PL235734B1 - Method for monitoring pathogens and the system for monitoring pathogens - Google Patents

Method for monitoring pathogens and the system for monitoring pathogens Download PDF

Info

Publication number
PL235734B1
PL235734B1 PL414136A PL41413615A PL235734B1 PL 235734 B1 PL235734 B1 PL 235734B1 PL 414136 A PL414136 A PL 414136A PL 41413615 A PL41413615 A PL 41413615A PL 235734 B1 PL235734 B1 PL 235734B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
data
user
pathogen
database
possibility
Prior art date
Application number
PL414136A
Other languages
Polish (pl)
Other versions
PL414136A1 (en
Inventor
Dawid NIDZWORSKI
Dawid Nidzworski
Piotr KRYCH
Piotr Krych
Artur KUPCZUNAS
Artur Kupczunas
Original Assignee
Eton Group Spolka Z Ograniczona Odpowiedzialnoscia
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Eton Group Spolka Z Ograniczona Odpowiedzialnoscia filed Critical Eton Group Spolka Z Ograniczona Odpowiedzialnoscia
Priority to PL414136A priority Critical patent/PL235734B1/en
Priority to PCT/EP2016/072886 priority patent/WO2017055229A1/en
Priority to EP16784403.4A priority patent/EP3356823B1/en
Publication of PL414136A1 publication Critical patent/PL414136A1/en
Publication of PL235734B1 publication Critical patent/PL235734B1/en

Links

Description

Opis wynalazkuDescription of the invention

Przedmiotem niniejszego wynalazku jest sposób monitorowania patogenów oraz system do monitorowania patogenów.The present invention relates to a pathogen monitoring method and a pathogen monitoring system.

W szczególności, niniejszy wynalazek dotyczy globalnego systemu monitorowania patogenów w czasie rzeczywistym, który korzysta z danych ze środowiska i na bieżąco analizuje ogniska choroby oraz rozprzestrzenianie się danego patogenu.In particular, the present invention relates to a real-time global pathogen monitoring system that uses environmental data to analyze disease outbreaks and the spread of a given pathogen on an ongoing basis.

Z publikacji amerykańskiego zgłoszenia patentowego US20060285736A1 znany jest sposób monitorowania stanu użytkownika za pomocą serwera oraz sieci komunikacyjnej. Sposób ogólnie obejmuje następujące etapy: (A) przechowywanie informacji identyfikacyjnych w bazie danych na serwerze, przy czym informacja identyfikacyjna służy do identyfikacji przynajmniej jednego z użytkowników danego typu; (B) odbieranie danych biometrycznych użytkownika z urządzenia, przy czym urządzenie podłącza się do sieci komunikacyjnej; oraz (C) identyfikacji użytkownika jako przynajmniej jednego z użytkowników w odpowiedzi na porównanie danych biometrycznych z informacją identyfikacyjną.From the publication of the US patent application US20060285736A1 there is known a method of monitoring the state of the user by means of a server and a communication network. The method generally comprises the steps of: (A) storing the identification information in a database on the server, the identification information being used to identify at least one user of a given type; (B) receiving user biometric data from the device, the device connecting to a communication network; and (C) identifying the user as at least one of the users in response to the comparison of the biometric data with the identification information.

Z publikacji amerykańskiego patentu US6101478A znany jest system sieciowy do identyfikacji danej osoby, przekazujący informacje do danej osoby, i zdalne monitorowanie danej osoby. System składa się z serwera i stacji roboczej do wprowadzania pytań do serwera, na które odpowiadać będzie osoba. System zawiera również zdalnie programowalne urządzenie podłączone do serwera za pośrednictwem sieci komunikacyjnej. Zdalnie programowalne urządzenie współdziała z daną osobą zgodnie z programem skryptowym otrzymanym z serwera. Serwer zawiera generator skryptu do generowania programu z pytaniami wprowadzonymi przez stację roboczą. Skrypt jest odbierany i wykonywany przez zdalnie programowalne urządzenie aby zidentyfikować osobę, przekazać pytania do osoby, otrzymać odpowiedzi na pytania, przesłać odpowiedzi do serwera. Identyfikacja osoby może zostać również osiągnięta za pomocą karty danych, urządzenia zdalnego monitorowania, albo przechwytywania danych z oddzielnego systemu informacyjnego. Jako że ten wynalazek dedykowany jest wielu użytkownikom, może być stosowany w miejscach publicznych, takich jak apteka lub klinika. Obsługa wielu użytkowników umożliwia również gromadzenie i śledzenie danych użytkownika dla branży medycznej.From the publication of the US patent US6101478A, a network system for identifying a given person, transmitting information to a given person, and monitoring the person remotely is known. The system consists of a server and a workstation for inputting questions to the server that will be answered by a person. The system also includes a remotely programmable device connected to the server via a communication network. A remotely programmable device interacts with the person in accordance with the script program received from the server. The server includes a script generator for generating a program with questions entered by the workstation. The script is received and executed by a remotely programmable device to identify the person, forward questions to the person, get answers to questions, send answers to the server. The person identification can also be achieved by means of a data card, a remote monitoring device, or data capture from a separate information system. As this invention is dedicated to many users, it can be used in public places such as pharmacies or clinics. Multi-user support also enables the collection and tracking of user data for the medical industry.

