RU2020135474A - Способ и система для компьютерного моделирования и имитации, применяемые для определения характеристик и/или оптимизации лекарственных средств - Google Patents

Способ и система для компьютерного моделирования и имитации, применяемые для определения характеристик и/или оптимизации лекарственных средств Download PDF

Info

Publication number
RU2020135474A
RU2020135474A RU2020135474A RU2020135474A RU2020135474A RU 2020135474 A RU2020135474 A RU 2020135474A RU 2020135474 A RU2020135474 A RU 2020135474A RU 2020135474 A RU2020135474 A RU 2020135474A RU 2020135474 A RU2020135474 A RU 2020135474A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
simulation
modeling
biological
settings
computer
Prior art date
Application number
RU2020135474A
Other languages
English (en)
Inventor
Лука ЭМИЛИ
Роберта БУРСИ
Алессиа БАРЕТТА
Альберто ПАЛАЦЦИН
Original Assignee
ИНСИЛИКОТРИАЛС ТЕКНОЛОДЖИС С.р.л.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ИНСИЛИКОТРИАЛС ТЕКНОЛОДЖИС С.р.л. filed Critical ИНСИЛИКОТРИАЛС ТЕКНОЛОДЖИС С.р.л.
Publication of RU2020135474A publication Critical patent/RU2020135474A/ru

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16HHEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H50/00ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
    • G16H50/50ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for simulation or modelling of medical disorders
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16CCOMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/50Molecular design, e.g. of drugs
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06FELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
    • G06F30/00Computer-aided design [CAD]
    • G06F30/20Design optimisation, verification or simulation
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B5/00ICT specially adapted for modelling or simulations in systems biology, e.g. gene-regulatory networks, protein interaction networks or metabolic networks
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16CCOMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/30Prediction of properties of chemical compounds, compositions or mixtures
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16CCOMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/60In silico combinatorial chemistry
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16CCOMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/70Machine learning, data mining or chemometrics
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A90/00Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
    • Y02A90/10Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Computing Systems (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Data Mining & Analysis (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Primary Health Care (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Evolutionary Computation (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Software Systems (AREA)
  • Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
  • Artificial Intelligence (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Computer Hardware Design (AREA)
  • Geometry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Medical Treatment And Welfare Office Work (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Management, Administration, Business Operations System, And Electronic Commerce (AREA)

Claims (71)

