RU2004120787A - Компьютерная система и способ расчета adme-свойств - Google Patents
Компьютерная система и способ расчета adme-свойств Download PDFInfo
- Publication number
- RU2004120787A RU2004120787A RU2004120787/15A RU2004120787A RU2004120787A RU 2004120787 A RU2004120787 A RU 2004120787A RU 2004120787/15 A RU2004120787/15 A RU 2004120787/15A RU 2004120787 A RU2004120787 A RU 2004120787A RU 2004120787 A RU2004120787 A RU 2004120787A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- substance
- properties
- adme
- substances
- chemical structure
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
- G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
- G16C20/30—Prediction of properties of chemical compounds, compositions or mixtures
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
- G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
- G16C20/40—Searching chemical structures or physicochemical data
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Computing Systems (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Complex Calculations (AREA)
Claims (17)
1. Способ расчета ADME-свойств веществ, состоящий из следующих этапов:
ввод молекулярных свойств вещества в биофизическую модель, причем данная биофизическая модель описывает взаимосвязь между молекулярными свойствами и ADME-свойством вещества,
вывод ADME-свойства вещества.
2. Способ по п.1, состоящий из следующих этапов:
ввод химической структуры вещества в банк данных,
циклический опрос банка данных на предмет ввода новой химической структуры,
автоматический расчет молекулярных свойств вещества, исходя из его химической структуры, после обнаружения при циклическом опросе новой химической структуры в банке данных,
автоматический ввод молекулярных свойств в биофизическую модель.
3. Способ по п.1 или 2, состоящий из следующих этапов:
обращение ко второму банку данных, содержащему экспериментально полученные данные по молекулярным свойствам вещества,
автоматический ввод рассчитанных и определенных экспериментально молекулярных свойств в биофизическую модель.
4. Способ по п.1 или 2, причем данная биофизическая модель представляет собой фармакокинетическую модель, основанную на физиологических механизмах, и эта модель затрагивает несколько органов, для каждого из которых составлена частичная модель, причем эти частичные модели связаны между собой посредством модели кровотока, и эта взаимосвязь описывается уравнениями сохранения массы.
5. Способ по п.1, причем молекулярные свойства вещества рассчитываются исходя из их химической структуры, предпочтительно в форме дескриптора или "отпечатков пальцев", статистическим методом, предпочтительно QSAR или HQSAR, или посредством нейронных сетей.
6. Способ по п.1, причем речь идет о веществах, обладающих фармакологической активностью в организме людей и/или животных, и для них рассчитываются одно или несколько из следующих ADME-свойств:
всосавшаяся часть дозы вещества после орального приема,
кривая зависимости концентрации от времени в воротной вене после орального приема вещества,
свободная фракция в плазме крови,
коэффициенты распределения между органом и плазмой крови,
кривые зависимости концентрации от времени в плазме крови и в соответствующих органах после орального или внутривенного введения вещества.
7. Способ по п.1 или 6, причем речь идет о веществах, используемых для защиты растений, и для них рассчитываются одно или несколько из следующих ADME-свойств:
а. Характеристика скорости проникновения в лист после инъекционного введения,
b. Характеристика скорости проникновения в насекомое через кутикулу,
с. Характеристика скорости распределения внутри растения после введения в лист (мобильность внутри флоэмы),
d. Характеристика скорости распределения внутри растения после введения в корень (мобильность внутри ксилемы),
е. Распределение концентрации в различных органах насекомого.
8. Способ по п.1, состоящий из следующих этапов:
а. повторный расчет ADME-свойства других веществ, в особенности других веществ, имеющих общую химическую основу.
b. Сортировка веществ по величине значения ADME-свойства.
9. Способ по п.8, причем для каждого вещества рассчитывается значения несколько ADME-свойств и сортировка веществ осуществляется по показателю, определяемому значениями двух или более ADME-свойств.
10. Способ по п.9, причем данный показатель представляет собой взвешенную сумму значений по меньшей мере двух ADME-свойств.
11. Способ по п.8, или 9, или 10, причем вывод ADME-свойств веществ осуществляется в табличной форме, предпочтительно в виде реляционной таблицы.
12. Компьютерная программа для реализации способа по пп.1-11.
13. Компьютерная система для реализации способа по пп.1-11.
