансформация клеток С127 и экспрессия в них Г-КСФ (+VSЕ). PRI me R 24. Transformation of C127 cells and expression of G-CSF (+ VSE) in them.

Перед тем, как использовать для трансформации клеток мыши С127, рТN-G4, полученную в примере 23, обработали рестриктазой BamHI. Двадцать микрограммов плазмиды рТ N-G4 растворили в 100 мкл реакционного раствора [10 ммоль/л трис-НСl (рН 8,0), 7 ммоль/л MgCl2, 100 ммоль/л NaCl, 2 ммоль/л 2-меркаптоэтанола, 0,01% бычьего сывороточного альбумина] и обработали с помощью 20 единиц Bam HI (Тakara Shuzo Co. Ltd), после чего обработали смесь фенолом и эфиром и провели осаждение этанолом.Before using C127 for transformation of mouse cells, the pTN-G4 obtained in Example 23 was treated with BamHI restrictase. Twenty micrograms of plasmid pT N-G4 was dissolved in 100 μl of the reaction solution [10 mmol / L Tris-Hcl (pH 8.0), 7 mmol / L MgCl 2 , 100 mmol / L NaCl, 2 mmol / L 2-mercaptoethanol, 0 , 01% bovine serum albumin] and treated with 20 Bam HI units (Takara Shuzo Co. Ltd), after which the mixture was treated with phenol and ether and ethanol precipitated.

Клетки мышей С127 выращивали в минимальной существенной среде Дульбекко, содержащей 10% сыворотки бычьего эмбриона ("Джибко"). Клетки, растущие на чашках (диаметром 5 см), трансформировали отдельной полученной ДНК, в количестве 10 мкг, на чашку, по способу с использованием фосфата кальция/(cм. Haynes, J. Weissman, С. Nuclec Асids Res. II, 687-706 (1983)] После обработки глицерином клетки инкубировали при 37оС в течение 12 ч.C127 mouse cells were grown in Dulbecco's minimal essential medium containing 10% bovine embryo serum (Djibco). Cells growing on plates (5 cm in diameter) were transformed with the individual DNA obtained, in an amount of 10 μg, per plate, by the method using calcium phosphate / (see Haynes, J. Weissman, C. Nuclec Acids Res. II, 687- 706 (1983)] After treatment with glycerol, the cells were incubated at 37 about C for 12 hours

Инкубированные клетки перенесли на три новые чашки (диаметром 5 см), и среду меняли дважды в неделю. На 16-й день очаги перенесли в свежие чашки и подвергли последовательному культивированию на минимальной существенной среде Дульбекко, содержащей 10% сыворотку бычьего эмбриона ("Джибко") с тем, чтобы отобрать клоны, обладающие высокой скоростью продуцирования Г-КСФ. Эти клоны продуцировали Г-КСФ в концентрации примерно 1 мг/л. Последующее клонирование дало клоны, которые могли продуцировать Г-КСФ в концентрациях 10 мг/л или выше. Кроме клеток С1271, в качестве клеток хозяина можно также использовать клетки NIН3Т3. The incubated cells were transferred to three new plates (5 cm in diameter), and the medium was changed twice a week. On day 16, the foci were transferred to fresh plates and cultured sequentially on Dulbecco's minimal essential medium containing 10% bovine embryo serum (Djibco) in order to select clones with a high rate of G-CSF production. These clones produced G-CSF at a concentration of about 1 mg / L. Subsequent cloning yielded clones that could produce G-CSF at concentrations of 10 mg / L or higher. In addition to C1271 cells, NIH3T3 cells can also be used as host cells.

П р и м е р 25. Экспрессия Г-КСФ в клетках СНО (+VSЕ)
1) Построение рНGG4-dhfr.
PRI me R 25. Expression of G-CSF in CHO cells (+ VSE)
1) Construction of pHGG4-dhfr.

Двадцать микрограммов плазмиды рНGA410, полученной в примере 22, растворили в 100 мкл реакционного раствора, содержащего 10 ммоль/л трис-НСl (рН 7,5), 7 ммоль/л MgCl2, 175 ммоль/л NaCl, 0,2 ммоль/л и ЭДТА, 0,7 ммоль/л 2-меркаптоэтанола и 0,01% бычьего сывороточного альбумина. Реакцию проводили в течение ночи при 37оС в присутствии 20 единиц рестриктазы Sal I (Тakara Shuzo Co. Ltd.), после чего проводили обработку фенолом и эфиром и осаждали этанолом.Twenty micrograms of the plasmid pHGA410 obtained in Example 22 was dissolved in 100 μl of a reaction solution containing 10 mmol / L Tris-HCl (pH 7.5), 7 mmol / L MgCl 2 , 175 mmol / L NaCl, 0.2 mmol / l and EDTA, 0.7 mmol / l 2-mercaptoethanol and 0.01% bovine serum albumin. The reaction was conducted overnight at 37 ° C in the presence of 20 units of restriction enzyme Sal I (Takara Shuzo Co. Ltd.), which was followed by phenol and ether treatment and ethanol precipitated.

Осадок ДНК растворили в 100 мкл реакционного раствора, состоящего из 50 ммоль/л трис-НСl, 5 ммоль/л MgCl2, 10 ммоль/л DТТ и по 1 ммоль/л каждого из dАТФ, dЦТФ, dГТФ и dТТФ, и реакцию проводили при 14оС в течение 2 ч в присутствии фрагманта Кленоу Е. сoli ДНК-полимеразы (10 микролитров; Тakara Shuzo Co. Ltd.), после чего проводили обработки фенолом и эфиром и осаждали этанолом.The DNA pellet was dissolved in 100 μl of a reaction solution consisting of 50 mmol / L Tris-Hcl, 5 mmol / L MgCl 2 , 10 mmol / L DTT and 1 mmol / L each of dATP, d-PTF, d-HTP and dTTP, and the reaction was carried out at 14 ° C for 2 hours in the presence of Klenow fragmanta E. coli DNA polymerase (10 microliters; Takara Shuzo Co. Ltd.), which was followed by treatment with phenol and ether and precipitated with ethanol.

Есo RI-линкер прикрепили к ДНК в осадке с помощью следующих способов: ДНК растворили в 50 мкл реакционного раствора, состоящего из 50 ммоль/л трис-НСl (рН 7,4), 10 ммоль/л DТТ, 0,5 ммоль/л cпермидина, 2 ммоль/л АТФ, 2 ммоль/л гексамин-кобальтхлорида и 20 мкг/мл бычьего сывороточного альбумина. Реакцию проводили при 4оС в течение 12-16 ч в присутствии Есо RI-линкера (Тakara Shuzo Co. Ltd.) и 200 единиц Т4 ДНК-лигазы (Тakara Shuzo Co. Ltd.). После обработки фенолом, промывки эфиром и осаждения этанолом, которые проводили в соответствии с обычными способами, осадок ДНК частично переваривали с Есo RI и с помощью гель-электрофореза 1% агарозного геля получили 3 мкг фрагмента ДНК длиной примерно 2,7 тыс. пар оснований.The Eco RI linker was attached to the DNA in the precipitate using the following methods: DNA was dissolved in 50 μl of a reaction solution consisting of 50 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.4), 10 mmol / L DTT, 0.5 mmol / L spermidine, 2 mmol / L ATP, 2 mmol / L hexamine-cobalt chloride and 20 μg / ml bovine serum albumin. The reaction was performed at 4 ° C for 12-16 h in the presence of an Eco RI-linker (Takara Shuzo Co. Ltd.) and 200 units of T4 DNA ligase (Takara Shuzo Co. Ltd.). After phenol treatment, washing with ether, and ethanol precipitation, which were carried out in accordance with conventional methods, the DNA pellet was partially digested with Eco RI and 3 μg of DNA fragment with a length of approximately 2.7 thousand base pairs was obtained by gel electrophoresis of 1% agarose gel.

Плазмиду pAdD26SVpA [Kaufman, R. G. Sharp, Р.А. Mol. Сеll Biol. 2, 1304-1319 (1982)] обработали с ЕсoRI и дефосфорилировали путем обработки бактериальной щелочной фосфатазой. Более конкретно, 20 мкг рАdD26SVpА и 20 единиц ЕсoRI добавили к реакционному раствору [50 ммоль/л трис-НСl (pН 7,5), 7 ммоль/л MgCl2, 100 ммоль/л NaCl, 7 ммоль/л 2-меркаптоэтанола и 0,01% бычьего сывороточного альбумина и реакцию проводили при 37оС в течение 10 ч. Затем 5 единиц бактериальной щелочной фосфатазы добавили к реакционному раствору, реакцию проводили при 68оС в течение 30 мин. После обработки фенолом посредством электрофореза выделили ЕсoRI фрагмент pAdD26SVpA с выходом примерно 5 мкг. Ренатирировали фрагмент длиной примерно 2,7 тыс. пар оснований и pAdD26SVpA, которые весили по 0,5 мкг каждый. Полученную плазмиду использовали для трансформации штамма DHI Е.coli по методу с использованием хлорида рубидия, и отобрали колонии, несущие плазмиду pНGG4-dhfr. Полученную плазмиду назвали рНGG4-dhfr (фиг.30).Plasmid pAdD26SVpA [Kaufman, RG Sharp, R.A. Mol. Sell Biol. 2, 1304-1319 (1982)] was treated with EcoRI and dephosphorylated by treatment with bacterial alkaline phosphatase. More specifically, 20 μg pADd26SVpA and 20 EcoRI units were added to the reaction solution [50 mmol / L Tris-HCl (pH 7.5), 7 mmol / L MgCl 2 , 100 mmol / L NaCl, 7 mmol / L 2-mercaptoethanol and 0.01% bovine serum albumin and reacted at 37 ° C for 10 hours. Then, 5 units of bacterial alkaline phosphatase was added to the reaction solution, the reaction was conducted at 68 ° C for 30 min. After phenol treatment by electrophoresis, an EcoRI pAdD26SVpA fragment was isolated in approximately 5 μg yield. A fragment of approximately 2.7 thousand base pairs and pAdD26SVpA, which weighed 0.5 μg each, was renatured. The resulting plasmid was used to transform E. coli DHI strain according to the method using rubidium chloride, and colonies carrying the plasmid pHGG4-dhfr were selected. The resulting plasmid was called pHGG4-dhfr (FIG. 30).

Альтернативный способ заключался в следующем: плазмиду рН GA 410 обработали Sal I и частично переваривали с Есo RI без присоединения какого-либо ЕсoRI-линкера. Выделили фрагмент ДНК длиной примерно 2,7 тыс. пар оснований и обработали с фрагментом Кленоу Е.coli ДНК-полимеразы, чтобы создать тупые концы. Фрагмент ЕсoRI, имеющий тупые концы, получили из pАdD26SVpА, как описано выше. Этот ЕсoRI-фрагмент и отдельно полученный фрагмент (примерно 2,7 тыс. пар оснований) обработали Т4 ДНК-лигазой, чтобы получить pНGG4-dhfr. An alternative method was as follows: plasmid pH GA 410 was treated with Sal I and partially digested with Eco RI without the addition of any Eco-linker. A DNA fragment of approximately 2.7 thousand base pairs was isolated and processed with a Klenow fragment of E. coli DNA polymerase to create blunt ends. The EcoRI fragment having blunt ends was obtained from pADD26SVpA as described above. This EcoRI fragment and a separately obtained fragment (approximately 2.7 thousand base pairs) were treated with T4 DNA ligase to obtain pHGG4-dhfr.

Плазмиду рН GA 410(Н), полученную в примере 23, обработали рестриктазами Hind III и Sal I, как описано в 2) в примере 23, и фрагмент Hind III Sal I присоединили к тупоконечному Есо RI фрагменту pAdD26SVpА, описанному выше. Этот способ можно также использовать для получения рНGG 4-dhfr (фиг.31)
2) Построение pG4DRI и pG4DR2.
The plasmid pH GA 410 (H) obtained in Example 23 was digested with the restriction enzymes Hind III and Sal I as described in 2) in Example 23, and the Hind III Sal I fragment was attached to the blunt-ended Eco RI fragment pAdD26SVpA described above. This method can also be used to obtain pHGG 4-dhfr (Fig.31)
2) Construction of pG4DRI and pG4DR2.

