RU2014104609A - Идентификация химических веществ с использованием хроматографического индекса удерживания - Google Patents
Идентификация химических веществ с использованием хроматографического индекса удерживания Download PDFInfo
- Publication number
- RU2014104609A RU2014104609A RU2014104609/28A RU2014104609A RU2014104609A RU 2014104609 A RU2014104609 A RU 2014104609A RU 2014104609/28 A RU2014104609/28 A RU 2014104609/28A RU 2014104609 A RU2014104609 A RU 2014104609A RU 2014104609 A RU2014104609 A RU 2014104609A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- compound
- retention index
- standard
- database
- retention
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
- G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
- G16C20/20—Identification of molecular entities, parts thereof or of chemical compositions
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/86—Signal analysis
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/86—Signal analysis
- G01N30/8665—Signal analysis for calibrating the measuring apparatus
- G01N30/8668—Signal analysis for calibrating the measuring apparatus using retention times
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/86—Signal analysis
- G01N30/8675—Evaluation, i.e. decoding of the signal into analytical information
- G01N30/8686—Fingerprinting, e.g. without prior knowledge of the sample components
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/04—Preparation or injection of sample to be analysed
- G01N2030/042—Standards
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/62—Detectors specially adapted therefor
- G01N30/72—Mass spectrometers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/62—Detectors specially adapted therefor
- G01N30/72—Mass spectrometers
- G01N30/7206—Mass spectrometers interfaced to gas chromatograph
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
- G06F2218/00—Aspects of pattern recognition specially adapted for signal processing
- G06F2218/12—Classification; Matching
- G06F2218/14—Classification; Matching by matching peak patterns
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Library & Information Science (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Computing Systems (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
Abstract
1. Способ идентификации неизвестного соединения с использованием газовой хроматографии - масс-спектрометрии (ГХ-МС), включающий:а) оценку прогнозируемого индекса удерживания стандартного соединения на основе атомной структуры стандартного соединения, иб) присваивание прогнозируемого индекса удерживания стандартному соединению.2. Способ по п. 1, где стадия оценки включает:i) определение типа атома и типа связи для каждого атома стандартного соединения,ii) выбор сравнительного соединения из базы данных, при этом сравнительное соединение имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение,iii) присваивание коэффициента каждому атому сравнительного соединения, при этом данный коэффициент характеризует вклад атома в известный индекс удерживания сравнительного соединения, иiv) применение коэффициента для оценки индекса удерживания стандартного соединения.3. Способ по п. 2, включающий выбор множества сравнительных соединений из базы данных, чтобы обеспечить обучающий набор, при этом каждое соединение из обучающего набора имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение.4. Способ по п. 2, в котором присваивание коэффициента включает создание матрицы.5. Способ по п. 4, в котором столбец матрицы соответствует типу атома, а строка матрицы соответствует соединению из базы данных, при этом соединение имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение.6. Способ по п. 1, дополнительно включающий определение точ�
Claims (18)
1. Способ идентификации неизвестного соединения с использованием газовой хроматографии - масс-спектрометрии (ГХ-МС), включающий:
а) оценку прогнозируемого индекса удерживания стандартного соединения на основе атомной структуры стандартного соединения, и
б) присваивание прогнозируемого индекса удерживания стандартному соединению.
2. Способ по п. 1, где стадия оценки включает:
i) определение типа атома и типа связи для каждого атома стандартного соединения,
ii) выбор сравнительного соединения из базы данных, при этом сравнительное соединение имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение,
iii) присваивание коэффициента каждому атому сравнительного соединения, при этом данный коэффициент характеризует вклад атома в известный индекс удерживания сравнительного соединения, и
iv) применение коэффициента для оценки индекса удерживания стандартного соединения.
3. Способ по п. 2, включающий выбор множества сравнительных соединений из базы данных, чтобы обеспечить обучающий набор, при этом каждое соединение из обучающего набора имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение.
4. Способ по п. 2, в котором присваивание коэффициента включает создание матрицы.
5. Способ по п. 4, в котором столбец матрицы соответствует типу атома, а строка матрицы соответствует соединению из базы данных, при этом соединение имеет известный индекс удерживания и состоит из атомов таких же типов и связей таких же типов, как и стандартное соединение.
6. Способ по п. 1, дополнительно включающий определение точности оцененного индекса удерживания.
7. Способ по п. 6, дополнительно включающий сортировку базы данных с использованием точности оцененного индекса удерживания.
8. Способ по п. 6, дополнительно включающий разделение базы данных с использованием точности оцененного индекса удерживания.
9. Способ по п. 6, дополнительно включающий использование точности оцененного индекса удерживания для обеспечения интервала поиска.
10. Способ по п. 1, дополнительно включающий оценивание индекса удерживания неизвестного соединения, анализируемого с помощью ГХ-МС.
