MXPA03002180A - Compuestos novedosos. - Google Patents

Compuestos novedosos.

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MXPA03002180A
MXPA03002180A MXPA03002180A MXPA03002180A MXPA03002180A MX PA03002180 A MXPA03002180 A MX PA03002180A MX PA03002180 A MXPA03002180 A MX PA03002180A MX PA03002180 A MXPA03002180 A MX PA03002180A MX PA03002180 A MXPA03002180 A MX PA03002180A
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    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
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    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Abstract

Se describen polipeptidos y polinucleotidos de los genes descritos en el cuadro I, y metodos para producir dichos polipeptidos mediante tecnicas recombinantes; se describen tambien metodos para usar polipeptidos y polinucleotidos de los genes descritos en el cuadro I en pruebas de diagnostico.

Description

polipéptido descrito en el listado de secuencias o un fragmento del mismo; o (d) un anticuerpo para un polipéptido de la presente invención, de preferencia para el polipéptido descrito en el listado de secuencias. Se apreciará que en dicho equipo, los incisos (a), (b), (c) o (d) pueden comprender un componente sustancial. Dicho equipo se usará en el diagnóstico de una enfermedad o susceptibilidad a una enfermedad, en particular enfermedades de la invención, entre otras. Las secuencias de polinucleótidos de la presente invención son valiosas para estudios de localización de cromosomas. Las secuencias descritas en el listado de secuencias son específicamente dirigidas a, y pueden hibridar con, una posición particular en un cromosoma humano individual. El mapeo de secuencias relevantes para los cromosomas de conformidad con la presente invención, es un primer paso importante en la correlación de esas secuencias con una enfermedad asociada a genes. Una vez que una secuencia ha sido mapeada para una posición cromosómica precisa, la posición física de la secuencia en el cromosoma se puede correlacionar con los datos del mapa genético. Dichos datos se encuentran, por ejemplo, en V. McKusick, Mendelian Inheritance in Man (disponible en línea a través de la Johns Hopkins University Welch Medical Library). La relación entre genes y enfermedades que han sido mapeados para la misma región cromosómica, se identifica entonces mediante análisis de ligamiento (co-herencia de genes físicamente adyacentes). Se pueden determinar ubicaciones precisas de cromosomas humanos para una secuencia genómica (fragmento de genes, etc.), usando mapeo de híbridos por radiación (RH) (Walter, M. Spillett, D., Thomas, P., Weissenbach, J. y Goodfellow, P., (1994), A method for constructing radiation hybrid maps of whole genomes, Nature Genetics 7, 22-28). Un número de paneles de RH está disponible de Research Genetics (Hunstville, AL, USA), por ejemplo, el panel de RH de GeneBridge4 (Hum Mol Genet 1996 marzo; 5(3): 339-46, A radiation hybrid map of the human genome, Gyapay G, Schmitt K, Fizamos C, Jones H, Vega-Czarny N, Spillett D, Muselet D, Prud'Homme JF, Dib C, Auffray C, Morissette J, Weissenbach J, Goodfellow PN). Para determinar la ubicación cromosómica de un gen usando este panel, se llevan a cabo 93 PCRs usando iniciadores diseñados a partir del gen de interés en moléculas de ADN de RH. Cada una de estas moléculas de ADN contiene fragmentos genómicos humanos aleatorios mantenidos en un fondo de células de hámster (líneas de células híbridas de (humano/hámster). Estas PCRs dan como resultado 93 puntuaciones que indican la presencia o ausencia del producto de PCR del gen de interés. Estas puntuaciones se comparan con puntuaciones creadas usando productos de PCR a partir de secuencias genómicas de ubicación conocida. Esta comparación se lleva a cabo en la dirección http://www.genome.wi.mit.edu/. Las secuencias de polinucleótidos de la presente invención son también herramientas valiosas para estudios de expresión en tejidos. Dichos estudios permiten la determinación de los patrones de expresión de los polinucleótidos de la presente invención, lo cual puede dar una indicación de los patrones de expresión de los polipéptidos codificados en tejidos, detectando las moléculas de ARN mensajero que los codifican. Las técnicas usadas son bien conocidas en la materia, e incluyen técnicas de hibridación in situ para clones dispuestos en una rejilla, tales como hibridación de microdisposiciones de ADNc (Schena et al., Science, 270, 467-470, 1995 y Shalon et al, Genome Res, 6, 639-645, 1996) y técnicas de amplificación de nucleótidos, tales como PCR. Un método preferido usa la tecnología TAQMAN (marca comercial) disponible de Perkin Elmer. Los resultados de estos estudios pueden dar una indicación de la función normal del polipéptido en el organismo. Además, estudios comparativos del patrón de expresión normal de moléculas de ARN mensajero con el de moléculas de ARN mensajero codificadas por una forma alternativa del mismo gen (por ejemplo, uno que tiene una alteración en el potencial de codificación del polipéptido o una mutación reguladora), pueden proveer pistas valiosas en la función de los polipéptidos de la presente invención, o de expresión inadecuada de los mismos en enfermedad. Dicha expresión inadecuada puede ser de naturaleza temporal, espacial, o simplemente cuantitativa. Otro aspecto de la presente invención se refiere a anticuerpos. Los polipéptidos de la invención o sus fragmentos, o células que los expresan, se pueden usar como inmunógenos para producir anticuerpos que sean inmunoespeclficos para los polipéptidos de la presente invención. El término "inmunoespecífico" significa que los anticuerpos tienen afinidad sustancialmente mayor por los polipéptidos de la presente invención, que su afinidad por otros polipéptidos relacionados de la técnica anterior. Se puede obtener anticuerpos generados contra los polipéptidos de la presente invención, administrando los polipéptidos o fragmentos que poseen epítopes, o células a un animal, de preferencia un animal no humano, usando protocolos de rutina. Para la preparación de anticuerpos monoclonales, se puede usar cualquier técnica que provea anticuerpos producidos por cultivos continuos de lineas de células. Ejemplos incluyen la técnica de hibridomas (Kohler, G. y Milstein, C, Nature (1975) 256:495-497), la técnica de triomas, la técnica de hibridomas de células B humanas (Kozbor et al., Immunology Today (1983) 4:72) y la técnica de EBV-hibridomas (Colé et al., Monoclonal Antibodies and Cáncer Therapy, 77-96, Alan R. Liss, Inc., 1985). Técnicas para la producción de anticuerpos de cadena sencilla, tales como los descritos en la patente de E.U.A. No. 4,946,778, se pueden adaptar también para producir anticuerpos de cadena sencilla para los polipéptidos de esta invención. Asimismo, se pueden usar ratones transgénicos, u otros organismos, incluyendo otros mamíferos, para expresar anticuerpos humanizados. Los anticuerpos descritos anteriormente se pueden usar para aislar o para identificar clones que expresan el polipéptido, o para purificar los polipéptidos mediante cromatografía de afinidad. Se pueden usar también anticuerpos contra los polipéptidos de la presente invención para tratar enfermedades de la invención, entre otras.
Los polipéptidos y polinucleótidos de la presente invención se pueden usar también como vacunas. Por consiguiente, en otro aspecto, la presente invención se refiere a un método para inducir una respuesta inmunológica en un mamífero, el cual comprende inocular el mamífero con un polipóptido de la presente invención, adecuado para producir una respuesta inmune de células T y/o de anticuerpos incluyendo, por ejemplo, células T citotóxicas o células T que producen atocinas, para proteger a dicho animal de la enfermedad, ya sea que la enfermedad esté ya establecida o no dentro del individuo. Se puede inducir también una respuesta inmunológica en un mamífero, mediante un método que comprenda liberar un polipéptido de la presente invención mediante un vector que dirija la expresión del polinucleótido y que codifique para el polipéptido ¡n vivo para inducir dicha respuesta inmunológica para producir anticuerpos que protejan a dicho animal de enfermedades de la invención. Una forma de administrar el vector, es catalizándolo en las células deseadas como un revestimiento sobre partículas, o de otra forma. Dicho vector de ácido nucleico puede comprender ADN, ARN, un ácido nucleico modificado, o un híbrido de ADN/ARN. Para su uso en una vacuna, un polipéptido o un vector de ácido nucleico se proveerá normalmente como una formulación (composición) de vacuna. La formulación puede comprender además un vehículo adecuado. Puesto que un polipéptido puede ser degradado en el estómago, se administra de preferencia parenteralmente (por ejemplo, mediante inyección subcutánea, intramuscular, intravenosa o intradórmica). Las formulaciones adecuadas para administración parenteral incluyen soluciones para inyección estériles acuosas y no acuosas que pueden contener antioxidantes, reguladores de pH, bacterióstatos y solutos que hacen que la formulación sea isotónica con la sangre del receptor; y suspensiones estériles acuosas y no acuosas que pueden incluir agentes de suspensión o agentes espesantes. Las formulaciones se pueden presentar en contenedores de una sola dosis o de dosis múltiples, por ejemplo, ampolletas y frascos sellados, y se pueden almacenar en una condición deshidratada por congelación que requiere sólo la adición del vehículo líquido estéril inmediatamente antes del uso. La formulación de vacuna puede incluir también sistemas adyuvantes para intensificar la inmunogenicldad de la formulación, tales como sistemas de aceite en agua y otros sistemas conocidos en la técnica. La dosificación dependerá de la actividad específica de la vacuna, y puede ser determinada fácilmente mediante experimentación de rutina. Los polipóptidos de la presente invención tienen una o más funciones biológicas que son de relevancia en uno o más estados de enfermedad, en particular las enfermedades de la invención mencionadas anteriormente. Por lo tanto, es útil identificar compuestos que estimulen o inhiban la función o el nivel del polipéptido. Por consiguiente, en otro aspecto, la presente invención provee un método para seleccionar compuestos para identificar los que estimulan o inhiben la función o el nivel del polipéptido. Dichos métodos identifican agonistas o antagonistas que se pueden usar para propósitos terapéuticos y profilácticos para dichas enfermedades de la invención mencionadas anteriormente. Se pueden identificar compuestos de una variedad de fuentes, por ejemplo, células, preparaciones libres de células, bibliotecas químicas, colecciones de compuestos químicos y mezclas de productos naturales. Dichos agonistas o antagonistas identificados de esta manera pueden ser substratos naturales o modificados, ligandos, receptores, enzimas etc., como puede ser el caso, del polipóptido; un mimétlco estructural o funcional de los mismos (véase Coligan et al., Current Protocols in Inmmunology 1 (2): capitulo 5 (1991 )), o una molécula pequeña. Dichas moléculas pequeñas tienen de preferencia un peso molecular menor de 2,000 daltons, más preferiblemente entre 300 y 1 ,000 daltons, y muy preferiblemente entre 400 y 700 daltons. Se prefiere que estas moléculas pequeñas sean moléculas orgánicas. El método de selección puede medir simplemente la unión de un compuesto candidato al polipóptido, o a células o membranas que poseen el polipóptido, o una proteína de fusión del mismo, mediante una marca directamente o indirectamente asociada con el compuesto candidato. En forma alternativa, el método de selección puede implicar medir o detectar (cualitativamente o cuantitativamente) la unión competitiva de un compuesto candidato al polipóptido contra un competidor marcado (por ejemplo, agonista o antagonista). Además, estos métodos de selección pueden poner a prueba si el compuesto candidato da como resultado una señal generada por la activación o inhibición del polipóptido, usando sistemas de detección adecuados para las células que poseen el polipéptido. Inhibidores de activación se ponen a prueba en general en presencia de un agonista conocido, y se observa el efecto de la activación por el agonista mediante la presencia del compuesto candidato. Además, los métodos de selección pueden comprender simplemente los pasos de mezclar un compuesto candidato con una solución que contiene un polipéptido de la presente invención, para formar una mezcla, midiendo una actividad de los genes descritos en el cuadro I en la mezcla, y comparando la actividad de la mezcla de los genes descritos en el cuadro I, con una muestra control que no contiene compuesto candidato. Los polipéptidos de la presente invención se pueden usar en métodos convencionales de selección de baja capacidad, y también en formatos de selección de alto rendimiento (HTS). Dichos formatos de HTS incluyen no sólo el uso bien establecido de placas de microtltulo de 96 cavidades y, más recientemente, de 384 cavidades, sino también métodos emergentes tales como el método de nanocavidades descrito por Schullek et al., Anal Biochem., 246, 20-29, (1997). Proteínas de fusión, tales como las obtenidas de la porción Fe y polipéptidos de los genes descritos en el cuadro I, como se describió anteriormente, se pueden usar también para pruebas de selección de alto rendimiento para identificar antagonistas para el polipéptido de la presente invención (véase D. Bennet et al., J Mol Recognition, 8:52-58 (1995); y K. Johanson et al., J Biol Chem, 270(16): 9459-9471 (1995)). Los polinucleótidos, polipéptidos y anticuerpos para el polipéptido de la presente invención, se pueden usar también para configurar métodos de selección para detectar el efecto de compuestos añadidos sobre la producción de ARN mensajero y polipéptidos en las células. Por ejemplo, se puede construir una ELISA para medir niveles de polipéptidos secretados o niveles asociados a células, usando anticuerpos monoclonales y policlonales mediante métodos estándar conocidos en la técnica. Esto se puede usar para descubrir agentes que puedan inhibir o intensificar la producción del polipéptido (denominado también agonista o antagonista, respectivamente) a partir de células o tejidos adecuadamente manipulados. Se puede usar un polipéptido de la presente invención para identificar receptores solubles o unidos a membrana, si es que existe alguno, mediante técnicas estándar de unión a receptores conocidas en la materia. Estas incluyen, pero no están limitadas a, pruebas de entrelazamiento y de unión a ligandos, en las cuales el polipéptido es marcado con un isótopo radiactivo (por ejemplo, 125l), modificado químicamente (por ejemplo, biotinilado), o fusionado a una secuencia de péptidos adecuada para detección o purificación, e incubado con una fuente del receptor putativo (células, membranas celulares, sobrenadantes de células, extractos de tejido, fluidos corporales). Otros métodos incluyen técnicas biofísicas tales como resonancia de plasmones de superficie y espectroscopia. Estos métodos de selección se pueden usar también para identificar agonistas y antagonistas del polipéptido que compiten con la unión del polipéptido a sus receptores, si es que se produce alguna. Métodos estándar para llevar a cabo dichas pruebas, son bien conocidos en la técnica. Ejemplos de antagonistas de polipéptidos de la presente invención incluyen anticuerpos o, en algunos casos, oligonucleótidos o proteínas que están estrechamente emparentados con los ligandos, substratos, receptores, enzimas, etc., como puede ser el caso, del polipéptido, por ejemplo, un fragmento de los ligandos, substratos, receptores, enzimas, etc.; o una molécula pequeña que se une al polipéptido de la presente invención, pero que no induce una respuesta (de modo que se evita la actividad del polipéptido), Los métodos de selección pueden incluir también el uso de tecnología de transgónicos y los genes descritos en el cuadro I. La técnica para construir animales transgónicos está bien establecida. Por ejemplo, los genes descritos en el cuadro I se pueden introducir, mediante microinyección, en el pronúcleo masculino de oocitos fecundados, mediante transferencia retroviral en embriones pre- o post-implantación, o mediante inyección de células madre embrionarias genéticamente modificadas, tal como mediante electroporación, en blastocitos del hospedero. Animales transgónicos particularmente útiles, son los denominados animales "de expresión reemplazada", en los cuales el gen de un animal es reemplazado por el equivalente humano dentro del genoma de ese animal. Los animales transgónicos de expresión reemplazada son útiles en el proceso de descubrimiento de fármacos, para validación del objetivo, en donde el compuesto es específico para el objetivo humano. Otros animales transgénicos útiles son los denominados animales "de expresión bloqueada", en los cuales la expresión del ortólogo de un polipéptido del animal de la presente invención y codificado por una secuencia de ADN endógeno en una célula, es anulada parcialmente o completamente. El gen de expresión bloqueada puede ser dirigido hacia células o tejidos específicos, puede ocurrir sólo en ciertas células o tejidos como consecuencia de las limitaciones de la tecnología, o puede ocurrir en todas, o sustancialmente todas, las células del animal. La tecnología de animales transgénicos ofrece también un sistema completo de clonación y expresión en animales, en el cual los genes introducidos se expresan para dar grandes cantidades de los polipéptidos de la presente invención. Los equipos de selección para su uso en los métodos descritos anteriormente, forman un aspecto más de la presente invención. Dichos equipos de selección comprenden: (a) un polipéptido de la presente invención; (b) una célula recombinante que expresa un polipéptido de la presente invención; (c) una membrana celular que expresa un polipéptido de la presente invención; o (d) un anticuerpo para un polipéptido de la presente invención; cuyo polipéptido es de preferencia el que se describe en el listado de secuencias. Se apreciará que en el equipo, los incisos (a), (b), (c) o (d), pueden comprender un componente sustancial.
Glosario Se proveen las siguientes definiciones para facilitar el entendimiento de ciertos términos usados con frecuencia anteriormente. "Anticuerpos", como se usa en la presente, incluyen anticuerpos policlonales y monoclonales, anticuerpos quiméricos, de cadena sencilla y humanizados, así como también fragmentos Fab, incluyendo los productos de un Fab u otra biblioteca de expresión de inmunoglobulinas. "Aislado" significa alterado "por la mano del hombre" de su estado natural, es decir, si ocurre en la naturaleza, ha sido cambiado o removido de su ambiente original, o ambos. Por ejemplo, un polinucleótido o un polipéptido presente naturalmente en un organismo vivo, no está "aislado", pero el mismo polinucleótido o polipéptido separado de los materiales coexistentes de su estado natural está "aislado", como el término se usa en la presente. Además, un polinucleótido o polipéptido que se introduce en un organismo mediante transformación, manipulación genética o mediante cualquier otro método recombinante está "aislado", incluso si está aún presente en dicho organismo, cuyo organismo puede ser vivo o no vivo. "Actividad de proteína secretada o actividad de polipéptidos secretados" o "actividad biológica de la proteína secretada o los polipéptidos secretados", se refiere a la función metabólica o fisiológica de dicha proteína secretada, incluyendo actividades similares o actividades mejoradas, o estas actividades con efectos secundarios no deseables disminuidos. Incluidas también son las actividades antigénicas e inmunógenas de dicha proteína secretada. "Gen de proteína secretada" se refiere a un polinucleótido que comprende cualquiera de las secuencias de nucleótidos anexas o variantes alélicas de las mismas y/o sus complementos. "Polinucleótido" se refiere en general a cualquier "polirribonucleótido (ARN) o polidesoxirribonucleótido (ADN), el cual puede ser ARN o ADN modificado o no modificado. Los "polinucleótidos" incluyen, sin limitación, ADN de cadena sencilla y de cadena doble, ADN que es una mezcla de regiones de cadena sencilla y de cadena doble, ARN de cadena sencilla y de cadena doble, y ARN que es una mezcla de regiones de cadena sencilla y de cadena doble, moléculas híbridas que comprenden ADN y ARN que pueden ser de cadena sencilla o, más típicamente, de cadena doble, o una mezcla de regiones de cadena sencilla y de cadena doble. Además, el término "polinucleótido" se refiere a regiones de cadena triple que comprenden ARN o ADN o ARN y ADN. El término "polinucleótido" incluye también ADN o ARN que contiene una o más bases modificadas, y ADN o ARN con estructuras de base modificadas para estabilidad o por otras razones. Bases "modificadas" incluyen, por ejemplo, bases tritiladas y bases no usuales tales como inosina. Varias modificaciones se pueden hacer al ADN y ARN; de esta manera, el término "polinucleótido" abarca formas químicamente, enzimáticamente o metabólicamente modificadas de polinucleótidos, como se encuentran típicamente en la naturaleza, así como las formas químicas de ADN y ARN características de virus y células. "Polinucleótido" abarca también polinucleótidos relativamente cortos, referidos con frecuencia como oligonucleótidos. "Polipóptido" se refiere a cualquier polipóptido que comprende dos o más aminoácidos unidos entre sí mediante enlaces peptídicos o enlaces peptídicos modificados, es decir, isoósteres de póptidos. "Polipéptido" se refiere a polipéptidos de cadena corta, referidos comúnmente como péptidos, oligopóptidos u oligómeros, asi como a polipéptidos de cadena más larga, referidos generalmente como proteínas. Los polipéptidos pueden contener aminoácidos diferentes de los 20 aminoácidos codificados por genes. Los "polipéptidos" incluyen secuencias de aminoácidos modificadas mediante procedimientos naturales, tales como procesamiento de post-traducción, o mediante técnicas de modificación química que son bien conocidas en la técnica. Dichas modificaciones se describen adecuadamente en textos básicos y en monografías más detalladas, así como en una literatura de investigación voluminosa. Pueden ocurrir modificaciones en cualquier parte en un polipéptido, incluyendo la estructura de base de péptidos, las cadenas laterales de aminoácidos y los extremos amino o carboxilo. Se apreciará que el mismo tipo de modificación puede estar presente al mismo grado o grado variable en diferentes sitios en un polipóptido determinado. Asimismo, un polipóptido determinado puede contener muchos tipos de modificaciones. Los polipéptidos pueden ser ramificados como resultado de ubiquitinación, y pueden ser cíclicos, con o sin ramificación. Pueden producirse polipéptidos cíclicos y ramificados a partir de procedimientos naturales de post-traducción, o se pueden obtener mediante métodos de síntesis. Las modificaciones incluyen acetilación, acilación, ribosilación de ADP, amidación, biotinilación, unión covalente de flavina, unión covalente de una porción hem, unión covalente de un nucleótido o derivado de nucleótido, unión covalente de un lípido o derivado de lípido, unión covalente de fosfatidilinositol, entrelazamiento, ciclización, formación de enlaces disulfuro, demetilación, formación de entrelazamientos covalentes, formación de cistina, formación de piroglutamato, formilación, gamma-carboxilación, glicosilación, formación de ancla de GPI, hidroxilación, yodación, metilación, miristoilación, oxidación, procesamiento proteolítico, fosforilación, fenilación, racemización, solenoilación, sulfación, adición de aminoácidos a proteínas mediada por ARN de transferencia, tal como arginilación, y ubiquitinación (véase, por ejemplo, Proteins - Structure and Molecular Properties, segunda edición, T. E. Creighton, W. H. Freeman and Company, New York, 1993; Wold, F., Post-translational Protein Modifications: Perspectives and Prospects, 1 -12, en Post-translational Covalent Modification of Proteins, B. C. Johnson, Ed., Academic Press, New York, 1983; Seifter et al., "Analysis for protein modifications and nonprotein cofactors", Meth Enzymol, 182, 626-646, 1990, y Rattan et al., "Protein Synthesis: Post-translational Modifications and Aging", Ann NY Acad Sci, 663, 48-62, 1992). "Fragmento" de una secuencia de polipéptidos se refiere a una secuencia de polipóptidos que es más corta que la secuencia de referencia, pero que retiene esencialmente la misma función o actividad biológica que el polipéptido de referencia. "Fragmento" de una secuencia de polinucleótidos se refiere a una secuencia de polinucleótidos que es más corta que la secuencia de referencia descrita en el listado de secuencias. "Variante" se refiere a un polinucleótido o polipéptido que difiere de un polinucleótido o polipéptido de referencia, pero que retiene las propiedades esenciales de los mismos. Una variante típica de un polinucleótido difiere en secuencia de nucleótidos del polinucleótido de referencia. Los cambios en la secuencia de nucleótidos de la variante pueden alterar o no la secuencia de aminoácidos de un polipéptido codificado por el polinucleótido de referencia. Los cambios de nucleótidos pueden dar como resultado sustituciones, adiciones, deleciones, fusiones y truncamientos de aminoácidos en el polipéptido codificado por la secuencia de referencia, como se describe más adelante. Una variante típica de un polipéptido difiere en la secuencia de aminoácidos del polipéptido de referencia. En general, las alteraciones son limitadas, de modo que las secuencias del polipéptido de referencia y la variante son estrechamente similares en general y, en muchas regiones, idénticas. Una variante de polipéptido y un polipéptido de referencia pueden diferir en secuencia de aminoácidos por una o más sustituciones, inserciones o deleciones, en cualquier combinación. Un residuo de aminoácido sustituido o insertado puede ser o no codificado por el código genético. Las sustituciones conservativas típicas incluyen Gly, Ala; Val, lie, Leu; Asp, Glu; Asn, GIn; Ser, Thr; Lys, Arg; y Phe y Tyr. Una variante de un polinucleótido o polipéptido puede ocurrir naturalmente, tal como un alelo, o puede ser una variante que no se sabe que ocurre naturalmente. Se pueden obtener variantes de polinucleótidos y polipéptidos de ocurrencia no natural mediante técnicas de mutagénesis, o mediante síntesis directa. También incluidos como variantes son los polipéptidos que tienen una o más modificaciones de post-traducción, por ejemplo, glicosilación, fosforilación, metilación, ribosilación de ADP, y similares. Las modalidades incluyen metilación del aminoácido N-terminal, fosforilaciones de serinas y treoninas, y modificación de glicinas C-terminales. "Alelo" se refiere a una de dos o más formas alternativas de un gen que ocurre en un locus determinado en el genoma. "Polimorfismo" se refiere a una variación en la secuencia de nucleótidos (y secuencia de polipéptidos codificada, si es relevante) en una posición determinada en el genoma dentro de una población. "Polimorfismo de nucleótido individual" (SNP), se refiere a la ocurrencia de variabilidad de nucleótidos en una posición de nucleótidos individual en el genoma, dentro de una población. Un SNP puede ocurrir dentro de un gen o dentro de regiones intergénicas del genoma. Los SNPs se pueden poner a prueba usando amplificación específica de alelos (ASA). Para el procedimiento, se requieren por lo menos 3 iniciadores. Se usa un iniciador común en complemento inverso al polimorfismo que está siendo puesto a prueba. Este iniciador común puede estar entre 50 y 1500 pares de bases de la base polimórfica. Los otros dos (o más) iniciadores son idénticos a algún otro, excepto que la base 3' final fluctúa para acoplarse con uno de los dos (o más) alelos que constituyen el polimorfismo. Se llevan a cabo entonces dos (o más) reacciones de PCR en el ADN molde, usando cada uno el iniciador común y uno de los iniciadores específicos de alelos. "Variante de empalme", como se usa en la presente, se refiere a moléculas de ADNc producidas a partir de moléculas de ARN transcritas inicialmente a partir de la misma secuencia de ADN genómíco, pero que han sufrido empalme de ARN alternativo. El empalme de ARN alternativo ocurre cuando un transcrito de ARN primario sufre empalme, en general para la remoción de intrones, lo cual da como resultado la producción de más de una molécula de ARN mensajero, de la que puede codificar para diferentes secuencias de aminoácidos. El término variante de empalme se refiere también a las proteínas codificadas por las moléculas de ADNc anteriores. "Identidad" se refiere a una relación entre dos o más secuencias de polipéptidos o dos o más secuencias de polinucleótidos, determinada al comparar las secuencias. En general, la identidad se refiere a una correspondencia exacta de nucleótido a nucleótido o de aminoácido a aminoácido de las dos secuencias de polinucleótidos o las dos secuencias de polipéptidos, respectivamente, sobre la longitud de las secuencias que se están comparando. "% de identidad" se refiere a secuencias en donde no existe una correspondencia exacta, es decir, se puede determinar un "% de identidad".
En general, las dos secuencias que serán comparadas se alinean para dar una correlación máxima entre las secuencias. Esto puede incluir la inserción de "espacios" en una o ambas secuencias, para mejorar el grado de alineación. Se puede determinar un % de identidad sobre la longitud completa de cada una de las secuencias que se están comparando (la denominada alineación global), que es particularmente adecuada para secuencias de la misma longitud o de longitud muy similar, o sobre longitudes más cortas definidas (la denominada alineación local), que es más adecuada para secuencias de longitud desigual. "Similitud" es otra medida más sofisticada de la relación entre dos secuencias de polipóptidos. En general, la "similitud" significa una comparación entre los aminoácidos de dos cadenas de polipéptidos, sobre una base de residuo por residuo, tomando en cuenta no sólo correspondencias exactas entre pares de residuos, uno de cada una de las secuencias que se están comparando (tales como para identidad), sino también en donde no existe una correspondencia exacta si, sobre una base evolutiva, un residuo es probablemente un sustituto del otro. Esta probabilidad tiene una "puntuación" asociada a partir de la cual se puede determinar entonces el "% de similitud" de las dos secuencias. Métodos para comparar la identidad y similitud de dos o más secuencias, son bien conocidos en la técnica. De esta manera, por ejemplo, se pueden usar programas disponibles en el paquete de análisis de secuencias Wisconsin Versión 9.1 (Devereux J et al, Nucleic Acids Res, 12, 387-395, 1984, disponible de Genetics Computer Group, Madison, Wisconsin, USA), por ejemplo, los programas BESTFIT y GAP, para determinar el % de identidad entre dos polinucleótidos, y el % de identidad y el % de similitud entre dos secuencias de polipéptidos. BESTFIT usa el algoritmo de "homología local" de Smith y Waterman (J Mol Biol, 147, 195-197, 1981 , Advances in Applied Mathematics, 2, 482-489, 1981 ), y encuentra la mejor región de similitud individual entre dos secuencias. BESTFIT es más adecuado para comparar dos secuencias de polinucleótidos o dos secuencias de polipéptidos que tienen longitud diferente, el programa asumiendo que la secuencia más corta representa una porción de la más larga. En comparación, el programa GAP alinea dos secuencias, encontrando una "similitud máxima" de acuerdo al algoritmo de Neddleman y Wunsch (J Mol Biol, 48, 443-453, 970). El programa GAP es más adecuado para comparar secuencias que tienen casi la misma longitud y se espera una alineación sobre la longitud total. De preferencia, los parámetros "peso de espacios" y "peso de longitud" que se usan en cada programa son 50 y 3 para secuencias de polinucleótidos, y 12 y 4 para secuencias de polipéptidos, respectivamente. De preferencia, los por cientos de identidades y similitudes se determinan cuando las dos secuencias que se están comparando están alineadas óptimamente. Otros programas que se usan para determinar la identidad y/o la similitud entre secuencias se conocen también en la técnica, por ejemplo, la familia de programas BLAST (Altschul S F et al, J Mol Biol, 215, 403-410, 1990, Altschul S F et al, Nucleic Acíds Res., 25:389-3402, 1997, disponible del National Center for Biotechnology Information (NCBI), Bethesda, aryland, USA, y accesible a través de la página local del NCBI en www.ncbi.nlm.nih.gov) y FASTA (Pearson W R, Methods in Enzymology, 183, 63-99, 1990; Pearson W R y Lipman D J, Proc Nat Acad Sci USA, 85, 2444-2448, 1988, disponible como parte del paquete de análisis de secuencias Wisconsin). De preferencia, la matriz de sustitución de aminoácidos BLOSUM62 (Henikoff S y Henikoff J G, Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 89, 10915-10919, 1992) se usa en comparaciones de secuencias de polipóptidos, en donde las secuencias de nucleótidos son primero traducidas en secuencias de aminoácidos antes de realizar la comparación. De preferencia, el programa BESTFIT se usa para determinar el % de identidad de una secuencia de polipóptidos o un polinucleótido en cuestión con respecto a un polinucleótido de referencia o una secuencia de polipóptidos, la secuencia de referencia y la secuencia en cuestión siendo alineadas óptimamente y los parámetros del programa fijados al valor de omisión, como se describió anteriormente. El "Indice de identidad" es una medida de la relación de secuencias que se puede usar para comparar una secuencia candidato (polinucleótido o polipéptido) y una secuencia de referencia. De esta manera, por ejemplo, una secuencia de polinucleótidos candidato que tiene, por ejemplo, un índice de identidad de 0.95 en comparación con una secuencia de polinucleótidos de referencia, es idéntica a la secuencia de referencia, salvo que la secuencia de polinucleótidos candidato puede incluir en promedio hasta cinco diferencias por cada 100 nucleótidos de la secuencia de referencia. Dichas diferencias se seleccionan del grupo que consiste de por lo menos una deleción, sustitución, incluyendo transición y transversión, o inserción de nucleótidos. Estas diferencias pueden ocurrir en las posiciones 5' o 3' terminal de la secuencia de polinucleótidos de referencia, o en cualquier parte entre estas posiciones terminales, entremezcladas individualmente entre los nucleótidos en la secuencia de referencia o en uno o más grupos contiguos dentro de la secuencia de referencia. En otras palabras, para obtener una secuencia de polinucleótidos que tiene un índice de identidad de 0.95, en comparación con una secuencia de polinucleótidos de referencia, un promedio de hasta 5 en cada 100 de los nucleótidos de la secuencia de referencia se pueden eliminar, sustituir o insertar, o cualquier combinación de las mismas, como se describió anteriormente. Lo mismo se aplica a mutatis mutandis para otros valores del índice de identidad, por ejemplo, 0.96, 0.97, 0.98 y 0.99. En forma similar, para un polipóptido, una secuencia de polipéptidos candidato que tiene, por ejemplo, un índice de identidad de 0.95 en comparación con una secuencia de polipéptidos de referencia, es idéntica a la secuencia de referencia, salvo que la secuencia de polipéptidos puede incluir un promedio de hasta cinco diferencias por cada 100 aminoácidos de la secuencia de referencia. Dichas diferencias se seleccionan del grupo que consiste de por lo menos una deleción, sustitución, incluyendo sustitución conservativa y no conservativa, o inserción de aminoácidos. Estas diferencias pueden ocurrir en las posiciones amino- o carboxi-terminal de la secuencia de polipéptidos de referencia, o en cualquier parte entre estas posiciones terminales, entremezcladas individualmente entre los aminoácidos en la secuencia de referencia, o en uno o más grupos contiguos dentro de la secuencia de referencia. En otras palabras, para obtener una secuencia de polipéptidos que tenga un índice de identidad de 0.95 en comparación con una secuencia de polipéptidos de referencia, un promedio de hasta 5 en cada 100 de los aminoácidos en la secuencia de referencia puede ser eliminado, sustituido o insertado, o cualquier combinación de los mismos, como se describió anteriormente. Lo mismo se aplica para mutatis mutandis para otros valores del índice de identidad, por ejemplo, 0.96, 0.97, 0.98 y 0.99. La relación entre el número de diferencias de nucleótidos o de aminoácidos y el Indice de identidad, se puede expresar mediante la siguiente ecuación: na < xa - (xa · I), en donde: na es el número de diferencias de nucleótidos o aminoácidos, Xa es el número total de nucleótidos o aminoácidos en una secuencia descrita en el listado de secuencias, I es el índice de identidad, • es el símbolo para el operador de multiplicación, y en donde cualquier producto no entero de xa e I es redondeado hacia el entero más próximo inferior antes de sustraerlo de xa.
"Homólogo" es un término genérico usado en la técnica para indicar una secuencia de polinucleótidos o de polipóptidos que posee un alto grado de relación de secuencias con una secuencia de referencia. Dicha relación se puede cuantificar determinando el grado de identidad y/o similitud entre las dos secuencias como se definió anteriormente. Dentro de este término genérico, están los términos "ortólogo" y "parólogo". "Ortólogo" se refiere a un polinucleótido o polipéptido que es el equivalente funcional del polinucleótido o polipéptido en otra especie. "Parálogo" se refiere a un polinucleótido o polipéptido dentro de la misma especie que es funcionalmente similar. "Proteína de fusión" se refiere a una proteína codificada por dos genes fusionados con frecuencia no relacionados, o fragmentos de los mismos. En un ejemplo, el documento EP-A-0 464 533-A describe proteínas de fusión que comprenden varias porciones de región constante de moléculas de inmunoglobulina junto con otra proteína humana o parte de la misma. En muchos casos, mediante el uso de una región Fe de inmunoglobulina como parte de una proteína de fusión, es ventajoso su uso en terapia y diagnóstico que dé como resultado, por ejemplo, propiedades farmacocinóticas mejoradas [véase, por ejemplo, el documento EP-A 0232 262]. Por otra parte, para algunos usos, sería deseable poder eliminar la parte Fe después de que la proteína de fusión haya sido expresada, detectada y purificada. Todas las publicaciones y referencias incluyendo, pero no limitadas a, patentes y solicitudes de patente, citadas en esta especificación, se incorporan en su totalidad en la presente como referencia como si se indicara que cada publicación o referencia individual fuera específicamente e individualmente incorporada en su totalidad en la presente como referencia. Cualquier solicitud de patente para la cual esta solicitud reclama prioridad, se incorpora también en su totalidad en la presente como referencia, de la misma forma descrita anteriormente para publicaciones y referencias.
CUADRO 1 CUADRO 2 Localización Polipeptldo más Nombre Familia Polinucleótido más en la célula próximo por del gen del gen próximo por homología (por homología homología) Ribonucleasa pancreática de Chinchilla EMBL: CNS01 RIH brevicaudata, gi: 133205 Sbg 100367 RibonuPresente en European Van Den Berg A, Van Secretado 5RNase cleasa Molecular Biology Den Hende-Timmer L, Laboratory. Beintema JJ. 1976. Biochim Biophys Acta 453:400-9 Protefna tipo fosfoleman humana, GB: AL022345 geneseqp:W51104 Presentado directamente Presentado por (HUMA- Fosfole- Sbg101525 or Sanger ) HUMAN GENOME Unido a man (10-DIC-1999) p 6PLM Centre, Hinxton, SCI INC membrana (PLM) Cambridgeshire, CB10 Número de solicitud y 1SA, Reino Unido. fecha de publicación: W09839448-A2, 1 -SEP-98 Molécula del sistema immune humano, geneseqp:B15536 EMBL: HSBA536C5 Presentado por (INCY-) sbg 100332 Inmunoglo Presente en European Unido a INCYTE PHARM INC 8IG bulina Molecular Biology membrana Número de solicitud y Laboratory. fecha de publicación: WO200060080-A2, 12-OCT-00 GB; AJ009617 Presentado directamente co-transportador de co- (17-JUL-1998) por Na+/ glucosa en transporta sbgl 02082 MPIMG, Abt.Lehrach, Max Oryctolagus cuniculus, Unido a dor de 9SGLT Planck Institut fuer g¡:520469 Pajor, A. M. membrana Na+/ Molekulare Genetík, 1994 Biochim. Biophys. glucosa Ihnestrasse 73, Berlín, Acta 1 194 (2), 349-51. 14195, Alemania. Protefna PRO1780 GB: AC016612 humana, geneseqp: UDP- Presentado (04-DIC-1999) B24025 glucorono- Production Sequencing sbg 100545 Presentado por Unido a siltransfera Facillty, DOE Joint GENENTECH INC OUDPGT membrana sa Genome Instituto, 2800 Número de solicitud y (UDPGT) Mitchell Drive, Walnut fecha de publicación: Creek, CA 9459T, E.U.A. WO200053750-A1, 14-SEP-00 GB: AC025280 Proteína Protelna Presentado (08-MAR- secretoria DKFZp434B044 2000) por Production rica en hipotética humana, gi: sbg 100262 Sequencing Facility, DOE cistelna 13899332 Wiemann, S., OTIa Secretado Joint Genome Instituto, (CRISP) Well, B. et al. Genome 2800 Mitchell Drive, inhibidor Res. 1 1 (3), 422-435 Walnut Creek, CA 94598, de tripsina (2001 ) E.U.A.