1. Способ компьютерного моделирования и имитации, применяемый для определения характеристик и оптимизации по меньшей мере одного лекарственного средства, предусматривающий следующие стадии:
хранение на компьютерной платформе (1) первого набора (D1) цифровых данных для моделирования, содержащего биологические, фармакологические, генетические, физиологические, фармакокинетические, фармакодинамические и клинические данные реального и/или виртуального индивидуума, относящиеся к одной или нескольким биологическим, и/или органическим, и/или функциональным частям индивидуума, с которыми предполагаются взаимодействия по меньшей мере одного лекарственного средства, и/или относящиеся к одному или нескольким эффектам, возникающим в результате указанных взаимодействий;
хранение на компьютерной платформе (1) второго набора (D2) цифровых данных для моделирования, содержащего биологические, фармакологические, генетические, физиологические, фармакокинетические, фармакодинамические данные одного или нескольких реальных и/или виртуальных животных, относящиеся к одной или нескольким биологическим, и/или органическим, и/или функциональным частям животного, на котором собираются тестировать по меньшей мере одно лекарственное средство, и/или относящиеся к одному или нескольким эффектам, возникающим в результате в результате тестируемых взаимодействий;
хранение на компьютерной платформе (1) третьего набора (D3) цифровых данных для моделирования, дающих представление о химико-физических свойствах и/или функциональных, и/или структурных, и/или динамических характеристиках химических соединений, и/или биологических соединений, и/или лекарственных средств, подлежащих отбору в ходе исследования и разработки по меньшей мере одного лекарственного средства;
хранение на компьютерной платформе (1) четвертого набора (D4) цифровых данных для моделирования, дающих представление о химико-физических свойствах и/или функциональных, и/или структурных, и/или динамических характеристиках биологических мишеней, подлежащих отбору в ходе исследования и разработки указанного по меньшей мере одного лекарственного средства;
хранение на компьютерной платформе пятого набора (D5) цифровых данных для моделирования, дающих представление о химических, химико-физических, биологических, физиологических, генетических, клинических, фармакологических, фармакодинамических и фармакокинетических данных, относящихся к одному или нескольким заболеваниям и/или терапевтическим областям, к которым относится указанное по меньшей мере одно лекарственное средство;
представление посредством компьютерной платформы (1) пользовательского интерфейса (4), который может быть подключен к Интернету и способен обеспечивать пользователю подключение и взаимодействие с компьютерной платформой (1) и с одним или нескольким прилагаемыми к ней программными продуктами;
получение информации (I) о выборе, и/или задании, и/или настройках, которая может быть введена пользователем посредством пользовательского интерфейса, причем информация о выборе и/или настройках содержит:
информацию (II) о выборе, и/или задании, и/или настройках модели фармакометрических и/или физиологических особенностей, представляющую собой модель фармакометрических и/или физиологических особенностей индивидуума на основе указанного первого хранящегося набора (D1) цифровых данных для моделирования и/или модель фармакометрических и/или физиологических особенностей животного на основе указанного второго хранящегося набора (D2) цифровых данных для моделирования;
информацию (12) о выборе, и/или задании, и/или настройках модели химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы на основе указанного первого хранящегося набора (D1), и/или указанного второго хранящегося набора (D2), и/или указанного третьего хранящегося набора (D3), и/или указанного четвертого хранящегося набора (D4), и/или указанного пятого хранящегося набора (D5) цифровых данных для моделирования, дающих представление о химических, химико-физических, фармакологических, биологических, генетических, физиологических свойствах указанной химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы;
информацию (13) о выборе, и/или задании, и/или настройках скрининговой и/или оптимизационной модели;
информацию (14) о выборе и настройках типа имитации и/или информацию (15) о выборе и настройках одного или нескольких вводимых параметров имитации и информацию (16) об одном или нескольких выводимых параметрах имитации;
обработка посредством компьютерной платформы (1) указанной информации (II) о выборе, и/или задании, и/или настройках модели фармакометрических и/или физиологических особенностей для разработки модели (M1) фармакометрических и/или физиологических особенностей на основе указанного первого хранящегося набора (D1) цифровых данных для моделирования и/или на основе указанного второго хранящегося набора (D2) цифровых данных для моделирования;
