PT2236598E - Microorganisms for improving the health of individuals with disorders related to gluten ingestion - Google Patents

Microorganisms for improving the health of individuals with disorders related to gluten ingestion Download PDF

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PT2236598E
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gluten
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Ester Sanchez Sanchez
Marcela Susana Medina
Giada De Palma
Inmaculada Nadal Gimenez
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Description

ΕΡ2236598Β1ΕΡ2236598Β1

DESCRIÇÃODESCRIPTION

INDIVÍDUOS GLÚTENGLUTEN INDIVIDUALS

MICRORGANISMOS PARA MELHORAR O ESTADO DE SAÚDE DE COM DISTÚRBIOS RELACIONADOS COM A INGESTÃO DEMICRORGANISMS TO IMPROVE THE STATE OF HEALTH WITH DISORDERS RELATED TO THE INGESTION OF

SECTOR DA TÉCNICA A invenção refere-se aos sectores da Indústria Alimentar e da Farmacêutica. Especificamente, a invenção refere-se ao campo dos probióticos e produtos derivados na forma de alimentos funcionais e novos alimentos, probióticos, simbióticos, nutracêuticos ou suplementos alimentares e composições farmacêuticas com aplicações clinicas.TECHNICAL FIELD The invention relates to the Food Industry and Pharmaceutical sectors. Specifically, the invention relates to the field of probiotics and by-products in the form of functional foods and novel foods, probiotics, symbiotics, nutraceuticals or food supplements and pharmaceutical compositions for clinical applications.

ESTADO DA TÉCNICA A doença celíaca é uma enteropatia, afeção do intestino, de uma natureza imunitária causada por intolerância permanente às proteínas do glúten de cereais, que afeta indivíduos geneticamente predispostos. A doença tem um vasto espectro clínico e inclui formas típicas, atípicas, silenciosas e potenciais. As formas típicas mais frequentemente presentes nos primeiros anos de vida (6-24 meses) e manifesta principalmente com sintomas intestinais e alterações relacionadas (malabsorção, diarreia crónica, perda de peso, distensão abdominal, atraso de crescimento, etc.). É normalmente a doença crónica mais comum, com uma prevalência de 0,7 a 2,0% entre a população geral e 15 a 20% entre os familiares em primeiro grau. Também, a ingestão de glúten e a doença celíaca são associadas com outros distúrbios tais como síndroma de Down, diabetes Mellitus tipo 1, dermatite 1 ΕΡ2236598Β1 herpetiforme, miopatia, esclerose múltipla, artrite, autismo, esquizofrenia, depressão, linfomas, e ataxia. A relação entre ingestão de glúten e distúrbios psiquiátricos, neurológicos e comportamentais é considerada um resultado da produção de péptidos bioativos, tais como exorfinas, possuindo atividade opióide.STATE OF THE ART Celiac disease is an enteropathy, an intestinal disorder, of an immune nature caused by permanent intolerance to cereal gluten proteins, which affects genetically predisposed individuals. The disease has a broad clinical spectrum and includes typical, atypical, silent, and potential forms. The typical forms most frequently present in the first years of life (6-24 months) and manifests mainly with intestinal symptoms and related alterations (malabsorption, chronic diarrhea, weight loss, abdominal distension, growth retardation, etc.). It is usually the most common chronic disease, with a prevalence of 0.7 to 2.0% among the general population and 15 to 20% among first-degree relatives. Also, gluten intake and celiac disease are associated with other disorders such as Down's Syndrome, Type 1 diabetes mellitus, herpetiform dermatitis, myopathy, multiple sclerosis, arthritis, autism, schizophrenia, depression, lymphomas, and ataxia. The relationship between gluten intake and psychiatric, neurological and behavioral disorders is considered a result of the production of bioactive peptides, such as exorphins, having opioid activity.

As proteínas do glúten (gliadinas e prolaminas e gluteninas análogas) representam o fator ambiental principal que desencadeia doença celíaca e outros distúrbios relacionados. Estas proteínas contêm sequências de péptidos ricas em prolina e glutamina, tornando-as mais resistentes a enzimas digestivas do que outras proteínas na dieta e, deste modo, capazes de permanecer no lúmen intestinal. Em indivíduos geneticamente predispostos, estes péptidos são responsáveis por uma reação análoga que envolve o sistema imunitário inato e adaptativo e que, globalmente, leva a inflamação crónica da mucosa intestinal, aumento dos linfócitos intraepiteliais, hiperplasia da cripta, e uma deterioração progressiva dos villi intestinais incluindo o seu total desaparecimento. Os péptidos tóxicos produzidos após a ingestão de glúten podem passar através do epitélio intestinal e são reconhecidos pelas moléculas HLA-DQ2 ou HLA-DQ8 de células apresentadoras de antigénio, de um modo preferido, após a sua desamidação através da ação de transglutaminase tecidular. Deste modo, estes são apresentados a recetores de células T, produzindo a sua ativação. Isto envolve a expressão do antigénio CD4, também conhecido como auxiliar (Th), e sua diferenciação em subpopulações de linfócitos, envolvendo deste modo imunidade adquirida. A subpopulação Th2 interage com células B que se diferenciam em células do plasma e produzem os anticorpos 2 ΕΡ2236598Β1 anti-gliadina, antiendomísio, e anti-transglutaminase tecidular. A subpopulação Thl é responsável por um aumento na secreção de citoquinas pró-inflamatórias (principalmente IFN-γ) e na proporção de IFN-y/IL-10 (Salvati et al 2005. Recombinant human interleukin 10 suppresses gliadin dependent T cell activation in ex vivo cultured coeliac intestinal mucosa. Gut. 54: 46-53) . Os péptidos de glúten podem também desencadear uma resposta no epitélio intestinal mediada pela citoquina IL-15, envolvendo o sistema imunitário inato (Green e Jabri 2006. Celiac disease. Ann Rev Med. 57:207-21). As gliadinas ingeridas estimulam a produção de IL-15 em células epiteliais, que favorece a expansão clonal de linfócitos T CD8 citotóxicos intraepiteliais e a expressão de IFN-γ (Jabri et al. 2000. Selective expansion of intraepithelial lymphocytes expressing the HLAE-specific natural killer receptor CD94 in celiac disease. Gastroenterology. 118:867-79; Mention et al., 2003. Interleukin 15: a key to disrupted intraepithelial lymphocyte homeostasis and limphomagenesis in celiac disease. Gastroenterology. 125: 730-45; Forsberg et al. 2007. Concomitant increase of IL-10 and pro-inflammatory cytokine in intraepithelial limphocyte subsets in celiac disease. Int Immunol. 2007:19, 993-1001). A composição da microbiota intestinal de doentes com doença celíaca também apresenta um desequilíbrio em relação com a dos indivíduos de controlo saudáveis, caracterizado pela predominância de bactérias pró-inflamatórias e uma proporção reduzida e composição de bactérias do ácido láctico e bifidobactérias. (Sanz et al., 2007. Differences in faecal bacterial communities in coeliac and healthy children as detected by PCR and denaturing gradient gel electrophoresis. FEMS Immunol Med Microbiol. 51 (3):562-8. Nadai et al., 2007. Imbalance in the composition of the duodenal microbiota of children with 3 ΕΡ2236598Β1 celiac disease. J Med Microbiol. 2007 Dec; 56 (Pt 12):1669-74; Collado et al. 2009. Specific duodenal and faecal bacterial groups are associated with paediatric celiac disease. J Clin Pathol. 62: 264-269). No lúmen intestinal e epitélio, a combinação de glúten com um aumento nas bactérias prejudiciais pode atuar como um fator desencadeador ou favorecer o processo patológico e as reações pro-inflamatórias em casos de doença celíaca ativa, assim como em outros distúrbios relacionados. Do mesmo modo, a presença ou ausência de certas espécies bacterianas podem favorecer ou proteger contra a toxicidade do glúten. A doença celíaca tem uma grande incidência e gravidade; no entanto, atualmente não existe terapia para estes doentes. A única alternativa é manter uma dieta estritamente isenta de glúten de longa duração. A conformidade com esta recomendação dietética é difícil e os doentes continuam a sofrer sintomas gastrointestinais, deficiências nutricionais, e riscos de saúde elevados (distúrbios imunitários, osteoporose, infertilidade, cancro, etc.) e o equilíbrio do seu ecossistema intestinal não é nunca totalmente restaurada. Adicionalmente, os indivíduos com doença celíaca refratária (5-10%) não respondem a esta recomendação dietética.Gluten proteins (gliadins and prolamins and analog glutenins) represent the major environmental factor that triggers celiac disease and other related disorders. These proteins contain peptide sequences rich in proline and glutamine, making them more resistant to digestive enzymes than other proteins in the diet and thus able to remain in the intestinal lumen. In genetically predisposed individuals, these peptides are responsible for an analogous reaction involving the innate and adaptive immune system and which, overall, leads to chronic inflammation of the intestinal mucosa, increased intraepithelial lymphocytes, crypt hyperplasia, and progressive deterioration of intestinal villi including its total disappearance. The toxic peptides produced after the ingestion of gluten can pass through the intestinal epithelium and are recognized by the HLA-DQ2 or HLA-DQ8 molecules of antigen presenting cells, preferably after their deamidation through the action of tissue transglutaminase. In this way, these are presented to T-cell receptors, producing their activation. This involves the expression of the CD4 antigen, also known as helper (Th), and its differentiation into subpopulations of lymphocytes, thereby involving acquired immunity. The Th2 subpopulation interacts with B cells that differentiate into plasma cells and produce anti-gliadin, antiendomysium, and anti-tissue transglutaminase antibodies. The Th1 subpopulation is responsible for an increase in the secretion of proinflammatory cytokines (mainly IFN-γ) and in the proportion of IFN-γ / IL-10 (Salvati et al 2005. Recombinant human interleukin 10 suppresses gliadin dependent T cell activation in ex live cultured coeliac intestinal mucosa Gut 54: 46-53). Gluten peptides may also elicit a response in the intestinal epithelium mediated by the IL-15 cytokine, involving the innate immune system (Green and Jabri 2006, Celiac disease, Ann Rev Med 57: 207-21). Ingested gliadins stimulate IL-15 production in epithelial cells, which favors the clonal expansion of intraepithelial cytotoxic CD8 T lymphocytes and the expression of IFN-γ (Jabri et al., 2000). Selective expansion of intraepithelial lymphocytes expressing the natural HLAE-specific killer receptor CD94 in celiac disease Gastroenterology 118: 867-79 Mention et al., 2003 Interleukin 15: a key to disrupted intraepithelial lymphocyte homeostasis and limphomagenesis in celiac disease Gastroenterology 125: 730-45 Forsberg et al. 2007. Concomitant increase of IL-10 and pro-inflammatory cytokine in intraepithelial limphocyte subsets in celiac disease Int Immunol 2007: 19, 993-1001). The intestinal microbiota composition of patients with celiac disease is also imbalanced relative to that of healthy control subjects, characterized by the predominance of pro-inflammatory bacteria and a reduced proportion and composition of lactic acid and bifidobacteria bacteria. (Sanz et al., 2007. Differences in Faecal Bacterial Communities in Coeliac and Healthy Children as Detected by PCR and denaturing gradient gel electrophoresis FEMS Immunol Med Microbiol 51 (3): 562-8. in the composition of the duodenal microbiota of children with 3 ΕΡ 2236598Β1 celiac disease.J Med Microbiol 2007 Dec; 56 (Pt 12): 1669-74; Collado et al., 2009. Specific duodenal and faecal bacterial groups are associated with pediatric celiac disease J Clin Pathol, 62: 264-269). In the intestinal lumen and epithelium, the combination of gluten with an increase in harmful bacteria may act as a triggering factor or favor the pathological process and pro-inflammatory reactions in cases of active celiac disease, as well as in other related disorders. Likewise, the presence or absence of certain bacterial species may favor or protect against the toxicity of gluten. Celiac disease has a high incidence and severity; however, there is currently no therapy for these patients. The only alternative is to maintain a strictly gluten-free diet of long duration. Compliance with this dietary recommendation is difficult and patients continue to suffer gastrointestinal symptoms, nutritional deficiencies, and high health risks (immune disorders, osteoporosis, infertility, cancer, etc.) and the balance of their intestinal ecosystem is never fully restored . In addition, individuals with refractory celiac disease (5-10%) do not respond to this dietary recommendation.

As opções terapêuticas ou coadjuvantes que estão normalmente sob investigação para tratar a doença celíaca incluem a administração oral de enzimas proteolíticas obtidas a partir de plantas ou microrganismos para acelerar digestão gastrointestinal de péptidos de glúten (Shan et al. 2005. Enzyme treatment of foodstuffs for celiac sprue. 20050249719/A1; Marti et al. 2006. Prolyl endopeptidase mediated destruction of T cell epitopes in whole glúten. 4 ΕΡ2236598Β1 20060286601/Α1; Stepniak y Koning. 2006. Enzymatic glúten detoxification: the proof of the pudding is in the eating! Trends Biotechnol. 24:433-4; Gass et al. 2007. CombinationTherapeutic or coadjuvant options that are normally under investigation for treating celiac disease include oral administration of proteolytic enzymes obtained from plants or microorganisms to accelerate gastrointestinal digestion of gluten peptides (Shan et al., 2005). Enzyme treatment of foodstuffs for celiac (2006), pp. 20050249719 / A1, Marti et al., 2006 Prolyl endopeptidase mediated destruction of T cell epitopes in whole gluten 4 ΕΡ2236598Β1 20060286601 / Α1, Stepniak and Koning, 2006. Enzymatic gluten detoxification: the proof of the pudding is in the eating! Trends Biotechnol 24: 433-4 Gass et al.

enzyme therapy for gastric digestion of dietary glúten in patients with celiac sprue. Gastroenterology. 133:472-80). A eficácia desta estratégia foi demonstrada em sistemas modelo utilizando preparações de proteína e péptido ou seus equivalentes recombinantes, mas estudos que demonstram a sua eficácia in vivo são ainda necessários em indivíduos que ingerem glúten como na comida. Apesar dos benefícios potenciais desta terapia como um adjuvante numa dieta isenta de glúten, os seus efeitos serão altamente dependentes do tempo de ingestão da preparação de enzima e permitirão apenas a ingestão ocasional de glúten reduzindo o limiar de toxicidade. Outras alternativas propostas incluem o desenvolvimento de compostos inibidores da transglutaminase tecidular (Khosla et al., 2006. Transglutaminase inhibitors and methods of use thereof W02007025247), anticorpos capazes de capturar os péptidos de gliadina (Fox, 2007. Antibody therapy for treatment of diseases associated with glúten intolerance. 20070184049/A1), compostos que bloqueiam os sítios de ligação de péptidos de glúten a moléculas HLA-DQ2 ou HLA-DQ8 (Sollid et al. 2007. Drug therapy for celiac sprue. 20070161572/A1); Peakman e Chicz. 2007. Peptide epitopes recognized by disease promoting CD4+ T limphocytes. 20070142622/A1), antagonistas de citoquinas pró-inflamatórias tais como IFN-γ (Maroun et al., 2007. Interferon useful for the treatment of interferon related diseases. 20070160609/A1), a administração oral de citoquinas reguladoras recombinantes (Salvati et al., 2005. Recombinant human interleukin 10 suppresses gliadin dependent T cell activation in ex vivo cultured celiac intestinal mucosa. Gut. 2005; 54:46-53), 5 ΕΡ2236598Β1 inibidores de moléculas de adesão envolvidas nas reações inflamatórias, e antagonistas de zonulina responsáveis por aumentos na permeabilidade paracelular (Paterson e Ginski. 2007. Formulations for a tight junction effector US20070196501/A1). Estas estratégias ocasionam a modificação de moléculas envolvidas em vários processos biológicos e sua utilização pode levar a efeitos secundários não desejados. As estratégias da indústria alimentar estão a ser desenvolvidas para evitar a presença de epitopos tóxicos na comida gue se ingere através da manipulação genética de certas variedades de trigo e a utilização de enzimas proteoliticas e lactobacilos durante os processos de fermentação de cereais, gue podem degradar os epitopos tóxicos. Desta forma, o objetivo é introduzir melhorias na dieta de doentes celíacos e proporcionar-lhes uma vasta variedade de produtos mas sem prevenir ou tratar a própria doença (Rizzello et al. 2007. Highly efficient glúten degradation by lactobacilli and fungai proteases during food Processing: new perspectives for celiac disease. Appl Environ Microbiol.73:4499-507). A utilização de estirpes pertencentes ao género Bifidobacterium como probióticos ou preparações farmacêuticas para o tratamento e prevenção de doença celíaca e distúrbios relacionados e é a base da presente invenção. Os benefícios das bifidobactérias especificamente selecionadas para este fim são numerosos. As bifidobactérias possuem uma especial capacidade para colonizar o trato intestinal de recém-nascidos, contribuindo significativamente para o desenvolvimento das suas defesas (imunitárias e outras) e para a tolerância oral aos antigénios dietéticos. Este grupo de bactérias é um dos principais constituintes da microbiota 6 ΕΡ2236598Β1 intestinal nos primeiros anos de vida, particularmente em crianças alimentadas a peito.enzyme therapy for gastric digestion of dietary gluten in patients with celiac sprue. Gastroenterology. 133: 472-80). The effectiveness of this strategy has been demonstrated in model systems using protein and peptide preparations or their recombinant equivalents, but studies demonstrating their in vivo efficacy are still required in subjects who ingest gluten as in food. Despite the potential benefits of this therapy as an adjuvant in a gluten-free diet, its effects will be highly dependent on the ingestion time of the enzyme preparation and will only allow the occasional intake of gluten reducing the threshold of toxicity. Other proposed alternatives include the development of tissue transglutaminase inhibitor compounds (Khosla et al., 2006, Transglutaminase inhibitors and methods of use thereof W02007025247), antibodies capable of capturing gliadin peptides (Fox, 2007. Antibody therapy for treatment of diseases associated Gluten intolerance, 20070184049 / A1), compounds that block the binding sites of gluten peptides to HLA-DQ2 or HLA-DQ8 molecules (Sollid et al., 2007; Peakman and Chicz. 2007. Peptide epitopes recognized by disease promoting CD4 + T limphocytes. 20070142622 / A1), pro-inflammatory cytokine antagonists such as IFN-γ (Maroun et al., 2007), oral administration of recombinant regulatory cytokines (Salvati et al. , 2005, 54: 46-53), 5 ΕΡ2236598Β1 inhibitors of adhesion molecules involved in the inflammatory reactions, and zonulin antagonists responsible for the disease by increases in paracellular permeability (Paterson and Ginski, 2007. Formulations for a tight junction effector US20070196501 / A1). These strategies cause the modification of molecules involved in various biological processes and their use can lead to unwanted side effects. Food industry strategies are being developed to avoid the presence of toxic epitopes in food that is ingested through the genetic manipulation of certain wheat varieties and the use of proteolytic enzymes and lactobacilli during the fermentation processes of cereals that may degrade the toxic epitopes. Thus, the goal is to introduce improvements in the diet of celiac patients and to provide them with a wide variety of products but without preventing or treating the disease itself (Rizzello et al., 2007). Highly efficient gluten degradation by lactobacilli and fungai proteases during food Processing: new perspectives for celiac disease, Appl Environ Microbiol.73: 4499-507). The use of strains belonging to the genus Bifidobacterium as probiotics or pharmaceutical preparations for the treatment and prevention of celiac disease and related disorders is the basis of the present invention. The benefits of specifically selected bifidobacteria for this purpose are numerous. Bifidobacteria have a special ability to colonize the intestinal tract of newborns, contributing significantly to the development of their (immune and other) defenses and oral tolerance to dietary antigens. This group of bacteria is one of the main constituents of the intestinal microbiota in the first years of life, particularly in breast fed children.

