RU2022109675A - METHOD FOR SIMULTANEOUS GENODIAGNOSTICS OF FOUR MUTANT BETA-CASEIN ALLELES IN CATTLE AND TEST SYSTEM FOR ITS IMPLEMENTATION - Google Patents

METHOD FOR SIMULTANEOUS GENODIAGNOSTICS OF FOUR MUTANT BETA-CASEIN ALLELES IN CATTLE AND TEST SYSTEM FOR ITS IMPLEMENTATION Download PDF

Info

Publication number
RU2022109675A
RU2022109675A RU2022109675A RU2022109675A RU2022109675A RU 2022109675 A RU2022109675 A RU 2022109675A RU 2022109675 A RU2022109675 A RU 2022109675A RU 2022109675 A RU2022109675 A RU 2022109675A RU 2022109675 A RU2022109675 A RU 2022109675A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
csn2
seq
reaction
diluent
cattle
Prior art date
Application number
RU2022109675A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2815238C2 (en
Inventor
Саида Нурбиевна Марзанова
Давудай Абдулсемедович Девришов
Яков Игоревич Алексеев
Нина Валерьевна Коновалова
Нурбий Сафарбиевич Марзанов
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии-МВА имени К.А. Скрябина" (ФГБОУ ВО МГАВМиБ-МВА имени К.И. Скрябина)
Общество с ограниченной ответственностью "АгроВет"
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии-МВА имени К.А. Скрябина" (ФГБОУ ВО МГАВМиБ-МВА имени К.И. Скрябина), Общество с ограниченной ответственностью "АгроВет" filed Critical Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии-МВА имени К.А. Скрябина" (ФГБОУ ВО МГАВМиБ-МВА имени К.И. Скрябина)
Publication of RU2022109675A publication Critical patent/RU2022109675A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2815238C2 publication Critical patent/RU2815238C2/en

Links

Claims (2)

1. Способ одновременной генодиагностики 4-х аллелей бета-казеина CSN2A1, CSN2B, CSN2A2, CSN2A3 у крупного рогатого скота, заключающийся в том, что проводят выделение ДНК из биологического материала, постановку полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, с использованием трех реакционных смесей, содержащих разбавитель, Taq ДНК-полимеразу, три положительных и один отрицательный контрольный образец для каждой реакционной смеси, при подготовке к проведению реакции рассчитывают необходимый объем компонентов, исходя из количества исследуемых образцов плюс 4, реактивы смешивают, затем в подготовленные для ПЦР пробирки вносят по 20 мкл приготовленной ПЦР-смеси, в каждую ПЦР пробирку добавляют по 5 мкл контрольных и исследуемых образцов, пробирки помещают в амплификатор, при числе циклов амплификации равном 40, анализ полученных данных проводят путем сравнения амплифицированных участков генов, результаты интерпретируют на основании наличия или отсутствия пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией.1. A method for simultaneous gene diagnostics of 4 beta-casein alleles CSN2 A1 , CSN2 B , CSN2 A2 , CSN2 A3 in cattle, which consists in isolating DNA from biological material, performing a polymerase chain reaction in real time, with using three reaction mixtures containing a diluent, Taq DNA polymerase, three positive and one negative control sample for each reaction mixture, in preparation for the reaction, calculate the required volume of components based on the number of test samples plus 4, the reagents are mixed, then in the prepared PCR tubes are filled with 20 μl of the prepared PCR mixture, 5 μl of control and test samples are added to each PCR tube, the tubes are placed in an amplifier, with the number of amplification cycles equal to 40, the analysis of the obtained data is carried out by comparing the amplified gene regions, the results are interpreted based on the presence or absence of intersection of the fluorescence curve with the threshold line set at the appropriate level. 2. Тест-система для осуществления способа по п. 1 методом постановки полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, характеризующаяся тем, что включает реактивы в виде трех комплектов, каждый комплект состоит из компонентов: реакционная смесь, разбавитель, полимераза и 4 контрольных образца, ПЦР смесь с CSN2A1, CSN2B, CSN2A2, CSN2A3, содержащую 50 мМ KCl, 50 мМ TRIS-HCl, 250 нМ dNTP, 2,5 мМ MgCl2, праймеры - в концентрации 200 нМ, флуоресцентно-меченных олигонуклеотидных проб - в концентрации 200 нМ, имеющие следующие последовательности: SEQ ID NO 1, SEQ ID NO 2, SEQ ID NO 3, SEQ ID NO 4, SEQ ID NO 5, SEQ ID NO 6, SEQ ID NO 7, SEQ ID NO 8, *rev -используется обратная последовательность, разбавитель, 2,5 ед. Taq ДНК-полимеразы.2. A test system for implementing the method according to claim 1 by performing a polymerase chain reaction in real time, characterized in that it includes reagents in the form of three sets, each set consists of components: a reaction mixture, a diluent, a polymerase and 4 control samples, PCR mixture with CSN2 A1 , CSN2 B , CSN2 A2 , CSN2 A3 , containing 50 mM KCl, 50 mM TRIS-HCl, 250 nM dNTP, 2.5 mM MgCl 2 , primers - at a concentration of 200 nM, fluorescently labeled oligonucleotide probes - at a concentration of 200 nM, having the following sequences: SEQ ID NO 1, SEQ ID NO 2, SEQ ID NO 3, SEQ ID NO 4, SEQ ID NO 5, SEQ ID NO 6, SEQ ID NO 7, SEQ ID NO 8, * rev - reverse sequence is used, diluent, 2.5 units. Taq DNA polymerase.
RU2022109675A 2022-04-11 Method for simultaneous gene diagnosis of four alleles of beta-casein in cattle and test system for its implementation RU2815238C2 (en)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2022109675A true RU2022109675A (en) 2023-10-11
RU2815238C2 RU2815238C2 (en) 2024-03-12