Десять микрограммов плазмиды pAdD26SVpA, указанной в I), растворили в 50 мл реакционного раствора, содержащего 50 ммоль/л трис-НСl (рН 7,5), 7 ммоль/л MgCl2, 100 ммоль/л NaCl, 7 ммоль/л 2-меркаптоэтанола и 0,01% бычьего сывороточного альбумина. После добавления 10 единиц каждой из рестриктаз EcoRI и BamHI, реакцию проводили при 37оС в течение 10 ч, после чего смесь обработали фенолом и промыли эфиром. Фрагмент ДНК примерно 2 тыс. оснований выделили с помощью электрофореза через 1% агарозный гель с низкой точкой плавления. Выделенный фрагмент ДНК обработали фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы по обычной методике с тем, чтобы создать тупые концы. Тупоконечный фрагмент ДНК подвергали обработке с фенолом, промыли эфиром и провели осаждение этанолом. ли Sal I и частично переваривали с Есo RI без присоединения какого-либо ЕсoRI-линкера. Выделили фрагмент ДНК длиной примерно 2,7 тыс. пар оснований и обработали с фрагментом Кленоу Е.coli ДНК-полимеразы, чтобы создать тупые концы. Фрагмент ЕсoRI, имеющий тупые концы, получили из pАdD26SVpА, как описано выше. Этот ЕсoRI-фрагмент и отдельно полученный фрагмент (примерно 2,7 тыс. пар оснований) обработали Т4 ДНК-лигазой, чтобы получить pНGG4-dhfr.Ten micrograms of the plasmid pAdD26SVpA indicated in I) was dissolved in 50 ml of a reaction solution containing 50 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.5), 7 mmol / L MgCl2, 100 mmol / L NaCl, 7 mmol / L 2- mercaptoethanol and 0.01% bovine serum albumin. After adding 10 units of each of the restriction enzymes EcoRI and BamHI, the reaction was carried out at 37 ° C for 10 hours, after which the mixture was treated with phenol and washed with ether. A DNA fragment of approximately 2 thousand bases was isolated by electrophoresis through 1% low melting point agarose gel. The isolated DNA fragment was treated with a Klenow fragment of DNA polymerase according to the usual procedure in order to create blunt ends. The blunt DNA fragment was treated with phenol, washed with ether and ethanol precipitated. whether Sal I was partially digested with Eco RI without the addition of any Ecoo linker. A DNA fragment of approximately 2.7 thousand base pairs was isolated and processed with a Klenow fragment of E. coli DNA polymerase to create blunt ends. The EcoRI fragment having blunt ends was obtained from pADD26SVpA as described above. This EcoRI fragment and a separately obtained fragment (approximately 2.7 thousand base pairs) were treated with T 4 DNA ligase to obtain pHGG4-dhfr.

Плазмиду рН GA 410(Н), полученную в примере 23, обработали рестриктазами Hind III и Sal I, как описано в 2) в примере 23, и фрагмент Hind III Sal I присоединили к тупоконечному Есо RI фрагменту pAdD26SVpА, описанному выше. Этот способ можно также использовать для получения рНGG 4-dhfr (фиг.31)
2) Построение pG4DRI и pG4DR2.
The plasmid pH GA 410 (H) obtained in Example 23 was digested with the restriction enzymes Hind III and Sal I as described in 2) in Example 23, and the Hind III Sal I fragment was attached to the blunt-ended Eco RI fragment pAdD26SVpA described above. This method can also be used to obtain pHGG 4-dhfr (Fig.31)
2) Construction of pG4DRI and pG4DR2.

Десять микрограммов плазмиды pAdD26SVpA, указанной в I), растворили в 50 мл реакционного раствора, содержащего 50 ммоль/л трис-НСl (рН 7,5), 7 ммоль/л MgCl2, 100 ммоль/л NaCl, 7 ммоль/л 2-меркаптоэтанола и 0,01% бычьего сывороточного альбумина. После добавления 10 единиц каждой из рестриктаз EcoRI и BamHI, реакцию проводили при 37оС в течение 10 ч, после чего смесь обработали фенолом и промыли эфиром. Фрагмент ДНК примерно 2 тыс. оснований выделили с помощью электрофореза через 1% агарозный гель с низкой точкой плавления. Выделенный фрагмент ДНК обработали фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы по обычной методике с тем, чтобы создать тупые концы. Тупоконечный фрагмент ДНК подвергали обработке с фенолом, промыли эфиром и провели осаждение этанолом.Ten micrograms of the plasmid pAdD26SVpA indicated in I) was dissolved in 50 ml of a reaction solution containing 50 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.5), 7 mmol / L MgCl 2 , 100 mmol / L NaCl, 7 mmol / L 2 -mercaptoethanol and 0.01% bovine serum albumin. After addition of 10 units each of the restriction enzymes EcoRI and BamHI, the reaction was conducted at 37 ° C for 10 h, whereupon the mixture was treated with phenol and washed with ether. A DNA fragment of approximately 2 thousand bases was isolated by electrophoresis through 1% low melting point agarose gel. The isolated DNA fragment was treated with a Klenow fragment of DNA polymerase according to the usual procedure in order to create blunt ends. The blunt DNA fragment was treated with phenol, washed with ether and ethanol precipitated.

Десять микрограммов плазмиды рНРА 410(Н), полученной в 1) примера 23, растворили в 50 мкл реакционного раствора, содержащего 10 ммоль/л трис-НСl (рН 7,5), 7 ммоль/л MgCl2 и 60 ммоль/л NaCl. Реакцию проводили при 37оС в течение 6 ч в присутствии 10 единиц Hind III. Фрагмент ДНК выделили посредством электрофореза через 1% агарозный гель с низкой точкой плавления, который проводили по обычной методике. Выделенный фрагмент ДНК затем обработали бактериальной щелочной фосфатазой, и тупые концы получили путем обработки фрагментом Кленоу. После обработки фенолом и промывки эфиром фрагмент ДНК присоединили тупыми концами к ранее полученному фрагменту ДНК примерно 2 тыс. оснований с помощью Т4 ДНК-лигазы по следующей методике: по 1 мкг каждого фермента ДНК растворили в 30 мкл реакционного раствора, содержащего 66 ммоль/л трис-HCl, (рН 7,5), 6,6 ммоль/л MgCl2, 5 ммоль/л DТТ и 1 ммоль/л AТФ, и реакцию проводили при 6оС в течение 12 ч в присутствии 50 единиц Т4 ДНК-лигазы. Продукт связывания использовали для трансформации штамма DHI Е. сoli. В результате получили рG4DR1 и pG4DR2, показанные на фиг.32.Ten micrograms of the plasmid pHRA 410 (H) obtained in 1) of Example 23 was dissolved in 50 μl of a reaction solution containing 10 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.5), 7 mmol / L MgCl 2 and 60 mmol / L NaCl . The reaction was conducted at 37 ° C for 6 hours in the presence of 10 units of Hind III. A DNA fragment was isolated by electrophoresis through 1% low melting point agarose gel, which was carried out according to the usual method. The isolated DNA fragment was then treated with bacterial alkaline phosphatase, and the blunt ends were obtained by treatment with the Klenow fragment. After phenol treatment and washing with ether, the DNA fragment was attached with blunt ends to a previously obtained DNA fragment of approximately 2 thousand bases using T 4 DNA ligase according to the following procedure: 1 μg of each DNA enzyme was dissolved in 30 μl of a reaction solution containing 66 mmol / L tris-HCl, (pH 7.5), 6.6 mmol / l MgCl 2, 5 mmol / l DTT, 1 mmol / l of ATF, and the reaction was carried out at 6 ° C for 12 hours in the presence of 50 units T 4 DNA ligases. The binding product was used to transform E. coli DHI strain. As a result, pG4DR1 and pG4DR2 shown in FIG. 32 were obtained.

3) Трансформация и экспрессия. 3) Transformation and expression.

Клетки СНО (штамм dhfr-любезно предоставленный доктором L. Сhasin из Колумбийского университета) культивирования для роста в альфа-минимальной существенной среде, содержащей 10% сыворотки теленка (α -МЕН с добавкой аденозина, дезоксиденозина и тимидина) в чашках (диаметром 9 см, Nunc). Культивированные клетки трансформировали по методике с использованием фосфата кальция [Wigler et al. Сеll, 14,725,(1978)] следующим образом. CHO cells (dhfr strain, kindly provided by Dr. L. Chasin from Columbia University) cultivation for growth in alpha-minimal essential medium containing 10% calf serum (α-MEN with the addition of adenosine, deoxenosine and thymidine) in cups (9 cm in diameter, Nunc). Cultured cells were transformed according to the method using calcium phosphate [Wigler et al. Sell, 14,725, (1978)] as follows.

Носитель ДНК (ДНК тимуса теленка) добавили в подходящем количестве к 1 мкг плазмиды рНGG4-dhfr, полученной в 1), и смесь растворили в 375 мкг ТЕ раствора, после чего добавили 125 мкл 1 моль/л CaCl2. После охлаждения раствора на льду в течение 3-5 мин, к раствору добавили 500 мкл 2x xНBS (50 ммоль/л Hepes, 280 ммоль NaCl, 1,5 ммоль/л фосфатного буфера). После повторного охлаждения на льду раствор смешали с 1 мл культуры СНО клеток, перенесли в чашки и инкубировали в течение 9 ч в инкубаторе с СО2. Среду удалили из чашки после промывки трис-буферным солевым раствором и добавления 20% глицерин-содержащего трис-буферного солевого раствора и повторной промывки добавили неселективную среду (описанная выше α -МЕ N среда за исключением того, что в нее добавили нуклеотиды). После инкубирования в течение 2 дней, культуру, разбавленную в 10 раз, перенесли на селективную среду (без добавок нуклеотидов). Продолжали культивирование, причем среду заменяли на свежую селективную среду через каждые 2 дня, и полученные колонии отобрали и перенесли на свежие чашки, где клетки выращивали в присутствии 0,02 мкмоль/л метотрексата, после чего производили клонирование путем выращивания в присутствии 0,05 мкмоль/л метотрексата, содержание которого потом увеличили до 0,01 мкмоль/л.The DNA carrier (calf thymus DNA) was added in an appropriate amount to 1 μg of the plasmid pHGG4-dhfr obtained in 1), and the mixture was dissolved in 375 μg of TE solution, after which 125 μl of 1 mol / L CaCl 2 was added. After cooling the solution on ice for 3-5 minutes, 500 μl of 2x xHBS (50 mmol / L Hepes, 280 mmol NaCl, 1.5 mmol / L phosphate buffer) was added to the solution. After repeated cooling on ice, the solution was mixed with 1 ml of CHO cell culture, transferred to plates and incubated for 9 hours in a CO 2 incubator. The medium was removed from the dish after washing with Tris-buffered saline and adding 20% glycerol-containing Tris-buffered saline and re-washing added a non-selective medium (the α-ME N medium described above except that nucleotides were added). After incubation for 2 days, the culture, diluted 10 times, was transferred to a selective medium (without the addition of nucleotides). Cultivation was continued, the medium being replaced with fresh selective medium every 2 days, and the obtained colonies were selected and transferred to fresh plates where cells were grown in the presence of 0.02 μmol / L methotrexate, after which cloning was performed by growing in the presence of 0.05 μmol / l methotrexate, the content of which was then increased to 0.01 μmol / l.

Трансформацию СНО клеток можно также осуществить путем совместной трансформации с РНGG4 и PAdD26SVpA [cм. Scahill et al. Proc. Natl. Асаd. Sci. USA, 80, 4654-4658 (1983)]
Клетки СНО трансформировали также следующими способами: pG4DRI или pG4DR2, полученные в (2), предварительно обрабатывали, соответственно, с помощью SalI и KpnI, чтобы получить фрагменты ДНК, и 10 мкг этих фрагментов использовали для трансформации клеток СНО, как указано выше, трансформированные клетки подвергали продолжительному культивированию в ряде селективных сред по описанному выше способу, примерно через 7 дней появилось не менее 100 отдельных колоний на чашку, эти колонии перенесли целиком на свежую чашку и подвергали продолжительному культивированию в ряде селективных сред в присутствии 0,01 мкмоль/л метатрексата, после чего появилось десять с лишним колоний, те же процедуры повторяли при последовательном увеличении концентрации метотрексата до 0,02 мкмоль/л 0,05 мкмоль/л и 0,1 мкмоль/л, и отобрали колонии, которые выживали, отбор колоний можно осуществить аналогичным способом, даже если по отдельности собрать полученные 10 с лишним колоний и подвернуть их культивированию при возрастающих концентрациях метотрексата.
The transformation of CHO cells can also be accomplished by co-transformation with PHGG4 and PAdD26SVpA [see Scahill et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 80, 4654-4658 (1983)]
CHO cells were also transformed in the following ways: pG4DRI or pG4DR2 obtained in (2) were pretreated with SalI and KpnI, respectively, to obtain DNA fragments, and 10 μg of these fragments were used to transform CHO cells, as described above, transformed cells subjected to continuous cultivation in a number of selective media according to the method described above, after about 7 days at least 100 separate colonies per dish appeared, these colonies were transferred whole to a fresh cup and subjected to continuous cultivation in a number of selective media in the presence of 0.01 μmol / L metatrexate, after which ten or more colonies appeared, the same procedures were repeated with a successive increase in the concentration of methotrexate to 0.02 μmol / L 0.05 μmol / L and 0.1 μmol / l, and the colonies that survived were selected, the selection of colonies can be carried out in a similar way, even if individually collect the obtained 10-odd colonies and tuck them into cultivation with increasing concentrations of methotrexate.

Рекомбинантный вектор, несущий "полицистронный ген", также можно использовать для трансформации СНО клеток. Пример этого альтернативного способа заключается в следующем: pAdD26SVpA обработали Pst I и выделенные два фрагмента присоединили к рBRG4-выведенному фрагменту КДНК КСФ c тем, чтобы построить рекомбинантный вектор, в котором адaновирусный промотор, КДНК КСФ, DHFR и поли(А) cайт SV40 были вставлены в написанном порядке. Этот рекомбинантный вектор использовали для трансформации клеток СНО. A recombinant vector carrying the "polycistronic gene" can also be used to transform CHO cells. An example of this alternative method is as follows: pAdD26SVpA was treated with Pst I and the selected two fragments were coupled to a pBRG4-derived CSF cDNA fragment to construct a recombinant vector in which the ananovirus promoter, CSF cDNA, DHFR and poly (A) SV40 site were inserted in written order. This recombinant vector was used to transform CHO cells.