DESCRIÇÃO DA INVENÇÃODESCRIPTION OF THE INVENTION

Breve Descrição da Invenção 0 pedido revela um método for selecionar microrganismos ou estirpes microbianas capazes de modular a resposta imunitária. Estes microrganismos, de um modo preferido pertencentes ao género Bifidobacterium, são capazes de ser utilizados para o tratamento ou prevenção de doenças mediadas pelo imunitário tais como a doença celíaca, devido às suas capacidades imunomodulatórias. A invenção de acordo com as reivindicações proporciona uma nova estirpe do género Bifidobacterium (CECT 7347; daqui em diante "estirpe da invenção" (IATA-ES1) ou o sobrenadante de uma cultura dos microrganismos da invenção ou o extrato obtido a partir dos microrganismos da invenção na forma de preparações concebidas para reduzir os riscos e melhorar a saúde e qualidade de vida dos indivíduos com doença celíaca e outros distúrbios relacionados com a ingestão de glúten (alergia, autismo, ataxia, diabetes, esclerose múltipla, etc.). A estirpe da invenção foi isolada a partir de fezes de bebés alimentados a peito saudáveis e identificada por sequenciação do 16S rRNA e genes tuf. Esta estirpe tem propriedades imunomodulatórias capazes de regular as respostas pró-inflamatórias tipo Thl característica de doença celíaca e doenças relacionadas (esclerose múltipla, diabetes, 7 ΕΡ2236598Β1 ataxia, etc.), assim como as respostas imunitárias tipo Th2 caracteristicas de alergias a proteínas da dieta mediadas por IgE, que resultam da ingestão de trigo e outras proteínas de cereais. A estirpe da invenção é caracterizada por induzir uma baixa produção da citoquina IFN-γ Thl e da citoquina pró-inflamatórias IL-1, e por induzir uma elevada produção das citoquinas reguladoras IL10 e TGF-β em células mononucleares do sangue periférico (PBMCs). 0 perfil de citoquinas induzido por esta estirpe não é uma característica comum de todas as bifidobactérias e bactérias do ácido láctico do intestino humano e torna-a particularmente adequada para modular a resposta imunitária anómala trazida por proteínas do glúten em indivíduos predispostos. A sua combinação com outros microrganismos, tais como por exemplo B. longum ATCC15707, podem potenciar a síntese da citoquina reguladora IL-10 benéfica para o controlo do processo de inflamação característico destas patologias. As bactérias não viáveis (inativadas através e vários procedimentos, tais como calor, congelamento-descongelamento, radiação, etc.) mantêm as suas propriedades imunomodulatórias. A estirpe da invenção é capaz de incorporar e hidrolisar os péptidos do glúten responsáveis por estes distúrbios, reduzindo a concentração de epitopos tóxicos e seu potencial patogénico. A estirpe da invenção possui peptidases específicas para hidrolisar substratos contendo prolina, que são comuns às proteínas do glúten. As combinações desta com outras estirpes de bifidobactérias que possuem peptidases de diversas especificidades permitem que a sua ação seja complementada, favorecendo a degradação de epitopos tóxicos. A combinação de bifidobactérias com outros microrganismos tais como Lactococcus lactis NCD0712, que tem uma proteinase 8 ΕΡ2236598Β1 ancorada na parede celular, também potência os efeitos hidrolíticos devido exclusivamente à ação da bifidobactéria. A estirpe da invenção é capaz de modular a resposta imunitária provocada pelos péptidos do glúten através de: (i) indução da síntese de citoquinas reguladoras (IL-10), (ii) redução da produção de citoquinas pró-inflamatórias IFN-γ, IL-1, IL-8 e IL-15 derivadas da resposta imunitária inata e adaptativa (iii) inibição das vias pró-inflamatórias mediada pelo fator nuclear kB (Exemplo 3, Tabela 3). A estirpe da invenção, assim como os seus compostos derivados de acordo com as reivindicações é também capaz de inibir as bactérias patogénicas isoladas da microbiota intestinal de doentes de doença celíaca, com potencial pró-inflamatório e fatores de virulência que favorecem o restabelecimento do equilíbrio intestinal (Exemplo 4, Tabelas 4 e 5) . Estas estirpes são também capazes de inibir a resposta pró-inflamatória das bactérias intestinais de doentes com doença celíaca ativa e dos que tinham uma dieta isenta de glúten, reduzindo a síntese de citoquinas pró- inflamatórias (TNF-α e IFN-γ) e aumentando a das citoquinas reguladoras (IL-10). A estirpe da invenção também possui atividades metabólicas (por exemplo: fosfatase, esterase, lipase, galactosidase, glucosidase e N-acetil-glucosaminidase) que favorece a digestão de nutrientes e melhora a síndroma da malabsorção e malnutrição características de doentes celíacos A estirpe da invenção possui a capacidade para aderir a mucina (1-4%) e é estável sob condições de stresse 9 ΕΡ2236598Β1 gastrointestinal (pH ácido e elevada concentração de bilis; Exemplo 5, Tabela 6 e Tabela 7) e dos processos tecnológicos de armazenamento e preparação de alimentos (refrigeração, liofilização, fermentação, etc.). In vivo é capaz de sobreviver em trânsito em humanos após administração oral. Todas estas propriedades garantem a sua persistência prolongada e a eficácia no intestino e sua utilização como probióticos e simbióticos (combinações de pró e prebióticos). Estes também garantem a sua utilização na forma de alimentos funcionais, novos alimentos, suplementos, nutracêuticos e fármacos para redução dos riscos e melhoria da saúde e qualidade de vida dos indivíduos com doença celíaca assim como com outros distúrbios relacionados com a ingestão de glúten.Brief Description of the Invention The application discloses a method for selecting microorganisms or microbial strains capable of modulating the immune response. These microorganisms, preferably belonging to the genus Bifidobacterium, are capable of being used for the treatment or prevention of immune mediated diseases such as celiac disease, owing to their immunomodulatory capabilities. The invention according to the claims provides a novel strain of the genus Bifidobacterium (CECT 7347; hereinafter " strain of the invention " (IATA-ES1) or the supernatant of a culture of the microorganisms of the invention or the extract obtained from the microorganisms of the invention in the form of preparations designed to reduce risks and improve the health and quality of life of individuals with celiac disease and other disorders related to gluten ingestion (allergy, autism, ataxia, diabetes, multiple sclerosis, etc.). strain of the invention has been isolated from feces of healthy breast fed infants and identified by sequencing of 16S rRNA and tuf genes. This strain has immunomodulatory properties capable of regulating proinflammatory responses characteristic of celiac disease and related diseases (sclerosis multiple, diabetes, 7α-2236598Β1 ataxia, etc.), as well as the Th2 type immune responses characteristics of IgE-mediated dietary protein allergies that result from the ingestion of wheat and other cereal proteins. The strain of the invention is characterized by inducing a low production of the cytokine IFN-γ Th1 and the pro-inflammatory cytokine IL-1, and by inducing a high production of IL-10 and TGF-β regulatory cytokines in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) . The cytokine profile induced by this strain is not a common feature of all the bifidobacteria and lactic acid bacteria of the human gut and makes it particularly suitable for modulating the abnormal immune response brought about by gluten proteins in predisposed individuals. Their combination with other microorganisms, such as for example B. longum ATCC15707, may potentiate the synthesis of the beneficial IL-10 regulatory cytokine for controlling the inflammation process characteristic of these pathologies. Non-viable bacteria (inactivated through and various procedures, such as heat, freeze-thaw, radiation, etc.) maintain their immunomodulatory properties. The strain of the invention is capable of incorporating and hydrolyzing the gluten peptides responsible for these disorders, reducing the concentration of toxic epitopes and their pathogenic potential. The strain of the invention has specific peptidases for hydrolyzing proline-containing substrates which are common to gluten proteins. Combinations of this with other strains of bifidobacteria that possess peptidases of diverse specificities allow their action to be complemented, favoring the degradation of toxic epitopes. The combination of bifidobacteria with other microorganisms such as Lactococcus lactis NCD0712, which has an εΡ2236598Β1 proteinase anchored in the cell wall, also potentiates the hydrolytic effects due solely to the action of bifidobacteria. The strain of the invention is able to modulate the immune response elicited by gluten peptides by: (i) inducing the synthesis of regulatory cytokines (IL-10), (ii) reducing the production of proinflammatory cytokines IFN-γ, IL -1, IL-8 and IL-15 derived from the innate and adaptive immune response (iii) inhibition of proinflammatory pathways mediated by nuclear factor kB (Example 3, Table 3). The strain of the invention as well as its derivative compounds according to the claims is also capable of inhibiting the pathogenic bacteria isolated from the intestinal microbiota of celiac disease patients with pro-inflammatory potential and virulence factors which favor the restoration of intestinal balance (Example 4, Tables 4 and 5). These strains are also able to inhibit the proinflammatory response of intestinal bacteria in patients with active celiac disease and those on a gluten-free diet, reducing the synthesis of proinflammatory cytokines (TNF-α and IFN-γ) and increasing of the regulatory cytokines (IL-10). The strain of the invention also has metabolic activities (for example: phosphatase, esterase, lipase, galactosidase, glucosidase and N-acetyl glucosaminidase) which promotes nutrient digestion and improves the malabsorption and malnutrition syndrome characteristic of celiac patients. has the ability to adhere to mucin (1-4%) and is stable under gastrointestinal stress conditions (acid pH and high bile concentration; Example 5, Table 6 and Table 7) and the technological processes of storage and preparation of (refrigeration, freeze-drying, fermentation, etc.). In vivo it is able to survive in transit in humans after oral administration. All these properties ensure their prolonged persistence and effectiveness in the gut and their use as probiotics and symbiotics (combinations of pro and prebiotics). These also ensure their use in the form of functional foods, novel foods, supplements, nutraceuticals and drugs to reduce risks and improve the health and quality of life of individuals with celiac disease as well as other disorders related to gluten intake.

Deste modo, um primeiro aspeto da revelação refere-se a um método para selecionar microrganismos ou estirpes de microrganismos capazes de modular a resposta imunitária a alergias alimentares, que compreende: (a) isolamento de microrganismos a partir de amostras, de um modo preferido fezes, a partir de indivíduos saudáveis, de um modo preferido bebés alimentados a peito, e (b) seleção destes microrganismos do estádio anterior capazes de modular a resposta imunitária e hidrolisar, inativar ou interferir com o mecanismo de ação de pelo menos um agente que causa alergias alimentares, de um modo preferido, doença celíaca. De um modo preferido, os microrganismos selecionados no estádio (a) pertencem a um género ou espécie potencialmente probiótico. Numa forma de realização preferida, a resposta imunitária modulada pelo microrganismo obtida no estádio (a) são as respostas pró-inflamatórias do tipo Thl ou Th2. Também, os microrganismos obtidos no estádio (a) e (b), 10 ΕΡ2236598Β1 alternativamente ou em adição à sua capacidade de modulação da resposta imunitária, podem ser selecionadas pela sua capacidade para aumentar a viabilidade e/ou integridade de células epiteliais melhorando a função de barreira intestinalThus, a first aspect of the invention relates to a method for selecting microorganisms or strains of microorganisms capable of modulating the immune response to food allergies, which comprises: (a) isolating microorganisms from samples, preferably feces , from healthy individuals, preferably breast fed infants, and (b) selecting such prior stage microorganisms capable of modulating the immune response and hydrolyzing, inactivating or interfering with the mechanism of action of at least one agent causing food allergies, preferably celiac disease. Preferably, the microorganisms selected at stage (a) belong to a potentially probiotic species or genus. In a preferred embodiment, the immune response modulated by the microorganism obtained in stage (a) is the Th1 or Th2 proinflammatory responses. Also, the microorganisms obtained in stage (a) and (b), 10E-2236598Β1 alternatively or in addition to their ability to modulate the immune response, may be selected for their ability to increase viability and / or integrity of epithelial cells by enhancing function of intestinal barrier

Os microrganismos selecionados pelo método acima ou capazes de hidrolisar, inativar ou interferir com os mecanismos de ação de pelo menos um agente que causa alergias alimentares e que modula a resposta imunitária podem ser utilizados para o tratamento ou prevenção de alergias alimentares (daqui em diante "microrganismos da invenção"). Deste modo, um aspeto da invenção refere-se aos microrganismos reivindicados para utilização como um medicamento ou composições alimentares, de um modo preferido, para o tratamento ou prevenção de alergias alimentares. A invenção refere-se a uma estirpe bacteriana com o número de depósito CECT 7347. A invenção refere-se ainda a uma composição (daqui em diante, a "composição da invenção") que compreende a estirpe da invenção, onde, além disso, está de um modo preferido presente nesta composição numa proporção entre 0,1 e 99,9%, de um modo preferido entre 1% e 99% e de um modo mais preferido entre 10% e 90%. Esta composição pode adicionalmente compreender outros microrganismos ou meios que potenciam, entre outros, a capacidade imunomoduladora do microrganismo ou estirpe da invenção ou a sua capacidade para hidrolisar, inativar ou interferir com os mecanismos de ação dos agentes que causam alergias alimentares. 11 ΕΡ2236598Β1 A invenção refere-se ainda a uma composição que pode ser obtida a partir dos compostos bioativos derivados dos microrganismos da invenção que são o sobrenadante de uma cultura de qualquer dos microrganismos da invenção (daqui em diante "sobrenadante da invenção") , ou os extratos obtidos a partir da cultura pura ou mista de qualquer dos microrganismos da invenção ou estirpe da invenção (daqui em diante, "extrato da invenção"), estes compostos bioativos derivados do microrganismo da invenção, daqui em diante "compostos bioativos derivados da invenção", podem ser utilizados para a preparação de alimentos, suplementos, nutracêuticos, produtos com base em probióticos ou simbióticos, novos alimentos ou medicamentos, e do mesmo modo as suas diferentes utilizações também fazem parte da invenção. Outro aspeto da revelação refere-se a um material de suporte para a preparação de produtos alimentares que compreende a composição da invenção ou pelo menos um microrganismo da invenção, de um modo preferido, a estirpe da invenção. Numa forma de realização preferida, o microrganismo da invenção está contido no material de suporte numa quantidade de pelo menos cerca de 105 cfu/g de material de suporte, de um modo preferido entre 106 cfu/g e 1012 cfu/g, de um modo mais preferido entre 106 cfu/g e IO10 cfu/g. De acordo com o exposto anteriormente, qualquer produto ou suplemento alimentar compreendendo a composição da invenção também forma parte da invenção. A invenção refere-se ainda a uma composição farmacêutica ou composição alimentar que compreende qualquer dos seguintes compostos: a composição da invenção, o sobrenadante da invenção, o extrato da invenção, um microrganismo da invenção, a estirpe da invenção e, opcionalmente, meios e/ou 12 ΕΡ2236598Β1 excipientes farmacologicamente aceitáveis. A quantidade de microrganismos que a composição farmacêutica ou composição alimentar deve conter variará de acordo com o tipo de patologia é concebida para tratamento. De um modo preferido, a referida patologia é uma alergia alimentar e, de um modo mais preferido, doença celíaca. No caso da preparação de composições alimentares, e de acordo com a presente invenção, pelo menos um microrganismo da invenção ou composto bioativo derivado da invenção, é incorporado no material de suporte, de um modo preferido, numa quantidade de entre 105 cfu/g e 1014 cfu/g do material de suporte, de um modo mais preferido, entre cerca de 108 cfu/g e 1013 cfu/g, e mesmo de um modo mais preferido entre 107 cfu/g e 1012 cfu/g, no caso de um microrganismo da invenção, e no caso de um composto bioativo derivado da invenção numa proporção de entre 0,1 e 99,9%, de um modo preferido entre 1% e 99% e de um modo mais preferido entre 10% e 90%. Estas composições alimentares podem ser utilizadas para a preparação de nutracêuticos, alimentos funcionais, probióticos, simbióticos, suplementos nutricionais ou qualquer outros tipos de produto concebido para o tratamento ou prevenção, de um modo preferido, de alergias alimentares e, de um modo mais preferido, de doença celíaca. A composição farmacêutica ou composição alimentar da invenção podem ser encontradas, de um modo preferido, na forma de comprimidos, cápsulas, microcápsulas, pós, soluções, pastas, etc.The microorganisms selected by the above method or capable of hydrolyzing, inactivating or interfering with the mechanisms of action of at least one agent that causes food allergies and that modulates the immune response may be used for the treatment or prevention of food allergies (hereinafter " microorganisms of the invention "). Thus, one aspect of the invention relates to the claimed microorganisms for use as a medicament or food compositions, preferably for the treatment or prevention of food allergies. The invention relates to a bacterial strain with the deposition number CECT 7347. The invention further relates to a composition (hereinafter, the " composition of the invention ") which comprises the strain of the invention, wherein, in addition , is preferably present in this composition in a proportion between 0.1 and 99.9%, preferably between 1% and 99%, and more preferably between 10% and 90%. This composition may further comprise other microorganisms or media which potentiate, inter alia, the immunomodulatory capacity of the microorganism or strain of the invention or its ability to hydrolyze, inactivate or interfere with the mechanisms of action of the agents that cause food allergies. The invention further relates to a composition obtainable from the bioactive compounds derived from the microorganisms of the invention which are the supernatant of a culture of any of the microorganisms of the invention (hereinafter " supernatant of the invention "), or the extracts obtained from the pure or mixed culture of any of the microorganisms of the invention or strain of the invention (hereinafter " extract of the invention "), these bioactive compounds derived from the microorganism of the invention, hereinafter " bioactive compounds derivatives of the invention " can be used for the preparation of foods, supplements, nutraceuticals, probiotic or symbiotic products, novel foods or medicaments, and likewise their different uses are also part of the invention. Another aspect of the invention relates to a carrier material for the preparation of food products comprising the composition of the invention or at least one microorganism of the invention, preferably the strain of the invention. In a preferred embodiment, the microorganism of the invention is contained in the carrier material in an amount of at least about 105 cfu / g carrier material, preferably between 106 cfu / g and 1012 cfu / g, in a more preferred manner. preferred between 106 cfu / g and 1010 cfu / g. Accordingly, any food product or supplement comprising the composition of the invention is also part of the invention. The invention further relates to a pharmaceutical composition or food composition comprising any of the following compounds: the composition of the invention, the supernatant of the invention, the extract of the invention, a microorganism of the invention, the strain of the invention and optionally means and / or 12 Ρ 2236598Β1 pharmacologically acceptable excipients. The amount of microorganisms that the pharmaceutical composition or food composition will contain will vary according to the type of pathology it is designed for treatment. Preferably, said pathology is a food allergy, and, more preferably, celiac disease. In the case of the preparation of food compositions, and in accordance with the present invention, at least one microorganism of the invention or bioactive compound derived from the invention is incorporated into the carrier material, preferably in an amount of between 105 cfu / g and 1014 cfu / g of the carrier material, more preferably between about 108 cfu / g and 1013 cfu / g, and even more preferably between 107 cfu / g and 1012 cfu / g, in the case of a microorganism of the invention , and in the case of a bioactive compound derived from the invention in a proportion of between 0.1 and 99.9%, preferably between 1% and 99%, and more preferably between 10% and 90%. Such food compositions may be used for the preparation of nutraceuticals, functional foods, probiotics, symbiotics, nutritional supplements or any other types of product designed for the treatment or prevention, preferably of food allergies, and, more preferably, of celiac disease. The pharmaceutical composition or food composition of the invention may preferably be found in the form of tablets, capsules, microcapsules, powders, solutions, pastes, etc.

Outro aspeto da invenção refere-se à composição da invenção, ao sobrenadante da invenção, extrato da invenção, composição farmacêutica da invenção, ou à composição 13 ΕΡ2236598Β1 alimentar da invenção em que o microrganismo da invenção ou a estirpe da invenção é combinada com outro microrganismo, um sobrenadante obtido da sua cultura ou as suas frações subcelulares. De um modo preferido, o referido microrganismo pertence ao género Lactococcus, de um modo preferido à espécie Lactococcus lactis e, de um modo mais preferido, é a estirpe Lactococcus lactis NCD0712. A invenção também se refere às diferentes formas de apresentação da composição da invenção que podem ser formuladas como um alimento, nutracêutico, preparação farmacêutica, suplemento, probióticos ou simbióticos, ou novos alimentos.Another aspect of the invention relates to the composition of the invention, the supernatant of the invention, the extract of the invention, the pharmaceutical composition of the invention, or the feed composition of the invention wherein the microorganism of the invention or the strain of the invention is combined with another microorganism , a supernatant obtained from its culture or its subcellular fractions. Preferably, said microorganism belongs to the genus Lactococcus, preferably to the species Lactococcus lactis and, more preferably, is the strain Lactococcus lactis NCD0712. The invention also relates to the different forms of presentation of the composition of the invention which may be formulated as a food, nutraceutical, pharmaceutical preparation, supplement, probiotics or symbiotics, or novel foods.

Definições:Definitions:

Bebés alimentados a peito: através da descrição este termo referir-se-á, de um modo preferido, a indivíduos saudáveis, de um modo preferido, com menos de dois anos de idade, de um modo mais preferido, menos de 1 ano de idade e, de um modo mais preferido, menos do que 6 meses de idade, que foram predominantemente alimentados a peito.Breast-fed infants: Throughout the disclosure, this term will preferably refer to healthy individuals, preferably less than two years of age, more preferably less than one year of age and, more preferably, less than 6 months of age, which were predominantly breast fed.

Indivíduos saudáveis: preferencialmente este termo refere-se a alguém que não sofre de qualquer tipo de patologia crónica ou aguda de acordo com os critérios dos médicos especialistas. Preferencialmente, a referida patologia provoca inflamação do epitélio intestinal, de um modo mais preferido, doença celíaca.Healthy individuals: preferably this term refers to someone who does not suffer from any type of chronic or acute pathology according to the criteria of the medical specialists. Preferably, said pathology causes inflammation of the intestinal epithelium, more preferably celiac disease.

Alergias alimentares: ao longo da descrição este termo referir-se-á, preferencialmente, às alergias alimentares 14 ΕΡ2236598Β1 causadas, preferencialmente, por leite, ovos, leguminosas, nozes, crustáceos, peixe, moluscos, sésamo, sementes de girassol, sementes de algodão, sementes de papoila, feijões, ervilhas, lentilhas e, de um modo mais preferido, por glúten.Food allergies: throughout the description this term will refer preferably to food allergies, preferably caused by milk, eggs, legumes, nuts, crustaceans, fish, molluscs, sesame, sunflower seeds, cottonseed , poppy seeds, beans, peas, lentils and, more preferably, gluten.

Resposta pró-inflamatória tipo Thl: a resposta a um estimulo que causa uma elevada produção de citoquinas tipo Thl, e de um modo preferido, da citoquina IFN-γ que é, de um modo preferido, pelo menos 100 vezes, de um modo mais preferido, pelo menos 15 vezes, de um modo mais preferido, pelo menos 10 vezes e de um modo ainda mais preferido pelo menos 4 vezes superior ao do controlo.Thl-type pro-inflammatory response: the response to a stimulus which causes a high production of Th1-type cytokines, and preferably the cytokine IFN-γ which is preferably at least 100-fold, in a more preferably at least 15 times, more preferably at least 10 times, and still more preferably at least 4 times that of the control.

Resposta pró-inflamatória do tipo Th2: a resposta a um estimulo que causa uma elevada produção de citoquinas tipo Th2, e de um modo preferido da citoquina IL4 que é pelo menos 100 vezes, de um modo mais preferido, pelo menos 15 vezes, de um modo mais preferido, pelo menos 10 vezes e de um modo ainda mais preferido, pelo menos 4 vezes superior à do controlo. Género ou espécie potencialmente probiótico: De um modo preferido ao longo da descrição, este termo referir-se-á às espécies e estirpes das seguintes divisões filogenéticas e géneros procariotas: Archaea, Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, Actinobacteria, Verrucomicrobia, Fusobacteria, Spirochaetes, Fibrobacters, Deferribacteres, Deinococcus,Pro-inflammatory response of the Th2 type: the response to a stimulus which causes a high production of Th2-type cytokines, and preferably the IL4 cytokine which is at least 100-fold, more preferably at least 15-fold, of a more preferred way, at least 10 times and even more preferably at least 4 times that of the control. Potentially probiotic genera or species: Preferably throughout the description, this term will refer to the species and strains of the following phylogenetic divisions and prokaryotic genera: Archaea, Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, Actinobacteria, Verrucomicrobia, Fusobacteria, Spirochaetes, Fibrobacters, Deferribacteres, Deinococcus,

Thermus, Cianobacteria, Methanobrevibacterium,Thermus, Cyanobacteria, Methanobrevibacterium,

Bifidobacterium, Lactobacillus, Streptococcus, Leuconostoc. Peptostreptococcus, Pediococcus, Lactococcus, Enterococcus, Ruminococcus, Coprococcus, Subdolingranulum, Dorea, Bulleidia, Anaerofustis, Gemella, Roseburia, Catenibacterium, Dialister, 15 ΕΡ2236598Β1Bifidobacterium, Lactobacillus, Streptococcus, Leuconostoc. Peptostreptococcus, Pediococcus, Lactococcus, Enterococcus, Ruminococcus, Coprococcus, Subdolingranulum, Dorea, Bulleidia, Anaerobustis, Gemella, Roseburia, Catenibacterium, Dialister, 15 ΕΡ 2236598Β1

Anaerotruncus, Staphylococcus, Micrococcus, Propionibacterium, Enterobacteriaceae, Faecalibacterium, Bacteroid.es,Anaerotruncus, Staphylococcus, Micrococcus, Propionibacterium, Enterobacteriaceae, Faecalibacterium, Bacteroid,

Parabacteroides, Prevotella, Eubacterium, Akkermansia, Bacillus, Butyrivibrio, Clostridium, etc. Assim como as espécies e estirpes de fungos e leveduras Saccharomyces, Candida, Pichia, Debaryomyces, Torulopsis, Aspergillus, Rhizopus, Mucor, Penicillium, entre outras.Parabacteroides, Prevotella, Eubacterium, Akkermansia, Bacillus, Butyrivibrio, Clostridium, etc. As well as the species and strains of fungi and yeasts Saccharomyces, Candida, Pichia, Debaryomyces, Torulopsis, Aspergillus, Rhizopus, Mucor, Penicillium, among others.

Meios: este termo refere-se, de um modo preferido, a meios de cultura, substratos, prebióticos, fibras, compostos bioativos, excipientes, ingredientes, etc. que melhoram quaisquer características dos microrganismos da invenção para utilização, de um modo preferido, na preparação de medicamentos, composições nutricionais, composições, materiais de suporte, sobrenadantes e alimentos da invenção (por exemplo, estabilidade, capacidades imunomoduladoras, capacidades de adesão, fermentação, hidrólise ou inativação de agentes que causam alergia, etc.).Means: This term refers preferably to culture media, substrates, prebiotics, fibers, bioactive compounds, excipients, ingredients, etc. which improve any features of the microorganisms of the invention for use in the preparation of medicaments, nutritional compositions, compositions, carrier materials, supernatants and foods of the invention (e.g., stability, immunomodulatory capabilities, adhesion capabilities, fermentation, hydrolysis or inactivation of allergy causing agents, etc.).

Material de suporte: de um modo preferido, o material de suporte é uma composição alimentar selecionada a partir de leite, iogurte, queijo, leite fermentado, produtos alimentares com base em leite fermentado, cereais fermentados, farinhas, sumos, açúcar, bolos, gelados, formulações para crianças, etc.Support material: Preferably, the carrier material is a food composition selected from milk, yogurt, cheese, fermented milk, fermented milk-based food products, fermented cereals, flour, juices, sugar, cakes, ice creams , formulations for children, etc.

Medicamento: através da descrição este termo referir-se-á a composições farmacêuticas ou formulações, de um modo preferido, concebidas para tratar ou prevenir alergias, alergias alimentares, doenças inflamatórias intestinais, infeções gastrointestinais e a translocação de microrganismos patogénicos ou suas toxinas, alteração do equilíbrio 16 ΕΡ2236598Β1 intestinal (disbiose), sobrecrescimento bacteriano, alteração da permeabilidade intestinal, intolerância a alimento, doença celíaca, síndroma de malabsorção, etc.Description: This term will refer to pharmaceutical compositions or formulations, preferably designed to treat or prevent allergies, food allergies, inflammatory bowel diseases, gastrointestinal infections and the translocation of pathogenic microorganisms or their toxins, change of the intestinal balance (dysbiosis), bacterial overgrowth, change in intestinal permeability, food intolerance, celiac disease, malabsorption syndrome, etc.

