RU2013115637A - Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии - Google Patents

Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии Download PDF

Info

Publication number
RU2013115637A
RU2013115637A RU2013115637/10A RU2013115637A RU2013115637A RU 2013115637 A RU2013115637 A RU 2013115637A RU 2013115637/10 A RU2013115637/10 A RU 2013115637/10A RU 2013115637 A RU2013115637 A RU 2013115637A RU 2013115637 A RU2013115637 A RU 2013115637A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
sequence
promoter
genetic construct
gene
seq
Prior art date
Application number
RU2013115637/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2533817C1 (ru
Inventor
Дина Викторовна Глазкова
Елена Владимировна Богословская
Михаил Леонидович Маркелов
Герман Александрович Шипулин
Валентин Иванович Покровский
Вадим Валентинович Покровский
Original Assignee
Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора) filed Critical Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора)
Priority to RU2013115637/10A priority Critical patent/RU2533817C1/ru
Publication of RU2013115637A publication Critical patent/RU2013115637A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2533817C1 publication Critical patent/RU2533817C1/ru

Links

Landscapes

  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

1. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает нуклеотидную последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности.2. Генетическая конструкция по п.1, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.3. Генетическая конструкция по п.1, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.4. Конструкция по пп.1, 2 или 3, дополнительно включающая молекулярный маркер, представляющий собой ген устойчивости к пуромицину, ген зеленого флуоресцентного белка или другую последовательность для селекции и/или мониторинга модифицированных клеток.5. Генетическая конструкция по пп.1, 2 или 3, где последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM 5a человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.6. Генетическая конструкция по пп.1, 2 или 3, где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2 или тетрациклин зависимый промотор.7. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает:векторную последовательность, обеспечивающую встраивание ДНК последовательностей в геном клетки человека, ипоследовательность, кодирующую модифиц�

Claims (40)

1. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает нуклеотидную последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности.
2. Генетическая конструкция по п.1, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.
3. Генетическая конструкция по п.1, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.
4. Конструкция по пп.1, 2 или 3, дополнительно включающая молекулярный маркер, представляющий собой ген устойчивости к пуромицину, ген зеленого флуоресцентного белка или другую последовательность для селекции и/или мониторинга модифицированных клеток.
5. Генетическая конструкция по пп.1, 2 или 3, где последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM 5a человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.
6. Генетическая конструкция по пп.1, 2 или 3, где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2 или тетрациклин зависимый промотор.
7. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает:
векторную последовательность, обеспечивающую встраивание ДНК последовательностей в геном клетки человека, и
последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности.
8. Генетическая конструкция по п.7, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.
9. Генетическая конструкция по п.7, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.
10. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM5a человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.
11. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена, UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2 или тетрациклин зависимый промотор.
12. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM5a человека, может быть в прямом или обратном направлении по отношению к вектору.
13. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, дополнительно включающая молекулярный маркер, представляющий собой ген устойчивости к пуромицину, ген зеленого флуоресцентного белка или другую последовательность для селекции и/или мониторинга модифицированных клеток.
14. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе ВИЧ-1, который включает, по меньшей мере, следующие области:
5'-LTR и 3'LTR,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ.
15. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе ВИЧ-1, который включает, по меньшей мере, следующие области:
5'-LTR и 3'LTR,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ,
и где последовательность вектора модифицирована с помощью последовательности SEQ ID N10 перед областью сРРТ.
16. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется самоинактивирующийся лентивирусный вектор, который включает, по меньшей мере, следующие области:
RSV/5'-LTR гибридный промотор,
3'LTR с делецией в области U3,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ.
17. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется самоинактивирующийся лентивирусный вектор, который включает, по меньшей мере, следующие области:
RSV/5'-LTR гибридный промотор,
3'LTR с делецией в области U3,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ,
и где последовательность вектора модифицирована с помощью последовательности SEQ ID N10 перед областью сРРТ.
18. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе одного или нескольких из лентивирусов: ВИЧ-1, ВИЧ-2, ВИО, вирус иммунодефицита крупного рогатого скота, лентивирус артрита-энцефалита коз, вирус инфекционной анемии лошадей, вирус иммунодефицита кошек, и/или вирус болезни Джембрана, или вектор, созданный на основе спумавируса.
19. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется невирусный вектор, созданный на основе векторной системы транспозон/транспозаза.
20. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где встраивание ДНК последовательности в определенное место хромосомы человека обеспечивается за счет внесения разрыва в заданный участок хромосомы с помощью специфической эндонуклеазы, и последующей гомологичной рекомбинации между векторными последовательностями, входящими в конструкции по пп.7, 8 или 9 и прилегающими к разрыву участками хромосомы.
21. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает:
последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности,
и одну или более последовательностей, выбранных из SEQ ID N 7, 8, 9, кодирующих искусственную микроРНК, которая ингибирует экспрессию гена рецептора человека CCR5 (miRNA CCR5).
22. Генетическая конструкция по п.21, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.
23. Генетическая конструкция по п.21, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.
24. Генетическая конструкция по пп.21-23, дополнительно включающая последовательность SEQ ID N4, кодирующую РНК шпильку, аналогичную TAR-последовательности (TAR), и/или антисмысловую последовательность к участку гена env ВИЧ SEQ ID N5 (а/s env).
25. Генетическая конструкция по пп.21-23, где, по меньшей мере, одна из последовательностей: микроРНК CCR5 и/или последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM 5α человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.
26. Генетическая конструкция по пп.21, 22 или 23 где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена, UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2, тетрациклин зависимый промотор или промотор РНК полимеразы III.
27. Конструкция по пп.21-23, дополнительно включающая молекулярный маркер, представляющий собой ген устойчивости к пуромицину, ген зеленого флуоресцентного белка или другую последовательность для селекции и/или мониторинга модифицированных клеток.
28. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает:
векторную последовательность, обеспечивающую встраивание ДНК последовательностей в геном клетки человека,
последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности,
и одну или более последовательностей, выбранных из SEQ ID N 7, 8, 9, кодирующих искусственную микроРНК, которая ингибирует экспрессию гена рецептора человека CCR5 (miRNA CCR5).
29. Генетическая конструкция по п.28, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.
30. Генетическая конструкция по п.28, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.
31. Генетическая конструкция по пп.28-30, дополнительно включающая последовательность SEQ ID N4, кодирующую РНК шпильку, аналогичную TAR-последовательности (TAR), и/или антисмысловую последовательность к участку гена env ВИЧ SEQ ID N5 (а/s env).
32. Генетическая конструкция по пп.28-30, где, по меньшей мере, одна из последовательностей: микроРНК CCR5 и/или последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM 5α человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.
33. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена, UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2, тетрациклин зависимый промотор или промотор РНК-полимеразы III.
34. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе ВИЧ-1, который включает, по меньшей мере, следующие области:
5'-LTR и 3'LTR,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ.
35. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе ВИЧ-1, который включает, по меньшей мере, следующие области:
5'-LTR и 3'LTR,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ
и где последовательность вектора модифицирована с помощью последовательности SEQ ID N1 перед областью сРРТ
36. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется самоинактивирующийся лентивирусный вектор, который включает, по меньшей мере, следующие области:
RSV/5'-LTR гибридный промотор,
3'LTR с делецией в области U3,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ.
37. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется самоинактивирующийся лентивирусный вектор, который включает, по меньшей мере, следующие области:
RSV/5'-LTR гибридный промотор,
3'LTR с делецией в области U3,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ,
и где последовательность вектора модифицирована с помощью последовательности SEQ ID N1 перед областью сРРТ.
38. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе одного или нескольких из лентивирусов: ВИЧ-1, ВИЧ-2, ВИО, вирус иммунодефицита крупного рогатого скота, лентивирус артрита-энцефалита коз, вирус инфекционной анемии лошадей, вирус иммунодефицита кошек, и/или вирус болезни Джембрана, или вектор, созданный на основе спумавируса.
39. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется невирусный вектор, созданный на основе векторной системы транспозон/транспозаза.
40. Генетическая конструкция по пп.28-30, где встраивание ДНК последовательности в определенное место хромосомы человека обеспечивается за счет внесения разрыва в заданный участок хромосомы с помощью специфической эндонуклеазы, и последующей гомологичной рекомбинации между векторными последовательностями, входящими в конструкции по пп.28, 29 или 30 и прилегающими к разрыву участками хромосомы.
RU2013115637/10A 2013-04-08 2013-04-08 Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии RU2533817C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2013115637/10A RU2533817C1 (ru) 2013-04-08 2013-04-08 Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2013115637/10A RU2533817C1 (ru) 2013-04-08 2013-04-08 Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2013115637A true RU2013115637A (ru) 2014-10-20
RU2533817C1 RU2533817C1 (ru) 2014-11-20

