PL205884B1 - Sekwencje nukleotydowe, konstrukt kwasu nukleinowego, wektor ekspresyjny, sekwencja aminokwasowa, sposób transformowania rośliny, transgeniczna roślina, transgeniczna komórka roślinna i część rośliny transgenicznej - Google Patents

Sekwencje nukleotydowe, konstrukt kwasu nukleinowego, wektor ekspresyjny, sekwencja aminokwasowa, sposób transformowania rośliny, transgeniczna roślina, transgeniczna komórka roślinna i część rośliny transgenicznej

Info

Publication number
PL205884B1
PL205884B1 PL346568A PL34656899A PL205884B1 PL 205884 B1 PL205884 B1 PL 205884B1 PL 346568 A PL346568 A PL 346568A PL 34656899 A PL34656899 A PL 34656899A PL 205884 B1 PL205884 B1 PL 205884B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
sequence
sbeii
wheat
seq
plant
Prior art date
Application number
PL346568A
Other languages
English (en)
Other versions
PL346568A1 (en
Inventor
Andrew Goldsbrough
Steve Colliver
Original Assignee
Monsanto Uk Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Monsanto Uk Ltd filed Critical Monsanto Uk Ltd
Publication of PL346568A1 publication Critical patent/PL346568A1/xx
Publication of PL205884B1 publication Critical patent/PL205884B1/pl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1048Glycosyltransferases (2.4)
    • C12N9/1051Hexosyltransferases (2.4.1)
    • C12N9/1071,4-Alpha-glucan branching enzyme (2.4.1.18)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8245Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified carbohydrate or sugar alcohol metabolism, e.g. starch biosynthesis

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Noodles (AREA)
  • Bakery Products And Manufacturing Methods Therefor (AREA)
  • Cereal-Derived Products (AREA)
  • Polysaccharides And Polysaccharide Derivatives (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Description

