RU2012119469A - QUANTITATIVE DETERMINATION OF IR-A AND IR-B FOR CLASSIFICATION OF TUMORS - Google Patents

QUANTITATIVE DETERMINATION OF IR-A AND IR-B FOR CLASSIFICATION OF TUMORS Download PDF

Info

Publication number
RU2012119469A
RU2012119469A RU2012119469/10A RU2012119469A RU2012119469A RU 2012119469 A RU2012119469 A RU 2012119469A RU 2012119469/10 A RU2012119469/10 A RU 2012119469/10A RU 2012119469 A RU2012119469 A RU 2012119469A RU 2012119469 A RU2012119469 A RU 2012119469A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
sequence
nucleic acid
seq
complementary
biological sample
Prior art date
Application number
RU2012119469/10A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Цзяци ХУАН
Крис МОРХАУЗ
Кати СТРЕЙЧЕР
Брэндон В. ХИГГС
Ихун ЯО
Тереза ЛАВАЛЛЬ
Original Assignee
МЕДИММЬЮН, ЭлЭлСи
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by МЕДИММЬЮН, ЭлЭлСи filed Critical МЕДИММЬЮН, ЭлЭлСи
Publication of RU2012119469A publication Critical patent/RU2012119469A/en

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6851—Quantitative amplification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Abstract

1. Синтетическая нуклеиновая кислота, содержащая 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов, где последовательность синтетической нуклеиновой кислоты содержит, по меньшей мере, 10-20 следующих друг за другом нуклеотидов любой из следующих последовательностей:(i) SEQ ID NO: 3, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 3 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;(ii) SEQ ID NO: 4, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 4 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;(iii) SEQ ID NO: 5, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 5 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; или(iv) SEQ ID NO: 6, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 6 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях.2. Набор праймеров для детекции и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-A в биологическом образце, где набор праймеров включает(a) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов последних 50 оснований экзона 10 гена INSR (SEQ ID NO: 1), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 1 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; и(b) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов первых 60 оснований экзона 12 гена INSR (SEQ ID NO: 2), комплементарную ей последователь�1. A synthetic nucleic acid containing 10-30 consecutive nucleotides, where the synthetic nucleic acid sequence contains at least 10-20 consecutive nucleotides of any of the following sequences: (i) SEQ ID NO: 3, complementary a sequence or sequence thereof capable of hybridizing with SEQ ID NO: 3 or a sequence complementary to it under stringent conditions; (ii) SEQ ID NO: 4, a complementary sequence thereof or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 4 or a sequence complementary to it under stringent conditions; (iii) SEQ ID NO: 5, a sequence complementary to it or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 5 or a sequence complementary to it under stringent conditions; or (iv) SEQ ID NO: 6, a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 6 or a sequence complementary to it under stringent conditions. 2. A primer kit for detecting and / or quantifying an IR-A nucleic acid sequence in a biological sample, where the primer kit includes (a) a synthetic nucleic acid sequence containing 10-30 consecutive nucleotides of the last 50 bases of exon 10 of the INSR gene (SEQ ID NO: 1), a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 1 or a sequence complementary to it under stringent conditions; and (b) a synthetic nucleic acid sequence containing 10-30 successive nucleotides of the first 60 bases of exon 12 of the INSR gene (SEQ ID NO: 2), complementary to its sequence�

Claims (14)

