PL230884B1 - Helper plasmid, the strain and the system of the broad host spectrum plasmid mobilization and use thereof - Google Patents

Helper plasmid, the strain and the system of the broad host spectrum plasmid mobilization and use thereof

Info

Publication number
PL230884B1
PL230884B1 PL400718A PL40071812A PL230884B1 PL 230884 B1 PL230884 B1 PL 230884B1 PL 400718 A PL400718 A PL 400718A PL 40071812 A PL40071812 A PL 40071812A PL 230884 B1 PL230884 B1 PL 230884B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
plasmid
plasmids
mobilized
pctx
seq
Prior art date
Application number
PL400718A
Other languages
Polish (pl)
Other versions
PL400718A1 (en
Inventor
Michał DMOWSKI
Michał Dmowski
Izabela KERN-ZDANOWICZ
Izabela Kern-Zdanowicz
Original Assignee
Inst Biochemii I Biofizyki Polskiej Akademii Nauk
Instytut Biochemii I Biofizyki Polskiej Akademii Nauk
Lkb Biotech Violetta Kochmanska I Marek Welnicki Spólka Jawna
Lkb Biotech Violetta Kochmańska I Marek Wełnicki Spółka Jawna
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Inst Biochemii I Biofizyki Polskiej Akademii Nauk, Instytut Biochemii I Biofizyki Polskiej Akademii Nauk, Lkb Biotech Violetta Kochmanska I Marek Welnicki Spólka Jawna, Lkb Biotech Violetta Kochmańska I Marek Wełnicki Spółka Jawna filed Critical Inst Biochemii I Biofizyki Polskiej Akademii Nauk
Priority to PL400718A priority Critical patent/PL230884B1/en
Priority to PCT/IB2013/058368 priority patent/WO2014037917A1/en
Publication of PL400718A1 publication Critical patent/PL400718A1/en
Publication of PL230884B1 publication Critical patent/PL230884B1/en

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/64General methods for preparing the vector, for introducing it into the cell or for selecting the vector-containing host
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli

Abstract

Wynalazek dotyczy plazmidu pomocniczego do mobilizacji, który obejmuje część mobilizującą systemu koniugacyjnego plazmidu pCTX-M3 (geny regionów tra i trb) oraz szczepu bakteryjnego do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy zawierającego wintegrowaną w chromosom bakteryjny część mobilizującą systemu koniugacyjnego (geny regionów tra i trb). Wynalazek dotyczy również systemów do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy obejmujących ten plazmid albo szczep bakteryjny oraz plazmid mobilizowany zawierający oriT o sekwencji nukleotydowej kompatybilnej z tym systemem.The invention relates to a mobilization helper plasmid which includes the mobilizing part of the pCTX-M3 conjugation system (tra and trb region genes) and a bacterial strain for efficient mobilization of broad host spectrum plasmids comprising the mobilizing part of the conjugation system (tra and trb region genes) integrated into the bacterial chromosome ). The invention also relates to systems for the efficient mobilization of plasmids with a broad spectrum of hosts comprising said plasmid or bacterial strain and a mobilized plasmid containing oriT having a nucleotide sequence compatible with said system.

Description

Opis wynalazkuDescription of the invention

Przedmiotem wynalazku są plazmidy pomocnicze do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy, szczepy bakteryjne do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy zawierające wintegrowaną w chromosom bakteryjny część mobilizującą systemu koniugacyjnego, system do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy obejmujący ten plazmid lub szczep bakteryjny oraz plazmid mobilizowany zawierający oriT o sekwencji nukleotydowej współdziałającej z tym systemem ich zastosowania oraz zestaw molekularny je zawierający.The invention relates to helper plasmids for the efficient mobilization of plasmids with a broad host spectrum, bacterial strains for the efficient mobilization of plasmids with a broad host spectrum, containing a bacterial chromosome-integrated mobilizing part of the conjugation system, a system for efficient mobilization of broad host-spectrum plasmids including this plasmid or bacterial strain, and a mobilized plasmid containing the oriT with a nucleotide sequence interacting with this system of their use and the molecular assembly containing them.

Plazmid pCTX-M3 został wyizolowany z klinicznego szczepu Citrobacter freundii w Polsce w 1996 roku jako wektor przenoszący gen blacTx-M-3, kodujący nowoodkrytą β-laktamazę o rozszerzonym spektrum substratowym typu CTX-M (Gniadkowski i wsp., 1998, Antimicrob. Agents Chemother., 42:827-832). Wkrótce został on jeszcze znaleziony w 15 ośrodkach szpitalnych w Polsce w 7 różnych gatunkach bakterii Enterobacteriaceae: Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Enterobacter cloacae, Morganella morganii, Serratia marcescens i Salmonella enterica (Baraniak i wsp., 2002, Antimicrob. Agents Chemother., 46:151-159). Wykazano również, że plazmid pCTX-M3 ma bardzo szeroki zakres gospodarzy i ulega replikacji w przedstawicielach α-, β- i γ- Proteobacteria (Mierzejewska i wsp., 2007, Plasmid, 57:95-107). W optymalnych warunkach co dziesiąta komórka E. coli niosąca plazmid pCTX-M3 może stać się jego dawcą w czasie koniugacji (Gołębiewski i wsp., 2007, Antimicrob. Agents Chemother., 51: 3789-3795), co więcej, transfer koniugacyjny tego plazmidu jest możliwy, choć z niską częstością, także z komórek Agrobacterium tumefaciens (a-Proteobacteria) do E. coli (γ-Proteobacteria) (M. Gołębiewski, dane niepublikowane).The plasmid pCTX-M3 was isolated from the clinical strain Citrobacter freundii in Poland in 1996 as a vector carrying the blacTx-M-3 gene, encoding the newly discovered β-lactamase with an extended substrate spectrum of the CTX-M type (Gniadkowski et al., 1998, Antimicrob. Agents) Chemother., 42: 827-832). Soon it was found in 15 hospital centers in Poland in 7 different species of Enterobacteriaceae bacteria: Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Enterobacter cloacae, Morganella morganii, Serratia marcescens and Salmonella enterica (Baraniak et al., 2002, Antimicrob. Agents Chemothericrob. Agents. ., 46: 151-159). It has also been shown that the plasmid pCTX-M3 has a very wide host range and replicates in representatives of the α-, β- and γ- Proteobacteria (Mierzejewska et al., 2007, Plasmid, 57: 95-107). Under optimal conditions, every tenth E. coli cell carrying the pCTX-M3 plasmid can donate it during conjugation (Gołębiewski et al., 2007, Antimicrob. Agents Chemother., 51: 3789-3795), and moreover, the conjugation transfer of this plasmid it is possible, albeit with a low frequency, also from Agrobacterium tumefaciens cells (a-Proteobacteria) to E. coli (γ-Proteobacteria) (M. Gołębiewski, unpublished data).

Sekwencja nukleotydowa plazmidu pCTX-M3 została ustalona, opisana i zdeponowana w banku genów GenBank pod numerem akcesyjnym AF550415. Plazmid ten niesie pojedynczy replikon typu IncL/M i koduje system koniugacyjny, którego geny są zlokalizowane w dwóch regionach tra i trb, a ich białkowe produkty wykazują podobieństwo od 30 do 60% do białek kodowanych w plazmidzie Collb-P9 z rodziny Incll (dotąd słabo zbadana grupa systemów koniugacyjnych T4BSS), charakteryzującej się wąskim zakresem gospodarzy. Transfer koniugacyjny to zjawisko powszechnie występujące wśród bakterii, odpowiedzialne za ich szybką zmienność, a także kluczowe w horyzontalnym rozprzestrzenianiu się genów w biosferze. Polega ono na przekazaniu odpowiednio przygotowanego DNA z komórki dawcy do komórki biorcy po tym, jak nastąpi między nimi bezpośredni fizyczny kontakt i utworzy się między nimi struktura zwana mostem koniugacyjnym. Posiadanie plazmidu koniugacyjnego lub transpozonu koniugacyjnego jest warunkiem koniecznym dla komórki bakterii do tego, żeby została dawcą w procesie koniugacji. Efektem transferu koniugacyjnego pomiędzy dawcą i biorcą jest powstanie transkoniugantów, komórek biorcy wzbogaconych o cechy kodowane przez DNA otrzymany od dawcy. Należy przy tym podkreślić, że DNA plazmidu przekazywanego drogą koniugacji „ucieka” działaniu systemu restrykcji biorcy, a co więcej, również duże plazmidy są tą drogą bardzo efektywnie przenoszone.The nucleotide sequence of the pCTX-M3 plasmid has been determined, described and deposited with the GenBank gene bank under accession number AF550415. This plasmid carries a single IncL / M type replicon and encodes a conjugation system whose genes are located in two regions of tra and trb, and their protein products show 30 to 60% similarity to the proteins encoded in the Collb-P9 plasmid from the Incll family (so far poorly examined group of T4BSS conjugation systems), characterized by a narrow host range. Conjugation transfer is a common phenomenon among bacteria, responsible for their rapid variability, and also crucial in the horizontal spread of genes in the biosphere. It consists in transferring properly prepared DNA from the donor cell to the recipient cell after direct physical contact between them occurs and a structure called a conjugation bridge is formed between them. The possession of a conjugation plasmid or a conjugation transposon is a prerequisite for a bacterial cell to donate through the conjugation process. The effect of conjugation transfer between the donor and the recipient is the formation of transconjugants, recipient cells enriched with the features encoded by the DNA obtained from the donor. It should be emphasized here that the DNA of the plasmid transferred by conjugation "escapes" by the restriction system of the recipient, and what is more, also large plasmids are very efficiently transferred in this way.

Kluczową funkcję w transferze koniugacyjnym pełnią białka uczestniczące w przygotowaniu DNA i utworzeniu pary koniugacyjnej dawcy z biorcą. W przypadku plazmidów koniugacyjnych, przygotowanie DNA do transferu zapewniają białka o funkcjach Dtr (ang. Dna transfer and replication): relaksaza/helikaza nacinająca jedną z nici DNA w rejonie oriT (ang. origin of conjugal transfer), białka pomocnicze, a także białko łącznikowe (ang. Coupling Protein), tworzące kompleks relaksosomu. Do utworzenia pary koniugacyjnej potrzebne są białka o funkcjach Mpf (ang. Mating pair formation), u bakterii Gram ujemnych odpowiedzialne za utworzenie pilusa, który łączy komórkę dawcy z biorcą.Proteins involved in the preparation of DNA and the formation of a donor-recipient conjugation pair play a key role in conjugation transfer. In the case of conjugation plasmids, DNA preparation for transfer is ensured by proteins with Dtr (Dna transfer and replication) functions: relaxase / helicase cutting one of the DNA strands in the oriT region (origin of conjugal transfer), auxiliary proteins, and a linker protein (Coupling Protein), forming the relaxosome complex. To create a conjugation pair, proteins with Mpf (Mating pair formation) functions are needed, in Gram-negative bacteria responsible for the formation of the pilus that connects the donor cell with the recipient.

Geny kodujące białka transferu koniugacyjnego zorganizowane są w wielogenowe operony, często z rozdzieleniem funkcji Dtr i Mpf np. w plazmidach z grupy IncP czy IncW. Białka mające funkcje Dtr są plazmidowo-specyficzne - przecinają nić tylko danego plazmidu, natomiast funkcje Mpf mogą być wykorzystywane przez współwystępujące w komórce bakterii plazmidy mobilizowalne, kodujące tylko funkcje Dtr i oriT. Minimalnym wymaganiem do tego, żeby plazmid mógł zostać zmobilizowany do transferu i przekazany komórce biorcy, czyli być plazmidem mobilizowanym, jest obecność samej sekwencji oriT. W takiej sytuacji plazmid pomocniczy, czyli mobilizujący, musi kodować białka odpowiedzialne za obie funkcje: Mpf i Dtr. Współdziałanie tych dwóch maszynerii - Mpf i Dtr zapewnia białko łącznikowe, które jest ATPazą, również kodowane w plazmidzie pomocniczym.The genes encoding the conjugation transfer proteins are organized into multi-gene operons, often with separation of Dtr and Mpf functions, e.g. in plasmids from the IncP or IncW group. Proteins with Dtr functions are plasmid-specific - they cut only the strand of a given plasmid, while the Mpf functions can be used by mobilizable plasmids that coexist in a bacterial cell, encoding only the functions of Dtr and oriT. The minimum requirement for a plasmid to be mobilized for transfer and donated to the recipient cell, i.e. to be a mobilized plasmid, is the presence of the oriT sequence itself. In such a situation, the helper, or mobilizing, plasmid must encode the proteins responsible for both functions: Mpf and Dtr. The interaction of these two machinery, Mpf and Dtr, provides a linker protein, which is ATPase, also encoded in the helper plasmid.

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

Jak wykazano w dotychczas prowadzonych badaniach, geny systemu koniugacyjnego plazmidu pCTX-M3 są zlokalizowane w dwóch odległych od siebie rejonach (Gołębiewski i wsp., 2007, Antimicrob. Agents Chemother., 51: 3789-3795). Co więcej, poza wspomnianym plazmidem Collb-P9 i R64 z rodziny Incll, oraz plazmidów o identycznym „szkielecie” plazmidowym (pEL60 i pCTX360), geny te nie wykazują istotnej homologii do sekwencji mających przypisane funkcje, zgromadzonych w publicznych bazach danych (I. Kern-Zdanowicz i M. Gołębiewski, dane niepublikowane). O ile geny kodujące systemy koniugacyjne pCTX-M3 i Collb-P9 (Incll), wykazują podobieństwo i w obrębie rejonów większość genów ma w obu plazmidach podobną kolejność, to całe rejony tra i trb mają względem siebie różną lokalizację. Co więcej, plazmid pCTX-M3 potrafi, choć z niską częstością, mobilizować plazmidy zawierające heterologiczne oriTcoiib-P9 i vice versa, plazmid z oriTPcTx-M3jest mobilizowany przez plazmid pochodny Collb-P9 (I. Kern-Zdanowicz i M. Gołębiewski, dane niepublikowane). Mimo podobieństwa regionów tra i trb, geny kodowane w rejonie wiodącym (ang. leading region) czyli te, które jako pierwsze wchodzą do komórek biorcy, są w pCTX-M3 i Collb-P9 różne (z wyjątkiem dwóch genów, kodujących Ssb - single stranded DNA binding protein oraz białka antyrestrykcji). Pierwszym genem w rejonie wiodącym pCTX-M3 jest orf35 (Gołębiewski i wsp., 2007, Antimicrob. Agents Chemother., 51: 3789-3795). Gen ten ma podobną długość, lokalizację i kierunek transkrypcji do genów kilku plazmidów, szczególnie tych o szerokim spektrum gospodarza. Według naszych niepublikowanych danych, hipotetyczny produkt tego genu wykazuje niską homologię do białka MobC z plazmidów z grupy IncQ i jest odległym homologiem białka TraK z plazmidu RP4, kodującego białko pomocnicze kompleksu relaksazy (Ziegelin i wsp., 1992, J. Biol. Chem., 267:17279-17286). W plazmidach o szerokim zakresie gospodarzy, takich jak R46 z IncN, R388 z IncW, RK2 (RP4) z IncP-1, czy NAH7 z IncP-9, w ich rejonie wiodącym znajduje się trójgenowy operon, tzw. operon wiodący (ang. leading operon). Wyniki badań przeprowadzonych na plazmidzie NAH7 z Pseudomonas putida pokazują, że operon wiodący traDEF bierze udział w modulacji zakresu biorcy (Miyazaki i wsp., 2008, J Bacteriol., 190:6281-6289). W innych plazmidach o szerokim spektrum gospodarzy, takich jak np. RSF1010 z IncQ jest tylko jeden, gen mobC (Meyer, 2009, Plasmid, 62:57-70), podobnie jak w rejonie wiodącym plazmidu pCTX-M3.As demonstrated in the studies conducted so far, the genes of the pCTX-M3 plasmid conjugation system are located in two distant regions (Gołębiewski et al., 2007, Antimicrob. Agents Chemother., 51: 3789-3795). Moreover, apart from the abovementioned Collb-P9 and R64 plasmids from the Incll family, and plasmids with an identical plasmid "skeleton" (pEL60 and pCTX360), these genes do not show significant homology to sequences with assigned functions, collected in public databases (I. Kern -Zdanowicz and M. Gołębiewski, unpublished data). While the genes encoding the pCTX-M3 and Collb-P9 (Incll) conjugation systems are similar, and most genes have a similar order in both plasmids, the entire tra and trb regions have different locations to each other. Moreover, the pCTX-M3 plasmid can, albeit with a low frequency, mobilize plasmids containing heterologous oriTcoiib-P9 and vice versa, the plasmid with oriT P cTx-M3 is mobilized by the Collb-P9 plasmid (I. Kern-Zdanowicz and M. Gołębiewski, unpublished data). Despite the similarity of the tra and trb regions, the genes encoded in the leading region, i.e. those that enter the recipient's cells first, are different in pCTX-M3 and Collb-P9 (except for the two genes encoding Ssb - single stranded DNA binding proteins and anti-restriction proteins). The first gene in the leading region of pCTX-M3 is orf35 (Gołębiewski et al., 2007, Antimicrob. Agents Chemother., 51: 3789-3795). This gene is similar in length, location, and direction of transcription to that of several plasmids, particularly those with a broad host spectrum. According to our unpublished data, the hypothetical product of this gene shows low homology to the MobC protein from the IncQ plasmids and is a distant homologue of the TraK protein of the RP4 plasmid, encoding the accessory protein of the relaxationase complex (Ziegelin et al., 1992, J. Biol. Chem., 267: 17279-17286). In plasmids with a wide range of hosts, such as R46 from IncN, R388 from IncW, RK2 (RP4) from IncP-1, or NAH7 from IncP-9, there is a trigenic operon in their leading region, the so-called leading operon. The results of studies on the NAH7 plasmid from Pseudomonas putida show that the traDEF leader operon is involved in the modulation of the recipient range (Miyazaki et al., 2008, J Bacteriol., 190: 6281-6289). In other broad host spectrum plasmids, such as e.g. RSF1010 with IncQ, there is only one, the mobC gene (Meyer, 2009, Plasmid, 62: 57-70), as is the pCTX-M3 plasmid leader.

Systemy transferu koniugacyjnego pozwalają na wydajne wprowadzenie z komórek dawcy do komórek biorcy każdego plazmidu niosącego specyficzną dla tego systemu sekwencję oriT.Conjugation transfer systems allow efficient introduction from donor cells to recipient cells of any plasmid carrying the system-specific oriT sequence.

W plazmidzie pCTX-M3 oriT (oriTpctx-m3) jest to fragment o długości o długości 106 bp (par zasad), który został przedstawiony na SEKW. ID. NR 1. Sekwencja οπΤΡοτχ-Μ3 obejmuje zarówno miejsce cięcia DNA przez nikazę czyli tzw. „nick site”, jak i region nic, w którym oddziałują białka kompleksu Dtr. Klonując oriTPcTx-M3do dowolnego plazmidu replikującego się w komórkach dawcy, można uzyskać plazmid mobilizowany przez system koniugacyjny plazmidu pCTX-M3 i za jego pomocą wprowadzić do komórek biorcy geny kodujące wybrane cechy.In plasmid pCTX-M3 oriT (oriT p ctx-m3), this is the 106 bp (bp) fragment shown in SEQ ID NO. ID. NO. 1. The sequence οπΤ Ρ οτχ-Μ3 covers both the site of DNA cleavage by nikase, i.e. "Nick site" as well as the nic region where proteins of the Dtr complex interact. By cloning oriT P cTx-M3 into any plasmid replicating in donor cells, a plasmid mobilized by the pCTX-M3 plasmid conjugation system can be obtained and genes encoding selected traits can be introduced into recipient cells.

Plazmidy zdolne do transferu koniugacyjnego, których biorcami mogą być bakterie należące do różnych grup taksonomicznych są interesującym obiektem do konstrukcji narzędzi biotechnologicznych, służących np. do wprowadzania plazmidów do „trudnych” szczepów bakterii. Plazmidem służącym do takiego celu jest plazmid z grupy IncP - plazmid RK2 (nazwany też RP4), którego system koniugacyjny jest przyporządkowany do dobrze scharakteryzowanej grupy T4ASS. Plazmid ten ma wielkość ok. 60 tys. pz. i determinuje oporność na tetracyklinę, ampicylinę i kanamycynę. Jest przy tym zdolny do replikacji w szerokim spektrum bakterii. Plazmid RK2 jest zdolny do mobilizowania plazmidów niosących oriTRK2, a biorcami plazmidów w takim transferze koniugacyjnym bądź mobilizacji mogą być nie tylko bakterie Gram ujemne, ale też Gram dodatnie (Poyart i Trieu-Cuot, 1997, FEMS MicrobioL, 156, 193-198). Opisano też transfer koniugacyjny przy pomocy RK2 do drożdży Saccharomyces cerevisiae (Bates i wsp., 1998, J. Bacteriol., 180:6538-6543) oraz komórek ssaczych (Waters, Naturę Genet., 2001,29:375-376).Plasmids capable of conjugation transfer, the recipients of which may be bacteria belonging to various taxonomic groups, are an interesting object for the construction of biotechnological tools, for example for introducing plasmids into "difficult" strains of bacteria. The plasmid serving for this purpose is the plasmid of the IncP group - the RK2 plasmid (also called RP4), the conjugation system of which is assigned to the well-characterized T4ASS group. This plasmid is about 60 thousand. pz. and determines resistance to tetracycline, ampicillin and kanamycin. It is also capable of replication in a wide spectrum of bacteria. The RK2 plasmid is capable of mobilizing plasmids carrying oriTRK2, and the recipients of the plasmids in such a conjugation transfer or mobilization can be not only Gram negative but also Gram positive bacteria (Poyart and Trieu-Cuot, 1997, FEMS MicrobioL, 156, 193-198). Conjugation transfer by RK2 to yeast Saccharomyces cerevisiae (Bates et al., 1998, J. Bacteriol., 180: 6538-6543) and mammalian cells (Waters, Nature Genet., 2001, 29: 375-376) has also been described.

Przy konstrukcji narzędzia do mobilizacji plazmidów, plazmid RK2 został w całości, łącznie z replikonem i genami warunkującymi oporność, wprowadzony do chromosomu bakterii E. coli przy pomocy faga Mu (Simon i wsp., 1983, Naturę Biotechnology, 1:784-791). System ten sprawnie mobilizuje plazmidy niosące oriTrk2 do transferu koniugacyjnego. Niestety wadą tego systemu jest wycinanie się z pewną częstością plazmidu z chromosomu, co więcej plazmid ten jest zdolny do dalszej koniugacji. Kolejną wadą tego systemu jest zdolność do mobilizacji z częstością rzędu 10 4 równieżIn the construction of the plasmid mobilization tool, the plasmid RK2 was completely introduced into the chromosome of E. coli bacteria, including the replicon and resistance genes, by Mu phage (Simon et al., 1983, Nature Biotechnology, 1: 784-791). This system efficiently mobilizes plasmids carrying oriTrk2 for conjugative transfer. Unfortunately, the disadvantage of this system is that the plasmid is cut from the chromosome with a certain frequency, what is more, the plasmid is capable of further conjugation. Another disadvantage of this system is the ability to mobilize a frequency of the order of 10 4 of the

PL 230 884 Β1 chromosomu bakterii, w który został wintegrowany. W bakteriach, które są biorcami w takim transferze, może powodować to liczne, niepożądane zdarzenia rekombinacyjne. Modyfikacja, powodująca uszkodzenie rejonu nic, w obrębie ohTrk2, sprawia, że obecny w chromosomie bakterii RK2, nie może już mobilizować chromosomu do transferu (Babic i wsp. 2008, Res Microbiol, 159: 545-549). Jednak wada, polegająca na możliwości wycinania się plazmidu z chromosomu nie została usunięta. Ponadto, trzeba podkreślić, że plazmid obecny w chromosomie niesie komplet swoich genów, w tym geny determinujące oporność na wspomniane powyżej antybiotyki.PL 230 884 Β1 of the bacterial chromosome into which it has been integrated. In bacteria that are recipients of such a transfer, this can cause numerous unwanted recombination events. The modification causing damage to the nic region within ohTrk2 means that the RK2 present in the bacterial chromosome can no longer mobilize the chromosome for transfer (Babic et al. 2008, Res Microbiol, 159: 545-549). However, the disadvantage of being able to excise the plasmid from the chromosome has not been removed. Moreover, it should be emphasized that the plasmid present in the chromosome carries all of its genes, including the genes determining resistance to the above-mentioned antibiotics.

System oparty na wintegrowanym do chromosomu plazmidzie RK2 wykorzystano do zaproponowania terapii antybakteryjnej polegającej na zmobilizowaniu do transferu koniugacyjnego plazmidu niosącego gen kodujący kolicynę E3 czyli rybonukleazę tnącą 16SrRNA. W badaniach tych wyleczono z infekcji myszy mające oparzenia zakażone Acinetobacter baumanii (Shankar i wsp, 2007, Journal of Bum Care and Reasearch, 28:16-12).The system based on the RK2 plasmid integrated into the chromosome was used to propose an antibacterial therapy involving the mobilization of a plasmid carrying the gene encoding the E3 colicin, i.e. the 16SrRNA cutting ribonuclease, for conjugational transfer. In these studies, mice bearing burns infected with Acinetobacter baumanii were cured of infection (Shankar et al., 2007, Journal of Bum Care and Research, 28: 16-12).

Celem wynalazku jest więc dostarczenie nowych plazmidów, bakterii i systemów do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy pozbawionych wad występujących w istniejących systemach do mobilizacji plazmidów i zapewniających wydajną mobilizację do szerokiej grupy bakterii biorców.The object of the invention is therefore to provide new plasmids, bacteria and systems for efficient plasmid mobilization with a broad host spectrum, free from the disadvantages of existing plasmid mobilization systems and ensuring efficient mobilization to a wide range of recipient bacteria.

Wynalazek oparty jest na nieoczekiwanym stwierdzeniu, że możliwa jest skuteczna zmiana konstrukcji znanego plazmidu pCTX-M3 i uzyskanie nowych plazmidów, szczepów bakteryjnych i opartych na nich systemów do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy. Takie plazmidy pochodne pCTX-M3, pozbawione są czynników patogennych i są niezdolne do transferu koniugacyjnego. Ponadto wynalazek oparty jest na nieoczekiwanym stwierdzeniu, że uzyskane plazmidy pochodne pCTX-M3 pozbawione orf35, którego obecność ze względu na jego położenie w regionie wiodącym i ewentualną funkcję w stabilizacji plazmidu w biorcy, wydawała się konieczna dla mobilizacji wykazują dodatkową, zwiększoną zdolność do mobilizacji plazmidów niosących oriTpcTx-M3. Taki plazmid, szczep bakteryjny i oparty na nich system do wydajnej mobilizacji plazmidów według wynalazku pozbawiony jest większości genów determinujących oporności na antybiotyki, jak również mobilnych elementów genetycznych, takich jak sekwencje IS i transpozony, dzięki temu są one stabilne strukturalnie i nie prowadzą do niekontrolowanych zjawisk rekombinacyjnych w gospodarzu bakteryjnym. Ponadto uzyskany plazmid, szczep bakteryjny i oparty na nich system według wynalazku zostały tak przygotowane, że zawierają niemniejszy zestaw genów niezbędnych do wytworzenia sprawnego systemu koniugacyjnego, a mniejsze rozmiary w porównaniu z kompletnym plazmidem pCTX-M3 ułatwiają ewentualne manipulacje w obrębie jego sekwencji, jak również ułatwiają wprowadzanie takiego plazmidu do komórek gospodarza (duże plazmidy trudno wprowadzić drogą transformacji). Taki plazmid, szczep bakteryjny i oparty na nich system niesie oriTpcTx-M3 mut, czyli uszkodzone miejsce oriT, zatem kodując system koniugacyjny sam nie może takiemu transferowi ulec, nie może zatem rozprzestrzeniać się w niekontrolowany sposób, a pozostaje wyłącznie w komórkach dawcy.The invention is based on the unexpected finding that it is possible to effectively change the construction of the known pCTX-M3 plasmid and obtain new plasmids, bacterial strains and systems based thereon for efficiently mobilizing plasmids with a broad host spectrum. Such pCTX-M3 derived plasmids are devoid of pathogenic factors and are incapable of conjugative transfer. Moreover, the invention is based on the unexpected finding that the obtained plasmids derived from pCTX-M3 lacking orf35, the presence of which, due to its position in the leader region and possible function in stabilizing the plasmid in the recipient, seemed necessary for mobilization, show an additional, increased ability to mobilize plasmids carrying oriTpcTx-M3. Such a plasmid, bacterial strain and the system based on them for efficient plasmid mobilization according to the invention are devoid of most genes determining antibiotic resistance, as well as mobile genetic elements, such as IS sequences and transposons, therefore they are structurally stable and do not lead to uncontrolled phenomena. recombinant in the bacterial host. In addition, the obtained plasmid, the bacterial strain and the system based on them according to the invention have been prepared in such a way that they contain no smaller set of genes necessary for the production of an efficient conjugation system, and the smaller size compared to the complete pCTX-M3 plasmid facilitate possible manipulations within its sequence, as well as facilitate the introduction of such a plasmid into the host cells (large plasmids are difficult to introduce by transformation). Such a plasmid, bacterial strain and the system based on them carry oriTpcTx-M3 mut, i.e. the damaged oriT site, therefore, when coding the conjugation system, it cannot be transferred to such a transfer itself, and therefore it cannot spread in an uncontrolled manner, and remains only in the donor's cells.

Wynalazek dotyczy więc plazmidu pomocniczego do mobilizacji, który obejmuje część mobilizującą systemu koniugacyjnego tra i trb w obrębie nukleotydów od 34 do 23136 SEKW. ID. NR 2 i od 24740 do 29654 SEKW. ID. NR 2, korzystniej obejmuje nukleotydy od 34 do 29654 SEKW. ID. NR 2, i przy czym plazmid pomocniczy do mobilizacji nie koduje funkcjonalnego białka Orf35 z pCTX-M3. Taki plazmid korzystnie jest plazmidem pMOBS, którego sekwencja przedstawiona jest na SEKW. ID. NR 2.The invention thus relates to a mobilization helper plasmid which comprises a mobilization portion of the tra and trb conjugation system within nucleotides 34 to 23136 of SEQ ID NO. ID. 2 and SEQ. 24,740 to 29,654 ID. 2, more preferably comprises nucleotides 34 to 29,654 of SEQ ID NO. ID. NR 2, and wherein the mobilization helper plasmid does not encode a functional Orf35 protein from pCTX-M3. Such a plasmid is preferably a pMOBS plasmid, the sequence of which is shown in SEQ ID NO. ID. NO 2.

