RU2010121856A - Способ объединения образцов для выполнения биологического анализа - Google Patents
Способ объединения образцов для выполнения биологического анализа Download PDFInfo
- Publication number
- RU2010121856A RU2010121856A RU2010121856/10A RU2010121856A RU2010121856A RU 2010121856 A RU2010121856 A RU 2010121856A RU 2010121856/10 A RU2010121856/10 A RU 2010121856/10A RU 2010121856 A RU2010121856 A RU 2010121856A RU 2010121856 A RU2010121856 A RU 2010121856A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- samples
- sample
- specified
- analysis
- combining
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
- C12Q1/6874—Methods for sequencing involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Abstract
1. Способ объединения образцов, подлежащих анализу на качественную переменную, где анализ включает количественное измерение аналита, причем указанный способ объединения образцов включает предоставление объединенного образца из n образцов, где количества индивидуальных образцов в объединенном образце таковы, что аналиты в образцах представлены в молярном соотношении x0:x1:x2:x(n-1) и где x представляет собой целое число, равное 2 или более, которое отображает число классов качественной переменной. ! 2. Способ по п.1, где аналит представляет собой биологическую молекулу, и качественная переменная представляет собой вариант указанной биологической молекулы. ! 3. Способ по п.2, где биологическая молекула представляет собой нуклеиновую кислоту. ! 4. Способ по п.3, где вариант представляет собой нуклеотидный полиморфизм в указанной нуклеиновой кислоте. ! 5. Способ по п.4, где нуклеотидный полиморфизм представляет собой однонуклеотидный полиморфизм. ! 6. Способ по п.3, где вариант представляет собой идентичность основания в определенном нуклеотидном положении. !7. Способ по любому из предыдущих пунктов, где количественное измерение включает измерение интенсивности, высоты пика или площади пика сигнала прибора. ! 8. Способ по п.7, где сигнал прибора представляет собой сигнал флуоресценции. ! 9. Применение способа по любому из пп.1-8 для генотипирования аллельного варианта у гаплоидных или полиплоидных индивидуумов, где число классов качественной переменной (x) равно p+1, где p обозначает уровень плоидности. ! 10. Применение по п.9, где x равен 3, для генотипирования аллельного варианта у диплоидных индивидуумов. ! 11. Способ осуществлени�
Claims (16)
1. Способ объединения образцов, подлежащих анализу на качественную переменную, где анализ включает количественное измерение аналита, причем указанный способ объединения образцов включает предоставление объединенного образца из n образцов, где количества индивидуальных образцов в объединенном образце таковы, что аналиты в образцах представлены в молярном соотношении x0:x1:x2:x(n-1) и где x представляет собой целое число, равное 2 или более, которое отображает число классов качественной переменной.
2. Способ по п.1, где аналит представляет собой биологическую молекулу, и качественная переменная представляет собой вариант указанной биологической молекулы.
3. Способ по п.2, где биологическая молекула представляет собой нуклеиновую кислоту.
4. Способ по п.3, где вариант представляет собой нуклеотидный полиморфизм в указанной нуклеиновой кислоте.
5. Способ по п.4, где нуклеотидный полиморфизм представляет собой однонуклеотидный полиморфизм.
6. Способ по п.3, где вариант представляет собой идентичность основания в определенном нуклеотидном положении.
7. Способ по любому из предыдущих пунктов, где количественное измерение включает измерение интенсивности, высоты пика или площади пика сигнала прибора.
8. Способ по п.7, где сигнал прибора представляет собой сигнал флуоресценции.
9. Применение способа по любому из пп.1-8 для генотипирования аллельного варианта у гаплоидных или полиплоидных индивидуумов, где число классов качественной переменной (x) равно p+1, где p обозначает уровень плоидности.
10. Применение по п.9, где x равен 3, для генотипирования аллельного варианта у диплоидных индивидуумов.
11. Способ осуществления анализа нескольких образцов, включающий объединение указанных образцов согласно способу по любому из пп.1-8 для предоставления объединенного образца и осуществления указанного анализа указанного объединенного образца.
12. Способ осуществления анализа множественных образцов, который включает осуществление анализа набора объединенных образцов, полученных способом по любому из пп.1-8, где в указанном образце анализируют качественную переменную и используют количественное измерение аналита в указанном образце.