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11390906B2 (en) Nucleotide sequence exclusion enrichment by droplet sorting (NEEDLS)
CN107385040B (en) Amplicon rescue multiplex polymerase chain reaction for amplification of multiple targets
EP2660331B1 (en) Method for single cell genome analysis and kit therefor
US20210246499A1 (en) Detection of short homopolymeric repeats
Shi et al. Real-time PCR of single bacterial cells on an array of adhering droplets
US20070042354A1 (en) Detecting pathogens in companion animals
US11104948B2 (en) NGS systems control and methods involving the same
EP3325152B1 (en) Automated sample to ngs library preparation
CN110512009B (en) Rapid screening kit and primer set
RU2015104459A (en) Method for the simultaneous genetic diagnosis of two mutant alleles causing CVM and BLAD in cattle and a test system for its implementation
RU2022109675A (en) METHOD FOR SIMULTANEOUS GENODIAGNOSTICS OF FOUR MUTANT BETA-CASEIN ALLELES IN CATTLE AND TEST SYSTEM FOR ITS IMPLEMENTATION
EP3325697B1 (en) Optimized clinical sample sequencing
US20100184024A1 (en) Method of Characterizing Nucleic Acids in a Mixed Sample
EP0517361A1 (en) A method for detecting and identifying pathogenic organisms using target sequences as detectors
Aslan et al. Nucleic Acid–Based Methods in the Detection of Foodborne Pathogens
KR20190065682A (en) DEVELOPMENT OF SINGLEPLEX REAL-TIME PCR KIT FOR RAPID DETECTION OF ENTEROINVASIVE ESCHERICHIA COLI USING icsA TARGET GENE
RU2017106872A (en) METHOD FOR SIMULTANEOUS GENODIAGNOSIS OF FOUR MUTANT CAPPA-CASEIN ALLELLES IN CATTLE CATTLE AND TEST SYSTEM FOR ITS IMPLEMENTATION
CN110592240A (en) RAA constant temperature fluorescence detection method and reagent for Vibrio Harveyi (VHV)
CN111662996A (en) Primer group and application thereof in rapid detection of Helianthus annuus Blume stem bacteria based on microfluidic chip
KR20190065680A (en) DEVELOPMENT OF SINGLEPLEX REAL-TIME PCR KIT FOR RAPID DETECTION OF SALMONELLA TYPHIMURIUM USING ttr TARGET GENE