Z publikacji amerykańskiego patentu US7427920B2 znany jest system monitorowania populacji, który korzysta z jednostki lokalnego zbierania danych w celu uzyskania danych o stanie fizycznym członka danej populacji. Urządzenie posiada procesor do korelowania i przechowywania danych, stanu fizycznego w czasie, oraz środki do przesyłania przechowywanych danych z procesora do zdalnych środków gromadzenia danych. Zdalne zbieranie danych uwzględnia dane dotyczące lokalizacji członka populacji w czasie, i analizy stanu oraz położenia w celu wykrycia zdarzeń, które nie są typowe. Stan fizyczny może być określany na podstawie danych z czujnika, przykładowo pomiaru poziomu tętna, temperatury i poziomu tlenu.From US patent publication US7427920B2, a population monitoring system is known which uses a local data collection unit to obtain data on the physical condition of a member of a given population. The apparatus has a processor for correlating and storing data, a physical state over time, and means for transferring the stored data from the processor to remote data collection means. Remote data collection takes into account the location data of a population member over time, and state and position analysis to detect events that are not typical. Physical condition can be determined from sensor data, such as heart rate, temperature, and oxygen levels.

Z amerykańskiego zgłoszenia patentowego US2008146956A1 znany jest sposób wykrywania, Helicobacter pylori, patogenów w układzie pokarmowym na podstawie pobranych próbek oddechowych.The US patent application US2008146956A1 discloses a method for detecting Helicobacter pylori pathogens in the digestive system on the basis of respiratory samples taken.

Opisany w nim sposób obejmuje pobranie pierwszej próby wydychanego powietrza od pacjenta, podanie mu roztworu mocznika znakowanego węglem C-13, następnie podanie odpowiedniej ilości wody w celu oczyszczenia jamy ustnej z resztek mocznika i pobranie kolejnej próbki wydychanego powietrza po czasie nie krótszym niż 5 min od podania wody.The method described in it includes taking the first sample of exhaled air from the patient, giving him a C-13-labeled urea solution, then administering a sufficient amount of water to clean the mouth of urea residues and collecting another sample of exhaled air after a time not shorter than 5 minutes after giving water.

Z amerykańskiego zgłoszenia patentowego US2008146956A1 znany jest sposób wykrywania, Helicobacter pylori, patogenów w układzie pokarmowym na podstawie pobranych próbek oddechowych.The US patent application US2008146956A1 discloses a method for detecting Helicobacter pylori pathogens in the digestive system on the basis of respiratory samples taken.

Opisany w nim sposób obejmuje pobranie pierwszej próby wydychanego powietrza od pacjenta, podanie mu roztworu mocznika znakowanego węglem C-13, następnie podanie odpowiedniej ilości wody w celu oczyszczenia jamy ustnej z resztek mocznika i pobranie kolejnej próbki wydychanego powietrza po czasie nie krótszym niż 5 min od podania wody.The method described in it includes taking the first sample of exhaled air from the patient, giving him a C-13-labeled urea solution, then administering a sufficient amount of water to clean the mouth of urea residues and collecting another sample of exhaled air after a time not shorter than 5 minutes after giving water.

Z chińskiego zgłoszenia patentowego CN104212765A znana jest linia komórkowa ludzkich komórek guza przysadki huashanc-GH, wykazująca odporność na analogi somastatyny. Linię komórkową uzyskuje się poprzez pobranie fragmentu guza od pacjenta w warunkach aspetycznych. Pobrany fragment przemywa się sterylnym PBS 2-3 razy, usuwa się tkankę łączną, martwicową i zakrzepy. Następnie tnie się go na mniejsze fragmenty i dodaje się trypsyny. Następnym etapem jest trawienie, przeprowadzane w czasie 30-50 min i temperaturze 37°C. Po trawieniu komórki się flirtuje, odwirowuje, inokuluje i pasażuje do 50 pokolenia.Tak otrzymane komórki znajdują zastosowanie w badaniach przesiewowych leków do leczenia czy środków bioterapeutycznych guzów przysadki.From the Chinese patent application CN104212765A, a human huashanc-GH pituitary tumor cell line is known to exhibit resistance to somastatin analogs. A cell line is obtained by aspirating a tumor fragment from a patient. The collected fragment is washed with sterile PBS 2-3 times, connective tissue, necrotic tissue and blood clots are removed. Then it is cut into smaller pieces and trypsin is added. The next step is digestion, carried out for 30-50 min at 37 ° C. After digestion, cells are flirted, centrifuged, inoculated and passaged for up to 50 generations. Cells obtained in this way are used in screening drugs for the treatment or biotherapeutic agents of pituitary tumors.