13. Способ по п.12, который дополнительно содержит установление вклада индивидуальных образцов в указанный объединенный образец на основе измерений.
14. Устройство для объединения нескольких образцов в объединенный образец, которое содержит приемник образца для предоставления объединенного образца и дополнительно содержит процессор для выполнения способа по любому из пп.1-8.
15. Устройство для анализа, которое содержит процессор, который предназначен для выполнения анализа набора объединенных образцов, полученных способом по любому из пп.1-8, где указанное устройство предназначено для выполнения анализа качественной переменной в указанном образце и для выполнения количественного измерения аналита в указанном образце.
16. Устройство по п.15, которое дополнительно содержит устройство для объединения по п.14.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP07119761.0 | 2007-10-31 | ||
| EP07119761 | 2007-10-31 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2010121856A true RU2010121856A (ru) | 2011-12-10 |
Family
ID=39052362
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2010121856/10A RU2010121856A (ru) | 2007-10-31 | 2008-10-31 | Способ объединения образцов для выполнения биологического анализа |
Country Status (18)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US8594946B2 (ru) |
| EP (1) | EP2222872B1 (ru) |
| JP (1) | JP2011504095A (ru) |
| KR (1) | KR20100098517A (ru) |
| CN (1) | CN101910413B (ru) |
| AU (1) | AU2008319580B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0818870A2 (ru) |
| CA (1) | CA2703938A1 (ru) |
| DK (1) | DK2222872T3 (ru) |
| ES (1) | ES2464817T3 (ru) |
| HK (1) | HK1151069A1 (ru) |
| IL (1) | IL205465A (ru) |
| MX (1) | MX2010004821A (ru) |
| NZ (1) | NZ585057A (ru) |
| RU (1) | RU2010121856A (ru) |
| SG (1) | SG185931A1 (ru) |
| WO (1) | WO2009058016A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA201003233B (ru) |
Families Citing this family (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP2425011A1 (en) * | 2009-04-29 | 2012-03-07 | Hendrix Genetics Research, Technology & Services B.V. | Method of pooling samples for performing a biological assay |
| KR101473705B1 (ko) | 2013-10-11 | 2014-12-18 | 삼성에스디에스 주식회사 | 생물학적 샘플 분석 시스템 및 방법 |
| KR20150137283A (ko) * | 2014-05-29 | 2015-12-09 | 사회복지법인 삼성생명공익재단 | 생물학적 샘플 분석 시스템 및 방법 |
| CN109072299B (zh) * | 2016-05-12 | 2022-01-04 | 先锋国际良种公司 | 同时合并基因分型的方法 |
| WO2023007883A1 (ja) * | 2021-07-28 | 2023-02-02 | 株式会社島津製作所 | 検体前処理装置及び検体プール検査方法 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20020172965A1 (en) | 1996-12-13 | 2002-11-21 | Arcaris, Inc. | Methods for measuring relative amounts of nucleic acids in a complex mixture and retrieval of specific sequences therefrom |
| AU2002311897A1 (en) | 2001-05-09 | 2002-11-18 | Third Wave Technologies, Inc. | Nucleic acid detection in pooled samples |
| WO2005075678A1 (en) | 2004-02-10 | 2005-08-18 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem | Determination of genetic variants in a population using dna pools |
-
2008
- 2008-10-31 MX MX2010004821A patent/MX2010004821A/es active IP Right Grant
- 2008-10-31 BR BRPI0818870 patent/BRPI0818870A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2008-10-31 CN CN2008801234428A patent/CN101910413B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2008-10-31 EP EP08845745.2A patent/EP2222872B1/en not_active Not-in-force
- 2008-10-31 JP JP2010531978A patent/JP2011504095A/ja active Pending
- 2008-10-31 ES ES08845745.2T patent/ES2464817T3/es active Active
- 2008-10-31 US US12/447,860 patent/US8594946B2/en active Active
- 2008-10-31 AU AU2008319580A patent/AU2008319580B2/en not_active Ceased
- 2008-10-31 DK DK08845745.2T patent/DK2222872T3/da active