Opis wynalazku
Przedmiotem wynalazku są sekwencje nukleotydowe kodujące enzymy sieciujące skrobię (SBE) z pszenicy, konstrukt kwasu nukleinowego zawierający taką sekwencję nukleotydową, wektor ekspresyjny zawierający taki konstrukt i sekwencja aminokwasowa kodowana przez taką sekwencję nukleotydową, sposób transformowania rośliny poprzez wprowadzanie do rośliny takich sekwencji nukleotydowych a także transgeniczna roślina i jej część oraz transgeniczna komórka roślinna.
W czasie ostatnich lat główny rozwój osiągnięty w nauce o zbożu koncentrował się na właściwościach podjednostek białkowych glutenu oraz ich roli w systemach piekarniczych. Było to w dużej mierze ułatwione dzięki dużej, naturalnej różnorodności białkowych podjednostek glutenu pochodzących z odmian uprawnych.
Pomimo, że komercyjnie dostępna mąka pszenna zawiera około 75-85% skrobi to jej rola nie została dostrzeżona, głównie z powodu trudności wynikających z różnic pomiarowych dotyczących budowy skrobi. Jednakże z powodu ograniczonych prac nad odmianami pszenicy wydaje się, że odczuwalny jest brak naturalnej różnorodności wśród uprawianych odmian pszenicy. Wraz z nadejściem technologii rekombinacji DNA oraz transferu genowego obecnie możliwe jest tworzenie nowych odmian roślin dlatego, modyfikacja składu skrobi w ziarnie pszenicy stała się realnie osiąganym celem.
Skrobia jest główną formą cukru zapasowego u roślin, stanowiącego 50% lub więcej suchej masy organów zapasowych, tj. bulw, ziaren zbóż. Skrobia ma szerokie zastosowanie zarówno spożywcze jak i przemysłowe. W wielu przypadkach w celu wytworzenia odmiennych właściwości odpowiadających wymaganiom odpowiednich zastosowań konieczna jest jednak modyfikacja pierwotnej skrobi metodami fizycznymi lub chemicznymi. Byłoby wysoce pożądanym, aby modyfikacji dokonywać już na poziomie rośliny tak, aby nie wykonywać innych zbędnych zabiegów. Aby uzyskać powyższy efekt drogą inżynierii genetycznej wymagana jest wiedza na temat szlaku metabolicznej biosyntezy skrobi. Obejmuje to właściwości genów oraz kodowanych produktów genowych, które katalizują syntezę skrobi. Wiedza na temat regulacji biosyntezy zwiększa możliwości „przeprogramowania” dróg biosyntezy w celu wytworzenia skrobi o nowych właściwościach skrobi, która będzie mogła mieć nowe zastosowania komercyjne.
Najbardziej znacząca właściwość skrobi wywodzi się ze zdolności utraty naturalnej, granulkowatej postaci i jednoczesnego pęcznienia oraz absorbowania wody w odpowiednich warunkach, nadając tym samym zmienioną lepkość oraz strukturę w procesie znanym jako żelifikacja. Żelifikacja skrobi została zdefiniowana jako (W A Atwell i wsp., 1988) „...zniszczenie (zakłócenie) cząsteczkowego porządku granulek skrobi, który objawia się w nieodwracalnych zmianach właściwości takich jak pęcznienie granulek, rozpuszczanie naturalnych kryształów, utracie dwójłomności, oraz solubilizacji skrobi. Punkt rozpoczęcia żelifikacji oraz zakres, w którym występuje, jest zależny od stężenia skrobi, sposobu obserwacji, rodzaju granulki, oraz heterogenności obserwowanej populacji granulek skrobi”.
Do pełnej żelifikacji skrobi potrzeba 14 cząsteczek wody na cząsteczkę bezwodnej glukozy, tj. minimum 75% wody (Donovan). Żelifikacja skrobi jest zwykle powodowana przez ciepło, ale może być także spowodowana przez fizyczne uszkodzenia a także przez pewne chaotropowe czynniki, głównie przez dimetylosulfotlenek (DMSO), mocznik, chlorek wapnia, silną zasadę i kwasy.
Różnorodność zjawisk zachodzących podczas żelifikacji można obserwować za pomocą wielu sposobów, łącznie z: dwójłomnością, dyfrakcją promieni rentgenowskich, różnicową kalorymetrią skaningową (DSC), 13C NMR. Pęcznienie może być obserwowane przy pomocy różnych sposobów, a zwł aszcza metod reologicznych.
Różnicowa kalorymetria skaningowa (DSC) jest sposobem destruktywnym, podczas której śledzi się zjawiska endotermiczne podgrzewanych granulek, głównie mierzy się temperaturę, a także energię endotermiczną (delta H) potrzebną do stopienia natywnych krystalitów. Temperatura żelifikacji skrobi nie zależy od zawartości wody, jeśli jest jej powyżej 75% (opisywane jako nadmiar wody), natomiast wzrasta, gdy ilość wody jest ograniczona (Donovan, 1979).
Stopień oraz rozmiar pęcznienia granulek skrobiowych w czasie podgrzewania decyduje o rodzaju lepkości wodnych roztworów skrobi w czasie podgrzewania. Pęcznienie jest więc bardzo istotne z punktu widzenia technologicznego. Konwencjonalnie wzrost lepkoś ci po ogrzaniu moż e być zmierzony za pomocą amylografu Brabendera (Brabender jest znakiem towarowym) (Kennedy i Cabalda, 1991) lub przy użyciu analizatora Rapid Visco (Rapid Visco jest znakiem towarowym Newport Scientific, Australia). Figura 1 jest typowym profilem wisko-amylografu skrobi pszenicznej w czasie trwania i po gotowaniu. Gdy granulki skrobi szybko pęcznieją pod wpływem wody w procesie zwanym kleikowaniem,
PL 205 884 B1 ich objętość wzrasta powodując wzrost lepkości. Początek kleikowania oznaczono za pomocą A na Figurze 1. Maksymalna lepkość, oznaczona za pomocą B, na Figurze 1 jest osiągnięta, gdy osiągnięto maksymalną objętość fazową. Ścinanie będzie przerywać/ powodować fragmentację pęczniejących granulek powodując, tym samym zmniejszenie lepkości. Całkowite rozproszenie jest oznaczone za pomocą C na Figurze 1. Potwierdzono to przez reologiczne badania oscylacyjne kleiku skrobiowego na różnych etapach profilu lepkości (Svenmark i Hermanson, 1990). Lepkość w danej temperaturze początkowej oraz maksimum lepkości wskazują, odpowiednio, początek oraz rozmiar kleikowania. Po ochłodzeniu rozpłynniona amyloza tworzy sieć w procesie reasocjacji cząsteczek, lub retrogradacji powodującej wzrost lepkości tak jak przedstawiono to na przykładzie D na Figurze 1. Retrogradacja (lub opóźnianie) lepkości wskazuje ilość rozpłynnionej amylozy z granulek.
Właściwości skrobi pszenicy są przydatne w wielu zastosowaniach, nie tylko związanych z przemysłem spożywczym, takich jak np. przemysł papierniczy, tekstylny, kleje. Jednakże, dla wielu zastosowań właściwości skrobi nie są optymalne i dlatego, w celu ich poprawy, przeprowadza się wiele modyfikacji chemicznych i fizycznych, dobrze znanych w dziedzinie. Przeprowadza się dwa rodzaje modyfikacji: kontrolowane zmiany temperatury żelifikacji i kleikowania oraz wytworzenie skrobi, która wykazuje mniejszą fragmentację granulek podczas kleikowania niż skrobia konwencjonalna.
Obecnie jedynymi sposobami zmiany temperatur żelifikacji oraz kleikowania skrobi są włączenia dodatków takich jak cukier, związki soli polihydroksylowych lub zastosowanie procesów chemicznych lub fizycznych. Redukcja fragmentacji granulek podczas kleikowania może być osiągnięta albo poprzez obszerną obróbkę wstępną metodami fizycznymi lub przez chemiczne usieciowanie. Procesy takie są kłopotliwe i mało skuteczne. Staje się zatem pożądanym otrzymanie roślin, które wytwarzają skrobię, która już wewnątrz rośliny posiada korzystne cechy wrodzone.
Skrobia składa się z dwóch głównych polisacharydów glukozowych: amylozy i amylopektyny. Amyloza jest liniowym polimerem składającym się z podjednostek glukozy połączonych wiązaniem α-1,4, podczas gdy amylopektyna jest wysoce rozgałęzionym polimerem zawierającym glukan, który w łańcuchu głównym połączony jest wiązaniem α-1,4, a w bocznym wiązaniem α-1,6. W bielmie pszenicy amylopektyna stanowi około 70% całkowitego składu skrobi, wyrażonej w zawartości amylozy. Amylopektyna jest syntetyzowana poprzez skoordynowane działanie kilku enzymów takich jak rozpuszczalna syntaza(syntetazy) skrobi (SSS), enzymy rozgałęziające skrobię (SBE), enzymy odgałęziające skrobię (DBE). Fizyczne właściwości skrobi są silnie zdeterminowane przez stosunkowo znaczną ilość amylozy i amylopektyny, a więc SSS, SBE i DBE odgrywają kluczową rolę, zarówno w ustalaniu składu jak i jakości skrobi. Tak więc, jednym z podejść do modyfikacji budowy skrobi mogłaby być, stosując metody transgeniczne, modyfikacja ekspresji enzymów zaangażowanych w biosyntezę skrobi w bielmie.
SBE katalizuje tworzenie wiązań α-1,6, tworząc miejsca rozgałęzień w tworzonej cząsteczce skrobi, poprzez hydrolizę wiązań α-1,4 a następnie ponowne przyłączenie uwolnionych łańcuchów glukonowych o wiązaniach α-1,4 do tego samego lub innego łańcucha glukozylowego. Reakcja ta dostarcza także nowego nieredukującego końca do dalszego wydłużenia pierwotnego łańcucha glukonowego α-1,4.
Dla wielu gatunków takich jak kukurydza (Boyer i Preiss, 1978), ryż (Nakamura i wsp., 1992), groch (Smitch, 1988), ziemniaki (Khoshnoodi i wsp., 1993) oraz pszenica (Morell i wsp., 1997) scharakteryzowano biochemicznie różne izoformy enzymów rozgałęziających skrobię. Ostatnio scharakteryzowano sekwencje genomowe oraz cDNA SBE dla kilku gatunków takich jak kukurydza (Baba i wsp., 1991; Fisher i wsp., 1993; Gao i wsp. 1997), groch (Burton i wsp., 1995), ziemniak (Kossmann i wsp., 1991), ryż (Nakamura i Yamanouchi, 1992; Mizuno i wsp., 1993), Arabidopsis (Fisher i wsp., 1996), maniok (Salehuzzaman i wsp., 1992) oraz pszenica (Rapellin i wsp., 1997, Nair i wsp., 1997, Rahman i wsp., 1997). Zestawienie sekwencji tych SBE ujawnia wysoki stopień konserwatywności sekwencji na poziomie aminokwasów oraz to, że SBE mogą być zgrupowane w dwie odrębne rodziny, znane jako SBEI oraz SBEII. Co więcej, analizy ujawniły, że w gatunkach występuje 50% homologia pomiędzy dwoma rodzinami SBEI oraz SBEII, a często nawet większa.
Kukurydza wyróżnia się tym, iż posiada kukurydzianą rodzinę SBEII składającą się z dwóch różnych członków, znanych jako SBEIIa oraz SBEIIb. Jeszcze do niedawna kontrowersyjne były domniemania czy SBEIIa oraz Ilb są w rzeczywistości a) kodowane przez geny w dwóch różnych loci i b) czy geny reprezentują różne allele jednego locus. Fisher i wsp. (1996) oraz Gao i wsp. (1997) dostarczyli dowodów na to, że SBEIIa oraz SBEIIb są kodowane przez niezależne geny. Jednakże nie ma niezbitych dowodów na to, że dwie izoformy istnieją jednocześnie w jednym genotypie kukurydzy.
PL 205 884 B1
Klony DNA dla dwóch opublikowanych sekwencji genowych, oczyszczono z różnych genotypów kukurydzy i dlatego też jest możliwe, iż reprezentują różne allele pojedynczego locus. Podsumowując, w kukurydzy zostały scharakteryzowane trzy różne geny SBE (Baba i wsp., 1991; Fisher i wsp., 1993, Gao i wsp., 1997). SBEI różni się od SBEIIa oraz SBEIIb składem aminokwasów, specyficznością do substratu, właściwościami kinetycznymi, reaktywnością immunologiczną, podczas gdy SBEIIa oraz SBEIIb są pod tym względem podobne (Guan i Preiss, 1993; Preiss 1991, Takeda i wsp., 1993). Na poziomie aminokwasów sekwencja wykazuje około 50% homologię z sekwencjami BEIIa oraz SBEIIb, podczas gdy SBEIIa oraz SBEIIb wykazują około 80% wzajemną homologię.
Przed niniejszym wynalazkiem, unikalną była kukurydza posiadająca enzymy typu SBEIIa oraz SBEIIb. Chociaż Arabidopsis posiada dwóch członków rodziny SBEII to podgrupa Arabidopsis nie wydaje się odpowiadać tym stwierdzonym u kukurydzy. Członkowie podrodziny Arabidopsis, niekoniecznie tak jak sekwencje kukurydzy należą do kategorii Ila oraz Ilb. Oba geny SBEII Arabidopsis mają podobny poziom homologii do obu genów SBEII kukurydzy - SBEIIa oraz SBEIIb ale podobieństwa nie są wystarczające, aby można było, jak dla kukurydzy, umiejscowić geny Arabidopsis w tych samych kategoriach co geny SBEIIa i SBEIIb. Naprawdę, dane sugerują, iż geny SBEII Arabidopsis, nie należą do tej samej kategorii genów kukurydzy Ila oraz Ilb.
Częściowo scharakteryzowano dwie formy jęczmiennego SBEII. Pomimo, że zostały nazwane SBEIIa oraz SBEIIb, to tylko niewielka ilość informacji o sekwencji została opublikowana (Sun i wsp., 1995) i nie można było wywnioskować, że formy te odpowiadają kategoriom Ila oraz Ilb kukurydzy. Faktycznie, na podstawie dostępnych informacji o sekwencji jęczmienia dwie sekwencje SBEII jęczmienia (SBEIIa oraz SBEIIb) wydają się wykazywać większą homologię do SBEIIa niż do SBEIIb kukurydzy.
Dla wszystkich innych gatunków roślin, dla których zidentyfikowano oraz opublikowano sekwencje SBEII, a więc dla ziemniaka, grochu, ryżu, manioku, pszenicy lub jęczmienia nie wyróżniono podgrup rodzin SBEII podobnych do podziału na SBEIIa oraz SBEIIb kukurydzy.
Badania nad oczyszczonym SBEI oraz SBEII wykazują, że izoformy te różnią się specyficznością wobec substratu pod względem zarówno długości jak i stopnia rozgałęzienia. W kukurydzy SBEI oraz SBEII wykazują wyraźną aktywność rozgałęziania in vitro, gdzie SBEI wykazuje wyższy stopień rozgałęziania substratu amylozowego w porównaniu do SBEII, podczas gdy, zarówno SBEIIa jak i lIb mają wyższy stopień rozgałęziania niż SBEI, gdy działają na substrat amylopektynowy (Guan i Preiss, 1993). Co więcej SBEI kukurydzy preferencyjnie przenosi dłuższe łańcuchy glukonowe (średnia długość łańcucha =24) niż SBEII (średnia długość łańcucha =21 (Ila) lub 22 (IIb)) (Takeda i wsp., 1993). Podobne obserwacje zostały przeprowadzone dla izoform SBEII oraz SBEII pszenicy oraz grochu (Morell i wsp., 1997; Smith, 1988). Badania mutacyjne kukurydzy, ryżu oraz grochu dowodzą, że mutanty z wysoką zawartością amylozy mają w każdym wypadku deficyt w aktywności analogów enzymów rozgałęziających w porównaniu do aktywności SBEII kukurydzy (Martin i Smith, 1995; Morell i wsp., 1995). Jednakż e, zwią zki pomię dzy obserwacjami biochemicznymi oraz dowodami genetycznymi sugerujące różnice w rolach enzymów pozostają niejasne.
Prezentowany wynalazek opiera się na nieoczekiwanym odkryciu nowej klasy genów SBEII pszenicy, nazywanej tutaj SBEII-1. Nowy gen SBEI-1 ma wysoką homologię do genu SBEIIb kukurydzy. Gen SBEII-1 pszenicy jest uważany za funkcjonalnie równoznaczny z genem SBEIIb kukurydzy i na podstawie tego uważ a się, że zmiana genu pszenicy SBEII-1 prawdopodobnie wpływa na właściwości skrobi, takie jak temperatura żelifikacji skrobi, w sposób analogiczny do zmiany genu SBEIIb opisanego w WO97/22703.
Podsumowując, mimo faktu znajomości dwóch różnych sekwencji genu SBEII kukurydzy, Arabidopsis oraz jęczmienia, tak jak to omówiono powyżej, przed niniejszym wynalazkiem, nie było powodu, żeby oczekiwać, że pszenica będzie posiadać podobne podgrupy genów SBEII jakie obserwuje się w kukurydzy. Dwa geny Arabidopsis wykazują różne podgrupy, a przed niniejszym wynalazkiem, nie było wystarczających dowodów na ustalenie czy dwie sekwencje SBEII jęczmienia należą do podgrupy typu kukurydzy. To znaczy przed niniejszym wynalazkiem nie było powodów, aby oczekiwać, iż pszenica posiada dwóch podobnych członków SBEII porównywalnych do tych występujących w kukurydzy. W następstwie niniejszego wynalazku Sun i wsp. (1998) przedstawili dane, które wskazują, że sekwencje jęczmienia, rzeczywiście, dzielą się na podgrupy w podobny sposób do sekwencji SBEIIa i Ilb kukurydzy oraz SBEII-2 i SBEII-1 pszenicy omawianej w tym dokumencie.
Twórcy wynalazku wykorzystali wysoki stopień konserwatywności sekwencji pomiędzy kilkoma sekwencjami genu SBE do zaprojektowania starterów oligonukleotydowych do motywów, które są
PL 205 884 B1 specyficzne albo dla rodziny SBEI albo dla SBEII oraz użyli tych starterów do powielenia sekwencji cDNA z rozwijającego się bielma pszenicy.
Gdy rozpoczęto pracę, doniesiono o pojedynczym klonie cDNA genu SBEII pszenicy o częściowej długości (Mousley, 1994). Wielokrotne zestawienie sekwencji z tą sekwencją SBE pszenicy wraz z innymi opublikowanymi sekwencjami SBE z wielu gatunków roślin ujawniło wiele motywów, które były wysoce konserwatywne. Startery oligonukleotydowe zaprojektowane tak, aby były komplementarne do tych motywów zostały użyte do sklonowania klonów o częściowej długości cDNA SBEII pszenicy. Zestawienie sekwencji cDNA klonu wykazało, iż klon może być podzielony na dwie klasy, które twórcy wynalazku oznaczyli jako SBEII-1 oraz SBEII-2, które pokazały większe niż 90% podobieństwo do członków klasy, ale tylko 60% podobieństwo pomiędzy klasami. Istotnie, porównanie pomiędzy reprezentatywnymi sekwencjami z każdej klasy z wcześniej zidentyfikowanymi klonami pszenicy SBEII, pWBE6 (Mousley, 1994) i SBEII (Nair i wsp., 1997) wykazało, że każdy wydaje się być homologiem do klasy SBEII-2. Nowe jest klonowanie cDNA SBEI-1 pszenicy.
Przedmiotem wynalazku jest sekwencja nukleotydowa, charakteryzująca się tym, że koduje sekwencję aminokwasową przedstawioną jako SEQ ID No:2.
Przedmiotem wynalazku jest też sekwencja nukleotydowa, charakteryzująca się tym, że stanowi sekwencję B2 przedstawioną jako SEQ ID No:3.
Przedmiotem wynalazku jest także sekwencja nukleotydowa, charakteryzująca się tym, że stanowi sekwencję B4 przedstawioną jako SEQ ID No:4.
Przedmiotem wynalazku jest również sekwencja nukleotydowa, charakteryzująca się tym, że stanowi sekwencję B10 przedstawioną jako SEQ ID No:5.
Przedmiotem wynalazku jest także sekwencja nukleotydowa, charakteryzująca się tym, że stanowi sekwencję B1 przedstawioną jako SEQ ID No:6.
Przedmiotem wynalazku jest również sekwencja nukleotydowa, charakteryzująca się tym, że koduje sekwencję aminokwasową B6 przedstawioną jako SEQ ID No:7.
Przedmiotem wynalazku jest także konstrukt kwasu nukleinowego, charakteryzujący się tym, że zawiera jedną z sekwencji nukleotydowych opisanych powyżej.
Korzystnie w konstrukcje tym sekwencja jest operacyjnie połączona, w orientacji sensownej lub antysensownej, z sekwencją promotora.
Przedmiotem wynalazku jest też wektor ekspresyjny, charakteryzujący się tym, że zawiera konstrukt określony powyżej.
Przedmiotem wynalazku jest też sekwencja aminokwasowa, charakteryzująca się tym, że kodowana jest przez jedną z sekwencji nukleotydowych określonych powyżej.
Przedmiotem wynalazku jest również sposób transformowania rośliny, polegający na tym, że wprowadza się do rośliny jedną z sekwencji nukleotydowych określonych powyżej, albo konstrukt, albo wektor określony powyżej, połączone operacyjnie z odpowiednim promotorem aktywnym w roślinie tak, aby spowodować ekspresję genu obecnego w roślinie.
Korzystnie wprowadza się sekwencję połączoną z promotorem w orientacji antysensownej.
Korzystnie jako roślinę stosuje się pszenicę.
Korzystnie zmienia się właściwości dotyczące zawartości skrobi i/lub składu skrobi rośliny.
Przedmiotem wynalazku jest także transgeniczna roślina, charakteryzująca się tym, że zawiera konstrukt określony powyżej.
Przedmiotem wynalazku jest też transgeniczna komórka roślinna, charakteryzująca się tym, że zawiera konstrukt określony powyżej.
Przedmiotem wynalazku jest również część rośliny transgenicznej, charakteryzująca się tym, że zawiera konstrukt określony powyżej.
Korzystnie transgeniczną rośliną lub jej częścią albo transgeniczną komórką roślinną jest pszenica.
W jednym aspekcie wynalazek dostarcza sekwencję nukleotydów kodują c ą sekwencję aminokwasową przedstawioną na Figurze 10 (SEQ ID No:2).
Funkcjonalny odpowiednik obejmuje sekwencje nukleotydowe, które różnią się swoim składem nukleotydowym w stosunku do tego pokazanego na Figurze 10 (SEQ ID No:1), ale które z racji degeneracji kodu genetycznego, kodują polipeptydy posiadające identyczne lub zasadniczo identyczne sekwencje aminokwasowe. Termin ten powinien zasadniczo odpowiadać sekwencjom, które są wystarczająco homologiczne do sekwencji opisanych w wynalazku, tak że mogą hybrydyzować do ich sekwencji komplementarnych w rygorystycznych warunkach hybrydyzacji (np. tak jak opisał Sambrook i wsp. 1989, tj. przemywanie 0,1X SSC, 0,5%SDS w temperaturze 68°C); lepiej jeśli takie odpowiedniki,
PL 205 884 B1 będą wykazywały co najmniej w 86%, jeszcze lepiej co najmniej w 90%, a najlepiej co najmniej w 95% homologię sekwencji (tj. podobieństwo sekwencji) do sekwencji opisanej w wynalazku. Homologia sekwencji jest odpowiednio określona przy użyciu programu „MEGALIGN” z pakietu programów DNAStar (MEGALIGN oraz DNAStar są znakami towarowymi). Oczywistym dla specjalistów z dziedziny będzie fakt, iż sekwencja nukleotydowa według wynalazku może znaleźć także użyteczne zastosowanie, gdy stanowi sekwencję „antysensowną”. W związku z tym funkcjonalne równoważniki sekwencji będą także obejmować te sekwencje, które mogą hybrydyzować w rygorystycznych warunkach hybrydyzacji, do sekwencji opisanej w wynalazku (zamiast do ich formy komplementarnej). Lepiej jeśli takie „antysensowne” równoważniki będą wykazywać co najmniej w 86%, jeszcze lepiej co najmniej w 90%, a najlepiej w 95% homologię sekwencji z komplementarną do skł adu sekwencją opisaną w wynalazku.
W innym aspekcie wynalazek dostarcza sekwencję nukleotydową, którą stanowi sekwencja B2 pokazana na Figurze 3 (SEQ ID No:3).
W dalszym aspekcie wynalazek dostarcza sekwencję nukleotydową, którą stanowi sekwencja B4 pokazana na Figurze 3 (SEQ ID No:4).
W dalszym aspekcie wynalazek dostarcza sekwencję nukleotydową, którą stanowi sekwencja B10 pokazana na Figurze 3 (SEQ ID No:5).
W jeszcze innym aspekcie wynalazek dostarcza sekwencję nukleotydową , którą stanowi sekwencja B1 pokazana na Figurze 3 (SEQ ID No:6).
W innym aspekcie wynalazek dostarcza sekwencję nukleotydową kodują c ą sekwencję B6 pokazaną na Figurze 4 (SEQ ID No:7).
Funkcjonalny odpowiednik, w tym kontekście, ma zasadniczo takie samo znaczenie jak przedstawiono powyżej, chociaż, lepiej jeśli odpowiedniki dla B2, B4, B10 i B6 będą wykazywać co najmniej w 90%, jeszcze lepiej co najmniej w 95% homologię sekwencji, w stosunku do sekwencji wedł ug wynalazku, podczas gdy lepiej jeśli odpowiednik B1 będzie zawierał co najmniej w 97% homologię sekwencji w stosunku do sekwencji według wynalazku.
Sekwencje według wynalazku są częścią nowych genów SBEII pszenicy, wraz z B1 będącą nową podklasą znanej klasy genów SBEII, tutaj opisywanej jako SBEII-2, wraz z nową podklasą nazwaną SBEII-2B. Pozostałe sekwencje nukleotydowe są w całości nową klasą genów SBEII pszenicy opisywanych tutaj jako SBEII-1. Sekwencje nukleotydowe zostały podzielone na trzy podklasy i opisane poniżej.
Nowe geny SBEII-1 pszenicy, które są przedmiotem tego wynalazku posiadają wysoką homologię sekwencji do genu SBEIIb kukurydzy. Uważa się, że geny SBEII-1 pszenicy posiadają podobne właściwości funkcjonalne do genu SBEIIb kukurydzy. Na tej podstawie oczekuje się, że przy pomocy manipulacji genetycznej genu SBEII-1 pszenicy będzie można, w sposób analogiczny do zmian genu SBEIIb kukurydzy opisanych w WO 97/22703 wpłynąć na właściwości skrobi wytwarzanej przez te rośliny, obejmujące temperaturę żelifikacji oraz właściwości reologiczne skrobi.
Chociaż, sekwencje kodujące nowych genów SBEII-1 pszenicy wykazują wysoką homologię sekwencji do genu SBEIIb kukurydzy, to cechuje je znaczna różnica występująca pomiędzy nie ulegającą translacji na końcu 3' sekwencją o maksymalnej homologii 31,8% a nie ulegającą translacji na końcu 3' sekwencją SBEII-1 pszenicy oraz SBEIIb kukurydzy, tak jak przedstawiono na Figurze 8.
Zgodnie z wynalazkiem opisano także sekwencję nukleotydową składającą się z sekwencji pokazanej na Figurze 5 (SEQ ID No:8), Figurze 6 (SEQ ID No:9) lub Figurze 7 (SEQ ID No:10).
Funkcjonalny odpowiednik, w tym kontekście, ma to samo ogólne znaczenie jak przedstawiono powyżej, ale lepiej z co najmniej 32%, jeszcze lepiej z co najmniej 40%, 50%, 60%, 70%, 80% lub 90% homologią sekwencji w stosunku do sekwencji na odpowiedniej Figurze.
Sekwencje mogą zawierać dalsze nukleotydy na końcu 5' lub 3'. Np. dla ułatwienia ekspresji pożądane sekwencje, zawierają w ramce odczytu, także kodon startowy ATG, a także mogą kodować sekwencję liderową.
Przedmiotem wynalazku jest też konstrukt kwasu nukleinowego zawierający sekwencję nukleotydową według wynalazku, dogodnie połączoną operacyjnie, w orientacji sensownej lub antysensownej, z sekwencją promotorową.
Wynalazek obejmuje także swoim zakresem sekwencje aminokwasowe kodowane przez dowolne sekwencje nukleotydowe według wynalazku.
Wynalazek dostarcza także wektory, szczególnie wektory ekspresyjne zawierające sekwencje nukleotydowe według wynalazku. Zazwyczaj, wektor będzie zawierał promotor oraz jedną lub większą ilość sygnałów regulatorowych, rodzaju dobrze znanego specjalistom danej dziedziny. Wynalazek
PL 205 884 B1 dostarcza także komórki transformowane (który to termin obejmuje transdukcję oraz transfekcję) zawierające wektor zawierający sekwencję nukleotydową według wynalazku.
Sekwencje nukleotydowe według wynalazku mogą być wprowadzone do roślin, szczególnie, lecz nie wyłącznie, do pszenicy, po to, aby wpływały na ekspresję SBE w roślinach i w związku z tym wywierały wpływ na właściwości skrobi wytwarzanej przez rośliny. W szczególności oczekuje się, że użycie sekwencji w orientacji antysensownej ma za zadanie zredukowanie lub supresję ekspresji enzymu. Dodatkowo, ostatnio w innych eksperymentach wykazano, że może istnieć także „supresja sensowna” (tj. ekspresja wprowadzonych sekwencji operacyjnie połączonych w orientacji sensownej może ingerować, przez jakieś nieznane mechanizmy, w ekspresję natywnych genów) tak jak opisał to Matzke & Matzke 1995. Jakikolwiek ze sposobów wspomnianych przez Matzke i Matzke może być, teoretycznie, zastosowany do wpływania na ekspresję homologicznych genów SBE gospodarza.
Uważa się, iż sposoby wprowadzania DNA w orientacji antysensownej są głównie operacyjne, poprzez wytwarzanie antysensownego mRNA, który hybrydyzuje do sensownego mRNA, zapobiegając translacji funkcjonalnego polipeptydu, prawdopodobnie powodując degradację zhybrydyzowanego RNA (np. Sheehy i wsp., 1988; Van der Krol i wsp.). Supresja sensowna wymaga także homologii pomiędzy wprowadzoną sekwencją i genem docelowym, ale jej dokładny mechanizm nie jest jasny. Jednak jest oczywiste, iż w stosunku do supresji antysensownej oraz sensownej, nie jest istotna ani pełna długość sekwencji nukleotydowej, ani sekwencja natywna. Lepiej aby „efektywna ilość” zastosowana w sposobie zawierała co najmniej jedną trzecią pełnej długości sekwencji ale można stwierdzić niewielkie niezgodności oraz błędy innych fragmentów (większych lub mniejszych), które mogą powodować zmiany we właściwościach rośliny.
Zatem, następny aspekt wynalazku dostarcza sposobu transformowania rośliny obejmującego wprowadzanie do rośliny efektywnej ilości sekwencji według wynalazku operacyjnie połączonej do właściwego promotora aktywnego w roślinie tak, aby wpłynąć na ekspresję genu obecnego w roślinie. Korzystnie jeśli sekwencja jest połączona z operatorem w orientacji antysensownej. Korzystnie rośliną jest pszenica. W korzystnym przypadku zmienione właściwości odnoszą się do zawartości skrobi i/lub składu skrobi rośliny (tj. ilość i/lub rodzaj skrobi obecnej w roślinie). Dogodnie sposób transformacji rośliny będzie może obejmować wprowadzanie oprócz efektywnej ilości sekwencji według wynalazku jednej lub większej ilości sekwencji nukleotydowych. Wprowadzona sekwencja według wynalazku oraz jedna lub większa ilość sekwencji nukleotydowych, które mogą być w orientacji sensownej lub antysensownej mogą być operacyjnie połączone z pojedynczym promotorem (który zapewniłby, że dwie sekwencje byłyby zasadniczo transkrybowane w tym samym czasie) lub mogą być operacyjnie połączone z oddzielnymi promotorami (które mogą być konieczne do optymalnej ekspresji). Oddzielne promotory mogą być identyczne lub różne. Odpowiednie promotory są dobrze znane specjalistom danej dziedziny i mogą należeć do typu konstytutywnego jak i sensownego. Przykłady zawierają promotor CaMV 35S (np. pojedyncze lub powtórzenia tandemowe) oraz promotor ubikwityny. Korzystniej jeśli promotor będzie specyficzny tkankowo. Pożądany jest promotor, który będzie powodował ekspresję sekwencji operacyjnie połączonej w pokaźnej ilości, tylko w tkankach roślin gdzie występuje synteza skrobi i/lub przechowywanie skrobi.
Sekwencje według wynalazku, oraz jedna lub większa ilość sekwencji nukleotydowych jeśli są pożądane, mogą być wprowadzone do rośliny za pomocą jednej z wielu dobrze znanych technik (np. transformacja wywołana przez Agrobacterium, lub przy zastosowaniu sposobów „biblistycznych”). Sekwencje mogą być najbardziej skuteczne w działaniu na aktywność SBE pszenicy, ale teoretycznie mogą być wprowadzane do dowolnej rośliny. Pożądane przykłady obejmują: groch, ziemniaki, kukurydzę, ryż, jęczmień, słodkie ziemniaki oraz maniok. Dogodnie rośliny będą zawierać naturalne geny kodujące cząsteczki SBE, które wykazują znaczącą homologię z wprowadzoną sekwencją kwasu nukleinowego opisanego w wynalazku.
W innym aspekcie, wynalazek dostarcza Transgeniczne komórki roślinne lub Transgeniczne rośliny, które zostały poddane transformacji sposobem opisanym powyżej. Potomstwo stransformowanych roślin może być uzyskane np. za pomocą wegetatywnej propagacji lub za pomocą krzyżowania stransformowanych roślin i zachowywaniu tak otrzymanych ziaren. Wynalazek dostarcza także części transgenicznych roślin. Dogodnie wynalazek dostarcza np. ziarno zawierające zmienioną skrobię, przy czym wspomniane ziarno uzyskane jest z transformowanych roślin lub ich potomstwa. Ziarno uzyskane z transformowanych roślin (lub ich potomstwa) będzie szczególnie przydatnym materiałem w pewnych zastosowaniach przemysłowych, a także w przygotowaniu i/lub procesach wytwarzania żywności np. w piekarnictwie.
PL 205 884 B1
W szczególności, odnosząc się do pszenicy wynalazek dostarcza pszenicy lub jej części, która w swoim typie dzikim posiada efektywny gen SBEII-1, ale która została stransformowana tak, że w komórkach co najmniej jednej części tej roś liny albo zredukowano, albo zwię kszono, albo wyłączono ekspresję polipeptydu SBEII-1. Roślina może być transformowana przy zastosowaniu sposobu przedstawionego powyżej lub może być wyselekcjonowana za pomocą konwencjonalnej hodowli, tak aby została pozbawiona genu SBEII-1, którego obecność lub brak mogą być z łatwością określone za pomocą skriningu próbek rośliny z sondą kwasu nukleinowego lub przy zastosowaniu specyficznych przeciwciał odpowiednio, dla genów pszenicy lub produktów genowych.
Skrobia może być wyekstrahowana ze stransformowanej rośliny lub potomstwa takiej rośliny, przy czym skrobia taka wykazuje zmienione właściwości w porównaniu do skrobi wyekstrahowanej z odpowiadają cych ale nie zmienionych ro ś lin.
Uważa się, iż zastosowanie sekwencji nukleotydowych według wynalazku umożliwi produkcję skrobi, szczególnie skrobi pszenicy wykazującej szeroki wachlarz nowych właściwości. Np. można przewidzieć, że na skutek transformacji rośliny w celu zmniejszenia aktywności SBEII powstanie skrobia ze stosunkowo większym stosunkiem amylozy i mniejszą ilością amylopektyny w porównaniu do niezmienionych roślin.
W szczególności wynalazek dostarcza: roślinę (zwłaszcza pszenicę) transformowaną za pomocą sposobu zdefiniowanego powyżej i zawierającą opisany powyżej wektor, zawierającą skrobię, która wyekstrahowana z rośliny wykazuje podwyższoną temperaturę początkową i/lub maksymalną żelifikacji, mierzoną za pomocą DSC, w porównaniu do skrobi ekstrahowanej z podobnych, lecz niezmienionych roślin; roślinę (szczególnie pszenicę) transformowaną za pomocą sposobu zdefiniowanego powyżej, zawierającą skrobię, która po wyekstrahowaniu z rośliny wykazuje podwyższoną początkową temperaturę żelifikacji (dogodnie podwyższoną o co najmniej 3°C, możliwe o co najmniej 7°C, co najmniej o 12°C lub nawet możliwe od 15°C do 25°C) zmierzoną za pomocą DSC w porównaniu do skrobi wyekstrahowanej z podobnej ale niezmienionej rośliny; roślinę (zwłaszcza pszenicę) transformowaną za pomocą zdefiniowanego powyżej sposobu, szczególnie w celu zmniejszenia ekspresji genu SBEII-1 polipeptydu, zawierającą skrobię, która wyekstrahowana z rośliny, ma w porównaniu do skrobi wyekstrahowanej z podobnej ale niezmienionej rośliny, wyższy stosunek amyloza : amylopektyna.
Wynalazek zostanie dalej opisany na zasadzie ilustracji w następujących przykładach i w odniesieniu do załączonych figur, w których:
Figura 1 jest wykresem zależności lepkości od czasu, pokazującym profil wiskoammylografu dla skrobi pszenicznej podczas oraz po gotowaniu.
Figura 2 przedstawia dopasowanie sekwencji aminokwasowej C końcowych części różnych znanych enzymów rozgałęziających skrobię (SEQ ID No:12 do 25), uzyskane z bazy danych European Molecular Biology Laboratory (EMBL) oraz nowej sekwencji SBEII-1 pszenicy według wynalazku (Osbell-1ALL) (SEQ ID No:11) z klonu 5A1 wraz z zaznaczonymi jednakowymi grupami bocznymi;
Figura 2a to tabela wag reszt aminokwasowych pokazująca odsetek podobieństwa oraz odmienności sekwencji pokazanych na Figurze 2;
Figura 3 przedstawia zestawienie sekwencji DNA dla różnych klonów rekombinacyjnych (B2, B4, B10, A2, B1, B11) (SEQ ID No: odpowiednio 3,4,5,26,6,27) zawierających geny enzymów rozgałęziających skrobię pszenicy, reprezentujących dwie klasy SBE: SBEII-1 oraz SBEII-2, każda zawierająca trzy podklasy A, B oraz C, wraz z zaznaczonymi grupami bocznymi różniącymi się od sekwencji konsensusowej (większości) (SEQ ID No:53);
Figura 3a to tabela wag reszt aminokwasowych pokazująca odsetek podobieństwa oraz odmienności sekwencji przedstawionych na Figurze 3;
Figura 4 przedstawia ułożenie sekwencji aminokwasowych klonów B6 (pszenny SBEII-1) (SEQ ID No:7) oraz B11 (pszenny SBEII-2) (SEQ ID No:28) w porównaniu do odpowiadających regionów SBEIIa kukurydzy (SEQ ID No:29) oraz sekwencji aminokwasowych SBEIIb (SEQ ID No:30) z grupami bocznymi różniącymi się od zaznaczonych w sekwencji SBEIIb kukurydzy.
Figura 4a to tabela wag reszt aminokwasowych przedstawiająca odsetek podobieństwa oraz rozbieżności względem sekwencji pokazanych na Figurze 4;
Figura 5 przedstawia nie ulegającą translacji sekwencję DNA klonu B2 na końcu 3' (SEQ ID No:8) (SBEII -1 pszenicy, podklasa A);
Figura 6 przedstawia nie ulegającą translacji sekwencję DNA klonu B10 na końcu 3' (SEQ ID No:9) (SBEII-1 pszenicy, podklasa B);
Figura 7 przedstawia nie ulegającą translacji sekwencję DNA klonu B4 na końcu 3' (SEQ ID No:10) (SBEII-1 pszenicy, podklasa C);
PL 205 884 B1
Figura 8 przedstawia dopasowaną sekwencję DNA dla nie ulegającego translacji regionu klonu B10 na końcu 3' (SEQ ID No:8), B2 (SEQ ID No:8) i B4 (SEQ ID No:10) oraz SBEIIb kukurydzy (ZMSBE2b) (SEQ ID No:31) wraz z resztami aminokwasowymi bocznymi różniącymi się od zaznaczonych z sekwencji B10.
Figura 8a to tabela wag reszt aminokwasowych przedstawiająca odsetek podobieństwa oraz odsetek rozbieżności sekwencji pokazanych na Figurze 8;
Figury 9a oraz 9b przedstawiają hybrydyzację odpowiednio klonu B1 (SBEII-2) oraz klonu B2 (SBEII-1) do trawionego enzymem HindIII genomowego DNA linii nullisomicznej-tetrasomicznej pszenicy Chinese Spring.
Figura 10 przedstawia DNA (SEQ ID No:1) oraz przewidziane sekwencje aminokwasowe (SEQ ID No:2) części klonu 5A1 SBEII-1;
Figura 11 przedstawia dane dopasowania sekwencji aminokwasów sekwencji genu SBEII-1 pszenicy według wynalazku, z klonu 5A1 (OsbelI-1ALL) (SEQ ID No:11), SBEI-D2 pszenicy (SEQ ID No:32) Rahman i inni 1997 (TASBEID2), SBEI1 pszenicy wg. Rapelin i wsp. 1997 (SEQ ID No:33) (TASBEI) oraz SBEII-2 pszenicy wg. Nair i wsp. 1997 (SEQ ID No:34) (SBEII-2 pszenicy) wraz z grupami bocznymi dokładnie pasującymi do zaznaczonej sekwencji konsensusowej (zgodnej) (SEQ ID No:54);
Figura 11a jest tabelą wag reszt aminokwasowych przedstawiającą odsetek podobieństwa i odsetek rozbieżności sekwencji przedstawionych na Figurze 11;
Figura 12 przedstawia analizę techniką 'northern blotting' ziaren pszenicy zebranych w różnych czasach po anthezie i hybrydyzowanych z fragmentami SBEII-1 oraz SBEII-2;
Figura 13 jest mapą restrykcyjną plazmidu pWxGS+;
Figura 13a przedstawia sekwencję (SEQ ID No:55) promotora (fragmentu HindIII-BamHl) w pWxGS+;
Figura 14 jest mapą restrykcyjną plazmidu pSRWXGUS1;
Figura 15 jest mapą restrykcyjną plazmidu pVTWXGUS2;
Figura 16 jest mapą restrykcyjną plazmidu pPBI-97-2;
Figura 17 jest mapą restrykcyjną plazmidu pSR97-26A-;
Figura 18 jest mapą restrykcyjną plazmidu pSR97-29A-;
Figura 19 jest mapą restrykcyjną plazmidu pSR97-50A-;
Figura 20 jest mapą restrykcyjną plazmidu pSR97-53A-;
Figura 21 jest mapą restrykcyjną plazmidu p97-2C;
Figura 22 jest mapą restrykcyjną plazmidu p97-2CWT1;
Figura 23 jest mapą restrykcyjną plazmidu pSC98-1;
Figura 24 jest mapą restrykcyjną plazmidu pSC98-2;
Figura 25 jest mapą restrykcyjną plazmidu pUNI;
Figura 26 pokazuje sekwencję DNA NaptII Sac1 fragmentu pUNI (SEQ ID No:35); a
Figura 27 jest mapą restrykcyjną plazmidu pUSN99-1;
Figura 28 jest mapą restrykcyjną plazmidu pUSN99-2;
Figura 29 jest częściową mapą restrykcyjną przewidywanej sekwencji (SEQ ID No:52) sklonowanego fragmentu p97-U3;
Figura 30 jest mapą restrykcyjną plazmidu pPBl96-36;
Figura 31 jest mapą restrykcyjną plazmidu p97-dUG1;
Figura 32 jest mapą restrykcyjną plazmidu p97-2BdUN1;
Figura 33 jest schematyczną ilustracją cząsteczkowej komory napromieniającej (nie w skali).
Figura 34 przedstawia histochemiczną lokalizację ekspresji Ubi-Gus w nasionach (ramka A), łodydze (ramka B), kwiecie (ramka C) oraz tkance liścia (ramka D) pszenicy transformowanej plazmidem pAHC25.
Figura 35 jest analizą „Southern blot 26 roślin potomnych transformantów BW119 transformowanych przez pAHC25.
Figura 36 przedstawia histochemiczną lokalizację ekspresji woxy-GUS w tkance bielma dwóch niezależnych transgenicznych lini pszenicy (w ramkach A oraz B) transformowanych plazmidem pWxGS+; i
Figura 37 jest analizą „Southern błot genomu DNA domniemanych pierwotnych transformantów ciętych przez Sac1 oraz hybrydyzowanych z sondą Sac SBEII-1 wielkości 1 kpz.
P r z y k ł a d y
Amplifikacja oraz charakterystyka cDNA dwóch klas klonów SBEII
Strategię klonowania opartą o PCR wymyślono dla izolacji rozgałęziających skrobię enzymów pszenicy stosując konserwowane domeny ze znanych sekwencji sklonowanych genów. Enzymy
PL 205 884 B1 rozgałęziające skrobi zostały sklonowane z wielu gatunków roślin, i Figura 2 przedstawia dane sekwencji aminokwasów uzyskane z European Molecular Biology Laboratory (EMBL), bazy danych nukletydów dla różnych znanych enzymów rozgałęziających skrobię:
SBEII-2 pszenicy dla Triticum aestivum (SEQ ID No:12)
ZM SBE2a (kukurydza) dla Zea mays (SEQ ID No:13)
ZM SBE2b (kukurydza) dla Zea mays (SEQ ID No:14) jęczmienny SBEIIa (SEQ ID No:15) jęczmienny SBEIIb (SEQ ID No:16)