обработка посредством компьютерной платформы (1) указанной информации (12) о выборе, и/или задании, и/или настройках модели химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы для разработки модели (М2) химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы на основе указанного первого хранящегося набора (D1), и/или на основе указанного второго хранящегося набора (D2), и/или на основе указанного третьего хранящегося набора (D3), и/или на основе указанного четвертого хранящегося набора (D4), и/или на основе указанного пятого хранящегося набора (D5) цифровых данных для моделирования;
обработка посредством компьютерной платформы (1) указанной информации (13) о выборе, и/или задании, и/или настройках скрининговой и/или оптимизационной модели для разработки скрининговой и/или оптимизационной модели (М3) на основе указанного пятого хранящегося набора (D5) цифровых данных для моделирования, и/или на основе указанного третьего хранящегося набора (D3), и/или указанного четвертого хранящегося набора (D4) цифровых данных; причем скрининговая и/или оптимизационная модель (М3) содержит поисковые алгоритмы и/или алгоритмы на основе искусственного интеллекта, адаптированные для выявления и связывания функциональных, и/или структурных, и/или динамических характеристик химических соединений, и/или биологических соединений, и/или лекарственных средств, и/или биологических мишеней, и/или заболеваний, которые имеют отношение к разработке по меньшей мере одного лекарственного средства;
обработка посредством компьютерной платформы (1) указанной информации (I) о выборе и/или настройках, вводимой пользователем, для задания вводимых данных (Din) о настройках для одного или нескольких программных продуктов для компьютерного имитации, прилагаемых к компьютерной платформе (1);
выполнение компьютерной имитации с помощью одного или нескольких программных продуктов для компьютерной имитации на основе указанных вводимых данных (Din) о настройках, указанной модели (M1) фармакометрических и/или физиологических особенностей, указанной модели (М2) химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы и указанной скрининговой и/или оптимизационной модели (М3) с получением выводимых данных (Dout) компьютерного моделирования и/или имитации;
обработка выводимых данных (Dout) компьютерного моделирования и/или имитации на основе указанной информации (16) о выборе и настройках одного или нескольких выводимых параметров моделирования и/или имитации для предоставления отчетности об искомых результатах (R) моделирования и/или имитации в выбранном пользователем формате; причем результаты (R) имитации содержат информацию, позволяющую выявить, и/или охарактеризовать, и/или связать функциональные, и/или структурные, и/или динамические характеристики химических соединений, и/или биологических соединений, и/или лекарственных средств, и/или биологических мишеней, и/или заболеваний, которые имеют отношение к разработке по меньшей мере одного лекарственного средства;
предоставление искомых результатов моделирования и/или имитации посредством пользовательского интерфейса (4).
2. Способ по п. 1, причем стадия представления пользовательского интерфейса предусматривает представление множества доступных для выбора пользователем шаблонов, связанных с соответствующими типами имитации, и причем каждый шаблон содержит:
множество вводимых параметров, которые можно выбрать для имитации, при этом каждый параметр связан с соответствующим диапазоном допустимых значений, которые подходят для реализации имитации, в котором можно задать значение параметра;
множество выбираемых выводимых параметров, включающих искомые количества в виде выводимого результата;
множество вариантов по отображению на экране и предоставлению отчетности, которые могут быть выбраны пользователем для выбора формата результатов.
3. Способ по п. 1 или 2, причем информация (I) о выборе и/или настройках, которая может быть введена пользователем, дополнительно содержит:
параметры, предназначенные для задания и/или предназначенные для проработки модели (M1) фармакометрических и/или физиологических особенностей,
и/или параметры, предназначенные для определения и/или предназначенные для проработки модели (М2) химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы,
и/или параметры, предназначенные для задания и/или предназначенные для индивидуализации алгоритмов компьютерной модели (М3) с помощью искусственного интеллекта;
и/или параметры, предназначенные для выбора и/или предназначенные для задания реальных или виртуальных пациентов или контингентов реальных или виртуальных пациентов;
и/или параметры, предназначенные для задания параметров вычислительных аспектов имитации.
4. Способ по п. 3, причем информация (I) о выборе и/или настройках, которая может быть введена пользователем, содержит начальные условия и предельные условия для выполнения компьютерного моделирования и имитации,