Wynalazek dotyczy również szczepu bakteryjnego do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy zawierającego wintegrowaną w chromosom bakteryjny część mobilizującą systemu koniugacyjnego tra i trb w obrębie nukleotydów od 34 do 23136 SEKW. ID. NR 2 i od 24740 do 29654 SEKW. ID. NR 2, korzystniej zawiera wintegrowane nukleotydy od 34 do 29654 SEKW. ID. NR 2, i przy czym w takim szczepie nie powstaje funkcjonalne białko Orf35 z pCTX-M3.The invention also relates to a bacterial strain for efficient mobilization of plasmids with a wide host spectrum, containing a bacterial chromosome-integrated mobilizing part of the tra and trb conjugation system within nucleotides 34 to 23136 SEQ ID NO. ID. 2 and SEQ. 24,740 to 29,654 ID. No. 2, more preferably has integrated nucleotides 34 to 29,654 of SEQ ID NO. ID. NR 2, and such strain does not produce a functional Orf35 protein from pCTX-M3.

Szczep bakteryjny korzystnie jest bakterią Gram ujemną wybraną z grupy składającej się z: Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Enterobacter cloacae, Morganella morganii, Serratia marcescens, Salmonella enterica.The bacterial strain is preferably a Gram negative bacterium selected from the group consisting of: Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Enterobacter cloacae, Morganella morganii, Serratia marcescens, Salmonella enterica.

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

Szczep bakteryjny korzystnie jest szczepem E. coli, do którego część mobilizująca systemu koniugacyjnego została wintegrowana w miejsce attB chromosomu, korzystniej jest to szczep E. coli S14.The bacterial strain is preferably an E. coli strain into which the mobilizing part of the conjugation system has been integrated into the attB site of the chromosome, more preferably it is E. coli S14 strain.

Wynalazek dotyczy również systemu do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy obejmującego plazmid według wynalazku i/lub szczep bakteryjny według wynalazku oraz plazmid mobilizowany zawierający oriT o sekwencji nukleotydowej która to sekwencja nukleotydowa zapewnia, że to oriT współdziała z tym systemem.The invention also relates to a system for efficient mobilization of plasmids with a broad host spectrum comprising a plasmid according to the invention and / or a bacterial strain according to the invention and a mobilized plasmid containing an oriT having a nucleotide sequence, which nucleotide sequence ensures that the oriT interacts with the system.

W korzystnym systemie oriT o sekwencji nukleotydowej, która to sekwencja nukleotydowa zapewnia, że to oriT współdziała z tym systemem jest οπΤΡοτχ-Μ3 lub oriTcoiibP9, korzystniej jest nim οπΤΡοτχ-Μ3 przedstawiony na SEKW. ID. NR 1.In a preferred oriT system with a nucleotide sequence, which nucleotide sequence ensures that the oriT interacts with this system is οπΤ Ρ οτχ-Μ3 or oriTcoiibP9, more preferably it is οπΤ Ρ οτχ-Μ3 shown in SEQ. ID. NO. 1.

W korzystnym systemie plazmid mobilizowany zawiera replikon umożliwiający replikacjęwdawcy, korzystnie zawiera ογϊρμβι z pUC19, ohra3 z pRA3, ohpisa z pACYC184 lub oriPcTx-M3 z pCTX-M3.In a preferred system, the mobilized plasmid comprises a donor replicon, preferably ογϊ ρ μβι from pUC19, ohra3 from pRA3, ohpisa from pACYC184, or ori P cTx-M3 from pCTX-M3.

Wynalazek dotyczy również zastosowania plazmidu pomocniczego według wynalazku, szczepu bakteryjnego według wynalazku oraz systemu zawierającego plazmid mobilizowany według wynalazku do wydajnej mobilizacji plazmidów do komórek biorcy, przy czym komórkami biorcy są bakterie Gram ujemne: a-Proteobacteria, β-Proteobacteria, γ-Proteobacteria oraz bakterie Gram dodatnie, szczególnie z klasy Bacilli.The invention also relates to the use of a helper plasmid according to the invention, a bacterial strain according to the invention and a system containing the plasmid mobilized according to the invention for efficient mobilization of plasmids into the recipient cells, the recipient cells being Gram negative bacteria: a-Proteobacteria, β-Proteobacteria, γ-Proteobacteria and bacteria. I play positive, especially from the Bacilli class.

Korzystnie w takim zastosowaniu plazmid mobilizowany zawiera οπΤΡοτχ-Μ3 lub oriTcoiib p?, korzystniej oriT przedstawiony na SEKW. ID. NR 1.Preferably, in such use, the mobilized plasmid comprises οπΤ Ρ οτχ-Μ3 or oriTcoiibp, more preferably an oriT shown in SEQ ID NO. ID. NO. 1.

W równie korzystnym zastosowaniu plazmid mobilizowany zawiera replikon umożliwiający replikację w dawcy, korzystnie zawiera οπρμβι z pUC19, ohra3 z pras, ohpisa z pACYC184 lub OriPcTx-M3 z pCTX-M3.In an equally preferred use, the mobilized plasmid comprises a replicon allowing replication in the donor, preferably οπ ρ μβι from pUC19, ohra3 from press, ohpisa from pACYC184 or Ori P cTx-M3 from pCTX-M3.

Wynalazek ponadto dotyczy zastosowania systemu według wynalazku do wprowadzania genów kodujących czynnik korzystny dla bakterii biorcy w specyficznym środowisku lub warunkach, w którym w koniugacji mobilizowane są plazmidy zawierające οπΤροτχ-Μ3 lub oriTcoiib p?, korzystniej zwierające oriT przedstawiony na SEKW. ID. NR 1, przy czym na mobilizowanym plazmidzie zostaje do komórki dawcy wprowadzony czynnik umożliwiający jego rozwój w specyficznym środowisku lub warunkach, który to czynnik jest bezpieczny dla szczepu dawcy.The invention further relates to the use of the system according to the invention for introducing genes encoding a beneficial factor for a recipient bacterium under a specific environment or conditions in which in conjugation plasmids containing οπΤ ρ οτχ-Μ3 or oriTcoiib pβ, more preferably containing the oriT shown in SEQ ID NO, are mobilized. ID. No. 1, whereby a factor enabling its development in a specific environment or conditions is introduced into the donor's cell on the mobilized plasmid, which factor is safe for the donor strain.

Wynalazek dotyczy również zastosowania systemu według wynalazku, do wprowadzania do szczepu biorcy w celu integracji z chromosomem biorcy sekwencji nukleotydowej wprowadzanej na mobilizowanym plazmidzie, w którym plazmid mobilizowany nie ulega replikacji, przy czym w koniugacji mobilizowane są plazmidy zawierające οπΤροτχ-Μ3 lub oriTcoiib p?, korzystniej zwierające oriT przedstawiony na SEKW. ID. NR 1, oraz mobilizowany plazmid obejmuje sekwencję integrującą do chromosomu biorcy. Korzystnie w takim zastosowaniu integracja z chromosomem biorcy sekwencji nukleotydowej prowadzona jest w celu przeprowadzenia mutagenezy transpozonowej, przy czym mobilizowany plazmid obejmuje sekwencję integrującą do chromosomu biorcy, którą jest sekwencja transpozonu.The invention also relates to the use of the system according to the invention for introducing into a recipient strain for integration into the recipient chromosome a nucleotide sequence introduced on a mobilized plasmid in which the mobilized plasmid does not replicate, wherein plasmids containing οπΤ ρ οτχ-Μ3 or oriTcoiib p are mobilized in conjugation. ', more preferably containing the oriT shown in SEQ. ID. No. 1, and the mobilized plasmid includes an integrating sequence into the recipient chromosome. Preferably in such use, integration into the recipient chromosome of the nucleotide sequence is carried out to effect transposon mutagenesis, wherein the plasmid to be mobilized comprises an integrating sequence into the recipient's chromosome which is the transposon sequence.

Zestaw molekularny zawierający plazmid według wynalazku i/lub szczep bakteryjny według wynalazku i/lub system do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy według wynalazku jest również objęty zakresem niniejszego wynalazku .A molecular kit comprising a plasmid according to the invention and / or a bacterial strain according to the invention and / or a system for efficient mobilization of broad-spectrum plasmids according to the invention is also within the scope of the present invention.

Termin „funkcjonalny odpowiednik sekwencji nukleotydowej” oznacza sekwencję nukleotydową, która koduje produkty zawierające identyczną lub wysoce podobną sekwencję aminokwasową lub nukleotydową do sekwencji kodowanych przez wyjściową sekwencję nukleotydową, której sekwencja nukleotydowa została zmieniona np. przez podstawienie, zastąpienie, delecję czy insercję tak, że nie zmienia to zasadniczo aktywności produktów kodowanych przez te sekwencje nukleotydowe.The term "functional equivalent of a nucleotide sequence" denotes a nucleotide sequence that encodes products that contain an amino acid or nucleotide sequence that is identical or highly similar to that encoded by the parent nucleotide sequence, the nucleotide sequence of which has been altered, for example, by substitution, replacement, deletion, or insertion such that no this substantially changes the activities of the products encoded by these nucleotide sequences.

Wykorzystując geny transferu koniugacyjnego z plazmidu pCTX-M3, wytworzony został wydajny system do mobilizacji według wynalazku, który umożliwia wprowadzanie z komórek bakterii Gram ujemnych z grupy α-, β-, lub γ-Proteobacteria np. Escherichia coli plazmidu zdolnego do replikacji w komórkach dawcy i/lub biorcy i zawierającego οπΤΡοτχ-Μ3 do komórek biorcy, którymi mogą być bakterie Gram ujemne: α-Proteobacteria jak np. Agrobacterium tumefaciens, β-Proteobacteria np. Ralstonia eutropha, γ-Proteobacteria jak np. Pseudomonas putida czy enterobakteriijak np. E. coli oraz bakterie Gram dodatnie z klasy Bacilli jak np. Lactococcus lactis.Using the conjugation transfer genes from the pCTX-M3 plasmid, an efficient mobilization system according to the invention was created, which enables the introduction of α-, β-, or γ-Proteobacteria Gram-negative bacteria from cells, e.g. Escherichia coli, a plasmid capable of replication in donor cells and / or the recipient and containing οπΤ Ρ οτχ-Μ3 into the recipient cells, which may be Gram negative bacteria: α-Proteobacteria, such as e.g. Agrobacterium tumefaciens, β-Proteobacteria, e.g. Ralstonia eutropha, γ-Proteobacteria, such as e.g. Pseudomonas putjak or e.g. enterobacteria E. coli and Gram positive bacteria of the Bacilli class, such as, for example, Lactococcus lactis.

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

W jednym z wykonań wynalazku geny kodujące system koniugacyjny są zlokalizowane na plazmidzie pMOBS. Jest on pochodną pCTX-M3, pozbawioną niesionych przez ten plazmid genów warunkujących oporność na antybiotyki, genów ruchomych elementów genetycznych takich jak IS czy transpozony, a zawierającą geny tra i trb, lecz pozbawioną genów orf35 i orf46 (Przykład 3). Plazmid pMOBS zawiera zestaw genów niezbędnych do wytworzenia sprawnego systemu koniugacyjnego który obejmuje nukleotydy od 34 do 23136 SEKW. ID. NR 2 i od 24740 do 29654 SEKW. ID. NR 2 tworzących moduły tra i trb (Fig. 1). Ze względu na mutacje wprowadzone do sekwencji nic w plazmidzie pMOBS (oriTpcTx-M3-mut jest niefunkcjonalny), plazmid ten jest niezdolny do transferu koniugacyjnego, ale pełni rolę plazmidu pomocniczego w transferze koniugacyjnym. Jak wykazano w Przykładzie 4 częstość mobilizacji plazmidu niosącego οπΤροτχ-μ3 w obecności plazmidu pMOBS jako plazmidu pomocniczego jest 1000-krotnie wyższa niż w obecności plazmidu pCTX-M3.In one embodiment of the invention, the genes encoding the conjugation system are located on the pMOBS plasmid. It is a derivative of pCTX-M3, devoid of antibiotic resistance genes carried by this plasmid, genes for mobile genetic elements such as IS or transposons, and containing the tra and trb genes, but devoid of the orf35 and orf46 genes (Example 3). The pMOBS plasmid contains a set of genes necessary for the generation of an efficient conjugation system that spans nucleotides 34 to 23136 of SEQ. ID. 2 and SEQ. 24,740 to 29,654 ID. 2 forming modules tra and trb (Fig. 1). Due to the mutations introduced into the sequence nothing in the pMOBS plasmid (oriTpcTx-M3-mut is non-functional), this plasmid is incapable of conjugative transfer but acts as a helper plasmid in conjugation transfer. As demonstrated in Example 4, the mobilization frequency of the οπΤ ρ οτχ-µ3 plasmid in the presence of pMOBS as a helper plasmid is 1000-fold higher than in the presence of pCTX-M3.

W innym z wykonań wynalazku geny kodujące system koniugacyjny (moduły tra i trb, Fig. 1) są zlokalizowane w chromosomie bakterii. W Przykładzie 4 przedstawiono częstość mobilizacji plazmidu niosącego oriTPcTx-M3W szczepie E. coli S14 w którym moduły tra i trb znajdują się w miejscu integracji faga λ. W tym przypadku częstość mobilizacji jest ok. 10-krotnie wyższa niż w obecności plazmidu pCTX-M3.In another embodiment of the invention, the genes encoding the conjugation system (tra and trb modules, Fig. 1) are located on the chromosome of the bacteria. Example 4 shows the mobilization frequency of the plasmid harboring the oriT P cTx-M3 in the E. coli S14 strain in which the tra and trb modules are located at the λ phage integration site. In this case, the mobilization frequency is about 10 times higher than in the presence of the pCTX-M3 plasmid.

W obu wykonaniach systemu według wynalazku na plazmidzie, który ma zostać przekazany do komórek biorcy jest zlokalizowany οπΤροτχ-μ3. Ponadto, geny potrzebne do mobilizacji tego plazmidu pozostają w komórce dawcy i nie są przekazywane do komórki biorcy w procesie koniugacji / mobilizacji.In both embodiments of the system according to the invention, οπΤ ρ οτχ-µ3 is located on the plasmid to be transferred to the recipient cells. Moreover, the genes needed for the mobilization of this plasmid remain in the donor cell and are not transferred to the recipient cell by the conjugation / mobilization process.

Na plazmidzie mobilizowanym, niosącym oriTPcTx-M3mogą być sklonowane geny, których funkcje można badać w komórkach gospodarza, do którego został on wprowadzony (Przykład 5 i 6). Zaletą tego systemu jest możliwość wprowadzania plazmidów do bakterii drogą, która pozwala na uniknięcie systemu restrykcji, działającego w każdej komórce bakteryjnej. Należy podkreślić, że w obu z wykonań systemu według wynalazku, geny kodujące elementy systemu transferu koniugacyjnego nie mogą być przekazane do komórek biorcy, a wprowadzany plazmid, niosący οπΤΡοτχ-Μ3 nie może się samodzielnie dalej rozprzestrzeniać wśród bakterii.Genes the function of which can be tested in the host cells into which it is introduced (Examples 5 and 6) can be cloned on the mobilized plasmid carrying the cTx -M3 oriT P oriT. The advantage of this system is the possibility of introducing plasmids into bacteria in a way that avoids the restriction system that works in every bacterial cell. It should be emphasized that in both embodiments of the system according to the invention, the genes encoding the elements of the conjugation transfer system cannot be transferred to the recipient cells, and the introduced plasmid carrying οπΤ Ρ οτχ-Μ3 cannot be spread further among the bacteria on its own.

Kolejną zaletą jednej z wersji systemu według wynalazku, w którym informacja genetyczna umożliwiająca koniugację jest zlokalizowana w chromosomie bakterii (chromosomalna lokalizacja genów transferu koniugacyjnego) jest brak możliwości wycinania się plazmidu w komórkach dawcy, jak to ma przykładowo miejsce w systemach opartych na wintegrowanym plazmidzie RK2. Wprowadzenie informacji genetycznej umożliwiającej koniugację do chromosomu bakterii również nie powoduje zawężenia wyboru plazmidu mobilizowanego ze względu na jego replikon (unika się niezgodności plazmidów). W systemie według wynalazku z chromosomalną lokalizacją genów transferu koniugacyjnego, podczas wytwarzania szczepów bakteryjnych będących jego częścią, do chromosomu bakterii, która potem będzie dawcą, wprowadzany jest wyłącznie fragment plazmidu pMOBS, kodujący geny tra-trb pCTX-M3, oraz gen cat niezbędny do selekcji integrantów. Co więcej, tak uzyskany szczep bakterii można poddać jeszcze dalszej modyfikacji, która polega na usunięciu z chromosomu genu cat. Zatem powstały szczep może być całkowicie pozbawiony wprowadzonego genu warunkującego oporność na chloramfenikol.Another advantage of one version of the system according to the invention, in which the genetic information enabling conjugation is localized in the chromosome of the bacteria (chromosomal location of the conjugation transfer genes) is that the plasmid cannot be excised in the donor cells, as is the case, for example, in systems based on the integrated RK2 plasmid. The introduction of genetic information enabling conjugation to the bacterial chromosome also does not restrict the selection of the mobilized plasmid in terms of its replicon (plasmid incompatibility is avoided). In the system according to the invention with the chromosomal location of the conjugative transfer genes, during the production of bacterial strains that are part of it, only the pMOBS plasmid fragment, encoding the pCTX-M3 trb genes, and the cat gene necessary for selection are introduced into the chromosome of the bacteria that will later be the donor. integrants. Moreover, the resulting bacterial strain can be further modified by removing the cat gene from the chromosome. Thus, the resulting strain may be completely devoid of the introduced chloramphenicol resistance gene.

Przygotowane systemy do koniugacji i narzędzia biotechnologiczne powstałe na ich bazie można wykorzystać w wielu aspektach, przykładowo do: a) do wprowadzania plazmidów niosących odpowiedni oriT do różnych biorców, których transformacja z różnych powodów jest niemożliwa (np. do szczepów klinicznych lub szczepów środowiskowych); b) do przygotowywania i prowadzenia terapii typu BCBT, opartej na zjawisku koniugacji bakterii (ang. Bacterial conjugation based therapy) a polegającej na wprowadzaniu na plazmidzie mobilizowanym czynnika, który będąc bezpieczny dla dawcy prowadzi do śmierci komórki biorcy (Filutowicz i wsp., 2008, Plasmid 60:38-44); czynnikiem takim mógłby być gen kodujący truciznę (np. z plazmidu pSM19035) z systemu trucizna-odtrutka, który w biorcy, w nieobecności odtrutki prowadziłby do śmierci, natomiast dawcę przed działaniem trucizny zabezpieczałby wprowadzony gen odtrutki, c) do wprowadzania w aktywny, kontrolowany sposób genów kodujących czynniki, które mogą być korzystne dla bakterii, które są niepodatne na transformację, w specyficznym środowisku lub warunkach lub w sytuacji, gdy wprowadzenie tych czynników w inny sposób może byćThe prepared conjugation systems and biotechnological tools based on them can be used in many aspects, for example for: a) introduction of plasmids carrying the appropriate oriT to different recipients, which cannot be transformed for various reasons (e.g. into clinical strains or environmental strains); b) to prepare and conduct BCBT therapy, based on the phenomenon of bacterial conjugation based therapy, consisting in the introduction of a mobilized factor on a plasmid, which, being safe for the donor, leads to the death of the recipient's cell (Filutowicz et al., 2008, Plasmid 60: 38-44); such factor could be the gene encoding the poison (e.g. from the plasmid pSM19035) from the poison-antidote system, which in the recipient, in the absence of an antidote, would lead to death, while the donor would protect the introduced antidote gene from the action of the poison, c) to be introduced in an active, controlled manner genes encoding factors that may be beneficial to bacteria that are not amenable to transformation, in a specific environment or conditions, or when introducing these factors by other means may be

PL 230 884 Β1 utrudnione (np. zastosowanie do wytwarzania szczepów wykorzystywanych w utylizacji np. przy oczyszczaniu ścieków, wprowadzanie genów oporności na metale ciężkie, genów rozkładu związków toksycznych takich jak fenol, toluen, dimetyloformamid itp.), d) do wprowadzania do biorcy, w którym plazmid mobilizowany nie ulega replikacji, genów, które miałyby zostać zintegrowane z jego chromosomem, w tym do mutagenezy transpozonowej (Simon i wsp., 1983, Naturę Biotechnology,1:784-791) z zastosowaniem różnych transpozonów, takich jak_Mu czy pochodne Tn3, Tn5 lub Tn7 (Choi i Kim, 2009. J. Microbiol. Biotechnol., 19:217-28).PL 230 884 Β1 difficult (e.g. application for the production of strains used in utilization, e.g. in wastewater treatment, introduction of heavy metal resistance genes, genes for the decomposition of toxic compounds such as phenol, toluene, dimethylformamide, etc.), d) to be introduced into the recipient, in which the mobilized plasmid does not replicate, genes that would be integrated into its chromosome, including transposon mutagenesis (Simon et al., 1983, Nature Biotechnology, 1: 784-791) using various transposons such as_Mu or Tn3 derivatives , Tn5 or Tn7 (Choi and Kim, 2009. J. Microbiol. Biotechnol., 19: 217-28).

Cytowane w opisie publikacje oraz podane w nich odniesienia są w całości niniejszym włączone jako referencje.Publications cited in this specification and references therein are hereby incorporated by reference in their entirety.

Dla lepszego zrozumienia wynalazku, został on zilustrowany w przykładach wykonania oraz na załączonych figurach rysunku, na których:For a better understanding of the invention, it is illustrated in the exemplary embodiments and in the accompanying drawing figures, in which:

Fig. 1 obrazuje graficzne przedstawienie modułów tra i, trb, wykorzystanych w przedstawionych przykładach. Koordynaty przy blokach ilustrujących rejony tra i trb odpowiadają tym z SEKW. ID. NR 2.Fig. 1 shows a graphical representation of the tra i, trb modules used in the examples shown. The coordinates at the blocks illustrating the tra and trb regions correspond to those of SEQ. ID. NO 2.

Fig. 2 przedstawia schemat klonowania skrajnych fragmentów modułów tra i trb plazmidu pCTX-M3 w pochodnej wektora pLDRIO zawierającej region attP (niezbędny do integracji do chromosomu) i utworzenie plazmidu pLDAB, prekursora plazmidu pLMAB212 (pokazanego na Fig. 3).Fig. 2 shows a scheme for the cloning of the terminal fragments of the tra and trb modules of the pCTX-M3 plasmid in the pLDR10 vector derivative containing the attP region (necessary for chromosomal integration) and generation of the pLDAB plasmid, the precursor of the pLMAB212 plasmid (shown in Fig. 3).

Fig. 3 przedstawia schemat bloków sekwencji, z których złożony jest plazmid pLMAB212 (zawiera oriTPcTx-M3), z którego został przygotowany plazmid pMOBS (zawiera oriTPcTx-M3-mut).Fig. 3 is a diagram of the sequence blocks of which plasmid pLMAB212 (contains cTx -M3 oriT P oriT) from which the pMOBS plasmid (contains cTx-M3-mut oriT P oriTx-M3-mut) is prepared.

Poniższe przykłady zostały umieszczone jedynie w celu zilustrowania wynalazku oraz wyjaśnienia poszczególnych jego aspektów, a nie w celu jego ograniczenia i nie powinny być utożsamiane z całym jego zakresem, który zdefiniowano w załączonych zastrzeżeniach.The following examples are provided merely to illustrate the invention and to explain its particular aspects, not to limit it, and should not be construed as being within the scope as defined in the appended claims.

PrzykładyExamples

W poniższych przykładach, jeśli nie wskazano inaczej stosowano standardowe materiały i metody opisane w Sambrook J. et al, „Molecular Cloning: A Laboratory manuał, 2nd edition. 1989. Cold Spring Harbor, N.Y. Cold Spring Harbor laboratory Press” lub postępowano zgodnie z zaleceniami producentów dla określonych materiałów i metod. W szczególności w podanych przykładach wykorzystano szczepy Escherichia coli DH5a [F~(<I>80dlacZAlVI15) recA1 endA1 gyrA96 thi-1 hsdR17(rk'mk+) supE44 relA1 deoR J(/acZYA-argF)U196] (Hanahan, 1983), Escherichia coli JE2571 RifR (leu thr thi lacY thy pil fla) (Bradley 1980), Pseudomonas putida KT2442 (RifR) (otrzymany C.M. Thomasa, Birmingham, Wielka Brytania), Agrobacterium tumefaciens LBA1010 RifR (otrzymany od D. Bartosika, Instytut Mikrobiologii, Uniwersytet Warszawski), Ralstonia eutropha 7MP228r (otrzymany od K. Smalli, Braunschweig, Niemcy). Hodowle bakteryjne prowadzono w podłożu LB (Kahn i wsp. 1979) lub na podłożu LB zestalonym 1,5% agarem w temperaturze 30°C, 37°C lub 42°C (Diederich i wsp. 1992, Sambrook i wsp. 1989). W określonych przypadkach podłoża uzupełniano antybiotykami: chloramfenikol 10 μg ml·1, kanamycyna 50 μg ml·1, rifampicyna 100 μg ml·1 i tetracyklina 20 μg ml·1. Izolację plazmidowego DNA wykonywano przy użyciu odpowiednich zestawów (A&A Biotechnology, Promega); reakcję PCR, mutagenezę ukierunkowaną i transformacje bakterii prowadzono standardowymi metodami (Sambrook i wsp. 1989). Enzymy restrykcyjne i modyfikujące stosowane zgodnie z zaleceniami producentów i stosowano odpowiednio produkty firm Fermentas, Roche oraz Kucharczyk TE.In the following examples, unless otherwise indicated employs standard materials and methods described in Sambrook J. et al, "Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2 nd edition. 1989. Cold Spring Harbor, NY Cold Spring Harbor laboratory Press ”or manufacturers' recommendations for specific materials and methods have been followed. In particular, the strains of Escherichia coli DH5a [F ~ (<I> 80dlacZAlVI15) recA1 endA1 gyrA96 thi-1 hsdR17 (rk'mk + ) supE44 relA1 deoR J (/ acZYA-argF) U196] (/ acZYA-argF) U196] were used in the examples given. Escherichia coli JE2571 Rif R (leu thr thi lacY thy pil fla) (Bradley 1980), Pseudomonas putida KT2442 (Rif R ) (derived from CM Thomas, Birmingham, UK), Agrobacterium tumefaciens LBA1010 Rif R (obtained from D. Bartosik, Instytut Microbiology, University of Warsaw), Ralstonia eutropha 7MP228r (obtained from K. Smalli, Braunschweig, Germany). Bacterial cultures were carried out in LB medium (Kahn et al. 1979) or on LB medium solidified 1.5% agar at a temperature of 30 ° C, 37 ° C or 42 ° C (Diederich et al. 1992, Sambrook et al. 1989). In certain cases, the media was supplemented with antibiotics: chloramphenicol 10 μg ml · 1 , kanamycin 50 μg ml · 1 , rifampicin 100 μg ml · 1 and tetracycline 20 μg ml · 1 . Plasmid DNA isolation was performed using appropriate kits (A&A Biotechnology, Promega); PCR, site-directed mutagenesis and bacterial transformation were performed by standard methods (Sambrook et al. 1989). Restriction and modifying enzymes used in accordance with the manufacturers' recommendations and the products of Fermentas, Roche and Kucharczyk TE were used, respectively.

Spis wykorzystanych plazmidów i uzyskanych sposobami przedstawionymi w poniższych przykładach plazmidów przedstawiono w Tabeli 1.The list of plasmids used and obtained by the methods presented in the plasmid examples below is presented in Table 1.

