Claims (35)
1. Способ обнаружения или диагностики рака у пациента, включающий определение уровня экспрессии гена C12ORF48 в полученном от пациента биологическом образце, в котором повышение указанного уровня по сравнению с нормальным контрольным уровнем гена указывает на то, что пациент страдает раком или имеет риск развития рака, котором уровень экспрессии определяют способом, выбранным из группы, состоящей из следующих способов:1. A method for detecting or diagnosing cancer in a patient, comprising determining a level of expression of the C12ORF48 gene in a biological sample obtained from a patient, wherein an increase in said level compared to a normal control level of a gene indicates that the patient has cancer or is at risk of developing cancer, which the expression level is determined by a method selected from the group consisting of the following methods:
(а) обнаружение мРНК гена C12ORF48,(a) detection of mRNA of the C12ORF48 gene,
(b) обнаружение белка, кодируемого геном C12ORF48, и(b) detecting a protein encoded by the C12ORF48 gene, and
(с) обнаружение биологической активности белка, кодируемого геном C12ORF48.(c) detecting the biological activity of the protein encoded by the C12ORF48 gene.
2. Способ по п.1, в котором указанное повышение составляет по меньшей мере 10% по сравнению с указанным нормальным контрольным уровнем.2. The method according to claim 1, in which the specified increase is at least 10% compared with the specified normal control level.
3. Способ по п.1, в котором полученный от пациента биологический образец представляет собой биоптат.3. The method according to claim 1, in which the biological sample obtained from the patient is a biopsy sample.
4. Способ по п.1, в котором рак выбран из группы рака поджелудочной железы и рака предстательной железы.4. The method according to claim 1, wherein the cancer is selected from the group of pancreatic cancer and prostate cancer.
5. Способ по п.4, в котором рак поджелудочной железы представляет собой аденокарциному панкреатических протоков, а рак предстательной железы представляет собой гормонорезистентный рак предстательной железы.5. The method according to claim 4, in which the pancreatic cancer is an adenocarcinoma of the pancreatic ducts, and the prostate cancer is a hormone-resistant prostate cancer.
6. Набор для диагностики рака, который включает реагент, выбранный из следующей группы:6. A kit for the diagnosis of cancer, which includes a reagent selected from the following group:
(а) реагент для обнаружения мРНК гена C12ORF48;(a) a reagent for detecting mRNA of the C12ORF48 gene;
(b) реагент для обнаружения белка C12ORF48; и(b) a reagent for detecting a C12ORF48 protein; and
(с) реагент для обнаружения биологической активности белка C12ORF48.(c) a reagent for detecting the biological activity of the C12ORF48 protein.
7. Набор по п.6, в котором реагент представляет собой зонд для генного транскрипта гена.7. The kit according to claim 6, in which the reagent is a probe for gene transcript of the gene.
8. Набор по п.6, в котором реагент представляет собой антитело против белка, кодируемого геном.8. The kit according to claim 6, in which the reagent is an antibody against a protein encoded by the gene.
9. Способ скрининга соединения-кандидата для лечения или профилактики рака, связанного с избыточной экспрессией гена C12ORF48, или ингибирования роста раковых клеток, который включает в себя стадии:9. A method for screening a candidate compound for the treatment or prevention of cancer associated with overexpression of the C12ORF48 gene or inhibition of cancer cell growth, which comprises the steps of:
(а) контактирование тест-соединения с полипептидом, кодируемым геном C12ORF48;(a) contacting the test compound with a polypeptide encoded by the C12ORF48 gene;
(b) обнаружение связывающей активности между полипептидом и тест-соединением; и(b) detecting binding activity between the polypeptide and the test compound; and
(с) отбор соединения, которое связывается с полипептидом.(c) selecting a compound that binds to the polypeptide.
10. Способ скрининга соединения-кандидата для лечения или профилактики рака, связанного с избыточной экспрессией гена C12ORF48 или PARP1, или ингибирования роста раковых клеток, который включает в себя стадии:10. A method of screening a candidate compound for the treatment or prevention of cancer associated with overexpression of the C12ORF48 or PARP1 gene, or inhibiting the growth of cancer cells, which comprises the steps of:
(а) контактирование тест-соединения с клеткой, экспрессирующей ген C12ORF48 в избыточных количествах; и(a) contacting the test compound with a cell expressing the C12ORF48 gene in excess; and
(b) отбор соединения, которое уменьшает уровень экспрессии гена C12ORF48.(b) selecting a compound that reduces the expression level of the C12ORF48 gene.