и/или параметры, относящиеся к способу численного решения, применяемому программным обеспечением для компьютерной имитации.
5. Способ по любому из предыдущих пунктов, дополнительно предусматривающий следующие стадии:
получение цифровых данных для моделирования модели фармакометрических и/или физиологических особенностей, и/или цифровых данных для моделирования химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы, и/или цифровых данных для моделирования скрининговой или оптимизационной модели путем выбора из множества цифровых моделей фармакометрических и/или физиологических особенностей, и/или цифровых моделей химических, и/или фармакологических, и/или биологических систем, и/или скрининговых или оптимизационных моделей, хранящихся в цифровой библиотеке (2) компьютерной платформы (1) и/или предварительно загруженных пользователем на компьютерную платформу (1);
получение цифровых данных (D1) для моделирования, содержащих биологические, фармакологические, генетические, физиологические, фармакокинетические, фармакодинамические и клинические данные реального и/или виртуального индивидуума, путем выбора из множества цифровых моделей реальных или виртуальных пациентов, хранящихся в цифровой библиотеке (2) компьютерной платформы (1) и/или предварительно загруженных пользователем на компьютерную платформу (1).
6. Способ по любому из предыдущих пунктов, причем цифровые данные для моделирования реального индивидуума представлены в анонимной форме, и/или без указания личности, и/или с указанием псевдонима.
7. Способ по любому из предыдущих пунктов, причем компьютерное моделирование и/или имитация включают моделирование и/или имитацию, которые производят поиск биологических мишеней, и/или которые производят поиск химических соединений, и/или которые производят поиск биологических соединений, и/или которые производят поиск лекарственных средств.
8. Способ по любому из предыдущих пунктов, причем компьютерное моделирование и/или имитации включают моделирование и/или имитацию для определения характеристик и/или оптимизации указанного по меньшей мере одного лекарственного средства,
и/или моделирование и/или имитацию для анализа и прогнозирования динамических характеристик по меньшей мере одного лекарственного средства на контингенте реальных или виртуальных пациентов,
и/или моделирование и/или имитацию для персонализированной оценки эффектов, оказываемых по меньшей мере одним лекарственным средством на конкретного реального или виртуального пациента,
и/или моделирование и/или имитацию для оценки безопасности, и/или эффективности, и/или соответствия текущим нормам по безопасности и/или эффективности.
9. Способ по п. 8, причем компьютерное моделирование и/или имитация дополнительно включают моделирование и/или имитацию для анализа и прогнозирования динамических характеристик у одного или нескольких лекарственных средств на контингенте реальных или виртуальных животных и/или для индивидуализированной оценки эффектов, оказываемых одним или несколькими лекарственными средствами на конкретное реальное или виртуальное животное.
10. Способ по любому из предыдущих пунктов, причем компьютерное моделирование и/или имитация включают моделирование и/или имитацию для проектирования и/или разработки одного или нескольких химических соединений, и/или для анализа и прогнозирования химико-физических, и/или фармакологических, и/или биологических свойств одного или нескольких химических соединений, и/или для оценки безопасности, и/или эффективности, и/или соответствия текущим нормам по безопасности и/или эффективности.
11. Способ по любому из предыдущих пунктов, причем компьютерное моделирование и/или имитация включают моделирование и/или имитацию для анализа, и/или выявления, и/или определения характеристик биологических мишеней для исследования и/или оценки безопасности и/или эффективности.
12. Способ по любому из предыдущих пунктов, причем компьютерное моделирование и/или имитация включают поисковые алгоритмы, которые производят действия над цифровыми данными для моделирования.
13. Система (10) для компьютерного моделирования и имитации, применяемая для определения характеристик и оптимизации по меньшей мере одного лекарственного средства, содержащая компьютерную платформу (1), причем компьютерная платформа содержит:
цифровую библиотеку (2), на которой хранится следующее:
первый набор (D1) цифровых данных для моделирования, содержащий биологические, фармакологические, генетические, физиологические, фармакокинетические, фармакодинамические и клинические данные реального и/или виртуального индивидуума, относящиеся к одной или нескольким биологическим, и/или органическим, и/или функциональным частям индивидуума, с которыми предполагаются взаимодействия по меньшей мере одного лекарственного средства, и/или относящиеся к одному или нескольким эффектам, возникающим в результате указанных взаимодействий;
