RU2012145776A - Прогнозирование раннего вирусологического ответа при лечении заражения вирусом гепатита с - Google Patents

Прогнозирование раннего вирусологического ответа при лечении заражения вирусом гепатита с Download PDF

Info

Publication number
RU2012145776A
RU2012145776A RU2012145776/10A RU2012145776A RU2012145776A RU 2012145776 A RU2012145776 A RU 2012145776A RU 2012145776/10 A RU2012145776/10 A RU 2012145776/10A RU 2012145776 A RU2012145776 A RU 2012145776A RU 2012145776 A RU2012145776 A RU 2012145776A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
individual
therapy
ribavirin
nucleotide
interferon
Prior art date
Application number
RU2012145776/10A
Other languages
English (en)
Inventor
Том ЧУ
Лоран ЭССЬЮ
Сорен ГЕРМЕР
Юрий ЛОПАТИН
Нэнси ШУЛЬМАН
Джеймс ТОММС
Original Assignee
Ф.Хоффманн-Ля Рош Аг
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ф.Хоффманн-Ля Рош Аг filed Critical Ф.Хоффманн-Ля Рош Аг
Publication of RU2012145776A publication Critical patent/RU2012145776A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes
    • C12Q1/706—Specific hybridization probes for hepatitis
    • C12Q1/707—Specific hybridization probes for hepatitis non-A, non-B Hepatitis, excluding hepatitis D
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes
    • C12Q1/706—Specific hybridization probes for hepatitis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10T—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION
    • Y10T436/00—Chemistry: analytical and immunological testing
    • Y10T436/14—Heterocyclic carbon compound [i.e., O, S, N, Se, Te, as only ring hetero atom]
    • Y10T436/142222—Hetero-O [e.g., ascorbic acid, etc.]
    • Y10T436/143333—Saccharide [e.g., DNA, etc.]

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

1. Способ прогнозирования раннего вирусологического ответа у человеческого индивида, инфицированного ВГС, на интерфероновую терапию, включающий:предоставление образца от указанного человеческого индивида и определение нуклеотида, присутствующего в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860, при этом присутствие по меньшей мере одной аллели с нуклеотидом С в rs12979860 у указанного индивида указывает на более высокую вероятность достижения раннего вирусологического ответа, по сравнению с индивидом, имеющем две аллели с нуклеотидом Т в rs12979860.2. Способ по п.1, в котором указанный индивид инфицирован ВГС с генотипом 1.3. Способ по п.2, в котором указанный индивид ранее не получал лечение с помощью интерферона.4. Способ по п.3, в котором указанная интерфероновая терапия включает терапию, выбранную из группы, включающей монотерапию пэгинтерфероном альфа-2а, терапию пэгинтерфероном альфа-2а с рибавирином или интерфероном альфа-2b с рибавирином.5. Способ по п.2, в котором у указанного индивида не был достигнут ранний вирусологический ответ в результате предшествующего лечения с помощью пэгинтерферона альфа-2b с рибавирином.6. Способ по п.5, в котором указанная интерфероновая терапия включает терапию с помощью пэгинтерферона альфа-2а с рибавирином.7. Способ прогнозирования раннего вирусологического ответа от человеческого индивида, инфицированного ВГС, на интерфероновую терапию, способ, включающий:предоставление образца от указанного человеческого индивида и выявление нуклеотида, присутствующего в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860, при этом наличие двух аллелей с нуклеотидом Т в rs12979860 у указанного индивида указывает на более

Claims (21)