П р и м е р 26. Анализ активности Г-КСФ (+VSЕ). PRI me R 26. Analysis of the activity of G-CSF (+ VSE).

Надосадочные жидкости культур клеток С127 и СНО, полученных, соответственно, в примерах 24 и 25, довели до рН 4 с помощью уксусной кислоты. После добавления равного объема н-пропанола, полученный осадок удалили центрифугированием. Надосадочную жидкость пропускали через открытую колонку (диаметром 1 см и длиной 2 см), заполненную С8 обращенно-фазным носителем (Yamamura Kagaku K. K. ) и элюрование осуществляли с помощью 50% н-пропанола. Элюент разбавили вдвое водой и подвергали его обращенно-фазной жидкостной хроматографии высокого давления на колонке YMC-C8 (Yamamura Kaguka K.K.), после чего элюировали н-пропанолом (30-60% линейный градиент плотности), содержащим 0,1% трифторуксусную кислоту. Фракции, которые элюировали при концентрациях н-пропанола около 40% выделили, высушили вымораживанием и растворили в 0,1 моль/л глицинолом буфера (рН 9). В результате этих процедур человеческий Г-КСФ в клетках С127 и СНО cконцентрировали примерно в 20 раз. The supernatants of the C127 and CHO cell cultures obtained in Examples 24 and 25, respectively, were adjusted to pH 4 with acetic acid. After adding an equal volume of n-propanol, the resulting precipitate was removed by centrifugation. The supernatant was passed through an open column (1 cm in diameter and 2 cm long) filled with C8 reverse phase support (Yamamura Kagaku K. K.) and elution was performed using 50% n-propanol. The eluent was diluted twice with water and subjected to high pressure reverse phase liquid chromatography on a YMC-C8 column (Yamamura Kaguka K.K.), followed by elution with n-propanol (30-60% linear density gradient) containing 0.1% trifluoroacetic acid. Fractions that were suirable at n-propanol concentrations of about 40% were isolated, freeze dried, and dissolved in 0.1 mol / L glycine buffer (pH 9). As a result of these procedures, human G-CSF in C127 and CHO cells was concentrated approximately 20 times.

В качестве контроля клетки трансформировали плазмидами, не содержащими КДНК человеческого Г-КСФ, и надосадочные жидкости этих культур были сконцентрированы в соответствии с описанными выше методами. Активности человеческого Г-КСФ образцов анализировали с помощью способов анализа активности человеческого Г-КСФ (а), описанного ранее в этом описании. Если эффективность экспрессии является достаточно высокой, то надосадочные жидкости культур можно анализировать непосредственно без предварительного концентрирования. Результаты сведены в табл.5, где данные основаны на концентрированных образцах. As a control, cells were transformed with plasmids not containing human G-CSF cDNA, and the supernatants of these cultures were concentrated in accordance with the methods described above. The activity of human G-CSF samples was analyzed using methods for analyzing the activity of human G-CSF (a) described earlier in this description. If the expression efficiency is sufficiently high, then the supernatant of the cultures can be analyzed directly without prior concentration. The results are summarized in table 5, where the data are based on concentrated samples.

П р и м е р 27. Аминокислотный анализ и анализ сахара (+VSЕ)
1) Анализ аминокислотного состава
Неочищенный образец КСФ, полученный в примере 26, очищали способами, описанными в примере 2(III). Очищенный образец КСФ гидролизовали обычными способами и протеиновую часть гидролизата проанализировали для определения его аминокислотного состава с помощью специального способа аминокислотного анализа с использованием автоматического аминокислотного анализатора "Хитачи 835" (фирмы "Хитачи"). Результаты приведены в табл.6. Гидролиз проводили при следующих условиях: (I) 6 н. раствор НСl 110оС, 24 часа, в вакууме (II) 4 н. раствор метансульфокислоты + 0,2% 3-(2-aмино-этил), индола, 110оС, 24 ч, 48 ч, 72 ч, в вакууме.
PRI me R 27. Amino acid analysis and analysis of sugar (+ VSE)
1) Analysis of amino acid composition
The crude CSF sample obtained in Example 26 was purified by the methods described in Example 2 (III). The purified CSF sample was hydrolyzed by conventional methods and the protein part of the hydrolyzate was analyzed to determine its amino acid composition using a special amino acid analysis method using a Hitachi 835 automatic amino acid analyzer (Hitachi company). The results are shown in table.6. Hydrolysis was carried out under the following conditions: (I) 6 N. a solution of Hcl 110 about C, 24 hours, in vacuum (II) 4 N. solution of methanesulfonic acid + 0.2% 3- (2-amino-ethyl) indole, 110 ° C, 24 hours, 48 hours, 72 hours, in vacuo.

Образец растворили в растворе (1,5 мл), содержащем 40% н-пропанол и 0,1% трифторуксусную кислоту. Аликвоты по 0,1 мл каждая сушили с помощью сухого газообразного азота, и после добавления реагентов, перечисленных в (I) или в (II), емкости герметически закрыли в вакууме, после чего проводили гидролиз содержимого. The sample was dissolved in a solution (1.5 ml) containing 40% n-propanol and 0.1% trifluoroacetic acid. Aliquots of 0.1 ml each were dried with dry gaseous nitrogen, and after adding the reagents listed in (I) or (II), the containers were sealed in vacuum, after which the contents were hydrolyzed.

Каждая из величин, приведенная в табл.6, представляла собой среднее значение из четырех измерений, величины для 24 ч для (l) и величины для 24 ч для (I) и величины для 24,48 и 72 ч для (II), за исключением того, что содержания Тре, Сер, 1/2 Цис, Мет, Вал, Иле и Трп были рассчитаны следующими методами (см. "Таmpaku Kagaku (Protein Chemistry) II", А Соurse in Biochemical Ехperiments, Тokyo Kagaku Dohjin):
-Для Тре, Сер, 1/2 Цис и Мет зависимость от времени величин для 24,48 и 72 часов для (II) экстраполировали к нулю часов.
Each of the values given in Table 6 was an average of four measurements, values for 24 hours for (l) and values for 24 hours for (I) and values for 24.48 and 72 hours for (II), for except that the contents of Tre, Ser, 1/2 Cis, Met, Val, Ile and Trp were calculated by the following methods (see "Tampaku Kagaku (Protein Chemistry) II", And Course in Biochemical Expert, Tokyo Kagaku Dohjin):
- For Tre, Ser, 1/2 Cis and Met, the time dependence of the values for 24.48 and 72 hours for (II) was extrapolated to zero hours.

-Для Вал и Иле использовали величину для 72 ч Для (II). - For Val and Ile, a value of 72 h was used For (II).

-Для Трп использовали средние величины для 24,48 и 72 ч (II). - For Trp, average values were used for 24.48 and 72 hours (II).

2) Анализ сахарного состава. 2) Analysis of sugar composition.

Внутренний стандарт (25 нмоль инозитола) добавили к 200 нг очищенного образца КСФ, использованного в анализе аминокислотного состава 1). После добавления метанольного раствора (500 мкл), содержащего 1,5 и раствор НСl проводили реакцию при 90оС в течение 4 ч в продуваемой азотом закрытой пробирке. После этого, как пробирку открыли, добавили карбонат серебра (Ag2CO3), чтобы нейтрализовать содержимое. После этого добавили 50 мкл уксусного ангидрида, и пробирку встряхивали в течение достаточного периода времени. Затем пробирку оставили в течение ночи в темноте при комнатной температуре. Верхний слой поместили в образцовую пробирку и сушили с помощью газообразного азота. К осадку добавили метанол, и смесь промыли и слегка отцентрифугировали. Верхний слой поместили в ту же самую пробирку и высушили. После добавления 50 мкл реагента ТMS (смесь 5:1:1 пиридина, гексаметилдисилазана и триметилхлоросилана) проводили реакцию при 40оС в течение 20 мин, и реакционный продукт хранили в низкотемпературном морозильнике. Стандартный образец приготовили путем смешивания 25 нмоль инозитола с 50 нмоль каждого из реагентов, галактозы (Гал), N-ацетилгалактозамина (Gal Nac), сиаловой кислоты и любых других подходящих реагентов.An internal standard (25 nmol of inositol) was added to 200 ng of the purified CSF sample used in the analysis of amino acid composition 1). After adding a methanol solution (500 .mu.l) containing 1.5 N HCl and the solution was reacted at 90 ° C for 4 hours in a nitrogen purged sealed tube. After that, as the tube was opened, silver carbonate (Ag 2 CO 3 ) was added to neutralize the contents. After that, 50 μl of acetic anhydride was added and the tube was shaken for a sufficient period of time. The tube was then left overnight in the dark at room temperature. The top layer was placed in a sample tube and dried with nitrogen gas. Methanol was added to the precipitate, and the mixture was washed and slightly centrifuged. The top layer was placed in the same tube and dried. After addition of 50 .mu.l TMS reagent (a mixture of 5: 1: 1 pyridine, hexamethyldisilazane and trimetilhlorosilana) were reacted at 40 ° C for 20 min, and the reaction product was stored in a deep freezer. A standard sample was prepared by mixing 25 nmol of inositol with 50 nmol of each of the reagents, galactose (Gal), N-acetylgalactosamine (Gal Nac), sialic acid and any other suitable reagents.

Полученные таким образом образцы подвергали газохроматографическому анализу при следующих условиях:
Условия анализа Колонка: 2% OV HP, 60-80
17 VIN port меш, 3М,
стекло
Температура: повышающаяся от
110 до 250оС со скоростью
4оС/мин.
The samples thus obtained were subjected to gas chromatographic analysis under the following conditions:
Analysis conditions Column: 2% OV HP, 60-80
17 VIN port mesh, 3M,
glass
Temperature: rising from
110 to 250 about With a speed
4 about C / min.

Давление газа-носителя (N2):
начальное 1,2-1,6 кг/см2
конечное 2-2,5 кг/см2
Чувствительность: диапазон
103 М Ω range, 0,1-0,4 В
Давление: H2 0,8 кг/см2
воздух 0,8 кг/см2
Подача образца: 2,5-3,0 мкл.
Carrier gas pressure (N 2 ):
initial 1.2-1.6 kg / cm 2
final 2-2.5 kg / cm 2
Sensitivity: Range
10 3 M Ω range, 0.1-0.4 V
Pressure: H 2 0.8 kg / cm 2
air 0.8 kg / cm 2
Sample flow: 2.5-3.0 μl.

В результате анализа, в образце КСФ по настоящему изобретению были идентифицированы галактоза, N-ацетилгалактозамин и сиаловая кислота. As a result of the analysis, galactose, N-acetylgalactosamine and sialic acid were identified in the CSF sample of the present invention.

П р и м е р 28. Получение вектора рН GV2 (для использования с клетками животных, линия -VSE). PRI me R 28. Obtaining a pH vector GV2 (for use with animal cells, line -VSE).

ЕсoRI фрагмент, полученный в примере 10, который имел КДНК, показанную на фиг. 8-10, обработали рестриктазой Dra I при 37оС в течение 2 ч, после чего обработали фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы I (Тakava Shuzo Co. Ltd.), чтобы создать тупые концы. Один микрограмм линкера Bgl II (8 mer, Тakara Shuzo Co. Ltd.) фосфорилировали с помощью АТФ и присоединили к примерно 1 мкг отдельной полученной смеси фрагментов. Соединенные фрагменты обработали рестриктазой Bgl II и подвергали агарозному гель-электрофорезу. Затем выделили только самый большой фрагмент ДНК.The EcoRI fragment obtained in Example 10, which had the cDNA shown in FIG. 8-10 was treated with restriction enzyme Dra I at 37 ° C for 2 hours, then treated with Klenow fragment of DNA polymerase I (Takava Shuzo Co. Ltd.), to create blunt ends. One microgram of the Bgl II linker (8 mer, Takara Shuzo Co. Ltd.) was phosphorylated with ATP and attached to approximately 1 μg of the individual fragment mixture obtained. The combined fragments were digested with Bgl II restriction enzyme and subjected to agarose gel electrophoresis. Then only the largest DNA fragment was isolated.

Этот фрагмент ДНК был эквивалентен примерно 700 парам оснований, содержащим участок, кодирующий полипептид человеческого Г-КСФ (см.фиг.18). Вектор pdKCR[Fukunagа et al. Proc. Natl. Асаd. Sci. USA, 81, 5086 (1984)] обработали рестриктазой BamHI, а затем дефосфорилировали щелочной фосфатазой (Тakara Shuzo Co. Ltd.). Полученный вектор ДНК присоединили к фрагменту КДНК длиной примерно 700 пар оснований в присутствии Т4 ДНК-лигазы (Тakara Shuzo Co. Ltd. ) с тем, чтобы получить рН GV2 (фиг.33). Как показано на фиг.33, эта плазмида содержала промотор раннего гена SV 40, участок инициации репликации SV 40, часть гена кроличьего β -глобина, участок инициации репликации рНR322 и pBR 322 выведенный β -лактамазный ген (Ampr), причем ген человеческого Г-КСФ присоединен ниже потоку от промотора раннего гена SV 40.This DNA fragment was equivalent to approximately 700 base pairs containing a region encoding a human G-CSF polypeptide (see FIG. 18). The pdKCR vector [Fukunaga et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 5086 (1984)] was treated with BamHI restrictase and then dephosphorylated with alkaline phosphatase (Takara Shuzo Co. Ltd.). The resulting DNA vector was attached to a cDNA fragment of approximately 700 base pairs in the presence of T4 DNA ligase (Takara Shuzo Co. Ltd.) in order to obtain a pH of GV2 (FIG. 33). As shown in FIG. 33, this plasmid contained the SV 40 early gene promoter, the SV 40 replication initiation site, part of the rabbit β-globin gene, the pHR322 and pBR 322 replication initiation site deduced β-lactamase gene (Amp r ), the human G gene Α-CSF is attached downstream of the promoter of the early gene SV 40.