Localización Pollpóptldo más Nombre Familia Polinucleótldo más en la célula próximo por del gen del gen próximo por homología (por homología homología) Transportador de GB: AP000350 glucosa GLUT10 de Presentado directamente humano, (10-JUN-1999) a las gl: 13540598 bases de datos de Presentado (10-FEB- DDBJ/EMBL/GenBank. 2000) Joost H.G., Transporsbg101273 titute of tador da Nobuyoshi Shimizu, Kelo Ins Unido a 2GLUT university, school of Pharmacology and membrana glucosa medicine, Molecular Toxicology, Medical Biology; 35 Faculty, Technical Shinanomachi, Shinjuku- University of Aachen, ku, Tokio 160-0016, Wendiingweg 2, Japón. Aachen, D-52057, Alemania transportador de GB- AP000350 glucosa GLUT10 de Presentado directamente humano, (10-JUN-1 S99) a las gi: 13540598 bases de datos de Presentado (10-FEB- DDBJ/EMBUGenBank. 2000), Joost H.G., Transporsbg101273 Nobuyoshi Shimizu, Keio Institute of Unido a tador de 2GLUTb University, School of Pharmacology and membrana glucosa Medicine, Molecular Toxicology, Medical Biology; 35 Faculty, Technical Shinanomachi, Shinjuku- University of Aachen, ku, Tokio 160-0016, Wendiingweg 2, Japón. Aachen, D-52057, Alemania EMBLAL354819, y SC:AL590007. Presentado (30-ABR-2001 Protelna de matriz y 04-MAYO-2001 ) por extracelular blastocelar embrionaria de Proteo- Sanger Centre, Hlnxton, Cambridgeshire, CB10 Lytechlnus variegatus, glucano sbg101817 1 SA, Reino Unido. gi:9837426 de sulfato 2CSP EMBL: AC0171 11 , Presentado (14-JUL- Secretado de Presentado (09-DIC- 2000) Biological condro ¡ti1999), Genome Sciences, Carnegie na Sequencing Center, Mellon University, 4400 Washington University Fifth Ave, Pittsburgh, School of Medicine, 4444 PA 15213, E.U.A. Forest Park Parkway, St. Louis, MO 63108, E. U.A. Proteína del ERGL de GB: AC020705 humano, gi: 11141891 Proteína Presentado (08-ENE- Presentado (06-SEP- interme2000), Genome sbgl 00457 diaría del 2000), Laboratory of Sequencing Center, Unido a OERGIC Molecular Biology, NCI, compartiWashington University membrana NIH, 37 Convent Dr., mento del School of Medicine, 4444 Bldg. 37, Rm. 4B20, ER-Golgi Forest Park Parkway, St Bethesda, MD 20892, Louis, MO 63108, E.U.A. E. U.A.
CUADRO 3 Nombre Enfermedades Usos del gen asociadas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg960509 cbrecpt en el tratamiento o diagnóstico de cáncer. Un homólogo cercano de sbg960509cbrecpt es Langerin. Langerin era una lectina tipo II dependiente de Ca2+, un receptor endocltico y expresado por células de Langerhans (LC). La transfección de ADNc de Langerin en fibroblastos, creó una red compacta de estructuras de membrana con características típicas de gránulos de Birbeck (BG). Se propuso que la inducción de BG era una consecuencia de la función de captura del antígeno por Langerin, permitiendo buscar en estos organelos, y proveyendo acceso a una vía no clásica de procesamiento del antígeno (Valladeau J, Ravel O, Trastorno sbg960509 Dezutter-Dambuyant C, oore , Kleljmeer M, Liu Y, Duvert- autoinmune y cbrecpt Frances V, Vincent C, Schmitt D, Davoust J, Caux C, Lebecque cáncer S, Saeland S. 2000. Immunity Ene; 12(1 ):71 -81 ). Se encontró una incongruencia notable entre transcritos variablemente empalmados para el segundo polipéptido receptor de asialoglucoproteína, H2, en células de hígado de humano normales y transformadas (Paietta E, Stockert RJ, Racevskis J. 1992. Hepatology Mar;15(3):395-402). Se demostró que la lectina tipo C de la superficie celular de macrófagos humanos reconoce a Tn Ag, un epltope bien conocido asociado a carcinoma humano (Suzuki N, Yamamoto K, Toyoshima S, Osawa T, lrimura T.1996, J Immunol Ene 1; 156(1 ): 128-35). Una modalidad de la Invención, es el uso de sbg614l26complfH en el diagnóstico o tratamiento de cáncer, enfermedad de Alzheimer y/o evasión de células tumorales. Un homólogo cercano de sbg614126complfH es el factor H de complemento humano. Se detectó el factor H de complemento humano mediante el anticuerpo AM34 en el fluido cerebroespinal de un paciente con enfermedad de Alzheimer. Se encontró recientemente que AM34 era capaz de teñir placas seniles Enfermedad de positivamente, y que el factor H estaba asociado con placas Alzheimer, seniles en el cerebro humano (Honda S, Itoh F, Yoshimoto M, cáncer, Ohno S, Hinoda Y, Imai K. 2000 J Gerontol A Blol Sel Med Sel. metástasis May,55(5): 265-9). Se sugirió también que la resistencia tumoral y sbg614126 excepcional de células de glioblastoma H2 humanas a la síndrome cornplfH destrucción mediada por el complemento, se debió a la urémico producción y unión del factor H y protelna 1 tipo factor H hemolltico (Junnikkala S, Joklranta TS, Friese MA, Jarva H, Zipfel PF, Merl atlpico recesivo S. 2000. J Immunol. Jun 1 ; 164(11 ):6075-81 ). Además, se mostró autosómico que el factor H se une a la sialoprotefna y osteopontina del hueso, y permite la evasión de células tumorales del ataque mediado por el complemento (Fedarko NS, Fohr B, Robey PG, Young F, Fisher LW. 2000. J Biol Chem. Jun 2;275(22): 16666- 72). Por último, la mutación del gen del factor H del complemento estuvo asociada con síndrome urémico hemolltlco atíplco recesivo autosómlco (Ylng L, Katz Y, Schleslnger , Carmi R, Shalev H, Haider N, Beck G, Sheffield VC, Landau D 1999. Am J Hum Genet Dic;65(6): 1538^6).
Nombre Enfermedades Usos del gen asociadas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg120703RNase como herramienta para la terapia contra el cáncer, y el tratamiento de trastornos relacionados con la apoptosis. Se ha mostrado que una ribonucleasa pancreática diseñada genéticamente tiene acción citotóxica sobre células tumorales de humano y de ratón, pero carece de toxicidad apreciable sobre células normales de ratón y humano Esta variante de ribonucleasa pancreática humana, sensibilizó selectivamente a células derivadas de un tumor de tiroides Sbg120703 Cáncer e humano a la muerte apoptótlca. Debido a su selectividad por RNase infección las células tumorales, y debido a su origen humano, se piensa que esta proteína representa una herramienta promisoria para la terapia contra el cáncer (Piccoli R, Di Gaetano S, De Lorenzo C, Grauso M, Monaco C, Spalletti-Cernia D, Laccetti P, Cinatl J, Matousek J, D'Alessio G. 1999. Proc Nati Acad Sci U S A 96:7768-73). Además, la ribonucleasa misma se puede usar para tratar una Infección por virus de ARN, y su antagonista puede ser útil en el tratamiento de trastornos relacionados con la apoptosis. Una modalidad de la Invención, es el uso de sbg98530TS en procesos de cicatrización de heridas, desarrollo del sistema nervioso e influencia sobre la angiogénesis o la supervivencia y migración celulares. Homólogos cercanos de sbg98530TS son las trombospondinas. Las trombospondinas son una familia de proteínas presentes ampliamente en la matriz extracelular embrionaria, y los patrones de expresión y propiedades in vitro de muchas trombospondinas sugieren funciones potenciales en la gula de migración de células y de Cáncer, conos del crecimiento, especialmente durante el desarrollo del sbg98530T trastornos de la sistema nervioso (Adams JC, 2000. Tucker RP Dev Dyn S cicatrización de 218:280-99). Las interacciones celulares con matrices heridas extracelulares son importantes para los cambios patológicos que ocurren durante la transformación celular y la tumorigónesls. Se ha sugerido que la trombospondina-1 modula el fenotipo del tumor al Influir sobre la angiogénesis o la supervivencia y migración celulares (Liaw L, Crawford HC. 1999. Braz J Med Biol Res 32:805-12). Además, la trombospondina-1 es también un componente transitorio de la matriz extracelular en el desarrollo y reparación de tejidos (Adams JC. 997. Int J Blochem Cell Biol 29:861-5). Una modalidad de la invención, es el uso de sbg563917RDP en el tratamiento o diagnóstico de insuficiencia renal crónica y cristalino envejecido y cataratas del ojo. Homólogos cercanos de sbg563917RDP, son dipeptidasas renales y del cristalino. Enfermedades Se ha reportado que la actividad de dipeptidasa renal fue renales, notablemente menor en el grupo con Insuficiencia renal sbg563917 envejecimiento, crónica (Fukumura Y, Kera Y, Oshitani S, Ushijima Y, RDP cataratas, cáncer Kobayashi I, LiuZ, Watanabe T, Yamada R, Kikuchi H, y enfermedad de Kawazu S y Yabuuchi M. 1999 Ann Clin Biochem Mar;36 Alzheimer (Parte 2):221-5). En contraste, se detectó actividad incrementada de dipeptidasa en el cristalino en envejecimiento y cataratas (Sulochana KN, Ramakrishnan S y Punitham R.1999 Br J Ophthalmol Jul;83(7):885).
Nombre Enfermedades Usos del gen asociadas Enfermedades Una modalidad de la invención, es el uso de sbg618069LRR asociadas con en el tratamiento o diagnóstico de desarrollo neural y los proteínas tango, trastornos del sistema nervioso del adulto. Homólogos trastornos cercanos de sbg618069LRR, son proteínas de repetición ricas asociados con la en leucina. Se ha mostrado que la proteina de repetición rica preservación y el en leucina, spineless-arístapedia, interactúa con las proteínas mantenimiento de tango bHLH-PAS para el control del desarrollo antenal y tarsal la glucosa en Drosophila (Emmons RB, Duncan D, Estes PA, Kiefel P, gastrointestinal, y Mosher JT, Sonnenfeld , Ward MP, Duncan I y Crews ST. la reparación de 1999. Development Sep; 126(17):3937-45). En el ratón, lesiones mucosas sbg618069 moléculas de ARN mensajero de NLRR-1 y NLRR-2 de agudas y LRR repetición rica en leucina neuronales, fueron expresadas crónicas, principalmente en el sistema nervioso central, y pueden enfermedad de desempeñar funciones significativas pero diferentes en el Parkinson, desarrollo neural y en el sistema nervioso del adulto (Taguchi enfermedad de A, Wanaka A, Morí T, Matsumoto K, Imal Y, Tagaki T y Alzheimer, AIS, Tohyama M. 1996. Brain Res Mol Brain Res Ene; 35(1 -2): 31- neuropatías, 40). Además, un miembro nuevo de la superfamilia GAC1 de cáncer, repetición rica en leucina, fue amplificado y sobreexpresado reparación de en gliomas malignos (Almeida A, Zhu XX, Vogt N, Tyagi R, tejidos y Mulerls M, Dutrillaux AM, Dutrillaux B, Ross D, Malfoy B y cicatrización de Hanash S. 1998. Oncogene Jun 11 ,16(23):2997~3002). heridas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg934 14Relaxin en el tratamiento o diagnóstico de remodelación de colágena, cáncer de mama y trastornos contráctiles uterinos. Un homólogo cercano de sbg9341 14Relaxin es Relaxin. Relaxin tiene varias actividades biológicas diferentes, incluyendo la inducción de remodelación de colágena y ablandamiento consecuente de los tejidos del canal del parto durante el parto, la inhibición de la actividad contráctil uterina, y la estimulación del crecimiento y la diferenciación de la glándula mamaria (Bani D. 1997. Gen Cáncer, Pharmacol 28: 13-22). Relaxin pertenece a la superfamilia de enfermedades la insulina, y es producida principalmente por el cuerpo lúteo reumáticas, en mujeres embarazadas y no embarazadas. En hombres, enfermedades sbg9341 14 relaxin es sintetizada en la próstata y liberada en el fluido cardiacas, Relaxin seminal (Goldsmith LT, Weiss G, Steinetz BG. 1995. esclerosis Endocrinol Metab Clin North Am 24: 171-86). Se ha sistémica demostrado también que relaxin regula el crecimiento y la (escleroderma) y diferenciación de las células del cáncer de mama en cultivo, parto antes de promueve la dilatación de vasos sanguíneos en varios término órganos, incluyendo el útero, la glándula mamaria, el pulmón y el corazón, tiene una acción cronotróplca sobre el corazón, inhibe la liberación de hlstamlna por células cebadas, deprime la agregación de las plaquetas y su liberación por los megacariocitos, e influye sobre la secreción de hormonas por la glándula pituitaria (Bani D. 1997. Gen Pharmacol 28: 13-22). Además, algunos reportes han mostrado que Relaxin es efectiva para disminuir la intervención de la piel en esclerosis sistémica (Furst DE. 199T. Curr Opin Rheumatol 10.123-8).
Nombre Enfermedades Usos del gen asociadas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg99174LOX- like en el tratamiento o diagnóstico de función endotelial o aterosclerosis. Un homólogo cercano de sbg99174LOX-like es el receptor 1 de lipoprotelna de baja densidad oxidada. sbg99174LOX-like, asi como también el receptor 1 de llpoprotefna de baja densidad oxidada, contiene un dominio de Trastornos lectlna tipo c (CTL) (Colonna M, Samaridis J, Angman L. 2000 cardiovasculares sbg99174L Eur J Immunol 30:697-704). La evidencia sugiere que la (por ejemplo, OX-like lipoprotelna de baja densidad oxidada (OxLDL) desempeña aterosclerosis, una función critica en los cambios de la función endotelial. El hipertensión, receptor de OxLDL tipo lectlna (LOX-1 ), es el receptor de apoplejía) OxLDL endotelial principal. Cambios funcionales de las células endoteliales están Implicados en la etapa más temprana de la patogénesis de la aterosclerosis (Aoyama T, Sawamura T, Furutanl Y, Matsuoka R, Yoshida C, Fujiwara H, asaki T. Biochem J. 1999 339 (Parte 1 ): 177-84). Una modalidad de la Invención, es el uso de sbg995002PIGR para transportar activamente IgA e Ig hacia la superficie apical de los epitelios. Un homólogo cercano de Infección e sbg995002PIGR es el receptor de inmunoglobulina polimérico. inflamación tal El receptor de inmunoglobulina polimérico se une a IgA e IgM como poliméricas en la superficie basolateral de las células enfermedad epiteliales. Ratones con expresión bloqueada de PIGR sbg995002 inflamatoria del carecen por completo de translocación externa activa de IgA e PIGR intestino, IgM, pero continúan siendo normales y fértiles (Johansen FE, enteropatla Pekna M, NorderhAGO IN, Haneberg B, Hietala MA, Krajci P, sensible a gluten Betsholtz C, Brandtzaeg P. 1999. J Exp Med 190:915-22). e infección del Además, se ha reportado que PIGR puede ser sobrerregulado tracto urinario por el factor de necrosis tumoral (FNT)-alfa (Takenouchi- Ohkubo N, Takahashl T, Tsuchiya M, Mestecky J, oldoveanu Z, Moro I; 2000. Immunogenetics 51 :289-95). Una modalidad de la invención, es el uso de sbg1033026C1q para regular funciones del sistema nervioso central. Un homólogo cercano de sbg1033026C1 q es el factor relacionado a C1 q. C1 q es una subunidad del complejo de enzima C1 que activa al sistema de complemento del suero Se ha mostrado que el transcrito del factor relacionado a C1 q (CRF) humano, es expresado a niveles más altos en el cerebro, en particular en el tallo cerebral. En forma similar, en el cerebro del ratón, los transcritos de CRF son más abundantes en áreas del sistema nervioso que intervienen en Trastornos del sbgl 03302 6C1 q la función motora (Berube NG, Swanson XH, Bertram MJ, sistema nervioso Kittle JD, Dídenko V, Baplel DS, Smith JR y Pereira-Smlth central OM., 1999, Brain Res. Mol. Braín Res. 63:233-240). Además, ACRP30 es estructuralmente similar al factor de complemento C1 q, y forma grandes homoolígómeros que sufren una serie de modificaciones de post-traducclón. Las proteínas ACRP30 pueden ser un factor que participa en el sistema balanceado complejo de homeostasis de energía que interviene en la ingestión de alimentos, catabolismo de carbohidratos y catabolismo de Kpidos (Scherer PE, Williams S, Fogliano M, Baldlni G, Lodish HF; 1995; J Blol Chem 270:26746-9).
Nombre Enfermedades Usos del gen asociadas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg1020829SGLT para regular el transporte de glucosa dependiente de Na(+). Un homólogo cercano de sbg1020829SGLT son los cotransportadores de Na+/glucosa. El cotransportador de Na+/glucosa intestinal humano (SGLT1 ), fue clonado y secuenciado. Se observó homología estrecha entre los cotransportadores de Na+/glucosa intestinal de conejo Cáncer, Infección, y de humano, y se encontró una homología significativa entre trastorno estos y el cotransportador de Na+/prolina (putP) de Escherichie autoinmune, col!, indicando que los cotransportadores de Na+/glucosa de trastorno mamíferos y de Na+/prollna de procariontes, comparten un gen hematopoyótíco, sbgl 02082 ancestral común (Hediger MA, Turk E, Wright EM. 1989 Proc trastornos de la 9SGLT Nati Acad Sci U S A Ago;86(15):5748-52). Además, el estudio cicatrización de de biopsias intestinales de pacientes con mala absorción de heridas, glucosa/galactosa (GCM), ha revelado un defecto especifico en inflamación y la absorción de glucosa dependiente de Na(+) en el borde en mala absorción de cepillo. Se encontró una mutación sin sentido individual en glucosa/galactosa SGLT1 amplificado a partir del ADN genómico derivado de miembros de una familia afectada con GG . Este SGLT1 mutado cosegregó con el fenotipo de GGM, y dio como resultado una pérdida completa del transporte de glucosa dependiente de Na(+) en oocrtos de Xenopus inyectados con este ARN complementario (Turk E, Zabel B, Mundlos S, Dyer J, Wright EM. 1991 Nature Mar 28;350(6316):354-6). Una modalidad de la invención, es el uso de sbg1005450UDPGT para regular el catabolismo de andrógenos y estrógenos en tejidos objetivo de esteroides periféricos. Un homólogo cercano de sbg1005450UDPGT es el gen de UDP-glucuronoslltransferasa (UDPGT), Se hablan encontrado mutaciones en el promotor y regiones de codificación del gen de UDP-glucuronosiltransferasa (UDPGT) Cáncer, infección, en siete pacientes con síndrome de Crigler-Najjar tipo II causado trastorno por reducción en la actividad de bílirrublna hepática UDPGT autoinmune, (Yamamoto K, Soeda Y, Kamlsako T, Hosaka H, Fukano M, trastorno Sato H, Fujiyama Y, Adachi Y, Satoh Y, Bamba T. 1998. J Hum hematopoyético, Genet 43(2):111-4). Se reportó también un caso de síndrome de trastornos de la Gilbert causado por una mutación sin sentido homocigótica del cicatrización de gen de UDPGT de bilirrubina (Mamo Y, Sato H, Yamano T, heridas, sbg 100545 Doida Y, Shimada M. 1998. J Pediatr Jun; 132(6): 1045-7). inflamación, OUDPGT Además, se habla clonado UDPGT UGT1A9 de ratón, y el ARN síndrome de mensajero fue expresado en tejidos extrahepáticos sensibles a Gilbert, síndrome estrógeno, indicando su función potencial en el metabolismo de de Crigler-Naijar estrógenos (Albert C, Vallee M, Beaudry G, Belanger A, Hum (CN) tipo II y mal DW. 1999. Endocrinology Jul;140(7):3292-302). El transcrito de funcionamiento UDPGT UGT2B23 de humano fue expresado también en tejidos del catabolismo extrahepáticos, incluyendo próstata, glándula mamaria, de hormonas epldldlmo, testículo y ovario. Se puso a prueba la actividad de esteroides UGT2B23 con 62 substratos endógenos potenciales, y se demostró que es activo sobre 6 esteroides y el ácido biliar, ácido hiodesoxicólico, sugiriendo que UGT2B23 podría desempeñar una función importante en el catabolismo de estrógenos y andrógenos en tejidos objetivo de esteroides periféricos (Barbier O, Levesque E, Belanger A, Hum DW. 1999. Endocrinology Dic; 140( 2):553& 8).
Nombre Enfermedades Usos del gen asociadas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg1002620Tla para regular células tumorales humanas. Un homólogo Cáncer, infección, cercano de sbg1002620Tla es la protelna hipotética humana trastorno DKFZp434B044. Este gen es también similar al inhibidor de autoinmune, tripsina que contiene la familia Sc7 de dominios extracelulares trastorno en su región N-terminal (Genome Res. 11 (3), 422-435 hematopoyético, (2001 )) La secuencia de P25TI del inhibidor de tripsina trastornos de la CRISP tuvo similitud con proteínas de la familia P25TI, cicatrización de Incluyendo alérgenos del veneno de insectos, proteínas heridas, Inflamación, especificas do testículo de mamífero y proteínas relacionadas trastornos de la sbg 100262 con la patogénesis de plantas. ARN mensajero que codifica para coagulación OTIa P25TI y otras dos proteínas relacionadas con la patogénesis por sanguínea, gliomas GliPR y RTVP-1, las cuales se mostró también son trastornos de la estructuralmente similares a las proteínas de la familia CRISP, adhesión celular, fue expresado con frecuencia en tejidos tumorales humanos, pancreatitis, choque, pero no detectado en líneas de células de tejido humano normal falla de órganos (Yamakawa T, Miyata S, Ogawa N, Koshikawa N, Yasumitsu H, múltiples y anamorl T, Miyazaki K 1998. Biochim Biophys Acta Ene 21 ; ulceración 1395(2):202-8,, urphy EV, Zhang Y, Zhu W, Blggs J. 1995. gastrointestinal Gene Jun 14; 159(1 ):131-5„ Rlch T, Chen P, Furman F, Huynh N, Israel MA.1996. Gene Nov 21 ;180(1-2):125-30). Una modalidad de la Invención, es el uso de sbg1002620Tlb como marcador para algunos tumores del sistema nervioso, y para regular la expresión de neuroblastomas y glloblastomas humanos. Un homólogo cercano de sbg1002620Tib es la protelna pulmonar 1 de gestación tardía (LGL1 ). La protelna pulmonar 1 de gestación tardía (LGL1 ) mostró 81% de homología con P25TI, el inhibidor de tripsina purificado a partir del medio de cultivo de células de glloblastoma humano (Kaplan F, Ledoux P, Kassamall FQ, Gagnon S, Post M, Koehler D, Deimllng J, Sweezey NB. 1999. Am J Physlol Cáncer, Infección, Jun;276(6 Parte 1 ):L1027-36; Koshikawa N, Nakamura T, trastorno Tsuchiya N, Isaji M, Yasumitsu H, Umeda M, Miyazaki K. autoinmune, 1996. J Biochem (Tokio) Feb; 1 19(2):334-9). Se aisló el ADNc trastorno que codifica para P25TI, y la secuencia tuvo similitud con las hematopoyético, proteínas de la familia CRISP, incluyendo alérgenos del veneno trastornos de la de insectos, proteínas específicas de testículo de mamífero y cicatrización de proteínas relacionadas con la patogénesis de plantas. El ARN heridas, inflamación, sbg 100262 mensajero de P25TI fue expresado con frecuencia en trastornos de la OTIb neuroblastomas y glioblastomas humanos, pero no detectado en coagulación líneas de células de tejidos humanos normales (Yamakawa T, sanguínea, Miyata S, Ogawa N, Koshikawa N, Yasumitsu H, Kanamorl T, trastornos de la Miyazaki K 1998. Biochim Biophys Acta Ene 21 ; 1395(2):202- adhesión celular, 8). Se mostró también que otras dos proteínas relacionadas con pancreatitis, choque, la patogénesis por gliomas, GIIPR y RTVP-1, son falla de órganos estructuralmente similares a las proteínas de la familia CRISP, múltiples, y El gen de GLIPR fue altamente expresado en el tumor cerebral ulceración humano, glioblastoma multifonrne/astrocltoma, pero no en tejido gastrointestinal cerebral de adulto o fetal normal, ni en otros tumores del sistema nervioso (Murphy EV, Zhang Y, Zhu W, Bíggs J. 1995. Gene Jun 14;159(1): 131-5). Especies múltiples de ARN mensajero de RTVP-1 fueron altamente expresadas en un panel de lineas de células de tumores del sistema nervioso que surgen de la glía; en contraste, la expresión de estas moléculas de ARN fue baja o faltó en lineas de células tumorales del sistema nervioso no derivadas de la glla (Rich T, Chen P, Furman F, Huynh N, Israel ??199T. Gene Nov 21;180(1-2):125-30).
Nombre Enfermedades Usos del gen asociadas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg102200MCTa en la regulación de células cancerosas, Incluyendo los linajes hematopoyétlcos, llnfoma de Burkltt y células de tumor sólido. Un homólogo cercano de sbg1 02200MCTa es MCT1 de hámster chino y ratón. El cotransportador de H+ - monocarboxllato de ratón (MCT1 ), rué clonado y secuenclado a partir de células tumorales de Ehrlich Lettre; la secuencia de MCT1 es 93% y 87% homóloga con CT1 de hámster chino y humano, respectivamente. El tratamiento con N- glicanasa-F y experimentos de traducción in vitro, demostraron que no se requería gllcosllación para la función de MCT1 (Carpenter L, Cáncer, infección, Reservae RC, Halestrap AP. 1 996. Blochlm Biophys Acta Mar trastorno 13;1279(2):157-63). Se encontró que el transportador de aulolnmune, monocarboxllato de pollo MCT3 clonado a partir de la genoteca de trastorno sbg102200M ADNc del epitelio pigmentario retlnlano (RPE), sólo se expresaba en hematopoyético, CTa células RPE. Una linea de células epiteliales de tiroides de rata, trastornos de la FRTL, transfectada con pCI-neo MCT3, mostró mejor captación de cicatrización de plruvato, sugiriendo que MCT3 puede regular loa niveles de lactato en heridas, e el espacio de los Interfotorreceptores (Yoon H, Fanelll A, Grollman EF, Inflamación Phllp NJ. 1997. Blochem Biophys Res Commun May 8,234(1 ):90-4). En el humano, MCT2 habla sido implicado como un transportador de piruvato primarlo en el hombre. Se encontró que las moléculas de ARN mensajero de MCT1 y MCT2 coexpresaban en varias lineas de células de cáncer humano, Incluyendo los llnajee hematopoyétlcos HL60, K562, MOLT-4, Rajl, llnfoma de Burkltt, y células de tumor sólido tales como SW480, A549 y G361 . Estos hallazgos sugirieron que los MCT1 y MCT2 humanos pueden tener funciones biológicas diferentes (Lln RY, Vera JC, Chaganti RS, Golde DW. 1998. J Biol Chem Oct 30;273(44):28959-65). Una modalidad de la Invención, es el uso de sbg102200MCTb en la regulación de células cancerosas, incluyendo los linajes hematopoyétlcos, llnfoma de Burkltt y células de tumor sólido. Un homólogo cercano de sbgl 02200MCTb es MCT1 de hámster chino y ratón. El cotransportador de H+ - monocarboxllato de ratón (MCT1 ), Tue clonado y secuenclado a partir de células tumorales de Ehrlich Lettre; la secuencia de MCT1 es 93% y 87% homóloga con MCT1 de hámster chino y humano, respectivamente. El tratamiento con N- gilcanaea-F y experimentos de traducción ¡n vitro, demostraron que no se requería gllcosllación para la función de MCT1 (Carpenter L, Reservae RC, Halestrap AP. 1 996. Blochim Biophys Acta Mar Cáncer, infección, 13;1279(2): 1 57-63). Se encontró que el transportador de trastorno monocarboxllato de pollo MCT3 clonado a partir de la genoteca de autoirmune, sbg102200M ADNc del epitelio pigmentario retiniano (RPE), sólo se expresaba en trastorno CTb células RPE. Una linea de células epiteliales de tiroides de rata, hematopoyético, FRTL, transfectada con pCI-neo/6MCT3, mostró mejor captación de trastornos de la plruvato, sugiriendo que MCT3 puede regular los niveles de lactato en cicatrización de el espacio de los Interfotorreceptores (Yoon H, Fanelll A, Grollman EF, heridas e Inflamación Phllp NJ. 1997. Blochem Biophy3 Res Commun May 8;234(1 ):90-4). En el humano, MCT2 habla sido Implicado como un transportador de plruvato primario en el hombre. Se encontró que las moléculas da ARN mensajero de MCT1 y MCT2 coexpresaban en varias lineas de células de cáncer humano, Incluyendo loe linajes hematopoyétlcos HL60, K562, MOLT-4, Rajl, llnfoma de Burkltt, y células de tumor sólido tales como SW480, A549 y G361 . Estos hallazgos sugirieron que los MCT1 y MCT2 humanos pueden tener funciones biológicas diferentes (Lln RY, Vera JC, Chaganti RS, Golde DW. 1998. J Biol Chem Oct 30;273(44);28959-65).
Nombre Enfermedades Usos del gen asociadas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg 020380LYG en el sistema Inmune e intensificación de la actividad de Inmunoagentes, y puede servir como Cáncer, biomarcadores de la actividad de enfermedad Infección, periodontal. Homólogos cercanos de sbg1020380LYG trastorno son las lisozimas. Las llsozimas son agentes de autoinmune, sbg 10203 defensa bacteriolltlcos, y han sido adaptados para trastorno cumplir una función digestiva (Qasba PK, Kumar S, 80LYG hematopoyético, 1997, C t Rev Blochem Mol Biol 32:255-306). Las trastornos de la lisozimas de tejidos y fluidos corporales intervienen en cicatrización de el sistema inmune, e intensifican la actividad de los heridas e inmunoagentes. Las lisozimas pueden servir como inflamación biomarcadores de actividad de enfermedad periodontal, a partir de su origen de células inflamatorias (Eley BM y Cox SW, 1998, Br Dent J 184:323-8), Una modalidad de la invención, es el uso de sbg 007026SGLT, un cotransportador de glucosa y sodio en humanos, en la regulación de la mala absorción de glucosa/galactosa (GGM), glucosuria renal familiar y trastornos renales diabéticos. Homólogos cercanos de sbg1007026SGLT son otros cotransportadores de glucosa y sodio de humanos y conejos. Los cotransportadores de glucosa y sodio en humanos son responsables de la acumulación activa de Mala absorción glucosa en las células (Hediger MA, Turk E, Wright EM. de 1989. Proc Nati Acad Sci U S A 86:5748-52), El glucosa/galacto sbg 10070 cotransportador de glucosa y sodio renal puede estar sa (GGM), relacionado con la fisiopatología de enfermedades glicosuria renal 26SGLT renales tales como glicosuria renal familiar y trastornos familiar y renales diabéticos (Kanai Y, Lee WS, You G, Brown D, trastornos Hediger MA, 1994. J Clin Invest 93:397-404), Además, renales el estudio de pacientes con mala absorción de diabéticos glucosa/galactosa (GGM), ha revelado un defecto específico en la absorción de glucosa dependiente de sodio en el borde en cepillo, y la desnldrataclón y diarrea severas consecuentes causadas por la mala absorción de glucosa/galactosa, son usualmente letales, a menos que estos azúcares sean eliminados de la dieta (Turk E, Zabel B, Mundlos S, Dyer J, Wright EM. 1991 Nature 350:354-6).
Nombre Enfermedades Usos del qen asociadas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg1012732QLUT en el mantenimiento de la homeostasls y el metabolismo celulares. Homólogos cercanos de sbg1012732GLUT son los transportadores de glucosa de transmembrana (gluts). La captación de glucosa se logra mediante los transportadores de glucosa de transmembrana (gluts), y el transporte de glucosa a través de las membranas plasmáticas es Importante para el mantenimiento da la homeostasls y el metabolismo celulares. La glucosa es absorbida por las células, y fosforllada entonces hasta glucosa-6-fosfato, y el uso de la glucosa por las células cancerosas se intensifica ampliamente cuando se Tumores, compara con la del tejido normal. El tejido tumoral se asocia con nefropatla sbg1012732 frecuencia con la expresión anormal y/o sobreexpreslón de los diabética e GLUT transportadores de glucosa, especialmente glutl (Smith TA. 1999. Br hlpogllcemia J Biomed Sel 56:285-92). El uso Incrementado de glucosa en células Inducida por glomerulares, causa la expresión y actividad Incrementadas de aldosa Insulina reductasa, proteína clnasa C y TGF-beta, las cuales han sido implicadas en la acumulación excesiva en la matriz extracelular en netropatla diabética (Z Katedry 1 Zakladu Patoflzjologll, Akaemll Medycznej w Poznanlu. 1999. Przegl Lek 56:793-9). Los cambios en el transporte de la glucosa endotelial y la abundancia de GLUT1 en las barreras del cerebro y la retina, pueden afectar severamente la liberación de glucosa hacia estos tejidos, e Implicaciones importantes en el desarrollo de dos complicaciones diabéticas importantes, hlpogllcemia inducida por Insulina y retinopatla diabética (Kumagai AK. 1999. Diabetes Metab Res Rev 15:261-73). Una modalidad de la Invención, es el uso de sbg10l2732GLUTb en el mantenimiento de la homeostasls y el metabolismo celulares. Homólogos cercanos de sbg1012732GLUTb son los transportadores de glucosa de transmembrana (gluts). La captación de glucosa se logra mediante los transportadores de glucosa de transmembrana (gluts), y el transporte de glucosa a través de las membranas plasmáticas es importante para el mantenimiento de la homeostasis y el metabolismo celulares. La glucosa es absorbida por las células, y Tosforilada entonces hasta glucosa-6-fosrato, y el uso de la glucosa por las células cancerosas se Intensifica ampliamente cuando se Tumores, compara con la del tejido normal. El tejido tumoral se asocia con nefropatla 6bg1012732 frecuencia con la expresión anormal y/o sobreexpreslón de los diabética e GLUTb transportadores de glucosa, especialmente glutl (Smlth TA. 1999, Br hipogllcemla J Biomed Sci 56:285-92). El uso incrementado de glucosa en células Inducida por glomerulares, causa la expresión y actividad Incrementadas de aldosa insulina reductasa, proteína cinasa C y TGF-beta, las cuales han sido Implicadas en la acumulación excesiva en la matriz extracelular en nefropatla diabética (Z Katedry I Zakladu Patoflzjologll, Akaemll Medycznej w Poznaniu. 1999. Przegl Lek 56:793-9). Los cambios en el transporte de la glucosa endotelial y la abundancia de GLUT1 en las barreras del cerebro y la retina, pueden afectar severamente la liberación de glucosa hacia estos tejidos, e implicaciones importantes en el desarrollo de dos complicaciones diabéticas Importantes, hlpogllcemia Inducida por Insulina y retinopatla diabética (Kumagai AK. 1999. Diabetes Metab Res Rev 15:261 -73).
Nombre Enfermedades Usos del gen asociadas Una modalidad de la invención, es el uso de sbg1018172CSP en la regulación de melanoma, trastornos autoinmunes, trastorno hematopoyético, trastornos de la cicatrización de heridas e inflamación. Un homólogo cercano de sbg1018172CSP, es la protelna del núcleo de proteoglucano de sulfato de condroitlna asociada a melanoma (MCSP) NG2. La proteína del núcleo de MCSP NG2 puede actuar como un Melanoma, correceptor para difusión y formación de contacto focal en infección, asociación con alfa 4 beta integrina en células de melanoma trastorno (llda J, Meijne AM, Spiro RC, Roos E, Furcht LT, McCarthy autoinmune, sbg101817 JB. 1995. Cáncer Res Mar 15;55(10):2177-85). La clonación trastorno 2CSP de MCSP, reconocida por el mAb 9.2.27, mostró que la hematopoyético, protelna del núcleo contenía un marco de lectura abierto de trastornos de la 2322 aminoácidos, que abarcaba un dominio extracelular cicatrización de grande, una reglón de transmembrana hidrofóbica y una cola heridas e citoplásmlca relativamente corta. Se detectó ARN de MCSP Inflamación en lineas de células de melanoma humano y en biopsias preparadas a partir de metástasis de piel de melanoma, pero no en otras células cancerosas humanas o una variedad de tejidos fetales y de humano adulto (Pluschke G, Vanek M, Evans A, Dittmar T, Schmid P, Itin P, Fllardo EJ, Reisfeld RA. 1996. Proc Nati Acad Sci U S A Sep 3; 93(18): 9710-5). Una modalidad de la invención, es el uso de sbg1004570ERGIC como sonda para estudiar el tráfico de proteínas en la vía secretoria, la cual es crucial para la dilucidación y el tratamiento de muchas enfermedades heredadas y adquiridas, tales como fibrosis qulstica, enfermedad de Alzheimer e infecciones virales, en la regulación de melanoma, trastornos autoinmunes, trastorno hematopoyético, trastornos de la cicatrización de heridas e inflamación. Un homólogo cercano de sbg1004570ERGIC es ERGIC-53, una proteína intermediaria del compartimento del ER-Golgi (ERGIC). Una protelna del ERGIC fue elevada más Cáncer, del doble en células de adenocarcinoma del colon HT-29 infección, resistente al fármaco antrtumoral KRN5500. Junto con otra trastorno información, la vía secretoria celular fue sugerida como un autoinmune, determinante primario de la sensibilidad a RNS50 trastorno (Kamishohara M, Kenney S, Domergue R, Vistica DT, sbg100457 hematopoyético, Sausvllle EA. 2000 Exp Cell Res May 1 ;256(2): 468-79). Se OERGIC trastornos de la mostró que mutaciones en ERGIC-53 causan deficiencia cicatrización de combinada de los factores de la coagulación V y VIII, y se heridas, sugirió que ERGIC-53 podría funcionar como un chaperón inflamación y molecular para el transporte, del ER al Golgi, de un enfermedad de subconjunto específico de proteínas secretadas, que incluyen Alzheimer los factores de la coagulación V y VII (Nichols WC, Seligsohn U, Zivelin A, Terry VH, Hertel CE, Wheatley MA, Moussalll MJ, Haurl HP, Ciavarella N, Kaufman RJ, Ginsburg D. 1998. Cell Abr 3;93(1 ):61-70). Además, se revisó que ERGIC-53 es una sonda atractiva para estudiar numerosos aspectos del tráfico de proteínas en la vía secretoria, lo cual es crucial para la dilucidación y el tratamiento de muchas enfermedades heredadas y adquiridas, tales como fibrosis quística, enfermedad de Alzheimer e infecciones virales (Hauri HP, Kappeler F yersson H, Appenzeller C. 2000 J Cell Sel Feb; 113 (Parte 4):587-96).
CUADRO 4 Expresión de ARN mensajero específica de tejidos y cuantitativa, detectada usando SvbrMan Se midieron patrones de expresión cuantitativos de ARN mensajero específicos de tejidos, usando PCR cuantitativa SYBR-Green (Applied Biosystems, Foster City, CA; véase Schmiügen T. D. et al., Analytical Biochemistry 285: 194-204, 2000), y se prepararon moléculas de ADNc humanas de varios tejidos humanos. Se diseñaron iniciadores de PCR específicos de genes, usando la primera secuencia de ácido nucleico incluida en el listado de secuencias para cada gen. El ciclo umbral (Ct) se define como el número de ciclos fraccional en el cual la fluorescencia del reportero generada por digestión de la sonda, alcanza un umbral definido como 10 veces el fondo. En los casos en donde el programa del sistema de detección de secuencias predijo más de un producto de PCR, se usó Taqman para la amplificación de PCR específica, indicada bajo los genes específicos. En el primer cuadro de subconjuntos de cada gen, se hicieron dos mediciones réplica del ARN mensajero del gen de identificación (GOI) de varios tejidos humanos (columnas 3 y 4). Las copias del ARN mensajero del GOI promedio de las dos réplicas, se obtuvieron del ARN de cada tejido (columna 5). La cantidad promedio de ARNr 18S del ARN de cada tejido se midió (columna 6), y se usó para normalización. Para obtener cada tejido con la misma cantidad de 50 ng de ARNr 18S, se calculó el factor de normalización (columna 7) dividiendo 50 ng entre la cantidad de ARNr 18S medida de cada tejido (columna 6). Las copias de ARN mensajero por 50 ng de ARN total, se obtuvieron multiplicando cada factor de normalización del GOI y las copias de ARN mensajero promedio (columna 8). El número de veces en que se repitió la alteración mostrada en el segundo cuadro de subconjuntos de cada gen, sólo se calculó para tejidos enfermos que tienen una contraparte normal. Existen modelos en la columna del número de veces en que se repitió la alteración para todas las muestras que no tienen contrapartes. Además, los cálculos del número de veces en que se repitió la alteración son el número de veces en que se repitió la alteración en la muestra enferma, en comparación con la muestra normal. Por consiguiente, no se hará un cálculo del número de veces en que se repitió la alteración después de cualquiera de las muestras normales. Para pares de cánceres en pacientes comparados (colon, pulmón y mama), cada tumor se compara con su contraparte normal específica. Cuando no existen pares normales/enfermos en pacientes comparados, cada muestra enferma se comparó otra vez con el promedio de todas las muestras normales de ese mismo tipo de tejido. Por ejemplo, el cerebro normal del mismo paciente que proveyó el cerebro de Alzheimer, no es aplicable. Tres muestras de cerebro normal y cuatro muestras de cerebro con enfermedad de Alzheimer, se usan en el número de veces en que se repitió la alteración. Se promediaron tres muestras normales, y cada una de las muestras con enfermedad de Alzheimer se comparó otra vez con el promedio.
