RU2016131028A - COMPOSITIONS CONTAINING ASYMMETRIC INTERFERING RNA WHICH ARE K-RAS SILENCED AND WAYS OF APPLICATION - Google Patents

COMPOSITIONS CONTAINING ASYMMETRIC INTERFERING RNA WHICH ARE K-RAS SILENCED AND WAYS OF APPLICATION Download PDF

Info

Publication number
RU2016131028A
RU2016131028A RU2016131028A RU2016131028A RU2016131028A RU 2016131028 A RU2016131028 A RU 2016131028A RU 2016131028 A RU2016131028 A RU 2016131028A RU 2016131028 A RU2016131028 A RU 2016131028A RU 2016131028 A RU2016131028 A RU 2016131028A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
chain
nucleotides
rna molecule
duplex rna
length
Prior art date
Application number
RU2016131028A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2016131028A3 (en
Inventor
Чиан Дж. ЛИ
Original Assignee
Бостон Биомедикал, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Бостон Биомедикал, Инк. filed Critical Бостон Биомедикал, Инк.
Publication of RU2016131028A publication Critical patent/RU2016131028A/en
Publication of RU2016131028A3 publication Critical patent/RU2016131028A3/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1135—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against oncogenes or tumor suppressor genes
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7105—Natural ribonucleic acids, i.e. containing only riboses attached to adenine, guanine, cytosine or uracil and having 3'-5' phosphodiester links
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57446—Specifically defined cancers of stomach or intestine
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/5748—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving oncogenic proteins
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/82—Translation products from oncogenes
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
    • G01N2333/914—Hydrolases (3)

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Claims (56)