Composição alimentar: ao longo da descrição este termo referir-se-á a alimentos (funcionais, convencionais e novos), suplementos alimentares, fórmulas para fins nutricionais, e nutracêuticos concebidos, de um modo preferido, para tratar ou prevenir alergias, alergias alimentares, doenças inflamatórias intestinais, infeções gastrointestinais e a translocação de microrganismos patogénicos ou suas toxinas, alteração do equilíbrio intestinal (disbiose), sobrecrescimento bacteriano, alteração da permeabilidade intestinal, intolerância a alimentos, doença celíaca, síndroma de malabsorção, etc.Food Composition: Throughout the term this term will refer to foods (functional, conventional and novel), food supplements, nutritional formulas, and nutraceuticals, preferably designed to treat or prevent allergies, food allergies, inflammatory bowel diseases, gastrointestinal infections and translocation of pathogenic microorganisms or their toxins, altered intestinal balance (dysbiosis), bacterial overgrowth, altered intestinal permeability, food intolerance, celiac disease, malabsorption syndrome, etc.

Composto bioativo derivado de um microrganismo: qualquer composto ou molécula que faz parte do microrganismo como uma parte estrutural, componente celular, fração subcelular, metabólito ou molécula secretada, obtenível por técnicas físico químicas ou biotecnológicas, incluindo entre outros centrifugação, filtração, liofilização, precipitação, sonicação, disrupção celular mecânica e química, extração do composto a partir de culturas utilizando enzimas e/ou agentes químicos, separação utilizando técnicas cromatográficas, clonagem e sobre-expressão dos genes que codificam as moléculas bioativas que são capazes de realizar uma função benéfica para a saúde. 17 ΕΡ2236598Β1A bioactive compound derived from a microorganism: any compound or molecule that forms part of the microorganism as a structural part, cellular component, subcellular fraction, metabolite or secreted molecule obtainable by physical chemical or biotechnological techniques including, inter alia, centrifugation, filtration, lyophilization, precipitation , sonication, mechanical and chemical cell disruption, extraction of the compound from cultures using enzymes and / or chemical agents, separation using chromatographic techniques, cloning and overexpression of genes encoding bioactive molecules that are capable of performing a beneficial function for the health. 17 ΕΡ 2236598Β1

DESCRIÇÃO DAS FIGURASDESCRIPTION OF THE FIGURES

Figura 1. Análise por SDS-PAGE dos perfis de proteína das diferentes digestões de gliadina. Painel A: 1) controlo de gliadinas após digestão com pepsina (G-P); 2) controlo de gliadinas após digestão com pepsina e tripsina (G-P-T); 3) G-P incubadas com a estirpe daFigure 1. SDS-PAGE analysis of the protein profiles of the different gliadin digestions. Panel A: 1) control of gliadins after digestion with pepsin (G-P); 2) control of gliadins after digestion with pepsin and trypsin (G-P-T); 3) G-P incubated with the strain of

invenção; 4) G-P-T incubadas com a estirpe da invenção (Bifidobacterium IATA-ES1). Painel B: 1) G-P de controlo; 2) G-P-T de controlo; 3) G-P incubado com a estirpe da invenção e Lactococcus lactis NCD0712; 4) G-P-T incubadas com a estirpe da invenção e Lactococcus lactis NCD0712.invention; 4) G-P-T incubated with the strain of the invention (Bifidobacterium IATA-ES1). Panel B: 1) Control G-P; 2) control G-P-T; 3) G-P incubated with the strain of the invention and Lactococcus lactis NCD0712; 4) G-P-T incubated with the strain of the invention and Lactococcus lactis NCD0712.

Figura 2. Cromato grama obtido da fração dialisável da digestão da gliadina in vitro. 0 pico 2 é aquele de um modo preferido hidrolisado pela estirpe da invenção.Figure 2. Gram chromatogram obtained from the dialysable fraction of gliadin digestion in vitro. Peak 2 is that preferably hydrolyzed by the strain of the invention.

Figura 3. Alteração da viabilidade celular (medida como atividade endolisossomal) provocada pela fração solúvel e digerida das gliadinas (Gld), na presença ou ausência de bifidobactérias in vitro. Albumina bovina - BSA -(controlo negativo); BifA2 (B. animalis); Bb (B. bifidum) e BL (Estirpe da invenção - Bifidobacterium longum IATA-ES1-) . Os resultados são expressos em valores médios e os desvios padrão são determinados em quadruplicado.Figure 3. Alteration of cell viability (measured as endolysosomal activity) caused by the soluble and digested fraction of gliadins (Gld), in the presence or absence of bifidobacteria in vitro. Bovine albumin - BSA - (negative control); BifA2 (B. animalis); Bb (B. bifidum) and BL (Strain of the invention - Bifidobacterium longum IATA-ES1-). The results are expressed as mean values and the standard deviations are determined in quadruplicate.

Figura 4. Produção de citoquinas pró-inflamatórias (TNF-a) e expressão do fator nuclear kB (NF-kB) em culturas de células Caco-2 expostas à fração solúvel e digerida das gliadinas (Gld), na presença ou ausência deFigure 4. Production of proinflammatory cytokines (TNF-a) and expression of nuclear factor kB (NF-kB) in cultures of Caco-2 cells exposed to the soluble and digested fraction of gliadins (Gld), in the presence or absence of

bifidobactérias in vitro. Albumina bovina - BSA 18 ΕΡ2236598Β1 (controlo negativo); BifA2 (B. animalis); Bb (B. bifidum) e BL (Estirpe da invenção - B. longum IATA-ES1-). Os resultados são expressos em valores médios e os desvios padrão são determinados em quadruplicado.bifidobacteria in vitro. Bovine albumin - BSA 18 Ρ 2236598Β1 (negative control); BifA2 (B. animalis); Bb (B. bifidum) and BL (Strain of the invention - B. longum IATA-ES1-). The results are expressed as mean values and the standard deviations are determined in quadruplicate.

DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO A presente descrição refere-se a um método para selecionar microrganismos ou estirpes de microrganismos capazes de modular a resposta imunitária em alergias alimentares, que compreende: (a) isolar microrganismos de amostras de indivíduos saudáveis, de um modo preferido crianças alimentadas a peito, e (b) selecionar os microrganismos do passo anterior capazes de modular a resposta imunitária e hidrolisar, inativar ou interferir com o mecanismo de ação de pelo menos um agente que provoca alergias alimentares, de um modo preferido doença celíaca. De um modo preferido, os microrganismos selecionados no passo a) pertencem a géneros ou espécies potencialmente probióticos.DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION The present disclosure relates to a method for selecting microorganisms or strains of microorganisms capable of modulating the immune response in food allergies, which comprises: (a) isolating microorganisms from samples from healthy individuals, preferably infants fed (b) selecting the microorganisms from the previous step capable of modulating the immune response and hydrolyzing, inactivating or interfering with the mechanism of action of at least one agent that causes food allergies, preferably celiac disease. Preferably, the microorganisms selected in step a) belong to potentially probiotic genera or species.

Outro aspeto da invenção refere-se a microrganismos capazes de hidrolisar, inativar ou interferir no mecanismo de ação de pelo menos um agente que provoca alergias alimentares e que modula a resposta imunitária. Estes microrganismos podem ser utilizados de um modo preferido para o tratamento ou prevenção de alergias alimentares, doenças inflamatórias intestinais, desequilíbrios no ecossistema intestinal (disbiose), sobrecrescimento bacteriano, síndroma de malabsorção, infeções gastrointestinais e translocação de microrganismos patogénicos ou suas toxinas, e alterações de permeabilidade intestinal. 19 ΕΡ2236598Β1 A invenção também proporciona microrganismos úteis para produzir formulações que reduzem os riscos e melhoram o estado de saúde de indivíduos que sofrem ou estão predispostos a sofrer de distúrbios relacionados com a ingestão de glúten através de vários mecanismos de ação, caracterizados por serem, microrganismos não modificados geneticamente, isolados e selecionados da microbiota intestinal de indivíduos saudáveis para as suas propriedades anti-inflamatórias e reguladoras.Another aspect of the invention relates to microorganisms capable of hydrolyzing, inactivating or interfering with the mechanism of action of at least one agent that causes food allergies and which modulates the immune response. These microorganisms may be preferably used for the treatment or prevention of food allergies, inflammatory bowel diseases, imbalances in the intestinal ecosystem (dysbiosis), bacterial overgrowth, malabsorption syndrome, gastrointestinal infections and translocation of pathogenic microorganisms or their toxins, and changes of intestinal permeability. The invention also provides microorganisms useful for producing formulations which reduce risks and improve the health status of individuals suffering from or prone to suffering from disorders related to gluten intake through various mechanisms of action characterized in that they are microorganisms not genetically modified, isolated and selected from the intestinal microbiota of healthy individuals for their anti-inflammatory and regulatory properties.

Os seus mecanismos múltiplos de ação incluem por exemplo, e sem limitar o âmbito da invenção: (i) regular a resposta imunológica inata e adaptativa provocada pelos péptidos tóxicos e imunogénicos do glúten; (ii) reduzir a concentração dos epitopos tóxicos no lúmen do intestino através do transporte e da hidrólise dos péptidos do glúten; (iii) fortalecimento da função de barreira defensiva contra bactérias ou outros agentes pró-inflamatórios e com fatores de virulência isolados a partir do trato gastrointestinal de doentes celíacos, e (iv) proporcionar atividades enzimáticas, para além das peptidases, que favorecem a digestão e fornecem os nutrientes para aliviar a síndroma de malabsorção típica destes doentes. Este microrganismo pode produzir efeitos benéficos em adição a estes mencionados, a título de ilustração e sem limitar o âmbito da invenção, reduzir o stress oxidativo associado à inflamação, regular a permeabilidade intestinal, favorecendo a colonização de bactérias Gram-positivas benéficas com funções protetoras, regulando a função das células que apresentam antigénio, inibindo a interação de péptidos tóxicos com as células imunocompetentes e epiteliais do hospedeiro, interagindo com metaloproteases, regulando o ciclo celular e apoptose, 20 ΕΡ2236598Β1 regulando o crescimento celular e a diferenciação e regulando as funções neuroendócrinas. (De Stefano et al., 2007. Lycopene, guercetin and tyrosol prevent macrophage activation induced by gliadina and IFN-γ. Eur J Pharmacol. 2; 566 (1-3):192-9; Silano et al., 2007. A decapeptide from durum wheat prevents celiac peripheral blood lymphocytes from activation by gliadin peptides. Pediatr Res. 61(1):67-71; Gross et al. 2007. Role of neuropeptides in inflammatory bowel disease. Inflama Bowel Dis. 3(7):918-32).Its multiple mechanisms of action include, for example, and without limiting the scope of the invention: (i) regulating the innate and adaptive immune response elicited by toxic and immunogenic gluten peptides; (ii) reducing the concentration of toxic epitopes in the lumen of the gut by transporting and hydrolyzing the gluten peptides; (iii) strengthening the defensive barrier function against bacteria or other pro-inflammatory agents and with virulence factors isolated from the gastrointestinal tract of celiac patients, and (iv) providing enzymatic activities, in addition to peptidases, which promote digestion and provide the nutrients to alleviate the typical malabsorption syndrome of these patients. This micro-organism can produce beneficial effects in addition to these by way of illustration and without limiting the scope of the invention, reducing the oxidative stress associated with inflammation, regulating intestinal permeability, favoring the colonization of beneficial Gram-positive bacteria with protective functions, regulating the function of antigen-presenting cells, inhibiting the interaction of toxic peptides with immunocompetent and epithelial cells of the host, interacting with metalloproteases, regulating the cell cycle and apoptosis, regulating cell growth and differentiation, and regulating neuroendocrine functions. (De Stefano et al., 2007). Lycopene, Guercetin and tyrosol prevent macrophage activation induced by gliadin and IFN-γ, Eur J Pharmacol 2, 566 (1-3): 192-9, Silano et al. Decapeptide from durum wheat prevents celiac peripheral blood lymphocytes from activation by gliadin peptides Pediatr Res. 61 (1): 67-71; Gross et al., 2007 Role of neuropeptides in inflammatory bowel disease Inflammation Bowel Dis. 918-32).

Os microrganismos da invenção pertencem, de um modo preferido, ao género Blfldobacterium. Os microrganismos deste género oferecem vantagens nas formulações de alimentos, novos alimentos, probióticos, simbióticos, suplementos, nutracêuticos, e formulações farmacêuticas para o tratamento ou prevenção de doença celíaca e distúrbios relacionados. As bifidobactérias possuem uma capacidade especial para colonizar o trato intestinal dos recém-nascidos, contribuindo significativamente para o desenvolvimento das suas defesas.The microorganisms of the invention preferably belong to the genus Blfldobacterium. Microorganisms of this genus offer advantages in food formulations, novel foods, probiotics, symbiotics, supplements, nutraceuticals, and pharmaceutical formulations for the treatment or prevention of celiac disease and related disorders. Bifidobacteria have a special ability to colonize the intestinal tract of newborns, contributing significantly to the development of their defenses.

Os microrganismos da invenção pertencem à espécie B. longum. Como um exemplo, e sem limitar o âmbito da invenção, a estirpe da invenção pertencente a esta espécie foi isolada a partir das fezes de crianças alimentadas a peito saudáveis e identificadas por sequenciação do gene 16S rRNA (Exemplo 6) e o gene tuf. O fragmento sequenciado (1437 bases) foi amplificado por PCR utilizando os iniciadores 27f e 1401 r e os iniciadores de sequenciação 530f e U-968f também foram utilizados de acordo com os processos descritos por outros autores (Satokari et al., 2001. Appl. Environ. Microbiol. 67, 504-513; Favier et al. 2002. Appl. Environ. Microbiol. 68, 219-226). Através do alinhamento das sequências obtido com 21 ΕΡ2236598Β1 aquelas que existem nas bases de dados (GenBank), foi detetada uma semelhança máxima com as sequências equivalentes a 14 estirpes diferentes da espécie B. longum e entre elas B. longum BG3 (número de acesso AY735403.1). Parte do gene tuf (498 pb) foi amplificada e sequenciada utilizando os iniciadores descritos por Ventura et al. (Analysis, characterization, and loci of the tuf genes in Lactobacillus and Bifidobacterium species and their direct application for species Identification. Appl Environ Microbiol. 2003; 69 (11): 6908-22). Neste caso, também foi detetada uma semelhança máxima com a espécie B. longum e especificamente com a sequência que corresponde à estirpe B. longum ATCC 15707 (número de acesso AY372042.1) seguindo o mesmo procedimento.The microorganisms of the invention belong to the species B. longum. As an example, and without limiting the scope of the invention, the strain of the invention belonging to this species was isolated from the feces of healthy breast fed children and identified by sequencing the 16S rRNA gene (Example 6) and the tuf gene. The sequenced fragment (1437 bases) was amplified by PCR using primers 27f and 1401 and the sequencing primers 530f and U-968f were also used according to the procedures described by other authors (Satokari et al., 2001 Appl. Environ Microbiol 67, 504-513, Favier et al., 2002 Appl Appl Environ Microbiol 68, 219-226). By aligning the sequences obtained with 21 ΕΡ 2236598Β1 those found in the databases (GenBank), a maximum similarity was detected with the sequences equivalent to 14 different strains of the B. longum species and among them B. longum BG3 (accession number AY735403 .1). Part of the tuf gene (498 bp) was amplified and sequenced using the primers described by Ventura et al. (Analysis, characterization, and loci of the tuf genes in Lactobacillus and Bifidobacterium species and their direct application for species identification Env Environ Microbiol 2003, 69 (11): 6908-22). In this case, a maximum similarity was also detected with B. longum species and specifically with the sequence corresponding to strain B. longum ATCC 15707 (accession number AY372042.1) following the same procedure.

Isto demonstra que B. longum apresenta propriedades ideais para regular o sistema imunitário da invenção de um modo semelhante a outras estirpes deste género selecionadas apropriadamente e espécies que o podem fazer, proporcionando os mesmos efeitos benéficos em indivíduos com distúrbios relacionados com a ingestão de glúten. A invenção refere-se a uma estirpe bacteriana que pertence à espécie B longum e gue foi depositada na Coleção Espanhola de Tipos de Culturas (Colección Espanola de Cultivos Tipo - CECT) , com sede em Bur jassot (Valência) , em 20 de Dezembro de 2007, correspondendo ao número de depósito CECT 7347. Esta estirpe pertence à espécie B. longum de acordo com a homologia da sequência do gene 16S rRNA com outros normalmente disponíveis nas bases de dados (GenBank), como descrito no exemplo 6; assim como com a homologia do gene tuf com o de outras estirpes desta espécies. Este último constitui um exemplo de uma estirpe do género Bifidobacterium 22 ΕΡ2236598Β1 que possui propriedades que permitem a sua utilização em formulações farmacêuticas ou medicamentos, alimentos (novos ou funcionais) ou suplementos nutricionais ou alimentares. A estirpe da invenção, pode ser combinada com outros microrganismos e compostos bioativos para melhorar as suas propriedades protetoras e metabólicas através de ações sinérgicas ou complementares, tais como o aumento na síntese total de citoquinas reguladoras e seus tipos, o aumento na capacidade inibidora contra bactérias patogénicas e da função de barreira intestinal, e o aumento na contribuição de peptidases e outras enzimas que favorecem a digestão aumentando a sus concentração total ou aumentando o seu tipo e especificidade.This demonstrates that B. longum exhibits optimal properties for regulating the immune system of the invention in a manner similar to other appropriately selected strains of this genus and species that can do so, providing the same beneficial effects in subjects with disorders related to gluten intake. The invention relates to a bacterial strain belonging to the species B longum and which has been deposited at the Spanish Collection of Types of Cultures (Spanish Collection of Crop Cultures - CECT), established in Burjassot (Valencia) on 20 December 2007, corresponding to the deposition number CECT 7347. This strain belongs to the species B. longum according to the sequence homology of the 16S rRNA gene with others normally available in the databases (GenBank), as described in example 6; as well as with the homology of the tuf gene with that of other strains of this species. The latter is an example of a strain of the genus Bifidobacterium 22 ΕΡ 2236598Β1 which has properties that allow its use in pharmaceutical formulations or medicaments, foods (novel or functional) or nutritional or dietary supplements. The strain of the invention may be combined with other microorganisms and bioactive compounds to enhance its protective and metabolic properties through synergistic or complementary actions such as increased total synthesis of regulatory cytokines and their types, increased inhibitory capacity against bacteria pathogenic and intestinal barrier function, and increased contribution of peptidases and other enzymes that favor digestion by increasing their total concentration or increasing their type and specificity.

Deste modo, outro aspeto da invenção compreende a combinação de bifidobactérias com outros microrganismos ou compostos bioativos, de um modo complementar e/ou sinérgico, favorecendo as respostas imunorreguladoras e a degradação dos péptidos tóxicos e imunogénicos do glúten. Como um exemplo de microrganismos, a estirpe B. longum ATCC 15707 pode reforçar o efeito imunomodulador da estirpe da invenção devido à sua elevada capacidade para induzir a síntese de IL-10 como demonstrado na tabela 1 (Exemplo 1); esta ação também pode complementar a indução de TGF-β produzida apenas pela segunda estirpe (Tabela 1, Exemplo 1) . Ao mesmo tempo, a estirpe Lactoccocus lactis NCD0712 pode complementar e intensificar a degradação de péptidos do glúten devido às bifidobactérias e dessa forma reduzir a concentração de epitopos tóxicos do glúten e a sai lesão intestinal e extraintestinal devido ao facto de possuir, para além de peptidases intracelulares, atividade proteolítica extracelular. A intensificação da 23 ΕΡ2236598Β1 atividade proteolítica é demonstrada no exemplo 2 e na figura 1, em que é possível apreciar uma desaparecimento quase total das bandas de proteína após a incubação das amostras digeridas de gliadina com suspensões celulares da estirpe da invenção e Lactoccocus lactis NCD0712 (Figura 1, painel B, pistas 3 e 4). Esta hidrólise foi superior àquela obtida utilizando apenas a estirpe da invenção (Figura 1, painel A, pistas 3 e 4).Thus, another aspect of the invention comprises combining bifidobacteria with other microorganisms or bioactive compounds in a complementary and / or synergistic manner, favoring immunoregulatory responses and degradation of toxic and immunogenic gluten peptides. As an example of microorganisms, strain B. longum ATCC 15707 may enhance the immunomodulatory effect of the strain of the invention because of its high ability to induce IL-10 synthesis as shown in Table 1 (Example 1); this action may also complement the induction of TGF-β produced only by the second strain (Table 1, Example 1). At the same time, the strain Lactococcus lactis NCD0712 can complement and enhance the degradation of gluten peptides due to bifidobacteria and thereby reduce the concentration of toxic epitopes of gluten and intestinal and extraintestinal damage due to the fact that in addition to peptidases intracellular, extracellular proteolytic activity. The enhancement of proteolytic activity is demonstrated in Example 2 and Figure 1 where it is possible to appreciate a near complete disappearance of the protein bands after incubation of the digested samples of gliadin with cell suspensions of the strain of the invention and Lactococcus lactis NCD0712 ( Figure 1, panel B, lanes 3 and 4). This hydrolysis was superior to that obtained using only the strain of the invention (Figure 1, panel A, lanes 3 and 4).

Outro aspeto da divulgação refere-se à utilização da estirpe da invenção, assim como os seus equivalentes não viáveis inativados por diferentes processos (congelamento, aquecimento, radiação, etc.) para objetivos imunomoduladores.Another aspect of the disclosure relates to the use of the strain of the invention, as well as its non-viable counterparts inactivated by different processes (freezing, heating, radiation, etc.) for immunomodulating purposes.

Os microrganismos não viáveis da invenção inativados por diferentes processos (congelamento, aquecimento, radiação, etc.) continuam a ser úteis para objetivos terapêuticos ou preventivos e também formam parte da presente invenção. Os efeitos imunomoduladores das bifidobactérias são produzidos, pelo menos em parte, por constituintes estruturais (DNA, componentes da parede celular, etc.). Isto torna possível que as bifidobactérias mantenham parte das suas propriedades imunomodulatórias sem manter necessariamente a viabilidade (Lammers et al., 2003. Immunomodulatory effects of probiotic bactéria DNA: IL-1 e IL-10 response in human peripheral blood mononuclear cells. FEMS Immunol Med Microbiol. 38: 165-72). Deste modo, o exemplo 3 e a tabela 3, demonstram que as suspensões celulares da estirpe da invenção, inativadas por ciclos de congelamento e descongelamento, podem modular a resposta pró-inflamatória desencadeada pelas gliadinas quando co-incubadas com células mononucleares do sangue periférico, reduzindo desse modo a síntese das citoquinas pró- 24 ΕΡ2236598Β1 inflamatórias (por exemplo IFN-γ) e aumentando a síntese de citoquinas reguladoras (por exemplo IL-10).Non-viable microorganisms of the invention inactivated by different processes (freezing, heating, radiation, etc.) continue to be useful for therapeutic or preventive purposes and also form part of the present invention. The immunomodulatory effects of bifidobacteria are produced, at least in part, by structural constituents (DNA, cell wall components, etc.). In the present study, Bifidobacteria were found to be responsible for the pathophysiology of Bifidobacteria, which is characterized by the presence of Bifidobacteria and their pathogenicity. Microbiol., 38: 165-72). Thus, Example 3 and Table 3 demonstrate that the cell suspensions of the strain of the invention, inactivated by freeze-thaw cycles, can modulate the proinflammatory response triggered by gliadins when co-incubated with peripheral blood mononuclear cells, thereby reducing the synthesis of the inflammatory pro-inflammatory cytokines (eg IFN-γ) and enhancing the synthesis of regulatory cytokines (eg IL-10).

