RU2018118573A - Способы культивирования клеток и наборы и устройство для них - Google Patents
Способы культивирования клеток и наборы и устройство для них Download PDFInfo
- Publication number
- RU2018118573A RU2018118573A RU2018118573A RU2018118573A RU2018118573A RU 2018118573 A RU2018118573 A RU 2018118573A RU 2018118573 A RU2018118573 A RU 2018118573A RU 2018118573 A RU2018118573 A RU 2018118573A RU 2018118573 A RU2018118573 A RU 2018118573A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- binding
- reagent
- paragraphs
- stimulant
- cells
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims 131
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims 213
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims 107
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 101
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims 35
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 33
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims 28
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims 23
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 claims 20
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims 20
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims 18
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 claims 18
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 claims 18
- 230000005526 G1 to G0 transition Effects 0.000 claims 17
- 239000002269 analeptic agent Substances 0.000 claims 17
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 16
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 16
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 claims 15
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 claims 15
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 claims 12
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims 12
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims 11
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 11
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 claims 9
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims 8
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 claims 8
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 claims 8
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims 8
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims 8
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims 8
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 claims 8
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 claims 8
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 claims 7
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 claims 6
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 claims 6
- 108010028230 Trp-Ser- His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys Proteins 0.000 claims 6
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims 6
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 6
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 claims 5
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 claims 5
- 150000001615 biotins Chemical class 0.000 claims 5
- 230000006378 damage Effects 0.000 claims 5
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 5
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims 5
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims 5
- 108010018381 streptavidin-binding peptide Proteins 0.000 claims 5
- 102000008102 Ankyrins Human genes 0.000 claims 4
- 108010049777 Ankyrins Proteins 0.000 claims 4
- 102000000584 Calmodulin Human genes 0.000 claims 4
- 108010041952 Calmodulin Proteins 0.000 claims 4
- 102000019034 Chemokines Human genes 0.000 claims 4
- 108010012236 Chemokines Proteins 0.000 claims 4
- 101100347633 Drosophila melanogaster Mhc gene Proteins 0.000 claims 4
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 claims 4
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 claims 4
- 108050006654 Lipocalin Proteins 0.000 claims 4
- 102000019298 Lipocalin Human genes 0.000 claims 4
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 claims 4
- 239000012504 chromatography matrix Substances 0.000 claims 4
- 230000006870 function Effects 0.000 claims 4
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims 4
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 claims 4
- 108010020195 FLAG peptide Proteins 0.000 claims 3
- XZWYTXMRWQJBGX-VXBMVYAYSA-N FLAG peptide Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XZWYTXMRWQJBGX-VXBMVYAYSA-N 0.000 claims 3
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims 3
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims 3
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims 3
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims 3
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 claims 3
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims 3
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims 3
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims 3
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims 3
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 claims 3
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 claims 3
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 claims 3
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 101710175625 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein Proteins 0.000 claims 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 claims 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 claims 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 claims 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims 2
- DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol bis(2-aminoethyl)tetraacetic acid Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCOCCOCCN(CC(O)=O)CC(O)=O DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 claims 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 claims 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 claims 2
- 239000006249 magnetic particle Substances 0.000 claims 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 claims 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 claims 2
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 claims 2
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 claims 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 claims 2
- 230000033458 reproduction Effects 0.000 claims 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 claims 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 claims 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims 2
- 108010082808 4-1BB Ligand Proteins 0.000 claims 1
- 108091008875 B cell receptors Proteins 0.000 claims 1
- 108010029697 CD40 Ligand Proteins 0.000 claims 1
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 claims 1
- 102100032937 CD40 ligand Human genes 0.000 claims 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 claims 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 claims 1
- 102000009410 Chemokine receptor Human genes 0.000 claims 1
- 108050000299 Chemokine receptor Proteins 0.000 claims 1
- 235000000638 D-biotin Nutrition 0.000 claims 1
- 239000011665 D-biotin Substances 0.000 claims 1
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 claims 1
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 claims 1
- 108010068370 Glutens Proteins 0.000 claims 1
- 101000914514 Homo sapiens T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Proteins 0.000 claims 1
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 claims 1
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 claims 1
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 claims 1
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 claims 1
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 claims 1
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 claims 1
- 102100027213 T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Human genes 0.000 claims 1
- 108060008683 Tumor Necrosis Factor Receptor Proteins 0.000 claims 1
- 102100040247 Tumor necrosis factor Human genes 0.000 claims 1
- 102100032101 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9 Human genes 0.000 claims 1
- 101710165473 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Proteins 0.000 claims 1
- 102100022153 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Human genes 0.000 claims 1
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 claims 1
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 claims 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 claims 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 claims 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 claims 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 claims 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 claims 1
- 230000008859 change Effects 0.000 claims 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 claims 1
- 230000009920 chelation Effects 0.000 claims 1
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 claims 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 claims 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 claims 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 claims 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 claims 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims 1
- 230000000139 costimulatory effect Effects 0.000 claims 1
- 108010057085 cytokine receptors Proteins 0.000 claims 1
- 102000003675 cytokine receptors Human genes 0.000 claims 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 claims 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 claims 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 claims 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 claims 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 claims 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 claims 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 claims 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims 1
- 210000001806 memory b lymphocyte Anatomy 0.000 claims 1
- 210000003071 memory t lymphocyte Anatomy 0.000 claims 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 claims 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 claims 1
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 claims 1
- 229920000620 organic polymer Polymers 0.000 claims 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 claims 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 claims 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 claims 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 claims 1
- 210000003289 regulatory T cell Anatomy 0.000 claims 1
- 210000002707 regulatory b cell Anatomy 0.000 claims 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 claims 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 claims 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 claims 1
- 229910001428 transition metal ion Inorganic materials 0.000 claims 1
- 102000003298 tumor necrosis factor receptor Human genes 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
- C12N5/0602—Vertebrate cells
- C12N5/0634—Cells from the blood or the immune system
- C12N5/0636—T lymphocytes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/461—Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
- A61K39/4611—T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/463—Cellular immunotherapy characterised by recombinant expression
- A61K39/4631—Chimeric Antigen Receptors [CAR]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/464—Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
- A61K39/4643—Vertebrate antigens
- A61K39/4644—Cancer antigens
- A61K39/464402—Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- A61K39/464411—Immunoglobulin superfamily
- A61K39/464412—CD19 or B4
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/7051—T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/03—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a transmembrane segment
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/50—Cell markers; Cell surface determinants
- C12N2501/51—B7 molecules, e.g. CD80, CD86, CD28 (ligand), CD152 (ligand)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/50—Cell markers; Cell surface determinants
- C12N2501/515—CD3, T-cell receptor complex
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/50—Cell markers; Cell surface determinants
- C12N2501/599—Cell markers; Cell surface determinants with CD designations not provided for elsewhere
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/998—Proteins not provided for elsewhere
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Mycology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Oncology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (316)
1. Способ модулирования клеток, причем способ включает инкубацию композиции, содержащей клетки-мишени, в присутствии стимулирующего средства, которое обратимо связывают с первым реактивом, содержащим множество сайтов связывания стимулирующих средств, способных к обратимому связыванию со стимулирующим средством, где
по меньшей мере множество клеток-мишеней иммобилизуют на основе во время по меньшей мере части инкубации; и
инкубацию осуществляют в условиях, в соответствии с которыми стимулирующее средство специфически связывается с молекулой, экспрессируемой на поверхности клеток-мишеней, тем самым индуцируя или модулируя сигнал в клетках-мишенях.