П р и м е р 29: Построение рекомбинантного вектора (-VSЕ) для использования при трансформации клеток С127. PRI me R 29: Construction of a recombinant vector (-VSE) for use in the transformation of C127 cells.

1) Построение рН GV 2(Н). 1) Construction of pH GV 2 (N).

Двадцать микрограммов плазмиды рН GV2 (рис.17)), полученной в примере 28, обрабатывали способами, описанными в 1) в примере 23, с тем, чтобы получить плазмиду, названную рН GV2 (Н) (фиг.34). Twenty micrograms of the plasmid pH GV2 (Fig. 17)) obtained in Example 28 was processed by the methods described in 1) in Example 23 so as to obtain a plasmid called pH GV2 (H) (Fig. 34).

2) Построение рекомбинантных векторов экспркессии рТNV2, рТNVAα и рТNVА β. 2) Construction of recombinant expression vectors pTNV2, pTNVAα and pTNVA β.

Используя 20 микрограммов рН GV2(Н), повторяли способы, описанные в 2) в примере 23, чтобы отобрать Е.coli, несущую плазмиду, имеющую рН GV2 выведенную КДНК Г-КСФ. Эту плазмиду назвали рТ N-V2 (фиг.34). Using 20 micrograms of pH GV2 (H), the methods described in 2) were repeated in Example 23 to select E. coli carrying a plasmid having pH GV2 derived G-CSF cDNA. This plasmid was named pT N-V2 (FIG. 34).

Аналогично обработали аденовирус типа II [Тampakushitsu, Kakusan, Koso (Протеины, нуклеиновые кислоты и ферменты), 27 декабря 1982, Kyoritsu Shuppan] чтобы получить плазмиду ΔpVA, которая содержала SalI-Hind III, фрагмент примерно 1700 пар оснований, несущий VAI и VAII и фрагмент, содержащий VAI и VAII, выделили из этой плазмиды. Этот фрагмент вставили в pТN-V2 в сайт Hind III с тем, чтобы получить рТNVAα и рТNVA β (рис.18). Из-за наличия VA гена аденовируса эти плазмиды могли усиливать экспрессию продукта транскрипции от раннего промотора SV40. Similarly, type II adenovirus was treated [Tampakushitsu, Kakusan, Koso (Proteins, Nucleic Acids and Enzymes), December 27, 1982, Kyoritsu Shuppan] to obtain the ΔpVA plasmid, which contained SalI-Hind III, a fragment of approximately 1700 base pairs, carrying VAI and VAII and a fragment containing VAI and VAII was isolated from this plasmid. This fragment was inserted into pTN-V2 at the Hind III site in order to obtain pTNVAα and pTNVA β (Fig. 18). Due to the presence of the adenovirus VA gene, these plasmids could enhance expression of the transcription product from the early SV40 promoter.

П р и м е рно 30. Трансформация клеток С127 и экспрессия в них Г-КСФ (-VSЕ) рТN-V2, полученную в примере 29, обработали рестриктазой BamHI перед тем, как ее использовали для трансформации клеток мышей С127. Example 30. Transformation of C127 cells and expression of G-CSF (-VSE) pTN-V2 obtained in Example 29 was treated with BamHI restrictase enzyme before it was used to transform C127 mouse cells.

Клетки мыши С1271 трансформировали с помощью полученной таким образом ДНК, чтобы экспрессовать Г-КСФ (см. пример 24), и отобрали клоны, имеющие высокую скорость продуцирования Г-КСФ. Эти клоны продуцировали Г-КСФ в концентрации примерно 1 мг/л. C1271 mouse cells were transformed with the DNA thus obtained to express G-CSF (see Example 24), and clones having a high G-CSF production rate were selected. These clones produced G-CSF at a concentration of about 1 mg / L.

Путем последующего клонирования можно отобрать клоны, которые могут продуцировать Г-КСФ в концентрации 10 мг/л. Аналогичным образом клетки С127 трансформировали с рТNVАα и рТNVAβ полученными в примере 29, и трансформанты отобрали для клонов, обладающих высокой способностью продуцировать Г-КСФ, что касается рТNVAα можно получить клоны способные продуцировать Г-КСФ с выходами 20 мг/л или более, в то время как посредством трансформации с рТNVA β получали клоны, имеющие более низкую продуктивность (несколько мг/л). By subsequent cloning, clones that can produce G-CSF at a concentration of 10 mg / L can be selected. Similarly, C127 cells were transformed with pTNVAα and pTNVAβ obtained in Example 29, and transformants were selected for clones with high ability to produce G-CSF, as for pTNVAα, clones capable of producing G-CSF with yields of 20 mg / L or more, while while, by transformation with pTNVA β, clones having lower productivity (several mg / L) were obtained.

Кроме клеток С1271, в качестве клеток хозяина можно также использовать клетки N1H3Т3. In addition to C1271 cells, N1H3T3 cells can also be used as host cells.

П р и м е р 31. Экспрессия Г-КСФ в клетках СНО (-VSЕ). PRI me R 31. Expression of G-CSF in CHO cells (-VSE).

1) Построение рНGV-2dhfr. 1) Construction of pHGV-2dhfr.

Фрагмент ДНК длиной примерно 2,7 тыс. пар оснований приготовили из 20 микрограммов плазмиды рНGV2 (пример 28) с помощью способов, описанных в 1) в примере 25. Этот фрагмент (0,5 мкг) и ЕсоRI-фрагмент pAdD26SVpА (0,5 мкг) подвергали ренатурации. Полученную плазмиду использовали для трансформации штамма DHI Е. cоli по способу с использованием хлорида рубидия, и отобрали колонии, несущие плазмиду pНGV2-dhfr. Полученную плазмиду назвали рНGV2-dhfr (фиг.35). A DNA fragment of approximately 2.7 thousand base pairs in length was prepared from 20 micrograms of the plasmid pHGV2 (Example 28) using the methods described in 1) in Example 25. This fragment (0.5 μg) and the EcoRI fragment pAdD26SVpA (0.5 mcg) subjected to renaturation. The obtained plasmid was used to transform E. coli DHI strain by the method using rubidium chloride, and colonies carrying the plasmid pHGV2-dhfr were selected. The resulting plasmid was called pHGV2-dhfr (Fig. 35).

Альтернативный способ заключался в следующем: плазмиду рНGV2 обрабатывали Sal I и частично переваривали с Есo RI без присоединения какого-либо линкера Есo RI. Выделили фрагмент ДНК длиной примерно 2,7 тыс.пар оснований, и его обработали с фрагментом Кленоу Е.соli ДНК-полимеразы, чтобы создать тупые концы. Тупоконечный ЕсоRI-фрагмент приготовили из pAD26SVpA, как описано выше. Этот ЕсоRI-фрагмент и отдельно полученный фрагмент (примерно 2,7 тыс. пар оснований) обработали Т4 ДНК-лигазой, чтобы получить рНGV2-dhfr.An alternative method was as follows: the plasmid pHGV2 was treated with Sal I and partially digested with Eco RI without the addition of any Eco Eco RI linker. A DNA fragment of approximately 2.7 thousand base pairs was isolated and processed with the Klenow fragment of E. coli DNA polymerase to create blunt ends. The blunt-ended EcoRI fragment was prepared from pAD26SVpA as described above. This EcoRI fragment and a separately obtained fragment (approximately 2.7 thousand base pairs) were treated with T 4 DNA ligase to obtain pHGV2-dhfr.

рНGV2(Н), полученную в 1) примера 29, обрабатывали рестриктазами Hind III и SalI как описано в 2) в примере 29, и Hind III Sal I фрагмент присоединили к тупоконечному Есо RI фрагменту pAdD26SVpA, описанному выше. Этот способ можно также использовать для получения рНGG4-dhfr (фиг.36). The pH GV2 (H) obtained in 1) of Example 29 was treated with restriction enzymes Hind III and SalI as described in 2) in Example 29, and the Hind III Sal I fragment was attached to the blunt-ended Eco RI fragment of pAdD26SVpA described above. This method can also be used to obtain pHGG4-dhfr (Fig. 36).

2) Построение pV2DR1 и pV2DR2
Десять микрограммов плазмиды pAdD26SVpA, упомянутой в 1), растворили в 50 мл реакционного раствора, содержащего 50 ммоль/л трис-НСl (рН 7,5), 7 ммоль/л MgCl2, 100 ммоль/л NaCl, 7 ммоль/л 2-меркаптоэтанола, и 0,01% бычьего сывороточного альбумина. Реакцию проводили при 37оС в течение 10 ч в присутствии 10 единиц каждой из рестриктаз ЕсoRI и BamHI. Поэтому обработку фенолом и промывку эфиром проводили обычным путем. Фрагмент ДНК длиной примерно 2 тыс. оснований выделили посредством электрофореза через 1% агарозный гель с низкой точкой плавления. Выделенный фрагмент ДНК обработали с фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы по обычному способу с тем, чтобы создать тупые концы. Тупоконечный фрагмент ДНК обрабатывали фенолом, промывали эфиром и проводили осаждение этанолом.
2) Build pV2DR1 and pV2DR2
Ten micrograms of the plasmid pAdD26SVpA mentioned in 1) was dissolved in 50 ml of a reaction solution containing 50 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.5), 7 mmol / L MgCl 2 , 100 mmol / L NaCl, 7 mmol / L 2 -mercaptoethanol, and 0.01% bovine serum albumin. The reaction was conducted at 37 ° C for 10 hours in the presence of 10 units each of restriction endonucleases EcoRI and BamHI. Therefore, phenol treatment and washing with ether were carried out in the usual way. A DNA fragment of approximately 2 thousand bases in length was isolated by electrophoresis through 1% low melting point agarose gel. The isolated DNA fragment was treated with the Klenow fragment of the DNA polymerase in the usual manner in order to create blunt ends. The blunt-ended DNA fragment was treated with phenol, washed with ether, and ethanol precipitated.

Десять микрограммов плазмиды рНGV2(Н), полученной в 1) примера 29, растворили в 50 мкл реакционного раствора, содержащего 10 ммоль/л, трис-НСl (рН 7,5), 7 ммоль/л MgCl2 и 60 ммоль/л NaCl. Реакцию проводили при 37оС в течение 6 ч в присутствии 10 единиц Hind III. Фрагмент ДНК выделили с помощью электрофореза через 1% агарозный гель с низкой точкой плавления, который проводили обычным способом. Выделенный фрагмент ДНК затем обработали бактериальной щелочной фосфатазой, и тупые концы создавали посредством обработки фрагментом Кленова. После обработки фенолом и промывки эфиром, фрагмент ДНК присоединили тупыми концами к ранее полученному фрагменту ДНК длиной примерно 2 тыс. оснований с помощью Т4 ДНК-лигазы по следующей методике: 1 микрограмм каждого фрагмента ДНК растворили в 50 микрограммах реакционного раствора, содержащего 66 миллимоль/л трис-НСl (рН 7,5), 6,6 миллимоль/л MgCl2, 5 ммоль/л DТТ и 1 ммоль/л AТФ, и реакцию проводили при 6оС в течение 12 ч в присутствии 50 единиц Т4 ДНК-лигазы. Продукт связывания использовали для трансформации штамма DHI Е.сoli. В результате получили плазмиды pV2DR1 и pV2DR2, показанные на фиг. 37.Ten micrograms of the plasmid pHGV2 (H) obtained in 1) of Example 29 was dissolved in 50 μl of a reaction solution containing 10 mmol / L, Tris-HCl (pH 7.5), 7 mmol / L MgCl 2 and 60 mmol / L NaCl . The reaction was conducted at 37 ° C for 6 hours in the presence of 10 units of Hind III. The DNA fragment was isolated by electrophoresis through 1% low melting point agarose gel, which was carried out in the usual way. The isolated DNA fragment was then treated with bacterial alkaline phosphatase, and blunt ends were created by treatment with a Klenov fragment. After treatment with phenol and washing with ether, the DNA fragment was attached with blunt ends to a previously obtained DNA fragment with a length of approximately 2 thousand bases using T 4 DNA ligase according to the following procedure: 1 microgram of each DNA fragment was dissolved in 50 micrograms of a reaction solution containing 66 mmol / tris-HCl (pH 7.5), 6.6 mmol / l MgCl 2, 5 mmol / l DTT, 1 mmol / l of ATF, and the reaction was carried out at 6 ° C for 12 hours in the presence of 50 units T 4 DNA ligases. The binding product was used to transform E. coli DHI strain. As a result, plasmids pV2DR1 and pV2DR2 shown in FIG. 37.

3) Трансформация и экспрессия. 3) Transformation and expression.

Клетки СНО трансформировали с плазмидов рН GV2-dhfr для экспрессии Г-КСФ в соответствии со способами, описанными в 3) в примере 25. CHO cells were transformed from plasmids pH GV2-dhfr for the expression of G-CSF in accordance with the methods described in 3) in example 25.

Трансформацию клеток СНО можно также осуществить путем совместной трансформации с рНGV2 и pAdD26SVpA. CHO cell transformation can also be accomplished by co-transformation with pHGV2 and pAdD26SVpA.