Também, os compostos bioativos derivados do microrganismo da invenção tais como compostos estruturais, aqueles que resultam do metabolismo, as moléculas segregadas por qualquer um dos microrganismos ou estirpes da invenção, obtidas através de técnicas bem conhecidas, formam parte da presente invenção e podem também ser utilizadas para modular as respostas imunitárias. Por exemplo, técnicas físico-químicas e biotecnológicas, incluindo entre outras centrifugação, filtração, liofilização, precipitação, sonicação, disrupção celular mecânica e química, extração de compostos baseados em culturas com enzimas e/ou agentes químicos, separação através de técnicas cromatográficas, clonagem de genes que codificam os referidos compostos e a sua sobre-expressão. 0 Exemplo 1 e a tabela 1 demonstram que os componentes estruturais que formam parte do envelope celular das bifidobactérias são responsáveis pelo menos em parte pela indução e produção de citoquinas reguladoras (IL-10 e TGF-β). No exemplo 3 e na tabela 3 em que as amostras de gliadina digeridas foram co-incubadas com suspensões celulares inviáveis da estirpe da invenção é também demonstrado que as componentes estruturais destas células são capazes de reduzir as respostas pró-inflamatórias realizadas pelas gliadinas e de aumentar a síntese de citoquinas reguladoras (IL-10). De igual modo, componentes estruturais, metabolitos e substâncias segregadas pela estirpe da invenção exerceram um efeito inibidor sobre o crescimento de bactérias potencialmente patogénicas isoladas de doentes com doença 25 ΕΡ2236598Β1 celíaca, como demonstrado no exemplo 4 e na tabela 4. No referido exemplo, o efeito inibidor das culturas de células desta estirpe foi avaliada utilizando a técnica da camada dupla em que ambas as células assim como os metabolitos e produtos segregados são colocados em contacto com o microrganismo patogénico, de modo que os efeitos inibidores podem ser devidos à ação sinergística de todos esses componentes. 0 efeito inibidor dos metabolitos e compostos segregados pelas bifidobactérias para o meio de cultura também foi avaliado utilizando como um agente inibidor os sobrenadantes de culturas sem células, previamente liofilizados. Deste modo, foi demonstrado que os compostos libertados para o meio de cultura proporcionam um efeito inibidor contra os potenciais patogénicos isolados a partir de doentes com doença celíaca (Tabela 5).Also, the bioactive compounds derived from the microorganism of the invention such as structural compounds, those resulting from metabolism, the molecules secreted by any of the microorganisms or strains of the invention, obtained by well known techniques, form a part of the present invention and may also be used to modulate immune responses. For example, physicochemical and biotechnological techniques including, among others, centrifugation, filtration, lyophilization, precipitation, sonication, mechanical and chemical cell disruption, extraction of compounds based on cultures with enzymes and / or chemical agents, separation through chromatographic techniques, cloning of genes encoding said compounds and their overexpression. Example 1 and Table 1 demonstrate that the structural components that form part of the cell envelope of bifidobacteria are responsible at least in part for the induction and production of regulatory cytokines (IL-10 and TGF-β). In Example 3 and Table 3 in which the digested gliadin samples were co-incubated with non-viable cell suspensions of the strain of the invention it is also shown that the structural components of these cells are able to reduce the proinflammatory responses performed by gliadins and to increase to the synthesis of regulatory cytokines (IL-10). Likewise, structural components, metabolites and substances secreted by the strain of the invention exert an inhibitory effect on the growth of potentially pathogenic bacteria isolated from patients with celiac disease, as demonstrated in Example 4 and Table 4. In said example, inhibitory effect of the cell cultures of this strain has been evaluated using the double layer technique in which both cells as well as the metabolites and secreted products are brought into contact with the pathogenic microorganism so that the inhibitory effects may be due to the synergistic action of all these components. The inhibitory effect of the metabolites and compounds secreted by the bifidobacteria into the culture medium was also evaluated using as an inhibitor the supernatants from previously freeze-dried cell cultures. Thus, it has been shown that the compounds released into the culture medium provide an inhibitory effect against pathogenic potentials isolated from patients with celiac disease (Table 5).

Numa forma de realização particular da presente invenção os microrganismos da invenção, a composição da invenção, o sobrenadante da invenção, o extrato da invenção, a composição da invenção farmacêutica ou nutricional, a estirpe da invenção, são caracterizados por serem capazes de regular ou modular a resposta imunitária inata e adaptativa provocada pelos péptidos danificadores do glúten ou outras alergias alimentares. A estirpe da invenção foi selecionada para as suas propriedades imunomodulatórias capazes de regular as respostas pró-inflamatórias de tipo Thl características de doença celíaca e doenças relacionadas (síndroma de Down, diabetes mellitus de tipo 1, dermatite herpetiforme, miopatia, esclerose múltipla, artrite, autismo, esquizofrenia, depressão, linfomas e ataxia), assim como as reações 26 ΕΡ2236598Β1 alérgicas de tipo Th2 que podem ser provocadas como um resultado da ingestão de trigo e outras proteínas de cereais. As estirpes são caracterizadas pela sua capacidade para induzir uma baixa produção da citoquina Thl IFN- γ (por exemplo <100 pm/mL) e da citoquina pró-inflamatória IL-1 (por exemplo <150 pm/mL) e induzir uma produção elevada das citoquinas reguladoras IL10 (por exemplo > 800 pm/mL) e TGF-β (por exemplo >50 pmol/mL) pelas células mononucleares do sangue periférico (PBMCs; Exemplo 1, Tabela 1). O perfil de citoquinas induzidas por estas bifidobactérias não é uma característica comum a todas as bifidobactérias e bactérias intestinais humanas do ácido láctico (Exemplo 1, Tabela 1) e torna-o especialmente ideal para modular a resposta imunitária anómala que as proteínas do trigo produzem em indivíduos predispostos e em doentes com uma doença celíaca ativa. A deteção destes efeitos imunomoduladores quando se utilizam suspensões celulares da estirpe selecionada como estímulo nestes testes (Exemplo 1 e Tabela 1) indica que os componentes estruturais que formam parte do envelope celular desta bifidobactéria são responsáveis, pelo menos em parte, da indução da produção da citoquina reguladora (IL-10 e TGF-β) que podem reduzir os efeitos tóxicos e imunogénicos dos péptidos do glúten. Também, no exemplo 3 e na Tabela 3 é demonstrado que a utilização de suspensões celulares inviáveis da estirpe da invenção (inativadas por ciclos de congelamento-descongelamento) co-incubadas com amostras de gliadina digerida é capaz de reduzir a síntese de citoquinas pró-inflamatórias (por exemplo INF-γ e IL-15) provocadas pelas gliadinas e aumentando a síntese de citoquinas reguladoras (por exemplo INF IL-10). Por isso, é demonstrado que os componentes estruturais das células da bifidobactéria podem regular as respostas imunológicas anómalas provocadas 27 ΕΡ2236598Β1 pelo glúten, sem que seja estritamente necessária para manter a viabilidade da bactéria. A estirpe da invenção, e o composto bioativo derivado da invenção, são caracterizados por serem capazes de fortalecer a função de barreira defensiva contra bactérias prejudiciais, por exemplo bactérias pró-inflamatórias e bactérias com fatores de virulência, isoladas a partir do trato gastrointestinal de doentes de doença celíaca.In a particular embodiment of the present invention the microorganisms of the invention, the composition of the invention, the supernatant of the invention, the extract of the invention, the composition of the pharmaceutical or nutritional invention, the strain of the invention, are characterized by being able to regulate or modulate the innate and adaptive immune response elicited by gluten-damaging peptides or other food allergies. The strain of the invention was selected for its immunomodulatory properties capable of regulating Th1-type proinflammatory responses characteristic of celiac disease and related diseases (Down Syndrome, type 1 diabetes mellitus, dermatitis herpetiformis, myopathy, multiple sclerosis, arthritis, autism, schizophrenia, depression, lymphomas, and ataxia) as well as Th2-type allergic reactions that can be elicited as a result of ingestion of wheat and other cereal proteins. The strains are characterized by their ability to induce a low production of the cytokine Th1 IFN-γ (e.g. < 100 μg / ml) and the pro-inflammatory cytokine IL-1 (e.g. < 150 μg / ml) and induce a (eg > 800 pm / ml) and TGF-β (e.g. > 50 pmol / ml) by peripheral blood mononuclear cells (PBMCs). The cytokine profile induced by these bifidobacteria is not a feature common to all human lactic acid bifidobacteria and intestinal bacteria (Example 1, Table 1) and makes it especially ideal for modulating the abnormal immune response that wheat proteins produce in predisposed subjects and in patients with active celiac disease. Detection of these immunomodulatory effects when using cell suspensions of the selected strain as the stimulus in these tests (Example 1 and Table 1) indicates that the structural components that form part of the cellular envelope of this bifidobacteria are responsible, at least in part, for the induction of the production of the regulatory cytokine (IL-10 and TGF-β) that can reduce the toxic and immunogenic effects of gluten peptides. Also, in Example 3 and Table 3 it is shown that the use of non-viable cell suspensions of the strain of the invention (inactivated by freeze-thaw cycles) co-incubated with digested gliadin samples is able to reduce the synthesis of pro-inflammatory cytokines (for example INF-γ and IL-15) caused by gliadins and enhancing the synthesis of regulatory cytokines (for example INF IL-10). Therefore, it is demonstrated that the structural components of bifidobacteria cells can regulate the abnormal immune responses caused by gluten without it being strictly necessary to maintain the viability of the bacterium. The strain of the invention and the bioactive compound derived from the invention are characterized in that they are capable of strengthening the defensive barrier function against harmful bacteria, for example proinflammatory bacteria and virulence-like bacteria isolated from the gastrointestinal tract of patients of celiac disease.

Os microrganismos da invenção são capazes de inibir bactérias com potencial patogénico e tóxico, isoladas a partir do intestino de doentes de doença celíaca (Exemplo 4, Tabelas 4 e 5) . Estes agentes patogénicos incluem, entre outras, estirpes das espécies Escherichia coli que codificam fatores de patogenicidade (por exemplo fímbria) e pertencem a grupos filogenéticos virulentos (por exemplo, B2) , estirpes do género Bacteroides e de outros géneros que produzem metaloproteases que contribuem para a lesão de tecidos, e estirpes hemolíticas isoladas a partir de biópsias do duodeno No exemplo 4 e na Tabela 4 o efeito inibidor de culturas celulares totais desta estirpe é demonstrado contra os agentes patogénicos isolados de doentes de doença celíaca, utilizando a técnica de camada dupla, de modo a que estes efeitos podem ser devidos a componentes estruturais, metabolitos e substâncias segregadas pela estirpe da invenção A Tabela 5 também apresenta o efeito inibidor dos sobrenadantes sem células das culturas desta estirpe que apenas contêm os metabolitos e os compostos segregados pela bifidobactéria para este meio. Em ambos os casos, os efeitos de inibição obtidos utilizando a estirpe selecionada são superiores àqueles obtidos utilizando outras estirpes 28 ΕΡ2236598Β1 ensaiadas para objetivos comparativos. Deste modo, os microrganismos ou a estirpe da invenção podem contribuir para restaurar o ecossistema intestinal e reduzindo a carga antigénica de origem microbiana gue iria favorecer o processo inflamatório e o aumento da permeabilidade do epitélio. De igual modo, a estirpe selecionada é capaz de inibir a síntese de citoguinas pró-inflamatórias (por exemplo IFN-γ e TNF-a) estimulada pela microbiota intestinal de doentes de doença celíaca em células mononucleares do sangue periférico. Por exemplo, concentrações de IFN-γ de 90,8 e de TNF-α ed 1966,3 pmol/mL produzidas por PBMCs sob a estimulação com a microbiota de doentes de doença celíaca podem ser reduzidas para valores de 8,2 pmol/mL e 295,2, respetivamente, na presença da estirpe da invenção (Exemplo 7) . Esta estirpe é também capaz de estimular a síntese de citoquinas reguladoras (IL-10), reduzida ao mesmo tempo pela microbiota intestinal de doentes de doença celíaca. Deste modo, por exemplo os valores de IL-10 de 49,3 pmol/mL induzidos pela microbiota de doentes de doença celíaca podem ser aumentados até valores de 107,5 pmol/mL através de estimulação da estirpe de Bifidobacterium IATA-H1. Através deste mecanismo imunomodulador a estirpe selecionada pode contribuir para restaurar o equilíbrio intestinal e evitar a sobre-estimulação do sistema imunitário provocado pela microbiota prejudicial que, juntamente com aquela provocada pelo glúten, podem criar um círculo vicioso que perpetua a inflamação.The microorganisms of the invention are capable of inhibiting bacteria with pathogenic and toxic potential, isolated from the intestine of celiac disease patients (Example 4, Tables 4 and 5). These pathogens include, but are not limited to, strains of Escherichia coli species encoding pathogenicity factors (eg fimbriae) and belong to virulent phylogenetic groups (e.g., B2), strains of the genus Bacteroides and other genera producing metalloproteases that contribute to tissue injury, and hemolytic strains isolated from duodenal biopsies In Example 4 and Table 4 the inhibitory effect of total cell cultures of this strain is demonstrated against pathogens isolated from celiac disease patients using the double-layer technique , so that these effects may be due to structural components, metabolites and substances secreted by the strain of the invention. Table 5 also shows the inhibitory effect of cell-free supernatants from cultures of this strain which contain only the metabolites and compounds secreted by bifidobacteria to this medium. In both cases, the inhibitory effects obtained using the selected strain are superior to those obtained using other strains tested for comparative purposes. Thus, the microorganisms or the strain of the invention may contribute to restore the intestinal ecosystem and reduce the antigenic load of microbial origin which would favor the inflammatory process and increase the permeability of the epithelium. Likewise, the selected strain is capable of inhibiting the synthesis of proinflammatory cytokines (eg IFN-γ and TNF-Î ±) stimulated by the intestinal microbiota of celiac disease patients in peripheral blood mononuclear cells. For example, concentrations of IFN-γ of 90.8 and TNF-α and 1966.3 pmol / ml produced by PBMCs under stimulation with the microbiota of celiac disease patients may be reduced to 8.2 pmol / ml and 295.2, respectively, in the presence of the strain of the invention (Example 7). This strain is also capable of stimulating the synthesis of regulatory cytokines (IL-10), reduced at the same time by the intestinal microbiota of celiac disease patients. Thus, for example, IL-10 values of 49.3 pmol / ml induced by the microbiota of celiac disease patients can be increased to values of 107.5 pmol / ml by stimulation of the Bifidobacterium IATA-H1 strain. Through this immunomodulatory mechanism the selected strain can contribute to restore intestinal balance and avoid the over stimulation of the immune system caused by the harmful microbiota that, together with that caused by gluten, can create a vicious circle that perpetuates inflammation.

Também, os microrganismos da invenção são caracterizados pela sua capacidade para transportar os péptidos do glúten que resultam da digestão gastrointestinal, reduzindo desse modo a concentração de epitopos lesivos. 29 ΕΡ2236598Β1Also, the microorganisms of the invention are characterized by their ability to carry the gluten peptides that result from gastrointestinal digestion, thereby reducing the concentration of injurious epitopes. 29 ΕΡ 2236598Β1

Especificamente, a estirpe da invenção possui a capacidade para recuperar péptidos tóxicos derivados da digestão gastrointestinal de gliadinas, a partir de produtos que resultam da digestão gástrica através da ação da pepsina (P) , assim como a partir da digestão intestinal por meio da ação da tripsina (T) e da pancreatina (X) (Exemplo 2, Figura 1). A incubação de gliadinas na presença de bactérias viáveis das estirpes selecionadas reduz a sua concentração e a presença de epitopos tóxicos determinados utilizando o anticorpo R5 por ELISA de sanduíche e deste modo os seus possíveis efeitos lesivos no intestino e ao nível extraintestinal. Por exemplo, a concentração de epitopos tóxicos de uma amostra de gliadina digerida com pepsina, tripsina e pancreatina (como indicado no Exemplo 2) de 2349 ppm de glúten determinados por ELISA de sanduíche foi reduzida para 169 ppm de glúten após incubação com suspensões celulares da estirpe da invenção. De igual modo, a incubação da estirpe da invenção com gliadina digerida nas condições gastrointestinais e dialisada, com uma membrana de tamanho de exclusão inferior a 15 kDa, e sua análise subsequente por HPLC na fase inversa tornou evidente a capacidade desta bifidobactéria para reduzir pelo menos em 10% a concentração da fração #2, que foi a principal fração de gliadinas digeridas e aquela que contêm péptidos imunogénicos identificados por espectrometria de massa, uma propriedade que o resto das estirpes testadas não apresenta (Exemplo 8, Figura 2) . Os efeitos biológicos no epitélio intestinal desta propriedade da estirpe de B. longum IATA-ES1 foram demonstrados após incubação das amostras digeridas de gliadina diferentes em culturas de células Caco-2, como descrito no Exemplo 8. Este exemplo demonstra que a estirpe da invenção pode desse modo aumentar a viabilidade das 30 ΕΡ2236598Β1 células epiteliais, ao contrário do resto das estirpes testadas (Exemplo 8, Figura 3) . Adicionalmente, a co-incubação da estirpe da invenção com a amostra digerida de gliadina diminuiu o efeito desta última na síntese de citoquinas pró-inflamatórias tais como TNF-alfa e a expressão dos fatores responsáveis NkB para a expressão de genes pró-inflamatórios (Exemplo 8, Figura 4). A capacidade da estirpe da invenção para capturar os oligopéptidos derivados da digestão de gliadina é reproduzida nas condições intestinais e na presença de sais de bílis. Esta capacidade é potenciada por meio de co-incubação com Lactococcus lactis NCD0712 que, apesar de não conseguir colonizar o intestino grosso, pode atuar como um coadjuvante nos primeiros estádios da hidrólise de glúten ingerido por meio da ação da sua protease ancorada à parede e outras peptidases (Exemplo 2, figura 1). A intensificação da atividade proteolítica por meio da ação de Lactoccocus lactis NCD0712 é demonstrada na figura 1 em que um desaparecimento quase total das bandas de proteína podem ser apreciadas após a incubação das amostras digeridas de gliadina com suspensões celulares da estirpe da invenção e Lactoccocus lactis NCD0712 (Figura 1, painel B, pistas 3 e 4) . Esta hidrólise foi superior àquela obtida utilizando apenas a estirpe da invenção (Figura 1, painel A, pistas 3 e 4) . A atividade da bifidobactéria no glúten também pode ser potenciada através da sua co-incubação com proteases e peptidases de Lactococcus lactis NCD0712 na forma de extratos. A estirpe da invenção pode modular a resposta imunológica anormal provocada pela interação dos péptidos tóxicos do glúten com as células imunocompetentes do 31 ΕΡ2236598Β1 indivíduo não apenas através da metabolização dos péptidos que atuam como antigénios danificadores, mas também através de mecanismos imunorreguladores (Exemplo 3, Tabela 3) . As suspensões de bactérias viáveis ou inativadas das estirpes selecionadas co-incubadas com PBMCs na presença de amostras digeridas de gliadina gastrointestinais são capazes de contrariar o efeito pró-inflamatório destas proteínas em diferentes fases da digestão, por ação da pepsina gástrica (P) e da tripsina intestinal (T) e pancreatina (X) . Esta estirpe é capaz de induzir uma redução na produção das citoquinas pró-inflamatórias IFN-γ, IL-1, IL-8 e IL15 responsáveis pela resposta imunitária adaptativa e inata, assim como aumentar a síntese da citoquina reguladora IL-10 (Exemplo 3, Tabela 3) . Estes efeitos são devidos, pelo menos em parte, à inibição das diferentes subunidades do fator nuclear (NF) kB, p50, p65 (RelA), c-Rel e Rei B determinado por um ensaio de ELISA (Trans AM NFkB, Active Motive, Bélgica) . A inibição deste fator de transcrição implica a inibição da expressão de um grande número de genes pró-inflamatórios que representam um ponto de controlo chave de processos inflamatórios e especificamente os que ocorrem na doença celíaca (Jelínková et al., 2004. Gliadin stimulates human monocytes to production IL-8 and TNF-alpha through a mechanism involving NF- kB. FEBS Lett. 571(1-3):81-5).Specifically, the strain of the invention has the ability to recover toxic peptides derived from the gastrointestinal digestion of gliadins, from products that result from gastric digestion through the action of pepsin (P), as well as from intestinal digestion through the action of trypsin (T) and pancreatin (X) (Example 2, Figure 1). Incubation of gliadins in the presence of viable bacteria of the selected strains reduces their concentration and the presence of toxic epitopes determined using the R5 antibody by sandwich ELISA and thus their possible harmful effects on the gut and the extraintestinal level. For example, the concentration of toxic epitopes of a sample of glidin digested with pepsin, trypsin and pancreatin (as indicated in Example 2) of 2349 ppm gluten determined by sandwich ELISA was reduced to 169 ppm gluten after incubation with strain of the invention. Likewise, incubation of the strain of the invention with gastrointestinal and dialysed digested gliadin with a membrane size exclusion of less than 15 kDa, and its subsequent analysis by reverse phase HPLC made evident the ability of this bifidobacterium to reduce at least in 10% the concentration of fraction # 2, which was the main fraction of digested gliadins and that containing immunogenic peptides identified by mass spectrometry, a property that the rest of the strains tested did not show (Example 8, Figure 2). The biological effects on the intestinal epithelium of this property of the B. longum IATA-ES1 strain were demonstrated after incubation of the different digested gliadin samples in Caco-2 cell cultures as described in Example 8. This example demonstrates that the strain of the invention may thereby increasing the viability of the 30 Ρ 2236598Β1 epithelial cells, unlike the rest of the strains tested (Example 8, Figure 3). In addition, co-incubation of the strain of the invention with the digested gliadin sample decreased the effect of the latter on the synthesis of proinflammatory cytokines such as TNF-alpha and expression of the responsible NkB factors for expression of proinflammatory genes (Example 8, Figure 4). The ability of the strain of the invention to capture oligopeptides derived from the digestion of gliadin is reproduced under intestinal conditions and in the presence of salts of bile. This capacity is potentiated by co-incubation with Lactococcus lactis NCD0712 which, although it can not colonize the large intestine, can act as a coadjuvant in the early stages of gluten hydrolysis ingested through the action of its protease anchored to the wall and other peptidases (Example 2, figure 1). The enhancement of proteolytic activity through the action of Lactococcus lactis NCD0712 is demonstrated in Figure 1 in which a near complete disappearance of the protein bands can be appreciated after incubation of the digested samples of gliadin with cell suspensions of the strain of the invention and Lactococcus lactis NCD0712 (Figure 1, panel B, lanes 3 and 4). This hydrolysis was superior to that obtained using only the strain of the invention (Figure 1, panel A, lanes 3 and 4). The activity of bifidobacteria in gluten can also be potentiated through their co-incubation with proteases and peptidases of Lactococcus lactis NCD0712 in the form of extracts. The strain of the invention may modulate the abnormal immune response elicited by the interaction of the toxic peptides of gluten with the immunocompetent cells of the individual not only by metabolizing the peptides that act as damaging antigens but also by immunoregulatory mechanisms (Example 3, Table 3). The viable or inactivated bacterial suspensions of the selected strains co-incubated with PBMCs in the presence of gastrointestinal digested gliadin samples are able to counteract the proinflammatory effect of these proteins at different stages of digestion by gastric (P) pepsin and intestinal trypsin (T) and pancreatin (X). This strain is capable of inducing a reduction in the production of the proinflammatory cytokines IFN-γ, IL-1, IL-8 and IL15 responsible for the innate and adaptive immune response, as well as enhancing the synthesis of the IL-10 regulatory cytokine (Example 3 , Table 3). These effects are due, at least in part, to inhibition of the different nuclear factor (NF) kB, p50, p65 (RelA), c-Rel and King B subunits determined by an ELISA assay (Trans AM NFkB, Active Motive, Belgium) . Inhibition of this transcription factor implies the inhibition of expression of a large number of proinflammatory genes that represent a key control point of inflammatory processes and specifically those occurring in celiac disease (Jelínková et al., 2004). Gliadin stimulates human monocytes to production IL-8 and TNF-alpha through a mechanism involving NF-kB FEBS Lett. 571 (1-3): 81-5).