RICBCE3 (ryżowy enzym typu SBEII) dla Oryza sativa (SEQ ID No:17)
RICESBE-1/97 (jak powyżej, zawiera sekwencje peptydu tranzytowego) (SEQ ID No:18) PSSBEIGEN (SBEI z grochu, który w rzeczywistości jest sekwencją typu SBEII) dla Pisum sativum (SEQ ID No:19)
STSBE (typ SBEI z ziemniaka) dla Solanum tuberosum (SEQ ID No:20)
TASBEI (SBEI-2 z pszenicy) dla Triticum aestivum (SEQ ID No:21)
TASBEI D2 (SEQ ID No:22)
ZMSBEI (SBEI z kukurydzy) dla Zea mays (SEQ ID No:23)
RICBEI (SBEI ryżowe) dla Oryza sativa (SEQ ID No:24)
PSSBEIIGN (SBEII z grochu, który w rzeczywistości jest sekwencją typu SBEI) dla Pisum sativum (SEQ ID No:25)
Figura 2 przedstawia również sekwencje nowego SBEII-1 z pszenicy, według wynalazku, zidentyfikowanego jako Osbell-1ALL (SEQ ID No:11).
Raport dopasowania z Figury 2 a także Figury 3, 4, 8 i 11 przygotowano stosując sposób Clustal, wraz z tablicą PAM 250 grup ważności dla sekwencji aminokwasów oraz tablicą ważności grup bocznych dla sekwencji DNA. Odległość par sekwencji wyrażona jako % podobieństwa przedstawiona na figurze 2A, 4A, 8A oraz 11A określono przy użyciu programu 'Megalign' z oprogramowania DNAStar i odpowiada procentowej homologii sekwencji.
Dopasowanie sekwencji przedstawiono na Figurze 2 ujawnia kilka domen, które są wysoce konserwowane. Jedna taka domena MDKDMYD (SEQ ID No:36), została niemal całkowicie konserwowana, co zostało uznane jako świadczące o tym, że ta domena będzie także obecna w genach kodujących enzymy rozgałęziające skrobię. Wzór ten został wybrany jako cel dla oligonukletydowego startera sensownego (SBEA). Przeprowadzono 3'RACE PCR na pierwszej nici cDNA bielma przy użyciu starterów Ro oraz SBEA.
Dwie populacje produktów PCR o przybliżonej wielkości 1 kpz oraz 1,2 kpz zostały wklonowane do wektora plazmidowego pT7Blue (Novagen). Oczyszczono plazmidowe DNA z domniemanych 36 zrekombinowanych klonów oraz oszacowano jego wielkość przy użyciu analizy restrykcyjnej. Do sekwencjonowania wyselekcjonowano piętnaście klonów zawierających inserty o długości pomiędzy około 1 kpz a 1,2 kpz.
Dopasowanie sekwencji uzyskane przy użyciu programu MEGALIGN z DNAStar wykazało, na podstawie stopnia homologii, że 15 wyselekcjonowanych klonów można podzielić na dwie różne klasy, które zostały nazwane SBEII-1 oraz SBEII-2. Co więcej, w oparciu o różnice sekwencji zarówno klasa SBEII-1 jak i SBEII-2 może być następnie podzielona na trzy podklasy (Tabela 1). Uważa się, że podział na trzy podklasy może ulec zmianie, ponieważ pszenica zawiera trzy homologiczne genomy.
T a b e l a 1
Klasa Podklasa Numer klonu
SBEII-1 A B2, B5, B6, B7, B12
SBEII-1 B B10
SBEII-1 C A1, A13, B4
SBEII-2 A B11
SBEII-2 B B1, B9
SBEII-2 C A2, C5
PL 205 884 B1
Porównanie pomiędzy sekwencjami należącymi zarówno do klasy SBEII-1 jak i SBEII-2 wykazało podobieństwo wynoszące od 90 do 96,8%. W przeciwieństwie do tego, podobieństwo sekwencji pomiędzy reprezentantami klasy SBEII-1 i SBEII-2 w porównywanym regionie wykazuje homologię wynoszącą tylko pomiędzy 58,8 a 60% (Figury 3 i 3a).
Co więcej, porównano reprezentatywne sekwencje klasy SBEII-1 oraz SBEII-2 z wcześniej opisywanymi klonami SBEII pszenicy, pWBE6 (Mousley, 1994) oraz ostatnio opublikowanym SBEII (Nair i wsp., 1997). Wyniki wykazały, że każdy z wcześniej wyizolowanych klonów SBEII wykazuje wysoką homologię (>90%) do klasy SBEII-2 (dane nie przedstawione). Co ważne, żadna z wcześniej opisywanych sekwencji pszenicy nie wykazywała wysokiej homologii sekwencji do SBEII-2 według wynalazku. Izolacja oraz właściwości trzech typów SBEII-1 (SBEII-1, podklasy A, B oraz C) uznano za nowe. Podklasa B SBEII-2 jest także nowa, jak również podklasy A i C odpowiadające sekwencjom wcześniej ujawnionym przez odpowiednio Mousley (1994) oraz Nair i wsp. (1997).
Dopasowanie przewidywanych sekwencji aminokwasowych reprezentujących klony B6 oraz B11 pszenicznych sekwencji (odpowiednio) SBEII-1 oraz SBEII-2 z odpowiadającymi im regionami sekwencji aminokwasów SBEIIa kukurydzy oraz SBEIIb (Figura 4 oraz 4a) wskazuje, iż sekwencja SBEII-1 (klon B6) jest bardziej podobna do sekwencji SBEIIb kukurydzy (88,7% podobieństwa) niż sekwencja SBEII-2 pszenicy oraz sekwencja SBEIIa kukurydzy (odpowiednio 82,2% oraz 82,6% podobieństwa) i podobnie, sekwencja SBEII-2 pszenicy jest bardziej podobna do sekwencji SBEIIa kukurydzy (86,9% podobieństwa) niż do sekwencji SBEII-1 pszenicy i sekwencji SBEIIb kukurydzy (odpowiednio 82,2% oraz 81,7% podobieństwa). Przypuszcza się, że gen SBEII-1 pszenicy jest spokrewniony filogenetycznie z genem SBEIIb kukurydzy, i że sekwencja SBEII-2 pszenicy jest filogenetycznie spokrewniona z sekwencją SBEIIa kukurydzy, a odpowiadające sekwencje pszenicy oraz kukurydzy prawdopodobnie wykazuję podobne funkcje.
Podczas gdy kodujące sekwencje klonów B2, B10 oraz B4 wykazują wysoką homologię sekwencji do genu SBEIIb kukurydzy, to równocześnie istnieje dużo większa rozbieżność w obrębie sekwencji nie ulegającej translacji na końcu 3'. Figura 5, 6 oraz 7 przedstawia odpowiednio, nie ulegające translacji sekwencje 3' klonów B2, B10, B4, a Figura 8 porównuje te sekwencje z odpowiadającymi im sekwencjami SBEIIb kukurydzy.
Rozważając kwestię bardziej dokładnie, przedstawiono następujące szczegóły doświadczenia.
Materiał roślinny
W celu uzyskania 16 godzinnego dnia z temperaturą 18 +/- 1°C odmianę Rialto gatunku Triticum aestivum uprawiano w szklarni z dodatkowym oświetleniem, kontrolą temperatury.
Manipulacje rekombinacyjne DNA oraz sekwencjonowanie
Zastosowano standardowe procedury według Sambrook i wsp. (1989). Sekwencjonowanie DNA przeprowadzono na sekwenserze automatycznym ABI, a sekwencje analizowano korzystając z oprogramowania DNASTAR dla Macintosh.
Izolacja RNA w celu zklonowania cDNA
RNA ekstrahowano z bielma Triticum aestivum odmiany Rialto, stosując zestaw do izolacji RNA Purescript (Flowagen) zasadniczo według instrukcji producenta. W skrócie, bielmo mrożono w płynnym azocie i rozdrabniano przez dwie minuty w dysmembranatorze do uzyskania proszku (Braun Biotech International). Przed ekstrakcją rozdrobnioną tkankę przechowywano w ciekłym azocie. Około 100 mg stałej tkanki przenoszono do probówek do mikrowirowania o pojemności 1,5 ml, przed mieszaniem przez obracanie i umieszczaniem w lodzie na 10 minut dodawano 1,2 ml buforu Lysis. Przed wirowaniem przy 13000 x g w temperaturze 4°C przez 20 minut wytrącano białko i DNA z lizatu komórkowego dodając 0,4 ml 'Protein-DNA Precipitation Solution' oraz mieszając przez obracanie. Supernatant rozdzielano do dwóch nowych probówek o pojemności 1,5 ml, z których każda zawierała 600 μl izo-propanolu. Z precypitatu RNA tworzono osad przez wirowanie przy 13000 g w temperaturze 4°C przez 10 minut, supernatant oddzielano a osad przemywano 70% etanolem przez kilkukrotne obracanie probówki. Przed rozpuszczeniem RNA w 7,5 ml 'RNA Hydration Solution' usuwano etanol i suszono osad powietrzem przez 15-20 minut.
Przygotowanie próbki cDNA bielma pszenicy
Próbkę cDNA bielma pszenicy przygotowywano z całkowitego RNA, ekstrahowano jak opisano powyżej, stosując odwrotną transkryptazę Superscript™ (Life Technologies), zasadniczo, według instrukcji producenta. W skrócie, pięć mikrogramów RNA, 10 pMol RoRidT17 [AAGGATCCGTCGACATCGATAATACGACTCACTATAGGGA(T17)] (SEQ ID No:37) oraz sterylną wodę destylowaną do objętości reakcji 12 μl w 500 μl probówce do mikrowirowania ogrzewano do 70°C
PL 205 884 B1 przez 10 minut przed szybkim schłodzeniem w lodzie. Zawartość probówki zbierano przez szybkie odwirowanie, zanim dodano 4 μl 5x First Strand Buffer, 2 μl 0,1 M DTT i 1 μl 10 mM dNTP i, po zmiksowaniu, inkubowano w 42°C przez 2 minuty. Dodawano 1 μl Superscript™, i po wymieszaniu inkubację kontynuowano przez 1 godzinę. Reakcję zatrzymywano przez ogrzewanie temperaturą do 70°C przez 15 minut. Do mieszaniny reakcyjnej dodawano 150 μl T10E1 a powstały cDNA używano jako matrycę do amplifikacji w reakcji PCR.
Powielanie sekwencji SBEII PCR-em z puli cDNA bielma
Powielono sekwencje SBEII z próbki cDNA bielma stosując startery Ro [AAGGATCCGTCGACATC] (SEQ ID No:38), które są komplementarne do regionu Ro startera RoRidT17 użytego do syntezy próbki cDNA oraz startera specyficznego dla SBEII, SBEA [ATGGACAAGGATATGTATGA] (SEQ ID No:39). SBEA zaprojektowano tak, aby był homologiczny do motywu MDKDMYD (SEQ ID No: 36), który jest usytuowany 1 kpz od końca 3' sekwencji kodującej dojrzałe białko. PCR przeprowadzano w 50 μl roztworu reakcyjnego, zawierającego 5 μl próbki cDNA, 25 pmol Ro, 50 pmol SBEA, 5 μl 5x buforu Taq, 4 μl 25 mM Mg2+, 0,5 μl 20 mM dNTPs oraz 1,25 u polimerazy Taq. Przed podgrzaniem do 94°C przez 7 minut, a następnie schłodzeniem do 75°C przez 5 minut zmieszano wszystkie składniki reakcyjne, z wyjątkiem polimerazy Taq. Podczas trzymania mieszaniny reakcyjnej w 75°C dodawano polimerazę Taq, po dokładnym wymieszaniu, reakcję prowadzono w termocyklerze: (94°C-30 sekund, 50°C-30 sekund, 72°C-1 min) 30 cykli, po których następował ostatni etap syntezy przez 10 min w temperaturze 72°C.
Przed ligacją z zastosowaniem pT7 Blue (Novagen) według zaleceń producenta, produkty PCR oczyszczano fenolem/chloroformem i przez ekstrakcję chloroformem. Domniemane klony SBE scharakteryzowano wstępnie za pomocą standardowego sposobu oczyszczania plazmidowego DNA i cięcia enzymami restrykcyjnymi. Do sekwencjonowania wyselekcjonowano reprezentatywne klony z insertami o różnych rozmiarach.
Lokalizacja genów SBE pszenicy na chromosomach
Do lokalizacji położenia sekwencji SBE na chromosomach użyto pszeniczne linie nullisomiczno-tetrasomiczne Chinese Spring (Chińska wiosna) opisane w Sears (1966). Linie ditelosomiczne (Sears, 1966) zostały użyte do określenia położenia sekwencji SBE na ramionach chromosomów. Dodatkowe linie ditelosomiczne jęczmienia Betzes w pszenicy zostały opisane w Islam (1983).
Lokalizację na chromosomach dwóch rodzin sekwencji SBEII (SBEII-1, SBEII-2) określono przez hybrydyzowanie z liniami pszenicznymi nulli-tetra i ditelsomicznymi z zastosowaniem oczyszczonych w żelu insertów różnych klonów. Figura 9a przedstawia hybrydyzację uzyskaną z sondą SBEII-2 (klon B1) z DNA ciętym Hindlll. Euploid Chinese Spring daje trzy prążki, w których jeden z kolei jest nieobecny w linii nullisomicznej chromosomu 2A, 2B i 2D. Ten sam blot był powtórnie hybrydyzowany z sondą specyficzną dla SBE-II (klon B2). Daje to całkiem inny profil hybrydyzacyjny (Figura 9b), przedstawiając specyficzność użytych sond. Znowu brak prążków w każdej z linii nullisomicznej 2A, 2B oraz 2D. Taki sam wzór prążków zaobserwowano przy użyciu klonów B2 oraz B4 SBEII-1. Tak więc podrodzina 1 oraz 2 sekwencji genowych SBEII leży w zespole drugiej grupy pszenicy na chromosomach homologicznych.
Użyto dodatkowych ditelosomicznych linii do zidentyfikowania położenia tych genów na ramionach chromosomów (dane nie przedstawione). Ujawniły one, iż obie sekwencje SBEII-1 oraz SBEII-2 są położone na długich ramionach homologicznej w zespole 2 grupy chromosomów pszenicy.
Do określenia czy sekwencje homologiczne są obecne w jęczmieniu zastosowano dodatkowe linie jęczmienia. Dzięki temu okazało się, iż sekwencje homologiczne do sekwencji SBEII-1 oraz SBEII-2 pszenicy są położone na długim ramieniu chromosomu jęczmienia 2H.
Izolacja RNA oraz analiza Northerna
Przed zmieleniem na proszek z użyciem urządzenia Braun Mikrodismembrator™ lub tłuczka albo moździerza, ziarna pszenicy zbierano w odpowiednich odstępach czasu i zamrażano w ciekłym azocie. Całkowity RNA wyizolowano stosując zestaw RNAqueus™ (Ambion Inc), według zaleceń producenta lub zgodnie z następującą metodą. Zamrożone sproszkowane ziarno mieszano z 10-cio krotną objętością 0,2 M TrisHCL, o pH 9, 0,4 M NaCl, 25 mM EDTA, 1% SDS, 1% PUPP, 0,25% Antifoam A i 0,2 M DTT. Mieszankę tę dwukrotnie ekstrahowano z taką samą objętością fenolu/chloroformu/alkoholu izoamylowego (25:24:1), kwasy nukleinowe wytrącano z fazy wodnej przez dodanie 0,8 objętości izopropanolu, a powstały osad rozpuszczano w wodzie. Następnie, RNA wytrącano selektywnie przez dodanie 1 objętości 4 M LiCl, inkubowano w temperaturze 4°C przez noc, a powstały osad rozpuszczano w sterylnej wodzie destylowanej H2O. Rozdział elektroforetyczny 15 μg
PL 205 884 B1 całkowitego RNA przeprowadzano przez noc w 1% żelu agarozowym, 2,21 M formaldehyd, 40 mM MOPS o pH 7,0, 10 mM octan sodu, 1 mM żel EDTA, w 40 mM MOPS o pH 7,0, 10 mM octan sodu, 1 mM bufor EDTA przy 1 V/cm. Żele umieszczano w 50 ng/ml wodnego roztworu bromku etydydny na 30 minut, odbarwiano w wodzie przez dwie godziny a następnie uwidaczniano i fotografowano w świetle UV. Następnie żele przemywano krótko sterylną wodą, a następnie przenoszono na HyBond N+™ (Amersham International), według standardowych protokołów (Sambrook i wsp., 1989) w ciągu nocy. Membrany rozkładano i suszono na powietrzu przed utrwaleniem UV o 312 nm przez 2 minuty.
Izolacja sond oraz oczyszczanie
W celu uwolnienia fragmentów, odpowiednio, średnio 0,8 kpz (NptII) oraz 1 kpz (SBEII-1) 5-10 μg plazmidów pUNI i pSR98-29 cięto Sst1 (Life Technologies Ltd), według zaleceń producenta. W celu uzyskania SBEII-2 o średniej wielkości 1,2 kpz 5-10 μg plazmidu pVT96-54 cięto BamHl. Przeprowadzono elektroforezę pociętych fragmentów w 1% żelu agarozowym o niskiej temperaturze topnienia. Fragmenty specyficzne genowo wycięto, a DNA oczyszczono stosując Wizard™ Gel Purification Kit (Promega).
Znakowanie sond oraz hybrydyzacja
5 ng odpowiedniej sondy (Maize Waxy promotor, NptII, fragmenty pszenicznego genu SBEII-1 lub SBEII-2) znakowano radioaktywnie stosując system Rediprime 11™ (Amersham International) przy użyciu a32PdCTP (Amersham International), według zaleceń producenta. Membrany hybrydyzowano przez noc w temperaturze 65°C w 0,6 M NaCl, 20 mM Pipes, 4 mM Na2EDTA2H2O, 0,2% żelatynie, 0,2% Ficolu 400, 0,2% PVP-360, 10 mM Na4P2O710H2O, 0,8% SDS, 0,5 mg/ml DNA denaturowanego nasienia łososia. Przemywanie po hybrydyzacji przeprowadzono stosując 30 mM NaCl, 2 mM NaH2PO<2H2O, 0,2 mM Na2EDTA2H2O, 0,1% SDS w temperaturze pokojowej przez 7 minut, a następnie w 65°C przez 10 minut. Filtry naświetlono na Kodak BioMax MR™ (Amersham International) w temperaturze -70°C. Bloty zostały zdjęte przez przemywanie w 15 mM NaCl, 1 mM NaH2PO<2H2O, 0,1 mM EDTA w temperaturze 90°C przez 10 minut lub dopóki nie pozostawały żadne ilości ponad tło.
Wydłużanie sekwencji SBEII-1 końca 3' w kierunku końca 5' końca dojrzałego peptydu
W celu zaprojektowania specyficznego startera Sb4 na końcu 3' wykorzystano rozbieżność sekwencji pomiędzy sekwencją SBEII-1 pszenicy a sekwencją SBEII-2. Starter ten został użyty w połączeniu ze specyficznym starterem SBEII końca 5' tak aby wydłużyć nową sekwencję SBEII-1 stosując metodę opartą na PCR.
W celu wydłużenia sekwencji SBEII-1 na końcu 3' w kierunku końca 5' dojrzałego peptydu zidentyfikowano drugą konserwowaną domenę i zaprojektowano oligonukleotydowy starter AGSBEI w orientacji sensownej. Powielanie techniką PCR puli cDNA z pierwszej nici bielma przeprowadzono za pomocą pary starterów AGSBEI-Sb4. Oddzielenie zamplifikowanych produktów przeprowadzono elektroforetycznie w 1% (wagowo) żelu agarozowym (dane nie załączone) wykazując tym samym, iż reakcja dała wyraźny prążek o przybliżonej długości 2,2 kpz. Zamplifikowane produkty 2,2 kpz zostały wycięte z żelu, zligowane z PT7Blue i transformowane do kompetentnych komórek Novablu E.coli. Po całonocnej hodowli, 9 domniemanych zrekombinowanych klonów oddzielono do dalszej analizy. Skrining każdego z wyselekcjonowanych klonów przy użyciu starterów specyficznych dla wektorów wykazał, iż klony 5A1, 5A2, 5A5 i 5A9 zawierają inserty o przewidywanych rozmiarach. Z tego powodu, do sekwencjonowania (Figura 10) wybrano klon 5A1 (który należy do podklasy C). Sekwencja aminokwasów z Figury 10 odpowiada sekwencji Osbell-1ALL z Figury 2. Pomimo niepełnej długości, przewidywana otwarta ramka odczytu zawiera nukleotydy 44 do 1823 i koduje 593-aminokwasowy peptyd. W oparciu o podobieństwo z genami kukurydzy, szacuje się, że sekwencji tej brakuje około 230 aminokwasów z przewidzianych 830 aminokwasów. Na tej podstawie można stwierdzić, że częściowa sekwencja reprezentuje około 70% sekwencji kodującej. Wielokrotne zestawienie sekwencji SBEII-1 z ostatnio opublikowanymi sekwencjami pszenicy: SBEII-2 (Nair i wsp., 1997), SBEI (Rapellin i wsp., 1997) oraz SBEI-D7 (Rahman i wsp., 1997) wskazuje na to, że sekwencja SBEII-1 wykazuje podobieństwo w 69,6%, 31,2% oraz 46,7% w stosunku do odpowiednio SBEII-2, SBEI oraz SBEI-D2 (Figura 11 oraz 11a). Uwidacznia to, że sekwencja SBEII-1 różni się od opublikowanych sekwencji SBE pszenicy i potwierdza wyniki zestawienia dotyczące sekwencji końca 3' (Figura 3). Wzrost względnej homologii w porównaniu do wartości uzyskanych po zestawieniu dotyczącym sekwencji końca 3' wynika z faktu, iż centralna domena SBE jest wysoce konserwowana (Burton i wsp., 1995, Gao i wsp., 1997). Jednakże oczywiste jest także, iż sklonowana sekwencja SBEII-1 pszenicy jest istotnie różna od wcześniej opublikowanych sekwencji SBE pszenicy i reprezentuje nową sekwencję.
PL 205 884 B1
Pełne dane dotyczące eksperymentu przedstawiają się następująco:
Sekwencje SBEII-1 wydłużono w kierunku końca 5' dojrzałego peptydu przez amplifikację puli cDNA bielma przy użyciu startera Sb4 [TTTTCTTCACAACGCCCTGGG] (SEQ ID No:40) SBEII-1 specyficznego do SBEII-1 w połączeniu ze starterem AGSBEI [TGTTTGGGAGATCTTCCTCCC] (SEQ ID NO:41). AGSBEI został zaprojektowany tak, aby był homologiczny do motywu GVWEIFLP (SEQ ID
No:42), który jest konserwowany w każdej znanej sekwencji SBE i jest usytuowany w stronę końca 5' sekwencji kodującej dojrzały peptyd. PCR przeprowadzono w 50 μΐ roztworu reakcyjnego złożonego z 5 μl próbki cDNA, 50 pmol Sb4, 50 pmol SBEA1,5 μl 5x buforu Taq, 4 μl 2 5 mM Mg2+, 0,5 μl 20 mM dNTP i 1,25 u polimerazy Taq. Wszystkie odczynniki zostały zmieszane przed reakcją PCR w termocyklerze (94°C-45s, 55°C-30s, 72°C 1 min 30s) 30 cykli, ostatni etap wydłużania trwał 10 min w 72°C. Amplifikowane produkty rozdzielono elektroforetycznie w 1% (wagowo) żelu agarozowym, a produkty o przewidzianych rozmiarach wycięto z żelu. Przed ligacją pT7 Blue (Novagen), DNA eluowano z żelu stosując zestaw do ekstrakcji QIAGEN według zaleceń producenta. Ligację przeprowadzono w objętości 10 μl mieszaniny reakcyjnej zawierającej 7,5 μl oczyszczonego produktu amplifikacji, 1 μl 10 x buforu do ligacji, 1 μl pT7Blue i 0,5 μl ligazy DNA T4 (Amersham). Składniki reakcyjne zmieszano dokładnie przed pozostawieniem na noc w temperaturze 4°C. Po całonocnej inkubacji, część mieszaniny reakcyjnej po przeprowadzonej ligacji użyto do transformacji komórek kompetentnych Novablue E.coli (Novagen). Dokonano posiewu transformowanych komórek na płytki LB uzupełnione X-gal (40 μgml-1), IPTG (0,1 mM), karbenicyliną (100 μgml-1) oraz tetracykliną (12,5 μgml-1), i inkubowano w 37°C przez noc. Początkowo, klony, o których przypuszczano, że zrekombinowały poddawano badaniu przesiewowemu na obecność insertu za pomocą kolonijnego PCR stosując specyficzne dla wektorów startery T7B oraz U19. Następnie przed sekwencjonowaniem w celu określenia orientacji insertu w rejonie wielokrotnego klonowania klony z insertami poddawano skriningowi za pomocą starterów specyficznych dla insertów w połączeniu ze starterami T7B lub U19.
Analiza Southerna
Analizą Southerna membran w liniach nulli-tetra oraz ditelosmicznych przeprowadzono, zasadniczo, tak jak to opisano w Jack i wsp. (1994).
Klony SbEII-1, omawiane powyżej, zostały wbudowane do wektorów w celu transformowania pszenicy.
Analiza Northerna
Analizę techniką Northerna przygotowano z całkowitego RNA z rozwijających się ziaren pszenicy uprawianej Bobwhite. Figura 12 przedstawia membranę Northerna RNA ziaren pszenicy odmiany Bobwhite uprawianej w szklarni jak to opisano wcześniej i zbieranych pomiędzy 5 i 29 dniem po anthezie. Membrana była hybrydyzowana z fragmentem ciętym Sac1, genu SBEII-1, wielkości 1 kpz, a następnie (po oddzieleniu membran) wraz z fragmentami 1,2 kpz BamHl SBEII-2, oba fragmenty oczyszczano i znakowano tak, jak opisano. Na Figurze 12, ramka A przedstawia żel RNA barwiony bromkiem etydyny przed poddaniem analizie Northerna. Ramka B przedstawia wyniki sondowania sondą SBEII-1, a ramka C przedstawia wyniki sondowania sondą SBEII-2. Porównując, w obrębie i pomiędzy, ramki B i C można zaobserwować różnice względnej intensywności sygnałów w różnych punktach czasu. W 5 dniu obserwowano relatywnie silniejszy sygnał z sondą SBEII-2 w porównaniu z sondą SBEII-1 wskazując, że profile transkryptów SBEII-1 oraz SBEII-2 są różne, sugerując tym samym, że dwie rodziny genowe (SBEII-1 oraz SBEII-2) podczas rozwoju zboża ulegają ekspresji w odmienny sposób. Wielkość obserwowanych transkryptów SBEII-1 oraz SBEII-2 wynosi średnio 3,5 kpz. Jednakże transkrypt SBEII-2 jest troszkę mniejszy niż transkrypt SBEII-1.
Konstrukcie plazmidu
Do konstrukcji plazmidu zastosowano standardowe procedury biologii molekularnej (Sambrook i wsp., 1989).
pWxGS+ (Figura 13) zawierający fuzję genu syntazy związanej z granulkami skrobiowymi kukurydzy (Shure i wsp. 1983) z promotorem -GUS-Nos został otrzymany w prezencie od Sue Wessler z Unilever Research (University of Georgia, Athens, USA) i na próbę, może być uzyskany z tych źródeł. Promotor pWxGS+ posiada przybliżoną długość 1,5 kpz i przedstawia skróconą wersję podobnego, ale większego fragmentu promotora opisanego przez Russel & Fromm (1997). Sekwencja promotora (fragment HindIII-BamHl) pWxGS+ jest przedstawiona na Figurze 13A (SEQ ID No:55).
pSRWXGUS1 (Figura 14) otrzymano przez wstawienie linkera Sac1 do [d(pCGAGCTCG)0] (New England Biolabs[NEB]) (katalog NEB No 1044) w miejscu Smal w pWxGS+.
PL 205 884 B1 pVTWXGUS2 (Figura 15) otrzymano przez wstawienie linkera BamH1 do [d(pCGGGATCCCG)] (SEQ ID No:43) (katalog NEB No 1044) w miejscu Ecll36II (izoschizomer Sac1, który daje tępe końce) miejsce pWxGS+.
Linker Sac1 wstawiono w miejscu Xbal (tępe końce utworzono stosując polimerazę Klenowa + dNTps) klonu B6 SBEII-1 w plazmidzie pT7Blue, w celu uzyskania klonu pośredniego. Sekwencja SBE była następnie oczyszczana z tego pośredniego klonu jako fragment Sac1 i ligowana do miejsca Sac1 pSRWXGUS1, zastępując sekwencję genu GUS, dając plazmidy pSR96-26 i pSR96-29 reprezentujące odpowiednio, sensowną i antysensowną orientację sekwencji SBEII-1 poniżej promotora Waxy.
W pT7Blue, w celu wyprodukowania klonu pośredniego linker BamH1 wstawiano w miejscu Xbal (tępe końce utworzono stosując polimerazę Klenowa + dNTps) klonu B11 SBEII-2. Sekwencję SBE czyszczono z tych pośrednich fragmentów jako fragment BamH1 i ustawiano w miejscach BamH1 pVTWXGUS2, zastępując sekwencję genu GUS, wytwarzając plazmidy pVT96-50 oraz pVT96-53 reprezentujące, poniżej sekwencji promotora Waxy odpowiednio, orientację sensowną oraz antysensowną SBEII-2.
pVT96-54. W celu uzyskania klonu pośredniego linker BamH1 wstawiano w miejscu Xba1 (którego tępe końce otrzymywano przy użyciu polimerazy Klenowa + dNTPs) klonu B9 SBEII-2 (odpowiednik klonu B1) do pT7Blue. Sekwencję SBEII-2 oczyszczano z tych pośrednich klonów jako fragment BamH1 i żeby otrzymać plazmid pVT96-54 wstawiano w miejsca BamH1 pVTWXGUS2, zastępując sekwencję genu GUS.
Sekwencje Waxy-SBE-NOS plazmidów pSR96-26 i pSR96-29 i pVT96-50 i pVT96-53 oczyszczano jako fragmenty Hindlll/EcoRI i wstawiano w miejscach EcoRl/Hindlll plazmidu pPBI-97-2 (znane także jako p97-2) (Figura 16). Plazmid pPBI-97-2 opisano w Europejskim Zgłoszeniu Patentowym Nr 97305694.8 (opublikowanym jako WO 99/06570). Po usunięciu pozostałości genu markerowego oporności na ampicylinę, powstałe plazmidy oznaczono jako pSR97-26A- (klon B6 (SBEII-1, podklasa A) w orientacji antysensownej), pSR97-29A- (klon B6 w orientacji sensownej) oraz pSR97-50A- (klon B11 (SBEII-2, podklasa A) w orientacji antysensownej) oraz pSR97-53A- (klon B11 w orientacji sensownej), jak przedstawiono, odpowiednio na Figurach 17, 18, 19 oraz 20.
p97-2C (Figura 21) uzyskano przez cięcie w miejscach polilinkerów Ecl136 II do Smal plazmidu pPBI97-2 (Figura 16), ligację oraz selekcję rekombinantów, w których region polilinkerów Smal do Ecl136 II został powtórnie insertowany w odwrotnej orientacji.
W celu utworzenia plazmidu p97-2CWT1 (Figura 22) sekwencje Waxy-NOS w pSRWXGUS1 przeniesiono jako fragment Hindlll/EcoRI w miejsca Hindlll/EcoRI plazmidu p97-2C.
pSC98-1 oraz pSC98-2. Wydłużony na końcu 5' klon 5A1 SBEII1 w pT7Blue (zawierający sekwencje SBE od współrzędnej 43 do 2003 pz na Figurze 10) cięto EcoRI oraz Xbal, a następnie, używając polimerazy Klenowa i dNTPs wypełniano nawisy. Powstałe fragmenty SBE zawierające tępe końce oczyszczono na żelu i ligowano z p97-2CWT1 (Figura 22), które cięto Ecl136ll i defosforylowano za pomocą jelitowej fosfatazy cielęcej. Powstałe rekombinanty poddawano screeningowi za pomocą analizy cięcia enzymami restrykcyjnymi, i identyfikowano klony zawierające dwie orientacje sekwencji SBE (w stosunku do promotora waxy). pSC98-1 (Figura 23) jest antysensowną wersją, a pSC98-2 (Figura 24) jest wersją sensowną. Po usunięciu genów markerowych oporności na ampicylinę, powstałe plazmidy zostały oznaczone odpowiednio, jako pSC98-1A- oraz pSC98-2A-.
Selekcja konstruktu promotor Ubikwityna-NptII: pUN1 pUN1 został utworzony w następujący sposób:
W celu utworzenia plazmidu pośredniego linker Sacl wstawiano w miejscu Smal plazmidu pAHC25 (Christen i Quail 1996). Żeby otrzymać pPBl95-9 z tego pośredniego plazmidu usunięto gen GUS poprzez cięcie Sacl, a następnie przez samoligację oraz identyfikację zrekombinowanych cząsteczek nie posiadających sekwencji GUS. pPBI95-9 cięto EcoRI, a następnie zidentyfikowano zrekombinowane cząsteczki nie posiadające sekwencji Ubi-BAR, które uległy samoligacji. Powstały plazmid oznaczono jako pPBI96-23. Sekwencję NptII amplifikowano za pomocą PCR z użyciem starterów AG95-7: 5'GATGAGCTCCGTTTCGCATGATTGAACAAGATGG (SEQ ID No:44) oraz AG95- 8: 5'GTCGAGCTCAGAAGAACTCGTCAAGAAGGC (SEQ ID No:45) stosując pPBIBAG3 (GoldsBrough i wsp. 1994) jako matrycę dla sekwencji NptII). Produkt amplifikacji klonowano w miejscu Sstl z pBluescript (Stratagene), a następnie sekwencjonowano. Sekwencjonowanie ujawniło, iż sekwencja NptII była raczej odmianą form mutanta niż, jak wcześniej oczekiwano była typu dzikiego. Forma zmutowana ma zmienioną jedną zasadę, która jest flankowana przez unikatowe miejsca Nco1 oraz Sph1. W celu
PL 205 884 B1 usunięcia regionu zawierającego zmienioną zasadę klon pBluescript cięto Nco1 oraz Sph1. Następnie dwa oligonukleotydy (Nptl: CCCGACGGCGAGGATCTCGTCGTGACC (SEQ ID No:46) oraz Npt2: CATGGGTCACGACGAGATCCTCGCCGTCGGGCATG) (SEQ ID No:47) łączono, żeby otrzymać fragment Nco1/Sph1. Został on sklonowany do klonu Bluescript/Npt11 ciętego Nco1/Sph1 i powstały klon sekwencjonowano, aby potwierdzić, że teraz gen miał formę typu dzikiego.
Następnie w celu utworzenia pUNI (Figura 25) sekwencje NptII oczyszczano jako fragment Sacl i wklejano do miejsca Sac1 pPBI96-23. pUN1 zawiera promotor typu dzikiego ubikwityny (promotor Ubi), który jest także opisywany jako ubikwitynowy system regulacyjny (skrót URS). Orientację sekwencji NptII w pUNl określano przez analizę cięcia enzymami restrykcyjnymi. Sekwencję fragmentu NptII Sac1 przedstawiono na Figurze 26 (SEQ ID No:35).
pUSN99-1 oraz pUSN99-2. Sekwencję SBEII-1 (klon B6) oczyszczono jako fragment Sac1 z plazmidu pSR96-26 i insertowano w rejonie Sac1 pPBI96-23 w celu wytworzenia plazmidów pUSN99-1 i pUSN99-2 (Figura 27 oraz 28) reprezentujących, odpowiednio, sensowną oraz antysensowną orientację sekwencji SBEII-1.
pPBI97-2BdUN1. PBI92-2BdUN1 (czasami także opisywane jako p97-2BdUN1) zawiera zrekonstruowany ubikwitynowy system regulacyjny (opisywany także jako zmodyfikowany promotor ubikwityny lub jako zmodyfikowany system regulacyjny ubikwityny (mURS), który pozbawiony jest on dwóch zachodzących na siebie 'elementów konsensusowych szoku cieplnego' opisywanych w EP 0342926 oraz US 5614399. Zmodyfikowany promotor ubikwityny przygotowywano przez powielenie techniką PCR dwóch fragmentów DNA przy użyciu, jako matrycy genomowego DNA kukurydzy, a następnie poddaniu ligacji dwóch fragmentów w celu uzyskania pojedynczego fragmentu pozbawionego konsensusowych elementów szoku cieplnego (HS). Miejsce restrykcyjne Kpn1 zostało umieszczone w miejscu elementów HS. Użyte startery zostały zaprojektowane na podstawie informacji o sekwencjach publikowanej przez Liu i wsp. 1995 (EMBL DNA dostęp do bazy danych ZMU29159). W celu usunięcia elementów HS i zastąpienia diagnostycznym miejscem Kpn1, promotor ubikwityny oraz sekwencje intronowe zamplifikowano jako dwa fragmenty używając do tego celu kombinacji starterów Hs1 + Ubi3-3 oraz HS2 + Ubi5-2, których sekwencje są podane poniżej. Startery Ubi5-2 oraz Ubi3-3 są homologiczne do sekwencji opublikowanych przez Lieu i wsp. 1995. Startery HS1 oraz HS2 są homologiczne do sekwencji umiejscowionych, odpowiednio, tuż przy końcu 3' oraz 5', na dwóch zachodzących elementach HS promotora ubikwityny, jak opisano w EP 0342926 i US 5361399. Oba startery posiadają ogon Kpn1 na ich końcach 5'.
Startery
HS1:5-ATTAGGTACCGGACTTGGCTCCGCTGTCGGC-3 (SEQ ID No:48)
HS2:5-TATAGGTACCGAGGCAGCGACAGAGATGCC-3 (SEQ ID No:49)
Ubi5-2:5-AGCTGAATCCGGCGGCATGGC-3 (SEQ ID No:50)
Ubi3-3:5-TGATAGTCTTGCCAGTCAGGG-3 (SEQ ID No:51)
W celu uzyskania plazmidów p97-U1 oraz p97-U2 amplifikowane produkty subklonowano do pGEM TEazy (Promega). Pełną długość (około 2 kpz) zmodyfikowanego promotora ubikwityny odtworzono przez subklonowanie fragmentu Kpn1-Sac1 z p97-U1 w miejscach Kpn1/Sac1 z p97-U2, żeby utworzyć p97-U3. Częściową mapę restrykcyjną przewidywanej sekwencji (SEQ ID No:52) klonowanego fragmentu do p97-U3 przedstawiono na Figurze 29. (Zmodyfikowany promotor ubikwityny (lub mURS) jest przedmiotem jednoczesnego Europejskiego Zgłoszenia Patentowego wniesionego przez niniejszych zgłaszających tego samego dnia co niniejszy wynalazek, pod oznaczeniem C1235,01/M). Zmodyfikowany promotor ubikwityny przeniesiono jako fragment Pstl z p97-U3 do plazmidu pPBI96-36. Plazmid pBI96-36 (Figura 30) zawiera połączenie genu reporterowego GUS-Nos pod kontrolą promotora ubikwityny typu dzikiego (otrzymanego z pAHC25) w plazmidowym szkielecie pUC. Promotor zastąpił regulacyjny system ubikwityny typu dzikiego w pPBI96-36, żeby utworzyć pośredni plazmid p97-dUG1 (Figura 31).
Konstruowanie pPBI97-2BdUN1
W celu uzyskania plazmidu p97-2BUbiNos, sekwencje Ubi-Nos w pPBI96-23 przeniesiono jako fragment EcoRI-Hindlll do EcoRI i miejsc cięcia Hindlll p97-2B (plazmid p97-2B opisano w Europejskim Zgłoszeniu Patentowym oznaczonym numerem 97305694.8 opublikowanym jako WO 99/06570). Żeby utworzyć p97-2BUbiNos zmodyfikowany promotor ubikwityny oczyszczono jako fragment HindllI/SacI z p97-dUG1 (Figura 31) i umieszczono w miejscach cięcia Hindlll oraz Sac1 p97-2BdUbiNos, zastępując promotor ubikwityny typu dzikiego. Żeby utworzyć pPBI97-2BdUN1 (Figura 32) sekwencję NptII w pUN1 oczyszczono jako fragment Sac1 i umieszczono w miejscu Sac1 p97-2BdUbiNos. Po usunięciu
PL 205 884 B1 markera oporności na ampicylinę, przy użyciu metody opisanej w WO 99/06570, powstały plazmid określony jako p97-2BdUN1A-, stosowano do transformacji pszenicy.
pCaineo pCaineo zawiera gen NptII kontrolowany przez promotor CaMV35S oraz intron Adhl z kukurydzy. Plazmid został opisany przez Fromm i wsp. 1986.
Transformacja pszenicy
Następującą kombinację (mikrowstrzeliwanie) użyto do transformacji pszenicy:
T a b e l a 2. Kombinacja plazmidów użyta w doświadczeniach transformacji pszenicy.
Konstrukt/konstrukty genu skrobi Konstrukt markera selekcyjnego
pAHC25
pWXGS+ pUN1
pSR97-26A-antysensowny pUN1 lub p97-2BdUN1
pSR97-29A-sensowny p97-2BdUN1 lub pCaiNeo
pSC98-1A-antysensowny p97-2BdUN1
pUSN-1 sensowny p97-2BdUN1
pUSN-2 antysensowny p97-2BdUN1
pUSN-1 sensowny i pUSN-2 antysensowny pUN1
pSC98-2A- sensowny p97-2BdUN1
Stosowane metody transformacji pszenicy, opisane tutaj, w dużym stopniu, oparte są na opisanych przez Barcelo i Lazzeri, 1995.
Zarodki pszenicy jarej odmiany Bobwhite oraz ozimej odmiany Florida hodowano w szklarni przez 16 dni przy naświetleniu o minimalnej intensywności 500 umol m -2s-1 z 0,5 M ponad warstwą liści. W dzień temperaturę szklarni utrzymywano na poziomie 19°C+/-1°C,a w nocy na poziomie
14°C+/-1°C.
Niedojrzałe zarodki pszenicy zbierano z rozwijających się ziaren. Ziarna zbierano i zarodki hodowano przez około 12 dni po antezie, do uzyskania zarodków o długości co najmniej 1 mm. Ziarna przemywano 70% etanolem przez 5 minut, a następnie przez 15 minut sterylizowano w 10% roztworze wybielacza Domestos (Domestos jest znakiem towarowym), a następnie przemywano 6 razy sterylną wodą destylowaną. Po usunięciu osi zarodka, zarodki układano powierzchnią osi na dół na żelu agarozowym (nr katalogowy Sigma A-3301) pożywką MM1. Ogólny przepis na MM1 jest podany w dodatku 1, a przepisy na różne inne składniki w dodatku 2. Przed napromieniowaniem zarodki utrzymywano w ciemności przez jeden lub dwa dni w temperaturze 24°C+/-1°C.
Plazmidy pAHC25, pCAiNeo, pUN1 oraz p97-2BdUN1 stosowano do dostarczenia markerów selekcyjnych w połączeniu z konstruktami genów skrobi, jak przedstawiono to w Tabeli 2. pAHC25 (Christansen i Quail 1996) zawiera chimeryczny gen Ubi-BAR, który dostarcza selekcji transformantów dla fosfonotrycyny, aktywnego składnika w herbicydach BASTA™ oraz Bialophos (patrz Block, M.de i wsp. 1987). Plazmidy pCAiNeo (Fromm i wsp., 1986), pUN1 oraz p97-2BdUN1 zawierają fuzję genu chimerycznego promotor-NptII oraz umożliwiają selekcyjnych transformantów przeciwko szeregowi antybiotyków aminoglikozydowych obejmując kanamycynę, neomycynę, genetycynę oraz paromycynę.
Mikrobombardowanie zastosowano do wprowadzenia plazmidów do komórek roślinnych. Do wytrącenia DNA plazmidu na 0,6 μg cząsteczkach złota (BIO-RAD numer katalogowy 165-2262) zastosowano następujący sposób: całkowitą ilość 5 μg DNA plazmidu dodano do 50 μl sonifikowanej przez jedną minutę zawiesiny cząsteczek złota (10 mg/ml) i w 1,5 ml probówce do mikrowirowania. Po krótkim wytrząsaniu przez 3 sekundy z drugiej strony wieczka probówki dodawano 50 μl 0,5 M roztworu chlorku wapnia i 20 μl 0,05 M zasady wolnej od spermidyny. Zawartość probówki mieszano poprzez zamknięcie wieczka i umieszczanie pukaniem w probówkę chlorku wapnia oraz spermidyny na dnie probówki. Po wytrząsaniu przez 3 sekundy, zawiesinę odwirowywano przy 13000 rpm przez 5 sekund. Supernatant usuwano, a osad rozpuszczano ponownie w 150 μl absolutnego etanolu. Wymaga to zeskrobania cząstek złota z wewnętrznych ścian probówki przy użyciu końcówki pipety. Po dalszym trzy sekundowym wytrząsaniu próbkę ponownie wirowano, a osad rozpuszczano ponownie w 85 μl
PL 205 884 B1 absolutnego etanolu. Cząsteczki krótko wytrząsano i sonifikowano przez 5 sekund sonifikatorem Camlab Trisonic T310 w łaźni wodnej aby uzyskać drobną dyspersję. Podwielokrotność 5 μl cząstek złota opłaszczonych DNA umieszczano w centrum makronośnika (BIO-RAD nr katalogowy 115-2335) i pozostawiono do wysuszenia przez 30 minut. Mikrobombardowanie cząsteczkami przeprowadzono przy użyciu komory Biolistic™ PDS-1000/He (BIO-RAD Instruments, Hercules CA), co przedstawiono schematycznie na Figurze 33, stosując ciśnienie helu 650 do 900 psi (membrana bezpieczeństwa: BIO-RAD nr katalogowy 165-2327 oraz odpowiednio 165-2328).
Na figurze 33 przedstawiono komorę próżniową składającą się z obudowy 10, wewnętrznych ścian bocznych, które zawierają szereg wgłębień 12 do podtrzymywania półek, takich jak półka na próbki 14 pokazana na 4 poziomie licząc od góry obudowy. Membrana bezpieczeństwa 16 jest podtrzymywana w rurze uderzeniowej 18, ciśnieniem helu w pobliżu góry obudowy. Podpora 20 znajdująca się w drugim zestawie wgłębień 12 licząc od góry obudowy utrzymuje jednostkę 22, obejmując ekran zatrzymujący oraz wiele pierścieni 24 z 11 pierścieniami poniżej podpory 20 i 3-4 pierścieniami powyżej podpory 20. Makronośnik 26 jest umiejscowiony na szczycie jednostki 22. Przybliżona odległość od membrany bezpieczeństwa 16 do makronośnika 26 wynosi 25 mm, z przybliżoną odległością od makronośnika 26 do zatrzymującego ekranu wynoszącą 7 mm, i przybliżoną odległością od ekranu zatrzymującego do półki na próbki 14 wynoszącą 67 mm. Szczyt jednostki 22 jest odległy około 21 mm od dna rury uderzeniowej 18, a dno jednostki 22 jest około 31 mm od szczytu półki na próbki 14.
Niedojrzałe zarodki poddawano mikrobombardowaniu pomiędzy 1 a drugim dniem po hodowli. Do zabiegu, niedojrzałe zarodki grupowano w okrąg średnicy w przybliżeniu około 1 cm, zawierający 20-100 zarodków, ułożonych osiową stroną do dołu na pożywce MM1. Płytkę Petri'ego (nie pokazano) zawierająca tkankę umiejscowiono w komorze na półce 14, na poziomie czwartej półki licząc od góry jak pokazano na Figurze 33. Następnie usunięto powietrze z komory, do osiągnięcia wynoszącej 28,5 cala Hg próżni. Makronośnik 26 przyspieszono uderzeniową falą helu stosując błony bezpieczeństwa, które pękają, gdy ciśnienie He w rurze uderzeniowej 18 osiąga 650 lub 900 psi. W ciągu jednej godziny po promieniowaniu, napromieniowane zarodki położono na pożywce MM1 w ilości 10 zarodków na 9 cm płytce Petri'ego, a następnie trzymano w całkowitej ciemności przez 2-3 tygodnie, w temperaturze 24°C. W tym okresie w napromieniowanych zarodkach zostaje wytworzony somatyczny callus zarodkowy.
