RU2019109949A - Библиотеки только-hc-cdr3 с уменьшенной комбинаторной избыточностью и оптимизированным распределением длины петли - Google Patents
Библиотеки только-hc-cdr3 с уменьшенной комбинаторной избыточностью и оптимизированным распределением длины петли Download PDFInfo
- Publication number
- RU2019109949A RU2019109949A RU2019109949A RU2019109949A RU2019109949A RU 2019109949 A RU2019109949 A RU 2019109949A RU 2019109949 A RU2019109949 A RU 2019109949A RU 2019109949 A RU2019109949 A RU 2019109949A RU 2019109949 A RU2019109949 A RU 2019109949A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- kabat
- antibody
- library
- seq
- variable domain
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/005—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies constructed by phage libraries
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/46—Hybrid immunoglobulins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1037—Screening libraries presented on the surface of microorganisms, e.g. phage display, E. coli display
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1082—Preparation or screening gene libraries by chromosomal integration of polynucleotide sequences, HR-, site-specific-recombination, transposons, viral vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/02—Libraries contained in or displayed by microorganisms, e.g. bacteria or animal cells; Libraries contained in or displayed by vectors, e.g. plasmids; Libraries containing only microorganisms or vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
- C40B40/06—Libraries containing nucleotides or polynucleotides, or derivatives thereof
- C40B40/08—Libraries containing RNA or DNA which encodes proteins, e.g. gene libraries
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
- C40B40/10—Libraries containing peptides or polypeptides, or derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/52—Constant or Fc region; Isotype
- C07K2317/526—CH3 domain
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
- C07K2317/565—Complementarity determining region [CDR]
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Virology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Claims (21)
1. Библиотека векторов с общей сложностью C=1,3×1010, которая экспрессируетчленыразнообразного семейства родственных антителу пептидов, полипептидов или белков, и которая экспрессирует по меньшей мере часть разнообразия указанного семейства родственных антителу пептидов, полипептидов или белков, где указанные векторы содержат разнообразные последовательности ДНК, кодирующие область HC-CDR3, и положение, предшествующее области HC-CDR3, где указанные последовательности имеют следующую формулу:
ZX1YnX3X4X5,
где:
Z соответствует положению 94 по Kabat;
X1 соответствует положению 95 по Kabat;
n представляет собой целое число от 3 до 11;
Y соответствует положениям 96-98 HC по Kabat (n=3) или положениям 96-99 HC по Kabat (n=4), или положениям HC 96-100 по Kabat (n=5), или положениям 96-100a HC по Kabat (n=6), или положениям 96-100b HC по Kabat (n=7), или положениям 96-100c HC по Kabat (n=8), или положениям 96-100d HC по Kabat (n=9), или положениям 96-100e HC по Kabat (n=10), или положениям 96-100f HC по Kabat (n=11);
X3 соответствует положению 99 HC по Kabat (n=3) или положению 100 HC по Kabat (n=4), или положению 100a HC по Kabat (n=5), или положению 100b HC по Kabat (n=6), или положению 100c HC по Kabat (n=7), или положению 100d HC по Kabat (n=8), или положению 100e HC по Kabat (n=9), или положению 100f HC по Kabat (n=10), или положению 100g HC по Kabat (n=11);
X4 соответствует положению HC по Kabat 101;
X5 соответствует положению HC по Kabat 102,
отличающаяся тем, что процентная доля p(L) каждой области HC-CDR3 длиной (L=n+4) в библиотеке соответствует значениям, приведенным в таблице 2C;
и положения Z, X1, X3, X4, X5 и Yn (n=3-11) для каждой области HC-CDR3 длиной L=n+4 заняты аминокислотами, перечисленными в таблицах 3A-3I, в соответствии с относительной частотой, как описанно в таблицах 3A-3I.
2. Библиотека векторов по п.1, где родственные антителу пептиды, полипептиды или белки представляют собой антитела или их фрагменты, выбранные из антитела, содержащего один или несколько константных доменов, одноцепочечного антитела, фрагмента FAB, антитела только с тяжелой цепью или только вариабельного домена тяжелой цепи.