PL 235 734 B1PL 235 734 B1

Wady znanych systemów to wykonywanie pomiarów oraz analiz na każdej osobie indywidualnie. Jednak istnieją przypadki, gdy wskazana byłaby globalna analiza lub selektywna analiza wybranych przedstawicieli populacji.The disadvantages of known systems are the measurement and analysis of each person individually. However, there are cases where a global analysis or selective analysis of selected population representatives would be advisable.

Biorąc pod uwagę opisany stan techniki, istnieje potrzeba zaprojektowania oraz implementacji efektywnego sposobu oraz systemu monitorowania patogenów, który monitoruje rozprzestrzenianie się zakażeń oraz przewidującego postępy rozwoju epidemii lub pandemii.Taking into account the described state of the art, there is a need to design and implement an effective pathogen monitoring method and system that monitors the spread of infections and predicts the progress of the epidemic or pandemic.

Przedmiotem wynalazku jest realizowany przy pomocy systemu komputerowego sposób monitorowania patogenów charakteryzujący się tym, że obejmuje następujące kroki: pobiera się dane testów dla monitorowanych patogenów za pomocą czytników testów i tworzy się powiązanie użytkownika z wynikiem testu; pobiera się dane geolokalizacji, powiązane z testami i przypisane do wskazanych użytkowników; dla testów z wynikami pozytywnymi, znając dane użytkownika, pobiera się dane społecznościowe użytkowników i analizuje się dane społecznościowe każdego z użytkowników w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu; analizuje się dane demograficzne, powiązane z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu; analizuje się dane geolokalizacyjne, powiązane z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu; analizuje się dane klimatyczne, powiązane z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu; oraz określa się, na podstawie wspomnianych analiz, kierunki rozwoju epidemii związanej z monitorowanymi patogenami.The present invention relates to a computer-implemented pathogen monitoring method characterized in that it comprises the following steps: collecting test data for the pathogens monitored with test readers and linking the user to the test result; geolocation data related to tests and assigned to indicated users are downloaded; for positive tests, knowing the user data is taken, the social data of the users is taken and the social data of each user is analyzed to determine the possibility of the pathogen spreading; demographic data related to a given user is analyzed in order to determine the possibility of spreading the pathogen; geolocation data related to a given user is analyzed in order to determine the possibility of spreading the pathogen; the climatic data associated with a given user is analyzed in order to determine the possibility of the spread of the pathogen; and on the basis of the above-mentioned analyzes, the directions of the epidemic development related to the monitored pathogens are determined.

Korzystnie, pobiera się dane demograficzne obejmujące wielkość aglomeracji i/lub rodzaj zabudowy i/lub skłonność do migracji i/lub dojazdów do pracy do innych lokalizacji i/lub wiek populacji.Preferably, demographic data including the size of the agglomeration and / or the type of development and / or the propensity to migrate and / or commute to other locations and / or the age of the population are collected.

Korzystnie, pobiera się dane klimatyczne obejmujące kierunek wiatru i/lub temperaturę i/lub nasłonecznienie i/lub wilgotność.Preferably, climatic data including wind direction and / or temperature and / or sun and / or humidity are collected.

Korzystnie, pobiera się dane społecznościowe każdego z użytkowników dotyczące miejsca lokalizacji użytkownika w przeszłości i/lub planów użytkowników dotyczących zmiany ich lokalizacji.Preferably, social data of each user are collected regarding the user's past location and / or the users' plans to change their location.

Przedmiotem wynalazku jest ponadto komputerowy system do monitorowania patogenów charakteryzujący się tym, że zawiera: dwukierunkową magistralę danych łączącą układy systemu; bazę danych użytkowników; bazę danych demograficznych; bazę danych klimatycznych; układ komunikacji z czytnikami testów umożliwiający pobranie dane z czytników; oraz analizator przystosowany do: pobierania danych testów dla monitorowanych patogenów za pomocą czytników testów i tworzenia powiązania użytkownika z wynikiem testu w bazie danych użytkowników; pobierania danych geolokalizacji powiązanych z testami i przypisywania ich do wskazanych użytkowników w bazie danych użytkowników; pobierania, dla testów z wynikami pozytywnymi, na podstawie danych użytkownika, z bazy danych użytkowników danych społecznościowych użytkowników i analizowania danych społecznościowych każdego z użytkowników w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu; analizowania danych demograficznych z bazy danych demograficznych, powiązanych z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu; analizowania danych geolokalizacyjnych z bazy danych użytkowników, powiązanych z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu; analizowania danych klimatycznych z bazy danych klimatycznych, powiązanych z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu; oraz określania, na podstawie wspomnianych analiz, kierunków rozwoju epidemii związanej z monitorowanymi patogenami.The invention further relates to a computerized pathogen monitoring system, characterized in that it comprises: a bi-directional data bus connecting the system circuits; user database; demographic database; climate database; communication system with test readers enabling data to be downloaded from the readers; and an analyzer adapted to: retrieve test data for the pathogens monitored with test readers and associate the user with the test result in a user database; downloading geolocation data related to tests and assigning them to specific users in the user database; download, for positive testing, with user data, from the user database of user social data, and analyze each user social data to determine the potential for spread of the pathogen; analyzing the demographic data from the demographic database associated with a given user in order to determine the possibility of the spread of the pathogen; analyzing geolocation data from the user database associated with a given user in order to determine the possibility of spreading the pathogen; analyze climate data from a climate database associated with a given user to determine the potential for the spread of the pathogen; and on the basis of the aforementioned analyzes, the directions of the epidemic development related to the monitored pathogens.