2. Способ по п. 1, в котором иммобилизация по меньшей мере множества клеток обратима.
3. Способ по п. 1 или 2, в котором
множество сайтов связывания стимулирующих средств содержит один или несколько сайтов связывания, Z1, которые способны к обратимому связыванию с партнером связывания, C1; и
стимулирующее средство дополнительно содержит один или несколько партнеров связывания, C1.
4. Способ по п. 3, в котором
множество сайтов связывания стимулирующих средств содержит два или больше сайтов связывания, Z1, и/или дополнительно содержит один или несколько сайтов связывания, Z2, которые способны к обратимому связыванию с партнером связывания, C1; и/или
стимулирующее средство содержит два или больше партнеров связывания, C1.
5. Способ по любому из пп. 1-4, в котором стимулирующее средство дополнительно содержит сайт связывания B2, где специфическое связывание между стимулирующим средством и молекулой на поверхности клеток-мишеней включает взаимодействие между B2 и молекулой.
6. Способ по любому из пп. 1-5, в котором
основа представляет собой или содержит стационарную фазу; и/или
основа представляет собой или содержит твердый носитель.
7. Способ по любому из пп. 2-5, в котором реактив представляет собой первый реактив и по меньшей мере часть инкубации осуществляют в присутствии (a) второго реактива, который иммобилизуют на основе, и (b) средства отбора, обратимо связанного с указанным вторым реактивом;
где специфическое связывание с помощью средства отбора с селективным маркером, экспрессируемым по меньшей мере множеством клеток-мишеней, вызывает обратимую иммобилизацию указанного по меньшей мере множества клеток-мишеней на основе.
8. Способ модулирования клеток, который включает
(1) объединение (a) композиции, содержащей клетки-мишени, (b) средство отбора, которое (i) способно к специфическому связыванию с селективным маркером, экспрессируемым одной или несколькими из по меньшей мере множества клеток-мишеней из множества, и (ii) иммобилизуют или способно к иммобилизации на основе, непосредственно или опосредованно; и (c) основы, в соответствии с чем одну или несколько клеток-мишеней из по меньшей мере множества иммобилизуют на основе через средство отбора; и
(2) инкубацию по меньшей мере множества клеток-мишеней в присутствии стимулирующего средства, обратимо связанного с реактивом, реактив содержит множество сайтов связывания стимулирующих средств, каждый способен к обратимому связыванию со стимулирующим средством, в условиях, в соответствии с которыми стимулирующее средство специфически связывается с молекулой, экспрессируемой на поверхности клеток-мишеней, тем самым индуцируя или модулируя сигнал в клетках-мишенях.
9. Способ по п. 8, в котором реактив представляет собой первый реактив и средство отбора обратимо связывают со вторым реактивом, который иммобилизуют на основе, где специфическое связывание с помощью средства отбора с селективным маркером, экспрессируемым по меньшей мере множеством клеток-мишеней, вызывает обратимую иммобилизацию указанного по меньшей мере множества клеток-мишеней на основе.
10. Способ по любому из пп. 7-9, в котором второй реактив содержит множество сайтов связывания средства отбора, каждый способен к обратимому связыванию со средством отбора.
11. Способ по п. 10, в котором
множество сайтов связывания средства отбора содержит один или несколько сайтов связывания, Y1, которые способны к обратимому связыванию с партнером связывания, D1; и
средство отбора дополнительно содержит один или несколько партнеров связывания, D1.
12. Способ по п. 11, в котором множество сайтов связывания средства отбора содержит два или больше сайтов связывания, Y1, и/или дополнительно содержит один или несколько сайтов связывания, Y2, которые способны к обратимому связыванию с партнером связывания, D1; и/или
средство отбора содержит два или больше партнеров связывания, D1.
13. Способ по любому из пп. 2-7 и 9-12, в котором обратимой иммобилизации по меньшей мере множества клеток-мишеней содействуют посредством обратимой иммобилизации реактива на основе, во время указанной по меньшей мере части инкубации.
14. Способ по любому из пп. 1-3, в котором
первый реактив не является и не связан с или ассоциирован с твердым носителем, стационарной фазой, бусиной, микрочастицей, магнитной частицей и/или матрицей во время указанной инкубации, и/или
первый реактив является гибким не содержит металлическую или магнитную сердцевину, полностью или в первую очередь состоит из органического мультимера, не является сферическим, не является по существу сферическим или однородным по геометрической форме и/или не является жестким.
15. Способ по любому из пп. 1-7, который дополнительно включает объединение:
(a) по меньшей мере множества клеток-мишеней;
(b) средства отбора, которое (i) способно к специфическому связыванию с селективным маркером, экспрессируемым одной или несколькими из по меньшей мере множества клеток-мишеней из множества, и (ii) иммобилизуют или способно к иммобилизации на основе, непосредственно или опосредованно; и
(c) основы;
в соответствии с чем одна или несколько клеток-мишеней из по меньшей мере множества становятся иммобилизованными на основе через средство отбора.
16. Способ по любому из пп. 7-15, в котором
средство отбора дополнительно содержит один или несколько партнеров связывания, D1, которые способны к обратимому связыванию с сайтом связывания, Z1; и/или
средство отбора дополнительно содержит один или несколько партнеров связывания, D1, которые способны к обратимому связыванию с сайтом связывания, Y1.
17. Способ по п. 15 или п. 16, который дополнительно включает, после указанного объединения, отделение и/или удаление других клеток композиции от иммобилизованных клеток-мишеней.
18. Способ по п. 17, который дополнительно включает выполнение стадии промывания.
19. Способ по п. 17 или п. 18, в котором указанное отделение и/или указанную стадию промывания осуществляют перед инициацией указанной инкубации.
20. Способ по любому из пп. 8-19, в котором основа представляет собой или содержит стационарную фазу и/или представляет собой или содержит твердый носитель.
21. Способ по любому из пп. 15-20, в котором
указанную инкубацию осуществляют и/или инициируют перед указанным объединением; или
указанную инкубацию осуществляют и/или инициируют после указанного объединения.
22. Способ по любому из пп. 15-21, в котором указанное объединение осуществляют во время по меньшей мере части указанной инкубации.
23. Способ по любому из пп. 15-22, в котором иммобилизация средства отбора на основе обратима.
24. Способ по любому из пп. 8-23, в котором множество сайтов связывания стимулирующих средств содержит один или несколько сайтов связывания, Z1, которые способны к обратимому связыванию с партнером связывания, C1; и
стимулирующее средство дополнительно содержит один или несколько партнеров связывания, C1.
25. Способ по п. 24, в котором
множество сайтов связывания стимулирующих средств содержит два или больше сайтов связывания, Z1, и/или дополнительно содержит один или несколько сайтов связывания, Z2, которые способны к обратимому связыванию с партнером связывания, C1; и/или
стимулирующее средство содержит два или больше партнеров связывания, C1.
26. Способ по любому из пп. 13-24, в котором стимулирующее средство дополнительно содержит сайт связывания B2, где специфическое связывание между стимулирующим средством и молекулой на поверхности клеток-мишеней включает взаимодействие между B2 и молекулой.
