RU2014104609A - Идентификация химических веществ с использованием хроматографического индекса удерживания - Google Patents

Идентификация химических веществ с использованием хроматографического индекса удерживания Download PDF

Info

Publication number
RU2014104609A
RU2014104609A RU2014104609/28A RU2014104609A RU2014104609A RU 2014104609 A RU2014104609 A RU 2014104609A RU 2014104609/28 A RU2014104609/28 A RU 2014104609/28A RU 2014104609 A RU2014104609 A RU 2014104609A RU 2014104609 A RU2014104609 A RU 2014104609A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
compound
retention index
standard
database
retention
Prior art date
Application number
RU2014104609/28A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2619395C2 (ru
Inventor
Чарльз САДОВСКИ
Грегер АНДЕРССОН
Кевин ДЖАДЖ
Original Assignee
Смитс Детекшен Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Смитс Детекшен Инк. filed Critical Смитс Детекшен Инк.
Publication of RU2014104609A publication Critical patent/RU2014104609A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2619395C2 publication Critical patent/RU2619395C2/ru

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16CCOMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/20Identification of molecular entities, parts thereof or of chemical compositions
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N30/86Signal analysis
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N30/86Signal analysis
    • G01N30/8665Signal analysis for calibrating the measuring apparatus
    • G01N30/8668Signal analysis for calibrating the measuring apparatus using retention times
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N30/86Signal analysis
    • G01N30/8675Evaluation, i.e. decoding of the signal into analytical information
    • G01N30/8686Fingerprinting, e.g. without prior knowledge of the sample components
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N30/04Preparation or injection of sample to be analysed
    • G01N2030/042Standards
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N30/62Detectors specially adapted therefor
    • G01N30/72Mass spectrometers
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N30/62Detectors specially adapted therefor
    • G01N30/72Mass spectrometers
    • G01N30/7206Mass spectrometers interfaced to gas chromatograph
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06FELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
    • G06F2218/00Aspects of pattern recognition specially adapted for signal processing
    • G06F2218/12Classification; Matching
    • G06F2218/14Classification; Matching by matching peak patterns

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Library & Information Science (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Computing Systems (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)

Abstract

1. Способ идентификации неизвестного соединения с использованием газовой хроматографии - масс-спектрометрии (ГХ-МС), включающий:а) оценку прогнозируемого индекса удерживания стандартного соединения на основе атомной структуры стандартного соединения, иб) присваивание прогнозируемого индекса удерживания стандартному соединению.2. Способ по п. 1, где стадия оценки включает:i) определение типа атома и типа связи для каждого атома стандартного соединения,ii) выбор сравнительного соединения из базы данных, при этом сравнительное соединение имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение,iii) присваивание коэффициента каждому атому сравнительного соединения, при этом данный коэффициент характеризует вклад атома в известный индекс удерживания сравнительного соединения, иiv) применение коэффициента для оценки индекса удерживания стандартного соединения.3. Способ по п. 2, включающий выбор множества сравнительных соединений из базы данных, чтобы обеспечить обучающий набор, при этом каждое соединение из обучающего набора имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение.4. Способ по п. 2, в котором присваивание коэффициента включает создание матрицы.5. Способ по п. 4, в котором столбец матрицы соответствует типу атома, а строка матрицы соответствует соединению из базы данных, при этом соединение имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение.6. Способ по п. 1, дополнительно включающий определение точ�

Claims (18)