Abreviaturas ALZ enfermedad de Alzheimer CT CLONTECH (1020 East Meadow Circle Palo Alto, CA 94303-4230, E.U.A.) KC muestra preparada por investigador de GSK COPD enfermedad pulmonar obstructiva crónica endo endotelial VEGF factor de crecimiento endotelial vascular bFGF factor de crecimiento de fibroblastos básico BM médula ósea osteo osteoblasto O A orteoartritis RA artritis reumatoide PBL linfocitos de sangre periférica PBMNC células mononucleares de sangre periférica VIH virus de inmunodeficiencia humana HSV virus de herpes simple HPV virus de papiloma humano Nombre del gen sbq960509brecpt Expresión general más baja en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en el cerebro intacto, hígado fetal y útero. Expresión de enfermedad más alta en 2 de las muestras de tumor de pulmón, una de las muestras de tumor de mama y una de las muestras de mama normal. La subregulación en 1 de 4 tumores de colon, implica intervención en el cáncer de colon. La subregulación en 2 de 4 muestras de cerebro con AD, así como también alta expresión en el cerebro intacto, sugiere una intervención en la enfermedad de Alzheimer. La subregulación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, y la subregulación en 4 de 4 muestras de pulmón asmático, implica a este gen en COPD y asma. La sobrerregulación en 2 de 3 muestras de corazón, propone funciones en DCM obstructiva y no obstructiva. Patrones difíciles de interpretar debido a Cts>35. Expresión de moderada a baja en células inmunes. Expresión moderada en sinovio con OA y RA.
Copias Coplas Coplas de interInterCopias 50 ARNm Ct ARNr Muestra medias medias promeng/ARN detec¬ (muestras 18S sbg960509cbrecpt de GOl de GOl dio de r 18S tadas/5 1 y 2) (mues(muesGOl (ng) (ng) 0 ng de tra 1) tra 2) ARN total Adipocitos subcutáneos 40, 40 0 0 0.00 3.06 16.34 0.00 Zenblo Tejido adiposo 40, 40 0 0 0.00 0.96 52,36 0.00 subcutáneo Zenbio Glándula suprarrenal 40, 40 0 0 0.00 0.61 81.97 0.00 Clontech Cerebro intacto 33.26, 24.63 48.4 36.52 7.24 6.91 252.18 Clontech 32.07 Cerebro fetal 40, 40 0 0 0.00 0.48 103.95 0.00 Clontech Cerebelo Clontech 40, 40 0 0 0.00 2.17 23.04 0.00 Cerviz 40, 40 0 0 0.00 2.42 20.66 0.00 Colon 40, 40 0 0 0.00 2.71 18.45 0.00 Endometrlo 40, 40 0.81 0 0.41 0.73 68.21 27.63 Esófago 40, 40 0 0 0.00 1.37 36.50 0.00 Corazón Clontech 40, 40 0 0 0.00 1.32 37.88 0.00 Hipotálamo 40, 40 0 0 0.00 0.32 155.28 0.00 Ileo 40, 40 0 0 0.00 2.58 19.38 0.00 35.56, Yeyuno 6.66 12.71 9.69 6.60 7.58 73.37 34.42 Riñon 40, 40 0 0 0.00 2.12 23.58 0.00 Hígado 40, 40 0 0 0,00 1.50 33.33 0.00 Hígado fetal 33.46, 14.95 27.51 21.23 10.40 4.81 102.07 Clontech 34.83 Pulmón 40, 40 0 0 0.00 2.57 19.46 0.00 Glándula mamaria 40, 40 21.94 10.06 16.00 13.00 3.85 61.54 Clontech iometrio 40, 40 0 0 0.00 2.34 21.37 0.00 Omento 40, 40 0 0 0,00 3.94 12.69 0.00 Ovario 40, 40 0 0 0.00 4.34 1 1 ,52 0.00 Páncreas 40, 40 0 0 0.00 0.81 61.80 0.00 Cabeza del 40, 40 0 0 0.00 1.57 31.85 0.00 páncreas Glándula parótida 40, 40 0 0 0.00 5.48 9.12 0.00 Placenta Clontech 40, 40 0.39 0 0.20 5.26 9.51 1.85 Próstata 40, 40 0 0 0.00 3.00 16,67 0.00 Recto 40, 40 0 0 0.00 1 .23 40,65 0.00 Glándula salival 34.79, 10.31 0 5.16 7.31 6.84 35.26 Clontech 40 Músculo 40, 40 0 0 0.00 1.26 39.68 0.00 esquelético Clontech Piel 40. 40 0 0 0.00 1 .21 41.32 0.00 Intestino delgado 40, 40 0 0 0.00 0.98 51.07 0.00 Clontech Bazo 40, 40 0 0 0.00 4.92 10.16 0.00 Estómago 35.8, 5.82 1.41 3.62 2.73 18.32 66.21 38.29 Testículo Clontech 40, 40 0 0 0.00 0.57 87.87 0.00 Timo Clontech 35.13, 8.48 8.75 8.62 9.89 5.06 43.55 35.08 Tiroides 40, 40 0 0 0.00 2.77 18.05 0.00 Tráquea Clontech 35.26, 7.9 ND 7.90 9.71 5.15 40.68 ND Vejiga urinaria 40, ND 0 ND 0.00 5.47 9.14 0.00 Utero 35.09, 8.67 17.4 13.04 5.34 9.36 122.05 33.87 genómlca 26.62 1067.33 actina b 27.44 670.43 1.00E+05 19.22 100000 1.00E+05 19.38 100000 1.00E+04 22.78 10000 1.00E+04 20.52 10000 1.00E+03 26.45 1000 1.00E+03 27.03 1000 1.00E+02 30.99 100 1.00E+02 31.26 100 1.00E+01 40 0 1.00E+01 40 0 1.00E-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 Número Coplas No. de veces en de de ARNm Muestra Coplas que se repitió la registro detecta- sbg960509cbrecpt Ct Intermedias Muestra alteración en la (Identlfl- das/SO de GOI población cador de ng de enferma GSK) ARN total colon colon normal GW98-167 2 941 29.42 332.32 normal tumor de colon GW98- tumor de 21940 30.95 66.31 132.62 -2.51 16T colon colon colon normal GW98-178 22080 31.32 53.01 10T.02 normal tumor de colon GW98- tumor de 22060 30.57 83.1 16T.20 1.57 177 colon colon colon normal GW98-561 23514 31.44 49.16 98.32 normal tumor de colon GW98- tumor de 23513 31.81 39.47 78.94 -1.25 560 colon colon colon normal GW98-894 24691 29.44 164.69 329.38 normal tumor de colon GW98- tumor de 24690 34.42 8.18 16.36 -20.13 893 colon pulmón pulmón normal GW98-3 20742 28.04 383.11 766.22 normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 34.22 9.19 18.38 -41.69 2 pulmón pulmón normal GW97- pulmón 20677 30.93 66.74 133.48 179 normal tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 27.11 667.61 1335.22 10.00 178 pulmón pulmón normal GW98- pulmón 21922 28.31 323.99 647.98 165 normal tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 30.92 67.22 134.44 164 -4.82 pulmón pulmón normal GW98- pulmón 22584 31.76 40.67 81.34 282 normal tumor de pulmón GW98- tumor da 22583 29.61 148.67 297.34 3.66 281 pulmón mama mama normal GW00-392 28750 27.64 487.44 487.44 normal tumor de mama GW00- tumor de 28746 27.47 539.99 1079.98 2.22 391 mama mama mama normal GW00-413 28798 33.36 15.44 15.44 normal tumor de mama GWQO- 28797 30.88 68.84 tumor de 137.68 8.92 412 mama mama normal GWOO- mama 27592-95 34.74 6.73 6.73 235:238 normal tumor de mama GW00- tumor de 27588-91 33.73 12.41 12.41 1.84 231 :234 mama mama mama normal GW98-621 23656 27.7 469.27 938.54 normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 33.1 18.13 36.26 -25.88 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 31.46 48.61 97.22 542 normal cerebro normal BB99- 25509 34.17 9.52 19.04 cerebro 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 35.69 3.79 7.58 904 normal Cerebro Cerebro con ALZ etapa 5 25502 40 0 0.00 con ALZ -41.28 BB99-874 etapa 5 Cerebro Cerebro con ALZ etapa 5 25503 34.96 5.91 11.82 con ALZ -3.49 BB99-8B7 etapa 5 Cerebro Cerebro con ALZ etapa 5 25504 33.13 17.82 35,64 con ALZ -1.16 BB99-852 etapa 5 Cerebro Cerebro con ALZ etapa 5 25542 40 0 0.00 con ALZ BB99-927 -41.28 etapa 5 Pulmón KC de pulmón CT normal 29,53 155.88 311.76 CT KC 26 de pulmón normal 26 de pulmón 27 de KC 27 de pulmón normal 39.2 0.46 0.46 pulmón 24 de KC 24 de pulmón COPD 40 0 0.00 -104.07 pulmón 28 de KC 28 de pulmón COPD 40 0 0.00 ¦104.07 pulmón 23 de KC 23 de pulmón COPD 34.81 6.44 6.44 -16.16 pulmón l 25 de KC 25 de pulmón norma 40 0 0.00 pulmón pulmón asmático pulmón 29321 38.99 0.52 0.52 -200.14 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 33.69 12.65 25.30 -4.11 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 33.53 13.98 27.96 OD03397 -3.72 asmático pulmón asmático pulmón 29325 34.27 8.96 17.92 -5.81 OD04928 asmático células células endotellales KC control 40 0 0.00 endotellales VEGF endo KC 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo KC 40 0 0.00 bFGF endo 0.00 corazón Clontech normal 35.53 4.19 8.38 corazón T-1 de corazón T-1 da 29417 34 10.5 21.00 2.51 Isquémico corazón T-14 de corazón con T-14 do 29422 31.16 58.24 116.48 13.90 DC no obstructiva corazón ?-33T9 de corazón con T-3399 de 29426 28.35 317.67 635.34 75.82 DCM corazón adenoides GW99-269 26162 31.52 46.93 93.86 adenoides amígdala GW98-280 22582 30.82 71.35 142.70 amígdala Células T PC00314 28453 34.36 8.47 16.94 Células T PBMNC 40 0 0.00 PBMNC Monoclto 40 0 0.00 monoclto Células B PC00665 28455 40 0 0.00 Células B células células dondríttcas 28441 31.52 47.02 94.04 dendrftlcas neutrófllos 28440 36.13 2.91 2.91 neutrófllos eoslnófilos 28446 40 0 0.00 eoslnófilos BM no BM no estimulada 40 0 0.00 estimulada BM BM estimulada 40 0 0.00 0.00 estimulada osteo osteo diferenciado 40 0 0.00 0.00 diferenciado osteo osteo Indiferenciado 40 0 0.00 Indiferencia do Condrocitos 40 0 0.00 condrocitos Sinovlo con SInovio con OA IP12/01 29462 32.08 33.47 33.47 OA SInovio con Slnovlo con OA NP10/01 29461 31.43 49.5 99.00 OA Sinovlo con SInovio con OA NP57/00 28464 30.42 91.04 182.08 OA Slnovlo con RA SInovio 28466 32.1 1 32.84 65.68 NP03/01 con RA Slnovlo con RA Sinovio 28467 31.07 61.51 123.02 NP71/00 con RA SInovio con RA Sinovio 28475 36.21 2.78 5.56 NP45/00 con RA Hueso con Hueso con OA 29217 31.49 47.85 47.85 OA (blobank) (blobank) Muestra 1 de hueso Hueso con J. Emory 30.1 1 109.44 218.88 con OA OA Muestra 2 de hueso Hueso con J. Emory 32.6 24.52 49.04 con OA OA Cartílago Cartílago (reserva) Normal 32.09 33.26 66.52 (reserva) Nombre del gen sbq960509cbrecpt No. de veces en que se repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon -2.51 tumor de colon 1.57 tumor de colon -1.25 tumor de colon -20.13 tumor de pulmón -41.69 tumor de G? limón 10 00 tumor G?? DI limón -4 82 ti imor flp ni limón tumor de mama 2 22 tiimnr rlp mama Q? tMfflHF de m t Cerebro con ALZ etapa 5 - -w41 .28 Cerebro con ALZ etapa 5 -3.49 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.16 Cerebro con ALZ etapa 5 -41 .28 24 de pulmón -104.07 28 de pulmón -104.07 23 de pulmón -16.16 pulmón asmático -200.14 pulmón asmático -4.11 pulmón asmático -3.72 pulmón asmático -5.81 VEGF endo 0.00 BFGF endo 0.00 T-1 de corazón 2.51 T-1 de corazón 13.90 T-3399 de corazón 75.82 BM estimulada 0.00 Osteo indlferenciado 0,00 Cartílago (reserva) -1 .84 PBL con VIH IIIB -11 .73 MRC5 con cepa F de HSV 19.22 Nombre del gen sbq614126complfH Expresión general de moderada a baja en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en hígado e hígado fetal. Se observa expresión menor (pero aún significativa) en el cerebro intacto, ovario y útero. Expresión de enfermedad más alta en 2 de las muestras de tumor de mama, una de las muestras de cerebro normal, una de los pulmones normales, una de las muestras de sinovio con OA y las células MRC5 infectadas por HSV. La sobrerregulación en 1 de 4 tumores de colon, sugiere una función en el cáncer del colon. La subregulación en 2 de 4 tumores de pulmón y sobrerregulación en 1 de 4 tumores de mama, sugiere funciones en cánceres de pulmón y mama. La subregulación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, asi como también subregulación en 4 de 4 pulmones asmáticos, implica una intervención en enfermedad pulmonar obstructiva crónica y asma. La sobrerregulación en 1 de 3 muestras de corazón, sugiere una función en DCM. La sobrerregulación en HSV, implica intervención en virus de herpes simple como factor de hospedero potencial. Expresión de moderada a baja en células inmunes, sinovio con RA y OA, hueso y condrocitos. 28.77, 13746.3 Hígado 417.4 407.38 412.39 1.50 33.33 2B.81 3 Hígado fetal 29.63, 246.38 266.67 256.53 10.40 4.81 1233.29 Clontech 29.5 Pulmón 40, 40 0 0 0.00 2.57 19.46 0.00 Glándula mamarla 34.19, 40 14.9 0 7.45 13.00 3.85 28.65 Clontech Mlometrio 35.76, 40 5.7 0 2.85 2.34 21 .37 60.90 36.04, Omento 4.81 21.16 12.99 3.94 12.69 164.78 33.62 34.29, Ovario 14.02 31.93 22.98 4.34 11.52 264.69 32.95 Páncreas 40, 40 0 0 0.00 0.81 61 .80 0.00 Cabeza del 38.98, 0.79 7.32 4.06 1 .57 31.85 129.14 páncreas 35.35 34.58, Glándula parótida 1 1.74 18.68 15.21 5.48 9.12 138.78 33.83 35.73, Placenta Clontech 5.82 6.06 5.94 5.26 9.51 56.46 35.66 Próstata 40, 40 0 0 0.00 3.00 16.67 0.00 Recto 40, 40 0.38 0 0.19 1.23 40.65 7.72 Glándula salival 40, 40 0.3 0 0.15 7.31 6.84 1.03 Clontech Músculo esquelético 40, 40 0 0.28 0.14 1.26 39.68 5.56 Clontech Piel 40, 40 0 0.33 0.17 1.21 41.32 6.82 Intestino delgado 40, 40 0 0 0.00 0.98 51.07 Clontech 0.00 Bazo 40. 40 0 0 0.00 4.92 10.16 0.00 Estómago 40, 36 0 4.92 2.46 2.73 18.32 45.05 Testículo Clontech 40, 40 0 0 0.00 0.57 87.87 0.00 Timo Clontech 40, 37.06 0 2.56 1.28 9.89 5.06 6.47 Tiroides 40, 40 0 0.31 0.16 2.77 18.05 2.80 Tráquea Clontech 40, 40 0.28 0 0.14 9.71 5.15 0.72 Vejiga urinaria 40, 34.13 0 15.53 7.77 5.47 9.14 70.98 33.21. Utero 27.27 35.32 31.30 5.34 9.36 293.02 32.79 Genómica 26.93 1288.98 Actina b 27.55 878.74 1.00E+05 20.07 100000 1.00E+05 20.14 100000 1.00E+04 23.43 10000 1.00E+04 23.34 10000 1.00E+03 26.84 1000 1.00E+03 27.02 1000 1.00E+02 31.72 100 1.00E+02 31.32 100 1.00E+01 33.78 10 1 .OOE+01 35.79 10 1 -OOE-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 No. de veces Número de Coplas de Coplas en que se registro ARNm Muestra Intermerepitió la (Idontlfl- Ct detectadas/ Muestra sbg614126complfH dias de alteración en cador de 50 ng de GOl la población GSK) ARN total enferma colon colon normal GW98-167 21941 34.6 13.63 27.26 normal tumor de colon GW98- tumor de 21940 35.71 7.35 14.70 -1.85 166 colon colon colon normal GW98-178 22080 40 0 0,00 normal tumor de colon GW98- tumor de 22060 39.81 0.75 1.50 1.50 177 colon colon colon normal GW98-561 23514 38.61 1.45 2.90 normal tumor de colon GW98- 23513 34.84 11.95 23.90 tumor de 8.24 560 colon colon colon normal GW98-894 24691 39.05 1.14 2.28 normal tumor de colon tumor de 24690 40 0 0.00 -2.28 GW98-893 colon pulmón normal pulmón 20742 35.78 7.04 14.08 GW98-3 normal tumor de pulmón tumor de 20741 40 0 0.00 -14.08 GW98-2 pulmón pulmón normal pulmón 20677 33.99 19.21 38.42 GW97-179 normal tumor de pulmón tumor de 20676 40 0.49 0.98 -39.20 GW97-178 pulmón pulmón normal pulmón 21922 39.63 0.82 1.64 GW98-165 normal tumor de pulmón tumor de 21921 38.89 1 .24 2.48 1.51 GW98-164 pulmón pulmón normal GW98- pulmón 22584 40 0 0.00 282 normal tumor de pulmón tumor de 22583 40 0 0.00 0.00 GW98-281 pulmón mama normal GW00- mama 28750 32.71 39.28 39.28 392 normal tumor de mama GW0O- tumor da 28746 31.65 70.89 141.78 3.61 391 mama mama normal GW00- mama 2879B 35.83 6.88 6.88 413 normal tumor de mama GW00- tumor de 28797 33.17 30.3 60.60 8.81 412 mama mama normal GW00- mama 27592-95 36.73 4.16 4.16 235:238 normal tumor de mama GWOO- tumor de 27588-91 35.98 6.33 6.33 1.52 231 :234 mama mama normal GW98- mama 23656 37.38 2.89 5.78 T21 normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 34.95 11.23 22.46 3.89 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 32.26 50.34 100.68 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 40 0.57 1.14 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 34.68 13.04 26.08 904 normal Cerebro con ALZ etapa Cerebro con 25502 40 0 0.00 -42.63 5 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa Cerebro con 25503 35.87 6.73 13.46 -3.17 5 ??99-T87 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa Cerebro con 25504 39.2 1.05 2.10 -20.30 5 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa Cerebro con 25542 40 0 0.00 -42.63 5 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 39.4 0.93 1.86 Pulmón CT KC 26 de pulmón 26 de normal pulmón KC 27 de pulmón 27 de normal 40 0 0.00 pulmón KC 24 de pulmón 24 de COPD 40 0 0.00 ¦0.62 pulmón KC 28 de pulmón 28 de COPD 40 0 0.00 -0.62 pulmón KC 23 de pulmón 23 de COPD 40 0 0.00 -0.62 pulmón KC 25 de pulmón 25 de normal 40 0 0.00 pulmón pulmón asmático pulmón 29321 36.52 4.68 4.68 7.55 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 40 0 0.00 -0.62 0DO3433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 40 0 0.00 -0.62 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 38.18 1.85 3.70 5.97 0DO4928 asmático células células endotellales KC control 40 0 0.00 endotellales VEGF endo KC 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo KC 40 0 0.00 bFGF endo 0.00 corazón Clontech normal 40 0 0.00 corazón T-1 de corazón T-1 de 29 17 40 0 0.00 0.00 Isquémico corazón T-14 de corazón con T-14 de 29422 40 0 0.00 0.00 DCM no obstructiva corazón T-3399 de corazón con T-3399 de 29426 36.03 6.13 12.26 DCM corazón 12.26 adenoides GW99-269 26162 34.08 18.19 36.38 adenoides 1.00E+05 19.13 1 OOO0O 1.OOE+05 19.38 100000 1.00E+04 22.56 10000 1.00E+04 22.67 10000 1.00E+03 26.01 1000 1.OOE+03 26.44 1000 1.00E+02 30.93 100 1.OOE+02 30.1 100 1.00E+01 38.59 10 1.00E+01 33.26 10 1.OOE-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 Nombre del gen sbq614126complfH No. de veces en que so repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon -1.85 tumor do colon 1 ,50 tumor de colon 8.24 tumor de colon -2.28 tumor de pulmón -14.08 tumor de pulmón -39.20 tumor de pulmón 1.51 tumor de pulmón 0.00 tumor de mama 3.61 tumor de mama 8.81 tumor de mama 1.52 tumor de mama 3.89 Cerebro con ALZ etapa 5 -42.63 Cerebro con ALZ etapa 5 -3.17 Cerebro con ALZ etapa 5 -20.30 Cerebro con ALZ etapa 5 -42.63 24 de pulmón -0.62 28 do pulmón -0.62 23 de pulmón -0.62 pulmón asmático 7.55 pulmón asmático -0.62 pulmón asmático -0.62 pulmón asmático 5.97 VEGF endo 0.00 bFGF endo 0.00 T-1 de corazón 0.00 T-14 de corazón 0.00 T-3399 de corazón 12.26 B estimulada 0.00 osteo Indiferenciado 0.00 Cartllafjo (reserva) 0.00 PBL con VIH IIIB 1.01 MRC5 con cepa F de HSV 128.16 Nombre del gen sba120703Rnase Expresión general de moderada a baja en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en cerebro intacto y glándula salival. Expresión moderada en el hígado fetal y el timo. Expresión de enfermedad más alta en 2 de las muestras de pulmón normal, una de las muestras de tumor de pulmón, la reserva de cartílago normal, y las células MRC5 infectadas por HSV. La sobrerregulación en 1 de 4 tumores de colon, sugiere una función en el cáncer de colon. La subregulación en 2 de 4 muestras de tumor de pulmón, sugiere implicaciones posibles en cáncer de pulmón. La sobrerregulación en 2 de 4 tumores de mama, implica una intervención en cánceres de mama. La subregulación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, implica una intervención en COPD. La sobrerregulación en 3 de 3 muestras de corazón, Implica a este gen en enfermedades del corazón, tales como DCM e isquemia. La alta expresión en el sinovio con OA y RA y las muestras de hueso con OA, sugieren una intervención posible en osteoartritis y artritis reumatoide. La sobrerregulación en HSV implica a este gen en virus de herpes simple como un factor de hospedero potencial. Expresión de moderada a baja en células inmunes. 35.03, Próstata 5.23 3.4 4.32 3.00 16.67 71.92 35.75 Recto 38.25, 40 0.76 0.21 0.49 1.23 40.65 19.72 Glándula salival 30.01 , 106.25 125.78 1 16.02 7.31 6.84 793.54 Clontech 29.73 Músculo esquelético 40, 39.16 0.41 0.44 0.43 1.26 39.68 16.87 Clontech 37.21 , Piel 1.42 5.31 3.37 1.21 41.32 139.05 35.01 Intestino delgado 40, 40 0 0.19 0.10 0.98 51.07 4.85 Clontech Bazo 35.4, 35.9 4.2 3.1 1 3.66 4.92 10.16 37.14 Estómago 36.12, 40 2.73 0.21 1.47 2.73 18.32 26.92 Testículo Clontech 40, 40 0 0 0.00 0.57 87.87 0.00 31 ,88, Timo Clontech 34.61 45.62 40.12 9.89 5.06 202.81 31.42 Tiroides 40, 35,22 0 4,67 2.34 2.77 18.05 42.15 35.38, Tráquea Clontech 4.26 1.17 2.72 9.71 5,15 13.98 37.52 Vejiga urinaria 38.77, 40 0.56 0.31 0.44 5.47 9.14 3.98 33,66, Utero 1 1.93 1.16 6.55 5.34 9.36 61.28 37.55 1342.6 Genómica 25.78 6 actina b 27.27 551.42 1.00E+05 19.03 100000 1.00E+05 19.08 100000 1.00E+04 22,28 10000 1.00E+04 22,27 102000 1.00E+03 25,85 1000 1.00E+03 25.6 1000 1.00E+02 30.44 100 1.00E+02 29,33 100 1.00E+01 34.4 10 1.00E+01 34.48 10 1.00E-00 1 0?-00 NTC 40 -1 NTC 40 0 No. de Número veces en Coplas de de Coplas que se ARNm registro Interme¬ Muestra sbg120703RNaso repitió la Ct detectadas/ Muestra (Identlfl- dias de alteración 50 ng de cador GOl en la ARN total de GSK) población enferma colon colon normal GW98-167 21941 29.03 142.85 285.70 normal tumor de tumor do colon GW98-166 21940 28.31 226.87 453.74 1.59 colon colon colon normal GW98-178 22080 33.08 10.78 21 ,56 normal tumor de tumor de colon GW98-177 22080 29.33 118.09 236.18 10.95 colon colon colon normal GW98-561 23514 30.02 76.09 152.18 normal tumor de tumor do colon GW98-560 23513 30.42 58.89 117.78 -1.29 colon colon colon normal GW98-894 24691 29.07 139.29 278.58 normal tumor de colon GW98-893 tumor de 24690 30.3 63.5 127.00 -2.19 colon pulmón normal GW98-3 pulmón 20742 2T.86 574.4 1148.80 normal tumor de pulmón GW98-2 20741 tumor de 30.07 73.89 147.78 -7.77 pulmón pulmón normal GW97-179 pulmón 20677 29.74 90.79 181.58 normal tumor de pulmón GW97- tumor de 20T7T 27.83 351.24 178 702.48 3.87 pulmón pulmón pulmón normal GW98-165 21922 26.63 663.94 1327.88 normal tumor de pulmón GW98- 21921 tumor de 29.38 114.52 229.04 164 -5.80 pulmón pulmón pulmón normal GW9B-282 22584 30 77.02 154.04 normal tumor de pulmón GW98- 22583 tumor de 29.64 97.04 194.08 281 1.26 pulmón mama mama normal GW00-392 28750 29.08 138.57 138.57 normal tumor de tumor de mama GWOO-391 28746 28.77 169.53 339.06 2.45 mama mama normal GW00-413 28798 mama 32.72 13.55 13.55 normal tumor de mama GWOO-412 tumor de 28797 31.01 40.4 80.80 5.96 mama mama normal GW00- 27592- mama 34.39 4.68 4.68 235:238 95 normal tumor de mama GW0O- 27588- tumor de 31.4 31.48 31.48 6.73 231 :234 91 mama mama mama normal GW98-621 23656 28.54 195.6 391.20 normal tumor de tumor de mama GW98-620 23655 30.37 60.84 121.68 -3.21 mama cerebro normal BB99-542 25507 32.94 11.79 23.58 cerebro normal cerebro normal BB99-406 25509 32.22 18.66 37.32 cerebro normal cerebro normal BB99-904 25546 32.3 17.71 35.42 cerebro normal Cerebro Cerebro con ALZ etapa 5 25502 32.82 12.76 25.52 con ALZ -1.26 BB99-874 etapa 5 Cerebro Cerebro con ALZ etapa 5 25503 30.31 63.18 126.36 con ALZ 3.T4 ??9T-887 etapa 5 Cerebro Cerebro con ALZ etapa 5 25504 31.42 31.08 62.16 con ALZ 1.94 BB99-862 etapa 5 Cerebro Cerebro con ALZ etapa 5 25542 33.35 9.08 18.16 con ALZ -1.77 BB99-927 etapa 5 Pulmón KC de pulmón CT normal 30.41 59.49 118.98 CT 26 de KC 26 de pulmón normal pulmón 27 de KC 27 de pulmón normal 37.T9 0.57 0.57 pulmón 24 de KC 24 de pulmón COPD 40 0 0.00 -40.17 pulmón 28 de KC 28 de pulmón COPD 40 0 0.00 -40.17 pulmón 23 de KC 23 de pulmón COPD 40 0 0.00 -40.17 pulmón KC 25 de pulmón normal 36.86 0.97 0.97 25 de pulmón pulmón pulmón asmático OD03112 29321 33.08 10.79 10.79 -3.72 asmático pulmón pulmón asmático OD03433 29323 29.94 80.31 160.62 4.00 asmático pulmón pulmón asmático OD03397 29322 29.79 87.94 175.88 asmático 4.38 pulmón pulmón asmático OD04928 29325 30.08 73.39 146.78 3.65 asmático células células endotellales KC control 40 0.13 0.13 endotellal es VEGF VEGF endo KC 40 0 0.00 -0.13 endo bFGF bFGF endo KC 40 0.12 0.12 -1.08 endo corazón Clontech normal 34.66 3.95 7.90 corazón T-1 de corazón Isquémico 29417 T-1 de 30.43 58.48 116.96 14.81 corazón T-14 de corazón con DCM T-14 de 29422 30.3 63.76 127.52 no obstructiva 16.14 corazón T-3399 de corazón con -3399 de 29426 31.14 T 37.27 74.54 DCM 9.44 corazón adenoides GW99-269 26162 33.15 10.31 20.62 adenoides 1.OOE+05 18.76 100000 1.00E+05 19.03 100000 1.00E+04 22.01 10000 1 ,???+04 22.05 10000 1.00E+03 26.01 1000 1.00E+03 25.68 1000 1.00E+02 30.57 100 1.00E+02 30.32 100 1.00E+01 32.24 10 1.00E+01 40 0 1 ,???-?? 40 0 1.00?-00 40 0 NTC 40 0 Nombre del gen sbq120703RNase No. de veces en que se repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon 1.59 tumor de colon 10.95 tumor de colon -1.29 tumor de colon -2.19 tumor de pulmón -7.77 tumor de pulmón 3.87 tumor de pulmón -5.60 tumor de pulmón 1.26 tumor de mama 2.45 tumor de mama 5.96 tumor de mama 6.73 tumor de mama -3.21 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.26 Cerebro con ALZ etapa 5 3.94 Cerebro con ALZ etapa 5 1.94 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.77 24 de pulmón -40.17 28 de pulmón -40.17 23 de pulmón -40.17 pulmón asmático -3.72 pulmón asmático 4.00 pulmón asmático 4.38 pulmón asmático 3.65 VEGF endo -0.13 bFGF endo -1.08 T-1 de corazón 14.81 T-14 de corazón 16.14 T-3399 de corazón 9.44 BM estimulada 0.00 osteo indlferenclado 0.00 Cartílago (reserva) -4.65 PBL con VIH II IB 2.31 MRC5 con cepa F de HSV 6.17 Nombre del gen sbq98530TS Expresión general moderada en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en el cerebro intacto, endometrio y testículo. Expresión moderada en corazón normal, músculo esquelético y esófago. Muestra expresión en la mayoría de las muestras del tracto gastrointestinal, asi como también las muestras del tracto reproductor femenino. Expresión de enfermedad más alta en una de las muestras de tumor de colon, las 3 muestras de corazón y los condrocitos. Los datos muestran predominantemente un patrón de expresión específico del músculo. La sobrerregulación en 1 de 4 tumores de colon, y la sobrerregulación en 2 de 4 tumores de mama, implican una intervención en cánceres de colon y mama. La subregulación en 3 de 3 muestras de COPD, implica una función en enfermedad pulmonar obstructiva crónica. La subregulación en HSV implica intervención en virus de herpes simple como un factor de hospedero potencial. Expresión general de moderada a baja en células inmunes. La alta expresión en condrocitos y sinovio con OA y RA, sugiere intervención posible en osteoartritis y artritis reumatoide.
Glándula parótida 31.67, 65.33 96.46 80.90 5.48 9.12 738.09 31.01 Placenta Clontech 33.13, 27.88 52.3 40.09 5.26 9.51 381.08 32.05 Próstata 35.03, 40 9.13 5.22 7.18 3.00 16.67 1 19.58 Recto 40, 35.19 0 8.32 4.16 1.23 40.65 169.1 1 Glándula salival 32.41 , 42.32 16.15 29.24 7.31 6.84 199.97 Clontech 34.06 Músculo esquelético 33.93, 17.41 19.28 18.35 1.26 39.68 727.98 Clontech 33.76 Piel 40, 40 0 0 0.00 1.21 41.32 0.00 Intestino delgado 34.1 1 11.73 15.7 13.72 0.98 51.07 700.46 Clontech Bazo 36.08, 40 4.94 0.37 2.66 4.92 10.16 26.98 Estómago 40, 40 0 0 0.00 2.73 18.32 0.00 Testículo Clontech 35.54, 6.79 25.83 16.31 0.57 87.87 1433.22 33.26 Timo Clontech 33.66, 20.35 15.62 17.99 9.89 5.06 90.93 34.12 Tiroides 40, 35.46 0 7.12 3.56 2.77 18.05 64.26 Tráquea Clontech 32.08, 51.54 59.21 55.38 9.71 5.15 285.14 31 .84 Vejiga urinaria 34.75, 10.8 2.91 6.86 5.47 9.14 62.66 36.99 Utero 31.79, 60.97 47.95 54.46 5.34 9.36 509.93 32.2 genómica 26.8 1 133.17 actlna b 27.6 706.62 1.00E+05 19.53 100000 1 -00E+05 19.54 100000 1.00E+O4 22.8 10000 1.00E+04 23.02 10000 1.00E+03 26.14 1000 1 0?+03 26.59 1000 1.00E+02 31.41 100 1.OOE+02 30.97 100 1 .00E+01 40 0 1.00E+01 35.24 10 1 ,???-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 No. de Número veces en Coplas de de Coplas que se ARNm Muestra registro Intermerepitió la Ct detectadas/ Muestra sbg98530TS (Identlfl- dias de alteración 50 ng de cador de GOl en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 26.26 1792.89 3585.78 colon normal tumor de colon GW98- 21940 26.2 1856.22 3712.44 tumor de colon 1.04 166 colon normal GW98-178 22080 27.25 986.8 1973.60 colon normal tumor de colon GW98- 22060 26.7 1369.12 2738.24 tumor de colon 1.39 177 colon normal GW98-561 23514 27.55 821.35 1642.70 colon normal tumor de colon GW98- 23513 24.64 4748.96 9497.92 tumor de colon 5.78 560 colon normal GW98-894 24691 27.27 971.87 1943.74 colon normal tumor de colon GW98- 24690 25.35 3093.47 6186.94 tumor de colon 3.18 893 pulmón normal GW98-3 20742 27.02 1133.68 2267.36 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 27.26 981.94 1963.88 -1.15 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 29.14 315.07 630.14 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 28.15 571.76 1143.52 1.81 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 27.86 682.2 1364.40 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 27.45 871.19 1742.38 1.28 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 28.12 581.74 1 163.48 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 29.32 283.71 567.42 -2.05 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 27.85 687.38 687.38 mama normal tumor de mama GW0O- tumor de 28746 26.61 1444.19 2888.38 4.20 391 mama mama normal GWOO-413 28798 28.43 483.03 483.03 mama normal tumor de mama GW0O- tumor de 28797 25.49 2836.66 5673.32 11.75 412 mama mama normal GW00- 27592-95 32.26 48.29 48.29 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de 27588-91 29.07 328.46 328.46 6.80 231 :234 mama mama normal GW98-621 23656 26.82 1279.07 2558.14 mama normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 26.8 1289.27 2578.54 1.01 620 mama cerebro normal BB99- 25507 29.03 337.63 675.26 cerebro normal 542 cerebro normal BB99- 25509 29.19 305.6 611.20 cerebro normal 406 cerebro normal BB99- 25546 30.44 144.55 289.10 cerebro normal 904 Cerebro con ALZ etapa 5 25502 28.47 471.8 943.60 Cerebro con 1.80 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25503 27.3 955.52 1911.04 Cerebro con 3.T4 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25504 27.42 891.77 1783.54 Cerebro con 3.40 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25542 29.31 285.16 570.32 Cerebro con 1.09 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 27.96 643.88 1287.76 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 35.82 5.66 5.TT 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 40 0 0.00 27 do pulmón KC 24 de pulmón COPD 40 0 0.00 24 de pulmón -325.52 KC 28 de pulmón COPD 35.3 7.73 7.73 28 de pulmón -42.11 KC 23 de pulmón COPD 36.67 3.39 3.39 23 de pulmón -96.02 KC 25 de pulmón normal 35.11 8.67 8.67 25 de pulmón pulmón asmático 29321 31.01 102.08 102.08 pulmón -3.19 OD03112 asmático pulmón asmático 29323 29.76 216.81 433.62 pulmón 1.33 OD03433 asmático pulmón asmático 29322 29.83 208.08 416.16 pulmón 1.28 OD03397 asmático pulmón asmático 29325 30.37 150.17 300.34 pulmón -1.08 OD04928 asmático células endoteliales KC control 37.54 2 2.00 células endoteliales VEGF endo KC 35.77 5.83 5.83 VEGF endo 2.92 bFGF endo KC 40 0 0.00 bFGF endo -2.00 corazón Clontech normal 26.09 1982.44 3964.88 corazón T-1 de corazón 29417 24 6956.27 13912.54 T-1 de corazón 3.51 Isquémico T-14 de corazón con 29422 24.55 5010.03 10020.06 T-14 de 2.53 DCM no obstructiva corazón T-3399 de corazón con 29426 24.05 6766.57 13533.14 T-3399 de 3.41 DCM corazón adenoides GW99-269 26162 30.56 134.11 268.22 adenoides amígdala GW98-280 22582 27.94 651.01 1302.02 amígdala Células T PC00314 28453 29.8 212.45 424.90 Células T PBMNC 33.01 30.69 30.69 PBMNC monocito 33.42 23.9 47.80 monocito Células B PC00665 28455 33.52 22.59 45.18 Células B células dendrfticas 28441 29.07 329.58 659.16 células dendrltlcas neutrófllos 28440 30.39 149 149.00 neutrófllos eosinófiloe 28446 35.41 7.25 14.50 eoslnófllos BM no estimulada 34.24 14.65 14.65 BM no estimulada BM estimulada 36.61 3.51 3.51 BM estimulada -4.17 osteo diferenciado 30.55 135.33 135.33 osteo 3.02 diferenciado osteo Indlferenciado 32.38 44.88 44.88 osteo indlferenciado Nombre del gen sbg98530TS Nombre del gen sbq563917RDP Expresión general de moderada a baja en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en testículo, hígado, tráquea y cerebro intacto. Muestra buena expresión en la mayoría de las muestras del tracto gastrointestinal. Expresión de enfermedad más alta en células T, células B, neutrófilos y eosinófilos. La sobrerregulación en 1 de 4 tumores de mama, implica intervención en cáncer de mama. La subregulación en 3 de 3 pulmones con COPD, sugiere una intervención en enfermedad pulmonar obstructiva crónica. La subregulación en la muestra de corazón isquémico, implica a este gen en enfermedad cardiaca isquémica. La subregulación en las células endoteliales tratadas con VEGF y bFGF, sugiere una función en angíogénesis. La sobrerregulación en HSV, implica intervención en el virus de herpes simple como un factor de hospedero potencial.