Po 2-3 tygodniach zarodki przeniesiono na wzmocnioną agarem pożywkę regenerującą, znaną jako pożywka R, i inkubowano przez 16 godzin, przy świetle dziennym, w temperaturze 24°C. Ogólny przepis na pożywkę R jest podany w dodatku 1. Zarodki przenoszono na świeże płytki w 2-3 tygodniowych odstępach. Skład pożywki regenerującej różni się w zależności od stosowanego systemu selekcyjnego. Dla napromieniowanych transformantów z genem BAR, pominięto roztwór 3 amino, a do selekcji użyto PPT (fosfofinotrycyna) w ilości 1 mg/l do 3 mg/l przez okres trzech 2-3 tygodniowych transferów. Do selekcji transformantów z genem NptII użyto trzy różne systemy: 1) Genetycynę (GIBCO-BRL nr katalogu 10131-019) włączono (w ilości 50 mg/l) bezpośrednio po przeniesieniu do pożywki regenerującej i utrzymywano na poziomie 50 mg/l po następujących przeniesieniach pożywki regenerującej. 2) i 3) najpierw zarodki przeniesiono do pożywki regenerującej bez selekcji, odpowiednio, na 12 dni i 2-3 tygodnie, a następnie przeniesiono do środka zwierającego Genetycynę w 50 mg/l. Po 2-3 pasażach w pożywkach regenerujących, zregenerowane kiełki przeniesiono do probówek hodowlanych zawierających 15 ml pożywki regenerującej o połowicznej sile jonowej z selekcją 3 mg/l PPt lub 35 mg/l genetycyny w zależności od tego, czy w pierwotnych mikrobombardowaniach użyto gen BAR genu NptII. Po wytworzeniu korzeni, zregenerowane rośliny przeniesiono do ziemi w szklarni.
Izolacja genomowego DNA oraz analiza Southerna
Analizę Southerna pierwotnych transformantów oraz materiału pochodzącego od potomstwa przeprowadzono następująco: zamrożone, wysuszone suche tkanki liścia rozdrabniano szybko w tłuczku Kontes™ i moździerzu, a genomowe DNA ekstrahowano jak opisano w Fulton i wsp., 1995. 5 μg DNA cięto odpowiednim enzymem restrykcyjnym, według zaleceń producenta oraz przeprowadzano elektroforezę przez noc w 1% żelu agarozowym, który następnie fotografowano, przemywano przenoszono na Hybond N+™ (Amersham International) według sposobu analizy Southerna, stosując standardowe procedury (Sambrook i wsp. 1989). Po przeniesieniu membrany suszono na powietrzu, ogrzewano w temperaturze 65°C przez 1-2 godziny i poddawano działaniu UV przy 312 nm przez minuty.
Znakowanie sondy do analizy Southerna transformowanego materiału przeprowadzono tak jak opisano powyżej.
PL 205 884 B1
Histochemię GUS zasadniczo przeprowadzono, jak opisano u Jeffersona (1987).
Ocena promotora ubikwityny w konstytutywnej ekspresji powiązanych transgenów
Plazmid pAHC25 (Christensen i Quail, 1996) transformowano do pszenicy, jak opisano we wcześniejszych paragrafach. Transformanty selekcjonowano na podstawie oporności na fosfinotrycynę. Analizę Southerna przeprowadzono na pierwotnych transformantach w celu potwierdzenia integracji sekwencji plazmidu (dane nie przedstawione). Przeprowadzono także analizę histochemiczną GUS i wykazano, iż promotor ubikwityny jest zdolny do wywoływania ekspresji GUS na wysokim poziomie w zakresie tkanek pszenicy. Figury 34 A, B, C oraz D przedstawiają histochemiczną lokalizację ekspresji GUS odpowiednio w tkankach ziaren, łodyg, kwiatów i liści. Analizy Southerna oraz histochemiczna GUS przeprowadzono również na własnych potomkach pochodzących od pierwotnych transformantów, żeby potwierdzić, że stosowany system transformacji jest zdolny do wytworzenia roślin transgenicznych, które stabilnie przenoszą zintegrowane sekwencje plazmidowe do roślin potomnych. Figura 35 przedstawia analizę Southerna 26 roślin potomnych transformanta BW119, który był transformowany pAHC25. W tym, przykładzie DNA genomowy roślin potomnych cięto enzymem restrykcyjnym Sac1, a membranę hybrydyzowano z sekwencją kodującą genu GUS. Wyniki analizy Southerna sugerują na obecność dwóch niezależnie segregujących loci integracyjnych, z których każde zawiera konkatamery plazmidowej sekwencji pAHC25.
Ocena promotora waxy kukurydzy do ekspresji specyficznych dla bielma transgenów skojarzonych
Plazmidy pWxGS+ oraz pUN1 kotransformowano wspólnie do pszenicy, jak opisano to we wcześniejszych paragrafach. Transformanty wyselekcjonowano na podstawie oporności na genetycyny. W celu potwierdzenia integracji sekwencji plazmidowych (wyniki nie przedstawione) analizę Southerna przeprowadzono na pierwotnych transformantach. Przeprowadzono także analizy histochemiczne, w celu określenia profilu ekspresji wywołanej przez promotor waxy kukurydzy. Większość transformantów, w których zachodziła ekspresja GUS wykazywała ekspresję specyficznie w tkankach bielma, co świadczy o przydatności tego promotora do wywoływania ekspresji transgenów skojarzonych w bielmie. Figury 36 A oraz B przedstawiają specyficzną dla bielma ekspresję GUS w ziarnach dwóch niezależnych transformantów. Nie zaobserwowaliśmy ekspresji GUS w pyłku kwiatowym zbóż tak, jak zauważyli to Russell i Fromm (1997). Jednakże stosowali oni także konstrukt, który miał wprowadzony intron hsp70 kukurydzy, który niewykluczone, że mógł mieć jakościowy i ilościowy wpływ na ekspresję.
Transformacja pszenicy konstruktami genów skrobi
Różne kombinacje konstruktów wyszczególnionych w Tabeli 2 łącznie transformowano do pszenicy stosując procedury opisane we wcześniejszych paragrafach. Transformanty selekcjonowano na podstawie oporności na genetycynę. Pierwotne transformanty potwierdzono przez analizę Southerna. Membrany były sekwencyjnie hybrydyzowane sondą sekwencji kodującej NptII oraz sondą regionu kodującego SBE. Figura 37 przedstawia przykład analizy Southerna, który zawiera 22 domniemane transformanty, które zostały wprowadzone techniką łączonego mikrobombardowania wraz z pSR97 29A- lub pSR97-26A-oraz pUN1 lub p97-2BdUN1. Genomowe DNA na tej membranie cięto Sac1. Najpierw membranę hybrydyzowano z sondą NptII. Linie oznaczone gwiazdką odpowiadają transformantom, które dały pozytywny sygnał z sondą NptII. Membranę pokazaną na Figurze 37 hybrydyzowano fragmentem SBEII-1 wielkości 1 kpz ciętym Sac1. Oczekuje się, że cięcie Sac1 uwalnia prążek hybrydyzujący SBEII-1, wielkości 1 kpz z sekwencji plazmidowych zarówno pSR97-29Ai pSR97-26A-, a intensywność tego prążka będzie różnić się w zależności od liczby kopii wstawionych sekwencji plazmidowych. Jak można zobaczyć na Figurze 37, zaobserwowano także kilka dodatkowych prążków hybrydyzacyjnych SBEII-1. Pięć z tych prążków jest obecnych we wszystkich liniach i wynika z hybrydyzacji do endogennych sekwencji SBEII-1 pszenicy. Dodatkowe prążki różnych rozmiarów, obserwowane w większości ścieżek, przedstawiają hybrydyzujący prążek wielkości 1 kpz najprawdopodobniej powstający na skutek integracji, w czasie której, przed integracją, jedna lub więcej kopii plazmidu została zlinearyzowana w sekwencji SBEII-1 wielkości 1 kpz. W przykładzie przedstawionym na Figurze 37, z 20 roślin pozytywnych na NptII, uznano, że 16 było transformowanych łącznie z sekwencjami SBEII-1, świadcząc o wydajności łącznej transformacji na poziomie 80%.
Skaningowa kalorymetria różnicowa (DSC)
Podgrzany wodny roztwór skrobi, w nadmiarze wody ulega, jak opisano wyżej wspólnej endotermicznej przemianie znanej jako żelifikacja, która powoduje topnienie stalitów skrobi. Skaningowa kalorymetria różnicowa (DSC) mierzy ilość energii (ciepła) absorbowanej lub uwolnionej przez próbkę,
PL 205 884 B1 gdy jest ona podgrzewana, schładzana lub przetrzymywana w stałej (izotermicznej) temperaturze. DSC było szeroko stosowane do badania żelifikacji oraz retrogradacji skrobi.
Analizę DSC przeprowadzono na pojedynczych ziarnach lub grupie pięciu ziaren pierwotnych transformantów wytworzonych przez transformację stosując każdą z kombinacji konstruktów genowych wyszczególnionych w Tabeli 2.
Stosowano dwa różne sposoby przygotowywania próbki i metodologii DSC.
Sposób 1
Pojedyncze próbki ziaren rozkruszano i rozdrabniano przy użyciu tłuczka i moździerza. Następnie powstałe otręby oddzielano a próbki odważano do 50 μτη aluminiowych pojemników do DSC. Do próbek dodano wodę w ilości trzykrotnie większej wagowo, i pojemniki z próbkami zaplombowano. Analizę przeprowadzono stosując system Perkin-Elmer DSC-7 Robotic™ wyposażony w Inetrcooler II™, w warunkach poniżej temperatury otoczenia. Próbki ogrzewano od 25°C do 80°C z szybkością ogrzewania 5°C na minutę. Rejestrowano entalpię żelifikacji, temperaturą początkową, maksymalną i końcową. Termogramy analizowano stosując oprogramowanie Perkin-Elmer (Thermal Analysis Software 7). Entalpię żelifikacji wyrażono w dżulach (J)/gram(g) próbki.
Sposób 2 ziaren pojedynczego pierwotnego transformanta lub pojedyncze nasiona pierwotnych transformantów zmielono w Camotec 1090™ Sample Mill. Następnie zmieloną próbkę przesiewano na sicie 250 mikronowym, żeby oddzielić otręby od bielma. Około 5 mg przesianych próbek dokładnie odważono do 50 μl pojemników aluminiowych DSC. Wodę w ilości trzykrotnie większej, wagowo, dodawano do pojemników na próbki i plombowano. Analizę przeprowadzono stosując system PerkinElmer DSC-7 Robotic™ wyposażony w Inetrcooler II™ oraz autosampler. Próbki ogrzewano od 40°C do 85°C z prędkością 10°C na minutę. Termogramy zanalizowano stosując oprogramowanie PerkinElmer (Pyris Software dla Windows v 3,5). Rejestrowano entalpię żelifikacji, temperaturę początkową, maksymalną oraz końcową.
Przy zastosowaniu sposobu 1, analizę DSC przeprowadzono na pojedynczych dojrzałych ziarnach pierwotnych transformantów, transformowanych kombinacjami plazmidów pSR97-26A-/pUN1, pSR97-26A-/p97-2BdUN1 i pSR97-29A-/p97-2BdUN1. Uzyskane dane porównywano z danymi materiału kontrolnego, który transformowano jednym z plazmidów NptII zawierających markery do selekcji, ale nie zawierających żadnych plazmidów „skrobiowych”. W Tabeli 3 podsumowane są wartości średnie temperatury początkowej, maksymalnej i końcowej oraz wartości entalpii dla wyselekcjonowanego materiału. Większości próbek wykazano wartości podobne do materiału kontrolnego. Jednakże, jak można odczytać z Tabeli 3 temperatura początkowa, maksymalna oraz końcowa była dla wielu transgenicznych próbek wyższa w porównaniu do wartości otrzymanych dla materiału kontrolnego. Np. transformant BW 326 wykazuje wzrost 6,7°C, 4,9°C oraz 4,6°C, odpowiednio, dla temperatury początkowej, maksymalnej oraz końcowej w porównaniu do wartości próbki kontrolnej.
Stosując sposób 2, przeprowadzono dalsze serie analiz DSC w grupach składających się z 5 ziaren pierwotnych transformantów, transformowanych kombinacjami plazmidów pSC98-1A-/p97-2BdUN1, pUSN-1/p97-2BdUN1, pUSN-2/p97-2BdUN1 i pUSN-1/pUSN-2/pUN1. Uzyskane dane porównano z danymi otrzymanymi dla materiału kontrolnego, który był transformowany jednym z plazmidów NptII, które zawierały markery do selekcji, ale nie zawierały żadnych plazmidów „skrobiowych”. W Tabeli 4 podsumowano średnią temperaturę początkową, maksymalną i końcową oraz wartości entalpii dla wyselekcjonowanych grup próbek. W wielu przypadkach istnieją dowody, iż temperatura początkowa, maksymalna i końcowa dla skrobiowego materiału transgenicznego była wyższa w porównaniu z wartościami otrzymanymi dla materiału kontrolnego. Np. transformant BW 727 wykazuje wzrost 9,8°C, 8,7°C i 9,1°C, odpowiednio, dla temperatury początkowej, maksymalnej i końcowej, w porównaniu do próbki kontrolnej BW nr 3 oraz wzrost 7,6°C, 6,8°C oraz 7,8°C, odpowiednio, dla temperatury początkowej, maksymalnej i końcowej, w porównaniu do próbki kontrolnej BW nr 2.
PL 205 884 B1
T a b e l a 3. Wyniki analizy DSC dla pojedynczych ziaren przy zastosowaniu sposobu 1. Przedstawione dane są średnimi dla 2 do 6 próbek z pojedynczych ziaren (T0, Tp, i Tf są, odpowiednio, temperaturą początkową, maksymalną i końcową).
Kombinacja plazmidów Oznaczenie linii T0 (°C) Tp (°C) Tf (°C) ΔΗ (J/g)
Próbka kontrolna BW1 55.2 59.7 66.5 4.66
pSR97-26A-/pUN1 BW283 57.1 60.4 65.0 2.12
BW135 57.2 62.1 68.6 4.86
BW324 57.8 62.1 69.1 5.33
BW325 58.4 61.8 68.7 3.90
BW326 61.9 64.6 71.1 2.46
BW348 60.7 63.4 69.7 3.76
pSR97-26A-/p97-2BdUN1 F227 57.4 61.4 67.3 2.65
pSR97-29A-/p97-2BdUN1 F310 62.1 63.7 69.2 6.75
F312 59.0 62.3 66.8 1.16
BW335 56.2 60.8 69.1 4.63
BW353 59.5 62.7 70.8 3.21
BW354 55.4 61.7 68.9 4.28
BW355 57.9 61.5 68.0 3.95
BW357 55.3 60.6 68.0 3.74
BW363 56.7 62.5 67.9 1.13
BW367 59.0 62.5 68.2 2.17
BW369 57.9 60.9 65.9 1.04
BW370 53.7 59.4 67.5 6.00
BW375 57.2 61.5 70.0 4.14
BW376 54.0 58.1 68.0 3.39
BW377 53.4 60.9 69.2 2.60
BW380 54.6 61.6 67.6 2.16
BW390 56.8 61.2 68.5 1.29
BW399 57.4 62.7 67.9 1.77
BW400 60.6 63.6 68.1 0.64
BW341 51.6 59.0 66.4 1.97
T a b e l a 4: Wyniki analizy DSC próbek 5 zbóż przy zastosowaniu sposobu 2. T0, Tp i Tf odpowiednio przedstawiają temperaturę początkową, temperaturę maksymalną oraz temperaturę końcową
Kombinacja plazmidów Oznaczenie linii T0 (°C) Tp (°C) Tf (°C) ΔΗ (J/g)
1 2 3 4 5 6
Próbka kontrolna F 1 60.1 63.9 68.0 6.30
Próbka kontrolna BW 2 59.3 64.0 68.4 5.94
Próbka kontrolna BW 3 57.08 62.09 67.08 4.28
PL 205 884 B1 cd tabeli 4
1 2 3 4 5 6
pSC98-1A-/p97-2BdUN1 BW449 59.3 62.9 67.9 3.95
BW477 57.7 63.6 70.6 8.30
F492 62.3 66.4 70.2 7.60
F494 63.6 67.3 71.0 5.73
BW511 59.6 63.8 67.2 0.98
BW518 60.2 64.9 69.2 3.57
BW519 58.4 63.6 68.5 4.13
BW527 58.7 63.7 69.0 6.38
BW549 59.9 64.8 69.3 4.48
BW550 60.2 64.6 68.9 5.06
BW552 60.8 62.9 67.9 3.74
BW553 59.5 63.9 67.5 3.60
BW555 61.0 66.1 68.2 5.43
BW557 62.7 66.9 71.0 5.08
BW559 61.6 65.9 70.8 5.08
BW563 61.4 65.1 69.4 1.90
BW564 59.4 64.5 73.2 7.08
BW576 61.8 65.6 69.3 2.65
BW587 61.3 65.4 69.4 5.36
BW614 63.9 67.9 71.8 5.83
BW618 61.3 65.6 69.7 3.54
BW583a 58.9 63.7 68.0 3.54
BW631 61.5 65.6 69.7 4.52
BW633 61.9 66.0 70.2 5.12
BW634a 60.8 64.9 70.2 5.10
BW637a 62.8 67.2 72.0 5.16
BW639 61.8 65.1 68.9 2.15
BW640a 62.2 66.7 71.0 3.23
BW642 63.2 67.2 70.9 4.90
BW698 62.9 67.0 70.9 4.48
BW700a 63.8 67.6 71.2 3.41
BE524a 59.4 64.3 68.9 4.05
pUSN-1/p97-2BdUN1 BW622 59.0 64.1 68.7 4.32
BW628 56.2 63.3 66.0 6.09
BW645 57.5 65.6 69.5 5.97
BW646 61.6 66.4 67.7 3.99
PL 205 884 B1 cd tabeli 4
1 2 3 4 5 6
BW647 61.3 65.4 69.0 3.47
BW648 59.8 64.4 68.8 4.65
BW649 61.3 65.6 70.1 5.07
BW656 59.9 64.6 69.2 5.38
BW660 62.0 67.3 71.0 4.23
BW661 61.5 65.8 69.6 3.88
BW664 61.1 66.1 70.8 4.81
BW665 61.6 66.5 69.4 5.25
BW667 63.0 67.1 70.8 3.91
BW672 63.0 68.1 71.9 5.43
BW673A 63.1 67.7 71.6 4.83
BW675 62.1 66.4 71.3 10.97
BW676 59.8 67.3 71.2 4.21
BW678 63.0 66.3 69.3 1.20
BW680 60.8 65.3 70.1 4.94
BW701 62.3 67.5 72.2 4.70
BW706 63.0 67.3 71.3 4.94
BW707 60.9 65.8 70.0 4.77
BW708 61.7 65.5 68.8 6.11
BW726 62.6 67.5 71.3 5.44
BW755 60.8 65.8 70.6 5.18
BW702 61.9 67.0 71.0 4.44
- BW756 62.3 66.1 69.7 4.83
pUSN-2/p97-2BdUN1 BW625 62.7 68.2 73.8 4.27
BW653 60.4 65.3 70.1 6.52
BW704 60.9 66.2 70.2 4.19
BW718 61.3 66.9 71.2 4.15
BW719 62.2 67.2 71.7 5.32
BW722 64.8 67.5 70.0 2.14
BW740 63.4 67.9 72.3 5.67
BW741 62.6 66.9 70.5 5.30
BW742 64.6 67.9 72.0 6.66
BW752 62.3 66.3 70.0 4.63
pUSN-1/pUSN-2/pUN1 BW685 62.6 65.5 69.0 2.60
BW686A 61.9 66.3 70.2 4.45
PL 205 884 B1 cd tabeli 4
1 2 3 4 5 6
BW714 63.0 67.6 71.3 3.53
BW727 66.9 70.8 76.2 5.19
BW728 62.0 66.3 70.4 5.70
BW731 63.3 67.9 73.0 4.90
Dodatek 1
Przepis na 2x stężoną pożywkę MM1
Składniki Objętość roztworu podstawowego na litr 2X stężonego środka
Makrosole MS (10 x roztwór podstawowy) 200 ml
Mikrosole L (100 x roztwór podstawowy) [nr kat. Sigma F-0518] 2 ml
FeNaEDTA MS (100 x roztwór podstawowy) [Katalog Sigma F-0518] 20 ml
Zmodyfikowane witaminy (x 1000) 1 ml
3 aminokwasowy roztwór (25 x roztwór podstawowy) 40 ml
Mioinozytol (nr katalogowy Sigma I-3011) 0,2 g
Sacharoza 180 g
AgNO3 (20 mg/ml roztworu podstawowego) dodany po sterylizacji przez filtry 1 ml
Picloram (1 m/ml roztworu podstawowego) dodany po sterylizacji przez filtry 4 ml
Sterylizować przez filtry i dodać do równej objętości roztopionego 2x żelu agarazowego (10 g/l) Przepis dla 2x stężonych pożywek R
Składniki Objętość roztworu podstawowego na litr 2X stężonego środka
Macrosole L7 (10 x roztwór podstawowy) 200 ml
Mikrosole L (100 x roztwór podstawowy) 2 ml
FeNaEDTA MS (100 x roztwór podstawowy) 20 ml
Witaminy/Inozytol L2 (x 200) 10 ml
Roztwór 3 aminokwasów (25 x roztwór podstawowy) 40 ml
Maltoza 60 g
2,4-D (1 mg/ml r-ru podstawowego) dodany po sterylizacji filtrowej 200 pl
Mieszanka izomerów cis trans Zeatyny (nr kat. Melford Z-0917) (5 mg/ml r-ru podstawowego) dodany po sterylizacji przez filtry 2 ml
Sterylizować filtracyjnie i dodać do równej objętości łatwo topliwego 2x żelu agarazowego (16 g/l)
PL 205 884 B1
Dodatek 2
Przepisy na składniki MM1 i pożywki R. Mikrosole L (1000x r-r podstawowy)
na 100 ml
MnSO4x7H2O 1,34 g
H3BO3 0,5 g
ZnSO4x7H2O 0,75 g
KI 75 mg
Na2MoO4x2H2O 25 mg
CuSO4x5H2O 2,5 mg
CoCl2x6H2O 2,5 mg
Sterylizować przez filtr membranowy 22 μm. Przechowywać w 4°C
Makrosole MS (10X roztwór podstawowy)
na litr
NH4NO3 16,5 g
KNO3 19,0 g
KH2PO4 1,7 g
MgSO4x7H2O 3,7 g
CaCl2x2H2O 4,4 g
NB.: CaCl2 rozpuścić przed zmieszaniem z innymi składnikami NB.: KH2PO4 przyrządzić osobno w sterylnej wodzie i dodać na końcu Roztwór należy przechowywać w 4°C po wyjęciu z autoklawu. Zmodyfikowane witaminy MS (1000x roztwór podstawowy)
na 100 ml
Tiamina HCl 10 mg
Pirodyksyna HCl 50 mg
Kwas nikotynowy 50 mg
Roztwór należy przechowywać w podwielokrotnościach 10 ml w temperaturze -20°C Roztwór 3 aminokwasów (25x roztwór podstawowy)
na litr
L-Glutamina 18,75 g
L-Prolina 3,75 g
L-Asparagina 2,5 g
Roztwór należy przechowywać w podwielokrotnościach 40 ml w temperaturze -20°C
PL 205 884 B1
Makrosole L7 (10X roztwór podstawowy)
na litr
NH4NO3 2,5 g
KNO3 15,0 g
KH2PO4 2,0 g
MgSO4x7H2O 3,5 g
CaCl2x2H2O 4,5 g
nb.: CaCl2 rozpuścić przed zmieszaniem z innymi składnikami nb.: KH2PO4 przyrządzić osobno w sterylnej wodzie i dodać na końcu Roztwór należy przechowywać w 4°C po wyjęciu z autoklawu. Witaminy/ Inozytol (200x roztwór podstawowy)
200x r-r podstawowy na 100 ml
Inozytol 4,0 g
Tiamina HCl 0,2 g
Pirodyksyna HCl 0,02 g
Kwas nikotynowy 0,02 g
Pantotenian Ca 0,02 g
Kwas askorbinowy 0,02 g
Roztwór należy przechowywać w podwielokrotnościach 40 ml w temperaturze -20°C
Atwell, W.A., Hood, L.F., Lineback, D.R., Varriano-Marston, E., and Zobel, H.F. (1988). The terminology and methodology associated with basic starch penomena. Cereal Foods World 33, 306-311.
Baba, T., Kimura, K., Mizuno, K., Etoh, H., Ishida, Y., Shida, O., and Arai, Y. (1991). Sequence conservation of the catalytic regions of amylolytic enzymes in maize branching enzyme-I. Biochem. Biophys. Res. Comm. 181(1): 87-94.
Barcelo P., and Lazzeri, P. (1995). Transformation of cereals by microprojectile bombardment of immature inflorescence and scutellum tissues. Methods in Molecular Biology - Plant Gene Transfer and Expression Protocols (vol 49), 113-123. Jones H [ed] Humana Press Inc., Totowa, NJ.
Block, M.de et al. (1987). EMBO J 6:2513-2518
Boyer, CD. and Priess, J. (1978). Multiple forms of (1-4)-a-D-Glucan, (1-4)-a-D-Glucan 6-glycosyl transferase from developing Zea mays L. kernals. Carbohydrate Res 61:321-334.
Burton, R.A., Bewley; J.D., Smith, A.M., Bhattacharyya, M.K., Tatge, H., Ring, S., Bull, V., Hamilton, W.D.O., and Martin, C. (1995). Starch branching enzymes belonging to distinct enzyme families are differentially expressed during pea embryo development. Plant J 7:1-13
Christensen, A.H., and Quail, P.H. (1996). Transgenic research, 5:213-218.
Donovan, J. W. (1979). Phase transitions of the starch-water system. Biopolym. 18, 263-275.
Fisher, D.K., Boyer, C.D., and Hannah, L.C. (1993). Starch branching enzyme II from maize endosperm. Plant Physiol. 102:1045-1046.
Fisher, D.K., Gao, M., Kim, K-N., Boyer, C.D., and Guiltinan, M.J. (1996). Two closely related cDNAs encoding starch branching enzyme from Arabidopis thaliana. Plant Mol. Biol. 30:97-108
Fromm ME, Taylor LP & Walbot V. (1986). Stable transformation of maize after gene transfer by electroporation. Nature 319: 791-793,
Fulton, T.M., Chunwongse, J., and Tanksley, S.D. (1995). Miniprep Protocol for Extraction of DNA from Tomato and other Herbaceous Plants, Plant Molecular Biology Reporter, 13 (3), pages 225-227.
PL 205 884 B1
Gao, M., Fisher, D.K., Kim, K-N., Shannon, J.C., and Guiltinan, M.J. (1997). Independent genetic control of maize starch-branching enzymes Ila and IIb: Isolation and characterisation of a Sbe2a cDNA. Plant Physiol. 114: 69-78.
Gaun, H.P., and Preiss, J. (1993). Differentiation of the properties of the branching isoenzymes from maize (Zea mays). Plant Physiol. 102: 1269-1273.
Goldsbrough AP, Belzile F, Yoder JI (1994). Complementation of the tomato anthocyanin without (aw) mutant using the dihydroflavonol 4-reductase gene. Plant Physiology 105, 491-496.
Islam, A.K.M.R. (1983). Ditelosomic additions of barley chromosomes to wheat. In Proc. 6th Int. Wheat Genet. Symp. 233-238. Kyoto, Japan.
Iack, P.L., Dimitrijevic, T.A.F., and Mayes S. (1994). Assessment of nuclear, nitochondrial and chloroplast RFLP markers in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) Theor. Appl. Genet. 90:643-649.
Jefferson RA (1987). Assaying chimaeric genes in plants: The GUS gene fusion system. Plant Molecular Biology Reporter 5 (4) 387-405.
Kennedy, J.F. and Cabalda, V.M.B. (1991). Bioactive carbohydrates in food. Chemistry in Britain, November, 1017-1019, 1026.
Khoshnoodi, J., Ek, B., Rask, L., and Larsson, H. (1993). Characterisation of the 97 and 103kDa forms of starch branching enzyme from potato tubers. FEBS 332 (1,2): 132-138.
Kossmann, J., Visser, R.G.F., Muller-Rober, B., Willmitzer, L., and Sonnewald, U. (1991).
Cloning and expression anaylsis of a potato cDNA that encodes branching enzyme: evidence for co-expression of starch biosynthetic genes. Mol. Gren. Genet 230: 39-44.
Liu et al (1995). Biochem Cell Biol 73: 19-30.
Martin, C., and Smith, A.M. (1995). Starch biosynthesis. Plant Cell 7:971-985.
Matzke & Matzke (1995). Plant Physiol. 107, 679-685.
Mizuno, K., Kawasaki, T., Shimada, H., Satoh, H., Kobayashi, E., Okumura, S., Arai, Y., and Baba, T. (1993). Alteration of the structural properties of starch components by the lack of an isoform of starch branching enzyme in rice seeds. J. Biol. Chem. 268(25): 19084-19091.
Morell, M.K., Rahman, S., Abrahams, S.L., and Appels, R. (1995). The biochemistry and molecular biology of starch synthesis in cereals. Auist. J. Plant Physiol. 22: 647-660.
Morell, M., Blennow, A., Kosar-Hashemi, B., and Samuel, M.S. (1997). Differential expression and properties of starch branching enzyme isoforms in developing wheat endosperm. Plant Physiol. 113:201-208.
Mousley, C.G. (1994). PhD Thesis, Wye College, University of London.
Nair, R.B., Baga, M., Scoles, G.J., Kartha, K.K., and Chibbar, R.N. (1997). Isolation, characterisation and expression analysis of a starch branching enzyme II cDNA from wheat. Plant Sci. 122:153-163.
Nakamura, Y., Takeichi, T., Kawaguchi, K., and Yamanouchi, H. (1992). Purification-of two forms of starch branching enzyme (Q-enzyme) from developing rice endosperm. Physiol. Plant 84: 329-335.
Nakamura, Y., and Yamanouchi, H. (1992). Nucleotide sequence of a cDNA encoding starch-branching enzyme, or Q-enzyme I, from rice endosperm. Plant Physiol. 99:1265-1266.
Preiss, J. (1991). Biology and molecular biology of starch synthesis and regulation. In Oxford Surveys Plant Mol. Cell Biol. 7:59-114.
Rahman, S., Abrahams, S., Abbott, D., Mukai, Y., Samuel, M., Morrell, M., and Appels, R. (1997). A complex arrangement of genes at a starch branching enzyme I locus in the D-genome donor of wheat. Genome 40:465-474.
Rapellin, A et al.1997. Isolation of a starch branching enzyme I cDNA from a wheat endosperm library. EMBL database accession Y12320.
Russell, D.A. and Fromm, M.E. (1977). Tissue-specific expression in transgenic maize of four endosperm promoters from maize and rice. Transgenic Research 6: 157-168.
Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T (1989). Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed. Cold Spring Harbour Laboratory Press, Cold Spring Harbour, NY.
Salehuzzaman, S.N.I.M., Jacobsen, E., and Visser, R.G.F. (1992). Cloning, partial sequencing and expression of a cDNA coding for branching enzyme in cassava. Plant Mol. Biol. 20:809-819.
Sears, E.R. (1966). In Chromosome manipulations and plant genetics Edited by R. Riley and K.R. Lavis, Oliver and Boyd, Edinburgh. pp29-45.
Sheeny et al (1988). PNAS 85, 9905-8809.
PL 205 884 B1
Smith, A.M. (1988). Major differences in isoforms of starch-branching enzyme between developing embryos of round- and wrinkled-seeded peas (Pisum sativum L.). Planta 175:270-279.
Shure, M et al 1983. Cell 35: 225-233.
Sun, C., Sathish, P., Deiber, A., and Jansson, C. (1995). Multiple starch branching enzymes in barley endosperm. In Photosynthesis from light to biosphere. P. Mathis (ed.) Vol. V:317-320.
Sun, C., Sathish, P., Ahlandsberg, S., and Jansson, C. (1998). The two genes encoding starch-branching enzymes IIa and lIb are differentially expressed in Barley. Plant Physiol. 118:37-49 (earliest electronic publication date 10th September 1998).
Svegmark, K. and Hermansson, A-M. (1990). Shear induced changes in the viscoelastic behaviour of heat treated potato starch dispersions. Carboyd. Polym. 13, 29-45.
Takeda, Y., Gaun, H.P., and Preiss, J. (1993). Branching of amylose by the branching isoenzymes of maize endosperm. Carbohydrate Res. 240:252-263.
Van der Krol et al, Mol Gen. Genet. 220, 204-212.
PL 205 884 B1
Lista sekwencji <110> Monsanto UK Ltd.
<120> Sekwencje nukleotydowe, konstrukt kwasu nukleinowego, wektor ekspresyjny, sekwencja aminokwasowa, sposób transformowania rośliny, transgeniczna roślina, transgeniczna komórka roślinna i część rośliny transgenicznej <130> C397.01/U <140>
<141>
<150>EP 98307337.0 <151> 1998-09-10 <160> 55 < 170> Patentln Ver. 2.1 <210> 1 <211> 2307 <212> DNA <213> Triticum aestivum <400> 1
catygacggc cagtgacttc gagctcggta cccggggatc cgatttggtg tgtgggagat 60
gttcttgcca aacaatgcag atggttcgcc accaattcct cacggctcac gggtgaaggt 120
gagaatggat actccatctg ggataaagga ttcaattcct gcttggatca agtactccgt 180
gcagactcca ggagatatac catacaatgg aatatattat gatcctcccg aagaggagaa 240
gtatgtattc aagcatcctc aacctaaacg accaaaatca ttgcggatat atgaaacaca 300
tgttggcatg agtagcccgg aaccaaagat caacacatat gcaaacttca gggatgaggt 360
gcttccaaga · attaaaagac ttggatacaa tgcagtgcaa ataatggcaa tccaggagca 420
ctcatactat ggaagctttg ggtaccatgt taccaatttc tttgcaccaa gtagccgttt 480
tgggtcccca gaagatttaa aatctttgat tgatagagct cacgagcttg gcttggttgt 540
cctcatggat gttgttcaca gtcacgcgtc aaataatacc ttggacgggt tgaatggttt 600
tgatggcacg gatacacatt acttccatgg cggttcacgg ggccatcact ggatgtggga 660
ttcccgtgtg tttaactatg ggaataagga agttataagg tttctacttt ccaatgcaag 720
atggtggcta gaggagtata agtttgatgg tttccgattc gatggcgcga cctccatgat 780
gtatacccat catggattac aagtaacctt tacaggaagc taccatgaat attttggctt 840
tgccactgat gtagatgcgg tcgtttactt gatgctgatg aatgatctaa ttcatgggtt 900
ttatcctgaa gccgtaacta tcggtgaaga tgttagtgga atgcctacat ttgcccttcc 960
tgttcaagtt ggtggggttg gttttgacta tcgcttacat atggctgttg ccgacaaatg 1020
gattgaactt ctcaaaggaa acgatgaagc ttgggagatg ggtaatattg tgcacacact 1080
aacaaacaga aggtggccgg aaaagtgtgt tacttatgct gaaagtcacg atcaagcact 1140
ggttggagac aagactattg cattctggtt gatggacaag gatatgtatg atttcatggc 1200
tctgaacgga ccttcgacac ctagtattga tcgtggaata gcactgcata aaatgattag 1260
acttatcaca atgggtttag gaggagaggg ttatcttaac tttatgggaa atgagttcgg 1320
gcatcctgaa tggatagact ttccaagagg cccacaagta cttccaactg gtaagttcat 1380
cccaggaaac aacaacagtt acgacaaatg ccgtcgaaga tttgaccagg gtgatgcaga 1440
PL 205 884 B1
atttcttagg taccatggta tgcagcagtt tgatcaggcg atgcagcacc ttgaggaaaa 1500
atatggcttt a^gacatcag accaccagta cgtatctcgg aaacatgagg aagataaggt 1560
gatcgtgttt gs.&aaaggęg acttggtatt tgtgttcaac ttccactgga gtaatagcta 1620
tttcgactac cgggttggct gtttaaagcc tgggaagtac aagęttgtct tagactcaga 1630
cgccggactc ttrggtggat ttggtaggat ccatcacact gcagagcac- tcacttctęa 1740
ctgccaacat gacaacaggc cccattcctt cccagcgcac actcctacca gaacctgtgt 1800
tgtctatgct ccaatgaact- aaacagcaaa gtgcagcata cgcatgcacg ctgttgttgc 1860
taacactagc aagaaaaaat cgtatggtca atacaaccag gtgcaaggtt taataagggt 1920
ttccttcaac gag~cctgga tagacaagac aacatcarga tgtgctctgt gctcccaaat 1980
tcccagggcg ttgcggagaa aaaatgctca tctgtgztac tttatggatc agggangaaa 2040
cctcccccaa anaccccctt tttttttgaa aggnggarag gcccccggtn tctgcatntg 2100
gatgcctcct taaatntttg tagccataaa ccattgczag tgtcctntaa attgacagtt 2160
tagaatagng gt^ntactcr tgtattttnt ttttgacact tagactgtat tcctcaaata 2220
atccacatgt tgtztac^cg aagntgagaa ataaaarcag agattgnagn aaaaaaaaaa 2280
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaa 2307
<2±0> 2 <211> 758 ;
<212> PRT <213> Triticun aestivum
<400> 2 Ile Arg Phe Gly 15 Val
Ile 1 Asp Gly Gin Leu 5 Arg Ala Arg Tyr Pro 10 Gly
Tr? Glu Ket Phe 20 Leu Pro Asn Asn Ala 25 Asp Gly Ser Pro Pro 30 Ile Pro
His Gly Ser 35 Arg Val Lys Val A.rg 40 Met Asp Thr Pro Ser 45 Gly Ile Lys
Asp Ser 50 Ile Pro Ala Trp Ile 55 Lys Tyr Ser Val Gin 60 Thr Pro Gly Asp
Ile 65 Pro Tyr Asn Gly Ile 70 Tyr Tyr Asp Pro Pro 75 Glu Glu Glu Lys Tyr 80
Val Phe Lys His Pro 85 Gin Pro Lys Arg Pro 50 Lys Ser Leu Arg Ile 95 Tyr
Glu Thr His Val 100 Gly Met Ser Ser Pro 105 Glu Pro Lys Ile Asn 110 Thr Tyr
Ala Asn Phe 115 Arg Asp Glu Val Leu 120 Pro Arg 7 1 λ Lys Arg 125 Leu Gly Tyr
Asn Ala 130 Val Gin Ile Met Ala 135 Ile Gin Glu His Ser 140 Tyr Tyr Gly Ser
PL 205 884 B1
Phe 145 Gly Tyr His Val Thr 150 Asn Phe Phe Ala Pro 155 Ser Ser Arg Phe G1 y 160
Ser Pro Glu Asp Leu 165 Lys Ser Leu Ile Asp 170 Arg Ala His Glu Leu 175 Gly
Leu Val Val Leu 180 Met Asp Val Val His 185 Ser His Al a Ser Asn Asn 190 Thr
Leu Asp Gly 195 Leu Asn Gly Phe Asp 200 Gly Thr Asp Thr His 205 Tyr Phe His
Gly Gly 210 Ser Arg Gly His His 215 Trp Met Trp Asp Ser 220 Arg Val Phe Asn
Tyr 225 Gly Asn Lys Glu Val 230 Ile Arg Phe Leu Leu 235 Ser Asn Ala Arg Trp 240
Trp Leu Glu Glu Tyr 245 Lys Phe Asp Gly Phe 250 Arg Phe Asp Gly Ala 255 Thr
Ser Met Met Tyr 260 Thr His His Gly Leu 265 Gin Val Thr Phe Thr Gly 270 Ser
Tyr His Glu 275 Tyr Phe Gly Phe Ala 280 Thr Asp Val Asp Ala 285 Vai Val Tyr
Leu Met 2S0 Leu Met Asn Asp Leu 295 Ile His Gly Phe Tyr 300 Pro Glu Ala Val
Thr 305 Ile Gly Glu Asp Val 310 Ser Gly Met Pro Thr 315 Phe Ala Leu Pro Val 320
Gin Val Gly Gly Val 325 Gly Phe Asp Tyr Arg 330 Leu His Met Ala Val 335 Ala
Asp Lys Trp Ile 340 Glu Leu Leu Lys Gly 345 A.sn Asp Glu Ala Trp Glu 350 Met
Gly Asn Ile 355 Val His Thr Leu Thr 360 Asn Arg Arg Trp Pro 365 Glu Lys Cys
Val Thr 370 Tyr Ala Glu Ser His 375 Asp Gin Ala Leu Val 380 Gly Asp Lys Thr
Ile Ala Phe Trp Leu Met Asp Lys Asp Met Tyr Asp Phe Met Ala Leu
385 390 395 400
PL 205 884 B1
Asn Gly Pro Ser Thr Pro Ser Ile Asp Arg Gly Ile Ala Leu His Lys 405 4io 415
Met Ile Arg Leu Ile Thr Met Gly Leu Gly Gly Glu Gly Tyr Leu Asn
420 425 430
Phe Met Gly Asn Glu Phe Gly His Pro C-iu Trp Ile Asp Phe Pro Arg
435 440 445
Gly Pro Gin Vai Leu Pro Thr Gly Lys Phe Ile Pro Gly Asn Asn Asn
450 455 460
Ser Tyr Asp Lys Cys Arg Arg Arg Phe Asp Gin Gly Asp Ala Glu Phe
465 470 475 4B0
Leu Arg Tyr His Gly Met Gin Gin Phe Asp Gin Ala Met Gin His Leu
485 490 495
Glu Glu Lys Tyr Gly Phe Met Thr Ser As.p His Giń Tyr Val Ser Arg
500 505 510
Lys His Glu Glu Asp Lys Val Ile Val Phe Glu Lys Gly Asp Leu Val
515 520 525
Phe Val Phe Asn Phe His Trp Ser Asn Ser Tyr Phe Asp Tyr Arg Val
530 535 540
Gly Cys Leu Lys Pro Gly Lys Tyr Lys Val Vai Leu Asp Ser Asp Ala
545 550 555 560
Gly Leu Phe Gly Gly Phe Gly Arg Ile His His Thr Ala Glu His Phe
565 570 575
Thr Ser Asp Cys Gin His Asp Asn Arg Pro His Ser Phe Ser Val Tyr
580 585 590
Thr Pro Ser Arg Thr Cys Val Vai Tyr Ala Pro Met Asn Thr Ala Lys
595 600 605
Cys Ser Ile Arg Met His Ala Val Val Ala Ser Thr Ser Lys Lys Lys
610 615 620
Ser Tyr Gly Gin Tyr Asn Gin Val Gin Gly Leu Ile Arg Val Cys Phe
625 630 635 640
Asn Glu Ser Trp Ile Asp Lys Thr Thr Cys Ala Leu Cys Ser Gin Ile
645 650 655
PL 205 884 B1
Pro Arg Ala Leu 660 Trp Arg Lys Asn Ala 665 His Leu Cys Tyr Phe 670 Met Asp
Gin Gly Xaa Asn Leu Pro Gin Xaa Pro Leu Phe Phe Leu Lys Gly Gly
675 680 685
Ala Pro Gly Xaa Cys Xaa Trp Met Pro Pro Xaa Phe Val Ala Ile Asn
690 695 700
His Cys Cys Pro Xaa Asn Gin Phe Arg Ile Xaa Val Xaa Leu Leu Tyr
705 710 715 720
Phe Xaa Phe Asp Ser Thr Val Phe Leu Lys Ser Thr Cys Cys Leu Leu
725 730 735
Glu Xaa Glu Lys Asn Gin Arg Leu Xaa Xaa Lys Lys Lys Lys Lys Lys
740 745 750
Lys Lys Lys Lys Lys Asn
755 <210> 3 <211> 1036 <212> DNA <213> Triticum aestivum <400> 3 atgtatgatt tcatggctct gaacggacct tcgacgccta atattgatcg tggaatagca 60 ctgcataaaa tgattanact tatcacaatg ggtttaggcg gagagggtta tcttaacttt 120 atgggaaatg agttcgggca tcctgaatgg atagactttc caagaggccc acaagtactt 180 ccaagtggta agttcatccc aggaaacagc aacagttacg acaaatgccg Łcaaagattt 240 gacctgggtg atgcagaatt tcttaggtat catggtatgc agcagtttga tcaggcaatg 300 cagcatcttg aggaaaaata tggttttatg acatcagacc accagtacgt atctcggaaa 350 cacgaggaag ataaggtgat cgtgtttgaa aaaggggact tggtatttgt gttcaacttc 420 cactggagta atagctattt cgactaccgg gtcggctgtt taaagcctgg gaagtacaag 480 gtggtcttag actcagacgc tggactcttt ggtggatttg gtaggatcca tcacactgca 540 gagcacttca cttctgaccg ccaacatgac aacaggcccc attcgttctc agtgtacact 600 cctagcagaa cctgtgttgt ctatgctcca atgaactaac agcaaggtgc agcatacgcg 660 tgcgcgctgt tgttgctagt agcaagaaaa atcgtacggt caatacagcc aggtgcaagg 720 tttaataagg attttttgct tcaacgagtc ctggatagac aagacaacat gatgttgtgg 780 cgtgtgctcc caatccccag ggcgttgtga agaaaacatg ctcatctgtg ttatgatttt 840 atggatcagc qacgaaactt cccccaaata cecatgcctc cttaaatctt tgtggccgta 900 aaccattgct agtgtcctct aaattgacag tttagcatag aggttttact tttgtatctt 960 ctttttgaca gttagacttt attcctcaaa taatcgacca gtcgtttact cgaaaaaaaa 1020 aaaaaaaaaa aaaaan 1036
PL 205 884 B1 <210> 4 <211> 1087 <212> DNA <213> Triticum aestivum <400> 4
atgtatgatt tcatggctct gaacggacct tcgacaccta atattgatcg ”2uć32ęC2 60
ctgcataaaa tgattagact tatcacaatg ggtttaggag gagagggtta tcttaacttt 120
atgggaaatg agctcgggca tcctgaatgg atagactttc caagaggccc acaagcactt 180
ccaactggta agttcatccc nngaaacaac aacagttacg acaaatgccg tcęaaaattt 240
gacctgggtg atgcagaatt tcttaggtat catggtatgc agcagtttga tcaggcgatg 300
cagcatcttg aggaaaaata tggctttatg acatcagacc accagtacgt atctcgaaaa 360
catgaggaag ataaggtgat cgtgtttgaa aaaggggact tggtatttgt gttcaacttc 420
cactggagta atagctattt cggctaccgg gttggctgtt taaagcctgg gaagcacaag 480
gttgtcttag actcagacgc cggactcttt ggtggatttg gtaggatcca tcacactgca 540
gagcacttca cttctgactg ccaacatgac aacaggcccc attcgttctc agtgtacact 600
cctagcagaa cctgtgttgt ctatgctcca atgaactaaa cagcaaagtg cagcatacgc 660
atgcacgctg ttgttgctag cactagcaag aaaaaatcgt atggtcaata caaccaggtg 720
caaggtttaa taagggtttt tgcttcaacg agtcctggat agacaagaca acatgatgat 780
gtgctctgtg ctcccaaatt cccagggcgt tgngnggaaa acatgctcat ctgtgttatc 840
attttatgga tcagngngga aacctccccc aaatacccat gcctccttaa acttttgtgg 900
tcctaaacca tggctactat cctctaaatt ggcagtttag catagaggtt ttacttttgt- 960
aaattttttt tgacagttaa tagactctat tcctcaaata attgacatgt cctttacaag 1020
aagatgagaa ataaaatcag ggattgaaga atccc.aaaag ctaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1080
aaaaaaa 1087
<210> 5 <211> 1120 <212> DNA <213> Triticum aestivum <400 5
atgtatgatt tcatggcgct gaacggacct tcgacgccta atattgatcg tggaatagca 60
ctgcataaaa tgattagact tatcacaatg •ggtctaggag gagagggtta tcttaacttt 120
atgggaaatg agttcgggca tcctgaatgg atagactttc caagaggccc acaagtactt 180
ccaagtggta agttcatccc aggaaacaac aacagttacg acaaatgccg tcgaagattt 240
gacctgggtg atgcagaatt tcttaggtat catggtatgc agcagtttga tcaggcaatg 300
cagcatcttg aggaaaaata tggttttatg acatcagacc accagtacgt ttcccggaaa 360
catgaggaag ataaggtgat cgtgtttgaa aaaggggact tggtatttgt gttcaacttc 420
cactggagta gcagctattt cgactaccgg gtcggctgtt taaagcctgg gaagtacaag 480
gtggtcttag actcggacgc cggactcttt ggtggatttg gtaggatcca tcacactgca 540
gagcacttca cttctgactg ccaacatgac aacaggcccc attcattctc agtgtacact 600
cctagcagaa cctgtgttgt ctatgctcca atgaactaac agcaaagtgc agcatacgcg 660
tgcgcgctgt tgttgctagt agcaagaaaa atcgtatggt caatacaacc aggtgcaagg 720
tttaataagg atttttgctt caacgagtcc tggatagaca agacaacatg atgttgtgct 780
gtgtgctccc aatccccagg gngttgtgaa gaaaacatgc tcatctgtgt tattttatgg 840
atcagggang aaacctcccc caaanacccc tttttttttt gaaaggngga taggcccccg 900
gtntctgcat ntggatgcct ccttaaatnt ttgtagccat aaaccattgc tagtgtcctn 960
PL 205 884 B1
taaatŁgaca tattcctcaa aęnaaaaaaa gtttagaata acaazcgaca aaaaaaaaaa gnggttntac tgttgtttac aaaaaaaaaa ttttgtattt tcgaagntga aaaaaaaaaa tntttttgac gaaataaaat agttagactg cagagattgn 1020 1080 1120
<210> 6
<211> 979
<212> DNA
<213> Triticum aestivum
<400 6
atatgtatga tttcatggct ctggataggc cttcaactcc tegeattgat cgtggcatag 60
cattacataa aatgatcagg cttgtcacca tgggtttagg tggtgaaggc tatcttaact 120
tcatgggaaa tgagtttggg catcctgaat ggatagattt tccaagaggc ccacaaactc 180
ttccaaccgg caaagttctc cctggaaata acaatagtta tgataaatgc cgccatagat 240
ttgatcttgg agatgcagat tttcttagat atcgtggtat gcaagagttc gatcaggcaa 300
tgcagcatct tgaggaaaaa tatgggttta tgacatctga gcaccagtat gtttcacgga 360
aacatg-agga agataaggtg atcttcttcg aaagaggaga tttggtattt gttttcaact 420
tccactggag caatagcttt tttgactacc gtgttgggtg ttccaagcct gggaagtaca 480
aggtggcctt ggactccgac gatgcactct ttggtggatt cagcaggctt gateatgatg 540
tcgactactt cacaaccgaa catccgcatg acaacaggcc gcactctttc tcggtgtaca 600
ctccgagcag aactgcggtc gtgtatgccc ttacagagta agaaccagca gcggcttgtt 660
acaaggcaaa gagagaactc cagagagctc gtggatcgtg agcgaagcga cgggcaacgg 720
cgcgaggctg ctccaagcgc catgactggg aggggatcgt gcntcttccc cagatgccag 780
gaggagcaga tggataggta gcttgttggt gagegetega aagaaaatgg acgggcctgg 840
gtgtttgttg tgctgcactg aaccctcctc etatettgea cattcccggt tgtttttgta 900
catataacta ataattgccc gtgcgcttca acatgaacat ataaatattc taataggtta 960
aaaaaaaaaa aaaaaaaaa 979
<210> 7 <211> 212 <212> PRT <213> Triticum aestivum
<400 7 Ala Leu Asn Gly Pro 10 Ser Thr Pro Asn Ile 15 Asp
Met 1 Tyr Asp Phe Met 5
Arg Gly Ile Ala 20 Leu His Lys Met Ile 25 Arg Leu Ile Thr Met 30 Gly Leu
Gly Gly Glu 35 Gly Tyr Leu Asn Phe 40 Met Gly Asn Glu Phe 45 Gly His Pro
Glu Trp 50 Ile Asp Phe Pro Arg 55 Gly Pro Gin Val Leu 60 Pro Ser Gly Lys
Phe 65 Ile Pro Gly Asn Ser 70 Asn Ser Tyr A.sp Lys 75 Cys Arg Arg Arg Phe BO
PL 205 884 B1
Asp Leu Gly Asp Ala 85 Glu Phe Leu Arg Tyr 20 His Gly Met Gin Gir. 95 Phe
Asp Gin Ala Met Gin His Leu Glu Glu Lys Tyr Gly Phe Met Thr Ser
100 105 110
Asp His Gin Tyr Val Ser Arg Lys His Glu Glu Asp Lys Val Ile Val
115 120 125
Phe Glu Lys Gly Asp Leu Val Phe Val Phe Asn Phe His Trp Ser Asn
130 13S 140
Ser Tyr Phe Asp Tyr Arg val Gly Cys Leu Lys Pro Gly Lys Tyr Lys
145 150 155 160
Val Val Leu Asp Ser Asp Ala Gly Leu Phe Gly Gly Phe Gly Arg Ile
- 165 170 175
His His Thr Ala Glu His Phe Thr Ser Asp Cys Gin His Asp Asn Arg
180 185 190
Pro His Ser Phe Ser val Tyr Thr Pro Ser Arg Thr Cys Val Val Tyr
195 200 205
Ala Pro Met Asn