Przedmiot wynalazku został przedstawiony w przykładzie wykonania na rysunkach, na których:The subject of the invention is presented in an exemplary embodiment in the drawings, where:

Fig. 1 przedstawia przykład testu diagnostycznego według wynalazku;Fig. 1 shows an example of a diagnostic test according to the invention;

Fig. 2 przedstawia czytnik umożliwiający odczytanie wyników testu;Fig. 2 shows a reader for reading the test results;

Fig. 3 przedstawia sposób według wynalazku; orazFig. 3 shows a method according to the invention; and

Fig. 4 przedstawia system informatyczny według wynalazku.Fig. 4 shows a computer system according to the invention.

Globalny system monitorowania patogenów według wynalazku, składa się z trzech elementów: (A) Testu diagnostycznego; (B) Czytnika umożliwiającego odczytanie wyników testu; oraz (C) Oprogramowania analizującego rozprzestrzenianie się zakażeń oraz przewidującego postępy rozwoju epidemii lub pandemii.The global pathogen monitoring system of the invention is comprised of three components: (A) A diagnostic test; (B) A reader that allows you to read the test results; and (C) Software that analyzes the spread of infection and forecast the progress of an epidemic or pandemic.

Przykład testu diagnostycznego według wynalazku został pokazany na Fig. 1. Testem diagnostycznym jest mikroczujnik (101) wykorzystujący oddziaływania pomiędzy komponentami biologicznymi/chemicznymi fragmentów patogenów z elementami biologicznymi/chemicznymi znajdującymi się na powierzchni elektrody (102) (np. przeciwciała anty-M1 do wykrywania wirusa grypy typu A, przeciwciała anty-GP do wykrywania wirusa Ebola, fragment komplementarny DNA do wykrywania materiału genetycznego o konkretnej sekwencji).An example of a diagnostic test according to the invention is shown in Fig. 1. The diagnostic test is a microsensor (101) using interactions between biological / chemical components of pathogen fragments with biological / chemical elements on the electrode surface (102) (e.g. anti-M1 antibodies for detection influenza A virus, anti-GP antibodies to detect Ebola virus, DNA complementary fragment to detect genetic material of a specific sequence).

PL 235 734 B1PL 235 734 B1

Testy wykonuje się poprzez nadrukowanie na materiał bazowy (103) papier lub plastik lub szkło, elektrody złotej lub srebrnej lub platynowej lub węglowej lub przewodzącej pasty organicznej. Następnie daną elektrodę modyfikuje się chemicznie poprzez dodanie odpowiednich grup funkcyjnych a następnie właściwego elementu biologicznego (np. przeciwciał) i/lub chemicznego (np. DNA). Test zakończony jest połączeniem (104) umożliwiającym włożenie testu do czytnika. Pomiar obecności patogenu w próbce odbywa się metodami: elektrochemiczną spektroskopią impedancyjną i/lub woltamperomerią cykliczną i/lub pomiaru z wykorzystaniem mikrowag kwarcowych i/lub zmiany absorpcji światła i/lub zmiany emisji światła.The tests are performed by printing on a base material (103) paper or plastic or glass, gold or silver or platinum or carbon electrodes or conductive organic paste. The given electrode is then chemically modified by adding appropriate functional groups followed by the appropriate biological (e.g. antibodies) and / or chemical (e.g. DNA) element. The test ends with a connection (104) for inserting the test into the reader. The presence of the pathogen in the sample is measured using the following methods: electrochemical impedance spectroscopy and / or cyclic voltamperomerism and / or measurement using quartz microbalances and / or changes in light absorption and / or changes in light emission.

Wykonanie testu polega na pobraniu materiału biologicznego od pacjenta (wymazu z gardła lub kropli krwi) a następnie umieszczenie w buforze, którego celem jest rozbicie patogenu na podjednostki badane w teście (np. białko M1 w przypadku wirusa grypy lub białko GP w przypadku wirusa Ebola). Następnie nanosi się bufor na komorę w mikroczujniku i następuję pomiar z wykorzystaniem czytnika.The test is performed by taking biological material from the patient (a throat swab or a drop of blood) and then placing it in a buffer, the purpose of which is to break down the pathogen into subunits tested in the test (e.g. M1 protein in the case of the influenza virus or GP protein in the case of Ebola virus) . Then, the buffer is applied to the chamber in the microsensor and the measurement is carried out using a reader.