27. Способ по любому из пп. 15-26, в котором
указанный реактив представляет собой первый реактив; и
иммобилизация средства отбора с основой является опосредованной и происходит через обратимое связывание средства отбора со вторым реактивом, который иммобилизуют на основе.
28. Способ по п. 27, в котором второй реактив содержит множество сайтов связывания средства отбора, способных к обратимому связыванию со средством отбора.
29. Способ по п. 28, в котором указанное множество сайтов связывания средства отбора содержит сайт связывания, Y1, который способен к связыванию с партнером связывания, D1, один или несколько из которых содержит средство отбора.
30. Способ по п. 29, в котором
указанное множество сайтов связывания средства отбора содержит два или больше сайтов связывания, Y1 и/или дополнительно содержит один или несколько сайтов связывания, Y2, которые способны к обратимому связыванию с партнером связывания, D1; и/или
средство отбора содержит два или больше партнеров связывания, D1.
31. Способ по любому одному из пп. 27-30, в котором второй реактив и средство отбора обратимо связывают вместе в комплекс во время указанного объединения, где объединение осуществляют посредством объединения клеток с комплексом.
32. Способ по любому из пп. 27-30, в котором второй реактив и средство отбора не находятся в комплексе во время указанного объединения, где объединение осуществляют посредством отдельного добавления второго реактива и средства отбора.
33. Способ по любому одному из пп. 7-12 и 15-32, в котором средство отбора дополнительно содержит сайт связывания, B1, и специфическое связывание между средством отбора и селективным маркером включает взаимодействие между B1 и селективным маркером.
34. Способ по любому из пп. 7-12 и 15-33,
в котором средство отбора содержит только один из указанных сайтов связывания, B1;
в котором средство отбора содержит только один сайт связывания, который специфически связывается с селективным маркером; и/или
в котором средство отбора специфически связывается с селективным маркером одновалентным образом.
35. Способ по любому из пп. 7-12 и 15-34, в котором средство отбора представляет собой или содержит средство, выбранное из группы, состоящей из фрагментов антител, фрагментов одновалентного антитела, белковых связывающих молекул с иммуноглобулиноподобными функциями, молекул, содержащих домены Ig, цитокинов, хемокинов, аптамеров, молекул MHC, комплексов MHC-пептид; лигандов рецепторов; и их связывающих фрагментов; и/или
средство отбора содержит фрагмент антитела;
средство отбора представляет собой или содержит Fab-фрагмент;
средство отбора выбирают из группы двухвалентных фрагментов антител, состоящей из (Fab)2'-фрагментов и двухвалентных одноцепочечных Fv (scFv) фрагментов;
средство отбора представляет собой одновалентный фрагмент антитела, выбранный из группы, состоящей из Fab-фрагментов, Fv-фрагментов и scFv; и/или
средство отбора представляет собой белковую связывающую молекулу с антителоподобными связывающими свойствами, выбранную из группы, состоящей из аптамеров, мутеинов, основанных на полипептиде семейства липокалина, глутел, белков, основанных на анкириновом каркасе, белков, основанных на кристаллиновом каркасе, аднектинов и авимеров.
36. Способ по любому из пп. 7-12 и 15-35, в котором
селективный маркер представляет собой корецептор B-клетки или T-клетки;
селективный маркер представляет собой или содержит элемент комплекса антигенного рецептора T-клетки или B-клетки;
селективный маркер представляет собой или содержит цепь CD3;
селективный маркер представляет собой или содержит ζ-цепь CD3;
селективный маркер представляет собой или содержит CD8;
селективный маркер представляет собой или содержит CD4 и/или
специфическое связывание между средством отбора и селективным маркером не индуцирует сигнал, или не индуцирует стимуляторный или активирующий или пролиферативный сигнал, в клетках-мишенях.
37. Способ по любому одному из пп. 1-36,
в котором стимулирующее средство содержит только один из указанных сайтов связывания, B2;
в котором стимулирующее средство содержит только один сайт связывания, который специфически связывается с молекулой; или
в котором стимулирующее средство специфически связывается с молекулой одновалентным образом.
38. Способ по любому из пп. 1-37, в котором
стимулирующее средство представляет собой или содержит средство, выбранное из группы, состоящей из фрагментов антител, фрагментов одновалентного антитела, белковых связывающих молекул с иммуноглобулиноподобными функциями, молекул, содержащих домены Ig, цитокинов, хемокинов, аптамеров, молекул MHC, комплексов MHC-пептид; лигандов рецепторов; и их связывающих фрагментов; и/или
стимулирующее средство содержит фрагмент антитела;
стимулирующее средство представляет собой или содержит Fab-фрагмент;
стимулирующее средство выбирают из группы двухвалентных фрагментов антител, состоящей из (Fab)2'-фрагментов и двухвалентных одноцепочечных Fv (scFv) фрагментов;
стимулирующее средство представляет собой одновалентный фрагмент антитела, выбранный из группы, состоящей из Fab-фрагментов, Fv-фрагментов и scFv; и/или
стимулирующее средство представляет собой белковую связывающую молекулу с антителоподобными связывающими свойствами, выбранную из группы, состоящей из аптамеров, мутеинов, основанных на полипептиде семейства липокалина, глутел, белков, основанных на анкириновом каркасе, белков, основанных на кристаллиновом каркасе, аднектинов и авимеров;
39. Способ по любому из пп. 1-38, в котором
молекула, экспрессируемая на поверхности клеток-мишеней, представляет собой или содержит элемент комплекса антигенного рецептора T-клетки или B-клетки;
молекула, экспрессируемая на поверхности клеток-мишеней, представляет собой или содержит цепь CD3;
молекула, экспрессируемая на поверхности клеток-мишеней, представляет собой или содержит CD3ζ;
молекула, экспрессируемая на поверхности клеток-мишеней, представляет собой или содержит антиген-связывающую часть T-клеточного рецептора или B-клеточного рецептора;
молекула, экспрессируемая на поверхности клеток-мишеней, представляет собой химерный антигенный рецептор;
специфическое связывание стимулирующего средства и молекулы способно доставлять первичный сигнал в T-клетку или B-клетку.
40. Способ по любому из пп. 1-39, в котором
стимулирующее средство содержит комплекс MHC I:пептид или его функциональную часть, комплекс MHC II:пептид или его функциональную часть и/или способно доставлять стимулирующий сигнал через комплекс TCR/CD3 в T-клетке, CD3-содержащий комплекс в T-клетке и/или ITAM-содержащую молекулу в T-клетке, и/или
указанная индукция или модулирование указанного сигнала ведет к увеличению экспрессии цитокина в клетке-мишени.
41. Способ по п. 40, в котором цитокин представляет собой IL-2, IFN-γ и/или IL-4.
42. Способ по любому из пп. 1-41, в котором молекула, экспрессируемая на поверхности клеток-мишеней, представляет собой первую молекулу и стимулирующее средство дополнительно способно к связыванию со второй молекулой, экспрессируемой на поверхности по меньшей мере множества клеток-мишеней.
43. Способ по любому из пп. 1-42, в котором молекула, экспрессируемая на поверхности клеток-мишеней, представляет собой первую молекулу, стимулирующее средство представляет собой первое стимулирующее средство и инкубацию дополнительно осуществляют в присутствии второго стимулирующего средства, которое способно к связыванию со второй молекулой, экспрессируемой на поверхности по меньшей мере множества клеток-мишеней.