Coplas Coplas Coplas Copia de Interme Intermes 50 ARNm Muestra Ct ARNr -días de dias de prome ng/AR detectasbg563917RDP (muestras 18S GOl GOl -dio Nr 18S das/50 1 y 2) (muestr (muestra de (ng) (ng) ng de a l) 2) GOl ARN total Adlpocltos 35.34, 40 3.66 0 1.83 3.06 16.34 29.90 subcutáneos Zenblo Tejido adiposo 40, 40 0 0.00 0.96 52.36 0.00 subcutáneo Zenbio Glándula suprarrenal 40, 40 0 0 0.00 0.61 81 .97 0.00 Clontech Cerebro Intacto 30.09, 91.85 96.8 94.33 7.24 6.91 651.42 Clontech 30.01 Cerebro fetal 40, 40 0 0 0.00 0.48 103.95 0.00 Clontech Cerebelo Clontech 35.19, 40 4.03 0 2.02 2.17 23.04 46.43 Cerviz 36.08, 40 2.33 0 1 .17 2.42 20.66 24.07 36.07, Colon 2.35 4.24 3.30 2.71 18.45 60.79 35.1 Endometrlo 35.01 , 40 4.49 0 2.25 0.73 68.21 153.14 Esófago 34.94, 40 4.68 0 2.34 1.37 36.50 85.40 Corazón Clontech 40, 40 0 0 0.00 1.32 37.88 0.00 Hipo tálamo 40, 40 0 0 0.00 0.32 155.28 0.00 Ileo 35.24, 40 3.89 0 1.95 2.58 19.38 37.69 35.37, Yeyuno 3.6 12.44 8.02 6.60 7.58 60.76 33.35 Riñon 40, 34.97 0 4.6 2.30 2.12 23.58 54.25 Hígado 33.51 , 34.6 11.25 5.78 8.52 1.50 33.33 283.83 33.1T, Hígado fetal Clontech 13.75 3.25 8.50 10.40 4.81 40.87 35.54 Pulmón 34.32 6.84 2.28 4.56 2.57 19.46 88.72 Glándula mamaria 40, 35.14 0 4.15 2.08 13.00 3.85 7.98 Clontech Mlometrio 40, 40 0 0.09 0.05 2.34 21.37 0.96 36.17, Omento 2.2 15.32 8.76 3.94 12.69 111.17 33.01 Ovario 40, 40 0 0 0.00 4.34 11.52 0.00 Páncreas 40, 40 0 0 0.00 0.81 61.80 0.00 Cabeza del páncreas 40, 40 0 0 0.00 1.57 31.85 0.00 35.43, Glándula parótida 3.46 0.24 1.85 5.48 9.12 16.88 39.81 Placenta Clontech 33.7, 35.45 10.02 3.42 6.72 5.26 9.51 63.88 Próetata 40. 40 0 0 0.00 3.00 16.67 0.00 Recto 40, 40 0 0 0.00 1.23 40.65 0.00 Glándula salival 34.89, 40 4.83 0 2.42 7.31 6.84 16.52 Clontech Músculo esquelético 40. 40 0 0 0.00 1.26 Clontech 39.68 0.00 Piel 40, 40 0 0 0.00 1.21 41.32 0.00 Intestino delgado 40, 40 0 0 0.00 0.98 51.07 0.00 Clontech 35.01 , Bazo 4.48 12.38 8.43 4.92 10.16 85.67 33.36 33.38, Estómago 12.18 7.48 9.83 2.73 18.32 180.04 34.18 34.25, Testículo Clontech 7.17 16.84 12.01 0.57 87.87 1054.92 32.8T 32.14, Timo Clontech 26.17 13.24 19.71 9.89 5.0T 99.62 33.25 Tiroides 40, 40 0 ?.0T 0.05 2.77 18.05 0.81 Tráquea Clontech 31.41 , 31 41.04 52.65 46.85 9.71 5.15 241.22 Vejiga urinaria 40, 35.05 0 4.38 2.19 5.47 9.14 20.02 33.77, Utero 9.62 12 10.81 5.34 9.36 33.41 101.22 Genómlca 26.54 813.56 actlna b 27.39 481.34 1.00E+05 18.71 100000 1.00E+05 8.92 100000 1.00E+04 22.44 10000 1.00E+04 22.11 10000 1.00E+03 26.05 000 1.00E+03 26.1 1 1000 1.00E+02 30.4 100 1.00E+02 30.17 100 1.00E+01 33.87 10 1.00E+01 33.26 10 1.OOE-00 40 0 1.OOE-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 Número Coplas No. de veces do Coplas do ARNm en que se Muestra registro Intermedetecta- repitió la Ct Muestra 8bg563917RDP (Idontlfl- dias de das/SO alteración en cador de GOl ng de la población GSK) ARN total enferma colon normal GW98-167 21941 30.39 148.35 296.70 colon normal tumor de colon GW98- 21940 30.93 110.14 220.28 tumor de colon -1.35 166 colon normal GW98-178 22080 32.93 36.71 73.42 colon normal tumor de colon GW98- 22060 34.8 13.09 26.18 tumor de colon -2.80 177 colon normal GW98-561 23514 31.41 84.68 169.36 colon normal tumor de colon GW98- 23513 32.09 58.33 1 16.66 tumor de colon -1.45 5T0 colon normal GW98-894 24T91 30.02 182.15 364.30 colon normal tumor de colon GW98- 24690 31.12 99.26 198.52 tumor de colon -1.84 893 pulmón normal GW98-3 20742 28.4 443.99 887.98 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 33.59 25.44 50.88 -17.45 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 28.63 391.85 783.70 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 29.16 292.08 584.16 -1.34 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 29.13 296.8 593.60 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 30.22 163.43 326.86 -1.82 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 31.71 71.72 143.44 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 31.74 70.77 141.54 -1.01 281 pulmón mama normal GW00-392 28750 31.49 81.02 81.02 mama normal tumor do mama GW00- tumor de 28746 33.58 25.62 51.24 -1.58 391 mama mama normal GW00-413 28798 35.07 11.31 1 1 :31 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28797 31.99 61.52 123.04 10.88 412 mama mama normal GWQ0- 27592-95 35.63 8.3 8.30 mama normal 235:238 tumor do mama GWOO- tumor de 27588-91 34.33 16.97 16.97 2.04 231 :234 mama mama normal GW98-621 23656 32.07 58.95 117.90 mama normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 32.71 41.33 82.66 -1.43 620 mama cerebro normal BB99- 25507 30.16 168.86 337.72 cerebro normal 542 cerebro normal BB99- 25509 31.12 99.35 198.70 cerebro normal 406 cerebro normal BB99- 25546 31.14 98.44 196.88 904 cerebro normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con -3.77 ??T9-874 25502 33.16 32.39 64.78 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 29.32 267.28 534.56 2.19 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 30.36 150.72 301.44 1.23 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 30.1 174.01 348.02 1.42 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 31.06 102.88 205.76 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 32.15 56.21 56.21 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 35.96 6.92 6.92 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 40 0 0.00 24 de pulmón -70.34 KC 28 de pulmón COPD 36.21 6.05 6.05 28 de pulmón -11.63 KC 23 de pulmón COPD 34.83 12.87 12.87 23 de pulmón -5.47 KC 25 de pulmón normal 34.89 12.45 12.45 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 32.57 44.76 44.76 -1.57 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 32.4 49.04 98.08 OD03433 asmático 1.39 pulmón asmático pulmón 4 OD03397 29322 31.79 68.6 137.28 1.95 asmático pulmón asmático pulmón 29325 31.34 88.11 176.22 2.51 OD04928 asmático células células endotollales KC control 35.77 7.68 7.68 endotellalos VEGF endo KC 40 0 0.00 VEGF endo -7.68 bFGF endo KC 40 0 0.00 bFGF endo -7.68 corazón Clontoch normal 31.09 100.75 201.50 corazón T-1 do corazón 29417 34.75 13.46 26.92 T-1 de corazón -7.49 isquémico T-14 de corazón con T-14 de 9422 33.69 24.17 DCM no obstructiva 2 48.34 -4.17 corazón T-3399 de corazón con T-3399 de 7.16 DCM 29426 33.48 2 54.32 -3.71 corazón adenoides GW99-269 26162 30.49 140.7 281.40 adenoides amígdala GW98-280 22582 30.07 177.32 354.64 amígdala Células T PC00314 28453 27.79 622.1 1244.20 Células T PBMNC 36.19 6.11 6.11 PBMNC monocito 33.24 30.91 T1.82 monocito Células B PC00665 28455 26.37 1355.2 2710.40 Células B células células dendrlticas 2T441 28.69 378.62 757.24 dendrítlcas 1.00E+02 31.03 100 1.00E+01 38.68 10 1.00E+01 33.47 10 1.00E-00 40 0 1 ,???-00 40 0 NTC 40 0 Nombre del gen sbq5639 7RDP No. de veces en que se repitió Telldoe enfermos la alteración en la población enferma respecto a la población normal tumor de colon -1.35 tumor de colon -2.80 tumor de colon -1.45 tumor de colon -1.84 tumor de pulmón -17.45 tumor de pulmón -1.34 tumor de pulmón -1.82 tumor de pulmón -1.01 tumor de mama -1.58 tumor de mama 10.88 tumor de mama 2,04 tumor de mama -1.43 Cerebro con ALZ etapa 5 -3.77 Cerebro con ALZ etapa 5 2.19 Cerebro con ALZ etapa 5 1.23 Cerebro con ALZ etapa 5 1.42 24 de pulmón -70.34 28 de pulmón -11.63 23 de pulmón -5.47 pulmón asmático -1.57 pulmón asmático 1 ,39 pulmón asmático 1.95 pulmón asmático 2,51 VEGF ando -7.68 bFGF endo -7.68 T-1 de corazón -7.49 T-14 de corazón -4.17 T-3399 de corazón -3.71 BM estimulada 1.20 osteo indiferenciado 0.00 Cartílago (reserva) -2.36 PBL con VIH IIIB -1.30 MRC5 con cepa F de HSV 20.45 Nombre del gen sbg618069LRR Expresión general baja en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en cerebro intacto, cerebro fetal, cerebelo y timo. Expresión de enfermedad más alta en una de las muestras de tumor de colon, una de las muestras de tumor de pulmón y los PBL no infectados. La subregulación en 2 de 4 tumores de colon, sugiere una función en cáncer de colon. La sobrerregulación en 1 de 4 tumores de pulmón, y la sobrerregulación en 2 de 4 tumores de mama, sugiere funciones en cánceres de pulmón y mama. La subregulación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, implica una función para este gen en COPD. Sobrerregulación en la médula ósea estimulada. La subregulación en una línea de células infectadas por VIH, asi como también una expresión moderada en células inmunes, sugiere una intervención en VIH. La sobrerregulación en HSV, implica intervención en virus de herpes simple como un factor de hospedero potencial.
Intestino delgado 40, 40 0.16 0 0.08 0.98 51.07 4.09 Clontech Bazo 35.59, 40 3.53 0.59 2.06 4.92 10.16 20.93 Estómago 36.73, 40 1.76 0.11 0.94 2.73 18.32 17.12 Testículo Clontech 37.91 , 40 0.86 0.1 0.48 0.57 87.87 42.18 Timo Clontech 30.22, 94.88 112.23 103.56 9.89 5.06 523.53 29.94 Tiroides 35.15, 40 4.62 0 2.31 2.77 18.05 41.70 Tráquea Clontech 33.49, 12.75 8.22 10.49 9.71 5.15 53.99 34.21 Vejiga urinaria 40. 40 0.09 0.08 0.09 5.47 9.14 0.78 Utero 35.26. 4.31 16.97 10.64 5.34 9.36 99.63 33.03 genómlca 26.04 1229.54 actina b 27.25 584.19 1.00E+05 19.09 100000 1.00E+05 19.04 100000 1.00E+04 22.35 10000 1.00?+04 22.35 10000 1.00E+03 26.07 1000 1.00E+03 26.26 1000 1.00E+02 30.64 100 1.00E+02 30.3T 100 1.00E+01 34.04 10 1.O0E+01 33.52 10 1.00E-00 40 0 1.00E-00 .. 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 No. de Número veces en de Coplas de Coplas que se Muestra registro IntermeARNm repitió la Ct detectadas/ Muestra sbg618069LRR (Identlfi- dias de alteración cador de 50 ng de GOl en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 29.52 176.51 353.02 colon normal tumor de colon GW98- 21940 33.45 18.5 37.00 tumor de colon -9.54 166 colon normal GW98-178 22080 31.82 47.14 94.28 colon normal tumor de colon GW98- 22060 29.68 160.67 1 7 321.34 tumor de colon 3.41 colon normal GW98-561 23514 30.33 110,78 221.56 colon normal tumor de colon GW98- 23513 33.11 22.39 44.78 tumor de colon -4.95 5T0 Colon normal GW98- 24691 28.1 396.95 793.90 colon normal 894 tumor de colon GW98- 24690 26.93 779.99 1559.98 tumor de 1.96 893 colon pulmón normal GW98- 20742 30.41 105.78 211.56 pulmón 3 normal tumor de pulmón 20741 26.28 1128.28 2256.56 tumor de 10.67 GW98-2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 29.28 201.91 403.82 pulmón 179 normal tumor de pulmón 20676 28.35 345.36 690.72 tumor de 1.71 GW97-178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 28.42 331.95 663.90 pulmón 165 normal tumor de pulmón 21921 30.98 76.05 152.10 tumor de -4.36 GW98-164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 34.15 12.36 24.72 pulmón 282 normal tumor de pulmón 22583 32.08 40.6 81.20 tumor de 3.28 GW98-281 pulmón mama normal GW00- 28750 29.67 161.68 161.68 mama 392 normal tumor de mama 28746 28.98 239.65 479.30 tumor de 2.96 GW00-391 mama mama normal GW00- 28798 31.78 48.04 48.04 mama 413 normal tumor de mama 28797 29.69 159.55 319.10 tumor de 6.64 GW00- 2 mama mama normal GW00- 27592- 34.18 12.14 12.14 mama 235:238 95 normal tumor de mama 27588- 29.2 211.28 211.28 tumor de 17.40 GWOO-231 :234 91 mama mama normal GW98- 23656 29.72 157.4 314.80 mama 621 normal tumor de mama 23655 31.12 70.17 140.34 tumor de -2.24 GW98-620 mama cerebro normal BB99- 25507 30.81 83.89 167.78 cerebro 542 normal cerebro normal BB99- 25509 31.02 74.28 148.56 cerebro 406 normal cerebro normal BB99- 25546 31.39 60.08 120.16 cerebro 904 normal Cerebro con ALZ 25502 32.54 31.07 62.14 Cerebro con -2.34 etapa 5 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25503 30.65 92.1 184.20 Cerebro con 1.27 etapa 5 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25504 31.68 50.92 101.84 Cerebro con -1.43 etapa 5 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25542 31.39 60.36 120.72 Cerebro con -1.21 etapa 5 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 30.47 101.87 203.74 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 39.27 0.65 0.65 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 40 0 0.00 24 de pulmón -68.13 KC 28 de pulmón COPD 37.38 1.93 1.93 28 de pulmón -35.30 KC 23 de pulmón COPD 34.28 11.47 1 .47 23 de pulmón -5.94 KC 25 de pulmón normal 40 0 0.00 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 33.17 21.73 21.73 -3.14 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 32.35 34.64 69.28 1.02 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 30.83 83.1 166.20 2.44 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 30.94 77.99 155.98 2.29 OD04928 asmático células células endotellales KC control 40 0 0.00 endotellales VEGF endo KC 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo KC 40 0 0.00 bFGF endo 0.00 corazón Clontech normal 30.52 99.45 198.90 corazón T-1 de corazón T-1 de 29417 28.78 270.18 540.36 2.72 Isquémico corazón T-14 de corazón con T-14 de 29422 29.62 166.76 333.52 1.68 DCM no obstructiva corazón ?-33T9 de corazón con T-3399 de 29426 30.05 129.76 259.52 1.30 DCM corazón adenoides GW99-269 2T1 T2 29.05 230.93 461.86 adenoides amígdala GW98-280 22582 29.77 152.22 304.44 amígdala Células T PC00314 28453 31.6 53.48 106.96 Células T PBMNC 39.8 0.48 0.48 PBMNC monocito 40 0 0.00 monocito Células B PC00665 28455 31.56 54.77 109.54 Células B células células dendrlticas 23441 34.09 12.8 25.60 dendrlticas neutrófllos 2T440 34.03 13.21 13.21 neutrófllos eosinófilos 28446 40 0 0.00 eosinófilos BM no BM no estimulada 40 0 0.00 estimulada B estimulada 35.71 5.04 5.04 BM estimulada 5.04 osteo osteo diferenciado 40 0 0.00 0.00 diferenciado osteo osteo Indiferenciado 40 0 0.00 indiferenciado condrocltos 33.5 17.89 44.73 condrocltos SInovio con SInovio con OA IP12/01 29462 32.24 37.02 37.02 OA SInovio con Slnovlo con OA NP10/01 29461 27.95 434.95 869.90 OA Sinovio con Sinovio con OA NP57/00 28464 30.9 79.82 159.64 OA Sinovio con Sinovio con RA NP03/01 28466 31.79 47.9 95.80 RA Nombre del gen sbq618069LRR Nombre del gen sba9341 4Relaxin Expresión general baja en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en testículo, hígado y cerebro intacto. Expresión de enfermedad más alta en 3 de las muestras de pulmón normal, una de las muestras de tumor normal, las células MRC5 infectadas por HSV, las adenoides y las células T. Expresión de enfermedad más alta en 2 de las muestras de pulmón normal, una de las muestras de tumor de pulmón, una de las muestras de mama normal, una de las muestras de tumor de mama, y las muestras de PBL no infectados. La subregulación en 1 de 4 tumores de colon, y la subregulación en 2 de 4 tumores de pulmón, implica funciones en cánceres de colon y pulmón. La subregulación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, y la sobrerregulación en 3 de 4 muestras de pulmón asmático, implica a este gen en COPD y asma. La sobrerregulación en 2 de 3 muestras de corazón, propone funciones en DCM obstructiva y no obstructiva. La subregulación en la reserva de cartílago con OA, y la baja expresión en el sinovio con RA y OA, hueso con OA y condrocitos, sugieren una intervención en osteoartritis y artritis reumatoide. La subregulación en una línea de células primarias infectadas por VIH, sugiere una intervención en VIH. La sobrerregulación en HSV, implica intervención en virus de herpes simple como un factor de hospedero potencial.
No. de Número veces en de Coplas Coplas de que se ARNm Muestra registro Intermerepitió la Ct detectadas/ Muestra sbg934114Relaxln (Identifl- dias de alteración 50 ng de cador de GOl en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 36.1 22.33 44.66 colon normal tumor de colon GW98- tumor de 21940 36.47 18.37 36.74 -1.22 166 colon colon normal GW98-178 22080 35.7 27.58 55.16 colon normal tumor de colon GW98- tumor de 22060 38.05 7.98 15.96 -3.46 177 colon colon normal GW98-561 23514 33.57 84.85 169.70 colon normal tumor de colon GW98- tumor de 23513 37.66 9.8 19.60 -8.66 560 colon colon normal GW98-894 24691 36.39 19.09 38.18 colon normal tumor de colon GW98- 24690 36.43 18.74 37.48 tumor de -1.02 893 colon pulmón normal GW98-3 20742 32.48 150.6 301.20 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 36.65 16.64 33.28 -9.05 2 pulmón pulmón normal GW97- pulmón 20677 33.22 102.07 204.14 179 normal tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 32.31 164.63 329.26 1.61 178 pulmón pulmón normal GW98- pulmón 21922 32.08 185.96 371.92 65 normal tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 35.14 37.09 74.18 -5.01 164 pulmón pulmón normal GW98- pulmón 22584 36.41 18.93 37.86 282 normal tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 35.24 35.13 70.26 1.86 281 pulmón mama normal GW00-392 28750 34.04 66.25 66.25 mama normal tumor de mama GWOO- tumor de 28746 37.9 8.61 17.22 -3.85 391 mama mama normal GWOO-413 28798 36.36 19.44 19.44 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28797 36.79 15.49 30.98 1.59 412 mama mama normal GW00- 27592-95 36.91 14.52 14.52 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de 27588-91 35.43 31.71 31.71 ' 2.18 231:234 mama mama normal GW98-621 23656 . 36.26 20.51 41.02 mama normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 35.76 26.68 53.36 1.30 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 37.99 8.21 16.42 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 40 1.41 2.82 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 40 0 0.00 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 38.65 5.82 11.64 1.81 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 37 13.9 27.80 4.33 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 37.4 11.24 22.48 3.51 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 38 8.19 16.38 2.55 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 35.32 33.59 67.18 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 37.02 13.72 13.72 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 40 0 0.00 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 39.97 2.78 2.78 24 de pulmón -7.81 KC 28 de pulmón COPD 40 0 0.00 28 de pulmón -21.71 KC 23 de pulmón COPD 39.0T 4.67 4.67 23 de pulmón -4.65 KC 25 de pulmón normal 38.61 5.92 5.92 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 36.02 23.31 23.31 1.07 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 34.12 63.36 126.72 5.84 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 33.99 68.06 136.12 6.27 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 33.77 76.08 152.16 7.01 OD04928 asmático células células endotellales KC control 40 0 0.00 endotellales VEGF ando KC 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo KC 38.16 7.54 7.54 bFGF endo 7.54 corazón Clontech normal 40 0 0.00 corazón T-1 de corazón T-1 de 29417 40 1.36 2.72 2.72 isquémico corazón T-14 de corazón con 29422 36.31 20.01 40.02 T-14 de 40.02 DCM no obstructiva corazón T-3399 de corazón con T-3399 de 29426 37.17 12.7 25.40 25.40 DCM corazón adenoides GW99-269 2T162 33.33 96.07 192.14 adenoides amígdala GW98-280 22582 34.86 42.85 85.70 amígdala Células T PC00314 28453 33.48 88.65 177.30 Células T PBMNC 40 0 0.00 PBMNC monocito 40 0 0.00 monocito Células B PC008B5 28455 32.44 153.68 307.36 Células B células células dendrltlcas 28441 35.78 26.47 52.94 dendrltlcas neutrófilos 28440 3T.18 21.43 21.43 neutrófilos eoslnófllos 28446 39.2 4.34 8.68 eoslnófllos BM no B no estimulada 39.56 3.6 3.60 estimulada BM BM estimulada 40 1.34 1.34 -2.69 estimulada osteo osteo diferenciado 40 0 0.00 . 0.0 diferenciado osteo osteo indiferenciado 40 0 0.00 Indiferenciado condrocitos 36.64 16.79 41.98 condrocitos Sinovio con Slnovlo con OA IP12/01 29462 34.75 45.45 45.45 OA Sinovio con Sinovio con OA NP10/01 29461 36.02 23.28 46.56 OA Sinovio con Sinovio con OA NP57/00 28464 34.24 59.37 118.74 OA Sinovio con Sinovio con RA NP03/01 28466 37.88 8.71 17.42 RA Sinovio con Sinovio con RA NP71/00 28467 36.02 23.22 46.44 RA Sinovio con RA NP45/00 28475 34.9 41.9 Sinovio con 83.80 RA Hueso con Hueso con OA (biobank) 29217 33.59 83.75 83.75 OA (biobank) Muestra 1 de hueso con J. Emory Hueso con 37.31 11.8 23.60 OA OA Muestra 2 de hueso con Hueso con J. Emory 37.47 10.81 21.62 OA OA Cartílago Cartílago (reserva) Normal 34.61 49.07 98.14 (reserva) Cartílago Cartílago (reserva) OA 40 0 0.00 -98.14 (reserva) Nombre del qen sbq934114Relaxin No. de veces en que se repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon -1.22 tumor de colon -3.46 tumor de colon -8.66 tumor de colon -1.02 tumor de pulmón -9.05 tumor de pulmón 1.61 tumor de pulmón -5.01 tumor de pulmón 1.86 tumor de mama -3.85 tumor de mama 1.59 tumor de mama 2.18 tumor de mama 1.30 Cerebro con ALZ etapa 5 1.81 Cerebro con ALZ etapa 5 4.33 Cerebro con ALZ etapa 5 3.51 Cerebro con ALZ etapa 5 2.55 24 de pulmón -7.81 28 de pulmón -21 .71 23 de pulmón -4.65 pulmón asmático 1.07 pulmón asmático 5.84 pulmón asmático 6.27 pulmón asmático 7.01 VEGF endo 0.00 bFGF endo 7.54 T-1 de corazón 2.72 T- 4 de corazón 40.02 T-3399 de corazón 25.40 BM estimulada -2.69 osteo diferenciado 0.00 Cartílago (reserva) -98.14 PBL con VIH IIIB -5.48 MRC5 con cepa F de HSV 52.53 Nombre del gen sbq99174LOX-like Expresión general moderada en muestras normales y enfermas.
Expresión normal más alta en cerebro intacto, hígado, piel, bazo y testículo.
Muestra expresión relativamente buena en las muestras del tracto reproductor femenino, así como también en las muestras del tracto gastrointestinal. Expresión de enfermedad más alta en una de las muestras de pulmón normal.
Una de las muestras de pulmón asmático, neutrófilos, eosinófilos, 2 de las muestras de sinovio con RA, y una de las muestras de hueso con OA. La subregulación en 1 de 4 muestras de tumor de pulmón, sugiere implicación posible en cáncer de pulmón. La sobrerreguiación en 2 de 4 tumores de mama, implica una intervención en cánceres de mama. La subregulación en 1 de 4 cerebros con AD, junto con la alta expresión observada en el cerebro, sugiere una intervención en enfennedad de Alzheimer. La subregulación en 2 de 3 muestras de pulmón con COPD, implica una intervención en enfermedad pulmonar obstructiva crónica. La sobrerreguiación en 1 de 4 muestras de pulmón asmático, implica una función en asma. La subregulación en cartílago con OA y alta expresión en sinovio con OA y RA, sugieren intervención posible en osteoartritis y artritis reumatoide. La corroboración de alta expresión en las células T, provee evidencia adicional de una función en RA/OA. Expresión moderada en otras células inmunes.
No. de Número veces en Coplas de de Coplas que se Muestra registro ARNm Interme¬ Ct detectadas/ Muestra repitió la sbg99174LOX-llke (Identlfl- dias de alteración 50 ng de cador de GOI en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 29.81 184.31 368.62 colon normal tumor de colon GW98- 1TT 21940 29.25 254.48 508.96 tumor de colon 1.38 colon normal GW98-178 22080 32.06 50.31 100.62 colon normal tumor de colon GW98- 22060 31.77 59.28 177 118.56 tumor de colon 1.18 colon normal GW98-561 23514 33.21 25.83 51.66 colon normal tumor de colon GW98- 23513 31.74 60.51 121.02 tumor de colon 2.34 560 colon normal GW98-894 24691 30.17 149.84 299.68 colon normal tumor de colon GW98- 24690 29.41 232.23 464.46 tumor de colon 1.55 893 pulmón normal GW98-3 20742 25.76 1914.72 3829.44 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 30.12 154.63 309.26 -12.38 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 29.59 209.5 419.00 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 27.2 835.04 1670.08 3.99 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 28.22 462.22 924.44 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 29.27 251.87 503.74 -1.84 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 30.18 149.17 298.34 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 28.47 399.41 798.82 2.68 ! 281 pulmón mama normal GW00-392 28750 30.24 143.58 143.58 mama normal tumor de mama GW0O- 28746 30.16 151.08 302.16 tumor de mama 2.10 391 mama normal GW00-413 28798 31.51 68.87 68.87 mama normal tumor de mama GW00- 28797 28.91 310.66 621.32 tumor de mama 9.02 412 mama normal GW0O- 27592-95 40 0 0.00 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- 27588-91 33.55 21.28 21.28 tumor de mama 21.28 231 :234 mama normal GW98-621 23656 31.57 66.56 133.12 mama normal tumor de mama GW98- 23655 31.15 84.8 169.60 tumor de mama 1.27 620 cerebro normal BB99- 25507 29.55 214.38 428.76 cerebro normal 542 cerebro normal BB99- 25509 29.15 270.89 541.78 cerebro normal 406 cerebro normal BB99- 25546 30.48 124.98 249.96 cerebro normal 904 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 33.57 20.99 41.98 -9.69 ??T9-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 29.89 176.42 352.84 -1.15 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 31.65 63.83 127.66 -3.19 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 31.04 T0.73 181.46 -2.24 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 29.94 170.8 341.60 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 30.63 115.04 115.04 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 32.22 45.83 45.83 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 34.16 14.91 14.91 24 de pulmón -9.21 KC 26 de pulmón COPD 33.51 21.7 21.70 28 de pulmón -6.33 KC 23 de pulmón COPD 32.51 38.67 38.67 23 de pulmón -3,55 KC 25 de pulmón normal 32.18 46.79 46.79 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 31.84 56.95 56.95 -2.41 OD03112 asmático pulmón asmático 29323 31.12 86.42 172.84 pulmón 1.26 OD03433 asmático pulmón asmático 29322 27,13 867.31 1734.62 pulmón 12.63 OD03397 asmático pulmón asmático 29325 30.25 142.92 285.84 pulmón 2.08 OD04928 asmático células endoteliales KC control 31.23 81.05 81.05 células endotellales VEGF endo KC 31.87 56.15 56.15 VEGF endo -1.44 bFGF endo KC 32.64 35.97 35.97 bFGF endo -2.25 corazón Clontech normal 35.46 7.06 14.12 corazón T-1 de corazón 29417 35.73 6.03 12.06 T-1 de corazón -1.17 Isquémico T-14 de corazón con 29422 34.34 13.49 26.98 T-14 de 1.91 DCM no obstructiva corazón T-3399 de corazón con 29426 33.65 20.01 40.02 T-3399 de 2.83 . DCM corazón adenoides GW99-269 26162 31.2 82.69 165.38 adenoides amígdala GW98-280 22582 30.8 103.96 207.92 Amígdala Células T PC00314 28453 28.16 480.4 960.80 Células T PBMNC 30.25 143.11 143.11 PBMNC monoclto 30.05 160.68 321.36 Monoclto Células B PC00665 28455 30.75 107.02 214.04 Células B células dendrftlcas 28441 30.32 137.17 274.34 células dendrltlcas neutrófllos 28440 26.32 1390.87 1390.87 neutrófllos eoslnófilos 28446 25.07 2854.44 5708.88 eosinófilos BM no estimulada 30.72 109.05 109.05 BM no estimulada BM estimulada 28.61 369.2 369.20 BM estimulada 3.39 osteo diferenciado 40 0 0.00 osteo -0.28 diferenciado osteo Indlferenclado 40 0.28 0.28 osteo Indlferenclado condrocltos 34.3 13.76 34.40 condrocltos Sinovio con OA IP12/01 29462 27.56 676.63 676.63 Slnovlo con OA Slnovlo con OA NP10/01 29461 31.41 73.19 146.38 Sinovio con OA Sinovio con OA NP57/00 28464 28.02 518.05 1036.10 Sinovio con OA Sinovio con RA NP03/01 28466 27.03 921.88 1843.76 Slnovlo con RA Slnovlo con RA NP71/00 28467 27.04 914.02 1828.04 Sinovio con RA Sinovio con RA NP45/00 28475 29.06 285.08 570.16 Slnovlo con RA Hueso con OA (blobank) 29217 26.78 1065.84 1065.84 Hueso con OA (biobank) Muestra 1 de hueso con J. Emory 30,27 141.07 282.14 Hueso con OA OA Muestra 2 de hueso con J. Emory 27.04 917.04 1834.08 Hueso con OA OA Cartílago (reserva) Normal 28,23 461.21 922.42 Cartílago (reserva) Cartílago (reserva) OA 33,16 2T.T5 53.30 Cartílago -17.31 (reserva) Nombre del gen sbg99174LOX-like No. de veces en que se repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon 1.38 tumor de colon 1.18 tumor de colon 2.34 tumor de colon 1.55 tumor de pulmón -12.38 tumor de pulmón 3.99 tumor de pulmón -1.84 tumor de pulmón 2.68 tumor de mama 2.10 tumor de mama 9.02 tumor de mama 21.28 tumor de mama 1.27 Cerebro con ALZ etapa 5 -9.69 Cerebro con ALZ etapa 5 ¦1.15 Cerebro con ALZ etapa 5 -3.19 Cerebro con ALZ etapa 5 -2.24 24 de pulmón -9.21 28 de pulmón -6.33 23 de pulmón -3.55 pulmón asmático -2.41 pulmón asmático 1.26 pulmón asmático 12.63 pulmón asmático 2.08 VEGF endo -1.44 bFGF endo -2.25 T-1 de corazón -1.17 T-14 de corazón 1.91 T-3399 de corazón 2.83 BM estimulada 3.39 osteo diferenciado -0.28 Cartílago (reserva) -17.31 PBL con VIH IIIB 1.1 1 MRC5 con cepa F de HSV 1.07 Nombre del aen sba995002PIGR (Taqman) Expresión general extremadamente baja en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en el colon y la glándula parótida. Expresión de enfermedad más alta en uno de los tumores de pulmón y uno de los tumores de colon. La sobrerregulación en 1 de 4 tumores de colon y 1 de 4 tumores de pulmón, implica funciones en cánceres de colon y pulmón. La subregulación en 3 de 4 muestras de cerebro con AD, así como también alta expresión en cerebro intacto, sugiere una intervención en enfermedad de Alzheimer. La subregulación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, implica a este gen en COPD. La subregulación en las muestras de corazón con DCM isquémica y no obstructiva, sugiere una función para este gen en enfermedad cardiovascular. Sobrerregulación en la muestra de médula ósea estimulada. La sobrerregulación en HSV, implica intervención en virus de herpes simple como un factor de hospedero potencial. Alta expresión en neutrófilos y eosinófilos.