11. Способ скрининга соединения-кандидата для лечения или профилактики рака или ингибирования роста раковых клеток, который включает в себя стадии:11. A method for screening a candidate compound for the treatment or prevention of cancer or inhibition of cancer cell growth, which comprises the steps of:
(а) контактирование тест-соединения с полипептидом, кодируемым C12ORF48;(a) contacting the test compound with a polypeptide encoded by C12ORF48;
(b) обнаружение биологической активности полипептида с этапа (а); и(b) detecting the biological activity of the polypeptide from step (a); and
(с) отбор соединения, которое подавляет биологическую активность полипептида, по сравнению с биологической активностью, обнаруженной в отсутствии тест-соединения.(c) selecting a compound that inhibits the biological activity of the polypeptide, compared with the biological activity found in the absence of the test compound.
12. Способ по п.11, в котором биологическая активность представляет собой клеточную пролиферативную активность.12. The method according to claim 11, in which the biological activity is cell proliferative activity.
13. Способ скрининга соединения-кандидата для лечения или профилактики рака, связанного с избыточной экспрессией гена C12ORF48, или ингибирования роста раковых клеток, который включает в себя стадии:13. A method for screening a candidate compound for the treatment or prevention of cancer associated with overexpression of the C12ORF48 gene or inhibition of cancer cell growth, which comprises the steps of:
(а) контактирование тест-соединения с клеткой, в которую был введен вектор, включающий область регуляции транскрипции гена C12ORF48 и ген-репортер, который экспрессируется под контролем области регуляции транскрипции;(a) contacting the test compound with a cell into which a vector has been introduced, including the region of transcription regulation of the C12ORF48 gene and a reporter gene that is expressed under the control of the region of transcription regulation;
(b) измерение экспрессии или активности указанного гена-репортера; и(b) measuring the expression or activity of said reporter gene; and
(с) отбор соединения, которое уменьшает уровень экспрессии или активности указанного гена-репортера, по сравнению с уровнем в отсутствии тест-соединения.(c) selecting a compound that decreases the level of expression or activity of said reporter gene, compared with the level in the absence of the test compound.
14. Способ по любому из п.п.9, 10, 11 и 13, в котором рак выбран из группы рака поджелудочной железы и рака предстательной железы.14. The method according to any one of claims 9, 10, 11 and 13, wherein the cancer is selected from the group of pancreatic cancer and prostate cancer.
15. Способ по п.14, в котором рак поджелудочной железы представляет собой аденокарциному панкреатических протоков, а рак предстательной железы представляет собой гормонорезистентный рак предстательной железы.15. The method of claim 14, wherein the pancreatic cancer is pancreatic duct adenocarcinoma, and the prostate cancer is hormone-resistant prostate cancer.
16. Двухцепочечная молекула, включающая смысловую цепь и антисмысловую цепь, в которой смысловая цепь включает нуклеотидную последовательность, соответствующую последовательности-мишени, состоящей из SEQ ID NO: 5, 7, 8, 14 или 15; и в которой антисмысловая цепь включает в себя нуклеотидную последовательность, которая является комплементарной смысловой цепи, в которой смысловая цепь и антисмысловая цепь гибридизируются друг с другом с образованием двухцепочечной молекулы, и в которой двухцепочечная молекула, после интродукции в клетку, экспрессирующую ген C12ORF48, ингибирует экспрессию гена.16. A double-stranded molecule comprising a sense strand and an antisense strand, in which the sense strand includes a nucleotide sequence corresponding to a target sequence consisting of SEQ ID NO: 5, 7, 8, 14, or 15; and in which the antisense strand includes a nucleotide sequence that is complementary to the sense strand, in which the sense strand and the antisense strand hybridize with each other to form a double-stranded molecule, and in which the double-stranded molecule, after introduction into the cell expressing the C12ORF48 gene, inhibits expression gene.
17. Двухцепочечная молекула по п.16, в которой двухцепочечная молекула представляет собой олигонуклеотид длиной приблизительно от 19 до 25 нуклеотидов.17. The double-stranded molecule according to clause 16, in which the double-stranded molecule is an oligonucleotide with a length of approximately 19 to 25 nucleotides.
18. Двухцепочечная молекула по п.17, в которой двухцепочечная молекула представляет собой одиночный нуклеотидный транскрипт, включающий в себя смысловую цепь и антисмысловую цепь, соединенные посредством одноцепочечной нуклеотидной последовательности.18. The double-stranded molecule of claim 17, wherein the double-stranded molecule is a single nucleotide transcript including a sense strand and an antisense strand connected by a single-stranded nucleotide sequence.