44. Способ по п. 43, в котором второе стимулирующее средство обратимо связывают с первым реактивом или обратимо связывают с четвертым реактивом.
45. Способ по п. 43 или 44, в котором
второе стимулирующее средство содержит один или несколько партнеров связывания, C1;
второе стимулирующее средство содержит один или несколько партнеров связывания, C2, которые способны к связыванию со стимулирующим средством-сайт связывания; и/или
второе стимулирующее средство содержит один или несколько партнеров связывания, C2, которые способны к связыванию с сайтом связывания, Z2, и реактив дополнительно содержит один или несколько сайтов связывания Z2.
46. Способ по п. 45, в котором
C2 и C1 представляют собой одно и то же или по существу одно и то же или содержат один и тот же или по существу один и тот же фрагмент;
Z1 и Z2 представляют собой одно и то же или по существу одно и то же или содержат один и тот же или по существу один и тот же фрагмент.
47. Способ по любому из пп. 43-46, в котором второе стимулирующее средство содержит один или несколько сайтов связывания, B4, которые содействуют специфическому связыванию между вторым стимулирующим средством и второй молекулой.
48. Способ по п. 42, в котором стимулирующее средство дополнительно содержит один или несколько сайтов связывания, B4, которые содействуют его специфическому связыванию со второй молекулой.
49. Способ по любому из пп. 42-48, в котором специфическое связывание средства или второго средства со второй молекулой способно усиливать, ослаблять или модифицировать сигнал, доставляемый через первую молекулу.
50. Способ по любому из пп. 42-49, в котором
вторая молекула представляет собой костимулирующую молекулу;
вторая молекула представляет собой вспомогательную молекулу; вторая молекула представляет собой цитокиновый рецептор;
вторая молекула представляет собой хемокиновый рецептор;
вторая молекула представляет собой молекулу иммунной контрольной точки; или
вторая молекула представляет собой элемент семейства TNF или семейства рецепторов TNF.
51. Способ по п. 50, в котором вторая молекула содержит CD28, CD137 или CD40 лиганд или CD40 или OX40 или ICOS или функциональную часть любого из вышеуказанных.
52. Способ по любому из пп. 7-12 и 15-51, в котором селективный маркер представляет собой первый селективный маркер и средство отбора дополнительно способно к связыванию со вторым селективным маркером, который экспрессируют на поверхности по меньшей мере множества клеток-мишеней.
53. Способ по любому из пп. 7-12 и 15-52, в котором селективный маркер представляет собой первый селективный маркер и средство отбора представляет собой первое средство отбора и инкубацию дополнительно осуществляют в присутствии второго средства отбора, которое способно к связыванию со вторым селективным маркером, который экспрессирован на поверхности по меньшей мере множества клеток-мишеней.
54. Способ по п. 53, в котором
второе средство отбора обратимо связывают со вторым реактивом или
второе средство отбора обратимо связывают с третьим реактивом, который иммобилизуют на основе или дополнительной основе.
55. Способ по п. 53 или 54, в котором
второе средство отбора содержит один или несколько партнеров связывания, D1; и/или
второе средство отбора содержит один или несколько партнеров связывания, D2, которые способны к связыванию с сайтом связывания, Y1; и/или
второе средство отбора содержит один или несколько партнеров связывания, D2, которые способны к связыванию с сайтом связывания, Y2, и второй реактив дополнительно содержит один или несколько сайтов связывания Y2.
56. Способ по п. 55, в котором
D2 и D1 представляют собой одно и то же или по существу одно и то же или содержат один и тот же или по существу один и тот же фрагмент;
Y1 и Y2 представляют собой одно и то же или по существу одно и то же или содержат один и тот же или по существу один и тот же фрагмент;
C1 и D1 представляют собой одно и то же или по существу одно и то же или содержат один и тот же или по существу один и тот же фрагмент; и/или
Z1 и Y1 представляют собой одно и то же или по существу одно и то же или содержат один и тот же или по существу один и тот же фрагмент.
57. Способ по любому из пп. 53-56, в котором второе средство отбора содержит один или несколько сайтов связывания, B3, которые содействуют специфическому связыванию между вторым средством отбора и вторым селективным маркером.
58. Способ по любому из пп. 52 и 54-57, в котором средство отбора дополнительно содержит один или несколько сайтов связывания, B3, которые содействуют его специфическому связыванию со вторым селективным маркером.
59. Способ по любому из пп. 43-58,
в котором второе стимулирующее средство содержит только один из указанных сайтов связывания, B4;
в котором второе стимулирующее средство содержит только один сайт связывания, который специфически связывается со второй молекулой;
в котором второе стимулирующее средство специфически связывается с молекулой одновалентным образом.
60. Способ по любому из пп. 43-59, в котором
второе стимулирующее средство представляет собой или содержит средство, выбранное из группы, состоящей из фрагментов антител, фрагментов одновалентного антитела, белковых связывающих молекул с иммуноглобулиноподобными функциями, молекул, содержащих домены Ig, цитокинов, хемокинов, аптамеров, молекул MHC, комплексов MHC-пептид; лигандов рецепторов; и их связывающих фрагментов; и/или
второе стимулирующее средство содержит фрагмент антитела;
второе стимулирующее средство представляет собой или содержит Fab-фрагмент;
второе стимулирующее средство выбирают из группы двухвалентных фрагментов антител, состоящей из (Fab)2'-фрагментов и двухвалентных одноцепочечных Fv (scFv) фрагментов;
второе стимулирующее средство представляет собой одновалентный фрагмент антитела, выбранный из группы, состоящей из Fab-фрагментов, Fv-фрагментов и scFv; и/или
второе стимулирующее средство представляет собой белковую связывающую молекулу с антителоподобными связывающими свойствами, выбранную из группы, состоящей из аптамеров, мутеинов, основанных на полипептиде семейства липокалина, глутел, белков, основанных на анкириновом каркасе, белков, основанных на кристаллиновом каркасе, аднектинов и авимеров; и/или
61. Способ по любому из пп. 52-60,
в котором второе средство отбора содержит только один из указанных сайтов связывания, B3;
в котором второе средство отбора содержит только один сайт связывания, который специфически связывается со вторым селективным маркером; и/или
в котором второе средство отбора специфически связывается со вторым селективным маркером одновалентным образом.
62. Способ по любому из пп. 52-61, в котором
второе средство отбора представляет собой или содержит средство, выбранное из группы, состоящей из фрагментов антител, фрагментов одновалентного антитела, белковых связывающих молекул с иммуноглобулиноподобными функциями, молекул, содержащих домены Ig, цитокинов, хемокинов, аптамеров, молекул MHC, комплексов MHC-пептид; лигандов рецепторов; и их связывающих фрагментов; и/или
второе средство отбора содержит фрагмент антитела;
второе средство отбора представляет собой или содержит Fab-фрагмент;
второе средство отбора выбирают из группы двухвалентных фрагментов антител, состоящей из (Fab)2'-фрагментов и двухвалентных одноцепочечных Fv (scFv) фрагментов;
второе средство отбора представляет собой одновалентный фрагмент антитела, выбранный из группы, состоящей из Fab-фрагментов, Fv-фрагментов и scFv; и/или
второе средство отбора представляет собой белковую связывающую молекулу с антителоподобными связывающими свойствами, выбранную из группы, состоящей из аптамеров, мутеинов, основанных на полипептиде семейства липокалина, глутел, белков, основанных на анкириновом каркасе, белков, основанных на кристаллиновом каркасе, аднектинов и авимеров.