Клетки СНО трансформировали также следующими способами: pV2DR1 или pV2DR2, полученные в 2), предварительно обработали с Sal I и Kpn I соответственно, чтобы получить фрагменты ДНК, и 10 мкг в этих фрагментов использовали для трансформации клеток СНО, как описано выше, трансформированные клетки подвергали непрерывному культивированию в ряде селективных сред таким образом, как описано выше, примерно через 7 дней было не менее 100 отдельных колоний на чашку, эти колонки переносили целиком на свежую чашку и подвергали непрерывному культивированию в ряде селективных сред в присутствии 0,01 мкмоль/л метотрексата, после чего появилось десять с лишним колоний, те же самые способы повторяли при концентрации метотрексата, последовательно возрастающей до 0,02 мкмоль/л 0,05 мкмоль/л и 0,1 мкмоль/л, и отобрали колонии, которые выжили, отбор колоний можно осуществить аналогичным образом, дале если полученные 10 с лишним колоний по отдельности отобрать и подвергнуть культивированию при возрастающих концентрациях метотрексата. CHO cells were also transformed in the following ways: pV2DR1 or pV2DR2 obtained in 2) was pretreated with Sal I and Kpn I, respectively, to obtain DNA fragments, and 10 μg of these fragments were used to transform CHO cells, as described above, the transformed cells were subjected continuous cultivation in a number of selective media in such a way as described above, after about 7 days there were at least 100 separate colonies per cup, these columns were transferred entirely to a fresh cup and subjected to continuous cultivation in a number of villages of objective media in the presence of 0.01 μmol / L methotrexate, after which ten or more colonies appeared, the same methods were repeated with a concentration of methotrexate successively increasing to 0.02 μmol / L 0.05 μmol / L and 0.1 μmol / l, and the colonies that survived were selected, the selection of colonies can be carried out in a similar way, further if the obtained 10-odd colonies are individually taken and cultured with increasing concentrations of methotrexate.

Рекомбинантный вектор, несущий "полицистронный ген" также можно использовать для трансформации клеток СНО. Пример этого альтернативного способа состоит в следующем: pAdD26SVрА обработали PstI и выделенные два фрагмента присоединили к pBRV2 выведенному фрагменту КДНК КСФ с тем, чтобы построить рекомбинантный вектор, в котором аденовирусный промотор, КДНК КСФ DНFR и сайт поли(А)SV 40 вставлены в написанном порядке. Этот рекомбинантный вектор использовали для трансформации клеток СНО. A recombinant polycistronic gene vector can also be used to transform CHO cells. An example of this alternative method is as follows: pAdD26SVpA was treated with PstI and the selected two fragments were attached to pBRV2 derived CSF cDNA fragment in order to construct a recombinant vector in which the adenovirus promoter, CSF DFF cDNA and the poly (A) SV 40 site are inserted in written order . This recombinant vector was used to transform CHO cells.

П р и м е р 32. Анализ активности Г-КСФ (-VSЕ)
С помощью способов, описанных в примере 26, человеческий Г-КСФ получили из надосадочных жидкостей культур клеток С127 и клеток СНО, которые получили в примере 30 и 31, соответственно. Активность человеческого Г-КСФ каждого из выделенных образцов анализировали, как в примере 26. Результаты приведены в табл.7.
PRI me R 32. Analysis of the activity of G-CSF (-VSE)
Using the methods described in example 26, human G-CSF was obtained from supernatants of cultures of C127 cells and CHO cells, which were obtained in example 30 and 31, respectively. The activity of human G-CSF of each of the selected samples was analyzed as in example 26. The results are shown in table.7.

П р и м е р 33. Аминокислотный анализ и сахарный анализ (-VSE)
1) Анализ аминокислотного состава.
PRI me R 33. Amino acid analysis and sugar analysis (-VSE)
1) Analysis of amino acid composition.

Неочищенный образец КСФ, полученный в примере 32, очищали в соответствии с методиками, описанными в примере 2(III). Очищенный образец КСФ подвергали анализу его аминокислотного состава по способам, описанным в 1) в примере 27. Результаты приведены в табл.8. The crude CSF sample obtained in Example 32 was purified in accordance with the procedures described in Example 2 (III). The purified CSF sample was subjected to analysis of its amino acid composition according to the methods described in 1) in example 27. The results are shown in table.8.

2) Анализ сахарного состава. 2) Analysis of sugar composition.

Очищенный образец КСФ, использованный для анализа аминокислотного состава в 1), подвергали анализу для определения его сахарного состава с помощью тех же способов и при тех же самых условиях, как описано в 2) в примере 27. В результате этого анализа было подтверждено наличие галактозы, N-ацетилгалактозамина и сиаловой кислоты в образце КСФ по настоящему изобретению. The purified CSF sample used to analyze the amino acid composition in 1) was subjected to analysis to determine its sugar composition using the same methods and under the same conditions as described in 2) in example 27. As a result of this analysis, the presence of galactose was confirmed. N-acetylgalactosamine and sialic acid in a CSF sample of the present invention.

П р и м е р 34. Построение рекомбинантного вектора, содержащего хромосомный ген для экспрессии в клетках СOS. PRI me R 34. Construction of a recombinant vector containing the chromosomal gene for expression in COS cells.

Плазмиду рBRCЕЗ β, которая была получена в примере 11 и которая содержала хромосомный ген, показанный на фиг. 13-17, обработали ЕсоRI. Плазмиду рSVH+K+, описанную Banerji et al. Сеll, 27, 299 (1981), обработали Kpn I, чтобы удалить глобиновый ген. Затем плазмиду подвергали частичному перевариванию с Hind III и, чтобы удалить часть позднего гена SV40. Фрагменты соединили повторно, чтобы получить вектор экспрессии pML -Е+.Plasmid pBRCEC β, which was obtained in Example 11 and which contained the chromosomal gene shown in FIG. 13-17, treated with EcoRI. Plasmid pSVH + K + described by Banerji et al. Sell, 27, 299 (1981), treated with Kpn I to remove the globin gene. The plasmid was then partially digested with Hind III and to remove part of the late SV40 gene. Fragments were re-combined to obtain the expression vector pML -E + .

Этот вектор обработали рестриктазой ЕсоRI и дефосфорилировали щелочной фосфатазой (Тakara Shuzo Co. Ltd), чтобы получить вектор ДНК, который связали с вышеупомянутой хромосомной ДНК с помощью Т4 ДНК-лигазы (Тakara Shuzo Co. Ltd.), чтобы получить рМL СЕЗ α. Как показано на рис. 20, эта плазмида содержала усилитель гена SV40, начало репликации SV40, начало репликации pB R322 и pBR322 выведенный β -лактамазный ген (Аmpr), и имела хромосомный ген человеческого Г-КСФ, присоединенный ниже по потоку от усилителя гена SV40.This vector was digested with EcoRI restriction enzyme and dephosphorylated with alkaline phosphatase (Takara Shuzo Co. Ltd) to obtain a DNA vector that was coupled to the above chromosomal DNA using T 4 DNA ligase (Takara Shuzo Co. Ltd.) to obtain pML CEZα. As shown in fig. 20, this plasmid contained the SV40 gene enhancer, the start of SV40 replication, the start of pB R322 replication and pBR322 deduced β-lactamase gene (Amp r ), and had the human G-CSF chromosome gene attached downstream of the SV40 gene enhancer.

П р и м е р 35. Экспрессия хромосомного гена человеческого КСФ в клетках СОS. PRI me R 35. Expression of the chromosomal gene of human CSF in the cells of the COS.

Клетки СОS-I (полученные благодаря любезности доктора Глузмана из лаборатории Коулд спринг харбор, США), которые выращивали до плотности примерно 70% в чашках Петри (диаметром 9 см, Nunc), используя среду DMEM (модифицированная Дульбекко среда Игл, поставляемая фирмой Nissui Seiyaku K. K. под торговым названием "Nissui"), содержащую 10% сыворотки теленка, трансформировали либо путем обработки фосфатом кальция [Wigler et al. Сell, 14, 725, (1978)] либо способом с использованием DEАЕ-декстрана, хлорохина, см. например, Гордон с сотр. Sciencе, 228, 810 (1985)]
Трансформацию по способу с использованием фосфата кальция проводили следующим образом: 160 мкг плазмиды pMLCЕЗα полученной в примере 34, растворили в 320 мкл ТЕ раствора и после добавления дистиллированной воды (3,2 мл) добавили 504 мкл 2 моль/л CaCl2.
COS-I cells (obtained thanks to the courtesy of Dr. Gluzman of the Could Spring Harbor Laboratory, USA), which were grown to a density of about 70% in Petri dishes (9 cm diameter, Nunc) using DMEM medium (Dulbecco modified Eagle medium supplied by Nissui Seiyaku KK under the trade name "Nissui") containing 10% calf serum was transformed either by treatment with calcium phosphate [Wigler et al. Cell, 14, 725, (1978)] or by a method using DEAE-dextran, chloroquine, see, for example, Gordon et al. Science, 228, 810 (1985)]
The transformation according to the method using calcium phosphate was carried out as follows: 160 μg of the plasmid pMLCЕЗα obtained in Example 34 was dissolved in 320 μl of TE solution and after adding distilled water (3.2 ml), 504 μl of 2 mol / L CaCl 2 was added.

К полученному раствору добавили 4 мл 2 НBS (50 ммоль/л Hepes, 280 ммоль/л NaCl, 1,5 ммоль/л фосфатного буфера, рН 7,12) и смесь охлаждали на льду в течение 20-30 мин. Охлажденную смесь добавляли по каплям к среде в количестве 1 мл на чашку Петри, где выращивали клетки СOS-1. После культивирования в течение 4 ч при 37оС в инкубаторе с СО2, клетки промывали безсывороточной DMEM средой, затем оставили стоять в течение примерно 3 мин при комнатной температуре в 5 мл среды DMEM, содержащей 20% глицерина, после чего промыли повторно безсывороточной средой DМЕМ. После удаления безсывороточной среды DМЕМ, добавили 10 мл среды DМЕМ, содержащей 10% сыворотки теленка, и культивирование продолжали в течение ночи в инкубаторе с СО2. После того, как среду заменили свежей средой такого же типа, культивирование продолжили еще в течение 3 дней.To the resulting solution was added 4 ml of 2 HBS (50 mmol / L Hepes, 280 mmol / L NaCl, 1.5 mmol / L phosphate buffer, pH 7.12) and the mixture was cooled on ice for 20-30 minutes. The cooled mixture was added dropwise to the medium in an amount of 1 ml per Petri dish, where COS-1 cells were grown. After culturing for 4 hours at 37 ° C in an incubator with CO 2, the cells were washed with serum-free DMEM medium, then left to stand for about 3 minutes at room temperature in 5 ml of DMEM medium containing 20% glycerol, and then washed repeatedly serum free medium DMEM. After removal of serum-free DMEM medium, 10 ml of DMEM medium containing 10% calf serum was added, and cultivation was continued overnight in a CO 2 incubator. After the medium was replaced with fresh medium of the same type, cultivation was continued for another 3 days.

Трансформацию по способу с использованием DEАЕ-декстрана, хлорохина проводили следующим образом: как в методике с использованием фосфата кальция, культивировали клетки СOS-1, чтобы они выросли до плотности 70% и промыли их дважды безсывороточной средой DМЕМ, к промытым клеткам добавили безсывороточную среду DМЕМ, содержащую 250 микрограмм/мл DEAЕ-декстрана в 2 мкг/мл плазмиды pML CEЗ α полученной в примере 34, и культивирование продолжали при 37оС в течение 12 ч, затем клетки дважды промыли безсывороточной средой DМЕМ и подвергали дальнейшему культивированию при 37оС в течение 2 ч в среде DMEM, содержащей 10% сыворотки теленка и 1 ммоль/л хлорохина, после этого клетки промыли дважды безсывороточной средой DМЕМ и культивировали при 37оС в течение дополнительных 3 дней в среде DМЕМ, содержащей 10% сыворотку теленка.Transformation according to the method using DEAE-dextran, chloroquine was carried out as follows: as in the method using calcium phosphate, COS-1 cells were cultured to grow to a density of 70% and washed twice with serum-free DMEM medium, serum-free DMEM medium was added to the washed cells containing 250 micrograms / ml DEAE-dextran in 2 ug / ml plasmid pML CEZ α obtained in example 34, and the culturing was continued at 37 ° C for 12 hours, then the cells were washed twice with serum-free DMEM medium and subjected to further kultivi tion at 37 ° C for 2 hours in DMEM medium containing 10% calf serum and 1 mmol / L chloroquine, washed twice with serum-free medium DMEM and cultured thereafter the cells at 37 ° C for an additional 3 days in medium DMEM containing 10 % calf serum.