210 <210> 8 <211> 378 <212> DNA <213> Triticum aestivum <400> 8 actaacagca aggtgcagca tacgcgtgcg cgctgttgtt gctagtagca agaaaaatcg 60 tacggtcaat acagccaggt gcaaggttta ataaggattt tttgcttcaa cgagtcctgg 120 atagacaaga caacatgatg ttgtggcgtg tgctcccaat ccccagggcg ttatgaagaa 180 aacatgctca tctgtgttat gattttatgg atcagcgacg aaacttcccc caaataccca 240 tgcctcctta aatctttgtg gccgtaaacc attgctagtg tcctctaaat tgacagttta 300 gcatagaggt tttacttttg Łatcttcttt ttgacagtta gactttattc ctcaaataat 360 cgaccagtcg tttactcg 378 <210> 9 <211> 449 <212> DNA <213> Triticum aestivum
PL 205 884 B1
<400> 9
aactaacagc aaagtgcagc atacgcgtgc gcgctgttgt tgctagtagc aaaaaaaatc 60
gtatggtcaa tacaaccagg tgcaaggttt aataaggatt tttgcttcaa cgagtcctgg 120
atagacaaga caacatgatg ttgtgctgtg tgctcccaat ccccagggng ttgtgaagaa 180
aacatgctca tctgrgttat tttatggatc agggangaaa cctcccccaa anaccccttt 240
tttttttgaa aggnggatag gcccccggtn tctgcatntg gatgcctcct taaatntttg 300
tagccataaa ccarrgctag tgtccrntaa attgacagtt tagaatagr.ę gttntacttt 360
tgtattttnt ttttgacagt tagactgtat tcctcaaata atcgacatgt tgtttactcg 420
aagntgagaa ataaaatcag agattgnag 449
<210> 10 <211> 428 <212> DNA <213> Triticum aestivum
<400> 10
actaaacagc aaagtgcagc atacgcatgc acgctgttgt tgctagcacc agcaagaaaa 60
aatcgtatgg tcaatacaac caggtccaag gtttaataag ggtttttgcr tcaacgagtc 120
ctggatagac aagacaacat gatgatgtgc tctgtgctcc caaattccca ggęcgttgng 180
nggaaaacat gcrcatctgt gttatcattt tatggatcag ngnggaaacc tcccccaaat 240
acccatgcct ccttaaactt ttgtggtcct aaaccatggc tactatcctc taaattggca 300
gtttagcata gaggttttac ttttgtaaat tttttttgac agttaataga ctctattcct 360
caaataattg acargtcctt tacaagaaga tgagaaataa aatcagggat tgaagaatcc 420
caaaagct 428 <210> 11 <211> 592 <212> PRT <213> Triticum aestivum <400> 11
Phe 1 Gly Val Trp Glu 5 Met Phe Leu Pro A.sn 10 Asn Ala Asp Gly Ser 15 Pro
Pro Ile Pro His 20 Gly Ser Arg Val Lys 25 Val Arg Met Asp Thr 30 Pro Ser
Gly Ile Lys 35 Asp Ser Ile Pro Ala 40 Trp Ile Lys Tyr Ser 45 Val Gin Thr
Pro Gly 50 Asp Ile Pro Tyr Asn 55 Gly Ile Tyr Tyr Asp 60 Pro Pro Glu Glu
Glu 65 Lys Tyr Val Phe Lys 70 His Pro Gin Pro Lys 75 Arg Pro Lys Ser Leu 80
Arg Ile Tyr Glu Thr His Val Gly Met Ser Ser Pro Glu Pro Lys Ile
90 95
PL 205 884 B1
Asn Thr Tyr Ala Asn Phe Arg Asp Glu Val Leu Pro Arg Ile Lys Arg 100 105 110
Leu Gly Tyr Asn Ala Val Gin Ile Met Ala Ile Gin Glu His Ser Tyr 115 120 125
Tyr Gly Ser Phe Gly Tyr His Val Thr Asn Phe Phe Ala Pro Ser Ser 130 135 140
Arg Phe Gly Ser Pro Glu Asp Leu Lys Ser Leu Ile Asp Arg Ala His
145 150 155 ISO
Glu Leu Gly Leu Val Val Leu Met Asp Val Val His Ser His Ala Ser
165 170 175
Asn Ast Thr Leu Asp Gly Leu Asn Gly Phe Asp Gly Thr Asp Thr His 180 185 190
Tyr Phe His Gly Gly Ser Arg Gly His His Trp Met Trp Asp Ser Arg 195 200 205
Val Phe Asn Tyr Gly Asn Lys Glu Val Ile Arg Phe Leu Leu Ser Asn 210 215 220
Ala Arg Trp Trp Leu Glu Glu Tyr Lys Phe Asp Gly Phe Arg Phe Asp '225 230 235 240
Gly Ala Thr Ser Met Met Tyr Thr His His Gly Leu Gin Val Thr Phe
245 250 255
Thr Gly Ser Tyr His Glu Tyr Phe Gly Phe Ala Thr Asp Val Asp Ala 260 265 270
Val Val Tyr Leu Met Leu Met Asn Asp Leu Ile His Gly Phe Tyr Pro 275 280 285
Glu Ala Val Thr Ile Gly Glu Asp Val Ser Gly Met Pro Thr Phe Ala 290 295 300
Leu Pro Vai Gin Val Gly Gly Val Gly Phe Asp Tyr Arg Leu His Met
30S 310 315 320
Ala Val Ala Asp Lys Trp Ile Glu Leu Leu Lys Gly Asn Asp Glu Ala
325 330 335
Trp Glu Met Gly Asn Ile Val His Thr Leu Thr Asn Arg Arg Trp Pro 340 345 350
PL 205 884 B1
G1 u Lys Cys 255 Val Thr Tyr Ala Glu 360 Ser His Asp Gin Ala 365 Leu Val Gly
Asp Lys Thr Ile AJ a Phe Trp Leu Met Asp Lys Asp Met Tyr f.sp Phe
370 375 380
Met Ala Leu Asn Gly Pro Ser Thr Pro Ser Ile Asp Arg Gly Ile Ala
385 290 395 400
Leu His Lys Met Ile Arg Leu Ile Thr Met Gly Leu Gly Gly Glu Gly
405 410 415
Tyr Leu Asn Phe Met Gly Asn Glu Phe Gly His Pro Glu Trp Ile Asp
420 425 430
Phe Pr.o Arg Gly Pro Gin Val Leu Pro Thr Gly Lys Phe Ile Pro Gly
435 - 440 445
Asn Asn Asn Ser Tyr Asp Lys Cys Arg Arg Arg Phe Asp Gin Gly Asp
450 455 460
Ala Glu Phe Leu Arg Tyr His Gly Met Gin Gin Phe Asp Gin Ala Met
465 470 475 480
Gin His Leu Glu Glu Lys Tyr Gly Phe Met Thr Ser Asp His Gin Tyr
485 490 495
Val Ser Arg Lys His Glu Glu Asp Lys Val Ile Val Phe Glu Lys Gly
500 505 510
Asp Leu Val Phe Val Phe Asn Phe His Trp Ser Asn Ser Tyr Phe Asp
515 520 525
Tyr Arg Val Gly Cys Leu Lys Pro Gly Lys Tyr Lys Val Val Leu Asp
530 535 540
Ser Asp Ala Gly Leu Phe Gly Gly Phe Gly Arg Ile His His Thr Ala
545 550 555 560
Glu His Phe Thr Ser Asp Cys Gin His Asp Asn Arg Pro His Ser Phe
565 570 575
Ser Val Tyr Thr Pro Ser Arg Thr cys Val Val Tyr Ala Pro Met Asn
580 585 590
PL 205 884 B1 <210> 12 <211> 771 <212> PRT <213> Triticum aestivum <400> 12
Ser Arg Ala Ala Ser Pro Gly Lys Val Leu Val Pro Asp Gly Glu Ser
1 5 10 15
Asp Asp Leu A-l a Ser Pro Ma Gin Pro Glu Glu Leu Gin Ile Pro Glu
20 25 30
Asp Ile Glu Glu Gin Thr Ala Glu Val Asn Met Thr Gly Gly Thr Ala
35 40 45
Glu Lys Leu Glu Ser Ser Glu Pro Thr Gin Gly Ile Val Glu Thr Ile
50 55 60
Thr Asp Gly Val Thr Lys Gly Val Lys Glu Leu Val Val Gly Glu Lys
65 70 75 30
Pro Arg Val Vai Pro Lys Pro Gly Asp Gly Gin Lys Ile Tyr Glu Ile
85 90 95
Asp Pro Thr Leu Lys Asp Phe A.rg Ser His Leu Asp Tyr Arg Tyr Ser
100 105 110
Glu Tyr Arg Arg Ile Arg Ala Ala Ile Asp Gin His Glu Gly Gly Leu
115 120 125
Glu Ala Phe Ser Arg G1 y Tyr Glu Lys Leu Gly Phe Thr Arg Ser Ala
130 135 140
Glu Gly Ile Thr Tyr Arg Glu Trp Ala Pro Gly Ala His Ser Ala Ala
145 150 155 160
Leu Val Gly Asp Phe Asn Asn Trp Asn Pro Asn Ala Asp Thr Met Thr
165 170 175
Arg Asp Asp Tyr Gly Val Trp Glu Ile Phe Leu Pro Asn Asn Ala Asp
130 185 190
Gly Ser Pro Ala Ile Pro His Gly Ser Arg Val Lys Ile Arg Met Asp
195 200 205
Thr Pro Ser Gly Val Lys Asp Ser Ile Ser Ala Trp Ile Lys Phe Ser
PL 205 884 B1
210 215 220
Val Gin A.1 a Pro Gly Glu Ile Pro Phe Asn Gly Ile Tyr Tyr Aso Pro
225 230 235 240
Pro Glu Glu Glu Lys Tyr Val Phe Gin His Pro Gin Pro Lys Arg Pro
245 250 255
Giu Ser Leu Arg Ile Tyr Glu Ser His Ile Gly Met Ser Ser Pro Glu
250 265 270
Pro Lys Ile A.sn Ser Tyr Ala Asn Phe Arg Asp Glu Val Leu Pro A.rg
275 280 285
Ile Lys Arg Leu Gly Tyr Asn Ala Val Gin Ile Met Ala Ile Gin Glu
290 295 300
His Ser Tyr Tvr Ala Ser Phe Gly Tyr His Val Thr Asn Phe Phe Ala
305 310 315 320
Pro Ser Ser Arg Phe Gly Thr Pro Glu Asp Leu Lys ser Leu Ile Asp
325 330 335
Arg Ala His Glu Leu Gly Leu Ile Val Leu Met Asp Ile Val His Ser
340 345 350
His Ser Ser Asn Asn Thr Leu Asp Gly Leu Asn Gly Phe Asp Gly Thr
355 360 365
Asp Thr His Tyr Phe His Gly Gly Pro Aro Gly His His Trp Met Trp
370 375 380
Asp Ser Arg Leu Phe Asn Tyr Gly Ser Trp Glu Val Leu Arg Phe Leu
385 390 395 400
Leu Ser Asn Ala Arg Trp Trp Leu Glu Glu Tyr Lys Phe Asp Gly Phe
405 410 415
Arg Phe Asp Gly Val Thr Ser Met Met Tyr Thr His His Gly Leu Gin
420 425 430
Met Thr Phe Thr Gly Asn Tyr Gly Glu Tyr Phe Gly Phe Ala Thr Asp
435 440 445
val Asp Ala Val Val Tyr Leu Met Leu Val Asn Asp Leu Ile His Gly
450 455 460
Leu His Pro Asp Ala val Ser Ile Gly Glu Asp Val Ser Gly Met Pro
PL 205 884 B1
465
470
475
430
Thr Phe Cys Ile Pro Val Pro Asp Gly Gly Val Gly Leu As? Tyr Arg 435 450 495
Leu His Met Ala Val Ala Asp Lys Trp Ile Glu Leu Leu Lys Gin Ser 500 505 510
A.sp Glu Ser Trp Lys Met Gly Asp Ile Val His Thr Leu Thr Asn Arg 515 520 525
Arg Trp Leu Glu Lys Cys Val Thr Tyr Ala Glu Ser His Asp Gin ila 530 535 540
Leu Val Gly Asp Lys Thr Ile Ma Phe Trp Leu Met Asp Lys Asp Met 545 550 555 560
Tyr Asp Phe Met Ala Leu Asp Arg Pro Ser Thr Pro Arg Ile Asp Arg . 565 570 575
Gly Ile Ala Leu His Lys Met Ile Arg Leu Val Thr Met Gly Leu Gly
580 585 5 = 0
Gly Glu Gly Tyr Leu Asn Phe Met Gly Asn Glu Phe Gly His Pro Glu 595 600 605
Trp Ile Asp Phe Pro Arg Gly Pro Gin Thr Leu Pro Thr Gly Lys Val 610 615 620
Leu Pro Gly Asn Asn Asn Ser Tyr Asp Lys Cys Arg Arg Arg Phe Asp
525 630 635 640
Leu Gly Asp Ala Asp Phe Leu Arg Tyr His Gly Met Gin Glu Phe Asp
645 650 655
Gin Ala Met Gin His Leu Glu Glu Lys Tyr Gly Phe Met Thr Ser Glu 660 665 670
His Gin Tyr Val Ser Arg Lys His Glu Glu Asp Lys Val Ile Ile Phe 675 680 685
Glu Arg Gly Asp Leu Val Phe Val Phe Asn Phe His Trp Ser Asn Ser 690 695 700
Phe Phe Asp Tyr Arg Val Gly Cys Ser Arg Pro Gly Lys Tyr Lys Val 705 710 715 720
Ala Leu Asp Ser Asp Asp Ala Leu Phe Gly Gly Phe Ser Arg Leu Asp
PL 205 884 B1
725 73C 725
His Asp Val A.sp Tyr Phe Thr Thr Glu His Pro His Asp A.sn Arg Pro
740 745 750
A.rg Ser Phe Ser Val Tyr Thr Pro Ser Arg Thr Ala Val Val Tyr Ala
755 760 765
Leu Thr Glu
770
<210> 13
<211> 797
<212> PRT
<213> Zea mays
<400> 12 ·
Ser Cys Ala Gly Ala Pro Gly Lys Val Leu Val Pro Gly Gly Gly Ser
1 5 15
Asp Asp Leu Leu Ser Ser Ala Glu Pro Val Val Asp Thr Gin Pro Glu
20 25 30
Glu Leu Gin Ile Pro Glu Ala Glu Leu Thr Val Glu Lys Thr Ser ser
35 40 45
Ser Pro Thr Gin Thr Thr Ser Al a Val A.la Glu Ala Ser Ser Gly Val
50 55 60
Glu Ala Glu Glu Arg Pro Glu Leu Ser Ser Glu Val Ile Gly val Gly
65 70 75 80
Gly Thr Gly Gly Thr Lys Ile Asp Gly Ala Gly Ile Lys Ala Lys Ala
85 90 95
Pro Leu Val Glu Glu Lys Pro Arg Val Ile Pro Pro Pro Gly Asp Gly
100 105 110
Gin Arg Ile Tyr Glu Ile A.sp Pro Mer Leu Glu Gly Phe Arg Gly His
115 120 125
Leu Asp Tyr Arg Tyr Ser Glu Tyr Lys A.rg Leu Arg Ala Ala Ile Asp
130 135 140
Gin His Glu Gly Gly Leu Asp Ala Phe Ser Arg Gly Tyr Glu Lys Leu
145 150 155 160
PL 205 884 B1
Gly Phe Thr Arg Ser 165 Ala Glu Gly Ile Thr 170 Tyr A.rg Glu Trp Ala 175 Pro
Gly Ala Tyr Ser Ala Ala Leu Val Gly Asp Phe Asn Asn Tr? Asn Pro
180 135 190
Asn Ala Asp Ala Met Ala A.rg Asn Glu Tyr Gly Val Trp Glu Ile Phe
195 200 205
Leu Pro Asn Asn Ala Asp Gly Ser Pro Ala Ile Pro His Gly Ser Arg
210 215 220
Val Lys Ile Arg Met Asp Thr Pro Ser Gly Val Lys Asp Ser Ile Pro
225 230 235 240
Ala Trp Ile Lys Phe Ser Val Gin Ala Pro Gly Glu Ile Pro Tyr Asn
245 250 255
Gly Ile Tyr Tyr Asp Pro Pro Glu Glu Glu Lys Tyr Val Phe Lys His
260 255 270
Pro Gin Pro Lys Arg Pro Lys Ser Leu Arg Ile Tyr Glu Ser His Val
275 280 285
Gly Met Ser Ser Pro Glu Pro Lys Ile Asn Thr Tyr Ala A.sr. Phe Arg
290 295 300
Asp Glu Val Leu Pro Arg Ile Lys Lys Leu Gly Tyr Asn Ala Val Gin
305 310 315 320
Ile Met Ala Ile Gin Glu His Ser Tvt Tyr Ala Ser Phe Gly Tyr His
325 330 335
Val Thr Asn Phe Phe Ala Pro Ser Ser Arg Phe Gly Thr Pro Glu Asp
340 345 350
Leu Lys Ser Leu Ile Asp Lys Ala His Glu Leu Gly Leu Leu Val Leu
355 360 365
Met Asp Ile Val His Ser His Ser Ser Asn Asn Thr Leu Asp Gl y Leu
370 375 380
Asn Gly Phe Asp Gly Thr A.sp Thr HAS Tyr Phe His Gly Gly Pro Arg
385 390 395 400
Gly His His Trp Met Trp Asp Ser Arg Leu Phe Asn Tyr Gly Ser Trp
405 410 415
PL 205 884 B1
Glu val Leu Arg 420 Phe Leu Leu Ser Asn 425 Ala Arg Trp Trp Leu 430 C-iu Glu
Tyr Lys Phe 435 Asp Gly Phe Arg Phe 440 Asp Gly Val Thr Ser 445 Met Met Tyr
Thr His 450 His Gly Leu Gir. Val 455 Thr Phe Thr Gly Asn 460 Tyr Gly Glu Tyr
Phe 4 65 Gly Phe Ala Thr Asp 470 Val Asp Ala Val Val 475 Tyr Leu Met Leu Val 480
Asn Asp Leu Ile Arg 485 Gly Leu Tyr Pro Glu 490 Ala Val Ser Ile C-ly 495 Glu
Asp Val Ser Gly 500 Met Pro Thr Phe Cys 505 Ile Pro Val Gin Asp 510 Gly Gly
Val Gly Phe 515 Asp Tyr Arg Leu His 520 Met Ala Val Pro Asp 525 i»ys Trp Ile
Glu Leu 530 Leu Lys Gin Ser Asp 535 Glu Tyr Trp Glu Met 540 Gly Asp Ile Val
His 545 Thr Leu Thr Asn Arg 550 Arg Trp Leu Glu Lys 555 Cys Val Thr Tyr Cys 560
Glu Ser His Asp Gin 565 Ala Leu Val Gly Asp 570 Lys Thr Ile Ala Phe 575 Trp
Leu Met Asp Lys 590 Asp Met Tyr Asp Phe 585 Met Ala Leu Asp Arg 590 Pro Ser
Thr Pro Arg 595 Ile Asp Arg Gly Ile 600 Ala Leu His Lys Met 605 Ile Arg Leu
Val Thr 610 Met Gly Leu Gly Gly 615 Glu Gly Tyr Leu Asn 620 Phe Met Gly Asn
Glu 625 Phe Gly His Pro Glu 630 Trp Ile Asp Phe Pro 635 Arg Gly Pro Gin Ser 540
Leu Pro Asn Gly Ser 645 Val Ile Pro Gly Asn 650 Asn Asn Ser Phe Asp 655 Lys
Cys Arg Arg Arg Phe Asp Leu Gly Asp Ma Asp Tyr Leu Arg Tyr Arg
6S0 665 670
PL 205 884 B1
Gly Met Gin Glu Phe Asp Gin Ala Met C-in His Leu Glu Gly Lys Tyr
675 680 685
Glu Phe Met Thr Ser Asp His Ser m,. — Vai Ser Arg Lys His Glu Glu
690 695 700
Asp Lys Val Ile Ile Phe Glu Arg Gly Asp Leu Val Phe Val Phe Asn
705 710 715 720
Phe His Trp Ser Asn Ser Tyr Phe Asp Tyr Arg Val Gly Cys Phe Lys
725 730 735
Pro Gly Lys Tvr Lys Ile Val Leu Asp Ser Asp Asp Gly Leu Phe Gly
740 745 750
Gly Phe Ser Arg Leu Asp His Asp Ala Glu Tyr Phe Thr Ala Asp Trp
755 760 765
Pro His Asp Asn Arg Pro Cys Ser Phe Ser Vai Tyr Ala Pro Ser Arg
770 775 7 8 0'
Thr Ala Val Val Tyr Ala Pro Ala Gly Al a Glu Asp Glu
7Β5 790 795 <210> 14 <211> 747 <212> PRT <213> Zea mays <400> 14
Ala Ala Ala Ala Ala Arg Lys Ala Val Met Val Pro Glu Gly Glu Asn
1 5 10 15
Asp Gly Leu Ala Ser Arg Ala Asp Ser Ala Gin Phe Gin Ser Asp Glu
20 25 30
Leu Glu Val Pro Asp Ile Ser Glu Glu Thr Thr Cys Gly -Ala Gly Val
35 40 45
Ala Asp Ala Gin Ala Leu Asn Arg Val Arg Val Val Pro Pro Pro Ser
50 55 60
Asp Gly Gin Lys Ile Phe Gin Ile Asp Pro Met Leu Gin Gly Tyr Lys
65 70 75 80
Tyr His Leu Glu Tyr Arg Tyr Ser Leu Tyr Arg Arg Ile Arg Ser Asp
90 95
PL 205 884 B1
Ile Asp Glu His Glu Gly Gly Leu 100
Lys Phe Gly Phe Asn Ala Ser Ala 115 120
Ala Pro Gly Ala Phe Ser Ala Ala 130 135
Asp Pro Asn Ala Asp Arg Met Ser 145 150
Ile Phe Leu Pro Asn Asn Ala Asp 165
Ser Arg Val Lys Val Arg Met Asp 180
Ile Pro Ala Trp Ile Lys Tyr Ser 195 200
Tyr Asp Gly Ile Tyr Tyr Asp Pro 210 215
Arg His ?i= Gin Pro Lys Arg Pro 225 230
His Val Gly Met Ser Ser Pro Glu 245
Phe Arg Asp Glu Val Leu Pro Arg 260
Val Gin Ile Met Ala Ile Gin Glu 275 280
Tyr His Val Thr Asn Phe Phe Ala 290 295
Glu Asp Leu Lys Ser Leu Ile Asp 305 310
Val Leu Met Asp Val Val His Ser 325
Gly Leu Asn Gly Phe Asp Gly Thr 340
Glu Ala Phe Ser Arg Ser Tyr Glu 105 110
Glu Gly Ile Thr Tyr Arg Glu Trp 125
Leu Val Gly Asp Val Asn Asn Trp 140
Lys Asn Glu Phe Gly Val Trp Glu 155 160
Gly Thr. Ser Pro Ile Pro His Gly 170 175
Thr Pro Ser Gly Ile Lys Asp Ser 185 190
Val Gin Ala Pro Gly Glu Ile Pro 205
Pro Glu Glu Val Lys Tyr Val Phe 220
Lys Ser Leu Arg Ile Tyr Glu Thr 235 . 240
Pro Lys Ile Asn Thr Tyr Val Asn 250 255
Ile Lys Lys Leu Gly Tyr Asn Ala 26S 270
His Ser Tyr Tyr Gly Ser Phe Gly 235
Pro Ser Ser Arg Phe Gly Thr Pro 300
Arg Ala His Glu Leu Gly Leu Leu 315 320
His Ala Ser Ser Asn Thr Leu Asp 330 335
Asp Thr His Tyr Phe His Ser Gly 345 350
PL 205 884 B1
Pro Arg Gly His His Trp Met Trp Asp Ser Arg Leu Phe Asn Tyr Gly 355 360 365
Asn Trp Glu Val Leu Arg Phe Leu Leu Ser Asn Ala Arg Trp Trp Leu 370 375 380
Glu Glu Tyr Lys Phe Asp Gly Phe Arg Phe Asp Gly Val Thr Ser Met
385 390 395 400
Met Tyr Thr His His Gly Leu Gin Val Thr Phe Thr Gly Asn Phe Asn
405 410 415
Glu Tyr Phe Gly Phe Ala Thr A.sp Val Asp Ala Val Val Tyr Leu Met 420 425 430
Leu Val Asn A.sp Leu Ile His Gly Leu Tyr Pro Glu Ala Val Thr Ile 435: 440 445
Gly Glu Asp Val Ser Gly Met Pro Thr Phe Ala Leu' Pro Val His Asp 450 455 460
Gly Gly Val Gly Phe Asp Tyr Arg Met His Met Ala Val Ala Asp Lys
465 470 475 480
Trp Ile Asp Leu Leu Lys Gin Ser Asp Glu Thr Trp Lys Met Gly Asp
485 490 495
Ile Val His Thr Leu Thr Asn Arg Arg Trp Leu Glu Lys Cys Val Thr 500 505 510
Tyr Ala Glu Ser His Asp Gin Ala Leu Val Gly Asp Lys Thr Ile Ala 515 520 525
Phe Trp Leu Met Asp Lys Asp Met Tyr A.sp Phe Met Ala Leu Asp Arg 530 535 540
Pro Ser Thr Pro Thr Ile Asp A.rg Gly Ile Ala Leu His Lys Met Ile
545 550 555 560
Arg Leu Ile Thr Met Gly Leu Gly Gly Glu Gly Tyr Leu Asn Phe Met
565 570 575
Gly Asn Glu Phe Gly His Pro Glu Trp Ile Asp Phe Pro Arg Gly Pro 580 585 590
Gin Arg Leu Pro Ser Gly Lys Phe Ile Pro Gly Asn Asn Asn Ser Tyr 595 600 605
PL 205 884 B1
Asp Lys 610 Cys Arg Arg Arg Phe 615 Asp Leu G1 y Asp Ala 62 0 Asp Tyr Leu Arg
Tyr His Gly Met Gin Glu Phe Asp Gin Ala Met Gin His Leu Glu C-ln
625 630 635 640
Lys Tyr Glu Phe Met Thr Ser Asp His Gin Tyr Ile Ser Arg Lys His
645 650 655
Glu Glu Asp Lys Val Ile Vai Phe Glu Lys Gly Asp Leu y&i Phe Val
660 665 670
Phe Asn Phe His Cys Asn Asn Ser Tyr Phe Asp Tyr Arg lis Gly Cys
675 680 685
Arg Lys Pro Gly Val Tyr Lys Val Val Leu Asp Ser Asp Ala Gly Leu
690 695 700
Phe Gly Gly Phe Ser Arg Ile His His Al a Ma G1U His Phe Thr Ma
705 710 715 720
Asp Cys Ser His Asp Asn Arg Pro Tyr Ser Phe Ser Val Tvr Thr Pro
725 730 735
Ser Arg Thr Cys Vai Val Tyr Ala Pro Vai Glu
740 745 <210> 15 <211> 50 <212> PRT <213> Hordeum vulgare <400> 15
Asn Asp Leu Gly Ile Trp Glu Ile Phe Leu Pro Asn Asn Ma Asp Gly
1 5 10 15
Ser Pro Pro Ile Pro His Gly Ser Arg Val Lys Val Arg Met Asp Thr
20 25 30
Pro Ser Gly Thr Lys Asp Ser Ile Pro Ma Trp Ile Lys Phe Ser Val
35 40 45
Gin Ala 50
PL 205 884 B1 <210> 16 <211> 50 <212> PRT <213> Hordeum vulgare
<400> 16 Asn Ala Asp 15 Gly
As? 1 Asp Tyr Gly Val 5 Trp Glu Ile Phe Leu 10 Pro Asn
Ser Pro Ala Ile Pro His Gly Ser Arg Val Lys Ile Arg Met Asp Thr
20 25 30
Pro Ser Gly Val Lys Asp Ser Ile Ser .Ala Trp Ile Lys Phe Ser Val
40 45
Gin Ala 50 <210> 17 <211> 760 <212> PRT
<213> 0ry2a <400> 17 sati ,va
Ala 1 Ala Gly Ala Ser 5 Gly Glu Val Met Ile 10 Pro Glu Gly Glu Ser 15 Asp
Gly Met Pro val 20 ser Ala Gly Ser Asp 25 Asp Leu Gin Leu Pro 30 Ala Leu
Asp Asp Glu 35 Leu Ser Thr Glu Val 40 Gly Ala Glu Val Glu 45 Ile Glu Ser
Ser Gly 50 Ala Ser Asp val Glu 55 Gly Val Lys Arg Val 60 Val Glu Glu Leu
Ala 65 Ala Glu Gin Lys Pro 70 Arg Val Val Pro Pro 75 Thr Gly Asp Gly Gin 80
Lys Ile Phe Gin Met 85 Asp ser Met Leu Asn 50 Gly Tyr Lys Tyr His 95 Leu
Glu Tyr Arg Tyr 100 Ser Leu Tyr Arg Arg 105 Leu Arg Ser Asp Ile 110 Asp Gin
Tyr Glu Gly 115 Gly Leu Glu Thr Phe 120 Ser Arg Gly Tyr Glu 125 Lys Phe Gly
PL 205 884 B1
Phe Asn 130 His Ser Ala Glu Gly Vai Thr 135 Tyr Arg Glu 140 Trp Al a Pro Gly
Ala 145 His Ser Ala Ala Leu 150 Val Gly Asp Fhe Asn 155 Asn Trp Asn Pro Asn 160
Ala Asp Arę Met Ser 165 Lys Asn Glu Phe Gly 170 Val Trp Glu Ile Phe 175 Leu
Pro Asn Asn Ala Asp 180 Gly Ser Ser Pro 185 Ile Pro His Gly Ser 190 Arg Val
Lys Val Arg 195 Met Glu Thr Pro Ser Gly 200 Ile Lys Asp Ser 205 Ile Pro Ma
Trp Ile 210 Lys Tyr Ser Val Gin Ala Ala 215 Gly Glu Ile 220 Pro Tyr Asn Gly
Ile 225 Tyr Tyr Asp Pro Pro 230 Glu Glu Glu Lys Tyr 235 Ile Phe Lys His Pro 240
Gir. Pro Lys Arg Pro 245 Lys Ser Leu Arg Ile 250 Tyr Glu Thr His Val 255 Gly
Met Ser Ser Thr Glu 260 Pro Lys Ile Asn 255 Thr Tyr Ala Asn Phe 270 Arg Asp
Glu Val Leu 275 Pro Arg Ile Lys Lys Leu 280 Gly Tyr Asn Ala 285 Val Gin Ile
Met Ala 290 Ile Gin Glu His Ala Tyr Tyr 295 Gly Ser Phe 300 Gly Tyr His Val
Thr 305 Asn Phe Phe Ala Pro 310 Ser Ser Arg Phe Gly 315 Thr Pro Glu Asp Leu 320
Lys Ser Leu Ile Asp 325 Lys Ala His Glu Leu 330 Gly Leu Val Val Leu 335 Met
Asp Val Val His Ser 340 His Ala Ser Asn 345 Asn Thr Leu Asp Gly 350 Leu Asn
Gly Phe Asp 355 Gly Thr Asp Thr His Tyr 360 Phe His Ser Gly 365 Ser Arg Gly
His His Trp Met Trp Asp Ser Arg Leu Phe Asn Tyr Gly Asn Trp Glu
370 375 380
PL 205 884 B1
Val Leu Arg Phe Leu Leu Ser Asn Ala Arg Trp Trp Leu Glu Glu Tyr
385 390 395 400
Lys Phe Asp Gly Phe Arg Phe Asp Gly Val Thr Ser Met Met Tyr Thr
405 410 415
His His Gly Leu Gin Val Ala Phe Thr Gly Asn Tyr Ser Glu Tyr Phe 420 425 430
Gly Phe Ala Thr Asp Ala Asp Ala Val Val Tyr Leu Met Leu Val Asn 435 440 445
Asp Leu Ile His Gly Leu Tyr Pro Glu Ala Ile Thr Ile Gly Glu Asp 450 455 460
Val Ser Gly Met Pro Thr Phe Ala Leu Pro Val Gin Asp Gly Gly Val
465 . 470 475 480
Gly Phe Asp Tyr Arg Leu His Met Ala Val Pro Asp Lys Trp Ile Glu
485 490 495
Leu Leu Lys Gin Ser Asp Glu Ser Trp Lys Met Gly Asp Ile Val His 500 505 510
Thr Leu Thr Asn Arg Arg Trp Ser Glu Lys Cys Val Thr Tyr Ala Glu 515 520 525
Ser His Asp Gin Ala Leu Val Gly Asp Lys Thr Ile Ala Phe Trp Leu 530 535 540
Met Asp Lys Asp Met Tyr Asp Phe Met Ala Leu Asp Arg Pro Ala Thr
545 550 555 560
Pro Ser Ile Asp Arg Gly Ile Ala Leu His Lys Met Ile Arg Leu Ile
565 570 575
Thr Met Gly Leu Gly Gly Glu Gly Tyr Leu Asn Phe Met Gly Asn Glu 580 585 590
Phe Gly His Pro Glu Trp Ile Asp Phe Pro Arg Ala Pro Gin Val Leu 595 600 605
Pro Asn Gly Lys Phe Ile Pro Gly Asn Asn Asn Ser Tyr Asp Lys Cys 610 615 620
Arg Arg Arg Phe Asp Leu Gly Asp Ala Asp Tyr Leu Arg Tyr Arg Gly 625 630 635 640
PL 205 884 B1
Met Leu Glu Phe Asp 645 Arg Ala Met
Phe Met Thr Ser 660 Asp His Gin Tyr
Lys Met Ile 675 Ile Phe Glu Lys Gly 680
His Trp 690 Ser Asn Ser Tyr Phe 695 A.sp
Gly 705 Lys Tyr Lys Val Val 710 Leu Asp
Phe Gly Arg Ile His 725 His Thr Ala
His Asp Asn Arg 740 Pro Tyr Ser Phe
Cys Val Val Tyr Ala Pro Ala Glu
155 160
Gin Ser 65 0 Leu Glu Glu Lys Tyr 655 Gly
Ile 665 Ser Arg Lys His Glu 670 Glu Asp
A.sp Leu Val Phe Val 685 Phe Asn Phe
Tyr Arg Val Gly 700 Cys Leu Lys Pro
Ser Asp Ala 715 Gly Leu Phe Gly Gly 720
Glu His 730 Phe Thr Ala A.sp Cys 735 Ser
Ser 745 Val Tyr Ser Pro Ser 750 Arg Thr
<210> 18 <211> 844 <212> PRT
<213 !> Oryra sativa
<400> 18 Val Glu 1 1 Ala Glu Arg 5 Gly Gly Cys
Ala Gly Glu Met 20 Ala Ala Pro Ala
Gly Leu Aj?g 35 .Ala Gly Ala Val Arg 40
Ser Trp 50 Arg Ala Ala Ala Glu 55 Leu
Gly 65 Arg Arg Phe Pro Gly 70 Ala Val
Val Ala Val Arg Ala Ala Gly Ala
Arg Gly Ile Arg Ser Gly Cys Gly 10 15
Ser Ala Val Pro Gly Ser .Ala Ala 25 30
Phe Pro Val Pro Ala Gly Ala Arg 45
Pro Thr Ser Arg Ser Leu Leu Ser SO
Arg Val Gly Gly Ser Gly Gly Arg 75 80
Ser Gly Glu Val Met Ile Pro Glu
PL 205 884 B1
85 90 55
Gly Glu Ser Asp Gly Met Pro Val Ser Ala Gly Ser Asp Asp Leu Gin
100 105 110
Leu Pro Ala Leu Asp Asp Glu Leu Ser Thr Glu val Gly Ala Glu Val
115 120 125
Glu Ile Glu Ser Ser Gly Ala Ser Asp Val Glu Gly Val Lys Arg Val
130 135 140
Val Glu Glu Leu Ala Ala Glu Gin Lys Pro Arg Val Val Pro Pro Thr
145 150 155 150
Gly Asp Gly Gin Lys Ile Phe Gin Met Asp Ser Met Leu Asn Gly Tyr
165 170 175
Lys Tyr His leu Glu Tyr Arg Tyr Ser Leu Tyr Arg Arg Leu Arg Ser
180 185 190
Asp Ile Asp Gin Tyr Glu Gly Gly Leu Glu Thr Phe Ser Arg Gly Tyr
195 200 205
Glu Lys Phe Gly Phe Asn His Ser Ala Glu Gly Val Thr Tyr Arg Glu
210 215 220
Trp Ala Pro Gly A-L a His Ser Ala Ala Leu Val Gly Asp Phe Asn Asn
225 230 235 240
Trp Asn Pro Asn Ala Asp Arg Met Ser Lys Asn Glu Phe Gly Val Trp
245 250 255
Glu Ile Phe Leu Pro Asn Asn Ala Asp Gly Ser Ser Pro Ile Pro His
260 265 270
Gly Ser Arg Val Lys Val Arg Met Glu Thr Pro Ser Gly Ile Lys Asp
275 230 285
Ser Ile Pro Ala Trp Ile Lys Tyr Ser Val Gin Ala Ala Gly Glu Ile
290 295 300
Pro Tyr Asn Gly Ile Tyr Tyr Asp Pro Pro Glu Glu Glu Lys Tyr Ile
305 310 315 320
Phe Lys His Pro Gin Pro Lys Arg Pro Lys Ser Leu Arg Ile Tyr Glu
325 330 335
Thr His val Gly Met Ser Ser Thr Glu Pro Lys Ile Asn Thr Tyr Ala
PL 205 884 B1
340 345 250
Asn Phe Arg Asp Glu fal Leu Pro Arg Ile Lys Lys Leu Gly Tyr Asn
355 360 365
Ala fal Gin Ile Met Ala Ile Gin Glu His Ala Tyr Tyr Gly Ser Phe
370 375 380
Gly Tyr His fal Thr Asn Phe Phe ?la Pro Ser Ser Arg Phe Gly Thr
385 390 395 400
Pro Glu Asp Leu Lys Ser Leu Ile Asp Lys Ala His Glu Leu Gly Leu
405 410 415
fal fal Leu Met Asp Val fal His Ser His Ala Ser Asn Asn Thr Leu
420 425 430
Asp Gly Leu .Asn Gly Phe Asp Gly Thr Asp Thr His Tyr Phe His Ser
435 440 445
Gly Ser Arg Gly His His Trp Met Trp Asp Ser Arg Leu Phe Asn Tyr
450 455 460
Gly Asn Trp Glu fal Leu Arg Phe Leu Leu Ser Asn Ala Arg Trp Trp
465 470 475 480
Leu Glu Glu Tyr Lys Phe Asp Gly Phe Arg Phe Asp Gly fal Thr Ser
485 490 495
Met Met Tyr Thr His His Gly Leu Gin fal Ala Phe Thr Gly Asn Tyr
500 505 510
Ser Glu Tyr Phe Gly Phe Ala Thr Asp Ala Asp Ala fal fal Tyr Leu
515 520 525
Met Leu Val Asn Asp Leu Ile His Gly Leu Tyr Pro Glu Ala Ile Thr
530 535 540
Ile Gly Glu Asp Val Ser Gly Met Pro Thr Phe Ala Leu Pro fal Gin
545 550 555 560
Asp Gly Gly fal Gly Phe Asp Tyr Arg Leu His Met Ala fal Pro Asp
565 570 575
Lys Trp Ile Glu Leu Leu Lys Gin Ser Asp Glu Ser Trp Lys Met Gly
580 585 590
Asp Ile fal His Thr Leu Thr Asn Arg Arg Trp Ser Glu Lys Cys fal
PL 205 884 B1
595 600 605
Thr Tyr Ala Glu Ser His Asp Gin Ala Leu Val Gly Asp Lys Thr Ile
610 615 620
Ala Phe Trp Leu Met Asp Lys Asp Met ΓΤ». » r- Asp Phe Met Ala Leu Asp
525 630 53 5 640
Arg Pro Ala Thr Pro Ser Ile Asp Arg Gly Ile Ala Leu His Lys Met
645 650 655
Ile Arg Leu Ile Thr Met Gly Leu Gly Gly Glu Gly Tyr Leu Asn Phe
660 665 670
Met Gly Asn Glu Phe Gly His Pro Glu Trp Ile Asp Phe Pro Arg Ala
675 680 685
Pro Gin Val .Leu Pro Asn Gly Lys Phe 7 1 λ Pro Gly Asn Asn Asn Ser
690 695 700
Tyr Asp Lys Cys Arg Arg Arg Phe Asp Leu Gly Asp Ala Asp Tyr Leu
705 710 715 720
Arg Tyr Arg Gly Met Leu Glu Phe Asp Arg Ala Met Gin Ser Leu Glu
725 730 735
Glu Lys Tyr Gly Phe Met Thr Ser Asp His Gin Tyr Ile Ser Arg Lys
740 745 750
His Glu Glu Asp Lys Met Ile Ile Phe Glu Lys Gly Asp Leu Val Phe
755 7 60 765
Val Phe Asn Phe His Trp Ser Asn Ser Tyr Phe Asp Tyr Arg Val Gly
770 775 780
Cys Leu Lys Pro Gly Lys Tyr Lys Val Val Leu Asp Ser Asp Ala Gly
785 790 795 800
Leu Phe Gly Gly Phe Gly Arg Ile His His Thr Ala Glu His Phe Thr
805 310 815
Ala Asp Cys Ser His Asp Asn Arg Pro Tyr Ser Phe Ser Val Tyr Ser
820 825 330
Pro Ser Arg Thr Cys Val Val Tyr Ala Pro Ala Glu
835 840
PL 205 884 B1 <210> 19 <211> 857 <212> PRT <213> Pisum sativum <400> 19
Lys Val Leu Ile Pro Glu Asp Gin Asp Asn Ser Val Ser Leu Ala Asp 15 10 15
Gin Leu Glu A.sn Pro Asp Ile Thr Ser Glu Asp Ala Gin Asn Leu Glu 20 25 30
Asp Leu Thr Met. Lys Asp Gly Asn Lys Tyr Asn Ile Asp Glu Ser Thr 35 40 45
Ser Ser Tyr Arg Glu Val Gly A.sp Glu Lys Gly Ser Val Thr Ser Ser 50 55 60
Ser Leu Val Asp Val A.sn Thr Asp Thr Gin Ala Lys Lys Thr Ser Val 65 70 . 75 80
His Ser Asp Lys Lys Val Lys Val Asp Lys Pro Lys Ile Ile Pro Pro 85 90 95
Pro Gly Thr Gly Gin Lys Ile Tyr Glu Ile Asp Pro Leu Leu Gin Ala 100 105 110
His Arg Gin His Leu Asp Phe Arg Tyr Gly Gin Tyr Lys Arg Ile Arg 115 120 125
Glu Glu Ile Asp Lys Tyr Glu Gly Gly Leu Asp Ala Phe Ser Arg Gly 130 135 140
Tyr Glu Lys Phe Gly Phe Thr Arg Ser Ala Thr Gly Ile Thr Tyr Arg
145 150 155 160
Glu Trp Ala Pro Gly Ala Lys Ser Ala Ala Leu Val Gly A.sp Phe A.sn
165 170 175
Asn Trp Asn Pro Asn Ala Asp Val Met Thr Lys Asp Ala Phe Gly Val 180 185 190
Trp Glu Ile Phe Leu Pro Asn Asn Ala A.sp Gly Ser Pro Pro Ile Pro 195 200 205
His Gly Ser Arg Val Lys Ile His Met A.sp Thr Pro Ser Gly Ile Lys 210 215 220
PL 205 884 B1
Asp 225 Ser Ile Pro Ma Trp 230 Ile Lys Phe Ser Val 235 Gin Ala Pro Gly Glu 240
Ile Pro Tyr Asn Gly Ile Tyr Tyr Asp Pro Pro Glu Glu Glu Lys Tyr
245 250 255
Val Phe Lys His Pro Gin Pro Lys Arg Pro Gin Ser Ile Arg Ile Tyr
2S0 265 270
Glu Ser His Ile Gly Met Ser Ser Pro Glu Pro Lys Ile Asn Thr Tyr
275 280 285
Ala Asn Phe Arg Asp Asp Val Leu Pro Arg Ile Lys Lys Leu Gly Tyr
290 295 300
Asn Ala Val Gin Ile Met Ma Ile Gin Glu His Ser Tyr Tyr Ma Ser
305 310 315 320
Phe Gly Tyr His Val Thr Asn Phe Phe Ala Pro Ser Ser Arg Phe Gly
325 330 335
Thr Pro Glu Asp Leu Lys Ser Leu Ile A.sp Arg Ala His Glu Leu Gly
340 345 350
Leu Leu Val Leu Met Asp Ile Val His Ser His Ser Ser Asn Asn Thr
355 360 365
Leu Asp Gly Leu Asn Met Phe Asp Gly Thr Asp Gly His Tyr Phe His
370 375 380
Pro Gly Ser Arg Gly Tyr His Trp Met Trp Asp Ser Arg Leu Phe Asn
385 390 395 400
Tyr Gly Ser Trp Glu Val Leu Arg Tyr Leu Leu Ser Asn Ma Arg Trp
405 410 415
Trp Leu Asp Glu Tyr Lys Phe Asp Gly Phe Arg Phe Asp Gly Val Thr
420 425 430
Ser Met Met Tyr Thr His His Gly Leu Gin Val Ser Phe Thr Gly Asn
435 440 445
Tyr Ser Glu Tyr Phe Gly Leu Ma Thr Asp Val Glu Ala Val Vai Tyr
450 455 460
Met Met Leu Val Asn Asp Leu Ile Hrs Gly Leu Phe Pro Glu Ala Val
455 470 475 480
PL 205 884 B1
Ser Ile Gly Glu Asp 485 Val Ser C-ly Met Pro 490 Thr Phe Cys Leu Pro 495 Thr
Gin A.sp Gly Gly 500 Ile Gly Phe Asn Tyr 505 Arg Leu His Met Ala 7al 510 Ala
Asp Lys Trp 515 Ile Glu Leu Leu Lys 520 Lys Gin Asp Glu Asp 525 Trp Arg Met
Gly Asp 530 Ile Val His Thr Leu 535 Thr Asn Arg Arg Trp 540 Leu Glu Lys Cys
Val 545 Val Tyr Ala Glu Ser 550 His Asp Gin Ala Leu 555 Val Gly Asp Lys Thr 560
Leu Ala Phe Trp Leu 565 Met Asp Lys Asp Met 570 Tyr Asp Phe Met Ala 575 Leu
Asp Arg Pro Ser 580 Thr Pro Leu Ile Asp 585 Arg Gly Ile Ala Leu His 590 Lys
Met Ile Arg 595 Leu Ile Thr Met Gly 600 Leu Gly Gly Glu Gly 605 Tyr Leu Aisn
Phe Met 610 Gly Asn Glu Phe Gly 615 His Pro Glu Trp Ile 620 Asp Phe Pro Arg
Gly 625 Glu Gin His Leu Pro 630 Asn Gly Lys Ile Val 635 Pro Gly A.sn A.sn Asn 640
Ser Tyr Asp Lys Cys 645 Arg Arg Arg Phe Asp 650 Leu Gly Asp Ala Asp 655 Tyr
Leu Airg Tyr His 660 Gly Met Gin Glu Phe 665 Asp Arg Ala Met Gin His 6* o Leu
Glu Glu Arg 675 Tyr Gly Phe Met Thr 630 Ser Glu His Gin Tyr 685 Ile Ser Arg
Lys Asn 690 Glu Gly Asp Arg Val 695 Ile Ile Phe Glu Arg 700 Asp A.sn Leu Val
Phe 705 Val Phe Asn Phe His 710 Trp Thr Asn Ser Tyr 715 Ser Asp Tyr Lys Val 720
Gly Cys Leu Lys Pro 725 Gly Lys Tyr Lys Ile 730 Val Leu Asp Ser Asp 735 Asp
PL 205 884 B1
Thr Leu Phe Gly 740 Gly Phe Asn Arg Leu 745 Asn His Thr Ala Glu 750 Tyr Phe
Thr Ser Glu Gly Trp Tyr Asp Asp Arg Pro Arg Ser Phe Leu Val Tyr
755 760 765
Ala Pro Ser Aro Thr Ma Val Val Tyr Ma Leu Ma Asp Gly Val Glu
770 775 780
Ser Glu Pro Ile Glu Leu Ser Asp Gly Val Glu Ser Glu Pro Ile Glu
785 790 795 800
Leu Ser Val Gly Val Glu Ser Glu Pro Ile Glu Leu Ser V al Glu Glu
805 810 315
Ala Glu Ser Glu Pro Ile Glu Arg Ser Val Glu Glu Val Glu Ser Glu
320 825 830
Thr Thr Gin Gin Ser Val Glu Val Glu Ser Glu Thr Thr Gin Gin Ser
835 340 845
Val Glu Val Glu Ser Glu Thr Thr Gin
850 855 <210> 20 <211> 779 <212> PRT <213> Solanum tuberosum <400> 20
Thr 1 Met Ma Pro Leu 5 Glu Glu Asp Val Lys 10 Thr Glu Asn Ile Gly 15 Leu
Leu Asn Leu Asp 20 Pro Thr Leu Glu Pro 25 Tyr Leu Asp His Phe 30 Arg His
Arg Met Lys 35 Arg Tyr Val Asp Gin 40 Lys Met Leu Ile Glu 45 Lys Tyr Glu
Gly Pro 50 Leu Glu Glu Phe Ala 55 Gin G1 y Tyr Leu Lys 60 Phe Gly Phe Asn
Arg 65 Glu Asp Gly Cys Ile 70 Val Tyr Arg C-lu Trp 75 Ma Pro Ma Ala Gin 80
Glu Asp Glu Val Ile 85 Gly Asp Phe Asn Gly 90 Trp Asn Gly Ser Asn 95 His
PL 205 884 B1
PL 205 884 B1
Leu Tyr Val His His Gly Ile Asn Met Gly Phe Thr Gly Asn Tyr A.sn 355 360 365
Glu Tyr Phe Ser Glu Ala Thr Asp Val Asp .Ala Val Val Tyr Leu Met 370 375 380
Leu Ala Asn Asn Leu Ile His Lys Ile Phe Pro Asp Ala Thr Val Ile
385 390 395 400
Ala Glu Asp Val Ser Gly Met Pro Gly Leu Gly Arg Pro Val Ser Glu
405 410 415
Gly Gly Ile Gly Phe Asp Tyr Arg Leu .Ala Met Ala Ile Pro Asp Lys 420 425 430
Trp Ile Asp Tyr Leu Lys Asn Lys Asn Asp Glu Asp Trp Ser Met Lys 435 . 440 445
Glu Val Thr Ser Ser Leu Thr Asn Arg A.rg Tyr Thr Glu Lys Cys Ile 450 455 460
Ala Tyr Ala Glu Ser His Asp Gin Ser Ile Val Gly Asp Lys Thr Ile
465 470 475 480
Ala Phe Leu Leu Met Asp Lys Glu Met Tyr Ser Gly Met Sar Cys Leu
485 490 495
Thr Asp Ala Ser Pro Val Val Asp Arg Gly Ile Ala Leu His Lys Met 500 505 510
Ile His Phe Phe Thr Met Ala Leu Gly Gly Glu Gly Tyr Leu Asn Phe 515 520 525
Met Gly Asn Glu Phe Gly His Pro Glu Trp Ile Asp Phe Pro Arg Glu 530 535 540
Gly Asn Asn Trp Ser Tyr Asp Lys Cys A.rg Arg Gin Trp Asn Leu Ala
545 550 555 560
Asp Ser Glu His Leu Arg Tyr Lys Phe Met Asn Ala Phe Asp .Arg Ala
565 570 575
Met Asn Ser Leu Asp Glu Lys Phe Ser Phe Leu Ala Ser Gly Lys Gin 580 585 590
Ile Val Ser Ser Met Asp Asp Asp Asn Lys Val Val Val Phe Glu Arg 595 600 605
PL 205 884 B1
Gly Asp 610 Leu Val Phe Val Phe 615 Asn Phe His Prc Lys 620 Asn Thr Tyr Glu
Gly Tyr Lys Val Gly Cys Asp Leu Pro G1V Lys Tyr Arg Val ?la Leu
625 630 635 540
Asp Ser Asp Ala Trp Glu Phe Gly Gly His Giy Arg Thr Gly His Asp
645 650 655
Val Asp His Phe Thr Ser Pro Glu Gly Ile ?ro Gly Val Pro Glu Thr
660 665 670
Asn Phe Asn Gly Arg Gin Ile Pro Ser Lys Cys Cys Leu Leu Arg Glu
675 680 685
His Val Trp Leu Ile Thr Glu Leu Met Asn Ala Cys Gin Lys Leu Lys
690 695 700
Ile Thr Arg Gin Thr Phe Val Val Ser Tvr Tv~ Gin Gin Pro Ile Ser
705 710 715 720
Arg Arg Val Thr Arg Asn Leu Lys Ile Arg Tyr Leu Gin Ile Ser Val
725 730 735
Thr Leu Thr Asn Ala Cys Gin Lys Leu Lys Phe Thr Arg Gin Thr Phe
740 745 750
Leu Val Ser Tyr Tyr Gin Gin Pro Ile Leu Arg Arg Val Thr Arg Lys
755 760 765
Leu Lys Asp Ser Leu Ser Thr Asn Ile Ser Thr
770 775
<210> 21 <211> 762 <212> PRT <213> Triticum aestivum <400> 21
Thr Met Ala Thr Ala Glu Asp Gly Val Gly Asp 10 Leu Pro Ile Tyr 15 Asp
1 5
Leu Asp Pro Lys Phe Ala Gly Phe Lys Glu His Phe Ser Tyr Arg Met
20 25 30
PL 205 884 B1
Lys Lys Tyr 35 Leu Asp Gin Lys His 40 Ser Ile Glu Lys His 45 Glu Gly Gly
Leu Glu Glu Phe Ser Lys Gly Tyr Leu Lys Phe Gly Ile Asn Thr Glu
50 55 60
Asn Asp Ala Thr Val Tyr Arg Glu Trp Ma Pro Ma Al a Met Asp Ma
65 70 75 80
Gin Leu Ile Gly Asp Phe Asn Asn Trp Asn Gly Ser Gly His Arg Met
B5 90 95
Thr Lys Asp Asn Tyr Gly Val Trp Ser Ile Arg Ile Ser His Val Asn
100 105 110
Gly Lys Pro Ala Ile Pro His Asn Ser Lys Val Lys Phe Arg Phe His
115 120 125
Arg Gly Asp Gly Leu Trp Val Asp Arg Val Pro Ma Trp Ile Arg Tyr
130 135 140
Ala Thr Phe Asp Ala Ser Lys Phe Gly Ala Pro Tyr Asp Gly Val His
145 150 155 160
Trp Asp Pro Pro Ser Gly Glu Arg Tyr Val Phe Lys His Pro Arg Pro
165 170 175
Arg Lys Pro Asp Ala Pro Arg Ile Tyr Glu Ma His Val Gly Met Ser
180 185 190
Gly Glu Lys Pro Glu Vai Ser Thr Tyr Arg Glu Phe Ma Asp Asn Val
195 200 205
Leu Pro Arg Ile Lys Ala Asn Asn Tyr Asn Thr Val Gin Leu Met Ma
210 215 220
Ile Met Glu His Ser Tyr Tyr Ala Ser Phe Gly Tyr His Val Thr Asn
225 230 235 240
Phe Phe Ala Val Ser Ser Arg Ser Gly Thr Pro Glu Asp Leu Lys Tyr
245 250 255
Leu Val Asp Lys Ala His Ser Leu Gly Leu Arg Val Leu Met Asp Val
260 265 270
Val His Ser His Ala Ser Ser Asn Lys Thr Asp Gly Leu Asn Gly Tyr
275 280 285
PL 205 884 B1
Asp Val Gly Gin Asn Thr Gin Glu Ser Tyr Phe His Thr Gly Glu Arg 290 295 300
Gly Tyr His Lys Leu Trp Asp Ser Arg Leu Phe Asn Tyr Ala Asn Trp
305 310 315 320
Glu Val Leu Arg Phe Leu Leu Ser A.sn Leu Arg Tyr Trp Met Asp Glu
325 330 335
Phe Met Phe Asp Gly Phe Arg Phe Asp Gly Val Thr Ser Met Leu Tyr 340 345 350
Asn His His Gly Ile A.sn Met Ser Phe Ala Gly Ser Tyr Lys Glu Tyr 355 360 365
Phe Gly Leu Asp Thr Asp Val Asp Ala Val Val Tyr Leu Met Leu Ala 370 375 380
Asn 385 His Leu Met His Lys 390 Leu Leu Pro Glu Ala 395 Thr Val Val Ala Glu 400
Asp Val Ser Gly Met 405 Pro Val Leu Cys A.rg 410 Ser Val Asp Glu Gly 415 Gly
Val Gly Phe Asp 420 Tyr Arg Leu Ala Met 425 Ala Ile Pro Asp Arg 430 Trp Ile
AlSD Tyr Leu 435 Lys Asn Lys Asp Asp 440 Leu Glu Trp Ser Met 445 Ser Gly Ile
Ala His 450 Thr Leu Thr Asn Arg 455 Arg Tyr Thr Glu Lys 460 Cys Ile Ala Tyr
Ala 465 Glu Ser His Asp Gin 470 Ser Ile Val Gly Asp 475 Lys Thr Met Ala Phe 480
Leu Leu Met Asp Lys 485 Glu Met Tyr Thr G1 y 490 Met Ser Asp Leu Gin 495 Pro
Ala Ser Pro Thr 500 Ile Asp Arg Gly Ile 505 Ala Leu Gin Lys Met 510 Ile His
Phe Ile Thr 515 Met Ala Leu Gly Gly 520 Asp Gly Tyr Leu Asn 525 Phe Met Gly
Asn Glu 530 Phe Gly His Pro Glu 535 Trp Ile A.sp Phe Pro 540 Arg Glu Gly Asn
PL 205 884 B1
Asn 545 Trp Ser Tyr Asp Lys 550 Cys Arg Arg Gin Trp 555 Ser Leu Ala Asp Ile 560
Asp His Leu Arg Tyr Lys Tyr Met Asn Ala Phe Asp Gin Ala Met Asn
565 570 575
Ala Leu Asp Asp Lys Phe Ser Phe Leu Ser Ser Ser Lys Gin Ile Val
580 585 590
Ser Asp Met Asn Glu Glu Lys Lys Ile Ile Val Phe Glu Arg Gly Asp
595 600 605
Leu Val Phe Val Phe Asn Phe His Pro Ser Lys Thr Tyr Asp Gly Tyr
610 615 620
Lys Val Gly Cys Asp Leu Pro Gly Lys Tyr Lys Val Ala Leu Asp Ser
625 630 635 640
Asp Ala Leu Met Phe Gly Gly His Gly Arg Val Ala His Asp Asn Asp
645 650 655
His Phe Thr Ser Pro Glu Gly Val Pro Gly Val Pro Glu Thr Asn Phe
660 665 670
Asn Asn Arg Pro Asn Ser Phe Lys Ile Leu Ser Pro Ser Arg Thr Cys
675 680 685
Val Ala Tyr Tyr Arg Val Glu Glu Lys Ala Glu Lys Pro Lys Asp Glu
690 695 700
Gly Ala Ala Ser Trp Gly Lys Thr Ala Leu Gly Tyr Ile Asp Val Glu
705 710 715 720
Ala Thr Gly Val Lys Asp Ala Ala Asp Gly Glu Ala Thr Ser Gly Ser
725 730 735
Glu Lys Ala Ser Thr Gly Gly Asp Ser Ser Lys Lys G1 y Ile Asn Phe
740 745 750
Val Phe Leu Ser Pro Asp Lys Asp Asn Lys
755 760 <210> 22 <211> 703 <212> PRT <213> Triticum aestivum
PL 205 884 B1 <400> 22
Ser Pro Pro Thr Leu Thr Ser Pro 1 5
Thr Met Leu Cys Leu Ser Ser Ser 20
Ala Asp Arg Pro Leu Pro Gly Ile 35 40
Arg Leu Ser Val Val Pro Ser Val 50 . 55
Pro Arg Lys Ala Lys Ser Lys Ser 65 70
Asn Lys Ile Ala Ala Thr Thr Gly i 35
Tyr Asp Leu Asp Leu Lys Leu Ala 100
Thr Arg Asn Arg Tyr Ile Glu Gin 115 120
Gly Ser Leu Glu Glu Phe Ser Lys 130 135
Thr Glu His Gly Ala Ser Val Tyr 145 - 150
Glu Ala Gin Leu Val Gly Asp Phe 165
Lys Met Ala Lys Asp Asn Phe Gly 180
Val Asn Gly Lys Pro Ala Ile Pro 195 200
Phe Arg His His Gly Val Trp Val 210 215
Tyr Ala Thr Val Thr Ala Ser Glu 225 230
His Trp Asp Pro Pro Ser Ser Glu 245
Pro Pro Ser Ala Val Pro Ser Thr 10 15
Leu Leu Pro Arg Pro Ser Ala Ala 25 30
Ile Ala Gly Gly Gly Gly Gly Lys 45
Pro Phe Leu Leu Arg Trp Leu Trp 60
Phe Val Ser Val Thr Ma Arg Gly 75 80
Tyr Gly Ser Asp His Leu Pro Ile 90 95
Glu Phe Lys ASp His Phe Asp Tyr 105 110
Lys His Leu Ile Glu Lys His Glu 125
Gly Tyr Leu Lys Phe Gly Ile Asn 140
Arg Glu Trp Ma Pro Ma Ma Glu 155 160
Asn. Asn Trp Asn Gly Ser Gly His 170 175
Val Trp Ser Ile Arg Ile Ser His 185 190
His Asn Ser Lys Val Lys Phe Arg 205
Glu Gin Ile Pro Ma Trp Ile Arg 220
Ser Gly Ala Pro Tyr Asp Gly Leu 235 240
Arg Tyr Val Phe Asn His Pro Arg 250 255
PL 205 884 B1
Pro Pro Lys Pro Asp Val Pro Arg Ile Tyr Glu Ala His Val Gly Val
260 265 270
Ser Gly Gly Lys Leu Glu Ala Gly Thr Tyr Arg Glu Phe Pro Asp Asn
275 280 285
Val Leu Pro Cys Leu Arg Ala Thr Asn Tyr Asn Thr Val Gin Leu Met
290 295 300
Gly Ile Met Glu His Ser Asp Ser Ala Ser Phe Gly Tyr His Val Thr
305 310 315 320
Asn Phe Phe Ala Val Ser Ser Arg Ser Gly Thr Pro Glu Asp Leu Lys
325 330 335
Tyr Leu Ile Asp Lys Ala His Ser Leu Gly Leu Arg Val Leu Met Asp
340 345 350
Val Vai His Ser His Ala Ser Asn Asn Val Ile Asp' Gly Leu Asn Gly
355 360 365
Tyr Asp Val Gly Gin Ser Ala His Glu Ser Tyr Phe Tyr Thr Gly Asp
370 375 380
Lys Gly Tyr Asn Lvs Met Trp Asn Gly Arg Met Phe Asn Tyr Ala Asn
385 390 395 400
Trp Glu Val Leu Arg Phe Leu Leu Ser Asn Leu Arg Tyr Trp Met Asp
405 410 415
Glu Phe Met Phe Asp Gly Phe Arg Phe Val Gly Val Thr Ser Met Leu
420 425 430
Tyr Asn His Asn Gly Ile Asn Met Ser Phe Asn Gly Asn Tyr Lys Asp
435 440 445
Tyr Ile Gly Leu Asp Thr Asn Val Asp Ala Phe Val Tyr Met Met Leu
450 455 460
Ala Asn His Leu Met His Lys Leu Phe Pro Glu Ala Ile Val Val Ala
465 470 475 480
Val Asp Val Ser Gly Met Pro Val Leu Cys Trp Pro Val Asp Glu Gly
4S5 490 495
Gly Leu Gly Phe Asp Tyr Arg Gin Ala Met Thr Ile Pro Asp Arg Trp
500 505 510
PL 205 884 B1
Ile Asp Tyr 515 Leu Glu Asn Lys Gly 520 Asp Gin Gin Trp Ser 525 Met Ser Ser
Val Ile Ser Gin Thr Leu Thr Asn Arg Arg Tyr Pro Glu Lys Phe Ile
530 535 540
Ala Tyr Ala Glu Arg Gin Asn His Ser Ile Ile Gly Ser Lys Thr Met
545 550 555 560
Ala Phe Leu Leu Met Glu Trp Glu Thr Tyr Ser Gly Met Ser Ma Met
565 570 575
Asp Pro Asp Ser Pro Thr Ile Asp Arg Ala Ile Ala Leu Gin Lys Met
580 585 590
Ile His Phe Ile Thr Met Ala Phe Gly Gly Asp Ser Tyr Leu Lys Phe
595 - 600 605
Met Gly Asn Glu Tyr Met Asn Ala Phe Val Gin Ala Vai Asp Thr Pro
610 615 620
Ser Asp Lys Cys Ser Phe Leu Ser Ser Ser Asn Gin Thr Ma Ser His
625 630 535 640
Met Asn Glu Glu Glu Lys Gly Ser Ala Leu Thr Lys Gly Tyr Thr His
645 650 655