63. Способ по любому из пп. 52-62, в котором
второй селективный маркер представляет собой корецептор B-клетки или T-клетки;
второй селективный маркер представляет собой или содержит элемент комплекса антигенного рецептора T-клетки или B-клетки;
второй селективный маркер представляет собой или содержит цепь CD3;
второй селективный маркер представляет собой или содержит ζ-цепь CD3;
второй селективный маркер представляет собой или содержит CD8;
второй селективный маркер представляет собой или содержит CD4 и/или
специфическое связывание между вторым средством отбора и вторым селективным маркером не индуцирует сигнал или не индуцирует стимуляторный или активирующий или пролиферативный сигнал в клетках-мишенях.
64. Способ модуляции клеток, способ включает:
(a) объединение композиции, содержащей клетки-мишени, и стимулирующего средства, обратимо связанного с реактивом, который иммобилизуют на основе, где реактив содержит множество сайтов связывания стимулирующих средств, каждый способен к обратимому связыванию со стимулирующим средством и способен к специфическому связыванию с молекулой, экспрессируемой на поверхности клеток-мишеней,
тем самым иммобилизуя клетки-мишени на основе; и
(b) отделение или удаление других клеток композиции от иммобилизованных клеток-мишеней; и
(c) инкубацию по меньшей мере некоторых из иммобилизованных клеток-мишеней в присутствии стимулирующего средства, в условиях, в соответствии с которыми сигнал индуцируют или модулируют по меньшей мере во множестве клеток-мишеней.
65. Способ по п. 64, в котором основа представляет собой или содержит твердый носитель и/или стационарную фазу.
66. Способ по п. 64 или 65, в котором множество сайтов связывания стимулирующих средств содержит один или несколько сайтов связывания, Z1, которые способны к обратимому связыванию с партнером связывания, C1; и
стимулирующее средство дополнительно содержит один или несколько партнеров связывания, C1.
67. Способ по п. 66, в котором
множество сайтов связывания стимулирующих средств содержит два или больше сайтов связывания, Z1, и/или дополнительно содержит один или несколько сайтов связывания, Z2, которые способны к обратимому связыванию с партнером связывания, C1; и/или
стимулирующее средство содержит два или больше партнеров связывания, C1.
68. Способ по любому из пп. 64-67, в котором стимулирующее средство дополнительно содержит сайт связывания B2, где специфическое связывание между стимулирующим средством и молекулой на поверхности клеток-мишеней включает взаимодействие между B2 и молекулой.
69. Способ по любому из пп. 1-68, в котором связывание между одним или несколькими из средств, обратимо связанных с первым, вторым и/или третьим реактивом, индивидуально можно разрушать посредством добавления вещества к клеткам.
70. Способ по п. 69, в котором
обратимое связывание между стимулирующим средством и первым реактивом можно разрушать посредством добавления вещества; и/или
обратимое связывание между средством отбора и первым реактивом или средством отбора и вторым реактивом можно разрушать посредством добавления вещества; и/или
каждое из обратимого связывания между стимулирующим средством и первым реактивом и обратимого связывания между средством отбора и вторым реактивом и/или первым реактивом можно разрушать посредством добавления вещества;
обратимое связывание между вторым стимулирующим средством и первым реактивом или четвертым реактивом можно разрушать посредством добавления вещества; и/или
обратимое связывание между вторым средством отбора и первым реактивом и/или вторым средством отбора и вторым реактивом и/или вторым средством отбора и третьим реактивом можно разрушать посредством добавления вещества; и/или
каждое из обратимого связывания между вторым стимулирующим средством и первым реактивом или четвертым реактивом и обратимого связывания между вторым средством отбора и первым реактивом, вторым реактивом и/или третьим реактивом можно разрушать посредством добавления вещества.
71. Способ по п. 69 или п. 70, в котором
вещество представляет собой или содержит свободный партнер связывания; или
вещество представляет собой или содержит конкурентное средство; и/или
вещество вызывает изменение, отлично от конкуренции за указанное связывание, которое разрушает связывание.
72. Способ по п. 71, в котором вещество не является вредоносным для клеток-мишеней или для большинства клеток-мишеней и/или в котором добавление вещества к клеткам-мишеням в количестве, достаточном для того, чтобы вызывать указанное разрушение, не снижает выживаемость и/или пролиферативную способность клеток на меньше чем или приблизительно 90%, 80%, 70%, 60% или 50%, по сравнению с отсутствием вещества при в остальном тех же условиях.
73. Способ по любому из пп. 69-72, в котором вещество представляет собой или содержит пептид или полипептид.
74. Способ по любому одному из пп. 69-73, в котором
вещество содержит молекулу из группы, состоящей из: стрептавидин-связывающих молекул; биотина; D-биотина; аналогов биотина; аналогов биотина, которые специфически связываются со стрептавидином или аналогом стрептавидина, имеющим аминокислотную последовательность Va144-Thr45-Ala46-Arg47 или lle44-Gly45-Ala46-Arg47, в положениях последовательности, соответствующих положениям с 44 до 47 стрептавидина дикого типа; и пептидов, содержащих или состоящих из последовательности, приведенной в любой из SEQ ID № 1, 4, 5 и 7; или
вещество содержит хелатор металлов, который необязательно представляет собой EDTA или EGTA.
75. Способ по любому из пп. 1-74, в котором
основа содержит смолу или матрицу;
основа содержит гельфильтрационную матрицу;
основа содержит хроматографическую матрицу; и/или
основа содержит мембрану, основанную на целлюлозе или основанную на органическом полимере.
76. Способ по п. 75, в котором хроматографическая матрица присутствует в колонке и/или в котором хроматография представляет собой колоночную хроматографию или плоскостную хроматографию.
77. Способ по любому из пп. 1-76, в котором основа содержит микрочастицу, жесткую частицу, магнитную частицу или бусину.
78. Способ по любому из пп. 1-77, в котором основа представляет собой стационарную фазу, присутствующую в контейнере во время целых или частичных указанной инкубации и/или указанного приведения в контакт.
79. Способ по п. 78, в котором контейнер включает контейнер, выбранный из группы, состоящей из: колонок, контейнеров, подходящих для двунаправленного потока, наконечников пипетки, пробирок и колонок, подходящих для протекания жидкого образца.
80. Способ по любому из пп. 1-79, в котором
клетки-мишени содержат клетки крови;
клетки-мишени содержат лейкоциты;
клетки-мишени содержат лимфоциты;
клетки-мишени содержат B-клетки;
клетки-мишени содержат популяцию B-клеток
клетки-мишени содержат T-клетки;
клетки-мишени содержат популяцию T-клеток; и/или
клетки-мишени содержат естественные киллерные (NK) клетки.