Fig. 2 przedstawia czytnik umożliwiający odczytanie wyników testu. Niniejszy wynalazek może korzystać z dwóch rodzajów czytników: stacjonarny (samodzielny) oraz mikroczytnik komunikujący się z urządzeniem zewnętrznym typu smartphone, telefon, tablet czy inne urządzenie posiadające oprogramowanie.Fig. 2 shows a reader for reading the test results. The present invention can use two types of readers: stationary (standalone) and a microprocessor communicating with an external device such as a smartphone, telephone, tablet or other device with software.

Oba czytniki posiadają układ pomiarowy (206) dający możliwość odczytania wyników testów poprzez pomiar: zmian impedancji i/lub zmian częstotliwości rezonansowej i/lub zmian absorbancji i/lub zmian fluorescencji. W tym celu łączy się komunikacyjnie test z czytnikiem (201).Both readers have a measurement system (206) that allows the test results to be read by measuring: changes in impedance and / or changes in resonance frequency and / or changes in absorbance and / or changes in fluorescence. For this, a test is communicating with the reader (201).

Czytnik stacjonarny wyposażony jest ponadto w moduł komunikacji dwukierunkowej (202) np. bezprzewodowej Wi-Fi i/lub GPRS i/lub GPS i/lub bluetooth umożliwiające zdalne przekazywanie informacji o wyniku do centralnego komputera poprzez bazę danych oraz specjalne oprogramowanie. W przypadku wyposażenia czytnika w moduł geolokalizacji, geolokalizacja czytnika jest powiązana z danym testem użytkownika, który, korzystnie, identyfikuje się przed odczytem testu.The stationary reader is further equipped with a two-way communication module (202), e.g. wireless Wi-Fi and / or GPRS and / or GPS and / or bluetooth, enabling remote transmission of information about the result to a central computer via a database and special software. When the reader is equipped with a geolocation module, the geolocation of the reader is associated with a given user test, which preferably identifies itself before reading the test.

Oprogramowanie oraz dane odczytane przez czytnik są przechowywane w pamięci odczytywalnej przez komputer (203) a sterowanie procesami pobrania oraz wysłania danych odbywa się za pomocą kontrolera (204).The software and the data read by the reader are stored in a computer readable memory (203) and the download and upload processes are controlled by the controller (204).

Mikroczytnik poprzez podłączenie do urządzenia zewnętrznego komunikuje się z bazą danych i przekazuje informacje do centralnego komputera. Wynik testu odczytywany jest za pomocą specjalnej aplikacji (205).By connecting to an external device, the microprocessor communicates with the database and transmits information to the central computer. The test result is read using a special application (205).

Układy czytnika, korzystnie, komunikują się między sobą za pomocą odpowiedniej dwukierunkowej magistrali danych (207).The reader circuits preferably communicate with each other over a suitable bi-directional data bus (207).

System informatyczny, według niniejszego wynalazku, pozwala na monitoring rozprzestrzeniania się patogenów w czasie rzeczywistym dzięki zbieraniu informacji z poszczególnych czytników za pomocą ich modułów komunikacji dwukierunkowej (202). System przewiduje rozprzestrzenianie się patogenów uwzględniając czynniki takie jak, np.: wielkość aglomeracji, miejsce pobytu pacjenta, rodzaj zabudowy, pogodę (kierunek wiatru, temperaturę, nasłonecznienie bądź wilgotność i tym samym przeżywalność patogenów w danym środowisku), komunikację publiczną (połączenia linii autobusowych, kolejowych a przede wszystkim lotniczych), dane udostępnione przez użytkowników (miejsca ich lokalizacji z 48 godzin przed infekcją na podstawie mediów w społecznościowych, konta pocztowego etc.), najbliższe plany udostępnione przez użytkownika (kontakty, kalendarz). System ten pozwala określić, z dużą precyzją, kierunki rozwoju ewentualnej epidemii czy pandemii.The computerized system according to the present invention allows real-time monitoring of the spread of pathogens by collecting information from individual readers with their two-way communication modules (202). The system provides for the spread of pathogens taking into account factors such as, for example: the size of the agglomeration, the patient's place of stay, type of building, weather (wind direction, temperature, sunlight or humidity, and thus the survival of pathogens in a given environment), public transport (bus connections, railway and, above all, air), data provided by users (places of their location from 48 hours before the infection based on social media, e-mail account, etc.), upcoming plans provided by the user (contacts, calendar). This system allows to define, with great precision, the directions of development of a possible epidemic or pandemic.