Páncreas 40, 40 0 0 0.00 0.81 61.80 0.00 Cabeza del páncreas 40, 40 0 0 0.00 1.57 31.85 0.00 36.7, Glándula parótida 11 .72 5.46 8.59 5.48 9.12 78.38 37.94 Placenta Clontech 40, 40 0 0 0.00 5.26 9.51 0.00 Próstata 40, 40 0 0 0.00 3.00 16.67 0.00 Recto 40, 40 0 0 0.00 1.23 40.65 0.00 Glándula salival 37.23, 8.45 2.5 5.48 7.31 6.84 37.45 Clontech 39.21 Músculo esquelético 40, 40 0 0 0.00 1 .26 39.68 0.00 Clontech Piel 40, 40 0 0 0.00 1.21 41.32 0.00 Intestino delgado 40, 40 0 0 0.00 0.98 51.07 0.00 Clontech Bazo 40, 38.76 1.25 3.3 2.28 4.92 10.16 23.12 Estómago 40, 39.25 1.25 2.43 1.84 2.73 18.32 33.70 Testículo Clontech 40, 40 0 0 0.00 0.57 87.87 0.00 Timo Clontech 37.82, 40 5.88 0 2.94 9.89 5.06 14.86 Tiroides 40, 40 0 0 0.00 2.77 18.05 0.00 Tráquea Clontech 40, 40 0 0 0.00 9.71 5.15 1 . 0.00 Vejiga urinaria 40, 40 0 0 0.00 5.47 9.14 0.00 Utero 38.34, 40 4.27 0 2.14 5.34 9.36 19.99 genómica 29.6& 888.99 actina b 30.72 462.87 1.00E+05 22.2 100000 1 00E+05 22.14 100000 1.OOE+04 25.72 10000 1.00E+04 25.66 10000 1.00E+03 29.16 1000 1.00E+03 29.07 1000 1.00E+02 32.37 100 1.00E+02 34.12 100 1.00E+01 37.12 10 1.00E+01 37.11 10 1.00E-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 NTC 38.03 -1 Número Coplas No. de veces de Coplas de ARNm en que se Muestra registro Intermedetectarepitió la Ct Muestra sbg995002PIG (Identifidias de das/50 alteración en cad or de GOl ng de la población GSK) ARN total enferma colon normal GW98-167 21941 33.43 149.84 299.68 colon normal tumor de colon GW98- 21940 32.49 274.64 549.28 tumor de colon 1.83 166 colon normal GW98-178 22080 40 0 0.00 colon normal tumor de colon GW98- 22060 31.11 675.8 1351.60 tumor de colon 1351.60 177 colon normal GW98-561 23514 37.74 9.09 18.18 colon normal tumor de colon GW98- 23513 35.81 31.94 63.88 tumor de colon 3.51 560 colon normal GW98-894 24691 33.17 177,11 354.22 colon normal tumor de colon GW98- 24690 31.61 488.49 976.98 tumor de colon 2.76 893 pulmón normal GW98-3 20742 35.48 39.55 79.10 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 28.32 4121.56 8243.12 104.21 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 36.47 20.69 41.38 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 37.24 12.59 25.18 -1.64 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 37.32 11.96 23.92 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 36.07 26.9 53.80 1 2.25 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 38.49 5.58 11.16 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 37.89 8.24 16.48 1.48 281 pulmón mama normal GW00-392 28750 39.03 3.93 3.93 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28746 38.01 7.65 15.30 3.89 391 mama mama normal G OO-413 28798 40 0 0.00 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28797 38.67 4.98 9.96 9.9T 412 mama mama normal GW00- 27592-95 40 0 0.00 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de 27588-91 40 0 0.00 0.00 231 :234 mama mama normal GW98-621 23656 36.12 26.13 52.26 mama normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 40 0 0.00 -52.26 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 37.14 13.43 26.86 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 40 0 0.00 406 normal cerebro normal ??T9- cerebro 25546 40 0 0.00 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 40 0 0.00 -8.95 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 40 0.51 1.02 -8.78 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 40 0.88 1.76 -5.09 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 40 1.9 3 0 -2.36 BB99-927 .8 ALZ etapa 5 C de pulmón CT normal 36.59 19.23 38.46 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 40 0 0.00 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 40 0 0.00 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 40 0 0.00 24 de pulmón -9.62 KC 28 de pulmón COPD 40 0 0.00 28 de pulmón -9.62 KC 23 de pulmón COPD 40 0 0.00 23 de pulmón -9.62 KC 25 de pulmón normal 40 0 0.00 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 40 0 0.00 -9.62 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 38.36 6.1 12.20 1.27 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 37.29 12.16 24.32 2.53 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 38.01 7.64 15.28 1.59 OD04928 asmático células células endotellales KC control 40 0 0.00 endotellales VEGF endo KC 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo KC 40 0 0.00 bFGF endo - 0.00 , corazón Clontech normal 37.85 8.49 16.98 corazón T-1 de corazón T-1 de 29417 40 0 0.00 -16.98 Isquémico corazón T-14 de corazón con T-14 de 29422 40 0 0.00 -16.98 DCM no obstructiva corazón T-3399 de corazón con ?-339T de 29426 39.5 2.9 5.80 -2.T3 DCM corazón adenoides GW99-269 26162 40 0 0.00 adenoides amígdala GW98-280 22582 36.35 22.46 44.92 amígdala Células T PC00314 28453 36.17 25.23 50.46 Células T PBMNC 40 0 0.00 PBMNC monoclto 40 0.45 0.90 monoclto Células B PC00665 28455 40 0.6 1.20 Células B células células dendrfticas 28441 38.07 7.37 14.74 dendrlücas neutrófiloa 28440 32.73 236.09 236.09 neutrófllos eosinófilos 28446 33.68 126.65 253.30 eosinófilos BM no BM no estimulada 40 0 0.00 estimulada BM estimulada 36.52 20.1 20.10 BM estimulada 20.10 osteo osteo diferenciado 40 0 0.00 0.00 diferenciado osteo osteo Indiferenciado 40 0 0.00 indiferenciado condrocitos 39.61 2.7 6.75 condrocitos Sinovio con Sinovio con OA IP12/01 29462 39.91 1.59 1.59 OA Nombre del gen sbq995002PIGR Expresión general de baja a moderada en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en los adipocítos subcutáneos, tejido adiposo subcutáneo, cerebro intacto y corazón. Expresión de enfermedad más alta en las 3 muestras de corazón. La subregulación en 1 de 4 muestras de tumor de pulmón, y la sobrerregulación en 2 de 4 muestras de tumor de mama, indica una función para este gen en cánceres de pulmón y mama. La sobrerregulación en 2 de 4 muestras de cerebro con AD, sugiere una intervención en enfermedad de Alzheimer. La sobrerregulación en 3 de 3 muestras de corazón, implica una intervención en enfermedades cardiovasculares tales como DCM obstructiva y no obstructiva, así como isquemia. Baja expresión en todas las células inmunes. Expresión de baja a moderada en muestras de hueso y sinovio con OA, así como también en las muestras de sinovio con RA. 34.82. Colon 2.39 0.23 1.31 2.71 18.45 24.17 38.44 Endometrlo 40, 35.09 0 2.01 1.01 0.73 68.21 68.55 Esófago 40, 40 0 0 0.00 1.37 3T.50 0.00 32.53, Corazón Clontach 10.45 3.32 6.8T 1.32 37.88 260.80 34.31 Hlpotálamo 40, 40 0 0 0.00 0.32 155.28 0.00 Ileo 40, 34.55 0 2.85 1.43 2.58 19.38 27.62 33.04, Yeyuno 7.51 2.33 4.92 6.60 7.58 37.27 34.86 Riñon 40, 40 0 0 0.00 2.12 23.58 0.00 35.81. Hígado 1.26 4.28 2.77 1.50 33.33 92.33 33.92 Hígado fetal Clontech 32.05, 40 14.25 0 7.13 10.40 4.81 34.25 Pulmón 40, 33.51 0 5.58 2.79 2.57 19.46 54.28 Glándula mamarla 31.05, 27.02 34.2 30.61 13.00 3.85 117.73 Clontech 30.69 lometrlo 33.29. 35.1 T.42 2 4.21 2.34 21.37 89.96 Omento 34.44, 40 3.07 0 1.54 3.94 12.69 19.48 32.59. Ovarlo 10.03 2.07 6.05 4.34 11.52 69.70 35.04 Páncreas 40, 40 0 0 0.00 0.81 61.80 0.00 Cabeza del páncreas 40, 40 0 0 0.00 1.57 31.83 . 0:00 34.63, Glándula parótida 2.71 7.29 5.00 5.48 9.12 45.62 33.09 32.77. Placenta Clontech 8.94 . 7.7 8.32 5.26 9.51 79.09 33.01 Próstata 40, 40 0 0 0.00 3.00 16.67 0.00 Recto 40, 34.44 0 3.06 1.53 1.23 40.65 62.20 Glándula salival 32.96, 40 7.94 0 3.97 7.31 6.84 27.15 Clontech Músculo esquelético 40, 40 0 0 0.00 1.26 39.68 Clontech 0.00 Piel 40. 33.46 0.6 5.75 3.18 1.21 41.32 131.20 Intestino delgado 40, 40 0 0 0.00 0.98 51.07 0.00 Clontech Bazo 35.65, 35 1.4 2.13 1.77 4.92 10.16 17.94 Estómago 40, 34.73 0 2.54 1.27 2.73 18.32 23.26 Testículo Clontech 40, 35.12 0 1.98 0.99 0.57 87.87 86.99 32.44, Timo Clontech 11.11 19.37 15.24 9.89 5.06 77.05 31.57 Tiroides 40, 40 0 0 0.00 2.77 18.05 0.00 34.58, Tráquea Clontech 2.79 5.4 4.10 9.71 5.15 21.09 33.56 33.45, Vejiga urinaria 5.8 6.21 6.01 5.47 9.14 54.89 33.34 33.19, Utero 6.82 1.32 9.07 5.34 9.36 84.93 32.41 Genómlca 25.47 981.57 actlna b 26.87 398.61 1.00E+05 18.24 100000 1.OOE+05 18,35 100000 1.00E+04 21 ,53 10000 1.00E+04 21 ,62 10000 1.00E+03 25,17 1000 1 0?+03 25.03 1000 1.00E+02 30.53 100 1.00E+02 30.49 100 1.00E+01 30.85 10 1.00E+01 40 10 1 0?-00 40 0 1.OOE-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 No. de Número Copla* de veces en de Coplas ARNm que se Muestra registro Ct Intermedetectarepitió la Muestra sbg1033026C1q (Identlfl- dia* de das/50 ng alteración , cador de GOl de ARN en la GSK) total población enferma colon normal GW98-167 21941 27.03 397.15 794.30 colon normal . tumor de colon GW98-166 21940 29.53 91.39 182.78 tumor de colon -4.35 colon normal GW98-178 22080 30.3 57.81 . 115.62 colon normal tumor de colon GW98-177 22060 29.31 103.84 207.68 tumor de colon 1.80 colon normal GW98-561 23514 28.79 140.64 281.28 colon normal tumor de colon GW98-560 23513 30.18 62.18 124.36 tumor de colon -2.26 colon normal GW98-894 24691 28.31 187.28 374.56 colon normal tumor de colon GW98- 24690 893 28.75 143.93 287.86 tumor de colon -1.30 pulmón normal GW9B-3 20742 28.18 201.78 403.56 pulmón normal tumor de pulmón GW98-2 20741 32.35 17.41 34.82 tumor de pulmón -11.59 pulmón normal GW97- 20T77 29.94 71.52 143.04 179 pulmón normal tumor de pulmón GW97- 178 20676 28.76 143.36 286.72 tumor de pulmón 2.00 pulmón normal GW98- 165 21922 28.69 149.49 298.98 pulmón normal tumor de pulmón GW98- 164 21921 31.28 32.63 65.26 tumor de pulmón -4.58 pulmón normal GW98- 22584 282 31.42 30.07 60.14 pulmón normal tumor de pulmón GW98-281 22583 30.33 56.83 113,66 tumor de pulmón 1.89 mama normal GW00-392 28750 28.72 146.7 146.70 mama normal tumor de mama GW00- 28746 27.02 398.56 797.12 tumor de mama 5.43 391 mama normal GW00-413 28798 30.95 39.63 39.63 mama normal tumor de mama GW0O- 28797 30.58 49.03 98.06 tumor de mama 2.47 412 mama normal GW0O- 27592-95 32.53 15.6 15.60 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- 27588-91 29.58 88.49 88.49 tumor de mama 5.67 231 :234 mama normal GW98-621 23656 27.5 300.39 600.78 mama normal tumor de mama GW98- 23655 29.28 105.43 210.86 tumor de mama -2.85 620 cerebro normal BB99- 25507 30.67 46.59 93.18 cerebro normal 542 cerebro normal BB99- 25509 29.54 90.66 181.32 cerebro normal 406 cerebro normal ??T9- 25546 31.13 35.58 71.16 cerebro normal 904 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25502 31.4 30.36 60.72 -1.T0 ??9T-874 etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25503 28.39 177.94 355.88 3.09 BB99-887 etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25504 28.92 130.19 260.38 2.26 BB99-862 etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25542 28.2 198.98 397.96 3.45 BB99-927 etapa 5 KC de pulmón CT normal 31.24 33.37 66.74 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 33.59 8.37 8.37 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 37.8 0.7 0.70 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 34.56 4.73 4.73 24 de pulmón -4.39 KC 28 de pulmón COPD 35.39 2.91 2.91 28 de pulmón -7.13 .
KC 23 de pulmón COPD 34.74 4.26 4.26 23 de pulmón -4.87 KC 25 de pulmón normal 33.85 7.19 7.19 25 de pulmón pulmón asmático 29321 35.04 3.57 3.57 pulmón asmático -5.81 OD03112 pulmón asmático 29323 32.44 16.48 32.96 pulmón asmático 1.59 OD03433 pulmón asmático 29322 29.4 98.44 196.88 pulmón asmático T.49 OD03397 pulmón asmático 29325 31.1 36.23 72.46 pulmón asmático 3.49 OD04928 células células endotellales KC control 40 0 0.00 endotellales VEGF endo KC 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo KC 35.4 2.89 2.89 bFGF endo 2.89 corazón Clontech normal 29.05 120.78 241.56 corazón T-1 de corazón 29417 26.23 633.79 1267.58 T-1 de corazón 5.25 Isquémico T-14 de corazón con 29422 25.74 847.85 1695.70 T-14 de corazón 7.02 DCM no obstructiva T-3399 de corazón con T-3399 de 29426 25.03 1289.37 2578.74 10.68 DCM corazón 1.00E+03 24.92 1000 1.00E+03 24.9 1000 1.OOE+02 29.22 00 1.00E+02 29.26 100 1.00E+01 33.13 10 1.OOE+01 34.32 10 1.OOE-00 40 0 1.OOE-00 40 0 NTC 40 0 Nombre del gen sbq1033026C1 q No. de veces en que se repitió la alteración en Tejidos enfermos la población enferma respecto a la población normal tumor de colon -4.35 tumor de colon 1.80 tumor de colon -2.26 tumor de colon -1.30 tumor de pulmón -11.59 tumor de pulmón 2.00 tumor de pulmón -4.58 tumor de pulmón 1.89 tumor de mama 5.43 tumor de mama 2.47 tumor de mama 5.67 tumor de mama -2.85 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.90 Cerebro con ALZ etapa 5 3.09 Cerebro con ALZ etapa 5 2.26 Cerebro con ALZ etapa 5 3.45 24 de pulmón -4.39 28 de pulmón -7.13 23 de pulmón -4.87 pulmón asmático -5.81 pulmón asmático 1.59 pulmón asmático 9.49 pulmón asmático 3.49 VEGF endo 0.00 bFGF endo 2.89 T-1 de corazón 5.25 T-14 de corazón 7.02 T-3399 de corazón 10.68 BM estimulada -3.13 osteo diferenciado 0.72 Cartílago (reserva) -1.23 PBL con VIH IIIB -1.80 M C5 con cepa F de HSV -1.75 Nombre del gen sbq1003675RNase Suspendido Nombre del gen sba 1015258PLM Expresión general baja en muestras normales y enfermas.
Expresión normal más alta en endometrio, hipotálamo, hígado, intestino delgado y testículo. Expresión de enfermedad más alta en uno de los pares de tumor de mama/mama normal, una de las muestras de cerebro normal, dos de las muestras de cerebro con enfermedad de Alzheimer, las células B y las células MRC5 infectadas por HSV. La subregulación en 1 de 4 muestras de tumor de pulmón, es suficiente para reclamar una función en cáncer de pulmón. La sobrerregulación en 2 de 4 muestras de tumor de mama, indica una intervención en cáncer de mama. La subregulación en 2 de 3 muestras con COPD, y en 1 de 4 muestras de pulmón asmático, implica una función en enfermedad pulmonar obstructiva crónica y asma. La sobrerregulación en la muestra de corazón con DCM obstructiva, sugiere una función potencial en enfermedad cardiovascular. Subregulación en la muestra de médula ósea estimulada. La subregulación en la reserva de cartílago con OA, implica a este gen en osteoartritis. La sobrerregulación en las células RC5 infectadas por HSV, sugiere que este gen puede ser un factor de hospedero en HSV. Baja expresión en todas las células inmunes, excepto las células B, que muestran expresión moderada. 37.54, Cabeza del páncreas 2.11 2.98 2.55 1.57 31.85 81.05 36.96 Glándula parótida 37.1 , 35.46 2.75 7.29 5.02 5.48 9.12 45.80 Placenta Clontech 36.07, 5.08 7.74 6.41 5.26 9.51 60.93 35.36 Próstata 37.4, 37.82 2.3 1.79 2.05 3.00 16.67 34.08 Recto 36.65, 3.59 2.32 2.96 1.23 40.65 120.12 37.39 Glándula salival 38.55, 1.16 0.74 0.95 7.31 6.84 6.50 Clontech 39,31 Músculo esquelético 37.59, 2.06 3.15 2.61 1.26 39.68 103.37 Clontech 36.87 Piel 38.36, 1.3 4.34 2.82 1.21 41.32 116.53 36.33 intestino delgado 36.05, 5.14 3.37 4.26 0.98 51.07 217.31 Clontech 3T.76 Bazo 37.62, 2.02 7.83 4.93 4.92 10.16 50.05 35.34 Estómago 35.8, 35.15 5.95 8.76 7.36 2.73 18.32 134.71 Testículo Clontech 35.14, 6.82 2.77 5.80 0.57 87.87 509.23 37.08 Timo Clontech 35.89. 5.65 9.22 7.44 9.89 5.06 37.59 35.06 Tiroides 37.59, 37.2 2.06 2.59 2.33 2.77 18.05 41.97 Tráquea Clontech 37.52, 2.14 1.66 1.90 9.71 5.151 9.78 37.95 Vejiga urinaria 37.47, 2.2 7.38 4.79 5.47 9.14 43.78 35.44 Utero 34.17, 15.66 16.17 15.92 5.34 9.36. , 149.02 34.12 genómlca 27.03 1097.52 actina b 27.23 974.77 1.00E+05 19.25 100000 1.00E+05 19.2 100000 1.00E+04 22.99 10000 1.00E+04 22.94 10000 1.OOE+03 27.09 1000 1.00E+03 27.28 1000 1.OQE+02 31.49 100 1.00E+02 31.46 100 1.00E+01 37.86 10 1.00E+01 35.45 10 1.00E-00 37.08 1 1.00E-00 37.4 1 NTC 36.45 -1 NTC 36.15 -1 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25503 31.57 97.99 195.98 3.95 BB99-887 etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25504 36.08 T.57 13.14 -3.78 BB99-862 etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25542 32.66 50.98 101.96 2.05 BB99-927 etapa 5 KC de pulmón CT normal 37.37 3.04 6.08 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 38.52 1.52 1.52 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 40 0 0.00 24 de pulmón -3.07 KC 28 de pulmón COPD 37,4 2.99 2.99 28 de pulmón -1.03 KC 23 de pulmón COPD 39.56 0.82 0.82 23 de pulmón -3.74 KC 25 de pulmón normal 38.43 1.61 1.61 25 de pulmón pulmón asmático 29321 39.45 0.88 0.88 pulmón asmático -3.49 OD03112 pulmón asmático 29323 36.48 5.19 10.38 pulmón asmático 3.38 OD03433 pulmón asmático 29322 35.56 8.99 17.98 pulmón asmático 5.86 OD03397 pulmón asmático 29325 37.06 3.66 7.32 pulmón asmático 2.38 OD04928 células endotellales KC control 39.29 0.T6 0.96 células ondoteliales VEGF endo KC 37.65 2.57 2.57 VEGF endo ¦ 2.68 bFGF endo KC 40 0.48 0.48 bFGF endo -2.00 corazón Clontech normal 40 0.68 1.36 corazón T-1 de corazón 29417 39.29 0.96 1.92 T-1 de corazón Isquémico , 1 -41 , T-14 de corazón con 29422 38.21 1.84 3.68 T-14 de corazón 2.71 DCM no obstructiva T-3399 de corazón con T-3399 de 29426 35.49 9.35 18.70 13.75 DCM corazón adenoides GW99-269 26162 39.63 0.78 1.56 adenoides amígdala GW98-280 22582 34.5 16.92 33.84 amígdala Células T PC00314 28453 34.57 16.25 32.50 Células T PBMNC 37.32 3.13 3.13 PBMNC monoclto 37.74 2.44 4.88 monoclto Células B PC00665 28455 33.32 34.36 68.72 Células B células dendrfticas 28441 37.29 3.19 células 6.38 dendrfticas neutrófilos 28440 36.01 6.85 6.85 neutrófilos eosinófilos 28446 35.38 9.98 19.96 eosinófilos BM no BM no estimulada 37.44 2.91 2.91 estimulada B estimulada 40 0.53 0.53 BM estimulada -5.49 osteo diferenciado 38.15 1.91 osteo 1.91 -1.38 diferenciado osteo osteo Indlferenclado 37.6 2.64 2.64 indlferenclado condrocitos 36.1 6.51 16.28 condrocitos Sinovlo con OA IP12/01 29462 35.58 8.86 8.86 Sinovlo con OA Nombre del gen sbg1015258PLM Nombre del gen sbg1003328IG ÍTaomar Expresión general moderada. Expresión normal más alta en cerebro intacto, cerebro fetal y cerebelo, con niveles de expresión ligeramente menores en colon y glándula mamaria. Expresión de enfermedad más alta en el colon y pares de tumores de pulmón, así como también en cerebro normal y cerebro con enfermedad de Alzheimer. La sobrerregulación significativa en 2 de 4 muestras de tumor de mama con ligera sobrerregulación en 1 de 4 muestras de tumor de mama, implica a este gen en cáncer de mama. La subregulación en 3 de 3 muestras con COPD, puede sugerir una intervención en enfermedad pulmonar obstructiva crónica. La subregulación en 1 de 4 muestras de asma, sugiere una función potencial para este gen en asma. La subregulación en las células RC5 infectadas por HSV, sugiere que este gen puede desempeñar una función en HSV. La alta expresión en 3 de 3 muestras de sinovio cón OA, 3 de 3 muestras de sinovio con RA, 2 de 2 muestras de hueso con OA, y la corroboración de alta expresión en células T y células B, implican a este gen en osteoartritis y artritis reumatoide. 33.39, Cerebro fetal Clontech 58.43 39.04 48.74 0.48 103.95 5066.01 34.06 31.32, Cerebelo Clontech 202.49 242.95 222.72 2.17 23.04 5131.80 31.02 Cerviz 36.36, 35.6 9.78 15.49 12.64 2.42 20.66 261.05 30.74, Colon 286.9 125.78 206.34 2.71 18.45 3807.01 32.11 34.58, Endometiio 28.47 12.11 20.29 0.73 68.21 1384.04 36.01 37.54, Esófago 4.82 11.78 8.30 1.37 36.50 302.92 36.05 36.23, Corazón Clontech 10.56 7.3 8.93 1.32 37.88 338.26 36.85 Hlpotálamo 40, 36.96 0 6.81 3.41 0.32 155.28 528.73 34.79, Ileo 25.09 30.4 27.75 2.58 19.38 537.69 34.48 30.14, Yeyuno 412.72 242.47 327.60 6.60 7.58 2481.78 31.02 33.94, Rlñón 41.89 28.12 35.01 2.12 23.58 825.59 34.61 36.11 , Hígado 11.41 17.61 14.51 1.50 33.33 483.67 35.38 30.24, Hfgado fetal Clontech 388.12 381.28 384.70 10.40 4.81 1849.52 30.27 35.59, Pulmón 15.59 20.98 18.29 2.57 19.46 355.74 35.09 Glándula mamarla 29.21 , 718.74 1090.18 904.46 13.00 3.85 3478.69 Clontech 28.52 lometrlo 33.7, 34.11 48.42 37.85 43.14 2.34 21.37 921.69 33.83, Omento 44.75 52.27 48.51 3.94 12.69 615.61 33.57 32.47, Ovarlo 101.42 109.96 105.69 4.34 11.52 1217.63 32.34 Páncreas 38.16, 40 3.31 0 1.66 0.81 61.80 102.29 Cabeza del páncreas 40, 36.68 0 8.07 4.04 1.57 31.85 128.50 31.68, Glándula parótida 162.92 241.11 202.02 5.48 9.12 1843.20 31.03 30.48, Placenta Clontech 335.37 274.53 304.95 5.26 9.51 2898.76 30.82 33.39, Próstata 58.39 122.82 90.61 3.00 16.67 1510.08 32.15 Recto 35.95, 12.5 18.32 15.41 1.23 40.65 626.42 35.32 Glándula salival 31.25, 211.88 303.2 257.54 7.31 6.84 1761.56 Clontech 30.65 Músculo esquelético 36.61 , 8.44 4.6 6.52 1.26 39.68 258.73 Clontech 37.62 36.37, Piel 9.71 11.56 10.64 1.21 41.32 439.46 36.08 Intestino delgado 36.74, 7.79 29.79 18.79 0.98 51.07 959.65 Clontech 34.51 34.78, Bazo 25.25 15.18 20.22 4.92 10.16 205.44 35.63 Estómago 40, 35.13 0.88 20.56 10.72 2.73 18.32 196.34 Testículo Clontech 35.01 , 22.07 1.33 11.70 0.57 87.87 1028.12 39.68 Timo Clontech 29.15, 29.2 749.23 724.61 73T.92 9.89 5.06 3725.58 32.02, Tiroides 133.23 123.77 128.50 2.77 18.05 2319.49 32.14 31.28, Tráquea Clontech 207.67 405.04 306.36 9.71 5.15 1577.52 30.17 33.07, Vejiga urinaria 70.6 78.07 74.34 5.47 9.14 679.48 32.91 33.01 , Utero 73.56 67.48 70.52 5.34 9.36 660.30 33.15 genómlca 29.15 746.77 actlna b 30.2 397.52 1.00E+05 21.06 100000 1.00E+05 20.94 100000 1.00E+04 25.06 10000 1.00E+04 24.54 10000 1.00E+03 28.32 1000 1.00E+03 28.77 1000 1.00E+02 33 100 1.00E+02 32.74 100 1.00E+01 35.9 10 1.00E+01 40 0 1.00E-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 No. de Número Copias de veces en de Coplas ARNm que se Muestra registro intermedetectarepitió la sbg1003328IG (Identlfl- Ct Muestra dias de das/30 ng alteración cador de GOl de ARN en la GSK) total población enferma colon normal GW98-167 21941 24.26 15509.01 31018.02 colon normal tumor de colon GW98- 21940 24.5 13727.44 166 27454.88 tumor de colon -1.13 colon normal GW98-178 22080 28.01 2276.97 4553,94 colon normal tumor de colon GW98- 22060 27.11 3618.2 7236.40 tumor de colon 177 1.59 colon normal GW98-561 23514 24.47 13993.67 27987.34 colon normal tumor de colon GW98- 23513 25.32 9040.47 18080.94 tumor de colon 560 -1.55 colon normal GW98-894 24691 24.17 16251.61 32503.22 colon normal tumor de colon GW98- 893 24690 25.15 9872.46 19744.92 tumor de colon -1.65 pulmón normal GW98-3 20742 24.4 14498.52 28997.04 pulmón normal tumor de pulmón GW98- 20741 24.66 12640.32 25280.64 2 tumor de pulmón -1.15 pulmón normal GW97- 20677 24.12 16680.84 33361.68 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- 20676 24.69 12468.91 24937.82 tumor de pulmón -1.34 178 pulmón normal GW98- 21922 25.09 10168.18 20336.36 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- 21921 25.49 8296.37 16592.74 tumor de pulmón -1.23 164 pulmón normal GW98- 22584 26.85 4131.52 8263.04 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- 22583 26.59 4702 9404.00 tumor de pulmón 1.14 281 mama normal GWOO-392 28750 25.9 6719.98 6719.98 mama normal tumor de mama GW00- 28746 25.04 10402.11 20804.22 tumor de mama 3.10 391 mama normal GWOO-413 28798 32.51 226.94 226.94 mama normal tumor de mama GW00- 28797 26.37 5261.73 10523.46 tumor de mama 46.37 412 mama normal GW00- 27592-95 34.58 78.63 78.63 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- 27588-91 28.45 1812.86 1812.86 tumor de mama 23.06 231:234 mama normal GW98-621 23656 25.26 9289.36 18578.72 mama normal tumor de mama GW98- 23655 25.65 7579.13 15158.26 tumor de mama -1.23 620 cerebro normal ??T9- 25507 22.52 37845.47 75690.94 cerebro normal 542 cerebro normal BB99- 25509 23.07 28574.8 57149.60 cerebro normal 406 cerebro normal BB99- 25546 23.85 19214.49 38428.98 cerebro normal 904 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25502 25.98 6442.51 12885.02 -4.43 BB99-874 etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ 25503 23.19 26936.06 53872.12 -1.06 BB99-887 etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25504 23.42 Cerebro con ALZ 23948.83 47897.66 -1.19 BB99-862 etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25542 24.15 16419.33 Cerebro con ALZ 32838.66 -1.74 BB99-927 etapa 5 KC de pulmón CT normal 25.63 7714.35 15428.70 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 32.34 247.99 247.T9 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 33.71 122.77 122.77 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 32.47 231.47 231.47 24 de pulmón -17.21 KC 28 de pulmón COPD 32.63 213.14 213.14 28 de pulmón -18.70 KC 23 de pulmón COPD 31.2 444.95 444.95 23 de pulmón -8.96 KC 25 de pulmón normal 33.46 139.4 139.40 25 de pulmón pulmón asmático 29321 31.6 360.95 360.95 pulmón asmático -11.04 OD03112 pulmón asmático 29323 28.66 1634.71 3269.42 pulmón asmático -1.22 0DO3433 pulmón asmático 29322 26.36 5294.26 10588.52 pulmón asmático 2.66 OD03397 pulmón asmático 29325 28.23 2033.93 4067.86 pulmón asmático 1.02 0DO4928 células células endotellales KC control 30.68 580.47 580.47 endotellales Queratlnocltos 29180 25.43 8538.15 17076.30 Queratinocitos Actina b control 29.74 938.61 genómica 28.79 1522.16 1.00E+05 20.84 100000 1.OOE+05 21.4 100000 1.00E+04 24.5 10000 1.00E+04 25.2 10000 1.00E+03 28,45 1000 1.00E+03 29.25 1000 1.00E+02 35.34 100 1.OOE+02 33.61 100 1.00E+01 38.95 10 1.00E+01 40 0 1.00E-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 Nombre del gen sbg1003328IG No. de veces en que se repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon -1 .13 tumor de colon 1.59 tumor de colon -1.55 tumor de colon -1.65 tumor de pulmón ¦1.15 tumor de pulmón -1.34 tumor de pulmón -1 .23 tumor de pulmón 1 .14 tumor de mama 3.10 tumor de mama 46.37 tumor de mama 23.06 tumor de mama -1.23 Cerebro con ALZ etapa 5 -4.43 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.06 Cerebro con ALZ etapa 5 -1 .19 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.74 24 de pulmón -17.21 28 de pulmón -18.70 23 de pulmón -8,96 pulmón asmático -11.04 pulmón asmático -1.22 pulmón asmático 2.66 pulmón asmático 1.02 VEGF endo -1.23 bFGF endo -2.24 T-1 de corazón -1.11 T-14 de corazón -1.27 T-3399 de corazón 1.37 BM estimulada 2.10 osteo diferenciado 3.42 Cartílago (reserva) -2.06 PBL con VIH IIIB -1.84 M C5 con cepa F de HSV -27.21 Nombre del gen sbq1020829SGLT Expresión general baja en muestras normales y enfermas. Expresión normal más alta en cerebro intacto, riñón y timo. Expresión de enfermedad más alta en adenoides, amígdalas, células T, células B y eosinófilos. Altamente específico de células inmunes. La subregulación en.1 de 4 muestras de tumor de pulmón, y la sobrerregulación en 1 de 4 muestras de tumor de mama, indica intervención en cánceres de pulmón y mama. La sobrerregulación en 3 de 4 muestras de cerebro con AD, sugiere una intervención en enfermedad de Alzheimer. La subregulación en 3 de 3 muestras con COPD, implica una función en enfermedad pulmonar obstructiva crónica. Subregulación en la muestra de médula ósea estimulada. Sobrerregulación en la muestra de osteoblastos diferenciados. La sobrerregulación en las células MRC5 infectadas por HSV, sugiere que este gen puede ser un factor de hospedero en HSV. La expresión de moderada a alta en las muestras con OA y RA, indica una función potencial en osteoartritis y artritis reumatoide. 36.06, Glándula parótida 13.32 7.31 10.32 5.48 9.12 94.11 37.07 35.98, Placenta Clontech 13.96 2.72 8.34 5.26 9.51 79.28 38.73 Próstata 40, 40 0 0 0.00 3.00 16.67 0.00 Recto 40, 40 0 0 0.00 1.23 40.65 0,00 Glándula salival 37.05, 7.4 7.36 7.38 7.31 6.84 50.48 Clontech 37.06 Músculo esquelético 40, 40 0 0 0.00 1.26 39.68 0.00 Clontech Piel 40, 40 0 0 0.00 1.21 41.32 0.00 Intestino delgado 40, 40 0 0 0.00 0.98 51.07 0.00 Clontech 35.62, Bazo 17.34 16.35 16.85 4.92 10.16 171.19 35.72 Estómago 40, 40 0 1.61 0.81 2.73 18.32 14.74 Testículo Clontech 40, 40 0 0 0.00 0.57 87.87 0.00 241.7 Timo Clontech 31.3, 31 .09 226.24 257.15 9.89 5.06 1221.92 0 Tiroides 40, 40 0 0 0.00 2.77 18.05 0.00 Tráquea Clontech 36.6, 36.64 9.68 9.44 9.56 9.71 5.15 49.23 Vejiga urinaria 40, 40 0 0 0.00 5.47 9.14 0.00 34.64, Utero 31.06 9.41 20.24 5.34 9.36 189.47 36.65 genómica 29.07 853.08 actlna b 27.08 2793.5 1 0?+05 20.85 100000 1.00E+05 21.1 1 100000 1 .00E+04 24.81 10000 1.00E+04 24.95 10000 1.00E+03 28.39 1000 1.00E+03 28.9 1000 1.00?+02 34.1 100 1.00E+02 32.86 100 1.00E+01 35.52 10 1.00E+01 40 0 1.00E-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 Número Coplas de No. de veces de Coplas ARNm en que se Muestra registro Intermedetectarepitió la Ct Muestra sbg1020829SGLT (Identlfi- dias de das/50 ng alteración en cador de GOl de ARN la población GSK) total enferma colon normal GW98-167 21941 31.06 206.55 413.10 colon normal tumor de colon GW98- 21940 31.18 193.59 387.18 tumor de colon -1.07 166 colon normal GW98-178 22080 30.74 244.37 488.74 colon normal tumor de colon GW98- 22060 30.37 299.28 598.56 tumor de colon 1.22 177 colon normal GW98-561 23514 29.31 527.04 1054.08 colon normal tumor de colon GW98- 23513 31.86 134.48 268.96 tumor de colon -3.92 560 colon normal GW98-894 24691 31.84 135.33 270.66 colon normal tumor de colon GW98- 24T90 31.9 131.57 263.14 tumor de colon -1.03 893 pulmón normal GW98-3 20742 28.81 689.14 1378.28 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 31.91 130.71 261.42 -5.27 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 30.04 356.26 712.52 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 29.05 605.73 1211.46 1.70 178 pulmón pulmón normal GW98- 2 922 28.42 852.41 1704.82 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 30.51 277.13 554.26 -3.08 ' 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 31.23 188.34 376.68 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 30.46 285 570.00 1.51 281 pulmón mama normal GW00-392 28750 31.14 197.15 197.15 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28746 32.15 114.65 229.30 1.16 391 mama mama normal GW00-413 28798 34.87 26.64 26.64 mama normal tumor de mama GW0O- tumor de 28797 31.83 136.42 272.84 10.24 412 mama mama nomial GW00- 27592-95 36.34 12.09 12.09 mama normal 235:238 tumor de mama GW0O- tumor de 27588-91 33.48 56.11 56.11 4.64 231:234 mama mama normal GW98-621 23656 32.39 100.78 201.56 mama nomial tumor de mama GW98- tumor de 23655 31.4 171.82 343.64 1.70 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 34.49 32.75 65.50 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 34.01 42.2 84.40 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 36.17 13.3 26,60 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 31.16 195.23 390.46 6.64 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 31.56 157.33 314.66 5.35 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 32.62 89.2 178.40 3.03 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 33.26 63.43 126.86 2.16 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 30.82 234.88 469.76 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 30.21 325.42 325.42 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 36.89 9 9.00 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 36.17 13.24 13.24 24 de pulmón -15.84 KC 28 de pulmón COPD 38.38 4.06 4.06 28 de pulmón -51.66 KC 23 de pulmón COPD 35.53 18.67 18.67 23 de pulmón -11.23 KC 25 de pulmón normal 34.37 34.83 34.83 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 33.65 51.41 51.41 OD03112 asmático -4.08 pulmón asmático pulmón 29323 30.62 260.95 521.90 2.49 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 31.31 180.14 360.28 1.72 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 31.14 197.09 394.18 1.88 OD04928 asmático células células endotellales KC control 32.56 92.23 92.23 endoteliales VEGF endo KC 33.2T 62.39 62.39 VEGF endo -1.48 bFGF endo KC 32.55 92.65 92.65 bFGF endo 1.00 corazón Clontech normal 33.17 66.25 132.50 corazón T-1 de corazón T-1 de 29 17 33.07 70.16 140.32 1.06 isquémico corazón T-1 de corazón con 29422 , 34.64 30.13 T-14 de 60.26 -2.20 DC no obstructiva corazón T-3399 de corazón con T-3399 de 29426 32.53 93.63 187.26 1.41 ' DCM corazón adenoides GW99-269 26162 28.92 650.55 1301.10 adenoides amígdala GW98-260 22582 27.11 1719.42 3438.84 amígdala Células T PC00314 28453 28.05 1037.04 2074.08 Células T PBMNC 36.57 10.71 10.71 PBMNC monoclto 33.22 64.68 129.36 monoclto Células B PC00685 28455 27.07 1757.79 3515.58 Células B células células dendrrticas 28441 33.77 48.05 96.10 dendrlticas neutrófilos 28440 30.71 248.56 248.56 neutrófilos eoslnófllos 28446 27.3 1549.7 3099.40 eoslnófllos BM no BM no estimulada 30.06 352.26 352.26 estimulada BM estimulada 34.14 39.39 39.39 BM estimulada -8.94 osteo diferenciado 36.29 12.42 12.42 osteo 12.42 diferenciado osteo osteo Indiferenclado 40 0 0.00 indiferenciado condrocltos 32.1 117.39 293.48 condrocltos Sinovio con Slnovlo con OA IP12/01 294T2 30.17 331.7 331.70 OA Sinovlo con Sinovlo con OA NP10/01 29461 32.05 120.98 241.96 OA Nombre del gen sbg 02Q829SGLT No. de veces en que ·« repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon -1.07 tumor de colon 1.22 tumor de colon -3.92 tumor de colon -1.03 tumor de pulmón -5.27 tumor de pulmón 1.70 tumor de pulmón -3.08 tumor de pulmón 1.51 tumor de mama 1.16 tumor de mama 10.24 tumor de mama 4,64 tumor de mama 1.70 Cerebro con ALZ etapa 5 6.64 Cerebro con ALZ etapa 5 5.35 Cerebro con ALZ etapa 5 3.03 Cerebro con ALZ etapa 5 2.16 24 de pulmón -15.84 28 de pulmón -51.66 23 de pulmón -11.23 pulmón asmático -4.08 pulmón asmático 2.49 pulmón asmático 1.72 pulmón asmático 1.88 VEGF endo -1.48 bFGF endo 1.00 T-1 de corazón 1.06 T-14 de corazón -2.20 T-3399 de corazón 1.41 BM estimulada -8.94 osteo diferenciado 12.42 Cartílago (reserva) -1.80 PBL con VIH IIIB -2.30 RC5 con cepa F de HSV 14.63 Nombre del gen sbg1005450UDPGT Expresión general de baja a moderada. Expresión normal más alta en endometrio, esófago y bazo con niveles de expresión menores en cerebelo, hipotálamo, recto y útero. Expresión de enfermedad más alta en una de las muestras de sinovio con OA. La subregulación en 1 de 4 muestras de tumor de colon, es suficiente para reclamar esta enfermedad en cáncer de colon. La sobrerregulación en 1 de 4 muestras de tumor de pulmón, indica una función potencial para este gen en cáncer de pulmón. La subregulación en 2 de 4 muestras de cerebro con AD, sugiere una intervención en enfermedad de Alzheimer. La subregulación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, y 4 de 4 muestras de pulmón asmático, sugiere intervención en enfermedad pulmonar obstructiva crónica y asma. La sobrerregulación en las células MRC5 infectadas por HSV, sugiere que este gen puede ser un factor de hospedero en HSV. Expresión moderada en células B y células dendrtticas.