второй набор (D2) цифровых данных для моделирования, содержащий биологические, фармакологические, генетические, физиологические, фармакокинетические, фармакодинамические данные одного или нескольких реальных и/или виртуальных животных, относящиеся к одной или нескольким биологическим, и/или органическим, и/или функциональным частям животного, на котором собираются тестировать по меньшей мере одно лекарственное средство, и/или относящиеся к одному или нескольким эффектам, возникающим в результате в результате тестируемых взаимодействий;
третий набор (D3) цифровых данных для моделирования, дающих представление о химико-физических свойствах и/или функциональных, и/или структурных, и/или динамических характеристиках химических соединений, и/или биологических соединений, и/или лекарственных средств, подлежащих отбору в ходе исследования и разработки по меньшей мере одного лекарственного средства;
четвертый набор (D4) цифровых данных для моделирования, дающих представление о химико-физических свойствах и/или функциональных, и/или структурных, и/или динамических характеристиках биологических мишеней, подлежащих отбору в ходе разработки указанного по меньшей мере одного лекарственного средства;
пятый набор (D5) цифровых данных для моделирования, дающих представление о химических, химико-физических, биологических, физиологических, клинических, фармакологических, генетических, фармакодинамических и фармакокинетических данных, относящихся к одному или нескольким заболеваниям и/или терапевтическим областям, к которым относится указанное по меньшей мере одно лекарственное средство;
один или несколько компонентов (3) для электронной обработки, которые способны производить посредством одного или нескольких программных продуктов или приложений (S1-S6), хранящихся на ней и выполняемых в ней, следующие действия:
представление пользовательского интерфейса (4), который может быть подключен к Интернету и способен обеспечивать пользователю подключение и взаимодействие с компьютерной платформой (1) с цифровыми данными и с одним или нескольким прилагаемыми к ней программными продуктами;
получение информации (I) о выборе и/или настройках, которая может быть введена пользователем посредством пользовательского интерфейса (4), причем информация о выборе и/или настройках содержит:
информацию (II) о выборе, и/или задании, и/или настройках модели фармакометрических и/или физиологических особенностей, представляющую собой модель фармакометрических и/или физиологических особенностей индивидуума на основе указанного первого хранящегося набора (D1) цифровых данных для моделирования и/или представляющую собой модель фармакометрических и/или физиологических особенностей животного на основе указанного второго хранящегося набора (D2) цифровых данных для моделирования;
информацию (12) о выборе, и/или задании, и/или настройках модели химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы на основе указанного первого хранящегося набора (D1), и/или на основе указанного второго хранящегося набора (D2), и/или на основе указанного третьего хранящегося набора (D3), и/или на основе указанного четвертого хранящегося набора (D4), и/или на основе указанного пятого хранящегося набора (D5) цифровых данных для моделирования, дающих представление о химических, химико-физических, фармакологических, биологических, генетических, физиологических свойствах указанной химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы;
информацию (13) о выборе, и/или задании, и/или настройках скрининговой и/или оптимизационной модели;
информацию (14) о выборе и настройках типа моделирования и/или имитации, и/или информацию (15) о выборе и настройках одного или нескольких вводимых параметров моделирования и/или имитации, и информацию (16) о выборе и настройках одного или нескольких выводимых параметров моделирования и/или имитации;
обработка указанной информации (II) о выборе, и/или задании, и/или настройках модели фармакометрических и/или физиологических особенностей для разработки модели (Ml) фармакометрических и/или физиологических особенностей на основе указанного первого хранящегося набора (D1) цифровых данных для моделирования и/или на основе указанного второго хранящегося набора (D2) цифровых данных для моделирования;
обработка указанной информации (12) о выборе, и/или задании, и/или настройках модели химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы для разработки модели (М2) химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы на основе указанного первого хранящегося набора (D1), и/или на основе указанного второго хранящегося набора (D2), и/или на основе указанного третьего хранящегося набора (D3), и/или на основе указанного четвертого хранящегося набора (D4), и/или на основе указанного пятого хранящегося набора (D5) цифровых данных для моделирования;