Os microrganismos da invenção e os compostos bioativos derivados da invenção, são caracterizados por serem capazes de hidrolisar péptidos do glúten através da sua atividade de peptidase, reduzindo a concentração de epitopos prejudiciais. Como um exemplo, a estirpe da invenção possui peptidases com especificidade larga e com especificidade para substratos que contêm prolina, que são muito abundantes em gliadinas e 32 ΕΡ2236598Β1 limitam a sua hidrólise através de enzimas convencionais (Exemplo 2, Tabela 2) . Especificamente, esta estirpe é uma daquelas com a atividade de iminopeptidase mais elevada (>300 U/mg proteína); de igual modo, apresenta atividade de prolil-endopeptidase (>8 U/mg proteína), X-prolil-dipeptidil-peptidase (>15 U/mg proteína), prolidase e atividade de prolinase (> 15 U/mg proteína) . Também possui atividade de tripeptidase (>130 U/mg proteína contra o substrato Gleu-Gly-Gly) e atividade de leucil-aminopeptidase (>70 U/mg proteína) A atividade desta estirpe contra substratos que contêm prolina, tais como Pro-pNA, é superior àquela detetada noutras bactérias láticas e especialmente a proporção de atividade Pro-pNA/Leu-pNA (Di Cagno et al. 2004. Sourdough bread made from wheat and non-toxic flours and started with selected lactobacilli is tolerated in celiac sprue patients. Appl Environ Microbiol. 70:1088-96; De Angelis et al. 2006. VSL#3 probiotic preparation has the capacity to hydrolyze gliadin polypeptides responsible for celiac sprue. Biochim Biophys Acta. 2006 1762(1):80-93), que favorece a hidrólise específica de péptidos do glúten com um elevado teor de prolina.The microorganisms of the invention and the bioactive compounds derived from the invention are characterized in that they are capable of hydrolyzing gluten peptides through their peptidase activity, reducing the concentration of detrimental epitopes. As an example, the strain of the invention has broad specificity and specificity peptidases for proline-containing substrates which are very abundant in gliadins and 32 Ρ 2236598Β1 limit their hydrolysis by conventional enzymes (Example 2, Table 2). Specifically, this strain is one of those with the highest iminopeptidase activity (> 300 U / mg protein); (> 8 U / mg protein), X-prolyl-dipeptidyl-peptidase (> 15 U / mg protein), prolidase and prolinase activity (> 15 U / mg protein ). It also possesses tripeptidase activity (> 130 U / mg protein against the Gleu-Gly-Gly substrate) and leucil-aminopeptidase activity (> 70 U / mg protein). The activity of this strain against proline-containing substrates such as Pro -pNA activity is higher than that detected in other lactic acid bacteria and especially the proportion of Pro-pNA / Leu-pNA activity (Di Cagno et al., 2004). (1): 80-93 (1999), pp. 253-223, and the author of this article, and the author of this paper, ), which favors the specific hydrolysis of gluten peptides with a high proline content.

Deste modo, a estirpe da invenção e os compostos bioativos derivados da invenção possuem atividade metabólica adicional àquela das peptidases (por exemplo: fosfatase, esterase, lipase, galactosidase, glucosidase e N-acetilglucosaminidase) que auxiliam na digestão de nutrientes que são ingeridos com a dieta, e melhoram a síndrome de malabsorção e desnutrição características de doentes de doença celíaca. 33 ΕΡ2236598Β1Thus, the strain of the invention and the bioactive compounds derived from the invention have additional metabolic activity to that of the peptidases (for example: phosphatase, esterase, lipase, galactosidase, glucosidase and N-acetylglucosaminidase) which aid in the digestion of nutrients which are ingested with diet, and improve the malabsorption syndrome and malnutrition characteristics of patients with celiac disease. 33 ΕΡ 2236598Β1

Finalmente, outra forma de realização particular é a utilização do microrganismo da presente invenção e os compostos bioativos derivados da invenção em combinação com outros microrganismos, na produção de formulações para reduzir os riscos e melhorar o estado de saúde dos doentes com doenças relacionadas com a ingestão de glúten, ou outras alergias alimentares.Finally, another particular embodiment is the use of the microorganism of the present invention and the bioactive compounds derived from the invention in combination with other microorganisms in the production of formulations to reduce risks and improve the health status of patients with diseases related to ingestion gluten, or other food allergies.

As formulações preparadas utilizando a estirpe da invenção podem ser desenvolvidas industrialmente dando origem a, entre outros e sem limitar o âmbito da invenção, formas diferentes de apresentação ao consumidor: alimentos (funcionais, convencionais e novos), suplementos, nutracêuticos, composições farmacêuticas, probióticos e/ou simbióticos, ou novos alimentos. A estirpe da invenção possui a capacidade para aderir à mucina (1-4%) e é resistente ao pH ácido do estômago (2,0; 2,5 e 3,0) e a concentrações elevadas de sais de bílis (0,5; 1,0; 2,0; e 3,0%) presentes no intestino delgado, que constituem as principais barreiras biológicas que limitam a sobrevivência de probióticos quando passam através do trato intestinal assim como durante os processos de fermentação alimentar e o seu período de armazenamento (Exemplo 5, Tabela 6) . Por exemplo, esta estirpe mantém uma viabilidade e capacidade de crescimento de 56-86% após 90 min de incubação a pH 2,0-2,5. Por isso, esta estirpe possui probabilidades mais elevadas de sobrevivência e de ser funcional do que outras isoladas e do que alguns probióticos normalmente comercializados, como pode ser observado a partir da Tabela 6 Esta estirpe também resiste ao trânsito gastrointestinal in vivo. Após a sua administração na forma de leite fermentado 34 ΕΡ2236598Β1 durante 4 semanas a doses de 107-108 cfu/mL duas vezes por dia é recuperada nas fezes e a sua concentração em relação à concentração inicial (sem ingestão de produtos probióticos) aumenta em pelo menos 1 unidade logarítmica. As bifidobactérias selecionadas crescem e permanecem viáveis em vários alimentos e bebidas, constituindo veículos ideais para a sua incorporação. Por exemplo, estes são capazes de fermentar e coagular leite, estes podem ser utilizados para a preparação de leites fermentados e outros derivados de leite. Estes também resistem a tratamentos tecnológicos para a produção e conservação de alimentos, suplementos e formulações farmacêuticas, tais como por exemplo temperaturas de liofilização e refrigeração, garantindo a sua exploração industrial.Formulations prepared using the strain of the invention can be industrially developed giving rise to, inter alia and without limiting the scope of the invention, different forms of presentation to the consumer: foods (functional, conventional and novel), supplements, nutraceuticals, pharmaceutical compositions, probiotics and / or symbiotic, or novel foods. The strain of the invention has the ability to adhere to mucin (1-4%) and is resistant to acidic pH of the stomach (2.0, 2.5 and 3.0) and to high concentrations of bile salts (0.5 , 1.0, 2.0 and 3.0%) present in the small intestine, which are the main biological barriers limiting the survival of probiotics when they pass through the intestinal tract as well as during the food fermentation processes and their period (Example 5, Table 6). For example, this strain maintains a viability and growth capacity of 56-86% after 90 min of incubation at pH 2.0-2.5. Therefore, this strain has higher probabilities of survival and of being functional than other isolates and than some commercially available probiotics, as can be seen from Table 6. This strain also resists gastrointestinal transit in vivo. After administration in the form of fermented milk 34 Ρ 2236598Β1 for 4 weeks at doses of 107-108 cfu / ml twice daily is recovered in the faeces and its concentration in relation to the initial concentration (without ingestion of probiotic products) is increased in at least least 1 logarithmic unit. The selected bifidobacteria grow and remain viable in various foods and beverages, constituting ideal vehicles for their incorporation. For example, these are capable of fermenting and coagulating milk, these can be used for the preparation of fermented milks and other milk derivatives. These also resist technological treatments for the production and preservation of foods, supplements and pharmaceutical formulations, such as for example lyophilization and refrigeration temperatures, guaranteeing their industrial exploitation.

Um aspeto particular da presente invenção compreende a utilização da estirpe da invenção ou compostos bioativos derivados da invenção na preparação de formulações na forma de alimentos.One particular aspect of the present invention comprises the use of the strain of the invention or bioactive compounds derived from the invention in the preparation of formulations in the form of foods.

Desta forma, os microrganismos da invenção podem fazer parte de um alimento formulado para proporcionar, para lá do seu normal valor nutricional, um feito benéfico na redução dos riscos e melhoria do estado de saúde de doentes com doenças relacionadas com a ingestão de glúten.In this way, the microorganisms of the invention may form part of a food formulated to provide, beyond its normal nutritional value, a beneficial accomplishment in reducing risks and improving the health status of patients with gluten-related diseases.

Outro aspeto particular da presente invenção compreende a utilização da estirpe da invenção, ou dos compostos da invenção bioativos derivados na produção de preparações na forma de nutracêuticos, definidos como substâncias bioativas naturais apresentadas numa matriz não alimentar, que neste caso deve produzir efeitos benéficos em doentes com doenças 35 ΕΡ2236598Β1 relacionadas com ingestão de glúten, reduzindo os seus riscos e melhorando o seu estado de saúde.Another particular aspect of the present invention comprises the use of the strain of the invention or the bioactive compounds of the invention in the production of preparations in the form of nutraceuticals defined as natural bioactive substances presented in a non-food matrix which in this case should have beneficial effects in patients with diseases related to gluten intake, reducing their risks and improving their health status.

No caso da utilização dos microrganismos, a estirpe da invenção ou compostos da invenção bioativos derivados para obter um suplemento dietético ou alimentar, deve incluir na sua composição o microrganismo ou seus compostos bioativos derivados com vista a complementar a dieta para fins de saúde e, neste caso especifico, com o objetivo de produzir efeitos benéficos em doentes com doenças relacionadas com a ingestão de glúten, reduzindo os seus riscos e melhorando a sua saúde.In the case of the use of the microorganisms, the strain of the invention or compounds of the invention derived therefrom to obtain a dietary or food supplement should include in its composition the microorganism or its bioactive compounds derived from it to supplement the diet for health purposes and in this specific case, with the aim of producing beneficial effects in patients with gluten-related diseases, reducing their risks and improving their health.

Outro aspeto particular da presente invenção compreende a utilização dos microrganismos da invenção, a estirpe da invenção ou compostos bioativos da invenção na produção de preparações farmacêuticas. Desta forma, serão utilizados na preparação de composições biologicamente cativas, capazes de serem utilizadas como medicamentos produzindo um efeito benéfico na redução dos riscos e melhoria do estado de saúde de doentes com doenças relacionadas com a ingestão de glúten.Another particular aspect of the present invention comprises the use of the microorganisms of the invention, the strain of the invention or bioactive compounds of the invention in the production of pharmaceutical preparations. In this way, they will be used in the preparation of biologically captive compositions capable of being used as medicaments producing a beneficial effect in reducing risks and improving the health status of patients with diseases related to gluten intake.

Noutra forma de realização particular da invenção, a estirpe da invenção ou compostos bioativos da invenção devem ser utilizados na produção de probióticos e/ou simbióticos (combinações de probióticos e prebióticos), em que os microrganismos são incorporados, por exemplo vivos ou liofilizados, em quantidades adequadas e em condições que permitem que realizem o seu efeito benéfico ou terapêutico em indivíduos com alergias a alimentos, de um modo preferido aqueles relacionados com a ingestão de glúten, reduzindo desse modo os seus riscos e melhorando o seu estado de saúde. 36 ΕΡ2236598Β1In another particular embodiment of the invention, the strain of the invention or bioactive compounds of the invention should be used in the production of probiotics and / or symbiotics (combinations of probiotics and prebiotics), wherein the microorganisms are incorporated, for example live or lyophilized, into adequate amounts and under conditions which enable them to effect their beneficial or therapeutic effect in individuals with food allergies, preferably those related to the ingestion of gluten, thereby reducing their risks and improving their health status. 36 ΕΡ 2236598Β1

Um objetivo particular final da presente invenção compreende a utilização da estirpe da invenção ou compostos bioativos da invenção na preparação de novos alimentos. É entendido que novos alimentos significam qualquer alimento ou ingrediente que não foi utilizado normalmente no passado para consumo humano na União Europeia até 15 de Maio de 1997, que iria produzir efeitos benéficos em doentes que sofrem de doenças relacionadas com a ingestão de glúten, reduzindo os seus riscos e melhorando o seu estado de saúde.A particular end goal of the present invention comprises the use of the strain of the invention or bioactive compounds of the invention in the preparation of novel foods. It is understood that novel foods mean any food or ingredient which has not been normally used in the past for human consumption in the European Union before 15 May 1997, which would produce beneficial effects in patients suffering from gluten-related diseases, their risks and improving their state of health.

EXEMPLOS DE FORMAS DE REALIZAÇÃO DA INVENÇÃO EXEMPLO 1. PROCESSO PARA SELECIONAR ESTIRPES DO GÉNERO BIFIDOBACTERIUM DE ACORDO COM A SUA CAPACIDADE PARA MODULAR A PRODUÇÃO DE CITOQUINA EM CÉLULAS MONONUCLEARES DO SANGUE PERIFÉRICO (PBMCs) 1. Preparação das culturas e sobrenadantes de blfidobactérlas e outras bactérias láticas intestinais.EXAMPLES OF EMBODIMENTS OF THE INVENTION EXAMPLE 1. PROCESS FOR SELECTING BIFIDOBACTERIUM GENDER STRENGTHS ACCORDING TO ITS CAPACITY TO MODIFY CYTOKINE PRODUCTION IN PERIFERIC BLOOD MONONUCLEAR CELLS (PBMCs) 1. Preparation of cultures and supernatants of blfidobactles and other bacteria intestinal diseases.

As estirpes foram inoculadas em 10 ml de meio de cultura MRS (Scharlau Chemie S.A., Barcelona, Espanha) contendo 0,05% de cisteína (MRS-C) a 1% com uma cultura de 24 h e foram incubadas durante 22 h a 37 °C em anaerobiose. (AnaeroGen; Oxoid, Basingstoke, Reino Unido). As células foram recolhidas por centrifugação (6 000 g, 15 min) , lavadas duas vezes em PBS (fosfato de sódio a 10 mM, cloreto de sódio a 130 mM, pH 7,4), e foram ressuspensas em PBS contendo 20% de glicerol. Foram congeladas frações destas suspensões utilizando azoto líquido e conservadas a -80°. O número de células viáveis após o ciclo de congelamento-descongelamento foi determinado através de contagem em placas de MRSC após incubação de 48 h. 37 ΕΡ2236598Β1 A viabilidade foi superior a 90% em todos os casos. Cada fração foi utilizada durante um único teste. Com o objetivo de avaliar os efeitos das bactérias mortas, algumas das frações foram inativadas pelo frio (3 ciclos de congelamento a -20°C e descongelamento) e inativadas pelo calor (30 min. a 80°C) . Os valores de pH dos sobrenadantes obtidos foram ajustados para 7,2 utilizando NaOH e foram esterilizados por filtração (tamanho de poro 0,22 mm, Millipore, Bedford, MA) para eliminar a presença possível de células viáveis. As frações dos sobrenadantes sem células foram conservadas a -80°C até utilização posterior.The strains were inoculated in 10 ml of MRS culture medium (Scharlau Chemie SA, Barcelona, Spain) containing 0.05% cysteine (MRS-C) at 1% with a 24 h culture and incubated for 22 h at 37øC in anaerobiosis. (AnaeroGen, Oxoid, Basingstoke, UK). Cells were harvested by centrifugation (6000 g, 15 min), washed twice in PBS (10 mM sodium phosphate, 130 mM sodium chloride, pH 7.4), and resuspended in PBS containing 20% glycerol. Fractions of these suspensions were frozen using liquid nitrogen and stored at -80Â °. The number of viable cells after the freeze-thaw cycle was determined by counting on MRSC plates after incubation for 48 h. 37 ΕΡ2236598Β1 Viability was above 90% in all cases. Each fraction was used during a single test. In order to evaluate the effects of dead bacteria, some of the fractions were inactivated by cold (3 cycles of freezing at -20 ° C and thawing) and inactivated by heat (30 min at 80 ° C). The pH values of the obtained supernatants were adjusted to 7.2 using NaOH and sterilized by filtration (0.22 mm pore size, Millipore, Bedford, MA) to eliminate the possible presence of viable cells. Fractions of cell-free supernatants were stored at -80øC until further use.

2. Isolamento e estimulação de PBMC2. Isolation and stimulation of PBMC

As PBMC foram isoladas a partir do sangue periférico de 4 voluntários saudáveis (idade média de 30 anos, intervalo de 24-40) em tubos com heparina. As PBMC foram isoladas por centrifugação em gradiente de Ficoll (Amersham Biosciences, Piscataway, NJ). As células foram lavadas com meio RPMI 1640 (Cambrex, Nova Iorque, EUA) e ajustadas para uma densidade de 1 x 106 células/ml em meio RPMI 1640 contendo adicionalmente 10% de soro de bovino fetal (Gibco, Barcelona, Espanha), 2 mM de L-glutamina, 100 pg/ml de estreptomicina e 100 U/ml de penicilina (Sigma). As PBMC foram incubadas em placas de poliestireno de 24 poços com fundo plano (Corning, Madrid, Espanha) na presença ou ausência de agentes estimulantes a 37°C, a 5% de C02, durante 24 h. As suspensões de bactérias vivas e mortas foram utilizadas como um estímulo a 1 x 106 CFU/ml, e volumes de sobrenadante de 150 μ/l. Como um controlo positivo foram utilizados lipopolissacáridos purificados (LPS) de E. coli 0111:B4 (Sigma, St. Louis, MO) a uma concentração de 1 pg/ml. Como um controlo negativo, foi 38 ΕΡ2236598Β1 testada a produção de citoquinas em PBMC não estimuladas. Cada tipo de estimulo foi testado em duplicado em cada experiência. Os sobrenadantes das culturas foram recolhidos por centrifugação, fracionados e armazenados em frações a -20°C até à deteção de citoquina. 3. Determinação de citoquinaPBMC were isolated from the peripheral blood of 4 healthy volunteers (mean age 30 years, range 24-40) in heparin tubes. PBMCs were isolated by Ficoll gradient centrifugation (Amersham Biosciences, Piscataway, NJ). The cells were washed with RPMI 1640 medium (Cambrex, New York, USA) and adjusted to a density of 1 x 106 cells / ml in RPMI 1640 medium containing additionally 10% fetal bovine serum (Gibco, Barcelona, Spain), 2 mM L-glutamine, 100æg / ml streptomycin and 100 U / ml penicillin (Sigma). PBMCs were incubated in 24-well flat-bottomed polystyrene plates (Corning, Madrid, Spain) in the presence or absence of stimulating agents at 37øC, 5% CO 2 for 24 h. Suspensions of live and dead bacteria were used as a stimulus at 1 x 10 6 CFU / ml, and volumes of supernatant 150 μl. As a positive control, purified lipopolysaccharides (LPS) from E. coli 0111: B4 (Sigma, St. Louis, MO) at a concentration of 1 pg / ml were used. As a negative control, the production of cytokines in unstimulated PBMC was tested. Each type of stimulus was tested in duplicate in each experiment. Culture supernatants were collected by centrifugation, fractionated and stored in fractions at -20 ° C until detection of cytokine. 3. Determination of cytokine

As concentrações de citoquinas (IL-1, IFN-γ, IL-10, e TGF-β) dos sobrenadantes foram medidas utilizando ELISA Bioscience kits (BD Biosciences, San Diego, CA) seguindo as instruções do fabricante.The cytokine concentrations (IL-1, IFN-γ, IL-10, and TGF-β) of the supernatants were measured using ELISA Bioscience kits (BD Biosciences, San Diego, CA) following the manufacturer's instructions.

Tabela 1. Propriedades Imunomoduladoras das bifidobactérias e de outras bactérias láticas intestinais. Efeito na produção de citoquinas pelas PBMC de bactérias viáveis.Table 1. Immunomodulatory properties of bifidobacteria and other intestinal lactic bacteria. Effect on the production of cytokines by the PBMC of viable bacteria.

Estimulo Produção de citoquina (pm/mL) IL-1 IFN-γ IL-10 TGF-β RPMI ND 9,0±1,0 58,0±3,0 ND LPS ND 12,0±0,5 399,0±8,0 ND ^Sl 103,0±37,0 10,1±1,0 2459,0±28,0 236,0±119,0 2A2 255,0±1,0 13,0±2,0 699,0±396,0 ND 3ATCC15707 - 66,1±23,9 4098,4±1551,7 - 4BIR-324 ND 11,0±5,0 469,0±15,0 ND 5W11 - 160,4±6,8 486,0±236,4 - 6BB536 - 143,7±18,3 1390,0±268,8 - 7lmiv 233,0±99,0 27,0±15,0 166,0±53,5 ND ND, não detetado não avaliado 1Estirpe da invenção (IATA-ES1), 2Bifidobacterium IATA-A2, 3Bifidobacterum longum ATCC15707, 4Bifidobacterium BIR-324, sBifidobacterum longum Wll, 6Bífídobacterum longum BB536, ?Lactobacíllus reuteri LM1V. 39 ΕΡ2236598Β1Cytokine production (μg / mL) IL-1 IFN-γ IL-10 TGF-β RPMI ND 9.0 ± 1.0 58.0 ± 3.0 ND LPS ND 12.0 ± 0.5 399.0 ± 8.0 ND + S 103.0 ± 37.0 10.1 ± 1.0 2459.0 ± 28.0 236.0 ± 119.0 2A 2 255.0 ± 1.0 13.0 ± 2.0 699.0 ± 396.0 ND 3ATCC15707 - 66.1 ± 23.9 4098.4 ± 1551.7 - 4BIR-324 ND 11.0 ± 5.0 469.0 ± 15.0 ND 5W11 - 160.4 ± 6.8 486.0 ± 236.4 - 6BB536 - 143.7 ± 18.3 1390.0 ± 268.8 - 7lmiv 233.0 ± 99.0 27.0 ± 15.0 166.0 ± 53.5 ND ND, unrecognized unreacted 1Estape of the invention (IATA-ES1), 2Bifidobacterium IATA-A2, 3Bifidobacterium longum ATCC15707, 4Bifidobacterium BIR-324, sBifidobacterium longum Wll, 6Bifidobacterium longum BB536,? Lactobacillus reuteri LM1V. 39 ΕΡ 2236598Β1

EXEMPLO 2. PROCESSO PARA SELECIONAR BIFIDOBACTÉRIAS CAPAZES DE HIDROLISAR E TRANSPORTAR PÉPTIDOS DE GLÚTEN REDUZINDO DESSE MODO A SUA TOXICIDADE A capacidade das estirpes para hidrolisar as proteínas e péptidos derivados de glúten foi medida através da quantificação da atividade de largo espetro e peptidases intracelulares específicas para hidrolisar sequências de péptidos que contêm prolina, presentes nos péptidos responsáveis para as respostas imunológicas e tóxicas de glúten. As células de culturas bacterianas de 16-18 horas cultivadas em MRSC foram recolhidas por centrifugação (9000 x g durante 10 minutos a 4°C) lavadas duas vezes em tampão Tris a 50 mM a pH 7 e ressuspensas no mesmo tampão concentrado 10 vezes em relação ao volume da cultura inicial. As células foram rebentadas mecanicamente utilizando um Bead-Beater (Biospec Products, EUA) adicionando 2 volumes de esferas de vidro para cada volume de células e aplicando 2 pulsos de 1,5 minutos. O sobrenadante obtido após centrifugação (8000 g, 10 min) para eliminar fragmentos insolúveis e células foi utilizado como um extrato enzimático para os testes de atividade. Os substratos testados foram como se segue: Leu-paranitroanilida (-pNA) para detetar aminopeptidases de especificidade larga, Leu-Leu-Gly para detetar aminopeptidases e tripeptidases de especificidade larga, Suc-Ala-Pro-pNA para detetar prolil-endopeptidases, Pro-AMC para detetar iminopeptidases, Gly-Pro-AMC para detetar X-prolil-dipeptidilpeptidases; Val-Pro para detetar prolidases, e Pro-Gly para detetar prolinases. No caso de substratos derivados de paranitroanilida, a mistura de reação consistiu em 200 μΐ de tampão fosfato a 50 mM, a pH 7,2, contendo 0,5 mM de substrato e 50 μΐ de extrato enzimático. A mistura de reação 40 ΕΡ2236598Β1 foi incubada a 37°C durante um máximo de 30 min. A hidrólise do substrato e a libertação de paranitroanilina foi monitorizada a 419 nm num espectrofotómetro (550 Microplate Reader, Bio-Rad, Hercules, CA, EUA). A hidrólise dos péptidos foi determinada através do ensaio de oxidase de L-aminoácido (Hejgaard, 1978, Rapad assay to detect peptidases in column effluent fractions using L-amino acid oxidase. Analytical Biochem 90: 835-839). Foram incubados 100 μΐ do tampão de reação que contém uma concentração de 0,05 mM com 50 μΐ de extrato enzimático durante 20 min. Após este período foram adicionados 100 μΐ do reagente de oxidase de L-aminoácido e, após 5 minutos de incubação, a absorvência foi medida a 530 nm. A concentração de proteína foi medida utilizando o método de Bradford com o kit comercial da BioRad (Hercules, CA, EUA) .EXAMPLE 2. A PROCESS FOR SELECTING HYDROLYSIS CAPABLE BIFIDOBACTERES AND TRANSPORTING GLUTEN PEPTIDES REDUCING THEIR TOXICITY THEREFORE The ability of the strains to hydrolyze gluten-derived proteins and peptides was measured by quantifying the broad spectrum activity and specific intracellular peptidases to hydrolyze proline-containing peptide sequences present in the peptides responsible for the immunological and toxic responses of gluten. Cells from 16-18 hours bacterial cultures cultured in MRSC were harvested by centrifugation (9000 xg for 10 minutes at 4øC) washed twice in 50 mM Tris buffer pH 7 and resuspended in the same buffer 10 times concentrated to the volume of the initial culture. Cells were mechanically busted using a Bead-Beater (Biospec Products, USA) by adding 2 volumes of glass beads to each cell volume and applying 2 pulses of 1.5 minutes. The supernatant obtained after centrifugation (8000 g, 10 min) to remove insoluble fragments and cells was used as an enzymatic extract for the activity tests. The substrates tested were as follows: Leu-paranitroanilide (-pNA) to detect broad specificity aminopeptidases, Leu-Leu-Gly to detect aminopeptidases and wide specificity tripeptidases, Suc-Ala-Pro-pNA to detect prolyl endopeptidases, Pro -AMC to detect iminopeptidases, Gly-Pro-AMC to detect X-prolyl-dipeptidylpeptidases; Val-Pro to detect prolidases, and Pro-Gly to detect proinases. In the case of substrates derived from paranitroanilide, the reaction mixture consisted of 200 μΐ of 50 mM phosphate buffer, pH 7.2, containing 0.5 mM of substrate and 50 μΐ of enzyme extract. Reaction mixture 40 Ρ 2236598Β1 was incubated at 37øC for a maximum of 30 min. Hydrolysis of the substrate and the release of paranitroaniline was monitored at 419 nm in a spectrophotometer (550 Microplate Reader, Bio-Rad, Hercules, CA, USA). The hydrolysis of the peptides was determined by the L-amino acid oxidase assay (Hejgaard, 1978, Rapad assay to detect peptidases in column effluent fractions using L-amino acid oxidase, Analytical Biochem 90: 835-839). 100 μl of the reaction buffer containing a concentration of 0.05 mM was incubated with 50 μl of enzyme extract for 20 min. After this time 100 μΐ of the L-amino acid oxidase reagent was added and, after 5 minutes of incubation, the absorbance was measured at 530 nm. Protein concentration was measured using the Bradford method with the commercial BioRad kit (Hercules, CA, USA).