19. Двухцепочечная молекула по п.18, в которой полинуклеотидная последовательность имеет общую формулу19. The double-stranded molecule of claim 18, wherein the polynucleotide sequence has the general formula
5'-[A]-[B]-[A']-3',5 '- [A] - [B] - [A'] - 3 ',
в которой [A] представляет собой нуклеотидную последовательность, включающую SEQ ID NO: 5, 7, 8, 14 или 15, [B] представляет нуклеотидную последовательность состоящую приблизительно из 3-23 нуклеотидов, и [A'] представляет собой нуклеотидную последовательность, комплементарную [A].in which [A] is a nucleotide sequence including SEQ ID NO: 5, 7, 8, 14 or 15, [B] is a nucleotide sequence of approximately 3-23 nucleotides, and [A '] is a nucleotide sequence complementary [A].
20. Вектор, включающий каждый или оба из комбинации полинуклеотида, включающего смысловую цепь нуклеиновой кислоты и антисмысловую цепь нуклеиновой кислоты, в котором смысловая цепь нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 5, 7, 8, 14 или 15, и в котором антисмысловая цепь включает нуклеотидную последовательность, которая является комплементарной смысловой цепи, в котором транскрипты смысловой цепи и антисмысловой цепи гибридизируются друг с другом с образованием двухцепочечной молекулы, и в котором вектор после интродукции в клетку, экспрессирующую ген C12ORF48, ингибирует экспрессию гена.20. A vector comprising either or both of a combination of a polynucleotide comprising a sense nucleic acid chain and an antisense nucleic acid chain, in which the sense nucleic acid chain comprises the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5, 7, 8, 14 or 15, and in which the antisense the chain includes a nucleotide sequence that is complementary to the sense strand, in which transcripts of the sense strand and antisense strand hybridize with each other to form a double-stranded molecule, and in which the vector after ntroduktsii a cell expressing the gene C12ORF48, inhibits expression of the gene.
21. Вектор по п.20, в котором полинуклеотид представляет собой олигонуклеотид длиной приблизительно от 19 до 25 нуклеотидов.21. The vector according to claim 20, in which the polynucleotide is an oligonucleotide with a length of approximately 19 to 25 nucleotides.
22. Вектор по п.20, в котором двухцепочечная молекула представляет собой одиночный нуклеотидный транскрипт, включающий смысловую цепь и антисмысловую цепь, соединенные посредством одноцепочечной нуклеотидной последовательности.22. The vector according to claim 20, in which the double-stranded molecule is a single nucleotide transcript comprising a sense strand and an antisense strand connected by a single-stranded nucleotide sequence.
23. Вектор по п.22, в полинуклеотид имеет общую формулу23. The vector according to item 22, the polynucleotide has the General formula
5'-[A]-[B]-[A']-3',5 '- [A] - [B] - [A'] - 3 ',
в которой [A] представляет собой нуклеотидную последовательность, включающую SEQ ID NO: 5, 7, 8, 14 или 15, [B] представляет нуклеотидную последовательность состоящую приблизительно из 3-23 нуклеотидов, и [A'] представляет собой нуклеотидную последовательность, комплементарную [A].in which [A] is a nucleotide sequence including SEQ ID NO: 5, 7, 8, 14 or 15, [B] is a nucleotide sequence of approximately 3-23 nucleotides, and [A '] is a nucleotide sequence complementary [A].
24. Способ лечения или профилактики рака, связанного с избыточной экспрессией гена C12ORF48, у пациента, включающий введение пациенту фармацевтически эффективного количества двухцепочечной молекулы против C12ORF48 или вектора, включающего двухцепочечную молекулу, которая ингибирует клеточную пролиферацию, контактируя с клеткой, экспрессирующей ген C12ORF48, и фармацевтически приемлемый носитель.24. A method for treating or preventing cancer associated with an overexpression of the C12ORF48 gene in a patient, comprising administering to the patient a pharmaceutically effective amount of a double-stranded anti-C12ORF48 molecule or a vector comprising a double-stranded molecule that inhibits cell proliferation by contacting a cell expressing the C12ORF48 gene and pharmaceutically acceptable carrier.
25. Способ по п.24, в котором двухцепочечная молекула представляет собой молекулу по п.16, в котором вектор представляет собой вектор по п.20.25. The method according to paragraph 24, in which the double-stranded molecule is a molecule according to clause 16, in which the vector is a vector according to claim 20.
26. Способ по п.24, в котором рак выбран из группы рака поджелудочной железы и рака предстательной железы.26. The method according to paragraph 24, in which the cancer is selected from the group of pancreatic cancer and prostate cancer.