1. Способ лечения злокачественного новообразования у субъекта, нуждающегося в этом, причем указанный способ включает введение субъекту, нуждающемуся в этом, дуплексной молекулы РНК, содержащей1. A method of treating a malignant neoplasm in a subject in need thereof, said method comprising administering to a subject in need of a duplex RNA molecule comprising (i) первую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 18-23 нуклеотида, где нуклеотидная последовательность первой цепи по существу комплементарна последовательности-мишени мРНК K-Ras, и(i) a first chain containing a nucleotide sequence of 18-23 nucleotides in length, where the nucleotide sequence of the first chain is substantially complementary to the K-Ras mRNA target sequence, and (ii) вторую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 12-17 нуклеотидов, где вторая цепь по существу комплементарна первой цепи и образует двухцепочечный участок с первой цепью, где первая цепь имеет 3'-выступающий участок длиной 1-9 нуклеотидов и 5'-выступающий участок длиной 0-8 нуклеотидов,(ii) a second chain containing a nucleotide sequence of 12-17 nucleotides in length, where the second chain is essentially complementary to the first chain and forms a double-stranded region with the first chain, where the first chain has a 3'-protruding portion 1-9 nucleotides long and 5'-protruding plot 0-8 nucleotides long, и где указанная дуплексная молекула РНК способна вызывать селективный сайленсинг гена K-Ras.and wherein said duplex RNA molecule is capable of inducing selective silencing of the K-Ras gene. 2. Способ лечения злокачественного новообразования у выбранной популяции пациентов, причем указанный способ включает стадии:2. A method of treating malignant neoplasms in a selected patient population, said method comprising the steps of: (a) измерения уровня амплификации мутантного гена K-Ras в биологическом образце, полученном от подходящего пациента с диагностированным злокачественным новообразованием;(a) measuring the level of amplification of the mutant K-Ras gene in a biological sample obtained from a suitable patient with a diagnosed malignant neoplasm; (b) подтверждения, что уровень амплификации мутантного гена K-Ras у подходящего пациента выше эталонного уровня; и(b) confirming that the level of amplification of the mutant K-Ras gene in a suitable patient is higher than a reference level; and (c) введения подходящему пациенту дуплексной молекулы РНК, содержащей(c) administering to a suitable patient a duplex RNA molecule containing (i) первую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 18-23 нуклеотида, где нуклеотидная последовательность первой цепи по существу комплементарна последовательности-мишени мРНК K-Ras, и(i) a first chain containing a nucleotide sequence of 18-23 nucleotides in length, where the nucleotide sequence of the first chain is substantially complementary to the K-Ras mRNA target sequence, and (ii) вторую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 12-17 нуклеотидов, где вторая цепь по существу комплементарна первой цепи и образует двухцепочечный участок с первой цепью,(ii) a second chain containing a nucleotide sequence of 12-17 nucleotides in length, where the second chain is essentially complementary to the first chain and forms a double-stranded region with the first chain, где первая цепь имеет 3'-выступающий участок длиной 1-9 нуклеотидов, и 5'-выступающий участок длиной 0-8 нуклеотидов, и где указанная дуплексная молекула РНК способна вызывать селективный сайленсинг гена K-Ras.where the first chain has a 3'-protruding portion 1-9 nucleotides long, and a 5'-protruding portion 0-8 nucleotides long, and where said duplex RNA molecule is capable of causing selective silencing of the K-Ras gene. 3. Способ лечения злокачественного новообразования у выбранной популяции пациентов, причем указанный способ включает стадии:3. A method of treating malignant neoplasms in a selected patient population, said method comprising the steps of: (a) измерения уровня экспрессии мутантного гена K-Ras в биологическом образце, полученном от подходящего пациента с диагностированным злокачественным новообразованием;(a) measuring the expression level of the mutant K-Ras gene in a biological sample obtained from a suitable patient with a diagnosed malignant neoplasm; (b) подтверждения, что уровень экспрессии мутантного гена K-Ras у подходящего пациента выше эталонного уровня; и(b) confirming that the expression level of the mutant K-Ras gene in a suitable patient is higher than a reference level; and (c) введения подходящему пациенту дуплексной молекулы РНК, содержащей(c) administering to a suitable patient a duplex RNA molecule containing (i) первую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 18-23 нуклеотида, где нуклеотидная последовательность первой цепи по существу комплементарна последовательности-мишени мРНК K-Ras, и(i) a first chain containing a nucleotide sequence of 18-23 nucleotides in length, where the nucleotide sequence of the first chain is substantially complementary to the K-Ras mRNA target sequence, and (ii) вторую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 12-17 нуклеотидов,(ii) a second chain containing a nucleotide sequence 12-17 nucleotides long, где вторая цепь по существу комплементарна первой цепи и образует двухцепочечный участок с первой цепью, где первая цепь имеет 3'-выступающий участок длиной 1-9 нуклеотидов, и 5'-выступающий участок длиной 0-8 нуклеотидов, и где указанная дуплексная молекула РНК способна вызывать селективный сайленсинг гена K-Ras.where the second strand is essentially complementary to the first strand and forms a double-stranded region with a first strand, where the first strand has a 3'-protruding portion 1-9 nucleotides long, and a 5'-protruding stretch 0-8 nucleotides long, and where said duplex RNA molecule is capable of induce selective silencing of the K-Ras gene. 4. Способ по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что злокачественное новообразование представляет собой рак желудочно-кишечного тракта, или субъект страдает раком желудочно-кишечного тракта или предрасположен к указанному заболеванию.4. The method according to any one of paragraphs. 1-3, characterized in that the malignant neoplasm is a cancer of the gastrointestinal tract, or the subject suffers from cancer of the gastrointestinal tract or is predisposed to the specified disease. 