1. Способ идентификации неизвестного соединения с использованием газовой хроматографии - масс-спектрометрии (ГХ-МС), включающий:
а) оценку прогнозируемого индекса удерживания стандартного соединения на основе атомной структуры стандартного соединения, и
б) присваивание прогнозируемого индекса удерживания стандартному соединению.
2. Способ по п. 1, где стадия оценки включает:
i) определение типа атома и типа связи для каждого атома стандартного соединения,
ii) выбор сравнительного соединения из базы данных, при этом сравнительное соединение имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение,
iii) присваивание коэффициента каждому атому сравнительного соединения, при этом данный коэффициент характеризует вклад атома в известный индекс удерживания сравнительного соединения, и
iv) применение коэффициента для оценки индекса удерживания стандартного соединения.
3. Способ по п. 2, включающий выбор множества сравнительных соединений из базы данных, чтобы обеспечить обучающий набор, при этом каждое соединение из обучающего набора имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение.
4. Способ по п. 2, в котором присваивание коэффициента включает создание матрицы.
5. Способ по п. 4, в котором столбец матрицы соответствует типу атома, а строка матрицы соответствует соединению из базы данных, при этом соединение имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение.
6. Способ по п. 1, дополнительно включающий определение точности оцененного индекса удерживания.
7. Способ по п. 6, дополнительно включающий сортировку базы данных с использованием точности оцененного индекса удерживания.
8. Способ по п. 6, дополнительно включающий разделение базы данных с использованием точности оцененного индекса удерживания.
9. Способ по п. 6, дополнительно включающий использование точности оцененного индекса удерживания для обеспечения интервала поиска.
10. Способ по п. 1, дополнительно включающий оценивание индекса удерживания неизвестного соединения, анализируемого с помощью ГХ-МС.
11. Способ по п. 10, в котором оценивание включает:
i) измерение времени удерживания неизвестного соединения,
ii) преобразование времени удерживания неизвестного соединения в индекс удерживания неизвестного соединения с использованием известного соотношения между временем удерживания и индексом удерживания.
12. Способ по п. 10, дополнительно включающий использование индекса удерживания неизвестного соединения для предварительного выбора стандартных соединений из базы данных и установление соответствия неизвестного соединения со стандартным соединением.
13. Способ идентификации неизвестного соединения с использованием ГХ-МС, включающий:
а) оценку индексов удерживания соединений из библиотеки стандартов на основе атомной структуры каждого соединения,
б) оценку индекса удерживания неизвестного соединения с использованием данных ГХ-МС по времени удерживания неизвестного соединения и известного соотношения между временем удерживания и индексом удерживания, и
в) использование индекса удерживания, оцененного для неизвестного соединения, для предварительного выбора подгруппы библиотечных соединений из библиотеки стандартов для последующей идентификации соответствия.
14. Система идентификации неизвестного соединения с использованием ГХ-МС, включающая:
а) устройство ГХ-МС,
б) базу данных стандартных соединений,
в) процессор, выполненный с возможностью осуществления способа по пп. 1-13.
15. Система по п. 14, в которой устройство ГХ-МС удалено от базы данных стандартных соединений.
16. Система по п. 14, в которой процессор выполнен с возможностью предоставления библиотеки стандартных соединений, упорядоченной по индексам удерживания.
17. Система по п. 14, в которой процессор выполнен с возможностью выбора подбиблиотеки из базы данных стандартных соединений.
18. Система по п. 14, в которой база данных стандартных соединений разделена на две или более подбиблиотеки.
RU2014104609A 2011-08-05 2012-08-03 Идентификация химических веществ с использованием хроматографического индекса удерживания RU2619395C2 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201161515722P 2011-08-05 2011-08-05
US61/515,722 2011-08-05
US201261647299P 2012-05-15 2012-05-15
US61/647,299 2012-05-15
PCT/US2012/049571 WO2013022771A1 (en) 2011-08-05 2012-08-03 Chemical identification using a chromatography retention index

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014104609A true RU2014104609A (ru) 2015-09-10
RU2619395C2 RU2619395C2 (ru) 2017-05-15

Family

ID=47668834

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014104609A RU2619395C2 (ru) 2011-08-05 2012-08-03 Идентификация химических веществ с использованием хроматографического индекса удерживания

Country Status (6)

Country Link
US (1) US20140274751A1 (ru)
EP (1) EP2739968A4 (ru)
JP (1) JP6110380B2 (ru)
CA (1) CA2843648C (ru)
RU (1) RU2619395C2 (ru)
WO (1) WO2013022771A1 (ru)

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB2482175B (en) * 2010-07-23 2016-01-13 Agilent Technologies Inc Fitting element with bio-compatible sealing
CA2906720C (en) 2013-03-15 2021-11-02 Smiths Detection Inc. Mass spectrometry (ms) identification algorithm
CA2940429A1 (en) * 2014-03-17 2015-09-24 Prism Analytical Technologies, Inc. Process and system for rapid sample analysis
WO2016002047A1 (ja) * 2014-07-03 2016-01-07 株式会社島津製作所 質量分析データ処理装置
EP3091354B1 (en) * 2015-05-04 2024-07-10 Alpha M.O.S. Method for detecting an analyte in a fluid sample
US10656128B2 (en) * 2016-04-15 2020-05-19 Mls Acq, Inc. System and method for gas sample analysis
CN108490106B (zh) * 2018-06-26 2020-01-21 华中科技大学 一种全二维气相色谱法中第二维保留指数的简便测定方法
CN109239247A (zh) * 2018-11-20 2019-01-18 西安交通大学 一种液相色谱无对照品定性分析方法
JP7569821B2 (ja) 2022-07-28 2024-10-18 日本電子株式会社 試料分析装置及び方法
US20240183829A1 (en) * 2022-12-05 2024-06-06 Halliburton Energy Services, Inc. Predictive chromatograph peak detection
KR20240142272A (ko) * 2023-03-21 2024-09-30 육군사관학교 산학협력단 화학물질 식별 시스템 및 방법

