RU2018139463A - Последовательная загрузка множества векторов для доставки с использованием одного селективного маркера - Google Patents

Последовательная загрузка множества векторов для доставки с использованием одного селективного маркера Download PDF

Info

Publication number
RU2018139463A
RU2018139463A RU2018139463A RU2018139463A RU2018139463A RU 2018139463 A RU2018139463 A RU 2018139463A RU 2018139463 A RU2018139463 A RU 2018139463A RU 2018139463 A RU2018139463 A RU 2018139463A RU 2018139463 A RU2018139463 A RU 2018139463A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
autonomously replicating
recombination system
drug resistance
interest
Prior art date
Application number
RU2018139463A
Other languages
English (en)
Inventor
Эдвард ПЕРКИНЗ
Эми ГРИН
Original Assignee
СИНПЛОЙД БАЙОТЕК, ЭлЭлСи
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by СИНПЛОЙД БАЙОТЕК, ЭлЭлСи filed Critical СИНПЛОЙД БАЙОТЕК, ЭлЭлСи
Publication of RU2018139463A publication Critical patent/RU2018139463A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/66General methods for inserting a gene into a vector to form a recombinant vector using cleavage and ligation; Use of non-functional linkers or adaptors, e.g. linkers containing the sequence for a restriction endonuclease
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/64General methods for preparing the vector, for introducing it into the cell or for selecting the vector-containing host
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/65Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression using markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602Vertebrate cells
    • C12N5/0693Tumour cells; Cancer cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2510/00Genetically modified cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00Nucleic acids vectors
    • C12N2800/10Plasmid DNA
    • C12N2800/106Plasmid DNA for vertebrates
    • C12N2800/107Plasmid DNA for vertebrates for mammalian

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (35)