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

Tabela 1Table 1

Przedstawia spis plazmidów wyjściowych wykorzystanych w przykładach wykonania oraz uzyskane z nich plazmidy pochodneProvides an inventory of the starting plasmids used in the embodiments and the derived plasmids derived therefrom

Plazmid Plasmid Najważniejsze cechy Źródło Highlights Source

Wektory i inne wykorzystane plazmidy Vectors and other plasmids used pCTX-M3 pCTX-M3 Gołębiewski i wsp., 2007, Antimicrob. Agents Chemother., 51:37893795 Gołębiewski et al., 2007, Antimicrob. Agents Chemother., 51: 37893795 pCTX-M3 orf 35::cat pCTX-M3 orf 35 :: cat pochodna pCTX-M3 zawiera gen cat zamiast orf35 M. Gołębiewski the pCTX-M3 derivative contains the cat gene instead of orf35 M. Gołębiewski pCTX-M3 orf46::cat pUC 18 pCTX-M3 orf46 :: cat pUC 18 pochodna pCΤΧ-Μ3 zawiera gen cat zamiast orf46 M. Gołębiewski wektor do klonowania οπρμβι, Apr Vieira i Messing, 1982, Gene, 19:259-268the pCΤΧ-Μ3 derivative contains the cat gene instead of orf46 M. Gołębiewski cloning vector οπ ρ μβι, Ap r Vieira and Messing, 1982, Gene, 19: 259-268 pUC19 pUC19 wektor do klonowania oripMBb Apr Vieira i Messing, 1982, Gene, 19:259-268ori cloning vector pM Bb Ap r Vieira and Messing, 1982, Gene, 19: 259-268 pLDRIO pLDRIO wektor do integracji w attP, Apr, Cmr Diederich i wsp. 1992, Plasmid 28:14-24vector for integration into attP, Ap r , Cm r Diederich et al. 1992, Plasmid 28: 14-24 pLDR8 pLDR8 plazmid pomocniczy do integracji, gen integrazy Diederich i wsp. 1992, Plasmid 28:14-24 integration helper plasmid, Diederich et al. integrase gene 1992, Plasmid 28: 14-24 pACYC184 pACYC184 wektor do klonowania oriPi5A, Tcr, Cmr Chang i Cohen, 1978, J Bacteriol. 134: 11411156. ori P and 5 A cloning vector, Tc r , Cm r Chang and Cohen, 1978, J Bacteriol. 134: 11411156. pET28A pOriT pET28A pOriT wektor do klonowania Kmr Novagen oriTcrx-M3 (31616-31721) w wektorze pMI3 - οπρμβι, Cmr. M. GołębiewskiCloning vector Km r Novagen oriTcrx-M3 (31616-31721) in the vector pMI3 - οπ ρ μβι, Cm r . M. Gołębiewski pBBRlMCS-2 pABB19 pBBRlMCS-2 pABB19 wektor do klonowania, oripBBRi, oriTRK2, Kmr Koyach i wsp. 1995 wektor, oripMBi, Apr Bartosik i wsp. 2012 J Microbiol Methods, 158:1183-1195cloning vector, ori pB BRi, oriT RK 2, Km r Koyach et al. 1995 vector, ori pMB i, Ap r Bartosik et al. 2012 J Microbiol Methods, 158: 1183-1195 pABB20 pABB20 wektor, oriRA3? Kmr Bartosik i wsp. 2012 J Microbiol Methods, 158:1183-1195vector, ori R A3 ? Km r Bartosik et al. 2012 J Microbiol Methods, 158: 1183-1195 pBSUlOO pBSULOO pochodna pAT28, oripMBi, οπΡΛΜβΐ, Spcr Apr Aymanns i wsp., 2011 PLoS One, 6:el9822 Plazmidy do składania tra trbderivative pAT28, ori pM Bi, οπ Ρ ΛΜβΐ, Spc r Ap r Aymanns et al., 2011 PLoS One, 6: el9822 Plasmids for splicing trb PUCA0118 PUCA0118 fr. pCTX-M3 (31285-32022) amplifikowany starterami FtraHind i RtraPst (Hindllł, Pstl), sklonowany w Hindlll-Pstl pUC18 fr. pCTX-M3 (31285-32022) amplified with primers FtraHind and RtraPst (HindIII, Pstl), cloned into HindIII-Pstl pUC18 pUCA0218 pUCA0218 fr. pCTX-M3 (52154-54408) amplifikowany starterami FtraSal i RtraXba (Sali, Pstl). sklonowany w Sall-Xbal pUC18 fr. pCTX-M3 (52154-54408) amplified with primers FtraSal and RtraXba (Sal, Pstl). cloned into Sall-Xbal pUC18 pUCA0318 pUCA0318 pochodna pUCAOl 18 z podstawieniami w sekwencji nic wprowadzonymi starterami FnicM i RnicM derivative of pUCAO118 with sequence substitutions nothing introduced with primers FnicM and RnicM pUCA3218 pUCA3218 fr. KpnI-Sall pUCA0218 sklonowany w pUCA0318 KpnI-Sall fr. KpnI-Sall pUCA0218 cloned into pUCA0318 KpnI-Sall pUCB0219 pUCB0219 fr. pCTX-M3 (87807-89020) amplifikowany starterami FtrbNco-RtrbEco (Sad, EcoRI), sklonowany w Sacl-EcoRT pUC19 fr. pCTX-M3 (87807-89020) amplified with FtrbNco-RtrbEco primers (Sad, EcoRI), cloned into Sacl-EcoRT pUC19

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

pUCB0318 pUCB0318 fr. pCTX-M3 orf46: :cat (83021-85053) amplifikowany starterami LtrbXba i RtrbBam, sklonowany w Smal pUC18 fr. pCTX-M3 orf46:: cat (83021-85053) amplified with primers LtrbXba and RtrbBam, cloned into Smal pUC18 pUCB3219 pUCB32!9B pUCB3219 pUCB32! 9B fr. Sall-KpnI pUCBO318 sklonowany w pUCB0219 Sall-Kpnl pochodna pUCB32!9? usunięty fr. Bspl407I (1543-1729)fr. SalI-KpnI pUCBO318 pUCB0219 cloned into SalI-KpnI derivative pUCB32! 9? deleted fr. Bspl407I (1543-1729) pLDl pLDB pLDAB pB$3-l pLMAB2 pLDl pLDB pLDAB pB $ 3-1 pLMAB2 pochodna pŁDRIO, usunięty fr. BsmI (1713-2120) fr. EcoRI-BamHI pUCB32l 9B sklonowany w EcoRI-BamHI pLDl fr HindTH-BamHI pUCA3218 sklonowany w HindlU-BarnHI pLDB Pochodna pCTX-M3 Bstl 1071-StuI (54309-57986), minireplikon, Apr fr. pBS3-l (3624-2152) zaw. replikcn pCTX-M3, amplifikowany starterami LRepCM i RepANB2 (Notl), sklonowany w Not! pLDABderivative of pŁDRIO, removed fr. BsmI (1713-2120) fr. EcoRI-BamHI pUCB32I9B cloned into EcoRI-BamHI pLD1 fr HindTH-BamHI pUCA3218 cloned into HindLU-BarnHI pLDB Derivative of pCTX-M3 BstI 1071-StuI (54309-57986), minireplicon, Ap r fr. pBS3-1 (3624-2152) containing replica pCTX-M3, amplified with primers LRepCM and RepANB2 (NotI), cloned into Not! pLDAB pSN17 pLMAB202 pSN17 pLMAB202 pochodna pCTX-M3 orf46::cat, fr. Ndel-SphI (53187-59797) i SphT-Ndel (80753-626) fr. Bspl407I pSN17 (11410-14854; 84420-87864 w pCTX-M3) sklonowany w Bspl407I pLMAB2 pCTX-M3 derivative orf46 :: cat, fr. Ndel-SphI (53187-59797) and SphT-Ndel (80753-626) fr. Bspl407I pSN17 (11410-14854; 84420-87864 in pCTX-M3) cloned into Bspl407I pLMAB2 pSS29 pLMAB212 pSS29 pLMAB212 pochodna pCTX-M3, Swal-SalJ (30630-59552) i Sall-Swal (64145-64426) fr. AatH-Nhel pSS29 (729-21542; 31362-52175 w pCTX-M3) sklonowany w Aatll-Nhel pLMAB202 derivative of pCTX-M3, Swal-SalJ (30630-59552) and Sall-Swal (64145-64426) fr. AatH-Nhel pSS29 (729-21542; 31362-52175 in pCTX-M3) cloned into Aatll-Nhel pLMAB202 pAL-AS14 pAL-AS14 fr. pLMAB212 (92-359) amplifikowany starterami FAatH i RnicSpe, sklonowany w Smal pAL3 fr. pLMAB212 (92-359) amplified with primers FAatH and RnicSpe, cloned into Smal pAL3 pAL-SP3 pAL-SP3 fr. pLMAB212 (356-1622) amplifikowany starterami FnicSpe i RPshAI, sklonowany w Smal pAL3 fr. pLMAB212 (356-1622) amplified with FnicSpe and RPshAI primers, cloned into Smal pAL3 pALAP pALAPKl palap palAPKl fr. Spel-Pstl pAL-SP3 sklonowany w Spel-Pstl pAL-AS14 fr. pET28a+ (3943-4832), zawiera gen oporności na kanamycynę, amplifikowany starterami FKanSpeż i RKanSpe (Spel), sklonowany w Spel pALAP fr. Spel-Pstl pAL-SP3 cloned into Spel-Pstl pAL-AS14 fr. pET28a + (3943-4832), contains the kanamycin resistance gene, amplified with FKanSpeż and RKanSpe (Spel) primers, cloned into Spel pALAP pMOBSK pMOBS pMOBSK pMOBS fr. Aatll-PshAl pALAPKl sklonowany w pLMAB212 AatH-PshAl pochodna pMOBSK, usunięty fr. Spel-Spel z genem oporności na kanamycynę Plazmidy niosące oriT fr. Aatll-PshAl pALAPKl cloned into pLMAB212 AatH-PshAl derivative of pMOBSK, deleted fr. Spel-Spel with the kanamycin resistance gene OriT bearing plasmids pAL3 pALoriT pBBToriT pAL3 pALoriT pBBToriT fr. BstUI pUC18 zaw. gen lacZ i MCS sklonowany w ScaI-PvuII pACYC184 fr. EcoRl-Pstl pOriT zaw. oriTpcrx-M3 sklonowany w EcoRl-Psrl pAL3 (replikon pl5A) fr. Xbal-Pvul pALoriT zaw. gen oporności na tetracyklinę i oriTpcrx-M3 sklonowany w Pvul-Xbal pBBRlMCS-2 (replikon pBBRl) ” fr. BstUI pUC18 containing lacZ gene and MCS cloned into ScaI-PvuII pACYC184 fr. EcoRl-Pstl pOriT incl. OriTpcrx-M3 cloned into EcoRl-Psrl pAL3 (pl5A replicon) fr. Xbal-Pvul pALoriT contains tetracycline resistance gene and oriTpcrx-M3 cloned in Pvul-Xbal pBBRlMCS-2 (pBBRl replicon) " pToriT pToiiTB pLMKoriT2 pToriT pToiiTB pLMKoriT2 Pochodna pBBToriT, usunięty fr.Bsal-Bstl 1071 zawierający MOBro Pochodna pToriT, usunięty fr. BamHI BamHI z genem oporności na kanamycynę fr. pToriTB (2310^1127) amplifikowany starterami FKanAatH i oriTminDAatll zaw. gen oporności na kanamycynę i oriTpcrx-M3 (Aatll) sklonowany w AatU pBS3-l (replikon pCTX-M3)PBBToriT derivative, deleted BSal-Bstl 1071 containing MOBro. PToriT derivative, deleted. BamHI BamHI with the kanamycin resistance gene fr. pToriTB (2310 ^ 1127) amplified with primers FKanAatH and oriTminDAatll containing the gene for kanamycin resistance and oriT p crx-M3 (AatII) cloned in AatU pBS3-1 (replicon pCTX-M3) pABB19oriT pABB19oriT fr. BamHI-Pstl ρΟιίΤιηίη (181-293) zaw. oriTpcrx-M3 sklonowany w BamHI-Pstl pABB19 (replikon pMBl) fr. BamHI-Pstl ρΟιίΤιηίη (181-293) incl. OriTpcrx-M3 cloned into BamHI-Pstl pABB19 (replicon pMBl) pABB20oriT pABB20oriT fr. Hindlll (wypelnione)-BaniHI pABB19oriT (417-541) sklonowany w PvuII-BamHI pABB20 (replikon RA3) fr. HindIII (filled) -BaniHI pABB19oriT (417-541) cloned into PvuII-BamHI pABB20 (RA3 replicon) pBSUoriT pBSUoriT Fr. Pael-SacI pOriTmin zaw. oriTycrx-M3 sklonowany w Pael-SacI pBSUlOO (pochodna pAT28, replikon pMB 1 / ρΑΜβ 1) Fr. Pael-SacI pOriTmin incl. OriTycrx-M3 cloned in Pael-SacI pBSUlOO (derivative of pAT28, replicon pMB 1 / ρΑΜβ 1)

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

Statery stosowane w reakcjach PCR prowadzonych w poniższych przykładach przedstawione są w Tabeli 2.The staters used in the PCR reactions performed in the examples below are shown in Table 2.

Tabela 2Table 2

Przedstawia nazwę, sekwencję starterów stosowanych w reakcjach PCR i wykorzystaną w reakcji matrycęShows the name, the sequence of the primers used in the PCR reactions, and the template used in the reaction

Nazwa Name Sekwencja Sequence Matryca PCR PCR matrix FtraHind FtraHind Startery do składania tra trb CATACCCTTTCGAAGCTTTCAGC Starters for folding tra trb CATACCCTTTCGAAGCTTTCAGC pCTX-M3 pCTX-M3 RtraPst RtraPst CTCCTGCTGCAGTTTCTGTGC CTCCTGCTGCAGTTTCTGTGC pCTX-M3 pCTX-M3 FnicM FnicM GTACGGGACAATATTGGTTTTTGGAGTACCGC GTACGGGACAATATATTGGTTTTTGGAGTACCGC pCJX-M3 pCJX-M3 RnicM RnicM CTCCAAAAACCAATATTGTCCCGTACTTAAATACC CTCCAAAAACCAATATTGTCCCGTACTTAAATACC pCTXM3 pCTXM3 FtraSal FtraSal GCAGGGTCGACTTCTATCTTCGCTAGCGG GCAGGGTCGACTTCTATCTTCGCTAGCGG pCTX-M3 pCTX-M3 RtraXba RtraXba ACTCTCTCTAGAACTCCGGGTTAC ACTCTCTCTAGAACTCCGGGTTAC pCTX-M3 pCTX-M3 FrrbXba FrrbXba AGATCTAGAAAACGTTGCTTAACGTGAG AGATCTAGAAAACGTTGCTTAACGTGAG pCTX-M3 orf46; ;cat pCTX-M3 orf46; ; cat RtrbBam RtrbBam TTCCAGGATCCCCTGGTACGCAGCGCAG TTCCAGGATCCCCTGGTACGCAGCGCAG pCTX-M3orf46::cat pCTX-M3orf46 :: cat FtrbNco (Sac) FtrbNco (Sac) CGGTTGAGCTCGTCGAGAATGGATTTAGC CGGTTGAGCTCGTCGAGAATGGATTTAGC pCTXM3 pCTXM3 RtrbEco RtrbEco AATAGAATTCCTCTGACACCCTCTC AATAGAATTCCTCTGACACCCTCTC pCTX-M3 pCTX-M3 FrepCNI FrepCNI GTGGCGGCCGCGTAAGAAACCATTATTATC GTGGCGGCCGCGTAAGAAACCATTATTATC pBS3-l pBS3-1 RrepANB2 RrepANB2 TAGGCGGCCGCGGTCTCGCACCCCTGCCGTCTTACG TAGGCGGCCGCGGTCTCGCACCCCTGCCGTCTTACG pBS3-l pBS3-1 FAatll FAatll Startery do mutagenezy nic site TTCTGACGTCACATCAGGCAAGTCG Mutagenesis primers nic site TTCTGACGTCACATCAGGCAAGTCG pLMAB2!2 pLMAB2! 2 RnicSpe RnicSpe AACCGAACTAGTCCCGTACTTAAATACCTC AACCGAACTAGTCCCGTACTTAAATACCTC PLMAB2I2 P LMAB2I2 FKanSpe2 FKanSpe2 GAACTAGTCATGAACAATAAAACTGTCTGC GAACTAGTCATGAACAATAAAACTGTCTGC pET28a+ pET28a + RKanSpe RKanSpe AGACTAGTATCCGCTCATGAATTAATTC AGACTAGTATCCGCTCATGAATTAATTC pET28a+ pET28a + Fnic Spe Fnic Spe GGACTAGTTCGGTTTTTGGAGTACCGCCGACAC GGACTAGTTCGGTTTTTGGAGTACCGCCGACAC pLMAB212 pLMAB212 RPshAI RPshAI GAAGACCGATGTCTGCAAATGTCTTATGC GAAGACCGATGTCTGCAAATGTCTTATGC pLMAB212 pLMAB212 FKanAatll FKanAatll Startery do kionowania Kan-oriT ATGGACGTCAGCTACTGGGCTATCTGG Kan-oriT kioning primers ATGGACGTCAGCTACTGGGCTATCTGG pToriTB pToriTB oriTminDAatll oriTminDAatll TTGGACGTCTGCAGAGATAGCTAACCTCGTTAGG TTGGACGTCTGCAGAGATAGCTAACCTCGTTAGG pToriTB pToriTB orf35uEc orf35uEc Startery do sprawdzenia integracji TCG A ATTCGAC ATTATTGGG AGGGC Starters to check the integration TCG A ATTCGAC ATTATTGGG AGGGC ybhB122 ybhB122 CTGGC AAGCGCCTCGATTAC CTGGC AAGCGCCTCGATTAC ybhC159 ybhC159 ACCAGGCGCGGTTTGATCAG ACCAGGCGCGGTTTGATCAG

Przykład 1Example 1

Przygotowanie plazmidów do mobilizacji, niosących οπΤροτχ-Μ3Preparation of plasmids for mobilization, bearing οπΤ ρ οτχ-Μ3

Przygotowano serię plazmidów do mobilizacji niosących ογϊΤροτχ-μ3. Plazmidy te różnią się przede wszystkim replikonem, a w konsekwencji również zakresem gospodarzy, w których te plazmidy mogą ulegać replikacji.A series of mobilization plasmids harboring ογϊΤ ρ οτχ-μ3 was prepared. These plasmids differ primarily in the replicon and consequently also in the range of hosts in which these plasmids can replicate.

Fragment EcoRI-Pstl plazmidu pOriT sklonowano w wektorze pAL3, aby uzyskać plazmid pALoriT (replikon p15A). Z tego plazmidu przeniesiono też fragment Xbal-Pvul do plazmidu o szerokim zakresie gospodarzy pBBR1MCS-2, uzyskując plazmid pBBToriT, z którego następnie usunięto region mobilizacyjny plazmidu RK2 (BsaI-BstllO7I), uzyskując plazmid pToriT (replikon PBBrl). Plazmid pOriT posłużył też jako źródło οπΤροτχ-μ3 do klonowania w wektorze pABB 19 i uzyskania plazmidu pABB19oriT (replikon pMB1). Z tego plazmidu przeniesiono też fragment Hindlll (wypełnione lepkie końce)-BamHI do wektora pABB20 (w miejsce PvuII-BamHI) o szerokim zakresie gospodarzy uzyskując plazmid pABB20oriT (replikon RA3). W celu przygotowania matrycy do amplifikacji regionu oriTPcTx-M3zgenem oporności na tetracyklinę, z plazmidu pToriT usunięto fragment BamHI-BamHI usuwając w ten sposób gen kodujący oporność na kanamycynę. Z tak przygotowanej matrycy, przy użyciu starterów FKanAatll i oriTminDAatll amplifikowano fragment DNA, który sklonowano w miejscu Aatll plazmidu pBS3-1 (minireplikon pCTX-M3) uzyskując plazmid pLMKoriT2 (replikon pCTX-M3). Plazmid pBSUoriT otrzymano poprzez sklonowanie fragmentu Pael-SacI plazmidu pOriTmin w miejscu Pael-SacI plazmidu pBSU100.The EcoRI-Pstl fragment of the pOriT plasmid was cloned into the pAL3 vector to obtain the pALoriT plasmid (p15A replicon). From this plasmid, the Xbal-Pvul fragment was also transferred into a plasmid with the broad host range of pBBR1MCS-2, obtaining plasmid pBBToriT, from which the RK2 plasmid mobilization region (BsaI-Bst11O7I) was then removed, yielding the plasmid pToriT (PBBrl replicon). The pOriT plasmid also served as the source of οπΤ ρ οτχ-μ3 for cloning in the pABB 19 vector and obtaining the plasmid pABB19oriT (replicon pMB1). From this plasmid, the HindIII (stuffed sticky ends) -BamHI fragment was also transferred into the broad host range pABB20 vector (in place of PvuII-BamHI), resulting in the plasmid pABB20oriT (RA3 replicon). To prepare the template for amplification of the cTx -M3 oriT P region with a tetracycline resistance gene, the BamHI-BamHI fragment was removed from the pToriT plasmid, thereby removing the gene encoding kanamycin resistance. From the template prepared in this way, using the FKanAatII and oriTminDAatII primers, the DNA fragment was amplified, which was cloned in the AatII site of the pBS3-1 plasmid (pCTX-M3 minireplicon), resulting in the plasmid pLMKoriT2 (pCTX-M3 replicon). The pBSUoriT plasmid was obtained by cloning the Pael-SacI fragment of the pOriTmin plasmid in the Pael-SacI site of the pBSU100 plasmid.

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

Przykład 2Example 2

Porównanie wydajności mobilizacji plazmidów niosących οπΤροτχ-Μ3Comparison of the mobilization efficiency of plasmids carrying οπο ρ οτχ-Μ3

Porównano wydajność koniugacji E. coli DH5a niosących plazmidy pCTX-M3 albo pCTX-M3orf35::cat (plazmid pochodny pCTX-M3 z wprowadzonym genem cat w miejsce genu orf35) albo pCTX-M3orf46::cat (plazmid pochodny pCTX-M3 z wprowadzonym genem cat w miejsce genu orf46) do komórek biorcy E. coli JE2571 RifR. Ustalono, że wszystkie trzy plazmidy są przekazywane w transferze koniugacyjnym z taką samą wydajnością tzn. około 101, co oznacza, że co dziesiąta komórka została dawcą plazmidu.The conjugation efficiency of E. coli DH5a carrying the plasmids pCTX-M3 or pCTX-M3orf35 :: cat (plasmid derived from pCTX-M3 with the introduced cat gene in place of the orf35 gene) or pCTX-M3orf46 :: cat (plasmid derived from pCTX-M3 with the inserted gene) was compared cat in place of the orf46 gene) into recipient cells E. coli JE2571 Rif R. It was found that all three plasmids are transferred in the conjugation transfer with the same efficiency, ie about 10 L , which means that every tenth cell was donated by the plasmid.

Porównano zdolność do mobilizacji plazmidu pToriT (replikon PBBR1, οπΤΡοτχ-Μ3, TcR) przez komórki E. coli niosące plazmidy pCTX-M3 albo pCTX-M3orf35::cat albo pCTX-M3orf46::cat do komórek biorcy E. coli JE2571 RifR. Okazało się, że plazmid pToriT w obecności plazmidu pomocniczego pCTX-M3orF35:: cat jest mobilizowany z blisko 1000 razy wyższą częstością niż w obecności każdego z pozostałych dwóch plazmidów (odpowiednio ponad 101 vs poniżej 10 3). Zwiększoną częstość mobilizacji pToriT w obecności pCTX-M3orf35: mat w stosunku do pCTX-M3 obserwowano również wtedy, gdy biorcą były komórki A. tumefaciens.The mobilization capacity of the pToriT plasmid (PBBR1 replicon, οπΤ Ρ οτχ-Μ3, Tc R ) by E. coli cells carrying the plasmids pCTX-M3 or pCTX-M3orf35 :: cat or pCTX-M3orf46 :: cat into recipient E. coli JE2571 cells was compared RifR. It turned out that the pToriT plasmid in the presence of the helper plasmid pCTX-M3orF35 :: cat is mobilized with nearly 1000 times higher frequency than in the presence of each of the other two plasmids (more than 10 1 vs less than 10 3, respectively ). An increased frequency of pToriT mobilization in the presence of pCTX-M3orf35: mat as compared to pCTX-M3 was also observed when A. tumefaciens cells were recipients.

W powyższym przykładzie wykazano, że pozbawienie genów kodujących system koniugacyjny plazmidu pCTX-M3 genu orf46 nie ma znaczenia dla mobilizacji, natomiast usunięcie orf35 podnosi jej wydajność 1000-krotnie.In the above example it was shown that the deprivation of the genes encoding the pCTX-M3 plasmid conjugation system of the orf46 gene is irrelevant for mobilization, while the removal of orf35 increases its efficiency 1000-fold.

Przykład 3Example 3

Wytworzenie plazmidu pMOBS, przygotowanie kasety genowej tra-trb do integracji do chromosomu oraz wytworzenie szczepu E. coli S14Generation of the pMOBS plasmid, preparation of the trb gene cassette for chromosome integration and generation of the E. coli S14 strain

Uzyskany końcowo plazmid pMOBS (SEKW. ID. NR 2), który posłużył do integracji do chromosomu bakterii regionów genowych tra i trb powstał w wyniku klonowania poszczególnych jego fragmentów uzyskanych poprzez amplifikację metodą PCR lub wycinanych z pochodnych pCTX-M3 (Fig. 2). Poniżej opisano poszczególne etapy prowadzące do uzyskania końcowego plazmidu pMOBS.The finally obtained plasmid pMOBS (SEQ ID No. 2), which was used to integrate the tra and trb gene regions into the bacterial chromosome, was created as a result of the cloning of its individual fragments obtained by PCR amplification or excised from pCTX-M3 derivatives (Fig. 2). The individual steps to obtain the final pMOBS plasmid are described below.

W pierwszym etapie, na matrycy pCTX-M3, przy użyciu par starterów FtraHind-RtraPst, FtraSal-RtraXba amplifikowano skrajne fragmenty regionu tra, które następnie sklonowane osobno w wektorze pUC18 w miejscach, odpowiednio Hindlll-Pstl i Sall-Xbal uzyskując plazmidy pUCA0118 i pUCA0218. Metodą mutagenezy ukierunkowanej, w sekwencji nic w plazmidzie pUCA0118, stosując startery FnicM i RnicM wprowadzono podstawienia nukleotydowe czyniące tę sekwencję niefunkcjonalną i uzyskano plazmid pUCA0318. Następnie, fragment KpnI-Sall pUCA0218 zawierający część regionu tra przeniesiono w miejsce KpnI-Sall plazmidu pUCA0318, uzyskując plazmid pUCA3218 zawierający dwie skrajne części regionu tra.In the first stage, on the pCTX-M3 template, using primer pairs FtraHind-RtraPst, FtraSal-RtraXba, extreme fragments of the tra region were amplified, which were then cloned separately in the pUC18 vector at the HindIII-Pstl and Sall-Xbal sites, resulting in the plasmids pUCA0118 and pUCA0218 . Site-directed mutagenesis in the nic sequence in plasmid pUCA0118 using FnicM and RnicM primers introduced nucleotide substitutions rendering this sequence non-functional and plasmid pUCA0318 was obtained. Subsequently, the KpnI-SalI fragment of pUCA0218 containing part of the tra region was transferred into the KpnI-SalI site of plasmid pUCA0318, resulting in plasmid pUCA3218 containing the two extreme parts of the tra region.

Równocześnie, na matrycy pCTX-M3, przy użyciu pary starterów FtrbNco-RtrbEco amplifikowano jeden ze skrajnych fragmentów regionu trb, który sklonowane w wektorze pUC19 w miejscu SacI-EcoRI. Drugi, skrajny fragment trb amplifikowano na matrycy pCTX-M3orf46: mat, przy użyciu starterów FtrbXba-RtrbBam i sklonowane w miejscu Smal plazmidu pUC18. Następnie, fragment Sall-KpnI plazmidu pUCB0318 przeniesiono w miejsce Sall-KpnI pUCB0219 uzyskując plazmid pUCB3219 zawierający dwie skrajne części regionu trb. W kolejnym kroku, aby umożliwić dalsze klonowania z pUCB3219 usunięto fragment (186 pz) pomiędzy miejscami Bspl407I.At the same time, on the pCTX-M3 template, one of the extreme fragments of the trb region, which was cloned in the pUC19 vector at the SacI-EcoRI site, was amplified using the FtrbNco-RtrbEco primer pair. The second, terminal trb fragment was amplified in pCTX-M3orf46: mat template using FtrbXba-RtrbBam primers and cloned into the Smal site of plasmid pUC18. Subsequently, the Sall-KpnI fragment of plasmid pUCB0318 was transferred into the Sall-KpnI site of pUCB0219, resulting in plasmid pUCB3219 containing the two extreme parts of the trb region. In the next step, the fragment (186 bp) between the Bspl407I sites was removed from pUCB3219 to allow further cloning.

Dalsze klonowania prowadzono w plazmidzie pLD1, pochodnej pLDR10 uzyskanej w wyniku usunięcia fragmentu pomiędzy miejscami BsmI, zawierającego gen warunkujący oporność na chloramfenikol. Najpierw w pLD1 sklonowane fragment EcoRI-BamHI plazmidu pUCB3219 (skrajne fragmenty trb), uzyskując plazmid pLDB, do którego wstawiono fragment Hindlll-BamHI pUCA3218 (skrajne fragmenty tra), uzyskując plazmid pLDAB (Fig. 2).Further cloning was carried out in plasmid pLD1, a derivative of pLDR10 obtained by removing the fragment between the BsmI sites containing the gene conferring resistance to chloramphenicol. First, the EcoRI-BamHI fragment of pUCB3219 (terminal trb fragments) was cloned into pLD1, yielding plasmid pLDB into which the HindIII-BamHI fragment of pUCA3218 (terminal tra fragments) was inserted, yielding plasmid pLDAB (Fig. 2).

Przed sklonowaniem w pLDAB dużych fragmentów regionów tra i trb, usunięto z tego plazmidu fragment Notl-Notl zawierający wysokokopijny replikon Pmb1, a na jego miejsce wprowadzono niskokopijny replikon pCTX-M3 (οπΤροτχ-μ3) uzyskany poprzez amplifikację z użyciem starterów FrepCNI i RrepANB2 na matrycy minireplikonu pCTX-M3, czyli na plazmidzie pBS3-1.Before cloning large fragments of tra and trb regions in pLDAB, the NotI-Notl fragment containing the high copy Pmb1 replicon was removed from this plasmid and replaced with the low copy pCTX-M3 replicon (οπΤ ρ οτχ-μ3) obtained by amplification with primers FrepANB2 and RrepANB2 on pCTX-M3 minireplicon template, i.e. on pBS3-1 plasmid.

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

W ten sposób uzyskano plazmid pLMAB2, do którego wprowadzono środkowy, Bspl407IBspl407I fragment regionu trb, z plazmidu pSN17, uzyskując plazmid pLMAB202. Następnie, do tego plazmidu wprowadzono środkowy, Aatll-Nhel fragment regionu tra z plazmidu pSS29 uzyskując plazmid pLMAB212 wielkości 33614pz (Fig. 3).Thus, the plasmid pLMAB2 into which the middle fragment of the trb region, Bspl407IBspl407I was introduced, was obtained from plasmid pSN17, resulting in plasmid pLMAB202. Then, the middle AatII-NheI fragment of the tra region from pSS29 was introduced into this plasmid, resulting in plasmid pLMAB212 of 33614 bp (Fig. 3).

Ponieważ plazmid pLMAB212 zawierał funkcjonalną sekwencję nic, przeprowadzono jego mutagenezę. W tym celu, przy użyciu par starterów FAatll-RnicSpe oraz FnicSpe-RPshAI, na matrycy pLMAB212 amplifikowano regiony ściśle sąsiadujące z sekwencją nic. Startery zostały zaprojektowane w taki sposób, aby wprowadzone podstawienia w sekwencji nic wprowadzały w tym miejscu sekwencję rozpoznawaną przez restryktazę Spel. Amplifikowane fragmenty klonowano osobno w plazmidzie pAL3, uzyskując odpowiednio plazmidy pAL-AS14 i pAL-SP3. Następnie, fragment Spel-Pstl plazmidu pAL-SP3 przeniesiono do pAL-AS14, uzyskując plazmid pALAP. Do tego plazmidu wprowadzono w miejsce Spel (czyli w zmodyfikowaną sekwencję nic) gen warunkujący oporność na kanamycynę uzyskany poprzez amplifikację przy użyciu starterów FKanSpe2 i RKanSpe na matrycy plazmidu pET28a+. Uzyskano w ten sposób plazmid pALAPKI, którego fragment Aatll-PshAI posłużył do wymiany odpowiedniego fragmentu wpLMAB212. Wprowadzenie genu oporności na kanamycynę do zmutowanej sekwencji nic umożliwiło selekcję odpowiednich transformantów i izolację plazmidu pMOBSK. W ostatnim etapie, z plazmidu pMOBSK usunięto fragment Spel-Spel (zawierający gen oporności na kanamycynę) uzyskując plazmid pMOBS (którego sekwencja przedstawiona jest na SEKW. ID. NR 2).Since plasmid pLMAB212 contained a functional nic sequence, it was mutagenized. For this purpose, regions closely adjacent to the nic sequence were amplified on the pLMAB212 template using the FAatII-RnicSpe and FnicSpe-RPshAI primer pairs. The primers were designed such that the introduced sequence substitutions would not introduce a Spel recognition sequence at this point. The amplified fragments were cloned separately in plasmid pAL3, resulting in plasmids pAL-AS14 and pAL-SP3, respectively. Then, the Spel-Pstl fragment of plasmid pAL-SP3 was transferred into pAL-AS14, resulting in the plasmid pALAP. The gene for kanamycin resistance, obtained by amplification using the FKanSpe2 and RKanSpe primers on the pET28a + plasmid template, was introduced into this plasmid in place of the Spel (i.e. in the modified nic sequence). Thus, the plasmid pALAPKI was obtained, the AatII-PshAI fragment of which was used to replace the corresponding fragment of wpLMAB212. The introduction of the kanamycin resistance gene into the mutant sequence did not allow the selection of appropriate transformants and the isolation of the pMOBSK plasmid. In the last step, the Spel-Spel fragment (containing the kanamycin resistance gene) was removed from the pMOBSK plasmid, resulting in the plasmid pMOBS (the sequence of which is shown in SEQ ID NO: 2).