System korzysta z danych ze środowiska i na bieżąco analizuje ogniska choroby oraz rozprzestrzenianie się danego patogenu.The system uses data from the environment and analyzes disease outbreaks and the spread of a given pathogen on an ongoing basis.

Fig. 3 przedstawia sposób według wynalazku. Proces rozpoczyna się w kroku (301) od pobrania danych testów za pomocą czytników stacjonarnych lub mikroczytników opisanych w odniesieniu do Fig. 2. Każdy z użytkowników zostaje powiązany z wynikiem testu.Fig. 3 shows the method according to the invention. The process begins in step (301) with retrieving the test data with the desktop readers or micro-engravers described with reference to Fig. 2. Each user is associated with a test result.

Dalej, w kroku (302), pobiera się dane geolokalizacji, powiązane z testami i przypisane do wskazanych użytkowników. Dane te zapisywane są w bazie danych systemu informatycznego.Next, in step (302), geolocation data related to the tests and assigned to the indicated users is retrieved. These data are stored in the database of the IT system.

Następnie, dla testów z wynikami pozytywnymi, w kroku (303) znając dane użytkownika, pobiera się dane społecznościowe użytkowników a w kroku (304) analizuje się dane społecznościowe każdego z użytkowników w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu. Dzięki tym informacjom można poznać miejsca lokalizacji użytkowników w przeszłości i/lub plany użytkowników dotyczące zmiany ich lokalizacji.Then, for the positive tests, in step (303), knowing the user data, the social data of the users is retrieved, and in step (304) the social data of each user is analyzed to determine the possibility of spreading the pathogen. With this information, it is possible to know where users have been located in the past and / or users' plans to change their location.

Dalej, w kroku (305), analizuje się dane demograficzne, powiązane z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu. Dane demograficzne to przykładowoFurther, in step (305), the demographic data associated with the given user is analyzed to determine the possibility of spreading the pathogen. Demographic information is for example

PL 235 734 B1 wielkość aglomeracji, rodzaj zabudowy, skłonność do migracji, dojazdów do pracy do innych lokalizacji, wiek populacji itp.The size of the agglomeration, type of development, tendency to migrate, commuting to other locations, age of the population, etc.

Następnie, w kroku (306), analizuje się dane geolokalizacyjne, powiązane z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu. Tutaj brana jest pod uwagę aktualna pozycja użytkownika, lub pozycja podana podczas przekazania wyników testu do systemu informatycznego. Jeśli użytkownik korzystał z mikroczytnika, system informatyczny może połączyć się z tym mikroczytnikiem w celu odczytania jego aktualnej geolokalizacji.Then, in step (306), the geolocation data associated with the given user is analyzed to determine the possibility of spreading the pathogen. Here, the current position of the user is taken into account, or the position entered during the transfer of the test results to the IT system. If the user has used the microprocessor, the IT system can connect to the microprocessor in order to read its current geolocation.

Dalej, w kroku (307), analizuje się dane klimatyczne, powiązane z danym użytkownikiem (lokalizacją), w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu. Dane klimatyczne mogą obejmować kierunek wiatru, temperaturę, nasłonecznienie bądź wilgotność i podobne, tym samym wskazywać przeżywalność patogenów w danym środowisku.Further, in step (307), the climatic data associated with a given user (location) is analyzed to determine the possibility of spreading the pathogen. Climatic data may include wind direction, temperature, sunshine or humidity and the like, thereby indicating the viability of pathogens in a given environment.

Końcowym etapem (308) jest określenie, na podstawie analiz z punktów (304-307 kierunków rozwoju ewentualnej epidemii czy pandemii.The final stage (308) is to determine, on the basis of analyzes from points (304-307), the development directions of a possible epidemic or pandemic.

Fig. 4 przedstawia system informatyczny według wynalazku. Układy systemu, korzystnie, komunikują się między sobą za pomocą odpowiedniej dwukierunkowej magistrali danych (407).Fig. 4 shows a computer system according to the invention. The system circuits preferably communicate with each other via a suitable bi-directional data bus (407).

System zawiera, zgodnie ze sposobem opisanym na Fig. 3, bazę danych użytkowników (405), bazę danych demograficznych (402) oraz bazę danych klimatycznych (406).The system comprises, according to the method described in Fig. 3, a user database (405), a demographic database (402) and a climate database (406).

Baza danych użytkowników (405) zawiera informacje o użytkownikach takie jak: dane identyfikacyjne, dane biometryczne, dane o historii chorób, miejsce pobytu pacjenta/użytkownika teraz i w przeszłości (dane geolokalizacyjne), plany podróży na najbliższy czas pobrane z kalendarza lub opisów na portalach społecznościowych, dane społecznościowe (przykładowo osoby, z którymi się kontaktuje i ewentualnie miejsca zamieszkania i/lub miejsca odwiedzane przez te osoby).The user database (405) contains information about users such as: identification data, biometric data, data on medical history, whereabouts of the patient / user now and in the past (geolocation data), travel plans for the nearest future taken from the calendar or descriptions on social networks , social data (for example, contact persons and possibly places of residence and / or places visited by these persons).