14. Компьютерная система по п.13, состоящая из следующих компонентов:
а. первый банк данных (13) для задания химической структуры вещества,
b. средство (14) для циклического опроса банка данных на предмет ввода новой химической структуры,
с. средство (15) автоматического расчета молекулярных свойств вещества исходя из химической структуры, после обнаружения при циклическом опросе новой химической структуры в банке данных,
d средство (17) автоматического расчета одного или нескольких ADME-свойств.
15. Компьютерная система по п.13 или 14, включающая в себя второй банк данных (18) для хранения экспериментально полученных данных по молекулярным свойствам вещества, причем автоматический расчет ADME-свойств осуществляется на основе рассчитанных и/или экспериментально полученных значениях молекулярных свойств.
16. Компьютерная система по пп.13, 14 или 15, включающая в себя средство (21) для вывода рассчитанных ADME-свойств различных веществ в структурированной форме, предпочтительно в табличной форме, в особенности в виде реляционной таблицы.
17. Компьютерная система по пп.13-16, включающая в себя средства для расчета показателя ADME-свойства, используемого для сортировки веществ.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE10160270.7 | 2001-12-07 | ||
| DE10160270A DE10160270A1 (de) | 2001-12-07 | 2001-12-07 | Computersystem und Verfahren zur Berechnung von ADME-Eigenschaften |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2004120787A true RU2004120787A (ru) | 2005-04-10 |
Family
ID=7708460
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2004120787/15A RU2004120787A (ru) | 2001-12-07 | 2002-11-25 | Компьютерная система и способ расчета adme-свойств |
Country Status (9)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US7765092B2 (ru) |
| EP (1) | EP1456646A2 (ru) |
| JP (1) | JP2005512176A (ru) |
| CN (1) | CN1659435A (ru) |
| AU (1) | AU2002346846A1 (ru) |
| CA (1) | CA2469388A1 (ru) |
| DE (1) | DE10160270A1 (ru) |
| RU (1) | RU2004120787A (ru) |
| WO (1) | WO2003048720A2 (ru) |
Families Citing this family (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE10256315A1 (de) * | 2002-12-03 | 2004-06-17 | Bayer Ag | Computersystem und Verfahren zur Berechnung eines pharmakokinetischen Verhaltens einer chemischen Substanz in Insekten |
| DE10350525A1 (de) * | 2003-10-29 | 2005-06-09 | Bayer Technology Services Gmbh | Verfahren zur Visualisierung der ADME-Eigenschaften chemischer Substanzen |
| DE102004010516A1 (de) | 2004-03-04 | 2005-09-22 | Bayer Technology Services Gmbh | Verbessertes Verfahren zur zeitlichen Dosierung von Arzneistoffen |
| WO2006065950A2 (en) * | 2004-12-16 | 2006-06-22 | Pharmix Corporation | Modeling biological effects of molecules using molecular property models |
| DE102005028080A1 (de) | 2005-06-17 | 2006-12-21 | Bayer Technology Services Gmbh | Verfahren zur zeitlich gesteuerten intravenösen Verabreichung des Narkosemittels Propofol |
| US8380730B2 (en) | 2008-10-09 | 2013-02-19 | International Business Machines Corporation | Program invocation from a query interface to parallel computing system |
| DE102010060311B3 (de) * | 2010-11-02 | 2012-02-02 | Freie Universität Berlin | Verfahren zur Unterstützung klinischer Studien |
| WO2016102463A1 (en) | 2014-12-23 | 2016-06-30 | Bosteels Arnaud | Combination of remifentanil and propofol |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5751605A (en) * | 1996-08-15 | 1998-05-12 | Tripos, Inc. | Molecular hologram QSAR |
| US20020035459A1 (en) * | 1998-09-14 | 2002-03-21 | George M. Grass | Pharmacokinetic-based drug design tool and method |
| ATE295541T1 (de) * | 1999-06-18 | 2005-05-15 | Biacore Ab | Verfahren und vorrichtung zur untersuchung von wirksstoffskandidaten und zur bestimmung ihrer pharmakokinetischen parametern |
| EP1167969A2 (en) * | 2000-06-14 | 2002-01-02 | Pfizer Inc. | Method and system for predicting pharmacokinetic properties |