1. Синтетическая нуклеиновая кислота, содержащая 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов, где последовательность синтетической нуклеиновой кислоты содержит, по меньшей мере, 10-20 следующих друг за другом нуклеотидов любой из следующих последовательностей:1. A synthetic nucleic acid containing 10-30 consecutive nucleotides, where the synthetic nucleic acid sequence contains at least 10-20 consecutive nucleotides of any of the following sequences: (i) SEQ ID NO: 3, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 3 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;(i) SEQ ID NO: 3, a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 3 or a sequence complementary to it under stringent conditions; (ii) SEQ ID NO: 4, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 4 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;(ii) SEQ ID NO: 4, a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 4 or a sequence complementary to it under stringent conditions; (iii) SEQ ID NO: 5, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 5 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; или(iii) SEQ ID NO: 5, a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 5 or a sequence complementary to it under stringent conditions; or (iv) SEQ ID NO: 6, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 6 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях.(iv) SEQ ID NO: 6, a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 6 or a sequence complementary to it under stringent conditions. 2. Набор праймеров для детекции и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-A в биологическом образце, где набор праймеров включает2. A set of primers for detecting and / or quantifying the nucleic acid sequence of IR-A in a biological sample, where the set of primers includes (a) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов последних 50 оснований экзона 10 гена INSR (SEQ ID NO: 1), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 1 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; и(a) a synthetic nucleic acid sequence containing 10-30 consecutive nucleotides of the last 50 bases of exon 10 of the INSR gene (SEQ ID NO: 1), a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 1 or a sequence complementary to it in harsh conditions; and (b) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов первых 60 оснований экзона 12 гена INSR (SEQ ID NO: 2), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 2 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях.(b) a synthetic nucleic acid sequence containing 10-30 consecutive nucleotides of the first 60 bases of exon 12 of the INSR gene (SEQ ID NO: 2), a complementary sequence thereof, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 2 or its complementary sequence in harsh conditions. 3. Способ детекции и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-A в биологическом образце, включающий этапы:3. A method for detecting and / or quantifying an IR-A nucleic acid sequence in a biological sample, comprising the steps of: (a) приведения биологического образца или нуклеиновых кислот, приготовленных из биологического образца, в контакт с набором праймеров по п.2 в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы; и(a) bringing the biological sample or nucleic acids prepared from the biological sample into contact with the set of primers according to claim 2 under conditions suitable for amplification based on a polymerase; and (b) детектирования и/или количественного определения амплифицированной последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-A.(b) detecting and / or quantifying the amplified IR-A target nucleic acid sequence. 4. Синтетическая нуклеиновая кислота, содержащая 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов, где последовательность синтетической нуклеиновой кислоты содержит, по меньшей мере, 10-20 следующих друг за другом нуклеотидов любой из следующих последовательностей:4. A synthetic nucleic acid containing 10-30 consecutive nucleotides, where the synthetic nucleic acid sequence contains at least 10-20 consecutive nucleotides of any of the following sequences: (i) SEQ ID NO: 11, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 11 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; или(i) SEQ ID NO: 11, a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 11 or a sequence complementary to it under stringent conditions; or (ii) SEQ ID NO: 12, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 12 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях.(ii) SEQ ID NO: 12, a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 12 or a sequence complementary to it under stringent conditions. 5. Набор праймеров для детекции и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце, где набор праймеров включает:5. A set of primers for detection and / or quantification of the nucleic acid sequence of IR-B in a biological sample, where the set of primers includes: (a) (i) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов последних 50 оснований экзона 10 гена INSR (SEQ ID NO: 1), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 1 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;(a) (i) a synthetic nucleic acid sequence containing 10-30 consecutive nucleotides of the last 50 bases of exon 10 of the INSR gene (SEQ ID NO: 1), a complementary sequence thereof, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 1 or her complementary sequence in harsh conditions; (a) (ii) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов экзона 11 гена INSR (SEQ ID NO: 9), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 9 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;(a) (ii) a synthetic nucleic acid sequence containing 10-30 consecutive nucleotides of exon 11 of the INSR gene (SEQ ID NO: 9), a complementary sequence thereof, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 9 or its complementary sequence in harsh conditions; a) (iii) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов соединяющих экзоны 10 и 11, комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с ней или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; иa) (iii) a synthetic nucleic acid sequence containing 10-30 successive nucleotides connecting exons 10 and 11, a sequence complementary to it, or a sequence capable of hybridizing with it or a sequence complementary to it under stringent conditions; and (b) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов первых 50 оснований экзона 12 гена INSR (SEQ ID NO: 10), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 10 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях, или последовательность, ей комплементарную.(b) a synthetic nucleic acid sequence containing 10-30 successive nucleotides of the first 50 bases of exon 12 of the INSR gene (SEQ ID NO: 10), a complementary sequence thereof, or a sequence capable of hybridizing with SEQ ID NO: 10 or its complementary sequence in harsh conditions, or a sequence complementary to her. 6. Способ детекции и/или количественного определения нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце, включающий этапы:6. A method for detecting and / or quantifying an IR-B nucleic acid in a biological sample, comprising the steps of: (a) приведения биологического образца или нуклеиновых кислот, приготовленных из биологического образца, в контакт с набором праймеров по п.5 в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы; и(a) bringing the biological sample or nucleic acids prepared from the biological sample into contact with the set of primers according to claim 5 under conditions suitable for amplification based on a polymerase; and (б) детектирования и/или количественного определения амплифицированной последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-B.