Leu Arg Ser Gly Cys Phe Asp Pro Ser Leu Pro Ser Thr Ser Ser Cys
650 665 570
Ala Phe Leu Gly Pro Ser Asn Gin Ser Pro Phe Ser Lys Pro Phe Ile
675 680 685
Gly Phe Pro Gly Cys Ile Phe Cys Cys Gly Leu Phe Lys Gly Glu
690 695 700 <210> 23 <211> 752 <212> PRT <213> Zea mays <400> 23
Thr Met Ma Thr Ma Lys Gly Asp Val Asp His Leu Pro Ile Tyr Asp
1 5 10 15
Leu Asp Pro Lys Leu Glu Ile Phe Lys Asp Has Phe Arg Tyr Arg Met
PL 205 884 B1
20 25 30
Lys Arg Phe Leu Glu Gin Lys Gly Ser Ile Glu Glu Asn Glu Gly Ser
35 40 45
Leu Glu Ser Phe Ser Lys Gly Tyr Leu Lys Phe Gly Ile Asn Thr Asn
50 55 60
Glu Asp Gly Thr Val Tyr Arg Glu Trp Ala Pro Ala Ala Gin Glu Ala
65 70 75 80
Glu Leu Ile Gly Asp Phe Asn Asp Trp Asn Gly Ala Asn His Lys Met
85 90 95
Glu Lys Asp Lys Phe Gly Val Trp Ser Ile Lys Ile Asp His Val Lys
100 105 110
Gly Lys Pro Ala Ile Pro His Asn Ser Lys Val Lys Phe Arg Phe Leu
115 120 125
His Gly Gly Val Trp Val Asp Arg Ile Pro Ala Leu Ile Arg Tyr Ala
130 135 140
Thr Val Asp Ala Ser Lys Phe Gly Ala Pro Tyr Asp Gly Val His Trp
145 150 155 160
Asp Pro Pro Ala Ser Glu Arg Tyr Thr Phe Lys His Pro Arg Pro Ser
165 170 175
Lys Pro Ala Ala Pro Arg Ile Tyr Glu Ala His Val Gly Met Ser Gly
180 185 190
Glu Lys Pro Ala Val Ser Thr Tyr Arg Glu Phe Ala Asp Asn Val Leu
195 200 205
Pro Arg Ile Arg Ala Asn Asn Tyr Asn Thr Val Gin Leu Met Ala Val
210 215 220
Met Glu His Ser Tyr Tyr Ala Ser Phe Gly Tyr His Val Thr Asn Phe
225 230 235 240
Phe Ala Val Ser Ser Arg Ser Gly Thr Pro Glu Asp Leu Lys Tyr Leu
245 250 255
Val Asp Lys Ala His Ser Leu Gly Leu Arg Val Leu Met Asp Val Val
260 265 270
His Ser His Ala Ser Asn Asn Val Thr Asp Gly Leu Asn Gly Tyr Asp
PL 205 884 B1
275 280 285
Val Gly Gin Ser Thr Gin Glu Ser Tyr Phe His Ala Gly A.sp Arg Gly
290 295 300
Tyr His Lys Leu Trp Asp Ser A.rg Leu Phe Asn Tyr Ala A.sn X -. Glu
305 310 315 320
Val Leu Arg Phe Leu Leu Ser Asn Leu Arg Tyr Trp Leu A.sp C-lu Phe
325 330 335
Met Phe Asp Gly Phe Arg Phe Asp Gly Val Thr Ser Met Leu Tyr His
340 345 350
His His Gly Ile Asn Val Gly Phe Thr Gly Asn Tyr Gin Glu Tyr Phe
355 360 365
Ser Leu Asp Thr Ala Val Asp Ala Val Val Tyr Met Met Leu Ala Asn
370 375 380
His Leu Met His Lys Leu Leu Pro Glu Ala Thr Val Val Ala Glu Asp
385 390 395 400
Val Ser Gly Met Pro Val Leu Cys Arg Pro Val Asp Glu Gly Gly Val
405 410 415
Gly Phe Asp Ty z Arg Leu Ala Met Ala Ile Pro Asp Arg Trp Ile Asp
420 425 430
Tyr Leu Lys Asn Lys Asp Asp Ser Glu Trp Ser Met Gly Glu Ile Ala
435 440 445
His Thr Leu Thr Asn Arg A.rg Tyr Thr Glu Lys Cys Ile Ala Tyr Ala
450 455 460
Glu Ser His Asp Gin Ser Ile Val Gly Asp Lys Thr Ile Ala Phe Leu
465 470 475 480
Leu Met Asp Lys Glu Met Tyr Thr Gly Met Ser Asp Leu Gin Pro Ala
485 490 495
Ser Pro Thr Ile Asp Arg Gly Ile Ala Leu Gin Lys Met Ile His Phe
500 505 510
Ile Thr Met Ala Leu Gly Gly Asp Gly Tyr Leu Asn Phe Met Gly Asn
515 520 525
Glu Phe Gly His Pro Glu Trp Ile Asp Phe Pro Arg Glu Gly Asn Asn
PL 205 884 B1
530 535
Trp Ser Tyr Asp Lys Cys Arg Arg 545 550
His Leu Arg Tyr Lys Tyr Met Asn 565
Leu Asp Glu Arg Phe Ser Phe Leu 580
Asp Met Asn Asp Glu Glu Lys Val 595 600
Val Phe Val Phe Asn Phe His Pro 610 615
Val Gly Cys Asp Leu Pro Gly Lys 625 630
Ala Leu Val Phe Gly Gly His Gly 645
Phe Thr Ser Pro Glu Gly Val Pro 660
Asn Arg Pro Asn Ser Phe Lys Val 675 680
Ala Tyr Tyr Arg Vai Asp Glu Ala 690 695
Lys Ala Glu Thr Gly Lys Thr Ser 705 710
Ala Ser Arg Ala Ser Ser Lys Giu 725
Lys Lys Gly Trp Lys Phe Ala Arg 740
540
Gin Trp Ser Leu Val Asp Thr Asp 555 560
Ala Phe Asp Gin Ala Met Asn Ala 570 575
Ser Ser Ser Lys Gin Ile Val Ser 585 590
Ile Val Phe Glu Arg Gly Asp Leu 605'
Lys Lys Thr Tyr Glu Gly Tyr Lys 620
Tyr Arg Val Ala Leu Asp Ser Asp 635 640
Arg Val Gly His Asp Vai Asp His 650 655
Gly Val Pro Glu Thr Asn Phe Asn 665 670
Leu Ser Pro Pro Arg Thr Cys Val 685
Gly Ala Gly Arg Arg Leu His Ala 700
Pro Ala Glu Ser Ile Asp Val Lys - 715 720
Asp Lys Glu Ala Thr Ala Gly Gly 730 735
Gin Pro Ser Asp Gin Asp Thr Lys 745 750 <210> 24 <211> 756 <212> PRT
PL 205 884 B1 <213> Oryza sativa <400> 24
Thr 1 Met Val Thr Val 5 Val Glu Glu Val Asp 10 His Leu Pro Ile Tyr 15 Asp
Leu Asp Pro Lys 20 Leu Glu Glu Phe Lys 25 Asp His Phe Asn Tyr 30 Arg Ile
Lys Arg Tyr 35 Leu Asp Gin Lys Cys 40 Leu Ile Glu Lys His 45 Glu Gly Gly
Leu Glu 50 C-lu Phe Ser Lys Gly 55 Tyr Leu Lys Phe Gly 60 Ile Asn Thr Val
Asp 65 Gly Ala Thr Ile Tyr 70 Arg Glu Trp Ala Pro 75 Ala Ala Gin Glu Ala 80
Gin Leu Ile Gly Glu 85 Phe Asn Asn Trp Asn 90 Gly Ala Lys His Lys 95 Met
Glu Lys Asp Lys 100 Phe Gly Ile Trp Ser 105 Ile Lys Ile Ser His 110 Val Asn
Gly Lys Pro 115 Ala Ile Pro His Asn 120 Ser Lys Val Lys Phe 125 Arg Phe Arg
His Gly 130 Gly Gly Ala Trp Val 135 Asp Arg Ile Pro Ala 140 Trp Ile Arg Tyr
Ala 145 Thr Phe Asp Ala Ser 150 Lys Phe Gly Ala Pro 155 Tyr Asp Gly Val His 160
Trp Asp Pro Pro Ala 165 Cys Glu Arg Tyr Val 170 Phe Lys His Pro Arg 175 Pro
Pro Lys Pro Asp 180 Ala Pro Arg Ile Tyr 185 Glu Ala His Val Gly 190 Met Ser
Gly Glu Glu 195 Pro Glu Val Ser Thr 200 Tyr Glu Phe Ala 205 Asp Asn Val
Leu Pro 210 Arg Ile_ Arg Ala Asn 215 Asn Tyr Asn Thr Val 220 Gin Leu Met Ala
Ile 225 Met Glu His Ser Tyr 230 Tyr Ala Ser Phe Gly 235 Tyr His Val Thr Asn 240
PL 205 884 B1
Phe Phe Ala Val Ser Ser Arg Ser Gly Thr Pro Glu Asp Leu Lys Tyr 245 250 255
Leu Val Asp Lys Ala His Ser Leu Gly Leu Arg Val Leu Met Asp Val 2S0 265 270
Val His Ser His Ala Ser Asn Asn Val Thr Asp Gly Leu Asn Gly Tyr 275 280 285
Asp Val Gly Gin Asn Thr His Glu Ser Tyr Phe His Thr Gly Asp Arg 290 295 300
Gly Tyr His Lys Leu Trp Asp Ser Arę Leu Phe Asn Tyr Ala Asn Trp 305 310 315 320
Glu Val Leu A.rg Phe Leu Leu Ser Asn Leu Arg Tyr Trp Met Asp Glu . 325 330 335
Phe Met Phe Asp Gly Phe Arg Phe Asp Gly Val Thr Ser Met Leu Tyr
340 345 . · ; 350
His His His Gly Ile Asn Lys Gly Phe Thr Gly Asn Tyr Lys Glu Tyr 355 360 365
Phe Ser Leu Asp Thr Asp Val Asp Ala Ile Val Tyr Met Met Leu Ala 370 375 380
Asn His Leu Met His Lys Leu Leu Pro Glu Ala Thr Ile Val Ala Glu
385 390 395 400
Asp Val Ser Gly Met Pro Val Leu Cys Arg Pro Val Asp Glu Gly Gly
405 410 415
Val Gly Phe Asp Phe Arg Leu Ala Met Ala Ile Pro Asp Arg Trp Ile 420 425 430
Asp Tyr Leu Lys Asn Lys Glu Asp Arg Lys Trp Ser Met Ser Glu Ile 435 440 445
Val Gin Thr Leu Thr Asn Arg Arg Tyr Thr Glu Lys Cys Ile Ala Tyr 450 455 460
Ala Glu Ser His Asp Gin Ser Ile Val Gly Asp Lys Thr Ile Ala Phe
465 470 475 480
Leu Leu Met Asp Lys Glu Met Tyr Thr Gly Met Ser Asp Leu Gin Pro
485 490 495
PL 205 884 B1
PL 205 884 B1
Glu Asp Cys Lys 755 <210> 25 <211> 762 <212> PRT <213> Pisum sativum <400> 25
Thr 1 Met Pro Ser Val 5 Glu Glu Asp Phe Glu 10 Asn Ile Gly Ile Leu 15 Asn
Val Asp Ser Ser Leu Glu Pro Phe Lys Asp His Phe Lys Tyr Arg Leu
20 25 30
Lys Arg Tyr Leu His Gin Lys Lys Leu Ile Glu Glu Tyr Glu Gly Gly
35 - 40 45
Lau Gin Glu Phe Ala Lys Gly Tyr Leu Lys Phe Gly Phe Asn Arg Glu
50 55 60
Glu Asp Gly Ile Ser Tyr Arg Glu Trp Ala Pro Ala Ala Gin Glu Ala
65 70 75 80
Gin Ile Ile Gly Asp Phe Asn Gly Trp Asn Gly Ser Asn Leu His Met
85 90 95
Glu Lys Asp Gin Phe Gly Val Trp Ser Ile Gin Ile Pro Asp Ala Asp
100 105 110
Gly Asn Pro Ala Ile Pro His Asn Ser Arg Val Lys Phe Arg Phe Lys
115 120 125
His Ser Asp Gly Val Trp Val Asp Arg Ile Pro Ala Trp Ile Lys Tyr
130 135 140
Ala Thr Val Asp Pro Thr Arg Phe Ala Ala Pro Tyr Asp Gly Val Tyr
145 150 155 ISO
Trp Asp Pro Pro Leu Ser Glu Arg Tyr Gin Phe Lys His Pro Arg Pro
165 170 175
Pro Lys Pro Lys Ala Pro Arg Ile Tyr Glu Ala His Val Gly Met Ser
180 185 190
Ser Ser Glu Pro Arg Ile Asn Ser Tyr Arg Glu Phe Ala Asp Asp Val
195 200 205
PL 205 884 B1
Leu Pro 210 Arg Ile Arg Glu Asn 215 Asn Tyr Asn Thr Val 220 Gin Leu Met PI a
Val 225 Met Glu His Ser Tyr 230 Tyr Ala Ser Phe Trp 235 Tyr His Val Thr Lys 240
Pro Phe Phe Al a Val 245 Ser Ser Arg Ser Gly 250 Ser Pro Glu Asp Leu 255 Lys
Tyr Leu Ile Asp 260 Lys Ala His Ser. Leu 265 Gly Leu Asn Val Leu 270 Met Asp
Val Ile His 275 Ser His Ala Ser Asn 280 Asn Val Thr Asp Gly 285 Leu Asn Gly
Phe Asp 290 Val Gly Gin Ser Ser 295 Gin Gin Ser Tyr Phe 300 His Ala Gly Asp
Arg 305 Gly Tyr His Lys Leu 310 Trp Asp Ser Arg Leu 315 Phe’ Asn Tyr Asn 320
Trp Lys Ser Ser Phe 325 Leu Leu Ser Asn Leu 330 Arg Trp Trp Leu Glu 335 Glu
Tyr Lys Phe Asp 340 Gly Phe Arg Phe Asp 345 Gly Val Thr Ser Met 350 Leu Tyr
His His His 355 Gly Ile Asn Met Ala 360 Phe Thr Gly Asp Tyr 365 Asn Glu Tyr
Phe Ser 370 Glu Glu Thr Asp Val 375 Asp Ala Val Val Tyr 380 Leu Met Leu Ala
Asn 385 Ser Leu Val His Asp 390 Ile Leu Pro Asp Ala 395 Thr Asp Ile Ala Glu 400
Asp Val Ser Gly Met 405 Pro Gly Leu Gly Arg 410 Pro Val Ser Glu Val 415 Gly
Ile Gly Phe Asp 420 Tyr Arg Leu Ala Met 425 Ala Ile Pro Asp Lys 430 Trp Ile
Asp Tyr Leu 435 Lys Asn Lys Lys Asp 440 Ser Glu Trp Ser Met 445 Lys Glu Ile
Ser Leu 450 Asn Leu Thr Asn Arg 455 Arg Tyr Thr Glu Lys 460 Cys Val Ser Tyr
PL 205 884 B1
Ala Glu Ser His Asp Gin Ser Ile 465 470
Leu Leu Met Asp Glu Glu Met Tyr 435
Leu Ser Pro Thr Ile Glu Arg Gly 500
Phe Ile Thr Leu Ala Leu Gly Gly 515 520
Asn Glu Phe Gly His Pro Glu Trp
530 535
Gly Trp Ser Tyr Glu Lys Cys Arg
545 _ 550
Thr Asn His Leu Arg Tyr Lys Phe
565
Asn Leu Leu Asp Asp Lys Phe Ser 580
Val Ser Ser Thr Asn Asn Glu Asp 595 600
Asp Leu Val Phe Val Phe Asn Phe 610 615
Tyr Lys Val Gly Cys Asp Leu Pro 625 630
Ser Asp Ala Thr Glu Phe Gly Gly 645
Asp Gin Phe Thr Ser Pro Glu Gly 660
Phe Asn Asn A.rg Pro Asn Ser Phe 675 680
Cys Val Val Tyr Tyr Arg Val Asp 690 695
Pro Asn Leu Gly Ser Val Glu Glu 705 710
Val Gly Asp Lys Thr Ile Ala Phe 475 430
Ser Ser Met Ser Cys Leu Thr Met 490 495
Ile Ser Leu His Lys Met Ile His 505 510
Glu Gly Tyr Leu Asn Phe Met Gly 525
Ile Asp Phe Pro Arg Glu Gly Asn 540
Leu Thr Gin Trp Asn Leu Val Asp 555 560
Met Asn. Ala Phe'Asp Arg Ala Met 570 575
Ile Leu Ala Ser Thr Lys Gin Ile 585 590
Lys Val Ile Val Phe Glu Arg Gly 605
His Pro Glu Asn Thr Tyr Glu Gly 620
Gly Lys Tyr Arg Val Ala Leu Asp . 635 640
His Gly Arg Val Gly His Asp Ala 650 655
Ile Pro Gly Ile Pro Glu Thr Asn 665 670
Lys Val Leu Ser Pro Pro His Thr 685
Glu Arg Gin Glu Glu Ser Asn Asn 700
Thr Phe Ala Ala Ala Asp Thr Asp 715 720
PL 205 884 B1
Val AJ. 3 Arg Ile Pro 725 Asp Val Ser Met Glu 730 Ser Glu Asp Ser Asn 735 Leu
Asp Arg Ile Glu Asp Asn Ser Glu Asp Ala Val Asp Ala Gly Ile Leu
740 745 750
Lys Val Glu Arg Glu Val Val C-ly Asp Asn
755 760 !
<210> 26 <211> 984 <212> DNA <213> Triticum aestivum <400> 26
atatgtatga tttcatggct ctggatagac cttcaactcc tcgcattgat cgtggcatag 60
cattacataa aatgatcagg cttgtcacca tgggtttagg tggcgaagcc tatcttaact 120
tcatgggaaa tgagtttggg catcctgaat ggatągattt tccaagaggt ccgcaaactc 180
ttccaaccgg caaagttctc cctggaaata acaatagtta tgataaatgc cgccgtagat 240
ttgatcttgg agatgcagat tttcttagat atcgtggtat gcaagagtcc gaccaggoaa 300
tgcagcatct tgaggaaaaa tatgggttta tgacatctga gcaccagtat gtttcacgga 360
aacatgagga agataaggtg atcatcttcg aaagaggaga tttggtattc gttttcaact 420
tccaccggag caatagcttt tttgactacc gtgttgggtg ttccaggcct gggaagtaoa 480
aggtggcctt agactccgac gatgcactct ttggtggatt cagcaggctt gatcatgatg 540
tcgactactt cacaaccgaa catccgcatg aoaacaggcc gcgctctttc tcggtgtaca 600
ctccgagcag aactgcggto gtgtatgccc ttacagagta agaaccagca gctgcttgtt 660
acaaggcaaa gagagaactc cagagagctc gtggatcgtg agcgaagcga ogggcaacgg 720
cgcgaggccg ctctaagcgc catgactggg aggggatcgt gcctcttccc cagatgccag 730
gaggagcaga tggataggta gcttgttggt gagcgctcga aagaaaatgg acgggcctgg 840
gtgtttgtcg tgctgcacta ccctcctcct atcttgcaca ttcccggttg totttgtaca 900
tataactaat aattgcccgt gcgctcaacg taaacatata aatattctaa taataggtta 960
tcccgtgaaa aaaaaaaaaa aaaa 984
<210> 27 <211> 977 <212> DNA <213> Triticum aestivum <400> 27
atatgtatga tttcatggct ctggatagac cttcaactcc tcgcattgat cgtggcatag 60
cattacataa aatgatcagg cttgtcacca tgggtttagg tggcgaaggc tatcttaact 120
tcatgggaaa tgagtttggg catcctgaat ggatagattt tccaagaggt ccgcaaactc 180
ttccaaccgg caaagttctc cctggaaata acaatagtta tgataaatgc cgccgtagat 240
ttgatcttgg agatgcagat tttcttagat atcgtggtat gcaagagttc gaccaggoaa 300
tgcagcatct tgaggaaaaa tatgggttta tgacatctga gcaccagtat gtttcacgga 360
aacatgagga agataaggtg atcatcttcg aaagaggaga tttggtattt gttttcaact 420
PL 205 884 B1
tccactggag caatagcttt Łttgactacc gtgttgggtg ttccaagoct gggaagtaca 480
aggtggcctt agactccgac gatgoactct ttggtggatt cagcaggctt gatcatgatg 540
tcgactactt cacaaccgaa catccgoatg acaataggcc gcgctctttc ttggtgraca 600
crcctagcag aactgcggtc gtgtatgccc ttacagagta agaaccagca gcggcttgtt 6 60
acaaggcaaa gagagaactc cagggagctc gtggattgtg agcgaagcga cgggcaactg 720
cgogaggctg ctctaagcgc catgactggg acgggatcgt gcctcttcoc otgatgccag 780
gaggatcaga tggataggta gcttgttggt gagcgctcga aagaaaatgg aogggcctgg 840
gtgtttgtcg tgctgcactt aaccctcctc ctatgttgca cattccccgg tgtttttgta 900
catataacta ataattgccc gtgcgcttca acatgaacat ataaatattc tatataaaaa 960
aaaaaaaaaa aaaaaaa 977
<210> 23 <211> 212 <212> PRT <213> Triticum aestivum <400> .28 ·
Met Tyr Asp_Phe Met Ala Leu Asp Arg Pro Ser Thr Pro Arg Ile .Asp 15 10 15
Arg Gly Ile Ala Leu His Lys Met Ile Arg Leu Val Thr Met Gly Leu 20 25 30
Gly Gly Glu Gly Tyr Leu Asn Phe Met Gly Asn Glu Phe Gly His Pro 35 40 45
Glu Trp Ile Asp Phe Pro Arg Gly Pro Gin Thr Leu Pro Thr Gly Lys 50 55 60
Val Leu Pro Gly Asn Asn Asn Ser Tyr Asp Lys Cys Arg Arg Arg Phe 65 70 75 80
Asp Leu Gly Asp Ala Asp Phe Leu Arg Tyr Arg Gly Met Gin Glu Phe
90 95
Asp Gin Ala Met Gin His Leu Glu Glu Lys Tyr Gly Phe Met Thr Ser
100 105 110
Glu His Gin Tyr Val Ser Arg Lys His Glu Glu Asp Lys Val Ile Ile 115 120 125
Phe Glu Arg Gly Asp Leu Val Phe Val Phe Asn Phe His Trp Ser Asn 130 135 140
Ser Phe Phe Asp Tyr Arg Val Gly Cys Ser Lys Pro Gly Lys Tyr Lys
145 150 155 160
Val Ala Leu Asp Ser Asp Asp Ala Leu Phe Gly Gly Phe Ser Arg Leu
PL 205 884 B1
165 170 175
Asp His Asp Val 180 Asp Tyr Phe Thr Thr 1S5 Glu His Pro His Asp 190 Asn Arg
Pro Arg Ser Phe Leu Val Tyr Thr Pro Ser Arg Thr Ala Val Val Tyr
195 200 205
Ala Leu Thr Glu
210 <210> 29 <211> 212 <212> PRT <213> Zea mays
<400> 29 Phe Met 5 Ala Leu Asp Arg Pro 10 Ser Thr Pro Thr Ile 15 Asp
Met 1 Tyr Asp
Arg Gly Ile Ala 20 Leu His Lys Met Ile 25 A.rg Leu Ile Thr Met 30 Gly Leu
Gly Gly Glu 35 Gly Tyr Leu Asn Phe Met 40 Gly Asn Glu Phe 45 Gly His Pro
Glu Trp 50 Ile Asp Phe Pro Arg Gly Pro 55 Gin Arg Leu 60 Pro Ser Gly Lys
Phe 65 Ile Pro Gly Asn Asn 70 Asn Ser Tyr Asp Lys 75 Cys Arg Arg Arg Phe 80
Asp Leu Gly Asp Ala 85 Asp Tyr Leu Arg Tyr 90 His Gly Met Gin Glu 95 Phe
Asp Gin Ala Met 100 Gin His Leu Glu Gin 105 Lys Tyr Glu Phe Met 110 Thr Ser
Asp His Gin 115 Tyr Ile Ser Arg Lys His 120 Glu Glu Asp Lys 125 Val Ile Val
Phe Glu 130 Lys Gly Asp Leu Val Phe Val 135 Phe Asn Phe 140 His Cys Asn Asn
Ser Tyr Phe Asp Tyr Arg Ile Gly Cys Arg Lys Pro Gly Val Tyr Lys
145 150 155 160
PL 205 884 B1
Vai Val Leu Asp Ser 165 Asp Ala C-ly Leu Phe 170 Gly Gly Phe Ser Arg 175 Ile
His Kis Ala Ala 130 Glu His Phe Thr Ala 185 Asp Cys Ser His Asp 190 Asn Arg
Pro Tyr Ser 155 Phe Ser Val Tyr Thr 200 Pro Ser Arg Thr Cys 205 Val Val Tyr
A_L 3 Pro Val Glu
210 <210> 30 <211> 216 <212> PRT <213> Zea mays
<400> 30
Met Tyr Asp Phe Met Ala Leu Asp Arg Pro Ser Thr Pro Arg Ile Asp
1 5 10 15
Arg Gly Ile Ala Leu His Lys Met Ile Arg Leu Val Thr Met Gly Leu
20 25 30
Gly Gly Glu Gly Tyr Leu Asn Phe Met Gly Asn Glu Phe Gly His Pro
35 40 45
Glu Trp Ile Asp Phe Pro Arg Gly Pro Gin Ser Leu Pro Asn Gly Ser
50 55 60
Val Ile Pro Gly Asn Asn Asn ser Phe As p Lys Cys Arg Arg Arg Phe
65 70 75 80
Asp Leu Gly Asp Ala Asp Tyr Leu Arg Tyr Arg Gly Met Gin Glu Phe
85 90 95
Asp Gin Ala Met Gin His Leu Glu Gly Lys Tyr Glu Phe Met Thr Ser
100 105 110
Asp Kis Ser Tyr Phe Ser Arg Lys His Glu Glu Asp Lys Val Ile Ile
115 120 125
Phe Glu Arg Gly Asp Leu Val Phe Val Phe Asn Phe His Trp Ser Asn
130 135 140
Ser Tyr Phe Asp Tyr Arg Val Gly Cys Phe Lys Pro Gly Lys Tyr Lys
145 150 155 160
PL 205 884 B1
Ile Val Leu Asp Ser Asp Asp Gly Leu Phe Gly Gly Phe Ser Arg Leu 165 170 175
Asp His Asp Ala Glu Tyr Phe Thr Ala Asp Trp Pro His Asp Asn A.rg 180 185 150
Pro Cys Ser Phe Ser Val Tyr Ala Pro Ser A.rg Thr Ala 7al Val Tyr 195 200 205
Ala Pro Ala Gly Ala Glu Asp Glu 210 215 <210> 31 <211> 217 <212> DNA <213> Zea mays <400> 31
tagcggggta ctcgttgctg cgcggcatgt gtggcgctgt cgatgtgagg aaaaaccttc 60
ttccaaaacc ggcagatgca tgcatgcatg ctacaataag gttctgatac trtaatcgat 120
gctggaaagc ccatgcatct cgctgcgttg tcctctctat atatataaga ccttcaaggt 180
gtoaattaaa catagagttt tcgtttttcg ctttcct 217
<210> 32 <211> 686 <212> PRT <213> Triticum aestivum <400> 32
Met Leu Cys Leu Ser Ser Ser Leu Leu Pro Arg Pro Ser Ala Ala Ala
1 5 10 15
Asp Arg Pro Leu Pro Gly Ile Ile Ala Gly Gly Gly Gly Gly Lys Arg
20 25 30
Leu Ser Val Val Pro Ser Val Pro Phe Leu Leu Arg Trp Leu Trp Pro 35 40 45
Arg Lys Ala Lys Ser Lys Ser Phe Val Ser Val Thr Ala A.rg Gly Asn 50 55 60
Lys Ile Ala Ala Thr Thr Gly Tyr Gly Ser A.sp His Leu Pro Ile Tyr 65 70 75 80
Asp Leu Asp Leu Lys Leu Ala Glu Phe Lvs Asp His Phe Asd Tyr Thr ' 85 50 95
PL 205 884 B1
Arg Asn Ara Tyr 100 Ile Glu Gin Lys His 105 Leu Ile Glu Lys His 110 Glu Gly
Ser Leu Glu Glu Phe Ser Lys Gly Tyr Leu Lys Phe Gly Ile Asn Thr
115 120 125
Glu His Gly Ala Ser Val Tyr Arg Glu Trp .Ala Pro Ala Ala Glu Glu
130 135 140
Ala Gin Leu Val Gly Asp Phe Asn Asn Trp Asn Gly Ser Gly His Lys
145 150 155 160
Met Ala Lys Asp Asn Phe Gly Val Trp Ser Ile Arg Ile Ser His Val
165 170 175
Asn Gly Lys Pro Ala Ile Pro His Asn Ser Lys Vai Lys Phe Arg Phe
•180 185 190
Arg His His Gly Val Trp val Glu Gin Ile Pro Ala' Trp Ile Arg Tyr
195 200 205
Ala Thr Val Thr Ala Ser Glu Ser Gly Ala Pro Tyr Asp Gly Leu His
210 215 220
Trp Asp Pro Pro Ser Ser Glu Arg Tyr val Phe Asn His Pro Arg Pro
225 230 235 240
Pro Lys Pro Asp Val Pro Arg Ile Tyr Glu Ala His Val Gly Val Ser
245 250 255
Gly Gly Lys Leu Glu Ala Gly Thr Tyr Arg Glu Phe Pro Asp Asn Val
260 265 270
Leu Pro Cys Leu Arg Ala Thr Asn Tyr Asn Thr Val Gin Leu Met Gly
275 280 285
Ile Met Glu His Ser Asp Ser Ala Ser Phe Gly Tyr His Val Thr Asn
290 295 300
Phe Phe Ala Val Ser Ser Arg Ser Gly Thr Pro Glu Asp Leu Lys Tyr
305 310 315 320
Leu Ile Asp Lys Ala His Ser Leu Gly Leu Arg Val Leu Met Asp Val
325 330 335
Val His Ser His Ala Ser Asn Asn Val Ile Asp Gly Leu Asn Gly Tyr
340 345 350
PL 205 884 B1
Asp Val Gly 355 Gin Ser Ala His Glu 360 Ser Tyr Phe Tyr Thr 365 Gly Asp Lys
Gly Tyr 370 Asn Lys Met Trp Asn 375 Gly Arg Met Phe Asn 380 Tyr Ma Asn Trp
Glu 385 Val Leu Arg Phe Leu 390 Leu Ser Asn Leu Arg 395 Tyr Trp Met Asp Glu 400
Phe Met Phe Asp Gly 405 Phe Arg Phe Val Gly 410 Val Thr Ser Met Leu Tyr 415
Asn His Asn Gly 420 Ile Asn Met Ser Phe 425 Asn Gly Asn Tyr Lys 430 Asp Tyr
Ile Gly Leu 435 Asp Thr Asn Val Asp 440 Ala Phe Val Tyr Met 445 Met Leu Ala
Asn His 450 Leu Met His Lys Leu 455 Phe Pro Glu Ala Ile’ 460 Val Val Ma Val
Asp 465 Val Ser Gly Met Pro 470 Val Leu Cys Trp Pro 475 Val Asp Glu Gly Gly 480
Leu Gly Phe Asp Tyr 485 Arg Gin Ala Met Thr 490 Ile Pro Asp Arg Tr? Ile 495
Asp Tyr Leu Glu 500 Asn Lys Gly Asp Gin 505 Gin Trp Ser Met Ser 510 Ser Val
Ile Ser Gin 515 Thr Leu Thr Asn Arg 520 Arg Tyr Pro Glu Lys 525 Phe Ile Ma
Tyr Ala 530 Glu Arg Gin Asn His 535 Ser Ile Ile Gly Ser 540 Lys Thr Met Ma
Phe 545 Leu Leu Met Glu Trp 550 Glu. Thr Tyr Ser Gly 555 Met Ser .-Li 3 Met Asp 560
Pro Asp Ser Pro Thr 565 Ile Asp Arg Ala Ile 570 Ala Leu Gin Lys Met Ile 575
His Phe Ile Thr 580 Met Ala Phe Gly Gly 585 Asp Ser Tyr Leu Lys 590 Phe Met
Gly. Asn Glu Tyr Met Asn Ala Phe Val Gin Ala val Asp Thr Pro Ser
595 600 605
PL 205 884 B1
Asp Lys 610 Cys Ser Phe Leu Ser 615 Ser Ser Asn Gin Thr 620 Ala Ser His Met
Asn 625 Glu Glu Glu Lys Gly 630 Ser Al s Leu Thr Lys 635 C-ly Tyr Thr His Leu 640
Arg Ser Gly Cys Phe S45 Asp Pro Ser Leu Pro 650 Ser Thr Ser Ser Cys 655 Ala
Phe Leu Gly Pro 660 Ser Asn Gin Ser Pro 665 Phe Ser Lys Pro Phe 67 0 Ile Gly
Phe Pro Gly Cys Ile Phe Cys Cys Gly Leu Phe Lys Gly Glu
675 680 685 <210> 33 · <211> 830 <212> PRT <213> Triticum aestiwum <400> 33
Met 1 Leu Cys Leu Thr 5 Ala Pro Ser Cys Ser 10 Pro Ser Leu Pro Pro 15 Arg
Pro Ser Arg Pro 20 Ala Ala Asp Arg Pro 25 Gly Pro Gly Ile Ser 30 Gly Gly
Gly Asn Val 35 Arg Leu Ser Ala Val 40 Pro Ala Pro Ser Ser 45 Leu Arg Trp
Ser Trp 50 Pro Arg Lys Ala Lys 55 Ser Lys Phe Ser Val 60 Pro Val Ser Ala
Pro 65 Arg Asp Tyr Thr Met 70 Ala Thr Ala Glu Asp 75 Gly Val Gly Asp Leu 80
Pro Ile Tyr Asp Leu 85 Asp Pro Lys Phe Ala 90 Gly Phe Lys Glu His 95 Phe
Ser Tyr Arg Met 100 Lys Lys Tyr Leu Asp 105 Gin Lys His Ser Ile 110 Glu Lys
His Glu Gly 115 Gly Leu Glu Glu Phe 120 Ser Lys Gly Tyr Leu 125 Lys Phe Gly
Ile Asn Thr Glu Asn Asp Ala Thr Val Tyr Arg Glu Trp Ala Pro Ala
PL 205 884 B1
130
135
140
Ala Met Asp Ala Gin Leu Ile Gly Asp Phe Asn Asn Trp Asn Gly Ser
145 150 155 160
Gly Eis Arg Met Thr Lys Asp Asn Tyr Gly Val Trp Ser Ile Arg Ile
165 170 175
Ser His Val Asn Gly Lys Pro Ala Ile Pro His Asn Ser Lys Vai Lys 180 185 ISO
Phe Arg Phe His Arg Gly Asp Gly Leu Trp Val Asp Arg Val Pro Ala 195 200 205
Trp Ile Arg Tyr Ala Thr Phe Asp Ala Ser Lys Phe Gly Ala Pro Tyr 210 215 220
Asp Gly Val .His Trp Asp Pro Pro Ser Gly Glu Arg Tyr Val Phe Lys
225 230 235 240
His Pro Arg Pro Arg Lys Pro Asp Ala Pro Arg Ile Tyr Glu Ala His
245 250 255
Val Gly Met Ser Gly Glu Lys Pro Glu Val Ser Thr Tyr Arg Glu Phe 260 265 270
Ala Asp Asn Val Leu Pro Arg Ile Lys Ala Asn Asn Tyr Asn Thr Val 275 280 285
Gin Leu Met Ala Ile Met Glu His Ser Tyr Tyr Ala Ser Phe Gly Tyr 290 295 300
His Val Thr Asn Phe Phe Ala Val Ser Ser Arg Ser Gly Thr Pro Glu
305 310 ' 315 320
Asp Leu Lys Tyr Leu Val Asp Lys Ala His Ser Leu Gly Leu Arg Val
325 330 335
Leu Met Asp Val Val His Ser His Ala Ser Ser Asn Lys Thr Asp Gly 340 345 350
Leu Asn Gly Tyr Asp Val Gly Gin Asn Thr Gin Glu Ser Tyr Phe His 355 360 365
Thr Gly Glu Arg Gly Tyr His Lys Leu Trp Asp Ser Arg Leu Phe Asn 370 375 380
Tyr Ala Asn Trp Glu Val Leu Arg Phe Leu Leu Ser Asn Leu Arg Tyr
PL 205 884 B1
PL 205 884 B1
645 6 5 0 65 5
Lys Gin Ile Val Ser Asp MeC Asn Glu Glu Lys Lys Ile Ile Val Phe
660 665 670
Glu Arg Gly Asp Leu Val Phe Val Phe Asn Phe His Pro Ser Lys Thr
675 680 685
Tyr Asp Gly Tyr Lys Val Gly cys Asp Leu Pro Gly Lys Τ’, r . - J Lys Val
690 695 700
Ala Leu Asp Ser Asp AL a Leu Met Phe Gly Gly His Gly Arg Val Ala
705 710 715 720
His Asp Asn Asp His Phe Thr Ser Pro Glu Gly Val Pro Gly Val Pro
725 730 735
Glu Thr Asn .Phe Asn Asn Arg Pro Asn Ser Phe Lys Ile Leu Ser Pro
740 745 750
ser Arg Thr Cys Val Al a Tyr Tyr Arg Val Glu Glu Lys Ala Glu Lys
755 760 765
Pro Lys Asp Glu Gly Ala Ala Ser Trp Gly Lys Thr Ala Leu Gly Tyr
770 775 780
Ile Asp Val Glu Ala Thr Gly Val Lys Asp AL a Ala Asp Gly Glu Ala
785 790 795 800
Thr Ser Gly Ser Glu Lys Ala Ser Thr Gly Gly Asp Ser Ser Lys Lys
805 810 815
Gly Ile Asn Phe Val Phe Leu Ser Pro Asp Lys Asp Asn Lys
320 325 830 <210> 34 <211> 818 <212> PRT
<213> Triticum aestivum
<400> 34
Met Ala Thr Phe Ala Val Ser Gly Trp Thr Leu Gly Val Ala Arg Pro
1 5 10 15
Ala Gly Ala Gly Gly Gly Leu Leu Pro Arg Ser Gly Ser Glu Arg Arg
20 25 30
PL 205 884 B1
Gly Gly Val 3 c Asp Leu Pro Ser Leu 40 Leu Leu Arg Lys Lys 45 Asp Ser Ser
Arg Ala Ala Ser Pro Gly Lys Val Leu Val Pro Asp Gly Glu Ser Asp
50 55 50
Asp Leu Ala Ser Pro Ala Gin Pro Glu Glu Leu Gin Ile Pro Glu Asp
65 70 75 80
Ile Glu Glu Gin Thr Ala Glu Val Asn Met Thr Gly Gly Thr Aia Glu
85 90 95
Lys Leu Glu Ser Ser Glu Pro Thr Gin Gly Ile Val Glu Thr Ile Thr
100 105 110
Asp Gly Val Thr Lys Gly Val Lys Glu Leu Val Val Gly Glu Lys Pro
115 120 125
Arg Val Val Pro Lys Pro Gly Asp Gly Gin Lys Ile Tyr Glu Ile Asp
130 135 140'
Pro Thr Leu Lys Asp Phe Arg Ser His Leu Asp Tyr Arg Tyr Ser Glu
145 150 155 160
Tyr Arg Arg Ile Arg Ala Ala Ile Asp Gin His Glu Gly Gly Leu Glu
165 170 175
Al a Phe Ser Arg Gly Tyr Glu Lys Leu Gly Phe Thr Arg Ser Ala Glu
180 135 190
Gly Ile Thr Tyr Arg Glu Trp Ala Pro Gly Ala His Ser Ala Ma Leu
195 200 205
Val Gly Asp Phe Asn Asn Trp Asn Pro Asn Ala Asp Thr Met Thr Arg
210 215 220
Asp Asp Tyr Gly Val Trp Glu Ile Phe Leu Pro Asn Asn Ala Asp Gly
225 230 235 240
Ser Pro Ala Ile Pro His Gly Ser Arg Val Lys Ile Arg Met Asp Thr
245 250 255
Pro Ser Gly Val Lys Asp Ser Ile Ser Ala Trp Ile Lys Phe Ser Val
260 265 270
Gin Ala Pro Gly Glu Ile Pro Phe Asn Gly Ile Tyr Tyr Asp Pro Pro
275 280 285
PL 205 884 B1
Glu Glu 290 Glu Lys Tyr Val Phe 295 Gin His Pro Gin Pro 300 Lys Arg Pro Glu
Ser 305 Leu Arg Ile Tyr Glu 310 Ser His Ile Gly Met 315 Ser Ser Pro Glu Pro 320
Lys Ile Asn Ser Tyr 325 Ala Asn Phe Arg Asp 330 Glu Val Leu Pro Arg 335 Ile
Lys Arg Leu Gly 340 Tyr Asn Ala Val Gin 345 Ile Met Ala Ile Gin 350 Glu His
Ser Tyr Tyr 355 Ala ser Phe Gly Tyr 360 His val Thr Asn Phe 365 Phe Ala Pro
Ser Ser 370 Arg Phe Gly Thr Pro 375 Glu Asp Leu Lys Ser 380 Leu Ile Asp Arg
Ala 385 His Glu Leu Gly Leu 390 Ile Val Leu Met Asp 395 Ile Val His Ser His 400
Ser Ser Asn Asn Thr 405 Leu Asp Gly Leu Asn 410 Gly Phe Asp Gly Thr 415 Asp
Thr His Tyr Phe 420 His Gly Gly Pro Arg 425 Gly His His Trp Met 430 Trp Asp
Ser Arg Leu 435 Phe Asn Tyr Giy Ser 440 Trp Glu Val Leu Arg 445 Phe Leu Leu
Ser Asn 450 Ala Arg Trp Trp Leu 455 Glu Glu Tyr Lys Phe 460 Asp Gly Phe Arg
Phe 465 Asp Gly Val Thr Ser 470 Met Met Tyr Thr His 475 His Gly Leu Gin Met 480
Thr Phe Thr Giy Asn 485 Tyr Gly Glu Tyr Phe 490 Gly Phe Ala Thr Asp 495 Val
Asp Ala Val Val 500 Tyr Leu Met Leu Val 505 Asn Asp Leu Ile His 510 Gly Leu
His Pro Asp 515 Ala Val Ser Ile Gly 520 Glu A.sp Val Ser Gly 525 Met Pro Thr
Phe Cys Ile Pro Val Pro Asp Gly Gly Val Gly Leu Asp Tyr Arg Leu
530 535 540
PL 205 884 B1
His 545 Met Ala Val PI a Asp 550 Lys Trp Ile Glu Leu 555 Leu Lys Gin Ser Asp 560
Glu Ser Trp Lys Met 565 Gly Asp Ile Val His 570 Thr Leu Thr Asn Arg 575 Arg
Trp Leu Glu Lys 580 Cys Val Thr Tyr Ala 585 Glu Ser His Asp Gin 590 fla Leu
Val Gly Asp 595 Lys Thr Ile Ala Phe 600 Trp Leu Met Asp Lys 605 Asp Met Tyr
Asp Phe 610 Met Ala Leu Asp Arg 615 Pro Ser Thr Pro Arg 620 Ile Asp Arg Gly
Ile 525 Ala Leu His Lys Met 630 Ile Arg Leu val Thr 635 Met Gly Leu Gly Gly 640
Glu Gly Tyr Leu Asn 645 Phe Met Gly Asn Glu 650· Phe Gly His Pro Glu 655 Trp
Ile Asp Phe Pro 660 Arg Gly Pro Gin Thr 665 Leu Pro Thr Gly Lys 570 Val Leu
Pro Gly Asn 675 Asn Asn Ser Tyr Asp 680 Lys Cys Arg Arg Arg 685 Phe Asp Leu
Gly Asp 690 Ala Asp Phe Leu Arg 695 Tyr His Gly Met Gin 700 Glu Phe Asp Gin
Ala 705 Met Gin His Leu Glu 710 Glu Lys Tyr Gly Phe 715 Met Thr ser Glu His 720
Gin Tyr Val Ser Arg 725 Lys His Glu Glu Asp 730 Lys Val Ile Ile Phe 735 Glu
Arg Gly Asp Leu 740 Val Phe Val Phe Asn 745 Phe His Trp Ser Asn 750 Ser Phe
Phe Asp Tyr 755 Arg Val Gly Cys Ser 760 Arg Pro Gly Lys Tyr 765 Lys Val Ala
Leu Asp 770 Ser Asp Asp Ala Leu 775 Phe Gly Gly Phe Ser 780 Arg Leu Asp His
Asp 785 Val Asp Tyr Phe Thr 790 Thr Glu His Pro His 795 Asp Asn Arg Pro Arg 800
PL 205 884 B1
Ser Phe Ser Val Tyr Thr Pro Ser Arg Thr Ala Val Val Tyr Ala Leu 805 810 315
Thr Glu <210> 35 <211> 813 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 35 gagctccgtt tcgcatgatt gaacaagatg gattgcacgc aggttctccg cccgcttggg 60 tggagaggct attcggctat gactgggcac aacagacaat cggctgctct gatgccgccg 120 tgttccggct gtcagcgcag gggcgcccgg ttctttttgt caagaccgac ctctccggtg 180 ccctgaatga actgcaggac gaggcagcgc ggctatcgtg gctggccacg acgggcgttc 240 cttgcgcagc t.gtgctogac gttgtcactg aagcgggaag ggactggctg ctattgggcg 300 aagtgccggg gcaggatctc ctgtcatctc accttgctcc tgccgagaaa gtatccatca 360 tggctgatgc aatgcggcgg ctgcatacgc ttgatccggc tacctgccca ttcgaccacc 420 aagcgaaaca tcgcatcgag cgagcacgta ctcggatgga agecggtctt grcgatcagg 480 atgatctgga cgaagagcat caggggctcg cgccagccga actgttcgcc aggctcaagg 540 cgcgcatgcc cgacggcgag gatctcgtcg tgacccatgg cgatgcctgc ttgccgaata 600 tcatggtgga aaatggccgc ttttctggat tcatcgactg tggccggctg ggtgtggcgg 660 accgctatca ggacatagcg ttggctaccc gtgatattgc tgaagagctt ggcggcgaat 720 gggctgaccg cttcctcgtg ctttacggta tcgccgctcc cgattcgcag cgcatcgcct 780 tctatcgcct tcttgacgag ttcttctgag ctc 813 <210> 35 <211> 7 <212> PRT <213> Triticum aestivum <400> 36 '
Met Asp Lys Asp Met Tyr Asp 1 5 <210> 37 <211> 40 <212> DNA <213> Sztuczna sekwencja <220>
<223> Opis sztucznej sekwencji: synetyczny oligonukleotyd <4O0> 37
PL 205 884 B1 aaggatccgt cgacatccat aatacgactc actataggga 40 <210> 38 <211> 17 <212> DNA <213> Sztuczna sekwencja <220>
< 2 2 3 > Qpjs sztucznej sekwencj i: synetyczny ol igonukleotyd <400> jd aaggatccgt cgacatc 17 <210> 39 <211> 20 <212> DNA <213> Sztuczna sekwencja <220>
<223> Opis sztucznej sekwencji: synetyczny oligonukleotyd <400> 39 atggacaagg atatgtatga 20 <210> 40 <211> 21 <212> DNA < 213 > Sztuczna sekwencja <220>
<223> Opis sztucznej sekwencji: synetyczny oligonukleotyd <400> 40 ttttcttcac aaccccctgg g 21 <210> 41 <211> 21 <212> DNA < 213 > Sztuczna sekwencja <220>
<223> Opis sztucznej sekwencji: synetyczny oligonukleotyd
PL 205 884 B1 <400> 41 tgtttgggag atcttcctcc c 21 <210> 42 <211> 8 <212> PRT <213> Triticum aestivum <400> 42
Gly Val Trp Glu Ile Phe Leu Pro 1 5 <210> 43 <211> 10 <212> DNA <213> Sztuczna sekwencja <220 <223> Opis sztucznej sekwencji: synetyczny oligonukleotyd <400> 43 cgggatcccg <210> 44 <211> 34 <212> DNA .
<213> Sztuczna sekwencja <223> Opis sztucznej sekwencji: synetyczny oligonukleotyd <400 44 gatgagctcc gtttcgcatg attgaacaag atgg <210> 45 <211> 30 <212> DNA .
< 2 χ 3 > Sztuczna sekwencja <220>
<223> Opis sztucznej sekwencji: synetyczny oligonukleotyd <400> 45 gtcgagctca gaagaactcg tcaagaaggc
PL 205 884 B1
PL 205 884 B1 <210> 50 <211> 21 <212> DNA < 213 > Sztuczna sekwencja <220>
<223> Opis sztucznej sekwencji: synetyczny oligonukleotyd <400 50 agctgaatcc ggcggcatgg c 21 <210> 51 <211> 21 <212> DNA <213> Sztuczna sekwencja <220 <223> Opis sztucznej sekwencji: synetyczny oligonukleotyd <400 51 tgatagtctt gccagtcagg g 21 <210> 52 <211> 2037 <212> DNA <213> Zea mays <400> 52
ttagctgaat ccggcggcat ggcaaggtag actgcagtgc agcgtgaccc ggtcgtgccc 60
ctctctagag ataatgagca ttgcatgtct aagttataaa aaattaccac atattttttt 120
tgtcacactt gtttgaagtg cagtttatcf atctttatac atatatttaa actttactct 180
acgaataata taatctatag tactacaata atatcagtgt tttagagaat catataaatg 240
aacagttaga catggtctaa aggacaattg gtattttgac aacaggactc tacagtttta 300
tctttttagt gtgcatgtgt tctccttttt ttctttgcaa atagcttcac ctatataata 360
cttcacccat tttattagta catccattta gggtttaggg ttaatggttt ttatagacta 420
atttttttag tacatctatt ttattctatt ttagcctcta aattaagaaa actaaaactc. 480
tattttagtt tttttattta ataatttaga tataaaatag aataaaataa agtgactaaa 540
aattaaacaa atacccttta agaaattaaa aaaactaagg aaacattttt cttgtttcga 600
gtagataatg ccagcctgtt aaacgccgtc gacgcagtct aacggacacc aaccagcgaa 660
ccagcagcgt cgcgtcgggc caagcgaagc agacggcacg gcatctctgt cgctgcctcg 720
gtaccggact tcgtccgctg tcggcatcca gaaattgcgt ggcggagcgg cagacgtgag 780
ccggcacggc aggcggcctc ctcctcctct cacggcaccg gcagctacgg gggattcctt 840
tcccaccgct ccttcgcttt cccttcctcg cccgccgtaa taaatagaca ccccctccac 900
accctctttc cccaacctcg tgttgttcgg agcgcacaca cacacaacca gatctccccc 960
aaatccaccc gtcggcacct ccgcttcaag gtacgccgct cgtcctccc: ccccctctct 1020
PL 205 884 B1
accttctcta gatcggcgtt ccgctccatg gttagggccc ggtagttcta cttctgttca 1080
tgtttgtgtt agatccgtgt ttgtgttaga tccgtgctgc tagcgttcgt acacggatgc 1140
gacctgtacg tcagacacgt tctgattgct aacttgccag tgtttctctt tggggaatcc 1200
tgggatggct ctagccgttc cgcagacggg atcgatttca tgattttttt tgtttcgttg 1260
catagggttt ggtttgccct tttcctttat ttcaatatat gccgtgcact tgtttgtcgg 1320
gtcatctttt catgcttttt tttgtcttgg ttgtgatgat gtggtctggt tgggcggtcg 1380
ttctagatcg gagtagaatt ctgtttcaaa ctacctggtg gatttattaa ttttggatct 1440
gtatgtgtgt gccatacata ttcatagtta cgaattgaag atgatggatg gaaatatcga 1500
tctaggatag gtatacatgt tgatgcgggt tttactgatg catatacaga gatgcttttg 1560
ttcgcttggt tgtgatgatg tggtgtggtt ccgcggtcgt tcattcgttc tagatcggag 1620
tagaatactg tttcaaacta cctggtgtat ttatraattt tggaactgta tgtgtgtgtc 1680
atacatcttc atagttacga gtttaagatg gatggaaata tcgatctagg ataggtatac 1740
atgttgatgt gggttttact gatgcatata catgatggca tatgcagcat ctattcatat 1800
gctctaacct tgagtaccta tctattataa taaacaagta tgttttataa ttattttgat 1860
cttgatatac ttggatgatg gcatatgcag cagctatatg tggatttttt tagccctgcc 1920
ttcatacgct atttatttgc ttggtactgt ttettttgtc gatgctcacc ctgttgtttg 1980
gtgttacttc tgcagatgca gatctttgtg aaaaccctga ctggcaagac tatcacc 2037
<210> 53 <211> 1085 <212> DNA <213> Triticum aestivum
<400> 53
atatgtatga tttcatggct ctggatggac cttcgactcc tgctattgat cctggcatag 60
cattgcataa aatgattagg cttgtcacca tgggtttagg tggagagggt tatcttaact 120
ttatgggaaa tgagtttggg catcctgaat ggatagattt tccaagaggc ccacaagttc 180
ttccaactgg taagtttctc cctggaaata acaatagtta tgataaatgc cctcgtagat 240
ttgatcttgg tgatgcagat tttcttaggt atcgtcgtat gcaggagttt gatcaggcaa 300
tgcagcatct tgaggaaaaa tatgggttta tgacatctga gcaccagtat gtttctcgga 360
aacatgagga agataaggtg atcgtgtttg aaagagggga tttggtattt gttttcaact 420
tccactggag taatagcttt tttcactacc gtgttgggtg tttcaagcct gggaagtaca 430
aggtggtctt agactccgac gctggactct ttggtggatt tggtaggctt gatcatgctg 540
tcgagtactt cacttctgac tgtccgcatg acaacaggcc gcattctttc tcggtgtaca 600
ctcctagcag aacttgtgtt gtgtatgctc ttatggagta agcagcaagt gcagcatacg 660
ctgccgctgt tgttgctagt agcaaggaga gatcgtaggt cactacacca ggtgcagggt 720
ttgatatgga tttttgcttg agcgagtcct ggatgggcaa gacagcgtga tgctgtgtgt 780
gctcccaaat cgccatggcg ttgggagggg atcgtgcttc tttgtgttat gctttgtgca 840
tcaggatgga actcccctag gtagccttgt tggtgagcgc tcgaaagaaa atggacgggc 900
ctgggtgttt gcttaaattt tgttgcccta aaccctcgct cctatcttgt acattgccgg 960
tttagatagg gtttgttttt gtacattttt ttgatagtta atagacttat tgct.cgr.gtg 1020
cttgacgttt tacatgaaca tataaatatt ctaaataggt taaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1080
aaaaa 1085 <210> 54 <211> 888 <212> PRT <213> Triticum aestivum
PL 205 884 B1 <400> 54
Met Leu Cys Leu Ser Xaa Ser Leu 1 5
Ala A.sp Arg Pro Zaa Leu Pro Gly 20
Leu Ser Ala Val Pro Ala Pro Xaa 25 40
Lys Ala Lys Ser Lys Ser Ser Val 50 55
Ile Xaa Ala Thr Xaa Xaa Xaa Gly 65 70
Leu Asp Pro Lys Leu Ala Xaa Phe 85
Xaa Xaa Tyr Xaa Xaa Gin Lys His 100
Leu Glu Glu Phe Ser Lys Gly Tyr 115 120
Xaa Xaa Ala Xaa Val Tyr Arg Glu 130 135
Gin Leu Val Gly Asp Phe Asn Asn 145 150
Thr Lys Asp Asn Phe Gly Val Trp 165
Asp Gly Ser Pro Ala Ile Pro His ISO
Asp Thr Pro Ser Gly Val Trp Val 195 200
Tyr Ala Val Gin Thr Ala Gly Glu 210 215
His Tyr Asp Pro Pro Ser Glu Glu 225 230
Pro Lys Lys Pro Asp Ser Leu Arg
Leu Pro Arg Pro Ser Arg Ala Ala 10 15
Ile Xaa Gly Gly Gly Zaa Xaa Arg 25 30
Xaa Leu Arg Trp Xaa Trp Pro Arg 45
Pro Val Xaa Ala Xaa Zaa Xaa Xaa 60
Val Xaa Xaa Leu Pro Ile Tyr Asp 75 80
Lys Xaa His Phe Asp Tyr Arg Xaa 90 95
Xaa Ile Glu Lys His Glu Gly Gly 105 110
Leu Lys Phe Gly Ile Asn Thr Glu 125
Trp Ala Pro Ala Ala Xaa Xaa Ala 140
Trp Asn Gly Ser Gly His Xaa Met 155 160
Ser Ile Arg Leu Ser Asn Asn Ala 170 175
Gly Ser Lys Val Lys Phe Arg Phe 1B5 190
Asp Ser Ile Pro Ala Trp Ile Lys 205
Ile Gly Ala Pro Tyr Asp Gly Ile 220
Lys Tyr Val Phe Lys His Pro Gin 235 240
Ile Tyr Glu Ala His Val Gly Met
100
PL 205 884 B1
245 250 255
Ser Gly Pro Glu Pro Glu Ile Asn Thr Tyr Ala Glu Phe Arg Asp Glu
260 265 270
Val Leu Pro Arg Ile Lys Ala Leu Gly Tyr Asn Ala Val Gin Leu Met
275 280 285
Ala Ile Gin G1 u His Ser Tyr Tyr Ala Ser Phe Gly Tyr His Val Thr
290 295 300
Asn Phe Phe' Ala Val Ser Ser Arg Ser Gly Thr Pro Glu Asp Leu Lys
305 310 315 320
Ser Leu Ile Asp Lys Ala His Ser Leu Gly Leu Arg Val Leu Met Asp
325 330 335
Val Val His _Ser His Ala Ser Asn Asn Thr Leu Asp Gly Leu Asn Gly
340 345 350
Phe Asp Val Gly Gin Gly Thr Asp Thr Ser Tyr Phe His Gly Gly Xaa
355 360 365
Arg Gly His His Lys Met Trp Asp Ser Arg Leu Phe Asn Tyr Gly Asn
370 375 380
Trp Glu Val Leu Arg Phe Leu Leu Ser Asn Ala Arg Tyr Trp Leu Asp
385 390 395 400
Glu Phe Lys Phe Asp Gly Phe Arg Phe Asp Gly Val Thr Ser Met Leu
405 410 415
Tyr Thr His His Gly Leu Asn Met Ser Phe Thr Gly Ser Tyr Lys Glu
420 425 430
Tyr Phe Gly Leu Ala Thr Asp Val Asp Ala Val Val Tyr Leu Met Leu
435 440 445
Ala Asn Asp Leu Ile His Gly Leu Xaa Pro Glu Ala Val Val Val Gly
450 455 460
Glu Asp Val Ser Gly Met Pro Val Leu Cys Xaa Pro Val Asp Glu Gly
465 470 475 480
Gly Val Gly Phe Asp Tyr Arg Leu Ala Met Ala Val Ala Asp Lys Trp
485 490 495
Ile Asp Leu Leu Lys Asn Lys Asp Asp Xa a Trp Ser Met Gly Xaa Ile
PL 205 884 B1
101
102
PL 205 884 B1
755 760 765
Xaa Xaa Xaa Zaa Zaa Leu Zaa Arg Xaa Zaa Gly Zaa Zaa Zaa Zaa Zaa
770 775 780
Zaa Phe Leu Zaa Pro Xaa Lys Zaa Zaa Zaa Zaa Xaa Zaa Zaa Zaa Leu
785 790 795 800
Xaa Xaa Xaa Zaa Zaa Zaa Pro Zaa Zaa Zaa Pro Xaa Ile Xaa Phe Xaa
805 810 815
Zaa Xaa Gly Gly Xaa Zaa Xaa Xaa Zaa Zaa Zaa Zaa Xaa Zaa Lys Xaa
820 825 830
Xaa Xaa Xaa Ala Val Xaa Zaa Xaa Xaa Xaa Ser Xaa Xaa Zaa Zaa Zaa
835 B40 845
Xaa Ile Leu Zaa Leu Zaa Zaa Zaa Zaa Ile Ile Xaa Zaa Zaa Xaa Xaa
850 855 860
Xaa Xaa Leu Xaa Xaa Xaa Zaa Zaa Zaa Xaa Zaa Zaa Zaa Zaa Zaa Zaa
865 870 875 880
Lys Lys Lys Lys Lys Lys Lys Lys
885 <210> 55 <211> 1488 <212> DNA <213> Zea mavs <400> 55
aagcttgcat gcctgcaggt cgactctaga ccaaatttca tggtagttgg gagcctaccc 60
agatttcatg attaactgtg ctattgaatt gttgaaaatg gttgtgtctg tcgtatccga 120
cggataacgg aaacccgtcc gaaattcaat gggcatgggc atagatatag atttgtaccc 180
actactagta tggtcgcagg cggatattgg ttgcaaccgc agatatagtt tcggggaaaa 240
ggattaggct cagctccatc cctagacccc acttgtgtgt gtgggggggt ctacccttca 300
aaaggaaaaa aaactacaca cagtgcatat aagaagatga atattccaaa attcagcagt 360
caagaagccc tgataaactg tctggcatag ctagtacttt atacacttca agaccaaaaa 420
aaatcactaa gtacagattt tagtgactcg taagtacaga tatcatctta caaggcccag 430
cccagcgacc tattacacag cccgctcggg cccgcgacgt cgggacacat cttcttcccc 540
cttttggtga agctctgctc gcagctgtcc ggctgcttgg acgttcgtgt ggcagattca 600
tctgtcgtct cgtctcctgt gcttcctggg tagcttgtgc agtggagctg acatggtctg 660
agcaggctta aaatttgctc gtagacgagg agtaccagca cagcacgttg cggatttctc 720
tgcctgtgaa gtgcaacgtc taggattgtc acacgccttg gtcgcgtcga tgcggtggtg 780
agcagagcag caacagctgg gcggcccaaa gttggcttcc gtgtcttcgt cgtacgtacg 840
cgcgcgccgg ggacacgcag agagcggaga gcgagccgtg cacgggggag gtggtgtgca 900
PL 205 884 B1
103
agrgcagccg cgcgcccgcg cccęcgcccg gtgggcaacc caaaaagtac ccacgacaag 960
cgaaggcgcc aaagcgatcc aagctccgga acacatcagc cacaagcagc cgagaaccga 1020
accggtgggc gacgcgtcgt gggacggacg cgggcgacgc ttccaaacgc ggccacgtac 1080
gccggcgtgt gcgtgcgtgc gtgcagacga caagccaagg cgaggcagcc cccgatcggg_ 1140
aaagcgtttt gggcgcgagc gctgccgtgc gggtcagtcg ctggtgcgca gtgccggggg 1200
gaacgggtat cgtgggaggc acggcggaga agagcgtggc gaggccgaga gcagcgcgcg 1260
gccgggtcac gcaacgcgcc ccacgtactg ccctccccct ccgcgcgcgc tagaaatacc 1320
gaggcctgga ccgggggccc ccccctcaca tccatccatc gaccgatcga tcgccacagc 1380
caacaccacc cgccgaggcg acgcgacagc cgccaggagg aaggaataaa ctcactgcca 1440
gccagtgaag ggggagaagt gtactgctcc gtcgactcta gaggatcc 1488
Zastrzeżenia patentowe