Uma unidade de atividade foi definida como a quantidade de enzima capaz de hidrolisar 1 pmol de substrato a 37°C durante 1 minuto. As atividades foram expressas em U/mg de proteína. A capacidade das estirpes para transportar e hidrolisar os péptidos derivados da digestão de gliadinas foi determinada por electroforese. Neste caso, as suspensões celulares foram ajustadas para uma densidade ótica de 4 até 655 nm, equivalente a 109 cfu/ml, e foram incubadas com três diferentes hidrolisados de gliadina a uma concentração final de 300-600 pg/ml em PBS aos quais foi adicionado 0,2% de glucose. Os hidrolisados de gliadina (Sigma, St. Louis, MO) foram obtidos por estimulação do processo de digestão gastrointestinal do seguinte modo: A). 100 g de gliadinas foram digeridas em um litro de HCL a 0,2 N (pH: 1,8) com 2 g de pepsina purificada a 37° durante 2 h (este hidrolisado será referido como G-P). B) A digestão resultante foi digerida com tripsina através da adição de 2 g de tripsina 41 ΕΡ2236598Β1 após ajustar o pH para 8 utilizando NaOH a 2N (este hidrolisado será referido como G-P+T. C) A amostra dupla digerida foi então tratada com 2 g de pancreatina e agitada durante 2 horas a pH 8 (este hidrolisado será referido como G-P+T+X). Após cada estádio de digestão foi centrifugada a 10 000 g durante 10 min, e o sobrenadante foi armazenado para testes posteriores a - 20°C. As amostras digeridas foram inativadas por incubação a 100°C durante 30 minutos. As suspensões bacterianas foram incubadas na presença dos três hidrolisados de gliadina (A, B e C) durante 6 horas, a 37°C, em anaerobiose. As alterações na viabilidade durante as incubações foram determinadas utilizando o sistema comercial LIVE/DEAD BacLight Kit (Molecular Probes, Leiden, Países Baixos) para microscopia seguindo as instruções do fabricante. A contagem de bactérias vivas (verde) e mortas (vermelha) foi realizada num microscópio de epifluorescência BX 51 Olympus (Tóguio, Japão). Em todos os casos foram detetadas perdas mínimas de viabilidade (0,0-11,5%) após incubação. Após o período de incubação foi centrifugada para eliminar células e proteínas insolúveis e os sobrenadantes foram esterilizados por filtração (tamanho do poro de 0,22 mm, Millipore, Bedford, MA) para eliminar a possível presença de células viáveis. A capacidade das estirpes para transportar e utilizar os diferentes hidrolisados de gliadina foi determinada através da avaliação do desaparecimento de bandas em géis de poliacrilamida convencionais a 15% e em géis de Tris-Tricina (géis Ready 10-20% de gradiente linear, gel de empacotamento a 4%, Bio-Rad, Barcelona, Espanha) para separação de péptidos. As proteínas foram visualizadas através de coloração com Coomassie Brilliant Blue R-250. A redução em epitopos tóxicos que resulta do transporte e da digestão de gliadinas através da ação das bactérias selecionadas foi avaliada utilizando um 42 ΕΡ2236598Β1 ensaio de ELISA de sanduíche R5 (Centro Nacional de Biotecnologia, Madrid).One unit of activity was defined as the amount of enzyme capable of hydrolyzing 1 pmole of substrate at 37 ° C for 1 minute. Activities were expressed as U / mg protein. The ability of the strains to carry and hydrolyze the peptides derived from the digestion of gliadins was determined by electrophoresis. In this case, the cell suspensions were adjusted to an optical density of 4 to 655 nm, equivalent to 109 cfu / ml, and incubated with three different gliadin hydrolysates at a final concentration of 300-600 pg / ml in PBS to which 0.2% glucose added. Gliadin hydrolysates (Sigma, St. Louis, MO) were obtained by stimulation of the gastrointestinal digestion process as follows: A). 100 g of gliadins were digested in one liter of 0.2 N HCl (pH: 1.8) with 2 g of purified pepsin at 37ø for 2 h (this hydrolyzate will be referred to as G-P). B) The resulting digestion was digested with trypsin by the addition of 2 g of trypsin Ρ36 2236598Β1 after adjusting the pH to 8 using 2N NaOH (this hydrolyzate will be referred to as G-P + T CC). The digested double sample was then treated with 2 g of pancreatin and stirred for 2 hours at pH 8 (this hydrolyzate will be referred to as G-P + T + X). After each stage of digestion it was centrifuged at 10,000 g for 10 min, and the supernatant was stored for further testing at -20 ° C. The digested samples were inactivated by incubation at 100 ° C for 30 minutes. Bacterial suspensions were incubated in the presence of the three gliadin hydrolysates (A, B and C) for 6 hours at 37øC under anaerobic conditions. Changes in viability during incubations were determined using the LIVE / DEAD BacLight Kit commercial system (Molecular Probes, Leiden, The Netherlands) for microscopy following the manufacturer's instructions. Count of live (green) and dead (red) bacteria was performed on an Olympus BX 51 epifluorescence microscope (Tóguio, Japan). In all cases, minimal losses of viability (0.0-11.5%) were detected after incubation. After the incubation period it was centrifuged to remove insoluble cells and proteins and the supernatants were sterilized by filtration (0.22 mm pore size, Millipore, Bedford, MA) to eliminate the possible presence of viable cells. The ability of the strains to carry and use the different gliadin hydrolysates was determined by assessing the disappearance of bands on conventional 15% polyacrylamide gels and Tris-Tricine gels (Ready gels 10-20% linear gradient, 4% packaging, Bio-Rad, Barcelona, Spain) for peptide separation. Proteins were visualized by staining with Coomassie Brilliant Blue R-250. The reduction in toxic epitopes resulting from the transport and digestion of gliadins through the action of the selected bacteria was evaluated using a 42 ΕΡ2236598Β1 R5 sandwich ELISA assay (Centro Nacional de Biotecnologia, Madrid).

Tabela 2. Atividade de peptidase de estirpes de bifidobactérias e lactobacilli de origem intestinal contra substratos sintéticosTable 2. Activity of peptidase from strains of bifidobacteria and lactobacilli of intestinal origin against synthetic substrates

Estirpes Atividade especifica (U/mg proteína)* Val-Pro Pro-Gly Leu-Gly- Gly Pro-pNA Leu-pNA Suc-Ala— Pro-pNA Gly- PropNA 1ES1 18,1±3,5 15,7±3,8 132,3±7,2 480,2±91,7 80,0±8, 9 8,5±1,9 17,1±0,0 ^A2 27,1±14,0 27,1±07,5 326,1±15,Ç 140,5±6,4 176,5±3,5 18,5±4,8 60,43±11, 0 15707 27,4±2,0 37,9±0,8 - - 5,1 ±0,5 0,02±0,6 0,2±0,5 4 Lm VI 9,34±0,7 10,3±0,6 54,6±2,7 7,8±3,7 61,8±3,4 8,0±3,5 15,2±3,2 *Média ± DP., não avaliado 1Estirpe da invenção (IATA-ES1), 2Bifidobacterium IATA-A2, 3Bifidobacterum longum ATCC 15707, 4Lactobacillus reuteri LM1V. EXEMPLO 3. REGULAÇÃO DA RESPOSTA IMUNOLÓGICA CAUSADA POR GLIADINAS EM CÉLULAS IMUNOCOMPETENTES ATRAVÉS DA SUA CO-INCUBAÇÃO COM ESTIRPES DO GÉNERO Bifidobacterium SELECIONADAS PELAS SUAS PROPRIEDADES IMUNOMODULADORAS.Pro-Gly Leu-Gly-Gly Pro-pNA Leu-pNA Suc-Ala-Pro-pNA Gly-PropNA 1ES1 18.1 ± 3.5 15.7 ± 3 , 8 132.3 ± 7.2 480.2 ± 91.7 80.0 ± 8.9 ± 8.5 ± 1.9 17.1 ± 0.0 ± A2 27.1 ± 14.0 27.1 ± 07.5 326.1 ± 15, 140.5 ± 6.4 176.5 ± 3.5 18.5 ± 4.8 60.43 ± 11.0 15707 27.4 ± 2.0 37.9 ± 0.8 - - 5.1 ± 0.5 0.02 ± 0.6 0.2 ± 0.5 4 Lm VI 9.34 ± 0.7 10.3 ± 0.6 54.6 ± 2.7 7.8 ± 3.7 61.8 ± 3.4 8.0 ± 3.5 15.2 ± 3.2 * Mean ± SD, not evaluated 1Style of the invention (IATA-ES1), 2Bifidobacterium IATA-A2, 3Bifidobacterium longum ATCC 15707, 4Lactobacillus reuteri LM1V. EXAMPLE 3. REGULATION OF THE IMMUNOLOGICAL RESPONSE CAUSED BY GLADIADINES IN IMMUNOCOMPETENT CELLS THROUGH THEIR CO-INCUBATION WITH BIFIDOBACTERIUM GENUS SELECTED BY THEIR IMMUNOMODULATING PROPERTIES.

As suspensões da estirpe selecionada (10δ—109 CFU/ml), assim como outros incluídos para propósitos comparativos, foram incubadas com os diferentes hidrolisados de gliadina (P, P+T e P+T+P), obtidas como descrito no exemplo 3, e os PBMCs numa concentração de 106 cfc/ml durante 24 h. Como estímulo de controlo os diferentes hidrolisados de gliadina foram utilizados sem bactérias e LPS de E. coli 0111:B4. A produção de citoquina basal foi também detetada sem adicionar qualquer 43 ΕΡ2236598Β1 estímulo. 0 procedimento para isolar PBMCs, estimular e detetar citoquinas foi descrito no exemplo 1.Suspensions of the selected strain (10δ-109 CFU / ml), as well as others included for comparative purposes, were incubated with the different gliadin hydrolysates (P, P + T and P + T + P), obtained as described in example 3 , and the PBMCs at a concentration of 106 cfc / ml for 24 h. As a control stimulus the different gliadin hydrolysates were used without bacteria and E. coli 0111: B4 LPS. Basal cytokine production was also detected without adding any stimulus. The procedure for isolating PBMCs, stimulating and detecting cytokines was described in example 1.

Tabela 3. Produção de citoquinas por PBMCs estimuladas simultaneamente por gliadinas digeridas em condições gastrointestinais e na presença de culturas inviáveis de bifidobactérias e outras bactérias lácticas com origem intestinal.Table 3. Production of cytokines by PBMCs stimulated simultaneously by gliadins digested in gastrointestinal conditions and in the presence of infeasible cultures of bifidobacteria and other lactic bacteria with intestinal origin.

Produção de citoqulna (pm/mL) Estímulo IL-1 IL—8 IFN—γ IL—10 IL—15 RPMI ND 173+17 9 + 1 58 + 3 ND LPS ND 2295+83 12+0,5 399+8 175+17 G-P 61±2 4570+484 4267 299+149 34 + 1 G-P + T 169622 149+83 13 6+16 37 + 3 5375+13 G-P+T+X 7 5±1 5264+122 36+9 272+18 25 + 7 1ES1/G-P 123±8 4921+129 11 + 1 1192+752 10 + 7 ES1/G-P+T 48±4 4928+288 8, 2+5 935+426 27+10 ES1/GP+T+X ND 5151+146 2+0, 5 1054+477 ND ÍA2/G-P 109+215 4480+23 6, 9+2 395+216 29+8 A2/G-P+T 129+4 2848+45 43+22 1002+615 46+13 A2/G-P+T+X 129+1 5099+30 29+4 1314+724 134+57 3LM1V/G-P ND 5152+119 62+31 721+16 33+4 LM1 V/G- P + T ND 5015+75 11 + 5 458+218 2 6+4 LM1 V/GP+ T+X ND 5189+98 -82+35 457+257 6 + 1Cytokine production (pm / ml) IL-1 IL-8 Stimulus IL-8 IL-10 IL-10 IL-15 RPMI ND 173 + 17 9 + 1 58 + 3 ND LPS ND 2295 + 83 12 + 0.5 399 + 8 175 + 17 GP 61 ± 2 4570 + 484 4267 299 + 149 34 + 1 GP + T 169622 149 + 83 13 6 + 16 37 + 3 5375 + 13 G-P + T + X 7 5 ± 1 5264 + 122 36 + 9 ES2 / G-P + T 48 ± 4 4928 + 288 8, 2 + 5 935 + 426 27 + 10 ES1 / GP + GP + T + X ND 5151 + 146 2 + 0, 5 1054 + 477 ND A 2 / GP 109 + 215 4480 + 23 6, 9 + 2 395 + 216 29 + 8 A2 / G-P + T 129 + 4 2848+ 45 43 + 22 1002 + 615 46 + 13 A2 / G-P + T + X 129 + 1 5099 + 30 29 + 4 1314 + 724 134 + 57 3LM1V / GP ND 5152 + 119 62 + 31 721 + 16 33 + 4 LM1 V / G-P + T ND 5015 + 75 11 + 5 458 + 218 2 6 + 4 LM1 V / GP + T + X ND 5189 + 98 -82 + 35 457 + 257 6 + 1

ND, não detetado 1Estirpe da invenção (IATA-ES1) 2Bifidobacterium IATA-A2 3Lactobacillus reuteri LM1V 44 ΕΡ2236598Β1 EXEMPLO 4. CAPACIDADE DAS BIFIDOBACTÉRIAS SELECIONADAS PARA INIBIR O CRESCIMENTO DE ISOLADOS DA MIROBIOTA INTESTINAL DE DOENTES COM DOENÇA CELÍACA COM POTENCIAL PATOGÉNICO. A atividade antimicrobiana das estirpes do género Bifidobacterium previamente selecionadas de acordo com as suas propriedades imunomodulatórias seguindo o procedimento descrito no Exemplo 1, foi determinado através de dois métodos: (i) a técnica da camada dupla e (ii) a técnica de difusão no agár. A atividade antibacteriana de cada estirpe foi avaliada globalmente através da técnica da dupla camada utilizando como microrganismos indicadores, bactérias isoladas a partir da microbiota intestinal de doentes com doença celiaca e com potencial patogénico. As bifidobactérias foram cultivadas em placas de MRS-C em linhas de cerca de 2 cm e foram incubadas em condições ótimas durante 16 h e o seu subsequente desenvolvimento foi inibido utilizando clorofórmio. 0 microrganismo indicador foi inoculado numa concentração de 104-105 CFU/ml em 10 ml de agar semissólido adequado, vertido sobre a camada de agár do microrganismo protetor e incubado a 37°C em anaerobiose. Após 24 h foram medidos os halos de inibição à volta das linhas de cultura das bifidobactérias.ND, not detected 1Abstract of the invention (IATA-ES1) 2Bifidobacterium IATA-A2 3Lactobacillus reuteri LM1V 44 ΕΡ2236598Β1 EXAMPLE 4. CAPACITY OF BIFIDOBACTERIA SELECTED TO INHIBIT THE GROWTH OF ISOLATES OF INTESTINAL MIROBIOTA OF CELL PHEASED CELIAC DISEASES. The antimicrobial activity of strains of the genus Bifidobacterium previously selected according to their immunomodulatory properties following the procedure described in Example 1 was determined by two methods: (i) the double layer technique and (ii) the agar diffusion technique . The antibacterial activity of each strain was evaluated globally through the double layer technique using as indicator microorganisms, bacteria isolated from the intestinal microbiota of patients with celiac disease and with pathogenic potential. The bifidobacteria were plated on MRS-C plates in rows of about 2 cm and incubated under optimum conditions for 16 h and their subsequent development was inhibited using chloroform. The indicator microorganism was inoculated at a concentration of 104-105 CFU / ml in 10 ml of appropriate semi-solid agar, poured onto the agar layer of the protective microorganism and incubated at 37øC under anaerobic conditions. After 24 h the inhibition halos were measured around the culture lines of the bifidobacteria.

De modo a avaliar a atividade antibacteriana devido à secreção de compostos de natureza proteica foi utilizada a técnica de difusão em agár. Foi inoculado 10 ml de meio de crescimento MRS-C a 1% com uma cultura de 24 h de cada uma das bifidobactérias e incubadas durante 16 h a 37°C. Os sobrenadantes foram obtidos por centrifugação (12 000 g, 15 min, 4°C) e concentrados por liofilização. As amostras 45 ΕΡ2236598Β1 liofilizadas foram ressuspensas em 1 ml de tampão fosfato a 50 mM a pH 6,5, neutralizadas com NaOH até atingir um pH de 6,5 para eliminar os efeitos dos ácidos orgânicos produzidos por fermentação, e esterilizadas por filtração. Estas amostras constituíram extratos brutos em que a possível atividade de proteínas antibacterianas produzidas pelas bifidobactérias foi determinada. O microrganismo indicador foi inoculado a uma concentração de 104-105 células/ml em 10 ml de agár semissólido e vertido sobre uma camada sólida de agár do mesmo meio. Após solidificar, os poços de 5 mm foram perfurados, aos quais foram adicionados 40 μΐ do extrato isento de células e neutralizados de cada uma das bifidobactérias. Foi deixado difundir durante 4 h a 4°C e foi subsequentemente incubado em condições ótimas para o indicador ou microrganismo patogénico. Após incubação os halos de inibição à volta do poço foram medidos.In order to evaluate the antibacterial activity due to the secretion of compounds of protein nature, the agar diffusion technique was used. 10 ml of 1% MRS-C growth medium was inoculated with a 24 h culture of each of the bifidobacteria and incubated for 16 h at 37 ° C. Supernatants were obtained by centrifugation (12,000 g, 15 min, 4 ° C) and concentrated by lyophilization. The lyophilized samples were resuspended in 1 ml of 50 mM phosphate buffer pH 6.5, neutralized with NaOH until a pH of 6.5 was reached to eliminate the effects of the organic acids produced by fermentation and sterilized by filtration. These samples constituted crude extracts in which the possible activity of antibacterial proteins produced by bifidobacteria was determined. The indicator microorganism was inoculated at a concentration of 104-105 cells / ml in 10 ml of semisolid agar and poured onto a solid layer of agar of the same medium. After solidification, the 5 mm wells were drilled, to which 40 μΐ of the cell-free and neutralized extract of each of the bifidobacteria were added. It was allowed to diffuse for 4 h at 4 ° C and was subsequently incubated under optimum conditions for the indicator or pathogenic microorganism. After incubation the inhibition halos around the well were measured.

Tabela 4. Inibição de bactérias potencialmente patogénicas isoladas culturas a partir de doentes das bifidobactérias. celíacos por Estirpes Inibição por (cm) Blfidobacterium spp IATA-A2 IATA—ESI Bacteroides CAQ4 0,4 1,4 Bacteroides vulgatus 0,5 1,3 Clostridium difficile 0,9 1,6 E. coli CBE9 1,1 1,9 BC-BP1 0,5 1,2 BC-B01 0,7 1,0 BC-BU1 2, 3 2, 0 BC-BU3 1,0 1,3 46 ΕΡ2236598Β1Table 4. Inhibition of potentially pathogenic bacteria isolated cultures from patients of bifidobacteria. celiac by Strains Inhibition by (cm) Blfidobacterium spp IATA-A2 IATA-ESI Bacteroides CAQ4 0.4 1.4 Bacteroides vulgatus 0.5 1.3 Clostridium difficile 0.9 1.6 E. coli CBE9 1.1 1.9 BC-BP1 0.5 1.2 BC-B01 0.7 1.0 BC-BU1 2, 3 2, 0 BC-BU3 1.0 1.3 46 ΕΡ 2236598Β1

Tabela 5. Inibição das bactérias potencialmente patogénicas isoladas a partir de sobrenadantes de culturas de bifidobactérias de doentes celíacos.Table 5. Inhibition of potentially pathogenic bacteria isolated from culture supernatants of bifidobacteria from celiac patients.