W celu wprowadzenia genów transferu koniugacyjnego do chromosomu E. coli DH5a w miejscu attB, z plazmidu pMOBS usunięto fragment Eco31I-Eco31I zawierający replikon οπΤΡοτχ-Μ3 oraz gen warunkujący oporność na ampicylinę. Następnie w cząsteczce wypełniono niekompatybilne lepkie końce, zligowano i takim DNA, zawierającym moduły genowe tra i trb niezbędne do mobilizacji, transformowano komórki E. coli zawierające plazmid pLDR8, niosący gen integrazy faga λ. Selekcję transformantów prowadzono zgodnie z zalecaną procedurą (Diederich i wsp. 1992, Plasmid, 28:14-24). Uzyskano w ten sposób szczep E. coli S14, a prawidłowość integracji potwierdzono przy użyciu PCR z parami starterów ybhC159-orf35UEc oraz FtrbNco-ybhB122.In order to introduce the conjugation transfer genes into the E. coli DH5a chromosome at the attB site, the Eco31I-Eco31I fragment containing the οπΤ Ρ οτχ-Μ3 replicon and the gene conditioning ampicillin resistance was removed from the pMOBS plasmid. Then, the incompatible cohesive ends were filled in the molecule, ligated and transformed with such DNA containing the tra and trb gene modules necessary for mobilization to transform E. coli cells containing the pLDR8 plasmid carrying the λ phage integrase gene. Selection of transformants was performed according to the recommended procedure (Diederich et al. 1992, Plasmid, 28: 14-24). In this way, the E. coli S14 strain was obtained, and the correct integration was confirmed by PCR with primer pairs ybhC159-orf35UEc and FtrbNco-ybhB122.

W ten sposób wytworzono niskokopijny plazmid pMOBS, niosący geny tra i trb pCTX-M3 oraz replikon οπΡοτχ-Μ3, markerem do selekcji komórek niosących ten plazmid jest gen cat warunkujący oporność na chloramfenikol, który może być usunięty. Wychodząc od szczepu E. coli DH5a po wprowadzeniu genów tra i trb do jego chromosomu (z genem cat jako markerem selekcyjnym), uzyskano szczep E. coli S14 zdolny do mobilizowania plazmidów niosących οπΤροτχ-μ3.Thus, a low copy plasmid pMOBS carrying tra and trb genes pctX-M3 and replicon οπ Ρ οτχ-Μ3, a marker for selection of cells carrying the plasmid is the cat gene for chloramphenicol resistance factor, which can be removed. Starting from the E. coli DH5a strain, after introducing the tra and trb genes into its chromosome (with the cat gene as a selection marker), an E. coli S14 strain capable of mobilizing οπ pla ρ οτχ-μ3-bearing plasmids was obtained.

Przykład 4Example 4

Porównanie wydajności mobilizacji plazmidu pToriT przez szczepy E. coli DH5a niosące plazmid pCTX-M3 albo plazmid pMOBS oraz szczep E. coli S14, zawierający geny tra-trb w chromosomieComparison of the mobilization efficiency of the pToriT plasmid by E. coli DH5a strains carrying the pCTX-M3 plasmid or the pMOBS plasmid and the E. coli S14 strain containing the tra-trb genes in the chromosome

Porównano wydajność mobilizacji plazmidu pToriT (plazmid niosący οπΤροτχ-μ3 o sekwencji przedstawionej na SEKW. ID. NR 1) przez szczepy E. coli DH5a niosące plazmid pCTX-M3 albo plazmid pMOBS oraz szczep E. coli S14, zawierający geny tra-trb w chromosomie do komórek biorcy E. coli JE2571 RifR. Ustalono, że w porównaniu ze szczepem niosącym pCTX-M3 (wydajność mobilizacji w przeliczeniu na 1 komórkę dawcy wynosi 10 3, tj. co tysięczna komórka niosąca plazmid jest dawcą plazmidu mobilizowanego), szczep niosący pMOBS mobilizuje z wydajnością blisko 1000 razy wyższą (blisko 10°), zaś szczep E. coli S14 z ponad 10 razy wyższą (10 2).The mobilization efficiency of the pToriT plasmid (plasmid carrying οπΤ ρ οτ3-μ3 with the sequence presented in SEQ ID NO. 1) was compared by E. coli DH5a strains carrying the pCTX-M3 plasmid or the pMOBS plasmid and E. coli S14 strain containing the tra-trb genes in the chromosome into recipient cells of E. coli JE2571 Rif R. It was established that in comparison with the pCTX-M3 carrying strain (mobilization efficiency per 1 donor cell is 10 3 , i.e. every thousandth plasmid carrying cell is the donor of the mobilized plasmid), the pMOBS carrying strain mobilizes with an efficiency nearly 1000 times higher (nearly 10 °), and the E. coli S14 strain more than 10 times higher (10 2 ).

W przykładzie pokazano, że komórki niosące wytworzony plazmid pMOBS według wynalazku są zdolne do mobilizacji plazmidów z 1000-krotnie większą wydajnością niż pCTX-M3, natomiast wytworzony szczep E. coli S14, mobilizuje plazmidy 10-krotnie wydajniej niż pCTX-M3.The example shows that the cells carrying the produced pMOBS plasmid according to the invention are able to mobilize plasmids with 1000-fold greater efficiency than pCTX-M3, while the produced E. coli S14 strain mobilizes plasmids 10 times more efficiently than pCTX-M3.

Przykład 5Example 5

Porównanie wydajności mobilizacji plazmidów niosących οπΤρστχ-Μ3Ζ różnymi replikonamiComparison of the mobilization efficiency of plasmids carrying οπΤ ρ στχ-Μ3Ζ with different replicons

Porównano wydajności mobilizacji plazmidów opartych na różnych replikonach (ori). Uzyskane wyniki dla wydajności mobilizacji przedstawiono w poniższej Tabeli 3.The mobilization efficiency of plasmids based on different replicons (ori) was compared. The results obtained for the mobilization efficiency are shown in Table 3 below.

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

Tabela 3Table 3

Zestawienie wydajności mobilizacji różnych replikonów przez różne szczepy dawców do różnych biorcówSummary of the mobilization efficiency of different replicons by different donor strains to different recipients

plazmid plasmid pABB19oriT pABB20oriT pALoriT pABB19oriT pABB20oriT pALoriT pLMKoriT pLMKoriT pToriT pBSUoriT pToriT pBSUoriT replikon replicon pMB1 RA3 P15A pMB1 RA3 P15A incL/M incL / M pBBR1 pBBR1/pAMp1 pBBR1 pBBR1 / pAMp1 Biorca Recipient Dawca Giver SM· SM E coli E coli E.coli DH5a(pMCBS) E.coli DH5a (pMCBS) 100-10-1 100-10-1 ' 1Óo .......... '1Óo .......... Wito Hello Wisei Wisei β·» β · » A. tumefaciens A. tumefaciens E. coli S14 E. coli S14 10-2 10-2 10-3-10-4 10-3-10- 4 i·' .•'i r,L>-J, i · '. •' i r, L> -J, ®B! 'λΎ·4®>'£'Ί ; ®B! 'λΎ · 4®>' £ 'Ί; w 0¾ ϋβί WiS. W# w W |||| is at 0¾ ϋβί WiS. W # w W |||| is es· es R. eutropha R. eutropha E. coli S14 E. coli S14 10-3-10-4 10-3-10- 4 I8i^ I8i ^ «Μ «Μ B·®» B · ® » L. lactis L. lactis E. coli DH5a(pMQBS) E. coli DH5a (pMQBS) 10-4-10-5 10-4-10-5

I tak plazmid pLMKoriT2 niesie replikon plazmidu pCTX-M3 - οπΡοτχ-Μ3, plazmid pABB19oriT niesie replikon wysokokopijnego wektora do klonowania pUC19 o wąskim zakresie gospodarza - οπρμβι, plazmid pToriT niesie replikon plazmidu pBBR1 o szerokim zakresie gospodarzy - oriPBBRi, plazmid pABB20oriT niesie replikon niskokopijnego plazmidu RA3 o szerokim zakresie gospodarzy - ohras, a plazmid pALoriT niesie ori p15A, replikon o średniej liczbie kopii i wąskim zakresie gospodarza. Wszystkie te plazmidy zawierały οπΤροτχ-μ3 warunkujące możliwość mobilizacji.Thus, plasmid pLMKoriT2 carries a replicon plasmid pctX-M3 - οπ Ρ οτχ-Μ3 plasmid pABB19oriT carries a replicon wysokokopijnego cloning vector pUC19 a narrow host range - οπ ρ μβι plasmid pToriT carries a replicon plasmid pBBR1 broad host range - ori P BBRI. plasmid pABB20oriT carries a replicon of the low copy number plasmid RA3 with a wide host range - ohras, and plasmid pALoriT carries the p15A ori, a medium copy number and narrow host range replicon. All these plasmids contained οπΤ ρ οτχ-μ3, which required mobilization.

Badana była zdolność do mobilizacji tych plazmidów przez szczep E. coli S14 do komórek biorcy E. coli JE2571RifR. Wysokokopijny plazmid pABB19oriT był mobilizowany z częstością 10°, to znaczy każda komórka szczepu S14pabbi9oht została dawcą tego plazmidu. Plazmid pLMKoriT2 był mobilizowany z częstością ok. 5 χ 10 4, plazmid pToriT był mobilizowany z częstością 10 2—10 3, natomiast plazmid pABB20oriT był mobilizowany z częstością różniącą się w kolejnych eksperymentach od 5 χ 10 3 do 10°. Plazmid pALoriT w obecności plazmidu pomocniczego pMOBS był mobilizowany z częstością 10°—101. Jednocześnie, gdy plazmidy te nie niosły οπΤροτχ μ3, nie ulegały mobilizacji.The ability to mobilize these plasmids by the E. coli S14 strain into the recipient cells of E. coli JE2571Rif R was tested. The high copy plasmid pABB19oriT was mobilized at a frequency of 10 °, that is, each cell of the S14pabbi9oht strain became a donor of this plasmid. The plasmid was mobilized pLMKoriT2 a frequency of approx. 5 χ 10 4 pToriT plasmid was mobilized with a frequency of 10 2 -10 3, and the plasmid was mobilized pABB20oriT with a frequency that differs in the following experiments 5 χ 3 of 10 to 10 °. Plasmid pALoriT in the presence of a helper plasmid was mobilized pMOBS a frequency of 10 ° -10 1. At the same time, when these plasmids did not carry οπΤροτχ μ3, they did not mobilize.

Plazmidy, do których została wprowadzona sekwencja oriTPcTx-M3 są mobilizowane przez szczep E. coli S14 z różną częstością, zależną od niesionego replikonu, dla wysokokopijnego plazmidu pABB19oriT sięgającą wydajności 10°.Plasmids into which the cTx-M3 oriT P sequence has been introduced are mobilized by the E. coli S14 strain with a different frequency, depending on the replicon carried, for the high copy plasmid pABB19oriT up to 10 °.

Przykład 6Example 6

Badanie wydajności mobilizacji plazmidów niosących οπΤροτχ-Μ3 przez szczep E. coli S14 do przedstawicieli α-, β- i γ- ProteobacteriaStudy of the efficiency of mobilization of plasmids carrying οπΤ ρ οτχ-Μ3 by E. coli S14 strain to representatives of α-, β- and γ- Proteobacteria

Wykorzystano wytworzony w Przykładzie 3 szczep E. coli S14 do mobilizacji plazmidów niosących oriTPcTx-M3do przedstawicieli α-, β- i γ-Proteobacteria, odpowiednio Agrobacterium tumefaciens, Pseudomonas putida i Ralstonia eutropha. Plazmid pToriT (replikon pBBR1) był mobilizowany do A. tumefaciens z częstością 10 3—10 4, do R. eutropha 10 3—10 4, do P. putida 10 4. Plazmid pABB20oriT (replikon RA3) był mobilizowany do A. tumefaciens z częstością 10 2, a do P. putida nawet 101. Szczep E. coli S14 oraz DH5a z plazmidem pMOBS były wykorzystane do mobilizacji plazmidu pBSUoriT (replikon pMB1 w E. coli oraz ρΑΜβ1 w L. lactis) do L. lactis. W obu przypadkach plazmid pBSUoriT był mobilizowany z częstością 10 4—10 5 w przeliczeniu na jedną komórkę dawcy.The E. coli S14 strain prepared in Example 3 was used to mobilize plasmids harboring cTx-M3 oriT P to representatives of α-, β- and γ-Proteobacteria, Agrobacterium tumefaciens, Pseudomonas putida and Ralstonia eutropha, respectively. Plasmid pToriT (pBBR1 replicon) was mobilized into A. tumefaciens at a frequency of 10 3 -10 4 R. eutropha 10 3 -10 4 P. putida 10 4. The plasmid pABB20oriT (RA3 replicon) was mobilized to A. tumefaciens with a frequency of 10 2 , and to P. putida even 10 1 . The E. coli S14 strain and DH5a with the pMOBS plasmid were used to mobilize the pBSUoriT plasmid (pMB1 replicon in E. coli and ρΑΜβ1 in L. lactis) into L. lactis. In both cases, the plasmid was mobilized pBSUoriT a frequency of 10 4 -10 5 per one cell donor.

System koniugacyjny plazmidu pCTX-M3 jest zdolny do mobilizowania plazmidów do różnych bakterii Gram ujemnych należących do grupy α-, β- i γ-Proteobacteria, ale także do bakterii Gram dodatnich jak np. Lactococcus lactis.The pCTX-M3 plasmid conjugation system is capable of mobilizing the plasmids to various Gram negative bacteria belonging to the α-, β- and γ-Proteobacteria groups, but also to Gram positive bacteria such as e.g. Lactococcus lactis.

Na poniższym wykazie sekwencji:In the sequence list below:

SEKW. ID. NR 1 przedstawia sekwencję nukleotydową oriTPcTx-M3SEQ. ID. NO: 1 shows the nucleotide sequence of the oriT P CTX-M3

SEKW. ID. NR 2 przedstawia sekwencję nukleotydową uzyskanego plazmidu pMOBSSEQ. ID. NO. 2 shows the nucleotide sequence of the resulting pMOBS plasmid

PL 230 884 Β1 <110> Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk <120> Plazmid pomocniczy, szczep i system o szerokim spektrum gospodarzy do mobilizacji plazmidów oraz ich zastosowania <130> PK/1670/AGRPL 230 884 Β1 <110> Institute of Biochemistry and Biophysics of the Polish Academy of Sciences <120> Helper plasmid, strain and system with a broad host spectrum for plasmid mobilization and their applications <130> PK / 1670 / AGR

<160> <160> 2 2 <170> <170> Patentln version 3.5 Patentln version 3.5 <210> <210> 1 1 <211> <211> 106 106 <212> <212> DNA GOUT <213> <213> citrobacter freundii citrobacter freundii

<400> 1 agatagctaa <400> 1 agatagctaa cctcgttagg cctcgttagg gggtgtcggg gggtgtcggg gcttgccctg gcttgccctg accaagacgt ttttggacgg accaagacgt ttttggacgg ccgccgcgtg ccgccgcgtg rcggcggtac rcggcggtac tccaaaaaca tccaaaaaca catcrtgtcc catcrtgtcc cgtact cgtact

106 <210> 2 <211> 33614 <212> DNA <213> artificail <400> 2 aattctcatg tttgacagct tatcatcgat aagctttcag cttcttaatg tcagacttaa gttcatcgag tacgtgcttt ttctcaagcc tttctgacgt cacatcaggc aagtcgtcga gaatgctttt gaattttccg atgtcctcac tgctatagaa tgctttcttt tttgcaggca tatgccctcc caataatgtc aaaatcgacc atgcctaacc ggagaaaatc ggacaaggct attcaggtga ttttacatga tgcccggcat gattcaattg ctctgcctgc caggcccttc gctgctggca ttcaaacagc gccgatggta gaattcaatg aggtatttaa gtacgggact agttcggttt ttggagtacc gccgacacgc ggcggccgtc caaaaacgtc ttggtcaggg caagccccga caccccctaa cgaggttagc tatctgatga gccgtagcga gagcagaaaa acagacgatc gaatccaggt gagatgttcc acagaagtga aagctaaact caccgaaaag gcccatgaag cagggcttag tcttagtcaa tatcttatca aatctgggct tggaaagcgc attcaatcga aaggtaatta caatgcactt gccgctcttg taaagataac agcccttcaa aaacatctgt ttaacgaagg tgccggagtt catagcaagg agtattcaga gattctgatc gaggtcaaaa aggccgcaca gaaactgcaa caggagatgg atggtgatac ctaaaatcat tgagggccga agggacaaaa agtccagctt tggtcagctg attaagtaca tggcagacaa gccgtctcag gagttgactg atacagttca gcctactcct gagacggctt tagctgttaa atcggatatg ttcgaagggt taaacaatta cctgacccgt aagcagaaag tgatcagcac accggtggat gttgagccag gtgtacagcg tgttgtggtt ggtgatgtta cctgccagta caataccttc tcgctcgatg gtgcagcaca ggaaatgaat tcagtttctc agcaaagcac acgctgtaaa gatccagtta tgcactatgt tctttcatgg cctgactatg aaaagccgaa tgatgatcag gttttcgatt cggtgaagtt tacactggca tcgatgggca tgtccgatca106 <210> 2 <211> 33614 <212> DNA <213> artificail <400> 2 aattctcatg tttgacagct tatcatcgat aagctttcag cttcttaatg tcagacttaa gttcatcgag tacgtgcttt ttctcaagcc tttctgacgt cacatcaggc aagtcgtcga gaatgctttt gaattttccg atgtcctcac tgctatagaa tgctttcttt tttgcaggca tatgccctcc caataatgtc aaaatcgacc atgcctaacc ggagaaaatc ggacaaggct attcaggtga ttttacatga tgcccggcat gattcaattg ctctgcctgc caggcccttc gctgctggca ttcaaacagc gccgatggta gaattcaatg aggtatttaa gtacgggact agttcggttt ttggagtacc gccgacacgc ggcggccgtc caaaaacgtc ttggtcaggg caagccccga caccccctaa cgaggttagc tatctgatga gccgtagcga gagcagaaaa acagacgatc gaatccaggt gagatgttcc acagaagtga aagctaaact caccgaaaag gcccatgaag cagggcttag tcttagtcaa tatcttatca aatctgggct tggaaagcgc attcaatcga aaggtaatta caatgcactt gccgctcttg taaagataac agcccttcaa aaacatctgt ttaacgaagg tgccggagtt catagcaagg agtattcaga gattctgatc gaggtcaaaa aggccgcaca gaaactgcaa caggagatgg atggtgatac ctaaaatcat tgagggccga agggacaaaa agtccagctt tggtcagctg attaagtaca tggcagacaa gccgtctcag gagttg ACTG atacagttca gcctactcct gagacggctt tagctgttaa atcggatatg ttcgaagggt taaacaatta cctgacccgt aagcagaaag tgatcagcac accggtggat gttgagccag gtgtacagcg tgttgtggtt ggtgatgtta cctgccagta caataccttc tcgctcgatg gtgcagcaca ggaaatgaat tcagtttctc agcaaagcac acgctgtaaa gatccagtta tgcactatgt tctttcatgg cctgactatg aaaagccgaa tgatgatcag gttttcgatt cggtgaagtt tacactggca tcgatgggca tgtccgatca

120120

180180

240240

300300

360360

420420

480480

540540

600600

660660

720720

780780

840840

900900

960960

10201020

10801080

11401140

12001200

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

ccagtatgtt ccagtatgtt gctgccatcc gctgccatcc accgggatac agataacctg accgggatac agataacctg catgtgcatg catgtgcatg ttgctgttaa ttgctgttaa 1260 1260 ccgcatcaat ccgcatcaat ccccagacat ccccagacat ataaagcagc ctcatcgagc ataaagcagc ctcatcgagc tttaccaaag tttaccaaag acactcttca acactcttca 1320 1320 tcaggcgtgc tcaggcgtgc cgcttactgg cgcttactgg aattgaagaa tggttggtcc aattgaagaa tggttggtcc cattcaaacg cattcaaacg gtgcatatgt gtgcatatgt 1380 1380 ggttaatgac ggttaatgac cgtcaacaga cgtcaacaga ttgtccggaa ccctcacagc ttgtccggaa ccctcacagc aagaaagagc aagaaagagc ggggcaactg ggggcaactg 1440 1440 gcgctcactc gcgctcactc gatcgcatca gatcgcatca acaagatgga gaataaagag acaagatgga gaataaagag ggggttgaaa ggggttgaaa cgctctatcg cgctctatcg 1500 1500 ciaratcgtt ciaratcgtt ggigatgaac ggigatgaac aggtaggcgg tagtcgtcaa aggtaggcgg tagtcgtcaa aacttgatcc aacttgatcc atgtttcagc atgtttcagc 1560 1560 tgggcttcgt tgggcttcgt gaagccaaaa gaagccaaaa gctgggatga tgtgcataag gctgggatga tgtgcataag acatttgcag acatttgcag acatcggtct acatcggtct 1620 1620 tcgtgtcgaa tcgtgtcgaa aaagcacagg aaagcacagg ggaaaaaggg ctacgtcatt ggaaaaaggg ctacgtcatt acccacgaac acccacgaac atcaaaacca atcaaaacca 1680 1680 gaagacggct gaagacggct gttaaggcga gttaaggcga gtctggtatt taacaaggcg gtctggtatt taacaaggcg caatataccc caatataccc tgaagtcgat tgaagtcgat 1740 1740 ggaagagcgc ggaagagcgc tttggtgaat tttggtgaat accagccttc acatattgaa accagccttc acatattgaa ccggccaaag ccggccaaag tatcggtatt tatcggtatt 1800 1800 taaaaccgca taaaaccgca tatacccctg tatacccctg gtgcttatcg tcgagatgcc gtgcttatcg tcgagatgcc aataaacgtc aataaacgtc tgcagcgtaa tgcagcgtaa 1860 1860 aattgagcgc aattgagcgc gcagaagaaa gcagaagaaa gaatgctgct caaggggcgc gaatgctgct caaggggcgc tatcgcgcct tatcgcgcct accggaacaa accggaacaa 1920 1920 tttaccggta tttaccggta tattctccgg tattctccgg ataaggatcg catcgccgat ataaggatcg catcgccgat gaataccgga gaataccgga aaattgccca aaattgccca 1980 1980 acatacccgg acatacccgg ttggtgaaaa ttggtgaaaa ataacgtccg gcattctgtt ataacgtccg gcattctgtt tcagatcctc tcagatcctc ataccagaaa ataccagaaa 2040 2040 gctgatgtac gctgatgtac aacctggctg aacctggctg agttcaaacg cctgcaggcg agttcaaacg cctgcaggcg gttgccaatc gttgccaatc tgcggcttag tgcggcttag 2100 2100 cttgcgtgaa cttgcgtgaa gaacgcaacg gaacgcaacg gtttcagagc ggctaaccca gtttcagagc ggctaaccca cggctttctt cggctttctt accgggagtg accgggagtg 2160 2160 ggtcgaacag ggtcgaacag gaagcactga gaagcactga agggtgataa ggcagcgctc agggtgataa ggcagcgctc agccaaatga agccaaatga ggggctttgc ggggctttgc 2220 2220 ctattcctcc ctattcctcc aggaagaagg aggaagaagg agaagtataa acagcagctg agaagtataa acagcagctg gttgagcaga gttgagcaga tcgggttcaa tcgggttcaa 2280 2280 ccgtaccttt ccgtaccttt aacgccatca aacgccatca ccagtcatga tcgtgatgat ccagtcatga tcgtgatgat gtggccgtaa gtggccgtaa tggcctcagc tggcctcagc 2340 2340 acgtcatggt acgtcatggt gtcaagccac gtcaagccac ggcttttgaa agacggtact ggcttttgaa agacggtact gttatctttg gttatctttg agcgcgacgg agcgcgacgg 2400 2400 taaaccggta taaaccggta gcggctgatc gcggctgatc gtggtcatat tgtgctgaca gtggtcatat tgtgctgaca gaaagtaatg gaaagtaatg gaatcgacaa gaatcgacaa 2460 2460 agagaaaacg agagaaaacg gctgatcttg gctgatcttg caattgcatt aacgattgct caattgcatt aacgattgct ggtaaagcca ggtaaagcca aatctgtacg aatctgtacg 2520 2520 tgrcgatggt tgrcgatggt gacggcgagt gacggcgagt itaaggaact gigctgtaat itaaggaact gigctgtaat cgratcgtcg cgratcgtcg atgcagcrgt atgcagcrgt 2580 2580 gaaccacaat gaaccacaat caccctgtcg caccctgtcg cgcagggcat taccttcaca cgcagggcat taccttcaca gatgccgctc gatgccgctc agcaggcgta agcaggcgta 2640 2640 tgctcaaaac tgctcaaaac gagaaacatc gagaaacatc gtttgattcg tgagcaaaal gtttgattcg tgagcaaaal aatagraaaa aatagraaaa atgaaatgca atgaaatgca 2700 2700 attcagaagt attcagaagt gaaagagacg gaaagagacg acaaattcaa tccgaagtaa acaaattcaa tccgaagtaa aatggagtaa aatggagtaa gaaatgaaaa gaaatgaaaa 2760 2760 tcaaaatgca tcaaaatgca aacggtcctc aacggtcctc gcggccgttt ctgtgttagc gcggccgttt ctgtgttagc tcttgccggg tcttgccggg tgtgcctctc tgtgcctctc 2820 2820 aaagcgaaaa aaagcgaaaa ggaaaaacaa ggaaaaacaa atctctgcac agcagctggt atctctgcac agcagctggt agatcaggaa agatcaggaa ttgcgtgagc ttgcgtgagc 2880 2880 aagccattaa aagccattaa gataaaactc gataaaactc gcacaggatg agctttacca gcacaggatg agctttacca ggctggagcc ggctggagcc attaacagga attaacagga 2940 2940 cccgttacaa cccgttacaa attccctacc attccctacc attatcaatg caaacagtca attatcaatg caaacagtca gtatgttcgt gtatgttcgt gtgagctggc gtgagctggc 3000 3000 agggtgatgc agggtgatgc ttacgaatta ttacgaatta ctggagcaac tggctaaaca ctggagcaac tggctaaaca gcgtggcctt gcgtggcctt caattcacca caattcacca 3060 3060 gtcaggggat gtcaggggat taagttaccg taagttaccg cttccactca atatcgatgt cttccactca atatcgatgt tggtggttcg tggtggttcg aaggttacgt aaggttacgt 3120 3120 ttgaacagtt ttgaacagtt gctgaccctg gctgaccctg atccgacaac aaacgcagta atccgacaac aaacgcagta ccgtgccacc ccgtgccacc atcaaccaga atcaaccaga 3180 3180 aacccggtga aacccggtga actgcagctg actgcagctg ctttacctca caccatcgaa ctttacctca caccatcgaa gaaaggttca gaaaggttca ttcctcagag ttcctcagag 3240 3240