5. Способ по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что нуклеотидная последовательность первой цепи содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70% комплементарна последовательности-мишени мРНК K-Ras.5. The method according to any one of paragraphs. 1-3, characterized in that the nucleotide sequence of the first chain contains a sequence that is at least 70% complementary to the K-Ras mRNA target sequence. 6. Способ по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что длина первой цепи составляет 19-23 нуклеотидов.6. The method according to any one of paragraphs. 1-3, characterized in that the length of the first chain is 19-23 nucleotides. 7. Способ по п. 6, отличающийся тем, что длина первой цепи составляет 21 нуклеотид.7. The method according to p. 6, characterized in that the length of the first chain is 21 nucleotides. 8. Способ по п. 7, отличающийся тем, что длина второй цепи составляет 14-16 нуклеотидов.8. The method according to p. 7, characterized in that the length of the second chain is 14-16 nucleotides. 9. Способ по п. 8, отличающийся тем, что длина второй цепи составляет 15 нуклеотидов.9. The method according to p. 8, characterized in that the length of the second chain is 15 nucleotides. 10. Способ по п. 9, отличающийся тем, что первая цепь имеет 3'-выступающий участок длиной 2-4 нуклеотида.10. The method according to p. 9, characterized in that the first chain has a 3'-protruding section with a length of 2-4 nucleotides. 11. Способ по п. 10, отличающийся тем, что первая цепь имеет 3'-выступающий участок длиной 3 нуклеотида.11. The method according to p. 10, characterized in that the first chain has a 3'-protruding section with a length of 3 nucleotides. 12. Способ по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что дуплексная молекула РНК содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид или его аналог.12. The method according to any one of paragraphs. 1-3, characterized in that the duplex RNA molecule contains at least one modified nucleotide or its analogue. 13. Способ по п. 12, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере, один модифицированный нуклеотид или его аналог представляет собой рибонуклеотид, модифицированный по сахару, остову и/или основанию.13. The method according to p. 12, characterized in that the at least one modified nucleotide or its analogue is a ribonucleotide modified in sugar, backbone and / or base. 14. Способ по п. 13, отличающийся тем, что рибонуклеотид, модифицированный по остову, содержит модификацию в фосфодиэфирной связи с другим рибонуклеотидом.14. The method according to p. 13, wherein the skeleton modified ribonucleotide comprises a modification in phosphodiester linkage with another ribonucleotide. 15. Способ по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что первая цепь содержит последовательность антисмысловой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 638-955.15. The method according to any one of paragraphs. 1-3, characterized in that the first chain contains an antisense chain sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 638-955. 16. Способ по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что вторая цепь содержит последовательность смысловой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 320-637.16. The method according to any one of paragraphs. 1-3, characterized in that the second chain contains a sequence of the sense chain selected from the group consisting of SEQ ID NO: 320-637. 17. Способ по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что первая цепь содержит последовательность антисмысловой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 638-955, и вторая цепь содержит последовательность смысловой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 320-637.17. The method according to any one of paragraphs. 1-3, characterized in that the first chain contains an antisense chain sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 638-955, and the second chain contains a sense chain sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 320-637 . 18. Способ по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что субъектом является человек.18. The method according to any one of paragraphs. 1-3, characterized in that the subject is a person. 19. Дуплексная молекула РНК, содержащая19. Duplex RNA molecule containing (i) первую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 18-23 нуклеотида, где нуклеотидная последовательность первой цепи по существу комплементарна последовательности-мишени мРНК K-Ras, и(i) a first chain containing a nucleotide sequence of 18-23 nucleotides in length, where the nucleotide sequence of the first chain is substantially complementary to the K-Ras mRNA target sequence, and (ii) вторую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 12-17 нуклеотидов,(ii) a second chain containing a nucleotide sequence 12-17 nucleotides long, где вторая цепь по существу комплементарна первой цепи и образует двухцепочечный участок с первой цепью, где первая цепь имеет 3'-выступающий участок длиной 1-9 нуклеотидов, и 5'-выступающий участок длиной 0-8 нуклеотидов, и где указанная дуплексная молекула РНК способна вызывать селективный сайленсинг гена K-Ras.where the second strand is essentially complementary to the first strand and forms a double-stranded region with a first strand, where the first strand has a 3'-protruding portion 1-9 nucleotides long, and a 5'-protruding stretch 0-8 nucleotides long, and where said duplex RNA molecule is capable of induce selective silencing of the K-Ras gene. 20. Дуплексная молекула РНК по п. 19, отличающаяся тем, что нуклеотидная последовательность первой цепи содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70% комплементарна последовательности-мишени мРНК K-Ras.20. The duplex RNA molecule according to claim 19, characterized in that the nucleotide sequence of the first chain contains a sequence that is at least 70% complementary to the K-Ras mRNA target sequence. 21. Дуплексная молекула РНК по п. 19 или 20, отличающаяся тем, что длина первой цепи составляет 19-23 нуклеотида.21. The duplex RNA molecule according to claim 19 or 20, characterized in that the length of the first chain is 19-23 nucleotides. 22. Дуплексная молекула РНК по п. 21, отличающаяся тем, что длина первой цепи составляет 21 нуклеотид.22. The duplex RNA molecule according to claim 21, characterized in that the length of the first chain is 21 nucleotides. 