11. Способ по п. 10, в котором оценивание включает:
i) измерение времени удерживания неизвестного соединения,
ii) преобразование времени удерживания неизвестного соединения в индекс удерживания неизвестного соединения с использованием известного соотношения между временем удерживания и индексом удерживания.
12. Способ по п. 10, дополнительно включающий использование индекса удерживания неизвестного соединения для предварительного выбора стандартных соединений из базы данных и установление соответствия неизвестного соединения со стандартным соединением.
13. Способ идентификации неизвестного соединения с использованием ГХ-МС, включающий:
а) оценку индексов удерживания соединений из библиотеки стандартов на основе атомной структуры каждого соединения,
б) оценку индекса удерживания неизвестного соединения с использованием данных ГХ-МС по времени удерживания неизвестного соединения и известного соотношения между временем удерживания и индексом удерживания, и
в) использование индекса удерживания, оцененного для неизвестного соединения, для предварительного выбора подгруппы библиотечных соединений из библиотеки стандартов для последующей идентификации соответствия.
14. Система идентификации неизвестного соединения с использованием ГХ-МС, включающая:
а) устройство ГХ-МС,
б) базу данных стандартных соединений,
в) процессор, выполненный с возможностью осуществления способа по пп. 1-13.
15. Система по п. 14, в которой устройство ГХ-МС удалено от базы данных стандартных соединений.
16. Система по п. 14, в которой процессор выполнен с возможностью предоставления библиотеки стандартных соединений, упорядоченной по индексам удерживания.
17. Система по п. 14, в которой процессор выполнен с возможностью выбора подбиблиотеки из базы данных стандартных соединений.
18. Система по п. 14, в которой база данных стандартных соединений разделена на две или более подбиблиотеки.
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201161515722P | 2011-08-05 | 2011-08-05 | |
US61/515,722 | 2011-08-05 | ||
US201261647299P | 2012-05-15 | 2012-05-15 | |
US61/647,299 | 2012-05-15 | ||
PCT/US2012/049571 WO2013022771A1 (en) | 2011-08-05 | 2012-08-03 | Chemical identification using a chromatography retention index |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2014104609A true RU2014104609A (ru) | 2015-09-10 |
RU2619395C2 RU2619395C2 (ru) | 2017-05-15 |
Family
ID=47668834
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2014104609A RU2619395C2 (ru) | 2011-08-05 | 2012-08-03 | Идентификация химических веществ с использованием хроматографического индекса удерживания |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20140274751A1 (ru) |
EP (1) | EP2739968A4 (ru) |
JP (1) | JP6110380B2 (ru) |
CA (1) | CA2843648C (ru) |
RU (1) | RU2619395C2 (ru) |
WO (1) | WO2013022771A1 (ru) |
Families Citing this family (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB2482175B (en) * | 2010-07-23 | 2016-01-13 | Agilent Technologies Inc | Fitting element with bio-compatible sealing |
CA2906720C (en) | 2013-03-15 | 2021-11-02 | Smiths Detection Inc. | Mass spectrometry (ms) identification algorithm |
CA2940429A1 (en) * | 2014-03-17 | 2015-09-24 | Prism Analytical Technologies, Inc. | Process and system for rapid sample analysis |
WO2016002047A1 (ja) * | 2014-07-03 | 2016-01-07 | 株式会社島津製作所 | 質量分析データ処理装置 |
EP3091354B1 (en) * | 2015-05-04 | 2024-07-10 | Alpha M.O.S. | Method for detecting an analyte in a fluid sample |
US10656128B2 (en) * | 2016-04-15 | 2020-05-19 | Mls Acq, Inc. | System and method for gas sample analysis |
CN108490106B (zh) * | 2018-06-26 | 2020-01-21 | 华中科技大学 | 一种全二维气相色谱法中第二维保留指数的简便测定方法 |
CN109239247A (zh) * | 2018-11-20 | 2019-01-18 | 西安交通大学 | 一种液相色谱无对照品定性分析方法 |
JP7569821B2 (ja) | 2022-07-28 | 2024-10-18 | 日本電子株式会社 | 試料分析装置及び方法 |
US20240183829A1 (en) * | 2022-12-05 | 2024-06-06 | Halliburton Energy Services, Inc. | Predictive chromatograph peak detection |
KR20240142272A (ko) * | 2023-03-21 | 2024-09-30 | 육군사관학교 산학협력단 | 화학물질 식별 시스템 및 방법 |
Family Cites Families (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4468742A (en) * | 1981-03-17 | 1984-08-28 | The Regents Of University Of California | Microprocessor system for quantitative chromatographic data analysis |