81. Способ по п. 80, в котором клетки-мишени содержат антиген-специфические T-клетки или их популяцию, T-хелперные клетки или их популяцию, цитотоксические T-клетки или их популяцию, T-клетки памяти или их популяцию, регуляторные T-клетки или их популяцию или NK клетки или их популяцию, антиген-специфические B-клетки или их популяцию, B-клетки памяти или их популяцию или регуляторные B-клетки или их популяцию.
82. Способ по любому из пп. 1-81, в котором индукция или модуляция сигнала индуцирует, ослабляет, ингибирует или усиливает активацию, пролиферацию, выживаемость и/или размножение.
83. Способ по любому из пп. 1-82, в котором
первый реактив, второй реактив и/или третий реактив независимо представляет собой или содержит стрептавидин, авидин, аналог стрептавидина, который обратимо связывается с биотином, аналог авидина, который обратимо связывается с биотином, реактив, который содержит по меньшей мере две хелатирующие группы, K, которые способны к связыванию с ионом переходного металла, средство, способное к связыванию с олигогистидиновой аффинной меткой, средство, способное к связыванию с глутатион-S-трансферазой, кальмодулин или его аналог, средство, способное к связыванию с кальмодулин-связывающим пептидом (CBP), средство, способное к связыванию с FLAG-пептидом, средство, способное к связыванию с HA-меткой, средство, способное к связыванию с мальтоза-связывающим белком (MBP), средство, способное к связыванию с эпитопом HSV, средство, способное к связыванию с эпитопом myc, и/или средство, способное к связыванию с биотинилированным белком-переносчиком
84. Способ по п. 83, в котором первый реактив, второй реактив и/или третий реактив независимо представляет собой или содержит олигомер или полимер.
85. Способ по любому из пп. 1-84, в котором первый реактив, второй реактив или третий реактив независимо представляет собой или содержит олигомер или полимер стрептавидина, авидина, аналога стрептавидина или аналога авидина, этот олигомер или полимер содержит мономеры стрептавидина, авидина или аналога, которые сшивают с помощью полисахарида или бифункционального линкера.
86. Способ по любому из пп. 2-7, 16-63 и 66-85, в котором
партнер связывания C1, партнер связывания C2, партнер связывания D1 и/или партнер связывания D2, независимо, содержат биотин, аналог биотина, который обратимо связывается со стрептавидином или авидином; и/или
каждый из партнера связывания C1 и партнера связывания C2, независимо, содержит биотин, аналог биотина, который обратимо связывается со стрептавидином или авидином; и/или
каждый из партнера связывания D1 и партнера связывания D2, независимо, содержит биотин, аналог биотина, который обратимо связывается со стрептавидином или авидином.
87. Способ по любому из пп. 1-86, в котором
первый реактив, второй реактив и/или третий реактив независимо содержат аналог стрептавидина или аналог авидина, который обратимо связывается с биотином;
первый реактив, второй реактив и/или третий реактив независимо содержат аналог стрептавидина или аналог авидина, который обратимо связывается с аналогом биотина; и/или
первый реактив, второй реактив и/или третий реактив независимо содержат аналог стрептавидина или аналог авидина, который обратимо связывается со стрептавидин-связывающим пептидом; и/или
первый реактив, второй реактив и/или третий реактив независимо содержат аналог стрептавидина или аналог авидина, который обратимо связывается со стрептавидин-связывающим пептидом, выбранным из группы, состоящей из Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 8), Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)3-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 17), Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)2-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 18) и Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)2Gly-Gly-Ser-Ala-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 19).
88. Способ по любому из пп. 2-7, 16-63 и 66-87, в котором
партнер связывания C1, партнер связывания C2, партнер связывания D1 и/или партнер связывания D2, независимо, содержит стрептавидин-связывающий пептид, выбранный из группы, состоящей из Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 8), Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)3-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 15 или 17), Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)2-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 18) и Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)2Gly-Gly-Ser-Ala-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 19);
каждый из партнера связывания C1 и партнера связывания C2, независимо, содержит стрептавидин-связывающий пептид, выбранный из группы, состоящей из Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 8), Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)3-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 17), Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)2-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 18) и Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)2Gly-Gly-Ser-Ala-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 19); и/или
каждый из партнера связывания D1 и партнера связывания D2, независимо, содержит стрептавидин-связывающий пептид, выбранный из группы, состоящей из Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 8), Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)3-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 17), Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)2-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 18) и Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(GlyGlyGlySer)2Gly-Gly-Ser-Ala-Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID № 19).
89. Способ по любому из пп. 1-88, в котором
первый реактив, второй реактив и/или третий реактив независимо содержат аналог стрептавидина, который содержит аминокислотную последовательность Va144-Thr45-Ala46-Arg47 в положениях последовательности, соответствующих положениям с 44 до 47 стрептавидина дикого типа, или аналог стрептавидина, который содержит аминокислотную последовательность lle44-Gly45-Ala46-Arg47 в положениях последовательности, соответствующих положениям с 44 до 47 стрептавидина дикого типа; и/или
90. Способ по любому одному из пп. 2-7, 16-63 и 66-89, в котором связывание между указанным партнером связывания C1 и/или партнером связывания C2, соответственно, и указанными сайтами связывания Z1 и/или Z2, соответственно, способно возникать в присутствии двухвалентного катиона и/или не способно возникать в отсутствие двухвалентного катиона, и/или его разрушают посредством удаления двухвалентных катионов.
91. Способ по любому из пп. 2-7, 16-63 и 66-90, в котором
каждый из указанных партнеров связывания C1 и/или C2 и/или каждый из указанных партнеров связывания D1 и/или D2, независимо, содержит кальмодулин-связывающий пептид и (первый) реактив и/или второй реактив и/или третий реактив и/или четвертый реактив содержит кальмодулин, или
каждый из указанных партнеров связывания C1 и/или C2 и/или каждый из указанных партнеров связывания D1 и/или D2, независимо, содержит FLAG-пептид и (первый) реактив и/или второй реактив и/или третий реактив и/или четвертый реактив содержит антитело, связывающее FLAG-пептид, или
каждый из указанных партнеров связывания C1 и/или C2 и/или каждый из указанных партнеров связывания D1 и/или D2, независимо, содержит олигогистидиновую метку и указанный (первый) реактив и/или второй реактив и/или третий реактив и/или четвертый реактив содержит антитело, связывающее олигогистидиновую метку.
92. Способ по любому из пп. 2-7, 16-63 и 66-91, в котором связывание между указанным партнером связывания C1 и указанным сайтом связывания Z1 и/или между указанным партнером связывания C2 и/или указанным сайтом связывания Z2 и/или указанным партнером связывания D1 и указанным сайтом связывания Y1 и/или указанным партнером связывания D2 и указанным сайтом связывания Y2 можно разрушать посредством хелатирования иона металла, которое необязательно выполняют посредством добавления EDTA или EGTA.
93. Способ по любому из пп. 2-7, 16-63 и 66-92, в котором
партнеры связывания C1 и C2 являются различными и/или их взаимодействия с (первым) реактивом можно разрушать посредством добавления отличающегося вещества или не посредством добавления одного и того же вещества;
партнеры связывания D1 и D2 являются различными и/или их взаимодействия со вторым реактивом можно разрушать посредством добавления отличающегося вещества или не посредством добавления одного и того же вещества;
партнеры связывания C1 и/или C2 являются различными по сравнению с партнерами связывания D1 и/или D2 и/или их взаимодействия с первым реактивом и вторым реактивом, соответственно, можно разрушать посредством добавления отличающегося вещества или не посредством добавления одного и того же вещества.