(b) detecting and / or quantifying the amplified IR-B target nucleic acid sequence. 7. Способ определения присутствия или отсутствия последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-A и последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце, включающий:7. A method for determining the presence or absence of an IR-A nucleic acid target sequence and an IR-B nucleic acid target sequence in a biological sample, comprising: приведение биологического образца или образца нуклеиновых кислот, приготовленного из биологического образца, в контакт с набором праймеров для детектирования и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-A в биологическом образце в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы, где набор праймеров включает набор праймеров по п.2, и/или приведение биологического образца или образца нуклеиновых кислот, приготовленного из биологического образца, в контакт с набором праймеров для детектирования и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы, где набор праймеров по пункту включает набор праймеров по п.5; иbringing a biological sample or a nucleic acid sample prepared from a biological sample into contact with a set of primers for detecting and / or quantifying the IR-A nucleic acid sequence in a biological sample under conditions suitable for polymerase-based amplification, where the primer set includes a set of primers according to claim 2, and / or bringing a biological sample or a nucleic acid sample prepared from a biological sample into contact with a set of primers for detection and / or quantifying an IR-B nucleic acid sequence in a biological sample under conditions suitable for polymerase-based amplification, wherein the primer set according to claim includes the primer set according to claim 5; and детектирование и/или количественное определение амплифицированной последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-A или IR-B.detecting and / or quantifying an amplified target sequence of an IR-A or IR-B nucleic acid target. 8. Способ выбора пациента, восприимчивого к лиганду IGFI/II или агонисту рецептора IGFR1, где способ включает:8. A method for selecting a patient susceptible to an IGFI / II ligand or an IGFR1 receptor agonist, wherein the method comprises: детектирование и/или количественное определение экспрессии IR-A в образце в соответствии с п.3;detecting and / or quantifying the expression of IR-A in the sample in accordance with claim 3; детектирование и/или количественное определение экспрессии IR-B в образце в соответствии с п.6; иdetecting and / or quantifying the expression of IR-B in the sample in accordance with claim 6; and где экспрессия IR-A и IR-B служит показателем того, следует ли вводить субъекту лиганд IGFI/II или антагонист рецептора IGFR1.where the expression of IR-A and IR-B serves as an indicator of whether the subject should be introduced ligand IGFI / II or an antagonist of the IGFR1 receptor. 9. Способ по п.8, отличающийся тем, что лиганд IGFI/II или антагонист рецептора IGFR1 является антителом.9. The method of claim 8, wherein the IGFI / II ligand or IGFR1 receptor antagonist is an antibody. 10. Способ по п.9, отличающийся тем, что антитело содержит компоненты последовательностей, перечисленных в таблице 1 и таблице 2.10. The method according to claim 9, characterized in that the antibody contains components of the sequences listed in table 1 and table 2. 11. Способ определения относительного присутствия или отсутствия последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-A и последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце, включающий:11. A method for determining the relative presence or absence of an IR-A nucleic acid target sequence and an IR-B nucleic acid target sequence in a biological sample, comprising: приведение биологического образца или нуклеиновых кислот, приготовленных из биологического образца, в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы, в контакт с набором праймеров по п.2;bringing a biological sample or nucleic acids prepared from a biological sample under conditions suitable for amplification based on a polymerase into contact with a set of primers according to claim 2; приведение биологического образца или нуклеиновых кислот, приготовленных из биологического образца, в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы, в контакт с набором праймеров по п.5;bringing a biological sample or nucleic acids prepared from a biological sample under conditions suitable for amplification based on a polymerase into contact with a set of primers according to claim 5; количественное определение амплифицированной последовательности нуклеиновой кислоты IR-A и IR; иquantification of the amplified IR-A and IR nucleic acid sequence; and и посредством этого определение относительной экспрессии IR-A в сравнении с IR-B в биологическом образце.and thereby determining the relative expression of IR-A compared to IR-B in a biological sample. 12. Способ классифицирования опухоли, включающий12. A method for classifying a tumor, including определение относительной экспрессии IR-A в сравнении с IR-B в образце опухоли способом по п.11,determining the relative expression of IR-A in comparison with IR-B in a tumor sample by the method according to claim 11, классификацию опухоли в соответствии с критериями, включающими относительную экспрессию IR-A и IR-B.tumor classification according to criteria including relative expression of IR-A and IR-B. 13. Способ лечения пациента с применением антагониста IGF, включающий13. A method of treating a patient using an IGF antagonist, comprising определение относительной экспрессии IR-A в сравнении с IR-B в образце ткани способом по п.11,determining the relative expression of IR-A in comparison with IR-B in a tissue sample by the method according to claim 11, классификацию пациента в соответствии с критериями, включающими относительную экспрессию IR-A и IR-B; иclassifying a patient according to criteria including relative expression of IR-A and IR-B; and введение антагониста IGF в соответствии с классификацией.the introduction of an IGF antagonist in accordance with the classification. 14. Способ классифицирования подтипа опухоли рака груди, включающий определение относительной экспрессии IR-A в сравнении с IR-B в образце раковой опухоли груди способом по п.11; и классификацию подтипа опухоли рака груди как люминал-B, если соотношение IR-A:IR-B ниже, чем пороговое значение. 14. A method for classifying a subtype of a breast cancer tumor, comprising determining the relative expression of IR-A compared to IR-B in a breast cancer tumor sample according to claim 11; and classifying a breast cancer tumor subtype as luminal-B if the ratio of IR-A: IR-B is lower than the threshold value.
RU2012119469/10A 2009-10-12 2010-10-11 QUANTITATIVE DETERMINATION OF IR-A AND IR-B FOR CLASSIFICATION OF TUMORS RU2012119469A (en)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US25078009P 2009-10-12 2009-10-12
US61/250,780 2009-10-12
PCT/US2010/052173 WO2011046871A1 (en) 2009-10-12 2010-10-11 Quantification of ir-a and ir-b for tumor classification