Colon 40, 35.16 0 5.12 2.56 2.71 18.45 47.23 Endometrlo 32.73, 31.85 22.19 37.5 29.85 0.73 68.21 ¦ 2035.81 Esófago 32.67, 29.39 22.91 165.34 94.13 1.37 36.50 3435.22 Corazón Clontech 37.12, 35.03 1.58 5.55 3.57 1.32 37.88 135.04 Hlpotalamo 34.08, 40 9.84 0 4.92 0.32 155.28 763.98 Ileo 34.35 8.33 8.33 2.58 19.38 161.43 Yeyuno 40, 40 0 0 0.00 6.60 7.58 0.00 Riñon 38.89, 40 0.54 0 0.27 2.12 23.58 6.37 Hígado 36.32, 40 2.55 0 1.28 1.50 33.33 42.50 Hígado fetal Clontech 36.96 1.74 1.74 10.40 4.81 8.37 Pulmón 40, 40 0 0 0.00 2.57 19.46 0.00 Glándula mamarla 40, 40 0 0 0.00 13.00 3.85 0.00 Clontech Mlometrio 40, 38.22 0 0.82 0.41 2.34 21.37 8.76 Omento 36.17, 40 2.8 0 1.40 3.94 12.69 17.77 Ovarlo 40, 40 0 0 0.00 4.34 11.52 0.00 Páncreas 40, 40 0 0 0.00 0.81 61.80 0.00 Cabeza del páncreas 40, 38.35 0 0.75 0.38 1.57 31.85 11.94 Glándula parótida 40, 40 0 0 0.00 5.48 9.12 0.00 Placenta Clontech 39.06, 35.49 0.49 4.22 2.36 5.26 9.51 22.39 Próstata 38.81 , 40 0.57 0 0.29 3.00 16.67 4.75 Recto 35.22, 33.25 4.94 16.2 10.57 1.23 40.65 429.67 Glándula salival 32.56, 34.56 24.55 7.36 15.96 7.31 6.84 109.13 Clontech Músculo esquelético Clontech 40, 40 0 0 0.00 1.26 39.68 0.00 Piel 34.26, 40 B.8 0 4.40 1.21 41.32 181.82 Intestino delgado 40 0 6.23 3.12 0.98 51.07 159.09 Clontech Bazo 40, 27.36 0 560.92 280.46 4.92 10.16 2850.20 Estómago 33.49, 39.12 13.98 0.47 7.23 2.73 18.32 132.33 Testículo Clontech 40, 40 0 0 0.00 0.57 87.87 0.00 Timo Clontech 40, 35.33 0 4.64 2.32 9.89 5.06 11.73 Tiroides 37.18, 35.52 1.53 4.13 2.83 2.77 18.05 ¦51.08 Tráquea Clontech 40, 40 0 0 0.00 9.71 5.15 0.00 Vejiga urinaria 40, 40 0 0.16 0.08 5.47 9.14 0.73 Utero 30.11 106.94 0 53.47 5.34 9.36 500.66 genómlca 35.81 3.47 actina b 26.86 757.01 1.00E+05 18.99 100000 1.00E+05 19.13 100000 1.00E+04 22.43 10000 1.00E+04 22.31 10000 1.00E+03 25.74 1000 1.00E+03 25.99 1000 1.00E+02 31.47 100 1.00E+02 29.82 100 1.00E+01 40 0 1.00E+01 40 0 1.OOE-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 26.02 -1 NTC 40 0 Muestra Número Ct Copias Copias de Muestra No. de sbg1005450UDPGT de IntermeARNm veces en registro dias de detectaque se (Identlfl- GOl das/50 ng de repitió la cador de ARN total alteración GSK) en la población enferma colon normal GW98-167 21941 40 0.17 0.34 colon normal tumor de colon GW98- 21940 39.88 0.29 0.58 tumor de colon 1.71 166 colon normal GW98-178 22080 40 0 0.00 colon normal tumor de colon GW98- 22060 40 0 0.00 tumor de colon 0.00 177 colon normal GW98-561 23514 40 0 0.00 colon normal tumor de colon GW98- 23513 40 0 0.00 tumor de colon , 0.00 560 colon normal GW98-894 24691 33.84 10.47 20,94 colon normal tumor de colon GW98- 24690 40 0 0.00 tumor de colon -20.94 893 pulmón normal GW98-3 20742 40 0 0.00 pulmón normal tumor de pulmón GW98- 20741 40 0 0.00 tumor de 0.00 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 31.67 37.94 75.88 pulmón normal 79 tumor de pulmón GW97- 2067T 33.08 16.47 32.94 tumor de -2.30 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 40 0 0.00 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- 21921 40 0 0.00 tumor de 0.00 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 40 0 0.00 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- 22583 35.03 5.16 10.32 tumor de 10.32 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 32.64 21.38 21.38 mama normal tumor de mama GW00- 26746 31.67 37.98 75.96 tumor de 3.55 391 mama mama normal GWOO-413 287T8 32.54 22.63 22.63 mama normal tumor de mama GW0O- 28797 29.23 161.71 323.42 tumor de 14.29 412 mama mama normal GW0O- 27592-95 37.05 1.55 1.55 mama normal 235:238 tumor de mama GW0O- tumor de 27588-91 35.03 5.17 5.17 3.34 231:234 mama mama normal GW98-621 23656 34.12 8.87 17.74 mama normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 40 0 0.00 -17.74 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 34.28 8.05 16.10 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 40 0 0.00 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 40 0 0.00 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 38.8 0.55 1.10 -4.88 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 40 0 0.00 -5.37 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 36.16 2.64 5.28 -1.02 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 40 0 0.00 -5.37 ??T9-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 36.61 2.02 4.04 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 40 0 0.00 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 40 0 0.00 24 de pulmón -1.35 KC 28 de pulmón COPD 40 0 0.00 28 de pulmón -1.35 KC 23 de pulmón COPD 40 0 0.00 23 de pulmón -1.35 KC 25 de pulmón normal 40 0 0.00 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 38.19 0.79 0.79 -1.70 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 36.09 2.76 5.52 4.10 OD03433 asmático pulmón asmático 29322 pulmón 40 0 0.00 -1.35 OD03397 asmático pulmón asmático 29325 pulmón 40 0 0.00 -1.35 OD04928 asmático células células endotellales KC control 40 0 0.00 endoteliales VEGF endo KC 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo KC 40 0 0.00 bFGF endo 0.00 corazón Clontech normal 40 0 0.00 corazón T-1 de corazón 29417 38.36 0.71 T-1 de 1.42 1.42 Isquémico corazón T-14 de corazón con T-14 de 29422 40 0 0.00 0.00 DCM no obstructiva corazón T-3399 de corazón con 29426 40 0 ?-33T9 de 0.00 0.00 DCM corazón adenoides GW99-269 26162 38.96 0.5 1.00 adenoides amígdala GW98-280 22582 35.44 4.04 8.08 amígdala Células T PC00314 28453 38.83 0.54 1.08 Células T PBMNC 40 0 0.00 PBMNC monocito 35.1 4.94 9.88 monocito Células B PC00665 28455 33.32 14.31 28.62 Células B células dendrfticas 28441 32.53 22.85 células 45.70 denddtlcas 1 ,???+02 29.65 100 1.00?+01 40 0 1 ??+01 40 0 1.???-00 40 0 1.00?-00 40 0 NTC 40 0 Nombre del gen sbg1005450UDPGT No. de veces en que se repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon 1 .71 tumor de colon 0.00 tumor de colon 0.00 tumor de colon -20.94 tumor de pulmón 0.00 tumor de pulmón -2.30 tumor de pulmón 0.00 tumor de pulmón 10.32 tumor de mama 3.55 tumor de mama 14.29 tumor de mama 3.34 tumor de mama -17.74 Cerebro con ALZ etapa 5 -4.88 Cerebro con ALZ etapa 5 -5.37 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.02 Cerebro con ALZ etapa 5 -5.37 24 de pulmón -1.35 28 de pulmón -1.35 23 de pulmón -1.35 pulmón asmático -1.70 pulmón asmático 4.10 pulmón asmático -1.35 pulmón asmático -1.35 VEGF endo 0.00 bFGF endo 0.00 T-1 de corazón 1.42 T-14 de corazón 0.00 T-3399 de corazón 0.00 BM estimulada 8.87 ostao Indlferenciado 0.00 Cartílago (reserva) -8.02 PBL con VIH IIIB 0.00 MRC5 con cepa F de HSV 551.53 Nombre del gen sbq1002620Tia Expresión general moderada. Expresión normal más alta en cerebro intacto, endometrio, miometrio, placenta y recto. Expresión de enfermedad más alta en uno de los pares de tumor de colon y de colon normal, las muestras de pulmón normal, una de las muestras de pulmón asmático, los neutrófilos, los eosinófllos, y una de las muestras de sinovio con RA. Expresado a altos niveles en todas las muestras representativas del tracto gastrointestinal, indicando una función potencial para este gen en IBS, IBD y enfermedad de Crohn. La subregulación en 1 de 3 muestras de pulmón con COPD, sugiere intervención en enfermedad pulmonar obstructiva crónica. La sobrerregulación en 1 de 4 muestras de pulmón asmático, implica una función en asma. Alta expresión en muestras de hueso y sinovio con OA, así como también en muestras de sinovio con RA. También alta expresión en los condrocitos. Expresión variable en las células inmunes, con expresión más alta en los neutrófilos y eosinófllos, y expresión más baja en las células dendríticas. La corroboración de alta expresión en células B y T, así como también en muestras con OA, implica a este gen en osteoartritis y artritis reumatoide.
No. de Número veces en de Coplas Copias de que se ARNm Muestra registro Intermerepitió la Ct detectaMuestra sbg10O2620Tla (Identlfl- dias de alteración das/90 ng de cador de GOl ARN total en la GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 24.54 22693.01 45386.02 colon normal tumor de colon GW98- 21940 24.18 26862.81 53725.22 tumor de colon 1.18 166 colon normal GW98-178 22080 27.08 6895.34 13790.68 colon normal tumor de colon GW98- 22060 28.41 3692.19 7384.38 tumor de colon -1.87 177 colon normal GW98-561 23514 26.58 8698.68 17397.36 colon normal tumor de colon GW98- 560 23513 27.85 4799.22 9598.44 tumor de colon -1.81 colon normal G 98-894 24691 25.9 11972.57 23945.14 colon normal tumor de colon GW98- 24690 28.04 4396.4 893 8792.80 tumor de colon -2.72 pulmón normal GW98-3 20742 24.25 26016.9 52033.80 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 27.64 5300.37 10600.74 -4.91 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 25.1 17476.66 34953.32 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor da 20676 25.53 14274.54 28549.08 -1.22 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 24.62 21917.37 43834.74 pulmón nornial 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 25.64 13526.49 27052.98 -1.62 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 27.08 6884.03 13768.06 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 25.37 15385.8 30771.60 2.23 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 26.07 11065.25 11065.25 mama normal tumor de mama GW0O- tumor de 28746 26.87 7T11.48 15222.96 1.38 391 mama mama normal GW00-413 28798 28.65 3294.68 3294.68 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28797 28.52 3496.94 6993,88 2.12 412 mama mama normal GW00- 27592-95 29.47 2243.69 2243.69 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de 27588-91 25.83 12385.23 12385.23 5.52 231 :234 mama mama nornial GW98-621 23656 26.05 1 1 188.07 22376.14 mama normal tumpr de mama GW98- tumor de 23655 26.03 11303.95 22607.90 1.01 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 27.68 5198.79 10397.58 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 29.81 1909.01 3818.02 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 31.84 735.25 1470.50 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 28.43 3650.66 7301.32 1.40 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 29.01 2785.56 5571.12 1.07 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 29.T5 2059.62 4119.24 -1.27 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 30.01 1742,3 3484,60 -1.50 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 25.49 14553.17 29106.34 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 31.8 749.93 749.93 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 33.35 362.66 362.66 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 30.67 1275.68 1275,68 24 de pulmón -6.03 KC 28 de pulmón COPD 29.25 2490.39 2490,39 28 de pulmón -3.09 KC 23 de pulmón COPD 30.11 1661.24 1661.24 23 de pulmón -4.63 KC 25 de pulmón normal 32.45 553.75 553.75 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 27.3 6215.19 6215,19 -1.24 OD031 2 asmático pulmón asmático pulmón 29323 26.66 8407,3 16814.60 2.19 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 24.06 28466.73 56933.46 7.40 ODQ3397 asmático pulmón asmático 29325 26.22 10313.71 20627.42 pulmón 2.68 OD04928 asmático células endoteliales KC control 40 0 0.00 células endoteliales VEGF endo KC 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo KC 40 0 0.00 bFGF endo 0.00 corazón Clontech normal 27.58 5449.78 10899.56 corazón T-1 de corazón 29417 28.42 3670.86 7341.72 T-1 de -1.48 isquémico corazón T-14 de corazón con 29422 27.18 6570.11 13140.22 T-14 de 1.21 DCM no obstructiva corazón T-3399 de corazón con 29426 26.23 10277.2 20554.40 ?-339T de 1.89 DCM corazón adenoides GW99-269 26162 31.98 688.86 1377.72 adenoides amígdala GW98-280 22582 29.31 2421.67 4843.34 amígdala Células T PC00314 26453 29.53 2176.21 4356.42 Células T PBMNC 33.23 383.88 383.88 PBMNC monoclto 31.07 1057.9 2115.80 monoclto Células B PC00665 28455 35.97 106.01 212.02 Células B células dendrltlcas 28441 33.56 328.62 657.24 células dendrlticas neutrófilos 28440 22.32 64510.36 64510.36 neutrófilos eoslnófilos 28446 24.18 26910.17 53820.34 eosinófilos BM no estimulada 30.35 1480.07 1480.07 BM no estimulada BM estimulada 31.71 782.56 782.56 BM estimulada -1.89 osteo diferenciado 31.42 895.71 895.71 osteo 2.03 diferenciado osteo indlferenclado 32.93 440.66 440.66 osteo Indlferenclado condrocltos 28.98 2820.8 7052.00 condrocitos Slnovlo con OA IP12/01 29462 25.37 15383.84 15383.84 Sinovio con OA Sinovlo con OA NP10/01 29461 27.12 6763.44 13526.88 Sinovio con OA Sinovio con OA NP57/00 28464 26.48 9130.81 18261.62 Sinovio con OA Sinovio con RA NP03/01 28466 27.78 4967.23 9934.46 Slnovlo con RA Sinovio con RA NP71/00 28467 24.72 20923.66 41847.32 Slnovlo con RA Sinovio con RA NP45/00 28475 26.15 10658.82 21317.64 Slnovlo con RA Hueso con OA (blobank) 29217 28.68 3248.19 3248.19 Hueso con OA (blobank) Muestra 1 de hueso con J. Emory 27.19 6545.82 13091.64 Hueso con OA OA Muestra 2 de hueso con J. Emory 27.24 6384.92 12769.84 Hueso con OA OA Cartílago (reserva) Normal 26.28 10016.65 20033.30 Cartílago (reserva) Cartílago (reserva) OA 26.67 8342.92 16685.84 Cartílago -1.20 (reserva) Nombre del gen sbq1002620Tla No. de veces en que se repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon 1.18 tumor do colon -1.87 tumor de colon -1.81 tumor de colon -2.72 tumor de pulmón -4.91 tumor de pulmón -1.22 tumor de pulmón -1.62 tumor de pulmón 2.23 tumor de mama 1.38 tumor de mama 2.12 tumor de mama 5.52 tumor de mama 1.01 Cerebro con ALZ etapa 5 1.40 Cerebro con ALZ etapa 5 1 .07 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.27 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.50 24 de pulmón -6.03 28 de pulmón -3.09 23 de pulmón -4.63 pulmón asmático -1 .24 pulmón asmático 2.19 pulmón asmático 7.40 pulmón asmático 2.68 VEGF endo 0.00 bFGF endo 0.00 T-1 de corazón -1.48 T-14 de corazón 1.21 T-3399 de corazón 1.89 BM estimulada -1.89 osteo diferenciado 2.03 Cartílago (reserva) -1.20 PBL con VIH IIIB -1.36 MRC5 con cepa F de HSV -2.57 Nombre del gen sbq1002620Tib Expresión general de moderada a alta. Expresión normal más alta en cerebro intacto, endometrio, yeyuno, placenta, timo y vejiga urinaria.
Expresión de enfermedad más alta en uno de los pares de tumor de colon y colon normal, una de las muestras de pulmón normal, una de las muestras de pulmón asmático, los neutrófilos y los eosinófilos. La fuerte expresión en todas las muestras del tracto gastrointestinal, implica a este gen en IBS, IBD y enfermedad de Crohn La subregulación en 1 de 4 muestras de tumor de pulmón, es suficiente para reclamar esta enfermedad en cáncer de pulmón. La subreguiación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, sugiere intervención en enfermedad pulmonar obstructiva crónica. La sobrerregulación en 1 de 4 muestras de pulmón asmático, implica una función en asma. La sobrerregulación en 2 de 3 muestras de corazón, sugiere que este gen puede desempeñar una función en miopatía cardiaca dilatada obstructiva y no obstructiva. La alta expresión en las muestras de sinovio con RA y OA, así como también la alta expresión en los condrocitos y células T, implican a este gen en osteoartritis y artritis reumatoide.
Coplas Coplas 50 Coplas de Intermect IntermeCoplas ARNr ng/AR ARNm Muestra dias de dias de prome¬ (muestras 1 18S Nr detectadas/ sbg10Q262QTIb y GOl GOl dio de 2) S 50 ng de (muestra (muestra GOl (na) 18 1) 2) (na) ARN total Adipocitos 31.35, 31.44 58.54 55.11 56.83 3.06 16.34 928.51 subcutáneos Zenblo Tejido adiposo 35.12, 34.21 5 9.05 7.03 0.96 52.36 367.80 subcutáneo Zenbio Glándula suprarrenal 40, 34.29 0 8.61 4.31 0.61 81.T7 352.87 Clontech Cerebro Intacto 1873.5 26.02, 26.06 1897.9 1849.19 7.24 6.91 12938.85 Clontech 5 Cerebro fetal Clontech 40. 36.43 0 2.13 1 .07 0.48 103.95 110.71 Cerebelo Clontech 40, 36.05 0 2.74 1.37 2.17 23.04 31.57 Cerviz 32.23, 33.04 33.1 1 19.47 26.29 2.42 20.66 543.18 Colon 30.44, 30.45 105.93 105.29 105.61 2.71 18.45 1948.52 Endometrlo 30.86, 30.56 80.75 97.92 89.34 0.73 68.21 6093.79 Esófago 33.03. 32.34 19.62 30.66 25.14 1.37 36.50 917.52 Corazón Clontech 40. 35.05 0 5.26 2.63 1.32 37.88 99.62 Hipotálamo 40, 36.17 0 2.53 1.27 0.32 155.28 196.43 Ileo 31.25, 30.31 62.52 115.58 89.05 2.58 19.38 1725.78 Yeyuno 27.75, 27.93 612.01 543.46 577.74 6.60 7.58 4376.78 Riñón 32.59, 31.86 26.03 42.14 34.09 2.12 23.58 803.89 Hígado 34.66, 34.5 6.77 7.52 7.15 1 .50 33.33 238.17 Hígado fetal Clontech 29.08, 28.58 256,83 356.67 306.75 10.40 4.81 1474.76 Pulmón 30.74, 30.68 87.44 90.91 89.18 2.57 19.46 1734.92 Glándula mamarla 27.49, 26.81 725.02 1132.42 928.72 13.00 3.85 3572.00 Clontech Mlometrlo 31.2, 30.29 64.54 1 17.26 90.90 2.34 21.37 1942.31 Omento 31.19, 30.12 65.05 130.86 97.96 3.94 12.69 1243.08 30.24, Ovarlo 120.95 99.3 110.13 4.34 11.52 1268.72 30.54 36.01 , Páncreas 2.81 1.97 2.39 0.81 61.80 147.71 36.55 Cabeza del 33.95, 10.72 3.36 7.04 1.57 31.85 224.20 páncreas 35.73 32.16, Glándula parótida 34.51 18.05 26.28 5.48 9.12 239.78 33.16 28.42, Placenta Clontech 395.01 512.77 453.89 5.26 9.51 4314.54 28.02 30.61 , Próstata 95.23 61.5 78.37 3.00 16.67 1306.08 31.28 Recto 30.5, 30.93 101.73 76.9 89.32 1.23 40.65 3630.69 Glándula salival 31.17, 65.95 70.23 68.09 7.31 6.84 465.73 Clontech 31.07 Músculo esquelético 40, 40 0 0 0.00 1.26 39.68 0.00 Clontech 34.37, Piel 8.18 18.53 13.36 1.21 41.32 551.86 33.12 Intestino delgado 36.71 , 1.78 5.55 3.67 0.98 51.07 187.18 Clontech 34.96 30.54, Bazo 99.47 60.88 80.18 4.92 10.16 814.79 31.29 Estómago 32.4, 31.53 29.49 52 40.75 2.73 18.32 746.25 Testículo Clontech 34.4, 35.19 8.03 4.79 6.41 0.57 87.87 ; 563.27 27.18, Timo Clontech 888.8 924.29 906.57 9.89 5.06 4583.24 27.12 32.17, Tiroides 34.36 79.27 56.82 2.77 18.05 1025:54 30.89 30.01 , Tráquea Clontech 140.31 230.28 185.30 9.71 5.15 954.15 29.25 28.33, Vejiga urinaria 420.47 565.71 493.09 5.47 9.14 4507,22 27.87 29.09, Utero 255.27 308 281.64 5.34 9.36 2637.03 28.81 genómica 27.16 900.78 actina b 27.4 769.87 1.00E+05 19.87 100000 1.00E+05 19.95 100000 1.00E+04 23.4 10000 1.00E+04 23.39 10000 1.00E+03 26.94 1000 1.00E+03 26.95 1000 1.00E+02 31.02 100 1.00E+02 30.96 100 1.00E+01 33.46 10 1.00E+01 40 0 1.00E-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 27.02 1400.04 2800.08 -1.47 ??99-T87 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 27,4 1105.21 2210.42 -1.86 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 27.1 1336.02 2672.04 -1.54 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 23.52 12295.29 24590.58 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 31.42 91.19 91.19 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 32.34 51.71 51.71 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 31.27 100.29 100.29 24 de pulmón -61.80 KC 28 de pulmón COPD 28.64 511.37 51 .37 28 de pulmón -12.12 KC 23 de pulmón COPD 30.52 159.17 159.17 23 de pulmón -38.94 KC 25 de pulmón normal 32.15 57.91 57.91 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 23.19 15086.65 15086.65 OD03112 asmático 2.43 pulmón asmático pulmón 29323 24.76 5706.9 11413.80 1.84 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 21.71 37760.01 75520.02 12.18 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 24.16 8255.16 16510.32 2.66 OD04928 asmático células células endotellales KC control 37.31 2.36 2.36 endotellales VEGF endo KC 40 0 0.00 VEGF endo -2.36 bFGF endo KC 35.67 6.54 6.54 bFGF endo 2.77 corazón Clontech , normal 26.32 2170.24 4340.48 corazón T-1 de corazón T-1 de 29417 25.87 2863.04 5726.08 1.3.2 Isquémico corazón T-14 de corazón con T-14 de 29422 24.62 6200.03 12400.06 2.86 DCM no obstructiva corazón ?-33T9 de corazón con T-3399 de 29426 24.06 8775.18 17550.36 4.04 DCM corazón adenoides GW99-269 2T162 29.2 362.88 725.76 adenoides amígdala GW98-280 22582 27.24 1222.33 2444.66 amígdala Células T PC0031 28453 28.09 723.06 1446.12 Células T PBMNC 30.67 145.75 145.75 PBMNC monocito 28.42 587.16 1174.32 monocito Células B PC00665 28455 34.17 16.57 33.14 Células B 31.78 72.95 células células dendrltlcas 28441 145.90 dendríticas neutrófilos 28440 21 ,46 44297.23 44297.23 neutrófilos eoslnófilos 28446 22.79 19332.21 38664.42 eosinófilos BM no BM no estimulada 29.22 358.53 358.53 estimulada BM estimulada 31.27 100.39 100.39 BM estimulada -3.57 osteo diferenciado 30.14 202.25 osteo 202.25 4.97 diferenciado osteo osteo Indiferenclado 32.72 40.67 40.67 Indiferenclado condrocitos 27.3 1178.3 2945.75 condrocitos Slnovlo con Slnovlo con OA IP12/01 29462 23.33 13860.23 13860.23 OA Nombre del gen sbg1002620Tlb Nombre del gen sbq102200MCTa Expresión general de moderada a baja. Expresión normal más alta en tejido adiposo subcutáneo, cerebro intacto, cerebro fetal, cerebelo e hígado fetal. Expresión de enfermedad más alta en 2 de 4 muestras de tumor de pulmón, una de las muestras de pulmón normal, una de las muestras de mama normal, y la muestra de pulmón de CT. La subregulación en 1 de 4 muestras de cáncer de mama, implica a este gen en cáncer de mama. La subregulación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, sugiere intervención en enfermedad pulmonar obstructiva crónica. La expresión moderada en sinovio con OA y RA, asi como también los PBLs, adenoides, amígdalas, células T, células B y los condrocitos, indica intervención en osteoartritis y artritis reumatoide.
RIflón 34.23, 34.1 11.02 11.9 11.46 2.12 23.58 270.28 Hígado 35.35, 37.28 5.65 1.79 3.72 1.50 33.33 124.00 Hígado fetal Clontech 29.45, 28.98 189.89 250.96 220.43 10.40 4.81 1059.74 Pulmón 34.99, 33.43 7.04 17.81 12.43 2.57 19.46 241.73 Glándula mamaria 31.76, 31.05 48.02 73.18 60.60 13.00 3.85 233.08 Clontech Miometrlo 34.46, 35.22 9.64 6.12 7.88 2.34 21.37 168.38 Omento 37.T4, 34.13 1.21 11.71 6.46 3.94 12.69 81.98 Ovario 34.03, 33.43 12.44 17.77 15.11 4.34 11.52 174.02 Páncreas 40, 40 0 0 0.00 0.81 61.80 0.00 Cabeza del páncreas 40, 40 0 0 0.00 1.57 31.85 0.00 Glándula parótida 32.56, 31.81 29.88 46.65 38.27 5.48 9.12 349.13 Placenta Clontech 40, 40 0 0 0.00 5.2T 9.51 0.00 Próstata 40, 36.21 0 3.39 1.70 3.00 16.67 28.25 Recto 40. 39.37 0 0.52 0.26 1.23 40.65 10.57 Glándula salival 30.6, 31.77 95.89 47.76 71.83 7.31 6.84 491.28 Clontech Músculo esquelético 40. 40 0 0 0.00 1.26 39.68 0.00 Clontech Piel 34.47, 35.32 9.58 5.75 7.67 1.21 41.32 316.74 Intestino delgado 40, 40 0 0 0.00 0.98 51.07 0.00 Clontech Bazo 34.1, 36.49 11.93 2.87 7.40 4.92 10.16 75.20 Estómago 35.17, 36.07 T.3 3.68 4.99 2.73 18.32 91.39 Testículo Clontech 37.98, 40 1.19 0 0.60 0.57 87.87 52.28 Timo Clontech 31.28, 30.4 63.69 108.05 85.87 9.89 5.06 434.13 Tiroides 33.08. 32.96 21.88 23.47 22.68 2.77 18.05 409.30 Tráquea Clontech 32.54, 31.34 30.14 61.71 45.93 9.71 5.15 236.48 Vejiga urinaria 33.91 , 40 13.32 0 6.66 5.47 9.14 T0.88 Utero 33.71 , 32.43 15.04 32.13 23.59 5.34 9.36 220.83 genómica 26.3 1237.42 actlna b 27.49 610.72 1.OOE+05 19.18 100000 1.OOE+05 19.45 100000 1.00E+04 22.6 10000 1.00E+04 22.53 10000 1.OOE+03 26.17 1000 1.OOE+03 26.19 1000 1.00E+02 30.61 100 1.00E+02 30.53 100 1.00E+01 40 0 1.00E+01 34.91 10 1.00E-00 40 0 1.00E-0O 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 No. de Número veces en Coplas de de Coplas que se Muestra registro ct ARNm IntermeMuestra repitió la sbg1O22O0MCTa (Identlfl dias de detectaalteración das/50 ng de cador de GOI en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 28.58 519.72 1039.44 colon normal tumor de colon GW98- 21940 30.18 202.86 405.72 tumor de colon -2.56 166 colon normal GW98-178 22080 31.39 100.15 200.30 colon normal tumor de colon GW98- 22060 29.62 282.42 564.84 tumor de colon 2.82 177 colon normal GW98-561 23514 30.36 183.13 366.26 colon normal tumor de colon GW98- 23513 30.45 173.87 347.74 tumor de colon -1.05 560 colon normal GW98-894 24T91 30.23 196.98 393.96 colon normal tumor de colon GW98- 246T0 30.35 183.76 367.52 tumor de colon -1.07 893 pulmón normal GW98-3 20742 26.68 1575.72 3151.44 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 28.8 456.47 912.94 -3.45 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 27.94 754.47 1508.94 pulmón normal 1 9 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 26.27 2002.28 4004.56 2.65 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 26.87 1411.09 2822.18 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 29.38 325.51 651.02 -4.34 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 30 225.32 450.64 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 28.64 502.02 1004.04 2.23 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 28.32 602.59 602.59 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28746 28.05 709.37 1418.74 2.35 391 mama mama normal GWOO-413 28798 29.56 292.43 292.43 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28797 30.05 218.89 437.78 1.50 412 mama mama normal GW00- 27592-95 30.96 128.91 128.91 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de 27588-91 30.57 161.3 161.30 1.25 231 :234 mama mama normal GW98-621 23656 27.04 1275.81 2551.62 mama normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 31.35 102.26 204.52 -12.48 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 28.44 564.32 1128.64 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 29.01 402.37 804.74 406 normal cerebro normal BB99- c 25546 29.67 erebro 274.03 548,06 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 29.6 284.82 569.64 -1.45 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 27.92 765.16 1530.32 1.85 ??99-T87 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 28.74 472.27 944.54 1.14 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 29.3 340.25 680.50 -1.22 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 26.69 1569.87 3139.74 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 31.07 120.9 120.90 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 31.17 113.69 113.69 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 31.8 78.78 78.78 24 de pulmón -10,98 KC 28 de pulmón COPD 32.79 44.02 44.02 28 de pulmón -19.65 KC 23 de pulmón COPD 31.35 102.33 102.33 23 de pulmón -8.45 KC 25 de pulmón normal 31.66 85.57 85.57 25 de pulmón pulmón asmático pulmón 29321 28.76 467.45 467.45 -1.85 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 27.73 851.21 1702.42 1.97 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 27.81 812.68 1625.36 1.88 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 29.42 317.12 634.24 -1.36 OD04928 asmático células endotellales KC control 33.06 37.57 células 37.57 endotellales VEGF ando KC 33.9 22.97 22.97 VEGF endo -1.64 bFGF endo KC 33.13 36.03 36.03 bFGF endo -1.04 corazón Clontech normal 31.1 118.18 236.36 corazón T-1 de corazón T-1 de 29417 31.16 114:67 229.34 -1.03 Isquémico corazón T-14 de corazón con T-14 de 29422 30.52 166.47 332.94 1.41 DCM no obstructiva corazón T-3399 de corazón con T-3399 de 29426 30.14 208.3 416.60 1.76 DCM corazón adenoides GW99-269 26162 29.07 388.9 777.80 adenoides amígdala GW98-280 22582 28.29 614.82 1229.64 amígdala Células T PC00314 28453 29.78 256.1 512.20 Células T PBMNC 33.73 25.44 25.44 PBMNC monoclto 33.52 28.71 57.42 monoclto Células B PC00665 28455 28.66 495.36 T90.72 Células B células dendrltlcas 28441 30.81 140.17 280.34 células dendrlticas neutrófilos 28440 30.17 204.92 204.92 neutrófilos eosinófilos 28446 34.19 19.39 38.78 eosinófilos BM no BM no estimulada 35.9 7.11 7.11 estimulada BM estimulada 35.77 7.7 7.70 BM estimulada 1.08 osteo osteo diferenciado 34.98 12.18 12.18 2.55 diferenciado osteo osteo Indlferenclado 36.59 4.77 4.77 Indlferenclado Condrocitos 32.91 41.03 102.58 condrocitos Slnovio con Slnovlo con OA IP12/01 29462 29.16 370.33 370.33 OA Nombre del gen sba102200MCTa Nombre del gen sbal 02200 MCTb Expresión general de alta a moderada. Expresión normal más alta en cerebro intacto, hígado, hígado fetal y timo. Expresión de enfermedad más alta en uno de los pares de tumor de colon y colon normal, uno de los pares de tumor de pulmón y pulmón normal, una de las muestras de pulmón asmático, las células dendríticas y los PBL no infectados e infectados por VIH. La sobrerregulación en 2 de 4 muestras de tumor de mama, es suficiente para reclamar esta enfermedad en cáncer de mama. La sobrerregulación en 1 de 4 muestras de cerebro con AD, indica una función potencial en enfermedad de Alzheimer. La subregulación en 3 de 3 muestras de pulmón con COPD, sugiere intervención en enfermedad pulmonar obstructiva crónica. La sobrerregulación en 1 de 4 muestras de pulmón asmático, indica una función potencial para este gen en cáncer de pulmón. Alta expresión en todas las células inmunes. La expresión también de alta a moderada en las muestras de sinovio con OA y RA, las muestras de hueso con OA, y en los condrocitos, sugiere intervención en osteoartritis y artritis reumatoide.
Cerviz 40, 34.34 3.17 8.5 5.84 2.42 20.66 120.56 Colon 33.67, 35.6 12.86 3.91 8.39 2.71 18.45 154.70 Endometrio 35.32, 34.43 4.66 8.05 6.36 0.73 68.21 433.49 Esófago 34.27, 35.14 8.86 5.19 7.03 1.37 36.50 25T.39 Corazón Clontech 40, 35.05 0 5.5 2.75 1.32 37.88 104.17 Hlpotálamo 40, 40 0 0 0.00 0.32 155.28 0.00 Ileo 35.29, 33.68 4.74 12.8 8.77 2.58 19.38 169.96 Yeyuno 31.23, 30.98 57.65 67.22 62.44 6.60 7.58 472.99 Riñón 34.67, 34.21 6.95 9.2 8.08 2.12 23.58 190.45 Hígado 30.76, 30.65 77.12 82.56 79.84 1.50 33.33 2661.33 Hígado fetal Clontech 26.8, 27.1 885.14 734.31 809.73 10.40 4.81 3892.91 Pulmón 40, 40 0 0.17 0.09 2.57 19.46 1.65 Glándula mamaria 31.28, 31.37 56.1 52.95 54.53 13.00 3.85 209.71 Clontech Mlometrio 34.16, 36.28 T.48 2.57 6.03 2.34 21.37 128.74 Omento 34.18, 33.42 9.3B 15 12.19 3.94 12.69 154.70 Ovario 34.21 , 34.18 9.24 9.39 9.32 4.34 11.52 107.32 Páncreas 40, 40 0 0.14 0.07 0.81 61.80 4.33 Cabeza del páncreas 40, 35.02 0 5.59 2.80 1.57 3 .85 89.01 Glándula parótida 31.23, 31.9 57.68 38.33 48.01 5.48 9.12 438.00 Placenta Clontech 31.77, 33.13 41.33 17.94 29.64 5.26 9.51 : 281 :70 Próstata 39.72, 35.03 0.31 5.56 2.94 3.00 16.67 48.92 Recto 35.36, 34.34 4.53 8.5 6.52 1.23 40.65 264.84 Glándula salival 30.52, 30.54 89.5 " 88.43 88.97 7.31 6.84 608.52 Clontech Músculo esquelético 0 Clontech 40, 40 0 0.00 1.26 39.68 0.00 Piel 40, 40 0 0 0.00 1.21 41.32 0.00 Intestino delgado 40, 39.27 0 0.41 0.21 0.98 51.07 10.47 Clontech Bazo 34.21 , 33.54 9.2 13.91 11.56 4.92 10.16 117.43 Estómago 35.05, 33.62 5.51 13.22 9.37 2.73 18.32 171.52 Testículo Clontech 40, 40 0 0 0.00 0.57 87.87 0.00 Timo Clontech 28.56, 28.44 299.45 322.02 310.74 9.89 5.06 1570.96 Tiroides 31.65, 32.3 44.76 29.81 37.29 2.77 18.05 673.01 Tráquea Clontech 32.3, 31.9 29.9 38.28 34.09 9.71 5.15 175.54 Vejiga urinaria 34.34, 35.02 8.49 5.59 7.04 5.47 9.14 64.35 Utero 33.07, 34.56 18.62 7.45 13.04 5.34 9.36 122.05 genómica 25.84 1597.08 actlna b 27.32 643.56 1.00E+05 19.22 100000 1.00E+05 19.33 100000 1.00E+04 22.48 10000 1.00E+04 22.95 10000 1.00E+03 26.19 1000 1.00E+03 26.37 1000 1.00E+02 31.23 100 1.OOE+02 30.48 100 1 ,???+01 32.76 10 1.00E+01 35.02 10 1.00E-00 40 0 1.OOE-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 No. de Número veces en Coplas de de Coplas que se ARNm Muestra registro intermerepitió la Ct detectaMuestra sbg102200MCTb (Identifl- dias de alteración das/50 ng de cador de GOl en la ARN total GSK) población enferma colon normal.GW98-167 21941 26.48 1723.59 3447.18 colon normal tumor de colon GW98- 21T40 26.06 2195.04 4390.08 tumor de colon 1.27 ; 166 colon normal GW98-178 22080 29.03 389.88 779.76 colon normal tumor de colon GW98- 22060 27.39 1015.65 2031.30 tumor de colon : 2.61 17 colon normal GW98-561 23514 26.74 1478.76 2957.52 colon normal tumor de colon GW98- 23513 26.37 1831.8 3663.60 tumor de colon 1.24 ¦ 560 colon normal GW98-894 24691 25.58 2918,02 5836.04 colon normal tumor de colon GW98- 24690 25 4089.75 8179.50 tumor de colon 1.40 893 pulmón normal GW98-3 20742 24.59 5183.31 10366.62 pulmón normal tumor.de pulmón GW98- tumor de 20741 24.94 4232.23 8464.46 -1.22 2 pulmón pulmón normal GW97- 20T77 25.73 2672.73 5345.46 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 25.36 3307.37 6614.74 1.24 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 26.13 2109.28 4218.56 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 25.54 2973.82 5947.64 1.41 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 27.08 1212.64 2425,28 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 27.45 979.82 1959.64 -1.24 281 pulmón mama nomial GWOO-392 28750 26.68 1536.57 1536.57 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28746 26.58 1T2T.58 3253.16 2.12 391 mama mama normal GW00-413 28798 31.71 81.9 81.90 mama nomial tumor de mama GW00- tumor de 28797 26.57 1632 3264.00 39.85 412 mama mama normal GW00- 27592-95 32.52 51.1 51.10 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de 27588-91 29.67 268.7 2T8.70 5.26 231:234 mama mama normal GW98-621 23656 26.48 1727.44 3454.88 mama normal tumor de mama GW98- 23655 25.65 2793.6 5587.20 tumor de 1.62 T20 mama cerebro normal ??9T- 25507 28.62 494 988.00 cerebro 542 normal cerebro normal BB99- 25509 29.45 304.68 609.36 cerebro 406 normal cerebro normal BB99- 25546 30.08 211.25 422.50 cerebro 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 25502 28.75 458.64 917.28 Cerebro con 1.36 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25503 26.86 1383.71 2767.42 Cerebro con 4.11 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25504 28.02 702.59 1405.18 Cerebro con 2.09 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25542 29.57 284.31 568.62 Cerebro con -1.18 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 26.58 1624.29 3248.58 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 34.19 19.27 19.27 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 32.45 53.23 53.23 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 33 38.6 38.60 24 de pulmón -21.75 KC 28 de pulmón COPD 32.24 59.95 59.95 28 de pulmón -14.Q1 KC 23 de pulmón COPD 32.87 41.63 41.63 23 de pulmón -20.17 KC 25 de pulmón normal 33.04 37.52 37.52 25 de pulmón pulmón asmático 29321 30.13 205.46 205.46 pulmón -4.09 OD03112 asmático pulmón asmático 29323 27.82 788.82 1577,64 pulmón 1.88 OD03433 asmático pulmón asmático 29322 25.17 3695.43 7390.86 pulmón 8.80 OD03397 asmático pulmón asmático 29325 27.6 894.3 1788.60 pulmón 2.13 OD04928 asmático células endoteliales KC control 28.2 633.43 633.43 células endoteliales VEGF endo KC 28.86 429.51 429.51 VEGF endo -1.47 bFGF endo KC 28.97 403.08 403.08 bFGF endo -1 ,57 corazón Clontech normal 28.83 437.62 875.24 corazón T-1 de corazón 29417 28.42 557.54 1115.08 T-1 de 1.27 Isquémico corazón T-14 de corazón con 29422 27.72 835.11 1670.22 T-1 de 1.91 DC no obstructiva corazón T-3399 de corazón con 29426 28.63 493.01 986.02 T-3399 de 1.13 DCM corazón adenoides GW99-269 26162 27 1269.75 2539.50 adenoides amígdala GW98-280 22582 26.33 1876.29 3752.58 amígdala Células T PC00314 28453 29.15 363.35 726.70 Células T PBMNC 33.05 37.41 37.41 PBMNC monocito 31.49 92.84 185.68 monocito Células B PC00665 28455 26.5 1700.87 3401.74 Células B células dendrflicas 28441 24.2 6511.17 13022.34 células dendrltlcas neutrófilos 28440 27.01 1262.74 1262.74 neutrófilos 1.00E+01 35.72 10 1.00E+01 34.74 10 1.00E-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 0 Nombre del gen sbg102200MCTb T-3399 de corazón 1.13 BM estimulada 3.54 osteo diferenciado 3.93 Cartílago (reserva) -1.48 PBL con VIH 11 IB -1.80 MRC5 con cepa F de HSV -4.51 Nombre del gen sbg1020380LYG Cancelado Nombre del gen sbq1007026SGLT Expresión general de buena a moderada. La expresión normal más alta se observa en cerebro intacto, cerebelo, hipotálamo, yeyuno, hígado fetal, recto y útero. Este gen muestra expresión específica de sistemas en muestras que representan al sistema nervioso central, los órganos reproductores femeninos y el tracto gastrointestinal. La expresión observada en las muestras enfermas, confirma que se observa en las muestras normales con los niveles de expresión más altos observados en las muestras de cerebro normal y muestras de cerebro con enfermedad de Alzheimer. La sobrerregulación en 1 de 4 muestras de tumor de colon, y 2 de 4 muestras de tumor de mama, así como también la subregulación en 1 de 4 tumores de pulmón, establece una función potencial para este gen en cánceres de colon y mama. La subregulación en 2 de 4 muestras de cerebro con enfermedad de Alzheimer, implica intervención en enfermedad de Alzheimer. La subregulación en 3 de 3 muestras con COPD, y la sobrerregulación en 2 de 4 muestras de pulmón asmático, sugiere una función potencial para este gen en trastorno pulmonar obstructivo crónico. La sobrerregulación en la línea de células endoteliales tratadas con VEGF, implica una función posible para este gen en angiogénesis. Subregulado en la muestra de médula ósea estimulada. La alta expresión en las muestras de sinovio con RA y OA, las muestras de hueso con OA y los condrocitos, con corroboración de alta expresión en las células T, células B, neutrófilos y eosinófilos, implica a este gen en osteoartritis y artritis reumatoide.