- 2008-10-31 KR KR1020107011893A patent/KR20100098517A/ko not_active Application Discontinuation
- 2008-10-31 WO PCT/NL2008/050687 patent/WO2009058016A1/en active Application Filing
- 2008-10-31 CA CA2703938A patent/CA2703938A1/en not_active Abandoned
- 2008-10-31 RU RU2010121856/10A patent/RU2010121856A/ru not_active Application Discontinuation
- 2008-10-31 NZ NZ585057A patent/NZ585057A/xx not_active IP Right Cessation
- 2008-10-31 SG SG2012080081A patent/SG185931A1/en unknown
-
2010
- 2010-04-29 IL IL205465A patent/IL205465A/en active IP Right Grant
- 2010-05-07 ZA ZA2010/03233A patent/ZA201003233B/en unknown
-
2011
- 2011-05-23 HK HK11105101.2A patent/HK1151069A1/xx not_active IP Right Cessation
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| DK2222872T3 (da) | 2014-06-02 |
| SG185931A1 (en) | 2012-12-28 |
| AU2008319580A1 (en) | 2009-05-07 |
| EP2222872B1 (en) | 2014-02-26 |
| WO2009058016A1 (en) | 2009-05-07 |
| JP2011504095A (ja) | 2011-02-03 |
| CN101910413B (zh) | 2013-08-14 |
| MX2010004821A (es) | 2010-08-02 |
| HK1151069A1 (en) | 2012-01-20 |
| IL205465A0 (en) | 2010-12-30 |
| ES2464817T3 (es) | 2014-06-04 |
| US20100216666A1 (en) | 2010-08-26 |
| IL205465A (en) | 2014-01-30 |
| CA2703938A1 (en) | 2009-05-07 |
| ZA201003233B (en) | 2011-06-29 |
| BRPI0818870A2 (pt) | 2015-05-05 |
| EP2222872A1 (en) | 2010-09-01 |
| AU2008319580B2 (en) | 2014-02-27 |
| KR20100098517A (ko) | 2010-09-07 |
| US8594946B2 (en) | 2013-11-26 |
| NZ585057A (en) | 2012-09-28 |
| CN101910413A (zh) | 2010-12-08 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Beckett | Measurement and analysis of equilibrium binding titrations: a beginner's guide | |
| Karsan et al. | Analytical and preanalytical biases in serum proteomic pattern analysis for breast cancer diagnosis | |
| RU2010121856A (ru) | Способ объединения образцов для выполнения биологического анализа | |
| ATE510208T1 (de) | Probenanalyseverfahren und probenanalyseeinrichtung | |
| EP1975623A3 (en) | Sample analyzer | |
| HUP0101655A2 (hu) | Eljárás kémiai és biológiai vizsgálatok kiértékelésére | |
| WO2001011354A3 (en) | Methods for characterizing, classifying, and identifying unknowns in samples | |
| ATE553216T1 (de) | Sonden, bibliotheken und kits zur analyse von nukleinsäuregemischen und verfahren zu deren konstruktion | |
| DE60335785D1 (de) | Analyseset mit Stechhilfe und Messgerät | |
| DE602005015517D1 (de) | Probentestträger und Verfahren zur Prüfung von okkultem Blut im Stuhl | |
| Bright et al. | Variability of mixed DNA profiles separated on a 3130 and 3500 capillary electrophoresis instrument | |
| Butts et al. | NIST validation studies on the 3500 Genetic Analyzer | |
| So et al. | Genetic analyzer‐dependent DNA methylation detection and its application to existing age prediction models | |
| JP2008304462A5 (ru) | ||
| ATE384139T1 (de) | Multi-test-analyse von echzeit- nukleinsäureamplifikationen | |
| Shrestha | Ten major future challenges in single-cell metabolomics | |
| FR2864550B1 (fr) | Puce d'analyse avec gamme etalon, trousses et procedes d'analyse. | |
| BRPI0516434A (pt) | método para testar quanto à presença de um micróbio em uma amostra | |
| JP6280910B2 (ja) | 分光システムの性能を測定するための方法 | |
| Asp et al. | International external quality assurance of JAK2 V617F quantification | |
| WO2007011571A3 (en) | Digitizing biology | |
| CN103616345A (zh) | 红外碳硫分析仪的碳含量测定方法 | |
| WO2022251666A3 (en) | System and methods for analyzing biosensor test results | |
| JP2000125900A5 (ru) | ||
| Fleischer et al. | Innovative software solution for special data evaluation in mass spectrometry |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA93 | Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination) |
Effective date: 20120110 |