3. Библиотека векторов по любому из предшествующих пунктов, где родственные антителу пептиды, полипептиды или белки содержат зародышевые вариабельные фрагменты человеческого антитела.
4. Библиотека векторов по любому из предшествующих пунктов, где родственные антителу пептиды, полипептиды или белки содержат вариабельный домен VK1 легкой цепи антитела человека, содержащий человеческие зародышевые последовательности, и вариабельный домен VH3 тяжелой цепи антитела человека, содержащий человеческие зародышевые последовательности
5. Библиотека векторов по п.4, где вариабельный домен VK1 легкой цепи каппа содержит человеческие зародышевые последовательности SEQ ID N. 3 и SEQ ID N. 4, область CDR3 легкой цепи содержит последовательность SEQ ID N. 5, и вариабельный домен VH3 тяжелой цепи содержит человеческие зародышевые последовательности SEQ ID N.1 и SEQ ID N. 2.
6. Библиотека векторов по п.4, отличающаяся тем, что вариабельный домен VH3 тяжелой цепи, содержащий человеческие зародышевые последовательности, соединен с вариабельным доменом VK1 легкой цепи каппа антитела человека, содержащим человеческие зародышевые последовательности, с использованием линкера из SEQ ID N. 6.
7. Библиотека векторов по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что основной вектор, используемый для получения указанной библиотеки, имеет SEQ ID 8.
8. Библиотека векторов по любому из предшествующих пунктов для отбора против антигенов-мишеней.
9. Библиотека векторов по п.8, отличающаяся тем, что указанная библиотека экспонирована на фаге для отбора против антигенов-мишеней.
10. Библиотека векторов по любому из пп. 1-9, отличающаяся тем, что указанная библиотека имеет разнообразие, ограниченное областью HC-CDR3 и положением, предшествующим HC-CDR3.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP16187884.8 | 2016-09-08 | ||
| EP16187884.8A EP3293293A1 (en) | 2016-09-08 | 2016-09-08 | Hc-cdr3-only libraries with reduced combinatorial redundancy and optimized loop length distribution |
| PCT/EP2017/072315 WO2018046525A1 (en) | 2016-09-08 | 2017-09-06 | Hc-cdr3-only libraries with reduced combinatorial redundancy and optimized loop length distribution |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2019109949A true RU2019109949A (ru) | 2020-10-09 |
| RU2019109949A3 RU2019109949A3 (ru) | 2021-01-21 |
| RU2745452C2 RU2745452C2 (ru) | 2021-03-25 |
Family
ID=56889022
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2019109949A RU2745452C2 (ru) | 2016-09-08 | 2017-09-06 | Библиотеки только-hc-cdr3 с уменьшенной комбинаторной избыточностью и оптимизированным распределением длины петли |
Country Status (19)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US10745696B2 (ru) |
| EP (2) | EP3293293A1 (ru) |
| JP (1) | JP6974909B2 (ru) |
| KR (1) | KR102281476B1 (ru) |
| CN (1) | CN109689947B (ru) |
| AU (1) | AU2017323432C1 (ru) |
| CA (1) | CA3035435A1 (ru) |
| DK (1) | DK3510187T5 (ru) |
| ES (1) | ES2966283T3 (ru) |
| FI (1) | FI3510187T3 (ru) |
| HR (1) | HRP20231434T1 (ru) |
| HU (1) | HUE063973T2 (ru) |
| IL (1) | IL265146B (ru) |
| LT (1) | LT3510187T (ru) |