| CA2416787A1 (en) * | 2000-07-28 | 2002-02-07 | Lion Bioscience Ag | System and method for predicting adme/tox characteristics of a compound |
| WO2002010741A2 (en) * | 2000-07-28 | 2002-02-07 | Lion Bioscience Ag | Regional intestinal permeability model |
| AU2002240131A1 (en) * | 2001-01-26 | 2002-08-06 | Bioinformatics Dna Codes, Llc | Modular computational models for predicting the pharmaceutical properties of chemical compounds |
-
2001
- 2001-12-07 DE DE10160270A patent/DE10160270A1/de not_active Ceased
-
2002
- 2002-11-25 CA CA002469388A patent/CA2469388A1/en not_active Abandoned
- 2002-11-25 RU RU2004120787/15A patent/RU2004120787A/ru not_active Application Discontinuation
- 2002-11-25 EP EP02783091A patent/EP1456646A2/de not_active Withdrawn
- 2002-11-25 JP JP2003549866A patent/JP2005512176A/ja active Pending
- 2002-11-25 CN CN028278100A patent/CN1659435A/zh active Pending
- 2002-11-25 US US10/497,759 patent/US7765092B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2002-11-25 WO PCT/EP2002/014150 patent/WO2003048720A2/de not_active Application Discontinuation
- 2002-11-25 AU AU2002346846A patent/AU2002346846A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| DE10160270A1 (de) | 2003-06-26 |
| CA2469388A1 (en) | 2003-06-12 |
| US20050119832A1 (en) | 2005-06-02 |
| US7765092B2 (en) | 2010-07-27 |
| JP2005512176A (ja) | 2005-04-28 |
| AU2002346846A1 (en) | 2003-06-17 |
| CN1659435A (zh) | 2005-08-24 |
| WO2003048720A3 (de) | 2004-04-22 |
| WO2003048720A2 (de) | 2003-06-12 |
| EP1456646A2 (de) | 2004-09-15 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Davidian et al. | Nonlinear models for repeated measurement data: an overview and update | |
| Costes et al. | MAppleT: simulation of apple tree development using mixed stochastic and biomechanical models | |
| Kanter et al. | Markov processes: linguistics and Zipf's law | |
| CN112071373A (zh) | 药物分子筛选方法及系统 | |
| RU2004120787A (ru) | Компьютерная система и способ расчета adme-свойств | |
| CN103093108A (zh) | 一种中药系统药理学分析平台及分析方法 | |
| Jensen et al. | A note on the analysis of germination data from complex experimental designs | |
| CN108363774A (zh) | 一种基于多层卷积神经网络的药物关系分类方法 | |
| Briggs et al. | Structured population dynamics: An introduction to integral modeling | |
| Voino-Yasenetsky et al. | Experimental pneumonia caused by bacteria of the Shigella group | |
| Laiolo et al. | The evolutionary convergence of avian lifestyles and their constrained coevolution with species' ecological niche | |
| Mohammed et al. | Development and validation of innovative machine learning models for predicting date palm mite infestation on fruits | |
| Kishi et al. | Characteristic features of statistical models and machine learning methods derived from pest and disease monitoring datasets | |
| Boyer et al. | Active particle in one dimension subjected to resetting with memory | |
| CN103065058A (zh) | 一种传统药物毒性评价方法及其系统 | |
| Rajesh et al. | Comparative study of decision tree approaches in data mining using chronic disease indicators (CDI) data | |
| Kearns et al. | Computational learning theory | |
| Bai et al. | CBDPS 1.0: A Python GUI application for machine learning models to predict bitter-tasting children’s oral medicines | |
| CN114360743A (zh) | 一种药物作用后差异转录表达谱及药物适应症的预测方法 | |
| Zarlis et al. | Optimization of the CNN model for smart agriculture | |
| Li et al. | Physical formula enhanced multi-task learning for pharmacokinetics prediction | |
| CN103077322A (zh) | 一种传统药物的心血管毒性评价预测系统及其方法 | |
| CN113506592A (zh) | 一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法 | |
| Mahato et al. | Qmine: A framework for mining quantitative regular expressions from system traces | |
| CN114613521A (zh) | 一种标准化分析中成药有效成分及标靶作用的计算模型 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20070626 |