Family

ID=53380025

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2013115637/10A RU2533817C1 (ru) 2013-04-08 2013-04-08 Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2533817C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114480503A (zh) * 2021-12-20 2022-05-13 北京镁伽科技有限公司 用dna标签标记的基因过表达慢病毒质粒文库及其制备方法和应用

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2592675C1 (ru) * 2015-06-11 2016-07-27 Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора) СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЯ ЭКСПРЕССИИ ХИМЕРНОГО ГЕНА Trim5a

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1835032A1 (en) * 2006-03-14 2007-09-19 Université de Liège A self-inactivating recombinant lentiviral vector for the inhibition of HIV replication
RU2426788C1 (ru) * 2010-03-01 2011-08-20 Федеральное государственное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФГУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора) Генетические конструкции для антивич-терапии

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114480503A (zh) * 2021-12-20 2022-05-13 北京镁伽科技有限公司 用dna标签标记的基因过表达慢病毒质粒文库及其制备方法和应用

Also Published As

Publication number Publication date
RU2533817C1 (ru) 2014-11-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
OhAinle et al. A virus-packageable CRISPR screen identifies host factors mediating interferon inhibition of HIV
JP7568513B2 (ja) フソソーム組成物およびその使用
US11976277B2 (en) Particle delivery systems
JP2018534937A5 (ru)
US8828718B2 (en) Gene transfer vectors comprising genetic insulator elements and methods to identify genetic insulator elements
Pluta et al. Use of HIV as a gene transfer vector
HRP20180184T1 (hr) Retrovirusni vektori s modificiranim polipurinskim nizom
JP2011505835A5 (ru)
JP2018513681A5 (ru)
JP2010520757A5 (ru)
KR20180079351A (ko) 레트로바이러스 생산을 위한 안정한 세포주
US11104902B2 (en) Splice inhibiting oligonucleotides
JP2019500030A5 (ru)
WO2019056015A2 (en) STRONG ISOLATOR AND ITS USES IN GENE ADMINISTRATION
Brown et al. Robust, reversible gene knockdown using a single lentiviral short hairpin RNA vector
Aurélie et al. Lentiviral vectors: a powerful tool to target astrocytes in vivo
Li et al. Two genetic determinants acquired late in Mus evolution regulate the inclusion of exon 5, which alters mouse APOBEC3 translation efficiency
US20180127470A1 (en) Cell Lines
RU2018118204A (ru) Улучшенные эукариотические клетки для получения белка и способы их получения
US20210348192A1 (en) Method for increasing lentiviral vector production
RU2013115637A (ru) Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии
RU2426788C1 (ru) Генетические конструкции для антивич-терапии
ES2744448T5 (es) Vectores para la expresión transgénica
WO2013121194A1 (en) Materials and methods relating to packaging cell lines
Spirin et al. Lentiviral vectors

Legal Events

Date Code Title Description
HE4A Change of address of a patent owner

Effective date: 20200824