| PL (1) | PL3510187T3 (ru) |
| PT (1) | PT3510187T (ru) |
| RU (1) | RU2745452C2 (ru) |
| SI (1) | SI3510187T1 (ru) |
| WO (1) | WO2018046525A1 (ru) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN109160948B (zh) * | 2018-09-21 | 2021-07-16 | 成都阿帕克生物科技有限公司 | 一种乙肝表面抗原纳米抗体及核酸分子和应用 |
Family Cites Families (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ES2360479T3 (es) | 2000-12-18 | 2011-06-06 | Dyax Corp. | Bibliotecas focalizadas de paquetes genéticos. |
| JP2007501011A (ja) * | 2003-08-01 | 2007-01-25 | ジェネンテック・インコーポレーテッド | 制限多様性配列を有する結合型ポリペプチド |
| CA2572961C (en) * | 2004-07-06 | 2016-08-16 | Bioren, Inc. | Universal antibody libraries |
| US7226460B2 (en) | 2004-08-02 | 2007-06-05 | Karl Storz Endovision, Inc. | Surgical instrument attachment system |
| NZ569359A (en) | 2005-12-20 | 2011-11-25 | Morphosys Ag | Novel collection of HCDR3 regions and uses therefor |
| AU2007303572A1 (en) * | 2006-10-02 | 2008-04-10 | Sea Lane Biotechnologies, Llc | Design and construction of diverse synthetic peptide and polypeptide libraries |
| MX344415B (es) * | 2007-09-14 | 2016-12-15 | Adimab Inc | Bancos de anticuerpos sinteticos, designados racionalmente y usos para los mismos. |
| US9873957B2 (en) * | 2008-03-13 | 2018-01-23 | Dyax Corp. | Libraries of genetic packages comprising novel HC CDR3 designs |
| WO2009132287A2 (en) * | 2008-04-24 | 2009-10-29 | Dyax Corp. | Libraries of genetic packages comprising novel hc cdr1, cdr2, and cdr3 and novel lc cdr1, cdr2, and cdr3 designs |
| CA2729749A1 (en) * | 2008-07-02 | 2010-01-07 | Emergent Product Development Seattle, Llc | Tnf-a antagonist multi-target binding proteins |
| US20110082054A1 (en) * | 2009-09-14 | 2011-04-07 | Dyax Corp. | Libraries of genetic packages comprising novel hc cdr3 designs |
| WO2016114567A1 (ko) * | 2015-01-13 | 2016-07-21 | 이화여자대학교 산학협력단 | 신규 항체 라이브러리 제조방법 및 이로부터 제조된 라이브러리 |
-
2016
- 2016-09-08 EP EP16187884.8A patent/EP3293293A1/en not_active Withdrawn
-
2017
- 2017-09-06 CN CN201780054632.8A patent/CN109689947B/zh active Active
- 2017-09-06 ES ES17765146T patent/ES2966283T3/es active Active
- 2017-09-06 PL PL17765146.0T patent/PL3510187T3/pl unknown
- 2017-09-06 PT PT177651460T patent/PT3510187T/pt unknown
- 2017-09-06 AU AU2017323432A patent/AU2017323432C1/en active Active
- 2017-09-06 SI SI201731436T patent/SI3510187T1/sl unknown
- 2017-09-06 DK DK17765146.0T patent/DK3510187T5/da active
- 2017-09-06 HR HRP20231434TT patent/HRP20231434T1/hr unknown
- 2017-09-06 JP JP2019513413A patent/JP6974909B2/ja active Active
- 2017-09-06 WO PCT/EP2017/072315 patent/WO2018046525A1/en active Search and Examination
- 2017-09-06 LT LTEPPCT/EP2017/072315T patent/LT3510187T/lt unknown
- 2017-09-06 FI FIEP17765146.0T patent/FI3510187T3/fi active
- 2017-09-06 EP EP17765146.0A patent/EP3510187B1/en active Active
- 2017-09-06 HU HUE17765146A patent/HUE063973T2/hu unknown
- 2017-09-06 RU RU2019109949A patent/RU2745452C2/ru active
- 2017-09-06 KR KR1020197008894A patent/KR102281476B1/ko active IP Right Grant
- 2017-09-06 CA CA3035435A patent/CA3035435A1/en not_active Abandoned
-