Baza danych demograficznych (402) zawiera informacje o wielkości aglomeracji w której przebywa użytkownik, rodzaju zabudowy, wieku populacji, liczby i rodzaju zachorowań, komunikacji publicznej (połączenia linii autobusowych, kolejowych, lotniczych), skłonności do migracji i/lub dojazdów do pracyThe demographic database (402) contains information on the size of the agglomeration in which the user resides, the type of buildings, the age of the population, the number and type of disease, public transport (bus, rail, airline connections), tendency to migrate and / or commute to work

Baza danych klimatycznych (406) zawiera informacje o kierunku wiatru, temperaturze, nasłonecznieniu, wilgotności powietrza, ewentualnych opadów - zarówno są to dane historyczne, obecne jak i prognozowane.The climate database (406) contains information on wind direction, temperature, sunshine, air humidity, possible precipitation - both historical, current and forecast data.

Układ komunikacji z czytnikami testów (401) umożliwia pobranie danych z czytników a kontroler/analizator steruje całym procesem zgodnie z krokami sposobu przedstawionego na Fig. 3.The communication system with the test readers (401) allows the data to be retrieved from the readers and the controller / analyzer controls the overall process according to the steps of the method shown in Fig. 3.

Claims (5)

1. Realizowany przy pomocy systemu komputerowego sposób monitorowania patogenów znamienny tym, że obejmuje następujące kroki:1. A computer-based pathogen monitoring method, characterized in that it comprises the following steps: - pobiera się dane testów dla monitorowanych patogenów za pomocą czytników testów i tworzy się powiązanie użytkownika z wynikiem testu;- test data for the monitored pathogens is retrieved using test readers and a user is linked to the test result; - pobiera się dane geolokalizacji, powiązane z testami i przypisane do wskazanych użytkowników;- geolocation data is downloaded, related to the tests and assigned to the indicated users; - dla testów z wynikami pozytywnymi, znając dane użytkownika, pobiera się dane społecznościowe użytkowników i analizuje się dane społecznościowe każdego z użytkowników w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu;- for positive tests, knowing the user data, the social data of the users is taken and the social data of each user is analyzed to determine the possibility of spreading the pathogen; - analizuje się dane demograficzne, powiązane z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu;- demographic data related to a given user are analyzed in order to determine the possibility of spreading the pathogen; - analizuje się dane geolokalizacyjne, powiązane z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu;- geolocation data related to a given user is analyzed in order to determine the possibility of spreading the pathogen; - analizuje się dane klimatyczne, powiązane z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu;- climatic data related to a given user are analyzed in order to determine the possibility of the spread of the pathogen; - oraz określa się, na podstawie wspomnianych analiz, kierunki rozwoju epidemii związanej z monitorowanymi patogenami.- and on the basis of the aforementioned analyzes, the directions of the epidemic related to the monitored pathogens are determined. 2. Sposób według zastrz. 1 znamienny tym, że pobiera się dane demograficzne obejmujące wielkość aglomeracji i/lub rodzaj zabudowy i/lub skłonność do migracji i/lub dojazdów do pracy do innych lokalizacji i/lub wiek populacji.2. The method according to p. Method according to claim 1, characterized in that demographic data including the size of the agglomeration and / or the type of development and / or the propensity to migrate and / or commute to other locations and / or the age of the population are collected. PL 235 734 B1PL 235 734 B1 3. Sposób według zastrz. 1 znamienny tym, że pobiera się dane klimatyczne obejmujące kierunek wiatru i/lub temperaturę i/lub nasłonecznienie i/lub wilgotność.3. The method according to p. The method of claim 1, characterized in that the climatic data including wind direction and / or temperature and / or sun and / or humidity are taken. 4. Sposób według zastrz. 1 znamienny tym, że pobiera się dane społecznościowe każdego z użytkowników dotyczące miejsca lokalizacji użytkownika w przeszłości i/lub planów użytkowników dotyczących zmiany ich lokalizacji.4. The method according to p. The method of claim 1, wherein the social data of each user is downloaded regarding the user's past location and / or the users' plans to change their location. 5. Komputerowy system do monitorowania patogenów znamienny tym, że zawiera:5. A computerized pathogen monitoring system, characterized in that it comprises: - dwukierunkową magistralę danych (407) łączącą układy systemu;- a bi-directional data bus (407) connecting the system circuits; - bazę danych użytkowników (405);- user database (405); - bazę danych demograficznych (402);- demographic database (402); - bazę danych klimatycznych (406);- climate database (406); - układ komunikacji z czytnikami testów (401) umożliwiający pobranie dane z czytników; oraz- a communication system with the test readers (401) enabling data to be retrieved from the readers; and - analizator (404) przystosowany do:- analyzer (404) adapted to: - pobierania danych testów dla monitorowanych patogenów za pomocą czytników testów (401) i tworzenia powiązania użytkownika z wynikiem testu w bazie danych użytkowników (405);- retrieving test data for the monitored pathogens with test readers (401) and associating the user with the test result in a user database (405); - pobierania danych geolokalizacji powiązanych z testami i przypisywania ich do wskazanych użytkowników w bazie danych użytkowników (405);- retrieving geolocation data related to the tests and assigning them to specific users in the user database (405); - pobierania, dla testów z wynikami pozytywnymi, na podstawie danych użytkownika, z bazy danych użytkowników (405) danych społecznościowych użytkowników i analizowania danych społecznościowych każdego z użytkowników w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu;- downloading, for positive testing, on the basis of user data, from the user database (405) of the social data of the users and analyzing the social data of each user to determine the possibility of spreading the pathogen; - analizowania danych demograficznych z bazy danych demograficznych (402), powiązanych z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu;- analyzing the demographic data from the demographic database (402) associated with the given user in order to determine the possibility of the spread of the pathogen; - analizowania danych geolokalizacyjnych z bazy danych użytkowników (405), powiązanych z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu;- analyzing geolocation data from the user database (405) associated with the user in order to determine the possibility of the spread of the pathogen; - analizowania danych klimatycznych z bazy danych klimatycznych (406), powiązanych z danym użytkownikiem, w celu określenia możliwości rozprzestrzeniania się patogenu; oraz- analyzing climatic data from the climate database (406) associated with a given user in order to determine the potential for spread of the pathogen; and - określania, na podstawie wspomnianych analiz, kierunków rozwoju epidemii związanej z monitorowanymi patogenami.- determining, on the basis of the above-mentioned analyzes, the directions of the epidemic related to the monitored pathogens.
PL414136A 2015-09-28 2015-09-28 Method for monitoring pathogens and the system for monitoring pathogens PL235734B1 (en)

