RU2013115637A - Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии - Google Patents
Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии Download PDFInfo
- Publication number
- RU2013115637A RU2013115637A RU2013115637/10A RU2013115637A RU2013115637A RU 2013115637 A RU2013115637 A RU 2013115637A RU 2013115637/10 A RU2013115637/10 A RU 2013115637/10A RU 2013115637 A RU2013115637 A RU 2013115637A RU 2013115637 A RU2013115637 A RU 2013115637A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- sequence
- promoter
- genetic construct
- gene
- seq
- Prior art date
Links
Landscapes
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
1. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает нуклеотидную последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности.2. Генетическая конструкция по п.1, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.3. Генетическая конструкция по п.1, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.4. Конструкция по пп.1, 2 или 3, дополнительно включающая молекулярный маркер, представляющий собой ген устойчивости к пуромицину, ген зеленого флуоресцентного белка или другую последовательность для селекции и/или мониторинга модифицированных клеток.5. Генетическая конструкция по пп.1, 2 или 3, где последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM 5a человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.6. Генетическая конструкция по пп.1, 2 или 3, где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2 или тетрациклин зависимый промотор.7. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает:векторную последовательность, обеспечивающую встраивание ДНК последовательностей в геном клетки человека, ипоследовательность, кодирующую модифиц�
Claims (40)
1. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает нуклеотидную последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности.
2. Генетическая конструкция по п.1, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.
3. Генетическая конструкция по п.1, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.
4. Конструкция по пп.1, 2 или 3, дополнительно включающая молекулярный маркер, представляющий собой ген устойчивости к пуромицину, ген зеленого флуоресцентного белка или другую последовательность для селекции и/или мониторинга модифицированных клеток.
5. Генетическая конструкция по пп.1, 2 или 3, где последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM 5a человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.
6. Генетическая конструкция по пп.1, 2 или 3, где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2 или тетрациклин зависимый промотор.
7. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает:
векторную последовательность, обеспечивающую встраивание ДНК последовательностей в геном клетки человека, и
последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности.
8. Генетическая конструкция по п.7, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.
9. Генетическая конструкция по п.7, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.
10. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM5a человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.
11. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена, UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2 или тетрациклин зависимый промотор.
12. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM5a человека, может быть в прямом или обратном направлении по отношению к вектору.
13. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, дополнительно включающая молекулярный маркер, представляющий собой ген устойчивости к пуромицину, ген зеленого флуоресцентного белка или другую последовательность для селекции и/или мониторинга модифицированных клеток.
14. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе ВИЧ-1, который включает, по меньшей мере, следующие области:
5'-LTR и 3'LTR,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ.
15. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе ВИЧ-1, который включает, по меньшей мере, следующие области:
5'-LTR и 3'LTR,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ,
и где последовательность вектора модифицирована с помощью последовательности SEQ ID N10 перед областью сРРТ.
16. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется самоинактивирующийся лентивирусный вектор, который включает, по меньшей мере, следующие области:
RSV/5'-LTR гибридный промотор,
3'LTR с делецией в области U3,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ.
17. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется самоинактивирующийся лентивирусный вектор, который включает, по меньшей мере, следующие области:
RSV/5'-LTR гибридный промотор,
3'LTR с делецией в области U3,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ,
и где последовательность вектора модифицирована с помощью последовательности SEQ ID N10 перед областью сРРТ.
18. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе одного или нескольких из лентивирусов: ВИЧ-1, ВИЧ-2, ВИО, вирус иммунодефицита крупного рогатого скота, лентивирус артрита-энцефалита коз, вирус инфекционной анемии лошадей, вирус иммунодефицита кошек, и/или вирус болезни Джембрана, или вектор, созданный на основе спумавируса.
19. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где в качестве вектора используется невирусный вектор, созданный на основе векторной системы транспозон/транспозаза.
20. Генетическая конструкция по пп.7, 8 или 9, где встраивание ДНК последовательности в определенное место хромосомы человека обеспечивается за счет внесения разрыва в заданный участок хромосомы с помощью специфической эндонуклеазы, и последующей гомологичной рекомбинации между векторными последовательностями, входящими в конструкции по пп.7, 8 или 9 и прилегающими к разрыву участками хромосомы.
21. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает:
последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности,
и одну или более последовательностей, выбранных из SEQ ID N 7, 8, 9, кодирующих искусственную микроРНК, которая ингибирует экспрессию гена рецептора человека CCR5 (miRNA CCR5).
22. Генетическая конструкция по п.21, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.
23. Генетическая конструкция по п.21, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.
24. Генетическая конструкция по пп.21-23, дополнительно включающая последовательность SEQ ID N4, кодирующую РНК шпильку, аналогичную TAR-последовательности (TAR), и/или антисмысловую последовательность к участку гена env ВИЧ SEQ ID N5 (а/s env).
25. Генетическая конструкция по пп.21-23, где, по меньшей мере, одна из последовательностей: микроРНК CCR5 и/или последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM 5α человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.
26. Генетическая конструкция по пп.21, 22 или 23 где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена, UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2, тетрациклин зависимый промотор или промотор РНК полимеразы III.
27. Конструкция по пп.21-23, дополнительно включающая молекулярный маркер, представляющий собой ген устойчивости к пуромицину, ген зеленого флуоресцентного белка или другую последовательность для селекции и/или мониторинга модифицированных клеток.
28. Генетическая конструкция для антиВИЧ терапии, которая включает:
векторную последовательность, обеспечивающую встраивание ДНК последовательностей в геном клетки человека,
последовательность, кодирующую модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3) и отличающуюся от исходной последовательности SEQ ID N2 множественными синонимичными заменами, обеспечивающими увеличение процента GC пар в составе ДНК последовательности,
и одну или более последовательностей, выбранных из SEQ ID N 7, 8, 9, кодирующих искусственную микроРНК, которая ингибирует экспрессию гена рецептора человека CCR5 (miRNA CCR5).
29. Генетическая конструкция по п.28, где процент GC пар в последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), составляет от 49 до 64%.
30. Генетическая конструкция по п.28, где в качестве последовательности, кодирующей модифицированный белок TRIM 5α человека (SEQ ID N3), использована последовательность SEQ ID N1.
31. Генетическая конструкция по пп.28-30, дополнительно включающая последовательность SEQ ID N4, кодирующую РНК шпильку, аналогичную TAR-последовательности (TAR), и/или антисмысловую последовательность к участку гена env ВИЧ SEQ ID N5 (а/s env).
32. Генетическая конструкция по пп.28-30, где, по меньшей мере, одна из последовательностей: микроРНК CCR5 и/или последовательность, кодирующая модифицированный белок TRIM 5α человека, находится под контролем конститутивного, тканеспецифичного или индуцибельного промотора.
33. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве промотора используется один из следующих промоторов: промотор гена PGK, гена EF1α, гена, UbC, промотор генов МНС класса II, промотор гена Т-клеточного рецептора, промотор гена β-интерферона, промотор гена IL2, промотор гена рецептора IL2, тетрациклин зависимый промотор или промотор РНК-полимеразы III.
34. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе ВИЧ-1, который включает, по меньшей мере, следующие области:
5'-LTR и 3'LTR,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ.
35. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе ВИЧ-1, который включает, по меньшей мере, следующие области:
5'-LTR и 3'LTR,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ
и где последовательность вектора модифицирована с помощью последовательности SEQ ID N1 перед областью сРРТ
36. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется самоинактивирующийся лентивирусный вектор, который включает, по меньшей мере, следующие области:
RSV/5'-LTR гибридный промотор,
3'LTR с делецией в области U3,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ.
37. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется самоинактивирующийся лентивирусный вектор, который включает, по меньшей мере, следующие области:
RSV/5'-LTR гибридный промотор,
3'LTR с делецией в области U3,
участок связывания специфической тРНК (PBS),
упаковочный сигнал (Ψ),
rev-отвечающий элемент (RRE),
посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита североамериканского лесного сурка (WPRE),
область сРРТ,
и где последовательность вектора модифицирована с помощью последовательности SEQ ID N1 перед областью сРРТ.
38. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется лентивирусный вектор на основе одного или нескольких из лентивирусов: ВИЧ-1, ВИЧ-2, ВИО, вирус иммунодефицита крупного рогатого скота, лентивирус артрита-энцефалита коз, вирус инфекционной анемии лошадей, вирус иммунодефицита кошек, и/или вирус болезни Джембрана, или вектор, созданный на основе спумавируса.