1. Способ прогнозирования раннего вирусологического ответа у человеческого индивида, инфицированного ВГС, на интерфероновую терапию, включающий:
предоставление образца от указанного человеческого индивида и определение нуклеотида, присутствующего в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860, при этом присутствие по меньшей мере одной аллели с нуклеотидом С в rs12979860 у указанного индивида указывает на более высокую вероятность достижения раннего вирусологического ответа, по сравнению с индивидом, имеющем две аллели с нуклеотидом Т в rs12979860.
2. Способ по п.1, в котором указанный индивид инфицирован ВГС с генотипом 1.
3. Способ по п.2, в котором указанный индивид ранее не получал лечение с помощью интерферона.
4. Способ по п.3, в котором указанная интерфероновая терапия включает терапию, выбранную из группы, включающей монотерапию пэгинтерфероном альфа-2а, терапию пэгинтерфероном альфа-2а с рибавирином или интерфероном альфа-2b с рибавирином.
5. Способ по п.2, в котором у указанного индивида не был достигнут ранний вирусологический ответ в результате предшествующего лечения с помощью пэгинтерферона альфа-2b с рибавирином.
6. Способ по п.5, в котором указанная интерфероновая терапия включает терапию с помощью пэгинтерферона альфа-2а с рибавирином.
7. Способ прогнозирования раннего вирусологического ответа от человеческого индивида, инфицированного ВГС, на интерфероновую терапию, способ, включающий:
предоставление образца от указанного человеческого индивида и выявление нуклеотида, присутствующего в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860, при этом наличие двух аллелей с нуклеотидом Т в rs12979860 у указанного индивида указывает на более высокую вероятность отсутствия раннего вирусологического ответа, по сравнению с индивидом, имеющим по меньшей мере одну аллель с нуклеотидом С в rs12979860.
8. Способ по п.7, в котором указанный индивид инфицирован ВГС с генотипом 1.
9. Способ по п.8, в котором указанный индивид ранее не получал лечение с помощью интерфероном.
10. Способ по п.9, в котором указанная интерфероновая терапия включает терапию, выбранную из группы, включающей монотерапию с помощью пэгинтерферона альфа-2а, терапию с помощью пэгинтерферона альфа-2а с рибавирином или интерферона альфа-2b с рибавирином.
11. Способ по п.8, в котором у указанного индивида не был достигнут ранний вирусологический ответ в результате предыдущего лечения с помощью пэгинтерферона альфа-2b с рибавирином.
12. Способ по п.11, в котором указанная интерфероновая терапия включает терапию с помощью пэгинтерферона альфа-2а с рибавирином.
13. Способ выбора продолжительности интерфероновой терапии для достижения устойчивого вирусологического ответа у индивида, инфицированного ВГС, в котором указанная интерфероновая терапия выбрана из терапии с помощью пэгинтерферона альфа-2а с рибавирином, пэгинтерферона альфа-2а с противовирусным агентом прямого действия, пэгинтерферона альфа-2а с рибавирином и противовирусным агентом прямого действия, или с помощью рибавирина с противовирусным агентом прямого действия (с помощью эндогенного интерферона), способ включающий:
предоставление образца от указанного человеческого индивида и выявление нуклеотида, присутствующего в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860, при этом присутствие по меньшей мере одной аллели с нуклеотидом С в rs12979860 у указанного индивида указывает на необходимость меньшей продолжительности указанной интерфероной терапии для достижения устойчивого вирусологического ответа, по сравнению с индивидом, имеющим две аллели с нуклеотидом Т в rs12979860.
14. Способ по п.13, в котором указанный индивид инфицирован ВГС с генотипом 1.
15. Способ по п.14, в котором указанный противовирусный агент прямого действия представляет собой ингибитор протеазы ВГС.
16. Способ прогнозирования ответа у человеческого индивида, инфицированного ВГС, на терапию с помощью пэгинтерферона альфа-2а, рибавирина и противовирусного агента прямого действия, способ включающий:
предоставление образца от указанного человеческого индивида и выявление нуклеотида, присутствующего в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860, при этом присутствие по меньшей мере одной аллели С в rs12979860 у указанного индивида указывает на более высокую вероятность достижения раннего вирусологического ответа или устойчивого вирусологического у указанного индивида на указанную терапию, по сравнению с индивидом, имеющим две аллели с нуклеотидом Т в rs12979860.
17. Способ по п.16, в котором указанный индивид инфицирован ВГС с генотипом 1.
18. Способ по п.17, в котором противовирусный агент прямого действия представляет собой ингибитор протеазы ВГС.
19. Способ прогнозирования реакции человеческого индивида, инфицированного ВГС, на терапию с помощью пэгинтерферона альфа-2а, рибавирина и противовирусного средства прямого действия, способ включающий:
предоставление образца от указанного человеческого индивида и выявление нуклеотида, присутствующего в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860, при этом наличие двух аллелей Т rs12979860 у указанного индивида указывает на более высокую вероятность отсутствия достижения раннего вирусологического ответа или устойчивого вирусологического ответа у указанного индивида на указанную терапию, по сравнению с индивидом, имеющим по меньшей мере одну аллель с нуклеотидом С в rs12979860.
20. Способ по п.19, в котором указанный индивид инфицирован ВГС с генотипом 1.
21. Способ по п.20, в котором указанный противовирусный агент прямого действия представляет собой ингибитор протеазы ВГС.
RU2012145776/10A 2010-04-13 2011-04-11 Прогнозирование раннего вирусологического ответа при лечении заражения вирусом гепатита с RU2012145776A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US32349210P 2010-04-13 2010-04-13
US61/323,492 2010-04-13
PCT/EP2011/055587 WO2011128280A1 (en) 2010-04-13 2011-04-11 Prediction of early virological response in hcv treatment

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2012145776A true RU2012145776A (ru) 2014-05-20

Family

ID=44276039

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012145776/10A RU2012145776A (ru) 2010-04-13 2011-04-11 Прогнозирование раннего вирусологического ответа при лечении заражения вирусом гепатита с

Country Status (10)

Country Link
US (1) US20120094284A1 (ru)
EP (1) EP2558601A1 (ru)
JP (1) JP2013529068A (ru)
KR (1) KR20130024914A (ru)
CN (1) CN102869792A (ru)
BR (1) BR112012026124A2 (ru)
CA (1) CA2794595A1 (ru)
MX (1) MX2012011805A (ru)
RU (1) RU2012145776A (ru)
WO (1) WO2011128280A1 (ru)

Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20120107278A1 (en) * 2010-10-29 2012-05-03 Pharmasset, Inc. Abbreviated hcv therapy for hcv infected patients with il28b c/c genotype
SG10201602044WA (en) 2011-09-16 2016-04-28 Gilead Pharmassett Llc Methods For Treating HCV
US20130137084A1 (en) * 2011-11-28 2013-05-30 Roche Molecular Systems, Inc. Single Nucleotide Polymorphism on Chromosome 15 That Predicts HCV Treatment Responses
US8889159B2 (en) 2011-11-29 2014-11-18 Gilead Pharmasset Llc Compositions and methods for treating hepatitis C virus
CA2852867C (en) 2013-01-31 2016-12-06 Gilead Pharmasset Llc Combination formulation of two antiviral compounds
CN108220424A (zh) * 2018-02-05 2018-06-29 广州和康医疗技术有限公司 一种检测il28基因位点的方法及试剂盒

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6936694B1 (en) 1982-05-06 2005-08-30 Intermune, Inc. Manufacture and expression of large structural genes
CA2735439A1 (en) * 2008-08-28 2010-03-04 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Analysis of hcv genotypes

Also Published As

Publication number Publication date
CA2794595A1 (en) 2011-10-20
EP2558601A1 (en) 2013-02-20
JP2013529068A (ja) 2013-07-18
BR112012026124A2 (pt) 2016-11-22
CN102869792A (zh) 2013-01-09
KR20130024914A (ko) 2013-03-08
MX2012011805A (es) 2012-12-17
WO2011128280A1 (en) 2011-10-20
US20120094284A1 (en) 2012-04-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Dietz et al. Deep sequencing reveals mutagenic effects of ribavirin during monotherapy of hepatitis C virus genotype 1-infected patients
Scherzer et al. Early virologic response and IL28B polymorphisms in patients with chronic hepatitis C genotype 3 treated with peginterferon alfa-2a and ribavirin
RU2012145776A (ru) Прогнозирование раннего вирусологического ответа при лечении заражения вирусом гепатита с
Attar et al. A new twist to a chronic HCV infection: occult hepatitis C
Sharma et al. Acute hepatitis C: management in the rapidly evolving world of HCV
WO2008024763A3 (en) Identification and characterization of hcv replicon variants with reduced susceptibility to hcv-796, and methods related thereto
Kwo Phase III results in Genotype 1 naive patients: predictors of response with boceprevir and telaprevir combined with pegylated interferon and ribavirin
RU2013109732A (ru) Прогноз кинетики вируса гепатита с при лечении, исключающем интерферон
RU2013146234A (ru) Выбор терапии гепатита с
Testoni et al. Ribavirin restores IFNα responsiveness in HCV-infected livers by epigenetic remodelling at interferon stimulated genes
RU2014124032A (ru) Однонуклеотидный полиморфизм на хромосоме 15, который позволяет прогнозировать восприимчивость к лечению вируса гепатита с
Yu et al. New treatments for HCV: Perspective from A sia
Eltahla et al. Cross-genotypic examination of hepatitis C virus polymerase inhibitors reveals a novel mechanism of action for thumb binders
Schweitzer et al. Impact of host and virus genome variability on HCV replication and response to interferon
Fried The role of triple therapy in HCV genotype 1‐experienced patients
Mobasheri et al. Evaluation of TRIM5 and TRIM22 polymorphisms on treatment responses in Iranian patients with chronic hepatitis C virus infection
NZ599373A (en) Biomarkers for predicting rapid response to hcv treatment
Blackard et al. Evidence of distinct populations of hepatitis C virus in the liver and plasma of patients co‐infected with HIV and HCV
Selzner et al. Hepatic gene expression and prediction of therapy response in chronic hepatitis C patients
Akhtar et al. Genotypes of hepatitis C virus in relapsed and non-respondent patients and their response to anti-viral therapy in district Mardan, Khyber Pakhtunkhawa, Pakistan
RU2012145777A (ru) Однонуклеотидные полиморфизмы для прогнозирования результатов лечения заражения вирусом гепатита с
Xie et al. Association between IFNL4 rs368234815 polymorphism and sustained virological response in chronic hepatitis C patients undergoing PEGylated interferon/ribavirin therapy: a meta-analysis
Polyak et al. Liver abnormalities after elimination of HCV infection: persistent epigenetic and immunological perturbations post-cure. Pathogens. 2021; 10 (1): 44
Abdallah et al. Impact of HCV Genome Structure on Responder to Pegylated Interferon Therapy in Egyptian Patients.
Echeverría et al. Molecular evolution of hepatitis C virus: from epidemiology to antiviral therapy (current research in Latin America)

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20140414