2019
- 2019-02-14 US US16/276,557 patent/US10745696B2/en active Active
- 2019-03-03 IL IL265146A patent/IL265146B/en active IP Right Grant
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| DK3510187T3 (da) | 2023-11-20 |
| EP3293293A1 (en) | 2018-03-14 |
| EP3510187B1 (en) | 2023-09-06 |
| KR20190044650A (ko) | 2019-04-30 |
| CN109689947A (zh) | 2019-04-26 |
| ES2966283T3 (es) | 2024-04-19 |
| JP6974909B2 (ja) | 2021-12-01 |
| AU2017323432C1 (en) | 2022-05-19 |
| AU2017323432B2 (en) | 2020-08-13 |
| AU2017323432A1 (en) | 2019-03-21 |
| EP3510187A1 (en) | 2019-07-17 |
| RU2745452C2 (ru) | 2021-03-25 |
| US20190211326A1 (en) | 2019-07-11 |
| HRP20231434T1 (hr) | 2024-03-01 |
| KR102281476B1 (ko) | 2021-07-28 |
| PT3510187T (pt) | 2023-11-03 |
| HUE063973T2 (hu) | 2024-02-28 |
| CA3035435A1 (en) | 2018-03-15 |
| LT3510187T (lt) | 2023-11-10 |
| SI3510187T1 (sl) | 2023-12-29 |
| WO2018046525A1 (en) | 2018-03-15 |
| JP2019528712A (ja) | 2019-10-17 |
| IL265146B (en) | 2020-09-30 |
| US10745696B2 (en) | 2020-08-18 |
| RU2019109949A3 (ru) | 2021-01-21 |
| FI3510187T3 (fi) | 2023-10-31 |
| DK3510187T5 (da) | 2024-09-02 |
| PL3510187T3 (pl) | 2024-01-22 |
| CN109689947B (zh) | 2022-06-21 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EA201892312A1 (ru) | Триспецифические и/или тривалентные связывающие белки | |
| MX2019012793A (es) | Agentes anticuerpos dirigidos contra el gen de activación de linfocitos-3 (lag-3) y usos de los mismos. | |
| GB2581620A (en) | GPCR binding proteins and synthesis thereof | |
| MX2022000112A (es) | Anticuerpos dirigidos contra gen 3 de activacion de linfocito (lag-3). | |
| CN103562223A (zh) | 抗c-Met抗体 | |
| RU2018133708A (ru) | Антитела, обладающие специфичностью к btla, и их использование | |
| JP2019520063A5 (ru) | ||
| Feige et al. | Principles and engineering of antibody folding and assembly | |
| RU2019111277A (ru) | Новые моноклональные антитела к белку программируемой смерти 1(pd-1) | |
| JP2019534277A5 (ru) | ||
| JP2016536322A5 (ru) | ||
| JP2017527274A5 (ru) | ||
| SA520411577B1 (ar) | أجسام مضادة ضد cd3 إبسيلون جديدة | |
| PH12021550662A1 (en) | Antigen-binding molecules capable of binding cd3 and cd137 but not simultaneously | |
| HRP20030805B1 (en) | Ganglioside-associated recombinant antibodies and the use thereof in the diagnosis and treatment of tumours | |
| EA201290568A1 (ru) | Связывающие гетеродимер протеины и их применение | |
| KR20210097829A (ko) | 신규한 항체 기본구조 | |
| FI3402821T3 (fi) | PSMA-sitova vasta-aine ja sen käyttöjä | |
| RU2019109949A (ru) | Библиотеки только-hc-cdr3 с уменьшенной комбинаторной избыточностью и оптимизированным распределением длины петли | |
| WO2016191675A2 (en) | Antibodies against glypican-3 and their uses in cancer diagnosis and treatment | |
| JP2016529213A5 (ru) | ||
| RU2017122172A (ru) | Антитела к IL-17C | |
| MX2021015763A (es) | Polipeptidos. | |
| JP2016536988A5 (ru) | ||
| AR124084A1 (es) | ANTICUERPOS DE CADENA PESADA QUE SE UNEN AL RECEPTOR a DE FOLATO |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| HC9A | Changing information about inventors |