Claims (18)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Sekwencja nukleotydowa, znamienna tym, ż e koduje sekwencję aminokwasow ą przedstawioną jako SEQ ID No:2.
  2. 2. Sekwencja nukleotydowa, znamienna tym, że stanowi sekwencję B2 przedstawioną jako
    SEQ ID No:3.
  3. 3. Sekwencja nukleotydowa, znamienna tym, ż e stanowi sekwencję B4 przedstawioną jako
    SEQ ID No:4.
  4. 4. Sekwencja nukleotydowa, znamienna tym, że stanowi sekwencję B10 przedstawioną jako
    SEQ ID No:5.
  5. 5. Sekwencja nukleotydowa, znamienna tym, ż e stanowi sekwencję B1 przedstawioną jako
    SEQ ID No:6.
  6. 6. Sekwencja nukleotydowa, znamienna tym, że koduje sekwencję aminokwasową B6 przedstawioną jako SEQ ID No:7.
  7. 7. Konstrukt kwasu nukleinowego, znamienny tym, że zawiera sekwencję nukleotydową kodującą sekwencję aminokwasową przedstawioną jako SEQ ID No:2, albo sekwencję nukleotydową, którą stanowi sekwencja B2 przedstawiona jako SEQ ID No:3, albo sekwencję nukleotydową, którą stanowi sekwencja B4 przedstawiona jako SEQ ID No:4, albo sekwencję nukleotydową, którą stanowi sekwencja B10 przedstawiona jako SEQ ID No:5, albo sekwencję nukleotydową, którą stanowi sekwencja B1 przedstawiona jako SEQ ID No:6, albo sekwencję nukleotydową kodującą sekwencję aminokwasową B6 przedstawioną jako SEQ ID No:7.
  8. 8. Konstrukt według zastrz. 7, znamienny tym, że sekwencja jest operacyjnie połączona, w orientacji sensownej lub antysensownej, z sekwencją promotora.
  9. 9. Wektor ekspresyjny, znamienny tym, że zawiera konstrukt określony w zastrz. 7 albo 8.
  10. 10. Sekwencja aminokwasowa, znamienna tym, że kodowana jest przez sekwencję nukleotydową określoną w zastrz. 1 albo 2, albo 3, albo 4, albo 5, albo 6.
  11. 11. Sposób transformowania rośliny, znamienny tym, że wprowadza się do rośliny sekwencję określoną w zastrz. 1 albo 2, albo 3, albo 4, albo 5, albo 6, albo 7, albo 8, albo 9, połączoną operacyjnie z odpowiednim promotorem aktywnym w roślinie tak, aby spowodować ekspresję genu obecnego w roś linie.
  12. 12. Sposób według zastrz. 11, znamienny tym, że wprowadza się sekwencję połączoną z promotorem w orientacji antysensownej.
  13. 13. Sposób według zastrz. 11 albo 12, znamienny tym, że jako roślinę stosuje się pszenicę.
  14. 14. Sposób według zastrz. 11 albo 12, albo 13, znamienny tym, że zmienia się właściwości dotyczące zawartości skrobi i/lub składu skrobi rośliny.
  15. 15. Transgeniczna roślina, znamienna tym, że zawiera konstrukt określony w zastrz. 7 albo 8.
  16. 16. Transgeniczna komórka roślinna, znamienna tym, że zawiera konstrukt określony w zastrz. 7 albo 8.
  17. 17. Część rośliny transgenicznej, znamienna tym, że zawiera konstrukt określony w zastrz. 7 albo 8.
  18. 18. Transgeniczna roślina, komórka roślinna lub część rośliny według zastrz. 15 albo 16, albo 17, znamienna tym, że rośliną jest pszenica.
PL346568A 1998-09-10 1999-09-09 Sekwencje nukleotydowe, konstrukt kwasu nukleinowego, wektor ekspresyjny, sekwencja aminokwasowa, sposób transformowania rośliny, transgeniczna roślina, transgeniczna komórka roślinna i część rośliny transgenicznej PL205884B1 (pl)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP98307337 1998-09-10
PCT/GB1999/003011 WO2000015810A1 (en) 1998-09-10 1999-09-09 Isoforms of starch branching enzyme ii (sbe-iia and sbe-iib) from wheat