23. Дуплексная молекула РНК по п. 22, отличающаяся тем, что длина второй цепи составляет 14-16 нуклеотидов.23. The duplex RNA molecule according to claim 22, characterized in that the length of the second chain is 14-16 nucleotides. 24. Дуплексная молекула РНК по п. 23, отличающаяся тем, что длина второй цепи составляет 15 нуклеотидов.24. The duplex RNA molecule according to claim 23, wherein the length of the second chain is 15 nucleotides. 25. Дуплексная молекула РНК по п. 24, отличающаяся тем, что первая цепь имеет 3’-выступающий участок длиной 2-4 нуклеотида.25. The duplex RNA molecule according to p. 24, characterized in that the first chain has a 3’-protruding section with a length of 2-4 nucleotides. 26. Дуплексная молекула РНК по п. 25, отличающаяся тем, что первая цепь имеет 3'-выступающий участок длиной 3 нуклеотида.26. The duplex RNA molecule of claim 25, wherein the first strand has a 3 ′ protruding portion of 3 nucleotides in length. 27. Дуплексная молекула РНК по п. 19 или 20, отличающаяся тем, что указанная дуплексная молекула РНК содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид или его аналог.27. The duplex RNA molecule according to claim 19 or 20, characterized in that said duplex RNA molecule contains at least one modified nucleotide or its analogue. 28. Дуплексная молекула РНК по п. 27, отличающаяся тем, что указанный по меньшей мере один модифицированный нуклеотид или его аналог представляет собой рибонуклеотид, модифицированный по сахару, остову и/или основанию.28. The duplex RNA molecule of claim 27, wherein said at least one modified nucleotide or an analog thereof is a sugar, backbone and / or base modified ribonucleotide. 29. Дуплексная молекула РНК по п. 28, отличающаяся тем, что рибонуклеотид, модифицированный по остову, содержит модификацию в фосфодиэфирной связи с другим рибонуклеотидом.29. The duplex RNA molecule according to p. 28, characterized in that the ribonucleotide modified on the backbone contains a modification in phosphodiester linkage with another ribonucleotide. 30. Дуплексная молекула РНК по п. 19 или 20, отличающаяся тем, что первая цепь содержит последовательность антисмысловой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 638-955.30. The duplex RNA molecule according to claim 19 or 20, characterized in that the first chain contains an antisense chain sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 638-955. 31. Дуплексная молекула РНК по п. 19 или 20, отличающаяся тем, что вторая цепь содержит последовательность смысловой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 320-637.31. The duplex RNA molecule according to claim 19 or 20, characterized in that the second chain contains a sense strand sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 320-637. 32. Дуплексная молекула РНК по п. 19 или 20, отличающаяся тем, что первая цепь содержит последовательность антисмысловой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 638-955, и вторая цепь содержит последовательность смысловой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 320-637.32. The duplex RNA molecule according to claim 19 or 20, characterized in that the first chain contains an antisense chain sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 638-955, and the second chain contains a sense chain sequence selected from the group consisting of from SEQ ID NO: 320-637. 33. Способ лечения злокачественного новообразования у субъекта, нуждающегося в этом, включающий ингибирование экспрессии гена K-Ras или активности K-Ras у указанного субъекта.33. A method of treating cancer in a subject in need thereof, comprising inhibiting K-Ras gene expression or K-Ras activity in said subject. 34. Способ ингибирования выживаемости и/или пролиферации опухолевых стволовых клеток (ОСК) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий ингибирование экспрессии гена K-Ras или активности K-Ras у указанного субъекта.34. A method of inhibiting the survival and / or proliferation of tumor stem cells (OSCs) in a subject in need thereof, comprising inhibiting K-Ras gene expression or K-Ras activity in said subject. 35. Способ по п. 34, отличающийся тем, что ингибирование экспрессии гена K-Ras или активности K-Ras включает введение субъекту, нуждающемуся в этом, дуплексной молекулы РНК, содержащей35. The method of claim 34, wherein the inhibition of K-Ras gene expression or K-Ras activity comprises administering to a subject in need of a duplex RNA molecule comprising (i) первую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 18-23 нуклеотида, где нуклеотидная последовательность первой цепи по существу комплементарна последовательности-мишени мРНК K-Ras, и(i) a first chain containing a nucleotide sequence of 18-23 nucleotides in length, where the nucleotide sequence of the first chain is substantially complementary to the K-Ras mRNA target sequence, and (ii) вторую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность длиной 12-17 нуклеотидов,(ii) a second chain containing a nucleotide sequence 12-17 nucleotides long, где вторая цепь по существу комплементарна первой цепи и образует двухцепочечный участок с первой цепью, где первая цепь имеет 3'-выступающий участок длиной 1-9 нуклеотидов, и 5'-выступающий участок длиной 0-8 нуклеотидов, и где указанная дуплексная молекула РНК способна вызывать селективный сайленсинг гена K-Ras.where the second strand is essentially complementary to the first strand and forms a double-stranded region with a first strand, where the first strand has a 3'-protruding portion 1-9 nucleotides long, and a 5'-protruding stretch 0-8 nucleotides long, and where said duplex RNA molecule is capable of induce selective silencing of the K-Ras gene.
RU2016131028A 2014-03-14 2015-03-16 COMPOSITIONS CONTAINING ASYMMETRIC INTERFERING RNA WHICH ARE K-RAS SILENCED AND WAYS OF APPLICATION RU2016131028A (en)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201461953590P 2014-03-14 2014-03-14
US61/953,590 2014-03-14
US201562121721P 2015-02-27 2015-02-27
US62/121,721 2015-02-27
PCT/US2015/020776 WO2015139044A1 (en) 2014-03-14 2015-03-16 Asymmetric interfering rna compositions that silence k-ras and methods of uses thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2016131028A true RU2016131028A (en) 2018-04-17
RU2016131028A3 RU2016131028A3 (en) 2018-10-16