Glándula parótida 36.88, 40 0.94 0 0.47 5.48 9.12 4.29 Placenta Clontech 33.84, 5.66 0.37 3.02 5.26 9.51 28.66 38.46 Próstata 38.76, 0.31 0.81 0.56 3.00 16.67 9.33 37.12 Recto 36.18, 1.42 5.7 3.56 1.23 40.65 144.72 33.82 Glándula salival 38.36, 0.39 0.12 0.26 7.31 6.84 1.74 Clontech 39.93 Músculo esquelético 35.69, 1.9 1 .38 1.64 1.26 39.68 65.08 Clontech 36.23 Piel 39.51 , 40 0.2 0.09 0.15 1.21 41 .32 5.99 Intestino delgado 40, 36.04 0.1 1 .53 0.82 0.98 51.07 41.62 Clontech Bazo 33.51 , 6.87 0.36 3.62 4.92 10.16 36.74 38.51 Estómago 34.14, 4.73 4.59 4.66 2.73 18.32 85.35 34.19 Testículo Clontech 35.81 , 40 1 .76 0.11 0.94 0.57 87.87 82.16 Timo Clontech 33.26, 7.96 12.55 10.26 9.89 5.06 51.85 32.49 Tiroides 40, 39.9 0.08 0.16 0.12 2.77 18.05 2.17 Tráquea Clontech 34.25, 33.8 4.42 5.77 5.10 9.71 5.15 :26.24 Vejiga urinaria 39.95, 0.1 1 .14 0.62 5.47 9.14 .: 5.67 36.54 Utero 33, 31.23 9.3 26.52 17.9 5.34 9.36 167.70 genómlca 24.72 1251 .19 actlna b 25.89 625.04 1.00E+05 17.54 100000 1.00E+05 17.65 100000 1.OOE+04 21 .03 10000 1.OOE+04 20.92 10000 1.OOE+03 24.87 1000 1.OOE+03 24.96 1000 1.00E+02 29.1 100 1 .00E+02 29.04 100 1 .00E+01 32.05 10 1.00E+01 33.51 10 1.OOE-OO 36.41 1 1.00E-00 37.41 1 NTC 40 0 NTC 40 -1 No. de Número veces en Coplas de de Coplas que se ARNm Muestra registro Intermerepitió la Ct detectaMuestra ebg1007026SGLT (Idontlfl- dias de alteración das/50 ng de cador de GOl en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 29.22 127.1 254.20 colon normal tumor de colon GW98- 21940 31.07 44.11 88.22 tumor de colon -2.88 166 colon normal GW98-178 22080 38.41 0.65 1.30 colon normal tumor de colon GW98- 22060 31.17 41.5 83.00 tumor de colon 63.85 177 colon normal GW9B-561 23514 31.21 40.69 81.38 colon normal tumor de colon GW98- 23513 33.06 14.04 28.08 tumor de colon -2.90 560 colon normal GW98-894 24691 29.63 100.41 200.82 colon normal tumor de colon GW98- 24690 32.22 22.7 45.40 tumor de colon -4.42 893 pulmón normal GW98-3 20742 29.8 91.46 182.92 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 34.26 7.02 14.04 -13.03 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 179 29.59 103.13 206.26 pulmón normal tumor de pulmón GW97- tumor de 178 20676 29.84 89.09 178.18 pulmón : -1.16 pulmón normal GW98- 21922 29.6 102.46 204.92 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 30.8 51.53 103.06 -1.99 164 pulmón. pulmón normal GW98- 22584 32.53 18.97 37.94 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 32.29 21.8 43.60 1.15 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 28.77 164.85 164.85 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28746 30.64 56.21 -1.47 391 112.42 mama mama nomial GW00-413 28798 34.49 6.17 6.17 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28797 30.37 65.97 131.94 21.38 412 mama mama normal GW00- 27592-95 32.87 15.66 15.66 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de .07 231:234 27588-91 29.8 91 91.07 5.82 mama mama nomial GW98-621 23656 28.95 149.19 298.38 mama normal tumor de mama GW98- 29.62 tumor de 23655 101.25 202.50 -1.47 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 24.5 1917.28 3834.56 542 normal cerebro normal ??TT- cerebro 25509 21.35 11736.92 23473.84 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 25.25 1248.68 904 ' 2497.36 normal Cerebro con ALZ etapa 5 25502 27.29 386.81 773.62 Cerebro con -12.84 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 23.61 3196.37 6392.74 -1.55 ??T9-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 25.56 1045.09 2090.18 -4.75 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 24.45 1976.24 3952.48 -2.51 BB99-927 ALZ etapa 5 pulmón normal Pulmón CT normal 31.07 44.03 88.06 CT 26 do pulmón 26 de pulmón normal 24.93 1496.87 normal 27 de pulmón 27 de pulmón normal 34.06 7.92 7.92 normal 24 de pulmón 24 de pulmón COPD 34.58 5.87 5.87 -5.45 con COPD 28 de pulmón 28 de pulmón COPD 40 0 0.00 -31.99 con COPD 23 de pulmón 23 de pulmón COPD 40 0 0.00 -31.99 con COPD 25 de pulmón 25 de pulmón normal 40 0 0.00 normal pulmón asmático pulmón 29321 33.19 13.04 13.04 -2.45 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 30.61 57.38 114.76 3.59 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 2T322 29.2 129.16 258.32 . 8.07 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 30.32 67.67 135.34 4.23 ODG4928 asmático células células endoteliales control 35.09 4.37 4.37 endoteliales VEGF endo 32.22 22.7 22.70 VEGF endo 5.19 bFGF endo 33.23 12.7 12.70 bFGF endo 2.91 corazón Clontech normal 33.53 10.71 21.42 corazón T-1 de T-1 de corazón 29417 33.43 11.37 22.74 corazón 1.06 isquémico Isquémico T-14 de T-14 de corazón con corazón con 29422 34.45 6.32 12.64 -1.6T DCM no obstructiva DCM no obstructiva T-3399 de T-3399 de corazón con 29426 31.98 26.02 52.04 corazón con 2.43 DCM DCM adenoides GW99-269 26162 29.56 104.93 209.86 adenoides amígdala GW98-280 22582 29 144.55 289.10 amígdala Células T PC00314 28453 32.03 25.34 50.68 Células T PB NC 37.71 0.97 0.97 PBMNC monocito 37.49 1.1 2.20 monocito Células B PC00665 28455 27.18 410.49 820.98 Células B células células dendrlticas 28441 33.7 9.73 19.46 dendrlticas neutrófllos 28440 32.48 19.6 19.60 neutrófllos eosinófilos 28446 32.44 20.08 40.16 eosinófilos BM no BM no estimulada 33.8 9.17 9.17 estimulada 1.OOE+01 32.93 10 1.00E+01 33.46 10 1.00E-00 38.18 1 1.00E-00 40 0 NTC 38.28 -1 *se ha omitido la muestra 26 de pulmón normal debido a fallas de amplificación múltiples de esa muestra Nombre del gen sbg1007026SGLT No. de veces en que se repitió la alteración Tejidos enfermos en la población enferma respecto a la población normal tumor de colon -2.88 tumor de colon 63.85 tumor de colon -2.T0 tumor de colon -4.42 tumor de pulmón -13.03 tumor de pulmón -1.16 tumor de pulmón - .99 tumor de pulmón 1.15 tumor de mama -1.47 tumor de mama 21.38 tumor de mama 5.82 tumor de mama -1.47 Cerebro con ALZ etapa 5 -12.84 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.55 Cerebro con ALZ etapa 5 -4.75 Cerebro con ALZ etapa 5 -2.51 24 de pulmón -5.45 28 de pulmón -31.99 23 de pulmón -31.99 pulmón asmático -2.45 pulmón asmático 3.59 pulmón asmático 8.07 pulmón asmático 4.23 VEGF endo 5.19 bFGF endo 2.91 T-1 de corazón 1.06 T-14 de corazón -1.69 T-3399 de corazón 2.43 BM estimulada -18.71 osteo diferenciado 1.26 Cartílago (reserva) -1.24 PBL con VIH IIIB -2.03 MRC5 con cepa F de HSV 1.86 Nombre del gen sbq 012732GLUT Expresión general de alta a moderada. Este gen es expresado principalmente en forma ubicua en todas las muestras normales analizadas con niveles de expresión más altos observados en cerebro intacto, cerebro fetal, cerebelo, riñón, hígado fetal y placenta. Este gen es también expresado principalmente en forma ubicua en las muestras enfermas. La subregulación en 3 de 3 muestras con COPD, sugiere una función potencial para este gen en trastorno pulmonar obstructivo crónico. La sobrerregulación en 3 de 3 muestras de corazón enfermo, implica una intervención en enfermedades cardiovasculares tales como DCM obstructiva y no obstructiva T isquemia. La subregulación en las células RC5 infectadas por HSV, sugiere que este gen puede desempeñar una función en HSV. Sobrerregulado en los osteoblastos diferenciados. La alta expresión en las muestras de sinovio con RA y OA, las muestras de hueso con OA y los condrocitos, con corroboración de alta expresión en células T, células B, células dendríticas, neutrófilos y eosinófilos, implica a este gen en osteoartritis y artritis reumatoide.
No. de Número veces en de Coplas de Coplas que se ARNm Muestra registro Intermerepitió la Ct Muestra sbg1012732GLUT (Identifi- dias de detecta- alteración cador de das/SO ng de GOl en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 25.38 1695.47 3390.94 colon normal tumor de colon GW98- 21940 25.51 1576.91 3153.82 tumor de colon -1.08 166 colon normal GW98-178 22080 26.8 765.5 1531.00 colon normal tumor de colon GW98- 22060 25.86 1297.34 2594.68 tumor de colon 1.69 177 colon normal GW98-561 23514 26.12 1120.64 2241.28 colon normal tumor de colon GW98- 23513 26.12 1121.89 2243.78 tumor de colon 1.00 5T0 colon normal GW9B-894 24691 24.85 2283.56 4567.12 colon normal tumor de colon GW98- 24690 24.37 2989.5 5979.00 tumor de colon 1.31 893 pulmón normal GW98-3 20742 24.37 2984.11 5968.22 pulmón normal tumor de pulmón GW98- 20741 25.38 1691.06 3382.12 tumor de -1.76 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 25.07 2020.52 4041.04 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- 20676 24.61 2607.03 5214.06 tumor de 1.29 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 24.92 2195.85 4391.70 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- 21921 25.36 1712.62 3425.24 tumor de -1.28 1T4 pulmón pulmón normal GW98- 22584 26.24 1049.97 209T.94 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- 22583 25.94 1241.B 2483.60 tumor de 1.18 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 25.26 1813.7 1813.70 mama normal tumor de mama GW00- 28746 24.87 2259.54 4519.08 tumor de 2.49 391 mama mama normal GWOO-413 28798 25.4 1672.46 1672.46 mama normal tumor de mama GWO0- 28797 25.21 1864.18 3728.36 tumor de 2.23 412 mama mama normal GW00- 27592-95 25.68 1435.2 1435.20 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- 27588-91 24.08 3510.78 3510.78 tumor de 2.45 231 :234 mama mama normal GW98-621 23656 24.16 3363.26 6726.52 mama normal tumor de mama GW98- 23655 24.19 3300.23 6600.46 tumor de -1.02 620 mama cerebro normal BB99- 25507 22.64 7880.57 15761.14 cerebro 542 normal cerebro normal BB99- 25509 23.32 5357.05 10714.10 cerebro 406 normal cerebro normal BB99- 25546 23.66 4436.27 8872.54 cerebro 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 25502 24.7 2474.23 4948.46 Cerebro con -2.38 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 23.22 5674.88 11349.76 -1.04 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 23.5 4868.6 9737.20 -1.21 ??TT-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 23.17 5843.2 11686.40 -1.01 BB99-927 ALZ etapa 5 pulmón normal Pulmón CT normal 25.61 1486.99 2973.98 CT 26 de pulmón 26 de pulmón normal 26.55 879.91 normal 27 de pulmón 27 de pulmón normal 29.44 174.3 174.30 normal 24 de pulmón 24 de pulmón COPD 29.99 128.5 128.50 -8.67 con COPD 28 de pulmón 28 de pulmón COPD 29.56 163.34 163.34 -6.82 con COPD 23 de pulmón 23 de pulmón COPD 29.59 160.67 160.67 -6.94 con COPD 25 de pulmón 25 de pulmón normal 29.24 194.83 194.83 normal pulmón asmático pulmón 29321 27.22 604.38 604.38 -1.84 OD03112 asmático pulmón asmático pulmón 29323 26.46 923.43 1846.86 1.66 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 26.16 1094.36 2188.72 1.96 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 25.51 1576.72 3153.44 2.83 OD04928 asmático células células endotellales control 29.09 211.78 211.78 endotellales VEGF ando 30.07 122.67 122.67 VEGF endo -1.73 bFGF endo 29.93 132.63 132.63 bFGF endo -1.60 corazón Clontech normal 27.35 561.26 1122.52 corazón T-1 de T-1 de corazón 29417 23.82 4053.65 8107.30 corazón 7.22 isquémico isquémico T-14 de T-14 de corazón con corazón con 29422 23.96 3746.25 7492.50 6.67 DCM no obstructiva DCM no obstructiva T-3399 de ?-339T de corazón con 29426 23.35 5282.35 10564.70 corazón con 9.41 DCM DCM adenoides GW99-269 2T162 25.71 1405.41 2810.82 adenoides amígdala GW98-280 22582 23.97 3725.77 7451.54 amígdala Células T PC00314 28453 25.03 2062.68 4125.36 Células T PBMNC 30.16 116.69 116.69 PBMNC monocito 30.15 117.05 234.10 monocito Células B PC00665 28455 23.22 5673.63 11347.26 Células B células células dendriticas 28441 25.74 1385.65 2771.30 dendriticas neutrófllos 28440 27.14 631.86 631.86 neutrófllos eosinófilos 2844T 28.27 335.66 671.32 eosinófilos BM no estimulada 30.08 122.25 122.25 BM no estimulada 1.00E-00 39.07 1 1.OOE-00 36.71 1 NTC 39,63 -1 *se ha omitido la muestra 26 de pulmón normal debido a fallas de amplificación múltiples de esa muestra Nombre del gen sbq1012732GLUT No. de veces en que se repitió la alteración en la Telidoe enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon -1.08 tumor de colon 1.69 tumor de colon 1.00 tumor de colon 1.31 tumor de pulmón -1.76 tumor de pulmón 1.29 tumor de pulmón -1.28 tumor de pulmón 1.18 tumor de mama 2.49 tumor de mama 2,23 tumor de mama 2.45 tumor de mama -1.02 Cerebro con ALZ etapa 5 -2.38 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.04 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.21 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.01 24 de pulmón -8.67 28 de pulmón -6.82 23 de pulmón -6.94 pulmón asmático -1.84 pulmón asmático 1 ,66 pulmón asmático 1.96 pulmón asmático 2.83 VEGF endo -1.73 bFGF endo -1 ,60 T-1 de corazón 7.22 T-14 de corazón 6.67 T-3399 de corazón 9.41 B estimulada 1.33 osteo diferenciado 2.91 Cartílago (reserva) -2,57 PBL con VIH IIIB -1.17 MRC5 con cepa F de HSV -15.40 Nombre del gen sbg1012732GLUTb Igual que sbg1012732GLUT.
Nombre del gen sbg1018172CSP Expresión general de moderada a baja. La expresión normal más alta se observa en cerebro intacto, riñón, tiroides y útero. Este gen es expresado en todas las muestras que representan el sistema reproductor femenino. La expresión de enfermedad más alta se observa en muchas de las muestras de pulmón normal y tumor de pulmón y las muestras de pulmón asmático. La subregulación en 2 de 4 muestras de tumor de pulmón, y la sobrerregulación en 2 de 4 muestras de tumor de mama, sugiere una intervención en cánceres de pulmón y mama. La subregulación en 3 de 3 muestras con COPD, sugiere una función potencial para este gen en trastorno pulmonar obstructivo crónico. La sobrerregulación en 2 de 4 muestras de pulmón asmático, implica una intervención en asma. La sobrerregulación en 1 de 3 muestras de corazón enfermo, implica una intervención en enfermedad cardiovascular tal como DCM obstructiva. La subregulación en la reserva de cartílago con OA, con corroboración de baja expresión en las células inmunes (células T y B en particular), implica a este gen en osteoartritis y artritis reumatoide. La sobrerregulación en las células MRC5 infectadas por HSV, sugiere que este gen puede ser un factor de hospedero en HSV.
Glándula parótida 34.26, 15.73 17,96 16.85 5.48 9.12 153.70 34.03 Placenta Clontech 32.64, 39.34 29.26 34.30 5.26 9.51 326.05 33.16 Próstata 35.71 , 40 6.95 0 3.48 3,00 16.67 57,92 Recto 33.84, 19.99 14,41 17.20 1 .23 40.65 699,19 34.42 Glándula salival 40, 40 0 0 0.00 7.31 6.84 0.00 Clontech Músculo 34.2, 40 16.33 0 8.17 1 .26 39.68 324.01 esquelético Clontech Piel 35.02, 40 10.31 0.48 5.40 1 .21 41 ,32 222.93 Intestino delgado 40, 40 0 0 0.29 0.98 51 ,07 14.81 Clontech Bazo 40, 35.31 0 8.71 4.36 4.92 10.16 44,26 Estómago 40, 35.4 0 8.3 4.15 2.73 18.32 76.01 Testículo Clontech 40, 37.31 0 2.82 1.41 0.57 87.87 123.90 Timo Clontech 30.9, 31.1 104.45 93.52 98.99 9.89 5,06 500.43 Tiroides 31 .62, 69.89 71 .93 70.91 2.77 18.05 1279.96 31 .57 Tráquea Clontech 34.19. 16.41 17.49 16.95 9.71 5.15 87.28 34.08 Vejiga urinaria 40, 34.4 0 14.55 7.28 5.47 9.14 66,50 Utero 30.63, 30.6 122.13 123.57 122.85 5.34 9.36 1150.28 genómica 26.58 1190.6 actina b 27.38 758.43 1 .00E+05 19.07 00000 1.00E+05 19.35 100000 1 .OOE+04 22.57 10000 1 .OOE+04 22.59 10000 1.00E+O3 26,24 1000 1 .OOE+03 26.31 1000 1 .OOE+02 30.18 100 1.OOE+02 31.64 100 1 .00E+01 35.9 10 1.00E+01 40 0 1 .OOE-00 40 0 1 .OOE-00 40 0 NTC 40 0 NTC 40 0 No. de Número veces en Coplas de de Coplas que se ARNm Muestra registro Intermerepitió la Ct detectaMuestra sbg1018172CSP (Identlfl- dias de alteración das/50 ng de cador de GOl en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 27.29 1064.89 2129.78 colon normal tumor de colon GW98- 21940 26.18 2023.1 1 4046.22 tumor de colon 1.90 166 colon normal GW98-178 22080 30.45 168.68 337.36 colon normal tumor de colon GW98- 22060 29.33 324.49 648 98 tumor de colon 1.92 177 colon normal GW98-561 23514 30.36 177.62 355.24 colon normal tumor de colon GW98- 23513 32.27 58.7 117.40 tumor de colon -3.03 560 colon normal GW98-894 24691 30.71 145.57 291.14 colon normal tumor de colon GW98- 24690 32.3 57.43 114.86 tumor de colon -2.53 893 pulmón normal GW98-3 20742 24.82 4478.67 8957.34 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 33.61 26.86 53.72 -166.74 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 26.31 1874.25 3748.50 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 24.52 5311 ,72 10623.44 2.83 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 24.99 4042.28 8084.56 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 27.19 1127.26 2254.52 -3.59 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 25.51 2990.53 5981.06 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 26.67 1522.51 3045.02 -1.96 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 32.25 59.17 59.17 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28746 30.48 165.82 331.64 5.60 391 mama mama normal GWOO-413 28798 34.58 15.31 15.31 mama normal tumor de mama GW0O- tumor de 28797 30.05 213.4 426.80 27.88 412 mama mama normal GW0O- 27592-95 34.41 16.85 16.85 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de 27588-91 33.52 28.31 28.31 1.68 231 :234 mama mama normal GW98-621 23656 28.22 618.19 123T.38 mama normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 32.02 67.94 135.88 -9.10 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 29.11 367.88 735.76 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 28.05 682.39 1364.78 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 29.06 379.07 758.14 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 30.06 211.81 423.62 -2.25 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25503 26.97 1280.13 Cerebro con ??9T-887 2560.26 2.69 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25504 29.85 239.03 478.06 Cerebro con -1.99 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 25542 28.13 652.56 1305.12 Cerebro con 1.37 BB99-927 ALZ etapa 5 Pulmón CT normal 26.97 1280.81 2561 ,62 pulmón normal CT normal 26 de pulmón normal 32.21 60,75 26 de pulmón normal 27 de pulmón normal 34 21.39 21.39 27 de pulmón normal 24 de pulmón COPD 32.11 64.1 1 64.1 1 24 de pulmón -13.87 con COPD 28 de pulmón COPD 33.01 38.18 38.18 28 de pulmón -23.29 con COPD 23 de pulmón COPD 32.84 42.15 42.15 23 de pulmón -21.10 con COPD 25 de pulmón normal 31.63 84.78 84.78 25 de pulmón normal pulmón asmático 29321 29.4 310.75 310.75 pulmón -2.86 OD031 12 asmático pulmón asmático 29323 27.02 1242.79 2485.58 pulmón 2.80 OD03433 asmático pulmón asmático 29322 25.97 2289.74 4579.48 pulmón 5.15 OD03397 asmático pulmón asmático 29325 26.84 1380.5 2761.00 pulmón 3.10 OD04928 asmático células endoteliales control 40 0 0.00 células endoteliales VEGF endo 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo 40 1.01 1.01 bFGF endo 1.01 corazón Clontech normal 33.02 37.93 75.86 corazón T-1 de corazón 29417 34.34 17.51 35.02 T-1 de -2.17 isquémico corazón isquémico T-14 de corazón con 29422 34.85 13.07 26,14 T- 4 de -2.90 DCM no obstructiva corazón con DCM no obstructiva T-3399 de corazón con 29426 29.74 254.69 509.38 T-3399 de 6.71 DCM corazón con DCM adenoides GW99-269 26162 35.07 11.5 23.00 adenoides amígdala GW98-280 22582 40 0 0.00 amígdala Células T PC00314 28453 36.12 6.22 12.44 Células T PBMNC 40 0 0.00 PBMNC monocito 40 0 0.00 monocito Células B PC00665 28455 40 0 0,00 Células B células dendríticas 28441 40 0 0.00 células dendríticas neutrófilos 28440 35.43 9.3 9.30 neutrófilos eosinófilos 28446 40 1.32 2.64 eosinófilos BM no estimulada 40 0 0.00 BM no estimulada 1.OOE+01 40 10 1.00E-00 40 0 1.OOE-00 40 0 NTC 40 0 *se ha omitido la muestra 26 de pulmón normal debido a fallas de amplificación múltiples de esa muestra Nombre del gen sba1018172CSP No. de veces en que se repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal tumor de colon 1.90 tumor de colon 1.92 tumor de colon -3.03 tumor de colon -2.53 tumor de pulmón -166.74 tumor de pulmón 2.83 tumor de pulmón -3.59 tumor de pulmón -1 .96 tumor de mama 5.60 tumor de mama 27.88 tumor de mama 1.68 tumor de mama -9.10 Cerebro con ALZ etapa 5 -2.25 Cerebro con ALZ etapa 5 2.69 Cerebro con ALZ etapa 5 -1.99 Cerebro con ALZ etapa 5 1.37 24 de pulmón -13.87 28 de pulmón -23.29 23 de pulmón -21.10 pulmón asmático -2.8T pulmón asmático 2.80 pulmón asmático 5.15 pulmón asmático 3.10 VEGF endo 0.00 bFGF endo 1.01 T-1 de corazón -2.17 T-14 de corazón -2.90 T-3399 de corazón 6.71 BM estimulada 0.00 osteo diferenciado 0.00 Cartilaqo (reserva) -45.96 P8L con VIH IIIB -2.74 MRC5 con cepa F de HSV 423.76 Nombre del gen sba1004570ERGIC Expresión general de moderada a baja. Este gen es expresado principalmente en forma ubicua en todas las muestras normales analizadas, con los niveles de expresión más altos observados en cerebro intacto, hipotálamo, páncreas y cabeza del páncreas. Este patrón de expresión sugiere que este gen puede estar involucrado en diabetes y otras enfermedades metabólicas. La expresión de enfermedad más alta se observa en colon, mama, y los pares de tumor de pulmón y pulmón normal, así como también las muestras de cerebro con enfermedad de Alzheimer, y las células T, células B, células dendríticas y eosinófilos. La sobrerregulación en 2 de 4 muestras de tumor de mama, sugiere una función para este gen en cáncer de mama. La sobrerregulación en 2 de 4 muestras de cerebro con enfermedad de Alzheimer, implica una intervención en enfermedad de Alzheimer. La subregulación en 3 de 3 muestras con COPD, y 4 de 4 muestras de pulmón asmático, sugiere una función potencial para este gen en trastorno pulmonar obstructivo crónico y asma. Sobrerregulado en la muestra de médula ósea estimulada.
Timo Clontech 32.15, 31.72 1 1.16 14.98 13.07 9.89 5 06 66.08 Tiroides 35.61 , 35.09 1.05 1.49 1.27 2.77 18.05 22.92 Tráquea Clontech 35.04, 34 ,75 1.55 1 .89 1 ,72 9.71 5.15 8.86 Vejiga urinaria 36,11 , 36.24 0.74 0.68 0.71 5.47 9.14 6.49 Utero 35.59, 35.68 1.06 1 1.03 5.34 9.36 9.64 genómlca 24.29 2416.83 actina b 26.09 706.6 1.00E+05 20.09 100000 1.00E+05 19.53 100000 1.00?+04 21.72 10000 1.00E+04 21.68 10000 1.00E+03 24.13 1000 1.00E+03 24.18 1000 1.00E+02 29. 3 100 1.00E+02 30.16 100 1.00E+01 31.7 10 1.00E+01 33. 6 10 1.00E-00 36.93 1 1.00E-00 34.75 1 NTC 36 -1 NTC 35.85 -1 No. de Número veces en Coplas de de Coplas que se ARNm Muestra registro intermerepitió la Ct detectaMuestra sbg1004570ERGIC (Identlfl- dias de alteración das/50 ng de cador de GOl en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 30.51 38.25 76.50 colon normal tumor de colon GW98- 21940 31.28 23.13 46,26 tumor de colon -1.65 166 colon normal GW98-178 22080 31.79 16.57 33.14 colon normal tumor de colon GW98- 22060 31.3 22.86 45.72 tumor de colon 1.38 177 colon normal GW98-561 23514 30.71 33.5 67.00 colon normal tumor de colon GW98- 23513 31.18 24.73 49.46 tumor de colon -1.35 560 colon normal GW98-894 24691 30.16 48.2 96.40 colon normal tumor de colon GW98- 24690 29.96 55 110.00 tumor de colon 1.14 893 pulmón normal GW98-3 20742 30.1 50.19 100.38 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 32.86 8.15 16.30 -6.16 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 31.65 18.14 36.28 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 31.05 26.89 53.78 1.48 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 30.44 40.16 80.32 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 30.72 33.36 66.72 -1.20 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 31.83 16.13 32.26 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 32.09 13.61 27.22 -1.19 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 32.76 8.73 8.73 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28746 30.68 34.38 68.76 7.88 391 mama mama normal GW00-413 28798 37.11 0.5 0.50 mama normal tumor de mama GW0O- tumor de 28797 30.8 31.72 63.44 126.88 412 mama mama normal GW0O- 27592-95 38.8 0.17 0.17 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de 231 :234 27588-91 37.36 0.43 0.43 2.53 mama mama normal GW98-621 23656 31.67 17.86 35.72 mama normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 32.59 9.8 19.60 -1.82 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 33.66 4.83 9.66 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 33.24 6.37 12.74 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 33.2 6.54 13.08 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 33.1 6.97 13.94 1.18 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 30.93 29.17 58.34 4.93 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 31.44 20.73 41.46 3.51 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 32.93 7,83 15.66 1.32 BB99-927 ALZ etapa 5 pulmón normal Pulmón CT normal 32.62 9.6 19.20 CT 26 de pulmón 26 de pulmón normal normal 27 de pulmón 27 de pulmón normal 40 0 0.00 normal 24 de pulmón 24 de pulmón COPD 39.15 0.13 0.13 ¦49.46 con COPD 28 de pulmón 28 de pulmón COPD 40 0.08 0.08 -80.38 con COPD 23 de pulmón 23 de pulmón COPD 38.59 0.19 0.19 -33.84 con COPD 25 de pulmón 25 de pulmón normal 40 0.09 0.09 normal pulmón asmático pulmón 29321 40 0 0.00 -6.43 OD031 12 asmático pulmón asmático pulmón 29323 38.47 0.2 0.40 -16.08 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 38.01 0.28 0.56 -11.48 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 38.13 0.26 0.52 -12.37 OD04928 asmático células endoteliales control 36.24 0.89 0.89 células endoteliales VEGF endo 39.8 0.09 0,09 VEGF endo -9.89 bFGF endo 37.19 0.47 0.47 bFGF endo -1 ,89 corazón Clontech normal 35.52 1.43 2,86 corazón T-1 de corazón T-1 de 29417 33.79 4.43 Isquémico 8,86 corazón 3.10 isquémico T-14 de T-14 de corazón con corazón con 29422 34.81 DCM no obstructiva 2.27 4.54 DCM no 1.59 obstructiva ?-339T de corazón con T-3399 de 29426 34.11 3.59 DCM 7.18 corazón con 2.51 DCM adenoides GW99-269 26162 34,97 2.05 4.10 adenoides amígdala GW98-280 22582 33.05 7.23 14.46 amígdala Células T PC00314 28453 31.09 26.2 52.40 Células T PBMNC 38.01 0.28 0.28 PBMNC monoclto 36.29 0.86 1.72 monocito Células B PC00665 28455 32.13 13.23 26.46 Células B células dendrltlcas 28441 31.94 14.96 29.92 células dendríticas neutrófllos 28440 34.08 3.66 3.66 neutrófllos eoslnófllos 28446 32,23 12,37 24.74 eoslnófiloa BM no BM no estimulada 39.73 0,09 0.09 estimulada BM estimulada tratado 37.03 0.53 0.53 BM estimulada 5.89 osteo osteo diferenciado tratado 36.8 0.61 0.61 0,61 diferenciado osteo osteo indiferenciado 40 0 0.00 Indiferenciado condrocltos 31.85 15.9 39,75 condrocltos Sinovio con Sinovio con OA IP1201 29462 38.61 0.19 0.19 OA Sinovio con Sinovio con OA NP10701 29461 33.11 6.96 13.92 OA Sinovio con Slnovio con OA NP57/00 28464 33,81 4.39 8.78 OA Slnovio con Sinovio con RA NP03/01 28466 33.11 6,96 13.92 RA Sinovio con Sinovio con RA NP71/00 284T7 32.03 14.14 28.28 RA Sinovio con Sinovio con RA NP45/00 28475 32.47 10.55 21.10 RA Hueso con OA Hueso con OA (biobank) 292 7 35.25 1 ,7 1.70 (biobank) Muestra 1 de hueso con J. Emory 34.54 2.72 5.44 Hueso con OA OA Muestra 2 de hueso con J. Emory 36.28 0.87 1.74 Hueso con OA OA Cartílago Cartílago (reserva) Normal 35.24 1.71 3.42 normal (reserva) Nombre del gen sbq1 Q04570ERGIC Nombre del gen sbg1016995IGBrecpt Expresión general de moderada a baja. La expresión normal más alta se observa en cerebro intacto y pulmón, con niveles de expresión ligeramente menores en endometrio, íleo, recto y piel. El alto nivel de expresión en la piel, puede sugerir una función posible para este gen en psoriasis y lupus. Los patrones de expresión en las muestras de la placa con enfermedad, indican que este gen es altamente específico de adenoides y amígdala. La subregulación en 2 de 4 muestras de tumor de pulmón, y la sobrerregulación en 2 de 4 muestras de tumor de mama, sugieren una intervención en cánceres de pulmón y mama. La subregulación en 3 de 3 muestras con COPD, sugiere una función potencial para este gen en trastorno pulmonar obstructivo crónico. Sobrerregulado en la muestra de médula ósea estimulada- Subregulado en el osteoblasto diferenciado. La sobrerregulación en los PBL infectados por VIH, sugiere que este gen puede ser un factor de hospedero en VIH.