Надосадочную жидкость полученной таким образом культуры клеток СOS-1 довели до рН 4 с помощью 1 н. раствора уксусной кислоты. После добавления равного объема н-пропанола, полученный осадок удалили центрифугированием. Поверхностный раствор пропускали через открытую колонку (диаметром 1 и длиной 2 см), заполненную 68 обращенно-фазным носителем (Yamamura Kagaku K.K.), и элюирование осуществляли с помощью 50% н-пропанола. Элюат разбавили в два раза водой и подвергали обращенно-фазной жидкостной хроматографии высокого давления на колонке YMC-С8 (Yamamura Kagaku K.K.), после чего проводили элюирование н-пропанолом (30-60% линейный градиент плотности), содержащим 0,1% трифторуксусную кислоту. Выделили фракции, которые элюировали при концентрациях н-пропанола примерно 40% затем их высушили вымораживанием и растворили в 0,1 моль/л глицидиновом буфере (рН 9). В результате этих процедур человеческий Г-КСФ в надосадочной жидкости культуры клеток СOS-1 сконцентрировали примерно в 20 раз. The supernatant of the thus obtained COS-1 cell culture was adjusted to pH 4 with 1 N. acetic acid solution. After adding an equal volume of n-propanol, the resulting precipitate was removed by centrifugation. The surface solution was passed through an open column (1 cm in diameter and 2 cm long) filled with 68 reverse phase support (Yamamura Kagaku K.K.), and elution was performed using 50% n-propanol. The eluate was diluted twice with water and subjected to high pressure reverse phase liquid chromatography on a YMC-C8 column (Yamamura Kagaku KK), followed by elution with n-propanol (30-60% linear density gradient) containing 0.1% trifluoroacetic acid . Fractions were isolated which were eluted at n-propanol concentrations of about 40%, then they were freeze dried and dissolved in 0.1 mol / L glycidine buffer (pH 9). As a result of these procedures, human G-CSF in the supernatant of the COS-1 cell culture was concentrated approximately 20 times.

В качестве контроля, клетки СOS-1 трансформировали pML-Е+, не содержащей хромосомного гена Г-КСФ, с помощью вышеописанного способа, и сконцентрировали надосадочную жидкость полученной культуры.As a control, COS-1 cells were transformed with pML-E + lacking the G-CSF chromosomal gene using the method described above, and the supernatant of the resulting culture was concentrated.

Активности человеческого Г-КСФ в полученных образцах анализировали по "Способу анализа активности человеческого Г-КСФ (а)", описанному ранее в данном описании. Результаты приведены в табл.9. Human G-CSF activity in the obtained samples was analyzed by the "Method for the analysis of human G-CSF activity (a)" described earlier in this description. The results are shown in table.9.

П р и м е р 36. РНК-анализ Г-КСФ (хромосомного гена). PRI me R 36. RNA analysis of G-CSF (chromosomal gene).

Клетки СОS, выращенные до клеточной концентрации 8 х 106 клеток/чашку (диаметром 9 см), трансформировали с помощью 80 мкг плазмиды рML CEЗ αЧерез 48 ч получили всю РНК по способу Сhirgwin [Biochemistry, 18, 5294-5299 (1979)]
Плазмиду рBRG4, полученную в примере 9, расщепили с помощью рестриктазы Aha III, и полученный pBRG4-выведенный фрагмент ДНК пометили радиоактивной меткой с помощью [ γ-32P] AТФ, используя Т4, полинуклеотидкиназу, чтобы получить фрагмент ДНК длиной 2,8 тыс. оснований, содержащий КДНК Г-КСФ. Фрагмент выделили и использовали в качестве зонда ДНК. После того, как денатурировали зонд ДНК (1,5 x105 счетов в минуту, 2,8 x106 счетов в 1 мин/мкг ДНК), его смешали с 20 мкг всей РНК, полученной из клеток СOS. Гибридизацию проводили при 45оС в течение 15 ч. Смесь переваривали с 200 единиц/мл или с 400 единиц/мл нуклеазы S1 (P.L. Biochemicals) по методикам Weaver and Weissmann [Nucleic Acid Res. 7, 1175-1193(1979)] после чего проводили гель-электрофорез через 4% полиакриламидный гель в присутствии 8,3 моль/л мочевины. Затем проводили детектирование с помощью авторадиографии.
COS cells grown to a cell concentration of 8 x 10 6 cells / dish (9 cm diameter) were transformed with 80 μg of plasmid pML CEZ α. After 48 h, all RNA was obtained by the method of Chirgwin [Biochemistry, 18, 5294-5299 (1979)]
The plasmid pBRG4 obtained in Example 9 was digested with Aha III restriction enzyme, and the resulting pBRG4-derived DNA fragment was radiolabeled with [γ- 32 P] ATP using T 4 polynucleotide kinase to obtain a 2.8 thousand DNA fragment .bases containing G-CSF cDNA. The fragment was isolated and used as a DNA probe. After the DNA probe was denatured (1.5 x10 5 counts per minute, 2.8 x10 6 counts per 1 min / μg of DNA), it was mixed with 20 μg of all RNA obtained from COS cells. Hybridization was carried out at 45 ° C for 15 hours. The mixture was digested with 200 units / ml or 400 units / ml of nuclease S1 (PL Biochemicals) according to the procedures Weaver and Weissmann [Nucleic Acid Res. 7, 1175-1193 (1979)] after which gel electrophoresis was performed through 4% polyacrylamide gel in the presence of 8.3 mol / L urea. Then, detection was performed using autoradiography.

В результате наблюдали полосу, соответствующую 722 парам основания, в виде сильно радиоактивно-меченной полосы в клетках СOS, где также отмечали полосу, соответствующую 487 парам основания. As a result, a band corresponding to 722 base pairs was observed as a strongly radioactively labeled band in COS cells, where a band corresponding to 487 base pairs was also noted.

Поэтому было найдено, что РНК клеток СOS содержала иРНК Г-КСФ обеих линий +VSЕ и -VSЕ. Therefore, it was found that the RNA of COS cells contained G-CSF mRNA of both lines + VSЕ and -VSE.

П р и м е р 37. Аминокислотный анализ и сахарный анализ (хромосомного гена). PRI me R 37. Amino acid analysis and sugar analysis (chromosomal gene).

1) Анализ аминокислотного состава. 1) Analysis of amino acid composition.

Неочищенный образец КСФ, полученный в примере 35, очищали в соответствии с методиками, описанными в примере 2 (III). Очищенный образец КСФ подвергали анализу его аминокислотного состава по способам, описанным в 1) в примере 27. Результаты приведены в табл.10. The crude CSF sample obtained in Example 35 was purified in accordance with the procedures described in Example 2 (III). The purified CSF sample was subjected to analysis of its amino acid composition according to the methods described in 1) in example 27. The results are shown in table 10.

2) Анализ сахарного состава. 2) Analysis of sugar composition.

Очищенный образец КСФ, использованный в анализе аминокислотного состава в 1), также подвергали анализу его сахарного состава с помощью тех же самых способов и при тех же самых условиях, какие описаны в 2) в примере 27. В результате этого анализа было подтверждено наличие галактозы, N-ацетилгалактозамина и сиаловой кислоты в образце КСФ по настоящему изобретению. The purified CSF sample used in the analysis of the amino acid composition in 1) was also analyzed for its sugar composition using the same methods and under the same conditions as described in 2) in example 27. As a result of this analysis, the presence of galactose was confirmed. N-acetylgalactosamine and sialic acid in a CSF sample of the present invention.

П р и м е р 38. Экспрессия хромосомного гена человеческого Г-КСФ в клетках С127. PRI me R 38. Expression of the chromosomal gene of human G-CSF in C127 cells.

Плазмиду pML СЕЗ α полученную в примере 34, обработали ЕсоRI, и выделили фрагмент примерно 4 тыс. оснований с помощью способов, описанных в Molecular Cloning, там же. Выделенный фрагмент использовали в качестве источника хромосомного гена Г-КСФ. The plasmid pML CEZ α obtained in Example 34 was digested with EcoRI and a fragment of approximately 4 thousand bases was isolated using the methods described in Molecular Cloning, ibid. The isolated fragment was used as a source of the G-CSF chromosomal gene.

Фрагмент обработали фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы I, чтобы создать тупые концы (А). The fragment was treated with a Klenow fragment of DNA polymerase I to create blunt ends (A).

Промотор SV40 (Есo RI-ЕсоRI фрагмент примерно 0,4 тыс. оснований) вырезали из плазмиды рНGA410 (полученной, как в примере 22) с помощью способов, описанных в Molecular Cloning, там же, и затем обработали с фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы (В). The SV40 promoter (Eco RI-EcoRI fragment of approximately 0.4 thousand bases) was excised from the plasmid pHGA410 (obtained as in Example 22) using the methods described in Molecular Cloning, ibid., And then processed with the Klenow fragment of DNA polymerase ( IN).

В отдельной стадии плазмиду pdBPV-I, имеющую вирус бычьей папилломы (BPV) [эту плазмиду получили благодаря любезности доктора Хоули, и она описана в Sarver, N. Sbyrne, J.С. Нowleу, P.М. Proc. Natl. Асаd. Sei. USA, 79, 7147-7151 (1982)] обработали Hind III и Pvu II, чтобы получить фрагмент ДНК примерно 8,4 тыс. оснований. Этот фрагмент обработали с фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы I и дефосфорилировали с помощью бактериальной щелочной фосфатазы (С). In a separate step, the pdBPV-I plasmid having bovine papilloma virus (BPV) [this plasmid was obtained thanks to the courtesy of Dr. Hawley, and it is described in Sarver, N. Sbyrne, J. C. Howle, P.M. Proc. Natl. Acad. Sei. USA, 79, 7147-7151 (1982)] treated Hind III and Pvu II to obtain a DNA fragment of approximately 8.4 thousand bases. This fragment was treated with a Klenow fragment of DNA polymerase I and dephosphorylated using bacterial alkaline phosphatase (C).

Фрагменты ДНК (А), (В) и (С), массой по 0,1 мкг каждый, растворили в 20 мкл реакционного раствора [50 ммоль/л трис-НСl (рН 7,6), 10 ммоль/л MgCl2, 10 ммоль/л DТТ, 1 ммоль/л AТФ] и реакцию проводили в течение ночи при 4оС в присутствии 180 единиц Т4 ДНК-лигазы.DNA fragments (A), (B) and (C), each weighing 0.1 μg, were dissolved in 20 μl of the reaction solution [50 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.6), 10 mmol / L MgCl 2 , 10 mmol / l DTT, 1 mmol / l ATF] and reaction was performed overnight at 4 ° C in the presence of 180 units of T4 DNA ligase.

Реакционный раствор затем обработали по способу с использованием хлорида рубидия, описанному в Molecular Cloning, там же, с тем, чтобы получить плазмиду pТNCE3α (фиг.39). The reaction solution was then processed according to the method using rubidium chloride described in Molecular Cloning, in the same place, in order to obtain the plasmid pTNCE3α (Fig. 39).

Фрагмент ДНК(А), использованный в качестве источника хромосомного гена Г-КСФ, можно заменить на фрагмент ДНК примерно 1,78 тыс. оснований, который получили следующим образом: 20 мкг pML CEЗ α растворили в 100 мкл смеси 10 ммоль/л трис-НСl (рН 8,0), 7 ммоль/л MgCl2, 100 ммоль/л NaCl, 7 ммоль/л 2-меркаптоэтанола и 0,01% бычьего сывороточного альбумина, раствор инкубировали при 37оС в течение 5 ч в присутствии 20 единиц StuI, а затем подвергали электрофорезу через 1,2% агарозный гель.The DNA fragment (A) used as the source of the G-CSF chromosomal gene can be replaced by a DNA fragment of approximately 1.78 thousand bases, which was obtained as follows: 20 μg pML CEZ α was dissolved in 100 μl of a mixture of 10 mmol / L Tris- HCl (pH 8.0), 7 mmol / l MgCl 2, 100 mmol / l NaCl, 7 mmol / l 2-mercaptoethanol and 0.01% bovine serum albumin, the solution was incubated at 37 ° C for 5 hours in the presence of 20 units of StuI, and then subjected to electrophoresis through 1.2% agarose gel.

Полученную таким образом плазмиду рТNCEЗ α использовали для трансформации клеток мышей С127 1, как в примере 24, и отобрали клоны, которые экспрессовали хромосомный ген человеческого Г-КСФ и которые обладали высокой способностью продуцировать Г-КСФ. The plasmid pTNCE3 α thus obtained was used to transform C127 1 mouse cells, as in Example 24, and clones were selected that expressed the human G-CSF chromosome gene and which had high ability to produce G-CSF.

П р и м е р 39. Экспрессия хромосомного гена человеческого Г-КСФ в клетках СНО. PRI me R 39. Expression of the chromosomal gene of human G-CSF in CHO cells.

Как и в случае экспрессии в клетках С127, плазмиду рМL CEЗ обработали Stu I, выделили фрагмент ДНК примерно 1,78 тыс. оснований, альтернативно, ту же самую плазмиду обработали ЕсоRI, и выделили ЕсoRI фрагмент примерно 4 тыс. оснований. Любой фрагмент можно использовать в качестве источника хромосомного гена Г-КСФ. As with expression in C127 cells, the pML plasmid CEZ was treated with Stu I, a DNA fragment of approximately 1.78 thousand bases was isolated, alternatively, the same plasmid was treated with EcoRI and an EcoRI fragment of approximately 4 thousand bases was isolated. Any fragment can be used as a source of the G-CSF chromosomal gene.

Как и в случае экспрессии в клетках С127, плазмиду рМL CEЗα обработали Stu I, выделили фрагмент ДНК примерно 1,78 тыс. оснований, альтернативно, ту же самую плазмиду обработали ЕсоRI, и выделили ЕсoRI фрагмент примерно 4 тыс. оснований. Любой фрагмент можно использовать в качестве источника хромосомного гена Г-КСФ. As with expression in C127 cells, the pML CEZα plasmid was treated with Stu I, a DNA fragment of approximately 1.78 thousand bases was isolated, alternatively, the same plasmid was treated with EcoRI and an EcoRI fragment of approximately 4 thousand bases was isolated. Any fragment can be used as a source of the G-CSF chromosomal gene.