Estirpe indicadora Inibição por (cm) Bifidobacterivaa spp. IATA-A2 IATA-ES1 Bac CAQ4 0,40 0, 45 Ent CBE9 0, 95 1,15Indicator strain Inhibition by (cm) Bifidobacterivaa spp. IATA-A2 IATA-ES1 Bac CAQ4 0.40 0.45 Ent CBE9 0.95 1.15

EXEMPLO 5. AVALIAÇÃO DA RESISTÊNCIA DAS BIFIDOBACTÉRIAS ÀS CONDIÇÕES DE STRESSE GASTROINTESTINAL A resistência das bifidobactérias isoladas às condições ácidas dos sucos gástricos, que constituem a primeira barreira biológica limitando a viabilidade de probióticos após ingestão, foi confirmada para cada uma das estirpes recuperadas. Para fazer isto, as suspensões de células de cada estirpe foram preparadas (108 células/ml) em PBS, contendo 3 g/1 de pepsina (Sigma, St. Louis, MO) e ajustada a pH 2 com HC1 e foram incubadas a 37°C durante um total de 120 min. Em diferentes vezes (0, 90 e 120 min), incluindo o tempo médio de esvaziamento gástrico (90 min), alíquotas foram tomadas para determinar a viabilidade através de contagens em placas de agar MRS-C. Subsequentemente, a tolerância de estirpes resistentes a pH ácido a outras condições de stresse tais como bílis, NaCl e elevadas temperaturas, foi estudada. Para conhecer a tolerância das estirpes estudadas à tolerância à bílis, a sua capacidade para crescer foi avaliada em MRS-C, a que foram adicionadas várias concentrações (0,5-1,5%) de Ox-gall (Sigma, St. Louis, MO). As alíquotas de 200 mL de cada meio, inoculada a 1% com 47 ΕΡ2236598Β1 culturas de 24 h, foram aplicadas em placas multi-poço e incubadas a 37°C. 0 crescimento foi monitorizado utilizando medições de absorvência a 655 nm num espectrofotómetro 550 Microplate Reader (BioRad, Hercules, CA) .EXAMPLE 5. EVALUATION OF RESISTANCE OF BIFIDOBACTERIA TO THE CONDITIONS OF GASTROINTESTINAL STRESSE The resistance of the isolated bifidobacteria to the acidic conditions of the gastric juices, which are the first biological barrier limiting the viability of probiotics after ingestion, was confirmed for each of the strains recovered. To do this, the cell suspensions of each strain were prepared (108 cells / ml) in PBS containing 3 g / l pepsin (Sigma, St. Louis, MO) and adjusted to pH 2 with HCl and incubated at 37 ° C for a total of 120 min. At different times (0, 90 and 120 min), including mean gastric emptying time (90 min), aliquots were taken to determine viability by counts on MRS-C agar plates. Subsequently, the tolerance of strains resistant to acid pH to other stress conditions such as bile, NaCl and elevated temperatures was studied. To know the tolerance of the studied strains to bile tolerance, their ability to grow was evaluated in MRS-C, to which several concentrations (0.5-1.5%) of Ox-gall (Sigma, St. Louis , MO). 200 ml aliquots of each medium, inoculated at 1% with 47 Ρ 2236598 culturas 24 h cultures, were loaded into multiwell wells and incubated at 37øC. Growth was monitored using absorbance measurements at 655 nm on a 550 Microplate Reader spectrophotometer (BioRad, Hercules, CA).

Tabela 6. Efeito das condições gástricas na capacidade de crescimento e viabilidade das estirpes de BifidobacteriumTable 6. Effect of gastric conditions on growth capacity and viability of Bifidobacterium strains

Viabilidade Capacidade de crescimento* <%) PH pH 3 2,5 2 Estirpes 3 2,5 2 Controlo Log cfu/mL t%) Log cfu/mL t%) Log cfu/mL t%) IATA-ES1 99, 4 ±4,2 86, 2± 13, 0 57, ± 2,3 9, 3± 0,0 9, 3± 0,0 99, 7 8, 1± 0,0 86, 7 5, 2± 0,0 56, 1 BIR 324 89,4 ±2,3 73, 1± 1, 0 61, 6+ 1,7 9, 1± 0,0 8,8± 0,0 96, 9 8,8± 0,2 96, 8 5, 7 9± 0,1 63, 6 Bion 3 98, 4 ±1, 9 78,4±1 , 7 11,6+ 3, 7 9, 0± 0,0 7,3± 0,0 81,2 4,8± 0,1 52,8 NCIMB 8809 1, 8± 0,5 8, 1± 0, 0 ^Viabilidade expressa como a percen Kit system (Molecular Probes) em s 100 %. fCapacidade de crescimento expressa e expressa como uma percentagem da ser 100 %. '/Desvios padrão médios dos resulta -, não detectado tagem da v jspensões em Log cfi_ recontagem dos obtidos iabilidade celulares c /mL determ da suspens em três t detetac =m PBS inado p ão de c estes i ia utilizar a pH 7,2, cr contagen élulas em /dependente ido o LI que foi 4 em pia DBS, que s nd, n VE/DEAD Ba considera cas de aga foi consi ão determi cLight do ser r MRSC derada /ado 48 ΕΡ2236598Β1Viability Growth capacity * <%) PH pH 3 2.5 2 Strains 3 2.5 2 Control Log cfu / ml t%) Log cfu / ml t%) log Cfu / ml t%) IATA-ES1 99.4 ± 4.2 86 ± 2 ± 13.0 57 ± 2.3 9 ± 3 ± 0.0 9.3 ± 0.0 99.778 ± 0.086, 0 56.1 1 BIR 324 89.4 ± 2.3 73.1 ± 1.06 61.6 ± 1.7 9.1 ± 0.0 8.8 ± 0.0 96.9 ± 8.8 ± 0, 2 96.8 ± 5.7 63 ± 6 Bion 3 98.4 ± 1.9 9 78.4 ± 1.7 7 11.6 ± 3.09 ± 0.0 7.3 ± 0 , 0 81.2 4.8 ± 0.1 52.8 NCIMB 8809 1.8 ± 0.5 8 ± 1 ± 0.0 Fe viability expressed as the percen Kit system (Molecular Probes) in s 100%. fCapacity of growth expressed and expressed as a percentage of being 100%. Mean standard deviations of the results of the assay of the results of the assay were not detected in the cell counts obtained with the suspension in three t detectable samples of PBS with a pH of 7.2 , counting the number of cells in the dependent cell, and the L1 that was 4 in the DBS cell, which is nd, n VE / DEAD Ba considered as cell counts, was considered as a determinant of the MRSC serotype 48 ΕΡ 2236598Β1

Tabela 7. Tolerância das estirpes Bifidobacterium à presença de sais biliaresTable 7. Tolerance of Bifidobacterium strains to the presence of bile salts

Estirpes Capacidadede crescimento relativa* (%) Concentração de oxgall (%) Controlo 0, 5 1,0 2,0 3,0 IATA-ESl 100 88,22±0,70 82,65±1,60 69,95±0,33 67,28±1,31 A2 100 73,03±0,98 64,12±1,79 60,96±0,59 38,21±1,44 BIR 324 100 62,68±3,55 43,99±1,64 38,29±0,32 37,06±0,48 NCIMB 8809 100 45,07±8,20 23,88±7,56 3,94±1,05 0,70±1,00 Bion 3 100 30,17±3,2 23,30±0,0 - — *Dados expressos como uma percentagem da velocidade de crescimento (h_1) obtidos na ausência de bílis, que foi considerado como sendo 100%. Os desvios padrão médios dos resultados obtidos em três experiências independentes.Strains Capacity of relative growth * (%) Oxgall concentration (%) Control 0, 5 1.0 2.0 3.0 IATA-ES1 100 88.22 ± 0.70 82.65 ± 1.60 69.95 ± 0 , 33 67.28 ± 1.31 A2 100 73.03 ± 0.98 64.12 ± 1.79 60.96 ± 0.59 38.21 ± 1.44 BIR 324 100 62.68 ± 3.55 43 , 99 ± 1.64 38.29 ± 0.32 37.06 ± 0.48 NCIMB 8809 100 45.07 ± 8.20 23.88 ± 7.56 3.94 ± 1.05 0.70 ± 1, 00 Bion 3 100 30.17 ± 3.2 23.30 ± 0.0 - - * Data expressed as a percentage of the growth rate (h -1) obtained in the absence of bile, which was considered to be 100%. The mean standard deviations of the results obtained in three independent experiments.

EXEMPLO 6. ISOLAMENTO E IDENTIFICAÇÃO DAS BIFIDOBACTERIAS SELECIONADASEXAMPLE 6. ISOLATION AND IDENTIFICATION OF SELECTED BIFIDOBACTERIAS

As estirpes do género Bifidobacterium foram isoladas a partir de fezes de bebés saudáveis alimentados a peito que não tinham ingerido alimentos contendo bifidobactérias durante pelo menos um mês antes da análise e a quem não tinha sido dado qualquer tratamento com antibióticos. As amostras foram mantidas a 4°C e foram analisadas sem terem passado mais do que duas horas desde a sua colheita. Duas gramas de cada uma foram diluídas em 10 mM de tampão fosfato contendo uma concentração de NaCl a 130 mM (PBS) e foram homogeneizadas num digestor Lab-Blender 400 (Seward Medicai, London, UK) durante 3 min, e depois diluídas em água peptonada. As alíquotas de 0,1 ml de várias diluições decimais foram inoculadas em agar MRS (de Man Rogosa and 49 ΕΡ2236598Β1Strains of the genus Bifidobacterium were isolated from feces from healthy, breast fed infants who had not ingested foods containing bifidobacteria for at least one month prior to analysis and who had not been given any antibiotic treatment. Samples were kept at 4 ° C and analyzed without more than two hours after collection. Two grams of each were diluted in 10 mM phosphate buffer containing a concentration of 130 mM NaCl (PBS) and homogenized in a Lab-Blender 400 digester (Seward Medical, London, UK) for 3 min, and then diluted with water peptone 0.1 ml aliquots of various decimal dilutions were inoculated onto MRS agar (from Man Rogosa and 49 ΕΡ 2236598Β1

Sharpe; Scharlau, Barcelona) contendo 0,05% de cisteína (Sigma, St. Louis, MO; MRS-C), e 80 mg/mL de mupirocina. Após 48-houras de incubação a 37°C em condições de anaerobiose (AnaeroGen, Oxoid, UK) as colónias isoladas foram selecionadas e a sua identidade foi confirmada através de um estudo da sua morfologia sob coloração de Gram. A identidade dos isolados foi confirmada por PCR especifico para o género, de acordo com a metodologia descrita por Kaufman et al. (1997, Identification and quantification of Bifidobacterium species isolated from food with genus-specific 16S rRNA targeted probes by colony hybridization and PCR. Appl. Environ. Microbiol. 63: 1268-1273), utilizando os iniciadores (LM26 e LM3) que amplificam um fragmento de 1,35 kb do gene do RNA 16S ribossómico. Também, o gene rRNA 16S foi sequenciado a partir de DNA total. O fragmento sequenciado foi amplificado utilizando os iniciadores 27f e 1401r e foi purificado utilizando o sistema comercial GFX™PCR (Amershan, Bioscience, UK). Para a sequenciação, os iniciadores 530f e U-968f foram também utilizados de acordo com os procedimentos descritos por outros autores (Jonson, 1994. Similarity analysis of rRNAs. In Methods for General and Molecular Bacteriology; Gerhard, P.; Murray, R. G.E.; Wood, W.A.; Krieg, N.R., Eds. American Society for Microbiology, Washington, DC. Pp 683-700; Satokari et al., 2001. Bifidobacterial Diversity in Human Feces Detected by Genus-Specific PCR and Denaturating Gradient Gel Electrophoresis. Appl. Environ. Microbiol. 67, 504-513; Favier et al. 2002. Molecular Monitoring ofSharpe; Scharlau, Barcelona) containing 0.05% cysteine (Sigma, St. Louis, MO; MRS-C), and 80 mg / mL mupirocin. After 48 hours of incubation at 37øC under anaerobic conditions (AnaeroGen, Oxoid, UK) the isolated colonies were selected and their identity confirmed by a study of their morphology under Gram staining. The identity of the isolates was confirmed by gender specific PCR, according to the methodology described by Kaufman et al. (1997, Identification and quantification of Bifidobacterium species isolated from food with genus-specific 16S rRNA targeted probes by colony hybridization and PCR Appl Appl Environ Microbiol 63: 1268-1273) using primers (LM26 and LM3) that amplify a fragment of the 16S ribosomal RNA gene. Also, the 16S rRNA gene was sequenced from total DNA. The sequenced fragment was amplified using primers 27f and 1401r and purified using the commercial GFX ™ PCR system (Amershan, Bioscience, UK). For sequencing, primers 530f and U-968f were also used according to the procedures described by other authors (Johnson, 1994. Similarity analysis of rRNAs, In Methods for General and Molecular Bacteriology, Gerhard, P .; Murray, RGE; Wood, WA, Krieg, NR, Eds, American Society for Microbiology, Washington, DC, pp. 683-700, Satokari et al., 2001. Bifidobacterial Diversity in Human Feces Detected by Genus-Specific PCR and Denaturating Gradient Gel Electrophoresis Appl. Microbiol 67, 504-513; Favier et al., 2002 Molecular Monitoring of

Succession of Bacterial Communities in Human Neonates. Appl. Environ. Microbiol. 68, 219-22). A sequenciação foi efetuada utilizando um sequenciador automático de DNA ABI 3700 (Applied Biosystem, Foster City, CA) . A pesquisa das sequências relacionadas foi efetuada na base de dados GenBank 50 ΕΡ2236598Β1 utilizando o algoritmo BLAST (Altschul et al., 1990. Basic local alignment search tool. J. Mol Biol. 215, 403-410). EXEMPLO 7. AVALIAÇÃO DA CAPACIDADE DE ESTIRPES DO GÉNERO BIFIDOBACTERIUM PARA REGULAR AS RESPOSTAS PRÓ-INFLAMATÓRIAS CAUSADAS PELA MICROBIOTA INTESTINAL ALTERADA DE INDIVÍDUOS CELÍACOS COM DOENÇA ACTIVA E APÓS TRATAMENTO COM UMA DIETA ISENTA DE GLÚTEN. 1. Preparação das culturas intestinais de bifidobactérias e amostras fecais para avaliação.Succession of Bacterial Communities in Human Neonates. Appl. Environ. Microbiol. 68, 219-22). Sequencing was performed using an ABI 3700 automatic DNA sequencer (Applied Biosystem, Foster City, CA). The search for the related sequences was performed in the GenBank database 50 ΕΡ 2236598Β1 using the BLAST algorithm (Altschul et al., 1990. Basic local alignment search tool, J. Mol Biol. 215, 403-410). EXAMPLE 7. EVALUATION OF CAPACITY OF BIFIDOBACTERIUM GENDER STRENGTHS TO REGULATE THE PRO-INFLAMMATORY RESPONSES CAUSED BY THE ALTERED INTESTINAL MICROBIOTY OF CELIAC INDIVIDUALS WITH ACTIVE DISEASE AND AFTER TREATMENT WITH A DIET FREE OF GLUTEN. 1. Preparation of intestinal cultures of bifidobacteria and fecal samples for evaluation.

As estirpes do género Blfldobacterium foram inoculadas em 10 ml de meio de crescimento MRS (Scharlau Chemie S.A., Barcelona, Espanha) contendo cerca de 0,05% de cisteina (MRS-C) a 1% com uma cultura de 24 h e foram incubadas durante 22 h a 37°C em anaerobiose. (AnaeroGen; Oxoid, Basingstoke, UK). As células foram recolhidas por centrifugação (6 000 g, 15 min) , lavadas duas vezes em PBS (10 mM de fosfato de sódio, 130 mM de cloreto de sódio, pH 7,4), e ressuspensas em PBS contendo 20% de glicerol. As aliquotas destas suspensões foram congeladas utilizando azoto liquido e conservadas a -80°C. O número de células viáveis após o ciclo de congelamento-descongelamento foi determinado por recontagem de placas MRSC após incubação durante 48 h. A viabilidade foi superior a 90% em todos os casos. Cada alíquota foi utilizada para um único teste.Strains of the genus Blfldobacterium were inoculated into 10 ml of MRS growth medium (Scharlau Chemie SA, Barcelona, Spain) containing about 0.05% cysteine (MRS-C) at 1% with a 24 h culture and incubated for 22 h at 37 ° C in anaerobiosis. (AnaeroGen, Oxoid, Basingstoke, UK). Cells were harvested by centrifugation (6000 g, 15 min), washed twice in PBS (10 mM sodium phosphate, 130 mM sodium chloride, pH 7.4), and resuspended in PBS containing 20% glycerol . Aliquots of these suspensions were frozen using liquid nitrogen and stored at -80øC. The number of viable cells after the freeze-thaw cycle was determined by recounting MRSC plates after incubation for 48 h. Viability was greater than 90% in all cases. Each aliquot was used for a single test.

As fezes de doentes celíacos com a doença ativa (no momento de diagnóstico) e tratado com uma dieta isenta de glúten durante pelo menos 2 anos foram diluídos 1/10 em tampão fosfato, homogeneizado num digestor durante 3-5 51 ΕΡ2236598Β1 minutos e congelado a -20 °C para utilização como um estimulo nas células mononucleares do sangue periférico. As amostras de fezes dos indivíduos saudáveis foram também tomadas como controlos.Feces of celiac patients with active disease (at diagnosis) and treated with a gluten-free diet for at least 2 years were diluted 1/10 in phosphate buffer, homogenized in a digester for 3-5 51 Ρ 2236598 minutos minutes and frozen at -20 ° C for use as a stimulation in peripheral blood mononuclear cells. Stool samples from healthy subjects were also taken as controls.

2. Isolamento e estimulação de PBMC2. Isolation and stimulation of PBMC

Os PBMC do sangue periférico de 4 voluntários saudáveis (média de 30 anos de idade, variando de 24-40) foram isolados em tubos com heparina. O isolamento de PBMC foi efetuado por centrifugação em gradiente de Ficoll (Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) . As células foram lavadas em meio RPMI 1640 (Cambrex, Nova Iorque, USA) e ajustadas a uma densidade de 1 x 106 células/ml em meio RPMI 1640 contendo também 10% de soro fetal de bovino (Gibco, Barcelona, Espanha), 2 mM de L-glutamina, 100 mg/ml de estreptomicina e 100 U/ml penicilina (Sigma). As PBMC foram incubadas em placas de poliestireno de 24 poços de fundo plano (Corning, Madrid, Espanha) na presença ou ausência de agentes de estimulação a 37° C, a 5% de C02, durante 24 h. Como um estímulo, foram utilizados extratos das fezes de indivíduos saudáveis, doentes com doença celíaca ativa e não ativa, na presença ou ausência de 30 mL de suspensões de células bacterianas vivas de 1 x 106 CFU/ml. Como um controlo positivo foi utilizado lipopolissacárido purificado (LPS) de E. coli 0111:B4 (Sigma, St. Louis, MO) numa concentração de 1 pg/ml. Como um controlo negativo foi testada a produção de citoquina em PBMC não estimuladas. Cada tipo de estímulo foi testado em duplicado em cada experiência. Os sobrenadantes das culturas foram recolhidos por centrifugação, fracionada e armazenada em alíquotas a -20°C até detecção da citoquina. 52 ΕΡ2236598Β1 3. Determinação de citoquinas e marcadores de ativação celular A concentração de citoquinas (IFN-γ, IL-10, e TGF-β) dos sobrenadantes foi medida utilizando kits ELISA de Bioscience (BD Biosciences, San Diego, CA) após as instruções do fabricante. Os marcadores das diferentes populações de linfócitos e os de ativação foram detetados utilizando anticorpos anti CD4, CD8 e CD86 marcados com FITC (eBioscience, San Diego, CA) e citometria de fluxo (Flow cytometer EPICS® XL-MCL; Beckman Coulter, Flórida). A implicação da via de transdução de sinal mediada pelo fator nuclear (NF) kB na resposta imunitária foi determinada por adição de um seu inibidor (lactacistina).Peripheral blood PBMC from 4 healthy volunteers (mean age 30 years, ranging from 24-40) were isolated in tubes with heparin. Isolation of PBMC was effected by Ficoll gradient centrifugation (Amersham Biosciences, Piscataway, NJ). Cells were washed in RPMI 1640 medium (Cambrex, New York, USA) and adjusted to a density of 1 x 106 cells / ml in RPMI 1640 medium also containing 10% fetal bovine serum (Gibco, Barcelona, Spain), 2 mM L-glutamine, 100 mg / ml streptomycin and 100 U / ml penicillin (Sigma). PBMCs were incubated in 24-well flat bottom polystyrene plates (Corning, Madrid, Spain) in the presence or absence of stimulation agents at 37øC, 5% CO 2 for 24 h. As a stimulus, fecal extracts from healthy subjects, patients with active and non-active celiac disease, were used in the presence or absence of 30 ml of live bacterial cell suspensions of 1 x 106 CFU / ml. As a positive control, purified lipopolysaccharide (LPS) from E. coli 0111: B4 (Sigma, St. Louis, MO) at a concentration of 1 pg / ml was used. As a negative control cytokine production in unstimulated PBMC was tested. Each stimulus type was tested in duplicate in each experiment. Culture supernatants were collected by centrifugation, fractionated and stored in aliquots at -20 ° C until detection of the cytokine. 3. Determination of Cytokines and Cell Activation Markers The concentration of cytokines (IFN-γ, IL-10, and TGF-β) of the supernatants was measured using Bioscience ELISA kits (BD Biosciences, San Diego, CA) after the manufacturer's instructions. Markers of the different lymphocyte and activation populations were detected using FITC-labeled anti-CD4, CD8 and CD86 antibodies (eBioscience, San Diego, CA) and flow cytometry (Flow cytometer EPICS® XL-MCL; Beckman Coulter, Florida) . The implication of the nuclear factor (NF) kB mediated signal transduction pathway in the immune response was determined by the addition of an inhibitor (lactacystin).

ResultadosResults

As fezes de doentes com doença celiaca, que apresentaram alterações na composição dos microbiota, induziram uma produção de citoquinas pró-inflamatórias (TNF-α e IFN-γ) superior à dos indivíduos saudáveis e uma produção da citoquina IL-10 anti-inflamatória inferior à de indivíduos saudáveis em PBMC. Estas também aumentaram a síntese da molécula de superfície CD86 essencial para a ativação de células T mais do que as fezes de controlo. A co-incubação com bifidobactéria regula o perfil de citoquinas pró-inflamatórias induzidas pela microbiota fecal de doentes com doença celíaca, reduzindo a síntese de TNF-α e IFN-γ e aumentando a de IL-10. A inibição da síntese de citoquinas na presença de lactacistina sugere que o NF kB está envolvido nos efeitos imunomoduladores exercidos pelas bifidobactérias. 53 ΕΡ2236598Β1Feces from patients with celiac disease, who presented alterations in the composition of the microbiota, induced a higher production of pro-inflammatory cytokines (TNF-α and IFN-γ) than healthy individuals and a production of the lower anti-inflammatory cytokine IL-10 to healthy individuals in PBMC. These also increased the synthesis of the essential CD86 surface molecule for T cell activation more than the control feces. Co-incubation with bifidobacteria regulates the proinflammatory cytokine profile induced by the fecal microbiota of patients with celiac disease, reducing the synthesis of TNF-α and IFN-γ and increasing that of IL-10. Inhibition of cytokine synthesis in the presence of lactacystin suggests that NF kB is involved in the immunomodulatory effects exerted by bifidobacteria. 53 ΕΡ 2236598Β1

EXEMPLO 8: CARACTERIZAÇÃO DAS FRAÇÕES DE GLIADINAS PRODUZIDAS NO PROCESSO DE DIGESTÃO IN VITRO E CARACTERIZAÇÃO DA REDUÇÃO DE PÉPTIDOS DERIVADOS DA DIGESTÃO GASTROINTESTINAL DE GLIADINAS POR BIFIDOBACTÉRIAS E SEUS EFEITOS BIOLÓGICOS 1. Digestão de Gliadina GastrointestinalEXAMPLE 8 CHARACTERIZATION OF FRACTIONS OF GLIADINES PRODUCED IN THE IN VITRO DIGESTION PROCESS AND CHARACTERIZATION OF THE REDUCTION OF PEPTIDES DERIVED FROM THE GASTROINTESTINAL DIGESTION OF GLIADINES BY BIFIDOBACTERIA AND THEIR BIOLOGICAL EFFECTS 1. Digestion of Gliadin Gastrointestinal

Foi utilizada uma preparação de gliadinas (Sigma, G3375) que contém quatro das isoformas, gliadinas α-β-, γ-, e ω-, destas proteínas cuja sequência completa de aminoácidos está disponível. A solução de diferentes alíquotas (150 mg) do extrato comercial de gliadinas foi efetuada numa solução salina isotónica (140 mM de NaCl, 5 mM de KC1) a pH 3, aquecendo a mistura a 55°C durante 30 minutos num banho com agitação. As amostras foram sujeitas a um processo de digestão gastrointestinal simulada utilizando pepsina (Sigma, P7000) (800-2500 Ul/mg proteína) e pancreatina porcina (P1750) (atividade, 43USP), e extrato de bílis (B3883). A digestão gástrica (pepsina em 0,1M de HCl/pH 3/lh, em agitação) foi efetuada em tubos de centrifugação (50 ml). Subsequentemente, o estádio intestinal (pancreatina-bílis em 0,1 M de NaHC03/pH 6,9-7/2h, em agitação) foi efetuada no compartimento superior (dador) (1,5 ml) de um sistema de bicâmara preparado com uma membrana de diálise (Spectra/Por 2.1, Spectrum Medicai, Gardena, CA) com um tamanho de poro de 15 KDa. No compartimento inferior (recetor) foi colocada uma solução salina (1 mL). Uma vez completo o processo de digestão o conteúdo em proteína total foi quantificado no sobrenadante (4000 rpm/5 min/4°C) da amostra gastrointestinal 54 ΕΡ2236598Β1 digerida e na amostra dialisada utilizando um kit comercial (Sigma, TP0200) com base no método de Lowry. 2. Análise cromatográfica das frações de gliadina após o processo de digestão in vitro.A preparation of gliadins (Sigma, G3375) containing four of the isoforms, α-β-, γ-, and ω- gliadins of these proteins whose complete amino acid sequence is available is used. The solution of different aliquots (150 mg) of commercial gliadin extract was performed in isotonic saline solution (140 mM NaCl, 5 mM KCl) at pH 3, heating the mixture at 55øC for 30 minutes in a stirred bath. Samples were subjected to a simulated gastrointestinal digestion procedure using pepsin (Sigma, P7000) (800-2500 IU / mg protein) and porcine pancreatin (P1750) (activity, 43USP), and bile extract (B3883). Gastric digestion (pepsin in 0.1 M HCl / pH 3/1 h, with shaking) was performed in centrifuge tubes (50 ml). Subsequently, the intestinal stage (pancreatin-bile in 0.1 M NaHC03 / pH 6.9-7 / 2h, with shaking) was performed in the upper (donor) compartment (1.5 ml) of a double chamber system prepared with a dialysis membrane (Spectra / Por 2.1, Spectrum Medicai, Gardena, CA) having a pore size of 15 KDa. A saline solution (1 mL) was placed in the lower compartment (receiver). Upon completion of the digestion process, the total protein content was quantified in the supernatant (4000 rpm / 5 min / 4 ° C) of the digested gastrointestinal sample and the dialysed sample using a commercial kit (Sigma, TP0200) based on the method of Lowry. 2. Chromatographic analysis of gliadin fractions after the in vitro digestion process.