1. Способ последовательной загрузки множества векторов для доставки в автономно реплицирующуюся нуклеиновую кислоту в клетке с использованием одного селективного маркера, включающий:
интеграцию первого вектора для доставки, содержащего маркерный ген и ген устойчивости к лекарственному средству, и первую представляющую интерес нуклеиновую кислоту, в автономно реплицирующуюся нуклеиновую кислоту с использованием первой системы рекомбинации;
вырезание маркерного гена и гена устойчивости к лекарственному средству из автономно реплицирующейся нуклеиновой кислоты с использованием второй системы рекомбинации с сигнальными участками альфа, где первая представляющая интерес нуклеиновая кислота остается в автономно реплицирующейся нуклеиновой кислоте;
интеграцию второго вектора для доставки, содержащего маркерный ген и ген устойчивости к лекарственному средству, и вторую представляющую интерес нуклеиновую кислоту, в автономно реплицирующуюся нуклеиновую кислоту с использованием первой системы рекомбинации; и
вырезание маркерного гена и гена устойчивости к лекарственному средству из автономно реплицирующейся нуклеиновой кислоты с использованием второй системы рекомбинации с сигнальными участками бета, где вторая представляющая интерес нуклеиновая кислота остается в автономно реплицирующейся нуклеиновой кислоте.
2. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадии
интеграции третьего вектора для доставки, содержащего маркерный ген и ген устойчивости к лекарственному средству, и третью представляющую интерес нуклеиновую кислоту, в автономно реплицирующуюся нуклеиновую кислоту с использованием первой системы рекомбинации; и
вырезания маркерного гена и гена устойчивости к лекарственному средству из автономно реплицирующейся нуклеиновой кислоты с использованием второй системы рекомбинации с сигнальными участками гамма, где третья представляющая интерес нуклеиновая кислота остается в автономно реплицирующейся нуклеиновой кислоте.
3. Способ по п. 1, где автономно реплицирующаяся нуклеиновая кислота представляет собой эндогенную хромосому.
4. Способ по п. 1, где автономно реплицирующаяся нуклеиновая кислота представляет собой синтетическую хромосому.
5. Способ по п. 4, где синтетическая хромосома представляет собой синтетическую хромосому млекопитающего.
6. Способ по п. 5, где синтетическая хромосома представляет собой синтетическую хромосому человека.
7. Способ по п. 1, где первая система рекомбинации представляет собой систему интегразы лямбда.
8. Способ по п. 1, где вторая система рекомбинации представляет собой систему рекомбинации Cre/lox.
9. Способ по п. 1, где сигнальные участки альфа и сигнальные участки бета выбраны из Lox2272, Lox5171, LoxM2 и LoxP, но сигнальные участки альфа и сигнальные участки бета не являются одинаковыми.
10. Способ по п. 1, где маркерный ген представляет собой ген флуоресцентного белка.
11. Способ последовательной загрузки множества векторов для доставки в автономно реплицирующуюся синтетическую хромосому в клетке с использованием одного селективного маркера, включающий:
интеграцию первого вектора для доставки, содержащего маркерный ген и ген устойчивости к лекарственному средству, и первую представляющую интерес нуклеиновую кислоту, в автономно реплицирующуюся синтетическую хромосому с использованием первой системы рекомбинации;
вырезание маркерного гена и гена устойчивости к лекарственному средству из автономно реплицирующейся синтетической хромосомы с использованием второй системы рекомбинации с сигнальными участками альфа, где первая представляющая интерес нуклеиновая кислота остается в автономно реплицирующейся синтетической хромосоме;
интеграцию второго вектора для доставки, содержащего маркерный ген и ген устойчивости к лекарственному средству, и вторую представляющую интерес нуклеиновую кислоту, в автономно реплицирующуюся синтетическую хромосому с использованием первой системы рекомбинации;
вырезание маркерного гена и гена устойчивости к лекарственному средству из автономно реплицирующейся синтетической хромосомы с использованием второй системы рекомбинации с сигнальными участками бета, где вторая представляющая интерес нуклеиновая кислота остается в автономно реплицирующейся синтетической хромосоме;
интеграцию третьего вектора для доставки, содержащего маркерный ген и ген устойчивости к лекарственному средству, и третью представляющую интерес нуклеиновую кислоту, в автономно реплицирующуюся синтетическую хромосому с использованием первой системы рекомбинации; и
вырезание маркерного гена и гена устойчивости к лекарственному средству из автономно реплицирующейся синтетической хромосомы с использованием второй системы рекомбинации с сигнальными участками гамма, где третья представляющая интерес нуклеиновая кислота остается в автономно реплицирующейся синтетической хромосоме.
12. Способ по п. 11, где синтетическая хромосома представляет собой синтетическую хромосому человека.
13. Способ по п. 11, где первая система рекомбинации представляет собой систему интегразы лямбда.
14. Способ по п. 11, где вторая система рекомбинации представляет собой систему рекомбинации Cre/lox.
15. Способ по п. 11, где сигнальные участки альфа, сигнальные участки бета и сигнальные участки гамма выбраны из Lox2272, Lox5171, LoxM2 и LoxP, но никакие из сигнальных участков альфа, бета и гамма не являются одинаковыми.
16. Синтетическая хромосома, содержащая первую, вторую и третью представляющую интерес нуклеиновую кислоту, полученная способом по п. 11.
17. Способ по п. 11, где стадии вырезания осуществляют посредством введения нуклеиновой кислоты вектора, кодирующего вторую рекомбиназу, в клетку, введения второй рекомбиназы в клетку или посредством доставки инкапсулированной второй рекомбиназы в клетку.
18. Способ по п. 17, где стадии вырезания осуществляют посредством введения нуклеиновой кислоты вектора, кодирующего вторую рекомбиназу, в клетку.
19. Способ по п. 11, дополнительно включающий определение того, вырезаны ли маркерный ген и ген устойчивости к лекарственному средству из автономно реплицирующейся синтетической хромосомы посредством сортировки клеток FACS после стадии вырезания.
20. Способ по п. 11, дополнительно включающий стадии
интеграции четвертого вектора для доставки, содержащего маркерный ген и ген устойчивости к лекарственному средству, и четвертую представляющую интерес нуклеиновую кислоту, в автономно реплицирующуюся синтетическую хромосому с использованием первой системы рекомбинации; и
вырезания маркерного гена и гена устойчивости к лекарственному средству из автономно реплицирующейся синтетической хромосомы с использованием второй системы рекомбинации с сигнальными участками дельта, где четвертая представляющая интерес нуклеиновая кислота остается в автономно реплицирующейся нуклеиновой кислоте.
21. Клетка, содержащая синтетическую хромосому по п. 16.
RU2018139463A 2016-04-12 2017-04-12 Последовательная загрузка множества векторов для доставки с использованием одного селективного маркера RU2018139463A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662321711P 2016-04-12 2016-04-12
US62/321,711 2016-04-12
PCT/US2017/027102 WO2017180684A2 (en) 2016-04-12 2017-04-12 Sequential loadings of multiple delivery vectors using a single selectable marker