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

ggacccgccc ggacccgccc atgaaactta atgaaactta aactgatcgt aactgatcgt gcttctgacg gcttctgacg ttaccgctgc ttaccgctgc ttgctgcgaa ttgctgcgaa 3300 3300 cgttgcacgc cgttgcacgc gcggacgact gcggacgact ccgatgttaa ccgatgttaa aggcctggat aggcctggat tactacatgg tactacatgg acccgccaag acccgccaag 3360 3360 ccaaagtgac ccaaagtgac gatgaggccg gatgaggccg atgttactgg atgttactgg cagtatgcta cagtatgcta aacgacgcag aacgacgcag cgcacaccat cgcacaccat 3420 3420 tggatttcgc tggatttcgc ggcggtaagg ggcggtaagg cagaacgcgc cagaacgcgc taaagaaatt taaagaaatt cgcgccgcgc cgcgccgcgc tggaaaatca tggaaaatca 3480 3480 gcgcagcaac gcgcagcaac cttgattaca cttgattaca tgtattcgtt tgtattcgtt ccagccgctg ccagccgctg atctcttctg atctcttctg aaggctacct aaggctacct 3540 3540 gcctccagtc gcctccagtc attgctgaag attgctgaag ctaaagacgt ctaaagacgt tgcacacatt tgcacacatt accaatgagc accaatgagc aaatccgaac aaatccgaac 3600 3600 ggccaaccgt ggccaaccgt gcctatgaca gcctatgaca ttgtggtgcc ttgtggtgcc ggcgcgcttt ggcgcgcttt gtcagtaacc gtcagtaacc caccgacatg caccgacatg 3660 3660 gaaaagctat gaaaagctat cttctgaccg cttctgaccg ggctgatggc ggctgatggc gcagcggatc gcagcggatc gaattgcctg gaattgcctg aaccggcggc aaccggcggc 3720 3720 aatgccgaag aatgccgaag gacgggaaac gacgggaaac aacgtgatat aacgtgatat ctggaaaaaa ctggaaaaaa gctgtcgcgc gctgtcgcgc tgggctggtc tgggctggtc 3780 3780 tgacggtcgc tgacggtcgc caaaaagctg caaaaagctg atgagatatt atgagatatt cactgctaat cactgctaat ttcaatcgcc ttcaatcgcc tcacacggga tcacacggga 3840 3840 ttacaccggc ttacaccggc atgttgcgct atgttgcgct acagcacgct acagcacgct actgcagcag actgcagcag ggcatgatta ggcatgatta aggctccagt aggctccagt 3900 3900 catcacacag catcacacag cagcagcaaa cagcagcaaa cagttacagg cagttacagg ggataaaaac ggataaaaac cgcctcatgc cgcctcatgc tgggcgataa tgggcgataa 3960 3960 aacgaaacgt aacgaaacgt atgaagcagc atgaagcagc aagctgagtt aagctgagtt tgacatcaac tgacatcaac aaacgcagct aaacgcagct ggaaaccgac ggaaaccgac 4020 4020 catacgttaa catacgttaa ggggcagtag ggggcagtag atggaagcat atggaagcat tcaattttgg tcaattttgg tccaacgctg tccaacgctg acgccccaga acgccccaga 4080 4080 cgctggaacg cgctggaacg ttttctcgta ttttctcgta cactgctcaa cactgctcaa acaatgaagt acaatgaagt gtccgatatt gtccgatatt ctgttgcagg ctgttgcagg 4140 4140 gcggagataa gcggagataa aatctgggta aatctgggta gaacgtcatg gaacgtcatg ggcgccagtt ggcgccagtt gcccatgaca gcccatgaca tcttacccgc tcttacccgc 4200 4200 tcgacaacct tcgacaacct ggagctggaa ggagctggaa cgtaccgttg cgtaccgttg ataaggtgtt ataaggtgtt cggtcaggag cggtcaggag atcaaaggga atcaaaggga 4260 4260 cgctgaaaag cgctgaaaag tgctgcggtc tgctgcggtc gttaataccg gttaataccg ctatccagct ctatccagct aagaggtgat aagaggtgat gaagcgggca gaagcgggca 4320 4320 cgattggact cgattggact cggccgcggc cggccgcggc gaaacccgcc gaaacccgcc ggttccgcgc ggttccgcgc gaactttact gaactttact caggccgata caggccgata 4380 4380 tttataaaac tttataaaac agaagcggca agaagcggca atgtctctga atgtctctga cactccgtgt cactccgtgt tctgaatgag tctgaatgag gttattcctc gttattcctc 4440 4440 agcttaaaca agcttaaaca aatgggtatt aatgggtatt gagccggacc gagccggacc tgtttaattc tgtttaattc tctgttgccg tctgttgccg gctgccggcc gctgccggcc 4500 4500 tcggactgat tcggactgat atgcggcgag atgcggcgag acgggatcgg acgggatcgg gcaagtcaac gcaagtcaac cttgatggcc cttgatggcc agcatattcc agcatattcc 4560 4560 agtattgcgg agtattgcgg tgaaacgtac tgaaacgtac caggaccgga caggaccgga aaatcatcac aaatcatcac ggttgaagat ggttgaagat cccatcgagt cccatcgagt 4620 4620 atcgcctggg atcgcctggg aagrcgagac aagrcgagac tggattgcgc tggattgcgc cggcgccggc cggcgccggc acagtcacag acagtcacag attgggcgcg attgggcgcg 4680 4680 atattgattc atattgattc cttccacaat cttccacaat tttatcactc tttatcactc tctccgggct tctccgggct ccgtcgttct ccgtcgttct ccgaagatta ccgaagatta 4740 4740 tgggggttgg tgggggttgg tgagctcctt tgagctcctt aaccgcctgt aaccgcctgt catttgaagc catttgaagc tgctgtactg tgctgtactg gcaggtaaat gcaggtaaat 4800 4800 ccggccactt ccggccactt ttgtcttggc ttgtcttggc acactgcacg acactgcacg tcaaaacggt tcaaaacggt cggagaagcc cggagaagcc atttcccgat atttcccgat 4860 4860 cattgcagaa cattgcagaa ctatccgccg ctatccgccg gaaatgcgtg gaaatgcgtg aagctgccgc aagctgccgc ctttgacctg ctttgacctg ctgagtatcc ctgagtatcc 4920 4920 tttcttacat tttcttacat catcgtgcaa catcgtgcaa cgcttgctta cgcttgctta aaacaaaaga aaacaaaaga cggccggcgc cggccggcgc aaggctgtcc aaggctgtcc 4980 4980 gtgaatatct gtgaatatct cgtcattgat cgtcattgat aacagcctgc aacagcctgc gccgcaaact gccgcaaact ctatgacgtt ctatgacgtt gattacagca gattacagca 5040 5040 agtggggccg agtggggccg ctacatcgac ctacatcgac gacctgttga gacctgttga tcgctgaaaa tcgctgaaaa ccgcagtctg ccgcagtctg attcagaatg attcagaatg 5100 5100 cctgggcaat cctgggcaat gcaccaggaa gcaccaggaa ggtttgatcg ggtttgatcg acgaagcgga acgaagcgga agtcatcgag agtcatcgag gtcgcaggat gtcgcaggat 5160 5160 atatggacta atatggacta tctggcgtta tctggcgtta aaagagggca aaagagggca agtatggaca agtatggaca ttaacaaatg ttaacaaatg gcgttatgcc gcgttatgcc 5220 5220 ggccggccac ggccggccac tgacggtttt tgacggtttt tggtgtgcct tggtgtgcct gttatctcgt gttatctcgt ttcttgtgta ttcttgtgta cttcatctgg cttcatctgg 5280 5280 tttccgttcc tttccgttcc cgtcagtaaa cgtcagtaaa aacctttgtt aacctttgtt atctgcacct atctgcacct gtgtggttct gtgtggttct cttttacttt cttttacttt 5340 5340

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

ctgctggcca ctgctggcca tgatgggcta tgatgggcta cacgttaccg gtgctgtacc cacgttaccg gtgctgtacc aggtcattct aggtcattct ccgggttatc ccgggttatc 5400 5400 cgcgggaaaa cgcgggaaaa aacttaccgg aacttaccgg gcggccgtgg tggtaccggc gcggccgtgg tggtaccggc gctctcagcg gctctcagcg ataacacata ataacacata 5460 5460 actacagggg actacagggg tagacagtat tagacagtat ggcgaaacct gaaattgcaa ggcgaaacct gaaattgcaa ctgaaagaac ctgaaagaac ccgtctgagt ccgtctgagt 5520 5520 attccctttg attccctttg acgatcgcca acgatcgcca acgtgcaata cgtgcggccg acgtgcaata cgtgcggccg gcaaactggc gcaaactggc tgatggcagt tgatggcagt 5580 5580 aatgctctgg aatgctctgg actacgtgaa actacgtgaa ggaagaaaag gtgtggtatg ggaagaaaag gtgtggtatg cacagccggg cacagccggg ggccaacctg ggccaacctg 5640 5640 agccggctga agccggctga aagagtggat aagagtggat ttttgacccc aataaggtga ttttgacccc aataaggtga tcgaagaacc tcgaagaacc gcccctggat gcccctggat 5700 5700 attcaagcca attcaagcca ttgaagatga ttgaagatga atttacggcg tggcttgaag atttacggcg tggcttgaag agcgcggtgc agcgcggtgc cattatcaaa cattatcaaa 5760 5760 gaccccatag gaccccatag agttcgatgg agttcgatgg ccagaagcat tatgtcgata ccagaagcat tatgtcgata cagtggacgg cagtggacgg taaagctggt taaagctggt 5820 5820 tcaagaaagg tcaagaaagg gggtgtatgc gggtgtatgc cgcctttctg gatggccgac cgcctttctg gatggccgac ctgcagggtg ctgcagggtg gtacagggac gtacagggac 5880 5880 tataagaacg tataagaacg gtggtgaaat gtggtgaaat tcagaaatgg gtatctaccg tcagaaatgg gtatctaccg gcgcagcccc gcgcagcccc taaccctgaa taaccctgaa 5940 5940 caaatggcca caaatggcca tgctccgtgc tgctccgtgc tgatgctgcg gcaaggcgtg tgatgctgcg gcaaggcgtg aacaaagagc aacaaagagc tgcagcgcaa tgcagcgcaa 6000 6000 gcggataagt gcggataagt ttgatcagac ttgatcagac cgctaaccgg ttgatggaag cgctaaccgg ttgatggaag aatataaccg aatataaccg gcttccggat gcttccggat 6060 6060 gccacgggag gccacgggag atctggcata atctggcata cctgaaaaac aaacaggtca cctgaaaaac aaacaggtca ttgccgctaa ttgccgctaa cggccttaaa cggccttaaa 6120 6120 gctgatgagc gctgatgagc ggggcaacgt ggggcaacgt tgtgatccct ctgtttaatg tgtgatccct ctgtttaatg ctgatggcga ctgatggcga gttcaggacc gttcaggacc 6180 6180 cttgagcgca cttgagcgca tctggtccga tctggtccga cggtagtaaa caccttgaaa cggtagtaaa caccttgaaa aagacggcca aagacggcca ggcatggggg ggcatggggg 6240 6240 agttttttcg agttttttcg ttgtgggtgg ttgtgggtgg ccaactgaag gatggtgaca ccaactgaag gatggtgaca acctgcttta acctgcttta tgccgaggga tgccgaggga 6300 6300 tatgcgacag tatgcgacag cagccagtat cagccagtat cagcgaagcc atcaatcagc cagcgaagcc atcaatcagc ctgtgatcat ctgtgatcat gacggttaat gacggttaat 6360 6360 gccggcaaca gccggcaaca tggtggaagt tggtggaagt tgctggccgc ctgaaagaca tgctggccgc ctgaaagaca cctttccaaa cctttccaaa cagcactcat cagcactcat 6420 6420 tacttccttg tacttccttg ctgacaatga ctgacaatga catttataaa gacgagaacg catttataaa gacgagaacg ttgggctaga ttgggctaga aaaagcgaca aaaagcgaca 6480 6480 gaagctgcag gaagctgcag agctgactgc agctgactgc cggccatgtt ctggtccctg cggccatgtt ctggtccctg cctttagcaa cctttagcaa cccgaaagaa cccgaaagaa 6540 6540 gggcttactg gggcttactg actacaacga actacaacga tttgcatgtc tctgaagggc tttgcatgtc tctgaagggc tggagcaagt tggagcaagt cagattgcag cagattgcag 6600 6600 gtagaaggag gtagaaggag ccattaatca ccattaatca aatgaacagg gtagacacta aatgaacagg gtagacacta tgccgactga tgccgactga taacccgaac taacccgaac 6660 6660 attactgacg attactgacg ttaatcacag ttaatcacag ctcgactgac agcgctgccg ctcgactgac agcgctgccg ttgcagctcc ttgcagctcc tgaaaaagcc tgaaaaagcc 6720 6720 gcgccggtgg gcgccggtgg ccagcacccc ccagcacccc tgcagctgct gaaccggtgg tgcagctgct gaaccggtgg aagccgcgcc aagccgcgcc ggtggccagc ggtggccagc 6780 6780 gcccctgcag gcccctgcag ctgctgaagc ctgctgaagc ggtggaagcc gcgccggtgg ggtggaagcc gcgccggtgg ccagcgcccc ccagcgcccc tgcagctgct tgcagctgct 6840 6840 gaaccggtgg gaaccggtgg aaaccgcgcc aaaccgcgcc ggtggcaagc acccctgaag ggtggcaagc acccctgaag ctgctgaacc ctgctgaacc ggtggaagcc ggtggaagcc 6900 6900 gcgccggtgg gcgccggtgg ccagcgcccc ccagcgcccc tgcagctgcc gaaccggaat tgcagctgcc gaaccggaat acgtcgcacc acgtcgcacc aacagatcga aacagatcga 6960 6960 gacggcgatg gacggcgatg atgaagagag atgaagagag taatagcgcc agtgatcttg taatagcgcc agtgatcttg aggcgtatgc aggcgtatgc cgctatgatg cgctatgatg 7020 7020 gcctttggcg gcctttggcg gtgaaacaac gtgaaacaac tgacactgct cagcaaaagc tgacactgct cagcaaaagc ctgaagggat ctgaagggat agcgcccagc agcgcccagc 7080 7080 gaacctgtag gaacctgtag ctaataccgc ctaataccgc cccggctgaa aatgaaaccg cccggctgaa aatgaaaccg aggagaagaa aggagaa aaaaacaaac aaaaacaaac 7140 7140 gaagaactgg gaagaactgg aaaacggcat aaaacggcat acgctgggca accaacgata acgctgggca accaacgata atgcagaaac atgcagaaac gccaccaaaa gccaccaaaa 7200 7200 gaacgtatag gaacgtatag acctggaagg acctggaagg gttaattgcc cggtttgggt gttaattgcc cggtttgggt acagagcaga acagagcaga gaaagactat gaaagactat 7260 7260 acggcgtata acggcgtata cgcttgatgg cgcttgatgg gcaggatgcg ttttacgatt gcaggatgcg ttttacgatt acggttcaca acggttcaca tctgcgtatg tctgcgtatg 7320 7320 gctacccctg gctacccctg aagccagcca aagccagcca gagtgacgag atgatcctgg gagtgacgag atgatcctgg cggccgttct cggccgttct taccgcggat taccgcggat 7380 7380

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

aagcaacatc aagcaacatc atcgtggtat atcgtggtat tgaaatcacc tgaaatcacc ggcagtgacg ggcagtgacg aatttaaaga aatttaaaga gcgagtgttt gcgagtgttt 7440 7440 aaccttatca aaccttatca gtgaatacaa gtgaatacaa cattgaggtg cattgaggtg aaactgacta aaactgacta acccagaaca acccagaaca aagggttaaa aagggttaaa 7500 7500 ttgctcgaac ttgctcgaac tcaaaaaagc tcaaaaaagc aaatgaaaca aaatgaaaca gcaaaagaaa gcaaaagaaa cggcaaaaga cggcaaaaga aaatgttgct aaatgttgct 7560 7560 gattcaaatg gattcaaatg cgaataagca cgaataagca ggaaggggca ggaaggggca aacgaaaagg aacgaaaagg caaattcatc caaattcatc agttcagcag agttcagcag 7620 7620 aatggaatgc aatggaatgc gctgggaaga gctgggaaga atcggcctct atcggcctct gtacagccga gtacagccga agaagcagaa agaagcagaa tgcatctgat tgcatctgat 7680 7680 actcaaaagg actcaaaagg aagataaagc aagataaagc tgcgggtgaa tgcgggtgaa tcctgggaga tcctgggaga aaggcgttat aaggcgttat cgtcgcgcat cgtcgcgcat 7740 7740 ggacgtgcta ggacgtgcta agtargagtg agtargagtg gaaagatgat gaaagatgat gaarccatga gaarccatga actactttgt actactttgt caccctcaaa caccctcaaa 7800 7800 aatgaacatg aatgaacatg gagagaagac gagagaagac actctggggg actctggggg aaagaccttg aaagaccttg agagagcggt agagagcggt taaagatgct taaagatgct 7860 7860 ggtgtagaca ggtgtagaca ccgaacgtct ccgaacgtct tgttacagtc tgttacagtc agaaagctgg agaaagctgg gatttgtgga gatttgtgga tgttgaggtg tgttgaggtg 7920 7920 aatgcacctg aatgcacctg tccgtgatga tccgtgatga aagcaacaag aagcaacaag atcgttcgtt atcgttcgtt atgaaactat atgaaactat ccagaccaaa ccagaccaaa 7980 7980 cgtaatgagt cgtaatgagt gggaagtaaa gggaagtaaa acctgtatac acctgtatac ccacagccaa ccacagccaa cagcagggaa cagcagggaa tgaacaggcc tgaacaggcc 8040 8040 tataagcctt tataagcctt ctgaactggt ctgaactggt tccgtatgat tccgtatgat gctgcaacct gctgcaacct tccagaagct tccagaagct ccgcacaaca ccgcacaaca 8100 8100 attcagcaga attcagcaga ttaccggrgi ttaccggrgi tgatcrcagc tgatcrcagc cgtgaggccg cgtgaggccg rgccrgaaaa rgccrgaaaa agaactgtar agaactgtar 8160 8160 tggrtcctgc tggrtcctgc cgaatggraa cgaatggraa gccagctcct gccagctcct gaaagcatga gaaagcatga caaaacccac caaaacccac aggctataaa aggctataaa 8220 8220 ctccctcaag ctccctcaag agtcaaaaac agtcaaaaac cgcgggtaca cgcgggtaca cctttgctgg cctttgctgg tcgcaccgca tcgcaccgca taaaaaaggc taaaaaaggc 8280 8280 gaacgcccgg gaacgcccgg attattacct attattacct tgttgagtct tgttgagtct cgtaaaggat cgtaaaggat tcatgcaggg tcatgcaggg gatcgcaaag gatcgcaaag 8340 8340 gataaggaat gataaggaat ctggcgagta ctggcgagta ccatagcgta ccatagcgta attggtaaag attggtaaag tgaacaagcg tgaacaagcg tattgataaa tattgataaa 8400 8400 gatggaaact gatggaaact ggaaaacgta ggaaaacgta tatgacactt tatgacactt tcagcaatca tcagcaatca ataaaaatgc ataaaaatgc agaaagtgga agaaagtgga 8460 8460 attgttttgc attgttttgc acggatacgg acggatacgg ccatgttgat ccatgttgat cagggaggta cagggaggta aaaacctgct aaaacctgct ttacaaaaac ttacaaaaac 8520 8520 acaattgcaa acaattgcaa atgaaaaaca atgaaaaaca gcctcagcat gcctcagcat ttacaaccgg ttacaaccgg cctcagatga cctcagatga ggtaaaaaac ggtaaaaaac 8580 8580 aaaacagtaa aaaacagtaa tgaagcagct tgaagcagct ttttcatcct ttttcatcct tctaatgctg tctaatgctg caaaaagaaa caaaaagaaa agatgatgaa agatgatgaa 8640 8640 aggagagaac aggagagaac agactcatgc agactcatgc accagtcgca accagtcgca aagtcagcgc aagtcagcgc ctcggccata ctcggccata aaacaaaaac aaacaaaaac 8700 8700 cctactcgta cctactcgta gcagtagggt gcagtagggt tttcctgcat tttcctgcat ttctgtgagc ttctgtgagc tcatttgcag tcatttgcag ccacacagac ccacacagac 8760 8760 ctgtgcagca ctgtgcagca tacgaactgg tacgaactgg caaaagctgg caaaagctgg tgctgatgct tgctgatgct gcctataaac gcctataaac aggaggttga aggaggttga 8820 8820 acggattaac acggattaac aacgccgcta aacgccgcta aaagtgaatc aaagtgaatc cagtacatct cagtacatct gattctctcg gattctctcg gacagtgcct gacagtgcct 8880 8880 ggggtcgcta ggggtcgcta tcggtatcac tcggtatcac taaaaatccc taaaaatccc tcaatttccg tcaatttccg tctatcagcg tctatcagcg acatcattga acatcattga 8940 8940 taaggtgaag taaggtgaag gatgaggtat gatgaggtat gcaatacggt gcaatacggt taaatcgaag taaatcgaag ataaatgaga ataaatgaga agtgggggag agtgggggag 9000 9000 cctgactaat cctgactaat acaacgcrgg acaacgcrgg acccgtggtc acccgtggtc aacgatttca aacgatttca tcccgactgc tcccgactgc cagatacgtc cagatacgtc 9060 9060 aggtatcctg aggtatcctg cccaacgcat cccaacgcat cttctaagaa cttctaagaa tgtgcaatta tgtgcaatta aacaatccgg aacaatccgg cagctgcgag cagctgcgag 9120 9120 tggaagtggt tggaagtggt gaggatgcaa gaggatgcaa acagtgatgc acagtgatgc attcccgttc attcccgttc catttgtaac catttgtaac taccggaaga taccggaaga 9180 9180 gtcctttcgg gtcctttcgg gattttatcg gattttatcg aatagcttgc aatagcttgc cggttcgtat cggttcgtat ttcaacgcgg ttcaacgcgg cggtgttccg cggtgttccg 9240 9240 ccgcggttag ccgcggttag taaacgcata taaacgcata aattctgtgg aattctgtgg caggtagaac caggtagaac atcacgtttt atcacgtttt gagtctacat gagtctacat 9300 9300 acgtatcaag acgtatcaag cgaatcttca cgaatcttca ttcatgaaac ttcatgaaac gtctgacagt gtctgacagt atgcagccag atgcagccag tcttcagctg tcttcagctg 9360 9360 atttcatatt atttcatatt ttttgagctc ttttgagctc atcgtcgctc atcgtcgctc atctcggcaa atctcggcaa acgctgcagg acgctgcagg tcggcgacct tcggcgacct 9420 9420 tttcctgtcc tttcctgtcc aggttatgga aggttatgga ctttccatca ctttccatca acttcgatcc acttcgatcc ggtacttcac ggtacttcac ttttccaaaa ttttccaaaa 9480 9480

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

gtggatttac gtggatttac ttttcgtgga ttttcgtgga cggaccaaag agattttcga cggaccaaag agattttcga agatctggag agatctggag agcttcatca agcttcatca 9540 9540 gccgtaatat gccgtaatat tgtgttcttc tgtgttcttc catgaaccgc tttgtggctg catgaaccgc tttgtggctg cggctttctc cggctttctc ttcagtggcc ttcagtggcc 9600 9600 ttctgttctt ttctgttctt ccttaaattt ccttaaattt ctcgatcatt ccctgtgcaa ctcgatcatt ccctgtgcaa tgtcggacca tgtcggacca catattaatg catattaatg 9660 9660 agttgctcaa agttgctcaa ggttttctgg ggttttctgg cggaattttg cgcaaaacgg cggaattttg cgcaaaacgg cggtggcttt cggtggcttt tcgtcgttcg tcgtcgttcg 9720 9720 cacatgataa cacatgataa ctgcacagga ctgcacagga ttcgtaatca ttatgttcgc ttcgtaatca ttatgttcgc tcatgtatac tcatgtatac ctcattgttc ctcattgttc 9780 9780 attaacgatc attaacgatc tgcgtgattt tgcgtgattt tctaacacaa acttttgaaa tctaacacaa acttttgaaa agagaaactc agagaaactc tatgaaaaca tatgaaaaca 9840 9840 caaaatggtg caaaatggtg aaaatattat aaaatattat ggatcaaact gactcggatc ggatcaaact gactcggatc aaaactcagt aaaactcagt cgttgatgat cgttgatgat 9900 9900 gacagcaacg gacagcaacg cccttgctcc cccttgctcc agctctggct gaagagagta agctctggct gaagagagta accgaacggt accgaacggt acaagaaatc acaagaaatc 9960 9960 gtatcgaaac gtatcgaaac atggtttaaa atggtttaaa agtaattttg attcaaacgc agtaattttg attcaaacgc taatcatatt taatcatatt agtcgcaatc agtcgcaatc 10020 10020 attatcattg attatcattg gtcttcaggg gtcttcaggg ttactggctt caccagaaaa ttactggctt caccagaaaa aaatcaaata aaatcaaata tattgcaacg tattgcaacg 10080 10080 aatgggggca aatgggggca tgatcacaga tgatcacaga agttcatcca accgatgaac agttcatcca accgatgaac ccgcttacac ccgcttacac ggcggaagag ggcggaagag 10140 10140 gtgatggact gtgatggact ttgccaaccg ttgccaaccg tacaatgatc aaatcgcttt tacaatgatc aaatcgcttt cactgaactt cactgaactt Tgtgaattac Tgtgaattac 10200 10200 gaaaaccaat gaaaaccaat taaccagcgt taaccagcgt ccgcggcgat tttagcgctg ccgcggcgat tttagcgctg aagggtacgt aagggtacgt tagtttccgt tagtttccgt 10260 10260 aaagcgctgt aaagcgctgt ccgatagtgg ccgatagtgg gctgctgaaa gatatcagtg gctgctgaaa gatatcagtg aaaaacgtct aaaaacgtct gaacgtaaaa gaacgtaaaa 10320 10320 ctttccacaa ctttccacaa ctcctggaac ctcctggaac cctgatcacg gaaggtctta cctgatcacg gaaggtctta tccgtggcac tccgtggcac caaaacctat caaaacctat 10380 10380 gcctggcaat gcctggcaat accgcattcc accgcattcc ggtgactgtt cagcttgttg ggtgactgtt cagcttgttg ggcaggctca ggcaggctca ggactacaga ggactacaga 10440 10440 ccgcaacctt ccgcaacctt acgatttgat acgatttgat ggttcaggta cgccgcgtca ggttcaggta cgccgcgtca aagaagacga aagaagacga agatccacgg agatccacgg 10500 10500 ggtattcaag ggtattcaag tagcacaggc tagcacaggc cattctcaaa ccccggaact cattctcaaa ccccggaact actgaggtca actgaggtca atcatgaaga atcatgaaga 10560 10560 ttaaactgtt ttaaactgtt aactgtactt aactgtactt atggccgcac tgttttcggc atggccgcac tgttttcggc aaattctgta aaattctgta tctgcagctg tctgcagctg 10620 10620 atgcgccgac atgcgccgac tggtaatgga tggtaatgga gcgccgcagc aaacggcgcc gcgccgcagc aaacggcgcc agctgtgcct agctgtgcct ggtggtgata ggtggtgata 10680 10680 ttgctcaatg ttgctcaatg gcagcaggcc gcagcaggcc agttccgggt tgcccgtaaa agttccgggt tgcccgtaaa tcagcagtca tcagcagtca caggtgcaac caggtgcaac 10740 10740 agcctccaca agcctccaca gcaaacagca gcaaacagca caggaacaag gtcagcagca caggaacaag gtcagcagca ggcgcaaggc ggcgcaaggc caacaaccac caacaaccac 10800 10800 aggcacaggc aggcacaggc ccaacagcgg ccaacagcgg ccaacgactg cactgcctcc ccaacgactg cactgcctcc tgcacccatg tgcacccatg ccgcagattc ccgcagattc 10860 10860 ciccaccaca ciccaccaca gcagcaggtt gcagcaggtt actcatgtta atccgcagac actcatgtta atccgcagac actggaagag actggaagag ttacctgcac ttacctgcac 10920 10920 ctgttctgca ctgttctgca gcagatccag gcagatccag cctattaccc ctggtcaggt cctattaccc ctggtcaggt gcggtcggcc gcggtcggcc cgcagcgcaa cgcagcgcaa 10980 10980 tggaagatat tggaagatat gagcgcggcg gagcgcggcg gccaaaacct caccattaac gccaaaacct caccattaac gccgatccca gccgatccca cgaatttcaa cgaatttcaa 11040 11040 gccagacggt gccagacggt atcactgtca atcactgtca gctggcgcat ccattccgca gctggcgcat ccattccgca ggtacgggta ggtacgggta tttccaaacc tttccaaacc 11100 11100 aggcaacgac aggcaacgac agtgacgttt agtgacgttt tcagatgcaa ccggacaccc tcagatgcaa ccggacaccc ctgggtatta ctgggtatta ggtgcccctc ggtgcccctc 11160 11160 catataattc catataattc gagtccctgt gagtccctgt gcttcaggtg gtgaactgtg gcttcaggtg gtgaactgtg tgttggctat tgttggctat attccaggat attccaggat 11220 11220 cggcggtatt cggcggtatt cacaatccag cacaatccag ccgaccaatg cctatgccag ccgaccaatg cctatgccag cgggaacatc cgggaacatc acagtgcttc acagtgcttc 11280 11280 tgaaggggct tgaaggggct ggccacgccg ggccacgccg gtcattatta acgtgaaggg gtcattatta acgtgaaggg ggcagaaccc ggcagaaccc tccgttaaat tccgttaaat 11340 11340 caaaaaccgt caaaaaccgt tgatgttgat tgatgttgat tatcgtctgg atctccgtat tatcgtctgg atctccgtat cccgaagcgc cccgaagcgc agtcctgaca agtcctgaca 11400 11400 caccggttta caccggttta taccgctacg taccgctacg cctgagaaaa aaatctcact cctgagaaaa aaatctcact gtatgacaag gtatgacaag cagctgcaga cagctgcaga 11460 11460 gcgtgctcga gcgtgctcga tggcatcccg tggcatcccg cctgaagatg ctcagcggtt cctgaagatg ctcagcggtt gaaacttaaa gaaacttaaa aacgcgccag aacgcgccag 11520 11520