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4468742A (en) * 1981-03-17 1984-08-28 The Regents Of University Of California Microprocessor system for quantitative chromatographic data analysis
JPS63204146A (ja) * 1987-02-19 1988-08-23 Shimadzu Corp ガスクロマトグラフイ質量分析装置における定性分析方法
US5602755A (en) * 1995-06-23 1997-02-11 Exxon Research And Engineering Company Method for predicting chemical or physical properties of complex mixtures
US5827946A (en) * 1997-04-30 1998-10-27 Hewlett-Packard Company Method for sample identification using a locked retention time database
US6632268B2 (en) * 2001-02-08 2003-10-14 Oakland University Method and apparatus for comprehensive two-dimensional gas chromatography
US20030130799A1 (en) * 2001-04-05 2003-07-10 Charles Pidgeon Structure/properties correlation with membrane affinity profile
US20040023295A1 (en) * 2001-11-21 2004-02-05 Carol Hamilton Methods and systems for analyzing complex biological systems
JP4438674B2 (ja) * 2005-04-13 2010-03-24 株式会社島津製作所 ガスクロマトグラフ装置及び該装置のデータ処理方法
CA2616164A1 (en) * 2005-07-25 2007-02-01 Metanomics Gmbh Means and methods for analyzing a sample by means of chromatography-mass spectrometry
CN100458421C (zh) 2005-09-28 2009-02-04 沈百华 林下参与栽培人参的微量化学鉴别方法
CN101918583A (zh) * 2007-10-19 2010-12-15 查尔斯斯塔克德雷珀实验室公司 用于鉴定样品中细菌的挥发性有机化合物的快速检测
US7884318B2 (en) 2008-01-16 2011-02-08 Metabolon, Inc. Systems, methods, and computer-readable medium for determining composition of chemical constituents in a complex mixture

Also Published As

Publication number Publication date
JP2014524568A (ja) 2014-09-22
WO2013022771A1 (en) 2013-02-14
CA2843648A1 (en) 2013-02-14
EP2739968A4 (en) 2015-04-15
CA2843648C (en) 2022-10-25
EP2739968A1 (en) 2014-06-11
RU2619395C2 (ru) 2017-05-15
US20140274751A1 (en) 2014-09-18
JP6110380B2 (ja) 2017-04-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2014104609A (ru) Идентификация химических веществ с использованием хроматографического индекса удерживания
Ting et al. Peptide-centric proteome analysis: an alternative strategy for the analysis of tandem mass spectrometry data
JP6332440B2 (ja) 細胞の分化状態の評価方法
Arike et al. Spectral counting label-free proteomics
Marx et al. A large synthetic peptide and phosphopeptide reference library for mass spectrometry–based proteomics
EP4249605A3 (en) Methods for analyte detection
RU2015127769A (ru) Оборудование и способ отбора проб в пласте
MY145833A (en) Micro-hydrocarbon analysis
JP2020502544A5 (ru)
WO2010119261A8 (en) Method for quantifying modified peptides
WO2015067969A3 (en) Method, array and use thereof for determining pancreatic cancer
WO2018072862A8 (de) Verfahren zum auswerten von daten einer massenspektrometrie und massenspektrometrisches verfahren sowie ein maldi tof massenspektrometer
EP3225697A3 (en) Optimization of multigene analysis of tumor samples
CN103534578A (zh) 确定样本中存在的成分的光谱装置以及方法
ATE510208T1 (de) Probenanalyseverfahren und probenanalyseeinrichtung
RU2016107649A (ru) Способ и система для датчика кислорода
MX2015013596A (es) Metodos, dispositivos y sistemas para analisis de muestras.
RU2011140471A (ru) Способ диагностики эндометриоза и диагностический набор для эндометриоза
RU2017108906A (ru) Поиск в многочисленных источниках
Kim et al. Development of a model system of uncertainty evaluations for multiple measurements by isotope dilution mass spectrometry: determination of folic acid in infant formula
JP3707010B2 (ja) クロマトグラフ/質量分析装置における汎用多成分一斉同定・定量方法
TW200801506A (en) Method and device of identifying individuals
Heil et al. Building spectral libraries from narrow-window data-independent acquisition mass spectrometry data
WO2013006278A3 (en) Identity elucidation of unknown metabolites
JP2011209062A (ja) マススペクトルデータの二次解析方法およびマススペクトルデータの二次解析システム