94. Способ по любому из пп. 2-7, 16-63 и 66-93, в котором
партнеры связывания C1 и C2 идентичны или по существу идентичны и/или их взаимодействия с первым реактивом можно разрушать посредством добавления одного и того же вещества;
партнеры связывания D1 и D2 идентичны или по существу идентичны и/или их взаимодействия со вторым реактивом можно разрушать посредством добавления одного и того же вещества;
партнеры связывания C1 и/или C2 идентичны или по существу идентичны по сравнению с партнерами связывания D1 и/или D2 и/или их взаимодействия с первым реактивом и вторым реактивом, соответственно, можно разрушать посредством добавления одного и того же вещества.
95. Способ по любому из пп. 1-94, который дополнительно включает
разрушение связывания между одним или несколькими из средств, обратимо связанных с первым, вторым и/или третьим реактивом.
96. Способ по п. 95, в котором указанное разрушение осуществляют после указанной инкубации или инициируют после инициации указанной инкубации; и/или
97. Способ по п. 95 или п. 96, в котором указанное разрушение осуществляют посредством введения вещества, которое разрушает взаимодействие между партнером связывания C1 и/или C2 и сайтом связывания Z1 и/или Z2.
98. Способ по любому из пп. 95-97, в котором указанное разрушение вызывает
завершение или уменьшение сигнала, доставляемого посредством одного из стимулирующих средств; или
завершение или уменьшение стимуляции, активации или размножения клеток.
99. Способ по любому из пп. 97-98, в котором указанное разрушение включает введение в клетки композиции, содержащей вещество.
100. Способ по любому из пп. 1-99, в котором композиция, приводимая в контакт со вторым реактивом, дополнительно содержит не клетки-мишени, и способ дополнительно включает отделение клеток-мишеней от не клеток-мишеней.
101. Способ по любому из пп. 1-100, который дополнительно включает, перед указанной инкубацией, размножение клеток, содержащихся в популяции клеток-мишеней, или где клетки размножены in vitro перед указанной инкубацией.
102. Способ по любому одному из пп. 1-101, где способ дополнительно включает замену среды или добавление вещества по меньшей мере один раз во время указанной инкубации.
103. Способ по любому одному из пп. 1-102, который дополнительно включает повторение одной или нескольких стадий способа итеративным образом, в соответствии с чем клетки одной или нескольких популяций последовательно выделяют и размножают по меньшей мере в двух циклах.
104. Способ по п. 103, где способ включает приведение в контакт клеток-мишеней в популяции с по меньшей мере двумя различными средствами отбора, в каждой из двух различных стадий приведения в контакт, соответственно, которые специфически связываются с двумя различными селективными маркерами, в котором по меньшей мере часть указанной инкубации осуществляют между приведением в контакт с двумя различными средствами отбора.
105. Способ по любому из пп. 1-104, который дополнительно включает введение рекомбинантной нуклеиновой кислоты в клетки-мишени популяции, эта нуклеиновая кислота кодирует рекомбинантный белок, в соответствии с чем клетки экспрессируют рекомбинантный белок.
106. Способ по п. 105, в котором указанное введение осуществляют после или во время указанной инкубации и/или пока клетки иммобилизованы на основе.
107. Способ по любому из пп. 1-106, в котором клетки, во время по меньшей мере части инкубации, экспрессируют рекомбинантный белок, введенный ex vivo.
108. Способ по любому из пп. 105-107, в котором введение нуклеиновой кислоты осуществляют между множеством из по меньшей мере двух стадий приведения в контакт.
109. Способ по п. 108, в котором одно из по меньшей мере двух средств отбора специфически связывается с рекомбинантным белком и/или одно из стимулирующих средств специфически связывается с рекомбинантным белком.
110. Способ по любому из пп. 1-109, в котором первый реактив не иммобилизуют на основе.
111. Способ по любому из пп. 1-110, в котором после указанной инкубации способ дополнительно включает перенос клеток-мишеней композиции в другое окружение, указанное окружение подходит для клеточной культуры или размножения.
112. Способ по п. 111, в котором клетки, переносимые таким образом, переносят в закрытой системе или закрытом контейнере в другое окружение; или в котором перенос включает удаление клеток, переносимых таким образом, из первого контейнера и перенос клеток во второй контейнер
113. Способ по п. 111 или 112, в котором другое окружение находится в инкубаторе.
114. Способ по любому из пп. 111-113, в котором указанный перенос осуществляют в закрытой системе, где указанный перенос включает перенос стерильно закупоренного контейнера, содержащего клетки, в стерильное окружение или в другое окружение внутри закупоренного контейнера, и/или где указанный перенос осуществляют в стерильном окружении или в стерильных условиях.
115. Способ по п. 114, который дополнительно включает, после переноса, открепление клеток от стационарной фазы посредством разрушения указанного обратимого связывания и необязательно удаления указанных клеток из присутствия стационарной фазы.
116. Способ по п. 115, который дополнительно включает размножение указанных удаленных клеток.
117. Способ по любому из пп. 1-116, в котором температурой, pH, pO2, pCO2 и/или температурой управляют во время по меньшей мере части указанной инкубации, необязательно автоматизированным образом.
118. Способ по любому из пп. 111-117, в котором питательные вещества подают к клеткам, содержащимся по меньшей мере в одной из по меньшей мере одной стационарной фазы для хроматографии, пока они находятся в окружении, подходящем для размножения.
119. Способ по любому из пп. 111-118, где стационарная фаза присутствует в устройстве по любому из пп. 131-143, где перенос для размножения подходящего окружения включает открепление стационарной фазы от клеток, пока указанная стационарная фаза присутствует в устройстве.
120. Промышленное изделие для очистки и модуляции клеток-мишеней, промышленное изделие содержит:
(a) стимулирующее средство, способное к специфическому связыванию с молекулой на поверхности клетки-мишени, таким образом, который индуцирует или модулирует сигнал в клетке-мишени;
(b) первый реактив, который содержит множество сайтов связывания стимулирующих средств, каждый способен к обратимому связыванию со стимулирующим средством;
(c) второй реактив;
(d) основу; и
(e) средство отбора, которое способно к обратимому связыванию со вторым реактивом и способно к специфическому связыванию с селективным маркером на клетке-мишени.
121. Промышленное изделие по п. 120, в котором основа представляет собой или содержит стационарную фазу и/или твердый носитель.
122. Промышленное изделие по п. 120 или 121, в котором второй реактив иммобилизуют на основе.
123. Промышленное изделие по любому из пп. 120-122, в котором первый реактив обратимо связывают со стимулирующим средством и/или в котором средство отбора обратимо связывают со вторым реактивом.
124. Промышленное изделие по любому из пп. 120-123, которое дополнительно содержит
второе стимулирующее средство, способное к специфическому связыванию со второй молекулой на поверхности клетки-мишени и обратимому связыванию с первым реактивом и/или обратимому связыванию с четвертым реактивом; и/или
второе средство отбора, способное к специфическому связыванию со вторым селективным маркером, который (i) содержит клетка-мишень или (ii) содержит другая клетка-мишень.
125. Промышленное изделие по п. 124, в котором другая клетка-мишень экспрессирует молекулу, с которой первое стимулирующее средство и/или второе стимулирующее средство специфически связывается.