Family

ID=54072526

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016131028A RU2016131028A (en) 2014-03-14 2015-03-16 COMPOSITIONS CONTAINING ASYMMETRIC INTERFERING RNA WHICH ARE K-RAS SILENCED AND WAYS OF APPLICATION

Country Status (11)

Country Link
US (1) US20170016001A1 (en)
EP (1) EP3116890A4 (en)
JP (1) JP2017511302A (en)
KR (1) KR20160130986A (en)
CN (1) CN107428794A (en)
AU (1) AU2015229033A1 (en)
CA (1) CA2937767A1 (en)
HK (1) HK1232228A1 (en)
RU (1) RU2016131028A (en)
TW (1) TW201620525A (en)
WO (1) WO2015139044A1 (en)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2735166C (en) 2007-08-27 2020-12-01 Boston Biomedical, Inc. Compositions of asymmetric interfering rna and uses thereof
WO2018098352A2 (en) 2016-11-22 2018-05-31 Jun Oishi Targeting kras induced immune checkpoint expression
US10802213B2 (en) * 2018-12-27 2020-10-13 Juniper Networks, Inc. Photodetector with sequential asymmetric-width waveguides
CN111534520A (en) * 2020-05-27 2020-08-14 深圳市疾病预防控制中心（深圳市卫生检验中心、深圳市预防医学研究所） Construction and application of lentivirus and recombinant vector for specifically inhibiting K-ras gene expression