Para analisar as gliadinas foi adaptado um método cromatográfico em fase reversa. A separação foi efetuada numa coluna BioBasic C18 (5 mm 4.6x250 mm) utilizando o equipamento 1050 HPLC de Hewlett Packard. As fases móveis utilizadas consistem em (A) Acetonitrilo (ACN, qualidade HPLC) aquosa a 15% (v/v) com ácido Trifluoroacético (TFA) 0,1 % (v/v) , e (B) ACN aquoso a 80% (v/v) com TFA 0,1% (v/v). O gradiente de eluição utilizado foi como se segue; 0-5 min., gradiente linear até 5% do solvente B; 5-12 min., gradiente linear até 20% do solvente B. A coluna foi lavada com 100% do solvente B durante 5 minutos, e foi reequilibrada utilizando as condições iniciais durante 3 minutos. As amostras foram filtradas através de uma membrana de nylon (13 mm 0,22 mm Millex GN, Millipore). Três aliquotas independentes de cada tratamento foram analisadas (100 μΐ). A absorção na região ultravioleta foi monitorizada a 210 nm. 3. Identificação das sequências de péptidos de gliadinas utilizando cromatográfia de fase reversa acoplada a electrospray-MsMs (RP-HPLC-ESI-MS/MS).To analyze the gliadins, a reverse phase chromatographic method was adapted. The separation was performed on a BioBasic C18 column (5 mm 4.6x250 mm) using the Hewlett Packard 1050 HPLC equipment. The mobile phases used consist of (A) 15% (v / v) aqueous Acetonitrile (ACN, HPLC grade) with 0.1% (v / v) Trifluoroacetic acid (TFA), and (B) 80% (v / v) with 0.1% TFA (v / v). The elution gradient used was as follows; 0-5 min, linear gradient up to 5% of solvent B; 5-12 min, linear gradient to 20% solvent B. The column was washed with 100% solvent B for 5 minutes, and was rebalanced using the initial conditions for 3 minutes. Samples were filtered through a nylon membrane (13 mm 0.22 mm Millex GN, Millipore). Three independent aliquots of each treatment were analyzed (100 μΐ). Absorption in the ultraviolet region was monitored at 210 nm. 3. Identification of gliadin peptide sequences using reverse phase chromatography coupled to electrospray-MsMs (RP-HPLC-ESI-MS / MS).

A separação cromatográfica foi realizada numa coluna BioBasic C18 (5 mm 4,6x250 mm) utilizando um sistema HPLCThe chromatographic separation was performed on a BioBasic C18 column (5 mm 4.6 x 250 mm) using an HPLC system

Agilent acoplado a um espectrómetro de massa com uma armadilha de iões quadruplo (Esquire-LC-Ms(n), Bruker Daltonics, Billerica, MA). O gradiente de eluição 55 ΕΡ2236598Β1 cromatográfica empregue foi o descrito na secção anterior. Na análise o azoto foi utilizado como nebulizador e gás de secagem, e hélio como o gás para a colisão molecular a uma pressão aproximada de 5 x 10 3 bar. A voltagem capilar da colisão foi mantida a 4 kV. 0 espectro de massa foiAgilent coupled to a quadrupole ion trap mass spectrometer (Esquire-LC-Ms (n), Bruker Daltonics, Billerica, MA). The chromatographic elution gradient employed was that described in the previous section. In the analysis the nitrogen was used as nebulizer and drying gas, and helium as the gas for the molecular collision at a pressure of approximately 5 x 10 3 bar. The capillary voltage of the collision was maintained at 4 kV. The mass spectrum was

monitorizado no intervalo de massa/carga de 500 - 5000. O método mostra a análise de massa média (Ms) do espectro 15, e a análise de massa sequencial Ms(n) do espectro 5. O limite da corrente de ião para efetuar a análise sequencial de massa foi estabelecida como 5000, e os iões precursores foram isolados num intervalo m/z de 4,0 fragmentado com uma rampa de voltagem de 0,39 a 2,6 V. Os dados espectrais m/z foram processados e transformados utilizando o programa computacional de análise fornecido pelo fabricante (Data Analysis versão 3, Bruker Daltonics) . As sequências de péptidos do espectro Ms(n) foram estabelecidas utilizando programas computacionais de análise (BioTools versão 2.1 (Bruker Daltonics). 4. Efeitos da co-incubação das gliadinas gastrointestinais digeridas com bifidobactérias.monitored in the 500-5000 mass / charge range. The method shows the mean mass (Ms) analysis of the spectrum 15, and the Ms (n) sequential mass analysis of the spectrum 5. The ion current limit for effecting the sequential mass analysis was set to 5000, and the precursor ions were isolated in a m / z range of 4.0 fragmented with a voltage ramp of 0.39 to 2.6 V. The m / z spectral data were processed and transformed using the computer analysis software provided by the manufacturer (Data Analysis version 3, Bruker Daltonics). The peptide sequences of the Ms (n) spectrum were established using computational analysis software (BioTools version 2.1 (Bruker Daltonics).) 4. Effects of co-incubation of gastrointestinal gliadins digested with bifidobacteria.

As amostras de gliadina gastrointestinal digeridas obtidas na secção 1 foram co-incubadas na presença e ausência de bifidobactérias intestinais, tais como a estirpe da invenção, situada na parte apical (dador) de uma cultura de células Caco-2 em transpoço, utilizado como modelo do epitélio intestinal. Com o propósito de estimar a redução dos efeitos tóxicos das gliadinas na presença da estirpe da invenção (IATA-ES1), a síntese das citoquinas pró-inflamatórias TNF-α e NFkB foi medida utilizando métodos ELISA na cultura de células Caco-2 da câmara inferior 56 ΕΡ2236598Β1 (recetor) na presença e ausência das bifidobactérias (Figuras 3 e 4) .The digested gastrointestinal gliadin samples obtained in section 1 were co-incubated in the presence and absence of intestinal bifidobacteria, such as the strain of the invention, located in the apical part (donor) of a transposable Caco-2 cell culture, used as template of the intestinal epithelium. In order to estimate the reduction of the toxic effects of gliadins in the presence of the strain of the invention (IATA-ES1), the synthesis of the proinflammatory cytokines TNF-α and NFκB was measured using ELISA methods in the Caco-2 cell culture of the chamber lower 56 ΕΡ2236598Β1 (receptor) in the presence and absence of bifidobacteria (Figures 3 and 4).

ResultadosResults

Análise por RP-HPLC da fração de proteína inferior a 15 KDa derivados_da_diálise_das_amostras_de_gliadina gastrointestinal digeridas. A separação cromatográfica (Figura 2) revela a presença de cinco frações de péptido sendo a principal a fração #2. Os estudos de diálise dos péptidos derivados de gliadina na presença de diferentes estirpes bacterianas (i. e., estirpe da invenção (IATA-ES1) e Bifidobacterium A2, isoladas no nosso laboratório demonstrou a capacidade proteolítica destas bactérias em gliadinas e especificamente na fração #2. A estirpe que causou a redução mais importante da fração #2 foi a estirpe da invenção (IATA-ES1), que reduziu mais do que 10% da fração nas condições do estudo. EXEMPLO 9. AVALIAÇÃO DA CAPACIDADE DE ESTIRPES DO GÉNERO BIFIDOBACTERIUM REGULAREM A MATURAÇÃO INDUZIDA POR GLIADINA E FEÓTIPO PRO—INFLAMATÓRIO EM CÉLULAS DENDRÍTICAS ENVOLVIDAS NA APRESENTAÇÃO DE ANTIGÉNIO. 1. Preparação das culturas de bifidobactérias intestinais e amostras de fezes para avaliação.RP-HPLC analysis of the protein fraction below 15 KDa derived from the digestion of gastrointestinal gliadin samples digested. Chromatographic separation (Figure 2) reveals the presence of five peptide fractions being the major fraction # 2. Dialysis studies of gliadin-derived peptides in the presence of different bacterial strains (ie, strain of the invention (IATA-ES1) and Bifidobacterium A2, isolated in our laboratory demonstrated the proteolytic capacity of these bacteria in gliadins and specifically in fraction # 2. strain that caused the most significant reduction of fraction # 2 was the strain of the invention (IATA-ES1), which reduced more than 10% of the fraction under the study conditions. EXAMPLE 9. ASSESSMENT OF CAPACITY OF BIFIDOBACTERIUM GENDER STRENGTHS REGULATE MATURATION INDUCED BY GLIADINE AND PRO-INFLAMMATORY FEOTYPE IN DENDRITIC CELLS INVOLVED IN THE PRESENTATION OF ANTIGEN 1. Preparation of cultures of intestinal bifidobacteria and fecal samples for evaluation.

As estirpes do género Bifidobacterium foram inoculadas em 10 ml de meio de crescimento MRS (Scharlau Chemie S.A., Barcelona, Espanha) contendo 0,05% de cisteína (MRS-C) a 1% com uma cultura de 24 h e foram incubadas durante 22 h a 37°C em anaerobiose (AnaeroGen; Oxoid, Basingstoke, UK) . As 57 ΕΡ2236598Β1 células foram recolhidas por centrifugação (6 000 g, 15 min), lavados duas vezes em PBS (10 mM de fosfato de sódio, 130 mM de cloreto de sódio, pH 7,4), e foram ressuspensos em PBS contendo 20% de glicerol. Alíquotas destas suspensões foram congeladas utilizando azoto liquido e conservados a -80°C. O número de células viáveis após o ciclo de congelamento-descongelamento foi determinado por contagem em placas de agar MRSC após incubação durante 48 h. A viabilidade foi superior a 90% e todos os casos. Cada alíquota foi utilizada para um único teste. Antes de utilizar as células como estimulo estas foram lavadas por centrifugação e foram ressuspensas em PBS. 2. Isolamento e estimulação de células dendríticas (DC) obtidas a partir de sangue periférico.Strains of the genus Bifidobacterium were inoculated into 10 ml of MRS growth medium (Scharlau Chemie SA, Barcelona, Spain) containing 0.05% cysteine (MRS-C) at 1% with a 24 h culture and incubated for 22 h 37 ° C in anaerobiosis (AnaeroGen, Oxoid, Basingstoke, UK). The 57 Ρ 2236598 Β 1 cells were collected by centrifugation (6000 g, 15 min), washed twice in PBS (10 mM sodium phosphate, 130 mM sodium chloride, pH 7.4), and resuspended in PBS containing 20. % glycerol. Aliquots of these suspensions were frozen using liquid nitrogen and stored at -80 ° C. The number of viable cells after the freeze-thaw cycle was determined by counting on MRSC agar plates after incubation for 48 h. Viability was greater than 90% and all cases. Each aliquot was used for a single test. Before using the cells as a stimulus these were washed by centrifugation and resuspended in PBS. 2. Isolation and stimulation of dendritic cells (DC) obtained from peripheral blood.

As PBMC foram isoladas a partir do sangue periférico de 4 voluntários saudáveis (idade média de 30 anos, variando de 24-40) em tubos com heparina. As PBMC foram isoladas por centrifugação em gradiente de Ficoll (Amersham Biosciences, Piscataway, NJ). As células foram lavadas com meio RPMI 1640 (Cambrex, Nova Iorque, USA) e foram ajustados para uma densidade de 1 x 106 células/ml em meio RPMI 1640 contendo também 10% de soro fetal de bovino (Gibco, Barcelona, Espanha), 2 mM de L-glutamina, 100 pg/ml de estreptomicina e 100 U/ml penicilina (Sigma). As PBMC foram incubadas em placas de 24 poços de poliestireno de fundo plano (Corning, Madrid, Espanha) na presença ou ausência de agentes de estimulação a 37°C, a 5% de o o to durante 2 4 h. como um estimulo foi utilizada gliadina (0,1 pg/ml) e IFN-γ (150 UI) na presença e ausência de bifidobactérias e outras bactérias intestinais. Como um controlo positivo foram utilizados 58 ΕΡ2236598Β1 lipopolissacáridos purificados (LPS) de E. coli 0111:B4 (Sigma, St. Louis, MO) a uma concentração de 1 mg/mL. Como um controlo negativo foi testada a produção de citoquina em PBMC não estimuladas. Cada tipo estimulo foi testado em duplicado em cada experiência. Os sobrenadantes das culturas foram recolhidos por centrifugação, fracionada e armazenada em aliquotas a -20°C até deteção da citoquina. 3. Determinação de marcadores de citoquinas e ativação celularPBMC were isolated from the peripheral blood of 4 healthy volunteers (mean age 30 years, ranging from 24-40) in heparin tubes. PBMCs were isolated by Ficoll gradient centrifugation (Amersham Biosciences, Piscataway, NJ). The cells were washed with RPMI 1640 medium (Cambrex, New York, USA) and adjusted to a density of 1 x 106 cells / ml in RPMI 1640 medium also containing 10% fetal bovine serum (Gibco, Barcelona, Spain), 2 mM L-glutamine, 100 pg / ml streptomycin and 100 U / ml penicillin (Sigma). PBMCs were incubated in 24-well flat-bottomed polystyrene plates (Corning, Madrid, Spain) in the presence or absence of stimulation agents at 37øC, 5% ot for 24 h. as a stimulus was used gliadin (0.1 pg / ml) and IFN-γ (150 IU) in the presence and absence of bifidobacteria and other intestinal bacteria. As a positive control, purified E. coli 0111: B4 (Sigma, St. Louis, MO) purified Î »22365981 lipopolysaccharide (LPS) at a concentration of 1 mg / ml was used. As a negative control cytokine production in unstimulated PBMC was tested. Each stimulus type was tested in duplicate in each experiment. Culture supernatants were collected by centrifugation, fractionated and stored in aliquots at -20 ° C until detection of the cytokine. 3. Determination of cytokine markers and cellular activation

As concentrações de citoquinas (IFN-γ, IL-10, e TGF-β) dos sobrenadantes foram medidas utilizando kits ELISA da Bioscience (BD Biosciences, San Diego, CA) seguindo as instruções do fabricante. Os marcadores de moléculas de ativação foram detetados utilizando anticorpos contra HLA-DR, CD86, CD40 e CD83 marcados com FITC (eBioscience, San Diego, CA) e foram quantificados por citometria de fluxo (Flow cytometer EPICS® XL-MCL; Beckman Coulter, Florida).Cytokine (IFN-γ, IL-10, and TGF-β) concentrations of the supernatants were measured using Bioscience ELISA kits (BD Biosciences, San Diego, CA) following the manufacturer's instructions. Activation molecule markers were detected using FITC-labeled HLA-DR, CD86, CD40 and CD83 antibodies (eBioscience, San Diego, CA) and quantified by flow cytometry (Flow cytometer EPICS® XL-MCL; Beckman Coulter, Florida).

Resultados A estirpe da invenção (IATA-ES1) reduziu pelo menos em 10% a produção de IFN-γ, a principal citoquina inflamatória que é produzida em resposta a gliadinas em doentes com doença celíaca, provocada pela estimulação das células dendríticas com gliadinas e outras bactérias intestinais potencialmente pró-inflamatórias (e.g. bacteróides e enterobactérias isolados de doentes com doença celíaca). Esta estirpe também produziu um aumento na síntese da citoquina anti-inflamatória IL-10 por células dendríticas de pelo menos 200% em comparação com o efeito produzido pela estimulação com 59 ΕΡ2236598Β1 gliadinas. A estirpe da invenção (IATA-ES1) reduziu a expressão de moléculas HLA-DR e CD86, induzidas após a incubação das células dendriticas na presença de gliadina e IFN-γ, entre 15 e 20%.Results The strain of the invention (IATA-ES1) reduced at least 10% the production of IFN-γ, the major inflammatory cytokine that is produced in response to gliadins in patients with celiac disease, caused by stimulation of dendritic cells with gliadins and other potentially proinflammatory intestinal bacteria (eg bacteroids and enterobacteria isolated from patients with celiac disease). This strain also produced an increase in the synthesis of the anti-inflammatory cytokine IL-10 by dendritic cells of at least 200% compared to the effect produced by the stimulation with 59 Ρ 2236598Β1 gliadins. The strain of the invention (IATA-ES1) reduced the expression of HLA-DR and CD86 molecules, induced after incubation of the dendritic cells in the presence of gliadin and IFN-γ, between 15 and 20%.

Lisboa, 25 de Março de 2013 60Lisbon, March 25, 2013 60

Claims (15)

ΕΡ2236598Β1 REIVINDICAÇÕES 1. Estirpe de Bifidobacterium longum depositada na Colección Espanola de Cultivos Tipo (CECT) com o número de acesso CECT 7347.1. Strain of Bifidobacterium longum deposited in the Colección Española de Culturas Tipo (CECT) with access number CECT 7347. 2. Estirpe como reivindicado na reivindicação 1, na forma de células viáveis.A strain as claimed in claim 1, in the form of viable cells. 3. Estirpe como reivindicado na reivindicação 1, na forma de células não viáveis.A strain as claimed in claim 1, in the form of non-viable cells. 4. Combinação de microrganismos, que compreende a estirpe como reivindicado em qualquer das reivindicações 1 a 3 e pelo menos outro microrganismo.A combination of microorganisms, comprising the strain as claimed in any of claims 1 to 3 and at least one other microorganism. 5. Combinação de microrganismos como reivindicado na reivindicação 4, em que os outros microrganismo são B. longum ATCC 15707 ande/ou L. lactis NCD0712.A combination of microorganisms as claimed in claim 4, wherein the other microorganisms are B. longum ATCC 15707 and / or L. lactis NCD0712. 6. Sobrenadante de uma cultura ou extrato obtido do microrganismo como reivindicado em qualquer das reivindicações 1 a 3, ou da combinação de microrganismos como reivindicado nas reivindicações 4 ou 5.A supernatant of a culture or extract obtained from the microorganism as claimed in any of claims 1 to 3, or the combination of microorganisms as claimed in claims 4 or 5. 7. Utilização da estirpe B. longum como reivindicado em qualquer das reivindicações 1 a 3; ou da combinação de microrganismos como reivindicado nas reivindicações 4 ou 5; ou dos sobrenadantes ou extratos como reivindicado na reivindicação 6, para a preparação de formulações concebidas para reduzir os riscos e melhorar o estado de saúde de doentes com doenças relacionadas com a tomada de glúten. 1 ΕΡ2236598Β1Use of the B. longum strain as claimed in any one of claims 1 to 3; or the combination of microorganisms as claimed in claims 4 or 5; or supernatants or extracts as claimed in claim 6, for the preparation of formulations designed to reduce risks and improve the health status of patients with gluten-related diseases. 1 ΕΡ 2236598Β1 8. Utilização como reivindicado na reivindicação 7, para a preparação de formulações concebidas para a prevenção e/ou tratamento de doença celíaca.Use as claimed in claim 7 for the preparation of formulations designed for the prevention and / or treatment of celiac disease. 9. Utilização como reivindicado nas reivindicações 7 ou 8, em que a formulação preparada é um alimento, um nutracêutico, um suplemento, uma composição farmacêutica, um probiótico e/ou a um simbiótico.Use as claimed in claims 7 or 8, wherein the formulated formulation is a food, a nutraceutical, a supplement, a pharmaceutical composition, a probiotic and / or a symbiotic. 10. Composição nutricional que compreende a estirpe B. longum como reivindicado em qualquer das reivindicações 1 a 3, ou a combinação de microrganismos como reivindicado nas reivindicações 4 ou 5, ou os sobrenadantes ou extratos como reivindicado na reivindicação 6.A nutritional composition comprising the B. longum strain as claimed in any one of claims 1 to 3, or the combination of microorganisms as claimed in claims 4 or 5, or the supernatants or extracts as claimed in claim 6. 11. Composição como reivindicado na reivindicação 10, que adicionalmente compreende um veículo.A composition as claimed in claim 10, which further comprises a carrier. 12. Composição como reivindicado na reivindicação 11, em que o veículo é leite, iogurte, queijo, leite fermentado, derivados lácteos, cereais, cereais fermentados, sumos, gelados, e/ou formulações para crianças.A composition as claimed in claim 11, wherein the carrier is milk, yoghurt, cheese, fermented milk, dairy products, cereals, fermented cereals, juices, ice creams, and / or formulations for children. 13. Composição como reivindicado em qualquer das reivindicações 10 a 12, em que a estirpe B. longum está presente numa quantidade de cerca de 106 cfu a cerca de 109 cfu por grama ou mililitro da composição.A composition as claimed in any of claims 10 to 12, wherein the B. longum strain is present in an amount of about 106 cfu to about 109 cfu per gram or milliliter of the composition. 14. Composição como reivindicado em qualquer das reivindicações 10 a 13, em que a referida composição pode ser encontrada na forma de um comprimido, cápsula, microcápsula, pó, solução ou pasta. 2 ΕΡ2236598Β1A composition as claimed in any one of claims 10 to 13, wherein said composition can be found in the form of a tablet, capsule, microcapsule, powder, solution or paste. 2 ΕΡ 2236598Β1 15. Composição farmacêutica que compreende a estirpe de B. longum como reivindicado em qualquer das reivindicações 1 a 3 ou a combinação de microrganismos como reivindicado nas reivindicações 4 ou 5; ou os sobrenadantes ou extratos como reivindicado na reivindicação 6, em conjunto com quantidades apropriadas de excipientes farmacologicamente aceitáveis. Lisboa, 25 de Março de 2013A pharmaceutical composition comprising the B. longum strain as claimed in any one of claims 1 to 3 or the combination of microorganisms as claimed in claims 4 or 5; or the supernatants or extracts as claimed in claim 6, together with appropriate amounts of pharmacologically acceptable excipients. Lisbon, March 25, 2013
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