обработка указанной информации (13) о выборе, и/или задании, и/или настройках скрининговой и/или оптимизационной модели для разработки скрининговой и/или оптимизационной модели (М3) на основе указанного пятого хранящегося набора (D5) цифровых данных для моделирования, и/или на основе указанного третьего хранящегося набора (D3) цифровых данных для моделирования, и/или на основе указанного четвертого хранящегося набора (D4) цифровых данных для моделирования; причем скрининговая и/или оптимизационная модель (М3) содержит поисковые алгоритмы и/или алгоритмы на основе искусственного интеллекта, позволяющие выявлять и связывать функциональные, и/или структурные, и/или динамические характеристики химических соединений, и/или биологических соединений, и/или лекарственных средств, и/или биологических мишеней, и/или заболеваний, которые имеют отношение к разработке по меньшей мере одного лекарственного средства;
обработка указанной информации (I) о выборе и/или настройках, вводимой пользователем, для получения вводимых данных (Din) о настройках для одного или нескольких программных продуктов (S5) для компьютерного моделирования и/или имитации, прилагаемых к компьютерной платформе (1);
выполнение компьютерного моделирования и имитации с помощью одного или нескольких программных продуктов (S5) для компьютерного моделирования и/или имитации на основе указанных вводимых данных (Din) о настройках, на основе указанной модели (M1) фармакометрических и/или физиологических особенностей, на основе указанной модели (М2) химической, и/или фармакологической, и/или биологической системы и на основе указанной скрининговой и/или оптимизационной модели (М3) с получением выводимых данных (Dout) компьютерного моделирования и/или имитации;
обработка выводимых данных (Dout) компьютерного моделирования и/или имитации на основе указанной информации (16) о выборе и настройках одного или нескольких выводимых параметров моделирования и/или имитации для предоставления отчетности об искомых результатах (R) имитации в выбранном пользователем формате; причем результаты (R) имитации содержат информацию, позволяющую выявить, и/или охарактеризовать, и/или связать функциональные, и/или структурные, и/или динамические характеристики химических соединений, и/или биологических соединений, и/или лекарственных средств, и/или биологических мишеней, и/или заболеваний, которые имеют отношение к разработке по меньшей мере одного лекарственного средства;
предоставление искомых результатов моделирования и/или имитации посредством пользовательского интерфейса (4).
14. Система (10) по п. 13, причем указанные один или несколько программных продуктов или приложений (S1-S7) компьютерной платформы (1) содержат:
один или несколько программных продуктов (S4) по управлению с помощью пользовательского интерфейса;
один или несколько программных продуктов (S5) для компьютерного моделирования и/или имитации, которые способны осуществлять компьютерное моделирование и/или имитацию при выполнении компьютером;
один или несколько программных продуктов (S1, S2, S3, S4, S6) для обработки, которые способны осуществлять указанные стадии обработки информации (II) о выборе, и/или задании, и/или настройках модели фармакометрических и/или физиологических особенностей, обработки информации (12) о выборе, и/или задании, и/или настройках химической, и/или фармакологической, и/или биологической модели, обработки информации (13) о выборе, и/или задании, и/или настройках скрининговой и/или оптимизационной модели, обработки информации (I) о выборе и/или настройках, вводимых пользователем, для получения вводимых данных (Din) о настройках для программных продуктов для компьютерного моделирования и/или имитации, и обработки выводимых данных (Dout) компьютерного моделирования и/или имитации для предоставления отчетности об искомых результатах (R) моделирования и/или имитации в выбранном пользователем формате.
15. Система по п. 14, причем компьютерная платформа (1) дополнительно содержит программный продукт (S7) по типу PIDO (Process Integration and Design Optimization - интеграция процессов и оптимизация проектирования), который способен управлять поточным процессом программных продуктов, прилагаемых к компьютерной платформе (1), и оптимизировать компьютерные имитации.
16. Система по любому из пп. 13-15, реализованная посредством распределенной платформы облачных вычислений.
RU2020135474A 2018-03-28 2019-03-26 Способ и система для компьютерного моделирования и имитации, применяемые для определения характеристик и/или оптимизации лекарственных средств RU2020135474A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
IT201800004045A IT201800004045A1 (it) 2018-03-28 2018-03-28 Metodo e sistema per modellizzazione e simulazione computazionale applicata a ricerca e sviluppo di farmaci
IT102018000004045 2018-03-28
PCT/IB2019/052450 WO2019186398A1 (en) 2018-03-28 2019-03-26 Method and system for computational modelling and simulation applied to drug characterization and/or optimization