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

ggagtaccaa ggagtaccaa agtctggcag agtctggcag atcggtgatg atcggtgatg agctctacgt agctctacgt cagaagtaac cagaagtaac atgcagctgc atgcagctgc 11580 11580 aggatgagtt aggatgagtt tgaaaaaacg tgaaaaaacg ctttccgcta ctttccgcta tcgatggcac tcgatggcac acatgtttac acatgtttac gtgctgccgg gtgctgccgg 11640 11640 caacaccagt caacaccagt gctgactttt gctgactttt tctgttaatg tctgttaatg gtcaggcgcg gtcaggcgcg tgacgttgaa tgacgttgaa gttgagctga gttgagctga 11700 11700 attaagggga attaagggga acgacgatgg acgacgatgg ctacagataa ctacagataa aggtaaagaa aggtaaagaa accagaaaaa accagaaaaa tgatgctcta tgatgcta 11760 11760 cgtcggtggt cgtcggtggt gctgctgcag gctgctgcag tggtggcgct tggtggcgct tctgggaggg tctgggaggg tactggttgt tactggttgt ttggctcatc ttggctcatc 11820 11820 agatgagccg agatgagccg gcaacgggcg gcaacgggcg ggtcgcaggt ggtcgcaggt gaaagcccag gaaagcccag gggctggaag gggctggaag ggaaaactgg ggaaaactgg 11880 11880 cagggaaaaa cagggaaaaa gctaatgatc gctaatgatc cccaatacaa cccaatacaa caagctgctg caagctgctg aatgagtgga aatgagtgga atgttgataa atgttgataa 11940 11940 ttcagataaa ttcagataaa gcggctctca gcggctctca caggggatag caggggatag cttcatctcc cttcatctcc acgttgtcag acgttgtcag ccagtaatcc ccagtaatcc 12000 12,000 ggtggccgtt ggtggccgtt gattacggca gattacggca ccaaagcacc ccaaagcacc gccaccaaaa gccaccaaaa tattcgtggg tattcgtggg aatcgtcagc aatcgtcagc 12060 12060 aaagccgtcg aaagccgtcg ggcgataaca ggcgataaca gtaaggcgaa gtaaggcgaa tgatgctgag tgatgctgag cagaaagagc cagaaagagc gtgagcgtca gtgagcgtca 12120 12120 ggctaaagcg ggctaaagcg gtggctacgt gtggctacgt tactgcagaa tactgcagaa aatagaccag aatagaccag gccagaacac gccagaacac cagttgtcac cagttgtcac 12180 12180 gggtgttgct gggtgttgct cttgcaaccc cttgcaaccc ctctgggagc ctctgggagc agaaggaaat agaaggaaat gacaagaacg gacaagaacg gcggtacctt gcggtacctt 12240 12240 ctcagggtgg ctcagggtgg accgattcgg accgattcgg tctatccgca tctatccgca gaacaaaaag gaacaaaaag ccggatgctg ccggatgctg aaaaacaaca aaaaacaaca 12300 12300 gggggcgaag gggggcgaag aataaggcca aataaggcca aagataaagg aagataaagg agcccggctt agcccggctt gtatcggctt gtatcggctt acacgcttgt acacgcttgt 12360 12360 gccggcagta gccggcagta atggatacgg atggatacgg cgatggacag cgatggacag tgacgatcag tgacgatcag aacagtattg aacagtattg ctattgccca ctattgccca 12420 12420 tgttccaact tgttccaact ggagcgcagg ggagcgcagg ccggcgccaa ccggcgccaa attctattct attctattct ggccaaaacc ggccaaaacc gtcttgccgg gtcttgccgg 12480 12480 cgatggtatt cgatggtatt cgaattcact cgaattcact tcaccggcat tcaccggcat ggagctgaac ggagctgaac ggagtgcagt ggagtgcagt gtaaggtcga gtaaggtcga 12540 12540 tgcgtatggc tgcgtatggc gtggcttccg gtggcttccg actcgttgcg actcgttgcg cgcggccgtt cgcggccgtt tcctcaaatg tcctcaaatg taaataaccg taaataaccg 12600 12600 ctggttcagc ctggttcagc cgtattattc cgtattattc tgccggctgt tgccggctgt cgctaacgga cgctaacgga ttaggccgaa ttaggccgaa ctggtcagct ctggtcagct 12660 12660 ctatgcggac ctatgcggac agcaattcgc agcaattcgc agatgattat agatgattat cactgacggc cactgacggc gggaacgcat gggaacgcat atcgttcaac atcgttcaac 12720 12720 tgatacacct tgatacacct gatggcaaag gatggcaaag cggtagccgg cggtagccgg taccattatt taccattatt ggcgggatgg ggcgggatgg gtgagcaagc gtgagcaagc 12780 12780 agggcgtgtc agggcgtgtc ctggccgacg ctggccgacg atgcagcccg atgcagcccg cctgccgatt cctgccgatt aagcaggtta aagcaggtta cggttgaccg cggttgaccg 12840 12840 taaccaactc taaccaactc ataggcatcc ataggcatcc agtttgtcgc agtttgtcgc gccagtgtat gccagtgtat gaaagcgact gaaagcgact gtggcgagaa gtggcgagaa 12900 12900 tttggaaaat tttggaaaat gcttcrgcag gcttcrgcag agcaggcgca agcaggcgca gcagcaagca gcagcaagca actccgacac actccgacac tatctagtgt tatctagtgt 12960 12960 gcaacctcag gcaacctcag cagatgcctc cagatgcctc agcctccggc agcctccggc tcctaattac tcctaattac cctcagcaaa cctcagcaaa actttccaag actttccaag 13020 13020 ctaccccggc ctaccccggc tacgggtatg tacgggtatg gcaccaataa gcaccaataa cccgtattac cccgtattac cgttaaggag cgttaaggag attgataatg attgataatg 13080 13080 aatctgtttg aatctgtttg aagatgacaa aagatgacaa taaaaaagaa taaaaaagaa gcagctcctg gcagctcctg cccaggaacc cccaggaacc ggtgtctgct ggtgtctgct 13140 13140 aagactgctg aagactgctg aaaagccaaa aaaagccaaa accgacagtg accgacagtg acgccagcag acgccagcag caaaagcaaa caaaagcaaa caaaaagccg caaaaagccg 13200 13200 cttaagatta cttaagatta gtgactatgc gtgactatgc atggattggt atggattggt ggtatcgctg ggtatcgctg tcatagctat tcatagctat cctgctttta cctgctttta 13260 13260 gtctggttgt gtctggttgt ttgggggctc ttgggggctc cgatagtggc cgatagtggc actgcgcctg actgcgcctg cggccgggaa cggccgggaa tggcacgatc tggcacgatc 13320 13320 cagtcttcag cagtcttcag ggcaacgtca ggcaacgtca gaacgtacag gaacgtacag gctgcccctg gctgcccctg ccgggcagga ccgggcagga ttctggtgac ttctggtgac 13380 13380 ttccgcgagc ttccgcgagc agatttccgg agatttccgg gattttgctg gattttgctg cagcaaaagg cagcaaaagg aacggctgga aacggctgga cgcgatagaa cgcgatagaa 13440 13440 tcaacttcta tcaacttcta aaaatggaat aaaatggaat gatgatcctt gatgatcctt tccagtcagt tccagtcagt tacaaagcgc tacaaagcgc taatgagcaa taatgagcaa 13500 13500 atcaaaaatc atcaaaaatc tgaacaatca tgaacaatca ggttcaggaa ggttcaggaa ctgaaaatga ctgaaaatga aagccgctgg aagccgctgg ttatgggcct ttatgggcct 13560 13560 tcatttagta tcatttagta atcagagtgg atcagagtgg aacaatttcg aacaatttcg ggggcaacgt ggggcaacgt cgcaggcatt cgcaggcatt acctttgttg acctttgttg 13620 13620

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

agaggttttt agaggttttt caattaatga caattaatga tttatctggc gatcttgctt tttatctggc gatcttgctt gggtaaaata gggtaaaata caaaaaccag caaaaaccag 13680 13680 acgtatgctg acgtatgctg tgaaggtcgg tgaaggtcgg tagtcaactt ggcggagtca tagtcaactt ggcggagtca ccattacggg ccattacggg tatcgatact tatcgatact 13740 13740 gaaaatagaa gaaaatagaa tcgttactac tcgttactac aagtaaaggc cttatccgct aagtaaaggc cttatccgct aaacaggacc aaacaggacc taaaaaggcg taaaaaggcg 13800 13800 aaactatgga aaactatgga tttagaatcg tttagaatcg gtattaattc aggttgctaa gtattaattc aggttgctaa cggtggtcag cggtggtcag gaaccgctga gaaccgctga 13860 13860 caaggctaat caaggctaat cataggtgtc cataggtgtc gctgcagtcg ttgggatcat gctgcagtcg ttgggatcat tggtgttatt tggtgttatt ggatatctga ggatatctga 13920 13920 rgagcctgcg rgagcctgcg gaagcaggcc gaagcaggcc aggcattcaa caaaaggtgr aggcattcaa caaaaggtgr ggaagttggc ggaagttggc agaattttrg agaattttrg 13980 13980 ccggtatcat ccggtatcat cttctgtgta cttctgtgta tgcctcatca cgttgaaggc tgcctcatca cgttgaaggc acagatgaac acagatgaac tcaggcggrg tcaggcggrg 14040 14040 ccactttagg ccactttagg atttggcgat atttggcgat gttagcttcg gacccgtcag gttagcttcg gacccgtcag ttatgcgagc ttatgcgagc gaatctacgt gaatctacgt 14100 14100 ttggcatggg ttggcatggg agccgcagca agccgcagca gtcaacgcag tgctggggat gtcaacgcag tgctggggat tgttagaatt tgttagaatt ctcggcgcat ctcggcgcat 14160 14160 acttttttta acttttttta caggggtata caggggtata aaggggttga aagactctta aaggggttga aagactctta ccttgagggc ccttgagggc catacggagc catacggagc 14220 14220 tgtcagcttc tgtcagcttc gggtacgaga gggtacgaga ggggcatcca ttgtgaaaat ggggcatcca ttgtgaaaat tgtatgtgga tgtatgtgga ctacttctga ctacttctga 14280 14280 tgttcgatac tgttcgatac acaaacgctc acaaacgctc gatgcgttgc agagcacatt gatgcgttgc agagcacatt aaacattcac aaacattcac tggtaatcaa tggtaatcaa 14340 14340 aaaggatact aaaggatact ttatgaaaat ttatgaaaat tgttaagctt atcaaagaca tgttaagctt atcaaagaca aggcattatc aggcattatc tgcatccatc tgcatccatc 14400 14400 gcagcgtatc gcagcgtatc agctgcgcgg agctgcgcgg aacggtggca aaatcgttag aacggtggca aaatcgttag tggtattgcc tggtattgcc gctggcatta gctggcatta 14460 14460 ctgagcaaag ctgagcaaag aggctgcggc aggctgcggc tgaaacgact gtctgggaga tgaaacgact gtctgggaga aaatcaatac aaatcaatac cttcacggaa cttcacggaa 14520 14520 ggtcttgcca ggtcttgcca gtacccagcc gtacccagcc tggtctgatt accggcggta tggtctgatt accggcggta aagtcattgg aagtcattgg tgttgtgttc tgttgtgttc 14580 14580 tttattgtcg tttattgtcg ggcttgtttc ggcttgtttc tcttttcctt aaaaacaaac tcttttcctt aaaaacaaac gcgggaaaga gcgggaaaga tatcagtggc tatcagtggc 14640 14640 agcttcatct agcttcatct tctggtcaat tctggtcaat ggttgttggt gcttgcctgg ggttgttggt gcttgcctgg tcggcctgac tcggcctgac cgcatggatc cgcatggatc 14700 14700 tcttctgttg tcttctgttg gttcaactgt gttcaactgt tggcgttgac gcaaccctgt tggcgttgac gcaaccctgt aatgtccctt aatgtccctt cggccccgcc cggccccgcc 14760 14760 ttgcggggcc ttgcggggcc aatatcggag aatatcggag ttccctcatg aaagatttta ttccctcatg aaagatttta agctcaccag agctcaccag gaatgaacaa gaatgaacaa 14820 14820 cctgccagat cctgccagat gccatgtgtg gccatgtgtg cgggataaag agcaaagatg cgggataaag agcaaagatg ttttctccct ttttctccct cgcagaagat cgcagaagat 14880 14880 ggacagaaag ggacagaaag agagaatgct agagaatgct ttgctctgta tgcctgtcgc ttgctctgta tgcctgtcgc tcgaacatcc tcgaacatcc ggagaaaatg ggagaaaatg 14940 14940 aaactagaga aaactagaga ctcaaaccgg ctcaaaccgg acttctgctg aagagaaata acttctgctg aagagaaata caaaccgaaa caaaccgaaa actctacagc actctacagc 15000 15,000 ctgcrgtTtc ctgcrgtTtc gttcaartgc gttcaartgc aaaggcggaa aagtcaacgg aaaggcggaa aagtcaacgg acgartctra acgartctra ccgtgaaaag ccgtgaaaag 15060 15060 gcgcagaaac gcgcagaaac ttaaacagat ttaaacagat attgctcagc acaactgacg attgctcagc acaactgacg tagttctaaa tagttctaaa cgaaaccggc cgaaaccggc 15120 15120 agtgatgatg agtgatgatg gatacgattt gatacgattt actgcacctg ataaaaaaac actgcacctg ataaaaaaac accatcagtt accatcagtt acttcccatg acttcccatg 15180 15180 aattttgacg aattttgacg atgagtttgt atgagtttgt cgcttctgtt gcagagtcag cgcttctgtt gcagagtcag acgaattgcc acgaattgcc ggatgtaagt ggatgtaagt 15240 15240 gactggaatg gactggaatg aaatttacaa aaatttacaa gggtaagaga ggttttaaat gggtaagaga ggttttaaat gatttctttc gatttctttc tttgaggatg tttgaggatg 15300 15300 tgatcgaagg tgatcgaagg tatctcacgc tatctcacgc aatctgacat caaatgactc aatctgacat caaatgactc gttaaaatac gttaaaatac tgtgatttga tgtgatttga 15360 15360 caacggttgt caacggttgt agggcttacg agggcttacg tcgcaggatc gcgttgagca tcgcaggatc gcgttgagca tcctgaaatc tcctgaaatc agggctccgt agggctccgt 15420 15420 acattctgac acattctgac cactaagaac cactaagaac aacgattttc ttaccgttat aacgattttc ttaccgttat tgaggttcag tgaggttcag ggcgctaaat ggcgctaaat 15480 15480 catcgtttga catcgtttga cgagaagtcg cgagaagtcg tttaatgact tcatcatgca tttaatgact tcatcatgca cctatcaaac cctatcaaac tccttgtcga tccttgtcga 15540 15540 attcctttat attcctttat taacagcggc taacagcggc cataagttgt ctgtggtgtt cataagttgt ctgtggtgtt cgaacgcgac cgaacgcgac tttaccaaga tttaccaaga 15600 15600 accaggaaga accaggaaga gctgaataat gctgaataat gtttataaac cgcaggtagc gtttataaac cgcaggtagc agcaatagag agcaatagag cgtctgcaga cgtctgcaga 15660 15660

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

tagacattaa tagacattaa agacctgatc agacctgatc gccgatgacg gccgatgacg caaaaaaaat caaaaaaaat cgccgctcat cgccgctcat tacagccgtg tacagccgtg 15720 15720 aacgcgctta aacgcgctta catcgtgctg catcgtgctg tatacctcga tatacctcga aggggatgat aggggatgat tgcgaaggat tgcgaaggat gaacttaaaa gaacttaaaa 15780 15780 acgaacaggc acgaacaggc aaaagctgcc aaaagctgcc ggcgtactga ggcgtactga aggatatccc aggatatccc gcagacgcgc gcagacgcgc ttcagtcaga ttcagtcaga 15840 15840 acccaatcga acccaatcga atttcagctt atttcagctt gaaggtttga gaaggtttga agatcacgca agatcacgca tgacgcgatg tgacgcgatg ctgtggcgcc ctgtggcgcc 15900 15900 tgattggtat tgattggtat gcttcagggg gcttcagggg gatgatgaat gatgatgaat caggaatggg caggaatggg gcttctggtr gcttctggtr gatgtcctcg gatgtcctcg 15960 15960 atgtcaaaca atgtcaaaca cgctggcgca cgctggcgca atgatgcgtc atgatgcgtc agatgctgtt agatgctgtt ccggaattca ccggaattca acatcagaaa acatcagaaa 16020 16020 actggtaccc actggtaccc tcgcacgccg tcgcacgccg tttgaccaaa tttgaccaaa atctgcgaat atctgcgaat ttatggcgcc ttatggcgcc ccacggaaag ccacggaaag 16080 16080 acaatatcga acaatatcga ctccgtgctg ctccgtgctg ccgccgcggc ccgccgcggc tgaatatcca tgaatatcca gatcatggaa gatcatggaa ggggaactgg ggggaactgg 16140 16140 aagaagatgg aagaagatgg tggcctgatt tggcctgatt tactgtgatg tactgtgatg gtaagtatta gtaagtatta cggctctgtt cggctctgtt gcccttgagt gcccttgagt 16200 16200 taccaccact taccaccact tcaccctgtc tcaccctgtc aaatttaagc aaatttaagc agttattcaa agttattcaa cgcgattaac cgcgattaac cggaaaatcc cggaaaatcc 16260 16260 cgtaccggat cgtaccggat aaaatatgac aaaatatgac tttataggcg tttataggcg ggggcaaaaa ggggcaaaaa agcactgttc agcactgttc tggccatcag tggccatcag 16320 16320 taatcatatc taatcatatc tttccttcgt tttccttcgt ttcattccct ttcattccct cactcggtaa cactcggtaa tatcgcgcgt tatcgcgcgt gatatggatt gatatggatt 16380 16380 atgtccgggc atgtccgggc ccagagcgaa ccagagcgaa accgatccaa accgatccaa cggctatcat cggctatcat ggccatcaac ggccatcaac tttgccacct tttgccacct 16440 16440 ggggcgacac ggggcgacac taaggatgaa taaggatgaa gccaaacgca gccaaacgca acctggcggc acctggcggc tttaactaag tttaactaag gcgattgaag gcgattgaag 16500 16500 gctggggtgt gctggggtgt atcaggtgtg atcaggtgtg tccaagacat tccaagacat atggcaatcc atggcaatcc aggtagcgca aggtagcgca ctgattgcat ctgattgcat 16560 16560 ccgtrccggg ccgtrccggg gctgacgacg gctgacgacg gccacaccig gccacaccig gctcairgca gctcairgca ttatccgccg ttatccgccg trgagtgaag trgagtgaag 16620 16620 gcttgcggat gcttgcggat gttacctttt gttacctttt gaacgtccgg gaacgtccgg ccagiccctg ccagiccctg gcatggtaaa gcatggtaaa ggcaatarca ggcaatarca 16680 16680 acttcatcac acttcatcac gctcgatggc gctcgatggc aagctgttcc aagctgttcc cctatcaaat cctatcaaat cgccagtccc cgccagtccc ctgcaggaga ctgcaggaga 16740 16740 aatttaccga aatttaccga tgtcatcacc tgtcatcacc ggtgttcctg ggtgttcctg gttccggtaa gttccggtaa aagcgtgctg aagcgtgctg gccaaccgcc gccaaccgcc 16800 16800 ttaacctgag ttaacctgag ttcgatttac ttcgatttac cgggctgata cgggctgata aaaaactgcc aaaaactgcc ttatctgacc ttatctgacc atcattgata atcattgata 16860 16860 agggctacag agggctacag tgcaaaaggt tgcaaaaggt atcgccgatc atcgccgatc tgattagcgc tgattagcgc tgagctgccg tgagctgccg tcagagaaac tcagagaaac 16920 16920 gtcaccagat gtcaccagat tgccagtatc tgccagtatc accctgaaca accctgaaca atgacgaatc atgacgaatc gcactgtatt gcactgtatt aacatctgcg aacatctgcg 16980 16980 atacgcagtt atacgcagtt aggttcaagg aggttcaagg tatctgacgc tatctgacgc agtttgagga agtttgagga agtattctta agtattctta aagcagatgc aagcagatgc 17040 17040 ttaacgcatt ttaacgcatt ctgtattgat ctgtattgat ccggcaattg ccggcaattg gccagccgcc gccagccgcc agatgcaatg agatgcaatg agcgttggcc agcgttggcc 17100 17100 aaatcgtcag aaatcgtcag taaggttgta taaggttgta tcaaacgtat tcaaacgtat acaaagcaaa acaaagcaaa agcgcattca agcgcattca agtgctaact agtgctaact 17160 17160 tgtttaagta tgtttaagta taacgacccg taacgacccg gtgattaatg gtgattaatg aagctctgaa aagctctgaa agaatcaggt agaatcaggt ctggataaag ctggataaag 17220 17220 agcttggtga agcttggtga agactggttt agactggttt gaaagagcta gaaagagcta catggtggga catggtggga agtcgttgat agtcgttgat aagctgtttg aagctgtttg 17280 17280 ccaaaaaata ccaaaaaata tcttcatgct tcttcatgct gcgacggttg gcgacggttg ctcagcgtta ctcagcgtta tgctgtgcca tgctgtgcca accattcacg accattcacg 17340 17340 attttattgc attttattgc tgaactacaa tgaactacaa actgaatcat actgaatcat ttaaaaacca ttaaaaacca atacgctgac atacgctgac gtaaaagtra gtaaaagtra 17400 17400 atgggagtga atgggagtga gcctgtagta gcctgtagta ggcttcgttg ggcttcgttg cacgttgctt cacgttgctt ccaggctgct ccaggctgct gcagctgagt gcagctgagt 17460 17460 atgccatttt atgccatttt ctcagggata ctcagggata acggtttatg acggtttatg atttcagccc atttcagccc ggagactcgc ggagactcgc attgcgatcc attgcgatcc 17520 17520 tggacatgca tggacatgca aaacgtcctc aaacgtcctc ggtgacagaa ggtgacagaa cgacacctgc cgacacctgc aggtaagctc aggtaagctc aagtccggca aagtccggca 17580 17580 ttatgtatct ttatgtatct ttttgcgcgc ttttgcgcgc cagatggctg cagatggctg tgcgtaacta tgcgtaacta ctacctgcct ctacctgcct cagtccgcag cagtccgcag 17640 17640 aaaccttcat aaaccttcat tcctgcttta tcctgcttta ccggagcagt ccggagcagt acagggcata acagggcata tcaccaggcg tcaccaggcg cgcatcaggg cgcatcaggg 17700 17700 agctttcaga agctttcaga agaggttaaa agaggttaaa catacctttt catacctttt atgatgagtg atgatgagtg tcataacttt tcataacttt gccggcatcg gccggcatcg 17760 17760

PL 230 884 Β1 actttattca aaatgcgctg aacaccgctg accttgaaga tcgtaaattc aacgtccgta 17820 ctgccttctc gtctcagtat ctgagccata tgccttcgag tgtgcttaaa accatgaaca 17880 gcctgtttat gatgcgcctg acggaagggg atgaagagta tctgaagcaa ttagagatca 17940 acatcccggc cgatatcctg cgtcgtttca gacagcttcc gcaaggggtt tatccggacg 18000 gaagtggtac tgcattcctc ggtattttta aaacaaaacg tggtcttatt tgccacattc 18060 tgaaaaacac attaggacca aaactgcttt gggctttgaa ctcatctgca aaagatagag 18120 cgctcagaga tgtgctttat gaagagctgg gaacgaaaaa agcaagggaa gaattagcaa 18180 atagattccc tatgggaagt gcatcaagta tcattgatga aatggtggtc aatcagggtg 18240 gtgagcgtga ttctgaagaa gaatcacaaa ctatggcgat gaagctcgct aaagaaatca 18300 tttctgatgt gagaagggga ttcagatgat aaaaatcgga aaagcaaaac ggtcagtgat 18360 ggccgtttca attctggcct tcagcgtaca gtcagcattt gcctatacgg tcaacgttaa 18420 cagcagcatt cccatctcaa cgcaggttat gccggcgttg agcacagcta atggcctgtt 18480 aggtaatatc caggccacgc tgattaacat tggtacggca atcagccagc agggcgatcg 18540 ccaggcagca ttaatgcagc aggtggctga aactaaccga cagttcgaag tcgagcaaaa 18600 acgtaatgac cggctgctgc aggcacagga taagtaccgt gttccggatg atatctgtgc 18660 gcagtctatt ggcggtggcg ccgcgggggt atcctctgcg gccgctggcg gtcagcgaac 18720 gctgggaagc gccagttctg cgaaagatgt taaggctatt tttgaagtgc cggcacgcgc 18780 aaccgacgtg gatgcatctt caacggccga agttcacagc cagtactgcg acagttcgga 18840 ttatgctgca tttggtggga cttcattctg cccaagtgta tctgacatgc cgcgggcaga 18900 tacgtcgctg agctcgttgc tttatggcgc cggcaaagaa ggcaaggcac ctgatctgac 18960 gtttacagat gagcagacag atgcggcgct gcgctatatg aaaaataccg cgttgcgcag 19020 tgctggrcgt cagctgagtc gtggggaagt taaaggcgcc agcgggcgaa Tttacctggg 19080 catgattcag caataccagg cgctcaccga cgcggccgca caacctcaga tggaaatgat 19140 cgccaactcc aaaccgaacc cggccactga tgccgcgctt gcagatgcgc gcaaagtgcc 19200 ggaagtcgaa tcctatttcc aggcgacggc cagtaacagg gcgaaacagc ttaaccgtat 19260 gtctgccaga gagtttgagg aattcgaagt aggtcgccgt tacagcaacc ctgcttacca 19320 ggcgacgctg accaacaaga acaccgaaga tttgatgcgt gagcaaatca atatcgccaa 19380 tctgaacaac tggttagtgc tgaaaaccaa acagcagctg gagaaacaaa atgtgctgct 19440 tggccagatc ctggcgaacg acgcatatca aacatacaaa ccgatgctgg cagcacagct 19500 ggagagtgtg aacgcgggag tatccagaaa atgaccgacg aaaataaaac aggggataaa 19560 gacacagcca aatcagggaa attaaaaaaa ggccttgatg ttgtaacagg tgtcaatgac 19620 ctcccggaag ggaaggctaa acgaacgata tattatatta ctggcatcag cgatatatat 19680 tttattatcg cgtcagtaaa gcaaacattc agcctgctct ttcagcgggc ttcattcgtt 19740 aagaagcaaa taaaaaacct tgatggtcca cctgttgatt ctgatgcaaa tcagccgttc 19800GB 230 884 Β1 actttattca aaatgcgctg aacaccgctg accttgaaga tcgtaaattc aacgtccgta 17820 ctgccttctc gtctcagtat ctgagccata tgccttcgag tgtgcttaaa accatgaaca 17880 gcctgtttat gatgcgcctg acggaagggg atgaagagta tctgaagcaa ttagagatca 17940 acatcccggc cgatatcctg cgtcgtttca gacagcttcc gcaaggggtt tatccggacg 18000 gaagtggtac tgcattcctc ggtattttta aaacaaaacg tggtcttatt tgccacattc 18060 tgaaaaacac attaggacca aaactgcttt gggctttgaa ctcatctgca aaagatagag 18120 cgctcagaga tgtgctttat gaagagctgg gaacgaaaaa agcaagggaa gaattagcaa 18180 atagattccc tatgggaagt gcatcaagta tcattgatga aatggtggtc aatcagggtg 18240 gtgagcgtga ttctgaagaa gaatcacaaa ctatggcgat gaagctcgct aaagaaatca 18300 tttctgatgt gagaagggga ttcagatgat aaaaatcgga aaagcaaaac ggtcagtgat 18360 ggccgtttca attctggcct tcagcgtaca gtcagcattt gcctatacgg tcaacgttaa 18420 cagcagcatt cccatctcaa cgcaggttat gccggcgttg agcacagcta atggcctgtt 18480 aggtaatatc caggccacgc tgattaacat tggtacggca atcagccagc agggcgatcg 18540 ccaggcagca ttaatgcagc aggtggctga aactaaccga cagttc Gaag tcgagcaaaa 18600 acgtaatgac cggctgctgc aggcacagga taagtaccgt gttccggatg atatctgtgc 18660 gcagtctatt ggcggtggcg ccgcgggggt atcctctgcg gccgctggcg gtcagcgaac 18720 gctgggaagc gccagttctg cgaaagatgt taaggctatt tttgaagtgc cggcacgcgc 18780 aaccgacgtg gatgcatctt caacggccga agttcacagc cagtactgcg acagttcgga 18840 ttatgctgca tttggtggga cttcattctg cccaagtgta tctgacatgc cgcgggcaga 18900 tacgtcgctg agctcgttgc tttatggcgc cggcaaagaa ggcaaggcac ctgatctgac 18960 gtttacagat gagcagacag atgcggcgct gcgctatatg aaaaataccg cgttgcgcag 19020 tgctggrcgt cagctgagtc gtggggaagt taaaggcgcc agcgggcgaa Tttacctggg 19080 catgattcag caataccagg cgctcaccga cgcggccgca caacctcaga tggaaatgat 19140 cgccaactcc aaaccgaacc cggccactga tgccgcgctt gcagatgcgc gcaaagtgcc 19200 ggaagtcgaa tcctatttcc aggcgacggc cagtaacagg gcgaaacagc ttaaccgtat 19260 gtctgccaga gagtttgagg aattcgaagt aggtcgccgt tacagcaacc ctgcttacca 19320 ggcgacgctg accaacaaga acaccgaaga tttgatgcgt gagcaaatca atatcgccaa 19380 tctgaacaac tggttagtgc tgaaaaccaa acagcagct g gagaaacaaa atgtgctgct 19440 tggccagatc ctggcgaacg acgcatatca aacatacaaa ccgatgctgg cagcacagct 19500 ggagagtgtg aacgcgggag tatccagaaa atgaccgacg aaaataaaac aggggataaa 19560 gacacagcca aatcagggaa attaaaaaaa ggccttgatg ttgtaacagg tgtcaatgac 19620 ctcccggaag ggaaggctaa acgaacgata tattatatta ctggcatcag cgatatatat 19680 tttattatcg cgtcagtaaa gcaaacattc agcctgctct ttcagcgggc ttcattcgtt 19740 aagaagcaaa taaaaaacct tgatggtcca cctgttgatt ctgatgcaaa tcagccgttc 19800