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2018139463A true RU2018139463A (ru) 2020-05-13

Family

ID=60041956

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018139463A RU2018139463A (ru) 2016-04-12 2017-04-12 Последовательная загрузка множества векторов для доставки с использованием одного селективного маркера

Country Status (8)

Country Link
US (1) US11898148B2 (ru)
EP (1) EP3443083B1 (ru)
JP (1) JP2019513397A (ru)
CN (2) CN117568371A (ru)
AU (1) AU2017250178B2 (ru)
CA (1) CA3020965A1 (ru)
RU (1) RU2018139463A (ru)
WO (1) WO2017180684A2 (ru)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106947775A (zh) * 2017-03-20 2017-07-14 百联微光(北京)科技有限公司 一种在体实时长时间连续记录基因转录活性的方法和装置
CA3228697A1 (en) 2021-08-30 2023-03-09 Edward L. Perkins Synthetic chromosome encoding two or more chimeric antigen receptors binding to tumor associated antigens

Family Cites Families (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6025155A (en) 1996-04-10 2000-02-15 Chromos Molecular Systems, Inc. Artificial chromosomes, uses thereof and methods for preparing artificial chromosomes
US20030033617A1 (en) 1996-04-10 2003-02-13 Gyula Hadlaczky Artificial chromosomes, uses thereof and methods for preparing artificial chromosomes
US7585622B1 (en) 1996-10-01 2009-09-08 Geron Corporation Increasing the proliferative capacity of cells using telomerase reverse transcriptase
GB9821193D0 (en) 1998-09-30 1998-11-25 Medical Res Council Mammalian artificial chromosomes and uses thereof
EP2390256A1 (en) 2001-05-30 2011-11-30 Agrisoma, Inc. Plant artificial chromosomes, uses thereof and methods of preparing plant artificial chromosomes
NZ545697A (en) 2001-05-30 2008-06-30 Glaxo Group Ltd A lambda-intR mutein comprising a glutamic acid to arginine change at position 174 of Wt lambda-intR
CN1863915B (zh) * 2002-03-29 2011-02-02 辛根塔参与股份公司 植物中λ整合酶介导的重组
CA2501708C (en) 2002-09-03 2012-01-03 Japan Science And Technology Agency Mammalian artificial chromosome
CN1717483A (zh) 2002-10-04 2006-01-04 麒麟麦酒株式会社 人类人工染色体(hac)载体
US7267984B2 (en) * 2002-10-31 2007-09-11 Rice University Recombination assembly of large DNA fragments
US20060174364A1 (en) * 2004-03-01 2006-08-03 Avigenics, Inc. Artificial chromosomes and transchromosomic avians
CA2705841C (en) 2007-11-14 2015-01-27 National University Corporation Tottori University Mammalian artificial chromosome vector comprising human cytochrome p450 gene (cluster) and non-human mammalian animal retaining the same
WO2010042490A1 (en) * 2008-10-06 2010-04-15 Boston Medical Center Corporation A single lentiviral vector system for induced pluripotent (ips) stem cells derivation
WO2011083870A1 (ja) 2010-01-06 2011-07-14 国立大学法人鳥取大学 マウス人工染色体ベクター
HU230368B1 (hu) 2012-11-16 2016-03-29 Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutatóközpont Új módszer az emlős mesterséges kromoszóma több génnel való feltöltésére
EP3256582A4 (en) 2015-02-09 2018-06-20 Edward Perkins Compositions and methods for monitoring in real-time construction and bioengineering of mammalian synthetic chromosomes