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030124513A1 (en) * 2001-05-29 2003-07-03 Mcswiggen James Enzymatic nucleic acid treatment of diseases or conditions related to levels of HIV
US20040121348A1 (en) * 2001-10-26 2004-06-24 Ribopharma Ag Compositions and methods for treating pancreatic cancer
JP2010519912A (en) * 2007-03-02 2010-06-10 エムディーアールエヌエー，インコーポレイテッド Nucleic acid compound for suppressing expression of RAS gene and use thereof
CA2735166C (en) * 2007-08-27 2020-12-01 Boston Biomedical, Inc. Compositions of asymmetric interfering rna and uses thereof
WO2013166004A2 (en) * 2012-05-02 2013-11-07 Novartis Ag Organic compositions to treat kras-related diseases

Also Published As

Publication number Publication date
EP3116890A4 (en) 2018-03-07
CA2937767A1 (en) 2015-09-17
TW201620525A (en) 2016-06-16
HK1232228A1 (en) 2018-01-05
US20170016001A1 (en) 2017-01-19
AU2015229033A1 (en) 2016-07-14
WO2015139044A1 (en) 2015-09-17
KR20160130986A (en) 2016-11-15
EP3116890A1 (en) 2017-01-18
CN107428794A (en) 2017-12-01
JP2017511302A (en) 2017-04-20
RU2016131028A3 (en) 2018-10-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2617877T3 (en) Asymmetric interfering RNA compositions and their use
CN103080314B (en) Dominant mutant genes expression inhibitor
RU2017132895A (en) A pharmaceutical composition for the treatment of cancer containing miRNA as an active ingredient
JP2018512110A5 (en)
JP2015142558A5 (en)
WO2009017803A3 (en) Antisense microrna and uses therefor
ES2192945B1 (en) A METHOD TO INTERFER WITH VIRUS INFECTION IN PLANTS.
JP2015507625A5 (en)
RU2016131028A (en) COMPOSITIONS CONTAINING ASYMMETRIC INTERFERING RNA WHICH ARE K-RAS SILENCED AND WAYS OF APPLICATION
Herr et al. MiR-127 and miR-376a act as tumor suppressors by in vivo targeting of COA1 and PDIA6 in giant cell tumor of bone
EA200870402A1 (en) PHARMACEUTICAL COMPOSITION
WO2006102461A3 (en) Influenza therapeutic
CY1121037T1 (en) ANTO-SENSORY POLYNUCLEOTIDS TO STILE EXTRACTION AND METHODS OF DYSTROPHY TREATMENT
RU2013102545A (en) Binding VEGFA S-RNA AND METHODS OF TREATING IN VIVO
EA201892366A1 (en) ANTISMINAL OLIGOMERS AND METHODS OF THEIR APPLICATION FOR THE TREATMENT OF DISEASES ASSOCIATED WITH THE GENE OF THE ACID ALPHA-GLUCOSIDASE
WO2005112636A3 (en) COMPOSITIONS AND METHODS FOR siRNA INHIBITION OF PRIMATE POLYOMAVIRUS GENES
EA201492148A1 (en) METHOD OF TREATMENT OF LITTLE-CELL LUNG CANCER
Dinh et al. Modulation of microRNAs in two genetically disparate chicken lines showing different necrotic enteritis disease susceptibility
Wang et al. The regulatory roles of miRNA and methylation on oncogene and tumor suppressor gene expression in pancreatic cancer cells
EA201391725A1 (en) METHOD OF TREATMENT OF LITTLE-CELL LUNG CANCER
JP6137484B2 (en) Double-stranded nucleic acid molecule for gene expression suppression
MX2020010802A (en) DOUBLE-STRANDED NUCLEIC ACID INHIBITOR MOLECULES MODIFIED WITH T<sub>M</sub>-INCREASING NUCLEOTIDES.
MX2007011665A (en) Influenza therapeutic.
EA201001266A1 (en) EFFECTIVE ANTI-TUMOR PARAMIXOVIRUSES
RU2014121304A (en) INHIBITION OF EXPRESSION OF VIRAL GENES

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20190204