Priority Applications (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL414136A PL235734B1 (en) 2015-09-28 2015-09-28 Method for monitoring pathogens and the system for monitoring pathogens
PCT/EP2016/072886 WO2017055229A1 (en) 2015-09-28 2016-09-27 A modified bdd substrate and its use as an impedance sensor for detection of biological molecules and a system and method for monitoring pathogens
EP16784403.4A EP3356823B1 (en) 2015-09-28 2016-09-27 A modified bdd substrate and its use as an impedance sensor for detection of biological molecules and a system and method for monitoring pathogens

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL414136A PL235734B1 (en) 2015-09-28 2015-09-28 Method for monitoring pathogens and the system for monitoring pathogens

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL414136A1 PL414136A1 (en) 2017-04-10
PL235734B1 true PL235734B1 (en) 2020-10-19

Family

ID=58463527

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL414136A PL235734B1 (en) 2015-09-28 2015-09-28 Method for monitoring pathogens and the system for monitoring pathogens

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL235734B1 (en)

Also Published As

Publication number Publication date
PL414136A1 (en) 2017-04-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11257215B2 (en) Systems and methods for collecting and transmitting assay results
US20160363550A1 (en) Mobile sample analysis system, mobile measurement device, and method for providing analysis results
US20130080071A1 (en) Systems and methods for sample processing and analysis
US11614439B2 (en) Method and devices for detecting viruses and bacterial pathogens
JP2021118734A (en) Systems for detection
CN106102505B (en) The more equipment of collapsible enclosure integrated-type
Priambodo et al. Monitoring self-isolation patient of COVID-19 with Internet of Things
Shilpa et al. Exploring the benefits of sensors in internet of everything (IoE)
CN109922732B (en) Diagnostic system and method
JP2016188862A (en) Biomarker monitoring system
KR20150102486A (en) System and method for performing diagnosis of domestic animal disease
US20240081677A1 (en) Method and devices for detecting viruses and bacterial pathogens
PL235734B1 (en) Method for monitoring pathogens and the system for monitoring pathogens
US9817007B2 (en) Method and apparatus for real-time detection of human cannabinoid intoxication
US11896372B2 (en) Device for reading, processing and transmitting test result data for pathogens or viruses in fluid test samples
US11892425B2 (en) Device for reading, processing and transmitting test result data for pathogens or viruses in fluid test samples
US20230264196A1 (en) Digital analysis system
Li et al. Noninvasive Breath Analysis Using NASA E-Nose Technology for Health Assessment
AU2021104312A4 (en) Smart covid-19 testing booth automation system
Zhou et al. IoT based portable impedance biosensor for rapid detection of foodborne pathogen
Karanasiou et al. HEARTEN: An integrated mHealth platform for holistic HF management
KR20180039965A (en) Apparatus for animal blood testing and control method thereof
WO2022245542A2 (en) Method and devices for detecting viruses and bacterial pathogens
Koley et al. Biochips Technology
JP2023061279A (en) Virus inspection system, virus inspection method, and virus sample collecting method