Фрагмент, используемый в качестве источника, обработали с фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы I (а). The fragment used as a source was treated with a Klenow fragment of DNA polymerase I (a).

Как в примере 38, промотор SV40 (ЕсоRI ЕсoRI фрагмент) вырезали из рНGA410), чтобы получить фрагмент примерно 0,4 тыс. оснований, который аналогично обработали с фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы (b). As in Example 38, the SV40 promoter (EcoRI EcoRI fragment) was excised from pHGA410) to obtain a fragment of approximately 0.4 thousand bases, which was similarly treated with the Klenow fragment of DNA polymerase (b).

В отдельной стадии плазмиду pAdD26SV pA [Kaufman, R.G. Sharp, Р.А. Mol. Сеll. Biol. 2, 1304-1319 (1982)] обработали с ЕсоRI, а затем с фрагментом Кленоу ДНК-полимеразы, и, наконец, дефосфорилировали посредством обработки бактериальной щелочной фосфатазой (с). In a separate step, plasmid pAdD26SV pA [Kaufman, R.G. Sharp, R.A. Mol. Sell. Biol. 2, 1304-1319 (1982)] was treated with EcoRI and then with the Klenow fragment of DNA polymerase, and finally dephosphorylated by treatment with bacterial alkaline phosphatase (c).

Фрагменты (а), (b) и (с), массой по 0,1 мкг каждый, растворили в 20 мкл реакционного раствора [50 миллимоль/л Трис-НСl (рН 7,6), 10 миллимоль/л MgCl2, 10 миллимоль/л DТТ, 1 миллимоль/л АТФ] и реакцию проводили в течение ночи при 4оС в присутствии 180 единиц Т4ДНК-лигазы.Fragments (a), (b) and (c), each weighing 0.1 μg, were dissolved in 20 μl of the reaction solution [50 mmol / L Tris-Hcl (pH 7.6), 10 mmol / L MgCl 2 , 10 mmol / l DTT, 1 mmol / l ATP] and reaction was performed overnight at 4 ° C in the presence of 180 units of T4 DNA ligase.

Реакционный раствор затем обработали по способу с использованием хлорида рубидия, описанному в Molecular Cloning, там же, с тем, чтобы трансформировать штамм DHI Е.coli. Из полученных Тетr колоний отбирали те, которые содержали плазмиду pD26SVCEЗ α
Как показано на фиг.40, плазмида pD26SVCEЗα имеет ген КСФ, присоединенный к раннему гену SV40 и ген dhfr, присоединенный ниже по потоку от основного позднего промотора аденовируса.
The reaction solution was then processed according to the method using rubidium chloride described in Molecular Cloning, in the same place, in order to transform the E. coli DHI strain. From the obtained Tet r colonies, those containing the plasmid pD26SVCE3 α were selected
As shown in FIG. 40, the plasmid pD26SVCE3α has a CSF gene attached to the early SV40 gene and a dhfr gene attached downstream of the main late adenovirus promoter.

Плазмиду рАdD26SVpА обработали с ЕсоRI и BamHI, как в 2) примера 25 с тем, чтобы получить фрагмент ДНК (примерно 2 тыс. оснований), содержащий ген dhfr. Этот фрагмент привязали к фрагменту (а) и к ЕсоRI-Sal I-фрагменту рНGA410(Н) с тем, чтобы построить вектоp экспрессии Ampr pDR CEЗα (фиг.40).Plasmid pADd26SVpA was processed with EcoRI and BamHI as in 2) of Example 25 in order to obtain a DNA fragment (approximately 2 thousand bases) containing the dhfr gene. This fragment was bound to fragment (a) and to the EcoRI-Sal I fragment of pHGA410 (H) in order to construct an expression vector of Amp r pDR CEZα (Fig. 40).

Клетки СНО трансформировали с полученными таким образом плазмидами pD26SVCEЗα и pDR CEЗα как в примере 25. Посредством повторной селекции при выращивании в присутствии метотрексата получили клоны штамма продуцирующего Г-КСФ. CHO cells were transformed with the plasmids pD26SVCEЗα and pDR CEЗα thus obtained, as in Example 25. Clones of the strain producing G-CSF were obtained by repeated selection when grown in the presence of methotrexate.

П р и м е р 40. Анализ активности Г-КСФ у трансформантов (экспрессующих хромосомный ген человека). PRI me R 40. Analysis of the activity of G-CSF in transformants (expressing the human chromosomal gene).

Надосадочные жидкости культур клеток С127 и клеток СНО, которые были получены в примерах 38, 39 соответственно обработали как в примере 26, чтобы получить человеческий Г-КСФ, и проанализировали его активность. Результаты приведены в табл.11. The supernatants of the cultures of C127 cells and CHO cells, which were obtained in Examples 38, 39, respectively, were processed as in Example 26 to obtain human G-CSF and their activity was analyzed. The results are shown in table.11.

П р и м ер 41. Молекулярный вес и изоэлектрическая точка трансформантов. PRI me R 41. Molecular weight and isoelectric point of transformants.

Очищенные образцы КСФ, использованные для анализа аминокислотного состава в примерах 16, 20, 27, 33 и 37, использовали для измерений их молекулярных весов и изоэлектрических точек с помощью следующих способов. The purified CSF samples used to analyze the amino acid composition in examples 16, 20, 27, 33 and 37 were used to measure their molecular weights and isoelectric points using the following methods.

1) Молекулярный вес. 1) Molecular weight.

Молекулярный вес КСФ определяли с помощью гель-электрофореза натрий-додецилсульфат-полиакриламидного гена (SDS-PAGE). Применяли электрофоретическую установку PROТЕАNТН (16 см, поставляемую фирмой "Bio-Rad Corporation", используя гель, изготовленный из полиакриламидного плиточного геля (Т 15% С 2,6%), размером 140 х 160 х 1,5 мм, при концентрации геля (Т 3% С 20% ). Денатурированный образец КСФ приготовили следующим способом: КСФ кипятили в течение 3 мин в растворе, содержащем 2% додецилсульфата натрия в 0,46 моль/л 2-меркаптоэтанола. После проведения электрофореза с 4 мкг образца при постоянном токе 30 миллиампер в течение 4 ч, гель удалили, и провели окрашивание с помощью 0,25% красителя бриллиантового голубого (Сoomassie Brilliant Blue R 250, производится фирмой "Сигма кемикл компани") для обнаружения полос. Следующие вещества использовали в качестве меток молекулярного веса после аналогичных обработок: фосфорилаза В (мол.м. 92500), бычий сывороточный альбумин (БСА, мол.м. 67000), овальбумин (ОVA, мол.м. 45000), карбоангидраза (мол. м. 31000), соевый трипсиновый ингибитор (мол.м. 21500) и лизоцин (мол.м. 14400).The molecular weight of CSF was determined by gel electrophoresis of the sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gene (SDS-PAGE). The PROTEAN TN electrophoretic apparatus (16 cm, supplied by Bio-Rad Corporation) was used using a gel made of polyacrylamide tile gel (T 15% C 2.6%), size 140 x 160 x 1.5 mm, at a gel concentration (T 3% C 20%). A denatured CSF sample was prepared as follows: CSF was boiled for 3 min in a solution containing 2% sodium dodecyl sulfate in 0.46 mol / L 2-mercaptoethanol. After electrophoresis with 4 μg of the sample at constant 30 milliamps for 4 hours, the gel was removed and stained with 0.25% br Illuminant blue (Сoomassie Brilliant Blue R 250, manufactured by Sigma Chemical Company) to detect bands. The following substances were used as molecular weight marks after similar treatments: phosphorylase B (mol.m. 92500), bovine serum albumin (BSA, mol m. 67000), ovalbumin (OVA, mol.m. 45000), carbonic anhydrase (mol. m. 31000), soybean trypsin inhibitor (mol. m. 21500) and lysozine (mol. 14400).

В результате обнаружили единственную полосу, соответствующую молекулярному весу 185000 ± 1000, для каждого из образцов КСФ, полученных примере 16 [Е.сoli (KДНК (+VSE)] и в примере 20 [Е.сoli/KДНК (-VSE)] и единственную полосу, соответствующую молекулярному весу 19000 ± 1000, для каждого из образцов КСФ, полученных в примере 27 [C127, СНО/КДНК (+VSE)] в примере 33 [С127, СНО/KДНК (-VSE)] и в примере 37 (СOS/g ДНК). As a result, a single band corresponding to a molecular weight of 185,000 ± 1000 was found for each of the CSF samples obtained in Example 16 [E. coli (KDNA (+ VSE)] and in Example 20 [E. coli / KDNA (-VSE)] and the only the band corresponding to a molecular weight of 19,000 ± 1000 for each of the CSF samples obtained in Example 27 [C127, CHO / CDNA (+ VSE)] in Example 33 [C127, CHO / KDNA (-VSE)] and in Example 37 (COS / g DNA).

2) Изоэлектрическая точка. 2) Isoelectric point.

Изоэлектрическую точку КCФ по настоящему изобретению определяли с помощью устройства для изоэлектрического электрофореза в плоском слое FВЕ-3000 (изготовляемом фирмой "Фармация файн кемиклз"). После 2-часового электрофореза при постоянной мощности 30 ВТ (Vмакс. 2000 В) на полиакриламидном геле (Т 5% С 3% 115x xмм 230 мм), содержащем формалит (рН 4 6,5, фирма "Фармация файн кемиклз" и 4 моль/л мочевины, КСФ зафиксировали с помощью 30% метанола/10% трихлоруксусной кислоты (35% сульфосалициловой кислоты и окрасили с помощью красителя бриллиантового голубого R-250 (Сoomassie). В качестве меток изоэлектрических точек использовали набор с низкими pI (pН: 2,5-6,5 поставляется фирмой "Pharmacia Fine Chemicals").The CSF isoelectric point of the present invention was determined using an FEE-3000 flat layer isoelectric electrophoresis device (manufactured by Pharmacy Fine Chemicals). After 2-hour electrophoresis at a constant power of 30 W (V max . 2000 V) on a polyacrylamide gel (T 5% C 3% 115x x 230 mm) containing formalite (pH 4 6.5, Pharmacy Fine Chemicals and 4 mol / L urea, CSF was fixed with 30% methanol / 10% trichloroacetic acid (35% sulfosalicylic acid and stained with diamond blue dye R-250 (Сoomassie). A set with low pI (pН: 2 was used as isoelectric point marks) 5-6.5 is supplied by Pharmacia Fine Chemicals).

Анализ разделения полос при рН от 4 до 6,5 дал единственную полосу, соответствующую рI 6,1 для каждого из образцов КСФ, полученных в примерах 16 и 20, и дал три раздельных полосы, соответствующие рI 5,5, 5,8 и 6,1 для каждого из образцов КСФ, полученных в примерах 27, 33 и 37. Analysis of the separation of the bands at pH from 4 to 6.5 gave a single band corresponding to pI 6.1 for each of the CSF samples obtained in examples 16 and 20, and gave three separate bands corresponding to pI 5.5, 5.8 and 6 , 1 for each of the CSF samples obtained in examples 27, 33 and 37.

П р и м е р 42. Защитный эффект человеческого Г-КСФ против микробной инфекции. PRI me R 42. The protective effect of human G-CSF against microbial infection.

Способ испытания 1. Защита против заражения Pseudomonas aeruginosa Эндоксан (Еndoхan, торговое название продукта фирмы Shionogi Co. Ltd.") вводили внутривенно в ICR мышей в возрасте 8-9 недель (самцы, масса тела 35,3 ± 1,38 г) при дозе 200 мг/кг. Затем мышей разделили на три группы, двум группам ввели с интервалами в 24 ч четыре подкожные инъекции (доза каждой 0,1 мл) раствора [1% пропанола в 0,5 (вес/объем) мышиного сывороточного альбумина и физиологическом солевом растворе] содержащего человеческий Г-КСФ (25000 или 50000 единиц/моль), в то время, как третьей группе вводили только растворитель по такой же схеме. Через три часа после последней инъекции мышей в каждой группе заразили Pseudomanas aeruginosa GNB-139 с помощью подкожной инъекции (3,9 x 105 колонииобразующих единиц/мышь). Через двадцать один час после заражения в первые две группы ввели еще одну подкожную инъекцию раствора, содержащего человеческий Г-КСФ (25000 или 50000 единиц/мышь), а в третью группу ввели только растворитель.Test method 1. Protection against infection with Pseudomonas aeruginosa Endoxan (Endohan, trade name of the product of Shionogi Co. Ltd. ") was administered intravenously in ICR mice aged 8-9 weeks (males, body weight 35.3 ± 1.38 g) when a dose of 200 mg / kg, then the mice were divided into three groups, the two groups were injected at intervals of 24 hours with four subcutaneous injections (each 0.1 ml dose) of a solution of [1% propanol in 0.5 (w / v) mouse serum albumin and physiological saline solution] containing human G-CSF (25,000 or 50,000 units / mol), while the third group was administered only erator in the same way. Three hours after the last injection, the mice in each group were infected Pseudomanas aeruginosa GNB-139 via a subcutaneous injection (3,9 x 10 May koloniiobrazuyuschih units / mouse). Twenty-one hours after infection in the first two groups introduced another subcutaneous injection of a solution containing human G-CSF (25,000 or 50,000 units / mouse), and only the solvent was introduced into the third group.