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2020135474A true RU2020135474A (ru) 2022-04-28

Family

ID=62751317

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020135474A RU2020135474A (ru) 2018-03-28 2019-03-26 Способ и система для компьютерного моделирования и имитации, применяемые для определения характеристик и/или оптимизации лекарственных средств

Country Status (11)

Country Link
US (1) US20210027865A1 (ru)
EP (1) EP3776590A1 (ru)
JP (2) JP2021519485A (ru)
KR (1) KR20210010854A (ru)
AU (1) AU2019244695A1 (ru)
BR (1) BR112020019853A2 (ru)
CA (1) CA3094922A1 (ru)
IL (1) IL277595A (ru)
IT (1) IT201800004045A1 (ru)
RU (1) RU2020135474A (ru)
WO (1) WO2019186398A1 (ru)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2023136354A1 (ja) * 2022-01-17 2023-07-20 株式会社エイゾス 統計データ取得装置、寄与度演算装置、治療行為探索装置、治療対象探索装置、統計データ取得プログラム、寄与度演算プログラム、治療行為探索プログラム、及び、治療対象探索プログラム

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20050060305A1 (en) * 2003-09-16 2005-03-17 Pfizer Inc. System and method for the computer-assisted identification of drugs and indications
JP2019512758A (ja) * 2016-01-15 2019-05-16 株式会社Preferred Networks マルチモーダル生成機械学習のためのシステムおよび方法

Also Published As

Publication number Publication date
IT201800004045A1 (it) 2019-09-28
KR20210010854A (ko) 2021-01-28
IL277595A (en) 2020-11-30
JP2021519485A (ja) 2021-08-10
JP2024023697A (ja) 2024-02-21
EP3776590A1 (en) 2021-02-17
BR112020019853A2 (pt) 2021-01-05
AU2019244695A1 (en) 2020-11-19
US20210027865A1 (en) 2021-01-28
WO2019186398A1 (en) 2019-10-03
CA3094922A1 (en) 2019-10-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN105993016B (zh) 用于为具有特定疾病的个体规划医疗的计算机化系统
US5657255A (en) Hierarchical biological modelling system and method
US8793144B2 (en) Treatment effect prediction system, a treatment effect prediction method, and a computer program product thereof
Gris et al. Supervised and unsupervised learning technology in the study of rodent behavior
US20150142465A1 (en) Pathway recognition algorithm using data integration on genomic models (paradigm)
Gomez-Cabrero et al. Workflow for generating competing hypothesis from models with parameter uncertainty
Assmus et al. Dynamics of biological systems: role of systems biology in medical research
Crawford et al. Sex, lies and self-reported counts: Bayesian mixture models for heaping in longitudinal count data via birth-death processes
WO2006065950A2 (en) Modeling biological effects of molecules using molecular property models
RU2020135481A (ru) Способ и система для компьютерного моделирования и имитации функционирования и/или динамических характеристик медицинских устройств, которые можно имплантировать пациентам или применять на пациентах
WO2020187987A1 (en) Population-level gaussian processes for clinical time series forecasting
JP2024023697A (ja) 薬物の特性化及び/又は最適化に適用される計算モデル化及びシミュレーションのための方法及びシステム
Colliot Machine Learning for Brain Disorders
Pyka et al. Parametric anatomical modeling: a method for modeling the anatomical layout of neurons and their projections
CN116246697B (zh) 用于药物的靶点蛋白质预测方法及装置、设备、存储介质
Agapito et al. Parallel and cloud-based analysis of omics data: Modelling and simulation in medicine
WO2023084472A2 (en) Method, software, database, and system for the most efficient phenotypic drug discovery using predictive and generative artificial intelligence
Peters et al. Effects of episodic future thinking on temporal discounting: a re-analysis of six data sets using hierarchical Bayesian parameter estimation and compilation of effect sizes
JP2021144615A (ja) 情報処理方法、情報処理プログラム及び情報処理装置
Karatzas et al. An approach for predicting the effects of endocrine disrupting chemicals on human health using deep learning
Singh et al. Systems Biology:“Cherry Picking” in a Treasure Trove
Munoz et al. Automatically Navigating Protein Interaction Networks with a Software Product Line Approach
Meng Inference approaches of genetic regulatory networks
CN114974597A (zh) 一种体格检查模拟方法、系统、智能设备及存储介质
Kapçiu et al. IT-Enabled WGCNA for Critical Gene Module Mapping and Therapy Optimization: Advancing Leukemia Care