JPS63204146A (ja) * | 1987-02-19 | 1988-08-23 | Shimadzu Corp | ガスクロマトグラフイ質量分析装置における定性分析方法 |
US5602755A (en) * | 1995-06-23 | 1997-02-11 | Exxon Research And Engineering Company | Method for predicting chemical or physical properties of complex mixtures |
US5827946A (en) * | 1997-04-30 | 1998-10-27 | Hewlett-Packard Company | Method for sample identification using a locked retention time database |
US6632268B2 (en) * | 2001-02-08 | 2003-10-14 | Oakland University | Method and apparatus for comprehensive two-dimensional gas chromatography |
US20030130799A1 (en) * | 2001-04-05 | 2003-07-10 | Charles Pidgeon | Structure/properties correlation with membrane affinity profile |
US20040023295A1 (en) * | 2001-11-21 | 2004-02-05 | Carol Hamilton | Methods and systems for analyzing complex biological systems |
JP4438674B2 (ja) * | 2005-04-13 | 2010-03-24 | 株式会社島津製作所 | ガスクロマトグラフ装置及び該装置のデータ処理方法 |
CA2616164A1 (en) * | 2005-07-25 | 2007-02-01 | Metanomics Gmbh | Means and methods for analyzing a sample by means of chromatography-mass spectrometry |
CN100458421C (zh) | 2005-09-28 | 2009-02-04 | 沈百华 | 林下参与栽培人参的微量化学鉴别方法 |
CN101918583A (zh) * | 2007-10-19 | 2010-12-15 | 查尔斯斯塔克德雷珀实验室公司 | 用于鉴定样品中细菌的挥发性有机化合物的快速检测 |
US7884318B2 (en) | 2008-01-16 | 2011-02-08 | Metabolon, Inc. | Systems, methods, and computer-readable medium for determining composition of chemical constituents in a complex mixture |
-
2012
- 2012-08-03 EP EP12821427.7A patent/EP2739968A4/en not_active Withdrawn
- 2012-08-03 US US14/237,106 patent/US20140274751A1/en not_active Abandoned
- 2012-08-03 WO PCT/US2012/049571 patent/WO2013022771A1/en active Application Filing
- 2012-08-03 RU RU2014104609A patent/RU2619395C2/ru active
- 2012-08-03 JP JP2014524116A patent/JP6110380B2/ja active Active
- 2012-08-03 CA CA2843648A patent/CA2843648C/en active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2014524568A (ja) | 2014-09-22 |
WO2013022771A1 (en) | 2013-02-14 |
CA2843648A1 (en) | 2013-02-14 |
EP2739968A4 (en) | 2015-04-15 |
CA2843648C (en) | 2022-10-25 |
EP2739968A1 (en) | 2014-06-11 |
RU2619395C2 (ru) | 2017-05-15 |
US20140274751A1 (en) | 2014-09-18 |
JP6110380B2 (ja) | 2017-04-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2014104609A (ru) | Идентификация химических веществ с использованием хроматографического индекса удерживания | |
Ting et al. | Peptide-centric proteome analysis: an alternative strategy for the analysis of tandem mass spectrometry data | |
JP6332440B2 (ja) | 細胞の分化状態の評価方法 | |
Arike et al. | Spectral counting label-free proteomics | |
Marx et al. | A large synthetic peptide and phosphopeptide reference library for mass spectrometry–based proteomics | |
EP4249605A3 (en) | Methods for analyte detection | |
RU2015127769A (ru) | Оборудование и способ отбора проб в пласте | |
MY145833A (en) | Micro-hydrocarbon analysis | |
JP2020502544A5 (ru) | ||
WO2010119261A8 (en) | Method for quantifying modified peptides | |
WO2015067969A3 (en) | Method, array and use thereof for determining pancreatic cancer | |
WO2018072862A8 (de) | Verfahren zum auswerten von daten einer massenspektrometrie und massenspektrometrisches verfahren sowie ein maldi tof massenspektrometer | |
EP3225697A3 (en) | Optimization of multigene analysis of tumor samples | |
CN103534578A (zh) | 确定样本中存在的成分的光谱装置以及方法 | |
ATE510208T1 (de) | Probenanalyseverfahren und probenanalyseeinrichtung | |
RU2016107649A (ru) | Способ и система для датчика кислорода | |
MX2015013596A (es) | Metodos, dispositivos y sistemas para analisis de muestras. | |
RU2011140471A (ru) | Способ диагностики эндометриоза и диагностический набор для эндометриоза | |
RU2017108906A (ru) | Поиск в многочисленных источниках | |
Kim et al. | Development of a model system of uncertainty evaluations for multiple measurements by isotope dilution mass spectrometry: determination of folic acid in infant formula | |
JP3707010B2 (ja) | クロマトグラフ/質量分析装置における汎用多成分一斉同定・定量方法 | |
TW200801506A (en) | Method and device of identifying individuals | |
Heil et al. | Building spectral libraries from narrow-window data-independent acquisition mass spectrometry data | |
WO2013006278A3 (en) | Identity elucidation of unknown metabolites | |
JP2011209062A (ja) | マススペクトルデータの二次解析方法およびマススペクトルデータの二次解析システム |