27. Способ по п.26, в котором рак поджелудочной железы представляет собой аденокарциному панкреатических протоков, а рак предстательной железы представляет собой гормонорезистентный рак предстательной железы.27. The method according to p, in which the pancreatic cancer is an adenocarcinoma of the pancreatic ducts, and the prostate cancer is a hormone-resistant prostate cancer.
28. Композиция для лечения или профилактики рака, связанного с избыточной экспрессией гена C12ORF48, которая включает фармацевтически эффективное количество двухцепочечной молекулы против C12ORF48 или вектора, включающего двухцепочечную молекулу, которая ингибирует клеточную пролиферацию, контактируя с клеткой, экспрессирующей ген C12ORF48, и фармацевтически приемлемый носитель.28. A composition for treating or preventing cancer associated with overexpression of the C12ORF48 gene, which comprises a pharmaceutically effective amount of a double-stranded molecule against C12ORF48 or a vector comprising a double-stranded molecule that inhibits cell proliferation by contacting a cell expressing the C12ORF48 gene and a pharmaceutically acceptable carrier.
29. Композиция по п.28, в которой двухцепочечная молекула представляет собой молекулу по п.16, в котором вектор представляет собой вектор по п.20.29. The composition according to p. 28, in which the double-stranded molecule is a molecule according to clause 16, in which the vector is a vector according to claim 20.
30. Композиция по п.28, в которой рак выбран из группы рака поджелудочной железы и рака предстательной железы.30. The composition of claim 28, wherein the cancer is selected from the group of pancreatic cancer and prostate cancer.
31. Композиция по п.30, в которой рак поджелудочной железы представляет собой аденокарциному панкреатических протоков, а рак предстательной железы представляет собой гормонорезистентный рак предстательной железы.31. The composition of claim 30, wherein the pancreatic cancer is pancreatic duct adenocarcinoma and the prostate cancer is hormone-resistant prostate cancer.
32. Способ скрининга соединения-кандидата, ингибирующего связывание между полипептидом C12ORF48 и полипептидом PARP1, который включает стадии:32. A method for screening a candidate compound inhibiting binding between a C12ORF48 polypeptide and a PARP1 polypeptide, which comprises the steps of:
(а) контактирование полипептида C12ORF48 или его функционального эквивалента с полипептидом PARP1 или его функциональным эквивалентом в присутствии тест-агента;(a) contacting the C12ORF48 polypeptide or its functional equivalent with the PARP1 polypeptide or its functional equivalent in the presence of a test agent;
(b) обнаружение связывания между полипептидами;(b) detecting binding between polypeptides;
(с) сравнение уровня связывания, обнаруженного на стадии (b), с уровнем, обнаруженным в отсутствии тест-агента; и(c) comparing the level of binding detected in step (b) with that found in the absence of a test agent; and
(d) отбор тест-агента, который уменьшает или ингибирует уровень связывания, по сравнению с уровнем, обнаруженным в отсутствии тест-агента на стадии (с).(d) selecting a test agent that decreases or inhibits the level of binding, compared with the level found in the absence of the test agent in step (c).
33. Способ по п.32, в котором функциональный эквивалент C12ORF48 включает в себя PARP1-связывающий домен.33. The method of claim 32, wherein the functional equivalent of C12ORF48 includes a PARP1 binding domain.
34. Способ скрининга соединения для лечения или профилактики рака, с использованием полипептида, кодируемого геном C12ORF48, который включают стадии:34. A method for screening a compound for the treatment or prevention of cancer using a polypeptide encoded by the C12ORF48 gene, which comprises the steps of:
(а) контактирование тест-соединения с полипептидом, кодируемым полинуклеотидом C12ORF48, в присутствии полипептида, кодируемого полинуклеотидом PARP1;(a) contacting the test compound with a polypeptide encoded by C12ORF48 polynucleotide in the presence of a polypeptide encoded by PARP1 polynucleotide;
(b) обнаружение биологической активности полипептида, кодируемого полинуклеотидом PARP1; и(b) detecting the biological activity of the polypeptide encoded by the PARP1 polynucleotide; and
(с) отбор тест-соединения, которое подавляет биологическую активность полипептида, кодируемого полинуклеотидом PARP1, по сравнению с биологической активностью полипептида, обнаруживаемой в отсутствии тест-соединения.(c) selecting a test compound that inhibits the biological activity of the polypeptide encoded by the PARP1 polynucleotide, compared with the biological activity of the polypeptide found in the absence of the test compound.
35. Способ по п.34, в котором биологическая активность представляет собой аутомодификационную активность.
35. The method according to clause 34, in which the biological activity is self-modification activity.