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL346568A1 PL346568A1 (en) 2002-02-11
PL205884B1 true PL205884B1 (pl) 2010-06-30

Family

ID=8235051

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL346568A PL205884B1 (pl) 1998-09-10 1999-09-09 Sekwencje nukleotydowe, konstrukt kwasu nukleinowego, wektor ekspresyjny, sekwencja aminokwasowa, sposób transformowania rośliny, transgeniczna roślina, transgeniczna komórka roślinna i część rośliny transgenicznej

Country Status (9)

Country Link
US (3) US6730825B1 (pl)
EP (1) EP1117814B1 (pl)
AT (1) ATE458061T1 (pl)
AU (1) AU767103B2 (pl)
CZ (1) CZ2001759A3 (pl)
DE (1) DE69942032D1 (pl)
HU (1) HUP0103618A3 (pl)
PL (1) PL205884B1 (pl)
WO (1) WO2000015810A1 (pl)

Families Citing this family (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AUPQ005299A0 (en) * 1999-04-29 1999-05-27 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Novel genes encoding wheat starch synthases and uses therefor
PT1210446E (pt) * 1999-09-09 2006-10-31 Monsanto Uk Ltd Sistema de regulacao da ubiquitina modificado
US7041484B1 (en) * 1999-10-29 2006-05-09 National Research Council Of Canada Starch branching enzymes
WO2001032897A2 (en) * 1999-11-05 2001-05-10 South African Sugar Association A high level, stable, constitutive promoter element for plants
AUPQ574200A0 (en) * 2000-02-21 2000-03-16 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Starch branching enzyme
US20020002713A1 (en) * 2000-03-01 2002-01-03 Allen Stephen M. Starch branching enzyme IIb
AU2001275433A1 (en) * 2000-06-09 2001-12-17 Prodigene, Inc. Plant ubiquitin promoter sequences and methods of use
DK1331845T3 (da) 2000-11-09 2012-04-23 Commw Scient Ind Res Org Byg med reduceret SSII-aktivitet og stivelsesholdige produkter med et reduceret indhold af amylopectin
AUPS219802A0 (en) * 2002-05-09 2002-06-06 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Barley with altered branching enzyme activity and starch and starch containing products with a reduced amylopectin content
CA2513289A1 (en) * 2003-01-20 2004-08-05 Sungene Gmbh & Co. Kgaa Expression cassette with promotors of starch synthesis 3 for the expression of nucleic acids in plant tissue containing starch
NZ544439A (en) * 2003-06-30 2009-11-27 Limagrain Cereales Ingredients Wheat with altered branching enzyme activity and starch and starch containing products derived therefrom
KR101274849B1 (ko) 2003-10-27 2013-06-13 코몬웰스 싸이언티픽 엔드 인더스트리얼 리서치 오가니제이션 아밀로스 비율이 증가된 전분을 갖는 쌀 및 이의 생성물
US7993686B2 (en) 2004-12-30 2011-08-09 Commonwealth Scientific And Industrial Organisation Method and means for improving bowel health
PL1833291T3 (pl) * 2004-12-30 2017-05-31 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Metoda i środki poprawy stanu zdrowia jelit
CA2653883C (en) 2008-07-17 2022-04-05 Colin Leslie Dow Jenkins High fructan cereal plants
BR112012002114A2 (pt) 2009-07-30 2015-09-15 Australian Capital Ventures Ltd cevadas e seu usos.
JP6063869B2 (ja) 2010-11-04 2017-01-18 アリスタ シリアル テクノロジーズ プロプライエタリー リミテッドArista Cereal Technologies Pty Ltd 高アミロースコムギ
WO2012103594A1 (en) 2011-02-03 2012-08-09 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Barley with modified ssiii
BR112014007928B1 (pt) 2011-10-04 2021-07-06 Arcadia Biosciences, Inc. polinucleotídeos sbeiia de trigo
ES3000665T3 (en) 2011-11-04 2025-03-03 Arista Cereal Tech Pty Ltd High amylose wheat - ii

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1997022703A2 (en) 1995-12-20 1997-06-26 E.I. Du Pont De Nemours And Company Novel starches via modification of expression of starch biosynthetic enzyme genes
EP1012250B1 (en) * 1997-09-12 2008-12-17 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Regulation of gene expression in plants

Also Published As

Publication number Publication date
EP1117814B1 (en) 2010-02-17
EP1117814A1 (en) 2001-07-25
CZ2001759A3 (cs) 2001-09-12
HUP0103618A3 (en) 2003-12-29
ATE458061T1 (de) 2010-03-15
US6730825B1 (en) 2004-05-04
PL346568A1 (en) 2002-02-11
DE69942032D1 (de) 2010-04-01
US7217857B2 (en) 2007-05-15
US20040216188A1 (en) 2004-10-28
AU767103B2 (en) 2003-10-30
US20080064864A1 (en) 2008-03-13
AU5872599A (en) 2000-04-03
US7465851B2 (en) 2008-12-16
HUP0103618A2 (hu) 2002-01-28
WO2000015810A1 (en) 2000-03-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US7465851B2 (en) Isoforms of starch branching enzyme II (SBE-IIa and SBE-IIb) from wheat
CA2303407C (en) Regulation of gene expression in plants
Nakamura et al. Essential amino acids of starch synthase IIa differentiate amylopectin structure and starch quality between japonica and indica rice varieties
Kim et al. Molecular cloning and characterization of the Amylose-Extender gene encoding starch branching enzyme IIB in maize
Kawasaki et al. Molecular analysis of the gene encoding a rice starch branching enzyme
US5908973A (en) DNA encoding fruit-ripening-related proteins, DNA constructs, cells and plants derived therefrom
US7667114B2 (en) Starch branching enzyme
CZ314099A3 (cs) Molekuly nukleové kyseliny kódující enzymy, které mají fruktosylpolymerázovou aktivitu, a vektory, hostitelské buňky a transgenní rostliny obsahující tyto nukleové kyseliny
WO1994011520A2 (en) Novel plants and processes for obtaining them
WO2009067751A1 (en) Plants with modified starch metabolism
Fisher et al. Two closely related cDNAs encoding starch branching enzyme from Arabidopsis thaliana
Bae et al. Molecular cloning and characterization of two novel isoforms of the small subunit of ADPglucose pyrophosphorylase from sweet potato
HUP0204400A2 (hu) Transzgenikus növények megnőtt maghozammal, biomasszával és betakarítási indexszel
Kim et al. Genomic organization and promoter activity of the maize starch branching enzyme I gene
AU2003285210B2 (en) Methods and means for modulating cellulose biosynthesis in fiber producing plants
AU761419B2 (en) (dull1) coding for a starch synthase and uses thereof
US6323015B1 (en) Sucrose phosphate synthase
ZA200104799B (en) Means and methods for influencing the flowering behaviour of plants.
CA2529455A1 (en) Plant limit dextrinase inhibitor
US6756218B2 (en) Sucrose phosphate synthase
AU727294B2 (en) Regulation of gene expression in plants
WO1999064562A2 (en) Expression control elements from genes encoding starch branching enzymes
US20040107462A1 (en) Sucrose phosphate synthase