Защитный эффект человеческого КСФ определяли путем подсчета числа мышей, которые выживали через 10 дней после заражения. The protective effect of human CSF was determined by counting the number of mice that survived 10 days after infection.

Получение клеточной суспензии. Obtaining cell suspension.

Pseudomonad aeruginosa GNB-139 культивировали в течение ночи при встряхивании при 37оС в жидкой среде для сердечных вливаний (торговое название "Difco"). Культуру суспендировали в физиологическом солевом растворе.Pseudomonad aeruginosa GNB-139 was cultured overnight with shaking at 37 ° C in a liquid heart infusion medium (trade name "Difco"). The culture was suspended in physiological saline.

2. Защита против заражения Саndida Эндоксан (Еndoxan торговое название фирмы Shionogi Co. Ltd."), вводили внутрибрюшинно в мышей ICR в возрасте 8 недель (самцы, масса тела 40,5±1,60 г) в дозе 200 мг/кг. Затем мышей разделили на две группы, одной группе ввели с 24 часовыми интервалами четыре подкожных инъекции (доза каждой 0,1 мл) растворителя [1% пропанола и 10% (вес/объем) ICR мышиной сыворотки в физиологическом солевом растворе] cодержащего человеческий Г-КСФ (50000 единиц/мышь), в то время как другой группе вводили только растворитель по такой же схеме. Через четыре часа после последней инъекции, мышей в каждой группе заразили Саndida albicans U-50-1 (штамм, выделенный из мочи лейкемийных больных, любезно предоставленный Бактериологической лабораторией, университета Тохоку, медицинской школы) с помощью внутривенной инъекции (5,6 x 105 колонийобразующих единиц/мышь). Защитный эффект человеческого Г-КСФ определяли путем подсчета числа мышей, которые выживали через десять дней после заражения.2. Protection against infection Sandida Endoxan (Endoxan, trade name of Shionogi Co. Ltd. "), was administered intraperitoneally in ICR mice at 8 weeks of age (males, body weight 40.5 ± 1.60 g) at a dose of 200 mg / kg. Then the mice were divided into two groups, one subcutaneous injection (dose of 0.1 ml each) of solvent [1% propanol and 10% (weight / volume) ICR mouse serum in physiological saline] containing human G- was administered at 24-hour intervals CSF (50,000 units / mouse), while the other group was administered only the solvent according to the same scheme. After the last injection, mice in each group were infected with Candida albicans U-50-1 (a strain isolated from the urine of leukemia patients, kindly provided by the Bacteriological Laboratory, Tohoku University Medical School) by intravenous injection (5.6 x 10 5 colony forming units / mouse) The protective effect of human G-CSF was determined by counting the number of mice that survived ten days after infection.

Поучение клеточной суспензии. Learning cell suspension.

Саndida albicand U-50-1 культивировали в течение ночи при встряхивании пpи 37оС в содержащей дрожжевой экстракт жидкой среде Sabouraud (2% декстрозы из фирмы "Junsei Pure Chemicals Co. Ltd."; 10% триптоказного пептона, торговое название "BBL", 5% дрожжевой экстракт из "Difcо"; рН 5, 6). Культуру дважды промывали физиологическим солевым раствором и суспендировали в физиологическом солевом растворе.Sandida albicand U-50-1 was cultured overnight with shaking VARIATIONS 37 ° C containing yeast extract liquid medium, Sabouraud (2% dextrose, from the firm "Junsei Pure Chemicals Co. Ltd."; 10% triptokaznogo peptone, trade name "BBL" , 5% yeast extract from Difco; pH 5, 6). The culture was washed twice with physiological saline and suspended in physiological saline.

3. Защита от заражения внутриклеточной паразитарной Listeria Эндотоксан (Еndotoxan, торговое название продукта фирмы Shionogi Co. Ltd.) вводили внутрибрюшинно в ICR мышей в возрасте 7 недель (самцы, вес тела 34,7 ± 1,24 г в дозе 200 мг/кг. Затем мышей разделили на две группы; одной группе с 24 часовыми интервалами вводили четыре подкожные инъекции (доза каждой 0,1 мл) растворителя [1% н-пропанола и 10% (вес/объем) ICR мышиная сыворотка в физиологическом солевом растворе] cодержащего человеческий Г-КСФ (50000 единиц/мышь), в то время как другой группе вводили только растворитель по такой же схеме. Через четыре часа после последней инъекции, мышей в каждой группе заразили Listeria monocytogenes 46 (любезно предоставленный микробиологической лабораторией медицинской школы университета Тохоку) посредством внутривенной инъекции 1,0 x 107 колонийобразующих единиц/мышь. Защитный эффект человеческого Г-КСФ определяли путем подсчета числа мышей, которые выживали через 12 дней после заражения.3. Protection against infection with the intracellular parasitic Listeria Endotoxan (Endotoxan, trade name of the product from Shionogi Co. Ltd.) was injected intraperitoneally into ICR mice at 7 weeks of age (males, body weight 34.7 ± 1.24 g at a dose of 200 mg / kg The mice were then divided into two groups: in one group, four subcutaneous injections (each 0.1 ml dose) of a solvent [1% n-propanol and 10% (w / v) ICR mouse serum in physiological saline] containing human G-CSF (50,000 units / mouse), while the other group was administered only solvent of the same pattern. Four hours after the last injection, the mice in each group are infected with Listeria monocytogenes 46 (kindly provided by microbiological laboratory Tohoku University Medical School) by intravenous injection of 1,0 x 10 July koloniyobrazuyuschih units / mouse. The protective effect of human G-CSF was determined by counting the number of mice that survived 12 days after infection.

Получение клеточной суспензии. Obtaining cell suspension.

Listeria monocytogenes 46 культивировали в течение ночи при встряхивании при 37оС в жидкой среде для мозгового сердечного вливания (торговое название продукта "Difco"). Культуру суспендировали в физиологическом солевом растворе.46 Listeria monocytogenes was cultured overnight with shaking at 37 ° C in a liquid medium for brain heart infusion (product name "Difco"). The culture was suspended in physiological saline.

Результаты
l) Испытания 1,2 и 3 проводили с полипептидом. Г-КСФ Е.соli (+VSE), полученным в примере 16. Результаты приведены в табл.12, 13 и 14.
results
l) Tests 1,2 and 3 were performed with a polypeptide. G-CSF E. coli (+ VSE) obtained in example 16. The results are shown in tables 12, 13 and 14.

ll) Испытание l проводили с полипептидом Г-КСФ Е,coli (-VSE), полученным в примере 20. Результаты приведены в табл. 15. ll) Test l was performed with the G-CSF E polypeptide, coli (-VSE) obtained in Example 20. The results are shown in table. 15.

lll) Испытание l проводили с очищенным образцом человеческого Г-КСФ, выведенным клетками CHO (+VSE), который был таким же, как и образец, использованный в анализе аминокислотного состава в примере 27. Результаты преведены в табл.16. lll) Test l was performed with a purified sample of human G-CSF excreted by CHO (+ VSE) cells, which was the same as the sample used in the amino acid composition analysis in Example 27. The results are summarized in Table 16.

По существу, те же результаты были получены, когда испытание 1 проводили с очищенным образцом человеческого Г-КСФ, выведенного С127 клеткой, который был таким же как образец, использованный в анализе аминокислотного состава в примере 27. Essentially, the same results were obtained when Test 1 was carried out with a purified sample of human G-CSF excreted by a C127 cell, which was the same as the sample used in the analysis of the amino acid composition in Example 27.

IV) Испытание I проводили с очищенным образцом человеческого Г-КСФ, выведенного СНО клеткой (-VSЕ), который был таким же, как образец, использованный в анализе аминокислотного состава в примере 33. Результаты приведены в табл.17. IV) Test I was carried out with a purified sample of human G-CSF excreted by a CHO cell (-VSE), which was the same as the sample used in the analysis of the amino acid composition in Example 33. The results are shown in Table 17.

По существу, те же результаты были получены, когда испытание l проводили c очищенным образцом человеческого Г-КСФ, выведенного клеткой С127, который был таким же, как образец, использованный в анализе аминокислотного состава в примере 33. Essentially, the same results were obtained when test l was performed with a purified sample of human G-CSF excreted by C127 cell, which was the same as the sample used in the amino acid composition analysis in Example 33.

Claims (1)

СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФАКТОРА, СТИМУЛИРУЮЩЕГО ОБРАЗОВАНИЕ КОЛОНИЙ ГРАНУЛОЦИТОВ, предусматривающий конструирование рекомбинантной плазмидной ДНК, содержащей фрагмент ДНК, кодирующий фактор стимулирования образования колоний гранулоцитов, трансформацию штаммов Escherichia coli или культивируемых клеток животных рекомбинантной плазмидной ДНК, культивирование трансформантов и выделение целевого продукта, отличающийся тем, что конструируют рекомбинантную плазмидную ДНК с фрагментом ДНК, кодирующим фактор стимулирования образования колоний гранулоцитов со следующей аминокислотной последовательностью, приведенной в описании. A METHOD FOR PRODUCING A FACTOR STIMULATING THE FORMATION OF GRANULOCYTIC COLONIES, which involves the construction of a recombinant plasmid DNA containing a DNA fragment encoding a factor for stimulating the formation of granulocyte colonies, the transformation of Escherichia coli strains or cultured animal cells, recombinant plasmid production, and transformed plasmid recombinant plasmid DNA with a DNA fragment encoding a colony stimulating factor ulotsitov of the amino acid sequence shown in the description.
SU864028325A 1985-12-02 1986-09-16 Method of preparing factor stimulating granulocyte colony formation RU2057809C1 (en)

Applications Claiming Priority (8)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP26945685 1985-12-02
JP269456/85 1985-12-02
JP269455/85 1985-12-02
JP60269455A JPS62129298A (en) 1985-12-02 1985-12-02 Novel polypeptide
JP27083985 1985-12-03
JP270839/85 1985-12-03
JP60270838A JPH06102021B2 (en) 1985-12-03 1985-12-03 Novel polypeptide
JP270838/85 1985-12-03

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2057809C1 true RU2057809C1 (en) 1996-04-10

Family

ID=27478848

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SU864028325A RU2057809C1 (en) 1985-12-02 1986-09-16 Method of preparing factor stimulating granulocyte colony formation

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2057809C1 (en)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2491290C2 (en) * 2007-07-27 2013-08-27 Биофарм Гезелльшафт Цур Биотехнологишен Энтвиклунг Фон Фармака Мбх Optimised method of purifying recombinant protein of growth factor
RU2596408C2 (en) * 2010-10-29 2016-09-10 Ханми Сайенс Ко., Лтд. Method of purifying human granulocyte-colony stimulating factor from recombinant e.coli
RU2772876C2 (en) * 2017-06-30 2022-05-26 Спарк Терапьютикс, Инк. Column-based methods for cleaning vector based on aav

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2491290C2 (en) * 2007-07-27 2013-08-27 Биофарм Гезелльшафт Цур Биотехнологишен Энтвиклунг Фон Фармака Мбх Optimised method of purifying recombinant protein of growth factor
RU2596408C2 (en) * 2010-10-29 2016-09-10 Ханми Сайенс Ко., Лтд. Method of purifying human granulocyte-colony stimulating factor from recombinant e.coli
RU2772876C2 (en) * 2017-06-30 2022-05-26 Спарк Терапьютикс, Инк. Column-based methods for cleaning vector based on aav

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP0215126B1 (en) Human granulocyte colony stimulating factor
EP0220520B1 (en) Human granulocyte colony stimulating factor
KR910001809B1 (en) Csf protein production and purification
EP0177568B1 (en) Recombinant dna molecules
NO318755B1 (en) Use of a hpG-CSF polypeptide for the preparation of a drug for stopping the proliferation of leukemia cells
FI103986B (en) cDNA clones encoding polypeptides having human cellular granulocyte macrophage and eosinophilic growth factor activity
JPH0657156B2 (en) New glycoprotein manufacturing method
EP0188864A1 (en) DNA encoding human interleukin 1 alpha and the amino acid chain corresponding thereto and vectors and hosts containing such DNA; and the preparatiion thereof
KR0142675B1 (en) Gene expression regulator
EP0328061A2 (en) Human colony-stimulating factors
RU2057809C1 (en) Method of preparing factor stimulating granulocyte colony formation
US5151349A (en) Method for expressing polypeptide having anti-tumor activity
US5650297A (en) DNA encoding human colony-stimulating factors
JPS62129298A (en) Novel polypeptide
KR920002312B1 (en) Method for producing colony stimulating factor
CA1341389C (en) Human granulocyte colony stimulating factor
AU626530B2 (en) Human granulocyte-macrophage colony stimulating factor and muteins thereof
JPS62132899A (en) Novel polypeptide
Yamamoto et al. Molecular cloning and expression of the cDNA encoding feline granulocyte colony-stimulating factor
EP1033373B1 (en) Feline granulocyte colony-stimulating factor
WO1986000338A1 (en) Growth-related hormone
HRP920628A2 (en) Human granulocyte colony stimulating factor
WO1986002100A1 (en) Vectors containing a gene for a protein having erythroid-potentiating activity and recombinant dna methods for producing said protein
CA1341625C (en) Recombinant mammalian gm-csf, dna encoding mammalian gm-scf and methods of use thereof
JPH07102151B2 (en) Novel polypeptide production method