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2012119469A true RU2012119469A (en) 2013-11-20

Family

ID=43876463

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012119469/10A RU2012119469A (en) 2009-10-12 2010-10-11 QUANTITATIVE DETERMINATION OF IR-A AND IR-B FOR CLASSIFICATION OF TUMORS

Country Status (11)

Country Link
US (1) US9150927B2 (en)
EP (1) EP2488667A4 (en)
JP (1) JP5859970B2 (en)
KR (1) KR20120093956A (en)
CN (2) CN102639711A (en)
AU (1) AU2010307020B2 (en)
BR (1) BR112012008672A2 (en)
CA (1) CA2777369A1 (en)
MX (1) MX2012004299A (en)
RU (1) RU2012119469A (en)
WO (1) WO2011046871A1 (en)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2805346B1 (en) * 2012-01-10 2018-05-30 Expression Pathology, Inc. Srm/mrm assay for the insulin receptor protein

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU4825699A (en) * 1998-06-19 2000-01-05 Genzyme Corporation Identification and use of differentially expressed genes and polynucleotide sequences
WO1999065928A2 (en) * 1998-06-19 1999-12-23 Genzyme Corporation Polynucleotide population isolated from non-metastatic and metastatic breast tumor tissues
AU2002309083A1 (en) 2001-03-30 2002-10-15 Biocrine Ab Method for identifying drugs for the treatment of type ii diabetes
AU2002312211A1 (en) * 2001-06-01 2002-12-16 Clingenix, Inc. Methods and reagents for diagnosis and treatment of insulin resistance and related conditions
AU2002357871A1 (en) * 2001-12-21 2003-07-15 Smithkline Beecham Corporation High throughput correlation of polymorphic forms with multiple phenotypes within clinical populations
US20050256649A1 (en) 2001-12-21 2005-11-17 Roses Allen D High throughput correlation of polymorphic forms with multiple phenotypes within clinical populations
CA2518956A1 (en) * 2003-03-10 2004-09-23 Applera Corporation Single nucleotide polymorphisms associated with stenosis, methods of detection and uses thereof
US7732154B2 (en) * 2003-04-25 2010-06-08 Medical And Biological Laboratories Co., Ltd. Methods for measuring the insulin receptor α subunit
CN1759834B (en) * 2004-09-17 2010-06-23 中国医学科学院医药生物技术研究所 Application of berberine or associated with Simvastatin in preparing product for preventing or curing disease or symptom related to blood fat
US20080171318A1 (en) * 2004-09-30 2008-07-17 Epigenomics Ag Epigenetic Methods and Nucleic Acids for the Detection of Lung Cell Proliferative Disorders
KR100565698B1 (en) * 2004-12-29 2006-03-28 디지탈 지노믹스(주) AML B- B-ALL T T-ALL Markers for the diagnosis of AML B-ALL and T-ALL
AU2007257094B2 (en) * 2006-05-05 2012-10-25 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating expression of SGLT2
US7547684B2 (en) * 2006-05-11 2009-06-16 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5′-modified bicyclic nucleic acid analogs
CA2665371A1 (en) * 2006-10-12 2008-06-12 Institute Of Virology Mn/ca9 splice variants
US9084770B2 (en) * 2008-10-14 2015-07-21 Antisense Therapeutics, Ltd. Modulation of insulin like growth factor I receptor expression in cancer