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

gccgaagtta gccgaagtta tgaaacggag tgaaacggag caatagacct caatagacct gtatcagaat gtatcagaat tgttggataa tgttggataa ggccagttta ggccagttta 19860 19860 tacaagaaat tacaagaaat actggctttg actggctttg ttgttttttt ttgttttttt gcattagtcc gcattagtcc tcattctgct tcattctgct ttttttaacg ttttttaacg 19920 19920 tctggttatg tctggttatg ccagattgct ccagattgct tctaaatggc tctaaatggc tcaccgaaca tcaccgaaca tgagcttgtt tgagcttgtt aagagcaact aagagcaact 19980 19980 ctcacctgtg ctcacctgtg gcgtcctgtt gcgtcctgtt tgctgctggg tgctgctggg atctttactt atctttactt tcattaaggc tcattaaggc tctcacatgt tctcacatgt 20040 20040 gagttcatgg gagttcatgg ggtggcagtt ggtggcagtt acgaaaccag acgaaaccag gctcactctg gctcactctg atgcagagca atgcagagca aggtacgtta aggtacgtta 20100 20100 cgttatttcc cgttatttcc ttaatgatgg ttaatgatgg gggagtgcgt gggagtgcgt aatacattta aatacattta atttttcgca atttttcgca ggctggtcaa ggctggtcaa 20160 20160 gagcgggggc gagcgggggc cacatgagta cacatgagta aattaaaaag aattaaaaag gttgcttcta gttgcttcta tctcttttcg tctcttttcg ttgtggcgtc ttgtggcgtc 20220 20220 gccttcatat gccttcatat tcagcggatt tcagcggatt tggggattga tggggattga tggcataact tggcataact gaagcggcta gaagcggcta aacgttcagg aacgttcagg 20280 20280 tgacctatcg tgacctatcg cgtcaaatgt cgtcaaatgt tacataccgt tacataccgt ttttggtgag ttttggtgag gtagttaata gtagttaata atccgtttag atccgtttag 20340 20340 cccttccggc cccttccggc gatggcttac gatggcttac ttaataacgt ttaataacgt tttcttcact tttcttcact gtcaacgaag gtcaacgaag ttatcgcgat ttatcgcgat 20400 20400 tcttgccctt tcttgccctt gtctatatgg gtctatatgg ggataatcag ggataatcag cattaagaaa cattaagaaa cttcaccagg cttcaccagg caggtcagtt caggtcagtt 20460 20460 gggaagtttc gggaagtttc attgagggtg attgagggtg atggcaataa atggcaataa cgcattcaaa cgcattcaaa attgttaaaa attgttaaaa cgacttttgg cgacttttgg 20520 20520 gtggttgttg gtggttgttg cttgtaccta cttgtaccta ccgttgtcgg ccgttgtcgg ttggtctgtg ttggtctgtg gcgcagctgc gcgcagctgc tttttctatg tttttctatg 20580 20580 gtgcggttca gtgcggttca atcattggcg atcattggcg taggatctgc taggatctgc caatgttatt caatgttatt gcagataaaa gcagataaaa cggcttcgga cggcttcgga 20640 20640 attagcgagt attagcgagt ggtaaagctg ggtaaagctg tctatatagc tctatatagc ccctgttatg ccctgttatg ccagaaatgg ccagaaatgg cgtctgttgc cgtctgttgc 20700 20700 aaaagggatg aaaagggatg tttgaaacaa tttgaaacaa acctttgtgc acctttgtgc tttgggtgta tttgggtgta aatcagggga aatcagggga ttgctcaaat ttgctcaaat 20760 20760 ggaggcttct ggaggcttct ggccaacatt ggccaacatt atgagaataa atgagaataa cgccagaatg cgccagaatg caataccaaa caataccaaa caggtgacag caggtgacag 20820 20820 cacatattct cacatattct atatctgtaa atatctgtaa acaacggctc acaacggctc agctgtatgt agctgtatgt gggaccgttt gggaccgttt cgctgccaca cgctgccaca 20880 20880 acgtccagca acgtccagca ggatggactt ggatggactt ctatcttcgc ctatcttcgc tagcggttat tagcggttat gcggattccg gcggattccg tctacagcgt tctacagcgt 20940 20940 tcagcaacaa tcagcaacaa gcaacggaca gcaacggaca cgttgtgggg cgttgtgggg aaaaatgaag aaaaatgaag actgctgcag actgctgcag agcagtttaa agcagtttaa 21000 21,000 tgcagcatat tgcagcatat atggcaaaaa atggcaaaaa tgcgttccgg tgcgttccgg ggacggtgag ggacggtgag ctgccagatg ctgccagatg ttgaaagcgc ttgaaagcgc 21060 21060 gatccagact gatccagact gctgcgcgtg gctgcgcgtg attaccagct attaccagct tcaggttcaa tcaggttcaa catgctgcta catgctgcta attcagcagc attcagcagc 21120 21120 cggtgacgac cggtgacgac gaaattgttc gaaattgttc aaaaaatgga aaaaaatgga gtcggatatc gtcggatatc aaagagaaag aaagagaaag ggtggctata ggtggctata 21180 21180 rcrrggtgrg rcrrggtgrg ractarcaca ractarcaca cattagctac cattagctac tgcgaatacc tgcgaatacc gagatgaaag gagatgaaag argrrgctaa argrrgctaa 21240 21240 cctgaagccg cctgaagccg gtagtfccag gtagtfccag gaatgagtaa gaatgagtaa cgatggcgat cgatggcgat atcggctcta atcggcta tcgartactt tcgartactt 21300 21300 taaaggcttg taaaggcttg ttccaggctt ttccaggctt accattctca accattctca actgaaaaat actgaaaaat agtaattata agtaattata cgccgcctct cgccgcctct 21360 21360 tggcaccgaa tggcaccgaa tctaacgcac tctaacgcac ttgcaaggaa ttgcaaggaa cattgatcaa cattgatcaa aaaagccttg aaaagccttg aaaatgccgc aaaatgccgc 21420 21420 cacaactgga cacaactgga gacggaacgt gacggaacgt cccttattac cccttattac aaaaattttc aaaaattttc gacttcaacg gacttcaacg ttacaaactg ttacaaactg 21480 21480 gcttgcaacg gcttgcaacg agtaactacg agtaactacg gcactggtga gcactggtga tggttacagt tggttacagt gacgtgacca gacgtgacca accctttact accctttact 21540 21540 caaaatgaaa caaaatgaaa gctatcggcg gctatcggcg attacacgtt attacacgtt aggtgtagct aggtgtagct gaggttggac gaggttggac tcgccagttg tcgccagttg 21600 21600 gaccgctatc gaccgctatc aatgttgcag aatgttgcag tgaaggtttc tgaaggtttc agaagggaag agaagggaag agtctacccg agtctacccg gttttgctgc gttttgctgc 21660 21660 gggaatgatg gggaatgatg aacaaactta aacaaactta cagggattcg cagggattcg agatgctatt agatgctatt gctggcgtat gctggcgtat tagaatcggt tagaatcggt 21720 21720 ttcgttcttg ttcgttcttg gtttacccgc gtttacccgc tgttttatag tgttttatag cctctttggt cctctttggt atcggtcttg atcggtcttg cactatctat cactatctat 21780 21780 ctggctgccg ctggctgccg tttataccga tttataccga tgatttattg tgatttattg gtttgttgct gtttgttgct atggcagatt atggcagatt ggctggttac ggctggttac 21840 21840 gcttatgaca gcttatgaca ggtgtattgg ggtgtattgg cgtcttccct cgtcttccct gtgggcagct gtgggcagct acccatatca acccatatca acattggcca acattggcca 21900 21900

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

gagtaatgat gagtaatgat gagcggagta gagcggagta catatggtta tgtgttcctt catatggtta tgtgttcctt atcgatgtaa atcgatgtaa tgattcggcc tgattcggcc 21960 21960 gatgctcatg gatgctcatg gtaatggggt gtaatggggt ttatttttgc ttctctggcc ttatttttgc ttctctggcc atcgtagctt atcgtagctt tgggaacagc tgggaacagc 22020 22020 gttaaacatg gttaaacatg atgtrtaaat atgtrtaaat tcgctatgga acaggtccag tcgctatgga acaggtccag tctgactctt tctgactctt rcactggcct rcactggcct 22080 22080 gctgtcatcg gctgtcatcg atcggatttt atcggatttt tgatgttata tgcaaggctt tgatgttata tgcaaggctt tgcacaggta tgcacaggta tggtggctcg tggtggctcg 22140 22140 cgtatttgca cgtatttgca cttcctgcga cttcctgcga ggatgccgaa ctatgttata ggatgccgaa ctatgttata aactggattg aactggattg gacagaagat gacagaagat 22200 22200 gaacgattca gaacgattca gtgtrgggtg gtgtrgggtg atatgcagaa ccatgttcat atatgcagaa ccatgttcat gacatctttg gacatctttg ctgcgttcgg ctgcgttcgg 22260 22260 tcgtggagcc tcgtggagcc aaaaatatga aaaaatatga accgtaacaa ccctaagcaa accgtaacaa ccctaagcaa tttaarcctg tttaarcctg acgcaggtgt acgcaggtgt 22320 22320 agataagagc agataagagc aaggacggca aaggacggca tcaaaggagc ttaaatatga tcaaaggagc ttaaatatga atgcgttatc atgcgttatc aaacactgac aaacactgac 22380 22380 tttaagaaaa tttaagaaaa ttagtaacaa ttagtaacaa tgcgcgtcct aaaaggcttg tgcgcgtcct aaaaggcttg gatactacgc gatactacgc atcatggctc atcatggctc 22440 22440 tggatgatgt tggatgatgt ttgtattcct ttgtattcct ctttctgttc gttagcgctt ctttctgttc gttagcgctt tcgtgtttct tcgtgtttct gagcggctta gagcggctta 22500 22500 tactggacgg tactggacgg ttagagacgg ttagagacgg ttcaattcag gagcactggt ttcaattcag gagcactggt ttagtacagt ttagtacagt cggtatcttt cggtatcttt 22560 22560 gtgatcgatg gtgatcgatg cagtgctgat cagtgctgat ctggatgttg aaaaaggact ctggatgttg aaaaaggact tcaggagccg tcaggagccg caagctctac caagctctac 22620 22620 caagtaactg caagtaactg cttcaatgaa cttcaatgaa gaactctggt ttcttcgagc gaactctggt ttcttcgagc ctcataagga ctcataagga ctgcgagcac ctgcgagcac 22680 22680 tatgacctgg tatgacctgg cccggagaac cccggagaac ttacatcggc tttgacttca ttacatcggc tttgacttca gtactggaat gtactggaat cataggagta cataggagta 22740 22740 gcatccctgt gcatccctgt atgccacatc atgccacatc cagtattaaa cgtgagcggc cagtattaaa cgtgagcggc tattttttga tattttttga agccgaaaca agccgaaaca 22800 22800 gtcgagtcat gtcgagtcat gggagtcagt gggagtcagt cggcagggag ttaatcataa cggcagggag ttaatcataa acctgcgaaa acctgcgaaa tacggggctt tacggggctt 22860 22860 acgacgataa acgacgataa cgatcacagc cgatcacagc tccaaatatc aataaagcgt tccaaatatc aataaagcgt acagggatat acagggatat ggaaatcatc ggaaatcatc 22920 22920 tgcagaacgc tgcagaacgc ataaaaatag ataaaaatag ggatgaaaac tatcagcatc ggatgaaaac tatcagcatc tgaagagtaa tgaagagtaa actgacagac actgacagac 22980 22980 gctggatggt gctggatggt tcataaacag tcataaacag caattattga gtttaacccg caattattga gtttaacccg ccgaatatgg ccgaatatgg cgggtttttt cgggtttttt 23040 23040 gtgtatactc gtgtatactc aagtggttat aagtggttat agtcgtatgt tgtgggagga agtcgtatgt tgtgggagga agtagtgaac agtagtgaac agagttactg agagttactg 2 3100 2 3100 agcgccagga agcgccagga acagaagagt acagaagagt aacccggagt tctagaggat aacccggagt tctagaggat ccccagatct ccccagatct agaaaacgtt agaaaacgtt 2 3160 2 3160 gcttaacgtg gcttaacgtg agttttcgtt agttttcgtt ccactgagcg tcagacccct ccactgagcg tcagacccct tatttgagta tatttgagta aatgcgattt aatgcgattt 23220 23220 ctgccagaag ctgccagaag ggcggcacaa ggcggcacaa aaaaacccga ctggtgagat aaaaacccga ctggtgagat cgggttttta cgggttttta tgttttgccc tgttttgccc 23280 23280 cggatggagg cggatggagg cgggaacacc cgggaacacc taaacaattg acggttaaat taaacaattg acggttaaat attacgccat attacgccat gagtgcagta gagtgcagta 23340 23340 aatgcaaacc aatgcaaacc acccggaata acccggaata gggtatactg cgcgggtcaa gggtatactg cgcgggtcaa tctgttgacg tctgttgacg ttcttctcca ttcttctcca 2 3400 2 3400 gcccccgctt gcccccgctt acgcggcgtg acgcggcgtg aacggattaa agccctggtt aacggattaa agccctggtt gaaaaacagg gaaaaacagg tggtgctgtt tggtgctgtt 23460 23460 tcaatgccct tcaatgccct ggctggagtg ggctggagtg ggaacatcta aacaattgac ggaacatcta aacaattgac gtgaggtagc gtgaggtagc cgctgtgaca cgctgtgaca 23520 23520 ggcaatgtaa ggcaatgtaa gggcgatcag gggcgatcag cggtgttcct gctctgtatg cggtgttcct gctctgtatg gagcaaacgg gagcaaacgg atgattaact atgattaact 23580 23580 tgttaatcgt tgttaatcgt cgttctgcgg cgttctgcgg gctgttgttg cagtgtctaa gctgttgttg cagtgtctaa cgctgtgata cgctgtgata gcggtcctgg gcggtcctgg 2 3640 2 3640 agctgarccg agctgarccg gcagtatrrt gcagtatrrt gactgaccgg aaacgtaacT gactgaccgg aaacgtaacT aaaggcgggg aaaggcgggg ggaccacrcc ggaccacrcc 23700 23700 ccgcctttta ccgcctttta acacaaacct acacaaacct tcatatatga atatcctcct tcatatatga atatcctcct tagttcctat tagttcctat tccgaagttc tccgaagttc 23760 23760 ctattctcta ctattctcta gaaagtatag gaaagtatag gaacttcggc gcgcctacct gaacttcggc gcgcctacct gtgacggaag gtgacggaag atcacttcgc atcacttcgc 23820 23820 agaataaata agaataaata aatcctggtg aatcctggtg tccctgttga taccgggaag tccctgttga taccgggaag ccctgggcca ccctgggcca acttttggcg acttttggcg 23880 23880 aaaatgagac aaaatgagac gttgatcggc gttgatcggc acgtaagagg ttccaacttt acgtaagagg ttccaacttt caccataatg caccataatg aaataagatc aaataagatc 23940 23940

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

actaccgggc actaccgggc gtattttttg gtattttttg agttgtcgag agttgtcgag attttcagga attttcagga gctaaggaag gctaaggaag ctaaaatgga ctaaaatgga 24000 24,000 gaaaaaaatc gaaaaaaatc actggatata actggatata ccaccgttga ccaccgttga tatatcccaa tatatcccaa tggcatcgta tggcatcgta aagaacattt aagaacattt 24060 24060 tgaggcattt tgaggcattt cagtcagttg cagtcagttg ctcaatgtac ctcaatgtac ctataaccag ctataaccag accgttcagc accgttcagc tggatattac tggatattac 24120 24120 ggccttttta ggccttttta aagaccgtaa aagaccgtaa agaaaaataa agaaaaataa gcacaagttt gcacaagttt tatccggcct tatccggcct ttattcacat ttattcacat 24180 24180 tcttgcccgc tcttgcccgc ctgatgaatg ctgatgaatg ctcatccgga ctcatccgga attacgtatg attacgtatg gcaatgaaag gcaatgaaag acggtgagct acggtgagct 24240 24240 ggtgatatgg ggtgatatgg gatagtgttc gatagtgttc acccttgtta acccttgtta caccgttttc caccgttttc catgagcaaa catgagcaaa ctgaaacgtt ctgaaacgtt 24300 24300 rtcatcgctc rtcatcgctc tggagtgaat tggagtgaat accacgacga accacgacga tttccggcag tttccggcag trtctacaca trtctacaca tatattcgca tatattcgca 24360 24360 agatgtggcg agatgtggcg tgttacggtg tgttacggtg aaaacctggc aaaacctggc ctatttccct ctatttccct aaagggttta aaagggttta ttgagaatat ttgagaatat 24420 24420 gtttttcgtc gtttttcgtc tcagccaatc tcagccaatc cctgggtgag cctgggtgag tttcaccagt tttcaccagt tttgatttaa tttgatttaa acgtggccaa acgtggccaa 24480 24480 tatggacaac tatggacaac ttcttcgccc ttcttcgccc ccgttttcac ccgttttcac catgggcaaa catgggcaaa tattatacgc tattatacgc aaggcgacaa aaggcgacaa 24540 24540 ggtgctgatg ggtgctgatg ccgctggcga ccgctggcga ttcaggttca ttcaggttca tcatgccgtt tcatgccgtt tgtgatggct tgtgatggct tccatgtcgg tccatgtcgg 24600 24600 cagaatgcrt cagaatgcrt aargaattac aargaattac aacagtactg aacagtactg cgargagtgg cgargagtgg cagggcgggg cagggcgggg cgtaaggcgc cgtaaggcgc 24660 24660 gccatttaaa gccatttaaa tgaagttcct tgaagttcct attccgaagt attccgaagt tcctattctc tcctattctc tagaaagtat tagaaagtat aggaacttcg aggaacttcg 24720 24720 aagcagctcc aagcagctcc agcctacacc agcctacacc gtttggcctc gtttggcctc ctgattaaca ctgattaaca acgccggcaa acgccggcaa acgccggcgt acgccggcgt 24780 24780 tcagggttac tcagggttac atctcgatca atctcgatca tcggaaacag tcggaaacag atcgtcttcc atcgtcttcc tggtggtaaa tggtggtaaa gcacgtcgtc gcacgtcgtc 24840 24840 tgtgtccgtc tgtgtccgtc ccatcaagcc ccatcaagcc agtcagcgaa agtcagcgaa cagttcaaac cagttcaaac aggcacaccg aggcacaccg acatttcctc acatttcctc 24900 24900 cggtgaaatt cggtgaaatt gcgccacact gcgccacact gcagctcgta gcagctcgta gaagacctca gaagacctca attttttcca attttttcca gcaggctgtt gcaggctgtt 24960 24960 ggccgctttg ggccgctttg tcgtagccga tcgtagccga acagcttgat acagcttgat cggcgggaag cggcgggaag tgcattgcat tgcattgcat ccgggttcgt ccgggttcgt 25020 25020 ttccgccagt ttccgccagt tcatcatcct tcatcatcct tacgttccgg tacgttccgg atagatgctg atagatgctg tacagcgtcg tacagcgtcg ccggcgatgg ccggcgatgg 2 5080 2 5080 cggtaatacc cggtaatacc tcgataaagc tcgataaagc ggtttatccg ggtttatccg catcggcagt catcggcagt tcgctggaaa tcgctggaaa acttctcatt acttctcatt 2 5140 2 5140 gtccggaatg gtccggaatg taaaacgctg taaaacgctg cgctgcgtac cgctgcgtac cagggcatcc cagggcatcc tggaaagaaa tggaaagaaa ttaccccctg ttaccccctg 25200 25200 accttcggtc accttcggtc tgctracgca tgctracgca gctcacgaar gctcacgaar gttcacgcgg gttcacgcgg tccttttcac tccttttcac ggatttggta ggatttggta 25260 25260 cagatcccct cagatcccct tcccggaccg tcccggaccg ttttggaaaa ttttggaaaa cgtgccgtgt cgtgccgtgt tcggcttcct tcggcttcct gcccggagag gcccggagag 25320 25320 ctctgaaraa ctctgaaraa taatcctggc taatcctggc cgacggtttc cgacggtttc gcgcagtatt gcgcagtatt tcaaaggtrt tcaaaggtrt tccggtcttc tccggtcttc 25380 25380 aatcgacrca aatcgacrca aaatatttca aaatatttca cgcgggtgtt cgcgggtgtt ggcgatcagc ggcgatcagc gaatccacct gaatccacct cgccgttcgc cgccgttcgc 2 5440 2 5440 gccgcgggcg gccgcgggcg agcgacgggt agcgacgggt gatcctggga gatcctggga ggaaaatacg ggaaaatacg cccattttrt cccattttrt ccagtgaacg ccagtgaacg 25500 25500 catctgcgca catctgcgca ctcagcgtat ctcagcgtat ccataccgct ccataccgct ggtgaaatac ggtgaaatac tggcccagct tggcccagct cgtcataaat cgtcataaat 25560 25560 cagcccgtat cagcccgtat ggcgcctgat ggcgcctgat tattcagcgc tattcagcgc gtgagtgagc gtgagtgagc aggacttcct aggacttcct cttttttccc cttttttccc 25620 25620 ttccagctgg ttccagctgg tagcccaggt tagcccaggt ccttactgat ccttactgat ggtcattcgc ggtcattcgc tgcagcgtca tgcagcgtca catataaacg catataaacg 2 5680 2 5680 gccaagcgtg gccaagcgtg gccgcttcac gccgcttcac cgcgtgacag cgcgtgacag ctccagcgac ctccagcgac gggatcatga gggatcatga cgatgagaat cgatgagaat 25740 25740 gcggtcattg gcggtcattg tggaaaatat tggaaaatat cgtccatccg cgtccatccg gatatcgccg gatatcgccg ctgtcttccg ctgtcttccg gaaaaacatg gaaaaacatg 2 5800 2 5800 gccataagtt gccataagtt tcattgaaca tcattgaaca gggagagcgt gggagagcgt cttcaggaac cttcaggaac tgacggctca tgacggctca tgtagttatg tgtagttatg 25860 25860 ctgttcgaag ctgttcgaag gcgcgggctt gcgcgggctt cccacgtttc cccacgtttc cgggtattcc cgggtattcc gcgttggcca gcgttggcca gcaggaagcc gcaggaagcc 25920 25920 tggtgtattt tggtgtattt tccagataac tccagataac tttccagcgc tttccagcgc ggcgtaaccc ggcgtaaccc tcgctgtgcc tcgctgtgcc agccgttttt agccgttttt 25980 25980 ctttgcctca ctttgcctca acgtacagcg acgtacagcg cggccattgc cggccattgc cggcagcgac cggcagcgac atgtttttct atgtttttct gaatagtgcg gaatagtgcg 26040 26040

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

ctgtgacaaa ctgtgacaaa agcagttcgc agcagttcgc cgcgggcgcg cttataacac cgcgggcgcg cttataacac agggcattga agggcattga tcagcgccga tcagcgccga 26100 26100 catcatggct catcatggct tttgccgtat tttgccgtat cctgccactg tgccgaatct cctgccactg tgccgaatct ccgcccacct ccgcccacct gggggagcat gggggagcat 26160 26160 ggattccatc ggattccatc aactggatga aactggatga tgaaggtcgg cggggcaacg tgaaggtcgg cggggcaacg ctgaagaggt ctgaagaggt tgactgagtt tgactgagtt 26220 26220 ggattgcgcg ggattgcgcg gggatgcttt gggatgcttt cctgcttcac caggttcacg cctgcttcac caggttcacg aacctgtcaa aacctgtcaa tactgccggt tactgccggt 26280 26280 cagcaggttg cagcaggttg aggacgtaat aggacgtaat aatcatcctc acggccgaaa aatcatcctc acggccgaaa cggcgcgcca cggcgcgcca gcgaccaggt gcgaccaggt 26340 26340 ggcgaaggcc ggcgaaggcc agcttgttat agcttgttat ctgctttacc gtctgagagg ctgctttacc gtctgagagg cagtagccac cagtagccac ggcaccacag ggcaccacag 26400 26400 caggaagtta caggaagtta acgataaacc acgataaacc catagaaggt ttcggtttta catagaaggt ttcggtttta cccgacccgg cccgacccgg tggtaccaaa tggtaccaaa 26460 26460 aaataccatg aaataccatg tggcgcagca tggcgcagca ggtccgtcat gttcagccac ggtccgtcat gttcagccac agctcgcggc agctcgcggc cgaacaggcg cgaacaggcg 26520 26520 tccccgctca tccccgctca tacccgacat tacccgacat ataaaattcc cttcgctttc ataaaattcc cttcgctttc tttcgctccc tttcgctccc ggaccttatg ggaccttatg 26580 26580 cgggatgcga cgggatgcga atgggcccca atgggcccca gacggtattc cgcctgggtt gacggtattc cgcctgggtt tccgtggtca tccgtggtca gggtgtcgtc gggtgtcgtc 26640 26640 gaacatttcg gaacatttcg cagtctttcg cagtctttcg gcattcgcag cggtggccgg gcattcgcag cggtggccgg aatttacgat aatttacgat ccgtgaatgc ccgtgaatgc 26700 26700 caccatcagc caccatcagc ggcggaagga ggcggaagga tgaggatgct cagcagcatg tgaggatgct cagcagcatg gtaaagggga gtaaagggga gaaacagacc gaaacagacc 26760 26760 cagcacggtc cagcacggtc agtatggcca agtatggcca gcaggccaaa ctgtacgttc gcaggccaaa ctgtacgttc ggagtgagga ggagtgagga accactccat accactccat 26820 26820 gaacgaacca gaacgaacca tctgggcgga tctgggcgga tgactttttt actgtctaca tgactttttt actgtctaca gattcctgtt gattcctgtt gcatagcggc gcatagcggc 26880 26880 tccgggttat tccgggttat tctcctattg tctcctattg cctgctgcag gcgggcatcg cctgctgcag gcgggcatcg tctttgacga tctttgacga cggaaaccgg cggaaaccgg 26940 26940 gatcacatca gatcacatca cccgaatcgg cccgaatcgg caacgatgga cggggtgccg caacgatgga cggggtgccg ataaacccga ataaacccga atttcgcaaa atttcgcaaa 27000 27,000 tgccatattg tgccatattg ttcgcgtcaa ttcgcgtcaa ccaggcgggc gccggtggta ccaggcgggc gccggtggta tccggggctg tccggggctg ttttcggatc ttttcggatc 27060 27060 gtcaattttc gtcaattttc gggttcatgg gggttcatgg tggtgtatcc catgttaatc tggtgtatcc catgttaatc gtgtcttccc gtgtcttccc agcttttcag agcttttcag 27120 27120 tcgggtatct tcgggtatct ttcccggtat ttcccggtat cgagtacagg agcggcgcgg cgagtacagg agcggcgcgg accatcgagc accatcgagc gcaggtcgcc gcaggtcgcc 27180 27180 ataaacggac ataaacggac acggggaaaa acggggaaaa tctcgacgtt atagcgtttg tctcgacgtt atagcgtttg ctcagttcct ctcagttcct gcagccgggg gcagccgggg 27240 27240 ttccagcgcg ttccagcgcg cggcagtgcg cggcagtgcg ggcacatcgg atcggaaaac ggcacatcgg atcggaaaac acatacaggg acatacaggg tgtgtttatg tgtgtttatg 27300 27300 cccggttgaa cccggttgaa agcgagatcg agcgagatcg taaagcgtcc gctggtgacg taaagcgtcc gctggtgacg gcatctttca gcatctttca gtgacagcaa gtgacagcaa 27360 27360 gtcgttatca gtcgttatca gccagttttt gccagttttt taggggcttc aggtgctgcc taggggcttc aggtgctgcc tgaacctgca tgaacctgca gctgctccgg gctgctccgg 27420 27420 cgcagtgaca cgcagtgaca ggctgctgca ggctgctgca gacccggcgc gggagcatac gacccggcgc gggagcatac gagtttgcct gagtttgcct gcagtggctg gcagtggctg 27480 27480 tgccggctga tgccggctga tgcatattca tgcatattca tcaacgcgcc gttgatggag tcaacgcgcc gttgatggag acgataaagc acgataaagc ccagcgcggc ccagcgcggc 27540 27540 gactggccag gactggccag aagataaagt aagataaagt tagacagccg gcgcacggca tagacagccg gcgcacggca ttgagtccgc ttgagtccgc gctgctgttt gctgctgttt 27600 27600 cagcttttta cagcttttta cggatattgt cggatattgt tcagcgcctc gatggcctga tcagcgcctc gatggcctga tattcgtttt tattcgtttt caaagcggaa caaagcggaa 27660 27660 cagctgcacc cagctgcacc gcttcaccag gcttcaccag aaaacgtatt gtgcgtcagg aaaacgtatt gtgcgtcagg atgtggccgc atgtggccgc tgccggcatc tgccggcatc 27720 27720 atggccaagt atggccaagt ccaaaatgac ccaaaatgac aggctgacag ggggaaggag aggctgacag ggggaaggag tgcagggctt tgcagggctt gttcctggta gttcctggta 27780 27780 gcttccgtca gcttccgtca gcggaaagat gcggaaagat aaagtgtgtt gcgatcggtt aaagtgtgtt gcgatcggtt tttacggtga tttacggtga gtttcatact gtttcatact 27840 27840 tcctcgctta tcctcgctta gagttccagg gagttccagg tgatcgggac gggttgccgg tgatcgggac gggttgccgg ctgaggttta ctgaggttta gccggcgtcg gccggcgtcg 27900 27900 gttcatcgtc gttcatcgtc tgtcagtcgc tgtcagtcgc agactgttgt tcggggtgtc agactgttgt tcggggtgtc gtgcggagct gtgcggagct gcaggcggcg gcaggcggcg 27960 27960 tagccggctc tagccggctc gtcttccgct gtcttccgct tcagcgtcag attcaaatgc tcagcgtcag attcaaatgc aaatggcggt aaatggcggt ataacgtctt ataacgtctt 28020 28020 cctgccagtg cctgccagtg agcgaccgga agcgaccgga atggcgggat cgcggcggtc atggcgggat cgcggcggtc aatatggcgg aatatggcgg taatggagca taatggagca 28080 28080