39. Генетическая конструкция по пп.28-30, где в качестве вектора используется невирусный вектор, созданный на основе векторной системы транспозон/транспозаза.
40. Генетическая конструкция по пп.28-30, где встраивание ДНК последовательности в определенное место хромосомы человека обеспечивается за счет внесения разрыва в заданный участок хромосомы с помощью специфической эндонуклеазы, и последующей гомологичной рекомбинации между векторными последовательностями, входящими в конструкции по пп.28, 29 или 30 и прилегающими к разрыву участками хромосомы.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2013115637/10A RU2533817C1 (ru) | 2013-04-08 | 2013-04-08 | Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2013115637/10A RU2533817C1 (ru) | 2013-04-08 | 2013-04-08 | Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2013115637A true RU2013115637A (ru) | 2014-10-20 |
| RU2533817C1 RU2533817C1 (ru) | 2014-11-20 |
Family
ID=53380025
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2013115637/10A RU2533817C1 (ru) | 2013-04-08 | 2013-04-08 | Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2533817C1 (ru) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN114480503A (zh) * | 2021-12-20 | 2022-05-13 | 北京镁伽科技有限公司 | 用dna标签标记的基因过表达慢病毒质粒文库及其制备方法和应用 |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2592675C1 (ru) * | 2015-06-11 | 2016-07-27 | Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора) | СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЯ ЭКСПРЕССИИ ХИМЕРНОГО ГЕНА Trim5a |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP1835032A1 (en) * | 2006-03-14 | 2007-09-19 | Université de Liège | A self-inactivating recombinant lentiviral vector for the inhibition of HIV replication |
| RU2426788C1 (ru) * | 2010-03-01 | 2011-08-20 | Федеральное государственное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФГУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора) | Генетические конструкции для антивич-терапии |
-
2013
- 2013-04-08 RU RU2013115637/10A patent/RU2533817C1/ru active
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN114480503A (zh) * | 2021-12-20 | 2022-05-13 | 北京镁伽科技有限公司 | 用dna标签标记的基因过表达慢病毒质粒文库及其制备方法和应用 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2533817C1 (ru) | 2014-11-20 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| OhAinle et al. | A virus-packageable CRISPR screen identifies host factors mediating interferon inhibition of HIV | |
| JP7568513B2 (ja) | フソソーム組成物およびその使用 | |
| US11976277B2 (en) | Particle delivery systems | |
| JP2018534937A5 (ru) | ||
| US8828718B2 (en) | Gene transfer vectors comprising genetic insulator elements and methods to identify genetic insulator elements | |
| Pluta et al. | Use of HIV as a gene transfer vector | |
| HRP20180184T1 (hr) | Retrovirusni vektori s modificiranim polipurinskim nizom | |
| JP2011505835A5 (ru) | ||
| JP2018513681A5 (ru) | ||
| JP2010520757A5 (ru) | ||
| KR20180079351A (ko) | 레트로바이러스 생산을 위한 안정한 세포주 | |
| US11104902B2 (en) | Splice inhibiting oligonucleotides | |
| JP2019500030A5 (ru) | ||
| WO2019056015A2 (en) | STRONG ISOLATOR AND ITS USES IN GENE ADMINISTRATION | |
| Brown et al. | Robust, reversible gene knockdown using a single lentiviral short hairpin RNA vector | |
| Aurélie et al. | Lentiviral vectors: a powerful tool to target astrocytes in vivo | |
| Li et al. | Two genetic determinants acquired late in Mus evolution regulate the inclusion of exon 5, which alters mouse APOBEC3 translation efficiency | |
| US20180127470A1 (en) | Cell Lines | |
| RU2018118204A (ru) | Улучшенные эукариотические клетки для получения белка и способы их получения | |
| US20210348192A1 (en) | Method for increasing lentiviral vector production | |
| RU2013115637A (ru) | Усовершенствование генетических конструкций для повышения эффективности антивич терапии | |
| RU2426788C1 (ru) | Генетические конструкции для антивич-терапии | |
| ES2744448T5 (es) | Vectores para la expresión transgénica | |
| WO2013121194A1 (en) | Materials and methods relating to packaging cell lines | |
| Spirin et al. | Lentiviral vectors |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| HE4A | Change of address of a patent owner |
Effective date: 20200824 |