126. Промышленное изделие по п. 124 или 125, в котором второе средство отбора способно к обратимому связыванию со вторым реактивом, или изделие дополнительно содержит третий реактив, способный к обратимому связыванию со вторым средством отбора.
127. Промышленное изделие по п. 126, в котором третий реактив иммобилизуют на основе или на другой основе.
128. Промышленное изделие по п. 127, в котором основа и вторая основа присутствуют в отдельных контейнерах, где указанные различные контейнеры необязательно соединяют по текучей среде друг с другом, что делает возможным прохождение клеточной суспензии через или за пределы одной из основ, за которой следует другая.
129. Промышленное изделие по любому из пп. 120-128, в котором основа представляет собой стационарную фазу, которая представляет собой или содержит хроматографическую матрицу, где промышленное изделие дополнительно содержит контейнер, который целиком или частично содержит хроматографическую матрицу.
130. Промышленное изделие по п. 129, в котором контейнер представляет собой колонку.
131. Устройство, которое содержит промышленное изделие по любому из пп. 120-130.
132. Устройство по п. 131, которое дополнительно содержит впуск текучего вещества, соединяемый по текучей среде с одним или несколькими компонентами устройства, и/или выпуск текучего вещества, соединяемый по текучей среде с одним или несколькими компонентами устройства.
133. Устройство, которое содержит:
(a) стимулирующее средство, способное к специфическому связыванию с молекулой на поверхности клетки-мишени, таким образом, который индуцирует или модулирует сигнал в клетке-мишени;
(b) первый реактив, который способен к обратимому связыванию со стимулирующим средством;
(c) второй реактив;
(d) основу,
(e) средство отбора, которое способно к обратимому связыванию со вторым реактивом и способно к специфическому связыванию с селективным маркером на клетке-мишени.
134. Устройство по п. 133, в котором основа представляет собой или содержит стационарную фазу для хроматографии.
135. Устройство по п. 133, в котором компоненты в (a)-(e) присутствуют во множестве контейнеров, по меньшей мере некоторые из которых находятся в соединении по текучей среде, в соответствии с чем один или несколько компонентов проходят из одного контейнера в другой внутри устройства.
136. Устройство по любому из пп. 131-135, которое находится в закрытой или стерильной системе.
137. Устройство по любому из пп. 131 и 134-136, которое дополнительно содержит выпуск образца, соединенный по текучей среде с одной из по меньшей мере одной стационарной фазы для хроматографии.
138. Промышленное изделие или устройство по любому из пп. 120-137, в котором устройство представляет собой функционально закрытую систему.
139. Промышленное изделие или устройство по любому из пп. 120-138, которые дополнительно содержат одно или несколько средств управления, способных регулировать или корректировать pH, pO2, pCO2, и/или термостатическое средство управления одного или нескольких контейнеров или их компонентов и/или по меньшей мере одной из по меньшей мере одной стационарной фазы для хроматографии.
140. Промышленное изделие или устройство по любому из пп. 120-139, которые дополнительно содержат соединение по текучей среде с контейнером, содержащим среду и/или одно или несколько питательных веществ и/или один или несколько источников углерода, в соответствии с чем соединение позволяет доставлять такую среду, питательные вещества и/или источники углерода к клеткам внутри устройства, необязательно когда указанные клетки иммобилизуют на стационарной фазе для хроматографии.
141. Устройство по любому из пп. 131-140, в котором по меньшей мере один из перечисленных компонентов и/или контейнер, содержащий их, можно отсоединять от устройства стерильным или асептическим образом.
142. Устройство по любому из пп. 131-141 или изделие по любому из пп. 122-130, которые можно применять в или способны к осуществлению способа по любому из пп. 1-121, где способ необязательно осуществляют автоматизированным образом.
143. Устройство по любому из пп. 131-141 или изделие по любому из пп. 122-130 для применения в способе по любому из пп. 1-121, где способ необязательно осуществляют автоматизированным образом.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201562245249P | 2015-10-22 | 2015-10-22 | |
| US62/245,249 | 2015-10-22 | ||
| PCT/IB2016/001650 WO2017068425A1 (en) | 2015-10-22 | 2016-10-20 | Methods for culturing cells and kits and apparatus for same |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2022121919A Division RU2022121919A (ru) | 2015-10-22 | 2016-10-20 | Способы культивирования клеток и наборы и устройство для них |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2018118573A true RU2018118573A (ru) | 2019-11-25 |
| RU2018118573A3 RU2018118573A3 (ru) | 2020-08-28 |
| RU2778411C2 RU2778411C2 (ru) | 2022-08-18 |
Family
ID=
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2018118573A3 (ru) | 2020-08-28 |
| CN108474791B (zh) | 2022-07-08 |
| EP3365678A1 (en) | 2018-08-29 |
| KR20180099641A (ko) | 2018-09-05 |
| HK1258933A1 (zh) | 2019-11-22 |
| JP2023027240A (ja) | 2023-03-01 |
| JP2018537964A (ja) | 2018-12-27 |
| BR112018008061A2 (pt) | 2018-11-13 |
| AU2016341533A1 (en) | 2018-05-10 |
| WO2017068425A1 (en) | 2017-04-27 |
| MA45489A (fr) | 2018-08-29 |
| NZ741859A (en) | 2024-02-23 |
| AU2016341533B2 (en) | 2023-07-06 |
| US11913024B2 (en) | 2024-02-27 |
| CN108474791A (zh) | 2018-08-31 |
| JP7194020B2 (ja) | 2022-12-21 |
| US20190112576A1 (en) | 2019-04-18 |
| MX2018004875A (es) | 2018-08-01 |
| CA3002751A1 (en) | 2017-04-27 |
| MX2022012196A (es) | 2022-10-27 |
| CN115261317A (zh) | 2022-11-01 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| AU2016341533B2 (en) | Methods for culturing cells and kits and apparatus for same | |
| US20240101613A1 (en) | Oligomeric particle reagents and methods of use thereof | |
| JP6696969B2 (ja) | 細胞の集団を拡大する方法、キット、及び装置 | |
| RU2018118574A (ru) | Способы, наборы, средства и устройства для трансдукции | |
| JP2018537964A5 (ru) | ||
| JP2018119982A (ja) | 標的細胞を可逆的に染色する方法 | |
| RU2016145424A (ru) | Способы выделения, культивирования и генетической инженерии популяций клеток иммунной системы для адоптивной терапии | |
| CA3117720A1 (en) | Process for producing genetically engineered t cells | |
| IL195285A (en) | A method for identifying B cells that express antibodies with antigen-specificity | |
| JP2021512618A (ja) | 閉鎖系におけるｃａｒ−ｔ細胞の製造方法 | |
| KR20220101641A (ko) | 세포 선택 및/또는 자극 장치 및 사용 방법 | |
| KR20240018454A (ko) | T 세포의 자극 및 형질도입 방법 | |
| JPWO2020089343A5 (ru) | ||
| JP2018042531A (ja) | キメラ抗原受容体 | |
| Wang et al. | Establishing cGMP manufacturing of CRISPR/Cas9-edited human CAR T cells | |
| US20230181641A1 (en) | Process for producing donor-batched cells expressing a recombinant receptor | |
| RU2778411C2 (ru) | Способы культивирования клеток и наборы и устройство для них |