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

gatccagctc gatccagctc aaggcccagc aaggcccagc acggccgccc acggccgccc gcacggttgg gcacggttgg cgggaatttc cgggaatttc gccgcctttt gccgcctttt 28140 28140 cttcatcgag cttcatcgag cgtcagccgg cgtcagccgg taactttcgc taactttcgc actgactcca actgactcca ggcaataacg ggcaataacg ccacctcctt ccacctcctt 28200 28200 caatgaagaa caatgaagaa cttcccgcgg cttcccgcgg ccggcgcttg ccggcgcttg aaagtgcata aaagtgcata ccataacgtg ccataacgtg cggtccacgc cggtccacgc 28260 28260 ctttcagcca ctttcagcca ccggaaattt ccggaaattt gcggatggca gcggatggca gctgcaggtc gctgcaggtc atcatcgaac atcatcgaac agcgcgtaga agcgcgtaga 28320 28320 gtagcgaacg gtagcgaacg ggagctgcgg ggagctgcgg cgcccctttg cgcccctttg caaattctct caaattctct gaacgcttcg gaacgcttcg cactggctgg cactggctgg 28380 28380 cgacggtcca cgacggtcca gagcccggcg gagcccggcg gccagcgaar gccagcgaar aaicagggaa aaicagggaa gccgtctua gccgtctua gtccgcaggc gtccgcaggc 28440 28440 aggaacggtt aggaacggtt gagarcgicg gagarcgicg agaatggati agaatggati tagccgtrgg tagccgtrgg ccggtcgccc ccggtcgccc ataaaccgca ataaaccgca 28500 28500 gatgtacaaa gatgtacaaa cgaggctgcg cgaggctgcg agtgcttttt agtgcttttt cccagggtgc cccagggtgc cagggaaagg cagggaaagg gccgcccctt gccgcccctt 28560 28560 gtttacctgt gtttacctgt gacaggaata gacaggaata ccttatgtgc ccttatgtgc ggctttttta ggctttttta cggaggcggc cggaggcggc 28620 28620 gtttagcggt gtttagcggt atcaatcagg atcaatcagg ttatgttcct ttatgttcct gggcaaactc gggcaaactc aacgggtgac aacgggtgac tgcgcgctgc tgcgcgctgc 28680 28680 gtgcttcttc gtgcttcttc cggatcttca cggatcttca ttcagcagca ttcagcagca gctgatcgag gctgatcgag gtggccaaac gtggccaaac cgggcgagga cgggcgagga 28740 28740 tatgggctat tatgggctat ccccggatag ccccggatag ttttttacca ttttttacca tcacccaggg tcacccaggg caggttccgg caggttccgg atggtcagtt atggtcagtt 28800 28800 tacgggtcag tacgggtcag acggtagtaa acggtagtaa ggattgcgcg ggattgcgcg agataaccca agataaccca gacgaacaac gacgaacaac ccgatgatta ccgatgatta 28860 28860 aaatgaacag aaatgaacag gggaaagagc gggaaagagc acgctggccg acgctggccg tgtcgttcat tgtcgttcat cacgctgata cacgctgata aagtcccaca aagtcccaca 28920 28920 gcgaaacctg gcgaaacctg gtgattatac gtgattatac cgcgccgccg cgcgccgccg acagcagcat acagcagcat gtcccggcgc gtcccggcgc tcggtcgcat tcggtcgcat 28980 28980 tacccggtgt tacccggtgt aatggcgtcc aatggcgtcc ggcagtacac ggcagtacac cgtagatcca cgtagatcca gtaaagcagg gtaaagcagg cgacaggctc cgacaggctc 29040 29040 cgtaaatcac cgtaaatcac ataatcacga ataatcacga aagccaaacc aagccaaacc acatcactgt acatcactgt gatcatgatg gatcatgatg agaagggccc agaagggccc 29100 29100 cgataatcat cgataatcat caggccatca caggccatca tcccctcccc tcccctcccc ctttccgttg ctttccgttg tggctggttt tggctggttt tgcatcagaa tgcatcagaa 29160 29160 cctcagagaa cctcagagaa ttttggtaaa ttttggtaaa ccttcccgat ccttcccgat ataccaggcc ataccaggcc ttacgcgccg ttacgcgccg gcgtattgga gcgtattgga 29220 29220 gtgatagcgg gtgatagcgg ccgacaccct ccgacaccct gccagaaatc gccagaaatc ccccccttcg ccccccttcg agaatgatgt agaatgatgt tgtatttgag tgtatttgag 29280 29280 gatgtaggca gatgtaggca ctggccattg ctggccattg cagaggcgca cagaggcgca aaagtcgtgc aaagtcgtgc tgcagctgct tgcagctgct ccgctctcac ccgctctcac 29340 29340 accaaaatca accaaaatca gccgccagct gccgccagct tattcgccca tattcgccca gatggtgttt gatggtgttt atctggaatg atctggaatg cgccgtaatc cgccgtaatc 29400 29400 gtaagtaccg gtaagtaccg tttttgtttt tttttgtttt tatttttcat tatttttcat tcccggtttc tcccggtttc ccgccttcag ccgccttcag tcagccacaa tcagccacaa 29460 29460 ggcgaggaat ggcgaggaat ccacggagag ccacggagag gaatgtgata gaatgtgata aatcigtgct aatcigtgct gcttcaacca gcttcaacca tgcaggttgg tgcaggttgg 29520 29520 cagcgggatt cagcgggatt gagggcgggg gagggcgggg catcaaccat catcaaccat aacaatctcc aacaatctcc taatgatttc taatgatttc tatttcgagt tatttcgagt 29580 29580 aaaaaatata aaaaaatata ccatcaaaag ccatcaaaag gagatttttt gagatttttt taaatcattt taaatcattt tggtgcgcat tggtgcgcat aattgagagg aattgagagg 29640 29640 gtgtcagagg gtgtcagagg aattcgaagc aattcgaagc agctttgcac agctttgcac tggattgcga tggattgcga ggctttgtgc ggctttgtgc ttctctggag ttctctggag 29700 29700 tgcgacaggt tgcgacaggt ttgatgacaa ttgatgacaa aaaattagcg aaaattagcg caagaagaca caagaagaca aaaatcacct aaaatcacct tgcgctaatg tgcgctaatg 29760 29760 ctctgttaca ctctgttaca ggtcactaat ggtcactaat accatctaag accatctaag tagttgattc tagttgattc atagtgactg atagtgactg catatgttgt catatgttgt 29820 29820 gttttacagt gttttacagt attatgtagt attatgtagt ctgtttttta ctgtttttta tgcaaaatct tgcaaaatct aatttaatat aatttaatat attgatattt attgatattt 29880 29880 atatcatttt atatcatttt acgtttctcg acgtttctcg ttcagctttt ttcagctttt ttatactaag ttatactaag ttggcattat ttggcattat aaaaaagcat aaaaaagcat 29940 29940 tgcttatcaa tgcttatcaa tttgttgcaa tttgttgcaa cgaacaggtc cgaacaggtc actatcagtc actatcagtc aaaataaaat aaaataaaat cattatttga cattatttga 30000 30,000 tttcaatttt tttcaatttt gtcccactcc gtcccactcc ctgcctctgt ctgcctctgt catcacgata catcacgata ctgtgatgcc ctgtgatgcc atggtgtccg atggtgtccg 30060 30060 acttatgccc acttatgccc gagaagatgt gagaagatgt tgagcaaact tgagcaaact tatcgcttat tatcgcttat ctgcttctca ctgcttctca tagagtcttg tagagtcttg 30120 30120 cagacaaact cagacaaact gcgcaactcg gcgcaactcg tgaaaggtag tgaaaggtag gcggatctat gcggatctat tcrtactcct tcrtactcct agatcttarg agatcttarg 30180 30180

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

cggtgtgaaa cggtgtgaaa taccgcacag taccgcacag atgcgtaagg agaaaatacc atgcgtaagg agaaaatacc gcatcaggcg gcatcaggcg ctcttccgct ctcttccgct 30240 30240 tcctcgctca tcctcgctca ctgactcgct ctgactcgct gcgctcggtc gttcggctgc gcgctcggtc gttcggctgc ggcgagcggt ggcgagcggt atcagctcac atcagctcac 30300 30300 tcaaaggcgg tcaaaggcgg taatacggtt taatacggtt atccacagaa tcaggggata atccacagaa tcaggggata acgcaggaaa acgcaggaaa gaagcggccg gaagcggccg 30360 30360 cggtctcgca cggtctcgca cccctgccgt cccctgccgt cttacggggg tgttcatagt cttacggggg tgttcatagt tacaacatcc tacaacatcc atcatgcttt atcatgcttt 30420 30420 tttctgccga tttctgccga gccgttggct gccgttggct cggcggggaa aagcacggtg cggcggggaa aagcacggtg gggcaaagaa gggcaaagaa gaatccggac gaatccggac 30480 30480 tggaggtitc tggaggtitc igctggccac igctggccac ccigcccggc atitgccggg ccigcccggc atitgccggg igctaacctg igctaacctg ggagcatagc ggagcatagc 30540 30540 gaccattctg gaccattctg gccgtcgtgc gccgtcgtgc cgcgtagcgg cgctgaaagg cgcgtagcgg cgctgaaagg ccaggcatat ccaggcatat tcccataatc tcccataatc 30600 30600 cacagaaaat cacagaaaat tgagcctgaa tgagcctgaa taacagtgat ctctttattg taacagtgat ctctttattg aataaagatc aataaagatc tttttaaaga tttttaaaga 30660 30660 agttaagagt agttaagagt gtattgcagc gtattgcagc ttgttttgac cacgattgca ttgttttgac cacgattgca ggtgacttta ggtgacttta tttcctcctt tttcctcctt 30720 30720 tgcggataac tgcggataac tgtggatagt tgtggatagt ggtgatttcg ctgccggtta ggtgatttcg ctgccggtta tccaccggcg tccaccggcg gcgccagaac gcgccagaac 30780 30780 gtcaaaaaat gtcaaaaaat cacgttggcc cacgttggcc acacgttaaa actggaggaa acacgttaaa actggaggaa atttgagcag atttgagcag gtcgcgccgg gtcgcgccgg 30840 30840 ctggccagca ctggccagca cgaaaaccgc cgaaaaccgc caggcggcgg taagagaatt caggcggcgg taagagaatt acagggggag acagggggag aaaatcagtg aaaatcagtg 30900 30900 ataatcaggg ataatcaggg ggaccggatt ggaccggatt ccctctccag ccccagatcg ccctctccag ccccagatcg agctgataca agctgataca ggtggctgcg ggtggctgcg 30960 30960 tactcgctgg tactcgctgg gtaaactgct gtaaactgct caggcgacag cgcgtgcagt caggcgacag cgcgtgcagt tcgtctttcg tcgtctttcg gcagcgtccg gcagcgtccg 31020 31020 tatcagatga tatcagatga acggacatgg acggacatgg cgtaagcccg gtcgtcatag cgtaagcccg gtcgtcatag ggctgttctg ggctgttctg ccagcgcttt ccagcgcttt 31080 31080 cagcttcttc cagcttcttc tcgcgcttac tcgcgcttac ccttcagggc ggcttcacgc ccttcagggc ggcttcacgc cggcgaacca cggcgaacca gcgtggcgtg gcgtggcgtg 31140 31140 catcattttt catcattttt tcataccagc tcataccagc gccggcgcgc ggctttaaca gccggcgcgc ggctttaaca gagatttctt gagatttctt ccgcctggcc ccgcctggcc 31200 31200 atgttcatca atgttcatca cgggttatcc cgggttatcc agcctgcagc ttcagcggcc agcctgcagc ttcagcggcc acctgttcgg acctgttcgg cctgctccgc cctgctccgc 31260 31260 atacagctta atacagctta tcgagatcaa tcgagatcaa caccgatcat cttccagagg caccgatcat cttccagagg cgttccgtca cgttccgtca gcaccacatg gcaccacatg 31320 31320 cttggggaac cttggggaac cacttgcggt cacttgcggt taaacgggtc ccatgtgacg taaacgggtc ccatgtgacg ccttcaggca ccttcaggca gcgccagtaa gcgccagtaa 31380 31380 cccgaattcc cccgaattcc atcatgtgct atcatgtgct gcagcagccg gcaaacccgc gcagcagccg gcaaacccgc ggtaccgtca ggtaccgtca ctttccggat ctttccggat 31440 31440 cacgttccct cacgttccct tcgctgtcct tcgctgtcct tttcgctgag ctgccacgcc tttcgctgag ctgccacgcc attttactga attttactga ggttgatagt ggttgatagt 31500 31500 gtcaatatgg gtcaatatgg gtagcccggt gtagcccggt caacggtgct gaccaggagc caacggtgct gaccaggagc ggcacaatcg ggcacaatcg catcgagtaa catcgagtaa 31560 31560 ttrctcccgc ttrctcccgc tccgggcgga tccgggcgga agtcgcgctg ccggccagcc agtcgcgctg ccggccagcc tgctcgcgca tgctcgcgca gctgcacgaa gctgcacgaa 31620 31620 gtacgggtgg gtacgggtgg cggctgatcc cggctgatcc gcatacgcag acttaacgcg gcatacgcag acttaacgcg cccgttttgc cccgttttgc gatcgcggcg gatcgcggcg 31680 31680 aacaaggcgg aacaaggcgg ttgtaggcat ttgtaggcat ggccaagctg gccagggagc ggccaagctg gccagggagc tttttgaaat tttttgaaat tgtccggtcg tgtccggtcg 31740 31740 gtaccagctg gtaccagctg ggctccgggc ggctccgggc agagacacgc cgttgagtgc agagacacgc cgttgagtgc gtaccgcgac gtaccgcgac gacggcgggt gacggcgggt 31800 31800 tttgcgcacg tttgcgcacg ggcctggtgc ggcctggtgc cttcatcgag aagcagctgc cttcatcgag aagcagctgc aggggcgatt aggggcgatt ctttagggga ctttagggga 31860 31860 ctggctttca ctggctttca agccaggaga agccaggaga tgaactccgg cgaaagacct tgaactccgg cgaaagacct tctactgact tctactgact caatgtcaga caatgtcaga 31920 31920 aagctgtagg aagctgtagg tatggattct tatggattct tttgattcac cagcccctgc tttgattcac cagcccctgc acttattggc acttattggc cgggctgtat cgggctgtat 31980 31980 tgcaataggg tgcaataggg tacgcatttg tacgcatttg ctataatcct ttctgccagc ctataatcct ttctgccagc aaggcagttt aaggcagttt gcgccccctg gcgccccctg 32040 32040 atttcatctc atttcatctc tgaccggcca tgaccggcca aagtgagagg atgaatcagg aagtgagagg atgaatcagg gggttttact gggttttact ttttgtggct ttttgtggct 32100 32100 cctgccacac cctgccacac cccaagcggt cccaagcggt acatctccgg gccgctcttc acatctccgg gccgctcttc ccgtgctaaa ccgtgctaaa Ttctgtaata Ttctgtaata 32160 32160 accccgtaag accccgtaag gttatgtaaa gttatgtaaa cgccgcttaa catatcatgc cgccgcttaa catatcatgc gtttctaagc gtttctaagc ggggcaatac ggggcaatac 32220 32220

PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1

ctgcgaaccc gcttttacat ctgcgaaccc gcttttacat agtaagatca agtaagatca ctcttcagaa ctcttcagaa tcgtcaaatt tcgtcaaatt tcaatccgtc tcaatccgtc 32280 32280 gtaataactt ttgacaagaa gtaataactt ttgacaagaa attcaatgac attcaatgac ttcagcctga ttcagcctga gtgagttttt gtgagttttt taacttttgt taacttttgt 32340 32340 gatctctatc aacattcttt gatctctatc aacattcttt ttgcatcttt ttgcatcttt ggggagataa ggggagataa aggtttaact aggtttaact ggtcgtgtgt ggtcgtgtgt 32400 32400 ttcccggata cggttccggt ttcccggata cggttccggt actctctctg actctctctg gaactccggg gaactccggg ttactcttct ttactcttct gttcctggcg gttcctggcg 32460 32460 ctcagtaact ctgttcacta ctcagtaact ctgttcacta cttcctccca cttcctccca caacatacga caacatacga ctataaccac ctataaccac ttgagtacct ttgagtacct 32520 32520 cgtgatacgc ctatttttat cgtgatacgc ctatttttat aggttaatgt aggttaatgt catgataata catgataata atggtttctt atggtttctt acgcggccgc acgcggccgc 32580 32580 caggrggcac ttttcgggga caggrggcac ttttcgggga aatgtgcgcg aatgtgcgcg gaaccccdta gaaccccdta TttgrtraTt TttgrtraTt tttctaaata tttctaaata 32640 32640 cattcaaata tgtatccgct cattcaaata tgtatccgct catgagacaa catgagacaa taaccctgat taaccctgat aaatgcttca aaatgcttca ataatattga ataatattga 32700 32700 aaaaggaaga gtatgagtat aaaaggaaga gtatgagtat tcaacatttc tcaacatttc cgtgtcgccc cgtgtcgccc ttattccctt ttattccctt ttttgcggca ttttgcggca 32760 32760 ttttgccttc ctgtttttgc ttttgccttc ctgtttttgc tcacccagaa tcacccagaa acgctggtga acgctggtga aagtaaaaga aagtaaaaga tgctgaagat tgctgaagat 32820 32820 cagttgggtg cacgagtggg cagttgggtg cacgagtggg ttacatcgaa ttacatcgaa ctggatctca ctggatctca acagcggtaa acagcggtaa gatccttgag gatccttgag 32880 32880 agttttcgcc ccgaagaacg agttttcgcc ccgaagaacg ttttccaatg ttttccaatg atgagcactt atgagcactt ttaaagttct ttaaagttct gctatgtggc gctatgtggc 32940 32940 gcggtattat cccgtgttga gcggtattat cccgtgttga cgccgggcaa cgccgggcaa gagcaactcg gagcaactcg gtcgccgcat gtcgccgcat acactattct acactattct 33000 33,000 cagaatgact tggttgagta cagaatgact tggttgagta ctcaccagtc ctcaccagtc acagaaaagc acagaaaagc atcttacgga atcttacgga tggcatgaca tggcatgaca 33060 33060 gtaagagaat tatgcagtgc gtaagagaat tatgcagtgc tgccataacc tgccataacc atgagtgata atgagtgata acactgcggc acactgcggc caacttactt caacttactt 33120 33120 ctgacaacga tcggaggacc ctgacaacga tcggaggacc gaaggagcta gaaggagcta accgcttttt accgcttttt tgcacaacat tgcacaacat gggggatcat gggggatcat 33180 33180 gtaactcgcc ttgatcgttg gtaactcgcc ttgatcgttg ggaaccggag ggaaccggag ctgaatgaag ctgaatgaag ccataccaaa ccataccaaa cgacgagcgt cgacgagcgt 33240 33240 gacaccacga tgcctgtagc gacaccacga tgcctgtagc aatggcaaca aatggcaaca acgttgcgca acgttgcgca aactattaac aactattaac tggcgaacta tggcgaacta 33300 33300 cttactctag cttcccggca cttactctag cttcccggca acaattaata acaattaata gactggatgg gactggatgg aggcggataa aggcggataa agttgcagga agttgcagga 33360 33360 ccacttctgc gctcggccct ccacttctgc gctcggccct tccggctggc tccggctggc tggtttattg tggtttattg ctgataaatc ctgataaatc tggagccggt tggagccggt 33420 33420 gagcgtgggt ctcgcggtat gagcgtgggt ctcgcggtat cattgcagca cattgcagca ctggggccag ctggggccag atggtaagcc atggtaagcc ctcccgtatc ctcccgtatc 33480 33480 gtagttatct acacgacggg gtagttatct acacgacggg gagtcaggca gagtcaggca actatggatg actatggatg aacgaaatag aacgaaatag acagatcgct acagatcgct 33540 33540 gagataggtg cctcactgat gagataggtg cctcactgat taagcattgg taagcattgg taactgtcag taactgtcag accaagttta accaagttta ctcatatata ctcatatata 33600 33600 ctttagattg attt ctttagattg attt 33614 33614

Zastrzeżenia patentowePatent claims

Claims (15)

Zastrzeżenia patentowePatent claims 1. Plazmid pomocniczy do mobilizacji, który obejmuje część mobilizującą systemu koniugacyjnego tra i trb w obrębie nukleotydów od 34 do 23136 SEKW. ID. NR 2 i od 24740 do 29654 SEKW. ID. NR 2, korzystniej obejmuje nukleotydy od 34 do 29654 SEKW. ID. NR 2, i przy czym plazmid pomocniczy do mobilizacji nie koduje funkcjonalnego białka Orf35 z pCTX-M3.A mobilization helper plasmid that includes a mobilization portion of the tra and trb conjugation system within nucleotides 34 through 23136 of SEQ ID NO. ID. 2 and SEQ. 24,740 to 29,654 ID. 2, more preferably comprises nucleotides 34 to 29,654 of SEQ ID NO. ID. NR 2, and wherein the mobilization helper plasmid does not encode a functional Orf35 protein from pCTX-M3. 2. Plazmid pomocniczy według zastrz. 1, znamienny tym, że jest plazmidem pMOBS, którego sekwencja przedstawiona jest na SEKW. ID. NR 2.2. The helper plasmid according to claim 1, The method of claim 1, which is a pMOBS plasmid, the sequence of which is shown in SEQ. ID. NO 2. 3. Szczep bakteryjny do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy zawierający wintegrowaną w chromosom bakteryjny część mobilizującą systemu koniugacyjnego tra i trb w obrębie nukleotydów od 34 do 23136 SEKW. ID. NR 2 i od 24740 do 29654 SEKW. ID. NR 2, korzystniej zawierający wintegrowane nukleotydy od 34 do 29654 SEKW. ID. NR 2, i przy czym w takim szczepie nie powstaje funkcjonalne białko Orf35 z pCTX-M3.3. A bacterial strain for efficient mobilization of plasmids with a broad host spectrum, containing a mobilizing part integrated into the bacterial chromosome of the tra and trb conjugation system within nucleotides from SEQ 34 to 23136. ID. 2 and SEQ. 24,740 to 29,654 ID. 2, more preferably having integrated nucleotides 34 to 29,654 of SEQ ID NO. ID. NR 2, and such strain does not produce a functional Orf35 protein from pCTX-M3. PL 230 884 Β1PL 230 884 Β1 4. Szczep bakteryjny według zastrz. 3, znamienny tym, że jest bakterią Gram ujemną wybraną z grupy składającej się z: Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Enterobacter cloacae, Morganella morganii, Serratia marcescens, Salmonella enteńca.4. The bacterial strain according to claim 1 A bacterium according to claim 3, characterized in that it is a Gram negative bacterium selected from the group consisting of: Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Enterobacter cloacae, Morganella morganii, Serratia marcescens, Salmonella entenca. 5. Szczep bakteryjny według zastrz. 3 albo 4, znamienny tym, że jest szczepem E. coli do którego część mobilizującą systemu koniugacyjnego została wintegrowana w miejsce attB chromosomu, korzystnie jest to szczep E. coli S14.5. The bacterial strain according to claim 1 The strain of claim 3 or 4, characterized in that it is an E. coli strain into which the mobilizing part of the conjugation system has been integrated into the attB site of the chromosome, preferably it is E. coli S14 strain. 6. System do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy obejmujący plazmid określony w zastrz. 1-2 i/lub szczep bakteryjny określony w zastrz. 3-5 oraz plazmid mobilizowany zawierający ohT o sekwencji nukleotydowej, która to sekwencja mikleotydowa zapewnia, że to ohTwspółdziała z tym systemem.6. A system for the efficient mobilization of plasmids with a broad host spectrum comprising the plasmid according to claim 1. 1-2 and / or the bacterial strain according to claims 1-2 3-5 and a mobilized plasmid containing ohT with a nucleotide sequence, which mycleotide sequence ensures that ohT interacts with this system. 7. System według zastrz. 6, znamienny tym, że ohT o sekwencji nukleotydowej, która to sekwencja nukleotydowa zapewnia, że to ohT współdziała z tym systemem jest οπΤΡοτχ-Μ3 lub or/Tcoiib P9, korzystniej οπΤΡοτχ-Μ3 przedstawiony na SEKW. ID. NR 1.7. The system according to p. The method of claim 6, characterized in that the ohT with a nucleotide sequence which nucleotide sequence ensures that the ohT interacts with said system is οπΤ Ρ οτχ-Μ3 or or / Tcoiib P9, more preferably οπΤ Ρ οτχ-Μ3 shown in SEQ. ID. NO. 1. 8. System według zastrz. 6-7, znamienny tym, że plazmid mobilizowany zawiera replikon umożliwiający replikację w dawcy, korzystnie zawiera ολ/ρμβι z pUC19, o/7ra3 z pRA3, ohpisa z pACYC184 lub ohTPcn-M3Z pCTX-M3.8. The system according to p. 6-7, characterized in that the mobilized plasmid comprises a replicon allowing replication in the donor, preferably comprises ολ / ρ μβι from pUC19, o / 7ra3 from pRA3, ohpisa from pACYC184 or ohT P cn-M3Z pCTX-M3. 9. Zastosowanie plazmidu pomocniczego określonego w zastrz. 1-2, szczepu bakteryjnego określonego w zastrz. 3-5 albo systemu zawierającego plazmid mobilizowany określonego w zastrz. 6-8 do wydajnej mobilizacji plazmidów do komórek biorcy, przy czym komórkami biorcy są bakterie Gram ujemne: a-Protcobacteria, β-Proteobacteria, γ-Proteobacteria oraz bakterie Gram dodatnie, szczególnie z klasy Bacilli.9. Use of a helper plasmid as defined in claim 1. 1-2, the bacterial strain according to claims 1 to 2 3-5 or a system comprising a mobilized plasmid according to claim 3, 5 or 5. 6-8 for efficient mobilization of plasmids into the recipient cells, where the recipient cells are Gram negative bacteria: α-Protcobacteria, β-Proteobacteria, γ-Proteobacteria and Gram positive bacteria, especially from the Bacilli class. 10. Zastosowanie według zastrz. 9, znamienne tym, że plazmid mobilizowany zawiera oriTPcTx-M3 lub onTcoiib-P9, korzystniej ohTprzedstawiony na SEKW. ID. NR 1.Use according to claim 1 9. The method of claim 9, characterized in that the mobilized plasmid comprises oriT P cTx-M3 or onTcoiib-P9, more preferably ohT as shown in SEQ ID NO. ID. NO. 1. 11. Zastosowanie według zastrz. 9-10, znamienne tym, że plazmid mobilizowany zawiera replikon umożliwiający replikację w dawcy, korzystnie zawiera ολ/ρμβι z pUC19, ohras z pRA3, oripi5A z pACYC184 lub ohTPcn-M3Z pCTX-M3.11. The use according to claim 1 The method of claim 9-10, characterized in that the mobilized plasmid comprises a replicon allowing replication in the donor, preferably comprises ολ / ρ μβι from pUC19, ohras from pRA3, oripi5A from pACYC184 or ohT P cn-M3Z pCTX-M3. 12. Zastosowanie systemu określonego w zastrz. 6-8 do wprowadzania genów kodujących czynnik korzystny dla bakterii biorcy w specyficznym środowisku lub warunkach, w którym w koniugacji mobilizowane są plazmidy zawierające ohTpctx-m3 lub onTcoiib-ps, korzystniej zawierające ohTprzedstawiony na SEKW. ID, NR 1, przy czym na mobilizowanym plazmidzie zostaje do komórki dawcy wprowadzony czynnik umożliwiający jego rozwój w specyficznym środowisku lub warunkach, który to czynnik jest bezpieczny dla szczepu dawcy.12. Use of the system as defined in claim 6-8 for introducing genes encoding a beneficial factor for recipient bacteria under a specific environment or conditions in which plasmids containing ohT p ctx-m3 or onTcoiib-ps, more preferably containing ohT as shown in SEQ ID, are mobilized in conjugation. ID, NR 1, wherein an factor enabling its development in a specific environment or conditions is introduced into the donor cell on the mobilized plasmid, which factor is safe for the donor strain. 13. Zastosowanie systemu określonego w zastrz. 6-8, do wprowadzania do szczepu biorcy w celu integracji z chromosomem biorcy sekwencji nukleotydowej wprowadzanej na mobilizowanym plazmidzie, w którym plazmid mobilizowany nie ulega replikacji, przy czym w koniugacji mobilizowane są plazmidy zawierające ohTPcn-M3 lub or/coiib-P9 korzystniej zwierające ohT przedstaw jony na SEKW, ID. NR I. oraz mobilizowany plazmid obejmuje sekwencje integrującą do chromosomu biorcy.13. Use of the system as defined in claim 6-8, for introduction into a recipient strain for integration into the recipient chromosome of a nucleotide sequence introduced on a mobilized plasmid in which the mobilized plasmid does not replicate, where plasmids containing ohT P cn-M3 or or / coiib-P9 are mobilized for conjugation, more preferably containing ohT ions are shown in SEQ ID NO. No. I. and the mobilized plasmid includes an integrating sequence into the recipient chromosome. 14. Zastosowanie według zastrz. 13, znamienne tym, że integracja z chromosomem biorcy sekwencji nukleotydowej prowadzona jest w celu przeprowadzenia mutagenezy transpozonowej, przy czym mobilizowany plazmid obejmuje sekwencjię integrującą do chromosomu biorcy, którą jest sekwencja transpozonu.14. Use according to claim 1 The method of claim 13, wherein integration into the recipient chromosome of the nucleotide sequence is carried out to effect transposon mutagenesis, wherein the mobilized plasmid comprises a transposon integrating sequence into the recipient's chromosome. 15. Zestaw molekularny, znamienny tym, że zawiera plazmid określony w zastrz. 1-2 i/lub szczep bakteryjny określony w zastrz. 3-5 i lub system do wydajnej mobilizacji plazmidów o szerokim spektrum gospodarzy określony w zastrz. 6-8,15. A molecular kit comprising a plasmid as defined in any one of the preceding claims. 1-2 and / or the bacterial strain according to claims 1-2 3-5 and or the system for efficient mobilization of broad host spectrum plasmids as defined in claims 1 to 5. 6-8,
PL400718A 2012-09-10 2012-09-10 Helper plasmid, the strain and the system of the broad host spectrum plasmid mobilization and use thereof PL230884B1 (en)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL400718A PL230884B1 (en) 2012-09-10 2012-09-10 Helper plasmid, the strain and the system of the broad host spectrum plasmid mobilization and use thereof
PCT/IB2013/058368 WO2014037917A1 (en) 2012-09-10 2013-09-07 The helper plasmid, bacterial strain and the broad host range system for plasmid mobilization and uses thereof

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL400718A PL230884B1 (en) 2012-09-10 2012-09-10 Helper plasmid, the strain and the system of the broad host spectrum plasmid mobilization and use thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL400718A1 PL400718A1 (en) 2014-03-17
PL230884B1 true PL230884B1 (en) 2018-12-31

Family

ID=49724617

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL400718A PL230884B1 (en) 2012-09-10 2012-09-10 Helper plasmid, the strain and the system of the broad host spectrum plasmid mobilization and use thereof

Country Status (2)

Country Link
PL (1) PL230884B1 (en)
WO (1) WO2014037917A1 (en)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR3099769B1 (en) 2019-08-05 2021-11-05 Bgene Genetics Bacterial mutagenesis by conjugation in liquid medium
WO2023092189A1 (en) * 2021-11-25 2023-06-01 The Westmead Institute for Medical Research Broad host range conjugative plasmids
CN114874968A (en) * 2022-06-21 2022-08-09 中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所 Method for in-situ modification of metagenome of plant endophytic microbiome

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6991786B1 (en) * 2000-08-30 2006-01-31 Wisconsin Alumni Research Foundation Anti-microbial biotherapeutic agents: alternatives to conventional pharmaceutical antibiotics

Also Published As

Publication number Publication date
PL400718A1 (en) 2014-03-17
WO2014037917A1 (en) 2014-03-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US6787316B2 (en) DNA cloning method
US20220411777A1 (en) C-to-G Transversion DNA Base Editors
KR102267412B1 (en) Rna trnascription vector and uses thereof
WO2020181202A1 (en) A:t to t:a base editing through adenine deamination and oxidation
Kim et al. Transcription induction of the ferric citrate transport genes via the N‐terminus of the FecA outer membrane protein, the Ton system and the electrochemical potential of the cytoplasmic membrane
CN113292658B (en) Fusion protein and application thereof in targeted degradation of intracellular protein
PL230884B1 (en) Helper plasmid, the strain and the system of the broad host spectrum plasmid mobilization and use thereof
CN110785180A (en) Oncolytic viral therapy and immunotherapy
KR102646320B1 (en) Recombinant bacteria for producing 3-hydroxypropionic acid, method for producing the same, and application thereof
WO2014190181A1 (en) Rna-directed dna cleavage and gene editing by cas9 enzyme from neisseria meningitidis
AU775001B2 (en) Delivery of functional protein sequences by translocating polypeptides
CN110951767B (en) Corynebacterium and escherichia coli double-expression vector with high copy capacity and construction method thereof
WO2022175383A1 (en) Methods and systems for generating nucleic acid diversity
US20040096938A1 (en) Method for generating split, non-transferable genes that are able to express an active protein product
CN112410389B (en) Application of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex in preparation of malonyl-CoA
US20220154221A1 (en) Site specific recombinase integrase variants and uses thereof in gene editing in eukaryotic cells
Joseph et al. Molecular characterization of heterologous HIV-1gp120 gene expression disruption in Mycobacterium bovis BCG host strain: a critical issue for engineering mycobacterial based-vaccine vectors
CN111778200B (en) Platform bacterium for producing L-aspartic acid, recombinant bacterium for producing beta-alanine constructed based on platform bacterium and construction method thereof
US20220145332A1 (en) Cell penetrating transposase
Takahashi et al. Suppressor mutants from MotB-D24E and MotS-D30E in the flagellar stator complex of Bacillus subtilis
WO2022178167A1 (en) Artificial dna replisome and methods of use thereof
Strathern Nusa Solubility in Escherichia coli: Discordant Homologues
Sun et al. Enzymatic Assembly for CRISPR Split-Cas9 System: The Emergence of a Sortase-based Split-Cas9 Technology
US20110033909A1 (en) Means and methods for cloning nucleic acid sequences
Alarcón Design and characterization of a biosensor for the detection of aminoglycoside compounds with codon-readthrough activity.