Also Published As

Publication number Publication date
AU2017250178A1 (en) 2018-11-22
WO2017180684A2 (en) 2017-10-19
AU2017250178B2 (en) 2021-04-15
CN109415717B (zh) 2023-02-28
EP3443083A4 (en) 2019-11-20
CN109415717A (zh) 2019-03-01
CA3020965A1 (en) 2017-10-19
US20200157553A1 (en) 2020-05-21
US11898148B2 (en) 2024-02-13
EP3443083A2 (en) 2019-02-20
JP2019513397A (ja) 2019-05-30
EP3443083B1 (en) 2023-12-13
CN117568371A (zh) 2024-02-20
WO2017180684A3 (en) 2017-11-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Li et al. Single-cell analysis of neonatal HSC ontogeny reveals gradual and uncoordinated transcriptional reprogramming that begins before birth
Sack et al. Profound tissue specificity in proliferation control underlies cancer drivers and aneuploidy patterns
Yan et al. A hormone that lost its receptor: anti-Müllerian hormone (AMH) in zebrafish gonad development and sex determination
Varuzhanyan et al. Mitochondrial fusion is required for spermatogonial differentiation and meiosis
Jurkin et al. The mammalian tRNA ligase complex mediates splicing of XBP1 mRNA and controls antibody secretion in plasma cells
Modzelewski et al. A mouse-specific retrotransposon drives a conserved Cdk2ap1 isoform essential for development
Jiang et al. Independent stem cell lineages regulate adipose organogenesis and adipose homeostasis
Nekrasov et al. Interactions between centromere complexes in Saccharomyces cerevisiae
Tang et al. A nanobody-based system using fluorescent proteins as scaffolds for cell-specific gene manipulation
Tricoire et al. A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity
Song et al. The homeobox transcription factor RHOX10 drives mouse spermatogonial stem cell establishment
AR113772A1 (es) Biorreactor de perfusión y métodos de uso relacionados
MX2023009328A (es) Metodos para encapsular celulas individuales, las celulas encapsuladas y usos de las mismas.
Medina et al. Anion exchanger 2 is essential for spermiogenesis in mice
RU2018139463A (ru) Последовательная загрузка множества векторов для доставки с использованием одного селективного маркера
RU2018139464A (ru) Способы создания синтетических хромосом, экспрессирующих биосинтетические пути, и их применение
Yamamoto et al. Systemic silencing of PHD2 causes reversible immune regulatory dysfunction
AR109451A1 (es) Composiciones y métodos para preparar anticuerpos basados en el uso de loci mejoradores de expresión
Casola Mouse models for miRNA expression: the ROSA26 locus
Halley et al. Herd-switching and long-distance dispersal in female African buffalo Syncerus caffer.
Williams et al. Sirtuin 1 promotes deacetylation of Oct4 and maintenance of naive pluripotency
Gao et al. Depletion of m6A reader protein YTHDC1 induces dilated cardiomyopathy by abnormal splicing of Titin
Jorjani et al. Genomic evaluation of BSW populations, InterGenomics: Results and Deliverables
Sollberger et al. Linker histone H1. 2 and H1. 4 affect the neutrophil lineage determination
Claußen et al. Global analysis of asymmetric RNA enrichment in oocytes reveals low conservation between closely related Xenopus species

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20200413