Endometrio 35.51 , 40 6,73 0 3.37 0.73 68.21 229.54 Esófago 37.22, 38,18 2.5 1.45 1 ,98 1.37 36.50 72.08 Corazón Clontech 40, 40 0 0 0,00 1.32 37,88 0.00 Hipotálamo 40, 40 0 0 0.00 0.32 155.28 0.00 Ileo 34.65, 34.1 1 11.04 15.09 13.07 2.58 19.38 253.20 Yeyuno 34.84, 34.04 9.91 15.72 12.82 6.60 7.58 97.08 Riñón 38.2, 39.11 1.43 0,84 1.14 2,12 23.58 26.77 Hígado 34.47, 38.59 12.26 1 ,14 6.70 1.50 33,33 223.33 Hígado fetal Clontech 33.51 , 33.07 21.26 27.43 24.35 10.40 4.81 117.04 Pulmón 27.32, 37.11 755,31 2.68 379.00 2.57 9.46 7373.44 Glándula mamarla 36.31 , 36.4 4.24 4.03 4.14 13.00 3,85 15.90 Clontech lometrio 40, 38,7 0.7 1.07 0.89 2.34 21.37 18.91 Omento 35,44, 36,14 6.98 4.68 5,83 3.94 12.69 73.98 Ovario 38,76, 35,49 1.03 6.82 3,93 4,34 11.52 45.22 Páncreas 40, 38,56 0.48 1.16 0,82 0.81 61.80 50.68 Cabeza del páncreas 40, 40 0 0 0.00 1.57 31.85 0.00 Glándula parótida 36.8, 35.45 3.2 6.98 5.09 5.48 9,12 46.44 Placenta Clontech 35.63, 35.1 1 6,27 8.47 7.37 5.26 9,51 70.06 Próstata 37.4, 37.5 2.26 2.14 2.20 3.00 16.67 36.67 Recto 35.45, 35.25 6.94 7,81 7.38 1.23 40.65 299.80 Glándula salival 37.3, 37.06 2.4 2.75 2.58 7,31 6.84 17.61 Clontech Músculo esquelético 40, 39.34 0 0.74 0.37 1.26 39.68 14,68 Clontech Piel 38.84, 34.56 0.98 11.63 6.31 1.21 41.32 260.54 Intestino delgado 40, 40 0 0.63 0.32 0.98 51.07 16.09 Clontech Bazo 34.37, 34.89 13 9,6 11.30 4.92 10.16 114,84 Estómago 39.73, 35.52 0.59 6.67 3.63 2.73 18.32 66.48 Testículo Clontech 38.91 , 40 0.94 0 0.47 0,57 87.87 41.30 Timo Clontech 31.96, 32,96 52.16 29.2 40.68 9.89 5.06 205.66 Tiroides 35.53, 40 6,66 0 3.33 2.77 18.05 60.11 Tráquea Clontech 37.99, 37.69 1.61 1.91 1.76 9.71 5,15 9.06 Vejiga urinaria 39.69, 39.02 0.6 0.89 0,75 5,47 9.14 6.81 Utero 34.41 , 33.56 12.67 20.75 16.71 5.34 9.36 156,46 genómica 26.31 1359.1 actina b 27.2 812.88 1 0?+05 19,24 100000 1.00E+05 19.38 100000 1 00E+04 22.67 10000 1.00E+04 22.67 10000 1.00E+03 26.31 1000 1.00E+03 26.28 1000 1.00E+02 30.17 100 1.00E+02 31.02 100 1.00E+01 36.17 10 1 .OOE+01 34.46 10 1.OOE-00 40 0 1.OOE-00 40 1 NTC 40 -1 NTC 40 -1 Muestra Número Ct Copias Copias de Muestra No. de sbg1016995IGBrecpt de intermeA Nm veces en registro dias de detectaque se (Identlfl- GOI das/50 ng de repitió la cador de ARN total alteración GSK) en la población enferma colon normal GW98-167 21941 29.45 174.86 349.72 colon normal tumor de colon GW98- 21940 32.1 33.44 6T.88 tumor de colon -5.23 166 colon normal GW98-178 22080 31.77 41.07 82.14 colon normal tumor de colon GW98- 22060 32.66 23.5 47.00 tumor de colon -1.75 177 colon normal GW98-561 23514 29.15 211.24 422.48 colon normal tumor de colon GW98- 23513 31.25 56.95 1 13.90 tumor de colon -3.71 560 colon normal GW98-894 24691 30.68 81.3 162.60 colon normal tumor de colon GW98- 24690 31.33 54.12 108.24 tumor de colon -1.50 893 pulmón normal GW98-3 20742 31.86 38.92 77.84 pulmón normal tumor de pulmón GW98- 20741 34.55 7.25 14.50 tumor de -5.37 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 28.38 342.07 684.14 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- 20676 32.1 33.52 67.04 tumor de -10.20 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 32.2 31.46 62.92 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- 21921 30.5 90.8 181.60 tumor de 2.89 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 29.82 138.8 277.60 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- 22583 32.72 22.64 45.28 tumor de -6.13 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 31.5 48.65 48.65 mama normal tumor de mama GW0O- 28746 31.9 37.84 75.68 tumor de 1.5T 391 mama mama normal GW00-413 28798 34.37 8.07 8.07 mama normal tumor de mama GW00- 28797 29.97 126.73 253.46 tumor de 31 .41 412 mama mama normal GW0O- 27592-95 35.08 5.2 5.20 mama normal 235:238 tumor de mama GW0O- 27588-91 32.3 29.54 29.54 tumor de 5.68 231 :234 mama mama normal GW98-621 23656 31.1 1 61.96 123.92 mama nomial tumor de mama GW98- tumor de 23655 31.27 56.22 1 12.44 -1.10 620 mama cerebro normal ??9T- cerebro 25507 33.3 15.82 31.64 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 33.02 18,83 37.66 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 33.93 10.62 21.24 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 32.36 28.38 56.76 1 ,88 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 31.79 40.66 81.32 2.69 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 32,04 34.76 69.52 2.30 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 31.79 40.51 81.02 2,68 BB99-927 ALZ etapa 5 pulmón normal Pulmón CT normal 33.32 15.63 31.26 CT 26 de pulmón 26 de pulmón normal 29.8 140.4 normal 27 de pulmón 27 de pulmón normal 38.71 0.54 0,54 normal 24 de pulmón 24 de pulmón COPD 39.31 0.37 0.37 -29.00 con COPD 28 de pulmón 28 de pulmón COPD 37.09 1.48 1 .48 -7.25 con COPD 23 de pulmón 23 de pulmón COPD 38.02 0.83 0.83 -12.93 con COPD 25 de pulmón 25 de pulmón normal 39.22 0.39 0.39 normal pulmón asmático pulmón 29321 37.96 0.86 0.86 -12.48 OD031 12 asmático pulmón asmático pulmón 29323 31.15 60.54 121.08 11.28 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 33.74 12.01 24.02 2.24 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 31 ,59 46.09 92.18 8.59 OD04928 asmático células células endotellales control 36.98 1.58 1 ,58 endotellales VEGF endo 39.28 0.38 0.38 VEGF endo -4.16 bFGF endo 37.3 1.3 1.30 bFGF endo -1.22 corazón Clontech normal 35,73 3.45 6.90 corazón T-1 de T-1 de corazón 29417 34.7 6.58 13.16 corazón 1.91 isquémico isquémico T-14 de T-14 de corazón con corazón con 29422 37.5 1.15 2.30 -3.00 DCM no obstructiva DCM no obstructiva T-3399 de T-3399 de corazón con 29426 35.15 4.96 9.92 corazón con 1.44 DCM DCM adenoides GW99-269 26162 25.98 1528.07 3056.14 adenoides amígdala G 98-280 22582 24.6 3626.43 7252.86 amígdala Células T PC00314 28453 34.49 7.5 15.00 Células T 1.00E+05 19.59 100000 1.00E+04 22.75 10000 1.00E+04 22.8 10000 1.00E+03 26.43 1000 1.00E+03 26.17 1000 1 ,???+02 30,09 100 1.00?+02 30.21 100 1.00?+01 35.27 10 1.00?+01 35.55 10 1.00?-00 39.31 1 1.00?-00 34.53 1 NTC 40 -1 *se ha omitido la muestra 26 de pulmói normal debido a fallas de amplificado! múltiples de esa muestra Nombre del gen sbq1016995IGBrecpt No. de veces en que se repitió la alteración en la Tejidos enfermos población enferma respecto a la población normal Tumor de colon -5.23 Tumor de colon -1.75 Tumor de colon -3.71 Tumor de colon -1.50 Tumor de pulmón -5.37 Tumor de pulmón -10.20 Tumor de pulmón 2,89 Tumor de pulmón -6.13 Tumor de mama 1 ,56 Tumor de mama 31.41 Tumor de mama 5.68 Tumor de mama -1.10 Cerebro con ALZ etapa 5 1.88 Cerebro con ALZ etapa 5 2.69 Cerebro con ALZ etapa 5 2.30 Cerebro con ALZ etapa 5 2.68 24 de pulmón -29.00 28 de pulmón -7.25 23 de pulmón -12.93 pulmón asmático -12,48 pulmón asmático 11.28 pulmón asmático 2.24 pulmón asmático 8.59 VEGF endo -4, 16 bFGF endo -1.22 T-1 de corazón 1.91 T-14 de corazón -3.00 T-3399 de corazón 1.44 BM estimulada 11.48 osteo diferenciado -5,78 Cartílago (reserva) -3.00 PBL con VIH IIIB 3.17 RC5 con cepa F de HSV 2.30 Nombre del gen sbg1151 bSREC Expresión general más alta en muestras normales y enfermas. Expresado principalmente en forma ubicua, pero expresión normal más alta en adipocitos, tejido adiposo, cerebro intacto, cerebro fetal y endometrio. Expresión de enfermedad más alta en una de las muestras de tumor de colon, una de las muestras de pulmón normal, condrocitos y las MRC5 no infectadas. No existen cambios significativos en cerebros de pacientes con enfermedad de Alzheimer. La subregulación en 1 de 4 tumores de pulmón, sugiere implicación posible en cáncer de pulmón. La sobrerregulación en 1 de 4 muestras de tumor de mama, es suficiente para reclamar una función en cáncer de mama. La sobrerregulación en 1 de 4 pulmones asmáticos, implica una función en asma. La subregulación en HSV, implica intervención en virus de herpes simple como factor de hospedero potencial. Alta expresión en células inmunes. La alta expresión en muestras de hueso y cartílago de pacientes con OA, así como también la alta expresión en condrocitos, indican intervención posible en osteoartritis y artritis reumatoide. Además, la corroboración de expresión en células inmunes (en particular células B y T), provee más evidencia para una función en RA/OA. 50 Copias Coplas Coplas de Muestra Ct Copias ARNr ng/AR intorme-dlas ARNm interme-dlas sbg1151 bSREC (muestras 1 promedio 18S Nr de GOI de GOI detectadas/ y 2) de GOI (muestra 1) (muestra 2) (ng) 18S 50 ng de ("9) ARN total Adipocitos subcutáneos 28.31 , 28.35 477.04 466.02 471.53 3.06 16.34 7704.74 Zenbio Tejido adiposo subcutáneo 30.79, 30.22 122.3 166.95 144.63 0.96 52.36 7571.99 Zenbio Glándula suprarrenal 33.96, 33.47 21.39 27,97 24,68 0.61 81.97 2022.95 Clontech Cerebro intacto 24.07, 23.98 4889.28 5123.8 5006.54 7.24 6.91 Clontech 34575.55 Cerebro fetal 31.1 , 32.29 103.16 53.55 Clontech 78.36 0.48 103.95 8145.01 Cerebelo 31.03, 31.99 107.02 63.18 85.10 Clontech 2.17 23.04 1960.83 Cerviz 31.22, 30.06 96.6 182.64 139.62 2.42 20.66 2884.71 Colon 30.68, 30.53 129.52 140.99 135.26 2,71 18.45 2495,48 Endometrio 30.59, 30,44 136.06 147.8 141.93 0.73 68.21 9681.45 Esófago 33.11 , 32.17 34.08 57.32 45.70 1.37 36.50 1667,88 Corazón 33.19, 32.41 32.68 50.11 41.40 1.32 37.88 1567.99 Clontech Hlpotálamo 34.34, 40 17.4 0 8.70 0.32 155.28 1350,93 Ileo 31.29, 30.13 92.84 174.99 133.92 2.58 19,38 2595.25 Yeyuno 29.7, 29,48 221.9 251 ,05 236.48 e.eo 7.58 1791 ,48 Riñón 31.03, 30.17 107.15 171.45 139.30 2.12 23.58 3285.38 Hígado 32,89, 33.16 38,61 33.17 35,89 1.50 33.33 1196.33 Hígado fetal 28.05, 28.15 550,64 518.95 534.80 10.40 4.81 2571.13 Clontech Pulmón 29.39, 28.63 263.85 398.99 331.42 2.57 19.46 6447.86 Glándula mamaria 27.56, 27.39 717.67 789.94 753.81 13.00 3.85 2899.25 Clontech Mlometrio 29.08, 28,93 312.86 339.46 326.16 2.34 21.37 6969.23 Omento 30,72, 29.32 126.7 273.04 199.87 3,94 12.69 2536,42 Ovario 28.89, 28.68 346,91 388.02 367,47 4.34 11.52 4233.47 Páncreas 35.24, 35,75 10.59 8.02 9.31 0.81 61 ,80 575.09 Cabeza del 35.25, 33,21 10.57 32.34 21.46 1.57 31.85 683.28 páncreas Glándula 28.46, 27.84 438.62 615.36 526.99 5.48 9.12 4808.30 parótida Placenta 28.67, 28.66 Clontech 39 9 393.15 392.53 5.26 9,51 3731.23 30.55, Próstata 139.05 84.64 1 1 1.85 3.00 16.67 1864.08 31.46 31 .28, Recto 93.33 85.92 89.63 1.23 31 .43 40.65 3643.29 Glándula salival 31 .13. 101.46 138.16 1 19,81 7.31 6.84 819.49 Clontech 30.57 Músculo esquelético 34.05, 20.38 10.59 15.49 1.26 39,68 614.48 Clontech 35.24 Piel 31.53, 31.2 81.49 97.36 89.43 1 .21 41.32 3695,25 Intestino delgado 34.81 , 13.41 23.18 18.30 0.98 51.07 934.37 Clontech 33.82 31.01. Bazo 108.41 147.9 128.16 4.92 10.16 1302.39 30.44 Estómago 32.01 , 31.1 62.6 102.97 82.79 2.73 18,32 1516.21 31.74, Testículo Clontech 72.49 53.45 62.97 0.57 87.87 5533.39 32.29 28.84, Timo Clontech 356,64 421.44 389.04 9.89 5.06 1966.84 28.53 30.12, Tiroides 176.76 184.5 180.63 2.77 18.05 3260.47 30.04 28.48, Tráquea Clontech 434.3 459.42 446.86 9.71 5.15 2301 .03 28.38 29.63, Vejiga urinaria 230.25 241.15 235.70 5.47 9.14 2154.48 29.55 28.69, Utero 387,47 461.07 424.27 5.34 9.36 3972.57 28.37 genómlca 26.24 1487.44 actlna b 27.28 839.2 1.00E+05 18.96 100000 1.00E+05 19.34 100000 1.00E+04 22.64 10000 1.00E+04 22.84 10000 1.00E+03 26.22 1000 1.00E+03 26.04 1000 1.00E+02 31.04 00 1.00E+02 30.1 100 1.00E+01 33.33 10 1.00E+01 39.08 10 1.00E-00 40 0 1.00E-00 40 1 NTC 40 0 NTC 40 0 Muestra Número Ct Coplas Coplas de Muestra No. de sbg1151 bSREC de intermeARNm veces en registro dias do detectaque se (Identifl- GOl das/50 ng de repitió la cador de ARN total alteración GSK) en la población enferma colon normal GW98-167 21941 24.55 5357.25 10714.50 colon normal tumor de colon GW98- 21940 22.61 19769.94 39539,88 tumor de colon 3.69 166 colon normal GW98-178 22080 26.71 1252.3 2504.60 colon normal tumor de colon GW98- 22060 26.13 1854,49 3708.98 tumor de colon 1 ,48 177 colon normal GW98-561 23514 26.82 1 165.06 2330.12 colon normal tumor de colon GW98- 23513 25.75 2390.26 4780.52 tumor de colon 2.05 560 colon normal GW98-894 24691 26.06 1948.57 3897.14 colon normal tumor de colon GW98- 24690 26.59 1362.55 2725.10 tumor de colon -1 ,43 893 pulmón normal GW98-3 20742 22.77 17753 35506.00 pulmón normal tumor de pulmón GW98- 20741 26.17 1803.8 3607.60 tumor de -9.84 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 25.24 3370.88 6741 ,76 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- 20676 24.14 7057.92 14115,84 tumor de 2,09 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 23.87 8442.49 16884.98 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- 21921 24.08 7339.83 14679.66 tumor de -1.15 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 25.51 2804.42 5608.84 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- 22583 24.2 6787,31 13574.62 tumor de 2.42 281 pulmón mama normal GWOO-392 28750 25.7 2480.5 2480.50 mama normal tumor de mama GW00- 28746 25.77 2364,2 4728.40 tumor de 1.91 391 mama mama normal GWOO- 13 28798 26.06 1948.1 1948.10 mama normal tumor de mama GW00- 28797 27.21 894, 11 1788.22 tumor de -1.09 412 mama mama normal GWOO- 27592-95 26.64 1317.83 1317.83 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- 27588-91 23.91 8225.11 8225,1 1 tumor de 6.24 231 :234 mama mama normal GW98-621 23656 24.46 5693,73 1 1387.46 mama normal tumor de mama GW98- 23655 23.91 8218.73 16437.46 tumor de 1.44 620 mama cerebro normal BB99- 25507 26.39 1553.13 3106.26 Cerebro 542 normal cerebro normal BB99- 25509 26.63 1325.63 2651 ,26 Cerebro 406 normal cerebro normal BB99- 25546 27.05 1001.6 2003.20 Cerebro 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 25502 26.97 1052.15 2104.30 Cerebro con -1.23 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 25.28 3289.99 6579.98 2.54 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 26.24 1725.06 3450.12 BB99-862 1.33 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 26.12 1864.26 3728.52 1.44 BB99-927 ALZ etapa 5 KC de pulmón CT normal 24.74 471 1.99 9423,98 Pulmón CT KC 26 de pulmón normal 27.78 611.36 61 1.36 26 de pulmón KC 27 de pulmón normal 28.27 439.19 439.19 27 de pulmón KC 24 de pulmón COPD 26.92 1091.1 1 1091.1 1 24 de pulmón -2,56 KC 28 de pulmón COPD 26.93 1085.65 1085.65 28 de pulmón -2.57 KC 23 de pulmón COPD 27.19 909.68 909.68 23 de pulmón -3.07 KC 25 de pulmón normal 27.62 678.79 678.79 25 de pulmón pulmón asmático Pulmón 29321 25.33 3173.52 3173.52 1.14 OD031 12 asmático pulmón asmático Pulmón 29323 25.36 3106.89 6213,78 2.23 OD03433 asmático pulmón asmático Pulmón 29322 23.81 8809.42 17618.84 6.32 OD03397 asmático pulmón asmático Pulmón 29325 24.76 4649.98 9299,96 3,34 OD04928 asmático células células endoteliales KC control 26 2021.13 2021.13 endoteliales VEGF endo KC 25.78 2343.21 2343,21 VEGF endo 1.16 bFGF endo KC 26.7 1264.03 1264.03 bFGF endo -1 ,60 corazón Clontech normal 26.62 1330.64 2661.28 corazón T-1 de corazón T-1 de 29417 27.07 984.33 1968.66 -1.35 isquémico corazón T-14 de corazón con T-14 de 29422 26.11 1877.75 3755.50 1.41 DCM no obstructiva corazón T-3399 de corazón con T-3399 de 29426 26.34 1608.79 3217,58 1.21 DCM corazón adenoides GW99-269 26162 27.T4 670.25 1340.50 adenoides amígdala GW98-280 22582 27,61 684.15 1368.30 amígdala Células T PC00314 28453 25.95 2098.64 4197.28 Células T PBMNC 31.16 63.19 63.19 PBMNC monocito 31.32 56.63 1 13.26 monocito Células B PC00665 28455 26.34 1609,52 3219.04 Células B células células dend iticas 28441 28.25 444.68 889.36 dendriticas neutrófilos 28440 26.1 1 1874.13 1874.13 neutrófilos eosinófilos 28446 2T.39 1553.82 3107.64 eosinófilos BM no BM no estimulada 31.45 51.76 51.76 estimulada BM estimulada 31.28 58,37 58.37 BM estimulada 1.13 osteo osteo diferenciado 24.62 5118.74 51 18.74 1.70 diferenciado osteo osteo indiferenciado 25.41 3015.6 3015.60 Indiferenciado Condrocitos 22.12 27351 ,89 68379.73 condrocitos Sinovio con Sinovio con OA IP12/01 29462 24.5 5551.61 5551.61 OA Nombre del gen sba1151 bSREC Nombre del gen sbq1399854ANK Expresión general baja. La expresión normal más alta se observa en cerebro intacto, cerebro fetal e hígado. Se observan buenos niveles de expresión en todas las muestras que representan el sistema reproductor femenino. La expresión de enfermedad más alta se observa en las muestras de cerebro normal y muestras de cerebro con enfermedad de Alzheimer, así como también en las células dendríticas. La sobrerregulación en 2 de 4 muestras de tumor de colon, y en 2 de 4 muestras de tumor de mama, así como también la subregulación en 2 de 4 muestras de tumor de pulmón, implican a este gen en cánceres de colon, mama y pulmón. La subregulación en 3 de 3 muestras con COPD, y 2 de 4 muestras de pulmón asmático, sugiere una función potencial para este gen en trastorno pulmonar obstructivo crónico y asma. La subregulación en la muestra de cartílago con OA, así como también la corroboración de baja expresión en los condrocitos normales y muchas de las células inmunes, sugieren intervención en osteoartritis. La sobrerregulación en las células MRC5 infectadas por HSV, sugiere que este gen puede ser un factor de hospedero en HSV.
Timo Clontech 38.47, 35.55 5,32 24.52 14.92 9.89 5.06 75.43 Tiroides 40, 40 0 2.15 1.08 2.77 18.05 19.40 Tráquea Clontech 35.37, 36.67 26.97 13.66 20.32 9.71 5.15 104.61 Vejiga urinaria 39,07, 40 3.89 1.42 2.66 5.47 9.14 24.27 Utero 36.01 , 33.41 19,29 75.06 47.18 5.34 9.36 441.71 genómica 29.57 558.84 actlna b 27.57 1592.66 1.00E+05 19.91 100000 1.00E+05 20,08 100000 1.OOE+04 23.79 10000 1.OOE+04 24.06 10000 1.00E+03 27.72 1000 1.00E+03 28.29 1000 1.00E+02 31 ,95 100 1.00E+02 33.62 100 1.00E+01 39.75 10 1.00E+01 35.41 10 1.00E-00 40 0 1.00E-00 40 0 NTC 40 -1 NTC 40 -1 No. de Número veces en Coplas de de Coplas que se ARNm Muestra registro Intermerepitió la Ct detectaMuestra tbg1399854ANK (Identlfl- dias de alteración das/50 ng de cador de COI en la ARN total GSK) población enferma colon normal GW98-167 21941 35.32 22.34 44.68 colon normal tumor de colon GW98- 21940 34.14 47.5 95,00 tumor de colon 2.13 166 colon normal GW98-178 22080 36.16 13.07 26.14 colon normal tumor de colon GW98- 22060 35.58 18.93 37.86 tumor de colon 1.45 177 colon normal GW98-561 23514 36.58 10.03 20.06 colon normal tumor de colon GW98- 23513 32,61 26,48 252.96 tumor de colon 12.61 560 colon normal GW98-894 24691 35.61 18.62 37.24 colon normal tumor de colon GW98- 24690 33.24 84.75 169.50 tumor de colon 4.55 893 pulmón normal GW98-3 20742 34.77 31.8 63.60 pulmón normal tumor de pulmón GW98- tumor de 20741 33.63 66.03 132.06 2.08 2 pulmón pulmón normal GW97- 20677 34.76 32.04 64.08 pulmón normal 179 tumor de pulmón GW97- tumor de 20676 34.44 39.23 78.46 1.22 178 pulmón pulmón normal GW98- 21922 35.18 24.44 48.88 pulmón normal 165 tumor de pulmón GW98- tumor de 21921 37.99 4.06 8.12 -6,02 164 pulmón pulmón normal GW98- 22584 33.64 65.37 130.74 pulmón normal 282 tumor de pulmón GW98- tumor de 22583 37.3 6.34 12.68 -10.31 281 pulmón mama normal GW00-392 28750 36.29 12.08 12.08 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28746 36.14 13.29 26.58 2.20 391 mama mama normal GW00- 13 28798 37.08 7,29 7.29 mama normal tumor de mama GW00- tumor de 28797 33.26 83.58 167.16 22.93 412 mama mama normal GW00- 27592-95 38.93 2,24 2.24 mama normal 235:238 tumor de mama GW00- tumor de 27588-91 36.57 10.08 10.08 4,50 231 :234 mama mama normal GW98-621 23656 34.9 29.32 58.64 mama normal tumor de mama GW98- tumor de 23655 36,11 13.51 27.02 -2, 17 620 mama cerebro normal BB99- cerebro 25507 29.6 866.9 1733.80 542 normal cerebro normal BB99- cerebro 25509 31.93 194.87 389.74 406 normal cerebro normal BB99- cerebro 25546 30.38 526.58 1053,16 904 normal Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25502 32.7 119.57 239.14 -4.43 BB99-874 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25503 30.08 634.97 1269 94 1.20 BB99-887 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25504 29.7 809.22 1618.44 1.53 BB99-862 ALZ etapa 5 Cerebro con ALZ etapa 5 Cerebro con 25542 29.93 700.82 1401.64 1.32 BB99-927 ALZ etapa 5 pulmón normal Pulmón CT normal 35.1 25.82 51.64 CT 26 de pulmón 26 de pulmón normal 36.74 9.07 normal 27 de pulmón 27 de pulmón normal 40 0 0.00 normal 24 de pulmón 24 de pulmón COPD 40 2.5 2.50 -7.11 con COPD 28 de pulmón 28 de pulmón COPD 40 0 0.00 -17,77 con COPD 23 de pulmón 23 de pulmón COPD 40 0 0.00 -17.77 con COPD 25 de pulmón 25 de pulmón normal 39.39 1 ,67 1.67 normal pulmón asmático pulmón 29321 40 0 0.00 -17.77 OD031 12 asmático pulmón asmático pulmón 29323 37 7,68 15.36 -1.16 OD03433 asmático pulmón asmático pulmón 29322 36.08 13.8 27.60 1.55 OD03397 asmático pulmón asmático pulmón 29325 40 0 0.00 -17.77 OD04928 asmático células endoteliales control 40 0 0.00 células endoteliales VEGF endo 40 0 0.00 VEGF endo 0.00 bFGF endo 35.68 17.77 17.77 bFGF endo 17.77 corazón Clontech normal 35.03 26.95 53.90 corazón T-1 de corazón 29417 36.36 11.53 23.06 T-1 de -2.34 isquémico coraz n isquémico T-14 de corazón con 29422 34.57 36.11 72.22 T-14 da 1.34 DCM no obstructiva corazón con DCM no obstructiva T-3399 de corazón con 29426 36.25 12.37 24.74 T-3399 de -2.18 DCM corazón con DCM Adenoides GW99-269 26162 38.51 2,92 5.84 adenoides amígdala GW98-280 22582 35.05 26.54 53.08 amígdala Células T PC00314 28453 35.5 19.98 39.96 Células T PBMNC 40 0 0.00 PBMNC Monocito 40 0 0.00 monocito Células B PC00665 28455 33.78 59.82 19.64 Células B células dendrltlcas 284 1 29.33 1026.14 2052.28 Células dendrltlcas neutrófilos 28440 31.3 292.56 292.56 neutrófilos eosinófilos 28446 35.97 14.79 29.58 Eosinófilos BM no estimulada 35.56 19.16 19.16 BM no estimulada BM estimulada tratado 34.79 31 .48 31.48 BM estimulada 1.64 osteo diferenciado tratado 40 2.59 2.59 osteo 2.59 diferenciado osteo indiferenciado 40 0 0.00 Osteo Indiferenciado condrocltos 37.11 7.15 17.88 Condrocltos Sinovlo con OA IP12/01 29462 35.95 14.93 14.93 Sinovio con OA Sinovio con OA ??10/0? 29461 35.74 17.17 34.34 Sinovio con OA Sinovio con OA NP57/00 28464 39.09 2.02 4.04 Sinovlo con OA Sinovio con RA NP03/01 28466 38.03 3.97 7.94 Sinovlo con RA Sinovio con RA NP71/00 28467 35.08 26.03 52.06 Sinovio con RA Sinovio con RA NP45/00 28475 37.1 1 7.13 14.26 Sinovlo con RA Hueso con OA (biobank) 29217 33.76 60.54 60.54 Hueso con OA (biobank) Muestra 1 de hueso con J. Emory 33.35 78.68 157.36 Hueso con OA OA Muestra 2 de hueso con J. Emory 34.15 47.2 94.40 Hueso con OA OA Cartílago (reserva) Normal 35.05 26.63 53.26 Cartílago normal (reserva) esa muestra Nombre del gen sbq1399854ANK No. de veces en que se repitió la alteración Tejidos enfermos en la población enferma respecto a la población normal tumor de colon 2.13 tumor de colon 1.45 tumor de colon 12.61 tumor de colon 4.55 tumor de pulmón 2.08 tumor de pulmón 1 .22 tumor de pulmón -6.02 tumor de pulmón -10.31 tumor de mama 2.20 tumor de mama 22.93 tumor de mama 4.50 tumor de mama -2.17 Cerebro con ALZ etapa 5 -4.43 Cerebro con ALZ etapa 5 1.20 Cerebro con ALZ etapa 5 1 .53 Cerebro con ALZ etapa 5 1.32 24 de pulmón -7.1 1 28 de pulmón -17.77 23 de pulmón -17.77 pulmón asmático -17.77 pulmón asmático -1.16 pulmón asmático 1.55 pulmón asmático -17.77 VEGF endo 0.00 bFGF endo 17.77 T-1 de corazón -2.34 T-14 de corazón 1.34 T-3399 de corazón -2.18 BM estimulada 1 .64 osteo diferenciado 2.59 Cartílago (reserva) -4.54 PBL con VIH IIIB 1.51 MRC5 con cepa F de HSV 10.50 CUADRO 5 Otras enfermedades basadas en la expresión del ARN mensajero en tejidos específicos Expresión en Otras enfermedades el tejido Cerebro Enfermedades neurológicas y psiquiátricas que incluyen enfermedad de Alzheimer, parálisis parasupranuclear, enfermedad de Huntington, distrofia miotónica, anorexia, depresión, esquizofrenia, dolor de cabeza, amnesia, trastornos de ansiedad, trastornos del sueño, esclerosis múltiple Corazón Enfermedades cardiovasculares que incluyen insuficiencia cardiaca congestiva, cardiomiopatía dilatada, arritmias cardiacas, enfermedad de Hodgson, infarto al miocardio, arritmias cardiacas Pulmón Enfermedades respiratorias que incluyen asma, enfermedad pulmonar obstructiva crónica, fibrosis qufstica, bronquitis aguda, síndrome de sufrimiento respiratorio del adulto Hígado Dislipidemia, hipercolesterolemia, hipertrigliceridemia, cirrosis, encefalopatía hepática, hepatocirrosis grasa, hepatitis viral y no viral, diabetes mellitus tipo II, tolerancia deteriorada a la glucosa Riñón Enfermedades renales que incluyen insuficiencia renal aguda y crónica, necrosis tubular aguda, cistinuria, síndrome de Fanconi, glomerulonefritis, carcinoma de células renales, hipertensión renovascular Músculo Enfermedad de Eulenburg, hipoglicemia, obesidad, tendinitis, esquelético parálisis periódica, hipertermia maligna, paramiotonía congénita, miotonía congénita Intestino Enfermedades gastrointestinales que incluyen miotonía congénita, íleo, obstrucción intestinal, estomatitis tropical, enterocolitis pseudomembranosa Bazo/linfa Linfangiectasia, hiperesplenismo, angiomas, espondilitis anquilosante, enfermedad de Hodgkin, macroglobulinemia, linfomas malignos, artritis reumatoide Placenta Coriocarcinoma, lunar hidatidiforme, plancenta previa Testículo Cáncer testicular, enfermedades reproductivas masculinas que incluyen bajo nivel de testosterona e infertilidad masculina Páncreas Cetoacidosis diabética, diabetes tipo 1 y 2, obesidad, tolerancia deteriorada a la glucosa LISTADO DB SECUENCIAS <110> SMITHKLINE BEECHAM CORPORATION SMITHKLINE BEECHAM p.l.C. GLAXO GROUP, LIMITED <120s. COMPUESTOS NOVEDOSOS cl30:> GP50034 <140> POR SER ASIGNADO <141> 13-09-2001 <150> 60/232,463 cl51> 13-09-2001 <150> 60/232,455 <151> 13-09-2000 <150> 60/237,293 <151> 02-10-2000 ¦=151> 07-11-2000 <150> 60/252,049 <151> 20-11-2000 <160> 8T <170> FastSEQ para Windows Versión <210> l c211> 1707 <212> ADN <213> Ho o sapiens <400> 1 atgaaggaag cagagatgga cggtgaggca gtccgcttct gcacagataa ccagtgtgtc 60 tccctgcacc cccaagaggt ggactctgtg gcaatggctc ctgcagcccc caagataccg 120 aggctcgttc aggctacccc ggcatttatg gctgtgacct tggtcttctc tcttgtgact 180 ctctttgtag tgggtaagcc cccagttcaa cagcagacaa gacctgttcc gaagcctgtg 240 caagccgtaa ttctgggaga caacattact gggcatttac cttttgaacc caacaatcat 300 caccactttg gcagggaggc agaaatgcga gagcttatcc agacatttaa aggccacatg 360 gagaattcca gtgcctgggt agtagaaatc cagatgttga agtgcagagt ggacaatgtc 420 aattcgcagc tccaggtgct cggtgatcat ctgggaaaca ccaatgctga catccagatg 480 gtaaaaggag ttctaaagga tgccactaca ttgagtttgc agacacagat gttaaggagt 540 tccctggagg gaaccaatgc tgagatccag aggctcaagg aagaccttga aaaggcagat 600 gctttaactt tccagacgct gaatttctta aaaagcagtt tagaaaacac cagcattgag 660 ctccacgtgc taagcagagg cttagaaaat gcaaactctg aaattcagat gttgaatgcc 720 agagccaatg ctgagatcca gggactaaag gaaaatttgc agaacacaaa tgctttaaac 780 tcccagaccc aggcctttat aaaaagcagt tttgacaaca ctagtgctga gatccagttc 840 ttaagaggtc atttggaaag agctggtgat gaaattcacg tgttaaaaag ggatttgaaa 900 atggtcacag cccagaccca aaaagcaaat ggccgtctgg accagacaga tactcagatt 960 caggtatcca agtcagagat ggaaaatgtg aataccttaa atgcccagat tcaggtctta aatggtcata tgaaaaatgc cagcagagag atacagaccc taaaacaagg aatgaagaat gcttcagcct taacttccca gacccagatg ttagacagca atctgcagaa ggccagtgcc gagatccaga ggttaagagg ggatctagag aacaccaaag ctctaaccat ggaaatccag caggagcaga gtcgcctgaa gaccctccat gtggtcatta cttcacagga acagctacaa agaacccaaa gtcagcttct ccagatggtc ctgcaaggct ggaagttcaa tggtggaagc ttatattatt tttctagtgt caagaagtct tggcatgagg ctgagcagtt ctgcgtgtcc cagggagccc atctggcatc tgtggcctcc aaggaggagc aggcatttct ggtagagttc acaagtaaag tgtactactg gatcggtctc actgacaggg gcacagaggg ctcctggcgc tggacagatg ggacaccatt caacgccgcc cagaacaaag cccctgttgt cttcgggttt tgggaaaaga atcagtctga caactggcgg cacaagaatg ggcagactga agactgtgtc caaattcagc agaagtggaa tgacatgacc tgtgacaccc cctatcagtg ggtgtgcaag aagcccatgg gccagggtgt ggcctga < 210 > 2 < 211 > 1095 c 212 > ADN < 2 13 Homo sapiens c 400 > 2 atgtcgagac aaggaaaatt attttctgct tttggagtgg gttgttgtgt aacggcaggc ttgccaaagg acgataacac tectagcacc attgcggatg tgcacaatgg ttatacgatg aatgttgtag agcaagttct aaaggatagt tttgtgttat ttttcccagg aacactttgt gattttccaa aaatacacca tggatttctg tatgatgaag aagattataa ccctttttcc caagttccta caggggaagt tttctattac tcctgtgaat ataattttgt gtctccttca aaatcctttt ggactcgcat aacatgcaca gaagaaggat ggtcaccaac accgaagtgt cccagaatgt gttcctttcc ttttgtgaaa aatggtcatt ctgaatcttc aggactaata catctggaag gtgatactgt acaaattatt tgcaacacag gatacagcct tcaaaacaat gagaaaaaca tttcgtgtgt agaacggggc tggtccactc ctcccatatg cagcttcact atgaaaacat gtggatacat acctgaactc gagtacggtt atgttcagcc gtctgtccct ccctatcaac atggagtttc agtcgaggtg aattgcagaa atgaatatgc aatgattgga aataacatga ttacctgtat taatggaata tggacagagc ttcctatgtg tgttgagtct actgcatatt gtgggccccc tccatctatt aacaatggag ataccacctc attcceatta tcagtatatc ctccagggtc aacagtgacg taccgttgcc agtccttcta taaactccag ggctctgtaa ctgtaacatg cagaaataaa cagtggtcag aaccaccaag atgcctagat ccatgtgtgg tatctgaaga aaacatgaac aaaaataaca tacagttaaa atggagaaac gatggaaaac tctatgcaaa aacaggggat gctgttgaat tccagtgtaa attcccacat aaagcgatga tatcatcacc accatttcga gcaatctgtc aggaagggaa atttgaatat cctatatgtg aatga < 210 = 3 < 2 11 > 984 < 2 12 > ADN < 2 13 > Homo sapiens 400> 3 atgttgctct tattcagtgt aatcctaatc tcatgggtat ccactgttgg gggagaagga acactttgtg attttccaaa aatacaccat ggatttctgt atgatgaaga agattataac cctttttccc aagttcctac aggggaagtt ttctattact cctgtgaata taattttgtg tctccttcaa aatccttttg gactcgcata acatgcacag aagaaggatg gtcaccaaca ccgaagtgtc tcagaatgtg ttcctttcct tttgtgaaaa atggtcattc tgaatcttca ggactaatac atctggaagg tgatactgta caaattattt 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1380 gtccagcgtc ttgtcagccc cgacggcaca caggaccagc tgctgctgcc ccacgccggc 1440 tacgcccggc cctggagccc tgcggaggac agccgcatac gcctgactgc ccggcgctgt 1500 cctggctga 1509 210> 6 211> 1356 212> ADN 213 > Homo sapiens <400> 6 atggactcgg cccctctgtt ccccaggccc cacctcttcc agaacctcct gctcttcctg 60 tgggccctgc tgaactgtgg tttgggggtc agtgctcagg gtccgggcga gtggaccccg 120 tgggtgtcct ggacccgctg ctccagctcc tgcgggcgtg gcgtctctgt gcgcagccgg 180 cgctgcctcc ggcttcctgg ggaagaaccg tgctggggag actcccatga gtaccgcctc 240 tgccagttgc cagactgccc cccaggggct gtgcccttcc gagacctaca gtgtgccctg 300 tacaatggcc gccctgtcct gggcacccag aagacctacc agtgggtgcc cttccatggg 360 gcgcccaacc agtgcgacct caactgcctg gctgaggggc acgccttcta ccacagcttc 420 ggccgcgtcc tggacggcac cgcctgcagc ccgggtgccc agggggtctg cgtggctggc 480 cgctgcctta gcgccggctg tgatgggttg ttgggctcgg gtgccctcga ggaccgctgt 540 ggccgctgcg gaggcgccaa cgactcgtgc cttttcgtgc agcgcgtgtt tcgtgacgcc 600 ggtgccttcg ctgggtactg gaacgtgacc ctgatccccg agggcgccag acacatccgc 660 gtggaacaca 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120 tatctgcggc gtctgctgct cctgctactg ctgctgctgc tgcggcagcc cgtaacccgc 180 gcggagacca cgccgggcgc ccccagagcc ctctccacgc tgggctcccc cagcctcttc 240 accacgccgg gtgtccccag cgccctcact accccaggcc tcactacgcc aggcaccccc 300 aaaaccctgg accttcgggg tcgcgcgcag gccctgatgc ggagtttccc actcgtggac 360 gggtatgtag gtctgaacag ctctcaaaag ctggcctgcc tcattggcgt ggagggtggt 420 cactcactgg acagcagcct ctctgtgctg cgcagtttct atgtgctggg ggtgcgctac 480 ctgacactta ccttcacctg cagtacacca tgggcagaga gttccaccaa gttcagacac 540 cacatgtaca ccaacgtcag cggattgaca agctttggtg agaaagtagt agaggagttg 600 aaccgcctgg gcatgatgat agatttgtcc tatgcatcgg acaccttgat aagaagggtc 660 ctggaagtgt ctcaggctcc tgtgatcttc tcccactcag ctgccagagc tgtgtgtgac 720 aatttgttga atgttcccga tgatatcctg cagcttctga agaagaacgg tggcatcgtg 780 atggtgacac tgtccatggg ggtgctgcag tgcaacctgc ttgctaacgt gtccactgtg 840 gcagatgatt cgaatcgatg ctcggtaccc gtcattggat ctgagttcat cgggattggt 900 ggaaattatg acgggactgg ccggttc ct caggggctgg aggatgtgtc cacataccca 960 gtcctgatag 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480 gcctcctatt ctgagctgga gcttgtgacc tcggctaaag gtctgaacag ctctcaaaag 540 ctggcctgcc tcattggcgt ggagggtggt cactcactgg acagcagcct ctctgtgctg 600 cgcagtttct atgtgctggg ggtgcgctac ctgacactta ccttcacctg cagtacacca 660 tgggcagaga gttccaccaa gttcagacac cacatgtaca ccaacgtcag cggattgaca 720 agctttggtg agaaagtagt agaggagttg aaccgcctgg gcatgatgat agatttgtcc 780 tatgcatcgg acaccttgat aagaagggtc ctggaagtgt ctcaggctcc tgtgatcttc 840 tcccactcag ctgccagagc tgtgtgtgac aatttgttga atgttcccga tgatatcctg 900 cagcttctga agaagaacgg tggcatcgtg atggtgacac tgtccatggg ggtgctgcag 960 tgcaacctgc ttgctaacgt gtccactgtg gcagatcact ttgaccacat cagggcagtc 1020 attggatctg agttcatcgg gattggtgga aattatgacg ggactggccg gttccctcag 1080 gggctggagg atgtgtccac atacccagtc ctgatagagg agttgctgag tcgtagctgg 1140 agcgaggaag agcttcaagg tgtccttcgt ggaaacctgc tgcgggtctt cagacaagtg 1200 gaaaaggtga gagaggagag cagggcgcag agccccgtgg aggctgagtt tccatatggg 1260 caactgagca catcctgcca ctccc&cctc gtgcctcaga atggacacca ggctactcat 1320 ctggaggtga 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Cys Val Gln Ala Leu 130 <210 89 <211> 324 <212> PRT 213 Homo sapiens Met Leu Lys Pro Lys Asp Leu Cys Pro Arg Ala Gly Thr Arg Thr Phe 1 5 10 15 Leu Glu Ala Me Gln Ala Gly Lys Val His Leu Ala Arg Phe Val Leu 20 25 30 ABp Ala Leu Asp Arg Ser lie lie Asp Cys Arg Ala Glu Gln Gly Arg 35 40 45 Thr Pro Leu Met Val Ala Val Gly Leu Pro Asp Pro Ala Leu Arg Ala 50 55 60 Arg Phe Val Arg Leu Leu Leu Glu Gln Gly Ala Ala Val Asn Leu Arg 65 70 75 80 Asp Glu Arg Gly Arg Thr Ala Leu Ser Leu Ala Cys Glu Arg Gly His T5 90 95 Leu Asp Ala Val Gln Leu Leu Val Gln Phe Ser Gly Asp Pro Glu Ala 100 105 110 Ala Asp Ser Ala Gly Asn Ser Pro Val Met Trp Al Ala Ala Cys Gly 115 120 125 His Gly Ala Val Leu Qlu Phe Leu Val Arg Ser Phe Arg Arg Leu Gly 130 135 140 Leu Arg Leu Asp Arg Thr Asn Arg Ala Gly Leu Thr Ala Leu Gln Leu 145 150 155 160 Ala Ala Ala Arg Gly His Gly Thr Ser Ala Gly Gly His Gly Gly Glu 165 170 175 Ala Gly Ser Ala Gly Lys Asn Ser Gly Arg His Arg Ala Gln Gly Ser 180 185 190 Glu Arg Pro Glu Leu Gly Arg Ser Met Ser Leu Ala Leu Gly Ala Val 195 200 205 Thr Glu Glu Glu Ala Ala Arg Leu Arg Ala Gly Ala Leu Met Ala Leu 210 215 220 Pro Asn Ser Pro Gln Ser Ser Gly Thr Gly Arg Trp Arg Ser Gln Glu 225 230 235 240 Val Leu Glu Gly Ala Pro Pro Thr Leu Ala Gln Ala Pro lie Gly Leu 245 250 255 Ser Pro His Pro Glu Gly Gly Pro Gly Ser Gly Arg Leu Gly Leu Arg 260 265 270 Arg Arg Ser Thr Ala Pro Aap lie P o Ser Leu Val Gly Glu Ala Pro 275 280 2B5 Gly P o Glu Ser Gly Pro Glu Leu Glu Ala Asn Ala Leu Ser Val Ser 290 295 300 Val Pro Gly Pro Asn Pro Trp Gln Ala Gly Thr Glu Ala Val Val Leu 305 310 315 320 Arg Ala Gln Arg

Claims (1)

320 NOVEDAD DE LA INVENCION REIVINDICACIONES
1 .- Un polipéptido aislado, caracterizado porque se selecciona del grupo que consiste de: (a) un polipéptido aislado codificado por un poiinudeótido que comprende una secuencia descrita en el cuadro I; (b) un polipéptido aislado que comprende una secuencia de polipéptidos descrita en el cuadro I; y (c) una secuencia de polipéptidos de un gen descrito en el cuadro I . 2 - Un poiinudeótido aislado, caracterizado porque se selecciona del grupo que consiste de; (a) un poiinudeótido aislado que comprende una secuencia de polinucleótidos descrita en el cuadro I; (b) un poiinudeótido aislado de un gen descrito en el cuadro I; (c) un poiinudeótido aislado que comprende una secuencia de polinucleótidos que codifica para un polipéptido descrito en el cuadro I; (d) un poiinudeótido aislado que codifica para un polipéptido descrito en el cuadro I; (e) un poiinudeótido que es un equivalente de ARN del poiinudeótido de los incisos (a) a (d); o una secuencia de polinucleótidos complementaria a dicho poiinudeótido aislado. 3.- Un vector de expresión, caracterizado porque comprende un poiinudeótido capaz de producir un polipéptido de la reivindicación 1 , cuando dicho vector de expresión está presente en una célula hospedera compatible. 4.- Un procedimiento para producir una célula hospedera 321 recombinante, caracterizado porque comprende el paso de introducir un vector de expresión que comprende un polinucleótido capaz de producir un polipéptido de la reivindicación 1 en una célula, de modo que la célula hospedera, bajo condiciones de cultivo adecuadas, produce dicho polipéptido. 5.- Una célula hospedera recombinante, caracterizada porque se produce mediante el procedimiento de la reivindicación 4. 6. - Una membrana de una célula hospedera recombinante de la reivindicación 5, caracterizada porque expresa dicho polipéptido. 7. - Un procedimiento para producir un polipéptido, caracterizado porque comprende cultivar una célula hospedera de la reivindicación 5, bajo condiciones suficientes para la producción de dicho polipéptido y para la recuperación de dicho polipéptido del cultivo.
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