Also Published As

Publication number Publication date
CN105861698A (en) 2016-08-17
MX2012004299A (en) 2012-10-05
JP5859970B2 (en) 2016-02-16
AU2010307020A1 (en) 2012-05-17
JP2013507144A (en) 2013-03-04
EP2488667A4 (en) 2013-07-10
EP2488667A1 (en) 2012-08-22
AU2010307020B2 (en) 2015-09-24
WO2011046871A1 (en) 2011-04-21
US9150927B2 (en) 2015-10-06
US20120283121A1 (en) 2012-11-08
BR112012008672A2 (en) 2017-05-23
CN102639711A (en) 2012-08-15
CA2777369A1 (en) 2011-04-21
KR20120093956A (en) 2012-08-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2022200667B2 (en) Methylated markers for colorectal cancer
EP3198026B1 (en) Method of determining pik3ca mutational status in a sample
CN114341367B (en) Molecular typing and survival risk gene group for lung adenocarcinoma, diagnostic product and application
RU2491289C2 (en) Polynucleotide primers
Venesio et al. Liquid biopsies for monitoring temporal genomic heterogeneity in breast and colon cancers
JP2010528585A (en) Usefulness of B-RAF DNA mutations in the diagnosis and treatment of cancer
JP2009077712A5 (en)
JP6609551B2 (en) Method for performing polymerase chain reaction and related uses
Becker et al. Changes in the miRNA profile under the influence of anabolic steroids in bovine liver
RU2012119469A (en) QUANTITATIVE DETERMINATION OF IR-A AND IR-B FOR CLASSIFICATION OF TUMORS
JP2017529852A (en) Method for predicting responsiveness to treatment with an EGFR inhibitor
CN102732618A (en) Kit used for detecting relative expression of AML1-ETO fusion gene
KR101335483B1 (en) Method of Detecting Human Papilloma Virus and Genotyping Thereof
CN115572764A (en) Tumor detection marker and application thereof
CN105525036A (en) HBV (hepatitis B virus) real-time fluorescent nucleic acid isothermal amplification detection kit
CN114574584A (en) Tumor detection marker and application thereof
CN115572765A (en) Tumor detection markers and application thereof
CN103966306A (en) EGFR mutation detection primer/probe and method (PCR/LDR method)
CN116555423A (en) Lung cancer methylation marker combination, detection product and application thereof
JP2017175953A (en) SYT-SSX fusion gene detection probe, SYT-SSX fusion gene detection probe set, SYT-SSX fusion gene detection method and SYT-SSX fusion gene detection kit
JP2013507144A5 (en)
US20210214805A1 (en) Analytical method and kit
CN102758011A (en) Nucleic acid detection kit for detecting ERCC1mRAN
Cocadiz et al. CD133, MUC1, and KRT19 chromosomal rearrangements and gene expressions as potential biomarkers for liver cancer
CN108441559B (en) Application of immune-related gene group as marker in preparation of product for evaluating distant metastasis risk of high-proliferative breast cancer

Legal Events

Date Code Title Description
HC9A Changing information about inventors
HC9A Changing information about inventors
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20161214